Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_AP019773 | Bartonella quintana strain MF1-1 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_AP019773
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
595353 : 603766
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP019773|595353:603766|DBSCAN-SWA ATCAGCGTAGCAAAATTTCTTGTAGAAATTTTCCGGTGTAGGAAGCGGGAACATTAATAATATCTTCAGGTCGTCCAACTGCCACAATTTCACCGCCACGATATCCACCTTCTGGTCCTAAGTCAATAATCCAGTCGGCTGTCTTTATAACTTCAAGATTATGCTCAATGACTGCGACTGTATTCCCTTGCTCAACGAGTTCGTGCAGTACTTCGAGGAGTTTAGAGATATCGTGAAAATGCAGCCCCGTTGTTGGTTCGTCCAAAATGTAGAGTGTGCGACCTGTTGTTTTGCGTGAAAGTTCTTTGGCAAGTTTCACGCGTTGGGCTTCACCACCGGAAAGTGTCGTGGCTTGTTGTCCTACTTTGATATAGCCGAGGCCGACTTTGATGAGGGTCTTCATTTTGTTGTGAATGGTGGGAACAGCTTGGAAAAATTCCTCTGCTTTTTCGATTGTCATATCCAAGACATCGGCGATCGACTTTCCTTTAAATTTCACTTCCAGTGTTTCTCGATTATAGCGTTTTCCTTGGCATACATCACAAGTAACGTAGACATCGGGCAAAAAGTGCATTTCAATTTTGATAACCCCATCACCTTGACATGCTTCGCAGCGTCCTCCCTTAACATTGAATGAAAAACATCCTGCTTGATAACCACGCGCTTTTGATTCTGGAAGTTCGGCAAACCACTCACGAATTGGGGTAAAAGCACCCGTATAGGTTGCTGGATTAGAACGTGGGGTACGTCCAATAGGAGATTGATTGATATCGATGACTTTATCGAGAAATTCTAATCCTTCAATTTTATCGTAGCTTTCTGGGCTGTGATGGCTTCCCATGATATAACATGATGCGGCTTTGAAAAGGGTTTCAATGAGGAGTGTTGATTTTCCTCCACCTGAAACGCCAGTTATACAGGTAAAGGTTCCAAGAGGAATTTCAGCATTGATATTTTTGAGATTATTGCCTCGAGCACCGATGATTTTCAGTGTTTTTGTCTTTGATATTTTACGTCGTTGAGTAGGGATGGTAACTGCCATTCTTCCTGAAAGATATTGGCCTGTGAGGGAAGAAGGATTTTCTATAATTTCTTGCGGTGTGCCTTGTGCCATGATTTTTCCACCATGAACGCCTGCTGCTGGTCCCATATCAACGACATGGTCTGCAGTAAGAATGGCATCTTCATCATGTTCAACAACAATAACTGTGTTGCCGAGATCGCGCAGATGATGCAGCATCTTTAGAAGGCGTGCATTATCACGTTGGTGTAAACCGATAGATGGTTCATCTAAAATATAAAGGACGCCTGTAAGACCAGAGCCAATCTGGGATGCTAACCGAATACGTTGACTTTCTCCACCTGAAAGTGTGCCTGAATTTCGAGATAAGGTAAGATATTCAAGTCCTACATGATTTAAAAAAGCTAAGCGTTCACGAATTTCTTTTAAAATGCGTACAGCTATATTACGTTGTTTTTCAGTCAGATATTGATCAATGTTGGCAAACCAATCATCTGCTTTTAAGATAGAAAGTTCTGATATTTGTCCAATATGCATCCCGTGGATTTTAATAGCGAGTGCTTCTGGTTTTAAACGATAACCATGACAGGCTGGACAGAGCGAAGAAGACATATAACGCTCGATTTCTTCACGTGACCACGCAGAATCTGTTTCTTTCCATTGTTTTTCCATATTCGGGATAACACCTTCAAAATGTTGGATCATTTTATGTGAACCTGAATCACTTTTATGGTCAAAGGAAATTGTCTTTCTTTTTGTGCCATAGAGAATAGCCTGCTGCGCTTCATCTGAGAGTGCACTCCATTTATCCGTGAGTTTAAATCCATAAATCTTACCCAATGCCTCTAAGATTTGGTTAGAAAAGGGTGAGGATGATTTAGACCAAGGGGCAATTGCTCCAGATTCTAAGGTGAGATTTTCATTTGGTATGATTTTTTTAGGGACGATTGCCTTTTTTGTGCCAAGTCCGTCGCAAGTAGGGCAAGCGCCAAAAGGGTTATTGAATGAAAAGAGCCGTGGTTCAATTTCAGGGATAGAAAATCCAGATATGGGGCAGGAAAACTTTTCTGAAAAAATAAGCCGTTTGTGCGTTTCATTTTTTGATTTATTGGCAGATTCCTTTGAGATTTCTTTTTGGGCTAAAGGTTGATCTGCCATTTCAACTACTGCAATCCCATCTGCTAGCTGCAAACAGGTTTTTATACTGTCAGCTAGGCGAGAGGCCATGTCATTATGCACAACAATGCGGTCTACCACAACATCTATGTCATGTTTATATTTTTTATCAAGAGGAGGAATATCAGGAATTTCATAAAATTTTCCATCAACTTTAGCGCGCTGAAATCCTTTTTTTAAAAGTTCCATTAACTCTTTTTTATATTCTCCCTTTCGTCCTCGCACTAAGGGCGCCATAATAAAAATCCGCGTACCTTCTGATAAGGCCATAATTTGATCGACCATTTGGCTTACTGTTTGGCTTTCGATAGGCAGTCCCGTCGTAGGGGAATGAGGAACACCGATACGTGCAAAGAGAAGGCGCATATAGTCGTGAATTTCAGTAACAGTACCTACTGTTGAACGGGGGTTGCGGCTGGTTGTTTTTTGTTCAATGGAGATGGCGGGGGAAAGACCATCTATTCGGTCGACATCTGGTTTTTGCATCATTTCCAGAAATTGGCGTGCATACGCAGAAAGGCTTTCAACATAGCGGCGTTGACCTTCGGCGTAAATTGTATCAAAAGCTAAGGATGATTTACCTGATCCAGAAAGCCCTGTTATGACGATCAGTTTGTCACGAGGGAGGTCTATATCAAGATTTTTAAGATTATGCTCACGTGCGCCGCGAATGGAGATGTATTTTTGATGAGCCATATTTTATCCTTGGCATGTTTGATCAAAATTAAGCATCTAAAGTGGAATAAAACTTTTCCTTTAGAATTACAACGTGGTTAATTGTTAAGGTGGAAAAAGAGTACAAGTTCTGTGGAAAGAAAGATCCAGAAAGCAGCTTTTTATTCTCTGGTGATGGAATAAACTATGCGTTGTTATCATCTTTTGCTATAATCACATGATGTAATGTTTAATTAAGGGTAGGCAAGATCCACATTGAGGTCAATTGCAGAGGTAAATGCGCAAATGGTAAGATCAAGATGGTAATTGACTGCATAAAGAGAGTGTTTTGCAAATTAAGACTTTGGAGTTTATGAGATGGCTGGTAGCCTTAATAAAGTTATTTTGATTGGTAATCTTGGTGCCGATCCTGAAATCCGCCGTTTGAATTCTGGTGATCAAGTTGCAAATCTGCGTATTGCGACTTCAGAAAGTTGGCGCGATCGTAATACAAATGAACGTAAAGAACGCACGGAGTGGCATAATATTGTTATTTTTAATGAAAACCTTGTCAAAGTTGTAGAGCAATATTTAAAAAAAGGTAGTAAGATCTATATTGAAGGTCAGTTGCAAACGCGCAAATGGCAAGATCAAAATGGTAATGACCGTTATACAACAGAAATTGTTTTGCAAAAATACCGGGGTGAATTACAAATGCTTGATGGGCGTGGAGTAACTGGGGGAGAGCAAATGCAAGGAGCAAACCAGTCGAGCGGCGGTTATGTCAATAGTGGTTTTGGAGACAGTGGCGTAAATCAGAGAAATGTTTTTGGTCAAAACAATAGCCAATCGGAAGAAAGCTTTTCACACAAATTAGATGATGATGTACCTTTTTGATGATACTTAAGGCGTATTGCTATTGTTTTTTGTATTTTTTGGTTGTTCGTTTCAGGTTTTTAAAGTTCAAAAAAACAGGTCTTGTTGATTTTGTTCGCCGTTTTTAACATAAATAAATAACATATTGAAAATTATTATTAAATTTCTTCTCTGATGTAGGGGAGAAATTGGCATCTTATGTATTTTTCGATATATAAAAAGTAGAGTGATTCTTTTTGAAAGTCTTAAAGCTGTGACCGATTTTAATCCACTACCAGAACGTGATGTGCTGACCGGTATTGAACCAATCAGTATTATTGATGAAATGCAACGCTCCTATCTCGATTATGCAATGAGCGTGATTGTTTCACGTGCCCTTCCTGATGTACGTGATGGTCTTAAACCTGTTCATCGGCGTATTCTTCATGCCATGAATGAAATGGGGCTTGCTTTCAATAAGCCGTATCGTAAGTCTGCGGGTGTTGTTGGTGAGGTTATGGGAAAATTCCATCCTCATGGAGATGCTTCAATTTATGATGCTTTGGTTCGTATGGCTCAGGATTTCTCTTTACGAAATCCATTGATTGATGGTCAAGGGAATTTTGGTTCTGTTGATGGCGATCCGCCTGCGGCGATGCGTTATACAGAATGTCGTTTGGAAAAAGTTTCAGAAGAGCTTTTAGCGGATATTGATAAAGATACTGTTGATTTTCAAGATAATTATGATGGACGTGATCGTGAACCCGTAGTCTTACCAGCGCGTTTCCCTAATCTTTTGGTCAATGGATCAGGTGGTATTGCCGTGGGAATGGCAACTAATATTCCTCCTCATAATCTTGGTGAAGTTGTTGATGCTTGTATCGCCTTGATTGATGATCCCAATATAACACTTGATAAAATAATTGAAATTATTCCTGGTCCTGATTTTCCCACTGGTGGTATTATCCTTGGTCATTCCGGTATCCGTTCGGCTTATGAAACGGGACGTGGTTCAATTATTATGCGTGCTAAAGTTGATATTGAGGAAATGCACAATGGTCGACAGGCAATCATTGTAAGCGAAATACCTTACCAAGTTAATAAAGCAACGATGATTGAGAAAATGGCCGAATTGGTGCGTGATAAACGCATCGAAGGAATCTCTGATTTGCGTGATGAATCTGATCGTGATGGGTATCGGGTCGTTATTGAGCTTAAGAAAGATGTTATTGCAGAAGTTGTTTTGAACCAATTGTATCGTTATACGCTGCTACAAACTTCCTTTGGTTGTAATATGGTGGCGTTAAACGGAGGAAAACCTGAACAGATGACGTTGATTGATATGCTTCGTGCATTTGTTTCTTTCCGGGAAGAAGTTGTTAGTCGGCGAACAAAATATCTTTTGCGTAAAGCACGCGAAAGGGCGCATGTTTTGGTCGGTCTTGCAATTGCTGTTGCCAATATTGATGAAATTATAGCGCTCATTCGCAAAGCATCTGATCCACAGATAGCGCGTTCACAGTTAATGGAGCGGCGCTGGCTGGCTGCTGATGTGGCGTCTTTGATTAAACTTATTGATGATCCTCGTCATATTATCTATGGGGATAATACTTATAATTTATCTGAAGAACAGGCACGTGCTATTCTGGAATTGCGCTTGCAAAGGTTAACAGCGCTTGGACGTGATGAAATTGCTGATGAATTGAATAAAATTGGAGTGGATATTGCGGATTATCTTCATATTTTGGCATCACGTTCACGGATTATGAGCATTGTTAAAGATGAACTAAATGTTCTTCGCGAAGCCTTTGCAACTCCTCGACGCACTATATTTGGTTTTGGTAGCGCTGAGATGGATTGTGAAGATCTGATCGCACCGGAAGATATGGTGGTAACGGTGAGTCATAGTGGCTATATTAAACGGGTTCCTCTCAATACATACCGTGCGCAGCGCCGCGGTGGTAAGGGGCGTTCTGGTATGTCTACAAAGGATGAGGATTTTGTAACACATTTGTTTGTGGTTAATACCCATACACCGGTTCTTTTCTTTTCAACGCGTGGAATTGTTTATAAGGAAAAAGTTTGGCGTTTGCCTATTGGTACACCGCAATCGCGCGGGCGGGCTCTGATCAATATGCTTCCCTTACAGCAAGGTGAGCGTATAACAACTATTATGCCCTTGCCAGAAGATGAAGCGAGTTGGAGCGCATTGGATGTGATGTTCGCAACTACGCGTGGAACTGTGCGTCGTAATAAATTATCAGATTTCGTTCAGGTTAATCGCAATGGCAAAATTGCAATGAAACTTGATGAGGAAGATGAAATTCTTTCTGTAGAAACTTGTACGGAACATGATGACGTTGTTCTAACAACCGCTAATGGACAATGTATTCGTTTTCCAGTCGTTGAGGTTCGTATTTTTGCAGGTCGTAATTCGGTAGGGGTACGTGGTATTAATTTGGCTAATGGTGATAAAGTCATTTCGATGACTCTCTTAGAGCATGTTGAGGCGACGTCGGTTGAGCGTTCTGCCTATATTAAACGTGTGATTCATGAACGGCGTGCTGCTGGTGCAGATGCTGAAGATATTTTAACTCTTGATGAAAATGACGTGGGAACCGAAACAGAGTTGACAGATGAGCGCTATGCAGAGCTTAATGCTCGTGAGCAAATGCTTTTAACATTGAGTGAATTTGGTTATGGAAAACGGTCTTCCTCATATGAGTTCCGGATTTCTGGACGTGGTGGAAAAGGGATTCGTGCAACAGATCCATCTAAGACGGCTGAAATTGGTAAATTAGTAGCGGCTTTTCCGGTGAAGGCACAAGATCAAATTATGTTGGTGTCAGATGGGGGGCAGCTTATTCGCGTCCCTGTGGATGGTATTCGTATAGGTGGTCGTTCGACGAAGGGGGTGAAAATTTTCAATACAGCTGAGGGTAAAAAAGTTGTATCAGTTGAGCGTATTTCTGAATCTGAAGATGATGTTAGCCAATTAGATGATGAAGCTGGAAAGCATTCTGATACGGTTGATGTGAGCGAAGAAAAATAATTCTGAAGGGGCCGAGAAAATAATGAAAATTGCTCTTTATGCCGGTTCCTTCGATCCTCTTACAAATGGTCATATTGCTATTTTGCAAGGCAGTTTTGTTTTGGCTGATAAGGTGGTTGTGGCTATAGGCATGCAGGCTAAAAAAAAATCACTTTTTAGTTTTGAAGAACGTGTTGATTTAATTACCCAGGTAGGGAAAGATTTGTTAAGTATAGGTCCTGATCGATTACAGGTTATTTCGTTTGATACTCTTTTGATTGATAAGGCGCGTGAAATTGGTGCTTCATTTCTTATTCGTGGGTTACGTGATGGCACTGACCTTGACTATGAAATGCAAATGGCGGGGATGAATGGTGTTATGGCTCCTGAATTACAAACTGTTTTTTTGCCGGCGAGTGTTTCAGGGCGTGCGATAACTTCTACCTTGGTGCGCCAGATTGCCTCTATGGGAGGTGATGTATCAGCCTTTGTACCTCCCAATGTTGAACGAGCTTTGCACTTAAAATTTCAATTTTCAAGGGAAAATGGTTGTGTCTCTTAAACTTTTTGCTGTTTTGACATGTATTTTTTGCTTTTTTTCATCGAGTGCTGTGGCAGATGATTCTAAGGCAGCTGATAATTCTAATATTCTTGTTTTATCTCTCAAAAATGGTGAAGTGGTTATTCGCTTTCGGCCTGATTTAGCACCAAAACATGTTGCACAAATCAAGAGGTTAACAAAGGAAGGTGCATACAACAATGTTGTATTTCATCGTGTTATTCCCGGTTTTATGGCACAGACTGGTGATGTGCAGTTTGGGAAGAAGGGCAGTGCGAATTTTGATCTTAAACGTGTTGGTACGGGTGGTTCCAATTATCCCAATATACCAGCAGAGTTTTCAGAGCAGCCATTTAAGCGTGGTACTGTTGGGATGGCACGTTCACAAAATCCTGATTCAGCTAATTCTCAGTTTTTCATTTGTTTTAATGATGCTGTTTTTTTAAATGGTCAGTATACTGTTGTTGGAGAAGTTGTAAAGGGAATGGATGTTGTTGATAAAATTAAAAAAGGCACCACAAGTAATAATGGATCTGTAAAAGATCCTGATATTATTAATGCTGCTACTTTACAAGCTGAGTAATAATTCAAAGGGAGTTAGCCGTATGTCCGAGATTAAAGATTTAGAGAATACTTTAATTCTTGAAACAACGAAGGGCAGAGTTGTTATTGAACTTTTTGCTGATTTAGCACCTAGGCATGTTGCACAAATCAGGAGGTTAACAAAGGAGGGTGCATACAACAATGTTGTATTTCACCGTGTTATTTCTGGTTTTATGGCACAGACTGGTGATGTGCAGTTTGGGAAGAAGGACAGTGCGAATTTTGATCCTAAACGTGTTGGTACGGGTGGTTCCAATTATCCCAATATACCAGCAGAGTTTTCTAATCTTTCGCATAAGCGTGGTACGGTTTCTATGGCACGTTCACAAAATCCTGATTCAGCTAATTCGCAGTTTTTTATCTGTTTTGCCGATGCTCCTTGGCTTGATCGTCAATATTCTATATGGGGGCAAGTTATTGAAGGTATGGAAAATGTCGATAAAATTAAGCATGGTGAACCTGTTGTAGATCCCGATGCAATTATTAAGGCCACAGTTGCTGCGGATACGAAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP019773|595353:603766|599332_602110_+|WP_042995589.1|DBSCAN-SWA MTDFNPLPERDVLTGIEPISIIDEMQRSYLDYAMSVIVSRALPDVRDGLKPVHRRILHAMNEMGLAFNKPYRKSAGVVGEVMGKFHPHGDASIYDALVRMAQDFSLRNPLIDGQGNFGSVDGDPPAAMRYTECRLEKVSEELLADIDKDTVDFQDNYDGRDREPVVLPARFPNLLVNGSGGIAVGMATNIPPHNLGEVVDACIALIDDPNITLDKIIEIIPGPDFPTGGIILGHSGIRSAYETGRGSIIMRAKVDIEEMHNGRQAIIVSEIPYQVNKATMIEKMAELVRDKRIEGISDLRDESDRDGYRVVIELKKDVIAEVVLNQLYRYTLLQTSFGCNMVALNGGKPEQMTLIDMLRAFVSFREEVVSRRTKYLLRKARERAHVLVGLAIAVANIDEIIALIRKASDPQIARSQLMERRWLAADVASLIKLIDDPRHIIYGDNTYNLSEEQARAILELRLQRLTALGRDEIADELNKIGVDIADYLHILASRSRIMSIVKDELNVLREAFATPRRTIFGFGSAEMDCEDLIAPEDMVVTVSHSGYIKRVPLNTYRAQRRGGKGRSGMSTKDEDFVTHLFVVNTHTPVLFFSTRGIVYKEKVWRLPIGTPQSRGRALINMLPLQQGERITTIMPLPEDEASWSALDVMFATTRGTVRRNKLSDFVQVNRNGKIAMKLDEEDEILSVETCTEHDDVVLTTANGQCIRFPVVEVRIFAGRNSVGVRGINLANGDKVISMTLLEHVEATSVERSAYIKRVIHERRAAGADAEDILTLDENDVGTETELTDERYAELNAREQMLLTLSEFGYGKRSSSYEFRISGRGGKGIRATDPSKTAEIGKLVAAFPVKAQDQIMLVSDGGQLIRVPVDGIRIGGRSTKGVKIFNTAEGKKVVSVERISESEDDVSQLDDEAGKHSDTVDVSEEK >NZ_AP019773|595353:603766|598581_599100_+|WP_011179516.1|DBSCAN-SWA MAGSLNKVILIGNLGADPEIRRLNSGDQVANLRIATSESWRDRNTNERKERTEWHNIVIFNENLVKVVEQYLKKGSKIYIEGQLQTRKWQDQNGNDRYTTEIVLQKYRGELQMLDGRGVTGGEQMQGANQSSGGYVNSGFGDSGVNQRNVFGQNNSQSEESFSHKLDDDVPF >NZ_AP019773|595353:603766|602132_602651_+|WP_014924201.1|DBSCAN-SWA MKIALYAGSFDPLTNGHIAILQGSFVLADKVVVAIGMQAKKKSLFSFEERVDLITQVGKDLLSIGPDRLQVISFDTLLIDKAREIGASFLIRGLRDGTDLDYEMQMAGMNGVMAPELQTVFLPASVSGRAITSTLVRQIASMGGDVSAFVPPNVERALHLKFQFSRENGCVS >NZ_AP019773|595353:603766|595353_598245_-|WP_161510374.1|DBSCAN-SWA MAHQKYISIRGAREHNLKNLDIDLPRDKLIVITGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLEMMQKPDVDRIDGLSPAISIEQKTTSRNPRSTVGTVTEIHDYMRLLFARIGVPHSPTTGLPIESQTVSQMVDQIMALSEGTRIFIMAPLVRGRKGEYKKELMELLKKGFQRAKVDGKFYEIPDIPPLDKKYKHDIDVVVDRIVVHNDMASRLADSIKTCLQLADGIAVVEMADQPLAQKEISKESANKSKNETHKRLIFSEKFSCPISGFSIPEIEPRLFSFNNPFGACPTCDGLGTKKAIVPKKIIPNENLTLESGAIAPWSKSSSPFSNQILEALGKIYGFKLTDKWSALSDEAQQAILYGTKRKTISFDHKSDSGSHKMIQHFEGVIPNMEKQWKETDSAWSREEIERYMSSSLCPACHGYRLKPEALAIKIHGMHIGQISELSILKADDWFANIDQYLTEKQRNIAVRILKEIRERLAFLNHVGLEYLTLSRNSGTLSGGESQRIRLASQIGSGLTGVLYILDEPSIGLHQRDNARLLKMLHHLRDLGNTVIVVEHDEDAILTADHVVDMGPAAGVHGGKIMAQGTPQEIIENPSSLTGQYLSGRMAVTIPTQRRKISKTKTLKIIGARGNNLKNINAEIPLGTFTCITGVSGGGKSTLLIETLFKAASCYIMGSHHSPESYDKIEGLEFLDKVIDINQSPIGRTPRSNPATYTGAFTPIREWFAELPESKARGYQAGCFSFNVKGGRCEACQGDGVIKIEMHFLPDVYVTCDVCQGKRYNRETLEVKFKGKSIADVLDMTIEKAEEFFQAVPTIHNKMKTLIKVGLGYIKVGQQATTLSGGEAQRVKLAKELSRKTTGRTLYILDEPTTGLHFHDISKLLEVLHELVEQGNTVAVIEHNLEVIKTADWIIDLGPEGGYRGGEIVAVGRPEDIINVPASYTGKFLQEILLR >NZ_AP019773|595353:603766|602640_603231_+|WP_161510375.1|DBSCAN-SWA MSLKLFAVLTCIFCFFSSSAVADDSKAADNSNILVLSLKNGEVVIRFRPDLAPKHVAQIKRLTKEGAYNNVVFHRVIPGFMAQTGDVQFGKKGSANFDLKRVGTGGSNYPNIPAEFSEQPFKRGTVGMARSQNPDSANSQFFICFNDAVFLNGQYTVVGEVVKGMDVVDKIKKGTTSNNGSVKDPDIINAATLQAE >NZ_AP019773|595353:603766|603253_603766_+|WP_014924199.1|DBSCAN-SWA MSEIKDLENTLILETTKGRVVIELFADLAPRHVAQIRRLTKEGAYNNVVFHRVISGFMAQTGDVQFGKKDSANFDPKRVGTGGSNYPNIPAEFSNLSHKRGTVSMARSQNPDSANSQFFICFADAPWLDRQYSIWGQVIEGMENVDKIKHGEPVVDPDAIIKATVAADTK |
6 | uncultured_Mediterranean_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
949856 : 955771
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP019773|949856:955771|DBSCAN-SWA TTTAAGCTTTTCCTTCCTTTGATACAGCTTTCTTCTCTTTAGATGCACCCACACGTTCCTTCTTTACAATTTTAGCTTCAGATTTTTTTTGTGTTTTTACTTTAGCATTAGGTTTTGATTTTTCTTCCGAAATGGGTTCTCCTTTAACGCGAACATCCGACAATGTTAAACGAATAACGCGAACACGCATACCGTCACAAATTTCAACCTCTAATTCACCACTCTCATCATAAACTTTCGTAACCTTGCCAATAATACCACCACCCGTTACAACGGTATCACCACGACGCACAGCATCAAGCATTTCCTTGCGTTTTTTCATTTGCGCACGTTGAGGGCGAATCATAAAAAAATACATAATTCCAAAAATCAAAATGAAAGGGACAAAAGTAACAAGTGAAGGCCCATTGGAAACATCCCCTGCAACTTGAGCATAAGCATTAGTAATAAACATTTTTATCTCCTATAGATTAAACTCCAGGTACTTGCCACTCTCCTAAAACAAGGCTTTTGGCTGCAAAAAGCTTCTAAAGGATCTATCGAGCGATAATTACACAATGTACTCACAGCTTTATCGAAAGGCAATAAATCCTTAAGAGATAGAAGGCAACGAGAAAAAATTTTAAAAAACAGATTTATTTCTCTCGTTTTGTATATCATGAATATAAGCATCTTCACTAACTGGAAAAACAAATGATGTAAAACAATTTTCTTCCTTTCCAATGAGCACAACTGATCGCTCTCCTAAAATGTGTGAATTTTTTTGCTGAAATACCATTGATTTAATCACATTGCTTGTTTTGTTCGAAAACTATATGAATTATAAACTTTTAAAATAAAGCCATCATGAATTAGTTTTCTAAATACTCGATAGGATCAACAGGTAAAGAATTCTTACGTACTTCAAAATAAACACGTGGAGTTTTAACATCTCCTGAAACACCAGACTTAGCAATCTCATCACCACGCCGTATCCTTTGCCCCCTGTTAACAACAAGCTTGCTATTATATCCATAAATAGTGATAATATTATTTTCATGTCGAATCATAACAACATTGCCGAGTTCTTTTAACCCATCACTTGCATAAATAACGATACCATTTTCCGCTGCCTTTACCGATGAGCCTTCAGGTACAGCAATATCTATTCCTCGACTCGTTGCCGTCCCTTTCTTTTGACCAAACTGGCTCAATAAACGCCCTCGTACCGGCCAACGCATCTTAGAAATTCCCGTAGCTTGTGGAGTCACACCATTATCCGTATTCATTACAGTGTTCAAAACATCCGTTTTATAATTCGATGAAGGCATCTGTGTGGAAGAATTCTGCTCAGCATTTGACCTGTTTATCTTTGAAGAAGGCATGGCTATTATAGGAGCTTTATCTGTAGATGGAGCTTTCTGATATCGTATAGAAGACCTGACTTGAGATTTGGATGAAGGTTCTGTTGATGTAACCCTATCATCATTTTGAGCATTCGAAGTTGCGACCGTACGCCTGCCTGGGATCATAAGCACCTGACCGATATAAATAGAATTATTATTGCTTATGCCATTTTCTAATTTTAATGCCTCAACACTGATCCCTATTTGCCGTGCAATGCTTAATAATGTATCCCCACTTTGAACGATATAAGAGTTTCGCCGAAAAAGAGGAGTATTATTCATTGAACGAGAAATTGTTCCAAGATTGCGTGGCGGAGTCCCTATAATTCGACCATCAGGAGAAAGCGTCCCGTCTTGTCGTGGAGAATTATATGAAGCACTGTCATCAGCCCATGAATTATTACTTGGCTCCACAGGTGGCAATTCAGTGCTTTGTATTACATCGCCACCGTACGATAGCATTCCCGGATCTGTAGGGATCGTTGTAGACATATTGGACCGATTAGAAACCGTATGATGAGAGAAAATATTAGCGAAACGCTGTGTACCAGAACTACACCCCGCAAGAATCGTTATCATCGCTAAAAGGGTTATCCCTTGATTACAACAGAAAATCTTACCCAAAACTTTTAAATACATAGTTTTGCTCACTCGCCAATACTCAAATTACTCTATTAGAACTTTTTAATATTACCTAAGAGTTAAAACTAAGATATTTTATTCAAAAATATCTTTACGGTAAAATCAAACTGAATTTGCTATAAAGCAAAAGATGAAATGCTTGAGGGAGTACCTACACTCTGAAAATCAAAGTGTTTCCGCAATACCTTCAATAAAGGGTTGATAGCGCACTTGAAACATTTCTAAGCACTCAAATCGGCTACCAATTTTTGTATAACGCGTAATCGTTTGTACCCCTTCATCGGGTCCTATGGCTTGAATGAGAATGCCATTTTCAGTTAAAAGTTCTAAAAATTCCTTTGGTTCATCAGAGCGTGATGGCCAAATAAGAATACGATCAAACGATCCAAAACCTGTAACAGTACGGCTTCCATCAAACTGTCGTAAAACAATATTCTCAATTCCCAAAGTTTGAAATTTTTGACGCGCCAAATCAATAAGTGTTTTATAGCGATCAATTGTTATTACACGTTCACTAAGACATGCCATAAGGGCAGTACAAAAACCAGAACCCGTACCAATTTCTAAGATGCGATGTTTCTTTTTCAACGATAAAGCAAAAAGGATCAAAAGCTGCTCTTCCAAACGCTCAATATATTCACCACACTCAATTGGGATAACTTTATTATCATATGCGCTGTTACACCAAGGAGAAGCCACAAACTGCTGCCGCGGAACTTTCTCCAATGCTGCAAAAAAGCGAACATCATCAATTCCTTTGCTGCGCATTTTCAGCACAAGACCGGCCAACTCCTCATGAAATCGTAAAATACCCTTTTGATTCATAGTATCATCCGATCTCCAACAAAGGAGTTACATGATTACACGCCCCCATTATCTCATTTAAAATGGCAAAACTTTGTGTTTGCATGCCATCATTTTCTAGCAATAAACTTATATCGTTTTTCCTTTTGCAAAATTAAGCAGTAATACAACGCATACCCTTTACATAAGGTTGTAAAACATCTGGTATAATAATCGACCCATCAGCCTGCTGATAATTCTCAAGAATGGCAATAAGACAACGACCAACAGCTGTACCAGAACCATTAAGACTATGAACGAATTTTAATGTTTTATCACCTTCTTTACGATACCGAGCATTCATGCGCCGCCCTTGAAAATCTCCACAAACTGAACAACTGGAAATTTCACGATAACATCCTTGGCCAGGAAGCCACACCTCAATATCATAAGTCTTACGGGCAGCAAATCCCATATCACCAGTAGAAAGAACCACTGTACGAAAAGGCAAACCAAGCCGTTTTAATACATCTTCTGCACATTCCGTCATACGTTCTAGTTCCATTAAAGACCGCTCTTCAGTAGTAATTGATACCATTTCTACCTTCCAAAACTGGTGTTGACGCAACATACCACGTGTATCACGGCCTGCAGATCCAGCTTCTGAGCGAAAACAAGGAGTCAAAGAAGAAAAGCGCAGTGGCAAATCTGATATCTCAAGAATTTCATTGTTTACCAAATTGGTTAACGGTACTTCTGCTGTAGAAATAAGCCACCGACCATCTGTCGTCCGAAAGAGATCGTCAGCAAATTTCGGCAACTGAGCTGCTCCATAAACAATCTCATCACGAACAAGAAGAGGTACCGAAACTTCTGTATAACCATGTTCATCAACATGCACATCAAGCATAAATTGACCCAATGCGCGTTCAAGCCGGGCCAATGCCCCTGAAAGCACTGTGAAACGTGCACCCGACAAACGGCTTGCCCGCTCAAAATCCATCTGCTTGAGATTTTGACCAAGATCAAAGTGTTCCTTTGGTGTAAAATCAAACATCACAGGTGTACCAAAATGTCGAATAACAACATTATCACTTCCATCTTTACCCAATGGAACATCATCCAATGGAATATTCGGGAGTGTTGAAAGAGCTCTCTCAAAGTTCTCTGTCAATCGCTTTTCTTCTGTTGTAGCAGAAGAAAGAAAGACTTTAATCTCTTCAACCTCAGCTCTAAGATGTTCAGCCATTGTCTGATCACACGCAGCTAAAGCCTGTCCTATTTCCTTTGAAGCCGCATTGCGACGCTCCTGTGCGGATTGCACTTTAGCAACATGTGACCGCCGCTCAAGATCAAGTTTTATTAACCTTTCAGCTTGTGGCTCAATGCCTCTCTTTGCCAATGCTTCATCTAATTTTTCAGGGTATTCACGAATCCACTTAATATCAAGCATCCAAATTCCTCATTTGCATCGTTTCTATTCGTTTCTTATCGCACAAGTTATAAACTTCTCTTAAGAGGATTTTTTCTCTTTTCTATCCAGTAGGCAATTAAAATTGAAATCTCATAAAGAGCAATCGTTGGTAAAGCCACTGCAAACATAGTAAAAAAATCCGATGGAGTTACTATCGCCGCAATTACAAAAGAGACGAGGATAGCCCACTTTCGTTTAGATACCAAACCATGAGAAGTTAAAAGTCCAACGTTCGTTAAAAGACTGGTGACAAGAGGTAATTGAAAAATCAAACCAAAAATCAGCATAAACGATGTCATAAAGCTCAAATAATCGGAGATACGGACTATAAACTCTATTCTTAAATGAACACCTGGAAGAAATTGCTGAGAAAGACTAAACCAAAGCATTATCGGCGCTAATAGAGCATAAACAAATGCTCCCCCAATACAAAATAAGATAGGGCTACTAATGAGAAATGGTAAAAAAGCCATGCGTTCATTTTTATAAAGACCTGGTGCGATAAAGCTATAAAACTGAAAAGCCGTACAGGGAAATGACAAAATAGCGGCCCCAAAAGCAGCAAGTTTCATTTTCGTTAAAAAAGTTTCCCATACTTGTGTTGATTGCAGACGAATACTTTCAGGATTACCACCCGACATTTTCATTGCCCACTGATAAGGCCATATCAAAAAATTTAAGATATAGTCTTTGACGAGAAAACACATCATAAAAGCTATTAAAAATGCGATCAGAGCAACAATAATTCGCTGACGAAGTTCAATCAAATGTTCTAAAAGTGGTGCCATATTGGCATCAACTTCATCTCTCTCATTCATGATGCATCTTCTTTATCTTTAGAAATTACAGAAATACTTCCAGAACTTTGAGAATCAACAGATACTGTTACCTCTTCATTGATTTTGTTCTGATCATATCCAACAATTTCTTTATTTTTTTCTGATTTATGGTGCATTGTATTTACATCAAAATTATTGCGGACATCCCCTACTGCATCATGAATGGGATTGAAAATTTCCATCAACTTCTTGTTTGGATTAAGATCATTAATATCCGATAATGTTTTTTGCAAATCATCGAGCTCGATTTGTTTCATTGCATCATCAAACTGATGACGAAATTCATTCGCTGTTGAACGTACATAAGCTATTGCTTTTGCCATTGTCCTTAGCATTTTCGGTAAATCTCTCGATCTAACTACGATGATGAGAACAAATAAGATCACAAGAAACTCTGGCCCATCAATCCCAAACATCACTTATACTCGACTTCCTTATTAAAAAATAATGTATAATTATTGAGTGTGTAATTGCGTCTTTATTACTTTCCACGCTGTTTTTTAGCAACAGACGCCTTGCCTTCTTTAAAGGAAGAAGAACCTTTTCTGCGTTCTGCTGCACGCTTCACCGATAACGGCTGAGATTGTTGAGGTCTAACATCTGTTGTTTTGGAATAGTCGGACATTTCAAGTTTATCCTCGAGAAGTTCTCCTTCTTCCTTCATATTCTTTTTAAAAGCTTTAATCCCCTTAGCCACATCGCCCATTAATTCAGAAACCTTACCGCGTCCGAAAAGCACAAGGACAATCAGTAAAATCACAATTAAATGTGTTGGTGAAAAAATATTACCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP019773|949856:955771|955459_955771_-|WP_011179259.1|DBSCAN-SWA MGNIFSPTHLIVILLIVLVLFGRGKVSELMGDVAKGIKAFKKNMKEEGELLEDKLEMSDYSKTTDVRPQQSQPLSVKRAAERRKGSSSFKEGKASVAKKQRGK >NZ_AP019773|949856:955771|950706_951879_-|WP_161510504.1|DBSCAN-SWA MYLKVLGKIFCCNQGITLLAMITILAGCSSGTQRFANIFSHHTVSNRSNMSTTIPTDPGMLSYGGDVIQSTELPPVEPSNNSWADDSASYNSPRQDGTLSPDGRIIGTPPRNLGTISRSMNNTPLFRRNSYIVQSGDTLLSIARQIGISVEALKLENGISNNNSIYIGQVLMIPGRRTVATSNAQNDDRVTSTEPSSKSQVRSSIRYQKAPSTDKAPIIAMPSSKINRSNAEQNSSTQMPSSNYKTDVLNTVMNTDNGVTPQATGISKMRWPVRGRLLSQFGQKKGTATSRGIDIAVPEGSSVKAAENGIVIYASDGLKELGNVVMIRHENNIITIYGYNSKLVVNRGQRIRRGDEIAKSGVSGDVKTPRVYFEVRKNSLPVDPIEYLEN >NZ_AP019773|949856:955771|949856_950309_-|WP_161510503.1|DBSCAN-SWA MFITNAYAQVAGDVSNGPSLVTFVPFILIFGIMYFFMIRPQRAQMKKRKEMLDAVRRGDTVVTGGGIIGKVTKVYDESGELEVEICDGMRVRVIRLTLSDVRVKGEPISEEKSKPNAKVKTQKKSEAKIVKKERVGASKEKKAVSKEGKA >NZ_AP019773|949856:955771|954953_955394_-|WP_042995357.1|DBSCAN-SWA MFGIDGPEFLVILFVLIIVVRSRDLPKMLRTMAKAIAYVRSTANEFRHQFDDAMKQIELDDLQKTLSDINDLNPNKKLMEIFNPIHDAVGDVRNNFDVNTMHHKSEKNKEIVGYDQNKINEEVTVSVDSQSSGSISVISKDKEDAS >NZ_AP019773|949856:955771|954165_954957_-|WP_014923964.1|DBSCAN-SWA MNERDEVDANMAPLLEHLIELRQRIIVALIAFLIAFMMCFLVKDYILNFLIWPYQWAMKMSGGNPESIRLQSTQVWETFLTKMKLAAFGAAILSFPCTAFQFYSFIAPGLYKNERMAFLPFLISSPILFCIGGAFVYALLAPIMLWFSLSQQFLPGVHLRIEFIVRISDYLSFMTSFMLIFGLIFQLPLVTSLLTNVGLLTSHGLVSKRKWAILVSFVIAAIVTPSDFFTMFAVALPTIALYEISILIAYWIEKRKNPLKRSL >NZ_AP019773|949856:955771|952840_954118_-|WP_161510505.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDIKWIREYPEKLDEALAKRGIEPQAERLIKLDLERRSHVAKVQSAQERRNAASKEIGQALAACDQTMAEHLRAEVEEIKVFLSSATTEEKRLTENFERALSTLPNIPLDDVPLGKDGSDNVVIRHFGTPVMFDFTPKEHFDLGQNLKQMDFERASRLSGARFTVLSGALARLERALGQFMLDVHVDEHGYTEVSVPLLVRDEIVYGAAQLPKFADDLFRTTDGRWLISTAEVPLTNLVNNEILEISDLPLRFSSLTPCFRSEAGSAGRDTRGMLRQHQFWKVEMVSITTEERSLMELERMTECAEDVLKRLGLPFRTVVLSTGDMGFAARKTYDIEVWLPGQGCYREISSCSVCGDFQGRRMNARYRKEGDKTLKFVHSLNGSGTAVGRCLIAILENYQQADGSIIIPDVLQPYVKGMRCITA >NZ_AP019773|949856:955771|952047_952707_-|WP_014923966.1|DBSCAN-SWA MNQKGILRFHEELAGLVLKMRSKGIDDVRFFAALEKVPRQQFVASPWCNSAYDNKVIPIECGEYIERLEEQLLILFALSLKKKHRILEIGTGSGFCTALMACLSERVITIDRYKTLIDLARQKFQTLGIENIVLRQFDGSRTVTGFGSFDRILIWPSRSDEPKEFLELLTENGILIQAIGPDEGVQTITRYTKIGSRFECLEMFQVRYQPFIEGIAETL |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(83.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|