Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048031 | Shewanella sp. Arc9-LZ chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,RT,DinG,DEDDh,csa3 | 1 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048031_1 | 1361802-1361894 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048031_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP048031_1
>1.1|1361827|43|NZ_CP048031|CRISPRCasFinder GCCTCAATTGTTATTAAGCCTGAAACTATGGATCAGCTCATGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048031_1
The CRISPR arrays of NZ_CP048031_1 >merge|NZ_CP048031|1|1361802-1361894|CRISPRCasFinder ATTCTGTTGTAAAGAGTCTTCAACGGCCTCAATTGTTATTAAGCCTGAAACTATGGATCAGCTCATGCATTCTGTTGTAAAGAGTCTTCAACG >NZ_CP048031|1|1|1361802-1361894|CRISPRCasFinder ATTCTGTTGTAAAGAGTCTTCAACG GCCTCAATTGTTATTAAGCCTGAAACTATGGATCAGCTCATGC ATTCTGTTGTAAAGAGTCTTCAACG
>NZ_CP048031.1|WP_011636566.1|1360870_1361215_+|alkylphosphonate-utilization-protein MSDVIPPCPKCESPYAYSDGTLLICPECANEWNPNEEVVDPDAIILKDANGNLLAEGDKVTLIKDLKVKGSSLVLKVGTKAVINHFVDGDHDIDCKVDGNGQMMLKSKFVKKQS >NZ_CP048031.1|WP_011636565.1|1360393_1360585_+|hypothetical-protein MENKTARFTVLMDPLKKQAFEQLCAAQDLTPSQVTRQLIREYLEKHDVSFGDNQSRPNPQVKS >NZ_CP048031.1|WP_162022574.1|1358858_1360184_+|protein-kinase MMQTLQQLNDGLLLGYQRVSIAEQLTEFPVKLFELADTLEVLDLGNNQLSSLPDNFADLHQLKILFVSNNLFDHLPAVLGQCPKLEMIGFKANQIRTVPEASIPKQTRWLILTDNHIEQLPDSLGQCHRLEKLALAGNRLTALPNSMANCHQLALIRLSANQLTALPHWLFELPNLAWLAFAGNAFSHVEHCDNTRVPIVPLTQFTLGQLLGQGASGLIYQATHHTENSVEANFSCDADVAIKLFKGMVTSDGYPADELDCCLTAGEHPNLINVVAQINKPEQLGLVMQLIPPSYGNLGLPPSLQTCSRDTFEAQTVFTWARITHIASQMADILAHLHQNGISHGDIYAHNIMINTHDNVLFGDFGAASNLKQFTPQHLQLMQAIEVRAFGYLVDDMLNLIDNPNTPQAAMLRQLVQDCLQHSSSTRPSFKALLPRLASIA >NZ_CP048031.1|WP_162022573.1|1357577_1358621_+|alkene-reductase MTASLFTPYKLNDTLTLSNKILMAPLTRCMADDDLVPTQAIADYYARRAEAGLIISEATIIRPDAQGYPNTPGLFTPAQIDGWRVVTDAVHKNDGKIFSQLWHTGRVAHSHFFDGGDVLSASAQAVEGTVPRMRELVYQTPKAATLDDIKQLVIDYAQAAANAIDAGFDGVEIHAANGYLIDQFLHHDSNRREDEYGQTPENMSRFALEVVDAIVARIGADRTAIRVSPGAYFNMAADPRDRGVFDYLLPELAKRNLAFLHGGIFDDSMQFDYLGGSISTYLRSVYTGTLVGVGSYTAETGSAAISDNKFDLLAIGRPFIANPDYVAKVRDGGELVAYADTMLTELI >NZ_CP048031.1|WP_101085568.1|1356835_1357432_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MRHAEFNRETVLRAAMSTFLVNGYAKTSMQDLTKATGLHPGSIYCAFDNKKGLYIAAIEQYQQDRNEQFQQLFANDRSAVDNLGAYLALIVQECLSCDATQACLLTKSLSEMGEQDEQIKQMTCQFLQLWQQSLVMVFDTAKAQKLIAQDCDSQFLAQYLVMGIYGLRTVAHTQPHEQVLQPLADKLLADLLRCESLN >NZ_CP048031.1|WP_101085570.1|1356476_1356734_+|TIGR02922-family-protein MKSESAEGQTSNATVTILYYEAPVGLEMHNAVMTDLQISQTGRVMIPESFRRGKSIIAVLEGECKILNSLGERVYSQRVMSKIDN >NZ_CP048031.1|WP_059746407.1|1355143_1355869_-|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRAYQNKKESMAKTAGQKTRIYSRYGKEIYICAKGGVDPDGNLALRSLIARAKKDQVPAHVIERAIEKARGGGGEDYDTARYEGFGPGGCMVIVDCLTDNGNRTFTQVRQAFVKNDAKLGSPGTVGHMFEHQAVFVFEGEDDEAILELLMMADVDVADVELEDGIISVFAPVSEFNNARTVLTEAFPEIDFKVENLAFVPQTMTELTGEDIESFEKFLAALDDCDDVQNVYHNADINDDE >NZ_CP048031.1|WP_162022572.1|1353566_1354619_-|GGDEF-domain-containing-protein MLTFIKNESKSNGELQQTHVISLFSLVGMLMTFVMGVISLFNSNYVLTITLFVSSIIYCLAYVALKKYNKLNLSSFIIIYSLYLLMFYLVFTGGVEQTGPLWIFIVAPVSVYVLGLSYGLINLLFFISVVAIIMFSPIEMPQYATYSTEFKVRLLLSFLTTTFLSALYEYSRMLSYNSALKLSKKYQQLALSDPLTTLANRRNALTILQQEKSRVSRNNESLSVLLCDLDHFKMVNDKYGHNCGDIVLTELAQVFKQSVRQQDCVARWGGEEFLFILPQTSAEQAFIIAEKIRTNVQHHKVLFHKQEISLTISMGISQLTDNQTIDELINNADRYLYQAKKNGRNQVYPQ >NZ_CP048031.1|WP_011636558.1|1352877_1353234_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MKINLSGHHVDVTDTVKQHVDEKFAKIASHFPTLISLDIIIAKEHGEYDVEIRTNYEGTRIAAKGTDLVMYPAITSAAKKLDAALKHRKGQLKADLHEKPDVTAPEIAYEKVQEMDLR >NZ_CP048031.1|WP_162022571.1|1351801_1352452_-|DsbA-family-oxidoreductase MTTNQLQIDIISDVMCPWCIVGYRRLEQALSKFDDLEVTLQWHPFELNPAMGPEGQHLGEHIAEKYGSTPEQSAQNRQRLTQMGADLGFEFNFSDSSRIYNTLLAHQLLYWAAESGKQTDLKLALFSSYFTEQKNPDDIEVLIEAATKVGLNADEARAVLTDKRFEAAVKEEEQLWISRGIQAVPAIVFNQQYLVSGAQDPDTIAELITKLTTEEA >NZ_CP048031.1|WP_162022575.1|1362130_1362670_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MTKILTVSASNSKNSINRMLLELASSKIEGHDVAMLDIRDYPMPFFSLDREESEGHPETAQQVRALFAEYDAFIIASPEHNGGIPAEFKNLIDWVSRLGDLQNPMFATKKPVLLLSTSPGPNGGATNLQTLSQLMPWWGADIKGTYSLGRFYDYFVDGKLNAEKDQELTNVVTAFVSAV >NZ_CP048031.1|WP_162022576.1|1362825_1363503_-|pilus-assembly-protein MQLLSKDSLHRGGFAGLKETRLVVDNKIGGQNDTWNGLGNFIYLADARFTPKGQTGMHPHKELDVISVMLEGSIEHQGSMENGKSMQANQVQAQRAGGEGFVHNEINPDNVENRMLQLWVLPEAAGEPASYKFHDLKKDQMIRVYGGNKSQSVTLDSETVIEVGLLSKNKNVTQEGEFIAYVTGGEGVLNGVEVKDGDLVRDEKLDFTALSEQVHLTLIYLNKAN >NZ_CP048031.1|WP_162022577.1|1363677_1364562_+|LysR-family-transcriptional-regulator MKLSLEACEVLDAIDRKGSFAAAAAALYRVPSTITYTVQKLEEDLGIMIYRREGRRSILTPAGKVLLDQGRELLKAAQSIVETAKQVDSGWESHITIALDTIYDIEELYNVVEEFYKLQTRVEVNITEEVLAGSWDAIIENRADLVIGAPHPEINTQGIKFEEIKVADWQFVVGRNHPLLEYDLPLSEDDIKPFHSIIIKDSSKRSPAMTHRIFEKQTVLRVASMEQKISAQIRGLGVGFLPTHRITNHLETGELVSLKIAKDAPLTPLFIGWRTNNKGRAIRWFIDKFRECNK >NZ_CP048031.1|WP_162022578.1|1365231_1366373_+|IS3-family-transposase MKTQPTYSTEFKIDAANLVIKQGYTTSEASKATGAGPTAIRRWVTQLRQEFEGITPSSHAITPEQKRIQELEAQIKKIEWEKDIPKKGYRSLNARQHQTIALIESLSREQNIVKQLCHLFEIPRSSYHYHLKHRGLVKPELGKLRQQAIAIHRDSRGSAGARTIAGQLNQLGENVGRYKAASLMRDAGLISNQPRKHRYKIANDESKIAPNLLKRQFNVEAINQVWCGDVTYVWSGTKWLYLAVVMDLYARKIVGWACSDSPNTDLTCAALRMAFESRGRPRNVVFHSDQGCHYSSLQYRQMLWKYQITQSMSRRGNCWDNAVMERFFRSFKTEWMPKYGYNSFDEAKHDVLNYILKHYNIKRGHSYNNYMTPTAAEMAA >NZ_CP048031.1|WP_162022579.1|1366863_1368354_-|2-methylcitrate-dehydratase MSSNVDINNRPDYDHVIQDIADYVLTFEVCSEEALDTARNCLMDTIGCGLLALRFPECTKHLGPIVQGTLVPNGARVPGTSLTLDPVKAAWDIGCIIRWLDYNDTWLAAEWGHPSDNLGAILAVADHLSQVRLSNGEPPLMMREVLEAMVMAHEIQGVIALENSFNRVGLCHVLLVRVASTAVVTKMMGGNREQIMAAISQAWADGGALRTYRHAPNAGSRKSWAAGDATSRAVCLANMSMRGEMGIPSVLTAPQWGFYDVSFSKTNKDQALKPQAERQFSFSQDYGSYVMENILFKISFPAEFHAQTAAEASVILHPQVKSRLAEINKIVIRTHESAIRIISKTGSLANAADRDHCLQYMIAVPLVFGSLTADHYEDEFHGAHPIIDELRDKMEIVEDKRFTAEYLEADKRSIANAIKVFFNDGSSTEEVVVEYPVGHRRRRKEGMPLLELKFKANLASRFPNQQCQTIFTVCKDQTTLEATPVNRFMDLFVIGF >NZ_CP048031.1|WP_162022580.1|1369398_1372815_+|type-I-restriction-modification-system-endonuclease MGSSFNNFDFLKHHDELLFRLALTAESCFAPDPNTTLLKMRQLGEELAKNIAARVGVDSGKDIKQIDLLKNLDYSLRLDQRIKDAFHTIRKLGNNANHDITSNSHRDALQSLQIGYALSVWYHQLYGGEKAKGFKPGPYIKPKDPSDEVRMLEEKMLELERKQQRTTERLAVAESINQLATEKAEAERKRSEKMLAESKVWEEVAIEQEAQLNEYRAKMEAANQELLINFQAKDQKSKTTEIKRIEKLPFHMDEAETRIIIDKQLNDAGWKADSVNLRFSKNVRPVPNENRAIAEWPTESGPADYVLFMGLIPVAVVEAKKTAKNVYSSIDQAKRYAKGLKPKNSFTIDTVWGEYKVPLTFATNGRPYLKQLEQESGIWFLDVRDNANRRKALKGWYTPTEIKLLLKQTPQQAEQKLDAMDFNYDLKLRDYQVDAIKAVEQTIKDGKDRALVAMATGTGKTKTCIALVYRLLKSERFRRILFLVDRSALGEQAANDFKEVRLENLQTFADTFDLMDLDDKRPDDSTKVHVATVQGLVQRILYPSDNDIKPGVGQYDCIVVDECHRGYLLDRELSDTEILFRDQKDYQSKYRSVIDYFDAFKIGLTATPALHTVDIFGEPVYSYSYTEAVLDGYLNDHLPPVRIHTKLSEQGIHYEVNEEVKVYDVENNDIKIYNTPDELDFDVSEFNKKVIAPSFTKVVTKWLIESDSINPYSEAKTLIFCVTDKHADEVVEALKQACEDYHGEVEDDAIQKITGATDKPLEKIRLYKNDRLPNVAVTVDLLTTGIDVPKICNLVFLRRVNSRILFEQMLGRATRLCPEIGKGPFKIYDAVDIYKQLENVNTMKPVVTNVDISFTELEREMADAANEDLQSLAKNQFIAKLQVKRRHLSPEQQDKFETLTGQPPAEFIKDLKAMPVEKIAEWFTRHPGLGELLDEKVKGAGGGNTQYISDHEDEFTKTTTGYGDGQKPEDYLSSFNDFVNANSNRMLAIQTVVQAPWELTRQSLKELALVLEQNKFREQDLQVAWKEVKSEDIAARIIGFIRQAAIGEALIPFEQRVDQALKRILASQDWKTPQIQWLNTIAKQMKATTIVDEAALDQGIFLHQGGTKRANKLFEQPVSNVLLMFNKALWQADMSKSA >NZ_CP048031.1|WP_162022581.1|1372868_1374377_+|N-6-DNA-methylase MSTQDLVAKLWNLCNLLRDDGVTYHEYINELTYLVFLKMVEETGREEHIPVGYRWADLEKYDSATRLEEYKKLLIHLGTHGSQITNAIYANASTVIRKPATLSKLVSEIDKLDWYSAKTEGLGDMYEGLLEINAGEKKSGAGQYFTPRVLINAMVELMKPNLDDVIVDPTAGTGGFLISAHHYLKEHHDVQALEPGAYDKYQHETFFGMELVPDTRRLAMMNLMLHDLAVDDVNSGILFGDTLSNEGKVLPPASLILANPPFGTKQGGGIPTRDDLITYTSNKQLAFLHLMYLRMLEPGGRAAVVLPDNVLFEGSTGQTIRKDLMEKCNLHTILRLPTGIFYAAGVKTNVLFFSKSKDLKKDKGQTKNVWVYDLRSNMPQFGKRTVLTKAHFDEFYQAVGSDLTQVDDAARHAFIKNHKHGSEIGNVDTCRLRCFSREEIAKKDDSLDLAWIRDDSSEDSANLPEPDVLINQALEEMAGAMRELQAILVELGSADESDEVML >NZ_CP048031.1|WP_162022582.1|1374373_1376146_+|type-I-restriction-endonuclease-subunit-S MSELPKGWSLANLSEILSEDGIISDGDWVESKDQDTNGEVRLIQLADIGDGIFLNKSDRFMNDEQTTRLRCTFLREGDVLIARMPDPLGRACLFPCLANDAVTVVDVCLVRFTEQSALINKLFMYWVNSPQIRNLIDMQASGSTRRRITRKKLALFNFPIPPLNEQIRIADKLDSILAKVDQAQARLEKIPHILKRFRQSVLAAATSGELTREWRGKDESFETEIPDFFIPIEWKYSNIEEIGVVKGGKRLPKGEVLTEVDTGLPYIRAGQLKNGTVIQGDNARNKQMFLQPETQAQIKRYTVNEGDAYLTIVGASIGDAGIIPKALHLANLTENAAKITDLKSLINTSFLSLWLRSEKLQQLIQLEIKSGAQGKLALKRINTLPVPLPPLDEQKEIVRRVEVLFSYAANVEKNYQEMKSRVDRLTQSVLAKAFRGELVPQDSNDEPASELLKRIKFSEVESKPKKKASPKRIAATTTEPKITKQVATKLSEQFEETFNVDLDAEKHEATDSLRTRYQSEIRKAQDSLLDAKFSVEQFRSVTEFKGDYEALKALIMNLLKGISGISEPILEIESWDEKSGDYLMRLVDQK >NZ_CP048031.1|WP_162022583.1|1376142_1377642_+|AAA-family-ATPase MKLISLQYSDPANSLQAYDFNFDNDRHESNALEPLCFVGLNGSGKSKLLEILAKIFFELDKLWRNTNKTKPTVSANFRFEYHLLPSRKYKEVIIEGRVGKPLIVRADGNVLESEALESVMPSNIVGYSSGHNETISTLFHELREREFGRVLKEVNEGDKGRRKLSRTLFLDRDSTKLLLLTAYIFSGKNGRDGLPSVQSSNKLLKTFADFIRLKQLTSFQIVIDTDSGRIILSQPMEQVLERLKRCALMINSNEKGKDRIYEMDFLLCEQSKKAFVKEFGTAQDFFEQLYELYSLNLISSSKNKTHQVFSIPERELKVLIKSPDAETEYLNLSDGEHQFIQVFTSLAYFAKQDSIFLLDEPESHFNPAWRAKFVLVMEDLLTAKQKSSEFLISTHSPYLVSACKSKNVTIFKRDNGKILCSQPKKETYGGTFDSLLKELFEVITPISEHSKASIEKIIKSDDVEKMKLALAFFAESPDKRDLYEAILRQGESLELRKDA >NZ_CP048031.1|WP_162022584.1|1377643_1378711_+|hypothetical-protein MLYGLKAIEDHPCFKMHDLLENLFFEYVSDKDFSDVVFRNIFSKKYINGHGKAFKKSLDDLVHSLPTNKAKKQKLYSQFVNNNSIEALCLEKGFIPESYIRWTDIIGVRLNGFLLNCYETKLDLSPFKRPDSSLKPTHSFYQEFIIKNGGICPFCGLNAYKNVFGSRREDLDHYLFKGKYPFAAANMWNLVPTCSECNQDYKKTKDVLFDAGVRTEAYYPYRKIGGVNLKVNLNIGFDNKTPDAWNIHITPKIAAELKQVENWVRIYGITRRYKNEIAAEHDNWIMTELLERGTVFVDTNGFRRFMISRARVHKKLFEKKLAPKSFLKTSFFVFVARYADDAFIGKYMLPFNAGL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048031_2 | 1482766-1482849 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048031_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP048031_2
>2.1|1482790|36|NZ_CP048031|CRISPRCasFinder TCCTAGCAGCGTAGCGCTCTAGGCTGTCGCTAAGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048031_2
The CRISPR arrays of NZ_CP048031_2 >merge|NZ_CP048031|2|1482766-1482849|CRISPRCasFinder TTTATAGCCTCTAGCCGCGAAGCGTCCTAGCAGCGTAGCGCTCTAGGCTGTCGCTAAGATTTTATAGTCTCTAGCCGCGAAGCG >NZ_CP048031|2|2|1482766-1482849|CRISPRCasFinder TTTATAGCCTCTAGCCGCGAAGCG TCCTAGCAGCGTAGCGCTCTAGGCTGTCGCTAAGAT TTTATAGTCTCTAGCCGCGAAGCG
>NZ_CP048031.1|WP_162022641.1|1482108_1482669_+|chalcone-isomerase MKLLASIGLSLSLMMPLLAQASMIADVEVAEQITVAEQPLILNGAGVRSKFFMDLYVGSLYLPTKVHTLEDVLTQPIAVIQLTITSGMITSNKMRDAITEGFEAATDNDTHSIAKDIEHFTQLFADEIVDGDQFTFVTQKGKGVSSIKNGNAQGDIAGEAFRQALLKIWLGETPVQQSLRQAMLAQ >NZ_CP048031.1|WP_162022640.1|1481548_1482028_+|DUF2947-domain-containing-protein MAHTYISLETYRRKWIFNHKDLPVSDDDKAFIKPLTDKSAMEVWDKWISNKSSRAELFEKGDWPIKQDAWAATEHWQSAWDSNDNAMPEAIIAHIQWPDDAVVYFCYEKYQIVETRWDVFVRNWKCFLFFDDGPILISPKHKQALMFLQNGQYKLGVRG >NZ_CP048031.1|WP_162022639.1|1478972_1481432_+|motility-associated-factor-glycosyltransferase-family-protein MNNILNNFAISRFNEYYLPSVNRYTFENIDSKTIYNHKFKKDFSFKDKLNIVIGMDSGLLASYALEQEIALGSKFIFIELDEVLSLLIIDVPLAKKKNFKIVNETDFLDLLEQEEIRIYIAKGAYEIYASLGVTSQHLEAYSSLFSRIEDKVQDEHFNHRSSLNQKVFFQTQLENVPDNHTPAKYLRNQFKGKTCLVVAGGPSLDEQIDWIVKNNDNLFIIAVSRIAGKLAKKSISVDIITCVDPQEFSFDVSREIFALSENTLLVNSYHISPKVLSQWQGQSVYLGQRYPWSSKNDHDNIITIGPTVTNSSVRLAIEMGFNRILLSGVDYCYSRTGYSHANGTVEANLGPSLGHSNKWVETYAGYQAEAPIQLVHAMASLASEVKEYPNVDFINLSNSAAKIEGVSHFSTEKIILDEFGSKIISSLDMCNTENKKLDLEQSLNECQKAKDDLTKLLKLTKNALTLSKKLNLNSLSSDVILNEVNKIEKSINSKYPELTRLIKMYGYFEFSKFLTTRETESWTQSHINEMTISYYDAFNQTCYNILKLVIKSYEKIVFRILEVNANSLIPLAPTWLENSQPGRVFLWCKNHKAPLSDSHENEIFEQLNEKFKEDITQVRKAYIDVLNKASKMENVYKKIMVLNSNKNSYGLSLTVQNLLPLIESDNEAKRLYHLALSFQLSLEQEPQQALDALLALPEDLSTEIELKHIILLALKLGDLSLASSTLVKMLVHSDEYIPQYANILKLQGKIQESVNVYLDYLEKYPLDTKTWIKLGLFMFEINQVEASYTAFSNAINAEPNNKVAHDHLSELTRLMNIPQ >NZ_CP048031.1|WP_162022638.1|1477436_1478438_-|UDP-N-acetylglucosamine-4,6-dehydratase-(inverting) MFDNKTILITGGTGSFGQKYTKTILARYKPKRLIILSRDELKQYEMQQIFNAPCMRYFIGDVRDADRLMQAFQDVDYVIHAAALKQVPAAEYNPMECIKTNIYGAENVIKAAIANKVKKVIALSTDKAASPINLYGATKLASDKLFVAANNIVGSGKTRFAAVRYGNVVGSRGSVVPYFKQLIANGASSLPITHPDMTRFWITLQDGVDFVLKNFSRMQGGEIFVPKIPSIHITELADAYGKGLPHEIVGIRPGEKMHEVMCPGDDSHHTIEFDDHFVITPSIKFFGRESDFTVNALNETGTLVNSGFEYNSGSNSHFLTVEEILKLDEESCL >NZ_CP048031.1|WP_162022637.1|1476300_1477440_-|UDP-4-amino-4,-6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine-transaminase MIPYGKHDIVADDIAAVVEVLQSDFLTQGPKVPEFEKAICDYTGAAFSVVVNSATSALHIACLALGVGPRDLVWTSPITFVASANCALYCGAEIDFVDVNSETGNMCPIALADKLRNAKHLPKVIIPVHLAGHSCDMQAIGDLAKQYAVSVIEDASHAIGGSYQDQKIGACQHSDICVFSFHPVKIITSAEGGVVTTQQFDLAKRMAQFRSHGIVKDPAVMLRTDEGDWYYEQHELGFNYRMTDLHAALGLSQLNRLDQFVAERNRLAVIYDKQLNGLSLTPVDPLTKSVSARHLYMIRLHQSDQRRRIFDCMRAKGIQVHVHYFPVHLQPYYLDLGFKKGDFVNAESFYQHILTLPLYPSLSDNGQQQVIDELYSYLA >NZ_CP048031.1|WP_162022636.1|1474511_1476221_+|acylneuraminate-cytidylyltransferase MTKTLAIVGARLNSSRLAKKHLLSLADEPMIGHIWRRLKLCSQVDSTELATTADSFNQPLIDWANIHQINCHPFYGDVNDLMARLDKIIQREAPAYILYICGDCPLIDPGFIDHGLSTLKASGKDSITLREGVKTLHEGISFYSRHGWEKLMTASQCIMSREHVGYADTLTPVLNKESINDSSDFSKIDHRISVDTQADYLFMAEVYQRWYDCHPTNSIVSLAWVQQQLITDSLLANINTHVAQKAADKQYAKASLYCHLGENIGLGHFRRIKLIADALQEYLSIGCTIHVLHDGKSLANGDSKIKWYQTEAQLLKVITSDSNPLLLLDFHPKFISLVELTQALLPPKQRGAKLIGIDKLASLLPTLDWLFIPSFNTTLRGEKISTGWKNYLFKTMPKRDKQHQILVLTGGSDALHYGDEFPSMLENLQLNWPIIWIQGPLAKPPIIRQGANIKVLKDPQNLYGLIAESEIVLSCYGLSLFESIFSNAATLLLPPQHLCDDEELQNLSEEKCCLISKSLADACTQLVDLVASETARNTLKKKAKKVFADHKGITQLIDDITQLMKDSQI >NZ_CP048031.1|WP_162022635.1|1472595_1474515_+|glycoside-hydrolase MPIYTQSHNIYAIFHLNLAFSSIDSSDHRRVIEDCYWPILQTIVNEGIPIGIELTGYTLECIQAIDPNWVSKLKFLLKDDRCDLIASGYSQIIGPLIPATVNQENLRLGQQSYQNLLGATPRIAYLNEQTVSASILDIYIDAGFEAVVIEWDNPYSNSPDWQLKMLNRPQSLLSASGRQIKVIWNHATAFQRFQRYVHSELTIGDYSDYLEQAIQPDTLAFPVYGSDAEVFDFRPGRYHTEEVQIRGEWERITQLFKALETNKKYNWIKISKLLSLWRQDSPLKLTNAEHPVAVKKQAKYNICRWGLSGRNDLLLNTLCYQRFKELNDQKSGDEEWRNLCRLWASDLRTHLTQIRYEALHIKSHRSNEPIFTPWEHKAEIRIQYDNERRRLQINTQEIALTLNCNRGLAIDSLAFSSHDFVPITGTLPQGYFDHINHGVDFYTNHLLIERFLNRDRVTDLNRVNYELAQQDGGLIIYCRQSLKSGLLLKWYRLNGEILHTGFHFEDTLRPEASIRLGFLTLLDCEARAWYQTHLGGIDAESFQISQDMDQGAPISSIVSSTSALGATDGSISFGNKNRGVQVSWDPALCAALPMISSKQIGSQYLNRLWFSLAEADETLKSGGSLLDFEFCITPRESLV >NZ_CP048031.1|WP_162022634.1|1471243_1472167_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MADINSGFHLHSGKVIDSRHGYDVIDCKECGFKHVMPMPTPEELEQVYREEYYTKDKPLFLSQSNEDAAWWERVFSDRFDTFEANLPQKSRRVFDVGAGPGFFLHHGLQRGWTTQGIEPSKQASEHAKELGVDVVTDFLSPTSVANFEPFDVVHACNVLEHIPNPIELLGCISELIKDEGLLCISVPNDYNPFQKTVRELDGLEPWWLAPPHHLNYFDVSSLTQLLNNSGFDVFLKESSFPIDMFLLMGDNYVGNDELGRACHKKRMKFEMSLIESGQNDLKRAWYQSMAEVGIGREICLYARKRSK >NZ_CP048031.1|WP_162022633.1|1469998_1471210_-|methyltransferase-domain-containing-protein MIKTKVLVQASSRSWAGGVDICMGMVEDEIAVVRTIRRVLCHFAGFDVVLVAPEFDRGGELDDIVKLIDDQRLSLYYGHNASPLNRMIEASHDLSDTDFVVRVDGIHFCFDPQASLSMLDIAISKQLDCIKLPDDFPVHFTSEIFRVGALKAIDAELTQAEDAKYRVHPKYYFSMNAQRFSVEFLADLPCYSDEYLAECRRLATQIYAIPRQEVNEHRIVSGDRLGFHYELALQHLKPDMKIIDIACADGYGVNIMSSHLKEVHGADLDELSVEFAKQNNSAANTEYFVEDITKLSFSDESYDAVTSFETLEHVPEHECLSEIKRVLKPGGVLVLSTPQNSIGHIPVNSCHLIEYSLNELLALVNQYFIVVKVIGIKAGIIYDETDPYGTNTVLICVKPNNKD >NZ_CP048031.1|WP_162022632.1|1468217_1469996_-|1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate-synthase MNTHQLIVPTLDALKQQSSAQLTQLAEDIRQFLICNISATGGHIGANLSVVELTIAIHAVFNSPTDKIIFDTGHQGYTHKILTGRVDNFATLNQYRGMNRFVARNESEHDAIDASHAGTSLSIASGYAKALKLTSPANYVVSMIGDGSLVEGMAFEGLNYCAEDKDNKLIIVINDNEMAIAKSVGGMRNLTSGENWQQNSRAFFEGMGFGYLLVEDGHDIACLLKQLATAKQLARPVIVHVKTEKGKGLACAKDHPYKMHFSMPFDAQTGKGAAATVVGRTYAVVAAEALKQKMATDEDVFAMTPATPYASSMDECLALYPDRALDVGMAEQQAVGMACGLALGGKKPVVCMQTTFMQRAYDQLIHDACYMDLPVTIFGVRAGFSGYDGATHHGIYDIPYLRSFPNMQVMYPVSSDDLTALIEKRLANPQGPMVILYPYEPIPSPEPDAGVVEPCGLSVAAKGSDGYLVCLGNRLAAAYELKALLKVQGKDCGIICVQSIKPFPAARFIELIEHTKHLITLEESVLNGGFGSLILETLADANMSIQVLRSGVNDKFVLPGNKDECSTECDMMPVQIIERLALQWPDYLGVNK >NZ_CP048031.1|WP_162022642.1|1482888_1483362_-|flagellar-protein-FlgN MTELNQPLHKQASEDQRKELHQLLDSQNQTLTQLKSLIVEEKAALSKQDADKLLALSKDKTQCLFNMKATDEKLASHPQHNLLTTDTELAQQVSRAKTILAECKDINSQNASLIELNIASLNRFAQALQASRNASSLTYNDKGKTSTISTLGNDFSA >NZ_CP048031.1|WP_162022643.1|1483463_1483793_-|flagellar-biosynthesis-anti-sigma-factor-FlgM MAIDIKHNTATNTQMRTARDTQSATQSTTTAAPKSAAPVKTDSVSITSQAHQLQSAQTKMASLPEVDQKKVAEIKQAISEGRYKVDPEKLAANIASFEAELGGLSFDRE >NZ_CP048031.1|WP_101085442.1|1483867_1484575_-|flagellar-basal-body-P-ring-formation-protein-FlgA MKVFFLCFLCSITFSLPAIASEEIITPSLSTIYALAKEAVAKKIDADSKAKVQITPQNLEGRISPPACYPPINVELASERAISRNNMVKLSCNSPDYDYPWQMYLSVRVEIQYPVVVANQLLSPDQIIGEHHLQVMYVDQYSLKGQFFSDTTTLIGSRVKRRVAKDSPVLSNNLCFVCKGDTVSIYAKTTNVEIKTLGEALRDGNIDEVIRVKNSNTSKQFDAVVIGVGEVEVRM >NZ_CP048031.1|WP_162022644.1|1484944_1485865_+|chemotaxis-protein-CheV MSSILDSVNKRTQLVGQNRLELLLFRLSGRQRFGINVFKVKEVLQCPPLTTLPKLNRFVKGVAHIRGSTISVIDLSAATGGRPLTSTENCFIIISEYNRSIQGFLVSSVERIINMNWEAIMPPPQGSGRSSYLTAVTEIEGELVEILDVEKILDEISPVKTSISKELNEALTIDREQHYHIMVIDDSAVARKQIIRSLESLNLQIDTAKDGREALEKLKSIAAEMDDVSVEIPLIISDIEMPEMDGYTLTAEIRNDPKLKNIKVVLHTSLSGVFNQAMVQKVGANDFIAKFNPDELAAAVNKHLSL >NZ_CP048031.1|WP_101085440.1|1485937_1486771_+|protein-glutamate-O-methyltransferase-CheR MTDKSLAEAEYNQFRLFLEQHSGIVLGENKQYLVRSRLAPLMGKHNLPSLSEVVKKSMKPIERQLRAEVIDAMTTNETLWFRDRYPFELLHNTLLPEYSKLGRPLKIWSAACSSGQEPYSLAMTVLEYQQRKPGALPGGATIQATDLSPSMLDRCKNAEYDGLALARGLSEERKRQFFDALPSGNMKVKDNVKRLVNFRAHNLLESYSLLGKYDIIFCRNVLIYFAPEAKAKILRQFAAALNPKGILFLGASESLAGLTEEFNMVRCNPGIYYQKKT >NZ_CP048031.1|WP_162022645.1|1486907_1487306_+|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgB MAINFDNALGVHQYSLGIRAQRAEVISSNIANANTPHYKAQDVNFASAMQAASSHQKGLSMSQTTEKHFDLTALSQQHVQYRMPNQADTGDGNTVDTQKEQAAFMQNALEYQMSLGFLESKFSGMRKALRGD >NZ_CP048031.1|WP_101085435.1|1487308_1487725_+|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgC MSLFNIFNVSGSGMSAQSVRLNTTASNIANADSVSSSVDKTYRARHPVFEAEMLKANSQQNSSPGVTVKGIVESNKPLLKEYSPDHPMADGDGFIYKPNVNVMEEMADMISASRSYQMNVQVADATKSMLQQTLRMGK >NZ_CP048031.1|WP_162022646.1|1487748_1488534_+|flagellar-hook-assembly-protein-FlgD MSLVNSYSQSLPQQSSSASNTSATTKSSVQTNTTSTTTGNPFLDGIRLPEESAIPESKDQMLKQEDFFALLSQQLSMQDPFKPVDNDQMIAQMASFSTVDGISNLNDEILNLNTVMSSSQALQASGLVGRKVLIPSDTGAISTESSEIKGVISTPSAIETITVRVEDESGQLIKSFNVDGSKGGNVDVTWDGLDKSGNPAKAGNYAIKASGKVDGTSQDLAVSTYAHVTSVSLGTVATGAILNLRGVGGIKLSDVLAVSET >NZ_CP048031.1|WP_162022647.1|1488594_1489980_+|flagellar-hook-protein-FlgE MSFNIALSGIAAAQKDLNTTANNIANVNTIGFKESRAEFADVYANSIFSNSKTAVGGGTTTTQVAQQFHQGSLQFTSNSLDMAISGGGFFVTSSELGSQDQSYTRAGAFKVDSANYMVDSAGNFLQGFPVDEDGNSTSVSLTTTQPIKIPDTAGSPVQTENVGLQMNLNVSEIALDPINFNPADSDTFNNSTSVTIYDSLGESHIMTTYFVKPTGGSHTGESNWVAFYAVDGDPVDVTTAGKYITDTDTDTDGDGLVDATGLASAANPSGVGTWSGAVLKFNSVGAYTISDPTTITTEALGAAGAGALGPGADGTQALTIKFNNPTQYASPFEVTELTQDGITVGRLTNVGIGSDGLITASYSNGSTVPLARVALVRFANEQGLTQVGNTSWKASIDSGAALAGEANSGTFGSIRSSALEQSNVDLTTELVDLISAQRNFQANSRTLEVNNTLNQTILQIR >NZ_CP048031.1|WP_101085429.1|1490262_1491006_+|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgF MDKFLYIAMSGAKQGMNALAVSANNLANANTDGFKADMVQARSMQAFGEGLPTRVFSMMESPGSNFNGGPIKTTGRDLDIAVKGDGWLAVQAADGSEGYTRAGSLKIDSTGLLLNSSNRPVMGASGPIVLPIPVEKIEISANGIISVRPQGATAEVIEEVARIKLVNPGNENLMRGEDGLFRLTAGGNAPNDPGVQVESGAVEGSNVNSVHEMVAMIDIQRQYEMQVKMMKNAEEIDRASTSLMRIS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048031_3 | 1605248-1605357 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048031_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP048031_3
>3.1|1605279|48|NZ_CP048031|CRISPRCasFinder TGCTGATATAATAAAGCATTAAAATGATTGAATACGCGACATTAGCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048031_3
The CRISPR arrays of NZ_CP048031_3 >merge|NZ_CP048031|3|1605248-1605357|CRISPRCasFinder AGTTTGATAGGTTGAAAGACGATACCTTTCTTGCTGATATAATAAAGCATTAAAATGATTGAATACGCGACATTAGCTCAGTTGGATAGGTTGAAAGACGATACCTTTCT >NZ_CP048031|3|3|1605248-1605357|CRISPRCasFinder AGTTTGATAGGTTGAAAGACGATACCTTTCT TGCTGATATAATAAAGCATTAAAATGATTGAATACGCGACATTAGCTC AGTTGGATAGGTTGAAAGACGATACCTTTCT
>NZ_CP048031.1|WP_011638096.1|1604527_1605076_+|CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate-3-phosphatidyltransferase MPFNLPIALTLFRIALLPVFIAVFYLPYPWAPFVSAFIFWLAALTDWLDGYAARKLGQLTRFGAFLDPVADKVMVSTALVLLVQQNDNVYLTLAALFMIGREIVISALREWMAEIGKRGVVAVSWIGKYKTATQMIAIIGLIWKPTPWLTDVAYGLFYIAAALTFWSMMSYISAAWKDLTAE >NZ_CP048031.1|WP_101087778.1|1602650_1604483_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MPSGFNAKSFLKHVTSAPGVYRMYDKHQQVIYVGKAKDLKKRLSSYFRVNIANVKTQALVSHIDHIDVTVTHSETDALLLENDYIKQYMPKYNVLLRDDKSYPYILLSGHKHPRLAYHRGPKREKGHYFGPYPNGGAVRESLHLMQKLFPIRQCDDLYYKSRSRPCLQYQLDRCSAPCVGIVSDEEYSEQVKLAGLFLRGKDKQVISQLVAKMETAAIDMEYERAAQYRDQITALRRVAEQQEVSNHKGDMDVIGVDYASGIACFHLLFIRDGKIFGSRSYYPSVPAETEIEEVLSSFLGQFYLNADIQRTIPKEVILSHHFDGIKELEASIEHALDKKFELKTQVRGDRANFLRLAMTNASNAVATRLSHKNTVEQRFQLLEEALELNEPIKRMECFDISHTMGESTVASCVVFNREGPHKADYRRYNITGITGGDDYAAMEQAISRRFDKIDNNGKVPDLVFIDGGIGQLRVAQTIVDEKCVNIDNPPLLICVTKGEGRKAGLETFIVGGSEQAFDIPSDSPAFHLMLHIRDESHRFAITGHRNKRQKTRNTSTLESIAGVGPKRRKALLQHLGGIQEVKGASVAELTKVPGISLEMAQTIHDALRGG >NZ_CP048031.1|WP_011638098.1|1601961_1602606_+|UvrY/SirA/GacA-family-response-regulator-transcription-factor MISVYLVDDHELVRTGIRRILEDERGIKVIGEAPDGETAVQWSRQNEADVILMDMNMPGMGGLEATRKILRYQPDAKIIVLTVQTEDPFPTKVMQAGASGYLTKGSTSPEVLRAITQVARGQRYLSPEIAQQMALSQFNHSDENPFSSLSERELQIMMMITNGEKVNDISEKLNLSPKTVNSYRYRLFAKLGIGGDVELTRLAIRYKMLDTGSF >NZ_CP048031.1|WP_162022701.1|1601291_1601711_+|YjbQ-family-protein MWLQREMTLNSKRRGFHLITDEVIARLPELGGINVGLLHVFIQHTSASLAINENADPTVRGDLERHFNVLAPEGAPYFQHTYEGADDMPAHIKSTLIGSSQSIPITHGRLNLGIWQGLYLCEHRDHASARTIIITLQGE >NZ_CP048031.1|WP_059747951.1|1599828_1600137_+|DUF962-domain-containing-protein MEPKRYSSFAEFYPFYLSQHQDPVCRRLHYIGSSIILVIIINTLINQHWWQLLWLPVVGYGFAWLGHFIFEKNRPATFTYPLYSLWADWVMFGQMIRRLWRK >NZ_CP048031.1|WP_101087773.1|1599129_1599759_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MDNNTLETLRAVYLTAEDLRVAASILYNAYHDDPYFIEVLGQDDNQQYEQKLRAAIREELNELWQQEQPLIGLFDGDRLIGVACVITQQVPLGEGRYWHWRFKMMLGTGWKSTQGLMQKETCILEHLPSQKCGVLQFIALSPNEQQKGYGAKLIQAVLSWCDEQPGLDGIGVFVSNSSHHQAFVKQEFVSIATVSIGNIEGEILFYSKA >NZ_CP048031.1|WP_101087772.1|1598719_1598956_-|DUF2789-domain-containing-protein MDTTSNDLSHLFKQLGLPHDQEGIDDFVIQNKLDKHTLITDADCWNSGQKAFLKEALLQDAQWSEVIDQLDVMMRAKL >NZ_CP048031.1|WP_162022700.1|1598301_1598685_+|DUF3192-domain-containing-protein MKLKLIAAALIGATSLGLSGCVISVGDHESGKSADYWQVQQDKNRDLLSKLSMGMSSDQVTTLMGTADFSEAYTKSAQNNAEQSIKVLFYRTQWAEGDGKTTKDECTPIVFKDDVLVGWGDTAYRQH >NZ_CP048031.1|WP_162022699.1|1597775_1598141_-|hypothetical-protein MSPIEQVLAAAKSIANNGHTPSLALIKSRLGNSIPMPTLIQGLQQFKALPKSEWQHLPELADIPSIADVPSHDQPDLTQVIQQVMTLQQHISQLTQRVTELENQLQNNMAQSNIINNKADQ >NZ_CP048031.1|WP_162022698.1|1597001_1597775_-|Zn-ribbon-containing-protein MFVTELRFECFADTTIETVEKAINAFLEALRANGQILGREFAVAFNDGEFRVRLLLPEKTSLANRHSSPWVKVTLAGLTAAKLLAPREKFIGQDINSEASNTDTPSWQLLYTSYVHMCSPLRNGDNLLPIPLYQLPATFNGDHKRIIKWQTEWQACDELQMAAATKAEYAALDEITRADSDLFRRGWDLRGRIEYLTNIPTYYYLYRVGGESLQAELARPCPRCGSKDWKLDEPLLDMFHFRCEPCRIVSNLSWDHQ >NZ_CP048031.1|WP_162022702.1|1605982_1607623_-|putative-pyridoxal-dependent-aspartate-1-decarboxylase MTSKITRQANASEDSLLRIFTAPEDSTSTLSIIEQKLSQDLAGFLGNSIAALEKPLSEIETDFSTYQIPTDPKFVSDYADEIMQNLVAHSVHTSAPSFIGHMTSALPYFVLPLSKMMVGLNQNLVKIETSKAFTPLERQVLGMMHHLVYQQSDDFYHQWMHSANHSLGAFCSGGTVANITALWIARNRLLQPCGEFKGVTREGMTKALRFYGYDDLAILVSDRGHYSLGKTADLLGIGRDNIISIPTDEHHKVDVAAMRDAAEKLAQQNIKVMAIVGIAGTTETGNVDPLTELAVLASELNCHFHVDAAWGGASLLSKKYSHLLKGIELADSVTIDAHKQMYVPMGAGMVLFKDPELAQAIVHHAEYILRVGSKDLGSQTLEGSRPGMAMLVHACLQIIGRDGYEILINNSLEKARYFASIIDQHPDFELVTEPELCLLTYRYVPKTVQAILTTALANQDSVLVASINELLDGLTQFIQKHQREQGKSFVSRTRIKPAKYLRQQTTVFRVVLANPLTSHQILHDVLTEQIDIAALDSEYLPQLLAL >NZ_CP048031.1|WP_162022703.1|1607853_1609023_-|glycerate-kinase MKIVIAPDSFKESLSALEVANAIENGFKQVFPNAQYCKVPMADGGEGTVQAMVDATQGQIINLTVTGPLGLPVNAFYGVLGQLDEDGNQTAIIEMAAASGLHLVPSTQRNPLLTTSFGTGELIADALDRGIRHIILGLGGSATNDAGAGMMQALGVQLSDINNTPLPFGGAALAELHYIDMQSCHPAIKECVIEVACDVDNPLCGPRGASAIFGPQKGATTEMVEQLDLALGHFAHIINQHLNQPIDGHWQLHPGAGAAGGMGFGVMTMLNATLKPGVDIVTKSVKLAQHCLNADLVITGEGRIDGQTVFGKTPMGVLNVAKQLNIPVIGISGCLGENADAILAEGMHAIFPIIPALQPLEQVLSEAQVNLTNTARNIAAMMSLSFADK >NZ_CP048031.1|WP_162022704.1|1609043_1610402_-|GntP-family-permease MGLILILIGVIAFIVIATSKFKLHPFLTLILASFLTAFAYGLPSNEIAKTITGGFGGILGYIGLVIVLGTIIGTILEKSGAAITMADVVIKLFGQRFPTLTMSMIGYLVSIPVFCDSGFVILNSLKQSMANRMKVSQVAMSVALATGLYATHTFVPPTPGPIAAAGNLGLESQLGLVIAVGVFVAAIAAFAGMLWANRFANEQPDGEGAEELNLQQEDFDDLKKTYGELPSPTKAFAPIFVPIILICLGSVANFPSKPLGEQGLFDLLVFLGQPVNALMIGLFLSLSLLKSNQKIKEFSDRISQGLVVSAPILLITGAGGAFGAVLKATEIGAFLGSSLSALGVGIFMPFIVAAALKSAQGSSTVALVATSALVAPLLGDIGLASEMGRVLTVMAIGAGAMTVSHANDSFFWVVTQFSRMSVKQAYRAQTMATLIQGVTAMITVYLLSLFLL >NZ_CP048031.1|WP_101087786.1|1610532_1611690_-|CdaR-family-transcriptional-regulator MFQIDTLIATKIVDRTMKIIGHNINVMNAQAVILGSGDIDRIGTVHEGALLAISQNRNVEISQAIASNLHGVKPGLNLPLHYQGQVVGVIGITGEPDTLSHYGELLKMTAEMIVEQANLQEQLQWQNRQKEEFISQLIHANEQDLPSLQQWALQLGVDLSVPRVAAIIELDNKNPLYQQDNQALKQVLYLLQNPVRDNLIAMTSLTQLVILKPAFLDGKQFDPELENQRINKLLKRLPANMQLSLHISLGHYFSGELGISYSYRTAKETLDIGKRLHPTKTKYLYQDYSLQVLLSGLRHHWRGNALAGPYMKLIAVDNNQQLQKTLAAYLEHMGDIQACANSLFIHRNTLRYRLDKIQTITNIDLHSFNGLLSLYLGQLIHQPST >NZ_CP048031.1|WP_162022705.1|1612060_1614148_-|MtrB/PioB-family-decaheme-associated-outer-membrane-protein MNTKLNLITLALLTSTSFSLMADGYGLANAKTDKIKYDAWNCKACAVETGTTGTVGVGIGYNSEDDIQSANAFNSSNQTAGKVDADIKYRGDNGYQAKVVANNMGMDNGRMEIDVGKLGLYRLNLGYRSIATYQSNNALSPYQNIGSDNLTLADNWVTAGSSSDMPMLYSSLTPFELSLKRERAGLGFEYQTESLFTTYVNFQREEKTGTKVASGSFFNQSMMLAEPVDYTTDILNAGIKLRGDHWFTSINYNGSVFSNNHQQLGFDSAFNPTFGAQSRGYMALDPDNEAHTISLMGQYNDSITSLSGRLLMGQMTQDQQLTSIGYGYSLPADSIDAKVDITGMTLKAVTKLSRAWRLTGSYDYNDRENNTQIEQWTQISINDVTGKVRYNTPYDLTTHSAKLSTDYRINHGLKLDAGYDFKRDERSNQGRETTDDNNVWARLRVNSFDMWDMWLKGSLSKRDGSEYKASESSSAEQNPLLRRYYLADRDRTQIEARVNHSPIDNLNVDFGVRYAYDDYTNTQIGLTESKDTNYDINLSYMINDDMNVNTFYNHQIIKSAQSGSANLSIATWQADIEDTVDVVGAGLSYNNLMDSRLRLGLDYTYSDSDSNTQVRQGISGDYGDYFAKVHNINVYAQYQATEKMALRIDYKMEKYLDNDDANDIEPDTIWNVMSLGNLQHDYTAHMIMLNVSYSL >NZ_CP048031.1|WP_162022706.1|1614160_1615150_-|DmsE-family-decaheme-c-type-cytochrome MKTTHSINTLFLALLCLTASTLFMSSHVQAAKWDASMTRAEVEATLDKKFAEGKYSPKGADTCLMCHKKTEKVMDLFKGAHGAIDSSKSPMAGLQCEACHGPLGSHNRGGKEPMITFGPTSTLAADKQNSVCMSCHLDDKRVAWDSSHHANADVACASCHSIHAEHDPILSKQTEVEVCTTCHTRQKADMNKRTSHPMKWNQMTCSDCHNPHGSLSDSDLVQPTVNETCYSCHAEKRGPKLWEHAPVTENCVNCHNPHGSVNDAMLKTRAPQLCQQCHASDNHTSNAYLGNTDMGSTVNGNAFTGGRSCLNCHSQVHGSNHPSGKLLQR >NZ_CP048031.1|WP_162022707.1|1615247_1617209_-|OmcA/MtrC-family-decaheme-c-type-cytochrome MMNKKYTKMALLLAMSASMTLVGCGGGDDGEAGNPGNPGGEPAEAIKTLNLDITKVTYQDSKPTIEVFATNEKDLPVAGLKDFEIKKVVQLIPAGASGAGNSAQWQFIGSEKAFTDHGNGNYSFTVNVEGFNPELTQRYNVIASASTLQDGVTGVPRTEITKDFDGEGFEAKYTKNIVSGATCNTCHAKGESIYHSYTDLETCTSCHTNEMAIEKDKVQVEFSHLIHNVHNNAKMYGRNLDKSAEAAHAIVQDNCTTCHVDSEQLSESNNWSRIPTMEACSSCHTDIDFKTGQGHPQQVDNSNCIACHNASWTEELHTTSYTQKKAFIDLYGMTATLTANKSSTEDKSATLSVTILDANGTAIDAASLVSKIQRIETITNVGPNFPIMGYNPSPGSGLAKISKDFIKAGLLQADVVIESGNLVYNIASLPFGAGDTDTAFSFIGLEMCNDGIQAIDCVDGVATTSMKAEFTVGTFSGNAPSYRHTDSVNFGSCDNCHGDTFELHKGHHAGFVMSEQLARELNGEVTIGLDGCVACHTPDGTYASGANQGAIEMKLHSVHSEQGIIKDCTQCHNDFNLDTFKVKGALATSQGLYTTPITATCASCHGFDTISQHAQSQGAVVNGSYQEANDAAQLETCFFCHAPTIENHTQVKL >NZ_CP048031.1|WP_162022708.1|1617496_1619671_-|OmcA/MtrC-family-decaheme-c-type-cytochrome MMKTITVSPAAKAVLSAGLIALALSGCGGSDGTNGEDGPDGIIGVNIDATSTLKATFTDATVVDGKVSVDFILKNANGVAVLGLTKDHDLRFGIAQLTPVTEMVGADGAKVEVDRGYQWQSYINTTKQPNASWIPADETNIAPSAQFQADVEAASKCTDCLVDNLDGSYSYTFQTNIAQVIEPLSITYQADDTQRITLELKQPLITANAHYDFQPSTGLTEDIASRDVVSINACYTCHQPESLALHGGRRIDLENCASCHTATSGDPETGNSVDFTYMIHAIHKGQDRVTSTVDGDVAAPYKVIGYGGGVHNYGNVMYPQKPAADCSACHVEGTNAPKDAALFNANKSDTACIACHTELASQQHVGVGTNCTSCHVEEGYGRSAKEAHGDVMKAYNETQAMNAVFSDVIVTADGKFSTTIKFTDASANVIAAEFIDQGSRIVMAWDSDKNYPTYQDASYSNRRLKLSEGTANADNSWTLVWDKITLPTDYVGKTFELWSAVTACFNHGGYGRPEVKLTACSTDDVQKVEIKSSPYHFVMAASAIDTSQTTATRRNIINTESCQGCHNQEVYHYDNGVNCQTCHTADKTLKNDDTYPGGKKSTSFAFKAHSAEGHYLKYAGVESGTVLKTDCKTCHTADGIQLGRATDRVWRYGDIDTGADVWMSSDTGACLSCHQKYRTDATVSHIESNGGIVDGISEDDARNRASEICSTCHTVDRVTKTHGF >NZ_CP048031.1|WP_101087795.1|1620589_1620892_-|late-competence-development-ComFB-family-protein MQLEIRNYYEVLLMEMLRDEGLMEELPEEYLADLCCVTLNQLPVRYIRHLVDTYFFENYQELKQMKTEISEALERSRQFLKANLQKRLKEEAEIAAEQQQ >NZ_CP048031.1|WP_162022709.1|1620972_1621914_-|histone-deacetylase MSVSIPFVYHASYSQLALPSTHRFPTTKYHNLYQHALKQQLLFEQYRHTPTPISKDSLYTVHCPQYVEQFINGTLDHKAQRRIGFPWSTALVTRTLHAVNGTRLCAELALKHGIAVHLTGGYHHAHYDFGSGFCIFNDLVIAARSAIDSGKADKVLIFDCDVHQGDGTATLTQGSPDIISCSIHCAQNFPSRKQQSDHDIALDKGCTDKQYLEYIQQILPYLIRIHQPDLIIYDAGVDIHQHDDLGYFAISNQGILARDKQVISIAQMHSIPLAAVIGGGYSRNEAELTIRHSQLLIAANEIWSPQCQAMQNQ |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048031_4 | 3506602-3506822 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048031_4
|
3 spacers
spacers of NZ_CP048031_4
>4.1|3506642|20|NZ_CP048031|CRT ATCTAGGCTGTTACTAAGAT >4.2|3506702|21|NZ_CP048031|CRT TCTAAGCTCTAGGTCTTTGCA >4.3|3506763|20|NZ_CP048031|CRT ATCTAGGCTGTTGCTAAGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048031_4
The CRISPR arrays of NZ_CP048031_4 >merge|NZ_CP048031|4|3506602-3506822|CRT TTTATAGCATCTAGCCGCGAAGCGTACTAGCAGCGCAGCGATCTAGGCTGTTACTAAGATTTTATAGCATCTAGCAGCGAAGCGCTCTAGTAGTCTAGACTCTAAGCTCTAGGTCTTTGCATTTATAGCATCTAGTCGCGAAGCGTACTAGCAGCGCAGCGATCTAGGCTGTTGCTAAGATTTTATAGCATCTAGCCGCGAAGCGTACTAGCAGCGCAGCG >NZ_CP048031|4|1|3506602-3506822|CRT TTTATAGCATCTAGCCGCGAAGCGTACTAGCAGCGCAGCG ATCTAGGCTGTTACTAAGAT TTTATAGCATCTAGCAGCGAAGCGCTCTAGTAGTCTAGAC TCTAAGCTCTAGGTCTTTGCA TTTATAGCATCTAGTCGCGAAGCGTACTAGCAGCGCAGCG ATCTAGGCTGTTGCTAAGAT TTTATAGCATCTAGCCGCGAAGCGTACTAGCAGCGCAGCG
>NZ_CP048031.1|WP_162023601.1|3505440_3506409_+|DUF3187-family-protein MKTNLKLISIVSIFTILPAKAQVVSFNDYGPLQVYAQSPMQSINLSPLLRSGFSLPQGQKEWYITANAASVWSESDELLADYYQNAISSGLKWQITEDLLFDAKYTWQFSGDNHLDSLTMWFHDAFGFEQNGRNKQAKHQSQIHSEKYHINVENFNGETLNNALNAYLGYQLLQNEHHGISIGGTLYYKYVDSGPFVDESFQQSVQINYGYHNGNHHVNSTLGMSFLHNTEPLSQNAFESHYLMLGLGYEYRRGRHGWLAEYHRYDGMVSWDKNFSEASNEAVLGYRYYFNSSAIEFTMVENFLNMDNSADIAYVLGYRHKF >NZ_CP048031.1|WP_162023600.1|3504336_3504678_-|hypothetical-protein MDFIWLLGLLAIYIPIQMCIDTYIVYRTDVQQKGCDYLLAFIPLLTLAYPEHYLYSFISLALIVLYGISLRYYAAFNDWLDFDQDRLAGLCLGGLGVGGIIITASLIYQFVQH >NZ_CP048031.1|WP_041413136.1|3503982_3504294_+|flagellar-biosynthesis-protein-FlhB MKDDSKKIQQAVALSFDGKSAPKITATGKDLVAEEMILIAKEAGIHIHQDPHLSEFLQLLELGDEVPKELYLLIAELIAFVYMLDGKFPEQWDNLHQKIVAQA >NZ_CP048031.1|WP_162023599.1|3501802_3503971_+|hypothetical-protein MAVPTTLPQKTVNTVTIKPADASPQKLAERKQTQTDSPSLPTKTSNDKSAVSSSSTTKSDLAAVLLPVKVLQPPANAPLDVTIENQQYQLNKTAELQKLLQQTAQVVIASDHAKLVARAVSSVNVPVVQTEIINNQATTPVMSTASAGSTVTSPAQTVTTQLVLLAQPIQLSLPQGLEELAKQNGVSTQQLATLATRTQGYPLPTAIIDQGKLTFSGGTSIQLSPNTALNSGQYLAKVVVQHQQLQLALTPVIAEITVNLTKLTTTPQADQSVQAANIIITKNEPAQILSQFLKKLESTPLPTLDNAVKGSDTQQKTPIKLTPFSAKIGQDSATVKTGGPVTQQPNPSGLSSESNLTKTASSMAQQANLAKNATNTVEQTSLSTKSLAEQNTPKANTASAIDNSAKSNAPSNNALNNNALNNNASNNNALNKMNSDPAPIEVLNKALSKAGAMPIKQQLSQQVTHNLASELFKHLPQISPHPLSALSDPALLSSELYSLAALNLAHTQLGHSTNSQPSPLFSGSAITTLFQLLLGVKTKSTGSGISDKLQAHLAQLQQRTLSKLSANSGLLAALDKLGGADSLAQLANSIALYQHASTDPNQAMTWYFALPYSINQRDEQFEGKFEQENDSDKDKKAGWKLQLKFNLAQGSLLICAHKQADVLDIQFKGNNQMLLTKVERFNQTLSDKITQIGFTPGKLTTQLAQIPATLLPGDHYLVKTRA >NZ_CP048031.1|WP_101086468.1|3500679_3501459_-|VacJ-family-lipoprotein MKYKWILLQVFVAVSMPVYAEAEAPQVATSSRPAVEIKYNDPRDPFEEVNRTMWDFNYLFLDRYIIRPVAHGYKDYVPNPVRTGVNNFVYNLEEPSSLVNNTLQGKWGWAANAGGRFTVNTTIGLLGLVDVADMMGMHRKQDDFNEVLGYYGTPNGPYFMAPFYGPIVTREIASDWVDGLYFPLSELTMWQSVLKWGLKGLDARSKAIDQERLLDNALDPYAFVKDAYLQHMDYKVFDGDVPSSQADDELLDEYLDELE >NZ_CP048031.1|WP_162023598.1|3499511_3500633_-|response-regulator MALTDVEILFVEDDPIFRHVVADFLQRQGARVQQACNGDEGIALFSDAIFDIVIADLSMPGLHGLSMLKQMQDINPAIPAIVISGNDVMSDVVEALRIGASDYLTKPIADLFIIEQAIIQAMMSAATPMNVSGQSHLQEMNELSYQELTDNLSLLEQNAQAAKSVQQQLFPASHIYYPKAEINYSLFKNNDVSAYFIDSTMVGEHHLVMYMAHFSPEDNSAAFGCVLLRSFINQKLKLFRNGLSNTLIEPNNMLSYLHERMVKSGLHIHTDIIYVCLDLTRYQLSIGQSGKGLRCYLRNGNELTPLALPESAPLGSTVWDKPSMQTRTLLLDEQICIGTHFYEHKQQLLDNRFTGLVYQSDIKAGGFMQLACR >NZ_CP048031.1|WP_101086470.1|3497329_3498838_+|peptide-MFS-transporter MSDAKPQGTLFGHPKGLFLLFTTELWERFSYYAMRAILVLYLVDKVQSNEAGGGLGWSQADALSLYGTFTGLVYLTPLIGGWLADNVLGQRKAIYIGGFLMAAGQFTLAAPHSWMPGLETTMFYIGLGTLIIGNGLFKPNISTMVGDLYPAGDHRRDGAFTIFYMGINLGAALSGFIVAWAYTSFGHEVVIGGEDVFINNWQAGFFCAGVGMILSLIIQFFFAQKLLGDIGTEPAAKVEQRKNAARGETRSEPLTKIERDRIKVIMVMGLFTIIFWAGFEQAGGLMNLFTNNFTDRMIGSWEVPTTYFQSLNAIFIVVFAPVIASIWIRLGKNEPNSPVKFALGLFLLAIGFLFMMGAVFEMGGDASVKSSMWWLVGAYFFHTMGELCLSPIGLSMVTKLAPLRIASLMMGAWFLFIAAANKIGGLVGSLIGHGGEVEEQLANAMAIFAGIGITAVVSGIILYLMSDKLVDWMHGAENKNETEEEVLEEEIAVTAEHEGIQR >NZ_CP048031.1|WP_162023597.1|3496148_3496796_-|OmpA-family-protein MTIIRAVTLILIGCFICTAHAWVDTDFDGVPDKKDACNDTPVNSVVMANGCIDTELLIVDEDAEDDAEFDEAELGATVTNNSALIAEQCRQQRDVSVAVDCFGSILQPVYFDFDKSVVLLTQRPTLVRVQQYIEQHPQVAIRLEGHTDNIGSDAVNRSLSLKRAATIKDLLVNEYQFQPTSIEIVGMSNKKPIADNATIEGRQRNRRVEFIISAE >NZ_CP048031.1|WP_101087193.1|3495289_3496114_-|mechanosensitive-ion-channel MEGLDALVEQAPEFLMTYGLKALAAIVIFLIGKYFSGVAKRITTKLLTNRKVDTTVVSFVANLAWMLVFVFTIVATLGQVGVQTASLVAVIGAAGLAVGLALQGSLSNFASGVLMVLFRPCRVGDFIEAAGVAGVVDEITIFSTRLRTGDNKMIIAPNSAIMNGTITNYSALEKRRIDLTIGVSYTADIAKTKKVLADILDNNQFVLKDPSYTIGLAELADSSINFVVRPWVKTPDYWTARFELLEQIKNALDAAEIEIPFPQMDLHVKEVPAK >NZ_CP048031.1|WP_162023596.1|3493209_3494934_-|ubiquinone-dependent-pyruvate-dehydrogenase MSQSIASFITQTLEQAGVKRIWGVTGDSLNGISDSLRKMGTIEWLGTRHEESAAFAAGAEAHISGELAVCAGSCGPGNLHLINGLFDCHRNKVPVLAIAAHIPSSEIGSNYFQETHPQELFKECSVFCELVSSPEQMPYLLETAMRQAILHNDVSVLVLPGDIALKAMPETTKPKWNVPKPASYIANLADTKTLATHLNKSGKVTLLCGAGCKDAHDEIVALAAKLQAPIVHAMRGKEFLEYDNPYDVGMTGFIGFSSGYHAMQQADTLLMIGTSFPYRAFYPENITILQIDNQPASLGRHVQIDFGVLGDTKNTVTSLLELIKEGRSSAHLEQCVKNYQESRKDLDVLANGKTSHNLIHPQYLTRLLDEQAGQDTIFTCDVGTPTVWAARYLSMNGQRRLIGSFNHGSMANALSQAMGAQSLDRNRQVIAMCGDGGFSMLMGELLSLKQLNLPIKIIVYNNRSLGFVAMEMKASGYLSNDTDLENPSFAKIAEACGLKGIHVNDPGKLPEAMAEMMEHSGPVVLEVDTAKQELAMPPKIKFEQAKGFSVYMMKALINGKGNEIVELSKTNWSR >NZ_CP048031.1|WP_162023602.1|3506837_3507776_-|diguanylate-cyclase MFIDEYISGAAPVRGKILLVDDQVVNIKILHQLLQADYDIYMARDGHQAIDMCKKVKPDIVLLDIEMPMLNGFDVCAHLKQDPDTEDVAVIFVTGHFDEVKEVKGFQLGAVDFIHKPINPVITKARIKNQMMSKSQTDLLRSIALLDGLTGVANRRKFDQVLPVSWLQCAREKQPLTIILLDIDFFKHFNDTYGHTEGDTCLRIVAQKIQDTVNRPYDLVARYGGEEFICVLPNTDLIGGTYVAQQIVDSIVSLKIAHLNSPISEFVTVSAGVSTVVPMYDMPNKNLVEAADKQLYLAKDRGRNRVLGCLAE >NZ_CP048031.1|WP_162023603.1|3507779_3512678_-|PAS-domain-S-box-protein MIKMTRLSSYKNALKLGIGVFAFGLVISFVTALSVKNQNNTIITQSLETVSEQVANNIIDRIVLYQYGLRGARGAVSTIGEDKITREIFRKYSLTRDIESEFPGARGFGYIRRVPVADEADFVAKAKLDDWPNYSVRQLNPHDDERYLIDYIEPIERNLAAVGLDISSEQNRKNAAQQAYLTGEVRLTGPITLVQATGNPLQAFLILMPIYRTGFTPSTEALREQQAFGWSYAPLVANEVFDKISLSRKTTKLLINDVTDAQNNVMFYETHLDDVNPLSDYSVTLDREIFGRKWHVSLVAYPEFVSGLHLSSPNIVFSYGAIVSLLLGGLIGFYGYALGRKRLILEDNERRANILEHSLDAIISFDCDGVITSWNDGAVTIFGYEKHEVIGLKKTTFIVPNDGYDAEAEKFNQVLSGKSLLNFVSQHKRKDNALLSTSMTSLAIYNEFGKIIGVSQTIRDITVQLNAEKQILNINANLERKVTERTQALQQALSENKTLLDNINQQLLYSETDKDGVILGVNDYFCLASGFTREQMIGQKHSILKSNQHDDAFWANMWQTINAGKTWHDEVCNHDSQGNVKWFDTVIAPVMDADDNLERCFALRIDITERKNTQLEKNELASLLTNVLAAASEIAIISTDNNGIINIFNRGAELLLGYQAEEIVGKQSPAIWHLPSEIRERSKQLTKEFGEDIIAFDVFVYKPRVQGPETRTWTYVRKDFSQCQVSLSVSAMRDQNGEIIGYLGVAVNIDVMLQQQEELVSASNQLSKAAEVAELGIWNLDFHTNRLQWNDRMFAMYDYPLALTEEELSYQHWQKRVHPDDLAMAELALKQAIDLNLPYDPTFRIITSTNQIRYIHAGAHISYDKSGKPVRVVGINRDITEQRELEQTLRLAKQASDAASAAKSQFLANMSHEIRTPMNAVLGMLQLIQHSDMSRQQADYVSKAEIAAKSLLGLLNDILDFSKIDAGKLELDLHPFQLETLMRELAVMLATNVHSKNLEVIFDLDPAIPYLIEGDELRLRQVLLNLAGNAIKFTSEGHVIVSVHCNECIANQANLTISITDTGIGISPEQGSKIFQGFVQAESSTSRRFGGTGLGLAITKRLVELMGGELTLSSHVGKGSRFWFDLTFNIVEIKNNDLDIDLQGKNILIVDDSKMSRKILSKTLMAHGAYVNEAHNGKQAINLIDQSLNASNHYDVIIMDWRMPDKNGLETANHIQAMFPAGKAPAIIMLTAYGAEVMEQTKQYRQQPFVSMLTKPVTANLMLESVYRAIHGLEQPIQSRKITNLALKGARVLVVEDNQLNRQVIDELLRLQGAIVTLAKDGIEGVDWVTKSNNQFDIVIMDMQMPVMDGLEATRIIRADGRFNDVPILAMTANASLADKTLCLDAGMNDHIGKPIDMTLLLPCILNLLGQDNSAYYHSTVNNPPIALPEVRNDGDDDAIIENPDSILRRFGGELAFFIDVKHHFASEMSEQLSLLTQAFALEDDNAISSIAHTIKGTSSNIGAKRLAAFAATLEHNIKNAVNVDSDACLSQMQGQINDSLHMLDTLFPDESAVLTTRTLDNSAVLPIQSIDADKTDRLMELLVDQNLDAIEYLERLLSNVVPDKQWLRLKNQVSQLEFLDAVDTLKSIIKE >NZ_CP048031.1|WP_162023604.1|3513493_3514636_-|hypothetical-protein MMFKSLFESKTVMASRMNILPKIVLLSKARVIASLVLLSSLLTSTVFAADYSVFRELDSQHPPGNVAVSSTGRVFMSNHHFYGVDSRIVELKKDGSIVDYPNTEFNQNLNPVLGVVIDEQGILWMLETASADGVGRLIGWDTQQNSLYKTISLTASVLPSNSFLNDLAVDRKHETVYVTDPAGGSNAALIVVDLTSGTARRVLDGSVYTRPEDVDTVINGNTLSIGGQPIRIGVDSLTVDPNNEWVYFGALSGEKLYRVHTQYLLDAKLSANMLRSKVEFYANKPISDGITIDNGGNIYVTDISHNAVGYIDTDRQYHILYQDDDKFSWSDGFSTTADGKLLVTVNKLHQSPAVNNQQDKSDGRYYIIQFDALTETTVGR >NZ_CP048031.1|WP_101086461.1|3514647_3515292_-|AhpC/TSA-family-protein MSLSTQLTEKRDASAANLPAEVLAIMSDATLNLKLSGIIDNAPKAGDKLAAFSLTNALGVTRHLTDLLANGPVVVTFYRGNWCPYCNLALRAYQQHLAEFKQLGATLVAITPELPDMSLSTAEKNELEFDVLSDVNAEYAKALGLVFTLPDSIRDLYKKFGVEVEKHNGAEQFDFPLAATFVVAKDGTIVKAFVDADYTYRLDPEDIISSLKAL >NZ_CP048031.1|WP_162023605.1|3515419_3515986_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAKKNFERADVLDKVITLFWQNGYAASSIQQITKATGLKPGSLYYEFDSKEGLFQAALARYATFSIEAIHQLMQQADDVKVGIRQILDNIVEQSKSCDYCGCFLIKTQLELASQGNELYKFASSQLTEIEHVYQHYLSQLYEPETAKAYAAQLMTVTFGIRIYGYQSESAATQTNTINALLPWLNEAE >NZ_CP048031.1|WP_162023606.1|3516103_3516769_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MTPLSNARGNATRQANKTLRRERLLSIARELISGNGFEAFTINELALKAQVSIPTVHNLLGKKSDIFEHLVVDMVAKVEAALAQPNIKDPIVATEAFIDSLLDLFAANETFYKAAFVAGERTQFFEHELPTGIFNKSLSIAMQVCVDAKNNGFLQGNIDVDWLAKQLFGCQRLARHDWVNGYISLSEYRTQVLIGAFITLAADATPSFQLRLFAVIKSLAS >NZ_CP048031.1|WP_162023607.1|3516864_3518037_+|phytanoyl-CoA-dioxygenase-family-protein MKQDITKSIEACAAHYGEQAQAMKTYLLNGQAKASSLNNRGPISFDNNGTLAKHIVEAYNEYGFYIFENVLNENELNEVKADLAQMRSTFSAAPYGKTTADGKPALGADHKAPSLIWSKSLGDPLGGTDIANGRHQVKLFEPTAAKDTPEYSPFVLLGSLQFSEACLRIYGHPQLLRVAEAVNGKDFAPFHECLFIKDPGVGAAVSWHQDGDTHWNSQHFDDGIHGFNFMAQVYGSTAVNGVWVLPGSHKTGKIDIKALIEQSGSERIEGLVPLICGPGDVVICNRQLLHGSFANTGFEPRVTVNFGFHRRSSVLGIMGAGMHSEAQEYTEEIIEQRSKVIGYAIDARKQKYPDETPYQYQPFIDKGLQYRWDQQAQKDIKDYNLHDLSI >NZ_CP048031.1|WP_162023608.1|3518089_3519064_+|dihydrodipicolinate-synthase-family-protein MPIPHGIYPVIHTPLHLDQSVDIVNFEACLRHYLTTDITGVTILGSGGELPYFSDKEQLELLISAHLTIGAHKKIIVGLQAYSATQAIDKINHYKPYADAILLLVNSYYPVAFEDYYQSIRTIAAASDTPIIFYYFPQITKQFLTVSQLEVILLLPNIIGIKDSSLHLLTAKKLIQKCPSTLYFSGLSLMLEQLPNAAGAICPLAAIYPQQSQHYWLAIKQNNDTQSRVYHQYLKAALPIINALNMPAKWQWNLLTLLSRCPIPLLKKVTSSHAQVKAALHIIGMPISPTVRHPLRSISESEIEKIRVLIAQNSQDSEAEYIKQ >NZ_CP048031.1|WP_162023609.1|3519194_3521666_-|S9-family-peptidase MKTFSLVLTSLAIAISGMVHGAEIDAKYIQRIGPVNQVSAAPLSKSAHADALRANLVAQLSQANHASKVTIFNQPLSWQAASTKVEGEGWLAYQVPMSTDRFTQGTLTVNGLENPQVYLNGQLVKSADKVELELNNGDYHLVVLADGQAQDSAFSLDWQGKSEVDNLDFAVQKTQRVSAEQLFDSKVISGLTLSPNGKYLLQSTIEYQASQGDTPIQVTELRKLSDNSVMYRWQDNRPSSAVWSSDSSQLVFVANKQIQLFNVADLSINVVATDMDNVSGLQWLGNTVLFSWEKPFKADDKATSKRFQALEDRWSYWRNNSQLYQVDVASGFIRQLTDNNVSSSLLDSNADKGKLLLTRSPVDYAQPAHGITQLVELTLADLSETMIGEYRSFNSALYADDGMYITAGPRFMDGIGIQDPNIEVNDYDGQLYWRDAKGNVSALSKAFDPSIGSMTKLENDDLIVTVTEGDRAPLYLFDKSKTRFNRIDTGVDMIDGFSVAIEQSTPTLVFAGTSATAPQKAYKMAVNSSRKQLLFDSQQLSYANTRLGKIEDFDFINTHGHNIDGRVYLPVDFDASKKYPALVYYYGGTSPVGRHFTGRWPFNLWAAQGYVVYVVQPNGATGYGQAFSGRHVNAWGKYSADDIIEGTKAFLNAYPSVDAKRVGNMGASYGGFMTMYLATKTDIFAASMSHAGISNLSSYWGHGWWGYGYSGVASRGSFPWNNPELYVEQSPLYHADKITTPLLLIHGNADTNVPVGESHYMYTALKLLGKEVELVEFNDQDHHINSRQARFDWWNTTMAWFDMKLKDEPQWWNSIYPETKESQ >NZ_CP048031.1|WP_162023610.1|3521927_3524015_-|TonB-dependent-receptor-plug-domain-containing-protein MLSYSAASLILSLGVIGVSEASAVDDSINTSGQSANHSENDSKSHSANPQHSEHDDPQADVDEHEHEHEHEEEMETIVIQATRSGRIADEQPIRVEVINREEIEEKAAMRPGNISMLVAETGGVRLQTTSPALGSANIRLQGLYGRYTQLLADGLPLYGNQAGSIGLLQVPPTDLSRVEIIKGSASSLYGGSALGGVINLVSRTPGDELSGEVLLNATTRDGQDVTTYFESPLSENVKGSVTAGAHYQDKQDIDSDGWIDLAGYERYTVRPRLFWEGQEGQTLYVTSGFMTEQRTGGTLGDNTVADGTSFEQSQDSDRLDGGLVFSMPLLESLTFNTRASAMVQDHVHVYGADIEEDQHESYLLENSIAGYTDNSDWVVGLAYQSEIFASDTYPEFDYSYKVPGAFAQLDYELTDQITTSYSARIDEHSEYGTQFSPRVSVLYRPSDLTIRGSYGEGYFAPTPFVEEIEAAGLSRLAPIDHLQEERAKTASLDVSYTFNDVETSLTLFGSNVDNVTGLEAFSANNDGSLDAVRLVNAPGESQIRGSEVLLRYYLGDVKLTASYLYLDATEVSPDGDGRRAIALTPRHSGGFVAMWEQHGNFRAGFEAYYTGTQNVNDNPYIDETNPYWHLGLMGEITVGRVSWFINLENLLDVKQTDEHPMLLPNRAPSGQWTTDIWSRNDGFIANAGVRVKFGH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048031_4 | 4.2|3506702|21|NZ_CP048031|CRT | 3506702-3506722 | 21 | NZ_CP048031.1 | 3506581-3506601 | 2 | 0.905 |
1. spacer 4.2|3506702|21|NZ_CP048031|CRT matches to position: 3506581-3506601, mismatch: 2, identity: 0.905
tctaagctctaggtctttgca CRISPR spacer tctaagctctagggctatgca Protospacer ************* ** ****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1281020 : 1288516
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048031|1281020:1288516|DBSCAN-SWA ATTATTTATTTAAACGCTTGTATTTTAATCGATGCGGTTCTACTACATCGGTGCCTAAGGTGGCTTTTAACCAAGTTGAGTACTCAGTATAGTTACCTTCATAGAAGCTCACTTTACCTTCATCACGGTAATCCAAAATATGGGTCGCAATACGGTCAAGGAACCAACGGTCATGGGAAATAACCATTGCACAACCAGGGAACTCTAATAACGCTTCCTCTAACGCTCGTAAAGTTTCAACGTCCAAGTCGTTGGTGGGTTCGTCGAGTAATAATACGTTGCCACCGGCTTGTAATAACTTAGCTAAGTGAACTCGGTTGCGCTCACCCCCCGATAATGAACCAATTATTTTCTGCTGATCGCCACCACGGAAGTTAAAGCGGCCTACGTAAGCACGGCTAGAAATTTCAGTGTTGTTGATGCGCATAATATCTTGGCCGCCTGAAATTTCTTGCCACACGGTGTTTTTGTCATTCATCGAATCACGGAACTGATCAACCGACGCAATTTGAACCGAATCACCGACAGAAATAGAGCCACTGTCTGGTTGTTCCTCGCCTGAGATCATTTTGAATAAGGTTGACTTACCCGCACCGTTAGCACCAATAATGCCGACGATAGCGCCCTTAGGAACCGTGAATGTCAAATCATCAATCAGTACGCGGTCACCATATGACTTGGTTAAATTAGTCACTTCAATGACTTTGTCGCCTAAACGAGGCCCTGGTGGAATAAACAGTTCATTGGTCTCGTTACGCTTTTGGTAATCGTTGGTGTTCAATTCTTCAAAGCGAGCCATACGGGCTTTACCTTTTGATTGACGACCTTTAGCACCTTGGCGTACCCACTCTAATTCTTTAGCAATGGTTTTTTGGCGGGCGCTTTCTGTGGACGATTCTTGGGACAAGCGCGCATCTTTTTGTTCAAGCCAAGATGAATAGTTACCTTCCCATGGAATACCTTCACCGCGGTCAAGTTCTAAAATCCAGCCAGCAGCATTATCTAAGAAGTAACGATCGTGGGTAATCGCCACCACGGTGCCGTTATATTCTTGTAAAAAGTGCTCTAACCACGCCACTGACTCTGCATCCAAATGGTTGGTTGGTTCGTCGAGTAATAGCATTTCCGGTTTTTCAAGCAATAAGCGACAAATGGCCACTCGGCGTCGTTCACCACCAGAGAGTACGGCAATTTTCTCATCCCAATCGGGCAGACGTAATGCGTTAGCTGCACGTTCAAGAATATGATCAAGATTATGCGCATCTTGAGATTGGATGATGGCTTCTAATTCGCCTTGCTCTTTTGCAAGTGCGTCGAAGTCTGCATCGGGCTCAGCATAAGCAGAATAGACCTCGTCTAAGCGTATTAGTGCATTTTTAGCTTCGCTTAGGGCTTCTTCGACGGCTTCGCGCACAGTTTGTTGTTCGTTTAAGCGCGGCTCCTGCGGTAAGTAGCCAATTTTTAACCCAGGCATTGGGCGTGCTTCACCTTCAATTTCGGTATCTATTCCCGCCATGATGCGCAGCAATGTTGATTTACCCGAACCGTTTAACCCGAGCACACCAATCTTAGCGCCAGGAAAGAAGCTTAATGAAATGTCTTTTAATATTTGCTTTTTGGGTGGGACAATTTTACCCACACGAAGCATGCTGTATACAAATTGAGCCATAATTATACTGTCTAATTGTCAACAAAGATGGTGATAATTCTACTGTATTATGTGCTGAACTCAACAGGCAATTGTGTGATTTTATCTAGCGTGCTTTTTAGACTCAATTCGCTAAACAATCTGCTAGCTTGGTGTTATCAACATGAATCGTTTTGTATTCAGAACACAGTGAATTTCATGTTGTTTGTACTGTAAATCATTATCGTTGCAGAGTAGAATACCGCGCAACCCTACTATATAGATAATGATGTTGGAGCTACCATGTTGAAGAAAGCGATGAATATTGCGGATTATGATCCAGAATTATTTAAAGCCATTGAAGATGAAACTTGTCGTCAAGAAGAACACATTGAATTGATTGCATCTGAAAACTATACCAGTCCACGTGTGATGGAAGCGCAAGGTTCTCAGTTAACTAACAAGTATGCTGAAGGTTATCCAGGCAAGCGTTATTATGGTGGGTGCGAATACGTTGATGTTGTTGAAACATTGGCTATTGAACGCGCAAAAGAATTATTTGGTGCAACTTATGCCAACGTACAGCCTCATTCAGGCTCACAAGCAAACAGCGCAGTGTTTATGGCGTTGTTACAACCTGGTGATACTGTTTTAGGGATGAACCTTGCTCATGGTGGTCATTTGACCCATGGTTCACCAGTGAATTTTTCAGGCAAGCTTTACAACATCATTCCTTACGGTATCGATGAAGCTGGCAAAATTGATTATGACGAAATGGAACGTTTAGCCATTGAGCACAAGCCTAAGATGATGATCGGCGGTTTTTCGGCATTTTCAGGCATAGTCGATTGGGCTAAAATGCGTGAGATTGCCGATAAAGTTGGTGCTTATTTGCTTGTTGATATGGCTCACGTTGCAGGCTTAGTGGCTGCAGGTGTTTATCCAACCCCTGTCCCACATGCACATGTGGTCACCTCAACAACTCATAAAACATTAGCGGGTCCACGTGGCGGGATTATTATCTCTGCTGCCGATGATGAAGTGTTGTATAAAAAGTTGAACTCAGCGGTATTCCCTGGTGGCCAAGGTGGCCCTTTAATGCATGTAATCGCAGGTAAAGCGGTTGCATTTAAAGAGGCATTAGAGCCAGAGTTTAAGGTATACCAGCAGCAAGTTGTTAAAAACGCTAAAGCTATGGTTGAAGTGTTTTTAGCTCGCGGTTACAAAATTGTTTCTGGCGGTACAGAAAACCATTTAATGTTGGTTGATTTAATTGGTCGTGATTTAACCGGTAAAGAAGCTGATGCTGCATTGGGCAATGCCAACATTACCGTCAACAAAAACTCAGTACCTGATGATCCACGTTCACCGTTTGTCACCTCTGGTGTTCGTATTGGAACGCCAGCAATTACTCGTCGTGGTTTTAAAGAAGCAGAAGCGAAAGAATTGACCGGTTGGATTTGTGACATTCTTGATGATGCATCTAACGCCGAAGTGGCTGAACGAGTGAAAGGTCAAGTGTTGGCATTATGTGCCCGATTCCCTGTATACGGTTAATCGTCACTTGATGCCTGTTGAAAAGGTTTAGGTTAACCTTGCTCAACAAATAGGATAAACTTTAATGGCCGCTAATTGTTAGCGGCCATTTTGTTTTTTTCTGCAGGAGGTTCAATGCATTGCCCTTTTTGTAGCGCGACCGATACCAAAGTTATAGATTCTCGATTAGTGGCTGATGGTCACCAAGTACGTCGCCGCCGGGAATGTACCGAATGTCATGAACGTTTCACCACGTTTGAAGGCGCAGAGTTAGTCATGCCTAGAGTCATCAAACGTGACGGCACTCGACAACCATTCGATGAAGAAAAATTGCGTGGCGGCATGCTACGTGCGGTCGAAAAACGCCCGGTCTCAATTGATGAAATTGAACAAGCATTGACTAAAATCAAATCAACACTGCGCGCGACAGGTGAGCGTGAGGTGAATTCTGAAATGATTGGTAATCTGATGATGGAACAATTGATGAGCCTTGATAAAGTGGCATATATCCGCTTTGCATCGGTTTATCGCGCATTTGAAGATGTATCCCAATTTGGTGAAGCCATTGCTAAATTGCAAAAGTAATGCTGCTTAATAATATCTGTTTTAATGGTTTTAATGGTTTTAATGGCATTTAAGCAATAAGAGATTATCTCCCATGTCTAACTGGTCCACCTTTGACACCCAAATGATGAGCCGTGCCATCGCGCTTGCCGAGAAAGGCCGTTATACCACTCGGCCAAATCCTTGTGTCGGTTGTGTCATTGTTTATCAGAATAAGATTATTGGTGAGGGTTATCATCAACGTGCTGGCCAAGGACATGCCGAAGTTAATGCGCTGAAAATGGTGCATGATAATGGCTTGTCTGCTGAAGGTGCCACGGCGTATGTCACTCTTGAACCTTGCAGTCATTATGGCCGCACACCACCTTGTGCTTTAGGCTTAATTAATGCCAAAGTTGCCAGAGTTGTGGTATCGGTGACCGATGCAAATCCACAAGTGTCTGGTCGCGGTATAACCCTGTTACGTGAGGCTGGTATTAACGTTGATGTTGGATTGCTCAGCGAACAAGCCTATGACCTTAATCTGGGTTTTATGAAGCGGATGAAAACAGGACTTCCTTGGATAACGGTAAAGATAGCAGCCAGTTTAGATGGTAAAACGGCTCTGTCTAATGGCGTGTCGAAGTGGATTACTGGCAGTGCAGCAAGAGCTGATGTGCAAAAATACCGCGCTAGCCATTGTGCATTAATCACTGGTGTTGAAACCATTCTTGTCGATGACCCAAGCCTTAATGTGCGCTATGAGGCGTTAGGTGAGTTAACCACTCGCCATACAAAAGATGAAATCTTCCAACCTCTAAGGGTTGTGCTCGACAGTCGCGCAAGATTAACAGCAACACAGCAATTATTTTCAATTCAAAGTCCTATTTTACTGGTTTCTGGCTGTCATTATCCCGAAAGCACCAAAGCTGCATTTCCAGATCACGTATCATTTCTTCAGTTAACGTGTGACTCGTCAGGCAGAATCCCATTGTTAGCTTTGCTAACATATTTAGGTCAGCATACTAATTCTGTTTTAGTTGAAGCCGGTGCTACCTTAGCCGGAGCATTTGTCGCCCAAGGGCTCGTTGATGATATTGTGCTTTACCAGGCGCCTAAACTATTAGGTAGCCACGGACGTAATATGTTGCAGTTACCTAATTACAGTACAATGGAGCAAACGCCGGCACTGCAATTAATTGATGAACGCAACGTTGGACAAGATAAGCGTTATATCCTCAGATATAATCAACCCTATTAATGTGCGTGTTGTTCAGTCCAAAACCTGAACAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048031|1281020:1288516|1282949_1284203_+|WP_162022543.1|DBSCAN-SWA MLKKAMNIADYDPELFKAIEDETCRQEEHIELIASENYTSPRVMEAQGSQLTNKYAEGYPGKRYYGGCEYVDVVETLAIERAKELFGATYANVQPHSGSQANSAVFMALLQPGDTVLGMNLAHGGHLTHGSPVNFSGKLYNIIPYGIDEAGKIDYDEMERLAIEHKPKMMIGGFSAFSGIVDWAKMREIADKVGAYLLVDMAHVAGLVAAGVYPTPVPHAHVVTSTTHKTLAGPRGGIIISAADDEVLYKKLNSAVFPGGQGGPLMHVIAGKAVAFKEALEPEFKVYQQQVVKNAKAMVEVFLARGYKIVSGGTENHLMLVDLIGRDLTGKEADAALGNANITVNKNSVPDDPRSPFVTSGVRIGTPAITRRGFKEAEAKELTGWICDILDDASNAEVAERVKGQVLALCARFPVYG >NZ_CP048031|1281020:1288516|1288039_1288516_+|WP_011636512.1|DBSCAN-SWA MNVVQGNIEAKNAKVAIVISRFNSFLVESLLDGAIDTLKRFGQVSDDNITVVRVPGAVELPLAAKRVAASGKFDGIIALGAVIRGGTPHFEFVAGECNKGLAQVALEYDLPVSFGVLTTDTIEQAIERSGTKAGNKGGEAALSLLEMVNVLQQLEQQL >NZ_CP048031|1281020:1288516|1286812_1287916_+|WP_162022546.1|DBSCAN-SWA MALHSIEEIIEDIRQGKMVILMDDEDRENEGDLIMAADKVTPAAINFMATYGRGLICQTMTKERCQQLNLPLMVTNNNAQFSTNFTVSIEAATGVTTGISAHDRAVTVQAAVAKDAKASDLVQPGHIFPLMAQEGGVLTRAGHTEAGCDLARLAGCEPSGVIVEILNEDGTMARCPDLEKFSEKHGIKIGTIADLIEYRNTNETTVVREAQCKLPTRFGEFTMVTFRDTIDNQLHYALVKDEVKPNCLVRVHLQNTFNDLLHSERDQKRSWPLEKAMERIASEGGVLVLLGNDEHTSNLLAKVKAFEAEDNGQSPAPAMWQGTSRRVGVGSQILSSLGVSTMRLLSSPKRYHSLSGFGLEVTDYIAE >NZ_CP048031|1281020:1288516|1284840_1285986_+|WP_162022544.1|DBSCAN-SWA MSNWSTFDTQMMSRAIALAEKGRYTTRPNPCVGCVIVYQNKIIGEGYHQRAGQGHAEVNALKMVHDNGLSAEGATAYVTLEPCSHYGRTPPCALGLINAKVARVVVSVTDANPQVSGRGITLLREAGINVDVGLLSEQAYDLNLGFMKRMKTGLPWITVKIAASLDGKTALSNGVSKWITGSAARADVQKYRASHCALITGVETILVDDPSLNVRYEALGELTTRHTKDEIFQPLRVVLDSRARLTATQQLFSIQSPILLVSGCHYPESTKAAFPDHVSFLQLTCDSSGRIPLLALLTYLGQHTNSVLVEAGATLAGAFVAQGLVDDIVLYQAPKLLGSHGRNMLQLPNYSTMEQTPALQLIDERNVGQDKRYILRYNQPY >NZ_CP048031|1281020:1288516|1284317_1284767_+|WP_011636508.1|DBSCAN-SWA MHCPFCSATDTKVIDSRLVADGHQVRRRRECTECHERFTTFEGAELVMPRVIKRDGTRQPFDEEKLRGGMLRAVEKRPVSIDEIEQALTKIKSTLRATGEREVNSEMIGNLMMEQLMSLDKVAYIRFASVYRAFEDVSQFGEAIAKLQK >NZ_CP048031|1281020:1288516|1286049_1286709_+|WP_162022545.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEALGTLRKIDRKGNDIRLTVASGKLDLTDVKLGDSIATNGVCLTVVERLGDGYVADISAETVDLTGFSRYQVGQKVNLEKAVTATTRLGGHMVSGHVDGIAKVEQCAYRGKSLEFWLSVPAQLSRYIAHKGSITIDGVSLTVNEVDGARFRLTIVPHTAGETTLVDLKVGDSVNIEVDLIARYLERLMQPETNHVQPASGVTMELLAKSGFLR >NZ_CP048031|1281020:1288516|1281020_1282688_-|WP_011636506.1|DBSCAN-SWA MAQFVYSMLRVGKIVPPKKQILKDISLSFFPGAKIGVLGLNGSGKSTLLRIMAGIDTEIEGEARPMPGLKIGYLPQEPRLNEQQTVREAVEEALSEAKNALIRLDEVYSAYAEPDADFDALAKEQGELEAIIQSQDAHNLDHILERAANALRLPDWDEKIAVLSGGERRRVAICRLLLEKPEMLLLDEPTNHLDAESVAWLEHFLQEYNGTVVAITHDRYFLDNAAGWILELDRGEGIPWEGNYSSWLEQKDARLSQESSTESARQKTIAKELEWVRQGAKGRQSKGKARMARFEELNTNDYQKRNETNELFIPPGPRLGDKVIEVTNLTKSYGDRVLIDDLTFTVPKGAIVGIIGANGAGKSTLFKMISGEEQPDSGSISVGDSVQIASVDQFRDSMNDKNTVWQEISGGQDIMRINNTEISSRAYVGRFNFRGGDQQKIIGSLSGGERNRVHLAKLLQAGGNVLLLDEPTNDLDVETLRALEEALLEFPGCAMVISHDRWFLDRIATHILDYRDEGKVSFYEGNYTEYSTWLKATLGTDVVEPHRLKYKRLNK |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1864603 : 1874451
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048031|1864603:1874451|DBSCAN-SWA TATGAAGCTTCCTATCTATTTAGATTATGCCGCAACAACCCCTGTAGATCCGCGTGTCGCAGAAAAAATGATGCAACACATGACAATGGACGGTGTGTTTGGTAATCCAGCATCGCGTTCACATCGTTATGGTTGGCAAGCAGAAGAGGCGGTTGATGTCGCCCGTAATCAAGTTGCCGATTTAATTAATGCTGATCACCGTGAAATTGTTTTCACATCAGGTGCGACAGAGTCAAGTAACCTTGCGATTAAAGGTATTGCCCATTTTTATCATAAAAAGGGCAAGCACATCATCACCAGTAAAACTGAACATAAAGCAACGTTAGACACGTGCCGTCAGTTAGAACGTGAAGGTTATGAAGTCACTTATCTTGTTCCCGATGCTAACGGCATTATCCCAATGGAACGCTTAGAAGCGGCGATGCGTGATGACACTATTTTAGTCAGCATTATGCACGTTAACAACGAGATTGGTGTTATCCATGACATCAACGCAATTGGTGAATTATGTCGTTCAAAAGGCATCTTTTTCCACATGGATGCGGCACAAAGTGCTGGCAAAATACCAATTGACGTTCAAACCACCAAAGTTGATTTGATTTCGATTTCTGGCCATAAAATGTATGGACCAAAAGGTATCGGCGCATTATATGTTCGCCGTAAGCCACGTATTCGTCTTGAATCGCAAATGCACGGTGGTGGACACGAACGCGGTATGCGTAGTGGCACACTAGCAACACATCAAATCGTTGGTTTAGGTGAGGCTGCAGTTGTTGCAAAACAAGACATGGCAGCTGATAGCGCACGTATTACTCATCTACGCGATAAGTTGTGGAACGGTATTAAACACATTGAAGAAACCTATATCAACGGTGATATGGAACAACGCTATAGTGGTATTTTTAACGTGAGCTTCAACTTTGTTGAAGGCGAGTCGTTAATGATGGCCTTGAAAGACTTAGCGGTTTCTTCAGGTTCAGCCTGTACTTCAGCAAGTTTAGAGCCAAGCTACGTATTACGTGCTTTGGGTTTAAATGATGAAATGGCACATAGCTCGATTCGTTTCTCTATTGGTCGCTTTACGACTGATGAAGAAATTGACCACGCTATCAAAACGATAACTGAATCTATCGATAAGTTACGTGAAATGTCTCCATTATGGGAGATGTTCAAAGATGGTATCGATTTAGAGCAAGTCCAATGGGCACATCACTAATTTAATCTTATTAAATGAGTGTAATACCATTAAATCGTAAACTGATAACGACACAGATTTTGGAGCAGTATCATGGCTTATAGCGAAAAAGTAATCGATCATTATGAAAACCCACGTAACGTAGGTTCATTTGATAAGAACGATCCATCAGTAGTAACTGGTATGGTTGGTGCACCCGCCTGTGGTGATGTAATGAAATTGCAACTTAAAATTAATGCTGACGGCATTATTGAAGATGCAAAATTCAAAACCTATGGTTGCGGTAGCGCAATTGCATCTAGCTCATTAGTAACAGAATGGGTCAAAGGCAAAAGCGTTGATGAAGCAGCGACGATTAAGAATGCAGACATCGCCGAAGAGTTAGCATTGCCGCCGGTTAAAATTCATTGCTCAATTTTGGCTGAAGATGCCATTAAAGCAGCAATTGAAGAGTACAAAAGCAGACAAGCTAAGTAATACCTGGAGTTAAGATGGCAATTTCAATGACCCCCGCTGCGGCTGATCGAGTTAGATCGTTTCTTGCTAATCGCGGGAAAGGCCTCGGCTTGCGCCTTGGGTTGAGAACATCAGGTTGTTCAGGAATGGCATACGTCATTGAGTTCGTTGACGATCTCAATGACGATGATGAACTTTATAATATCGAAGGTGTGAATATCATCATCGATGCAAAAAGCTTCATTTATTTGCAAGGTATTGAACTTGATTTTGTCAAAGAAGGCCTAAACGAAGGTTTTCAGTTCAATAACCCTAACGCAAAGGGTGAGTGTGGTTGTGGTGAAAGTTTCACCGTTTAATCATTGTTCACCTAATTAAGCCGTTTTATATCAAACAGTAAGCATGATATCTGCCCATGAATTATTTCGACCTGTTTAATGTAGTACCTGCCTTTGATATCGACACCGCCTTACTTGCAGAGCGCTATCGCGACCTGCAAAGGGCGGTTCATCCCGATAAATTCGCTAATGATACCGAGCAACAAAAGCTCCTTTCAGTACAGCGTACTGCACAAGTTAATGATGGCTATCAAACGTTAAAGAATCCCTTACGCCGTGCTGAACATATGTTGAGCTTGCGCGGAATTGAATTAAGTCATGAAACCACAACATTGAAAGATGGTGCATTTTTGATGCAGCAAATGGAGTGGCGTGAAGCACTTGAAGACATCAAAGATAGTAGTGAACCACAGTCATCAATTGATGAACTGTATGATTCGTTTGCTGAATTTGAGTCAACATTATTCACTAAGCTAGCGACGCTATTGATTAGTGATGAAAGTTCAGATGCTTTATTAGCGGCAGATCAAATTCGTAAGCTAAAATTTATGGCAAAATTACATGATGAGTTAGCCCGTATTGAAGATGGCTTGCTCGACTAATTGGCCCTAAATTCTAAACCTTATTATTTATGATTAGCTTGGCTAATCGATAACACAACAAGTTGGAACACTATGGCACTGTTGCAAATTGCAGAACCTGGCCAAAGCGCCGCACCGCACCAGCATCGTCTTGCGGTTGGAATTGATCTTGGTACCACCAACTCACTTGTTGCTGCGGTAAGAAGTGCTCAAGCATTAACTTTGCCTGATGAGCAAGGTCGTCATTCATTGCCGTCTGTGGTGCATTATGGCGAAACCAATGTGTTAGTGGGCTATGAAGCTCAAGACAAATCAGCTTTAGAACCACAAAACACCATCGTTTCTGTGAAGCGTTTTATGGGACGTAGCCTCACTGATATTCAGTCTGGTGTACATCGTTTACCCTACGCATTACACGCGAGTGAAAACGGCTTGCCAGTGTTTACTACGCCGATGGGACAAGTTAATCCTATTCAAGTGTCTGCCGAAATTTTAAAACCTTTAATTGCGCGAGCTGAAACCACATTAGGTGGTGAATTAGAAGGTGTGGTGATTACCGTACCTGCGTATTTTGATGATGCACAACGTCAAGGTACCAAAGATGCTGCTGAATTATTGGGTGTTAAAGTATTACGTTTATTGAACGAACCCACTGCTGCAGCCATTGCTTATGGATTAGATTCAAAGCAAGAAGGTGTGATTGCCATTTACGACTTGGGCGGCGGTACTTTCGATATCTCGGTTTTACGATTAAACCGTGGCGTATTTGAAGTGTTAGCCACAGGTGGTGATTCTGCATTGGGTGGTGATGATTTCGATCACTTACTCGTGAGCCATTTACAACAGGCATGGCAGATAACAGAACCAGGCAGTCAATTAGCACGTCAATTACTGATTGAAGCTCGCCGAATTAAAGAAGCGTTGACTGACAATGACAGCGTTGAAGCTTCTGTCGTCATGGCTGAAAAGACATTAACCTGCATTGTCGATAAAAGCTTACTTAACGAGTTAATTGGCGCGTTGGTGAAAAAAACCATCGGCAGTTGTCGTCGTACTTTACGTGATGCTGGCGTGAGTGTGGATGAGGTTATTGAAACCGTCATGGTCGGTGGCTCAACTCGCGTGCCATTGGTGCGTGAACAAGTTGAAACTTTTTTCAAAAAGACACCATTGACATCAATCGATCCTGATCGTGTTGTTGCTATTGGTGCCGCGATTCAAGCAGATATTCTTGTTGGTAATAAGCCTGAATCGGATTTGTTACTATTAGATGTGATTCCATTATCCCTAGGTGTTGAAACCATGGGCGGCCTGGTTGAAAAAGTGGTTACTCGTAATACCACTATTCCCGTTGCTCGCGCACAAGAGTTTACCACGTTTAAAGATGGTCAAACGGCCATGGCATTCCATGTGGTGCAAGGTGAGCGTGAACTCGTTGATGATTGTCGCTCATTGGCCCGTTTTACCTTACACGGTATTCCGCCTCTAGCGGCAGGTGCTGCACATATCCGGGTGACATTCCAAGTGGATGCTGATGGCTTGCTTAGTGTTACCGCGATGGAAAAGTCCACCGGGGTTAAGACATCGATTCAAGTTAAACCGTCATTTGGTTTATCTGATACTGAAATAGCAACCATGTTAAAAGATTCGATGAAGTATGCTAAAGATGACATTACTCGTCGTATGCTGGCTGAACAAAAAGTTGAAGCGGCGCGGGTGATCGAATCGCTTAATGCTGCTTTGGCAAAAGATGCAGCGCTTCTAGATGAGCAAGAACGCGAAGAGTTAGTCGTTGCGATTGCCCAACTTGATTCCGTAGCACAGCAAGATGATATTGATGCCATTGAAAAAGCGATTGCAAATCTCGATGATAAAACCCAAGATTTTGCGTCAAGACGTATGGATAATTCTATTAGAGCGGCGCTAAAAGGGCAGTCGGTCGACAACATATAGGTGAAATGATGCCACAGTTAGTATTTTTACCCCATCAAGAACTTTGTCCAGATGGCGCAGTACTTGAAGCAGAAGTGGGTGAGACCATTTTAAACGTTGCGCTGCGTAACGGTATTCATATTGAACATGCGTGCGAAAAGTCATGTGCTTGTACTACATGCCATGTCATTGTGCGTGAAGGTTTTGAACAGCTTGACGAAAGTGATGAGCTAGAAGACGACATGCTAGATAAAGCATGGGGACTTGAGCCTGAAAGTCGTTTATCTTGCCAAGCTAAAGTGGTGGATTGCGATATGATTATCGATATTCCTAAATACACAGTCAATATGGTCAGCGAAGGTTAGTGTTTGCCGAAGTATTAACGTATCAATAATCCCATTTATAGCGGGTAATTGATCAAAAAAAAAAGAGCCAATCTTGCTAGATTGGCTCTTTTTTTATCTGTGGTCATTCCAGTCATTGATTTTAAATAAACTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048031|1864603:1874451|1866288_1866612_+|WP_011637876.1|DBSCAN-SWA MAISMTPAAADRVRSFLANRGKGLGLRLGLRTSGCSGMAYVIEFVDDLNDDDELYNIEGVNIIIDAKSFIYLQGIELDFVKEGLNEGFQFNNPNAKGECGCGESFTV >NZ_CP048031|1864603:1874451|1867265_1869125_+|WP_162022808.1|DBSCAN-SWA MALLQIAEPGQSAAPHQHRLAVGIDLGTTNSLVAAVRSAQALTLPDEQGRHSLPSVVHYGETNVLVGYEAQDKSALEPQNTIVSVKRFMGRSLTDIQSGVHRLPYALHASENGLPVFTTPMGQVNPIQVSAEILKPLIARAETTLGGELEGVVITVPAYFDDAQRQGTKDAAELLGVKVLRLLNEPTAAAIAYGLDSKQEGVIAIYDLGGGTFDISVLRLNRGVFEVLATGGDSALGGDDFDHLLVSHLQQAWQITEPGSQLARQLLIEARRIKEALTDNDSVEASVVMAEKTLTCIVDKSLLNELIGALVKKTIGSCRRTLRDAGVSVDEVIETVMVGGSTRVPLVREQVETFFKKTPLTSIDPDRVVAIGAAIQADILVGNKPESDLLLLDVIPLSLGVETMGGLVEKVVTRNTTIPVARAQEFTTFKDGQTAMAFHVVQGERELVDDCRSLARFTLHGIPPLAAGAAHIRVTFQVDADGLLSVTAMEKSTGVKTSIQVKPSFGLSDTEIATMLKDSMKYAKDDITRRMLAEQKVEAARVIESLNAALAKDAALLDEQEREELVVAIAQLDSVAQQDDIDAIEKAIANLDDKTQDFASRRMDNSIRAALKGQSVDNI >NZ_CP048031|1864603:1874451|1871922_1874451_+|WP_101088139.1|DBSCAN-SWA MSSVTLTAKAIRRSLLAVAATSVATTGLFSSVAFAADEQKVERIEVTGSRIQRQDMETASPVTIISAEAIRAEGFTSVDQLLQAQTSMAGAALGSSSNNGSDGVAQVDLRGMGSQRTLVLLNGRRMVNSGSGADSSVDLNSIPVSMISRVEILKDGASAVYGSDAIAGVVNIITKKDFEGFQLDLNGSTTSESDGETGELSGLYGFNTDGGNYTIGAAYSKRESVIQSDRSWTEPGASSFLPTGSLGGKVRNDAGEWVARSTGYDYTTSSYYQTPNERYSLFANMIQELDNNLVLTGDVLYTKRKSDQQLAPQPADVMLNVCGAPGVAAGAACITLDQAMTDGEIAADDTGRVNYRRRTTDAGPRIYSQDTDTFRISAALAGELDINTGMNWDIAYTYGKNKADSSVENSINATNLKQSVYANQDAWFTGVPLTGEIVNDISFTDNADGGNEQHVVSAGLNGELFDVSAGAVAFAIGAEYRYESGFYNPDPVTVAGDSTAAQQDATDGDYNVLSVFQEVSVPFTEKLTGEFALRYDDYSTFGKASTWKVGLTYEASDDLMLRTVAATGFRAPSISELFGGDTGSYDYLDDPWGNAQDPQILVRYTSDDDLKAEESDSYTAGLVYSPSYVEGLSLTLDYWRFKVTNAITRLDVQAGLEECFANASAAACETFNIGANGDLSNLTNSLTNVGSQDTSGLDFNLAYNFEALSLDWKISNDTTYLLNFEQEDNDYTNKIDGNFGAYAEVRNNFSIQAGQDSWSVNYFNRYIGEMDDLNTGDKVDSILYHNLAGTYYVTDMITLSAGVKNITDEEPSGVSNGSDGGTVPEVYDTIGRQYYGGVTVKF >NZ_CP048031|1864603:1874451|1870702_1871134_+|WP_041413046.1|DBSCAN-SWA MAIERTFSIIKPDAVAKNHIGAIYNRFESAGLKIIASKMVQLSKEQAEGFYAEHSARPFFGALVSFMTSGPVMVQVLEGENAVLANREIMGATNPAEAARGTLRADYAASIDENAVHGSDAVESAAREIAYFFSADEVCPRTR >NZ_CP048031|1864603:1874451|1865890_1866274_+|WP_011637877.1|DBSCAN-SWA MAYSEKVIDHYENPRNVGSFDKNDPSVVTGMVGAPACGDVMKLQLKINADGIIEDAKFKTYGCGSAIASSSLVTEWVKGKSVDEAATIKNADIAEELALPPVKIHCSILAEDAIKAAIEEYKSRQAK >NZ_CP048031|1864603:1874451|1869641_1870538_+|WP_101088137.1|DBSCAN-SWA MRIAILSQGPQLYSTKRLVEAAVARGHEVKVINPLKCYMNINMTKPSIHMAGKDLGHFDAVIPRIGASVTFYGSAVLRQFEMMGVYAVNGSIGIARSRDKLRSMQLLSRQGIGLPITGFANKPSDIPDLIDMVGGAPLVVKLLEGTQGIGVVLAETRKAAESVLEAFMGLKANIMVQEYIAEAQGADIRCFVLGDKVIAAMKRQAKPGEFRSNLHRGGSATLVKLTPEERSVALRAAKTMGLNIAGVDLLRSNHGPVVMEVNSSPGLEGIEKATQKDVADAIIGFMEKNANKSIKSAQ >NZ_CP048031|1864603:1874451|1869133_1869469_+|WP_101088135.1|DBSCAN-SWA MPQLVFLPHQELCPDGAVLEAEVGETILNVALRNGIHIEHACEKSCACTTCHVIVREGFEQLDESDELEDDMLDKAWGLEPESRLSCQAKVVDCDMIIDIPKYTVNMVSEG >NZ_CP048031|1864603:1874451|1866668_1867193_+|WP_101088130.1|DBSCAN-SWA MNYFDLFNVVPAFDIDTALLAERYRDLQRAVHPDKFANDTEQQKLLSVQRTAQVNDGYQTLKNPLRRAEHMLSLRGIELSHETTTLKDGAFLMQQMEWREALEDIKDSSEPQSSIDELYDSFAEFESTLFTKLATLLISDESSDALLAADQIRKLKFMAKLHDELARIEDGLLD >NZ_CP048031|1864603:1874451|1864603_1865818_+|WP_101088128.1|DBSCAN-SWA MKLPIYLDYAATTPVDPRVAEKMMQHMTMDGVFGNPASRSHRYGWQAEEAVDVARNQVADLINADHREIVFTSGATESSNLAIKGIAHFYHKKGKHIITSKTEHKATLDTCRQLEREGYEVTYLVPDANGIIPMERLEAAMRDDTILVSIMHVNNEIGVIHDINAIGELCRSKGIFFHMDAAQSAGKIPIDVQTTKVDLISISGHKMYGPKGIGALYVRRKPRIRLESQMHGGGHERGMRSGTLATHQIVGLGEAAVVAKQDMAADSARITHLRDKLWNGIKHIEETYINGDMEQRYSGIFNVSFNFVEGESLMMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGLNDEMAHSSIRFSIGRFTTDEEIDHAIKTITESIDKLREMSPLWEMFKDGIDLEQVQWAHH |
9 | Faustovirus(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1994930 : 2036380
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP048031|1994930:2036380|DBSCAN-SWA 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54 | Vibrio_phage(42.86%) | terminase,protease,portal,integrase | attL 1992550:1992565|attR 2024554:2024569 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2157578 : 2166534
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP048031|2157578:2166534|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP048031|2157578:2166534|2165874_2166534_-|WP_101087639.1|DBSCAN-SWA MNQQSVISPSLSTTDVNKMLKNTYMLLAMTLAFSAVTAGLAMAINIGPMMSIGLSLGSLVLLFVTLKKADSAAAIFWVFAFTGMQGASLGYILNHYAGMANGPGLIMQALGLTSIIFVSLSAYALTTKKDFSFMRGFLFAGLLVMIGAMVINIFVGSSILFMAMNAGIALLMTGFILYDTSRIVNGGETNYVRATISLYLDFLNLFISLLHLMGIGNDD >NZ_CP048031|2157578:2166534|2165419_2165809_-|WP_162022965.1|DBSCAN-SWA MSKFIIQVNGSVYGSTASFRALSFCQSALANGHQIINVFFYQDGVTNSNALTCPASDEIDMHSNWQSLSSQHSIPLTNCVSAALRRGVLSPQDATENGKPQWNSSDAFTMGGLGELVVGIEQADRLISF >NZ_CP048031|2157578:2166534|2164406_2164745_-|WP_101087635.1|DBSCAN-SWA MVNFFEFNGQQIETDHQGYLKNVNDWQEPMAIAIAATENIELTEQHWEVIRFVRDFYLEYKTSPAIRVLVKAIGQRLGADKGNSKYLYTLFPIGPAKQATKIAGLPKPAKCL >NZ_CP048031|2157578:2166534|2162608_2163895_+|WP_101087634.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDPKFLRNELEITAERLATRGFILDVDNLTKLEEKRKSLQVATEDLQASRNAISKSIGQAKARGEDTSSIMAQVGDLGAQLDAKKAELAELLQQINSIAMSMPNLPDESAPVGADENDNVEVRRWGTPKVFDFEVKDHLDLGEALGGLDFKSAVKITGSRFIIMRGQIARLNRALGQFMLDLHTTEHGYTETYVPLLVNEDSLLGTGQLPKFGEDLFHTKPATEEGQGLSLIPTAEVPLTNYVRDMIVDESELPMKMTALTSCFRSEAGSYGRDTRGLIRQHQFDKVELVQIAHPDNSMQALEEITANAEKVLQLLNLPYRTMVLCTGDMGFGSSKTFDIEVWLPAQNTYREISSCSNMKDFQARRMQARYRSKVDNKPALLHTLNGSGLAVGRTLVAVLENYQNQDGTITVPEVLRPYMGGLSLIG >NZ_CP048031|2157578:2166534|2160891_2162223_+|WP_162022962.1|DBSCAN-SWA MANLGFDFAPDFRPLAARMRPREISEYIGQAHLLGEGKPLRKALEANRAHSMLLWGPPGTGKTTLAELIAHYANAHVERISAVTSGVKDIRAAIEQAKAIAQSRGQRTLLFVDEVHRFNKSQQDAFLPFIEDGTVIFIGATTENPSFEINNALLSRARVYLINRLSSDEINLIVTQALADVERGLGKRQLTLPADVAKQLADISDGDARKALNLLELMSDLVADAGAFTTEMLTQVAGHQAAGYDKNGDQFYDLISAVHKSVRGSAPDAALYWYCRILEGGGDALYVARRLLAIASEDIGNADPVAMTVALNAWDCYHRIGPAEGERAIAQAVLYLASAPKSNAVYSAFGAARELAKQTGHEPVPNHLRNAPTKLMKDIGFGKEYRYAHNEPGAYAAGENYFPESLQHSQFYQPTNRGFEKRIQDKLAQLNQLDQQSEDKRYD >NZ_CP048031|2157578:2166534|2160238_2160883_+|WP_162024330.1|DBSCAN-SWA MNKRITVLSLLLATSLSSVAATADDATELRAKLSNIDSLHATFTQQVTDINSKPIQTGSGVFALAYPNQFYWHLTQPDESLIVADGANLWIYNPFAEEVTVMDVAQAVDASPMALLVHRDEATWAKYSVIKRAVSGKSSCFDIQPKKLNSNVVAVSVCFEASQLVKFNLTDEQGNLSQFALTQQRKVKDNETNIFKFAVPDNVDIDDQRLKQTN >NZ_CP048031|2157578:2166534|2165043_2165400_-|WP_162022964.1|DBSCAN-SWA MKSLAIMFRHAPLGTTSTREGLDFAMLSASFEQQVSIIFTNEAVLHLLAGQTPEQAGSKDYVSAFKALSLYDIDTVLVCAESMLTLGLQPNDLSIAATMATPEVISQTLQAADEVLVF >NZ_CP048031|2157578:2166534|2164738_2165047_-|WP_162022963.1|DBSCAN-SWA MILHHIQTSVMTDDALSTCLRYIHPTDSILLSSDAVNCLLQTQWQQRLANIALFVLQDDVVARGLSDRLMIILANKAAGSFDIIDYSQFVEQSLLHDKVITW >NZ_CP048031|2157578:2166534|2162215_2162590_+|WP_101087633.1|DBSCAN-SWA MTNVFLVALGGSIGAVLRYLLSIFMIQVFGSSFPFGTLLVNLLGSFLMGVVYALGQLSHISPEIKALIGIGLLGALTTFSTFSNETLLLLQEGLWQKAILNVLLNVTLCLFMVYLGQQLIFSRV >NZ_CP048031|2157578:2166534|2157578_2160236_+|WP_162022961.1|DBSCAN-SWA MTQENSLKTLSGLQRLLEGGLILCCMVATYILLALSSFNPSDPGWSQSHFQGEIHNWTGAVGAWTADVLFYFFGFIAFLIPMIIATTGWFIFNRAHRVFEIDYFSVGLRIIGFILMLLALAALVSMNAENMFVFSAGGVAGDVIGQAMLPYFNKLGTTLLLMCFIGAGFTLATGVSWLTIIELTGLGSIWLAKKIWTLPRLFKRERETEDTKGFMSLVDKFTQRRNEIDLQNEPSLDKPSKSAVKVPIHIKPAIETPPIVEKKRSFFSRKAKPAEDINVSDNDDDEFDIDDRQEPSMQLDNDDTSFAPWVATKDDVDFDIDDDNDDGVNDSPAINNLDIADEPFEEAFNKPHSTGALVAQQKPKKDVRIVDGVVVIDGQTPQQARQKMDPLPSITLLDVPDRKKNPISEAELQQVARLVETKLADFNIIANVVGVYPGPVITRFELELAPGVKASKITNLSKDLARSLLSENVRVVEVIPGKAYVGLELPNKFRETVFMRDVLDSAAFKDSKSTLSMVLGQDIAGEPVVVDLGKMPHLLVAGTTGSGKSVGVNAMITSLLYKSGPDDVRFIMIDPKMLELSVYEGIPHLLCEVVTDMKEAANALRWCVGEMERRYKLMSALGVRNLKGYNFKIKEAAAKGEYIPDPLWKSSESMLDDAPPLEKLPSIVVVVDEFADMIMIVGKKVEELIARIAQKARAAGIHLILATQRPSVDVITGLIKANIPTRIAFQVSSRIDSRTILDQQGAETLLGMGDMLYLPPGTGLPNRVHGAFIDDHEVHKVVADWCARGKPQYIEEILNGATDGEQVLLPGETSDSEEELDALYDDAVAFVTETRRGSISSVQRKFKIGYNRAARIIEMMESQGIVTAQGHNGNREVLAPPPPRN |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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