Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP048054 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP048053 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
NZ_CP048055 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP048052 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B chromosome, complete genome | 3 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,csa3 | 0 | 2 | 35 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1811 : 57111
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048054|1811:57111|DBSCAN-SWA 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57 | unidentified_phage(32.14%) | tail,capsid,transposase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
12001 : 56981
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048053|12001:56981|DBSCAN-SWA 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MGPEVTQQRRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS |
41 | Streptococcus_phage(33.33%) | portal,integrase,transposase,terminase | attL 39204:39263|attR 61490:62055 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
60496 : 171823
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048053|60496:171823|DBSCAN-SWA TGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCCATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGATAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGATTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGGATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCCTAAAGATAATAAAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAAATCAAAGGATAACAACTAGACGACAAAACACAATCAGTATATTATCTTAATATATTAACTTATTATACTTATATGGATACGGAAAAATGGGCCTCAGCAAACAAGCAAAAATTTTAAGCGAGCGCCAAAAAAAATAATTTTAAGTCTTATACAGCCATGTTACCGCGCCCTCCGTCATCTAAAATTCTACAGTTCATTTAAACTTTCCTGAACCGAATCATGTTCTTCTAAAATTAAAGGTTGTACAAACTCTCTCTGGAACAAATTTGGAGGGTGTTGAAGAGATTCTTCTTGAGATGATTGCCTCTCTGATAAAGTATCGGATAATATAGCAGTAATATCGCGCTTTAAATCTTCAAATAAACTTCCAACTGTCTCTGTTGTTTTACGCTCAATTTTTTCATCAAAATATTCACTAATGCACAAATTAGTTTTTTCAATAAATGCTTTACTTAATAAGTTTTCACTATCTTCATTATCTGCAATGAATTGATAAAGATGACGTTGCAAAGATTTTAACTGTCCCAAGCTATTTATCCTACCATTAGTGTCTGCAAAGCAACCTCTTTTATTCTCTATCTTGTCAGATAATTCATTGATTGCTACTTGTATCCTTTGAGTTATTTTAATAATTAAATCTATATTTTTTGACTTTCTAGGTAAAATTAATTCTTTAACTGGCATCCTGCTTACTTTAAGTAACAAACCTTCATCTGTTGATGAAATCCCATCACGATCTACAGCAATAGGTTGTGTTTTTACCTTTTCATTCAATGAAATACTGATTTTTTCCATATCGAACCCGAATTTTTCACACCTCCCTGTTAAGGAGAGCACGTAAGAGTAAGAAGCATTCTGTACATCTATAATTGTGAACTCAATCTTATCTCCTAACTTTTTCAGAAGATTACTCAACCATCTTGAAAATTGTTCGCTACCAGCAAAAGAACCACTTGCATGAAACAACCCATAACCTTGTTCTGACTGGGCAACAATCGCTGCACATCCTCCTAAAGCAGATCCATACGTAGCTCTTGAAGTTGCACCTGTTACCAATACATCATCACTATAGCTTGGTACAACAACTCCTGAATCCATAGCAATAGATTTAGTGATAGGCATGACATCTCCTGTTTAATACATTTTACAAAACATATTATTGTAAATGTCGCACATAGAGATATATATTATTTTTAATTATTTGTTTTAAACAATTAAAGGTGGTGAAAATTGTTCACGCTTAGTGAATATAATATTCTGAATTTTTAATCATAATATGAAAGGTAAATTTTAGGGAGGGTTACCACAGTGTGAGCAGTAGGTAACCCGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCGATATGCCCATAGATGGCAACCAAACTCTCAATGGCTGGACTCAGACGATAACAATAAAAGACACCTATGAAGATAACGCTTGAGGTTGTGCGTGCACCCTTAATTGACTGTGGTGGAGAAAGCGGGCGGAGAGGAAGGGGGTAAAGCCAAGCTTTCTAACAGTTTAAACGCAGGATTGAAGTCGCCTTTAAGCATGCCTTTATTGCTGAAAAAAATTGTTAACTCAATAAAATCAACAACTAATGAATTTATCCTAGCATCAATGGCTTGATTTTGAGTGTTAAATCTGGCATCTTTCACCATTGACCAACGAAAATAGCCTGAAGAGACGACAGGCATGCAAAGGTCTGCATCTTAATAAGATGCCAACTTTAAGTAGCTGACTTTAGGAAAATTATCAGAATGTACATTAATCCGCAAGAGTTTTATTCCTCATTTAAACCAGACATCATTGCCAAGGGCAAGATTATTCTTAACAATGCTGGCGTTAAAATTAATGAAACGGATCGTTACGGCATCTCAGCAGTGATTGGTGAAAAAAAACAATATAACATATTCATTGGTAATGAAGCACAACCATTTTCTACTGAAAAAATCCTATTCTC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102 | Streptococcus_phage(50.0%) | portal,transposase,integrase | attL 80095:80154|attR 148441:150176 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
186969 : 191899
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP048053|186969:191899|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP048053|186969:191899|190404_191139_-|WP_036771649.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRHQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRIVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAASF >NZ_CP048053|186969:191899|189537_189894_+|WP_157894751.1|DBSCAN-SWA MKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQDFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVAIAMAVGRLIAGEDHNSIYNERELLIL >NZ_CP048053|186969:191899|187924_188521_+|WP_162038697.1|DBSCAN-SWA MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYAGDPGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKGEWYGKKITLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALASRIGIYKNNMHYPRIYRIISLNRYRAIARHKMA >NZ_CP048053|186969:191899|186969_187353_+|WP_027242929.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPVTEVDHIKPHDGDHDLMWNQRNWQALCKPCHSRKTVNDDGGFGRKRSPQGRGI >NZ_CP048053|186969:191899|187439_187922_+|WP_075278733.1|terminase|DBSCAN-SWA MSRMRGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDGVAICPGYFDEIAKGAFDSAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSAVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSSAIESEIDKILD >NZ_CP048053|186969:191899|189980_190367_+|WP_087910668.1|portal|DBSCAN-SWA MSASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETDGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTSVRRDEKTKKLIYRHCCEKL >NZ_CP048053|186969:191899|191185_191899_-|WP_048876202.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTALLQKI |
7 | Streptococcus_phage(42.86%) | portal,transposase,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
25559 : 41581
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048055|25559:41581|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048055|25559:41581|28483_29458_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP048055|25559:41581|29838_30420_+|WP_027242946.1|DBSCAN-SWA MPTQKHMEKITNLIDDLQKRITKLDGQIEAEAKSSFISSGLLEREKSKGSRPVEYYHNVREFSRKLLPKIASWARKALLLCECKNFLEEMTKDDSKALEHATHLNETYLRHSNLAVFEARFRSMTKSLCSKTYKILKSIAKENQQSAVAATNWGGGAYAVADIVNRHQSSGLTSVEEGLQVVELPQTQPAMQG >NZ_CP048055|25559:41581|28194_28410_-|WP_144420855.1|head,tail|DBSCAN-SWA MTEGESHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP048055|25559:41581|25972_26530_-|WP_027242944.1|tail|DBSCAN-SWA 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MFKTLKRSVLVCVIPVLSSSLLITSAYATCYVDYKNSSENTWNITLKNLEGDTAHIYCPNKTLGYKESCTFPVNPGDSVSVGFSHTAGMIKAYISFSSTINGHSESLNDLLVEAIDDHCPEIYYNDSVPYGITLNKPSIGNVIFAPYSENESTLNKFSKINFEADTNKKFS >NZ_CP048055|25559:41581|32126_32609_-|WP_027242949.1|terminase|DBSCAN-SWA MSRAKGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDRVAICPDYFDEIAKGAFESAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSTVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKTSLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDKILD >NZ_CP048055|25559:41581|40136_40493_-|WP_075278739.1|transposase|DBSCAN-SWA MHLRGYGWITVFRFVAKNGRMDYIGTNIEEPSRDQVEVIVKARWSIEVYHRELKQTCGIERCQARTGRAQRNHISLSIAAWVDKYKRKLNEKISLYQQDGDVIKVGISCSIQKILAAT >NZ_CP048055|25559:41581|40606_41581_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP048055|25559:41581|32695_33079_-|WP_027242950.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLKDDKLIPAIEVDHIKPHDGDYELMWNQHNWQALCKPCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGV >NZ_CP048055|25559:41581|34783_35758_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP048055|25559:41581|30455_30848_-|WP_075275490.1|capsid|DBSCAN-SWA MLDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAATGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA >NZ_CP048055|25559:41581|36594_36960_-|WP_027242954.1|DBSCAN-SWA MLADWGDYIQRGAEHGSSNSIFGMIQKYGGVVIQNNNSGNDPYIANSDALEVDRIVNELLHSDCKSDQTMARILVIHYGITGSAAKKQAIYHISSPTYDSYLGKGVSYVRGCLNALMCKPA >NZ_CP048055|25559:41581|39480_40071_+|WP_016212329.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLNKQAKILSERQEKTVLSSLQSTTYPTRNTAMFLLSIKAGLRAKEIAALTWEMLLTPESELCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQVLSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP048055|25559:41581|25559_25976_-|WP_027242943.1|DBSCAN-SWA MKKTIHGTGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLVNGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVIHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYANT >NZ_CP048055|25559:41581|36195_36450_-|WP_027242953.1|DBSCAN-SWA MNNKHKKTLREIYTDPIKVNIVWSDVEKMLIAAGATIEERSGSAIAIFLGDEYLGIHRPHPERTAQRYVVKKVRELLKRNGIHA >NZ_CP048055|25559:41581|31938_32124_-|WP_027242948.1|DBSCAN-SWA MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKAPSVI >NZ_CP048055|25559:41581|38989_39250_-|WP_027242955.1|DBSCAN-SWA MNNKHRKTLRDIFHNPIKASIVWADIEKLLLALGAEVIERDGSRVAVILNQVKTTFHRPHPEKTTDKGAVKSIRLFLKNAGVDKNA >NZ_CP048055|25559:41581|30944_31919_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP048055|25559:41581|33291_34158_-|WP_027242951.1|DBSCAN-SWA MPKYDQMIQKEIEQSSRRLYKDVDALRSGNTPVEMIPVAHHTVEYSNHKAKLSALSSRMPQSEAERTRDIHDFIAHSSARAALSGLARCEESLTSFMKVHIQSEAAELLPYMTVIFFNVQDPKVPENKNNHCFLMLSANDPSAQLQGFDFKTQVARVNQARQELLSVFERNPGDNYLVDPYLVECVSLKKALKGNNAEFMDAYDERSYLGLASADLGTVDSRDIDIHLITKKERELVTEFKQGNPDFVLNNSIHHTAGPWKDRFQFPFLSAHEEPEPEGEEAALYYCG >NZ_CP048055|25559:41581|38643_38997_-|WP_016211078.1|DBSCAN-SWA MLKYKGYIGKVEEIHEGDEYIYGIVPNIKDVISFRGKNIKELTKDFKLAIDDYLALCDEREEEPDKPFSGRFMTRLGSDLHEEVFLASMNDSGAKSMNDWVVSACLEKLKHDQTVKR |
22 | unidentified_phage(35.71%) | capsid,integrase,tail,terminase,transposase,head | attL 20055:20114|attR 42192:42483 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048052_1 | 1098675-1098770 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048052_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP048052_1
>1.1|1098699|48|NZ_CP048052|CRISPRCasFinder ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048052_1
The CRISPR arrays of NZ_CP048052_1 >merge|NZ_CP048052|1|1098675-1098770|CRISPRCasFinder CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAGATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTCCAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG >NZ_CP048052|1|1|1098675-1098770|CRISPRCasFinder CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC CAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG
>NZ_CP048052.1|WP_017378009.1|1096269_1098015_-|hypothetical-protein MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP >NZ_CP048052.1|WP_036771696.1|1094394_1095855_-|hypothetical-protein MIKVIKENEGAIVTKGQETILLTGSIYDGSNLGKSPAIIALSELGSGLFCAKATLQSENSCLSWLQELKETLGNEITFHLTGKQSKEDLAELQILCQQAEIEAQFPIPEKQPLLYSLATGVNANGIIEKEDLYEKTGGFSFSLTLTKEIEQAISELEKKIKDSWFTINTKGRTDSIILLKELKQNLEQLGESYIGPVNSESDLKFPKSLKEAIKDYSGSEAKNGRQQTTTVGGLLKTLDFHFTRYTVLTTKFTQVPVLTATWHTSEPSADTDSASATPMPDINESKSTPPPPPPAELKAGAKARREEEAAVTVLTNAMEFADDNAEDLPPPPPPSNPDLQQPLPDFNDSDFPPPPPPPPPSDEEQMPLADFDDIELPPPPPMDFETGPETQVSPIEEVNSGATPTDGTGPDTTEKKDSANITAEMQSIMARRGAIGGPDSETEAGEDDSWSDQEDNSGPNQSPSTLFQRQQSQSQEADNSNPLQYN >NZ_CP048052.1|WP_053093668.1|1093612_1094212_-|hypothetical-protein MRIITKPTTAKCNIQAYIRYLLSEPVRTSCTGLSDVLLNISHDSVNRFLLRENYRPEDLWTEVSEKIDLNNGVLSVDDMVIDKPYSNAEKTDLIGFFYSGKHHCVVKGVNVITLYYTDQHDVSVPINFRIIDPDEGKTKNEHFREMLQQVLSWGLQPSWVTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP048052.1|WP_144420647.1|1093277_1093475_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVSEDIIRLFSIANSMPRLYFLINFRFSMLEYQQSPAASHGVLSTG >NZ_CP048052.1|WP_155046604.1|1092936_1093077_-|hypothetical-protein MLSTPWLAAGAVAVRFKQSIVGMKVVYKSNGTTLRARSEQKRTLAQ >NZ_CP048052.1|WP_048875964.1|1092089_1092869_-|hypothetical-protein MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ >NZ_CP048052.1|WP_017376708.1|1091123_1091525_-|transposase MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP048052.1|WP_036773793.1|1090601_1090979_-|hypothetical-protein MLSTPWLAAIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP048052.1|WP_027242834.1|1088834_1090142_+|hypothetical-protein MKFIYPGINAPLDTEKSLYAETTQGYFSHKESGKALDFNFIKKQESYFSQWDKRTAFTCEEYKALTHQQRLQLYRLHTTRWNYTLSLLLKDPGAGPDSPLYAEKQFLQNLNENEEMRKLYAGWFIDYVESREGETSKAVEALFKKEMQLKPECDLSKEKQIAVKVRGFRDEITELQAWLMNGSSAERIAIEKYDTKAVNQFIKYQLGQVSKSEFNKTFERAQSKCNKVLKNALHLTTSAASILTEKKIDLNSSVEWERLKNSQHLQKAVLILHKSNINLADSWDTLKDNSHLQKAVLTLHHESSINLTEHWDKVKNNSPLQKALAASYDYLNAERSSWSKMHHNHGIRQTHKFIRHLMASENQTLSGIQAEMQQWLHGYGHFSRASGSASNSRMSFALQSGLCPQADTPPTLLFNTSLQATEVEQEVTNQVTLSS >NZ_CP048052.1|WP_146619530.1|1087828_1088086_+|hypothetical-protein MFRQKCSHSYRYYAVAMPKINMLTDFTDGDFERIHKAHWNIERFHRATKQLCSIEKFQVRTTECIKNHIFRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP048052.1|WP_017378007.1|1099828_1101772_-|hypothetical-protein MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS >NZ_CP048052.1|WP_048875961.1|1101917_1103321_-|IS4-family-transposase MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP048052.1|WP_017378006.1|1103440_1104070_-|response-regulator MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD >NZ_CP048052.1|WP_017378005.1|1104308_1105028_-|sulfate-transporter-CysZ MSGFHYFLNGLNFILTPKMRRYLYLPILLNIILLLVLSYLGVHGIEVITNHVSTSLPHGLHFLRPIATIILSLALITLLVFSFTTLASIIGAPFYSLLCEAVLQKKDHQLPQDNITALIKDMPRLIGRELIKLRYFIIRVMILMILLFIPGINLIVSLLWFIFNCWMQAIQYIDYPMDVLKHPFKQTLKATRQTPLTAMSFGLVCFVCTLIPLLNLIAIPAAVAGGTLLWSERIQPLLK >NZ_CP048052.1|WP_017378004.1|1105141_1108681_+|chromosome-segregation-protein-SMC MRLKKIKLAGFKSFVDPMTVELPSQLAAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVMGESSAKNLRGESITDVIFSGSSARKPVSQATIELIFDNSQGKLVGPYVSYSEISIKRIVNREAQSSYFLNGTKCRKRDIADVFLGTGLGPRSYSIIEQGMISRVIEAKPEELRVHLEEAAGISKYKERRKETERRIRHTRENLERLGDIREELGKQLSRLHQQAQAAEKYQNFKKEEREVKGQLYIQRWKSLQTQHGQEQKKIQEHEVIVEKQRAGQQHIDASLEKERLALSEASEKLHACQADYYQAGNEVSRLEQQIEHATTRIRETGQEMARLNTSLEKARSELAADEQQKVLLSAQEEALEPETELLQNAVDEAALSAEEAEVSYRQLEKERESLLQQVALCRQEAEVEQTRIRHMEEQGQRLQQRLERLRAETHNSDLISLEVGLEDVQGQQRELEEKEQELQLGAEEQQQRLIQQRQLIEQQRKGLEQQRGELHPLKGRLASLEALQQAALFDVNADSASSVKTWLETQGLIASKQLAQSLRVQEGWETAVETVLGDNLQALYTPGYQVNACVAELEMSLICIDQPLALNVNTQVAQGHENQAGILKLTDVIEPGESLPSQLQHVYLAEDLLAALRIRSELKSYESVVTVDGLWLGVNWLKVTKRDDSQSGVIAREKELMTLRQQELALEESICLHEEQLSQSQEVLMQVEAQVKSVQQQAQALQRELAEVKARVSGRLAHIEQVRARLAVVEHELSEALELFNEEQEEIKIARQRLEIAVEKMAELELQRQALESGRVEASRTTQEARQQLESLKSQYQQKQMQLQRVQSEQAGIKAALQRLEELLGRDKVRLVELEQSRIGLEEPLEEQRMLLDEQLERQLSFEDRLKTVKDQAQAHENQVRTFEKQLHEQMNQVAHAREALEQGRMQAQELFIRRQSVEEQLVEAGFQLRGLLEIYQEGCDVKELETALEDIGRRIQRLGVINLAAIDEYAGQSERKVYLDAQHDDLTEALDMLEAAIRKIDKETRTRFKETFDEVNGHFKLLFPKLFGGGSATLELIGEDLLEAGVALMAHPPGKRNSTIHLLSGGEKALTAAALVFAIFQLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSESVQFIFISHNKIAMEMADQLVGVTMREPGVSRLVAVDIEKALEMAEE >NZ_CP048052.1|WP_017378003.1|1108747_1109578_+|hypothetical-protein METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG >NZ_CP048052.1|WP_036773465.1|1109564_1111604_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA MSPAKLKRELVSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN >NZ_CP048052.1|WP_027243145.1|1111619_1112675_+|protease-SohB MITQLLADYGLFLIKTATLVAAILIVFSGLLALAMKNRLAKQKGSLEVEKLNDHYDDLKETIEIEVLDKKELKALEKERRKEEKQERKDKKKNKSKETETDDEDAASAARIFVLDFDGDIEASAVHALREEVDALLTFINEKDEVVVRLESPGGMVSPYGLAASQLARFRSKGVKLTIAVDQVAASGGYLMACVADRVIAAPFAVLGSIGVVFQMPNFHRVLKKHDVEYEQLTAGDYKRTLTMFGKNTKEGREKLQEELEDIHYLFKNFVGEYRPQLDIDKVATGEHWFGQRALELNLVDELITSDDYLLSRADEHDIYSVNYMEKQTLADRLGIMARALLGKLATAGVKR >NZ_CP048052.1|WP_017377998.1|1112685_1113216_+|hypothetical-protein MQRKAIVLLSGGGYSSLCLYLARSQGYLPYALSLDIPKRHFQLDSAQQFARDVGVAEHQVIAMNENSLSDSKALTYYSSLLSFAVNWAQELSAQDIFIGLHPSAEHTLEYMVEWLQSYQELINLSSTTAIRIQTPLLFMSDKKREQTAEQFNLKLPEPVSKLKSKKKKFIQRIFSE >NZ_CP048052.1|WP_075275277.1|1114715_1114955_-|hypothetical-protein MANRDNIPRSVVEVVVKMLSCRTKFAGHDEYSCSNSGCKHTKVVTYTCKSRLCSSCGKKPLSNGLLHRISYSQSANTST |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048052_2 | 1336860-1337277 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048052_2
|
6 spacers
spacers of NZ_CP048052_2
>2.1|1336881|53|NZ_CP048052|CRT TTACCTGGGACTGATACTGCAATTTCTACCTTCTACTTTGAGGTCTGCTTCAA >2.2|1336955|58|NZ_CP048052|CRT GCTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAGTTCAAGGTTCTACTTTTGAGGTTCTGCTTCTCAA >2.3|1337034|45|NZ_CP048052|CRT GCTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAAAGGTTCTACTTGAGGGCTTCT >2.4|1337100|52|NZ_CP048052|CRT CTAGGATGAGAGGATTCTGCTTCTCAAGGTTCTTTTGAGGTTCTGCTTCTCA >2.5|1337173|39|NZ_CP048052|CRT GCTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAGGATTCTACTTCTCAA >2.6|1337233|24|NZ_CP048052|CRT ACTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048052_2
The CRISPR arrays of NZ_CP048052_2 >merge|NZ_CP048052|2|1336860-1337277|CRT GGTTCTAAGCTTATAGATTCTTTACCTGGGACTGATACTGCAATTTCTACCTTCTACTTTGAGGTCTGCTTCAAGGTTCTACTTTTGAGGGTTCTGCTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAGTTCAAGGTTCTACTTTTGAGGTTCTGCTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAGGGTTCTGCTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAAAGGTTCTACTTGAGGGCTTCTGGTTCTACTTTTGAAAGGTCTCTAGGATGAGAGGATTCTGCTTCTCAAGGTTCTTTTGAGGTTCTGCTTCTCAGGTTCTACTTTTGAGGGTTCTGCTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAGGATTCTACTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAGGATTCTACTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAGGATTCTACTGCTCAGGACTCT >NZ_CP048052|2|1|1336860-1337277|CRT GGTTCTAAGCTTATAGATTCT TTACCTGGGACTGATACTGCAATTTCTACCTTCTACTTTGAGGTCTGCTTCAA GGTTCTACTTTTGAGGGTTCT GCTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAGTTCAAGGTTCTACTTTTGAGGTTCTGCTTCTCAA GGTTCTACTTTTGAGGGTTCT GCTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAAAGGTTCTACTTGAGGGCTTCT GGTTCTACTTTTGAAAGGTCT CTAGGATGAGAGGATTCTGCTTCTCAAGGTTCTTTTGAGGTTCTGCTTCTCA GGTTCTACTTTTGAGGGTTCT GCTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAGGATTCTACTTCTCAA GGTTCTACTTTTGAGGATTCT ACTTCTCAAGGTTCTACTTTTGAG GATTCTACTGCTCAGGACTCT
>NZ_CP048052.1|WP_017378249.1|1334823_1336563_+|hypothetical-protein MKFIKLKQKFILVLQLVDGLSGRGATKHQGKARSTEDKKDLVSEVEKILSVGFLEGLSAVVTDSGRSKQAEVLTRTRENIASLLEDSEVKEKLGLLTTAKIAHFEVVYKYLLGEEGEELDALVQALFAQKSTNSQEIDFCRYEAVEGLNSHFELKANIRPRKEFFVKFYHEMKRANSEISDAKETIEEINKKKSAADSSARRKTNLVTSQSDVLTSIATLYIQGDRERGLKSHSESYFNKIFGPYLEFNGGSPVIAPGYSLVDGNSDFEQILAGIVDNCQRKRTFWARVWGKLQAGKISALLLEAADKDCSKTALKINSGNVRAREAFSSNWIGNKPSECQAEAKALLDEFNRDKHLLKILPKTIEAGEAKKAKLLDDFARKVADYGKELKSAFNAIRSFRLLVQKAEKKGAAVGGLDSQVKDAEGGEKPQQATFLQKELQLTGERKVDGAIIVKHIEGIADNEQLLSLYDKLKEKEYLIKGNLLRIFSHFRTTMSGEAVKCSETWHTIEAAFTNRVRSNHQAMDGSEQGWTQLVTNYPFLRNHMQAQIVAASDVLLFRPALEQSTEVSPEELSCMAHL >NZ_CP048052.1|WP_017378250.1|1334012_1334246_+|hypothetical-protein MKKSFVIILVIIALFSCFMVSFIAGGANGFLKIFSSLLSLLEWGILGFIIFVTGLFVIFGSIVVCAAVWDELFKKKK >NZ_CP048052.1|WP_144420661.1|1333192_1333780_-|hypothetical-protein MIKIKKLPCILTLMPLLLSSLSSCSIYPVDLGTDATYKSPVTASALPFPIQVAPIKFTKAGLYKHYRFYSTERFPATLRLTVQSMLTQANLGSPLNNNTHLKKASTLKIKLYPITINDSSKNTVVGTFSFSATLENNQQTLWNKKLSATITGSSLDNLFKQAAQEIAYAINYTLTQECRFNINTVQCNGERFKIT >NZ_CP048052.1|WP_017378252.1|1332260_1333226_+|phosphatase-PAP2-family-protein MEVTGDKAATCKRNNVLITFISYLNKNFSYLDKATILLSTILILLSFLFSYINCKYTHYLSSVTPPLFIGSILIILAIMLTLLALPLCQALPKISLVFKLIGLYLIAWVAMLLAYNMQFTPFDPLDDYLYHIDLALGFDLGLWMQWLHQHPYIQQSLLYIYDSLEYQAFILPIIACFLVNQQDIELFLAKFAFLNLIGCLIYYFWPTASPASVVNSPYFTQGQLDIVLQFKQLHEGIQPSVIGAGLISFPSFHVIWSALFTCLFKKKRYLFWPLLTLNIILWFSTVLLGWHYIFDVIAGLILVLLAIVIFDYVILNRSPLH >NZ_CP048052.1|WP_017378253.1|1331859_1332270_+|hypothetical-protein MFKKIVSSFKSAASYSFLKESFSFIFSTSKKILTVSPDNKNGEKTQINELEISNHEIKKAKSVFRFLMWVYFLFFIIIFTYTLVNIVNHSLMTAIIGIAASLACLSLAFKYHFWLTQIKVGQLGITLKEWYESLWK >NZ_CP048052.1|WP_017378254.1|1331517_1331853_+|hypothetical-protein MDYNSTFTKVMRLYVGHRFFWKGDEISHEDVLSLSGNIIETLLRKVNLTYSFLFDSKISYSRKRLEGQSQESIHINSDKETAFILLLIVIDIMEEAVIKSGDDVYLDNYIK >NZ_CP048052.1|WP_129556634.1|1330974_1331517_+|hypothetical-protein MLISILINVALLAAFIVSLSSRPEPKYFATTSNGQLIKLHSLSFPVMNDSAVISWLSDIVPNINSLDFLNYRTQIREKRKYFTSYGWEQYLKAFQPIVEKIRDNKYVARAVVSDVPVVIQKGNIDGVYSWRLQVPMIITYQQGASRDTQNVIWTVLIQRSNEHADSLFGIAQIIQKGDET >NZ_CP048052.1|WP_017378256.1|1329921_1330671_+|hypothetical-protein MPKPGDSDNNPLGQQPEEFEMVDGQPVPIPASGAQAGDDGSELEDLPAQDQAEAAAEKEREEREKEEKKKRLTEMRDALGKTHEDMGKQPERARSISKQHRDAGNDLTQRMEKLSEIDPKNVTDEEKADFLRELRALGEEANRLAMSDKEKVPLRAGFLGTFISLIQKFVAWNREDNVDFQLEAIKDQAEALKQKFDSELSEYNTAGADGPKPGGTGPRCADDEEDADNQRDEEKKKKQKEEMMKELAM >NZ_CP048052.1|WP_017378257.1|1326771_1329891_+|DotA/TraY-family-protein MLSLVPGPGNDQSVYFLWQIFGNIIYWVSGQETSDTDLTIIHYVISAFNSGLLSLLLVIYALVIFIGTLNTAHQGEFLGRNWSSLWMPIRAIFGPLCVVPVKYGFCLAQVILLYGVLVGVQLANYVWNSLETDLDGTAIPSVPVSLLNSVKENVGRAVLYRSVQKVSDSLGLKTTDLPSTRLKSSYACDEVQGANQFYNIGNTPTFCANSQSLIPTSLLPKLTSYTSQLCQPNKFDNFIAAMRWFYQDPYNDNGMTIKPAGVPGLSSGTLAQQCVDAVDSLLTGGSSSMEKVYNYNFSVAGKNQVIALKANLGDAYSHDNNDNKERYVNAVGHIAFNFENQNYSSGKASDYSKSADEFTRIIVNDLYKNDVKQAHSSLNDYLSELNKNLLNVAGDATNRLVKNTNVPTDVSVRQGTDIVTHSVNCNNYLINGNLSLRYLECLQLKDSGQTFSMYDVSNKDYPFENYIKSWWIGGGSYLAVDKIMNYNLEMVKHKLDQEISYPGMNIVSTVHYEIPLSVNYYPLIDGHPPRYQNSEGNTEYASDVKTTIVSANAGVTSVTNTIPDGLSMVSSSWASNVYHAVPACIEESGSQACKDIIALQTQLLNLPSEWRPPFIYLFNLVKSGSKSAMKSISDSPKDVTFLNNVFYFLKQNGIYQPTTTTAVPVYAVIGRIFDQVGGNGLSSDMTAVMNEFYNLGMPSSNLFSKIMQAQQVGADVVQAVIDSFTNIFENYQEQFKDIQSTAESMISDWSWGAGIAGALGGLFGAGSIGTAAAILGQTAVQLYMATQIGNLSMSLAWLPIALVVLGSLFTAAISFVVMMPLIPYFLFWAGTIVWALSILEGLVAAPLVALALVYPEGHEILGHGSPAIKIALNIIFRPVLMVIGVIAAMALTYVLITYSAQGFHLVAPLILNNFSASGMVNGIVSCFLIFIYASFMMMAFSKCFSVIYLIPDKVFDWIGASAGHRAGAEEVQQLQGKTEGMGSQAGQSMGSGVQQGIQAKQTETQSSVQAQSQDIQVAEKAGEAAGSEARSAAEMAASL >NZ_CP048052.1|WP_017378258.1|1325944_1326742_+|hypothetical-protein MNIIKKTLIVFAVISSVSLNSIQVSHADPVSMAVLLKELYSIQGNQKAGNKELERANSALNSGFPPDTLKSFENLSPQSPQLSKFSEYMQDVSHSGSKSKENNSVKAQIKNLSDNKYLMSLVQGQYYDKEVKENLLSAGASPQAVVLATAVLSQVNLNEKTNSQLLKAVQAQLSKNWQDGLRVSTRDQLLRMISLQLSVSNLSQYQQLRTQELMALLQLAGLMDHGALLGKLTEINNKSIGIDKKLSEVNRQLDIINRHFKKSSN >NZ_CP048052.1|WP_036817286.1|1337333_1339646_+|hypothetical-protein MPIPEAPKNNDARLNLKEYAAPTGKYQAEFQEKSAASKQKLIDLLQEYETRYNSNFVDYLGDLLKIKADLIIPFLKKLNAFIEDTKGSRSDAIQFLLDTQHLAEMFPSQRETALFEVVCEFVFDIKSIELDEFIQALYERTPDSQPGEVDNFKLQALREISDQLSLNVIVPSGEDYLKGRQQVEQSLASNKEKLQEIESLRNGLSKHKSHAVTKQNEVLYKIIGLYVHGSEQDGLKSHGRKYFDRLFAPYFKFNDGDPQLSVEYTGDGFDFEDILKGIVENCKEKRTVWAVMGRQLQAGKIAKLLLEEASRYTEETGLRNIEGDVRRGISFSSSWDIKGPPYKQKIIIQTLNENITEVEGEIACLDEEKKGLVSAVREDINKAGAHVKLRIEELIERKRQEEERKKREEAERKRAELAERQKLAECKELLPEAMIKDLEGLVTPIASIPAEQQILINSANLKLVMQCISDIQGQGNEVLKALHYWLAKNYDFLKKPENNAVSDRSTTMSGQKEACSSEWNVIELTLAKCMFANAEKCDALASIPELILQNPFLKLYDRLQPSAEADAVDGAEGGAVGGARADVVDGAGARSGVESIARDFEVVMKSQKLITNIDAALGRDKKSKKNDLELIRTQVQSVPDNRVLEKLFAWLMTQGYLWKTTGFSFTNTTMFGKERYCRSTWGKIEECFAKKMTTNSCQAALHGRLDVKGIDKLIEDNPFLNKHRSLIKKTQKNFDLEAMELETEGRLFERQQSAETSSIESSLEVSYANT >NZ_CP048052.1|WP_027242796.1|1340318_1341590_+|phosphopentomutase MLKGRVIILLMDSFGIGASEDAEQFGDVGADTFGHIVEHAAHGLADSPERQGALKLPYLASLGLEQAAKQSRGRPIAKTITGDLELPIQGVYGYAIEQSCAKDTTSGHWEITGVPVEFEWDYFHKTAECKTPGQDSSCFPADFMQRFLVETGLTQGVLDAGHASGTEVINRLGDEHCLTGKPIVYTSADSVFQIACHEKSFGLERLYGLCETARELFDEMGLNIGRVIARPFVGNKAGEYQRTGNRHDYSVPPPQPTLLEYVVKNGGEVISVGKIADIFADRGISHKVKATGITELFDQSLTAFKRSKAGSLVFTNFVDFDSQYGHRRDVAGYAKALEYFDSRLPELMDSMEPGDLMILTADHGCDPTWPGSDHTREHIPVLAWGPGLQSKNIGQRHSFADIGQSIADFMGLAPLAHGQSFLS >NZ_CP048052.1|WP_017378245.1|1341612_1342341_+|deoxyribose-phosphate-aldolase MDKTKKTVMALIDLTSLNLDDNDQTIVDVCAKASNRLGKVAAVCIDPKFVGLAKKLLKNQHIAVASVVNFPLGNKSIETVLADINQVLIDGADEIDLVIPYQDYLQKGSSERALHLVKASKALCNDKLLKVILETGELKSRALIFKAACDAINAGADFIKTSTGKTAVGATVSAVKAMLDAIQINLRYHPHVGLKVSGGVKTLAEALQYIHLAKEVYGKENIQVSSMNLRFGASHLVDDLYT >NZ_CP048052.1|WP_017378243.1|1342603_1343746_-|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIDFPTLQVIGWIIVGATLLSFALTSGFDSGIGILLPFIGRNDTERRLTLNVIGPTWDGNQVWLIAAGGAVFAIWPLVYSTAFSGYYVAMLLILWSLFLRPVGFEYRSKLPNQTWRNNWDIGIFIASFIPILIMGIAFGNLLLGSPFSYDPVFLRMQYTGSFIDLLSPFALLSGVIAIFMVICHGAAYLNLRTKGIIKTRAQKALRLFAWCYLIAFALAGLLITYKIPGYFLGSQAGSIHDPLINHVNRHVGAWLNNYHTHHWMVLAPVIGFLGAFLAIISTHANRAIWSFIGTSFIQIGTLLTAAFSLFPFIMPSSSDPAHSLTVWNASTSQYTLTIIAIVAIIMVPVIFCYTSFVYIKMWRDGPINEKDIEKNQHILY >NZ_CP048052.1|WP_017378242.1|1343762_1345364_-|hypothetical-protein MLPIEHVVELSRWQFGITALYHFIFVPLTLGMTWILFGMECLYVKTGKQVYKDMVRFWGKLFGINFAMGVVTGITMEFEFGVNWAYYSQYVGDIFGAPLAIEGLVAFMLESTFFGIFFFGWDKLSKKQHLFATFCLAIGSMFSALFILIANGWMQHPVGSQFNIDSMRMELTSFYDVLLNPTAQAEFAHTITAGLVTAAMFVTGISSYYLLKGRDIVFAKRSFIYGSFFGLIVLLGVAFFGDHAGLDVDETQPMKMAAIEGLWETPEAPAPWTILALPSNNQLKNLAAIKIPYALSIIATHSLDGTVKGMQEIIADNVVRMTQGRKAYLALIELRTEKNIDGKTLSAEQLATAKHTLERYKDDLGYGLLLKSYISDIQHASEAQIQHVAKQAIPEVWAVFYSFRLMIGCFGIMLLIVLAAGFFNLRGKLWEQRWLFRTALYAIPLPFLACLFGWFVAEHGRQPWVVQNTLPTAMGASSVSTGQLTFSLTGFALFYTLLFIIEIYLMFKYARLGPSALHSGRYHFEQLAHANKS >NZ_CP048052.1|WP_157894728.1|1345858_1346011_+|hypothetical-protein MAQLTHNSGSFATFTSAGVVRRALTQAGFVVKKIPGFAGKREMMRGWETI >NZ_CP048052.1|WP_017378240.1|1346007_1347285_+|FAD-dependent-5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34)-oxidoreductase-MnmC MTMLVEGNYAPWNRLAASATSPNVIVVGAGIAGASTSWALSTQGFNVTLVEKAAEAAQEASGNLAGLMMPALATDQSSFAEYFIQAYLYSIQHAKTLAQSHQFNFSQTGIIQLAFNDRQQKRQKNWLELKHVADLLEWVSQEQVMALSGLDFSCSGVYFKEAAWLSPYLYVKSHIHACKASINCLFNSYVNQLHYEQGLWKLYDQHQQLIAEAPTLILANASDATRLLGQFSSVLPLSLRTVRGQVSALKNHARVSQLKLPVCYDGYITPVINGKNYLGATFIDDYQAKCLHQDRVQNIQQLKQVLPGLNIDEREYKDLSQDRAALRCITTDYLPVIGPVPDVAFYRQHYSRLIQDRRESRYPSAQYLPGLFMNIGHGSRGMVSAPFATKLLVSELMGKDLKLSKRLREHLHPGRFLIRQLKKGK >NZ_CP048052.1|WP_017378239.1|1347633_1347903_+|hypothetical-protein MPINTKQSLKRFQAQDALQASGSFLKKGLPEGTNQADFIKAVNREIQIVIDGMQSIVRNNQPSASSYRGEDSVRELVALQFLPLRAMEC >NZ_CP048052.1|WP_036771505.1|1348107_1348608_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYATIDEISGKKVNFFSKTAVREKSIQELKSLQNALEVIFTEPEEKLTKEFVQLIQERISQVYEEKITYKNKRLVCCLFDELKQDLSTLHCSIDSLNAGFSVANVSDKSQVQQCESVQSPMLFYQQHEQNLQPVDRDRSCYVMYETSV >NZ_CP048052.1|WP_036771503.1|1348768_1349872_+|hypothetical-protein MPMTREDWFKKANCPINESNNEKVTLYLDLDENVFSYHKKNKKMDQEVDVGCFNVLNVKKMSFHTSSGIFFVDKRAFLEVKKFLDNGHDLQVVTAGAYPPEIISKIFNELGIDIKLQHGENYFNRFDFGAGESKALNKQEFIDKHLNNNKAMLIDDQFWNKPKAKEGVLFTLTSPSRPFPTLVAIDKNLVLNLQKVGIDYDEIWKHAKDNLELQALAATTVSSAEGWQKAKQFIAVKSALESFNPAQSSQTPFSLITVNKRENLRDLRGLCSAVAASEEHSGLLVGELARLLNLPSNNALKLEICPEGNAVSMNDIDNYVSVPELLDRNRRAEGDLEAAGGALSMLMLEAHTKTLEAEQLNSMPLTH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048052_3 | 1655939-1656048 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048052_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP048052_3
>3.1|1655965|58|NZ_CP048052|CRISPRCasFinder CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048052_3
The CRISPR arrays of NZ_CP048052_3 >merge|NZ_CP048052|3|1655939-1656048|CRISPRCasFinder TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCTCGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGCTATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC >NZ_CP048052|3|2|1655939-1656048|CRISPRCasFinder TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCT CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC
>NZ_CP048052.1|WP_017376785.1|1654433_1655339_-|LysR-family-transcriptional-regulator MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL >NZ_CP048052.1|WP_017376784.1|1654007_1654193_-|hypothetical-protein MEKIERVYARDHGISGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLGGYLG >NZ_CP048052.1|WP_027242578.1|1653434_1653971_+|DUF2062-domain-containing-protein MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER >NZ_CP048052.1|WP_162038665.1|1652115_1653327_-|ComEC-family-competence-protein MCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY >NZ_CP048052.1|WP_048876008.1|1651144_1652119_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP048052.1|WP_155046589.1|1650915_1651065_-|hypothetical-protein MTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP048052.1|WP_155046590.1|1650571_1650736_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP048052.1|WP_036774017.1|1649694_1650570_+|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG >NZ_CP048052.1|WP_162038664.1|1649185_1649404_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVLLMSNSRFFRYVNLINAAWFPWAVVRACDDVGSLGLRTKTCYAGSCICAST >NZ_CP048052.1|WP_162038663.1|1648458_1649259_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV >NZ_CP048052.1|WP_144420682.1|1656745_1656907_+|phosphatase MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP048052.1|WP_155046588.1|1657441_1657651_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP >NZ_CP048052.1|WP_027243099.1|1658766_1660080_-|DEAD/DEAH-box-helicase MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK >NZ_CP048052.1|WP_027243098.1|1660315_1661461_+|carboxypeptidase-family-protein 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>NZ_CP048052.1|WP_017376798.1|1666401_1667037_+|LysE-family-translocator MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP048052_2 | 2.5|1337173|39|NZ_CP048052|CRT | 1337173-1337211 | 39 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 84046-84084 | 0 | 1.0 |
NZ_CP048052_2 | 2.5|1337173|39|NZ_CP048052|CRT | 1337173-1337211 | 39 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 84286-84324 | 0 | 1.0 |
NZ_CP048052_2 | 2.5|1337173|39|NZ_CP048052|CRT | 1337173-1337211 | 39 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 84676-84714 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP048052_2 | 2.6|1337233|24|NZ_CP048052|CRT | 1337233-1337256 | 24 | MN871441 | UNVERIFIED: Aeromonas phage AsSzw2, complete genome | 200918-200941 | 4 | 0.833 |
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acttctcaaggttctacttttgag CRISPR spacer acctctgaaggttctacttttgag Protospacer **.*** *****************
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gcttctcaaggttctacttttgaggattctacttctcaa CRISPR spacer acttctcaaggttctacttttgaggattctactgctcag Protospacer .******************************** ****.
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177. spacer 2.5|1337173|39|NZ_CP048052|CRT matches to NZ_CP039048 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
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178. spacer 2.6|1337233|24|NZ_CP048052|CRT matches to NZ_CP033067 (Pseudoalteromonas agarivorans strain Hao 2018 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
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179. spacer 2.6|1337233|24|NZ_CP048052|CRT matches to NZ_CP050314 (Shewanella aestuarii strain PN3F2 plasmid pPN3F2_1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
acttctcaaggttctacttttgag CRISPR spacer gcttctcaaggttctgcttttggt Protospacer .**************.******.
180. spacer 2.6|1337233|24|NZ_CP048052|CRT matches to MN871441 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsSzw2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
acttctcaaggttctacttttgag CRISPR spacer chttctcaaggttctacctttdag Protospacer ***************.*** **
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
608 : 56203
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048052|608:56203|DBSCAN-SWA 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57 | Escherichia_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
191881 : 322808
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048052|191881:322808|DBSCAN-SWA 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111 | Acinetobacter_phage(11.11%) | tRNA,tail,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
330774 : 384187
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP048052|330774:384187|DBSCAN-SWA 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48 | Staphylococcus_phage(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
441184 : 508331
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP048052|441184:508331|DBSCAN-SWA 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58 | Acinetobacter_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
517832 : 630356
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP048052|517832:630356|DBSCAN-SWA 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111 | Staphylococcus_phage(25.0%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
636218 : 679170
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP048052|636218:679170|DBSCAN-SWA TATGACTCAATCGCCAATCCAGCCTCATGTTCAAACAGCAAAAGTACAGCGCAAGATCAAAAGCTTTGTTCGCCGTGAAGGCCGCTTAACCAAAGGCCAAGAGCAAGCCTTAGCAAAGCACTGGCCACACTACGGTAAAACTATCACCGAAGGCCACTTTAATGCGCTTCAAGAGTTTAAAAATCACCAGCCAATCACCTTAGAAATTGGCTATGGCATGGGAAATTCCCTAGTGACCATGGCAAAAGCCATGCCTGAGCATAACTTTATTGGTATTGAAGTTCACCGTCCCGGTGTCGGTTCGTTGTTATTACAGATGGAACAAGAAAACATCACGAATATTCGTAATTATATGGACGATGCCGTTGAAGTTCTCAAACAATGCATTCCAGATTATAGCTTAAGCCAAGTGCAGATTTTCTTTCCAGACCCTTGGCATAAAAAACGTCACCATAAGCGCCGCTTAATTCAGCCAACATTCATTGATTTACTCTCCAAAAAACTAACGATGGGAGGAATGATTCACTTAGCCACTGACTGGGAAAACTATGCTGAACATATGATGCAGGTGCTATCGGCACATAGCCACTTTGAAAATACCGCAGGCATTGATCAGTACACCCCACGGCCAAATTATAGGCCGTTAACCAAATTCGAACAACGCGGCCAACGTTTAGGTCATGGCACCTGGGACTTACTATTTAAAAAAATCAAAAAGTAAGCGAAACTAGATAATAAAATATAAAATTAACGCAAGAGACCGAGAAAAAATATAATATTCAAGGTGGAATAAGCGCATGACACTTTCAATGATTTTTGTCCTGACTGTCCTCGTTTGCACCATTATTTTATTTATCACCGAGTGGCTCAGAACCGATGTCACAGCCCTCCTAGTTTTAACTATACTCGGCCTATCTGGCATATTAAGCCCGCAACAAGCTTTTGCCGGCTTTTCCAGCAGCGCCATTATCTCCATCATTGCGGTCATGATTATTGGCGCTGGAATCGACCGTGTTGGCCTATCCAATTACCTGGCACAACTGATTTTAAAATTAGGAGGGCGCAGTGAATCCCGTCTCATTGCCGCCCACGCATTTAGTGCTGGACTACTTGCAAGCTTTCTGCGTAATGTCGGTGCAGTTGCCCTCTTGATGCCAGTGATCAGTCGCATTTCTATGCGCACACAAACTTCAAAATCCAGACTGCTGATGCCTGTGGCCTTTTGTGCCATTATTGGCGGCACAGTCACCATGGTCGGTTCCGGGCCACTCATTATTCTCAACGAATTCATGGCCTCAGCTGGACACGGCGAGCAATACCACCTCTTCTCTGTTGCCCCTGTTGGTCTCGCTCTACTGATTGCAGCGGTTTTATTTTTTGCTCTTTTCGCGCGCCACTGGCTCCCTGTTACGAAAGAAAAACGTTTTGGTGTGCGCAAAACTTACTTTCGCAACACCTACGGTATCGGTGGGCAGTTTTTTGAACTCACCATTACCCCCAACAGCCCACTCATTGGTATGTCTTTAAAAGAGCTAGAAACTAAAATTCATAATAATATTGCCATCATTGGCCTTTATAATGAAAAAGAAATCACCTCCCCGCCTTTGCGCAAAAGCATTTTAAAAGCCCACTTTAAACTCGCTTGCCTCGCTGATGAAAAGCGCATTAGCGATTTTGCCAAAGAGTTTAATCTTGCAATCGAGCCTCGCTTAAAGAAATTTGCTGAGGTACTAAGCCCCGCACGGACAGGCCTCAGTGAAGTTGTTATTCCACCCAGTTCCGACCTTATTGGCCAACAAGTCAAAAAATTAAAAATGCGGCGCACGCATGGCTTACAACTACTTGCGGTACTACGTGGTAAAACCTCACGCTTAGGCGATGAAATGAAGGCAATGACTTTACGCGCTGGCGATACCTTAGGGGTATTTTCACCCTGGCAAGATTTAAGCCGACTTGAAAAAAATGAAAGCTACCTGGTCATCACCAGTGACTACCCAAAAGAACACCAACACCTAGAAAAACGCTGGTATGCACTGGCCATTGCACTATTTACTCTCGTCCTGGTTATCTTACCTGCAGTACCAGAACCTTTAAGCCTGATGACCGGCGCAGTGCTTATGATTGTCACCGGTTGTATTCCGATAGAAATCGCTTACCAGTCGATCAGCTGGCGTACAGTTTTCTTACTTGCCGGGCTTATCCCCTTGGGCACGGCCTTGCAGATAACAGGAACAGCACAGTGGCTAACCCAAGGCATCATTGACCTATTGCATGGCTGGTCAACCTTAGAAATCGCGTTTTTAATCGGTATTATTACGACCTTTGCCACCCTGGTAATGACCAATGTTGGGGCAACACTATTACTCGTTCCCATCGTCATTCACCTGGCTACAGAAACTGGCGCTGACCCGCGCTTATTCGCCTTAATTGTTGCTGTTTGCGCATCCAATTCATTCTTATTACCCTCCCACCAGGTCAACACCTTGATCACTGGCCCTGGAGGCTACCGCGTCAGTGATTTTATTAAAATTGGCAGTGTCATGACGGTTATTTTTTTAATCATTGCGATTCCTGTACTTTATTGGACAACTTAAATAGACCATAACAACACCAACTAAAAATAACCTAAATTATCAACTACACTCCAAATAAGTCACACAACGGTCATTCTTTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGAATTATGGAGTAATTATCATTATGGCAACAAGAAAAGCACTGTCACTAGCCATTGCCGCCGCAATTGCTGCAAGCTTAGCGACCACAGTCTCTAACATTCATGCTGCTAAATCTGAAAAATGCTACGGTATTGCCAAGGCAGGGAAAAATGACTGCGCAACCCCTCACCATGCCTGTGCAGGTCAAGCTAAAACCAGTGGTGATAAAAAAGAGTGGATTATGATGCCTAAAGGTCTGTGTGATAAAATCGTCGCCGGTCAAAGTAAATCAAGCTAGCTCTGACTTTGTAAATCGGCAATCGGCATGAACAATACCGTAAATAATGCTCGATACATTAGCCTCTCATCCGCTTGTACTCACTTAATGCTATACTCACCTCTTGATTTGTAATTAACTTAAAATTAGGAGGTAAGTCATAGATATGAAGACTATCATCGATAGCCATATTCATTTTTGGGATTTAAAAAATAACATTAATCAATGGGTATATAACGAAAAAAAAGAATTACAGCAAGACTTTCTCCCAACAGCATTACCATGCAAGCAATTCGTTCATATCGAAGCCCATGATTCAGCAATTAATACCATTCAAGAAATAAAATGGTTAGAAACTCAATTAAGTCAATATCATATGTGCTATATTGGCTATGGAGATTTTTACGTCGATGATCATCATTTTTTATTACAGCTTAATCAGCTCAAAAAATATTCAAAGGTTGTCGGTATTCGGCAAATTATGTCTTACCACACGGAGTCTACCTACTCACCGTGCCAATATCATTACCTTCCTAAAAACTTCACCCAAAAGCTCACGTTACTAAAAGATCATCACTATATTTTTGAATGTCAAATGTATGCGAGTCAGCTACTTAATATACTAGACAATATCAGCGACTCTCAAGTCACCACAGTCATCGAGCATATGGCCTTGCCACTCACCCAATCTAGCCAAGAGATGCAAGCCTGGCATGACTTAATCAAAGAAATCACTCAATATACTAATATTATTTTAAAACTCTCAGGATTTTATATGATGAATAGCCAGGGAAAACCACTAGATGGTTGCTTAGACGCTATTTTATCTAATATACCAAGCCAAAGATTATGCTATGGCTCTAATTTTCCTGTCGATAACTACCATCACTACACACTATGGCAAGAAACATTAATGAATAAACTACCCCAAATAACACATGAAGATATTTTTTATAATACAGCAAACAAAGTATATTTTAGACCTTAATCTATTAATGCTATTATTTTGATAATAAATAATCGATATAACAAACAAACGTATTTATTGGAAACTAAATTAGAAACTGAGAAAATAAGTACAAAGCTAATATTAACTAGCCTATAAAAACAAGTAGCACGAAAATTTATTGAAGGGAGAACAATGAAGCAATTTAATAACAACGCTCCACCATACAATACTATTCGCGCAAAATCACCTATCCTCAGCAATTATACCAATCACTTTCAACTCGTGCACCATCACAGGATACCGCGTTAGATTTGGGTTGTGGTAATGGTGTCTCCACTCACCGCCTAGCTCCATATTTTAATGACGTTGCCGGCTGCGATATAGGAGACATGCTCATTCAACAAGCACGTCAAAACTACCCTAATATCCTAATGGCACTACCTTAAGAGCTAGATCTGAACAAAAACGCACTTTAGCGCAATAATCACTTGAAGTCAGCAACCGTATAAGGTTGTATATTTTCGTCTAACAACTCAGACGGAAACTGACAGATGCATTATGTAATTAATAAACTAAAATCACAAATTGAAAAACAAAAAGCAACCCTTTTAGATGATGAAGGAAGTCTAAGCATTGAAAGCCTTCTGTCCTCCGATAAGTTTCAAAGCATCATCAACAATTGCCGAAGCTTTAGATCGCGTTTTTATACGCCATTTGTAACACTCATACTATTTATACGGCAAGTACTCTCTCCAGATAAATCATGCAAAAATACGGTTGCTACTTTCCTTGCATCAGTGTCGACAGAGGATAATAATAACATCCCATCAAGCAA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44 | Acinetobacter_phage(27.27%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
686525 : 758755
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP048052|686525:758755|DBSCAN-SWA 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56 | Staphylococcus_phage(44.44%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
771228 : 831498
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP048052|771228:831498|DBSCAN-SWA 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51 | Acinetobacter_phage(27.27%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
867302 : 989629
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP048052|867302:989629|DBSCAN-SWA 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95 | Staphylococcus_phage(22.73%) | transposase,integrase,tRNA | attL 869938:869997|attR 920359:921119 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1008689 : 1051881
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP048052|1008689:1051881|DBSCAN-SWA CTCAGCTGGTCAATAGGTTACACTGGATATTAAGCGATGGCTTCTTCTCCTGAAGACAGTAGGCTGCTAATCCAGCAAGAATATTGACCATAAAGTTGTTGACACTACGATGCCTGGAATGCTCGATTTGTGAGATATTTTTAAGTTGGTCAAATACACTTTCAATAACTCCAGGTTTTCTGAGTAAAATTTTATCAATGATAGGCATGAGCTTATTTTTCATATTCTTACGAATTTTTGTGATTAATTGCAGTCCTTTTTCATAAAGCCTGTTAAATAAATCTTGTGAAATGTAACCTTTATCGCCAATAATTTTTCCTGTGAGGCTTTGAGCCATTTCAGGTAACACAACACGATCATCCGTTGTTGCTTGACTGAGTTTAAAGGCCATCAACTCTCCCATATCATTGACAATTAGATGGAGCTTAAAGCCATAGAACCAGCCCATCGTTGAACCACATTTTTTAGCCAGTCCTTTAAAGACTCTATTTTGGTGACTACGTTTATGATGACAGACTCGCAGTACGGTTGAATCGACAAAATAGATTCCCGTCGGTGTTTTTCTTTGGGCGGCAATAAAAAAACACAGGGGGAGTAATATAGTTGGCATTAATTCAACAAATCGATTGTAGCTCACTGCCTTGGGGAAGCATTTTTTCAAATGACCCTGGACTTCCCTTTGATAGTAATGTTTGAAGTTACGATAGTGGGATTGATGAAAATAAATCATGATGGTCATTATTTCACTCGTTGACATGCGGCTTGGTTTATTACGTTGCTTATCTTGATGCTCAAGTAATGAGGCTTGCCAGTGAGGTAAGAAAACCTGACAAAAGTCATCGACAATACAAAACAAACCGATTAAGCTGGTATCTATAAGTAGCTCCTTGCAATGGATTTAGACTTTGAGAACCTAAATATTAATTGCAAACGAGCTGCTTTTTCAATAGGACCTTATATCGAACTCACGTTTTATTAGTACAGATTTCGCTAAATGTATGCTTTTCTGTAGTAGTAAAATAGTTTTGACTACTAGTGAGGCTATTATGACGTACCACAAAGATCAGGGCCCATATAAATAGTTAATTTTTAACAGGGCCCTTTCGTTTATAGTCAGGTTATAAGCCTTTTTTTAGCGTTTTTAACACTTATGCTCGGCCTGATTTTTGTATGGGTTTTGATTATCAGAAAGTTGCCCTTTAATATAGGAGTCACTTTGGTTCTTGGTTGATTGTGTTTCTTGGGCTGGATAGTGTGGACATAGATGTTTTTTAGTGCTGGGATTGTTTTCTAAATAAATTAATGCCCCCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTCTAGTCCAAGAAATATTTGAGCCATCACGGTTGGTGTGGGTTGGAATAATAGTTGCATTGCTAGGGAATTGATAACCGCGTGAAAGCAGGCGGCTAAAATAAGCTGAATTGATGCAATAGGTATATAGAAATGGATTATTCGGGTAAGTTTTTTGTAGTTGATCCCAAGATGTTGCACAAAACTGCTTGCCCTTTTGCTTAAGTAAATCGGCACTGAGTGATTGTAAATTAAAAAATTTTGCAATATAGCTAAACCCTGATAAGGCATTGAAGGTTTTATTTGCGTCAATCAGACTATTGATAGCTTGAACTTGATGTACTTTAGTAATTAATGGGCTAATACTTCTTTGACACATTGCGTAATCAGCAAATTGTGAGCGTTTGCCGTTGGGAAGTCTATAGCCATTAGGAAAGCATATAGTATGATTTAAAAATTGATTGCGCAATTGATCTTGCCCTAAGCCAAGATAGCTTGCTGAGTAAATAGAAATTGGCCTATGGCCTAATGGCACTACCTTAAGAGCTAGATCTGAACAAAAACGCACTTTAGCGCAATAATCACTTGAAGTCAGCAACCGTATAAGGTTGTATATTTTCGTCTAACAACTCAGACGGAAACTGACAGATGCATTATGTAATTAATAAACTAAAATCACAAATTGAAAAACAAAAAGCAACCCTTTTAGATGATGAAGGAAGTCTAAGCATTGAAAGCCTTCTGTCCTCCGATAAGTTTCAAAGCATCATCAACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGAATTGCCGAAGCTTTAGATCGCGTTTTTATACGCCATTTGTAACACTCATACTATTTATACGGCAAGTACTCTCTCCAGATAAATCATGCAAAAATACGGTTGCTACTTTCCTTGCATCAGTGTCGACAGAGGATAATAATAACATCCCATCAAGCAATACAGGACCTTACTGTAAAGCACGTCAAAAGTTACCAATAGAAACGCTTGAATCACTCGTTAAACTCAGTGGAGATAGTTTATCTAAAAGCAGTAATGCACGTTGGAAGATTTATAATCGAGAGGTGAAGCTTATTGATGGGACAAGCCTTACGATGGCAGATAGCGAGGAAAATCAATCACGTTATCCTCAACATGATGCTCAAAAGGCAGGCGCAGGCTTCCCTATTATGCGACTTGTTGCCATTATGTCACTTACAACGGGAGGCATTATTGATTATGCAGTTGGCGCTTATAAAGGTAAAGGAACGGGTGAACACGCGCTGTTAAGACAAATTAAGGACAGCATTCATAAGGATGATATTGTGATGGGTGATCGGTATTTCCCTTGTTTTTTCGTGATGGGTGATTTGCAGTCAATAGGTGCTGATGGTATTTTTAAAGCACATTCACAGAGGAAGTATGACTTTCGTAAAGGAAGGAAGTTGGGTTCAAAAAATCACCTTGTCATTTGGAAAAAGCCTCACAAACCTGACTGGATGACACAAGAAACATACGATAGTTATCCTGATCAAATGACGGTAAGAGAGTTCAAAATCAAAGGGGAGGTTTATGTAACAACTTTTCAAGATCATAAAAAATACAATAAAGTTGCATTGGCTAATCATTACAAACAAAGGTGGCACATTGAAATCAATTTCAACAGCTTAAAAACCATTATGTCAATGGATCATTTAAGAAGTAAGACACCTGACATGGTACATAAAGAAATTGCAGTACACTTTTTAGCATACAACTTAATTAGAACGCTTATTGCAGAAGCTTGTCGTAATACTGAACGCCTTCCTATACAGGTTAGTTTCAAGGGTGTAATACAGTTATTTAATAGCTTTGTGTCATTACTCAGTTTCTCGGCAGACTGTAATAAAGCCCATGCAATATTGTTGCATGCAATCATAAAAAACAAGGTTGGGAATAGGCCTGGACGGATTGAACCTCGGGCTGTTAAAAAACGTCCCAAAGCATTCAGGCGACTGAATAAAAGCAGGGAATTGGAAAAGGCAGAAATAACTAAAAGAATGAAGAAAAATAGCAATAAAAAATGTTCATCCGCTCCTTAAGGTAGTGCCATTAGCCTATGGCCTAGATTAATCCGGGTGATATTATTATCATGCACATTGGTTGTTGGGTGGAAAGTAATTTGTGTCGAAGCACCGCCCATCTCTAAAATACCATTTGTATGTGCAGTTAAGCGAAATTTGGCATTATCCCAGTTATTATCTATCCAAGCAAAGATGCCTTCCCACCTGCCGGAAATTGTGCGTATGCCATGTGGGAATATATTAAACTTCTTGCTGTTTGGCTGTTGCTGTAGTGTTGTTCTTATCGCCTGATAAATCGCTTTTTGAGCATCTTGAGAAAGCAAGCGCATTCCTGCGGTGCCGTAGAGTCCAAATTGAACTTTACTGGCATCGCTATAACAACTGTTAGGAATATTCACCTTTTTTAATAATTCACTGATGTAATCAGGTGCTTTATCTGCGCTGATTGTCGATAAGCCTGGTGAAAGCTTAGCTGCTTTTCCAAGCTCGGCCACTTTACCAAAGTGGCTCTTATTGAGGTCATATTGATAAAGGTGTGCTCGTGAGCCTGAACTACCTGCGTCAATGATTAAAGCGCATTGTGTTGATGCCTGCGTGGTAGACAATGCACTTATTGATAGAATGCAAGTGATAATGAGATATAAATTTTTATTTTTCATTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACTGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTACCCTTGATAAATTAAGTTTATTTAAACTTTAAAATAATTTTTTTAATTAGATTTAATACCTAAATTTGAGCATGAATAAACTTATAGCACTTTTTTGTTTTAGAAGGTAGAAAATATTGATGGAGTATGTGAGCGGATTGATCTTAACTCG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43 | Orpheovirus(22.22%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1055427 : 1112675
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP048052|1055427:1112675|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(20.0%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1119539 : 1153681
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP048052|1119539:1153681|DBSCAN-SWA 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28 | Acinetobacter_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1193868 : 1254146
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP048052|1193868:1254146|DBSCAN-SWA 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51 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1282885 : 1298201
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP048052|1282885:1298201|DBSCAN-SWA 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15 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_15 |
1358178 : 1398583
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP048052|1358178:1398583|DBSCAN-SWA 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39 | Tupanvirus(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1404249 : 1509675
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP048052|1404249:1509675|DBSCAN-SWA AATGAAAACAGCCATAATTCGTCAAGCGTTTTTAGATTATTTCAAAGGTAAAGGGCACAGTGTTGTGCCCAGCAGTTCTTTAGTGCCTAAAGATGATCCGACATTATTATTTACTAATGCCGGTATGGTGCAGTTTAAGGATGTTTTTTTAGGCCAAGAGCAACGTGATTATACACGAGCGACCTCGTCTCAGCGTTGCGTGCGTGCAGGGGGCAAGCATAATGACTTGGATAATGTTGGCTATACCGCACGCCATCATACGTTTTTTGAGATGTTGGGTAATTTTAGCTTTGGTGATTATTTCAAGCGTGAAGCGATTTTGTTTGCATGGGAGTTTTTAACTGAAGTTATGAAGTTGCCTAAAGAAAAACTATGGGTGACGGTGTATGACAAAGACGAGGAAGCTGCGACGATTTGGACCAATGATATCGGCTTAAGTCAAGAACGAGTGATTCGTATTGCCACTAAAGATAATTTTTGGGAAATGGGTGATACTGGGCCGTGTGGCCCATGCAGTGAAATTTTTTATGATCATGGACCTGAGGTGTTTGGTGGGTTGCCAGGGACTGTCGATGAAGACGGTGATCGCTATATAGAAATCTGGAATATTGTCTTTATGCAATATAACCGGGGGGCTGATGGTGAACTTAACCCGTTGCCTAAGCCATCTGTTGATACGGGGATGGGTCTTGAGCGCTTAGCCGCTATTTTACAAGGAGTGCACAATAACTACGATATTGATCTTTTTCAGGCATTAATTCGTTATGCCGCAGACTTGGCGCATTGTCGTGATTTGGCAAACCCGTCATTGCGGGTCATTGCTGATCATATTCGCTCGTGCAGTTTTTTAATTGTTGATGGAATGGTTCCTTCGAGCGAAAGTCGAGGTTATGTGCTTAGGCGTATTATTCGTCGCGCCATTCGTCATGGTCATAAACTAGGGATTCAAGACGCATTTTTTTACAAGTTAGTTGCCCCGCTGGTACAACAGATGGGAGAGGCTTACCCAGAACTGCTTCAGCAACAGGCGATGATTGAACGTATATTACTGCAAGAAGAAGAGCAGTTTGCAAAAACGCTAGAACAAGGCATGCGTGTTTTTGAGCAAAGTATTGCAGATTTAACCAGCGCTGAGATTCCTGGTGAGACTATCTTTAAACTTTATGATACGTATGGTTTTCCGGTGGATTTGACAGCGGATATTGCTCGTGAACGTAACCTTTCTGTTGATGAGGCGGGTTTTGAGGTGCATATGGAGGCACAGCGTGAGCGTGCCCGCGCTGCAAGTCAGTTCTCTCTGGATTATAATGAGTTAGCTCAGTTAGAAACGTGTTCAACATTTAGTGGTTATGATAAGACGCAAGATCAGGTAAAAGTGACCGATATTATCTTAGGTAGAGTAAGTGTTGAGCAAATTACCTCAGGCCAAGAGGGGGTGCTCGTGCTCGATGCATCACCCTTTTATGCTGAGTCTGGCGGGCAAGTTGGCGATACTGGAATCATTAAAGCAGGAGGAGCTGAGTTTCTAGTCACAGATACGCAAAAGCAGCAAGAGGCGATTTTGCATATTGGTCGAGTGGTTAAAGGTGAGTTTTTTATTGGTGAAGAGGTGCAGGCCTTAGTTGATGATAAGCAACGCCAAGCAACAGCGTTAAATCATTCAGCAACGCATTTATTACATGCAGCGTTAAGAAAAGTGTTGGGTGAGCATGTGATGCAAAAAGGTTCTTTGGTCGATAGTGGGCACTTACGTTTTGATTTCTCGCATTTCGAAGCGATTAATGCAGTACAGTTAGCTGAAATAGAAGGTCTGGTCAATCAGCAGATTCGTTGCAATCATCCTATAGAAACAAACATAATGGCAATAGAGGTCGCGCAAGCACAAGGAGCAATGGCTTTATTTGGCGAAAAATATGCGGATGATGTGCGCGTGCTGTCTATGGGTGATTTTTCTATGGAGCTTTGTGGTGGAATACATACTAAGCGCACCGGTGATATTGGTTTGATGAAAATTACCAGTGAGTCAGGTATTGCTGCAGGTGTGCGTCGTATTGAGGCGGTGACGGGTGAAGACGCCTTGGTTTATGTGACTGTTCATGAGCAAGCGTTGCAGACGTTGGCAGAAAAATTTAAGGGTAATCGCCATACTGTGGTTGAAAAAGCAGACCAGTTATTGTTAAAACTGCGTCATTTAGAGAAAGAAACTGAGCGCTTAAAAGCGCAGTTAGTCCGTTCTCAAGGTGCTGATTTAGCATCCCTAGCTGTAGAGGTTAAAGGCGTTAAAGTTTTGGCTGCGAAAGTTGAGGGCGTTGAAGCGAAAGGCTTGCGTGATTTAGTCGATCAGTTGAAAAATAAACTTGGTTCTGCGGTGATTATTTTGGCCGTTGTAGAGGATAGCCGGGTTCACTTAATTGCAGGCTCTACACATGATTGCAAGAGTAAAGTGCCAGCAGGGCAACTAGTTAACTTTGTCGCAGAGCAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGACCGGATATGGCCCAAGCCGGTGGCCGCGAGCCTGAAAAACTGGCCCAAGCGCTAGAAAGTGTAACTGTTTGGGTGGCTGAGCGGCTATAAACCCAGCGATAAAATAAAAAAAAATTGATTTAATAAAAGGTCCAGGAAGGGCCTTTTTATGTTAAAGATGTGCTAAATTTGTTGAATTTTTATAAAGAACAGGGTAGTATTCGCAGCTCGTGCTTGATGTTGCACAGCATAAGTCCTAACGGATGTTTTAGGGCGAATGTTTAGACTAAAGTCAGTTGTTATTTTTGACGATATTAGTACTAGGGCATAAAGACTCTAGTGCCTAGCTCGTAGTATAACTGACCAGGTTCTGTGGGACATGAGATGCGAAGGGTTTAAGCAAAGGAGAAAATTTTAATGTTAATTTTAACTCGCCGTATTGGTGAAACATTAATGATTGGTGATGATGTCACTGTGACTGTCCTCGGTATTCGTGGTAATCAAGTTCGTATTGGTGTGAATGCACCTAAAGAGGTCTCTGTTCACCGTGAAGAAATCTATTTACGTATTCAAGAAGAAAAAGATGGTGGTCAAAGTCAAGCAGGCCATTCTTCTGCTTCTGAAATGAACGGTAATCGTGTCCCTTTCCCAGGCAGTGATGATATAGATGGAAATAGATAATTATAGATGGAAATAAGTCCTAAGTATTTGACTTCGCTCGGCAAGTCTGTATAATTTGCCGAGTCGCTGGAGAGGTGGGTGAGTGGCTGAAACCAGTTCCCTGCTAAGGAACCGTATGCTAACGCGTACCGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCACGTTAATCGACGCGCCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCGGTCGGAGGTTCGAATCCTTCCGGGCGCGCCAACTTACCTTGCTTTTCTCCTCACCTTATTGCTTTAAGCCTCGACTGTTTTTTGCTGTGCTAATGTTTCTGTCGTAATATTCATCCACCAGGTATTAAGCCCTAGAATTACGTGAGTTCGATATAACTCAACCATTTAGCAGGTTATATTTTATGCCAAGAGAAGGCTTCTTTTCCTGTAAACAGTAGGCTGCTAAGCCAGCAACAATATTCACCATAAAGTTATCAGCACTACGATGTCGGGAGTGCTCAATTTGAGAAATATTTTTCAATTGGTCAAAAACACTTTCTATAATCCCCCTTTTTCTTAATAGAATTTTATCAATCATTAAAACCAGCTTATTTTTCATGTTTTTACGAATCTTTGTGATAAGTTGAAGTCCTTTTTCATACAATTGATCAAATAATTTTTGTGAAATATAGCCTTTATCACCAATAATTTTACCTGTTAAGTTCTCGGCCATTTTAGGTAATACGACACGGTCATCTGTAGTAGCTTTACTCATTTTAAAGGCCATTAACTCTCCCATATCATTCACAATAATGTGGAGCTTAAAGCCGTAGTACCACCCCATCGTTGACTTAGATTTTTTAGCTAATCCCTTGAAAGCTCTATTTTGAGACGCACGTTTTTCATGACAAACACGGAGTATTGTCGAATCAACAAAATAAATCCCTGTTGCTGTTTTACCTTGGGCCGCAATGAAAAAACACAGAGGCAATAAGATGCTCGGCATGAGTTCAACGAATCTGTTGTAGCTAACGCTGTTTGGAAAGTATTTTACCATGCTACCTTTTATTACATGAAGATAATACATCTTAAAATTTCGGTAATTAGATTTGTGAAAATAAATCATAATTGTCATTATTTCACTTGTTGACATTTGTGAAGGCTTATTAGGTTTTTTATTCGTATCTTCTAGCAAAATAGCATTCCATTGAGGTAATAACTCTTGGCAGAAATCATCTATTACACAAAAGAGAGAAATCAATGTTAAGTCCATTTTATTGCTTCTTTAGAACTAAATTTAGACTCTATTTAGCCGCAAAATCACTGGTTTTTCAAATACTTCTTATGTCGAACTCACGTTAAAATAAATAATCATAAATTAGAATCAATGAATGCAGATTATTTTTCTGATAATTTTAAAGAAAATATAAAAAATTATGCTAAAAATCATGCTGGTCGAGGGGTTTTTAAGAAACGAAATCGAGCAACAATGGTGATGTATGGTTACTTTAACGATGGTGAAAATCAAAAGGTTGATAGAGTATTTTGTAAAAGTCCTGTCTAAGTTAATTTAACAGAGGATTCCACTTATCACTTGTACTATTTTAGGGGAGGGTTACCATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGTGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCG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94 | Burkholderia_phage(13.04%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1568009 : 1583868
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP048052|1568009:1583868|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP048052|1568009:1583868|1571067_1571760_-|WP_048876004.1|DBSCAN-SWA MKEQECNTNINININIHVTDIQRPKVTITRKPHTEIKIDAQNSETASHIKLDEPAEELETPAKETATVEAAAPAPEELETPAEETATAEAAAPAPEELETPAEETATAEAAAPAPEELETPTEETATAEAAAPAPEELETPAEETATAEAAAPAPEELETPAEETATAEAAAPAPEELETPAEETATAEAAAPAPEELETPAEETATAEAAAPVEEAIELDLEDSPPPKS >NZ_CP048052|1568009:1583868|1577863_1578037_-|WP_075275317.1|DBSCAN-SWA MKNKLVLMIDKILLRKRGIRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP048052|1568009:1583868|1569792_1570946_-|WP_087910642.1|transposase|DBSCAN-SWA MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKGNTVKYAWIKENKCVFPIGRLCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLAKRIKGIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQSQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPVAKNVLDRDFSATRPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKTGLIWHSDRGSQYASESHREILKDYKIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS >NZ_CP048052|1568009:1583868|1571768_1572956_-|WP_027242833.1|DBSCAN-SWA MKRLAAKTKIQLAILGNSLLILVIWAIISQSNLFESPITATISSAAIISVLYALVSSKIILRPIKKLIENFGHSHLFEEQKPSNNEVDFLEQLQHSLSKTHQDIAKNINDLYGDLYSIFEKTDRLLTEARSEGKDTETEKQLIDNIMQISAAINEVEASAQNATNAAQEASQKAQDGQNVVAKTTSAINNLSKEVTAASEVIGKLAQDSEGIGTVLDVIRGIAEQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEVRTLAQRTQQATQEIQEMIEKLQSNASDAVNTMEHGRNSADTSVQQAAEAGKSLDSITDAVKKIISTNTTIFSAAKNQSEITQRLNEQLKKLTQEEVSEETSAAAEAIQEDLNRIALRMERLSLKLETVDSDCDVQVMSLEE >NZ_CP048052|1568009:1583868|1578166_1579084_+|WP_048876005.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIANAASHGVLSTG >NZ_CP048052|1568009:1583868|1579425_1580085_-|WP_053093673.1|transposase|DBSCAN-SWA MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMGKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMGWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYENALRHLKCNTTLY >NZ_CP048052|1568009:1583868|1573777_1575007_+|WP_017376485.1|DBSCAN-SWA MSGFHGVLGLIVFYLLAWGLSENRKHVSLKLILLGLFWQFVFALILLKVPVITEIFQWVNQGVIAVTAATQQAVGFMFGGLASPSAESHLGFILALQALPVLIVISALSALLFHWRILPLIIRVFSWVFQKTMRIGGTLGIAAAANVFIGMNESPLVIRPYLKRLTHSELFSLMVCGMAGVAGTVMVLYASIVGPIIPNVIGHVIMAVLISVPAALTVSRVMVPETEVVSVGGQAEFAKAASTLDAISVGIMDGAKVLVTVVAMLIGFLALIYLLNMALALLPYVDGQALSLQRVLGWLMSPVAWLMGVPWQEAQVAGSLLGTKMILNEVVAYGEFVHVSSLLSEKVQLMMLYALCGFANLGSVGIMIGIYGALIPERRQEVTRLGVRAVIAGTLSTCMTGTIVGMLYV >NZ_CP048052|1568009:1583868|1575201_1575648_-|WP_144420789.1|DBSCAN-SWA MAKKVRPNTSVSITKMMQMIQKNNPHAFNNNSASSLMENTTLIIPTRTTTNQLKPEQLQLTRTEQRQQLLRQLAKNKQHVSTQNITKLKEELKLSKIRFKKIEDRNQELLKKMQKLHLQLQKLQAKMLKASEQRHSLNTHTTQNNSDS >NZ_CP048052|1568009:1583868|1573105_1573732_+|WP_017376484.1|DBSCAN-SWA MGQKSTIIIGIAGASASGKSLLASTIVNEIGSERVTVISEDAYYNDQSDIPFHIREQTNYDHPDAFDHELLKEHLQKLRRGESVEIPQYNYVTHTREEATRKVGGQSIVVLEGILLLTDKELRQLMDIRIYMDTPLDFCILRRIKRDVIGRGRSIESVIQQYEETVRPMYLQFIEPSKRYADVIVPRGGKNRIAIDLIKAKMRELLEE >NZ_CP048052|1568009:1583868|1582893_1583868_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP048052|1568009:1583868|1575839_1577198_+|WP_017376487.1|DBSCAN-SWA MNHNHQAEIKKTGLWQQRRSERLTKRPCDTRSVYQRDRARLIHSLSFRRLQGKTQVIGQGDSDFYRSRLTHSMEVAQIGAGLVDNLKRRYHTQDEYIPFPETALIETLGLAHDIGHPPFGHGGEQALNYLMRADGGFEGNGQTLRLLSHLTTHTTPGFGLDMTRRTLVGVLKYPAPYSRACGHYPPEPKSNDTTAIRVHEWLPPKCFFDDESQVVDWALGALLADEKQRFMSVSEQANYENMHYLPKYAGFDTTLLNLADDIAYAVHDLEDAIFLGFISAHLWEEVAHLFNDSDWAKRFNLESISHDLFAESYQRKQMIGALVHAFISSVEIEQRQLFKDPLFDYQAFLPQEVADILQQLKELVKTHFINRHGLQALEYRGQQIIMRLFEALASDPSRLLPHENLIFWQQAESEAQQMRVLADYVSGMTDEYATRLYERLFIPRAGSIFDRY >NZ_CP048052|1568009:1583868|1580165_1580669_-|WP_144420674.1|transposase|DBSCAN-SWA MFCSRNARVKYAFISAHGKLHSITLMCRLFRVSPSGYYKWLNHQPSHRQRRNKRLDHQITTIYKEHRGRYGAPRITRELHRQGVDCSLHRIIRRMKCMNLKVKVKRKFKVTTDSKHNLPVAVNVLKRDFSTNHINQKILSDITYIRTDEGWLYLAAVLDLHSRSIIT >NZ_CP048052|1568009:1583868|1580641_1580929_-|WP_017376491.1|transposase|DBSCAN-SWA MRKSCYSEEFRKEAVATALRSVSVTQTAKDLGIPSATLHTWVNQLKSQPKATKKSPDNEELLKENCRLNKELAKLREEKEILKKAARYFAQEMPE >NZ_CP048052|1568009:1583868|1568009_1568993_-|WP_048876002.1|transposase|DBSCAN-SWA MLSTPWLAANEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA |
14 | unidentified_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1598853 : 1703387
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP048052|1598853:1703387|DBSCAN-SWA 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102 | Staphylococcus_phage(24.0%) | transposase,integrase,tRNA,protease | attL 1599921:1599980|attR 1658487:1659027 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1723151 : 1782065
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP048052|1723151:1782065|DBSCAN-SWA 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53 | Acinetobacter_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1785979 : 1846115
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP048052|1785979:1846115|DBSCAN-SWA 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47 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase,tRNA,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1877132 : 1989656
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP048052|1877132:1989656|DBSCAN-SWA 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97 | Acinetobacter_phage(23.08%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
2007158 : 2074734
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP048052|2007158:2074734|DBSCAN-SWA 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49 | Acinetobacter_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
2084840 : 2135918
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP048052|2084840:2135918|DBSCAN-SWA 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48 | Acinetobacter_phage(27.27%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2151081 : 2199010
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP048052|2151081:2199010|DBSCAN-SWA 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42 | Bacillus_thuringiensis_phage(14.29%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2211708 : 2264481
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP048052|2211708:2264481|DBSCAN-SWA 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43 | Staphylococcus_phage(41.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2336052 : 2382759
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP048052|2336052:2382759|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP048052|2336052:2382759|2356378_2356654_+|WP_017375695.1|transposase|DBSCAN-SWA MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNRYHPNNPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAY >NZ_CP048052|2336052:2382759|2371603_2372551_+|WP_026063691.1|DBSCAN-SWA MSKLMLFTGNAHPELANKVAKHLHIPLGNAQINCFSDGEISTEILENVRGNDVFILQPTCSPANDHLMEVMILADALRRSSAGRITAVIPYYGYARQDRRTRSSRVPITAKVVADMLAGVGINRVMTVDIHAEQIQGFFHIPHDNVYGSPVLLEHVLDKKLIDPVVVSPDVGGVARARGFAKRLNNADLAIIDKRRPRANEARIMHIIGDVKGRDCILVDDIVDTAGTLCKAAEALREHGATNVSAYCVHPVLSGNAIANIENSSLTELVVTDTIPLSEAAKQCVRIKQLSLAPMLSEAIRRVCHEESISSMFIE |
41 | Synechococcus_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2388454 : 2424733
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP048052|2388454:2424733|DBSCAN-SWA 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34 | Acinetobacter_phage(25.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2469862 : 2535469
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP048052|2469862:2535469|DBSCAN-SWA 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58 | Staphylococcus_phage(18.18%) | transposase,tRNA,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2539470 : 2603249
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP048052|2539470:2603249|DBSCAN-SWA 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53 | Planktothrix_phage(10.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2635037 : 2678382
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP048052|2635037:2678382|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2686725 : 2742662
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP048052|2686725:2742662|DBSCAN-SWA 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49 | Staphylococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2768733 : 2803822
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP048052|2768733:2803822|DBSCAN-SWA 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39 | Escherichia_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
2815933 : 2842284
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP048052|2815933:2842284|DBSCAN-SWA 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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEESLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQREFDITQPFSRLYFMPREGFFSCKQ >NZ_CP048052|2815933:2842284|2837262_2837511_+|WP_017376985.1|DBSCAN-SWA MPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKIRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP048052|2815933:2842284|2815933_2818414_-|WP_017376964.1|tRNA|DBSCAN-SWA 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MFLTGQWVQPSMNYQSTCYLLGAAQLEQLPYDTGAEVAFAGRSNAGKSSAINVITGLSKLARTSNTPGRTQLINLFSVNEHCRLVDLPGYGFAQVPVAMKQKWQATLSNYLEVRECLKGIVLMMDIRHPFKPYDEMMIAWAVSSGLPMHILLTKSDKLKHGAATRTLLAVKKKLSDHADISVQLFSSLKKTGVDQARDILDCWFNQS |
29 | Staphylococcus_phage(40.0%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_34 |
2925945 : 3037079
Sequences of DBSCAN-SWA_34
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34 >NZ_CP048052|2925945:3037079|DBSCAN-SWA 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102 | Staphylococcus_phage(13.33%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_35 |
3070072 : 3130719
Sequences of DBSCAN-SWA_35
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_35 >NZ_CP048052|3070072:3130719|DBSCAN-SWA 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54 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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