CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP048066	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A chromosome, complete genome	2 crisprs	RT,DEDDh,cas3,DinG,csa3	1	1	32	31
NZ_CP048070	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence	1 crisprs	NA	0	1	0	0
NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	2	0
NZ_CP048068	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	0
NZ_CP048069	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. NZ_CP048066

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP048066_1

• CRISPR_ID: NZ_CP048066_1
• CRISPR_location: 386412-386541
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP048066_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP048066_1

>1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048066_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP048066_1

>merge|NZ_CP048066|1|386412-386541|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP048066|1|1|386412-386541|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP048066.1|WP_155046939.1|388878_389667_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_054300516.1|391160_391994_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP048066.1|WP_075273359.1|384669_385245_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP048066.1|WP_016211797.1|383215_384619_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP048066.1|WP_016211271.1|393312_394257_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP048066.1|WP_016212008.1|387686_388385_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_155047052.1|376431_377160_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_016212044.1|379014_379269_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP048066.1|WP_036794771.1|379991_380978_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP048066.1|WP_032126227.1|387358_387649_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_036777801.1|378022_378241_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_016212010.1|388401_388698_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_016211795.1|381115_381310_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_155046940.1|389871_390255_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_036777835.1|394561_395347_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_016211268.1|392109_393294_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP048066.1|WP_155047051.1|375417_376287_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_054300521.1|381995_383054_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP048066.1|WP_054300520.1|385190_385505_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_075273619.1|390527_391103_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP048066.1|WP_054300516.1|391160_391994_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	2.70834e-151
NZ_CP048066.1|WP_075273359.1|384669_385245_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP048066.1|WP_016211797.1|383215_384619_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP048066.1|WP_016211268.1|392109_393294_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP048066.1|WP_016212044.1|379014_379269_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP048066.1|WP_054300521.1|381995_383054_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	1.22796e-09
NZ_CP048066.1|WP_036794771.1|379991_380978_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP048066.1|WP_016211271.1|393312_394257_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37

Protein sequences

>NZ_CP048066.1|WP_054300520.1|385190_385505_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP048066.1|WP_075273359.1|384669_385245_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP048066.1|WP_016211797.1|383215_384619_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP048066.1|WP_054300521.1|381995_383054_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKVQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRDKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP048066.1|WP_016211795.1|381115_381310_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP048066.1|WP_036794771.1|379991_380978_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP048066.1|WP_016212044.1|379014_379269_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP048066.1|WP_036777801.1|378022_378241_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPKDKGKPFKP
>NZ_CP048066.1|WP_155047052.1|376431_377160_-|hypothetical-protein
MLCRPENSETLKNILISQKDTLISGAKHHKNILVLLIKTAIEFGNVRLLVTLDRLDLNPDRILFENTRQSFMQHLINHVYKYDDEEFAVWLFTVLYKQKIHFPHAKETFKIDFLDTSLRVNALQCLVYSGFFKLALCLSEAGIIDKASSTRYKGERRQVAACGFLITAIVKEGISQEKLDLLVALANGHDIATSQHLISIYRGLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP048066.1|WP_155047051.1|375417_376287_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAYVSAIQNQGGNELEKLIRLIDTLAKLSVINIYKQDSAAILPFYMHPALAYQGIIQEYQQQLSHTRTMRNPHAISQYRVGEALGWLTMLKLAIHCTICHKSVQAGDRARQTRQLLQALSNLKKRNLSLEPLRTSLMLVDGVSMCFQPLRVFHPTHIMEIFAHQLLQLSEKGNCDNFAQIIDLIQQQVLTALKGTEFEALQNAKKHVATIFSLIPPSQPIHANNLPQTPEISATQSTTDEIKPARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP048066.1|WP_032126227.1|387358_387649_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP048066.1|WP_016212008.1|387686_388385_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP048066.1|WP_016212010.1|388401_388698_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP048066.1|WP_155046939.1|388878_389667_+|hypothetical-protein
MTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP048066.1|WP_155046940.1|389871_390255_+|hypothetical-protein
MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP048066.1|WP_075273619.1|390527_391103_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP048066.1|WP_054300516.1|391160_391994_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQQVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP048066.1|WP_016211268.1|392109_393294_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP048066.1|WP_016211271.1|393312_394257_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP048066.1|WP_036777835.1|394561_395347_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDVMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP

Crispr_ID: NZ_CP048066_2

• CRISPR_ID: NZ_CP048066_2
• CRISPR_location: 2653015-2653135
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP048066_2

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP048066_2

>2.1|2653052|47|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048066_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP048066_2

>merge|NZ_CP048066|2|2653015-2653135|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP048066|2|2|2653015-2653135|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP048066.1|WP_016210936.1|2663478_2664273_-|thymidylate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234984
NZ_CP048066.1|WP_036778484.1|2661699_2662311_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP048066.1|WP_155047227.1|2651430_2651904_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_052047041.1|2650961_2651225_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_155046943.1|2652602_2652743_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_036778294.1|2642961_2644344_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP048066.1|WP_155047228.1|2655033_2655516_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|279973
NZ_CP048066.1|WP_075275117.1|2652147_2652570_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_016211759.1|2658706_2659894_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP048066.1|WP_098082812.1|2650213_2650729_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_016210935.1|2660470_2661013_-|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP048066.1|WP_036778479.1|2657735_2658461_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP048066.1|WP_054300492.1|2649058_2650069_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP048066.1|WP_129556590.1|2656370_2656766_+|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP048066.1|WP_016210671.1|2644958_2646218_+|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP048066.1|WP_036778297.1|2644352_2644826_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048066.1|WP_016210943.1|2661009_2661696_-|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP048066.1|WP_032126312.1|2656762_2657557_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP048066.1|WP_016210676.1|2646673_2648755_+|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP048066.1|WP_016210944.1|2662357_2663377_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP048066.1|WP_016210936.1|2663478_2664273_-|thymidylate-synthase	gnl|CDD|234984	PRK01827, thyA, thymidylate synthase; Reviewed.	0
NZ_CP048066.1|WP_036778484.1|2661699_2662311_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	2.90159e-95
NZ_CP048066.1|WP_016210943.1|2661009_2661696_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP048066.1|WP_155047228.1|2655033_2655516_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	4.80837e-07
NZ_CP048066.1|WP_036778294.1|2642961_2644344_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP048066.1|WP_016211759.1|2658706_2659894_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP048066.1|WP_016210935.1|2660470_2661013_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP048066.1|WP_036778479.1|2657735_2658461_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	3.8045e-65
NZ_CP048066.1|WP_054300492.1|2649058_2650069_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.53e-14
NZ_CP048066.1|WP_129556590.1|2656370_2656766_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP048066.1|WP_016210671.1|2644958_2646218_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP048066.1|WP_032126312.1|2656762_2657557_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP048066.1|WP_016210676.1|2646673_2648755_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP048066.1|WP_016210944.1|2662357_2663377_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143

Protein sequences

>NZ_CP048066.1|WP_155046943.1|2652602_2652743_+|hypothetical-protein
MIEDPPALRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP048066.1|WP_075275117.1|2652147_2652570_-|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
>NZ_CP048066.1|WP_155047227.1|2651430_2651904_+|hypothetical-protein
MTYDQRMAFLTISSFILWSFLMKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP048066.1|WP_052047041.1|2650961_2651225_+|hypothetical-protein
MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD
>NZ_CP048066.1|WP_098082812.1|2650213_2650729_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP048066.1|WP_054300492.1|2649058_2650069_+|protein-kinase
MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTQDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP048066.1|WP_016210676.1|2646673_2648755_+|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP048066.1|WP_016210671.1|2644958_2646218_+|6-phosphofructokinase
MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI
>NZ_CP048066.1|WP_036778297.1|2644352_2644826_-|hypothetical-protein
MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFILQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
>NZ_CP048066.1|WP_036778294.1|2642961_2644344_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKKEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA
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MVECADSRHATLCDADSRGFIIVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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>NZ_CP048066.1|WP_016211759.1|2658706_2659894_+|S-methyl-5-thioribose-kinase
MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL
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>NZ_CP048066.1|WP_016210944.1|2662357_2663377_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase
MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK
>NZ_CP048066.1|WP_016210936.1|2663478_2664273_-|thymidylate-synthase
MRTYLDLMQRVLETGAEKTDRTGTGTLSVFGHQMRFDLSAGFPLLTTKKLHLRSIIHELLWFLKGETNIAYLNENKVRIWDEWANAEGDLGPIYGAQWRSWAGADGKTIDQMTQVIEQIKINPDSRRLIVSAWNVAEIEKMALPPCHALFQFYVAEGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTLMIAQVTGLEPGDFVHTLGDAHLYSNHLEQVKTQLQRDCRGLSMMKINPEVKDIFDFKYEDFILENYDPHPHIKGAVAV

Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

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9. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	3075 : 115257	109	Staphylococcus_phage(21.43%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	144957 : 202948	59	Staphylococcus_phage(37.5%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_3	226634 : 297631	60	Acinetobacter_phage(25.0%)	tail,tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_4	326572 : 386432	57	Bodo_saltans_virus(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	470664 : 626724	167	Escherichia_phage(36.84%)	tRNA,integrase,transposase,protease	attL 537451:537510|attR 551661:551834
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DBSCAN-SWA_8	827081 : 894188	57	uncultured_Mediterranean_phage(30.77%)	tRNA,transposase	NA
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DBSCAN-SWA_10	1035929 : 1080272	38	Staphylococcus_phage(25.0%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_11	1106333 : 1165963	51	Staphylococcus_phage(30.0%)	tRNA,integrase,transposase,protease	attL 1119764:1119823|attR 1162587:1163688
DBSCAN-SWA_12	1173141 : 1226063	49	Staphylococcus_phage(20.0%)	integrase,tRNA,transposase	attL 1176740:1176799|attR 1232724:1233012
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DBSCAN-SWA_25	2346835 : 2409175	56	Planktothrix_phage(18.18%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_26	2499065 : 2581775	81	Escherichia_phage(37.93%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_27	2597116 : 2625297	29	Acinetobacter_phage(12.5%)	integrase,tRNA,transposase,protease	attL 2594505:2594564|attR 2612339:2612627
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DBSCAN-SWA_31	3022760 : 3046380	24	unidentified_phage(50.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_32	3077193 : 3129642	52	Acinetobacter_phage(28.57%)	tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP048066|3075:115257|DBSCAN-SWA
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MECADSRHVTLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTFSITFGYDYFEYLKKIL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036776466.1|4569_6462_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis enzyme MnmG	NA	NA	NA	NA
WP_036776463.1|6509_7136_+	16S rRNA (guanine(527)-N(7))-methyltransferase RsmG	NA	NA	NA	NA
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WP_016209322.1|13402_14263_+	F0F1 ATP synthase subunit gamma	NA	NA	NA	NA
WP_016209339.1|14293_15685_+	F0F1 ATP synthase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016209335.1|15709_16138_+	F0F1 ATP synthase subunit epsilon	NA	NA	NA	NA
WP_016209325.1|16231_17596_+	UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase	A0A0N7G7I9	Chrysochromulina_ericina_virus	6.6e-37	40.5
WP_036776458.1|17651_19487_+	glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)	A7IW18	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	3.3e-124	44.0
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WP_075274976.1|21167_21419_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274975.1|21827_22010_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047256.1|22214_23438_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	7.3e-11	24.8
WP_075273397.1|23649_24045_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300271.1|82654_83629_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_036777721.1|84746_85520_-	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_162034399.1|85617_86646_-	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210702.1|87300_90363_-	efflux RND transporter permease subunit	S5VTK5	Leptospira_phage	1.2e-62	22.9
WP_016210701.1|90359_91424_-	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
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WP_016210700.1|92764_93928_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
WP_032126484.1|93933_94533_-	RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210697.1|94720_95221_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.0e-19	41.2
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WP_016211097.1|97706_98549_+	shikimate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_036777711.1|98528_99338_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126369.1|99505_99733_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211100.1|99733_100684_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126371.1|100739_101291_+	YqgE/AlgH family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211103.1|102621_103320_+	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126370.1|103330_104155_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
WP_016211108.1|104484_104853_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|104847_105909_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211248.1|106318_107533_-	aromatic amino acid transport family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036777695.1|108908_110636_+	oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

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MQLMKRKRYVLSILLLSAIVALAMGVKASYAKDHADKKTQLMQCLTPKVLRLAKTTQVGLIAEDLTNGELLYSQNATQSFLPASVIKLVTAIAALAYLPEDYQFKTRISLVGKQVGQLFSGQAYIKFAGDPSFKSEYLTRFVEKLYAQGVRRFNGNIIVDRHDFTAPDAAPGWLVDNMHICYAAPINALILDENCRRTAIFTEDHKVIIKPEFPLSFSNQVKIRDDISLPCRLEIGIKPGNHVVFYGCMQPQQSYRLALAVRDPLDYLVQRLQQVFKQQGITWQGKVREGSSAKQGNAFIYFHSQPLGLMIEEMLATSNNIIAEALLKKLGQLYYHQPGSFTDGIAAIKAILTDQLHLDTENWLLYDGSGLSRYNQVTPEQFNQLLIALYKKPMLYKKVYAVLPRLGIDGRLVYYSVPRHLKGKIRGKTGSMQGVSNLVSIVKLSSGHDVAVSLFLSPGLNKFKNYRKVQMNLLDCFA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556619.1|146913_148122_+	HAMP domain-containing histidine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209598.1|148188_148773_+	YggT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126223.1|148838_149498_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209605.1|150424_151216_+	uroporphyrinogen-III synthase	NA	NA	NA	NA
WP_129556620.1|151296_152181_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047034.1|152182_153370_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|153346_154321_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_155047035.1|154840_155020_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209580.1|155111_155636_+	ankyrin repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209612.1|156019_156388_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209595.1|156425_156698_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300576.1|156788_158084_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211692.1|158719_159622_+	LysR family transcriptional regulator	Q6JIH3	Burkholderia_virus	1.6e-18	28.4
WP_051307362.1|159678_160530_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211694.1|161109_163119_+	DNA helicase Rep	A7KV33	Bacillus_phage	3.0e-110	37.8
WP_054300271.1|163156_164131_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211637.1|164632_166045_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_032126550.1|166537_167545_+	DNA polymerase IV	NA	NA	NA	NA
WP_016211636.1|167564_169085_+	AMP-binding protein	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	2.7e-31	27.1
WP_016211018.1|170035_171352_+	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
WP_016211015.1|171455_171839_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211019.1|171973_175039_-	MMPL family transporter	S5VTK5	Leptospira_phage	5.1e-53	20.6
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WP_016211016.1|176234_176789_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273381.1|176903_177473_+	PadR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_155047036.1|178513_179413_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047037.1|179557_179863_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212565.1|180293_180653_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|180674_181040_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046700.1|181096_181261_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|181250_181550_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126725.1|182582_183149_-	DUF1415 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210241.1|183160_183946_-	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210235.1|184577_185501_+	two pore domain potassium channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210246.1|185552_186548_-	NAD(P)-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210237.1|186579_187074_-	protein-export chaperone SecB	NA	NA	NA	NA
WP_036778333.1|187165_187423_-	glutaredoxin 3	NA	NA	NA	NA
WP_016210233.1|187512_187935_-	rhodanese-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210236.1|188253_188970_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210247.1|189013_189265_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778330.1|189269_190706_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210231.1|190733_192176_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210242.1|192263_192602_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210243.1|192686_193217_+	outer membrane family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210228.1|193277_195470_+	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	1.3e-106	36.0
WP_016210238.1|195512_195998_-	ProQ/FinO family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210226.1|196267_196699_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080664837.1|197561_197705_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_052104672.1|197735_198620_-	formyltetrahydrofolate deformylase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126790.1|200235_201141_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP048066|226634:297631|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209871.1|226634_228617_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
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WP_016209874.1|230436_233106_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|233129_235049_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|235218_236640_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|236785_237760_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_054300537.1|237791_238199_+	glyoxalase	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|238477_238699_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|238862_240524_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|240596_240887_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_036776911.1|241112_241568_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|241632_242097_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|242189_243536_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|243535_244441_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|244502_245489_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|245481_245724_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|245845_247390_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_036776914.1|247436_248723_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|248765_250160_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|250183_250363_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307322.1|250359_250539_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_054300181.1|250542_250824_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|250880_251246_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|254251_254749_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016210095.1|254919_255615_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_080664831.1|255717_257280_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|257595_259389_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
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WP_016210077.1|260365_261796_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|262128_263184_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|263152_263830_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|263819_264656_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|264815_265109_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA
WP_122940784.1|265215_266022_-	trfA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210083.1|266326_267181_-	Hsp33 family molecular chaperone HslO	NA	NA	NA	NA
WP_036776920.1|267335_268385_-	nitronate monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_036776924.1|268435_269092_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210097.1|269109_270390_-	HlyC/CorC family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210096.1|270663_272025_+	signal recognition particle protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126863.1|272424_272976_+	paraquat-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
WP_162034387.1|277288_277447_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211802.1|278407_279679_+	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_036778206.1|279735_280719_+	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016211800.1|280715_281501_+	type III pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|282508_283084_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300535.1|283087_283807_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211357.1|285084_286566_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
WP_016211355.1|286628_287738_-	S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase	E3SJ82	Synechococcus_phage	2.9e-35	29.8
WP_016211354.1|287835_289797_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211359.1|290326_290731_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047045.1|290783_291479_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047246.1|291455_292430_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	1.8e-28	32.2
WP_098082809.1|292600_292951_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034402.1|293668_293806_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|293893_294976_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_129556499.1|296478_297631_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP048066|326572:386432|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP048066|470664:626724|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300513.1|470664_471528_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556623.1|471744_473304_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-09	24.9
WP_051307335.1|473325_474360_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210643.1|474408_474978_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_122940481.1|475113_476085_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
WP_016210645.1|476096_477674_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556624.1|477739_478726_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300512.1|479057_480167_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210650.1|480272_481457_-	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210649.1|481534_483523_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_016210644.1|483731_483887_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300510.1|484157_484340_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|484482_484848_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|484793_485369_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047056.1|485358_485721_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126128.1|486637_488044_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210501.1|488061_489048_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|489050_490205_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|490201_490897_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|491031_492522_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_036777447.1|492542_493592_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|493658_495053_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777444.1|495931_497863_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	1.0e-120	36.6
WP_075273353.1|497867_498398_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_016210493.1|498432_498627_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|498669_499029_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|499448_500444_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_036777440.1|500456_502838_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|502843_503131_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_052133265.1|503402_503879_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP048066|648429:691063|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP048066|708814:822533|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211118.1|723270_724518_+	NADP-dependent isocitrate dehydrogenase	Q77Z09	Phage_21	1.1e-14	72.2
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WP_016210282.1|735975_736713_+	flagellar basal body rod protein FlgF	NA	NA	NA	NA
WP_016210283.1|736740_737526_+	flagellar basal-body rod protein FlgG	NA	NA	NA	NA
WP_032126333.1|737571_738276_+	flagellar basal body L-ring protein FlgH	NA	NA	NA	NA
WP_016210279.1|738263_739430_+	flagellar basal body P-ring protein FlgI	NA	NA	NA	NA
WP_016210277.1|739483_740317_+	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210270.1|740386_743374_+	flagellar hook-associated protein FlgK	NA	NA	NA	NA
WP_016210281.1|743415_744807_+	flagellar hook-associated protein 3	NA	NA	NA	NA
WP_162034413.1|744820_745396_-	murein L,D-transpeptidase catalytic domain family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211367.1|745691_746474_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126330.1|746621_747581_+	TAXI family TRAP transporter solute-binding subunit	NA	NA	NA	NA
WP_036779263.1|747923_749933_+	TRAP transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016211366.1|749988_750276_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126332.1|750528_751728_+	trans-2-enoyl-CoA reductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046995.1|752374_753261_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126540.1|753394_754258_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|754488_754782_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
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WP_016211589.1|756142_757375_-	phosphoglycerate dehydrogenase	A0A1V0SBV6	Catovirus	7.4e-96	47.8
WP_036778365.1|757364_758027_-	HAD-IB family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_129556496.1|758301_759540_-	YihY family inner membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126329.1|759725_760355_+	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211588.1|760430_761132_+	cyclase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556499.1|761299_762452_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2
WP_016212343.1|762691_763498_-	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	W8CYX9	Bacillus_phage	7.7e-09	42.9
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WP_016209808.1|764802_765171_-	cell division topological specificity factor MinE	NA	NA	NA	NA
WP_036778458.1|765167_765986_-	septum site-determining protein MinD	NA	NA	NA	NA
WP_016209813.1|766086_766902_-	septum site-determining protein MinC	NA	NA	NA	NA
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WP_016209805.1|769841_771335_-	neurotransmitter symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209818.1|771467_772283_-	exodeoxyribonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_016209799.1|772378_772795_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209815.1|773181_773721_-	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777937.1|774038_775751_+	HAMP domain-containing protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	4.3e-25	30.2
WP_016209812.1|776197_778021_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1L2BWV7	Bacteriophage	9.7e-44	40.5
WP_016209821.1|778110_778443_+	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209800.1|778473_779070_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
WP_036777933.1|779066_780191_+	2-hydroxyacid dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209822.1|780326_780974_+	methyltransferase domain protein	W8CYT3	Bacillus_phage	1.4e-08	30.8
WP_016209810.1|781030_782944_+	molecular chaperone HtpG	A0A1B1ISV4	uncultured_Mediterranean_phage	6.9e-117	38.3
WP_155047117.1|784533_787833_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209817.1|788534_789503_-	plasmid replication region DNA-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209809.1|789609_790098_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209823.1|790522_790966_+	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|792187_792763_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|792708_793074_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300408.1|793124_793781_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	9.6e-10	31.0
WP_080664854.1|794117_794699_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126179.1|794656_794908_+	TSUP family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211113.1|794937_796263_-	ribonuclease HI	G3MB70	Bacillus_virus	1.7e-37	36.3
WP_016211112.1|796318_796966_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211115.1|797158_799111_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	2.7e-44	28.0
WP_016211114.1|799243_802174_+	peptidase M16 inactive domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274672.1|802539_803133_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|803170_803536_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|803481_804057_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047118.1|804046_805489_-	type VI secretion system contractile sheath large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016212252.1|805526_805685_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212466.1|805999_806725_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372269.1|806929_807301_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075285937.1|807657_808338_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779996.1|808357_809914_+	DUF2974 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211391.1|809925_810501_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728317.1|810567_813933_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|814123_815098_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556498.1|815277_815886_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_036778626.1|815882_817823_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	1.8e-72	33.0
WP_016210594.1|817958_818612_+	glutaredoxin 2	NA	NA	NA	NA
WP_016210595.1|818788_819967_+	formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210588.1|820334_821660_+	fimV domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126176.1|821750_822533_+|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP048066|827081:894188|DBSCAN-SWA
AGTGGTAAATATTGCGAGTTATTATGCTAAAGAGTTAGCCAGTGCTGAAGACGCCTGTGTATTTTTAGGCTGTAAAACACCTGAGTTATGGTTAGAATGCGCTTTAGCTCATCAAGAAATTTTACTGATTGATCATGCACAGTGTGAAAAAAAAGCGGCGACGACGGCGTTATCGATGATTAACCGTTATAGTGATCATACTGATATGGTAATGCGTATGTCTAAGCTTGCTCGTGAGGAGCTTAGACATTTTGAGCAAGTATTAGTGATTATGAAAAAACGTGGCATTCAATATAGTACGCTTTCCGCCTCGCGTTATGCTGAGGGTTTGCGTCAGCATATTCGTGCTGGGCGTGTTGAGTGCTTGGTTGATACGTTAATTATTGGCGCCTTTATTGAGGCACGTTCGTGTGAGCGTTTTGCTGCATTAGTTCCTTTATTGGATACAGAGCTTGCAAAATTTTACCAAGGTTTGCTCGCGTCTGAAGCACGGCATTTTTTAATGTATTTGCACTTTGCCAAAAAGGTTGCTGATGAAAGTATCGATAAGCATGTTGAGCGTTTTCGTAAAATTGAGTGTAATTTAATTGAAACTGGCGATGAACAGTTTCGTTTTCACAGTGGCGTGCCTCGTTCGCTGCGAGCCATGGAATGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTTTACTGAAGCAGGTTCTTTGCAACAATAACAAATTAGATGAATAAATTATTTTCTAGCTTAATTGCAAAATACTATGATATTTTGATGGAATAATTTTAGAAGGTCAAGCGAGGAGTGCTTATGCAATTACGGTTATTTATTATTAGTCTGTTTGTTAATCTATGGGTCATTACCTTTCATGCTAGCTTTGCTAGTTCCCCGGTTATTCAAGAGAGTTCTGAGCGTTTTCATCCTGTTTGGGCAGCACAGGGGATGGTGGCAAGTCAGGAAGCTTTAGCGACTAAGGTTGGACGTGATGTTTTGGCTCAAGGTGGTAATGCCGTTGATGCTGCTGTGGCTGTGGGCTTTGCCTTGGCAGTAACCTTGCCGCGTGCTGGTAATTTAGGCGGTGGTGGCTTTATGTTGGTTTGGTTGAATAAGGAACATAAGGCGCTTGCGATTAATTATCGAGAAAAAGCGCCACTTGCTGCCAGTGCGAATATGTATTTAGATAAAGAAGGCAATGTTGATCGGCATAAAATCACCCAAACTTATTTAGCCGCAGGTGTGCCAGGAACAGTGGCTGGTTTAACCTATGCGTTAAAAAAATATGGTACGATGCCGCTCAAGCAAGTGATAGCACCTGCGATTGCACTTGCTCGTCAGGGGATTCGAGTAACACCTGATTTGGCAAGTTCTCTTGTTCAGGCAAAAGCTAGATTAGAAAAATCACCGAGATCTCAAGCGATTTTCTTTAAGAAGAACAATCAAAATTATCAAGCGGGCGATTTATTGATTCAAGGTGATTTAGCAAGTAGCCTTTCATTAATTGCTCAACAAGGAGAAAGGGCATTTTATCAAGGAAAAATCGCTAAAAAAATTGTTGCAGCAATGAAAGCGCATGGTGGGTTAATTACCCTTGCAGATTTAAAAAAATATCAAGTGCAGGAGCTGGAGCCGATCGTTGGTCACTATAATGGCTATACGATTTATTCTATGCCACCGCCAAGTTCTGGTGGGGTGACACTGATTGAATTACTCAATATTTTATCTGGTTTTCCATTAAAAGACTTAGGTCTTAATAGTGCTCAGAGTATTCATCTAATGGTTGAAGCGATGAATTTAGTTTATCGTGATCGTAATCATTATTTGGGTGATCCAAATTTTGTTAAAATGCCATTAAAGCGTTTAGCCTCTATGCAGTATGCGGATCAATTACGCCAGCAAATTCAATGGAGTTATCACACACCATCATCAAAAATTTCAGCAAAGAAATTTGATGATCCTGAGAGTTATCAGACGACGCATTACTCTATTATTGATAAAGACGGCAACATGGTTACAAATACTTATACCTTGAATTATTCCTATGGTAATGGTCATGTTGTCCCTGGAACGGGTATATTACTAAATAATGAAATGGATGACTTTACGGCTAAGCCTGGCGTGCCGAATGGCTTTGGTTTGGTTCAAGGTGAAGCGAATGCAGTTGCGCCGGAGAAAAGACCATTAAGTTCAATGACGCCAACCCTCGTGTTAAATTCACAAGGCCAGCCATTATTAGCAACAGGCTCTCCGGGGGGTAGTCGCATTATTACCACGGTTTTGCAAGTTTTACTTAACCGTTTTACTTATGGATTAAATATTGCGAGCAGTGTGGCTGCACCAAGGATTCATAGCCAGTTATGGCCGGATGTGATTTTATATGAACAGGGAATTAGTTTAGATACTTTACTTAAGTTACAGGAAATGGGCCACAAACTTCAACCTGTTGATGCGATGGGTTCTGCACAAACGGTGGAAAAGAACCAGACTCGCGGTGATTATGGTGTTGCAGACCCACGTCGTTCTGGTGCATTGGCGGCAGGTCCGAGTGAGATAATTTCGAAAAAAGCAGTTTAGTTATTGCACTAGGACTTTTAAATATACATATAATTTAGGCAGGTTTATTCCTGCCTTTTATTTAATTAAATCTGAGATTATGGCTTAATTTCAAGGCTTGATCGTAAAAATCTATGATTAAAATAAATCTCTGAATGTTTTTTTAGTTGCTTTACACTATTTTAGTGATGGACTAGGTTACTTATTGGGAAAATATCAATCATTGTTGTCTATCTGTAGTCGCTACTCTATTAGCTTTTATTGGCTTTTCCCTGGGGTTCTATTTGGATAAGCTCGTGTAGATTGTTCAAATTAAGGCATACCGTTAGTGGTATGCTTTAAATACCATATTATAGCACTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACATGTAAGTTACCCTAACTATTGTTATATTGTTAATAAACTTTATATATATTGGTTAAATGTAGTTTTAATGTTAGGGTAATTGCCTTTTATTTAAAACAATTTAAATTATAGCTTAGTTAATGTAAATATTAGCTTGGTTTATTTTTTACTGTCAATAGCTTTTAAAATATATTTTAAGAGTGAAAGTTGGAAGTTAATATGATAATTTCTAGTTTATTTAATAAATTTCTTTACTTTACAAAGAGTAATAGTATGAAAGTTGTGTGATATTGACGCTTCTTATTGTTAATAATATTTAATTTATAGCAAAGATTTATCGATTTAATCTTTATTAACATTAATAGGATATTTTCATGCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGTGATCAGGCTACCCTATTCCGGACAAATAAATTACAATAATCCGAGCCGGAGGAATCACAATGGGAAAGCGTCACGTCACCAAGTACACCGAAGAATTTAAAAAATCATCTGCCAAGCTTGCAGTCGATTCAAATCAAGCAATCAGTCATACAGCACAGGAATTGGGTATTCACTCAAGTACACTGCATGGTTGGGTCAATAAATATCATCCAAACAGTCCAAATACTGTTAAAGATGAAGTTAGTGATATGGCTGCTGAAATAAAACAGTTAAAAAAAGAGTTGGCTAGAGTGACACAGGAACGTGAAATACTAAAAAAAGCGGCGGCGTACTTTGCAAGCGAAACACAGTAAAGTATGCCTGGATCAAAGAAAATAAATGTGTTTTTCCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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MSFELLHKDGRARRGRLSFPRGVVETPAFMPVGTYGTVKGLTPEEVSATGAHIVLGNTFHLMLRPGTEIIEQHGDLHDFMQWQGPILTDSGGFQVFSLGALRKLDEKGVTFRSPVNGSKVFMGPEESMWVQRKLGSDIVMIFDECTPYPASYETARESMELSLRWARRSKDAHGDNPAALFGIIQGGMYPDLRQRSTEGLLEIGFDGYAIGGLSVGEPKHEMFSTLDATTPLMQEDKPRYLMGVGTPDDLVEGVRRGVDMFDCVMPTRNARNGHLFTSEGVIRLRNSANKTDTRPVDEACACSTCRHYSRAYLHHLDKCNEMLGARLNTVHNLHYYQKVMRGLRTAIDAGKLDEFVCQYYAKQNKDVPELA
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MKKLFAILGLLAVSSASFAADAPAAGATSSLMSFLPLVVIVIIFYFLLIRPQSKRAKEHRKLLSELAKGDEVSTSGGVLGKVIKVDESVVTIEIANDVEIQVQKSAVSAVLPKGTIK
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MPYVEVESRLSKMQKIDEKPGGVTNGFIGIKVNKGEEGELFNKFKDFYLDRYNIDVRDLEITNYYQLIQLFHLDNIKESYKDIKSAFTKYCKENGFAYLVKNDHKDPRISRGVLNQVSNPTKNFRQTGTYTKLSAKGRLGTLAAEAMGYAYNIAKRGYKEDKNKESLEEVFALNLANIIGLGAPQASILVKKYKNGEAKFCVKTHWEPSLIHDQSASKVTAHTRYLAAMLTISDYDMLGSRGQNAAAKLRADGSGTDLYVYDCGHPFSNKAITNIAPFESENDLYTLVGLVNTYLALPKSWLTQSQINILEHIKDYIETIPALNQYIIQNPKSYRQMKEGLTNDIESLDISHDEKLFYKSHIEGLETKLQESFRNTVMSLFKSNKDIVKAIQAAARRKHVKHVKLLNKQLSWQLSTVLQNIHTLGSQGYGQAYHQARESFNSLCAFLNGNDPETAIKLIEHKEKEIPDSQNTPQELKNLKIQLKKLKEILIDPDIHNKYLHTTIQKQYAVEKIRKVIYTKLSNITKSSENIDKLYDQFKELISAYNLAKSQLAHHDITPSAQELFNAELEAIEKNSKPDELNSVNFEQLKEFVKNDFQDLPEHKHVEKLDSSATITTATPKNKERTITLESLPPTRKRASAYSQPDSSNTPLPKEHLKQQVSLQLSSLLQNIHKLGSAEIALSEPYQESQRAFNILCAFLSGNEPKAAVKYIEHKEKEIPDTPGTPQELKNLKVELQKLKGLLTNPDIANANLHVTMQKYYALDTARRNIFAKLSSIVKSSESANNLSEQCKRLIDAYNLAKANLPNNEIIPTAQELFSIELTAIESNSKPEELHSINSARLKRFIQSGFQEHTEKSATDTVSATAPISRKRADAYLHQPCRTSSLMLNAFTNAHHQHADTEMAPAIVVAP
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MKEIIDLTASIDESHQGERIDQVLADLFSDYSRSRLQAWLKAGAILVDGQTWRAKDKVIGGEMVTLHVERELEIVAKPQPIDLNIVYQDDALIIINKPAGLVVHPGAGVQDSTLMNALLHLDPAIATVPRAGIVHRLDKDTTGLMVVARTLEAHTKLVDALQKREIRREYEAVVQGILTGGGTIDEPVGRHPVHRTKMSVVKPGQGKPAVTHFKVLTRFLQHTHVRVQLETGRTHQIRVHMAHRRHALIGDGTYGGRLKIPAGASDELKNMIRYFKRQALHACELSLAHPVTGELMTWQAPLPEDMTQLLMALKHG
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MDVVIIGATGLIGSALILKLYRQHEITAVGRDVRVVRQQFPFCKSLALQDLGLEDLAACDVVINLAGENIGQGRWNEARRAKIINSRISVTQQVVTLCRKLGHEAPRVFNASAIGVYGLQETSVSVSPQLTEESPLPSPPTDFLSEVAIDWENVLKFLDPEKVVQLRFAVVLAGNGGALPKLALPFYFGCGGKIASGQQMVSWVALKDVVAAIVFLLERPLLWGAFNIVAPEGVHQYQFAGVLANVLKRPNLMWTPGFLLQLVYGQMAKELILKGQYVVPKRLLDVGFQFQYGDLARALQDIYSE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_054300173.1|833607_834669_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300406.1|834969_837705_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007042.1|840258_841074_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047119.1|841482_842805_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	9.3e-12	24.3
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WP_105962623.1|843442_844596_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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WP_155047121.1|846115_847219_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	9.5e-10	24.8
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WP_016209947.1|848342_849005_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209940.1|850417_853189_-|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
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WP_016209931.1|853860_855333_-	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
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WP_016209932.1|857539_858580_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
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WP_016209935.1|862180_863125_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
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WP_016209944.1|864458_865886_-	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
WP_036777566.1|866086_866764_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209939.1|866898_868173_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
WP_036777569.1|868240_868996_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209948.1|869047_869965_+	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273594.1|871039_872410_-	MFS transporter	Q6JIH2	Burkholderia_virus	4.2e-39	27.4
WP_054300276.1|872449_873424_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.0e-28	32.3
WP_016211771.1|873716_873905_+	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211770.1|873918_875052_-	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075285934.1|875251_875560_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034414.1|875547_879342_+	tandem-95 repeat protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210891.1|885130_885904_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126206.1|886437_886734_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210888.1|886756_887008_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047123.1|886953_887676_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210886.1|887744_888524_-	outer membrane protein assembly factor BamD	NA	NA	NA	NA
WP_016210887.1|888606_889557_+	23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase RluD	NA	NA	NA	NA
WP_016210889.1|890066_892913_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556478.1|893302_894188_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP048066|934582:1014509|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211219.1|941408_942686_+	FAD-dependent 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34) oxidoreductase MnmC	NA	NA	NA	NA
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WP_016210805.1|954629_955301_+	pyrimidine 5'-nucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_032126141.1|955719_956994_+	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016210804.1|957058_958978_+	DNA mismatch repair endonuclease MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	4.5e-84	34.0
WP_032126139.1|958984_959914_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA
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WP_155047129.1|963453_964110_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|964313_964679_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556449.1|964693_965200_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211418.1|966341_966803_-	YaiI/YqxD family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP048066|1035929:1080272|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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MFNIFKPARHRAPLPKETVDSAYKRYRFQVFLGIFIGYAGYYLVRKNFSLAIPYLQQQGFDKGDLGLVLAAVSIAYGLSKFVMGTISDRSNPRTFLTVGLLLSALINLFFGAASISMSSIPLMFCLMFLNGWFQGMGWPACGRTMVHWFSVGERGTKMSIWNVAHNVGGGLIGPLAIMGLALFSAWQSLFYFPALIAIVVAIFVFFSLRDTPQSVGLPPIEVYNNDCPAVAQHNEHNYDHERELTTREILFKYVLNNKLLWYIALANVFVYLVRYGVIDWAPTYLTEAKGFDHKESNWAYFLYEYAGIPGTIVCGWLSDKVFRGQRAPAAILYMLGVVGAVLVYWLSPAGYPWVDSLALIAIGFLIYGPVMLIGVQALDLVPKKAAGTAAGLTGLFGYLGGAVLANALMGYIVQYLGWRGGFIMLVAACILAIFFLSLTWSSHSKKKAASVANMT
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MARSGRYYISSHKSSEEKLPEYIRNHWGIENKLHWVLDVHLNDDADRKLNKNAVDNISRIKRLAVNLVRKNDFGNKKSVRLKLKQLQWDENYLLNILLGKS
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MQLHVVKRCLLVIILLLFSSFCLAAELAYVHIRPQFLTNLQGTTKHLYVEVTLLIPKDASVEEVINNNMPLIRSALVDLFSQQTLKKLSKKRGVNGLQSEALKTITRVLTENAQNVDIKRVLFTKFNYN
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MKKIIHSLLVTATTLTTLSFNAHAVDIYGHRGARGLSPENTIPAYNTALRLGVNYVDMDITMTKDGVLVVNHDLNLNPNTTKNNKGQWVSKKNSLFINTLTLKQLQHYDVGTIKPGTPYSTLFSQQYPVQHTKIPTLKYVVQYVKAIAGEKVGFQVEIKTDPAHPHQSATPKQFATALAKLLKAEGITDRTEVQAFDWPCLIALQKINPNIKTAYLTEAASNKQMTSDNPKIAGLWTGGHLLKNYNNSIPKMIHALGGKLWDPEDRELTKPSLEEAHKLGLKVVVWSDPVATGQAFDNKMMEKMISWGVDGIITDRPDQLRGLIAARGFNLPQGFIINNT
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MAKLYSDQKVLLIYLTVRSLESTGPLTEFRELIVSAGREIVNEICLSRSDVHAASFLGQGQIERVKEEFINSNEGISEVIINHALTSVQVRNLSTLFSCRVLDRTDLILDIFAKRARTFEGKLQVELTQLQHQATRLVQKSGHYDQQRGGIGVRGGAGETGLEVDRRVLRQRIATLKKRLVHIRDSRALGRQRRQRSQQPTIALVGYTNAGKSTLFNALSDSSAYADDRLFATLDPTLRRAVIPGFGDIVLADTVGFIQQLPPQLIDAFRATLEETAQADLLLHVIDGASEDYLLRIEQVNEVLVEIGAEHIPQILVFNKVDLLDNLASSALKLDCQESWARVSAVKQLGFDVLYEKILYAIGGEAVDTVLRIPMNRAEVRTELHRLRTVLSERYDEDWAWIHVKGSYAVLNHALDRYGLSLIQCKQY
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MTIHARSGLNQESRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MVNSKKLGGRPPKYGKRVMFDATLYLLRTGCSWRHLPKDFPPWKSVYTQYRSWIKCNIFERIHAILRNKLRKLDGKKPTPSAGIADSQSVKITDRGGLHGYDGARRLMVGKGI
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MQKFMPCEEDDDFFGLSSNHHQLLQASFAFTESIQLNQPALFFDQKRAQKEALRAVLSCEGTIL
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MGLFSVIVIAVTSMIGSGWLFSAQLNAQLAGNYAFIAWIIAAAVAIIVGLCFSRLCILFPERGINAKCTSISHGKDFGMIFAFAIWFGLLAMIPTEAQATTQYLSPFIKFVTLYQNDALTITGKFAALVILLVYFIINYFGITLLAKVNNISTVFKVSIPLLTIIILLAAHFDTTNFNLSANANEYTLKTVKTALIGAGLIYAFNGFQVVAAFASEIKNPQRNVPLAIIISILFTLGIYMLLQLAFMGAIPTEIAIKGWSQLNFNSPLVNLTMLLGLNFIVIALIADSIVSPSITGMTYLGACSRMLYAMAEQGQMPRWIAKLCPKHNLSKRSLILNFIISAIILFNSSSWAALMVLTTAFNILGYIGAPLALGVLDKKRRFFYGVVFVMLGLLLSTLNTQDFILSNLAISVMMVIYAGVQLKNGKRFNLRSFSFIAYLWILMLVAHLNWAVVILAFAFFFYATGEKFTQQSKILNPPEAKFTSA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210928.1|1036555_1036861_-|transposase	ISAs1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046723.1|1037019_1037175_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728346.1|1038081_1038414_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047138.1|1038431_1038914_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_162034416.1|1038889_1039231_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047140.1|1039317_1039902_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1039847_1040213_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211651.1|1040446_1041982_-	glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211650.1|1042106_1043591_+	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
WP_016211648.1|1044538_1045078_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047141.1|1046281_1046488_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075278621.1|1046676_1047018_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126641.1|1047053_1049624_-	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.9e-30	22.9
WP_016209840.1|1049731_1050217_+	CinA family protein	B5TK85	Pseudomonas_phage	1.2e-36	56.2
WP_016209844.1|1050389_1051430_+	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
WP_016209835.1|1051407_1051890_+	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_016209832.1|1054786_1055050_+	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_016209831.1|1055328_1056027_-	DUF3865 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209841.1|1056246_1056441_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|1056516_1058076_-	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_161625459.1|1058394_1059267_-	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1059399_1060374_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155064795.1|1060613_1062071_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_016209826.1|1062899_1063922_-	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_036777393.1|1064252_1065620_+	glycerol-3-phosphate transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209846.1|1065855_1066110_+	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_032126639.1|1066125_1067412_+	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_016209836.1|1067431_1068646_+|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
WP_016209838.1|1068645_1069539_+|protease	protease modulator HflC	NA	NA	NA	NA
WP_016209839.1|1069736_1071035_+	adenylosuccinate synthase	A0A2R8FF47	Brazilian_cedratvirus	1.2e-64	33.5
WP_016209829.1|1072414_1074814_+	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	2.7e-70	33.5
WP_016209834.1|1074810_1075569_+	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
WP_016209842.1|1075745_1076135_+	flagellar basal body-associated FliL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300373.1|1076862_1077720_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1077716_1078691_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155046721.1|1078862_1079030_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|1079210_1080272_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP048066|1106333:1165963|DBSCAN-SWA
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MPGRLTRPTNKKTISSLLFSAVRSSHARRIERIQKYLDSGVDPNARYLVEGISYNSIDAAIKWGGSPDIVRLLLNKGGNPYLHTRGVQWPDDNRIKKQMMAALLEYSQFKIPAHVLGRLLFWGVEHNHIDIVQKTLEMGADPNTYCYLQGSHHKKSLTPFQLAVKLKSREMIPLLLQYGADFDLNFHEENGKDPLTYARSNDDDGQFFDFLLDQYHRQIGACKQVQAGIGLEQVRVKLGPEQTQGRPLNAELDHLVAGFLVGKDHQFDFSEFQKQIEIDKSQSKSLEEQRKEENRENWGYFCSKVAGSGNSPKTQALRNFKKCEPTKRAMKGLIATAAQRRGDDEWRPNSLKRLCKMLKKENYSFLLDLLGIKKDQVTADNLRSIAIYDCIGKVDSSGYAYDYFSIKRMGKPREGYICADQTKFFNNIRDKKHPHFLFQDRYNIIEECEIGPALEPIW
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MEIASFLNALSGFVWGPVMLILLLGCGLYLTIRLRLLQLRKLGVALKLIVKKDSKQAKGEISGFKALTTAMAATVGTGNIAGVATAIVLGGPGAVFWMWMTALIGMVTKYAEAVLAVKYRETDANGNFVGGPMYYIKNGLGSRWRGLGVAFAIFGTIAAFGIGNSVQSNSMAHVLNNHFGISPWLVGGVSAVLVGLVLFGGIRWIGRVTSYLVPIMAVFYIIGGLVVIGLNIHHLSSVFMLIINSAFSGAAAAGGFAGATIMAAIRFGVARGVFSNEAGLGTAPIAHAAAKTNSPVRQGLIAMTGTFFDTMILCSITAFVILLSGLWTSGETGAALSSDAFQVAFNGGGLVVTVGLVIFAFTTLLGWSYYGERCASYLFGTKIIIPYRILWVIVIVLGAVANLNLLWLVADILNALMAIPNLIALILLAPIVVKLTRDYEGS
>NZ_CP048066|1106333:1165963|1149361_1150288_+|WP_075273553.1|DBSCAN-SWA
MVITDATATNIALPNITLSLHANLADLQWIVGGYTLTFACFLIFAGYLTDRLGARTMFLFGLILFSITSIACGLSTIVGALISFRLLQGISAAILVPASLSLINSNYSNQKDRACAIGIWGSAGGIAAAGGPIFGGLLTSGFGWPAVFFINVPIGIISVIVVYKNVYDASIRENYKFDILGQIIGFIAVTLLMYFLVELGNQGHSLSGITIMIGGSGIFALSLFIYIEIYSSHPILSLTFFREKNFSISMIIGVLINIGLYGTLFILPLYFQQIKGYNTLKIGLSILPMLVLVSISSYLSGKVIALNE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211286.1|1107130_1107478_+	50S ribosomal protein L19	NA	NA	NA	NA
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WP_032126803.1|1112148_1113381_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	7.5e-32	26.6
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WP_036778577.1|1128062_1129346_-	homogentisate 1,2-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210325.1|1131137_1132514_+	ankyrin repeat domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126265.1|1142903_1143821_+	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104656.1|1144144_1144648_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155064793.1|1147883_1148054_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047262.1|1151537_1151654_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212589.1|1152042_1152480_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_129556637.1|1152954_1153734_-|integrase	site-specific integrase	NA	NA	NA	NA
WP_016210843.1|1154348_1154579_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210844.1|1154665_1155793_+	Fic family protein	D7RWK9	Brochothrix_phage	5.7e-10	23.2
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WP_032126340.1|1157794_1158556_-	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046965.1|1158835_1161292_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210839.1|1161443_1162217_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_148037535.1|1162275_1162482_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1162622_1163597_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211148.1|1163801_1165130_-	sodium:alanine symporter family protein	NA	NA	NA	NA
1162587:1163688	attR	NA	NA	NA	NA
WP_016211143.1|1165393_1165963_-|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	7.3e-30	39.5

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP048066|1173141:1226063|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126690.1|1212615_1213098_+	WbuC family cupin fold metalloprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016210112.1|1213791_1215219_-	YdiU family protein	A0A075BSJ0	Microcystis_phage	2.5e-55	35.0
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WP_016210114.1|1217334_1218594_+	calcineurin-like phosphoesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016210107.1|1218665_1218938_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036793752.1|1219227_1220700_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210113.1|1221146_1222196_-	RNA polymerase sigma factor RpoS	M4SMP8	Cyanophage	7.9e-30	31.5
WP_016210110.1|1222383_1223139_-	5'/3'-nucleotidase SurE	A0A1B1ITZ2	uncultured_Mediterranean_phage	5.4e-65	52.0
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WP_016210106.1|1224971_1226063_-|tRNA	tRNA pseudouridine(13) synthase TruD	NA	NA	NA	NA
1232724:1233012	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP048066|1234004:1287941|DBSCAN-SWA
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MRISSQFDAGNIEVISAESVNNLQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGNALIIKHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLEQSNSDHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDENNALAHVLLSKAVFYVVANMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTNSPEVYYVKEKMQETGVDLFLDIHGDEALPYNFVAGTEGNPSYSARIQSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR
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MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLANGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKKSPILFTIISYAGAGYLVYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLFNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFNIVVQ
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MGYPVEFRRKVFKLKEKKELTYEEVSELFGVSMRTLFRWNTRIEIKKKAPKPRAINLEELKNDVRNHPDSYQWERAQRFGVSQHCIQHWLNFLGISCKKNTKTSKSQRKYTYKLPE
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
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MRALRDIKKDKGINQALDRSCGGFSTKVHILTEGLGYPVDFVLTRGQAHDAPQAQGLLTSVAFDQIIADKAYDDIKIRELVVKKGAKCIIPSKSNRINKFDHDQHVYKERHLIECCIGKLKQFRRVFSRFEKRACRYLSFLKIASTILWLR
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MRENGQRLKPRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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>NZ_CP048066|1234004:1287941|1237323_1238130_+|WP_016211631.1|DBSCAN-SWA
MKQIEQKISILLLLNFTLISTSLAATSHMTGYFENVTNNSSIDIVIKQGNKPYIQIINAADSMLPFIKTDVEKNTLMISTKPNAPWDAFKHTKINVYTPHLTAIKNSSSGKIKIYYADKLTAVTLSGSGDIKGKNIKAEKLAVKLTGSGDINLSGILKVQAIDQQGTGDVELSNIYQNALTITHSGSGDTKLKGRINQLSINNKGSGKIDTRDLKAKQVTVSFSGSGNINLYAQNSLNAELSGSGNINVEGHPQHISQKTRGTGHIKL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211632.1|1235356_1236211_+	DUF481 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300351.1|1236246_1237068_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211631.1|1237323_1238130_+	DUF2807 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047157.1|1239183_1239588_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|1239652_1240805_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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WP_155046942.1|1242528_1243415_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300349.1|1244475_1246200_-	protein kinase	M1I1A9	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	1.7e-05	25.6
WP_032126825.1|1246751_1248065_-	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	3.5e-51	32.0
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WP_098082850.1|1249514_1249691_+	DUF1508 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104609.1|1249726_1250359_-	MarC family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047158.1|1251180_1253454_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372279.1|1253592_1253928_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212266.1|1255149_1255797_+	LysE family translocator	NA	NA	NA	NA
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WP_054300173.1|1256423_1257485_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211733.1|1258099_1258924_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	X2KR27	Campylobacter_phage	2.4e-05	28.3
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WP_016211732.1|1260792_1261491_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144019306.1|1261854_1262034_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126682.1|1262095_1262422_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777261.1|1262529_1263273_-	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211403.1|1263286_1264330_-	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
WP_016211405.1|1264465_1266238_-|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L0E9	Tupanvirus	4.9e-08	41.9
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WP_054300271.1|1268987_1269962_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_016211669.1|1270786_1271137_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211666.1|1271291_1274111_-	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
WP_016211664.1|1274483_1275212_+	single-stranded DNA-binding protein	A0A2I7QWB5	Vibrio_phage	6.2e-42	65.6
WP_032126677.1|1277180_1277744_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211557.1|1277938_1279168_-	na+ dependent nucleoside transporter family protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.0e-08	22.0
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WP_032126678.1|1280166_1281177_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
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WP_016212424.1|1283656_1283935_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300271.1|1286966_1287941_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP048066|1316587:1352136|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_14

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300339.1|1351164_1352136_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	9.2e-25	33.8

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP048066|1510557:1569023|DBSCAN-SWA
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MCANDIELDEMWSFVGHKKNQRWLWHAIDHSTRKILAYHFGRRKDEALIALKSKLSSAASHGVLSTG
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MNSPLYPDNISDSEWTLIRKYLVNSKKLGGRPPKYGKRVMFDATLYLLRTGCSWRHLPKDFPPWKSVYTQYRSWIKCNIFERIHAILRNKLRKLDGKKPTPSAGIADSQSVKITDRGGLHGYDGGKKINGRKRHIITDTSGLLIKAKVTEANLGDRKGLTRLLDSIVGKFHRLKTVYVDMGYNGYKFSNEIKKKFNKIIEVIKRPRKYFWVPSDVTDVASYLESIGYEVVDGFKAQSKRWVVERTFAWIGKYRRLSKDYEYKVNYSESLIYLAMIKNMLGKIIKKGV
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MVIALENSSLKNYIGLMDQLNSLGIDNLVVAGEKATLIHLQGDNRREDAQKIKDILPGSIRLIDTKKPTL
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MLSLAVITTAYLAQQPLLSAPISKTQINTAYSQNIQSIKQEFIIKITQSENTINQMILQKRQHILSLIQKKSLSKQEITQLQALAKQYKLNNLHFKHPHDFSALLKRVDIIPNALISAQAINESNWGRSRFAIEGNNFFGMRCHYPGCGIIPKARPANNHWEVANYSSMTASVRAYIHTLNTHNAYQALRDLRADMRANHQDISAFKLAEGLTAYSIKGTKYVELIQKIITRYLSKESTFQFA
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MPDSGSDEVNEAKQELFAAKIADGTPGLYLALKNGCHQATESYIDGVFSASLGIALNE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211983.1|1511946_1512606_+	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_016212551.1|1514522_1515017_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211946.1|1516372_1517128_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211943.1|1517388_1517742_+	ArsC family reductase	NA	NA	NA	NA
WP_033923708.1|1518993_1519869_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036776195.1|1520280_1521528_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047180.1|1522170_1522374_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300304.1|1522426_1522705_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209473.1|1522777_1523161_-	holo-ACP synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209489.1|1523157_1523889_-	pyridoxine 5'-phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209497.1|1523891_1524635_-	DNA repair protein RecO	NA	NA	NA	NA
WP_016209492.1|1524648_1525548_-	GTPase Era	NA	NA	NA	NA
WP_016209466.1|1525553_1526228_-	ribonuclease III	E5EQH1	Micromonas_sp._RCC1109_virus	8.9e-27	34.5
WP_129556644.1|1526633_1527521_-	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209482.1|1527571_1529374_-	elongation factor 4	A0A2K9L2P9	Tupanvirus	5.1e-21	39.2
WP_016209457.1|1529673_1530255_-	RNA polymerase sigma factor RpoE	NA	NA	NA	NA
WP_036776203.1|1530398_1531973_+	L-aspartate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_155047181.1|1531980_1532322_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209486.1|1532419_1532671_-	succinate dehydrogenase assembly factor 2	NA	NA	NA	NA
WP_016209469.1|1532751_1533750_+	folate-binding protein YgfZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209471.1|1533896_1534223_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209462.1|1534232_1534376_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209474.1|1534385_1534796_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034426.1|1534937_1535162_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034427.1|1535053_1535239_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047182.1|1535952_1537983_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209467.1|1538052_1539078_-	FUSC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034462.1|1539070_1539352_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776209.1|1540555_1541551_+	glycosyl hydrolase family 17	NA	NA	NA	NA
WP_016209459.1|1541810_1542977_+	rasGEF domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209478.1|1543140_1544094_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_036776213.1|1544116_1546135_+	DEAD/DEAH box helicase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209490.1|1546225_1546549_-	YqcC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209463.1|1546975_1547359_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126730.1|1547713_1548202_-	glycine zipper 2TM domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209472.1|1548304_1549675_-	DNA repair protein RadA	NA	NA	NA	NA
WP_016209456.1|1549788_1550520_+	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase family protein	M1IDP9	Pelagibacter_phage	5.3e-09	35.8
WP_016209491.1|1550544_1551642_-	alanine racemase	NA	NA	NA	NA
WP_016209475.1|1551674_1553096_-	replicative DNA helicase	A0A077SK18	Escherichia_phage	1.7e-152	62.1
WP_016209484.1|1553305_1553758_-	50S ribosomal protein L9	NA	NA	NA	NA
WP_016209480.1|1553769_1553997_-	30S ribosomal protein S18	NA	NA	NA	NA
WP_016209481.1|1554046_1554373_-	30S ribosomal protein S6	NA	NA	NA	NA
WP_052104552.1|1554575_1555265_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209488.1|1555414_1555903_+	GAF domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209465.1|1555943_1557044_-	3-dehydroquinate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209460.1|1557090_1558173_-	chorismate synthase	A0A291AU41	Pandoravirus	1.0e-72	42.1
WP_075274651.1|1558162_1558729_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007071.1|1558719_1560075_-	3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209485.1|1560076_1561099_-	chorismate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_155047183.1|1561123_1561897_-	3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209496.1|1561926_1562139_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047184.1|1562544_1563564_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047185.1|1563663_1564549_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047186.1|1564553_1565783_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126540.1|1565812_1566676_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046981.1|1567674_1567851_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300299.1|1567940_1569023_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP048066|1572928:1642079|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_16

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

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MLSKDLEMTLNLAFKVAREKRHEFMTVEHLLLSLLDNTAAASVLQVCGADLERLRHSLSQFLDETTPLIPSNDYDCDTQPTLGFQRVLQRAVFHVQSAGKTEVTGANVLVAIFGEQDSQAVYFLRQQNITRLDVVNYISHGISKIHDDDPSVDYDQPSPQGGGERGEEAEEAMVGPLESFAVNLNEKARQGAIDPLIGRNQELERVVQVLCRRRKNNPLLVGEAGVGKTAIAEGLAWRIIENDVPDVINESVVYSLDLGALLAGTKYRGDFEKRFKSVLRQLQKVKDAILFIDEIHTIIGAGAASGGVMDASNLIKPLLSSGELRCMGSTTYQEYRGIFEKDRALARRFQKIDITEPTEDETYRILKGLKSRFEAHHNIRYSNSALKVAAELSARYIPDRFLPDKAIDVMDEAGAYQRLREQDKRKKVITVTDIEKIIAKMARIPEKRVSASDRKSLENLERDLKILIFGQDEAIEALVSTIKMSRAGLRDEAKPIGSFLFAGPTGVGKTEVSRQLSKLLGVELIRFDMSEYMESHSVARLIGAPPGYVGYDQGGLLTDAVTKQPHCVLLLDEIEKAHPDIFNILLQVMDHGTLTDNNGRQADFRHAIVILTTNAGAFEESRASYGFFEQDHAADGIESVKRAFSPEFRNRLDSIIRFKPLSFDVIKHVVDKLICELQAQLDDKGILLDIDEEARGWLAEHGYDHKMGARPMSRLIQNVLKRPLAEELLFGKLSHGGAVHITQKEGELCLDFQEEKV
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MKIWTVANQKGGVGKTTTAVTLGGILASQGKRVLLLDLDPHGSLTSYLGYSPDKVEKGAYELFLQKGRMSAVLGDQIIKRTNFADLWLIPASITLATLDRQLGTQEGMGLLITKALKKLRVRYDYVIIDCPPILGVLMVNALAACEKVIIPAQTEFLALKGLERMIDTLAMVKKTKSFNFSTVILPTMFDRRTSAALGSLKILEEQYKKWLWRLPVPVDTKLREASQLGVPISQLYPQSRGLYVYQQFLDYLLESGAGSEMAQPLMSDPGVFV
>NZ_CP048066|1707912:1762798|1742270_1743032_+|WP_016211550.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MNLNTRLPFLLDLNRDDFPSPEQALTHPDGLLAIGGDLSPTRLIKAYYHGIFPWFTEEDPILWWSPSLRAVLAPSDFHLSRSLKKLIKKQAFQVTVNQCFNKVIDRCAKAHAHQGTWITATMIHAYTQLHRAGHAHSIEVWQDQQLVGGLYGVSTGGIFSGESMFQCTSNASKVAFAALIALLKSEHNDNGVLIDCQLLNPHLATLGVHNIARTHYLHLLEQYRDKFHLKPTWAQANKLITNALTSLTNVSSI
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MSTEEKSAKLNIEVIIEQLLDQVHGDSWLSEQSVDQLTAYIIEEAYELVTAVSTKNSLFIKDELADVLYQVLLQAHHQAISLGEVIRHLEKKLKQRHAHVFNNIDGQAGQVKTQFRLNHPEQSWLEIKNQEKQQAPMQLLDHVADCLPGLQKALKMQRIAAKVGFDWPDVSGVVDKLYEEIDELVNAVKVGDQVLVHDEMADVLFSSVNVARVLNIDPEVALQQACCKFRQRFNYIENELKKAKLSLNEASLEKMDELWCEAKLTLKPDGQ
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MKHWKKVVVTGFGLLAVVLAGCSSYKDNTIAPAPLKIFKPKVAVLEHWQAQVGEGSGTAAKAVLSFGDEGYWQYQAAENWHLNVTQAGQSLYAVDYNGLVKSFNLAGQTNWHVNLKQLLTASPVAGPEYVYVVTAEGTVFALNKKTGQIQWQKPLGSLVIAAPAAAKGVVVIHTKPGAVIALRAVDGRQLWRYDLLLNPSMTMERSSVPVIAGQQVVIGSDNGQVVALDRQTGDLLWQYQVAVPSGASEVAQIVDVDVTPVVKDGTVYVSSVKNRTIAVSLQSGRMLWKHKVGSFSGLAVSQNKVIVTANNGALWALDRQTGKAVWVDSNLLGRGPTAPAIVGHYVVVGDYKGFVHWFSLKTGQLVGRMSVGARAIVGQPVVDGSIVYVMDASGRLVAVRGSKVEEL
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MKRTCLRALLAAASVVLVGCSSLTHHDQQSTQSTSSVDKGHSVQSLQKGSAAATLGKGK
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MSILPKIRIVLVETSHSGNIGAVARAMKNMGLGRLYLVAPNDFPSDQAYALSSHAEDVLDHAVISASLAEAIADCQLVFGTSARERKVPWPLEAPRQMAQRVMSEHSQHEIAVVFGRERTGLTNQELQCCHYHVHIPTNEEYSSLNLAQAVQVIAYELRLAALDHNQNVNNNALNNDNNIGLKTIEQPEKLLASSAQMEGFYLHLEKLLRKIHFLDEAQEGMLMLKLRRLYQRSRVEEAEMHILRGILSKMERRLDEKGKSK
>NZ_CP048066|1707912:1762798|1733156_1733951_+|WP_016209411.1|DBSCAN-SWA
MQPIINIATRAARRAGALMLQRIDRLDTLKVAEKGIGNYVSDVDKSAESTIIETIQKAYPEHTILSEESGQTPQESDYLWIIDPLDGTNNFIHGNPNFCISIAIQYRGRTEHAVIYDAIRDELFSATRGQGAKLNDHRIRVSQRNKLEGATISTSLTHATDQYAAAFFASQHSLYEQHVALRRSGSIALDLAYVAAGRLDASYTLGAQRWDIEAGLLLVREAGGLASDLNGGESNISEGELLAGNPKSLKHLLQTLRPHYTKKS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209434.1|1707912_1709334_-|tRNA	glutamate--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_129556553.1|1709423_1711016_-	glutamate--cysteine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209439.1|1711179_1711806_-	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300277.1|1711886_1714568_-	Rne/Rng family ribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_016209445.1|1715050_1716007_+	23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC	NA	NA	NA	NA
WP_016209435.1|1716107_1716479_+	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	1.1e-05	29.4
WP_016209404.1|1716505_1717369_+	chemotaxis phosphatase CheX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047194.1|1717358_1718117_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776598.1|1718405_1718891_-	DUF2802 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209443.1|1718965_1719487_-	chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016209406.1|1720421_1721243_-	ParA family protein	Q8JL10	Natrialba_phage	5.0e-16	32.2
WP_016209408.1|1721557_1721728_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209427.1|1721881_1723285_-	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
WP_016209446.1|1723378_1724602_-	outer membrane protein assembly factor BamB	NA	NA	NA	NA
WP_016209402.1|1724615_1725344_-	tetratricopeptide repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209424.1|1725358_1726636_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	6.6e-23	25.1
WP_016209433.1|1726735_1727110_-	rhodanese-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209412.1|1727194_1728082_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209436.1|1728139_1728868_-	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_129556555.1|1728864_1729995_-	23S rRNA (adenine(2503)-C(2))-methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_016209444.1|1730125_1730554_-	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	39.4
WP_032126508.1|1730648_1731008_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776605.1|1730997_1732209_-	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|1732205_1732994_-|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209411.1|1733156_1733951_+	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1734156_1735131_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155049809.1|1735305_1736601_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|1736604_1736904_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|1736893_1737058_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|1737114_1737480_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211553.1|1737819_1738560_-	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211549.1|1738563_1741068_-	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211548.1|1741330_1742287_+	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211550.1|1742270_1743032_+|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_054300275.1|1743109_1743985_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211259.1|1744109_1744355_+	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_016211262.1|1744414_1746688_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_075273504.1|1746742_1747096_-|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211261.1|1747285_1747579_+	cold shock domain-containing protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_032126515.1|1747751_1747931_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|1748006_1748582_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|1748864_1750181_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|1750191_1750560_-	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|1750590_1751253_-	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_155046731.1|1751427_1752312_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|1752480_1753200_+	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_016211478.1|1753179_1753995_-	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126518.1|1754011_1756213_-	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|1756295_1757645_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_016211473.1|1757719_1758319_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|1758302_1758512_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777061.1|1758829_1760017_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|1760212_1761502_+	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|1761912_1762798_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP048066|1775307:1820428|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_052104774.1|1783077_1783710_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556557.1|1783757_1784069_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047067.1|1784213_1785107_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126170.1|1785270_1785543_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211040.1|1785769_1786981_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209661.1|1925770_1926646_+	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
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WP_016209658.1|1927609_1928965_-	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
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WP_016209649.1|1933185_1934151_-	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	7.9e-45	39.8
WP_016209640.1|1934609_1935629_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300271.1|1940475_1941450_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_162034433.1|1942177_1942606_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1942838_1943813_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155047207.1|1943922_1944996_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211685.1|1945941_1947747_-	excinuclease ABC subunit UvrC	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP048066|1966234:2014157|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300271.1|1996595_1997570_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_016209374.1|2012705_2014157_-|tRNA	tRNA lysidine(34) synthetase TilS	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP048066|2049574:2091755|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300221.1|2091257_2091755_+|protease	protease inhibitor I42 family protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP048066|2098689:2142198|DBSCAN-SWA
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MQQYSDQELCELGQEVINTEIQSLQPLIDRIGRDFVQAIKTLLHCQGRIIVTGMGKSGHIGNKIAATMASTGTPAFFVHPGEAGHGDLGMIQANDVVLAISYSGNSSEILTLTPHFHHLNVPLITMTGNPNSELAHQSIAHLDISVAQEACPLGLAPTSSTTATLVMGDALAITLLKARGFTEQDFALSHPLGRLGRRLLLKVADLMHTGDQVPSVGPQVSLSAALLEISNKRLGMTTVANSDYQLLGIFTDGDLRRALQHSININTTSIDSVMGTNPKTISPDMLAIDCLQLMEESKITSLVVTDHAKHIRGVIHMHDLLQAGLL
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MKLIIVSGRSGAGKTVCSHILEDLGFRCIDNLPITMLEQLATNMKTTQNTPTAVSIDVRNQLDQLKHFEDILNKIRQNAIDVEVIYLDAHDESLLRRFSETRRRHPLSTNTGLSLADALQQETILLEPLSRCADLTVDTSEFNLHQLRDFMRQRLGQSSNNSTLSVLIQSFGFKYGAPKDSDFIFDVRCLSNPYWMPHLRDYTGKDPIIIDYLDQQDDVQHMLGDLKRFINTWLEPFSLNNRSYLTISIGCTGGMHRSVYLVEKLVSQINSTYCNLQHRHRELL
>NZ_CP048066|2098689:2142198|2130791_2131523_+|WP_016209538.1|DBSCAN-SWA
MTVATLKAHQIAKRYKGRWVAEDISLHVNQGEIVGLLGPNGAGKTTSFYMMVGLVACDQGEIYIDHTEITDWPIHKRSQRGISYLPQEASIFRHLTVSQNILAILELQPTLSKQQRQAKLAHLLDELNIEHIKDNIGISLSGGERRRVEIARALATNPKFILLDEPFAGVDPISITDIKESIFHLKERNIGVLITDHNVRETLDICERAYIVNAGHIIAADTPENILTDPNVRRYYLGDEFRL
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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MTDATTDKGQSQEWQQFSTMTEEMLMQSQKAFAQLIECQPSGNVGMGSVKQVQQIVQDTMLAWMNNPIGFVESQVQLWNNYMTLWQRTVFGFMEGKPVLPMITPNKGDRRFKHEDWENMPLFDFIKQAYLLTAEHITETINNLEHLDDKRSQQAAFYTRQFVAALSPSNFAATNPEVLRMIVESKGENLIKGMQNLIDDFKRGKGVLNIRMTDLEAFAVGKNIAMTAGQVVYENETMQLIQYTPTTKNVYEKPVLIIPPWINKYYILDLQEKNSFVKYLLDQGLTVFLVSWVNPDGSQQTEGFADYMQEGIFSALCAIEQAIDIKEVNAIGYCIGGTLLAASLAYMAKKNDDRIASATFFTTLLDFTEPGEIGVFIDEEQVTELEQLMNEKGYLSGRNMALTFNMLRENDLIWSYFVNNYLCGKEPFPFDLLYWNSDSTNLPEKLHSYYLRNMYLNNTLIVPGGLEFNDVPIDLAAVSVPSYFLSAEQDHIAPWKSTYAGAQLLGGEVKFVLGGSGHIAGVVNPPLKNKYGYWSNDELPDSSEAWLETAAQNEGSWWPHWVNWVAKYSGKKVPARDPSSGGLTAIEPAPGRYVKVQVDDMFESYVTDVA
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MRSIKVAWAVVFCTLATFIFSGQASFAADAKAATNPRAVIQATVMELNQQLGQLKQGQALAGESLEQIINSSLLPKADLGFMLKQILGPEWRGITPQKQQELLVAFKARLVTTYSAILKNYNNQRIKVFPLRGGLAANTNKRDGMDTVNIKTMIFGGGQPLDVTFSMVKTTNGWKVFDVIASGVSVVQSFSSQFRPFVKQNGVDSLIEALKKPVSRS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016212599.1|2100949_2101159_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047217.1|2101208_2102270_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|2102344_2103250_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_059372279.1|2104017_2104353_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|2104312_2104768_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036780649.1|2104878_2105865_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126181.1|2105880_2106501_-	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
WP_016210401.1|2106621_2107674_-	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
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WP_016210413.1|2109848_2110091_-	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
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WP_016210406.1|2110944_2111889_-	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|2111942_2112893_-	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|2112899_2113949_-	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|2114007_2114181_-	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|2114198_2114729_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|2114970_2115612_+	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|2115774_2117604_-	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|2117771_2118644_+	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556468.1|2118635_2118938_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034438.1|2119143_2120802_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273445.1|2121074_2121332_+	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|2121417_2122101_-	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_016209508.1|2122151_2123042_-	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|2123103_2123862_-	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|2123864_2125133_-	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|2125208_2125460_-	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|2125493_2125841_-	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|2125844_2126498_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|2126520_2126985_-	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_036780687.1|2126981_2127749_-	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209539.1|2127752_2128553_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_016209498.1|2128692_2129673_+	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209499.1|2129678_2130236_+	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_129556465.1|2130222_2130795_+	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|2130791_2131523_+	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
WP_016209519.1|2131678_2133070_+	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|2133094_2133406_+	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|2133762_2134617_+	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209502.1|2134617_2135220_-	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209530.1|2136314_2136959_+	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209534.1|2136975_2137362_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|2137581_2138514_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209515.1|2138618_2139134_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|2139176_2140133_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209524.1|2140114_2141803_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126187.1|2141799_2142198_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP048066|2173634:2221585|DBSCAN-SWA
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MEVIKSGHSVYRLQYHIVWVCKYRGRVLNSGVCEYLKKVLGKLLRSMPGVEIETIDFDGDHLHMAG
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>NZ_CP048066|2173634:2221585|2191904_2192270_-|WP_054300209.1|DBSCAN-SWA
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300209.1|2191904_2192270_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036779278.1|2193588_2194542_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_032126199.1|2196620_2196932_+	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_155047071.1|2197279_2197603_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779281.1|2197627_2198083_-	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
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WP_016211491.1|2200873_2201170_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_051307343.1|2206659_2207187_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210909.1|2207879_2209157_+	na+ dependent nucleoside transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779246.1|2209159_2209414_-	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-20	58.8
WP_016210913.1|2209447_2209969_-	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_032126716.1|2210139_2211123_-	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210908.1|2211213_2212029_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2213240_2214302_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212580.1|2215037_2215388_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2215475_2215841_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2215786_2216362_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_162034440.1|2216965_2217493_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034441.1|2217489_2218077_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126810.1|2218119_2218818_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211661.1|2219076_2220033_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.4e-33	31.9
WP_016211663.1|2220097_2220763_+	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|2220856_2221585_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP048066|2229283:2276648|DBSCAN-SWA
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MNKELLDIYSDYLISQNYYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDSEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKVQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
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MHRSLQLKKIHHVALIVSDYAASKAFYCDILGLEVIAETYRRERRSYKLDLKLMNGNQLELFSFVNPPKRLSFPEACGLRHLAFAVENINESVKCLQQHGIDVEPVRVDALTEKKYTFFADPDGLPLELYEI
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MKALKYSIFGLFIIFIAIFSALNAQSVVINYYFGNIHLPMALLLVIVFIFAITISSLLFLMKVVNLRIKIRSLEKKYSKLEKQL
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MSLTEEQLRLIANLLQEQLKEHKDYLLNAIRLTVSQNQAEELEITIRQNKPVGINIVHQAIFKTMNIDRDKTMSAERKEYADNFTKRWLKDPSKEGRCTETIAYTPRYSEKIFDQYLATFLQQDHQIHNQLQTTPLLPELAHEVAEFAIGKGPCSNLFYQNATSSEPEPEPEPEPTSSCCAVL
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MRALRDIKKDKGINQALDRSCGGFSTKVHILTEGLGYPVDFVLTRGQAHDAPQAQGLLTSVAFDQIIADKAYDDIKIRELVVKKGAKCIIPSKSNRINKFDHDQHVYKERHLIECCIGKLKQFRRVFSRFEKRACRYLSFLKIASTILWLR
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MKLQTYIDQGYLRAERVESLSEHQKKVLGLNIIYQLIRDGSLTIERALIFTLAQYSVFSSKAVCQLIENKTFTVEEVLTFGMWQKRALESKVIRSFIDSGCMTFKKAAELSDEQQNFLDLDVVRKLIQEGILPFDVALNLTWRQQQNLEVPMVVELLRSKDERCCLTLDQVLRLQWMALDNLKSKTVCALLQEGILPSVEKALSLAAEQRQSLELPIVAKLLRSKDCLLHLTLEQALKVRSRQEAMLESKHIHKPPSVI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211538.1|2230436_2231360_+	GGDEF domain-containing protein	A0A127AWB9	Bacillus_phage	1.1e-24	42.1
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WP_081007046.1|2231929_2232178_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212179.1|2233617_2233770_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212177.1|2234192_2234366_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036781320.1|2236917_2237145_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300445.1|2239575_2240127_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210829.1|2240396_2241416_-	thiamine-phosphate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016210832.1|2241402_2241825_-	transcription antitermination factor NusB	NA	NA	NA	NA
WP_016210828.1|2241826_2242300_-	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	6.9e-26	42.8
WP_052133275.1|2242415_2243039_-	3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	1.1e-39	43.7
WP_016210836.1|2243068_2243743_-	riboflavin synthase	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	3.0e-30	37.7
WP_016210835.1|2243748_2244897_-	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A1V0SE20	Indivirus	1.0e-43	35.4
WP_032126465.1|2244893_2245355_-	transcriptional regulator NrdR	NA	NA	NA	NA
WP_016210830.1|2245430_2246681_-	serine hydroxymethyltransferase	A0A219Y950	Aeromonas_phage	6.3e-103	54.7
WP_016210824.1|2246807_2248487_+	energy-dependent translational throttle protein EttA	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	4.3e-38	26.7
WP_016210826.1|2248596_2249463_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2250365_2251340_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_036781250.1|2251435_2252221_+	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_051307345.1|2252364_2253051_-	SGNH/GDSL hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211002.1|2253084_2253483_-	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211001.1|2253646_2253952_-	competence protein ComEA	NA	NA	NA	NA
WP_016210998.1|2254029_2254284_-	LapA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126469.1|2254437_2256099_-	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
WP_016210997.1|2256158_2256842_-	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_080664849.1|2256841_2257930_-	3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase	M1Q1P2	Streptococcus_phage	4.9e-75	43.3
WP_016211004.1|2257978_2260615_-	DNA gyrase subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	2.0e-98	32.6
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WP_054300448.1|2262278_2264648_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2264691_2265666_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300449.1|2265685_2266465_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372279.1|2266597_2266933_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|2266892_2267348_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211507.1|2267673_2268993_+	TRZ/ATZ family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211505.1|2268996_2269713_+	bifunctional 2-polyprenyl-6-hydroxyphenol methylase/3-demethylubiquinol 3-O-methyltransferase UbiG	NA	NA	NA	NA
WP_016211506.1|2269709_2270351_+	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_081007048.1|2270343_2270442_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2270782_2271148_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2271093_2271669_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047096.1|2271700_2271973_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047095.1|2272029_2272170_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_155047094.1|2272314_2272782_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211503.1|2272932_2273388_-	cadmium-induced protein CadI	NA	NA	NA	NA
WP_016211508.1|2273442_2273787_-	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211502.1|2273816_2274860_-	ACR3 family arsenite efflux transporter	NA	NA	NA	NA
WP_129556569.1|2275562_2275772_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962625.1|2275761_2276648_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP048066|2346835:2409175|DBSCAN-SWA
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MPKQQSPTVSQKPSHGKRIEDFNIGFQKGEVKQKLKCTLREFNKLEPDSAMKKYTLEGLSDAYRHLDAELKPNLKEKDFYSDTAVPDLLLLATFPVSLFLLYSLSSNFRRLWHIGSDHEAIQDTLNIYDKYQHIQNNLEQIRATHPEMSEVCNKISTLSEELFTHGLKIAHSGRIKSLEGKRFNQHLNHLSALTFKLAHNPSSEHAQAFTQYKQSIKQSPWLKIQLAIKSIFSAFNKLTQRHSNEAPSDKELRLDAAQLGLSQEHERQAKSIAKTSLPFLDHARSNQPQDNQQAVELIPIADQ
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
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MHIKRWLLPASIAGFFLLVYLLSPILGSFFAAILLAYLGSPWVLRLESYHIPRTLSVLVILFLIGAVLFSLPLIIIPMVEMQVVLLINQLPKINHYLQSHIFPLLSHYLHLDVKTFNLNLPDLTQKFSVLLTQNPDLLKISWNTIFSSGIKIIGWGIQLVLVPVVAFYFLRDWNTILAKGRNLLPRRLEPTLYKLITTCDEVLAAFLRGQLFVMLCLGIFYALGLSIVGLKTAVLIGMLVGIISIVPYLGSIAGIIIAVLSAIAQFQDISHIIYVLIVFILGHALEGWVLTPLLVGDRIGLHPVAVIFAVLAGGQLFGFAGVLLALPAAAVIMVIIRYFYQDYISSHFYQQESQYSSASATDGPGSLEK
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MNANTALALDIEFQNGLIGEISVGLPSEEKMIHWLECVLQGRRQTAELCVRIVEKDEIHALNATYRHKDKPTNVLSFPAELPKELKSPLLGDIVICKVIVEQEAIEQEKLLEAHWAHMLVHGALHLLGFDHIDDEDADAMETLEIDILSQLGYANPYQQKEVSPV
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MKRRNISSGSDWEKQIGFSQAVCVGPFIQISALTPVDAEGKVIGIRDAYEQTKQILTNLQATLEHAGAEMADVVRTRIYVKDLRLWQEIGRAHGEAFQDIKPATSMLEVSRMTGPDFLVSIEADAIIDESAERV
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MKIFLVGGAVRDELINYPTEDKDWVVVGSTPEKMIKQGYHPVGKDFPVFLHPQTKEEYALARTERKTAQGYHGFTIHADPSVTLEEDLMRRDLTINAMAKDHHSKIIDPYHGQHDIKNKLLRHVSPAFSEDPVRILRIARFLARYHHLGFTIAAETRTLMAQMVQAGEVNTLVPERVWQELSKALHEKSPSAFFSTLEQCGALKILFPEIAALINQVKDTAWEPQCNLWSHFLNCLDQQEKPQIRFASALKTSYYSKQSNLKSLIQRLRIPKSFSSVMLTTAQLHPIYYSLPKQNAAQILDLLNQLSAFKNTQQLNNFADSCNLNLNLNQLSDHKEKLQHYIKIVESINPDEFIQQGLQGAQIGTAIQEKRLALIKGSRKK
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MSTDVKTKQGIIYAILGYGLWGLSPIYYKQIMQIPALEILANRIIWSCVLLAIISLLLKQLTEVRKVLTQKNKVIFLFFSTLFLACNWLIYIWAVNNDHVLETSLGYYVNPILNIILAMVILKERLRVWQWFAVALVVMGVLIQIIHYGSLPWVSLGLAFTFGCYGMLRKKLGLAAVTGLLCETALLTPFALIYLHFFDYSATANFIENTTSMNVLLMLAGVVTVIPLLGFTAAATRLKFSILSFFQYLTPTILFIIAVTLYGEKLTLSLIITFFFIWLALVVLAIEGLARSRARGGLSQSKSAV
>NZ_CP048066|2346835:2409175|2402841_2403657_-|WP_016210881.1|DBSCAN-SWA
MYSRDGYFAGTDVQRVDDLNQAFSNPKVKGIFEVRGGWGSSRILPLIDYNNIKKHPKILIGFSDITSLLLAINKKTGLETFHGTMGIQRWPEFTVEYMKKVLFDGSKVVFENPRPKPDPTVDLILTKDRIEVIHEGVASGPLIGGNLSVLVALLGTEYEPSWQGKILFVEDVDEKNYRIDRLLSQLELAGVFKEIKGFIFGKCTRCEMATGSDGAKTLREIVEHYVASRNIPTFMGSMIGHIPENFTLPEGLPVIMNANNGTIKMLEPAVI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556571.1|2346835_2347546_+|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
WP_017376619.1|2347574_2347979_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126712.1|2350146_2350605_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209553.1|2351349_2352360_+	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	2.9e-58	42.2
WP_016209566.1|2352844_2353756_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209545.1|2354081_2357576_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209551.1|2357613_2358453_-	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.8e-45	45.0
WP_036777155.1|2358639_2358855_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209547.1|2358903_2359479_-	ribonuclease HI	V9M0C8	Vibrio_phage	1.3e-29	46.6
WP_016209540.1|2359475_2359814_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209568.1|2359982_2360972_-	murein tripeptide/oligopeptide ABC transporter ATP binding protein OppF	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-18	32.7
WP_016209572.1|2360972_2361935_-	oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppD	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.7e-16	32.1
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WP_054300455.1|2364329_2364695_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556449.1|2364709_2365216_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212572.1|2365273_2365666_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|2365795_2366161_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300461.1|2366217_2366526_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046731.1|2366617_2367503_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080728364.1|2367655_2367928_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126774.1|2368536_2368872_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307356.1|2369031_2370564_-	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211411.1|2371432_2371930_-	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_036779082.1|2371933_2372926_-	AAA family ATPase	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_155047091.1|2373040_2374387_-|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
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WP_016212287.1|2375750_2376896_+|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
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WP_016211372.1|2382703_2383561_-	PIG-L family deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211371.1|2383547_2384471_-	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_036778204.1|2384667_2386059_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|2386105_2387149_+	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211370.1|2387191_2387635_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|2387767_2388958_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|2389012_2389159_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212140.1|2389709_2390627_-	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_036794860.1|2390894_2391188_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|2391264_2391459_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300462.1|2392477_2393395_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210876.1|2393860_2394703_-	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210873.1|2394770_2395421_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210874.1|2395435_2396476_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_036794016.1|2396613_2397684_+	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|2397710_2398820_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210871.1|2398836_2399154_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210879.1|2399150_2399510_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210881.1|2402841_2403657_-	LD-carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2403867_2404929_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212048.1|2405691_2406249_+	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
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WP_054300237.1|2408113_2409175_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP048066|2499065:2581775|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036779399.1|2500851_2501106_-	DUF2282 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274943.1|2580231_2580756_+	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.5e-05	33.1
WP_129556588.1|2580946_2581114_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP048066|2597116:2625297|DBSCAN-SWA
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MKIIYFKNDFIDVTRVIFYLFDNVILKKKYKANGEFQDFIAIKQDVIVPFLDALQSVVTDSEAVADHAAKSCRVHTEENINILLNDPQIIEQIRKLCVDKILIFEIFFKHILKVDDAAFDCLIQVLLKTCAPELTDNQSDFYRLEAVQSLAKLLKLNVSLPSNQGFLEKLNTIGQNITEKKQKLNKLDANSKTLEQLIQVRAQIFNRQRAIFERVTTWYVGGSADHGLSKHNQSRFEKIFSPYLNFNNGQPRLADEYQPNTLIFDELLPEIISKCEQTTKHWLDKNLYHGAKTIEILVNEAKAEAQDPESQRLCAELKTACVAAEKILASKSPNFTPLPSLMPLEHADNLSIKLHYFQEEDDKRQNTLNLELQSLEKERNTLSQFIDKAIEIVKHAYQELLDKIKKESAQIIHMIER
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MMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYTALHSVTCLEAAHSTTVLSHDSTVRIDF
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MLHFIRKIDSGRFGKVVLVGGSAGGQFAVKLFRQQHDQPGRVSTSAQLEVANFNSFSHRIQDIGRAEVVDLTDIQGLTAGDLDNYCLEAMLMPLFQNEREVRYEEIQPYLANLAERNFFMGDPKADNFFYTTEFGLMPIDFGLVFAGDSPLLMGVYLSAVINAPFQYSNAFENPYMGETGRRYQGLREGRESGLVGGRESRLFFDNEATVALALVPSGSTPELEVIQEVQEKSESNGPCCAVL
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MPMPKLKEIQDKYLILLAEACSKVDECVRDRQSIHKPINESTNKKCKEYVSHKAVEHFFLEESDNEIENAYKELKEELESSNEKRLYTIDLMIFFIKKQRIKLTLQE

Homologous phage analysis in the prophage region

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2594505:2594564	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_155047222.1|2612349_2613024_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.2e-09	31.8
2612339:2612627	attR	NA	NA	NA	NA
WP_155047223.1|2613067_2613313_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210068.1|2613943_2614519_-	spermidine N1-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036778086.1|2614594_2615470_-	6-pyruvoyltetrahydropterin synthase	A0A140B3P3	Vibrio_phage	8.0e-12	24.0
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WP_052104629.1|2615870_2616896_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047224.1|2617039_2617516_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036778088.1|2617500_2618583_-	alanine racemase	A0A0P0YM39	Yellowstone_lake_mimivirus	2.0e-20	27.5
WP_036777829.1|2618823_2619228_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210073.1|2619940_2620672_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210076.1|2620928_2622230_+	inosine/guanosine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016210066.1|2622371_2623040_+|protease	modulator of FtsH protease YccA	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	3.6e-28	44.1
WP_032126425.1|2623483_2624080_-	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210052.1|2624100_2625297_-|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	A0A2I2L594	Orpheovirus	8.2e-07	24.4

Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP048066|2681394:2728474|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP048066|2732819:2825880|DBSCAN-SWA
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MPKLFFTFDGTNANPDYKSPLGQATLVELNSMAAQLHNENYSAAEVKLTAYQGVLAHIERSKFYFAGPGTSNRSSQKVINYKAMFNGSKGEFGLENTTNKALEIIKYKIQNLAENATLDIAITGWSRGGIAAFQLLRKLQDQLSIAEIEKLGKVHIYGLDPVPGGPLDRKRLDFASLSDETHPFIKKVSADIFYAEHSAIITNASTPYFQPLFSPLPKGQHRLWVLKEANHDRSFGNAGIDNENMQQVKQAIANHNYRDEEQHTTGNFSCLAPTELTKKRFVKNDGQDSLLQQHELKQFQYNMTNKVLVKIATEVMNRFAARSDTSDYLALLIQKKYQGKDIPQPEPDNLDQIKLKRFFDLITESPEIKLEELAEITKTNTNRYGLDKLATLMGVQTSSEKDLQAELKELDTSL
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP048066|2950745:3014875|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_30

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MRDKIKLVSSAGTGHFYTTDKNKRTTTEKLEFKKYDPVVRKHVLYKEAKIK
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MMLSRFLNVGTNWFGLLMIVRLGEDALATTTLITAVFTPVQIGCWSIFVAVSVISARSIVKKQYAYCAALLRQATLLAPVIALPMVILLYYVAPLLSLAGQPAHLIPPCSDYLKIIALSLIPSLFCINAQQFLYGIGKPRLALLFSTLTSITILTLTYLFIHGSYGFPNLGINALALANVIAYSTTFLVIVLFFYFSPLLKAFPLWQKPKSREKKIRQKILKIGLPISGQSCAELSALSFAVFMMGHFGPHALAAQQIVTQCSIIAMLIPLGIAHSVSIFVSQAKGQGYLPHQLRTAGYIGTAMALALMLKISFIYLFYHQHLLKLYTNQPLADEIGQLAQLFFIINAFTLLANCIRTVMAGFLRGLYETKLTMLNSIFCYWGIALPIGALLAFSTGIGPLGLRYAMLGALLIASWLLFKRFLLLTQYPHQQHASSIQ
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MPPFLKTVFLLICSNTIMSFAWYGNLKTEQHKAFWIAILTSWGIAFFEYIFLIPANRTGFLDAHLSLAQLKIIQEVISLSIFVPFAIFYMKQTISWNFLWAGFCLAGAVYFIFK
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MQNTVTPTHINNNVLLYTKNISQRLVGEDKQTQHILDNINFTLYDNEIVAILGKSGAGKSTFLRTIAGLLPASSGKAYHQDTLIEKPIEEIAMVFQSFALLPWLTVLDNVCFGLDAQGMSKSTSKAKALKAIQLVGLGGYEHAYSKELSGGMRQRVGFARALVVEPKILLMDEPFSALDIGTASTLRKDIIRLWQEHAIQTRSMVIVTHSVEEAVTMADRVIVFDHHPGRIAFETHILTDHPRDIQSANLREKIALISEQLLEGAH
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MKIYIFLMILIIPYIASAMPLENTKVNMKVMVTIIPPLKLKVGNLNFDTLVKPITGKKMYQADTELYLYGAPKQSVKITLAKQVTIENKKNKLIVWLSLVNKKVILNRKGKAYSVITGAIKLTPLTKTGNYSGQTIITASYF
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MNDTARYQAGRRATLIGAGLNFCLAVLKIVVGLFGRSHALVADGIHSFSDLICDFFVLMAARYGMSEPDQDHPYGHGRIETVATVVLSIFLITLGVGIGIDAFYSLVQGSDARPDSYTLIIAVISIVVNEGLFRYTLKVADQINSDLLRANAWHSRGDSLSSLIVLIGIIGSLLGWSFLDAVAAIIVALMIIKMGMTWGWRALKELIDTALPEDQVADIANAIRAIPHVLAVHDLRTRKMAGYVLLDVHILIHPYISASEGHFIAEQVRAGLMQQFASIRDITVHVDVEEHAHDLNIVKLLSRDQINHDLMPVWQTILGVQQPVDFMLHYLQEKVIIDLYLPNKVIKGADAIIAQLQNSVSNYPDVEKLRAFLKVKA
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MKEIDLSDPELYLDRELSFIEFNQRVVQQAADEAVPLLERLHFLSIASSNLDEFFEIRVAGVKQRLNYNAQMQNDAGLLPQELIKNISVQTHALVKEQYRLFYEELIPKLAKENIEFHFAVDGLAESKQAWLKRYFRNEILPVVSPIGLDYAHPFPRLVNKSLNFIVSLEGKDAFGRDSGLAIVHVPRALPQLIEVPDKEDEKKTGLIFLSSIVQEYIGDLFPGMTAMGCYPFRLTRNSDLFLDEEDVDDLAHALQGELLSRRYGEAVRLEVAENCPEEIQAFLLRQYVLTTDDLYFIHGPATLLSLSAVIGILDRPDLMYPPFVPLLPKGLRNKNLFDMVSEKDILLLHPFESFKPIVDLVLQAARDPNVMVIKQTLYRSEATSKMVDALVEAARAGKAVTAVVELRARFNEEDNISLANRLQQAGALVVYGVVGYKTHAKMTLIVRREGRKFKHYVHLGTGNYHEKNALVYTDYSLFSHNQELAEDVHRVFQQLTGMGKTTKLKKLIQSPFTMHKTLIKFIQREVEFVNAGKPGKIIAKMNALTEQELIRELYRASQAGVEIELIVRGVCCLRPGIKGVSDNIKVKSIVGRFLEHSRIYYFRNGGEAEVYCSSADWMERNLFSRVEVCFPIQDTKLKQRVISDGLTTYLSDNSQSWLLNADGSYTRSVPRSQEPRSAQQQLLDKYS
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MPLIKKLNAEILRKIAKNYKKTHHGKEHSSAYQLAEQLWQQAQSDTLTEKQCATILRERLEDLNSACGNSLGNAIRTTLDNFYGRKSRSLTILCIPLIGGEYYPDIERYKLHESYLNQDFDPLFASFDDHFTDEHPIFEHKNHRTIIRQEILRQVENNGINHNFFKNAERILRSDLNFMQLILTNPQTFAQLYAPEIQGMDQRQLVNLYVGIKKGIISPWANDISHSLKAVKYVLMAKVESNGIAPDVKAKEISAVIDDKRNSFSPFSTNARKHIDSLENRDELKRTLRKSSEPPKLVFQATLQEQQTTIKQMAYPVDCEM
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MDTSLIGLFCIVDDFCQVFLPHWKASLLEHQDKQRNKPSRMSTSEIMTIMIYFHQSHYRNFKHYYQREVQGHLKKYFPKAVSYNRFVELMPTILLPLCFFIAAQRKTPTGIYFVDSTVLRVCHHKRSHQNRVFKGLAKKCGSTMGWFYGFKLHLIVNDMGELMAFKLSQATTDDRVVLPEIAQGLTGKIIGDKGYISQDLFNRLYEKGLQLINKIRKNMKNRLMPIIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSVNNFMVNILAELAAYCLQEKKPSLNIQRNLLTS
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MEDTMFCNILNLIVIGAGIGFLSGLLGSGGTTFLIPVLAAFFTYIIALHSASVHFAVFTALAISALTSLSSMAAYVKQKLIKKNHVRSIIPALLIANIIGLCCAIKISAFMSAILFAIFLLYLSYSIFFDKKQGIIMRYLPLMSGWVGFQSGLLGISGGSIAFSYLAKMPMEFEQSTALSTLITFSISLIGLIIGLCSHSNIKLAWATGFIYWPAVVLVTPVSSIMARLGMRTAKVLPLLLLKLIFALMMLSAALYMLSSVI
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MVGHHAVSIKAKARLTARRTCRAGTKVGLSDPVVLYGRAIAQRIKGTPGITG
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MPSSRFDPQALKEIATLYMQAYQHDSDYQDPDNEYGELYGAAQQLKRQARAGHFSEEESARVLRALLERINNSLKFSLQTSDLGYKIRETLRQFYGLSPTHVNPSEPSVGHIAQRGLNGPYLPALKAYELQESYLGKNLNGLFTLFERRKQKTKGHSEFTNSKHRTAIKKEILRQIETYGIEQSLTEQATKVLAHHSDFLHGRKTSSIKESLTSPKVFAALYAPEILTMNQRQLVDKFNAIKDGTQPPYNKDKSHSLKALKYALIDHIEQSGQLDDGVAVHEVNQVIDHRRGFFTPMTNTRDRVNSTPLLAQLLPKSKNPQQPMFDQAKADAQQQEQTPTATISSGQEPG
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MPNHKVNKDKFITLNTHDYHELLMLLAPCPLAFCTLLKCTHSKKSNIILIKKKKLDQLLSHGLSALCCEKSIRLPATLDNKTTHLNLAKANKQSHTTIELIGLY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|2950745_2951720_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211161.1|2952302_2953412_-	histidinol-phosphate transaminase	A0A142C026	Faustovirus	2.5e-18	23.8
WP_016211154.1|2953423_2954068_-	maleylacetoacetate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016211163.1|2954086_2955073_-	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211162.1|2955152_2956229_-	4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211156.1|2956431_2957256_+	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211160.1|2957572_2958577_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211155.1|2958785_2959751_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047242.1|2959889_2960765_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211700.1|2961061_2962114_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211698.1|2962381_2962810_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211697.1|2963035_2963515_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211702.1|2963570_2964821_-	malic enzyme, NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032127042.1|2964923_2965142_-	50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
WP_036777591.1|2965599_2966454_+	SIS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210728.1|2966508_2966979_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_016210732.1|2967366_2968746_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	5.1e-53	31.6
WP_016210726.1|2968773_2969232_-	dUTP diphosphatase	G0YQD9	Erwinia_phage	4.2e-52	69.6
WP_032126740.1|2969209_2970427_-	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	3.7e-39	34.2
WP_017375944.1|2970618_2970855_+	50S ribosomal protein L28	NA	NA	NA	NA
WP_016210730.1|2970868_2971024_+	50S ribosomal protein L33	NA	NA	NA	NA
WP_016210731.1|2971104_2972067_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210735.1|2972226_2973543_+	MATE family efflux transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210727.1|2973552_2974221_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210734.1|2974583_2976398_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	3.8e-24	45.1
WP_054300166.1|2976515_2977304_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211543.1|2977884_2979636_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211544.1|2979646_2980447_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	5.8e-33	38.6
WP_016211545.1|2980549_2981038_-	dihydrofolate reductase	A0A1B2IDT7	Erwinia_phage	2.4e-29	43.7
WP_032126435.1|2981211_2981526_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375799.1|2982546_2982891_+	DMT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034387.1|2983802_2983961_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210038.1|2988584_2989547_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HUT5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	8.8e-20	27.0
WP_016210039.1|2989733_2990993_-	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|2991216_2991543_-	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_052104566.1|2991737_2992688_+	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126434.1|2992745_2994812_-	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_016210042.1|2996397_2997978_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|2998134_2999544_-	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210047.1|2999603_3000737_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210033.1|3000876_3001701_-	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_016210034.1|3001928_3002558_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210044.1|3002893_3003265_-	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210046.1|3003568_3003856_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126431.1|3004007_3004856_+	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210037.1|3004983_3006024_+	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_155047244.1|3006096_3008034_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300165.1|3008317_3008977_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3009131_3010106_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300164.1|3010181_3011201_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556602.1|3011599_3011809_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273820.1|3012683_3013766_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.2e-142	71.8
WP_054300161.1|3013813_3014875_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP048066|3022760:3046380|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_31

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MDVMTKDTIAHMLENASQAFNRKNFIDSKNTLDQLIQQHPQVAEAWYRLALVLYKQNKLTSAIDHLQHALQLDPKNYIYHYQLGLCYKASEKPLDASFSLLQAVSLHPQDQTVLNALITELNTLKTNHPKHTLKMVRKLSQIFKHDTGLQLAKAKLLKGLPLIELITEDASLLDDIYQILELRTINARPLAPQVQILALSTNNLNEHLNDLLDHKSIKTLPQEKVQAIICHPLLLRTLTSFPISHAHIEQPLVKLRKSFLYHATHKTLNITQEVLTFLNCLCQQTWLNEYIYSTDSDESTWLKQLHKAIHTTELTPIQFIYSTLLWYCYHSVSEDEQTLHKSLQYLNAPLLQPIFNQYRSLQREKSLQKHLNKITSINDKVSKKVRNQYEESPYPRWTAVDIEPIKRNLSTLIQEHLPHFSPSKSLLKPARILIAGCGSGYQAINLASCCDAKEIIAIDLSATSLSYAKRMAEEFNITNIQFQQADILELTNSIDQPFDYILASGVLHHLNDPLAGWQVLTNLLKPKGIMLIGLYSKTGRKTVTQARKYIKEQKLAATPEDIRKLRADILQAPSHPLKPLSKWRDFFTLSECRDLIFHVKEHQFTLNQIKQALAKLSLQFTGFQSHDLALGKHKEKITARENYQNLDLWAEYEKNNPDLFYCMYNFFCQKK
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNPGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
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MIKNKVLFNKFGIFNIIIFGMFILVLIILLVNIFKYGDHKKINFIKIREIENKENFLQKINSARENYENKLKKIASYNIESTSESVERFLDLLYHAEGMTKSQVSKVREKPNGSFDKVSVSLSVITDYLTFIRFLIILQQSNLLFSIAASHGVLSTG
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MDFGKVCSKVYEALGGKKWDFGKVCSKVYEALGGKKWDFGKVCSKVYEALGGKKWDLAKSALKSMKP
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MPSPYSYDLRVRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MDFGKVCSTVYEALGGKKWNFGKVCSTVYEALGGKKWNFGKACSTVYEP
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP048066|3022760:3046380|3031718_3032837_+|WP_162034450.1|DBSCAN-SWA
MPRSRESLSDTVKAISTALSGLFSSIPTVFRGLGGLITYTGAGIGNIIRNCLGIVSGIIATLGNLALKLSAGAVGLFSEVGNLGLKAFAGITGLFSEVGNLGLKAFAGITSLFAEIGNLGLKAFAGITGLFAEVGNLGLKAFAGITGLFAEVGNLGLKAFAGITSLFAEIGNLGLKAFAGITGLFAEVGNLGLKAFAGITGLFAEVGNLGLKAFAGITGLFAEVGNLGLKALSGITGLFAEIGNLGLKAFAGITGLFAEIGNLGLKAFAGITGLFAEVGNLGLKAFAGITGLFAEVGNLGLKALSGITGLFAEIGNLGLKAFAGITGLFAEVGNLGLKALSGITGLFAEVGNLGLKAFAGITGLFAEVGNLG
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MKSISLSEEIILPSLNVKEGKDQEFSRNELNLKAIKYKDFRKVMLLPEEDQMHTMMKIVSGLSEDDIGELSAEDTAEISEYVFESIHKYVQLGQKITNMSS
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MTEGDFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVK
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MKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
>NZ_CP048066|3022760:3046380|3041474_3042584_+|WP_129556605.1|DBSCAN-SWA
MPKRSETRPYILRFPTYQAPGGQYLGINFGGTRARNSFLAALRKLDNRQDDEYFPWIDTLANGSTLHIERSHPQLSTPEFHNESGGIEIAQFYPSQVHKRIGRPVSPEPSADVDLSQAFTTLLFQALAQGHDDAAVPNLAISQQPAPTAQHQPTYQQQPAYSPTANASASPQVNNPQLQHLNALLQRIETAAQALELHGGGTTITDQHGEKITLSSSLAKVYGKARSMRDHILINPDHMYLGDEIRQRLIQPMQKLNKKTQTWETKEAGGKGPRGGERDSTTTDLYNDVIATLEKRFNLTPPLASAPSYPQAEAPLAFSPPQPGAPTPSGVAATATLLHDHEQMEGHMEGHTPQAPGATSSAPSAPPGP
>NZ_CP048066|3022760:3046380|3037289_3037655_-|WP_032126362.1|DBSCAN-SWA
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP048066|3022760:3046380|3022760_3023646_+|WP_155047053.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDIKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP048066|3022760:3046380|3034250_3035102_+|WP_162034453.1|DBSCAN-SWA
MGLGKVCSKVYEALGGKKWDFGKVCSKVYEALGGKKWDFGKVCSKVYEALGGKKWDFSKVCSTVYEALGGKKWDFSKVCSKVYEALGGEKWSFKQAYEAFSTNWFFGGKPWMKQTVAKDMASAVAGYKFSLGQPINTLRNMASKCAMDFSAIRKYTDVAVSSTGGLIAGMIAAPFTAVGQTIGGLVTGCKNAGLPGLVVGMFVGLGYGLSFPFRNIYNSYVNATADIPLDPSSSTDTHPTNCALIASDASRVNQYTAGLFQREQQSQVQGSKPGYSPSEPLLG
>NZ_CP048066|3022760:3046380|3037718_3038087_+|WP_155047247.1|DBSCAN-SWA
MLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVL
>NZ_CP048066|3022760:3046380|3027068_3029399_+|WP_036778680.1|DBSCAN-SWA
MKALRVFTWFAISLLLIVMLVTASLLYYIVNNLPDVSTLRSVQLQEPLRIYSADDKLIAEIGNKRRIPVSLAEIPQDLIHAILATEDHRFYQHSGVDIKGLARAVIGLITTGEKRQGGSTITMQVARNFFLSRKKTYLRKFNEILLAFKIEHELTKNEILSLYLNKIYLGQRAYGVGAAAKIYYGETVSQLDLAEIAMIAGLPQAPSAINPIYNPNAAKKRRSHVLTRMLRYGYINHAQYQKAMAAPIKTKFHRTKTAVYAPHVAEMVRRYITELFPKIAYTGGFKVYTTIDSSLQTAINHALENGLTAYDRRHGYRGPISWINLQQRSPTDLLKQFNHFPSIKNKPTAIVTTMTDNSAEALLKDGQKITIPWQGLAWARRYINEKRRGPAPKQTVDILKAGDVILVQYQKDHWQLTQKPAIEGAAVSLNSNNGAVLALIGGLPFTQSNFNRAIQAERQPGSSFKPFVYSAALEKGYTAASIINDSPIVLPGNETYELWRPQNDNRRFRGATRLRTGLTHSMNLISIRLLQDIGIDYTHQYVQRFGFAAQSLPQNLSLALGTNTLTPLQLAAAYSSFANSGYRVIPFYIDRIVNSNHNILFQAAPPTVPRYQQGDQPQAPRIISAQNAYIMTSIMQDVARLGTAKRTQELKRQDIAGKTGTTSEQQDGWFAGFTPDVVTTVWVGFDSPQPTGEYSSTLALPIWIDYMKTALNYYPERRWPRPDNLVTLRIDPNTGQLAHDWQKETIFETFRKKYAPKHYSNQANTHLPGDLAQDLF
>NZ_CP048066|3022760:3046380|3044982_3046380_-|WP_036776867.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MTMSVKAILAGAAKVGDRVTVKGWVRTKRDSKAGISFVAINDGSCFDSVQVIAANSLTNYESEIAKLTKDCAVIASGELVESPGQGQSFEVQATDIQVVGWVEKPESYPVSPKRHTVEYLREVAHLRPRTNLFAAVTRVRNCISQAIHRFLSQEGFAWVHTPLITASDCEGAGEMFRVSTLDMLNLPRTDKGAIDYSQDFFGQESFLTVSGQLNVEAYCLAMSKVYTFGPTFRAENSNTSRHLAEFWMIEPEIAFADLNDNAALAERMLKFVSTALLEQCADDMAFFAARVDKQALTRLETISQSNFEIMDYTTAIEQLLKADKSFEFPVAWGVDLASEHERYLCEELVGKPVTVMNYPKDIKSFYMRLNEDGRTVAAMDVLAPGVGEIIGGSQREERLDVLKARMQEIGVSEQHLDWYLDLRRYGTVPHAGFGLGLERLVSYVTGVANVRDVIPFPRTPGNIPF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556669.1|3024592_3024988_-	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|3025917_3026493_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|3026438_3026804_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778680.1|3027068_3029399_+	PBP1A family penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556603.1|3029519_3031535_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034450.1|3031718_3032837_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034451.1|3033768_3033918_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034452.1|3034089_3034293_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034453.1|3034250_3035102_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212386.1|3035166_3035472_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307322.1|3035662_3035842_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_155047245.1|3035845_3036034_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047246.1|3036057_3037032_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	1.8e-28	32.2
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WP_155047247.1|3037718_3038087_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|3038090_3038977_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047248.1|3039040_3039727_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047249.1|3039979_3041080_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556605.1|3041474_3042584_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|3043626_3043992_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047002.1|3044006_3044612_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036776867.1|3044982_3046380_-|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A167RLM0	Powai_lake_megavirus	1.8e-77	34.4

Sequences of DBSCAN-SWA_32

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32

>NZ_CP048066|3077193:3129642|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP048066|3077193:3129642|3105602_3106106_-|WP_016210340.1|DBSCAN-SWA
MALLNILQYPDPRLRLQAKPVTVFDDALAQTVQDMYETMYESSGIGLAATQVNIQQQILVMDLSENRSDPLCVINPEILETFDHAEHDEGCLSFPGVFAKVERAARIKIAAFDQRGEKFELEAEGLLAVCLQHEIDHLEGKVFIDYLSPLKRKRLEKKLLKQRRQVL
>NZ_CP048066|3077193:3129642|3127795_3128557_+|WP_036776493.1|DBSCAN-SWA
MLLKTFFIIIIILITLLIGPIWLAVTGQVQFGQNWQTADRHSIGIAPTAGQFKEAVVQLYEARAFNWRGLFAVHTWIAVKPYGATHYTNYQVTGWNAYHNRPIVDISSGAPDRLWFGHTPIIVKSLTGKKAEILITKIAKAAKSYPYAHTYQAWPGPNSNTFIAYILDQTPEFGAIMPANALGKDYVSLKIIITRLADKTGYRLSLWGVLGLIISNRQGVQLNLFGLTLGLSWQPWGVILPGLGLLPKPSNHE
>NZ_CP048066|3077193:3129642|3085329_3085866_+|WP_032126699.1|DBSCAN-SWA
MNIDTLKQLMPSYAKDIKLNLSAVLSEQGAPGLTLNQIASISLASAFATKNNTIITEILTAAREHISDNELEASKLAATLMAMNNIYYRYVHLASSKEVTSLPAKLRMQGIMNPGVDSIDFELYSLAVSVINGCGMCMDSHTKQLLKHNVKPEAIQSSVRIASVIHAASQAVSIEKSL
>NZ_CP048066|3077193:3129642|3079503_3080389_+|WP_155047003.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFDYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP048066|3077193:3129642|3115028_3115160_+|WP_155046758.1|DBSCAN-SWA
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP048066|3077193:3129642|3107388_3107868_+|WP_016210342.1|DBSCAN-SWA
MIKESVLDVLMYLFDQNSETEQSLSSDQAALSAELEKAGFAKDEVERAFHWLEGLVDTSQRPKHFEPSMTTRAFAAKELSVIGSEHLSYILYLEHIGILNVELRELVIDRIMALGIDEIDLSHVKWVALMVLNNHYEDGFETEWFEEMILTDPKTEVQH
>NZ_CP048066|3077193:3129642|3080575_3080797_+|WP_016212372.1|DBSCAN-SWA
MAKYHALFLQQDKHMHNLLQATPLPLELDHEIVEFSIGQGPCQQLGKCSDLLYQHATNPEPESTTTTGCCAVL
>NZ_CP048066|3077193:3129642|3125967_3127494_-|WP_036779326.1|DBSCAN-SWA
MKKTVVLLVLDGWGHSTDTNSNAILNANTPVWDHLTATYPMTLISASGTDVGLPAGQMGNSEVGHLNLGAGRVVYQDLLRIGCDIESGAFFDNKTLTEAVDTAVNQDAAVHIMGLLSPGGVHSHEDHIEAMIDLAVQRGAEKIYLHAFLDGRDTAPKSAESSLARFEEKFVKSGKGRIASIIGRYYAMDRDQRWERIEAAYQLITEGKAEHQAKSAVDALQAAYARGERDEFVQATCIGKAVALNSNDTLIFMNFRADRARQLSQVFSDESFAGFARVVHPRLSAFVNLTEYATSINAQVAYPSLTLNNVLGEVLAKAGKKQLRIAETEKYAHVTFFFNGGIEEVFAGEERVLIASPKVATYDLQPQMSAQELTDKLVAAIASQDFDAIICNYANADMVGHTGDYAAAVQAIEALDHCLSQVVAAGQQVAADILITADHGNAELMENLQTGQPHTAHTSNLVPLVYIGKDATLTKEGGTLSDIAPTLLQLLDLTVPVEMTGQSLVYLK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075273401.1|3077193_3077646_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047251.1|3077683_3077908_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_155047003.1|3079503_3080389_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212372.1|3080575_3080797_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047252.1|3080912_3081491_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047253.1|3081635_3081830_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3081888_3082863_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300148.1|3082916_3083978_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036776841.1|3084705_3085245_+	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126699.1|3085329_3085866_+	alkyl hydroperoxide reductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211866.1|3086517_3086820_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126698.1|3087269_3087578_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556607.1|3088186_3088636_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556608.1|3088918_3089629_+	VUT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211232.1|3089855_3090254_-	DUF3135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778156.1|3091121_3092072_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_016211227.1|3092071_3094150_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211228.1|3094297_3094813_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016211234.1|3094821_3095385_+	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211229.1|3095365_3096112_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211230.1|3096251_3096704_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034456.1|3097316_3097964_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210335.1|3097960_3098857_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210345.1|3098889_3099957_+	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210352.1|3099975_3100344_-	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_129556609.1|3100369_3101818_-	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210336.1|3101827_3103207_-	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_051307328.1|3103247_3104579_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_032126694.1|3104550_3105510_-|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	2.2e-10	35.9
WP_016210340.1|3105602_3106106_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	1.4e-13	37.1
WP_016210346.1|3106240_3107392_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|3107388_3107868_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126693.1|3108014_3110336_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	2.3e-98	35.7
WP_016210343.1|3110337_3110907_+|tRNA	tRNA threonylcarbamoyladenosine biosynthesis protein RimN	NA	NA	NA	NA
WP_129556610.1|3111882_3112461_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210347.1|3112761_3113019_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556718.1|3113027_3114214_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-58	43.8
WP_155046758.1|3115028_3115160_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_162034457.1|3115707_3116607_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_087910645.1|3117501_3118654_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_155047031.1|3118889_3119486_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046697.1|3119533_3119677_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|3119724_3120630_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211194.1|3120817_3121207_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211196.1|3121485_3122211_-	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211199.1|3122265_3123435_-	glycoside hydrolase family 3 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211200.1|3123409_3124717_-	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	2.1e-24	28.6
WP_129556617.1|3124756_3125596_-	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779326.1|3125967_3127494_-	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_036776493.1|3127795_3128557_+	DUF3750 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|3128755_3129121_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273371.1|3129066_3129642_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP048066.1|WP_155046721.1|1078862_1079030_-|hypothetical-protein	1078862_1079030_-	55 aa aa	NA	NA	NA	1035929-1080272	yes
NZ_CP048066.1|WP_016210146.1|1080473_1080965_+|hypothetical-protein	1080473_1080965_+	163 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP048066.1|WP_081377353.1|1173141_1173807_+|transposase	1173141_1173807_+	221 aa aa	NA	NA	NA	1173141-1226063	yes
NZ_CP048066.1|WP_054300361.1|1173784_1174081_-|hypothetical-protein	1173784_1174081_-	98 aa aa	NA	NA	NA	1173141-1226063	yes
NZ_CP048066.1|WP_016212013.1|1186719_1187103_+|hypothetical-protein	1186719_1187103_+	127 aa aa	NA	NA	NA	1173141-1226063	yes
NZ_CP048066.1|WP_016212220.1|1196928_1197084_+|hypothetical-protein	1196928_1197084_+	51 aa aa	NA	NA	NA	1173141-1226063	yes
NZ_CP048066.1|WP_155047155.1|1205585_1205735_+|hypothetical-protein	1205585_1205735_+	49 aa aa	NA	NA	NA	1173141-1226063	yes
NZ_CP048066.1|WP_162034387.1|1207723_1207882_-|hypothetical-protein	1207723_1207882_-	52 aa aa	NA	NA	NA	1173141-1226063	yes
NZ_CP048066.1|WP_098082828.1|1575272_1575530_+|transposase	1575272_1575530_+	85 aa aa	NA	NA	NA	1572928-1642079	yes
NZ_CP048066.1|WP_098082828.1|1634028_1634286_-|transposase	1634028_1634286_-	85 aa aa	NA	NA	NA	1572928-1642079	yes
NZ_CP048066.1|WP_054300290.1|1635024_1635282_-|hypothetical-protein	1635024_1635282_-	85 aa aa	NA	NA	NA	1572928-1642079	yes
NZ_CP048066.1|WP_016212461.1|1844959_1845334_+|hypothetical-protein	1844959_1845334_+	124 aa aa	NA	NA	NA	1840969-1949553	yes
NZ_CP048066.1|WP_016211583.1|1866208_1867117_+|hypothetical-protein	1866208_1867117_+	302 aa aa	NA	NA	NA	1840969-1949553	yes
NZ_CP048066.1|WP_016211528.1|1887757_1888063_-|hypothetical-protein	1887757_1888063_-	101 aa aa	NA	NA	NA	1840969-1949553	yes
NZ_CP048066.1|WP_016211529.1|1889304_1889457_+|hypothetical-protein	1889304_1889457_+	50 aa aa	NA	NA	NA	1840969-1949553	yes
NZ_CP048066.1|WP_016209640.1|1934609_1935629_+|hypothetical-protein	1934609_1935629_+	339 aa aa	NA	NA	NA	1840969-1949553	yes
NZ_CP048066.1|WP_155046989.1|1939178_1940243_+|hypothetical-protein	1939178_1940243_+	354 aa aa	NA	NA	NA	1840969-1949553	yes
NZ_CP048066.1|WP_155083645.1|1941542_1941830_+|hypothetical-protein	1941542_1941830_+	95 aa aa	NA	NA	NA	1840969-1949553	yes
NZ_CP048066.1|WP_162034433.1|1942177_1942606_+|hypothetical-protein	1942177_1942606_+	142 aa aa	NA	NA	NA	1840969-1949553	yes
NZ_CP048066.1|WP_016210742.1|1979172_1979448_-|hypothetical-protein	1979172_1979448_-	91 aa aa	NA	NA	NA	1966234-2014157	yes
NZ_CP048066.1|WP_054300240.1|1983640_1983844_+|hypothetical-protein	1983640_1983844_+	67 aa aa	NA	NA	NA	1966234-2014157	yes
NZ_CP048066.1|WP_129556569.1|2275562_2275772_+|hypothetical-protein	2275562_2275772_+	69 aa aa	NA	NA	NA	2229283-2276648	yes
NZ_CP048066.1|WP_016209540.1|2359475_2359814_-|hypothetical-protein	2359475_2359814_-	112 aa aa	NA	NA	NA	2346835-2409175	yes
NZ_CP048066.1|WP_016209990.1|2765991_2766396_-|hypothetical-protein	2765991_2766396_-	134 aa aa	NA	NA	NA	2732819-2825880	yes
NZ_CP048066.1|WP_144019123.1|2766428_2767172_-|hypothetical-protein	2766428_2767172_-	247 aa aa	NA	NA	NA	2732819-2825880	yes
NZ_CP048066.1|WP_155047234.1|2767661_2767805_-|hypothetical-protein	2767661_2767805_-	47 aa aa	NA	NA	NA	2732819-2825880	yes
NZ_CP048066.1|WP_016212372.1|3080575_3080797_+|hypothetical-protein	3080575_3080797_+	73 aa aa	NA	NA	NA	3077193-3129642	yes
NZ_CP048066.1|WP_155047252.1|3080912_3081491_+|hypothetical-protein	3080912_3081491_+	192 aa aa	NA	NA	NA	3077193-3129642	yes
NZ_CP048066.1|WP_155047253.1|3081635_3081830_+|hypothetical-protein	3081635_3081830_+	64 aa aa	NA	NA	NA	3077193-3129642	yes
NZ_CP048066.1|WP_155046758.1|3115028_3115160_+|phosphatase	3115028_3115160_+	43 aa aa	NA	NA	NA	3077193-3129642	yes
NZ_CP048066.1|WP_162034457.1|3115707_3116607_+|hypothetical-protein	3115707_3116607_+	299 aa aa	NA	NA	NA	3077193-3129642	yes

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_155046721.1|1078862_1079030_-|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_155046721.1|1078862_1079030_-|hypothetical-protein
MKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1040239-1040276	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1040239-1040276, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016210146.1|1080473_1080965_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016210146.1|1080473_1080965_+|hypothetical-protein
MHQKEQITELLECPQELTLVKIVLLAGLEKVIANCLDRQSVVKLKIAEFFRLEVEAITEGSDSDESLSAELASLKMDKLKDILKKAACAFHQKSGLFTAKSYQVAKPYFEVLRELFGISDVEWKGILAHEANLDCEELSLQFYNKYMANKDDMASPGHLPTRP

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_081377353.1|1173141_1173807_+|transposase

>NZ_CP048066.1|WP_081377353.1|1173141_1173807_+|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1204180-1204217	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1204180-1204217, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_054300361.1|1173784_1174081_-|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_054300361.1|1173784_1174081_-|hypothetical-protein
MTNNEIEGLTPQQEEVVLLKNLLLESLDKLINSCKKSSVVLDFLGLPDVRHDSRFKRIETLIDNLLEIDTGNIIDHPELTERYIEHSPYAQVINILIA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1204180-1204217	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1204180-1204217, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016212013.1|1186719_1187103_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016212013.1|1186719_1187103_+|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1204180-1204217	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1204180-1204217, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016212220.1|1196928_1197084_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016212220.1|1196928_1197084_+|hypothetical-protein
MYSLYIFHSPQYYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1204180-1204217	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1204180-1204217, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_155047155.1|1205585_1205735_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_155047155.1|1205585_1205735_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVSQLRSAKNPNLPRPTHPVLSTPWLAACAGFPG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1204180-1204217	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1204180-1204217, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_162034387.1|1207723_1207882_-|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_162034387.1|1207723_1207882_-|hypothetical-protein
MVGHHAVSIKAKARLTARRTCRAGTKVGLSDPVVLYGRAIAQRIKGTPGITG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1204180-1204217	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1204180-1204217, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_098082828.1|1575272_1575530_+|transposase

>NZ_CP048066.1|WP_098082828.1|1575272_1575530_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1641167-1641130	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1638606-1638643	1

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1641167-1641130, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1638606-1638643, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_098082828.1|1634028_1634286_-|transposase

>NZ_CP048066.1|WP_098082828.1|1634028_1634286_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1641167-1641130	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1638606-1638643	1

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1641167-1641130, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1638606-1638643, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_054300290.1|1635024_1635282_-|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_054300290.1|1635024_1635282_-|hypothetical-protein
MKKKRNKYPLRKLWEIFCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1641167-1641130	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1638606-1638643	1

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1641167-1641130, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1638606-1638643, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016212461.1|1844959_1845334_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016212461.1|1844959_1845334_+|hypothetical-protein
MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1862901-1862864	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1846250-1846287	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1890828-1890865	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1862901-1862864, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1846250-1846287, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1890828-1890865, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016211583.1|1866208_1867117_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016211583.1|1866208_1867117_+|hypothetical-protein
MLKFNVRENNDRSSYVSILRNKPGWKKGEGSPYESIANLKFSSSVSEYPEKLGEKDKKNLSPDEVTSLENWYSCVLFSAKNFGSSIVDLESLIYRLDPKFNDALNELAAAARKHDIDFTPQQIMLDALLEAAKKTEHAIEKKTRKKADILSKVDIDSRPAGLLYRLDEKNRGIFEALFGLPCGQAKMIKEFNATAQRYGRRGDTTLNTLEKMAYPKKGEHPLTVKKWMFSAAIDLLYENQLNPINVISADSVAQYFALQRKQEGISVEECVFIFEKRFDPNKTQLKLAVKAIEKQYGETVNV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1862901-1862864	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1846250-1846287	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1890828-1890865	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1862901-1862864, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1846250-1846287, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1890828-1890865, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016211528.1|1887757_1888063_-|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016211528.1|1887757_1888063_-|hypothetical-protein
MSQNQSKFPAPAKKVKREKISSKATKKELEITSKGDDSYIERNELDPNAPPTKGYTVPLNEYELTLLLKISEKHDRSQRKQIRRFVIDALEQEAKTLGIGI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1862901-1862864	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1846250-1846287	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1890828-1890865	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1862901-1862864, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1846250-1846287, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1890828-1890865, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016211529.1|1889304_1889457_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016211529.1|1889304_1889457_+|hypothetical-protein
MSCKKSRLVIKFRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1862901-1862864	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1846250-1846287	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1890828-1890865	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1862901-1862864, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1846250-1846287, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1890828-1890865, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016209640.1|1934609_1935629_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016209640.1|1934609_1935629_+|hypothetical-protein
MPSFNDILNQYLLHFKKYFLDLDLSLNHRTSILSSQGTTPNFQEIAKLFSDGEIEKEFESLQNKLNRYPDTSHLELYIKFNDFFKSKTDHSLESERVIGFFKDRNESIAGKKLLEIVFLESISFAASADLQESFNAELKSAINITAEEDNDSFYELIKEQFKEASTYPLSRFNLSYHPKAFEQLDQLGLGDQSNCILELLGHPPQLINIEGISNQVKEIFENAKKSIPTEIESTQQNLIAACYEKYQANVIGLIFNFFIPKEKNQEDLELQLFIYENEFLSSSNFANHGTQFESFCPKILEIIKASNKEHIQESDSQLFFSQQKEKTTFDSSASARYNQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1862901-1862864	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1846250-1846287	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1890828-1890865	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1862901-1862864, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1846250-1846287, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1890828-1890865, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_155046989.1|1939178_1940243_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_155046989.1|1939178_1940243_+|hypothetical-protein
MPLSTLNEVQNQYALYFKQACLNTSQSFITRGSIKNGGASVGIENIEGHFTDQEIESKFKVLKESLRGCSPSERSDLLNNFSLFINNKTNHDVDTVRVLAFFKDKDITDLTFLEILYLEAINFEASAALQIAFYKTNQTKTDTEEGVLATQAQKSLFTSVADLFLSQLNLSYHPNIFANLDKIGLGNQPEYIQGALKCSQQLNDEDYQLLKEMSEDLKEMYQAIKNHVALSSEPSSNNNSDSFLSSLFSCFATQKLDLEARFKQYQSRTIETFFDFFTPDNKNQSQEALKAQLSQLKADFLSSSDSSFQSSLSSPLNRAETQNNQPSPSSPLLFSQQQAAAAHSTAPTPEPSPY

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1862901-1862864	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1846250-1846287	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1890828-1890865	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1862901-1862864, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1846250-1846287, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1890828-1890865, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_155083645.1|1941542_1941830_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_155083645.1|1941542_1941830_+|hypothetical-protein
MPLSTLNEVQNQYALYFKQACLNTSQSFITRGSIKNGGASVGIENIEGHFTDQEIESKFKVLKESLRGVHLVKDPTYLIILAYLLIIKQIMTLIL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1862901-1862864	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1846250-1846287	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1890828-1890865	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1862901-1862864, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1846250-1846287, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1890828-1890865, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_162034433.1|1942177_1942606_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_162034433.1|1942177_1942606_+|hypothetical-protein
MSEDLKEMYQAIKNHVALSSEPSSNNNSDSFLSSLFSCFATQKLDLEARFKQYQSRTIETFFDFFTPDNKNQSQEALKAQLSQLKADFLSSSDSSFQSSLSSPLNRAETQNNQPSPSSPLLFSQQQAAAAHSTAPTPEPSPY

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1862901-1862864	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1846250-1846287	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1890828-1890865	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1862901-1862864, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1846250-1846287, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1890828-1890865, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016210742.1|1979172_1979448_-|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016210742.1|1979172_1979448_-|hypothetical-protein
MNIILKNTVNILSHRSGLLKSKSYEVAMPYLLECKKLLEISEQDWEVMLAIQYGFGKFHPEHEHQTFKFYEQYMDKHDGRLDGLNLTVQPQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1992675-1992712	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1992675-1992712, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_054300240.1|1983640_1983844_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_054300240.1|1983640_1983844_+|hypothetical-protein
MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	1992675-1992712	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 1992675-1992712, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_129556569.1|2275562_2275772_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_129556569.1|2275562_2275772_+|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	2270757-2270720	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 2270757-2270720, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016209540.1|2359475_2359814_-|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016209540.1|2359475_2359814_-|hypothetical-protein
MSYPALIQQIDKLSKKYGFERHKMRFISGITDAETLAAERKLSHADAEGLIQQHGINGIWLAWLTDDGLLIEDECFKYIDELLAMPSYAEEWFDLVNGHEEIQKKEAQGLDK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	2364304-2364267	0
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	2367529-2367566	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 2364304-2364267, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 2367529-2367566, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016209990.1|2765991_2766396_-|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016209990.1|2765991_2766396_-|hypothetical-protein
MYILVCYGGYPYHAAYVVAIFTGGSFVTQEVYAGDIDSLRLKVKGDFRIYKDLESFFDRSIECMQNKKAQIIILKPAIESNFSNLLIFESVIRKTRQSTLLMYESMEVDEEAPLVAGAEAMLHYYSELLRCTKQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	2824115-2824152	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 2824115-2824152, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_144019123.1|2766428_2767172_-|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_144019123.1|2766428_2767172_-|hypothetical-protein
MLKNLKELIKEYNIQTIDALEQLKSDLLRESDSREFCKKYGIDYSPIEFTFHQGFYFLFNAANELNDQYPNDRNLIAYFTYRLSSQQQKAFEPVTNMLEIAKLAEDKIEGDCQLLEQGGNQPKAIKTFKEKAIKAVYKYVESTLAGPEHSNKAREEYQQSIKNCSEECKAALDDSSCERLRKVLKVLVNFLTHISLVGIVANIYHKHTTGSWLLFERKKESYDIQENLHGIQKISESAMQVNLYLSA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	2824115-2824152	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 2824115-2824152, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_155047234.1|2767661_2767805_-|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_155047234.1|2767661_2767805_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	2824115-2824152	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 2824115-2824152, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_016212372.1|3080575_3080797_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_016212372.1|3080575_3080797_+|hypothetical-protein
MAKYHALFLQQDKHMHNLLQATPLPLELDHEIVEFSIGQGPCQQLGKCSDLLYQHATNPEPESTTTTGCCAVL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	3128730-3128693	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 3128730-3128693, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_155047252.1|3080912_3081491_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_155047252.1|3080912_3081491_+|hypothetical-protein
MNFIIDFFKGQHQDHQKVLLPLASIKEDVVNAVDREKLTISPKDQYEFSLIRTNELFLEKIRALNLFDNIEDYLSAYNNIVAWDPKATESFSPPYLVAIQGAFLECCHESFKKKINISKEHSTEILANKWLYTAIMTVQQQSTAIEENYTTIKQRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	3128730-3128693	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 3128730-3128693, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_155047253.1|3081635_3081830_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_155047253.1|3081635_3081830_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAIVANILRLRHLHSTQTAENQTIINDYSATVFRLFGEYCSKKIDNSALRHLKCNTQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	3128730-3128693	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 3128730-3128693, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_155046758.1|3115028_3115160_+|phosphatase

>NZ_CP048066.1|WP_155046758.1|3115028_3115160_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	3128730-3128693	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 3128730-3128693, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP048066.1|WP_162034457.1|3115707_3116607_+|hypothetical-protein

>NZ_CP048066.1|WP_162034457.1|3115707_3116607_+|hypothetical-protein
MYVQKIINEPDFIKHFEKYKPEFLMLTQAGLDQDQYKGKYIEKLLADPRQFAQSYKYLENQGIKPQIYLQKILDNPTQFKQNGQKLKNLALKQPIYIQKILDNPALITQFEKYPEVFLDLNRLGLNQREHIDKVLQTPRQFMLSYRRLKDCGLNAAKYIQVILDDPQQFEQRCQHLEAFGLDLYRFIEKLVDAPTTFDDNIPGMLKLHAVYKKLSEKIAANQLLVRGVLGVGVDIIFKGEKKTVPTGIGNLWSVVVEKWKTESHAKGTTPQANLPSMLWLSYRDSQTQEVYQSINQLLS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP048066_1	Orphan	1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder	386458-386495	38	3128730-3128693	0

1. spacer 1.1|386458|38|NZ_CP048066|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048066 position: 3128730-3128693, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. NZ_CP048070

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP048070_1

• CRISPR_ID: NZ_CP048070_1
• CRISPR_location: 11110-11283
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP048070_1

Consensus_repeat	Method
ATATTCGTTCCCATATTGTTCGATATATGTTCCTGATTG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP048070_1

>1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder
CGTTCCTATATTCGTTCCATATTGTTCCGATATATGTTCCTGATTGTTCCTATATTCGTTCCCATATTGTTCCGATATATGTTCCTGATTGTTCCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048070_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP048070_1

>merge|NZ_CP048070|1|11110-11283|CRISPRCasFinder
ATATTCGTTCCCATATTGTTCGATATATGTTCCTGATTGCGTTCCTATATTCGTTCCATATTGTTCCGATATATGTTCCTGATTGTTCCTATATTCGTTCCCATATTGTTCCGATATATGTTCCTGATTGTTCCTATATTCGTTCCATATTGTTCCGATATATGTTCCTGATTG

>NZ_CP048070|1|1|11110-11283|CRISPRCasFinder
ATATTCGTTCCCATATTGTTCGATATATGTTCCTGATTG	CGTTCCTATATTCGTTCCATATTGTTCCGATATATGTTCCTGATTGTTCCTATATTCGTTCCCATATTGTTCCGATATATGTTCCTGATTGTTCCT
ATATTCGTTCCATATTGTTCCGATATATGTTCCTGATTG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP048070.1|WP_036778352.1|16944_17598_-|DUF4376-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|373004
NZ_CP048070.1|WP_162034521.1|11626_12439_-|AAA-family-ATPase	unknown	unknown	gnl|CDD|379293
NZ_CP048070.1|WP_155047333.1|7590_8022_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048070.1|WP_162034518.1|4221_4539_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
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rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP048070.1|WP_036778352.1|16944_17598_-|DUF4376-domain-containing-protein	gnl|CDD|373004	pfam14301, DUF4376, Domain of unknown function (DUF4376). This domain family is found in bacteria and viruses, and is approximately 110 amino acids in length.	0.00342903
NZ_CP048070.1|WP_162034521.1|11626_12439_-|AAA-family-ATPase	gnl|CDD|379293	pfam13614, AAA_31, AAA domain. This family includes a wide variety of AAA domains including some that have lost essential nucleotide binding residues in the P-loop.	3.01921e-35
NZ_CP048070.1|WP_054300692.1|16507_16945_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|368573	pfam05708, Peptidase_C92, Permuted papain-like amidase enzyme, YaeF/YiiX, C92 family. Amidase_YiiX is a family of permuted papain-like amidases. It has amidase specificity for the amide bond between a lipid and an amino acid (or peptide). From the structure, a tetramer, each monomer is made up of a layered alpha-beta fold with a central, 6-stranded, antiparallel beta-sheet that is protected by helices on either side. The catalytic Cys154 in UniProtKB:Q74NK7, Structure 3kw0, is located on the N-terminus of helix alphaF. The two additional helices located above Cys154 contribute to the formation of the active site, where the lysine ligand is bound.	3.53506e-08
NZ_CP048070.1|WP_054300148.1|5873_6935_-|transposase	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	8.82012e-13
NZ_CP048070.1|WP_054300271.1|8620_9595_-|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	5.97286e-78
NZ_CP048070.1|WP_075275277.1|4986_5226_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	6.98937e-12
NZ_CP048070.1|WP_075273327.1|14459_15035_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.58738e-46
NZ_CP048070.1|WP_155047338.1|14980_15346_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|379154	pfam13384, HTH_23, Homeodomain-like domain.	8.99474e-08
NZ_CP048070.1|WP_054300690.1|15566_15830_+|RNA-binding-protein	gnl|CDD|240845	cd12399, RRM_HP0827_like, RNA recognition motif in Helicobacter pylori HP0827 protein and similar proteins. This subfamily corresponds to the RRM of H. pylori HP0827, a putative ssDNA-binding protein 12rnp2 precursor, containing one RNA recognition motif (RRM), also termed RBD (RNA binding domain) or RNP (ribonucleoprotein domain). The ssDNA binding may be important in activation of HP0827. .	2.29873e-35
NZ_CP048070.1|WP_075275277.1|2610_2850_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	6.98937e-12
NZ_CP048070.1|WP_162034522.1|18746_20654_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|227076	COG4733, COG4733, Phage-related protein, tail component [Function unknown].	2.03834e-21
NZ_CP048070.1|WP_162034519.1|8347_8536_-|DUF4160-domain-containing-protein	gnl|CDD|379344	pfam13711, DUF4160, Domain of unknown function (DUF4160).	0.000453052

Protein sequences

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>NZ_CP048070.1|WP_162034518.1|4221_4539_-|hypothetical-protein
MPIIKNSQDKTLTESIRVPSNSKRLIETLSKLIEKALETLREEIKNAYFYQSSYEQEKSIEELKALQAVLVGKDKGVEKPLEEQPFELIQAKIKQHCNDYITYKI
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MANRDNIPRSVVEVVVKMLSCRTKFAGHDEYSCSNSGCKHTKVVTYTCKSRLCSSCGKKPLSNGLLHRISYSQSANTST
>NZ_CP048070.1|WP_162034517.1|2264_2441_+|hypothetical-protein
MPNFNFLAQSNQTDVMIYHSIASGDAAYFIEKIKYIPEDHTVNIRINSQAAVSPKALR
>NZ_CP048070.1|WP_162034520.1|11447_11603_-|hypothetical-protein
MKKKEKTIFDSLRKSTAKEDIDALAKEVIGMMQINKNDATNSTSLKEPTVV
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MDIDPKITAKEVASFLGLTVQAVHKRIKVKGAKEKKAQNRIYFGHDTAREIIEPKVKQFKIATAVVKGGVGKTTLAEALAIRTALYGLRVLCIDIDQQANLTKGLGMDKQAKECPVMIDLIEGKASPEDSILSVIPGLDLVPSRLDNVTLDGYMMLNRVNPSFIFNKLFGNVFKNYDLIIFDCPPTLGSTVCAAMLCSDLVIAPINPDVYSYEGIEIMGKEIENIYGQFNTKVNWKILLNKFDSRTILSTDYISQLLKDPSFLQSCLKVL
>NZ_CP048070.1|WP_075273327.1|14459_15035_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MQDFKINEVIGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDNPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTDWINKGPIDSVLATDENAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSSEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVKTAGTADVRFKDDPWPLTEKVLSSEDFNKNINFYNHSKTSGPGGDLGFNIFVANPSETTVLYIALPWLCIGYGNYWRDNPINIISHTKRKILSEDSGYSMSLNGVWSQWNTITQTYTDENVFTVNFPIAFPIACTNVVITALDPDQLSSNDMIPKLCSRSRSSFQMMFSPGLQAAGFSYFATGY
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MGE targeting detection<

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NZ_CP048070_1	1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder	11149-11244	96	NZ_CP013808	Piscirickettsia salmonis strain PM31429B plasmid p2PS12, complete sequence	38296-38391	40	0.583
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NZ_CP048070_1	1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder	11149-11244	96	NZ_CP013783	Piscirickettsia salmonis strain PM49811B plasmid p2PS6, complete sequence	38296-38391	40	0.583
NZ_CP048070_1	1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder	11149-11244	96	NZ_CP048054	Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p2, complete sequence	47741-47836	40	0.583
NZ_CP048070_1	1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder	11149-11244	96	NZ_CP039206	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed2, complete sequence	1154-1249	40	0.583
NZ_CP048070_1	1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder	11149-11244	96	NZ_CP050947	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence	7629-7724	42	0.562

1. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 36, identity: 0.625

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2. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 37, identity: 0.615

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3. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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4. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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5. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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6. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039090 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-111 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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7. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039090 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-111 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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8. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039115 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-135 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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9. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039115 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-135 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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10. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039063 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-099 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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11. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039063 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-099 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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12. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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13. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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14. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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15. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038906 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-008 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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16. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038906 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-008 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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17. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038929 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-013 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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18. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038929 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-013 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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19. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039174 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-138 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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20. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039174 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-138 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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21. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013797 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p1PS9, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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22. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013797 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p1PS9, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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23. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012510 (Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-2, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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24. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012510 (Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-2, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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25. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013788 (Piscirickettsia salmonis strain PM58386B plasmid p2PS7, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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26. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013788 (Piscirickettsia salmonis strain PM58386B plasmid p2PS7, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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27. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013823 (Piscirickettsia salmonis strain PM25344B plasmid p2PS14, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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28. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013823 (Piscirickettsia salmonis strain PM25344B plasmid p2PS14, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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29. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013803 (Piscirickettsia salmonis strain PM22180B plasmid p2PS13, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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30. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013803 (Piscirickettsia salmonis strain PM22180B plasmid p2PS13, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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31. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039233 (Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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32. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039233 (Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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33. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039233 (Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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34. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039233 (Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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35. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039233 (Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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36. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013820 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p4PS10, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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37. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013820 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p4PS10, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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38. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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39. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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40. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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41. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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42. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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43. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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44. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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45. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013792 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p1PS8, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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46. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013792 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p1PS8, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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47. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013815 (Piscirickettsia salmonis strain AY3864B plasmid p4PS11, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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48. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013815 (Piscirickettsia salmonis strain AY3864B plasmid p4PS11, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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49. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011852 (Piscirickettsia salmonis LF-89 = ATCC VR-1361 plasmid pPSLF89-3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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50. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011852 (Piscirickettsia salmonis LF-89 = ATCC VR-1361 plasmid pPSLF89-3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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51. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039073 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-108 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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52. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039073 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-108 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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53. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039100 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-117 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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54. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039100 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-117 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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55. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039105 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-118 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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56. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039105 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-118 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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57. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039179 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-139 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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58. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039179 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-139 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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59. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039110 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-134 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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60. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039110 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-134 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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61. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039053 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-081 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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62. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039053 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-081 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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63. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013948 (Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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64. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013948 (Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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65. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039058 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-098 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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66. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039058 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-098 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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67. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039079 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-109 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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68. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039079 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-109 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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69. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039084 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-110 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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70. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039084 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-110 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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71. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039047 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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72. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039047 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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73. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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74. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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75. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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76. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038921 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010b plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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77. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038921 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010b plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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78. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038902 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006b plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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79. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038902 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006b plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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80. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013808 (Piscirickettsia salmonis strain PM31429B plasmid p2PS12, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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81. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013808 (Piscirickettsia salmonis strain PM31429B plasmid p2PS12, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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82. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048061 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p5, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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83. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048061 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p5, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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84. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013783 (Piscirickettsia salmonis strain PM49811B plasmid p2PS6, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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85. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013783 (Piscirickettsia salmonis strain PM49811B plasmid p2PS6, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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86. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048054 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p2, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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87. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048054 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p2, complete sequence) position: , mismatch: 38, identity: 0.604

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88. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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89. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039090 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-111 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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90. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039090 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-111 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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91. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039115 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-135 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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92. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039115 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-135 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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93. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039063 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-099 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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94. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039063 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-099 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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95. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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96. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038906 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-008 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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97. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038906 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-008 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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98. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038929 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-013 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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99. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038929 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-013 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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100. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039174 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-138 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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101. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039174 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-138 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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102. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039200 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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103. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039200 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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104. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039200 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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105. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013771 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p3PS3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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106. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013797 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p1PS9, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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107. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013797 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p1PS9, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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108. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012510 (Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-2, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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109. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012510 (Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-2, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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110. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013788 (Piscirickettsia salmonis strain PM58386B plasmid p2PS7, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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111. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013788 (Piscirickettsia salmonis strain PM58386B plasmid p2PS7, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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112. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013767 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p5PS2, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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113. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013767 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p5PS2, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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114. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013767 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p5PS2, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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115. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013823 (Piscirickettsia salmonis strain PM25344B plasmid p2PS14, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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116. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013823 (Piscirickettsia salmonis strain PM25344B plasmid p2PS14, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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117. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013803 (Piscirickettsia salmonis strain PM22180B plasmid p2PS13, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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118. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013803 (Piscirickettsia salmonis strain PM22180B plasmid p2PS13, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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119. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013820 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p4PS10, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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120. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013820 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p4PS10, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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121. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013775 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p2PS4, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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122. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013775 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p2PS4, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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123. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013775 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p2PS4, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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124. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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125. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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126. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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127. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013792 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p1PS8, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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128. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013792 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p1PS8, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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129. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013815 (Piscirickettsia salmonis strain AY3864B plasmid p4PS11, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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130. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013815 (Piscirickettsia salmonis strain AY3864B plasmid p4PS11, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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131. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011852 (Piscirickettsia salmonis LF-89 = ATCC VR-1361 plasmid pPSLF89-3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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132. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011852 (Piscirickettsia salmonis LF-89 = ATCC VR-1361 plasmid pPSLF89-3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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133. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039073 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-108 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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134. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039073 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-108 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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135. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039100 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-117 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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136. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039100 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-117 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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137. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039105 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-118 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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138. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039105 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-118 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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139. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039179 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-139 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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140. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039179 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-139 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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141. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039110 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-134 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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142. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039110 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-134 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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143. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039053 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-081 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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144. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039053 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-081 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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145. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013948 (Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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146. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013948 (Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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147. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039058 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-098 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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148. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039058 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-098 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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149. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039079 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-109 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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150. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039079 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-109 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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151. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039084 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-110 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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152. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039084 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-110 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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153. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039047 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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154. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039047 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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155. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012417 (Piscirickettsia salmonis strain PM15972A1 plasmid pPSA1-4, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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156. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012417 (Piscirickettsia salmonis strain PM15972A1 plasmid pPSA1-4, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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157. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012417 (Piscirickettsia salmonis strain PM15972A1 plasmid pPSA1-4, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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158. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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159. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038921 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010b plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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160. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038921 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010b plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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161. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038902 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006b plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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162. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038902 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006b plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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163. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013808 (Piscirickettsia salmonis strain PM31429B plasmid p2PS12, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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164. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013808 (Piscirickettsia salmonis strain PM31429B plasmid p2PS12, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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165. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048061 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p5, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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166. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048061 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p5, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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167. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013783 (Piscirickettsia salmonis strain PM49811B plasmid p2PS6, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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168. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013783 (Piscirickettsia salmonis strain PM49811B plasmid p2PS6, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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169. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048054 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p2, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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170. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048054 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p2, complete sequence) position: , mismatch: 39, identity: 0.594

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171. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039090 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-111 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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172. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039115 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-135 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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173. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039063 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-099 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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174. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038906 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-008 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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175. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038929 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-013 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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176. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039174 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-138 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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177. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013771 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p3PS3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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178. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013797 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p1PS9, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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179. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012510 (Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-2, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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180. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013788 (Piscirickettsia salmonis strain PM58386B plasmid p2PS7, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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181. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013823 (Piscirickettsia salmonis strain PM25344B plasmid p2PS14, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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182. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013803 (Piscirickettsia salmonis strain PM22180B plasmid p2PS13, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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183. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039233 (Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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184. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013820 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p4PS10, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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185. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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186. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013792 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p1PS8, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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187. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013815 (Piscirickettsia salmonis strain AY3864B plasmid p4PS11, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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188. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011852 (Piscirickettsia salmonis LF-89 = ATCC VR-1361 plasmid pPSLF89-3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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189. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039073 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-108 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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190. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039100 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-117 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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191. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039105 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-118 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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192. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039179 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-139 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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193. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039110 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-134 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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194. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039053 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-081 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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195. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013948 (Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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196. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039058 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-098 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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197. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039079 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-109 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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198. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039084 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-110 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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199. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039047 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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200. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038921 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010b plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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201. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038902 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006b plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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202. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013808 (Piscirickettsia salmonis strain PM31429B plasmid p2PS12, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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203. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048061 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p5, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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204. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013783 (Piscirickettsia salmonis strain PM49811B plasmid p2PS6, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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205. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048054 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p2, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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206. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039206 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 40, identity: 0.583

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207. spacer 1.1|11149|96|NZ_CP048070|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 42, identity: 0.562

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3. NZ_CP048069

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	4736 : 45056	57	unidentified_phage(19.05%)	capsid,head,portal,transposase,terminase,protease,tail	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP048069|4736:45056|DBSCAN-SWA
ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAGATGTTGTGGAAAAAAAGCTACCGATATAGAGGATAAACGAATGCTCGCTACTTACCTCAAAGATGAACATAAGCTAAGCCTCGTGGTTGCTTGTAATTTAGTCACTCTTCCAAGAGCAAGCTATTACCGAAAAAAACAGCATCAATCTGATGATGCTGAAATAATTTCAGAGCTAAAGACGTTAGCGAGCAAACACAAACGCTGGGGTTGCGACAAAATGGTCGCATATTTAAAAAACAAAGGTAAGCCTTGGAACCATAAGCGCATTCGTCGAGTCTATATTGAAATGGGCTTAAACATAAGCTGTAAACCAAAGCATCACTACGTCAAAACGAGCCTGAATATTTATTTCAGCCTATCTACAAAAATGTTTGTTGGTCATTAGATTTTATGAGTGACGCCCTTCTGAGCGGTACGAAATTTAGAACGATGAACCTCATTGATGATTACAACCGTAAGGCTTTAGGCATCGCTATCGATTTTTCAATGCCTGCTGTTTTTGTCACGTCCAAACTTGATGAGTGGTGCAAAGTGCATGGCTACCCTGAAATGCTGCGGACTGACAATGGGCCTGAATTCATTTCTTCCCATTTCCAAGAATGGGCTGAAGGGCATGGAATTCAACTGCGTCGGATACAACCAGGAAAACCTGCTCAAAATGGTTATATTGAACGATTTAACCGCACTTATCGTGGTGATATTTTAGATTCCAATCAATTTACTTCATTGCAGCAAGTTCAGAAACTTAGTGATGACTGGATCGTTGAATATAACACGATCAGACCACATCAATCTTTAAAGAATCTTTCACCAGACACATTTGCTGAGAAACGTGAAAAACAGTTAGAAAAAATTTCGACAAAAACAGAGGGATAATTCCAGTTTTAAACTGTCTCACTTATGGGAGGTTGACACGGCCAGCCGGTACTGAGCAGCGCAAAATAGACATCTTCAATCATAGTTTTTGTTTTTTCAGCGCGAGGGTTAATGCATTTTTAAAAATATCGATGGATGTTTGCGCGTTATCATTCAGCGCCGGGCGAATAAACGGCCGTGCCGGTTGGTGACTGCTGCCATATTCTTGCTCGATAGCGTATTGAATTTTACGTGCAGGCCCCACCGTCACATTAACAATGGTTCGGCGGCCTTTGCCTTTTTTAGAACGCCGTTTAATTGACTCAGCTAAAGCGCCTGACTTTTGCGGTGCATTCGCTTTCATTTGTGCCTCAACCGGTTCCGCGGCTTTACGCAGGGCGCGACGGTTTAGGTTTCTTATTTTTTTCGGTTCTAAGGTTTTAAGTTTCTGCTCTAATTCACGTAAACCCTCAACAGAAAAACTCATTTTAGGCATGCAGCCACTCCCGACAGGCTAAAATAAGCTCACGATTACGCTCATCTGGATTAATCACACTTAAAATCTCCAAATAACGACCATCAAAAACAAGGCGCAACGACGGGGTAATATCAGATCGATAACGCAGGGTCACCGTTTGAGTAATTTCATGATAAAACTGTTGGGCGCTAAAGAGTTCCCGGCCTGCACTCGGACTGACCCGTGCCCAGACGGTAGTAATATCCTGCCAATAATCGACGGCTTCACCATAATTATTGGCACCGATTAAATTATTTTGTAAAGTCACGCGATGGCGTAACAAACTCGCTCTCATGCGCTTAAATGCCGATGTGGATTGAGTAAAAAATGGGTACTCATCGGCACCTCTTTCACCGTTAAAGTACTCGTTGATTCACGGTTTTCATAAAAGTGACCGGCAGACATTAAGATGGCAATTTCTATCGATTTATTAATTAACACACTGTTTTCAATCGTTTCCAAGTCATTTGTATTATTTACAATTGCACGGTCTAGATAGTCCTCGGCGGCTTGTAGGGCAGCGGCAAGAATAAACGCTAAATAATCATCTTCGTTATTATCTTCGATGCGTAGATGGCTTTTTAGGCGTGCTAAATCGATCATTTTGGTTTTTTCTTCGATGTTTTAACGTTAACTGCCTCAGCATCACCGTGCTTCATCATGGCTTTTGCGGTTTTGTCGGGTAAATCAATAATATCGCCGATATTATAAGAAATATTTATCCCGGCCCGAGGCACTAAGATTTTAACTTTCATAAAGTCCCTTTTACTTTTAAATTTGATTTAAATGTGAATTAAAACGATTTAAATGATGCTGCTGAAGCTTCTGCTGCCAGAGGGGGTGCTTCCTCCGCTCTGTCATAAAATAACAAGCTTGCTTCTCCTTGGCTGCGACTGACAAAATCATCGACTGCTTTATAAGCAGCCGCTTTTTGCGCATCACTATAAAAAGAAGGATCCGCACCTTCTTTTTTTATCCATTGGATTAAGGCTGTACATTTTTCATTTTGAGATATTGGGCGAGACCTAATGTTCCTTATTTCAAAAAGATTCATCTGTGGTAGAGTTTCAAATTTATAATATTCTTCTGGTACAACATCTGTACTGAGTAACCCTTCAGTTGTTTTTGTAATATGATTTCTATAACCCCAAAGATTTTTAAAGGAAGACGTTCCTCGAACTATAGGTGCTAACTGCAATGCTCGATTAAAAATTTCTTGTAAATCGGTATTACTAATGTCCATATATTTTTGGATAGCAAAGTCCAAACTACCTATTAGTGCTTGATAGCTCTTACCTTTTCGATTACTAGAGCTAGAATACCAATCACTCGATTTTGAAGCTATTCTTTCAATAAATAGCTTAAGGTCTTTCAACTGCCCCCATCGTTTGCTATCACAAATTAGATTAGTATCGATAGAGTTACGTCTACGACCTTGGGTAGAATATGTCTCTTTAGTAAAGAGCTTTCTGCTCTCTTCTTGGTAAGCTAGATTAAAATCCCTTAACAGTCTTTTTTCTGCGATTTTTATAGGTTGAGTTGTACCAAACGCTTCAGAATAGCCTTCTGTTTTAATTTCACCATCAAAACACTCTTCAAGATCAAACTGTTTTCCAAATTCTTTTGCATAGTTTATATGGCTTTTATAATTGGAAAGTTTGGTTGCCTTATAAATCCAGGTATCAACGATAATTGCATTTTCTAGTTCTGTTTTCTCACTAAGCTCTTTTATATTATCAGAAATATAAACATTTGATTTTGTTTGTTGGTGCAAACTTGATGATTGATGAATTAAGCAAAAGGCATGAAGAGGAGTTTTAATTACTGATATATAAACAGGTGCTTCAAATTTATTTAACATTGAGCCTAAGAAAGTACTAACTTCACTTAGTTCACTACAAAAACCAACTCTATGATCTAATGCTCTTTTTGCGTATGCTGAGGGAGCTTGCTCATCAATTTTACCACTAGTAGCATTAATCCCTTCTCTAATCGAGTATACTTTTTTATATCTTTCATCAAAAAAAGAATTTCCTGTCAACAAATAAAGGTTTTCTGAATATTTAATATTTCGGCGAACTGCTGTGACTAAGGCAGCACCAATTGCGAGTAACTGATTTGCATTCATGGCAATAATACCTTAAATGTATTAATGCCATGGTAATATTTTATAAATAAAAATAGTATATTAATTAATTATATAAAGTTTATTTATTAATAAATAAAGCATCTAATTTTTATTAATTTTTTAAGATACAGCTGTTTTAAGTTGTTTAATTGCCTCTGTCTCAAGCAATAAGGCATCCACACGCAACCACATTAAATAACCAACTTCACCGGTTTCAGCATAAAGCTCGTTCAATCGACGCAGCGAAATACCCCCACGATCAGCAATAATAAAATTAGAAAAATCACCGAACAAGGCGGCACATTTCCCGGCGGCGAGGGTGTCCATAAAGTCCGAGGTATTCACACGTTTACCACGTAATAAATCACCCTCACCGCTTTTAAAATCAGGCTGAATAATATACTGGCCATTACCATCTTTCATTTTTAAC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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300271.1|4736_5711_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_162034508.1|5845_6190_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_162034509.1|6195_6681_+|transposase	transposase family protein	S5WIU1	Leptospira_phage	8.1e-30	42.4
WP_016211139.1|6760_7156_-	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211132.1|7148_7472_-|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211137.1|7468_7780_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_155047318.1|7970_9305_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211140.1|9425_10619_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_016211130.1|10676_11333_-|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.9e-43	44.9
WP_155047319.1|11295_11916_-|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	5.5e-39	50.9
WP_075275277.1|12008_12248_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104629.1|12118_13144_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047320.1|13274_13997_-|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	2.6e-40	40.8
WP_155047321.1|13993_15676_-|terminase	terminase large subunit	A0A1P8DTK0	Proteus_phage	6.9e-137	45.7
WP_016212234.1|15678_16158_-|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_155047322.1|16234_16627_-	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.4e-26	47.2
WP_054300271.1|16961_17936_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_016212235.1|18033_18399_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780870.1|18551_18881_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047323.1|18880_19207_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047324.1|19635_20421_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	7.6e-38	36.4
WP_016210974.1|20432_20840_-	DUF4411 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210972.1|20848_21076_-	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|21371_22346_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047330.1|22365_22695_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210960.1|22836_23310_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A220NRQ8	Escherichia_phage	4.9e-32	63.4
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WP_036780969.1|23592_23982_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047331.1|24210_24558_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210959.1|24550_24913_-	hypothetical protein	R9TNL4	Vibrio_phage	2.9e-24	53.8
WP_016210973.1|24881_25442_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210962.1|25464_26280_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210976.1|26326_26626_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210958.1|26779_27085_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034504.1|27344_27497_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210971.1|27753_28509_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210975.1|28585_29311_+	LuxR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_036780204.1|29331_30693_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_155047327.1|30780_31134_-	toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	1.1e-12	35.8
WP_155047328.1|31126_31339_-	addiction module toxin, HicA family	NA	NA	NA	NA
WP_155047329.1|32715_33045_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080963666.1|33502_33742_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876259.1|33612_34629_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027243195.1|34954_36001_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375692.1|36408_36642_+	hypothetical protein	Q7Y5W4	Haemophilus_phage	1.3e-06	42.6
WP_017375691.1|36665_37367_+	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	9.6e-32	37.6
WP_036773107.1|37350_37668_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126713.1|37994_39032_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212089.1|39130_39361_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126714.1|39597_40137_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047316.1|40304_40754_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300598.1|40753_41191_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104629.1|41360_42386_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274768.1|42256_42556_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|43110_44085_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047317.1|44219_45056_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.9e-42	36.7

4. NZ_CP048068

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1475 : 48729	53	Streptococcus_phage(31.58%)	capsid,head,tail,portal,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	51831 : 64944	21	Enterobacteria_phage(21.43%)	protease,capsid,head,portal,tail,transposase,terminase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP048068|1475:48729|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_162034482.1|1475_1745_+	hypothetical protein	A0A1X9I6U5	Streptococcus_phage	8.2e-08	37.5
WP_162034483.1|1683_2718_+|portal	phage portal protein	Q6DMU2	Streptococcus_phage	1.5e-70	45.1
WP_162034484.1|2680_2911_+	hypothetical protein	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.2e-13	52.9
WP_162034485.1|2927_3023_+	hypothetical protein	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	5.9e-06	67.7
WP_162034486.1|3033_3261_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034487.1|3459_3801_+|capsid	phage major capsid protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034502.1|3800_4106_+|capsid	phage major capsid protein	M1Q1R5	Streptococcus_phage	1.6e-07	28.7
WP_162034488.1|4219_4546_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	1.5e-16	43.6
WP_036778347.1|4581_5163_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274765.1|5475_5787_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	2.5e-08	31.7
WP_075274764.1|5783_6107_+|head	phage head closure protein	K7PH08	Enterobacteria_phage	5.4e-14	41.7
WP_162034503.1|7258_7567_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047304.1|10536_10668_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377927.1|12186_12501_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034489.1|12831_13557_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211377.1|13580_14603_-	AAA family ATPase	A0A1V0DZZ0	Clostridioides_phage	3.2e-12	27.5
WP_162034490.1|15363_15765_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034491.1|15977_16388_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126623.1|16500_17733_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

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MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPTTEVDHIKPHDGDHDLMWNQNNWQALCKSCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGV
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MNNWYQIKAQANKSADVYIYDYIGDYGVEAKSFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIITHIDSLAASMASIIALTGDTVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAACVKPNQYKNTPQTLIKHSENNAAKALQRHKLALKRSLL
>NZ_CP048068|51831:64944|63023_63605_-|WP_036778347.1|DBSCAN-SWA
MPTQKHMEKITNLIDDLQKRITKLDGQIEAEAKSSFISSGLLEREKSKGSRPVEYYHNVREFSRKLLPKIASWARKALLLCECKNFLEEMTKDDSKALEHATHLNETYLRHSNLAVFEARFRSMTKSLCSKTYKILKSIAKENQQSAVAATNCGGGAYAVADIVNRHQSSGLTSVEEGLQVVELPQTQPAMQG
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MNMNSLLSVALQMTEGVPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHNSIYNERELLIL
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MFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALASRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDSQTQDGLNVHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKVCAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPPSVI
>NZ_CP048068|51831:64944|54062_54302_+|WP_016210963.1|DBSCAN-SWA
MNTFKKITDDLERGTRFLVVTVVLLYTCTLIVYVVQWGLSLFTDEINADLGSALITAYFLIILSVIIGAFFDKLGRNHD
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MIDLTRLKSHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYLDRVIVNNTDDLEAIANSVLINKSIEITILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRYLSA
>NZ_CP048068|51831:64944|52858_53395_+|WP_036780304.1|DBSCAN-SWA
MNLIKPFLNNKTDEEVERITSDWWEAIGNFPNVVWDAARTQLLKTMTSFMVTPGEFRKMCQEVKPEELGYTSTKQAYAECYLNIRQRHKVTQPRHWSHATVFIASEALRAQNYACGISEYRKFEKSYLKAIYRDLNGERLPYPPVVLPMIENKPGKSRQCGSEHLAKLRGVLGRPAHA
>NZ_CP048068|51831:64944|53363_53726_+|WP_155047314.1|DBSCAN-SWA
MEYLGGPLMPSRVSAGERAFQLHCRLEKITLPEQEYRFHKTRKWRFDFAWPDLKIAVEVEGGAYSQGRHTRGKGFEADCEKYNTATESGWRVFRYSTQQVSQYIAIRQLKRVLEKYHVDD
>NZ_CP048068|51831:64944|59905_61147_+|WP_054300593.1|portal|DBSCAN-SWA
MKLFKRWFGAATELEPSTEYGGYELLDITPMSASGQSIHPDNAMHLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKALATDHPLYSVLHDLPNAEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDSTTVRRDEKTKKLVYSTILNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQAHGAQLFGNGARPSGILTTDGALKKEGRENLAESWKKSHGGKNSNGVAVLENGLKWQTLTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARASFYNRMFSIGVMSQNDIRKLENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQNNEQLVSDQSTSK
>NZ_CP048068|51831:64944|54680_54983_+|WP_155047311.1|DBSCAN-SWA
MNEKQKALAKTSMVEFNKIFDLIKKSVLDTTENLDKKSEQVFYFTGFITLLIDQLIDLQLQVIKSSVDDKSLSLMILKQLDEKIQEKIKESREDCHKCAV
>NZ_CP048068|51831:64944|61821_62988_+|WP_155047306.1|capsid|DBSCAN-SWA
MPDIYELAQQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYKDLNTQQLNIKNRIAKIEEVEAQEREINSLSSEPLRAGVQSPTDNTPINPLATEEYEKNFFAYMRGQNSGVDIRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTDSTTELPMADSYGAATWTGDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIGAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPIGVTAAAPTSITLDDILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA
>NZ_CP048068|51831:64944|64548_64944_+|WP_075274763.1|DBSCAN-SWA
MPKISFSVEGLRDLEKQLKQLAPKKIRTLNRRALRKAAEPLEQQMKANAPQKSGALVESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPTRKIDYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKSTLTLAIKKQKL
>NZ_CP048068|51831:64944|58294_59269_-|WP_155047308.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP048068|51831:64944|64232_64556_+|WP_075274764.1|head|DBSCAN-SWA
MRAGLLRHRVTLQNNLVGTNNYGEAVEYWQDIATVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEISQTVTLRYRSDVTPLLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWVHA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016211080.1|51831_52818_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0S2MVA0	Bacillus_phage	4.3e-14	45.4
WP_036780304.1|52858_53395_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047314.1|53363_53726_+	hypothetical protein	R9TNL4	Vibrio_phage	2.9e-24	53.8
WP_155047315.1|53718_54066_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210963.1|54062_54302_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034499.1|54294_54684_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047311.1|54680_54983_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034500.1|54970_55420_+	single-stranded DNA-binding protein	G8EYH4	Enterobacteria_phage	7.2e-33	64.9
WP_052047121.1|55584_55986_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126915.1|56164_56548_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.7e-25	45.5
WP_155047310.1|56634_57117_+	hypothetical protein	Q9B019	Phage_GMSE-1	1.1e-13	33.3
WP_162034501.1|57384_58275_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	2.3e-83	55.7
WP_155047308.1|58294_59269_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.3e-26	31.5
WP_155047307.1|59312_59909_+	hypothetical protein	E4ZFM0	Streptococcus_phage	2.0e-38	45.3
WP_054300593.1|59905_61147_+|portal	phage portal protein	Q6DMU2	Streptococcus_phage	2.7e-85	43.6
WP_054300592.1|61109_61766_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	5.4e-45	45.9
WP_155047306.1|61821_62988_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	1.2e-66	38.7
WP_036778347.1|63023_63605_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274765.1|63924_64236_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	2.5e-08	31.7
WP_075274764.1|64232_64556_+|head	phage head closure protein	K7PH08	Enterobacteria_phage	5.4e-14	41.7
WP_075274763.1|64548_64944_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	6.0e-07	39.1

5. NZ_CP048067

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP048067_1

• CRISPR_ID: NZ_CP048067_1
• CRISPR_location: 111921-112144
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers
• Cas_protein_info: RT

Consensus repeat of NZ_CP048067_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP048067_1

>1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048067_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP048067_1

>merge|NZ_CP048067|1|111921-112144|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP048067|1|1|111921-112144|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP048067.1|WP_157894761.1|121503_121650_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP048067.1|WP_081377350.1|108083_108899_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377437
NZ_CP048067.1|WP_016211890.1|113564_116141_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273167
NZ_CP048067.1|WP_155047284.1|103838_104867_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048067.1|WP_036771347.1|116257_117235_-|IS5-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|290455
NZ_CP048067.1|WP_036774631.1|122012_122477_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048067.1|WP_075273826.1|106259_107387_-|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	gnl|CDD|275209
NZ_CP048067.1|WP_155047299.1|117562_118921_+|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|350771
NZ_CP048067.1|WP_016212014.1|100750_101164_-|DUF2190-family-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048067.1|WP_016211879.1|110689_111709_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP048067.1|WP_155047285.1|123610_123868_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048067.1|WP_155047013.1|107607_107754_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048067.1|WP_036780064.1|109144_109735_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271175
NZ_CP048067.1|WP_054300202.1|101261_101990_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP048067.1|WP_017375910.1|119104_119833_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP048067.1|WP_105962623.1|105146_106300_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP048067.1|WP_162034470.1|117359_117473_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP048067.1|WP_054300202.1|112632_113361_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP048067.1|WP_036771347.1|123886_124864_+|IS5-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|290455
NZ_CP048067.1|WP_105962623.1|102056_103210_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP048067.1|WP_075273826.1|106259_107387_-|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	2e-50	166.1	0.1

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP048067.1|WP_081377350.1|108083_108899_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	2.93086e-44
NZ_CP048067.1|WP_016211890.1|113564_116141_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|273167	TIGR00601, UV_excision_repair_protein_RAD23_homolog_A, UV excision repair protein Rad23. All proteins in this family for which functions are known are components of a multiprotein complex used for targeting nucleotide excision repair to specific parts of the genome. In humans, Rad23 complexes with the XPC protein. This family is based on the phylogenomic analysis of JA Eisen (1999, Ph.D. Thesis, Stanford University). [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0.00878524
NZ_CP048067.1|WP_054300202.1|112632_113361_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP048067.1|WP_036771347.1|116257_117235_-|IS5-family-transposase	gnl|CDD|290455	pfam13737, DDE_Tnp_1_5, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis.	3.06507e-32
NZ_CP048067.1|WP_075273826.1|106259_107387_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|275209	TIGR04416, hypothetical_protein, group II intron reverse transcriptase/maturase. Members of this protein family are multifunctional proteins encoded in most examples of bacterial group II introns. These group II introns are mobile selfish genetic elements, often with multiple highly identical copies per genome. Member proteins have an N-terminal reverse transcriptase (RNA-directed DNA polymerase) domain (pfam00078) followed by an RNA-binding maturase domain (pfam08388). Some members of this family may have an additional C-terminal DNA endonuclease domain that this model does not cover. A region of the group II intron ribozyme structure should be detectable nearby on the genome by Rfam model RF00029. [Mobile and extrachromosomal element functions, Other].	4.35291e-98
NZ_CP048067.1|WP_157894761.1|121503_121650_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	1.36328e-07
NZ_CP048067.1|WP_016211879.1|110689_111709_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP048067.1|WP_036780064.1|109144_109735_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	2.06134e-23
NZ_CP048067.1|WP_054300202.1|101261_101990_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP048067.1|WP_017375910.1|119104_119833_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	2.26977e-51
NZ_CP048067.1|WP_105962623.1|105146_106300_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	2.3205e-84
NZ_CP048067.1|WP_155047299.1|117562_118921_+|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein	gnl|CDD|350771	cd18013, DEXQc_bact_SNF2, DEXQ-box helicase domain of bacterial SNF2 family proteins. Proteins belonging to the SNF2 family of DNA dependent ATPases are important members of the chromatin remodeling complexes that are implicated in epigenetic control of gene expression. The Snf2 family comprise a large group of ATP-hydrolyzing proteins that are ubiquitous in eukaryotes, but also present in eubacteria and archaea. The bacterial SNF2 present in this family are members of the DEAD-like helicase superfamily, a diverse family of proteins involved in ATP-dependent RNA or DNA unwinding. This domain contains the ATP-binding region.	2.71429e-84
NZ_CP048067.1|WP_036771347.1|123886_124864_+|IS5-family-transposase	gnl|CDD|290455	pfam13737, DDE_Tnp_1_5, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis.	3.06507e-32
NZ_CP048067.1|WP_105962623.1|102056_103210_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	2.3205e-84

Protein sequences

>NZ_CP048067.1|WP_016211879.1|110689_111709_+|ParA-family-protein
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NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP038948	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	197195-197236	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP038973	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP039036	Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence	128617-128658	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	92334-92375	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	137266-137307	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP038963	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence	128617-128658	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137267-137308	0	1.0
NZ_CP048067_1	1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT	112078-112119	42	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93293-93334	0	1.0

1. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|111946|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|112013|40|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|112078|42|NZ_CP048067|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1333 : 45290	55	Indivirus(17.65%)	protease,transposase,integrase	attL 9609:9668|attR 37706:38881
DBSCAN-SWA_2	55200 : 161976	112	Streptococcus_phage(21.28%)	integrase,capsid,head,transposase,tail	attL 93570:93629|attR 146110:147354

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP048067|1333:45290|DBSCAN-SWA
GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGACACCTTCATTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATGGCCATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTGATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAGCGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCATTTTTTTGAAATTCCTGAATCTAAATTCTTAAGCCTGCTTCTTTAACTAATTGCCAAAGTGAGGATTTACGCTTGTGCTCCTCTTTTCAATTTCGCGTGATAATCAGCTTGTGAAGAAACATCCCCCACTCTTTGACCTCTTTAGCAAATTTCATCGCTTGCTTTAAATCATTGACGGCATATTTATAGTATTTAGATTGAGATTTTGTAAGTACGCCCTTAACAAGCATACGACGACACAAAACGGCTTCTAAAAAACACTCATGTTTGGCCAGTTGATTTGACAACTGGCGTAAGGGTGAATAATACACATTGCGTACTTCACCCTCTTCACGCACCCACTCAGCCACTGTGGCCACCTCACCCATTTCGATTAAAAACTCAAAACTTATGGTCAGTGATTGTTCTTTTGCTAGACGAATCGCATTTTCTTTAGCAGCACCTACTTCTTTAGCCGTGCAATGCTTTATATAGACTTGAAAGCTTTTAGCATCGAGGTGTTGCTCAAATTCATGCCAACGAATCTTTTGTGCTTCTTTACCTAACCCCTCTAATTCATAGGCTTCGATGAGCAATTTATTAATTTCATGTTGACAATGAAGTGGCTCATCACAACTGACTAAATAATCGATGGCTTCTTTAGAGCGCCAAGCTTTAATAAGACGTTTTGCAATTTCAATAATTTGATAAGCATGAAGCTCGGGTGATTCTTGACGTAACAGATCAATATAATCATCCACTGAGTCACGCAAGTCCGCGATTTCTTGTAACGCAGTTTTTAAATGACTGTGACGTCCTCTTTCTTTTAATTCAGAAAGATCAGCACGATCAAAAAAAACAATATTCCCTATCTTTTTAAGCTTTTCTTTTTCTTTAGGTGGTTTAAGCTTTGAAAGTGTTTCCTTAATTAAACGCTCTAAATGATCAACACCTTCTTTGTTTAAGGCTTGTTTAAATTTAGAAATTGTATTATCGCGCACACCATAATCATTTTCTAATGCAACATCGAAGACTTTCTCTGCGAGTTTTTTCTGGTCTATTTTCTCAGCCTGTGCCCAAGTCTTACCCCAACATTCAACCGCATACCGATAACAACCGCCTAAATCCCCATTAGAGTCATCGGCACGCTCAAAAACAACATTATCGGAGGTGATTAATAACTCCAACACCTCGGCAGCCAGTTCTGGCGCTTGCCCCCGGAGATTTTTATTAACTGCAGCAATAATTTGATCAATCTGATAAGCCAAGCCTGACGCTTCACGCCATTCTAAAAATTTCTTGCCGCGTTTAATGGTATTAACTTCGGCTTTGAGATTTTTCGCTAATTTTTTTGGATCGAGACTGACGAGTAATAAGTCCAGCTTTTTTTTTAAAAACTTATCTTCTTCTGCATAAGAGAGTATACAATCAAACAATTTATCCTGGCTGATTTTTTCTAGTTTTTTTGACCAGGTTTCACGATTGAGCTTTGGCATGACGATCCTTTAAAGTTTAAATTCTTGGTAGGCAGGTTGAGCACTGACATAGCACACCCTTTGAGCCATTGTAATTGAGTCATCGTCGTTTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGCGGAGGGCGAAATTTCAAATTGCGACAGAACCCGTAAGTGACGCTTACGAGAACTATATATATTCTATAAAATTATCATATCCATAAAAATAATTCATTTGAGTTATATTTAATATCAATATAAATTTAATTTTGCTAATTTAGTAAGCATTAATATTTGAGGTAATTTTATGAAAAATATAAAAAAAACTATTGGAGTGATTGTGTTAAGTGTTATATCAAGTGGCTGGGCAGTTGCCTGGAGTCCTTGGATTGTTTGTGGAGGAGCAACGCATAAAGTCTATCCTGAAGGAGGAGGAGATCCTTTTGATCAAACATCTTATTATTCAGCGCGATGTTCTGATGGACAAGCACCTGAAGGCTTCACATGTGCATATCATCCAGCTCGCCTTGTAAATGTTATTTATATAAATAATGTTGGAGGCAAAGATAACTATTATGATGTTAGTCAAAGTCAAATGAACGCTATTGATAAAATATGTCAAAAAATCGATAAAAGTGCAAAAGCAGAAGATCCTGCATATTTAGCTCATAGACAGGGAGATAATGGTGGAGGAATGTACGGTCATTATTATGACTTTAGAGTAGTTAGCAATAATAATTTCTTTTCTAAAGAAAAAATTATTTTTTAACCGTATAGCGAAAATCTCGGGGGATTGCCCCCGTGATGGGCATTGTGGTTCTGTCGCAATTTGAAATTTTCATAAAAGTATAATGCTCCCGAGTTTTCAGACAGAATAATTTAACGATTTATTCCTGAAAGGTTAAAATGATGCTTAACATTTTAGGAGCTATGACATGAGTCAAAAAAGAAAGAAGCCAAGCGCTGAATTTAAAACTAAAGTTGTCTTAGAGGTCATCGAAGGAGATCAGATGCTCAACCAAATATGTTCGAAATA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MKKLYVGNLTYSVEDRDLVEMFSKYGEVISARVITDRDTGRSKGFAFVEFQTQEQAQAALELDGKDSGGRNLKVNMAKPQEKRQSSW

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_162034465.1|1946_2132_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273816.1|4504_5341_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.9e-20	32.6
WP_016212398.1|5603_6065_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP048067|55200:161976|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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93570:93629	attL	NA	NA	NA	NA
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