Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP044004 | Francisella tularensis subsp. holarctica strain B-8365 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas4,cas2,DEDDh,csa3,cas3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
366609 : 444194
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044004|366609:444194|DBSCAN-SWA GTTAATCCGAGAGTATTTTGTTAAACACATAAGAGATAGCATCACAAATTTTTTCAAAACTATTATTCACTTTTCTAAATATTTTTTTAAAGTTAGCCCAAACCTTTTCAATAGGATTTAAATCTGGAGAGTACGGAGGTAGATATAATATTTGTACATCAAATTTATTGGCTATTTCAATCAGCTTAGAGGATTTATGGAAACTAGCATTATCCATTACTATAGTAGTTTTAGGTTTTAATGATGGGCATAAGTGTTCCTCAAACCATTGATTAAAAATTTCAGTATTGGTATATCCGCTGTACTCTAATGGAGCTATAATCTTTTTATCTGCATAATTATATCCAGCAACAATACTTCTTCTTTGTGTTTGATATGCTAAAACCTCGCCATAACTAGGCTCACCAATTAGTGACCATCCTCTTAGGATAGAAAGCTTATTGTCACACCCCATCTCATCTATATAAAATAACAAGTTTTGAGCTATTTCTTTTAGTTTTTCTATATACTCCAACCTTTCATGTTCTTTTCTTTGCTTATATTTTGGAGTCTTTTTTTAAAACTAAAACCAAGTATATTAAGACAATCATAAAATGTACTTCTTGGAATATCAGGGGCTAATGCTTCTTTTATATCTAATGTACTTGCATCTGGATGATCTATCAAATACTGTTCAATCAATGTTTTATCAGTAAAGCTAGCGACTCTGCCACAACCAACTCCTTGCCTTGAACTATAATCTCCGGTTCTTTTATAAAGCTCTATCCATGAAACAACTGTACGCTTATCTATGTTAAAAAACTTACTCAGCTCGAACTCCGTCATACCTTCTTCATATTTATTAATTACAATGTCTCTAAAATCTTGGCTATATGATGGCATTTTTATTAGACATTATAACATTTCTACAAATATCTTTTTCTACAAATATCTTTCGGATTAACTATATGGGTATTTTAGGAATCCTAGTTGCTATGATAGCAGGGTTTGTCATGCCTAAGAATTTAATAAGTATTGATTCATTAGCTTAAAACAATATTTTAAATATTTCTACTTTCATCTTCATCAATAATATATCTAGGACGTTTTTTTGCTTCATCAAATATACGACTTATATATTCACCTAAAACTCCCAAAGAAATAAGCTGGACACCACTGAAAAACATAATACTCACAACTATAGTTGGCCAACCTGTTACATTGACATTAAAAAATAAGCTCTGGACAAAAATATAAAAGCCATATGCTAATGCAAATATTGAAACTACAATTCCTAAAACAGATATCAATCTAAGCGGAACTGATGAAAAAGAGAATATACCTGTAAATGCCAGCTTAAAGAGCTTTTTATATCCCCAGCGACTTGCAGTGCCGTCTTTACGATCTGCAACCTCAAATGGTATAGCATAAGAGTTAAAGCCAATCCATGCAAAAAGTCCTCTGATAAAACGACTATTCTCAGGCAATGAATTAAATGCTTTTATACATTGCTTATCCAATAGTCTAAAATAACCTGCATTTGCAGGAATCTTAACTCCCATAAGCTTATTGCTAAGCTTGAAGAATGTCTCCGACAAGAAGCTTCTCGTAGCGCTTTGATCATCTCTTGTCCTTACACCATAGACATTAGAGTAGCCTTCGCACCATTTGCTATAAAACTGATCTATCACCTCAATAGGATGTTGAAAGTCACAATCCATTATTATCGCAGCATCAGCATCTCTAGATGCTTCTAAACCTGCAGTGATAGCTGCCTCTTGACCAAAATTTCTTGAAAAAGAAATAAATTTAATATTTAACTGATTAACTAATGACTGAATAATTTTTTTAGAATTATCCAAACTTCCATCATCCACAACTACTATTTTATAGTTTATACTGATTTGACTAAGTTTAGCTGCTAGCTCCCTTAAAAAGGATTCTATCAATACTTCTTCATTATAAACTGGTATCACCGCATAAATACGCGGGTTATCAACATTTCTACTTGTCATCACAAATACAAAATATATTAACCTTAATTAATGCTATTATAACCATGAAAGTATAAAATACCTAGTAGTAAAGGTGATAATTCAATTAGCAAATAAAAGTTATGGTTAAAAAAATAATAATTTGTGCAGATGACTTTGGCATGAGTGATAATATAAATATTGCTATTATTAACCTCTTGGAAAAAAAGGTTATTAATGCCACTAGCTGTATGCCAAATATGCCTGCATTCAAATTAGGAATTGCTCAATTAAAAAAAATATATAATGATTTTAGTCATGTTGGTATACATTTAAATTTAACTGAAGGTAATGCTTTTACAAATCCAAAATCTATAACTAGAAATGGCAAATTTTTGTCACTATCAAAACTTCTTGTCAAATCAAAACTTAGAGCAATAAATTATGATGATGTTTATAATGAGCTGAAAGCTCAAATAAATAACTTTATCGAAGACTGGGGCGCGCTGCCAGATTTTATTGATGGCCATCAACATGTTCATCATTTTCCAATAATTAGAAAAGCTGTTATAAATCTATATAAAGATTTCAATATGTACACTAAGCAGACCTATATCCGCTCAACATATAAAATGGATAAATCGGACTTTAAGTCACTAATAATCTATCGTAGCGGTGCAAAAAAGTTTTATAATATGCTAATAAAAAACAATATCAAGCATAACTCAAGTTTTGCCGGAGTTTATTCGTTAGAAAGTGATAATCAAGACTTTAGAAAAGTTATTCTAGAGGCTTATGCCAAAATTAAAGATGGAGGTATAATAATGTGCCATCCTGCTGCGGATATTGATATAAAAGATCCAATATCACAGTCACGCATTAAAGAATTTGCTTACTTTAACTCCAAACAAGCACTACAAGATCAAAAAGATCATAATATTGTACTATAAATAACTGCTATTTTACTTTCTTATAAATATAACGAGGATTAATAGTATCTGCTAAAAGTTTGTTTTCAAAGTCAACTCTAACCAAAACACCTAGCGTATAACACATAATTAATAAACTACTTCCCCCATAACTTATCAGTGGTAATGTAAGACCCTTAGTAGGGAGTAGTCCTGTATTAACACCAATATTAACAAAAACTTGAAAAGCAATCCAAAAACCAACACCATAAGCAAGAAAAGCCTGATAATATCTATTAAGTTCAAAAGCCATTTTAGCAATACTCATAGCTCTAAATACAATAAAAAGGTACACTGCAAGTAGAACCATCAAACCAACAACTCCTAATTCCTCAGCAATCACAGAAGTAATAAAGTCAGTATGTGCTTCTGGTAAGAAAAATTGCTTTTGAATTCCATTCCCGAGACCATCACCGAACCAGCCACCACGTCCAAAACCTATCAATGCTTGAACAAGCTGATAGCCAGAGCCATTGGCATTTTCCCATGGGTGTAAAAACCCTGTAATTCTGTGCATTCGATATGGTGATATAATTACTAGCATCGCAGCCATCATAACCATAGTACCTAAAAGTAAACCATACCAGCGCACTTTGTTACCTGCTACAAACAGCATTCCCATAACACATATTGATATAACAACTGTAGAACCAAAATCTGGCTGCATTAATAACAATATTGCGATACAACCCAATAAAGTAATTGGTCTAAGAATTCCTTCTTTAAAATTAGCCATCTTTTTTAGATTTTCAGCAATATAACCTGAGAAGAATATAATCGCCAAAAGTTTAGCCAATTCTGCAACTTGGATATTAATAATTAGCAAAGGTATCCAGCGTCGCGCACCATTGACACTTTTCCCAATTCCTGGCACAAGTACAGCAACTAAGACGATCAACATCACAAAGAAAAAAGCATTATAATTCTTTTCATAATTCTTAGTTGGTACTAATAAAGCCAATAAAAATAAAAAAATTGCAATAATTGCAAAAAAACCCTGTCTGATAGAATAAAAATAAGGATTATTGTAGTCATCTAAAGCAACAATCATAGATGCAGAAGTCACCATAACCCAACCAAAAGTAAGTAGGCCAAGCATTATAAAGACAATTGAAATATCAATCTCTAATTTGGCTCTTACACGTTCTTTTTTTGAGTTTTTGCCACTCAACAATAGTTTTAATCTATATAACACTTATACTTCCTAACTTTTTTGCTCTAGCTGAGCAACAAGATTTTGAAAAACTTCACCGCGCTGTGCATAACCACTAAATTCATCAAAGCTTGCACATGCTGGAGATAATAACACTATCTCATTGGAATTGGCTTTTTGACTAGCCAATTCGAAAGCTTGTTTCATATTATTACATAATTGATATTTACAGTAGCCTTTGATATAGCTTTCAATATATTCTTTATCAGCTCCATATATATAGACATATTTAACATATTTATCTAGTGATTTTATCATCAAACTAAAATCACCGCCCTTTGCTACACCACCCAATAATAATATGATATTTTTAGAATTTGTTATACTATTAAGAGCAGCTATTGTAGCTCCAACATTAGTACCTTTTGAATCATTTATATAAGTTGTACCATTTACTTTCTTTACAATCTTACAGCGATGTTCTAAGCCTTTAAATTTTTTAATAGAGTCTATTGCTTGATTAATATCTAAACCTAACCTATCAAGGATATTTAGCACAACAATAATATTTTCTAAATTATGTTCACCAAAAAGTTTAGTCTCAACAATATCTAATAGCTTTGTTGAATTACGGTAGATAGCGCCTCTTATTATTTGATATTCGCCAGCATACTTAATACCATTATGCACATCATAAACAAAAAAATCGTTACTGAATTTTGCCAAATTAAGTTTTGACTGCTTGTATTGCTCAAAATTTTGGTATCTATCTAAATGATCTGGTGAAACATTAATAATACAACCTAGATCAAATCTAACACAATTAAATAAATTTATCTGAAAACTTGATACTTCAACAACACAGTAATCAAATTTCTCACCTATTTTGTTTAAAGCTGGGGTACCAATATTACCAACAAGAATACT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58 | Phaeocystis_globosa_virus(29.41%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
792403 : 800218
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044004|792403:800218|DBSCAN-SWA TATGAAAAATATCAGAAACTTTTCGATAATTGCGCATATTGACCATGGTAAGTCTACTCTTTCAGACAGGTTTATACAAGTCTGTAATGGTCTAAGTGAGCGTGAAATGAAAGAGCAGGTTCTTGATTCTATGGATATAGAAAGAGAGCGTGGGATTACGATTAAGGCGCAATCTGTGACGCTTGACTATACAGCTAGAGATGGACAAACATATCAGCTTAATTTCATTGATACACCAGGACACGTTGATTTCTCTTATGAGGTGTCGCGCTCATTAGCAGCTTGTGAAGGAGCTTTACTTGTAGTAGATGCCGCTCAAGGCGTAGAAGCCCAGACAGTAGCAAACTGTTATACTGCCATTGAGCAGAATTTAGAGGTTATACCTATATTAAATAAAATTGATTTACCTTTTGCAGAGCCGGATAGAGTAGCTCAAGAAATTGAAGAAATAATCGGTATTGATGCTACAGGGGCTACTACATGCAGCGCTAAGATAGGTATTGGTGTAGAAGATGTTTTAGAAACTATTGTTGCTAAAGTTCCAGCTCCTGAAGGTGATGTTAATGCAAAGCTGCAAGCTTTGATTATAGATTCATGGTTTGATAACTATCTTGGCGTGGTTTCACTTGTCAGAGTCAAAAATGGTACCATAAAGAAAGGTGAAAAGTTCAAGGTTATGTCAACAGGAGTTGCTTACCAGGTTGATAGACTCGGAGTATTTACGCCGAAAATGAAAGACCTAGATCATCTCAAAGCAGGAGAGGTCGGTTTTATCGTTGCTGGGATTAAGGATATTCATGGTGCACCAGTTGGTGATACGCTCACTCATGCACATAACCCAACAGATAAGCCTGTACCTGGATTTAAAAAGGTTCAACCTCAAGTTTATGCAGGGATGTTTACTATAAGTTCTGACGATTATCCTGATTTTAGAGAAGCTCTCGAAAAGTTAAGTTTAAATGATGCGTCACTATTTTTTGAGCCAGAGGTATCACAAGCTTTAGGTTTTGGCTTTAGATGTGGTTTCTTGGGTATGCTACACATGGAGATTATTCAAGAGAGATTAGAAAGAGAGTATAACCTTGATTTAATCACTTCTGCACCAACAGTTGTTTATAAAGCTATTAAGAAAGATGGTGAAATTATCGAAGTTGATAATCTATCTAAACTACCAGAGCCAGGAGCGATAGCTGAGATACAAGAGCCAATTGTAAGGGCAAATATTCTTGTACCAAAAGATTATGTTGGTAGTGTAATTACTATCTGTATTGAAAAAAGAGGTGTACAGGTTGATCTTAATTATGTGGGGAATCAAGTTTCTATAACTTATGACCTACCAATGATTGAAGTTGTGTCTGATTTCTTTGATACTCTTAAATCTGTAACGAAAGGTTATGGATCATTAGATTATGAGTTGATTCGTTATGAGCCAGCGAATATGGTGTGTCTAGATGTGCTCATAAATGGCGATAAGGTTGATGCATTAGCAAGTATTGTGCATAAAGATCAGGCTAAATACAAAGGTAGAGAACTAGTTGAGCGTCTCAAAGAGTTGATTCCTAGACAAATGTTTGAGGTCGCAATTCAAGCAGCTATAGGTGGAACTATCGTTGCAAGAAGTACAGTTAAAGCATTGCGTAAGAACGTTTTAGCGAAATGCTATGGTGGTGACGTTTCACGTAAGAAAAAACTATTAGAGAAGCAAAAAGAGGGTAAAAAGAGAATGAAGAATATTGGCTCTGTTGAAATTCCTCAAGAAGCTTTTTTATCAGTGCTTAAAAAATAAAATTATAGTTATTATGGAAAATAAAAAAGTAATAGTAGGTATCTCAGGAGGTGTGGACTCATCAGTTTCAGCTTTGCTCTTGAAACAGCAAGGTTATGATGTAACAGGTGTTTTTATGAAAAACTGGGAAGAAGATGATACAGATGAGTTTTGCTCAGCGGAGCAAGATATCGCTGATGCTCAAGCTGTTTGTGACTCTATAGGGATACCTTTCAAAAAGATTAATTTTACCGCTGAATACTGGGATAATGTTTTTGAGCATTTTCTAATAGAGTATAAAGCTGGCAGAACACCTAATCCTGATATCTTATGCAATAAGGAAATCAAATTTAAAGCCTTTCTGAGCTATGTACATCTTTTAGGCGGTGATTATATTGCTACAGGACATTATGCTCAAACAAGACTAGCCGCTGATGGTTCAGTACAGTTAGTCAAAGGACTTGATGATAATAAGGATCAAACATATTTTTTATATACTCTAGGTCAAGAGCAACTTAGACAGACGATATTTCCTATAGGCAACATTGAAAAATCTAAAGTGCGTGAAATTGCCAAAGAAAATAATCTTGTAACATTTGATAAAAAAGATAGTACTGGTATCTGCTTCATAGGTGAGCGTAAGTTTAAAGAATTTTTGTCTAAGTATTTGCCTGCTCAAAAAGGTGAAATCCATGATGAAAATGGTATCAAGATCGGTATGCATGATGGATTGATGTATTATACAATTGGTCAAAGACAGGGGCTTGGTATAGGTGGTGTAAAAGATCGCCCTGAGGTACCTTGGTTTGCAGCTAAAAAAGATTTAGAAAACAATGTCTTGATTGCTGTGCAAGGTCATGATCATCCATTACTATTTAAGCAGTCACTACAAGCTATCGAGCTAAGTTGGGTTGCAGGTATGGCTCCGGCAGATAAATTTAGATGTGCAGCAAAAGTCCGCTATAGACAAAAAGATCAGTCTTGTGAAGTCGAAGTAAATCAAGATGGTTCAGTTAATGTAACTTTTGATCAGCCACAAAGAGCAATCACACCAGGACAGTCAGTAGTATTTTATATTGATGATGTTTGCTTAGGTGGGGGAGTAATTATTTAGAATTACTCTTATTTAATTTCTATTTATTGTCACTTGCTAGAGTTGTTTTTGGAGTATCATTGCTATCAACTTGAGTGGTTGAAGCAGTTTTTGTGGCTGTTTGTATTGTACTACCACTACTTTCTTGATTGATAGGCTTTTTCGCTATAGTACTAATACTACTACCACTTGCTAGTGTGGTTTCTTTGTCTTCGCGTTGCTCATCTGCCTTAGTTATTAGATCGTTATCTAGCGCTGCGACACTACTTGCAACTTCTTGGTGAGTGTATCCTGTATCTTTTTTATCGCTGTCGACAACATCTTTAAGATAGTCATCAACTTTCTTTTTGACATTTGTTTGACTCTTCATAACATCTCTCTGCATGAATTGAGCTTCATGGACAGCGTCAATAGTCATATGTGTATATAAGTATTCTGGATCAATAATAAATGGTCTAAGCTCGGTACTATACTCTTTCTCTAAGCCAGGAAAATAAACAGTATAAGCAACTTTTATACGTTTTTTACCTTCTTTATCATTAACAACCATTGCTACAAGATTTGAATCTATTTCATATTCTTTTCTAACAAGGTGATATTGTTGCTTTCTATCAAGGACAATCTGCTTAACTGGAGTTGCAAAAACTTTTTTAGTTTTAATTGGTTTATTAACCGTGGTAACCCCAGCTTTTCGTAACTCTTCAATAGCGTAGTTTCCATAGTCGTCCTTAGCAAGTCTAACATCTATTTCAATCATCTTAGCTAAAACATATTCTCTAAATTCACGAGCTTGTTTTAATGTAAATGCAAGACAAGTACCTGTATCATCTTTCTGAAAACAACCATTTCTCTTATCAATTAGCACAAAAAGTTTTTGTGTCTTATCGTAATAGAGCTGATAGTCAGGAGAGTTCTCACCATGACCTAGATAAACAAACTGGTCGTTAGATAGCATACCACATGATGCTATAATTACGCTTAGTAATAATATTAATAATGTTTTTTTGAATATATTGCGCATACTAAATTCCATGATTTAATAACAATTACAGGAGATAATTTTTGCGTAATGCTGCTAAAAAGTAAAGTATTGATTATACAAAATAATCAAAAATTAACTCTTAGCATTTTCTTGCATTAGTTTTTTATACTTTTTCTCTATCATTTTGCGCTTTAGTGAACCAAGATGGTCAAAGAAAGTTATACCATTAAGATGATCTATCTCATGTTGGATGCATCTAGCTAAAAATCCATCTTTTTCAACTTCAATCTCTTCTCCAAATTCATTAAGTGCCTTTATTTTGACTACAGTGGCCCTATTTACCTTTGCGGAAACACCAGGAAAAGAAAGACAGCCCTCTTCATCAATTATTTTACCGTTTTGTTCAATTATTTCAGGGTTAATGATAGTGATTATTTCAGGGTTTTGCTCTTCTAAGTTATCATACATGATAAAGAATCTTTTTTTGATACCAACTTGTATTGCTGCTAAACCCACGCCATTTGCTTCTAGCATTAGCTCATGCATTTCAGCAATAGTTGCACGTAAATCATCATTGATTTCATCTTTTGTAACTTCTTTAGCAACCTCTTTTAAAACTGGGTGAGGGTACTTTAGAATTTCTAAAGACATATTCATACTCCTTGTTCTAAAATATCTTTTTTCATCTTTGCCATCGTTATGGCAGCTTGGATAGAGTATTTACCTTTATGACCTTTTTTGCCACCGACTCTTTCTAAGGCTTGCTCTTTGTTGTGTGTGGTTAATATACCAAAAATTACTGGTAAATTATATTGGTGCATGACTTTTTGTGTACCATAACTTACCTGATCGCAAACATAATCATAGTGATCTGTCTCGCCTCGGATTACGCAACCTAGTAATACTATTGCATCAAACTCTTTAGTTTCTGCTAGGAGCTTTGCTGCATATGGAAGTTCAACTGCTCCAGTAACTTTTTTGATACAAATTTGACTATCTTTTAAGCCTTGAGCATATGCTTCTTCTAATGCACCCTCAAGCATTTTATCAGTTATCAAAGAGTTAAATTCACTTACAACGATTGCTAATTTTCTCATAATTTATACCTATATTCCTTTAATTGTATGTTTTGCTTTAATTTTTTTAGTTATCAAGTAGTTTCTATTGTGAGAGTTTACAAATGCCTCACAATATACTGGTTGTGTTTCTATATCAACGTTTCTAAGAGCAGCTAGCTTTTCAGGATTATTAGATATTAATCGGCAGCGGTTGACATTGTTATATTTTAGGACTTGTATAGCTAGATCGTATTTTCTTGCGTCAGCGGGTAAGCCAAGAGCTAAATTAGCTTCAAGAGTGTCCATATTTTCATTCATCTGCAAATTATAGGCTTTAAGCTTATTTGTTAAACCAATACCTCTACCTTCTTGGTCAAGATATATAAAAAAGCCACCCTCTTCGCTAATCATTTCAATTCCTTTATGTAATTGATCTTGGCAGTCACAGCGTAGCGAGCCAAAAATATCTCCTGTTATGCAAGATGAATGCATTCTTACTAAAGGATTATTACCAGAATAAGGTTTAGATAAAACAACAACTTCATCACCACTAAAGTTATCTTTATACACACTCATTTCCAATTCGCCAATTTTCTTGAATGGTATAGTAGAGCTTGCCATTTTCGTGACAAAAATTTCAGTTGCTAAACGATATTGGTAAAGCTCTGCAATAGTTAAAAGAGGCAGATCGTGCTTTTTAGCAAATGCTTCTAGTTCAGCAGCTTTCATCATGGTGCCATCTTTATTCATTAGCTCACATAGAACTCCAGCGCTATTAAAACCACTTAGTTTCATAAGATCAACAGTTGCCTCAGTATGACCATTTCTACCAAGTACGCCTTTATCATTGGCTATAAGAGGGAATATATGTCCAGGTCTAGCTAATTCTTCTGCTTTAGCATCAGCTTTTGATGCAACTTGAATAGTATGTGCTCTATCCTTTGCTGATACTCCTGTAGTTACCCCTTCTTTAGCCTCTATAGTTACAGTAAAAGGAGTTGTAAAAGTACTATTGTTTTGGTCAGCAGCTACCATTGGCGTTAGATTTAATTCTCGTGCTTTCTTTGAGTCCATTGCCAAACAAATGATGCCACTTGTATGCTCAAGCATAAATGTGATATTTTCTTCTGTGGCTTTTTGACCCGGTAGAATTAGATCACCCTCATTTTCTCTATCATAATCATCAAGTACAACTACGGGTTTGCCTTGCTTAAGAGCTTCTATGGCATTCTCAACATTATTTTTTATTTGCTCAAACATTTTCTTTAAATCCTTGTATATATTTATAGATATATTTACCTGTTGCATCAGCTTCAAGATTTACCATAGAACCATTACTATAGTTTTTTGCGATAGTAACTTCAATGGTGTGAGGTATCAAAGTTACAGTAAATGAATCTTTGAGTACATTTATTACAGTTATACTCATACCATCTATGGTTACAAAACCTTTCTTTATTAAGTATTTTAGAAATTCTCTAGAAGCAGAAATTTCAATTAACCATGCACCACCGACATTTTGAATACTTTTGATTTGCCCTGGTTCATCAATATGACCTTGTACCATATGCCCACCAATATGATCACCATAGCGCATTGCAAGTTCGATATTTACTAGTTGGTTCTCCTTAAGAGTATCAAGATTAGTTTTTTTAAGTGTCTCTGGTACTGCATCAAAATTAGCTGTTAAGTTTTGCTTATCAAGTTTTGTAACAGTAAGACAGGTACCATTAATCGCAACACTATCACCAATGCTACATTGAAGACTATTATCAAATTTGATACAAAAAGTTTTTAGACTATCTTTAGTTGTTATTTTTTTAATTGTTCCTAGTTGCTGAACTATGCCACTAAACATTAGAATTTTCCTTAAAACAAGAGTTTATTATTATATCCTCTCTTACAGAGATTTGATTGAAGCTTAGCTGCTGTTTGGGGTTATAATCAGCTATTATTACCGGAGCTAAGTATGTATAAAATTCATTAACAAGTTTTTGATTAATAAAACTATTTAGGGTTTTATTACCACCTTCAACAAGAAGACTAGTTATTCCAATCTTACCCATCTTCTCAAGTAAGGTATCTAAACAAACCTGATGTTGACTTTGTGGTAATAGCCAATATTCAATGCCAAGTTGGTTAAGCTTGGTTGCTACTCGTGCAGAGATCTTTGAACAAACAAAAATCGTTTTGGCATGCCTTTGATCTAAAACTCGCCAATTATGATTTATTGTTGTCAGATGATTAGCAAGTATAAATCTAGTTGAATGTTTTATTTTATTGATATTTATTCTTACATCAAGACTTGGATTGTCATCAATTAGAGTTTGCTTGCCAATTAAGATAGCGTCACAAATATTGCGCAATTCATGAGTATTTACGAATGCTTGATGTGAGCTTATTTTTTTTGAGTCACCATCATTAACAGCTATTTTACCATCTAATGACATAGCCCATTTTGCATAAACAAAAGGTTTTTTGGTTGTTTGATAATGAAAAAATATTTTATTTAACTCTTGTGCTTGTTTCTCTAGTAAGCCTACTTCGACTGTTATACCAGCATTTTTGAGTCTTTCGACGCCTTTGCCAGCAACTTTAGGGTTTGGATCAAGAGTAGCAATAATTACTTTTTTTATCCCAGCTTTGATTATGGTATCAGTACAGGGAGGAGTTCTTCCACAGTGACAGCATGGTTCTAGTGTTACGTATGCTGTAGCTCCTTTTGCTTTATCAACCGCTTTTGTCAGTGCGTGAACCTCTGCATGCGCTTCTCCTACAGTTTCATGCCAACCTTCCGAGATAATTGCACCATTTTTTACTATTATGCAACCAACCATTGGATTAGGTGATACTGTAAGTCTACCTCTATTTGCTAGAGTAAGTGCTTGTTGCATATAATATTTATCGATATTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044004|792403:800218|795300_796293_-|WP_003014029.1|DBSCAN-SWA MEFSMRNIFKKTLLILLLSVIIASCGMLSNDQFVYLGHGENSPDYQLYYDKTQKLFVLIDKRNGCFQKDDTGTCLAFTLKQAREFREYVLAKMIEIDVRLAKDDYGNYAIEELRKAGVTTVNKPIKTKKVFATPVKQIVLDRKQQYHLVRKEYEIDSNLVAMVVNDKEGKKRIKVAYTVYFPGLEKEYSTELRPFIIDPEYLYTHMTIDAVHEAQFMQRDVMKSQTNVKKKVDDYLKDVVDSDKKDTGYTHQEVASSVAALDNDLITKADEQREDKETTLASGSSISTIAKKPINQESSGSTIQTATKTASTTQVDSNDTPKTTLASDNK >NZ_CP044004|792403:800218|796895_797339_-|WP_003014034.1|DBSCAN-SWA MRKLAIVVSEFNSLITDKMLEGALEEAYAQGLKDSQICIKKVTGAVELPYAAKLLAETKEFDAIVLLGCVIRGETDHYDYVCDQVSYGTQKVMHQYNLPVIFGILTTHNKEQALERVGGKKGHKGKYSIQAAITMAKMKKDILEQGV >NZ_CP044004|792403:800218|794201_795281_+|WP_010032231.1|tRNA|DBSCAN-SWA MENKKVIVGISGGVDSSVSALLLKQQGYDVTGVFMKNWEEDDTDEFCSAEQDIADAQAVCDSIGIPFKKINFTAEYWDNVFEHFLIEYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLSYVHLLGGDYIATGHYAQTRLAADGSVQLVKGLDDNKDQTYFLYTLGQEQLRQTIFPIGNIEKSKVREIAKENNLVTFDKKDSTGICFIGERKFKEFLSKYLPAQKGEIHDENGIKIGMHDGLMYYTIGQRQGLGIGGVKDRPEVPWFAAKKDLENNVLIAVQGHDHPLLFKQSLQAIELSWVAGMAPADKFRCAAKVRYRQKDQSCEVEVNQDGSVNVTFDQPQRAITPGQSVVFYIDDVCLGGGVII >NZ_CP044004|792403:800218|799150_800218_-|WP_003014043.1|DBSCAN-SWA MKNIDKYYMQQALTLANRGRLTVSPNPMVGCIIVKNGAIISEGWHETVGEAHAEVHALTKAVDKAKGATAYVTLEPCCHCGRTPPCTDTIIKAGIKKVIIATLDPNPKVAGKGVERLKNAGITVEVGLLEKQAQELNKIFFHYQTTKKPFVYAKWAMSLDGKIAVNDGDSKKISSHQAFVNTHELRNICDAILIGKQTLIDDNPSLDVRININKIKHSTRFILANHLTTINHNWRVLDQRHAKTIFVCSKISARVATKLNQLGIEYWLLPQSQHQVCLDTLLEKMGKIGITSLLVEGGNKTLNSFINQKLVNEFYTYLAPVIIADYNPKQQLSFNQISVREDIIINSCFKENSNV >NZ_CP044004|792403:800218|796374_796893_-|WP_003014032.1|DBSCAN-SWA MSLEILKYPHPVLKEVAKEVTKDEINDDLRATIAEMHELMLEANGVGLAAIQVGIKKRFFIMYDNLEEQNPEIITIINPEIIEQNGKIIDEEGCLSFPGVSAKVNRATVVKIKALNEFGEEIEVEKDGFLARCIQHEIDHLNGITFFDHLGSLKRKMIEKKYKKLMQENAKS >NZ_CP044004|792403:800218|792403_794188_+|WP_003014022.1|DBSCAN-SWA MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLSDRFIQVCNGLSEREMKEQVLDSMDIERERGITIKAQSVTLDYTARDGQTYQLNFIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDAAQGVEAQTVANCYTAIEQNLEVIPILNKIDLPFAEPDRVAQEIEEIIGIDATGATTCSAKIGIGVEDVLETIVAKVPAPEGDVNAKLQALIIDSWFDNYLGVVSLVRVKNGTIKKGEKFKVMSTGVAYQVDRLGVFTPKMKDLDHLKAGEVGFIVAGIKDIHGAPVGDTLTHAHNPTDKPVPGFKKVQPQVYAGMFTISSDDYPDFREALEKLSLNDASLFFEPEVSQALGFGFRCGFLGMLHMEIIQERLEREYNLDLITSAPTVVYKAIKKDGEIIEVDNLSKLPEPGAIAEIQEPIVRANILVPKDYVGSVITICIEKRGVQVDLNYVGNQVSITYDLPMIEVVSDFFDTLKSVTKGYGSLDYELIRYEPANMVCLDVLINGDKVDALASIVHKDQAKYKGRELVERLKELIPRQMFEVAIQAAIGGTIVARSTVKALRKNVLAKCYGGDVSRKKKLLEKQKEGKKRMKNIGSVEIPQEAFLSVLKK >NZ_CP044004|792403:800218|797348_798560_-|WP_003014037.1|DBSCAN-SWA MFEQIKNNVENAIEALKQGKPVVVLDDYDRENEGDLILPGQKATEENITFMLEHTSGIICLAMDSKKARELNLTPMVAADQNNSTFTTPFTVTIEAKEGVTTGVSAKDRAHTIQVASKADAKAEELARPGHIFPLIANDKGVLGRNGHTEATVDLMKLSGFNSAGVLCELMNKDGTMMKAAELEAFAKKHDLPLLTIAELYQYRLATEIFVTKMASSTIPFKKIGELEMSVYKDNFSGDEVVVLSKPYSGNNPLVRMHSSCITGDIFGSLRCDCQDQLHKGIEMISEEGGFFIYLDQEGRGIGLTNKLKAYNLQMNENMDTLEANLALGLPADARKYDLAIQVLKYNNVNRCRLISNNPEKLAALRNVDIETQPVYCEAFVNSHNRNYLITKKIKAKHTIKGI >NZ_CP044004|792403:800218|798552_799158_-|WP_003014040.1|DBSCAN-SWA MFSGIVQQLGTIKKITTKDSLKTFCIKFDNSLQCSIGDSVAINGTCLTVTKLDKQNLTANFDAVPETLKKTNLDTLKENQLVNIELAMRYGDHIGGHMVQGHIDEPGQIKSIQNVGGAWLIEISASREFLKYLIKKGFVTIDGMSITVINVLKDSFTVTLIPHTIEVTIAKNYSNGSMVNLEADATGKYIYKYIQGFKENV |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1595695 : 1663428
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP044004|1595695:1663428|DBSCAN-SWA AATGGCTAAAATTCTATATTGTTCTTTTTGTGGTAAATCACAACAAGAAGTCAAAAATATTATCTCAGGAAGAGATGGTAATATTTGTAACGAATGTGTAAGTAAATGTGCCGAAAAAATTCGTAGTACTGGTAGTACTAGTGCTGAAGATATCTCATTTGAAAAATTACCAAAGCCAGTTGAAATCAAAAAATACTTAGATGATTATATTATCGGTCAAGATAATGCTAAAAAAGTGTTATCAGTAGCTGTATACAATCATTATAAAAGAATTACATCTAACCTAACAAAAGATGATGATACTGAGCTTAAAAAAAGTAACGTGCTGTTAATTGGTCCAACGGGATCAGGTAAGACATTATTTGCCCAGACTTTAGCAAAGTTGTTAAATGTTCCTTTTGCTATAGCAGATGCCACTACTCTTACTGAGGCTGGTTATGTTGGTGATGATGTTGAAAATATAATTGTTCGACTTTTGCAAAATGCTGATTTTGATGTTGCTAAAGCACAAAAGGGTATTATTTATATTGATGAGATAGATAAAATCGCACGCAAATCAGAAAGTACGTCAATAACTCGTGATGTTTCTGGTGAGGGTGTGCAGCAGGCATTATTAAAACTTATTGAGGGTACAGTGTCTTCTGTGCCTCCTAAAGGCGGCAGAAAGCATCCTAATCAAGATATGATTCAAGTGGATACTTCAGATATATTATTTATTTGTGGTGGAGCATTTGCTGGTATCGAGAAGGTTATAAAGCACAGAATGGATAAGGTCAGTATTGGGTTTAATGCTGATGTTATTCAACAAAAAAATAGCTTAGATAGCGATAAACTTATGCAAAAGATTGAAAGTGAAGATTTGACTAGATTTGGGCTTATTCCAGAATTGATTGGTCGTTTGCCAATAGTTACAGTTCTAAATGAACTTAAAGAAGAAGATTTAGTTAGAATCCTTACAGAACCTAAAAATGCTTTAATTAAACAGTATATTAAGCTGTTTAAGTTTGATAATGTTAATATTGAGTTTACCGATCAAGCTCTTGTTGAGATAGCTAAAAAAGCAATAACTAAAAAGACAGGCGCGAGAGGTCTAAGAACTATTTTAGAAAATGTACTTCTTGAAGTGATGTTTCATATACCTTCATCTGAAGATATTGAAAAAGTTATTATCAATGACAAAGTAATTCTAGAGCAGCAAGAACCAATCTTAGCGATAAAAACACAACAGCAAAAACAATTAAAAGATATAATCTAATAATTTACAGGAGGATGTAAGTTTATGTCAGAACCCCTAAATGTCGTTCCTGTTATTCCTTTAAGAGATGTTGTTATTTATCCATCGATGACTCTACCACTTAATGTTGGGCGTAAAAAGTCAATAGAGGCAGTTAAACAGGCATCAAATAATTATAATAACTATATTTTATTAGCTACACAAAAAAATGGTTCGAGTGGCGGTGATGTTGTAGAAAATATATATGATATTGCAACTCTTGCTAAAGTTGTTCAGATAATGAAACTTCCTGATGGTAGTCTGAAAATAATAGTCGAGGGTATTGCTAAAAGACTAGTAGCTAAGTATGAAGATATTGATGGTTGTATCTATGCAAATTTAGATAGTTTACATATTGATGATAACTATGATCCCAGCCAAGTTGATAAAGAACTAAAAGCTATTTTACTATCAGTTTCTGATTCGCTTAAAAGATTTGTTGATATCAGTGGTAGAGTTTCGAAAGAATCATTAGCTACATTGATAAATACGGAAGAGCCACATAAATTTATTTATGAAATAGCTACTATACTTAATACAGAAATAGCTAAAAAACAAAAAATCCTTGAGGCAACGGATATAAAAAATAAAGCCTTGCTACTACTTTCATATCTTTATGAAGAGCTAGAGATACTAGAGCTAGAAGCTAAGATCAAAGATAGAGTCAAAGCTCAAGTTGATAAGAATCAGCGTGAATACTATCTAAATGAGCAAGTCAAAGCGATATATAAAGAGCTTGGTGAAGCTGATGAAGAATCAGAAGTATCTGTTTTGAAAAAAAGGATTGAGCATACTAAGATGTCTAAAGAGGCAAAAGAGAAATGCTTAAAAGAGCTCAAGAAACTTAAGGCTATGCCGCCTTCTTCATCAGAATCAGCTGTTTCGAGAAACTATATTGAAACTATACTTTCTCTACCATGGGGTAAGAGGGCAAAAGTTAAAAGAGATATTAATCTTGCTGAGAAAGTTTTAGAAAAAGATCATTACGGTATCAAAAAAGTTAAAGAAAGGATCCTTGAGCATTTAGCTGTTCAGATTAAAAGAGACAGTAATACTAAAGCACCAATTCTGTGCTTAGTAGGACCTCCAGGAGTAGGTAAAACATCTATAGGACAGTCGATTGCTAGAGCAACAGGGCGTGAGTATGTGCGTATGGCTTTAGGTGGTGTACGTGATGAGTCTGAGATTAGGGGACATCGTCGTACATACATAGGTTCTATGCCTGGTCAAATTATCCAAAAGATAATTAAATCAAAGACAGAGAATCCACTTTTCTTATTAGACGAGATTGATAAAATTTCTTCTGATTTCCGTGGTGATCCATCTGCCGCGCTCTTAGAAGTACTTGATCCAGAGCAAAATAGTACATTTAACGATCATTACCTTGAGATAGACTATGATTTATCAAAGGTAATGTTTGTTGCTACAGCAAATTCCTTAGATATAGATCCAGCATTACGTGATAGATTAGAGATTATCAACTTATCAGGCTATACCGAAATAGAGAAGCAAGCTATCGCAAAACAGTATTTAATACCTAAAGCATTAGAAAATAATGGTTTGACTAAGGATGAAATTAATTTCACACCAAAAGCTATCCTTGATATTATCAGATATTATACAAGAGAGGCTGGTGTAAGAAATCTTCAGCAAAAAATAGATGGTGTTTGCCGTAAAGCAGTTAAAAATCTCTTAAAGGATTCAAATACTGGCAAAATTTCGATTACACAAAAAAATCTCGAAGATTATCTTGGTGTACATCAGTATGATTATGGTGTTAAAAATGCTAAAGCAAAAGTAGGTCAAGTAACAGGTTTAGCTTGGACATCAGTTGGTGGAGAGCTTTTGACTATAGAAGCTCTAGCAATGCCAGGAAAAGGTAAAGTTAAATATACTGGTAGTCTTGGTGATGTAATGAAAGAATCTATAGATGCTGCTTTTAGTGTGGTACGCTCAATGTCAAAAGACTATAAGTTAGAAGATGATTTCTATGAGAAAAAAGATATACATATTCATGTCCCTGAAGGAGCTACACCAAAAGATGGTCCAAGTGCTGGTATTGCGATGACAACGGCTTTAGTTTCTGTATATACAAACAAACCAGTTAGAAATGATGTGGCAATGACAGGTGAGGTGACACTCCGTGGTGAAGTGCTAGCTATAGGCGGTTTAAAAGAAAAGCTTTTGGCAGCATTAAGAGGTGGAATTAAGGAGGTTTTGATCCCAAAACAGAATGTTAAAAATTTAGCCGATGTTGATAAAGAAATCCTGGAAAAACTCGAAATAACCCCTGTAAGTAGCATAAAAGAGGTTTTAGAGAGAGTTTTTTGATATTTAACTGTTGAAACACTGCATTTTTAGTGTTATAAAGTTAACTGACACTTGTCAATTGTATAAAAATAAAGGAGTTTAAAAACATGAACAAGAGTGAATTAGTAAGTGCTATAGCTAAAGAAGCAGATGTTACTAAAGAAGTTGCTAGCAACACTCTAGATGCTACTATTGCGGCAGTAACTAAAGCTTTAAAAAATGGTGATAGCGTAACTCTAGTAGGTTTTGGTACTTTTCAGGTAAAAGAAAGAAGTCCTAGAGAGGGTAGAAACCCAAAGACTGGTGAAACTATTAAGATCCCTGCTTCTAAAGTTCCTAGCTTTAAAGCTAGTAAGGGTCTTAAAGACGCTGTAAAATAATAAAAAGTTACAAAAAAGTAATTTTTTTAAAGGCATGCTTAACAGTATGCCTTTTTTTTATCTATAATATTTACAAGTTAATTAAATTACTCATTAATTAAGGTCAATAAAAATGTTACAGTCTTTTAATGATAGACTCAAAGGTCCTTTTACATGGATTGTGGTTATCTCGATAAGCTTTATTTTTGTAATTTCTGGAATGACATTCTTTTTTACAAATATTGGTAGTAGTAGAGCATATGTTGCTAAAGTTGGTGATAATGAAATAAGCTCACAACAATTCCAACAATATGTTCAAAGTGCTACTACAGAAGAACAAAAGAGAGCTATTTTATCTCAAATGATAGATCAGTATTTGATATTAGCCGATGCACAACGCCATGATATTGTAGTGTCAAAACTAGCGCTACAATCAGCAATATTTACTAACCCAATGTTCTTTGATAAAGATGGAAAGTTTTCTGCTGAAAAGCTAAAACAGGTTGTAGCTTATTTAGGTGGAATGGATAAACTTGAGCAGATATTAGCTCAAAATATTCAAGCGACTATAATTCCTAAAACTATAGTAGATACATCTATTGTTACAGATTATGATACTAAGTTACTTAATAGTATATACTCTGTGAATAAGTATATAGACTATCTCAAGGTTTCTCCAACAGATTTTAAATCACAAATTAAACCAAGCCAACAAGATTTACAAAGCTATTATGATAGTCATAAAAATGAGTATATAACACCAGCACAAAAGACAATTAGCTACTTTATAATTACAAAAGATAATTTTGTGCCTAAAAATAAAATTAGTGAAGATGAAATAAAAGCATATTATCAAGCACATAAAGAATTGTTCAAAGATTTTGATAATAATGCCAAGTCTACTATTCAAAAGATAATCCAAAATAGGTATGCCTTAGAGCAGTTTAATGAGTACACACAAAATATTGATAGTATTAAGTATACTAAATTAGAGAAACAATTTGGCAAAGCTAAAACAGCTACAATTGTTGATAATAATGATACGACAATTAGTAATG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60 | Bacillus_virus(11.11%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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