Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048279 | Staphylococcus sp. MI 10-1553 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas1,cas2,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csm6,cas6,cas14j,cas3,DEDDh,RT,DinG,csa3,cas9,WYL | 0 | 9 | 14 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP048279_1 | 140048-140521 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048279_1
|
6 spacers
spacers of NZ_CP048279_1
>1.1|140085|34|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAATAACTCCGTCTGCTTCATTAAAATTGTAC >1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTATTTTTTTGAATTCTTTATATTTTTTAGA >1.3|140226|36|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAATTTCACGCTACTAGTTCGCCATATGGTGTTTT >1.4|140299|38|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACGGTCGTGATTTGATTTCTTTGATGTATTTTTCAT >1.5|140374|35|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTAAACTTCGAGCATTTGTTTATCTGTACTTAAC >1.6|140446|39|NZ_CP048279|CRISPRCasFinder,CRT CGATAGCAAAAGTATTATAAAGTGCATTACGATGATTTG |
cas6,csm6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048279_1
The CRISPR arrays of NZ_CP048279_1 >merge|NZ_CP048279|1|140048-140521|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACATAAAATAACTCCGTCTGCTTCATTAAAATTGTACAATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACTAATTATTTTTTTGAATTCTTTATATTTTTTAGAAATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACTCAAATTTCACGCTACTAGTTCGCCATATGGTGTTTTAATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACTAAACGGTCGTGATTTGATTTCTTTGATGTATTTTTCATAATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACTTGTAAACTTCGAGCATTTGTTTATCTGTACTTAACAATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACTCGATAGCAAAAGTATTATAAAGTGCATTACGATGATTTGAATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAAAGGT >NZ_CP048279|1|1|140048-140445|PILER-CR AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACA TAAAATAACTCCGTCTGCTTCATTAAAATTGTAC AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT AATTATTTTTTTGAATTCTTTATATTTTTTAGA AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT CAAATTTCACGCTACTAGTTCGCCATATGGTGTTTT AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT AAACGGTCGTGATTTGATTTCTTTGATGTATTTTTCAT AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT TGTAAACTTCGAGCATTTGTTTATCTGTACTTAAC AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT >NZ_CP048279|1|1|140048-140521|CRISPRCasFinder AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACA TAAAATAACTCCGTCTGCTTCATTAAAATTGTAC AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT AATTATTTTTTTGAATTCTTTATATTTTTTAGA AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT CAAATTTCACGCTACTAGTTCGCCATATGGTGTTTT AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT AAACGGTCGTGATTTGATTTCTTTGATGTATTTTTCAT AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT TGTAAACTTCGAGCATTTGTTTATCTGTACTTAAC AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT CGATAGCAAAAGTATTATAAAGTGCATTACGATGATTTG AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAAAGGT >NZ_CP048279|1|1|140048-140521|CRT AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACA TAAAATAACTCCGTCTGCTTCATTAAAATTGTAC AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT AATTATTTTTTTGAATTCTTTATATTTTTTAGA AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT CAAATTTCACGCTACTAGTTCGCCATATGGTGTTTT AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT AAACGGTCGTGATTTGATTTCTTTGATGTATTTTTCAT AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT TGTAAACTTCGAGCATTTGTTTATCTGTACTTAAC AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAGAACT CGATAGCAAAAGTATTATAAAGTGCATTACGATGATTTG AATCAGATAGAACCCCGTACAAAAGGGGACGAAAGGT
>NZ_CP048279.1|WP_162680857.1|139029_139782_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MINKLTIELSLPSNIKPNYLGSILHGVIMDYLSTDMAAQLHHYYAYSPLKQRIYLKNHLIIWEIISMNDNLSGELIEIFSKNETLFLKHYHTHIQLKTFIVTKFNIKEMMNGFLGKDDLSRFIHIKIQTPMSFKMKNEYLIFLDINRFFRSIMIQFDSFFDNYKMYDKETLDFIESNVKIVDYKLKSTKFYLEKVKIPSFTGELSLKVKGPLPFLQLIYFLLEFGELSGVGIKTSLGMGKYSIIERENKK >NZ_CP048279.1|WP_162680856.1|137764_139033_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm6 MKILFSPIGNTDPWSNYRDGAMLHIVRQYRPDKIVLFFTESIWNGNENMPGRKEFNWNKIISSVSPDSKVEIKIDKVENEHDFDSYKELFHNYILEIMNEEPNAEVLLNVTSGTPQMESTLCLEYVTYPNHKECIQVATPEPEKNIKRIFANPNDQEEALQKVNENEMNSKIRSKSIDIISFREAMIRSQIIGLIYNYDYEAALTLISEQKSFRNAKNLRKKLLLMTTQVKTHEIFPEINASYNNKALKKVLFHYLILKMRYDRQDVAETLIRVKSIAEFIIRDYIEVHYPNIIIEENGKPYLNTNDNMPFLMKYQKRLKNEYKSYVPQRILSLPTFIDILKVLSPKSPLLKELLAINDVNGLRNSVAHHLDTLKLDRNKNHTKIRLSVESIKNMLNIAYPEIDEKDFNYFEEKNKELIGLL >NZ_CP048279.1|WP_162680855.1|136743_137748_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MSIKVYEATIKTVGPVHIGSGRTIRKQDYIYDFHKSMVHMVNGAELVKFLKGKDLLDDYQKFLRHPPKKPRESGLKNFLDAHRIKQDEWKTFIKFSEQVHQGKKHGTYKPKPLNDIHLMMRDGQNQVYIPGSSIKGAIKTAVVSKYNEAEKDIFSKIKVSDSEPIDECHLAIYQKIDINKVDKPMPLYRECIDVNTEIKFTLSLEDDIYTIEDIEECIQSFYKNYYNEWLIGFKETNGGRRFSIEGGMPALVGENVLYLGAGTGFVSKTTHYQLKNRLQAKKDSFEILRKKFSSTYGKMKEIPKNVPVVLKGTINEIKKEAYQQGMCMITFNSK >NZ_CP048279.1|WP_162680854.1|135831_136740_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MNFEIFKLYFKTPVHFGKKRLSDGEMTISADTLFSALFIESLQMGINTDWLLNDLVISDTFPFESELYYLPKPLIKIESKEEGNHKDFKKLKYIPVYNYMDYIQGHLQANDAKDLNEIFNIGHFSLQTKVSLISQETDPDADSEPYSIGTFTFEVNAGLYFIAKGSDKTLEKLKVVMNTLQFSGIGGKRFAGLGRFEVQNVNDSSLNQLLSNKGVKHILLSTAMAKEHELEASCEDARYTLKKRSGFIQSVNYSETLVKKNDFYSFSAGSVFTNPFKGDIFNVGMEGQHPVYRYGKPLWLEV >NZ_CP048279.1|WP_162680853.1|135176_135821_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MYSKIKITGTIEVVTGLHIGGGGESSMIGAIDSPVVRDLQTKLPIIPGSSIKGKMRSLLAKNYGLKMKQENHNDDHENVLRLFGSSEKGNIKRARIQISDAFYSDKTKKLFAEKDIAYTETKFENTINRLTAVANPRQIERVTRGSEFDFTFIYNVDDESEVEKDFENIKRALSLLENDYLGGGGTRGNGRIQFKDILIETVIGDYDSSKLRIK >NZ_CP048279.1|WP_162680852.1|134749_135175_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MILAKTTSGKNIDLNFAHEVIKNNVKKYRDKPGKEKEELFGGLTTSKLRNLMEQVNRLHTIAFNSNEEKLSDKFLDELEYLKVKFYYEAGREKSVDEFLKKTLMFPIIDKVIKKESREFFLDYCKYFEALVAFAKYYQKED >NZ_CP048279.1|WP_162680851.1|132473_134747_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MNKKTSLMYGALLHDIGKIIYRSNNHPFAKGTHSKLGRLFLSKFSGFKNNDILDCVSYHHFKELSKVKLDKDNPAYITYIADNIASGIDRRDVIEEGDQENEKHAFNFDKNTPLFSVFNIVNSQTQGQTEGKFIFSKESHIEYPKNEEVQYTSGNYTQLMEDMKQDLIEKIKVNEHHFSSLLQWTESLWQYVPSSTNKNQLVDISLYDHSRITCAIASCIYDYLTEKNICDFQNELFSNYKKTQAFYDENAFLLLSMDMSGIQDFIYNISGSKALKSLRSRSFYLEIMIEVIVDEFLYRVGLSRANLLYTGGGHAYLIVPNTNYVKEQVELFQYDIKEWFIQEFTTDLSLSIAYEACSGNDLMNSNGNYKTIWRNVSNKLSDMKSQKYTAKDILRFNHEHSHGDRECKECLRSDTEINEEGLCSVCEGIISISNDLRDKSFFVVSNSGKLKMPFNNFLNVLNYEEAETLANHDDNAKIYSKNEPFVGQGISTNLWMCDYDYASQYEEMKYSGISSYAERSVGIRRLGVVRADIDNLGTIFISGIPENYNSLSRTATLSRQLSLFFKYELTNLLKGYQITAIYSGGDDLFLIGAWDDIVEASIHINDRFNAFTMGKLTISAGIGMFNAKYPISKMAFETGLLEEAAKTGDKNQVALWMNEKVYGWKELKEQVLKEKLSLIQEAFKTTDKHEKAFIYKILVLLRNKEQINIARLAYLLSRSKMTNDFSSLVFKWAQEEQEKEELITALEYYIYQIREAE >NZ_CP048279.1|WP_162680850.1|132154_132460_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MILLVCFDLSRETRLDRKKANKYRERLLELGFSMKQFSLYERYISTAQKKDKLLEILQKEIPDTGSITLYMLPDEVNNKQITILGKNAELIKEREPKLIFL >NZ_CP048279.1|WP_162680849.1|131246_132155_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKDIIYVESHYFVTVKNESLKFKNIIDKNERFYLLDDIEALVFDSPRSYYSQKLIVKCVEYNILVLFCDLKHSPIAEIISDFAMVNRLQRIQDQLQVLSKTKDRLWKKIVANKIINQAKCIENNVNKGSTAKSLCEYARSVGPGDRTNRESVAARLYFQSLYGKNFKRGRYDDKINSALNYGYSILRSFIKKELAIHGFEMSLGIKHHSTENPFNLADDIIECYRPFVDSMVYDLIFNCHISSFGVTEKKKMLEVLYENCLIDKKIVKLVDSIKLTVQSLIKCYKQNTPTHLLLPKLIEVGN >NZ_CP048279.1|WP_162680848.1|130166_130835_-|response-regulator-transcription-factor MQYEALIIEDDIDIAHILSLTLTKMNIKAHIVYSGLEAQACIEKNTYDLILLDLMLPEVTGEEILPIIKANTNSKIIVISAKVDIEEKVHLLHKGADDYITKPFDIKEVAARVAVQLRNLEHHKNPEVLVWKDLRLDLTKHQAYIKNIEMNLTNTEYDILTLLMSQPENAFSKQKIYEKVQGIYFGDDNTINVHISNIRKKISKHTNETYIKTVWGIGFMLI >NZ_CP048279.1|WP_162680858.1|142285_142654_+|hypothetical-protein MRQAIPQAAVGAIQRAQHLVAVGDPVQIEPVVTIDRNLIDFVRKAFNVPERLVSIESSVQTLSDGANLYGYWKGEDAEKQWIGIPLWVYRRCLNPMFTISNTIAICEGARYSRSRRIKKRLA >NZ_CP048279.1|WP_162680859.1|143085_143937_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MGVLSHMKSMQSEMSAAERKIFQFIYNNSEKIASMTANDIAKASGASSPTVVRFSKKMGYNSLTELKIELSAEAKKVPSVNTYSDVDQDESFYSLKNKLASNARYTIDETTALFNEKQFLDACKFIEEKEYCYVLGIGASSLTAMDIVQKWGRLGKNIVSEPDYNTVLPQLILHQKDCVIWLVSNSGLTSELISLAETAKDLNIPIITLTQFGQNPLSKLADVNLQTSRPMESIYRSAATDSILAQFITVDLLFYVYISRNRENAEKIYTTRSIVEEYRKKYF >NZ_CP048279.1|WP_162680860.1|144038_146009_-|PTS-transporter-subunit-EIIC MGKEELTLNELAKEIYAGAGGLENVQTVNHCMTRIRMNIYDNHKVDQRKLKSIPGVLGVIFDEQLQVIIGPGKVTKVANEMVSLAGVDLGENINKSSGKERVNANAAKMKAAQKAKQKNSPLRSILKDISNIFVPMIPAFVGSGLIAGIAAVMNNLITAGTLSATTWQQFVDILNILKNGMFAYLVIYTGINAAKVFGANQTLGGVIGAVVTLTGMNVDKPIKNLITGDALTAGQGGIIGVIFAIWLLSIIEKKLHKIIPDSVDIIFTPTLSLLIVGLLEIFLIMPLAGLISNVLVGGINWVLSVGGPFSGFVLGSLFLPMVMFGLHQILTPIHIQMINETGMTLLLPILAMAGAGQVGAAIALWVKLRKDTELTEMIKGALPVGVLGIGEPLIYGVTLPLGRPFITACIGGGIGGAVIGAIGGIGSIAIGPSGIALIPLISNNHWIGYILGLISAYIGGFIVTYFLGIPKDKLLEQSPIDSKISTVAVNQVKDNKTDNKISKQETEFFNAVTTGSLHPLEESTDPVFSKRMMGEGYFIIPTDEEIFSPVSGTISTIFPTKHAIGITTDNGLEVLLHMGVNTVELNGLPFDVFITEGQKVTTDSKIAKLDLRAIKTANKDTSIMVVITNMEKVDSYKLESCGSVTPTDTVFSVTTH >NZ_CP048279.1|WP_162680861.1|146025_146922_-|N-acetylmuramic-acid-6-phosphate-etherase MKMINLDNLTTEHRNENSYNLDEMSLGLALKKMNQEDQKVALAISEQLTQIEKLIDAATENLKKGGRLIYMGAGTSGRLGVLDAVECVPTFGADTDMIIGLIAGGNKAMISAIEGIEDDIDQGKKDLMSLRLTKNDMVIGVTASGRTPYVIGGINYAQSIGAQTGSLSCNKNSEISMIANFPIEVDCGPEFLTGSTRLKSGTAQKMVLNMISTVSMIGIGKVYKNLMVDVKPTNRKLIERSKRIIMQATEVNYVTATRYFEEANQNVKLAIVMILTNSNKEEATKKLVKADGFIRRTI >NZ_CP048279.1|WP_162680862.1|146908_147982_-|DUF871-domain-containing-protein MFGFSVFLNQPLSTEIKQYIEKMATSGFTGVFTSLHIPEDNNTHYHKLLIELGNITKSLNLDLMVDISSSSLQNAGFSVNRINELQSIGVTGLRADDNISIKSIAQLSNKITIALNASTITSNDIQELKLANANFDRLEAWHNYYPRSETGLDEEWYRKKTKWLKTLGLKTQAFVPGNNNLRGPLYQGLPTLEKHRNYHPLAASLDLLSETDKIFIGDPGLSDSVLNQFANYIQKNNILLHVDSFSNQIDFALGEHTNRLDEARDVIRSAYSRKKKITNIQPLLNIKRDTGSVTIDNSKYLRYMGEIQITKYSLPADEKVNVVGQVSQNDQHLIQFIKGGQKFTLIKNDIESEDEND >NZ_CP048279.1|WP_162680863.1|148864_155992_+|amino-acid-adenylation-domain-containing-protein MTQQYESVLFNRDPSTPPHSYVVHLPKSLDIQRLLYALTQLVQTQSLLRASFTYVEGELKYRIRQFAPFIEVVHEARALSDLNFEVDLEHNAFDTTIPTTAPLFAFKIICLTDCMLLQFNVSPLIFDEASMPIFLSQLSHYYENPFQSITLTPSFSELIQQMHQLRRLPSFKMQLQQWQSQQVVQDTYHAYMPVQSLTNENHTQWQTVKIQHDKVNLDDIYSSIILANHFIGRSDDVHVGLTTMRTPSFDQGDAIGPRIRILPGNFHVDRTLSYQQFKTRLSSQINTIVNEEVLHLTDLIEAHTGFPFETLIHSEPIHYTFEIAGEVCKAERLKPIETEAALDVYVQEVEDGYVVKMLYNRDQYDDLTIETYANLIRHLCLQGATRPEVPMNSFSLMTTAQDEAILQQLLRTESDIFATVPELFAEQVQRHPDKVAVRFENDSITYAQLDRLTNQVARQIRARGVKPNDYIAVMAERSMEMIVAVLGIVKSGAAYVPIDPDYPEARIQYILEDVQPALFVLHQVDFDTTAPTVLLKDLQVGSDATVPVVNHCDDDVYVIYTSGTTGQPKGTRIMHQSVDRLVKGVDYVPLNEATKILLSGTIAFDAVTFEIYGALLNGGELVVLSKDQLLNPKALEQAIQKYEINTMWLTASLFNATVSTHVEALEPLSYLLVGGEALTRKWVELLHQRPHHPQIINGYGPTESTTFTTTYTMPETIPARIPIGKPIRETDIYILQGTQRCGIGVPGELCIGGAGLAKGYLNRPELTASRFIDHPFGTGKLYRTGDLVRLQPDGEIDYLGRLDKQVKIRGFRIELTEIERAIERIHGVNKAVVVTREVEGDKQLYAFYEGEQEISNQTMTTTLSAQMPSYMVPLSFQRIDQIPMTVNGKLNTQALPDPETRLQSHYEAPRNEMEQVLCHIFEEVLHIERVDIHDHFFELGGHSLKATLVVNRIEREWHKPMTVADLMKYPTVASLSERLEGMSESQTETMPIVTSNQQAYPASAAQRGMYFLWQLDPDDTVYNVPFIWRLSAPLDIEKLRHAVSQLIERHEILRTQFGMDNQQVYQYIQDCHIPDFEVVTLEEHDPQVLVECMMQPFDLENDRLLRIRYIQTPEDDFLFMDTHHSVNDGMSQTIILDELNQLYQDKPLPTTTHQYKDYSAWSNQREMTNHQTYWHELLKETPPTLELPLDYPRPHVKSTKGEMYQWQLDEDLSQKIKQYVQQHDVTDFMFFMSVIMVLLSQYSRQEEIVLGSVMSARTHPDTERMLGMFANSVVFKGQPTRNKPWLTFLDEMKTMSLAAYAHQDYPFSVLVDDLIAQRDASRHPFFDVIVIRQNNEAHHAHFGHSRLIHQHPKSTTAKFDLSFIIEEDNHQFAWNIEYRTDLFHKETIQHMCDQFEVMIQAILDRTALRIGELPIAKLDMHQWVEAHVTPQPMAYPEQETVGNRIKQLALQAPEATAMIFGNQHHSMQMLYQRALAIARHLYEQGCRKGDRVALLMTRGPEMIESMIAAALLGCPYVPIDTDYPKTRIEFILKDAQVKHILTNVPPRFTTAATLDVRSCVTQEDDAQVIQSSEHVEANDVLYMIYTSGTTGQPKGVQITHHNVMNLVTGWSQNIKLTSDDVILQYANIVFDASVMEIYCALFNSCPLVIASEQERKDIFALEQCLRTQHVTVALIPAQLCMMMTDYHLRCLITGGSVSTPELVERVRPHCEMYANAYGPTESTVITTAWIDDGQSALQRVPIGRPLPNIQVYIVSEGRLCGVGIPGELCIAGDSLAKGYLNRPEVNAQAFIPNPWGDGQLYRTGDLARYLNNGEIEFLGRIDQQEKINGYRIELEEITNQMNRVDGILDSVVKVDRTHEHAQLVGYYVAEKDQSDALRYALTAQLPQYMVPQIFIRLEELPLTPNGKLDVKALPDVHSQLDRAVTMPRNQTEQQLVDVFEQVLNVTPIGIDNDFFELGGNSIATMKVVMLLKNKGIDMDMQDIYQYKTIRALVAQNEPTQLDVPGNIDVLQTMIATNQTPLSEVSQQSLGTVLLTGATGFLGAYLLYELTERYQRVHCLIRAESELQARERLIDNLSYYFDSSTREKMMRNVDIIHGDTNQDFTQLATSIDTIIHAAARTDHFGEDDEFYEANVKSTVDLIALAKRAQAQLIYISTLSVAGDFSEEQEDTQFSETTIFKDQRITSPYARSKFYAELEVLEAMRQGLKVKIMRVGNLTSSRHGNITMKNMRTNRFSIVMHDLLQLDKIGISAAQTPISFSFVDEAAQMIIQFAEIQQSTYNTFHITNHHEYTMQSMLEKLTNRTIKVVDDATFEQYVHDAGYYAWVGLMHHDDKLKPAIITQDFTLSVMKELDLSWSELSEAWLARWQQRLNDTFK >NZ_CP048279.1|WP_162680864.1|156002_156662_+|4'-phosphopantetheinyl-transferase-superfamily-protein MIFIVNLEKMTNAMTKQLAHKQYLFKRNHTKHHYKSNENQHRVGELLVHYGLRKMYQLESLDWQFKFGTYGKPYIDSPQPVFISLSYSGNYVACAFDQSEIGLDIENLSPIEWQRLKIQFTKEEAHWIDNETQFYMIWTQKEAYAKLTGKGLSEGVATNNVLEPLYYHGQPIAFQTQIKDTLMIQLCQTKPCTQTPMIEVDLETLLASSYMDHPGSFTH >NZ_CP048279.1|WP_162680865.1|157044_157872_+|autolysin MLKMFSVLSTSLTLLLMPMVFAPTTYARSLFSRPLPSSTLAQTVPTMMLMNHDEHDSPSQNSTENNAPGTETAHQDQQNRTLPPLDYPNVNQYIIEHHLPHSKIVKDPRMNTLPHLPYRYGTYMGVVIHEVGEDNRTLQQWVDRMYATYYRAFVHAFVDNNEIHLTAPSEYYVWGAGKQANPYFYQIEVVRMYTFDDFARSVNNQAWLAAYMLKQNHLTPTLADDQEGVGSVISHNAVRKYWGGTTHVDPIAYYARWGYDMHQFFDLVKYHYNHM >NZ_CP048279.1|WP_162680866.1|158240_158441_+|hypothetical-protein MEALFEFVKSLSYIIVSIPTSYFIAFGVTIYALMLCIFLVRAPIKTFFDRHYYGGDSDQMPFVAGP >NZ_CP048279.1|WP_162680867.1|158610_161406_+|type-I-restriction-endonuclease-subunit-R MAYQSEFALENDVLKQLTQMGYEQLNIHTHDEMLQNFRAIINERHIKALNHQPLTDSEFDRLITDINGKSVFDSAVILRDKYVLKRDDETVVYLSFLDQNKWCQNKFQVTNQVSVKDTYKSRYDVTILINGLPLVQIELKRSGVAISEAFNQVERYRKQNFTGLFRYIQLFVISNKMETRYYANSDLTILKSHMFYWSNEKNERINYLKSFIEDFLEPCHLAKMISRYMIVNETDKILLALRPYQVYAVEKLIERSLETNNNGFIWHTTGSGKTLTSFKASQILSQQEGIKKVIFLVDRKDLDSQTLAEFNKFQEDSVDLTDSTRKLLKQLGDATLPLIVTTIQKMVHAIKSNHPVMNQYEHDKVIFIIDECHRSQFGDKHRLVKRHFKNAQYFGFTGTPRFEENKSQDGRATADIFDKCLHHYLIKDAIRDGNVLGFSVDYARTFDPKKDLKEEYVNKINEKEVWMAEERISKITEHIIENYAKKTRDGHYTSMLTVQSIPMAIAYYEAFKKAKEAGKHDLNVTTIFTFRPNEDSNEQEDFVHSREMLDRVMVDYNAMFGTNFNTDYFDGFFSDVSKKMKKVIPGEKIDILIVVDMFLTGFDSKKLNTLYVDKNLKYHNLIQAYSRTNRVEKETKPYGNIVCYRDLKAETDQAIEIFSQTDNTDTVLSGSFEEYLDDFKEVLKQLFALVITPADVDKLDREDDQKEFVLIFRALASLLLKLKTFEEFEFTQEQVGISEQTFEDYKSKYLNLYEKVVKSNKEETEGVSILGDIDFKVEILRNDLINVQYIMNLIGQIELQDKAEQNRNRKQIHQLLDRADDEQLRLKADLIRQFLDKVVPTLKEGTDVNEAYYQYEEAEKYKEIEAFAEDKAYPSQLLGHIIEEYEYSGSINKNTIDKGLENQDGFLAKTKTANKIKSFVMETVQKYGSTE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048279_2 | 2091792-2092420 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048279_2
|
9 spacers
spacers of NZ_CP048279_2
>2.1|2091830|29|NZ_CP048279|PILER-CR GAAAATCTATTTATAGCGAGAAGCCCCCT >2.2|2091897|28|NZ_CP048279|PILER-CR CATTCTAATACCTAAAATCGCATAAATA >2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR CGGTTGAAGATATTAAAGATGAGCTAGCCA >2.4|2091828|31|NZ_CP048279|CRT CAGAAAATCTATTTATAGCGAGAAGCCCCCT >2.5|2091895|29|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder ACATTCTAATACCTAAAATCGCATAAATA >2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder ACGGTTGAAGATATTAAAGATGAGCTAGCCA >2.7|2092027|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder AATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCG >2.8|2092093|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder TCTTATCAATACTTCGATAGCGTTCGTTCA >2.9|2092159|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR AATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCG >2.10|2092225|29|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CAACGTAACCACGACACAGATGCCGGCTT >2.11|2092290|29|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ATAGCCTCTGCAACTTCTTTATGCTTTAT >2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR TAAGTGTACTTATAGTGTGCTATTTCTTCA >2.13|2091829|30|NZ_CP048279|CRISPRCasFinder AGAAAATCTATTTATAGCGAGAAGCCCCCT |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048279_2
The CRISPR arrays of NZ_CP048279_2 >merge|NZ_CP048279|2|2091792-2092420|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR GTTTTACTTCTTTACTAAATAAACATAGTGCTAAAACAGAAAATCTATTTATAGCGAGAAGCCCCCTGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACACATTCTAATACCTAAAATCGCATAAATAGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACACGGTTGAAGATATTAAAGATGAGCTAGCCAGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACAATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCGGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACTCTTATCAATACTTCGATAGCGTTCGTTCAGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACAATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCGGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACCAACGTAACCACGACACAGATGCCGGCTTGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACATAGCCTCTGCAACTTCTTTATGCTTTATGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACTAAGTGTACTTATAGTGTGCTATTTCTTCAGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC >NZ_CP048279|2|2|2091792-2092027|PILER-CR GTTTTACTTCTTTACTAAATAAACATAGTGCTAAAACA GAAAATCTATTTATAGCGAGAAGCCCCCT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACAC ATTCTAATACCTAAAATCGCATAAATAG TTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACACG GTTGAAGATATTAAAGATGAGCTAGCCAGT TTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACAATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCGGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACTCTTATCAATACTTCGATAGCGTTCGTTCAGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC AATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCG GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC CAACGTAACCACGACACAGATGCCGGCTT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC ATAGCCTCTGCAACTTCTTTATGCTTTAT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC TAAGTGTACTTATAGTGTGCTATTTCTTCA >NZ_CP048279|2|2|2091792-2092420|CRT GTTTTACTTCTTTACTAAATAAACATAGTGCTAAAA CAGAAAATCTATTTATAGCGAGAAGCCCCCT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC ACATTCTAATACCTAAAATCGCATAAATA GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC ACGGTTGAAGATATTAAAGATGAGCTAGCCA GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC AATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCG GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC TCTTATCAATACTTCGATAGCGTTCGTTCA GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC AATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCG GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC CAACGTAACCACGACACAGATGCCGGCTT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC ATAGCCTCTGCAACTTCTTTATGCTTTAT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC TAAGTGTACTTATAGTGTGCTATTTCTTCA GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC >NZ_CP048279|2|2|2091793-2092420|CRISPRCasFinder TTTTACTTCTTTACTAAATAAACATAGTGCTAAAAC AGAAAATCTATTTATAGCGAGAAGCCCCCT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC ACATTCTAATACCTAAAATCGCATAAATA GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC ACGGTTGAAGATATTAAAGATGAGCTAGCCA GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC AATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCG GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC TCTTATCAATACTTCGATAGCGTTCGTTCA GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC AATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCG GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC CAACGTAACCACGACACAGATGCCGGCTT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC ATAGCCTCTGCAACTTCTTTATGCTTTAT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC TAAGTGTACTTATAGTGTGCTATTTCTTCA GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC >NZ_CP048279|2|3|2092123-2092420|PILER-CR GAAAATCTATTTATAGCGAGAAGCCCCCT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACAC ATTCTAATACCTAAAATCGCATAAATAG TTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACACG GTTGAAGATATTAAAGATGAGCTAGCCAGT TTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACAATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCGGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAACTCTTATCAATACTTCGATAGCGTTCGTTCAGTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC AATGCTCCAAAAGCAGAAAGCACAGATTCG GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC CAACGTAACCACGACACAGATGCCGGCTT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC ATAGCCTCTGCAACTTCTTTATGCTTTAT GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC TAAGTGTACTTATAGTGTGCTATTTCTTCA GTTTTACTTCTTTCTAAATAAACATAGTGCTAAAAC
>NZ_CP048279.1|WP_162682325.1|2090516_2091527_-|zinc-binding-alcohol-dehydrogenase-family-protein MEAIIARQPFQLAEGQKFEKVSRELPTPEAHDILVKVHATGVNPVDTKMRQALLNADARVLGFDAAGVVEVVGDAVTDFKPGDRVYYSGSNQRDGSNQTYQLVNENYLALMPETLSFAEAAALPLTAITAYETLFDVFNISPKPQENQGKTLFIINGAGGVGSIVTQIAKAYGLTVITTASRPETRAWSEKMGADIVLNHQEDLAKQFDDQNLSCPNYIFCTYDTDYYYDVMIDLVQPRGHIATIVAFNQDQDLNALKQKSITFTHEFMFARAIHGVDEWMYRKYLEDVTTKVDSGQYQTTLNSVLSGLTPENVFKAHEMMEAQSHIGKLVIEIVE >NZ_CP048279.1|WP_162682324.1|2088945_2090460_-|BCCT-family-transporter MKQTEKKKHVSVVFWISLLLCSLFVLVGAIFPKQMEQTTQSITTWIGQNFSWYYLLLLLAIFLVCIYLLFSRYSQITLGEEGEEPEFSLKSWFAMLFSAGMGIGLVFWTTAEPISHAYTATPIHQAGTQAAIDDSLQFAFFHWGIHAWAVYAIVALAFAYFNFHKGYPGLVSATLTPLFGEKRMQGLLGKLLDILAIIATVTGVSATLGFGALQISEGLNFLFNIPANFTTQILIIIIATALFIWSTWSGLSKGIKMLSNINMILAFVVLVVVFIIGPTLYILNMFTNSLGNYIAHFFDMSLRLTINNPEKTQWIQNWTVFYWAWWISWAPFVGIFIARVSRGRTIKEFIVGVLFVPSFVCFIFFAVFGASAIYLQDNGIANNAGEAIETATFATLEHFPFGFVMSIVTLVVVMIFFVTSADSATYVLGMLSTNGDNYPGSWVKVSWGIMLALFALIMLLTGGTQAIQNLLIIAALPFSFVIIFMVWSLFKALAAERPRLSKRK >NZ_CP048279.1|WP_162682323.1|2088120_2088663_-|alkaline-shock-response-membrane-anchor-protein-AmaP MTRIKNFILGLLIVIIVGFLLFMYIDYKPIKSYQDYFYQFNWFYPLLIGLAAFLVLIGLILFFRAFKPTYRKPGLYKDYKDGHIYISRKSIENTVYDTIAKYDAIRQPNVVSKLYNKKNNSFIDITTDFLVPSEATNVQSLVEQLRVDIKENVERFSELHVKTVKVNVRDQKRDNGPRVV >NZ_CP048279.1|WP_019165072.1|2087862_2088108_-|DUF2273-domain-containing-protein MSNENRNGQSERDSVEQFAKILQNYKWRIIGFFFFLIIAILFLTLGFWKTILIIVLCLIGIGVGYIKDRTQDFLNLLNRLS >NZ_CP048279.1|WP_162682322.1|2087316_2087808_-|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MAVENNKAKENYNKETGVNERERQQSQENQGPQFSNSLTFSDEVVEKIAGIAAREVRGILDMKGGFVDSISGSFNGGNNVTQGVSAEVGEKQAAIDLKVILEYGESAPKIFRKVTELIKEQVKHITGLDVVEVNMQVDDVMTRKEWQQKNEKNRDQNENKGLQ >NZ_CP048279.1|WP_162682321.1|2086026_2087172_+|MFS-transporter MTIMRTLTFMLSIFIVGMVEMVVAGIMNLMSTDLNISEAWIGQLVTIYAFTFALTGPILVKLTEKYSPKSVLLSAIAFFVIGNLMIALSPNFTILIIGRIISSAAAALIVVKILSTTVVLARPENRGKMLGIVYTGFSASNVFGVPIGTLIGDWAGWRFTFGLIILVGLIAGVLLTVYLPKEVKSSPQTTRNRTSRILDKGEVTKLLSITFILLTANSVAYIYINPLILSGGHNIQFVSLALLIIGIAGMLGTSMGGFFTDKLSFKTWLLVSGGAFVIVMLVLNQLWTASTILLIALFIWHIIQWSTNPAVQSGLIDQVEGDNSQVMSWNMSALNAGIGFGALLGGLIVSHIDLHATIYFAAGMGFIGFIIILMLKKKRVA >NZ_CP048279.1|WP_162682320.1|2083948_2085916_+|sialic-acid-synthase MKTEQNHLSMIEKDFTKDEMENYQTVLQFDSNWATQFKRHILVGRDKITARLVASLYRENLVGSYTNSTFVQAEQLEHSAISSGELLMIHFTYGPLTLYARVIGHHAFNRVDVTGPFYWRTPDGEDRRVLHPNEVLDVIINEDTQYQGAAAEQFRDDMENSAAHMTLALSYQALHPLKDASSLLDYIEAQDDPYLTSEQLVVEGHPLHPGAKLRKGMSAQETIDYSSEYQHTMPMQFILLHRDVARTMVQQGTYAEVVYHAFDGLKSVAQQAIGTHAKLEDYMPLIVHPWQYEHIIRTEYQHELDTKAIIPLDYTKSYYAGLSFRTLMPKKPDVSPHIKLSTNVHITGEIRTLSEQTTHNGPLMTNILTAISAQDTLFNNVPTSPVPEIAGAHFYLSKDSQPDEQEQRSEQLGTLFRQNIYDMIDSDSLPLIPSSLVVTHPETTRPLIVELVERFGQSSKDTTDIDTRAQWFKAYAASLIDYVVPLLVKYGIALEAHLQNTIAIFEPSTGAFSHMLIRDFEGLRIDAEQLAQMGYDTAHFHEKSRILTKSQTSVFNKAFYSTIQNHLGELVAALARFYNDAALENTLWSIVRQQIEQCFAKLEAADIDPQRLAHMQDIFFNETIDYKCVTTMRLLDKAHEYTYVKVDNPLSKLII >NZ_CP048279.1|WP_162682319.1|2082663_2083848_-|MFS-transporter MAKWFFPSTFLLFLGNWIGQIALNWYAYQLNENPMDLALINFFRLAPIFILSLWAGSFADRYRRSTLIKMTVTSSMVITGTLTVCVLFMNEIPMLYLYIYACLRGCMSAVETPVRQAVLPDISERLTVSKAVSYHSFLLNVCRSIGPAVAGFIIAAYDVPIAFVVQTICYALALVSSIPLKLAVVKPVKNKQFSLAVVMQYFKLHLQGRRIFMTSLLIMAMGYSYTTMLPILTDEVYPNSASVFGTAMTVSAIGGVLATLTIPYVLQKFSTDNCYYLSSILFGIALLLLYPLGEIGLFLMIFFVGLFGQFARTTNRIYFQNDVEQESRGKILSVIMMDRGMIPFGAMLLSYFTELIGITTTFLVMGGATTIIAILGFLTNFKMNGGKTVHDTQP >NZ_CP048279.1|WP_162682318.1|2080910_2082680_-|siderophore-synthetase MTLNHKLNADQNIQYRMLIACMKEQLFPEKTQLQYKQKQVVIQYHQHVLTVQYETISTLYQLELSGPIVYRVGTEDVTIETVEQLIEVLGAHFGITFHNQLVEELLHSRLGLELSYQQLRQRERVMRHSLKFSRMPDTLNFIAWLNHMNGDELFSVLGYTEGMVWEGHPSHPLTKTKLPLNTNEIQQYAPEFMKIIPLKIVLVRKDLLKSTTMTGEEDFVLRKMFPDKKSQLRQWMQMYEGTLDDYRIMLVHPWQYTNVITARFKIMIAQHDVIPTPFTVDSKATLSFRTMRLLQYPYHVKLPVNVQATSAVRTVSTVTTVDGPKLSYQLQDMLDIYPTLSVASEPYGAHIDVEADLARQFAMIVRHSPEVEVHRHEDTQLVTAVLTQVNPVDGQVVVDSLIEYLYGEINTQTIQQFMRQYMEALIPPLIAYIQQYGIALEAHQQNTILQIDKENETLSFIVRDLGGSRIYPETLKQTVPDFEITNDSLVSDEIEAVIAKFQHAVIQNQLGTLIHHFHHVHQIDEMTLYAIAADEIEAAIDPTRAHAAALKRILFGDKMTVKALLNMRMKQKVKQYVQIDIKNPLEREL >NZ_CP048279.1|WP_162682317.1|2079830_2080907_-|alanine-racemase MPQIHINLSKIKYNAMVLQCMLAEQGVRMIPVTKCMGGDTKVHQQFREMGFNTLAESRLTTMMSGEQQPSKQDMMIKGALPHEINDVVRYSQISIQTELETICALSDEAVAQGVKHHIYLMVDWKDGREGALTYEVVPLIKEIIRLKGVYLKGLSFNFMCFRQIPPTEEDIVYINYFIESVERDTGMKFKTISGGNSSMLTLAMYADLGRINELRIGEALFRGYETAYNMRLPYLFDNAVTLSGRILEIKPRLNLETRQSYMQALVDIGQLDTVISGIQPVDRQLKIVGHSSDTLMMNLGLADYYQIGDKIEFHLDYAALAHSMHMRHIPKSYDEDLGIEQLVSGFVDIKKNNFIKQY >NZ_CP048279.1|WP_162682326.1|2092609_2093458_-|hypothetical-protein MKIASHVTEVLEIKEESVNIITFEDTALCGTFIQDFMDYMTNKPVVENQFAHFISDDYETISPKNFHPIILNCGDRNLLGQKLIEEKVYQIFEEQIINYEKANHSFLKFEQSLIDLKNTLGIYDDDYQIELQPSIFKLRRLLKLFGLDFHNELEDLSEINKRKAFIDLLIHSTKENILIVLFPESHLGIRDIEVFMQLLKKYHFTTIVFTNHPSIIINEENIFLCKSNKECHDIEKIKEELSLFIPDEMVSYQLTHMIAYHEFVGENLSEFKRYFKFINHYN >NZ_CP048279.1|WP_162683043.1|2093454_2093748_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFDLPVETSSERRAYRQFVKFLTNEGYVRLQFSIYCKLIFNSSTLNHQITKLKSVVPSNGIVQALVVTENQFSNMKYLVGTPPKGQIGLSSERVIEL >NZ_CP048279.1|WP_162682327.1|2093826_2094702_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSFRTVIITKESKLSLRMNQLIVKGENLSRIPLNEILCLVIEHPNVSMTGHLMNALSDQKIVTILCNTKHLPNTVLLPLYGHHRQVRLIQNQISWKSERKAELWQLLVKYKILNQKQVVQEFFKESSTDLFDAFVNSVELDDSTNREGHAAKVYFNIILDHGHARGDDTAQNAAMDYGYQVLLAIVARTIVSKGYLTELGIKHRNEFNIYNLASDFMEIFRPLIDYLVLKNVEQQFETDQKRAILNILNRRLIVDNKRYFFLNAVEIYVDSLFKYLSSGDIEVIKIPTWTY >NZ_CP048279.1|WP_162682328.1|2094691_2098696_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MAQKPYILSLDIGTGSVGYACMDKEFNILKYYDKDAIGVYLFDGALTAQERRQFRTARRRNNRRIKRLGLLQEILAPLVQNPNFYQFQRQFTWKNDNMDFKNKSLSEVLSFLRYAPKKYPTIYHLQEALLLKDEKFEPELIYIALYHLVKYRGHFLFNYLNIENLSNNDNMEDFVELIEVYEKLNNISLNLDYEKKKEIFDILQDNEMTKNDREKAVVKIEKELKQFSKMLLGLKFNEGDLFNHADNAEELKEAKQSHSFADNYEENLTSFLTVEQLELIERANKIYLSFTLQDILNGNKSMAISKVAAYDKFKNELKQVKDIVYKADPTKVQFKKIFVSSKESLKQYEAIPNDENFSALCLFDQYVIRPKKQYSSFIKELKKIIPQDSELYFEAENDTLLKVLNTTDNASIPMQISLYEAETILRNQQKYHAEITDEIIEKVLSLIQFRIPYYVGPLVNDQATAKFGWMERKSNEPIKPWNFDEVVDRSKSATQFIRRMTNKCTYLMNEDVLPKNSLLYQEMELLNELNAIQVRFQTDPKNRKYRLIPQIKLFAVEHIFKKYKTVSHSKFLEIMLNSNHRENFMNHGERLSIFGTQDDKKFVSKLSSYQDMTKIFGNIDDKRAQIEEIIQWITIFEDKKILVQKLKENYPELTSQQINQLKKLNYSGWGRLSEKLLTHSHQGHSIIELLRHSDENFMEILTNDDYGFQNFIKEENQVQSNTIQYQDIANLATSPALKKGIWSTIKLVRELTSIFGEPEKIIMEFATEDQQKGKKQKSRKQLWDDNVKKNKLKSVDEYKYIIDVANKLNNEQLQQEKLWLYLSQNGKCMYSGKSIDLDTLLSSNATKYYEVDHIIPRSFIKDDSIDNKVLVIKAMNQTKGDQVPLQFIHHPYERIAYWKSLNKAGLISDSKLHKLMKPEFNAMDKEGFIQRQLVETRQISVHVRDFLKEEYPDAKVIPMKAKMVTEFRKKFDIPKIRQMNDAHHAIDAYLNGVVYHGAQLAYPNVDLFDFNFKWEKVREKWKALGEFNTKQKTRELFFFKKLEKMEVSQGERLISKIKLDMNHFKINYSKKLANIPQQFYKQTALSPKTAELKYESDKSTDAVYSSLTTYQTFVVAIKTATKKGKVKMQYQMIDHYVFDFYKFKNGNEKELALYLARRENKEEVLDAHIVYSLNKGDLLYINNHPCYFVSSNEVINAKQFELTVEKQLSLYNALNNKETSVEELVNVYDDIAEKVTNEYRHYLNSALKEERVKTLFSQSNQSHEDFVKALDELFKVVKASAVRSEKIGSRKNSMSNRAFLGKGRDVKIAYTSISGLKTTKPKSLFKLAESRNEL >NZ_CP048279.1|WP_162682329.1|2098950_2100171_-|carboxylesterase-family-protein MAKMMQIHDKQIKVCAFNQSYAAFQIPYAQNEGRLQYSSLLKWEDLDTVIDCSMRGRVFPQNPNRLSTVMGCRQEEKNQSEAAFHLNIFSSKQFKNKPVLFWIHGGGWLTGGGALPWYDGNHLAENEDIVVVTINYRIGALGAFQTEEGPKNLGLNDIINALTWVHNNIYYFGGDSDNITVGGQSAGAWYTAALLGHVDAHHLFNKAILASFPGQIKPLTALSSQQLSTQLQNYLAPKTMATATTQEILDAQNQVMTHLSHHQPSRIPTSFIPIESEQLSKDLIDQAVKVSGGNKDVMAWVTQNEMNAFKPHGNIADELDKMRVEEFEQPTKALLQQFEDKGSDVHFQIIDGGNDRLGAPHCFDLPLLFGNFEQWSNAPMLEGTKDQKLKAASRQLQQHVAQFMRA >NZ_CP048279.1|WP_162682330.1|2100189_2101398_-|MFS-transporter MESTQGSKIWTKEFVVNFIINFLVFLCMYLLMVVMARYTIQTFDTTDSIGGLVAGLFVIGSLLGRFMTGRFVDNVGPRKLLVVGSILLLITQALYFVEGSLMLLIIVRILNGMATAVVTTATGAVAGYLTPENRKGEGIAMFGLSLIVGAAIGPFFGLYLSEHYPMEVIFTLCIVIGVISFASVFFLNVEFPQAEQPVHATHQKFSIHKYFAVEAVPVGIVTLLIAVGYSSLLSFIQFFATENHFESISSYYFIVYAIAALVTRPIAGQLMDEYNENVVNIPAFISFALSLFLLGITQNPIAFFVSAILAGIGYGNLASTLQAVAVKVVPFHKIGLATATFFIGLDVGLGFGPFVLGMFTAKIGFANIYICMGVLLVLTLIFYYFVHGKRMKNIYGKQLSQH >NZ_CP048279.1|WP_162682331.1|2101405_2101825_-|MarR-family-transcriptional-regulator MNDFFSLTLSLYRPYVKKIEPILNEHSLNLARWLVLKDIGYHQPTALVEIAKRRFIEKSTTHQILKVFEEKQLIVVTTDKNDKRHKWIELSKEGQVLFQSINKRILEMDDKILSEVKNDENFEHICQFMEQLLNRMKGS >NZ_CP048279.1|WP_162682332.1|2102063_2103467_-|6-phospho-beta-galactosidase MKKLPKDFIFGGATAAYQAEGATNIDGKGRVAWDTYLEENYWYTAEPASDFYHRYPVDLELSEKFGVNGIRISIAWSRIFPTGYGEVNPQGVDYYHRLFKECIKRNVEPFVTLHHFDTPETLHSNGDFLNRDNIQHFVDYAEFCFNEFKEVNYWTTFNEIGPIGDGQYLVGKFPPGIQYHFEKVFQSHHNMMVAHAKAVVLFKEQGHQGEIGVVHALPTKYPFNPDNPEDVRAAELEDILHNKFILDATYLGHYSEKTMEGVNHILSVNGGKLDLREEDFEILEAAKDLNDFLGINYYMSDWMRGFEGESEITHNSKGDKGGSKYQLKGVGQREFDVDVPRTDWDWMIYPQGLYDQIMRVKNDYPNYKKIYITENGLGYKDDFVDNTVQDDARIDYVKQHLEVIADTIEDGANVKGYFIWSLMDVFSWSNGYEKRYGLFYVDFETQERYPKKSAYWYKKLAETQIIE >NZ_CP048279.1|WP_162682333.1|2103484_2105218_-|PTS-transporter-subunit-EIIC MNKLIGLIEKGKPFFEKLSRNIYLRAIRDGFISAMPIILFSSIFLLIAYVPNIFGFKWSKEMEALIMKPYGYTMGIVGLFVAGTTAKALTDSFNRKLERTNQINFISTMLASMSGFLFLASNALEEGGFANAFMGTKGLLTAFLSAFITVFIYNICIKNNITIKMPKEVPPNISQVFKDLIPFSLVILILYGLDILSRSVNKTNVAESILKTFEPLFTAADGYVGITIIFGAFAFFWFVGIHGPSIVEPAIAAITYANIETNFKLLHAGEHADKILTPGTQMFIVTMGGTGATLVVPFIFMWLSKSKRNKAIGRASVVPTFFGVNEPILFGAPIVLNPIFFIPFIAAPIINVWIFKFFVDVIGMNSFSVFLPWTTPGPLGIVMGTGFEVWAFVLAITLIIVDVIVYYPFFKVYDNQILEDELKGVDSTNELHAKVGENFNTKKAEAILGSTANKSTDQAVKEDKDSSAVSDITGPTNVLVLCAGGGTSGLLANALNKAAAEYNVPVKAAADSYGAHMDIMKDFDLVILAPQVASNYQDIKRDTDRLGIKLAKTQGVEYINLTRDGQAALKFVQDQFK >NZ_CP048279.1|WP_096555582.1|2105223_2105538_-|PTS-lactose/cellobiose-transporter-subunit-IIA MNREEVTMLGFEIVAYAGDARSKYLEALSAARDGDYDKAEQLIEEGNQCIVDAHKAQTSLLQKEAIGDDIAYSVTMMHGQDHLMTTILLKDMLKHIIELYKRGS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048279_2 | 2.7|2092027|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder | 2092027-2092056 | 30 | MK075005 | Staphylococcus phage phiSP119-2, partial genome | 4795-4824 | 3 | 0.9 |
NZ_CP048279_2 | 2.9|2092159|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092159-2092188 | 30 | MK075005 | Staphylococcus phage phiSP119-2, partial genome | 4795-4824 | 3 | 0.9 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NZ_CP013752 | Lactobacillus plantarum strain KP plasmid unnamed3, complete sequence | 65038-65070 | 4 | 0.879 |
NZ_CP048279_2 | 2.2|2091897|28|NZ_CP048279|PILER-CR | 2091897-2091924 | 28 | KC821607 | Cellulophaga phage phi19:1, complete genome | 7895-7922 | 6 | 0.786 |
NZ_CP048279_2 | 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR | 2091963-2091992 | 30 | KC413988 | Streptococcus phage phiST1, complete genome | 12576-12605 | 6 | 0.8 |
NZ_CP048279_2 | 2.11|2092290|29|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092290-2092318 | 29 | MN855764 | Siphoviridae sp. isolate 508, partial genome | 48364-48392 | 6 | 0.793 |
NZ_CP048279_2 | 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092355-2092384 | 30 | NC_019782 | Lactobacillus phage AQ113, complete genome | 30602-30631 | 6 | 0.8 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NZ_CP009068 | Borreliella afzelii K78 plasmid cp32-9, complete sequence | 30062-30094 | 7 | 0.788 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NZ_CP015328 | Bacillus filamentosus strain Hbe603 plasmid pBEH6, complete sequence | 7405-7437 | 7 | 0.788 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | MN693111 | Marine virus AFVG_25M354, complete genome | 16918-16950 | 7 | 0.788 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NZ_CP019921 | Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-9-4, complete sequence | 59753-59785 | 7 | 0.788 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NC_017423 | Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-12, complete sequence | 26563-26595 | 7 | 0.788 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NZ_CP019848 | Borreliella burgdorferi plasmid cp32-4, complete sequence | 29095-29127 | 7 | 0.788 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NZ_CP019759 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-4, complete sequence | 29096-29128 | 7 | 0.788 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | MN855959 | Siphoviridae sp. isolate 167, complete genome | 6312-6344 | 7 | 0.788 |
NZ_CP048279_2 | 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR | 2091963-2091992 | 30 | LR877331 | Klebsiella phage vB_KpnM_311F genome assembly, chromosome: 1 | 75853-75882 | 7 | 0.767 |
NZ_CP048279_2 | 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR | 2091963-2091992 | 30 | NC_031095 | Klebsiella phage PKO111, complete genome | 123151-123180 | 7 | 0.767 |
NZ_CP048279_2 | 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR | 2091963-2091992 | 30 | MN101230 | Klebsiella phage KPN6, complete genome | 57380-57409 | 7 | 0.767 |
NZ_CP048279_2 | 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR | 2091963-2091992 | 30 | CP015514 | Vibrio vulnificus strain FORC_036 plasmid unnamed, complete sequence | 288860-288889 | 7 | 0.767 |
NZ_CP048279_2 | 2.5|2091895|29|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder | 2091895-2091923 | 29 | KC821607 | Cellulophaga phage phi19:1, complete genome | 7894-7922 | 7 | 0.759 |
NZ_CP048279_2 | 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder | 2091960-2091990 | 31 | MN101230 | Klebsiella phage KPN6, complete genome | 57380-57410 | 7 | 0.774 |
NZ_CP048279_2 | 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder | 2091960-2091990 | 31 | LR877331 | Klebsiella phage vB_KpnM_311F genome assembly, chromosome: 1 | 75852-75882 | 7 | 0.774 |
NZ_CP048279_2 | 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder | 2091960-2091990 | 31 | NC_031095 | Klebsiella phage PKO111, complete genome | 123150-123180 | 7 | 0.774 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NZ_AP019717 | Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence | 249692-249724 | 8 | 0.758 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NC_011995 | Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1, complete sequence | 4176-4208 | 8 | 0.758 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NC_014533 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence | 639984-640016 | 8 | 0.758 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NZ_CP034857 | Buchnera aphidicola (Sitobion avenae) strain Sav plasmid pTrp, complete sequence | 2831-2863 | 8 | 0.758 |
NZ_CP048279_2 | 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR | 2091963-2091992 | 30 | AP011616 | Thermus phage phiYS40 DNA, complete genome | 35394-35423 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR | 2091963-2091992 | 30 | DQ997624 | Thermus thermophilus phage YS40, complete genome | 35394-35423 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR | 2091963-2091992 | 30 | NC_008584 | Thermus phage phiYS40, complete genome | 35394-35423 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR | 2091963-2091992 | 30 | NZ_CP049807 | Acinetobacter pittii strain A1254 plasmid pA1254_1, complete sequence | 34026-34055 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.7|2092027|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder | 2092027-2092056 | 30 | LR700236 | marine metagenome genome assembly, complete genome: monopartite | 5723-5752 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.9|2092159|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092159-2092188 | 30 | LR700236 | marine metagenome genome assembly, complete genome: monopartite | 5723-5752 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.11|2092290|29|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092290-2092318 | 29 | LC553736 | Salmonella phage SAP012 DNA, complete sequence | 17575-17603 | 8 | 0.724 |
NZ_CP048279_2 | 2.11|2092290|29|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092290-2092318 | 29 | MN694452 | Marine virus AFVG_250M839, complete genome | 32448-32476 | 8 | 0.724 |
NZ_CP048279_2 | 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092355-2092384 | 30 | NZ_CP017986 | Klebsiella pneumoniae strain 825795-1 plasmid unnamed1, complete sequence | 54093-54122 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092355-2092384 | 30 | NZ_CP018714 | Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_152021 plasmid pKp_Goe_021-1, complete sequence | 160013-160042 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092355-2092384 | 30 | NZ_CP018720 | Klebsiella pneumoniae strain KP_Goe_828304 plasmid pKp_Goe_304-1, complete sequence | 120021-120050 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092355-2092384 | 30 | NZ_CP018702 | Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_827024 plasmid pKp_Goe_024-1, complete sequence | 100464-100493 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092355-2092384 | 30 | NZ_CP042866 | Escherichia coli strain ATCC BAA-196 plasmid unnamed1, complete sequence | 50482-50511 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092355-2092384 | 30 | NZ_CP018313 | Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_822579 plasmid pKp_Goe_579-1, complete sequence | 342-371 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092355-2092384 | 30 | NZ_CP018687 | Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_149473 plasmid pKp_Goe_473-1, complete sequence | 22235-22264 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092355-2092384 | 30 | NZ_CP034054 | Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence | 257391-257420 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092355-2092384 | 30 | NZ_CP018696 | Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_149832 plasmid pKp_Goe_832-1, complete sequence | 197601-197630 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_2 | 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2092355-2092384 | 30 | NZ_CP018708 | Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_827026 plasmid pKp_Goe_026-1, complete sequence | 150119-150148 | 8 | 0.733 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NZ_CP007513 | Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome | 428798-428830 | 9 | 0.727 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NZ_CP050184 | Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID1, complete sequence | 96866-96898 | 9 | 0.727 |
NZ_CP048279_1 | 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 140156-140188 | 33 | NZ_CP033050 | Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence | 298880-298912 | 9 | 0.727 |
NZ_CP048279_2 | 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR | 2091963-2091992 | 30 | NC_048697 | Pseudomonas phage Littlefix, complete genome | 19802-19831 | 9 | 0.7 |
NZ_CP048279_2 | 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder | 2091960-2091990 | 31 | AP011616 | Thermus phage phiYS40 DNA, complete genome | 35393-35423 | 9 | 0.71 |
NZ_CP048279_2 | 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder | 2091960-2091990 | 31 | DQ997624 | Thermus thermophilus phage YS40, complete genome | 35393-35423 | 9 | 0.71 |
NZ_CP048279_2 | 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder | 2091960-2091990 | 31 | NC_008584 | Thermus phage phiYS40, complete genome | 35393-35423 | 9 | 0.71 |
NZ_CP048279_2 | 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder | 2091960-2091990 | 31 | NZ_CP049807 | Acinetobacter pittii strain A1254 plasmid pA1254_1, complete sequence | 34026-34056 | 9 | 0.71 |
1. spacer 2.7|2092027|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder matches to MK075005 (Staphylococcus phage phiSP119-2, partial genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
aatgctccaaaagcagaaagcacagattcg CRISPR spacer aatgctccaaaagcagaaaactcagattct Protospacer *******************.* *******
2. spacer 2.9|2092159|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK075005 (Staphylococcus phage phiSP119-2, partial genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
aatgctccaaaagcagaaagcacagattcg CRISPR spacer aatgctccaaaagcagaaaactcagattct Protospacer *******************.* *******
3. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013752 (Lactobacillus plantarum strain KP plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.879
-aattatttttttgaattctttatattttttaga CRISPR spacer caattcgtttttt-aattctttatatttttttga Protospacer **** ****** ***************** **
4. spacer 2.2|2091897|28|NZ_CP048279|PILER-CR matches to KC821607 (Cellulophaga phage phi19:1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
cattctaatacctaaaatcgcataaata CRISPR spacer aaaactaacacctaaaaccgcataaatg Protospacer * ****.********.*********.
5. spacer 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR matches to KC413988 (Streptococcus phage phiST1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer cgtataaagatattcaagatgagctaggta Protospacer ** *.******** ************ .*
6. spacer 2.11|2092290|29|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN855764 (Siphoviridae sp. isolate 508, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
atagcctctgcaacttctttat---gctttat CRISPR spacer ttagcttctgcaacttctttattaaactt--- Protospacer ****.**************** .***
7. spacer 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_019782 (Lactobacillus phage AQ113, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
taagtgtacttatagtgtgctatttcttca CRISPR spacer tcagaatctttatagtgagctatttcttca Protospacer * ** .* .******** ************
8. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009068 (Borreliella afzelii K78 plasmid cp32-9, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aattatttttttgaattctttatatt---ttttaga CRISPR spacer cattatttttttgaatgctttttattacattct--- Protospacer *************** **** **** **.*
9. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015328 (Bacillus filamentosus strain Hbe603 plasmid pBEH6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aatta--tttttttgaattctttatattttttaga CRISPR spacer --ttaacttttttaggattctttatattttttcct Protospacer *** ****** *.****************
10. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693111 (Marine virus AFVG_25M354, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aattatttttttgaattctttatattttttaga CRISPR spacer tctttcttttttggattttttatattttttaaa Protospacer ** .*******.***.*************.*
11. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019921 (Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-9-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aattatttttttgaattctttatat----tttttaga CRISPR spacer cattatttttttgaatactttttataacatttt---- Protospacer *************** **** *** ****
12. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017423 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-12, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aattatttttttgaattctttatat----tttttaga CRISPR spacer cattatttttttgaatactttttataacatttt---- Protospacer *************** **** *** ****
13. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019848 (Borreliella burgdorferi plasmid cp32-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aattatttttttgaattctttatat----tttttaga CRISPR spacer cattatttttttgaatactttttataacatttt---- Protospacer *************** **** *** ****
14. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019759 (Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aattatttttttgaattctttatat----tttttaga CRISPR spacer cattatttttttgaatactttttataacatttt---- Protospacer *************** **** *** ****
15. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855959 (Siphoviridae sp. isolate 167, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
-aattatttttttgaattctttatattttttaga CRISPR spacer taaata-ttttttgaattctttttatttattgcg Protospacer ** ** *************** ***** **. .
16. spacer 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR matches to LR877331 (Klebsiella phage vB_KpnM_311F genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer cgtttgaagataataaagatgagcctttga Protospacer ** ********* ***********. . *
17. spacer 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR matches to NC_031095 (Klebsiella phage PKO111, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer cgtttgaagataataaagatgagcctttga Protospacer ** ********* ***********. . *
18. spacer 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR matches to MN101230 (Klebsiella phage KPN6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer cgtttgaagataataaagatgagcctttga Protospacer ** ********* ***********. . *
19. spacer 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR matches to CP015514 (Vibrio vulnificus strain FORC_036 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cggttga--agatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer --atttatccgattttaaagatgagctagcct Protospacer .** * *** *****************
20. spacer 2.5|2091895|29|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder matches to KC821607 (Cellulophaga phage phi19:1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
acattctaatacctaaaatcgcataaata CRISPR spacer taaaactaacacctaaaaccgcataaatg Protospacer * ****.********.*********.
21. spacer 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder matches to MN101230 (Klebsiella phage KPN6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
acggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer acgtttgaagataataaagatgagcctttga Protospacer *** ********* ***********. . *
22. spacer 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder matches to LR877331 (Klebsiella phage vB_KpnM_311F genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
acggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer acgtttgaagataataaagatgagcctttga Protospacer *** ********* ***********. . *
23. spacer 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder matches to NC_031095 (Klebsiella phage PKO111, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
acggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer acgtttgaagataataaagatgagcctttga Protospacer *** ********* ***********. . *
24. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019717 (Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
aattatttttttgaattctttatattttttaga CRISPR spacer gttttatcttttcaattctttttattttttagt Protospacer . ** *.**** ******** **********
25. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011995 (Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
aattatttttttgaattctttatattttttaga CRISPR spacer ttttatttttttaaattttttatattcataata Protospacer **********.****.********. * * *
26. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014533 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
aattatttttttgaattctttatattttttaga CRISPR spacer agcaaattttttgaattttttaaattttttcta Protospacer *.. * ***********.**** ******* *
27. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034857 (Buchnera aphidicola (Sitobion avenae) strain Sav plasmid pTrp, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
aattatttttttgaattctttatattttttaga CRISPR spacer tagttcttttttgaattctttttatttcttggg Protospacer * * .*************** *****.**.*.
28. spacer 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR matches to AP011616 (Thermus phage phiYS40 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer taattgaagaaattaaagatgagctttctt Protospacer ...******* ************** *.
29. spacer 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR matches to DQ997624 (Thermus thermophilus phage YS40, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer taattgaagaaattaaagatgagctttctt Protospacer ...******* ************** *.
30. spacer 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR matches to NC_008584 (Thermus phage phiYS40, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer taattgaagaaattaaagatgagctttctt Protospacer ...******* ************** *.
31. spacer 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR matches to NZ_CP049807 (Acinetobacter pittii strain A1254 plasmid pA1254_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer agattgaagagattaaagaagagctattac Protospacer *.******* ******** ****** .
32. spacer 2.7|2092027|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder matches to LR700236 (marine metagenome genome assembly, complete genome: monopartite) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatgctccaaaagcagaaagcacagattcg CRISPR spacer gaggctcccaaagcagaaagcacattaact Protospacer .* ***** *************** *
33. spacer 2.9|2092159|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to LR700236 (marine metagenome genome assembly, complete genome: monopartite) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatgctccaaaagcagaaagcacagattcg CRISPR spacer gaggctcccaaagcagaaagcacattaact Protospacer .* ***** *************** *
34. spacer 2.11|2092290|29|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to LC553736 (Salmonella phage SAP012 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
atagcctctgcaacttctttatgctttat CRISPR spacer tgcacctctgcaacttctttatccgtttc Protospacer .****************** * ** .
35. spacer 2.11|2092290|29|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN694452 (Marine virus AFVG_250M839, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
atagcctctgcaacttctttatgctttat CRISPR spacer tccatatctgcaacttctctatactttat Protospacer . .. ************.***.******
36. spacer 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP017986 (Klebsiella pneumoniae strain 825795-1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taagtgtacttatagtgtgctatttcttca CRISPR spacer ccaccccactaatagtctgctatttcttca Protospacer . * . .*** ***** *************
37. spacer 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP018714 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_152021 plasmid pKp_Goe_021-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taagtgtacttatagtgtgctatttcttca CRISPR spacer ccaccccactaatagtctgctatttcttca Protospacer . * . .*** ***** *************
38. spacer 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP018720 (Klebsiella pneumoniae strain KP_Goe_828304 plasmid pKp_Goe_304-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taagtgtacttatagtgtgctatttcttca CRISPR spacer ccaccccactaatagtctgctatttcttca Protospacer . * . .*** ***** *************
39. spacer 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP018702 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_827024 plasmid pKp_Goe_024-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taagtgtacttatagtgtgctatttcttca CRISPR spacer ccaccccactaatagtctgctatttcttca Protospacer . * . .*** ***** *************
40. spacer 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP042866 (Escherichia coli strain ATCC BAA-196 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taagtgtacttatagtgtgctatttcttca CRISPR spacer ccaccccactaatagtctgctatttcttca Protospacer . * . .*** ***** *************
41. spacer 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP018313 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_822579 plasmid pKp_Goe_579-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taagtgtacttatagtgtgctatttcttca CRISPR spacer ccaccccactaatagtctgctatttcttca Protospacer . * . .*** ***** *************
42. spacer 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP018687 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_149473 plasmid pKp_Goe_473-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taagtgtacttatagtgtgctatttcttca CRISPR spacer ccaccccactaatagtctgctatttcttca Protospacer . * . .*** ***** *************
43. spacer 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP034054 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taagtgtacttatagtgtgctatttcttca CRISPR spacer ccaccccactaatagtctgctatttcttca Protospacer . * . .*** ***** *************
44. spacer 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP018696 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_149832 plasmid pKp_Goe_832-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taagtgtacttatagtgtgctatttcttca CRISPR spacer ccaccccactaatagtctgctatttcttca Protospacer . * . .*** ***** *************
45. spacer 2.12|2092355|30|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP018708 (Klebsiella pneumoniae strain Kp_Goe_827026 plasmid pKp_Goe_026-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taagtgtacttatagtgtgctatttcttca CRISPR spacer ccaccccactaatagtctgctatttcttca Protospacer . * . .*** ***** *************
46. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007513 (Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
aattatttttttgaattctttatattttttaga CRISPR spacer ttctccttttttaatttctttatattttttatc Protospacer .* .******.* ****************
47. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050184 (Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
aattatttttttgaattctttatattttttaga CRISPR spacer ttctccttttttaatttctttatattttttatc Protospacer .* .******.* ****************
48. spacer 1.2|140156|33|NZ_CP048279|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033050 (Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
aattat-ttttttgaattctttatattttttaga CRISPR spacer -ctgacattttttgaatcctttctattttttctc Protospacer * *. **********.**** ********
49. spacer 2.3|2091963|30|NZ_CP048279|PILER-CR matches to NC_048697 (Pseudomonas phage Littlefix, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer tggttgaagatattcaagatgaaatcatgg Protospacer .************* *******. * .. .
50. spacer 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder matches to AP011616 (Thermus phage phiYS40 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
acggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer ttaattgaagaaattaaagatgagctttctt Protospacer ...******* ************** *.
51. spacer 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder matches to DQ997624 (Thermus thermophilus phage YS40, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
acggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer ttaattgaagaaattaaagatgagctttctt Protospacer ...******* ************** *.
52. spacer 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder matches to NC_008584 (Thermus phage phiYS40, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
acggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer ttaattgaagaaattaaagatgagctttctt Protospacer ...******* ************** *.
53. spacer 2.6|2091960|31|NZ_CP048279|CRT,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049807 (Acinetobacter pittii strain A1254 plasmid pA1254_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
acggttgaagatattaaagatgagctagcca CRISPR spacer cagattgaagagattaaagaagagctattac Protospacer *.******* ******** ****** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
12985 : 81108
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048279|12985:81108|DBSCAN-SWA TATGTTAGACATTAAATTATTCAGAAATGAACCAGAGAGAGTTAAGGAGAAAATCGCGTTACGTCAAATGGATCCGTCAGTTGTAGATGAAGTGTTAGCGTTAGACCAACAACGCCGCGATTACATACAACAAACTGAAGAGTTAAAAGCAGAACGTAACAAGGCATCTCAACAAATTGCTGAAAAGAAACGTAATAAAGAAAATGCGGATGACGCGATTAAAGCGCAACGTGAAGTAGGCGAAAAAATTAAAAATATCGATGCACAGTTAAAAGAAGCGGATACGAAATTAAATGACATCTTATCACGTATTCCAAACCTTATTCACGATGATGTACCTGAAGGTGAAGATGATTCTGATAATGTAGAACTTAAAAGATGGGGTACACCACGTGAGTTCGACTTTGAAGCGAAAGCACACTGGGACTTAGTAGAATCATTAGAAATGGCAGACTTTGACCGTGCCGCACGTGTATCTGGTGCACGTTTCGTTTATTTAACAAATGACGGTGCTAAATTAGAGCGTGCGTTAATGAACTTTATGATTACGATGCATACGACACAACACGGTTACCGCGAAATGATGGTGCCTCAATTAGTCAATGCTAAAGCGATGTACGGTACAGGACAATTACCTAAATTTGAAGAAGATTTATTTAAAGTAGAAAAAGAAGGCTTATACACAATTCCAACTGCAGAAGTACCTTTGACAAACTACTATAGAGACGAAATTGTACAGCCGGGTGTCTTACCAGCTAAGTTTACAGGTCAATCAGCATGTTTCAGAAGTGAAGCGGGATCAGCAGGCCGTGATACACGTGGTTTAATCCGTCTTCACCAATTCAATAAAGTTGAAATGGTACGTATCGAAAAACCTGAAGATTCATGGGACGCTTTAGAAGAAATGACATCAAATGCAGAAGCGATTCTTGAAGCATTGAACTTACCATACCGTCGCGTGATTTTATGTACAGGCGATATTGGTTTCGGTGCAAGTAAAACATATGACTTAGAAGTATGGTTACCAAGCTACAATGACTACAAAGAAATCAGCTCATGTTCAAACTGTGTAGACTTCCAAGCGCGTCGTGCAAATATCCGTTTCAAACGTGATAAAGATGCCAAACCTGAATACGCACATACGTTAAATGGCTCTGGTTTAGCAGTAGGTCGTACATTTGCGGCGATTGTAGAGAACTATCAAAATGAAGACGGTACGATTACGGTGCCTGAACCGTTAGTGCCATTCATGGGTGGACAAACTGTCATTAAACCTCTATAAGATGAAAATGAAGTTACGAACAATTAAATAAAGGTGAGTTGAAATCAAATCAGGAGCTCGTATTTTTAATATGCGAACTTCTGATTTTTTACGTCTGAAGAGGGCAAGGGAGGGTAAAAAGTAATAAAAGTAAAAAATAAGACATACCTCATCAATTGTTATCTCAATATTATTAAATCTATATAAACTCCTTTATAAAAGTGTTTTTACACGGTAGGTTAGGCTGAGGTACGTATGAGGTAAGACTGACTTGATAGCGTAATGAGATAAGTTGTACTATAATAAGAAAAATTTTCAAGGGGGTGAGTCTCAATGTCTTATACTACATTTAAACAAGGTATCCAAGATTGTCTCCCAACTGTACTAGGATATGCTGGGGTAGGCTTTTCATTTGGAATTGTAAGTGTCACATCAGGATTCAACATTTTAGAAATATTACTGCTCTCTTTACTCGTTTATGCAGGGGCAGCACAATTTATTATTATCGCACTCATTGCCGTACAGACACCGATTTGGGTCATTGTGCTCACTGCAATGATTGTCAATAGTCGTATGTTTTTATTAAGTATGACATTGGCGCCGAATTTCAAACATGATCATTTGATACATAGGGTAGGTGTAGGGTCTTTGTTAACGGATGAAACATTTGCTGTTGCTATCACGCCTTATTCGAAAGGGCACACGATTACATATCAGTGGATGTATGGCTTAAATTTATTGGCCTACTTATTTTGGGCATTGGTCACTGTGCTCGGGGGATTGTTAGGTGATTTCTTCCAACATCCAGAAGTATTTGGCTTAGACTATGCGATTACAGCGATGTTTATCTTTTTAGCAATTTCACAATTTGAGGGCATTACGAAATCGAAGTTACGTGTGTATCTCTACTTAGTTGCAATTGTTATTGTTATGATGTTACTACTCAGTTTGTTTTTGCCTTCATATTTAGCAATTTTACTTGCATCGACTTTAAGTGCGACGATAGGGATGGTGATTGACCGATGAGCATGTACGTATTTTGGACGATCTTTTTAGCAGGACTTGGCACTTTACTCATCAGAATCACCCCTTTTGTCATGATTTCGCGTATGGAACTGTCTGAAAAGGTGCTCAAGTGGCTGACGTTTATTCCGATTACTTTATTTACTGCATTAGTGGTGGATGGATTCATTCAGCAACAAGGAGGTGTGATGGGTTATACATTGAATTGGAACTTTATCATCGCGCTCATTCCGACACTTATCATTGCTTTTTGGACAAGGAGTTTAACGATAACAGTCATTGTCGGTATGGTCAGTGTGGCATTGTTGAGAACTATCGGATTATTCTAACAATCATTTGCATACGTGATAGGTTTGCGGTATGATTAAAGACACAACATAACTTTAATTAAAAATAAGCTTATTAAGAGAAGTTGAGGGATTTGGCCCAGTGACACTTCAGCAACCACTTATCGTTATAAGTACGGTGCTACAACCAACCACGTCATGTGGATGATAAGTTCATTTAAAAACTGACTTACGAACGTTGTATAGCCGTCAAAGGTTGTACAACTTTTTTAATTTTTAGAGGGAGGGCAGACTAAAATGGTGAATTATCACGTGGACACATTAGCATTAGGTGCATTTACGACAGAATCCGGTGAAACGATTGAAAATTTGAAACTTCGGTATGAGTATGTAGGTTATCCTGGCCAACCACTCGTCGTCGTATGTCATGCGTTGACAGGCAACCATCTCACTTATGGTACAGAAGACAATCCAGGGTGGTGGCGAGAGATTATTGATGGGGGGTATATGCCAGTTCATGATTATCAATTTCTAACATTTAATGTGATTGGTAGTCCATTTGGGTCGAGTTCTCGTTTAACAGATCCAAACTTCCCAAAAAAGCTCACAATGCGAGATATTGTGCGTGCCCTTGAGAAAGGCATCGAAGCGTTAGGTCATCAAAAAATCGACATTCTCATCGGTGGCTCATTAGGTGGCATGCAAGTGATGGAGCTCCTCTACAATCAAAAATTCGAAGTGAAAAAGGCTGTCATTTTAGCAGCTACTGAAAAAACGTCTTCTTATAGTCGGGCGTTTAATGAAATTGCGAGACAAGCTATTCATTTAGCAGGAGAAGAAGGGTTAAGTATCGCGCGGCAACTCGGCTTTTTAACGTACCGGTCCTCTAAAAGTTATGATGCGCGCTTCACACCTGATGAAGTAGTGTTATACCAAAAGCATCAAGGCGACAAATTTAAAGAACAGTTTGATTTGCAATGTTATTTAACACTCCTCGATGTATTAGATAGTCATGACATTCACCATGGTAGAGATGATGTCGCAAACGTATTCCAATCATTAGACACGAAAGTACTCACGCTCGGCTTTACAGATGACTTGCTGTATCCAGATGACCAAGTCGCTGCGTTAGGCTGTTATTTCAAATATCACCGCCATTTCTTTGTGCCTGATAATGTAGGTCATGATGGCTTTTTATTGAATTTTAACGATTGGGCACCGTACCTTTATCATTTCCTAAAAGTTTCACGATTTAGACGCTAACTTTAGACGAAAACGTTACCTTTTTGTTATAATTGCGTCAACTAAGAATACTAGACAAGAAGCTATATTTTAGGGATAATAGCTAAAATATAGCTTTTCTAATGTGTTTAAGAAAAGTGACGTTTTGTAATTCAATTGTAAGACGCGTGAAATCATGTGGCGCAAATTGTATTCATATTACAAAGCCTGTAAAATAGAATTTATAGACTATAATAGTTTGGAAGTGGCGTCTTTGTTTTCGAAAATTAATCCTAAAGCAACCCTAATCAGCATTGTGGCGTTGTTAGCGGTGACTTTAGTTATACATGTTATGCCTGGATTAGCAATTATTTTGGCATGCTTTAGTTTAATCCCAGGTATCGTTTTATGGTACCAATCTAAGCATTCGTTTGGCTTAGTCGCACTCATCGCGATAATTCTCTCAACGCTCACAGGCAACGTTTTTGTGATGACATTTTTAATCATTATTTTAGTTTTAAGTATGGTTATTAGTCAGTTATTAGTCCAACGTGCTTCTAAAGAGCGCATCTTATATTCAGTGACATTCGTGGCAAGTGTTTTAACATTAAGTGCGATAATGATTTTACAAACTTTGAAAAAAATCCCGTATGCTGATGACTTATTGCAACCGTATCGTGCAATTGTGCATCAAACTGCAGAGTTAGAAAATTTGGATCAACAAGCACAAGAGATTTTAAACAATTCGCTTCAACAACTCGCAATACAGTTGCCGGGGATGATTGTAGTAGCGATTGCAATTTATGCTATCATCACATTGCTCATCATTTTCCCGATTTTACGTAAGTTCAAAGTGGCAACACCTGTATTTCGCCCACTTTTTTTCTGGCAAATGAAGCGTTCAGTTTTCATTATGTATGCATTGGCATTATTAACAACGATTACAACACAACCTGCCACTACGCCGAATAGCATTGGCATTAATTTCCAAATCGTTTTAGGTTTCTTATTGGTTATTCAAGGTTTAAGTTTTATTCATTTCTTTGCATCTATTAAAAAAATGCCCGGCGCGTTAAAAGTGATTTTAGTGATTGTCGGTGTGCTATTTTATCCAATGACACGCCTTATTGGTTTACTCGATTTGGGATTGAATTTAAAACGTATGATAAAAAATGATAAGAGGTGACAAGATGAATCGTCATTCAATG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56 | Streptococcus_phage(25.0%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
284026 : 319889
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048279|284026:319889|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048279|284026:319889|307531_308866_+|WP_162680968.1|DBSCAN-SWA MLTVTYDLVTAQVSNIPNEPHQFRLRGLKQLTPHEQQALKRFVIQQRLAVSLNRAVHCTKEETCHHVAQLQSFWRAHQHQRPRPLHTLLGWLCVILMFAAPVYVAYHLSDWLQNQYVAPWIDTLAEHALFRPSLIQAFLFGDYGVLSLGTYSLVWALPVVVMLSLSSAVIEQSHLKQYIIWSIAPTMGKVGLEGTDIIPLLEGFGCNAAAIVQAGHQCQLCTRTRCMSLISFGTSCSYQIGATLSIFNVAHQTWLFIPYLLLVLIGGLLHNRLWYPSEQRFIAAQVLSHEPVVWPSMKRVLAQMWDSVKMFLFQALPIFMAICLIASALALTPVLEMISKLFIPLLSLLHIPHELSPGLLFSMIRKDGMLLFNMGGGQFIQSLSAWQVLLLVFFSSTFTACSVTMTMVIRQLGLKEGSKMVGRQMVTSLACVAILGSITWLILL >NZ_CP048279|284026:319889|292997_293300_-|WP_162680957.1|DBSCAN-SWA MKKTLVTGFAVAALSTGIFAVSNEANAQVTSQNGIILHDDSRILEHELQYVDVLINPNTNLQTKERLKAYFESQGLNTVSEIVQKAKQDGLDTSKYDYLI >NZ_CP048279|284026:319889|294935_295466_+|WP_162680958.1|DBSCAN-SWA MNVRYPIGGLEIPETITRAHIDSWLEEIAQYVQDLRKTVTNLNQGDLQETYREGSFTVQQLVHHIADSQMNMFQRLKLALTDTHPQVPNFVQDEWVKLADSDLPIEVSIQMLEAINQRVVAIGQHLTEAELTRDFVLEDSGATTVGETIAKLSWHERHHLAHIQIALGQFDIGHSN 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MDGIDVQILKLLKTNARMRVKTISSIVMLSEPSVKNRISKMIESGVIDGFHVDVNYEKLGYMIGFFMKITEIKIAISEFEKRIQQFSDFQEYYAVTGTEKFIIKGHTKDIASLNAVIMKMEHIAEFNTSIVLHKMKVDDLEHPLIDE >NZ_CP048279|284026:319889|291313_292729_-|WP_162680956.1|DBSCAN-SWA MNIDIKNAHTQFNHVVYDEVAHLLNREMKDLPATLQPTAYMIAKYQHMSIPKEGKAVDEVMDLLHNEILTYNYRANHPRAFSFIPGPASELSWLTDLLTSAHNIHASNFANAPLPIAIEHCLIRYLSEKIGFDPILSGGVFVSGGSMATLTAITAGRDAMIPISQMSKATVYLTAQAHFSVAKALHIAGFAKSQLRYIPTDDLYAMDVTALEHQIEFDIAQGYHPIIIVATTGTTNTGAIDDLNHITRIAQQHRLWVHADGAYGLSHIFTEEGQQLLKDIDKVDSVTWDAHKLLFQTYSCAMVIVKNKNHLLSTYGVEAEYLDDITSTNENIDPEKLGIELTRPPRGLKLWVTLQVLGEDEISRRIEHGQEMARYAEHQIQQMTDWKIVTAPQLSIVNFRYEDPQKSPEENDKVMQYAASRIAQSGYAVAYTTELNHRRVIRFCTIHPETTHADIDGTLQRLNTYVHEAST >NZ_CP048279|284026:319889|289206_289776_-|WP_162680955.1|DBSCAN-SWA MNFENTALVLVDLQKGIANMGETAPHSVSTVLDNASQMVKLFKENNGFIAFVRVNFHDGQDALKPNAMRPLPGGEPAPDFAELADELGAEPHDYIVNKRGFSGFFGTDLDLQLRRRGIKNIILGGISTHVGVDTTARDAYQHAYNQYFLSDMMSAPEASLHNFSIEHTFPLMGQVLTTAEMIARLQSEK >NZ_CP048279|284026:319889|304890_305112_-|WP_162680966.1|DBSCAN-SWA MAISVRLNTQDEQLFKSYAKTNNMTLSELFRNAVFEKIEGEYDLAVYRESLEEYNKNPVIYSHAEVCRLLGIE >NZ_CP048279|284026:319889|317722_318118_-|WP_162680976.1|DBSCAN-SWA MSNIIHDLYTGGYLIIDEIENHLNKRIIQLIIEFFTGELNVNGATLIFSTHYVEVLDTIDRSDAIYVTQKKPKSEINRFSDLLGDKDRNDKKKSDLFLSGIIDTMPTYQSYRGTKNIIAALLQKGDTHEKN >NZ_CP048279|284026:319889|297424_297748_+|WP_162680960.1|DBSCAN-SWA MILDRINPDDLFPTEHIETSVLGIMPYQMKDVTKRFEAAYVATNERLILNVDMDGQFYYRNIQFSEIKAIKTTDNALEITFDYGVFTLEESDADKVKTMSEYLHSKI >NZ_CP048279|284026:319889|295713_297204_+|WP_162680959.1|DBSCAN-SWA MNRDESKLTGLFGHPVSDRENSMTAGPRGPLLMQDWYFLEQMAHFDREVIPERRMHAKGSGAFGTFTVTNDITQYTNAKIFSEVGKQTEMFARFSTVAGERGAADAERDIRGFALKFYTEDGNWDLVGNNTPVFFFRDPKLFASLNHAVKRDPRTNMRSAQNNWDFWTSLPEALHQVTILMTDRGIPKGYRHMHGFGSHTYGMINANNERVWVKFHFRTQQGIENLQPDEAAAIIANDRESSQRDLYNAIEEGNFPKWKMYIQVMTEEQAKNHKDNPFDLTKVWYKGDYPLIEVGEFELNRNPENYFMDVEQAAFAPTNIIPGLDFSPDKMLQGRLFAYGDAQRYRLGVNHWQIPVNQPKGVGVENICPFSRDGAMRFLDGNQGGQTHYYPNSYGAHESQPEYKRPPLELEGGAYEYDFREDDSNYFEQPGKLFRLQSPEQQARMFITTANEMEGTTDEVKRRHIKHCYQADVNYGTGVAKALGMEDQLESIIAEI >NZ_CP048279|284026:319889|285358_285985_-|WP_019166837.1|DBSCAN-SWA MAKLLYITAHPLDELLSASMAAGKTFKETYEQAHPEDEVVHIDLFKEDIPQIDADVFSGWGKLQNGETLTDAEQKKVNRLGEIVEEFINADKYVFVSPMWNLSFPPVLKAYIDAVAVAGKTFKYTSEGPVGLLTDKKALHIQARGGFYSEGPGADLEHGDRYIKTMMAFFGVPSYETIIVEGHHAAPERSEEIKAHSLRQAEELGRNF >NZ_CP048279|284026:319889|312972_313077_-|WP_162680972.1|DBSCAN-SWA MLDFLVSIVAPSISGCIVVYFTYWLSKRNDKKKK >NZ_CP048279|284026:319889|287010_287649_+|WP_162680953.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP048279|284026:319889|319484_319889_-|WP_162680977.1|transposase|DBSCAN-SWA MKLDTNNHSVFLLYYHLVLVTKYRRHVIDDKISEFAKTTFVRIAASYHITLVEWNHDKDHVHIMFKAQPKTELTKFINAYKSASSRLIKRDFPKVRQFLWKEMFWSRSFCLLTTGGAPIDVIKKYIQNQGYNHK >NZ_CP048279|284026:319889|306428_307538_+|WP_162680967.1|DBSCAN-SWA MKQHHRVIIIGAGAAGIGMAVTMKTLRFEDVCVIEGGSIGQSFKNWPKSTRTITPSFTSNGFGMPDMNAIAKDTSPAFTFNEEHLSGDTYAEYLTVVAEHYDIDVRTETKVEDVQFVDSVYELNTSQGTLTADYIYVATGDFAFPNQPFDHGIHYSEVDDFKGLPGHTFTIIGGNESAFDAAIHLAKQGAQVSLYTSSTGFDADEADPSIRLSPYTHQRLREVVQQGAEIEMNVHYRAESIVFRHGQYEIHFDNGAIVYSPTEPIIATGFDVTKNPLIQQLFTVREGEVRLTDLDESTRYPNVFLIGARVRHDEAILCYIYKFRARFAVLARTMMQREGLAVDQKVIDSYRDNQMYLDDYSCCEVACSC >NZ_CP048279|284026:319889|316213_317005_+|WP_162680974.1|DBSCAN-SWA MDTQKVDRKLEVDEQKQFHHRVEALDYYTQQFMQHVPFENLDVQNGVPISTDLDDLYHKIIEQGRGGYCYEVNTFYAAYLESKGYETHFLPATIHTPNGGRSLEDSHVTLAVVIDGETYIADVGFGGLPVKSIHVTDDGHDTVQDISGEYRAVRENDMIAIQKWVDDAWQTKFVAKAQPQEINYFDDVLEHNQHDPKSPFVHSVIVTMPTATGRVTMTQNHLTVTDEDGKHKTLVTPDNYQQLLQQHFGIDLTVPRLEKTEKE 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>NZ_CP048279|284026:319889|310835_311258_+|WP_162682972.1|DBSCAN-SWA MNLEFNIAVHVLAFLNQHHGEVFNSQALAGNVCVNPVQLRRVMSKLQQEVYVKVVRGQKGGYLTTEDGPAIKLEALFRLFNRPENYGCLFTGHPSIHCEISQKIEQVMYGHYLTEQEIIANYYQHQTIGDILNQIREVKA >NZ_CP048279|284026:319889|299559_300936_+|WP_162680962.1|DBSCAN-SWA MRTIDFLVFIVYFAALISVGIIGVLKAKSSEKYMVADRNLGLLMLFGCLTAVFLGGSSTIGTSQLGYEMGLSGFWFVFSLGVGITIFGLFLLDRIMDLQVITISELLYRLFGHRVRVMGAVVTAMYTLMICVTQVIAMGAVVSQIFHWPMMTAILVGGSIVFVYTILGGMWTLSITDVIQFLVMTIGMFCIMLPMSLHSVGGLTMLFEQMPTSHLSFFNIGFGEIVNYFVTYTLGVMVGQDIWQRFFTGKTKRISKTSGVLVGLYSALYSIVMVIVGMCAYVLFPNIQNTQNVFAHMAFEILPNGLLGIVFAALIAAIMSTASGTLLASATIISNDLLKPYVFKNMEDHQFLGLTRLTTFILAVIAIVISIWVKEVLIAIDIAYAILTGGIFMPVVLGLFMKRITPQAAFYAIIASVMVIFIGIGIAGPQSTATIFYAILVNAIILIIMSQFQRKKEA >NZ_CP048279|284026:319889|310083_310752_+|WP_162680970.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP048279|284026:319889|303491_303896_-|WP_162680965.1|transposase|DBSCAN-SWA MKLDTNNHSVFLLYYHLVLVTKYRRHVIDDKISEFAKTTFVRIAASYHITLVEWNQDKDHVHIMFKAQPKTELTKFINAYKSASSRLIKRDFPKVRQFLWKEMFWSRSFCLLTTGGAPIDVIKKYIQNQGYNHK >NZ_CP048279|284026:319889|287894_289106_-|WP_162680954.1|DBSCAN-SWA MENKRTSPLFIIIMAGLAAFGPLSIDMYLPALPEVKNHFGTTTALTQLTLTLFMVGLAVGNIVAGTMSDSTGRKKPLIVSLISYIIASIVIALAPNVIVMIVFRFIQGVSGGAGIVLSRAIATDLYKGRALTQFLALLMLVNGAAPVLAPMFGGFILSLANYRVLFWILTLLSLLMLVGVFFKIGETLPQSSRRPARVKAIAEDFKMLLTRRSFMLPILIQGFTFAMFFSYMAASPFIMQNLYGLTAQQYSYIFALTGLGLIVTAQLTGRLVKYINQHVLFRTFSFIQLAGAILAIFALINHWSLWILLPSFLFIMAPVAGIATLAFAIAVEGQKKGIGSASSLVGLLQYFIGGISTPLVGLQGEYSYVPYILVVIVTMTIIMFLQFYHYWANTRHESQTHVE >NZ_CP048279|284026:319889|311258_312584_+|WP_162680971.1|DBSCAN-SWA MEKYDLIVVGFGKAGKTLAKFAAQQGKKVAVIEKSAEMYGGTCINIGCIPSKVLVHDGIEAASFNDAMQRKRDVVSALNHKNYHNLADEDTVDVINMTASFKSAYEIVLLNAQGETVKTIEGTNIVINTGAKSVIPNIKGVDTSQRVYDSKAIMDLTQQPKRLVIVGGGYIALEFASIFANFGTEVTVLERADQILKKEDEAIAKQVTEDLTQKGIQFVYHAETEAIQDEADVTKVVTSQGTFEADAVLVATGRKPNTEGLNLEGAGVQLGKRGEVVVNDKLQTSVDHIYAVGDVNGGLQFTYISLDDFRIVKSQLFGNGQRTLEQRGAVPYTMFIDPPMSRVGMTAAEAREKGYDVLENQVPVNTMPRHKINNDTRGLFKAVVDAKSGQVLGATLYGQQSEELINIVKLAIDQQLSYAVLRDNIYTHPTMAESFNDLFNV >NZ_CP048279|284026:319889|297869_298316_+|WP_019166850.1|DBSCAN-SWA MAQGREQVVEDLNLQLSNFTVLWTKIHNYHWYVKGHNFFALHEKFEELYNKVAVYVDEIAERALALEGKPVGTMKEVLEVSSIEEAEKNISAEQMVAQLAADFETVVKELKQAQGNAEEAGDDRSADMFIEIATELEHNIWMLKAYIG |
35 | Enterococcus_phage(27.27%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
421139 : 554347
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP048279|421139:554347|DBSCAN-SWA 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107 | Streptococcus_phage(20.83%) | holin,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
751512 : 810910
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP048279|751512:810910|DBSCAN-SWA 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45 | Streptococcus_phage(33.33%) | holin,transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
896347 : 904767
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP048279|896347:904767|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP048279|896347:904767|896816_897950_+|WP_162681392.1|DBSCAN-SWA MTFDKLQIGQTVGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGFKVVVLDPVETCPCRYVAHEFIHAAYDDMPALERLGELSDVITYEFENIAAEQLQKLVSKYNVPQSYQAIQLLQDRLTEKQTLDQVGTKVVPFVQVTSEADLDEAVKTLGFPFMLKTRFGGYDGKGQIRLTSEAQLDEARELIATQECVAEQFLDLAKEVSLTVTIGNEGQIVYFPLQENEHRNQVLFKTVVPARANHEQEARCEVDKITQAVHFVGTFTVEFFIDQQNELYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGHRLPEQIELLKPAIMMNLLGKDLDLLEDELFAHPDWHVHLYGKDSRKPERKMGHLTVLTDDISKTEQQMVVKFEGRDEYK >NZ_CP048279|896347:904767|898650_898911_+|WP_014614277.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALTRAVHDLGYEQVNDIRVGKVLYMTVDEATDEAVHNVVTTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDEKENQ >NZ_CP048279|896347:904767|899576_901766_+|WP_162681395.1|DBSCAN-SWA MPKFLEPSAEEVKSEKLYRDMGLSDTEFEKVTEILGRTPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELTEKTNRRLLRGVVAGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDEHYDGNPLVNAMCVGVIDHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITYDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGIHLELEKVPVREEGISPYEMMLSETQERMLLVVKKGTEQKFLDLFDYHELDSAVIGKVTDTNRFVLTYEGEVFADIPVEPLADEAPVYILEGEPLQHDAAPNRYDNIDVNDVFDRLLTHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTMIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVFNDPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGAKPLAMTDCLNYGSPEKKHIYQQLTDSTRGMAEACEALATPVVSGNVSLYNETRTSSIFPTPVVGMVGLIENVDFLKSYQPSVGDTLYVIGKTTDSYGGSQIEKLLYSDVNHEVEKVDLSQEAAKGEAVRAAIREGVISHTQTIGKGGLVMTLAKISAHYSLGIDAEVNLTNAQLFSETQGRYIVAVKAGQTLTIEGATRIGSLTDTDDFKVVAQDSVIERRTSELKREWEGAIESCMTSVD >NZ_CP048279|896347:904767|904200_904767_+|WP_162681398.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGTNFDNIMKRVKSGELEHIEVTALYTDQPTAACRQLAQQHDIPVHAFEPRTFDDKVAYETAVLNGLRHEEVEWIVLAGYMRLIGETLLSAYEGRILNIHPSLLPKYKGKNAVGQALNSGDKETGSTVHYVDAGMDTGQIIEQRTCPIYEDDTQQSLEERIKSLEYELYPAVIKKIIR >NZ_CP048279|896347:904767|898912_899584_+|WP_162681394.1|DBSCAN-SWA MKFAVLRFPGSNCDRDMYNAALKSGVDADYVDYRETSLKGYDGVLIPGGFSFGDYLRSGAVASVAPIITEVKRLADEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFVSRNEHLKIVNNQTPFTNRYAEGEEVVYPVAHGEGHYYCTDEIYQDLVKNNQIILKYVDNPNGSHDDIAGIVNKAGNVCGMMPHPERALEAILGTDSGVKLFESMVNSWREQNA >NZ_CP048279|896347:904767|897946_898648_+|WP_162681393.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRVFSTEQPDVLRIEYKDEVTAGNGAKKDAMVGKGRLNNQITSHIFEYIKKEGVDSHFVQQLSETEQLVKAVDIVPLEVVVRNIAAGSITKRLGFEKGHVFDYPFVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLGIADDTTIAQLKEQALRINQALIKLMDEMGLALVDFKIEFGVDREGQLLLADEISPDTCRIWDKATQENFDKDVYREDTGSLIDTYQTFLNKLEAL >NZ_CP048279|896347:904767|903169_904201_+|WP_162681397.1|DBSCAN-SWA MAESYKKAGVDIEAGYEAVKRMSSHVERTMRKEVLGGLGGFGATFDLSQLNMKAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYDKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATHKVVPEIIEQIVKGISDGCVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDEYIDGSKVEIGDVIIGLASNGIHSNGYSLVRRLVAESGIDVNDTFEGEQSFLDVLLTPTALYVSPVLAVKKDIQIKAMTHITGGGFYENIPRALPKGKTAVVNTASFPTPSIFNWLQAQGNINTDEMYHIFNMGIGFTLVVAPEDEAAVHEILKNANVDAYTIGHIAEEDSAIRLTEAK >NZ_CP048279|896347:904767|896347_896830_+|WP_162681391.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWNVMKEACVMLEEFNIPYDQKVVSAHRTPHMMVDFATNARSNGYHAIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGQAGAKNAGILAARMIGMTDQEVQRKLEAYEQSLVEKVEAMQDDLR >NZ_CP048279|896347:904767|901744_903166_+|WP_162681396.1|DBSCAN-SWA MYDIRGLNEECGVFGIWNHPHAAYLTYMALHSLQHRGQEGAGIVCSNGEQLFGARGMGLLTEAISQQQLDSLQGYPNAIGHVRYATTGASEISNVQPFLFKHSKGDLGLAHNGNLTNAHQIRLAIESTGGIFQTTSDSEVLAHLLIKGKSENIKTNQKAALNQVKGAFSCVILNEGQLTATRDNRGVRPLMLGQVDGAYCVASETCAFTAIGAEYIRDIEPGELITFSGENEVEYDMYTQDIGYKMCSMEYVYFARPDSEFHRHSIYNVRKALGRKLAEEMGIDADIVIGVPDSSLQAAKGFSEQTGIPNEQGLLKNRYIGRTFITPDQSVRERQVRMKHSPIRDVIEGKRVVVIDDSIVRGTTSKYIVKALKSAGAKEVHMGISSPPLQDPCYYGIDVSTHAELMAAQHTVEEIREMIGADTLTYLSVEGMHEVFKAHDSKGECNACFTGDYPIEIVDHELPEVKEMKRRGV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
985293 : 995148
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP048279|985293:995148|DBSCAN-SWA TTTATGAATTATTATTTTCTAGTTCTTTAATCGCTTCATTGTAATTGTATTTTTTCTCAACAATATCGTGTGCTTTATCGTAATTATAATTATACTTATTCATCAGATAATGTTCAAGTGCCTCATGTCGTAGCATTAATATATCTATTTTTTTAATATGTTTACCTTCTCTTAATCTCATCCAACTATTCGCCATATAAAAATCTGGATAAAAATTACTATACCCTGATGCTAATTCATATTTATTTTCAAACATATGTTCATACACACGCTTTATTGTTGATTCCCTGAAACCTGTGTTTTTAGCCACTATTTTTATTTCTGAGTTCTTATTTCTATACAACACAGATTTATAATATCTCTCAGCGTGTGCAGTCCTTCTTTCCATATATGGATCATTTATATTATTTAATGCTCCGGACTCTCTTTTAAGACCGTCCTCATCCCTCAATCGATACTTCCCTTGTCTATCTTTGAAGAACTTGTCACGCCAGTTCCCTACATGTGGTACCGTCGTGCTTCGACAATGGGGATGCATCGGCGGGGCATTGACACCAGGCACCATGTCTTTCACTTTAAAAACTTTTTATCATAATGACGACTGATTTTAGACGTCTTTTCATCACGTTTCGCCACAAACTCATATTCCGCATCGTCGCCCATCGTTTCTAAATAGTGCATTTTCTGTGCTTCTGTTTGCACACGTGCAGCTTCGGTAATCAATAGCCTTTTTGTATTAGCGACTGTCTGCTGTTGCTTCTTACGTATCTCCGGCACAAACTCATACGGATGACGCCCACGTAACATCACATGGCTTGCCATCCGCTCAACATCTTTTCTGAGTTCATCTTGATTATTCCAAAGCCTTTCTAATACGTAACTTTCTCAAAGTGTGATTAACAAAGACCGATTCTCTATGGAAACATCATAAAATAAAAAAGTGCACCTTAACCTTTTTATCTGTTAGGTGCAATATTACCATCCTATAAATAGGGCTTCAGGAGATTCATTATTTTTAATGTTTGCCCTTATTTCATAAATCGCATGTCCGATATACAGACTTATGTCTTTATCGTATTCCGTTTTTTCAACACTAAGCACTTTTAAGTTATCAATCCCTATAGTAATTCTCCCTGACACTTTTTGGTTGTTAGGATAATAATCATAAGTCACGCTTTTTTCGTCTTTACTCACTAACTTCAAATCTAACATTGTTCTCTATCTCCTTTTTATTATAATTAAGTACGCTCTGTTTAAATTGTCAGAAAAATATAGAAGAAGTATTAGAGAGTATAAGAGTATGTCACCTGAGGAAAAAAGAAAAATTGAAGACGGGTTTATAGAATACGTGAAAGAAAGGAGTCCGATATTAAGGAATGTTGGTGACGAGGCGTTAAGACATAAATTTAAAATGATGTCGAATTTTATCGATATTAGCGAGGAGTAAATAGTTGATGACGCAATATCTAATCACTACATTCACAGACAGCACAGGACAAACGTTCACTGGAGTAACTAAGGCTAGATACAATCAAACGTTTACTTTTGTACTTGCAGAAATTGAACCTCTCATGACTAAAGTCACGAGATTCTTGGGAATAGAGCATACTTGTATGTATATTTCTTTACTAACAGAGGAAAGTAATTTATTAGAGTATCAACAGTTCGAAAGCTACATTGATGTCGATGATGAAATATTAGGTAATTTACAAGATATTATGTACAACATTGTTTCGGTAGACAACTGGAGAGAAAGCTTTGAGGAGGCTAAAAATAAAAAGCCATAAAGACTTTTTATTTTTCAGCAATAAGCACCTTGATTCCTAAATATAAATTTTTAATCACATAGAAAGCTGCAGCTATAACAAAAATAATACCCAATATAAACATCATATCTGAGTAATTATTGTTATTATATATACCGAAAATTATAGTGGATAATCCAAGAAAAACGATTGGCAGAAAATGATAAAGCAAAGCTCTTTTAGCGTTGTTCGATGTCTCCCCACTAGATAAAATCCAAATTGCAATTGGAAAGATAAATGGCGCAAAAAAGACACTGAAGTAACATAAAGAAGAAAGGATTTTATTTGACGACATATTCATTTCAACACCTCCTAGTTTATATTGCAAACGTATCATGTGAGGTTGAAAAATGCTAATGAAAAGTTAATATCTTACAAAATTGTAAGGTGAAAAAAGGAATGCTGAATAAAATGTTAAAAATATTGTTCTATATCGCAATGTACGAGTTAGGCAAATATATGACTGAACAAATATTAATTAAATGCATATCTAATAATGACGTCGAAGCACTCAAAGACTTTACACAAAATGATCACATCCATTTAAACAACTTTAAAGCAGAGGTGTCGGATTGATGTCTTTAAGAAAGTCAACTGTTAATTATTTAGAAAGTGAATTGCATAATTATCCCTATATCGACAAAGACATTAATAGAGTTAGAGAGGAAGTGCTACATCCCTGGTCTCCGGGAGATGAAAATATAGGTGGTGGACGTTCTGGAGAGAATTTATGCGTAACAGAAATAAAAGCGACACGCGTTGTAAATGATAGACGTTTAGCACAGTTGACTAGATTAAAAGTATCTATAGAGGTTGTATATAACATGACTACTGATGAAGGGTGCAAGTTAATGGATTTATATTATTTTGCGAAGCCTAGAAAACTTAATTTAACAGGGGTCGCTGATACTTTACACATTAGTAAAACCGTTGCGTATGACTTACGTAAAGGTATATTGTCGATGTTAGCTGATGAATTAGGGATTATTCATTGAGTGGAAAAATTCCGGAAAAATAGCATCACTTAACGTGTTATTATGTTAGTGTATAGAAATGTACGACATGATGATTTGTGTTTCTGTCTACGATGAACTTTTGTTGCTTATTCATTGTATTCCTCCTTTTGATAATATAATCGTGAAGGCGTCCTAGAGGCGTCTTTTTTGTGCGTTGTTATGAATTACACAGTGTGTGATTGATATGAGTATATAACTCAAATGAAATATCGAACTAGGGCATCTTAATTGCTGTGTCTTTTTGTCATTAAACCCTTAACACATACTATAACATATGTTATAACATATGTAGGAAATAAATCAAGATGAGCTTATCAAAAGAAGTTATTAAGAAAATTGAGCAAGGCGGATGGTATCTTGTAAGAGTGGTTGGTAGTCATCATCACTTTAAGCATCCAACGCGTAAAGGCAAAGTCACTGTTCCACATCCAAAGAAAGATTTACCTCGTGGAACAGAATGCTCAATCTTAAAGCAAGCAGGACTATTATAGTCTTCTTGCATCTTCTTTAATTGGAGGGATAAATATGAAGTATCATTTCTATGCAGTATTACAACGAGAAGATAACGACTATAACGTATACTTTCCGGATTTACCAGGCGCGATAACGTTTGGTAATGATATTGAAGATGCTGTATTTATGGCACAGGATGCATTAGAGGGTCATTTACTGGTAATGGAAGATGATGGTGATGAGATACCTAAACCATCTGAGTATAAGGAACTTGTCAATGATCTAGAGGCTAATGAGCAATTACAATTAGTGACTGTCGATACTAAACTTGTTAGGATTAAAGAAGAGAATAAGACAGTGAATAAGATGGTGACATTGCCACAGTATATGGTTGTGTTAGGTAAAGAAAAAGGCGTTAACTTTAGTCAGACCTTACAGAGAGCATTAAAAGAAGAATTGAATATTTAAGATTGAGACATCACATTGCGTGGTGTCTTTTTATTATGACTAAAAAAGCTAATAGCGTGAGAGTTGGTGATAGATGAAATGAAATTGACAGAAAAGCAACAGATGTTTGTAGATGAATACATTATAGATTTAAATGCGACACAAGCAGCTATACGTGCAGGTTATAGCGAGAAGTGCGCGAGGCAGGTTGGGAATGCAAATATGTCAAAAGTGTACATGCAACAAGCGATTCAAGCGAGGTTAGCTGAAAAGAAAGACAATCTCGTTATGAAACAGGATGAAATACTTGAGAGATTAACGAGACTTGGGAGGCGTGAGGAGCCAGATTATCAAGTTGTGATTGTTGAGACACCTGTATTCGACAACAATAATAGGGTGCTAGGCGTTGAAAAGAAACCTCAAATCGTTGAAGTACCAACACAAAATAAAGATGTAATTAAAGCACTGGAACTGTTAGGTAAGCGTTATATGATGTGGAATGGCAAACAATCAGAAACGCAAGAATCAAAACTCGAAACGTTGATTAAACAGAACAGGCAAGTGATTGACGATGAATAAACTGAGTCACCAATTTACTGATAAGCAATATGCCATTTATCGTGACGTGATGAAAAAGGACTGGTTTCTATGTATCTTATATGGCGCTAAACGTACAGGTAAAACGATTTTCAACAACTATATGTTTTTAGAAGAAGTGTTAAATGTACGTGAGCGTGCGACAAGGCTTGGTATAAGAAACCCGCAGTACATTTTAGCCGGTTATACATTGGCGCATTACTTTAAAAATGATAAGCTACGGATTTTATATGACGCTTGTCCTCGATTTGCCTCAGAGATTTATAACTATGCGTGGGACACTAAAAAAGATTTACCGATGAAAGAATACGATGACGTGATGGATGCGATGCGTTATGCGTTACTCACGTTTGTAGAAACATTCGAACAAAGAAGTGTTGAAGATGAAATTGATTTAATTCAACAATTAGGAATTTAGGTGATAGAATGCGGTTTAAACCTGACAGTAATTTAATATTTACGTGTAAAGACGTTGATGATTTGTTAGCCAAAAATGGTGAAAAATTGTTAACGTTTTTTAATTTACATCGAGATCAGCAACGTCCTCGATTACAAGAGCTGCTCGATTATTATTTGACGAATAATAAGGGAATCAATCAACGTCCGGGACGTGATGAACCATACGCGGATTATCGTATTGCACACGCGTTTGTGAAGAATGGTACGGACTTTATTCGCGGTTATATCGGTGGGAATGAAATTACATTCCGCGATGAGCAATATGCTGATGAGATTCAACACATTAATGACATTAACGATGCACATGTTGTTAACGTTGAGATTTTAGAAGACTGTATTATTTATGGACGCGCTTATGAGATTGTATATCGTAATACGGACAATCAAGACATCTTTAAGCGTTTAGATCCAAAAAATGTGTTTGTGATTTACAGTAATGACATTGAAGTTGAGCCGATTGCAGCTGTGCGTTATCGTTCAGAAAAGACAAACGGTAAAGATGTGACGTTGATTGATTTCTATACCGCTGATTATCGTGCTTATTTTTATGTAGATGATAACCGTTTAAGAGAACGTGCAGACATGCCACAAGAGCTGAATATGCATCATATGTTACAGATTCACGAATATAATGCGAATCGGTTCAGACAAGGTGTGTTTGAAAATGTACTCGATTTAATCGATGCATATGATTACGCAGAGTCTGATACAGCGAATTATATGACCGATTTGAACGATGCGATGCTAAAAATTGAGGGGCATTTAGACTTAGATATTGAAGAGGCTAGAAAAATGCGTAAGTCCCGTATTATTTTAGCTAAAACAAAACCTGATGCATCCGGCCGTATCGGTAATGCGAATGTCGATTATATTTATAAGCAGTATGACGTTGCTGGCGTTGAAGCATACAAGAAGCGTATTCAAAAAGACATCCACAAGTTTACGAATACGCCTGATTTATCCGATGAACATTTCGGTGGGGTGCAGTCGGGTGAGGCAATGAAATATAAGTTATTCGGACTTGAACAGTTACGCTCAACAATTGAAAGGCAGTTGACGAAAGGCTTTAAACGTCGGTTTGCGATTATTCAAAGTGTGCGGAATCACTTGAATGATCATGTCGATTTTACGAATATGCGTATTGAGTTTAAGCCTAACATCCCGCAATCCTTAGCAGAATATGCAGACATCTTTATTAAGCTTGGCGGTCGTGTCAGTCAAGAAACGTTATTGTCTTGGCTTCCGAATATTGAAAATCCTAAAGAAGAACTTGAAAAAGTGAAACAGGAAGAACAAGAAAGCTCAAGTGCAAATGACTATCAAGACGCGATGAAAGAAGACATGAACGATGTCGAGCTTGAATGATTATTGGTTAGAACGCGCGAAGCAGTTCATCCAGTCTGAAACATTAGAAGATGCTGCAAAGGTGGCTGAAATTGAGCGCATTGTGGCGATGATGTTTGCGGATATCTACAAAAACTTGTTGGCCTATTATGGGAAGCTCGCGACAGCTGAAGGGATTGACTGGCGAGAAGCGAAAAAGATAGTGGATGCGTTCGATATTGAAATGTTTCAAATGCAAGCGAAAGCCTATGTGGAGAATAAAGACTTTAGTGAAAAAGCGAATGAAGAGCTGAAGCGTTATAACACGACCATGTATGTGAATCGTGAGCAGTTGTTAAAACATGAGCTCGGTTTAATTGTAACGAAAGCCTATGCGGAACAAGAGAAAGTGGTGAATCATCACTTACAAGATAGCGTGACACGTACATTGAAACATCAAGCAGGTATTTTAGGTGCGGATGTGCATGTAAAGCAGTCAGATGTTGAAGCGATTGTGTATTCTAACTTTGGCAAGCTGAATTGGTCTGAGCGACTTTGGAATAATCAAGATGAACTCAGAAAAGATGTTGAGCGGATGGCAAGCCATGTGATGTTACGTGGGCGTCATCCGTATGAGTTTGTGCCGGAGATACGTAAGAAGCAGAAGCAGACAGTCGCTAATACAAAAAGGCTATTGATTACCGAAGCTGCACGTGTCCAAACGGAAGCACAGAAAATGCACTATTTAGAAACGATGGGCGACGATGCGGAATATGAGTTTGTGGCGAAACGTGATGAAAAGACGTCTAAAATCTGTCGTCATTATGATAAAAAAGTGTTTAAAGTGAAAGACATGGTGCCTGGTGTTAATGCCCCGCCGATGCATCCCCATTGTCGAAGCACGACGGTACCACATGTAGGAAACTGGCGTGATAAGTTCTTCAAGGATAGACAAGGGAAGTATCGATTGAGGGGTGACGAGGAAACGAAGCAACTTTTAGCTAAAAAAGAAATGACGGATGCTCTGGATAGTGGTAAAATAAAAGTTGAATTAAATGTTGATAAACAGAACCGACACCAATTAGGTCATCAATTGTATGAAGCCTATAAGAAAAAGAATTTACAAAAAGGGCTTCCAATACCAAGTTATACAATATTAGACAATGATGAACTCAATGCATTAATAATTCAAAAAGCTGGTAAGGGCTATTTACTAGTTGATAAAAAAGGGAAATGGCTAAATAAAGAAGTCATCGATTTTGATAAAACTGTCGGGAAAGTATACACTGATGGCCGGTTTATAGAAACGAAATGGGGGAAGGTGCACTACTCAAAAACGGGTAGCCATGTTGTCCCTAAAAAGGAGGAGAATAAGTAATGAAACTATGGACATATGTCGGGAAAAATGTACGAATAGAATTGACTGATGGTCAACTATTCATCGGTAAAGCTACTGATTATGACGATGAAATGGATAATGAAAGCGGAGAAGATTCTATAAATTTATATGATGGTATATGTTTATATGATTTTAATGAAAGCGAAATAAAATCGATTGAAATTATAGATTAGGCACCTAACTGATAATAATGGTTGCGGTGCTCTTTTTATACCTAATTTTAAGCTACTGTATTGCAGTGGCTATTTTTTATGCCCAAACCGTGCTTATGGCGTTAAAAGATGCAAGTGTAGTCCAAACCATGCAATGACATAAAACTTGCAAGAGTAGATTTAAATGAGGTGCGAAATATGAAAGAACAATGGTTAAAGTTAAGCTTACAATTTTTTAATGATGCGGGTACTGAAGAGGCGACAAGTGATGAGAATACCGAAACTGAAGCAGCTGAAGCGACACAAGAAGCTGAAGAACTGTCTGAAGCGCAACTTAAGTTAGTGAATGATCGTGTGAATGAAGAGATGCAACGACGTACGAAAGAGATGCGTCAACAGATTCAAGATGAGTTAGCTGAGAAGCAAAAAGAAGCTGATAAGTTGCGTAAGATGAACGCCGAACAAAAGCATCAATACGAGCTTGAAAAGGCTGAAAAAGAACGTGATGAGTATAAGCAACAACTCGAGTCATACAAGATGCGTCAAGAAGCGATGGCGATGTTCAGTGAGGCAGGCATGCAAGCCCCTGAATCTTTATTGAATATGGTCGTTCAAGATACAGCTGAAGCAACAAAAGAAGCTGTAGATAGCTTTGTTTCGATGGTGAATCAAGAAGTACAGCGTCAGTTAGAAAGTAAGGCGACACAAAGCCGTGTTGTTGGAAATCATGTTGAAGCGCCTAAAACAGATGAAGCTTGGAAAACATTTTTAAATTAAGAAAGGTTGATTTGATGATGAAATTTAATTTACAATTTTTTGCTGATACGGCTACGGGCGGGACTGCAACACCTGCAGCAGCAACACAAACGAAAGTGGCACTAGGTGAAACGAAATTAAAGGACAAACACACTGGCATTGTAAAAACTGTGACAGATGCGAAGTCGTATGTGACACCTGCATTGATTACTGATGATGCGATTTATATGGAGGGGCGTTCATTCACTGTGATGAAAGGTGATGTCGCTGAATTACGTGATTATGACCGTACACAAGCGAACCATATGGACAGCCCGAAAATTACTGAAACAACTTACTTCTTAGATCAAGAGAAGTATTGGGGTCGTTTTATTGATGCGCTTGATAAACGTGATACTGAAGGTAATATTGATGTGAACTATGTGGTTGCACGTCAATCGGCTGAAGTGGTCGCGCCTTACCTTGATAACTTACGCTTTAAGAACATTGCTCAAAATGCGAAAGAGCATATAACTGTGGGTGAGAATCGTGAGTACGATGCGGTTTTATCAGTGACTGAAAAGATGACGGACGATATTGCGCCTGCAAACCGAACATTATTCGTAACGCCTGCTTTCTACACTAAAATTAAACAGCTTGTCATTCAATTGCCACAAGGGGATAACAAGCAACAAACGAATTTGACGAAGTGATTAACGATGAGTCGAATTAATACCTATCCAATCAATAATCACCCAAAATCTACAGATAAAAAAGAGATAAACTCTTCACCGAGATTTTACAATTCGTATAATATCAAAAGTGATGGGAACATCCGTATTTCGGAAGTGGATACAATGTCGTTAGATTATATTACACGTCCTGAATGTGAACAGCATCAAAAGCATATGGACTCAAGGTTTGATAATGTAGAGCTGAGAATTGATAACGCCGTAAAAAATTTGAAAGAAGAAATAAACTTAGAAAAAGTCACATCAAAGCGTTTTTGGATTGGTATATCTGTAGTATTGTTGATATGTATAGTAAAGGCTGTGTTCTAAATGAGGAACGAAATCATAAAACTACTTGATTCTAATATTAGTGCATACAAAATTAGTAAAGACACAGGCGTGAATGAAGCGACTATTAAACAATTAAGATTAGGGAAGTCTAAATTAGATAGGTTAGGTTTGTTGAACGCCGAAAAACTATACAATTATCAAAAACAACTCGAAAAAGATAACGGATAAAAAACCCCCCTGCCTGCAATAGGTGGGGTCACGTGTCAATTTATAAAAAAGTGTTAACTATATTCCGTACGGGTAGTATAATAAATGTTGGAGGTTTTCAAATATGACAGGTCAAATGTATTTATCGTTATTAATATTAAGCCTACCATTATTATTGTTTATAGCAAGAAAGACACATTTATATTACTTAGATAAAAAGAATGTGAAAAGAAATGACTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP048279|985293:995148|992769_992964_+|WP_162681471.1|DBSCAN-SWA MKLWTYVGKNVRIELTDGQLFIGKATDYDDEMDNESGEDSINLYDGICLYDFNESEIKSIEIID >NZ_CP048279|985293:995148|988638_989034_+|WP_162681467.1|DBSCAN-SWA MKYHFYAVLQREDNDYNVYFPDLPGAITFGNDIEDAVFMAQDALEGHLLVMEDDGDEIPKPSEYKELVNDLEANEQLQLVTVDTKLVRIKEENKTVNKMVTLPQYMVVLGKEKGVNFSQTLQRALKEELNI >NZ_CP048279|985293:995148|994535_994739_+|WP_162682996.1|DBSCAN-SWA MSLDYITRPECEQHQKHMDSRFDNVELRIDNAVKNLKEEINLEKVTSKRFWIGISVVLLICIVKAVF >NZ_CP048279|985293:995148|990114_991434_+|WP_162682995.1|portal|DBSCAN-SWA MLTFFNLHRDQQRPRLQELLDYYLTNNKGINQRPGRDEPYADYRIAHAFVKNGTDFIRGYIGGNEITFRDEQYADEIQHINDINDAHVVNVEILEDCIIYGRAYEIVYRNTDNQDIFKRLDPKNVFVIYSNDIEVEPIAAVRYRSEKTNGKDVTLIDFYTADYRAYFYVDDNRLRERADMPQELNMHHMLQIHEYNANRFRQGVFENVLDLIDAYDYAESDTANYMTDLNDAMLKIEGHLDLDIEEARKMRKSRIILAKTKPDASGRIGNANVDYIYKQYDVAGVEAYKKRIQKDIHKFTNTPDLSDEHFGGVQSGEAMKYKLFGLEQLRSTIERQLTKGFKRRFAIIQSVRNHLNDHVDFTNMRIEFKPNIPQSLAEYADIFIKLGGRVSQETLLSWLPNIENPKEELEKVKQEEQESSSANDYQDAMKEDMNDVELE >NZ_CP048279|985293:995148|991417_992770_+|WP_162681470.1|head|DBSCAN-SWA MSSLNDYWLERAKQFIQSETLEDAAKVAEIERIVAMMFADIYKNLLAYYGKLATAEGIDWREAKKIVDAFDIEMFQMQAKAYVENKDFSEKANEELKRYNTTMYVNREQLLKHELGLIVTKAYAEQEKVVNHHLQDSVTRTLKHQAGILGADVHVKQSDVEAIVYSNFGKLNWSERLWNNQDELRKDVERMASHVMLRGRHPYEFVPEIRKKQKQTVANTKRLLITEAARVQTEAQKMHYLETMGDDAEYEFVAKRDEKTSKICRHYDKKVFKVKDMVPGVNAPPMHPHCRSTTVPHVGNWRDKFFKDRQGKYRLRGDEETKQLLAKKEMTDALDSGKIKVELNVDKQNRHQLGHQLYEAYKKKNLQKGLPIPSYTILDNDELNALIIQKAGKGYLLVDKKGKWLNKEVIDFDKTVGKVYTDGRFIETKWGKVHYSKTGSHVVPKKEENK >NZ_CP048279|985293:995148|989584_990028_+|WP_162681469.1|DBSCAN-SWA MNKLSHQFTDKQYAIYRDVMKKDWFLCILYGAKRTGKTIFNNYMFLEEVLNVRERATRLGIRNPQYILAGYTLAHYFKNDKLRILYDACPRFASEIYNYAWDTKKDLPMKEYDDVMDAMRYALLTFVETFEQRSVEDEIDLIQQLGI >NZ_CP048279|985293:995148|987672_988092_+|WP_162681465.1|DBSCAN-SWA MSLRKSTVNYLESELHNYPYIDKDINRVREEVLHPWSPGDENIGGGRSGENLCVTEIKATRVVNDRRLAQLTRLKVSIEVVYNMTTDEGCKLMDLYYFAKPRKLNLTGVADTLHISKTVAYDLRKGILSMLADELGIIH >NZ_CP048279|985293:995148|993141_993720_+|WP_162681472.1|DBSCAN-SWA MKEQWLKLSLQFFNDAGTEEATSDENTETEAAEATQEAEELSEAQLKLVNDRVNEEMQRRTKEMRQQIQDELAEKQKEADKLRKMNAEQKHQYELEKAEKERDEYKQQLESYKMRQEAMAMFSEAGMQAPESLLNMVVQDTAEATKEAVDSFVSMVNQEVQRQLESKATQSRVVGNHVEAPKTDEAWKTFLN >NZ_CP048279|985293:995148|986267_986504_-|WP_162681462.1|DBSCAN-SWA MLDLKLVSKDEKSVTYDYYPNNQKVSGRITIGIDNLKVLSVEKTEYDKDISLYIGHAIYEIRANIKNNESPEALFIGW >NZ_CP048279|985293:995148|985862_986114_-|WP_162680744.1|DBSCAN-SWA MASHVMLRGRHPYEFVPEIRKKQQQTVANTKRLLITEAARVQTEAQKMHYLETMGDDAEYEFVAKRDEKTSKISRHYDKKFLK >NZ_CP048279|985293:995148|994739_994928_+|WP_162680745.1|DBSCAN-SWA MRNEIIKLLDSNISAYKISKDTGVNEATIKQLRLGKSKLDRLGLLNAEKLYNYQKQLEKDNG >NZ_CP048279|985293:995148|989112_989592_+|WP_162681468.1|terminase|DBSCAN-SWA MKLTEKQQMFVDEYIIDLNATQAAIRAGYSEKCARQVGNANMSKVYMQQAIQARLAEKKDNLVMKQDEILERLTRLGRREEPDYQVVIVETPVFDNNNRVLGVEKKPQIVEVPTQNKDVIKALELLGKRYMMWNGKQSETQESKLETLIKQNRQVIDDE >NZ_CP048279|985293:995148|988418_988604_+|WP_162681466.1|DBSCAN-SWA MSLSKEVIKKIEQGGWYLVRVVGSHHHFKHPTRKGKVTVPHPKKDLPRGTECSILKQAGLL >NZ_CP048279|985293:995148|985293_985857_-|WP_162682994.1|DBSCAN-SWA MVPGVNAPPMHPHCRSTTVPHVGNWRDKFFKDRQGKYRLRDEDGLKRESGALNNINDPYMERRTAHAERYYKSVLYRNKNSEIKIVAKNTGFRESTIKRVYEHMFENKYELASGYSNFYPDFYMANSWMRLREGKHIKKIDILMLRHEALEHYLMNKYNYNYDKAHDIVEKKYNYNEAIKELENNNS >NZ_CP048279|985293:995148|995031_995148_+|WP_162681473.1|DBSCAN-SWA MTGQMYLSLLILSLPLLLFIARKTHLYYLDKKNVKRND >NZ_CP048279|985293:995148|987496_987673_+|WP_162681464.1|DBSCAN-SWA MLNKMLKILFYIAMYELGKYMTEQILIKCISNNDVEALKDFTQNDHIHLNNFKAEVSD >NZ_CP048279|985293:995148|987086_987398_-|WP_162681463.1|DBSCAN-SWA MNMSSNKILSSLCYFSVFFAPFIFPIAIWILSSGETSNNAKRALLYHFLPIVFLGLSTIIFGIYNNNNYSDMMFILGIIFVIAAAFYVIKNLYLGIKVLIAEK |
17 | Staphylococcus_phage(53.33%) | portal,head,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1201767 : 1274665
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP048279|1201767:1274665|DBSCAN-SWA 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85 | Staphylococcus_phage(72.06%) | portal,transposase,integrase,tail,head,terminase,capsid,holin,protease | attL 1204192:1204209|attR 1245713:1245730 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1291686 : 1315405
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP048279|1291686:1315405|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP048279|1291686:1315405|1305609_1306041_-|WP_162681718.1|DBSCAN-SWA MTVTQPQYENILYIKSSESLEHQLVIQHLTHEQQSQMSMKQFIDQLAYRFQRDVRTQQKIASETLKVHQMIPIFLSKSLILCPLQSQRAAIQYYINVTQVIAASSHQQDTRIHFNNNLSLIVPMPLNQFVRKWKDGYLLTALM >NZ_CP048279|1291686:1315405|1306043_1306532_-|WP_162683020.1|DBSCAN-SWA MVFDTLYAQYYKFIHFLLHQHQISYNYDEYFQLLLIRLWELSMTYDATFNQSFKTYINYQLKYYLIDLLRSAHTQFTTIPLDMSANELKAMSSSHLYWLLDDVVQTLKPTHRTWFRFYLQGYQQKEIQQLMQVSATTIRKYKIATFRHIKQALTQDDLKKGF >NZ_CP048279|1291686:1315405|1303073_1303421_-|WP_162681714.1|DBSCAN-SWA MNMLLVALGGGIGAVLRAFISATTSRYMNTSFPIATLIVNLMGSFCIGYFNHLTLLSPELKLLMITGLLGGFTTFSTLTLELLYMLNTKMWGRLILYSTLQFVGCFVLCFIGMQL >NZ_CP048279|1291686:1315405|1303417_1303783_-|WP_162683019.1|DBSCAN-SWA MKYILIFLGGCIGALLRWQTSFITIGYHLPIGTFIANLVGAFLMGYFTERLHHWNTNHPKLKQGLTTGFLGALTTFSTFQLELVTLAQQLDWLTLIIYGLFSYSGGLICCFLGYKLGGVHA >NZ_CP048279|1291686:1315405|1297710_1299303_-|WP_162681710.1|DBSCAN-SWA 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25 | Staphylococcus_phage(95.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1319682 : 1327410
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP048279|1319682:1327410|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP048279|1319682:1327410|1320242_1321196_-|WP_162681731.1|DBSCAN-SWA MGTYFPYAFEKKRYHTLNYHLKNKFGQKIFKVALDGGFDCPNRDGTVAHGGCTFCSAAGSGDFAGNRADAIEVQFKEIKNKMHEKWHEGQYIAYFQAFTNTHAPVAVLREKFEAALKEPGVVGLSIGTRPDCLPDDVVDYLAELNKRTYLWVELGLQTIHQETSDLINRAHDMDCYYEGVAKLRRHNINVCSHIINGLPGEDYDMMMETAKAVAQMDVQGIKIHLLHLLKGTPMMKQYDKGLLEFMTKEQYIQLVCDQLEQLPPEMIVHRITGDGPIDLMVGPMWSVNKWEVLNDIDAELERRGTVQGESYSSQVRI >NZ_CP048279|1319682:1327410|1322835_1325247_+|WP_162681733.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSYNHQEVEKKWQTYWLENKTFKTEDNIGQKKFYALDMFPYPSGAGLHVGHPEGYTATDILSRYKRMQGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALDTGNDPSAFTKRNIQTFKRQIQELGFSYDWDREVSTTDPEYYKWTQWIFIQLYKKGLAYIDEIPVNWCEALGTVLSNEEVVDGVSERGGYPVVRRPMKQWVLKITEYADRLLEDLDTLDWPESIKDMQRNWIGRSEGAKVNFKVENIDTPIEVFTTRPDTIYGATFLVLSPEHALVNRITTPQQYEKVKHYQDEAAKKSDLERTDLAKEKTGVFTGAYAIHPFTGEQVPIWIADYVLASYGTGAVMAVPAHDERDYEFATTFDLPVVTVIENDAETPYYTGDGPHVQSGELDGLNNEAAIAKAIALLEAKGLGEKKVNYKLRDWLFSRQRYWGEPIPIIHWENGSMTTVPENELPLLLPKTDEIKPSGTGESPLANIDDFVNVVDPETGMKGRRETNTMPQWAGSCWYYLRYIDPNNDQMLADPEKLKHWLPVDLYIGGVEHAVLHLLYARFWHKVLYDLGVVPTSEPFQKLFNQGMILGEGNEKMSKSKGNVVNPDDIVRSHGADTLRLYEMFMGPLEASIAWSENGLDGSRRFLDRIWRLFLTEAGQLTAKVIEDDTPALQTVYHQTVKKVTEDFESLSFNTAISQLMVFINECYKVEHISKAYAEGFVKMLAPIAPHIGEEIWSILGHDTTITYQPWPSFDPSLLEEDVVEIVVQVNGKVRAKIEIPKDMSKEDMEATALANDNIKAAIEGKEIKKVIAVPQKLVNIVAK >NZ_CP048279|1319682:1327410|1321342_1322524_+|WP_162681732.1|DBSCAN-SWA MNMPREIWWLVIGMAINITGASFLWPLNTIYMNEELGKSLSTAGLVLMVNSFGMIVGNLLGGTLFDKLGGYRTIMLGTIVSLCATILLNFFHGWPWYAIWLIMLGFGGGMIIPAIYAMAGAVWPQGGRQTFNAIYLAQNIGVALGAALGGFVAELSFNYIFMANLAMYVIFFFIALFQFKIDYQATVKHQETLENVAHIQNKKHFTALILLCVMFALCWIAYVQWQTTIASFTQSIGISMSQYSLLWTVNGVLILVGQPLILPIIHLIKGQLKKQLYFGLVVFILSFFVTSFATSFSIFVVGMVIMTFAEMFVWPAVPTIANNLAPKGRKGVYQGIVNSASTVGKAFGPLVGGILVDVFNMQIMFLSMIGLLLIAMVFLSIYDRKVDQKTLYR >NZ_CP048279|1319682:1327410|1326153_1327410_-|WP_162681735.1|DBSCAN-SWA MYQTIVIGGGPSGLMAAISSSQNGQSVLLLEKKKGLGRKLKISGGGRCNVTNNLPYAEIIKHIPGNGKFLYSPFSIFDNQSIIEFFESRGVALKEEDHGRMFPVSNQSQDVLDALICELKQNDVTVKEEQTVVDVKKVDADHFQVQLQNGDTYEAKTVIIATGGTSVPQTGSTGDGYRFAQSLGHYITELFPTEVPIKSNAPFIKNQSLKGLSLKNVGLSVLKKNGKKRITHQMDMLFTHFGISGPAALRCSQFIYQEQKSQKQQNIQMQIDAFPEINEEELKQKITKQLKSQPDKHIKNALKGLIEERYLTLMIESTNIPFETTYHHISAQQLSTLAHQFKAFTFEVYGTLPLEKAFVTGGGVSIKEIVPTTMESKITPGLYLCGEVLDIHGYTGGYNITSALVTGFVAGYFAGLAE >NZ_CP048279|1319682:1327410|1319682_1320246_-|WP_162681730.1|DBSCAN-SWA MIVERILPFAKTLIRSHTTPESVVIDATCGNGHDTQFLADLVPNGHVYGCDIQQEAIENTKQRVQDYNNVSLFLTGHEWITQYIRDEHLTQVHAAIFNLGYLPKGDKSIVTQSATTLAAVQTIFAVLQPEGIIVLVVYPGHEEGAEESETLLKQLAAFDQQRAHVLKYEFINQQNRPPYVIALEKRA >NZ_CP048279|1319682:1327410|1325273_1325585_+|WP_162681734.1|DBSCAN-SWA MKEMTTDELKEIVLSSEPVNIIDVREDEEVAMGMIPNAEHIPMNDIPDHVDDFKKDTTYYIVCAGGVRSAKVVEFLNDHGIDAVNVEGGMRAWGNEGLEFKRI |
6 | Staphylococcus_phage(100.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1448713 : 1458056
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP048279|1448713:1458056|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP048279|1448713:1458056|1452670_1454956_+|WP_162681832.1|DBSCAN-SWA MIKSKFQWQTDTNHQSMDDALVDQYKLTPLMRYILESKGYTESAQLAQILATSKENMYDPSLMSDMDKAVERIHTAIQNQEKILVYGDYDADGVTSTTIMVKTLQQLGAIVGWYIPNRFTEGYGPSEPAFKNAYDEGVSLIITVDNGIQGHAEIEMVQNLGVDVIVTDHHEIGDTLPVAYAIVHPMHPDYDYPFYSLCGAGVALKLAQSLLGDVPNVFWIYAMIGTIADLVSLTDENRFIVKHGLKLLNESPPASIAAILIQAQFNDTVTEETIGFIVGPRLNAVGRLDDATLAAELLMTDDEDEALFLAEQVEHFNVERKDIVQKIVDEAMVMAEDAVQAGEHFLVLAKENWHEGVLGIVASRIVETFHLPTMVLNIDHAQQHAKGSSRSITQVSMFEALTSQQTLISKFGGHHMAAGLTLPIDQISALREGLNTWMSTHIDTTAIQPIQKVDVTVDVGHITVEQIQSIERLRPFGTDFKRPIIQVNGLTVLQSKGIGQQQAHLKMTFIEQNLQALFWNQGALSSELMPYQHVDVTGELQINEWNGNRTAQMVLTDMKSNERQILDYRSKNKRLPVFDDDQHVCYLIHPNQDKASPHEYYYGENVPQQYDKCVMRDLPLTIEDIKLSCHYLNTSQVYLVFQHERSIYFEGLPQHADFKNCYKALYQKGQTDLQKDGVALSQFINVKPMMLKFILKVFLELGIISQKNGIIEIVHSTDKQHITSSRVYQARVQRIEVEKQLLYEEFGAIKSWIENELARNE >NZ_CP048279|1448713:1458056|1455866_1458056_+|WP_162681833.1|DBSCAN-SWA MNNEYPYSVDEVLHKAKQYLDKEQYEYVLKSYHIAYKAHEGQFRKNGLPYIMHPIQVAGILTEMHLDGPTIVAGFLHDVIEDTPYTFDDVAEMFNVEIATIVDGVTKLKKVKYRSKEEQQAENHRKLFIAIAKDVRVILVKLADRLHNMRTLRAMPREKQIRISKETLEIYAPLAHRLGINTIKWELEDIALRYIDNVQYFRIVNLMKKKRSEREAYIENAIENIRKEMDIMDIDGDINGRPKHIYSIYRKMMKQKKQFDQIFDLLAVRVIVHSIKDCYAVLGLVHTLWKPMPGRFKDYIAMPKQNMYQSLHTTVVGPNGDPLEIQIRTFEMHEIAEHGVAAHWAYKEGKQVDKDNENYNKKLNWLKDIAETDHTSSDAQEFIESMKFDLQSDKVYAFTPASDVIELPYGAVPIDFAYAIHSEVGNKMIGAKVNGKIVPIDYVLQTGDIVEIRTSKHSYGPSRDWLKIVRSSSAKSKIKSFFKKQDRSSNIEKGKFMVEAELKEQGFRPEELLTEKNIRIVNDKYNFANEDDLYASVGFGGVTALQIVNKLSERLRIEHKQKALNQAQEVTKAAPIKDSITTDSGVYVAGLDNVLIKLSKCCNPIPGDRIVGYITKGHGIKVHRTDCPNIKNENERLIDVEWVKSKDASQKYQVDLEVTAYDRNGLLNEVLQAVNSTSSQLIKVAGKSDVDRNAVIHLSIMVKNVHEVYKVADKIKQLGDIYTVTRVWK >NZ_CP048279|1448713:1458056|1448713_1449853_+|WP_162681829.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELKQMNTKILLGNTYHLWLQPGNDIVKKAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEDSIKIQNDLGSDIIMAFDECPPMPAGYDYVKNSLERTTRWAERCLVAHQRPDDQALFGIIQGGEYKDLRQQSAEELVKLDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYEMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSTGRLVVKNAQFKDDFRPLDENCDCYTCQNYTRAYLRHLIKADETFGIRLTTYHNLHFLLKLMENIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVDNPKNF >NZ_CP048279|1448713:1458056|1450274_1452554_+|WP_162681831.1|DBSCAN-SWA MKKVSRLIAFILLVVLLFAGMGATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVNPLEDGDKIDNTAVQSTAKTLERRVNVLGVSEPKIQVEDQNRIRVQLAGVQDQNQARKILSSQANLTIRDADDKVLLTGKDLVQGSAKQEFKQNTNQPAVTFKLKDSDKFKKVTEEISKKQENVMVVWLDFEKGDSYEKEKTKEDPKFISAASVNQPINSTNVEISGGFQGEKGISEAKQIADLLNSGSLPVELKEIYSTSVGAQFGQDALDKTIHASMIGIGIIFLFMLLFYRLPGIVAVITLTTYVYLTMVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDEIRIGRTLKQAYKKANKSSFITIFDANLTTVLAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLAILMSFVTAVFLTRILLSLIVHSNVFKKKLWWFGVKQSQIHDINKGYDVHELSTPYDKADFVKWAKPLFALSGVVILAGVIILAIFKLNLGIDFTSGTRVDIQSNQKLTQAQVEKTMESIDLKPNQLSIGGSNNENASMQFKRDLNKDEVAKVTDTLKSQYGKEPSVNTVSPVIGQELAKNAMLAVLIASIGMIIYISLRFEWRMGIASIISLLHDAFMIIAVFSLFRLEVDITFIAAVLTIIGYSINDTIVTFDRVREMLSKIKVITKEEQIDYIVNSSIRQTLTRSINTVLTVVIVVIALLVLGASSIFNFSLALLIGLLSGVYSSIIIAVPLWGMLKKRELRKSPHHKLVVYKRKRTNEEKVLV >NZ_CP048279|1448713:1458056|1449869_1450133_+|WP_162681830.1|DBSCAN-SWA MSSLISLLPLVLLFVVMWFFMIRPQQKRAKAHRQMVEQLQAGQRVTTIGGIKGTVRAVDETSAVITVNGKGTELTFEKQAIKQVDPS >NZ_CP048279|1448713:1458056|1454967_1455486_+|WP_096545126.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVKDWPKAGVNFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVKFAKEKNVDIVVGPEARGFIIGCPVAYAMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGSNVLTMHADAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAINLVEKQGGIVAGIAFIIELAYLNGMEKIKDYDVMCLIKYDE |
6 | uncultured_Mediterranean_phage(66.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1600643 : 1609069
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP048279|1600643:1609069|DBSCAN-SWA TATGTACGAAGTAAAACTGGATGCTTTTAACGGGCCTTTAGACTTGTTATTGCATCTCATCAATGAATTTGAAATTGATATTTATGACATCCCTATGCGCGAATTAACCGAACAATATATGCAGTATGTTCACGCTATGAAAAAATTAGAGATCAATATTGCAAGTGAGTATTTATTGATGGCTTCAGAATTACTGATGATTAAGAGTAAAATGTTGTTGCCCGATACGTCATCTGATTTAGTTGAAGAAGAAGACCCACGTGAGGCACTCGTTGAAAAGTTAATCGAATATCAAAATTACAAAGCTTATTCAGAAATGTTAGAAGAGAAGCGTCAAGCACGTGAACATTATTTCACTAAACCACCGACAGATTTTTCGCATTATGAATATTCTGAGCGACTTTCCGAAGATACGACTATCGATTTAACAAAACTGATCGTCGCTTATCAAAAAATGAAAACGCGTGTATCATTGAAAAAGCCGACCACTGTGGATATTCGAAAAGAAACGTATACGATCCAACAATCAACAACATACATTTATGATAAATTAAAGAAAGTTTCTCAAATTACATTTTTTGATCTATTTACATTTAATGAATCTATCGAACACGTCGTCACACATTTTCTGGCTTTACTCGAAATGTCAAAAACAGGCATGATACAATTACAACAAGTGAAAGCTTTCCACAACTTTGAAATTAGAAAAGGAGTTAATTATGACGCTTAAAGTTACTGAAGCGCTAACTGCGATACTGTATACAGTTGGTGAAGATGGCATTGATGAAGCACAACTGATGGCATCACTCGACGTGGATTACGAGACGTTAACCCATGCTATCGATATACTTGAGTTACCTGGGCTCATGGTACAAAAATTCGGTCAAACTTATGTTTTAACGACCCAAAAAGAGGCAGAACCGTATATCGAATCACTCATTATTAATAAAGCATCTGCCAAATTATCACAAGCTGCAATGGAAGTATTAGCCATTATTGCCTATAATCAGCCCATGACACGTAATGATATCGAATTGATTCGCGGTATTCAATCTGACGGTCCAGTTAAAACATTGATTGCTAAAGGATTAATTGAACCCAAAACCAATCCCGAGGCACGTGGACAACAGCTCTTTACAACAGATTTATTTTTAAATGTCTTTGGTCTGGAGAGTCTTGAGGCACTTCCAACAACAGATGAAGAAGAAGAGGAAATTGAATCGTTTTTCAGCCAACTGGTGAATCAGAAAGGAGATTCTTAAATGAGTCAAGAATTAGAAAGATTACAAAAACGTATTGCGAACAGTGGTTATACCTCTCGACGTAAAGCAGAAACATTAATTGTAGAAGGTAAAGTACAAGTCAACGGTAAAACAATCACTGAATTAGGGACAAAAGTACGTCCATCTGATGAAGTCACAGTAGAAAGGATACCGCTTGAGCAAGAAGACAAACTTTATATCCTGTTCTATAAACCTGCGCAAGTGATTACAAGCGTTTCAGATGATCGTGGTCGAAAAGTTGTTACTGATTATTTTGATGATTTAGAAACACGTATTTATCCAGTGGGGCGTCTAGACTACGATACATCTGGACTACTGTTATTAACAAATGATGGTGAGTTCACAAACTTAATGACACATCCACGCTATAAAATCCCAAAAACGTATGTTGCTAAAATAGAAGGATATATTTTACGTGAACAAGTGAAACAACTTGAAAAAGGAATTCAACTTGAAGATGGGCTGACTCAACCTGCAAAAGTAAAAGTGAAAAAGCAAAATAAAGAAAAAAATACATCACTTGTTGAAATTACCATTACTGAAGGTCGAAACCGTCAAGTGCGTCGTATGTTTGAACATTTTGGTTTTAGCGTACAAAAGTTATCACGCGTTTCATTTGGTCCGCTCTCTTTGAAAGGGCTAGGCGCTGGAGAAGGACGTGTATTATCACCGCATGAAGTGAAATCATTGCGTCACCTTGCGGAAAACGGTCAACAACAACGCTAACTATTATCCAAGTCAGCACGCACGTCATTGTTTTATTATTACCCGAATATATCATTATGGTATAATATGCTTTGAGTTAGAAATGTCACCATGTGTGGGAGGTATGTCATGATGACTAATGAAATCTTAGTCGTAGATGATGAACATCGAATTAGAAAATTATTAAAATTATATTTGGAAAGAGAAGGTTATGTCATTGCGGAGGCAAGTGATGGGCGCGAAGCTTTAGACATGGCGACAAAATATGATTATTCATGTATTTTGTTAGATTTAATGTTGCCTGAAATGGATGGTCTTGAAGTTGCTGTTAAATTACGTGAACTTAAAGATACGCCTATTATTATGCTCACTGCAAAAGGCGAAGAAAATAATCGCGTTGAAGGTTTTGAATCAGGTGCCGATGATTATATCGTTAAGCCATTTTCACCACGCGAAGTTGTGTTGCGTGTTAAAGCCTTATTACGTCGTACAGAATCTTCAAAAGCTGAACAAAACGAGCCACATGCCCGTGATATGATTGAATTTAAACATTTAACGATTGATAATGATGCACATAAGGTATTGGCAGATGGGACCCCGGTTAACCTCACGCCAAAAGAATATGAATTACTCATTTTCTTAGCTAAAACACCGAACAAAGTATTTGATAGAGAACAATTATTAAAAGAAGTTTGGCATTACGAATTTTACGGTGATTTACGTACTGTAGATACACATGTCAAACGTTTGCGTGAAAAATTAAATCGTGTTTCTGCAGATGCAGCAAAAATGATACAAACCGTTTGGGGTGTAGGATATAAATTCGAAGTTAGCAAGTCGGATGAAACGACTTAATAACGTTGTCGTAAAACTGTGGTTAACTATTATTTTAATAGTAACGACAGTTTTAATTTTATTAAGTGCTGCATTAATCACATTTTTTCAATATTATTTCACGCAAGAAACTGAACGCGCGCTCTATCAAAGTGCTGAAAACGTGAACCAAGTGTTACTCAAAAACGATAATCGAAAACTAGCTATTGAACATAGTGAAGCTTTGTTAGAGGATAATAAAGGGCTTATCATTTTACCGGACCGTGCTAATATCAATGAAAAAGATACTGTTAAAAAGAAAATGCTCAAAGAAATCAGTCAACATCCAAATTTTGACCGTGTACTGAAAGATAATCAATCCGAACTACAACACGTCACTTTTAAAATTGATGGTAAAACGCATACTTATGTGTTACTCGGTTATCCCTCTAAAGACGACAATGGCCAATCTTCAGCAATTTTTATTTATCAAGATTTAAAAAGTATTGATGATACGAATAACATCATTACGATTATGATTTTAATTACAGCTGTGATTTTCTTAGCTATTACAACGGTTTTCGCATTTTTCTTATCAACGCGTATTACGAATCCACTGCGTCAACTTAAAACGCAAGCGAAAGAAGTTGCTCGAGGAAACTATGATAAGCCTGTGCCGATTCAAACGAGAGATGAAATTGGCGAGCTTGCCATGACTTTTAACAAAATGAGCCGTAGCATTCAAACACATATCGACGCATTAACGACATCTAAAAACATTCGTGATACCCTTATTAATTCAATGGTTGAAGGGGTATTAGGTATCAATCACAAGAAACAAATTATTATTTCAAATGCCTTAGCTGAAAGAATGTTATCAGAATTAAACGAATCCGATCGCGAAATGTTTAATCAACAAATTGAAGATACATTTGAGAGCCAAAAAACAGAATATAGAGAATATGAAATGAATCAGCGTTTTTATGTGATTATTATGAGTCATATTAAAAAAATTCAAGCTAATGGTGAAGGTGGCCTTGTTGCTGTCGTGCGTGATATGACAAACGAACATGAGCTTGAACAAGTGAAAAAAGACTTTATCGCAAGTGTTTCTCATGAATTGCGCACACCGATTTCATTGTTACAAGGTTACACCGAGTCAATCGTGGATGGTGTCGTCACTGAACCCGAAGAAATCAATGAATTTTTAACGGTTGTATTAGATGAGTCAAAACGATTAAGTCGCTTAGTCAATGAATTGTTGAATGTCGCGAAAATGGATGCTGAAGGTTTGAATGTCACACGAGAAGTTCAACCGATGCAAGATTTAGTTAAAAAAATGGCGATGAAATATCGTCAACAAGCGCAAGAACTAGATCTAACATTAGATTTTCAAATGGATGGCGAGATAGCTTCACTTTGGTATTATGATTTTGATCGCATGGAACAAGTGTTGACGAACCTTGTCGATAATGCATCGCGTTATACACAACCTGGCGATACGATATCAATCAAAGCAACGGCTGATAATGACAACCAAATTTTAACTGTTGAAGATACGGGCGTTGGTATCGCACCTCAACATTTAGAGAAACTTTTCGAGCGCTTTTATAAAGTGGACTCTGCGCGTAAACGTGGCTCACAAGGAACAGGCCTCGGATTGTTTATCACACGCATGATTGTAAATGCGCACGGTGGTCATATTCGCGTAGAAAGTGAACTCGAAAAGGGAACGAAATTTATCATTTCTCTGCCCAAAAAATCGCATGTAGAAGAAGAAAACTAATAAACATATAACATTTCATCATGGAACGACGATATCTTATTTTAAAGTCGAGATGTCGCCGTTCCTTTTTTATATCTAGATGATTGTTAAGTTGTTGCAAATAGATTGTATTCAAAAGTTATCTCATGTAAACTAATAACGAAAATAATAAAAAATTAATTCATCTTCGGGGTAGGGTGTAATTCCCAACCGGCAGTAAAATAAGCCTGCGACCTGCAAATGATGTTGAGCATCTTTGTGGCTGATCTAGTGAGATTCTAGAGCCGACAGTTAAAGTCTGGATGGGAGAAGATGGAGGTTTATTTGTGTTGCTTTTTATTCCTCCTATTCGTGAAAGATGAATTTAATAGGAGGTTTTTTTATGAAGCAAAAGCAAACGAAACGAATGATAACGGTAGGGATGTTAAGTGCGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP048279|1600643:1609069|1603471_1605229_+|WP_162681964.1|DBSCAN-SWA MKRLNNVVVKLWLTIILIVTTVLILLSAALITFFQYYFTQETERALYQSAENVNQVLLKNDNRKLAIEHSEALLEDNKGLIILPDRANINEKDTVKKKMLKEISQHPNFDRVLKDNQSELQHVTFKIDGKTHTYVLLGYPSKDDNGQSSAIFIYQDLKSIDDTNNIITIMILITAVIFLAITTVFAFFLSTRITNPLRQLKTQAKEVARGNYDKPVPIQTRDEIGELAMTFNKMSRSIQTHIDALTTSKNIRDTLINSMVEGVLGINHKKQIIISNALAERMLSELNESDREMFNQQIEDTFESQKTEYREYEMNQRFYVIIMSHIKKIQANGEGGLVAVVRDMTNEHELEQVKKDFIASVSHELRTPISLLQGYTESIVDGVVTEPEEINEFLTVVLDESKRLSRLVNELLNVAKMDAEGLNVTREVQPMQDLVKKMAMKYRQQAQELDLTLDFQMDGEIASLWYYDFDRMEQVLTNLVDNASRYTQPGDTISIKATADNDNQILTVEDTGVGIAPQHLEKLFERFYKVDSARKRGSQGTGLGLFITRMIVNAHGGHIRVESELEKGTKFIISLPKKSHVEEEN >NZ_CP048279|1600643:1609069|1606401_1606650_-|WP_014613875.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAYVILDDNQGTTPVPEELYEDLEDAFEGCPTDSIKVEEESFDGDALKFE >NZ_CP048279|1600643:1609069|1607692_1609069_+|WP_162681967.1|DBSCAN-SWA MLKEALKQYFGFTTFRPGQESIISSVLEGQHTLGILPTGSGKSLCYQLPTYMKQQPTLVISPLISLMDDQVMQMKMQGEHRVVAIHSGMEQAAKKRALQQLTQARFIFVSPEFILQPHHFNLFKNIRFGMIVLDEVHCLSEWGFDFRPHYALIGKVTSYFNEATVLALTATATRHLKDDIQRVIQKPIHVIEHSMDRPNVALSVKFMSSYEEKVDWLIDTIATSGPTIIYVSSKKVSLYLATSIYEAGYLTGIYHGDLSYQERHTVQQQFLNNDIRIIVATSAFGMGVNKPDIRTIIHFHVSPTPSSYLQEIGRAGRDGLPSQAIAFFQPDDQYLMETLALVNIMYASDVDQYEVGQMIDSEKLAILDVLTQAFSLQQLKQIFTQNENMKRQGYRHMYHYILTKQCRRQHLLNYFGMTKETTDACCDQCNTLSPIYEKNKKKVKRKLTYIEKLENLFH >NZ_CP048279|1600643:1609069|1605590_1606136_+|WP_162681965.1|DBSCAN-SWA MKQKQTKRMITVGMLSAIAIVLTFIKFPLPFLPPYLTIDVSDVPALLATFTLGPVAGLLVELIKNLLNFFFNLSDPVGPVANFLAGASLLLVSYGIYRKNQSTKHLILGLITGTIVMTVVLAIMNYFVLLPLYGMIMNLSDVANNLKLIIAAGIIPFNIIKGALISIIFVLLYQRIGHILK >NZ_CP048279|1600643:1609069|1601361_1601904_+|WP_162681962.1|DBSCAN-SWA MTLKVTEALTAILYTVGEDGIDEAQLMASLDVDYETLTHAIDILELPGLMVQKFGQTYVLTTQKEAEPYIESLIINKASAKLSQAAMEVLAIIAYNQPMTRNDIELIRGIQSDGPVKTLIAKGLIEPKTNPEARGQQLFTTDLFLNVFGLESLEALPTTDEEEEEIESFFSQLVNQKGDS >NZ_CP048279|1600643:1609069|1600643_1601372_+|WP_162681961.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFNGPLDLLLHLINEFEIDIYDIPMRELTEQYMQYVHAMKKLEINIASEYLLMASELLMIKSKMLLPDTSSDLVEEEDPREALVEKLIEYQNYKAYSEMLEEKRQAREHYFTKPPTDFSHYEYSERLSEDTTIDLTKLIVAYQKMKTRVSLKKPTTVDIRKETYTIQQSTTYIYDKLKKVSQITFFDLFTFNESIEHVVTHFLALLEMSKTGMIQLQQVKAFHNFEIRKGVNYDA >NZ_CP048279|1600643:1609069|1601904_1602651_+|WP_162681963.1|DBSCAN-SWA MSQELERLQKRIANSGYTSRRKAETLIVEGKVQVNGKTITELGTKVRPSDEVTVERIPLEQEDKLYILFYKPAQVITSVSDDRGRKVVTDYFDDLETRIYPVGRLDYDTSGLLLLTNDGEFTNLMTHPRYKIPKTYVAKIEGYILREQVKQLEKGIQLEDGLTQPAKVKVKKQNKEKNTSLVEITITEGRNRQVRRMFEHFGFSVQKLSRVSFGPLSLKGLGAGEGRVLSPHEVKSLRHLAENGQQQR >NZ_CP048279|1600643:1609069|1602762_1603485_+|WP_026066968.1|DBSCAN-SWA MTNEILVVDDEHRIRKLLKLYLEREGYVIAEASDGREALDMATKYDYSCILLDLMLPEMDGLEVAVKLRELKDTPIIMLTAKGEENNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTESSKAEQNEPHARDMIEFKHLTIDNDAHKVLADGTPVNLTPKEYELLIFLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSADAAKMIQTVWGVGYKFEVSKSDETT >NZ_CP048279|1600643:1609069|1606752_1607700_+|WP_162681966.1|DBSCAN-SWA MKQLILYLYHHASAYKTKKSIFNIIIGKKTHQTFFDAVSLNILSLYGCAPKLKYEQFEQIISHEPHHHTTIQTSNRMTYSTLDATFKALQLLVQTVSHIQHNQRTFLPITSQVEIHEAVRFIYYEIEQQQLQDAFEEEATTLFKMLSEKHDTLYTHYLLTGYDEPMYTFAQISMIESIDMNDLYTAYYEQLLSIYLFIQNTDTFPILSQCMMTIEISDRVMQTLQLLQKGYSIVQIAQIEQVRETTIEDHILDLFMKHLLTNYDDFFTHPYNQFLKFYQVQPYQRLKLYKEQFESLSYFELKLAIIGSAKGELHA |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2509777 : 2572138
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP048279|2509777:2572138|DBSCAN-SWA 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60 | Bodo_saltans_virus(25.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2580461 : 2621225
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP048279|2580461:2621225|DBSCAN-SWA ATTACTTAACCTCTATTTTTCCCCACAGTGCTTTTTCTTTCAATAATTTTCCTTCTTTATCAGTAATTTTTCCAATCGGCATATAAAAATTATCCTTCTTATTAGCCCCATCCGCTTGATACTTAAAGCGAATCCACCACATCTTGTTTTTAACATCTTTAATCACTTGATCAAATACTACATATTCACCTGGATAAATCCATGAACCACTGTCCACTTCTTCCGCATCCATTCCAAATGCGCGACGTACGACAATCGCATCGTCGTTATCTTCATAAGCAGTGAAAATACCATGCCATGCCCACACCGTTTTAGGTGGTTTACCTTGCTTCGGCTTGCTCACCGTTTTTGCTACTTTCGGCGCTGGTGCATCTCCATTCATATACTTAACGACCAAATCATCAATAATATGCATGTCGTGTCTGCCATAACCCGCTGCTTCCAAAATATTGCCTGGATCTTGCTTATCGTACTGAATATCTTGATGGCCTGGCATTTCATTACGTGGGTTAATATCCCAAGAATTACACAACGCACCCATAATACGACACGCATTGTCTAATGACTTACGTGTTCTATTCCTATCAGAAAAGTAACAAGCTTCTAACCCAAAAGCGATATCATTCGCATCATCACCGTACCAATTATTGTCGATAGGCGTATCATACAATACATGCCATGCCTTTTCAGTCACTGGAATACAGATAATACACTCTTTATCGTCCACAAACACATGCGCTGATGCAGTATAAGCCCAATCGATATTATACGTATTTCGATAATAATCGACATTATTTTGAGCGGTGCTATCCCTATTTCCTGTATCGTGAAACACCGCAAATTTAGGATTCCCACTTACGAGCCTTTGACCGCTTCGACGTGTCCCAATTGGCAAAAAATCCGTATATACGGGTACACCGTTCCATGTACCGATTTTTTCTTTAACCATTTTGTAACCTCCTTCTTATCATTTTTTAGTTGTATCCGACATTTCTTCTTTTAACTCATGCATAATTGACTTATGCTCATCATTCCCAATTATTGCTAACTTCTCAGCAATCTGTTTAGGAATTAAAACACCCATCTCAGCACAATTCTCTACAATCGACAGTCCTTCATTGGCAATGTAAAAGAATAACGTCACCATCACAATACCGCCGTTCGTACCAATAATTTGATCAATCATATTAGCTAAAATAACAATACAGAAAATCAATAGCTTCCTAGCATAACCAAAAAACGAAGCATGACTCCATAAATTCTTATTTTTTAGCGCCTTCGCAACGCCAGTTAAAATATCTAACCCCATCAATATCATCAAAAAATATAAAATTTTTAATTCCCCCGCAAAAACAAACGTTTTAAAAACCTCAGACTCTGTAAAGCTTATCATCATATGAATCACCTCTAGTTGTTTCTATACGTAATTTTGATTGGAACATTTTTGAATTCTTGTGCAATGTCTGGCTCTTCCTCTCCTATACTCACTAAATGGCGAATAAAACGTTCAACTTCATCGGTAGACCTTCCATTTACACCAGACCAATATACTGTATTTTCTACATATTCCGGATTTGATAAAACTTCGTTACCAAATTCAACTTTTTCTACACTTTTACCTTCAAAATTTAACGCTTCAGGATTAACAGCGATTCCAAATAAACCGCCTAGATCCCTAAAAATTCGATTTGGTACAACTGTAGCACTATATGTACCGTCACTATTTTCAGTAGGATTAACCGCTACTTCTGTCGGCGCATTATTGCTATTTGACTCCTCATCATTGCTTGTTGCTAGTTCAGAAGTGCCTTCAGCTTCTGTTGTGTTAGAATTCGATTCTGCCACAACGCTATTATCAGCCTCATCAGCATATGTGACTTTAAGTAATTCAGGTAAATATTCAAAACCACGTTCAGTCGTATAACCCGTTTTAGTTAAGCTGTCAGTGAATTGCGTTACATCAGAAATACGGTTATATTCGTCTGTATTATTTGGAATCGTATACCAATATGGCGAATTTTGAAGTGTACCCGAAGCATTCAAAATAGATGCCTTTTGACTTTCTATTTTCAATATTTTCTTGTTTTCTAAACTTATTTCTGATTCATCAAAATTTATAATAAAACTTTGATTTTCTTTCCAAAAAATACCTGTAGGATACAGATGTTTAACGACAGTTCCGTTTCCTAAATCTTCATCAGGTGACAATTCCACTTTATTTTCAAACTTAGGACTTACTGCATATTTTTCTAAAAATGATTGAATGCTATTCGATATGAATTCATGACCTTTTTCATTTGGATGTAGACCATCTTCCTGGCCTTCTTCATATGCAAAAAAGGTCTTATTTACAGCAGGTTCCCATACTCTCAAATTACTTTCATGGTACAGATCCAAAACAGGTAAACCGAACATTTTAGAGATGTTTATAATGACATCTACTAATTGTCCTAATGTATAACCTGCCTCGTTCGCCACTTCTTTCAACGGATAACATTCTATTCTAGGAAGCGGCGTCATTACTACAATTGGTGTATTAGGGAAATGATTCGTTAATTGCAATAAAGTAAAATAAATACTGCCTGCAACAGTTCGATAATTACGTTCTTCAGCAGTACCTAATGGGTTCGTCTTATCACCTACTAGACCATAATCATTAGTACCTAAAAAGACGCAAATAAAGTCTGGTTGTTCTTTAATTTCTAAAGCAACATTTTTACGGTCTTGAAATCCTGTGCCGCTAATCCCCATATTAATGACATTCAAACCTGTTCGTGCAGCAATGAATTCATGATAATTTGTTGTTGTTCTGAAATTCTTCTCAGTGATACTATCACCAACAAAAACACCTGTTTTTCCTTTAAGCACTGATAAATTTTTAGGTTCATCCAGTTTTAAATCATCTTTGTTATCTAATACGACATCAGATACAACTTTCTTTAATTCATCCAAATCAAATAATTTAGATTTCAATGCATTTTTAATAGCGGTATAAACCAAATCAACATTAACTTCTTTAGAAATCGCTTTGCCTAATTGACTTTCAACTACCTCAAGTTCAACACTGTTATCGCTCGAAAAAATGCGACCACCACACACAATTTCAACCGTGTAAATATGAGCTGGTATCATCTCAGCAATGCTAAACGCTACAACATCGTTATGCACACGACCATCAAATTTATACACATCATCACCATGACTTAAATAAACTGTCGCGGTTGACTCAAGCGTTAATTCGTCGTCGTTAAAATCACCTAACCTAAATCTCAATACTGATGTGTCACCCTGTTTAATACAAGTGCCATCAATTGCTGTTAACGTATTCACTAAAACTTTCAAAAAATCACCTCTTAAAGCAAATATAAAAAAGGATGGACAAGCCACCCTTTTATTCATCATCTATCTTTTTTATTCATCAAAAAATATTGACTAAATTAATTACAAGTACGTTTAAAAAATGCCATAAATTGCAGTAATATACGCATTCGAATCAACTGCTTTTTCATCTCCAGTTGCTCTTAATGCTTTTTCTAATACAATGTGTGTGTCATCTTTTATTCGAATTACAACTTCATCAAGATAGCCGTTTTTAAAGCCACCATCAACGCTACGCATTCCGATATTATTTAAATAAATTGTATTGCCATTGCTAGGAATCTTAATAAACTCAACAGCATGTCGATTTGTAGTATAGCTAACTTCAATCAGTAAATTCCCAAAGTCATGACAATTTCCTTTTAAAGTGGCAGTTTGCCCCTTAACTAAATTGCCAGACCATAATTTCACTGGCACAGAAGTGACCCATCGACCATGTAATTTACCGTTATATTTTTCAATTGCATAGCCTGTGCCTAACATCGTAAGCATACCATTATTTTCGTTCTTCATAACCGCTTCAATGTATCCATCTGCATTGTTTGAGTTACGTGTGGGCACATTTTTAGTTGTGCTGTTAAAATAATAAACACCCGATTTTGTAATAGTAGAAACATCATCGAGTACACCTGTTTTAACACCCGTCACCTCTTCTTTAATTCGTCCCACTTCTTCGTTAGTTTCACGCTTTAAACTTTCTATTTTTCCATTGATACTATCAACGTTGTTAGTAATCGTATTGATTGCTTCGTTAAGCTCAGCTCTCGTCAAAATCTCGCGTTCATTCGCGATACCTTGAATCAAATCTAACTGTTGCTTTAATGCTTTGGCTAAAGTGACATTCGCTTCTACTTGAGCTTCTGTTCCTGCAGCTTTAATTTTCAATTCTTCTAAATACGTATTAATTTTACCTTCTAACTCTGAGACTTTTTGTTGATACTCAGTGTAGTATGATTCTGAGTTAATGCCAAACTCAACCATATTTTTAAGTACTCTTACTTGAACCTCAAGCGTTGAATCTGTTTGTTCACCGCGTTTTAATTTAAAAAACGCTTGTTTATATTCTCCTTCAGCAGTACTCGCTTGATGTGGAAATGTATATCGAAATACACCATTGACAGGATCTAATACAATTGCACCGCGTGTGTCGATAATTTTTTCCCCATCCGGTTTAACGCCCTCAAAAACAGGTGTAAGACCTGTTAAGTTATATGGTGTGCCGTTCGACCATACTGTAACCGTTACTGTTTTAAGCCCGCCATCACCTACACGCGTGATTAAATGTTGTTGCTTCTCTTGCGCTGTGCCAAGCTTCGTCATGTCATAAAATAAGTCTTGATTTGCCATAACTTATACCACTCCCTTAACCATAAAAATAGAAATAATTTTTTAATAATTCATGTGTAATGACTTCATGTCCTAATTCATTCGGATGAAGCCCATCCACCATGTTTTTAACACGGAACGCAGGATTGTAAGGATCTAACAAATGCGTATGATATGCATCAAAAACAGGTACATTTAATTCTGAACATGCAATTACTTGCGCATTTACATACGCTTCTAAATCAAGACCTAAACCATTTTTATCTGTATCTTTACGTCGTATCGTTGTACCGTTG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>NZ_CP048279|2580461:2621225|2592604_2592958_-|WP_162681685.1|tail|DBSCAN-SWA MVSVLVDNNEVVLHFGLGELMALDRDLGFEVKKVKLGSGLGFLVPKLEEGDVVGLAIMLKAATSRQPYPLKTEAQLESALVYAHETYGSFEAFGKVVIEEMGKHVLTQDLIKKHQKD |
49 | Staphylococcus_phage(73.53%) | tail,integrase,terminase,head,plate,holin | attL 2577461:2577510|attR 2618351:2618400 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
2793288 : 2833311
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP048279|2793288:2833311|DBSCAN-SWA 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MSEDNPQIDAEAREVFRLLESGNDEYEALWYWFREVSMTSFNALYKLLDIHFDYIQGEAFYNDKLKDTVTLLEQKDLLKRDDGAYIVELEDLPPALIKKSDGASLYITRDLSAVLYRTATFDPSRILYVVGQEQSIHFKQLEQVTHLLGLKTVIEHVPFGLILKGGKKMSTRQGKVVLLEDIIAEVEAAVLKTLEEKQSQLTNKQETASEIAIASVKFYDLKNDRLSIYDFKIDEMLAFEGDTALYIMYTYARMQSILRKSGYANNGKDSFRFEENMWAILKHLKSYNEVLEIAAVNYTPSSICRYTLQLCRHFNSYYNVERILGSANEASKMMLLEVVSKNIEEAMQLLGIKLIKEI |
37 | Staphylococcus_phage(31.25%) | transposase,tRNA,integrase,bacteriocin,protease | attL 2817528:2817543|attR 2834532:2834547 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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