Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP048386 | Spiroplasma sp. BIUS-1 chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_CP048386
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
4580 : 18707
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048386|4580:18707|DBSCAN-SWA AATGAGCGATATCAAACATGGACGTATTTTAGAAATTGATATAAAGAACGAAGTTGAAAAAGATTTTTTAGAATACTCAATGAGTGTTATTGTAAGTCGTGCCCTTCCAGATCTAAAAGATGGATTAAAACCAGTTCATAGAAGAATCATTTATGCAATGAATGATTTAAAAATCACTTCAGATTCACCACACAAAAAATCAGCACGTATTGTTGGTGAAGTTATTGGTAAATATCACCCACATGGTGATTCATCAGTTTACGAAGCAATGGTAAGGATGTCACAAGATTTTTCATATAGATATCCTTTAGTTGAAGGTCATGGTAACTTTGGATCTATCGATGGTGATGGAGCTGCTGCTATGCGTTATACTGAAGCAAGATTGGCAAAAATTGCATCAGTATTATTGAAAGATATTGATATGGATACAGTTCCTTTCATAGATAACTATGATGCATCTGAAAGAGAACCAAAATATTTAACTGGGTATTTTCCAAACCTACTAGTTAATGGAGCTACAGGTATTGCAGTTGGTATGGCTACAAACATACCTCCACATAACCTTAGAGAAGTTACAAAAGCTATAGTGGAATATATAAAAAATGATCAAATTACAATTGATGAAATTTTACAATATATTAAAGGTCCTGATTTTCCAACTGGAGCTTTAATGACAAATGGTAAAAGTATGATTGATGGTTATAAAACTGGAAAAGGAAATTTAATCATTAGATCAAAAATCGATATTGAAGATAATGGTAAAAATCAAAGAATTGTTGTAAGTGAGATTCCTTATCAAACAAACAAATTAAAAATTGTTGAAAAGATAGCTGAACTTTATAAAAATAAAATGATAAGTGGAATATCAGATATTAGAGATGAATCTAACTATGAAGGAATTAGAATTGTTGTTGAACTACAAAAAAATTCAAATCCTCAACTTATAATTAAAAAGTTATATAAGTATACAAACTTACAATCAAGTTTTGCAATTAACATGTTATCTCTAAATAATGGAATACCTGTTGTTTTAAATATTAAAGACATAATTAAATTTTATGTTAAACATCAAATTGAAATTATTGTTAAAAGAAGTGTATTTGAAAAAAATAAATTAAATGCAAGATTACATATTTTAAATGCAATAAGAATTACTTTAGATAACATTGATGAAATTATAAAAATAATTAAAGACTCAAAAACAACTGAAGTTGCAAATGAAAAATTATTTGAGAAATTTGGATTTGATGAAAAACAATCTAAAGCAATTTTAGATATGAGACTTCAAAGATTAGTTGGACTTGAAAGAGAAAAAGTTGAATTAGATATTAAAAATATCGAAATTAGAATTTCTGAATTAGAAGAGCTTTTAGCTTCAAAAGAAAAACAAGATGATCTTCTAATAAAACAACTTGAAGATATTGCACAAAAATATGGTGATGACAGAAGAACAAAAATCATTGAAGAAGATGAAACTCAAATTGATGAGGAAGAATTAATTCAAGATTCACAAATGTTAATAACTTTATCAGAAGAAGGATACATTAGAAGATTGTCTAATGAAGATTTCAAAACACAAAAACGTGGTGGTAAAGGTGTAATTATAAATTCAACTCAAGACGATAATATAGTTATAGCTAAAGTTGGTAAAACAAAAGATGACGTATTATTTTTCACTGACGAAGGAAAAGTTTATAGAATCAAAGGTTATAACATTACTCAATTTTCAAGAAACGCAAGAGGAGTTCCTGTTATTAATTTCATAGGAATTAACTCTTCAGAAAAAGTTACATCAATTTTATCTTTAAAAGATAAAAAGAATATTTATAAATATTTATTATTTGTAACTCAAAAAGGAATTGTTAAAAAAGTTGAAATTGATGAATTTAGTAGAATAAATAATTTTGGTAAAATTGCAATCAATTTAGATGATGGAGATAAATTAGTTTCTGTTATTCCAACTGTTGGAGGAACTGAAATTTTAATTGCGTCTCAAAACGGAAAAATCATAAAAGTTAATGAGAATGATTTCAGACCAATGTCTAGATCTTCACGTGGAGTTAAAGGTATGGGTCTAGATAAAAATGACTCAGTTGTATCTTCATGTTCAAGTTATAAAAACGAATGTGTTGCAACTATATCAGAAAAAGGAATTGTTAAAAAAACACTTATAAGTGAATACAATATTTTTGGTAGAGGTGCTAAAGGTGTTGTTGGTATGAAGCTTAGTGATAAAACAGGTAAGTTTAAATCAGTTTTACCAATAAGAGAAACAGATGAAATTCTTATGATTTCATCAAAAGGAAAGATAATAAAGATTGGTGCGCAAGACATTAATCTTCAATCAAGAAATTCAACAGGAGTAATAGGTTTCAATTTAGAAGAAGATGAAACAATTACTGCATCAACATTAGAATGAAATAAAGGTGAATAAAAATGTTAGACATTAATAAAATCGAAAGTGACTTTGAAAAAGTTAGTCAAGACTTAGCAAAAAGAAATAAAGATTTTAAAAGTGAGTTAAATGAATTAGTAGAATTAAATTCACAAAGAAAAAAAATCACTTTTGAAGTTGAAGAATTGAAAGCTGAAAAAAATAAGATCTCAAAAGAAATTGGATTACTTGCAAGAGAAAATAAAAAAGAAGAAATTGAAAAATTAAAAAATGAAGTTTCTGAAATAAATAATAAAATTGAAAAACTTGATGCAAGTTTAAAAAACATTGAAACAGATTTAAATTCAAAGTTAAGCTATATTCCAAATATACCAAATGAAAATATTCCTCTTGGAAAAGATGAAGAAGACAATGTTGAAATTAAAAAATGAAACTCAGACAATTTAAAAACAAATGGAGGAGCTCATTGAGAAATAGCTTCTAAATTAAATCTAGTAGATTTTGAATTAGGTTCAAAATTATCTGGATCAAGATTTGTTGTTTATACAAACAAGGGAGCTAAAATGATAAGAGCTCTGACTGATATATTAATTTCTAGACATACACAAAACGGTTATAAAGAAATGTGACTACCATTAATTGTTAATAAAGAAAACATGTATGGTACAGGACAACTTCCTAAATTTGAAGAGGATGCTTATAAAGTTGATGATCAATATCTGATTCCAACTTCAGAGGTACCTTTGACAAATACTGTTAGAGAAAGAATTCTAGATAAAAAAGAATTACCAATGTATCTAACTGCATTCACTCAATGTTTTAGAAGAGAAGCTGGAAGTGCAGGAAGAGACACAAAAGGATTAATCAGACTACACCAATTTAATAAAGTGGAAATGGTAAAAATAACAGATTCAAAAAGCTCTTATGAAGAGTTAGAAAAAATGTTATTAGATGCAGAAGATTGTTTACAATTATTTAATCTACCTTATAGAGTTGTGGAGTTGTGTGGTGGAGATATAGGTTTCTCTTCTGCAAAAACTTATGATTTAGAAGTTTGATTTCCAAATCAAAACAAATACAGAGAAATCTCATCATGTTCAAATTGCTTAGACTTTCAAGCAAAAAGAATTATGACAAGATATAAAAACGACGAAGGAAAAAATCAGTATGTACATACTCTAAATGGATCAGGACTTGCAGTTGATAGATTATTTGCTGCAATAATGGAAAATTATTACGATGGAGAAAAACTAATTCTACCTGAAGTACTAAGACCATATTTTGGAAATGAAGAATTTTTAAAATAATGTTTCACGTGAAACATTATTTTTTTTATCAAATTGTTTCACGTGAAACAATTTGATAAAAAGCAAAATTACATTAATTTTGCTTAAAAAATGTTATTATATAAATGTCATTGTAAGGGTGACGTTCGAATTTGGTCAGGACCGGAAGGTAGCAGCCATAAGAATCTAGTGCCTTGTACAATGACTTTTTTTTGTTTTTTTTGGGAGATAAAATAATGGATAATATTTTTAATGTTTTAAATAAAGAAATAACAAAGTGTTCTAAAACTAAAGATGTTCCAGTGGCTGCTTTAATTTTAAATAATAAAAATGAAGTAATTCACAAAGACTCCAACACAAGACAAAAAAACTTTAATTTCACTGATCACGCAGAAGTTAAAGTTTTAAATAAAATTTATAAAAAGTTAAAAACAAAAAACCTAAAAGAATATACATTAGTTACAACACTAAAACCCTGTTTAATGTGTTTAACAGTTATAGAAGAAGCTAATATAAAAAAAGTTATGTACTACTTAGACAATTTAAAATGTAATTATAATAAGTTAACTACAAACATTGAATTTGTTAAGATAGGTAGTGTTGAAGAAACAGAATATTTCGAAAAACAATTAAAGGAATTCTTTTCTCAATTAAGGAAATAACTATGTAAAATATTTATGCAAGAGGAATTAAAAAATGGAAAATAAAAAATCACTTTATAGAGAATATAGACCGAAAAATTTTGATCAAGTTGCTGGTCATGAAGGTATAAAAGAAATATTAATATCTCAAATAAAATCAAATTCTTTTGGACATGCCCTACTTTTTTCTGGTCAAAGAGGTACTGGTAAAACATCTATAGCAAAAATATTTTCTAAAGTAGTTAATTGCCAAAACTTAGATAATTATAATCCATGTGACGAATGTTTGAGTTGTAAGGAATTTAACAATAACTCTCATGCAGATATTTTTGAAATTGATGCAGCTTCAAATAATGGTGTAGAAGAAATTAGAAATATAAAAGCAAATGTTTCTTTAATGCCAAGTTTTTCTAAATACAAAGTTTATATAATCGATGAAGTTCATATGTTATCTAACTCTGCTTTTAATGCACTATTAAAAACATTAGAAGAACCACCAAAGCATGTTCTTTTTGTTTTAGCTACAACAGAGTTCTCAAAAATTCCAGCCACAATAATATCAAGATGTCAGTTATTTAATTTCAAAAGAATAGCACAAAGATCTTTAGAAGACAAAATTAAAGAGATATGTAATCTTGAAGGTAAAGAGATAAGCGAAGAAGCTCTAAATGAAATATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048386|4580:18707|10938_11505_+|WP_162684481.1|DBSCAN-SWA MEKIIEELKKLDGVSKKTAEKIVFDLIINEEKLDSLSEMINKIKTTYSECDNCFFFKENNKCSFCDNQNRNKNIICVVSTKLDALKILDSSYNGMIHVLNGEINLNKNIGPEKLKMSELFVRINKGIELLLALNLTFEGEVTSNYIANKAKGIADKISRIARGIPLGGVIDYIDQETLNDAILNRKKM >NZ_CP048386|4580:18707|13623_14760_+|WP_162684485.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLNKDKKYILAISGGADSVFLFHYLIENGIKNFVACHVNYNFRKDSNKDAELVTELCEKNNIELKILNIEQNYSQLKDNFESWARKVRYDFFCEELINQKADAILIAHNLNDHVETYLMQKKNKKTVSYYGIKKETTYKEKKIIRPILEFKKSEIVNSLMTKKIDFITDSTNADLKYERNKIRANLNESDFEKYLDEIFQNNSVLQKYEKQFEIIKDQSFLNLNNISSDEKWNEYLVFNFLKTKGLEKEIFFSKKSILKEIIKQLKTSKSFIEIYKGDFVIIKDYEKMYAINKREYVFFEINIEEKKKYESILKDNNIDFDGNLLITNDWKKYQSKISINGITLSKYYKDKKVSYIKRQQNILIFDKSKKILLNKITI >NZ_CP048386|4580:18707|14790_16719_+|WP_162684486.1|protease|DBSCAN-SWA 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12 | Bacillus_virus(12.5%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
98456 : 108851
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048386|98456:108851|DBSCAN-SWA 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GAACCATATATAAATAAAAAAATAAAAAGTTTAAGTGCTGGATGAAAAAAAAGAGCTATTATGGCAAGTGTTCTTGTTAGAACTCCGGAATATATAGTTTTTGATGAACCAACAGCTAATGTGGATGTTGAAGCTAAATTATCTTTCATGAATATTTTGCATGAACTTTCAAAAATAGGAGTTACAATACTGATCACAAGTCATATTTTGGAAGAACTACAAGAAGTTGCAAACTATGTTGTATTTATTAGAGACGGAGAAGTTGTTATGGAAAAAGATTTCGATAACAAAACGGAATCAATTGCTCAATTATATAAATTAGTTATGGCAGAAAAAGATAATAAAGAAAAATTATTAAAAGAAATTTATAGCGCAAATGAAGGGATTGGAATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048386|98456:108851|98456_100628_+|WP_162684563.1|DBSCAN-SWA MIENLLKQLNDEQLDSVITTDVPLRIIAGAGSGKTRVITTKIAYLIEKENIFPSKILAVTFTNKAAQEMRDRVNKIIPDMDRNPMITTFHSFCVRVLREDCEYIGLSKDFTIIDNADQNKIIRDIIKNLDISTDKTKPEKKILSKISNWKSKQLTWEEAYEETFNVAEKKWAKAYRDYEKYLSEKNCLDFDDLILKVHKLFNENLDVREKWKNRFDYILVDEFQDTNYTQFDLVKWLTGSRNNLTVVGDPDQTIYSWRGAKVNIILNFKDEFKNARTVMLTENYRSTKPILDIANEFIDNNKNREKKDIFTQKKEGEIVKVKEVASRNFEAKFVSKKIKELVEEKNYKYSDIYVLYRTNAWSQEFEKEFQNQKIPFHLIGGFKFRDRKVIKDVTSLLRAVVFKDDLAMERVFGFTPKVGAVTATKIKQAAYEYDLNLFDFLTKESQAVNSISKNLNELINCLIKAREVFEENKSLLELTELLVKLSGYRDRLDLKDKEDVEALQNLEAYYDQMEKYDLEYNQSENELNRAVSFLQEEAISSDEEGIAEINKVTLLTIHSAKGLENKVVFIVGLNKDVFPSKMSFYSMESLEEERRAFYVAITRAQELLFISYVSGEYSYISSGELGASRFIQELNPDLYEIERNIYFHSNNETTSGYKGKPNLEAKPTKLDAGVVKGDKIKHMVFGQGTVVKVIDKYISVAFADPKQGVKMIPITTSAWEKME >NZ_CP048386|98456:108851|102999_105165_+|WP_162684567.1|DBSCAN-SWA MNKDNIKSLSGTDESDEYIKLNARAKLFVPGQDNFKLDIQAAELYMKEHIEPNMVKFSSTKERIEYLITNQYYDEEVMNRYSMDQIDEITKYAYSFEFKFPSFMGALKFFNAYGLKTFDGKQYLENYEDRVVANALFLAGGNFEKAKNILRQIILGRFQPATPTFLNAGKKQRGEYVSCYLLRVEDNMESIARAVTTSLQLSKRGGGVALCLTNLREFGAPIKNIENQATGVIPVMKILEDSFSYANQLGQRQGAGAVYLNVHHPDIMSFLDTKRENADEKIRIKSLSLGVVVPDITFELAKENKEMALFSPYDVAKVYGKPFSDISVTEEYENMVNNPKIKKTYINARKLFQAIAELHFESGYPYLLFDDTVNNNNAHPVAGRIVMSNLCSEIVQVSTPSEFNADLSFSKTGEDICCNLGSMNIAKTMESGEEFSEVIYNSILALDHVSRNSDLSSAPSIENGNKNNHAVGLGAMNLHGFLATNHIYYNSPEAVDFTNMFFYTMAYHAFKASNKLAKEYGSFAGFKISKFADGSYFDKYTKCEESKWTPESDTVKNLFDKNNVTIPTQKDWIELSEEIKKTGLANSHLMAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVAPVEVRKEGKLGRVYVPAYKIDFDNMGYYSLGAYEVGPDPIIDIVAAAQQHVDQAISLTLFMTDQATTRDLNKAYIRAFKKGCASIYYVRVRQEVLEDSENYECDACVI >NZ_CP048386|98456:108851|106002_108084_+|WP_162684569.1|DBSCAN-SWA MEKVLKTLSKEEKKVNFNKEFKNFSLLYKINLKLSLKDVGSILSGITFASLMSLFFILEFSSVITSGSSAEYGKYKILVYTLGSAALIFHILLNSLYLFKKQVKDGIASIELRAGFKTWKSYLIRVLIIYSTSLVYIGVTLFVTIILNFASLKDTVLFFNLHYSQVFFFGFLAFFTTLIMTVAMVLLKTSMATMFAMVYMIAIVLAPITASIKFMIKPNNDSNYKTNIRVLSGSQFYNQFKYDEKLFNDTDANGNSITNKLINDYVNQVLSPIATETENKNNVYDESYKLEGFSLRHNVKENGLYNGKAIKNSKASHILTKNLGLGQVYYNYNVFEQKTQFGDIKRSYLLEGTPIWNILEPINDYVYKNRNEFNSKYKGEIPTMFIEPTTYRWNIKNEGSNIDLNDFVKQLSKDLPEYSNILNFILNFYNKYNSVIAPSNLANNYWSGGSDGRRAAYNDIIDSALIPATRDKNSYYFGKLNYYSWKEVYTIENEDQYMPNSFNLDQVDGDNTSSNKRKDLGIDKNNPEAFNHNNEMAKVYNDFPELTIINQLLVSLWRMSMDFDVYRKGALDSSLYEYYNTTVASNSLKTDIFRHFAAMSTGLFSDPLYNDLLNVSNEAFYQGQFYTIKNIFDFENFSYTNKDSNKAMESPYKTISVKSKKAFLIPLAYFVYIVLISPLGYLGYVVFNKKAKL >NZ_CP048386|98456:108851|101514_102537_+|WP_162684565.1|DBSCAN-SWA MAKKKNQYYYDSLSPIEFAMNKFNGRMRSVNWNVMNDEKDLEVWNRATQNFWLPEKVPVSNDLVSWKTLTPEWQELITRTFTGLTLLDTIQATVGDVAQVPNSLTDHEQVVYTNFAFMVAVHARSYGTIFSTLCSSEQIEEAHEWVINCDSLQERAKALIPYYVGNDPLKSKVAAALMPGFLLYGGFYLPFYLSARGKLPNTSDIIRLILRDKVIHNYYSGYKYQRKVEKLSPEKQAEMKKFVFDLLYELIDLENKFLYELYDGFGIAEDAVRFSLYNAGKFLQNLGYESPFTEEETRIEPEIFTQLSARADENHDFFSGNGSSYVMGVTEETSDEDWEF >NZ_CP048386|98456:108851|102538_102994_+|WP_162684566.1|DBSCAN-SWA MHDDVIKISHKDVKRPKGKVFVVYFSSISNNTHRFMEKLDVNEARIPYELDEQLIVDKEYVLITPTYAGGGGDTKGAVPAQVVKFLNNEKNRNLCRGVIASGNTNFGDTFAIAGPIISKKLKVPLLYQFELLGTKHDVETIREILEDFWKE >NZ_CP048386|98456:108851|100713_100977_+|WP_162684564.1|DBSCAN-SWA MTSFKATVIDPVGLHARPASVLTKEASKFASEIKIKCGDKEGNLKSIMNVMALAVKTGAEITIEANGEDENEAIEAIEKAMKDNSII >NZ_CP048386|98456:108851|108098_108851_+|WP_162684570.1|DBSCAN-SWA MIEIKNITRDLGGFVINQVSFKIKKGSVVAFVGDNGAGKTTTIKALFGELKLEQGEILMDGRSIFDEDNLQRIAFFPDSNSVPLNMKVKDYVSYVCAVNGMSKLEAQDAAKKIFAMLSLEPYINKKIKSLSAGWKKRAIMASVLVRTPEYIVFDEPTANVDVEAKLSFMNILHELSKIGVTILITSHILEELQEVANYVVFIRDGEVVMEKDFDNKTESIAQLYKLVMAEKDNKEKLLKEIYSANEGIGI >NZ_CP048386|98456:108851|105256_106003_+|WP_162684568.1|DBSCAN-SWA MIEIKNISRKLGNFGLDNVSFTIKKGSVVAFVGDNGAGKTTTIKALFGELKLDSGEILIDGQDLFKNNNLSKVAFFPDSNNVPLDIKIHEYLHYICAANNMTKEKTDLSIDNVYRLLELRPYKDKKIKELSSGWKKKAIMASVLVRSPEYIIFDEPTANVDVESKMYFMDIFKLLSKVGITILITSHIIEELQELANYLVLIKKGQIVYANDFDRTKEHIMDVYKKHMNEPIKDLHILRELYLKKETK |
8 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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