Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019711 | Absiella sp. 9CBEGH2 | 1 crisprs | csa3,PD-DExK,DinG,WYL,DEDDh,cas3,cas2,cas1,cas9 | 0 | 7 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019711_1 | 1807085-1807978 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019711_1
|
13 spacers
spacers of NZ_AP019711_1
>1.1|1807121|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAATGCCTGCGATAATGAGGCGTGGATAA >1.2|1807187|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTAGAATTAGATATACAAAATCCAGAAG >1.3|1807253|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTGTGTGCATTATGTCCGCCATGTACATT >1.4|1807319|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGTGTCTTAATCATGTCTAGCATGCAATC >1.5|1807385|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACTTGCTCGTGCCTGTTGAGCACGTAAA >1.6|1807451|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATGCGGTAACCTGTCCAACAATTGCAGA >1.7|1807517|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCCTTGAACCAGTGGGCATACGTGGAAAG >1.8|1807583|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGTAAGACATCAATAATCAACAATTATAC >1.9|1807649|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAAAGCGGACAATCGAATACCGCATAATT >1.10|1807715|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGCTGTAGCTTGTTTGCTTTGCTCATGCG >1.11|1807781|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGATTTTATAGCTTTCAAGAGGTTTTGC >1.12|1807847|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTCTGTGATGTGCCTTTTATCGACAACT >1.13|1807913|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTTGGGATAACTTGAGTGATATAGAACT |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019711_1
The CRISPR arrays of NZ_AP019711_1 >merge|NZ_AP019711|1|1807085-1807978|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACGCAATGCCTGCGATAATGAGGCGTGGATAAGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACTGGTAGAATTAGATATACAAAATCCAGAAGGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACTGTGTGTGCATTATGTCCGCCATGTACATTGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACACGTGTCTTAATCATGTCTAGCATGCAATCGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACTGACTTGCTCGTGCCTGTTGAGCACGTAAAGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACTGATGCGGTAACCTGTCCAACAATTGCAGAGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACTCCCTTGAACCAGTGGGCATACGTGGAAAGGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACGCGTAAGACATCAATAATCAACAATTATACGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACGGAAAGCGGACAATCGAATACCGCATAATTGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACTAGCTGTAGCTTGTTTGCTTTGCTCATGCGGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACCTTGATTTTATAGCTTTCAAGAGGTTTTGCGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACTGGTCTGTGATGTGCCTTTTATCGACAACTGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAACATCTTGGGATAACTTGAGTGATATAGAACTGTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC >NZ_AP019711|1|1|1807085-1807978|PILER-CR GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC GCAATGCCTGCGATAATGAGGCGTGGATAA GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGGTAGAATTAGATATACAAAATCCAGAAG GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGTGTGTGCATTATGTCCGCCATGTACATT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC ACGTGTCTTAATCATGTCTAGCATGCAATC GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGACTTGCTCGTGCCTGTTGAGCACGTAAA GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGATGCGGTAACCTGTCCAACAATTGCAGA GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TCCCTTGAACCAGTGGGCATACGTGGAAAG GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC GCGTAAGACATCAATAATCAACAATTATAC GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC GGAAAGCGGACAATCGAATACCGCATAATT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TAGCTGTAGCTTGTTTGCTTTGCTCATGCG GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC CTTGATTTTATAGCTTTCAAGAGGTTTTGC GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGGTCTGTGATGTGCCTTTTATCGACAACT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC ATCTTGGGATAACTTGAGTGATATAGAACT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC >NZ_AP019711|1|1|1807085-1807978|CRISPRCasFinder GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC GCAATGCCTGCGATAATGAGGCGTGGATAA GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGGTAGAATTAGATATACAAAATCCAGAAG GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGTGTGTGCATTATGTCCGCCATGTACATT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC ACGTGTCTTAATCATGTCTAGCATGCAATC GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGACTTGCTCGTGCCTGTTGAGCACGTAAA GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGATGCGGTAACCTGTCCAACAATTGCAGA GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TCCCTTGAACCAGTGGGCATACGTGGAAAG GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC GCGTAAGACATCAATAATCAACAATTATAC GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC GGAAAGCGGACAATCGAATACCGCATAATT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TAGCTGTAGCTTGTTTGCTTTGCTCATGCG GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC CTTGATTTTATAGCTTTCAAGAGGTTTTGC GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGGTCTGTGATGTGCCTTTTATCGACAACT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC ATCTTGGGATAACTTGAGTGATATAGAACT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC >NZ_AP019711|1|1|1807085-1807978|CRT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC GCAATGCCTGCGATAATGAGGCGTGGATAA GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGGTAGAATTAGATATACAAAATCCAGAAG GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGTGTGTGCATTATGTCCGCCATGTACATT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC ACGTGTCTTAATCATGTCTAGCATGCAATC GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGACTTGCTCGTGCCTGTTGAGCACGTAAA GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGATGCGGTAACCTGTCCAACAATTGCAGA GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TCCCTTGAACCAGTGGGCATACGTGGAAAG GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC GCGTAAGACATCAATAATCAACAATTATAC GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC GGAAAGCGGACAATCGAATACCGCATAATT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TAGCTGTAGCTTGTTTGCTTTGCTCATGCG GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC CTTGATTTTATAGCTTTCAAGAGGTTTTGC GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC TGGTCTGTGATGTGCCTTTTATCGACAACT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC ATCTTGGGATAACTTGAGTGATATAGAACT GTTTCATTCTAGCAAAAATCCATATGGTAACAAAAC
>NZ_AP019711.1|WP_115716390.1|1806457_1806643_+|hypothetical-protein MIDPKNHTYHVEILGSEEKFNEMIEAIRAKAVWLSDEEIEEILDEETEKNIGPSFWYSQMY >NZ_AP019711.1|WP_163104630.1|1805579_1806170_-|hypothetical-protein MYVAINGTGNSKSIYIMSSYRKNNGKTSSRIFRKLGRLNDLLPQFDNNEEKLLEWARSEAKKDTLSHQQDTAPVLIPFSSDKKIKKNEVLLFNVGYLFLQSICSNLHFDNICRNIKNHHKFEYDIHRILCDLVYARVLYPSSKRSSFSFAHSLLEQPKYKLQDIYRSLSILAEESDYIQAEVYRNSNFLHKRMMLE >NZ_AP019711.1|WP_118278062.1|1805195_1805495_-|transposase MAKKKPVFDNDFRSNAVRYVQQHTNLTMKECAANLGVGRSTLSRWISESKKSENGSVEMRGTGNFESDEAKEIARLRRELRDTKDALEILKKAIGILGD >NZ_AP019711.1|WP_115716392.1|1800494_1801730_-|phosphoribosylamine--glycine-ligase MNVLVIGKGGREHALVYAVSKSAKVDKIYAAPGNPGMAQLAECVDISDSDVEALVAFAKDKQIDLTIVGPEHTLSLGVVDEFQKEGLKIFGPSKDAAQVESSKDFAKKIMVKHGIPTAAYATFDNEEDAVAYVKEQGAPIVVKEDGLKAGKGVTVAQTLEEALDALHIAFSIPNNKVVIEECLCGFEFSLICFVCDDIVLPMQIAQDHKCAYDGDKGPNTGGMGVYSPVKKITPAIIDEAMETIMKPMAKAMMEEGHPFTGFLYGGLMLTDKGIKTIEFNARFGDPEAEVILPRLKSDFVEVIENIMNHKTVELTWDEEVTLGVVMASEGYPASSTKGAVITGFEDVDSMIFHMGTKEIDGNLVTDGGRVLIVVSKEKTLEEAYKKAYEDVEKITCDKLFYRKDIGKKDMQ >NZ_AP019711.1|WP_115716393.1|1798809_1800480_-|formate--tetrahydrofolate-ligase MFKTDLEIAQECILEPIRDVAAKIGVTEDDLEYYGKYKAKVSLDLLNRNKDKEDGKLILVTAINPTKAGEGKSTTTVGLGDALNRMGKKTMIALREPSLGPVFGLKGGAAGGGYAQVVPMEDINLHFTGDMHAITTANNLISACLDNHIHQGNALDIDIEHVTWKRCLDMNDRTLRNIRIGMGAKANGVERQDGFNITVASEVMAVLCLATSLSDLKTRLGNMLVAYNTKNEPIYVKDLGIEGALAMVLKDAIKPNMVQTLEHNPVLIHGGPFANIAHGCNSILATKTCLKLADYTVTEAGFGADLGAEKFLDIKCRFGNLKPNAVVIVATIRALKQHGNVAYEDLKEENVEAMLEGCANLAKHIDTVKQFGLPYIVAINEFASDTPKEVEALENWCKEHGHPMSLSQVWAKGGEGALDLAEKVVALCEEENSYAPLYDVEDSIEDKIHTIATKVYGADGVEFSEEAKQQIALYNKMGWDKMPICMAKTQMSLSDDAKKYGAPKGFTITVRELNPSLGAGFLVALTGKVLTMPGLPAVPAANNMDIDEEGHIKGLF >NZ_AP019711.1|WP_115716394.1|1797811_1798645_-|hypothetical-protein MNRLRLWGKAVKMEIREHKSTFAVYVILRALVIVMMILQILNKNYENAFLCILTLFLFIVPSIIQLQFRIELPKTLEVIILLFIFSAEILGEISSFYILFPMWDTVLHTLNGFLAAAIGFSLVDLLNQSERMEFKLSPLFMAIVAFCFSMTIGVLWEFYELFMDQFMGLDMQKDTIIHSFHSVLLDPTKSNIPILVDNIKDVVVNGKSLGLGGYIDIGLLDTMEDLLVNFIGAFVFSIFGYFYVKSRGKHHFATRFIPRRKKHSRDYLHIVKEQSRK >NZ_AP019711.1|WP_115716395.1|1796263_1797748_+|DUF1846-domain-containing-protein MNKIAFDNEKYLKMQSEHILERINKFDNKLYLEFGGKLFDDHHAARVLPGFQPDSKLNMLLQLKEQVEIVIAVCASDIEKNKIRSDMGITYDVEVLRLIDAFRGTGLYVGSVVITQYANQSAADAFKKHLENLGVKVFLHYPISGYPNNTSFIVSDEGYGKNDYIETTKPLIVVTAPGPGSGKMATCLSQLYHEHKRGIKAGYAKFETFPIWNLPLKHPVNLAYEAATADLNDINMIDPFHLEAYGETTVNYNRDVEIFPVLNAMFEKILGTSPYKSPTDMGVNMVGYCIVDDEAAKEASNCEIIRRYYKAKVDYKKGYTDENTIRKIEIIMSQADITDKDRKCVQPAIEKAEETGAPAVAIELPDGRIVTGKTTSLLGASSAALLNALKALGNINDEIPLISPSIIEPIQKLKVNSLGNHNPRLHTDEILIALSISATMNPISHLALQQLDKLKDCEAHSTVILSQVDANTFRKLKINLTCEDRYQTKKLYHK >NZ_AP019711.1|WP_163104628.1|1794691_1795957_-|UDP-N-acetylglucosamine-1-carboxyvinyltransferase MEEVIKIKGGKKLNGTVRIGGSKNATVALIPASILANGPVTICGVPSISDVESLSVLLQDLGVMVDVRSSDSILIDTENMQNKPLVHDAVNKLRASYYFMGALLGKYGHVEIRMPGGCYLGPRPIDLHLKGFEALGATVKYDHGCYVLDAPELVGTKIFLDIASVGATINIMMAAVHAKGRTTIENAAKEPEIIDVATLLNKMGAQIRGAGTNVITIDGVDELSGCFHEIIPDRIEAATYIVLAAAAGEKVKIENIIPHHLESLTSKLTELGVDMKIDIDSITIHGGLDNLHPIDIKTLPYPGFATDIQQPLTALLTQAQGQSIVTETIYTERFKHCFELEKMGAKINVMTPSSFINGPTPLSGAEVSATDLRCGACLVIAGLIADGVTTIRNIYHIERGYEHIVEKLTAIGAQIWREEIN >NZ_AP019711.1|WP_118277627.1|1793207_1794641_-|DEAD/DEAH-box-helicase MKFKDFSFDGKIIHALDKLHYIDMFPIQEKVIPLLYDRQDVIAQSKTGSGKTAAYLLPVIQNTRWDEKEPQALILTPTRELALQVKEEYDNISIYQRLKCVTIFGRQPYKFQIEDLKQRTHAVVGTPGRILDHLERGTLSLNKIQYVVLDEADEMLNMGFIESVKKIMTYFPENHTTALFSATMPEPILELAQKFMKNPVHIKIEETSIHTGIHYAYEIKEHEKTQFLIQLLCKELPQSCIVFAKTQAHVIEVCDALYEKGMSVDKLHGGMLQEDRIQNIKDFKRGLFRILVATDVAARGIDIEDVTHIINYDMPNEKETYVHRKGRTGRAFGKQGITISFLSQYDAQRKEELEEYLGYALEIHDRNEVDQIHVDEELLRKLEENPQVKKDKAEALRKDTTKLYINKGKSKKIRAGDIVGAICQIEGIQSEDIGVIQVQEHQSYVDILNGKGKEVLKALNQKTIKGKKIKVEIAKEN >NZ_AP019711.1|WP_118277632.1|1791996_1792917_-|peptidoglycan-binding-protein MLINKNIGQVIESMLDYGTFCKKGGTCMVSKRMQFALLISIFTLFGCASGNSATQTVNKTELLFTGDKKAIEHESMLSVMQLYHSVDENDIKEIAFLENMKPQNNESFVTNVRNADGELRSVSALKTLSEDVVSTVEKQKEAERKKREIEKKTKLARQAGIPSDENGLFPLYTTTYGVDCYGCNFNNGQGNTAMGVKLDINKGVLLPNGSWQPGIQYGKYYVIAADPGIPMCSVLKVYDHGLRGSGISPDKPFEAIVLDRGGAIRGTHVDLYIGSENSGAIQKVSNTSAKAQIIRLGGMKNGSCPL >NZ_AP019711.1|WP_115716389.1|1808033_1808906_-|hypothetical-protein MNKITIDNGSNSIDIQMDHKKYIIGNNMQEKRNLELMIKQFFQKTESEYRSENNLEAKILMDGEAVSNKRMLFLEINPYYSLIEDCKLSSKSLVLKYLEKKLQDKIYFDTIRTLDILFQSLAEEANDDNLKIAFHEMNFKQLLKILEAYFSDDFQKDEFDLSYEDVILFQIHLINEIIAHTEDKDMIIVSVNIPIITDTIIEEMKSTGHSFFFIFTNNYCEKMKLDEVILSEEELYDLADINSIFYEIEETYNEIQQVEVLKENMKKFVKLNYTYKAFNVIDELTHFSNK >NZ_AP019711.1|WP_115716388.1|1808902_1809226_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MIYEFMRLILFFDLPVTTKKDRKTYAQFRKYLIQNGYMMMQYSVYCKIFANREAAVKHVANLEKSVPKKGQIRLLLVTEKQYAKIEIITGGKSMQETILNSDSFIKI >NZ_AP019711.1|WP_115716387.1|1809215_1810109_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGHRVIYVEKCEHLKLYLDNLKVEINGNDILFPISDIQILVIDNYKSNMSVPLINKLTENNVCTILCGIDHLPKSYLLPMNGHFSSSGNIEKQIHWENEKKDYIHQEIVRCKILNQIEILKQNEKSFEVIKKLYDFTDDLLPGDITNREGLAAKMYFRELYGDNFIRFDEDVINAGLNYGYSIFRSLITSIIVAKGYLPNLGIFHKGKQNMFNLSDDIIEVFRPIVDNYVYTEMREDLFFKKEHKEALIQLTNKRVVIDDRKQTVANAINVMLDSIFRYFDDVDTKLLFPLPILYDL >NZ_AP019711.1|WP_163104632.1|1810209_1813548_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MNSYVLGLDIGITSVGYGVIDLKTNNFVDYGVRLFKEGTAAENEARRSARGRRRLLSRRKNRLEDMRNLLKKYQIIDENFKPLSNVYELRNKGLSTSLTNDELASALLHLTKHRGSVLDTVEDDEEAAKDSEKTKAVLGTNAKLLAQGRYVCQLQLERLQSEGKVRGHANNFKTTDYIEEANEILKHQNIDEKLKEKIIEIIQRKRAYYEGPGSEKSPTPYGRFIEVDGQIQQIDLIEKMRGKCSVYPNESRAPKMSLSAELFNFLNDLNNLTVDGEKLTTEEKNQILKVVSQKGSITLKQVAKLLEVEEDSFAGYRIDKSNKPLLTEFKGYKKVKKIFKECGEDISFHDYEKIDFIIEIITKQKGMQERKTSLENSKYTFTNTLLDKLVLMNGVSGYHALSFKALRELNKELYMTDMNHMQILHQMNLFDKNRISHKGRNNIMADETAILSPVARRAQNETFKVINELRKKYGEFDSIVIEMTRDKNSVEQAKKQRESQRYFEGLNKEVNRILEEYGYDADKVNGKTKTKLRLYMEQDGKSAYTLQPLDIRRIISDPTYTEIDHVIPVSISLDDSLNNKVLITRMENQLKGQMTPVEAYQKGKFVDTGCTLVEYIESVKNNKKYNNKKKGNLLFKEDITKFSVIQQFINRNLVDTSYACRVVLNTLSDYFKDNGIDTKVHTVVGKLTNKLRQQIQLEKIRDEDYLHHAVDALIVASIKKMGLLNSYLMKYTFDKLYDEMTGEVKEVPEDKAFFDEKYISFIVNLKTLYMQSNQYYRGILERKEMVYAPIKISHKINTKPNRQVADETIYSTRNIDNKEMIVQKYKDIYEPKFDKLTNDILSGVTEQKYLMARNDPQTFDILKQIIMHHFDEFKDSKEYYKKEVKKGVVTYKLVGDNPLYLYKEEFGPVRKCSKKGNGPVITSMKYVDGQLGSHIDISKNYDVKNKKIILKQVSPYRTDIYLCSDGKYRFVTVRYKDVFYKKEKQKYVIDANWYAEEKKRKKIDDNAKFICSMHRDELIGIVRKEGDKYIYDESTEHGGEVKYHDGIHSEILKFTATNNDQNGIIEVKPVFTYCKKQLKPAILNCVEVSKYATDVLGNLYKVKQNILKLEFE >NZ_AP019711.1|WP_158572271.1|1813758_1815030_-|DUF2399-domain-containing-protein MNIEQEFYLFLKERKGLHRLFDAWITQYERLGYAGGSVVVENVKQEEMEAIGTFLGCDLRKQKQIHIYWRQMQKAMDNSRFSTCNIEEVFTLWKGKPLRNKKEERRKKEEFENKMIEKVLEETKDTYFPMWWELQKKQYPEFFHKVKKLLLEDKETLLLCIQAIEQLPYLTHNKKPLAVFAAEISKDPHFFDKGMSYQMLYKGICYRMKKEEPNTLEEKNKLFYDAGLIRDDISNYCMLCHINAEIENQGHAGWNGFFMNYETWNVSLWNLSQIDKIKKDIKKVYILENPSVYRMLCEYGKKHNINDIGFLCTSGQLNLCAYILLDMLVDSKIQLYYSGDFDPEGIQIADKLKQRYKENIVLWHYDEHDYRKCISNKTISERRLMMLRNIKDLKLIQVSQRIEQEKRSGYQEKLIDVYKEDIL >NZ_AP019711.1|WP_163104634.1|1815026_1819049_-|TIGR02680-family-protein MEFVSKWHPNRMGMVDFWYYTNEEFHFDHGHMLLRGSNGSGKSVTMQSFIPLLLDGNKSSERLDPFGTRSRKIENYLLEEEGGRDDRIGYLYLEFKREESDTYKTIGMGLHARKGKPLDTWYFVIEDNRRIGVDIQLMQNDLAISRQSLKNLIQEQLYTSQKVYCEKVNQALFGFERIEEYKEAIDLLLQLRSPKLSNSLKPSMLNEILNNSLRPLSEEDLRPMSEAISNMDNIKDQLDALKQSRQSANAIYQVYEQYGKALLYEKLHLYQNAYKEEEMQKKKQDSFYREQEENKKIKEECLEKQKDYQRKIELLKKEEEDLNASDRLRLVKEVQGLEKEYAQLKEELQRKLQALDKKETQYHETKKDYKKQKDEYEVLCMQIDEKLKEMDDLQEELQLEEHDAFRLEFQEETTKDYDFTYTLRFVKEKEENLRQVILKLKEYTSQKEVLEQLIDSCQQREDEVQKQRSLVSKYESLYDEMLDEYREGMNSWYASLKQLHIEKSALEDMQKFLSEYEERKTFLPIQNIIQQAFHIDKEQLSTTRIQLENEQRLVQKELLRLHQEIEEWENKEDPMPFIEDGRKQNRAFLDKQGISYRPLYTLLEFDEQVNEELKGQIEEYLQRSRLLNALLVHKDQKETILKKEIGSFDDYVFTDKEVEYLSSWYLKGNTLQELYQSLFAFFEELHISVNGLSFDEDGYQMHAIYGTLAKDKQVVFVGKKAREQYRKDKIEELKALKEEQQKEETRLKDKIADILGKEEILKEESASFLTEDDLQKALLMWKEEEGRLSLLERSLNEAKKRVEEKQAMLQKLYLDVQKMASSFPVKLQVEAFEEYRSSFEDYKQYLQDICTMYPSSRKALEMKLYLSVKLNELEEDIDTVKYEKDQLDEQSILKQQLLVQKQQQLKELGGDDITKRLQEISDLLIRLPKEQLQNERKLGSLEEAEIKINEELRHLEVDLQEKEQTTALYLDILKEQVDNGCIRIPLEEYDDLVATVMLYEKQNPIQKKSDTLKGDVQGVFYAQRGSLQDYQVSFTMDDLWEEVDGISSRIHLKAKFHGKQLPFEQLLEQLDTAIETQKHLLEDSDRHLFEDILVNIISKKIRIRIQDSKHWVETMNRYMNAMTDSSSGLRLSLQWRNKKAESEEELDTKELVELLQKDVGMLKESDLKKLSTHFRSRIESVRRVMDEEDNMQSFHQLMRVVMDYRQWFEFRILAQKAKDTKKELTNQLFFSFSGGEKAMAMYVPLFSAVAAKFESSRKDAPLLIALDEAFAGVDDKNISIMFALIEKFNFDYIMNSQVLWGDYPTVHHLAIYELFRPDNARFVTVIPYEWDGKVKRMKME >NZ_AP019711.1|WP_118277583.1|1819048_1820179_-|TIGR02678-family-protein MNCIEQLLQQRWILKKQNPQLYYEIKDNQKELRKKLQDRFGYVLIINPLLAKLEKIPGKAEAWMGIQEFETIQEYQMFCYLLMYLEDKEIEEQFVLSMLSEYIQLRFPQGQVSWNSYQCRRQLIHVLQYALKYNLILQSDGDQDAFLKNEESEVLYENTGNSRYFMRTFARDILTFQNPEDFMQSEWVDMEEDRGIVRRQRSYRRLLLSCGVYPSLDKEKDEDYTYIRNYRGKIEQDFRSMFSCDLHVHSSSAYLMLEEDCSMGKIFPQNGALHDLMLVFHSEIHKKLSKYTLRLSANEVLIMEKEKTLTLMHTVVKRNRALLPKKYQEEALSAQKLVENLYTMFLLYGFMEEDEENCYFYPIIGKIQGEFVEVKE >NZ_AP019711.1|WP_118277584.1|1820175_1821657_-|TIGR02677-family-protein MKMNDKLIKPIREVNYLRADNVERYRVIMRFFYEEHEKIHYWLYKEDVFQMMKEFSMFQEYTMEQCQNDLQSLSEWGNLTAHQDTTKVQTVQEFKNKRYRYQLSEYSVAIERLTIELENLEVEGASLQPTLLERIRNQISEAKQIVNKSEEEVYGWWHSLNDDFIRLNQNYQDYIRTLNSAKAEELMKSKEFLLFKDKLINYLRTFVKNLQNHGLVIESLLKDLNKEEIASIFDKVVSYEMKIPRLGKQLKKEDVLENCYGRWESLYDWFAAENGENEVDRLYHITNEIIRRMTRYALQIGEFQNQGTNRREEYQHVANIFSKCTNILEAHKLSAMIFGCETTLHLKHIEPRETDSIHSGVYEEKSVSLLLEPRSRVIRKKTVRKPADDYSLEKEIQKQEVIRKAEERQKKIDALIHNGKITFSTLPLVDQDIRKILLGWISRAMAVKTRKAKTDQGKEYHVVYEKDGECSVSFEDGNLVMPCFEIVFEEDGE >NZ_AP019711.1|WP_118277585.1|1821916_1822510_+|transcriptional-regulator MYSKKEFELYVKSENGILLYSDMISLGLGRYHIKELEKDGTIEKVERGIYCHKDYTSDTMKIYQKMNNKMIYSNETALYLHDLVDRYPMVYTATTISGYHLREKENLKLYYVKEELWDIGKMEIKDPWGNILNVYDMERTICDIVKNQKKIELQVYLQAIKNYFQRKDKNLRKLARYAKKMGIQDKIRDIVYMHMEP >NZ_AP019711.1|WP_118277586.1|1822522_1823401_+|nucleotidyl-transferase-AbiEii/AbiGii-toxin-family-protein MIYRNTDNWKSEIKKSAKLKGVDVPSMQQRFILEEFAKKIGSSPYGDRLILKGGFIVSTLLGMDTRTTRDLDVTCRTTIYDISEMENIVKKVLKTPSDSFFEYELADIKQAQKDDENAGFIVSINARKDNISLNLKIDVSNNTLIYPDAIRTTLPSMFNEEDIKLLSYPLENIIAEKYETTLDRGEFNSRMRDLYDIYFLMKDSSQLVDKNLLADTIIKVSEERGTIDNLYEFEEILEELQNSTAFQSSFKKHGEKFGFEDITLKDVFKIFREIHDMVEDKLNIDESTSIKI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019711_1 | 1.5|1807385|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1807385-1807414 | 30 | NZ_KU510528 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain M13/0401 plasmid pSAM13-0401 clone ST22, complete sequence | 23110-23139 | 7 | 0.767 |
NZ_AP019711_1 | 1.10|1807715|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1807715-1807744 | 30 | MH617587 | Microviridae sp. isolate ctii141, complete genome | 802-831 | 7 | 0.767 |
NZ_AP019711_1 | 1.11|1807781|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1807781-1807810 | 30 | MK448500 | Streptococcus satellite phage Javan442, complete genome | 8001-8030 | 7 | 0.767 |
NZ_AP019711_1 | 1.11|1807781|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1807781-1807810 | 30 | MK448499 | Streptococcus satellite phage Javan441, complete genome | 8001-8030 | 7 | 0.767 |
NZ_AP019711_1 | 1.3|1807253|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1807253-1807282 | 30 | NZ_CP017242 | Rhizobium etli 8C-3 plasmid pRsp8C3a, complete sequence | 141254-141283 | 8 | 0.733 |
NZ_AP019711_1 | 1.12|1807847|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1807847-1807876 | 30 | NZ_CP032091 | Pseudoalteromonas donghaensis strain HJ51 plasmid unnamed1, complete sequence | 765835-765864 | 8 | 0.733 |
NZ_AP019711_1 | 1.3|1807253|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1807253-1807282 | 30 | MH552475 | Siphoviridae sp. isolate ctbe4, complete genome | 40761-40790 | 9 | 0.7 |
NZ_AP019711_1 | 1.8|1807583|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1807583-1807612 | 30 | MN480763 | Streptococcus salivarius strain YU10 plasmid pSsal-YU10, complete sequence | 145258-145287 | 9 | 0.7 |
NZ_AP019711_1 | 1.9|1807649|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1807649-1807678 | 30 | NZ_CP043499 | Rhizobium grahamii strain BG7 plasmid unnamed, complete sequence | 744541-744570 | 9 | 0.7 |
1. spacer 1.5|1807385|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KU510528 (Staphylococcus aureus subsp. aureus strain M13/0401 plasmid pSAM13-0401 clone ST22, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgacttgctcgtgcctgttgagcacgtaaa CRISPR spacer cgtagcgctcgtgactgttgagcaagtaaa Protospacer .* .******* ********** *****
2. spacer 1.10|1807715|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH617587 (Microviridae sp. isolate ctii141, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tagctgtagcttgtttgctttgctcatgcg CRISPR spacer ttcctgtagcttgtttgctttgcgcagttc Protospacer * ******************** ** .
3. spacer 1.11|1807781|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448500 (Streptococcus satellite phage Javan442, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttgattttatagctttcaagaggttttgc CRISPR spacer gttctttttaaagctttcaagagcttttat Protospacer ** ***** ************ ****..
4. spacer 1.11|1807781|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448499 (Streptococcus satellite phage Javan441, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttgattttatagctttcaagaggttttgc CRISPR spacer gttctttttaaagctttcaagagcttttat Protospacer ** ***** ************ ****..
5. spacer 1.3|1807253|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017242 (Rhizobium etli 8C-3 plasmid pRsp8C3a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgtgtgtgcattatgtccgccatgtacatt CRISPR spacer agttccattattatgtccgcgatgtacatt Protospacer ** . .*********** *********
6. spacer 1.12|1807847|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032091 (Pseudoalteromonas donghaensis strain HJ51 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggtctgtgatgtgccttttatcgacaact CRISPR spacer ttgaaatagatgtgccttttaacgacaaca Protospacer * * ************* *******
7. spacer 1.3|1807253|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH552475 (Siphoviridae sp. isolate ctbe4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgtgtgtgcattatgtccgccatgtacatt CRISPR spacer ggtgtgtggattatgtccgccactaccgcc Protospacer ******* *************. *...
8. spacer 1.8|1807583|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN480763 (Streptococcus salivarius strain YU10 plasmid pSsal-YU10, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gcgtaagacatcaataatcaacaattatac CRISPR spacer gtcagtgaaatcaataatcaacaattaatt Protospacer *. . ** ****************** .
9. spacer 1.9|1807649|30|NZ_AP019711|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043499 (Rhizobium grahamii strain BG7 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ggaaagcggacaatcgaataccgcataatt CRISPR spacer tctatgcggacaatcgtataccgcatgccg Protospacer * *********** *********. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
197156 : 210642
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP019711|197156:210642|DBSCAN-SWA 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16 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
467195 : 554894
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP019711|467195:554894|DBSCAN-SWA 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89 | Erysipelothrix_phage(34.88%) | transposase,tail,protease,terminase,head,integrase,holin,tRNA,capsid,portal | attL 532948:532964|attR 534299:534315 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
777326 : 823867
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP019711|777326:823867|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(21.43%) | transposase,tail,terminase,head,holin,capsid,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1907175 : 1920092
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP019711|1907175:1920092|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP019711|1907175:1920092|1911820_1911976_+|WP_118277557.1|DBSCAN-SWA MKQISNEKFGQFLVELRKEKEMTQKELAEKLFVSDKTVSKWECGVSQTKGY >NZ_AP019711|1907175:1920092|1910530_1911388_+|WP_118277558.1|DBSCAN-SWA MATKKKHKKKKNISSKPSFYDTFYKTKESSIEEYIQQLKDAGFQTSKEEILKQYETLTSVEDLVLSVSPTHRTVYQKLLLKLIPEQYDLHTLCDPYYIYADALSLSNTEMEIQEEITEIYKLMKRIENMYTQQKKDLMYFHHVYDFDITTFLVTAFIRYASICPNDEQMQEAENQANNLLSIYKKNQSFFADMKAALLCGYAASGNIEIANKKKEELLNMYPKEPYFVYYSLLHGIASSKNIDKFEDFYKEAMKYMVFSAEEQTFKDQITLLYKAYEEYLKGAKA >NZ_AP019711|1907175:1920092|1918478_1920092_+|WP_008394611.1|DBSCAN-SWA MKQQIYNTALYLRLSRDDELQGESSSITTQRSMLRLYAKEHHLNVIDEYIDDGWSGTNFDRPSFQRMIEDIEAGKINCVVTKDLSRLGRNYIMTGQYTELYFPSHNVRYIAIDDGVDSEKGESEIAPFKNIINEWVARDTSRKVKSAFKTKFAEGAYYGAYAPLGYKKHPDIKGKLLVDEETKWIVEKIFSLAYQGYGSAKITKILREEKVPTASWLNFTRYGTFAHIFEGKPESKRYEWTIAHVKAILKSEVYIGNSVHNRQSTVSFKSKKKVRKPESEWFRVENTHEPIIDKEVFYRVQEQIKSRRRQTKEKATPIFAGLVKCADCGWSMRFATNKANKTPYSYYSCSFYGQFGKGYCSMHYIRYDVLYQAVLERLQYWAKAVQQDEEKVLNKIQKVGNAERIREKKKKASALKKAENRQNEIDRLFAKMYEDRACEKITERNFIMLSGKYQKEQIELEQQITNLREELSKMEQDMIGAEKWIELIKEYSVPKELTAPLLNAMIEKILIHEATTNEENERIQEIEIYYRFIGKVD >NZ_AP019711|1907175:1920092|1911384_1911696_+|WP_118361707.1|DBSCAN-SWA MRVQELASYRNEKNFSSPFYAELFCDDIWGDNGEDCASVTIHPTKEGWHLHYIRTQSGIPYPFAPHTSKIVDEYEKDVNDEQFYDYLLLHNLQEAFMDYITTV >NZ_AP019711|1907175:1920092|1918157_1918367_+|WP_008394616.1|DBSCAN-SWA MNCLERFYRKGVCVIDNAVKTIQKKNNKCGIGNRGKTKIVVKEHFSEKGKTMEELLTDVMLEKAKQTIA >NZ_AP019711|1907175:1920092|1914076_1915282_+|WP_008394621.1|DBSCAN-SWA MKYQKIKEALQALQEGKLVLVMDDKERENEGDLICSAQFATTENVNFMATYAKGLICMPMSESLANRLMLSPMVEDNTDNHETAFTVSIDYKDTTTGISAEERGLTARMCVTENVNPFDFRRPGHMFPLIAKNGGALERNGHTEATVDLLRLAGLKECGLCCEIMNENGKMMRTPDLIQFSQTHHIPTLTIKELQEYRKVYDLLVECVSVVEMPTKYGNFKAHCYINKLNGEHHVALVMGDLNNGNDVLCRVHSECLTGDAFGSLRCDCGQQLDKAMKMIAENGSGVLLYMRQEGRGIGLVNKLKAYHLQDNGMDTLDANLALGFQGDLREYYIGAQILRDLGIKSLHLLTNNPDKVYQLEDYGMKISSRVPIEIEANPYDSFYLKTKKDRMGHILNMEEK >NZ_AP019711|1907175:1920092|1917878_1918067_-|WP_008787514.1|DBSCAN-SWA MAVREYHYLTAQVMAIKEDKSFTRTQIGCRSLLQEKGHGVSVSTARCLSKVLNCFIQLSKSD >NZ_AP019711|1907175:1920092|1912336_1913437_+|WP_008690020.1|DBSCAN-SWA MSDTEYMKLAIKLAKKGAGYVNPNPMVGAVIVKDNRIIGQGYHEIFGGLHAERNALKNCRESPVGATLYVTLEPCCHYGKTPPCTEAIIKSGITRVVVGTLDCNPIVSGKGVKVLEENNIQVVIGILEMECQQLIKVFRKYVTRHIPYVFMKYAMTMDGKIATYTNQSKWISGEKARKQVHQFRHKVTAIMVGVNTVIQDDPLLTCRLENGENPIRIVCDTDLRTPITSKIIKTANDIKTYIATSSIDESKIALYRKCGCEIIYTKKKGNHIDLMNLMQCLGNMQIDSLLLEGGSAMNWSALEQQIVDEVQIYIAPKIFGGSAKSPVSGQGVAFPNDAIMLKPYAFSQVGNDYFIESEVIYPCLQE >NZ_AP019711|1907175:1920092|1916158_1917373_+|WP_008394618.1|DBSCAN-SWA MNDKNFIEELRQKREEYGVTQRKLAVACGISRTYFNQIENGTVVPSAELKQTIEKQIERFNPQEPLFLLIDYFRVRFPTTDALKIIREVLQLKADYMLYEDFGKYGYESKYVLGDINIMCSMQEHLGVLLELKGRGCRQMESYLLAQERSWYDFMLDCLTAGGKMKRLDLAINDKAGILDIPKLKEKYKAGECISYFRMQKDYSGTEKCGSDLPKNTGETLYLGSTSSELYMCAYQKNYEQYVKNGIEVEDTEIKNRFEIRMKNERAYYAVVDLLTYRDAERTAFSIINHYVRFVDREDDKPKSQWKTNDDWAWFIGENREPIRLTTKPEPYTLQKALHWLQRQVAPTIKMVQALDRENHTTILKDMIEQAELKDKHKHLLQLEKSTIEERIDTAVPQENDGIF >NZ_AP019711|1907175:1920092|1907175_1910376_-|WP_118277559.1|DBSCAN-SWA MKFKLLKSFNITTKTDRRDLQKILNDIQVIKLEISDEGWDSYHIDAVCKQGDAFYDVSLRVEYNRVEHYYSECNCKEFNPYSLRKYCPHILAVCDFLEGKEAVDYTWEDVYEMEGYLAYKRKKELELFRMQSKHALDKLYKKKQQVHEKTINSCLDTKIYSIEINKEGSGFQDFRVGFKVGCEKKYVIKDIPNFVQAVERKQYVKYGKNLAFVHDIEKFDEHSKKIIHFMEKCIMMDREFLSGRYLYPLNSYEMTDTFYDIMYPKKPAEEMKFCVGVTKEEDLLCFETRNTEFIIGGENYFYKFKDGELVRFHTSFFELLELFIIQTQERLFVSLDDYPEFYDKIFRHIQANLNIVEGEDLLPQIKTENCIVHKPELYGDVYDADTISFKPVAYDEQEQKVALLTNQNYETNANIEILLSVLDEKSVYKDKEENAFFMNIDEDDTLSFLQNNVPALQKICDVYVSDALKKIGKKTNYTITTGVHLNNNLLEISFHTEDFDMKEIGAILKAMKKKKRYTRLKSGQILHLESEQLEDIESLLEDYDLSEKNIKNGTLKLDAFHSLSLDERLKENSSLKINRDEALKQYIENFQNNKIRYTVNEDYMDILRDYQKIGVKWLLTMYQYKFNGILADEMGLGKTLQVICMLDSVKDEGKQFLVVAPASLIYNWQDEIQKFSKTLSSCIITGNKTNRKNLIHKEHVDVYITSYDYLRNDIEEYKDIMFDTVILDEAQNIKNQKTKNAECVKQLQAAHRFALSGTPIENALSELWSIFDFLMPGYLFSYAHFRKHYEIPIVSKQDEKANKTLKRLVSPFILRRTKKDVLTELPDKVDHQYLIDFSEEEKKLYFANAMQVNKELKQKLDQNSIGKIEILAMLTRLRQICCDPRLVFEGITTPSSKLQACIDLVNTLHENNKKILIFSSFTSLMDLLAQELDKQKLPYYMLTGSTNKEKRREMVEAFQKDDTPIFLISLKAGGTGLNLTAAEAVIHIDPWWNVSAQNQATDRAHRIGQNANVQVYRMIMKDSIEEKIEKLQQQKKDLADNFVEGNDGSLSTMSKADILDLFAHKE >NZ_AP019711|1907175:1920092|1915282_1915750_+|WP_008394619.1|DBSCAN-SWA MNTFEGNLVAENIKIGIVVARFNEFITSKLLAGALDNLKRENVGEKDIEVAWVPGAFEIPLIASKMAKSKKYDAIICLGAVIRGSTSHYDYVCSEVSKGIAQISLNTETPVMFGVLTTDTIEQAIERAGSKAGNKGSECAQGAIEMVNLIRALEV >NZ_AP019711|1907175:1920092|1913421_1914057_+|WP_008394622.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEIGKVERIQKDTCNCKLSIKASKILEDIHLGDSIAVNGICLTVTCFTRQSFTVDVMNETWNRTALSLLRHGSLVNLERAMPMNGRLGGHIVTGHIDGTGRISSVRRDKNAVWYQINTQREILNLIVEKGSIAIDGISLTVAKVSKADFSVSVIPHTLEQTILKNKQVGDMVNLENDILGKYVQKLIDNSNETELSKELLCRYGF |
12 | Staphylococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2244374 : 2297170
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP019711|2244374:2297170|DBSCAN-SWA CATGGGCGAAAGTACAATAATTCGTAATTCTCATAATGTTTCAGATATTGTCTTTCATTTTGTTTGCCCAACAAAGTATCGTCGCGTGGTAATAAACGAAAATGTAGATGAGCATTTGAAGCAAATATGCGTGGGGATTGAAGAAAGATATGATTGGATAAAATTCCTTGAAATAGGGACAGATAAGGATCATGTACATTTTTTGGTTCAATCCACACCGAATTATAGTCCAGCAAAGGTAATCACAACGATAAAAAGTATAACAGCGAAACGCATATTTGCGGAATGTCCAGAAGTGAAGAAACAGTTGTGGGGAGGCTCATTTTGGAGAGAGGGATACTATGTATCCAGTGTAGGAAAGCACACAAGTGAAAAAGCAGTACAGAGGTATGTTCAAAATCAAGGCAAACAAGATGAATATAAACAACTGTATTTGCATGTGTAAGCGCCTAATCCAGAATACCCCGCAGCAAATGCGACGGAACGCATTTACGGGGCTCTGCCCCGGGGTAGTTTGTTTTATTTGGTTGATTATATGTAGAGTAGAAAGGAGAAAATTCTTTATGACAAAAAAGAAATCAGGAAATAAAAGTATATTTAAAAGTTCAGGATTTTATTTTGTGTTGCTGTATTTACTATTAACAATAGCTTTTATTGTTCAAATACTAACAGTTAATTTGCTACCAATGAAATTTCTAATTCCTATTATTGTAATAATAATATTATTATCGTTAGGTATGTACTATTTACAAATGGGAAGGCATATAAATAAGATTAATAAAGTCTTAGGTAAGATATTAATTATTATATTATCTGTTCTTTTAGGTTTTGGAAATTGGTATTTGTATTCAACAGGTTCTGCTTTTAGTAGGATGACGACAAGGAAAGATATTTCAGTTGTTTCTATTGTCGTCATGAAAGATAGTTCTATAGAAAAAGTTAATGATTTAAATGAAAAAAAATTGGGGATAATGAGTGTAGGTGATATAGAAACACAAGATAAGGCAATGTCAGACTTGAAGAAAGATTTAGGCAATGAGCCAACTACAGCTAAATATAATTCATATAAAGATTTTGGTGATGATTTATATGAAGGGAAAGTAGATGCAATCTTGTTAAATGAAGGATCACGTGGAATGTTTGAGGATAATCATTCTGACTTTGACCAAAAAACAAGGGTTGTTAAACAATATACATATAAAAGTGAGGCAAAAGATATAAGTAAAAATGTCGATGTAACAAAAGATCCATTTAATGTGTATATTACAGGTATGGATACATATGGTACTATTACAACAATTTCCCGTTCTGATGTGAATATGATTGTTACTATAAATCCGAAAACTCATCAAATACTAATGACAGGAATTCCTCGTGATTTTTATGTGCCACAAACTTGTCAAGGAAATCAATCCGATAAATTGACACATACAGGTATTTATGGTGTTGAATGTACAATCAGTTCTGTAGAAAATTTTATGGGTATTGATTTGAATTATTATGCACGTGTTAATTTCTCAAGTGTAGTAGATATAGTAGATGCACTGGGTGGAATTACAATTAATGCACCATTTGCATTTACAACATCAGCAGGACTTCAAATACAAAAAGGTGATAATAATTTAAATGGATATGAGACACTGATGTTTGTTCGCGAAAGAAAAAATTTACCAGATGGAGACAGGGAGCGTAGTAGAAACCAAATGAGGGCATTTGAAGCGATAATTAATAAAGCTATTTCTCCTTCTATTATTACAAACTATTCTAGTATCATGAATGCGGTAAGTGGAAGTTTTCAAACAAATATGAGTCAAAAAGAAATGACAGACTTTATTAAGCAGCAATTAAATGATATGAAGGGTTGGGACATTAAGCAAATTCAGGTTAGTGGTAGTGGGGCAACTCTGTACTCTCCAGCTAATGGATTTAATTCTTATGTTATGGTTCCCAATGAAGCAACTGTAGAAAATGCTAAGAAATTAATTGATAAAATTGATTCTGGTGAATTAATTACTGATGAAGATGTAGCTTATCAAAATCAATTGGTATCTAAAGCTGGATAATACTCTAGGTGACCTATTTATGAGGATAGGTCATCTTTTTTTTATTTTCTGGAGGTAACGTTGTTAGAGTTAATTAATTGTGATACTATATAAGCGATATATTTTTAAATAAAGGGATAATGTGAAACATTAATATATCATGGGGAGGATTTATTGATGAGAAAGTATGTTTTACCATGGACGTTGTTTATATTAGAGATATCAAGTTTTTACTTGCTAGCTAATTTTCTTGATTTACCAAGAAATGTTATATGTCATTTTATGATTGTATTCGTTCTATTTTTATTTGTATTTGAACATTATAAGATATCATCTAAACTTATTTGGGATGAAATTAAATCAGTTGGAAAAGCAATGATTTGTTTTTTTATTGTTGAGGTTGTAATCTTATCGGCATTTAATGGGGATGACTGGTTTCTTAGTATAGTGATTTTGACGGCTGCAATGTACTTTATCATTCTATTTTTAGATAGAACCTTAAGGATTTTGTTACGAGAAAACTTAGCTAGAAGAACTTTGATTATCGGGGTTGGTTATGAAGCAGCAAGACTTGGTAACATTGCGCAAAACAATCGCTTTGCGTTAACGAAAGTAATAGGATATTTGCGTTATAAAAATGAGCCTATTGATGAAGAATTGGTAGAAAGATATGAGAAAAACGTAAATACAAAGCAGGAGATAAATATTTATGAAGATATGCGATTAGAGGAAATCATAAAAAAAGAAAAAATTGATCAAGTGATAGTTGCATTACCGGGTGTACCCAAAAAAGAGATAAATAAGTTAATGCTTCGCTTGTATGATAAAGTTAAAGTAATTAAATATATACCAGAGGTTAATGGACTTTTAACATTTAATTCAAAAATACAAGACTTCGATGGAACCATATTAATTTCAACTGCGCAGGGAAGTATTGGATTTGTAGATAAGGTGATTAAAAGATTAATTGATATTATTGCCGCTATATTTGGAATACTTCTATTGGTGCCAATTGCAATATATGTAAGATGTAAAAATCATAAAAATGGTGATTATAACAGTATCTTTTTCTCACAGGAGCGCATTGGACTAGATGGGAAACCTATTAAAATTTATAAATTTAGGACGATGATTCCAAATGCAGAACAGGTTTTGGAGGAATTGATGGAAAAAGATGTCTCTATTAAAGAGGAATATTTAAAGAATAAAAAACTGCAGAATGATCCAAGAATTACAGAAGCAGGTCATTTCTTAAGAAAATCTTCGTTAGATGAATTTCCACAGTTTATTAATGTTTTAAAAGGGGAAATGAGTTTGGTTGGCCCTAGACCATACCTTTTCAGAGAAAAAGACGATATGGGAGTATACTATAATTCAGTTATTCAGTGTAAACCGGGAATTACCGGTATGTGGCAGGCAAATGGTAGAAGTGATGTTGGGTTTGAAGATCGATGCAAGTTAGATGATTACTACTATCGAAACTGGAATCTGAGCTTAGATATGATAATTCTATATAAAACAGTTAAAAGTGTTTTTTATGGAAAAGGAGCCTTATAAGTTACAGAGTATATTAAAAAAACGTAAGAAAAATATTATACAGAAATACGAGATTGTTATTATAATGGATAGTATGAATATTATATGAAGTAGGAGATTGTATGAAAAATAACGTAGAAAATCAAGAAAAGAAAAAGTTTTATAAAAATGCTGGATTTTATTTTTTAGTTATCTATGCGTGTTTGACTGTTGCATTCATCACTCAGGCATTTATGGTAAATATTGTGCCAATGAAGTTTTTAATACCAATAGTAGTTGTATTAGTGCTATTGTTTGCGGGAATGTGGTATTTCCAAATGAATGGAAAAGTAAATAAAATAAATAAAGTATTAGGAAAAGTAGCTATTGTTGTCTTATCTATTCTTTTAGGAGTAGGGAACTGGTATTTATTTTCAACGGATACAGCATTTAGTAAAATTACAAACAAAGATGATGTATCTGTAGTTTCGGTAGTTGTAATGAAAAATAGTCCTATTAAAGATATGTCTGATTTAAAGGGACAAAGGTTAGGTATTATTAATTTAGGGGATACAAGCACACAAGAAAAAGCTTTGAATGATATTACTTCAGATTTAGGCTCAGAACCAACAACAGTAAAGTATAACTCATATAAAGATTTTGGAGATGACCTGTATGATGAAAAAGTAGATGCAATACTGTTAGATGAAGGTTCCAGAGGAATGTTTGAGGATAATCATGCAGATTTTAATTTAAGAACTAGAGTGGTTAAACAATATACTTATAAAATTGAGTCAAAAGATATTAGTAAAAATGTTAATGTAACGACAAAGCCATTTAATATTTACATAACTGGAATTGATACATATGGAAGTATTTCAACAAAATCACGTTCTGATGTTAACATGATTGTTTCTGTTAATCCAAAAACACACCAAATCTTAATGACTGGAATTCCTCGTGATTTCTACGTTCCACAGACATGTCAAAACAATCAGTTGGATAAACTAACACATACAGGGATTTTTGGTGTTGACTGTACTATTAATACAATGGAAAACTTTATGGATATTGATCTAAATTATTATGCAAGAGTTAATTTCTCAAGTGTTGTAGACATTGTTGATGCGTTAGGTGGAATAACGGTAAATTCTCCTTTTGCATTTACAACGCTGCATGGGAAATATCAAATTAAACAAGGAGAAAACCATTTAAATGGTGAGCAAACATTGGGATTTGTTAGAGAGCGATATGGCTTATCAGATGGAGATAGAGAAAGAAGCCGTAATCAAATGCGAGTTGTAGAAGCAATGATCAATAAAGCAATTTCTCCAGCTATTATTACAAACTATACAAGTATCATGGATGCAGTGAGTGGAAGTTTCCAAACCAATATGAGTCAAAGTGAAATTACAAGTTTAATAAAAATGCAGCTAGATGATA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46 | Streptococcus_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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