Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP048798 | Lactobacillus iners strain KY chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_CP048798
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP048798_1 | 683336-683433 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048798_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP048798_1
>1.1|683359|52|NZ_CP048798|CRISPRCasFinder TATTTATTTTGGCCTATTTATAGCCATTTGAGTTGATGGAAGTTTTATTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048798_1
The CRISPR arrays of NZ_CP048798_1 >merge|NZ_CP048798|1|683336-683433|CRISPRCasFinder CACGATTCACTCACGATTATTTTTATTTATTTTGGCCTATTTATAGCCATTTGAGTTGATGGAAGTTTTATTTCACACGATTAACTCACGATTATTTT >NZ_CP048798|1|1|683336-683433|CRISPRCasFinder CACGATTCACTCACGATTATTTT TATTTATTTTGGCCTATTTATAGCCATTTGAGTTGATGGAAGTTTTATTTCA CACGATTAACTCACGATTATTTT
>NZ_CP048798.1|WP_006730930.1|677572_677830_-|hypothetical-protein MIDKDKAIEIAQKYAIDHLLVRNCKIEDLQATVIDDYFTIKVEPIEVTQDTIVYTNKSNLVTVDKRTGDTYLIDEDGYKPMVSRL >NZ_CP048798.1|WP_160807881.1|669038_669863_-|phage-tail-protein MKQYEFHDLDVNTRGDPSWLPPEAMFIISDGIGIPLEDLIDGYQTLTVSGRELSVYEVNTQSVDNEDGVMFLSANRPVREIEVSYKLEAEKDEEFRAKYQLLNYYLSNKQFDFYFYDDDQYQWTGTVSSTEKPEPGKNIVKSSFTITCNDPYKRLRKSVIYTNRDGMLRITEPAFYLTTPDLISIYLEDSSSTVQVSNGRQTISLTGVFNPNDNIKIKISTDSDKQSDIILNGQSHLELLNLDSDFENFALKRDDIVTVSPHADLSIKFRRKEL >NZ_CP048798.1|WP_163623667.1|667050_669042_-|hypothetical-protein MRLLLYDNHERLLAIVNGYGTIEREINVYDQLNVEVPPTRKNIDLLKKTMKVGVPYPSTKKYQLFKVEKVSLNSKPLTITAIDSAADDLDTQYLIRDKRFINKPLSQVLPVIFEQTTWKYKQFAPDNSDIISFYRISPKEALKKVEGIFGTEVRFLYSIQGNKVIDKTCEVYEQIGESTNIRLVQGINVTNVDYTQDQTRLYTAAVGRGAGIQNTDNDGNATGGYSRSIEFTNISWSKANGDPVDKPVGQDYVEIPEATQKYGWLDENGQCHPRIAKFEFPDEQNVNKLLKETYDKLLSLSQPQIIVETTVAKIGQRVNLGDEVTVVIYEPYKLTYKARVIKVEENPDNDSLSAVTVGFTSVERQAEREFQQEQALVDTKTDFNQALGDTKTNFNQALGDTKTNFNQALDDTKTNFNQELENQKDESERRYLEHNRKFTELQQETSDKIKSTKESMDSELSAHQQAINEQMEKAKKAIRAVEEKTAKEIDDARDSIMNFVSRNSEGAPLEFYDEQGKLVKGIPPVSTIKSKDGKFELNASGFNFGNHVLGGNGELYADGIYGNKIEGYSIIGAHISGGTIQGVTIEGDSYFRSSGAGGIAVVSGDSGFSFGACAMGSGHISIGTGNWNGTDFYTSGDVICSSVVVGGMALTSSDVAKLQGLKG >NZ_CP048798.1|WP_163623666.1|666826_667048_-|hypothetical-protein MSFFKDADTIDLAIIAKEYEKINREVMHENLVLRIQLRQHTEREKELLKILKEKIPEFYEALKKGDEKNDTES >NZ_CP048798.1|WP_163623665.1|664224_664560_-|hypothetical-protein MQQYNYYFSNDSVPFDTITTTHEYKENHYPIVVTQPDPSLKEPKYDWAKGAWIENAAESQGEKIHALQEEVKKFQSVIAQLTSIAQTQKMLATLIATKKGESTNDINRRAL >NZ_CP048798.1|WP_163623664.1|664094_664250_-|XkdX-family-protein MTSTEELYKQILINLYQILKVMSVQEVKQFVEAGAITTADFKEITGVEYVQ >NZ_CP048798.1|WP_006731463.1|663789_664044_-|hypothetical-protein MQFLIKRHDDEKNHVDEKEHLVEEALLAILHDKIYTVGTEIIRQGEISTEDMNNLEHLYEPYKALGGNGTCKKIMNKINELPIK >NZ_CP048798.1|WP_163623663.1|663340_663775_-|hypothetical-protein MINIKNVTEWLPWVSIVILFIAQKIASYYDFAQKNDPDIATKMKHIGLIAKWAVADQSRYADKAGAAKFEDAVDKVVKETGVSTTLAKGAVQASYIDLKDKKDSQVPADRPAVLPQASNPIVTENTLKPVEDTSATVEDLDPHR >NZ_CP048798.1|WP_006732586.1|662227_663331_-|glycosyl-hydrolase-family-25 MKKNTYVVDVSSYNPSDLSTYKNCGATMAIVKVSEGVAYRNPKGAAQIASAKSLGMECAGYFFCTFSNDLNGARAQALYAVESAKIMGLPGGSYLATDWETGTGASYNNVNGGKSKNTQAVLLTMDVIASAGYKPLLYSGAYLLKSNLDTSVILSHYPNSLWVASYPTSNAVSTANMNYFPAIPGVALWQFTDNWNGIHTDASIAVIDSDNGNNTEGDEDMSWHPEINVNELGRFKVTRPDGAQLYKDSDLTIPIAGAVKPAGGTYKIFKARNGAVNAGGEQWFSQADGLTKVNPLSVNQKAKGIICKIIADDAYTQNETTPNCAGIKYLPAGSSWKVISKKGDYLEIGGEKDGRYVLASKCKIILW >NZ_CP048798.1|WP_050751946.1|660882_661110_-|hypothetical-protein MLKIRQIKRSISNIDIEKALRNPIHKESIITDELGRKSQKIIGDFTTVDINPDTMEVITTYPTKKSKRQRYLKGR >NZ_CP048798.1|WP_163623668.1|683592_683898_-|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MDKPLTINVAGLNYKVVVTEYFKASDDDRNLWGYCDYGDLTIYIRKSLNEERKQQTLIHELTHAVFSEAGFTEQDEETVTRLSSVLYQVLKQNPHIFTFQS >NZ_CP048798.1|WP_163623669.1|689477_689846_-|hypothetical-protein MNRFIPQMNKEQEEILKERNKYYELLELAPSTLVVSIGTEQFVVGKYCEYNTSFDNAEDFIRWRLKKLKSLDKLAHEMGYSSDELLDFMEDLLEYDSEENLEQLLIDRYDAENMETWINGKK >NZ_CP048798.1|WP_163623670.1|691802_692021_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNEFGNRLKDLRESKRWTKVYVADQLNLPTSTYANYEYGTREPNLELSSKIAALFGVSTDCLLTGKKMHQST >NZ_CP048798.1|WP_163623671.1|692236_692497_+|hypothetical-protein MHPYKKNHTKHKYRPNTLPYIAGHEFGHYVNGDNGICYYTPSSTLQAEAQADNYSVNLMYEIAEEQGFTSQIPLNSLMHFQSHQID >NZ_CP048798.1|WP_006729045.1|700636_700963_-|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MKVLHKLLKRKVKGFTLIEMVVVIAIIAMLILLIAPNLFSYRDKANNTANDAFIKTVQMQVDLYKDEYGKNITVSDMHDKNYLTDNQVKKIEANHITIKDGKVIAPKN >NZ_CP048798.1|WP_163623672.1|703427_703670_-|hypothetical-protein MASTTGKIVGDKNQSITYVYEKVVKKEQPAPTPVPTPQPQPKKGIFKEIHIYVTKDEDGKTIQSENKVNGYDGDNTQREE >NZ_CP048798.1|WP_163623673.1|703703_703925_-|hypothetical-protein MKKSLRRNNQLRLQRQFQFQRRSHKEGTFKEIHIYVTKDEDGKIISTIQSENNVNGYRDNSKRIKKMDLNLKE >NZ_CP048798.1|WP_163623674.1|704457_704619_-|hypothetical-protein MARDNRKIVGDKNQSITYVYEKVVKKEQPAPTPVPTPQPQPKKESSRNSHLCH >NZ_CP048798.1|WP_163623675.1|704916_705363_-|hypothetical-protein MTEMSTQTEKNEKDGFEFKGIKDLQDNPNYSTDGNSTTGKIVGDKNQSITYVYEKVVKKEQPAPTPTPAPEPKPQPKKGTFNEIYIYVTKDEDGKIISTIQSENKVNGYDGDDYTTEKNEKDGFKFKEIKDLQDNPTYSIDGKSTIGR >NZ_CP048798.1|WP_163623676.1|706127_706307_-|hypothetical-protein MIDNIVSNKQPPRFEEAEKAYIKAHYKRIAFSAGQHGQFDPKDETIYYVNPDRHMILAS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP048798_2 | 716503-716670 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048798_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP048798_2
>2.1|716540|29|NZ_CP048798|PILER-CR,CRISPRCasFinder CATACATCATCCCTGTGAAATATCTGCAG >2.2|716606|28|NZ_CP048798|PILER-CR,CRISPRCasFinder GCTTTCTTTGCTCCTGGATCTACATATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048798_2
The CRISPR arrays of NZ_CP048798_2 >merge|NZ_CP048798|2|716503-716670|PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTTTACCTAGTGCATAAATTACATAACTCTCAAACACATACATCATCCCTGTGAAATATCTGCAGGTTTTACCTAGTGCATAAATTACATAACCCTCAAACAGCTTTCTTTGCTCCTGGATCTACATATCGTTTTACCTAGTGCATAAATTACATAACTCTCAAACC >NZ_CP048798|2|1|716503-716670|PILER-CR GTTTTACCTAGTGCATAAATTACATAACTCTCAAACA CATACATCATCCCTGTGAAATATCTGCAG GTTTTACCTAGTGCATAAATTACATAACCCTCAAACA GCTTTCTTTGCTCCTGGATCTACATATC GTTTTACCTAGTGCATAAATTACATAACTCTCAAACC >NZ_CP048798|2|2|716503-716670|CRISPRCasFinder GTTTTACCTAGTGCATAAATTACATAACTCTCAAACA CATACATCATCCCTGTGAAATATCTGCAG GTTTTACCTAGTGCATAAATTACATAACCCTCAAACA GCTTTCTTTGCTCCTGGATCTACATATC GTTTTACCTAGTGCATAAATTACATAACTCTCAAACC
>NZ_CP048798.1|WP_163623680.1|708003_708159_-|hypothetical-protein MKDPPHQKGYAFTGLVIEVKDKDGKVQEHPYAFDNPVVEDMTLKAKYVPDV >NZ_CP048798.1|WP_163623679.1|707649_707877_-|hypothetical-protein MLTEKAALTTQRMAMVDIDAVQTIDNLRPDAAYSAQAVYEDHNISQIHNLTRLLLTKMQRRMLLGLFTKYLAKRV >NZ_CP048798.1|WP_163623678.1|707017_707278_-|hypothetical-protein MTYDIVDGLQNGLLPDIKPQANPGYRFVRWDPAVPDTLASVKSRTYTAIFEPDISTRKDNPYIISVGDPLPDAKELLAGAKICQTM >NZ_CP048798.1|WP_163623677.1|706556_706808_-|hypothetical-protein MSDQDQKNSGIDKHTLAVDRYIRTHYKLVTFDAKQNGDFASPDVERSYYVKPDVEVTIPRPGVIAKAGYDFSGWKQGNTPYSR >NZ_CP048798.1|WP_163623676.1|706127_706307_-|hypothetical-protein MIDNIVSNKQPPRFEEAEKAYIKAHYKRIAFSAGQHGQFDPKDETIYYVNPDRHMILAS >NZ_CP048798.1|WP_163623675.1|704916_705363_-|hypothetical-protein MTEMSTQTEKNEKDGFEFKGIKDLQDNPNYSTDGNSTTGKIVGDKNQSITYVYEKVVKKEQPAPTPTPAPEPKPQPKKGTFNEIYIYVTKDEDGKIISTIQSENKVNGYDGDDYTTEKNEKDGFKFKEIKDLQDNPTYSIDGKSTIGR >NZ_CP048798.1|WP_163623674.1|704457_704619_-|hypothetical-protein MARDNRKIVGDKNQSITYVYEKVVKKEQPAPTPVPTPQPQPKKESSRNSHLCH >NZ_CP048798.1|WP_163623673.1|703703_703925_-|hypothetical-protein MKKSLRRNNQLRLQRQFQFQRRSHKEGTFKEIHIYVTKDEDGKIISTIQSENNVNGYRDNSKRIKKMDLNLKE >NZ_CP048798.1|WP_163623672.1|703427_703670_-|hypothetical-protein MASTTGKIVGDKNQSITYVYEKVVKKEQPAPTPVPTPQPQPKKGIFKEIHIYVTKDEDGKTIQSENKVNGYDGDNTQREE >NZ_CP048798.1|WP_006729045.1|700636_700963_-|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MKVLHKLLKRKVKGFTLIEMVVVIAIIAMLILLIAPNLFSYRDKANNTANDAFIKTVQMQVDLYKDEYGKNITVSDMHDKNYLTDNQVKKIEANHITIKDGKVIAPKN >NZ_CP048798.1|WP_163623681.1|718536_718740_-|hypothetical-protein MDTIDKADNLLKFVTLMCPAGSAHALKMVGLIERIRKSNVISSFNEFKLINQSVTGLFESEEDLLRL >NZ_CP048798.1|WP_163623682.1|719086_719407_-|hypothetical-protein MSTKDFRVTRPSFYKKGALFNQNLSRKGSNLAPIKEHSPKSNPLKYGGYSGKNNSFFVVVAGKDNKGKDIVKLIPVNTLIYKKMLHCDYKAKQELLTSYVANNFAK >NZ_CP048798.1|WP_163623794.1|719871_719988_-|hypothetical-protein MENRVLVEKELNVKKSDIYPISDANIIPQKIKGQVVKL >NZ_CP048798.1|WP_163623683.1|720178_720337_-|hypothetical-protein MKLEIMKHDPEKIFIEMARSKEDHPKRKLSRKADLKQVYKDSKSKLFLLLKG >NZ_CP048798.1|WP_163623684.1|720842_720992_-|hypothetical-protein MVLSELNTIKFNGVNISEKLKDDIYQNLFKNIQKVTKRDCKIILKSMRI >NZ_CP048798.1|WP_163623795.1|721116_721242_-|hypothetical-protein MTVKDKIISLLTFRLPYYIGPVNPAVHGKFAWAKVSKEVTL >NZ_CP048798.1|WP_006730691.1|724766_725117_-|protein-CrcB MAWLMVLIGGICGALVRYKINIYTSNFYLGTFPLATLCVNLAGSFLMGILFAKVCAGYSYALLGTGFLGGLTTFSTMNFELLDALRNKQYLIFISYFVLTYLGGFTLLLIGYILAK >NZ_CP048798.1|WP_163623685.1|725116_725515_-|CrcB-family-protein MVKKIIQVKSLKIYLVIAILAAIGSILRSCLAKEINGVLLVNILGCIALGFINLFLKDYNYSNLSLAKGLTVGFIGSFTTFSSYNLEIFKLINHKQYLAGLTYFVLFAALGLFCTWIGMLLEKLVVKVGKNR >NZ_CP048798.1|WP_163623686.1|725530_727054_-|hypothetical-protein MLQENSKKNQFFIRLLQCFILIQPLLDTYFFYANSKLKKLFVFSIPTLLRFGLIALIVFLFWKFSISESRSRYFKYICVYALILVFYSVGHLWYFSTFPAISKVMIIKEAFYIVRMLLPVSMIYIIYHTEFSIQQFMVVIQGLVALISGSIVISNLICKSMCSYDNHKLIVANIFSWFSRSDFTFREIASKGWFYFANTISAILVLLVPLIIYLLLTRFNFINSILYIITGMAMIMLGTRVGTLGFVAINILSILVYLVHIFILRNAKFSIKPLILIAIFVGAYCATIPYSPMSRRNQSTETVAKKSTKHHTKRLIKKLDKALSQKETKAEKKEYIIAFVKKYHNRFNIPKKYIKYSIPVENNYQFWNKVYHWPSIKRMDNRLLEETMVKEYMSQKSVGLVKIFGISYLAMTQLFHLERDFVSQKDSMGFIGMILLVGIYPIMIVYSIYKWLRYSQLRTMLNSFLIMANGLLILVAYNSGNVMDFLTASLIASFTFGFMLLQQKKVK >NZ_CP048798.1|WP_006729028.1|729163_730516_-|phosphoglucosamine-mutase MLKYFGTDGVRGVANAGLTPEMAFKLGRDGGYILTKHKSAGERARVLVSRDTRISGQMLEYALISGLLSVGIEVLELGVITTPGLSYLVRAQGADAGVQISASHNPVEDNGIKFFGSDGLKLSDEKEAEIEALIDSKEDTLPRPSAQGLGTVTSYHEGSSKYLQFIENTLPEQLDGIKVVVDGANGASSALISRLFADMGVDFTTIATHPDGLNINDHVGATHTELLQQEVVKQGAQLGLAFDGDADRCIAVDEKGNEVDGDHIMYVIGCYLADHGRLKNDTIVTTVMSNLGFTKALERRGIKNIRTQVGDRYVSEEMRANGYNLGGEQSGHVIISDYHNTGDGMLTGLHLLYVMKDTGKSLSELLSDFKSYPQKLVNVPVRNKQDWKKSTKISAAIAEVEKTLGDDGRIFVRPSGTQELIRVMTEAPTQELADKCCQDVVDVVKAEMGI |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
88625 : 99600
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048798|88625:99600|DBSCAN-SWA AATGATTCCAAAAATAATTCATTATGTATGGGTCGGAGGAAATCCAAAACCCAAAAATATTCAAAAATGTATGAAAACTTGGTCAAAACATTTAAAAGATTATCAAATTATTGAATGGAACGAATCTAATTTTGATATTCATGAAAATAAATATGTTGAGCAAGCATATAAGGCAAAAAAATGGGCCTTTGTGTCTGACTATATTAGGGCCAAAGCAATTTATGAAATGGGTGGCATTTATTTAGACACTGATGTCTTAGTATTAGATGATTTACATGAATTATTAGATAATCGTGCCTTTGTTGGATTTGAAAATATAGATAATCCATTTACAGCTGTTTTTGGTGCAGAACCTAAACATCCTTTAATTAAAGATATGCTTGATTATTATGATGATCGTAATTTCGAATTTGATGCTAGTGATCAATTAAAGGGCGTAAATACAGTATCTGTTTCTGATATTTTGAAAAAAGTATATGGTGCTAAGCCTAATAATCTTGAACAAACTATCAAAGATGGTGTTCATGTTTATCCAGATGGAATTTTATGTAATCCTTCCGGTCAATCAAAAACAATCCATGTATTTACTGGTACATGGATGGAGGGGAAAAAATCACTTAAGCGAAAAATTATTACAATGTTAAAAGTTAATATCAAAACTAAGTTTCAAGCTAAAGTTTATGCTAAGTTGTTTCGTTAATTTGAATATAATTGTTAAATATTGCACTACTAGTGTATGGGGGAAAGTAAATGTTTAATCCAGAATTAGATCGAGATGATTCACTAATATTACATACAGATTTATATGAAATTAATATGATGTATACATATTTTAAAAAGGGTATTAGTGAACGCAAAGCCGTTTTTGAAGTATATTTTAGAAAAGAGCCTTTTGGTAATGGTTATGCTTTATTTGCTGGATTAAGTCATATGATTGATTATATTAAAAAAATACATTTTGCCGAGAGTGATTTGCAATATTTGAAAGAAAATGAAAATTATGATGACGATTTTATTTCATATTTGCGTAATTTGAAAATTAATTTAACAGTTAGGTCTGCCCAAGAGGGTGAATTAGTTTTTGCTAATGAGCCGATTGTACAAGTAGAAGGTCCTTTAGCTCAATGTCAATTAGTGGAAACTGCAATTTTGAATATTATTAACTTTCAAACTTTGATTGCTACGAAGGCAGCTAGAGTAAAGATTGCAGTTGGCGATCAAGCTATAATGGAATTTGGCTCTAGGCGTGCTCAAGAAACAGATGCTGCAATTTGGGGAACACGAGCTGCATATATTGGTGGTTTTGATGCAACGAGTAATGTTAGAGCGGGAAAATTATTTGGTATTCCTATTTCTGGCACACATGCTCATTCATTAGTTCAAGCATTTGGTAATGAATATGACGCCTTTATGGCATATGCTCAAACGCATAAAGATTGCGTCTTTTTGGTCGATACTTATGATACATTGCGTAGTGGCGTGCCAACTGCTATTAAAGTAGCAGATGAAATGGGTGATAAGATTAATTTCTTAGGTGTGCGGATTGATTCTGGTGATATGGCCTATATTTCTAAAAAGATCCGTAAACAACTTGATGATGCTGGATATCCTAACGCTAAAATTTTTGCTTCTAATGATTTGGATGAAAAGACCATTTTGAACTTAAAAATGCAAGGTGCAAAAATAGATGTTTGGGGTGTGGGTACCAAATTAATTACAGCTTATGATCAGCCTGCTTTAGGTGGTGTATATAAGTTAGTTTCGATTGAACATAGTGATGGTAAAATGTATGATACATTGAAGATATCTTCTAATGCAGAAAAAGTTTCAACTCCAGGTAAGAAACAGGTCTGGCGTATATCAGCTAATTCTGAAAAGAAAAATGAAGGTGATTGGATTTCATGTTGGAATGAGGATCCTCGTAAGTTAGACGCCCTTTATATGTTTCATCCACAATATACTTATATTAATAAGGTAGTGACAAATTATACTGCCTATCCAATTTTGAAAGATATTTTTGTTGATGGTAAACAAGTTTATGTAGAGCCTTCATTGCAGGAAATTAAAAAGTTTGCAATGACTAATTTGGATGGATTATGGGACGAATACAAACGTGGCTTGAATCCACAAGAGTATCCAGTTGATTTATCGCAAGCTTTATATGATCATAAGATGCATTTGATTAGCAAAATTAGAACTCAGATAATAAAAAGGGAATGTGAAGACTAATAATGAGAGATTTACAAAAAAAGATTATTGCGTATGAACAAGTTGCTCCAAAAATTGATGCTAAAAAAGAAATTAGACGTTCAATTAATTTCTTAAAAGAATATTTACTCAAAAATACAGGATTGAAAACTTATGTCTTAGGTATATCAGGCGGTCAAGATTCAACTTTAACAGGTAAGTTAGCCCAAATGGCTATCAGTGAATTAAGAGCAGAAACTGGTGATAATGAGTATCAATTTATTGCTGTAAGATTACCTTATGGTGTCCAAAAAGATGCAAGTGATGCTGCTGATGCCGTTGCATTTCAACATGCTGATCAGGATTTGATAGTTAATATTAAATCTGCGGTAGATGCAACAGTTAAAAGTCTAGAAGAATCTGGCATTGAAATTAGCGATTTTAATAAAGGAAATATCAAAGCTCGTCAAAGAATGATTGTACAATATGCTATTGCTGGTGCCAATAAAGGTGCCGTTATCGGAACAGATCATGCTGCTGAGAATATTTCTGGATTTTTCACTAAATATGGTGATGGAGCGTCTGATATTTTACCTATTTTTAGATTAAATAAACGTCAAGGAAAAGCTCTGTTACAAGAATTGAATTGCCCCAAGCATTTATATCAAAAGGCACCTACTGCCGACTTAGAAGAGAAACGACCAGCTTTGCCTGATGAGCAGGCATTAGGAGTCAGCTATGATAAGATAGATGATTATCTTGAAGGTAAAGAGTTAGCTAAAGTTGATGCTGAGCGGATTGAATATTTGTGGACAAGAAGCGAACATAAGCGACATTTGCCGATTACGATTTTTGATAATTTTTATAAAAAAAATAATTAAAATGAGCCGTCTTACTTGCCAACATTAAGATTTATTTAATATAATATAATCTAGTAAGGGAGTAACGGCAAGCAATTGCGGTAAGTTCAACACCCGAGAATGATAATTCTCTGGACTTATCTTAATAAGTGAGACTTATGTTTTATTTGACATAAGTCTTTTTTTATCAATTGGAGGAAAAATTGTGCAACAAGAAATTTATCAACAAAAATCTGAAGATGTCATTAAACAACTTAAAACATCTATAAATACGGGACTAAGTTTACAACAGGTATCAGATAGACTTAAGACGGATGGCTTGAATGAGCTTGTGGGTAAGCAAAAACGTGGATTATTCTTGCGATTTATTGACCAATTTAAAGATTTTATGATTATAGTCCTGATTGTAGCTGCCATTTTATCAGGAGTAGTTGCAAATGAATGGACAGATGCGGCTATTATTATGTTTGTCGTTTTACTTAATGCGGTTTTGGGAATTATTCAAGAAGCTAGAAGTGAGGCAGCTATAGAAGCATTGAAGCAAATGTCGACGCCAAATGCTCATGTTCGTCGTGATGGTCAAGTTGTTGAGATTCCTAGTACACAACTTGTTAAGGGTGATATCGTATTACTTGAAGCAGGGGATGTTGTGCCAGCAGATTTGCGGTTAGTTTTAGCTAAAAATCTTAAGATTGAAGAAGCTGCTCTAACTGGTGAATCTGTTCCAGTAGAAAAAAAGAGTAAAGTGATTGAAGCTGATGATGTTGCTTTAGGAGATCGAATCAATATGGCATACTCTAACACCAATGTTACTTATGGTCGCGGTGAAGGGGTAGTTGTTGCTACAGCGATGGATACTGAAGTAGGTAAGATTGCAACAATGTTAAATAATGCTGATGAAACTGATACTCCATTAAAAGCCAACTTGAATCAATTAGGTAAAACTTTAACTTTAATGATTTTAGGAATATGTGCATTTGTATGTGTGGTTGGTATTTTTACTAAACAAGGAACGATGCCTTTTGACAAGCTGGCTATAGAAATGTTTTTAGTAGCTGTTTCTTTAGCAGTAGCTGCTATTCCAGAAGGGTTGCCAGCAATTGTTACTATCATTTTAGCTTTAGGTACTCAAAATATGGCTAAACATAAGGCGATTGTGCGAAAATTACCTGCTGTCGAAACTTTAGGAGCAACTGATATTATTGCTTCTGATAAAACAGGTACTTTGACTCAGAATAAAATGACTGTTGAAAAAGTGTTTTATAATGATACATATCATTGTGACAAATTAGAAGATAAAGATAATCTTGCCATTAAAATAATGACCCTAGCTAATGATACTAAAATAACCGATAATAATTCATTGCTAGGTGATCCTACTGAAACAGCTCTTATTCAATATGCTTTAGATTCTAAATGGAATGTTGTTGACTATTTAGCAAATAATAAGCGTGTTCAAGAAGTACCATTTGATTCGGATAGAAAATTGATGTCAACTGTACATCAACAAGCAGATGGTAAATATTTTGTAGCAGTGAAGGGTGCTCCAGATGAGTTATTAAAGCGAGCAGTTTCACTATGGCATGATGATAAAATAGTTGATCTTGATGCATCAGAAAAAGCTAAAATTTTAGCTGCTAATAATGAAATGGCCAAAAATGCGTTGCGTGTTTTAGGTTTAGCTTACAAAGTTGTTGATGATAAGTTCACTGAAGTTAATTCAACGGTGGTTGAACAGAACTTAATTTTTGTTGGTTTAGTAGGTATGATTGATCCAGAACGACCAGAAGCTAAAGCTGCAGTTGCTAAAGCAAAATCTGCTGGCATTAGGACTATAATGATTACTGGGGATCATCAAGTAACTGCTGCTGCAATTGCTAAACGTTTGGGAATTATTGGCGAAGATGATACTAATTGTGTCATTACTGGTGCAGAACTAGACAAGATATCAGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048798|88625:99600|90855_91692_+|WP_163623571.1|DBSCAN-SWA MRDLQKKIIAYEQVAPKIDAKKEIRRSINFLKEYLLKNTGLKTYVLGISGGQDSTLTGKLAQMAISELRAETGDNEYQFIAVRLPYGVQKDASDAADAVAFQHADQDLIVNIKSAVDATVKSLEESGIEISDFNKGNIKARQRMIVQYAIAGANKGAVIGTDHAAENISGFFTKYGDGASDILPIFRLNKRQGKALLQELNCPKHLYQKAPTADLEEKRPALPDEQALGVSYDKIDDYLEGKELAKVDAERIEYLWTRSEHKRHLPITIFDNFYKKNN >NZ_CP048798|88625:99600|91876_94540_+|WP_163623572.1|DBSCAN-SWA MQQEIYQQKSEDVIKQLKTSINTGLSLQQVSDRLKTDGLNELVGKQKRGLFLRFIDQFKDFMIIVLIVAAILSGVVANEWTDAAIIMFVVLLNAVLGIIQEARSEAAIEALKQMSTPNAHVRRDGQVVEIPSTQLVKGDIVLLEAGDVVPADLRLVLAKNLKIEEAALTGESVPVEKKSKVIEADDVALGDRINMAYSNTNVTYGRGEGVVVATAMDTEVGKIATMLNNADETDTPLKANLNQLGKTLTLMILGICAFVCVVGIFTKQGTMPFDKLAIEMFLVAVSLAVAAIPEGLPAIVTIILALGTQNMAKHKAIVRKLPAVETLGATDIIASDKTGTLTQNKMTVEKVFYNDTYHCDKLEDKDNLAIKIMTLANDTKITDNNSLLGDPTETALIQYALDSKWNVVDYLANNKRVQEVPFDSDRKLMSTVHQQADGKYFVAVKGAPDELLKRAVSLWHDDKIVDLDASEKAKILAANNEMAKNALRVLGLAYKVVDDKFTEVNSTVVEQNLIFVGLVGMIDPERPEAKAAVAKAKSAGIRTIMITGDHQVTAAAIAKRLGIIGEDDTNCVITGAELDKISDTDFVKCVANYKVYARVSPEHKVRIVKAWQKNGKIVAMTGDGVNDAPSLKQADIGIGMGITGTEVSKGASDMVLADDNFATIVEAVRQGRKIFSNIQKAILYLMSCNVGEVLTVFMMTMLGWEILAPVQLLWINLVTDTLPAVALGVDPVERDIMKHKPRGKKSNFLSAVGISIVYQGILEGILVLGVYQIGLHIGPHIGNYKLLHGDALTMAFLTLGLIQLFHAFNSKFITKSIFCKDTLKNKWFNLAIIVSAIIMSAVEIPGLTSLFKVTELNIAQWLVVLTAGILMIAIVEIVKLFQRNAEK >NZ_CP048798|88625:99600|96043_96655_+|WP_006738206.1|DBSCAN-SWA MANKKINTIAIFSVFVAIVMLQTFIPCLGYIRFFPALPAITTLPLTVTVFGILMGPKMGGFLGFFWGTLSLFRAYTQPADLVSIMLFQNAVIAIIPRFLAGVVPGLVGKLWQQRHSTRNYLISVAAGVASTLTNTLMVILFTSIFYNHSSKLMSCLGYTDTSKSLIIVLLIALSFNSACEAIFTGILTPLIVVPLRKVLSKRL >NZ_CP048798|88625:99600|89374_90853_+|WP_163623570.1|DBSCAN-SWA MFNPELDRDDSLILHTDLYEINMMYTYFKKGISERKAVFEVYFRKEPFGNGYALFAGLSHMIDYIKKIHFAESDLQYLKENENYDDDFISYLRNLKINLTVRSAQEGELVFANEPIVQVEGPLAQCQLVETAILNIINFQTLIATKAARVKIAVGDQAIMEFGSRRAQETDAAIWGTRAAYIGGFDATSNVRAGKLFGIPISGTHAHSLVQAFGNEYDAFMAYAQTHKDCVFLVDTYDTLRSGVPTAIKVADEMGDKINFLGVRIDSGDMAYISKKIRKQLDDAGYPNAKIFASNDLDEKTILNLKMQGAKIDVWGVGTKLITAYDQPALGGVYKLVSIEHSDGKMYDTLKISSNAEKVSTPGKKQVWRISANSEKKNEGDWISCWNEDPRKLDALYMFHPQYTYINKVVTNYTAYPILKDIFVDGKQVYVEPSLQEIKKFAMTNLDGLWDEYKRGLNPQEYPVDLSQALYDHKMHLISKIRTQIIKRECED >NZ_CP048798|88625:99600|94685_95828_+|WP_006729620.1|DBSCAN-SWA MSSWETKFAKKGLTFDDVLLIPAESHVLPNEVDLSVKLADNIKLNLPFISAGMDTVTESSMAIAMALQGGMGVIHKNMSIVAQAGEVATVKGVMLSGNFTRAAVDEENKLLVAAAVGVTSDTFQRAQALLEAGANAIVIDTAHGHSAGVLRKIKEIREHFPKATLIAGNVATAEGTKALFDSGVDIVKVGIGPGSICTTRIIAGVGVPQITAIYDAASVAREYGKTIIADGGIKYSGDIVKAIAAGGNAVMLGSMFAGTTETPGQIITDGDKKYKVYRGMGSIGAMAQSHGSSDRYFQGGVNEANKLVPEGIEARVEYKGDVSDTIFQLIGGLRSGMGYVGARNIDELINKAQFVQMTNSGLRESHPHDVQITKAAPNYK >NZ_CP048798|88625:99600|88625_89324_+|WP_006729616.1|DBSCAN-SWA MIPKIIHYVWVGGNPKPKNIQKCMKTWSKHLKDYQIIEWNESNFDIHENKYVEQAYKAKKWAFVSDYIRAKAIYEMGGIYLDTDVLVLDDLHELLDNRAFVGFENIDNPFTAVFGAEPKHPLIKDMLDYYDDRNFEFDASDQLKGVNTVSVSDILKKVYGAKPNNLEQTIKDGVHVYPDGILCNPSGQSKTIHVFTGTWMEGKKSLKRKIITMLKVNIKTKFQAKVYAKLFR >NZ_CP048798|88625:99600|97371_99600_+|WP_163623573.1|DBSCAN-SWA MNEESMLAGLNPEQQQAVQCTQGPLLVVAGAGSGKTSVLTRRIAYLIREKGVAPWNILAITFTNKAASEMRERVKQLLDSDADSIWMSTFHALCVRILRRYAEKIGYANNFSIADTAEQLTLIKRILKELNIDSKKFDPKSLVNAISNAKNDLLDPEEYAKQVSNEYEKKIAIVYREYQKNLKHDCIMDFDDLIMQTLVLFKSEPEVLHYYQNKFWYILVDEYQDTNQAQYELCHLLAQQHKNICVVGDADQSIYGWRGANMQNILNFEQDYRNDNCNTIKLEQNYRSTGHILNAANAVIKNNKNRKPKKLWTNSGEGSKVNYYRASTGNDEAIFIIGKINKEIKENGYKYSDFAILYRTNAQSRNIEEAFVKSNIPYKIVGGHKFYDRKEIKDIMAYLRLVANPADYMSLHRIINAPRRGIGPTTISKFEEFMFSNNYTALEALQSLELAPISGKLFNIMKDFGRKLEEMIIFAKNNTVTELTNKILNDFGYIDALKAEHTIEADTRLENLDEFLTVTKQFDDNYEANEDGAKAVDDFLAEVSLLSDQDDLQENIDQVALMTLHAAKGLEFPVVFLVGMEEGIFPLARAQSDNSELEEERRLAYVGITRAKKQLYLTNAIHRMLYGHYQNNNASRFISEINDIDLADISPVADNSFSSFANKNTNSHSVQHEKPVIAKKAAGAIGADKKTWSVGDQVEHKAWGKGVVTKVNGSGEDMELDIAFANLGVKRLLAAFAPIKKV |
7 | Bacillus_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
809798 : 817910
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048798|809798:817910|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048798|809798:817910|811211_812495_+|WP_006735513.1|DBSCAN-SWA MINTIPSKRKVFLAGVNLNNSNFNYYMDELAKLAEANQMEVVGRSWQNLETIVTGTYFGLGKINEIKHLAKELHATVIIINDELTPTQIRNLEKMTKLSILDRTELILEIFSNRVRTKQAKLQVQLARLQYELPRLHPSENRLDQQRGSGGGFNNRGAGETKLELNRRTIQQQISNIKKDLKKINQQEIIKATQRNNSFLPQVALVGYTNSGKSTTLNNLLNEYSKSADKKQVFTKDMLFATLDTHVRRIDLENKLSFIISDTVGFVSNLPHNLIESFKATLQEVRDADLIINVVDASDPNILQMIQTTTKVLDELQIGDVPIITAFNKVDKTDRSYPQIEGNGNILYSAKDPESIRLLAKLIQKKIFSNLQVVELFLPLQMGDKLNYLHTHGQVIEEKYQDNGIYIKTKICKKIADKFAKYNYKSK >NZ_CP048798|809798:817910|809798_810434_+|WP_006734269.1|DBSCAN-SWA MYTKEIIQSLIQNKIVTISPDKPFTYASGMLSPIYTDFRLTISYPKLWNMICDDLATLIKEKYPQVTVIGGVATAGIPHAAIVAQKLGLPMIYVRPKPKDHGKGRQIEGLFTAQDKIVLIDDLITTGGSVINAVKAAQKSGADVIGVSSIFTYYLPDAKDNFAKINIPFAPLLSYPELLKQEKETGHVTDKEYMLLKNWHDDPWAWGKQFN >NZ_CP048798|809798:817910|813364_814024_-|WP_006728888.1|DBSCAN-SWA MLLKNITVKYGRKVALDNISLTLRNDGKIVGILGDNGSGKTTLVNLILKNINKFKGQREIEGSFSYMPDRYFLYESMTIKESIDLFKSVYSDFDEQRMYKILQKFSISPQLKLHDCSKGMHEQVHLALVFSRNTDFYVLDEPLSATDPIKRRYFMDIIQNYRRKNSTVLMVTHLIRDLGDMLEDVIFIKDGHILSHNSRAEILAVDKTLEDAYIRRIGQ >NZ_CP048798|809798:817910|810527_811178_+|WP_006735508.1|DBSCAN-SWA MKKIYLVRHGQTFINRYDKMQGWCDTPLTNQGIKEAENTGVVLKDIPFDIAFSSDLKRACDTCDYIISENCNRHELQHISSPFFREQFYGYFEGMNSDEAYRMIGGPHGYPTREKLLSAIDLDTVKDYMKEADPYHDAESASEYWQRLNQGFSLLNQLDDVKNILLVTHGFTIRSIVNRFAKGKYNLLHGPQNGSITIMKINDKEIKITDYNKLEL >NZ_CP048798|809798:817910|815436_816726_-|WP_163623701.1|DBSCAN-SWA MTVVAVVGSQWGDEGKGKMTDYLSQSADMTVRSNGGNNAGHTIAFGGKTFKMRLIPSGIFEAKKETVIGNGVVINPEVLLDEIKYLEDNGINTDKLAISNRAHIVMPYDILQDVYQEEAKGANKVGTTKNGIGPTYMDKASRIGIRMCDLLEKDTFEEKLRFNLNEKNALFVNVYGKEALKFEDIFEKYWKLGQELKKYVTDTSVIVNDAIDNDDKVLFEGAQGVMLDIDQGTYPFVTSSNTVTGGITTGIGIGPSKVDTVIGICKAYTTRVGAGPFPTELLDETGNYIRETGHEYGTVTGRPRRVGWFDSVALRHSKRVAGIDALSLNLLDVFSGLKTVKIAVAYELDGQKIDYYPASLKELERCKPIYEELPGWDEDITKVTKLEDLPENARHFLSRVSELVGVPLVTVSVGPDREQTIVLKNPWEM >NZ_CP048798|809798:817910|814137_815433_-|WP_006728889.1|DBSCAN-SWA MLDRYTRPEMGKIWTDENRYAAWLKVEIAATNAWSELGEVPVADAQKIAKKASFTAERVAEIEAITHHDVVAFTRAVSESLGEERKWVHFGLTSTDVVDTAQGVLLKEANDILRSDLAHLKNTIAKKALKYKDTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGRWYAEIIRDIDRFEHAAAGVESGKISGAVGTFANVPPEVETSVLHQLGLNQQPITSQVLPRDLHAEYLAMLALIATSIENWATEIRSLQRSEIHEVEEHFRAGQKGSSAMPHKRNPIGSENLCGMARVIRGHMLTAYENVSLWHERDISHSSAERIILPDTTIAIDYMLNRFDKILENLDVFPETMLKNMDRTYGLIYSQRLLLKLIDEAGLSREKAYDMVQKLTARSWNEQIQFRQLVDESEITKYLSKSDIDDAFDYHYHLKHVDDIFKKLGIL >NZ_CP048798|809798:817910|816917_817910_+|WP_006731873.1|DBSCAN-SWA MSNYFSMEAFDYDDIQLVPNKCIIKSRKEADTSIKFGKRTFKLPVVPANMESVINEPLAVWLAENDYYYVMHRFQPEKRADFIKMMHDKGLFASISVGIKDEEYKFIDQLANEKLVPEYITIDVAHGHSDYVIKMIKYIKEKLPESFLTAGNIATPEAVRELENAGADATKVGIGPGRACITKLKTGFGTGGWQLAALRMCSKAARKPLIADGGIRHNGDIAKSVRFGASMVMIGSLFAGHLESPGNIITIDNKTYKQYWGSASAVQKGAYNNVEGKQLLVPYRGSIKDTLKEMQEDLQSAISYAGGKDLHSIRVVDYVIVKSSIMNGDK |
7 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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