Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP044463 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 chromosome, complete genome | 0 crisprs | TnsE_C,csa3,cas14j,cas3,DEDDh,WYL | 0 | 0 | 8 | 0 |
NZ_CP044473 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-10, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044467 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044471 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-8, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044468 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044470 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-7, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044466 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044464 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-1, complete sequence | 0 crisprs | RT,WYL,DEDDh | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP044465 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044472 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-9, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044469 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-6, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
106861 : 149025
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044463|106861:149025|DBSCAN-SWA 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40 | uncultured_Caudovirales_phage(34.78%) | integrase,transposase | attL 92190:92206|attR 112117:112133 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
160332 : 166896
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044463|160332:166896|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044463|160332:166896|166363_166579_-|WP_001054887.1|DBSCAN-SWA MNLTYITTKELAERIHYNERTIRNQLKDSVLIEGIHYIRPFGGRKILYVWERIEEDMTKTTLGSLHSLQLQ >NZ_CP044463|160332:166896|161518_162574_+|WP_163170708.1|DBSCAN-SWA MWQDDHFIENNKPTPNEQLKFLKHIQQILQSGTFTSTYKFALLISITRLAIEQGQDTGAALHLEYQDIAEKFIDLYWKQSLPFQFNQYEPFTIHQSTGKQAKIISEIQNAQQQFKTLAALRKDVLYWNRLKRTVATTVKQMPVVYLQNLNGQTVEFLYCLEDSKQSLKLLPKVMYCLRQFSEIIEELCQKRWIDFVRLNKQNLVVLDGLPDLDEFMFAPSRNQLGQVADFLIDLQECQCFYCGKSLKNSKYAVDHFIPWSLYPADTGHNFVLADEKCNSQKSNYLASEQFLQQWQERNYLHDQSIVREISQLGFLTDLQRSHRVADWAYKQAIENEYLVWLGGKDKHILGV >NZ_CP044463|160332:166896|162799_163285_+|WP_163170709.1|DBSCAN-SWA MTQVQLQQLQKQLWNIANTLRGTMGADEFRDYILGFIFFKYLSEKSVNFANELLDGEDLIQKFIEENMPKMINGQSVQTAFSEFWDAEKEQAYQHLCKEENLKPEAMKQVLEHYEFTKRLPRKEELKDLPNYKVKLFERENVFSNLLVKTRQLIEKFYVGF >NZ_CP044463|160332:166896|165165_166350_-|WP_163170713.1|DBSCAN-SWA MAAIRTRYGKLCVDFRYLNIRCRETTALEDNAQNRKKLEKAIERMEAEILLGIFDYAKYFPKSSRLKEIKNAENRVNEISSKTPLFSKFCEIWFTDKEIEWRTSYKGKIQIVIKKYLIPFFGTIPVINIKKSDILGFRSSLAKVTHGKNQECLSPSRINQIMIALRMILDSAAERYDFDSPYKNIKNLKQGKIEVTPFSLKEVHAILATVRDDFKPYYTVRFFTGMRTSEIDGLQWKNVDLPRREIHVREALVNGELGGTKTYGSDRTIQMSDRVYQAFLQQKSLNNGKSEFVFCNRDGGPLDYRLVNKRVWHPLLRFLGLKPRRAYQTRHTAATLWLSAGENPEWIARQLGHSTTEMLFRVYSRYIPNVTRRDGSAFEAMLERLNTEELAHEQ >NZ_CP044463|160332:166896|166689_166896_+|WP_163170714.1|DBSCAN-SWA MIVCNLPVLLAERRMKVADVARATGMSKTTLHKLYNGQSTRVDFETLEKLCALLNVDVGDLLKFKPDE >NZ_CP044463|160332:166896|160332_161532_+|WP_163170707.1|DBSCAN-SWA MNQTSNYYNQHAQAFFENTYQVEMESLYAPFLRYLPEQALILDLGCGSGRDTLAFKKKGYQVEAIDYSAELVEKARELTGIEVRQQSFYELNEVAKYDGIWACASLLHCERDRLTEVLARIFKALKPNGVCYMSFKYGDTDREKEGRSFTDLNEKQAYDLLKQIDQALLLQQWITVDKRPDRTEEWINVIWKKQSHAFDYYPQRLYSRAELMKEPSLIPAEHGIYFWWFKTNPPGIPIKNCITYQEYTLLYVGISPDKKAKPNSKSNLRIRLKTHFAGNAEGSTLRRTLGILLAEMSGYPLRRVGSGNRMTFTHSGEQWLDAWLEDNAYVSWIICEEPWNVEEKVFEQTILPLNLKGNQHEFKETLSAMHKKAIQNAKMMEIATEAGLQRQVKLQHVAG >NZ_CP044463|160332:166896|164927_165176_-|WP_163170712.1|DBSCAN-SWA MNSKAFFGGVVVSPEADMVARELIHELHIPKLHNLAFLLEINKCFDDHQALRLWLQRMLDDGQAHYDDLAQQARLRLMSLAH >NZ_CP044463|160332:166896|164316_164859_-|WP_163170711.1|DBSCAN-SWA MHKDISIWMPLYIGDLQAKFARMTAEQIGAALLLMMDFWKNGAIPHDLATVCSITKLSQHTKAKSLLNTLIALELFEVESEQIHSNFLTSLKSQALQNQQMKSDKAKNAAQARWGKSASNAQASTKQRKVNAQAAPEKSPSITQAMLESCPSSSSSSSSSSSSSNFEEKNEDFLENSKWI >NZ_CP044463|160332:166896|163562_164306_-|WP_163170710.1|DBSCAN-SWA MNTMLKTLQFRTETTETLCPTHHIPLMEIAGHKLCKLCTKETVHHSHAAYADELQQRLLQQKIKNSGLNKRYLDRGFKNYVVACPAQDNTIKLCQAFAQQIISDHNPNMLMIGTPGTGKTHLSASIIRNILHNSTKSARYYTSAEIAQKMMDTWSDASRSEKEVIDHFSSFDLLVIDEYGLHDRHEKRLEMVHKVLYSRYDNMKSTLLISNFTVQNMQRDLGVRLWSRLHENSLIIVPCYWADQRIT |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1538866 : 1609167
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP044463|1538866:1609167|DBSCAN-SWA AATGAATTACGACTATATTATTATTGGTGCAGGTTCTGCGGGTAATGTATTGGCAGCGCGTTTAACGGAAGATCCAGAGATCAAAGTCTTGTTGCTGGAAGCGGGTGGTCCGGATCATCGGCTGGATTTTAGAACCCAGATGCCAGCCGCTTTGGCTTATCCATTACAGGGACGACGCTATAACTGGGCCTACCTGACCGACCCCGAACCACATATGAATAACCGTCGGATGGAATGCGGTCGTGGTAAAGGCTTGGGTGGTTCTTCGTTAATTAACGGCATGTGCTACATTCGCGGTAATGCCATGGATCTGGAACAGTGGGCCAGCCTGAAGGGGCTTGAACACTGGAGCTATGCCGAATGTCTGCCATATTATAAAAAAGCGGAAAGCCGTGATATTGGTGGCAATGATTATCATGGCGATTCTGGACCGGTTTCGGTGGCAACGCCTAAACAGGGCAATAATGAACTGTTTCATGCCATGATCGAAGCGGGTGTACAGGCCGGTTATCCACGTACCGATGATCTGAACGGTTACCAACAGGAAGGCTTCGGTCCGATGGATCGAACTGTGACGCCGCAAGGCCGTCGTTCCAGTACAGCACGTGGTTATCTCGATATGGCCAAAGGTCGGGATAATCTCACGATTATTACCCACGCTATGACCAACCGTATTCTGTTTAATCGTAATCAGGCGATTGGTGTGGAATATTTTGAGGGGCAAAATACCTTGCAGCCGATTCAGGTGTTTGCCGATCGTGAAGTGCTACTTTGTGCTGGTGCAATTGCATCACCGCAAATCCTGCAACGTTCTGGTGTGGGTTCGGCTGAACTGTTAAAAAGTCTGGATATTCCTGTAGTTCAGGATTTACCGGGAGTGGGTGAAAACCTGCAAGACCATCTGGAAATGTACTTGCAATATCAGTGCAAAAAACCGGTGAGCTTATATCCGGCTTTGAAATGGTATAACCAGCCGATGATTGGGGCAGAATGGTTATTTTTGGGTAAGGGCATTGGCGCGAGCAATCAGTTTGAAGCAGGTGGTTTTATCCGCTCTTCAGATGAATTTGAATGGCCGAATATTCAGTATCACTTTTTACCGATTGCGATTAACTACAATGGCACCAATGCCATTCATGAGCATGGTTTTCAAGCTCATGTTGGTTCAATGCGTTCGCCGTCGCGTGGCCGTGTCCGTCTGAAATCCAAAGACCCGTTTGAGCATCCAAGTATTCTGTTTAACTATATGAGTACGGAACAGGACTGGCGCGAGTTCCGCGATGCGATCCGGATCACCCGGGAAATTATGCAGCAGCCGGCACTTGATCCCTATCGCGGTGAAGAAATCAGTCCAGGTAAAGAGGTACAGACCGATGCCGAGATTGATGAATTTGTTCGTAATCATGCAGAAACCGCGTATCATCCATCGTGTAGCTGTAAAATGGGTGAGGATGACATGGCGGTTGTCGATGGTTATGGACGCGTACATGAAATGCAGGGTCTGCGTGTGATTGATGCCTCGATAATGCCTTTGATCATTACCGGTAACCTCAATGCAACTACGATTATGATCGCTGAAAAACTGGCAGACCATATTCGTGGCAAACCTGCTCTTGCGCCTTCATCGGCACCTTTTTACAAGGCGCCTCGCGCTTAAATCATGGTTTTATTCCTGTCATCTGGCAAAGCAGGAGTAAAACGAATTTCAATTTTTTTCCCAAAACGGAGATAAAACCTCGACTGCTGTCGTTTTATCTCCGGCTTTGCTTAATACAATTTATATTTTATGAAAATATTCAATCAAACAGTGCTGTTTGGCTGTGCTGCTGTTTCAAGTTTTTACTGTTATGCCGATGATGCGGAAGTAAAACAAATAGAAGCAAGCGGAAACTTGAGTGTGGTCTCCAAATACGTCTCCCGCGGTTTGACCAATGCACCTGAAAATGATGACGTTGCTGTACAGGCTGCATTGAATCTGGCTTATGGCAATTTTTATGTGGGATATTGGGGATCTACGCTTGGATACTCTTATGCAGAAGTGCAGGGGCGTCCGGGACATCGTTCAGACAAATTTGAGCATGACTTTCTGCTGGGTTATACCCATAGCAGCGAACATTATGACTGGGATTTATGGAACGCAACCTATTATTATCCGGGCGGCAAGCATACTACCGGAAATGAGCTGGGTTTAAATGTAAGTCGTGCGTTGAATGATCAGACCAGTATCGGGGCCAGCATATCGGCCTATCTGTATGATGTGGCTTATGCCAATCAGGGCGATACTTTTTATACACTGAATCTGACCCATCAATTGAATGATCGCCTGAATGCCAGCGTTACGGCAGCAGGGAGCTATTTTAACGATGAAGGCAAATATGAGGGCGGTGAACTGGGCGATACCGAAAAGCAGTTTGCCTTTCGTTATGCTTCTGCCGGACTCAGTTATGCGCTTTTACCTCAGGTAAGTTTGTCGGGTGAATATATCTTTGGCGGTTATGACCGCTATGATGACAAGCAGCGTAATCTTGCAGTAGTTGCACTGAGTTATGATTTTTAAAATTATGAAATCATTCAGACTAGGCGGGTGAAAATCTGCCTTATCTGCAACTTTGATTAATAGCTTAAGCCATGACTTGAAGTTGATTCATGCTCCGGCAGCTCAGGAAAGACTGAGGGTCTGGTTTAATCTGCCAGAATTTCAGACAAATATTATCAATTTCATAAAATAATTCTATAATAGCGCCCATTCTCGGCAGCGTTATCCAGACACTTAGTCAAATGGCATAACCTGACCATTTTCTATTTTTCATTCAAGTTCTCCTCCGTGAACCGGCTTGTATATTCAGATTCAGCATCTTATCTGTCCGTGACGGCACATAAGAATATTTAGGTATCCACATGGAAATTAAGGTCAATTATCTCGATAATCTACGCCAGGAAGCCAAGTTCGATGACTTCACGGTGATTGCCGATCAGCCGATCCGCTATAAAGGCGATGGTTCGGCACCTGGCCCATTCGATTATTTTCTGGCGTCGTCGGCACTTTGTGCGGCTTATTTTGTCAAAGTCTATTGCGCAGCACGTGACATTCCAACCGATAATATCCGCCTTTCGCAAAACAATATTGTTGATCCTGAAAACCGCTATAAACAGATTTTTAAAATCCAGGTTGAACTGCCGGCTGATATTTCTGAAAAAGATCGCCAAGGAATTTTACGTTCGATAGACCGTTGTACCGTCAAGAAAGTAATTCAAACCGGTCCTGAATTTGTCATTGAAGAAGTGGAAAGTATTGATGCGGATGCTCAAGCCTTGTTAATGCCAAGTCTAGCTTCTGAAAACAGTACGTTTATTCCAGGTAAAGACCTTCCGCTGGAAGAAACGATTGCCAATATGTCTGCCATTCTAGCAGGGCTTGGCATGAAAATTGAAATTGCCTCTTGGCGTAATATCGTGCCGAATGTGTGGTCGCTACATATCCGTGATGCGCAGTCGCCAATGTGTTTTACCAATGGTAAAGGTTCAACCAAAGAAAGTGCGCTGGCATCTGCCTTGGGTGAATTTATTGAACGCCTGAACTGCAACTTCTTCTATAATGATCAGTTCTGGGGTGAAGATATTGCCAATGCAGAATTTGTGCATTATCCAGATGAAAAATGGTTCCAGCCAGGTCCGAATGGCGAACTACCTGCAGAAGTTTTAGATGAACATACCCGTGAAATTTATGATCCTGAAGATGAGTTATTGGGTACCCATCTTTATGACACCAACTCGGGTAATAAGGCTCGTGGCATCTGTTCATTGCCATTTGTACGTCAATCTGATGGTGAAACCGTTTATTTTCCGTCGAATCTGATTGAAAACTTATACCTGAGCAATGGTATGAGCGCCGGGAATACGCTGGCTGAAGCGCAAGTACAATGTCTGTCTGAAATTTTTGAGCGTGCAGTTAAACGCGAAATTCTGGAAGGTGAACTGGCACTTCCGGATGTGCCTGAACATGTTCTGGCAAAATATCCAAAAATTGTTGAAGGCATTAAAGGTCTGGAAGAACAGGGCTTTCCGGTTCTGGTCAAAGATGCGTCATTAGGCGGCCAGTTCCCGGTGATGTGTGTCACCTTGATGAACCCGCGTACCGGCGGTGTATTTGCCTCATTCGGTGCCCATCCTAACTTTGAAGTGGCCTTAGAGCGTAGTTTGACTGAATTGCTGCAAGGTCGTAGTTTTGAAGGTCTGAATGATCTGCCAAAACCAACCTTTAGCAGCAATGCAGTGACTGAACCGAATAACTTTGTTGAGCACTTTATTGATTCTAGTGGTGTAGTGTCTTGGCGTTTCTTCAGCGCGAAATCAGATTATGATTTTGTCGAGTGGGATTTCACCAATAATGGTCAAAACTCGAATGCGGATGAAGCTCAGGAATTATTCACGATTCTTGAAGACATGGGCCATGAAGTTTATATGGCGGTGTATCAGCATTTGGGTGCCACCGCTTGCCGTATTCTGGTACCGGGCTATTCGGAAATCTATCTGGTAGAAGATCTGGTTTGGGACAATACCAACAAGGCTTTGTTATATCGTGAAGATATCCTGAATCTGCACCGTCTGGATGATGAACAACTGCAAGCATTGGTTGAGCGTCTGGAAGAAGCAGATGAGGATGACTATACCGAGATCAAAACCTTGATCGGTATCGAGTTCGATGAAAATACTGAATGGGGCCAGCTCACTATTCTTGAACTGAAACTTCTGATTTATGTGGCTTTGCAGCAATTTGAAGAAGCTAAAGATCTGGTTGAGCAGTTCCTGCAGTTTAATACCAATACCGTTGAACGTGGCCTGTTCTACCAGTGCATGAATGTCGTTCTGGAAGTCATGCTGGATGATGACATGGAACTGGAAGATTATGAGCACAACTTCCGCCGTATGTTTGGTGATGAACGTATGGATGCGGTGATGGGTTCAGTTGAGGGCATAGTTCGTTTCTATGGCCTGACTGA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59 | Catovirus(20.0%) | holin,plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1770236 : 1780921
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP044463|1770236:1780921|DBSCAN-SWA 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CCAATATTTTCCTTTACTTGGCAACCAGAAGCGGTACTTTGGAATTGCGGAAGATGGTGGTCGCGATACTACCCAGGAAGAACTGGTGGATTTTGCTGTGACTGAATGCACCCAGCACAATCAGCTGAATTCCCTGCTCCTGCTGATAAGACAGAATGTTCTCTGCCACATCACCATAGCGGTATTCAGGAACAACATCCAGTCCAGCTTCTTTCAGATAGTTCAACGGTTCATTCAGGATTTCAGCATGATCTCCGACATACAACAAATGACACTGTAGCAGTTTCAGCAAATCACTTTCTGCAATGCGTCTCATCATCTGGATACAGGTTGGTGAATATTCGTAGGCAAAGATAAAGCGTGTTGGCGGTTTAAAGTTTTCACCCACTGTCATCACCGTACAATTGGCACCACGGATAAAGTTTTCCACATTGGTGCCCATCGGCTTGTTTTTCTCAGCAGAGCGTTCACCCAAACGTCCAATAACGACAATATCATCAGGTCTGAGTAACTGAAAGCTTTGTTCCAGGAAATCCCCTTTTTCCTGAATATGGATGGTGTTGATATTGTGTTTTTCTTTGATCTGGTCAGAAATGTGTCGCAGCAGATTATTGCTATAGTCTAAAGCCAGTTCACTCTGTTTCTGTTCAAGCTCGGCCAGTTCTTTTAGTAGCATGGCATTGCTTTCAAAACCAATCACACCACTAATTTCCCCCAAATGATAACTTGCAGGGTAATAATCCAAAACTTGCAATAACACCAGCTCGCGATGGGTCTGCTTGGCAATCCATGCAGCCGCTTCTGCGAGGGCATTAATGCATGGAGAAGAATCAATGCAGGCAATGACACGTTTCATGTTTAGCCTCTCTCATTATAATAAAAGTTCTTAGATATTTTTAAGTTAGCATAGCCTTCGGCAAATGTGCAGCAAATTCTGTAGCACAGGATTTGAATTATGTTATTTTTTATGTGACGTTCTAGTGGCTTATACATTTTTGAACTACTCGAACAATCCTTGTATCGTCTGAAACTCTAAACATGTATTAATCCCGGTAGCGAATCAGTTTGGCCGGATTACCTGCAACGATCATGCGTTCATCCACATCTTTGGTTACCATACTATTCATACCAACAATGGCCTGATCCGCAATTTTCACTCCGTCTTTAATACCGACATGAGCACCAAGCCAGACATCACGGCCAATTTCAATCCCTTTGGAACGCACCGGCTGTTTATAAATGGGCTGTTCCAGTTCCATCCCATGATCAAAAGCGTACAGGTGACAATAGGCTGCCATACGCACCTGATCATGTAACTTAATTCCTACCCGTCCACCATCCAGAATACAGTGGTGATTAATCGCAACTTCATTGCCAATTTCTAGTGGCCCATGCAAGGTACAGTCCGCTGCGATAAAGCTATGATCACCAATTACGATTTTTCGGCCCGGTTCAGCGAAGATATGGGCCAGTGGTGAAATAAAGCAGTTCTCCCCAATCTCAACTGTTTCCATTTCACGCAGATAGTCCTGATATTCGCGCTGCCACTGTTCTGCCCAGCCCCGGTTTTTAGGCTTGAGTGACCAGTATAGCCACGGCATATAATTAAGACGATGCTTATGCTGCTCGCGGTATTTCAGTAGAGGGTCCTGCTGCTCAGTCATCTTGGGGCTCATCTATAATTTTTAAGGCTTCACGTCCGCGGCTGATATCCTGAATCTTCAAGGCAAATGGCTCAATCTGATGTTTCTGCATTTGCGCAATAACCTCGACGCCTTCTGCGGTATAATCTTCCTGATAGTCAATCTGTTGCTGATTCAGCTCATACTGAAAAATAGCCCATTCACTAAAATTACAACGAAAGGACACTTTCTTCTTTTCAATCAGTTCAATCTTTTCAGCTAAGATTAGGCATTGCCCCGCACAGCCCCCATAAGCACGAACCAAACCACCCGTACCTAGCTTGATTCCTCCATACCAGCGATTCACTAGCACCAATACATTGGTCAGCTCATTGCCTTCAATGGTCGCTAAAATCGGTCGACCTGCGGTGCCAGAAGGCTCGCCATCATCATTAAAACGCACATTATGTCCAATTTTCCATGCCCAGCACTGATGCGTCGTGGTGGTATCACGATAAACTTCCAGAAAATCCTTTACATCCTGTTCGGATTCCACCGGCGTAGCAAAGGCCTGAAAGCGGCTCTTCTTGATCTCTTCTTCAAAACTGACAAGGCTGGCAATAGTAAAAGACATTGGATTCAAACAATAACATCACTGTGTTGCAGTATAACGTGTTTGCTGGCACAAACAAAAAAGCCCCTAGACATAGAGGCTTGATTTTGTACAACTACTATGAAGGATTAGCGTTCGCGTAATGCTTCTTTGGCCTTGTTAAACGGTTTAACCAGATAATCCAGTACGGTTTTTTCACCCGTACGGATATCCACGGTGGCCACCATGCCCGGGGTGATATTAAATTCCTGTCCGGCTTTATTGGTCAGCTTGTCATTTTCGGTACGGATATACACACGATAGTAAAATTGGTCCTGTTTGACTTCATCACGTAGAGTATCGGGGGAAATCACAGTGACTTTACCTTTCAGGCCGCCATAAATCGAGTAATCATAAGCGGTAATTTTGACCAGAGCTTCCTGATCCGGACGGATAAAGGCAATATCACGTGGTGAAATACGTGCCTCGACCAGCAATTTTTCATCCAGCGGTACAATCGTCATCAACTTGCCGTTTTGTGGAATGACGCCTCCCAAGGTCATGACATCAATTTCCTTCACCACGCCACGTACTGGCGATTTGAAAATAGTCCGGTTCAGCGTATCGGATTTACCACGTACCACCTGTTGCTGAGTTTCCACATCAGTATTGGCTTTGGCAAGTTCTTCACGCGCTTTCACAAAATACTGGTTCCGCACATCATTCATCTGGTTTTGCAGGTCATTGGCTTCACGTTTTAAACGCAGAACTTCCACTTCGCTTGCAGCCCCTTTTGCAACTAATGGTTCAGTCATCGCCAGTTCTTGCTGTACCAGTACCAATGCCTGCTGTAACCCTGCTAAAGATTGTTCCAGATTAGCACGACGCGATTTATATAATGCAGTTTCCTCTGCCACCAGTTTTGGCTCTTTGAGTACCTCTGGCGGGAAGGACAACGGCGCACCAGTGACTTCAGCACGTAAGCGTGCCGCAGTTGCACGCGAAGAAATTAACAGAGAAGCCGATTCACCTACATTGGATTCAAAACGGGTGGGATCCAGCTGTGCCAATACCTGACCCTGCTCGACAATTTCACCTTCTTTGACGTTCAGTTTGGTGAGGATACCACCTTCTAGAGACTGAATAACCTGTTCCTTGGAAGAGGGTATCACTTTACCGGTGCCTGTCGAAACTTCTTCCAGCTTGAACAGCCATGCCCACGTCAGCAGAATCAGTAAGCCTATGCCAATGATCCAGATAATCACACTTGATTTTGGCAAAGGTGGTTCCTGAAAGCTGACTTTGGTTGAACGCTTGATTTCCTGTTGTGCACTCATGCGCTTGCTCCCGTAACACGCTTCGCTCCACCTTGTGATTGGTTCAGGATCTGGTCCCGCGGACCATCCATCACAATCTTGCCGTCATTTACGACAATAATACGATCTACCAGTTCAAGTACCGCACGACGATGTGTAGCCACCACCATGGTTCGGCCAATCAGATAAGTTTTTAAATTATCAATCAGCTGTTTCTCAGAAACATCATCAATGGCAGCAGTGGGTTCATCCAGCAATAAAATTCGTGGTTGGCGAATCAGTAAACGAGAAAGTAACAAGGCTTGACGCTGCCCCCCAGAGAAGCCCACACCACCTTCCAAAATGATATGGTCCAGGCCTTCTTTCTTTTCCTGAACAAAGCCCAATGCACCTGTGAGTTGCAAAGCTTCCAGGATTTGCTGGTCAGTTGCCAGTGGTGCACCCAGCGTCAGGTTTTCACGAATGCTGCCATAAAATAACTGTGAATTTTGATTCAGTAGGCCCATATCACGGCGCACATCTGCCGGATCAATCAGGTTCAGGTCAATCCCATCAAGTTTAACCTTACCCTGTAACGGCGTTTGCATACCGGATAACAACTGCAATAAGGTTGATTTACCGGCACCATTACGCCCCAAAATCGCAATCTTCTCACCAGGCTTGATGTCCAGTTTGGGAATTACTAGAGTCGGTTTAGGGTCATCTTCACCATATTTGAATACTGCCCCGCTCAGCTCGTACTGACCTTCGAGTAATGGGCGGTGAATCAGATGTGAATAATCCGGCTGATCTACCGGCTTTTTCATCAGTTCATCCAAACCGTTTTTCGCGACTTTCGCCTGCTGTAAACGCCCCAACACACCGGTAATTTGGGAAATTGGCGCAAGCATACGCGAAGACAGGATTGAACAGGCAACCAGTGCACCTGTGGTCATTTCACCTTCCATAACGGCAAAACAGCCCACTAACACGACGATGGCAAATGTCAGGCCTTGAATCTTTTGCGTCCAGGCGGTCATCAAACCAACGATTTTACGTTGCTGCATGCTGACATCCGCAGACACTTCATTCATATGGTTCCACTGGTTCTGGAAACGCGATTCAGCACGCAGTAGCTTGATGTCTTCAATTCCTTGTACTGCTTCCACCAGCAATGCATTACGGATTGCAGATTCACGCATGCCCATTTGTGCCAGCTCACCCAGTTTTTTCTGTGCCAGAATCCCCGGTAGAATCATTATGGGTACGACTAACAGCATCACCCAGAACAGGTTTCCACCAATGAGCCAGAAAATCCCCAAGAACAGGAAGAAAAATGGCAGGTCGGCAATTGCAGTCACCGTAGTAGACGTCACCAATTCACGAACACCTTCCAGTTCACGAATCTGTGAAATAAAAGTACCGGTAGATTTTGAACGCTCTTTATTTTTAATGCGTAAGGCATGACCAAAAACCTGGTCAGAAATACGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP044463|1770236:1780921|1777598_1778786_-|WP_004894337.1|DBSCAN-SWA MSAQQEIKRSTKVSFQEPPLPKSSVIIWIIGIGLLILLTWAWLFKLEEVSTGTGKVIPSSKEQVIQSLEGGILTKLNVKEGEIVEQGQVLAQLDPTRFESNVGESASLLISSRATAARLRAEVTGAPLSFPPEVLKEPKLVAEETALYKSRRANLEQSLAGLQQALVLVQQELAMTEPLVAKGAASEVEVLRLKREANDLQNQMNDVRNQYFVKAREELAKANTDVETQQQVVRGKSDTLNRTIFKSPVRGVVKEIDVMTLGGVIPQNGKLMTIVPLDEKLLVEARISPRDIAFIRPDQEALVKITAYDYSIYGGLKGKVTVISPDTLRDEVKQDQFYYRVYIRTENDKLTNKAGQEFNITPGMVATVDIRTGEKTVLDYLVKPFNKAKEALRER >NZ_CP044463|1770236:1780921|1770236_1772870_+|WP_163171445.1|DBSCAN-SWA MTSSELMADLSTLTPMMQQYMSVKMQHPHSLMFYRMGDFYELFFEDAHKAAKILGITLTHRGKANGQPIPMAGVPFHAAEGYLARLVKKGETVVICEQIGEVTGKGPVERGVVRIITPGTLTDDALLGAHQTSNLVALCIQQNKIGIALLDLSAGIFKVQQIDYDLNQLAIELARLMPSEIVVDENLQEQDLVEHLKRQLDVPVSKRPNVDFNLNNAQKTLCDQFAVSTLAGFGIDHLPLAKAAAAALIHYAKETQKTALPHIRSIQLEQSSDFIALDPVTRRNLELIEPLFEHGTSLFQLINDCQTAMGGRLLSRTLMQPLRDTAILDERLDATQVLLDGFHESPIRLVLKEISDIERVLSRIALGSARPRDLVQLRQACAQIPFLRHALQPMVSQQQSKLLIQLNEELGDFHGLHERLMSAIVENPPVLLRDGNVIAEGFDAELDELRKIRDHAGQFLIDLEIKEREQSGIPTLKIGYNRVSGYYIELTRAQAEQAPEHYIRRQTLKNAERYITPELKAFEDKVLSSESRALAREKLIFEMLLDELREDIGNLQMMSSAIAQIDLLCNFAHQARLRNWSRPKYSPEIGLKIQAGRHPVVEALSKTAFTPNDTQLDYQHRMAIITGPNMGGKSTFMRQTALIALLAYCGSYVPAQAVTLGPIDRIFTRIGSADDLSTGKSTFMVEMTETSQILHHATSQSLVLMDEVGRGTSTYDGLSLAWACVLDLTRRIQCLCLFATHYFELTELASESGIDNYHVTAREVNGNLILLHKVQQGPASQSHGLQVAKLAGIPASVIREAQNRLRILEKQHHTKPQSPQPDLFAIEQVETVVERIIEVEKPSAALELLEDIDVDSLSPREALQQLYALKDLLKLPG >NZ_CP044463|1770236:1780921|1773072_1773396_+|WP_004812595.1|DBSCAN-SWA MTFVVTENCIKCKYQDCVEVCPVDCFYEGPNFLVINPDECIDCALCEPECPANAIFSEDELPEGQEVFIELNAELSQKWPNITQIGDQPADREEWNGKADKLQYLEK >NZ_CP044463|1770236:1780921|1774381_1775047_+|WP_004894345.1|DBSCAN-SWA MQQMWTDLDNYIDSHLIPDDSILKQTLENTAAHGFPDHLAVAANQGMLLQMLIQMNGCKRVLELGTFAAYSTMWLARALPEDGYILTIEGRDTHAAMGQENIERANLKQTVELKCGRAADILKALPEDTEPFDFIFIDADKQSYPEYLELSLKLSRSGTVIFLDNVIRAGAIIDLDNNKPSIEGIRSMFEAMQNHPRLLSSTALQTVGSKGHDGFALAIVK >NZ_CP044463|1770236:1780921|1776278_1776875_-|WP_171063875.1|DBSCAN-SWA MKYREQHKHRLNYMPWLYWSLKPKNRGWAEQWQREYQDYLREMETVEIGENCFISPLAHIFAEPGRKIVIGDHSFIAADCTLHGPLEIGNEVAINHHCILDGGRVGIKLHDQVRMAAYCHLYAFDHGMELEQPIYKQPVRSKGIEIGRDVWLGAHVGIKDGVKIADQAIVGMNSMVTKDVDERMIVAGNPAKLIRYRD >NZ_CP044463|1770236:1780921|1776891_1777491_-|WP_163171446.1|DBSCAN-SWA MSFTIASLVSFEEEIKKSRFQAFATPVESEQDVKDFLEVYRDTTTTHQCWAWKIGHNVRFNDDGEPSGTAGRPILATIEGNELTNVLVLVNRWYGGIKLGTGGLVRAYGGCAGQCLILAEKIELIEKKKVSFRCNFSEWAIFQYELNQQQIDYQEDYTAEGVEVIAQMQKHQIEPFALKIQDISRGREALKIIDEPQDD >NZ_CP044463|1770236:1780921|1773535_1774249_+|WP_004812593.1|DBSCAN-SWA MKHFYKGLLGLSMIPFVMVGCTTATKKPMTLPDGKRIYIPQEQVKVDRKVLPKSIPFAYTNWAAVANNLSRVREYEVFLERNSVGNIIPSFELMRTARDWSRCGGPQYMVPSRELWSNQLPTLRVFKYLVAANVLNDFEVTSVYRDLPLNKCAGGANSSRHLYNSAIDFRIGPEFPQPEDYAYIENTKFKLCQFWIQHGQSLNMGLGLYASGQIHIDTQGYRTWGPDLSRRSSMCNY >NZ_CP044463|1770236:1780921|1775248_1776091_-|WP_071321085.1|DBSCAN-SWA MKRVIACIDSSPCINALAEAAAWIAKQTHRELVLLQVLDYYPASYHLGEISGVIGFESNAMLLKELAELEQKQSELALDYSNNLLRHISDQIKEKHNINTIHIQEKGDFLEQSFQLLRPDDIVVIGRLGERSAEKNKPMGTNVENFIRGANCTVMTVGENFKPPTRFIFAYEYSPTCIQMMRRIAESDLLKLLQCHLLYVGDHAEILNEPLNYLKEAGLDVVPEYRYGDVAENILSYQQEQGIQLIVLGAFSHSKIHQFFLGSIATTIFRNSKVPLLVAK >NZ_CP044463|1770236:1780921|1778782_1780921_-|WP_163171447.1|DBSCAN-SWA MSNTINYQPWLQAILNIAKHYRIEPSEERIRLQLDWNQHHDVDELLKVVTRQIGLNVRKNKFDASLLSPWKLPILVEFENGEVGVIERIDSEGNASVQLSGDQGLSQVFDLDHLKQGAKSLYILRPESSVPDARVDEYIKPFEKNWFWSIVLNDWKRYIDVMFASLIANILALATIVFSMNVYDRVIPSQSIPTLWVLAGGVLIAAIFEFTLRVSRIYLSDIIGKRADLRISDQVFGHALRIKNKERSKSTGTFISQIRELEGVRELVTSTTVTAIADLPFFFLFLGIFWLIGGNLFWVMLLVVPIMILPGILAQKKLGELAQMGMRESAIRNALLVEAVQGIEDIKLLRAESRFQNQWNHMNEVSADVSMQQRKIVGLMTAWTQKIQGLTFAIVVLVGCFAVMEGEMTTGALVACSILSSRMLAPISQITGVLGRLQQAKVAKNGLDELMKKPVDQPDYSHLIHRPLLEGQYELSGAVFKYGEDDPKPTLVIPKLDIKPGEKIAILGRNGAGKSTLLQLLSGMQTPLQGKVKLDGIDLNLIDPADVRRDMGLLNQNSQLFYGSIRENLTLGAPLATDQQILEALQLTGALGFVQEKKEGLDHIILEGGVGFSGGQRQALLLSRLLIRQPRILLLDEPTAAIDDVSEKQLIDNLKTYLIGRTMVVATHRRAVLELVDRIIVVNDGKIVMDGPRDQILNQSQGGAKRVTGASA |
9 | Indivirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1817395 : 1831939
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP044463|1817395:1831939|DBSCAN-SWA 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15 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | integrase | attL 1816448:1816463|attR 1828574:1828589 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1839464 : 1859292
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP044463|1839464:1859292|DBSCAN-SWA 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28 | Acinetobacter_phage(60.0%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2090805 : 2097614
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP044463|2090805:2097614|DBSCAN-SWA AATGATCGACAACTATGACTCCTTTACTTACAACATCGTCCAGTACTTTGGCGAGCTGAATCAAGAAGTAAAAGTAGTCCGTAATGATGCCGTGACTTTAGAAGATATTGAGCGATGGCAACCTAAATATCTGGTCATTGGCCCTGGTCCATGTTCTCCAAGTGAAGCCGGTATTTCTATTCCTGCGATTCAGCACTTTTCTGGCAAGATTCCGCTATTAGGCGTATGTCTCGGCCATCAAAGTATTGGTCAGGCATTTGGCGGTGACATTGTGCGCGCTAAACGTGTCATGCACGGCCGTCTATCCGACATGTATCACAGTGACAAAGGGATTTTCAGCAACCTGCCTTCTCCATTTTCTGCGACGCGCTATCACTCACTGGTGATTGATCAGGCGACCTTGCCGGAATGTCTGGAAGTGACCTGCTGGACCAATGAAGCAGATGGCTCAATGGAAGAAATCATGGGCGTAAAACATAAGACATTACCTGTTGAAGGTGTGCAGTTCCATCCGGAGTCCATCCTAAGCCAGCATGGCCATCAAATCTTTAAAAACTTCCTAGAAATTTATGCGTAAATAATGATGAATATTCAACAAGCTTTAAACCATATTACAAAAAACATTCACCTGACTCAGCCACAAATGGAAGACGTGATGCGTTGCATCATGTCGGGTGAAGCCACCGATGCACAAATTGGCGCCCTGATGATGGGTCTACGCTTAAAAGGCGAAAGCATCGATGAAATTACCGCTGCAGCACGTGTGATGCGTGAATTAGCTCTGAAAATTGATGTCAGCGATTTGCCATATTTGGTCGATATTGTTGGCACAGGTGGTGATGGTCAGAACTTATTTAACGTCTCTACTGCTTCAAGTTTTGTTATTGCGGCTGCAGGCGGAACTGTTGCTAAACATGGCGGTCGTGGTGTATCTGGTAAATCAGGTTCATCCGATGTCCTAGAGCAAGCAGGTATTTGCCTTGATCTGAGTCTTGAGCAAAGTGAACGTTGCATTCGTGAAATTGGTGTAGGGTTTTTATTCGCCCCAAATCACCACAAAGCGATGAAATATGCCGCTGCGCCACGTAAAGAATTGGGTTTCCGTAGTATTTTTAATTTACTCGGCCCGCTTACGAATCCGGCTGGAGTAAAACGTTTCGTCATTGGTGTTTTCTCACATGAATTGTGCCGCCCAATGGCTGAAGTGCTTAAGCAACTCGGTGCTGAACATGTCATGGTGGTGCATTCACAAGATGGTTTAGATGAAATCAGTTTAGCATCTAAAACTTATGTGGCTGAACTCAAGAATGGTGAAATCACTGAATGGGAAATCATTCCTGAACAGGTCGATATTGCCTCTCAAACCTTAACAGATCTAACCATTGACAGTGCTGCCGACAGCTTAAAACTGATTAAAGACGCGTTAAGCAAAAAGAAATCTGAAATTGGTGAGAAAGCCGCAAATATGGTGGCGCTTAATGCTGGTGCAGGTATCTATGTAGCTGGTTTAACCACCAGCTATAAACAAGGTGTTGCTCTTGCCCATGACATTATTTATGGGGGGCAAGCTCTAGAAAAAATGGGCATTTTGGCAGAATTTGGCAATACGCTCAAAGAATACGACATCTAAGACAGCAGGAATTTTTAATCATGGTAGATATCGCAAATACGATTCTAGGTAAGATCGTAGACCGGAAAAAAGAAGAATTTGCTGCACGTCTGAAGCAAAAAAGTTATAAGGATGTTGAAGAGCTGGCTCAAGCTGGCACACCTGTACGTGGCTTTGCTCAATCATTGCTGGCTAAGCGCCCGGGGGTGATTGCTGAAATCAAGAAAGCATCTCCATCCAAAGGCATTATCCGTGAAAACTTTAATCCAGCGGAAATTGCCGCACAGTATCAGGATGCAGGCGCTGCATGTTTATCCGTATTGACCGATGTGGATTTCTTCCAGGGTGCTGATGAGAATATTCAGATTGCACGTTCGCATTGCGATTTGCCAGCCCTACGTAAAGATTTCCTGATTGATCCTTATGGGGTGATTGAAGCGCGAGCTTTACATGCAGACTGTATCTTGCTGATTGTGGCTTGCCTGTCTGATCAGCAACTGGAAGAAATGTCGAAGACTGCTTTTGAGCATAATCTGGATGTTTTAGTCGAAGTGCATGATGAGGCCGAACTCGAACGTGCGCTTAAACTTTCAGATCGCTGCCTGTTGGGTGTAAATAATCGTAACTTGAAGACCTTTGATGTCGATTTAAATACCTCACTGCGTTTAAAACAGTTACTCGATCCATCTCGCCTGTTGGTGACTGAAAGTGGTATCGCAACACCTGCGGATGTCGCGATGATGCAGGAACATGATATTCATGCCTTTCTGGTTGGTGAAAGCTTTATGAAACAGCCGCGTCCGGATCATGCATTCCGCGAACTGTTTGGTGAACCAGAAGCTGTATAAAAATTTTCAATTCAGGGCAAAATTCGTTTTGCCCTGATTCTTCCTACTCCCTGAATCAACTTTTAGAACTTCTAATTTATCTGTTTTTCTGTTCTGCCCCAGCTTGAAATCTCTCTCTAAAATTCAGCCTATCAGCCTGGATATAATCAAATACATTCTGCTTATATGAACAGTAAGACCTAAAAAATCAAATAATAAACGTGAGCTCTTATTGTATATTCACGTTTAAATTTCATTTAAATATTCACTTGAACAGAATACCTAAACAGTATGCGCGCAATGCAGTTCTCATTTTCTTGAATCAGGACTATAATTTATCAATATTTTCGCATCTTGCATGTTTTTTGATTATGAGCAAACACGATTCTTCGCTTTCCAAAGATCAGTTTAACTTACTAAAGCAATTTAAAAAACAGATCAGCAATCCACAGCCACGCGTTGAAGTTGAAGCACCTGTGGTGAAAACACCTGAACAGGAACAAGCTGATGAGCTGGAATTGTTTCGTAAACAGATGCAGGGTGTACAAAAAATCGATAATGGCAATATCGCAAAAATCGAAAAAGCCGGTAAGAAAAAACCGGATGCACAGACACTAGCCAAACGTGCTGCTGCTGAAGGTCCGATGCAGACTGATGAAACTGCCCTTTCTGATACCCAGGCCATGCTGAATCCAGTCGGAAGTCAGGCTGCGTTGAGCTATCGCATTGCGACCCTACAGCACAAAGTCTTTGAAGATCTGAAAGCCGGCAATCTGCGCTGGTATGAAGCAGTCGATCTGCACGGCTGTACCGTGGAAGAAGCACGTGTTGCAGTATTGCAAATTATCCAGATGGCGAAAGATGAAAACCAGAACGTAATTAAGATCGTACATGGTAAAGGTCCGGAAGCCATTTTAAAGACCTACGTAAATGGCTGGCTGCGTCAGCACCGTGATGTTTTGGCCTTTGTCAGCGCACCTGAAAACCAGGGCGGTACTGGCGCTGTGCTGGTTCTGCTCAAGCGGGCGGAAAAGAATCCAAAGTTCAAACAGTAATCGGAATTAACTCCAAATTAAGGCAATGTAATAGTTTTCTGCTACAATGCCGTCCTTGTTCTATCTCAGTGTAAGTGAATACGTCATATGACTATGCAGCAATCCTACGCAAACATTCTTACTGCCGTTGGTGAAGATTTAAATCGCCCTGGTCTCAAAGATACGCCTGTGCGTGCTGCGAAAGCGTTTTCGTATTTAACTTCCGGCTATAGCCAGACTCTGGAAGAAGTGACCAATAATGCGGTATTCCCGTCTGATAACCATGAGATGGTTTTGGTCAAAAATATCGAATTCTATTCGCTGTGTGAACACCATTTATTGCCATTTTATGGTCGTGTGCACATTGCTTATTTGCCAGAAGGCCGTGTTTTAGGTCTGTCTAAATTTGCCCGTATTACTGAAATGTTTGCACGTCGCTTACAGATTCAGGAAAATCTGACCCAGCAAATTGCAGAAGCAGTGGCTGAAGTGACTGGCGCACGTGGTGTGGCTGTGGTGATTGATTCTGCGCATATGTGCATGATGATGCGTGGTGTGGGCAAGCAGGAATCAACGACACGTACTGTTTCTTTTGTGGGTGATTTTAAAACCAATAAAGAAGAACGTCGTGAATTCCTGAGCGCAGTACCTGAAGCTTACTAATCGTTTCGATTTCAAAAGCCTCGACACTTGTTGAGGCTTTTTTATATGTGCTTTAATTTGTTCAATTTCAGATAACTTTAGCTTGAGGATTCACTATGTCATCAATTTGGTTAGCAGGTCATGGTTTAACCCAGAGTGAAACCATAATTGATTATCCCCGTCCTGATCGCCTGGTCGCTGGCAATCCTAAACGTTCTACACAAAGCTTGTATGATCATCCCAATATGAATTGCGGTATCTGGGAATGTGAAGTCGGTGCATGGAATATTGTGTTCGCTGAAAATAAACAGGAATTCTTTACGGTCATTGAAGGTACAGTTCGCCTGCATGATGCCAACAAAAAAAGTTATGTAGAAATCAAAGCCGGTGATGCAGGTATTATTCCACCAGGCTTTGTCGGTACTTTTGAAGTGGTAGAGGCAGTCAAAAAATACTTTGTCGTAATTGAAGCATAAAACCTGCTTTTGCAGGTTTTTCTTTTTAAAATTATAAATAAATTCGACTTCTACAATTCATTACAGCATCACTACCCGCTTTAGCACTCTTCCAGCCTACATTATTCCTGATCATCTATTCAGTTATGTAGATTGATCTGCTTGTCTATTGCACTTAATAAAAAATACATACATTTTAAGAAAGCTCATGGACTTCAAAAATACAGACAGGCATTCATGGTTATAGGGAAATATAGATACATAAGGAGAAAATATGACGATTAAAAAATCTTCAAAAAATGTTCCCCGTAAAACCTCGCGGGTAGTTTCGACCAGTTTTGATTACTCGCTGGATTTTGAAAAAATTGATTTTAGAAAACGGCCTGAATTGTACCGGATTGGACGTGGTGAACAGGGCGTGCTTTCAGTTGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP044463|2090805:2097614|2091387_2092434_+|WP_163172726.1|DBSCAN-SWA MNIQQALNHITKNIHLTQPQMEDVMRCIMSGEATDAQIGALMMGLRLKGESIDEITAAARVMRELALKIDVSDLPYLVDIVGTGGDGQNLFNVSTASSFVIAAAGGTVAKHGGRGVSGKSGSSDVLEQAGICLDLSLEQSERCIREIGVGFLFAPNHHKAMKYAAAPRKELGFRSIFNLLGPLTNPAGVKRFVIGVFSHELCRPMAEVLKQLGAEHVMVVHSQDGLDEISLASKTYVAELKNGEITEWEIIPEQVDIASQTLTDLTIDSAADSLKLIKDALSKKKSEIGEKAANMVALNAGAGIYVAGLTTSYKQGVALAHDIIYGGQALEKMGILAEFGNTLKEYDI >NZ_CP044463|2090805:2097614|2094388_2094937_+|WP_171249847.1|DBSCAN-SWA MQQSYANILTAVGEDLNRPGLKDTPVRAAKAFSYLTSGYSQTLEEVTNNAVFPSDNHEMVLVKNIEFYSLCEHHLLPFYGRVHIAYLPEGRVLGLSKFARITEMFARRLQIQENLTQQIAEAVAEVTGARGVAVVIDSAHMCMMMRGVGKQESTTRTVSFVGDFKTNKEERREFLSAVPEAY >NZ_CP044463|2090805:2097614|2095032_2095392_+|WP_163171644.1|DBSCAN-SWA MSSIWLAGHGLTQSETIIDYPRPDRLVAGNPKRSTQSLYDHPNMNCGIWECEVGAWNIVFAENKQEFFTVIEGTVRLHDANKKSYVEIKAGDAGIIPPGFVGTFEVVEAVKKYFVVIEA >NZ_CP044463|2090805:2097614|2095645_2096209_+|WP_163171646.1|DBSCAN-SWA MTIKKSSKNVPRKTSRVVSTSFDYSLDFEKIDFRKRPELYRIGRGEQGVLSVEPYKSEILPHWRFADEEKAQASSTRIYAMFIDYLEKEDFIGADMARKFLQMGYTRARRYANHKGGKKYDGPVPDDKKGLSGAHGRDELPRQREDPVKAAAARIFKQKWDEAKLHPEYIKQKQKFKDWIESLQSHQ >NZ_CP044463|2090805:2097614|2090805_2091381_+|WP_171056639.1|DBSCAN-SWA MIDNYDSFTYNIVQYFGELNQEVKVVRNDAVTLEDIERWQPKYLVIGPGPCSPSEAGISIPAIQHFSGKIPLLGVCLGHQSIGQAFGGDIVRAKRVMHGRLSDMYHSDKGIFSNLPSPFSATRYHSLVIDQATLPECLEVTCWTNEADGSMEEIMGVKHKTLPVEGVQFHPESILSQHGHQIFKNFLEIYA >NZ_CP044463|2090805:2097614|2096210_2097614_-|WP_163171648.1|DBSCAN-SWA MDNECMDMLAGQWQHICQNYSSDDLVHAFQFIQDNALILVEEFYKNMLVEKESAEFFSDDLIQQRLRNTLHQWLLESFSVGINKHYLQAVQKQHTVGHVHARVGIPSWLIMRGVREIERKIFELLEEDEQLLTLTTCSYLVQVMSFATEIMCRSYEAKTAKNQEIKHSYRLFSAMQDVAVQKDKQRSCLLDWENELMYKVFSGQETLRHPLLSKSEFGLWFIHKASYAFTGSDQVQLIIERIHQVDTLNQIILECQDKTKKLNLIQQIRELNREIQHLIDQLFQVAEYIESGNDSLTQLLNRRYLNTIISREITYSRQNQTPLALLALDADFFKTINDKFGHAAGDLALKFIADGLQKYSQGSDYAFRVGGEEFLLLLVDTDQRRAMNIAENIRKFIEEGIITTAQGIQFKFTVSIGCVIYDGHPDYQKFLDTADTALYAAKNTGRNRVYLAKNNPDTRVSNTPSLT >NZ_CP044463|2090805:2097614|2093611_2094295_+|WP_163168420.1|DBSCAN-SWA MSKHDSSLSKDQFNLLKQFKKQISNPQPRVEVEAPVVKTPEQEQADELELFRKQMQGVQKIDNGNIAKIEKAGKKKPDAQTLAKRAAAEGPMQTDETALSDTQAMLNPVGSQAALSYRIATLQHKVFEDLKAGNLRWYEAVDLHGCTVEEARVAVLQIIQMAKDENQNVIKIVHGKGPEAILKTYVNGWLRQHRDVLAFVSAPENQGGTGAVLVLLKRAEKNPKFKQ >NZ_CP044463|2090805:2097614|2092454_2093261_+|WP_163171642.1|DBSCAN-SWA MVDIANTILGKIVDRKKEEFAARLKQKSYKDVEELAQAGTPVRGFAQSLLAKRPGVIAEIKKASPSKGIIRENFNPAEIAAQYQDAGAACLSVLTDVDFFQGADENIQIARSHCDLPALRKDFLIDPYGVIEARALHADCILLIVACLSDQQLEEMSKTAFEHNLDVLVEVHDEAELERALKLSDRCLLGVNNRNLKTFDVDLNTSLRLKQLLDPSRLLVTESGIATPADVAMMQEHDIHAFLVGESFMKQPRPDHAFRELFGEPEAV |
8 | Acinetobacter_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2773199 : 2838178
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP044463|2773199:2838178|DBSCAN-SWA CATGAGTCGCGCCATATCGCATATTGATACCTTCCAAGGCTTAATTCTTGCCTTACAAAACTACTGGGCGGAGCAAGGCTGCGTCGTTTTGCAACCTTACGACATGGAAATGGGTGCAGGGACATTCCACACTGCAACATTCCTTCGTGCGCTAGGTCCTGAAACCTGGAACGCGGCTTATGTTCAGCCATCACGCCGTCCGAAAGATGGCCGTTATGGTGAAAACCCGAACCGCCTGCAACACTACTACCAGTTCCAGGTGGTATTAAAGCCAAACCCGGACAATATCCAGCAGCTTTATCTGGATTCTTTAAAAGCCATCGGTATTGATCCTTTAGTTCACGACATCCGTTTTGTGGAAGATAACTGGGAATCTCCAACACTGGGTGCTTGGGGCTTAGGTTGGGAAGTTTGGCTGAACGGCATGGAAGTGACTCAGTTCACGTACTTCCAGCAAGTCGGTGGTGTTGAATGCTACCCGGTAACTGGCGAAATCACTTACGGTCTGGAACGTCTGGCAATGTACTTGCAAGGCGTTGATTCAGTTTACGATCTAGTTTGGACCAAAGGTCAGTTCGGTACAGTGACGTATGGCGATGTGTTCCATCAAAATGAAGTAGAACAATCGACTTATAACTTTGAATATGCACCAGTCGACAAGATGTTTGAACTGTTCGACTTCTATGAAGCTGAAGCAACGCGTTTAATCGAAGCGAAACTTCCACTTCCTGCCTATGAGCAAGTGGTAAAAGCATCGCATAGCTTTAACCTGCTGGATGCACGTGGCGCAATTTCTGTGACTGAACGTCAGCGTTATATCTTACGTGTACGTACATTAGCACGTTCGATTGCAACCAGCTATGTAGCAGCACGTGCTGAACTTGGTTTCCCAATGGCTGAACCACATCTTCGTGATGAAGTTTTAGCGCAGTTAAAAGCACAAGTTGAAGCGGAAGCAAAAGTTGAATCTAAGGAGAGCAAATAATGTCTAAACATACAGTATTGTTCGAATTAGGCTGTGAAGAACTTCCACCGAAAAGCCTGAAAAAATTACGTGATGCTTTGCAAGCTGAAACGGTTAAAGGCTTAAAAGATGCGGGTCTTGCTTTTGATTCAATCGAAGCTTATGCAGCACCACGTCGCCTTGCACTTAAAATTATCAATGTTGATGGCGCACAAGCAGACACTCAAAAACGTTTTGACGGCCCTGCTGTTCAAGCCGCTTACGATGCAGAAGGTAAACCAACACGTGCCCTTGAAGGCTTTATGCGTGGTCAAGGCATTACGGTTGATCAGGTCTCTACTTTCCAGGCCGGTAAAGTTGAAAAAGTATGCTACTTAAAAGACGTAAAAGGTCAAAGCCTTGATGTACTTTTACCACAAATTTTACAAAATGCTTTAGACAACCTACCAATCGCAAAACGCATGCGTTCAGCGGCAAGCCGTACCGAATTCGTTCGTCCTGTAAAATGGGTGATGTTGTTAAAAGACAACGATGTGGTTGATGCAACTATTCAAGATCACAAAGCAGGTAATGTGACTTATGGTCACCGTTTCCATGCACCTGAAGCAATTACGCTTACACATGCAGACGAATACTTAGCGAAGTTAAAAGCGGCTTACGTTGTAGCGTCTTTTGAAGAGCGTCAAGCAATCATTGATGGTCAAGTGAAAGCACTTGCTGATGAAGTGAATGCGATTGCGATTGTGCCAAGCGACCTTCGTGATGAAGTAACAGCCTTGGTTGAATGGCCTGTTGCGCTTCGTGCCAGCTTCGAAGAACGCTTCCTTGCTGTTCCTCAAGAAGCTTTGATTACCACCATGCAGGACAACCAAAAGTACTTCTGCTTAGTAAATGCGGACAATAAACTTCAACCGTACTTCATTACTGTGTCAAACATTGAGTCAAAAGACCCGACACAAATTATTGAAGGTAACGAGAAAGTTGTTCGTCCACGTTTGTCGGATGCTGAATTCTTCTTCTTACAAGACCAAAAACAACCACTTGCTTCTCGTAAAGAGAAATTGGCGAACATGGTCTTCCAGGCAGAATTGGGTACGCTTTGGAACAAGTCTGAACGTATTGCGAAATTGGCTGTTGCTTTAGCGCCTATTACAGGTGCAAACCCTGCTGATGCTGAAAAAGCTGCGCTTCTTGCAAAATGTGACTTAACCTCTGAGCTTGTGGGTGAATTCCCAGAACTTCAAGGCATTGCAGGTACTTACTACGCACGTCTTGAAGGTGAAAATGATGAAGTTGCTGAATCTTTGGGTGAGCAATATTTACCTAAATTCGCAGGTGACGTTTTACCAAAAACGAAGACAGGTACAACGATTGCCCTTGCCGACCGTCTAGATACTTTAACTGGTATTTTCGGTATTGGTCAGGCACCTACAGGTTCTAAAGACCCGTTTGCGCTACGTCGTTCTGCGATTGGTATCCTGCGTCTGGTGACTGAAAACGAACTTGATGTTTCAATCGAAGATCTGATCAAGCTGGCATTAGCTGCTTATGGCGATGTATTGAAAGACCACGACAAGACTCTGGCAGATGCGGTTGCCTTCCTTGAAGGTCGTTACCGTGCGAAATACGAAGACCAAGGCGTTGATGTTGACGTAATCCAAGCCGTTCAAGCGCTTTCACCAAAATCACCGCTTGATTTTGACAAGCGTGTGAATGCGGTCAATCACTTCCGTGCATTGCCTGAAGCGGCTGCGCTTGCTGCTGCGAATAAGCGTGTTGCCAACATTCTTGCAAAAGAAGCTGCACCTGAAGGCTCAGTGGTTGAAGCAAACCTGGTTGAAGATGCTGAAAAAGCATTGTTCGCTGAACTTGCGAAAATCACGCCTGTGGTTGAGCCGTTATTTGCTGCCAAAGACTATACTGCTGCGCTGTCTGCACTTGCTGCACTTCGCGCGCCAGTCGATGCGTTCTTTGACGGTGTAATGGTCATGGCGGATGATGCTGCGCTTAAATCAAACCGTTTGTTGATGCTTGCACAGCTTCGTGACTTGTTTACGAAAGTGGCCGATATTTCGGTGTTACAGCACTAAGTTTCAATTGCTTGAAGTTTAAACAAAACCCCGCTATAAGTTAGTGGGGTTTTTTATTGATGACAAATAATGCAAGCAAATTATAAAACTTATGATTTTCAAAAGAGTCGTGATCGTATAGATGAAATTTTAAACTCTTCAGATAATAATTACGAAGAAAAAGAATCGATCCCAAATCGCGATACTTTAACTTTTAATAATGGGTACTATATCTGTTGCTCTGCCATATTTATTGACATGAGAGGTTCAAAGGAATTCTCGAAAAAACATACAAGACCTGTTACTGCAAAAATATATAGAAGCTATATCTCAGAGCTAGTTGCTGTTCTTAATAGTAATATAAGATTAAGAGAAATTTACATAGAAGGCGACTGTGTATGGGGGGTTTTCAATACCCCAAATAAGTCTGACGTAGATAGCATTCTCGATACAGCTGCCCAAGCTGCTTCACTTATCGATACATTAAATGTCAAACTCAGAAAGAAAAAGTATTCTGAAATAACAGTAGGAATAGCCTGCCATGATGCAGATGTTCTTATGATTAAAGCAGGTTACAGTGGTAGTGGTATTAACGAAGTAACTTGGATTGGAAAACTTGTAGGTGAAACTGCTGACCTATGCTCTAAAGCCAGTAGATGGAACTCAAAAAGGACTCTTTATAGCAAAAAATTTTATGATAGTTTGACCGATAAAGAAAGAAAAAGAATAGATTGGATAAATTGGAATTACACTTACGAATGCTATGAAGGAAATACTATTTATACTTCAATGAATAATTGGGTATTAGAAAATGGATAAATTTGAATTTCTACATTCGGCTATACAGGATACCCAACAAAATATTCGAGCGATTGATTTTAAAATTGGTGCATTATTAGCAGGCTTAATTGTCCCTTTTCCTCAAATAAGAGAAATTTTCAAATATTTAACAATTAATGAATTTTAGTGGCAGCATGCTTTAGCAGCAATAATTTTTGTAATGTGGCTAATAACCGTTCTTATTTTACTTTTAGCACTTTCAGCAATTGATAATCCTAGTAAACATATTTCAGATAATACAAATCAAAAAGGTCTATATTTTGGCGGTGGTTTATTTAACTTCAAATTATTAAATATTTTTTGGAGGACAAATAACTTTGCTACAAAATCTGTCCGAGACTACAAAAATGAAATTGAAGATACCTCTCTAGATATTTCAAAAGAATTAGCTTATGAACATTTAAAGTTAATCTATATTCGTGATCTAAAAATTTTCCGCTTACGCCATGCAATAGTATTAATTTTTGTGCTTATTATAGTGGGATCTATAAGCTTTCTATCTGCCCCAAATACGAAGAAAATTGATGTCGTAAATCAAGATATTCAACATCTTCAACCAAAACAATATTTAGATTATTTGTTATAGGCATTTCACTTTATATTTCCTATACTCAACCTAACAACACTCAACAAGAAAGAATCATATGAAATTTAAAGCTCTTATTTTGACTGGTCTTGCGGGTATTGCTCTTTCAGCGTGTACATCTCAACCGACTGTTCCTCAACTCCAACTCGGCGTATTACAGGAAGTACAGAATCTTGAAGTTTATCCTGAAACGACGAACAACAGTGCAAAACTGACTAAGTTCATGGATAAATGCGTGATCGAATTTAGAGGTCAGCTTGAAAGCAGCCGCGTAATTGAACAATGGTCGTTTAAAGGTTTGACCCTGATTGATGCCGGTTCAGCAACTTTCCAGCGTGACAATACCAGCACTGCACAAAAATTTGACCTGCACAGCGAAACTGCTCAAAAGAACTTCCTGGCACTACGCAATCACTTTGCCAAAGAAGCAATCGAACAGTGTAACTAAGTACCACGCCCTATATTTACATCAAATATGGGGCAGCTTCTCTTTCAAATAATCTTCCTATCAAATTTATTCTCTACTTATTCTTGAGATCAG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58 | uncultured_Mediterranean_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
3201 : 59472
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044464|3201:59472|DBSCAN-SWA TATGAACATGGATATATATTCAGCAACACCTCCTGTTGCTAAAAAACGCAGAACATACAGCAAAGAATTCAAATTCAGTATTGTCAATGCCTGCAAAAATCCTAATACCTCGATCGCTTCGGTCGCACTGCAACATAGTATTAATGCCAACCTTGTCAGTCGTTGGATCAGGATCTTCAGGCATCATGAGGGTGCCGTGCAGGATCCTACTCATGTGAATCCAGCATTTATTGCTTTGCCTTACACTGCTGCAATCAGCCAACCTATTGATGAGAGGATCACGTTGTGTATCACCGTGCCTCATACGAATAATGATATTCAGCTAAAATGGCAGACATCAGAAATACCTGTCTTGGCAGAATTACTCAAGGCACTGGCAACATGATCCGTATCAATGAAATTTGGCTCTCTACCCAGCCCATGGACATGCGTGCAGGTATGGATACGACCATGGCTCAGGTGGTGAGAGCCTTTGGCTACATCAAACCGCATTGTGCTTACCTGTTCTGTAATAAACGTGGCCATCGCATGAAAGTGTTGGTACATGATGGACTGGGCATCTGGCTGTGTGCCCGGCGGCTGGAACAGGGCAAATTTCACTGGGCTCAAGTTCACCAAGGTGAAACCGTGGCCCTCAGCCTGGAACAGTTACAGGCACTGATCCAAGGTTTGCCCTGGCAGCGCATTGGACGACAGCAGGTGGTGACGATGCTTTAAACCAGGCTGTTCCATTCTGCTATTCTCCAAACGTTCTATTTCATTCTTCTCATGACCTCAGGCATACTGCGGTCATGAATACGCTGCCTGACTTAAGCCAACTGACCCATGAACAACTGCTGGAATTCACCAGGCAGTTGGCGATGCAGCATCAGTCTCTGGCACAATCAAATCAAGAATTAGAAAAATCAAACCAGCAATTAGATGCCAGAGTTCAACATCTTGAAGTCACCAATCAGCAATTAGATTCTAAAGTTCAACATCTTTCTATTCTCAATCAAAAATACGAGCATGAACTCGCACTATTTAAACAGCACAAATTCGGCAGTAAAAACGAACATCTCACTGCAAAACAAATCCACCTGTGGGATGAAGCGGTTGAAGAAGATATTGCCGCGGTTGATCTAGAACTGGAACGGCTAAATGCAGATAAAACCCATGCAGCGACACAGAAAGCCACAGTCAACAAACCTAAACGTCGACTGCTGCCAGATCATCTACACACCATCCGTATTGAGCATGAACCTGCATCAACCCAATGCAGTTGTGGCTGCCAGTTACGTCGTATCGGCGAAGATATCAGTGAAAAACTGCATTTCAGACCGGCACAGTTCTATAAGGAACAGCATGTACGTGGCAAATGGGTCTGTGATCAGTGCGACACCCTGACTCAGCAAGCGATGCCCGCCTATGTGATTGATAAAGGTATTGCCAGTCCTGAACTGCTCAGCCATGTGCTGGTATCGAAGTATGCCGATCATTTACCGCTGTACCGTCAGCGCCTGATCTATCAGCGGGCGGGCATTGATCTGTCCAGATCCACGTTATCTGACTGGATTGGTCGCTGCGGTGTGGAACTGGAACCTCTGGCCAATGCCTTAAAACAGGTGGTGCTGCAACAGCGGGTGATCCATGCCGATGAAACGCCGGTCACCATCATGCGGATGGGTGAGAATGAGAAAAAACCGAAGAAAGGTTATGTCTGGGCCTATGCCACTACACAGTACAATCCAGTTCAAGCCGTGATCTATGACTTTCAGGATAGTCGTTCAGGTCAGCATGCTGAAGCGTTCCTGAAAGACTGGCAGGGCCATCTGGTCTGTGATGATTACAGCGGTTATAAAGCACGCTTTAAATCAGGTCAGGTCATTGAGGTGGGCTGCATGGCGCATGCGCGTCGTAAATTCCATGAACTGCATGTGACCAAAAAAAGTCAGGTCGCTGAACAGGCATTAGTGCTGATTCAGAAACTGTATGCCATAGAAGCAGAACTCAGGAAAAAGACCGATGGTACAGCAGAACAGCGCCGCGAATACCGACAACAGCATAGTCAACCGGTGATGCAACAACTGTATGAATGGCTCAACCAACATCAACTGACTGTGCCATCGAGTTCTCCAACCGCCAAGGCGATCAATTACACTCTGAAGCGTTGGCCAGCTTTAAGCCGCTATCTGGATGATGGCAATCTACCGATTTGCAATAACTGGGTGGAAGTGCGACACGAAGTCGCTTAATGAAGTTGTTCCCCCTGCGGGAACCACCCGTGTCACCGGGTGAATCTAGAAGGCTGAATAAAGAGCGCCTTCGACAATGTAACGAGGCACCGCAAGGTGCGGGGTATCAATCGTGAGAGACGTACCCTTCTGGCAGCCATAGCCGGACAAGGGCTAGATAATCGGTATGGTGAACACATGTGAATCTGCGTAACGATCGTTAAGTTGAACGAGCGGAAATGGCTGATACGCTCGAACCAAAACGGTAATGGAGGTGGGAATTGCGTCTTTCGACTACGCATTCGTGACCCATACGCCTCCCGGTCGATAGCAGGCACCTAAGCCGATGTACTTCAGTAAGCGGAACGTGGAAATCCCGTATTACTCCCATTGGGAAAGCAGTTTGCAAAAACTGCCCATGGTGATGCGGGCGAAGGAACGAGGAAAAAGCGAATGCCAGTCTGTAATGGGTTGGATAGAGGTTGAAACATTACCCCACGCGAAAGCGGGCTGACGTCCTTATGGTCTCTCATCACAAGAGAGTGTGTAGAACCCTTTTAATGGAGGGAGAGCAAATGAATGCAGCAGTATCAGCGTGTGCACCTTCCAGCACATCGTGGGACAGCATCGATTGGATTGCTGTACAGCGTCATGTCAGAGGGCTGCAAGCGCGTATTGTGAAGGCGGTACAAGACGGCAGGCATAACAAGGCGAAAGCTTTGCAATGGCTGCTGACTCACTCGTTTAGTGGCAAAGCATTGGCCGTCAAACGAGTGTCTGAAAACAAAGGCAAAAACACGGCTGGGGTCGACAAGGTGACTTGGAATACACCCAAGGCCAAGACCGGTGCGATGATGTCGTTGAAGAGGCGAGGTTACACGCCCCTTCCGCTTCGGAGAGTCCTTATTCCGAAGAAAAATGGCAAGATGAGACCTCTCGGGATACCCACGATGAAATGCCGGGCCATGCAGGCGCTCCATCTGCTGGCTTTGGAACCCATCGCGGAGACCATCGCTGATCGGAACTCTTATGGATTCAGACCACAACGCTCAACCGCGGATGCTGCAGCACAGTGCTTTGGTGTGCTGTCAAGAAAAGTAAGTGCGGAGTGGGTGCTAGAGGGTGACATTCAAGGCTGTTTCGACAATATCAGCCATGACTGGATGATCGCCAACCTCCCAATGGACAAGGTGATTCTACGGAAATGGCTCAAAGCCGGTTACGTCTACCAAAGCAAGCTGTTTCCCAGTCTTTCCGGAACACCGCAAGGAGGTATTATCTCCCCGGTGTTGGCCAACATGACCTTGGACGGACTGGAAACGATGCTGGCGAAGAGGTTCCCTAACGCCAAATGGACAGGCAAAAAGCTGCAACTGGTACGGTATGCGGATGATTTCATCATCACGGGGTATTCTAAAGAGTGGCTCGAAAATGAAGTTCGCCCTGCCGTGGTTGAATTTCTGGCGCAGCGCGGTCTCGTGCTCTCTCAGGAAAAGACCAAAATCACGCACATAGGGAACGGGTTCGATTTTCTTGGGTGGAACGTACGCAAGTACAATGGCAAGCTACTGATCAAGCCGTCAAAGGCAAACATCAGTGCTCATCTCGATAAGCTGCGAGCATTAATCAATGCAAACAAAGCGACACGACAGGCCACTTTGATCGGTTTGCTCAACCCTATTCTAAGGGGTTGGGCCAACTATCATAGTTATGTCGTTGCCAAGAAGGTTTTCAACCAGGTAGACAGCGCAGTGTGGGAAATGCTCTGGCGATGGGCGGTACGTCGCCACCCTCGCAAAACACTCCGATGGGTCAAAGATCGGTATTTCAAAGTACAAGGAGCGCGTCGATGGGTGTTCTCATGTGATGAACAGTCCGCCGATGGTCGGAAGCGACAATACACATTAGTGTCTGCCTCGGACACGCCAATTGTGCGACATATCAAGATCAAGGCTGCTGCTAACCCTCATGACCCCGCATGGGATGAGTACTTCGAATCCCGATGGGGTAAAAGAATGCTGGTCTCCGCAAAGGGGCGAGCCAAGCTGTATCGGGTGTGGCTAAAACAAGGTGGTCGCTGCTGCGCCTGTCTTAAACCAGTCACCAAAGATACACCATGGCACAGCCGTCATATTGTGAAGCTAAGTCATGGTGGAACGGATGCAGTTGCTAATCTTGAGATTTACCATCTGTATTGTCCGAGGAGTGTTCAGTTTGCCAATGTCAACGATGTATAACCGGGTGCCGAATGGCGCCTTAGCAGAGGCTTGAGCCGTGTGCTGGGAAACTCGCATGCACGGTTCTTAGGGGGTTGGACGTAGGTAACTGCGTCTGACTACCCGACAATCAAATGCGACCTTGGGCGTTGGGACGTAAGAACTGGCTGTTTGCAGGTTCGCTGCGCAGCGGCCAGCGAGCGGCGAATATCATGACTTTAATCCAGTCAGCAAAGCTGAATGGCTTGGATCCGTATGCTTATTTAAGTGATGTGCTGAAAAGGCTACCGACACACAAAGTGACCCAAATTGAAGAATTGCTGCCGCACTGCTGGAAACCTAAATCGAATTAAAAATTGGTATGGGATTCAGCGGACGCTTACGACTCAAATATCTCTTGCCGTAGATAAAATTATAGATTGAATCTTTGAGCGCATATTGAGCAACAACTTGTGGCGTATCACCTGTATCCAAAAAAATGTAGCAGCTCTTAATTTCTTCTTGCATGGACAGATTTTTAGAAGTCATCACTCATAGCCTCTGATTTATTATTAGCGCGTACCCGAATTTT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MSKKQKTYTAEFKAEAIKAIEENQGNVSESARQLGISMQTLSNWNNKAKAGTLAGTKQYSPDLNALLEENKKLKQQLKTAEMEREFFKKGSSVLCQRKSVRYAYMKSQSHLFPIILMARLLRVSVSRFYDWLKRGMSKRSIQRNQQTIMVKIAHEETKQSYGYVRLTKHLQAQGIKISTYAVRQIKKSNQLYCKRHKRFKRTTNSDHNRSIYDNLLKQQFSMTKPNLAWSSDITYIWTAEGWLYLAAVKDLYTKQVVGYSLNERMTAKLVCDALNMAIRNQKPAKDLIVHSDRGSQYCSNEYRNLLEKFDFQGSMSKKGDCFDNAPIESFWGILKNELVHHRNYKTREEAKADITKYIELFYNQRRIQKGLDFKTPNQMAEDFYRLAA >NZ_CP044464|3201:59472|47449_48154_+|WP_001067855.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP044464|3201:59472|57273_58488_+|WP_000214122.1|DBSCAN-SWA MTTTRPAWAYTLPAALLLMAPFDILASLAMDIYLPVVPAMPGILNTTPAMIQLTLSLYMVMLGVGQVIFGPLSDRIGRRPILLAGATAFVIASLGAAWSSTAPAFVAFRLLQAVGASAMLVATFATVRDVYANRPEGVVIYGLFSSMLAFVPALGPIAGVLIGEFLGWQAIFITLAILAMLALLNAGFRWHETRPLDQVKTRRSVLPIFASPAFWVYTVGFSAGMGTYFVFFSTAPRVLIGQAEYSEIGFSFAFATVALVMIVTTRFAKSFVARWGIAGCVARGMALLVCGAVLLGIGELYGSPSFLTFILPMWVVAVGIVFTVSVTANGALAEFDDIAGSAVAFYFCVQSLIVSIVGTLAVALLNGDTAWPVICYATAMAVLVSLGLVLLRLRGAATEKSPVV >NZ_CP044464|3201:59472|12750_14016_-|WP_000934717.1|DBSCAN-SWA MLNRLNVYYNGWGESWLWGTLISSTATTGRPTIAFEYSPEAIQQGVELSSYLLPLKGLPFRQGFPTHQMGLPGPVYDALPDGWGMMLMDRYFKKIGLNSARIGPLERLTYISSHAMGALSFEPCVADMQTSENIPLQQLAQEVQEVLKGEGGEFLQHLLVMGGSPQGARPKALVYRDPVNLEFSTQDSDQHEAWLIKFPAQQEHPEVCAIEAVYAECLRLCAIETPDTHFFNLPNGLTAFASKRFDRQNGMRIPMQSLAAYTGADYKVPGSLDYRNFLRATLMCTQDVRERLHAFKRAVFNVLFNNRDDHTKNFSFLMEKNGQWKLAPAYDVTFCEGPGGYHQMDIMGEALNISRNDIHKLGTSEANLTTLEVDEIILTMREIALQFSQIAQRLYPHQIRESTLQMIQSRIQQNIDFLTET >NZ_CP044464|3201:59472|3201_3585_+|WP_163143549.1|transposase|DBSCAN-SWA MNMDIYSATPPVAKKRRTYSKEFKFSIVNACKNPNTSIASVALQHSINANLVSRWIRIFRHHEGAVQDPTHVNPAFIALPYTAAISQPIDERITLCITVPHTNNDIQLKWQTSEIPVLAELLKALAT >NZ_CP044464|3201:59472|53327_54200_-|WP_084929516.1|DBSCAN-SWA MERNIKDSQNFLHNAQLVNKLVGLSNITCDDLVYEIGPGKGIITRALLGRCRQVVAIEYDAELYRRLLEQLKGHEDLVLLNRDFLTVDLPSEPYKVFSNIPFNMTADILSKLLTTGRTPEDLYLVMQQEAVYKYAGEPLCQDGFKSLLFKPIYEIKVIHNFDKADFSPSPNVSIFFVNFHKKEYCDIKKLPLIDYWDFLAFVYSAPGRFFKEKTKKVFSYEQQKRIRKQIDLHEEAFISEWTYKQWLAMFDVYSKMVSPEKKKLVIGAYSRLIAEQAKLDKLHRDRSKKY >NZ_CP044464|3201:59472|51493_52987_+|WP_001120888.1|transposase|DBSCAN-SWA MPHVAARTASRDRDTGRYQSHRPEQTLLYQIVDEYYPAFAALMAEQGKELPGYVQREFEEFLQCGRLEHGFLRVRCESCHAEHLVAFSCKRRGFCPSCGARRMAESAALLVDEVLPEQPMRQWVLSFPFQLRFLFASRPEIMGWVLGIVYRVIATHLVKKAGHTHQVAKTGAVTLIQRFGSALNLNVHFHMLFLDGVYVEQSHGSARFRWVKAPTSPELTQLTHTIAHRVGRYLERQGLLERDVENSYLASDAVDDDPMTPLLGHSITYRIAVGSQAGRKVFTLQTLPTSGDPFGDGIGKVAGSSLHAGVAARADERKKLERLCRYISRPAVSEKRLSLTRGGNVRYQLKTPYRDGTTHVIFEPLDFIARLAALVPKPRVNLTRFHGVFAPNSRHRALVTPAKRGRGNKVRVADEPATPAQRRASMTWAQRLKRVFNIDIETCSGCGGAMKVIACIEDPIVIKQILDHLKHKAETSGTRALPESRAPPAELLLGLFD |
49 | Escherichia_phage(30.0%) | integrase,transposase | attL 41794:41853|attR 58815:59338 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP044469_1 | 4917-5016 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP044469_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP044469_1
>1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder TCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCATTTGTAGTTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP044469_1
The CRISPR arrays of NZ_CP044469_1 >merge|NZ_CP044469|1|4917-5016|CRISPRCasFinder ATGTCCGGTAAAAGTAGTTTCTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCATTTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAA >NZ_CP044469|1|1|4917-5016|CRISPRCasFinder ATGTCCGGTAAAAGTAGTTTCTATG TCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCATTTGTAGTTTA ATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAA
>NZ_CP044469.1|WP_020846814.1|3844_4786_-|replication-initiation-protein MDENKKTYPLSWVVMQNNVQECFKSMNIDEKRMLILASPIARTTDATEKDRIMITAEEFARECGIKTHSAYTQLELASKNLLKRNFSYNNERGKKVLSNWVIDCTYEDGGIAIRFPEIVLLMLKEFDKLNPYTKYKKDIVLSLKKDYSFDLYHLAKKHQAMGQFEMSLEHIKNELGLPKSYDKLCNLKDRVMKPSLNEITTNTDIELTYENVKKGRSVVGFKFIVKEKPKPKLIAPQRDQRTIDMFCNLSDAQINKYSTILSKLSELSDLSNFPDYPTFALWISGILRDPKSVREETTKRIFKALHSKTDFKP >NZ_CP044469.1|WP_004870774.1|3560_3848_-|hypothetical-protein MRTKAELDAMSHQELKDYEQSLLALWTPRMAIESDIERLSTHHSELLEVFNQLKNPDAPKNSRLKDSILSLKYKIESLEGKLSDLIQDNRLNSAD >NZ_CP044469.1|WP_000052512.1|1487_2963_-|ABC-F-type-ribosomal-protection-protein-Msr(E) MSLIIKARNIRLDYAGRDVLDIDELEIHSYDRIGLVGDNGAGKSSLLKVLNGEIVLAEATLQRFGDFAHISQLGGIEIETVEDRAMLSRLGVSNVQNDTMSGGEETRAKIAAAFSQQVHGILADEPTSHLDLNGIDLLIGQLKAFDGALLVISHDRYFLDMVVDKIWELKDGKITEYWGGYSDYLRQKEEERQHQAVEYELMMKERERLESAVQEKRQQANRLDNKKKGEKSKNSTESAGRLGHAKMTGTKQRKLYQAAKSMEKRLAALEDIQAPEHLRSIRFRQSSALELHNKFPITADGLSLKFGSRTIFDDANFIIPLGAKVAITGSNGTGKTSLLKMISERADGLTISPKAEIGYFTQTGYKFNTHKSVLSFMQEECEYTVAEIRAVLASMGIGANDIQKNLSDLSGGEIIKLLLSKMLLGKYNILLMDEPGNYLDLKSIAALETMMKSYAGTIIFVSHDKQLVDNIADIIYEIKDHKIIKTFERDC >NZ_CP044469.1|WP_000155092.1|547_1432_-|Mph(E)-family-macrolide-2'-phosphotransferase MTIQDIQSLAEAHGLLLTDKMNFNEMGIDFKVVFALDTKGQQWLLRIPRRDGMREQIKKEKRILELVKKHLSVEVPDWRISSTELVAYPILKDNPVLNLDAETYEIIWNMDKDSPKYITSLAKTLFEIHSIPEKEVRENDLKIMKPSDLRPEIANNLQLVKSEIGISEQLETRYRKWLDNDVLWADFTQFIHGDLYAGHVLASKDGAVSGVIDWSTAHIDDPAIDFAGHVTLFGEESLKTLIIEYEKLGGKVWNKLYEQTLERAAASPLMYGLFALETQNESLIVGAKAQLGVI >NZ_CP044469.1|WP_163169824.1|15_318_+|hypothetical-protein MSVDNLEQKIAKQEERLRQLKEQKKAAIAREKKKVSDQQRKDDTRRKILLGAWALNKLKNDESFKQQLADFEQFLNTENKTEENKQKDKDLFNGFIWDKT >NZ_CP044469.1|WP_004870770.1|5497_7150_-|MobA/MobL-family-protein MAIYHFSVKTISRGNGRSAVACAAYRSSEKLVCDFYGKEQDYTRKTGVEFTKIYAPENTNTELLKRQTLWNEVEKVERRKDALLAREFEIAFPSELNAEQRENMLNELCRNLVKKYGVIVDAAIHAPHTDSGSDERNYHAHIMFTTRSINEQGGFSAKKYRDFSRDNGTETVSHWRESFAELCNHHLEQNGFDERVDHRSYEDQESDLEATQHEGPQATYLRRRGIFTEISLKNDEIKLRNLKIKKVIALDENIKVSEDLVQKVRSELQFQYSQAEYSEKTSQKLYEFQNEELSKLTTKLDTMSSAISELRKKEPLFFKTKWINQINDLIDQHNTQLDIQKHISGLSEIEKKERYSDHLNKWTEENQLLQPKKSFAKFDEPNITVKQRKLNDQISNIDHQISEISRRETEYQEYVRDQRLEIINSYIFEEDNYGNKYFSPQNGEKQKRLYAEEMEDLKIQELHAAFTKKIETEAQQEFSQKRAIQLENDRKDRESREQQLRKEREQQEQRYAQEREQQEHLAFVRRQEQEKQQRNEPKKPENDNNHDYTP |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP044469_1 | 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder | 4942-4991 | 50 | NZ_CP044477 | Acinetobacter schindleri strain HZE33-1 plasmid pHZE33-1-3, complete sequence | 1455-1504 | 0 | 1.0 |
NZ_CP044469_1 | 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder | 4942-4991 | 50 | NZ_CP044487 | Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-4, complete sequence | 60-109 | 0 | 1.0 |
NZ_CP044469_1 | 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder | 4942-4991 | 50 | NZ_CP032272 | Acinetobacter sp. WCHAc010034 plasmid p4_010034, complete sequence | 9937-9986 | 0 | 1.0 |
NZ_CP044469_1 | 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder | 4942-4991 | 50 | NZ_CP031712 | Acinetobacter wuhouensis strain WCHA60 plasmid p4_010060, complete sequence | 9573-9622 | 0 | 1.0 |
NZ_CP044469_1 | 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder | 4942-4991 | 50 | NZ_CP032282 | Acinetobacter sp. WCHA55 plasmid p3_010055, complete sequence | 2168-2217 | 0 | 1.0 |
NZ_CP044469_1 | 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder | 4942-4991 | 50 | NZ_CP043310 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence | 3115-3164 | 0 | 1.0 |
NZ_CP044469_1 | 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder | 4942-4991 | 50 | NZ_CP043310 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence | 10800-10849 | 0 | 1.0 |
NZ_CP044469_1 | 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder | 4942-4991 | 50 | NZ_CP043310 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence | 18495-18544 | 0 | 1.0 |
NZ_CP044469_1 | 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder | 4942-4991 | 50 | NZ_CP043310 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence | 26190-26239 | 0 | 1.0 |
NZ_CP044469_1 | 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder | 4942-4991 | 50 | NZ_CP032104 | Acinetobacter lwoffii strain EK30A plasmid pALWEK1.11, complete sequence | 6071-6120 | 0 | 1.0 |
NZ_CP044469_1 | 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder | 4942-4991 | 50 | NZ_CP044469 | Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-6, complete sequence | 4942-4991 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044477 (Acinetobacter schindleri strain HZE33-1 plasmid pHZE33-1-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta CRISPR spacer tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta Protospacer **************************************************
2. spacer 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044487 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta CRISPR spacer tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta Protospacer **************************************************
3. spacer 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032272 (Acinetobacter sp. WCHAc010034 plasmid p4_010034, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta CRISPR spacer tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta Protospacer **************************************************
4. spacer 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031712 (Acinetobacter wuhouensis strain WCHA60 plasmid p4_010060, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta CRISPR spacer tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta Protospacer **************************************************
5. spacer 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032282 (Acinetobacter sp. WCHA55 plasmid p3_010055, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta CRISPR spacer tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta Protospacer **************************************************
6. spacer 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043310 (Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta CRISPR spacer tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta Protospacer **************************************************
7. spacer 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043310 (Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta CRISPR spacer tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta Protospacer **************************************************
8. spacer 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043310 (Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta CRISPR spacer tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta Protospacer **************************************************
9. spacer 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043310 (Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta CRISPR spacer tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta Protospacer **************************************************
10. spacer 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032104 (Acinetobacter lwoffii strain EK30A plasmid pALWEK1.11, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta CRISPR spacer tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta Protospacer **************************************************
11. spacer 1.1|4942|50|NZ_CP044469|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044469 (Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta CRISPR spacer tccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcatttgtagttta Protospacer **************************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|