Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047352 | Proteus mirabilis strain ZA25 chromosome, complete genome | 5 crisprs | c2c9_V-U4,cas3,DEDDh,DinG,PD-DExK,csa3,cas2,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e | 0 | 6 | 10 | 0 |
NZ_CP047354 | Proteus mirabilis strain ZA25 plasmid pZA25-qnrD, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP047353 | Proteus mirabilis strain ZA25 plasmid pZA25-tetX-168kb, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047352_1 | 177659-177750 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047352_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047352_1
>1.1|177683|44|NZ_CP047352|CRISPRCasFinder TATATTTTAAAAGATAAAACAGAATATTTATTATCTTGAAATAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047352_1
The CRISPR arrays of NZ_CP047352_1 >merge|NZ_CP047352|1|177659-177750|CRISPRCasFinder ATAGCTTAGAAAAATAAGTACTAATATATTTTAAAAGATAAAACAGAATATTTATTATCTTGAAATAGATAGCTTAGAAAAATAAGTGCTAA >NZ_CP047352|1|1|177659-177750|CRISPRCasFinder ATAGCTTAGAAAAATAAGTACTAA TATATTTTAAAAGATAAAACAGAATATTTATTATCTTGAAATAG ATAGCTTAGAAAAATAAGTGCTAA
>NZ_CP047352.1|WP_004249675.1|176071_177547_+|ketol-acid-reductoisomerase MANYFNTLNLRQQLSQLGKCRFMSRDEFADEANYLKGKKVVIVGCGAQGLNQGLNMRDSGLDIAYALRQEAIDEKRASWRRATENGFEVGTYEALIPQADLVVNLTPDKQHSAVVQAVQPLMKSGAALGYSHGFNIVEVGEKIRDDITVVMVAPKCPGTEVREEYKRGFGVPTLIAVHPENDAKGEGMAIAKAWAAATGGHRAGVLESSFVAEVKSDLMGEQTILCGMLQAGSLLCYDKMVAEGVEPGYAGKLIQFGWETITEALKQGGITLMMDRLSNPAKMRAYALSEQLKEIMAPLFAKHMDDIISGKFSETMMADWANDDKNLLTWREETGASAFENYPEYEGKISEQEYFDHGVLMVAMVKAGVELAFDTMIEAGIIAESAYYESLHELPLIANTIARKRLYEMNVVISDTAEYGNYLFSFAAVPMLKEFMTRLQSGDLAKHVPDSGTDNAQLRDINEAIRQHPIEIVGKKLRGYMTDMKKIAVAN >NZ_CP047352.1|WP_004246362.1|175011_175899_-|HTH-type-transcriptional-activator-IlvY MDIRDLKLFLHLAESCHFTKTAQAMHVSPSTLSRQIQRLEEQLGHPLFLRDNRQVTLTDAGEQLKRYAQHTLLQYKQLKHTLNQNSPSLSGELRLFCSVTAAYSHLPPILDRFRAENPLVEIKLTTGDAADAVDKVISDEADLGIAGKPEKLPENICFEKIGEIPLVLIAPALPGNVRHLATQEKPDWLNIPFIIPEHGPSRQRIALWFKRHRIQNPLIYATVSGHEAIVSMVALGCGIALIPQVVVDNCPEPVRNRISLLDNISLVEPFELGVCGLHKRLQEPVISAFWRLLHH >NZ_CP047352.1|WP_004246363.1|173451_175026_+|threonine-ammonia-lyase,-biosynthetic MAAFRPLTSAPSSAEYLKAALSAPVYEAAVVTPLQEMAKISQRLENTILVKREDRQPVHSFKLRGAYNMIAGLTPEQKAKGVVTASAGNHAQGVALSANRMGVKALIVMPIATADIKVDAVRQFGGEALLYGANFDEAKAKAIALAKEMGYTFVPPFDHPAVIAGQATLAMELLQQDVHLDRIFVPVGGGGLIAGVAVLIKQLMPEIKIIGVEAEDAACLKAALEAGHPVELPRVGLFAEGVAVKRIGDETFRLCQKYVDDVITVDSDAICAAVKDLFEDVRAIAEPSGALALAGLKKYVEEHQIKGERLAHVLSGANVNFHGLRYVSERCELGEKREALFAVTIPEQKGSFLRFCQILGQRVVTEFNYRYSDADPENARIFVGVRLSQGLQERKEIVQQLTEAGYQVSDLSDDEMAKLHVRYMVGGRPNQPLKERLFSFEFPEAPGALMKFLKTLGTYWNITLFHYRSHGTDYGRVLVAFELPETEGRFERHLDALGYEYHDETGNPSFQLFLSPQTASLVVE >NZ_CP047352.1|WP_004249676.1|171597_173448_+|dihydroxy-acid-dehydratase MPKYRSATTTHGRNMAGARALWRATGMTDADFGKPIIAVVNSFTQFVPGHVHLRDLGKLVAEQIEAAGGVAKEFNTIAVDDGIAMGHGGMLYSLPSRELIADSVEYMVNAHCADAMVCISNCDKITPGMLMASLRLNIPVIFVSGGPMEAGKTKLSDQLIKLDLVDAMIQGANPNVSDADSEQIERSACPTCGSCSGMFTANSMNCLTEALGLSQPGNGSLLATHADRKTLFINAGKRIVELTKRYYEQDDLSALPRNIAKKEAFENAMILDIAMGGSTNTVLHLLAAAQEGDVDFKMEDIDRLSRQVPHLCKVAPSTQKYHMEDVHRAGGVMGILGELDRAGLLNRNVNNILGLSLPETLAQYDVMLSQDEQVKSMYQAGPAGIRTTKAFSQDCRWPTLDTDREQGCIRSKAHAYSQDGGLAVLSGNLAQDGCIVKTAGVDEDNLVFSGPAKVYESQDDAVEAILGGKVVAGDVVIIRYEGPKGGPGMQEMLYPTSYLKSMGLGKACALITDGRFSGGTSGLSIGHVSPEAANGGIIGLVEEGDIVDINIPNREINLRVDEKTLAARREAQLARGDKAWTPKDRQRQVSFALRAYASLATSADKGAVRDKSKLGG >NZ_CP047352.1|WP_004246365.1|170598_171525_+|branched-chain-amino-acid-transaminase MTKQADYIWFNGEMVPWAEAKVHVMSHALHYGTSVFEGVRCYDSHKGPVVFRHREHMQRLHDSAKIYRMPVAQSVDELMEACRETLRKNQLVSAYIRPLVFIGDVGMGVNPPEGYKTDIIIAAFPWGAYLGEEALDKGIDAMVSSWHRAAPNTIPTAAKAGGNYLSSLLVGSEARRHGYQEGIALDVHGYLSEGAGENLFEVKDGVIFTPPFTSSALPGITRDAIIKLAKDLGYEIREQVLSRESLYLADEVFMSGTAAEITPVRSVDGIQVGIGRCGPVTKAIQKAFFGLFTGETEDKYGWLDPVNP >NZ_CP047352.1|WP_004246366.1|170309_170588_+|acetolactate-synthase-2-small-subunit MNQHNITIEARFCPEILERILRVIRHRGFHICSMNMNITESNYINLALTVSSQRPVDLLCSQLTKLADVAGIQVLHQQQKEKLQFISALSAM >NZ_CP047352.1|WP_004246367.1|168663_170313_+|acetolactate-synthase-2-catalytic-subunit MNGAQWLVQALRKQRVETVFGYPGGAIMPVYDALYDGGVEHVLCRHEQGAAIAAIGFARSTGTTGVCIATSGPGATNVITGLADALLDSVPVVAITGQVASNLIGTDAFQEVDVLGLSLACTKHSFLVSDVNELPRVVSEAFSIAKQGRPGPVLIDITKDVQLADASHLADYPLPQEQEFPYPEHEIAQALQMLAQAKKPILYVGGGVAMSQGVEALRSFVKQTQIPVVSTLKGLGCANAFDANYLGMLGMHGTKAANYAVQRSDLLIAVGARFDDRVTGRLNTFAPNAKVIHIDIDYAELNKLKQAHIALLGDAKVLLPKLSQPLAIEAWQEEVQQLIAEYAWRYDHPGEAIYAPLLLKQLSDAKPENSIVTTDVGQHQMWSAQHMTFDAPENFITSSGLGTMGFGIPAAIGAQIARPDACVICVSGDGSFMMNVQELGTIKRKQLPIKLVLLDNQRLGMVRQWQELFFEQRYSETILTDNPDFVALAKAFDIPGQRITEKAQVAEAIKCLLTSDGPYLLQVSIDDAENVWPLVPPGASNDEMMEKSK >NZ_CP047352.1|WP_017827031.1|168432_168534_+|ilv-operon-leader-peptide MNTIVLVISLIIVSVVVIINPLCGAALGRRKAN >NZ_CP047352.1|WP_036920151.1|166455_167988_-|YifB-family-Mg-chelatase-like-AAA-ATPase MALAVIYTRASLGISAPLITIEAHISQGLPGLTLVGLPETVVKEAKDRVRSALINSGYSYPAKRITINLSPADLPKEGARYDLPIALAILIASEQLISDKLNSYEFIGELALSGKLQKVNAVIPSILSANKDNRISIISIEHQSEVSLLPNKSALLASHLLDICHHLENNTPLIEAKNNINHKTIENQNNKDISDIIGQNNAKRAAEITAAGNHNILFLGPPGTGKTMLAQRINTLLPPLTAKEALDVLIISSLSNTIHHDGKWPLRPFRAPHHTASAVALTGGGSIPKPGEITLAHHGILFLDELPEFDRRVLDALREPLDARKITISRAKAKISYPANVLLVGALNPSPTGHYQGTHNRTPVKQVLRYLSKVSGPFLDRFDLSVEMPLLPQGALLQSTHTNESSSIIRARVLQARERQFQRSGKLNTYLSSKEIEHFCQLHTEDALFLEETLNKLGLSIRAWHKILRVSRTIADLENEQKIQRNHLIEALSFRAMDRLMIYLQKQLEG >NZ_CP047352.1|WP_004246370.1|166069_166408_+|DUF413-domain-containing-protein MAESFITTNRFFDNKHYPRGFSRHGDFTIKEAQILERHGQAFNELDLGKREPATEAEKLFVAMCRGEREAATVEEKIWKKYTSRISRPKRFHTLSGGKPQLDPSDDYTDSDD >NZ_CP047352.1|WP_004246360.1|177801_178071_-|type-II-toxin-antitoxin-system-mRNA-interferase-toxin,-RelE/StbE-family MRKVSYSGQFKKDLKLAEKRGKDINKLKEIILLLVQGKRLPAQLKDHPLTGNWKPRRDLHIEPDWLLIYKIDNDTVHFDRTGSHSDLFK >NZ_CP047352.1|WP_004253075.1|178071_178320_-|hypothetical-protein MSIKSELIATKVDIELKEAFVAIARNKHRPASQILRDLIRVYVESNQTQPNEKTLNTFAKTDKGDDVFYAEDAHDLFKKLDI >NZ_CP047352.1|WP_004249673.1|178492_180514_+|DNA-helicase-Rep MRLNPGQQKAVEYVSGPCLVLAGAGSGKTRVITNKIAYLIRQCRYSAKQIAAVTFTNKAAREMKERVAQTLGKQEAKGLMISTFHTLGLEIIKREYKALGIKSNFSLFDDQDQSALLKELTVDLLEEDKDLLSQLKSQISNWKNDMLTPEQVIGRAQSQQDHTFAECFRRYEQHLLSCNVLDFDDLISKPTLLLRTNEEVRARWQQRIRYLLVDEYQDTNTSQYELVKWLVGERARFTVVGDDDQSIYSWRGARPQNLVLLQKDFPQLNVIKLEQNYRSSGRILKSANILIENNPHVFEKRLFSELGYGDELRVLTANNEEHEAERVAGELIAHHFINKTNYKDYAILYRGNHQSRIFEKYLMQNRIPYRISGETSFFSREEIKDILAYLRVITNPDDDAAFLRIVNKPRREIGPMTIQKLGEWAKVRDKSLFNACFDLGLSQTLTGRGLSALQAFSQWMARIVQQSEREPLLAVRDLLHEMDYESWLYETSSSAKAAEMRMKNINQLFSWMSEMLEGDELHEPMTLSQVVNRFTLRDMMERGETDEELDQVQLMTLHASKGLEFPHVFLVGMEEGILPHQSSIDEDNVEEERRLAYVGITRAQKTLTFTLCKERRQYGELIRPEPSRFLYELPQDDLHWDTNKKKVLSAQEKQEKGQKGVAGLKAMLARHKP >NZ_CP047352.1|WP_004246357.1|180588_182097_-|guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate-diphosphatase MLKSSSLYAAIDLGSNSFHMLVVREIAGSIQVLSRVKRKVRLAAGLNKENELSEQAMERGWQCLRLFSEYLRDIPAEQIRVVATATLRIAKNADIFVAKASEILGNTVHVISGEEEARLIYRGVAHTTGGAEQRLVVDIGGGSTELVTGTGAKTTQLMSLSMGCVTWLERYFSDRSLTEENFAQAQQAAKAILAPVAEKLIQQGWQVCVGASGTVQALQEIMIAQGMDELITLPKLERLKQKAIECGKLEELEIEGLTFERALVFPSGLAILIAIFETLHIENMILAGGALREGLVYGMLHLPIEQDIRQRTLRNIQRRFQIDIEQAHRVQQLAEHFFIQVSKSWQLDNRCRELLSSACALHEIGLSVDFRQAPSHASYLVSHLDLPGYTPAQRRLIASFLRNQKGIIDLAPLNQQNALPINQAYRLVRLLRLAIIFASRRRDDTLPALRLRTEDEKLIITLPHQWIAEHPLRAENLHEEIQLQSYVHWPLMLEEQNNSRIG >NZ_CP047352.1|WP_004246356.1|182100_183399_-|ATP-dependent-RNA-helicase-RhlB MSKTYLTEKKFSDFALHPKVIEALEKKGFSNCTQIQALTLPITVKGHDIAGQAQTGTGKTLAFLTSTFHYLLTHPAKEGHEKNQPRALIMAPTRELAVQIYTDAQPLAQSTGVKMGLAYGGDGYDEQLKVLNNGVDIVIGTTGRLIDYVKQGHINLNAIQVVVLDEADRMYDLGFIKDIRWLFRRMPNAAERMNMLFSATLSYRVRELAFEQMNNPEYVEVEPEQKTGFSIKEELFYPSNEEKMRLLQTLIEEEWPERCIIFANTKHRCDDIWAHLAADGHRVGLLTGDVPQKKRLRILEDFTQGNIDILVATDVAARGLHIPSVTHVFNYDLPDDCEDYVHRIGRTGRAGKSGNSISLACEEYALNLPAIETYIQHAIPVSKYNSDALLTDLPEPKRRHRPRQGQPRRNNSAPRRGNNTQRNNRNKRPSHS >NZ_CP047352.1|WP_004246355.1|183518_183845_+|thioredoxin-TrxA MSDKILHLSDNTFDVDVLQATGPVLVDFWAEWCGPCKMIAPILDEVATEYAGKLTVAKLNIDENPATAPKYGIRGIPTLILFKNGAVAATKVGALSKTQLKEFLDENI >NZ_CP047352.1|WP_004246354.1|184406_185666_+|transcription-termination-factor-Rho MNLTELKNTPVSELIALGENMGLENLARMRKQDIIFSILKQHAKSGEDIFGDGVLEILQDGFGFLRSSDSSYLAGPDDIYVSPSQIRRFNLRTGDTIAGKIRPPKEGERYFALLKVNEVNFDKPENARSKILFENLTPLHANNRLRMERGNGSTEDLTARVLDLAAPIGRGQRGLIVAPPKAGKTMLLQNIAANIAHNYPDCVLMVLLIDERPEEVTEMQRLVKGEVIASTFDEPASRHVQVAEMVIEKAKRLVEHKKDVIILLDSITRLARAYNTVVPSSGKVLTGGVDANALHRPKRFFGAARNVEEGGSLTIIATALVDTGSKMDEVIYEEFKGTGNMELHLSRKIAEKRVFPAIDYNRSGTRKEELLTSQDELQKMWILRKIIHPMGEIDAMEFLINKLAMTKTNEEFFDFMKRS >NZ_CP047352.1|WP_004246352.1|186060_187152_+|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase MDILKMSTNVFYVFLFSFAFLFVARKVAKKIGLVDKPNYRKRHHGLIPLVGGISVYFGIVFAFYVSDIYIPHKELYLICAGILVFIGALDDRYDISVKIRATIQALVGIAMMVFGGLKLESLGHAFGPWDMHLGPFGYIVTLFAVWAAINAFNMVDGIDGLLGGLSCVSFGALGILLYQSGSSALAFWCFSFIAAILPYIMLNLGVCGKKFKVFMGDAGSTLIGFTIIWLLISSTQVDPHPINAVTALWIIAIPLMDMVAIMYRRLRKGMSPFSPDRQHIHHLIMRAGFTPRQAFVLITLAAAVLAAIGIIGENLSFVPEWVMLALFLLAFVMYGYCIKRAWRVARFIKRYKRRLRKATQLKH >NZ_CP047352.1|WP_004249670.1|187175_188234_+|ECA-polysaccharide-chain-length-modulation-protein MNSENNVSRQGFSPDNELDIRGLCCALWSGKRWIIGFALLFALIALGASYLMQPKWSAIAMTERPTVNNLGSYYSQSQFLRNLDTQINPSVTVSQLSIPDEAYQEFVTQISAFDTRREFWLQTDYYKQRKENDAQADAALLDELINNIQFTPADEKKLVNDQLKLIAETANDSSQLLNEYIAFANKRAAEHLNEEVIAAWATRTQSMKALVKRQEMAAQAAYQRQINLLKQSIKVAEKQGISQKQTSIAIDELPDSKLFLLGVPLLQSQLETLMATGPDFDSDYDQNTAMLSTLAVGAKLQDNFQTYRFLRTPEDPVKRDSPRRAFMMVLWGAIGVLVGAGVALVRRSSLKK >NZ_CP047352.1|WP_004246349.1|188363_189494_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing) MKVLTVFGTRPEAIKMAPLVHALANDDSFEAKVCVTAQHREMLDQVLNLFEIKPDYDLNIMKPGQDLTDITCRILEGLKPVLASFQPDVVLVHGDTTTTMAASLAAFYQQIPVGHVEAGLRTGNLYSPWPEEANRTIAGHLAMYHFAPTETAKLNLVREAVADKNIFVTGNTVIDALFWVSERVMGNQTLLDELAVQYPFIQPERKMILVTGHRRESFGGGFERICQALAEIALAHPDVEVVYPVHLNPNVSEPVKRILHGINNIKLIQPQDYLPFVYLMNHAYLILTDSGGIQEEAPSLGKPVLVMRDTTERPEAVEAGSVRLVGTDTKRIVSEVTSLLTDENAYHQMSKATNPYGDGHACQRILEALKNNQVTL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP047352_2 | 2519804-2519951 | TypeI-E |
I-E
Consensus repeat of NZ_CP047352_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP047352_2
>2.1|2519833|32|NZ_CP047352|PILER-CR ATAAACAAAGGGTTGGTCATCTCCGAATACAG >2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR GGGATAAGGAACATCAGACAACAGCATCAGGC |
cas2,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047352_2
The CRISPR arrays of NZ_CP047352_2 >merge|NZ_CP047352|2|2519804-2519951|PILER-CR TTTATCCCCGTATACACGGGGAACACATAAACAAAGGGTTGGTCATCTCCGAATACAGCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACGGGATAAGGAACATCAGACAACAGCATCAGGCCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC >NZ_CP047352|2|1|2519804-2519951|PILER-CR TTTATCCCCGTATACACGGGGAACACATA AACAAAGGGTTGGTCATCTCCGAATACAGCGG TTCATCCCCGTATACACGGGGAACACGGG ATAAGGAACATCAGACAACAGCATCAGGCCGG TTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC
>NZ_CP047352.1|WP_036918635.1|2518408_2519632_-|alanine-racemase MPLAIRYLALLPLFVITACQQPVNYNPPATQVAQVQPAIVNNSWIEISRSALDFNVKKVQSLLGKQSSLCAVLKGDAYGHDLSLVAPIMIENNVQCIGVTNNQELKEVRDLGFKGRLMRVRNATEQEMAQATSYNVEELIGDLDMAKRLDAIAKQQNKVIPIHLALNSGGMSRNGLEVDNKSGLEKAKQISQLANLKVVGIMSHYPEEDANKVREDLARFKQQSQQVLEVMGLERNNVTLHMANTFATITVPESWLDMVRVGGIFYGDTIASTDYKRVMTFKSNIASINYYPKGNTVGYDRTYTLKRDSVLANIPVGYADGYRRVFSNAGHALIAGQRVPVLGKTSMNTVMVDITSLNNIKPGDEVVFFGKQGNSEITAEEIEDISGALFTEMSILWGATNQRVLVD >NZ_CP047352.1|WP_164527114.1|2515931_2518331_+|membrane-bound-PQQ-dependent-dehydrogenase,-glucose/quinate/shikimate-family MKISHFYRWIVFIILTILALYFTVLGGYLVSLAGSPFYLFTGVMLLIIAACFLSRKKSTLLLFNFLFLITIVWSIWESGFDFWALAPRLDIIFILGLLLIPFTLNNNVYTCRTNKIGLFTLLATTLIIILGSSLTDPHAINGQFTQQQPTNSISPIGVNDNDWPAYGRTQAGIRYSPLTQINSDNVDKLVEKWTFHTGDEKRANDAVEITNEVTPIKIEDNLFLCTPHQYLISLDPATGKEKWRFDSKLQYNKSFQHMTCRGVAYYNQNNSAEFAKSLDVRQPSISDECPEKVFLPVNDGRLIAVNAQTGNACRDFGQNGEINLLASMPYAYLGGYNPTSPPIVTGNTIIIGGSVTDNLSTQEPSGVIRGYDVNSGKLIWVFDTGAEDPNAMPGKETQFVHNSPNAWAPLAYDAQTDVVYIPTGVGTPDIWGGDRHPLKERYANSVLALKGSTGELLWHFQTTHHDLWDMDVPSQPSLVDIKTDKNETIPAIYIVTKTGNVFVLDRRDGTPIVPVTEKPVPTSVKYGPQTQGEHYSPTQPFSALNLAPKNKLQGSDMWGGTMADQLLCRIAFHQFNYEGIYTPPSENGTLVFPGNLGIFEWGGISVNQDRQVAVMNFITLPFISKLYLKDPQDSQAIDAGHGEQGLQPMTGTPYSVDIHPFLSPLGLPCKQPPWGFVAGVDLTKNELVWQQRFGTIRDSLPNLVELPPLKIGVPGLGGAISTAGNVMFVAASQDNYIRAFNVTNGKMLWEARLPAGGQATPMTYSIGGKQYVVIMAGGHGSFGTKMGDSLVAYGLPDNL >NZ_CP047352.1|WP_004247166.1|2515557_2515701_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP047352.1|WP_004247166.1|2515017_2515161_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP047352.1|WP_004247166.1|2514476_2514620_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP047352.1|WP_017827864.1|2511996_2514141_+|phosphate-acetyltransferase MSRTIMLVPTDTRVGLTSVSLGVIRSMEQKGVRLSVFKPIAQPRVKGALDQTTAIIRSHSTIQSAEPLNMDYVESLLSSNKKDVLMEEIVARYHENTADAEVVLIEGLVPMRKHPFAQSLNYEIAKTLGAEIVFVTALGNNTAEQLKERIEFARAEFGGVKNQNITGVIVNKLNAPVDDQGRTRPDLSEIFDDSSKAIISNIDLNTIEKNSPLPLLGCIPWNFDLIATRATDMAKHLNATIVNKGDIETRRIKSVTFCARSIPHMLEHFRPGSLLVTSADRPDVLVSACLAAMNGVEIGAILLTGGYQIDAPIKQLCERAFETGLPIFMVNSNTWQTSLNLQSFSLEVPADDHERIEKIQNYVAQHINNQWIDSLTANSERPNRLSPPAFRYQLTELARKAKKRIVLPEGDEPRTVKAASICAERGIATCVLLGDPEEIRRVAAAQGVELGTGIELVNPKEVREIYVPRLVELRKNKGMTEVVAREQLEDNVVLGTLMLEKGVVDGLVSGAVHTTANTIRPPLQLIKTAPGSSLVSSVFFMLLPEQVYVYGDCAINPDPTAEQLAEIAIQSADSAKAFGIDPRVAMISYSTGNSGAGSDVEKVREATRLAQEKRPDLIIDGPLQYDAAVMADVAKSKAPNSPVAGKATVFIFPDLNTGNTTYKAVQRSADLVSIGPMLQGMRKPVNDLSRGALVDDIVYTVALTAIQASQQENA >NZ_CP047352.1|WP_004243716.1|2510716_2511919_+|acetate-kinase MSSKLVLVLNCGSSSLKFAIINPENGEEFLSGLAECFNLPEARLKWKMDGQKHEAALGAGAAHSEALNFIVNTILAEKPELSQQIAAIGHRIVHGGEKFTKSVVITDEVIKGIEAAIPFAPLHNPAHLIGIEEARKAFPHLINKMVAVFDTAFHQTMPEEAYLYALPYSLYKDHSIRRYGAHGTSHFFVSREAAKMLNKPVDELNVITCHLGNGGSVSAIVNGKCVDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPAIVFHLHDTLGMSVEDINKLLTKESGLLGLTEVTSDCRYVEDNYETKADAKRAMDVYCHRLAKYIGSYCALMEGRLDAIIFTGGIGENAAMVRELSLKKLALLGFEVDHQRNLDARFGKSGTITTDNSRLAVVIPTNEELVIAQDASRLTA >NZ_CP047352.1|WP_004243712.1|2509869_2510325_-|DUF412-domain-containing-protein MNEPTVTPPGFFKKLRLGNEYLKTWPVEKQLAPVFPENRMIKATRFGIRYMPPIAIFTLTWQIALGGDLGPAITTALFACSLPMQGLWWLGKRAATPLPAVLLNWFYEIREKFEQAGIALAPVEKTPTYLSLAHLLKRAFKQLDRSFLDDV >NZ_CP047352.1|WP_023843594.1|2509234_2509729_-|YfbU-family-protein MEMTHAQRLILSNQYKMMTMMDPDNAERYRRYQTIIERGYGLQLRELDRDFDEMSEETCRTIINIMEMYHALQVSRENLKSPEMPDARRVAFMGFDAATESRYLSYVRFMVNTEGRYTHFDSGSHGFNSQTPMWEKYQRMLAVWLACPRQYHLSSVEIQQILNA >NZ_CP047352.1|WP_004243707.1|2508537_2509200_-|sugar-phosphatase MTITCKGFLFDLDGTLVDSLPVVEYCWALFGERVGVSTQEINNYIHGKPAIESIRHFMPNATQAQIEETFRWLEKLEATQTEGLAPLPGAIELINRLNDLAIPWAIVTSGTVPIASTRQSVTGIPEPKHWVTAECITQGKPNPEPYLLGAKKLGLAPKECVVFEDAAAGIYSGLDAGCQVIAVHAPISLPRRNEIDLIIDSLNDLQIDKENQQVVIKHKC >NZ_CP047352.1|WP_017627993.1|2520009_2520306_-|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSMIVVVTEAVPPRLRGRLAVWLLEVRAGVYVGNVSARIREMIWQQINEFAEDGNVVMAWGTNTESGFDFQTYGENRREPIDFDGLRLVLFKPYKEDV >NZ_CP047352.1|WP_036918638.1|2520308_2521229_-|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAFIPLRPIPIKDRHSMIFIGMGRIDVKDGAFVVIDEINGERMLIPVGSLACILLEPGTRISHAAVKLAATVGTLLIWVGEAGVRLYSVGQPGGARSDKLLYQAKLALDNDLRLKVVRKMFELRFGESAPLKRSVDQLRGIEGARVRKQYQMLAKKFKIDWKGRRYDPKDWEARDIINRCISAATACLYGVTEAAILAAGYAPAIGFVHTGKPLSFVYDIADIIKFDTVVPVAFKVASYKAIAPDREVRIACREAFRKYQTLNKLIPLIEEVLSAGEITPPEPPIDAQPPAIPQAHPFGDEGHREK >NZ_CP047352.1|WP_036918640.1|2521229_2521907_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRISIDYSADYLHSLLANKLPDGYTIHQLLWRLFTEEKERSFLYRLEIGKNGKPIFYILSSIAPTTKNNFFKIETKPFLPKLVKKMKLAFSLRANPTVCITDKEGKRHRHDVLMHAKKQAQLDGKDYSHDDIHHLMQQAALNWISSDDRLNKWGISLTQLPDIKAYTPERIKKPSGKIMSFSSVDYQGVLTIEEPHLFWQQYQQGFGRAKAFGCGLMLIRNI >NZ_CP047352.1|WP_036918643.1|2521906_2522644_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MAQYLVFRLYGPLASWGLPAVGGDRQTGIAPSRSAILGLLSASLGINRKDESKLLQLQQSVLVATKQLVPSMLLRDFHTTQVPSKRKNITHPTRRSELAEKDQNTILSSRDYRCDAIWIIAIKLTGHSQYTLEQLKNALLKPVYILSLGRKSCPLSLPMMPKIVEVEQLKEALDTQFPYITTSDKADSYWFHSDGWVTYFWEGNYQDIKGENIMTLYPWDDPINRQHWQFRQRKMYQMSVKRESE >NZ_CP047352.1|WP_036918645.1|2522656_2523691_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHILTSYAPSNLNRDDLGRPKTAIMGGFERLRISSQSLKRHWRTSELFNIALSGNIGIRTKKFGLQLYDALIEGGVSEKNAKNWVELIIEQYGKIKKDSIETEQLVHISHLEKSLAFDLINLLIKEQREPTKQELESLKTINTSVDIALFGRMLASAPKYNIEAACQVAHAISVHSTVIEDDYFTAVDDLNNGETDTGSAHIGEAGFAAALFYSYICINKTQLIESLDGNEELANKAIQALTEVAIKVSPTGKQNSFASRAYASYVLAEKGSYQPRSLSVAFLKPIDDEDMENAAINALKFRMENFDKVYGTCAESRYQLNAVQGEGSLSGLLQFVAE >NZ_CP047352.1|WP_052124564.1|2523721_2524309_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MGSYKSKNITLYNYPELKINVLRWWESLFLSPNELSKKGILPAPNRYKSELKRCDSITAIMLTEGFRALWLSFPVDLINNATTEDIERWATIVAILVYITQDSEKHFATIAGEKDESKKSCISESRFLQLQSSRTYDEFIRRLRRILIQIKGKSSVLSMCKDIEKWVLEKQRFSSIQKNKQIIIEWAMKYYQAAI >NZ_CP047352.1|WP_036918648.1|2524295_2525894_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNIINQPWLPFRFRDGEIKTLPISAISHPDIIDFSLNRADFKGAAYQFAIGLLQTIFAPEDEDEWEEYFETPPSSKKLQSAFDKVAHAFNIMGDGPLFMQDFSTLEEQKNIPIAQLLIDAPGENGIKQNTDHFIKQGIADVMSLEMAVLALFTLQINAPSGGKGHLVSLRGGGPLTTLVYPAEENSTLWQKLWLNVINREFWEYDEPNFDDGSVFPWLIPLNLKEGKGEKVSPDDVHPLYMYWAMPRRIRLKVENKSVTCQISDMKSNFSVRYYVTKNYGLDYQEGWLHPLTPYYWDPKKPEMFPNSIKGRQGGIHYNLWDRLFLSSNENGQKSATVVSHYLKLYQLLEFTRKPRLLIFGYDMDNMKPRGWYNLEMPIFHVKDEYNNKIINEIKIIQKLTIDCLKSVKEQVKKAWFSSPKDMKGDISFIDLTFWQRSENIFFEVVQNIIVQIQKNDFLTHEQAKKWLNSIRKISISIFDEYALSALGTQKSVSGCIKARNGLIKDLYSNKRIKKFTEDFKITKENGEQYGIL >NZ_CP047352.1|WP_036918650.1|2525890_2528584_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MDKDYYSYWGKFKSENNHEYYHLLPYHSLDVAAVGMILFPENSKIIKDISTFLQIHPKEFSKLFLLLLSLHDIGKFSSSFQYINPNIIDKLKVPESRFSYDGNNYRHDRLGYYFWRKIKNTIFSSIIISNADYKERKISDGFWIIFETALGHHGKPINKNNIDESIENYIHKDNDKAAIDFTLDILKLFSPKLSVENFYDKGWKERLKQISWLLAGMVTLSDWIGSNRDYFPYYKKKIPLSEYWSLALNRAKKAVLSSGFNRNYQISPFISVEYHFGYKPTPLQQWAEKVTINEHPQLFILEDTTGSGKTEAALTLAHRLMEVDAADGFYFGLPTQATSNAMFLRIINHYKKIFDEKNEVPSIVLAHSASNMNEQFTKIIRDGNERYNISDNTASAQCYQWLSDSRKKALLATIGVGTLDQALLSMLPRRHQSLRLLGLNRKIIIFDEIHSADEFMFEIIEKLLSTHLHQGGSVILLTATLSLKQRKRIIDGWFNAFNQISPEIESKSFPLATHLTCFPKVIKKEYPLKSRNQVSRKVKVEIINKEDQCIDIIISAINNGNCVVWIRNTVNDAIKSYYDIKKRLSKDNNCLLFHSRFNLKDRKIREEQVLKYFGKNSTAQQRKGTVLIATQVFQESLDADADIMISDICPIDDLIQRSGRLHRHTRTKYGDYTSETIDKRRPPILYVHAPLFIETPSSCWLTEQFSSTETVYRSPGRLWLTLRSLTRLGEINMPKDARQLIESVYSDNAYNEIPQSLIQKENNDIGEKKARVSKAKIQLLKINKGYSEESSEFWTEDHYDISTRYSDIEMVNILLLKKIKDNYVPWIEDSHFSIALSTVKISKKKYADKLVSVPQEVIDTINKQYPQARYLQLWIPDEDHYYQYDHLIGFCERQELS >NZ_CP047352.1|WP_004243721.1|2529538_2530795_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MDFFRFLMSDVLSEPAILVGLIALIGLIAQKKPATECIKGTVKTIMGFVILGAGAGLVINSLGDFSTIFQHAFGIQGVVPNNEAIVSIAQKSFGKEMALIMFFAMLINILIARLTPWKYIFLTGHHTLFMSMMVAVILATAGLEGAVLVAVGSLVVGVSMVFFPAIAHPYMKKITGSDDVALGHFSTISYVVSGFIGSKFGNKAHSTEEMNVPKSLLFLRDTPVAIAFTMGIIFIITCLFAGDTFVREVSGGKNWFMFSLMQSITFAAGVYIILQGVRMVIAEIVPAFKGISDKLVPNAKPALDCPVVFPYAPNAVLVGFLSSFAAGVIGMFILYALDWTVIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGAILGAFAQGLLITFLPVFLLPVLGDIGIANTTFSDADFGVIGILLGIIVR >NZ_CP047352.1|WP_012368108.1|2530805_2531093_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGSSLMMEMSIKSILKDLAVNADVDHVDLGSAKGTPSDIYVGTRDIAEQLNAQAVNGKIVSLDNMIDKVAMKEKLSTALRELGAL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP047352_3 | 2528830-2529408 | TypeI-E |
I-E
Consensus repeat of NZ_CP047352_3
|
9 spacers
spacers of NZ_CP047352_3
>3.1|2528859|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTACGCTCACCGCGTGCTGGTCTAGTCAT >3.2|2528920|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGGGTTCAGCGGGCAAGCGGTATTCGAACAC >3.3|2528981|33|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTGAGATCCCACGATGAAAAGGAACGTACTG >3.4|2529043|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACAATCGACAAATATTCACCCAACAAATCCG >3.5|2529104|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATCAGGAAGCGGTAGATACCGAGGTGAGTAA >3.6|2529165|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACATTACGTGTGTCGCGACAAGCAAAATCAC >3.7|2529226|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCCTGCTCTTCACCAGAAAGACCATGAATTT >3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATGGCTCATCGGTGTTAAAGTTATCCATAG >3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACCGATAATATTAGTGGTGGTTTCCGCTTCA |
cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047352_3
The CRISPR arrays of NZ_CP047352_3 >merge|NZ_CP047352|3|2528830-2529408|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGATTCATCCCCGTACATACGGGGAACACTTATTACGCTCACCGCGTGCTGGTCTAGTCATCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTGGGGTTCAGCGGGCAAGCGGTATTCGAACACCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTATTGAGATCCCACGATGAAAAGGAACGTACTGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACGACAATCGACAAATATTCACCCAACAAATCCGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACGATCAGGAAGCGGTAGATACCGAGGTGAGTAACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACGACATTACGTGTGTCGCGACAAGCAAAATCACCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACAGCCTGCTCTTCACCAGAAAGACCATGAATTTCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTAATGGCTCATCGGTGTTAAAGTTATCCATAGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACCACCGATAATATTAGTGGTGGTTTCCGCTTCACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP047352|3|2|2528830-2529408|PILER-CR CGATTCATCCCCGTACATACGGGGAACAC TTATTACGCTCACCGCGTGCTGGTCTAGTCAT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGGGGTTCAGCGGGCAAGCGGTATTCGAACAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TATTGAGATCCCACGATGAAAAGGAACGTACTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GACAATCGACAAATATTCACCCAACAAATCCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATCAGGAAGCGGTAGATACCGAGGTGAGTAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GACATTACGTGTGTCGCGACAAGCAAAATCAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AGCCTGCTCTTCACCAGAAAGACCATGAATTT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAATGGCTCATCGGTGTTAAAGTTATCCATAG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CACCGATAATATTAGTGGTGGTTTCCGCTTCA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP047352|3|2|2528830-2529408|CRISPRCasFinder CGATTCATCCCCGTACATACGGGGAACAC TTATTACGCTCACCGCGTGCTGGTCTAGTCAT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGGGGTTCAGCGGGCAAGCGGTATTCGAACAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TATTGAGATCCCACGATGAAAAGGAACGTACTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GACAATCGACAAATATTCACCCAACAAATCCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATCAGGAAGCGGTAGATACCGAGGTGAGTAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GACATTACGTGTGTCGCGACAAGCAAAATCAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AGCCTGCTCTTCACCAGAAAGACCATGAATTT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAATGGCTCATCGGTGTTAAAGTTATCCATAG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CACCGATAATATTAGTGGTGGTTTCCGCTTCA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP047352|3|1|2528830-2529408|CRT CGATTCATCCCCGTACATACGGGGAACAC TTATTACGCTCACCGCGTGCTGGTCTAGTCAT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGGGGTTCAGCGGGCAAGCGGTATTCGAACAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TATTGAGATCCCACGATGAAAAGGAACGTACTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GACAATCGACAAATATTCACCCAACAAATCCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATCAGGAAGCGGTAGATACCGAGGTGAGTAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GACATTACGTGTGTCGCGACAAGCAAAATCAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AGCCTGCTCTTCACCAGAAAGACCATGAATTT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAATGGCTCATCGGTGTTAAAGTTATCCATAG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CACCGATAATATTAGTGGTGGTTTCCGCTTCA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC
>NZ_CP047352.1|WP_036918650.1|2525890_2528584_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MDKDYYSYWGKFKSENNHEYYHLLPYHSLDVAAVGMILFPENSKIIKDISTFLQIHPKEFSKLFLLLLSLHDIGKFSSSFQYINPNIIDKLKVPESRFSYDGNNYRHDRLGYYFWRKIKNTIFSSIIISNADYKERKISDGFWIIFETALGHHGKPINKNNIDESIENYIHKDNDKAAIDFTLDILKLFSPKLSVENFYDKGWKERLKQISWLLAGMVTLSDWIGSNRDYFPYYKKKIPLSEYWSLALNRAKKAVLSSGFNRNYQISPFISVEYHFGYKPTPLQQWAEKVTINEHPQLFILEDTTGSGKTEAALTLAHRLMEVDAADGFYFGLPTQATSNAMFLRIINHYKKIFDEKNEVPSIVLAHSASNMNEQFTKIIRDGNERYNISDNTASAQCYQWLSDSRKKALLATIGVGTLDQALLSMLPRRHQSLRLLGLNRKIIIFDEIHSADEFMFEIIEKLLSTHLHQGGSVILLTATLSLKQRKRIIDGWFNAFNQISPEIESKSFPLATHLTCFPKVIKKEYPLKSRNQVSRKVKVEIINKEDQCIDIIISAINNGNCVVWIRNTVNDAIKSYYDIKKRLSKDNNCLLFHSRFNLKDRKIREEQVLKYFGKNSTAQQRKGTVLIATQVFQESLDADADIMISDICPIDDLIQRSGRLHRHTRTKYGDYTSETIDKRRPPILYVHAPLFIETPSSCWLTEQFSSTETVYRSPGRLWLTLRSLTRLGEINMPKDARQLIESVYSDNAYNEIPQSLIQKENNDIGEKKARVSKAKIQLLKINKGYSEESSEFWTEDHYDISTRYSDIEMVNILLLKKIKDNYVPWIEDSHFSIALSTVKISKKKYADKLVSVPQEVIDTINKQYPQARYLQLWIPDEDHYYQYDHLIGFCERQELS >NZ_CP047352.1|WP_036918648.1|2524295_2525894_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNIINQPWLPFRFRDGEIKTLPISAISHPDIIDFSLNRADFKGAAYQFAIGLLQTIFAPEDEDEWEEYFETPPSSKKLQSAFDKVAHAFNIMGDGPLFMQDFSTLEEQKNIPIAQLLIDAPGENGIKQNTDHFIKQGIADVMSLEMAVLALFTLQINAPSGGKGHLVSLRGGGPLTTLVYPAEENSTLWQKLWLNVINREFWEYDEPNFDDGSVFPWLIPLNLKEGKGEKVSPDDVHPLYMYWAMPRRIRLKVENKSVTCQISDMKSNFSVRYYVTKNYGLDYQEGWLHPLTPYYWDPKKPEMFPNSIKGRQGGIHYNLWDRLFLSSNENGQKSATVVSHYLKLYQLLEFTRKPRLLIFGYDMDNMKPRGWYNLEMPIFHVKDEYNNKIINEIKIIQKLTIDCLKSVKEQVKKAWFSSPKDMKGDISFIDLTFWQRSENIFFEVVQNIIVQIQKNDFLTHEQAKKWLNSIRKISISIFDEYALSALGTQKSVSGCIKARNGLIKDLYSNKRIKKFTEDFKITKENGEQYGIL >NZ_CP047352.1|WP_052124564.1|2523721_2524309_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MGSYKSKNITLYNYPELKINVLRWWESLFLSPNELSKKGILPAPNRYKSELKRCDSITAIMLTEGFRALWLSFPVDLINNATTEDIERWATIVAILVYITQDSEKHFATIAGEKDESKKSCISESRFLQLQSSRTYDEFIRRLRRILIQIKGKSSVLSMCKDIEKWVLEKQRFSSIQKNKQIIIEWAMKYYQAAI >NZ_CP047352.1|WP_036918645.1|2522656_2523691_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHILTSYAPSNLNRDDLGRPKTAIMGGFERLRISSQSLKRHWRTSELFNIALSGNIGIRTKKFGLQLYDALIEGGVSEKNAKNWVELIIEQYGKIKKDSIETEQLVHISHLEKSLAFDLINLLIKEQREPTKQELESLKTINTSVDIALFGRMLASAPKYNIEAACQVAHAISVHSTVIEDDYFTAVDDLNNGETDTGSAHIGEAGFAAALFYSYICINKTQLIESLDGNEELANKAIQALTEVAIKVSPTGKQNSFASRAYASYVLAEKGSYQPRSLSVAFLKPIDDEDMENAAINALKFRMENFDKVYGTCAESRYQLNAVQGEGSLSGLLQFVAE >NZ_CP047352.1|WP_036918643.1|2521906_2522644_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MAQYLVFRLYGPLASWGLPAVGGDRQTGIAPSRSAILGLLSASLGINRKDESKLLQLQQSVLVATKQLVPSMLLRDFHTTQVPSKRKNITHPTRRSELAEKDQNTILSSRDYRCDAIWIIAIKLTGHSQYTLEQLKNALLKPVYILSLGRKSCPLSLPMMPKIVEVEQLKEALDTQFPYITTSDKADSYWFHSDGWVTYFWEGNYQDIKGENIMTLYPWDDPINRQHWQFRQRKMYQMSVKRESE >NZ_CP047352.1|WP_036918640.1|2521229_2521907_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRISIDYSADYLHSLLANKLPDGYTIHQLLWRLFTEEKERSFLYRLEIGKNGKPIFYILSSIAPTTKNNFFKIETKPFLPKLVKKMKLAFSLRANPTVCITDKEGKRHRHDVLMHAKKQAQLDGKDYSHDDIHHLMQQAALNWISSDDRLNKWGISLTQLPDIKAYTPERIKKPSGKIMSFSSVDYQGVLTIEEPHLFWQQYQQGFGRAKAFGCGLMLIRNI >NZ_CP047352.1|WP_036918638.1|2520308_2521229_-|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAFIPLRPIPIKDRHSMIFIGMGRIDVKDGAFVVIDEINGERMLIPVGSLACILLEPGTRISHAAVKLAATVGTLLIWVGEAGVRLYSVGQPGGARSDKLLYQAKLALDNDLRLKVVRKMFELRFGESAPLKRSVDQLRGIEGARVRKQYQMLAKKFKIDWKGRRYDPKDWEARDIINRCISAATACLYGVTEAAILAAGYAPAIGFVHTGKPLSFVYDIADIIKFDTVVPVAFKVASYKAIAPDREVRIACREAFRKYQTLNKLIPLIEEVLSAGEITPPEPPIDAQPPAIPQAHPFGDEGHREK >NZ_CP047352.1|WP_017627993.1|2520009_2520306_-|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSMIVVVTEAVPPRLRGRLAVWLLEVRAGVYVGNVSARIREMIWQQINEFAEDGNVVMAWGTNTESGFDFQTYGENRREPIDFDGLRLVLFKPYKEDV >NZ_CP047352.1|WP_036918635.1|2518408_2519632_-|alanine-racemase MPLAIRYLALLPLFVITACQQPVNYNPPATQVAQVQPAIVNNSWIEISRSALDFNVKKVQSLLGKQSSLCAVLKGDAYGHDLSLVAPIMIENNVQCIGVTNNQELKEVRDLGFKGRLMRVRNATEQEMAQATSYNVEELIGDLDMAKRLDAIAKQQNKVIPIHLALNSGGMSRNGLEVDNKSGLEKAKQISQLANLKVVGIMSHYPEEDANKVREDLARFKQQSQQVLEVMGLERNNVTLHMANTFATITVPESWLDMVRVGGIFYGDTIASTDYKRVMTFKSNIASINYYPKGNTVGYDRTYTLKRDSVLANIPVGYADGYRRVFSNAGHALIAGQRVPVLGKTSMNTVMVDITSLNNIKPGDEVVFFGKQGNSEITAEEIEDISGALFTEMSILWGATNQRVLVD >NZ_CP047352.1|WP_164527114.1|2515931_2518331_+|membrane-bound-PQQ-dependent-dehydrogenase,-glucose/quinate/shikimate-family MKISHFYRWIVFIILTILALYFTVLGGYLVSLAGSPFYLFTGVMLLIIAACFLSRKKSTLLLFNFLFLITIVWSIWESGFDFWALAPRLDIIFILGLLLIPFTLNNNVYTCRTNKIGLFTLLATTLIIILGSSLTDPHAINGQFTQQQPTNSISPIGVNDNDWPAYGRTQAGIRYSPLTQINSDNVDKLVEKWTFHTGDEKRANDAVEITNEVTPIKIEDNLFLCTPHQYLISLDPATGKEKWRFDSKLQYNKSFQHMTCRGVAYYNQNNSAEFAKSLDVRQPSISDECPEKVFLPVNDGRLIAVNAQTGNACRDFGQNGEINLLASMPYAYLGGYNPTSPPIVTGNTIIIGGSVTDNLSTQEPSGVIRGYDVNSGKLIWVFDTGAEDPNAMPGKETQFVHNSPNAWAPLAYDAQTDVVYIPTGVGTPDIWGGDRHPLKERYANSVLALKGSTGELLWHFQTTHHDLWDMDVPSQPSLVDIKTDKNETIPAIYIVTKTGNVFVLDRRDGTPIVPVTEKPVPTSVKYGPQTQGEHYSPTQPFSALNLAPKNKLQGSDMWGGTMADQLLCRIAFHQFNYEGIYTPPSENGTLVFPGNLGIFEWGGISVNQDRQVAVMNFITLPFISKLYLKDPQDSQAIDAGHGEQGLQPMTGTPYSVDIHPFLSPLGLPCKQPPWGFVAGVDLTKNELVWQQRFGTIRDSLPNLVELPPLKIGVPGLGGAISTAGNVMFVAASQDNYIRAFNVTNGKMLWEARLPAGGQATPMTYSIGGKQYVVIMAGGHGSFGTKMGDSLVAYGLPDNL >NZ_CP047352.1|WP_004243721.1|2529538_2530795_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MDFFRFLMSDVLSEPAILVGLIALIGLIAQKKPATECIKGTVKTIMGFVILGAGAGLVINSLGDFSTIFQHAFGIQGVVPNNEAIVSIAQKSFGKEMALIMFFAMLINILIARLTPWKYIFLTGHHTLFMSMMVAVILATAGLEGAVLVAVGSLVVGVSMVFFPAIAHPYMKKITGSDDVALGHFSTISYVVSGFIGSKFGNKAHSTEEMNVPKSLLFLRDTPVAIAFTMGIIFIITCLFAGDTFVREVSGGKNWFMFSLMQSITFAAGVYIILQGVRMVIAEIVPAFKGISDKLVPNAKPALDCPVVFPYAPNAVLVGFLSSFAAGVIGMFILYALDWTVIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGAILGAFAQGLLITFLPVFLLPVLGDIGIANTTFSDADFGVIGILLGIIVR >NZ_CP047352.1|WP_012368108.1|2530805_2531093_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGSSLMMEMSIKSILKDLAVNADVDHVDLGSAKGTPSDIYVGTRDIAEQLNAQAVNGKIVSLDNMIDKVAMKEKLSTALRELGAL >NZ_CP047352.1|WP_004243724.1|2531122_2531566_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MLKTLLTPDVVQVIPQVKDWREAIKIACQPLIDKGCIEPRYVDAIYKSHEQIGPYYVLGPGIAMPHARPEEGVNQLSLALTIIEKGVEFGADENDPVKLLIVLAATDNDSHINAIVKLAELFDNQDDIDTLLQAKSKAEVLAVINHY >NZ_CP047352.1|WP_004243725.1|2531792_2532839_+|LacI-family-transcriptional-regulator MIKTRKRRNTGRVTLQEVAKHAGVGSMTVSRALRTPELVSDKLREKVNQAVAELGYIPNASAGALASAQSHIIAVLLPSFTDKASADFMQSLQQILSRHHYQILVGCYEYQLHKATDVINMLLQSNPAALVAFGSQLSDVQFLHISNANVPVVSVASQSNEQSAISIDCGYEKAAFDLTHYLIQQGKRCVGYVGALQGQRLHHQQITGWSRALLKNYLNAEQSVTTPDPASMAYGRQALTEILLRQPELDAVICSHESIALGMMFECQRRLIKIPQDLAIACLEGSENSAQIAPSLTSIHFNYHKIGKEAGKHLIALLQHLRDEVDNAMFENTVINYAYRLELGQSTP >NZ_CP047352.1|WP_004243726.1|2532835_2533378_-|NUDIX-hydrolase-YfcD MEQENTAVVEWVDIVDEKNEVVAQATRQQMRAENLRHRATYIVVHDGMGKILAQRRTETKDFYPGWLDATAGGVVQQGENALESARREAEEELGIAGVPFAEHGQFYYDDESCRVWGSLFSCVSHGPFALQPEEIEEVCWLTPLEITERCDEFTPDSLKALSLWLTRNNSTRLDTKETTD >NZ_CP047352.1|WP_004250689.1|2533574_2534189_+|thiol:disulfide-oxidoreductase MIDLYYANTPNGQKITLFLEEVAMPYTLHHVDIGKGDQFKPEFLAISPNNKIPAIVDNAPADGGEPLSIFESGAILIYLAEKSGKLLSHDLREKMTQLQWLFWQVGGFGPMLGQNHHFTRYAPEKVPYAINRYTKETERLYQVLESRLAQSPYLGGNDYSIADIATYTWARYHDTHHIDLADYPAVEKWLNTISQRPAAKKLFG >NZ_CP047352.1|WP_036918654.1|2534253_2535159_+|TIGR01777-family-protein MNILITGGTGLIGRALICQLALDKHNITVLSRSPQKVYSHFCNEMACWTHLDDKENLNQFDAVINLAGEPIADKRWTPEQKQTLVNSRCKLTQKLVDLIKASDSPPGVLISGSAVGFYGDQGENNVTEETPPKDEFTHQLCAKWENIALDAQTPLTRVCLLRTGIVLSTKGGALPKMSPPFKLGLGGKLGNGKQYMPWIHIDDMVNAIVFLLNNNNTQGAFNLTAPHPVQNKAFTTTLAHILKRPAFMTVPATILKLMMGESATLVLGGQQAFPKKLLDAGFSFRYPQLEGALEDIIRHKK >NZ_CP047352.1|WP_017827869.1|2535178_2535760_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MKKLIVGLTGASGAIYGIRLLEILKSVPSVETHLVISQAARRTISLETDYSLKDIHALADIIYDDRDIGATISSGSFRVNGMVILPCSIKSLSGIVHSYTDTLVTRAADVVLKEGRKLVLCVRETPLHLGHLRLMTQAAELGAIIMPPVPAFYFQPKTIDDIVNQTVNRVLDQFDIDLPDDLFQRWQGDKPAR >NZ_CP047352.1|WP_004243730.1|2535881_2537399_-|amidophosphoribosyltransferase MCGIVGIAGVNPVNQSIYDALTVLQHRGQDAAGIATIDENNGFRLRKANGLVKDVFETRHMLRLKGTIGIGHVRYPTAGSSSASEAQPFYVNSPFGITLAHNGNLTNAHLLRRQLFETARRHINTTSDSEILLNVLAYELDRFDHFPLEPDNIFTAVAAMHKKLRGAYACVALIIGHGLLAFRDPYGIRPLVLGKRTLEDGRSEYMVASESVALDTLGFEFLRDVAPGEAVYITEQGQLFTRQCAENPQLVPCLFEYVYFARPDSFIDKISVYNARLRMGQKLGAKIAKEWEDLQIDVVIPIPETSCDIALEIAHILNKPYRQGFVKNRYVGRTFIMPGQQERRKSVRRKLNANRAEFRDKNVLLIDDSIVRGTTSEQIVELAREAGAKKVYFASAAPEVRFPNVYGIDMPNANELIAHGREVDEIRKLIGADGLIFQDLSDLIAAVQEENPDINQFECSVFDGVYITKDIDQGYLDYLENLRRDDEHKIRDQHEAENLEIYNEG >NZ_CP047352.1|WP_004243731.1|2537429_2537921_-|colicin-V-production-protein MVWIDYAIIAIIGFSALVSLIRGFVREALSLITWGCGFFVASQFYPYLAVYFTRFEDELVRNGIAIVTLFIATLIVGAVINYVISSLVQRTGLSGTDRVLGICFGALRGVLIVSALLFVLGAFTPMADSADWQRSELIPQFNHIIRWFFDYLQNASSFVSEKM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047352_4 | 2792079-2792221 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047352_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP047352_4
>4.1|2792102|37|NZ_CP047352|CRISPRCasFinder TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA >4.2|2792162|37|NZ_CP047352|CRISPRCasFinder CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047352_4
The CRISPR arrays of NZ_CP047352_4 >merge|NZ_CP047352|4|2792079-2792221|CRISPRCasFinder GGTGATATCAATTTCACAGGTGGTGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAAGGTGATATCAATTTTACAGGTGGCGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTATGGTAATACCAACTTTACTGGTGG >NZ_CP047352|4|3|2792079-2792221|CRISPRCasFinder GGTGATATCAATTTCACAGGTGG TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA GGTGATATCAATTTTACAGGTGG CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT GGTAATACCAACTTTACTGGTGG
>NZ_CP047352.1|WP_036905137.1|2790163_2790391_+|hypothetical-protein MIHIPASGFIYMASIIKSMLENPCINKEFEKLIAADLLPILQNETNMTENFTALHLIKKTNNRRIILYKNLFIIN >NZ_CP047352.1|WP_164527127.1|2790016_2790163_+|hypothetical-protein MAINEKFVQEISSINYNNGIFSLYFVGQDPHKIAQGIMPEKDEELALK >NZ_CP047352.1|WP_004244067.1|2786745_2789343_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase MLEEYRKHVAERAAEGVVPKPLDATQTAALVELLKSPPKGEEEFLLDLIVNRVPPGVDEAAYVKAGFLTALAKGETTSPLITPEKAVELLGTMQGGYNIHALIEALDNDKLAPIAAKALSHTLLMFDSFYDVEEKAKAGNVYAKQIMQSWADGEWFTERPELAEKITVTVFKVTGETNTDDLSPAPDAWSRPDIPLHALAMLKNAREGIEPDQPGSVGPIKQIEALNKKGFPLAYVGDVVGTGSSRKSATNSVLWFMGDDIPYVPNKRGGGVVLGGKIAPIFFNTMEDAGALPIEVDVSKLNMGDVIDIYPYKGEIRNHETNELLETFALKTEVLIDEVRAGGRIPLIIGRGLTSKARSALGLPPSTLFRHAKAVEQSDRGFSLAQKMVGRACGRDGIRPGEYCEPKMTSVGSQDTTGPMTRDELKDLACLGFSADLVMQSFCHTAAYPKPVDVTTHHTLPDFIMNRGGVSLRPGDGIIHSWLNRMLLPDTVGTGGDSHTRFPIGISFPAGSGLVAFAAATGVMPLDMPESVLVRFKGKMQPGVTLRDLVHAIPLYAIKEGLLTVEKKGKKNIFSGRILEIEGLPELKVEQAFELADASAERSAAGCTIKLDKAPIIEYLQSNIVLLKWMIAEGYGDRRTLERRITAMENWLADPQLLEADADAEYAAVIEIDLNEIKEPILCAPNDPDDARLLSEVANSKIDEVFIGSCMTNIGHFRAAGKLLDQHKGQLPTRLWVAPPTKMDAAQLTEEGYYSVFGKSGARIEVPGCSLCMGNQARVADGATVVSTSTRNFPNRLGTGANVYLASAELAAVASLLGRLPEPQEYLDFINKVDETAEDTYRYLNFDQLEQYTDKATQVIFQTTV >NZ_CP047352.1|WP_004244066.1|2786203_2786575_-|YacL-family-protein MDYEFQRDLTGGILARFSMDHEAIGYWLNDEIQGDISLIDQILTEMDEVKGSEKQWQLIGKEYSLSIDDEEIMVRANTLHFETDDLEEGMSYYDNESIAFCGLDDFATMLQKYRLFILENRRS >NZ_CP047352.1|WP_004248539.1|2785251_2786112_-|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS MNELPASLDEATGWFVANQELFIQYAVNIVAAFLILFIGLFVAKMVSKGVARILTLRHIDATVVTFLSVLVRYTVIAFTLIAVLGRLGVQTASVIAVLGAAGLAVGLALQGSLSNFAAGVLIVIFRPIRAGEYVMIGAVEGTVRDVQIFSTTLRSADDRIIVIPNSKIISSEVINLSREPNRRTQIIVGVAYDADIDKVKKVLGDVVAQDKRIQHNQGVTIRLHEMAPSSLNFVVRVWTTNDDAWPVYWDLMENFKRALDANNIGIPFPQMDVYMHQAQNTVMKAE >NZ_CP047352.1|WP_004244063.1|2784459_2785083_-|arginine-exporter-ArgO MLTTFFQGFLLSAAMILPIGAQNAFVLQQGSKKQYHLMSAFLCALSDVILISGGVFGGSALLSQSEYLLLLITWGGVAFLLWYGWNAFKTAFTKEIELSQHKNQVKSRWRVIVTLVAVTWLNPHVYLDTFVVLGSIGGQLSAELRPWFTFGAVFASISWFFALSLLAAWFSPILSQVTAQRIINLFVGCVMWFIALQLAAQGWKNLF >NZ_CP047352.1|WP_004248538.1|2783634_2784369_-|oxidative-stress-defense-protein MKVKAMVLASMLALGAPSIALAGAVPEGPHITTSGNATIKATPDMATLNIQVSEKAKDAAQAKKQVDERVAKYFAFLKENGVTKEDIDAANIRTQPNYEYDKKAERSVINGYTATRTVDVKIKKLDQLNTLLDGALAAGLNEINNVEFGVNDPEQYKAKAREVAIKNAIQQASSVAKGFGADLGAVYSVSYRAPEATPYPIARMKMDAMALSAPSPEAVKETYQQQSIEFKDYVDVVFELKTAK >NZ_CP047352.1|WP_017827180.1|2783038_2783467_+|hypothetical-protein MADIATLIAKWRNGLEVEIYTENYEFRYGRIKSSRFNASGEESVYYATYFHTRAKPKDNDPLLIITFDPVVGQDDFMFIETIIDHRTYFGSPGAGKTKSHIERRSSDLKRRIENGKKISSEPSSSVQNVNKNNNDSPDQENK >NZ_CP047352.1|WP_004244060.1|2782749_2782971_+|hypothetical-protein MSTFIRRSRNVALAIDAGRKSGSANIEGNTPADIQASLLKSLGEFTASIPTTKQQPYVKGSHGANHKKTYFGR >NZ_CP047352.1|WP_004244059.1|2781647_2782547_+|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP MKRPDYRALQALDAVIRERGFERAAQKLCITQSAVSQRIKQLENLFGQPLLVRTVPPQPTEQGQKLLALLHQVEMLEEQWLGDENSGSTPLLLSLAVNADSLATWLLPALHPVLTQLPIRLNIQVEDETRTQERLRRGEVVGAISIQPQALPSCLVDQLGALDYLFVASPDFAQRYFANGVTKSSLLKAPAVAFDHLDDMHQAFLQQNFGLSPGSVPCHIVNSSEAFVQLAKQGSTCCMIPHLQIADELKSGELIDLTPGLCQRRMLYWHRFAPESRTMRKVTDALLDYGRKVLKQDEE >NZ_CP047352.1|WP_004244077.1|2804671_2806099_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSTEIKAQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLDTVLVERHSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKALSEHGVVFDAPKTDIDKIRIWKDKVISQLTGGLAGMAKGRKVNVVNGEARFTGSHTLSVEGSEGTTTITFENAIVAAGSRPIELPFIPHEDPRVWDSTDALQLKTVPERLLVMGGGIIGLEMGTVYHALGSQIDVVEMFDQVIPAADKDVVKVFTKRISKKFNLMLETKVTAVEAKEDGIYVTMEGKKAPAEPQRYDAVLVAIGRVPNGKLLDAGKAGIEVDDRGFIHVDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVISGKKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGMTEKEAKEKGVSYEVATFPWAASGRAIASDCADGMTKLIFDKETNRVIGGAIVGSNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDIALTIHAHPTLYESIGMAAEVFEGSITDLPNPKAKKKK >NZ_CP047352.1|WP_164527129.1|2806300_2808172_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase MSIEIKVPDIGADEVEVTEVMVKVGDHIEEEQSLITVEGDKASMEVPSPQAGIVKEIKIAVGDKVETGSLIMIFDTEEGAQAPAQEAAPAPSAAAPAASELKEVHVPDIGGDEVEVTEVMVKVGDTISEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVSTGSLIMVFEVAGSAPAPSASAPAPAASAPAASAIKDVNVPDIGGDEVEVTEVMVKVGDTIAEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVKTGSLIMTFEVAGAAPAAQAPAAPAASTSAAPAPSAPAKAPASAPAAKEEFVENEAYVHATPVIRRLAREFGVNLAKVKGTGRKGRILREDVQSYVKELIKRAESAPANAGGGLPGMLPWPKVDFSKFGEIEEVELSRIQKISGANLSRNWVMIPHVNLFDEADITEVEEFRKQQNKEAEKKKLDVKITPLVFVMKAAAKALADMPRFNSSISEDGQKLILKKYINIGIAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGILELSYELAEVSKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGTTGFAPIVNAPEVAIMGLSRSSMKPVWNGKEFVPRLMLPMSLSFDHRVIDGADGARFITLINHYMSDLRRLVM >NZ_CP047352.1|WP_004244080.1|2808184_2810851_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type MSDMLKNDVDPIETRDWLQAIDSVIREEGVERAQFLIDQVLKQARNGGLDIALGGSVHSDYINTIPVEDEPAYPGNLELERRIRSAIRWNAVMMVLRASKKDLELGGHMASYQSSATLYEVCFNHFFRAHNDNDGGDLVYFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLNNFRQEIGGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLSAIYQAKFLKYLDHRGLKDTTKQRVYAFLGDGEMDEPESKGAITIAVREKLDNLCFVVNCNLQRLDGPVTGNGKIVNELEGIFAGAGWNVIKVMWGDRWDALLRKDTSGKLIQLMNETLDGDYQTFKSRDGAYVREHFFNRYPETAALVKDMTDDEIWALNRGGHDPKKVFAAFQKAKETKDKPTVILAQTIKGYGMGETAEGKNIAHQVKKMNMDGVKHFRDRFNIPVSDEKVAELPYITFDKDSEEYKYLHARRQELEGYLPARRTRFDEKLEIPTLEDFSQLLEEQSKEISTTIAFVRALNVMLKNKSIKDRLVPIIADEARTFGMEGLFRQIGIYSPNGQQYTPQDREQVAYYKEDVKGQILQEGINELGAGASWLAAATSYSTNNLPMIPFYIYYSMFGFQRIGDLCWAAGDQQARGFLIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSLTIPNCISYDPAFAYEVAVIMQDGLERMYGDKQENVYYYITTLNENYHMPAMPAGAEEGIRKGIYKLESLEGAKGKVQLLGSGSILRHVREAAQILSTEYGIGSDVYSVTSFTELARDGQDCERWNMLHPSEEPRVPYIAQIMNDAPAVASTDYMKLFAEQVRTYVPADDYRVLGTDGFGRSDSRENLRHHFEVDTSYVIVAALGELAKRGEIDVKVVEEAIKKYNINPEKVNPRLA >NZ_CP047352.1|WP_012368227.1|2811014_2811785_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR MAYTKIRQPKLSDVIEQQLEHLILEGTLRPGEKLLPERELAKQFDVSRPSLREAIQKLEAKGFLLRRQGGGTFVQDNLWQSFSDPLAQLLSGHPESQFDLLETRHALEGIAAYYAALRGTDDDLERIKASHARIIDAHDKGDIAAESDAVLQYQLIVTEAAHNVVLLHLLRCMVPMLEQNIRQNFEFLYTRKEMLTAVSEHRTQIYQAIINREPEAAREASHRHLAFIEDVLLDMSREHTRRERSLRRLQQHPDLF >NZ_CP047352.1|WP_004250361.1|2812111_2812654_-|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD MEIKQGWLTGVKHVPSPNYDNRPEGEIPSLLIIHNISLPPGQFGGPYIDQLFTNTLAVDDHPFFNEIAHLRVSAHCLIRRDGEIVQYVPFTARAWHAGVSFYKGREKCNDFSIGIELEGTDECDFTPQQYQQLSTLTQQLIEHYPGIKENITGHSDVAPGRKTDPGPHFNWSYYRALLAK >NZ_CP047352.1|WP_004248548.1|2812864_2813308_+|prepilin-peptidase-dependent-pilin MNTLNYHSTENGFTLMELMIVIAIISILSSVAIPAYHGYIQKAALTDVLQTLSPYRSAVELCHYEHQYNQCHADASFMPQQFRSRYLTDIHVANGVISAKGKAQLEGLTIVMTPATNSKETLPHWQINCTSTNTALQKLCHKVFKSH >NZ_CP047352.1|WP_004248550.1|2813406_2814510_+|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component-TadA MNNTIHTATEFIEQLLRHSLAQRVSDLHLEPQQNSLRIRARIDNHLVLFSPPDNQLANEILTRLKILANINIAEKRLPQDGQFNWSYQKNNYSIRVATLPTLYGEKIVLRLMNNLQQPQLAQLGFQTIHLTLLKKYLTQPQGMILVTGPTGSGKTLTLYSCLQYLNKDNRNINSIEDPIELPIHGINQTQITEKAGITFATILRALLRQDPDVIMIGEIRDQQTAEIAIKAAQTGHLVLSTLHTNSTQATLARLANLGIAKDLIDSCVKLIISQRLVRCLCSNCKYPSPEQKNFIINNQQIILPNWQATGCQFCYSGYKGRTAIYDCFELAKQSLPSPYALFNSGIELIKKGITSLDEVYQVVGDIE >NZ_CP047352.1|WP_036918804.1|2814506_2815706_+|transporter MKLHFIYRYNALTYQGKWLSGNVVAQSKHEVIDQLIQQQKLPVKIRLYRVIIFQNSDKQYRIQLLEQLALLLHSGLALLPALTLLKEECRYLHWQCVLNDIIFHLNQGGALSKQLSRYPLYFPANLTHFIYIGEESGKLDEVLLLQTTQLKNQRDLIKKIIKAFQYPLFLLLTLIVITISMLSYVLPEYQSLYSAFNTELPTLTLTLIRCSQWFSQYSLIILLFILIISYSYYTIKHHNAKFRDIEQRCWLNLPYLGILLRYHQLHIIFQIMTITQQAGLPLLQGLKIITEQLTHSLYQRALTDMIAHITQGKSLSSFMRHNPLFPPICYQFISSAENSGQLQFFCQQLTHWFYHQLEERLDSVKTWLEPILMTLIALITGTLIIAMYLPVLQLGDTIH >NZ_CP047352.1|WP_004244087.1|2815983_2816598_+|dephospho-CoA-kinase MTYTVALTGGIGSGKTTIANGFASLGVPLVDADVIARLVVEPDSPGLKALQQHFGDTILLPDGKLNRAQLRHIIFQNQQEKAWVNQLLHPLIQQETQKQIQQIRAPYFIWVVPLLVENKLTHLADRILVVDVTEEEQITRTMQRDGVSRDHVLKILQAQAKREQRLAVADDIIENHDNSLNQDEQIKQLHQHYLELAQKSNTGQ >NZ_CP047352.1|WP_004244089.1|2816600_2817353_+|cell-division-protein-ZapD MSEETSTIIFEHPLNEKMRSWLRIENSLIQLNSFQSINSLSSALSFFRAVSEFIEVLDRGEIRAELLKELEKRQKKLQQWLSFPNVDKEIVSHIINELSESACALSKAPRIGQHLKQDKIISLVKQRLSIPGGCCSFDVPTLHLWLNLPQTVRTEKLTCWQEGLYPLQNALNALLTLIRQSDTFKPVLSHNGFYQDSTEEGELLRIKLLASQQIYPQVSGHKNRYAIRFLPLDSEHGTIPSELPFEISCC |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP047352_5 | 3865403-3865542 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047352_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP047352_5
>5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR TTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACA >5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR CTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047352_5
The CRISPR arrays of NZ_CP047352_5 >merge|NZ_CP047352|5|3865403-3865542|PILER-CR AGTTCCAAACTATTTTGTCATTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCCAGTTCCCATCTATTTTGTCACTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCTCCCAGTTCCCAACTATTTTGTCC >NZ_CP047352|5|3|3865403-3865542|PILER-CR AGTTCCAAACTATTTTGTCATTT TTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCC AGTTCCCATCTATTTTGTCACTC TTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCTCCC AGTTCCCAACTATTTTGTCC
>NZ_CP047352.1|WP_001353740.1|3864800_3865040_-|DUF1819-family-protein MTPFRYNSDLTSGSLQTRECRIITGLLLQELDEAAWDKAMYKENVLQKRTQSTVRRISSALRKRLEHLSSDFWAFAFLC >NZ_CP047352.1|WP_000497519.1|3864286_3864613_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MFVFPSSTLCNHPYNGKLCRHHLHDSVARKALKAAVQKAGIVSKRVTCHTFRHSFATHLLQAGRDIRTVQELLGHNDVKTTQIYTHVLGQHFAGTTSPADGLMLLINQ >NZ_CP047352.1|WP_000071896.1|3863635_3864172_+|class-2-integron-integrase-IntI2 MSNSPFLNSIRTDMRQKGYALKTEKTYLHWIKRFILFHKKRHPQTMGSEEVRLFLSSLANSRHVAINTQKIALNALAFLYNRFLQQPLGDIDYIPASKPRRLPSVISANEVQRILQVMDTRNQVIFTLLYGAGLRINECLRLRVKDFDFDNGCITVHDGKGGKSRNSLLPTRLIPAIK >NZ_CP047352.1|WP_070342364.1|3862404_3863250_-|lincosamide-nucleotidyltransferase-Lnu(F) MLQQKMIERFKEACHEDARIIAALMFGSFAIGEGDEFSDIEFAVFIQDDHFENFDQRSWLNAVSPVAAYFPDDFGHHTALFENGIRGEFHFMRKSDIPVISTWQGYGWFPSLEEAVLLDRSGELSRYASALVGSPPKREGAPLVEGLVLNLISLMLFGANLLNRGEYARAWALLSKAHENLLKLVRLHEGATDHWPTPSRALEKDVSEDSYNRYLACTGSAEPKALCVAYHETWKWSLELFRSVAGPLNIELPRIVIAQTKRLLNESATPHNKMLTSEEEL >NZ_CP047352.1|WP_000777554.1|3861934_3862408_-|trimethoprim-resistant-dihydrofolate-reductase-DfrA1 MKLSLMVAISKNGVIGNGPDIPWSAKGEQLLFKAITYNQWLLVGRKTFESMGALPNRKYAVVTRSSFTSDNENVLIFPSIKDALTNLKKITDHVIVSGGGEIYKSLIDQVDTLHISTIDIEPEGDVYFPEIPSNFRPVFTQDFASNINYSYQIWQKG >NZ_CP047352.1|WP_001206316.1|3861126_3861918_-|ANT(3'')-Ia-family-aminoglycoside-nucleotidyltransferase-AadA1 MREAVIAEVSTQLSEVVGVIERHLEPTLLAVHLYGSAVDGGLKPHSDIDLLVTVTVRLDETTRRALINDLLETSASPGESEILRAVEVTIVVHDDIIPWRYPAKRELQFGEWQRNDILAGIFEPATIDIDLAILLTKAREHSVALVGPAAEELFDPVPEQDLFEALNETLTLWNSPPDWAGDERNVVLTLSRIWYSAVTGKIAPKDVAADWAMERLPAQYQPVILEARQAYLGQEEDRLASRADQLEEFVHYVKGEITKVVGK >NZ_CP047352.1|WP_000679427.1|3860615_3860963_-|quaternary-ammonium-compound-efflux-SMR-transporter-QacE-delta-1 MKGWLFLVIAIVGEVIATSALKSSEGFTKLAPSAVVIIGYGIAFYFLSLVLKSIPVGVAYAVWSGLGVVIITAIAWLLHGQKLDAWGFVGMGLIIAAFLLARSPSWKSLRRPTPW >NZ_CP047352.1|WP_000259031.1|3859782_3860622_-|sulfonamide-resistant-dihydropteroate-synthase-Sul1 MVTVFGILNLTEDSFFDESRRLDPAGAVTAAIEMLRVGSDVVDVGPAASHPDARPVSPADEIRRIAPLLDALSDQMHRVSIDSFQPETQRYALKRGVGYLNDIQGFPDPALYPDIAEADCRLVVMHSAQRDGIATRTGHLRPEDALDEIVRFFEARVSALRRSGVAADRLILDPGMGFFLSPAPETSLHVLSNLQKLKSALGLPLLVSVSRKSFLGATVGLPVKDLGPASLAAELHAIGNGADYVRTHAPGDLRSAITFSETLAKFRSRDARDRGLDHA >NZ_CP047352.1|WP_000376616.1|3859451_3859655_-|hypothetical-protein MDSEEPPNVRVACSGDIDEVVRLMHDAAAWMSAKGTPAWDVARIDRTFAETFVLRSELLGIASENGK >NZ_CP047352.1|WP_000184001.1|3858090_3859296_-|chromate-efflux-transporter MTNNPTDDSRPWSVFLIFLRLGLTSFGGPIAHLGYFRAEFVTRRRWLSERSYADLVALCQFLPGPASSQVGIAVGLSRAGYSGALAAWAGFTLPSAIALILFALGISSYGDYVSQGALHGLKVVAVAVVAQAVWGMARNLCTDGLRVTIMAIATCVVLLVPSAWGQVGVIAIAGIAGRLLFKPAKVVEHDPLPITVSHRAGVLWLSLFFVLLIGLPVLAELMPSQTMAMVDSFYRVGSLVFGGGHVVLPLLQAEVVPSGWVNNESFLAGYGAAQAVPGPLFTFAAFLGASMNTAPSGWIGGIVCLLAIFAPSFLLVVGSMPFWERLRRNTGIQAALAGINAAVVGLLLAALYQPVWTSAIFQPQDFGLALVALVALMFWKLPPWLVVLGSGAAGWLLSVAL >NZ_CP047352.1|WP_004249986.1|3865951_3867028_+|putative-2-aminoethylphosphonate-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLQFNINSQNGSMPHIRVENIQKRFNQFIALDGVSLEIKQGELVCLLGPSGCGKTTLLRCIAGLETQDHGSIFNYDNNISHLPPQARDYGILFQSYALFPNLTVQQNIAYGLAGQPRNVIKNRVNEMLELVGLQDRKKKYPGELSGGQQQRVALARALAPAPSLLLLDEPMSALDAQVREHLCVELRNLQQSLNITTLMVTHNQDEAMLMADRIAVMNNGKVEQYGSSEEIYNHPQTPFVAEFVGKGNWLPFNRNQHGEAMIGSREVQLKHTAVPHNQGRLFCRPESIKINPIQNKHNQYDANIQNVVFLGSRCIMKFELDHLPGHLLQAEISAAELHSIQNGKVKVTLPANELHIFA >NZ_CP047352.1|WP_004246582.1|3867040_3868732_+|putative-2-aminoethylphosphonate-ABC-transporter-permease-subunit MSVIVPTKSINRLDSLFVAGGKLFIICLLTLGVLLPLLAIFWRGFTPDISQGGGFQAAIDLFTSANFLWLVGNSISVSLSVAVITVPLAYLFAYALHRTLIPFKSLWRGISLLPLLAPSMLPGIALVYLFGNQGLLRSLLTESIYGYWGLVLGEVIYTFPHALMILLSALSMSDARLFDAASSLGASSWRTFRSVTWSSSRHGIFAALCLVFTLTITDFGIPVVVGGDYQVLALEAYKAVLGQQQFGRGALIGMLLLLPALLTFGVDVWLRKRQRDAMSSRAQFYLPKANFQRDTLYLIFVMLICALFLLVFGTAVYSSFIQFWPYNLSFSLRHYNFEGLPGGWLAYTNSIILAFYTATIGCFLIFMGAYLIEKTASHSWLNNLLRMLSFVPMAVPGLVLGLGYVFFFNLPNNPLNFLYGSMVLLVLCSIAHFFTTAYMTASTALRQLDKEFEAASLSLKAPLYRHFWRITIPLCLPALLDIYRYLFVSAMTTVSAAIFLYSPDTILAAVAVLNMDDAGNIGGAAAMSTLILTTSAGVSILLSIASQGVLRRTQAWHQREAKQ >NZ_CP047352.1|WP_023843642.1|3868780_3869788_+|putative-2-aminoethylphosphonate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MLKKLILATSLLFSAGTVFAATEITVYTAIESEQLQAYKQAFEAKYPDIKIKWVRDSTGIITAKLLAEKDRPQADVVWGLAASSLAILKAQNMLEPYAPAQLDDIDVKFRDSNNPPTWVGMDVWAATICYNTIEAQKLGLSKPTSWQDLTKPEYKGKIVMPNPASSGTGFLDVSAWLQIFGEQEGWAYMDKLHQNIGQYVHSGSKPCKMAASGEYPIGISFEYPALQLKRQGAPLDIILPQEGLGWDIEATAIIKGTNKRDAAQKLADFSASKEAMKLYSANFAVLANTSVPVSQTELPRDYAQRLIKNDFIWAAEKRDTILTEWRKRYDGKSAK >NZ_CP047352.1|WP_164527180.1|3869852_3870980_+|TIGR03364-family-FAD-dependent-oxidoreductase MKFDIAVIGAGIIGLSHAYAAAQRGLRVAIFERSYTPVGASVRNFGHGLILGQAPGKMLDLAKNSREIWATMAKQAKFLTRQKGTYLLARTQSEHAVLEAFVDGRAKTYGYDCELLSKTQLATVYGGQLQHHRAALHGKEDQVLFSREAIPQLAAYLGSLANVTSYFSTLVRDIDVDTGALITSNGTFSAEKIIVCSGHDYQTLLADEIKKLDPIVCRLQMLRVTAEQNIGLAHALMTGLNCTHYGAFADLPEAQALAKEIKMQSPLIEQYGIHLLITPTPYGDLIIGDSHEYSLDAQPFNSEEVDNLLIELAEHTLGCSVQVKERWQGVYGAKGKEPISILTPSEKVTAVLMRTGLGMSVGPGLGEQNIRQLFD >NZ_CP047352.1|WP_080047755.1|3871054_3871459_-|DUF1240-domain-containing-protein MIKIEPVKLILSSIAILFIAIFSIYISTSYYITYFLMEDRILFSFQTGLLVFATPLILYFSYYSFILGYQKKLQRMNNKVAGICAGIAIIGIVFSFFFSIYVALDLTSKGYYSCYKSSAFAPNEYVIAKEMCKK >NZ_CP047352.1|WP_036908624.1|3871514_3871802_-|YjeO-family-protein MKIILRTFIFLYFIFLLILINILSISDYEWMIGEGDIDNLCQLPLNGRYVIEPILILIPCILLLFLEKNKKLRWGYVTITVIYIIWSFYLRFNFC >NZ_CP047352.1|WP_020946476.1|3871890_3872703_-|phosphonoacetaldehyde-hydrolase MNKSVEAVILDWAGTVVDFGSFAPTQIFVDAFAQAFNFKISLSEARGPMGMGKIDHIRALLNEPNIRTRWTAQFGHPPSEEEAQHIYRTFMPLQIAQVVHFAKPIEGALEAISTIRAQGIKIGSCSGYPKAVMDVLVPKAAEYGYQPDCVVASDEIAAGSRPGPWMALKNVIELGVMSVARCVKVDDAVTGIAEGLNAGMWTVGLSVSGNEFGATFEQYQTMEQAEIENRKRIAENKLRTAGAHYIIDTLANLPAVIEDINQRIANNQKP >NZ_CP047352.1|WP_004249805.1|3873577_3874711_+|M20-family-metallopeptidase MQHTINSQYDEMVDFLKELVNIDSGSYDKQGVDAVADLLIQRYQKLGFVVEVFENEQLGNNYRLVHKDATNPQIFIAAHLDTVFPKGTVAERPFSIDGSRAYGPGVIDMKASHVLTYYAINALKQSGDLSYQNVEILLNCDEEIGSKTSRHLIEKYAKNKAYALIMEPARANGAIVSARRGVGTYELLIEGKASHSGIAPEAGISAIQELSYKIQALHALSRHDEGLSVNVGLISGGTSVNTVAPHARAEIDVRISTDEQGIEIDKQVREVCSQPVLAGVKLTLNGGINRPPMVKTPESANLIEIIKQQADLIGLAIEDISTGGGSDASFTAGVGTPSVDGLGPIGGYQHSDKEYLDLPSLTERTVLFANVIKRLSQ >NZ_CP047352.1|WP_004246570.1|3874720_3876127_+|YfcC-family-protein MEKSKKIKWAMPDAFIIIFGIVILAAIATYLIPAGSYQRETVNGLNRVVPNSFNYVAQNPASLMDVFYAIPVGLKQSASIIFLIFMIGGAIAIYDRTRAIDSGINALIVKTKGNYQALIITVAFIFGMLSSLGLAANAVIAFIPIGIALSRSMKLDAITGVAVVYLGYYAGNAVGVLDPTILGTAQTLAEVPLFSGVIFRVVLFAILIVVTIAYIVWYARRIANDPTTSYMYGIAKDDPDYEQPHTQSLDSTFSLRQKLSLVVFIAFIGLFLYGAFEYKWGIEHLSAIFIMMSIVVAAMFKIAPNDYIKTFMKGAQSLVYGALVVGIARAVIVILDEGRVLDSIVQATLVPLQQTSHFWGAQLLYFFNLLFNLLVTSGTGQASIVMPIMVPILDILDLTRQTGVLILKLGDGFTNIITPTSGVLMAVLAVGKVPWTRWVKFVFPILMIWVVIGMAAIGIATAISYGPV >NZ_CP047352.1|WP_164527181.1|3876219_3876858_-|TetR-family-transcriptional-regulator MKSSKIDRLNVLDTALSLLEKEGIEGLTMRKLADALHIKAASLYWHFDNKQTLIEGMADRIVSEVAVDFHYSQDWKADLKRLATELREAFLQHRDGARVFAGTYVISENVLRINNTLITLIMQSGASAELASNMSMTLLYFILGCCIEQQAITLIDSEILMQKRLAFEQIVRDKYPQTWQVREILFADDFAMRFNFGLEQLVTGFEHQLMTP |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_KX774387 | Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence | 10387-10419 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP053895 | Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence | 72648-72680 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_KU963389 | Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence | 15133-15165 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP047288 | Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence | 62060-62092 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP044485 | Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence | 28402-28434 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP025853 | Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence | 25816-25848 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_KT754165 | Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence | 23240-23272 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP053372 | Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence | 57315-57347 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP024247 | Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2 | 64739-64771 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP053043 | Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence | 95158-95190 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | JX469830 | Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence | 41349-41381 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP013819 | Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence | 10767-10799 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP025925 | Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence | 13633-13665 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP025875 | Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence | 10830-10862 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP013795 | Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence | 10767-10799 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP023380 | Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence | 15396-15428 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP011314 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence | 172056-172088 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NC_008357 | Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence | 68063-68095 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP027138 | Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2 | 74789-74821 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP022673 | Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence | 78315-78347 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP045128 | Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence | 89271-89303 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_LT985250 | Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence | 152291-152323 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_MK360096 | Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence | 17850-17882 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP053897 | Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence | 75880-75912 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_MF150120 | Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence | 40084-40116 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_KX756453 | Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence | 42453-42485 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NC_015472 | Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence | 13464-13496 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP013800 | Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence | 12090-12122 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | MG516911 | Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence | 57128-57160 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP003997 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence | 42619-42651 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP054380 | Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence | 38153-38185 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NC_002525 | Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence | 10525-10557 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP048015 | Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence | 49215-49247 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP034054 | Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence | 140941-140973 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP047114 | Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence | 46467-46499 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP034046 | Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence | 150963-150995 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP027700 | Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence | 7471-7503 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP053899 | Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence | 116699-116731 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_MK264770 | Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence | 42620-42652 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_CP013819 | Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence | 10823-10863 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_CP003997 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence | 42555-42595 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | CP025875 | Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence | 10886-10926 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_CP011314 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence | 172112-172152 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_CP022673 | Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence | 78371-78411 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_CP048015 | Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence | 49151-49191 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_CP047114 | Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence | 46403-46443 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_CP034046 | Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence | 150899-150939 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_CP045128 | Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence | 89327-89367 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_CP027700 | Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence | 7407-7447 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_LT985250 | Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence | 152347-152387 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_MK360096 | Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence | 17906-17946 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_MK264770 | Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence | 42556-42596 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047352_3 | 3.2|2528920|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2528920-2528951 | 32 | MK047642 | Phage NG55, complete genome | 29355-29386 | 2 | 0.938 |
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NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP038508 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FARPER-219 plasmid p-F219, complete sequence | 228634-228666 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP052788 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0611 plasmid pN19S0611, complete sequence | 321488-321520 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP052786 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0641 plasmid pN19S0641, complete sequence | 10079-10111 | 2 | 0.939 |
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NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP052832 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1040 plasmid pN17S1040, complete sequence | 277011-277043 | 2 | 0.939 |
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NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP052818 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1509 plasmid pN17S1509, complete sequence | 1788-1820 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_MH476540 | Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence | 87104-87136 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP052795 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0125 plasmid pN19S0125, complete sequence | 166287-166319 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP047882 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain 119944 plasmid pESI, complete sequence | 264306-264338 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP052802 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S976 plasmid pN17S0976, complete sequence | 197576-197608 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP052840 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S024 plasmid pN16S024, complete sequence | 9544-9576 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP052836 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S103 plasmid pN16S103, complete sequence | 222743-222775 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP052828 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1126 plasmid pN17S1126, complete sequence | 8856-8888 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP052826 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1245 plasmid pN17S0637, complete sequence | 292607-292639 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP016409 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502916 plasmid pFSIS1502916, complete sequence | 299316-299348 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP016407 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502169 plasmid pFSIS1502169, complete sequence | 299920-299952 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP016413 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM44454 plasmid pCVM44454, complete sequence | 295999-296031 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_CP016411 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain N55391 plasmid pN55391, complete sequence | 293612-293644 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | CP052814 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S349 plasmid pN17S0349, complete sequence | 281790-281822 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865426-3865458 | 33 | NZ_MG764552 | Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence | 61314-61346 | 2 | 0.939 |
NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_CP053897 | Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence | 75936-75976 | 2 | 0.951 |
NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | MN310378 | Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence | 73436-73476 | 2 | 0.951 |
NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_MH476540 | Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence | 87160-87200 | 2 | 0.951 |
NZ_CP047352_5 | 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR | 3865482-3865522 | 41 | NZ_MG764552 | Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence | 61250-61290 | 2 | 0.951 |
NZ_CP047352_2 | 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR | 2519894-2519925 | 32 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 22316-22347 | 3 | 0.906 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | MK433577 | Klebsiella phage ST512-KPC3phi13.6, complete genome | 7850-7881 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | NC_010463 | Enterobacteria phage Fels-2, complete genome | 6687-6718 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | NC_049453 | Klebsiella phage ST13-OXA48phi12.1, complete genome | 13070-13101 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | MK433581 | Klebsiella phage ST258-KPC3phi16.1, complete genome | 7850-7881 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | KT630647 | Salmonella phage SEN8, complete genome | 19172-19203 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | NC_019488 | Salmonella phage RE-2010, complete genome | 27376-27407 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | NC_049454 | Klebsiella phage ST15-OXA48phi14.1, complete genome | 25959-25990 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | MK416009 | Klebsiella phage ST11-OXA245phi3.1, complete genome | 26909-26940 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | MK422449 | Klebsiella phage ST512-KPC3phi13.2, complete genome | 25885-25916 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | MK416020 | Klebsiella phage ST11-VIM1phi8.4, complete genome | 6077-6108 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | MK433580 | Klebsiella phage ST11-OXA48phi15.3, complete genome | 6387-6418 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | MK422454 | Klebsiella phage ST340-VIM1phi10.2, complete genome | 26909-26940 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | MK416011 | Klebsiella phage ST437-OXA245phi4.1, complete genome | 7850-7881 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529348-2529379 | 32 | MK433582 | Klebsiella phage ST258-KPC3phi16.2, complete genome | 6387-6418 | 4 | 0.875 |
NZ_CP047352_3 | 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529287-2529318 | 32 | MN693749 | Marine virus AFVG_250M1175, complete genome | 34448-34479 | 7 | 0.781 |
NZ_CP047352_3 | 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529287-2529318 | 32 | MN694794 | Marine virus AFVG_250M1172, complete genome | 35153-35184 | 7 | 0.781 |
NZ_CP047352_3 | 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529287-2529318 | 32 | MN694703 | Marine virus AFVG_250M1171, complete genome | 35067-35098 | 7 | 0.781 |
NZ_CP047352_3 | 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529287-2529318 | 32 | MN694422 | Marine virus AFVG_250M844, complete genome | 33167-33198 | 7 | 0.781 |
NZ_CP047352_3 | 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529287-2529318 | 32 | MN693830 | Marine virus AFVG_250M842, complete genome | 32714-32745 | 7 | 0.781 |
NZ_CP047352_3 | 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529287-2529318 | 32 | MN693633 | Marine virus AFVG_250M1174, complete genome | 5264-5295 | 7 | 0.781 |
NZ_CP047352_3 | 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529287-2529318 | 32 | MN693832 | Marine virus AFVG_250M1173, complete genome | 5265-5296 | 7 | 0.781 |
NZ_CP047352_3 | 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529287-2529318 | 32 | MN694319 | Marine virus AFVG_250M843, complete genome | 32834-32865 | 7 | 0.781 |
NZ_CP047352_3 | 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529287-2529318 | 32 | MN694684 | Marine virus AFVG_250M1170, complete genome | 5262-5293 | 7 | 0.781 |
NZ_CP047352_3 | 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529287-2529318 | 32 | MN694707 | Marine virus AFVG_250M1176, complete genome | 5266-5297 | 7 | 0.781 |
NZ_CP047352_3 | 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2529287-2529318 | 32 | MN693767 | Marine virus AFVG_250M1169, complete genome | 35260-35291 | 7 | 0.781 |
NZ_CP047352_2 | 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR | 2519894-2519925 | 32 | HM559717 | Synechococcus phage S-CBP4 genomic sequence | 2028-2059 | 8 | 0.75 |
NZ_CP047352_2 | 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR | 2519894-2519925 | 32 | NC_025464 | Synechococcus phage S-CBP4, complete genome | 41633-41664 | 8 | 0.75 |
NZ_CP047352_2 | 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR | 2519894-2519925 | 32 | NZ_AP014659 | Bradyrhizobium diazoefficiens strain NK6 plasmid pNK6a, complete sequence | 114908-114939 | 9 | 0.719 |
NZ_CP047352_2 | 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR | 2519894-2519925 | 32 | NZ_CP049701 | Bradyrhizobium sp. 1S5 strain 323S2 plasmid pB323S2b, complete sequence | 35291-35322 | 9 | 0.719 |
NZ_CP047352_2 | 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR | 2519894-2519925 | 32 | NC_015062 | Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01, complete sequence | 74390-74421 | 9 | 0.719 |
NZ_CP047352_2 | 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR | 2519894-2519925 | 32 | KC139649 | Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds | 38950-38981 | 9 | 0.719 |
NZ_CP047352_2 | 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR | 2519894-2519925 | 32 | KC139634 | Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical protein gene, partial cds; and capsid related protein, hypothetical proteins, tail length tape measure protein, hypothetical protein, enolase-like protein, hypothetical protein, tail protein, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, DNA methylase, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds | 18673-18704 | 9 | 0.719 |
1. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_KX774387 (Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP053895 (Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_KU963389 (Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP047288 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP044485 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP025853 (Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_KT754165 (Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP053372 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP024247 (Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP053043 (Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to JX469830 (Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP013819 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP025925 (Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP025875 (Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP013795 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP023380 (Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP011314 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NC_008357 (Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP027138 (Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP022673 (Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP045128 (Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_LT985250 (Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_MK360096 (Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP053897 (Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_MF150120 (Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca Protospacer *********************************
26. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_KX756453 (Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NC_015472 (Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP013800 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to MG516911 (Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP003997 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP054380 (Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NC_002525 (Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP048015 (Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP034054 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP047114 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP034046 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP027700 (Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP053899 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_MK264770 (Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_KX774387 (Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_MF150120 (Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP053895 (Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_KX756453 (Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_KU963389 (Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP047288 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NC_015472 (Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP044485 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP025853 (Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_KT754165 (Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP013800 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP053372 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP024247 (Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP053043 (Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to MG516911 (Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to JX469830 (Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP013819 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP003997 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP025925 (Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP025875 (Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP013795 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP054380 (Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NC_002525 (Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP023380 (Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP011314 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NC_008357 (Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP027138 (Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP022673 (Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP048015 (Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP034054 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP047114 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP034046 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP045128 (Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP027700 (Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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74. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_LT985250 (Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_MK360096 (Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP053899 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_MK264770 (Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 3.2|2528920|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047642 (Phage NG55, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
tggggttcagcgggcaagcggtattcgaacac CRISPR spacer tggcgttcagcgggcaaccggtattcgaacac Protospacer *** ************* **************
79. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052804 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S973 plasmid pN17S0973, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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80. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP038508 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FARPER-219 plasmid p-F219, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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81. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052788 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0611 plasmid pN19S0611, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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82. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052786 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0641 plasmid pN19S0641, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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83. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052838 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S097 plasmid pN16S097, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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84. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP051676 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1234 plasmid pN16S1234, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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85. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052779 (Salmonella enterica strain 19TN07GT06K-S plasmid pN19S1233, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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86. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052832 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1040 plasmid pN17S1040, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
87. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to MN310378 (Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
88. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052806 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S816 plasmid pN17S0816, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
89. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052818 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1509 plasmid pN17S1509, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
90. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_MH476540 (Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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91. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052795 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0125 plasmid pN19S0125, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
92. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP047882 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain 119944 plasmid pESI, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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93. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052802 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S976 plasmid pN17S0976, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
94. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052840 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S024 plasmid pN16S024, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
95. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052836 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S103 plasmid pN16S103, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
96. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052828 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1126 plasmid pN17S1126, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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97. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052826 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1245 plasmid pN17S0637, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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98. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP016409 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502916 plasmid pFSIS1502916, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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99. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP016407 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502169 plasmid pFSIS1502169, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
100. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP016413 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM44454 plasmid pCVM44454, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
101. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP016411 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain N55391 plasmid pN55391, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
102. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to CP052814 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S349 plasmid pN17S0349, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
103. spacer 5.1|3865426|33|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_MG764552 (Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
104. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP053897 (Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccaccctc Protospacer ***************************************..
105. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to MN310378 (Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctctcccctaaataatccttaaaaaccccatttccacccct Protospacer ****.*********************.**************
106. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_MH476540 (Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctctcccctaaataatccttaaaaaccccatttccacccct Protospacer ****.*********************.**************
107. spacer 5.2|3865482|41|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_MG764552 (Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctctcccctaaataatccttaaaaaccccatttccacccct Protospacer ****.*********************.**************
108. spacer 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
gggataaggaacatcagacaacagcatcaggc CRISPR spacer tggataaggaacatcagataacagcatcagac Protospacer *****************.***********.*
109. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK433577 (Klebsiella phage ST512-KPC3phi13.6, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatatttgaggtggtttccgcttcg Protospacer *.*********** * ***************.
110. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010463 (Enterobacteria phage Fels-2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatattggaggtggtttccgcttcg Protospacer *.***********.* ***************.
111. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049453 (Klebsiella phage ST13-OXA48phi12.1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatattggaggtggtttccgcttcg Protospacer *.***********.* ***************.
112. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK433581 (Klebsiella phage ST258-KPC3phi16.1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatatttgaggtggtttccgcttcg Protospacer *.*********** * ***************.
113. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT630647 (Salmonella phage SEN8, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatattggaggtggtttccgcttcg Protospacer *.***********.* ***************.
114. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019488 (Salmonella phage RE-2010, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatattggaggtggtttccgcttcg Protospacer *.***********.* ***************.
115. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049454 (Klebsiella phage ST15-OXA48phi14.1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer ctccgataatattggaggtggtttccgcttcc Protospacer * ***********.* ***************
116. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK416009 (Klebsiella phage ST11-OXA245phi3.1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatattggaggtggtttccgcttcg Protospacer *.***********.* ***************.
117. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK422449 (Klebsiella phage ST512-KPC3phi13.2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatattggaggtggtttccgcttcg Protospacer *.***********.* ***************.
118. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK416020 (Klebsiella phage ST11-VIM1phi8.4, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatattggaggtggtttccgcttcg Protospacer *.***********.* ***************.
119. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK433580 (Klebsiella phage ST11-OXA48phi15.3, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatattggaggtggtttccgcttcg Protospacer *.***********.* ***************.
120. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK422454 (Klebsiella phage ST340-VIM1phi10.2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatattggaggtggtttccgcttcg Protospacer *.***********.* ***************.
121. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK416011 (Klebsiella phage ST437-OXA245phi4.1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatatttgaggtggtttccgcttcg Protospacer *.*********** * ***************.
122. spacer 3.9|2529348|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK433582 (Klebsiella phage ST258-KPC3phi16.2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
caccgataatattagtggtggtttccgcttca CRISPR spacer cgccgataatattggaggtggtttccgcttcg Protospacer *.***********.* ***************.
123. spacer 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693749 (Marine virus AFVG_250M1175, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
124. spacer 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694794 (Marine virus AFVG_250M1172, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
125. spacer 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694703 (Marine virus AFVG_250M1171, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
126. spacer 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694422 (Marine virus AFVG_250M844, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
127. spacer 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693830 (Marine virus AFVG_250M842, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
128. spacer 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693633 (Marine virus AFVG_250M1174, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
129. spacer 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693832 (Marine virus AFVG_250M1173, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
130. spacer 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694319 (Marine virus AFVG_250M843, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
131. spacer 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694684 (Marine virus AFVG_250M1170, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
132. spacer 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694707 (Marine virus AFVG_250M1176, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
133. spacer 3.8|2529287|32|NZ_CP047352|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693767 (Marine virus AFVG_250M1169, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
134. spacer 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR matches to HM559717 (Synechococcus phage S-CBP4 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gggataag---gaacatcagacaacagcatcaggc CRISPR spacer ---atgggtctgaacaccagactacagcatcagga Protospacer **..* *****.***** ***********
135. spacer 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NC_025464 (Synechococcus phage S-CBP4, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gggataag---gaacatcagacaacagcatcaggc CRISPR spacer ---atgggtctgaacaccagactacagcatcagga Protospacer **..* *****.***** ***********
136. spacer 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_AP014659 (Bradyrhizobium diazoefficiens strain NK6 plasmid pNK6a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gggataaggaacatcagacaacagcatcaggc CRISPR spacer cggataaggaagatcagccaacagcagggtag Protospacer ********** ***** ******** . .
137. spacer 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NZ_CP049701 (Bradyrhizobium sp. 1S5 strain 323S2 plasmid pB323S2b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gggataaggaacatcagacaacagcatcaggc CRISPR spacer cggataaggaagatcagccaacagcagggtag Protospacer ********** ***** ******** . .
138. spacer 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR matches to NC_015062 (Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gggataaggaacatcagacaacagcatcaggc CRISPR spacer tggatagggagcatcagacaacagaagaggat Protospacer *****.***.************* * .*..
139. spacer 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR matches to KC139649 (Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gggataaggaacatcagacaacagcatcaggc CRISPR spacer acgctggggaacatcagaaatcagcatcagca Protospacer . * *..*********** * *********
140. spacer 2.2|2519894|32|NZ_CP047352|PILER-CR matches to KC139634 (Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical protein gene, partial cds; and capsid related protein, hypothetical proteins, tail length tape measure protein, hypothetical protein, enolase-like protein, hypothetical protein, tail protein, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, DNA methylase, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gggataaggaacatcagacaacagcatcaggc CRISPR spacer acgctggggaacatcagaaatcagcatcagca Protospacer . * *..*********** * *********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
904371 : 956195
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047352|904371:956195|DBSCAN-SWA 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38 | Organic_Lake_phycodnavirus(50.0%) | protease,integrase,transposase | attL 901619:901634|attR 963634:963649 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1060115 : 1068650
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047352|1060115:1068650|DBSCAN-SWA CTTACTCATTTGGTGTCTCCTTATCCAGTGCTTGTAACAACATTCCTTTCGAAATTAAACCGATATAACGGTTTTTTTCATCAATAACAGGGATCGCACAGGGAGATTGCGCAACAGTAGAAATCAGTTCATTTAATGGTGTATCACCATTAATCGCACAAGGTTCAGTTAAAATAGCGGATCCAATAGGTTGCTTCGCTTTTAATGCTTCTTCAAGAGAAGTGACAGAAACAATACCTGCAAATTTCCGTCCTCGCTCAATTAAATAACCAAAGTTTCTATCTTCATCTTCCAGTACTTTTAATGCTGAACGGGGACCAAAACCTGGCGCAATATGCAGTAGTGTTTCTGGGCGACGTTTAGCAATATCTTTAGCGCTAAATACATGACTGATATCAACGCCACGGAAGAAGGTACGTACATAATCATTGGCTGGATTATTAAGAATTTCATCAGGGGTACCTATTTGTACCACCACACCACCTTGCATAATCGCGATACGATCGCCAATACGCATGGCTTCATCCAGATCATGAGAAATAAATACAATGGTGCGTTGTTTATCACCCTGTAAGCTTAATAACTCATCTTGCATTTCTGTTCGGATTAATGGGTCAAGTGCGGAGAATGCCTCATCCATTAATAAGATATCAGGATCATTGGCCAGTGCACGAGCAAGCCCAATACGTTGTCGCATCCCACCGGATAACTCATCCGGCCAAGATTGAGCATGAGAGCTTAAGTTAACTTGCTCTAATGCTGCCATGGCTTTTTCATAGCGCTCTTCTTTGCTAATGCCTGCAAGCTCCATACCAAATGCTGTATTATCGAGTACATTCATATGAGGCATTAAAGCGAATGATTGAAACACCATACTGATTTTTTTACGTCGAACTTGTCGTAAATCTTTATCAGACATGGTGGTGATGTTTTCACCATCAATAAGGACTTCGCCTTTAGTGGGATCTATCAGACGATTGAGAAGGCGCACTAATGTAGATTTACCAGAGCCTGATAATCCCATGATGACAAATATTTCGCCTTCTTCAATGGCCAGATTGGCATTTTGCACACCAACGGTTAACCCTGTTTTATCAAAGATTTGGTCTTTGTTCATACCAGATTCTAATAATTCAAAGGCACGTTTAGGGTGCTCACCAAATATTTTATATAGGTTTTTTACTTCGAGTTTAATTGCCATGCAATATCTATTTTCCTATTTAAATATGAAAGGAATAAATTAAATGTTAATAAATTAGTTTGTTGTTTTTCCTAAATTGAGATTTTTAGTAGGGGAATTACCCTATCATAATGAACAAGCCTGACAACCCTATGTTAATTATAATTAAACAAATAATTTTGTGATTTTTTTAGGTTTTTTTTGATAATTAATATTTAAATAAAGTAAAATTATAGAAAAGAAAGAAGTCAAAAAAACCATACTAACTGTATGAAATAACATTATTTTTATTCAGATGTTAATTTTAATTATCATCACAATAGAAATAACAACAAAATAAAAAAATGTAAAAAGATACTAATAAAATAAAAATAGAAAAAAATGCATTAACATTAAAAAATCTTATGATTTTTAAGGGGTGATCTTAAGTTATCGATAACTAGTCATAAAAATCATTCGTAAAAAATTGATAATTCTGGTTAATGGGACGGTAAAAATCACACAATCAGGTTGTTTTTCAAGCAAATAAAAAGGCACTAAAAAATAAGTTTTATTTTTCAGTGCATTATATTAATCGATTAATTCATAATTAATATGAATGTATTCTGTTTTTTTACTATAGAGGGTTAGCTAGAAATCCCAGTCATCATCTTCGGTATTGATCGTTTTACCGATAACATAAGAAGAGCCTGAGCCAGAAAAGAAATCATGATTTTCATTTGCATCTGGCGATAGTGATGAAAGTATTGCTGGACTAACATTAGTTATTTCATCTGGAAATAGTGCTTCATAACCTAAATTCATCAGCGCTTTATTCGCATTATAATGAAGGAATTTTTTTACATCTTCTGTCCAACCGACAGAGTCGTAGAGATCTTCTGTATATTTAACTTCATTATCATATAAATCTAATAATAATGAGAAAGCAAAGTCTTTAATATCTTGTTTCTCTAATGATGATTTATTTAATAACTGATTTTGGAATTTATAGCCAATATAATAACCATGCACAGCTTCGTCACGAATAATTAAACGAATTAAGTCGGCTGTATTGGTTAATTTCCCTCGACTTGACCAATACATTGGTAAATAAAATCCAGAATAGAATAAAAAAGACTCTAAAAATACACTGGCAATTTTTTTCTTTAATGGATCACTATCTTGATAATAACGCAGAATAATATCTGATTTCTTTTGCAAATAGGTATTTTCTTCACTCCAACGATAAGCATCATCAACATCTGTTGTTAAGCAGAGTGTCGAAAATATCGAGCTATAAGAGCGAGCATGTACCGCTTCCATAAAACAGATATTCGATAATACCGCCTCTTCATGAGGAGTCTGAGCATCAGGCATTAAGGTTGGTGCCCCGACCGTATTTTGTATCGTATCGAGCAGTGTAAGCCCTGTAAATACACGGATAGTCAACTGTTTTTCAGCTTGGGTTAAGGTATTCCATGAAGGTATATCATTAGAAAGTGGAATTTTTTCGGGTAACCAAAAATTCATGGTTAAACGGTTCCAAACTTCTAAATCTTTTTCGTCTTCAATACGATTCCAATTTATCGCATTAACACGACTTAAATAAGATGCAGACATAGTAACACTTTCCTTATCATTATTATTAAAGGGCGCATGAAACACAGCCTTTTATTTCTGTGCCGGCTAATGCTGTTTGTCTAATACGAATGTAATACAAGGTCTTTATACCTTTACGCCATGCATAAATTTGTGCTTTATTAACATCCCTTGTGGTTGCTTCATCAGAAAAGAATAATGTTAGCGACAATCCTTGGTCGATATGTTGTGATGCTTGGGCATAGGTATCGATAATTTTTTCTGCGCCAATTTCATAAGCATCTTGATAAAAATGACGGTTTTCATTGGTCATAAAAGGGGCGGGGTAATAAACCCGACCGATTTTACCTTCTTTTCTTATTTCAATCGGTGCCACAATGGGGTGAATACTCGATGTAGAGTGATTGATATAAGAGATTGATCCTGTTGGTGGTATTGCTTGTAAGTTTTGATTATAAATACCGTGAGTCATAATCGAGAGCTTAAGTTTTTGCCAATCTTCTTGGGTTGGAATATGAATATTGGATTGGCTAAATAGCTGGTGGACTTTTTGGGTTTTAGGTAACCACTGTTTTGATAAATATTTATCAAAATACTCCCCAGTGGCATATTTTGACTGTTCAAACCCTTTAAAGCGCTGTTTAGTCTCTATCGCTAATTGGTTAGAGGCTAAAAGGGCATAGTATGTTACGGTATAGAAATAGATATTGGTAAAATCAAGTCCTTCTTCTGAACCATAATAAATCCCTTCACGGGCTAAATAACCATGTAAGTTCATTTGCCCTAAGCCAATGGCATGAGATGCTTGGTTGCCTTTTTCAATAGAAGGTACAGATTCTATTTTAGTCATTTGTGCCACACTCGTCAGTGCTCTGATGGCAACATTTACGGTATGTGCAAAATCTGGTGAGTCCATCGCCATGGCGATATTCATTGATCCGAGATTACAGCTAATATCATGACCAATTTGTCGATAACTTAAATCAGGATTGTATTCACTGGCACTATTTACTTGTAAGATTTCTGAGCATAAATTGCTCATATTAATTCGGCCCGCAATCGGATTTGCGCGATTGACGGTATCTTCAAACATAATATAGGGATAACCTGATTCAAATTGAATTTCAGCTAAAGTTTGAAAAAATGCCCGTGCTTTAATTTTTTTCTTACGTATCTCTGCATTGTTGACCATTTCAGTATATTTTTCGCTAATACTGATTTCTGACATAGGAACGCCATATACTCGTTCTACATCATAAGGTGAAAATAGATACATATCTTCGTTGCGTTTAGCTAATTCAAAGGTGATGTCGGGAATAACGACACCTAATGAAAGCGTCTTAATACGTATTTTTTCATCAGCATTTTCTCGTTTTGTATCTAGAAAATGATAGATATCAGGATGATGAGCATGGAGATAAACCGCTCCAGCACCTTGTCTTGCGCCTAATTGATTGGCATATGAGAAGGCATCTTCAAGCATTTTCATTACCGGTACTACGCCAGACGATTGGTTTTCAATGCGTTTTATGGGGGCTCCTGCTTCTCGTAAATTAGTCAGTAAGAAAGCAACACCTCCGCCACGTTTCGACAATTGCAACGCAGAATTGACTGCTCGGCCAATGGACTCCATGTTGTCTTCGATACGTAATAAAAAACAAGAGACCAATTCGCCACGCTGTTTTTTTCCACAATTTAAGAAAGTAGGGGTTGCAGGCTGGAAACGGCCACTAATTATCTCATCGACAAGGTGAGTGGCGAGTTTGGTATTCCCCTGTGCTAGGGTTAAGGCAACCATACAAACACGATCTTCATAGCGTTCGAGATAACGCTCACCATCAAAGGTTTTTAAGGTGTAACTGGTGTAGTATTTAAATGCACCTAGGAACGATTGAAAGCGAAATTTTTTGCTATAGGCATGCTTAAAAAGCTGTTTGATAAACGGGAAATCGTACTGCTCTAATACTTGTGCTTCGTAGTAGTGTTGTTGCACCAGAAAATCGAGCTTTTCTTTTAGATCATGAAAAAACACCGTATTTTGATTAACGTGTTGACGAAAAAAATGGTGGGTGGCTAATTTGTCTTTATCAAACTGGATATTGCCTTGCTCATCATAGAGATTGAGCATGGCATTTAAGGCGTGATAATCGAGTTGTTCTATAGAATGGGTCATGTTTTTTATCTCATTCACTTTTTAGTCATTATTTGCTTGCTGACCAAAATGTGCTTAATCCGGTTTTTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047352|1060115:1068650|1067178_1067667_-|WP_004246061.1|DBSCAN-SWA MPHHSHYILHDELIGFDIFKYIDIKFIFSNNRKRSVIYRLIFCRDENYHSLINKLYAENIKNLTISVVSFYNIETENYQNCDMFDKPPDSINLTSSETRYLYITLIDIILLIAQTEKIDILTFQAYSEELRRVYIRLINKYAESKNLNVYVEEAYFVIQTNI >NZ_CP047352|1060115:1068650|1066666_1066876_+|WP_004246068.1|DBSCAN-SWA MSKLKGNVKWFNETKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIVSEGFKTLAEGQKVEFEVTDGAKGPSAANVVAI >NZ_CP047352|1060115:1068650|1065073_1065478_-|WP_004246072.1|DBSCAN-SWA MQSTAPLIYFSSRSENCHRFVQKLNLQATRIKEDEPLQATQPFVLLCPTYGGGGVKGAVPKAVIQFLNIPENRQLIRGVIASGNTNFGSAYGLAGDIIAQKCQVPFLYRFELLGTPEDVKRVKTGLSTFWSASK >NZ_CP047352|1060115:1068650|1060115_1061315_-|WP_004247426.1|DBSCAN-SWA MAIKLEVKNLYKIFGEHPKRAFELLESGMNKDQIFDKTGLTVGVQNANLAIEEGEIFVIMGLSGSGKSTLVRLLNRLIDPTKGEVLIDGENITTMSDKDLRQVRRKKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMELAGISKEERYEKAMAALEQVNLSSHAQSWPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVRTFFRGVDISHVFSAKDIAKRRPETLLHIAPGFGPRSALKVLEDEDRNFGYLIERGRKFAGIVSVTSLEEALKAKQPIGSAILTEPCAINGDTPLNELISTVAQSPCAIPVIDEKNRYIGLISKGMLLQALDKETPNE >NZ_CP047352|1060115:1068650|1065489_1065714_-|WP_004246071.1|DBSCAN-SWA MSVILYTKPNCVQCSATERALQQQKIPFTAVDLTQDTQALAKIVSMGYRQVPVVVNGDEHWSGFCPDKIRQIAR >NZ_CP047352|1060115:1068650|1068275_1068650_-|WP_004246058.1|DBSCAN-SWA MLNIAIAVFIGGGLGSVLRWLISYRLNSLFPHFATGTLVANCIGAFIIAFGIAWFSKAPNIDPIWKIMLTTGFCGGLTTFSTFSVEVVALFNEGRIGWALGTMGANLAGSFLMTAFAFWLLREM >NZ_CP047352|1060115:1068650|1062918_1065045_-|WP_004252248.1|DBSCAN-SWA MTHSIEQLDYHALNAMLNLYDEQGNIQFDKDKLATHHFFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVQQHYYEAQVLEQYDFPFIKQLFKHAYSKKFRFQSFLGAFKYYTSYTLKTFDGERYLERYEDRVCMVALTLAQGNTKLATHLVDEIISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRAVNSALQLSKRGGGVAFLLTNLREAGAPIKRIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIYHFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPDITFELAKRNEDMYLFSPYDVERVYGVPMSEISISEKYTEMVNNAEIRKKKIKARAFFQTLAEIQFESGYPYIMFEDTVNRANPIAGRINMSNLCSEILQVNSASEYNPDLSYRQIGHDISCNLGSMNIAMAMDSPDFAHTVNVAIRALTSVAQMTKIESVPSIEKGNQASHAIGLGQMNLHGYLAREGIYYGSEEGLDFTNIYFYTVTYYALLASNQLAIETKQRFKGFEQSKYATGEYFDKYLSKQWLPKTQKVHQLFSQSNIHIPTQEDWQKLKLSIMTHGIYNQNLQAIPPTGSISYINHSTSSIHPIVAPIEIRKEGKIGRVYYPAPFMTNENRHFYQDAYEIGAEKIIDTYAQASQHIDQGLSLTLFFSDEATTRDVNKAQIYAWRKGIKTLYYIRIRQTALAGTEIKGCVSCAL >NZ_CP047352|1060115:1068650|1061924_1062893_-|WP_004247427.1|DBSCAN-SWA MSASYLSRVNAINWNRIEDEKDLEVWNRLTMNFWLPEKIPLSNDIPSWNTLTQAEKQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPTLMPDAQTPHEEAVLSNICFMEAVHARSYSSIFSTLCLTTDVDDAYRWSEENTYLQKKSDIILRYYQDSDPLKKKIASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAVHGYYIGYKFQNQLLNKSSLEKQDIKDFAFSLLLDLYDNEVKYTEDLYDSVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDEITNVSPAILSSLSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKTINTEDDDWDF >NZ_CP047352|1060115:1068650|1065995_1066469_+|WP_004246069.1|DBSCAN-SWA MYQDYLNTPKGFPKPYISITADDDGITSLNFVSEKEALVNSNAIIDLCIKQLKEYFSGKRTLFSVPLAPKGTEFQIRVWQTLQSIPYGEIWSYKKLALTLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIIPCHRVIGHNGKLVGYTGGLDIKRWLLHYEKVDIDE |
9 | Mycobacterium_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1108310 : 1154453
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047352|1108310:1154453|DBSCAN-SWA 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72 | Burkholderia_phage(19.57%) | tRNA,holin,lysis,head,integrase,terminase | attL 1104586:1104601|attR 1131188:1131203 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1319724 : 1398257
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP047352|1319724:1398257|DBSCAN-SWA AATGGGTCAGTTTGATTTTTTAACAGAAACCACACTAGGGGAGAAGGTCTCTCAGTTAAATGAGCCACCTGCGATGTATAAGGTGATCTTGAATAATGATGATTACACCCCCATGGATTTTGTTGTAGAAGTATTAACAATGTATTTTTTTCTTAACGAAGAAAAAGCCACACAAATTATGTTGGACGTTCATCATAAAGGGAAGGGAGTGTGTGGTGTCTATAGTGCGGATATCGCTGAAACTAAAGTTGCACAAGTGAATCAATACGCCAGAGAAAATGGCCATCCACTTTTGTGTACACTGGAAAAAGCGTAGTCCGGTGAGTCTTTTAAGGAGGAGGTGCTTATGCTTAATCACGAATTAGAGCTTAGTCTTAACATTGCATTCGCGAAAGCCCGTGATAACAGACACGAATTTATGACTGTAGAGCACCTGTTGCTGGCGCTATTAAGTAACAAATCGGCGCGTGAAGCATTGGAAGCTTGTAAAGTCGATTTAGCAGTCTTACGCGAAGAGCTTGAAATCTTTATTCGTAAAACGACACCTATTTTACCCGAGCATGTCGATAGAGAAACACAGCCAACCTTGAGTTTCCAACGTGTATTACAACGTGCTGTGTTCCATGTGCAATCTTCAGGTAAAAATGAAGTTTCCGGTGCCAATGTGTTAGTGGCGATTTTTAGTGAGCAAGAGTCTCACGCCGCTTATCTACTACGTAAACATGATGTTAGCCGTCTTGATGTGGTTAATTTTATCTCTCATGGCATTTTAAAAGATGATCAACAAAACAGTGATGATCAGTCTGATATGGGCGATATAAATGCACAATCTCAACAAGAGATGCCACAAGGCGATGATCGCATGGATAATTTTACCACTAACTTAAACCAGTTGGCGCGTCAGGGTAAAATTGATCCACTTATCGGCCGTCAAGCGGAATTAGAAAGAACGATACAAGTCTTATGTCGTCGACGTAAAAATAACCCATTACTGGTCGGTGAATCGGGTGTCGGTAAAACGGCAATTGCAGAAGGGCTTGCATGGCGTATTGAACAAAATGATGTGCCTGATGTGATGAAAGGCTGTACGCTCTATTCTCTTGATATTGGATCTTTATTAGCAGGAACCAAATATCGTGGTGATTTCGAAAAACGCTTTAAAGCGTTATTGAAAACACTTGAAAAAGATGAAAAAAGTATCTTATTTATCGATGAAATTCATACCATCATTGGTGCTGGTGCCGCCTCTGGTGGACAAGTTGATGCCGCTAACTTAATTAAACCACTATTATCAAGTGGTCGTATTCGTGTGATTGGTTCAACCACTTATCAAGAATTTAGTCAGATCTTTGAAAAAGATCGCGCCTTGGCTCGTCGTTTCCAAAAAATTGATGTAATTGAGCCTTCGGCAGATGAAACCGTATTGATTATTAAGGGATTGCGTCAGAAGTATGAAGCACATCACGATGTGCGTTATACCAATAAGGCCATTCAGGCAGCTGTTGATTTATCGGTTAAATACATTACTGATAGACACCTTCCTGATAAAGCCATTGATGTTATTGATGAAGCCGGTGCGAAAACCCGTTTAATTGCACCAAGTAAACGTAAAAAGACGATTAATGTCTCTGATATTGAATCGGTAGTAGCAAAAATTGCCCGTATTCCAGAAAAAACGGTTTCTAGCAGTGATAAGTCAATGCTAAAAAATCTGGATAACCAATTAAAAATGTTGGTGTTCGGTCAAGATCAAGCTATTCATGCCTTGGCTGAATCTATCAAAATGAGCCGAGCAGGTTTAGGGCAAGAGAATAAGCCGGTTGGCTCTTTCTTATTCGCCGGACCAACTGGGGTGGGTAAAACAGAAGTAACGGTCCAGTTGGCGAAAGCGCTTAATATTAAGCTACTGCGCTTTGATATGTCTGAATATATGGAACGACATACGGTAAGCCGTTTAATAGGGGCACCTCCTGGTTATGTTGGTTTTGATCAAGGTGGATTACTCACAGATGCGGTGATTAAAAACCCTTATTCTGTAGTGTTACTTGATGAGATTGAAAAAGCACATCCTGATGTGTTTAACATTCTGCTACAAGTGATGGATAACGGAACACTTACTGATAATAATGGCCGTAAAGCTGATTTTCGTAATGTGATTTTGGTGATGACAACCAATGCGGGTGTTCATGAAACGCAACGTAAATCGATAGGGTTTACTGAACAAGATCATAGCACTGATGCCATGGTTGAAATCAAAAAAGCGTTTTCCCCAGAGTTTCGTAACCGTTTAGATAGCATTATTTGGTTTAATGCGCTATCAGCCGATATTATTGCTATGGTGGTCGATAAATTTATTGTCGAGTTACAAGCTCAATTGGATGATAAAGGGGTATCGCTAGAGGTAAGTCAAGAAGCTCGCCAATGGTTAAGTGATAAAGGTTACGATAAAGCAATGGGAGCAAGACCTATGGCTCGCGTAATTCAAGAAAATCTGAAAAAACCATTAGCCAATGAAATTCTGTTTGGCTCGTTAGTTAATGGTGGCTCGGTTTCTGTGACCTTAAATGACCAAGAAAATAAATTACAGTACCAATTTACTAGCCAAGAAAAATTGGCTAAAAAAGAAGATACCGTTATTTAATAATAGCGGTTTATCTTAGGCTAAAAAGCAGACACCACAGGTCAGCATCAATTCATGCTTTGCCTGTGGTGTTTTTTTTCACCCGAAATGATGATATTGCGGGAGAGAATGGATTGGGATCAACGGCTACGGAAGATGATACGGCCTTTGCTCAGGTCATATGGGGTCAGCTCAACGGTAACCTTGTCGCCTGTCAGGATACGAATATAGTTTTTACGCATTTTTCCTGAAATATGAGCGGTAACGACGTGTCCGTTTTCTAATTCTACACGGAACATCGTGTTTGGCAGAGTATCCAGTACAGTGCCTTGCATTTCAATGTTGTCTTCTTTGGCCATCTAATCCTCTAAGTTTTAATAACCATATTTTTTAAACGGCAAGATAATGCCGAAAATATTGTCCTATGTAAAGGAATGTTATTGGTTAACAAAGATGTTTGCTTTGCTAACAAGTTAATATTCCTTACCGTTACTTGTGTTTTAGTTGCTGAAAAACAAGGTTAATAACACAAGTCATAATTCTTTATTGTGCGGTATTTATTGCAATAAAATAACAACATCCAAACCACACTTTGGATGTGCAAGATGAATTTTTGTATAGACCACAGCAGTGAAATTCTATTTAAAATCTGATGGGCTTTACAAAAACGAGTGGTGATTATAATTCCAACGATTGCTGATACCAACACTTTTTATCAATAATCACCTTTTTCCAACGAGATAGCGCCTCTAAATAGCGATCTCTGGCAATTTCTATCGCACCTAATGCTGCCGTATGAGAGTTTAACACTTGGCAATCAAATAGTTGACCCCCATAACGCAGAAAATGGTTATAAAAAGCAACAAAGGCACATTTAGAAGCATTATTTCGACGACTAAACATTGATTCACCGCAGAAAACGGCACCAACGTTAACCCCATATAAACCACCGACCAATTCGTCGCCCTCCCAAACTTCTACAGAATGGGCTTCTCCTTGTTGGTGCAATGCCCGATAGCCGGTTTTTATATCAGGGCCTATCCAAGTTCCCTCATCACGTACACTACAGGCCTCAATGACATCAGAGAATGCCTGATTTAAGGTGATGGTATAAGGCGCTTGGCGTAAAAACTTACGTAACGTACGACCAATATGCAATGTTCCTGCGGGTAAGACGGCTCGGGGATCGGGTGACCACCATAACGGCGTTTCATGGGGGGGATACCAAGGGAAAATCCCCGTTTGATAAGCCTCTTTCAAACGAGCAGGGGAAATATCGCCACCAATTGCCAATAACCCACTTGGCTCTTTTAAAGCCAAATGGGGGGCAGGAAAAGTCACATCGTGTTCATCTAATTGAAACAACGGCATATTACGCCTCATCATGTGGCATTAACAATGCTTGTCTTTGATGAAATTTAGCATACTGACCTTGCTGTTGTAATAACTGACGATGCGTGCCGGTTTCGACAATATGACCGCCATCCATCACACAAATTTTATCCATTTTATCTAACCCAGAAAGTCGGTGGGTGATCATTAATACCGCTTTTCCTTGGCAATGTTGCTGTAATAGCGCGAGGATCTGTTGCTCTGTGTCTGCATCAAGACCTTCTGTTGGCTCATCAAGTAAAATAAGTGGTGCATTATGGAGTATGGCTCTTGCCAGCCCTAAACGTCGTTGTTCGCCTCCAGAAAGCTGTCTTCCACCATCACCCATCCATGCATTTAAACCTTCATCATTTTCGACCAGTTGTTCAAGACCAACTTGGCGTAGAACATGAGTAAGCTCTTCATCTGTCGCATCTTCTTTTGCCATAATTAAGTTCTCTCTTAAAGTATGGCTAAAAACATGCACACGTTGAGGTACAACAGACATCATTGAACGCAATGTCGCTTCATCATAATCAGCAAGAGATAAATGATTTAATGTGATCACGCCCTGAGAGGGATCGAACGCGCGATTGACTAATTGTAAGAGTGTTGATTTACCACAACCCGTTTTACCCAGTAATGCCACATGTTGTCCTGCTTCAATGGTGAGATCAACATGATTGATCACAGGCATGGGTTGATTAGGATAGGTAAAGCAGACATCCCGTAGTGTTAATGAGGCGCTCGGTTTTATCTCTCCCCCTTGGGCTGGGAAGGTGACATCGGGTTGTTGCTCAATTAAATGCGTAATACGCGTAGCCGATGTCATGACTTGCCCTAAATGTTGAAATGCGACAGTCACCGGGCCGAGCGATTCAAATGCCGCTAATGCACAGAAAGTAAAGAGAGCGATGAGTGCTTCTGGCATAAAGTGGGCATCAATACCATCGGCAGCTAACCATAAAATCAGTGTGGCGGTTAATCCCGAGGCTAAAATCATTAGCGA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57 | Bacillus_phage(23.53%) | protease,tRNA,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1554994 : 1636532
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047352|1554994:1636532|DBSCAN-SWA 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94 | Salmonella_phage(21.95%) | portal,tRNA,transposase,lysis,head,integrase,capsid,tail,terminase | attL 1555978:1555992|attR 1570466:1570480 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1863338 : 1873330
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047352|1863338:1873330|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047352|1863338:1873330|1870256_1870874_-|WP_004242892.1|DBSCAN-SWA MSTQYGFYIDSSRCTGCKTCELACKDFKNLSPEVNFRRIYEYAGGDWTEQDGVYTQNVFAYYLSISCNHCDDPACVKVCPSGAMHKREDGFVVVNEEVCIGCRYCHMACPYGAPQFDEVKGHMTKCDGCYERVAEGKKPICVGSCPLRALDMAPIEELRAKYGDLAEIAPLPSAKYTKPNIVLKLNANSRPVGDTTGHLANPEEV >NZ_CP047352|1863338:1873330|1865407_1867108_-|WP_004248043.1|DBSCAN-SWA MATTTLIYIAVFLTVLLIMGKVIGNYLARLIEGDLPHWVTKTEQVIWRSCGFKPAGKAIQSMSWYHYMFALLIFNSMGALLLLVILLNQGYLPLNPQFAPNMSWDLALNTTISFITNTNWQAYSGETAVSYLSQMMGLTVQNFLSATTGIAVAFVLIRALTQSSCHSIGNAWVDIGRITLYLLLPLAIIWSLLFVSQGVIQNFHPALLSQGLENQQWLPMGPVASQEAIKLLGTNGGGYFAANSAHPYENPTSFSNFLQILAIFLLPTALCFAFGRLSGTQRQGYTLLWVMTLIFIVAVSVIVWAEWRGNPQFTLMGADSSLNMEGKESRFGLIGSALFVAVTTAASCGAVNAMHDSLTALGGMVPMWLMQTGEVIFGGVGSGFYGMILYVLLAVFIAGLMVGRAPEYLGKKIGVAEMKWVAVAILISPAITLLGTTLALFSEVGREAILNPGPHGFSEVLYAFTSAANNNGSAFAGLNANSVFYNLLLGITMLVGRFGVMLPVLAIAGSLAIKKRQAESLATLSTTSPLFIFLLFLTVIMIGALTFVPALALGPIAEHLQLLWAK >NZ_CP047352|1863338:1873330|1868643_1869255_-|WP_004242890.1|DBSCAN-SWA MEQQVITDISLSARIIGAAFYYPPTEKSDIVELLSSGKWLTEWPYGSEEEKQRIASLLAQTTYQDETLAQAYQRLFIGPYALPAPPWGSVYLDHENVLFGDSTLDLREWMLENGIDIALTQNEPEDHFGLMVMMVAWVAETRPEKLTELLAEHLLPWAYRYLEKLSLQGAFPYYEGLAMLATLTLKSWQSLLSITPVEKQLFC >NZ_CP047352|1863338:1873330|1868129_1868591_+|WP_004242888.1|DBSCAN-SWA MSDKQFIQQAISLATENVKVGGRPFGAVIVKNGQVIAHAVNQITATNDPTAHAELLALREAGKVLGRAKLDDCVVYASGQPCPMCLAAMRMAGISQIFYAYSNDDAQPYGLSTANIAKALRVAPEQQEGLQFVQIKPEDEKQPALYQLWSQQS >NZ_CP047352|1863338:1873330|1869394_1870255_-|WP_164527077.1|DBSCAN-SWA MGMGLHEWPLMFFTVIGQSVAGAFIIMGCAILSGKLPEALNRKVHYSMFGLWLLMGIGFLLSMIHMGTPMRAFNSFIRFGHSSLSNEIASGATFFALGGLYWLISVLNRMPAALGKLWLVVVMILAVLFITAISRVYQIDTVPTWYNGYTTVNFVLTAFIGGPILAALLMRIAGFNLNCISALPLLSVIAIIISAIVATSQGFELGSIQTSVQKAVDLVPDYGFLMGIKLIALTLGLACWIAPLLRKNNPSVSLMVLGFILVFVGEFIGRGVFYGLHMTVGMAVVG >NZ_CP047352|1863338:1873330|1867443_1868130_+|WP_036918303.1|DBSCAN-SWA MNAIYLKTKWFFYFLGLLMVSSIFMVKAMANSDKADLVTLAQEGNLPELKRQIAQGENIEQRDIKLRTPLMAATHANQIEVAKYLIEQGANVNARDAIYDSPYLYAGARGLQEILALTLAHGADLNSINRYGGTALIPAAERGHVATVKTLIDAGVDVNHVNRLGWTALIEAIILGDGSQKYADIVMLLIDGGADVNLADGSGRTPLTLAKDKGYTNIINILQQAGAK >NZ_CP047352|1863338:1873330|1870885_1873330_-|WP_017628118.1|DBSCAN-SWA MKNIKEMTLLSTPLSRRRFVKVGAAGGLVATAGGLSLPFSQAMASEQTAPTSTNKEKVVWSACTVNCGSRCPLRMHVVDGEIKYVETDNTGNDVYDEFHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLRYPMKRVGKRGEGKFERISWDEAFDTISDTMKRLIKDYGNESIYLNYGTGTLGGTMTKSWPPGATLIARLMNCCGGYLNHYGDYSTAQIAAGLNYTYGGWADGNSPSDIENTKLVVMFGNNPGETRMSGGGVTYYVEQAREKSDARMIIIDPRYTDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVNALAYVMIKEDLVDKPFLDKYCVGYDETTMPEGAPKNAHYKAYILGDGADGQPKTPEWAAQITGIPAARIVKLAREIAGAKPAYITQGWGPQRRSNGELASRAIAMLAILTGNVGINGGNTGAREGSYSIPFVRMPTLTNPVTTSISMFMWTDAILRGPEMTATRDGVRGKDKLDVPIKMVWNYAGNCLVNQHSEINRTHEILQDDKKCEMIVVIDNHMTASAKYADILLPDCTASEQMDFCMDASAGNMAYVIFADQAIKPRFESRNIYEMTSEIAKRMGVGEKFTENRTQEEWLRHLYEQSRQNLPELPTFEEFRAQGIFKKRDPQGHHVAYREFRADPLNNPLTTPSGKIEIYSSQLAEIKATWELAADDVIDPLPIYSAGFESYGDPAMDKYPLQMTGFHYKARTHSTYGNVDVLKAACPQEIWINPVDATKRGIKHGDLVRIYNDRGEVRINAKVTPRILPGVVGLSEGAWYNPDSNRIDHAGCINVLTTQRPSPLAKGNPSHSNLVEVVKA >NZ_CP047352|1863338:1873330|1863338_1865396_-|WP_036918301.1|DBSCAN-SWA MKKTPLFNRKTMMSAFLDAIKKCTPQAQWHNPVMFIVYVGALLTTGIWFAVLLGYLPPDNHFTFQVMFWLWITLLFANFAESLAESRSKAQAASLRGAKQQSKAVRLQHADLHAPQEIIDSLLLHKGDIVLVNAGEVIPCDGEVIEGGASVDESAITGESAPVIRESGGDFSSVTGGTRVLSDWLIIRCSAEAGNSFLDRMIGMVEGAKRRKTPNEIALTILLTALTLIFLFACTTLYPFSVFAVQFQHHGEVISVVTLIALLVCLIPTTIGGLLSSIGVAGMSRMLDANVIATSGRAVEAAGDVDVLLLDKTGTITLGNRQASRFIPLSGITEKQLADAAQLSSLADETPEGRSIVILAKQRFNLRERDLTSMGASFVPFSAMTRMSGVNIGERIIRKGSVDAIRRHIEVSHSHFPDEVNTIVEQVARAGATPLVVVENQNILGVVELKDIVKGGIKERFAQLRQMGIKTVMITGDNHLTAAAIAAESGVDDFLAQATPEAKLALIRQYQSEGRLVAMTGDGTNDAPALAQADVAVAMNSGTQAAKEAGNMVDLDSNPTKLIEVVHIGKQMLMTRGALTTFSIANDIAKYFAIIPAAFAVTYPQLNMLNIMGLHSPASAMLSAVIFNALIIVFLIPLALKGVHYRPVSAHSLLRRNLSLYGISGLIVPFLGIKLIDMILAIIGL |
8 | Escherichia_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2013364 : 2082547
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP047352|2013364:2082547|DBSCAN-SWA AATGAGCATCCCAAAAGAGCAATATAATTTTAACAAATTACAAAAACGCTTACGCCGTAACGTTGGGCAAGCTATCGCTGATTTTAATATGATTGAAGATGGCGATAAAATCATGGTGTGCCTTTCTGGCGGGAAAGATAGCTATACTCTCCTATCTATCTTAATGAATTTGCAAAAAAGCGCGCCAATACAATTTTCCTTAATTGCCGTTAATTTAGATCAAAAACAGCCGGGCTTCCCTGAGCATATTTTACCTGAATATCTTGAGCAACTGGGTGTAGAGTATAAAATTGTTGAAGAGAATACTTACGGTATTGTAAAAGAGATCATTCCAGAAGGTAAAACCACCTGTTCACTTTGCTCTCGCTTACGTCGTGGTATTTTATACCGTACAGCCACCGAAGTTGGGGCAACAAAAATTGCTTTAGGCCACCATCGTGATGATATTTTAGAAACGCTGTTTCTGAACATGTTTTATGGTGGAAAGCTAAAGGGCATGCCACCTAAATTAATGAGTGATGACGGAAAACATATCGTTATTCGTCCATTGGCTTATGCCAGAGAAAAAGACATTGAGCGTTTTGCTCAAGCAAAAAATTTCCCTATTATTCCGTGTAATCTTTGTGGCTCTCAACCTAACTTGCAACGCCAAGTGATCAAAGAGATGCTAAGAGATTGGGATAAACGTTACCCTGGGCGCATTGAAACCATGTTTAGGGCAACCCAAAATATTGTTCCCTCGCATCTATGTGATACCCAATTATTTGACTTTGCTAATATCAAACAGGGTGATGAGATTATTAACGGCGGTGATCTAGCATTTGATAAGGATGATATTCCAACAAGCCCTATTCTTTCCGATGATGAAGATGAGCGTCCTGACTTTAGCCAAGCTAGATTGGATGTTGTTGAGGTAAAATAAGCATAGCCAGTATTATCCCTAGCAAACCATCGTCGTTGCGCTGGGGTTTAATATGCTTTGCTTATGACGAGAATAATAAGCAAAAAAAAACCGATGTTTATTTAACATCGGTGTAATAATGGTCAATTATTCTGTATTAAGAACTCAATATGAGAAAAACTACAATTATGGAGCACAACGTTCATCGCTCAACGTTGTATTCACCTGCGAGAGTTATAATGCCAGATGTTGGCATTTAAAAAATTGATATATCTCAAACAGAGTTAGAGAATTCTTTTTTAAATCCATTTAGTTACGATTAATTTGCTGAAATTTCACAACCACCTACTACGCTTTAACCACCAAGCAACAATCACAATCAAGAAAAACAGTGAAAAGCAAAATATAGCAAAGCCATAAGGAAACTCATTACCGGGGATCCCCCCTAAATTAACCCCAAATAGTCCTGTCAAAAAGGTCGTGGGCAAAAATAGCATCGCCATTAATGACATGGTATATGTGCGCCTGTTCATCGCATCTGCCATCATTGAAGTAATTTCATCAGCAATAACGGCTGTACGAGAAATACTACTATCTAAATCTTCTAATCGACGCGAGAGACGTTCTGATATTTCAACCAAACTAATGCGATCACTGTCGCTCATCCAAGGTAATTTTTCGATAGAGAGTCGAGAGAATACATCACGTTGTGGCGCCATATAACGGCGTAACACAATCAGTTGCTTACGTAGCAATGCCAATTCACCTCGAGCCGGAATTTGCTGATCGAGGATCATATCTTCCAACTCAATTAATTGGTCATGAAGTGTTTCAACAAAATCACCTATTTCATCTGTCACTGCATCGGCCATAGTGATCAACCAACTACCACTATTTTCTGGACCATCACCCACTTCTAAAGAGTGGATCACCGAATCAACGGAATTAACGCGACGATGTCGGCTCGAAATAATCATTTGACCATTAATATAAATACGATACGCAATCAGTTCATCCGGCCGATCATCGGGGTTGTTATTAATCGTTTGCAAATTAATAATAACCCCTTCCCCGATACGCTGTGCCTTAGGTCGAACATTTTCAGCTAAAAGCACATCTTTTGCGATAGGAGGAAGTAACTCAGTCTGATTAATCCACTGATCACTTTTGGGTTTACGATAATCGAGATGAACCCAAAAAGGCCTTTCATTACTTGCTATGCTATTAGCCGTGATCGGCATAATTCCGCCATGCCCATTAAGCTGAGCCGTATAGATAGCATCAGAATCTTCGATTATAGCGTTATTGACACTTTTCATTATTCGTCCTCCTTGATACCATCATTTAAAATATAATTTTATGCTTTTTTCTAAAATCATGTAAACAATCAATAATATTGCCTTTATTTGATTATGTTGCAAGAGGTTAAATCAAGCCACTATTTAGCCTAGATTAACGCCATCACGTTCCCCCATCTACAACAACATTATTGAGTAAAATATTTTCTACTTTAAGATTTTTACACTAAAATAAGCATTAATTATTAGGTTATAATAGATTTTTCAATATATGCCTATATTTAGGTTATCGATTGGCACTAGATATTAGTCATAAAAATGAAATTTGCTTAAAATAAACGCAAATATTTAATTAATTTGTCGCCCCTGAAATAAGGCTATTAATATGAAAAAGTTTCTCACCATTCCTTTATTTTTACTTTTAGCAGGATGCAATACAGCGACAGGAACCAACACCCAAGTTATGAACGATTCGACAAAAACACTGCTTATTGACTCTCAGCTTTATGATTGTGTTGGTGTTGCGCCAATGAAATGCATGAAAGTAAAAGAATTACCTGCTGGTGAATGGTCTCTCTTCTATCAAAATATCGAAGGATTTGATTACCAAGCGGGAACGCAGTACAAAGTAAAAGTCAAAGTTACAGATATTCCTAATCCTCCTGCGGATGCACCAAGCATCAAATATACACTGGTTGAGATCTTAGATAAAAAGTAAGTAACTCACTAGCTAAACAATGGATTTTCGGATCCATTGTTTATTTCGCTATTATTACGCTTTCCTTTAGCTATAAATTATAAATAAGATCCAATAATAATAACGATTATTTATAAAATATCTTATATTATCTAAGATTATAGTAATTACCCTTCTATTAATACCAAAATAATTTCTTTTAACTCAATAAGAATGCTAGTTTTTTTTAAGAATCATTCCAAAGAAATTAACTTGAAATATGTTATTAACTCACTAAAAATATCGCCATCTCCAACAAATTAGATACGCGATAATGAAAAAAAATCTTATTTTATTTATAAGCTTTATTTTACCTTTCTCTCCATCACTACATGCTTTTGAGAATAATCAGGCAATTTATGGCGGTTACATATATGGAAAAATAAAAAACCACAAAGCAAATGGTGCAATAATAAGTTATCACTATGGATCCGATATTCACTGGGGAATGTTACTTTCATTACTGCATATCAAGTCAACACATCAAAGCCATTTTATAGACGCTAGCTCACTTAAACTAGGCACAAAAGATGAACATGCAAAGGTTTCTGCATTGTTAATAGGCCCAACGTATCGAATTACACCTTCTTTGGCTATCTACGCCCAAATGGGGCCTAAAAAATTAAAATATCGAGTTGATAAAAGTTATTCAGGCGTTGCGGTAACCGATACCATTATCGTCGACACCACCAATGTGATGTTTCAAGCGGGTATTGATTATAGCCTTAGAAAAAATGTAGGCATTAATCTTGGCTATTTACATTCAGATACTGAGTCAAACAAACATAATATTAGACTAAATAGTATCCAATTATCCCTAGGCTATCGTTTTTAATGTTTTATAAATAAACGATAACATAAGTTAAAAATAATCTTATCAATTTTATTTGTTGTTAAAATACGTTTACTGACCACTGAAATTATAATTATAAGGCTATATTAAGTAGTTATACCTATAAATAAAAAGTATAAATTTATACTTTGCATCAACTGCACGATTAGTCAAAACATTCATGCAAAATTATATTAACATAATTTTGCAATGTTTATTCCTTTTGAGTCTCCTTCTGTTGCATAACAGAGGGATTTTTTTTCTCTATCTCTCTTCCCCTAAAAAAAAAGTACGCAATAATCATTACGTACTCTTTGCTAATATTTTGGCTTTCTTATCTTATTGCCTGTAACACTTATTTAATGCTTTATAACATACAGCATATGGCTATAAGCGACATCTTCAGGATTCTCAATGGGATAACCTTTTAGCCAAGGTTTAATTAGACGCCCATTAGTATACTGATAGATAGGGGCAATAGGCGCCTCTTCCGCAATAACCTGTTCTGCACGATTATAGAGACGATTTCTTTCCTCTTCATCTGTCGTCATATTGGCTTGGACTAAAATCTCATCATATTGCTGGCTCTGATATTTTGGGATGTTTCCAGCATGCTTAGAGCCTAATAAAGATAAAAATGTGGAGGGTTCATTGTAATCGCCTATCCATGACGCTCTTATCACATCAAAATCACCTGAATTACGACTATCAATATAAGTTTTCCACTCTTGATTGCGTAAGTTTACCTTTACGCCTAACTTTTTCTTCCACATAGAAGCAACAGCAATGGCGATCTTTTGATGATTTTCTGAATTATTATAAAGCAGAGAGAGAGTTAAAGGATTATGAGGACCATAGCCGGCTGCTGATAACAATATTTTGGCTTGGCTATCTAATTCATCCTGACTGTATTCATCATATAGCGTTGGCTCAGGCGTAAAATTAGCCGTCACATCAGGAGTAAAGCGATTCGCTGATTTTTCTCCAGTACCAAGGACTTTATCAGTAATAATTTTTCTATCAATTGCCATAGCTAACGCTTTGCGAACCCGAATATCTTTGGTAGGCCCTGCTTGTGTATTAAATGCATAATAATAAGTACCTAACTGCTCAGGGATATACACTTGATCAGGAATATCTTTCATCAATTTGTGATATAAGTGTTTAGGAAAAGACTCTGTAATATCAATATCCCCAGCTAAATAACGTTTAGTCGCTTGTGATTCATGATTA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91 | Morganella_phage(19.51%) | portal,tRNA,lysis,head,integrase,protease,capsid,tail,terminase | attL 2081535:2081550|attR 2083258:2083273 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2438278 : 2455207
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP047352|2438278:2455207|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP047352|2438278:2455207|2443623_2444811_-|WP_036918580.1|DBSCAN-SWA MADYRYINNKGVIVPDTAALRKEVEDEFRTVFGQSINLSPETPQGVLATMEIENRDAIVRNNAELANQINPDIAGGIFLDAIWALMGGERINATHSYLSNVEFMGVPGTIIPKGSQALTINGAVFETLTSLIIADTGKITGDMRAKEYGPITCGIGQLNKVASSVLGWEKVNNTTHAIIGRYAESDIKARRRRKQTLAKNTISVAQAITSSLYELAGVNSLSFRENFTDKTLTIDGISLLPHSIYVCVEGGDSHEIANVLLRTKTIGAAFNGDIEINLLEPASGQEYPVKFSRPKEVTIFCKVTVKKSPFDAQTIIPDALEKWSHGEIEGDNGLVVGRDVSPFEISAAVNAVEPHLFVTKVELSTDGKNWHVALIPIAINQIARLPKGAIQVVMI >NZ_CP047352|2438278:2455207|2452307_2452820_-|WP_004248364.1|DBSCAN-SWA MNDNDINKAIREQLIKQLIKTDINAEVITGYQPEEITDNNIIMFFPIKEVSQGWQKRSYDVQGNNANHTEQQLVELTYQVQSFTKKQSDFTAGDLIRTTRMIIHSLPFIESMRKKGIGIQRATEIRRAPIINEGNSYEHNPSFDFNVTFPSSLSLNTAATHLLISNLSRI >NZ_CP047352|2438278:2455207|2441624_2442965_-|WP_036918579.1|DBSCAN-SWA 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22 | Burkholderia_phage(30.77%) | holin,lysis | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3205691 : 3214547
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP047352|3205691:3214547|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP047352|3205691:3214547|3212424_3213009_-|WP_004245609.1|DBSCAN-SWA MVSLRKDQTVSLSKQAPALSHLMFGLGWDPIKKKGFLGGLFGGNNSIDLDASCVLLDVNGKQIDTIWFRKLKSTCQSVIHSGDNLTGEGDGDDETIFVDLNRLPSLVEYLVFTVNSFRGQTFNEVENAFCRVVDKTTNKELAHYKLTEQGAHTGIVIAALQRNHGQWDFTAFGSPCKGLVIDEMMPDILATVVR >NZ_CP047352|3205691:3214547|3207660_3208341_+|WP_004245602.1|DBSCAN-SWA MQPQFENAKNTVKTLSVFDFDGTLTYHDSFIPFLKFAFGRRKFARRIIKMVFPTLRCFRRKLTRDELKEVLIKTFLTDIKEEWLKEKAEAFCKAYWTKLMRPAGLLAVAEEINRHAEVTICSASPAMVLQPFADRLGIKLIGTTLEVVDGVLTGKIIGNNCRCGEKIKRLERVYGDLTQYHLRAWGDSRGDHELLYAAQDPHWRYFHTGSNKSKKSPIKITLKKDS >NZ_CP047352|3205691:3214547|3213401_3214547_+|WP_017827550.1|DBSCAN-SWA MNSLIGSSVYRRQLTCGTLSVTPNCSLEHLDELFDIAERRNPKRAFLFVSKVLGRHIPVSPKKMRETYQQMAKQFPQSLEGPILFIGMAETAVGLGAGIFDEVRDRYPQALYLTSTRHPIADGELFCKFKENHSHATDHLLYLPHNLEQRQWIQQAKTIVLIDDEATTGNTFLNLLSALREEGKLTQIKQIIAVTLTDWSGDALQKRSPLPITTFSLVQGKWQWQANPDAPLPVMPNVNITASGQVAITGKQSWGRLGMTTPANDLGLFIHVSEGEKILVLGSGEFVWEPFLLAERLEKQGAIVKYSSTTRSPIATNFAIQSAITFTDNYGLGIPNFVYNVAHQQFDRILLCCETPAESIDSQLIEALYKVAPIVEVISYD >NZ_CP047352|3205691:3214547|3210795_3211251_-|WP_004245607.1|DBSCAN-SWA MSFFNKLKEGFNSGRAELTKQVSRFKNKKFMQGTVAVCARIAIASDGVSSEEKQKMLGFLKASEELKVFDTSEVIEFFNKLISSFEFDTEVGKGETMKYILAMKDQPEAAQLAIRVGIAVAKSDGDFDNDEKEAVRAIAVALGFEPAEFDL >NZ_CP047352|3205691:3214547|3209735_3210761_-|WP_004249445.1|DBSCAN-SWA MVSTHIGFPTETVIVFVVLAIGAIFIDLFMHRADKPITLKNAVFWSIFWVVVAMAFAGFLYVHHGAEVASLFVTGYALEKVLSVDNLFVMMAIFSWFAVPDRFRHRILYWGIIGAIVFRAIFVAIGTGLLSLGPYVEIVFALIVAWTAVMMLRSGNDSEEIEDYSQHLAYRLVKRFFPIWPKITGHAFLLTQKEVDAELAKPENKDITIGRGTKAALYATPLMLCVAVVELSDVMFAFDSVPAIIAVSREPLIVYSAMMFAILGLRTLYFVLEALKQYLIHLEKAVIALLFFIAVKLGLNATDHIWQHGYSISATTSLFVVLGVLALGILASFVFPEKKNK >NZ_CP047352|3205691:3214547|3211275_3212424_-|WP_070487147.1|DBSCAN-SWA MTLTPGGNISVPDQTLMVRIHSGSPVDVSAFRLYASGKVNGDADMVFYGQTTNDDRTIIYATAGNSTSFTVDLTRLRPDVDRIAFTATCEGQQTIAHLQHLSIQVDANNNVVANGHVDIDGRTEAALILGELYRRNGSWKFRFIAQGFNGGLKPLAEYFGVDIADPEPAPAPAPAPSSVKLSKVSLTKEKPAISLTKKDDFGKIRINLDWHRESKSGGSGLLGGLFGGNKGIDLDIGAFVELQDGYKSVIQALGNGFGDFNRMPYVELQGDDRTGDVAGGEWIFINGREWKNIKQVLIFTFIYEGVPNWSKTDGVVTIHVPEQPPIETRLTDGNNGRAMCAIARLVNENGSIKVERLNEFFKGHRDMDNAYGWGFRWTAGSK >NZ_CP047352|3205691:3214547|3209089_3209668_-|WP_004249446.1|DBSCAN-SWA MSVSLSKGGNVSLSKAAPTMKNVLVGLGWDARSTDGQDFDLDASAFLLAANGKVRSDADFIFYNNLRSADGSVVHTGDNRTGEGDGDDEALKIKLDTIPSDVEKIIFVVTIHEAQARRQSFGQVSGAFIRLVNDDNQIEVARYDLTEDASTETAMLFGELYRHNGEWKFRAVGQGYAGGLGSVCAQYGINAS >NZ_CP047352|3205691:3214547|3205691_3207260_-|WP_004245601.1|DBSCAN-SWA MSIKRTVKLGSSLLLLIFILSSALSSFFIYKMQNNFTQVDVLSARYDDVLMARYQLAIMRSNVNYLLQDKDSRVADRNKIIQQNKKLAIMAKNTMETWVKEKKMTVAAQKNADDISTLFYNLIDKLVLDPNKLATIKIKANQFDQDFEHLDQLFEKYIQTRNKNSLYLTHKQDSMVEFSIYSTIISLIILLIVLYFVLHWINKTFVSNLNTLSEILNKVGNADLVFSVPQVKNDEFGKLFSRVSDMQKALTSTIFSVKKEAMDIKGGAFKIASGNQELSSRTEEQSSALQQTAASMEQIKIAVANNTDNTIEANNIINQSTDIVMDGANVMKEAVLSMKKIEQGAVKVGEINDVINKLANQTNILALNAAVEAARAGEQGRGFTVVAAEVRNLAAKSAEAAKEISQVLKASINDVTYGTNLVNKSGECMQEIVSSISKVNKIMQGISLASEEQRLGVEQIAVAINQMDTVVQQNASLVDLAASSTMMLNDKAQVLMDNVAVFNIDDLEKEPEQKQELINEQE >NZ_CP047352|3205691:3214547|3208437_3209013_-|WP_004245603.1|DBSCAN-SWA MAVSLVKGGNVSLTKEAPTMTVAMVGLGWDARVTDGAEFDLDASVFMVGEDGKVLSDASFIFFNNKVSQCGSVEHQGDNRTGEGEGDDEQVKITLSKVPAEVKKLVFAVTIYDAENRKQNFGMVSNSFMRVYNNDNNTEIARFDLSEDASTETAMIFGELYRHGSDWKFKAVGQGFAGGLGALAAQHGVNI |
9 | Caulobacter_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3759526 : 3864613
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP047352|3759526:3864613|DBSCAN-SWA 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94 | Escherichia_phage(32.14%) | transposase,integrase,tRNA | attL 3806780:3806839|attR 3865417:3865432 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
29818 : 47601
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047353|29818:47601|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047353|29818:47601|42708_45690_+|WP_140114247.1|transposase|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP047353|29818:47601|32839_33544_-|WP_001067855.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP047353|29818:47601|38929_39055_-|WP_014342213.1|DBSCAN-SWA MRNPSLSLARVLANQLARDPVESDPKRSLTTGTNRPILLKK >NZ_CP047353|29818:47601|37269_37419_-|WP_014342212.1|DBSCAN-SWA MLFAPTLADKAILPTAWGGRYFFNRIGRTQPFGSTEPCLYPTKLRKLAR >NZ_CP047353|29818:47601|37417_38788_+|WP_000971921.1|transposase|DBSCAN-SWA MMGQLPGGQQRLFYSFNLEDHVPAQHLLRSIDQCLDLSDLRAYLADFYSPIGRPSIDPELMVRMLVVGYCYGIRSERRLCEEVHLNLAYRWFCRLGLEDEVPNHSTFSKNRHGRFRDSDLFRWLFNEVLRRCMAAGLVKGEGFAVDASIIKADASRQRGVAGDEVDWNDPKLSSRAVREYLEALDEEALAEALPKKISLTDPQSRWTAAPGGPAFFAYSTNYLIDTEHGVIMDVEATPAHRTAEVDSTRTMVERVEAQFDLTPERLIGDTAYGTAPMLAWMVEEKDIEPHVPVWDKTERKDDSLSSNDFHWSQDANEYRCPAGKPLRSEWRAFTQQRSRVTKAKTVIYRSSQTDCATCPLKAKCCPNTPNRKIVRSIHEAARDVARRIAKTPEYLVSRCERKKVEMLFAHLKRIMKLDRLRLRGLTGATDEFTLAAMVQNLRRMAKLLPQGPPLTG >NZ_CP047353|29818:47601|36166_37303_+|WP_000080861.1|DBSCAN-SWA MSQLSQLRSPAAVQAAIDEFVQLGRTKFLARHGYGKSRDFLVRDPKTGTDCDSKAIAGVAFGKQFPEQGPLTADSFSGGETTVVPALTRLGFRIIRIGEDWSEEEVLATVEDYFDMLRAEAAGEPYHKSEHNQALRQLLNGRSKSSVELKHQNISAVLDALGLPYINGYKPRGNSQLLLRKSVHAYVLEHQQTVGALVDALEEVKLPGDKTYRAALVEPPAREVLVRTPASLRQRLPRKFDYAARDEANRKLGRAGEQWVIGYEQQRLTELGHPELFQRLDWVSDTQGDGAGFDILSFEEDAHERFIEVKTTNGGVGSSFLVSHNELEFSKEAGDQFHLYRVFQFRDGPRLFTLPGDLSQHVHLKPTDYRASFRSLVG >NZ_CP047353|29818:47601|40883_41720_-|WP_000480968.1|DBSCAN-SWA 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MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP047353|29818:47601|33776_34637_+|WP_164526951.1|DBSCAN-SWA MHTRKAITEALQKLGVQTGDLLMVHASLKAIGPVEGGAETVVAALRSAVGPTGTVIGYASWDRSPYEETLNGARLDDEARRTWLPFDPATAGTYRGFGLLNQFLVQAPGARRSAHPDASMVAVGPLAETLTEPHELGHALGEGSPVERFVRLGGKALLLGAPLNSVTALHYAEAVADIPNKRWVTYEMPMLGRDGEVAWKTASDYDSNGILDCFAIEGKPDAVETIANAYVKLGRHREGVVGFAQCYLFDAQDIVTFGVTYLEKHFGTTPIVPPHEAVERSCEPSG >NZ_CP047353|29818:47601|30705_31521_-|WP_000018326.1|DBSCAN-SWA MSHIQRETSCSRPRLNSNLDADLYGYRWARDNVGQSGATIYRLYGKPNAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTAFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF >NZ_CP047353|29818:47601|35673_35865_-|WP_000951934.1|DBSCAN-SWA 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17 | Escherichia_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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