Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP049364 | Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978 plasmid pAB1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP049365 | Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978 plasmid pAB2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP049363 | Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,WYL,cas3,csa3,RT | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
5522 : 14856
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP049364|5522:14856|DBSCAN-SWA CTTATGCTGTATGTGCCATTTTGTTTTGTTCAATATAAGCCAAAACATCAGACTTCATATAATTTACTTGTCGTTTATGAGGTTTAGAGAATGGAATGCCGCCACCTTCACATCTTTTCTTCTGCAACCACGGTAAGGATACGTGCATAACAATAGCTACTGTTTCAGGTGGAAAAGTTTGATTATCAGCAGCTTCCCAAAATTCCTTCTTAGCAGCCTCTTTTTCTGCATGAGTCATACGATCTAATTTAGTTAAACGTGACATTTATTTCTCCTTACTTTCCGCTTTAGGATTTGCCCACCAAAGTACAGGGCCATCTTCTGAATCAAATGCTGCAATTAAAAAGAGTCCTTGTTCTGGCGGTTCTGGCTTCCAGTTTGGCCAAACTACTGCATCTTCCGGTATATTTGGTATTTCATCGTAATCTAATAGTTGAGTTTCAATTTCAACTCTAAGATTCATTTGAAGTTGTGCCCACTGTTCTCTTGTATAGGCTTCAGCTCCTTCTTCAATGGTGTCAAACAATTCAATATCTGGATGAAACCAATTGAAAAGGTTTTCAGGTGGTTCTATTGGCTGGATCTGATATTTAAAACCCGTCTCACTAGATCCATAAAATAGTTTTGCTTCATCAAAGCTTTTGGTTACAAGAGGGGCAGAGCCTTTCTTGTAGCAAATTACTATTTCATCAAATTTAAAAACACGTTCAGCTGTCTTCAAATCAAAGCATTGGTACATAGGTTCACTAAACCAACTCTCAACATAAAATAGATTTTTAATATGATCTTTGCGGGAACCGTGCCATTTCTGAACTTTGATAACATCATCAAAAATTTCTAAGAAAAAGTTGTTGCCTTCCTTTTCATGCATTTTTCTATAACGCTCAACAGCTCGCTCAGCTATCTCTTTTGAAGCTGCTGGCGTTTGCTTAAAAGGGCTGTAACCTTCAGGTCGCATTGCAACCGCCCATAAAGTTGATTCACTCATCCTTCAGCTCCCGATTCGCTAACACCCAACTTAATGCAACCTTCCTCAGGTAAATCAGCATACCAACAGTAGTATCCTTCACCGTCATAACCATCTTGGAGCCATTTGATGGTCATTTCAGTTTCCATCTGGAATTGATCTTTTTCCCCATCTGGCGCACCAAAATCAAAGGCTTCTTTTAGTTCAGCGCAAGTTAGAGTGACACTAGGGGTGGGAGTATCTGGCACCGTCTCGGCTTTGGCTTTATTCCATAACTGCCAAGCATCATTAGTTACAATATTGAAATAGCCATTCATTGTTTCACTGAATGCTAGGATGTCATTTTTACGAATAGCACTTTCACGTTTAAAAATTTCTGTAGTTTTGAATTGTGATTCAAAAGGGATACGTTCATTACCTGTCATTTAAGCCACCATCTCTGCATATTCTTCTTTAGTCCATTCAACAAACTCTTTATAAAGCTGCTGCGCGGGTTTATTTAACCGGTTGTGATAGTCGATCGTTATGCGGCGCCAAGCGACTGGTACCGCATAATGCTTGGTTAGAAACATCGCTTGATCCATGCCTTGCCGGACTATTACGTAGCCCAGCAATTGCAAGTAGTACATAAAACCAAGCATGTGTTTTTGGCTCACTTTCTTGTACTGATCTTTCATATTAGAAACCGTCTCCTAATAAATAATCAGGCTCAGCCTCTTGAAGTGGCGTAGATGTAGGGTTCTCTAATTCAAAGCGGCGTTTCTTAACAAAGTCCATGAGTCGTGATTGAATCTGTGGATCTCGTGCGGCCACATCTATTTCCAAAGCATCTAATGTTGTGAGGTCGGGCGCGTTTTGGATCTGGACCATTAGTGAAGGTGGTTCAGTTGCTTGCGCCTTAGATTTTTCGAGCTCTTCAAGACGTTTGTGAGTTGCAAGTAGCAAAGGCTCCATTTGTTTATCAGACCAAGTGCGTGTATATCGATAAACTGCATTTACTTCGTCTGGTGTTTTTGAGTCCTTAACTCGTTGCAGCAGGGTATCAAGTTTCTTCTGATATTCTGAATCAGCGGTTTCTGATTCAATAGCCGGCTCAGCTGTTTGTGCTTTTTCTACAACCTCTGGTTTTGAATTTTTAACTTTTAGAGATTCCGCATGACTTTCTGAAGGCTTTTCTTCTTCGACTTCTTCAGTAGGCTTATTTAGAAGTTTTAGAATGTCTTCCGCAAACTCACCACCGCTGATTTTAATAATCGCGCAGCAATGAGCAAATGCATTATCAAAACTTGAGTGAACTTGGCCATGCTGGAGCATGCGCAATTGTCCTTTAGATCCATTCCACTTAAACTGCTGCACACCTAATTCAACAGTTGGGCTAGGGTAAGAGCAAGTAGAACCTTTTTCTGGCGCAACTCTTAATGGTTCTGGTACCTCAAATTCACCAATAAAAATAGTTCTAGGCTTTAATTGAAATTCGAATTTATCAAAAACATCAAAGCCAAAGTCATAAGGGTTAAATGGTTCCCAGCCATTACGCTCAGTATTATTTACTAAAAGTAATTCACCGTTGGCCCAAGCAAGTTTGGCTTCAACTTTATTTAGAATTTTCATGCTGTCATCCCCGTTTTCGCTAAGGTTTCAATTTCTTGTTTAACTGCAGTTAGTTTTGCCGCTTCAATTTGGATCAGGGCATCTATGCCGAAGTGCTCACAAACTGTTTTTACATCGAGGCCACGTTCAGCAATAAAGTTTTGAAGTTCATCTCTTTGTTGATCTGAGATACCGTTAAATTCTGGTGGACTAATCCAAGTGCCACGTTGTTTATCAAACGTGCAATTCAATGCTTTAGCTCTCATTAACATTGCTTGGCGCATGTTCTGGTAATACATGTGTTCTTTATCAAGCGACTCAGTTAATTGATTAAGGTCACCTGCATGCTCAGCTTCTTCACAGCTTTGTTTCCAGTTTTCTAGCTCTTCTTGGGCTTTAGCTGCTGCAAGTTGTGCAGGCGTTAAGGTGTTAATGTGATCTTTAGCTTGAGTAATCAGGTCAGCCAAGAAAGTAGGATGTGCTTTAAGATCTGGTACCCATACTTCACCAGTTTCACCACCTAAAGCACCTGAGTTTTTCGCATGATGTGTAGGCGAGGGTTTAAAATTAATAACGCGGGCATTTTTACCTTCACCTGTAGTAACAGTTGTTAGATAACCCATCACATCTGCGATACGGTAAAGCTCGTTACGGTTTTTACCACCTAGATCTGGTCGGTAAATAATTTGATCACCGTTTTGATCTTCTGAAGCGTGTGCAATGAAAACAACGTCTTTACCTAAACTGATCAAAGTATTGATGTATTGCTTGAACGTTTGGTTCGCTAATCCTTGAGCCTTTAACTTTAAAGAACCATCTTTTTGACGGTTATTTGCCGTAAGTAACAGGTGGGTTTTAATGCATTCAAGCATTGCACCCACGGTATCAATGACTACGGTTTTATAGGGTGCTAAGTCCTGCGGCGTAAGGTTTGCAACATCACTCCATTGTTGAACCTGTACAACCGCACCTCGACGTAATTCACCAGTACGGTGAGCACCACGGTCAAAGTCAAAAGAAATTGCTTTTTCCGCAGTAAAGCCCATCGATGATTTACCTAAACCCGGATCAGCGTATAGGTACACAATAATTGCTTGAACTAATAAAGTTTGGTCAGCAGTAATAATCGGTAGAGCCATTTTTATTATCCTTATCTTGAGCCAGTGAAGCCGCGCTTAGTTTTATAAGCTTTGCGGTCATAGGTAGGGATATTTGTTTCACGCAGTTTTATAGCGAGCTGCTTTCTGCGCTGAAAATCAATTTCTTGTGTGAGTTCATTCCAAACTTTTGGATAGTCAGTTTGGAACCTGAACACATTTAAAGGCGTCTTAAATCCGTCTTTAACTTTGTAAAGAACTGAGCCATTAGCATTAGATGCGTACACTTGCCAGCCGATGCGAACTGAATACAGCCCTTTATCATCACGACCTAAAAAAGACTTATAGCCGTCAGGGTGCTTTTTGAAATTAGACATGTTCAGCCTCCTTACATTCGCATGCACCAACAAAGGCATACGTAAGCGGGCTAGGAGCATCTACAGGTGAGACGTCCTTAATATTTAAAGGAATAATTTCTTTGCGATATTTAACTAAAACCACATCACCTTCACGGCAATCGACAATTCCTTCTTTTGAAGAAAAACGAGCAGATTTAGAAGATTGGGTTACTCTGCAAAATGAAACCTCATCACCAGCTTTGATTTTTGAACGGTCAACAGGAATCATCTTCTTGCAAGTAGGGCAGTTGTAATCTTTCATTAGGCTGCCTCCACCAACTTGTTACGTTCGATGAAGCCTTTTAGAAGGCTATTGATGTTGCGGATGTCTTCAAATTCGGTGAAATCGTTATATGACTTACCATTAATGTCAGTGATTTCATTTACTGTGAGTTGGGTAATATCAACAGTGGTGAATTCAGAACCCGGAACGCCGTAGCTGTCTGGATGAGCTTCAAAATCAAAGCTAACGTTTAAACGGAAGCTATCTAATTTAATTACAGCAACTCCAGAATGCTTACCTGTGATTTTTGCGGTTAACACGCTGTAAGTACTTGGTTGAGTTTTAGGTGTAAAAAGAGTAGGTGCGTCTTTTGTTTGGAAAGCTGGTTGCAATTGGCAAGCAACTAAAGAACCACCAGAGATTGCAAGAGCAGCCATGCTGACAAATGCAAATGAGTTGAAAGGGGTAGCTTTTACGTTCATAATTGATCTCGCAGTTTGCAAAAGCACATCGGAAGGTAAGAGAGTCGATGTGCTTTTTGTTGTCTACGAGATTTATATTAACTATGGTTAATTTTTTAGTCAAGAGAAAAGTTAACAATGGTTAATCTTTTTATTAACTATAATTCATGCTTTAATAGACAAAAGAAAACCCAACTATCAAAGGTGATAGAAATGAGTCTAGGCGAAGAAATGTTTGAATGGCGCAAGCAGATGGTTGAGAAACTACTGCTTCAGGAAAGTAATATTGATCAACTAGAAGAAAAAGTTGATCGTGCTGAAAAGATTCTTTTTGGTGATTGCACAGCCGCTTTCAAAATAGAGTGCACGCTTCGGAACGCGTATGCGCTGAAAGCTATTCTTGATGACTTTGCCACCAAGAATAACTGCAAGGTAAGTATAGTAGAGTGTGAGTAATCAGGGTTAGCTCATTCCTGAAATGGGTTTTGATGTGGCTTTAGGCTTTGGCTTAAGTTCTTTTAAAGCTTCTTCTACCGCTTTCAGTGATTCCTGGTAGGTTTTAACCCAAAGATCAGCACTTTTTATATTGATGGTTGAAGGATCAGTATCAGCAATGGTTGCCTTAGTAAGCTCTAACGCTAGAGCTTCTATGATTTCAGTTTTCATATTTTCTCCGATATTAATGGTTATTTAAGATCAATGTTGGCACAAAGTCTTAATCCCATAATATCAGGGAAAATTTGAATATATTAAAAAAGAAAACCCACCGTGGTGGTGGGTAGATTAGATGAATTGGATCGCTTTTTACTTATTGCTCAATACTTTTGCTTTTGCCTCTCTTGATTCTTTGCGATCTTTTAATGTTTTTTCAAGCAAAGAGATTTCTCTTAAGTCAGACCAAGCTAAGAAGAAGCTAAAAATTGAGGTGAGTCCAACAGAAAGTATTAGAGCTAAAAGATGCTTAGCTGAAAGTAAGCCTAATAAATTAAGTATATACATACTAAAAACAAGAATAATAAAAAGCATAGCCACATATAAAGATGACTTACTTCTTATGTCCACAGTTGAAGTCAACCTATCTCGTTCTGACTGATTTAAACCATCAAGCTTTAATGCATCGAGCATACCTTTATAAGCCAAATAAATTTGACTTAAAGGGAGAAGCAGTACAAATGAAAATTGAACCAGATTTATTGTAATATTTAACTCTAAATATTTAAAAATTATTGAAAATATAGCAAACAGACCGACTAACACTAGTGCGATAAATCTAGCATTATTGTAGAAGGGTAAGTAGCGTTTAGCCATATTAGTCACCAAAATTTATATTGGTAGTCATCCAATTATACAATTGAACTTTTAGGCCGTCGTTATAAACTTTATTATTGATTGTTTCAACTGAAATCTTGCCGCTCATTTTTAGATTATCAGCCGTAACCTTGGTCCCATCCTCAAGAGTAATAACATAATCATCATTATGTCGCATGGATGAAGCTACAGTATCAATAACTTTTTGCCCACTTTTTGAGGTTTTGCGGTTGTATGTAAGTGTTAATTTTAACTTTAGGTTTGCGTCATCAAGCCCATCCTCTAGTTTTAAATTTCTAAATCAACTCCAAAAGCTGACTTAAGCACATCAACCACATTATCTTCAATTTTATAGTCAATTTTCGCAGGTATGCTTGATTCGACAGTATGAACAGGTTGAAGTTCTGTTGACCCAATGCCAGATGAGATTGAAATAGTTTTAGCTGGAGTTGATTCAAGCTTTTGCTTAACAGTGGGATTTGGAGCATCTTTTAATATTAATGCACTATTCTCTGGCAATGCTTTGGCTGCTTCACCCAAAAGCCAGCCCAAATATGACTCCAAGGTTCTAGCGGTAAGTGATCTTGATTGAATGATTGCGACATGGTTATCAATAACACCAAAGTAAAGAACACTATCAATAAACTCTTTTCTTACAACCTCTGTAGCGTCAACGCCATCTTCATCATCTGGCAGATCATCTGTTAAATAGGTTTTAATGGGAAATTCAGTAGCATCATCACTGTCTATCTTTAATACAGCCTGAGCTTGCCTGACTCAACAATAATCAACTCGCCAAAGAACATGCTTTGGTGTGAACTAGCATGATTAATTAGAATAAAATCATCTTTTGTTGCGGAGACAAATTGTTGACGATTTATGGCTTTATAGTAAAAAGAATCCTTATCCAGCAATTGTGCTTTTAGTAATTGACCTAGATTGGCGCCTTTTAGAAAATCTACTTTTTTGTAGTGTACTGTTTTGTCTTTTACTACTGTTTTACTCATTATTTCCTCCTCCCGAATCGCTCTAAAGTACTGTGTCGGGTTCACAACTTATTAATCTTTGGTGTTGTTAATTTTCTGCCCAAGCTTTCCTTCTTTTACCAACTGCACTACTTGTTCATTTGTAAGGACTGGAATAAAGACTTTATCACCAATGTCCTTTGAGAGGATCTTCACTTCTTCGGCTGTTAGCACCAAAGCTTCACCATGTTTCGCAGCATCATTGATGCGAGCAATAATCTGGTTGATTGGTCGTTTTGAATTGTCCATAAGTCTTCCTGTGATTAATGCGAATAAGGATGTTCTTGTCTGTGCTGACTTGGCGGCACGATATCTGTAATAGCGGTAATACTTTCAACTTCGTCCATTTCAAAGAAAAATCGCTCACCACCATTCACAGAAAGCAAACTTAAAACCCCACCATTGATGCCGACAAATTCTTTAATTGTGCATCTTCCATCCTTCAAGCACACCTGAACAAACTCATTCGGCACAAGATCTGCATCAGGGTCGCATACAACATACCAGCCATTACGAATTGCTGGAAACATTGAGTCGCCAGTGCCTTTAATGCCATAGGCTCGTGGACCTGCTGTATGAGTTGGAACATAGCCATCCCCAGCATTTCCATCGTATCCCATATCTGTGAAATACCCATCCATTCCCATTTTTGAATAGGCTTTAACTGGAACATATCTTTTTTGTATAGGGAAAGGCTTAGCTGGCGCTTGAACAAACTTAACGGCATCTTCACTATCTGGAATATTGTACTTCTGCTTAAATGCTTCAATATCAATAACATTTAATTGAGCTAAATTGTTACTCGATTCTTGTTCATCCGATCCACCATAAAGCAACCAATCGTCACTCACACCTAAAAATTTCGCAATGACTTTCAAATTTTCTGCTGTAGGTACGCTAGTTCCATCTAGCCATTTCTTTGCTGCAACAGGAGATTTTTAGTTGCTCTTGCTAAATCAGCGGCTCTTAATTTTTTTCTTCAAGTTTTTGCCTAATTCGAGTGTGTAAAGACATAACAAATATTCCAAAAACATTAACTAATGTTAATACGATCTATTGAAACTATGGTTAACAAGTGGTAAATTTGGTTTATTAACTATAGTTAACTTGGTGTAACCATGAAAATTAGTGACCTCATGACATACCACGGCTGCAAAAATCGGAAAGAGTTGTCTGAAAAAACTGGATATTCAACCGTGACCCTCTGGAAGTGGGAAAACAACGGTATACCAGCCAGAACTCAAGCAGTCCTGCAAGTCAAAACCAAAGGCAAACTTAAAGCCGATTTACAAGCATTAACCGCTTAGAACTAAACCATGAGCAAAGTATTAAATGAATTGCCTGCAAGCGCTAGCAATAACGAATCGCTCATATTGCAAGCACTTAACGCTAGCAATCAAAGACAAGTAGCAGAGATGATAAATGTCGATGCAAGCATCCTTTCACGGATGAAAACAGAAAAGAAATCAAATGGATGGACTGAGATTGAGTTTATTAGCTTTTGTTGACAGCCATTGGTTTGAAGGTTGTGCAAGAAAGTGATGTGTATTGCTCACCTGAAATTGCAGAAGCAACGCGAGTTTATTTAGCACATGCATTCACTTCACCTGAATACATGCGGATTTTATTCAAATAAAAAACCACTACCTGCTGTAACAGGAGTGGTTTCGCATTCACAAATTTAGGAACCCATGAATATGCAAAACAATTTATCAAATCAAACAACCGAACGCAACCAGCCAGAATTTTTAGTGGGTGACGTTGTAGTGCTTACTAAAGAGTGCCGTACTTTCAAATCAAATGATTTGTTTGAAGTTAAAAACAAAACTTTGACTAGGTTGTGGACTATCAAATCGGAGAATCATTTGATTCTGGTTTCATCAAAAGAAATCCGTACAGCAACAGTAGCAGAGCTCAACGCCAAACGCCGGCTAACAAGCGCAGAGCAAGCATTAGCGGAGGTGTCATGAATAGTTAATTTAAGTATAAACCTGAGTACAAACAGATTCAGGAAATTCAGTCCTTCTTTGATCCAGCGTTAGTGATTCTCAATGAGCTACATGATCGTAACCGTAAAAATCTAAGAGCCAAAGGTTATGACGAAAATAATGCTGCAATAACGCGTGAAGAATTTTCACAAACTATGGCACAGCGTTTTCGCACTAATCAGTGGTTAGCAGGGCAGATCGTTAATAGTTTGGCTAATGCTGACTTGGTTCAAAAATTTGGTGGGTATGTAAAGCCTAAGGTCGGTGTACATGAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP049364|5522:14856|14631_14856_+|WP_000602535.1|DBSCAN-SWA MILNELHDRNRKNLRAKGYDENNAAITREEFSQTMAQRFRTNQWLAGQIVNSLANADLVQKFGGYVKPKVGVHE >NZ_CP049364|5522:14856|12853_13468_-|WP_000862907.1|DBSCAN-SWA MKVIAKFLGVSDDWLLYGGSDEQESSNNLAQLNVIDIEAFKQKYNIPDSEDAVKFVQAPAKPFPIQKRYVPVKAYSKMGMDGYFTDMGYDGNAGDGYVPTHTAGPRAYGIKGTGDSMFPAIRNGWYVVCDPDADLVPNEFVQVCLKDGRCTIKEFVGINGGVLSLLSVNGGERFFFEMDEVESITAITDIVPPSQHRQEHPYSH >NZ_CP049364|5522:14856|9834_10278_-|WP_001101038.1|DBSCAN-SWA MNVKATPFNSFAFVSMAALAISGGSLVACQLQPAFQTKDAPTLFTPKTQPSTYSVLTAKITGKHSGVAVIKLDSFRLNVSFDFEAHPDSYGVPGSEFTTVDITQLTVNEITDINGKSYNDFTEFEDIRNINSLLKGFIERNKLVEAA >NZ_CP049364|5522:14856|7166_8099_-|WP_000698529.1|DBSCAN-SWA MKILNKVEAKLAWANGELLLVNNTERNGWEPFNPYDFGFDVFDKFEFQLKPRTIFIGEFEVPEPLRVAPEKGSTCSYPSPTVELGVQQFKWNGSKGQLRMLQHGQVHSSFDNAFAHCCAIIKISGGEFAEDILKLLNKPTEEVEEEKPSESHAESLKVKNSKPEVVEKAQTAEPAIESETADSEYQKKLDTLLQRVKDSKTPDEVNAVYRYTRTWSDKQMEPLLLATHKRLEELEKSKAQATEPPSLMVQIQNAPDLTTLDALEIDVAARDPQIQSRLMDFVKKRRFELENPTSTPLQEAEPDYLLGDGF >NZ_CP049364|5522:14856|10470_10713_+|WP_000051960.1|DBSCAN-SWA MSLGEEMFEWRKQMVEKLLLQESNIDQLEEKVDRAEKILFGDCTAAFKIECTLRNAYALKAILDDFATKNNCKVSIVECE >NZ_CP049364|5522:14856|9544_9835_-|WP_000656405.1|DBSCAN-SWA MKDYNCPTCKKMIPVDRSKIKAGDEVSFCRVTQSSKSARFSSKEGIVDCREGDVVLVKYRKEIIPLNIKDVSPVDAPSPLTYAFVGACECKEAEHV >NZ_CP049364|5522:14856|8095_9217_-|WP_001207474.1|DBSCAN-SWA MALPIITADQTLLVQAIIVYLYADPGLGKSSMGFTAEKAISFDFDRGAHRTGELRRGAVVQVQQWSDVANLTPQDLAPYKTVVIDTVGAMLECIKTHLLLTANNRQKDGSLKLKAQGLANQTFKQYINTLISLGKDVVFIAHASEDQNGDQIIYRPDLGGKNRNELYRIADVMGYLTTVTTGEGKNARVINFKPSPTHHAKNSGALGGETGEVWVPDLKAHPTFLADLITQAKDHINTLTPAQLAAAKAQEELENWKQSCEEAEHAGDLNQLTESLDKEHMYYQNMRQAMLMRAKALNCTFDKQRGTWISPPEFNGISDQQRDELQNFIAERGLDVKTVCEHFGIDALIQIEAAKLTAVKQEIETLAKTGMTA >NZ_CP049364|5522:14856|11061_11565_-|WP_001129676.1|DBSCAN-SWA MAKRYLPFYNNARFIALVLVGLFAIFSIIFKYLELNITINLVQFSFVLLLPLSQIYLAYKGMLDALKLDGLNQSERDRLTSTVDIRSKSSLYVAMLFIILVFSMYILNLLGLLSAKHLLALILSVGLTSIFSFFLAWSDLREISLLEKTLKDRKESREAKAKVLSNK >NZ_CP049364|5522:14856|13708_13897_+|WP_000703023.1|DBSCAN-SWA MKISDLMTYHGCKNRKELSEKTGYSTVTLWKWENNGIPARTQAVLQVKTKGKLKADLQALTA >NZ_CP049364|5522:14856|5786_6509_-|WP_000004579.1|DBSCAN-SWA MSESTLWAVAMRPEGYSPFKQTPAASKEIAERAVERYRKMHEKEGNNFFLEIFDDVIKVQKWHGSRKDHIKNLFYVESWFSEPMYQCFDLKTAERVFKFDEIVICYKKGSAPLVTKSFDEAKLFYGSSETGFKYQIQPIEPPENLFNWFHPDIELFDTIEEGAEAYTREQWAQLQMNLRVEIETQLLDYDEIPNIPEDAVVWPNWKPEPPEQGLFLIAAFDSEDGPVLWWANPKAESKEK >NZ_CP049364|5522:14856|6913_7165_-|WP_000654846.1|DBSCAN-SWA MKDQYKKVSQKHMLGFMYYLQLLGYVIVRQGMDQAMFLTKHYAVPVAWRRITIDYHNRLNKPAQQLYKEFVEWTKEEYAEMVA >NZ_CP049364|5522:14856|14287_14560_+|WP_001180660.1|DBSCAN-SWA MQNNLSNQTTERNQPEFLVGDVVVLTKECRTFKSNDLFEVKNKTLTRLWTIKSENHLILVSSKEIRTATVAELNAKRRLTSAEQALAEVS >NZ_CP049364|5522:14856|12623_12839_-|WP_000370485.1|DBSCAN-SWA MDNSKRPINQIIARINDAAKHGEALVLTAEEVKILSKDIGDKVFIPVLTNEQVVQLVKEGKLGQKINNTKD >NZ_CP049364|5522:14856|10719_10923_-|WP_000845537.1|DBSCAN-SWA MKTEIIEALALELTKATIADTDPSTINIKSADLWVKTYQESLKAVEEALKELKPKPKATSKPISGMS >NZ_CP049364|5522:14856|9228_9552_-|WP_000064463.1|DBSCAN-SWA MSNFKKHPDGYKSFLGRDDKGLYSVRIGWQVYASNANGSVLYKVKDGFKTPLNVFRFQTDYPKVWNELTQEIDFQRRKQLAIKLRETNIPTYDRKAYKTKRGFTGSR >NZ_CP049364|5522:14856|5522_5786_-|WP_000088974.1|DBSCAN-SWA MSRLTKLDRMTHAEKEAAKKEFWEAADNQTFPPETVAIVMHVSLPWLQKKRCEGGGIPFSKPHKRQVNYMKSDVLAYIEQNKMAHTA >NZ_CP049364|5522:14856|6505_6913_-|WP_000147323.1|DBSCAN-SWA MTGNERIPFESQFKTTEIFKRESAIRKNDILAFSETMNGYFNIVTNDAWQLWNKAKAETVPDTPTPSVTLTCAELKEAFDFGAPDGEKDQFQMETEMTIKWLQDGYDGEGYYCWYADLPEEGCIKLGVSESGAEG |
17 | Acinetobacter_phage(93.75%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP049363_1 | 2184167-2184252 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP049363_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP049363_1
>1.1|2184190|40|NZ_CP049363|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP049363_1
The CRISPR arrays of NZ_CP049363_1 >merge|NZ_CP049363|1|2184167-2184252|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP049363|1|1|2184167-2184252|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP049363.1|WP_000795915.1|2182929_2183166_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP049363.1|WP_001124846.1|2182035_2182647_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP049363.1|WP_000885229.1|2181353_2181965_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP049363.1|WP_000376215.1|2180741_2181197_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP049363.1|WP_001990047.1|2179036_2180683_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP049363.1|WP_000115408.1|2175406_2178871_-|response-regulator 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
950963 : 963632
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP049363|950963:963632|DBSCAN-SWA 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17 | Acinetobacter_phage(41.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
999004 : 1020273
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP049363|999004:1020273|DBSCAN-SWA 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13 | Acinetobacter_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1182152 : 1194500
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP049363|1182152:1194500|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1198458 : 1227132
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP049363|1198458:1227132|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1232748 : 1263287
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP049363|1232748:1263287|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP049363|1232748:1263287|1255952_1257428_+|WP_000052512.1|DBSCAN-SWA MSLIIKARNIRLDYAGRDVLDIDELEIHSYDRIGLVGDNGAGKSSLLKVLNGEIVLAEATLQRFGDFAHISQLGGIEIETVEDRAMLSRLGVSNVQNDTMSGGEETRAKIAAAFSQQVHGILADEPTSHLDLNGIDLLIGQLKAFDGALLVISHDRYFLDMVVDKIWELKDGKITEYWGGYSDYLRQKEEERQHQAVEYELMMKERERLESAVQEKRQQANRLDNKKKGEKSKNSTESAGRLGHAKMTGTKQRKLYQAAKSMEKRLAALEDIQAPEHLRSIRFRQSSALELHNKFPITADGLSLKFGSRTIFDDANFIIPLGAKVAITGSNGTGKTSLLKMISERADGLTISPKAEIGYFTQTGYKFNTHKSVLSFMQEECEYTVAEIRAVLASMGIGANDIQKNLSDLSGGEIIKLLLSKMLLGKYNILLMDEPGNYLDLKSIAALETMMKSYAGTIIFVSHDKQLVDNIADIIYEIKDHKIIKTFERDC >NZ_CP049363|1232748:1263287|1254135_1254321_-|WP_002026779.1|DBSCAN-SWA MFPNQLTFYFNYRISGDTSGGLQLFGLIGLIYGPIIFALTMVLLRLYTIEFKDFLERQDNS |
30 | Escherichia_phage(25.0%) | integrase,transposase | attL 1225162:1225177|attR 1253506:1253521 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2681374 : 2696171
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP049363|2681374:2696171|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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