Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP050079 | Pediococcus acidilactici strain PMC48 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas1,cas2,csn2,DEDDh,DinG,cas3,csa3 | 0 | 2 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP050079_1 | 421768-422067 | TypeII-A |
NA
Consensus repeat of NZ_CP050079_1
|
4 spacers
spacers of NZ_CP050079_1
>1.1|421804|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTTACAATTCCGTGCAACAGGGTTGAATT >1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGAACAACTAAATGAAAAACCTAAGCGAA >1.3|421936|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAGCAGATTGTTGAAGTGTTGCAATACTT >1.4|422002|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACCCGTTGGTTATATCACACCTATGGGC |
csn2,cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP050079_1
The CRISPR arrays of NZ_CP050079_1 >merge|NZ_CP050079|1|421768-422067|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCCGTTACAATTCCGTGCAACAGGGTTGAATTGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCTCGAACAACTAAATGAAAAACCTAAGCGAAGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCACAGCAGATTGTTGAAGTGTTGCAATACTTGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCTTACCCGTTGGTTATATCACACCTATGGGCGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGAGC >NZ_CP050079|1|1|421768-422067|PILER-CR GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC CGTTACAATTCCGTGCAACAGGGTTGAATT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TCGAACAACTAAATGAAAAACCTAAGCGAA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACAGCAGATTGTTGAAGTGTTGCAATACTT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TTACCCGTTGGTTATATCACACCTATGGGC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGAGC >NZ_CP050079|1|1|421768-422067|CRISPRCasFinder GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC CGTTACAATTCCGTGCAACAGGGTTGAATT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TCGAACAACTAAATGAAAAACCTAAGCGAA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACAGCAGATTGTTGAAGTGTTGCAATACTT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TTACCCGTTGGTTATATCACACCTATGGGC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGAGC >NZ_CP050079|1|1|421768-422067|CRT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC CGTTACAATTCCGTGCAACAGGGTTGAATT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TCGAACAACTAAATGAAAAACCTAAGCGAA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACAGCAGATTGTTGAAGTGTTGCAATACTT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TTACCCGTTGGTTATATCACACCTATGGGC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGAGC
>NZ_CP050079.1|WP_166481339.1|421067_421739_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MKLTYRTHEPVEIKPHAITVLGTNNSTVYIDLVNGMQERNELILAFDENYKELEISKVFDWIGDVGTQDLVIQKYLTKIERVFAEGLVDEQRNQIHDQVNQLFNTVAEQLFMLDLPISVSYDFDLKKLLKYCGVHFDPLSVGNPYGIIEAILKIHEECAINSCVVLTNVAHYLTATQIEELTQLVSQTNQALLLIEFTEIGNQEAYGNSEFYYIDNDFVDWHR >NZ_CP050079.1|WP_159208909.1|420765_421071_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMIMFDLPVETAVQRKQYRQFRKALINEGFLMIQYSVYVRVCVNKKSTTFMENRIKTYLPENGTIQALTLTEKQYNDMHFLVGERVKDVRNTSDRTVIL >NZ_CP050079.1|WP_166481338.1|419882_420788_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRSVIITQHAKLSYSAHAMIVQTNDGINQIPVDDVSLLLISTTQAVITTALISELSKKNVKIVFTDEAREPISEIYGYYPANRTAQLLREQVNWDSELQQILWTKLVANKIINQINVLNLLEHSTDELVTELEKLELNDLTNREAVVAHKYFPLLFESGFTRRDGSVINAALNYGYSILLSAVNQEIVANGYVTYLGIHHDSEENQFNLASDLMEPFRPVVDCWVANQKFNQLTPDIKYGLVELLSLELKYNGKKTILRNAITDHVRNCLKYLAGKANSFTIEMELSDEVPNNAINDNV >NZ_CP050079.1|WP_075139704.1|414802_415384_-|hypothetical-protein MKKIASIAILAVLPLTLASCGNHSTSNSDTSSNSSKTEKVAKSSSKSSVSKDAKSSSDDKATSSSASANSSKDSTNSNSSSNSNSASSSTSSVTDSSSSADNQMSRSDLTKAEKKNGNRPLADEKIQNEQAAVALLTEKYGNQNWKVAFSSIGKSSPIYFHITSPKHGSYYVYANGDVQSADGDLSNHQIVNK >NZ_CP050079.1|WP_166481337.1|412040_414575_+|M1-family-metallopeptidase MANIERFYTKFHPTNYQIKLAISRETKEIKGTTTITGEALSSQIDIHQKDLQIEELRVDGTAGDFTVDQAAEAIHVKLPHTGTVTLEIKYTTKLTNTMMGIYPSYYEVNGETKQLVGTQFETTFARQAFPCVDEPEAKATFDLAIKFDEHPGEVVLSNMPETKVEDGYHYFARTVKMSTYLIAFAFGDLQSKQTKTKSGVQVGVFATKAHQPQELDFALDIAKRAIEFYEDFYQTPYPLPHSWQLALPDFSAGAMENWGLVTYREAYLLLDPKNTTLRTKQVVATVIAHELAHQWFGDLVTMQWWDDLWLNESFANMMEYVAVDALEPEWQIWELFQNSEAGAALQRDATDGVQSVHVQVNDPAEIDALFDGAIVYAKGARMLVMVRALIGDDALRQGLQKYFASHQYGNATGNDLWQALGEAANMPIGDIMHTWLDQPGYPVVTAQVENGDLVLEQQQFFIGEGQAQQRQWQIPLNGNYAEVPALLQTKTLNLGNYQDLRDQNQQPFRLNVGNSSHFIVRYDQRLLDDILADWEQLSAIDQLQLLQDLRLLAEGKQISYAEIVPLLPRFAKTDSALVTEMLYRVANDLKKFVAPQSSAEKQLKKFFGELSQAPAQRLGWQAAAGETNDDQLMRPMVLKAALYAENSAVTAQAHQLFEENEAQLPKLPAAIRSLVIRNEVEHFGSPELFARLLKEYQRTSDASYKSDLCQALTATPSLPLIQQLVQQFENAQVIKPQDLRAWFRGVLANPQGQGPAWNWIRDEWQWLEDTVGGDMEFATYITVIAGIFQTPTRLAEFKAFFEPKLATPGLTREITMDIKVIETRVALIETERDAVQAAVVQAIK >NZ_CP050079.1|WP_166481336.1|410604_412014_+|multidrug-efflux-MFS-transporter MEAQNTRHTNPMIVVAVVALMSFMGILTETSMNVTFPALMKEFHVPLNTVQWVTAGYLLMAALVMLTSAYMKRRFTNRQLFTAAAILFSSGDLICGLATNFWVLLAGRLIQAGCVGLCTPLMVNIILDVVPQHKLGTYIGMANLIILIAPALGPTFGGAVVAFNSWRMIFWSTLPVALVLMLLGMKVIKQYAPTDQHYAFDWTRFLLLGMALVSLIVGLNALGEMQLGTFVGLLIVSIGLTILFVKRSHTATKALFSLQVFKQPAFLYSFLPYIMLQFANVGINFLLPNYVQDVFQATSLVGGLILLPGSLFNGFGQPLYGWLLDRFGGKVPLYTGDLLFTLALVGLMCWGPQLGVVGITIAYLIFAIGRSMAFGNSVAYGLKHIDKEFQNDANALYNTGQQVTGAIGTTVLAILMGSVKRPGYTHAQNVSAGSQLAFILLVIFGCVIFVFFHHLVNLKNLPEDKGVDL >NZ_CP050079.1|WP_058121014.1|409768_410413_+|SDR-family-oxidoreductase MAKIFIAGGSGRVATALIKNLVADSNEVVAGARHPENVVEMDHVNAVKLDLHDGVDAIADLMKGSDAVYFTAGSRGADLLQTDAMGAVKTMQAAEKLGIKRYVMLSSLYTLESERKWHEGGLADLLDYTTAKFFADNYLVHDTDLDYTIVQPTSLTEEAGTGQIYIGKDLPQKTNPIPDVAKVLADVLKHPNTVKKVFMMSSGSQAIDQALANV >NZ_CP050079.1|WP_166481335.1|407931_409485_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MANTDLSNFDKIIVLDFGSQYNQLITRRIREFGVYSELLSHKITAEEIKQINPKGIIFSGGPNSVYDDDAFRVDPEIYQLGIPILGICYGMQLMAYNLGGRVESADNREYGHADINVTDDQAALFKGLPATQTVWMSHGDLVREVPAGFKTVATSANCPIASMADDERKFYGVQFHAEVRNTQYGNDILKHFAFDVCQAQANWSMNDFIDMQVEKIREEVGDRKVLLGLSGGVDSSVVGVLLNKAIGDQLVCIFVDHGLLRKGEAKQVMDSLEGKFGLNIIKVDAQDRFLSKLAGVTDPEQKRKIIGNEFIEVFNDEAQKLKGIDFLAQGTLYTDVIESGTDTAQTIKSHHNVGGLPEDMHFELIEPLRTLFKDEARDLGEKLGMPEDLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLQIVRDSDLILREEIKNAGLDRDIWQYFTVLPGIRSVGVMGDGRTYDYTVGIRAVNSIDGMTADFARIPWEVLQKISVRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPATVEWE >NZ_CP050079.1|WP_166481564.1|405942_407805_+|heavy-metal-translocating-P-type-ATPase MIKMQRWFTRFANPLLGVAALLTATGWLLQHGGGSPEVAGMAYGIATLVAGMPILLKAIAALRARVASIELLVSIAVLGALIIGELEEAAMVTFLFGLGNYLERRTLKQTHRALANLTEMQPTQALLVSEGQTRTVAIDDVEVGDQLLVRIGDQVPVDGRVVTGTATVNEAAITGEARVVNKTPTDQVYTGTIVENGQMVVEARKVGEETTFGKIIELVEEAQDNQAPVSRFIDQFARFYTPLVLVLALLTQLVTQDFRLAITILVLACPGALVIGTPVSNVAGIGRGAQSGILIKGGQVIDQLAKVRTILMDKTGTITTGKPTVQSFYQYSQQDWLAVAAQLEKQTNHPLAAAVVEFYEQRTGQPVQNHDISITTVKGIGVTATWHGHQVKLGSPRILEPSAQKLSNKQTADLQKLRENGQSVILMIVDGALVLAMGLSDQVRPGVASALKRLRQTGVTNQWMVTGDQLNVAQSVAHIVGITQVKAGQLPNEKAQFLKELQASGQPVLFVGDGINDSPAIAQAAVGIAMGSGTDVAIETSDVVLINPDFKNVVFARQIAQTTLRNMMENVGIAVGTVALLMLGVSLGWVNMASGMFFHEVSILVVIFNAMRLLKLKRPG >NZ_CP050079.1|WP_166481334.1|405404_405950_+|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MAKSIEERYLVEQKQAEIDHHQPTAGAMADHVLANLRVLTNKLVQAAWYVKGPSYFADREYLLQLQATLNHDFVQLGDQLRAVGEKPASVTAEFSEYSMLTEDPRIKYYSTEAILAGLVADCQTSLMFIQRAIALANQESKFPLASYLIELNGQFDRASQKLQARLGKEPREGLEEDDDDD >NZ_CP050079.1|WP_024862570.1|423584_424232_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MKISKSSLLTLITYLAIFLLPSVINLFVRLGASFIWVETIDYLVGAALLVVINLKNSEINQIETRRIPFFRAIAWGIIGTALVIVLQFVVSYVTFILGQNPASANTATLVTLAKINPFFVLAITVGAPIMEELVFRKVLFGNLSTLFGMRSNLGLTIMAIISSLAFAFMHNDSHIFLYAAIGLLFCWLYHKTGRIQTSMIAHILMNGLVVLPLVM >NZ_CP050079.1|WP_002829962.1|424421_424706_+|co-chaperone-GroES MLKPLGDRVILEAKDEEEQTVGGIVLASNAKEKSQTGKVVAVGNGRVLDDGKTLPMNVKVGDTVVYDKYAGTEVTYEDQKYLVVHEKDLVAVVE >NZ_CP050079.1|WP_002829959.1|424728_426351_+|chaperonin-GroEL MAKEIKFSEDARTKMLKGVDKLADTVKSTIGPKGRNVVLEQSYGSPTITNDGVTIAKSIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDIAGDGTTTATVLTQAIVNEGMKNVTAGANPVGIRRGIEKATEKAVAALHNMSHEVKTKDDIAQIASISSANPEVGKLIADAMEKVGNDGVITIEESRGVDTTLDVVEGMQFDRGYMSQYMVTDNDKMEANLDNPYILITDKKIANIQDILPLLQSVVEQSRSLLIIADDITGEALPTLVLNKMRGTFNVVAVKAPGFGDRRKEQLEDIAILTGGTVITDDLGLNLKDVTIEQLGQANKVTVTKDDTTIVEGSGSQEQIAERVAMIKQQISETTSDFDKEKLQERLAKLAGGVAVIRVGAATETELKEKKYRIEDALNATRAAVEEGFVPGGGTALVNVIASLEDLDAEGDELTGINIVRRALEEPVRQIAENAGEEGSVIVTKLKTQKDGVGYNAATDEWVDMIEAGIVDPTKVTRSALQNAASVSALLLTTEAVVADLPEEKPAAPAAPNPGMGGMM >NZ_CP050079.1|WP_002829957.1|426649_428482_+|APC-family-permease MFSYLKRILIGKPLKTLDESGQALTKFKALALLSSDALSSIAYGTEEILSVLIVLSAAATWYSIPIAAIVLVLLFAITVSYRQIIKAYPSGGGAYVVASKNWGTSAGLVAGGSLLVDYMLTVAVSVTSGTEAITSAIPALQKYHVAIAVLIVLGIMALNLRGLRESASFLTIPVYLFVVVISIMIIVGLYNIVTGQVTYHAAAAIGSTVPGMTFVLFMRALSSGSSSLTGVEAISNAVPNFKKPRRKNAAATLAIMSLILASFFAGITFLAYYSGITPMSSQTVLSQIGVTVFGHGIFYYILQLSTALILAVAANTGFSAFPMLAYNLAKDKFMPHAYMDRGDRLGYSNGIISLAAGAIVLILIFGGQTGLLIPLYAIGVFVPFTLSQSGMIVHWKREGGAHWWINASANLLGALLSAVLVVCLLFLHFSNVWPYFVVMPLLLRMFYKIRKHYDEVADQLRVVEKGKVNLHDYDGSTVIVLVSNVTQVTSGAINYARSIGDYVIAMHVSFDANPEKEHKTAMEFKAEYPDVRFIDIHSSYRSITNPTLRFCDVIAKRAAERNYTTTVLVPQFVPRKPWQNILHNQTGLRLRAALNSRENIIVSTYNYHLK >NZ_CP050079.1|WP_002831110.1|428703_429879_+|undecaprenyl/decaprenyl-phosphate-alpha-N-acetylglucosaminyl-1-phosphate-transferase MRFEIVVSLFATMIISAILTPFVRRIAFKIGAVDKPNARRVNKVPMPTMGGLAIFLAFNFSLFFLLRNQIPNPQFYGIFFGECIIMLTGIIDDIFELKPSQKMIGILLAALAVYWFAEVQMTTLTLPFIGIVHLGWFSLPITLIWIAAITNAINLLDGLDGLATGVTIIALFTTGFTGLFFLPSTNIYIVIMIFTLVAAEVGFLPYNFFPARIYLGDTGALFIGFMIAVFSLSGLKNATFISVLIPVMILGVPLTDTIYAILRRLLNKQSIAHADKRHLHHRLMQMGLTHRQTVLVIYGISMIFSFIALLYPLSTLWGSVLLTIGILVGIELFVEAIGLVGENRTPMLSWIKRLVRTTTSKTASNEFKEEDTLKDRVRSRSERHQQKKHHD >NZ_CP050079.1|WP_002831111.1|429948_430587_-|YigZ-family-protein MKLILSVKEPVTTEQDIKKSRFISRIIPVQTEEEAQTKLQDIREIEAKATHNCFAYVLGDHQDIQRASDDGEPSGTAGAPILEVLKRENLTNVLVVVTRYFGGIKLGAGGLIRAYGSSTSLAVQSATLMESVDQELLAITIDYQNNDQLTYYLEQHQITQVNHEYTTQVITTVAVDQDQVADLKAELTGLFSGNVSFKDGGQQRVQVPYQPQ >NZ_CP050079.1|WP_008842440.1|430618_431938_+|DEAD/DEAH-box-helicase MEAKVKEKYYGRLVPVNQAEATDPTVNYFPAVIVKKRRIQCQRCGATTKLKEGSLPNQQYYCRHCINLGRMSTLVKLGNLPEPNHFPVGRSYLKWQGQLTPDQQRCANEIISSIKQQTDRLLWAVTGAGKTEMLFPGINFALKKALRVAIASPRIDVVLELHPRIQAAFPEIAIALLHGRTSTPYTYTQLVLCTTHQLLRFYHAFDVLIIDEVDSFPFAMNPALHYAAHQARKECGTTIYLTATPDGQLLKDSRSHRLPTSYLTRRFHGHPLPEIKMVSGCNWQKLIHRRRLPERLRQFLMAQAKTQRQFLVFVPRIDQLSSVLQAIQKQFPELDLATVYAEDPERIEKVSAMREGQLTGLITTTILERGVTFPGIDVAVLGADDEIFSMAALVQIAGRVGRSPKRPTGTVLFIGQMLTRRIKRAQRQIKFMNQQAFKQ >NZ_CP050079.1|WP_002829951.1|432737_433292_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MLDFNVRGENIEVTESIRDYVEKRIGKIEKYFDQGANPKAHVNLKVYQDRTAKVEVTIPLPYLVLRAEETSPDLYASVDLVTDKLERQIRKYKTKINRKSRETGYKGVEIPQEDAREDEEEASEFDIVRTKQVSLKPMGAEEAILQMDMLGHNFFIYEDADTGSVDIVYRRHDGRYGLIESANE >NZ_CP050079.1|WP_002829950.1|433440_435804_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MANILKKWVESDAREIKRLGKKADKIDALKDEMAQLSDEELKAKTPEFKERLKNGETLDDILIEAFAVAREGAKRVLGLFPFRVQLIGGMVLHGGNIAEMKTGEGKTLTATLPVYLNALGGEGVHVVTVNEYLAERDSTEMGELYKWLGLTVGVNTAEMSPDEKREAYNCDITYSTNSEIGFDYLRDNMVVYKEDMVQRPLNFALIDEVDSVLIDEARTPLIISGQTEPSVTLYQRADRFVKTLTDGDYTIDWESKSISLTENGIRRGEKYFNTDNLYDVENSALNHHIDQALRANYIMTKDKDYVVSDDGEVLIVDSFTGRVMEGRRFSDGLHQAIEAKEHVEIQDGSKTMANITYQNLFRMYKKLSGMTGTAQTEAEEFREIYNMEVVSVPTNRPVVRDDRPDLLYPTLESKFKAVVKEIKKLHTKGQPVLVGTVAVETSEYLSRLLDRERIPHVVLNAKNHAREAEIVANAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGPGVVELGGLAVIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDVGMSQFYLSLEDDLMIRFGSERIKDLLSRMKVADEDAVIQSRLISRQVESAQKRVEGNNYDARKNVLQYDDVMRAQREVIYAERQQVIMEEHSLKDVLMPMVYRTIDRVVDAHTAKTKKSYDLDTIVEFARTTLVNENDINIEDLEGKSANEIKDYLKQLADQMYKQKEDALYAPEQILEFEKVVILRVVDQHWTDHIDAMDQLRQSVGLRGYGQLNPLVEYQQEGYRMFNEMVTDIEYETTRLFMKSEIRQNLER >NZ_CP050079.1|WP_141782997.1|435881_436998_+|peptide-chain-release-factor-2 MELTDAKHQIEDMQKEVADFGRSLDLDALNESISVNEAKMAEPDFWNDQEKAQKIINETNVLKAKYDNYKNLTDHVENLEVTLELLEMEADPDVQAEFEDELSQTAKLLRDYRLGLLLNGKYDANNAILEIHPGAGGTESQDWGSMLLRMYTRWAEQHQFKVQIEDYQAGEVAGISSVTIRVMGHNAYGYLRSEKGVHRLVRLSPFDSAGRRHTSFASVDVMPELDDSVEVNINPDDLRVDVYRSSGAGGQHINKTSSAVRITHLPTGIVVASQAERSQLQNRVTAMNMLKAKLFELEEQKKAEEKAKLEGTQLEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNLETANVQGVMDGDLDDFINAYLQWKLQKRNPK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP050079_2 | 620364-620467 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP050079_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP050079_2
>2.1|620388|56|NZ_CP050079|CRISPRCasFinder CCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCATTATCTTGAGCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP050079_2
The CRISPR arrays of NZ_CP050079_2 >merge|NZ_CP050079|2|620364-620467|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCATTATCTTGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG >NZ_CP050079|2|2|620364-620467|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTG CCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCATTATCTTGAGCCG TTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG
>NZ_CP050079.1|WP_166481569.1|613782_614787_+|flippase-like-domain-containing-protein MILAGLVIFGYSLRGVNLHQVSHDILNLNVGWLLVALLCIILYLGFEAVATKVLVESSGDRLSWKDAIRIPLIEQLFNGLTPFSSGGQPAQLVALMQSGIEGGRASSVLLMKFVVFQSMVVLNFIFSLLIGFQYLEDKIKFLSWFVLFGFLIHLAVIIGLLMIMYWHNFTKKMFDLIFIPIKRFTKPERYLRWKTSIDAKVDTFYLESVRMKSQWRLLAKVALLTFLQLLFYYLIPYFILLALGKTHVHLIMVTCLHVLIFMVISLFPIPGGAGGAEYGFSVIFAQFVGNSSKLVLAMIIWRLLTYYFGMFAGMFATVIKPNRINRIVPKKTSE >NZ_CP050079.1|WP_004166561.1|612720_613737_+|glycosyltransferase-family-4-protein MPIKVNMFSSASKVKGQGVGSAYEELIRLLKTHFPKEIDLSINRYTQADISHYHTIDPQFFVSTFTKKRGVKVGYVHFLPETIEGSLKIPQPFRWLFYKYIIAFYKRMDQIVVVNPTFIDQLVKYGIKREIITYIPNFVRKDEFYQYDAEQRRQVREQLGVQDRFTILGIGQVQERKGVKDFIKLAQQHPEMYFIWAGGFSFGRLTDGYADLKKVVDNPPANLKFTGIVDRNKLVEYYNAADLFLLPSYNELFPMSVLEAFSCGTPVMLRDLDLYHSIIKGYYIAADNYAEMDQKLSALVKNPAQLRDYQQRADQASAEYSEDHLAEIWLNYYSSLLK >NZ_CP050079.1|WP_004166563.1|611502_612690_+|glycosyltransferase-family-4-protein MNIGLFTDTYFPQVSGVATSIKTLRDQLEKQGHQVYIFTTTDPKVDTNVYERNVFRFTSIPFVSFTDRRIAISGFIRATQIAKELNLDIVHTQTEFSLGWMGKFVAKALKIPVIHTYHTMYEDYLHYVANGKLLKPYHVKQMTRAFCYHIDGIVAPSERVQRTIQRYGIQVPTRIIPTGVNLEQYQKDSNPQQCREALGYDAKTPVLLSLSRLAYEKNIQEVIDCFPAILKEVPDAQLLIVGDGPARTSLENQVHDLGLEKHVKFTGEINNDQVYRYYQAADLFVSASDSESQGLTYIEAMASHLKVVAKSGPYTDELLDDPSLGKVFDTEGQLVQAIKRYIEHPDEFNDPRPREKKLYEISADYFGKRIVDYYNSAISAHADLEHGSKKESELE >NZ_CP050079.1|WP_004166564.1|610643_611417_+|alpha/beta-hydrolase MEFILKTGETIYYEDQGEGIPILFLTGFGGNTEIWSGQVNFFLQHGYRVIRLDYLNHGRSDRVDYDLKIGDLADEVLQLVDALEIKEPIGIGNSMGAAVLWNILSIRGWDFVSKAIFVDQSPRMMNDDQWHYGFKNLNEANFEQLMSEPILRPAYRRIEGYVYKNSKAIDSKYPFSQPKNRSLVKGHARKDWRPVLRAATKPVLFILGEKSPFFNPQMGDALKQLNSRIQVEVMSNVGHIPMAEEPAQFNQLVLRFL >NZ_CP050079.1|WP_002829776.1|608846_610571_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MTGTLKGIAASDGIAIAKAYLMVDPDLSFEKKTITDVDAEINRLHDALEQSKKELTLIKAKAAENLGAEEAEVFEAHLTILSDPELIGNIEDKIKNDTINAEEATKEVTDNFIAMFEAMTDNAYMQERAADIRDVTKRLMSHLLGVELPNPALIDSEVIIVAHDLTPSDTAQLDRRYVKGFITDIGGRTSHSAIMSRTLEIPAVVGSEKATTSVKQGDMMIVDGLTGDALINPSDDEIKEYEQKSADFKAQKAEWEKLKNERTVSKDGVHFDLAANIGTPDDLQGVLDNGGEAVGLFRSEFLYMNASELPSEDQQFEAYKKVVEGMNGKQVVVRTMDIGGDKDLPYLPLPEEMNPFLGYRAIRISLDRTDLFRTQLRALLRASAYGKLAIMFPMIATVAEFKKARAIYDDERQKMIDAGTKVGEIQVGMMMEIPAAAMIADKLAKYVDFFSIGTNDLIQYSFAADRGNEKVSYLYQPYNPSLLRLIKQTIDASHAEGKWTGMCGEMAGDQIAVPILMGLGLDEFSMSATSILKTRSLMKKLSTDDMKKLAEKAITEAETNKDVIKLVEETVNNK >NZ_CP050079.1|WP_002829779.1|608580_608847_+|phosphocarrier-protein-HPr MEKRDFHVIAETGIHARPATLLVQAASKFNSDIQLTYKDKSVNLKSIMGVMSLGVGQGADVTISADGDDEADAIAALEDTMKKEGLSE >NZ_CP050079.1|WP_002829780.1|608249_608438_+|hypothetical-protein MRDYLKLLNDLKDGVLDELTITAEEFQEFQPVFMDFPERKQLIGEAQRGGTITYRYENNKKQ >NZ_CP050079.1|WP_002829782.1|605825_608033_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit MLCQNCHKNEATIHLYTNVNGRRTEVNLCQNCYQLLKNQQLNNNNGNGGARMAQDPFGFGNLDDIFRAMQGGNVSRPEDMYGQQVPPTQAGRGGGNNPNGGNGSSLLGQYGLNLTDLAKQGKIDPVIGRDKEIERVIEILNRRTKNNPVLIGEAGVGKTAVVEGLAQRIVEGSVPQKLLNKQIIRLDVVSLVQGTGIRGQFEQRMQELMKEVQNNPDLIVFIDEIHEIVGAGNAEGGMDAGNVLKPALARGDFQLVGATTLKEFRDIEKDAALARRLQPVQVDEPSEEEAIKILKGIQKKYEDYHHVHYTDDAIVAAVKLSKRYIQDRYLPDKAIDLLDEAGSKKNLTINVADPETIQKKIDEAEAEKKKALESEDYEKAAYYRDQVSKLEKNKDGATNKEDEPTITAEDMEKIIESKTDIPVGDLQKQEQEQLQNLASNLKAHVIGQDEAVDKISRAIRRNRIGLNGTGRPIGSFLFVGPTGVGKTELAKQLADQLFGSKDAMIRFDMSEYMEPHSISKLIGSPPGYVGYEEAGQLTEQVRRHPYSLILLDEVEKAHPDVMHMFLQILDDGRLTDSQGRTVSFKDTIIIMTSNAGSGDVEADVGFGAAMQGKTHSVLDKLGNYFKPEFLNRFDDIVEFHALTKDNLMQIVDLMIADVNKMLATQGLHVNVTKPVEERLVELGYDPKMGARPLRRVIQEQIEDRIADFYLDHPSEKQLIARIKDDKIEVAPDDKK >NZ_CP050079.1|WP_004166854.1|604521_605499_+|GMP-reductase MKVFDYEDIQLIPAKCVVRSRSECDPTVELGKHTFKLPVVPANMQTIINEEIAEKLAADGYFYIMHRFEPETRLAFVKKMKAKGLISSISVGVKDGEYDFIDELAAKNLVPDYITIDVAHGHAQTVIDMIHYIKEKLPESFVIAGNVGTPEGVRELESAGADATKIGIGPGKVCITKLKTGFGTGGWQLSALRWCAKVARKPLIADGGIRNHGDIAKSIRFGATMVMIGSLFAGHIESPGETKVEDGVTYKEYFGSASQYQKGEAKNVEGKKIWIHQRGHLADTLKAMQEDLQSAISYAGGRDLESIRKVDYVIVKNSIFNGDIL >NZ_CP050079.1|WP_002829785.1|603648_603903_+|hypothetical-protein MSKNLKIDLNTDELIGSREASLMWGKQKDYVRTIYNKYPERFPTGTIRKFGKQLIVTREGMESVTGIKYEDLDKKNIEKAKLPR >NZ_CP050079.1|WP_166481366.1|622410_623142_-|hypothetical-protein MDKIKIPKINYHVDRKSYLPAILAVILTSTVWYFSSHFSSEPFKHNLTVQIIFFLASFMANFITFDQLTNKTNLRLIAPLAVIPVAFFIILLVSKERYVSLLGLLTLVPFISVFLPFQGKNGVGLISFAFSISVLSPIAFFYIRNAFVSSMFLKTCLLLCLVFLMILFSVFVAHPEQFIYLEIGLLVVIAIFSLVLFKQWSTVLYPMIGILGWYLPRVKLPRNFILLVLIILICVTFLFTAGH >NZ_CP050079.1|WP_002830669.1|623313_624504_+|methionine-adenosyltransferase MSERHLFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDELLKNDPDARVACETTVTTGLVVVVGEISTTAYIDIQKVVRKTIKDIGYVGGEYGFDGENCAVIVAIDEQSPDIAQGVDDSLETREGHEDRLNRIGAGDQGLMFGYATDETKELMPLPIMLSHHLMQRIAKLRKEQVISYLRPDAKAEVTVEYDDNDQPVRVDTVVLSTQHDPDVTLEQIRKDVIEKVIKEVIPAELLDEKTNFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGAAHHGGGAFSGKDATKVDRSASYAARYIAKNIVAAGLAKKAEVQIAYAIGVAEPVSVMVDTFGTGKVSEEALTKAVRQIFDLRPAGIIEMLDLKRPIYKQTAAYGHFGRTDVDLPWEKTDKVAELKAFFQK >NZ_CP050079.1|WP_036671172.1|624679_626149_+|MFS-transporter MKKKQTNVALVTVAIFVATFMSAIEGTIVSTAMPTIVGDLHGVNLMNWVISIFLLTNAIFTPIYGKLSDIFGRKRVFIIGIIIFLIGSMLSGLAHSMTTLIIWRALQGIGAGSIMPVSNTIIADIYSLEKRAKVMGLNGSAWGIASIIAPLLGGFIVDNLSWHWIFFINVPIGIITIILIQLYLKEEVSVHRKKIDYWGSVWLMLSLLGLMYGFQLLGESTASKLILGLSFIIFVVAGALFIRQERRAEDPIIFLDLFNDRTFVIQNVATMLVSGLLIGFEVYLPTWTQGILGLPASLAGFAVTPSSVLWIFGSFLAGKMLVKLKANQILRISLTILAIGSFLLAVIPASTPFVAFFFIAAILGVGFGITITSTLVISQQLVSKDRIGVATSFNTLAKTLGQTIMMSVFGIIMNGTINMGIAHHPRINMTMMNQVINPQTAKQLPANLLPTLRDILYSALHNIYICGFILIIVAIVINAFSRPRTQKNK >NZ_CP050079.1|WP_004165584.1|626228_626792_-|methyltransferase-domain-containing-protein MLDNAMQYSHRLLAEVVQPGDHVVDATMGNGHDTLFLANLVQSQGQVFSFDIQAAALSATEARLEKQLPDHQHVQLIQDSHDQLTQYVDTPISGAVFNLGYLPGGDKQIITHSASTIAAVQQCLQLLKVGGRVVLVCYYGHPGGAAELAKLLEFTANLDQHQFTCLRYEFINQVHQPPILLAIERRK >NZ_CP050079.1|WP_002830673.1|627825_630243_+|leucine--tRNA-ligase MAYNHKEIEPKWQRYWQKHETFKTVESEQKPKYYALDMFPYPSGQGLHVGHPEGYTATDIMSRMKRMQGYKVLHPMGWDAFGLPAEQYAMKTGNNPKDFTAHNIKNFKRQIQSLGFSYDWSREVNTTDPEYYKWTQWIFEQLYKKGLAYEKETLVNWAPDLMGGTVVANEEVVNGKTERGGFPVYRKPMKQWILKITAYADRLIDDLDLVDWPDSIKEMQKNWIGRSIGASVFFDVEDSDQKIEIFTTRADTLYGATYLVISPEHPLVDQLTTLESKAAVEEYKQAVATKSDLERTDLNKDKTGVFTGSYAVNPVNGKKIPIWIADYVLASYGTGAVMAVPAHDPRDYEFARKFKIDIVPVIGGGNLDEEAYTGDGPHINSGFLDGLNKQEAIDKMLDWLEEHGAGHKKVNYRLRDWVFSRQRYWGEPIPVIHWEDGETTLVPEDELPLRLPATDNIKPSGTGESPLANLEDWLNVVDENGRKGRRETNTMPQWAGSSWYFLRYVDPKNQNKIADEDLLKEWLPVDLYVGGAEHAVLHLLYARFWHKVLYDLGVVPTKEPFQKLVNQGMILGSNHEKMSKSKGNVVNPDDIVERFGADTLRLYEMFMGPLTESVAWSEEGLNGSRKWIERVWRLMIDDNNHLRDRITMINDHKLDLIYNQTVKKVTEDYENMRFNTAISQMMVFVNEAYKADALPMVYMEGLVKLLSPIVPHVAEEIWQIMGHEETITYEAWPTYDESKLVQDTVQVILQVNGKVRSKVEVEKDLDQAELEKIALADERIQQWTAEKDIKKVIVIPNKIVNIVAK >NZ_CP050079.1|WP_002830674.1|630498_632181_+|polysaccharide-biosynthesis-protein MDKPSEFDTAESQYLGSQPLRENSGNSSSKAKMLEGSAWMTAGSIFSRILGAIYIIPWVIWFGVYSDQANALYTKGYNIYSFFLIAAIAGIPSAISKQVAHYNAINEFALGQRLYKRGLLLSVGTGVVCAAILFFGAPFLNDGDPNVTTVLHALAWAVLVIPTMSLTRGFFQGYQEMGPSAVSQFIEQLARVAYMLVTAYLIMYKNHGDWVYGVAQSTFAAFIGALGGLLVLIGYFVKYRRRLRYLSQHSVNGLAISTTSLYKEIIAQAVPFIIIGSAITIFQLIDQYTFFRIMRSVSDYSATVLNNMFAIFAFNANKLVMIVISLASALAVTSVPILSEAKTRGDRAEISRQVADSILLFAFLMIPSALGMAAVAQPAYTLFYHLSDVGTAILQFNSYVAIVLGLFTVISAVMQGIGENVLAVKYFVVGMIVKFIFQFPMVAIFSAVGSLISTAIGFAVVNWLILRHINREYGLDYDKINGFIGKIITYSFGTFFIAFVVTNGLYLVMNPANKVQALIVILVAATLGGLFYVVCVLKSRLADEIIGGRAAGLRRMLKIK >NZ_CP050079.1|WP_004165588.1|632191_632911_+|rRNA-pseudouridine-synthase MRVDKFLHDMNVGTRSQIRKLIKEKAVFVNDVVAKSGRVKVDPVVDQVRLGEQVITYQQYFYFMMNKPLGVVTATEDRKQKTVMDLFNKVDFRKDLFPVGRLDKDTEGLLLITNNGPLAHQLLAPERHVQKTYEAVVTGQITDPAVKQFADGIVLKDGTQLKPADLTILNYSALDEQTLVHVTLKEGKYHQVRRMFGSLGERVVSLKRISFGPLQLEEGLLPGTYRELSDEEIEKLKTE >NZ_CP050079.1|WP_004165589.1|633017_633848_-|NAD(P)H-hydrate-dehydratase MLKINRQTLKSHWPVRQKQSHKGTYGHLLLIAGNAQYGGAGILAASAAIYAGGGLVTLATAKNNFTAVRATLAEIMLIDFTDFDQLSQSLANATGVVIGPGLGTDSTSLAVLNFTMAHIAEGVPLIIDGSAIDLVAQHDLRVSHHPTIYTPHQMEWQRLSGIKIADQSVERNQAVVDQLNATVVLKHYHTEIYAPAAPVAQIMAGNPGMATGGSGDSLTGILLALIAQANSVNEGVRLGTFLHSYTADLIYEHEAVVLPHRLICRLPAVLKQLSQP >NZ_CP050079.1|WP_002830677.1|633973_634435_+|universal-stress-protein MDYKKILFGYDGSPESMAAFNRAVEIAKSNHAKLIIASVMKKQPANTASVSLGFGVIETGIDLQDTLDQWKTTLEKLKQDAQQQGLPAEDIEVVFKQGSPKSMLSYTLPKEYDVDLIVLGATGMGTVAQVILGSTASYVVENAAPDVVIVKNN >NZ_CP050079.1|WP_002830678.1|634764_635049_+|DUF2089-family-protein MEKWISNLSDEELAFIKVFILSSGSLKKMARYYDVSYPTIRTKTDQLIKKIKRLDDNENKKGFKEQIMNLVIEDEISLQAAEKILALREEELKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP050079_3 | 1482276-1482432 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP050079_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP050079_3
>3.1|1482313|24|NZ_CP050079|PILER-CR TCAACGGTTCGGATCTTGCCAATC >3.2|1482374|40|NZ_CP050079|PILER-CR CTTCTTGGAGTCCTATCGCATGGAGCGTCTCTAGCAATCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP050079_3
The CRISPR arrays of NZ_CP050079_3 >merge|NZ_CP050079|3|1482276-1482432|PILER-CR CTTCGTCGCCTAGCTCCTCAACATTACTGTGACGCTCTCAACGGTTCGGATCTTGCCAATCACTCGTCGCCTTGCTCCTCCTTCTTGGAGTCCTATCGCATGGAGCGTCTCTAGCAATCTCTTCGTCGCCTAGCTCCTCGACATTACTGTGACGCTC >NZ_CP050079|3|2|1482276-1482432|PILER-CR CTTCGTCGCCTAGCTCCTCAACATTACTGTGACGCTC TCAACGGTTCGGATCTTGCCAATC ACTCGTCGCCTTGCTCCTCCTTCTTGGAGTCCTATCG CATGGAGCGTCTCTAGCAATCTCTTCGTCGCCTAGCTCCT CGACATTACTGTGACGCTC
>NZ_CP050079.1|WP_024862997.1|1481281_1481908_-|N-acetyltransferase MEKDYLIRLEQPADYRKTEAMVREAFWNVYRPGCYEHYVLHVLRKSREFVPQLNLVMEKDHQIIGQICFVKAKMVDKNGNEVPVLTFGPLSIAPAYQRKGYGKKLLDYGIAQARKWGASALCIEGNLAFYKHAGFEVAATKGIRYAGEPENGELPYFLAKELREGFFEQVQGALYYTPSAYYVSESDVNKFDQQFPPKEKRVLPGQLA >NZ_CP050079.1|WP_002832208.1|1480621_1481080_+|flavodoxin MPTAKVVFATITGNNEDCADIITEALEDLGVEVDETEISQTDAAELKDYDINVIVPYTYDEGALPEEGLDFYDDLADLDLSGKIYGVAGSGDTFYEEFYCVAVDKFSEALTKANATKGTADLKINLAPESQEDLDHLDQFAQDLVDAYNAQN >NZ_CP050079.1|WP_004165485.1|1479753_1480569_-|recombination-regulator-RecX MININSEETKKITKITAQKRAGRYNVFLDGEYAFPISEETFIHFRLGKGMAVNGTLLKEIGEYETNAEAYNIALTYITGQLRTENEVRQKLRQQDYEESVIEAVIAKLADLNLLDDREYAKSYVRTMMRTGDKGPRYLINHLRQKGVLENDLQAGLQLFTDAEQVALAVRVGQKLQKRHQAQALRQQQLKIRQNLMQKGFTSEIIEKALAEIEFTVDSDAEYEKLRKLGERLLRRYQGQPEYQRTTKIKRSLYQKGFEMELIERFLNENDS >NZ_CP050079.1|WP_002832206.1|1479106_1479661_-|DUF402-domain-containing-protein MSQYSDGPKEGEYIAIKSYKHDGSLHRTWRETMVLKNSQDEFIGCNDHTVVIEDNDRRWVTREPALVYFNKHTWFNVVAMIRDNGVSYYCNIASPYVLDREALKYIDYDLDVKVFPNGERRLLDTDEFEQFSRQWHYSADTIQILLDSVRELTDWINKKRGPFSVEFINIWYKRYLNIAERNTR >NZ_CP050079.1|WP_008841091.1|1477895_1479026_-|AI-2E-family-transporter MFEKFRKTPLMYWSLELLIIATLLWVCTKIDFLFSPIGTFISTVFMPLILATFLYYMLHPLVKLLMKVHYKKFRISRTWAVVLVFVGFLLLIAWGISSFLPSLIDQISQMLGNLPMIAKKLQVAIPQLVDHSWLRKVDFDPYLKNLNSEIGQYAEQFLANMTNSIGNIIAALTNITVIVITVPIILFYMLKDGYKLIPTISRIVPEHNRKSVLDLFYSMSDTLSSYISGQVIECIFVGTFTVIGYMIIHQPYGLVLGVIAGICNIIPYVGPYFGIFPSLLVAIAQSPEQVISVIIVVLIVQQVDGNLIYPNVIGKSLQIHPLTIIILLLVAGKLAGILGMILAVPTYAIVKVLINFIHHIWVLDRDKIEEKVKPEK >NZ_CP050079.1|WP_002832202.1|1477415_1477820_-|glycerol-3-phosphate-cytidylyltransferase MTRVITYGTFDLLHKGHVRLLKRARELGDHLTVCLSTDEFNAVKGKKAYTPYEDRKYILEAIKYVDEVIPERGWDQKINDVKENDIDIFVMGDDWKGQFDFLKDYCKVIYLPRTEGISTTKIKRDLGLGDYKKD >NZ_CP050079.1|WP_166481473.1|1475780_1477349_-|peptide-chain-release-factor-3 MNQAELKAAVDKRRTFAIISHPDAGKTTITEQLLLFGGVVREAGTVKARKTGNYAKSDWMEIEKKRGISVTSSVMQFDYAGKRINILDTPGHEDFSEDTYRTLMAVDSAVMVIDSAKGIEPQTKKLFQICKMRGIPIFTFMNKLDRDGREPLDLVNELEEVLGIDAYPMNWPIGMGKGLAGLYDIYNNRIELHTDEPEYLALDSNGELKEPNPIEEESVFQDAMMEVDLMKEAGNQFDEAKIAKGELTPVFFGSALTNFGVKTFLDAYLQFAPAPSAHKVADGEQIQPTDEEFSGFVFKIQANMNPNHRDRIAFLRICSGEFDRGMDVTLKRTGKTLRLSNSTQFMADARENVERAVAGDIIGLYDTGNFQIGDTIYTGKQPVQFEKLPQFTPELFMGVSAKNVMKQKSFHKGIQQLVQEGAVQLYTNYTTGDYILGAVGQLQFEVFQFRMQNEYNSEVVMQPMGKKIARWINPEQLDEKMSSSRNLLVKDRAGQPLFLFENQFAERWFKGKYPDVELTAKL >NZ_CP050079.1|WP_005918921.1|1473508_1475677_-|LTA-synthase-family-protein MNRLWGKFRRGLNTKFGFFMLITGLFWLKSYIAYQTKFTLGVQGGMQELILAISPLGFAILLFGIGLYIRGKWAYWYMIVMDAILSTWLFANILYYREFSDFITFNLIKGSGAASDNLGKSLMGILRPTDFLVFVDVIFVIAILAFGFAKIDQQRFKLVNSLAVTILSIGVLAANLALAYSNRSGLLTRTFDNNYIVKYLGLQSFTLYDGVKTVQNSNKKKEAKSSQLKPINEFLKKNNVPANIEYKGVAKGKNVIIIHLESLQQFVINQKWKGKEITPNINKFYNDKNTLAYDNFFNQVGQGKTADAEMMLENSLFGLPEGSAMVTDGTTNTFQSMPAIMDQHGYTTAAFHGDVASFWNRDNAYKSFGYQYFFSKQYYSLKKGYVSGYGMKDKLFLQQSAKFLEELPQPFYAKLITVSNHYPYGIEKKNVSIDPWETGDSTVDPYVQTAHYLDQAVGELISYLKKTGLYDKSLIMMYGDHYGISNNHKPAIAKILGLKGVTNYDLAMFQKVPFMIHAPGLKGGVNHNYSGEIDVMPTLLNLLGIDTPGAYQFGHDINSKQYNQIVAFRNGDFVSKKYTKYGGDLYYTATGEQITDETASQKREVKQIQQYVNNELNYSDRIINGDLLRFADLDWFKKVNKADYSYTKKTALKNLKKAQKSKTSLLEQNHGRSTVDDYVTDAPELPENEDKAASSSSSSNSSSEDSSHSGSSSADPATQEDK >NZ_CP050079.1|WP_005918925.1|1472137_1472500_-|DUF1634-domain-containing-protein MNAKQKEMNHVELLIGRILQVGVYISAIVIICGIGLWLVKNGSGYAGALPTRLGVIFQGAMQLKPYAVLMLGIFLLILTPVLRVVVSIYAFAKEGDRLYVAITTIVLIILIIGMTIGYQG >NZ_CP050079.1|WP_008841095.1|1471158_1471893_-|hypothetical-protein MKVEPNVVISEFIVNMVDELHGADNSNVDVAEKVKEQADSLADFKVPYYVLTNGPGREHVDDGLTIVHLDLFEHFPNLTLYFQRLLLAFDFLKAHPEIKKAALTDAADVTMLNYPFDNVQEGILYMGDETSPIFNTSIIISNDAPTYMRDFIWENNDLPILNLGVMVGTRDVLIEYLGIMVKLITEAELKVKQGDASYNLGHFEMLISNYVAYRYFSNRLIHGREVSTIFNGFQERSSAWFKHK >NZ_CP050079.1|WP_166481474.1|1482712_1482874_+|hypothetical-protein MGMFSFVSKWNRAGELFRTRQFILTFAKEEYLVKIEEVIKKRREELAKKESNQ >NZ_CP050079.1|WP_141783081.1|1482979_1483069_+|putative-holin-like-toxin MSVYQALMLMLAFATFVIALLTFVFTFCA >NZ_CP050079.1|WP_166481475.1|1483258_1483702_+|hypothetical-protein MGEITKTHSFKQYISEAFDHGKYMVIQQGENPIAGYANGDPFENFKDVTLFGDHTLSLFKPQEKFFVASDGIKILSPSLKMNGMFYYYLLEKYRPQSEGYKRHFTIMKKSTALFPIEIDEQIKISNFLEELDSLIALHQRKPNTLFS >NZ_CP050079.1|WP_166481572.1|1484644_1485091_-|restriction-endonuclease-subunit-S MGQSPSSKNYTENPNDHILVQGNADMKNGHVVPRVWTTQITKQAEKGDLILSVRAPVGDIGKTDYDVVLGRGVAAIKGNSFIFQLLTKMKINGYWTRFSTGSTFESINSDNIKNAQISIQSLREQEKIGGLFNEFDSLIALHQRKPKW >NZ_CP050079.1|WP_166481476.1|1485171_1488267_-|type-I-restriction-endonuclease-subunit-R MSNAPKDASEKKFQEDFCNELAKYRWQKTDELDGNKHKVTVETLINNWRQELNRINADQLEGYELTDNEFDQVLKKVSQIQNSYEAAKLLAIEEGKGKIDGIYRDDNPGVTREQITLTIFKKSQVGGGDSSYQIAREVQTPHGNRFDIVLLINGLPLINIEQKRTDKNLDEAFGQFKRYYRDGEYQNNFMAFSQMMVVTSEIETRYFATPKSLNDFNPSFVFHWADRENNVINQWQKVIKHFLMIPMAHQMVGDYLVIDEASDKDNRRHMLMRPYQVYALQAIEGAALGKDRLGMPHGGYIWHTTGSGKTITSFKTALVLSTRLSYDKVVFMVDRTELDQRTADNFKAYAAYEPVEVDNTPSTHQLAQQMNHKRSGIVVTTIFKMNSLVKKLMENHDTSLAEKKIVFIIDEAQRTTMGDMMVTIKRYFKKNGLFYGFTGTPLFEENHVKGKIVTSRNRSRLIDTTEKLFGLELHRYTIDEAIRDGNVLGFNVDYINTGEFKNYEDLRDQLIQIKLKQNEEADARAIERTVRGMDNVQVEEEALKNKLLIYRDETHIPQVVKTILENWDYQSQNKEFNAILTVARKDRAVAYFDEFQKQIAKNKQKLNIAVTFSFGNENDPDNIANPELVERMFTSYEKFTGIKFAFGDKKAGSDAYFEDLVDRATRGGSGLNPKNIDLVIVADQLLTGYDSKKLNTLYVDRSLELQGLIQAYSRTNRVFKKNKKDFGMIVNFQYPALTKKRVETALKLYGSGGKSSLAIVERYGVAVEKFAKLVGEMRETLKEPANWMDLKSDVDATKKFMDAFLVAAKQLSRVQQYYEYKWSDKKFTISEHQWMKYRGAYQNLRGTNIVEPPVEPPAELISTQSKLVDTQQVTADSILKLIGNQKKQSHNNQLTEEDLQKIEDWIQDLSDQGEYQKAQLIKQFLNEVVLADQKASFEDINDEFEKWKQQKLNQAIDKFARKWGIDEDLLQKSVQNYNPADPEVVPYIADLNKAISFANAEDKSCGNLLKHKMTVMKKLPKWMVNTTKQYK >NZ_CP050079.1|WP_166481477.1|1488329_1489490_-|restriction-endonuclease-subunit-S MSKDKKRLVPVRRFKEFENAPAWEQRKLTEIVNRVNKSSNSDVLPKVEFEDIVSGEGRLNKDISSKLDSRKGTLFESENILYGKLRPYLKNWLFPDFEGVALGDFWVFEATDVSVPSFDYYLIQSDDYQKVANDTSGTKMPRSDWKNVSSTDFAIPSKDEQKQIGAFFKQLDDTITLHQRKLDKLKRVKSAYLTEMFPAEGEREPKRRFPGFTVAWEQRKLGDVVNRFDNLRIPVTASKRIHGEFPYYGANGIQDYVDGYTHNGEYILVAEDGASNVYDYPVNYVKGKVWVNNHAHVIQGKTNIADNLFLLNAIKSINIASFLVGGSRAKLNAEIMMELPIKIPSYNEQKKIGKYFANIDSLITLHQRKLDKLKKMKAAYLEEMFV >NZ_CP050079.1|WP_166481478.1|1489489_1492069_-|type-I-restriction-modification-system-subunit-M 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP050079_3 | 3.1|1482313|24|NZ_CP050079|PILER-CR | 1482313-1482336 | 24 | NC_031280 | Acinetobacter phage vB_AbaM_phiAbaA1, complete genome | 47059-47082 | 3 | 0.875 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | MF360958 | Salicola phage SCTP-2, complete genome | 110995-111024 | 6 | 0.8 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | NC_010632 | Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02, complete sequence | 29954-29983 | 7 | 0.767 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | NC_015432 | Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus MS1146 plasmid pSSAP1, complete sequence | 32213-32242 | 8 | 0.733 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | MG557618 | Staphylococcus phage HSA30, complete genome | 4295-4324 | 9 | 0.7 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | KY779849 | Staphylococcus phage qdsa002, complete genome | 49912-49941 | 9 | 0.7 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | MF001365 | Staphylococcus phage SA3, partial genome | 19388-19417 | 9 | 0.7 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | MH159197 | Staphylococcus phage VB_SavM_JYL01, complete genome | 19479-19508 | 9 | 0.7 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | MK250904 | Staphylococcus phage VB-SavM-JYL02, complete genome | 18051-18080 | 9 | 0.7 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | MT554104 | Staphylococcus phage ESa1, complete genome | 47035-47064 | 9 | 0.7 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | NC_019448 | Staphylococcus phage GH15, complete genome | 46544-46573 | 9 | 0.7 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | MT786458 | Staphylococcus phage vB_SauH_SAP1, complete genome | 141636-141665 | 9 | 0.7 |
NZ_CP050079_1 | 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421870-421899 | 30 | MN304941 | Staphylococcus phage vB_SauH_IME522, complete genome | 133105-133134 | 9 | 0.7 |
1. spacer 3.1|1482313|24|NZ_CP050079|PILER-CR matches to NC_031280 (Acinetobacter phage vB_AbaM_phiAbaA1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
tcaacggttcggatcttgccaatc CRISPR spacer tcaacggttcagatcgtgccaatg Protospacer **********.**** *******
2. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer taaaacaacttaatgaaaaatctaagaaaa Protospacer * .******* *********.***** .**
3. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010632 (Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer cagaactactaaaagaaaaacctaaccaga Protospacer . **** ****** *********** *..*
4. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015432 (Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus MS1146 plasmid pSSAP1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer gattacaacaaaatgaaaaacctaaacgtg Protospacer ***** ***************.** .
5. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG557618 (Staphylococcus phage HSA30, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
6. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY779849 (Staphylococcus phage qdsa002, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
7. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF001365 (Staphylococcus phage SA3, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
8. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH159197 (Staphylococcus phage VB_SavM_JYL01, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
9. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250904 (Staphylococcus phage VB-SavM-JYL02, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
10. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT554104 (Staphylococcus phage ESa1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
11. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019448 (Staphylococcus phage GH15, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
12. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT786458 (Staphylococcus phage vB_SauH_SAP1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
13. spacer 1.2|421870|30|NZ_CP050079|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN304941 (Staphylococcus phage vB_SauH_IME522, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
435881 : 443555
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP050079|435881:443555|DBSCAN-SWA AATGGAGCTAACGGACGCAAAACATCAAATTGAAGATATGCAAAAAGAGGTCGCTGACTTCGGGAGGTCTCTTTGACTTAGATGCGTTGAACGAAAGCATCAGTGTTAACGAGGCAAAGATGGCGGAACCTGATTTCTGGAATGATCAGGAAAAAGCCCAAAAAATAATTAACGAAACTAACGTATTAAAAGCTAAATACGACAATTATAAAAATTTAACTGACCATGTGGAAAACTTAGAGGTCACCCTAGAACTATTGGAAATGGAAGCGGACCCCGACGTGCAGGCGGAGTTTGAAGACGAACTTTCCCAAACGGCCAAACTGTTGCGTGACTACCGGTTAGGGCTGTTGCTGAATGGCAAGTACGATGCCAATAATGCCATTTTGGAAATTCATCCGGGAGCTGGCGGAACCGAATCCCAAGACTGGGGCTCGATGTTACTGCGGATGTATACCCGCTGGGCGGAACAGCACCAATTCAAGGTCCAAATTGAAGATTACCAAGCCGGCGAAGTTGCCGGAATTAGTAGTGTTACAATACGGGTGATGGGCCATAACGCCTACGGCTACCTACGTTCGGAAAAAGGGGTTCACCGCCTCGTGCGGTTATCGCCTTTCGATTCAGCCGGGCGGCGGCACACCTCGTTTGCTTCGGTAGACGTAATGCCAGAATTAGACGACTCGGTAGAAGTTAACATTAACCCAGACGATTTACGGGTGGACGTTTACCGCTCTAGCGGGGCCGGCGGGCAGCATATTAACAAAACTTCTTCGGCTGTTCGGATTACTCATTTGCCAACCGGAATCGTGGTCGCTAGCCAAGCGGAACGGTCCCAATTGCAAAACCGGGTTACCGCGATGAATATGTTAAAGGCCAAGTTGTTCGAGTTAGAAGAGCAGAAAAAGGCCGAAGAAAAGGCTAAGTTAGAGGGAACCCAGCTAGAAATCGGTTGGGGATCCCAAATTCGCTCTTATGTTTTTCATCCGTATTCAATGGTCAAGGATCACCGGACCAATTTAGAAACTGCGAATGTGCAAGGTGTGATGGACGGCGATCTGGATGACTTTATTAACGCTTATTTACAATGGAAGTTGCAGAAACGTAATCCTAAATAGGAGATTTTTTCATGGCAATGACAATTTTAGTGGTCGATGATGAACCGGCAATCGTTACACTCTTAACGTACAATTTAAAACAGGCTAATTATCAAGTGATTAGCGTAGACAACGGGGTTGATGCTGTTAAAGAAGTGCAACGCGGGAAGGTCGATTTTGTGATTATGGACTTGATGCTGCCCCAGTTGGACGGGGTCGAAGCTACGAAACAAATCCGTAAGTTCAATGAACAAATTCCGATTATTATGTTGACGGCTAAATCTAGCGAAGTGGATAAGATTTTAGGACTAGAATTAGGGGCGGACGACTACTTAACCAAACCGTTTAGCCCACAGGAATTAATTTCCCGGATTAAGGCTATTTTGCGGCGGACTAACCGGGTGGTCGACTTAAAGGAAATTGTCCCTGAATTACCTGCTACCGGAATTACGATTGATTTTAAGCGGCTGACGGTACAAAAAAATGGGCAACCGGTGGCTTTAACACCCAATGAATTTCGGTTGTTGAAGTTTTTGTTTCAAAATAGTAACCAAGTTTTATCACGGGATCAAATCCTCGAACAGGTTTGGGGATACGAGTATGGCGGGCAGACGCGCATTGTGGATATGCACATCAGCCATTTACGCGACAAGCTGGAAGATGATCCAAAACATCCACGGTTGATTAAAACTATTAGGGGGTTCGGTTATGAGTTCTTCACAAAAGAAGGGCATTAGAAAAACCATTCAGTTTGGGCTAGCAAGTTTGATTGGGAACGCGTTTATGGCCTTTCTGGTTTATAAATTAATTGTTAAGGAAAACCCGCGGGTCACCCGGGTCGACATGACCTTAATGATTGCGGTAATTTTATTGATTACCGTGATTGAAGTGATTGTTTTTTGGAGTAATCAAAAGAACATCATTGAGCGGCAACACCAGTTCCGAATTAACCTGGAAGAGACCATTAAAGGGAATAAGGTTCCTAAAATTTACCTGGATCCAGACGACCCCTTTTATAAATTATCTAAGGCCGTTAATGAAATTAGTAAACACGAGCGTCACCAAATTCACGAGTTGACCAACCAACAAAATGAATTAAAAGCGATTATGGATAACTTACCGGTGGGAGTATTAGTAATCAATCGACACCGGGAGTTACAGGTGGCGAATACTTACGCCATTAACCGGTTAGGAATCACGGCGCTCGATATTCCGCACCCTTACACGTTAGACGTGCGAAATCAGGAGCTCAGAAACTTAGTTGACCAAGTTTTCCAAAGTCGCCAAAGCGTCACTAAAACACTCGAACTGGAAGACGGCGGGCAATCTTATATTTTTGAAACTAACGTAGTTTACAGTCCCAAAGTGCACCACAAGTTTGAAATTATCGTGTTGCTTTACGACGTAACTGAAAGCGTACGGTCGAAACGAATTGAACAGGATTTTGTTAACAACGCCTCTCATGAGTTGCGGACCCCCATCACTTCAATTGCTGGATTTGCGGAAACGTTGTTGGAGGGCGCCAAAGACGATCCCGAAACGCTGGATAACTTTTTAAATATTATTAAGTCGGAAAGTGACAAATTAGTGCGCCTGGCGGATGATATTTTGACCATGTCCCAGGTTAAAAATGAACCAAAGACCTGGAAGAAAGTTAACTTGTACGCTTACGTGGAACAGCAATTTCACATGTTACAAAACAATTTACAAGAAATGCAGTTGACGGTGGAAAATAAAATTCCGGAAACGGCCATGGAAACCGTGGTAGAAAACGACCTTTTCCAAATCACTAAGAATTTGATTACTAACGCGATTAGTTACAATCGCCATGGTGGAAAGATTAAGGTCGAATACGCTTCGCACCACGATAGTTGGGAATTGTCAGTTAGTGATACCGGAATCGGAATTCCGTTAGATCAGTCTGAACGAGTTTTCGAGCGCTTTTACCGGGTTAACAATGCGGTGAAGGGCGGAACCGGCCTGGGGTTAGCCATTGTTAAGGAAGCCGTCGTGGATATGGGCGGTAGCGTTCGGATTGAATCGGACGATGACGATAGTGGAACCACCGTCGTAGTTCGGTTTAAGCGCCGGGTTTAAAATAATAATTTACACAATTAAGGTGTCGGAAAATTCCGACGCCTTTTTTTGTTGACTTTGACGATGTAAAAGTAAGTTTTTGCTCATGGGGATGTGGATAACTTAGCTAATCTTGGCGTTAGTTTCGACATCTTTACATAATCTTTACATTACCCATATGGAACCTTTACCTAGCTTTCATAAGCTAAATATGTAAGTAAGGAACAGGAAAAACGGGAGGTTCGCTAATGAATAAATGGCTTAAGTTGCTGCTTAGTTGCGGATTAATTTTGGGAATTGGGTTACTTGCGGGTTGCCAGAATAAAGACGCCACCCAAAAAGTAACCATCGTCGGTTCGACTGCGTTGCAGCCCTTGGTGGAAAAAGCGGCGGCAGATTATCAGGTAACTCACCCGCAAGCACAGATCACCGTGCAGGGTGGCGGATCGGGTACCGGACTTGGTCAAGTTCAACAAGGAGCGGTACAAATCGGAAACTCTGATGTATATGCTGGGCAACAAGATGGGATTCGAGCTAGTCAATTAAAGGATCACCAAGTGGCGGTAGTCGGCATTGCACCCGTGGTCAATAAAGACGTGGGAATTAAGAATTTGTCCATGACCGAGTTACAAAAAATTTTCACGGGAAAAATCACCAATTGGAAACAGGTGGGCGGCCCGGATGAAAAAATTGTGATAATCAATCGGGCCCAAGGCAGCGGAATCCGGAAAACGTTTGAACAAACGGTTTTACCGCATGGTGGCGCAGTAAATGCTCAGGAACAGGATGCTAACGGAACGGTGCAAAAGGTGGTGCAGGCAACTCCCGGGGCAATCAGTTATCTGTCCTTTTCATATTTCAATAAGCAGTTACAGCCAATCGCGATCGACGGAGTACAACCCACCGCGGAAAACGTGCAAACTAACCGGTGGAAAATTTGGTCGTATGAGCACATGTACACCCAGCTGAAAACTAACTCAGCAACCCGAGACTTCCTTAAGTACATGACGTCCCAGACGGTACAAAAAAATTTAGTGAGTGATTTAGGATACATTTCCATTCATGATATGCAAGTGAAACGGACCATGGACGGAAAAGTGATTCCGATCAGGGGGAGCAAAATGATTGATGAAATTCAAAAGGAATTAACCCAAAAGTCACAAGCCGCGCGGCAAGATCAATTGGGCAAATTAATCGCCCGGATTTGTGTGGGAGTAATTATGCTAGTAGTTCTAGCAATCTTATTCATGATCACTTCCAAAGGCTTAGCAACTTTTTCAGAAAACAAAATCAGTGTAGGCGATTTTTTCACCAAAACAATCTGGAATCCGACTGCTAAACCGACCCCGTTAGTGGGTGCATTACCGATGATTGTCGGTTCTTTTGCAGTAACCCTGGGCTCGGCACTTTTGGCAGCGCCTTTGGCAATGGCAACGGCCATCTTCATGGTGGAAATTGCAAACAAACGACGTCGGGGCCTTCTTCAAGCGGTAATTGAGTTACTAGTGGGAATCCCATCGGTAGTTTACGGGTTCGTCGGCTTAACGGTGGTGGTCCCCGCTCTCCGTAGTATTTTCGGTGGAACCGGTTTTGGAATCTTAGCTGGCGCCCTGGTGTTATTGGTAATGATTTTGCCAACCGTAACCGCAATGTACGTGGATAGTTTACAAGCAGTTCCCCGTCACTATCGGGAAGCTTCCTTAGCGTTAGGGGCAACCCGTTGGCAGACAATTTCTAAAGTAGTGGTGCGTGCTTCCTTACCCGGGTTGTTAACGGCGATTATTTTTGGGATGGCCCGCGCCTTTGGCGAAGCACTCGCGGTACAAATGGTAATCGGAAACGCAGCGGTTTTGCCAAAAGATGTTTTGACTCCGGCGGCTACGTTGACCAGTGTTTTAACGACTGGAATCGGGAATACAGTGTTGGACACTTTACCAAACAACGCCCTGTGGTCCTTAGCTCTGGTACTGTTGATAATGTCACTATTTTTCAACCTATTAATTCGGATGATTGGCAAAAAGGGGGCGTTTAAATGAAGGCGAAACGAATTGACCGGATTGCAACCGGGGTAATTTACGCAATGGTGGGATTGGTCGTTTTAATCCTAATTGGGTTGCTAGGTTTTATCTTAGCGACCGGATTACCACACGTATCGTGGCGATTTCTGACATCTTCGGCGGCCGCCTTTAGTGCAGGAGGCGGCATTGGGGATCAATTGTTTAACTCATTTTATTTATTGGTGCTAACCCTGATACTATCCTTACCGATTGCGTTAGGAGCAGCAATTTATTTAAACGAGTATGCGCCCCAAAATAAAATTACCGAAATTATGCGAATCATGATTGAAGTGTTGAGTTCGTTGCCTTCGGTAGTGGTCGGGTTGTTTGGCTTCTTACTTTTCGTGGTGCAGTTTCAACTAGGATTTTCCATTCTTTCAGGTGCAATTGCCCTAACGCTATTCAATTTACCACTGTTAACCCGTAGCATTGAAAATGCCTTGGCAGGGGTGCCTGATTTACAACGAGAAGCAGGTTTAGCGTTGGGGATTTCCCGGTGGCACACGATTACCAAGGTAATTCTACCAGCTGCCTTACCCGGGATTTTAACCGGAGTAATTCTGAGTGCGGGACGGGTGTTCGGGGAAGCCGCTGCACTAATTTTTACCGCGGGACAAAGCGCACCAAGTTTAAATTACGCCGATTGGAACCCGCTTAGCAGCACTAGTCCACTGAATATTTTCCGGCCGGCGGAAACCCTTGCCGTCCACATTTGGAAGATTAACACGGAGGGAATCATGCCCGATGCTAGCCAGGTATCTGCAGGAGCTTCTGCAGTTTTGATTATCGTAATTTTAATATTTAATTTCAGCGCTCGGCGCTTAGGTAACTGGGTATACCGGCGAATTACTGCGAGCCGATAGGGGGATGAATGCAATGCAAACCAACGTTAATGAAAGTTCAATCCTAAGGTTTCCAACTAACCGTGAAATTGCACTGGAAACTCACGATTTACAGGTATTCTATGGGGAAAAGCAAGCCCTTTTTGATGCCTCGCTACAGTTCCCCCGGTATTCAATTACAGCGTTAATTGGTGCCTCGGGATCGGGAAAGTCGACCTACTTACGCAGCTTGAACCGGATGAACGATGGCATTGCGCGAGTAACCGGTAGCATTACGTACCGGGGGTTAGATATTAATACGAATAACGTTGATATTTACCAAATGCGGCGCCGGATCGGGATGGTTTTTCAACGTCCCAACCCGTTTGCTAAGTCAATCGAACGTAACATCACCTTTCCATTACGCGAGCATGGGATAAGGGATTCCGCGCAACTAGCTGAAGTGACCGAGACGAGTTTACGACAAGCTGCCCTGTGGGATGAAGTGCATGACCGCTTAAATGCAAGTGCCTTAGCACTCTCGGGCGGACAACAACAGCGCTTGTGCATTGCCCGGGCGTTGGCGATGAATCCCGACATTCTACTGTTAGATGAGCCGGCCAGCGCGCTAGATCCGGTGTCGACCGCTAAGATTGAAACCACGCTGCGAGAATTAAAAAAGCGGTATACGATCATCATCGTTACGCATAGCATGGAGCAGGCGTCACGATTAAGCGATTATACGGCGTTCATGCATTTAGGGAAGATTGTAGAATTTGATACAACCAAGAATATTTTTACCAATCCCCGTGAAAAATTGACGGAAGACTATATTTCAGGAAACTTTGGTTAAAGGAGAAGGGTAATGAGTAATAACGTGGTAACTGCAGAAGACGTGCGCTTATCTTATGGGAAAACGGAGGCTTTACACGGAATTAACCTTAACTTGCCAAAAAACCAAATTACGGCGTTAATTGGTCCGTCGGGAAGTGGCAAATCAACCTTTTTACGTTGTTTGAACCGGATGAACGATTTAATTCCAGAAGTGCGGGTGACCGGAACGATTCGGGTTGCGGGGCAGGACATTTACGATGCTCAAACTGACGAAGCGGATTTAAGACGGCGGGTCGGTATGGTTTTCCAACAACCCAACCCCTTTCCATTTTCGGTTTATGACAACGTCACCTACGGGCTCCGCCTTGCGGGAATCACTGACCCCCAAGTTTTAGCGGAACGGGTGGAGACGAGTCTGAAACAGGCCGCGGTTTGGCAAGAAACTAAAGATCATTTAAAAAGCAACGCCCTTTCTTTTTCGGGCGGGCAGCAGCAGCGGATCTGCATTGCCCGGGTGTTAGCGGTTCAACCGGAAATTATTCTTTTAGATGAACCAACTAGTGCGCTAGACCCGATTTCGGCGGGGAAGGTGGAAGAAAGTTTGGTGGCTTTGAAAGAAAATTACACATTAGCGGTAGTGACCCACAATATGCAACAGGCCTCTCGAATTTCGGATCAGACGGCGTTCTTTTTAAACGGGCAGTTAGTGGAAGCGGGGCCAACTGCTAAACTATTTTTAAATCCGGATCAGACGGCAACGAGTGATTACTTGAACGGTAAATTTGGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP050079|435881:443555|439301_441089_+|WP_166481340.1|DBSCAN-SWA MNKWLKLLLSCGLILGIGLLAGCQNKDATQKVTIVGSTALQPLVEKAAADYQVTHPQAQITVQGGGSGTGLGQVQQGAVQIGNSDVYAGQQDGIRASQLKDHQVAVVGIAPVVNKDVGIKNLSMTELQKIFTGKITNWKQVGGPDEKIVIINRAQGSGIRKTFEQTVLPHGGAVNAQEQDANGTVQKVVQATPGAISYLSFSYFNKQLQPIAIDGVQPTAENVQTNRWKIWSYEHMYTQLKTNSATRDFLKYMTSQTVQKNLVSDLGYISIHDMQVKRTMDGKVIPIRGSKMIDEIQKELTQKSQAARQDQLGKLIARICVGVIMLVVLAILFMITSKGLATFSENKISVGDFFTKTIWNPTAKPTPLVGALPMIVGSFAVTLGSALLAAPLAMATAIFMVEIANKRRRGLLQAVIELLVGIPSVVYGFVGLTVVVPALRSIFGGTGFGILAGALVLLVMILPTVTAMYVDSLQAVPRHYREASLALGATRWQTISKVVVRASLPGLLTAIIFGMARAFGEALAVQMVIGNAAVLPKDVLTPAATLTSVLTTGIGNTVLDTLPNNALWSLALVLLIMSLFFNLLIRMIGKKGAFK >NZ_CP050079|435881:443555|441085_441973_+|WP_008841839.1|DBSCAN-SWA MKAKRIDRIATGVIYAMVGLVVLILIGLLGFILATGLPHVSWRFLTSSAAAFSAGGGIGDQLFNSFYLLVLTLILSLPIALGAAIYLNEYAPQNKITEIMRIMIEVLSSLPSVVVGLFGFLLFVVQFQLGFSILSGAIALTLFNLPLLTRSIENALAGVPDLQREAGLALGISRWHTITKVILPAALPGILTGVILSAGRVFGEAAALIFTAGQSAPSLNYADWNPLSSTSPLNIFRPAETLAVHIWKINTEGIMPDASQVSAGASAVLIIVILIFNFSARRLGNWVYRRITASR >NZ_CP050079|435881:443555|437685_439074_+|WP_005916145.1|DBSCAN-SWA MSSSQKKGIRKTIQFGLASLIGNAFMAFLVYKLIVKENPRVTRVDMTLMIAVILLITVIEVIVFWSNQKNIIERQHQFRINLEETIKGNKVPKIYLDPDDPFYKLSKAVNEISKHERHQIHELTNQQNELKAIMDNLPVGVLVINRHRELQVANTYAINRLGITALDIPHPYTLDVRNQELRNLVDQVFQSRQSVTKTLELEDGGQSYIFETNVVYSPKVHHKFEIIVLLYDVTESVRSKRIEQDFVNNASHELRTPITSIAGFAETLLEGAKDDPETLDNFLNIIKSESDKLVRLADDILTMSQVKNEPKTWKKVNLYAYVEQQFHMLQNNLQEMQLTVENKIPETAMETVVENDLFQITKNLITNAISYNRHGGKIKVEYASHHDSWELSVSDTGIGIPLDQSERVFERFYRVNNAVKGGTGLGLAIVKEAVVDMGGSVRIESDDDDSGTTVVVRFKRRV >NZ_CP050079|435881:443555|441977_442784_+|WP_008841838.1|DBSCAN-SWA MNAMQTNVNESSILRFPTNREIALETHDLQVFYGEKQALFDASLQFPRYSITALIGASGSGKSTYLRSLNRMNDGIARVTGSITYRGLDINTNNVDIYQMRRRIGMVFQRPNPFAKSIERNITFPLREHGIRDSAQLAEVTETSLRQAALWDEVHDRLNASALALSGGQQQRLCIARALAMNPDILLLDEPASALDPVSTAKIETTLRELKKRYTIIIVTHSMEQASRLSDYTAFMHLGKIVEFDTTKNIFTNPREKLTEDYISGNFG >NZ_CP050079|435881:443555|437009_437714_+|WP_024862566.1|DBSCAN-SWA MAMTILVVDDEPAIVTLLTYNLKQANYQVISVDNGVDAVKEVQRGKVDFVIMDLMLPQLDGVEATKQIRKFNEQIPIIMLTAKSSEVDKILGLELGADDYLTKPFSPQELISRIKAILRRTNRVVDLKEIVPELPATGITIDFKRLTVQKNGQPVALTPNEFRLLKFLFQNSNQVLSRDQILEQVWGYEYGGQTRIVDMHISHLRDKLEDDPKHPRLIKTIRGFGYEFFTKEGH >NZ_CP050079|435881:443555|435881_436997_+|WP_141782997.1|DBSCAN-SWA MELTDAKHQIEDMQKEVADFGRSLDLDALNESISVNEAKMAEPDFWNDQEKAQKIINETNVLKAKYDNYKNLTDHVENLEVTLELLEMEADPDVQAEFEDELSQTAKLLRDYRLGLLLNGKYDANNAILEIHPGAGGTESQDWGSMLLRMYTRWAEQHQFKVQIEDYQAGEVAGISSVTIRVMGHNAYGYLRSEKGVHRLVRLSPFDSAGRRHTSFASVDVMPELDDSVEVNINPDDLRVDVYRSSGAGGQHINKTSSAVRITHLPTGIVVASQAERSQLQNRVTAMNMLKAKLFELEEQKKAEEKAKLEGTQLEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNLETANVQGVMDGDLDDFINAYLQWKLQKRNPK >NZ_CP050079|435881:443555|442796_443555_+|WP_008841837.1|DBSCAN-SWA MSNNVVTAEDVRLSYGKTEALHGINLNLPKNQITALIGPSGSGKSTFLRCLNRMNDLIPEVRVTGTIRVAGQDIYDAQTDEADLRRRVGMVFQQPNPFPFSVYDNVTYGLRLAGITDPQVLAERVETSLKQAAVWQETKDHLKSNALSFSGGQQQRICIARVLAVQPEIILLDEPTSALDPISAGKVEESLVALKENYTLAVVTHNMQQASRISDQTAFFLNGQLVEAGPTAKLFLNPDQTATSDYLNGKFG |
7 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
627825 : 694109
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP050079|627825:694109|DBSCAN-SWA TATGGCTTACAATCATAAAGAAATTGAACCTAAGTGGCAACGCTATTGGCAAAAACACGAGACTTTTAAAACGGTTGAAAGTGAACAAAAGCCGAAGTACTATGCTTTAGATATGTTCCCATACCCATCTGGGCAAGGACTGCACGTGGGCCATCCTGAAGGCTATACTGCTACAGATATTATGTCCCGGATGAAGCGGATGCAAGGATACAAGGTATTACATCCAATGGGGTGGGATGCCTTTGGATTACCTGCCGAACAATACGCAATGAAGACGGGGAACAACCCGAAGGACTTTACTGCGCACAATATTAAGAACTTTAAACGTCAAATCCAGTCCCTAGGTTTTTCATACGATTGGTCACGGGAAGTTAACACGACCGATCCCGAATATTACAAGTGGACCCAATGGATTTTTGAACAACTCTACAAAAAAGGGTTGGCTTACGAAAAAGAAACGTTGGTTAACTGGGCGCCCGACTTAATGGGTGGTACGGTTGTGGCTAACGAAGAAGTGGTGAACGGAAAGACTGAACGCGGTGGGTTCCCAGTTTACCGGAAGCCAATGAAACAATGGATCTTAAAAATCACTGCTTACGCAGACCGGTTGATCGATGACTTAGATTTAGTAGATTGGCCTGACAGCATTAAGGAAATGCAAAAGAATTGGATTGGTCGTTCGATTGGGGCCAGCGTCTTCTTTGATGTGGAAGACAGTGACCAAAAGATCGAAATCTTTACCACCCGTGCTGACACTTTGTATGGGGCAACGTACTTAGTTATTTCGCCAGAACACCCGCTAGTTGACCAATTGACCACCCTTGAAAGCAAGGCAGCGGTTGAAGAATACAAGCAAGCGGTCGCGACTAAGTCAGACTTGGAACGGACCGATTTGAATAAGGACAAGACCGGAGTCTTCACTGGTAGTTACGCAGTTAACCCCGTTAACGGCAAGAAAATTCCAATTTGGATTGCGGATTACGTATTGGCTTCGTACGGTACCGGAGCGGTGATGGCGGTTCCAGCTCATGATCCTCGTGATTACGAATTCGCTAGAAAGTTCAAGATTGACATTGTGCCAGTTATCGGCGGCGGTAACCTTGATGAAGAAGCTTATACCGGCGATGGCCCACACATTAATTCTGGTTTCTTAGATGGTTTAAACAAGCAAGAAGCTATTGATAAAATGTTGGATTGGTTAGAAGAACACGGAGCTGGTCATAAAAAGGTTAACTACCGGTTGCGCGACTGGGTCTTCTCTCGCCAACGCTACTGGGGCGAACCAATTCCGGTAATTCATTGGGAAGACGGCGAAACTACGCTGGTTCCTGAAGATGAACTTCCGTTACGGTTACCTGCTACGGACAATATCAAACCTTCTGGTACGGGTGAAAGTCCACTCGCTAACTTAGAGGATTGGTTGAACGTGGTTGACGAAAATGGACGGAAAGGCCGGCGGGAAACCAACACCATGCCACAATGGGCAGGCAGTTCCTGGTACTTCTTACGCTACGTGGATCCTAAGAACCAAAACAAGATTGCCGACGAAGATCTGCTCAAGGAATGGTTACCGGTAGACTTGTACGTTGGTGGTGCAGAACACGCGGTGCTTCACTTGCTATACGCTCGGTTCTGGCACAAGGTTCTTTATGATCTTGGAGTAGTGCCAACTAAGGAACCGTTCCAAAAACTAGTCAACCAAGGGATGATCTTGGGAAGCAACCATGAAAAAATGTCTAAGTCCAAAGGTAACGTGGTTAACCCGGACGACATCGTAGAACGGTTTGGCGCAGATACTCTCCGGCTCTACGAAATGTTCATGGGTCCGTTGACCGAATCCGTGGCTTGGAGTGAAGAAGGCTTGAATGGTAGTCGGAAGTGGATCGAGCGGGTTTGGCGGCTAATGATTGACGACAATAATCATTTGCGAGACCGGATCACGATGATTAACGACCACAAGTTAGACTTGATTTACAACCAAACGGTTAAGAAGGTTACGGAAGACTACGAAAACATGCGCTTTAACACTGCCATTTCGCAAATGATGGTCTTTGTTAACGAAGCGTACAAGGCGGACGCATTACCAATGGTATACATGGAAGGCCTTGTGAAGTTACTCTCGCCAATCGTTCCACACGTTGCCGAAGAAATTTGGCAAATCATGGGTCATGAAGAAACCATCACTTACGAAGCATGGCCAACTTATGATGAAAGTAAGTTAGTGCAGGACACCGTGCAAGTGATTCTACAAGTTAACGGAAAAGTACGGAGTAAGGTAGAGGTTGAAAAGGACCTTGACCAAGCTGAATTAGAAAAAATTGCTTTAGCGGATGAACGCATCCAACAATGGACTGCGGAAAAAGACATCAAAAAGGTGATCGTCATCCCGAATAAGATCGTTAACATCGTTGCAAAATAAAGTTTAGTGTGAAACGAAGCTATATTCGCGACGTAGTTAAAAACTAAATTAGGGGTTAGAATTCAGGGTGGATTCTAACCCCTTTTTAGTTGAAAAGTCTTTTTAAAAAGTCTGGCGATTAAAGAAAAACTAGTTTTCAAATCTATGATCGATTTGGATTCCTATTCAAAAGGTAATTGTCTTTGAAATTTAATTGTCGGGGGTCGCTAAGTGTATTAAAATAATGTAGATTGACTAGTGAAAGTAGGTTTTAAAATGGATAAACCATCTGAATTTGATACCGCGGAATCACAATACTTAGGCTCGCAACCGTTAAGGGAGAATAGTGGTAATTCTTCTTCCAAAGCTAAGATGCTGGAAGGGTCGGCTTGGATGACAGCGGGCAGTATTTTTTCGCGAATTTTAGGTGCGATTTATATTATCCCGTGGGTAATTTGGTTTGGAGTTTATAGTGATCAAGCAAACGCCCTGTATACCAAGGGCTATAATATCTATAGCTTCTTTTTGATCGCGGCAATTGCCGGAATCCCATCCGCAATTTCCAAACAGGTCGCCCACTATAACGCCATTAACGAGTTTGCGTTAGGTCAGCGTTTGTATAAGCGGGGGTTACTACTATCGGTAGGAACGGGGGTTGTTTGTGCGGCAATTTTGTTCTTTGGAGCACCCTTTTTAAACGACGGGGATCCAAACGTAACTACCGTGCTCCACGCCTTAGCTTGGGCCGTTTTGGTAATTCCCACGATGAGTTTGACCCGGGGATTTTTCCAAGGATATCAAGAAATGGGGCCGTCGGCGGTTTCTCAATTTATTGAGCAACTAGCGCGGGTGGCCTATATGTTGGTAACTGCGTACTTAATTATGTACAAAAACCATGGTGACTGGGTTTACGGAGTGGCCCAATCCACGTTTGCCGCCTTTATTGGTGCCTTAGGCGGTTTGCTGGTGTTGATTGGGTACTTTGTTAAGTATCGCAGGCGGCTAAGGTATTTATCCCAACATAGTGTGAACGGCCTGGCGATATCGACAACTAGTTTATACAAAGAAATTATCGCGCAAGCAGTTCCGTTTATTATTATTGGTTCAGCAATCACAATTTTTCAGTTGATTGACCAATATACTTTCTTTCGGATTATGCGGTCGGTCAGTGATTATTCGGCCACCGTTTTAAATAACATGTTTGCGATTTTTGCCTTTAACGCTAACAAATTAGTAATGATTGTAATTTCGTTGGCATCTGCACTAGCGGTTACGTCAGTGCCGATTTTATCGGAAGCCAAGACCCGGGGGGACCGGGCGGAAATTAGCCGACAAGTGGCGGACTCAATTTTACTATTTGCCTTTTTGATGATTCCGTCCGCCTTAGGGATGGCAGCAGTTGCCCAACCGGCCTACACTTTGTTTTACCATCTCAGCGACGTGGGTACCGCAATTTTGCAGTTCAACTCCTACGTGGCAATCGTCTTGGGATTGTTTACGGTAATTTCTGCCGTGATGCAAGGGATTGGCGAAAACGTCCTAGCTGTGAAGTATTTTGTGGTGGGGATGATCGTTAAATTTATTTTCCAATTTCCGATGGTAGCCATTTTCTCGGCAGTGGGTTCGCTAATTTCGACCGCAATTGGATTTGCCGTAGTTAACTGGTTAATCTTACGCCATATTAACCGTGAATACGGGTTAGATTATGATAAGATCAATGGCTTTATCGGGAAAATTATTACTTATTCTTTTGGGACCTTTTTCATTGCGTTTGTAGTGACCAACGGGTTGTATCTAGTGATGAATCCGGCTAATAAGGTTCAAGCACTGATCGTGATTTTAGTGGCTGCTACGTTAGGCGGGCTCTTTTACGTAGTTTGTGTCCTTAAAAGTCGCTTAGCTGATGAAATTATCGGCGGACGTGCTGCGGGCTTACGAAGAATGCTTAAAATTAAGTAGGGGGGATCCTGTGCGAGTTGATAAGTTTTTGCACGATATGAATGTAGGTACTCGAAGTCAGATTCGGAAATTAATTAAGGAAAAGGCCGTTTTTGTTAATGACGTGGTGGCTAAATCTGGACGGGTGAAGGTTGACCCCGTGGTTGACCAAGTTCGTTTGGGAGAACAGGTGATTACTTATCAGCAGTACTTCTACTTTATGATGAATAAACCCCTTGGCGTGGTAACCGCTACGGAAGACCGCAAGCAAAAGACGGTGATGGATTTATTTAATAAAGTTGATTTTCGGAAGGATCTCTTCCCAGTAGGCCGCCTTGATAAGGATACCGAAGGGTTATTATTGATTACCAACAACGGCCCCTTAGCCCACCAACTGTTAGCGCCCGAACGGCACGTTCAAAAGACGTACGAAGCCGTGGTGACCGGCCAAATTACCGATCCGGCAGTTAAGCAGTTTGCCGACGGAATTGTTTTGAAAGACGGTACCCAATTAAAGCCGGCCGACTTGACCATCCTGAATTATTCCGCGCTGGATGAACAAACCCTCGTTCACGTGACCTTGAAGGAAGGTAAGTATCATCAGGTGCGGCGGATGTTTGGCAGTCTTGGCGAACGGGTTGTCAGCCTAAAACGAATTAGTTTT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74 | Lactobacillus_phage(76.32%) | integrase,head,tRNA,terminase,holin,capsid,portal,protease,tail | attL 626882:626898|attR 684279:684295 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
917698 : 924883
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP050079|917698:924883|DBSCAN-SWA CCTAGTCATGTTTGTGACGATCCCAAAAAATCTGAGTCATCGCAATTTTTAATTTTTGCTTCTCATCCTCGGTTAAATCATCTCCTCCATAAGTGAATGTCCCATCGTTGTCTTCAAGAAATCTCTTTAAATCGGTAGTGTCCTTTTCGTTTGCCCATTTAGGGGTGCTGTTTCTACCCAATAAGTAGTCTATTGTTACATTAAAATACTTAGATAGTTTTACCAAAGCTTCGTTATCAGGTTGGCGTGTATCATTTTCATAACCGGATATAGATACCTTTGATACGCCTAATATTCTACCTAACTCTTCTTGAGTCATCTTTTTTTCTTTTCGCAATTCTCTAATTCGTTGGCCTAATGGCATTTTAAGCACCTCACTTCATTTAAATTTTAATACGTTAACCTAAAGTTAACAACAAAAGTTAACAAATTAGGAATTTTCACTTGACATTTAACTTTAGGTTAACTATTATAATTAACGTAAGGTTAATTTAGGAGGTGATTCAATGATTTTATATAACTTGAAAAAAGCACGAGAACAAGCTGGTTTAACTATGGACGATATGGGCAATGCTTTAGGAATAAGTAAAGTTGCGTATTGGAAAATCGAACATGGTAAAACTAAACTCAGTTATAAAAATGCTGTTATTATTTCCGAAAAAGTTAACAAACCTGCAGAAGATATTTTTTTACAAGATGAGTTAATAAATAAGGAACTTAAGGGGGTGACAGCATGACTGAACAAAACAAGCCACTAATTGAAATTAAAACGTATTTTGACGATTTGAAAGAAATTAAAGAGCTGCTACCGCAAATAGCAACTCTTCAACAGAAGTATGAAGTTAGATTAAACATCAACTTACGTCCATAGAATCAATCAAATCATGGAGGTGGCAACAAAAATGGACAAAAACAAAGGTATCTCATTAAAAATCACTCGTCCCGAAAAGAATGCCGATGTTAAAGAATCTTGGGGATACGAAGTTAGAATTAATGGCCACAAAATCGAACAAGGTATTAACGCTATTTCGTTGGATATGGTTGCAAATAAGAAACCAGTTTTGACAATCAAGTGTTGGCCGGATGCAATTGAAGCTGATTTACAGGCACTAGTTAAATTAATGGACATCTCTGAAAAAAATAAAGTTCCTGATGTGCCACAAGATAAGTTAGTGAAAATTATTTCAGAATTTAAAAAAGTTGAGGATGAATTTGCGCTTCGCCCTCAACAACTTCATGAAATATTGAATTACATTACTAGATCAGTTTAATAACGTAATATCGTATTTTCCCCAGCTTGTATCAATTTTTATAGGTATGTCTTTAGCAGCAAACCATGAAATTACATCTCCTTCTGAGGGAGTATCTTCAACTACTAATTTAACGGGAAAAGATTTCTGATTGTTTTTAAGTGCTTCGTGATAAGCACTAACTAAGTTTTTCTCGAATTGCTCATTCATTAATAATCACCACCTTTCAGTGGTAATTATACGCTATCAAGTTTTCAAAGAACGTAGGAGGTGAAGACATGACGATCACGAAAGCAAAACAATTACACAGTCAGCTAGGAATGCAACAATGCTATGAATTGTGTAATGACTGGCTCGATGAACAAGATATTTTATTTGCAATCAAAAATAAAATCATCCATGAATTAACATTTCAAGCTATATGCAAGGATGTCATTCCAGCATGGGCTGTGAAACAAAAAATTAACTCAATGCCTACAGCTATGATTGGCTAATCAATCTTTTTTACACTTTTAATAATACCGTGGGATTACGTGTATTAAAATCCCACGATGTACACAAATAGGAGGTGATTCAAGTTGGTAATAGAGGACGTGATGGACGAGTTAGACAAATGTTTAATCCGTAATAGATTAACCCGAACTCAATTCGCAAATGCATTACACGTGTCCAAGCAGGCCGTATCGAACTGGTTCTCCGGTGATAATCACGTGATACCGCTAGACAAATTAATTAGCATTGCTGATTTGTTAAAGGATGAAAGATTTAAATTTGTCGTTGCTGATTATGTACTGGACACGCGATTGCTTGCTAAAAACGAATATGCTTCCGATCCATTATCACAATTTATGAGGGTAAATAAAGAGGAGGAAGAACGGAGACTACTTAATGAACAGGTACAAGTGATTTTAGCTAAACCAGTTACTTATTGGAACGACGAGGAACGAAGCTTCTTGATTAAATTTAGAAAAGAATTCTCTGAAGAGCGACAGGCGGAAAATGATTTCGCAATTGCGCTAGATGAGGCATTGGAGGTGATCTAATTGGCAGTAATCCAGTTTGAAGGAATTGACGAAAAAGTAGCTGATCGGGTAGTTGAATTAATCATTCCAAAAATAGAAGAACGACTGAGCCAAACGACTAAGCCTGACCAGTTACTTACACAAGAACAGGTAATGAAAAAGCTACACGTCGGTTTTGAGCTTTTTAAAAGAGATTACTATCCCACTATGCCACATATTGGGCATGGTAAGGGAATTCGGTACTCGGAAAAAGCTGTTGATAAATGGATTCAAGAAAATCAGAAGACGTTAATGGAGGAATAATATGAATTTTTTAGCTTATTTGGGACTTATATTTATCGGCGCAGTAGTCGACAGGGTAGTTATTTTTATGGATGACCCAAAAGACGATATTGAATATATCGAAGAAAAAAAGAAAGGGAATCGTTATGTTACGAAAAGAAATTAAGGCAATAAAAAAATCCCGCACGGCCATGCGAGATTCAAGAGCTATAAATATTATCTATGCTTTTATCTTACCACCGAAAGAAGGTGCCGTAAATGTTTCCATCTAAGCAGTTTGATAATTGGTTACAGAACACAACAGTTGATAATTATTACAACGGAATTGCGTTAAGGGAATTAACAGATGAAGAGATCCAAGACAAAGCTTATGCCAAGTTAGAAAAAATGGATTCAGTCGATATGGCTGAAATGTTTGAAGATTTAATTTATGACAACAAAATTCCGGCGCAGTTAATTGCTTACATTTTTGGAATCGATACGGAGGTAGGAACTAATGAGTAATGAACTAATGAATAAGACGGTAACCTATGCAGTTAATGGGGAGGACGTTAATTTATCGGGAAACATGGTTAAGAGTTATTTAACCAGTGGTAACGGAGCGGTTACTGATCAAGAGGTAACAATGTTTATCCAGCTATGCCGGTACCAACACTTAAACCCGTTTCTAAATGAAGCATACCTAGTTAAATTCGGTAACAACCCTGCTCAAATTATTACTTCGAAAGAAGCGTTTATGAAGCGTGCTGAAGCTAATGAGAATTATGACGGTATGAAAGCCGGTTGTATTGTCGAACGGGACGGCGATATTAAATATACCAACGGGGCATTCATATTAAAGGCAGATAAGATTCTCGGTGCTTGGGCAGAAGTATATCGCAAAGACCGAAGCCAGCCTGTCCACATCGAGATTTCGATGGAAGAGTTTAGCAAATCTCAAGCAACTTGGAAAAGCATGCCGGCAACAATGATTCGTAAGACCGCAATTGTTAATGCTTTGCGTGAAGCATTCCCACAAGACTTAGGAGCCTTATATACGGAAGATGATAAGAACCCCCATGAAAATAAGGTGGAGGATAAACCTAAGCAACCAGTAGTTAACGCAACAGAAGTAGCGGACACTTTGGCTAAGAAGTTTGCTAAGCAGGAAGATATTAAGCCTGCCGAAGGTGTAATCGAAACTAATGAGGAGGAATCAAATAATGCAAGCAACCATGGAGAAACAACAGAACCCGTTAATGACGTTGAGGAACCAACAGCCACTGCCGAAGTTGAACAGGGAAAATTACTATGATTTAGCAACTGAAAGCTACATGTCATTTTCGTTGTACAAACGGTTTAAGAAATGTGAAGCCGAAGCCATGGCTTACCTTAATGGAGAAATACCTAAGATTGAAGAAACTAATGCGGCCTTGTTAATGGGTAACTACCTCCATACTTATTTCGAATCAGGGGAAGCACACGCTTCTTTTATTGAAGAAAATCAAAAGGAATTAATTAGTAGCCGGGGTAAGAGTAAAGGATCGCTTAAGAGCAATTACGTTTTAGCGGACAAGATGATTAAAGCGCTTAATCAACAGGAGTTATTTAAAGGCGTCTATCAAGGCAAAAAAGAAGTGATCCTAACTGGCGAATTGTTTGGTATGAGCTGGAAAGTTCGCATTGATTGCTTACATGTCCCCGGAGATGAATCAGACGTAGCTTACTTTTGCGATTTAAAAACATCTAAGAACCTACATGCTAAGTTCTGGAACAATGATCTACATGAATGGCAACCATTTGTAACTGCCTATAACTATGATTTACAGATGGCGGTTTATCAAGAGATTATCCGACAAAACTATGGAATGACGTTTGCACCATTTATTTTTGGGGTTTCAAAAGAAGATGTGCCTGAAGTAGTGGGGATTGAATTTAAGCAGGTGGAATTAGACGAACCGCTATCCGCATTAGAAGCTGATATGCCACACATTATTAGGCTACTAAATGGCGAAGAGGAACCCCTTAGCTGTGGTAGATGTGATTATTGCAAAGCTCATAACCAATTAATTGGGTTCGTAGACATCGACTCGCTACTGGATTAGGAGGTGATGGCTTGAATTACATCAAACAGCTTAACGCATTCTATGATCAGCTCGAACTAAACCCGTTAAATTCATCTGAAATTGCTTTATGGCACGCATTGATGCGCATAAACAATAAAACAGCATGGTCAACGACGTTTACGGTGGCTTCATCAACGTTGTGTAAATACGCTGGAATGAAAGATACAAGCAAATCATCAACATTCTACAATGCGAGAAATGGATTACAGCAAAAGGGCTACATCAAGTGGAAATCACGTAAAGGGAACCAAGCCGCTTTATACCAATTAAAAGATTTGACTACATTATTTGTAGACAACTATGTAGACAGTACTGTAGACAGTTCTGTAGGCAATACTGTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP050079|917698:924883|920747_921545_+|WP_008840860.1|DBSCAN-SWA MSNELMNKTVTYAVNGEDVNLSGNMVKSYLTSGNGAVTDQEVTMFIQLCRYQHLNPFLNEAYLVKFGNNPAQIITSKEAFMKRAEANENYDGMKAGCIVERDGDIKYTNGAFILKADKILGAWAEVYRKDRSQPVHIEISMEEFSKSQATWKSMPATMIRKTAIVNALREAFPQDLGALYTEDDKNPHENKVEDKPKQPVVNATEVADTLAKKFAKQEDIKPAEGVIETNEEESNNASNHGETTEPVNDVEEPTATAEVEQGKLL >NZ_CP050079|917698:924883|919225_919441_+|WP_036685013.1|DBSCAN-SWA MTITKAKQLHSQLGMQQCYELCNDWLDEQDILFAIKNKIIHELTFQAICKDVIPAWAVKQKINSMPTAMIG >NZ_CP050079|917698:924883|918959_919157_-|WP_166481435.1|DBSCAN-SWA MNEQFEKNLVSAYHEALKNNQKSFPVKLVVEDTPSEGDVISWFAAKDIPIKIDTSWGKYDITLLN >NZ_CP050079|917698:924883|924406_924883_+|WP_008840867.1|DBSCAN-SWA MINRAVLIGRLTRDPELKYTTNGVAVASFNLAVNRQFTNQDGEREADFINCVMWRKAAEIFCDYTHKGSLVGIDGRIQTRSYENQQGQRVYVTEVVADNFSFLESKSQSNQNNGSYVPQDNGFGQNNGPTTPNNTNPNDPFSGKQGQSIDITDEDLPF >NZ_CP050079|917698:924883|923504_923912_+|WP_036685016.1|DBSCAN-SWA MVKMNDQDKKIIKEALKQGFTFDEAMEFIEKMREAHYTQISYNSERGKGLMIGDDEDVLVGLLALSSKLLQRTDDFEMKLKIITTYEKWVTQKTGELLEKNSVIVSSADELDELNIPEPVKEELRQILNEKFNGK >NZ_CP050079|917698:924883|918203_918434_+|WP_008840854.1|DBSCAN-SWA MILYNLKKAREQAGLTMDDMGNALGISKVAYWKIEHGKTKLSYKNAVIISEKVNKPAEDIFLQDELINKELKGVTA >NZ_CP050079|917698:924883|920273_920417_+|WP_158002712.1|DBSCAN-SWA MNFLAYLGLIFIGAVVDRVVIFMDDPKDDIEYIEEKKKGNRYVTKRN >NZ_CP050079|917698:924883|923926_924163_+|WP_144235476.1|DBSCAN-SWA MNVKKIDLFNSDLFGSKEASLMWGKQQDYVRTIWNKYPERFPAGTIRKFGHQLIVTREGMEAVTKREAKYTFDEIMKG >NZ_CP050079|917698:924883|924177_924414_+|WP_052017553.1|DBSCAN-SWA MKLIQRIGKMNNGYKSGYQDGQKEALLELGRKLRAMSEPLFQKLMKEQKFSDSDDIRLEVLNEIADWEKEMLEAVIDD >NZ_CP050079|917698:924883|918599_918968_+|WP_036685008.1|DBSCAN-SWA MDKNKGISLKITRPEKNADVKESWGYEVRINGHKIEQGINAISLDMVANKKPVLTIKCWPDAIEADLQALVKLMDISEKNKVPDVPQDKLVKIISEFKKVEDEFALRPQQLHEILNYITRSV >NZ_CP050079|917698:924883|920509_920755_+|WP_008840859.1|DBSCAN-SWA MFPSKQFDNWLQNTTVDNYYNGIALRELTDEEIQDKAYAKLEKMDSVDMAEMFEDLIYDNKIPAQLIAYIFGIDTEVGTNE >NZ_CP050079|917698:924883|918430_918568_+|WP_008840855.1|DBSCAN-SWA MTEQNKPLIEIKTYFDDLKEIKELLPQIATLQQKYEVRLNINLRP >NZ_CP050079|917698:924883|919543_919990_+|WP_036685090.1|DBSCAN-SWA MDELDKCLIRNRLTRTQFANALHVSKQAVSNWFSGDNHVIPLDKLISIADLLKDERFKFVVADYVLDTRLLAKNEYASDPLSQFMRVNKEEEERRLLNEQVQVILAKPVTYWNDEERSFLIKFRKEFSEERQAENDFAIALDEALEVI >NZ_CP050079|917698:924883|922346_922811_+|WP_008840862.1|DBSCAN-SWA MNYIKQLNAFYDQLELNPLNSSEIALWHALMRINNKTAWSTTFTVASSTLCKYAGMKDTSKSSTFYNARNGLQQKGYIKWKSRKGNQAALYQLKDLTTLFVDNYVDSTVDSSVGNTVGNPVALNKQNKTKQNNINSITGAPPKPNVYIPLTKLT >NZ_CP050079|917698:924883|922837_923521_+|WP_008840863.1|DBSCAN-SWA MLKMFGYFTSLVKDGLLFKPQFKLTDHEKHVLAKHQGGLMEIRITDPRQISSDQRAKIYAMFGDIDRWQEYRDPDYVKHICKSQYCYENAVDWFSLSDCSMERANSFIKFLIDFCLKWDIPWSMRTMDMIDGDYWLCYYGLVHRQCCICRNPADIAHITAVGRTNRNKIDHRGKYVMPLCRTHHQEQHTIGISTFMKKYHIKGVKIDDKLARILNLGNWRTQNGENE >NZ_CP050079|917698:924883|919990_920272_+|WP_008840858.1|DBSCAN-SWA MAVIQFEGIDEKVADRVVELIIPKIEERLSQTTKPDQLLTQEQVMKKLHVGFELFKRDYYPTMPHIGHGKGIRYSEKAVDKWIQENQKTLMEE >NZ_CP050079|917698:924883|921453_922335_+|WP_052017552.1|DBSCAN-SWA MQATMEKQQNPLMTLRNQQPLPKLNRENYYDLATESYMSFSLYKRFKKCEAEAMAYLNGEIPKIEETNAALLMGNYLHTYFESGEAHASFIEENQKELISSRGKSKGSLKSNYVLADKMIKALNQQELFKGVYQGKKEVILTGELFGMSWKVRIDCLHVPGDESDVAYFCDLKTSKNLHAKFWNNDLHEWQPFVTAYNYDLQMAVYQEIIRQNYGMTFAPFIFGVSKEDVPEVVGIEFKQVELDEPLSALEADMPHIIRLLNGEEEPLSCGRCDYCKAHNQLIGFVDIDSLLD >NZ_CP050079|917698:924883|917698_918061_-|WP_008840853.1|DBSCAN-SWA MPLGQRIRELRKEKKMTQEELGRILGVSKVSISGYENDTRQPDNEALVKLSKYFNVTIDYLLGRNSTPKWANEKDTTDLKRFLEDNDGTFTYGGDDLTEDEKQKLKIAMTQIFWDRHKHD |
18 | Lactobacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1091996 : 1100557
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP050079|1091996:1100557|DBSCAN-SWA CTTATTTAATCAATTTTCGTTGTTTTAGAACTTCGCATAGGCTAACAAAATATAATTCATGCTCGACTTGGTGAATTCTTTGCGCTAATTTTGCCACATCATCATTGGGCAAAATAGGAACCGCCCGCTGCGCAATGATGGGGCCAGTATCAATTCCATCGTCAATCCAGTGCACGGTGACCCCGGTAACTTTTACACCGTATGCCAAAGCGTCTTCAATGCCGTGTCGTCCCGGAAAGGCAGGCAACAATGCGGGATGAATATTAATAATGGCCTGCGGGTAGGCTTCTAGTAGCACTTCCGTAATAATTTTCATGTAACCGGCTAATACAATTAGTTTTAAATCGTATTTTTGCAACTCGAGCAGAATTGCTTGTTCGTAAGCCGTTTTGTCGGCAAATTCGCCCAAACGGTGGGTCCAAACTGGAATCCCCAATCTGACCGCTTTTTCAACTACTGGTGCATCTGGTTGATCACAGACTAAACATGCAATGCGAATTGGTACGTTAGTTTCTTCGATGTGACGGGCAAGTGCAACAAAATTGGTGCCGGTCCCCGACGCAAATATTGCGATCTTAATCATTAATCAGCTCCTAAAAGTACGACGGCTGGTGCATTTTCTGGGCGCCTCTTCACTTGGCCAATCTTAAAATACGGTTCTTTTTGGCGGTCGAGTTCGTCCCTTACTTGCTGATATTGCTGAGGACTCACGGTTAACACCATGCCAATTCCCATATTGAAAGTTTGGTAACGGTCGGTTTGTGAAAGTTTTCCAAGCTTAGTGAGAACCTTAAAAATCGCTGGTTTAGGCCAACTAACCAATTTTATTTCAGCCTGTTGGTTAGGTTGTAACATCCGCGGTACGTTTTCTAGTAGTCCGCCACCCGTAATGTGGGCGATCCCGTTTAATAACCTTTTTTGTAATAGAGGTCGGATCGCGTTGCCGTATAACCGGGTCGGTTCCAAAAGTTCTTCGATTAATGGACGGGCAATCCCTGGCAAATAGTCGTCAAATTGGTAATGGTGATCCGTAAAGAGGATTTTACGCACCAATGAGTAACCGTTACTGTGTAATCCAGTCGAAGGTAAACCAATCAAATAATCCCCTTCACTTACCATGGCTGAACTGAGGAGATCTCTTTTAGCACCTAAACCAACCGCAAAGCCGGCTAAATCAAAATGCTGGTCTTGATAAAGTCCTGGCATCTCGGCCGTCTCTCCGCCTAATAACGGGATGGATTGGGCCTGGCAAGCTTTCAAAATCCCTTTTAAAATTGCATCTGTTTGGTCGCTTTCTAAATGTGAAAACGCCAAATAATCTAAAAAGAATAGCGGTAATGCGCCCTGTGCCAACAAATCGTTAACGCACATTGCTACCAAATCTTGCCCTAACGATTCGACTTTTCCAGTTTGGGCAGCTAACAGCACTTTAGTTCCCACTCCGTCAGCCCCCGCCACTAAAACTGGATCGTCTAATTGATCTTCGGAAAGTTGGTAACATCCGGCAAAATTGCCAATCCCATTTAGAATGTGGGGACCTTGTTCACCAATTGCTTGCTTTAAGCCTTCAATAATTTCTTCGCCCGCAGCAATGTTTACTCCCGCTTGTTCATAAGCATTTTTGGTCATTATTATTTCTCCTTTGCGACTCCCGTTGACGATAACGTAGTGTCTTTTGCGGTTTTAGGAACTTCAAAACCGGCCGCGTAATCGTAAAGCGGCGTAGGATATTTTCCATCAAAGTACGCTACGCAAAGTCCATCATTAGGGACATCTTGGTGCAAACCGATGGCTTCAATCAAACCGGGCAAGCTCAAAAAGTGCAACGAGTCCGCCCCGATTGCAACGCGCATTTCCTTTACCGTGAGGTTTGCCGCCATTAATTCACGAGTATGTTCGATATCAATTCCGTAAAAGCAAGGGTATTTCAACGGTGGTGAACTGATCATCAAATGCACCGCTTTAGCCCCCGCTTTTTTCAACATTTTTACAATGTACTTGCTGGTGGTCCCCCGAACAAGCGAGTCGTCAACGAGGGCTACCTTTTTCCCCGCAACTACCGCGGATAACACTGTCAACTTCATCTCAACCCCCTGTTCACGTAACTTAGGGGTGGGTTGAATAAACGTGCGGCTGCTGTACTGATTTTTAATCAGGCCCATTTCATTTGGGACTCCCAACTGCTCCGCCACTCCTGCCGCTGCTGATAGCGAGGAATTGGGTACCCCAACGACAATGTCCACATCTAACGGATTTTCTTGGGCTAATCGCTTACCCATTCGTTGTCGCGCGAGATGGACATTCACCCCGTAAAGGTTCGAATCTGGACGGGCGAAATAAATAAATTCCATCGAACAAATTGCTAGCTGAGTCTCGGTCGTAAAATGGCTAATTTTAACTCCCTGGTCGTCAATTTGGACTAGTTCGCCAGGTTCTACGTCCCGAACAAACTCGGCACCCACCGCCGTTAACGCACAAGTTTCACTTGCGATCACGAATGCGCCATTAGCTAATTGTCCAATCACCAAAGGTCGGAAACCATTGGGGTCCAGTGCTGCGTATAAAGCATTTTCCGTAAGAATTAGGTACGCGAACCCACCCTTAATTTGTCGCAAACTAGCCTTTAATTTTTCACTAAAACTCGCCTGCTTTTGGTGCTGAATTAGGTGCATTAGAACTTCGGTATCCGAATTGGATTGAAAAATTGCGCCCTGCTCTTCTAACTGGTGGCGCAGCGTAATTGCATTTGTCAAATTACCATTATGGGCCATCGCCACGTCCCCTTGTAGATAGTGAAAAAGCAGCGGCTGCACATTTTCAACCCCGCGGCTTCCAGCCGTACCATAACGGACATGGCCAATTGCACTGCGCCCAATTAAGTTCGTTAAGTCATCCGGGTTACTGAATACGTCCGCTAAAAGACCTAGGCCTTTGTGGATGGCAAATTTTCCCGTGGGAGTACGGGTTACGATGCCCGCCCCCTCTTGTCCGCGATGCTGTAAGCTGTGTAATCCGATATACGTTCGTTGAGCTGCATCAGAATCTTGCCAAACTCCAAAAATACCGCATTCTTCGTTGAGTCCCTTTAATTCAGTTGCCATGCGAGTGCTTCCTTCCAACTAGTTTCGGCCGCCGTTAAATCAACGTCCAACATGTCATCAGTGGTTAAGATTTTAAGCCGATCACCCCTACATGCCCTAATGGCGTTGCTTTGCCAGCAGTTTTAGCTTCAAAATGCGCCCGGTTTGCTGGCGTAACGGTTACGAGGAATCGCGATTGGTTTTCAGCAAATAATTCGGCGGCCGCTAAGTCAGTTTGCACGTTAAACCCGATTTTTCCTGCGAAGGCACTTTCTGCGAGGGCGATCGCTAATCCACCTTCTGCCAAATCGTGCGCACTAGCCAAAAGTCCTTCATGAATTAGGTCGCTTACTAAGCGTTGTTGGTCAATTTCGTATTGCAAATCAAAGTCGAACAGTTTACCTTCCACGTGGCCTAATTGCATTTTTTGGAGTTCACTACCGTTTAAGGCATCCGTAGTTTCGCCTAAAACATAAATCAAATCACCCGTTTGTTTAAAATCTAAGGTGGTTATCCAAGCTGGATCTTCAATTATTCCGACCATGCCCACCATGGGCGTAGGGTAAATTGATTGCCGATTAAATTCGTTGTACAGTGAAACGTTGCCCGAAATCACGGGAGTATCAAAAACATCGCAGGCTGCGGCCATTCCATTAATGGCTTGGGCTAATTCGTAGTAACATTCTGGATCTTCTGGGCTCCCAAAATTCAGACAATCGGTAATTGCTAAAGGCTTTCCTCCCGTTGCCACCACGTTGCGGGCGGCTTCGCTAACGGCAATTTGTCCTCCAAGGTAAGGATCCAAGTATAAGTAACGGGGATTCGCGTCGGTAGTCATTGCGAGTGCTTTTTGGGTCCCGCGGATTCGAACTACTGCAGCGTCACTTTGAACGGTTGAAATCGTGTTAGTTTGTACTTGTGCATCGTAGCGTTCAAAGATTGCTTCTTTATTAGCAATCGTGGCTTGACGCAACATGGCATTAAAGGTTGCCGTCAAATCCTTAACTTGCGGTTGAAATTGCTTTCCATCGCCCTTGACACGTTGCGGTTTTTGGCTTGGTCGATGATAAGTCGGTGCTTCATCAACTAACGCATGAATTGGGACATCGGCTACGGTGGTCCCTTTAAAAATCAGTTGATATCGCTGGTCTTCGGTGACCTCCCCAATTTTTACAGCGATACTGTCATATTTTGCAAAAATTTCCTCTACTTCACGTTCGTGCCCCTGCTTAACGCAGAGCAACATCCGTTCTTGGGATTCAGAAAGCATTAATTCGTAGGGAATCATGTCTGTTTCCCGTTGAGGAACCAAGTCAAGATCCAAGCGCATCCCAAATCCCGCTTTGGCCCCCATTTCCGCTGATGAGGAAACTAAGCCCGCCGCCCCCATATCTTGAATCCCTACCAACCATTCGGCATGGTTATTAATTAATTCTAAGCAAGCTTCCATTAACTGTTTTTCGGCAAACGGATCCCCAACCTGGACCGCCGACCGTTGTGTAGCCTGTGCATCATTAAACTCAGTAGAAGCAAAAATAGCGCCTTGAATCCCATCTCGGCCAGTTTTAGCGCCCACATAATAGATTGAATTGCCGACCCCTGCGGCAGCTCCCCGCTGTTGGTCAGCAACGTTCAACAAGCCCACGCACATGGCGTTCATCACCGGGTTATTCTGGTAAATCGCATCAAAAGTCGTTTCTCCACCAACCGTAGGAATCCCCATGCAATTACCGTAGTCGCCAATTCCCGCTACGGTTTGGTCCACTAAGTATTTTGTCCGGGCGTCAGTCAATTCACCAAAATGCAGACTGTCCATTAACGCGATTGGTCGGGCGCCCATGGAAAAAATATCTCGAATAATGCCGCCCACGCCGGTTGCCGCACCTTGATAAGGTTCCACTGCCGTAGGATGATTATGAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP050079|1091996:1100557|1092577_1093624_-|WP_008840997.1|DBSCAN-SWA MTKNAYEQAGVNIAAGEEIIEGLKQAIGEQGPHILNGIGNFAGCYQLSEDQLDDPVLVAGADGVGTKVLLAAQTGKVESLGQDLVAMCVNDLLAQGALPLFFLDYLAFSHLESDQTDAILKGILKACQAQSIPLLGGETAEMPGLYQDQHFDLAGFAVGLGAKRDLLSSAMVSEGDYLIGLPSTGLHSNGYSLVRKILFTDHHYQFDDYLPGIARPLIEELLEPTRLYGNAIRPLLQKRLLNGIAHITGGGLLENVPRMLQPNQQAEIKLVSWPKPAIFKVLTKLGKLSQTDRYQTFNMGIGMVLTVSPQQYQQVRDELDRQKEPYFKIGQVKRRPENAPAVVLLGAD >NZ_CP050079|1091996:1100557|1093626_1095096_-|WP_166481451.1|DBSCAN-SWA MATELKGLNEECGIFGVWQDSDAAQRTYIGLHSLQHRGQEGAGIVTRTPTGKFAIHKGLGLLADVFSNPDDLTNLIGRSAIGHVRYGTAGSRGVENVQPLLFHYLQGDVAMAHNGNLTNAITLRHQLEEQGAIFQSNSDTEVLMHLIQHQKQASFSEKLKASLRQIKGGFAYLILTENALYAALDPNGFRPLVIGQLANGAFVIASETCALTAVGAEFVRDVEPGELVQIDDQGVKISHFTTETQLAICSMEFIYFARPDSNLYGVNVHLARQRMGKRLAQENPLDVDIVVGVPNSSLSAAAGVAEQLGVPNEMGLIKNQYSSRTFIQPTPKLREQGVEMKLTVLSAVVAGKKVALVDDSLVRGTTSKYIVKMLKKAGAKAVHLMISSPPLKYPCFYGIDIEHTRELMAANLTVKEMRVAIGADSLHFLSLPGLIEAIGLHQDVPNDGLCVAYFDGKYPTPLYDYAAGFEVPKTAKDTTLSSTGVAKEK >NZ_CP050079|1091996:1100557|1091996_1092578_-|WP_008840996.1|DBSCAN-SWA MIKIAIFASGTGTNFVALARHIEETNVPIRIACLVCDQPDAPVVEKAVRLGIPVWTHRLGEFADKTAYEQAILLELQKYDLKLIVLAGYMKIITEVLLEAYPQAIINIHPALLPAFPGRHGIEDALAYGVKVTGVTVHWIDDGIDTGPIIAQRAVPILPNDDVAKLAQRIHQVEHELYFVSLCEVLKQRKLIK >NZ_CP050079|1091996:1100557|1100074_1100557_-|WP_008841004.1|DBSCAN-SWA MKKVAVVMGSISDWPTMKETAAMLDKFEVAYERHVISAHRMPSELQKFGKQAQKDGYGVIIAGAGGAAHLPGMLAANTILPVVGVPIESHALHGLDSLLSIVQMPSGVPVATTAIGQAGAKNAALLAIEILAVTESRLAKKMIEFRQKQTQEAQNSEKQW >NZ_CP050079|1091996:1100557|1098218_1098953_-|WP_008841002.1|DBSCAN-SWA MKKTTLIKEGKAKRLYNTDEADVVWVEYLDQATALNGKRKDQVIGKGALNNQIDCILFKMLDAKGIHTDFIKKISDTEQLNYKVDVIPLEVVVRNAAAGSFQRKFAVPYLREFDQPIVEFFYKSDKLDDPFINTNQAVALKIISYAEGEILENLALQINRLLKERFRQAHLQLVDFKVEFGKTANGKIMLADEISPDSCRLVDLTTKTSLDKDVFRKKTGDLVTVYQEVLRRLINSQEEAHVQS >NZ_CP050079|1091996:1100557|1097971_1098232_-|WP_008841001.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTYKESILDPQGAAIKKALHHLNYQEVQKVTVGKYFEIQVADGGQNVNEQIQKMCDELLANVNMETYRFEIQDVQEGEK >NZ_CP050079|1091996:1100557|1098930_1100091_-|WP_008841003.1|DBSCAN-SWA MKSSGEAGVYLPPATIGIIGGGQLGQMIALAAKAMGYKVGILDPTPNCPAGQVSDFQIVAAYNDQQALLKMAERSDVLTYEFENVDLVSLEAAQKLAALPQGTNLLYVTSDRLREKHFLASHDLPITPYQPVSNPTELNDAITKLGYPCILKSCEGGYDGHGQQDINSEADLPAGRSLVSQTPCILEKRQKFSKELSVMVTRSRDGQVRCFPVAENIHHNHILHQSIVPARVTEEVQQKAQKIARQIAQGLCLRGVLGIEFFMLADDRLLVNELAPRPHNSGHYSIEACNISQFEAHVRSICGLEIPKITQHAPAVMVNLLGQHLTLARQKLAQRPHWHFHDYGKAGSRVNRKMGHITLLGELQPSLDSIQAEKIWEISNEENDVN >NZ_CP050079|1091996:1100557|1095160_1097284_-|WP_166481452.1|DBSCAN-SWA MMTELTPTKIKDQKLYVQWGLSEDEFNQIRNTLGRLPNFTETGLFAAMWSEHCAYKNSKPLLKQFPTTGQQILQGPGEGAGIVDIGDGQAVVFKAESHNHPTAVEPYQGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALMDSLHFGELTDARTKYLVDQTVAGIGDYGNCMGIPTVGGETTFDAIYQNNPVMNAMCVGLLNVADQQRGAAAGVGNSIYYVGAKTGRDGIQGAIFASTEFNDAQATQRSAVQVGDPFAEKQLMEACLELINNHAEWLVGIQDMGAAGLVSSSAEMGAKAGFGMRLDLDLVPQRETDMIPYELMLSESQERMLLCVKQGHEREVEEIFAKYDSIAVKIGEVTEDQRYQLIFKGTTVADVPIHALVDEAPTYHRPSQKPQRVKGDGKQFQPQVKDLTATFNAMLRQATIANKEAIFERYDAQVQTNTISTVQSDAAVVRIRGTQKALAMTTDANPRYLYLDPYLGGQIAVSEAARNVVATGGKPLAITDCLNFGSPEDPECYYELAQAINGMAAACDVFDTPVISGNVSLYNEFNRQSIYPTPMVGMVGIIEDPAWITTLDFKQTGDLIYVLGETTDALNGSELQKMQLGHVEGKLFDFDLQYEIDQQRLVSDLIHEGLLASAHDLAEGGLAIALAESAFAGKIGFNVQTDLAAAELFAENQSRFLVTVTPANRAHFEAKTAGKATPLGHVGVIGLKS |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1334304 : 1343091
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP050079|1334304:1343091|DBSCAN-SWA GCTATTCAATCGTCGCCCCTAACGCATTTTTAAAATGGGACAACGCCCATTCTTGACCGTGTTCGGTAAACGTTGCGACCGTCGTTGGGTCAATAATTAACTGGTAACCCAGGTCATAGGCATCAACTGCCGTATGCAAGACACAAATATCCGTACAAACCCCTGCTAATCGCAAAGTATCTACGTGACGTTCACGTAAACGAATGTCTAAATCTGTGCCCGCAAAGGAACTATAACGAGTTTTAGCAAACTGCCGGACCCGCGGATTATCCTGATTCAATTCGTACCAGTCCTTTAATTGGCCATACAATTCCCGTCCCCAGGATCCTTCTAAATTATGCGCATCAAATAATTTGGTTTCGGGATGGTAGGGATCCTTTTCAACATGTAGATCCGTTGGTAGCATTACCCAACCACCTTCGCGAAGTTCCCGATTAGCGGCTTTAATCAAGGCTGGTTCAATTGCTTGGCCCACCTTGCCAGTCGTTAACGCTCCGTTCGTAGCAACAAAATCATTTGTATAATCAATAATCAGTAAAGCTTCGTTTGCCCCCATTTTAATTCCTCGCTTCCTGGTTTTGCACCTGCTTATTCTACGTTAATTCCACAACGTTGGTAAATCGCGTCAACGTTCTTCAAGTGGTAGCGATAGTTAAAAATTGATTTAACTTCTTCATCACTTAACGTCGTCTTTATTTTACTATCTTTAAGCAGTAAGTCCATAAAATGCTGCCCAGTATTCCAAACTTCCATGGCAATTGGTTGAACAGTGTCGTAAGCTTCTTCCCGAGTCCAACCTTTATCGATGAGCTTCAACATGACTTGTTGTGAGAAAATCAACCCGTGGGTCATTTCCAAATCCTTTTTAATTTCGTCTTCGTTAATGACCAGGTTATTTAAAATCCGGTTCATCCGGTTTAATACATAGTCCACCAAGGAAGTCGCGTCCGGTAAAATTACCCGTTCTGCCGAAGAATGCGAAATATCACGTTCGTGCCACAAATTCATGTTTTCAAAGGCCGTAACCATCTCGCCACGCACCACCCGACTTAAACCAGAAACATTTTCTGAGCCGATCGGATTACGTTTATGAGGCATTGCGGAAGAACCCTTTTGACCCTTGGCAAAGCCTTCCCGCATTTCGTTAACTTCGGTACGTTGTAAATGCCGAATTTCAGTTGCCATTTCTTCAATTTGGGAAGCAATCAGTGCTAGCACGCTTAAGTATTCGGCGTGTAAATCCCGTGGCAAAATCTGGGTGGAAATTTCTTGGTGCCGGATTCCCAACATTTCGCAAACCCACTCTTCAATTTGAGGAGTGATATTAGCAAACGTTCCTACTGCACCGCTGATTTTACCCACTTCAATGTGTTGGCGAGCCTGCTTGAAGCGTTCAATATTGCGGTTGATTTCGGAATACCAGCGTAGGAATTTCAAACCGATCGTAGTTGGTTCCGCGTGAATCCCGTGGGTCCGCCCTACCGTAATCAGGTCTTTATACTTGATTGCCATTTCCTTCAAAGTTGCTTGGAGCTTTTCTAAATCAGCTGCGATGATTTTGTTAGCTGCTTTAATCCGCAACGATTGTGCAGTGTCAACCACGTCGGTACTGGTCAAACCGTAATGGATCCATTTCCGTTCTTCACCTAAAGATTCGGAAACCGCCCTTGTAAAGGCAATCACGTCATGGTGAGTCTGACTTTCAATTTCATCAATTCGGTCAATATCAAAACGCGCATTCTTCTCAATTAGTGCTAGGTCTTCATCCGGAACTTTTCCGACCTTATTCCAAGCTTTGACTACCGCAATTTCAACTTCTAGCCAACTGTCAAACTGCGCTTGCCGGTTCCATATTTTTTGCATTTCAGGTCGTGTATAACGATCAATCATTTAGATTACCCCTCGTCCTAAAAAAATTATTTACTAACCTATTTTATCAAACTCTCCCTAATTAATAAACGCGAACTATCAAATGCTTAACCCTTCCAATAATTCGGGTCGACTCATTTAAATTTACCCTATTTTATGTTATTATCAGGAAGTTGTGTATTGATAAAAATGGAGGAATGAAGATGACAGCTACAGTAGTAATCGGCAGCCAGTGGGGCGACGAAGGAAAGGGTAAGATCATTGATTTTTTGGGACAAAACGCTGATGTTACCGTTCGTTACTCTGGTGGAGATAACGCAGGTCATTCCTTGGTCGTTAACGATCAAAAGCTTGCCTTGCGACTAATCCCATCCGGAATTTTGGCACCTAATTCAATTTGCATTATTGGCAACGGAACCGTGGTTAACCCACGCACCCTATTAGACGAAATTAAAGAATTAAATCAAGCCGGCGTAAACACCGACCACTTAAGAATTTCTGACCGGGCACACATCATTTTCCCTTACCACATCTTGCAAGATCAACAACAAGAACGGGATCGCTCTAAAAACGGCGAAAAAATTGGTACTACCAATAAGGGCATTGGTCCGGCATACATGGATAAGATGCAACGGATCGGGATCCGGGCCGTCGACTTGCTTGACGCTGAAGGATTAAAAGAAAAGATTGCCTTCAACCTAGCTCAAAAGCAACGGGTTTTAGATGACGATCTTTGGGAACAATTACCAAGCGTGGATGAACTTACAAAGCAATACGCTGAATACGGACAAATCCTAAAAGATTACATCACCGATACCAGTTACTTAATCAACACTAAATTGCACGAACAAAAACGGGTTCTTTTTGAAGGCGCCCAAGGAACCATGCTTGATATTGACCATGGTACCTACCCATTCGTTACCTCCTCAAATCCGACGGCTGGTGGTGCTGCTACCGGCTCTGGAATTGGGGTAACTAAAATCAAGCACGTCATTGGCGTATGTAAGGCATACGTTTCTCGAGTTGGTGAAGGTCCTTTCCCAACCGAACAAATTAACGAAATTGGTGATCGCATTCGCGAAGTTGCTCACGAATACGGTACCGTTACCCACCGTCCGCGGCGGATTGGTTGGTTTGACGGGGTTTTGATGAAGTACGTTGCCGACGTCAACGGCTTGACTGACTTAGTCGTCAACTGTCTCGATGTCTTGTCCGGCTTCGACGAAGTGAAAATTTGTACCGGTTACCAAACCGATCACGGAGTAATTAATTATTACCCAGCTTCTGAAAAGGAACTCGAAAACTTAACCCCAATTTACGAAACTTTACCAGGTTGGCAAGAAGATTTAACCCAAATGCAGTCTTACGATGAATTACCTGCCAACGCGAAAAATTATCTTAAGAAGATCGAAGAAATTACTGGCGTACAAGTTAGTGCCTTTTCAATCGGTCCTGACCGTGAACAAACCGTAGTAGTAAATGATATGTGGGATTAAGCTTTATTAACCACCATAAATAGTAAAAATAAACCATGTAAAAAGGCCCTGTAACACCCGACCAGGATGTTGCAAGGCCTTTTTTAATTTAAAAAATAGTCGGTACTAGTCCGCCGTCAATTCTCAAAGCTTCTCCAGAAAATGATGACGAATCCGGACTAGCCACAAAGGTTACGAACCGTCCAATTTCTGCAGGACGAATAAGACGCTGAATTTGTGATCTAGAGCGGTGGTTCTTCATGAAGTCTGCTTCCCATTGTTCTTCAGGAATTCCGCTATCCTGATACATTTCGGTAAGCATCTTTTGAACACCTTCCGTAAGGGTTGAACCCGGCATCACCGTATTTACCGTTACGTGAGTACCCACGGTCAGGTTCGATAGGCTCTTTGCCAAAGATAAGTTCATGGTCTTTGTCATGCTATACTGGGGCATTTCTCCCGAAGGCATAACGGCTTCTTCGCTAGCAATAAAAATTACCCGACCAAAGTCTTGTTTTAGCATGTGGGGCATGTAAAATTTAGCTAGTGCATTGCCAGCCAAAACGTTGGTCCGGAAATAACGTTCCCAAGTCTCATCATCAATATTCCAATACTCCATGGTGCCAAAAATCCCCATGTTATTCACTAAAATATCGACTTCGGGAAATTTTTCAAACAACACTTGCCGACTTTTATCATCAGTAATATCGAAAGGCGCTCCCTGCGGATGGGTTTTAGGAAACTGTGTTTTAATTTCATCGACTACCTTCTGCACGTCAGCAGCTCGACGACCATTAATAATTACGTTAGTCCCCTCCCGGGCCATTTCCATCGCAATTGCTTTTCCAATTCCCTTAGTTGAACCAGTTATTAACGCTAATTTACCATCTAAATGTAGTTCCATTTAATTATCCTCGCTTTCCAAATTAAAAATCAAACGTGTCCGGATCGGGACCAACCCGTAAGTTTTCATTTAGCTCATTAATTTTAGCCATCTCGGCGGCGGTTAGTTCAAAGTCAAAGACTTCCGCGTTACTCTTAATTCGGGCGGGCTTGACCGATTTAACTACCAACAAAACGTCCCGTTGGATGTCCCACCGTAAAATAATTTGAGCAACGCTCTTTTGATGGTTTTGCGCAATTTCGATCAAAACAGGATTATTCAAAATTTTTCCCTGCATTAACGGCGACCAAGCTTGAATTTTCAAGTTGTGGGCGGTCGCAAATTCGATCAACTCCGTTTGGCTTAGCTTAGGGTGGGTCTCCACTTGGTTAACCACCGGCATGACTTCCGCAAATTCAGCCAGCTCTTTTAAATGGCTGATTTGGAAATTACTTACCCCAATCGCCTTGATTTTACCGTCGTGATAAAGTTTTTCTAACGCCTTCCAAGAATCCCGGAAAGCGTCTTGACCCGGCCAGTGGATTAAATACAAATCAAGATAATCCAAGTCCAATTTAGCCAAGCTATCTTGAAAAGCCCGGAGCGTTTCATCATAAGAAAGATGGTCATTCCACACCTTAGAAGTGATGAATAAGTCTTCTCGCTTTAGCCCGGTTGCGGCCAAGCCGGCTTTAATCCCGGCTCCGGTCCCCGCTTCATTGTCGTATACTTGGGCGGTGTCAATCAAGCGGTACCCCGCTTTGATTCCTTCGGCAACCACTTGCGCAGTTTGCTCATTAGGAATCTGAAACACTCCCATCCCCAAACCTGGCATGGTCGTGCCGTTGTTTAAAGTTACGCGATCGTCTAAAGATTTAATCATATTAACAATGCTCCTTAATTAAATTAGTAAAGCAATTATAGAAACAAAGTTTCATTTAATCTAGTACCGACTTTATTGTGCTATACTTACCTAAAAGTTACTTTTAATAACTACAGGGGTGCAATTAATGGAGAAAAAAATATACAATATCGGGGTTGAAGCAACGATGGACGTGATTGGCGGAAAATGGAAGCCAATTATCCTGTGCAACCTTCGCCACGGGAAACAACGCCCAAGCGAATTGCGTCGGCAAATTTCTGGCATCAGCCAAAAAATGCTCACTCAAGAATTACGCGAACTAGAACGTGACCACATCGTCAACCGGAAAACTTACAACGTAATTCCTCCCAAGGTAGAGTATTCCCTTAGCGACTATGGACAGACTTTGTCCACTCTGTTAGACCAGTTATGTTCGTGGGGGGAAATGCACGTGCAGACTTTACAGAAAAATGGCGTAGATGTTAAACTAAACTCAACCGGCATCTCTGGCAGAAATTAAAAACACGGAGCTGAATCGTCGTCAGTGCGATCCAGCTCCGTGTTTTTATAAATTTAATTCTTTGAATTACTAGTCAAGAGCTTGTTTAGTTTACCGTCGAGTAAGCCGTTGCTGGACTTTAGCAAGTCCTGTGCTAAACACCGTTAAAATAACGCCCAATAAGAATAGCCCTAGCGCGATCGTAAATTCTCGTACCAATAAATCTTGTCCAGCAGTCTGTACGATTTGCTTAACCACTGGGTACTGAATCGGTAAATTACTCAATACGTTGCTTACGTATCCAATTCCGCAAATAATGGCTACAAATCCGCCGACTACTAGCAAGGTAGAACTGATGGTACTGAGCAGTCGTTTACGTAGCAACGCATATGCCAATGTCAAAACTAGCCCCACGCCACTAACCCAAATTACGGTTTGGTCAATCCGCGATAATTTTTGCACCTGGCCGGCGTATCGGGAAAGTTTCTGGGTATCTAGCTGACTATTAAAAACGGCCACTACTTTGCTAACTACCATTGCGTTAACCATTTGTTGGAAAGCCCCCGTAGCTTGGGTGCTTTGGTTGATTGCGTTAGTAATGATATTTTCGTCAATGTGCACTTGCTGCCCATCGTAAAATTGCTGAACCATCGTTTTTAACTCGTCGTTAACTAGATCATCTGGAATTAGGTTGCTTTGGTTAATCCCCGCTTGCTGTAACTGGGTATCCAACTGTTGATTAATTACTTCGGCAGCACTAGACTTTTCAATTTGCTGCTGTACGTAATTTGCATTAAACACGGTCTGTTTAGCCGAAACCGCGCCAAAGAAGAATAACCCAAATAAAATCATTAACACCCTTGCTACCACAAGGCGTGGCGGTCGAACGGGCACCTCCGTTTGATCAACTTTCTTTTCTGCTAAATGACTTTGCCTGCTCATCCTGGTTTCTTGAATTTTAACCACTTCCCCTTCTCAATCATAATTAAACGTGCGTTTTCAACGCTTTGCATTGGTTAACAGCTTCATCCACTTCTTAGTTTATCATTTCGCCTGTTTTTTCTTCAATGAAAGCAGATGTAATTTATTTTTATTTTTGAAAACTCCTCCGAAAGCTTGCAAAATTGGTATTGCATATCCCCTTTTAGATAAGATATACTTTTAAACAGTGTGTCTCATTAAAATACTTTTTAAGGGAGTTAGATGATGGAATATAGTTTTTTTGCTAAATTAGCTGCTGAATTCTTGGGTACAGCTATTTTAGTCATTTTAGGAAATGGTTCGGTTGCCAACGTGGAACTTAAAGGAACTAAGGGAAACGGTAGTGACTGGCTTGTAATCGCCGTTGGTTACGGTTGTGGAGTCATGGTTCCGGCATTAATGTTTGGAACCGTGTCAGGAGCCCAAATCAACCCCGCATTTACAATTGGGTTAGCCGTCTCCGGAATGTTTAGCTGGTCACAAGTTATCCCATTTATAATTGCTCAAATGCTGGGTGCGATTATTGGTCAACTAGTTGTTTACTGGGCTTACTTACCACATTACGATCAAACCACTGACCCAGAATCAATTTTAGGAACTTTTGGTACCATTGATGCAAGTGATAGCTTATGGAACGGCTTTGTTAACGAGTTTGTTGGTTCGTTCATCCTCTTCTTCGGTGCAACTGCCTTTACGCATGCCCCATATTTCAAGGAAAACATGAGCTCGGTATTTATCGCCCTCGGTTTCCTTGTAGGAACTTTGGTTGCTTCACTTGGTGGTGCAACTGGTCCAGCTTTAAACCCCGCACGGGATTTAGGTCCACGGTTAGTCCACGCTATTTTACCAATTAAACATAAGGGTTCTTCCCAATGGAACTACGCACCAATTCCAGTAATTGCCCCTATTTTAGCGGGAATCTGTGCCGTAGCGTTATACAAAGGGATTTTCTTATAAAAGACTTATACATAAATAGTCCATATAATATTAAAAAGGTGAAGATTGTTATTTTCGTAATGAAAAACAATCTTCACCTTTTTTGGTTTAATTAAAATAAAAAATGCTTTTCAAGGATTAAAAATTCTTGAAAAGCATTTTGATTTGCTTTACTTAGGGGTCAAAGCTGGTTTATTCTGCTTAACCCGAACCTAGCGTAACGCTAAATTTCCGTTAACTTTCCCAAACTCCCCGACTTTCTACACCCGCTCGTTTTAAGCTTATTTAGTTGATTGTCTGAACACCATGTCAAATGGCAAAGTAATGTTCCGTTCTTCAACTTCTTCTTTGTTCATTAACTTAGTCAATAGCCGCATTGCTACCGCCCCAGTGTCGTACATTGGGTGGCCAATTGAACTAATTTGTGGGCGCACCATCTTAGTTAAGTTAGTATTGTTGCTGGTCATGATTTCAAACTCTTCAGGTACTTTTACGTTAAGGTCTTGTAACCCATTTAAAAGTCCAACTGCTAAACGGTCGTTAGCAACGAAAGCAGCCGTGATATCGCTTGAAGCAATTTGCGAAGCTAACTTAATTCCGTCTTCGTAAGTGTTAGTAGTTTCAAATACGAGGCTTTCATCAAAGTCAATGTTTGATTCAGCTAAAGCACGCTTGTATCCTTCGATCCGGAACTTTCCGTTTACCGGTTGTGAAAGTGGTCCAGAAACAAAAGCAACCTTCTTGTTTTTATTTTCAATTAGTTTTCGAACTGATTCGTAAACGGCCGCTTCGTTGTCAATGCTAACGGACGGTAACGCATGCTTGTCATCAACGGAACCCGCAAAAACCACGGGAGTCCGTGCTGACTTCAACGCTTCCCGTAACCGATCGTCGATTGCGTTCCCCATGTAAATAACACCGTCAACTTGCTTGGCAAGCAAGTTTTCAAGTACTTCCACTTTCTTATCGACATCTTCATCAGAATTTTCCAAAATGATATTGTACTTGTACATTGAAGCAATATCGTCAATCCCCCGTGCTAATGCAGCAAAGAACATTTCGGTGATGTCAGGTAAGATAACCCCGATAGTGGTTGATTTTTTACTTGCTAATCCGCGCGCAACCGCATTAGGATGGTAATCTAAGCGTTCGATTACTTCGTTAACCTTCTTACGGGTGTCGGGCTTAACGTTAGGGTTTCCGTTAACTACCCGAGAAACGGTTGCCATGGAAACGCCGGCTTCACGAGCAACGTCGTAAATTGTAATAGTTTGTTTTGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP050079|1334304:1343091|1338573_1339413_-|WP_008842326.1|DBSCAN-SWA MIKSLDDRVTLNNGTTMPGLGMGVFQIPNEQTAQVVAEGIKAGYRLIDTAQVYDNEAGTGAGIKAGLAATGLKREDLFITSKVWNDHLSYDETLRAFQDSLAKLDLDYLDLYLIHWPGQDAFRDSWKALEKLYHDGKIKAIGVSNFQISHLKELAEFAEVMPVVNQVETHPKLSQTELIEFATAHNLKIQAWSPLMQGKILNNPVLIEIAQNHQKSVAQIILRWDIQRDVLLVVKSVKPARIKSNAEVFDFELTAAEMAKINELNENLRVGPDPDTFDF >NZ_CP050079|1334304:1343091|1339540_1339912_+|WP_160185653.1|DBSCAN-SWA MEKKIYNIGVEATMDVIGGKWKPIILCNLRHGKQRPSELRRQISGISQKMLTQELRELERDHIVNRKTYNVIPPKVEYSLSDYGQTLSTLLDQLCSWGEMHVQTLQKNGVDVKLNSTGISGRN >NZ_CP050079|1334304:1343091|1336375_1337668_+|WP_036685871.1|DBSCAN-SWA MTATVVIGSQWGDEGKGKIIDFLGQNADVTVRYSGGDNAGHSLVVNDQKLALRLIPSGILAPNSICIIGNGTVVNPRTLLDEIKELNQAGVNTDHLRISDRAHIIFPYHILQDQQQERDRSKNGEKIGTTNKGIGPAYMDKMQRIGIRAVDLLDAEGLKEKIAFNLAQKQRVLDDDLWEQLPSVDELTKQYAEYGQILKDYITDTSYLINTKLHEQKRVLFEGAQGTMLDIDHGTYPFVTSSNPTAGGAATGSGIGVTKIKHVIGVCKAYVSRVGEGPFPTEQINEIGDRIREVAHEYGTVTHRPRRIGWFDGVLMKYVADVNGLTDLVVNCLDVLSGFDEVKICTGYQTDHGVINYYPASEKELENLTPIYETLPGWQEDLTQMQSYDELPANAKNYLKKIEEITGVQVSAFSIGPDREQTVVVNDMWD >NZ_CP050079|1334304:1343091|1341097_1341829_+|WP_002832045.1|DBSCAN-SWA MEYSFFAKLAAEFLGTAILVILGNGSVANVELKGTKGNGSDWLVIAVGYGCGVMVPALMFGTVSGAQINPAFTIGLAVSGMFSWSQVIPFIIAQMLGAIIGQLVVYWAYLPHYDQTTDPESILGTFGTIDASDSLWNGFVNEFVGSFILFFGATAFTHAPYFKENMSSVFIALGFLVGTLVASLGGATGPALNPARDLGPRLVHAILPIKHKGSSQWNYAPIPVIAPILAGICAVALYKGIFL >NZ_CP050079|1334304:1343091|1334891_1336193_-|WP_024863049.1|DBSCAN-SWA MIDRYTRPEMQKIWNRQAQFDSWLEVEIAVVKAWNKVGKVPDEDLALIEKNARFDIDRIDEIESQTHHDVIAFTRAVSESLGEERKWIHYGLTSTDVVDTAQSLRIKAANKIIAADLEKLQATLKEMAIKYKDLITVGRTHGIHAEPTTIGLKFLRWYSEINRNIERFKQARQHIEVGKISGAVGTFANITPQIEEWVCEMLGIRHQEISTQILPRDLHAEYLSVLALIASQIEEMATEIRHLQRTEVNEMREGFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVSGLSRVVRGEMVTAFENMNLWHERDISHSSAERVILPDATSLVDYVLNRMNRILNNLVINEDEIKKDLEMTHGLIFSQQVMLKLIDKGWTREEAYDTVQPIAMEVWNTGQHFMDLLLKDSKIKTTLSDEEVKSIFNYRYHLKNVDAIYQRCGINVE >NZ_CP050079|1334304:1343091|1340002_1340857_-|WP_056985103.1|DBSCAN-SWA MVKIQETRMSRQSHLAEKKVDQTEVPVRPPRLVVARVLMILFGLFFFGAVSAKQTVFNANYVQQQIEKSSAAEVINQQLDTQLQQAGINQSNLIPDDLVNDELKTMVQQFYDGQQVHIDENIITNAINQSTQATGAFQQMVNAMVVSKVVAVFNSQLDTQKLSRYAGQVQKLSRIDQTVIWVSGVGLVLTLAYALLRKRLLSTISSTLLVVGGFVAIICGIGYVSNVLSNLPIQYPVVKQIVQTAGQDLLVREFTIALGLFLLGVILTVFSTGLAKVQQRLTRR >NZ_CP050079|1334304:1343091|1342089_1343091_-|WP_002832047.1|DBSCAN-SWA MSKQTITIYDVAREAGVSMATVSRVVNGNPNVKPDTRKKVNEVIERLDYHPNAVARGLASKKSTTIGVILPDITEMFFAALARGIDDIASMYKYNIILENSDEDVDKKVEVLENLLAKQVDGVIYMGNAIDDRLREALKSARTPVVFAGSVDDKHALPSVSIDNEAAVYESVRKLIENKNKKVAFVSGPLSQPVNGKFRIEGYKRALAESNIDFDESLVFETTNTYEDGIKLASQIASSDITAAFVANDRLAVGLLNGLQDLNVKVPEEFEIMTSNNTNLTKMVRPQISSIGHPMYDTGAVAMRLLTKLMNKEEVEERNITLPFDMVFRQSTK >NZ_CP050079|1334304:1343091|1334304_1334859_-|WP_002832038.1|DBSCAN-SWA MGANEALLIIDYTNDFVATNGALTTGKVGQAIEPALIKAANRELREGGWVMLPTDLHVEKDPYHPETKLFDAHNLEGSWGRELYGQLKDWYELNQDNPRVRQFAKTRYSSFAGTDLDIRLRERHVDTLRLAGVCTDICVLHTAVDAYDLGYQLIIDPTTVATFTEHGQEWALSHFKNALGATIE >NZ_CP050079|1334304:1343091|1337756_1338551_-|WP_008842327.1|DBSCAN-SWA MELHLDGKLALITGSTKGIGKAIAMEMAREGTNVIINGRRAADVQKVVDEIKTQFPKTHPQGAPFDITDDKSRQVLFEKFPEVDILVNNMGIFGTMEYWNIDDETWERYFRTNVLAGNALAKFYMPHMLKQDFGRVIFIASEEAVMPSGEMPQYSMTKTMNLSLAKSLSNLTVGTHVTVNTVMPGSTLTEGVQKMLTEMYQDSGIPEEQWEADFMKNHRSRSQIQRLIRPAEIGRFVTFVASPDSSSFSGEALRIDGGLVPTIF |
9 | Bacillus_virus(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1482979 : 1522071
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP050079|1482979:1522071|DBSCAN-SWA 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40 | Erysipelothrix_phage(82.61%) | head,terminase,holin,capsid,portal,protease,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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