Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042938 | Mycoplasma bovis strain MJ1 chromosome, complete genome | 2 crisprs | NA | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042938_1 | 244100-244182 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042938_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042938_1
>1.1|244123|37|NZ_CP042938|CRISPRCasFinder GCTTGATGAATCAGGCGAATCGCTTTGAGTTCCAGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042938_1
The CRISPR arrays of NZ_CP042938_1 >merge|NZ_CP042938|1|244100-244182|CRISPRCasFinder TCTGTACGAGATGTGCTTGAAGAGCTTGATGAATCAGGCGAATCGCTTTGAGTTCCAGATTCTGTACGAGATGTGTTTGAAGA >NZ_CP042938|1|1|244100-244182|CRISPRCasFinder TCTGTACGAGATGTGCTTGAAGA GCTTGATGAATCAGGCGAATCGCTTTGAGTTCCAGAT TCTGTACGAGATGTGTTTGAAGA
>NZ_CP042938.1|WP_014829885.1|242408_243395_-|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MNNNNALLFGMPNCIKLAERISKMINIPLSTLTLTKFADGETMPVSDEAVRGKDVYIIASTSRPVNDNLMILYLFIDSLKRASAKSINIALAYYGYARQDRKASGRQPIGAKLVADFLETAGASKIITVDLHNSAIQGFFNIPIDDLKASFTLAKAIKRSHEKFTVVSPDHGGTVRARSLAELISNDIKISIIDKRRTGINQTEVMGLIGDVKDQNAVIIDDIIDTGGTIIKAAETLKQYGAKKIVIAATHGIFSKGFDIFENNPAVEKVIITDSIDNDELLDKYKKLEIVSLDRFLGSVIDCSINGKSISMLYDKFAKEIKENESHK >NZ_CP042938.1|WP_013954638.1|241729_242425_-|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MNHINKEYLLNKYSKQIPLLYRYAQMIYEKNKVMNICGFDSVDEIFNQGILGSILVFENAMNEYNHDFVNKKILDIGAGAGFPSVPLLIALDNKFELVIMESITKRCTFLESVKNEFNLNLTIINARAEEINDYNSYFDYICARAVGSVIKIYLMTNHHLAQNGYFILPKGKNYHAEIDEFKNKFTLEKDNISSFEYEDSINNENSSLVLIKKTKPTPRGWPWKWAKIKNY >NZ_CP042938.1|WP_013456076.1|241157_241487_+|hypothetical-protein MSRTKKLSISYLITYPIAFIVTVVLLVLYGRQLLDFAQQKEGFTGNLALWTVYLLYAVVIVVPFIMLIINILLIFFNVGTIARILLIVGLFVPWCSFVGALIALIRPGK >NZ_CP042938.1|WP_013954636.1|239980_240688_+|hypothetical-protein MNNYSEVAIELQSKLEEAINNIFEITNNEISINVEDVNILQRDNNSINSSTAIGYILEEYLIRKIEQYLSSPDCHFEFSMKPNNKANTSSYDFSLVYKDHLFYINLKANRNVNDAIAAINRLYSDYVEYEGKNPLHYLVFKTNYDIDKSKISNQNKIIIKGTYSFFLEQIDFSKGWKQDHRSWSPGGKLNSGRLIVSKNFFNENQIEISKISYEQTRAYLEEMFNKNFSVAEYEE >NZ_CP042938.1|WP_013954635.1|239013_239988_+|DNA-cytosine-methyltransferase MGKRGIIDLFAGAGGLTLGFTQNNFDILDTIEFWQPAVDTYNFNFKKNVVAKDITDSEVRNELESNWKNKTDLVIGGFPCQGFSLAGRRSKDDERNQLYKYTIDVISRLQPYGFVLENVKGILSFRESDNELVVDKIQKMLAKENYYTKFILLDSSNFGVPQKRERVIFIGCKDKEKVDKVISLLSKHKEKIVTVFDAIGHLEKVTDDKEIPNHIFSKHSEEIKERFMKLKEGESLSKSFSDAFRKLSYDKPSPTVKENHGGVHVHPVLPRVLTPRELANLQSFPEDFIFLGTKSNVLKQIGNAVPVKLSYEIAKIVNKVFFNE >NZ_CP042938.1|WP_075271093.1|238109_238826_+|ribonuclease-HIII MQFLDLDVESSLLENKSIIGVDEVGVGDYFGPLCACAVFIDAQNVNKVAELGIKDSKKLSDKRIKELALKLKNSGLIHYSLAHLNPSGYNKLNKSYNANILKMFVHLKAINSVVFKLKNIKYDYIFIDKYASVDNMLKYYNELVINNNWANFQEINEDILIANKAESYSISVAAASILARDQFLTLVSKMNDEYNTVFPLGAGPKVNAFAKDFFAKHSYDEEVIKKTCKKSFKMNILN >NZ_CP042938.1|WP_013954633.1|237178_238108_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MSTLTNNKKEKFLFAIDLDGTLLSSSRENIVPENCIKAIQRAKDEGHVVCIFTGRPWRSTKPIYDMLGLNTVVSNYNGAQIHNPKDDNFIPHIKYLNLNEMLYILGDQKVKKEISNLAIEGPGWVQLEHRDDDIEAVFGFSSAEKFTVGINLNKVPLSPTGIVFDVKETTDAEELRRYLRARYGDLGEFSYWSKGEGLTPVFDITNVTVNKGRALSLLSRYYGVDLDHTIAFGDGFNDVPMFKVATVSVVLGNAADLVKRHATVRLKKTNKEGGVGDYINKFLDNPEKEIAKSKAMALKMRKVSIQEEE >NZ_CP042938.1|WP_013954632.1|234451_237037_+|DNA-topoisomerase-IV-subunit-A MNKKKEQQLNDLLSKIVRENLDTVVADRFSRYSKYVIQQRALPDVRDGLKPVQRRILYSMYDLGLQHNKPFKKSARVVGDVIGKYHPHGDSSIYDAMVRMGQEWKMGHTLVEMHGNVGSIDDDPAAAMRYTEARLSEIADYVIGDIKKNTVKFAPNFDDSEKEPVVMPVLIPNLLINGSTGIASGFATEMPPHNLNEILDAAIAKIKNPAIELSKLAKIIQGPDFPTGGVIYGTDGIYEAFERGKGRITLASRYNVYSDNKYKYIEITEIPYGVIKSKLVHEIDLIVDSEEVAGLIEVKDQTDRNGINILITLDKNVNENVIVNYLFLKTQMRIYYNYNNVVIDNHTPKTMGISALLDAYLKHVKDVKVKTIEFDLIKHKARLEIVIGFLKVAKITDKVIEVIRKSEDSKQGVIDNLMSAFDFTLNQATAIAELRLYKLSKTDEHTFMFEKQELEEKIKQCELLLTNPDEFNNYLVSLFRDLKHKFGRIRRTSIEIEQINSSVNQEDLVKEEEVFLGISKFGYIKKVSKKTYESNLITTYGIKEDDNILFYDIASSLDKLLLFTNLGNYAYLPVFKVNESKWKEFGIHLSDFVDLSSGEEIVSVIKVSDFDVTNYVCMFTKKGQGKKVLLKDFDVSRFSKTFVAMKLKNDDELISAKLSNGLKDVLLITKNNFASLYSENDVPIYGLKSNGNKACYLANGDELVSFTVVKPNDSVALVSQSNKVRLINVSEISRVSKQNKGVSIFSKGRLNNAIVQCDPLLDETKLLLVNNQGQAHFEKIQNYVKQASTKFINFDADDIRTISLISNYSSTTNDNEFHSYEKESSDENQLMNKAIETKNSIDLSIDEILSKVDELLKKDKK >NZ_CP042938.1|WP_013954631.1|232521_234438_+|DNA-topoisomerase-IV-subunit-B MSNSNYDASSIQQLKGLEAVRKRPGMYIGSTDVNGLHHLIWEIVDNSIDEALAGEANEIAVILKNDGSVVVSDNGRGIPVGKTPSGKSAVELVFTELHAGGKFNEGAYKTSGGLHGVGSSVVNALSNKLKCLVYRDKHVYETIFENGDNIVQKTHIIGSTNKRGTLIQFWPNYEIFKKAKFNFETIAERLRESSFLISNLSIKLLDEQSGKSEEFKYSNGIKAFVEFINDSKTALFNVYSFKTVVNEIEIECGFQYTDGFNETILSFVNNVKTRDGGTHEIGLKSAITKTFNDFALDEKVLKGKNTFDGEDVREGLTVVLSVKIPEKFLEFVSQTKDKLGTPEAKSAVEEAVSKNLKTWITENKQIAKKILDKIKRASDSRESARKARLEARKTKSALKERQILSGKLTPAQTKNVKEKELFLVEGDSAGGSAKSGRDRKFQAILPLRGKVINTEKARLIDILKNEEINTIINAIGAGIGVDFDINKIQYDKVIIMTDADTDGAHIQILLLTFFFRHMRKLIEEGKVYIALPPLFKLSINKGQKKILYAWDEDELKELLQSKMKGAEVQRYKGLGEMNADQLWETTMNPETRTLIQVRIQDAALAERRVSTLMGDNVDSRKEWINKNVNFTMEDDFEI >NZ_CP042938.1|WP_013954630.1|231010_232408_+|CvpA-family-protein MKIIESLENIAFNSWSILIPIILVIFIVILAIVSGLRRGIYGGLIILLFGLSGWIIGIFAAKPLVDVIVIKTKITLPGNKQIDAEILRKMFYGIAMFVIQILFLIVGEIISLLLRKWIKKPLKNMRENKVSSVGSRSLGAVLSTAGIVPCAILTANVTGFLTTNNKVIDANDKMLNYISFKKAEGVSKYTPGLIASAKIGNDLLNASSGSKLDETVIGAFEWYLQQFANPDNYVLLSVSKDGQAKPIISTNALKNINRKEEQEKVLQGLIPFILGDSSVKKNGITLFFNFNTSSAGAFKYDSNSGKIEINTDNSENTQLKVKNIGKISNIFQLYTATPESFRILEYLSKLGLKDAKASEGFDEIYSLVDQTEPVWDILNAAQLKFNMNPSYRIKVYDREYVKRMKDILFDLFEKNTGGKFKYDRKELNEEKMKSWVTIQTIHQKIYWIVSSVIDNVFITPENVSN >NZ_CP042938.1|WP_038582854.1|244939_245707_-|hypothetical-protein MPNKVVITGFKDSLINENIIIKPEPIPPINRENPIMKDAETSTNDESSSSSTSRTDSGTQSDSPASSSSSSTSRTDSGTQSDSPASSSSSSTSRTDSGTQSDSPASSEPEKANSELSNERKIKEKGYRLNELTAYPYDLIDVDDDANKDELAKKLNDVITHKNGAIAIVGGSFFSKCNNLQLTGLSINKSIKSETKSQISTHNKLIGFFEGSDGYGIKVGHHGEANSKKYLFKWRLVKEDGNFGPKVYEQIIDLS >NZ_CP042938.1|WP_013954646.1|246393_247338_-|hypothetical-protein MMNSKMIKHKFLVSLGLISAPVLSLTVLSSTGCNNKNSTTDDNYLIPEKSFYEKSNYYDSLEGLNGNKLYSELIKIQHNHLSGIKSYRYLKTIYKDAFKDLYYEKDGSLLDIYSENPIGKDPYNYSFNDSGSSAKSEGLGFNREHLVPQSWFKREKLARQDAHHVWPADILVNNKRDNYPFGKVTNAIFTSKNGTKIDSYLAEPIDEFKGDIARAHLYFAITHASRYKMHNKGNEVFKFFDNKPLVNKYFDTYTKWAKKDQINLFDIVRNNEIAKHQNGLRNPFSDYPELIDLIINPGNKVFVNKGILKSNIAV >NZ_CP042938.1|WP_013954647.1|247436_249383_+|transketolase MNINQKVVASMQAIALDSINNAGGGHIGSAIDISPIMYAVVAKHMKISADHPKWISRDRLILSAGHASMSFYSMMHFLGLLSLDEMKNHKRKHSKTPSHPETDAFDFVDASTGPLGQGIAMGVGMAIAEKKMSLKINKGNTKVIDNYTYVIAGDGCLQEGITHEALQIASVMKLNKFILIHDYNKIQLDTKVSDVSNVDLLAYFKALNFNVIEINEASYDNIDKAITEAKKSDRPTYIMVHNIIAPFTPFENTTKGHHGILNSEQTIEFKKAIGLENKAPFEYDSDVYEYGRTIMANKAKSYEEWLVELDNHKKQFPWIHSLLLETINNETNYDFSNILVKQDDLAIRDYFKAFSEIVDFSYPFLIGGGADVGSSTKVRFADSILDYGQRIDYGVREFAMTAINNGINLYGGLKTADSTFLAFSDYAKGALRLGGIMKLPAVHLYSHDSYLVGDDGPTHQPIEQVTVLRSIPNLLVIRPCDKYELVMGLNYAYNNTSTQVAIIGTRQPIKTMHSSKFSEFMAASLVYENKEFDISILSSGSEVELAYKTAVELKNHGIIANVISVPVLQKLVDNDELAIKLKLDKKPMFAIEASNDPLWYKLSKYNKIDGHFASEYGFSDKGNVVYDSMGFNVNSIVDKVKQFLSKNA >NZ_CP042938.1|WP_075271169.1|249445_250000_-|inorganic-diphosphatase MSNVIEIKIEIPKNSNIKYEYNREDGQIHVDRILRGDFKYPCNYGFIPNALDWDGDELDVLLYSPETFITGVVVNARIIGAMKMNDSGETDTKLIAVHDDDYRLENINSLKELPEPFLLDIETFFNNYKNWKKPNLTKVLGFEDEKWAFAELEECKELMDKYGKMPKKEFVAKMMKEHPEKYTF >NZ_CP042938.1|WP_013456603.1|250079_250349_+|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSKVKSIAKQEEFRQRNNAMKTRVRKAIRAAREAVLAKEEGFEKKVFEAHSIIATAVQKGIYHPNKGARKSSRLDHFVNEQKSKQ >NZ_CP042938.1|WP_075271086.1|250461_251049_-|hypothetical-protein MQMIVKTAAIEVLRELQKLLESENINYSLGLSNYYEYKNKPELFLINDIEVCLWHKDFYFLLKKYPNHFILPENLPFKSLAPYYKFQGSSIKINIIVGTSDEKINYWYKFRNYKRLIYWGNSKKHWFYYFLGHRTQRVYLHDLVNDLVVERYTKFIILNSEIDKFKAFDNLNFNKRFFVTEKGITIPFFEPFRSL >NZ_CP042938.1|WP_075271069.1|251142_253311_+|hypothetical-protein MGKKKTPFFERLLQKNAEQENKNKTTGKSKKSRSWKIATTSTVLVLAVATGITVPLVINSTKKNFIDGYASNTNVASAKIGDHNLDLNFGDFKNIYQNHNTSTSEERLKEIDKIILYYLYDQEQKASAEYQKLWNDSKRSDEKDNNSFRLPTLDELKTKFKNELVDIENNMKLQFGTANWQTEFNKHLVQKYNGAKNIDEAVKNKTFEHIKTDALRRFRLTNGDSKKDEIERKGKDGKHVFGWWHNKNGTNKDKFIELEDKSKLALATDSFVFKDSYKSIDPFIDSYIENEKPRIISEFTIPGIAPAKKNEKWKIDKNIFLRYLFYAKQGTFGLDKVTKGYNVVKEKFNSFDHYIKSVVNKANGNNILPDDAIQYSSILNMFSTSKEDIKKNWGTSGLTSISELVTGDNFQKFLANNRKLLFGETQNVSSNTPKEIDIFGNIEEIKNEIDELIKNDSNGTATHVASSSSSTSSSEDQITTNDKAAEYNKKLEKFFTEVNESQSKGLTEKLFEEKILKKFVKLFESSGKIQTVYRVKFNGDKEPKDVTGILSPEGFKLLIFGKPVKKEDIVEMIQNDFILNSKYKKQLGVRYNALQKLNKQLSRNEYILKMLKDNEFREYLKTQNNNFATDQNGKKLENVKYNEQSIKDLIASSTAAIQFDKISNFIKLSKAAATWIETRAKNNYDELFELKDGKAYFKHNKDKTAASLVLEYLKKEFNLEAK >NZ_CP042938.1|WP_075271062.1|253322_254708_+|hypothetical-protein MKKISKKLLASLSLFTIPSVAIISAKCGNDVETTERLNQQKDLKDAKRVAELEEIWKNFALSYIYNIKPSNKHDAISWKKNFEKEFNNQQSQLFKDSYEAYKIFALDQLSKNEYYFVEKSLEWKKNDVFKSNPFDWISTKNFPGETDQKNFIRIWMEDKTGIRKEINNMLLVKAYFGISDLKQLQTIANNIANAGKADKDKSKDQKFEYFVGGKDAKFDLKHYNLVKYAFENKYIQLWKRTFDDKTTSNDVFTRKEIKNTISSKEEFNAFFKDTAEAEKKAKEWEIITKNTEDKELQGYAGIQKDPGTYGLNWNETDNKRRENSSGTYGAYDALNSILISFSDLTSKGSSVGVKDKDGKSIVSYINQIVPVGKKTKLKTKEDYTKDKVEDSKLKETEVLSFEGTIYKDNLDKLAYLFYGKDAKNLLEKAIEAFAHLGVKIKVNKEIAPLYEQLKNKVWVEK >NZ_CP042938.1|WP_013456168.1|254707_255043_+|HIT-family-protein MDDLFLKIISGEEEGKIFYEDEYCVAFYDKFPIQPGHFLVVPRVKSKNITEADDFTAGHLINTARKLGKQEVLDKGIAGFKILINTGRSADQSIFHTHVHVIPYKEKSKDN >NZ_CP042938.1|WP_078086163.1|255427_256456_+|IS30-like-element-ISMbov1-family-transposase MKTVSNIVGFKSRSIYNLFDRITIETKRGYAKYQKKCKLCGMDLKGKTIYVISALKFLNLIETRHDSKRLENNSKLLMKYIDIFKFYKQLLYFYLANRNSFNLDSKAVKQSVASIIFKYIRELEAQGKLQNSYIPSVQNFYRILAKHSAFGLKLDILPYKSNGKYGSRTTVKHETKKKTIGKLITERPESVNLRLNDNDYEMDTVIGLRSDNYCILTLINRKSRMFYCTLSRRNAKAIKENLEKLIKDNNLVIDTLTIDNGSENYKLPEIESIKEIFHCHPYSSSEKGSIENAHRLLRRYIPKGKSIDKYVGQDLKPIADFINSHPRIYKGVSGFKCAKQMQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042938_2 | 420426-420532 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042938_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042938_2
>2.1|420455|49|NZ_CP042938|CRISPRCasFinder GATTATCATCCATCATCTTATTCCCATCATTTAATTTTAATTCATCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042938_2
The CRISPR arrays of NZ_CP042938_2 >merge|NZ_CP042938|2|420426-420532|CRISPRCasFinder ATCTACAGGCTCAGACTTCATTGGTGATGGATTATCATCCATCATCTTATTCCCATCATTTAATTTTAATTCATCCATATCTACAGGCTCAGACTTCATTGGCGATG >NZ_CP042938|2|2|420426-420532|CRISPRCasFinder ATCTACAGGCTCAGACTTCATTGGTGATG GATTATCATCCATCATCTTATTCCCATCATTTAATTTTAATTCATCCAT ATCTACAGGCTCAGACTTCATTGGCGATG
>NZ_CP042938.1|WP_167662371.1|415615_416656_+|zinc-dependent-alcohol-dehydrogenase MKAFVVKAPKEYSVELIDIPEPVDNEILVKLETSGICHTDLHIANFDWPRQPNYPMIPGHEGIGIVTKVGPNCTKIKVGDRVGVGYMYSACGQCEYCISGKEILCVSRVVTSLVKPGTFAEYTIGHEDYVLPIPKELDIVSGAPILCGGVTSYKALKQAELKVGDYVAIIGIGGLGHFAISYAKAMGLNIVAIDIDDKKLESAKYEGAHYIYNANDLSFVQEVKELTNGGVHAVINTSVSTSSASLAMYILRRAGRQVLVGVPPKDENGKIEFPLSILGTISGEQHVLGSVVGTRQDTKEALILGTKGIVSKIGRIISLDEVKDVFEQLAKGELIGRAVIDFRSYK >NZ_CP042938.1|WP_167662370.1|412670_414797_+|lipoprotein MIGLVISSNLLVISCNYKSISKPNASDSSSVINRDNKDNKKSTESNNSINDNSNNNSNNPNMSSNNNNQTKPNVQPINPTNINQLNYQDNKIYDPNKDSDYFRDSHLFSLDFLLNNSAYTISRSTSKFHTATHNINTFLKTGYYNNPVDFRNVYDQETDNRFWEHIKNRGWYGDLGLDDEQKTAFYNDHLSINGMVEQQYLDKFNKSEINSSTDLNFNFNELISKNPFGYLPSNLSQLFYYMDFKSISKLFKISNIKDIKANFDDKNGEFEILLTTNDKNYYQKIDKNNTNKLKKDLDYYQYIYDRSFSILIWFNRWKRDKFGLQEDEITKDFKSGTVWVLDRVLNKELENKGYYELLLATNIHVFSLAEAFDKSIYFEKNSKHKFADSWKADFFDYENVNDSKNAEFMTTRAKQEELTSNIINNVTGSTPTFKAESQYLQAAYYTPRYNVSGFKTNDLHTGLAYIENFNKTTRLSSTKNGGADFVILKLQIQKDKLKNILPKLDKVINTDKEKDWYIGLGKDELFTPLKTQFYAGYPATQLGMNRNLTYKFQANKSIGGVISTQNRYVNENNFQSLWTKYDADENKDWNSHNDNWTKYTEPFIENQHGMLKRVLTQHSSLYTRIEKEDDALVDGSSGSMAIDSSFNLIGINYLLSKDEKHNTTSNAISLIQGQSTYSDDFNGNLRTDFVKKLKKDNLLTVKLNPKNS >NZ_CP042938.1|WP_013954660.1|411063_412452_-|transposase MAVPAEIRAIERPKNTVVKKSGSMWAVIERVGCIRKNGNNQPVEGKVIGHIIDGKFVPKEKLKITVSMKNFGDYEIAKSVSKDLLTDLSNVYPQDMAKHIYAVALLRSINPRMTNNKLDEVFNESFMSVESPELKLGKNNVSSLIKWIGKDYSKVLEFIQNRVSKIDESNKIAIDGMLKNNNSKVNSLNDFSYKSKLKNSKNISILIAFNVTTRDVICSLPYSGNCVDVTSFPDFLEKTGINKGIIIGDKGINSSALMSNVGFIHPLKRSLKLLEEIDAYNMKDKINSKDEPTWCKKIFHNGLYYYAFRNLKRASKEEQDFMSSKKFSIERYEKIKHKFGTIVYVSDQDITCEDALNLYKQRWEIELVNDFYKNTLELETVRQHDDYSVYGDEFLNMLTLIIGNRIKNKFADSRILETKTYRDVMKIFKQYKKIQMPYKNDIWYETELPKKSMELIEKILYS >NZ_CP042938.1|WP_078086171.1|409569_410598_-|IS30-like-element-ISMbov1-family-transposase MKTVSNIVGFKSRSIYNLFDRITIETKRGYAKYQKKCKLCGMDLKGKTIYVISALKFLNLIETRHDSKRLENNSKLLMKYIDIFKFYKQLLYFYLKNRNSFNLDSKAVKQSVASIIFKYISELEAQGKLQNSYIPSVQNFYRILAKHSAFGLKLDILPYKSNGKYGSRTTVKHETKKKTIGKLITERPESVNLRLNDNDYEMDTVIGLRSDNYCILTLINRKSRMFYCTLSRRNAKAIKENLEKLIKDNNLVIDTLTIDNGSENYKLPEIESIKEIFHCHPYSSSEKGSIENAHRLLRRYIPKGKSIDKYVGQDLKPIADFINSHPRIYKGVSGFKCAKQMQ >NZ_CP042938.1|WP_141774540.1|408195_409230_+|variable-surface-lipoprotein MKKSKYILLTTLSPIISLPFLSASCITEAKSDNKMEKDIKINENTDEKNSSETMNNKQKQDKSSIDSKMEEKADNKTEKDIKINENTDEKNSSETMNNKQKQDKSSIDSKMEEKADNKTEKDIKINENTDEKNSSETMNNKQKQDKSSIDSKMEEKADNKTEKDIKINENTDEKNSSETMNNKQKQDKSSIESKMKEKTEKQDSKTNSEKQDSETDDSSNELTIPSESTPKDMPTENSEINDYLDKVKEYGKEASEFYELLSKLFKTKYKDKIIQKIGKFEKIIKEFSKLYEGTKNNLDQIIEGFKEPDFKKALLELLNSYKESREEIKNAIKELKEIENESRF >NZ_CP042938.1|WP_167662310.1|406337_407726_-|transposase MAVPAEIRAIERPKNTVVKKSGSMWAVIERVGCIRKNGNNQPVEGKVIGHIIDGKFVPKEKLKITVLMKNFGDYEIAKSVSKDLLTDLSNVYPQDMAKHIYAIALLRSINPRMTNNKLDEVFNESFMSVEYPELKLGKNNVSSLIKWIGKDYSKVLKFIQNRVSKIDESNKIAIDGMLKNDNSKVNSLNDFSYKSKLKNSNNISILIAFNVTTRDVICSLPYSGNCVDVTSFPDFLEKTGINKGIIIGDKGINGSVLKSNVGFIHPLKRSLKLLEEIDAYNMKDKINSKDEPTWCKKIFHNGLYYYAFRNLKRALKEEQDFMSSKKISIERYEKIKHKFGTIVYVSDQDITCEDALNLYKQRWEIELVNDFYKNTLELETVRQHDDYSVYGDEFLNMLTLIIGNRIKNKFADSRILETKTYHNVMKIFKQYKKIQMPYKNDIWYETELPKKSMELIEKILYS >NZ_CP042938.1|WP_013954727.1|398593_405625_+|hypothetical-protein MKLKLKPIIITSAITFSATVALAVGLSYVPFGDKKIDQSGTKHFRDEVHGAPGLPNQSDISHLPLATPELHHLGPRVASKHIIKESDKVKYVALGDSISAGFDARLDKDYPGNYDKEKNTITGISFPTYLAKFIQTSNGSKSKLESYTNYASSGTSLEDWTFLLSADEAKIKELEEKQSDKLAYYKRKFGENILEKAKKIKDELKTSNLVTITLSANDFMELAYKKLKDSNFISNIQNIKANPSSAIAQIGAAFQDIFGEMKNRIDKFSAELKKHVTTDNVNFIGYPLPVPYLFVLLDNYLFNNSQSKLIVSQMSINLLNDNIKTQVTKNNFNFINPYNVSFWTKSENMSRLNPVIFDIHPGSYGYKKMAQDVFIKLITSDRHSKALNEQGIDWNDQYIDQDAISFTRQLEFSDQYKAIKQSLTENINNNLFEEDEIYSAFNTIRQKGFEHYKKRVLDNTLVTSIIDGAIDLLLRSQYFKKADPSNKLAKFFTDGNKRNLVNFKSWIDKSEFIPNLLLKSELEFKNTYLKQDNPDQGTRANLMDFANTLKKNLLNEADLITLLVSFFNSDFIQDSKEELKGILEEFAHNMIVQNVDAKQLSEAINKLSSSNGLGKINAYEIVQLIKSVLGSQSVKKSIGELFLNLANNSNAYKKAKTIDELLKLFLTDQGFQKIINDLTSDLLDELSNDNDLNKTFSAFASAVAKANGDIFKDIEEKDLKELFSASAKSLKDLNKEFKIAETFVSSLLTEVSRSGIKNISFSNILSSAWSQLKKNFEGKRLDESLIKIAKAFANAESQNAKNALGKLLGNAFKYAKNSPELINKISNFILDQSSTAAKNISSSDLSEFIKAIFNSNEFEALFSDLAKSLVQINKENWNEITSFADLVRYVFVNFVTGKNQSIGPRANEAMKSLLRNENVKKSTIKILLSTLKGYTSITKGIGDDKLLSLFYDVFGKYDELDRVFKFENIYESLLSYLGTNSGNINLTELSYQLNRKLERAFENKSIEDVILELVKIISKDKFAKNHKETLVKLVENIFAFAKEGKYISTTIADSIFESINKDSLGNFITKDDLVKLIHQLLTDESFKKLMGSVLSTIADADSSTVQNFSNIKDLMDFIVGKIVKSSDYQYVQGVAKLLTQSDAFIKLIQNASKDFFDFSENDIKTLFVALTGSKELNDLTKDFLVKGIFTTKTKWAEISNLDLIIKNWLKESSSANLADNLEKFFVSLVNKDVVAEVFANSSFKAANKYANAFEGIKENEYTSFIKDLFKILPELSNKLFVKKYFVEQLFDELRNEGTKANLQSVFNSYIQKLSASFQSNNWDKNVLDLIKVINSKGLISKHKSMLSKLINNTVSKVFTNEKFGNDLGGQIFNSFKEIKTFANENDFKKLIAKSFNSTNFQNFFKQLTEELLSVAGNELEKATSVKSLMDKAVQSLKSKGALENLAQFAKEFVNFDESQSIFNNLFNSIGNAKEGVKFTPSQIKELINYLADDNDLKELTISLLTEGFFSDKLSINDFNDYDMLLKTWLNKYEVRKSVVKNVKSIIEKAFSKHSIRRTFATLIYKLMENEESLVRFITSKDLIALISDSLQNYGKVNHVLNFNNWFLDGIFEQLAKNGTKIDNKAVEELVVKNLGDKFSSKNWEKSAVDLIKSLASVKIVLNHEDTIGQFVANIFNYAADKKEVGSMIYDQLTTSYKDTINKYIAKDKFNNIIKAIFVKNQKAIASLMKNITLSMKLDIAKYHNSQTIMDVFKIYFDQEEKIYLISKDISVVVDSLLKDKDIQEFIKTALNEQLKQYNIQVDSKENKDFIKAFIDELPTLISNLHLVPKLLNGVSSGLKQYKSATELFTNIISLTLESINFNDFSLIKTVLESDTLNKHSKVLGDNIKAIYKGATSDDKLVSKFIDDFGLTNLLSSKGISDSEAKEVLKLVFKSGDADGALGLLIDGFFKDVSKFKEVNSWPKFISTLISNVDEYKAKEHIKKWMVEIVNNNSTRLFDVIAHLLIEQFNKNGYKIPAHEKSIIAKFIHSLTKSIVGTKEQLTNNNSQNKDVFNDMVNSIFNALKKLNDDDDILDKVAEAAKSGALSFVTEGTSISIAKIFDNIPKFQKLMENVDSKAYADFINVMFKYADPTDDNGLFKAIFHSDKSSGSLKLGARGFLDILKGKVQQLISAFVMPLMKNYVRELEETKEVYRTAQQVKQYVSGYQALWRVYASLAAMLYSNTPRWLFWNATNLTSEGFLRAGFEDAFQKAIEDKNLDKYYNNYSAIGLKWKGKVNHEFWAGVSKLWHGPTSFSISQNYYARDYVLAYIYYQGNNDILFNAGKTMRQVLIEDLVRGYMPVDTS >NZ_CP042938.1|WP_013954726.1|395563_398365_-|C1-family-peptidase MSKKTYKQFAWWLLIIFFPFILFFISAKISNKSLKLDNQLNSTAESVSLSNDKSKQRYYTLRDDYILFNQYQANTGLCWDFSITKSLETALMLANKEMYDFSEASISALHAGHIADGGNFTIYNKLLNKHGIAFESDFRFGDLYHFPNAGAYYHKLLELYKPKYITNLADKLETVEFDKTKIRENLNAIKHHIVNHSSLVTNVEHWTTTKRKINSRDIHEIVHYGGAPNLHSVAIIGWDDDYVSISGKKGAFIVLNSDWPYFNNDGTNYLPYDSLEIVSSLYGFKYKAPKYISSRSNTSIKNKYSGFYDSKRDHKYNYAASPLNQNVFNWNDEIKIEYQFNEFYGKINSFNARIYQDGFEITNKFKIEKNHNTLIVISNDRTLNPGSYTVKLDYSFIDKNKTKNEQEVRQIYVLDGSEGLMSHSYWQYNENAPYNHFIFHSANGYNLNKKTPVILSSEKNDNYSLMLNYLNQDNKVEYRVNNESISANRSWVFDLRLNKLNTKHSNNDEYFADIDTYVNGQKTKTTKYKIYRLNTNRNYIIAKFYYDLNGSYIDNIVSEVPFDFNKSDQKFFINDANKSGSKFKRYEYVTKDGQYKELPKDISSGKYYVSSEIIKSLKQSTNDLNVVYSRGLDQYYNTPVIIKPIFENENAKIDVDVLRGKTEFSATTKVNTTDFQLRISDNANSNIVIPNRIVYSNDENIIKSTDKFIELEFDYKNQIYRKKIDIKVNKKVIYDDLKLVKSTFKYNGQGQQPQFNHELDHSLVNVSGNYNTQIGTYTVKLQINNSEYTFPGNKDELEFNWSIIDPSSYNEEYNNNINANTNDDVKQEDSVKNNSSLDPNEANNHIHDQFRINNIASSSGVIDINNRSVHNIERKDNKNELNNKTNETIKILNQAKTGLSLQAIIIISVSSAIVLVITISLVAVKISKSKKHK >NZ_CP042938.1|WP_038582700.1|394270_395299_+|variable-surface-lipoprotein MKKSKFLILGSIASSSLLMIAASCDVKKKDVETSNSEKQDSKTNSQSNSGNQGSRPDSESNSGNQGSKINSQSNSGNQGSRPDSESNSEKQDSKTNSQSNSGNQGSRPDSESNSGNQGSKINSQSNSGNQGSRPDSESNSGNQGSKTDSESNSENQDSKTNSQSNSGNQGSKTDSESNSENQDSKTNSQSNSGNQGSRPDSESNSENQDSKTDGSRHESTTPSESTQNDIPTENYKIDDYLNRVKTYGKEANLLITLLAGAWTENYDELQKKYASLWPIVTEFFKLHEKIVSKFDEIKKEIEEFFGKPESKNNKLDNLLKQYEKSRDEIKDAIEVLKRLQKK >NZ_CP042938.1|WP_038582875.1|392896_393937_+|zinc-dependent-alcohol-dehydrogenase MKAFVVTEPKKWSVKEVDVPKPKYKEVLIEMETSGICHTDLHAANYDWLVEPKYPLIPGHEGIGKVVALGEGCTRLKIGDRVALAWLHDACGYCEFCLTGRETLCPNQNMSAYTKDGSYAEYAIGHEDYVGLVPEKLDIVTGAPIVCAGVTTYKSLKQTKAKAGNFVAVIGVGGLGQMAIQYAKAMGLRPIGVDLQDEKCELALKSGAEYAFNSAKDPKFIEKIIEVTGGGVHAVVNTSVHPSAAEQGMDMLRRGGRQVLVGLPAKDKHGKDDFKVSIFWSVLLERELAGSIVGTRQDLAEALEYAAEGKVKSEVTKVVKLEEVADIFEKLQKGEFLGRAVIDFRK >NZ_CP042938.1|WP_013456319.1|420754_421483_-|purine-nucleoside-phosphorylase 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MSYIKLEKKFKLLLGTITSAVPLSFVLSCTNNKEQNSDTDAKTPIKQADKHFLAIDQLIKLSPREIHSKTKTYIEKNKEFKNFLKTRNINFISEEYPRHENELDKEYWTYAKYLGEYGNHGDDSYQKTQFFNPSIPIGHYLNHQHLEKFSEEEVKDLKVKTIDLSSLIRNNPFGYLPSNLSQLLSYATYESIEKKFNLRNISNIKTSYDDIKGVIYLLISTNNNKNKHYYLINKDNNKELKANIDFFTYIKDRSIELNVNAKQWVSTVDQQKNISGIFNFPKFLGTAWVIDRIKNNNNNNNNHYELLLATNMHVFNLRSTFDKTYHYDKFKKYENYKDKDYGWKEFPPGFYDGIKTNDSGDNRNIEPKPAFKVNRIKENSLDLDFGVFEKNKYKYELDHSDRIDAFEDAYAQYLDAPYYTPRYESNNTYLKAIEKNPETLKNNFSYFNTKNSGADFLTLRLKIKKDKLKDVLPKLASVIGTDEEKDFYVNFSNKEFSPIKTQFYAGYSRHWDPFSKKSSQFRGVKSEGGIISTKRRIVDENWFRDVWLRYDEKLNKEYNSENNLWEKYQQPFIKKKDKDDKYQLIKEEHGMPLTTLDQFSTLYTNIPFGDLNLKEGASGSMAIDSSFNVIGILNTRVDNVIGDKKVIKFDKPYGKDGIIDGIVVRPQTNGIVLFKSLSDDYIGKEKQPFIIDGLKNKLINDKLETIKLNPNSK >NZ_CP042938.1|WP_013456554.1|432246_432969_+|SDR-family-oxidoreductase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
78679 : 89382
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042938|78679:89382|DBSCAN-SWA TATGAAAACTGTTTCTAATATTGTGGGATTTAAATCAAGATCAATTTATAACTTATTTGACAGAATTACAATTGAAACAAAGCGTGGCTATGCTAAATACCAAAAGAAATGTAAATTGTGTGGTATGGACTTAAAAGGCAAAACGATATATGTAATTAGTGCTCTCAAATTTTTGAATTTAATTGAAACAAGACATGATTCAAAAAGATTAGAAAACAATTCTAAATTGCTTATGAAATACATTGACATTTTTAAGTTTTACAAACAGTTACTGTACTTTTATTTGAAGAATAGAAATAGTTTTAACTTAGATAGTAAAGCTGTTAAACAGTCTGTGGCAAGCATTATTTTTAAATACATAAGTGAACTAGAAGCACAGGGAAAACTTCAAAATTCATATATTCCATCAGTTCAAAACTTTTACCGTATATTGGCTAAACATAGTGCTTTTGGTCTAAAATTAGATATTCTTCCATATAAATCAAACGGCAAATATGGAAGCAGAACAACAGTAAAGCATGAGACAAAGAAAAAGACAATAGGTAAACTTATTACTGAACGTCCAGAATCAGTTAATTTAAGACTAAATGACAATGATTATGAAATGGACACTGTAATTGGTTTGAGATCAGACAATTATTGCATTCTTACATTAATCAACAGAAAATCTAGAATGTTTTATTGCACGCTCTCTAGAAGAAATGCAAAAGCAATAAAAGAAAATTTAGAGAAGTTGATTAAGGACAATAATCTTGTTATTGACACATTAACTATTGATAATGGAAGTGAAAATTACAAACTTCCAGAGATAGAATCAATCAAAGAAATTTTCCATTGTCATCCTTATTCATCATCAGAAAAAGGTAGCATTGAAAATGCTCACAGGCTTTTAAGAAGATACATTCCAAAGGGAAAATCTATAGATAAATATGTTGGTCAAGATCTAAAACCAATAGCCGATTTTATAAATTCACATCCAAGAATTTATAAAGGTGTCTCAGGCTTTAAATGCGCTAAGCAAATGCAATAAAAATTAACATCAACACAAAATTTTGCACTTTTGAGTACTCAAAAGTATCTTTTCTTTATTCTTTTTTTATGCTTTAGGTAATTTTCTTGTCAGAACCACCAAAAATTGGTATTATTTTTCCAATACTCAAATTAGGTGCTTTTTAATTTAAGAATTTATATTCTTGCTTTATTTTTTTACTATTATTTTTATAATATTTACTATGAATATAGATGCAATTTATAGTACCTTTTTTGTTAATGGATCAAACGTTATTTCGGCATGATTTGTGATAATATTTGGATTTTTAGGAATGTCAATGACTCTTATTTTAGGTCTTCCGCAAGCCATTCATCTATACAAGTGCAAGAAAACTGGAAATGTTAAGTATTATTCATACTGAATGTTTTTATTCGGAATCCTTTCATGGATATTTTTAGGTGCTTTTGATCCAGTTCAAAAAATGTTTGCTATTGTAATATCTAATTGCATTTGCTCTTTAATTTATGTTATTACGTTGTGACTTACTTATAGATATTCAAGCGATCCTAAACGTAAAAGAAATCAATGAATCGTATTATTTTCATCGCTTTTACTTTCAATTTTTGTAATTAGCTTGTCAATTTCAGCCTTAGTTTTAGAATGAAAACTACCCCAAATTGCACAAATGAGTATTGCTCAAATAGTGCCAATAATTACAACATTTGCATTCTTTCCTCAGGTATTGAAGGCAATAGATTCTAAAGATTATTCAGGAATGTCTGCTTCAATGGTTTGAACATTCATCTTAGCTAACGTGTTTTGAACATTATATTGAGTGTTTTTTATAATTAATGCCGGAATTGCCCCACAATTAATAAGTGCACTAATATGGCAAGTTTTATCATTACTTCTATATTCACTTTTGTTAATAAAAATGATGCATCAAGCAAAGCTAAATAAAATAAACAATACCAATGAAAATGTAGCGGAGAACAAATATGTATAAATCTAAACTGACTTTAAAAGAAACGCAACAAGCTATTCAAGATCTTAAATTTGCCTTTACAAAAAAACTTAATCAAGAGTTAAAATTAACAAGAGTTTCTGCCCCTTTATTTGTTACTTCAAGCTCTAAAATTAATGATGGCTTAAATGGTGATATCCCAGTTATTTTCTCACCAAATAAATGAAAAGAAAATATCGAAATTGTGCACTCACTTGCTAAGTGAAAAAGATCTGCACTATCAAGATACAAATTTTTACCTGGTGAAGGTTTATGGACGGATATGAATGCAATCCGCAAGGATGATGAAGTAGACTATAAGCATTCATTATATGTTGATCAATGAGACTGGGAATTAATTATTAACAAAGATGATCGAAACCTAGAATTTTTGAAAAGAATTGTCGGAACAATCTATAAATCAATTAGATATGTTGAAAACAAAATCAACTTTAAGTATCCTGTATTAGACCAAAAGTTGCCATCTGAAATAAAATTTATTAACTCTGAAGAGCTATACAGAGAGTTTCCTAATGTAAGTCCCGAGGAAAGGGAAAATATAGTTGCCAAAAAGTACAAAGCTGTTTTTATTTACAAAATAGGTCACACATTACCTGATGGCTTGCCTCATTCAAAAAGAGCGTTTGACTATGATGATTGGGAATTAAATGGCGACATCGTTTTTTATGATAAAGTTAATGATGCAGCCTTAGAAATTTCATCAATGGGTATAAGGGTTGATAGTGATTCGCTAACTAAACAAGCTAAAATTTCTAGAAAAAAAGATAGTGATATGGGCGAGTACCATAAGTTAGTATTAAATCAAAAATTACCTTACACTATTGGTGGCGGTATTGGGCAAAGCAGATTAAGTATGTTCTTATTAGAAAAGAAGCACATTGGCGAAGTTCAAGCAAGCGTTTGACCTGATGAGCATAGAGAATTTTTTGAGAAAGAAGGAGTTATTTTACTATAGGTGGATTTTCTAAAATATCTATAAAATAGTGTTTTTAGTAAATTAACTATCTAATAGATATATATTATTGGCAAAATTAAATAAATTAATTTATATATCTTATTAGTATTAATATAATATATGTATGAGTTCTGTAGGTTATAAAAGATTTCAGGCATTTTGCAAAGCTAATAACATAGAAATTAATAACGAGTTAGAAGGAACCGAACTGGTTCTTTTTAATCTTAATTATGATGAGAATTCAAATGATAAATTGAAGTTAGAATTCCGCTTTAAAAATTTTATTTCATTTGATACAGTAAGAAAATTAAAATCCTTCATAAGTTCTAACAGAGGCAAATGAGATGTTTCATTTGTTTTTTCTAGCGATTCATATAGCAAAGAAAATATCTTATGTTTTGTCAATAAAATAATTGATAAAACACGTTTTATGCCTTTAAAACAGATTAATTGGGAAAATAAATTTGTTGTAAAAGACAATAATGCCTATTTTGAAAACATTGATAGGGATTTCGAGAATCAATATGGAATGCTGATTGATAAGTTACTAAACAAACTTAAAGAATATGGTTTTGCAACGCTTGATTTTTCATATAACTATGCAGCAAACTTAACTTCTAATGATCAAAATTTATCATTAAATGCAGAAGAATCTGAAAAGATAAAAAGAGAACTTTTTAAAAAAATGATTGAATTAGACCAGTCATCTACATCATATGAAAGTAATAGTAACAGTCCACTAAGGATAAAGAGGAATCTTAACAAGAGTTATACAAGGTACTCTATCAAAGATTTAAATGATGCGCCAAGCAGAGTTAATGTAGAATTTGTTGGTATATTATTTGCTTCTAAAAAAACTTTTTCTAAAAACAAACGGTTAACTATCCAATTCAAAGTAAGTGACTTTGAGAGTGCTGTTAATTGTATGTGATTCTTAGACACTGACTGATTGAGTAATGAGCAAAAAAATTTAATTAACCCCGAAAATCAATCTTGGGTTAAGGTTAAAGGTTCAATTCCAAGTAGTGACAAGATTAAAGGAAACAACTTCTTTGTCTATGTTGATTCGCTTGAATTAACAGCTTGTCCACTAAATATAAATGAAGATAAAGCACCTGAAGATAGAAAAAGAGTTGAGTTCCATATTTCAACAAAAATGAACACAATGGATGGACTTTTTAATGCTGATGATTTTGTTGAAAGAGCTAAAAGATGAAAAATGCCAGCAATCGGCATTATGGACACCGATGGCGCACAGGGCTATCCCAAATTATTTAATAAAGCAAAAAAATCAGGAATTAAAGCCATATACGGAACTGCATTCACTACTATAAATAAGGCAAATGAGGCAATTTTAGGCGAAATTCCTGAAGGCAGTTTTAAAGACTATCCATATGTTTCATTTGACATTGAAACAACAGGATTAAGTCCAAAATTCCACGAAATAATTGAATTTGGTGCAGTTGATATTAATCAAGATTTAAAGGTGGGTAAAACAACTCAGTTTTTTATCAAGCCAAAAGATAAAATTGGTAGTTTTACTACTGAATTAACTGGAATTACACAGCAAATGCTTGATTCTAAGGGGCTTGATATAAAAGAAGGTCTAGAAAAAATTTATGATTGTTTAGACGGAAAAATAGCTATTGCACATAATGCAAAATTTGACTTTAACTTTTTAAAGGAACAATTTAGACTCAACAATATGCAATTCCCAAGAGTCACTGTTATTGACACTCTGGTAGCTTCTAGAATTGGCTTTCCGGGATATAAACGTCACAAATTAGAAGATGTTGCGTCAAGACTTGGTGTTGTTTATGATCCAAATGTTGCTCACCGTGGGGATTATGATGCCAAGGTTTTGGCAAATGTATGAGTTAATATTATTTCAGAATTGAATGCCAAGGGTATTTTCACTTTAGATGACCTTAGCAAGTATTCTTCTAACGAACTTTATGCAAAAATGCATGGGTATGAGGTTTCAACAATTGCTTTAAATAATCAAGGCTTAAAGAAGCAATTTGAGTTGATAACTGACTGCTTAACCAAAAAATATATTAATGGTCCAATAACATTCAAAGAAGACTTTGCTTCTTTGAATAGAACGGATATCTTAGTAGGTTCTGGAACATTAAAAGGCTTATTAATTGATAAGTATTTTTACTCATCCCATGATGATTTTATAAATGAGCTTAAACTTTATGATTTTATTGAAATTCCGGCACCTCAATGTTTTGAACACTGAATAAAATACGGATTTATAACCACAAAACAACTGCAAAAAGGCTTGAGCGAAATTATCTATGAAGCAAAAAAACATTCTAAGATTTTTATTGCAACTGCGGATGTTAAGTATTTAGACCCATGAGATCAAGAAATTTTTAAATCTCTTGTTTATGCAAAAGGAATAAAGAATGCTAGACATTATTTATTTGACTATAAAAAAGCCGAAGAAGGAAGATTAGTTATACCAAATCAACGCTTTTTAACTACTGAAGAAATGACTGAGCAATTTGCGTTTTTACAAGATAACCAGCTAATAGAAGAATTAGTCATTGATAATACTCAGTTAATAGCTAATATGGCTGAAAATATTGAAGTAATTAAATCTGGTTTGTTTACACCTGAATTTGATGATTCTAAGAAAAAATTATATGACTTAGTCTATAAAAATGCATATGCAAAATATGGTGAGAAACTTCCTGAAATAATTCAAAAAAGAATTGATTCTGAACTTAACCCAATTATTAAGTATGGTTTTGATGTAATTTATTGAATAAGTTATAAACTTGTGAAACTTTCAATTGACCAAGGATTTATTGTTGGTAGCAGAGGTTCTATAGGTTCGTCATTTGTTGCATCATTAATTGGAATTTCTGAAGTTAATCCGTTAACTCCTCATTATTGTTGTCCTAATTGTAAATATTTTGAAGTAGCTAATGCTCCAGGCGTAACTAGCGGATACGATTTGCCTGATAAGCCTTGTCCTGAGTGTAATACGCTTATAAAAGGTGACGGGCAAAGCATACCTTTTGAAACATTTTTAGGATTTAATGCTGATAAAGTCCCTGATATTGATCTTAACTTTACAGGGGAATTTCAAGGTGTTGTGCATGAAGAAATCCGTAGACTTTTTGGTAAAAGTCATACATTTAGAGCTGGAACTATTTCCAAAGTGGCTGAAAAAACAGCATTTGGATATGTGAAGTCATATGCTGAGCAAACTAGACAAACTATTCCACAAATTTTTGTTGAATTTTTAGCGAACAGAATTAAAGATGTTAAAAGAACAACAGGTCAACACCCTGGTGGGATTATTATAATCCCTAAGCAATTTGATATTTTTGATTTTACCCCTATAAATTACCCAGCAAATGATCAAAGTTCATCTTGACTAACAACACACTTTGACTACAAAGCCATTCATGATAATGTATTAAAATTTGATATCCTAGGCCATGATAATCCTACATCTATAAAATTGCTAGAGCAGTACACTGGTATTAATATTTATGACGTTCCCAAGAATGATCAAAATGTTATAAAACTTTTTAGCTCAACTGAACCAATGGGCATAAGCCCTGATCAAATTTCTAATGAAAAAACAGGAGCAATAGGTTTACCTGAATTTGGTACGTCATTTGTTAGACAAATGCTTAATGACATAAAACCTAAAACTGTTGCAGATTTAATTTCTATTTCAGGTCTTAGTCACGGAACTAATGTTTGAATTAATAATGCTGATGAATTAGTTTTAGAAAAAGGGCGCAAACTAAATGAAGTTGTCTGTTGTAGAGATGACATTATGCCTATGTTAATTGCAAAAGGTATCGAGCCTTTGATGTCGTTTACACTAATGGAAAAAGTAAGAAAAGGCAAAGGTTTATCAAATGATGAAGTTGAACTACTAGAAAAACATAATGTTCCAAACTGGCTTATAAAAAGTATGCAAAAAATTGAATATTTATTCCCCAAAGCGCATGCAACAGCATATGTAACTATGGCACTATGAATTGCTTGATTTAAGCTATATGAACCATTGGCTTTTTATGCAAGTTACTTTACTGCCCATTCAAAAGCAGATGATATTAAAAATATGATTGATAAACCTAATGGAATTAAAGTTTCAAAAAGGCTTTATGAGTTAAAGAAAACCGAAGATAGAAGTAATAAAGAAAACGATCTTATTGGCGTTTTTGAAGTAGCTGAAGAATTGTACGCAAGAGGTTTTTATATATCAAATGTAGATATTGACAAATCCCAAGCTGAAAAGTGGCTTATTGATAAAGAAAAAGGATGCCTAATACCACCTTTTTCAACAATCGAAAGCTTGGGATCGGTTAAAGCAAATGATATAGTTAATGCAAGAGAAGAAAAGCCATTTTTATCTAAGGAAGACTTTAAAACTAGAACAGGTGTTTCAAAAACTGTTTTTGATACAATGAACCAAATGAAGATCTTAGATAGTCTAAACGATTCAGACCAACTAACTCTTTTTTAGCCAATATGTCTATAAAATAGGGATATTCAGATATCTCTATTTTTTATAATTATATTCTTACAAAAATAAAAAAATTTTCTATAATTAACTAAGTGGTCGCGTAGCTCAGCAGGATAGAGCACAAGCCTTCTAAGCTTGTTGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGTGATCGCCATTTTTTTATTTTTTGATAATAAAACAAGCACTATGCTAAATTTATAATAAAATTTTATCACTGTGTGTTCACATAGCTCACCAGGTAGAGCACAAGCCTCCTAAGCTTGGGGTAACGGGTTCAATTCCCGTTGTGAACGCCATTTTTTTATTTAAAAATTCATAGTTTTTATACTATTTTGGGATTTTTTAAAAAAACATAAAAAGTAATTAAAAAACTTTAAAATTTATTAATATGAATAATTTGGCAAATGAACTAAGACCTAAGACATTAGATGACATTATTGGGCAAAAACAAGTGGTTGATTTACTTAAGAAAGTTGCAAAAGATAGAATTCATTCTAGCTTTATTTTCTTTGGAGAGTCAGGAACTGGTAAAACCTCATCGGCAGTGGCTTTGGCAAATGATTTAGGCTTAAAATATAATTATTTTAATGCATCAGTTAACTCCAAGGCTGAATTAACTAAAATGCTGTCTGAAAATGAAGTTTTGATTATTGATGAAATACACAGATTAAACAAAGACAAACAAGATATCTTGCTTTCATACTTAGAATTTGACAAAATTATAATTTATGCAACCACTACTGAAAATCCATATTTTAGAGTTAACCCGGCTCTGAGAAGCAGAATGCAAATATTGCAATTTACAAAGTTAAGCGAAGATGAAATGTTTGAAGGGGTGAAATTAAATCTAAAAAAACATTTTCCAAATTATGAAATGGATGACTCGACAATAAAAGTTTTTGTTAAGTTGTCAAATGGAGATTATAGATCTTGTCTTAATAACTTACAGATGTTGATTTTAATGACCAAAAATAAACAAATTAGCTTAGATGATATTAAAAAATTTGTGCCGAACATATCATTTTACAGTGACGAAAATTCATCCTCGCATTACAATAACCTTTCAGCATTTCATAAATCATTAAGAGGTTCTGATGTTGATGCATCGCTATATTATGGTGCGATAATACTAAAATCTGGTGATTTACAAGGTCTATTTAGAAGACTTATTGCTTGTAGCTATGAAGATGTTGGATTTGCTGATCCAAATTTGCAACTAAGAGTTAAAAATGCAATTGAATCGGCCGAAATGCTTGGCTTACCAGAAGCAAAACTACCTATTTTTTATGCAATTATTTCTGTGGCATTGGCTCCAAAAAGTAATTCTATGTATATAGCTATGCAAAATGTAGAAAATTATATTGATGCTGGCAATATATATGACGTTCCTAAGTTTTTGAGAGATGGACACTATGCTTCAGCTTCAAAATTAGGCGATTCCATAGGTTATAAATATCCGCACGATTTTCCTAATCATTTTGTAAAACAGGAATATTTGCCAAAGGAAGCTAAAGGCAAGAGGTTCTTTTTACCAATGGAAACAGATTCGAAAAGAATAACGGAATACTACAAATTTATTAAGCAATTAAAAGGAGAAAAAGATGAGTTCTAAAATAAATTGAGATGAAATTAAAACTTTTGAACAATACAAGCAGGCTAAGAATTTAGCTTTTGGACCTGGTAGTGAAATAGAAGAGCTTAAATCAAAGATAAAGAGCTCAAATCCTGAAGAAAGAAAATTAATAGGAATTAAAATTAGTGAAATTAAATCATTTTATGAACTTAAGTTTAAAGAAATTGAAGAAAAGTTAGAAAAAGACAAAATAAATAAGATTATTGAAAATGAATTTATTGATGTAACTAAACCTTTAAAGCAATTAGGATCGCTCCATCCTATTAGCATTATTGAGCAAAGATTAAGAGATTGATTTACACAAAACGGCTATTTTGAAGCCGTTGGTGGCGAAATTACAAATGAGGAATATAACTTTGAAAGACTTAATATTCCAAATAATCATCCAGCCAGAGCTTCTCACGATTCACTTTATATAACAAACAATATTTTATTAAGAACCCATAACACTGGAATAACTGCTTATGAATTAGAAAAAAACGCCAATAAATGCGCCAATATTTTTTCAATTGGTAAAGTTTATAGAAATGATGAGGATGATGCAACGCACTCGCATCAATTTACACAGCTTGACTTTGTAAGTGTAGGACAACAAGTTAGTTTTCCAAATTTAATATGAACTCTTAAGTCACTTCTATCATATGTGTTTGAAGAAGAATTAGAAATCAGATTAAGACCAAGTTATTTCCCTTTTACTGAGCCTAGCGTTGAAGTTGACATTTTTTACAAAAATAAATGAATCGAAGTCCTAGGAGCAGGAATGTTACACTCTAATGTAATGAAAAAAGCAGGATATGATAGTAAAAAGTTTTATGGTTTTGCTGCTGGTTTAGGCTTAGAAAGACTCACAATGATCAAGTACGCAATAAGCGACATTAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042938|78679:89382|80667_81648_+|WP_013954530.1|DBSCAN-SWA MYKSKLTLKETQQAIQDLKFAFTKKLNQELKLTRVSAPLFVTSSSKINDGLNGDIPVIFSPNKWKENIEIVHSLAKWKRSALSRYKFLPGEGLWTDMNAIRKDDEVDYKHSLYVDQWDWELIINKDDRNLEFLKRIVGTIYKSIRYVENKINFKYPVLDQKLPSEIKFINSEELYREFPNVSPEERENIVAKKYKAVFIYKIGHTLPDGLPHSKRAFDYDDWELNGDIVFYDKVNDAALEISSMGIRVDSDSLTKQAKISRKKDSDMGEYHKLVLNQKLPYTIGGGIGQSRLSMFLLEKKHIGEVQASVWPDEHREFFEKEGVILL >NZ_CP042938|78679:89382|81772_86149_+|WP_013954531.1|DBSCAN-SWA MSSVGYKRFQAFCKANNIEINNELEGTELVLFNLNYDENSNDKLKLEFRFKNFISFDTVRKLKSFISSNRGKWDVSFVFSSDSYSKENILCFVNKIIDKTRFMPLKQINWENKFVVKDNNAYFENIDRDFENQYGMLIDKLLNKLKEYGFATLDFSYNYAANLTSNDQNLSLNAEESEKIKRELFKKMIELDQSSTSYESNSNSPLRIKRNLNKSYTRYSIKDLNDAPSRVNVEFVGILFASKKTFSKNKRLTIQFKVSDFESAVNCMWFLDTDWLSNEQKNLINPENQSWVKVKGSIPSSDKIKGNNFFVYVDSLELTACPLNINEDKAPEDRKRVEFHISTKMNTMDGLFNADDFVERAKRWKMPAIGIMDTDGAQGYPKLFNKAKKSGIKAIYGTAFTTINKANEAILGEIPEGSFKDYPYVSFDIETTGLSPKFHEIIEFGAVDINQDLKVGKTTQFFIKPKDKIGSFTTELTGITQQMLDSKGLDIKEGLEKIYDCLDGKIAIAHNAKFDFNFLKEQFRLNNMQFPRVTVIDTLVASRIGFPGYKRHKLEDVASRLGVVYDPNVAHRGDYDAKVLANVWVNIISELNAKGIFTLDDLSKYSSNELYAKMHGYEVSTIALNNQGLKKQFELITDCLTKKYINGPITFKEDFASLNRTDILVGSGTLKGLLIDKYFYSSHDDFINELKLYDFIEIPAPQCFEHWIKYGFITTKQLQKGLSEIIYEAKKHSKIFIATADVKYLDPWDQEIFKSLVYAKGIKNARHYLFDYKKAEEGRLVIPNQRFLTTEEMTEQFAFLQDNQLIEELVIDNTQLIANMAENIEVIKSGLFTPEFDDSKKKLYDLVYKNAYAKYGEKLPEIIQKRIDSELNPIIKYGFDVIYWISYKLVKLSIDQGFIVGSRGSIGSSFVASLIGISEVNPLTPHYCCPNCKYFEVANAPGVTSGYDLPDKPCPECNTLIKGDGQSIPFETFLGFNADKVPDIDLNFTGEFQGVVHEEIRRLFGKSHTFRAGTISKVAEKTAFGYVKSYAEQTRQTIPQIFVEFLANRIKDVKRTTGQHPGGIIIIPKQFDIFDFTPINYPANDQSSSWLTTHFDYKAIHDNVLKFDILGHDNPTSIKLLEQYTGINIYDVPKNDQNVIKLFSSTEPMGISPDQISNEKTGAIGLPEFGTSFVRQMLNDIKPKTVADLISISGLSHGTNVWINNADELVLEKGRKLNEVVCCRDDIMPMLIAKGIEPLMSFTLMEKVRKGKGLSNDEVELLEKHNVPNWLIKSMQKIEYLFPKAHATAYVTMALWIAWFKLYEPLAFYASYFTAHSKADDIKNMIDKPNGIKVSKRLYELKKTEDRSNKENDLIGVFEVAEELYARGFYISNVDIDKSQAEKWLIDKEKGCLIPPFSTIESLGSVKANDIVNAREEKPFLSKEDFKTRTGVSKTVFDTMNQMKILDSLNDSDQLTLF >NZ_CP042938|78679:89382|88722_89382_+|WP_013954533.1|DBSCAN-SWA MKNKFDEFIENESKKEYFIDLFASIENESKSNNIFPSKDKIFECLKYSNPEELKLIIIGQDPYYKKGYADGLAFSTENKHCPKSLENIITELKKDYPSALVETFSLKSWAKNHILLLNSVLTVSEDKPNSHSGFGWEIFISNLLDFILELNCNVIFGIWGKKAYSLIKDKVDDKRIIYTSHPSPLSYSKTNHSFKDSNFFKKVNAKLTNPIDFSIRKEN >NZ_CP042938|78679:89382|86554_87778_+|WP_013954532.1|DBSCAN-SWA MNNLANELRPKTLDDIIGQKQVVDLLKKVAKDRIHSSFIFFGESGTGKTSSAVALANDLGLKYNYFNASVNSKAELTKMLSENEVLIIDEIHRLNKDKQDILLSYLEFDKIIIYATTTENPYFRVNPALRSRMQILQFTKLSEDEMFEGVKLNLKKHFPNYEMDDSTIKVFVKLSNGDYRSCLNNLQMLILMTKNKQISLDDIKKFVPNISFYSDENSSSHYNNLSAFHKSLRGSDVDASLYYGAIILKSGDLQGLFRRLIACSYEDVGFADPNLQLRVKNAIESAEMLGLPEAKLPIFYAIISVALAPKSNSMYIAMQNVENYIDAGNIYDVPKFLRDGHYASASKLGDSIGYKYPHDFPNHFVKQEYLPKEAKGKRFFLPMETDSKRITEYYKFIKQLKGEKDEF >NZ_CP042938|78679:89382|87767_88733_+|WP_013456569.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSSKINWDEIKTFEQYKQAKNLAFGPGSEIEELKSKIKSSNPEERKLIGIKISEIKSFYELKFKEIEEKLEKDKINKIIENEFIDVTKPLKQLGSLHPISIIEQRLRDWFTQNGYFEAVGGEITNEEYNFERLNIPNNHPARASHDSLYITNNILLRTHNTGITAYELEKNANKCANIFSIGKVYRNDEDDATHSHQFTQLDFVSVGQQVSFPNLIWTLKSLLSYVFEEELEIRLRPSYFPFTEPSVEVDIFYKNKWIEVLGAGMLHSNVMKKAGYDSKKFYGFAAGLGLERLTMIKYAISDIRYLYKNDLRTLLQFKNEK >NZ_CP042938|78679:89382|78679_79708_+|WP_078086171.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTVSNIVGFKSRSIYNLFDRITIETKRGYAKYQKKCKLCGMDLKGKTIYVISALKFLNLIETRHDSKRLENNSKLLMKYIDIFKFYKQLLYFYLKNRNSFNLDSKAVKQSVASIIFKYISELEAQGKLQNSYIPSVQNFYRILAKHSAFGLKLDILPYKSNGKYGSRTTVKHETKKKTIGKLITERPESVNLRLNDNDYEMDTVIGLRSDNYCILTLINRKSRMFYCTLSRRNAKAIKENLEKLIKDNNLVIDTLTIDNGSENYKLPEIESIKEIFHCHPYSSSEKGSIENAHRLLRRYIPKGKSIDKYVGQDLKPIADFINSHPRIYKGVSGFKCAKQMQ >NZ_CP042938|78679:89382|79910_80675_+|WP_041309069.1|DBSCAN-SWA MNIDAIYSTFFVNGSNVISAWFVIIFGFLGMSMTLILGLPQAIHLYKCKKTGNVKYYSYWMFLFGILSWIFLGAFDPVQKMFAIVISNCICSLIYVITLWLTYRYSSDPKRKRNQWIVLFSSLLLSIFVISLSISALVLEWKLPQIAQMSIAQIVPIITTFAFFPQVLKAIDSKDYSGMSASMVWTFILANVFWTLYWVFFIINAGIAPQLISALIWQVLSLLLYSLLLIKMMHQAKLNKINNTNENVAENKYV |
7 | Faecalibacterium_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
322439 : 410598
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP042938|322439:410598|DBSCAN-SWA 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58 | Tupanvirus(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
477581 : 523821
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP042938|477581:523821|DBSCAN-SWA 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36 | Faecalibacterium_phage(40.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
710948 : 744971
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP042938|710948:744971|DBSCAN-SWA 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37 | Faecalibacterium_phage(60.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
763045 : 825761
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP042938|763045:825761|DBSCAN-SWA 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44 | Staphylococcus_phage(18.75%) | tRNA,transposase,integrase | attL 762384:762410|attR 822978:823004 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
944232 : 1006261
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042938|944232:1006261|DBSCAN-SWA 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49 | Faecalibacterium_phage(22.22%) | transposase,tRNA,integrase | attL 943900:943951|attR 983392:983443 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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