Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048760 | Campylobacter jejuni strain ZS005 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,WYL,csa3 | 0 | 1 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048760_1 | 1359434-1359513 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048760_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP048760_1
>1.1|1359457|34|NZ_CP048760|CRISPRCasFinder TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048760_1
The CRISPR arrays of NZ_CP048760_1 >merge|NZ_CP048760|1|1359434-1359513|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTCTTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAATCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC >NZ_CP048760|1|1|1359434-1359513|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTC TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAA TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC
>NZ_CP048760.1|WP_002858238.1|1359032_1359359_+|ribosome-silencing-factor MQERIDLIVKILDEKKAENIKTIDMSEQEYFVKYVIIAATLGERHALSLIDELKTRLKAKGEEFLNIDSSEEWSVIDLGDILIHLLTPEHRGIYNIEELLENLKKGRV >NZ_CP048760.1|WP_002867281.1|1358459_1359005_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKIALFGGSFDPPHNGHNSVVLEALGKLDIDKLIIMPTYINPFKQSFSADEKQRFLWVKKLWGHLPKVEICDFEIRQKRPVPSIESVKYLYKLYNPSKFYLLIGADHLEKLHLWHDFEKLNSLVEFVIANRNDIGIPKNFKDLKTNKKIASSFIRDTLNTNEVCEEIEDEVKKYYEKLQKN >NZ_CP048760.1|WP_167840739.1|1357401_1358400_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRCVARIILERNDIELVAINDTTDIELTKYLFKYDTVHGEFKGSVDSEGDDLVVNGKKIKVFKSRNVKDLDFAKHGAQIVLECTGAHLTMAKCQEFVDMGVQKVIMSAPAKDDTPTYVLGVNSELYKGESIISNASCTTNCLGPVCRVLQDNFGIEKGLMTTIHAYTNGQSIIDAKAKDKRRSRAAAQNIIPTSTGAAKAMKLVMPELNGKLHGQSMRVPVIDVSSVDLTAQLSRKVNKDEINEAFRKAAATNLKGILMVDDDERVSSDFITCSYGAIVASDLTQVIADDFIKVIAWYDNEWGYSSRLVDMAVYIANKA >NZ_CP048760.1|WP_002783833.1|1356196_1357399_-|phosphoglycerate-kinase MSDIISIKDIDLAKKKVFIRCDFNVPQDDFLNITDDRRIRSAIPTIRYCLDNGCSVILASHLGRPKEISSKYSLEPVAKRLARLLDKEIIMAKDVIGEDAKTKAMNLKAGEILLLENLRFEKGETKNDENLAKELASMVQVYINDAFGVCHRAHSSVEAITKFFDEKHKGAGFLLQKEIDFASNLIKHPARPFVAVVGGSKVSGKLQALTNLLPKVDKLIIGGGMAFTFLKALGYDIGNSLLEEELLEEANKILTKGKNLGVKIYLPVDVVAAPACSQDAPMKFVPAQEIPNGWMGLDIGPASVRLFKEVISDAQTIWWNGPMGVFEIDKFSKGSIKMSHYISEGHATSVVGGGDTADVVARAGDADEMTFISTGGGASLELIEGKELPGVKALRSKENE >NZ_CP048760.1|WP_002860389.1|1355528_1356200_-|triose-phosphate-isomerase MIFAANLKCNHTRASFKIYAEILNKTMGAKCDDIIVFPPSVAFLENENNFIQGAQNFYPCVNGAFTGELGKEHLDEFGIKCVLIGHSERRALGDEELIGAKFDFAKEHGYKIVFCIGENLDTKNSGKTLEFLKKQLEIIDLNYERLIIAYEPIYSIGTGVSAQSTDIAKVLEFLVSLTKAPLLYGGSVNENNIKEILSVKYCGGVLIGSAALKVENFIKLIKG >NZ_CP048760.1|WP_052794212.1|1354700_1355525_-|enoyl-ACP-reductase-FabI MIMKGKKGLIVGVANNKSIAYGIAKACFDQGAQLAFTFLNDALKKRVEPIAQEFNSNFVYELDVNNNEHLDSIAEKIKKDLGEIDFVVHAVAFAPKEALENSFLETSKEAFDIAMQTSVYSLLSLTRAVLPILKEKGSILTLSYLGGVKYVPHYNVMGVAKAALESSVRYLARDLGVKGIRVNAISAGPIKTLAASGIGDFRMILKYNEINSPLKRNVSIEDVGNSAMYLLSDLANGVTGEIHYVDAGYNIMGMGDVEKNEEGQTVLCWDNQKG >NZ_CP048760.1|WP_167840738.1|1353203_1354697_-|hydrogenase-small-subunit MAKLSNEELKNILEDRIKKLENSTLKEDKVINEESVKILARHLSLGNEIPALAQRFFQIAPKTKLVWLHLCECTGCSESLLRSELPSFDELIFDFFSLEYHETLMAANGTKAEELLEHVLEEDFILAVEGGVAAIDTFFLTIGAQGESGYEILEKLAAKAKAIFAVGTCSSYGGIQAAYPNPSKTCGISEVLSQKVVNIPGCPPSDINIIATLSFFALFGVLPELDEQNRPVWAYGKCLHDMCERKAKFESGIFAEHFDDEAAKNGACLFKIGCKGPYTYNNCPKVKFNAKTSWPVAAGHGCIACSEKNFWDEFGNYEKPMANIFSYAKLCNEELKQEFFPEEQIKILEQIDFEFESNIKLILQNIAKNKLGASLVENYKKSFEKNYAFIEQNFDENPMPSKDFWKYLEMSFILVKGAFLKDKNDFLIAAKNYAFKHASPYDFKLNMNAEKPKLDVSKSFRMTLIYLCGGLDFEGIAYSILKAFEDNITKISSLKAS >NZ_CP048760.1|WP_167840737.1|1351365_1353207_+|ferrous-iron-transport-protein-B MKKIKIALVGQPNVGKSLLINVLCKANMKVGNFSGVTIEKASAKTFYKNYEFEIIDLPGTYSLDGYSEEEKITRHFLNQNDYDVIVNVLDATNLERNLILSAELLSLNKKMLLALNMCDEAKKEGIELDTSVLSQEFQSQVVEISAKTKENLELLLQKIIILFESKFISRSQFYTPLCEKSPEKEYLLYFINELSKKIITRKKEERNLTKKIDALLIHKFFGLPIFLFLMWLLFQLTFSLGQIPMDYIESGFNALGELVKNNISNTFIASALADGIIAGVGAVILFLPNIMILFLGIALLETTGYMSRIAFLLDGILHKFGLHGKSFIPLITGFGCSVPAFMATRTLKNKRDRLLTLFVINFMSCGARLPVYVLFIGAFFPSEKAGNYLFGIYILGAILGLCAAKFLRMTAFRGLDEPFVMEMPKYRMPNWHLVWFMVYNKAKMYLKKAGTFILLASLLIWFASNFPKNEENLNDFNAQERAIEQSYLGQFGKGIEPIFKPLELDWKLSISLISGLAAKEVMISTMGVLYSLGKEVDETSSDLKGIIAKNIPIPSAVAFILFVMIYNPCFAATIVFSKESGKLKYTLFLFLFTCISAYIVAFIGLHIAKILLN >NZ_CP048760.1|WP_002859677.1|1351144_1351369_+|ferrous-iron-transport-protein-A MTLDNLKDGQKAIIVNLSAQKELKNRLLSFGFIKNKNLKKIHSSLKNATIMVELDASCVILRSDEAKTIEVNLI >NZ_CP048760.1|WP_126207373.1|1349722_1351063_+|MmgE/PrpD-family-protein MFYSEILADFIFNLKYENIPNTVVQRAKELMLDSLGTAIAASKEECVLNAFKAFENLSTEKNTLIWVNDQKLDPIYAAMLDGIASHALDFDDTHTEAILHASAILTPLCLSYGFHVSKDAKKIIKAFIVGWEIAARVGIASKGTFHKRGFHTTAIAGIFGSVSASAILLDLNKEQIINALGLAGSFASGINEFLSNGSNSKVLHIANAIKNGIIVAHFAKNHMSGPLSIFEGRDNIFKCFGIEEECDKTELNKALGEIWQTMQVSIKPYPSCHFAHGLIDCAIALKNDSLKADEIKSIHCFVDEVPISFICDPLEAKYTPNSAYEAKFSMPFLMALGFFDGKITLESYENLKREEVLEFAKKISYEKRKSQGFPKYFPGHLEASLQDGRTIQKDVFINKGNFDNPLSFEELKAKFLANAQIYLDNAKANKILDQIINLENLNHFSF >NZ_CP048760.1|WP_167840740.1|1359814_1361185_-|phosphoglucosamine-mutase-PgmL MLDVIFREYDIRGLYDKELNEKSVKAIGFCLGQTMLNKGCKNVSVGYDARYSANELFNYLVSGLNKAGIKIYDIGLVPTPLGYFSLYEGLKFDANVMITGSHNPKDYNGFKITINKESFFGVELKEFSKEVYKHLDDDIEENLEVEKYDILSLYVKFMCEQFSFLKDFNYKFGVDCTNGAAGVVIEPLIKALNLKAHVMFAEPDGQFPNHAPDPTEEENLSAIREFLNQNQDYSLAFAFDGDADRMVALSKTHVFCGDELCYLFAKNIPNPRILGEVKCSKNLFDEVAKFGTIFMGKTGHSNIKKMMKEKDIDLAAEVSGHIFFKHRYFGYDDGIYAFLRALELVYKGFDLESMIKALPKLYTTPEIKIPVNEEEKFKLVEEFQKEIEKGALKGVKSLCEIDGARIDFGDGWALLRASNTSPYLITRFEATSLERAKELESMVFTLFNDIKARFKN >NZ_CP048760.1|WP_002855429.1|1361306_1361843_+|flagellar-basal-body-associated-protein-FliL MDEELENEETKKKKGGSLVIIIVILLFVLLLSIMGVIAWLISSSSSDESEVKEAPKEEAKADKPKVSAPTQRGSDFANIGPMYPLDPFTLNLLSDSGSRYVKCTIELEQNSELLKPELDKKVPVIRDIIIRTLTAKTFEEVSTQKGKERLKDELVGKINEILTDGFIKNVYFTDFVVS >NZ_CP048760.1|WP_002825806.1|1361842_1362190_+|holo-ACP-synthase MRVGCDIIAISRIEKIHSRHGKNFLDKFLSPKEQILIKNPATLAGLWAAKEAASKALGVGICELCSFFDIEISKDEKNAPKLKYSQKITKDFNITQTSLSISHDNGFAIAIVAIV >NZ_CP048760.1|WP_002780440.1|1362190_1362610_-|hypothetical-protein MKRVRTKIRANFRRRVKRTLKGSLKEKLAGTILLCAIVPLAVLGYLFIVIIGIFFNTARARQGVRALDHFVNASLFNGYAWESVSSHAWRERNRKKWARIVIKITDFFQKDHCKRANKREQPVVDFILSRNLDKQTIGK >NZ_CP048760.1|WP_002780438.1|1362606_1363968_-|cytochrome-P450 MSECPFFPKPYKNKASTLLTFLLKRRSWLDGLYERSYKMQTGYVKMPNFDLYVINDTKEVKRMMVDEVREFPKSAFLHELLSPLLGESIFTTNGEVWKKQRELLRPSFEMTRINKVFNLMSEAVADMMDRFSKYPNHAVIEVDEAMTFITADVIFRTIMSSKLDEEKGKKILNAFVTFQEQSVHTAMRRMFRFPKWLSYVLGDCKRAKAGDVIRQVLSDIIKPRYDMADNAEFEDILGSLLLVVDADTNKRFSFEEILDQVAMLFLAGHETTASSLTWTLYLLSLYPKEQEKAYEEITQVLQGGVIEISHLRQFKYLTNIFKESLRLYPPVGFFAREAKKDTQVRDKLIKKGSGVVIAPWLIHRHEEFWTNPHGFNPSRFEGEYKKDAYLPFGVGERICIGQGFAMQEAILILANILKTYKLELEEGFVPDVVGRLTVRSANGMRIKFSKRKL >NZ_CP048760.1|WP_085782221.1|1363964_1365086_-|DUF829-domain-containing-protein MDREVFYIAGYDPKSYRFYYDLFKKNLKDYSHAFNIKVDLSKIEKNEQFPFFQISCEGVQTTYHFLTWNDIVKKNWSENYKDALADCYSFFRIYTITGLFIKFGKESIYQLITGYYPFFYVLFSLLFSLVLAFGSFAFLQNYMHFSLAIIIGCFLGFLLNHFLFKLGKKLAVFWIARICAFCATWQDKKTGAMQERIKLFANTIVDKLKQNENKQDYELVLVAHSVGTIVCIEVLECILRQNLDLSLLHKLKILTLGECIPLVSYQKKADEFRKKLEFVSRFDLKWYDYTSIIDGACFPQVDFFRTSGVNAKFTPPFLSAKFHTLYEKHEYKKIKRDKNKAHFLYLYSISVKGDYDFFSFIIMPKFLEEKVKI >NZ_CP048760.1|WP_002868491.1|1365157_1366342_-|capsule-polysaccharide-modification-protein-KpsS MRFSTKIKKEFSGKNVLLLQGPVGNFFHHLAMKMKKNQTKVFKLNFNGGDFFFYPSGTRCKCDEKDLENFYRDFFQNKKIDAILMYNDCRIIHAKAIKVAKELGIEIWIFEEGYLRPYCITLEKDGVNANSSLPRDKNFYLSQNIFTKESIKEIPGGFKFMAFDAFLYWLFAFILAPFFNNKLHHRTLYPFEFLFWFRSLYRKYLYKITEKKLNEKIYNLEKKYFLAILQVYSDTQIKYHYKKSIEHFIEETILSFANHARAKSYLVFKHHPMDRGYKNYSKLINDLSQKYHVEGRVLYVHDTHLPVLLRKALGCITINSTVGLSAILEGCPTKVCGNAFYDFEGLSYPKKLQFFWREAHAYKPNPVLVCNFKKYLLQTNQFNGNFYKNFFLDK >NZ_CP048760.1|WP_167840741.1|1366338_1368408_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein MKHYSISKKLIANVRNFYTISLYKKKSKINKDDLFLGWGRKKSGLKAINLAKKYKAKFMLLEDGFIRSLNLGVENSPSFSMVKDDIGIYYDATAPSKLENLLNTYEFKDEEIKQAKKAIELIKKYKISKYNNNLDIPDDYFQKDEKRVLIITQTANDASLEFGLAKGFKTVDMIKDAIKENPKSKIYIKIHPDVLSGKKQSDLDINSLPKECILITENFNPVALLEFFDKVYTKTSGMGFEALMQECECICYGIPFYAGWGLTKDKLECKRRMQKRSLEEVFYAAYILYSEYFNPYFNQKSNIFDTIQTLAKYKDIEKANSNRLFFFGFSKWKRKFVKPFFIAKNNEIIFLDFLDCLKNIQLKENDKFFIWGKRIDYNALKTTLIKKAQDENLLHFTPKISLVEDGFIRSISLGSDLTRPFSLIVDDKGLYIDPNKASKLEELLQNEIFDENMLNRAKNIIKILLENRFSKYNGLKHENLKINAKIGQKIILIPAQVEDDASMILGGFGLSTLDLLKEVRSKNQDAYIIFKPHPDVLSGNRVGLKDETLILEFCDEIVKDCSIDSAIKIADEIHTITSTSGFDALLRAKKVFTYGMPFYAGWGLTKDKYRCERRTRKLSLEELVAGALIAYPRYINPKTKTLCEIEVCLDIMLNLQKDYFSKKYIKLAIDFKTFMLRKIRRFYEFLAKK >NZ_CP048760.1|WP_002818256.1|1368404_1368917_-|adenylyl-sulfate-kinase MINSPYIIWLTGLAGSGKTTIGQALYEKLKLKYKNLIYLDGDELREILGHYAYDRQGRIDMALKRAKFAKFLNDQGMMVIVTTISMFNEIYDYNRKQLKNYYEIYIECDMHELIQRDQKGLYTKALNKEIDNVVGVDIEFDKPEADLVINNSCRNNLEEKVELIIKKLAL >NZ_CP048760.1|WP_002825812.1|1368906_1369668_-|NTP-transferase-domain-containing-protein MNAIILAAGFGSRLMPLTKDQPKCMVEYKNKKIIDYEIEALKSAGINEIAVVGGYLNEVLKNYLNKYDIEHFFINSKYDKTNMVHTFFCAKDFILKCIEEKQDLIISYADIVYFQDCVQKLINAKEELAIVVDKSWRKLWSKRFANPLEDAETLKMTNGYIIELGKKANAYDEIEAQYIGLFKFSYQFLSEVIAFYEMLDRDILYDNKNFENMYMTSFLQALIEKYNNAKAVEIDGNWCEIDFMSDLEVQIDK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048760_1 | 1.1|1359457|34|NZ_CP048760|CRISPRCasFinder | 1359457-1359490 | 34 | MH752385 | Bacillus phage Ray17, complete genome | 8509-8542 | 10 | 0.706 |
1. spacer 1.1|1359457|34|NZ_CP048760|CRISPRCasFinder matches to MH752385 (Bacillus phage Ray17, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttttttagctttatactcagccttactcatataa CRISPR spacer cttacaagctttatactcagccttattgatcgtt Protospacer .** . *******************.* **
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1196608 : 1237577
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048760|1196608:1237577|DBSCAN-SWA ATTATATTTTAAACTGAACTTTTAAAATTTCTTTTAATTCATTTATCGCTTTAATATTTTCTTGAATTTTAAATGGTTCTTTAAAAACAAAATCGATCGTTTTATCAAGATGCAAATAACAATGTTCAGGCTTATTAAAAGCTCCAAAAGCAACCTTTAAAAGCAAATTCTCATCTTGTTTATAGATGCTTTCAAAATGCAAGAAAAAATCATCTTTTTTTATAGTAATATTTTTAAAGTTCTGCTCTATTTTTTTCAAATCCTCTTTAGAAAATTCAACCGATGAGAGATTAAATTCATTTAACTCATAGTTTTTACACTCTTGGTTAAAATTCCACACCCAAAGATCATATATATTTTTTTCTTGCTTTTTCCATCTATCTTCATATTTGCTTGAAATTTCTAAATTTTCATTTTTTCTAAGGCTAAATTTTGGAGCAGGAAAAGTCAAAAATTGCTCTAAAGTAAAATTAAAATACTCAAAACTATCTGTTCTAAGCTCAAAACGACCATTTTGAACTAAAACCCTAGCACATTCTTTGCAAAAATCTTTCCCAATAACTCGCCTATGAGGCTTTTTGTCCCAAGGAACAGGGAAATGTAAAAAAATCTTTTCAACTGATTTTGATTTTAATACACTCAATAACAATCTCGCATCACTTTGGATTAGCAAAATATTATTTACATTTTGTGCTTTAGCAAGTTTAGCTACTTGAGTTAAAGCTGGATTGTAAATTTCCACCCCTAAAATTAAAACATTTGGATTTTCTTTTGCTTGATAAAGCAAATGTCTTCCTGATCCAAAGCCTATTTCTATATAAATTTTACCTTGAAGTCTAGATAAAAGCTCATCAAAATTATCAACAATAAATGGTGTTTTTTCAATTAAAGCATTGTTTTTAAGTCCAAAAGCTTCATTGATAATATCCTCACAAAAACCTTCTTTAAAGATTTTTAAAGCCTTTTGCAAATAACCTATTTTAGAAGGTTTTGTATGTTTATCGCCTTTAATCACAAAACCATTTTGTGCTTTTTTAATCTGCAGAAAAAAACTCTCTTCTTGAACCTTTGTATAAATAAGACTAACATTATCATTCTTAGCAAGCCAAAGAAATTCAACATCATCCTTACTATAAGGCAGATTTATTTCTTTGATCTTTTTACTTTTAAAATTTGGCACTACTGAGCCGCCTTAACTTTGCTTGAAGGTTCTGAACGAAGTCCAGCTGAATCAATAGCAATAACTTCATAACTATATTCCACCCCTGGTAAAGCTTTTACATCTTTTAATCGCTTTTCTTTAATGCCTTTAAAAACTGCATTTTGCTCCCCACCATAGCGTCTTACTTCATACTCAACAGCTCTAGTATCATTATCACTCCATTCTAAATTTATCCCTTCACTTGTGCTTTGGGCCAAAATAATACTAGGAGCCAAAGGGTTGCCTAAAGTTTTACCTTCTACACCATCTTTTGGCATAGGACTTTCAAGACCATCTTTATCGACCACTGTTACTTTATAATACTTGCTTTTACCTGCTCCTTCTACTATATCCTCATAAGAATTTTTATCAGTCTTTGCCAAAACACTAAAAGGAAGGAAACTTGAGCTCGTAGAATAAACTTTATAATAAGAAAAATCTTCATACGTAGGAGCATCCCAAGTTAAAATGATTTTATTAGAACCATCTGTACTAGCACTTAAATGCTCAACTTGAGGAGGTAAAGCCTTGCTTGTAGAACTTACAACTTGACTTGGCTCACTCTTTATCCCATTAAAACTCACAGCAATAATTCTATAACTTGAATTTTCATTAGGTTTTAAATCACCATCGATGTATTCAGCGTTTAAACGATTTTTTACTTCTGCAATTTTTTTAAATTCTTTATCATCACCTTTGGCTCTTTCAATAATATAAGAATCAACCCTAAAATCAGGATGCGGACGCCAAATAAGTTTAATACGATTAGGCAAATTAGTCACAGCTTGAACAAAAGGAACAGCTTCAAGTCTTGGAGCTGTGCTCACTTCTATAACCTTGCCATCTTCTGAAATTTGTCCTTGTTCATTAAAGCTTTTCATCATATAACGATACTTAGTACCAGGCTCTAATTTAGTATCTACATAATGAGTTTGAAACTTATCTTTAATAGTGCCTACAAGTCTAAAATCAGGATTTTCATCACTAGAACGATACAAATAAAATCCTTTAATATTTTCATTATATAAAGGCTCCCATTCAAAAGCAATATTACTCATATCACTAAGACTTTTTAAACTTTCAACCTTTGGCAAGCTTTCATTTACAGCAGGCTCTTTACTTGAAGCTAGCGAATTCATTTGCGAAACACTACAAGCGCTAAGTAAAAGAGTTAAAAAACTCAAGTAAAAACTCAAGCGAAATCTTTTCATCATTCTCTCCTAAATTAATTTGTTTAAACATAATATTTTTAAAATCTTCCATCAAAGGTGCTTTAACAAAAATTTGCTCTTTGGTTTTTGGATGGATAAAATACAAAAAATAAGCATGTAACATTATCCTACAATCATACTTACCCTTATAACCATACAAACTATCGCCTAAAATATAGCGATTTAAACTAGCCAAATGCGCTCTAATTTGATGAGTTCTTCCTGTGAAAAGCTTAGCAGCCATCAAAGTTAAATTTTCAGTTTTTACTACATTTATAAAAGCTGATTTTGCGTTTTTACTGAATTTATTTTCCTTATCTATGGCTATTTTTTTAATAGCATTAGAAGGCGAACGCATTAAAAATTTTTCTACTATAATTTTATCTTCTTTTAGTGGCAAATCAATTAACGCAAGGTAAATTCTTCCCATGCTTTTATCTGCAAGCTGTTCGCTTAATCTTTGATGGGTGAAGTTATTTTTCGCTATCAGTATAGCTCCGCTTGTATCTTTATCTAATCTATGAACAAGACCAGCTCTTATCTCTCCTCCTAAATTTGATAAAGTATATTTTTTTTCTATTAACCAATCCACTAAAGTGGCATTTTTAACGCTACTTGCTCCATGAACGACTAAATTTGAAGGTTTATTTAAAACAAGTAAGTCTTCATCTTCGTATAACACATCAATATCAAAATCCACTTCAAACTGAGGTTTTATCTCATCGCAAAGCTTTAAACTTGCAATAGAAATAATATCACCATTTTTAAGCTTAAATGAATTTTTATCTTGAATTTTATCATTAACCTGTACACAATCTCTTTCTATAAGTAAAGCAACTTGATTGCGACTTTGGTTTAATTTTTTAGCCAAAAACACATCAAGCCTTGAATTTTCATCTACTAAAAAAGTTTGCATTTTTTCCTTAGAGGTTTTGATAAATTTAAAATTTTAGTTTATAATTATAGCTTTATATTACCAACTGAAGGCAAATTTTGTTTAGATTAGATAGAAGAATTTTAACTCATTTTGACTATATGCAACCCATTTTATTTTTACCCATAATTCTTATTTCATTTTTCTTGATCTTTGAGGCTAATCCTTTTTTAGCAGAAAAACAGTTTGTTTATGCCTGTGTAGGATTGTTTGCTTTTATAGTTTTTTTCTTCTTCCCTATAAGGAAATTTATTTGGATTATTCCTGTTGCTTATTGGATTAATATTTTTTTATTGCTAAGCGTAGATATTTTTGGGATTGAAAAATTAGGTGCTAAAAGATGGCTTGAAATTCCTTTCACTCACTTTACTATACAACCTTCTGAAATTTTTAAACCTAGTTTTATTTTAATGCTTGCTTATCTTATTTATCAAAATCCTCCTCCAAAAAATGGATACAAACTTAAACAATTCATCAAACTTAGTTTTTATATCATCTTACCTTTTTTGCTAATTGCAAAAGAACCTGATTTAGGAAGTGCTATGGTTTTACTACTTGTTGGTTTTGGAGTGCTTTTTATCATGGGAGTTCATTATAAAATTTGGTTAAGTATTGTTATAGCTATAAGCGTTAGCTCTCCTATTATTTATACACATCTTTTAAAGCCCTACCAAAAGCAAAGAATTCATGATTTTATTTCAGAAAAACCAAGTTATCAAGTAACCCAATCAATGATAGCTATTGGAAATGGTGGTTTAACTGGAAAATCTCAAGATGAAGCTACACAAACTCATTTTAAATTTTTACCTATTTCAACTAGTGATTTTATCTTCGCTTACATGATAGAAAGATTTGGATTTATTGGGGGATTGACATTAATTATATTTTATATTTTACTTATTTTTCATCTACTTAGTTTAAATTATAAACTTAAAGATGATTATTTTGCTAGAGTTGCTATTAATTGTGTTGCATTATTTATTTTTATTTACGCGGCAGTAAATATCTCAATGACTATAGGTTTTGCACCAGTAGTTGGAATCCCTTTGCCTTTTTTTAGTTATGGTGGAAGTTCTTTTACTATTTTTATGATTTTTTTTGGAATTTTACAGCATTTAATCACTTTTAGATATTTTTGGACGGATATAAAGGCTAAATAAAATATTTTTAAGCATTAATAAGATATAATTTTATCTTTTAATTCAACTTAGGCGGATTTATAGCTCAGTTGGTTAGAGCAACCGGCTCATAACCGGTTGGTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTAAATCCACCATTACTCTTTTTTATCAAATCCCTATTTTGCTTTAATATATTAATCAAATGCCTATAATAAAATGTTTTAAAGCTTGTTCTATATCGTTCTTTTATATTCCAAAATGTGCTATAATGTTCTTAAAAAAGTGGGTCACTTTTCCAAAAATGGGTTACAAAATGGGCTACTTTTTACACCAAAATAGACACTAAAAAAGAGAGAAAAATTAATGGCAAAAATTAACAAACTTACCGATAGTTTTTTAAAAAGCATTAAATGCGAAAGTGATAAAAAATTTATAAAATTTGCTGATCCGAGTTTAAAAGGCTTATATGTTTTTATTTATCCTAGTGGTAAAAAATTATTTAAAATAAGACAAGCAAAT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58 | Campylobacter_phage(100.0%) | tRNA,tail,head,terminase,integrase,capsid,portal | attL 1194619:1194638|attR 1207010:1207029 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1376140 : 1384604
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048760|1376140:1384604|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048760|1376140:1384604|1383965_1384604_-|WP_052798066.1|DBSCAN-SWA MTKIKAIIFDMDGVLIEAKDWHYEALNRALKLFGMEITRYEHLTTFDGLPTKDKLKMLSLERGLPKSLHSFINELKQQYTMEIVYSLCKPRFHHEYALSKLKFEGYKMAVCSNSIHNSIKVMMKKSALENYLDFYISNEDVKKGKPDPEMYIKAIERLKLNPKECMIVEDNENGIKAARASGANVMIVDEVSEVNYENIKNHICKFEEELKC >NZ_CP048760|1376140:1384604|1380730_1382590_-|WP_052798069.1|DBSCAN-SWA MNIVIPMAGLGSRFAKAGFDKPKPFVDVLGKPMVVRVLENLRYKDARYILIARKEHLIKEKKLVDEIKNNFNVEFIAIDKLTQGTACTVLYARKYINNDMPLMIANSDQIVDINIADFIKDSFKRGLDGSILTFIDKEKNSKWSFVRLKGDLVVEVKEKEAISEFATVGIYLFNKGKIFVESAIDMIIENDRVNNEFYTCPVYNYAIKNGAKIGVYNIEDKQMHGIGTPEDLEKYKKYKEIDELSLITRDQCPITYSKNIEIINSRQFPLFCGCIEQDQKKDIICEEQFAVCRDSGVLFLNKLIPLDILYKNGHYAGNIGKIWDEHHKEFAKFIFQIRPKNILEIGGGHGKLSQFFLEMDNVNWTIVEPNIENKFENVNYIDGFFSKDICNNKQYDTIIHSHVLEHVYDPNEFFSEISSFLNNDKGYMIFSIPNMSKWLKNKYSNCLFFEHTILLDENVVDYILGNNNFTIIVKKYFKEHSIFYLAKKDVRSVKITLENKYLENKVDFGNMLRFYKNKVEYINSYIKQTPKKVYLFGAHLFSQNLIYSGLDTLKIVCILDNDLNKQKKRLYGTKFIVRSPKILINDSNALVILNAGIYNDEIEKDIIENINNKIEIIKC >NZ_CP048760|1376140:1384604|1383246_1383972_-|WP_052798067.1|DBSCAN-SWA MLNIVVPIAGKSYFFDNEKDGFPKPFIEICGKTMLEHFVKNYENVKNKRFIFILKEEDVKRYHLDDAINVLTNNQSKIIILKNETQGMVCSVLMAIDEINLNDSLLIVNMDQIFEYDLNEVISELSLNDAGVLSFESVHPRWAYVKCDENNFVLEAFEKKPVSKNAIAGFYYFNKADFFVKSAFDMIKKDVNYEGKYFIASTLNELILQDKKIINISIDKNRYFTFYSHAKINEYERIKNA >NZ_CP048760|1376140:1384604|1376859_1378383_-|WP_167840745.1|DBSCAN-SWA MILITSAKYSSSDFTLEFGKIPPSFLPLGNKRLYEYQIELFKNCNQKVFLSLPSDFKLSKFDEKKLKELNVEILFVPNNLSLGESVVYCLNVCCAFDEKLYILHGDTFFKELVFKENSLQVAKVKENYDWAYLDNEFHTPLKTIEDDLILAGAYGFSHPQFLIKCIVESSYSFVDGMKAYSKAYTFDIIKNDTWLDFGFITSYFHSKKAVSTQRNFNNIDISNGYIKKSSSWQEKIKAEINWFDNLPKELFIYTPKVITYEDSYEIEYLCNNTLAELYVFGKLPNYVWKRIFKSLKEFLDKLHSFKSNDKDINFNCKEKTLKRLQEFSMQSGIDLHKNIVINSKSYPSILTLVDKLDFYMNDIDEFSLIHGDFCFSNIMYDFRAGAIKTFDPRGFDFSGKITPYGDKKYDFAKLVHSVFGLYDFIIAGFFECKVNSDNIEFFIEEDVNILDIQKEFLDVFDIDDNIKALTLHLFLSMLPLHNDFKEKQMAFLSNTFMLYDTFFKESK >NZ_CP048760|1376140:1384604|1382586_1382916_-|WP_002826454.1|DBSCAN-SWA MKNYKLDEMIRGWFVGNFDPSVFKTNDVEVGVKEYKKGDTEEKHHHKIATEITVIISGKVRMNDKIYSKGDIVMINPGEVTDFEALEDAINVVVKLPGANNDKYLGECQ >NZ_CP048760|1376140:1384604|1378379_1378778_-|WP_052798071.1|DBSCAN-SWA MKTLLIDLDGTLTIDEEHVDYIDKKPNIILIKTLKEYKKQGFKINIFTSRNMRTFDGDLEKIKFHTLPTITTWLQKYDVPYDEIIIGKPWCGYDGFYVDDKAIRPSEFISLNYEQIKELLRKENPHKDGGNK >NZ_CP048760|1376140:1384604|1378817_1380737_-|WP_052798070.1|DBSCAN-SWA MLNNADILVKKAIDNWSYELLDNFLNNENLSDEHLLLMYKLGRYNFFLENIDYIDRLSSFLNTDSKDLYDFMHTCLKDKTVNENFLLGNYKNSYMSFLSSHLDVVDFGDFNFFLKILNEVKKSQDLILQSFFLKNSIDFFYINSSDIFFKGGIYFIMLEIIYNNFLNTLGGRLYYDKLRFIAGRYFISKKSYSGSRIALCLNGQLRPGWRDSIKALIDSFSHLGNIDVFIYSWDVESLWPGSGGNGAGWIRRFFYPMLNECPRELIMSNIDFSEKFPNVFGVISREFNKKIFIKDVLVLDNKIKKVILESYSKVVNRLGELKNDSKIYYGIYQVYKAMEEYEKQNNFKYDFIVRIRPDYIIEKNDIKIEDLHLLELNDIYDARYFCGLDGSLQIGRRSAMEIYMKTWVYAKENKENPYFNTYLKHFPQTCMSPGNGFLSHYVLSQWTDFLKLKVVKMNIKFSHLNHFLFDNISFPDVKNELNKDIWHIKKNKIFNEVQIGKIIDFFDLIAKKYQIISKNRNNLVKIKIQNHLAYKLGQAMIDNSKSILGYIKMPFVLFYIRYKHQKELQRRKTNPELVLPPLEDCSDYEEALKIKNYFSYKLGEALIQASKNWYKGGYVKFLFFDLFALNQNKIKSKKK >NZ_CP048760|1376140:1384604|1376140_1376863_-|WP_167840744.1|DBSCAN-SWA MIIIFPMAGLSSRFAKAGYDKPKYMLDLKGNSVFFHAVNSFKKYFKNFKFIFVYRDIENTSNFIKEECKKLGIKSYESVRLEQETLGQAHTVRLGLERANIKDDENILIFNIDTFRPNFSLPTTLDFCNIDGYLEVFEADGEQWSFVLADENDNVIKTAEKERISSLCSSGLYYFKKTKDFKEIFDRMKTENDFSEGELYIAPMYNYLIKKGLIIKYHIISLDEIIFCGTPDEYEILISI >NZ_CP048760|1376140:1384604|1382918_1383254_-|WP_052798068.1|DBSCAN-SWA MLKKLTEKYISAFNKKDINEVANLLNENFVLEDPVVKRIEGKEECLKAIENIFKNCNKLSFSAKNIFQDKNITFIEFILILDDIRLEGVDIIEWHDKKIVELRAYLDIPKG |
9 | Synechococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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