Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP050917 | Acinetobacter baumannii strain DT-Ab003 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP050916 | Acinetobacter baumannii strain DT-Ab003 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 9 | 0 |
NZ_CP050918 | Acinetobacter baumannii strain DT-Ab003 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
8710 : 16298
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP050917|8710:16298|DBSCAN-SWA AATGGAAGATATGCAAACTATCATAGATAAAATTAGTAAGTGCCTAGCATTATCAAAAAGTGCCAATGAGCATGAAGCAGCCGTTGCACTTAAGCAAGCACAGACATTGATGCAGAAGTACAAAATAAGTGAAAAACAGATACTAATTAGTGATATTAAAGAGCGAATTATTCAGACAAAAACTCAAAGAACTAAAGATATTGAAAGACGGCTTAAAGTAATGATCGCAAATGTCTTTGAATGCGGAAGTTACTCAGGTTTTTACACTTTAGAAGGTGTGAAATATCAACAACATGTTTTTTATGGAGTTGAACCAAATGTGTCTATTGCAACATATGCATATACTGTTTTACTCCCTATTTTGATTAAAAATAAACAAAGTTATTTAGCCACTTTACATGGAAATACTAAACTTAAATCTAAGAGACGTTTAGGCATAAGCTATCATAGAGGGTGGATTCTTGGAGTTGAAAAAAAGTGTAGGAACTTAAATCCAGATAAAGAGCTAAAGGAAAAACTGAGCGAATATGAGAAAACTCTTAATCTTATATATTGCGAAGTTAAAAGTGTTAAACATTATAATAAAGATATGCTTAATCAAGCACGAGTAAAAGGGTATTCGGACGGGAGTAAGGTGAACTTACATCATGCTATTGATCCTAATGAAACGAAAAAGATTTTCTTGAGTTGATTGAATGAGTAACGTTGATCCTCAACTTGAGCATGTTGATCCAGCTCATCCTGCTGCACCGGATGCTTACATGAGAGTTCTGAACTGTAAGAGTAATTATGTAAATATATTAGCTGGATGGTTTCTTAAAGATGGTAAGAAGAAATTTTATATTGCAGATGTAAGAGGCAATGAAGTTGAAGCCGGTTTTAACAGGCTTGATTGGTTGACAGAGTTTGACACAATTTATAAGGGCAAATAGGTTTTCTATTTGTCCTTATTTTTTTTATTCTTTTTGCGATTTTCAATAGTTTGTTGAACATCTTCAAAGCTAATTGTATTTATATATCTTTGAACCAATGTTTCAACAATATCTGAAGTTTTAACCATTTGACGTTGCTCTTGTTGCATATCTAATGCGGTATCCATAACAAGTTGAGCTGTTGGATCCCGGAGACGTACTGTAGATCCCATAACAAATCCTCCTTTCAGTAATTTATTATATGTGATTTATTTAATTTATATACAAAAAATATTACAAGTTTAATTTTGTTTTTGATCATATTTGTTAATTCTAGCCATGTTTTATTTCTTTGGTAGTTTAGGCTACCTTGTTTCTATAAAATTGGATCTAGGAGCAAATAGAGCGATTTAGAGGGCTATTTGTCGCAACCCTGCGGGATTGCTTTGTTATTACCGGATAAGGTCCAATGGGAGAAGTTTCACTTCTTCGGTCGTCTAGTCAAAATCACAGATTTTGACTGACTCGCTCGAAGTTTGAAACGGTAATCAAGGAGGGGGATGCTCGCAAATTTCATCAGTTCGCAACGTGGACACGTTGCTCTGCAAATGTATTTTATAACACGAAAAATTACACTAAATATATGTTTTTTCTTAATAAAAAGACATGAAAATGTAGTATAATTAAGGGGTGAAATCGGATAGGCTGGTTTCTATATATGAGCTGAAAAGCTTAAGGTGAATTGAATGAAAAATAATGCTTTATATAAAAAGCTTGATAGACATGATGATGTGAATGTTATTCCTAATGTATTAAAAAATGCTATAGGACAGGCACTTGCATCTGAAGGTAAGTTGTTCTCTGTCTCAGAAATAGATTTAGATATTTATGATTTAATTATCGTCAGTATGAGTGGCGGAAAAGATAGTATTGCTTCTTTGCTCTATTTAATAGAGAAAGGCGTGGACATGTCAAAGGTTGAATTGTGGCATAACCTTGTTGACGGTAAGAGTGAGCCGTTTATGGATTGGCTGTTTATGGATAGCTACAACAAACAGCTTGCCAAAGCATTTAATTTACCAATTTATAATAGCTGGTTAATGCATGGCTTCGAGGGGGAGATGCTAAAAAATAATTCCATAAGCCATGAATATGAGATTGAAACACCGAGTGGGAATATCATTATTCCAAGAAAACGAGCAAAAGCTGGAACGAGATTGCGGTTTCCTCAACAATCAGCAGATCTCCGTATTAGATGGTGTTCTTCAGCTCTGAAGATCGAGGTAGGGCGTAGAGCTTTATCAAACCAGGAGCGTTTTAATAACTCTAAAGTTTTATTTGTTACTGGAGAGCGTCGAGAAGAAAGTCCTAATCGAGCAAAATACTTCCAATTAGAAACACATTTTTGTGATAATCGTAATGGGAAAAAAGGTCGTCTAATTGATGCATATCGACCAGTTCTTGATTTTACAGAACGTCAAGTGTGGGAAATTTTAGAGCGTCATAATGTCGCAGCGCCAGTACCATATCGCTTAGGATGGTCGAGATCAAGCTGTATGACTTGTATCTATAATAGCCCGAAAGTTTGGGCAACAATCAAACATTATTTTCCCAATCGTATTGATCGAATTTTTAAATACGAAGAACAATTTGCAACTACAATTAGTCGAAAAAAAATCAATGTCATAAATATAAGTGAGGGTATTCAGCCTTTTAATATCAATGATTTAGTAGCTTTGGATCAGGCAATGAGAAAAGAATATACCTTGCCTATATTTACAAAAAAATGGGAGCTACCTATGGGGGCCTTTAATAAAGAGGGATGCGGTTCAGATTAAAAATTATAAAAGGCTAAAACAATTGAGATTCGAGCAGAAATGCTTAAGGTGAAATTAATGAAATCATATTATCAAATTAGCTTTAGTGGTGGACGTACTTCAGCATATTTAACCTGGTACTTGCTTAATAACTATAGCCACCTTTATAACTTTATAGTCACATTTGCAAATACAGGCATTGAGCATGAGAAAACTTTAGAGTTTGTCGATAAATGTGATAAATATTTTAATTTCAATACAGTTTGGTTAGAAGCAGTTATTCACCCTAAAAAAAGAGTAGGTACGACGCATAAAGTTGTCAATTTTAAGACAGCTACCAGGGGGCCAGTACTTTTTGAACAGATGATTGAGAAATACGGAATTCCTAATAAAGTTTATAAGCATTGCACCCGTGAATTAAAAATAAGACCAATGGATTCATATATTCGTAGTATTGGGATGAAACCTAAAGATATCCCTACTGCAATCGGTATCCGGGCTGATGAATCTAAACGTTGTGCTAAGGATGCAGAAGCAAATAACTTTATTTATCCATTAGTCACAGAACATCCAGTGGATAAGCAATTCATATTAGATTGGTGGTCAAAGCAAGCGTTTGATCTAGAGCTAAATGAATGGGATGGAAATTGTAATATGTGTTTTGAGAAATCATTTCCAAAATTATTGAAGCAGCTTGAATCAAATCCGTTTGCTTTAGAGTTTCATTTACGAATGGAAAGGATCCACGGGCAAACTAACAATCAACCAGGCAGGCCTGATAGAGTTTTTTTTCGTCAAAATACTTCAGCAATTGATATCTTAAATATGTTTAACCAAGCGAATGTAGCTTAGACATGTGTTATGTGATTTTTAAAGTAGGTGTAGGTAAGTATATCTATCCCTAACACACTAGAATATTAAAAAATGCTGTCAGTTCCATTAATTAACTAGAGTGGATGAACCTAAAATCAATTAGATTCGCAATTTAGAAGCGCAACCCTGCGGGATTGCTTTGTTACTCCCGGATAAGCTCCAATGGGAGAAGTTTCACTTCTTCGGTCGTCTAGTCAAAATCACAGATTTTGACTGACTCGCTCGAAGTTTGAAACGGTAATCAAGTAGGGAGATGCTCGCAAATTCCTTCAGTTCGCAACGTGGACACGTTGCTCTGTTAGTAATGTTTAATTCGAAAATATATTTCATTAAATTAATGTTTTTTAACAATATTAACGTTTAAAGATCTTGATTAAAATACATCATTGTATTACAATTTTGGTTAGAAATCGGATAGGCTGATTTCGTATTTTGAGCTGAAAAGCTTATGGTGAAAAAATGAATAATTATTTTAATGTATTAATCATAACTGATTTAAAAATTGGTCGTTTAAAGACTCCATCACATTGTGCATGTGCTGTTGGCCATATTGATATTAAGAAGCCATCTTTTGAATACAATACTGGCTTAGTTGCCTTATCTACTACTATGTATGATTGTAAGGACTTTAATGTTTATACATTAAGTACAAAAGAGTCATTTAATAAGTTTATTTCAACATTAAAAGTTCTTGAAGAATTGATTGGTATTCCTTGTCCTTTCTTAACCGCTATTCAAGAAACATATGAGTTCTATGGTGACTTCATTTTTGAATGTTTGACCTGGTTTAATAATAACGCAGATATATTATTCAGACCTGACCACTTGGGAGAATTCACTAAAACAGCAGATGAGTCTCTTAATTTCCAATTAATGTATTTCAAAGTCTTAGAAACTTTTCGTAAAGCCGGTTTAAATGGTTTTATACAATTCAATACATTGAAAACTATTAATTGATTGAGCTGAAGAGCTTGCGGAGAAAAAAGTGAATTCAAAAGTTAACATTGGTAAAACTTATAGTGTTTTGAAAAGTGAGTTTATACATACCTTAAAAAGTATCGACCAATCTAAAAACATTTATGAAATATTTCATGACTTTGTTTTTTGTTCAGCAGCAGCATTAAGAAACTCAATTGGTCATAGATATCAAAATTTGTTTAACCACAATATTGAAAATGAATATCTTCAACGTATCAATCGTTACGACGTTAGTGGACGTTTAAAAATAAAAAAATTGTTTTATCTGTTGGTGGATTTATGCGAAGCAAAGGGTGAGCCATATGATGTGTTAGGTAGCATTTACATGGAATTAGAAATTGGGAATGATCATATCGGCCAATATTTTACACCAAGTGAGGTATCAAATTTATGTGCTCAAGTTGTAATGACCGACCTTAAAAAACAACTTGAGGAAGAGGGGGTGATTTCGATTTCCGATCCAGCTTGTGGAGCTGGCTCAACTTTACTTTCAACTGTAAAACTCTGTTTGGAATCTAAGATACAAGTGCAAGATCACTTGTATATTGAGGCAGCAGACATTGATAGAAACGTTGCTTTAATGTGTTATATACAACTAAGTTTGTGGGCAGTGCCTTGCCGTATTTTTGTTGGTGATACCCTCAAGTTAAAGTATCGTGAATGCTGGTGTAGCTTAATGTATTACGTAAAAGGGTGGGACATAAAATTGCATAGTCAAAAATTAAAGGAAATTGTACATAAAGCTGAAGATTATGTACCTAATTTCATTTTAATTAATGATTGATTTTTTTATATGCATAGATGTAACTTACACAAGCTTAGGTTGTTGCGGATCCGCAACAACCTATTTAAGACAAATTGGCGCTATAAAATTTAATCTTTTTCTTGCAAAAAAGTATGTTTTAGTAGTATAATTTATTCAGAAATCGGATAGGCTGATTTCAAAATTGAGCAGAAATGCTTGGAGTAAAGAACAATGAAAAAAATCGTAATCACTAACGAAAAGGGTGGGATTGGCAAAACCTCTGTTGCTGTTCATTTGGCACATTACTGTTATGAGCGCGGTATGCGTGTTCTATTTGTAGACATGGATAAACAAGGTAATAGTGGTTTCTCACTTAGTAAAGTTGCGGTTGAGATTAAAGATACCCATAGTCTATTTGCGGATATCCAAAACTTTGAAACTTTAGATAAATATTTTGTTCTTTTTAAAGGTAATAAGAGTTTAAAATCACTTTTTGATCCTACAGAACAAGAGTTTAAGCTAGATAAAGTTGAAGAATACCAACGTAATTTCAAATCAAATATTGCTAAGGCTAACGAATTTTTTGATATCTGTATTTTTGATACACCTCCTACAGACGGCCCGTTTCAGCGATTACCTTTGTTAGTTTCTGAATTTGCTCTATCTCCTTTTTTATTGGATAAATATTCAATTCTAGGGCTAAGAGGTATTATTGATACCACACAAGAAATTAAAGAAGTAAACCCAAAAATTCAGTTTCTAGGGCTGCTTCCAAATATGGTTAGTGCTAACTCTGTTACTCAAAAAACAACTTTAAATGAATTGCAGAAACAACTGAGTCATTTAATGCTTGATAAGACTGCTTTCATCCCTAATCGATCTGCAATTGCTGATGCAAGTGAACAACAAGTTCCAGTATGGAAAATTGATAAAACGTCAGCAAAAGATGTAGGGCGAAAAATCAAAAAAATTAATCAATTAGTTTTAGAGAAAATGGGGGTTTAAGCTATGTCTTCTTTATTAGGTGATTTAAACGCTGTTGATAGCTCATTAACTTCAGCAAACTTAAATGCTAACAATAACTCTGACCGCACAATTCTAAAATTGCCGCTTAATCGGGTTAAGTTGGATCCTCAGAATGTACGTCTTGAATATGATCAAGATTATGTAAAAGAACTGGCAAATACTATTTTGAGAGATGGTTTACTTCAGCCTATTTCAGTTAGAGCCGATTCTGATAATCCTGGTGAATATATTATTAATATGGGCCATTATCGTTATTTAGCTCATAAACATTTGAACTTGGATACTATCGAAGCAACGATTGATAACAAACTTGGTTCACGCCGAGTAAAAATGTCAGAAAACTTATTTAGAAAAGACATGAGTTTGCTTGAAATTGCTACGAATTTAAAATTGATGCTAGAAGAAGGCGTGGCAGAGAATCCAAAGTATAGTTATGACGATTTAGCTAATGAAATTAATAAGTCAAAGACATGGGTTTCTCGAAGATTACAATTGCTTGAATCAGATGATTATCTAAAAAGCCTTATGGCTAATAAAATGGTAAATGATGCTGAAACTGGCACGATCATTAAAAACTTATTAGCTGAGTATCCAGAAGAAGTAAAAGCGTTAGTAGCAGATCATGAAGGTGCTATTTCATCAAAATTAGCCCGTGTATGGTCTAAAGAGCTGAAGGGTGAAATTATTACCTCAAGCACTTCAGAGGTAACACAGTCATCTTTAGAACTTCAGAATTCGCCAAAGGCTTGTGAAAAAAATGAAGATAGTAAAGTGGACAATACTCAAGAGCTCATTACCGAAACTAAAGAGACTTTACAGCAACCTGCAAAAGTTCAAGAATCGGTTGAAAATACTGAAGCAGTGAAAGATGAAAAATCTTTTACGACTACTACTCAAAAGCAAACAAAAGAGATTGTAAAACAAGCAAATGAAAAGGCATTTTCAGAGCTTGAGACAGCTTATTTTAATGGTATTTTGGAAAGTTACGTCAGTATTTTAGATTTAACAGAAAGCGAAGATGAAGACTTAGTATCAGTAGCTTGTGGCTTTTTAAGAAGCTTTAATGATGAAAATACAGCTAATTTGTTTTCGTGGAAAAGCTTAATTCAATATCCAGTACTAGTTAATGAGTTGGCGACTATTTTAGATTCTATGGCGCAATTACATGTATTTGTTCCATCTTCTAATGTTGAAGACTCTCGTATGCAAGTTATTTTAAATCAACAAGACCTTATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP050917|8710:16298|9404_9641_+|WP_000072937.1|DBSCAN-SWA MSNVDPQLEHVDPAHPAAPDAYMRVLNCKSNYVNILAGWFLKDGKKKFYIADVRGNEVEAGFNRLDWLTEFDTIYKGK >NZ_CP050917|8710:16298|14264_15038_+|WP_000724905.1|DBSCAN-SWA MKKIVITNEKGGIGKTSVAVHLAHYCYERGMRVLFVDMDKQGNSGFSLSKVAVEIKDTHSLFADIQNFETLDKYFVLFKGNKSLKSLFDPTEQEFKLDKVEEYQRNFKSNIAKANEFFDICIFDTPPTDGPFQRLPLLVSEFALSPFLLDKYSILGLRGIIDTTQEIKEVNPKIQFLGLLPNMVSANSVTQKTTLNELQKQLSHLMLDKTAFIPNRSAIADASEQQVPVWKIDKTSAKDVGRKIKKINQLVLEKMGV >NZ_CP050917|8710:16298|9646_9853_-|WP_000535991.1|DBSCAN-SWA MGSTVRLRDPTAQLVMDTALDMQQEQRQMVKTSDIVETLVQRYINTISFEDVQQTIENRKKNKKNKDK >NZ_CP050917|8710:16298|11515_12289_+|WP_000844619.1|DBSCAN-SWA MKSYYQISFSGGRTSAYLTWYLLNNYSHLYNFIVTFANTGIEHEKTLEFVDKCDKYFNFNTVWLEAVIHPKKRVGTTHKVVNFKTATRGPVLFEQMIEKYGIPNKVYKHCTRELKIRPMDSYIRSIGMKPKDIPTAIGIRADESKRCAKDAEANNFIYPLVTEHPVDKQFILDWWSKQAFDLELNEWDGNCNMCFEKSFPKLLKQLESNPFALEFHLRMERIHGQTNNQPGRPDRVFFRQNTSAIDILNMFNQANVA >NZ_CP050917|8710:16298|8710_9400_+|WP_000389917.1|DBSCAN-SWA MEDMQTIIDKISKCLALSKSANEHEAAVALKQAQTLMQKYKISEKQILISDIKERIIQTKTQRTKDIERRLKVMIANVFECGSYSGFYTLEGVKYQQHVFYGVEPNVSIATYAYTVLLPILIKNKQSYLATLHGNTKLKSKRRLGISYHRGWILGVEKKCRNLNPDKELKEKLSEYEKTLNLIYCEVKSVKHYNKDMLNQARVKGYSDGSKVNLHHAIDPNETKKIFLS >NZ_CP050917|8710:16298|10366_11458_+|WP_166686228.1|DBSCAN-SWA MKNNALYKKLDRHDDVNVIPNVLKNAIGQALASEGKLFSVSEIDLDIYDLIIVSMSGGKDSIASLLYLIEKGVDMSKVELWHNLVDGKSEPFMDWLFMDSYNKQLAKAFNLPIYNSWLMHGFEGEMLKNNSISHEYEIETPSGNIIIPRKRAKAGTRLRFPQQSADLRIRWCSSALKIEVGRRALSNQERFNNSKVLFVTGERREESPNRAKYFQLETHFCDNRNGKKGRLIDAYRPVLDFTERQVWEILERHNVAAPVPYRLGWSRSSCMTCIYNSPKVWATIKHYFPNRIDRIFKYEEQFATTISRKKINVINISEGIQPFNINDLVALDQAMRKEYTLPIFTKKWELPMGAFNKEGCGSD >NZ_CP050917|8710:16298|15041_16298_+|WP_166686227.1|DBSCAN-SWA MSSLLGDLNAVDSSLTSANLNANNNSDRTILKLPLNRVKLDPQNVRLEYDQDYVKELANTILRDGLLQPISVRADSDNPGEYIINMGHYRYLAHKHLNLDTIEATIDNKLGSRRVKMSENLFRKDMSLLEIATNLKLMLEEGVAENPKYSYDDLANEINKSKTWVSRRLQLLESDDYLKSLMANKMVNDAETGTIIKNLLAEYPEEVKALVADHEGAISSKLARVWSKELKGEIITSSTSEVTQSSLELQNSPKACEKNEDSKVDNTQELITETKETLQQPAKVQESVENTEAVKDEKSFTTTTQKQTKEIVKQANEKAFSELETAYFNGILESYVSILDLTESEDEDLVSVACGFLRSFNDENTANLFSWKSLIQYPVLVNELATILDSMAQLHVFVPSSNVEDSRMQVILNQQDLI >NZ_CP050917|8710:16298|13295_14072_+|WP_001086346.1|DBSCAN-SWA MNSKVNIGKTYSVLKSEFIHTLKSIDQSKNIYEIFHDFVFCSAAALRNSIGHRYQNLFNHNIENEYLQRINRYDVSGRLKIKKLFYLLVDLCEAKGEPYDVLGSIYMELEIGNDHIGQYFTPSEVSNLCAQVVMTDLKKQLEEEGVISISDPACGAGSTLLSTVKLCLESKIQVQDHLYIEAADIDRNVALMCYIQLSLWAVPCRIFVGDTLKLKYRECWCSLMYYVKGWDIKLHSQKLKEIVHKAEDYVPNFILIND >NZ_CP050917|8710:16298|12769_13267_+|WP_001067227.1|DBSCAN-SWA MNNYFNVLIITDLKIGRLKTPSHCACAVGHIDIKKPSFEYNTGLVALSTTMYDCKDFNVYTLSTKESFNKFISTLKVLEELIGIPCPFLTAIQETYEFYGDFIFECLTWFNNNADILFRPDHLGEFTKTADESLNFQLMYFKVLETFRKAGLNGFIQFNTLKTIN |
9 | Alteromonadaceae_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP050916_1 | 2324152-2324237 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP050916_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP050916_1
>1.1|2324175|40|NZ_CP050916|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP050916_1
The CRISPR arrays of NZ_CP050916_1 >merge|NZ_CP050916|1|2324152-2324237|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP050916|1|1|2324152-2324237|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP050916.1|WP_000795915.1|2322914_2323151_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP050916.1|WP_001124846.1|2322020_2322632_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP050916.1|WP_000885229.1|2321338_2321950_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP050916.1|WP_000376215.1|2320726_2321182_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP050916.1|WP_001990047.1|2319021_2320668_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP050916.1|WP_000115408.1|2315391_2318856_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP050916.1|WP_000107128.1|2314435_2315395_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP050916.1|WP_001025680.1|2314007_2314292_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP050916.1|WP_002017921.1|2313784_2313898_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP050916.1|WP_000937460.1|2313060_2313696_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP050916.1|WP_000983628.1|2324868_2325282_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP050916.1|WP_000432330.1|2325423_2326302_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP050916.1|WP_001990041.1|2326358_2328503_-|catalase-HPII 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1163818 : 1178615
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP050916|1163818:1178615|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1282141 : 1322655
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP050916|1282141:1322655|DBSCAN-SWA 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60 | Acinetobacter_phage(94.74%) | capsid,plate,integrase | attL 1282123:1282139|attR 1323918:1323934 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1383609 : 1404453
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP050916|1383609:1404453|DBSCAN-SWA 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19 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2437602 : 2508340
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP050916|2437602:2508340|DBSCAN-SWA 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58 | uncultured_Caudovirales_phage(25.0%) | plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2585660 : 2641539
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP050916|2585660:2641539|DBSCAN-SWA 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53 | Escherichia_phage(28.57%) | tRNA,integrase,transposase | attL 2629923:2629982|attR 2641543:2642365 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2716027 : 2748063
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP050916|2716027:2748063|DBSCAN-SWA 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46 | Acinetobacter_phage(43.33%) | terminase,integrase,tail,capsid,portal,head,protease | attL 2715814:2715867|attR 2751900:2751953 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2759094 : 2787768
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP050916|2759094:2787768|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2791726 : 2804074
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP050916|2791726:2804074|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP050916|2791726:2804074|2799146_2799389_-|WP_000051960.1|DBSCAN-SWA MSLGEEMFEWRKQMVEKLLLQESNIDQLEEKVDRAEKILFGDCTAAFKIECTLRNAYALKAILDDFATKNNCKVSIVECE >NZ_CP050916|2791726:2804074|2801761_2802694_+|WP_000698529.1|DBSCAN-SWA MKILNKVEAKLAWANGELLLVNNTERNGWEPFNPYDFGFDVFDKFEFQLKPRTIFIGEFEVPEPLRVAPEKGSTCSYPSPTVELGVQQFKWNGSKGQLRMLQHGQVHSSFDNAFAHCCAIIKISGGEFAEDILKLLNKPTEEVEEEKPSESHAESLKVKNSKPEVVEKAQTAEPAIESETADSEYQKKLDTLLQRVKDSKTPDEVNAVYRYTRTWSDKQMEPLLLATHKRLEELEKSKAQATEPPSLMVQIQNAPDLTTLDALEIDVAARDPQIQSRLMDFVKKRRFELENPTSTPLQEAEPDYLLGDGF >NZ_CP050916|2791726:2804074|2803351_2804074_+|WP_000004579.1|DBSCAN-SWA MSESTLWAVAMRPEGYSPFKQTPAASKEIAERAVERYRKMHEKEGNNFFLEIFDDVIKVQKWHGSRKDHIKNLFYVESWFSEPMYQCFDLKTAERVFKFDEIVICYKKGSAPLVTKSFDEAKLFYGSSETGFKYQIQPIEPPENLFNWFHPDIELFDTIEEGAEAYTREQWAQLQMNLRVEIETQLLDYDEIPNIPEDAVVWPNWKPEPPEQGLFLIAAFDSEDGPVLWWANPKAESKEK >NZ_CP050916|2791726:2804074|2802695_2802947_+|WP_000654846.1|DBSCAN-SWA 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23 | Acinetobacter_phage(95.45%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3038694 : 3051478
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP050916|3038694:3051478|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP050916|3038694:3051478|3042016_3043087_-|WP_002052057.1|DBSCAN-SWA MNKILFGDCRTLMAQMIQEGLKAQTCVTSPPYFGLRDYGVDGQLGLESTVDEYVQNMVEVFRLVRELLHEDGTLWLNLGDSYAGSGRGITRTGLNDGKNPKTKGLILPKQNAAQSNLKPKDLIGIPWKVAFALQADGWYLRQDIIWHKPNPMPESITDRCTKAHEYIFLFSKSRRYYFDHVAIKEPVAESSIKRLSQNLDDQQGSDRVVNKHNGPMKAVYSRSSRDSFKRSNSKRAVAHPNQSMGTHRADRKESNYDLLTRNKRSVWQVSTKPYKGAHFATFPMDLIEPCILAGSRVNDVVFDPFMGSGTTAAVAKKLKRQYLGCELNPKYEHLQKERLSQIHTNMELQFEGGCHV >NZ_CP050916|3038694:3051478|3046842_3048513_-|WP_020752533.1|DBSCAN-SWA 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19 | Acinetobacter_phage(53.85%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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