CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP050946	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP050938	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A chromosome, complete genome	2 crisprs	DEDDh,csa3,RT,cas3,DinG	1	1	34	31
NZ_CP050940	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP050941	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP050945	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	3	7
NZ_CP050939	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP050943	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP050947	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP050944	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p6, complete sequence	0 crisprs	RT	0	0	0	0
NZ_CP050942	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0

1. NZ_CP050946

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	14192 : 24529	12	Moraxella_phage(33.33%)	transposase,tail	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP050946|14192:24529|DBSCAN-SWA
GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTCTTTCAAAGCCTCAATTTCTATTTGAGAATCAGCATACATTCTCTTAAGTTGCTGGTTCTCTTTCTCTAATTGTTTTAGCCTTTTTAGCTGAGAGATATCCATTGCCCCATAACGTTCTTTTAAGATGTAATACGTGCTAGTTGAGATTCCGTAGTCTCTTGCTGTGGTTTCTATATCTGCTCCAGCCTCAACACGCTTAAGCAACTCTACGATTTTTGATTCACTTAATTTGCTCTTTTTCATATGCTCTCCTGTTTGAAAATGTTAACAGAAGATTCCAGTTATGAGTTGTCTCATTTTAAGGGAGGGTTACCGCCGGTGTTCCCTATTATGTTACCTAAAAATCAAATACTGCCCGCAGTGACGTATCAGGTAATTGGCGGTGATCGACGTTATAGTCTGGATGCTCAGGCGCATTTGCAGAAAAAAACCATACAAATAAGTTGCATCGCTAAAACCTATCAAGAATGCAAACTCATGCAAGACAGTATCACCGAAATATTAAACGGCTATCACAGTGAAAAAATCCAGCTGATTACCTTTGAATCAGAGCTAGATCAGTATGAACAGGACACCAAAACCTACCGCACTAATTTAACCTTTACTTTAACAGGAGTTGTATGATGAGTGAGTCTATCGGCGCCCTTTCAGAGATTTATCGTGACAGTGATAATGCAGGCAATTACGTCAAACTGGCCAATATTACTAACATCGGTGAAATCTCATCGAGCCGCGATAAAATTGATGTGACCGAATACGGCAGTACACAGAAAAAATATAAGCTCGGCCTGAAAGATCATGATGAAATTCAGCTCGATATGAATGTCGCCCAAGACAATAGTGAGCTGAAAAATTTAATTAGTGATCATGATACCGGCATAGAGCGCCAGTTTAAAATTATTTTGGCCACCCAACCGAAACGGCAGATTTATGAATTTACCGCCTTGATCACTAATCACAAAATCATCGCCCCGCTAAGTGAAGTGATTAGCATGAGCGTGAGTTTGCAGCCGACCAGTGTGATTGTCCAAAGTGATGAGGTATAAAATGGCTCTCCGTAATGCTTTATTTAATCTTGCCTTTAAAACCGCCCCAGTAACTTTGGGCGAATTAGAATTACAGGTAAAAGAACTCTCCATTGCCGAACAACAACGTTATCAAGAACTGCATCCGAGTTTAAGCGAAACTGAAGCCAATTTATTACTAATTTGCTTATCTTTGTGTGACCACCAAGGCGTTAAAATCCTTGATGTCAGTGAATATAAAAAACTGGCTGAATTACCGCTCGGCGTTATTAAACAAATCACCGATGCGATTGTTGAAGTGAATGGCTTTAATGAAAGTGCAGCGCACGATCTTAAAAAAAACTAGCTCATGATCATGAGCGACGGTTTTTATTTCGTTTAGCTTTAGCGCTAGGCAAAACGGTGAATCAGCTCTCACAGGAACTTAGTCTTTCTGAATTTAATGAGTGGCTGGCGTATTACTCACTGGAACCGTTTGGCGTGGAAAAAGACGACCATCGCACCGCTTTAATGGTGAGCGCGGTTGTGAATGGACCCTTGCAGCGCAAAGATAAAACACTATTTACCCCTAATGATTTTATGCCGAACTATAGCGCTGGTGATGAGAAAAAAACACAAAGCGCGACAGACATGGCCGCTATTTTATCCGCAATTGCAAAAAGGCAGTAAGCGATGGCAACAATCGGTTCTCTCGTTGTTAATTTAAGTGCAAATTCCGCTCAACTCGTTAAATCTTTAACCAAAGCAGAACTTGCCAGCAAGAACTTTTCTAAAAAAGTGCAGCGTAATCTGAAAAAGACAACGCTGGCCTTTGCCGCCGTTTCCACCGCAGCAACGGGGGCTGTAGCGGTGATGATTAGTAAGTCCAGTGACTCGATTGATTTACTCGCCAAAACCTCGGACAAGCTCGGGGTCACCACTGAAGCACTGGCGAGCTTACGCCATGCCGCAGAGCTGACCGGCGTTTCACAAAATAAACTCGATATGGGCTTACAACGGATGACGCGGCGCTTATCTGAAGCGGCGGCAGGCACTGGTGAAGCACGCAAAGCCTTGGTTGAATTAGGCTTAGATGCTGAGCACTTAAATCAACTCTCCCCAGATGCGGCCTTTAAAGAAGTCGCGCGAGCGATGGAAAACGTCGAAGGTCAATCGGATAAAGTGCGTTTAGCGTTTAAGCTGTTTGACTCGGAAGGGGTGAGTCTCGTTAATACTTTAGCTTTAGGGGCTGAAGGGTTAGACCAAGCCGCCAGTGAAGCGGCACGGCTTGGCATTGCGATTAATCGCATTGATGCGGCAAAAGTTGAGGCCGCGAATGATGCAGCATATAAAATGCGTCAATTGTTTGTTGGAGTCAGTCACCAGCTCGCGATTACCTTTGCGCCGATTATTGAGGATTTAACCACACGTTTTACTAACGCCGGCACCGCAGCAAGTAGTTTTAGCAGTAATGTACTCAGTGGGTTTCGTGTTGTAGCTAAGTCCTTTGCTATCGTTGGTGATGGTGTGCATTACATCAACGTCGGCCTTGATATTATTAGCGCAGGCTTTGCGGTGATGAAAAATATGGCCATTCAATCCCTAACTGCAATTGCTAAGGGGTTAAGTTGGCTCTATCAAAAAATGGGCGAGGGGATTAATTTCGTCCTCTCTCAATATCAAAAAATAGCAAAAGCCGGAGCCATATTACCTATCGTTGGTAATAAATTTGAGCGCCTTGGTCAATCCATAGCACGCATGAAATCCAGTGTTTCCGAACGTTTTACCCTCGATACCTCCGGATTAAACATCGCAGAAGAAAGCGCGAATAATGTCAATCAAAAGCTCGCACAACTTTATCAAACTCTATTTTCAAAACGACCCACTGAAAGCGTTGATGCTTATTTTGATGAGATTGAGCAAAAAGCCGCGGCCTTAGATGAAAAAATAAGGGCCGCGCAACCGGAAAAATCTGCGCTGATGGGTGCCTCACTACGCGCTCAGGACAATCAAAAGCAACTTGATAGCTTAAAAGAGCGCTTACTTTCTGAAGAAGAAGCCATTAAGCATTCGTATGACAAGCAAAAACGCATTATTTTAGACGCCACCCGTGAAGGTTCAGAAGAGCGGATAAAATTATTAGAAAAAATTGAAGTTCAAAAAAATACTAAATTAAAGGATCTAGCTCAAAAGCAAGCAAAAGAATTGAATGGCGTCGGCCACCAAGCGAAAGAGTTCGCCGGCAATATGGAAGGCAGTTTTAGTAATGCCTTTGCCGGGGTGGTCAAAGGCACGGCCACTGTTTCAGATGCTTTTAGCTCAATGCTCAATGACATGGCCGCCGAAGCCTTATCAATGGCCTCCCGTGGCATTTTTAAAAGTATTTTAGGTGGCGTTATCGGTTCGGTGGGTGGCAGCAGTTTTGCCTCATGGTTTAGTGGGGGCGCTACTGCCGCCGGGGCGAAAGCCTCCGGGGGAAGCGTTGCCGCAGGACAACTGTATCGTGTCAATGAACACGGCGCCGAACTCTTTAGTAGCGGTGGTAAAGACTACTTAATGACTGGTAAAAAAGCCGGCTTTGTCACACCCAATCATCAACTCGGGCAAACGGTGATATCAAATCAAGTGCAAAATAACATTACCATTGCCCCGACAATCAATGCCAGCGGCGCCGATGGCGAGCAAGTCAGCCAGGAGGTCGTAACAACGATTAAACATATTGTTAATGATCAAATCTTTAAATTAAAAAAACAAAAGTTATTGAATGCTTAATTTTCCCAGTCTTTTACCAACAAAAATCGCTATGGATAAGCTTAAGCCACGCCTGCGTATAACGCCGCTCGGCGATGGTTATGTGCAGCGCGAAGCCGATGGTCTAAATACACTACGCCATTATTTTACTGTGAGTTTTATCGGCTTAAGTGAAATAGAAAAAGACAGCCTGATTAATTTTGTTACAGAACGCGCCGGATTAGAGCCGTTTTTATGGTATCACCCCGGAGAAAAACGCTACTTTCAAATCATTTGTTCTGAGTGGCAAGCGAACTTACAACACAATTATTGGACGGTGGTTTTACGTTTTGAGGAGGATTTTAACCCAGTATGAGCTTAGTCGAGTCTGCCAAGATTTATCTATTTACCCTTGATTTAACGCCTTTACAGTCTTCAATAAAATATCACTTTTGTAACAGTCCGGATGGTAATCAAGCCGTACGCTTTGGCGGGGTGGAGTATCAGCCGATTCCGTTAAAAACGGATGGTTTTGAACGTACAACGATTCACCAGCCGACGCCCTCGATTGTGCTCGGCAATGTAAAACCTATTTTGTTACCCCTTTTAAAAGCCCATGATAATTTGCGCGGTGCGTTAATTCGTCGGGTGATGACCTACGTTAGGCATTTAGACGGCCACAGCGACCCGGATGCCAGTGCCACCTTGCCCGAACAAGTCTATGTGATTGAACGCAAATCCCAGCATAACAATTTAACCATTACCTTTGAGTTGGGCAGTAAATTACCGAGTGATTTAAAACTACCTAGGCGCACCCAGCTCGCCTCATGCTCCAAAATATATCGCCAATGGGATGAAGAACAACAAGCCTGGATCGCCGGCAGCTGCCCTTATGCCGCAGCTCAGTATTACAACGAATTTGGACAACAAACGACTGATAAAACAAAGGATCAATGTGGTAAAAAACTTTCAGACTGCATGGCGCGCTTCGGCAATGGACACGCTTTACCCTTTGAAGGCTTCGAGGGCATTAAACCATTTTAAAGCCTACGCGCTCGAGCAATATCCCAGGGAAGCCGTCGGGCTGATTTTACCGGCAGATCACTTTATGCCTTGCCCTAATTTATCCACCACACCCGAAGAGAATTTTTGCATAGACCCCGCTCAACTCATTGATACCCCAAGCGGTACGATACTGATGCATTCCCACCCCGACGGCAGTGTTGAGCCGTCATTAGCGGATATGGTCAGTCAACGTGACACCGGATTATTGTGGGGGATTGTTGCACTCAACCAGCATGCAGTGACCGATGCCATTGTTTTTGGTGAGCAGTTATTCACACAACAATTACTCGAGCGTCCCTTTTTGCATGGTGTTTTTGATTGCTATTCGTTGATCCGTGATTTTTATGCCGTTGAAAAAAAGATTTTTTTGCCTGATTTTCCGCGGCAACGTTCATGGTGGGAAATCGAAAAATATAATTTATATGAGCGTTATTTTACCGAGGCCGGTTTTATTGAAGTGGATAAAGCCACCTCACTTTGCCGCGGTGATGTGTTATTGATGCGCGTTGGTCGCACCACCTGCATTAATCATGGGGCGATTTATTTGGGTGAAGATTGTCGACTGAAAGAAGACCACAATACTGTCAGCTTGCCCGGGATGATTTTACATCATGTTTGTGACAACTTAAGCCGCCGTGAAATGTTGAGTGAGTGGCAAAAGCGTATTGCCAAGGTGGTCCGTTATGAAAACTAAAATTTATTTGCATGGACGTTTGGGCCGCATTTGCGGCTCTTTTTTTGAGCTAAATATTCATCATGCCCGTGAAGCACTTTATGCCTTATCAACACAATTACCCGAATTTAAAAAAATTATTCAAGCCGGTGAGTGGGCGATTTTTCGAAAGCGTCAATCACTGAACTTAGAACAATTAGAGTTAAATTGTGCCGGCGGTGAATTACATATTGTGCCCAAGCCGAAGGGGGCGAAAAATTCAGGGTTCACGCAGATTTTAATCGGTGCGGCTTTAATTACCGCCGGTTATTTTTCAGTCGGAACGGCATTGGCGCCGATTGCTGGAGGGCTTAGCGCCGCAGGTACAGGTCTTGTGATCAGTGGGGCGTTGACCATGCTTTCACCGCAGCCGAGTTATGATAATGATTACAGTACCACCGACCCAAATGCATCGACTTTATTTAGTGGTGTCGATAATGTTGCCGCGCCCGGGGCGCCGGTGCCACTCATTTATGGTGAGCACTTGGTGGGGAGTTCAGTGGTGTCGAGTCAGTATAAAACCTTATGAAAAAAATGATTCACGGCGCCGGCGGTGGTGGCGGTAAAGGTGGCGGTAGTACTCATACACCCACCGAAGCCCCTAATACGCTTTCAACCAATGCTGTCGTTACGTTAGTTGATTTACTCGGTGAAGGCGAGATTGAGGGTTTAGTGAATGGCGCTCAATCGGTATATTTTGATGATACCCCACTACAAAATGCCGACGGCTCTTACAATTTTGAAGGGGTGACTCTTAAAAGCAATAACGGTACACCCTCGCAAGATTATTTACCCGGGTTTGCCGAGTCAGCCAGTGAGGAGGCGTTTAATGTAAAAGTCACTCATGAGCAGCCGGTGATTCGCACGGTTGGCCGCCAAGAGACCAATGAACTGCGTGTTAAAATCGGCTTGGATGCGCTCACCGAGTATGCAAATAACGGTGATATTAACGGCTCTAGCGTGCATATTCGCATGTATTTAAATAACGTGCTGGTGGTTAATCATGAAATTACCGGCAAAACAACGAGTAAACTTGAGCAGACTTTTATTATTAAAATATCCCCTGGGTATTATATTGCAGACATTGAAACCTCGGATGTTGTTCTGGATAACCTTGACGAGTATTTCAGCTGGAAGCGGGCCGGTGCACATGCAATTACGAATAATTATTATAAACCCACCCATTTTACCTATCCTTACACCTTAAAAGTTGAACGTGTCACTGAAGATAGCGACTCGAGTCGGGTGCAAAATACCGTCTATTTAACCAGCATCACCGATGTGATTGATACAAAGCTTAGCTACCCTAATAGTGCGGTTGTTGGCTTGGAGTTTAGCGCTGCGCAATTTGGTAATCAGTTGCCGAAGCGCAGTTATTTAATCCGTGGCTTAAAAATTCAAGTGCCGAGTAATTACGATCCCAGTACGCGAGTTTATAGCGGAATTTGGGATGGCAGCTTTAAAACAGAATACTCGAATAATCCGGCCTGGGTATTTTATGACTTACTGACGAATCAGCGTTATGGTGCTGGTAACTATCTCGTTGAATCTGATGTAGACAAGTGGGAGCTGTATAGCATCGCCCAATATTGTGATGAATTGGTGCCGGATGGCCGTGGCGGCAAGCAACCACGCTTTTGCTGCAATTTAGCCATTAATAACCAAAACCAAGCCCTCAACATGATTACTCAGCTGACGTCTATTTTTCGTGGAATGGCCTACGATGCGGCGGGAACCATTCAATTTAGTCAAGACCGTCCGCGTGAACCGTCGATGTTAATTACACAAACCGATGTCGTGAACGGGCAATTTGATTATCAGACGAGCAGCATTAAAGAATTGCATTCGGTCTGTGTGGTCGCCTTTAGAAATCCAGATTTAAATTATTCCATTGATCAAGAAGTGGTGGAGGATGCCAGCCGCTTAGCGCGCTTAGGTGAGCGCCGCTTGGAAATTACTGCGGTCGGTTGCACCTCCCGATCTCAAGCGATGCGCCAAGGGCTTTGGGCACTGCAATCGGAGGCACAGAGTGACATGATAAGCTACAAAGCCACGCAAGACCACATTCATTCACTGCCGAGCGATATTGTTAAAATCTTTGACCCCAATATGGATCAGGAAGAAGGGGCGGCCGGTGTCATTACCGCGGTGACTGATAATGTGGTTACTTTAGATCGTGAGGTCAGTTTATCCAGTCAAAACACCCTGATGATTTTTTCAGCGGAGCAAGGGATTGAAGAATACACAGTGATTGGTGCACCCGGGTCTAGAAGGCTGGAAATAGACCGCACCATCATCGCTGATGTAGGCACACGCTGGGTATTGTATCATGCCACTCCACCCAAACAGTGGCGCATTACGGCCATCACTGAAGAAGACGACGGCACCTATACCGTGAATGCCATCGCCCATGACCCGGATAAATATCAAAAAATCGACGAAGAGCGGGCGCTAGGCGTCAGTAAAGAAAATACCGCTATTCCAAGCTTAAAAGCACCGAGTAATTACCGCGTTGAACAAAGCGTAAGTTATCACGGCGGCATCGCCGAAGCGGTCTTGATTGTTGCCTTTGATGGCGATCCAAATGCGGCGTATTACGAGTATCAAGTGCGTAGCAATGACGGTAATTATTCCGACGTTAAAACCACCCATTTAAATCATATTGAGTTCAGTAGCACAGGTGCAACCTACACGTTTCGAGTGCGTGCGATGGGCTGGTTTGGGCAACGTAGCCATTATTCAACATACCACTGTAGCGCATCGCTGGAGCAGCAGATTCCTCAGAATGTCAGCCGTTTTGTCTCCTCGTATAGCGATAAAATCGCCGTTTTAGAATGGGCGAAAAATCCAGAGTTGTATGTTAAACACTACGAAATCAGGCACGGTACGGCTTGGGAAAATTCCATTCTCATTGCAGAACTTGATAGCACCACACTGCATCTTACCCATGCGCGGCCTGGCTTTTATTTAATTAAGGCGGTGAGTCAGTGGGGGATTAAATCAGCTGAAGCGAGTGTGTTAGAGCTGACTGATTTAACGCCCTTAAATATTATTCAAGAATATAATTATGCCGCTAATGATTGGCCGGGTGAGTTTGATCATACCGCCGTTAATAATAACAACCATATTCGTTTATTTTCATACTACTCTTGGGGCGGTATGGCCCAACCCTGGGACGATTATAGTGACAGCTGGGAAAACACCAAAAGCGGCACCTTAGCCACCGACATTAGTGCAGGGTATTACCTAAGTGCTGTTTATGATCTGGGTAAAACCATGCGCTGCCGTGTCTATGCGGATATGCAAATCAGTCAAAGCAACGATGATTTATCGTGGGATAATATGCAACAGGCGTGGGAGCATTACACGCTAGAAAATAATTGGTCGTGGTTAGGATCACCAGAAGCCTGTGGCTTTGAAGTGCAATTTTCAACATCAAGCGATAGTGAGAGTTGGTCGGAGTTTATGCCGCTCACCGCATCCTTTAGTCACTTTCGTTATGCGAAATTTAAAGTCATTTTAACGCGCTTTGATGCCCAATATACCCCAGAATTGCAAGAATTAAGCTGCACCTTTGATGTGCCGGAGACTGTTTATAACGTTGATAACTTTCCGGTGAGTGCAGCCAGTTCTACCTATGTTTTCCCCGAACCGATGCAGCAAAAAGTTATTGTGATTGCGACCATTCAAAGCGGCGCAGCGGGGGATCAAGTGCAGGTCAATAAAAGCTTAACTCAAGCGACGGTGAATATTTTTGATAAAGACGGCACAGCAAAAACAGGCGAAGTCGATTTATATATAGGAGGGCATTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP050946|14192:24529|15828_16251_+|WP_016211141.1|DBSCAN-SWA
MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDTGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLSEVISMSVSLQPTSVIVQSDEV
>NZ_CP050946|14192:24529|19951_20698_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA
MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN
>NZ_CP050946|14192:24529|16632_16899_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA
MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ
>NZ_CP050946|14192:24529|19311_19983_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA
MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF
>NZ_CP050946|14192:24529|16902_18981_+|WP_075275195.1|DBSCAN-SWA
MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKKTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAKGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVSERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA
>NZ_CP050946|14192:24529|14192_15167_+|WP_054300271.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP050946|14192:24529|18973_19315_+|WP_036776958.1|tail|DBSCAN-SWA
MLNFPSLLPTKIAMDKLKPRLRITPLGDGYVQREADGLNTLRHYFTVSFIGLSEIEKDSLINFVTERAGLEPFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVVLRFEEDFNPV
>NZ_CP050946|14192:24529|21241_24529_+|WP_075275194.1|DBSCAN-SWA
MKKMIHGAGGGGGKGGGSTHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLVNGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYANNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKPTHFTYPYTLKVERVTEDSDSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLSYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRVYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTNQRYGAGNYLVESDVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYSIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIVKIFDPNMDQEEGAAGVITAVTDNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEIDRTIIADVGTRWVLYHATPPKQWRITAITEEDDGTYTVNAIAHDPDKYQKIDEERALGVSKENTAIPSLKAPSNYRVEQSVSYHGGIAEAVLIVAFDGDPNAAYYEYQVRSNDGNYSDVKTTHLNHIEFSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYHCSASLEQQIPQNVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELDSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYNYAANDWPGEFDHTAVNNNNHIRLFSYYSWGGMAQPWDDYSDSWENTKSGTLATDISAGYYLSAVYDLGKTMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLENNWSWLGSPEACGFEVQFSTSSDSESWSEFMPLTASFSHFRYAKFKVILTRFDAQYTPELQELSCTFDVPETVYNVDNFPVSAASSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH
>NZ_CP050946|14192:24529|15466_15829_+|WP_155047337.1|DBSCAN-SWA
MLTEDSSYELSHFKGGLPPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV
>NZ_CP050946|14192:24529|20687_21245_+|WP_054300696.1|tail|DBSCAN-SWA
MKTKIYLHGRLGRICGSFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQAGEWAIFRKRQSLNLEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFTQILIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVAAPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL
>NZ_CP050946|14192:24529|16252_16576_+|WP_075275196.1|DBSCAN-SWA
MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKILDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN
>NZ_CP050946|14192:24529|15163_15448_-|WP_155047336.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKKSKLSESKIVELLKRVEAGADIETTARDYGISTSTYYILKERYGAMDISQLKRLKQLEKENQQLKRMYADSQIEIEALKDALRHLKCNTTLY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|14192_15167_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047336.1|15163_15448_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047337.1|15466_15829_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|15828_16251_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275196.1|16252_16576_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|16632_16899_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275195.1|16902_18981_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.4
WP_036776958.1|18973_19315_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|19311_19983_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|19951_20698_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_054300696.1|20687_21245_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_075275194.1|21241_24529_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC0	Moraxella_phage	5.2e-112	33.2

2. NZ_CP050938

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP050938_1

• CRISPR_ID: NZ_CP050938_1
• CRISPR_location: 576170-576290
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP050938_1

Consensus_repeat	Method
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP050938_1

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GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP050938_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP050938_1

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AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG
AGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP050938.1|WP_036778479.1|570843_571569_+|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP050938.1|WP_016210944.1|565927_566947_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112
NZ_CP050938.1|WP_016211905.1|577400_577811_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_129556590.1|572538_572934_-|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP050938.1|WP_075273298.1|574216_574792_+|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP050938.1|WP_016210943.1|567608_568295_+|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP050938.1|WP_075275117.1|576734_577157_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_016210671.1|583086_584346_-|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP050938.1|WP_036778484.1|566993_567605_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP050938.1|WP_036778294.1|584960_586343_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP050938.1|WP_016210935.1|568291_568834_+|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP050938.1|WP_036778297.1|584478_584952_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_098082812.1|578575_579091_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_052047041.1|578079_578343_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_016210676.1|580549_582631_-|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP050938.1|WP_155047228.1|573788_574271_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|279973
NZ_CP050938.1|WP_032126312.1|571747_572542_+|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP050938.1|WP_016211759.1|569410_570598_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP050938.1|WP_155046943.1|576561_576702_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_054300492.1|579235_580246_-|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP050938.1|WP_036778479.1|570843_571569_+|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	3.8045e-65
NZ_CP050938.1|WP_016210944.1|565927_566947_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP050938.1|WP_129556590.1|572538_572934_-|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP050938.1|WP_075273298.1|574216_574792_+|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	9.17211e-46
NZ_CP050938.1|WP_016210943.1|567608_568295_+|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP050938.1|WP_016210671.1|583086_584346_-|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP050938.1|WP_036778484.1|566993_567605_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	2.90159e-95
NZ_CP050938.1|WP_016210935.1|568291_568834_+|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP050938.1|WP_016210676.1|580549_582631_-|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP050938.1|WP_155047228.1|573788_574271_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	4.80837e-07
NZ_CP050938.1|WP_032126312.1|571747_572542_+|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP050938.1|WP_016211759.1|569410_570598_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP050938.1|WP_036778294.1|584960_586343_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP050938.1|WP_054300492.1|579235_580246_-|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.53e-14

Protein sequences

>NZ_CP050938.1|WP_075273298.1|574216_574792_+|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP050938.1|WP_155047228.1|573788_574271_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MVECADSRHATLCDADSRGFIIVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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>NZ_CP050938.1|WP_016211759.1|569410_570598_-|S-methyl-5-thioribose-kinase
MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL
>NZ_CP050938.1|WP_016210935.1|568291_568834_+|acireductone-dioxygenase
MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD
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MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS
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>NZ_CP050938.1|WP_016210944.1|565927_566947_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase
MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK
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MIEDPPALRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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>NZ_CP050938.1|WP_098082812.1|578575_579091_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP050938.1|WP_016210676.1|580549_582631_-|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
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>NZ_CP050938.1|WP_036778297.1|584478_584952_+|hypothetical-protein
MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFILQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
>NZ_CP050938.1|WP_036778294.1|584960_586343_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKKEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA

Crispr_ID: NZ_CP050938_2

• CRISPR_ID: NZ_CP050938_2
• CRISPR_location: 2974988-2975117
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP050938_2

Consensus_repeat	Method
TTAAAAAATACAATAAAGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTAT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP050938_2

>2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder
AGCGCTGGATTAACAGTTTCTGACATAATATCAGTAGG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP050938_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP050938_2

>merge|NZ_CP050938|2|2974988-2975117|CRISPRCasFinder
TTAAAAAATACAATAAAGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTATAGCGCTGGATTAACAGTTTCTGACATAATATCAGTAGGTTAAAAAATACAATAAGGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTAT

>NZ_CP050938|2|2|2974988-2975117|CRISPRCasFinder
TTAAAAAATACAATAAAGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTAT	AGCGCTGGATTAACAGTTTCTGACATAATATCAGTAGG
TTAAAAAATACAATAAGGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTAT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP050938.1|WP_054300516.1|2969534_2970368_+|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP050938.1|WP_016211795.1|2980218_2980413_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_075273619.1|2970425_2971001_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_054300521.1|2978474_2979533_-|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP050938.1|WP_155066233.1|2971861_2972713_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_016212044.1|2982259_2982514_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP050938.1|WP_016211271.1|2967271_2968216_+|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP050938.1|WP_016212008.1|2973143_2973842_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_036777801.1|2983287_2983506_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_054300520.1|2976023_2976338_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_075273359.1|2976283_2976859_+|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP050938.1|WP_155047051.1|2985241_2986111_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_036777835.1|2966181_2966967_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_016211268.1|2968234_2969419_-|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP050938.1|WP_155047052.1|2984368_2985097_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_036794771.1|2980550_2981537_-|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP050938.1|WP_032126227.1|2973879_2974170_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_155046940.1|2971273_2971657_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_016212010.1|2972830_2973127_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050938.1|WP_016211797.1|2976909_2978313_-|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP050938.1|WP_054300516.1|2969534_2970368_+|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	2.70834e-151
NZ_CP050938.1|WP_075273359.1|2976283_2976859_+|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP050938.1|WP_016211268.1|2968234_2969419_-|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP050938.1|WP_036794771.1|2980550_2981537_-|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP050938.1|WP_016212044.1|2982259_2982514_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP050938.1|WP_054300521.1|2978474_2979533_-|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	1.22796e-09
NZ_CP050938.1|WP_016211271.1|2967271_2968216_+|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP050938.1|WP_016211797.1|2976909_2978313_-|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0

Protein sequences

>NZ_CP050938.1|WP_032126227.1|2973879_2974170_-|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP050938.1|WP_016212008.1|2973143_2973842_-|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP050938.1|WP_016212010.1|2972830_2973127_-|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP050938.1|WP_155066233.1|2971861_2972713_-|hypothetical-protein
MSMLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP050938.1|WP_155046940.1|2971273_2971657_-|hypothetical-protein
MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP050938.1|WP_075273619.1|2970425_2971001_-|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP050938.1|WP_054300516.1|2969534_2970368_+|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQQVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP050938.1|WP_016211268.1|2968234_2969419_-|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP050938.1|WP_016211271.1|2967271_2968216_+|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP050938.1|WP_036777835.1|2966181_2966967_-|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDVMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP
>NZ_CP050938.1|WP_054300520.1|2976023_2976338_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP050938.1|WP_075273359.1|2976283_2976859_+|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP050938.1|WP_016211797.1|2976909_2978313_-|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
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>NZ_CP050938.1|WP_016211795.1|2980218_2980413_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP050938.1|WP_155047051.1|2985241_2986111_+|hypothetical-protein
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Self-targeting detection

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_ID	Protospacer_location	Mismatch	Identity
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MGE targeting detection<

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NZ_CP050938_2	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974
NZ_CP050938_2	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	NZ_CP038914	Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	3076 : 50562	50	Staphylococcus_phage(25.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_2	71780 : 131063	54	Bacillus_phage(14.29%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_3	145446 : 191417	54	Bacillus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	402305 : 419902	14	Acinetobacter_phage(50.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	423077 : 468070	48	uncultured_Caudovirales_phage(25.0%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_6	491410 : 547618	55	Powai_lake_megavirus(12.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_7	574216 : 669242	84	Escherichia_phage(17.39%)	transposase,protease,integrase,tRNA	attL 616909:616968|attR 653502:653791
DBSCAN-SWA_8	700206 : 735271	34	Escherichia_phage(57.14%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	781961 : 889139	101	Acinetobacter_phage(21.05%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_10	914642 : 972275	55	Planktothrix_phage(28.57%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_11	992178 : 1207274	216	Staphylococcus_phage(22.22%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_12	1217735 : 1267259	50	Armadillidium_vulgare_iridescent_virus(40.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_13	1273776 : 1406653	111	uncultured_Mediterranean_phage(21.74%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_14	1447049 : 1477670	27	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_15	1482038 : 1535001	43	Staphylococcus_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_16	1556421 : 1600767	40	Klosneuvirus(22.22%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_17	1626828 : 1676444	48	Staphylococcus_phage(40.0%)	transposase,integrase,tRNA	attL 1651210:1651269|attR 1686339:1687440
DBSCAN-SWA_18	1685332 : 1748776	58	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA,integrase,protease	attL 1675073:1675132|attR 1755438:1755727
DBSCAN-SWA_19	1840555 : 1874952	33	Tupanvirus(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	1881026 : 2013813	112	Staphylococcus_phage(10.0%)	transposase,plate,integrase,tRNA	attL 1901460:1901519|attR 1941935:1942349
DBSCAN-SWA_21	2033384 : 2092815	59	Escherichia_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_22	2096721 : 2170855	55	Staphylococcus_phage(28.57%)	transposase,integrase	attL 2105326:2105385|attR 2116883:2117820
DBSCAN-SWA_23	2236410 : 2291298	56	Orpheovirus(16.67%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_24	2303807 : 2348930	44	Moraxella_phage(16.67%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_25	2369471 : 2415693	52	Staphylococcus_phage(21.43%)	transposase,integrase	attL 2372074:2372133|attR 2419322:2419761
DBSCAN-SWA_26	2420136 : 2477063	48	Staphylococcus_phage(16.67%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_27	2505201 : 2553128	36	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_28	2588545 : 2626941	37	Pseudomonas_phage(40.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_29	2644356 : 2695302	57	Bacillus_phage(18.18%)	transposase,plate,protease	NA
DBSCAN-SWA_30	2726739 : 2774694	51	Synechococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_31	2788969 : 2890865	102	Escherichia_phage(44.83%)	transposase,integrase,tRNA	attL 2796530:2796589|attR 2819701:2819874
DBSCAN-SWA_32	3007683 : 3065034	60	Acinetobacter_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_33	3069085 : 3126767	49	Staphylococcus_phage(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_34	3139333 : 3194448	55	Acinetobacter_phage(40.0%)	transposase,tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP050938|3076:50562|DBSCAN-SWA
GATGTCTGCCGTAGAGACAATTGCCGCGCAAGCGACGCCTAGTGGCCGTGGCGGCGTCGGCATTGTGCGTATTTCCGGGCCGAAAGTAGTAGCCCTTGCCACGCTACTACTCGGACGAGTCCCTAAAGCACGTTATGCACACTATGGACCATTTTTAGGTGAACAAGGTGAGATCCTAGATTTTGGCATTAGCTTATATTTTAAAGGCCCACACTCATTTACTGGAGAAGATATACTCGAATTGCAAGGACATGGCGGTCCTGTTGTTACGGATAACTTGCTACAGTACATTTTGGTGCAGGATGGCGTCAGAATGGCGCGTCCTGGTGAGTTTTCCGAACGGGCATTTTTAAACGATAAACTGGATTTAGCTCAGGCAGAAGCTGTCGCTGATCTGATTGATGCCTCATCAACACAGGCCGCACGCTCTGCTTTGCGTTCTTTGCAGGGTGAGTTTTCTAAAGAGGTTCATGCCCTTGTTGATCAGGTAATCTATTTGCGTACTTATGTTGAAGCGGCAATAGACTTCCCTGAGGAGGAAGTGGACTTTCTTTCTGATGGAATTGTTGAGACTAAGTTAAATAATATTCGCGGACACTTAGAGCGCATTCGCTCACAGGCACGACAAGGTGCCTTATTACGTGAGGGGATGACGGTTGTTTTAGCAGGTCGGCCAAATGCAGGAAAATCAAGTTTATTGAATGCATTGACGGGTAAAGAGTCGGCGATAGTGACTGATGTTGCAGGGACGACACGCGACTTATTACGAGAGTATATTCATATTGATGGCATGCCTTTACATATCATTGATACTGCAGGTTTAAGGCACACAGATGACGTGGTTGAGCGTCAAGGTGTTGAACGTGCTCTGAATGAAATTCGTCAGGCTGATCAATTATTATTATTAGTGGATAGTCATGAAACTCCTGCGACAGGGTTAACTGAAGTGTGGCCCAGCCAGCTAGATGATTTAATGGGTGAATTAGATGTGACGGTTGTTCGCAACAAGATCGATATGCATGGCCATGATCGTGATCGCTTACAGGCGGAGCAGTTTGAAAGAGAGGGTGTTACTTGGATTAGTTTATCGGCGAAAACCGGTGAAGGAGTCTCATTATTAACCCAGCACCTCAAGTCGGTTATGGGCTTTAATAGCCAGGCTGAGGGACGTTTTTCAGCACGTCGACGTCACTTAGACGCCTTGGAGCGGGCAGAGCGCAGTTTAAATGAAGGCTATGAACAATTTTTAGTTTTAAATGCTGGCGAATTATTAGCCGAAGATTTGCGCCATGTTCAGGGTTATTTGTCAGAGATCACCGGTGAGTTTAGTTCGGATGATTTGCTTGGGCAGATCTTTACAAGTTTCTGTATAGGTAAATAGGTGTGCATAACTTCGTGGGTTATACACAGGATATGCCCTGTAATTAACGATTTATCCACAAGTTAATTAGTGTTAACTCTGTTTTGTTAAGTATTTTAAAGTTAGGTTGATATGATGTTTTTTGATGAGCACTTTGATGTCATTGTTGTTGGTGGTGGCCATGCAGGTGTCGAGGCCGCGCTGGCTGCTGCACGCAGTGGTGTAAGTACCTTATTGCTCACTCATAATATTGAAACGATTGGTCAAATGTCGTGTAATCCGGCCATCGGTGGGGTGGGCAAAGGCCATTTAGTTAAAGAGATTGATACCTTAGGTGGTGTAATGGCTTTAGCTGCTGATTGTGGTGGTATTCAGTTTCGGACTTTAAATGCGCGCAAAGGTCCTGCGGTACGAGCAACACGTGCACAAGCAGATCGTATGCTTTATAAGGCGGCAATTCGTGAGATTGTTGAAAATCAGCTGAATCTGAAAATTTTTCAGCAATCTGTTGATGATCTAATTGTTGAGGGTGATCGTGTCAGCGGTGTTGTGACACAAATGGGCTTAAAGTTTCGAGCAAAAGCGGTGGTTTTGACAGTAGGAACTTTTTTAGGCGGAGTGATTCATATTGGCTTGGAGAATCACTCAGGTGGCCGGGCCGGTGACCCTGCGGCGAATGCGCTAGCACGACGATTAAGGGAGTTGCCGTTTACGGTAGGGCGCCTGAAAACAGGTACACCACCGCGTATTGATGCGAGAACGATTGATTTTTCTGATTTGCAAGAGCAACCCGGTGATACACCGTGTCCAGTGTTTTCATTTATGGGCTCGCTTGACTTGCATCCGCAGCAAATCTCATGCTATATCACGCATACCAATGAAAAAACACATGATATTATCCGCGCAGGTCTTGATCGCTCACCGATGTATTCAGGTGTGATTGAAGGGGTTGGCCCGCGTTATTGTCCATCGATTGAAGATAAAATCACCCGTTTTGCTGATAAATCATCGCATCAAATCTTTATTGAGCCGGAAGGATTAACGACTCATGAGATTTACCCTAATGGCATCTCGACAAGCTTACCCTTTGATGTACAGGTACAACTGGTACGCTCAATGAAAGGGTTTGAACAGGCTCATATTCTAAGACCTGGTTATGCAATTGAATATGATTATTTTGATCCGCGTGGTTTAAAGCCGAGTTTAGAGACGAAATATATCAGCGGTCTATTTTTTGCTGGACAAATTAATGGTACCACTGGTTATGAGGAAGCCGGAGCGCAGGGGCTATTAGCAGGAATAAACGCGGCATTAGGCGCACAAGAAAAAGAGAGTGTTCATTTTCGTCGTGATGAGTCTTATCTTGGTGTGCTAGTCGATGATTTAATTACTTTAGGAACACAAGAACCTTATCGAATGTTTACTTCACGTGCTGAATATCGTTTATTATTGCGTGAAGATAATGCTGATTTACGCTTAACAGCAAAAGGGCGTGAATTAGGTTTGATTGACGATAAGCGTTGGCGAGCATTTGAAGAAAAATGTGAAGCCATTGAGTTGGAAAAACAGCGATTAAAATCAACATGGTTGCAACCTGAATCAGCCCAGGCCCTACTGTTAAAAGAGCAGTTTGGAGTGACACTGGGGCGTGAGCATAGCTTAGAGAGCTTATTGCGTCGTCCTGAAGTTAAGTATCAAAATCTAGCAATAGTTGCACCAGCAGAATTAAGTTGTACAGATGATGTTGCCGAGCAAGTTGAAGTGCAGATTAAATATGCAGGCTATATTGAGCGCCAGCGTGATGAAATTGCTAAACAACGTCGTCATGAAGAAACAAAAGTACCGCCTGAATTTGATTATGATGCAGTCAGTGGTTTATCTAATGAGGTAACAGCAAAGTTAAAATTAGCACGCCCTGAGACGGTCGGCCAAGCCTCGCGCATATCCGGAGTAACCCCGGCGGCTATATCATTGCTCTTAGTTTATCTTAAAAAACAGCGTTATATTAATGATGAAAATCTGGCCTGATTTAATTTAGGCATAAATTAAAATAAGTTGAAGTTGTTAGCGATAAAATGTTAAAAGAAAAGTTAATCCAAGGTATTAATCAATTAAATTTATCACTCGGTGATGATCAAGTTAATTTGTTGATTGATTATGTGCAGTTATTAAATAAATGGAATAAAACCTATAATTTAACTGCAATTCGAGATATTAACGAGATGATCAGTGTGCATCTCTTAGATAGTTTAGCTGTGGCGCCTTATTTACAGGGGTATGATATTCTTGATGTGGGTACGGGAGCCGGACTGCCGGGAATTCCCTTGGCAATTTGCTTTCCAGAGTATAACTTTACGTTATTGGATAGTAACGGTAAAAAAACACGTTTTGTGCAACAAGCGGTTTTAACTTTAGGCTTGAAAAATATTAACGTGGTACAAAGCCGGATAGAGCACTTTGTGAGCCACGATAAGTTTACGACCATCATCAGTCGTGCCTTTGCTGCAATCGATGATATGCTAAAAGGGGCTGCTCATTTGTGTCGGCATCAGGGAGAATTTTTAGCAATGAAGGGAATAGATCCAGAAAAAGAGTGGCAAGCGGTCGCCGCAGATTATCATCTGCTTGAGACCATCAAATTATCTGTACCTTTTATTGATGGTGATCGCCACTTAGTGCGTATACGTTTAAAAAATAAGTAAGCATGTTGGGGGAGTTATTGTGGGGAAAGTGATTGCGCTAGCAAATCAAAAGGGAGGTGTGGGAAAAACCACCAGTTGCATCAACCTGGCAGCTTCTTTAGCTTCATTGAAAAAGAAAGTCTTACTTATTGATATTGACCCTCAAGGCAATGCCACTATGGGTAGTGGGGTGAATAAACATGAGGTTGAGTTTAGTATTAATGATGTACTCATTACTGAAATATCCATACAACAAGCACGGATTGATGCTAGTTTAGCGGGTTATGATTTGATTGCTGGCAATGCCAATACGACAGAAGCTGAAATTCAATTGTTTCAATTTGAACAACGTGAACAACGGTTAGCACAGGCTCTTGCGCCTATTAAAGAAGACTATGATTTTATTTTAATTGATTGTCCTCCTTCTTTAAATATGCTGACTTTAAATGCGTTAACTGCAGCAAACTCGGTATTTATTCCGATTCAATGTGAGTATTTTGCTCTAGAGGGCTTATCTTCACTGCTTGAAACGGTCGAGAAAATTAGAGAGTCTTTAAATAGCGAGTTACAGATAGAAGGCGTGCTTAGAACTATGTATGATGCGCGCAATCGCTTAACGATGGATGTTTCAGAGCAGTTGGTAAAACACTTTGGTAAGCAAGTATATAAGGCAATTATTCCACGTAATGTGCGTTTGGCGGAAGCGCCTAGCCATGGATTGCCGATTATTAAATATGATAAATATTCAAAAGGATCGTTGGCCTATCTTGCTTTGGCAAAAGAGTTTATTCGTAAAAATAAAGCGGTTCAGAAAGTAGCTCAACTTACGTCAAAATCAAAACCAAAACTCAGTGCAGTAAAAACGCAAGCTAAATCTAAATCAGCGAAATCCAGGTCCAATAAATCTAAAGTGAAAATGGCGTAATCTACAGTATCTAAGGTAAGGGTGGTAAGGTGAT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209325.1|16232_17597_+	bifunctional UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase GlmU	A0A0N7G7I9	Chrysochromulina_ericina_virus	6.6e-37	40.5
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WP_075274975.1|21828_22011_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183130.1|22215_23061_+	hypothetical protein	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	1.1e-10	26.4
WP_075273397.1|23648_24044_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211852.1|26396_27110_-	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	1.7e-28	36.0
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WP_016211790.1|44210_44906_-	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|46210_46576_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|46632_46797_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_081007065.1|47298_48138_+	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016212335.1|48154_48493_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|49587_50562_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP050938|71780:131063|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211245.1|77602_78334_+	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211251.1|79226_79850_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047032.1|80537_81599_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209609.1|95529_96534_+	dTDP-glucose 4,6-dehydratase	A0A1D7XFE8	Escherichia_phage	3.3e-78	48.9
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WP_016209613.1|96988_98377_+	oligosaccharide flippase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183131.1|98406_99546_+	glycerophosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209593.1|99577_100432_+	glycosyltransferase family 2 protein	A0A167RG86	Powai_lake_megavirus	5.4e-05	30.8
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WP_016209596.1|101789_102881_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209602.1|102880_104137_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209607.1|104137_105064_+	NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein	A0A2K9L4U8	Tupanvirus	3.9e-57	44.6
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WP_122940262.1|108327_109143_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_122940232.1|109373_110354_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209597.1|110407_110638_-	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	1.0e-06	40.7
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WP_129556618.1|111889_112987_+|protease	trypsin-like serine protease	A0A1B1IT49	uncultured_Mediterranean_phage	5.3e-21	28.1
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WP_016209598.1|115120_115705_+	YggT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126223.1|115770_116430_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209605.1|117356_118148_+	uroporphyrinogen-III synthase	NA	NA	NA	NA
WP_129556620.1|118228_119113_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047035.1|121772_121952_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209580.1|122043_122568_+	ankyrin repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209612.1|122951_123320_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300576.1|123720_125016_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211692.1|125651_126554_+	LysR family transcriptional regulator	Q6JIH3	Burkholderia_virus	1.6e-18	28.4
WP_051307362.1|126610_127462_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211694.1|128041_130051_+	DNA helicase Rep	A7KV33	Bacillus_phage	3.0e-110	37.8
WP_054300271.1|130088_131063_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP050938|145446:191417|DBSCAN-SWA
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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP050938|402305:419902|DBSCAN-SWA
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MRALRDIKKDKGINQALDRSCGGFSTKVHILTEGLGYPVDFVLTRGQAHDAPQAQGLLTSVAFDQIIADKAYDDIKIRELVVKKGAKCIIPSKSNRINKFDHDQHVYKERHLIECCIGKLKQFRRVFSRFEKRACRYLSFVSVATSVGILHIQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_075273327.1|404408_404984_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|405010_406072_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046997.1|406646_409169_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183134.1|410160_412617_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212310.1|414390_414846_+	DUF21 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104637.1|414875_415412_+	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212085.1|415467_415941_+|tRNA	tRNA (uridine(34)/cytosine(34)/5- carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)- methyltransferase TrmL	NA	NA	NA	NA
WP_032126534.1|415982_416498_-	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_016212084.1|416497_417514_-|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|417795_418770_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_081007003.1|419142_419604_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273313.1|419563_419902_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP050938|423077:468070|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126275.1|426020_426572_+|protease	ATP-dependent protease subunit HslV	NA	NA	NA	NA
WP_032126276.1|426582_427950_+|protease	ATP-dependent protease ATPase subunit HslU	A0A173GFL6	Erwinia_phage	9.5e-44	30.1
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WP_016209977.1|464199_465885_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	2.9e-26	29.6
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WP_155047246.1|467095_468070_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	1.8e-28	32.2

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP050938|491410:547618|DBSCAN-SWA
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MLEVRALQVRLDEFADRVSSLRGYLDYDLKCERLVEVERELEAPDIWSQPERAQELGRERVQLESLVEQFKNISARIVDAKDLIELAVEEQDAESLDEVVSESDALDEKIGQLEFRRMFSGQMDPNNAYLDVQSGSGGTEAQDWAEMVLRMYLRWGEQNGFKTELVEASAGDVAGIKSATIHFQGEYAFGWLRTETGVHRLVRKSPFDSGNRRHTSFCSVFISPEVDDNIDIDINPADLRIDTYRASGAGGQHVNRTDSAVRITHIPTNTVVQCQNDRSQHKNKDQAMKQLRAKLYELEMSKRNAEKQALEEGKSDIGWGSQIRSYVLDASRIKDLRTSVETSNTQAVLDGDLNAFIEASLKAGL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211782.1|496847_497030_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211784.1|499544_500267_-	aquaporin family protein	M1HH19	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.6e-26	35.8
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WP_016210162.1|520601_521639_+	fructose-bisphosphate aldolase class II	NA	NA	NA	NA
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WP_155047230.1|525327_525750_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211963.1|528737_529397_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212030.1|530470_530716_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212033.1|530807_531470_+	O-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016212032.1|531593_532721_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104666.1|533308_533767_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300193.1|533931_534138_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126304.1|535183_535528_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183135.1|536002_537949_+	protein kinase family protein	A0A1S5XZ05	Kurlavirus	1.0e-06	34.9
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WP_016210987.1|538632_539832_-	Bcr/CflA family efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_036778253.1|541279_542818_+|tRNA	lysine--tRNA ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	3.5e-87	36.5
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WP_017377817.1|544844_545342_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126306.1|546326_546623_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183136.1|546847_547618_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP050938|574216:669242|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036778294.1|584960_586343_+	UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210675.1|587029_587746_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210679.1|587913_590238_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	2.0e-17	39.9
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WP_016210055.1|594236_594875_-	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210070.1|594913_595186_-	DUF1315 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126423.1|595279_595543_-	BolA family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_016210053.1|595925_596468_-	septation protein A	NA	NA	NA	NA
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WP_016211722.1|648069_651372_+	type I restriction endonuclease subunit R	A0A220A398	Liberibacter_phage	1.7e-54	27.1
WP_036780093.1|651381_652203_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300481.1|664084_664813_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
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WP_075273369.1|665818_666634_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212641.1|667162_667609_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047076.1|667804_668080_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047077.1|668088_669242_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	4.4e-58	43.8

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP050938|700206:735271|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036780855.1|701700_702198_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212214.1|702172_702673_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_054300477.1|702831_703560_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.6e-43	41.4
WP_144019359.1|703704_703902_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300478.1|704063_705800_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-24	44.0
WP_054300202.1|706079_706808_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211623.1|707622_709263_-	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_036779883.1|709375_710725_+	UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein	A0A127AXI2	Bacillus_phage	2.1e-75	37.2
WP_016211625.1|710721_711591_+	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.2e-68	47.5
WP_054300475.1|712074_712803_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.6e-43	41.4
WP_016212196.1|713211_713457_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212195.1|713453_713840_+	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212193.1|713907_714246_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|714368_715097_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211949.1|715236_716487_-	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	1.6e-93	46.3
WP_016211951.1|716520_717618_-	glutamate 5-kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	3.9e-48	34.3
WP_054300202.1|718234_718963_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_075274932.1|719271_719493_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211812.1|719714_721328_-	DEAD/DEAH box helicase	A0A2I7RG64	Vibrio_phage	9.2e-62	32.6
WP_016211816.1|721369_721723_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047083.1|722791_723520_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	4.3e-43	41.4
WP_016210945.1|725711_726302_+	16S rRNA (guanine(966)-N(2))-methyltransferase RsmD	NA	NA	NA	NA
WP_016210946.1|726428_727814_+	L-serine ammonia-lyase	NA	NA	NA	NA
WP_036779396.1|727908_728106_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126573.1|728199_729018_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126574.1|729524_729902_+	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779393.1|729914_730151_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210951.1|730150_730357_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779389.1|730539_731259_+|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210954.1|731347_733132_+	SLC13 family permease	NA	NA	NA	NA
WP_036779399.1|733230_733485_+	DUF2282 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_144019244.1|733841_734453_+	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|734542_735271_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP050938|781961:889139|DBSCAN-SWA
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MKLDQDEINRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVHVTQRCVP
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MAQVRIVDCQLETAAQDFALSLRETGFAVVKNHGIPFELVRSVYNEWLAFFKTEAKYQYLFDRDKQDGYFPPEVSETAKGHTEKDIKEYYHIYSWGRYPAGLSNQAHELCEKSTELAVMLLNWLEAETPAEIREKLSESFASMITASDNILQRILHYPPMTGDEEPGAIRAAAHGDINLLTVLPSSNEPGLQVKPLGSDWIDVPCEPETIVINAGDMLEEATAGYYPSTLHRVINPTGAGSANSRLTAPLFLHPRSDVVLSERHTAKSYLDERLKELGVK
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MENTVDMIKGQIADTAVLLYMKGSPQQPQCGFSAQAVQALMACGVKFGYVDVLASPEVRATLPQVSSWPTFPQLFINGELVGGSDIVAELHQSGELQTMLDAVKGASAE
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MSKSMTKQSLSGHWRIVWMALWDQEYVDLIEPGYIKLMRKAKENFSLVLLGDFLAM
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MTNIVKDLQERNHLVRWGILIGLTFFSLATLFILAIDFKILRDPDIIQDHHFRILLFILVIYFTVYATSGFIRSLARYLNNRYLARFTALPKLSCYQESCTRNYFPNKPYDHIVILL
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MTNIVKDLQERNHLVRWGILIGLTFFSLATLFILAIDFKILRDPDIIQDHHFRILLFILVIYFTVYATSGFIRSLARYLNNRYLARFTALPKLSCYQESCTRNYFPNKPYDHIVILL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_036771330.1|787243_788218_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_016211615.1|788452_789169_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211620.1|790712_791237_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211619.1|791304_793125_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210267.1|793979_794486_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210259.1|794549_795968_+	asmA-like family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210248.1|796088_796343_+	DUF493 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210257.1|796489_796762_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777860.1|797333_797909_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210265.1|797905_798076_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126418.1|798991_799222_+	sulfurtransferase TusA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777864.1|799308_800400_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210258.1|800380_801334_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	4.9e-31	27.9
WP_051307325.1|801539_803042_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	3.8e-46	29.0
WP_032126416.1|803082_803586_+	peptide deformylase	A0A1D8KUY1	Synechococcus_phage	2.8e-09	33.6
WP_016210254.1|803845_805021_+	acyl-CoA desaturase	NA	NA	NA	NA
WP_016210252.1|805929_806301_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210255.1|806513_808775_+	cadmium-translocating P-type ATPase	A0A218MNH6	uncultured_virus	1.8e-95	35.2
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WP_129556655.1|809471_810476_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047085.1|810579_811173_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|811245_812307_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047086.1|812301_813072_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300465.1|813064_813844_-	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155047087.1|814065_814209_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047088.1|814275_815429_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_168183138.1|815486_815720_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211061.1|816322_816676_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211058.1|816796_817330_-	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377041.1|823753_824083_+	Grx4 family monothiol glutaredoxin	NA	NA	NA	NA
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WP_155047086.1|826219_826990_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300465.1|826982_827762_-	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155047087.1|827983_828127_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126660.1|831383_833021_+	NAD+ synthase	A0A2L0UZF5	Agrobacterium_phage	5.8e-88	38.2
WP_016211065.1|833025_833247_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211066.1|833344_834358_+	quinone-dependent dihydroorotate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377041.1|837668_837998_+	Grx4 family monothiol glutaredoxin	NA	NA	NA	NA
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WP_075274949.1|839078_840140_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047086.1|840134_840905_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300465.1|840897_841677_-	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_168183139.1|841898_842042_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047088.1|842108_843262_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_155047089.1|843319_843715_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300249.1|843729_844095_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211061.1|844156_844510_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211058.1|844630_845164_-	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126660.1|845302_846940_+	NAD+ synthase	A0A2L0UZF5	Agrobacterium_phage	5.8e-88	38.2
WP_016211065.1|846944_847166_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211066.1|847263_848277_+	quinone-dependent dihydroorotate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211063.1|848439_850668_+	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.0e-82	35.0
WP_032126658.1|850648_851353_-	purine-nucleoside phosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_017377041.1|851587_851917_+	Grx4 family monothiol glutaredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_155047090.1|852241_852748_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_168183140.1|852997_853213_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183141.1|853227_854061_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126663.1|854087_854330_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126664.1|855048_855732_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212048.1|855925_856483_-	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|857246_858308_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210881.1|858518_859334_+	LD-carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_054300463.1|859834_862564_+	kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016210879.1|862666_863026_+	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210871.1|863022_863340_+	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|863356_864466_-	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_036794016.1|864492_865563_-	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126665.1|865682_866741_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210873.1|866755_867406_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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MNVLLEVDNVSFSYRHQHKIFFKKIKPASQLAVANVTFKLNQGESLGVVGESGSGKSTLARLLVKLMQPDQGQILYREKNIFSKAYRRQEYAKCVQLIFQDPLSSLNPRRTVLQTITEVLAYYYRPEGMLNNKQSIQVKASELIAEVGLTPEAFSYYPHELSGGQRQRLALARALAVSPELLVADEVVSALDVSVQAQIIQLMQLLLKERGLSLIFISHDLAVIQQLTTHVLVMFQGQIVESLPAQALDQAKHPYTQSLIKAIPVLDPIKRHQYAMDLEVVSAVSQQGCAYLARCQQAQLKCQREPPVLTHTGGKKQQIACWYAD
>NZ_CP050938|914642:972275|944376_944595_-|WP_016210711.1|DBSCAN-SWA
MANYHSETMDDTLSELTESVLREVNSTTSRRNPKKKKEDKAKAVATRRALEKHFERKRWQRQYGGIEHYSSL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016209544.1|915416_917132_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209558.1|917128_917491_+	small Multidrug Resistance family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209576.1|917505_918660_+	DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein	A0A2K9L0G1	Tupanvirus	8.1e-36	31.9
WP_016209573.1|918663_919671_+	glycosyltransferase	B9UDL7	Salmonella_phage	8.3e-37	34.2
WP_016209549.1|919673_920690_+	bifunctional UDP-4-keto-pentose/UDP-xylose synthase	D5GW02	Campylobacter_virus	5.5e-12	25.8
WP_016209557.1|920906_921992_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209541.1|922098_922491_-	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183142.1|922674_923907_+	diaminopimelate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016209575.1|923922_925224_+	aspartate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_129556653.1|925262_927044_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126218.1|927054_928041_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_036777172.1|928121_929198_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_036777175.1|929297_930272_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	2.5e-14	31.8
WP_032126219.1|930298_931276_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-15	31.6
WP_017376633.1|931478_931748_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209548.1|932066_933353_+	na+ dependent nucleoside transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209571.1|933417_934098_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210710.1|939832_940612_+	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_032126770.1|940710_941565_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210714.1|941608_941977_-	Xcc1710-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210715.1|941979_942777_-	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126769.1|942969_943380_+	MerR family DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210707.1|943386_944307_-	1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase/D-cysteine desulfhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_016210711.1|944376_944595_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210717.1|944695_945451_-	phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778805.1|945742_947179_+	SEL1-like repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210720.1|947439_948069_+	MarC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210716.1|948167_948500_-	TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210718.1|948507_948804_-	sulfurtransferase complex subunit TusB	NA	NA	NA	NA
WP_016210721.1|948805_949162_-	sulfurtransferase complex subunit TusC	NA	NA	NA	NA
WP_016210708.1|949158_949521_-	sulfurtransferase complex subunit TusD	NA	NA	NA	NA
WP_017376751.1|949654_950329_-	Bax inhibitor-1/YccA family protein	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	8.9e-35	45.4
WP_016210723.1|950806_951451_+	DUF4937 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047092.1|951835_952114_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047093.1|952593_953298_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211429.1|953817_954255_-	DUF1841 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376743.1|954329_954962_-	endonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_016211433.1|954977_955625_-	RnfABCDGE type electron transport complex subunit B	NA	NA	NA	NA
WP_016211428.1|955627_957691_-|tRNA	methionine--tRNA ligase	A0A1V0S905	Catovirus	3.8e-36	26.8
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WP_168183143.1|960661_961174_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183144.1|961157_961724_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300456.1|963323_964535_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_168183215.1|970034_970544_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_168183216.1|971570_972275_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP050938|992178:1207274|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP050938|1217735:1267259|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP050938|1273776:1406653|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13

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MADEKNIQSQKDADNAVSDELIETAQRDSGENSIEEALEQVLADTTANSSEDSQFGSYQTGYRGEGLEEPEDTGGGPERSDTNLESAAQGGGGGNNVAPLEEINVSFQSGLDGVETEFDVGAGDGASLNTILGITPDINNNAAIQSGGAANRGAIAGEEEAVAETVPAEAVEAATSSTDDAEATESEIPLPDDDSDLSLSAEPAADDDTVTVNDDSAEPVINNNPRAIDDNLTLSEDLAFTFNAADILANDSDVDGDSLALTGISQSPEHGALIDNGDGSWTFTPTENYNGQDSFIYTVSDGQGGFATATVALTIDPVNDDPVVIDSLESGTEDVPLVFDVSDLISDIDSNNTFIDSFEQPENGILTLDGTTFTFTPHENWHGDTHFNYVVADGEGGTAAGSVDMHLTAVNDDPTAQGHTFELKKDGSIRFSEADLLAGATDVDGDNLSATAVTDPANGDLVNNGDGTWTFTPDDNWNGETQFDYTLVDGQGGEVTETVTLDVDPQAEKVNVEFILNDQQTIYPDYRDESTNYTVQSPGDFGVTESISGEQMATQGIGNSDQISVGYQDENAASIQLESGWNSIKNIFAVSDEAADVSISDFVRTDVQLGDGGDSTVNIEGAKRGDITSGDGSDTINISAETNGAGWDNTFNISSAEGEDFISLSGDQDITVFNVNAGSGDDVIQLGNGYANSTIHAGYGDDTVRGGTGEDAIFGGAGDDALRGGQGEDSLRGGAGNDDLRGGAGEDVLRGGQGEDSLRGGAGNDDLRGGAGEDVLRGGQGDDSLRGGAGDDSLRGGAGDDALRGGQGDDSLRGGAGNDDLRGGAGEDVLRGGQGEDSLRGGAGNDDLRGGAGEDVLRGGQGDDSLRGGAGDDSLRGGAGDDALRGGQGDDSLRGGAGNDDLRGGAGEDVLRGGQGEDSLRGGAGDDNLRGGAGEDVLRGGAGDDNLRGGAGNDDLHGGAGNDALDGGEGVDTVYAGQGDDAATFVVGQSEGIDQYYGGSGEDTLRIELSAEQLENNDIIADLHGLNDFIADHADESSRNGPVETFEHLGVQVGDFEKLDIVVDGQAMDINDIQVENQWTNDDFDQSQHSRPAHFQVGDPEHSPDGGEALHGHRDADSTKDFDHEWDTKAHHHRGLEGEEGAHDVLTGSDSNDAYTLDWGGREEIASIEEFNTGAGDDIVDLASYRYEYGDTVMNLGEGSDVGWGNIGEDQIFGGAGNDWLAGNSGNDLLKGGLGDDRLEGNAGDDEIHVGQGDDIAMGHTGNDLFVFNLDEGNLGQNWVSGGEGEDSLQLSGSGGQNWVLHVENGGDGEVIHGTTGEAGQYGAEGGLSFSGSITFEDGQSKVQFSDIEKIEWF
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MQTMRFKSSGLIIYLSLLAAITPFSTDIYLASMPTIAREFHSSSLLLQLTLSLFFLGFALGQLFWGPLSDKIGRKPTAIIGISVYFIASVLCAFSVNINQLIIFRLLQALGACAGVVVAMAMVKDIFTEHNRMTKTLSFIITILTLTPLIAPIIGSYLLIHFNWPSNFYFLAGYGLFLIFAMCFIQESHPYQTRKPLPINKLARTYLEQIQHKPFLLITIAVSANFCTMFAFISSSPFIYIDIYHVSTAQFGYLFALNALALIIGSFILNHLKKRLTDQAIMTIGTLGALITALIMSVLLTVNPTNIINMIIPSFMITFFVGMLMPLLMSLTLKNVIHYAGLASALVGALRFSAAALISAFIGVLIANNPAPLPYTMTVLSLTTLFFSQCYCKCYSNAKILQTNHNMAN
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MHANIYGQDDQDLRAFNADHRLHMQAKLPLLNLIEAAQHAGIHLALISAYRSFDRQLAIWNAKALGEKPVFDRTGQYQIQIDHLAPKERVFAILNWFALPGTSRHHWGTDFDIFDLNARPAGYHIQLVPSEYQPGGVFSNLGQWLDNNLANTPFFRPFWGEPSGVAAEPWHISYRPLAAEFQTLFCIDDLTKVIEQAPILLKDEILAELDEIVSRFVLAIDDVRR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556499.1|1273776_1274929_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2
WP_016212343.1|1275168_1275975_-	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	W8CYX9	Bacillus_phage	7.7e-09	42.9
WP_016209806.1|1276787_1276937_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209808.1|1277279_1277648_-	cell division topological specificity factor MinE	NA	NA	NA	NA
WP_036778458.1|1277644_1278463_-	septum site-determining protein MinD	NA	NA	NA	NA
WP_016209813.1|1278563_1279379_-	septum site-determining protein MinC	NA	NA	NA	NA
WP_016209801.1|1279663_1281718_+	VWA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126324.1|1281717_1282140_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209805.1|1282318_1283812_-	sodium-dependent transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209818.1|1283944_1284760_-	exodeoxyribonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_016209799.1|1284855_1285272_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209815.1|1285658_1286198_-	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777937.1|1286515_1288228_+	HAMP domain-containing protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	4.3e-25	30.2
WP_016209812.1|1288674_1290498_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1L2BWV7	Bacteriophage	9.7e-44	40.5
WP_016209821.1|1290587_1290920_+	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209800.1|1290950_1291547_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
WP_036777933.1|1291543_1292668_+	2-hydroxyacid dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209822.1|1292803_1293451_+	methyltransferase domain protein	W8CYT3	Bacillus_phage	1.4e-08	30.8
WP_016209810.1|1293507_1295421_+	molecular chaperone HtpG	A0A1B1ISV4	uncultured_Mediterranean_phage	6.9e-117	38.3
WP_155047117.1|1297010_1300310_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209817.1|1301011_1301980_-	plasmid replication region DNA-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209809.1|1302086_1302575_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209823.1|1302999_1303443_+	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1304664_1305240_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1305185_1305551_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300408.1|1305601_1306258_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	9.6e-10	31.0
WP_080664854.1|1306594_1307176_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126179.1|1307133_1307385_+	TSUP family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211113.1|1307414_1308740_-	ribonuclease HI	G3MB70	Bacillus_virus	1.7e-37	36.3
WP_016211112.1|1308795_1309443_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211115.1|1309635_1311588_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	2.7e-44	28.0
WP_016211114.1|1311720_1314651_+	peptidase M16 inactive domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274672.1|1315016_1315610_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_168183158.1|1315647_1316007_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300286.1|1316070_1316535_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047118.1|1316524_1317967_-	type VI secretion system contractile sheath large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016212252.1|1318004_1318163_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212466.1|1318477_1319203_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372269.1|1319407_1319779_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780001.1|1320135_1320399_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779999.1|1320385_1320817_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779996.1|1320836_1322393_+	DUF2974 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211391.1|1322404_1322980_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728317.1|1323046_1326412_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1326602_1327577_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556498.1|1327756_1328365_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_036778626.1|1328361_1330302_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	1.8e-72	33.0
WP_016210594.1|1330437_1331091_+	glutaredoxin 2	NA	NA	NA	NA
WP_016210595.1|1331267_1332446_+	formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210588.1|1332813_1334139_+	fimV domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126176.1|1334229_1335012_+|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA
WP_016210587.1|1335113_1335974_+	acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016210590.1|1336148_1337411_+	bifunctional tetrahydrofolate synthase/dihydrofolate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210593.1|1337490_1338021_+	colicin V production protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210586.1|1338042_1339548_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	1.7e-86	41.0
WP_016210592.1|1339560_1340217_+|tRNA	tRNA-(ms[2]io[6]A)-hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016212005.1|1340606_1342367_+	gamma-glutamyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1342705_1343281_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_081377359.1|1346088_1346718_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300406.1|1347450_1350186_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047120.1|1355577_1355922_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209947.1|1360830_1361493_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209940.1|1362905_1365677_-|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
WP_052104625.1|1365752_1366196_-	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
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WP_016209945.1|1368990_1370025_+	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_016209932.1|1370027_1371068_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_036777579.1|1371250_1372366_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	4.8e-94	48.9
WP_016209930.1|1372404_1372758_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_036777561.1|1372778_1374647_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209935.1|1374668_1375613_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
WP_016209925.1|1375846_1376125_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209938.1|1376334_1376973_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209944.1|1376947_1378375_-	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
WP_036777566.1|1378575_1379253_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209939.1|1379387_1380662_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
WP_036777569.1|1380729_1381485_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209948.1|1381536_1382454_+	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300404.1|1382562_1383456_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273594.1|1383528_1384899_-	MFS transporter	Q6JIH2	Burkholderia_virus	4.2e-39	27.4
WP_054300276.1|1384938_1385913_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.0e-28	32.3
WP_016211771.1|1386205_1386394_+	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211770.1|1386407_1387541_-	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183161.1|1387740_1391805_+	cadherin-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_168183217.1|1394447_1395017_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300398.1|1396027_1396909_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210892.1|1396966_1397563_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210891.1|1397595_1398369_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126206.1|1398902_1399199_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210888.1|1399221_1399473_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047123.1|1399418_1400141_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210886.1|1400209_1400989_-	outer membrane protein assembly factor BamD	NA	NA	NA	NA
WP_016210887.1|1401071_1402022_+	23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase RluD	NA	NA	NA	NA
WP_016210889.1|1402531_1405378_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047008.1|1405395_1405710_-	DnaJ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|1405767_1406653_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP050938|1447049:1477670|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211219.1|1453875_1455153_+	FAD-dependent 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34) oxidoreductase MnmC	NA	NA	NA	NA
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WP_155047126.1|1455956_1456448_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052133287.1|1460730_1461129_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212039.1|1461317_1461875_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212040.1|1462051_1463401_+	DNA recombination protein RmuC	NA	NA	NA	NA
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WP_036776426.1|1466239_1467091_+	pyridoxal kinase PdxY	NA	NA	NA	NA
WP_016210805.1|1467099_1467771_+	pyrimidine 5'-nucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_032126141.1|1468189_1469464_+	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016210804.1|1469528_1471448_+	DNA mismatch repair endonuclease MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	4.5e-84	34.0
WP_032126139.1|1471454_1472384_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA
WP_054300383.1|1472479_1474960_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047129.1|1475923_1476580_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|1476783_1477149_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556449.1|1477163_1477670_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP050938|1482038:1535001|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016211422.1|1482038_1482509_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP050938|1556421:1600767|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_16

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MQKFMPCEEDDDFFGLSSNHHQLLQASFAFTESIQLNQPALFFDQKRAQKEALRAVLSCEGTIL
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MVKKKTTSKKAQQDPHARREANKYENPIASREHILALIKGAAVALSRGEIAEQLALRDEESLEALRRRLRAMERDGQLVRKKEGYYPADKFELVEGRVHAHKDGFGFVCLDDADDVFLSIGQMKALWHGDIVQARISGVSAKGRREGTVVDIIERGVEQVTGRFFTSARGHYVEPDDKKTKQRIFITAENAGGAEDGQMVSILILSHPSYRRQADGRVVEILGDYMAPGMETDVALRVHNIPHEWPEAVQEQVQDFGEEVLEKDKKGRVDLRELPLVTIDGEDARDFDDAVYCEEKVSGGWRLYVAIADVSHYVRKGSALDKEALKRGNSVYFSGRVVPMLPEILSNGLCSLNPHVDRLCMVSEITISAAGRLSGYKFYPALMRSHARLTYTDVSQILEHDDTRLKEKYRALVPHLHSLYTMYQVLLKRREERGALDFETTELKVLFRSDRKIEKIVPSARNEAHRLIEECMLCANVATARFLRKHELAALYRVHEGPKADKVVDVRQFFSELGLNLPGGSKPSPQDYAMALKSIQGRDDFHVVQTVLLRSLMQAVYSPEEKGHFGLAYPAYTHFTSPIRRYPDLLVHRIIRHQLGLTGGVSYSEEKMLEYGEHCSMTERRADEATRDALDALKCEYMLDKIGEQFVGTISAVTHFGIFVQIKDVYIEGLVHVSQLQGDYYHFDGTRHCLMGERTKRCYTLGDEVEIVVANVNLDTKMIDFSLLEFLQDNLQKKGNSQGTKKTAKKKIGKKVAQSKKSTVADDKQPVAAKKATKKNSNRKAKVKNNAKSSRFKVKKKNK
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210928.1|1557047_1557353_-|transposase	ISAs1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300375.1|1557567_1557768_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728346.1|1558574_1558907_-	SnoaL-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047138.1|1558924_1559407_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155047140.1|1559810_1560395_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1560340_1560706_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211651.1|1560939_1562475_-	glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211650.1|1562599_1564084_+	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
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WP_155047141.1|1566774_1566981_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126642.1|1567050_1567512_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126641.1|1567547_1570118_-	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.9e-30	22.9
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WP_016209844.1|1570883_1571924_+	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
WP_016209835.1|1571901_1572384_+	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_036777412.1|1572380_1574975_+|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	8.3e-89	41.3
WP_016209832.1|1575281_1575545_+	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_016209831.1|1575823_1576522_-	DUF3865 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209841.1|1576741_1576936_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|1577011_1578571_-	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_161625459.1|1578889_1579762_-	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1579894_1580869_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_164997259.1|1583155_1583302_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209826.1|1583394_1584417_-	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_036777393.1|1584747_1586115_+	glycerol-3-phosphate transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209846.1|1586350_1586605_+	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_032126639.1|1586620_1587907_+	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_016209836.1|1587926_1589141_+|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
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WP_016209834.1|1595305_1596064_+	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
WP_016209842.1|1596240_1596630_+	flagellar basal body-associated FliL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300373.1|1597357_1598215_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1598211_1599186_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155046721.1|1599357_1599525_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|1599705_1600767_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211286.1|1627625_1627973_+	50S ribosomal protein L19	NA	NA	NA	NA
WP_016211289.1|1628084_1628357_+	hypothetical protein	A0A1B0Z0G5	Vibrio_phage	3.2e-12	53.4
WP_016211767.1|1629973_1630783_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211764.1|1631621_1632443_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126803.1|1632643_1633876_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	7.5e-32	26.6
WP_032126790.1|1634109_1635015_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126804.1|1635174_1636050_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211806.1|1636214_1636940_-	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_081007037.1|1636982_1638521_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	7.5e-05	36.9
WP_016211804.1|1638527_1639913_+|tRNA	cysteine--tRNA ligase	A0A2K9L6B7	Tupanvirus	2.5e-47	32.1
WP_054300271.1|1640295_1641270_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155047144.1|1641714_1643040_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300276.1|1643075_1644050_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.0e-28	32.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

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ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCCAAGTAGTTACGGATAAAAATAAAAAATTTATGAACTTCATAGCGCCAAAATAATCAAAACTTATTTATCAAAGTATAGTCAAATTTAATAGCGCTAAAATGAAATAACGAGACTATGAACCTTCATAATCCCTAGTCAACTTAACAACTATAGGTGCTAACAATATTAAAGCAATCAGATTAGGAATAGCCATCAACGCATTTAAAATATCTGCAACTAGCCACAATAAATTTAGATTAGCGACAGCACCTAAAACAATCACAATTACCCATAGAATACGATAGGGAATAATGATTTTAGTACCAAATAAATAGCTCGCACAGCGTTCCCCATAATAACTCCAACCAAGCAAAGTAGTGAAAGCAAAAATAACGAGTCCCACCGTAACAACCAAGCCACCGCCATTAAAAGCAACCTGAAAAGCATCTGAAGAAAGCGCAGCCCCTGTCTCGCCAGATGTCCATAACCCACTTAATAAGATAACAAAGGCAGTAATACTACAAAGAATCATTGTATCAAAAAAGGTCCCGGTCATTGCGATTAATCCCTGGCGAACTGGGCTATTTGTTTTTGCTGCTGCATGAGCAATCGGTGCTGTGCCTAAACCCGCCTCATTTGAAAAAACACCGCGCGCAACACCAAAGCGAATCGCAGCCATTATCGTTGCACCAGCAAACCCTCCTGCTGCTGCTGCGCCACTAAACGCACTATTAATAATCAACATAAATACACTGGATAGGTGGTGAATATTAAGCCCAATAACAACCAGGCCGCCGATAATATAAAAAACAGCCATAATAGGAACCAAATAGCTAGTCACACGCCCAATCCAACGAATTCCTCCGAACAGTACTAAGCCCACCAAAACAGCACTGACTCCACCGACTAACCAAGGTGAAATACCAAAGTGATTATTTAATACGTGCGCCATCGAGTTACTTTGAACACTGTTGCCTATACCAAACGCTGCAATCGTTCCAAAAATAGCAAAGGCAACCCCTAAGCCTCGCCAGCGAGAGCCTAACCCATTTTTAATGTAATACATTGGACCACCAACGAAATTACCATTCGCATCCGTTTCCCGATATTTTACGGCAAGAACGGCTTCAGCATACTTTGTCACCATACCAATTAGTGCGGTCATCCACATCCAAAAAACAGCACCTGGCCCTCCTAAGACAATTGCAGTTGCAACGCCTGCAATATTTCCTGTACCTACCGTTGCAGCCATTGCTGTAGTCAATGCTTTAAAGCCACTGATTTCTCCTTTTGCTTGTTTTGAGTCTTTTTTAACAATTAGTTTAAGTGCTACACCCAGTTTTCTAAGCTGCAATAACCGTAAGCGTATCGTTAAATAAAGACCACAACCTAAAAGCAAAATCAGCATAACCGGGCCCCAAACAAAGCCACTTAATGCATTTAAAAATGATGCTATTTCCATATTAAAACTCACTCCTTGATTTACCTCTTTACTAGTGTAACAAAAAAGGCATAAGTAAAAGCAAGAGAAAAAATATTTTGGCTCGATTAATTATTTTTATAAACCTTTTAATAAAGTTAGGTTTAAGCATAATAGCTAGTCATAGCTCTACATGATTATTTCAAATAAAGGCAACTATAATAAAATTAATTCTGTTTTTTAAAAGCAAGTCAGGCATTTATAACAATATATGCCTGACTATAAAACGGTTATGATGTAATCAATTAAAGCTCACTGGCTGAAGCGATCACTTTATTTACAATGCCATATTCTTTGGCTTCTTCTGCCGTCATCCAGTAATCACGCTCAGTATCTTCTTCGACCTTCTCAAGTACCTGACCCGTACGCTCAGCAATAATAACATTCAAGCGCTTTCTCATTTTAATAATTTCTTTGGCTTGAATTGCTAGGTCCGTTGCCTGGCCACGTGCACCACCACTAGGTTGGTGTAATAAAAAACGTGTATTTGGCAAACAATAACGATCTTCTTTTTCAGCGCCTAGGAAGATTAAACTTCCTGCACTAGCCACCCAGCCGGTGCCAATCACACGAACACGAGGCTTGATAAAACGCATGACATCATGAATTGAATCTCCCGACTCAACATGCCCTCCCGGTGAATTCACATACACAGTAATCTCATCATCGCTCACATGTGCTAAAGCAATAAGTTGAGAAGTTACTTTTTGAGCCAGTTTTTGGTTAATTTCACCAAAAATAAAGACACTGCGCGCTTCAAACAGTTTTTCATCAATTAATGCTGAACCTTGAAGCTGTTGTTCTTGATCACTCATAATTTTATTTCACCTTTATTTCTTTTCTTCATTAACGACAAATTTATAAAATTCGCGGACAACGGTTACATTAATATCCGCAGGTAAATAGTCTTGGCTCAGCCAATCTTCACCATCCAAGCCTTCCATATACAAATTAATAATATGAGGACCGCGTTTTGCCAATTCAAGACGTGCTTGCTCTTCAGTTTGGCAATCAAAGTCTTCATTCTCAATTAACTCTTTTACATCTGTTGCAAAAGCCTCATAGGCCATACGATTGCGATCACAGTCAAACTCTTTAGCAACCTGATCGATGATATCGTCAATGTGCGGGTAATTTTTCAAAACAATATCCTATTGGTTATTATGCACAGAGTGTAGCATGTCCTTTAGTATTTCAACATGTTCAGGCAAGTCATTTAATGCCGGGATATATTCAAAAAACTCCCCACCCACAGCAAAAAACATGGCTTTACTTTGCTCATTAATCTCTTCCAGTGTTTCTAAACATTCAACAGAAAAGCCCGGACACACGACATAGACTTTTTTTATGCCTTTTTTAGGTAAAGCAGTTAATAGGTCATGAGTGTAAGGCTGTAGCCATTTTTGCAAGCCAAAACGGGATTGAAAACTAATGGCCCACTGCTGTTTTGTTAACCCCAGTTTTTCTGCCAATAATGCTGCGGTTTCATGGCACTGCACTTCATAAGGGTCTCCCATTTTAACCATCTTCTGCGGTAAGCCATGAAAAGACATCAGCAATAACGCATCAAAATGTTGATTTATTTTTGGCAAGATCGTCGATGCTAACGCATTAATATAACTAGGCCGGTTATGATAACTCTCAATTACCTTCAGTGGCTTTTGCCAGCTTAATTCTTTAATTTTTTCTGTCACAGTCAGCGTTGTTGCCATCGAGTATTGTGGATAAAGGGGTATAACAATCACTTCATCAACAAACGCTTGAATCTCATCATAAGCCACTTGGAATGAAGGTTGACCATAACGCATTGCAACAACGACCCGATGATCCTCATCTTCAAGTTCAAACTCTAATTTTGCCGCAAGCTCCTGCATATAAGACCGTAATGGTGAATCACCTTTTTGCCAAATCAGCTGATAAGACTCAACTAAGCGCTGTGATCTTTTTGGCAAAATAACATACCTTAACAAAGGTTGCCACAACCATGCTGGTAATTGCACAACATAAGGATCTGATAAAAATTCTTGCAGGTACTCTTTAATTGCTTCAGCTGTTGGCGCACAAGGCGTCCCCAAGTTAACTAAAACGACACCATATGTTTTTGACATAAACCACTCTAAACCACTCTAAACCACTCTAAACCCGCGCCATCATACCACATGGCATGACCTTTGCTTAAATCTTAATAATCTCACTTCATAAAAATGGAAAATAAACTGTATGCACCGGCGTGAACTTAATCAGGCGTTTGACCGCTCTTTTGCTTTACTCATTGAAGAAGAAAACTGCCAACACATTACTGACTTATTAGAGCAATTATGCTGTGACCATCATGATTTATTGATTGAAACAAAATACGATGATGTTGAAGTCTGTTTTAAATACCAAGCACAGGAAAACTATATAGAAATGGTTGTATACCAAGATAAAGTGTTACTCGAGGACTATCATATCGCCATTGAGAAAGTCTGTG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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300354.1|1728393_1728912_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.3e-30	42.9
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WP_016210112.1|1736504_1737932_-	YdiU family protein	A0A075BSJ0	Microcystis_phage	2.5e-55	35.0
WP_122943012.1|1738048_1738504_-	DUF4442 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210108.1|1738689_1739955_+	sodium:proton antiporter	A0A2H4J178	uncultured_Caudovirales_phage	9.1e-49	42.8
WP_016210114.1|1740047_1741307_+	calcineurin-like phosphoesterase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210110.1|1745096_1745852_-	5'/3'-nucleotidase SurE	A0A1B1ITZ2	uncultured_Mediterranean_phage	5.4e-65	52.0
WP_036777611.1|1745912_1747502_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210106.1|1747684_1748776_-|tRNA	tRNA pseudouridine(13) synthase TruD	NA	NA	NA	NA
1755438:1755727	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP050938|1840555:1874952|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_19

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MKSIQSAESQFNNMGRLGKILADIKSTCLGFNKSLKKASPQAKSDFKLAGELIEELDERLDELNRRQEEARRHQEREKVRRHHLNESIRNLKKEIDLADEVVKPFEEELDKLDKSLRLGMDFSPMHERISQIQEKVDYHKRRRNKAVALLCFDELCNPLLPREIYNQEVLEFISPTEMTMT

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211180.1|1857219_1857684_-	low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126449.1|1857704_1858628_-	50S ribosomal protein L3 N(5)-glutamine methyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211857.1|1872109_1872988_+	endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211856.1|1873578_1873764_-	(2Fe-2S)-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183220.1|1874439_1874952_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	1.1e-16	39.0

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP050938|1881026:2013813|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP050938|2033384:2092815|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_21

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211946.1|2039199_2039955_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211943.1|2040215_2040569_+	ArsC family reductase	NA	NA	NA	NA
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WP_033923708.1|2041821_2042697_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036776195.1|2043108_2044356_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209489.1|2045985_2046717_-	pyridoxine 5'-phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209497.1|2046719_2047463_-	DNA repair protein RecO	NA	NA	NA	NA
WP_016209492.1|2047476_2048376_-	GTPase Era	NA	NA	NA	NA
WP_016209466.1|2048381_2049056_-	ribonuclease III	E5EQH1	Micromonas_sp._RCC1109_virus	8.9e-27	34.5
WP_129556644.1|2049461_2050349_-	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209482.1|2050399_2052202_-	elongation factor 4	A0A2K9L2P9	Tupanvirus	5.1e-21	39.2
WP_016209457.1|2052501_2053083_-	RNA polymerase sigma factor RpoE	NA	NA	NA	NA
WP_036776203.1|2053226_2054801_+	L-aspartate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_155046977.1|2054808_2055129_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209486.1|2055247_2055499_-	succinate dehydrogenase assembly factor 2	NA	NA	NA	NA
WP_016209469.1|2055579_2056578_+	folate-binding protein YgfZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209471.1|2056724_2057051_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209462.1|2057060_2057204_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209474.1|2057213_2057624_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209468.1|2057765_2058077_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_155047182.1|2058782_2060813_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209467.1|2060882_2061908_-	FUSC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776209.1|2064347_2065343_+	glycosyl hydrolase family 17	NA	NA	NA	NA
WP_016209459.1|2065602_2066769_+	rasGEF domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209478.1|2066932_2067886_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_036776213.1|2067908_2069927_+	DEAD/DEAH box helicase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209490.1|2070017_2070341_-	YqcC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209463.1|2070767_2071151_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126730.1|2071505_2071994_-	glycine zipper 2TM domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209472.1|2072096_2073467_-	DNA repair protein RadA	NA	NA	NA	NA
WP_016209456.1|2073580_2074312_+	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase family protein	M1IDP9	Pelagibacter_phage	5.3e-09	35.8
WP_016209491.1|2074336_2075434_-	alanine racemase	NA	NA	NA	NA
WP_032126729.1|2075466_2076891_-	replicative DNA helicase	A0A077SK18	Escherichia_phage	1.7e-152	62.1
WP_016209484.1|2077097_2077550_-	50S ribosomal protein L9	NA	NA	NA	NA
WP_016209480.1|2077561_2077789_-	30S ribosomal protein S18	NA	NA	NA	NA
WP_016209481.1|2077838_2078165_-	30S ribosomal protein S6	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_22

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP050938|2236410:2291298|DBSCAN-SWA
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MVQVRENVRPSLDEDVTRIESWLSSVHETLGYQDEQMTLIAKACELAQQYGRETAALCGHSAYYQGVMMADILIELHVDHETFAAAIIYPLYYYGAVSCEVIETELSSAALVRIVTGVKRMEAMQTIRRGQDMASMDRLRKMLLSMVEDVRIVLVKLAERAFALRVIKEEAEPVRKQIALDVQEIYAPLANRLGVGQLKWEMEDLAFRYLEKETYKRIAKLLDERRLDRERYIRDVINELESALANAHIEGEVSGRVKHIYSIWRKMHKKSLAYDEIYDVRALRIMVGEVKDCYAALGIVHSLWKHIPREFDDYIATPKENGYRSIHTAVVGPEGKTVEVQIRTFNMHEEAELGVAAHWRYKEGVKHDASYESKINWLRQLLDWQEEVADANDAIEDLKAQVVDDRVYIFTPKGDVMDLPRGATPLDFAYHVHTEVGHRCKGAKVGGVIVPLTYELKTGDRVEVLTAKNGQPSRDWLSSHLGYLKTTRARNKAASWFKQLRREDNIIEGRALLEREAERLGIENIDYGRLTERYKMHSVDDIFIGVACGELRPLQLLNYLQPSIDKKEELMPVAHAVSLLQKEAQLGEVVVAGVDNLMTHMARCCKPVPGDQVVGYITMGRGISVHRQNCSNVAFEHVEKSRLVEVQWGDVECQSYPVDICIWSTELDHTTKALMMLLSGEKISVQSLNVQREKKGQPAVVLVTLKVESLTILGRLLDKIQQLTSVMEVTRKR
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MQPIINIATRAARRAGALMLQRIDRLDTLKVAEKGIGNYVSDVDKSAESTIIETIQKAYPEHTILSEESGQTPQESDYLWIIDPLDGTNNFIHGNPNFCISIAIQYRGRTEHAVIYDAIRDELFSATRGQGAKLNDHRIRVSQRNKLEGATISTSLTHATDQYAAAFFASQHSLYEQHVALRRSGSIALDLAYVAAGRLDASYTLGAQRWDIEAGLLLVREAGGLASDLNGGESNISEGELLAGNPKSLKHLLQTLRPHYTKKS
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METLLCLTNENFDQTVEDNELTVVEFHADWCEPCRSFDKVFVEVAKEHADVVFAKIDTEKEVELAREFHVRSIPRLMIFKKNVVVADQTGELPFDVVNDLIKQAKSLDMSDIHQHMAKQFLS
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MIYLDYAATTPVDPEVIQAMQECLGLEGDFANPSSLHRLGWLAAEKIKHARGQIARLVGADSKAIIFTSGATEANNLAIKGVCEAYQKRGRHIITSKAEHKSVLDVFAVLEKQGFEVTYLTPNKQGLIDPEILQTAMHEQTILVSLMHVNNELGVAHDLVALGTIVKAHGAIFHVDAVQALGKLPIDLAELPVDLMSFSAHKCYGPKGVGTLFVRRRPKVRLHAQQHGGGHELGLRSGTLATHQIVGFGRACELAEEKLNEEPQRVMALRDRLWQGLSQYDQVYWNGQGALTQAPGILSVSFAGVDGESLLACLPELAVSQGSACNSTTVEISHVLAAIGMPAERAHSTLRFSLGRYSTLAEVDQVIEQVGRALTHLRKLSPTWQVQQAGADPALLPWRRYVE
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MDTSLIGLFCIVDDFCQVFLPHWKASLLEHQDKQRNKPSRMSTSEIMTIMIYFHQSHYRNFKHYYQREVQGHLKKYFPKAVSYNRFVELMPTILLPLCFFIAAQRKTPTGIYFVDSTVLRVCHHKRSHQNRVFKGLAKKCGSTMGWFYGFKLHLIVNDMGELMAFKLSQATTDDRVVLPEIAQGLTGKIIGDKGYISQDLFNRLYEKGLQLINKIRKNMKNKLMPIIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSVNNFMVNILAGLAAYCLQEKKPSLNIQRNLLTS
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MMGLMIQGSFLAVLLLLLGVLCYLWRSIKHYRQQLCELQGHCHVFMSSSIGIGQRLALLERYLGRDLYKELGHDAFPEKEENLYRQAAKLAALGMGKKELAEGFDLTDTEAELLELMSTQPLNSPMASKKMAQPEKTVQKAQSQQHLNHPAIKRYKSHQQD
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MKRMLINASQPEELRVAMVDGQHLYDLDIETAGYEQKKASVYKGRVTRIEPSLEAAFVEYGADRHGFLPLKEIAPEYYDATANTDKRGRVHIRDAVREGQEVLVQIDKEERGTKGAALSTYITLAGCYLVLMPNNPRAGGISRRIDGEEREELKQILEQLNLPNDMGLIIRTAGIGKNLEEIQWDLSILQKQWQAIRAGFARIAAPSLIYRESDVVLRAIRDYLRPGVNEIVVDDRDVYDRIAHHLKQLRPDYLNCLKHYQDPVPLFSRFNIEGQIESAFEREVRLPSGGAIVIDHTEAMISIDINSARATKGGDIEETAFNTNIEAAEEVARQLRLRDLGGLVVIDFIDMVQPRHQRDVENCLRDALKMDRARVQTGRISRFGLLEMSRQRLRPALGESSQHVCPRCSGHGYIRGIESLALAVMRLLEEEAMKGQQGQIQAQLPVEVATFLLNEKRGILAQIERRHRVSLLLIPNINLQTPHYQVMSVSDHAREDAASYSLVSQVQSVEDLTKAAVKYEEPVVKDLSYGASPKRGLLNKLWQYLSGASHSHSAQASEDTAATVEPIRPVKVHSASSSSSSSSSEGRDRNKRQGSTGGGSGRRSQGGGQLAAAPSKGQSGGGRHRRNEGGTVVKGNLASSGESHERSSNRSNSNKTTDARRKSTGGKSSSVSQQRKSVKSASDVDKDASKKAVTTQRTEAMVEVKAAVEPVSVKVAVEQVSSVVSSSAEAKVTTTGGATTSGQKTETVVVEQAAVMEKVVRAKRPNFTTLESQVETTVISSGVIDRAVPSSYHHGNIGAHRLEPWRSALSAAASSIAEIKQIETIANDESSTESVIVKVVEKLHQGRSPLQWHERLKGSQAAISHSIEHIRQVETKVAVAIAAAENQVKTNIQ
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MKHWKKVVVTGFGLLAVVLAGCSSYKDNTIAPAPLKIFKPKVAVLEHWQAQVGEGSGTAAKAVLSFGDEGYWQYQAAENWHLNVTQAGQSLYAVDYNGLVKSFNLAGQTNWHVNLKQLLTASPVAGPEYVYVVTAEGTVFALNKKTGQIQWQKPLGSLVIAAPAAAKGVVVIHTKPGAVIALRAVDGRQLWRYDLLLNPSMTMERSSVPVIAGQQVVIGSDNGQVVALDRQTGDLLWQYQVAVPSGASEVAQIVDVDVTPVVKDGTVYVSSVKNRTIAVSLQSGRMLWKHKVGSFSGLAVSQNKVIVTANNGALWALDRQTGKAVWVDSNLLGRGPTAPAIVGHYVVVGDYKGFVHWFSLKTGQLVGRMSVGARAIVGQPVVDGSIVYVMDASGRLVAVRGSKVEEL
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MKVNVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209434.1|2236410_2237832_-|tRNA	glutamate--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_129556553.1|2237921_2239514_-	glutamate--cysteine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209439.1|2239677_2240304_-	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300277.1|2240384_2243066_-	Rne/Rng family ribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_016209445.1|2243548_2244505_+	23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC	NA	NA	NA	NA
WP_016209435.1|2244605_2244977_+	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	1.1e-05	29.4
WP_016209404.1|2245003_2245867_+	chemotaxis phosphatase CheX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047194.1|2245856_2246615_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776598.1|2246903_2247389_-	DUF2802 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209443.1|2247463_2247985_-	chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016209405.1|2248030_2248924_-	cheW-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209406.1|2248920_2249742_-	ParA family protein	Q8JL10	Natrialba_phage	5.0e-16	32.2
WP_016209408.1|2250056_2250227_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209427.1|2250380_2251784_-	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
WP_016209446.1|2251877_2253101_-	outer membrane protein assembly factor BamB	NA	NA	NA	NA
WP_016209402.1|2253114_2253843_-	tetratricopeptide repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209424.1|2253857_2255135_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	6.6e-23	25.1
WP_016209433.1|2255234_2255609_-	rhodanese-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209412.1|2255693_2256581_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209436.1|2256638_2257367_-	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_016209409.1|2257363_2258473_-|tRNA	bifunctional tRNA (adenosine(37)-C2)-methyltransferase TrmG/ribosomal RNA large subunit methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_016209444.1|2258624_2259053_-	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	39.4
WP_032126508.1|2259147_2259507_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776605.1|2259496_2260708_-	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|2260704_2261493_-|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209411.1|2261655_2262450_+	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2262655_2263630_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_032126933.1|2263798_2265100_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|2265103_2265403_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|2265392_2265557_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|2265613_2265979_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211553.1|2266318_2267059_-	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211549.1|2267062_2269567_-	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211548.1|2269829_2270786_+	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211550.1|2270769_2271531_+|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_054300275.1|2271608_2272484_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211259.1|2272608_2272854_+	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_016211262.1|2272913_2275187_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_075273504.1|2275241_2275595_-|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211261.1|2275784_2276078_+	cold shock domain-containing protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_032126515.1|2276250_2276430_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|2276505_2277081_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|2277363_2278680_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|2278690_2279059_-	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|2279089_2279752_-	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2279926_2280292_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2280237_2280813_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|2280980_2281700_+	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_016211478.1|2281679_2282495_-	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126518.1|2282511_2284713_-	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|2284795_2286145_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_016211473.1|2286219_2286819_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|2286802_2287012_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777061.1|2287329_2288517_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|2288712_2290002_+	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|2290412_2291298_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP050938|2303807:2348930|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211448.1|2308154_2309363_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_155047009.1|2311259_2311433_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_052104774.1|2311577_2312210_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556557.1|2312257_2312569_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047067.1|2312713_2313607_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126170.1|2313770_2314043_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

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CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCCATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCGGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGACCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAGGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATGAATTTTTGAAATTCTTCCATATCGCTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAATCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGGGTATCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAACTTGTGTAATAAGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATAGTATGTCAGAAACTGTTGATCGAGCGCTATAAGTCACACCACAAGCACTAAAAGCTACTTTTTTCATTAACTTTAAACAGCTTACTTTATTCAAGACAAATTAAAAAATTACATATATTTAACACTTAAAAATACACCTAAAAGTAAGGACTGAAAATGTGATGCATAATAAATAATTAATATTGATCTCCTTGTTATCAGGAGTATAATAACCAAATATTTTCATTATAAAAGCATTTAATTTAGAGGTGACTGTGTTTAATAAGTTATATACTTTATTGCTTTTATTAGGCTCCGTTGACATTTCCATATAAATCCTGAGAATAAGTAGTATTTTGCTTGGAGGCAATGATGCCAAAATTATTAGAACAAAAGCAGTGGGACAAAATCTACTTATTCTTAAAAGACTTTCCAGGGATTTACTGTGGCTCAGAAAGGAAATGTCGTTTATTTATCGAAGCCGTTATATGGATTCTCCGTACAGGCTCCCAATGGCGTTACCTACCGGAAGATTATGGATATTGGAATAGTGTTTATAAACGGTTTAGTCGTTGGGATAACCGAGGCGTTTGGGATGCTCTTTTTACATCTGTGCAAACACCTGAACTAGACTCAGGTATGGTTGATTCAACAGTGATTCGAGCTCATGCGTGCTCTGCGGGATATAAAAAAAGACAAAGGGATTAACCAAGCCTTAGATCGTAGCTGTGGAGGCTTTAGTACAAAAGTCCATATTTTAACAGAGGGGTTGGGTTATCCTGTAGATTTTGTACTGACACGAGGGCAAGCACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGTTTACAAGGAAAGGCATTTGATAGAGTGCTGCATTGGCAAGTTAAAACAATTTAGAAGAGTTTTTTCACGTTTTGAAAAAAGGGCTTGCAGATATTTATCCTTTTTGAAAATTGCAAGCACTATCTTATGGTTAAGGTGAAATGTCAACGGAGCCTAGTTTTTAACTCATATTTTTATGCATTAAGCGGTCGCACTATTACGATATACAATCAAACGATACAGGATATCACCCTTCACTTTTTTGACTCAGCCTGCATATATACAAATTTGAGTAGTCCCGAAGCAGCCTCGATGGACTCCGTAGATAATACCACCCTTAAAGCAAATAGCTCTATCAAAGTGCATGAAGAATCAAACGCAAGCAATAGCTGTTTTTTTATTCGCCTTTACCCTAGTGAATATAAACTCAAAGCATCCTTAAGTATTGCTCCTTATATTTATACTGTGATGCAAGGTAGTGCATACGGCTCAGGAGTTGAACGCTTTATGCGCTATAGCGCAATAGGAGGCAGTATAGAGAGATTTACATTTAGTTTTAAGGATAAGAATATTTATATTAAGCATTAATGATTACGCACTCTTTAAATCCTAATCTAGGATAGCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCCTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTAGTTTATCATATCAATACGCTATCATCTCCCATTAAAGCGTACAACACTTTTAAACTTCATTAGGAAAGAGTCCTTGTAATTAATTTCAAGAAGATCAATAAAGCTACACTAAATCATATATAAAAAACTTAAATCTCCACCCTCTAAAATAAAAAACACACCGCAAAATAACAAGTCAATTTATTTATCAAAAAAAACATTGATTTTTATATTTTTTGATATAAATATATATCTTATATTCTACAATAATATTTATACCAAAAATCTAAGAAGCCAAACTTATGCCAAAAAATATTTTTGTATTTAATATTAATAAAACATTACTATGGGCTGAAGAGCATCCAAGAACCATAAACCAAGTACCTACTCAATCAACTTGGCCATTTTATGGATGTGATAATATTCATATTATTAATCAAGAAAAGATCGCCAAAATAATGCAAGCAATTTTAGCAAATGGAGATCAAATCGTCTTCCTACAAGAAAGAGCAAAAACAACAAAAAATAATACGAGGGAAGAGAAAGAAAAAGAGCAAACAGAAAAAGCAGAGTTTTTAAGGCTGTGCACTGATAAATATGGCATCTCCTTGCAGCCAAATAACATTTATTTTCACCATGGTAGCGATGGAAAAATCGCTCGTCTTTTAAGCATATAGCACTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_25

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP050938|2420136:2477063|DBSCAN-SWA
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MRNLSNTSKAHSPVLISLIAGVEYYDFAILAILAPSLSRVFFPNLHLSIDPLFAIYAIGALFRPVGSIMWGHFADRYGRKKTLITTSFIMIFSTLCISILPNGHQAPIFSPIALLTLRCLQGVSLGGDASSAAVLIAETVSNKKRGFYVSFVFAMNSLGSLLAAAMAYLLLKITPANVMLEWGWRIPFVFGAFLLIICLIFRSGVLESTIFEKNPQRYRLPVSALFKHHSPQVFIGICLGFLGNSLVGLSFSFPTLATNQGFPTSQSSLAYTIATLYLTVLYPIAGYFSDIIGRQRLLTIISILTLISSIFIFQLMNIQTTLAITLFMIIIDTFMAITISSAQCAYSELFPTPVRVTGVGIVDSMSSSIGGMMPLLCNIAISLFHNNSAPAYILTIAASATCLAALMLHDQTGRPLTFDEHSTV
>NZ_CP050938|2420136:2477063|2476553_2477063_-|WP_155047206.1|transposase|DBSCAN-SWA
MEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINRPPSSEVQHSVESSYSYR
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MPEEKDEMVTELKSTEALLTLPLLPLRDVVVYPHTVMPLFVGRTRSIKALEVAMAKDQKVFLVAQRDAKQDDPGQEGLFVIGTVATVLQLLKLPDGTLKVLVEGEYRAHLDEFIEVDEIHTAQVSLLEEEGVGERELEVLGRSLISQFEQYVKLNKKIPPEVLSSMAGTEDPSRLADSIAAHLSLKTEDRQKLLEQANLRERLEQLMALLEFEIDLLQVEKRIRGRVKRQMEKSQREYYLNEQMKAIQKELGDLEDGGNELDELEKRIKESGMTEEAHDKAMSELSKLKNMSPMSSEATVCRNYIDALISVPWKKRSKTRSDLSKAEDVLEADHYGLEEVKERILEYLAVQKRVKKLKGPVLCLVGPPGVGKTSLGQSIAKATNRKFLRMALGGVRDEAEIRGHRRTYIGSMPGKIIQKLSKAEVKNPLFLLDEIDKMAQDFRGDPASALLEVLDPEQNHTFNDHYLEVDYDLSDVMFIATANSLNIPGPLLDRMEVIRIPGYTEDEKLNIAKRYLLPKQIKANGLKKNELAVEDEALISIIRHYTREAGVRSLEREISKVCRKVVKQILLKREDKETLKLTAKELEDYLGVQRYRYGEAEEKDQVGLVTGLAWTEVGGELLTIEAATTKGKGKVQRTGKLGDVMQESIQAAVTVVRSRAEMLSIPEESFEKLDVHIHVPEGATPKDGPSAGIGMCTALVSVYTSIPVRSDVAMTGEITLRGEVLPIGGLKEKLLAAHRGGIRTVLIPEENRRELKEIPENILKDLDVQPVRWIEDVLKVALTESPGDLTRLIASSRARSTEGQPGVRKH
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MSQNQSKFPAPAKKVKREKISSKATKKELEITSKGDDSYIERNELDPNAPPTKGYTVPLNEYELTLLLKISEKHDRSQRKQIRRFVIDALEQEAKTLGIGI
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MLNFELSNGDKVPGVGLGTWLASDAEVFASVKQALECGYRHIDCAPIYLNEKAVGQSLKDSLGSRLLSRDELWVTSKLWNSFHEPEKVVGALKKSLFDLQLDYLDLYLMHWPVALKSTVGLNIAETADGFLSLEQVPLTATWQAMEELVKQGLVKNLGVSNFSISKLKMLQSQVSIPPVVNQVESHPYLVQHDLMKFCQSHNIHVTAYAPLGSGGRPEHFKEQDEPAVTVLANTSIRDIAKKYSLTVAQVILQWQLQRGVSVIPKSLNVMRMQENLAVIDALKLEHSDIAVINELDRAYRYYVGSTWTCDGSPYVADTFWC
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MLKLYASKYSGKKVSDQKKYGGLAQALFLAVTNDHNFKGCKSANERFSYVENLNALLFAFKAGTLQGETPSVI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075273327.1|2420136_2420712_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212436.1|2421336_2421747_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047205.1|2421921_2422143_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556523.1|2422630_2423516_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212436.1|2424141_2424552_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047205.1|2424726_2424948_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2424967_2425942_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_080664862.1|2426787_2427486_-	P-loop NTPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211529.1|2428048_2428201_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046745.1|2428659_2429226_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_168183186.1|2429273_2429549_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212436.1|2430432_2430843_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183187.1|2431181_2431454_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_033923634.1|2432060_2432609_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126157.1|2432813_2433218_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211514.1|2433504_2435397_-	DNA topoisomerase IV subunit B	A0A172JHT4	Bacillus_phage	1.4e-80	32.9
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WP_059372266.1|2442053_2442539_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776625.1|2442628_2444143_-	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209659.1|2444269_2445298_+	UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209654.1|2445362_2446505_+	galactokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209656.1|2446623_2448327_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.8e-21	24.8
WP_016209642.1|2448323_2450444_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_016209652.1|2450440_2451790_+	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209662.1|2451761_2453909_-	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	1.8e-25	36.7
WP_016209657.1|2454336_2454732_+	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209643.1|2454740_2455625_-	lipid A biosynthesis acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.4e-40	35.3
WP_075273480.1|2455656_2457555_-	surA N-terminal domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209655.1|2457637_2457910_-	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_032126161.1|2458013_2460446_-	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	9.5e-220	52.7
WP_016209663.1|2460513_2461815_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3
WP_016209647.1|2461896_2462502_-	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209645.1|2462614_2463919_-	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209661.1|2464522_2465398_+	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
WP_075273478.1|2465513_2466185_-	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209658.1|2466361_2467717_-	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126165.1|2467837_2468569_-	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126159.1|2468654_2469368_-	aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_016209651.1|2470013_2471288_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209646.1|2471318_2471894_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209649.1|2471938_2472904_-	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	7.9e-45	39.8
WP_016209640.1|2473362_2474382_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047206.1|2476553_2477063_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP050938|2505201:2553128|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126362.1|2589066_2589432_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210612.1|2593915_2595166_+	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210605.1|2595154_2596036_-	peptide chain release factor N(5)-glutamine methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210611.1|2596028_2597114_-	peptide chain release factor 1	W8EDB3	Pseudomonas_phage	4.3e-07	41.2
WP_016210607.1|2597110_2598370_-|tRNA	glutamyl-tRNA reductase	NA	NA	NA	NA
WP_036778813.1|2598538_2599198_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210600.1|2599348_2600011_+	outer membrane lipoprotein LolB	NA	NA	NA	NA
WP_168183191.1|2600358_2601306_+	ribose-phosphate pyrophosphokinase	A0A1V0SHF7	Hokovirus	5.8e-40	34.7
WP_016210606.1|2601402_2602029_+	50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc	NA	NA	NA	NA
WP_016210603.1|2602034_2602616_+|tRNA	aminoacyl-tRNA hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210599.1|2603861_2604575_+	5'-methylthioadenosine/adenosylhomocysteine nucleosidase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

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TATGAAAATCTCTCAACTCATCCGCCATAACCGCTTTGTTATTAGCATCAGTACCTGCTGCCTGTTATTGTCTTTTTTAGCAACAAGTTCGGCCAATTATGCTGCAACAGCAAATACGAATACAAATACTCGCCAGTCATTCACCCAGGCATTTAACAACAGCAAAGCTCTCGCTGTTTCCAAGCCCGGACAAACCTTTGAAATTAAAGTCCCTGCCAACCCAACCACTGGCTTTTCATGGTTTTTAAAGTCCTATGACCATGATCTTTTGGACGTCGTTAACCAACGTTATAATGCACCTAAAACCAATATGATCGGCGCTCCCGGCAAAGATATTTGGACATTTAAAGCCAAGCCCATGTTTTTCACTGCCCCACAAATCACGGTCATTGAGTTATATAGCGCACGTCCGTTTGATATTCGTAAAGGCCAGGTATTAAAGCTCGCTGTAGTCTCACAGCCATCTGCACCTAACCTAGTAAAAAATAATCTAAAATAATTAATAAAATAAAATTTAATATACTACTTTAAGGGAACCTAAACGTTGTATTCTCTACATACTAATTACCAACAATTTATTGATGAGCTAAAAAAAAGCCCATTCTCTGGCGATATCAATACGGATTTTGGTAGCCGTATTGTCTTTGCCACAGATAACAGCATTTATCAAAACTTGCCCCAAGCGGTCATTGCCCCGCGTCACCATCAAGATATCCTTTGTATAACAAAATTACTTACCCAGACTAAATTTCGCCATATCGCTTTAAGTGCACGCGGTGGCGGCACTGGCACCAACGGCCAATCTTTAAGTGCTAGTATTATTCTTGATACAACAAAATACCTAACTCAAATCCTTGAAATTAATCCAAAAGAGCGCTGGGTACGTGTACAATCGGGTGTCATTCGCGATCAACTCAATGATGCCTTAAAACAATACGGTCTTTTTTTTGCACCGAGCTTATCCACTAGTAATCGGGCAACTTTAGGGGGCATGACCAATACGGACGCCTGCGGACAAGGATCACGCATTTATGGCCATACCAGCGATCATATTCTCGAAAGTACCTGTATCTTTGCTGATGGTAGTCAGCACACCATTCAATCCCACCCCTCAGCACAAGATCTCAAAAAAAACTCACCGCGGCTACAGGCATTATCTAATCAACTATCAAATAAACTAACAGCGCATCAACAGGAAATTAACCAATACTTTCCTAAATTAAGCCGCTATATGACCGGCTATAACCTTGCCCAATGCCAAAACAACCATAACAACAATCATCACGCGCTGAACCTCAATAAACTGATTGCAGGCTCAGAAGGTACTCTAGCCATTGTCACTGAACTGAAATTAAACTTAATGCCGATTCCAAAGTTCAAGCAGGTGTTCGCCTTATTTTATACTGATTTTCAAGATGCCTTAAAAAGTGCTCACCAGTTGCTCGCAATCAACCCAACCTCAATCGAAAGCATCGATGATAATGTACTAAATCTTGCTAAACAAGATCCAATTTACACTGAACTTGAGGATTTTTTTCAAGGCAAGCTCCCTGAGAATTTAAGCGCACTTAACCTCATTGAATTTACAGCCAACACACTTGAAGAATTACAAGATAAAATCAAGCCATTACAAGCCCAACTACATAATAAAACCGGGAAAATTATTCCCACAGGTTATACTAACACCCAAGATCCTAAGCAAATTGAAACCCTCTGGAATCTACGGAAAAAAAGTGTTGGCTTACTAGGGAATACCCCAGGTGAACGTCGACCCTTACCCTTCATTGAAGATACTGTTGTTCCTCCCGAACATTTGGCTGACTATATTTTTGAATTACGTCAATTGCTGGAACAGCATGGACTCACCTATGGCATGTTTGGCCATGTTGATGTCGGCTGTTTACACGTCCGTCCAGCGTTAGATTTAAAGCAAGAACATGACGTTACACTCATAACAACACTGACTGAAGAAACAGCAAAACTGGTTAAAAAGTACCATGGCCTCCTCTGGGGTGAGCATGGTAAAGGCTATCGTGGCCACTATATTAAGGATTACATTGGCGACAATCTCTATAGTCTCATGGCTGAAATTAAAAGCTTATTTGATCCTTTTAATCAACTCAATCCCGGAAAATTAGTTTCCTCGCCTTATAAACCACAAGCATTATTACCGATTCGCAGCACCTTGCGTGGTGATTATGACAAGCACATCAATCTAACTCATCAAAATAACTATCAAACTATTTTACGCTGTAATGGCAATGGTGCCTGCTTTACCTATCAGAAAGATCAGGTGATTTGTCCCTCCTATAAAGTCACAAATAACCGTTTACATTCTCCTAAAGGTCGTGCCAATTTATTACGTGAATGGAGCCGGCAAGACTCAACGGGTGAGCTCACCTCTACATTTGAAAAAGAAGTGTATCATGCCCTACATGGCTGTCTCGGCTGCAAAGGCTGTGCAACTGCCTGCCCCGTACAAGTGAATATTCCAAATAGCAAAGCAAAATTTTTAAACCATTACTATCAAAAAAATAAACGGCCATTAAAAGATTATCTCATTGCCCATATCGAATCTTTATTACCACTACAAGCTACCATTCCTAGATTCTTTAATACGTTATCCCATAACCCAATCAGCACTTACCTTATAAAGCAGTTAGGCTTAGCGGATCTACCCAGATTAAGCACACCCAGTTTAAGTGCCAGGCTAAAAAAAGCGCAGATTCCTCTTTATAACCTAAATGACTTACATCAACTTTCCAGAGCCGATAGAGAAAAAGCGGTAATTCTCGTACAAGATCCATTTACCAGCTTTTATGAAGCTGAGCTTATCACTGACGCTTATGACCTTATTAAAAAACTGGGTTATCAACCATTGATTCTGCCTTTTAAAAAAAATGGTAAGGCCATGCATGTAAAAGGGTTTTTAACTAGCTTTAATCAGCTTGTCGAAGAAAACAGTCAATTTTTTAATCAAATTGCTAACACCGGCATTCCCATGATCGGCCTCGATGCCAGCACCGTGCTCTGCTATCGCGATGAATACCAGGACTACAGTAATCAATCCAATCTACAGCCAGAGTTTAATATTTTATTAATTTCAGAATGGCTAAAATCTATTAATATTGATTCTAGTATTACTAAAAAATATCACTCTGCCATTGAATATACACTATTGCAGCACTGCACAGAAAAGTCACTATTGCCTGAAAGCACGAAACAATGGCTGAATGTTTTCAAGCAATTTAATTTAACATTAAATATTATTCCAAGCGGCTGCTGCGGCATGGCCGGCACCTACGGCCATGAAACTGAACATGTAGAAAACTCAGGGAAATTATTTCGACAAAATTGGCAGGAAACTATCGAGCAATATAGCAAAGAGCAAATTCTAGCGACCGGATTTTCTTGCCGTTGCCAAACCAAACGTTTCAAAGGTTTTAAACCTAAACACCCGTTAAGCGCTTTACTGCATGCTCTACAAGAAAAAACCTAGGCCATAAATCATAAAAATATAAAATAATTATGGCGGTTTACTATATTTATATCTTAGAGTGCAATAATGGTGCGTTTTATACTGGCTATACCACCAATATAAAGCGCCGCTATCAAGAGCATTTACAAGGCAGCCCTAAATGCAAATACACCCGTGCATTCCCACCCAAACAATTAGCCGTTTGCTGGCAAATTCATAGTACTTTGTCTCATACTTTAAAAATAGAAGCCTTTATTAAAAAATTACCACGCTCAAAAAAACTACAGCTCATTCATTTTCCAGAGCAATTATTAACACAGTGCCAACATATTACCGATGCTATTGTTCTATTTCATTTTCAGCACCAACAGCAACCAACTTAATAAATTTTTTACATTTTAATTTAAAAAAATAACAAAATTACACATAGAGCTACGACGGGTACTTTGCTAGAGTCACAGCTGAAACTATATTTTATTAAAGGACTAAAGTGAAATACCATGGCAAACAAACTAACACGTTTTATTGCGCAAGAAATACGGCAACTAAGAGATACCATTCAAAATAAACAAGAAAATGAACGATGGTGCTGGCCAGTAACAGGAACTAAGCGTGCTATACGTATTTGGCTACTTAATGAAATGGAAAAAGAGCTTTTAGAGCATAATTTTAGCCGTCCTGAGGATTTAGAAATCTTTTTAAGTCAATGGAGTGATAAAATTGAAAACTTTACTGCCATCCCACCAAACAGCAAAGGCATTGGCAAAGGTCAAACTATCCGTGATTTTTTTAATCGGAAAAAAGATAGTAGTATTTTTAGTGAACTTAAGCAATATTGCCTAACAGAAGGCATTCCTTTGGTGACCTACACATCCTTGGCGGATCATATGGCCTTTGCAGGTCAGGGCGCACGATACAGCAAAGCTACTCCTTTTTTTAATCACACATCCACATTAACAAGCCCCACGCCAGAAGAACACTATGTATCATTATCCGACACTGAAATTTATGAAGCATAAAGCAGCCCAGCAGACAGCTCCTCTAAACCTTCCTCCCTCTTTTCACCCGAAGATAACCATTAGCGACTTTTTTCTTTAGTCTACTTTTTACATTCTGGTGAAAGCGATTAACAATATTACTAACCATAAAAAGTTAAACATTTGTCACATAACCCACAAGTTGACACCTTTTTTGTTGAGACCCAACATATTGTAAGCCTCTAAATTTTGCTGATTCAGCTGAAAGTAACCCATAAAGTAACAAAAAATAAAGTTTTATGAGTGGCACTATATTCTGGTCTGATCAATGTGTTACAAATATTATAATCCCCACTAAAATATTACTATTTTTAATAAAAGCATTCAGTTAACAATATTAGCATAGTAGGATGATCAGCACTTTTCTTGATTAGCCTCAAAAAAGCTAGGAGTTCAGTCGAAACTTATGGTATACCAATGAGGCTAAAGCTATTCAACCGTGAGGAAGATTAATTTATGACTGCCCGTATTATGATCATTGATGA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MANKLTRFIAQEIRQLRDTIQNKQENERWCWPVTGTKRAIRIWLLNEMEKELLEHNFSRPEDLEIFLSQWSDKIENFTAIPPNSKGIGKGQTIRDFFNRKKDSSIFSELKQYCLTEGIPLVTYTSLADHMAFAGQGARYSKATPFFNHTSTLTSPTPEEHYVSLSDTEIYEA
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MAVQQNRKTRSKRDMRRSHDALTAPTLTIDATTGETHRRHHVSPNGFYRGRKVIDVE
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MSSEVLSDTLAGRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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>NZ_CP050938|2644356:2695302|2679623_2680088_-|WP_016209535.1|DBSCAN-SWA
MNNNKWLETWVGLFVLLGIAGLFVLVLQMSGIQFSSFGQKNYDVNATFSTVGDLKKGASVRIAGVLVGKVERVQLDAVTYQANVTFKINGNVKNIPDDSSASIRSAGILGDNYVMISPGYSETFLTNGGKITTTYPPVGLDSLISNFVGGKVKK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036777003.1|2644899_2647854_+	FAD-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209901.1|2647883_2648216_+	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	8.0e-05	34.2
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WP_016209908.1|2649326_2650037_+	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	2.2e-31	34.8
WP_016209899.1|2650033_2651068_+	phosphate regulon sensor histidine kinase PhoR	W8CYF6	Bacillus_phage	1.3e-32	34.2
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WP_016212369.1|2652368_2652815_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126790.1|2655444_2656350_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210413.1|2662948_2663191_-	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
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WP_075273448.1|2667298_2667829_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210408.1|2670871_2671744_+	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047218.1|2671735_2673904_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273445.1|2674176_2674434_+	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|2674519_2675203_-	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_016209508.1|2675253_2676144_-	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|2676205_2676964_-	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|2676966_2678235_-	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|2678311_2678563_-	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|2678596_2678944_-	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|2678947_2679601_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|2679623_2680088_-	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_036780687.1|2680084_2680852_-	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209539.1|2680855_2681656_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_016209498.1|2681795_2682776_+	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209499.1|2682781_2683339_+	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_168183193.1|2683271_2683898_+	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|2683894_2684626_+	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
WP_016209519.1|2684781_2686173_+	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|2686197_2686509_+	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|2686865_2687720_+	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209502.1|2687720_2688323_-	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|2688398_2689238_-	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_164997271.1|2689415_2690063_+	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209534.1|2690079_2690466_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|2690685_2691618_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209515.1|2691722_2692238_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|2692280_2693237_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126187.1|2694903_2695302_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP050938|2726739:2774694|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126716.1|2763246_2764230_-	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210908.1|2764320_2765136_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2766347_2767409_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212580.1|2768144_2768495_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2768582_2768948_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126810.1|2771228_2771927_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211661.1|2772185_2773142_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.4e-33	31.9
WP_016211663.1|2773206_2773872_+	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|2773965_2774694_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8

Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP050938|2788969:2890865|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_31

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_32

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32

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MGTGVVVEYDASVPLVFTEDAANKVKALIEEEENERLKLRVFITGGGCSGFQYGFSFDEEAAEDDTQVEKNGVILLVDPMSFQYLMGAEIDYREDVSGSQFVIRNPNAKTTCGCGSSFAV

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155047049.1|3030688_3032770_-	protein kinase	A0A2H4UVE2	Bodo_saltans_virus	4.0e-17	28.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_33

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33

>NZ_CP050938|3069085:3126767|DBSCAN-SWA
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MNDTARYQAGRRATLIGAGLNFCLAVLKIVVGLFGRSHALVADGIHSFSDLICDFFVLMAARYGMSEPDQDHPYGHGRIETVATVVLSIFLITLGVGIGIDAFYSLVQGSDARPDSYTLIIAVISIVVNEGLFRYTLKVADQINSDLLRANAWHSRGDSLSSLIVLIGIIGSLLGWSFLDAVAAIIVALMIIKMGMTWGWRALKELIDTALPEDQVADIANAIRAIPHVLAVHDLRTRKMAGYVLLDVHILIHPYISASEGHFIAEQVRAGLMQQFASIRDITVHVDVEEHAHDLNIVKLLSRDQINHDLMPVWQTILGVQQPVDFMLHYLQEKVIIDLYLPNKVIKGADAIIAQLQNSVSNYPDVEKLRAFLKVKA
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MILKTRPNKVERQGSDHQYQEILANIQLKLQGVQLKLNQLDKINNQKYRTLYTLYKIYQITPRGVYFKSMSYHDGVIDLQGASRQRALIRKLINDIESSADLAIDSVNISDDVSRVTISEKIRFSLVAHFL
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MIKNKVLFNKFGIFNIIIFGMFILVLIILLVNIFKYGDHKKINFIKIREIENKENFLQKINSARENYENKLKKIASYNIESTSESVERFLDLLYHAEGMTKSQVSKVREKPNGSFDKVSVSLSVITDYLTFIRFLIILQQSNLLFSIAASHGVLSTG
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MRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MYIQQRNKLNFILVIFGVIAAQAAVSLYLPSLPAIDHEWHLASGQAQLTLSAFFLTFGVSQLFYGALSDHFGRKPLLLMGLVILVLSSVWAIYATSFHSLLAARLVQGVGGGALSVLARAIIRDLFHGDELRKAISILAIAASFTPALAPSLGGWLEDHFDWRSSFVILTAYSIILLVTIFSLFTETNQYQRQPNESIDFSKVVASYYSVTKNKLFWCYGFAILIGYLSLVICLANASFLLEKKFGLSAEITGYLMFVQPGFFLVGNLLQHKLTDKISGDLFLKFGMVILGVIGLSFLFQGVFHSATLINVLLTLALAGFATSLILVNALAGVLLPFTENAGAAAALSGVLQMVGASFITALISNLHWTSIIDLGWIYLALFVVLYISLLFLHRIRLYSPCYKSA
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MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC
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MTSLSEKIIKPKLGVLELAKQLGNVSKACEVMGYSRDSFYRFKKLYETGGEEALQEISKKRPNVKNRVPEHIEQAVIDLAIENPALGQLRASNELLQRGVIVSSSGVRSVWLRNGLETFKKRLKALEAKSAQDGILLTEEQLQALEKAKQEKEAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGTMKGVGRIYQQTFVDTYSRVAFACLYTEKNAVTAAHALNESVIPWFEERDTPLLRILTDRGTEYCGKIEHHAYQLYLAIEDVDHTRTKARSPQTNGICERFHRTMKQEFYDIAFRKKVYNSLEELQVDVDEWLIKYNQHRPHSGKYCYGKTPMQTFQDSKHLAQEKIINKNVQSDSLINQTNVVR
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MAYAYQAKKSASFLRRLNNPFDSDSKGFKPYITPGWNKQLELIGHTVCYSDYVVAVYGPIGAGKSTFLELLKQRLDKRAQFSHLQGESKHSELTTLRAIAVALYLPPADHCTTIEHCFDYIYKYMAERRHTGVSYVLTVDHADHFGPKILSMLQLLAAKLRDQKGCMLHFLLFGEERLIRQLKEILGDKSWQEYLYCCKLKPFSDVEVQLYLDDKLRSLSEAFAFSERDIDLVLKGAVGLPGRINQISRQLVQQKEPKQTRAHRGYRNWAVVFSLLVLISVVVSYLSNQPSWHDSARYGEHSKQSVSHKTTAGLKPGEVSVPLILPGKASSG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211359.1|3070784_3071189_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211354.1|3071718_3073680_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211355.1|3073777_3074887_+	S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase	E3SJ82	Synechococcus_phage	2.9e-35	29.8
WP_016211357.1|3074949_3076431_-	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
WP_016211358.1|3076854_3077316_+	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300534.1|3077363_3077564_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300535.1|3077708_3078428_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|3078431_3079007_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|3078952_3079318_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211800.1|3080014_3080800_-	type III pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_036778206.1|3080796_3081780_-	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016211802.1|3081836_3083108_-	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210038.1|3088855_3089818_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HUT5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	8.8e-20	27.0
WP_016210039.1|3090004_3091264_-	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|3091487_3091814_-	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_052104566.1|3092008_3092959_+	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126434.1|3093016_3095083_-	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_016210049.1|3095088_3096084_-	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210042.1|3096669_3098250_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|3098406_3099816_-	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210047.1|3099875_3101009_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210033.1|3101148_3101973_-	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_016210034.1|3102200_3102830_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210044.1|3103166_3103538_-	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210046.1|3103841_3104129_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126431.1|3104280_3105129_+	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210037.1|3105256_3106297_+	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_155047244.1|3106369_3108307_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300165.1|3108590_3109250_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3109404_3110379_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300164.1|3110454_3111474_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556602.1|3111872_3112082_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|3112956_3114039_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_054300161.1|3114086_3115148_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211201.1|3115228_3115537_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211206.1|3115651_3116968_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_036778698.1|3117429_3118647_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211205.1|3118788_3119685_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211203.1|3119771_3120770_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126430.1|3120878_3121403_-	shikimate kinase AroK	NA	NA	NA	NA
WP_129556668.1|3121650_3122889_-	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	6.0e-13	24.1
WP_168183206.1|3123033_3123399_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273512.1|3123576_3123921_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211207.1|3124115_3124259_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212222.1|3124396_3124870_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556669.1|3124866_3125262_-	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|3126191_3126767_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_34

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34

>NZ_CP050938|3139333:3194448|DBSCAN-SWA
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MISVGQKLPEFNVKATVSNTLNDNAFTEITEKSYAGKWKVLFFWPKDFTFVCPTEIAAFNDLYSDFDDRDTVLLGGSTDSEFVHLAWRQNKEELYDLRFPMLADVKRELSAKLGILDSEEGVSQRATLIIDPENIIRFVMVTDLNVGRNPQEVIRVLDALQTDELCPCNWQAGDQTIKV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_168183209.1|3140272_3140734_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_168183210.1|3140717_3141377_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556605.1|3141771_3142881_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212095.1|3143063_3143393_-	PLD-like domain protein	A0A1B2LRT6	Wolbachia_phage	6.1e-13	55.3
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WP_155047002.1|3144303_3144909_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036776867.1|3145279_3146677_-|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A167RLM0	Powai_lake_megavirus	1.8e-77	34.4
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WP_016209707.1|3149438_3149762_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209703.1|3149763_3150993_-	conjugal transfer protein TrbI	NA	NA	NA	NA
WP_016209722.1|3150992_3152036_-	TrbG/VirB9 family P-type conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209720.1|3152715_3155205_-	cagE, TrbE, VirB, component of type IV transporter system family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126705.1|3156618_3157776_+	HlyD family efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209727.1|3157795_3160903_+	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209723.1|3160904_3162410_-	YifB family Mg chelatase-like AAA ATPase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209709.1|3162867_3163209_+	P-II family nitrogen regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_155049898.1|3165293_3166811_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209706.1|3168152_3169151_-	3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209711.1|3171097_3171769_-	phosphoribosylanthranilate isomerase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209717.1|3172570_3173569_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	5.2e-39	32.7
WP_016209697.1|3173570_3174149_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	2.8e-45	45.0
WP_016209713.1|3174145_3175615_-	anthranilate synthase component I family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209719.1|3175658_3175946_-	trp operon repressor	NA	NA	NA	NA
WP_168183211.1|3176206_3176743_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300152.1|3176769_3177135_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046757.1|3177191_3177347_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273401.1|3177491_3177944_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155047003.1|3179801_3180687_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212372.1|3180873_3181095_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047252.1|3181210_3181789_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047253.1|3181933_3182128_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3182186_3183161_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_036776841.1|3185003_3185543_+	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
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WP_016211866.1|3186815_3187118_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211227.1|3192369_3194448_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
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NZ_CP050938.1|WP_155047097.1|1040245_1040929_+|hypothetical-protein	1040245_1040929_+	227 aa aa	NA	NA	NA	992178-1207274	yes
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NZ_CP050938.1|WP_032126179.1|1307133_1307385_+|TSUP-family-transporter	1307133_1307385_+	83 aa aa	NA	NA	NA	1273776-1406653	yes
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NZ_CP050938.1|WP_155046721.1|1599357_1599525_-|hypothetical-protein	1599357_1599525_-	55 aa aa	NA	NA	NA	1556421-1600767	yes
NZ_CP050938.1|WP_016210146.1|1600968_1601460_+|hypothetical-protein	1600968_1601460_+	163 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
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NZ_CP050938.1|WP_016212013.1|1709429_1709813_+|hypothetical-protein	1709429_1709813_+	127 aa aa	NA	NA	NA	1685332-1748776	yes
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NZ_CP050938.1|WP_162034402.1|3067709_3067847_+|hypothetical-protein	3067709_3067847_+	45 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP050938.1|WP_098082809.1|3068564_3068915_-|hypothetical-protein	3068564_3068915_-	116 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP050938.1|WP_129556602.1|3111872_3112082_-|hypothetical-protein	3111872_3112082_-	69 aa aa	NA	NA	NA	3069085-3126767	yes
NZ_CP050938.1|WP_016211201.1|3115228_3115537_-|hypothetical-protein	3115228_3115537_-	102 aa aa	NA	NA	NA	3069085-3126767	yes

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_129556569.1|993054_993264_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_129556569.1|993054_993264_-|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1069934-1069971	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1072852-1072889	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1181417-1181454	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	998106-998069	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1069934-1069971, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1072852-1072889, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1181417-1181454, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

4. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 998106-998069, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016212318.1|1030937_1031369_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016212318.1|1030937_1031369_+|hypothetical-protein
MAKPIPKIEINILKYLSRNGIENNNIKIIEEVFEESTSDFILTVKESNFSTITAMQQELNAGINAGINASGNNRIDIVEGSNSEVTLIIPYGAFSLLNSFLELSQGPQARQQPGLFEQRSADRAGGGAEPALEYDDDDLVADC

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1069934-1069971	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1072852-1072889	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1181417-1181454	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	998106-998069	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1069934-1069971, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1072852-1072889, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1181417-1181454, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

4. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 998106-998069, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016212320.1|1031370_1031697_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016212320.1|1031370_1031697_+|hypothetical-protein
MDNKGFCYWLQGYFEIEQNAYLNKEKLALIEDQLNALVVDKGKFTRWLSQVCDYIKGLDYPEETINVFTPIIKESLSNVFRHVIDNSYVGIDRKTRHQVHEEGLNDES

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1069934-1069971	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1072852-1072889	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1181417-1181454	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	998106-998069	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1069934-1069971, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1072852-1072889, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1181417-1181454, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

4. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 998106-998069, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_036781320.1|1031683_1031911_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_036781320.1|1031683_1031911_+|hypothetical-protein
MTNREFYYWIVGFAQLADDVSLDEHQIKIIKNHADLAQLTDGYVAKNVCRFIKEIEVCQQGQHQAVIARFIDCSF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1069934-1069971	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1072852-1072889	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1181417-1181454	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	998106-998069	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1069934-1069971, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1072852-1072889, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1181417-1181454, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

4. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 998106-998069, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_155047097.1|1040245_1040929_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_155047097.1|1040245_1040929_+|hypothetical-protein
MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYNEALSTAIEKIKKTEVSDKNYPAVNAHMLPFLKAYFFSYIEKALAKIDEEEGSLVQKLNAKLSFLSTLKSSFRAKFSGEWAHQFYFDHSSALNEVAGFDSEGECPQSYFALFNAFEAVGNKDRKAVTLALTLDKFSSTQVVCDNREIFSTE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1069934-1069971	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1072852-1072889	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1181417-1181454	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	998106-998069	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1069934-1069971, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1072852-1072889, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1181417-1181454, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

4. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 998106-998069, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_032126498.1|1185786_1186347_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_032126498.1|1185786_1186347_-|hypothetical-protein
MKIKALANSLQFKIYTLLAVTITMTLTITGIIEYLGDKNSLQQQLKQDALISSQRIASSLAEPLWNLSHTQVQAILKSNLKSREIQALQIKLQPGNKIITTYKDSNNKIIHISKPIVNSNYNDSIILPIKYRDETVGKLTYFIDSSSINETLTKIIYKQGLQTFILNLLIIAATYILISKIIIKPL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1069934-1069971	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1072852-1072889	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1181417-1181454	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	998106-998069	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1069934-1069971, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1072852-1072889, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1181417-1181454, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

4. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 998106-998069, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_032126179.1|1307133_1307385_+|TSUP-family-transporter

>NZ_CP050938.1|WP_032126179.1|1307133_1307385_+|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1315585-1315622	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1355515-1355552	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1305614-1305577	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1343655-1343618	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1315585-1315622, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1355515-1355552, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1305614-1305577, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

4. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1343655-1343618, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016212421.1|1495677_1495860_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016212421.1|1495677_1495860_-|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1485567-1485530	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1485567-1485530, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_164997259.1|1583155_1583302_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_164997259.1|1583155_1583302_+|hypothetical-protein
MFAVLLLQACSFNHAEKSQIVNSMVAPFVATGQFIMANAGKNFAQSAA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1560769-1560732	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1560769-1560732, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_155046721.1|1599357_1599525_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_155046721.1|1599357_1599525_-|hypothetical-protein
MKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1560769-1560732	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1560769-1560732, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016210146.1|1600968_1601460_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016210146.1|1600968_1601460_+|hypothetical-protein
MHQKEQITELLECPQELTLVKIVLLAGLEKVIANCLDRQSVVKLKIAEFFRLEVEAITEGSDSDESLSAELASLKMDKLKDILKKAACAFHQKSGLFTAKSYQVAKPYFEVLRELFGISDVEWKGILAHEANLDCEELSLQFYNKYMANKDDMASPGHLPTRP

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016211151.1|1688688_1689000_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016211151.1|1688688_1689000_-|hypothetical-protein
MKNYPHIDDIIDQVAKEFDCDRNRMAYEAFATDVKELIENEDFDCQTEEQARLELAKRGPHIINLYMEGLDGEDWLSQDYLPADINVTVVREFYKFVVNEEKK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1726930-1726893	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1726930-1726893, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_081377353.1|1695852_1696518_+|transposase

>NZ_CP050938.1|WP_081377353.1|1695852_1696518_+|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1726930-1726893	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1726930-1726893, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016212013.1|1709429_1709813_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016212013.1|1709429_1709813_+|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1726930-1726893	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1726930-1726893, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_155047152.1|1714583_1715306_+|transposase

>NZ_CP050938.1|WP_155047152.1|1714583_1715306_+|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCLWPVRKVSFRVSCSGIETTFPVITTTWFKTESSKHK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1726930-1726893	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1726930-1726893, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_032126537.1|1716081_1716267_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_032126537.1|1716081_1716267_-|hypothetical-protein
MEKIERVYARDHGLSGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLDGYLG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1726930-1726893	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1726930-1726893, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016212220.1|1719640_1719796_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016212220.1|1719640_1719796_+|hypothetical-protein
MYSLYIFHSPQYYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	1726930-1726893	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 1726930-1726893, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016212461.1|2373459_2373834_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016212461.1|2373459_2373834_+|hypothetical-protein
MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2391364-2391401	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2374787-2374750	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2391364-2391401, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2374787-2374750, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_168183184.1|2394582_2395347_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_168183184.1|2394582_2395347_-|hypothetical-protein
MMTIKQIQLSEENRGNPKRGRKANLLSNMWQDIEASEVERLIDLNRDRHQENKDTEATITLSKYIPHKSYSAKELLHYPELTMLLRKEKQYLVKDYLLTGPLFELRTPLFMIEAGKQLLQIENDFRESLASEQKRLNNLMFLAKNKVKNIRVTGGKPSCQWSAGTIELNGVSWRVNKDSPAYLGPTGGIEALSFSYCEEIGQMDSFKIETAHIGTSIVELKVRNKGHNKGRRAFLNIEKLGLVPTAEAKAPSVI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2391364-2391401	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2374787-2374750	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2391364-2391401, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2374787-2374750, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016211528.1|2426501_2426807_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016211528.1|2426501_2426807_-|hypothetical-protein
MSQNQSKFPAPAKKVKREKISSKATKKELEITSKGDDSYIERNELDPNAPPTKGYTVPLNEYELTLLLKISEKHDRSQRKQIRRFVIDALEQEAKTLGIGI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2422568-2422605	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2429612-2429575	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2422568-2422605, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2429612-2429575, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016211529.1|2428048_2428201_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016211529.1|2428048_2428201_+|hypothetical-protein
MSCKKSRLVIKFRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2422568-2422605	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2429612-2429575	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2422568-2422605, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2429612-2429575, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016210742.1|2518142_2518418_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016210742.1|2518142_2518418_-|hypothetical-protein
MNIILKNTVNILSHRSGLLKSKSYEVAMPYLLECKKLLEISEQDWEVMLAIQYGFGKFHPEHEHQTFKFYEQYMDKHDGRLDGLNLTVQPQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2531684-2531647	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2531684-2531647, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_054300240.1|2522611_2522815_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_054300240.1|2522611_2522815_+|hypothetical-protein
MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2531684-2531647	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2531684-2531647, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016212022.1|2812704_2812923_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016212022.1|2812704_2812923_+|hypothetical-protein
MSPQQEKLFWKKFERELGFDSGEAALSHLSAGRPIYYGDDRYSDAVIKEYPDGTKQLVRFDDNDNEIIIEEL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2819875-2819912	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2875744-2875781	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2877110-2877073	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2819875-2819912, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2875744-2875781, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2877110-2877073, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016212024.1|2813518_2813767_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016212024.1|2813518_2813767_+|hypothetical-protein
MSVEVEHSLACDGHERDRDFLTTPEIQQLLEGSKKGRYPIRDQARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2819875-2819912	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2875744-2875781	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2877110-2877073	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2819875-2819912, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2875744-2875781, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2877110-2877073, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_155047057.1|2853433_2853850_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_155047057.1|2853433_2853850_-|hypothetical-protein
MTKLEEVIAAASQALKSTDKVVESKNEEIVRLEGKIECKNQTIVEVQKKVVELEKTVASKDKLTTAMGKAMVSRDKQITSQGQEINLLKQSISEFCQSNKSSLEASGGESPCIFEGHFSNGQSGTAVNSGTHVPSTNH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2819875-2819912	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2875744-2875781	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2877110-2877073	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2819875-2819912, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2875744-2875781, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2877110-2877073, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_036780545.1|2854013_2854724_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_036780545.1|2854013_2854724_-|hypothetical-protein
MPEILAQKEVNQLEVKLRTLLLELSNSGQSAQRKPQASLNSFQSLQPVGSMQFSLTCAPFQPTRLFTFFQPFGSMQPSCSFASLQFLRSLQSPKPSPIFQPFGQFLFGLPIGGNYRADLIKVKSSLEALKKISAQTANGYEPSIPPFRVELAIYNLKKVLASIIDNKGLVTSKAHKVHLEIVELLGNIQRCFDAGVASHKIKELEGQVKGNKAEIRELKLTEGLASVDIDCLKKIS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2819875-2819912	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2875744-2875781	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	2877110-2877073	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2819875-2819912, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2875744-2875781, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 2877110-2877073, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
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Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_162034402.1|3067709_3067847_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_162034402.1|3067709_3067847_+|hypothetical-protein
MKPNQHKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_098082809.1|3068564_3068915_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_098082809.1|3068564_3068915_-|hypothetical-protein
MRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_129556602.1|3111872_3112082_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_129556602.1|3111872_3112082_-|hypothetical-protein
MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	3122971-3123008	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	3079381-3079344	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 3122971-3123008, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 3079381-3079344, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050938.1|WP_016211201.1|3115228_3115537_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050938.1|WP_016211201.1|3115228_3115537_-|hypothetical-protein
MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	3122971-3123008	0
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	3079381-3079344	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 3122971-3123008, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

2. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050938 position: 3079381-3079344, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

3. NZ_CP050941

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	13896 : 48304	43	Streptococcus_phage(19.05%)	portal,terminase,capsid,integrase,protease,tail,head,transposase	attL 46921:46980|attR 54986:55273

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP050941|13896:48304|DBSCAN-SWA
CATGTCCATTGTTCGAATTCATAGAAAAGAAAAAGATTTTGTTGTACTTGATAAACAGTTTTTAAATGATGAAGGCTTATCTTTTCGTGCTAAGGGTCTGTTGTCTTATTTGTTGTCTTTGCCTGACGATTGGAAAGTGTCGAGATCACATCTTGCAAAAATATCTCAGGATGGGCCGACCTCAGTTAATTCTACTCTGAAGGAGTTAAAAGAGGCGGGATATATTTTACTTATTTCAGAGCGCGAAAATGGAAAAATATCGGGGTATGATTACCTTGTCTTTGAAACGAAAGCACTTGCTGATGCTTATTTGTCCTCTTCTACCCATACAGATGTTAGTCAACCCACTAAAACGGCCCAAGGTGCTGAGCAAGAAGAAGATGAGCTGCGAGTGGGCAAGCTGTTAGCAGTAAAGCAGCTAGCGGTAAAAAGCCCCCTACTAAATAATAATAGTACTAAGAATAATAGTACTAAGAAAAATATTATGTGCGCTGACACGCACGAAGCTGATTCTCACACTGAACTTTCTAATCAATCAGAACGCAAATACAAAACCAGCAAAGGCCAATTTTTAACGGGTGAAAAACTGAGTGTGTTTGAACAGGTTTGGGAAGCTTATCGACACAAATCAGAAGCGGCAGAAAATAACTACAGCAAATCAAACAAAGCTGCCGCCGCTCATTCATTTTTAAAAAACTGGCCTGACATTCAGCAAGATGCTTCGTTAGTTATTCAACAAGCAGAGGTTGAAGCACATAACCGCGCGGTGAAAAGCATGGCAGATTCAAACTTTAAACCGAAGCACTTAGAAGGCTGGTTAAGTGAACGTCGTTGGACACAAGAAAGCGTGATGATTAATGAAAGTATCTACTTAGCAAGAGGGACGCAGCATGGAAACTCATCCATTCAAGGTAATCAACATAAACTCTCAGTTGCAGAAAGATTACAAAGACTGCACGAAAAAAGGCAGAGAGAAGCAAACGATTAAGTTTGGGCCGGATATATCAATTTCAGAGTTTTTGGACAAGATGAACTTAATCAAGCCTTTTTTGAATAACAAAACGGATGAAGAAGTTGAAAGAATTACTAGCGATTGGTGGGAAGCCATTGGTAACTTTCCAAACGTTGTTTGGGATGCAGCGAGAACCCAGTTACTAAAAACCATGACCTCATTCATGGTGACGCCGGGCGAATTTCGCAAGATGTGCCAAGAGGTGAAACCTGAAGAGCTCGGCTACACGAGCACCAAGCAAGCTTATGCCGAGTGTTATTTAAATATTCGTCAACGCCATAAAGTCACTCAGCCGCGTCATTGGTCACACGCAACCGTCTTTATCGCCTCAGAGGCGCTCAGAGCGCAGAACTATGCTTGTGGCATAAGTGAGTACCGCAAGTTCGAGAAAAGCTATTTAAAGGCTATTTACCGCGATTTAAACGGTGAACGCTTGCCATATCCTCCGGTTGTTTTACCGATGATCGAAAATAAACCGGGTAAAAGCCGCCAATGTGGTAGTGAACACCTGGCAAAATTGCGTGGAGTACTTGGGAGGCCCGCTCATGCCTAGCAGAGTTTCAGCAGGTGAGCGCGCGTTCCAGCTGCATTGCCGTTTAGAAAAAATCACCTTACCCGAGCAAGAGTATCGCTTTCATAAAACGCGTAAATGGCGTTTCGATTTTGCCTGGCCTGATTTAAAAATCGCCGTCGAGGTAGAAGGTGGGGCTTATTCGCAAGGTCGCCATACCCGCGGTAAAGGCTTTGAGGCCGACTGTGAGAAGTACAACACGGCAACAGAATCCGGCTGGCGAGTATTTCGTTATTCAACTCAGCAAGTGAGTCAATACATTGCAATTCGCCAACTCAAACGTGTTTTAGAGAAGTATCATGTTGATGATTGAAAACTATGAATGTCAGTTAATTACTGAGGAATTTCGTGATTTAGCCATAGAGGATATTGCCGAAGCGATTAATGCCGGTGTCGAGGAATGTCGAAAAAAATGGAAAGCCTACGACCAGCCCTATAAAACCCGTAATAGATTATTTGAAGAGCACTACAAGCTGGGCTTACGTGTGCAATATGATCGCTATGTTCATGCGAGACCAAAACGCATTAAAGCCCTACGTGAGTTTATCAACCAAAAAACCGCGGTTATTAATTGCCGTTCTATCGTCCCTCCCAAGCCATTTTTAACGCGAAAATACTCAGAAAAACAATTATCAGGGAAGCGTAGAGTATGAATACATTTAAAAAAATTACCGATGATCTAGAGCGAGGCACCCGGTTTTTAGTCGTTACGGTGGTATTACTTTATACCTGTACCTTGATTGTTTATGTGGTGCAATGGGGCTTAAGTTTGTTTACCGATGAGATTAATGCAGATTTGGGCAGTGCCTTAATCACTGCGTATTTTTTAATTATTTTATCGGTAATTATTGGGGCGTTTTTTGACAAGCTAGGCCGCAATCATGACTAGCAAGGTAACTCAATTAGATCAAGAACCCCCCTGAAAAACGTCTAGCGCTGTTAATCGTTTCAGAGCGTTACAGTAAGGGCAAATATGATGTCTGTATGGACTTGAATAATAAAATTCAATCAAGAATAAACCGCCATATCAAAATCATCTTACTCGGTATATTTACGATTTTTATCTGTAATGTTATCGCAGCAGTGTCTTTGTGGTTTGGTGTTGTGTTTGTGGCTTTATTTTTATGTGCAATTTGGCTGTCTGTTACAAATGACGTTAAAACGCAAATGCTGATTTTAGATGAAGCTGAGGAAAATCTACAAGCAAATGAGCAGATCAATCAACTGATTCACGGAGAGCTTAAAAACAAAGAAATGGAGATAATTAAGTGAATGAAAAACAAAAAGCATTAGCAAAAACATCTATGGTTGAGTTTAATAAGATTTTTGATCTGATAAAAAAAAGTGTGCTTGATACAACAGAGAACCTTGATAAGAAAAGTGAACAAGTGTTTTATTTTACTGGCTTTATAACTTTGTTGATTGATCAGCTGATAGATCTTCAATTGCAAGTAATTAAGAGCTCTGTTGATGATAAGTCATTATCTCTCATGATATTGAAGCAGCTTGATGAAAAGATACAAGAGAAAATCAAAGAAAGCAGAGAGGACTGCCATAAATGCGCGGTGTAAATAAAGTTATTATTGTCGGCCGCTTGGGCCAAGATCCTGAGATTAGAAGCACGCAAAGTGGGGAGAGTGTTGCAACGCTGTCTGTAGCGACGTCAGAGCAATGGCAAGACCAACACGGGGTTAACCATGAATCGATTGAATGGCATCGAGTTGTCTTGTTTAGTGGCTTGGCAAATATCGCTAAAGACTACTTAAGAAAAGGCGCACAGGTCTACGTTGAGGGCAAGATAAAAACGCGTAAATGGCAGGATAACCAGGGCAAGGATCGCTATACGACTGAGATTGTTGGCAAAACTATGCAAATGCTCGGGGGCGGCGAACGCATACAAACAGCAAAACCACCACCGCCACAACCTTCATCACCGGGCCAACAAGCGTTTAAAGCCAAACAAGCACAGTTACACGCACAACATAGCTCGTCGGAGATTGAACAAATAGATGAGGATATACCTTTCTAAAAGTTAGATAAGAAAAATATACCATTAACAAAATCAAGTACTTATCAATGCTTTTGAAATTCAAGAATTTTAAGTCTGTGCGAACCGTTATTTTAATTGCAACTAGGAGCCTGAAAAATGCTAAATATCACGCAAGTTAGAAGTATGTTGGCAGATTGGGGCGATTATATACAGCGAGGCGCAGAGCATGGCTCAAGTAACTCTATTTTTGGCATGATACAAAAATACGGCGGTGTCGTCATACAAAACAATAACAGCGGTAATGATCCTTACATTGCCAATAGTGATGCACTGGAAGTGGATAGAATCGTCAACGAGCTTTTACACAGTGATTGCAAGAGTGATCAAACCATGGCACGTATACTCGTGATTCATTACGGCATAACCGGCTCAGCGGTTAAAAAGCAAGCAACCTTTCGTATATCTGTTGCTGTATATAACAGCTTTTTAAGTAAGGGAGTGAGTTATGTGCGTGGGTGTTTAAATCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACCCTACACTAAGCGGCCATAAAATTCTATAAAAAAACATTATTGGGGGTGGATTAAAATCATTTAGTAAGAAAAAACTATTGTTTTATCATGATAAAAACTGTAGCCTTTAGGTAAGCTAGTTATTTTCATGTCTAGCTAATGACATTTAATTCCATTAAGACCTTTCAAGGTCTTTTTTTTTATTTATTATTTTTATGAGATTACACATTGCCTAGACGTGCTAAGCAAATTTGCTGTTATGCCGGATGTCATAACACAACCTATGCACGCTACTGCGAATACCACGAACAACACGGCAATCGATACCATGCCCCACGCAAAACAACTGCCCAGCGCGGCTATGGGGGGCGGTGGCAGCGTGAACGTAAGATATTTTTACAAGATCATCCGCTGTGCAAGCAGTGCTTACAAGATGACAAACTAATCCCGACGACTGAAGTGGATCATATTAAGCCGCATGATGGTGACCATGATTTGATGTGGAATCAAAACAATTGGCAAGCGCTGTGTAAGTCCTGTCACTCACGTAAAACAGTGAATGAAGACGGTGGTTTTGGTCGTAAAAAATCACCCCAGGGGAGGGGTGTATAAAATGTCTATGACCTTTATTTCCTGACCACCCGCCTAGTCGAATTTTTACGTATGCGAAATTAGAACTAAAAACTTGGAGGTTTTTGATGTCTAGAGCAAAAGGGCAAGGTAGAAAGCCAAAACCAACAAAAATTAAGAAAATTACAGGGAATCCTGGATGTAGAAAACTAAATGAGCATGAGCCAAAACCACAGGATGGGGTTGCCATTTGTCCAGGTTATTTTGATGAAATAGCAAAAGGAGCCTTTGATTCAGCCGTCTCTGATCTTGAATATATGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MLKNYKHLITPLLSLIILTLGSALLTTFLSLKLDSLNTSEFLIGGLTTAYYAGMVLGAFKLEGLILRVGHIRAYSAFASMLAVFSILHGFYVDVYFWLLLRFLGGIATAGLYIVIESWILSATDNKNRGGSLALYMIALYVAQAGGQWLLNIGDQDTLILYCIAAVFASLSVIPLALTRTTAPIFSEPETLSIGQMIKLSPSGVSTCFVSGMILGSIYGLYPIFIQNSGYPTAEISIIMGLTIFGGMIFQYPFGRLSDLISRRYVIAFLALMSSVLCVAIIEIGKDNVYIISILSFLLGGTTFCLYPIGISHTCDRVNNNQIVSASQTLLLSYGLGATFGPIIAPLFNIVMVDGEILVFIMVMSLPLCLFMLWRKQISASVPMEEKHSFVPATEITPVTNEMDPRADEGQ
>NZ_CP050941|13896:48304|23176_23833_+|WP_054300592.1|protease|DBSCAN-SWA
MNNWYQIKAQANKSADVYIYDYIGDYGVEAKSFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIITHIDSLAASMASIIALTGDTVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAACVKPNQYKNTPQTLIKHSENNAAKALQRHKLALKRSLL
>NZ_CP050941|13896:48304|27357_27780_+|WP_155047305.1|DBSCAN-SWA
MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDTGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLTEAISMSVSLQPTSVITQSDEV
>NZ_CP050941|13896:48304|18701_19184_+|WP_155047310.1|DBSCAN-SWA
MSRAKGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDGVAICPGYFDEIAKGAFDSAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSAVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSSAIESEIDKILD
>NZ_CP050941|13896:48304|28161_28428_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA
MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016211080.1|13896_14883_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0S2MVA0	Bacillus_phage	4.3e-14	45.4
WP_036780304.1|14923_15460_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047314.1|15428_15791_+	hypothetical protein	R9TNL4	Vibrio_phage	2.9e-24	53.8
WP_155047315.1|15783_16131_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210963.1|16127_16367_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923627.1|16462_16750_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047311.1|16746_17049_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126916.1|17036_17507_+	single-stranded DNA-binding protein	L7TJL2	Pseudomonas_virus	1.5e-33	48.8
WP_052047121.1|17651_18053_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126915.1|18231_18615_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.7e-25	45.5
WP_155047310.1|18701_19184_+	hypothetical protein	Q9B019	Phage_GMSE-1	1.1e-13	33.3
WP_162034501.1|19451_20342_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	2.3e-83	55.7
WP_155047308.1|20361_21336_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.3e-26	31.5
WP_155047307.1|21379_21976_+	hypothetical protein	E4ZFM0	Streptococcus_phage	2.0e-38	45.3
WP_054300593.1|21972_23214_+|portal	phage portal protein	Q6DMU2	Streptococcus_phage	2.7e-85	43.6
WP_054300592.1|23176_23833_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	5.4e-45	45.9
WP_155047306.1|23888_25055_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	1.2e-66	38.7
WP_036778347.1|25090_25672_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183246.1|25839_25995_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274765.1|25991_26303_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	2.5e-08	31.7
WP_075274764.1|26299_26623_+|head	phage head closure protein	K7PH08	Enterobacteria_phage	5.4e-14	41.7
WP_075274763.1|26615_27011_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	6.0e-07	39.1
WP_075274762.1|27007_27358_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047305.1|27357_27780_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274761.1|27781_28105_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|28161_28428_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047313.1|30016_30370_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_155047304.1|31096_31228_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|32834_33098_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780292.1|33403_34153_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211377.1|34176_35199_-	AAA family ATPase	A0A1V0DZZ0	Clostridioides_phage	3.2e-12	27.5
WP_032126388.1|35959_36985_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126623.1|37097_38330_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|38506_39481_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_027242955.1|39729_39990_+	type II toxin-antitoxin system HicA family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_036780061.1|39982_40336_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	1.1e-12	35.8
WP_017375910.1|40612_41341_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_144420837.1|41727_42660_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|42801_43530_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_168183247.1|43559_45590_-	S9 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_155047303.1|45961_46963_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.3e-29	33.2
46921:46980	attL	NA	NA	NA	NA
WP_081007075.1|47308_47650_-	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126152.1|47713_48304_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	1.4e-20	33.8
54986:55273	attR	NA	NA	NA	NA

4. NZ_CP050945

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP050945_1

• CRISPR_ID: NZ_CP050945_1
• CRISPR_location: 99348-99571
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers
• Cas_protein_info: RT

Consensus repeat of NZ_CP050945_1

Consensus_repeat	Method
TTTGTGTTCCGTTTGTGTTCCGTTT	CRT

spacers of NZ_CP050945_1

>1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT
TTATTTTTTAGCGTCTGTTTATTTTCGGAGATAAAACCTAAT
>1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT
TATCTTTAGAATTTGATTTAATTACTTTTTCTTTATTTAACTTGTATTCCG
>1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT
CGTCTGTTTATTTTCGGAGTTAAAGCCTAAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP050945_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP050945_1

>merge|NZ_CP050945|1|99348-99571|CRT
TTTGTGTTCCGTTTGTGTTCCGTTTTTATTTTTTAGCGTCTGTTTATTTTCGGAGATAAAACCTAATTTTGTGTTCCGTTTGTGTTCCGTTTTATCTTTAGAATTTGATTTAATTACTTTTTCTTTATTTAACTTGTATTCCGTTTGTGTTCCATTTCTATTTTTTATCGTCTGTTTATTTTCGGAGTTAAAGCCTAATTTTGTGTTCCGTTTGTGTTCCGTTT

>NZ_CP050945|1|1|99348-99571|CRT
TTTGTGTTCCGTTTGTGTTCCGTTT	TTATTTTTTAGCGTCTGTTTATTTTCGGAGATAAAACCTAAT
TTTGTGTTCCGTTTGTGTTCCGTTT	TATCTTTAGAATTTGATTTAATTACTTTTTCTTTATTTAACTTGTATTCCG
TTTGTGTTCCATTTCTATTTTTTAT	CGTCTGTTTATTTTCGGAGTTAAAGCCTAAT
TTTGTGTTCCGTTTGTGTTCCGTTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP050945.1|WP_155047286.1|87277_87844_+|recombinase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239737
NZ_CP050945.1|WP_155047299.1|87933_89292_+|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|350771
NZ_CP050945.1|WP_016211879.1|99782_100802_-|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP050945.1|WP_155047013.1|103737_103884_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050945.1|WP_168183289.1|102592_103087_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377437
NZ_CP050945.1|WP_155047285.1|93981_94239_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050945.1|WP_016212014.1|110338_110752_+|DUF2190-family-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050945.1|WP_036780064.1|101756_102347_-|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271175
NZ_CP050945.1|WP_017375910.1|89475_90204_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP050945.1|WP_075273826.1|104104_105232_+|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	gnl|CDD|275209
NZ_CP050945.1|WP_016211890.1|95351_97928_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273167
NZ_CP050945.1|WP_168183291.1|108292_109446_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP050945.1|WP_017377658.1|86587_87274_+|Fic-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225718
NZ_CP050945.1|WP_036771347.1|94257_95235_+|IS5-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|290455
NZ_CP050945.1|WP_155047284.1|106635_107664_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050945.1|WP_157894761.1|91874_92021_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP050945.1|WP_054300202.1|109512_110241_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP050945.1|WP_036774631.1|92383_92848_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP050945.1|WP_168183290.1|103099_103408_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377437
NZ_CP050945.1|WP_082300623.1|91675_91894_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP050945.1|WP_075273826.1|104104_105232_+|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	2e-50	166.1	0.1

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP050945.1|WP_155047286.1|87277_87844_+|recombinase-family-protein	gnl|CDD|239737	cd03768, SR_ResInv, Serine Recombinase (SR) family, Resolvase and Invertase subfamily, catalytic domain; members contain a C-terminal DNA binding domain. Serine recombinases catalyze site-specific recombination of DNA molecules by a concerted, four-strand cleavage and rejoining mechanism which involves a transient phosphoserine linkage between DNA and the enzyme. They are functionally versatile and include resolvases, invertases, integrases, and transposases. Resolvases and invertases affect resolution or inversion and comprise a major phylogenic group. Resolvases (e.g. Tn3, gamma-delta, and Tn5044) normally recombine two sites in direct repeat causing deletion of the DNA between the sites. Invertases (e.g. Gin and Hin) recombine sites in inverted repeat to invert the DNA between the sites. Cointegrate resolution with gamma-delta resolvase requires the formation of a synaptosome of three resolvase dimers bound to each of two res sites on the DNA. Also included in this subfamily are some putative integrases including a sequence from bacteriophage phi-FC1.	3.48507e-50
NZ_CP050945.1|WP_155047299.1|87933_89292_+|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein	gnl|CDD|350771	cd18013, DEXQc_bact_SNF2, DEXQ-box helicase domain of bacterial SNF2 family proteins. Proteins belonging to the SNF2 family of DNA dependent ATPases are important members of the chromatin remodeling complexes that are implicated in epigenetic control of gene expression. The Snf2 family comprise a large group of ATP-hydrolyzing proteins that are ubiquitous in eukaryotes, but also present in eubacteria and archaea. The bacterial SNF2 present in this family are members of the DEAD-like helicase superfamily, a diverse family of proteins involved in ATP-dependent RNA or DNA unwinding. This domain contains the ATP-binding region.	2.71429e-84
NZ_CP050945.1|WP_016211879.1|99782_100802_-|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP050945.1|WP_168183289.1|102592_103087_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	3.01516e-28
NZ_CP050945.1|WP_036780064.1|101756_102347_-|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	2.06134e-23
NZ_CP050945.1|WP_017375910.1|89475_90204_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	2.26977e-51
NZ_CP050945.1|WP_075273826.1|104104_105232_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|275209	TIGR04416, hypothetical_protein, group II intron reverse transcriptase/maturase. Members of this protein family are multifunctional proteins encoded in most examples of bacterial group II introns. These group II introns are mobile selfish genetic elements, often with multiple highly identical copies per genome. Member proteins have an N-terminal reverse transcriptase (RNA-directed DNA polymerase) domain (pfam00078) followed by an RNA-binding maturase domain (pfam08388). Some members of this family may have an additional C-terminal DNA endonuclease domain that this model does not cover. A region of the group II intron ribozyme structure should be detectable nearby on the genome by Rfam model RF00029. [Mobile and extrachromosomal element functions, Other].	4.35291e-98
NZ_CP050945.1|WP_016211890.1|95351_97928_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|273167	TIGR00601, UV_excision_repair_protein_RAD23_homolog_A, UV excision repair protein Rad23. All proteins in this family for which functions are known are components of a multiprotein complex used for targeting nucleotide excision repair to specific parts of the genome. In humans, Rad23 complexes with the XPC protein. This family is based on the phylogenomic analysis of JA Eisen (1999, Ph.D. Thesis, Stanford University). [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0.00878524
NZ_CP050945.1|WP_017377658.1|86587_87274_+|Fic-family-protein	gnl|CDD|225718	COG3177, COG3177, Fic family protein [Function unknown].	9.0877e-19
NZ_CP050945.1|WP_036771347.1|94257_95235_+|IS5-family-transposase	gnl|CDD|290455	pfam13737, DDE_Tnp_1_5, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis.	3.06507e-32
NZ_CP050945.1|WP_157894761.1|91874_92021_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	1.36328e-07
NZ_CP050945.1|WP_054300202.1|109512_110241_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP050945.1|WP_168183290.1|103099_103408_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	1.40004e-06
NZ_CP050945.1|WP_168183291.1|108292_109446_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	3.007e-79

Protein sequences

>NZ_CP050945.1|WP_016211890.1|95351_97928_-|hypothetical-protein
MPVRFNPIKKVSLNGKVFNVPKEVPNKALVKLGQQQPDVVEILADFFRTNPKQEFFSKLFLGDRYQISAMYVSLRNIGLNQRIYIQKVFDDPEGFSDIIQRLSNIELCQSVYVQAAFENPDLIAVFEKHKDKFTSLNQFELNQWVYVKAVLGDPDRFDDILQRLRDIALCEPVYVQAALKSPQRVVEFAKHTHRLVTLNALEPNQFVYVQKVLDDPEGFDAILQQLSDIELCQLPYIQAALDYPDRVDVFKAHQDKFALFNHLKLSQLTNIEAVLGNLEGFDEGYRSLKAVGLDQPKNIQAMLDNIEKFNENLQNLREVGLDQPKNIQAMLDNIEKFNENLQNLRKVESDQSDNIQLMLDNIEEFNENFQILRQFGLSQQLYIESILKSPNVIVNISDCSDELLMLEELGLGQTVYLQKVLDHPDRSKANLYRLIRMGLDQPVYVQSALKDLDRFDDVCQRLNDIELCESAYVQAVLDDPNRIAVFERHKDKFTSLNQFGLNQWIYVKAVLDDPKGFDDILQRLRDIALCAPVYVQAALQDPQRVAEFAKHTHRLVTLNALEPNQFVYVQKVLDNPEGFDAILQQLSDIELCQSVYVQAVLDDPNIITKLKEHQKKLVKLNQLGLSQPKYIQAVFDHPEDFERNLQTLEILGLNKTEYVQAIFDDPTRIDKLHKYHHLFFRLHMLGLSQPICVDAVFNNTEKYAQICSCLEEVKDRIETVEDTIQQSSLGQSREQGFKSHYPVYKSKVIQSSFDFLISERKDPAEMKAHLFEHEREFLCNSNIKSDRSSFGAICRSAMRALTNTIFIIVAPVVGYKRNWHKKNMSITEKCLPFYNHTESTNKVMDLTCDIQHTLVADF
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NZ_CP050945_1	1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT	99516-99546	31	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137267-137297	2	0.935
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3. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|99373|42|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.2|99440|51|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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137. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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138. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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******************* ****.******

139. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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140. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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******************* ****.******

141. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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142. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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143. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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144. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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145. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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146. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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147. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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148. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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149. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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150. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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151. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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152. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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153. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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154. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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155. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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156. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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157. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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158. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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159. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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160. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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161. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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162. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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163. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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164. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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165. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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166. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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167. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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168. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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169. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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170. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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171. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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172. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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173. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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174. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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175. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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cgtctgtttattttcggagataaaacctaat	Protospacer
******************* ****.******

176. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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177. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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178. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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179. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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180. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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181. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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182. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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183. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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cgtctgtttattttcggagataaaacctaat	Protospacer
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184. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

cgtctgtttattttcggagttaaagcctaat	CRISPR spacer
cgtctgtttattttcggagataaaacctaat	Protospacer
******************* ****.******

185. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

cgtctgtttattttcggagttaaagcctaat	CRISPR spacer
cgtctgtttattttcggagataaaacctaat	Protospacer
******************* ****.******

186. spacer 1.3|99516|31|NZ_CP050945|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2381 : 58176	56	Streptococcus_phage(18.75%)	transposase,integrase	attL 18642:18701|attR 40108:41060
DBSCAN-SWA_2	64277 : 124422	56	Streptococcus_phage(25.0%)	transposase,integrase	attL 109506:109565|attR 130283:131083
DBSCAN-SWA_3	128069 : 184982	59	Streptococcus_phage(14.81%)	capsid,protease,tail,integrase,transposase,head	attL 120399:120458|attR 128448:129983

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP050945|2381:58176|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP050945|64277:124422|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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130283:131083	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP050945|128069:184982|DBSCAN-SWA
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MPTQENLKKTRKLIDKLDAKIASLQKKADLYANIDPNLRRCLQRQRTQDLPLYQQYENLKQFAKTNNNRVADPIVVSQSRKLVVLLKCKSFLQESIHDIGAAKRGSDFLNSLFGISRFDGTTYHYAAAFENAAWGAFSATKRLCSETRKLLKERVSVEAEAAQSAGQWRTASPVLNTLQSFQVTSSEPSPEANAPGQS
>NZ_CP050945|128069:184982|130778_131021_-|WP_016212365.1|DBSCAN-SWA
MDAVVRKWGNSLGLLLPLSIARELHINDGSHVTIDKVGDEIHIKPLTHTQTLELLLSEITPENSHDLVDWGEELGGERFE
>NZ_CP050945|128069:184982|179651_179789_+|WP_155047273.1|DBSCAN-SWA
MEPTETSSSTETKLERIAWLSAVDPGKVFNQVMHHFNLRLGNTIL
>NZ_CP050945|128069:184982|159408_160017_+|WP_155047277.1|DBSCAN-SWA
MARSDRCELDNSHWSTMLSLLTLYGSSTVKLAVRVKQKLLCYKAIFYVYWVIFTRINPRYNTAYYLSEVEKMLNCGTDKNGFTLFGCSNCGKGRHKIYFSCKGNACLKCAKRYGREVMERISSKLFLGISYRQVVLTLPEQLRVPFYNHKNQDKLYSDFMRLVHNCVSVATSRFRNFKKMILAAMFRRMLNSGQYCCGHYRI
>NZ_CP050945|128069:184982|166032_166356_+|WP_016210667.1|head|DBSCAN-SWA
MRAGLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEISQTVTLRYRSDVTPSLRLVFEGRYLEILSVINPDERNRELILACREWVHA
>NZ_CP050945|128069:184982|130450_130777_-|WP_036781349.1|DBSCAN-SWA
MPERGDIIFLSLDPTLGSEQRGNRPFLVLTSKPYNLKVGLVTGCPVTSKIKGYPFEVELPKNNSVHGAVLVNQLTTKDFRARGWNHADKLDKKSLERVQGLIDVMLKG
>NZ_CP050945|128069:184982|135333_136068_-|WP_075273857.1|transposase|DBSCAN-SWA
MARRKRFKKNQPFKWKHYSGDIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAASF
>NZ_CP050945|128069:184982|128069_128447_+|WP_016212154.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA
MATPLVMSAMEMAINLRQPGEGTLFHSDRGSQYTSKKYRKLLSKHKIEASMSSVGACLDNAPVERFFGSLKNEWLLNVVHLTRESMAEDVKAYIRYYNHDRLHTANEYLSPVNFENSRKMVSCLT
>NZ_CP050945|128069:184982|144509_144710_-|WP_075274748.1|DBSCAN-SWA
MDKHRDVVVENVIKVLACGTTVMGHSKYCCSSSECSHTKVVPYTCKSRFCSACGKKGHCCKKFRFE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
120399:120458	attL	NA	NA	NA	NA
WP_016212154.1|128069_128447_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	Q716C2	Shigella_phage	1.2e-17	46.0
WP_016212152.1|128753_129137_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|129606_130335_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
128448:129983	attR	NA	NA	NA	NA
WP_036781349.1|130450_130777_-	potassium ABC transporter ATPase	A9D9Y1	Lactobacillus_prophage	1.1e-11	36.6
WP_016212365.1|130778_131021_-	antidote-toxin recognition MazE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274745.1|131733_132462_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.2e-37	42.2
WP_052047129.1|132744_134328_+	protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016212311.1|134448_135180_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273857.1|135333_136068_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	8.4e-39	43.6
WP_016212404.1|136844_137078_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273881.1|137198_139385_+	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A0K2FLP8	Brevibacillus_phage	9.2e-73	30.2
WP_036779532.1|139394_139796_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A222YXG1	Escherichia_phage	3.9e-22	47.0
WP_016212456.1|139792_140080_-	type II toxin-antitoxin system HigB family toxin	A0A0P0ZE17	Stx2-converting_phage	2.9e-11	39.2
WP_016212579.1|141700_141898_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047246.1|143394_144369_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.9e-25	30.0
WP_075274748.1|144509_144710_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183303.1|144975_145356_+|transposase	transposase family protein	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	3.6e-33	70.8
WP_016212061.1|145479_147522_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|148426_148792_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|148737_149313_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_075274752.1|149309_149609_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047018.1|149644_150448_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.9e-55	45.2
WP_155047281.1|150515_150845_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	5.5e-06	36.8
WP_052104629.1|151071_152097_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_052047135.1|152277_153090_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	4.9e-56	45.0
WP_032126637.1|153172_153466_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
WP_075273747.1|153528_154119_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052047048.1|154380_154881_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046767.1|154880_155042_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034469.1|156781_157162_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211936.1|157651_158674_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047277.1|159408_160017_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168183304.1|160081_160831_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556718.1|161428_162615_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-58	43.8
WP_155047276.1|162643_163423_+	hypothetical protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	1.8e-18	31.7
WP_052047108.1|163973_164372_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556716.1|164505_164796_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-12	42.7
WP_016210655.1|164809_165406_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210656.1|165572_165728_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210663.1|165724_166036_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	4.3e-08	30.8
WP_016210667.1|166032_166356_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	1.0e-12	39.0
WP_016210658.1|166348_166744_+	hypothetical protein	Q7Y404	Yersinia_phage	1.6e-07	40.0
WP_016210651.1|166740_167091_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210664.1|167090_167513_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|167810_168716_+|transposase	IS481 family transposase	A8RHK4	Spiroplasma_virus	6.8e-14	26.0
WP_129556697.1|169100_169493_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211776.1|169975_171313_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211775.1|171480_171849_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	1.2e-25	46.3
WP_016211773.1|171950_172625_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126360.1|173211_173946_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211895.1|174068_175127_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211894.1|175635_176382_+	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	4.9e-18	29.9
WP_016211897.1|176382_176787_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377350.1|177180_177996_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046942.1|178626_179512_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.6e-10	22.8
WP_155047273.1|179651_179789_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047272.1|181309_182038_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_016212298.1|183938_184265_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307374.1|184505_184982_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.2e-15	39.2

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP050945.1|WP_155046709.1|13075_13276_-|hypothetical-protein	13075_13276_-	66 aa aa	NA	NA	NA	2381-58176	yes
NZ_CP050945.1|WP_016212398.1|14911_15373_-|hypothetical-protein	14911_15373_-	153 aa aa	NA	NA	NA	2381-58176	yes
NZ_CP050945.1|WP_016212260.1|19810_20083_+|hypothetical-protein	19810_20083_+	90 aa aa	NA	NA	NA	2381-58176	yes
NZ_CP050945.1|WP_016212257.1|20102_20327_+|hypothetical-protein	20102_20327_+	74 aa aa	NA	NA	NA	2381-58176	yes
NZ_CP050945.1|WP_032126838.1|20663_20867_+|hypothetical-protein	20663_20867_+	67 aa aa	NA	NA	NA	2381-58176	yes
NZ_CP050945.1|WP_129556706.1|28712_29342_+|hypothetical-protein	28712_29342_+	209 aa aa	NA	NA	NA	2381-58176	yes
NZ_CP050945.1|WP_155047019.1|52015_52168_+|hypothetical-protein	52015_52168_+	50 aa aa	NA	NA	NA	2381-58176	yes

Protein sequences of NZ_CP050945.1|WP_155046709.1|13075_13276_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050945.1|WP_155046709.1|13075_13276_-|hypothetical-protein
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKSVETLCIVGKIGVIIQETSKQGLATKRAITIKSVI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	13627-13590	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 position: 13627-13590, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050945.1|WP_016212398.1|14911_15373_-|hypothetical-protein

>NZ_CP050945.1|WP_016212398.1|14911_15373_-|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	13627-13590	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 position: 13627-13590, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050945.1|WP_016212260.1|19810_20083_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050945.1|WP_016212260.1|19810_20083_+|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	13627-13590	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 position: 13627-13590, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050945.1|WP_016212257.1|20102_20327_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050945.1|WP_016212257.1|20102_20327_+|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	13627-13590	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 position: 13627-13590, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050945.1|WP_032126838.1|20663_20867_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050945.1|WP_032126838.1|20663_20867_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	13627-13590	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 position: 13627-13590, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050945.1|WP_129556706.1|28712_29342_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050945.1|WP_129556706.1|28712_29342_+|hypothetical-protein
MNREWVELSKDTSQIYLQVYALQSVQIHIIQMQQQGDSHSIVSTNDLLEERATSYELQCELGLPCGHMLIDLVFDLNDRVVSQRSLESFTKLVQPIQTLKLLDTHRLNVIEKQVINFIKILKLRQPQDIHFELKAIWPEYIQFHLEDEKTLDLKTKHLYLVEIVADGSGIKVAVNQKYQCCYLFDQDKNSLKKLLNDLHACDVPVSFKQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	13627-13590	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 position: 13627-13590, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP050945.1|WP_155047019.1|52015_52168_+|hypothetical-protein

>NZ_CP050945.1|WP_155047019.1|52015_52168_+|hypothetical-protein
MKKTRADVEKALQKSRESGNGVSLSGAKLTDVTVSTTELKYAIFSNNFHN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP050938_2	Orphan	2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder	2975034-2975071	38	13627-13590	0

1. spacer 2.1|2975034|38|NZ_CP050938|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 position: 13627-13590, mismatch: 0

agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	CRISPR spacer
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg	Protospacer
**************************************

5. NZ_CP050939

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	21737 : 34941	15	Erysipelothrix_phage(25.0%)	portal,transposase,head,terminase,tail,protease,capsid	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP050939|21737:34941|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIGSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|21737_22712_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047322.1|23046_23439_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.4e-26	47.2
WP_016212234.1|23515_23995_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_155047321.1|23997_25680_+|terminase	terminase large subunit	A0A1P8DTK0	Proteus_phage	6.9e-137	45.7
WP_155047320.1|25676_26399_+|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	2.6e-40	40.8
WP_155047319.1|27760_28381_+|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	5.5e-39	50.9
WP_016211130.1|28343_29000_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.9e-43	44.9
WP_016211140.1|29057_30251_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_155047318.1|30371_31706_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211131.1|31744_31900_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|31896_32208_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_016211132.1|32204_32528_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211139.1|32520_32916_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_155047317.1|32995_33832_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.9e-42	36.7
WP_054300271.1|33966_34941_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7

6. NZ_CP050943

7. NZ_CP050947