CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP051260	Proteus mirabilis strain STP3 chromosome, complete genome	4 crisprs	DEDDh,c2c9_V-U4,cas3,DinG,PD-DExK,RT,csa3,WYL,TnsE_C	0	2	15	0

1. NZ_CP051260

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP051260_2

• CRISPR_ID: NZ_CP051260_2
• CRISPR_location: 2464427-2464534
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP051260_2

Consensus_repeat	Method
ATAATTGCCTTTAGGTTGATATTT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP051260_2

>2.1|2464451|60|NZ_CP051260|CRISPRCasFinder
CCCATCAGACTCCGCTTTGGTATAACTATCGCCTTTATTCGCATAATTTCCCGCAGGAGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP051260_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP051260_2

>merge|NZ_CP051260|2|2464427-2464534|CRISPRCasFinder
ATAATTGCCTTTAGGTTGATATTTCCCATCAGACTCCGCTTTGGTATAACTATCGCCTTTATTCGCATAATTTCCCGCAGGAGCATAATTGCCTTTGGGTTGATATTT

>NZ_CP051260|2|2|2464427-2464534|CRISPRCasFinder
ATAATTGCCTTTAGGTTGATATTT	CCCATCAGACTCCGCTTTGGTATAACTATCGCCTTTATTCGCATAATTTCCCGCAGGAGC
ATAATTGCCTTTGGGTTGATATTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP051260.1|WP_049213336.1|2460832_2461450_+|dimethylsulfoxide-reductase-subunit-B	unknown	unknown	gnl|CDD|131996
NZ_CP051260.1|WP_004250735.1|2456772_2458029_+|mechanosensitive-ion-channel	unknown	unknown	gnl|CDD|366370
NZ_CP051260.1|WP_004243622.1|2467885_2468698_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_004243611.1|2461453_2462230_+|dimethyl-sulfoxide-reductase-anchor-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|225839
NZ_CP051260.1|WP_012368081.1|2458382_2460821_+|molybdopterin-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|274006
NZ_CP051260.1|WP_041701181.1|2454438_2455296_-|D-amino-acid-transaminase	unknown	unknown	gnl|CDD|180656
NZ_CP051260.1|WP_004243627.1|2471875_2472334_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_004243628.1|2472393_2472846_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_004243612.1|2462345_2462888_-|DUF924-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377592
NZ_CP051260.1|WP_004243600.1|2453068_2453731_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224215
NZ_CP051260.1|WP_004243623.1|2468666_2468987_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_107337176.1|2469489_2471793_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223496
NZ_CP051260.1|WP_017628010.1|2465669_2466857_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377414
NZ_CP051260.1|WP_036971128.1|2468992_2469487_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_017628013.1|2463456_2463636_+|GhoT/OrtT-family-toxin	unknown	unknown	gnl|CDD|371222
NZ_CP051260.1|WP_004243621.1|2467190_2467883_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|375779
NZ_CP051260.1|WP_004243604.1|2455482_2456061_+|HdeD-family-acid-resistance-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182308
NZ_CP051260.1|WP_004243617.1|2466849_2467194_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_004243615.1|2465016_2465673_-|DUF2612-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|371354
NZ_CP051260.1|WP_004250737.1|2453815_2454376_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|238045

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP051260.1|WP_049213336.1|2460832_2461450_+|dimethylsulfoxide-reductase-subunit-B	gnl|CDD|131996	TIGR02951, anaerobic_dimethyl_sulfoxide_reductase_subunit_B, DMSO reductase, iron-sulfur subunit. This family consists of the iron-sulfur subunit, or chain B, of an enzyme called the anaerobic dimethyl sulfoxide reductase. Chains A and B are catalytic, while chain C is a membrane anchor.	1.91743e-91
NZ_CP051260.1|WP_004250735.1|2456772_2458029_+|mechanosensitive-ion-channel	gnl|CDD|366370	pfam00924, MS_channel, Mechanosensitive ion channel. Two members of this protein family of M. jannaschii have been functionally characterized. Both proteins form mechanosensitive (MS) ion channels upon reconstitution into liposomes and functional examination by the patch-clamp technique. Therefore this family are likely to also be MS channel proteins.	1.66127e-32
NZ_CP051260.1|WP_004243611.1|2461453_2462230_+|dimethyl-sulfoxide-reductase-anchor-subunit	gnl|CDD|225839	COG3302, DmsC, DMSO reductase anchor subunit [General function prediction only].	1.76747e-46
NZ_CP051260.1|WP_012368081.1|2458382_2460821_+|molybdopterin-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|274006	TIGR02166, Putative_dimethyl_sulfoxide_reductase_chain_YnfE, anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family. Members of this family include known and probable dimethyl sulfoxide reductase (DMSO reductase) A chains. In E. coli, dmsA encodes the canonical anaerobic DMSO reductase A chain. The paralog ynfE, as part of ynfFGH expressed from a multicopy plasmid, could complement a dmsABC deletion, suggesting a similar function and some overlap in specificity, although YnfE could not substitute for DmsA in a mixed complex.	0
NZ_CP051260.1|WP_041701181.1|2454438_2455296_-|D-amino-acid-transaminase	gnl|CDD|180656	PRK06680, PRK06680, D-amino acid aminotransferase; Reviewed.	7.55875e-127
NZ_CP051260.1|WP_004243612.1|2462345_2462888_-|DUF924-domain-containing-protein	gnl|CDD|377592	pfam06041, DUF924, Bacterial protein of unknown function (DUF924). This family consists of several hypothetical bacterial proteins of unknown function. Structurally, this family resembles TPR-like repeats.	1.54842e-89
NZ_CP051260.1|WP_004243600.1|2453068_2453731_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|224215	COG1296, AzlC, Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance) [Amino acid transport and metabolism].	1.03721e-32
NZ_CP051260.1|WP_107337176.1|2469489_2471793_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223496	COG0419, SbcC, ATPase involved in DNA repair [DNA replication, recombination, and repair].	0.00189201
NZ_CP051260.1|WP_017628010.1|2465669_2466857_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|377414	pfam04865, Baseplate_J, Baseplate J-like protein. The P2 bacteriophage J protein lies at the edge of the baseplate. This family also includes a number of bacterial homologs, which are thought to have been horizontally transferred.	9.13292e-07
NZ_CP051260.1|WP_017628013.1|2463456_2463636_+|GhoT/OrtT-family-toxin	gnl|CDD|371222	pfam10753, Toxin_GhoT_OrtT, Toxin GhoT_OrtT. GhoT is part of the GhoT-GhoS type V toxin-antitoxin (TA) system. OrtT is homologous to GhoT, but it is not part of a TA pair. In this case, it acts as an independent toxin to reduce growth during stress related to amino acid and DNA synthesis.	7.72766e-13
NZ_CP051260.1|WP_004243621.1|2467190_2467883_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|375779	pfam18352, Gp138_N, Phage protein Gp138 N-terminal domain. This domain is found in the N-terminal domain of gene product 138 (gp138) in an unidentified bacteriophage. Gp138 is thought to be involved in the process of opening the host cell membrane during infection. The domain has an OB-fold with an intramolecular disulfide bond between C114 and C120.	1.64931e-18
NZ_CP051260.1|WP_004243604.1|2455482_2456061_+|HdeD-family-acid-resistance-protein	gnl|CDD|182308	PRK10209, PRK10209, HdeD family acid-resistance protein.	2.20798e-64
NZ_CP051260.1|WP_004243615.1|2465016_2465673_-|DUF2612-domain-containing-protein	gnl|CDD|371354	pfam11041, DUF2612, Protein of unknown function (DUF2612). This is a phage protein family expressed from a range of Proteobacteria species. The function is not known.	4.26666e-71
NZ_CP051260.1|WP_004250737.1|2453815_2454376_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|238045	cd00093, HTH_XRE, Helix-turn-helix XRE-family like proteins. Prokaryotic DNA binding proteins belonging to the xenobiotic response element family of transcriptional regulators.	5.86135e-15

Protein sequences

>NZ_CP051260.1|WP_017628013.1|2463456_2463636_+|GhoT/OrtT-family-toxin
MSVIATIGIGYLIGAVLSFIITFFLTKDPSLAMRLLSAFLIAITWPLSFPMAIIFSIFG
>NZ_CP051260.1|WP_004243612.1|2462345_2462888_-|DUF924-domain-containing-protein
MVPYQPVLTFWFEECTPKQWFQKDSAFDKEIKDRFGELCISASRAELASWRESIEGRLGEIIILDQFSRNIWRDTPKAFAQDNMALILAQEAIRLPEYLTLTPVKRKFLIMPFMHSESQKIHQDAIALFSQLNDDDTYQYELRHKEIIDKYGRYPHRNEILGRTSTPEELAFLQQPGSSF
>NZ_CP051260.1|WP_004243611.1|2461453_2462230_+|dimethyl-sulfoxide-reductase-anchor-subunit
MHELPLVFFTVLGSSAAGLFLIAYISKKLGQIDEQQLRNANILALILMLVGLGIGGLHVGQPLRFFNMLLGVGRSPMSNEAFLSGVFTGFAFATVALTIMKKWRGLREICNLFTVIFGLAFVWSIPQVYHIPTIANWNTDYTTLQFWMTLLIGGGVLAMVSGARRLGALSFIIGAIITFAARSGYVSFLSFNGPELSAEQSLFWGFQLAVLALGIVVVGFSALKAQTSKVTLATCAAAVVIAELSGRIAFYNLWHITM
>NZ_CP051260.1|WP_049213336.1|2460832_2461450_+|dimethylsulfoxide-reductase-subunit-B
MKQYGFYFDSTKCTGCKTCQVSCKDEKDLDLGPKFRRVYEYGGGSWAKQDGIWTQNIYSYYLSISCNHCSNPTCVAGCPTGAMHKREEDGLVVVNQDVCVGCRYCELRCPYGAPQFDEKKKLMSKCDGCYERVAQGMKPVCVESCPQRALDFDDIDVIRAKHGTECGIAPMPDPSLTNPNIVIKAHKDAKPSGDKTGSVQNAAEV
>NZ_CP051260.1|WP_012368081.1|2458382_2460821_+|molybdopterin-dependent-oxidoreductase
MSMSKIKNNVSITEMSRRGFIQSAAVLSGAAAVAGTVSLPFSANAQTPQGIRPDETSETIKYSACLVNCGSRCPLKVHVKDGVIRRISNETMFDDSTFGLHQIRPCLRGRSVRWKTYNPDRLKYPMKRVGKRGEGKFERISWDEATSIIADKLKYTIDTYGNEAIYYQYGTGSTGANLHGRTACKRLLSTVGGFLSDYGTYSYSQLTGIVPYVYGDMLESLLTEIENSDLVVMFGHNLAETRMSGGGQFYETLNALDKSKSKVIIIDPRRTDSVTTLGAEWIPIYPGTDAALVAALGYVMIQEGITDEAFLREYCIGWDKQTLPASAPENGSYKDYILGNGPDGIAKTPEWASQLTGISVARIIQLAREIGNARAAWISQGWGIQRTSNGEQACRAIMMLPLMSGHIGRPGTNTGCWGGSIEYPVASFAIPNPVKTQIPTFMWSEAVARGEELTSKNAGVRNKDKLDTGIKFMWCYSSNVIGNQHADLNKTHELLQDESKCEFILVWDNHMTPSAKYADILLPDVTTVETNDLINNSYASGAYHYMVRLQNAIEPLWENRPNYDVLADIAEKLGVKEKFTEGRTYQEWIEYCYNQVKANNPALPSFAETNDMGIVDRKLPPRSAYVALEAFRQDPIANPLKTASGKIEIYSEKLMQDTEGWILPEGDRIPAIPEYCKNEEGVENVTLKEKFPLQMTGFHDKGHVHSTYFNVAMLREAIPHQFWLNPVDAAQRGLKSGDIAEIYNERGRLHIRVKVTDRVLPGVIAVPQGAWRSLDTTGVDTGGCINTLTSWHPSPFAKGNPQHTNLVEVKRA
>NZ_CP051260.1|WP_004250735.1|2456772_2458029_+|mechanosensitive-ion-channel
MQQQLLTWIRQFNEEYAQITSLLLVLLIIFVVALVLHFILHKLVLPKLSKAISKYDQKWQLSFEINKLFSRFAFLIQGVVINIQALLWMGPGKTQEILTTTAQAWCLLFGLLMIFSIMDLCLQIMRNSPSFGRLPLRGIFQSLKLVASVLIGIMIVSLLIGKSPLILLSGLGAMTAVLMLVFKDPIMGLVAGIQLSANNMISLGDWLEMPKYGADGAVVDISLTTVKVRNWDNTVTTIPTYSLISDSFKNWQAMTQSGGRRIKRSLSLDINSIYFLDQENIDKLEKAQLLEPYIKSKVGEISSYNASLCHEHQMPLNQRGMTNVGTFRAYVEAYLKNHPKIHKQMTIMVRQLAPTSEGLPIEIYAFTNTTVWVEYEAIQSDIFDHIFAILPQFGLRIHQSPTGSDVRALKFPTNIDTP
>NZ_CP051260.1|WP_004243604.1|2455482_2456061_+|HdeD-family-acid-resistance-protein
MLDINKNNLSQLTEKLVKKQCTLMSIIAMLGLLAGIICIINPFSSGVVVSVFLGVVFFACAITSIMAAFNSRISSGWSMLITLLAGFIYLFLGYIFITDPLNGMLSLAFIIGYLFIFAGILRLVLGFKQIKDSFYGWFNILVGFLDLVLAYFLLAFGPETSITLVMALIGIQLILSSITILSIASAIKRMTR
>NZ_CP051260.1|WP_041701181.1|2454438_2455296_-|D-amino-acid-transaminase
MSEIVYLNNQFVPKEQANISVFDRGFLFADAVYEVTAVINGQLIDFEGHFQRLQRSCKALSMPFSLTKEQLKEIHGQLIDKNHLHEGLIYLQVTRGADSSRFFDFPSSSVAPTLVLFVQHSTVVNHPNASKGISVVSVEDIRWQRCDIKTVALLAACLAKHHAHQQGADDAIFIKEGYITEGSSSNFFIVNQQDEIITRPLSQDILPGITRQAIIQLAKEQKLTIIERLFTLEEAKQAKEAFISSATTLIWPVISIDNEKINQGKVGALSQRLREIYLEKAGVKP
>NZ_CP051260.1|WP_004250737.1|2453815_2454376_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
MSSPSAPIEIISQSIARERKKAGLSLAEIARRAGIAKSTLSQLEAGQGNPSIETLWAICVALNIPFSQLISSPKPEVKVIRKGDGFKISAEKAYYHAFLLSSCPNGAKRDIYTVIAQPGKDRVSDPHSKNVTEHILIISGRAIVGTLDNQQELSPGDYICYPGDVTHVLRALEPDTTAVMIIEHHN
>NZ_CP051260.1|WP_004243600.1|2453068_2453731_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease
MHINSRLDNNVLRDILLVSLADGIVGISYGALAHTQGFDFWVPLSLSIFVLAGASEFLFIGVVAMGGSAIYAALAGLMVNARHIPFSMAVKELPGKGIKSLLGFHILNDESVVFGLSQSTAEQNRLAFWACGLGILLMWPLGTMLGVYLGSFIVDIKMLGLDAMFPAIILALSLPALKNKLTRKAAIIGSVIALATTLFLPAGIPVLLSLLGVLFVVRKI
>NZ_CP051260.1|WP_004243615.1|2465016_2465673_-|DUF2612-domain-containing-protein
MNIQQFDYHSDLLQAILWQYENADKLKSLAHFKADYFHQSTVLFWQNWYRDIFNIDTANDFGLAVWARILDVPLGIDISPSEKTKIGFGFGKKKANFNANFRRNTDYTLSLTLDQKRMLIRMRYFNLTQSPTVTNINQFLKRFFWRGESKVFVLDPFDMTYMYYVFNFNPDERLRLLLENFDLMPRPSGVGVKYRIITKKAFGYGSYRKNFLKSNFGE
>NZ_CP051260.1|WP_017628010.1|2465669_2466857_-|hypothetical-protein
MADYRYINNKGVIVPDTAALRKEVEDEFRTVFGQSINLSPETPQGVLATMEIENRDAIVRNNAELANQINPDIAGGIFLDAIWALMGGERINATHSYLSNVEFMGVPGTIIPKGSQALTINGAVFETLTSLIIADTGKITGDMRAKEYGPITCGIGQLNKVASSVLGWEKVNNTTHAIIGRYAESDIKARRRRKQTLAKNTISVAQAITSSLYELAGVNSLSFRENFTDKTLTIDGISLLPHSIYVCVEGGDSHEIANVLLRTKTIGAAFNGDIEINLLEPASGQEYPIKFSRPKEVTIFCKVTVKKSSFDAQTIIPDALEKWSHGEIEGDNGLVVGRDVSPFEISAAVNAVEPHLFVTKVELSTDGKNWHVALIPIAINQIARLPKGAIQVVMV
>NZ_CP051260.1|WP_004243617.1|2466849_2467194_-|hypothetical-protein
MRTFAINQHNDLVIDAKGDLQICDNDEAVKNLCQHFIKAVRGEMLHKKDKGIPYWSATFSRQVDIPLFEMAFRQRLAEIEEVVAISHFNAFLDNGVLKYQADIRTIYGGFTLHG
>NZ_CP051260.1|WP_004243621.1|2467190_2467883_-|hypothetical-protein
MSKPNNDIASVGSLAGAFSSAFRHLMMNTDDMLPATVIDYDEKSNRAVIKPLVMMLTTDNQTISRAPVANIPVFRFGGGGFFIRAPIKAGDFGWLKANDRDISLIFQRGGLEDRPNTTRLHTFSDAMFFPDTLKGWVIDGKNIDALVIQSMDGSVCFSLHNDKVVLETPKYEINARETIFTGNVTVNGNYAVNGNSDSQGGVMRHNGKDIGSTHRHSGVQAGKDNTGSPI
>NZ_CP051260.1|WP_004243622.1|2467885_2468698_-|hypothetical-protein
MDLRRIRLGIEVGERLQWYEGLRISASGTKYANPLQNECNVTISGLNAQTRDYLLTETSPYNNNKQTRRLYLEVGRVNTGLLSLFIGDIVSAEIDSPPDVTLTLSAKTSHQSAGKIISSSGGTMRRLSEIALAIADDCGVKLDFQATDKNIANWYYCGSALHQIERLQEAGDVKAFIDDDTLFVKDDDKALKSRLRILNMNSGMIGIPKATESGLTVSYLIDSTSELGGMLRLESKLNPSLNGDYIIEQLAFSVASHEADFNYTAICKRA
>NZ_CP051260.1|WP_004243623.1|2468666_2468987_-|hypothetical-protein
MQEIPLQAIPNQRFSVAIAGVNWQLTLKVANQTMFCDIEREGEILITGMRLVANTPIIPYRYLNQGINLMFLTEHDALPWYEEFTKTQSLVYWSEEDGSSTNKARN
>NZ_CP051260.1|WP_036971128.1|2468992_2469487_-|hypothetical-protein
MITEVRIFDLASFTTLFDSVNPTQVTIDDSHQAITFTVENGESRSDHVVINPISISISLLLTGDIANAYATIKQLYDENTLVGIQTRVSTYQPMLLESLSHDEDPSKVDAIELKLKFIEWKSIEPEYNKKSAKSTKKPKQSSTINRGNVKSKKSMPIGKKRARR
>NZ_CP051260.1|WP_107337176.1|2469489_2471793_-|hypothetical-protein
MSLLPVFSQVLTLDAEVSDNALNNIRKSTNEILEEMKKIEQGASAGINHFFAFVQEIAASFNELSLEPEINLSVDNQEIIQASETVENSIQKIVKTALSSTQEFDTFLQNILTGLTSLSLDEPINIEINSGETQEKIHSITSSIDALKDAMSVLNYTRNLLSNDVDSDASHLANLNAEYQAMEDQLASLNNELTLLTEAEKKNKENKLVIDEVIKNLGADYDQFISTMQTQGIKAAIEEAQAQRRLSSSVDETGKSYQQTVDKMKDFILNAIGATDIMGTLQKVFSASLERSQEIESLDKLSKKMGVAAIDIDAFSGAMAAIGGTKEAAQADLAAMATAFDDTQDPIEQLLQVADNVKNMSFDDAQKELEKLGVVDDKTIELMMKGRQELERTMGVQKQFSGINDDSIESAIQLNATIHKFSQLAAQFKNNFLDMIIPTLAKGMEWFDKLVDFCVKNKDIVISFFSAIGAAVAIYYLPVMISAAASTLAMALPIIAIATVIGLLGVAFKLVYDDIMNFINGNDSMIGRILEKYPVLKSVIMTIWQAWQSFFEYLKEAVTVVADFVIAAWDLISNSFNQFIQTLEIGINNLIAWGQSIIDIFIFVSDSVVSLFEWMWGCVEKILDFVDEKINLIQDIWQSAKSFFGMDDEEKEIRVVQKVERRLTNEGELDYILPQSQTATRYYSPMQEVKSLNNGLAISSNNSLNPMTSQMISNQSSIKNESNVQIGEIKIETQATNGAEVVKEIKKSYTEQEAKNISQNHSSGWRV
>NZ_CP051260.1|WP_004243627.1|2471875_2472334_-|hypothetical-protein
MLIKPKEITVIDSDRQQHTFIISRLPATIGREILAKYPLSNAPKIGDYEVSKEAMLKMMAYVAVEKEGQEIYLKTSTLIDNHVPDGEALIRLELEMLKYNTSFFGNGGSQNFLQYLLGKLSGSLPSIIKTLMASLPSSSQPASPLSQNSKQP
>NZ_CP051260.1|WP_004243628.1|2472393_2472846_-|hypothetical-protein
MNDISATGLSLIIQASKTFPAGIPITTFSDEGDPLDLPTVNITQTAVDINGNLVSWSSPTPQTVTINVLAGSEEDENLAILFDANTARRGRRPASDVITLVASYGDGSITTARNGRITGGCRGNSVAGVGRLKSKQYTFIFQDFDRVRAR

Crispr_ID: NZ_CP051260_1

• CRISPR_ID: NZ_CP051260_1
• CRISPR_location: 2464103-2464277
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers

Consensus repeat of NZ_CP051260_1

Consensus_repeat	Method
ATAATTGCCTTTAGGTTGATATTT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP051260_1

>1.1|2464127|60|NZ_CP051260|CRISPRCasFinder
CCCCTTAGGCTGATATTTACCATCTGACTCTGATTTAGAATAACTATAACCTGTCGCTAA
>1.2|2464211|42|NZ_CP051260|CRISPRCasFinder
ATTATCAGATTCCGTTTTAGTATAGGATGCACCCACTAATGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP051260_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP051260_1

>merge|NZ_CP051260|1|2464103-2464277|CRISPRCasFinder
ATAATTCCCTTTGGGTTGATAATTCCCCTTAGGCTGATATTTACCATCTGACTCTGATTTAGAATAACTATAACCTGTCGCTAAATAATTGCCTTTAGGTTGATATTTATTATCAGATTCCGTTTTAGTATAGGATGCACCCACTAATGCATAATTGCCTTTGGGTTGATAATTT

>NZ_CP051260|1|1|2464103-2464277|CRISPRCasFinder
ATAATTCCCTTTGGGTTGATAATT	CCCCTTAGGCTGATATTTACCATCTGACTCTGATTTAGAATAACTATAACCTGTCGCTAA
ATAATTGCCTTTAGGTTGATATTT	ATTATCAGATTCCGTTTTAGTATAGGATGCACCCACTAATGC
ATAATTGCCTTTGGGTTGATAATTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP051260.1|WP_049213336.1|2460832_2461450_+|dimethylsulfoxide-reductase-subunit-B	unknown	unknown	gnl|CDD|131996
NZ_CP051260.1|WP_004250735.1|2456772_2458029_+|mechanosensitive-ion-channel	unknown	unknown	gnl|CDD|366370
NZ_CP051260.1|WP_004243622.1|2467885_2468698_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_004243611.1|2461453_2462230_+|dimethyl-sulfoxide-reductase-anchor-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|225839
NZ_CP051260.1|WP_012368081.1|2458382_2460821_+|molybdopterin-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|274006
NZ_CP051260.1|WP_041701181.1|2454438_2455296_-|D-amino-acid-transaminase	unknown	unknown	gnl|CDD|180656
NZ_CP051260.1|WP_004243627.1|2471875_2472334_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_004243628.1|2472393_2472846_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_004243612.1|2462345_2462888_-|DUF924-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377592
NZ_CP051260.1|WP_004243600.1|2453068_2453731_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224215
NZ_CP051260.1|WP_004243623.1|2468666_2468987_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_107337176.1|2469489_2471793_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223496
NZ_CP051260.1|WP_017628010.1|2465669_2466857_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377414
NZ_CP051260.1|WP_036971128.1|2468992_2469487_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_017628013.1|2463456_2463636_+|GhoT/OrtT-family-toxin	unknown	unknown	gnl|CDD|371222
NZ_CP051260.1|WP_004243621.1|2467190_2467883_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|375779
NZ_CP051260.1|WP_004243604.1|2455482_2456061_+|HdeD-family-acid-resistance-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182308
NZ_CP051260.1|WP_004243617.1|2466849_2467194_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_004243615.1|2465016_2465673_-|DUF2612-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|371354
NZ_CP051260.1|WP_004250737.1|2453815_2454376_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|238045

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP051260.1|WP_049213336.1|2460832_2461450_+|dimethylsulfoxide-reductase-subunit-B	gnl|CDD|131996	TIGR02951, anaerobic_dimethyl_sulfoxide_reductase_subunit_B, DMSO reductase, iron-sulfur subunit. This family consists of the iron-sulfur subunit, or chain B, of an enzyme called the anaerobic dimethyl sulfoxide reductase. Chains A and B are catalytic, while chain C is a membrane anchor.	1.91743e-91
NZ_CP051260.1|WP_004250735.1|2456772_2458029_+|mechanosensitive-ion-channel	gnl|CDD|366370	pfam00924, MS_channel, Mechanosensitive ion channel. Two members of this protein family of M. jannaschii have been functionally characterized. Both proteins form mechanosensitive (MS) ion channels upon reconstitution into liposomes and functional examination by the patch-clamp technique. Therefore this family are likely to also be MS channel proteins.	1.66127e-32
NZ_CP051260.1|WP_004243611.1|2461453_2462230_+|dimethyl-sulfoxide-reductase-anchor-subunit	gnl|CDD|225839	COG3302, DmsC, DMSO reductase anchor subunit [General function prediction only].	1.76747e-46
NZ_CP051260.1|WP_012368081.1|2458382_2460821_+|molybdopterin-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|274006	TIGR02166, Putative_dimethyl_sulfoxide_reductase_chain_YnfE, anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family. Members of this family include known and probable dimethyl sulfoxide reductase (DMSO reductase) A chains. In E. coli, dmsA encodes the canonical anaerobic DMSO reductase A chain. The paralog ynfE, as part of ynfFGH expressed from a multicopy plasmid, could complement a dmsABC deletion, suggesting a similar function and some overlap in specificity, although YnfE could not substitute for DmsA in a mixed complex.	0
NZ_CP051260.1|WP_041701181.1|2454438_2455296_-|D-amino-acid-transaminase	gnl|CDD|180656	PRK06680, PRK06680, D-amino acid aminotransferase; Reviewed.	7.55875e-127
NZ_CP051260.1|WP_004243612.1|2462345_2462888_-|DUF924-domain-containing-protein	gnl|CDD|377592	pfam06041, DUF924, Bacterial protein of unknown function (DUF924). This family consists of several hypothetical bacterial proteins of unknown function. Structurally, this family resembles TPR-like repeats.	1.54842e-89
NZ_CP051260.1|WP_004243600.1|2453068_2453731_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|224215	COG1296, AzlC, Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance) [Amino acid transport and metabolism].	1.03721e-32
NZ_CP051260.1|WP_107337176.1|2469489_2471793_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223496	COG0419, SbcC, ATPase involved in DNA repair [DNA replication, recombination, and repair].	0.00189201
NZ_CP051260.1|WP_017628010.1|2465669_2466857_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|377414	pfam04865, Baseplate_J, Baseplate J-like protein. The P2 bacteriophage J protein lies at the edge of the baseplate. This family also includes a number of bacterial homologs, which are thought to have been horizontally transferred.	9.13292e-07
NZ_CP051260.1|WP_017628013.1|2463456_2463636_+|GhoT/OrtT-family-toxin	gnl|CDD|371222	pfam10753, Toxin_GhoT_OrtT, Toxin GhoT_OrtT. GhoT is part of the GhoT-GhoS type V toxin-antitoxin (TA) system. OrtT is homologous to GhoT, but it is not part of a TA pair. In this case, it acts as an independent toxin to reduce growth during stress related to amino acid and DNA synthesis.	7.72766e-13
NZ_CP051260.1|WP_004243621.1|2467190_2467883_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|375779	pfam18352, Gp138_N, Phage protein Gp138 N-terminal domain. This domain is found in the N-terminal domain of gene product 138 (gp138) in an unidentified bacteriophage. Gp138 is thought to be involved in the process of opening the host cell membrane during infection. The domain has an OB-fold with an intramolecular disulfide bond between C114 and C120.	1.64931e-18
NZ_CP051260.1|WP_004243604.1|2455482_2456061_+|HdeD-family-acid-resistance-protein	gnl|CDD|182308	PRK10209, PRK10209, HdeD family acid-resistance protein.	2.20798e-64
NZ_CP051260.1|WP_004243615.1|2465016_2465673_-|DUF2612-domain-containing-protein	gnl|CDD|371354	pfam11041, DUF2612, Protein of unknown function (DUF2612). This is a phage protein family expressed from a range of Proteobacteria species. The function is not known.	4.26666e-71
NZ_CP051260.1|WP_004250737.1|2453815_2454376_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|238045	cd00093, HTH_XRE, Helix-turn-helix XRE-family like proteins. Prokaryotic DNA binding proteins belonging to the xenobiotic response element family of transcriptional regulators.	5.86135e-15

Protein sequences

>NZ_CP051260.1|WP_017628013.1|2463456_2463636_+|GhoT/OrtT-family-toxin
MSVIATIGIGYLIGAVLSFIITFFLTKDPSLAMRLLSAFLIAITWPLSFPMAIIFSIFG
>NZ_CP051260.1|WP_004243612.1|2462345_2462888_-|DUF924-domain-containing-protein
MVPYQPVLTFWFEECTPKQWFQKDSAFDKEIKDRFGELCISASRAELASWRESIEGRLGEIIILDQFSRNIWRDTPKAFAQDNMALILAQEAIRLPEYLTLTPVKRKFLIMPFMHSESQKIHQDAIALFSQLNDDDTYQYELRHKEIIDKYGRYPHRNEILGRTSTPEELAFLQQPGSSF
>NZ_CP051260.1|WP_004243611.1|2461453_2462230_+|dimethyl-sulfoxide-reductase-anchor-subunit
MHELPLVFFTVLGSSAAGLFLIAYISKKLGQIDEQQLRNANILALILMLVGLGIGGLHVGQPLRFFNMLLGVGRSPMSNEAFLSGVFTGFAFATVALTIMKKWRGLREICNLFTVIFGLAFVWSIPQVYHIPTIANWNTDYTTLQFWMTLLIGGGVLAMVSGARRLGALSFIIGAIITFAARSGYVSFLSFNGPELSAEQSLFWGFQLAVLALGIVVVGFSALKAQTSKVTLATCAAAVVIAELSGRIAFYNLWHITM
>NZ_CP051260.1|WP_049213336.1|2460832_2461450_+|dimethylsulfoxide-reductase-subunit-B
MKQYGFYFDSTKCTGCKTCQVSCKDEKDLDLGPKFRRVYEYGGGSWAKQDGIWTQNIYSYYLSISCNHCSNPTCVAGCPTGAMHKREEDGLVVVNQDVCVGCRYCELRCPYGAPQFDEKKKLMSKCDGCYERVAQGMKPVCVESCPQRALDFDDIDVIRAKHGTECGIAPMPDPSLTNPNIVIKAHKDAKPSGDKTGSVQNAAEV
>NZ_CP051260.1|WP_012368081.1|2458382_2460821_+|molybdopterin-dependent-oxidoreductase
MSMSKIKNNVSITEMSRRGFIQSAAVLSGAAAVAGTVSLPFSANAQTPQGIRPDETSETIKYSACLVNCGSRCPLKVHVKDGVIRRISNETMFDDSTFGLHQIRPCLRGRSVRWKTYNPDRLKYPMKRVGKRGEGKFERISWDEATSIIADKLKYTIDTYGNEAIYYQYGTGSTGANLHGRTACKRLLSTVGGFLSDYGTYSYSQLTGIVPYVYGDMLESLLTEIENSDLVVMFGHNLAETRMSGGGQFYETLNALDKSKSKVIIIDPRRTDSVTTLGAEWIPIYPGTDAALVAALGYVMIQEGITDEAFLREYCIGWDKQTLPASAPENGSYKDYILGNGPDGIAKTPEWASQLTGISVARIIQLAREIGNARAAWISQGWGIQRTSNGEQACRAIMMLPLMSGHIGRPGTNTGCWGGSIEYPVASFAIPNPVKTQIPTFMWSEAVARGEELTSKNAGVRNKDKLDTGIKFMWCYSSNVIGNQHADLNKTHELLQDESKCEFILVWDNHMTPSAKYADILLPDVTTVETNDLINNSYASGAYHYMVRLQNAIEPLWENRPNYDVLADIAEKLGVKEKFTEGRTYQEWIEYCYNQVKANNPALPSFAETNDMGIVDRKLPPRSAYVALEAFRQDPIANPLKTASGKIEIYSEKLMQDTEGWILPEGDRIPAIPEYCKNEEGVENVTLKEKFPLQMTGFHDKGHVHSTYFNVAMLREAIPHQFWLNPVDAAQRGLKSGDIAEIYNERGRLHIRVKVTDRVLPGVIAVPQGAWRSLDTTGVDTGGCINTLTSWHPSPFAKGNPQHTNLVEVKRA
>NZ_CP051260.1|WP_004250735.1|2456772_2458029_+|mechanosensitive-ion-channel
MQQQLLTWIRQFNEEYAQITSLLLVLLIIFVVALVLHFILHKLVLPKLSKAISKYDQKWQLSFEINKLFSRFAFLIQGVVINIQALLWMGPGKTQEILTTTAQAWCLLFGLLMIFSIMDLCLQIMRNSPSFGRLPLRGIFQSLKLVASVLIGIMIVSLLIGKSPLILLSGLGAMTAVLMLVFKDPIMGLVAGIQLSANNMISLGDWLEMPKYGADGAVVDISLTTVKVRNWDNTVTTIPTYSLISDSFKNWQAMTQSGGRRIKRSLSLDINSIYFLDQENIDKLEKAQLLEPYIKSKVGEISSYNASLCHEHQMPLNQRGMTNVGTFRAYVEAYLKNHPKIHKQMTIMVRQLAPTSEGLPIEIYAFTNTTVWVEYEAIQSDIFDHIFAILPQFGLRIHQSPTGSDVRALKFPTNIDTP
>NZ_CP051260.1|WP_004243604.1|2455482_2456061_+|HdeD-family-acid-resistance-protein
MLDINKNNLSQLTEKLVKKQCTLMSIIAMLGLLAGIICIINPFSSGVVVSVFLGVVFFACAITSIMAAFNSRISSGWSMLITLLAGFIYLFLGYIFITDPLNGMLSLAFIIGYLFIFAGILRLVLGFKQIKDSFYGWFNILVGFLDLVLAYFLLAFGPETSITLVMALIGIQLILSSITILSIASAIKRMTR
>NZ_CP051260.1|WP_041701181.1|2454438_2455296_-|D-amino-acid-transaminase
MSEIVYLNNQFVPKEQANISVFDRGFLFADAVYEVTAVINGQLIDFEGHFQRLQRSCKALSMPFSLTKEQLKEIHGQLIDKNHLHEGLIYLQVTRGADSSRFFDFPSSSVAPTLVLFVQHSTVVNHPNASKGISVVSVEDIRWQRCDIKTVALLAACLAKHHAHQQGADDAIFIKEGYITEGSSSNFFIVNQQDEIITRPLSQDILPGITRQAIIQLAKEQKLTIIERLFTLEEAKQAKEAFISSATTLIWPVISIDNEKINQGKVGALSQRLREIYLEKAGVKP
>NZ_CP051260.1|WP_004250737.1|2453815_2454376_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
MSSPSAPIEIISQSIARERKKAGLSLAEIARRAGIAKSTLSQLEAGQGNPSIETLWAICVALNIPFSQLISSPKPEVKVIRKGDGFKISAEKAYYHAFLLSSCPNGAKRDIYTVIAQPGKDRVSDPHSKNVTEHILIISGRAIVGTLDNQQELSPGDYICYPGDVTHVLRALEPDTTAVMIIEHHN
>NZ_CP051260.1|WP_004243600.1|2453068_2453731_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease
MHINSRLDNNVLRDILLVSLADGIVGISYGALAHTQGFDFWVPLSLSIFVLAGASEFLFIGVVAMGGSAIYAALAGLMVNARHIPFSMAVKELPGKGIKSLLGFHILNDESVVFGLSQSTAEQNRLAFWACGLGILLMWPLGTMLGVYLGSFIVDIKMLGLDAMFPAIILALSLPALKNKLTRKAAIIGSVIALATTLFLPAGIPVLLSLLGVLFVVRKI
>NZ_CP051260.1|WP_004243615.1|2465016_2465673_-|DUF2612-domain-containing-protein
MNIQQFDYHSDLLQAILWQYENADKLKSLAHFKADYFHQSTVLFWQNWYRDIFNIDTANDFGLAVWARILDVPLGIDISPSEKTKIGFGFGKKKANFNANFRRNTDYTLSLTLDQKRMLIRMRYFNLTQSPTVTNINQFLKRFFWRGESKVFVLDPFDMTYMYYVFNFNPDERLRLLLENFDLMPRPSGVGVKYRIITKKAFGYGSYRKNFLKSNFGE
>NZ_CP051260.1|WP_017628010.1|2465669_2466857_-|hypothetical-protein
MADYRYINNKGVIVPDTAALRKEVEDEFRTVFGQSINLSPETPQGVLATMEIENRDAIVRNNAELANQINPDIAGGIFLDAIWALMGGERINATHSYLSNVEFMGVPGTIIPKGSQALTINGAVFETLTSLIIADTGKITGDMRAKEYGPITCGIGQLNKVASSVLGWEKVNNTTHAIIGRYAESDIKARRRRKQTLAKNTISVAQAITSSLYELAGVNSLSFRENFTDKTLTIDGISLLPHSIYVCVEGGDSHEIANVLLRTKTIGAAFNGDIEINLLEPASGQEYPIKFSRPKEVTIFCKVTVKKSSFDAQTIIPDALEKWSHGEIEGDNGLVVGRDVSPFEISAAVNAVEPHLFVTKVELSTDGKNWHVALIPIAINQIARLPKGAIQVVMV
>NZ_CP051260.1|WP_004243617.1|2466849_2467194_-|hypothetical-protein
MRTFAINQHNDLVIDAKGDLQICDNDEAVKNLCQHFIKAVRGEMLHKKDKGIPYWSATFSRQVDIPLFEMAFRQRLAEIEEVVAISHFNAFLDNGVLKYQADIRTIYGGFTLHG
>NZ_CP051260.1|WP_004243621.1|2467190_2467883_-|hypothetical-protein
MSKPNNDIASVGSLAGAFSSAFRHLMMNTDDMLPATVIDYDEKSNRAVIKPLVMMLTTDNQTISRAPVANIPVFRFGGGGFFIRAPIKAGDFGWLKANDRDISLIFQRGGLEDRPNTTRLHTFSDAMFFPDTLKGWVIDGKNIDALVIQSMDGSVCFSLHNDKVVLETPKYEINARETIFTGNVTVNGNYAVNGNSDSQGGVMRHNGKDIGSTHRHSGVQAGKDNTGSPI
>NZ_CP051260.1|WP_004243622.1|2467885_2468698_-|hypothetical-protein
MDLRRIRLGIEVGERLQWYEGLRISASGTKYANPLQNECNVTISGLNAQTRDYLLTETSPYNNNKQTRRLYLEVGRVNTGLLSLFIGDIVSAEIDSPPDVTLTLSAKTSHQSAGKIISSSGGTMRRLSEIALAIADDCGVKLDFQATDKNIANWYYCGSALHQIERLQEAGDVKAFIDDDTLFVKDDDKALKSRLRILNMNSGMIGIPKATESGLTVSYLIDSTSELGGMLRLESKLNPSLNGDYIIEQLAFSVASHEADFNYTAICKRA
>NZ_CP051260.1|WP_004243623.1|2468666_2468987_-|hypothetical-protein
MQEIPLQAIPNQRFSVAIAGVNWQLTLKVANQTMFCDIEREGEILITGMRLVANTPIIPYRYLNQGINLMFLTEHDALPWYEEFTKTQSLVYWSEEDGSSTNKARN
>NZ_CP051260.1|WP_036971128.1|2468992_2469487_-|hypothetical-protein
MITEVRIFDLASFTTLFDSVNPTQVTIDDSHQAITFTVENGESRSDHVVINPISISISLLLTGDIANAYATIKQLYDENTLVGIQTRVSTYQPMLLESLSHDEDPSKVDAIELKLKFIEWKSIEPEYNKKSAKSTKKPKQSSTINRGNVKSKKSMPIGKKRARR
>NZ_CP051260.1|WP_107337176.1|2469489_2471793_-|hypothetical-protein
MSLLPVFSQVLTLDAEVSDNALNNIRKSTNEILEEMKKIEQGASAGINHFFAFVQEIAASFNELSLEPEINLSVDNQEIIQASETVENSIQKIVKTALSSTQEFDTFLQNILTGLTSLSLDEPINIEINSGETQEKIHSITSSIDALKDAMSVLNYTRNLLSNDVDSDASHLANLNAEYQAMEDQLASLNNELTLLTEAEKKNKENKLVIDEVIKNLGADYDQFISTMQTQGIKAAIEEAQAQRRLSSSVDETGKSYQQTVDKMKDFILNAIGATDIMGTLQKVFSASLERSQEIESLDKLSKKMGVAAIDIDAFSGAMAAIGGTKEAAQADLAAMATAFDDTQDPIEQLLQVADNVKNMSFDDAQKELEKLGVVDDKTIELMMKGRQELERTMGVQKQFSGINDDSIESAIQLNATIHKFSQLAAQFKNNFLDMIIPTLAKGMEWFDKLVDFCVKNKDIVISFFSAIGAAVAIYYLPVMISAAASTLAMALPIIAIATVIGLLGVAFKLVYDDIMNFINGNDSMIGRILEKYPVLKSVIMTIWQAWQSFFEYLKEAVTVVADFVIAAWDLISNSFNQFIQTLEIGINNLIAWGQSIIDIFIFVSDSVVSLFEWMWGCVEKILDFVDEKINLIQDIWQSAKSFFGMDDEEKEIRVVQKVERRLTNEGELDYILPQSQTATRYYSPMQEVKSLNNGLAISSNNSLNPMTSQMISNQSSIKNESNVQIGEIKIETQATNGAEVVKEIKKSYTEQEAKNISQNHSSGWRV
>NZ_CP051260.1|WP_004243627.1|2471875_2472334_-|hypothetical-protein
MLIKPKEITVIDSDRQQHTFIISRLPATIGREILAKYPLSNAPKIGDYEVSKEAMLKMMAYVAVEKEGQEIYLKTSTLIDNHVPDGEALIRLELEMLKYNTSFFGNGGSQNFLQYLLGKLSGSLPSIIKTLMASLPSSSQPASPLSQNSKQP
>NZ_CP051260.1|WP_004243628.1|2472393_2472846_-|hypothetical-protein
MNDISATGLSLIIQASKTFPAGIPITTFSDEGDPLDLPTVNITQTAVDINGNLVSWSSPTPQTVTINVLAGSEEDENLAILFDANTARRGRRPASDVITLVASYGDGSITTARNGRITGGCRGNSVAGVGRLKSKQYTFIFQDFDRVRAR

Crispr_ID: NZ_CP051260_3

• CRISPR_ID: NZ_CP051260_3
• CRISPR_location: 2825791-2825933
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers

Consensus repeat of NZ_CP051260_3

Consensus_repeat	Method
GGTGATATCAATTTCACAGGTGG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP051260_3

>3.1|2825814|37|NZ_CP051260|CRISPRCasFinder
TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA
>3.2|2825874|37|NZ_CP051260|CRISPRCasFinder
CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP051260_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP051260_3

>merge|NZ_CP051260|3|2825791-2825933|CRISPRCasFinder
GGTGATATCAATTTCACAGGTGGTGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAAGGTGATATCAATTTTACAGGTGGCGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTATGGTAATACCAACTTTACTGGTGG

>NZ_CP051260|3|3|2825791-2825933|CRISPRCasFinder
GGTGATATCAATTTCACAGGTGG	TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA
GGTGATATCAATTTTACAGGTGG	CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT
GGTAATACCAACTTTACTGGTGG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP051260.1|WP_049203011.1|2846575_2847019_+|prepilin-peptidase-dependent-pilin	unknown	unknown	gnl|CDD|236718
NZ_CP051260.1|WP_004244091.1|2851116_2851332_+|DNA-gyrase-inhibitor-YacG	unknown	unknown	gnl|CDD|234754
NZ_CP051260.1|WP_104459311.1|2817347_2818082_-|oxidative-stress-defense-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236840
NZ_CP051260.1|WP_004250354.1|2850311_2851064_+|cell-division-protein-ZapD	unknown	unknown	gnl|CDD|235389
NZ_CP051260.1|WP_060555638.1|2845822_2846365_-|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD	unknown	unknown	gnl|CDD|236984
NZ_CP051260.1|WP_110706929.1|2844725_2845496_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR	unknown	unknown	gnl|CDD|181879
NZ_CP051260.1|WP_060555640.1|2849694_2850309_+|dephospho-CoA-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|234620
NZ_CP051260.1|WP_004244077.1|2838382_2839810_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|180579
NZ_CP051260.1|WP_004248541.1|2823728_2823875_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_004244059.1|2814331_2815231_+|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP	unknown	unknown	gnl|CDD|235144
NZ_CP051260.1|WP_049203012.1|2847117_2848221_+|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component-TadA	unknown	unknown	gnl|CDD|236694
NZ_CP051260.1|WP_064506049.1|2815433_2816408_-|nucleotidyl-transferase-AbiEii/AbiGii-toxin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378065
NZ_CP051260.1|WP_004244080.1|2841895_2844562_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type	unknown	unknown	gnl|CDD|236500
NZ_CP051260.1|WP_104459312.1|2816404_2817124_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_012368224.1|2818963_2819824_-|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS	unknown	unknown	gnl|CDD|182386
NZ_CP051260.1|WP_104459310.1|2818172_2818796_-|arginine-exporter-ArgO	unknown	unknown	gnl|CDD|236463
NZ_CP051260.1|WP_168725682.1|2819915_2820287_-|YacL-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235372
NZ_CP051260.1|WP_060558294.1|2840011_2841883_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|236999
NZ_CP051260.1|WP_036905137.1|2823875_2824103_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_004244067.1|2820457_2823055_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236424

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP051260.1|WP_049203011.1|2846575_2847019_+|prepilin-peptidase-dependent-pilin	gnl|CDD|236718	PRK10574, PRK10574, putative major pilin subunit; Provisional.	1.09342e-54
NZ_CP051260.1|WP_049203012.1|2847117_2848221_+|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component-TadA	gnl|CDD|236694	PRK10436, PRK10436, hypothetical protein; Provisional.	1.61652e-179
NZ_CP051260.1|WP_004250354.1|2850311_2851064_+|cell-division-protein-ZapD	gnl|CDD|235389	PRK05287, PRK05287, cell division protein ZapD.	1.19728e-117
NZ_CP051260.1|WP_060555638.1|2845822_2846365_-|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD	gnl|CDD|236984	PRK11789, PRK11789, 1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine amidase AmpD.	2.03006e-131
NZ_CP051260.1|WP_110706929.1|2844725_2845496_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR	gnl|CDD|181879	PRK09464, pdhR, pyruvate dehydrogenase complex transcriptional repressor PdhR.	8.44249e-168
NZ_CP051260.1|WP_060555640.1|2849694_2850309_+|dephospho-CoA-kinase	gnl|CDD|234620	PRK00081, coaE, dephospho-CoA kinase; Reviewed.	7.63102e-90
NZ_CP051260.1|WP_004244077.1|2838382_2839810_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase	gnl|CDD|180579	PRK06467, PRK06467, dihydrolipoamide dehydrogenase; Reviewed.	0
NZ_CP051260.1|WP_004244059.1|2814331_2815231_+|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP	gnl|CDD|235144	PRK03635, PRK03635, ArgP/LysG family DNA-binding transcriptional regulator.	1.29397e-161
NZ_CP051260.1|WP_004244091.1|2851116_2851332_+|DNA-gyrase-inhibitor-YacG	gnl|CDD|234754	PRK00418, PRK00418, DNA gyrase inhibitor YacG.	3.56265e-30
NZ_CP051260.1|WP_064506049.1|2815433_2816408_-|nucleotidyl-transferase-AbiEii/AbiGii-toxin-family-protein	gnl|CDD|378065	pfam08843, AbiEii, Nucleotidyl transferase AbiEii toxin, Type IV TA system. This family was recently identified as belonging to the nucleotidyltransferase superfamily. AbiEii is the cognate toxin of the type IV toxin-antitoxin 'innate immunity' bacterial abortive infection (Abi) system that protects bacteria from the spread of a phage infection. The Abi system is activated upon infection with phage to abort the cell thus preventing the spread of phage through viral replication. There are some 20 or more Abis, and they are predominantly plasmid-encoded lactococcal systems. TA, toxin-antitoxin, systems on plasmids function by killing cells that lose the plasmid upon division. AbiE phage resistance systems function as novel Type IV TAs and are widespread in bacteria and archaea. The cognate antitoxin is pfam13338.	1.77496e-24
NZ_CP051260.1|WP_004244080.1|2841895_2844562_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type	gnl|CDD|236500	PRK09405, aceE, pyruvate dehydrogenase subunit E1; Reviewed.	0
NZ_CP051260.1|WP_168725682.1|2819915_2820287_-|YacL-family-protein	gnl|CDD|235372	PRK05248, PRK05248, hypothetical protein; Provisional.	2.87698e-60
NZ_CP051260.1|WP_104459310.1|2818172_2818796_-|arginine-exporter-ArgO	gnl|CDD|236463	PRK09304, PRK09304, arginine exporter ArgO.	5.53506e-119
NZ_CP051260.1|WP_012368224.1|2818963_2819824_-|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS	gnl|CDD|182386	PRK10334, PRK10334, small-conductance mechanosensitive channel MscS.	3.21493e-120
NZ_CP051260.1|WP_060558294.1|2840011_2841883_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase	gnl|CDD|236999	PRK11854, aceF, pyruvate dehydrogenase dihydrolipoyltransacetylase; Validated.	0
NZ_CP051260.1|WP_104459311.1|2817347_2818082_-|oxidative-stress-defense-protein	gnl|CDD|236840	PRK11087, PRK11087, oxidative stress defense protein; Provisional.	3.45973e-114
NZ_CP051260.1|WP_004244067.1|2820457_2823055_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase	gnl|CDD|236424	PRK09238, PRK09238, bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase; Validated.	0

Protein sequences

>NZ_CP051260.1|WP_036905137.1|2823875_2824103_+|hypothetical-protein
MIHIPASGFIYMASIIKSMLENPCINKEFEKLIAADLLPILQNETNMTENFTALHLIKKTNNRRIILYKNLFIIN
>NZ_CP051260.1|WP_004248541.1|2823728_2823875_+|hypothetical-protein
MAINEKFVQEISSINYNNSIFSLYFVGQDPHKIAQGIMPEKDEELALK
>NZ_CP051260.1|WP_004244067.1|2820457_2823055_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase
MLEEYRKHVAERAAEGVVPKPLDATQTAALVELLKSPPKGEEEFLLDLIVNRVPPGVDEAAYVKAGFLTALAKGETTSPLITPEKAVELLGTMQGGYNIHALIEALDNDKLAPIAAKALSHTLLMFDSFYDVEEKAKAGNVYAKQIMQSWADGEWFTERPELAEKITVTVFKVTGETNTDDLSPAPDAWSRPDIPLHALAMLKNAREGIEPDQPGSVGPIKQIEALNKKGFPLAYVGDVVGTGSSRKSATNSVLWFMGDDIPYVPNKRGGGVVLGGKIAPIFFNTMEDAGALPIEVDVSKLNMGDVIDIYPYKGEIRNHETNELLETFALKTEVLIDEVRAGGRIPLIIGRGLTSKARSALGLPPSTLFRHAKAVEQSDRGFSLAQKMVGRACGRDGIRPGEYCEPKMTSVGSQDTTGPMTRDELKDLACLGFSADLVMQSFCHTAAYPKPVDVTTHHTLPDFIMNRGGVSLRPGDGIIHSWLNRMLLPDTVGTGGDSHTRFPIGISFPAGSGLVAFAAATGVMPLDMPESVLVRFKGKMQPGVTLRDLVHAIPLYAIKEGLLTVEKKGKKNIFSGRILEIEGLPELKVEQAFELADASAERSAAGCTIKLDKAPIIEYLQSNIVLLKWMIAEGYGDRRTLERRITAMENWLADPQLLEADADAEYAAVIEIDLNEIKEPILCAPNDPDDARLLSEVANSKIDEVFIGSCMTNIGHFRAAGKLLDQHKGQLPTRLWVAPPTKMDAAQLTEEGYYSVFGKSGARIEVPGCSLCMGNQARVADGATVVSTSTRNFPNRLGTGANVYLASAELAAVASLLGRLPEPQEYLDFINKVDETAEDTYRYLNFDQLEQYTDKATQVIFQTTV
>NZ_CP051260.1|WP_168725682.1|2819915_2820287_-|YacL-family-protein
MDYEFQRDLTGGILARFSMDHEAIGYWLNDEIQGDISLIDQILTEMDEVKGSEKQWQLIGKEYNLSIDDEEIMVRANTLHFETDDLEEGMSYYDNESIAFCGLDDFATMLQKYRLFILENRRS
>NZ_CP051260.1|WP_012368224.1|2818963_2819824_-|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS
MNELPASLDEATGWFVANQELFIQYAVNIVAAFLILFIGLFVAKMVSKGVARILTLRHIDATVVTFLSVLVRYTVIAFTLIAVLGRLGVQTASVIAVLGAAGLAVGLALQGSLSNFAAGVLIVIFRPIRAGEYVMIGAVEGTVRDVQIFSTTLRSADDRIIVIPNSKIISSEVINLSREPNRRTQIIVGVAYDADIDKVKQVLGDVVAQDKRIQHNQGVTIRLHEMAPSSLNFVVRVWTTNDDAWPVYWDLMENFKRALDANNIGIPFPQMDVYMHQAQNTVMKAE
>NZ_CP051260.1|WP_104459310.1|2818172_2818796_-|arginine-exporter-ArgO
MLTTFFQGFLLSAAMILPIGAQNAFVLQQGSKKQYHLMSAFLCALSDVILISGGVFGGSALLSQSEHLLLLITWGGVAFLLWYGWNAFKTAFTKEIELSQHKNQVKSRWRVIVTLVAVTWLNPHVYLDTFVVLGSIGGQLSAELRPWFTFGAVFASISWFFALSLLAAWFSPILSQVTAQRIINLFVGCVMWFIALQLAAQGWKNLF
>NZ_CP051260.1|WP_104459311.1|2817347_2818082_-|oxidative-stress-defense-protein
MKVKEMVLASMLALGAPSIALAGAVPEGPHITTSGNATIKATPDMATLNIQVSEKAKDAAQAKKQVDERVAKYFAFLKENGVTKEDIDAANIRTQPNYEYDKKAERSVINGYTATRTVDVKIKKLDQLNTLLDGALAAGLNEINNVEFGVNDPEQYKAKAREVAIKNAIQQASSVAKGFGADLGAVYSVSYRAPEATPYPIARMKMDAMALSAPSPEAVKETYQQQSIEFKDYVDVVFELKTAK
>NZ_CP051260.1|WP_104459312.1|2816404_2817124_-|hypothetical-protein
MKIKPLVEKEINRFEFGKIFTYRDLTPYLSNPETTVKAVSRLVKNGDIKRFAKGQFYRPKKGIFGEMQLSDAEKLKTFMYQNGKRKGYITGMGLYNRLGLTTQIPKTITIASDKSPQRKDFGTVEVKLVKAKVPVSESNREYLEILDVLSNIKKIPDSNPSEVMKVIAKKLKNIKKDGLYELINLASFYSPVTRALLGLLIENININLALELKKQLNPTTHYRIGLDSYWDNAEEWNIE
>NZ_CP051260.1|WP_064506049.1|2815433_2816408_-|nucleotidyl-transferase-AbiEii/AbiGii-toxin-family-protein
MNLHNNPDVFLELINRTAEYFKIPEVYVEKDYWVTHVLLQLSLSEFRNDFIFKGGTALSKVFGLIKRFSEDVDLAMFNNRGLSSNQIKKCMKVAEETIATGLTYIQKPDESKGSQFRKVYYKFPRIVSGEFGHASDVILLETNSFTSPEPFSFMPTESLIAEFIKKAQIEGGNEIITHYGLEKFEVNVLDIKRTVAEKILGLVRASSEADPKQALADKIRHIYDLCMIKRNKHYSQFFDSDSLWKMMDIVIQADRDQFREAGQWLDQPLHKSVLFSKSSEIWESIRGIFHGEFSELVYDSDLPSDDEVFSLLSSVASLLQKWSD
>NZ_CP051260.1|WP_004244059.1|2814331_2815231_+|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP
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>NZ_CP051260.1|WP_004244077.1|2838382_2839810_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase
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>NZ_CP051260.1|WP_060558294.1|2840011_2841883_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase
MSIEIKVPDIGADEVEVTEVMVKVGDRIEEEQSLITVEGDKASMEVPSPQAGIVKEIKIAVGDKVETGSLIMIFDTEEGAQAPAQEAAPAPSAAAPAASELKEVHVPDIGGDEVEVTEVMVNVGDTISEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVSTGSLIMVFEVAGSAPAPSASAPAPAASAPAASAIKDVNVPDIGGDEVEVTEVMVKVGDTIAEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVKTGSLIMTFEVAGAAPAAQAPAAPAASTSAAPAPSAPAKAPASAPAAKEEFVENEAYVHATPVIRRLAREFGVNLAKVKGTGRKGRILREDVQSYVKELIKRAESAPANAGGGLPGMLPWPKVDFSKFGEIEEVELGRIQKISGANLSRNWVVIPHVNLFDEADITEVEEFRKQQNKEAEKKKLDVKITPLVFVMKAAAKALADMPRFNSSISEDGQKLILKKYINIGIAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGILELSYELAEVSKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGTTGFAPIVNAPEVAIMGLSRSSMKPVWNGKEFVPRLMLPMSLSFDHRVIDGADGARFITLINQYMSDLRRLVM
>NZ_CP051260.1|WP_004244080.1|2841895_2844562_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type
MSDMLKNDVDPIETRDWLQAIDSVIREEGVERAQFLIDQVLKQARNGGLDIALGGSVHSDYINTIPVEDEPAYPGNLELERRIRSAIRWNAVMMVLRASKKDLELGGHMASYQSSATLYEVCFNHFFRAHNDNDGGDLVYFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLNNFRQEIGGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLSAIYQAKFLKYLDHRGLKDTTKQRVYAFLGDGEMDEPESKGAITIAVREKLDNLCFVVNCNLQRLDGPVTGNGKIVNELEGIFAGAGWNVIKVMWGDRWDALLRKDTSGKLIQLMNETLDGDYQTFKSRDGAYVREHFFNRYPETAALVKDMTDDEIWALNRGGHDPKKVFAAFQKAKETKDKPTVILAQTIKGYGMGETAEGKNIAHQVKKMNMDGVKHFRDRFNIPVSDEKVAELPYITFDKDSEEYKYLHARRQELEGYLPARRTRFDEKLEIPTLEDFSQLLEEQSKEISTTIAFVRALNVMLKNKSIKDRLVPIIADEARTFGMEGLFRQIGIYSPNGQQYTPQDREQVAYYKEDVKGQILQEGINELGAGASWLAAATSYSTNNLPMIPFYIYYSMFGFQRIGDLCWAAGDQQARGFLIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSLTIPNCISYDPAFAYEVAVIMQDGLERMYGDKQENVYYYITTLNENYHMPAMPAGAEEGIRKGIYKLESLEGAKGKVQLLGSGSILRHVREAAQILSTEYGIGSDVYSVTSFTELARDGQDCERWNMLHPSEEPRVPYIAQIMNDAPAVASTDYMKLFAEQVRTYVPADDYRVLGTDGFGRSDSRENLRHHFEVDTSYVIVAALGELAKRGEIDVKVVEEAIKKYNINPEKVNPRLA
>NZ_CP051260.1|WP_110706929.1|2844725_2845496_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR
MAYTKIRQPKLSDVIEQQLEHLILEGTLRPGEKLLPERELAKQFDVSRPSLREAIQKLEAKGFLLRRQGGGTFVQDNLWQSFSDPLAQLLSGHPESQFDLLETRHALEGIAAYYAALRGTDDDLERIKASHARIIDAHDKGDIAAESDAVLQYQLIVTEAAHNVVLLHLLRCMVPMLEQNIRQNFEFLYIRKEMLTAVSEHRTQIYQAIINREPEAAREASHRHLAFIEDVLLDMSREHTRRERSLRRLQQHPDLF
>NZ_CP051260.1|WP_060555638.1|2845822_2846365_-|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD
MEIKQGWLTGVKHVPSPNYDNRPEGEIPSLLIIHNISLPPGQFGGPYIDQLFTNTLAVDDHPFFNEIAHLRVSAHCLIRRDGEIVQYVPFTARAWHAGVSFYKGREKCNDFSIGIELEGTDECDFTLQQYQQLSTLTQQLIEHYPGIKENITGHSDVAPGRKTDPGPHFNWSYYRALLAK
>NZ_CP051260.1|WP_049203011.1|2846575_2847019_+|prepilin-peptidase-dependent-pilin
MNTLNYHSTENGFTLMELMIVIAIISILSSVALPAYHGYIQKAALTDVLQTLSPYRSAVELCHYEHQYNQCHADASFMPQQFRSRYLTDIHVANGVISAKGKAQLEGLTIVMTPAANSKETLPQWQINCTSTNTALQTLCHKVFKSH
>NZ_CP051260.1|WP_049203012.1|2847117_2848221_+|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component-TadA
MNNTIHTATEFIEQLLRHSLAQRVSDLHLEPQQNSLRIRARIDNHLVLFSPPDNQLANEILTRLKILANINIAEKRLPQDGQFNWSYQKNNYSIRVATLPTLYGEKIVLRLMNNLQQPQLAQLGFQTIHLTLLKKYLTQPQGMILVTGPTGSGKTLTLYSCLQYLNKDNRNINSIEDPIELPLHGINQTQITEKAGITFATILRALLRQDPDVIMIGEIRDQQTAEIAIKAAQTGHLVLSTLHTNSTQATLARLANLGIAKDLIDSCVKLIISQRLVRCLCSDCKYQSPEQKNFIINNQQIILPNWQATGCQFCYSGYKGRTAIYDCFELAKQSLPSPYALFNSGIELIKKGITSLDEVYQVVGDIE
>NZ_CP051260.1|WP_060555640.1|2849694_2850309_+|dephospho-CoA-kinase
MTYTVALTGGIGSGKTTIANGFASLGVPLVDADVIARLVVEPDSPGLKALQQHFGDTILLPDGKLNRAQLRHIIFQNQQEKAWVNQLLHPLIQQETQKQIQQIRAPYFIWVVPLLVENKLTHLADRILVVDVTEEEQITRTMQRDGVSRDHVLKILQAQAKREQRLAVADDIIENHDNSLNQDEQIKRLHQHYLELAQKSNTGQ
>NZ_CP051260.1|WP_004250354.1|2850311_2851064_+|cell-division-protein-ZapD
MSEETSTIIFEHPLNEKMRSWLRIENSLIQLNSFQSINSLSSALSFFRAVSEFIEVLDRGEIRAELLKELEKRQKKLQQWLSFPNVDKEIVSHIINELSESACALSKAPRIGQHLKQDKIISLVKQRLSIPGGCCSFDVPTLHLWLNLPQTVRTEKLTCWQEGLYPLQNALNALLTLIRQSDTFKPVLSHSGFYQDSTEEGELLRIKLLASQQIYPQVSGHKNRYAIRFLPLDSEHGTIPSELPFEISCC
>NZ_CP051260.1|WP_004244091.1|2851116_2851332_+|DNA-gyrase-inhibitor-YacG
MSEKLIVKCPTCRTEVIWDESSPYRPFCCKRCQLIDLGEWAAEEKRIPSQSESNDSDEWSEMPEQDPKPFN

Crispr_ID: NZ_CP051260_4

• CRISPR_ID: NZ_CP051260_4
• CRISPR_location: 4044906-4045045
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers
• Cas_protein_info: TnsE_C

Consensus repeat of NZ_CP051260_4

Consensus_repeat	Method
CCCAGTTCCCAACTATTTTGTCA	PILER-CR

spacers of NZ_CP051260_4

>4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR
TTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACA
>4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR
CTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP051260_4

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP051260_4

>merge|NZ_CP051260|4|4044906-4045045|PILER-CR
AGTTCCAAACTATTTTGTCATTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCCAGTTCCCATCTATTTTGTCACTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCTCCCAGTTCCCAACTATTTTGTCC

>NZ_CP051260|4|1|4044906-4045045|PILER-CR
AGTTCCAAACTATTTTGTCATTT	TTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCC
AGTTCCCATCTATTTTGTCACTC	TTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCTCCC
AGTTCCCAACTATTTTGTCC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP051260.1|WP_023843642.1|4048300_4049308_+|putative-2-aminoethylphosphonate-ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274494
NZ_CP051260.1|WP_001271300.1|4039076_4039454_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP051260.1|WP_004246571.1|4053069_4054203_+|M20-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|349881
NZ_CP051260.1|WP_000497519.1|4043789_4044116_+|tyrosine-type-recombinase/integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|131303
NZ_CP051260.1|WP_000777554.1|4042333_4042807_-|trimethoprim-resistant-dihydrofolate-reductase-DfrA1	unknown	unknown	gnl|CDD|238127
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HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP051260.1|WP_000251879.1|4037229_4038846_+|transposase	TnsE_C	TnsE	2.6e-52	171.4	0.0

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP051260.1|WP_023843642.1|4048300_4049308_+|putative-2-aminoethylphosphonate-ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|274494	TIGR03261, phnS2, putative 2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein. This ABC transporter extracellular solute-binding protein is found in a number of genomes in operon-like contexts strongly suggesting a substrate specificity for 2-aminoethylphosphonate (2-AEP). The characterized PhnSTUV system is absent in the genomes in which this system is found. These genomes encode systems for the catabolism of 2-AEP, making the need for a 2-AEP-specific transporter likely. [Transport and binding proteins, Amino acids, peptides and amines].	0
NZ_CP051260.1|WP_004246571.1|4053069_4054203_+|M20-family-metallopeptidase	gnl|CDD|349881	cd03885, M20_CPDG2, M20 Peptidase Glutamate carboxypeptidase, a periplasmic enzyme. Peptidase M20 family, Glutamate carboxypeptidase (carboxypeptidase G; carboxypeptidase G1; carboxypeptidase G2; CPDG2; CPG2; Folate hydrolase G2; Pteroylmonoglutamic acid hydrolase G2; Glucarpidase; E.C. 3.4.17.11) subfamily. CPDG2 is a periplasmic enzyme that is synthesized with a signal peptide. It is a dimeric zinc-dependent exopeptidase, with two domains, a catalytic domain, which provides the ligands for the two zinc ions in the active site, and a dimerization domain. CPDG2 cleaves the C-terminal glutamate moiety from a wide range of N-acyl groups, including peptidyl, aminoacyl, benzoyl, benzyloxycarbonyl, folyl, and pteroyl groups to release benzoic acid, phenol, and aniline mustards. It is used clinically to treat methotrexate toxicity by hydrolyzing it to inactive and non-toxic metabolites. It is also proposed for use in antibody-directed enzyme prodrug therapy; for example, glutamate can be cleaved from glutamated benzoyl nitrogen mustards, producing nitrogen mustards with effective cytotoxicity against tumor cells.	4.57797e-158
NZ_CP051260.1|WP_000497519.1|4043789_4044116_+|tyrosine-type-recombinase/integrase	gnl|CDD|131303	TIGR02249, Integrase/recombinase_E2_protein., integron integrase. Members of this family are integrases associated with integrons (and super-integrons), which are systems for incorporating and expressing cassettes of laterally transferred DNA. Incorporation occurs at an attI site. A super-integron, as in Vibrio sp., may include over 100 cassettes. This family belongs to the phage integrase family (pfam00589) that also includes recombinases XerC (TIGR02224) and XerD (TIGR02225), which are bacterial housekeeping proteins. Within this family of integron integrases, some are designated by class, e.g. IntI4, a class 4 integron integrase from Vibrio cholerae N16961. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair, Mobile and extrachromosomal element functions, Other].	2.82591e-45
NZ_CP051260.1|WP_000777554.1|4042333_4042807_-|trimethoprim-resistant-dihydrofolate-reductase-DfrA1	gnl|CDD|238127	cd00209, DHFR, Dihydrofolate reductase (DHFR). Reduces 7,8-dihydrofolate to 5,6,7,8-tetrahydrofolate with NADPH as a cofactor. This is an essential step in the biosynthesis of deoxythymidine phosphate since 5,6,7,8-tetrahydrofolate is required to regenerate 5,10-methylenetetrahydrofolate which is then utilized by thymidylate synthase. Inhibition of DHFR interrupts thymidilate synthesis and DNA replication, inhibitors of DHFR (such as Methotrexate) are used in cancer chemotherapy. 5,6,7,8-tetrahydrofolate also is involved in glycine, serine, and threonine metabolism and aminoacyl-tRNA biosynthesis.	3.39419e-57
NZ_CP051260.1|WP_017628743.1|4049372_4050500_+|TIGR03364-family-FAD-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|132407	TIGR03364, putative_secreted_oxidoreductase, FAD dependent oxidoreductase TIGR03364. This clade of FAD dependent oxidoreductases (members of the pfam01266 family) is syntenically associated with a family of proposed phosphonatase-like enzymes (TIGR03351) and is also found (less frequently) in association with phosphonate transporter components. A likely role for this enzyme involves the oxidative deamination of an aminophosphonate differring slightly from 2-aminoethylphosphonate, possibly 1-hydroxy-2-aminoethylphosphonate (see the comments for TIGR03351). Many members of the larger FAD dependent oxidoreductase family act as amino acid oxidative deaminases.	5.09954e-149
NZ_CP051260.1|WP_017628742.1|4051006_4051294_-|YjeO-family-protein	gnl|CDD|337858	pfam10840, DUF2645, Protein of unknown function (DUF2645). This family of proteins appear to be restricted to Enterobacteriaceae. Some members in the family are annotated as YjeO however no function for this protein is currently known.	2.113e-18
NZ_CP051260.1|WP_012368613.1|4051382_4052195_-|phosphonoacetaldehyde-hydrolase	gnl|CDD|184075	PRK13478, PRK13478, phosphonoacetaldehyde hydrolase; Provisional.	1.04211e-159
NZ_CP051260.1|WP_001353740.1|4044303_4044543_-|DUF1819-family-protein	gnl|CDD|378066	pfam08849, DUF1819, Putative inner membrane protein (DUF1819). These proteins are functionally uncharacterized. Several are annotated as putative inner membrane proteins.	2.15941e-15
NZ_CP051260.1|WP_004249814.1|4045471_4046548_+|putative-2-aminoethylphosphonate-ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|274496	TIGR03265, PhnT2, putative 2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein. This ABC transporter ATP-binding protein is found in a number of genomes in operon-like contexts strongly suggesting a substrate specificity for 2-aminoethylphosphonate (2-AEP). The characterized PhnSTUV system is absent in the genomes in which this system is found. These genomes encode systems for the catabolism of 2-AEP, making the need for a 2-AEP-specific transporter likely. [Transport and binding proteins, Amino acids, peptides and amines].	0
NZ_CP051260.1|WP_004249808.1|4050574_4050979_-|DUF1240-domain-containing-protein	gnl|CDD|336520	pfam06836, DUF1240, Protein of unknown function (DUF1240). This family consists of a number of hypothetical putative membrane proteins which seem to be specific to Yersinia pestis. The function of this family is unknown.	6.90543e-32
NZ_CP051260.1|WP_017628744.1|4046560_4048252_+|putative-2-aminoethylphosphonate-ABC-transporter-permease-subunit	gnl|CDD|274495	TIGR03262, PhnU2, putative 2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein. [Transport and binding proteins, Amino acids, peptides and amines].	0
NZ_CP051260.1|WP_000071896.1|4043138_4043675_+|class-2-integron-integrase-IntI2	gnl|CDD|131303	TIGR02249, Integrase/recombinase_E2_protein., integron integrase. Members of this family are integrases associated with integrons (and super-integrons), which are systems for incorporating and expressing cassettes of laterally transferred DNA. Incorporation occurs at an attI site. A super-integron, as in Vibrio sp., may include over 100 cassettes. This family belongs to the phage integrase family (pfam00589) that also includes recombinases XerC (TIGR02224) and XerD (TIGR02225), which are bacterial housekeeping proteins. Within this family of integron integrases, some are designated by class, e.g. IntI4, a class 4 integron integrase from Vibrio cholerae N16961. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair, Mobile and extrachromosomal element functions, Other].	3.54716e-72
NZ_CP051260.1|WP_001206315.1|4040868_4041657_-|ANT(3'')-Ia-family-aminoglycoside-nucleotidyltransferase-AadA1	gnl|CDD|184296	PRK13746, PRK13746, aminoglycoside resistance protein; Provisional.	1.61477e-174
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NZ_CP051260.1|WP_004246570.1|4054212_4055619_+|YfcC-family-protein	gnl|CDD|224207	COG1288, COG1288, Predicted membrane protein [Function unknown].	4.57307e-113
NZ_CP051260.1|WP_000704156.1|4041714_4042239_-|streptothricin-N-acetyltransferase-Sat2	gnl|CDD|366181	pfam00583, Acetyltransf_1, Acetyltransferase (GNAT) family. This family contains proteins with N-acetyltransferase functions such as Elp3-related proteins.	4.87486e-19
NZ_CP051260.1|WP_000251879.1|4037229_4038846_+|transposase	gnl|CDD|376049	pfam18623, TnsE_C, TnsE C-terminal domain. The bacterial transposon Tn7 facilitates horizontal transfer by directing transposition into actively replicating DNA with the element-encoded protein TnsE. Structural analysis of the C-terminal domain of TnsE identified a central V-shaped loop that toggles between two distinct conformations. It is suggested that a conformational change within the C-terminal domain of TnsE underlies target site selection by regulating stable engagement of the target DNA while providing a signal for activating transposition.	6.8797e-67

Protein sequences

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MFVFPSSTLCNHPYNGKLCRHHLHDSVARKALKAAVQKAGIVSKRVTCHTFRHSFATHLLQAGRDIRTVQELLGHNDVKTTQIYTHVLGQHFAGTTSPADGLMLLINQ
>NZ_CP051260.1|WP_000071896.1|4043138_4043675_+|class-2-integron-integrase-IntI2
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>NZ_CP051260.1|WP_000704156.1|4041714_4042239_-|streptothricin-N-acetyltransferase-Sat2
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MSYEPPRDGYTNGYIVDVMYDNRPSKYPAVFRTYVRIPDYVELDNAEELADAIIREVELKEAWLTRVLGNSADPDASVGKWDRRLAQCGGIDEMSSGVQATYFSPNGQLVGLVAYIDAEWMDE
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NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	NZ_CP047114	Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence	46403-46443	0	1.0
NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	NZ_CP034046	Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence	150899-150939	0	1.0
NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	NZ_CP045128	Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence	89327-89367	0	1.0
NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	NZ_CP027700	Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence	7407-7447	0	1.0
NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	NZ_LT985250	Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence	152347-152387	0	1.0
NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	NZ_MK360096	Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence	17906-17946	0	1.0
NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	NZ_CP053899	Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence	116635-116675	0	1.0
NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	NZ_MK264770	Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence	42556-42596	0	1.0
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052804	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S973 plasmid pN17S0973, complete sequence	113091-113123	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP038508	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FARPER-219 plasmid p-F219, complete sequence	228634-228666	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052788	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0611 plasmid pN19S0611, complete sequence	321488-321520	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052786	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0641 plasmid pN19S0641, complete sequence	10079-10111	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052838	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S097 plasmid pN16S097, complete sequence	13470-13502	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP051676	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1234 plasmid pN16S1234, complete sequence	201786-201818	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052779	Salmonella enterica strain 19TN07GT06K-S plasmid pN19S1233, complete sequence	212524-212556	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052832	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1040 plasmid pN17S1040, complete sequence	277011-277043	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	MN310378	Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence	73380-73412	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052806	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S816 plasmid pN17S0816, complete sequence	282696-282728	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052818	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1509 plasmid pN17S1509, complete sequence	1788-1820	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	NZ_MH476540	Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence	87104-87136	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052795	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0125 plasmid pN19S0125, complete sequence	166287-166319	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	NZ_CP047882	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain 119944 plasmid pESI, complete sequence	264306-264338	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052802	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S976 plasmid pN17S0976, complete sequence	197576-197608	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052840	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S024 plasmid pN16S024, complete sequence	9544-9576	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052836	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S103 plasmid pN16S103, complete sequence	222743-222775	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052828	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1126 plasmid pN17S1126, complete sequence	8856-8888	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052826	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1245 plasmid pN17S0637, complete sequence	292607-292639	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	NZ_CP016409	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502916 plasmid pFSIS1502916, complete sequence	299316-299348	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	NZ_CP016407	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502169 plasmid pFSIS1502169, complete sequence	299920-299952	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	NZ_CP016413	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM44454 plasmid pCVM44454, complete sequence	295999-296031	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	NZ_CP016411	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain N55391 plasmid pN55391, complete sequence	293612-293644	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	CP052814	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S349 plasmid pN17S0349, complete sequence	281790-281822	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR	4044929-4044961	33	NZ_MG764552	Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence	61314-61346	2	0.939
NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	NZ_CP053897	Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence	75936-75976	2	0.951
NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	MN310378	Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence	73436-73476	2	0.951
NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	NZ_MH476540	Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence	87160-87200	2	0.951
NZ_CP051260_4	4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR	4044985-4045025	41	NZ_MG764552	Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence	61250-61290	2	0.951

1. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_KX774387 (Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP053895 (Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_KU963389 (Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP047288 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP044485 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP025853 (Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_KT754165 (Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP053372 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP024247 (Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP053043 (Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to JX469830 (Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP013819 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP025925 (Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP025875 (Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP013795 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP023380 (Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP011314 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NC_008357 (Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP027138 (Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP022673 (Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP045128 (Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_LT985250 (Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_MK360096 (Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP053897 (Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_MF150120 (Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_KX756453 (Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NC_015472 (Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP013800 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to MG516911 (Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP003997 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP054380 (Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NC_002525 (Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP048015 (Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP034054 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP047114 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP034046 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP027700 (Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP053899 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_MK264770 (Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_KX774387 (Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_MF150120 (Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP053895 (Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_KX756453 (Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_KU963389 (Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP047288 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NC_015472 (Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP044485 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP025853 (Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_KT754165 (Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP013800 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP053372 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP024247 (Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP053043 (Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to MG516911 (Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to JX469830 (Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP013819 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP003997 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP025925 (Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP025875 (Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP013795 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP054380 (Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NC_002525 (Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP023380 (Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP011314 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NC_008357 (Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP027138 (Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP022673 (Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP048015 (Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP034054 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP047114 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP034046 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP045128 (Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP027700 (Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_LT985250 (Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_MK360096 (Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP053899 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_MK264770 (Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052804 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S973 plasmid pN17S0973, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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79. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP038508 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FARPER-219 plasmid p-F219, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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80. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052788 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0611 plasmid pN19S0611, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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81. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052786 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0641 plasmid pN19S0641, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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82. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052838 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S097 plasmid pN16S097, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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83. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP051676 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1234 plasmid pN16S1234, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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84. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052779 (Salmonella enterica strain 19TN07GT06K-S plasmid pN19S1233, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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85. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052832 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1040 plasmid pN17S1040, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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86. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to MN310378 (Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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87. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052806 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S816 plasmid pN17S0816, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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88. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052818 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1509 plasmid pN17S1509, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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89. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_MH476540 (Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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90. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052795 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0125 plasmid pN19S0125, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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91. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP047882 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain 119944 plasmid pESI, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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92. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052802 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S976 plasmid pN17S0976, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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93. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052840 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S024 plasmid pN16S024, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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94. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052836 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S103 plasmid pN16S103, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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95. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052828 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1126 plasmid pN17S1126, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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96. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052826 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1245 plasmid pN17S0637, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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97. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP016409 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502916 plasmid pFSIS1502916, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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98. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP016407 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502169 plasmid pFSIS1502169, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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99. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP016413 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM44454 plasmid pCVM44454, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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100. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP016411 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain N55391 plasmid pN55391, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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101. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to CP052814 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S349 plasmid pN17S0349, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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102. spacer 4.1|4044929|33|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_MG764552 (Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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103. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_CP053897 (Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951

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104. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to MN310378 (Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951

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105. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_MH476540 (Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951

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106. spacer 4.2|4044985|41|NZ_CP051260|PILER-CR matches to NZ_MG764552 (Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	860429 : 916203	46	Morganella_phage(28.57%)	protease,holin,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	1062045 : 1070579	9	Mycobacterium_phage(28.57%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	1110238 : 1156478	64	Morganella_phage(52.5%)	integrase,tail,capsid,lysis,terminase	attL 1110152:1110170|attR 1163390:1163408
DBSCAN-SWA_4	1331153 : 1410106	58	Bacillus_phage(23.53%)	plate,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	1489239 : 1539005	62	Enterobacteria_phage(25.53%)	holin,integrase,protease,tail,lysis,terminase,portal	attL 1483220:1483236|attR 1494758:1494774
DBSCAN-SWA_6	1620986 : 1689787	80	Morganella_phage(25.0%)	protease,integrase,capsid,tRNA,tail,lysis,head,transposase,terminase,portal	attL 1618637:1618651|attR 1637180:1637194
DBSCAN-SWA_7	1924662 : 1934654	8	Escherichia_phage(66.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_8	2458382 : 2477251	22	Burkholderia_phage(26.67%)	lysis,holin	NA
DBSCAN-SWA_9	2975502 : 3023809	76	Proteus_phage(25.0%)	holin,integrase,tail,capsid,terminase	attL 2975273:2975328|attR 3022659:3022714
DBSCAN-SWA_10	3282581 : 3291461	9	Caulobacter_phage(50.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_11	3353620 : 3368076	18	Escherichia_phage(50.0%)	integrase,transposase	attL 3354969:3355028|attR 3369463:3369533
DBSCAN-SWA_12	3372608 : 3438457	54	Escherichia_phage(20.0%)	integrase,transposase	attL 3372557:3372616|attR 3378961:3379022
DBSCAN-SWA_13	3913485 : 3932997	21	Escherichia_phage(57.14%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_14	3936197 : 3991789	52	Escherichia_phage(25.0%)	integrase,transposase,tRNA	attL 3940150:3940163|attR 3970855:3970868
DBSCAN-SWA_15	4017387 : 4068093	48	Virus_Rctr41k(25.0%)	integrase,protease,transposase,tRNA	attL 4004284:4004300|attR 4055494:4055510

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP051260|860429:916203|DBSCAN-SWA
AATGACCCAACGAAGAAAACCTAGAAAATATACTGATGAGTTCAGAGAAGAAGCTGTAAAGCTAGTCACTGAACAAGGTTACAGTGTTACTGAAGCAGCCAAATCATTAGGCATAACAACTAAGCTGCTTTACAACTGGAAAGACAAACTAGCCAAGCAAACTTCAGGCGAAGCATTAAGCAAAGATGAGAGAGCTGAACTGGTTAAGCTCAGAAAAGAGAATAAACGCTTACAGATGGAGCGTGAGATCTTAAAAAAGGCGAGTGCCTTCTTTGCGAAAGAAATGAAATAAAGTTCGAATATATTAAAGAGCAGCAATGGCGCTTTCCAATTAGCGTTTTGTGCGAGGTTCTAGAAGTGAGTCGGTCAGCCTATTACGCATGGCTGAGGCGACCAGCCAAGATTATTAGTGTTGAAGAGTTAATGCTTTATCGTCGCATGAAGAGGTTATTTGATGATAGCCGCAGTAGTGCTGGTGCCAGAACCTTAATGAAGTTGCTACGCAAAGAAGGCTTTAAAATTGGTATTTGTCGGGTTAAGAGCTTGATGAAAAAGCTCGGTTTAGTCGTTAAACAGCGAGTGGCTTATAAAGTGACGACTATGCGCAAACATAGCCATGCGGTTGCTGATAACTTATTGAAGCGCCAATTCAATCCAGCCAGAGCAAATCAGGCGTGGGCGGGTGATATCACCTATCTAAGAACGCATCAAGGCTGGATGTACCTAGCTGTTGTGATGGATTTGCATTCTCGCCGTATTATTGGCTGGGCGTTGAGTAAACGCATGACGGTTGATTTAACCATGAGAGCGATGCAAATGGCTATCAACCTGCGTCAACCCAAAGCAGGCTTGATCTTCCATAGCGACAGAGGCTCACAATACACCAGTAAGCGTTTTCAATCATTGCTATGGAGCAATCGAATTACGCCATCAATGAGTGGTTGTGGAGCATGTTTAGATAATGCTGTGGTTGAAAGGTTTTTCGGCAGCTTGAAAAATGAATGGCTATTAAATGTTTACCATTTAACCAGAGAAAGCATGAAAACTGATGTAGAGAAATACATCAAATACTACAACTCAGTTCGGCTTCATACTTCATTAAATGATATGTCGCCAATTGAGTTTGAAAGTGTAAGGAAAAAGTGTGCGGCCTAGCTTGACCAGATCATACCTCTTATTTCTACAGCACGATCCCATGGTTATATTTTTGACAAACAACATCGGGTTTTTCAGGAAGACATTGCCTATGGACTAGCGCTTCTTGTTGCTCTTGGAGAACGTCTTCGAGTGCCAACACCCTATATAAGAGAAATATATGATTGGTGTTGTGGTTATATGGGAGGAATTTTGCCTCACCCTCAGCTCCCAATGGATTGGCCAATAATAAGGGTGAAATAGTATGCGTGTTACCGGCAGTGTCATTTTTATTGTCCAGTTTTTATTTATCGTACAGCTACTCTCAATGGGAGCCATGGAAATGAGTGGCCCTTTTTGGCCGCTTCATCTCGAAAGTATGGCGTCGACAGAGCTACTGAGTATCGTGGGAACCGGCGTGTATATCGCACCTATGTTGGGCGTTATGCTAACCAGTACCTTTTGGGGACGAATAGGCGATAAAACTGGCAATAAAGTGATGATGATCCGTGCACTGATGGGGCTGGCATTAACGCAATTGGGGCTCGCTTTTGCCAATGATGTCTGGGTAATACTGCTACTACGTTTTTTACAGGGAACTTGTGCGGGGTATATTGCACCTGCTCAAGCTTATGGTATTGCCATGATCCCCGTAGCACAACGTACTCGGCTTTTGGCATGGTTACAAGTATCTACCAATGCAGGATCGTTAGCTGGAGCCATTGCTGGTGGGGCCATCCTCGATTTACTGAGTTTCTTTTGGATAAATTTCGGGGCATTTATCATTTGTACGTTATGTGCACTACTGGTTTTTTTCATATTACCGAATGATTTACCGCGCCACGCTTCATCCAATTGCGTCACTTCCTCAACAAATAAAGCAAAAGCGATATCATCAATTAACCACAGCGTCATTGTTGGCTTACTTACCGTACTGGGTTTGTTATTAATGAGCCGCATGATCACACAAACCCCTTTTTCTCTTTATGTCAGTAGCGTATTTAATGCCCCTAACTGGTTAACAGGGGTCGCTTACGGATTGCAGGCTACAGGTGTGATTGTCTCAGCCTCCCTCTGGGCAAGATGGTTTGAAGCACACAACATATCTCATGCACTCTATCGAATGGTGGGGATCATTGCGGGATGTTTTATTGTGACCTTACTGCTAGCAGCAGTAAGAGAAATAAGCTGGTTTATCGGACTTTATTTTTTGTGGGGCATTCTTCTTGGGGCAACAACGCCAGTATTAACCGCATTAATATCTCGCTCAACCGCTGAAAGTAAACAGGGTTATATTTTGGGACTGGTGCAAAGTATTAGCCAGTTTGCCTCTATGGTTGGCATTGCACTGGGGGGCGGAATACTTGTTTGGCCTGGGTTGACCACGTTGTTTTTGTGTGTGGCGGTGATGTATTGCATTACTTTAATTATTACGCTGAAAATGAGTTACTCTTCAAAAAACACTAACCAAAAATAGGTTATTAATCATGATATTACGATTTATATTTTCTATTGTATTGTTGTATTCATCAATGGCTTACGCTTACTCACAGCAAGTTGTAACACCTGTTACTGATCTACTTGGCAGAACCGTGAATGTCAAATTACCGGTACAGCGCGTCATTTTGGGGGAAGGACGACAGCTTTATTTAGTGGCTATGTTTGATAAAGAAAATCCAGCACAAAGGATAGTCGCTTGGCGAAAAGATTTAATACAGACCGATCCTGCCACATGGCAGCAGTACCGACAACAATTTCCACAGTTGGCAAAAATCCCTACCTTTGGTGGCAGCGAACAAGGAACGTTTGATATAGAGCAGGCGATTAATCTGCAACCTGATGTCATCATCATGAATATGGACGCACGCAATACTATTGTTGATGCTGGACACGAAGCTGCACTAGCCCGAGCGGGTATTCCCATTGTTTATGTCGACTTTCGCTATGATCCTATTGCACACATTCCTCCAACAGTGACGTTATTTGGTAAATTATTTGGCCAACCAGATCGCGCAGAAGCTTATTTAACATTCCGTGATAAAGAGTTACAACGAGTGACATCTCGAGTTGAACAATTACAGGGGACATTGCCAAAAGTATTTTTAGAGCGTCTTGGGGGTTATTCAGAAGAGTGCTGTATGACCTTTGGTAAAGGGAGTTTTGGCCGTTTTGTTAAAATAGCGGGGGGGGATAATATTGCCGACAATCTTGCTCCGGGAACCTTTTTTACGCTAAATCCAGAAAAAGTGGTTGTTGCAAATCCCGATATTGTGATTATTACCAGCGGCAATTTTCAGGCATTTGTGCCGGGTGGAAAGTGGATCCCACTTGGGCCGGGGATTAATATTCAACAATCAAAACACCGACTCGCATGGTTTACGACTCGCCCTGCTTATGTTGATAGTAACGCTCGCCGTCGTGGCGCATTTTTTGCTATTTGGCATCAGTTTTATAATAGTCCCTATGATGTTATTGCTATCCAGCAGCTAGCTAAGTGGATACATCCCCAATTATTTGCTGATCTTGATCCTGATGACACATTCCGTCGTTTACATCAAGAATTTCTACCCATCTCATATCAGCCGGGATATATGATTGATTTGGAAAAAGAGGGGAGGTAAATATGGAGTATGATGTCGTGTTATATCCCATTGCCTTGCTCCGTCCTTCAGAAGAAGTCAACATGGCTCATGTTGAAGCTTTAACTAAGGAAATAGTCCGTTGCCAAAGATGGACAACACCTATACCCATTGAAAAAGAGACCGGAATTATTATGGACGGTAATCATAGGTATCAAGTCGCTCATCATCTTGCTCTCACTTATATTCCTTGTGTGTTGCTTGATTACACTGATACACGCATAACTGTGTATGATTGGCAGAATGGACGGGCGTTTAGCCCATTAAGAATAAGGGAGCAGATATTAAAGCAAGGTAATATTTTCCCTTATAAAACTACTCGACATCTATTTTCTCCAAGCCTTCCGGCCGTTAATTTTCCACTTGAACAGTTAGTTGAAAAAATAGCCAGTAATCATCTGAATGTTTTCAAGTTAGGTATTGGTAGGTGACCATTAACAGCGGGAAAATTAAATAGCTTAGTATTTATTTGATTTGATGGATAAAACAGCAACGTAATTTTAGCTTGATTAGTCGTATCAAGCTAAGGTTTAATAAGATACTTCTTAATTGCGCAAATAAAAGTCATTTTTCATTTTTGTTGCGCAACAATGTGGTGGTGTAATGTTATTTCCCGCGTTTATCGTAATAAATGCTGTTTAAATCAAAGAATTATTGATTTTCACTGATTACGATAGCCACCTTTGTGGATTTTTTATATTGCGGTTTTTTGCCCGCATTGAGAGAATCAGCTATCTAGATGCTTTTTATCCGACTTGGAGTAGAAAATGACCACTCGTAAAACCCTTGCAAATGCGATCCGTTTTTTAAGCATGGATGCAGTGCAAAAAGCCAAATCAGGGCACCCTGGTGCACCTATGGGCATGGCTGATATTGCAGAAGTATTATGGCGTGATTTTTTAAATCATAATCCAACTAATCCTCACTGGGCAGATCGTGACCGTTTTGTTTTATCTAACGGCCATGCTTCAATGCTGATTTATAGCTTATTACATCTGTCTGGTTATCAAGTTTCTTTAGATGATCTAAAAAATTTCCGTCAGCTGCATTCTAAAACACCGGGTCACCCAGAATATGGTTATACCCCAGGTGTTGAAACTACCACGGGTCCTTTAGGTCAAGGGATTGCTAACGCAGTAGGTTTTGCGATCGCAGAACGCACATTAGCGGCTCAATTTAACCGTCCTGGTCACGATATCGTAGATCACTACACCTACGCCTTTATGG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MNIAMTERYKWLLFFLFILLTYFIPLETRLLWQPDEIRYAEISREMLVSGNWSVPYLLDIRYFEKPVLGYWINCIAQWLFGESHFAVRIVVVTSTLLTGWLIYKAAMVVWRNSALAFNAMTVFLSSFLVLAIGTYNILDPIVTLFVTAAMYSFLVALSTPNKKGKIIAYMGIGFFCALGFLTKGFIAVVLPALVFLVMAISQARFKEVVCYSSIALLALAITAGPWVITVALQAPDYWNYFFWVEHVQRFIAKESARSQPTWFYIPIVILGVLPWLGFLFGALKSAFSLKKGTLYFLLWFALFFAFFSASKGKLLTYMLPCFVPLSILIAHYIEELKDRPDEKISKVNASINIAFGLMGISAVIYSLYSAKFALYDTNETLKIVLAISGFLFWSVIGAGALFRQTQFLTMFCSIGLSLVIGYAIPEKIESRSTPENIIQRYYEPLSNKSYLLTDEVGIGTSLAWGLKRTDIRLTETKGELAYGLNYPDVKNKYYSLEQLLALIEANQYKGVAIVLVRPDRKQILTKLTTLKEKPIVEKEGDLTLVFFN
>NZ_CP051260|860429:916203|911967_913932_-|WP_168725578.1|protease|DBSCAN-SWA
MTIVKNVKETTNFYLPKGIITTGTMIGWPKKSPNEITTITYTFPDHNTYREIIKNKNPLTENMRKKTLKDIYEYYRLVNIREQKKQELNTIEDKDSEASKKRIKELEEGIKKIANDIYTILDNIPIYIYSTQETIFPHQQEVIEEILKHASDILPIFFKKISPYSNADLKFGYYNQFVNISGTKFISGYRKGSASHPNEEGTPIKEIKPDEEHDKPGTIFIDFSSREYYKTIKQDNIDEYIENEADIYDIYYINNDKTITIARGNNELRKEYQQNKHKIGSFVYHTFIHELGHSLGLFHIWEYILNEKHKVLDSIKYSVMSYKCPDIKDADFGGLYPMTFMLVDILLLQYLYGENMTTRLENNTYGFHSNTGRAAYSLNNIEDKLVSCIWDSGGIDTLDFSLYTVNQVINLNEGCFSDIGGLRSNISIAYKTIIENAIGSKGDDTLIGNPFDNNLIGGDGNDLFYGGDGNDLFYGGSGNDVIYGEMGNDVLYGDDGDDMLIDYYGANMLNGGKGNDRICVASMDRGLPGRNIIQGGEGDDEIYLGTGTHNVTGGQGNDTFNFFCYEGIESNSSIWDFEKNKDKITLLTRDYRKIDISKMKKVDKLSGDKNEFSLNYNKPANKTIIDVSISSNDDKSIVHIEIVGIFNHDELFAV
>NZ_CP051260|860429:916203|904353_905679_-|WP_004247333.1|DBSCAN-SWA
MTIEKNVIPLSEKISDDPKKFLVIGWTVVLLGLAIFIFWAAFAPLDKGVPAIGNVVISGNKKSVQSSVEGIITHIFVKNGDPVSAGQTLIQLSPIQSQALVKSLSEQYDNLLITQQRLYAELNQQTSFKLNNSDKYYSSTENREKLLLQQNRLLNEKSAELISEINGYKAAIDGITGRLTHLKRSIQNKKSQISNLQNQLNDLQILANEGYIPRHRYQEMVRELAENNNQLNETFGQISALEKQKLEYEQRILQRNANFHQLARTELNKIQLQISETEKQLIIETDKLAKMAIIAPISGTVMDLSVFTQGGFVKTGQTLMDIVPEDHQLVIEARLAPHLIDKVTPGLPVDLIFSAFNQNTTPKIPGEVTIISADRLIDERTTEPYYQVLINIKDYTLLADNKNKLKAGMPVDVFIKTGDRSLLNYLFKPVLDRLHTSLTEE
>NZ_CP051260|860429:916203|885342_885897_+|WP_004244937.1|DBSCAN-SWA
MKQQINKNSLVSILVLLSFFITTNVTAVTPVLSSTGLSQNSPITPIYPIPINIKGYVIAHPPCMINEGKTVEVNFGDVLSTRVDGLNYKRLVDYHPSCEQMPINTLKLSVEGNGTFFDANALMTNITGLGIRILYQNKPLKLGQAINFTYPDFPVLEAVPVRDFSTLLVGGDFSTTATLRMEYQ
>NZ_CP051260|860429:916203|861827_863039_+|WP_049199436.1|DBSCAN-SWA
MRVTGSVIFIVQFLFIVQLLSMGAMEMSGPFWPLHLESMASTELLSIVGTGVYIAPMLGVMLTSTFWGRIGDKTGNKVMMIRALMGLALTQLGLAFANDVWVILLLRFLQGTCAGYIAPAQAYGIAMIPVAQRTRLLAWLQVSTNAGSLAGAIAGGAILDLLSFFWINFGAFIICTLCALLVFFILPNDLPRHASSNCVTSSTNKAKAISSINHSVIVGLLTVLGLLLMSRMITQTPFSLYVSSVFNAPNWLTGVAYGLQATGVIVSASLWARWFEAHNISHALYRMVGIIAGCFIVTLLLAAVREISWFIGLYFLWGILLGATTPVLTALISRSTAESKQGYILGLVQSISQFASMVGIALGGGILVWPGLTTLFLCVAVMYCITLIITLKMSYSSKNTNQK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_102140835.1|860429_861582_+|transposase	IS3 family transposase	Q716C2	Shigella_phage	7.8e-47	38.6
WP_049199436.1|861827_863039_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_049210456.1|863049_864183_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706741.1|864185_864632_+	ParB N-terminal domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244955.1|864968_866963_+	transketolase	NA	NA	NA	NA
WP_004244954.1|867221_868241_+	erythrose-4-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_004247314.1|868343_869507_+	phosphoglycerate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_004244952.1|869571_870651_+	class II fructose-bisphosphate aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_004244951.1|870741_870954_-	TM2 domain-containing protein	A0A060AN66	Enterococcus_phage	1.0e-05	62.2
WP_110706740.1|871216_872695_-	dipeptide/tripeptide permease DtpB	NA	NA	NA	NA
WP_004244949.1|873318_873837_-	4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component	NA	NA	NA	NA
WP_004252455.1|873944_874136_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244947.1|874412_874850_+	homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR	NA	NA	NA	NA
WP_004247316.1|874920_876924_-|holin	choline BCCT transporter BetT	A0A2I7QNT1	Vibrio_phage	8.0e-23	26.0
WP_012367525.1|877292_877958_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244944.1|878207_878882_+	DUF421 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706739.1|878964_879882_-	ribonuclease Z	NA	NA	NA	NA
WP_004244940.1|881129_881657_+	type 1 fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706738.1|881896_884524_+	outer membrane usher protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244938.1|884572_885331_+	fimbria/pilus periplasmic chaperone	NA	NA	NA	NA
WP_004244937.1|885342_885897_+	fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244936.1|885910_886429_+	fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247321.1|886439_886976_+	type 1 fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247322.1|886994_887843_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244929.1|887863_888184_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A1W6JNW5	Morganella_phage	1.1e-06	41.8
WP_004247323.1|888748_889315_-	phase variation DNA invertase MrpI	A0A2L1IV36	Escherichia_phage	2.0e-51	52.4
WP_004247325.1|889993_890521_+	MR/P fimbria major subunit MrpA	NA	NA	NA	NA
WP_023843516.1|890618_891167_+	MR/P fimbria assembly terminator MrpB	NA	NA	NA	NA
WP_004247328.1|891189_893805_+	MR/P fimbria usher protein MrpC	NA	NA	NA	NA
WP_110706737.1|893860_894619_+	MR/P fimbria assembly chaperone MrpD	NA	NA	NA	NA
WP_004244923.1|894632_895178_+	fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244922.1|895190_895676_+	fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244920.1|895686_896235_+	type 1 fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244918.1|896256_897084_+	MR/P fimbria adhesin subunit MrpH	NA	NA	NA	NA
WP_004244917.1|897105_897429_+	transcriptional regulator MrpJ	A0A1W6JNW5	Morganella_phage	1.6e-05	55.3
WP_004244916.1|898052_899627_+	AbgT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_004244915.1|899666_900044_-	DUF1992 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244914.1|900175_900514_+	carboxymuconolactone decarboxylase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247331.1|900866_902513_+	lipid IV(A) 4-amino-4-deoxy-L-arabinosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_110706736.1|903001_904354_-	TolC family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247333.1|904353_905679_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_110706735.1|905695_907435_-	type I secretion system permease/ATPase	W8CYL7	Bacillus_phage	1.4e-28	29.0
WP_004247335.1|907597_909073_-|protease	serralysin family metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_107337183.1|909675_911739_-|protease	matrixin family metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_168725578.1|911967_913932_-|protease	metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_107337182.1|914238_916203_-|protease	metalloprotease	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP051260|1062045:1070579|DBSCAN-SWA
CTTACTCATTTGGTGTCTCCTTATCCAGTGCTTGTAACAACATTCCTTTCGAAATTAAACCGATATAACGGTTTTTTTCATCAATAACAGGGATCGCACAGGGAGATTGCGCAACAGTAGAAATCAGTTCATTTAATGGTGTATCACCATTAATCGCACAAGGTTCAGTTAAAATAGCGGATCCAATAGGTTGCTTCGCTTTTAATGCTTCTTCAAGAGAAGTGACAGAAACAATACCTGCAAATTTCCGTCCTCGCTCAATTAAATAACCAAAGTTTCTATCTTCATCTTCCAGTACTTTTAATGCTGAACGGGGACCAAAACCTGGCGCAATATGCAGTAGTGTTTCTGGGCGACGTTTAGCAATATCTTTAGCGCTAAATACATGACTGATATCAACGCCACGGAAGAAGGTACGTACATAATCATTGGCTGGATTATTAAGAATTTCATCAGGGGTACCGATTTGTACCACCACACCACCTTGCATAATCGCGATACGATCGCCAATACGCATGGCTTCATCCAGATCATGAGAAATAAATACAATGGTGCGTTGTTTATCACCTTGTAAGCTCAATAACTCATCTTGCATTTCTGTTCGGATTAATGGGTCAAGTGCGGAGAATGCCTCATCCATTAATAAGATATCAGGATCATTGGCCAGTGCACGAGCAAGCCCAATACGTTGTCGCATCCCACCGGATAACTCATCCGGCCAAGATTGAGCATGAGAGCTTAAGTTAACTTGCTCTAATGCTGCCATGGCTTTTTCATAGCGCTCTTCTTTGCTAATGCCTGCAAGCTCCATACCAAATGCTGTATTATCGAGTACATTCATATGAGGCATTAAAGCGAATGATTGAAACACCATACTGATTTTTTTACGTCGAACTTGTCGTAAATCTTTATCAGACATGGTGGTGATGTTTTCACCATCAATAAGGACTTCGCCTTTAGTGGGATCTATCAGACGATTGAGAAGGCGCACTAATGTAGATTTACCAGAGCCTGATAATCCCATGATGACAAATATTTCGCCTTCTTCAATGGCCAGATTGGCATTTTGCACACCAACGGTTAACCCTGTTTTATCAAAGATTTGGTCTTTGTTCATACCAGATCCTAATAATTCAAAGGCACGTTTAGGGTGCTCACCAAATATTTTATATAGGTTTTTTACTTCGAGTTTAATTGCCATGCAATATCTATTTTCCTATTTAAATATGAAAGGAATAAATTAAATGTTAATAAATTAGTTTGTTGTTTTTCCTAAATTGAGATTTTTAGTAGGGGAATTACCCTATCATAATGAACAAGCCTGACAACCCTATGTTAATTATAATTAAACAAATAATTTTGTAATTTTTTCAGATTTTTTTTGATAATTAATAATTAAATAAAGTAAAGTTATAGAAAAGAAGAACGTCAAAAAATTCATACTAACTGTATGAAATAACATTATTTTTAATCAGATGTTAATTTTAATTATCATCACAATAGAAATAACAACAAAATAAAAAAATGTAAAAAGATACTGATAAAATAAAAATGGAAAAAAACGCGTTAACATTAAAAAATCTTATGTTTTATGAGGGTGATCTTAAGTTATCGATAACTAGTCATAAAAATCATTCGTAAAAAATTGATAATTCTGGTTAATGGGACGGTAAAAATCACACAATCAGGTTGTTTTTCAAGCAAATAAAAAGGCACTAAAAAATAAGTTTTATTTTTCAGTGCATTATATTTATCGATTAATTCATAATTAATATGAATGTATTCTGTTTTTTTACTATAGAGGGTTAGCTAGAAATCCCAGTCATCATCTTCGGTATTGATCGTTTTACCGATAACATAAGAAGAGCCTGAGCCAGAAAAGAAATCATGATTTTCATTTGCATCTGGCGATAGTGATGAAAGTATTGCTGGACTAACATTAGTTATTTCATCTGGAAATAGTGCTTCATAACCTAAATTCATCAGCGCTTTATTCGCATTATAATGAAGGAATTTTTTTACATCTTCTGTCCAACCGACAGAGTCGTAGAGATCTTCTGTATATTTAACTTCATTATCATATAAATCTAATAATAATGAGAAAGCAAAGTCTTTAATATCTTGTTTCTCTAATGATGATTTATTTAATAACTGATTTTGGAATTTATAGCCAATATAATAACCATGCACAGCTTCGTCACGAATAATTAAACGAATTAAGTCGGCTGTATTGGTTAATTTCCCTCGACTTGACCAATACATTGGTAAATAAAATCCAGAATAGAATAAAAAAGACTCTAAAAATACACTGGCAATTTTTTTCTTTAATGGATCACTATCTTGATAATAACGCAGAATAATATCTGATTTCTTTTGCAAATAGGTATTTTCTTCACTCCAACGATAAGCATCATCAACATCTGTTGTTAAGCAGAGTGTCGAAAATATCGAGCTATAAGAGCGAGCATGTACCGCTTCCATAAAACAGATATTCGATAATACCGCCTCTTCATGAGGAGTCTGAGCATCAGGCATTAAGGTTGGTGCCCCGACCGTATTTTGTATCGTATCGAGCAGTGTAAGCCCTGTAAATACACGGATAGTCAACTGTTTTTCAGCTTGGGTTAAGGTATTCCATGAAGGTATATCATTAGAAAGTGGAATTTTTTCGGGTAACCAAAAATTCATGGTTAAACGGTTCCAAACTTCTAAATCTTTTTCGTCTTCAATACGATTCCAATTTATCGCATTAACACGACTTAAATAAGATGCAGACATAGTAACACTTTCCTTATCATTATTATTAAAGGGCGCATGAAACACAGCCTTTTATTTCTGTGCCGGCTAATGCTGTTTGTCTAATACGAATGTAATACAAGGTCTTTATACCTTTACGCCATGCATAAATTTGTGCTTTATTAACATCCCTTGTGGTTGCTTCATCAGAAAAGAATAATGTTAGCGACAATCCTTGGTCGATATGTTGTGATGCTTGGGCATAGGTATCGATAATTTTTTCTGCGCCAATTTCATAAGCATCTTGATAAAAATGACGGTTTTCATTGGTCATAAAAGGGGCGGGGTAATAAACCCGACCGATTTTACCTTCTTTTCTTATTTCAATCGGTGCCACAATGGGGTGAATACTCGATGTAGAGTGATTGATATAAGAGATTGATCCTGTTGGTGGTATTGCTTGTAAGTTTTGATTATAAATACCGTGAGTCATAATCGAGAGCTTAAGTTTTTGCCAATCTTCTTGGGTTGGAATATGAATATTGGATTGGCTAAATAGCTGGTGGACTTTTTGGGTTTTAGGTAACCACTGTTTTGATAAATATTTATCAAAATACTCCCCAGTGGCATATTTTGACTGTTCAAACCCTTTAAAGCGCTGTTTAGTCTCTATCGCTAATTGGTTAGAGGCTAAAAGGGCATAGTATGTTACGGTATAGAAATAGATATTGGTAAAATCAAGTCCTTCTTCTGAACCATAATAAATCCCTTCACGGGCTAAATAACCATGTAAGTTCATTTGCCCTAAGCCAATGGCATGAGATGCTTGGTTGCCTTTTTCAATAGAAGGTACAGATTCTATTTTAGTCATTTGTGCCACACTCGTCAGTGCTCTGATGGCAACATTTACGGTATGTGCAAAATCTGGTGAGTCCATCGCCATGGCGATATTCATTGATCCGAGATTACAGCTAATATCATGACCAATTTGTCGATAACTTAAATCAGGATTGTATTCACTGGCACTATTTACTTGTAAGATTTCTGAGCATAAATTGCTCATATTAATTCGGCCCGCAATCGGATTTGCGCGATTGACGGTATCTTCAAACATAATATAGGGATAACCTGATTCAAATTGAATTTCAGCTAAAGTTTGAAAAAATGCCCGTGCTTTAATTTTTTTCTTACGTATCTCTGCATTGTTGACCATTTCAGTATATTTTTCGCTAATACTGATTTCTGACATAGGAACGCCATATACTCGTTCTACATCATAAGGTGAAAATAGATACATATCTTCGTTGCGTTTAGCTAATTCAAAGGTGATGTCGGGAATAACGACACCTAATGAAAGCGTCTTAATACGTATTTTTTCATCAGCATTTTCTCGTTTTGTATCTAGAAAATGATAGATATCAGGATGATGAGCATGGAGATAAACCGCTCCAGCACCTTGTCTTGCGCCTAATTGATTGGCATATGAGAAGGCATCTTCAAGCATTTTCATTACCGGTACTACGCCAGACGATTGGTTTTCAATGCGTTTTATGGGGGCTCCTGCTTCTCGTAAATTAGTCAGTAAGAAAGCAACACCTCCGCCACGTTTCGACAATTGCAACGCAGAATTGACTGCTCGGCCAATGGACTCCATGTTGTCTTCGATACGTAATAAAAAACAAGAGACCAATTCGCCACGCTGTTTTTTTCCACAATTTAAGAAAGTAGGGGTTGCAGGCTGGAAACGGCCACTAATTATCTCATCGACAAGGTGAGTGGCGAGTTTGGTATTCCCCTGTGCTAGGGTTAAGGCAACCATACAAACACGATCTTCATAGCGTTCGAGATAACGCTCACCATCAAAGGTTTTTAAGGTGTAACTGGTGTAGTATTTAAATGCACCTAGGAACGATTGAAAGCGAAATTTTTTGCTATAGGCATGCTTAAAAAGCTGTTTGATAAACGGGAAATCGTACTGCTCTAATACTTGTGCTTCGTAGTAGTGTTGTTGCACCAGAAAATCGAGCTTTTCTTTTAGATCATGAAAAAACACCGTATTTTGATTAACGTGTTGACGAAAAAAATGGTGGGTGGCTAATTTGTCTTTATCAAACTGGATATTGCCTTGCTCATCATAGAGATTGAGCATGGCATTTAAGGCGTGATAATCGAGTTGTTCTATAGAGTGGGTCATGTTTTTTATCTCATTCACTTTTTAGTCATTATTTGCTTGCTGACCAAAATGTGCTTAATCCGGTTTTTACACGTTTAACATCTTCAGGCGTACCAAGTAACTCAAAACGATAGAGAAAAGGGACTTGGCATTTTTGTGCAATAATGTCACCTGCTAAGCCGTAAGCAGAGCCAAAATTGGTATTTCCTGAAGCAATAACACCGCGTATTAATTGGCGATTTTCAGGGATATTTAAAAACTGGATCACCGCTTTAGGCACTGCGCCTTTAACGCCACCGCCACCATAAGTTGGGCAGAGCAACACAAAAGGTTGTGTGGCTTGTAGTGGTTCATCCTCTTTTATCCTTGTCGCTTGTAGATTAAGTTTTTGTACGAAGCGGTGACAATTTTCTGAGCGACTAGAGAAATAAATTAAAGGGGCAGTCGATTGCATAAGTTGCTCCTTTAGCGCGCTATTTGACGAATTTTATCTGGGCAAAAGCCAGACCAATGTTCGTCACCATTAACGACAACCGGTACTTGGCGATATCCCATAGAAACTATTTTTGCTAATGCTTGAGTGTCTTGGGTGAGATCAACCGCAGTGAAAGGAATTTTTTGTTGTTGTAATGCGCGCTCGGTTGCACTGCATTGAACACAATTTGGTTTGGTATAGAGGATCACAGACATAGAATAACCCTTATAAAAATGTGAATGTGTCTGCTCACAGTCACAATGAAAAGTGCTTAAATACTATATATAGGTTTATTCTTTTTCAACCACACTAGATATGGTGTTTTTTATTATTGATAATGATTATTATTAAAATTAAGCAGTTAGCAGATTTATTTTATTTTCTTATCGCTCATTTGAGCAATTTTTATTAGGTATAGTAGAAAATTAGATGATTGATTTACTTACAAAGCATGTTTTAATCTTGATGATACAGACAAATCAATAGAGAACACATTATGTACCAAGATTATCTCAATACGCCGAAAGGTTTTCCAAAGCCTTATATATCCATTACCGCAGATGATGATGGCATCACCAGCCTTAACTTTGTTAGTGAAAAAGAGGCGTTAGTTAATTCAAATGCCATAATTGACCTGTGTATAAAACAGTTAAAAGAGTATTTTTCGGGTAAACGAACCCTATTTTCAGTGCCACTAGCGCCAAAAGGAACCGAATTTCAAATACGCGTTTGGCAGACTTTACAGTCTATTCCTTATGGTGAAATTTGGAGTTATAAAAAGTTGGCACTTACATTAGGTTCCGTCAACTATTGCAGAGCGGTAGGAATGGCAAATTCACGTAACCCAATCTCGTTAATTATTCCTTGCCATCGCGTCATTGGTCATAATGGTAAGTTAGTAGGCTATACTGGGGGACTTGATATCAAACGTTGGCTATTACACTATGAAAAAGTGGATATTGATGAATAGTTCATATTGTAAGTATTAAGCACTATTTCTTAAGTGATTAATGGCTTAAGTTATGGGATTTGTCTGAATAATAATCGTTTAACAGAAAAAAAATACGCGTTTCGTGATCTAGACTGTGGACAGCGAATCATCATTTTTGTTTTACTATAGCCAACGCAAAACGCTTGCGTTTATTTTCTATTTTAAAGGTAAACTTGATGTCTAAATTAAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAACGAAACTAAAGGTTTTGGTTTTATCACTCCAGAAGATGGCAGTAAAGATGTGTTCGTCCACTTTTCCGCTATTGTTTCAGAAGGTTTTAAAACACTTGCTGAAGGTCAAAAGGTAGAGTTTGAAGTTACTGACGGCGCGAAAGGGCCATCTGCTGCAAACGTTGTCGCTATCTAATTAACGACTTCTCCAAAAGTAAAAAACGTTTTTGAAATGACCCCCAATAGTTGGACAACCAATTATTGGGGGTCTTTTTATGTCAAATACAGGGGGGATTTAAACATCATCATTGCCAATCAATGGTCAGCGGATGAAGCATTTCAGACACTTTCTGAACAGTATTTATTAAAATAAATTAAAACTATTTTACTAAAAGCTGACTATCTTGTTCTGCCTTCTTTTTAGCCTGCTGAAAACGAAGAAGTAACTCATTTTTCTGGACTTTAATAGCGTTATAGTCAACATTGTCGTTTTTCTTTTTAGATATTTGTTTGTATAACAAAATAAGCCTCCTCAACGTAAACATTTAAATTTTTCGATTCAGCGTACTTATTAATTAATCGAATATAAACTCTTCTGAGCTCTTCACTGTATGCTTGGAAAGTCAAAATATCTATTTTTTCAGTTTGTGCTATCAAAAGAATAATGTCAATGAGTGTTATGTAAAGATACCGAGTTTCTGATGATGTCAAATTAATTGAATCTGGCGGTTTATCAAACATATCACAATTTTGATAGTTTTCAGTCTCTATATTATAAAAACTAACAACACTAATAGTTAAATTTTTTATATTTTCGGCATATAACTTATTAATTAATGAATGATAATTTTCATCTCGGCAAAAAATAAGCCTGTAAATAACACTCCTTTTCCTATTATTGGAAAAAATAAATTTAATATCTATATATTTAAAGATATCAAAACCAATAAGCTCATCATGTAAAATGTAATGTGAATGGTGAGGCATTTAATTTCTCATTATTATAAAAATAATTGAATTAATTTAATAACAATTAAATCATCAAGATACCAACAAAAAATTTCATTTATTAGATATAAAACCCTCATCAAAAACAATAATAAAAAACCTAAAAATAACAAAAATTGAAAATAGATAATAATAAATTAAACTGTTTTCTTAAAAATACTATTTGAAATACTCTAATAGTTGGACAACCCATTATTGGGGGTCTTTTTATGTCAAATACAGGGGGGATTTAAACATCATCATTGCTACTTAGGGTGACAATGCTTGCCACACTGCATAACTCTCGCTCGTTTTGATGATGAAAAAAGACTTGAGAAATTTAAAGAGGAGCTTGCGTATTTAGCTGCGGGATAAATACCGTGGTTGAAAGTTTTTTAAATTATTAAAATCAAGAATACATCATAGCTATCATTTTAAAATATCAATGAATGTATTGATAAAATTGGCTAATTTATTGAGTAATACCACCGGGAACAAAATCAAATTAAAAGGCCTGACATTGGTTGAATATTAAGTTCAGGCCTTATAAATCGCTTAACTAAAAGAGTACAACTTTATGATTAACGGTTTTTATCTTGTTAAAGAGACTACATTTCACGGAGTAGCCAGAATGCGAATGCCGTCATCAGAAACGAGCCCGCTAAGTTTGCCCCCATGGTGCCTAATGCCCAGCCTATTCGTCCTTCATTAAATAAGGCGACCACCTCAACAGAAAAAGTAGAAAAGGTGGTTAAGCCACCACAAAAACCTGTGGTAAGCATGATTTTCCAAATAGGGTCAATATTGGGAGCTTTACTAAACCAAGCAATGCCAAAGGCGATAATAAAGGCACCAATACAGTTAGCGACCAAGGTCCCCGTTGCAAAATGGGGAAAAAGAGAATTAAGGCGGTAGCTAATTAGCCAGCGTAGTACGCTACCTAAACCACCGCCGATAAATACAGCTATTGCAATGTTAAGCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP051260|1062045:1070579|1067002_1067407_-|WP_004246072.1|DBSCAN-SWA
MQSTAPLIYFSSRSENCHRFVQKLNLQATRIKEDEPLQATQPFVLLCPTYGGGGVKGAVPKAVIQFLNIPENRQLIRGVIASGNTNFGSAYGLAGDIIAQKCQVPFLYRFELLGTPEDVKRVKTGLSTFWSASK
>NZ_CP051260|1062045:1070579|1068595_1068805_+|WP_004246068.1|DBSCAN-SWA
MSKLKGNVKWFNETKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIVSEGFKTLAEGQKVEFEVTDGAKGPSAANVVAI
>NZ_CP051260|1062045:1070579|1064847_1066974_-|WP_004252248.1|DBSCAN-SWA
MTHSIEQLDYHALNAMLNLYDEQGNIQFDKDKLATHHFFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVQQHYYEAQVLEQYDFPFIKQLFKHAYSKKFRFQSFLGAFKYYTSYTLKTFDGERYLERYEDRVCMVALTLAQGNTKLATHLVDEIISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRAVNSALQLSKRGGGVAFLLTNLREAGAPIKRIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIYHFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPDITFELAKRNEDMYLFSPYDVERVYGVPMSEISISEKYTEMVNNAEIRKKKIKARAFFQTLAEIQFESGYPYIMFEDTVNRANPIAGRINMSNLCSEILQVNSASEYNPDLSYRQIGHDISCNLGSMNIAMAMDSPDFAHTVNVAIRALTSVAQMTKIESVPSIEKGNQASHAIGLGQMNLHGYLAREGIYYGSEEGLDFTNIYFYTVTYYALLASNQLAIETKQRFKGFEQSKYATGEYFDKYLSKQWLPKTQKVHQLFSQSNIHIPTQEDWQKLKLSIMTHGIYNQNLQAIPPTGSISYINHSTSSIHPIVAPIEIRKEGKIGRVYYPAPFMTNENRHFYQDAYEIGAEKIIDTYAQASQHIDQGLSLTLFFSDEATTRDVNKAQIYAWRKGIKTLYYIRIRQTALAGTEIKGCVSCAL
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MLNIAIAVFIGGGLGSVLRWLISYRLNSLFPHFATGTLVANCIGAFIIAFGIAWFSKAPNIDPIWKIMLTTGFCGGLTTFSTFSVEVVALFNEGRIGWALGTMGANLAGSFLMTAFAFWLLREM
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MPHHSHYILHDELIGFDIFKYIDIKFIFSNNRKRSVIYRLIFCRDENYHSLINKLYAENIKNLTISVVSFYNIETENYQNCDMFDKPPDSINLTSSETRYLYITLIDIILLIAQTEKIDILTFQAYSEELRRVYIRLINKYAESKNLNVYVEEAYFVIQTNI
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MAIKLEVKNLYKIFGEHPKRAFELLGSGMNKDQIFDKTGLTVGVQNANLAIEEGEIFVIMGLSGSGKSTLVRLLNRLIDPTKGEVLIDGENITTMSDKDLRQVRRKKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMELAGISKEERYEKAMAALEQVNLSSHAQSWPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVRTFFRGVDISHVFSAKDIAKRRPETLLHIAPGFGPRSALKVLEDEDRNFGYLIERGRKFAGIVSVTSLEEALKAKQPIGSAILTEPCAINGDTPLNELISTVAQSPCAIPVIDEKNRYIGLISKGMLLQALDKETPNE
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MYQDYLNTPKGFPKPYISITADDDGITSLNFVSEKEALVNSNAIIDLCIKQLKEYFSGKRTLFSVPLAPKGTEFQIRVWQTLQSIPYGEIWSYKKLALTLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIIPCHRVIGHNGKLVGYTGGLDIKRWLLHYEKVDIDE
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MSVILYTKPNCVQCSATERALQQQKIPFTAVDLTQDTQALAKIVSMGYRQVPVVVNGDEHWSGFCPDKIRQIAR
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MSASYLSRVNAINWNRIEDEKDLEVWNRLTMNFWLPEKIPLSNDIPSWNTLTQAEKQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPTLMPDAQTPHEEAVLSNICFMEAVHARSYSSIFSTLCLTTDVDDAYRWSEENTYLQKKSDIILRYYQDSDPLKKKIASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAVHGYYIGYKFQNQLLNKSSLEKQDIKDFAFSLLLDLYDNEVKYTEDLYDSVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDEITNVSPAILSSLSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKTINTEDDDWDF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_004246075.1|1062045_1063245_-	glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein ProV	G3M9Y6	Bacillus_virus	3.8e-28	37.6
WP_004247427.1|1063853_1064822_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	R4TBI6	Mycobacterium_phage	3.5e-133	71.0
WP_004252248.1|1064847_1066974_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	V9VI16	Lactococcus_phage	1.5e-205	51.3
WP_004246072.1|1067002_1067407_-	class Ib ribonucleoside-diphosphate reductase assembly flavoprotein NrdI	R4JF54	Bacillus_phage	3.7e-12	38.5
WP_004246071.1|1067418_1067643_-	glutaredoxin-like protein NrdH	V5UN81	Mycobacterium_phage	1.4e-13	47.9
WP_004246069.1|1067924_1068398_+	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_004246068.1|1068595_1068805_+	transcription antiterminator/RNA stability regulator CspE	A0A1W6JNX5	Morganella_phage	5.9e-22	74.2
WP_004246061.1|1069107_1069596_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004246058.1|1070204_1070579_-	fluoride efflux transporter CrcB	A0A2H4J148	uncultured_Caudovirales_phage	2.7e-25	52.0

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP051260|1110238:1156478|DBSCAN-SWA
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MGKGGGGGITPRLLDDNLKNKQFLNVIDLVSEGPIEGPVGGMSGFLLNGTPVVDADGNPNIHGVEVQWRAGTQTQEPLEDFPFVEKEIPVNVEVKKSTPILRTISDQETDRVRFTLGVSALVSQDDKGNQHDATVEMLIEVNDGSGWTHAETAKITGKISGQYLESYIIDAPKKKPFQIRVSRLTDDSKSDLLKNGTVWASYTEITDAKFSYPNSAVVGMKIDKSQYGDTPNRTYHIKGMIIQVPDNYDPEPRTYTGIWTGRFKPAWTNNPAWVFYDLVTNERYGIGEMIGSFGVDKFALYAIARYCDELVDDGFGNKEPRFTFNAYITSQRKAKEVLDDLASVFRGMPLWDGQQLTCFQDRPSDPVWTYTNSNVIDGKFKYTSTAKSARHNAIEVSWINPSNGWSEEREFIQDDDLIQRFGGVNVKKVTAFGCTSRGQAHRVGKWILQTEKLEKDSVTFSTGREGINCISGDIIEVADDSFAGVKVGGRVLSVNGSAITIDAPIDWKYDDKGTFSFLGTSGRFEKIEIQSIDGDIVTLREVPRGLKQYGVFSITKSMLITRLFRVITISENNDGNYLYNCIQHEPQKESIVDNGVDFTGNPPTQNVIRIPNIERLSIAYVDDSPQVQARAMWVTTAINRNISFNVTLYKNSKVVSTGNTTDLEYYFNGLEAGDYLVGVRGQDANGMLGNESKVQMVIGTPSAPSSIIVESGFFEIKLIPHIAAPHTLNTEFEFWFSGEIKINNINEIESKADFLSRAKFWTKGQLKPGRDYWFYVRSVNEYGKSHFVEAKGQVDGNIDAILEELAGQISRDQLAQDLLGEINSKANQIDITELHELMRINHDKILSELMRHGATIEESEKKWEEAGKLLAERINQVSTATEAQATAIKQEQQARIETDKTEAQQRQFLATQLRGDYTGNDLSKVTAGLISAEKQARVTGDQAEAKARQSLETRMNGNVSAINQSLETLTSKQQAQTQEILTLNSNLKGKADSSVVNALNTRVTNLDGKVTSATSQVQTLSSKLDTVKADLTESVVVDLDLSKLNENTYYPIILPLVTSRRYAFKVFRTLGQYSDNKPSYATHSTKGFAVIVEWQVSGSGWGTQSENRIIDNFDWRWTNQSPVMGPAQLTNGSVEYIYLRGGAKYQLTKHKSVNHQIITRTYTNNKQSVAPKGFVANEVPKSSEQKANATANAVNQLETKVTEVSGKVTSTAQQVTRLESQVGTSSAKIEQTSKVVTDINGKISASWTMKVQQDSKGNKVITGIGLGFNAQGNSQFLVNAQNFAVISSLNGKVVTPFIVKNGQVVVNEAFIGDATITSAKIANVLQSTNFSHANKVGYQLNMRTGEEIKYGNNAQGYWIETNILKRLFDKKGTMRIRMGIW
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MECANTRKQFNQFISNHLIASALQALRNKTQSAVARKLGVHDSTILRRTEKYPEICETLVASGIIDFVMEGERKISEEEYRFLWKQMGELSQMKIKENASIAATNEACCSMEFTI
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MQSQLMLDNSMMIQILLERLKAGIVDREEMQRELRAAVAKALANFSGQITSRSKLNAIIAELKRELSPVLTSYSEHLLQSVLDIGVESSQLEVDSLSQIVTNEVSKPDAEKVKKAILNVPLILTAWGGSLFLKKFISSWVTSSIQQVENQTVLAMAAQSNIQVLQSTINGAAIDKTQVSTSTISRITYNYRTIANTAIQHAHTCAAQEFYKENDDLIKEEEFSAILDNKTSSTCRALSGNRYPVGAGPMPPLHPNCRSQRLPILNDKFANLIITKPIGRSEWGEESYYEWLSRQPAKRQDLILGPTRGKLFRDGGLSPERFAQLQLHKNFKPMTLKDMQKFAPKAFERAGIELK
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MVGVEIYTNNRLIQLTDKLETICVLRKATPDELTSSSGPHDSYPRIYALNSQWMVAPISKVSIPQHGVGLEVYDEQGKMKFSSLAKLVCFEKYYDVNTGSAGKGSLRIAGKSGHRYGMIKTRSMGYFHNTNIRSYIDPDTWDEVWTFKRYSERYVLVDDVGGLTFEYRYEFLGEEDGWISMPPSREGSGLMEQGLMIDVSMLED

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1110152:1110170	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_017827452.1|1113359_1113869_-	single-stranded DNA-binding protein	C6ZR36	Salmonella_phage	4.9e-54	57.3
WP_017827451.1|1113868_1114480_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A1W6JP21	Morganella_phage	1.1e-73	69.2
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WP_017628823.1|1114798_1114951_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_165439118.1|1115218_1115374_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036919939.1|1115427_1115688_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017628819.1|1115887_1116385_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004245994.1|1116406_1116724_-	hypothetical protein	A0A1W6JNZ0	Morganella_phage	7.1e-19	52.3
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WP_036908283.1|1117540_1118320_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036908281.1|1118354_1118999_-	LexA family transcriptional regulator	A0A077KGZ5	Edwardsiella_phage	1.9e-79	65.0
WP_004247477.1|1119104_1119314_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	K7PKH4	Enterobacteria_phage	1.2e-25	83.3
WP_049256531.1|1119459_1119807_+	hypothetical protein	A0A1W6JNY4	Morganella_phage	1.1e-36	72.9
WP_004251793.1|1119902_1120076_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036895070.1|1120072_1120840_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A5LH71	Enterobacteria_phage	1.5e-22	51.9
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WP_063215454.1|1122252_1122582_+	hypothetical protein	A0A1C9LVV9	Vibrio_phage	1.1e-22	39.0
WP_036919942.1|1122649_1123099_+	hypothetical protein	A0A2H4FNF5	Salmonella_phage	2.9e-13	32.2
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WP_004247148.1|1124764_1125286_+	DUF1440 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_060555895.1|1125444_1125867_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247489.1|1125920_1126190_+	hypothetical protein	A0A2H4FNF0	Salmonella_phage	6.0e-19	53.5
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WP_012367623.1|1126641_1126800_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012367624.1|1126802_1127264_+|lysis	lysis protein	A0A1P8DTG0	Proteus_phage	6.3e-24	45.8
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WP_004245979.1|1128192_1128399_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004245978.1|1128395_1128554_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012367626.1|1128581_1129190_+	hypothetical protein	A0A077KBY7	Edwardsiella_phage	2.2e-64	68.5
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WP_168725585.1|1130678_1132055_+	DUF4055 domain-containing protein	A0A1W6JNV0	Morganella_phage	1.3e-210	78.4
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WP_017628797.1|1135266_1135608_+	hypothetical protein	A0A1W6JNW7	Morganella_phage	1.2e-51	79.6
WP_017628796.1|1135610_1135979_+	hypothetical protein	A0A1W6JNX7	Morganella_phage	3.3e-52	83.6
WP_017628795.1|1135975_1136347_+	hypothetical protein	A0A1W6JNU7	Morganella_phage	1.5e-47	70.7
WP_026164642.1|1136411_1137167_+	DNA breaking-rejoining protein	A0A1W6JNT1	Morganella_phage	9.1e-105	77.3
WP_017827425.1|1137216_1137909_+	hypothetical protein	A0A1W6JNX2	Morganella_phage	7.6e-90	71.1
WP_017827424.1|1138069_1139059_+	hypothetical protein	A9YX09	Burkholderia_phage	1.3e-71	46.4
WP_017827423.1|1139181_1139955_-	LexA family transcriptional regulator	A2I308	Vibrio_virus	2.3e-10	30.8
WP_017827422.1|1140056_1140227_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017827420.1|1140997_1141723_+	hypothetical protein	A0A0P0ZD96	Stx2-converting_phage	1.4e-65	56.8
WP_017827419.1|1141959_1143162_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017827418.1|1143162_1144311_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017827417.1|1144413_1144722_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017827416.1|1144786_1148122_+	tape measure protein	A0A1W6JNU2	Morganella_phage	2.5e-207	45.4
WP_017827415.1|1148137_1148338_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017827414.1|1148339_1148651_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017628783.1|1148794_1149124_+|tail	phage tail protein	A0A1W6JNT2	Morganella_phage	9.6e-43	71.6
WP_017827413.1|1149120_1149819_+|tail	phage minor tail protein L	A0A1W6JNT8	Morganella_phage	2.6e-114	82.8
WP_017827412.1|1149822_1150542_+	C40 family peptidase	A0A1W6JNU8	Morganella_phage	1.4e-110	74.5
WP_017628780.1|1150478_1151045_+|tail	tail assembly protein	A0A1W6JP03	Morganella_phage	3.1e-49	76.7
WP_168725586.1|1151044_1155190_+	DUF1983 domain-containing protein	A0A1W6JNW2	Morganella_phage	0.0e+00	75.5
WP_004245936.1|1155183_1155552_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247523.1|1155553_1156168_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247524.1|1156217_1156478_+	hypothetical protein	A0A1P8DTJ0	Proteus_phage	1.9e-17	57.4
1163390:1163408	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP051260|1331153:1410106|DBSCAN-SWA
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MDHRLLEIIACPVCHGKLIFDKENSELICKIDHLAYPVRDNIPVLLENEARELSLEEEK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_004244559.1|1331498_1333793_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.3e-170	42.9
WP_004244560.1|1333911_1334130_-	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_004247616.1|1334449_1335142_-|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_004244562.1|1335143_1336895_-	cysteine/glutathione ABC transporter ATP-binding protein/permease CydC	W8CYL7	Bacillus_phage	4.0e-18	22.8
WP_017628444.1|1336897_1338667_-	cysteine/glutathione ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD	W8CYL7	Bacillus_phage	3.0e-21	23.5
WP_004247618.1|1338805_1339765_-	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.2e-64	45.8
WP_004244566.1|1340307_1340802_+	leucine-responsive transcriptional regulator Lrp	NA	NA	NA	NA
WP_168725592.1|1340929_1344733_+	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	1.7e-90	49.3
WP_004244569.1|1344845_1345451_+	outer membrane lipoprotein chaperone LolA	NA	NA	NA	NA
WP_110706932.1|1345461_1346811_+	replication-associated recombination protein A	G3MBE0	Bacillus_virus	4.0e-79	40.6
WP_004244571.1|1346944_1348234_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	4.1e-97	46.2
WP_004244572.1|1348413_1348746_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247622.1|1349146_1350196_+	ureidoglycolate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_168725593.1|1350268_1351174_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244575.1|1351531_1352272_-	pyruvate formate lyase 1-activating protein	A0A2P0VNQ0	Tetraselmis_virus	2.3e-20	27.0
WP_004244576.1|1352379_1354662_-	formate C-acetyltransferase	A0A2P0VNR5	Tetraselmis_virus	1.0e-159	41.6
WP_004244577.1|1354716_1355571_-	formate transporter FocA	NA	NA	NA	NA
WP_036900836.1|1356241_1357999_-	30S ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor YcaO	NA	NA	NA	NA
WP_004244579.1|1358226_1359264_+	L-asparaginase 2	NA	NA	NA	NA
WP_108717050.1|1359338_1360592_-	filamentous hemagglutinin N-terminal domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_104459796.1|1360728_1362159_-	MFS transporter	A0A0M3UL24	Mycobacterium_phage	1.5e-07	24.8
WP_004244582.1|1362295_1363384_+	3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase	M1Q1P2	Streptococcus_phage	5.7e-84	47.0
WP_004252010.1|1363580_1364867_+	3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_004244585.1|1365155_1365833_+	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_004244586.1|1366014_1367688_+	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
WP_004244587.1|1367752_1368040_+	integration host factor subunit beta	A7KV42	Bacillus_phage	8.4e-11	40.0
WP_143475375.1|1368464_1370834_+	DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2	Q0H255	Geobacillus_phage	3.6e-22	29.3
WP_004244589.1|1370870_1372616_+	lipid A ABC transporter ATP-binding protein/permease MsbA	W8CYL7	Bacillus_phage	8.4e-61	30.9
WP_004244590.1|1372612_1373614_+	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	NA	NA	NA	NA
WP_004247631.1|1374109_1374325_+	cold shock domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244593.1|1374739_1374919_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244594.1|1374923_1375685_+	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_004247632.1|1375807_1376638_-	envelope biogenesis factor ElyC	NA	NA	NA	NA
WP_004247633.1|1377017_1377791_+|tRNA	tRNA uridine 5-oxyacetic acid(34) methyltransferase CmoM	NA	NA	NA	NA
WP_004244597.1|1377800_1379123_+	chromosome partition protein MukF	NA	NA	NA	NA
WP_004247634.1|1379103_1379835_+	chromosome partition protein MukE	NA	NA	NA	NA
WP_004247635.1|1379831_1384289_+	chromosome partition protein MukB	NA	NA	NA	NA
WP_004247636.1|1384570_1385224_-	type A chloramphenicol O-acetyltransferase	G3CFL0	Escherichia_phage	8.2e-102	80.4
WP_004247637.1|1385630_1386344_+	acid phosphatase AphA	NA	NA	NA	NA
WP_004247638.1|1386686_1388402_+	L,D-transpeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_168725594.1|1388733_1389282_+	YcbK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247640.1|1389331_1389982_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_004244607.1|1390074_1390548_-	Hcp family type VI secretion system effector	NA	NA	NA	NA
WP_004247642.1|1390638_1392375_-	type VI secretion protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244609.1|1392367_1393723_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244610.1|1393760_1397309_-	type VI secretion system membrane subunit TssM	NA	NA	NA	NA
WP_110706694.1|1397311_1398775_-	type VI secretion system protein TssA	NA	NA	NA	NA
WP_004244612.1|1398780_1399431_-	type VI secretion system-associated protein TagO	NA	NA	NA	NA
WP_004244614.1|1399432_1400221_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_104459791.1|1400224_1402948_-	type VI secretion system ATPase TssH	K4FB40	Cronobacter_phage	1.4e-83	30.5
WP_004244617.1|1402956_1403712_-	DotU family type IV/VI secretion system protein	NA	NA	NA	NA
WP_026164596.1|1403704_1405063_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
WP_004244619.1|1405064_1405616_-	type VI secretion system lipoprotein TssJ	NA	NA	NA	NA
WP_004247648.1|1405617_1406886_-	type VI secretion system-associated FHA domain protein TagH	NA	NA	NA	NA
WP_004244621.1|1406890_1407928_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssG	NA	NA	NA	NA
WP_046334530.1|1407891_1409667_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssF	NA	NA	NA	NA
WP_004244624.1|1409674_1410106_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP051260|1489239:1539005|DBSCAN-SWA
TTTATGCAATCTCACAATGTGGCACTTCAACCCATTGTACATGGTTTTCTGTATAAATCTTGGTTGACTCTGCATCACTATGAGCCATTCGAGCTTGTGGATCAAAACCACGTTGTTTAAACATAAAGGCCGCCAATGCTCTTATTTCATGAAAGGTTGGTCTTTCATCTAAAGGCAAATGACTAGTAACGCCAACCCGATCACGTAGCGCTGAAAATGCACGGCTAAGGTAATCAGGTGCGACTTGTGTTGGATGATTAACCTCTTTACTCACTTTATTTGGGATACGAGTAGGTAGTCTATGCACAATATAAGGGCTTGCCACATTGTCACGGCTATTATCGATGATTTCCTTAAGCGCTTTACCTATGGGGATCGCAATATGAGATGCCTCTTTATGTTGTACTTTTTGTCTGTGAATATAAATCATCCCGTATATTCCATTTAAAGGTTCCTCATACCATAAGCACCCACATATACCTTCTTTGGGAGCTTTGATATTGTATTTTATACGTGATACTTCTAGCCTTGCTTGCGTTGTCTGTAATGCGAGATCCATTGCTGTTCTTAACCAAGGCTCTGCGGATGATCGAATTTTAAGAAAGTCATTATAAGATAATCTTCTCCGTTTTTTACCATCGACTCTTTTCATTTTCTTACGTTCAGCGGGGTTATCGAACATAAGAGATTCATCCATTGCGTAACTAAAAATTTTCTTTAGAAAGCTTACCTTACGATTTTGTACATTAGCAGAAGCATCGGCATGATATTCATTAATATAGCCATTTACATGTTCCAGTGAGATTTCATTTGTGGGGATATCTTTAAAAAAGATCTTAATTCTTTCTAAGTCATTAACCCAGTTACTAAGTGTACTGTCTGATGGTTTCTCATCATTAGTGATCCGCAAAAATAACTTATCTAAATGTTCTGAGAGAGGGAGAGCCTCTCCATATTGCCCTCCCGAGTCAATAATTAATGAGTTAACAGAAACGCATTTTTCTGGTCGCATAATATTGTTGTATTCTCTGGCTATTGCGATAGCTTTTGCTTTATCAGCACCAATGCATTTTCGAATACCATTAGTCAGTGTTAAGCGATACTGTTTTTTGGATGAATCGTAATACAGAAAGTCAGGTAGATGCCTAAATTCCTTTCTTCTCGGTCTACTGGCCATATCACGAAGCCCTTATTAACTCATCGACACATGAAGAAATAACGGACTCAATACCCCAACGTTCGGATGAATATACCCTACTTCAAATTCTCGTTTAGCCCACGCACTAGCTTTCATCAGTTTTCCGCTCATTTTGGTCTTGCCTCATCATCAATAAAATAAGTCGGTCTGCTGTATCACAGGAGTGTTTGATTTCAGCGTCAGTGCATGGTCTATTTCTTACACTGAACGCTAACCGACCTAATTTAATATCAAAACTTGTTAATACTTGGTTCCCTGGTTTCCAAGGTGTTAATAATTTCATGGTGGTCACCCATTGGTCTTGAATAAACCACCATGCTAATAACAACGAAAAGTAAAAACTGATTATGCTTAATCAACTTTTTACTCGAATAATTCCCTCTACTGGATAGCACTCTGCAATTTTCCCTTTGGTCGCGAATAATTCCTTATCAATTAAACAATTTTTTTCATTGGGATAAATATAACCGTAGGGTTCAAACTGACAATTTACCGAACTCTACAAAGCCACACTCGATGTGCTTTGGAATTTTATCCTTCGTAAGCAATTCTCCACTCAAAAAGCTGTAGAAAATGCAGTATCTCAATTATTAAGTTTCACATAGAGGCAAGACCAATGAGCAAATCAAAGACTAAAGAAGAAAGACAGTGGCTATCAGATGTAGCGGAACTGGGTTGTATTTGTTGTCGCAATATGGGGCTTGGGGCAAGTAGAGCGGAAATACATCATGTTAGAACAGGGCAGGGAATGGCACAACGAGCCAGTCATACAGATTTACCACTGTGTCCGCCACATCATAGGGCGTGTTATGAAACCGGCTTTCATGCATCACCTAAATCATGGCAAGAAATTCATGGTAGCGAGATTGAGTTATTAGAACAGACTAAGCAAGAAGTAATGGAGTTACGAGCATGTCGAGTATAAAGAGCATATCAGATGGATTAAAACTTGATGATGATCAGGTTGCATGGATCCAGCCTTGGTTATCAAAATTTGGAGCATGGGTATATTAAGGGAGGATAGAAAAAAGGCAAAGCAGTATTATTGCTGAATTTATGGCAACAGTAGAAAGGCGTGATTATCCTGAGCGAGAAATGTGCAATAACGACGATGGTATGTTGATCGCTAAAGTGGTCGATAAAATTTATCACATAGACAGAATAGCGTTTACGCACTTGTTACTGCGTTATGCCTTCGGTAGTTCAGATCGCGCTATTGCTCGTTATTACCACAATATAGCAAAACCGCGACAAATGATTAGGCGCAATAGAACGGTAGAATATAGAAAACCCTCGATGTCTACATGTAGAAGAGAAATTGAGGACATAATTAATTCAGCCGAATATTTAATTTACCCACATTTAAAAGATGCATTTAAAAAACGAGAAAAAAAGTGGAAAAGTAAAAATAATAGCAAGAACGTGTTGACTTCTTTGAGCCAATGATCCACTATTTAAGTATAAATTGCCGTTTTTATACGGTGACCAACTAACCCAGCCTAAACGCTGGGTTTTTTATTCTTGATATATAAATAATTTATTCTACACAAGTAAACTCCATTTTAGGCAAAGTTGTTATTCGTAAAGACTCTTTACTATCTGAATCTTTTTTTATATACATTATTTCATCTGTTTTTGCTAAGATGAAAACCTTACTGGTAATTTCAGATATAGGGGTAGTGAATTTTTTTGGTATGCCTAACGAAGTAATTTCATTACTGGAGTAGCACCTATATTCATAACCTATTCCTGATGCTTTTATTTGAAAGTTACTTTGTAATAGGACTGGGGTAAGAAGAATTATTCCTAAAGTAAATAAGAAAATTGAGCTATTTATTTTATCTTTGAAACTAGTCATTATAATCATCAGTGCTAAATACAAGATCCCATATAAAAATATTATATAATGAAAACTCTCATTATTAGAGTTATTAGACACTAATGTTAATGAATATAATATTAATAAATATATAAAAATGATTATGGTTGTTAGAAAAAGAAAAAATGCTATTTTATATAATTTTGCTTTTGATGATTTTTTTAGCGTTATAATGGCAGGTATTATGAATAAAGAAATGATTATCACAATTAAAGGAATAGATGTGTCATCATAATTTATTATGTTATAAATACATGCTGATATGGATAGATAAATAATTATTTTAGATATATCAGTCAGATTTTTATATTGACTGTCTTTGTTGAGTGTTTTTTCATTTTCTAGAGCTAAAAGAAAACATAACCCAGTATATATAATATAGATAAAGGTGAATGCTATTGTAAATATACCAATGGTGGTTATTATCTTTATGTTTATCAAGTCAATAAATTTAATGTTGTTGTTATTACAATATATTATGACAGATAACACTCCATAAATGGCAGGAAGATACAATAGTGTTTTCTTTATTTTCTTTATTGGCTCTATCATTTTAATTATATTGTTTAAGTGTCTATTTATTTCATAAAATATAATGCTTTTCATAATCTATCCATAGGAAATATGTGGTAACCCTATATTATCAAAATTAATAAAAAAAATGGAACACTCCAATGGGGGGCGTATGCGTATGCCTGAAAAAAATATTGATTTCTGGGCGCAATTTTTTCGCTGGATACAAATTAATTTGCCTTTTTTAAGTGGTGTGACGTTAGCAACTTTTATTGCGTTTATTCGCGAACGTCGAGAGGGAAATACAACTCGGCAATCATTTGCGGAAGCTGTGATGTGTGGAGCTTTAACTGTTGGTGCTATTCGTGCGTTTGATTTAGGGCTTCATTATATGGGCTTGTCTGACTCATGGACATCATTGGCTGAATTTTGTGGTGCTATGATTGGCTTTCTTGGAACTAAAAAGTTAAGTCGTGTTCTCGATACGATATTCATATTTATTAAAAATAAACTTGGAGTAAATAAGTAATGTCGAAATATGTGTTTAGTAAACTTAGTGAAAAGAATATGCAGGGTGTTCATCCTGATTTAGTCAAATAACTCGACGAGCACTAGAATTGACCGATGTCGATTTTATGGTTATTGAAGGTAAGCGTAATGAAGCCCGTCAACGTCAGTTGGTCATTAATGGTAAAAGTCGAACGATGAATAGTCGGCATCTTACTGGCCATGCAGTGGATTGTGCACCTATTGTGAATGGCTCAATACCTTGGCAAGAATGGTCATACTTTAAAAAAGTGGCTGATGCGATGATCCAAGCTGGTAAAGAGTTTGGCATTGATGTTGAGTGGGGCGGTAATTGGGATTCATTTAAAGATGGTCCTCATTTTCAATTAACGTGGAAATCATATCCGGCGTAACGTCTATGAATATCACCAAATTACTCACTGGTAGTTGTGTGGTGTTGGCATTTTGGCTCTGGTGGGTAAGAGATGACTACGACAAGTTGAGCAAAGACTACAACACAGCAACTAGCCAACTCTCCCAGCAAATCGAAATCAACAATAAATATCAATCTCGTATCACTAAATTAAACGAACTCGATACAAAACACACTAAGGAACTCAGCGATGCAATGTCTGAAATTAGCCAGTTGCGTGTTAGCGCTGAGCGTAATCCTAACAGGGTGTACATCAAAGCCGAATGTCCAAAATCCGAAGGCGCTACCACCTCCGGCGTGGCTAATGCAACCACCGCCCGACCTACTGACACCGCTATCCGAAATTATTGGTTACTCAGAGAGCGAATTGCACAGTCAGAGCAAATGATTAAAAGGATGCAGGAGTATATAAAAGCTGAATGCAATAACTAAATACAAGCCTTTAAGTTTACTATTTATCGTTGATTAGG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MIEQAILAHAKEQAPSEACGLLVSTAQGEQYLPCVNQHADPKNYFTISFDDFIRAEQQGEVIAVVHSHPDGQPYLSTLDRQLQVNSALPWWVVCDEKIHCYQPVSHLLGRHFIHGSTDCYGLFRDAYHLAGHDLPDFERHDNWWRQGKELYLDNMISSGFRQVKKEAQPGDIILCCYASSRANHAGIYLGNQTILHHIPNQLSKREEYNERWQRMTHSIWRYRDWQPSDFTGICNDLDVALI
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MSLLLLKSRPLVVIPELAVRLGLNEAMLLQQIQYWLTETTSGVEYDGSRWIYNTVEEWKNQFPFFSESTIKRAFTNLKKQGVLRIEQINKSNHDRTNYYAINYDHHLLTDGVNMTQSNSDNTSNRAVQNDLIDKRKLKPSNSSKCTVLNGSKWPDLTENTTEITSESTTETNSSCQVPTEPDNAPEKLILDYFNKVTNSKYREGKTTTGHIKARLAEGFTSEDLILITDYLTAKWQKDPKMRDYLRPKTLFVPENCIEYQDKAIKWRDAGRPECVNGRWLKPGEVSVEINTVERDETFRKMFTSGWKPENRIQALAVEQAKKNGLGRMSEVAGLASFRGIWKQATEQVALEAK
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MIDYALKLQELKSQPAHKLKEIGDQWQSPDNLYYGINSKYGPFTLDLFTDGQNSKCPHFYTVEDNALTQDWAEKLKEIGGSAFGNPPYSRSSYHEGQPLTGVGHIMSHALAMREQYGRYVFLLKAATSETWWPEEADHVCFIRGRIGFDVPEWFVPADEKQKPTGAFFAGAIVVFDKTWTGKKFDYIHRDELEQIGKAFIEQMKWLASRGVA
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MSYIATATNKHFYYLDVRIEDIDIQDIATGLANECRFNGQIDNFYSVAQHSVYTSYLVAPEFALEALLHDASEAYVKDLPSPLKKLLPEYKLIELRVEKMIRKKFGLPENMSDEVHFADLMMLATEKRDLDIDAGSNWLMLEGIPASDFAVNPLPPRQAKSLFIRRFNELYKEVENG
>NZ_CP051260|1489239:1539005|1506030_1506927_-|WP_126656788.1|DBSCAN-SWA
MSRPSLKNVIVYKAQLPSAEAMSDHLSKIPFTEVLESHFCSYGYIPNPVTNELVTPITDGYLLTFRFDQKILPNAVIKKEVNERISKLKENGIEFIEPDIKNTVTAEFLRKAFVKTITTLVLYHPSKEYLLVASSNKNIANSAISTLIKACGSVKTETIHIDDVSQGLTTRLLNTLNNEEETDCFGKNFYLGQFYLLERKIDNKKEIVKYDADFNSIRDVLFDSLNNQFKINLIQLYTDDIQFKLTSDFHFKGIKPVNKIEFDDKDRVYRYRHECSLIMFYMTITIDFLIDLLKYKEK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1483220:1483236	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_046335325.1|1491973_1492921_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046335330.1|1493006_1493357_+|holin	phage holin, lambda family	NA	NA	NA	NA
WP_161779750.1|1493463_1493748_+	M15 family metallopeptidase	A0A1P8DTE2	Proteus_phage	2.4e-42	80.9
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WP_046335323.1|1494377_1494734_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046335322.1|1494832_1495843_+|terminase	terminase small subunit	A0A0U2RXW9	Escherichia_phage	6.4e-37	37.0
1494758:1494774	attR	NA	NA	NA	NA
WP_046335178.1|1496060_1496516_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046335342.1|1499361_1500432_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_049219126.1|1501209_1502391_-	recombinase	A0A2D1GN00	Marinobacter_phage	2.0e-29	30.0
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WP_168725602.1|1504047_1504581_-	hypothetical protein	J9Q748	Salmonella_phage	6.1e-39	46.6
WP_168725603.1|1504583_1504853_-	hypothetical protein	A0A248SL63	Klebsiella_phage	1.8e-18	65.4
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WP_126656788.1|1506030_1506927_-	recombination-associated protein RdgC	A0A1W6JP69	Morganella_phage	7.5e-98	59.7
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WP_049211705.1|1507622_1508312_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	S5FUZ3	Shigella_phage	6.6e-70	58.5
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WP_004251659.1|1509227_1509401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004251656.1|1509397_1509577_+	DUF4222 domain-containing protein	A0A1W6JP38	Morganella_phage	1.8e-11	55.2
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WP_168725609.1|1514847_1515870_+	site-specific DNA-methyltransferase	A0A1W6JP25	Morganella_phage	6.9e-132	69.8
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WP_070486607.1|1516179_1516416_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_168725616.1|1518986_1519535_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036970268.1|1519995_1520508_+	KilA-N domain-containing protein	A0A2H4FQV0	Salmonella_phage	7.4e-58	63.4
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WP_168725617.1|1521011_1523114_+|terminase	phage terminase large subunit family protein	A0A291AWY5	Escherichia_phage	1.5e-293	68.8
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WP_063073894.1|1527208_1527481_+	ATP-binding protein	K7PH43	Enterobacteria_phage	1.1e-15	46.1
WP_063073895.1|1527490_1528054_+|tail	phage tail protein	K7PMB7	Enterobacterial_phage	6.2e-50	57.1
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WP_074561718.1|1528993_1529383_+|tail	phage minor tail protein G	K7PJY4	Enterobacterial_phage	3.1e-16	41.0
WP_152964570.1|1529403_1529724_+|tail	phage tail assembly protein T	K7PHE1	Enterobacteria_phage	3.3e-16	41.5
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WP_168725620.1|1533126_1533498_+	superinfection immunity protein	A0A0S2SY85	Pseudomonas_phage	3.1e-13	33.0
WP_070486639.1|1533550_1534255_+|tail	phage minor tail protein L	A5LH40	Enterobacteria_phage	1.6e-66	51.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP051260|1620986:1689787|DBSCAN-SWA
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MSNTMTGTVKWFDEGKGFGFITPADGSKDVFVHFSAIQSDSFKTLAEGQQVSFTMENGMKGPAAGNVVAL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1618637:1618651	attL	NA	NA	NA	NA
WP_168725627.1|1620986_1622090_-|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA
WP_004247118.1|1622195_1622648_-	NUDIX hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_004247841.1|1622640_1623270_-	23S rRNA pseudouridine(2457) synthase RluE	NA	NA	NA	NA
WP_004251822.1|1623408_1624662_+	NADP-dependent isocitrate dehydrogenase	Q77Z09	Phage_21	1.8e-20	90.7
WP_060556847.1|1624771_1625905_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	Q77Z04	Phage_21	1.0e-155	72.8
WP_017628380.1|1625879_1626131_-	excisionase	NA	NA	NA	NA
WP_060556846.1|1626216_1626741_-	hypothetical protein	A0A1W6JP41	Morganella_phage	1.0e-54	61.6
WP_049217153.1|1627129_1627777_-	LexA family transcriptional regulator	K7PM82	Enterobacteria_phage	2.9e-75	65.1
WP_049217157.1|1627880_1628075_+	hypothetical protein	H9C161	Pectobacterium_phage	6.5e-15	61.0
WP_060556845.1|1628112_1628589_+	hypothetical protein	A0A1W6JP72	Morganella_phage	3.0e-45	60.4
WP_036976728.1|1628651_1628861_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017628377.1|1628850_1629030_+	DUF4222 domain-containing protein	A0A1W6JP38	Morganella_phage	3.4e-10	55.2
WP_060556894.1|1629587_1630103_+	hypothetical protein	U5P0A0	Shigella_phage	3.5e-23	44.2
WP_060556844.1|1630124_1630931_+	KilA-N domain-containing protein	A0A1W6JP13	Morganella_phage	1.8e-90	62.5
WP_060556843.1|1630927_1631953_+	DUF968 domain-containing protein	A0A1W6JP62	Morganella_phage	9.2e-84	46.5
WP_049219743.1|1631980_1632379_+	antitermination protein	Q8W638	Enterobacteria_phage	1.6e-31	54.3
WP_004244726.1|1632719_1632932_+	RNA chaperone/antiterminator CspA	A0A1W6JNX5	Morganella_phage	3.1e-26	81.4
WP_060556842.1|1633263_1633722_+	Hsp20 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_060556841.1|1634215_1635031_+	DUF1837 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_060556840.1|1635020_1638128_+	DEAD/DEAH box helicase	NA	NA	NA	NA
1637180:1637194	attR	NA	NA	NA	NA
WP_060556839.1|1638558_1638981_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_020946092.1|1639046_1639316_+	phage protein	A0A2H4FNF0	Salmonella_phage	1.6e-19	53.3
WP_168725628.1|1639315_1639786_+	lysozyme	A0A1W6JNW4	Morganella_phage	4.7e-51	63.4
WP_168725629.1|1639767_1639926_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168725630.1|1639928_1640390_+|lysis	lysis protein	A0A2H4JHL8	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-12	34.7
WP_168725631.1|1640386_1640755_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168725632.1|1641448_1641799_+	HNH endonuclease	A0A1P8DTD1	Proteus_phage	4.6e-59	92.9
WP_168725633.1|1641795_1642197_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168725634.1|1642387_1642882_+|terminase	phage terminase small subunit P27 family	U5P067	Shigella_phage	4.5e-68	75.6
WP_168725635.1|1642878_1644609_+|terminase	terminase large subunit	Q8HAD6	Salmonella_phage	4.1e-294	82.3
WP_049212495.1|1644618_1644798_+	hypothetical protein	S5FXQ9	Shigella_phage	1.7e-09	54.7
WP_168725636.1|1644797_1646027_+|portal	phage portal protein	Q8HAD4	Salmonella_phage	7.2e-176	72.2
WP_168725637.1|1645998_1646649_+|head,protease	HK97 family phage prohead protease	Q8HAD3	Salmonella_phage	1.3e-94	79.1
WP_168725638.1|1646662_1647871_+|capsid	phage major capsid protein	U5P0G9	Shigella_phage	1.1e-155	69.1
WP_063109140.1|1647952_1648261_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A1B5FP86	Escherichia_phage	4.8e-12	40.2
WP_168725639.1|1648257_1648587_+|head	phage head closure protein	NA	NA	NA	NA
WP_168725640.1|1648576_1649050_+	hypothetical protein	A0A0R6PHU8	Moraxella_phage	1.6e-11	30.2
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WP_115370344.1|1654744_1655326_+	hypothetical protein	Q7Y3Z7	Yersinia_phage	3.1e-52	50.0
WP_049219722.1|1655342_1655678_+	hypothetical protein	Q775B6	Bordetella_phage	3.7e-10	35.3
WP_168725642.1|1655756_1656155_+	hypothetical protein	A0A059VK01	Pseudomonas_phage	1.2e-31	46.2
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WP_168725644.1|1688135_1688552_-|transposase	IS200/IS605 family transposase	A0A1S5RHE3	Helicobacter_phage	1.7e-44	62.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP051260|1924662:1934654|DBSCAN-SWA
CTTAAAGCCCAATAATAGCTAAAATCATATCGATGAGTTTAATGCCTAAAAAAGGAACAATTAACCCACTTATTCCGTATAAAGAGAGATTACGGCGTAATAATGAATGAGCAGAAACAGGACGATAATGCACACCTTTCAACGCTAAAGGGATCAAAAAGACGATGATCAAAGCATTAAAAATAACGGCTGATAACATCGCGGATGCTGGGGAGTGTAATCCCATAATATTGAGCATATTCAATTGTGGATATGTCACCGCAAAAGCTGCGGGAATAATGGCAAAATATTTTGCGATATCATTGGCAATACTAAAGGTGGTTAGGGCGCCACGGGTCATAAGCATTTGTTTACCAATATGAACGACTTCAATTAATTTGGTGGGATTTGAGTCCAAATCAACCATATTGCCTGCTTCTTTAGCGGCTTGCGTTCCTGAATTCATAGCCACAGCAACATCGGCTTGCGCTAAAGCCGGCGCATCATTAGTACCATCTCCGGTCATAGCGACAAGTCGGCCTTCTGATTGATATTGACGGATCAACGCCAGTTTAGCCTCTGGAGTGGCTTGCGCAAGAAAATCATCTACACCGGACTCGGCAGCAATGGCCGCAGCAGTAAGATGGTTATCACCGGTGATCATCACGGTTTTAATGCCCATTTGGCGAAGTTGAGCAAAGCGCTCTTTGATCCCCCCTTTGACGATATCTTTAAGTTCAACTACACCAAGGATATTTTGATTTTCAACGACGACTAATGGCGTAGCACCAGCTCTTGCGACTTGCTCGACTATGGTGTTGACTTCATCGGGAAAATGACTATGACTAACTTCGATATGGCGACGAATAGCATCAACCGAGCCTTTACGTATAATACGCTCGCCAATATTTACGCCACTCATTCTGGTCATCGCTGAGAATGGAACAAAAGAGGCTCCCATCGAAGTTAAATCTCGTTCACGTAAATTAAAGCGCTGTTTGGCTAATATAACGATGCTACGACCCTCAGGTGTTTCATCTGCTAAAGAGCTTAATTGCGCCGCATCTGCCAATTGTTTTTCAGTTATTCCTGATAGAGGAATAAAACGAGAAGCTTGGCGATTACCTAAAGTAATTGTCCCTGTTTTATCGAGTAATAAAACATCAACGTCTCCTGCGGCTTCTACTGCACGTCCACTCGTCGCGATCACATTAGCGTCTAACATCCGGCTCATACCTGCCACACCAATAGAAGAGAGTAGTCCGCCGATGGTTGTAGGGATCAGACAAACTAATAATGCGATTAACGTTACAACAGAAATAACCTCACCATGCTCTTGGAATTGCACGGCAAACACACTAAAAGGATAGAGTGTGGTACAAGCGAATAAAAAGATCAGCGTTAGGGCCGTTAATAAAATAGTTAATGCAATTTCATTCGGCGTTTTTCTGCGTTTAGCCCCTTCCACCATACCAATCATACGATCGAGGAAAGAGTTACCCGCTTCAGCACTACAACGAATAATCAACCAGTCAGATAACACACGAGTCCCTCCAGTAACAGAAGAAAAATCGCCACCTGACTCACGAATAACGGGAGCTGATTCACCGGTGATCGCACTTTCATCAACAGAAGCGCCACCTTCAATCACTTCACCATCACAAGGAATTACCTCGCCAGCATTGACCAAAACAATATCGCCTTTATGTAATAAAAGTGAATCAATGATTTCTTGGGGAGCGTGAAGATCAGCATGCTGTAAGCGCACCGCTTTAGATTGTTGTTTCGCACCTCGTAAGCTTGCCGCCTGTGCTTTACTACGACTTTCTGCTAAAGATTCAGCAAAATTGGCAAATAGTAGGGTTATCCATAACCAAAACATGACTTGAAAAGTAAAATGATTATCTGGTGGTAGATACCCCAGTAAAACGGCAAACCAAATACCCGTAGTGAGTAGTGCACCAACATAAACAATAAACATCACCGGATTATGCCATTGGGCTTGAGGGGTGCATTTTTTGATAGCATCCAAGAAAGCTGACATCATTGTTTTTCTATTAAAAAGAGGTGTTTTTTTCATGATGAGTGTCCTTATTTAGCCCATAACAACTGTAAATGCTCAGCAATAGGGCCTAGTGCTAATGCCGGAACAAAGGTGAGCGCACCAATCATTATTACTGTGAGGAACAATAGAAAAATAAATAGCGGTGAAGTAGTGGACAATGTGGCTAAGCTTTCGGCTTGGCGTTTTTTTATTGCCAAACTACCGGCGATAGCTAAGACAGGCAACATGACACCAAAACGTCCGACAAGCATAGTGATACCTAATAACAGATTATAAAAAACAGAATTAGCATTCAGTCCGGCGAAAGCACTGCCATTGTTATTGGCAGCTGAAGTAAAAGCGTATAAAACTTCACTAAAACCATGAGGACCAGGATTTAAAATCGCTTCGCGACCTACTTCGCTAAAGAGGGCAAGTGTTGTACCTAATAAGGTGATTGCTGGTGATATTAAAATAGCGACAGCAACCCATTTCATTTCTGCTACACCAATTTTTTTGCCGAGATATTCAGGTGCTCGACCCACCATTAATCCAGCGATAAAAACAGCTAACAAAACATACAAGATCATGCCATAAAAACCAGAACCAACACCGCCGAAGATGACTTCTCCAGTTTGCATTAACCACATAGGAACCATACCTCCTAATGCAGTTAATGAATCATGCATGGCATTTACTGCACCACAAGAAGCAGCTGTAGTGACGGCAACAAATAACGCACTGCCTATTAAACCAAAGCGACTCTCTTTACCTTCCATATTTAATGAACTATCCGCACCCATTAACGTAAATTGTGGGTTGCCTCTCCATTCAGCCCAAACAATCACGCTAACCGCAACAATAAAAATCAATGTCATTACCCAAAGTAAGGTATAGCCTTGCCGTTGTGTGCCACTCAGTCGGCCAAAGGCGAAGCATAGCGCGGTAGGTAACAGGAATATGGCAAGTATTTGTAAAAAGTTACTGAAAGAGGTTGGGTTTTCATAAGGATGAGCAGAGTTTGCTGCAAAATAGCCTCCTCCATTGGTTCCTAACAGTTTAATCGCCTCTTGAGAAGCAACGGGGCCCATTGGTAACCATTGCTGATTTTCAAGTCCTTGGCTTAATAGCGCGGGATGGAAATTTTGGATCACGCCTTGGCTAACAAATAACAGTGACCAAATAATGGCTAAAGGTAGTAACAGATATAGGGTAATACGACCAATATCTACCCAAGCATTACCAATGGAATGGCAAGAAGATTGTGTTAATGCTCTGATCAATACAAAGGCAACAGCGATCCCCGTTGTTGCTGATAAGAAATTTTGTACTGTGAGCCCCATCATTTGGCTTAAATAGCTAACGGCTGTTTCACCGCTATAGGCCTGCCAATTGGTATTAGTAATAAAACTAATGGTGGTATTTAATGCTAAATCCCAACTCATATTAGGTGCAAACTGTGGATTTAAAGGTAAATAACCTTGATTAAGTAAAATTACCAATAATAAAAGTGCTCCCATTGAGTTAAAAATTAACAGGGCGAACATATAGTGATACCAACTCATAGACTGAATCGCTTTGCCGGCAGGTTTAAAACCACAGCTACGCCAAATAACCTGTTCTGTTTTTGTTACCCAATGAGGTAAATCACCTTCTATGAGACGAGCAAGATAATTGCCAATCACTTTTCCCATAATCAGTAAGACGGTGAGAAAAACGGCAATATAGATCAACGTTGTTGTTGCCATTTTTAAAATGCCTCTGCATGAAACAACACATAAATAAGATAAGCAGTGAGCACAATAACTAATGCCACAGCACCGAATATCAACATTTGAACTATCCTTTTGCGATTTAGATTGAGTAAAGCTACTGAAAGAGGTGTAAAGATGTTGATAAAAGCGCTATGGCGGATGTAAAAAAAGTATAAAAATGCTGACCAAACCTAAATCAAGGCTTAATGGTGGAATATTTTATTCCTCAATAGGTTGAAATAATGCCATCCCTTTGTTAGATGTAATAAATGGTCGAATAATCTGCTGATTAAGCAGGCTGAAAATACCCCTTCACGAGGAGAGATTGAATGAATGCTATCTATTTAAAGACCAAGTGGTTTTTCTACTTCTTAGGCCTATTAATGGTTTCATCTATCTTTATGGTAAAAGCAATGGCAAATTCTGATAAAGCAGATCTAGTAACATTGGCACAAGAGGGAAACTTGCCAGAATTAAAGCGCCAGATAGCGCAAGGAGAGAATATTGAACAACGAGATATCAAATTGCGTACACCGCTAATGGCGGCTACTCATGCGAATCAAATTGAGGTGGCAAAATACCTGATTGAACAAGGGGCTAACGTCAATGCCCGCGATGCTATCTATGATTCACCTTATCTTTATGCTGGAGCGAGAGGATTGCAGGAAATTTTAGCCTTAACCTTAGCCCATGGCGCAGATCTGAATAGCATCAACCGTTATGGTGGTACGGCATTGATTCCTGCGGCGGAGCGCGGCCATGTTGCCACAGTAAAAACCTTGATTGATGCCGGTGTGGATGTCAATCATGTTAATCGCCTTGGTTGGACTGCGTTAATTGAAGCCATTATTTTAGGTGATGGAAGTCAAAAATATGCAGATATCGTGATGTTGCTGATCGATGGTGGGGCGGATGTTAATTTAGCTGATGGATCTGGACGTACACCATTAACCTTAGCGAAAGATAAAGGCTATACCAATATCATCAATATTCTTCAACAAGCAGGGGCAAAATAATGTCAGATAAGCAATTTATACAGCAAGCCATTTCGCTTGCCACAGAGAATGTGAAAGTTGGTGGGCGTCCCTTTGGCGCGGTGATCGTGAAAAATGGCCAAGTGATTGCTCATGCTGTTAATCAAATTACAGCGACAAATGATCCAACTGCACATGCAGAATTATTAGCATTACGAGAAGCTGGAAAAGTGTTAGGACGAGCAAAATTGGATGATTGTGTGGTTTATGCCAGTGGTCAACCTTGTCCAATGTGTTTGGCGGCTATGCGTATGGCGGGGATCTCACAAATATTTTATGCTTACTCTAATGATGATGCCCAGCCTTATGGATTATCGACAGCCAATATTGCTAAGGCATTAAGAGTCGCTCCGGAGCAACAAGAAGGGTTGCAATTTGTGCAAATAAAACCTGAAGACGAAAAACAACCGGCACTTTATCAGCTTTGGTCTCAACAATCTTAACTAAAAATAACAGCCCAATTAGGGCTGTTCTTCTTTTGATCAAATCAGTCGATTAGCAAAATAGCTGTTTTTCAACAGGAGTAATCGAGAGTAGGGATTGCCAGCTTTTAAGCGTTAACGTTGCTAACATGGCAAGACCTTCATAATAAGGGAATGCTCCTTGTAATGACAATTTCTCTAGATAGCGATAAGCCCAAGGTAATAAATGTTCAGCAAGTAGTTCAGTTAATTTTTCAGGGCGTGTTTCTGCAACCCATGCCACCATCATCACCATTAAACCAAAGTGATCTTCAGGTTCATTTTGAGTCAAGGCAATATCAATACCATTCTCCAGCATCCATTCACGTAAATCTAAGGTTGAATCACCAAATAAGACATTCTCATGATCAAGATACACCGATCCCCAAGGTGGTGCAGGTAGCGCATAAGGCCCAATAAATAAACGTTGATAGGCTTGTGCTAATGTTTCATCTTGATAGGTAGTTTGCGCCAATAATGAGGCAATGCGTTGTTTTTCTTCTTCAGAGCCATAAGGCCATTCAGTTAACCATTTGCCGCTTGAGAGTAACTCAACAATGTCACTTTTTTCAGTTGGTGGGTAATAGAAAGCAGCCCCAATAATACGGGCAGAGAGAGAAATATCTGTAATAACTTGTTGTTCCATAATATTTTTATTATCCGCTGAAATGTATATTATCTATAATAGGTTATTCCCTATATAAACATAATGACTAAGATTAAAAAAGGGTAACACAGTAAAAGAAAACCGCCATTACGGCGGTTTTTAAGGATAAATAGGTTGATTAACCTACAACAGCCATTCCTACTGTCATATGTAAGCCATAGAATACGCCACGACCAATAAATTCACCAACAAACACTAAAATAAAACCTAACACCATTAAAGAAACAGAAGGATTATTTTTGCGTAATAACGGTGCTATCCAACAAGCTAACCCTAATGTCAGTGCAATCAATTTAATGCCCATTAAAAAACCGTAATCAGGAACTAAATCAACCGCTTTTTGTACGGAGGTTTGAATTGAACCCAATTCAAAGCCTTGAGAGGTAGCCACAATAGCACTGATAATAATGGCGATGACACTTAATAGCGGTAATGCACTAATACAATTTAAGTTAAAACCGGCAATACGCATTAACAGTGCCGCTAAAATAGGGCCACCAATAAATGCGGTTAGTACGAAGTTAACTGTGGTATAGCCATTATACCAAGTAGGTACAGTATCAATTTGATAAACTCGCGAAATAGCCGTGATAAATAGCACTGCAAGTATCATGACAACCACTAGCCACAATTTACCTAATGCAGCAGGCATTTTATTTAACACACTGATTAACCAATATAAGCCACCTAAAGCAAAGAATGTGGCACCACTGGCAATTTCATTACTTAATGATGAATGACCAAAACGGATAAAAGAGTTAAAGGCACGCATTGGGGTTCCCATGTGGATCATGGAGAGTAAAAAACCAATCCCCATTAATAACCACAAACCAAACATGCTGTAATGCACTTTGCGATTTAACGCTTCAGGCAGTTTGCCTGAAAGAATGGCGCAACCCATAATAATAAAGGCGCCAGCCACACTTTGACCAATAACGGTAAAGAACATCAGTGGCCATTCATGTAATCCCATGCCCATCTTAAACCTCCTCTGGGTTAGCCAGATGCCCGGTGGTGTCACCTACAGGTCGGCTATTGGCATTTAATTTAAGAACAATATTCGGTTTAGTGTATTTCGCAGATGGAAGAGGGGCTATTTCAGCAAGATCACCATATTTAGCGCGTAACTCTTCAATCGGTGCCATATCTAATGCACGCAATGGGCAAGATCCGACACAAATTGGCTTTTTGCCTTCAGCAACACGCTCATAACAACCATCACATTTGGTCATGTGGCCTTTGACTTCATCAAACTGCGGTGCACCATAAGGACATGCCATATGGCAATAACGACAGCCTATACACACTTCTTCATTCACCACCACAAAACCATCTTCGCGTTTGTGCATGGCGCCACTTGGACAGACTTTTACGCAAGCCGGATCGTCACAGTGGTTACATGAAATAGATAAGTAGTAAGCAAAAACGTTTTGCGTATACACACCATCTTGCTCGGTCCAATCACCACCGGCATATTCATAAATACGGCGGAAATTGACCTCAGGGGATAAATTTTTAAAATCCTTGCACGCGAGTTCGCAGGTTTTGCAGCCGGTGCAACGACTTGAATCGATATAAAAACCATATTGCGTTGACATAACCAGACTCCTTACGCCTTGACGACTTCAACAAGATTACTGTGAGAAGGATTACCCTTAGCAAGTGGTGAAGGGCGTTGGGTCGTTAACACGTTAATGCAACCTGCATGATCAATGCGGTTACTGTCTGGGTTATACCAAGCCCCTTCACTTAATCCCACAACGCCCGGCAAAATACGTGGTGTCACTTTAGCCTTGATACGTACTTCACCGCGATCGTTATAAATACGGACTAAATCGCCGTGTTTGATACCACGTTTTGTAGCATCAACAGGGTTTATCCAAATTTCTTGTGGACAAGCCGCTTTTAATACATCCACGTTGCCATAAGTTGAGTGGGTACGAGCTTTATAGTGAAAACCCGTCATTTGTAATGGGTATTTATCCATAGCAGGGTCGCCATAGCTTTCAAAACCTGCGGAGTAGATTGGCAGTGGATCAATCACATCGTCTGCTGCTAATTCCCATGTCGCTTTAATTTCAGCTAATTGCGAAGAATAAATTTCAATTTTTCCTGACGGCGTTGTCAGTGGATTGTTGAGTGGATCAGCGCGGAATTCACGGTAAGCCACATGATGGCCTTGTGGATCACGTTTTTTAAAGATACCTTGTGCCCGAAATTCTTCAAAGGTAGGCAGTTCTGGTAAATTTTGACGAGATTGCTCATAAAGATGGCGTAACCACTCTTCTTGGGTACGATTTTCGGTAAATTTCTCACCCACCCCCATACGTTTAGCAATTTCGCTGGTCATCTCATAGATATTGCGACTTTCAAAACGTGGCTTAATCGCTTGGTCAGCGAAAATCACGTAAGCCATATTCCCCGCAGAAGCATCCATACAGAAATCCATTTGCTCTGATGCCGTGCAATCTGGCAGTAAGATATCTGCATATTTTGCCGATGCGGTCATATGATTATCGATAACCACAATCATTTCGCATTTTTTATCATCTTGTAGGATTTCATGAGTACGGTTTATTTCTGAATGTTGGTTAACTAAGCAGTTCCCCGCATAGTTCCAGACCATTTTAATAGGTACATCCAGTTTATCTTTACCTCGCACGCCATCACGTGTAGCGGTCATTTCAGGACCACGTAAAATGGCATCTGTCCACATAAACATAGAAATACTGGTCGTGACAGGGTTAGTTAAGGTTGGCATACGGACAAAAGGAATGCTGTAAGAGCCTTCACGGGCACCGGTATTGCCCCCATTTATTCCCACATTACCTGTTAAGATAGCGAGCATTGCAATAGCGCGAGAGGCTAATTCGCCATTTGAACGGCGTTGTGGGCCCCAACCTTGAGTAATATAAGCCGGCTTAGCACCGGCGATTTCACGGGCTAATTTGACAATACGTGTCGCGGGAATGCCGGTAATTTGTGCTGCCCATTCTGGGGTTTTGGGTTGACCATCTGCGCCATCACCTAAAATATAGGCTTTATAGTGGGCGTTTTTAGGTGTCCCTTCTGGCATCGTAGTTTCGTCGTAACCAACGCAGTATTTATCTAAGAAGGGTTTATCGACTAAATCTTCTTTGATCATGACATAAGCTAACGCATTAACTAAAGCTGCATCAGTACCTGGACGAATGGGGATCCACTCATCCTCACGACCTGCACCCGTATCAGTATAGCGAGGATCAATAATTATCATGCGAGCATCTGATTTTTCACGAGCTTGCTCAACATAATAAGTTACACCACCGCCACTCATACGTGTTTCGCCGGGATTATTACCAAACATAACAACCAATTTAGTATTTTCGATGTCTGAAGGACTATTGCCATCAGCCCATCCCCCGTAGGTGTAATTTAAGCCTGCAGCGATCTGCGCAGTACTATAATCGCCATAATGGTTGAGATAACCACCACAGCAATTCATTAAACGGGCAATAAGGGTTGCTCCTGGTGGCCAAGATTTTGTCATGGTGCCACCGAGGGTGCCTGTACCGTAATTTAGATAAATAGATTCATTGCCATAATCTTTTATCAGGCGTTTCATGGTGTCGGAAATAGTATCAAAGGCTTCATCCCAAGAGATACGTTCAAATTTACCTTCACCACGTTTACCTACGCGTTTCATGGGATAACGTAAGCGATCTGGATTATAAACACGTCGACGCATAGAGCGACCACGTAAGCAAGCTCGTACTTGATGGAACTCGTCGTAAACGTCATTGCCGGTATTGTCTGTTTCAACGTACTTAATTTCGCCATCAACGACATGCATACGCAATGGACAACGACTACCGCAATTGACGGTACATGCACTCCAGACGACTTTTTCTTTATTGGTAGATGTCGGCGCTGTTTGCTCCGAAGCCATGGCTTGGCTAAAGGGGAGAGATAATCCACCCGCCGTTGCAACTAATCCACCAGCGGCTCCCACTTTGACAAAGCGTCGGCGAGATAGGGGGGTGGAAAGTAACGCCATCTCTTTGATGTTTTTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_004248043.1|1926731_1928432_-	potassium-transporting ATPase subunit KdpA	NA	NA	NA	NA
WP_036918303.1|1928767_1929454_+	ankyrin repeat domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004242888.1|1929453_1929915_+	nucleoside deaminase	S4VYZ2	Pandoravirus	7.0e-15	34.6
WP_004242890.1|1929967_1930579_-	Tat proofreading chaperone DmsD	A0A077SLS7	Escherichia_phage	7.3e-28	39.1
WP_004242891.1|1930718_1931579_-	dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit family protein	A0A077SK59	Escherichia_phage	3.7e-25	35.5
WP_004242892.1|1931580_1932198_-	dimethylsulfoxide reductase subunit B	A0A077SL61	Escherichia_phage	2.2e-72	58.6
WP_110706632.1|1932209_1934654_-	molybdopterin-dependent oxidoreductase	A0A077SK27	Escherichia_phage	1.2e-219	50.2

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP051260|2458382:2477251|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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MSIKQTRYVDIASAVIGASTAPMRKLTARIFSTNPKIPAGKVLEFTSGQVDAFLGADSPEAQFARQYFSYVSPAPVSKPKELQIASYEPMGRAPTLFGGPVATLDKLKLIEEGELTLVIGDVTKKISKLSLQDVTSYSDIASLIQAKLNAESEPQFASCYVTFNAMDSAFLISGGVQEKAQISVNNSPLADALGLSQGQTSEGNASQTALEAFMAAEAISDSFGSATFLTELSIEQSVELAEYVAGENVKYQLYLSVPDQQAEMYSKALMNTASTGLNLKTEENFFVQALPMAIMAATDFERTNATTNYMYRQFGITFPSQVTTDMAADRLDKLRLNYYGETAVSGSEISFYQRGFLCGNGANPVDMSVHANEQWLKAYIAQQWLSLLLSTSGIPANKDGEARAMMIIAGAVTKALNNGTIQTGKALTEVQKIAITDAAGDDLAWHDVQNKGYWYNAEIVEQTGPGNLPEYTMKYVLIYGKGDWVRKVEGSHNLV
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MKEQGISALLAGGMAILRSLYNAGGWKKTFLDGLMCAMFAWFIKDILLLFSINHQFAYLASVFIGYVGIEPVSKLLIRKNRS
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MITEVRIFDLASFTTLFDSVNPTQVTIDDSHQAITFTVENGESRSDHVVINPISISISLLLTGDIANAYATIKQLYDENTLVGIQTRVSTYQPMLLESLSHDEDPSKVDAIELKLKFIEWKSIEPEYNKKSAKSTKKPKQSSTINRGNVKSKKSMPIGKKRARR
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MAKIARGERNNNPGNIRHGAKWQGLASTQTDKDFCQFISPEYGIRAIYKLIQTYQNKYGLNTIKSIIYRYAPPNENNTLGYIERVSKEIGIESNKTIDTQIKKVCISLSIAIINIELGYQPYAKKVFEDAWLLL
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MSVIATIGIGYLIGAVLSFIITFFLTKDPSLAMRLLSAFLIAITWPLSFPMAIIFSIFG
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MNDISATGLSLIIQASKTFPAGIPITTFSDEGDPLDLPTVNITQTAVDINGNLVSWSSPTPQTVTINVLAGSEEDENLAILFDANTARRGRRPASDVITLVASYGDGSITTARNGRITGGCRGNSVAGVGRLKSKQYTFIFQDFDRVRAR
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MDLRRIRLGIEVGERLQWYEGLRISASGTKYANPLQNECNVTISGLNAQTRDYLLTETSPYNNNKQTRRLYLEVGRVNTGLLSLFIGDIVSAEIDSPPDVTLTLSAKTSHQSAGKIISSSGGTMRRLSEIALAIADDCGVKLDFQATDKNIANWYYCGSALHQIERLQEAGDVKAFIDDDTLFVKDDDKALKSRLRILNMNSGMIGIPKATESGLTVSYLIDSTSELGGMLRLESKLNPSLNGDYIIEQLAFSVASHEADFNYTAICKRA
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MNDNDINKAIREQLIKQLIKIDINAEVITGYQPEEITDNNIIMFFPIKEVSQGWQKRSYDVQGNNANHTEQQLVELTYQVQSFTKKQSDFTEGDLIRTTRMIIHSLPFIESMRKKGIGIQRATEIRRAPIINEGNSYEHNPSFDFNVTFPSSLSLNTAATHLLISNLSRI
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MLIKPKEITVIDSDRQQHTFIISRLPATIGREILAKYPLSNAPKIGDYEVSKEAMLKMMAYVAVEKEGQEIYLKTSTLIDNHVPDGEALIRLELEMLKYNTSFFGNGGSQNFLQYLLGKLSGSLPSIIKTLMASLPSSSQPASPLSQNSKQP
>NZ_CP051260|2458382:2477251|2460832_2461450_+|WP_049213336.1|DBSCAN-SWA
MKQYGFYFDSTKCTGCKTCQVSCKDEKDLDLGPKFRRVYEYGGGSWAKQDGIWTQNIYSYYLSISCNHCSNPTCVAGCPTGAMHKREEDGLVVVNQDVCVGCRYCELRCPYGAPQFDEKKKLMSKCDGCYERVAQGMKPVCVESCPQRALDFDDIDVIRAKHGTECGIAPMPDPSLTNPNIVIKAHKDAKPSGDKTGSVQNAAEV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_012368081.1|2458382_2460821_+	molybdopterin-dependent oxidoreductase	A0A077SK27	Escherichia_phage	5.0e-261	54.5
WP_049213336.1|2460832_2461450_+	dimethylsulfoxide reductase subunit B	A0A077SL61	Escherichia_phage	4.4e-89	68.3
WP_004243611.1|2461453_2462230_+	dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit	A0A077SK59	Escherichia_phage	5.1e-42	39.8
WP_004243612.1|2462345_2462888_-	DUF924 domain-containing protein	A0A1V0SIY0	Klosneuvirus	1.9e-19	34.7
WP_017628013.1|2463456_2463636_+	GhoT/OrtT family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_108716900.1|2463775_2465011_-	hypothetical protein	Q6IWQ6	Burkholderia_phage	2.4e-14	34.1
WP_004243615.1|2465016_2465673_-	DUF2612 domain-containing protein	Q6IWQ4	Burkholderia_phage	2.3e-35	39.9
WP_017628010.1|2465669_2466857_-	hypothetical protein	A0A2H5BG53	Pseudoalteromonas_phage	1.9e-72	37.7
WP_004243617.1|2466849_2467194_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004243621.1|2467190_2467883_-	hypothetical protein	A0A2H4P6V3	Pseudomonas_phage	1.2e-29	35.7
WP_004243622.1|2467885_2468698_-	hypothetical protein	Q6IWQ0	Burkholderia_phage	9.0e-42	39.2
WP_004243623.1|2468666_2468987_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036971128.1|2468992_2469487_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_107337176.1|2469489_2471793_-	hypothetical protein	A0A2H5BG44	Pseudoalteromonas_phage	2.0e-14	23.1
WP_004243627.1|2471875_2472334_-	hypothetical protein	Q6IWV4	Burkholderia_phage	1.9e-25	48.5
WP_004243628.1|2472393_2472846_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168725666.1|2472856_2474344_-	DUF3383 domain-containing protein	A0A088C3U1	Shewanella_sp._phage	5.4e-77	35.5
WP_110706591.1|2474352_2474865_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036918597.1|2474901_2475351_-|lysis	lysis protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706590.1|2475347_2475752_-	structural protein	A0A0E3JJ20	Enterobacteria_phage	1.1e-24	45.8
WP_168725667.1|2475754_2476003_-|holin	phage holin, lambda family	A0A1P8DTE4	Proteus_phage	8.9e-17	53.8
WP_036918599.1|2476435_2477251_-	antitermination protein	M9NZB0	Enterobacteria_phage	2.1e-54	43.3

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP051260|2975502:3023809|DBSCAN-SWA
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MKTIFIKDFSRFPGPRYKYLGEFSGEEFRDDILIPAIKNNNGDIEINLDGVLGYGSSFLEETFGGLVRHGVDKDLILKIRDRIISSDESIKQEVISYIDDSL

Homologous phage analysis in the prophage region

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2975273:2975328	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_049257604.1|3002315_3002693_-	hypothetical protein	A0A1W6JP00	Morganella_phage	1.4e-05	30.8
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WP_164526264.1|3003023_3003359_-|holin	phage holin, lambda family	A0A1P8DTE4	Proteus_phage	8.1e-05	31.5
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WP_159262679.1|3009047_3010133_-	DNA replication protein	E5AGE9	Erwinia_phage	1.4e-82	50.7
WP_168725563.1|3010125_3010350_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168725711.1|3010398_3010734_-	transcriptional regulator	A0A1P8DTF0	Proteus_phage	2.0e-51	96.3
WP_036895075.1|3010869_3011055_-	hypothetical protein	A4KWW0	Enterobacteria_phage	2.3e-09	58.3
WP_168725712.1|3011150_3011861_+	LexA family transcriptional regulator	A4KWV9	Enterobacteria_phage	3.3e-80	62.1
WP_168725713.1|3011896_3013012_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_072502853.1|3013014_3013323_+	STAS-like domain-containing protein	A0A2H4J4X6	uncultured_Caudovirales_phage	2.3e-14	48.4
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WP_036970054.1|3014174_3014444_+	hypothetical protein	A0A1P8DTK1	Proteus_phage	6.2e-24	72.5
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WP_094960320.1|3015868_3016123_+	hypothetical protein	A0A1P8DTG3	Proteus_phage	2.5e-38	95.2
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WP_036908295.1|3016930_3017737_+	recombination protein RecT	A0A1P8DTF2	Proteus_phage	1.9e-145	98.9
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WP_109910842.1|3018319_3018589_+	hypothetical protein	A0A248SL63	Klebsiella_phage	3.5e-19	66.7
WP_168725718.1|3018591_3018912_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168725719.1|3019105_3019456_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_049211072.1|3019465_3019711_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_060558087.1|3019869_3020235_+	DUF2528 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_060558086.1|3020238_3020466_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_168725720.1|3020452_3021055_+	DNA methyltransferase	A0A248SKY3	Klebsiella_phage	2.0e-54	52.0
WP_004247695.1|3021062_3021257_+	hypothetical protein	A0A1P8DTH3	Proteus_phage	3.5e-29	90.6
WP_070487132.1|3021490_3022648_+|integrase	site-specific integrase	A0A0M4R586	Salmonella_phage	8.9e-176	74.9
WP_004244243.1|3022936_3023809_+	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	5.7e-34	36.8
3022659:3022714	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP051260|3282581:3291461|DBSCAN-SWA
TTTATTCTTGTTCATTGATTAACTCTTGTTTCTGCTCTGGCTCTTTTTCAAGATCGTCAATATTAAAGACTGCGACATTATCCATCAGCACTTGTGCTTTATCGTTTAACATCATGGTAGAAGAGGCGGCGAGATCGACCAAAGAGGCATTTTGTTGTACTACCGTATCCATTTGATTAATTGCTACTGCAATTTGTTCGACACCAAGACGTTGCTCTTCCGACGCTAAACTAATCCCTTGCATGATCTTGTTTACTTTTGAAATGGAAGAGACAATCTCTTGCATGCACTCACCGCTTTTATTCACTAAATTTGTACCATAGGTAACATCATTGATAGATGCTTTAAGAACTTGGCTAATCTCTTTTGCTGCTTCAGCACTTTTTGCGGCTAAGTTCCGTACCTCAGCGGCCACAACGGTGAACCCACGCCCTTGCTCGCCAGCTCTTGCTGCTTCTACGGCAGCATTTAAGGCCAAAATATTAGTTTGATTGGCTAATTTATTAATAACATCATTAATTTCCCCAACTTTCACTGCACCTTGTTCTATTTTCTTCATCGATAATACAGCTTCTTTCATGACATTAGCGCCATCCATAACAATGTCAGTAGATTGATTAATAATATTATTTGCTTCAATTGTATTATCGGTATTGTTAGCAACGGCTATTTTGATCTGCTCCATACTGGCAGCGGTTTGTTGTAACGCACTGGATTGTTCTTCTGTACGAGATGAAAGCTCTTGATTACCAGAAGCAATTTTAAATGCGCCCCCTTTTATATCCATAGCCTCTTTTTTGACAGAAAAGATTGTCGAGGTTAATGCTTTTTGCATATCACTGACACGAGAAAAAAGTTTACCAAACTCATCATTTTTTACTTGTGGTACAGAAAAAACCAAGTCAGCATTACCTACTTTATTTAATATCTCAGACAATGTATTAAGATTAGAGACAAAGGTTTTATTGATCCAATGAAGCACAAAGTACAAAACAATTAATAAAATAATTAATGAGATAATTGTTGAGTAGATAGAAAACTCAACCATTGAATCTTGTTTATGAGTAAGGTAGAGACTATTTTTATTTCTAGTCTGAATATATTTTTCAAATAATTGATCAAGATGTTCAAAATCTTGATCAAATTGATTAGCTTTTATCTTTATTGTCGCTAATTTATTAGGATCTAAAACTAATTTATCTATCAGATTATAAAATAACGTCGAAATATCATCAGCATTTTTTTGTGCTGCAACAGTCATTTTCTTCTCTTTCACCCATGTTTCCATGGTGTTTTTAGCCATGATAGCTAGCTTTTTATTTTGCTGAATAATTTTGTTACGATCTGCGACACGACTATCTTTGTCTTGTAATAGATAATTGACATTAGAACGCATAATAGCCAGTTGATAACGAGCCATCAACACATCGTCATAACGTGCAGATAAGACATCAACTTGAGTAAAATTGTTTTGCATTTTATAAATAAAAAATGAAGATAAGGCAGACGATAGAATAAAAATCAATAACAGTAAAGAAGAGCCTAATTTTACGGTTCGTTTAATACTCATGATAAAAATACCTATATGCGCATATCGATAAGATTTATTTTTTATCGACACAATGATATTTTTATTTAATTATTAGAGATAACACTAGGTCATTGATTTTTATTTTAAATAAATTTTTATATCATAAACAAAATAAGTTATTTTTAATAACTGCTATAATTATTGGTATATTATAAAATAAAACAAACCAATTCTTTTAAAACATAATCCGCTATCAATTAGTGCATTCTTCTTTATGCTCAATATCAATTTTCATTTTATATGACTAATATCATCAACGATTAAAAATAAAAACCTTATTTTTTCAATAAGATACTGATGATACTATCTCATTTTGAGAACAATGATATAATAGGCGCTTTACCTCATAAACTCTGATGATTTACGGAGCTCAATATTTATGCAACCACAATTTGAAAACGCAAAAAACACCGTAAAAACATTATCAGTGTTTGATTTTGATGGTACTTTAACCTATCACGATAGCTTTATCCCTTTTCTAAAGTTTGCCTTTGGGCGTCGTAAATTTGCTCGTCGTATTATCAAAATGGTATTCCCCACATTACGTTGTTTTAGACGTAAACTGACTCGTGATGAATTAAAAGAAGTGCTGATTAAAACTTTTTTAACCGATATCAAAGAAGAATGGCTCAAAGAAAAAGCCGAAGCCTTTTGTAAAGCCTACTGGAGTAAGTTAATGCGTCCTGCAGGTTTATTAGCCGTTGCTGAAGAGATTAACCGTCATGCTGAAGTGACCATTTGTTCAGCTTCTCCAGCTATGGTGTTGCAACCTTTTGCGGATCGACTTGGTATAAAGTTAATAGGAACAACACTTGAAGTGGTTGATGGTGTGCTGACAGGAAAAATCATTGGCAATAACTGCCGTTGTGGCGAAAAAATCAAACGATTAGAGCGTGTCTATGGCGATCTTACTCAATACCACTTAAGGGCGTGGGGCGATTCACGTGGTGATCATGAATTACTCTATGCTGCACAAGATCCACATTGGCGCTATTTCCACACAGGAAGTAATAAGTCAAAAAAATCACCTATTAAAATAACGCTTAAAAAAGACTCATAAGTGATTATATAAAAATAAAGCGGGAAACGTATTTTCCCGCTTTATCCATAAACTAACTATTTATCTAGCCATCTTGGCGCTTTTATTAGCGAAAGATTAAATATTGACGCCATGTTGTGCGGCTAGTGCGCCTAAACCACCCGCAAAACCTTGGCCTACTGCTTTAAATTTCCAATCTGAACCATGACGATAGAGTTCACCAAAGATCATCGCCGTCTCCGTAGAGGCATCTTCAGAAAGATCAAAACGTGCAATTTCAGTGTTATTGTCGTTATTATAAACGCGCATAAAACTGTTGCTCACCATACCAAAGTTTTGTTTGCGGTTTTCAGCATCGTAAATAGTGACAGCAAAAACCAGTTTTTTCACTTCAGCAGGAACTTTGGATAAAGTGATTTTGACTTGTTCATCATCACCTTCGCCTTCTCCAGTACGATTATCGCCTTGGTGTTCAACACTACCACATTGGCTCACTTTATTATTAAAGAAGATAAAACTTGCATCTGAAAGCACTTTTCCATCTTCACCGACCATGAATACTGACGCATCTAAATCAAATTCAGCGCCATCTGTCACGCGGGCATCCCATCCTAAACCAACCATAGCCACCGTCATGGTTGGTGCTTCTTTAGTTAGCGAAACATTACCACCTTTAACAAGGGAAACAGCCATATCAAAGCTCCTACTGTGTTGAATAAACTGACAATTAGGAATAACTGCCAGTAATTTGTGATTTCATAACATACGATTAAGAGGCGTTAATACCATATTGCGCACATACTGAGCCTAAGCCCCCTGCATATCCTTGGCCTACAGCACGGAATTTCCACTCACCGTTATGACGATATAACTCACCAAATAACATCGCCGTTTCCGTTGATGCATCTTCCGTTAAATCATAACGAGCAACTTCAATTTGGTTGTCATCATTAACTAAACGAATAAACGCACCAGATACCTGACCAAAGCTTTGACGACGCGCTTGCGCTTCATGGATAGTCACTACAAAGATAATTTTTTCGACATCACTGGGGATGGTATCTAGTTTGATTTTTAGTGCTTCATCATCACCATCACCTTCACCTGTTCGGTTATCACCAGTGTGAACAACAGAGCCGTCGGCAGATCTTAAGTTGTTATAAAAAATGAAATCGGCATCGCTACGTACTTTTCCATTAGCGGCTAACAGAAATGCAGATGCATCTAAGTCAAAATCTTGACCATCTGTAGAACGGGCATCCCAACCAAGTCCGACTAGGACGTTTTTCATCGTTGGGGCTGCTTTGCTTAAAGAAACATTACCACCTTTAGAAAGAGAAACGCTCATCTTCAACCTCTTCAATTTATGTTGCGATATTCTAATTTCCCAAGAATATCGGTTATCATTATTTACCTTATTTATTCTTTTTTTCTGGGAATACAAAACTTGCCAGAATACCCAGAGCAAGAACACCAAGCACTACGAATAGGCTGGTTGTCGCGGAAATGCTATATCCATGCTGCCAAATATGATCTGTTGCATTAAGCCCCAGCTTTACAGCAATAAAGAACAGCAATGCAATAACCGCTTTTTCAAGGTGAATCAGATACTGTTTTAATGCCTCTAACACAAAGTAGAGAGTACGTAAGCCCAAAATAGCGAACATCATTGCACTATAAACAATCAGTGGCTCACGACTAACGGCAATGATTGCAGGCACCGAATCGAAAGCAAACATCACATCAGAAAGCTCTACCACCGCCACACACAACATAAGCGGTGTCGCATATAACGCAGCTTTTGTACCTCGCCCGATAGTTATGTCTTTGTTTTCCGGTTTTGCTAACTCTACATCAACCTCTTTTTGTGTTAATAAGAAGGCATGTCCAGTAATTTTTGGCCATATAGGGAAAAATCGTTTTACTAAGCGATAAGCAAGATGCTGTGAATAGTCTTCAATTTCTTCACTATCATTCCCACTTCTCAGCATCATTACGGCTGTCCAAGCAACAATCAGAGCAAAGACTATCTCAACGTAAGGCCCTAAACTTAATAAGCCGGTACCAATAGCAACAAAGATCGCACGGAATACAATGGCACCAATGATCCCCCAATACAGAATGCGGTGACGGAAACGATCAGGAACCGCAAACCAAGAGAAAATCGCCATCATGACAAATAGGTTATCGACAGACAGCACTTTCTCTAATGCATAACCCGTCACGAATAAGCTTGCAACTTCTGCACCATGGTGGACGTATAAAAAACCCGCGAATGCCATGGCAACGACTACCCAGAATATTGACCAAAAAACAGCATTCTTTAACGTTATCGGCTTATCTGCACGATGCATAAATAAATCGATAAAAATAGCGCCTATCGCAAGTACAACAAAAACAATGACAGTTTCTGTCGGAAAACCAATATGTGTGGATACCATAATTATTCCTAAACGGTTCCCTATATAAAATTAATTACAAATCAAACTCTGCGGGCTCAAAGCCTAATGCAACGGCAATAGCACGCACCGCCTCTTTTTCGTCATTGTCAAAATCACCATCACTTTTCGCAACAGCAATACCGACACGGATCGCTAATTGTGCAGCTTCTGGCTGATCTTTCATTGCCAGAATATACTTCATCGTTTCACCTTTACCGACTTCAGTATCAAATTCAAAACTGCTAATTAGCTTATTAAAGAATTCGATCACCTCGGAGGTATCAAAGACTTTAAGCTCTTCTGATGCTTTTAAAAAACCTAGCATCTTCTGCTTTTCTTCAGAACTCACACCATCGCTGGCAATAGCGATACGAGCACAAACTGCGACCGTACCTTGCATAAATTTTTTGTTTTTAAAACGACTGACTTGCTTAGTTAACTCCGCTCGCCCGGAATTAAAACCTTCTTTTAATTTATTGAAAAAACTCATTTTTATTCTCCTTATTTCGTGTATTCACTTAGATCCAGCAGTCCAGCGAAATCCCCATCCGTAGGCATTATCCATATCGCGATGGCCTTTAAAAAATTCATTGAGACGTTCAACTTTGATTGATCCGTTTTCATTAATAAGTCGTGCGATGGCACACATAGCTCGACCATTATTACCATCCGTTAAACGTGTTTCGATAGGTGGTTGCTCGGGAACATGAATAGTGACCACACCATCTGTTTTACTCCAGTTAGGAACCCCTTCATAAATAAAAGTAAAAATAAGCACTTGCTTGATATTTTTCCATTCACGTCCATTGATAAAAATCCACTCGCCACCCGCTACATCACCAGTGCGATCATCACCTTGTAACTCAACATAAGGCATGCGATTAAAATCACCGAATCCATTTCCTAAGGCTTGGATCACTGACTTATAACCATCTTGTAGTTCAACAAAGGCGCCAATATCTAAATCAATACCTTTGTTACCACCAAATAATCCACCTAATAACCCGGAACCACCGCTTTTACTTTCTCGATGCCAATCGAGGTTAATGCGGATTTTGCCGAAATCATCCTTTTTAGTTAAGCTAATTGCAGGTTTCTCTTTAGTTAGCGAAACCTTGCTTAAGTTCACTGAGCTCGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTTCAGGATCAGCAATATCAACACCAAAATATTCCGCCAATGGTTTTAATCCACCGTTAAATCCTTGTGCAATAAACCGAAATTTCCAGCTTCCATTGCGACGGTATAGCTCACCTAAAATTAATGCCGCTTCAGTGCGTCCATTGATATCAACATGGCCGTTCGCAACGACATTATTGTTAGCATCAACTTGAATAGACAAATGTTGTAGATGAGCAATGGTTTGTTGCCCCTCACAAGTAGCTGTAAAAGCAATTCTATCGACATCAGGACGTAAGCGAGTTAAGTCAACCGTAAACGACGTGCTATTACCTGCTGTTGCATAAATAATAGTACGGTCATCATTAGTGGTTTGACCATAAAACACCATATCAGCATCACCGTTCACTTTTCCTGAGGCATAAAGCCTAAATGCAGATACATCAACAGGTGAGCCTGAGTGAATACGCACCATTAACGTTTGATCAGGTACGGATATATTTCCGCCAGGTGTTAGGGTCATTTATCGCACCACCGTCGCCAAAATATCTGGCATCATCTCGTCAATGACAAGCCCTTTACAAGGTGAGCCAAAAGCCGTGAAATCCCATTGTCCGTGATTACGTTGTAAAGCGGCAATCACGATCCCAGTATGAGCGCCTTGTTCCGTTAATTTGTAATGAGCAAGCTCTTTATTGGTTGTTTTATCGACAACTCGACAAAACGCATTTTCAACTTCATTAAAGGTCTGCCCACGGAAACTATTGACAGTGAAAACCAAATATTCAACCAATGAAGGAAGACGATTTAAATCAACAAAAATAGTTTCATCATCACCATCACCCTCTCCTGTTAAGTTATCTCCTGAGTGAATAACGGACTGACAAGTTGATTTTAGTTTACGAAACCAAATAGTATCGATTTGTTTACCATTTACATCGAGTAATACACAACTTGCATCTAAATCTATCGAATTATTACCACCAAAGAGTCCACCGAGAAATCCCTTTTTCTTAATAGGATCCCAGCCTAAACCAAACATTAGGTGACTCAGTGCAGGGGCTTGTTTACTGAGAGAGACTGTCTGATCCTTGCGTAATGAAACCATAATTAACTCCCTTCAAAGGTAGAATGAAACAACAATATCACTTGCATATAAATACAAATTATAAATCATCATATCATGATGAAGTAGTTCGGCAAGTCTATTTTTATCAACTTACTTCAAGAGATTGTAAACATATTGAAATAAAAGAAATTTTTATAGATAAACACAATTAAAACTTAAGTTAAAAACAAAAAATACCGCATTAACCTAATTATTTTAAATTAAAGTAAAATAGATCACATTATGATTGACATGATAAAATAGAAACTTCATGATGAGAAAACAGGTTTTAGCTTAAACATTCACAGTATGTGACGTTATGTTCAACACGGCTTAGCTTATACCCAGATAAATGCACTTAAAAAACTAATTAGTACGGATAATAAAGAATAATGAATAGTTTGATTGGCTCTTCTGTTTATCGTCGCCAACTCACTTGTGGCACATTAAGCGTAACGCCAAATTGCTCATTAGAACATCTTGATGAACTTTTTGATATTGCGGAAAGACGCAACCCTAAGCGCGCTTTTTTGTTTGTCAGTAAAGTATTAGGGCGCCATATTCCTGTTTCACCTAAGAAAATGCGTGAAACTTATCAACAAATGGCCAAACAATTTCCTCAATCACTCGAAGGCCCTATTCTTTTTATTGGTATGGCAGAAACTGCGGTCGGTTTAGGTGCGGGGATTTTTGATGAAGTAAGAGATCGCTATCCTCAAGCCCTCTACCTTACTTCAACGCGCCATCCTATTGCTGATGGTGAATTATTCTGTAAATTTAAAGAAAATCACAGTCATGCAACTGATCACCTACTTTATTTGCCTCATAACCTAGAACAACGCCAATGGATCCAGCAAGCGAAAACCATTGTGTTAATTGATGATGAAGCAACCACAGGTAATACCTTTCTTAACTTGCTGTCTGCATTACGTGAAGAAGGTAAGTTAACACAAATTAAGCAGATTATTGCTGTCACATTAACCGATTGGAGTGGTGATGCTCTGCAAAAGCGTTCACCATTACCCATAACAACCTTCTCTTTAGTGCAGGGAAAATGGCAATGGCAAGCCAATCCCGATGCACCATTACCTGTTATGCCAAATGTCAATATTACTGCTTCAGGACAGGTTGCTATCACAGGAAAACAAAGCTGGGGACGCTTAGGCATGACAACCCCTGCTAATGATCTTGGCCTATTTATTCATGTTTCTGAGGGTGAAAAAATATTGGTTTTAGGCTCTGGTGAATTTGTCTGGGAACCCTTTTTATTAGCAGAACGCTTAGAAAAACAAGGGGCTATTGTAAAATATAGCTCGACGACTCGCTCACCTATTGCCACTAATTTTGCTATCCAATCAGCGATAACTTTTACTGATAATTACGGATTAGGCATTCCTAACTTTGTCTATAACGTGGCTCATCAGCAATTTGATCGCATTCTGCTTTGTTGTGAAACCCCTGCCGAAAGTATTGATAGTCAACTTATTGAGGCTCTCTATAAAGTTGCCCCTATTGTTGAAGTAATTAGCTATGACTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP051260|3282581:3291461|3290315_3291461_+|WP_017827550.1|DBSCAN-SWA
MNSLIGSSVYRRQLTCGTLSVTPNCSLEHLDELFDIAERRNPKRAFLFVSKVLGRHIPVSPKKMRETYQQMAKQFPQSLEGPILFIGMAETAVGLGAGIFDEVRDRYPQALYLTSTRHPIADGELFCKFKENHSHATDHLLYLPHNLEQRQWIQQAKTIVLIDDEATTGNTFLNLLSALREEGKLTQIKQIIAVTLTDWSGDALQKRSPLPITTFSLVQGKWQWQANPDAPLPVMPNVNITASGQVAITGKQSWGRLGMTTPANDLGLFIHVSEGEKILVLGSGEFVWEPFLLAERLEKQGAIVKYSSTTRSPIATNFAIQSAITFTDNYGLGIPNFVYNVAHQQFDRILLCCETPAESIDSQLIEALYKVAPIVEVISYD
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MVSTHIGFPTETVIVFVVLAIGAIFIDLFMHRADKPITLKNAVFWSIFWVVVAMAFAGFLYVHHGAEVASLFVTGYALEKVLSVDNLFVMMAIFSWFAVPDRFRHRILYWGIIGAIVFRAIFVAIGTGLLSLGPYVEIVFALIVAWTAVMMLRSGNDSEEIEDYSQHLAYRLVKRFFPIWPKITGHAFLLTQKEVDVELAKPENKDITIGRGTKAALYATPLMLCVAVVELSDVMFAFDSVPAIIAVSREPLIVYSAMMFAILGLRTLYFVLEALKQYLIHLEKAVIALLFFIAVKLGLNATDHIWQHGYSISATTSLFVVLGVLALGILASFVFPEKKNK
>NZ_CP051260|3282581:3291461|3285979_3286558_-|WP_004249446.1|DBSCAN-SWA
MSVSLSKGGNVSLSKAAPTMKNVLVGLGWDARSTDGQDFDLDASAFLLAANGKVRSDADFIFYNNLRSADGSVVHTGDNRTGEGDGDDEALKIKLDTIPSDVEKIIFVVTIHEAQARRQSFGQVSGAFIRLVNDDNQIEVARYDLTEDASTETAMLFGELYRHNGEWKFRAVGQGYAGGLGSVCAQYGINAS
>NZ_CP051260|3282581:3291461|3282581_3284150_-|WP_004245601.1|DBSCAN-SWA
MSIKRTVKLGSSLLLLIFILSSALSSFFIYKMQNNFTQVDVLSARYDDVLMARYQLAIMRSNVNYLLQDKDSRVADRNKIIQQNKKLAIMAKNTMETWVKEKKMTVAAQKNADDISTLFYNLIDKLVLDPNKLATIKIKANQFDQDFEHLDQLFEKYIQTRNKNSLYLTHKQDSMVEFSIYSTIISLIILLIVLYFVLHWINKTFVSNLNTLSEILNKVGNADLVFSVPQVKNDEFGKLFSRVSDMQKALTSTIFSVKKEAMDIKGGAFKIASGNQELSSRTEEQSSALQQTAASMEQIKIAVANNTDNTIEANNIINQSTDIVMDGANVMKEAVLSMKKIEQGAVKVGEINDVINKLANQTNILALNAAVEAARAGEQGRGFTVVAAEVRNLAAKSAEAAKEISQVLKASINDVTYGTNLVNKSGECMQEIVSSISKVNKIMQGISLASEEQRLGVEQIAVAINQMDTVVQQNASLVDLAASSTMMLNDKAQVLMDNVAVFNIDDLEKEPEQKQELINEQE
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MSFFNKLKEGFNSGRAELTKQVSRFKNKKFMQGTVAVCARIAIASDGVSSEEKQKMLGFLKASEELKVFDTSEVIEFFNKLISSFEFDTEVGKGETMKYILAMKDQPEAAQLAIRVGIAVAKSDGDFDNDEKEAVRAIAVALGFEPAEFDL
>NZ_CP051260|3282581:3291461|3289338_3289923_-|WP_004245609.1|DBSCAN-SWA
MVSLRKDQTVSLSKQAPALSHLMFGLGWDPIKKKGFLGGLFGGNNSIDLDASCVLLDVNGKQIDTIWFRKLKSTCQSVIHSGDNLTGEGDGDDETIFVDLNRLPSLVEYLVFTVNSFRGQTFNEVENAFCRVVDKTTNKELAHYKLTEQGAHTGIVIAALQRNHGQWDFTAFGSPCKGLVIDEMMPDILATVVR
>NZ_CP051260|3282581:3291461|3285327_3285903_-|WP_004245603.1|DBSCAN-SWA
MAVSLVKGGNVSLTKEAPTMTVAMVGLGWDARVTDGAEFDLDASVFMVGEDGKVLSDASFIFFNNKVSQCGSVEHQGDNRTGEGEGDDEQVKITLSKVPAEVKKLVFAVTIYDAENRKQNFGMVSNSFMRVYNNDNNTEIARFDLSEDASTETAMIFGELYRHGSDWKFKAVGQGFAGGLGALAAQHGVNI
>NZ_CP051260|3282581:3291461|3284550_3285231_+|WP_012368337.1|DBSCAN-SWA
MQPQFENAKNTVKTLSVFDFDGTLTYHDSFIPFLKFAFGRRKFARRIIKMVFPTLRCFRRKLTRDELKEVLIKTFLTDIKEEWLKEKAEAFCKAYWSKLMRPAGLLAVAEEINRHAEVTICSASPAMVLQPFADRLGIKLIGTTLEVVDGVLTGKIIGNNCRCGEKIKRLERVYGDLTQYHLRAWGDSRGDHELLYAAQDPHWRYFHTGSNKSKKSPIKITLKKDS
>NZ_CP051260|3282581:3291461|3288165_3289338_-|WP_143475448.1|DBSCAN-SWA
MTLTPGGNISVPDQTLMVRIHSGSPVDVSAFRLYASGKVNGDADMVFYGQTTNDDRTIIYATAGNSTSFTVDLTRLRPDVDRIAFTATCEGQQTIAHLQHLSIQVDANNNVVANGHVDINGRTEAALILGELYRRNGSWKFRFIAQGFNGGLKPLAEYFGVDIADPEPAPAPAPAPAPAPAPAPSSVNLSKVSLTKEKPAISLTKKDDFGKIRINLDWHRESKSGGSGLLGGLFGGNKGIDLDIGAFVELQDGYKSVIQALGNGFGDFNRMPYVELQGDDRTGDVAGGEWIFINGREWKNIKQVLIFTFIYEGVPNWSKTDGVVTIHVPEQPPIETRLTDGNNGRAMCAIARLINENGSIKVERLNEFFKGHRDMDNAYGWGFRWTAGSK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_004245601.1|3282581_3284150_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	7.2e-11	33.7
WP_012368337.1|3284550_3285231_+	HAD-IB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_004245603.1|3285327_3285903_-	TerD family protein	K4JRX3	Caulobacter_phage	1.2e-27	40.3
WP_004249446.1|3285979_3286558_-	tellurium resistance membrane protein TerD	K4JRX3	Caulobacter_phage	2.4e-33	41.5
WP_004245605.1|3286625_3287651_-	TerC/Alx family metal homeostasis membrane protein	K7QKE8	Escherichia_phage	1.3e-74	47.9
WP_004245607.1|3287685_3288141_-	tellurite resistance TerB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_143475448.1|3288165_3289338_-	tellurium resistance protein TerA	NA	NA	NA	NA
WP_004245609.1|3289338_3289923_-	tellurium resistance protein TerZ	K4JRX3	Caulobacter_phage	4.2e-17	30.2
WP_017827550.1|3290315_3291461_+	hypothetical protein	A0A172Q0Y1	Acinetobacter_phage	1.2e-31	27.2

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP051260|3353620:3368076|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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MKEKIYTIKNLCDELNQPRQKVRRRLEKLEIKAINEDTRTYENEPLEYNHQAFLKLAEEFDVRIDNKECTASVQRMNSTVQQKKQAKIN

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001261740.1|3355089_3355881_-	ANT(3'')-Ia family aminoglycoside nucleotidyltransferase AadA2	NA	NA	NA	NA
WP_032084014.1|3355965_3357186_-	EreA family erythromycin esterase	NA	NA	NA	NA
WP_032084013.1|3357378_3357852_-	trimethoprim-resistant dihydrofolate reductase DfrA32	A0A1B2IBQ4	Erwinia_phage	6.5e-16	33.1
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WP_001067858.1|3361369_3362074_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-138	99.6
WP_063102497.1|3362267_3362654_+	bleomycin binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_000084745.1|3362973_3363366_-	NimC/NimA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001067858.1|3363561_3364266_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-138	99.6
WP_168725730.1|3364305_3364395_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_124724886.1|3364483_3364753_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015639707.1|3364686_3364986_+	DUF536 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_156734542.1|3365017_3366067_+	Cfr family 23S rRNA (adenine(2503)-C(8))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_164526969.1|3366791_3367325_+	recombinase family protein	Q1MVP4	Enterobacteria_phage	4.0e-14	34.4
WP_001067858.1|3367371_3368076_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-138	99.6
3369463:3369533	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP051260|3372608:3438457|DBSCAN-SWA
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MSVSLIGRSGALAFIKAKRLRIPLFMERVSAGFPSPAQDYVEQTLDLNELCIKRPAATFFVRVEGDSMIDAGIHPDDILVVDRSVQAEHGDIVIAGIHGELTVKELQLRPCVMLIPRNQVYEPIHIPEVIWSS
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MQRLCLLFLLVAPLSWVQVSWAQEPFLLSDEDKKIVEMSRSILQSAVDGSSEFIEPFAPVEQPVSLKHNDEWLIFASSSLGDSSLKQLFKEASVTGAIVLFRGIPEGKTLGAAIRDWHTLMAGLDPVPQVRIDPKAFVHWRVTSVPAIFRIDDDKVTASALGVYSKDWLQRQIESGNTGSLGQRGPIHSILEPDLMQVAMQRLQSIDLGALKKKAIERFWSRQTFTDLPKATQYRIRTVDPTIVMQRPLLDANGRTLIPAGTRINPLKALPFTQQLVVFNASNAEEVDAVAHWLEGQDRTLRRITLITTQLDRAQGWNSLNALEKTLDSPVYLLNASLKQRFDLQVTPSFVQAKGLAFEIEEIPAKELVHEKAQ
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MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF

Homologous phage analysis in the prophage region

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3372557:3372616	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_001067855.1|3374447_3375152_-|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.8e-139	100.0
WP_001038045.1|3375984_3376644_-	tetracycline resistance transcriptional repressor TetR(C)	NA	NA	NA	NA
WP_053409934.1|3376736_3377927_+	tetracycline efflux MFS transporter Tet(C)	A0A2H4UVM2	Bodo_saltans_virus	8.1e-07	24.0
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WP_071533317.1|3378165_3378351_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000015696.1|3378376_3378655_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	NA	NA	NA	NA
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3378961:3379022	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_024008834.1|3399598_3400171_-	type IV conjugative transfer system lipoprotein TraV	NA	NA	NA	NA
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WP_064497042.1|3402417_3403044_-	pilus assembly protein	NA	NA	NA	NA
WP_000433891.1|3403040_3403322_-	type IV conjugative transfer system protein TraL	NA	NA	NA	NA
WP_031500457.1|3403458_3404565_-	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	A0A0A7RTT7	Clostridium_phage	1.3e-35	29.0
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WP_064497043.1|3405267_3405903_-	DUF4400 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_047109294.1|3410635_3411817_-	DUF4268 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_064497047.1|3411888_3414315_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_064497048.1|3414314_3418196_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_064497049.1|3418292_3420944_-	DEAD/DEAH box helicase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_064497050.1|3420945_3422781_-	site-specific DNA-methyltransferase	Q1MVP0	Enterobacteria_phage	8.6e-40	31.4
WP_064497051.1|3422861_3423815_-	WYL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_064497052.1|3424132_3424432_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_064497053.1|3424519_3425425_-	DNA polymerase III subunit epsilon	NA	NA	NA	NA
WP_168725731.1|3426066_3426468_+	translesion error-prone DNA polymerase V autoproteolytic subunit	A0A218MND2	uncultured_virus	1.1e-29	60.2
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WP_001043260.1|3427744_3428560_+	sulfonamide-resistant dihydropteroate synthase Sul2	NA	NA	NA	NA
WP_001082319.1|3428620_3429424_+	aminoglycoside O-phosphotransferase APH(3'')-Ib	Q75ZG1	Hepacivirus	4.9e-24	34.3
WP_000480968.1|3429423_3430260_+	aminoglycoside O-phosphotransferase APH(6)-Id	NA	NA	NA	NA
WP_001120891.1|3430231_3430771_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_001255015.1|3430882_3431188_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_000214122.1|3431215_3432430_-	chloramphenicol/florfenicol efflux MFS transporter FloR	S4TR35	Salmonella_phage	1.2e-18	28.7
WP_001447541.1|3432652_3433537_-	DUF3363 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_001120888.1|3433567_3435061_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_000985631.1|3435478_3438457_-|transposase	Tn3 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP051260|3913485:3932997|DBSCAN-SWA
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MLRSQRRGRDPPCWLSEKEPLVGKRRVNFQRCWLPVSRIGLHRRGVERVNCGPKLLDLGEKGVYSSYTLSAAGQKGIRPCPSR
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MVRKYFGTDGIRGKANEGAMTAETALRVGMAAGRVFRRGDHRHRVVIGKDTRLSGYMLEPALTAGFTSMGMDVFLFGPLPTTYRKNKRPFHPSPTALDRS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_011091028.1|3914625_3915501_+	class A extended-spectrum beta-lactamase CTX-M-3	A0A1B0VBP7	Salmonella_phage	5.4e-125	82.1
WP_013023839.1|3915547_3916024_-	WbuC family cupin fold metalloprotein	NA	NA	NA	NA
WP_001067855.1|3916801_3917506_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.8e-139	100.0
WP_000376616.1|3917623_3917827_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_124743826.1|3917954_3918794_-	sulfonamide-resistant dihydropteroate synthase Sul1	NA	NA	NA	NA
WP_000679427.1|3918787_3919135_-	quaternary ammonium compound efflux SMR transporter QacE delta 1	NA	NA	NA	NA
WP_001749986.1|3919357_3919810_-	NAD(+)--rifampin ADP-ribosyltransferase Arr-3	NA	NA	NA	NA
WP_000186237.1|3919894_3920527_-	type B-3 chloramphenicol O-acetyltransferase CatB3	A0A2R8FE91	Brazilian_cedratvirus	4.1e-26	41.2
WP_001334766.1|3920664_3921495_-	oxacillin-hydrolyzing class D beta-lactamase OXA-1	NA	NA	NA	NA
WP_063840321.1|3921625_3922180_-	fluoroquinolone-acetylating aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase AAC(6')-Ib-cr5	NA	NA	NA	NA
WP_001067855.1|3922323_3923028_-|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.8e-139	100.0
WP_001199192.1|3923141_3923918_+	aminoglycoside N-acetyltransferase AAC(3)-IVa	NA	NA	NA	NA
WP_000742814.1|3924146_3925172_+	aminoglycoside O-phosphotransferase APH(4)-Ia	NA	NA	NA	NA
WP_000602738.1|3925593_3926346_-|transposase	IS6 family transposase	A0A0N9RU54	Staphylococcus_phage	2.4e-33	38.7
WP_166635460.1|3928270_3928642_+	phenol hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_085940648.1|3928838_3929929_-|transposase	IS4 family transposase ISAba1	NA	NA	NA	NA
WP_001043260.1|3930018_3930834_+	sulfonamide-resistant dihydropteroate synthase Sul2	NA	NA	NA	NA
WP_000251875.1|3930920_3931223_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_001445143.1|3931116_3931368_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001067784.1|3932292_3932997_+|transposase	IS6-like element IS1006 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.9e-120	85.8

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP051260|3936197:3991789|DBSCAN-SWA
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MTEKKLKGIRAIAFDLDGTLTDSAVGLTEATNYALKAKGFPTVDKHHVTIWVGNGVDMLLKRALQHCGVKDVTDTLLKEVRDLFDECYANSVKTGSNLFPHVKETLEKLASYSLSLGIVTNKPTPFIQPLLKQLGIDNDFSLVLGGDDVKQKKPHPAPLYLTMGTFGVKKEELLFVGDSRNDIIAAQAAQCPCVGLTYGYNYGEPIADSKPDFILDDFADLLSILDITSMTTVEQN
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MNRSGSLSSFLEEVEKYNAHQPEYHQAVREVFTTLWPFLEKNPQYREQSLLERLVEPERIIQFRVCWLDDKGQVQVNRAWRVQFNSAIGPYKGGMRFHPSVNLSILKFLGFEQTFKNALTTLPMGGAKGGSDFNPKGRSHAEVMRFCQALMTELYRHLGADTDVPAGDIGVGAREVGFMAGMMKKLSNSNECVFTGKGLSFGGSLIRPEATGYGLVYFTNAMLKRHGMSLDGMRVAVSGAGNVAQFTIEKCLELGAKVVTASDSGGTVVDEAGFTTEKLARLTEIKNNYGRIEEYAKEFGLTYLEGQQPWAVAVDIALPCATQNELDLDAAKVLIKNGVKAVAEGANMPTTIAATDAFIEAGVLFAPGKAANAGGVATSGLEMAQNAARLSWKAEKVDARLHHIMLDIHHACVNYGGEGKQTNYIQGANIAGFVKVADAMLAQGVL
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MEKITVTLGERSYPITIASGLFHQPETFLPLKKGQQVMIVTNVTLAPLYLDKVTNTLEQQGVLVDSVILPDGEQYKSLTVMNDVFTALLEKNHNRDTTLLALGGGVIGDLTGFAAASYQRGVRFIQVPTTLLSQVDSSVGGKTAVNHPLGKNMIGAFYQPASVVIDLDCLATLPPRELSSGLAEVIKYGIILDKDFFIWLENNIDKLIALEPKAMAYCIRRCCELKAQVVAADEKETSGLRALLNLGHTYGHAIEAHMGYGVWLHGEAVAAGMVMAAKTAQDLGQFTQAETQRVIQLLKKANLPVNGPDEMQPEDYLPHMMRDKKVSAGKLHLVLPKGIGQSELRADISREQVYKAITSCINAN
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MKNETNIRRGRHCVFLMHVHLVFVTKYRRKIFDQDAIEKLRGYFASVCADFDVELVEMDGERDHVHLLINYPPKLAISNLVNSLKGVSSRLLRRDRPDIAQRYYYKGVLWSPSYFAGSCGGAPISIIHQYIEQQETPR
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MSQPSQESAVRLDKWLWAARFYKTRAIARTMIEGGKVHYNGVRGKPSKNVEVGAEIRLRQGNDERTVTVLMVSAQRLGAAQAQLLYCETPESIAKREKIALARKMNALTMPHPERRPDKKERRTLLRLKQTNLPGSD
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MNRTNIFFGESHSDWLPVRGGESGDFVFRRGDGHAFAKIAPASRRGELAGERDRLIWLKGRGVACPEVINWQEEQEGACLVITAIPGVPAADLSGADLLKAWPSMGQQLGAVHSLSVDQCPFERRLSRMFGRAVDVVSRNAVNPDFLPDEDKSTPQLDLLARVERELPVRLDQERTDMVVCHGDPCMPNFMVDPKTLQCTGLIDLGRLGTADRYADLALMIANAEENWAAPDEAERAFAVLFNVLGIEAPDRERLAFYLRLDPLTWG
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MATQIDFTLSNKVAVITGGAAGIGLSIAQMFIEKGAKVALLDRSEQVEQVAHRLNSAVGIWCDVSSEESVKQAVHSVIEEFDRIDILVNCAGIVALAPAESLSLEDWNKTLSVNLTGTFLLCQQVGQHMLQRGQGKIINLASQAGIIALPEHIAYCASKAAIINMTKVMALEWGPKGLQINAISPTIVMTDLGKKAWEGEKGEQMKAQIPARRFAEPEEIAAAAVFLASGAADMINGHNLVIDGGYTIQ

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001403349.1|3938542_3938968_-	recombinase family protein	Q1MVP4	Enterobacteria_phage	2.7e-53	100.0
WP_001067855.1|3938944_3939649_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.8e-139	100.0
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3940150:3940163	attL	NA	NA	NA	NA
WP_001067855.1|3940804_3941509_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.8e-139	100.0
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WP_001082319.1|3944299_3945103_+	aminoglycoside O-phosphotransferase APH(3'')-Ib	Q75ZG1	Hepacivirus	4.9e-24	34.3
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WP_001067855.1|3945999_3946704_-|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.8e-139	100.0
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WP_001294663.1|3951903_3952254_-	mercuric transport protein MerT	NA	NA	NA	NA
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WP_004246658.1|3967772_3968978_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_110706861.1|3969390_3970092_+	pirin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_168725741.1|3970207_3971827_-	phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)	A0A2H4PQN1	Staphylococcus_phage	2.2e-140	52.6
3970855:3970868	attR	NA	NA	NA	NA
WP_004246652.1|3972031_3972916_-	Hsp33 family molecular chaperone HslO	NA	NA	NA	NA
WP_004246651.1|3972943_3973357_-	ribosome-associated heat shock protein Hsp15	NA	NA	NA	NA
WP_017827151.1|3973430_3975539_-	intracellular growth attenuator family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036919365.1|3975894_3976452_+	ADP compounds hydrolase NudE	NA	NA	NA	NA
WP_004249852.1|3976541_3977345_-	MetQ/NlpA family ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_012368592.1|3977678_3980213_-	peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD-transpeptidase MrcA	NA	NA	NA	NA
WP_036919369.1|3980329_3981154_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004246641.1|3981141_3981741_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706860.1|3981724_3982258_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706859.1|3982264_3983380_+	type IV pilus secretin PilQ	D0U174	Enterobacteria_phage	1.0e-11	24.9
WP_012368596.1|3983960_3984482_+	shikimate kinase AroK	NA	NA	NA	NA
WP_004249857.1|3984534_3985629_+	3-dehydroquinate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_004246636.1|3985783_3986728_+	SPOR domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004249858.1|3986809_3987625_+	adenine-specific DNA-methyltransferase	A0A1S6L1V5	Vibrio_phage	1.2e-65	47.1
WP_004246629.1|3987669_3988344_+	ribulose-phosphate 3-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_110706858.1|3988340_3989051_+	phosphoglycolate phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_004246627.1|3989052_3990081_+|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_110706857.1|3990141_3991350_-|transposase	IS200/IS605 family element transposase accessory protein TnpB	A0A1B0VCD8	Salmonella_phage	9.5e-189	81.0
WP_110706856.1|3991372_3991789_+|transposase	IS200/IS605 family transposase	A0A1S5RHE3	Helicobacter_phage	7.6e-45	62.8

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP051260|4017387:4068093|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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