Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP051636 | Avibacterium paragallinarum strain ADL-AP17 chromosome, complete genome | 1 crisprs | PD-DExK,cas3,DinG,DEDDh,cas2,WYL,cas14j | 0 | 1 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP051636_1 | 624230-624356 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP051636_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP051636_1
>1.1|624266|55|NZ_CP051636|CRISPRCasFinder TATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTT |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP051636_1
The CRISPR arrays of NZ_CP051636_1 >merge|NZ_CP051636|1|624230-624356|CRISPRCasFinder GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAATATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTTGGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA >NZ_CP051636|1|1|624230-624356|CRISPRCasFinder GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA TATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTT GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA
>NZ_CP051636.1|WP_035684723.1|623500_624049_+|oligoribonuclease MQLDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKDLNILAEGPVLAIHQPDSLLAKMSDWCKKTHRENGLIERVKQSKLNERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSVAQDKRFLFKYMPDLAEYFHYRYLDVSTLKELASRWSPEILNNFSKKNTHLALDDIRESIAELAYYREHFIKAP >NZ_CP051636.1|WP_035684717.1|622370_623429_-|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA MSKQKLTHNQQRRIKSNNVRALQRHKLKMKKEIEWQDEMLGPTQEGTVVTRYSVHSDVEDEQGQIYRCNLRRTLSNLVVGDKVIWRKGNEQLQGVSGVIEAIHPRKNEITRPDYYDGLKVIAANIDRIIIVSAVVPELSLNIIDRYLVVCENANIPAVILLNKVDLLSEEQRQQVETQLKIYQDIGYQTMMISAKTGKHMQDLTALLSSGTSIFVGQSGVGKSSLINAILPEVNAQVGEVSELSGLGKHTTTSSRLYHLPQGGDLIDSPGIRELGLWHLNANQITKGYREFQYFLGTCKFRDCKHLNDPGCALKEAVEKGKIHPIRFNNYHNLIESLSNIKGNRRFVIQDNG >NZ_CP051636.1|WP_017807274.1|621890_622148_-|phosphocarrier-protein-Hpr MYSKDVEITAPNGLHTRPAAQFVKEAKAFASDITVTSGGKSASAKSLFKLQTLGLTQGTVITISAEGEDEQKAVDHLVALIPTLE >NZ_CP051636.1|WP_035684716.1|620065_621793_-|phosphoenolpyruvate-protein-phosphotransferase-PtsI MISGIPASPGIVFGKALVLKEEKIVLDTQKIQDDQIEAEVERFYAGRNAAVEQLTAIKDRAYASLGEEKAAIFEGHLMILEDEELEEEIIDYLRSNKVNAGVAASTIIAQQVAMLSEIDDEYLKERAGDIQDIGNRLIKNILGMKIVDLGEINEEAILVAYDLTPSETAQLNLDKVLGFITDIGGRTSHTSIMARSLELPAIVGTNTVTQQVNTGDFLILDAVNNQVYINPTQEEIDRLRKLEQQLKEEKEELAKLKDLPALTLDGHRVDVVANIGTIRDIDGAERNGAEGVGLYRTEFLFMDRDQLPTEEEQFIAYKEVVEAMNGRLVVLRTMDIGGDKELPYLNLPKEMNPFLGWRAIRIALDRKEILHAQLRAVLRASAFGKLAVMFPMIISVEEIRALKAEIALLKEQLRNEGKAFDENIQIGVMVETPSAAVNAKFLAKEVDFFSIGTNDLTQYTLAVDRGNELISHLYNPMTPSVLNLIKQVIDASHAEGKWTGMCGELAGDEKATLLLLGMGLDEFSMSAISVPRIKKLIRNVNYQDAKVLADAALEQPTAADIERLVTDFLVEKALN >NZ_CP051636.1|WP_017807272.1|619502_620003_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MGFFDKLFGSKNSKTVEVEIYAPLSGEIVNIEDVPDVVFSEKIVGDGVAIRPTGNKLVAPVDGVVGKIFETNHAFSMESEDGVELFVHFGIDTVELKGEGFIRVADEGQKVKRGDTIIELDLEVLESKAKSVLTPVVISNMDEISHIEKKTGEVIAGESIILILKK >NZ_CP051636.1|WP_035684715.1|616514_619178_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type MSEMLTNDVDPIETNDWLLAIDSVIREEGVERAQFIIEQLMQHARANSVSLPTGVTTDYINTIPTSEEPNYPGNLDLERRIRGAIRWNAIMMVLRASKKDLELGGHMSSFQSSATIYEVCFNHFFKARTEKNGGDLVFFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLDNFRQEVHGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLNAIYQARFLKYLHHRGLKDTADQTVYAFLGDGEMDEVESRGGLAFAAREKLDNLVFVINCNLQRLDGPVTGNGKIIQELEAQFNGCGWEVIKVIWGRRWDRLLQRDTSGKLLQLMMEVVDGDYQTFKSKDGAYVRKHFFGRYPETEALVAEMTDDEIWALNRGGHDPLKVFAAFNKAKQVKDKPVVLLVKTVKGYGMGESAEGKNIAHQVKKMDMSGVKHVRDRFNIAVSDEDIEKLPYIKFEEGSEEYKYLHERRQALNGYVPTRSPRFSQALEVPALEEFAQLFEAQSRPISTTMAFVRSLNVLLKNKSVGKHIVPILADEARTFGMEGLFRQIGIYNPHGQNYTPQDREQVAYYREAIDGQVLQEGINEQGATASWIAAATSYSTNDVPMIPFFVYYSMFGFQRVGDLMWLAGDQRARGFMIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSAVIPNCISYDPAFAFEVPVIIQDGIRRMYGPEQEDVYYYITTLNETYDQPAMPKGAEEGIRKGIYKFETVTGQGKGKVQLLGSGAILRHVREAAQLLANDFGVTSDVYSVPSFTEVARNGADVERWNLLHPEAEARTPYIAQVMNDAPAVAATDYIRLYAEQVRAYVPAQSYRVLGTDGFGRSDSRENLREHFEVNAHYVVVAALAELVKQGIFDKKVVADAIAKYGIDADKINPLYA >NZ_CP051636.1|WP_035684713.1|614564_616463_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase MAKEIQIPDIGGDEVTVTEVMVKAGDTVEVDQSVINVEGDKASMEVPSPEAGVIKEVLVKVGDKVSTGTPMFILESADSAPASAPAVEEKAAPASTAPTQSAVSSVIEIHVPDIGGDEVNVTEILVNVGDSVAEEQSILNVEGDKASMEVPAPVAGVVKEILIKVGDKVSTGSLVMKFETTAATPAAQPAAEAPAAPAAVSGSVQDVHVPDIGGDEVNVTEIMVAVGDSVSEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEILVKSGDKVSTGSLIMRFEVAGSAPAAAPAAQPAATPAQTQAAAPVQSAQPANQAEVTASASFAHATPVVRRLAREFGVNLDKVKGTGRKGRILKEDVQAYVKAAVKAVESDSVSATASTGAANGAGLGLLPWPKVDFSKFGEVEQVELGRIQKISGANLHRNWVMIPHVTQWDKADITDLEQFRKEQNVLAEKQKLDVKITPLVFIMKAVAKALEAYPRFNSSLSEDAQSLILKKYINIGVAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGIIELSRELAEISKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGGTQFTPIVNAPEVAILGVSKSEMTPVWNGKEFTPRLMLPLSLSYDHRVIDGADGARFITFINGVLSDLRRLVM >NZ_CP051636.1|WP_035684710.1|613053_614478_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MNKEIKTQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLDTVIVERYSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKSLAEHGIVFGEPQTDIDKIRGWKEKVINQLTGGLAGMAKMRKVQVVNGYGKFSGPNTIIVAGDEGETTIHFDNAIIAAGSRPIQLPFIPHEDPRIWDSTDALKLKEVPKNLLIMGGGIIGLEMGTVYHALGSNIDVVEMFDQVIPAADKDIVQIYTKRIEKKFNLLLETKVTAVEAKEDGIYVSMEGKAANETRRYDAVLVAIGRTPNGKLIDANVAGVEVDDRGFIHTDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVIAGQKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGKTEKECKAEGINYEVAKFPWAASGRAIASDCADGLTKLIFDKDTHRIIGGAIVGTNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDLALTIHAHPTLHESVGLAAEVFEGSITDLPNPKAKKKK >NZ_CP051636.1|WP_035684708.1|610986_612756_-|autotransporter-outer-membrane-beta-barrel-domain-containing-protein MKTFNLNLVSISLGIAFTVTSINSFAAAANPLYAVNSTGSHSSSLNGSVNGGTSAFLYDNGDKSFNKLMIVDKLQQGAESQDRKDFETTYGIQFEWFEHDGSLTEEGKKHIYQAENGTFKSEVHLTKEEKVKFSAQKGSTADSQPTSNNSEATVHPKESSSIISNNSQPEAEGKSGEIIPTPSEKIETKERVEDASSHTELPKMGSATVIPATPTLKMTEARDTTEKAKPVMEIKAEQNLASATSAFSGTLSDLSQTTRAMATSFFNNTAVVQDQSAMVRNNAQYFVSYRHYFVEPIGIDKSDLRRQPSEMNVTTPNVNTYVDYAYHHYTLKNKNFHSKIHRNDITLGGYAQINGYNLGLAMISMKGNSTTLNNYTLASKVKMRTNGLLATFGWAFDKSYLNLGAYAVFSKVNTSRSPFGNSEQHASFNTQQYALDIVYGRSLYQTENSSILLNGGLTNVYYHQDSFNEQTDSQNATPYSLQVDSSAYFNSFAHLGMQASYQTYISSFTTRSDIALRVEQALTANRFDLKLQDGTTITGSKNDKFTVRLSVGQTFIFDKVSIRVGAEFIEGNRTNARLDTVSATLSYRF >NZ_CP051636.1|WP_035684706.1|609528_610902_+|TolC-family-protein MLKQSKLSLAIGLSVLLAGCANLDDSYKTSQQDFQQYEELTKQYNIQENWWTLYHDPQLNQLVQQALENNKDLAKAAIAVNTALYNANLIGANLVPSFSGSLSSSASKNINTGGNSTISHGGSLNVSYTLDLWRRLADASSAAEWRHAASEQDLEAARISLINSVILTYYQLGYLNDAISTVNKTINYYSEINRIMQNKFRQGVADRASSDQAQQAVLTAHNTLINYQTQKKTAEATLRNLLNLKPNDSLPATYPHILNVKNVGINLNVPLSAIANRPDVKGYQYRLNSAFKDAKAMQKSWFPSITLGGSLGSSGNKIDNAFNTPIAGGTVGISLPFLNWNAVKWNVKISESAYDLALVNFEQSITKALNDIDTNYFIYNQANQSFENLKQTYDYNKRITQYYKNRYDAGISELREWLNAASTERNSELSILNAKYNLIQSENAVYSAMGGYYSVEQ >NZ_CP051636.1|WP_035684725.1|624469_625552_-|peptide-chain-release-factor-1 MKPSIISKLDSLNERHEELEALLGDASVISDQEKFRAYSKEYAQLEDVVKCFARWKQLNSNMEEAQLLLDDPSMREMAQEEVEECKAEIEQVEAQLQILLLPKDPNDEYNCYLEIRAGTGGDEAGIFAGDLFRMYSRYAESKRWRVEMLSANESEQGGYKEVIVKISGENVYGQLKFESGGHRVQRVPKTESQGRIHTSACTVAVMPELPESELPEINPADLRIDTYRSSGAGGQHVNTTDSAVRITHIPTGIVVECQEERSQHKNKAKAMSVLASRIVQAEQEKLAAEQADTRRNLLGSGDRSDKIRTYNYPQGRVTDHRINLTIYRLDEVMNGKMDELIQPIITEYQADQLAALSDQG >NZ_CP051636.1|WP_035684727.1|625755_627045_-|serine--tRNA-ligase MIDPNLLRNNLAEVAEKLKIRRGFELDEARISELEDQRKALQVKTETLQAERNTRSKAIGAAKARGEDIAPLLAEVDNMGIELSMAKSQLDDVQAELQEIALSIPNIPADEVPLGNDENDNVEISRWGEPRTFDFEVKDHVTLGEHLQGLDFAAGVKLSGARFVVMKGQIAKMHRALAQFMLDLHTEQHGYSETYVPYLVNHATLYGTGQLPKFGEDLFHTKPLEGEQPYALIPTAEVPVTNLVRDEILEQAELPIKMTAHTPCFRSEAGSYGRDTRGLIRMHQFDKVEMVQIVEPEKSMEALEELTGHAEKVLQLLNLPYRKVLLCTGDMGFGSAKTYDLEVWVPAQNTYREISSCSNMWDFQARRMQARYRVKGEKKPRLVHTLNGSGLAVGRTLVAVLENYQNADGSITVPEVLRPYMGGLEVIGK >NZ_CP051636.1|WP_035684730.1|627118_628468_-|replication-associated-recombination-protein-A MSNFAFDFAENDFRPLAARMRPTNLEEYYGQRHLIGVGKPLRKAIEAGHIHSMILWGPPGTGKTTLAEIIAQRINAEVERISAVTGGVKEIREAIERAKQNRLTGQRTILFVDEVHRFNKSQQDAFLPYIEDGTVTFIGATTENPSFELNNALLSRAKVYILKPLTPQDIEQVLQRAIQDKEKGLGNEHFVLEDNVLQLLAEYVNGDARLALNSLELMADMAEEGKNGKILHRTLLTEVLGERQARFDKQGDRFYDLISALHKSVRGSSPDAALYWYARILTAGGDPLYVARRLLAIASEDVGNADPRGMQVALAAWDCFTRVGAAEGERAIAQAIVYLAVAPKSNAVYQAFNAAKKMAVESPDYDVPEHLRNAPTKLMKELGYGAEYRYAHNEENAYAAGENYFPEALKETKFYFPTQRGMEIQIGEKLEKLRQLDEKSQIQRYKLVK >NZ_CP051636.1|WP_017806586.1|628655_629015_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MVVKKKWEVIATARFKIWLKEQDEATRISVFNALNNLRFYGPQLSRPYVDTIKGSQYPNMKELRIQHKSKPLRAFFAFDPLRQAIVLCAGNKSNNKQFYKQMITIADAEFTDYLATLEK >NZ_CP051636.1|WP_017806585.1|629016_629325_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTQYTTLDELIAQESPETQQCIKEMSEELILETGLAMIREQLALSQKELAQAIGVSQSAIAQIEQRGNDVKLSTLKRYIEKMGGELSLTVKMPTGYSQIFPL >NZ_CP051636.1|WP_035684733.1|629376_629997_-|outer-membrane-lipoprotein-chaperone-LolA MKKMAVKMTALLCLGLSPLAWADAVSELQARLNKVEALSADYVQKVSDPKGKEIQQGKGKIQIKRPNLFRMDNQAPQESQVISDGKTLWFYDPFVQQVTANWVADAVNNTPFVLLTSNDTQYWKQYNVEQNADTFTLKPKSAKSQIKQFDIRIDGEGVLKNFSTTEKDGQTNLYLLRNITNQPLADSLFKFSVPKGVELDDQRKKK >NZ_CP051636.1|WP_035684736.1|630078_632931_-|DNA-translocase-FtsK MIKRITTNLTPKQYMGELCLGIISLFGLYLIVAWSSYSPFDNTWAVSSSQPETINKAGALGAWLIGLFFTLFGHIGNVIPFILCFVPIYLFKTKKFTQLTAIKAAIRTLGGVILFAGLTTLATLLLSNTSAYLAGGVLGGSLVVSLYPILGKAGLILSALLFTVAGFVLCSGKVLIQLFVRFYYWLTMNEHKTPTMATPEEPQEQSEPVPLEEIIIHKVEPRPEPQQAENTEQSEEAESPKSNQPFIQISGLKELTQPVASDNAPSSAENTENNATLFDPRKMELFSRYDVGQDDSLPNVSLPQSTSAVAPVVQVELVSPQISPPITPQKPELHAISQPANTQSAVSFSEEFLPYEAPNEPELKVSIPDYSVEAYQVTEDFAEPSDEMDDLARQFAAQEQQRLAEMQQRAKEINEEDTLEHILAEQEPASNQPSYKPYGDSLIHPALQKQVSIKEKPTTPLPSLDLLEKRQVEVQEITREEILDTSQRIEQQLRNFNVKATVKDVLVGPVVTRYELELQPGVKASKVTSIDTDLARALMFRSIRVAEVIPGKPYIGIETPNLHRQMVPLRDVLDSPEFRESKSLLSMALGKDISGNPIVVDLAKMPHLLVAGSTGSGKSVGVNTMILSLLFRVKPEEVKFIMIDPKVVELSIYDGIPHLLTEVVTDMKKAANALRWCVDEMERRYQLLSALRVRNIEGYNEKIEEYNAMGMPIPNPIWRPGDTMDAMPPALEKLSYIVVIVDEFADLMMVAGKQIEELIARLAQKARAIGIHLILATQRPSVDVITGLIKANIPSRIAFTVASKIDSRTILDQGGAETLLGRGDMLYSGQGSSDLIRVHGAFMSDDEVARVADDWRARGKPNYIEGILDSAEEEDSDTPRTGDDGELDDLFDEVMNFVIETGTTSASSIQRKFRVGFNRAARIMDQLEEQGIVSPLQNGKREILARRSDY >NZ_CP051636.1|WP_017806582.1|632932_633412_-|leucine-responsive-transcriptional-regulator-Lrp MEKKLPKALDAIDIKILNELQRNGKISNIDLSKKVGLSPTPCLERVKRLEKQGVIMGYRALLNPELLDSPLLVIVEITLVRGKPDVFEEFNDAVQQLDEIQECHLVSGDFDYLLKTRVADMAAYRKLLGTTLLRLPGVNDTRTYVVMEEVKQTNFLQLK >NZ_CP051636.1|WP_035684738.1|633558_634911_-|deoxyguanosinetriphosphate-triphosphohydrolase-family-protein MKNSINPLWLERFINDNPREKDHRPPFRRDRGRILHSAAFRCLQAKTQIHAVGENDFYRTRLTHSLEVAQIGSSLVSQLKFSEAFTHLAQQLNIENAQLQKQLKPLLPSNDLIESLCFAHDIGHPPFGHGGEVALNYMMQSHGGFEGNAQTFRVLTKLEPYTLNAGMNLTRRTLLGVVKYPAILDEVSPQYAELAMPNHSNPFSIKLTDWIPGKGLFREDKAMFDWLLAPLSEADRHLFQTLSSLRETSQQTLKTRYKSLDCSIMELADDIAYGVHDLEDAIVVGVIHLQQWQEALAQLKNSSSPWIREHIDALSEKLFSAHHYERKNAIGALVNYFITNVRWKITADFTEPLLRYNAELPEDVLAVLKVFKDFVLKYVICDVTTQRIEYKGQRMLTEMFQIFESDPERLLPRNTANRWKMASAEQKKRIICDYIAGMSDAYAIKVYQQL >NZ_CP051636.1|WP_035684739.1|634912_635599_-|CidB/LrgB-family-autolysis-modulator MIYAYTLLTIVVFALALQISKRLKSLVFNSFILTVAMLITIVLIFHLPYEDYYQGNAPLNHLLGVSVVALALPLYEQFRQIQAYWKTILFITALSSFFSMCVGAILALLLGAEPEIVATILPKSVTTPIAMEIADNLGGIPSVAAVAVLLAGLQGSMFGYVILKTIRIKHSQAIGLSVGAVSHVLGTVSCMETDPKAGNFSSISLVLCGILSSIFAPFVFKFIYLMVA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP051636_1 | 1.1|624266|55|NZ_CP051636|CRISPRCasFinder | 624266-624320 | 55 | NZ_CP010410 | Xanthomonas sacchari strain R1 plasmid unnamed, complete sequence | 454272-454326 | 10 | 0.818 |
NZ_CP051636_1 | 1.1|624266|55|NZ_CP051636|CRISPRCasFinder | 624266-624320 | 55 | NZ_CP048065 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p9, complete sequence | 33562-33616 | 11 | 0.8 |
NZ_CP051636_1 | 1.1|624266|55|NZ_CP051636|CRISPRCasFinder | 624266-624320 | 55 | CP022016 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence | 202572-202626 | 12 | 0.782 |
NZ_CP051636_1 | 1.1|624266|55|NZ_CP051636|CRISPRCasFinder | 624266-624320 | 55 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 683766-683820 | 18 | 0.673 |
1. spacer 1.1|624266|55|NZ_CP051636|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010410 (Xanthomonas sacchari strain R1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.818
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer gcactgctcccaagcgggaatagctcagttggtagagcgcaaccttgccaaggtt Protospacer ** **.* *************************.*********** ****
2. spacer 1.1|624266|55|NZ_CP051636|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048065 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p9, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.8
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer cctttccagttgcgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccaaggtt Protospacer . *.*. *. .************************************* ****
3. spacer 1.1|624266|55|NZ_CP051636|CRISPRCasFinder matches to CP022016 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.782
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer gttgcttgatactgcgggaatagctcagttggtagagcacgaccttgccaaggtc Protospacer * .* * .****************************.********* ***.
4. spacer 1.1|624266|55|NZ_CP051636|CRISPRCasFinder matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 18, identity: 0.673
tatcttatctctt-----------gcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgcc CRISPR spacer -----------ttagaagtaaaaagcggaaatagctcagttggtagagcacaaccttgcc Protospacer ** ****.*******************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
257969 : 279069
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP051636|257969:279069|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP051636|257969:279069|266060_266357_+|WP_136711940.1|DBSCAN-SWA MIQIKSTTLFKKWLDELKDLRARAKIQTRIKRLQLGNFGDVKPVGEGISELRITEGKGYRIYLKNQNGVVVILLCAGDKSIQSKDIEKAKLLAKELGV >NZ_CP051636|257969:279069|276925_277183_+|WP_017807508.1|DBSCAN-SWA MKNKITDLNNHLFSQLEKLLDEDLTDEELKREIARANAVSGIASNIIQNSNTAIKAMQLFGDRTIEADAPDFLRISKAQNDKKTL >NZ_CP051636|257969:279069|263427_263703_-|WP_035689243.1|DBSCAN-SWA MHDLIKHTIQTLLFLVATIVVLSLAEAYAQTAEDYYAMQGFSTEQLAEMERQANLEWQQEQGDLQPNLTVEAEKYLKNYTALLQEALDNGK >NZ_CP051636|257969:279069|268845_269052_+|WP_017807328.1|DBSCAN-SWA MNKIAAFRKAANLTQADMAKHLNKTQGAIGHYELGIRQPSIETAKQIVQVLNEHGLTCSLDDVFPVGG >NZ_CP051636|257969:279069|259317_259635_-|WP_051128139.1|DBSCAN-SWA MNTDLLNERAKTHGDFISGAETFYHLMKPIIDSQLFERNKVKAYAATMIAAKLTRICNGDENFPDHWDDIIGYAQLATGKQFEPTSAVSLPFAQHIHPDLGGENI >NZ_CP051636|257969:279069|266794_267568_-|WP_017807325.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP051636|257969:279069|268054_268708_-|WP_017807327.1|DBSCAN-SWA MKKPWNQYVREKMQDQNLKQDDIAEAMNKTQGAIGHWLTGRRNPNVGEVAQMIHLAGVDKVILNSDGTLEDFDPNASFTSVKKSYSYPLISSIQAGTWTEACDFHDSIGYDYIDTEIDAGEDAFFLRISGLSMEPKFSEGDLVLIDIRKRPHPGDFVAAVNGNGEATLKRYRELGEISESGHPHFELVPLNPDFPTLSSMRQDIRIIGVAVEHRSYL >NZ_CP051636|257969:279069|266357_266648_+|WP_017807324.1|DBSCAN-SWA MMELQDFDIAEHLRSEEEIQLYLNEVLQENDVDLILSALGDIAKARNMSQLAREVGVSREGLYKAFSGKGNPTFSTVLKVMKALNLSFEVKRVTHA >NZ_CP051636|257969:279069|264126_264663_-|WP_168939906.1|DBSCAN-SWA MKKYELTDEYIEIGFVTKIKLYRIKALVAIASIGVSAGDLGGYVEKESNLDQSGNAWVYGDAKVYGDAVVYGDAVVSGDAVVYGNAVVCGDAKVYGNAVVCGDAKVSERSDIVWFSNVGTEYGTLTVFKTKQGVLWATRGCFSGSVEEFLKKSAEVHDEKTKREYQLLIEVAKSRLGE >NZ_CP051636|257969:279069|270841_271648_+|WP_035689420.1|DBSCAN-SWA MSMLLMVKAMQCKVGNPTRKLVLLKLADNANDEGICFPSYQNIADQCEITRRSAISHIEALIETGFVEKKTRKTPEGNTSNLYVLHLDRDGENSALPSENDSLRVVKNLHHPSENISPTPSENISPRTSHSINQSINHTSSSEKISDGSVGKKSRFKFSDDDMTAAQWIFGLILKLNPNTKTPSFENWANEIRLMRERDKRTHREICGLFQWANQDLFWKTNILSPAKLREKWDQLTVKKNNSKPQRKTASELNAIEWNTEEGWRGML >NZ_CP051636|257969:279069|263724_264033_-|WP_046097548.1|DBSCAN-SWA MKIFINLTAKEATPEQKSAGVIDVDPALRHQFNRALTFFSQPSKALIEERAAYLTTMAAQLNADYVLVDAPLFLISTLESKLKARGIQPVYSLYPYSGFVEV >NZ_CP051636|257969:279069|257969_258866_-|WP_035689252.1|DBSCAN-SWA MFWFKNAMIYRLTKAMDFSNLSSQLEACEFTPCGSSEASKFGWIAPLSTSEQLCFEANGQILLVAQREEKILPNYVVTKELTNRVKALEEKEGRKLKKVERLSIKDDVVASLLPQAFTRSTYTALWIDTQNQLIYVDAASAKRAEDALALLRKSLGSLPVIPLAFANDASLVMTNWVNEAPDWLTVLEEAELTGLKEDGIAKFKRQDLDSNEIYSLLEAGKVVTKIALEWEGNLSFVLCDDGTLKRLKFADEIKEKNDDIAKEDIAQCFDADFLLMAATISELTKRLLNEFGGEKERV >NZ_CP051636|257969:279069|267569_268055_-|WP_017807326.1|DBSCAN-SWA MSRLNEHKFCLNNEEALQFIELLKSYDKDLYWNKGRNIHWRTINFVPNDRDELAGPVPGATVQVDYKYSKRVKESGKLVLTLFKRKQHEKLRAYQLELSDENKISSHDGNTIIKGSHEHIGKQVRKIIPDTEIENIAHWFALFCDKIRLEFTGSKLNLPEE >NZ_CP051636|257969:279069|275941_276112_-|WP_017807323.1|DBSCAN-SWA MYFEIFKGVNGQWYWRLKAANHEPIAQSEGYTTKQNCLHCIGLVMDTNRQTPVREV >NZ_CP051636|257969:279069|270074_270845_+|WP_046097539.1|DBSCAN-SWA MSRLSMISEQNASIKMSSREIAELCGKQHNHVLRDIRAYVGAILQIERGINVKSLDWSEKEGVELFGHTPIGGVVCQYEVNSQNNQRYPIYYLDKSATLTVISGYNVILRKRIIDRWLELENQQQSTALLPQNYLQALEALVEKERQNQALALENKELKPKAAFVDHYVDVGTSKSLRETAKILNMPEKAMIIRLIEDKALYRQSGNLLPYADKQQQGLFTVKTGTTDHDHNYTQTRVTGKGIEWIAQRYASELML >NZ_CP051636|257969:279069|271671_272328_+|WP_165381618.1|DBSCAN-SWA MQNAMARQAKFPSQPQQKSQRLPNEIEKLVDQIFSQLFAACPAMRGQFDEVQLPITKRTWVLGFAENNIRTIEQVRAGMRKVRSKPDDYFPGVGKFISWCKQDRFEALGLPNEEELYQRLKKFQGYGMLEIHKFQFESDAEYWLLTDLYCDNREATKKELRKAVGEALDSMATRLEAGETLPKPQITLPAKPSFVPPEVQRKINQHGIEKCKAILGMK >NZ_CP051636|257969:279069|261607_262549_-|WP_035689276.1|DBSCAN-SWA MEFNLILSTESKVLSTNISTFQQQAENYLAGLSNRFETDDDFAQAKQDIKDLTELEKRTKEAIANAQNGEIKQLIEQAQAMAERFRQARLEREKLVKTKEAEIKASIVNDAFERLAVIKSGFENDVCIALEQVISKATIKKRLDEATKRRSTLATLTKAVNAEETLIGAEIAAEAARLSARRKLIPISYEYLFKDWLNLITGDDDLEPIIQARIADEEKREAKIKAKAEQEAKARAEAKANLNALQTNEKTETNENTAHIEPQTPTQETAATATQFILKIPAQEIPFTGTLEQLREYFAPVKALGITATIVKQ >NZ_CP051636|257969:279069|265571_265742_+|WP_017807323.1|DBSCAN-SWA MYFEIFKGVNGQWYWRLKAANHEPIAQSEGYTTKQNCLHCIGLVMDTNRQTPVREV >NZ_CP051636|257969:279069|269557_269965_-|WP_168939907.1|DBSCAN-SWA MDMSSIFTSVKTTLDLLSGLESNAVLNERVALLKDQIEILRYAHETAQKELSEYKEKCAALENEIASYRQAEQFIFEQGAAFKKTSSGYIEAVYCPNCLTVAGGSFSAFPFQCGKCKWRSMFKVSEFKGIFKSLP >NZ_CP051636|257969:279069|265335_265557_-|WP_017806446.1|DBSCAN-SWA MQNEMKRYAISYFFKGKKWCSDVYANSFEEAQEKVKAMSQATIDGELYCSIYVPVKPQSRIARLLLKLLHKFS >NZ_CP051636|257969:279069|258925_259321_-|WP_051128140.1|DBSCAN-SWA MIIEIPTTKQVNIKYIKLVIPVRYDDEDIPYNFPLRDGDQWCGIIDLDASKIENWPENHPAKMNMKICDEGEYYLLDENKNVISSLINDYIPDCLPNDYGDYIDLHIDEAGKVTNMPNKLIFDQFFGGCSE >NZ_CP051636|257969:279069|259721_260201_-|WP_035689249.1|DBSCAN-SWA MAGINKAIIVGNLGNDPEIRTMQNGDQVATISVATSESWTDKQTGERRELTEWHRIVLYRRLAEIAGQYLKKGSKVYVEGRIRTRKWQDQQGIERYTTEIQGDVLQMLDSRQDGQGAQTNAPPRQTQSTKSNAYANAKNGNYTPPAQNNGDELDDDIPF >NZ_CP051636|257969:279069|276126_276348_+|WP_017806446.1|DBSCAN-SWA MQNEMKRYAISYFFKGKKWCSDVYANSFEEAQEKVKAMSQATIDGELYCSIYVPVKPQSRIARLLLKLLHKFS >NZ_CP051636|257969:279069|260817_261597_-|WP_035689246.1|DBSCAN-SWA MTTALQTLTNKLAERFEMGSSENLPQTLMATAFRGQNVSPDQMTALLVVANQHGLNPWTNEIYAFPNNGGIVPIVGVDGWSRIMNDHPQFDGIEFTFNDDNSCTCNIYRKDRTRPTTVTEYMIECSRNTQPWKSHPKRMLRHKAMIQCARLAFGFTGIYDQDEAERIVENQKEPLNVTPKPNVIEGQAVELATSEQIDTLNQLIQLTNTDTEKAFAYYSVQSIEQLSKAKAEHFIKTLNGRLDESAQNDNNKASEEVPL >NZ_CP051636|257969:279069|260188_260821_-|WP_046097549.1|DBSCAN-SWA MIDGLITLDCEQGSEEWLTARLGIPTGTGFKNIVRISGDRSATYIKYLAELVEESILGLPDSRYKSDYMERGNQLEPLARGAYEFLTGNKVQQVGGVYLDEKREVMVSPDGLIPELKKGLEIKCPKMSTHITYIIEGGIPLEYVIQVQANLWVTGYETWDFVSYCPEYQKQPLYLFTVERNQALMEAFDYHIPEFLTALKALKGENQWQA >NZ_CP051636|257969:279069|273072_273357_+|WP_035689367.1|DBSCAN-SWA MNLRKEAKGRECQVRLPGICNFNPETVVLAHYRMAGINGVGQKPDDIFGAWACSSCHDAADFRVKTSYSRDELRLALAEGVFRTQAILRMEGKL >NZ_CP051636|257969:279069|276604_276922_+|WP_035660437.1|DBSCAN-SWA MMNIVIERNPASKKYCEKAEIRSMGKAGRLARMFAKSRQKKIKTGKPDRIKTALVMLPIPSKSQIEKAAAQFQAVKPNYHKGEIGVNTVRATQKIRRGCQELMRI >NZ_CP051636|257969:279069|278103_279069_+|WP_046097210.1|integrase|DBSCAN-SWA MQKLENPSFSNYFEHWITTYKKGTIQRVTYRKYENSLVKLREYEELNDINDYDKINYQQLINRYAQTHSIQTVKDFNIHLRSCVRELIDEGILLRDFTSKVKITGNPPPVRKKFLEEDELKKLVRALNLDRKELNWDHFIYLLLTTGMRFAEGMGLTPEDFDFDNLTVSINKTYDYKASSIKKNADSSNFTRTKTLSSVRVVRLDFRTAYILRDLIENAPQGKSIWADWYYSNSNAKAIYNTTINDQLKRACKRAGIDPISVHSLRHTHASLLIANEVDMQVVSKRLGHSKTSITQDVYTHLMGTAEQKAQSKINAVMAGI >NZ_CP051636|257969:279069|273682_274033_+|WP_035689370.1|DBSCAN-SWA MSELILTLPYPPTVNHYWKHTKSGLHYVTTQGKAYQQAVKILSQNAPHFAGKVAVNISIYPPDNRRRDIDNIFKALLDALVKAEVIQDDSLIVKLVAEKLKPVKGGKVEVHIEGVK >NZ_CP051636|257969:279069|274032_274395_+|WP_035689371.1|DBSCAN-SWA MRAIDDIHTTAIRYGKWANEGHGLGYPAIEPFLKEAEKWHHGIPVLDDDTALKINACTIKMRAVTPELFQAFMLRFVSGKSINQICQEMDVSDGTVKKYIYAALQSLKLLLTENQCIFIA >NZ_CP051636|257969:279069|272436_273072_+|WP_052716788.1|DBSCAN-SWA MASKTRRKTEIHAVKYANGAIVAETDYDRNLLKSLPIGSAVKIVPLSHNRNYQHHKKFFALLDAGFEYWHPEFSVLTQAEEWVAQAVAKEIAIAANDENLYTNITKPIADKVLAKVRSNREAKLDYEGMKTLEAYLDHVMKKAGFYDIKPNQDGGTIKIRWSIAFDRLPQEKFNEVYKGVYGVIWNETLCHIYQNEWELENKINQLIAFGG |
33 | Mannheimia_phage(44.44%) | integrase | attL 255979:256030|attR 282214:282265 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
285938 : 292418
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP051636|285938:292418|DBSCAN-SWA AATGAAACTTTACGAAATCGCAGAAAGCTACAACAACGTAGCAGAACTCTTAGCTAACCCAGAATTTGCCGAAAATGCGGATATTATCACCGCACTTGATGCCATAGAAGATGAGTTTAACAACAAAGCCATCAACACCATTAAAGCCATTAAACGCGTGGAAGGCGATATTGACTTACTTGATGCCGAAATCAAGCGACTAACGGCAATGAAAAAAGCCCGTCAAAACCGTATTGAGGAAGTGAAAAACTACCTTAAATACAATATGCAAAAAACGGGGATTTTCAAAATCGAAAGCCCGCTGTTCAAAATTGCCTACAGCGAACGAAAACAAAGTGCGGTGGAAATTGACGACAATTTATTCCTTGCCAATAACCTTGATGAAAACCTTGTCAGCGTCAAAATCACCCCGAACAAAACCGCCATTAAAGAGGCGTTGAAACGGGGTGATGATGTGATTGGGGCAAGGTTGGTTGATAGCCAAGTGTTAAGCATTAAATAGGAGTAATCAAATGCAATTTCAAAAAGCAGAACGAAAAAAATCAAAGCTCAGACTTGCCTTAACAGGTCCAAGTGGATCGGGTAAAACTTATGGGGCTTTGCTTGTTGCGAAAGGGCTAGGTGGAAGAATTGCGGTAATTGATACCGAAAAAGGGAGTGCTTCCCTTTATTCTCATTTGGTCGATTTTGATGTGCTAGACCTAGAAGCCCCTTACACCCCTGAACGCTATCGCCAAGCAGTTAGATTAGCCGTTGAAAACGGGTATGATGTCGTAATTATTGATAGCATTACGCACGAATGGTCAGGAGCTGGAGGTTGCCTTGAGTTAAATGACGAAATCGCCAAAGCGAAATTCAAAGGAAATACTTGGAGTGCGTGGAGTGAGACCAAAGCACGCCACCGTGCTTTAATTGATGACTTACTTGCCAGCCCAACTCACATCATTGTTACAATGCGAAGTAAAACTGAGACCGCTCAAGCAGAAATAAATGGTCGCAAGCAGGTTCAAAAACTTGGAATGAAAGCGGAACAAAATGACGGTATTGAGTATGAATTTACTACTGTATTGGATTTAATCCACGACGGCAATTTTGCTCAGCCGAGTAAAGACCGTACAGGCTTATTCCCACCTAATGGAAATCCATTTAAATTATCCGCTGAAATAGGGAAACAGCTTGTAGAGTGGTTGGAAAGCGGTGTTGATTTAACCTTTAAAAGGGCTGAGGTTCACAGAGATAAAATGCTACAAAAAATAACGACTGCAGAAACGCTCGAATTGCTAGGTGAAATGAGTAAATATGTTACTGATAAATTTAAAGATTATCCGATTTTATTAACAGAGTTAGAACAAGCAATTTTAGCTCGCAAAGCGAGTTTAGATAATCAAGGGGGAGAATAATGGCAGGCATAAACAAAGCCATCATCGTCGGCAATTTAGGCAACGATCCAGAAATCCGCACAATGCAAAATGGCGATCAGGTTGCAACAATCAGCGTGGCAACCTCAGAAAGCTGGACTGATAAGCAAACAGGCGAACGGCGAGAACTCACTGAATGGCATCGCATTGTTTTTTACCGCAGACAAGCAGAAATTGCAGGGCAATACTTGCATAAAGGCTCAAAAGTGTATGTTGAAGGACGTATCAGAACCAGAAAATGGCAAGATCAACAAGGCATTGAGCGTTACACCACTGAAATTCAAGGCGATGTATTGCAAATGCTAGACAGTCGCCAAGATGGACAAGGTGCGCAAACAAACGCACCACCACGTCAAACGCAATCGACAAAATCCAATGCTTATGCTAACGCCAAAAACGGTAACTACACACCACCAGTGCAGGGTGGTAATGATGGATTAGATGATGATATTCCATTTTAGGAGAGAGTATGGACAAATTAAAGTTTGCCGACGTAACATTAGTTAATGGAGGTAGAGCGTGGATTAATTTTCACGAAATAGAATGCATTAAAGATTGTTACTATCGCTTTGATGAAGAAACAGATGACATCATAGAAGGTGACAAATGGGAATTTAAAGCAACTAAAGTCATAATGAAAAGTGGGCGTATCTATTATGTAGATTTCACTTTAGACAGTTTCGACGATAAATTCAATCTAGACCAATTTAGATTATAGACAAATCGCCCTTATTTAAGGGCTTTTTTTACGAGGTAAAAAATGAACACAAACGAGCTACTCAACGAACGAGAAAAAACGCACGGCGATTTTATCAGCGGTGCAGAAACCTTTTATCACCTGATGAAGCCAATTATTGATAGTCAGCTATTTGAACGCAACAAAGTCAAAGCCTACGCCGCCACAATGATTGCCGCCAAACTCACCCGAATTTGCAATGGTGATGAAACCTTCCCCGACCACTGGGACGACATCATCGGCTACGCTCAATTAGCCACTGGCAAACAATTTGAGCCACAGCAAGCGGTAAGTGTGCCGGTTGTGGATTATATGAAAAAGCCTAACTCCAACTGTTAGGCTTTTCCGAACAGTTGCGAAGTTATGAATGGGCTTGTTTAAGTAACAAAATTGCTTGTTCTAATATCTTTCCTTTTGAAATACCAAGCTCAACAGCAAGCCTATCTATTTCATCTGAAACAGATTGTGGAATTTTAAAAGACTTCGTTACAATGCCCCGCTTTGCCTCGCTACGAGCATTTATTTCGGTTCTTGACAATGCCATAATTATTCCCTATGATTTGAAGAACTGGGGGACTGGTACTCCCCCAGTAAGTTATCAGATTAATAAACTGGCAAAGACCAGAGTAATAAAACGATAACTAGGATAATACGGATTAACATATTATTATCCTCTTCGTTATCGTGAGGATTAAGCCTCACACTCACTTTCAAGCTATCCCTTGAAAGTGAGATTATTATAATGTATGTTTACATACAAGGCAAGTAATATTTTAAGAAAGCCCGCAATGTTTATTGTGGGCTTTTTATTTGACACTGCCCAAAATCATTTAGGATAACCAAACAGGTCGCATTAAGCGACCTTATTTGTTTCAGCAAACAGCTTAATTCCCTCTGAAACAATCTGCGTTTTAGAAAGCCCCGTTTGGCTGCTAAGCTGAGCTAAAAGAGCGATAGTTTCCTCGTGAAGTTTATAAGATTGCAAACGCACGCCGCGTTTTTTATCGCTTTTTTCTTGCTGTTCTTGACGCGTTAAACCTGATTTAGGACGACCACGAGACATATTAACCTCTTGCATTTAATGAATTAACGGTTTATAGTAGGAGCCATTGGGGGACACTTCCACATATCCCCCGCAGGTTTATCCTAGAATGCTGGCATTGCCACCATTAGCAGGATAATTAGGATTGCGAGCTTCAAACACATATCCTAACTCCTTTTTTGATGCCCGATTTCAGTCGGGCTTCTCATTTTTAGAACCATTCCAAAAACAAGATTATTGTAGTTTATACTTCATAAAGAAGCAAGATTTATTTAGTATTTACTAATTATTTTTTATTTGACACCGCCCAAACTTCGGATTAAGATAACCGCACTTACTTTCCAAAAGCGGTTTCCGCCTCCGATATAAAGCGGTTTTTTTGTACCTAAATTTAGGTTTAATCCGATGAGATCGGGGCGAGAGAACGATATACAATACATCTGAATAAGTTCCGCCCATCTTTTGGAGGGTAAGTTGAACCCCGATCACCACTTAATGATCGGATTAATTACTTAAATCCAAAAGGTACAAAATTATGTCAAACTTACAAATCTTAAATAACTCTATCCGCACTTTGGATAATCTTTATTCATTAAATGATCTTCATCTTGCTAGCGGTAATGATCCAAAACATCGCCCTAGTTTGTTCGTTCGTAATGAGCAGACAAAAGAATTAGTCAAAGAAATTGAAAGTGAAAATACCCGAAGCACAAAAACGATCTTCGCTCTAAAAACCATCAGAGGTGGCAAAGATATTTCTGTTCAAGGCACTTGGGCTTGCGAAGAACTCGTCCTATCCTATGCAATGTGGATAAGCCCGAAATTTCATCTTGTTGTCTTGCGTGCTTTCTTGGCAATGCACAAAGGCGAAGTGAAACAGCAACAACTCGCCTTGCCCGAACCAGAGAAAAAATACACATTCGAGTTCACCGAGTACGAACTCGAACAACTCGCGTGGCTCTGGTTCAGTCACAAACGAATGAACACCCTACTTGCTGACCTTTACGAGCCACTCAACGCCCTTGGCTCAACCTTTAGTGGCACGGTTTACAGCCACGCTCACGAGTACAGACATCACTACGAACACACCCAAGCCACAATGCAACGCCTAATTGAGCCGTTCAAACACTCAACAAAGCTCAACTGGCAACGGGTTATCCCAAGAATTAGCCCAACGCAAAAACAGCTAGGCTTCTAAAAACGCCCCAAAAACCGACCGCACTTCCTCGTGAACCGTGTGGCAGTTTTGCTCAACCAAAATTCAGCAAAAAGGTGAAATTATGTTCAAGATTTTAATGATTATCGGCTTGTTGTGGTGTGCGTTCGAACTCGATTTAAGCTCAGACTGCGATGGGCATTATTGTGGAATAACCACTGATTTAATCACAAAAAATTAACTCAACCCAAGCCTACTTTGTAGGCTTTTTTATTAGGAAACCCTATGGAAAAACTCATCAAATCCCAAACGAGAGTAAGAGCGTTTGGCGAGGTGTACACGCCGCAAAAACTGGTGCAAAAAATGACCGCACTTTTACCCGAAGAGAGCTTTGAGCCTGAAAAGAAAATTCTCGAACCTAGCTGTGGCACGGGGAATTTTTTATATGACATACTCAACCGCAAGCTATGTAAAATCCTCGTAGGTCCAAAGCGTCCTTATTACAAGGTGCTGAATATGTATCAGGCACTAGCGAGCGTGTACGGCGTAGATATTCAACTCGACAACGTGATCGAATGCCAACAACGTTTAAAAAGCCTATTTTGCGAACGCCTCGCAATGCTGCACGTTAAGCCTTTTGACTATTTTGTCGATCACGTCTTAATTAACAACATCAGGCGAGGCAACGCCCTTGAGGACGCATTCACCTTTATTGATGTCGAGATCGTTTTCAAAGATCGTGATATTGGTATTAAGGTAGAGAAAGATAGCTTTTTGCTTAGCGAATATGAATGCCATTTGCAACAGAACACCTCTCAACTCCAAGCCGTGCGATTGCTGGCATTTGAAGATGAGATAGGGATTACCAGAAATGCAACCTAAGGCTAAAAAGCCTATTTTATTGGAGGGAATATGGAGTTTATAAATACAGAAAAAGCTGGAAAGCTCCTTAATATGCATCCAGCAACAGTGAGAGAAAGAGCGAAAAAGAAAGAAATACCCGCTTATAAAATTGGTAAGTATTGGAGGTTTGATCCTAAAGAGCTTGAGTTTTTTGTAAAAAATAGTCAAAATCGCCCCGAACAAGAGATGGGGCATAAGGAGAATTTATGTCGCGTCAAATCATCTCCCTCAAGAAAAGAGGGGAAATCTGGCATTACTCGTACACCTCACCAACGGGTGAGCGGGTACGCCGAAGTTCTCGGACTACCGATAAAACCCAAGCAATGCAATTAGCCTCGAAAGAATATAATGAATGTTGGCGAGTATTTAAACTTGGTGAACGTCCAGAATATTCTTGGCAAGAGGCGGTTATGCAATGGCTTGAAGAAAAGCCGAAACGTAAACAAGATCGCAATATGATTTATGGATTACGTTGGCTGGATCAGTATCTTGGAAATAAAAAATTAAATGAAATCGACCGTAATCTGATTAAATTTATCCAATCTGAAAAAGCAAAAGAGGGGGTTAAAAATAGGACTATTAACGCTATTTTGCAACAGATTAGAGTGATACTCAGAGCGGCAGTTGAATGGGATTGGCTAGATAAATGTCCCGCAATAAAACTCTTGCCCGAACCTAAGCGACGCATTCGTTGGCTGACGGAAAGCGAAGAAATGCGGTTAATGCAAGAATTGCCAGAGCATTTAAAAGCCATTGTACAATTTGCGATTTTAACTGGGTTAAGAATGTCGAATATAACGCAATTAAAATGGTCGCAAATTGATTTACCGAAAAAACTTGCTTGGATAAACTCAGACGAGTCAAAGACGGGAAACAGCATTGGTATTCCGCTCAATGACAAAGCAATTGAAGTTATTGTAGCACAGTTTGGTAAACACAAAGAAAACGTATTTACTTATAAAGGGAAGCCTGTAAGGATTGCAAATACAAAAGCATTCCGTAATGCGTTAAGTCGTGCGGGCATAAAGAATTTCCGGTTCCACGACCTAAGGCATACTTGGGCTACAAGGCATATTATGTCTGGAACACCTTTATATGTATTGCAAGAACTTGGTGGCTGGAGTAAAACAGATACTGTCCGAAAATATGCACACCTATCTGTTGAGCATTTACATAGCCACGTTAACAATGTTCAGCTTTTTGGTACAAAATTGGCACAACACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP051636|285938:292418|290574_291171_+|WP_051128099.1|DBSCAN-SWA MEKLIKSQTRVRAFGEVYTPQKLVQKMTALLPEESFEPEKKILEPSCGTGNFLYDILNRKLCKILVGPKRPYYKVLNMYQALASVYGVDIQLDNVIECQQRLKSLFCERLAMLHVKPFDYFVDHVLINNIRRGNALEDAFTFIDVEIVFKDRDIGIKVEKDSFLLSEYECHLQQNTSQLQAVRLLAFEDEIGITRNAT >NZ_CP051636|285938:292418|288944_289154_-|WP_035688068.1|DBSCAN-SWA MSRGRPKSGLTRQEQQEKSDKKRGVRLQSYKLHEETIALLAQLSSQTGLSKTQIVSEGIKLFAETNKVA >NZ_CP051636|285938:292418|287336_287816_+|WP_035688057.1|DBSCAN-SWA MAGINKAIIVGNLGNDPEIRTMQNGDQVATISVATSESWTDKQTGERRELTEWHRIVFYRRQAEIAGQYLHKGSKVYVEGRIRTRKWQDQQGIERYTTEIQGDVLQMLDSRQDGQGAQTNAPPRQTQSTKSNAYANAKNGNYTPPVQGGNDGLDDDIPF >NZ_CP051636|285938:292418|287824_288073_+|WP_035688059.1|DBSCAN-SWA MDKLKFADVTLVNGGRAWINFHEIECIKDCYYRFDEETDDIIEGDKWEFKATKVIMKSGRIYYVDFTLDSFDDKFNLDQFRL >NZ_CP051636|285938:292418|288115_288430_+|WP_035688062.1|DBSCAN-SWA MNTNELLNEREKTHGDFISGAETFYHLMKPIIDSQLFERNKVKAYAATMIAAKLTRICNGDETFPDHWDDIIGYAQLATGKQFEPQQAVSVPVVDYMKKPNSNC >NZ_CP051636|285938:292418|288452_288635_-|WP_035688065.1|DBSCAN-SWA MALSRTEINARSEAKRGIVTKSFKIPQSVSDEIDRLAVELGISKGKILEQAILLLKQAHS >NZ_CP051636|285938:292418|291398_292418_+|WP_035688073.1|integrase|DBSCAN-SWA MSRQIISLKKRGEIWHYSYTSPTGERVRRSSRTTDKTQAMQLASKEYNECWRVFKLGERPEYSWQEAVMQWLEEKPKRKQDRNMIYGLRWLDQYLGNKKLNEIDRNLIKFIQSEKAKEGVKNRTINAILQQIRVILRAAVEWDWLDKCPAIKLLPEPKRRIRWLTESEEMRLMQELPEHLKAIVQFAILTGLRMSNITQLKWSQIDLPKKLAWINSDESKTGNSIGIPLNDKAIEVIVAQFGKHKENVFTYKGKPVRIANTKAFRNALSRAGIKNFRFHDLRHTWATRHIMSGTPLYVLQELGGWSKTDTVRKYAHLSVEHLHSHVNNVQLFGTKLAQH >NZ_CP051636|285938:292418|286449_287337_+|WP_035688055.1|DBSCAN-SWA MQFQKAERKKSKLRLALTGPSGSGKTYGALLVAKGLGGRIAVIDTEKGSASLYSHLVDFDVLDLEAPYTPERYRQAVRLAVENGYDVVIIDSITHEWSGAGGCLELNDEIAKAKFKGNTWSAWSETKARHRALIDDLLASPTHIIVTMRSKTETAQAEINGRKQVQKLGMKAEQNDGIEYEFTTVLDLIHDGNFAQPSKDRTGLFPPNGNPFKLSAEIGKQLVEWLESGVDLTFKRAEVHRDKMLQKITTAETLELLGEMSKYVTDKFKDYPILLTELEQAILARKASLDNQGGE >NZ_CP051636|285938:292418|285938_286439_+|WP_035688053.1|DBSCAN-SWA MKLYEIAESYNNVAELLANPEFAENADIITALDAIEDEFNNKAINTIKAIKRVEGDIDLLDAEIKRLTAMKKARQNRIEEVKNYLKYNMQKTGIFKIESPLFKIAYSERKQSAVEIDDNLFLANNLDENLVSVKITPNKTAIKEALKRGDDVIGARLVDSQVLSIK >NZ_CP051636|285938:292418|289668_290331_+|WP_035688071.1|DBSCAN-SWA MSNLQILNNSIRTLDNLYSLNDLHLASGNDPKHRPSLFVRNEQTKELVKEIESENTRSTKTIFALKTIRGGKDISVQGTWACEELVLSYAMWISPKFHLVVLRAFLAMHKGEVKQQQLALPEPEKKYTFEFTEYELEQLAWLWFSHKRMNTLLADLYEPLNALGSTFSGTVYSHAHEYRHHYEHTQATMQRLIEPFKHSTKLNWQRVIPRISPTQKQLGF |
10 | Mannheimia_phage(25.0%) | integrase | attL 280907:280922|attR 293415:293430 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1464830 : 1487798
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP051636|1464830:1487798|DBSCAN-SWA TTTAACGTAAGTAATTTACGGTTTTTGTGGGGCTTTGCTCTGTTCTTGGGCTGTTAAAAATCAAGTTTTCGATTTCTTGCTGTATTTTTTTATCTTTAAGCGATTGGGTGTGCTTGGCGATAAAGCTTTCTAGCGTTTGTGCAAGTCGATTGCTAGCAGTACCAAGGTTGAAAGCGGTTTTGTAGTTTTTATGGCTTTCCAAGTCGGAAAATAGCTCCTCTAAACGCTCCCAAGCGGCAACAGAATGATTGATGTAATTCATTGCTTTAGCTAGCATATAGAAATTTTCCATATCTAACGCAAGGCTATTGGGTGGCAATTCTTGCATTGGGTGCATTGAAGCAATGTAAATCATCACATCACGATGATCTTTGCGTTTGATTTGCTCATATTTCGCCACCGCAAATTTATTTTTCACTCTTGCCCAGATTTCGCCATAACTCATTTTTGTGCGTTGATGGGTTGCAGCAACGGCGTTTTGAATAAGGCGTTGTTCTTCGGGGGTGATGGTGTCGTTTTCATTTATTGATAAAACTTTTTCTGCCTTGCCTTTATTCCAATAATCAAACAATGCTTGATAACATTCTCTTTTGTAGGTGATCAAGGTTTCTCTGATTTCAGGTTTCACCCGTTTTACATCAATGCCAAATAGCCAGCCGTTGAGGTATTGGATTGGAAGGCATAATGTTTGTTGTTCACCACCTTGTGAAGGTATGGTTATAATGACCATACCTTGAGAAAGAACTTCATCGCGTTTAATTCTTGCATATTGAGCTTTCCAGTCCAGACCAATATTTTCACAAATTGGCTTCATTGCGACATAATGAACGTTGTTTTGCTCAAATGTAGTTAAAGTGCGGTCGTAAAATTGGATTGTTTGGAGTTGAGTTTGAATTGACATAATAGCCTCTGTAATTTTCGAAATTTTGCTAGCCAATTTAAGGTGTTCTTATAACACGAATACCTTTTGAAATTGGTGATCGAGCGGTTCGAAAGCCTACAGCAGGCTGGAGTTATTTCCCTTGCGGGTATTGTATTCCTCGCCCACTCGATCATAGATTAAAATTACCATTTTTGTCCAAACTTGGCTGAGAAAAGGAGAAACACCAAATTCTAGATACAAAAAAACCGCAATGGATTTAGGTCTTGCGGAACTGACCGCTGTAAGGTTTCGACACCTATCAGACTAATACTAATAAAAAGCCTATTGCTTGTCAATAGGCTATATTGATGTTCGGCAACAGATCACTTTCTACGTCGTTTTCGGCGTTTTTTAGATGAATTGGAACCAAAAATACCTAATATTGATATTGCAACAAACAATACAAAAAACACAATTTTAAATATCCAAACTAGGATAGAAAATATCTTTTTAAATATCTTTTTTTTGCTGCCTTTTCTTTCTGCCAGCCAAACTTCCTTAGGAATAAGATGAAGAACTGGTTTAGTCGGTTCGTTAGACATTTTCGTTATCCTCATCATCTGATTCTGTTATTTCGTTATATTGATTGGATTTTTTCATAGCTTGTGATTGGCGATATTCATTGGCTTCTGCAACCATTGTGAACTCCACTTCACAACCTAATTTTTCAGCAGCTTTTGCAATTTCGGCAAGATCGACCTCAAAAAATTCTTTTTTAGTATTAACTCTATTGACCTGACAATGTGCGAATTTTTTATGTAATGTGTTTTCTAGTTTTGGTGCATCATCTGTCCTAATTAAAGCGTGGACATCAAAAGGGAATGGAACACTGGCATCACCTAATTCTTTAACTCGATCTAACGGTTCTAATCTTCTTGTCATTCCGATTTTATAAACATTTTCCCCAAAAGAACCAATGTTAGAAATGACATATACCGTACCTTGTTTGGTGAGTTGAGCCATTGATATAGCACGTTGAGAGTCTTCTATCGCTTGCTTTAAATCTTGTTCTGCTTGAGCCAGTTTAGCTAATAACTCTTTATTGGTTTTATCTAATTCAAGCAATTTTTTATACTGTGCGATCTCTTTTTGAGCTTCCCTCTCTTTTTGTTCCGCTAGTTTTCTTTGTTTTTCAGCTTCACGTTGAACTTTTTGTTCTTCTCTCATCTCTTCTTGAATACGTTGCTGTTCCTCTTTTTCTCGTTGTTTTTTAAGTTCATATTCAAAGGCTAGGTGTAATTCTTCGTGTTTCAGAGCTAAATAATCTTCGCTAATGAAGATCCGAAATATCACGCCTTGTTTGTTTAACCTTTCAAAGGACTTAGTCATTTTATTCTTGAACAAATCAAAGTTTCGGAAAGAGACATCGTTAATCAATAAATCACATTCTTTGTCAAATGCCGTAAGCATTATAGTTGATATGTTATTCATCATAGTAAAACCATCTTTTTCAGCTGTTTTACCTAGCCCGACGACCCATTCAGCATCGGAATATGTAGCTTGCTCTGATTTTTTTAATTCAGCTTGTTTCTGTTTATTTTCATTCCATTTTTCTTTGAAACGTTTAGAAGAGCGAAATCTGAATTTTGGTGTGTAAGGAGCAATAGTGGAGACTTCTTGAGCGCATTCTGATTGACTGCCCTTAGAAAAGGGTTGTCCTTGATTGTTTTTGAGTTTCTTCCATTTTCTATAGTAAATAACAAATAAGATTAAAAAAATAGGGGAGGATAAAAACCAAATGATTGGTAATGCGGCGTCCATAAATAAACTCCTAAAATGAATGTGGGAATTTATCATACCAAAATTAAGAAACTTTTAAAGTAAGTGAGAACACCTTAATCAGATTGTATTCAACGAGCTTAAAATTGAGCTGGCCAAATTTATCACTGAGATAGCAGCATTAAAACTAACAAAAATTAACTCATTGAAAAAGTGTAGTGCTATGATATACAATAACCGTATTATTAATTAAATTCTTACCTTATGATACTTTCATTTAAGCATAAAGGCTTGGAAAAATTCTATAAAACTGGCTCAACTGCTGGGATTATTGTTGCACATTCGGCTAAATTAAAGCGAATTTTAGCGCGATTAAATAGCTCAAAACAAATACAAGATATGAATATCCCGGGTTGGAATTTGCACCCATTAGCTGGAAACCTAACCAATCATTGGAGTGTTAAGGTAAATGGTAATTGGCGAGTTACGTTTAAACTGGAAAATGGACACGCTGAAATTGTGGATTATCAAGATTATCATTAGGAGATTACGATGAATATGTATTGCCCACCGCACCCAGCAGAAGTTATCAAAGAAGATATTTTACCCGAGTTAGGCTTAACTGTAACACAGGCGGCTAAACAGTTAGGCGTAAACAGGGTAACCTTTTCCCGATTATTAAACGGCAAGTCCGCAATTAGTGCTGAAATGGCTTTACGGCTGCACGCTTGGCTAGGGGAAAATAGCCCTAGTCCAGAGAGCTGGTTACATCAGCAAGCGGATTATGATTTATGGAAAGCCTCACAAAAGCAAACATTTTCGGTTCAGCCTGCTTTTGTAGTATAGCGAATATAAGAAAAGCCTATTGATTATCTATAGGCTTTGAACATATCTATTTTATTGATAATTCAACCAACCTGAAATGGGGTCGGCTAAACTCATCATCGTCCGTGTTTTACGCTTCTTCATTTTCCGCATCTAACAGTGCCTTTCTTTCTTCCATTTCAGCACGCTCCTGCATTAACCGCGTCTCTTCCTGTCCTGAAGCTAAAATTGCGTCAAGTTCTTCGTAAACTTTATCCATACTTTTCACTTCAACGGTTGATTCGACTTGTTGTTTTGGAACTAAATCATAATTTACATTCCCCAAGAATTGCACAAGTCTTGAGTCATACATTCCAACTAAACCGCCCTCAACAAGCATTGTTTTGCCTAGATCTTTAAACCTTTTGTACGCACCGAATAATTGTTTATTTTTTATACTTCCATCTTCATTTTTCGCAGTACAATTATCTGTAAATGTTTGTTCATCAACACCACACAATAGAGCCATTCTTGTTATTGTTGGGAAAGCAACGCCAAGTATATCCATTTTCTTTCCCTCACTGTCTTTTTGAATTAACTCATAGTATTTGAGTTTCCCTTCAACATAATCATTGATCGCAGCCTCCATTTTCTCAATAGCTAAATCTGGATCAAACTTATAGGGACGTCCCCGTTTGGTTTCCCATTGCCCCTCTTCTAATTTGAGTTCCCTCTTCGAAATTGCGGCACTCACTTTTGCTTTACGTTTAACTTTTGTTTTTGCCGTTGTTGCAGCTTCCTTTCTAGTCGCCATATCTATATCCCACTAAATCCAGTTGCTTTTCGCTTCCATCACTTAACACGCTTTTGAATTGACGCAATATATTGTCATCATAGGATTCTTTTGATAGCCTTCTTCGAGTGGATGAAATACGTTGGTTGATTTTATCGACTTGCTTCATCACTAATGACCCCGCTTTAATATCCTCATCGAAATTAGGGTTGAGTTCACGCATTCGATTTACCGCATCAACGAGTTCAGCACTCTCATCACAAAGCATTGATAAGTGCATACTCAGAACCTGAGCTGACGCACCTTTAACTATGGTTTCTGTCAGCCCCTCTAAAAGCTGATTAGCATAATGCTGCACACTGCTATAAATAGCGAGTTGCTCAACACTTCTTGGATCTCGTTCTGGGTAATTCGACATACCCAGCAAATAATCCATTGACACGCCATAGCACAATGATGCCCGAGCAAGAAAATTATGATTAATCGCCGTTTTCGAGGTTTTTCTTTCCATCTTGGAAATCATACTCGTATTAGTATAGCCCATTTCCGCTGCGGCTCTCTCTGGGCTTTTCCTTGCAAGTAAACGCGCACTTAAACAACGTGCACGGATTAAATCAGGATTTAACTTAAAGTTACTAATTTTTTTCGTCATACAACAACCTTACTTAACTAATCCACTTAACCACACTCTCATTTCTAACTTTTTATAAACGACTAAATCAATATTACCGCTCCCGCTTTTCTAATAACTTCACTTTCCGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP051636|1464830:1487798|1470713_1471151_-|WP_035689209.1|DBSCAN-SWA MVKGAGGTFVPADEMFLPALQGFKNGEMYSVEIKRTRNPQFHRKVFAFFKFCFEYWAAENTELQFQSEAKQFDTFRKNLTVLAGFREVTYTIDGRMRVEPQSLSYGNMEQDEFEQCYSALINAAIKHIFNDTTDPNVINQLHSFF >NZ_CP051636|1464830:1487798|1486964_1487249_+|WP_035689262.1|DBSCAN-SWA MKVEIARYELNDLVVYAERYALGRSTYAVNDVCSFIKNHYKKLSKNTLNILIKDIQDYCDNRGEVTFREMWKEILGLLEEEYAHWQPLPDEPKS >NZ_CP051636|1464830:1487798|1468022_1468316_+|WP_026138622.1|DBSCAN-SWA MNMYCPPHPAEVIKEDILPELGLTVTQAAKQLGVNRVTFSRLLNGKSAISAEMALRLHAWLGENSPSPESWLHQQADYDLWKASQKQTFSVQPAFVV >NZ_CP051636|1464830:1487798|1485714_1486044_+|WP_035689257.1|DBSCAN-SWA MEIKETLHVRDFIYHGLRFVSEDCPLLKEPGDINYARWIMSMHDVPATLSFDIEEYVKQFPLYCMYNGIKHKFINVSRLGDVFITDNLESESYNKRVSITNLYQFSKEV >NZ_CP051636|1464830:1487798|1483061_1483541_+|WP_035689249.1|DBSCAN-SWA 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37 | Mannheimia_phage(52.63%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1678783 : 1765614
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP051636|1678783:1765614|DBSCAN-SWA 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105 | Haemophilus_phage(23.94%) | tRNA,plate,holin,tail,terminase,transposase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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