Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP051637 | Avibacterium paragallinarum strain ADL-AP16 chromosome, complete genome | 1 crisprs | PD-DExK,cas3,DinG,DEDDh,cas2,WYL,cas14j | 0 | 1 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP051637_1 | 624244-624370 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP051637_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP051637_1
>1.1|624280|55|NZ_CP051637|CRISPRCasFinder TATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTT |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP051637_1
The CRISPR arrays of NZ_CP051637_1 >merge|NZ_CP051637|1|624244-624370|CRISPRCasFinder GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAATATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTTGGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA >NZ_CP051637|1|1|624244-624370|CRISPRCasFinder GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA TATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTT GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA
>NZ_CP051637.1|WP_035684723.1|623514_624063_+|oligoribonuclease MQLDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKDLNILAEGPVLAIHQPDSLLAKMSDWCKKTHRENGLIERVKQSKLNERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSVAQDKRFLFKYMPDLAEYFHYRYLDVSTLKELASRWSPEILNNFSKKNTHLALDDIRESIAELAYYREHFIKAP >NZ_CP051637.1|WP_035684717.1|622384_623443_-|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA MSKQKLTHNQQRRIKSNNVRALQRHKLKMKKEIEWQDEMLGPTQEGTVVTRYSVHSDVEDEQGQIYRCNLRRTLSNLVVGDKVIWRKGNEQLQGVSGVIEAIHPRKNEITRPDYYDGLKVIAANIDRIIIVSAVVPELSLNIIDRYLVVCENANIPAVILLNKVDLLSEEQRQQVETQLKIYQDIGYQTMMISAKTGKHMQDLTALLSSGTSIFVGQSGVGKSSLINAILPEVNAQVGEVSELSGLGKHTTTSSRLYHLPQGGDLIDSPGIRELGLWHLNANQITKGYREFQYFLGTCKFRDCKHLNDPGCALKEAVEKGKIHPIRFNNYHNLIESLSNIKGNRRFVIQDNG >NZ_CP051637.1|WP_017807274.1|621904_622162_-|phosphocarrier-protein-Hpr MYSKDVEITAPNGLHTRPAAQFVKEAKAFASDITVTSGGKSASAKSLFKLQTLGLTQGTVITISAEGEDEQKAVDHLVALIPTLE >NZ_CP051637.1|WP_035684716.1|620079_621807_-|phosphoenolpyruvate-protein-phosphotransferase-PtsI MISGIPASPGIVFGKALVLKEEKIVLDTQKIQDDQIEAEVERFYAGRNAAVEQLTAIKDRAYASLGEEKAAIFEGHLMILEDEELEEEIIDYLRSNKVNAGVAASTIIAQQVAMLSEIDDEYLKERAGDIQDIGNRLIKNILGMKIVDLGEINEEAILVAYDLTPSETAQLNLDKVLGFITDIGGRTSHTSIMARSLELPAIVGTNTVTQQVNTGDFLILDAVNNQVYINPTQEEIDRLRKLEQQLKEEKEELAKLKDLPALTLDGHRVDVVANIGTIRDIDGAERNGAEGVGLYRTEFLFMDRDQLPTEEEQFIAYKEVVEAMNGRLVVLRTMDIGGDKELPYLNLPKEMNPFLGWRAIRIALDRKEILHAQLRAVLRASAFGKLAVMFPMIISVEEIRALKAEIALLKEQLRNEGKAFDENIQIGVMVETPSAAVNAKFLAKEVDFFSIGTNDLTQYTLAVDRGNELISHLYNPMTPSVLNLIKQVIDASHAEGKWTGMCGELAGDEKATLLLLGMGLDEFSMSAISVPRIKKLIRNVNYQDAKVLADAALEQPTAADIERLVTDFLVEKALN >NZ_CP051637.1|WP_017807272.1|619516_620017_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MGFFDKLFGSKNSKTVEVEIYAPLSGEIVNIEDVPDVVFSEKIVGDGVAIRPTGNKLVAPVDGVVGKIFETNHAFSMESEDGVELFVHFGIDTVELKGEGFIRVADEGQKVKRGDTIIELDLEVLESKAKSVLTPVVISNMDEISHIEKKTGEVIAGESIILILKK >NZ_CP051637.1|WP_035684715.1|616528_619192_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type MSEMLTNDVDPIETNDWLLAIDSVIREEGVERAQFIIEQLMQHARANSVSLPTGVTTDYINTIPTSEEPNYPGNLDLERRIRGAIRWNAIMMVLRASKKDLELGGHMSSFQSSATIYEVCFNHFFKARTEKNGGDLVFFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLDNFRQEVHGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLNAIYQARFLKYLHHRGLKDTADQTVYAFLGDGEMDEVESRGGLAFAAREKLDNLVFVINCNLQRLDGPVTGNGKIIQELEAQFNGCGWEVIKVIWGRRWDRLLQRDTSGKLLQLMMEVVDGDYQTFKSKDGAYVRKHFFGRYPETEALVAEMTDDEIWALNRGGHDPLKVFAAFNKAKQVKDKPVVLLVKTVKGYGMGESAEGKNIAHQVKKMDMSGVKHVRDRFNIAVSDEDIEKLPYIKFEEGSEEYKYLHERRQALNGYVPTRSPRFSQALEVPALEEFAQLFEAQSRPISTTMAFVRSLNVLLKNKSVGKHIVPILADEARTFGMEGLFRQIGIYNPHGQNYTPQDREQVAYYREAIDGQVLQEGINEQGATASWIAAATSYSTNDVPMIPFFVYYSMFGFQRVGDLMWLAGDQRARGFMIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSAVIPNCISYDPAFAFEVPVIIQDGIRRMYGPEQEDVYYYITTLNETYDQPAMPKGAEEGIRKGIYKFETVTGQGKGKVQLLGSGAILRHVREAAQLLANDFGVTSDVYSVPSFTEVARNGADVERWNLLHPEAEARTPYIAQVMNDAPAVAATDYIRLYAEQVRAYVPAQSYRVLGTDGFGRSDSRENLREHFEVNAHYVVVAALAELVKQGIFDKKVVADAIAKYGIDADKINPLYA >NZ_CP051637.1|WP_035684713.1|614578_616477_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase MAKEIQIPDIGGDEVTVTEVMVKAGDTVEVDQSVINVEGDKASMEVPSPEAGVIKEVLVKVGDKVSTGTPMFILESADSAPASAPAVEEKAAPASTAPTQSAVSSVIEIHVPDIGGDEVNVTEILVNVGDSVAEEQSILNVEGDKASMEVPAPVAGVVKEILIKVGDKVSTGSLVMKFETTAATPAAQPAAEAPAAPAAVSGSVQDVHVPDIGGDEVNVTEIMVAVGDSVSEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEILVKSGDKVSTGSLIMRFEVAGSAPAAAPAAQPAATPAQTQAAAPVQSAQPANQAEVTASASFAHATPVVRRLAREFGVNLDKVKGTGRKGRILKEDVQAYVKAAVKAVESDSVSATASTGAANGAGLGLLPWPKVDFSKFGEVEQVELGRIQKISGANLHRNWVMIPHVTQWDKADITDLEQFRKEQNVLAEKQKLDVKITPLVFIMKAVAKALEAYPRFNSSLSEDAQSLILKKYINIGVAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGIIELSRELAEISKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGGTQFTPIVNAPEVAILGVSKSEMTPVWNGKEFTPRLMLPLSLSYDHRVIDGADGARFITFINGVLSDLRRLVM >NZ_CP051637.1|WP_035684710.1|613067_614492_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MNKEIKTQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLDTVIVERYSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKSLAEHGIVFGEPQTDIDKIRGWKEKVINQLTGGLAGMAKMRKVQVVNGYGKFSGPNTIIVAGDEGETTIHFDNAIIAAGSRPIQLPFIPHEDPRIWDSTDALKLKEVPKNLLIMGGGIIGLEMGTVYHALGSNIDVVEMFDQVIPAADKDIVQIYTKRIEKKFNLLLETKVTAVEAKEDGIYVSMEGKAANETRRYDAVLVAIGRTPNGKLIDANVAGVEVDDRGFIHTDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVIAGQKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGKTEKECKAEGINYEVAKFPWAASGRAIASDCADGLTKLIFDKDTHRIIGGAIVGTNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDLALTIHAHPTLHESVGLAAEVFEGSITDLPNPKAKKKK >NZ_CP051637.1|WP_035684708.1|611000_612770_-|autotransporter-outer-membrane-beta-barrel-domain-containing-protein MKTFNLNLVSISLGIAFTVTSINSFAAAANPLYAVNSTGSHSSSLNGSVNGGTSAFLYDNGDKSFNKLMIVDKLQQGAESQDRKDFETTYGIQFEWFEHDGSLTEEGKKHIYQAENGTFKSEVHLTKEEKVKFSAQKGSTADSQPTSNNSEATVHPKESSSIISNNSQPEAEGKSGEIIPTPSEKIETKERVEDASSHTELPKMGSATVIPATPTLKMTEARDTTEKAKPVMEIKAEQNLASATSAFSGTLSDLSQTTRAMATSFFNNTAVVQDQSAMVRNNAQYFVSYRHYFVEPIGIDKSDLRRQPSEMNVTTPNVNTYVDYAYHHYTLKNKNFHSKIHRNDITLGGYAQINGYNLGLAMISMKGNSTTLNNYTLASKVKMRTNGLLATFGWAFDKSYLNLGAYAVFSKVNTSRSPFGNSEQHASFNTQQYALDIVYGRSLYQTENSSILLNGGLTNVYYHQDSFNEQTDSQNATPYSLQVDSSAYFNSFAHLGMQASYQTYISSFTTRSDIALRVEQALTANRFDLKLQDGTTITGSKNDKFTVRLSVGQTFIFDKVSIRVGAEFIEGNRTNARLDTVSATLSYRF >NZ_CP051637.1|WP_035684706.1|609542_610916_+|TolC-family-protein MLKQSKLSLAIGLSVLLAGCANLDDSYKTSQQDFQQYEELTKQYNIQENWWTLYHDPQLNQLVQQALENNKDLAKAAIAVNTALYNANLIGANLVPSFSGSLSSSASKNINTGGNSTISHGGSLNVSYTLDLWRRLADASSAAEWRHAASEQDLEAARISLINSVILTYYQLGYLNDAISTVNKTINYYSEINRIMQNKFRQGVADRASSDQAQQAVLTAHNTLINYQTQKKTAEATLRNLLNLKPNDSLPATYPHILNVKNVGINLNVPLSAIANRPDVKGYQYRLNSAFKDAKAMQKSWFPSITLGGSLGSSGNKIDNAFNTPIAGGTVGISLPFLNWNAVKWNVKISESAYDLALVNFEQSITKALNDIDTNYFIYNQANQSFENLKQTYDYNKRITQYYKNRYDAGISELREWLNAASTERNSELSILNAKYNLIQSENAVYSAMGGYYSVEQ >NZ_CP051637.1|WP_035684725.1|624483_625566_-|peptide-chain-release-factor-1 MKPSIISKLDSLNERHEELEALLGDASVISDQEKFRAYSKEYAQLEDVVKCFARWKQLNSNMEEAQLLLDDPSMREMAQEEVEECKAEIEQVEAQLQILLLPKDPNDEYNCYLEIRAGTGGDEAGIFAGDLFRMYSRYAESKRWRVEMLSANESEQGGYKEVIVKISGENVYGQLKFESGGHRVQRVPKTESQGRIHTSACTVAVMPELPESELPEINPADLRIDTYRSSGAGGQHVNTTDSAVRITHIPTGIVVECQEERSQHKNKAKAMSVLASRIVQAEQEKLAAEQADTRRNLLGSGDRSDKIRTYNYPQGRVTDHRINLTIYRLDEVMNGKMDELIQPIITEYQADQLAALSDQG >NZ_CP051637.1|WP_035684727.1|625769_627059_-|serine--tRNA-ligase MIDPNLLRNNLAEVAEKLKIRRGFELDEARISELEDQRKALQVKTETLQAERNTRSKAIGAAKARGEDIAPLLAEVDNMGIELSMAKSQLDDVQAELQEIALSIPNIPADEVPLGNDENDNVEISRWGEPRTFDFEVKDHVTLGEHLQGLDFAAGVKLSGARFVVMKGQIAKMHRALAQFMLDLHTEQHGYSETYVPYLVNHATLYGTGQLPKFGEDLFHTKPLEGEQPYALIPTAEVPVTNLVRDEILEQAELPIKMTAHTPCFRSEAGSYGRDTRGLIRMHQFDKVEMVQIVEPEKSMEALEELTGHAEKVLQLLNLPYRKVLLCTGDMGFGSAKTYDLEVWVPAQNTYREISSCSNMWDFQARRMQARYRVKGEKKPRLVHTLNGSGLAVGRTLVAVLENYQNADGSITVPEVLRPYMGGLEVIGK >NZ_CP051637.1|WP_035684730.1|627132_628482_-|replication-associated-recombination-protein-A MSNFAFDFAENDFRPLAARMRPTNLEEYYGQRHLIGVGKPLRKAIEAGHIHSMILWGPPGTGKTTLAEIIAQRINAEVERISAVTGGVKEIREAIERAKQNRLTGQRTILFVDEVHRFNKSQQDAFLPYIEDGTVTFIGATTENPSFELNNALLSRAKVYILKPLTPQDIEQVLQRAIQDKEKGLGNEHFVLEDNVLQLLAEYVNGDARLALNSLELMADMAEEGKNGKILHRTLLTEVLGERQARFDKQGDRFYDLISALHKSVRGSSPDAALYWYARILTAGGDPLYVARRLLAIASEDVGNADPRGMQVALAAWDCFTRVGAAEGERAIAQAIVYLAVAPKSNAVYQAFNAAKKMAVESPDYDVPEHLRNAPTKLMKELGYGAEYRYAHNEENAYAAGENYFPEALKETKFYFPTQRGMEIQIGEKLEKLRQLDEKSQIQRYKLVK >NZ_CP051637.1|WP_017806586.1|628669_629029_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MVVKKKWEVIATARFKIWLKEQDEATRISVFNALNNLRFYGPQLSRPYVDTIKGSQYPNMKELRIQHKSKPLRAFFAFDPLRQAIVLCAGNKSNNKQFYKQMITIADAEFTDYLATLEK >NZ_CP051637.1|WP_017806585.1|629030_629339_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTQYTTLDELIAQESPETQQCIKEMSEELILETGLAMIREQLALSQKELAQAIGVSQSAIAQIEQRGNDVKLSTLKRYIEKMGGELSLTVKMPTGYSQIFPL >NZ_CP051637.1|WP_035684733.1|629390_630011_-|outer-membrane-lipoprotein-chaperone-LolA MKKMAVKMTALLCLGLSPLAWADAVSELQARLNKVEALSADYVQKVSDPKGKEIQQGKGKIQIKRPNLFRMDNQAPQESQVISDGKTLWFYDPFVQQVTANWVADAVNNTPFVLLTSNDTQYWKQYNVEQNADTFTLKPKSAKSQIKQFDIRIDGEGVLKNFSTTEKDGQTNLYLLRNITNQPLADSLFKFSVPKGVELDDQRKKK >NZ_CP051637.1|WP_035684736.1|630092_632945_-|DNA-translocase-FtsK MIKRITTNLTPKQYMGELCLGIISLFGLYLIVAWSSYSPFDNTWAVSSSQPETINKAGALGAWLIGLFFTLFGHIGNVIPFILCFVPIYLFKTKKFTQLTAIKAAIRTLGGVILFAGLTTLATLLLSNTSAYLAGGVLGGSLVVSLYPILGKAGLILSALLFTVAGFVLCSGKVLIQLFVRFYYWLTMNEHKTPTMATPEEPQEQSEPVPLEEIIIHKVEPRPEPQQAENTEQSEEAESPKSNQPFIQISGLKELTQPVASDNAPSSAENTENNATLFDPRKMELFSRYDVGQDDSLPNVSLPQSTSAVAPVVQVELVSPQISPPITPQKPELHAISQPANTQSAVSFSEEFLPYEAPNEPELKVSIPDYSVEAYQVTEDFAEPSDEMDDLARQFAAQEQQRLAEMQQRAKEINEEDTLEHILAEQEPASNQPSYKPYGDSLIHPALQKQVSIKEKPTTPLPSLDLLEKRQVEVQEITREEILDTSQRIEQQLRNFNVKATVKDVLVGPVVTRYELELQPGVKASKVTSIDTDLARALMFRSIRVAEVIPGKPYIGIETPNLHRQMVPLRDVLDSPEFRESKSLLSMALGKDISGNPIVVDLAKMPHLLVAGSTGSGKSVGVNTMILSLLFRVKPEEVKFIMIDPKVVELSIYDGIPHLLTEVVTDMKKAANALRWCVDEMERRYQLLSALRVRNIEGYNEKIEEYNAMGMPIPNPIWRPGDTMDAMPPALEKLSYIVVIVDEFADLMMVAGKQIEELIARLAQKARAIGIHLILATQRPSVDVITGLIKANIPSRIAFTVASKIDSRTILDQGGAETLLGRGDMLYSGQGSSDLIRVHGAFMSDDEVARVADDWRARGKPNYIEGILDSAEEEDSDTPRTGDDGELDDLFDEVMNFVIETGTTSASSIQRKFRVGFNRAARIMDQLEEQGIVSPLQNGKREILARRSDY >NZ_CP051637.1|WP_017806582.1|632946_633426_-|leucine-responsive-transcriptional-regulator-Lrp MEKKLPKALDAIDIKILNELQRNGKISNIDLSKKVGLSPTPCLERVKRLEKQGVIMGYRALLNPELLDSPLLVIVEITLVRGKPDVFEEFNDAVQQLDEIQECHLVSGDFDYLLKTRVADMAAYRKLLGTTLLRLPGVNDTRTYVVMEEVKQTNFLQLK >NZ_CP051637.1|WP_035684738.1|633572_634925_-|deoxyguanosinetriphosphate-triphosphohydrolase-family-protein MKNSINPLWLERFINDNPREKDHRPPFRRDRGRILHSAAFRCLQAKTQIHAVGENDFYRTRLTHSLEVAQIGSSLVSQLKFSEAFTHLAQQLNIENAQLQKQLKPLLPSNDLIESLCFAHDIGHPPFGHGGEVALNYMMQSHGGFEGNAQTFRVLTKLEPYTLNAGMNLTRRTLLGVVKYPAILDEVSPQYAELAMPNHSNPFSIKLTDWIPGKGLFREDKAMFDWLLAPLSEADRHLFQTLSSLRETSQQTLKTRYKSLDCSIMELADDIAYGVHDLEDAIVVGVIHLQQWQEALAQLKNSSSPWIREHIDALSEKLFSAHHYERKNAIGALVNYFITNVRWKITADFTEPLLRYNAELPEDVLAVLKVFKDFVLKYVICDVTTQRIEYKGQRMLTEMFQIFESDPERLLPRNTANRWKMASAEQKKRIICDYIAGMSDAYAIKVYQQL >NZ_CP051637.1|WP_035684739.1|634926_635613_-|CidB/LrgB-family-autolysis-modulator MIYAYTLLTIVVFALALQISKRLKSLVFNSFILTVAMLITIVLIFHLPYEDYYQGNAPLNHLLGVSVVALALPLYEQFRQIQAYWKTILFITALSSFFSMCVGAILALLLGAEPEIVATILPKSVTTPIAMEIADNLGGIPSVAAVAVLLAGLQGSMFGYVILKTIRIKHSQAIGLSVGAVSHVLGTVSCMETDPKAGNFSSISLVLCGILSSIFAPFVFKFIYLMVA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP051637_1 | 1.1|624280|55|NZ_CP051637|CRISPRCasFinder | 624280-624334 | 55 | NZ_CP010410 | Xanthomonas sacchari strain R1 plasmid unnamed, complete sequence | 454272-454326 | 10 | 0.818 |
NZ_CP051637_1 | 1.1|624280|55|NZ_CP051637|CRISPRCasFinder | 624280-624334 | 55 | NZ_CP048065 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p9, complete sequence | 33562-33616 | 11 | 0.8 |
NZ_CP051637_1 | 1.1|624280|55|NZ_CP051637|CRISPRCasFinder | 624280-624334 | 55 | CP022016 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence | 202572-202626 | 12 | 0.782 |
NZ_CP051637_1 | 1.1|624280|55|NZ_CP051637|CRISPRCasFinder | 624280-624334 | 55 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 683766-683820 | 18 | 0.673 |
1. spacer 1.1|624280|55|NZ_CP051637|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010410 (Xanthomonas sacchari strain R1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.818
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer gcactgctcccaagcgggaatagctcagttggtagagcgcaaccttgccaaggtt Protospacer ** **.* *************************.*********** ****
2. spacer 1.1|624280|55|NZ_CP051637|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048065 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p9, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.8
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer cctttccagttgcgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccaaggtt Protospacer . *.*. *. .************************************* ****
3. spacer 1.1|624280|55|NZ_CP051637|CRISPRCasFinder matches to CP022016 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.782
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer gttgcttgatactgcgggaatagctcagttggtagagcacgaccttgccaaggtc Protospacer * .* * .****************************.********* ***.
4. spacer 1.1|624280|55|NZ_CP051637|CRISPRCasFinder matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 18, identity: 0.673
tatcttatctctt-----------gcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgcc CRISPR spacer -----------ttagaagtaaaaagcggaaatagctcagttggtagagcacaaccttgcc Protospacer ** ****.*******************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
257942 : 279150
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP051637|257942:279150|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP051637|257942:279150|263400_263676_-|WP_035689243.1|DBSCAN-SWA MHDLIKHTIQTLLFLVATIVVLSLAEAYAQTAEDYYAMQGFSTEQLAEMERQANLEWQQEQGDLQPNLTVEAEKYLKNYTALLQEALDNGK >NZ_CP051637|257942:279150|257942_258839_-|WP_035689252.1|DBSCAN-SWA MFWFKNAMIYRLTKAMDFSNLSSQLEACEFTPCGSSEASKFGWIAPLSTSEQLCFEANGQILLVAQREEKILPNYVVTKELTNRVKALEEKEGRKLKKVERLSIKDDVVASLLPQAFTRSTYTALWIDTQNQLIYVDAASAKRAEDALALLRKSLGSLPVIPLAFANDASLVMTNWVNEAPDWLTVLEEAELTGLKEDGIAKFKRQDLDSNEIYSLLEAGKVVTKIALEWEGNLSFVLCDDGTLKRLKFADEIKEKNDDIAKEDIAQCFDADFLLMAATISELTKRLLNEFGGEKERV >NZ_CP051637|257942:279150|274113_274476_+|WP_035689371.1|DBSCAN-SWA MRAIDDIHTTAIRYGKWANEGHGLGYPAIEPFLKEAEKWHHGIPVLDDDTALKINACTIKMRAVTPELFQAFMLRFVSGKSINQICQEMDVSDGTVKKYIYAALQSLKLLLTENQCIFIA >NZ_CP051637|257942:279150|265416_265638_-|WP_017806446.1|DBSCAN-SWA MQNEMKRYAISYFFKGKKWCSDVYANSFEEAQEKVKAMSQATIDGELYCSIYVPVKPQSRIARLLLKLLHKFS >NZ_CP051637|257942:279150|269638_270046_-|WP_168939907.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP051637|257942:279150|277006_277264_+|WP_017807508.1|DBSCAN-SWA MKNKITDLNNHLFSQLEKLLDEDLTDEELKREIARANAVSGIASNIIQNSNTAIKAMQLFGDRTIEADAPDFLRISKAQNDKKTL >NZ_CP051637|257942:279150|265652_265823_+|WP_017807323.1|DBSCAN-SWA MYFEIFKGVNGQWYWRLKAANHEPIAQSEGYTTKQNCLHCIGLVMDTNRQTPVREV >NZ_CP051637|257942:279150|266875_267649_-|WP_017807325.1|DBSCAN-SWA MIDCQWLHNQIDLHCHKVTSLNGSAGVCVQTNHKWLDGSLLSFYIIPQGEQLLITDDCDTLFHFHTTGLIEHKRSWKKIKDKLNTVHTDIALEDDGEILCITTQEKATYAIADYTSALCGLMHYERELAGIPMQVNHLADEVELYLKAWKPYAKFTRSPKVNGISGHSYTLDFQLDDQLIMAINPTPNAVGSVMRKAGDILSGNDLAGRKMLVVVDDRSDQLFEQKAEEEIQIIASLVKAVPLSRLIEISAKTNQIQ >NZ_CP051637|257942:279150|277244_277952_+|WP_051128146.1|DBSCAN-SWA MTKKRFRFTDEHIAFIREHKDLAPKDLIQAFYQQFGLLKNRQVFRKLKKRLGIISTVQHCNRYTKEELAFIKENCTLPQAELTKLFNQKFNRNQTAQVIRVLCAKRGWLTGRNGRFKKGEHLKPIGYERFCPMAKAVLIKTGVKRYERKSRVIWEQAFGKIPQGFVLWFKDGNIQNCELSNLELISRNEMLWRHKLNYHELDSSVKQTFNVFIQLREKLIKLKKQQQQKDRIAKG >NZ_CP051637|257942:279150|259290_259608_-|WP_051128139.1|DBSCAN-SWA MNTDLLNERAKTHGDFISGAETFYHLMKPIIDSQLFERNKVKAYAATMIAAKLTRICNGDENFPDHWDDIIGYAQLATGKQFEPTSAVSLPFAQHIHPDLGGENI >NZ_CP051637|257942:279150|272517_273153_+|WP_052716788.1|DBSCAN-SWA MASKTRRKTEIHAVKYANGAIVAETDYDRNLLKSLPIGSAVKIVPLSHNRNYQHHKKFFALLDAGFEYWHPEFSVLTQAEEWVAQAVAKEIAIAANDENLYTNITKPIADKVLAKVRSNREAKLDYEGMKTLEAYLDHVMKKAGFYDIKPNQDGGTIKIRWSIAFDRLPQEKFNEVYKGVYGVIWNETLCHIYQNEWELENKINQLIAFGG >NZ_CP051637|257942:279150|274720_275725_+|WP_035689374.1|DBSCAN-SWA MVITNETEFLDYISSIIIDEGQKLNSKDFELPNIEFNGYPNLFFNVKGSTYSSTLTTPLLNALSELILEIQKSYCLIKYETSNLQRLTLEDRKNIDIIFKIKEGSSEGESDNTQIANGIFSVIKDGMVGMNGWQKLAVLVTFLGIIGGLGYKWLDNQAIEQATSAATINNAITALSDTNKQAFELLKERGKTEISNEIELHSEQAQAQFFKEVAKDPNAEQATLNQITADRTLLDDYKKRTSKHRTKTPKVDWFMIKGIELYAPQYIETDIDVSVIRESDDTEFTLSTSLTLMSDEELSALKDALGTNNLVKIAYEELKENGKITKSQFVRIEQ >NZ_CP051637|257942:279150|276685_277003_+|WP_035660437.1|DBSCAN-SWA MMNIVIERNPASKKYCEKAEIRSMGKAGRLARMFAKSRQKKIKTGKPDRIKTALVMLPIPSKSQIEKAAAQFQAVKPNYHKGEIGVNTVRATQKIRRGCQELMRI >NZ_CP051637|257942:279150|260790_261570_-|WP_035689246.1|DBSCAN-SWA MTTALQTLTNKLAERFEMGSSENLPQTLMATAFRGQNVSPDQMTALLVVANQHGLNPWTNEIYAFPNNGGIVPIVGVDGWSRIMNDHPQFDGIEFTFNDDNSCTCNIYRKDRTRPTTVTEYMIECSRNTQPWKSHPKRMLRHKAMIQCARLAFGFTGIYDQDEAERIVENQKEPLNVTPKPNVIEGQAVELATSEQIDTLNQLIQLTNTDTEKAFAYYSVQSIEQLSKAKAEHFIKTLNGRLDESAQNDNNKASEEVPL >NZ_CP051637|257942:279150|263697_264006_-|WP_046097548.1|DBSCAN-SWA MKIFINLTAKEATPEQKSAGVIDVDPALRHQFNRALTFFSQPSKALIEERAAYLTTMAAQLNADYVLVDAPLFLISTLESKLKARGIQPVYSLYPYSGFVEV >NZ_CP051637|257942:279150|273763_274114_+|WP_035689370.1|DBSCAN-SWA MSELILTLPYPPTVNHYWKHTKSGLHYVTTQGKAYQQAVKILSQNAPHFAGKVAVNISIYPPDNRRRDIDNIFKALLDALVKAEVIQDDSLIVKLVAEKLKPVKGGKVEVHIEGVK >NZ_CP051637|257942:279150|258898_259294_-|WP_051128140.1|DBSCAN-SWA MIIEIPTTKQVNIKYIKLVIPVRYDDEDIPYNFPLRDGDQWCGIIDLDASKIENWPENHPAKMNMKICDEGEYYLLDENKNVISSLINDYIPDCLPNDYGDYIDLHIDEAGKVTNMPNKLIFDQFFGGCSE >NZ_CP051637|257942:279150|266141_266438_+|WP_136711940.1|DBSCAN-SWA MIQIKSTTLFKKWLDELKDLRARAKIQTRIKRLQLGNFGDVKPVGEGISELRITEGKGYRIYLKNQNGVVVILLCAGDKSIQSKDIEKAKLLAKELGV >NZ_CP051637|257942:279150|273153_273438_+|WP_035689367.1|DBSCAN-SWA MNLRKEAKGRECQVRLPGICNFNPETVVLAHYRMAGINGVGQKPDDIFGAWACSSCHDAADFRVKTSYSRDELRLALAEGVFRTQAILRMEGKL >NZ_CP051637|257942:279150|259694_260174_-|WP_035689249.1|DBSCAN-SWA MAGINKAIIVGNLGNDPEIRTMQNGDQVATISVATSESWTDKQTGERRELTEWHRIVLYRRLAEIAGQYLKKGSKVYVEGRIRTRKWQDQQGIERYTTEIQGDVLQMLDSRQDGQGAQTNAPPRQTQSTKSNAYANAKNGNYTPPAQNNGDELDDDIPF >NZ_CP051637|257942:279150|261580_262522_-|WP_035689276.1|DBSCAN-SWA MEFNLILSTESKVLSTNISTFQQQAENYLAGLSNRFETDDDFAQAKQDIKDLTELEKRTKEAIANAQNGEIKQLIEQAQAMAERFRQARLEREKLVKTKEAEIKASIVNDAFERLAVIKSGFENDVCIALEQVISKATIKKRLDEATKRRSTLATLTKAVNAEETLIGAEIAAEAARLSARRKLIPISYEYLFKDWLNLITGDDDLEPIIQARIADEEKREAKIKAKAEQEAKARAEAKANLNALQTNEKTETNENTAHIEPQTPTQETAATATQFILKIPAQEIPFTGTLEQLREYFAPVKALGITATIVKQ >NZ_CP051637|257942:279150|276022_276193_-|WP_017807323.1|DBSCAN-SWA MYFEIFKGVNGQWYWRLKAANHEPIAQSEGYTTKQNCLHCIGLVMDTNRQTPVREV >NZ_CP051637|257942:279150|264099_264744_-|WP_051128137.1|DBSCAN-SWA MKKYELTDEYIEIGFVTKIKLYRIKALVAIASIGVSAGDLGGYVEKESNLDQSGNAWVYGDAKVYGDAVVYGDAVVSGDAVVSGDAEVYGNAKVYGDAVVYGNAKVYGNAVVCGDAVVYGNAVVCGDAKVYGNAVVCGDAKVSERSDIVWFSNVGTEYGTLTVFKTKQGVLWATRGCFSGSVEEFLKKSAEVHDEKTKREYQLLIEVAKSRLGE >NZ_CP051637|257942:279150|271752_272409_+|WP_165381618.1|DBSCAN-SWA MQNAMARQAKFPSQPQQKSQRLPNEIEKLVDQIFSQLFAACPAMRGQFDEVQLPITKRTWVLGFAENNIRTIEQVRAGMRKVRSKPDDYFPGVGKFISWCKQDRFEALGLPNEEELYQRLKKFQGYGMLEIHKFQFESDAEYWLLTDLYCDNREATKKELRKAVGEALDSMATRLEAGETLPKPQITLPAKPSFVPPEVQRKINQHGIEKCKAILGMK >NZ_CP051637|257942:279150|267650_268136_-|WP_017807326.1|DBSCAN-SWA MSRLNEHKFCLNNEEALQFIELLKSYDKDLYWNKGRNIHWRTINFVPNDRDELAGPVPGATVQVDYKYSKRVKESGKLVLTLFKRKQHEKLRAYQLELSDENKISSHDGNTIIKGSHEHIGKQVRKIIPDTEIENIAHWFALFCDKIRLEFTGSKLNLPEE >NZ_CP051637|257942:279150|276207_276429_+|WP_017806446.1|DBSCAN-SWA MQNEMKRYAISYFFKGKKWCSDVYANSFEEAQEKVKAMSQATIDGELYCSIYVPVKPQSRIARLLLKLLHKFS >NZ_CP051637|257942:279150|270155_270926_+|WP_046097539.1|DBSCAN-SWA MSRLSMISEQNASIKMSSREIAELCGKQHNHVLRDIRAYVGAILQIERGINVKSLDWSEKEGVELFGHTPIGGVVCQYEVNSQNNQRYPIYYLDKSATLTVISGYNVILRKRIIDRWLELENQQQSTALLPQNYLQALEALVEKERQNQALALENKELKPKAAFVDHYVDVGTSKSLRETAKILNMPEKAMIIRLIEDKALYRQSGNLLPYADKQQQGLFTVKTGTTDHDHNYTQTRVTGKGIEWIAQRYASELML >NZ_CP051637|257942:279150|270922_271729_+|WP_035689420.1|DBSCAN-SWA MSMLLMVKAMQCKVGNPTRKLVLLKLADNANDEGICFPSYQNIADQCEITRRSAISHIEALIETGFVEKKTRKTPEGNTSNLYVLHLDRDGENSALPSENDSLRVVKNLHHPSENISPTPSENISPRTSHSINQSINHTSSSEKISDGSVGKKSRFKFSDDDMTAAQWIFGLILKLNPNTKTPSFENWANEIRLMRERDKRTHREICGLFQWANQDLFWKTNILSPAKLREKWDQLTVKKNNSKPQRKTASELNAIEWNTEEGWRGML >NZ_CP051637|257942:279150|268926_269133_+|WP_017807328.1|DBSCAN-SWA MNKIAAFRKAANLTQADMAKHLNKTQGAIGHYELGIRQPSIETAKQIVQVLNEHGLTCSLDDVFPVGG >NZ_CP051637|257942:279150|268135_268789_-|WP_017807327.1|DBSCAN-SWA MKKPWNQYVREKMQDQNLKQDDIAEAMNKTQGAIGHWLTGRRNPNVGEVAQMIHLAGVDKVILNSDGTLEDFDPNASFTSVKKSYSYPLISSIQAGTWTEACDFHDSIGYDYIDTEIDAGEDAFFLRISGLSMEPKFSEGDLVLIDIRKRPHPGDFVAAVNGNGEATLKRYRELGEISESGHPHFELVPLNPDFPTLSSMRQDIRIIGVAVEHRSYL |
33 | Mannheimia_phage(44.44%) | integrase | attL 255952:256003|attR 282295:282346 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
286019 : 292499
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP051637|286019:292499|DBSCAN-SWA AATGAAACTTTACGAAATCGCAGAAAGCTACAACAACGTAGCAGAACTCTTAGCTAACCCAGAATTTGCCGAAAATGCGGATATTATCACCGCACTTGATGCCATAGAAGATGAGTTTAACAACAAAGCCATCAACACCATTAAAGCCATTAAACGCGTGGAAGGCGATATTGACTTACTTGATGCCGAAATCAAGCGACTAACGGCAATGAAAAAAGCCCGTCAAAACCGTATTGAGGAAGTGAAAAACTACCTTAAATACAATATGCAAAAAACGGGGATTTTCAAAATCGAAAGCCCGCTGTTCAAAATTGCCTACAGCGAACGAAAACAAAGTGCGGTGGAAATTGACGACAATTTATTCCTTGCCAATAACCTTGATGAAAACCTTGTCAGCGTCAAAATCACCCCGAACAAAACCGCCATTAAAGAGGCGTTGAAACGGGGTGATGATGTGATTGGGGCAAGGTTGGTTGATAGCCAAGTGTTAAGCATTAAATAGGAGTAATCAAATGCAATTTCAAAAAGCAGAACGAAAAAAATCAAAGCTCAGACTTGCCTTAACAGGTCCAAGTGGATCGGGTAAAACTTATGGGGCTTTGCTTGTTGCGAAAGGGCTAGGTGGAAGAATTGCGGTAATTGATACCGAAAAAGGGAGTGCTTCCCTTTATTCTCATTTGGTCGATTTTGATGTGCTAGACCTAGAAGCCCCTTACACCCCTGAACGCTATCGCCAAGCAGTTAGATTAGCCGTTGAAAACGGGTATGATGTCGTAATTATTGATAGCATTACGCACGAATGGTCAGGAGCTGGAGGTTGCCTTGAGTTAAATGACGAAATCGCCAAAGCGAAATTCAAAGGAAATACTTGGAGTGCGTGGAGTGAGACCAAAGCACGCCACCGTGCTTTAATTGATGACTTACTTGCCAGCCCAACTCACATCATTGTTACAATGCGAAGTAAAACTGAGACCGCTCAAGCAGAAATAAATGGTCGCAAGCAGGTTCAAAAACTTGGAATGAAAGCGGAACAAAATGACGGTATTGAGTATGAATTTACTACTGTATTGGATTTAATCCACGACGGCAATTTTGCTCAGCCGAGTAAAGACCGTACAGGCTTATTCCCACCTAATGGAAATCCATTTAAATTATCCGCTGAAATAGGGAAACAGCTTGTAGAGTGGTTGGAAAGCGGTGTTGATTTAACCTTTAAAAGGGCTGAGGTTCACAGAGATAAAATGCTACAAAAAATAACGACTGCAGAAACGCTCGAATTGCTAGGTGAAATGAGTAAATATGTTACTGATAAATTTAAAGATTATCCGATTTTATTAACAGAGTTAGAACAAGCAATTTTAGCTCGCAAAGCGAGTTTAGATAATCAAGGGGGAGAATAATGGCAGGCATAAACAAAGCCATCATCGTCGGCAATTTAGGCAACGATCCAGAAATCCGCACAATGCAAAATGGCGATCAGGTTGCAACAATCAGCGTGGCAACCTCAGAAAGCTGGACTGATAAGCAAACAGGCGAACGGCGAGAACTCACTGAATGGCATCGCATTGTTTTTTACCGCAGACAAGCAGAAATTGCAGGGCAATACTTGCATAAAGGCTCAAAAGTGTATGTTGAAGGACGTATCAGAACCAGAAAATGGCAAGATCAACAAGGCATTGAGCGTTACACCACTGAAATTCAAGGCGATGTATTGCAAATGCTAGACAGTCGCCAAGATGGACAAGGTGCGCAAACAAACGCACCACCACGTCAAACGCAATCGACAAAATCCAATGCTTATGCTAACGCCAAAAACGGTAACTACACACCACCAGTGCAGGGTGGTAATGATGGATTAGATGATGATATTCCATTTTAGGAGAGAGTATGGACAAATTAAAGTTTGCCGACGTAACATTAGTTAATGGAGGTAGAGCGTGGATTAATTTTCACGAAATAGAATGCATTAAAGATTGTTACTATCGCTTTGATGAAGAAACAGATGACATCATAGAAGGTGACAAATGGGAATTTAAAGCAACTAAAGTCATAATGAAAAGTGGGCGTATCTATTATGTAGATTTCACTTTAGACAGTTTCGACGATAAATTCAATCTAGACCAATTTAGATTATAGACAAATCGCCCTTATTTAAGGGCTTTTTTTACGAGGTAAAAAATGAACACAAACGAGCTACTCAACGAACGAGAAAAAACGCACGGCGATTTTATCAGCGGTGCAGAAACCTTTTATCACCTGATGAAGCCAATTATTGATAGTCAGCTATTTGAACGCAACAAAGTCAAAGCCTACGCCGCCACAATGATTGCCGCCAAACTCACCCGAATTTGCAATGGTGATGAAACCTTCCCCGACCACTGGGACGACATCATCGGCTACGCTCAATTAGCCACTGGCAAACAATTTGAGCCACAGCAAGCGGTAAGTGTGCCGGTTGTGGATTATATGAAAAAGCCTAACTCCAACTGTTAGGCTTTTCCGAACAGTTGCGAAGTTATGAATGGGCTTGTTTAAGTAACAAAATTGCTTGTTCTAATATCTTTCCTTTTGAAATACCAAGCTCAACAGCAAGCCTATCTATTTCATCTGAAACAGATTGTGGAATTTTAAAAGACTTCGTTACAATGCCCCGCTTTGCCTCGCTACGAGCATTTATTTCGGTTCTTGACAATGCCATAATTATTCCCTATGATTTGAAGAACTGGGGGACTGGTACTCCCCCAGTAAGTTATCAGATTAATAAACTGGCAAAGACCAGAGTAATAAAACGATAACTAGGATAATACGGATTAACATATTATTATCCTCTTCGTTATCGTGAGGATTAAGCCTCACACTCACTTTCAAGCTATCCCTTGAAAGTGAGATTATTATAATGTATGTTTACATACAAGGCAAGTAATATTTTAAGAAAGCCCGCAATGTTTATTGTGGGCTTTTTATTTGACACTGCCCAAAATCATTTAGGATAACCAAACAGGTCGCATTAAGCGACCTTATTTGTTTCAGCAAACAGCTTAATTCCCTCTGAAACAATCTGCGTTTTAGAAAGCCCCGTTTGGCTGCTAAGCTGAGCTAAAAGAGCGATAGTTTCCTCGTGAAGTTTATAAGATTGCAAACGCACGCCGCGTTTTTTATCGCTTTTTTCTTGCTGTTCTTGACGCGTTAAACCTGATTTAGGACGACCACGAGACATATTAACCTCTTGCATTTAATGAATTAACGGTTTATAGTAGGAGCCATTGGGGGACACTTCCACATATCCCCCGCAGGTTTATCCTAGAATGCTGGCATTGCCACCATTAGCAGGATAATTAGGATTGCGAGCTTCAAACACATATCCTAACTCCTTTTTTGATGCCCGATTTCAGTCGGGCTTCTCATTTTTAGAACCATTCCAAAAACAAGATTATTGTAGTTTATACTTCATAAAGAAGCAAGATTTATTTAGTATTTACTAATTATTTTTTATTTGACACCGCCCAAACTTCGGATTAAGATAACCGCACTTACTTTCCAAAAGCGGTTTCCGCCTCCGATATAAAGCGGTTTTTTTGTACCTAAATTTAGGTTTAATCCGATGAGATCGGGGCGAGAGAACGATATACAATACATCTGAATAAGTTCCGCCCATCTTTTGGAGGGTAAGTTGAACCCCGATCACCACTTAATGATCGGATTAATTACTTAAATCCAAAAGGTACAAAATTATGTCAAACTTACAAATCTTAAATAACTCTATCCGCACTTTGGATAATCTTTATTCATTAAATGATCTTCATCTTGCTAGCGGTAATGATCCAAAACATCGCCCTAGTTTGTTCGTTCGTAATGAGCAGACAAAAGAATTAGTCAAAGAAATTGAAAGTGAAAATACCCGAAGCACAAAAACGATCTTCGCTCTAAAAACCATCAGAGGTGGCAAAGATATTTCTGTTCAAGGCACTTGGGCTTGCGAAGAACTCGTCCTATCCTATGCAATGTGGATAAGCCCGAAATTTCATCTTGTTGTCTTGCGTGCTTTCTTGGCAATGCACAAAGGCGAAGTGAAACAGCAACAACTCGCCTTGCCCGAACCAGAGAAAAAATACACATTCGAGTTCACCGAGTACGAACTCGAACAACTCGCGTGGCTCTGGTTCAGTCACAAACGAATGAACACCCTACTTGCTGACCTTTACGAGCCACTCAACGCCCTTGGCTCAACCTTTAGTGGCACGGTTTACAGCCACGCTCACGAGTACAGACATCACTACGAACACACCCAAGCCACAATGCAACGCCTAATTGAGCCGTTCAAACACTCAACAAAGCTCAACTGGCAACGGGTTATCCCAAGAATTAGCCCAACGCAAAAACAGCTAGGCTTCTAAAAACGCCCCAAAAACCGACCGCACTTCCTCGTGAACCGTGTGGCAGTTTTGCTCAACCAAAATTCAGCAAAAAGGTGAAATTATGTTCAAGATTTTAATGATTATCGGCTTGTTGTGGTGTGCGTTCGAACTCGATTTAAGCTCAGACTGCGATGGGCATTATTGTGGAATAACCACTGATTTAATCACAAAAAATTAACTCAACCCAAGCCTACTTTGTAGGCTTTTTTATTAGGAAACCCTATGGAAAAACTCATCAAATCCCAAACGAGAGTAAGAGCGTTTGGCGAGGTGTACACGCCGCAAAAACTGGTGCAAAAAATGACCGCACTTTTACCCGAAGAGAGCTTTGAGCCTGAAAAGAAAATTCTCGAACCTAGCTGTGGCACGGGGAATTTTTTATATGACATACTCAACCGCAAGCTATGTAAAATCCTCGTAGGTCCAAAGCGTCCTTATTACAAGGTGCTGAATATGTATCAGGCACTAGCGAGCGTGTACGGCGTAGATATTCAACTCGACAACGTGATCGAATGCCAACAACGTTTAAAAAGCCTATTTTGCGAACGCCTCGCAATGCTGCACGTTAAGCCTTTTGACTATTTTGTCGATCACGTCTTAATTAACAACATCAGGCGAGGCAACGCCCTTGAGGACGCATTCACCTTTATTGATGTCGAGATCGTTTTCAAAGATCGTGATATTGGTATTAAGGTAGAGAAAGATAGCTTTTTGCTTAGCGAATATGAATGCCATTTGCAACAGAACACCTCTCAACTCCAAGCCGTGCGATTGCTGGCATTTGAAGATGAGATAGGGATTACCAGAAATGCAACCTAAGGCTAAAAAGCCTATTTTATTGGAGGGAATATGGAGTTTATAAATACAGAAAAAGCTGGAAAGCTCCTTAATATGCATCCAGCAACAGTGAGAGAAAGAGCGAAAAAGAAAGAAATACCCGCTTATAAAATTGGTAAGTATTGGAGGTTTGATCCTAAAGAGCTTGAGTTTTTTGTAAAAAATAGTCAAAATCGCCCCGAACAAGAGATGGGGCATAAGGAGAATTTATGTCGCGTCAAATCATCTCCCTCAAGAAAAGAGGGGAAATCTGGCATTACTCGTACACCTCACCAACGGGTGAGCGGGTACGCCGAAGTTCTCGGACTACCGATAAAACCCAAGCAATGCAATTAGCCTCGAAAGAATATAATGAATGTTGGCGAGTATTTAAACTTGGTGAACGTCCAGAATATTCTTGGCAAGAGGCGGTTATGCAATGGCTTGAAGAAAAGCCGAAACGTAAACAAGATCGCAATATGATTTATGGATTACGTTGGCTGGATCAGTATCTTGGAAATAAAAAATTAAATGAAATCGACCGTAATCTGATTAAATTTATCCAATCTGAAAAAGCAAAAGAGGGGGTTAAAAATAGGACTATTAACGCTATTTTGCAACAGATTAGAGTGATACTCAGAGCGGCAGTTGAATGGGATTGGCTAGATAAATGTCCCGCAATAAAACTCTTGCCCGAACCTAAGCGACGCATTCGTTGGCTGACGGAAAGCGAAGAAATGCGGTTAATGCAAGAATTGCCAGAGCATTTAAAAGCCATTGTACAATTTGCGATTTTAACTGGGTTAAGAATGTCGAATATAACGCAATTAAAATGGTCGCAAATTGATTTACCGAAAAAACTTGCTTGGATAAACTCAGACGAGTCAAAGACGGGAAACAGCATTGGTATTCCGCTCAATGACAAAGCAATTGAAGTTATTGTAGCACAGTTTGGTAAACACAAAGAAAACGTATTTACTTATAAAGGGAAGCCTGTAAGGATTGCAAATACAAAAGCATTCCGTAATGCGTTAAGTCGTGCGGGCATAAAGAATTTCCGGTTCCACGACCTAAGGCATACTTGGGCTACAAGGCATATTATGTCTGGAACACCTTTATATGTATTGCAAGAACTTGGTGGCTGGAGTAAAACAGATACTGTCCGAAAATATGCACACCTATCTGTTGAGCATTTACATAGCCACGTTAACAATGTTCAGCTTTTTGGTACAAAATTGGCACAACACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP051637|286019:292499|286019_286520_+|WP_035688053.1|DBSCAN-SWA MKLYEIAESYNNVAELLANPEFAENADIITALDAIEDEFNNKAINTIKAIKRVEGDIDLLDAEIKRLTAMKKARQNRIEEVKNYLKYNMQKTGIFKIESPLFKIAYSERKQSAVEIDDNLFLANNLDENLVSVKITPNKTAIKEALKRGDDVIGARLVDSQVLSIK >NZ_CP051637|286019:292499|288196_288511_+|WP_035688062.1|DBSCAN-SWA MNTNELLNEREKTHGDFISGAETFYHLMKPIIDSQLFERNKVKAYAATMIAAKLTRICNGDETFPDHWDDIIGYAQLATGKQFEPQQAVSVPVVDYMKKPNSNC >NZ_CP051637|286019:292499|289025_289235_-|WP_035688068.1|DBSCAN-SWA MSRGRPKSGLTRQEQQEKSDKKRGVRLQSYKLHEETIALLAQLSSQTGLSKTQIVSEGIKLFAETNKVA >NZ_CP051637|286019:292499|291479_292499_+|WP_035688073.1|integrase|DBSCAN-SWA MSRQIISLKKRGEIWHYSYTSPTGERVRRSSRTTDKTQAMQLASKEYNECWRVFKLGERPEYSWQEAVMQWLEEKPKRKQDRNMIYGLRWLDQYLGNKKLNEIDRNLIKFIQSEKAKEGVKNRTINAILQQIRVILRAAVEWDWLDKCPAIKLLPEPKRRIRWLTESEEMRLMQELPEHLKAIVQFAILTGLRMSNITQLKWSQIDLPKKLAWINSDESKTGNSIGIPLNDKAIEVIVAQFGKHKENVFTYKGKPVRIANTKAFRNALSRAGIKNFRFHDLRHTWATRHIMSGTPLYVLQELGGWSKTDTVRKYAHLSVEHLHSHVNNVQLFGTKLAQH >NZ_CP051637|286019:292499|287905_288154_+|WP_035688059.1|DBSCAN-SWA MDKLKFADVTLVNGGRAWINFHEIECIKDCYYRFDEETDDIIEGDKWEFKATKVIMKSGRIYYVDFTLDSFDDKFNLDQFRL >NZ_CP051637|286019:292499|287417_287897_+|WP_035688057.1|DBSCAN-SWA MAGINKAIIVGNLGNDPEIRTMQNGDQVATISVATSESWTDKQTGERRELTEWHRIVFYRRQAEIAGQYLHKGSKVYVEGRIRTRKWQDQQGIERYTTEIQGDVLQMLDSRQDGQGAQTNAPPRQTQSTKSNAYANAKNGNYTPPVQGGNDGLDDDIPF >NZ_CP051637|286019:292499|286530_287418_+|WP_035688055.1|DBSCAN-SWA MQFQKAERKKSKLRLALTGPSGSGKTYGALLVAKGLGGRIAVIDTEKGSASLYSHLVDFDVLDLEAPYTPERYRQAVRLAVENGYDVVIIDSITHEWSGAGGCLELNDEIAKAKFKGNTWSAWSETKARHRALIDDLLASPTHIIVTMRSKTETAQAEINGRKQVQKLGMKAEQNDGIEYEFTTVLDLIHDGNFAQPSKDRTGLFPPNGNPFKLSAEIGKQLVEWLESGVDLTFKRAEVHRDKMLQKITTAETLELLGEMSKYVTDKFKDYPILLTELEQAILARKASLDNQGGE >NZ_CP051637|286019:292499|288533_288716_-|WP_035688065.1|DBSCAN-SWA MALSRTEINARSEAKRGIVTKSFKIPQSVSDEIDRLAVELGISKGKILEQAILLLKQAHS >NZ_CP051637|286019:292499|290655_291252_+|WP_051128099.1|DBSCAN-SWA MEKLIKSQTRVRAFGEVYTPQKLVQKMTALLPEESFEPEKKILEPSCGTGNFLYDILNRKLCKILVGPKRPYYKVLNMYQALASVYGVDIQLDNVIECQQRLKSLFCERLAMLHVKPFDYFVDHVLINNIRRGNALEDAFTFIDVEIVFKDRDIGIKVEKDSFLLSEYECHLQQNTSQLQAVRLLAFEDEIGITRNAT >NZ_CP051637|286019:292499|289749_290412_+|WP_035688071.1|DBSCAN-SWA MSNLQILNNSIRTLDNLYSLNDLHLASGNDPKHRPSLFVRNEQTKELVKEIESENTRSTKTIFALKTIRGGKDISVQGTWACEELVLSYAMWISPKFHLVVLRAFLAMHKGEVKQQQLALPEPEKKYTFEFTEYELEQLAWLWFSHKRMNTLLADLYEPLNALGSTFSGTVYSHAHEYRHHYEHTQATMQRLIEPFKHSTKLNWQRVIPRISPTQKQLGF |
10 | Mannheimia_phage(25.0%) | integrase | attL 280988:281003|attR 293496:293511 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1464648 : 1487724
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP051637|1464648:1487724|DBSCAN-SWA TTTAACGTAAGTAATTTACGGTTTTTGTGGGGCTTTGCTCTGTTCTTGGGCTGTTAAAAATCAAGTTTTCGATTTCTTGCTGTATTTTTTTATCTTTAAGCGATTGGGTGTGCTTGGCGATAAAGCTTTCTAGCGTTTGTGCAAGTCGATTGCTAGCAGTACCAAGGTTGAAAGCGGTTTTGTAGTTTTTATGGCTTTCCAAGTCGGAAAATAGCTCCTCTAAACGCTCCCAAGCGGCAACAGAATGATTGATGTAATTCATTGCTTTAGCTAGCATATAGAAATTTTCCATATCTAACGCAAGGCTATTGGGTGGCAATTCTTGCATTGGGTGCATTGAAGCAATGTAAATCATCACATCACGATGATCTTTGCGTTTGATTTGCTCATATTTCGCCACCGCAAATTTATTTTTCACTCTTGCCCAGATTTCGCCATAACTCATTTTTGTGCGTTGATGGGTTGCAGCAACGGCGTTTTGAATAAGGCGTTGTTCTTCGGGGGTGATGGTGTCGTTTTCATTTATTGATAAAACTTTTTCTGCCTTGCCTTTATTCCAATAATCAAACAATGCTTGATAACATTCTCTTTTGTAGGTGATCAAGGTTTCTCTGATTTCAGGTTTCACCCGTTTTACATCAATGCCAAATAGCCAGCCGTTGAGGTATTGGATTGGAAGGCATAATGTTTGTTGTTCACCACCTTGTGAAGGTATGGTTATAATGACCATACCTTGAGAAAGAACTTCATCGCGTTTAATTCTTGCATATTGAGCTTTCCAGTCCAGACCAATATTTTCACAAATTGGCTTCATTGCGACATAATGAACGTTGTTTTGCTCAAATGTAGTTAAAGTGCGGTCGTAAAATTGGATTGTTTGGAGTTGAGTTTGAATTGACATAATAGCCTCTGTAATTTTCGAAATTTTGCTAGCCAATTTAAGGTGTTCTTATAACACGAATACCTTTTGAAATTGGTGATCGAGCGGTTCGAAAGCCTACAGCAGGCTGGAGTTATTTCCCTTGCGGGTATTGTATTCCTCGCCCACTCGATCATAGATTAAAATTACCATTTTTGTCCAAACTTGGCTGAGAAAAGGAGAAACACCAAATTCTAGATACAAAAAAACCGCAATGGATTTAGGTCTTGCGGAACTGACCGCTGTAAGGTTTCGACACCTATCAGACTAATACTAATAAAAAGCCTATTGCTTGTCAATAGGCTATATTGATGTTCGGCAACAGATCACTTTCTACGTCGTTTTCGGCGTTTTTTAGATGAATTGGAACCAAAAATACCTAATATTGATATTGCAACAAACAATACAAAAAACACAATTTTAAATATCCAAACTAGGATAGAAAATATCTTTTTAAATATCTTTTTTTTGCTGCCTTTTCTTTCTGCCAGCCAAACTTCCTTAGGAATAAGATGAAGAACTGGTTTAGTCGGTTCGTTAGACATTTTCGTTATCCTCATCATCTGATTCTGTTATTTCGTTATATTGATTGGATTTTTTCATAGCTTGTGATTGGCGATATTCATTGGCTTCTGCAACCATTGTGAACTCCACTTCACAACCTAATTTTTCAGCAGCTTTTGCAATTTCGGCAAGATCGACCTCAAAAAATTCTTTTTTAGTATTAACTCTATTGACCTGACAATGTGCGAATTTTTTATGTAATGTGTTTTCTAGTTTTGGTGCATCATCTGTCCTAATTAAAGCGTGGACATCAAAAGGGAATGGAACACTGGCATCACCTAATTCTTTAACTCGATCTAACGGTTCTAATCTTCTTGTCATTCCGATTTTATAAACATTTTCCCCAAAAGAACCAATGTTAGAAATGACATATACCGTACCTTGTTTGGTGAGTTGAGCCATTGATATAGCACGTTGAGAGTCTTCTATCGCTTGCTTTAAATCTTGTTCTGCTTGAGCCAGTTTAGCTAATAACTCTTTATTGGTTTTATCTAATTCAAGCAATTTTTTATACTGTGCGATCTCTTTTTGAGCTTCCCTCTCTTTTTGTTCCGCTAGTTTTCTTTGTTTTTCAGCTTCACGTTGAACTTTTTGTTCTTCTCTCATCTCTTCTTGAATACGTTGCTGTTCCTCTTTTTCTCGTTGTTTTTTAAGTTCATATTCAAAGGCTAGGTGTAATTCTTCGTGTTTCAGAGCTAAATAATCTTCGCTAATGAAGATCCGAAATATCACGCCTTGTTTGTTTAACCTTTCAAAGGACTTAGTCATTTTATTCTTGAACAAATCAAAGTTTCGGAAAGAGACATCGTTAATCAATAAATCACATTCTTTGTCAAATGCCGTAAGCATTATAGTTGATATGTTATTCATCATAGTAAAACCATCTTTTTCAGCTGTTTTACCTAGCCCGACGACCCATTCAGCATCGGAATATGTAGCTTGCTCTGATTTTTTTAATTCAGCTTGTTTCTGTTTATTTTCATTCCATTTTTCTTTGAAACGTTTAGAAGAGCGAAATCTGAATTTTGGTGTGTAAGGAGCAATAGTGGAGACTTCTTGAGCGCATTCTGATTGACTGCCCTTAGAAAAGGGTTGTCCTTGATTGTTTTTGAGTTTCTTCCATTTTCTATAGTAAATAACAAATAAGATTAAAAAAATAGGGGAGGATAAAAACCAAATGATTGGTAATGCGGCGTCCATAAATAAACTCCTAAAATGAATGTGGGAATTTATCATACCAAAATTAAGAAACTTTTAAAGTAAGTGAGAACACCTTAATCAGATTGTATTCAACGAGCTTAAAATTGAGCTGGCCAAATTTATCACTGAGATAGCAGCATTAAAACTAACAAAAATTAACTCATTGAAAAAGTGTAGTGCTATGATATACAATAACCGTATTATTAATTAAATTCTTACCTTATGATACTTTCATTTAAGCATAAAGGCTTGGAAAAATTCTATAAAACTGGCTCAACTGCTGGGATTATTGTTGCACATTCGGCTAAATTAAAGCGAATTTTAGCGCGATTAAATAGCTCAAAACAAATACAAGATATGAATATCCCGGGTTGGAATTTGCACCCATTAGCTGGAAACCTAACCAATCATTGGAGTGTTAAGGTAAATGGTAATTGGCGAGTTACGTTTAAACTGGAAAATGGACACGCTGAAATTGTGGATTATCAAGATTATCATTAGGAGATTACGATGAATATGTATTGCCCACCGCACCCAGCAGAAGTTATCAAAGAAGATATTTTACCCGAGTTAGGCTTAACTGTAACACAGGCGGCTAAACAGTTAGGCGTAAACAGGGTAACCTTTTCCCGATTATTAAACGGCAAGTCCGCAATTAGTGCTGAAATGGCTTTACGGCTGCACGCTTGGCTAGGGGAAAATAGCCCTAGTCCAGAGAGCTGGTTACATCAGCAAGCGGATTATGATTTATGGAAAGCCTCACAAAAGCAAACATTTTCGGTTCAGCCTGCTTTTGTAGTATAGCGAATATAAGAAAAGCCTATTGATTATCTATAGGCTTTGAACATATCTATTTTATTGATAATTCAACCAACCTGAAATGGGGTCGGCTAAACTCATCATCGTCCGTGTTTTACGCTTCTTCATTTTCCGCATCTAACAGTGCCTTTCTTTCTTCCATTTCAGCACGCTCCTGCATTAACCGCGTCTCTTCCTGTCCTGAAGCTAAAATTGCGTCAAGTTCTTCGTAAACTTTATCCATACTTTTCACTTCAACGGTTGATTCGACTTGTTGTTTTGGAACTAAATCATAATTTACATTCCCCAAGAATTGCACAAGTCTTGAGTCATACATTCCAACTAAACCGCCCTCAACAAGCATTGTTTTGCCTAGATCTTTAAACCTTTTGTACGCACCGAATAATTGTTTATTTTTTATACTTCCATCTTCATTTTTCGCAGTACAATTATCTGTAAATGTTTGTTCATCAACACCACACAATAGAGCCATTCTTGTTATTGTTGGGAAAGCAACGCCAAGTATATCCATTTTCTTTCCCTCACTGTCTTTTTGAATTAACTCATAGTATTTGAGTTTCCCTTCAACATAATCATTGATCGCAGCCTCCATTTTCTCAATAGCTAAATCTGGATCAAACTTATAGGGACGTCCCCGTTTGGTTTCCCATTGCCCCTCTTCTAATTTGAGTTCCCTCTTCGAAATTGCGGCACTCACTTTTGCTTTACGTTTAACTTTTGTTTTTGCCGTTGTTGCAGCTTCCTTTCTAGTCGCCATATCTATATCCCACTAAATCCAGTTGCTTTTCGCTTCCATCACTTAACACGCTTTTGAATTGACGCAATATATTGTCATCATAGGATTCTTTTGATAGCCTTCTTCGAGTGGATGAAATACGTTGGTTGATTTTATCGACTTGCTTCATCACTAATGACCCCGCTTTAATATCCTCATCGAAATTAGGGTTGAGTTCACGCATTCGATTTACCGCATCAACGAGTTCAGCACTCTCATCACAAAGCATTGATAAGTGCATACTCAGAACCTGAGCTGACGCACCTTTAACTATGGTTTCTGTCAGCCCCTCTAAAAGCTGATTAGCATAATGCTGCACACTGCTATAAATAGCGAGTTGCTCAACACTTCTTGGATCTCGTTCTGGGTAATTCGACATACCCAGCAAATAATCCATTGACACGCCATAGCACAATGATGCCCGAGCAAGAAAATTATGATTAATCGCCGTTTTCGAGGTTTTTCTTTCCATCTTGGAAATCATACTCGTATTAGTATAGCCCATTTCCGCTGCGGCTCTCTCTGGGCTTTTCCTTGCAAGTAAACGCGCACTTAAACAACGTGCACGGATTAAATCAGGATTTAACTTAAAGTTACTAATTTTTTTCGTCATACAACAACCTTACTTAACTAATCCACTTAACCACACTCTCATTTCTAACTTTTTATAAACGACTAAATCAATATTACCGCTCCCGCTTTTCTAATAACTTCACTTTCCGT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37 | Mannheimia_phage(52.63%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1678812 : 1765640
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP051637|1678812:1765640|DBSCAN-SWA 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105 | Haemophilus_phage(23.94%) | tRNA,terminase,tail,holin,plate,capsid,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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