Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP051638 | Avibacterium paragallinarum strain ADL-AP15 chromosome, complete genome | 1 crisprs | PD-DExK,cas3,DinG,DEDDh,cas2,WYL,cas14j | 0 | 1 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP051638_1 | 624411-624537 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP051638_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP051638_1
>1.1|624447|55|NZ_CP051638|CRISPRCasFinder TATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTT |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP051638_1
The CRISPR arrays of NZ_CP051638_1 >merge|NZ_CP051638|1|624411-624537|CRISPRCasFinder GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAATATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTTGGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA >NZ_CP051638|1|1|624411-624537|CRISPRCasFinder GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA TATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTT GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA
>NZ_CP051638.1|WP_035684723.1|623681_624230_+|oligoribonuclease MQLDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKDLNILAEGPVLAIHQPDSLLAKMSDWCKKTHRENGLIERVKQSKLNERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSVAQDKRFLFKYMPDLAEYFHYRYLDVSTLKELASRWSPEILNNFSKKNTHLALDDIRESIAELAYYREHFIKAP >NZ_CP051638.1|WP_035684717.1|622551_623610_-|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA MSKQKLTHNQQRRIKSNNVRALQRHKLKMKKEIEWQDEMLGPTQEGTVVTRYSVHSDVEDEQGQIYRCNLRRTLSNLVVGDKVIWRKGNEQLQGVSGVIEAIHPRKNEITRPDYYDGLKVIAANIDRIIIVSAVVPELSLNIIDRYLVVCENANIPAVILLNKVDLLSEEQRQQVETQLKIYQDIGYQTMMISAKTGKHMQDLTALLSSGTSIFVGQSGVGKSSLINAILPEVNAQVGEVSELSGLGKHTTTSSRLYHLPQGGDLIDSPGIRELGLWHLNANQITKGYREFQYFLGTCKFRDCKHLNDPGCALKEAVEKGKIHPIRFNNYHNLIESLSNIKGNRRFVIQDNG >NZ_CP051638.1|WP_017807274.1|622071_622329_-|phosphocarrier-protein-Hpr MYSKDVEITAPNGLHTRPAAQFVKEAKAFASDITVTSGGKSASAKSLFKLQTLGLTQGTVITISAEGEDEQKAVDHLVALIPTLE >NZ_CP051638.1|WP_035684716.1|620246_621974_-|phosphoenolpyruvate-protein-phosphotransferase-PtsI MISGIPASPGIVFGKALVLKEEKIVLDTQKIQDDQIEAEVERFYAGRNAAVEQLTAIKDRAYASLGEEKAAIFEGHLMILEDEELEEEIIDYLRSNKVNAGVAASTIIAQQVAMLSEIDDEYLKERAGDIQDIGNRLIKNILGMKIVDLGEINEEAILVAYDLTPSETAQLNLDKVLGFITDIGGRTSHTSIMARSLELPAIVGTNTVTQQVNTGDFLILDAVNNQVYINPTQEEIDRLRKLEQQLKEEKEELAKLKDLPALTLDGHRVDVVANIGTIRDIDGAERNGAEGVGLYRTEFLFMDRDQLPTEEEQFIAYKEVVEAMNGRLVVLRTMDIGGDKELPYLNLPKEMNPFLGWRAIRIALDRKEILHAQLRAVLRASAFGKLAVMFPMIISVEEIRALKAEIALLKEQLRNEGKAFDENIQIGVMVETPSAAVNAKFLAKEVDFFSIGTNDLTQYTLAVDRGNELISHLYNPMTPSVLNLIKQVIDASHAEGKWTGMCGELAGDEKATLLLLGMGLDEFSMSAISVPRIKKLIRNVNYQDAKVLADAALEQPTAADIERLVTDFLVEKALN >NZ_CP051638.1|WP_017807272.1|619683_620184_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MGFFDKLFGSKNSKTVEVEIYAPLSGEIVNIEDVPDVVFSEKIVGDGVAIRPTGNKLVAPVDGVVGKIFETNHAFSMESEDGVELFVHFGIDTVELKGEGFIRVADEGQKVKRGDTIIELDLEVLESKAKSVLTPVVISNMDEISHIEKKTGEVIAGESIILILKK >NZ_CP051638.1|WP_035684715.1|616695_619359_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type MSEMLTNDVDPIETNDWLLAIDSVIREEGVERAQFIIEQLMQHARANSVSLPTGVTTDYINTIPTSEEPNYPGNLDLERRIRGAIRWNAIMMVLRASKKDLELGGHMSSFQSSATIYEVCFNHFFKARTEKNGGDLVFFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLDNFRQEVHGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLNAIYQARFLKYLHHRGLKDTADQTVYAFLGDGEMDEVESRGGLAFAAREKLDNLVFVINCNLQRLDGPVTGNGKIIQELEAQFNGCGWEVIKVIWGRRWDRLLQRDTSGKLLQLMMEVVDGDYQTFKSKDGAYVRKHFFGRYPETEALVAEMTDDEIWALNRGGHDPLKVFAAFNKAKQVKDKPVVLLVKTVKGYGMGESAEGKNIAHQVKKMDMSGVKHVRDRFNIAVSDEDIEKLPYIKFEEGSEEYKYLHERRQALNGYVPTRSPRFSQALEVPALEEFAQLFEAQSRPISTTMAFVRSLNVLLKNKSVGKHIVPILADEARTFGMEGLFRQIGIYNPHGQNYTPQDREQVAYYREAIDGQVLQEGINEQGATASWIAAATSYSTNDVPMIPFFVYYSMFGFQRVGDLMWLAGDQRARGFMIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSAVIPNCISYDPAFAFEVPVIIQDGIRRMYGPEQEDVYYYITTLNETYDQPAMPKGAEEGIRKGIYKFETVTGQGKGKVQLLGSGAILRHVREAAQLLANDFGVTSDVYSVPSFTEVARNGADVERWNLLHPEAEARTPYIAQVMNDAPAVAATDYIRLYAEQVRAYVPAQSYRVLGTDGFGRSDSRENLREHFEVNAHYVVVAALAELVKQGIFDKKVVADAIAKYGIDADKINPLYA >NZ_CP051638.1|WP_035684713.1|614745_616644_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase MAKEIQIPDIGGDEVTVTEVMVKAGDTVEVDQSVINVEGDKASMEVPSPEAGVIKEVLVKVGDKVSTGTPMFILESADSAPASAPAVEEKAAPASTAPTQSAVSSVIEIHVPDIGGDEVNVTEILVNVGDSVAEEQSILNVEGDKASMEVPAPVAGVVKEILIKVGDKVSTGSLVMKFETTAATPAAQPAAEAPAAPAAVSGSVQDVHVPDIGGDEVNVTEIMVAVGDSVSEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEILVKSGDKVSTGSLIMRFEVAGSAPAAAPAAQPAATPAQTQAAAPVQSAQPANQAEVTASASFAHATPVVRRLAREFGVNLDKVKGTGRKGRILKEDVQAYVKAAVKAVESDSVSATASTGAANGAGLGLLPWPKVDFSKFGEVEQVELGRIQKISGANLHRNWVMIPHVTQWDKADITDLEQFRKEQNVLAEKQKLDVKITPLVFIMKAVAKALEAYPRFNSSLSEDAQSLILKKYINIGVAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGIIELSRELAEISKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGGTQFTPIVNAPEVAILGVSKSEMTPVWNGKEFTPRLMLPLSLSYDHRVIDGADGARFITFINGVLSDLRRLVM >NZ_CP051638.1|WP_035684710.1|613234_614659_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MNKEIKTQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLDTVIVERYSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKSLAEHGIVFGEPQTDIDKIRGWKEKVINQLTGGLAGMAKMRKVQVVNGYGKFSGPNTIIVAGDEGETTIHFDNAIIAAGSRPIQLPFIPHEDPRIWDSTDALKLKEVPKNLLIMGGGIIGLEMGTVYHALGSNIDVVEMFDQVIPAADKDIVQIYTKRIEKKFNLLLETKVTAVEAKEDGIYVSMEGKAANETRRYDAVLVAIGRTPNGKLIDANVAGVEVDDRGFIHTDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVIAGQKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGKTEKECKAEGINYEVAKFPWAASGRAIASDCADGLTKLIFDKDTHRIIGGAIVGTNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDLALTIHAHPTLHESVGLAAEVFEGSITDLPNPKAKKKK >NZ_CP051638.1|WP_035684708.1|611167_612937_-|autotransporter-outer-membrane-beta-barrel-domain-containing-protein MKTFNLNLVSISLGIAFTVTSINSFAAAANPLYAVNSTGSHSSSLNGSVNGGTSAFLYDNGDKSFNKLMIVDKLQQGAESQDRKDFETTYGIQFEWFEHDGSLTEEGKKHIYQAENGTFKSEVHLTKEEKVKFSAQKGSTADSQPTSNNSEATVHPKESSSIISNNSQPEAEGKSGEIIPTPSEKIETKERVEDASSHTELPKMGSATVIPATPTLKMTEARDTTEKAKPVMEIKAEQNLASATSAFSGTLSDLSQTTRAMATSFFNNTAVVQDQSAMVRNNAQYFVSYRHYFVEPIGIDKSDLRRQPSEMNVTTPNVNTYVDYAYHHYTLKNKNFHSKIHRNDITLGGYAQINGYNLGLAMISMKGNSTTLNNYTLASKVKMRTNGLLATFGWAFDKSYLNLGAYAVFSKVNTSRSPFGNSEQHASFNTQQYALDIVYGRSLYQTENSSILLNGGLTNVYYHQDSFNEQTDSQNATPYSLQVDSSAYFNSFAHLGMQASYQTYISSFTTRSDIALRVEQALTANRFDLKLQDGTTITGSKNDKFTVRLSVGQTFIFDKVSIRVGAEFIEGNRTNARLDTVSATLSYRF >NZ_CP051638.1|WP_035684706.1|609709_611083_+|TolC-family-protein MLKQSKLSLAIGLSVLLAGCANLDDSYKTSQQDFQQYEELTKQYNIQENWWTLYHDPQLNQLVQQALENNKDLAKAAIAVNTALYNANLIGANLVPSFSGSLSSSASKNINTGGNSTISHGGSLNVSYTLDLWRRLADASSAAEWRHAASEQDLEAARISLINSVILTYYQLGYLNDAISTVNKTINYYSEINRIMQNKFRQGVADRASSDQAQQAVLTAHNTLINYQTQKKTAEATLRNLLNLKPNDSLPATYPHILNVKNVGINLNVPLSAIANRPDVKGYQYRLNSAFKDAKAMQKSWFPSITLGGSLGSSGNKIDNAFNTPIAGGTVGISLPFLNWNAVKWNVKISESAYDLALVNFEQSITKALNDIDTNYFIYNQANQSFENLKQTYDYNKRITQYYKNRYDAGISELREWLNAASTERNSELSILNAKYNLIQSENAVYSAMGGYYSVEQ >NZ_CP051638.1|WP_035684725.1|624650_625733_-|peptide-chain-release-factor-1 MKPSIISKLDSLNERHEELEALLGDASVISDQEKFRAYSKEYAQLEDVVKCFARWKQLNSNMEEAQLLLDDPSMREMAQEEVEECKAEIEQVEAQLQILLLPKDPNDEYNCYLEIRAGTGGDEAGIFAGDLFRMYSRYAESKRWRVEMLSANESEQGGYKEVIVKISGENVYGQLKFESGGHRVQRVPKTESQGRIHTSACTVAVMPELPESELPEINPADLRIDTYRSSGAGGQHVNTTDSAVRITHIPTGIVVECQEERSQHKNKAKAMSVLASRIVQAEQEKLAAEQADTRRNLLGSGDRSDKIRTYNYPQGRVTDHRINLTIYRLDEVMNGKMDELIQPIITEYQADQLAALSDQG >NZ_CP051638.1|WP_035684727.1|625936_627226_-|serine--tRNA-ligase MIDPNLLRNNLAEVAEKLKIRRGFELDEARISELEDQRKALQVKTETLQAERNTRSKAIGAAKARGEDIAPLLAEVDNMGIELSMAKSQLDDVQAELQEIALSIPNIPADEVPLGNDENDNVEISRWGEPRTFDFEVKDHVTLGEHLQGLDFAAGVKLSGARFVVMKGQIAKMHRALAQFMLDLHTEQHGYSETYVPYLVNHATLYGTGQLPKFGEDLFHTKPLEGEQPYALIPTAEVPVTNLVRDEILEQAELPIKMTAHTPCFRSEAGSYGRDTRGLIRMHQFDKVEMVQIVEPEKSMEALEELTGHAEKVLQLLNLPYRKVLLCTGDMGFGSAKTYDLEVWVPAQNTYREISSCSNMWDFQARRMQARYRVKGEKKPRLVHTLNGSGLAVGRTLVAVLENYQNADGSITVPEVLRPYMGGLEVIGK >NZ_CP051638.1|WP_035684730.1|627299_628649_-|replication-associated-recombination-protein-A MSNFAFDFAENDFRPLAARMRPTNLEEYYGQRHLIGVGKPLRKAIEAGHIHSMILWGPPGTGKTTLAEIIAQRINAEVERISAVTGGVKEIREAIERAKQNRLTGQRTILFVDEVHRFNKSQQDAFLPYIEDGTVTFIGATTENPSFELNNALLSRAKVYILKPLTPQDIEQVLQRAIQDKEKGLGNEHFVLEDNVLQLLAEYVNGDARLALNSLELMADMAEEGKNGKILHRTLLTEVLGERQARFDKQGDRFYDLISALHKSVRGSSPDAALYWYARILTAGGDPLYVARRLLAIASEDVGNADPRGMQVALAAWDCFTRVGAAEGERAIAQAIVYLAVAPKSNAVYQAFNAAKKMAVESPDYDVPEHLRNAPTKLMKELGYGAEYRYAHNEENAYAAGENYFPEALKETKFYFPTQRGMEIQIGEKLEKLRQLDEKSQIQRYKLVK >NZ_CP051638.1|WP_017806586.1|628836_629196_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MVVKKKWEVIATARFKIWLKEQDEATRISVFNALNNLRFYGPQLSRPYVDTIKGSQYPNMKELRIQHKSKPLRAFFAFDPLRQAIVLCAGNKSNNKQFYKQMITIADAEFTDYLATLEK >NZ_CP051638.1|WP_017806585.1|629197_629506_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTQYTTLDELIAQESPETQQCIKEMSEELILETGLAMIREQLALSQKELAQAIGVSQSAIAQIEQRGNDVKLSTLKRYIEKMGGELSLTVKMPTGYSQIFPL >NZ_CP051638.1|WP_035684733.1|629557_630178_-|outer-membrane-lipoprotein-chaperone-LolA MKKMAVKMTALLCLGLSPLAWADAVSELQARLNKVEALSADYVQKVSDPKGKEIQQGKGKIQIKRPNLFRMDNQAPQESQVISDGKTLWFYDPFVQQVTANWVADAVNNTPFVLLTSNDTQYWKQYNVEQNADTFTLKPKSAKSQIKQFDIRIDGEGVLKNFSTTEKDGQTNLYLLRNITNQPLADSLFKFSVPKGVELDDQRKKK >NZ_CP051638.1|WP_035684736.1|630259_633112_-|DNA-translocase-FtsK MIKRITTNLTPKQYMGELCLGIISLFGLYLIVAWSSYSPFDNTWAVSSSQPETINKAGALGAWLIGLFFTLFGHIGNVIPFILCFVPIYLFKTKKFTQLTAIKAAIRTLGGVILFAGLTTLATLLLSNTSAYLAGGVLGGSLVVSLYPILGKAGLILSALLFTVAGFVLCSGKVLIQLFVRFYYWLTMNEHKTPTMATPEEPQEQSEPVPLEEIIIHKVEPRPEPQQAENTEQSEEAESPKSNQPFIQISGLKELTQPVASDNAPSSAENTENNATLFDPRKMELFSRYDVGQDDSLPNVSLPQSTSAVAPVVQVELVSPQISPPITPQKPELHAISQPANTQSAVSFSEEFLPYEAPNEPELKVSIPDYSVEAYQVTEDFAEPSDEMDDLARQFAAQEQQRLAEMQQRAKEINEEDTLEHILAEQEPASNQPSYKPYGDSLIHPALQKQVSIKEKPTTPLPSLDLLEKRQVEVQEITREEILDTSQRIEQQLRNFNVKATVKDVLVGPVVTRYELELQPGVKASKVTSIDTDLARALMFRSIRVAEVIPGKPYIGIETPNLHRQMVPLRDVLDSPEFRESKSLLSMALGKDISGNPIVVDLAKMPHLLVAGSTGSGKSVGVNTMILSLLFRVKPEEVKFIMIDPKVVELSIYDGIPHLLTEVVTDMKKAANALRWCVDEMERRYQLLSALRVRNIEGYNEKIEEYNAMGMPIPNPIWRPGDTMDAMPPALEKLSYIVVIVDEFADLMMVAGKQIEELIARLAQKARAIGIHLILATQRPSVDVITGLIKANIPSRIAFTVASKIDSRTILDQGGAETLLGRGDMLYSGQGSSDLIRVHGAFMSDDEVARVADDWRARGKPNYIEGILDSAEEEDSDTPRTGDDGELDDLFDEVMNFVIETGTTSASSIQRKFRVGFNRAARIMDQLEEQGIVSPLQNGKREILARRSDY >NZ_CP051638.1|WP_017806582.1|633113_633593_-|leucine-responsive-transcriptional-regulator-Lrp MEKKLPKALDAIDIKILNELQRNGKISNIDLSKKVGLSPTPCLERVKRLEKQGVIMGYRALLNPELLDSPLLVIVEITLVRGKPDVFEEFNDAVQQLDEIQECHLVSGDFDYLLKTRVADMAAYRKLLGTTLLRLPGVNDTRTYVVMEEVKQTNFLQLK >NZ_CP051638.1|WP_035684738.1|633739_635092_-|deoxyguanosinetriphosphate-triphosphohydrolase-family-protein MKNSINPLWLERFINDNPREKDHRPPFRRDRGRILHSAAFRCLQAKTQIHAVGENDFYRTRLTHSLEVAQIGSSLVSQLKFSEAFTHLAQQLNIENAQLQKQLKPLLPSNDLIESLCFAHDIGHPPFGHGGEVALNYMMQSHGGFEGNAQTFRVLTKLEPYTLNAGMNLTRRTLLGVVKYPAILDEVSPQYAELAMPNHSNPFSIKLTDWIPGKGLFREDKAMFDWLLAPLSEADRHLFQTLSSLRETSQQTLKTRYKSLDCSIMELADDIAYGVHDLEDAIVVGVIHLQQWQEALAQLKNSSSPWIREHIDALSEKLFSAHHYERKNAIGALVNYFITNVRWKITADFTEPLLRYNAELPEDVLAVLKVFKDFVLKYVICDVTTQRIEYKGQRMLTEMFQIFESDPERLLPRNTANRWKMASAEQKKRIICDYIAGMSDAYAIKVYQQL >NZ_CP051638.1|WP_035684739.1|635093_635780_-|CidB/LrgB-family-autolysis-modulator MIYAYTLLTIVVFALALQISKRLKSLVFNSFILTVAMLITIVLIFHLPYEDYYQGNAPLNHLLGVSVVALALPLYEQFRQIQAYWKTILFITALSSFFSMCVGAILALLLGAEPEIVATILPKSVTTPIAMEIADNLGGIPSVAAVAVLLAGLQGSMFGYVILKTIRIKHSQAIGLSVGAVSHVLGTVSCMETDPKAGNFSSISLVLCGILSSIFAPFVFKFIYLMVA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP051638_1 | 1.1|624447|55|NZ_CP051638|CRISPRCasFinder | 624447-624501 | 55 | NZ_CP010410 | Xanthomonas sacchari strain R1 plasmid unnamed, complete sequence | 454272-454326 | 10 | 0.818 |
NZ_CP051638_1 | 1.1|624447|55|NZ_CP051638|CRISPRCasFinder | 624447-624501 | 55 | NZ_CP048065 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p9, complete sequence | 33562-33616 | 11 | 0.8 |
NZ_CP051638_1 | 1.1|624447|55|NZ_CP051638|CRISPRCasFinder | 624447-624501 | 55 | CP022016 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence | 202572-202626 | 12 | 0.782 |
NZ_CP051638_1 | 1.1|624447|55|NZ_CP051638|CRISPRCasFinder | 624447-624501 | 55 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 683766-683820 | 18 | 0.673 |
1. spacer 1.1|624447|55|NZ_CP051638|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010410 (Xanthomonas sacchari strain R1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.818
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer gcactgctcccaagcgggaatagctcagttggtagagcgcaaccttgccaaggtt Protospacer ** **.* *************************.*********** ****
2. spacer 1.1|624447|55|NZ_CP051638|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048065 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p9, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.8
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer cctttccagttgcgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccaaggtt Protospacer . *.*. *. .************************************* ****
3. spacer 1.1|624447|55|NZ_CP051638|CRISPRCasFinder matches to CP022016 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.782
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer gttgcttgatactgcgggaatagctcagttggtagagcacgaccttgccaaggtc Protospacer * .* * .****************************.********* ***.
4. spacer 1.1|624447|55|NZ_CP051638|CRISPRCasFinder matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 18, identity: 0.673
tatcttatctctt-----------gcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgcc CRISPR spacer -----------ttagaagtaaaaagcggaaatagctcagttggtagagcacaaccttgcc Protospacer ** ****.*******************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
266145 : 279154
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP051638|266145:279154|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP051638|266145:279154|271756_272413_+|WP_165381618.1|DBSCAN-SWA MQNAMARQAKFPSQPQQKSQRLPNEIEKLVDQIFSQLFAACPAMRGQFDEVQLPITKRTWVLGFAENNIRTIEQVRAGMRKVRSKPDDYFPGVGKFISWCKQDRFEALGLPNEEELYQRLKKFQGYGMLEIHKFQFESDAEYWLLTDLYCDNREATKKELRKAVGEALDSMATRLEAGETLPKPQITLPAKPSFVPPEVQRKINQHGIEKCKAILGMK >NZ_CP051638|266145:279154|270926_271733_+|WP_035689420.1|DBSCAN-SWA MSMLLMVKAMQCKVGNPTRKLVLLKLADNANDEGICFPSYQNIADQCEITRRSAISHIEALIETGFVEKKTRKTPEGNTSNLYVLHLDRDGENSALPSENDSLRVVKNLHHPSENISPTPSENISPRTSHSINQSINHTSSSEKISDGSVGKKSRFKFSDDDMTAAQWIFGLILKLNPNTKTPSFENWANEIRLMRERDKRTHREICGLFQWANQDLFWKTNILSPAKLREKWDQLTVKKNNSKPQRKTASELNAIEWNTEEGWRGML >NZ_CP051638|266145:279154|267654_268140_-|WP_017807326.1|DBSCAN-SWA MSRLNEHKFCLNNEEALQFIELLKSYDKDLYWNKGRNIHWRTINFVPNDRDELAGPVPGATVQVDYKYSKRVKESGKLVLTLFKRKQHEKLRAYQLELSDENKISSHDGNTIIKGSHEHIGKQVRKIIPDTEIENIAHWFALFCDKIRLEFTGSKLNLPEE >NZ_CP051638|266145:279154|268139_268793_-|WP_017807327.1|DBSCAN-SWA 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21 | Mannheimia_phage(33.33%) | integrase | attL 266405:266418|attR 280515:280528 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
286023 : 292503
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP051638|286023:292503|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP051638|286023:292503|290659_291256_+|WP_051128099.1|DBSCAN-SWA MEKLIKSQTRVRAFGEVYTPQKLVQKMTALLPEESFEPEKKILEPSCGTGNFLYDILNRKLCKILVGPKRPYYKVLNMYQALASVYGVDIQLDNVIECQQRLKSLFCERLAMLHVKPFDYFVDHVLINNIRRGNALEDAFTFIDVEIVFKDRDIGIKVEKDSFLLSEYECHLQQNTSQLQAVRLLAFEDEIGITRNAT >NZ_CP051638|286023:292503|288537_288720_-|WP_035688065.1|DBSCAN-SWA MALSRTEINARSEAKRGIVTKSFKIPQSVSDEIDRLAVELGISKGKILEQAILLLKQAHS >NZ_CP051638|286023:292503|286023_286524_+|WP_035688053.1|DBSCAN-SWA MKLYEIAESYNNVAELLANPEFAENADIITALDAIEDEFNNKAINTIKAIKRVEGDIDLLDAEIKRLTAMKKARQNRIEEVKNYLKYNMQKTGIFKIESPLFKIAYSERKQSAVEIDDNLFLANNLDENLVSVKITPNKTAIKEALKRGDDVIGARLVDSQVLSIK >NZ_CP051638|286023:292503|288200_288515_+|WP_035688062.1|DBSCAN-SWA MNTNELLNEREKTHGDFISGAETFYHLMKPIIDSQLFERNKVKAYAATMIAAKLTRICNGDETFPDHWDDIIGYAQLATGKQFEPQQAVSVPVVDYMKKPNSNC >NZ_CP051638|286023:292503|289029_289239_-|WP_035688068.1|DBSCAN-SWA MSRGRPKSGLTRQEQQEKSDKKRGVRLQSYKLHEETIALLAQLSSQTGLSKTQIVSEGIKLFAETNKVA >NZ_CP051638|286023:292503|291483_292503_+|WP_035688073.1|integrase|DBSCAN-SWA MSRQIISLKKRGEIWHYSYTSPTGERVRRSSRTTDKTQAMQLASKEYNECWRVFKLGERPEYSWQEAVMQWLEEKPKRKQDRNMIYGLRWLDQYLGNKKLNEIDRNLIKFIQSEKAKEGVKNRTINAILQQIRVILRAAVEWDWLDKCPAIKLLPEPKRRIRWLTESEEMRLMQELPEHLKAIVQFAILTGLRMSNITQLKWSQIDLPKKLAWINSDESKTGNSIGIPLNDKAIEVIVAQFGKHKENVFTYKGKPVRIANTKAFRNALSRAGIKNFRFHDLRHTWATRHIMSGTPLYVLQELGGWSKTDTVRKYAHLSVEHLHSHVNNVQLFGTKLAQH >NZ_CP051638|286023:292503|287421_287901_+|WP_035688057.1|DBSCAN-SWA MAGINKAIIVGNLGNDPEIRTMQNGDQVATISVATSESWTDKQTGERRELTEWHRIVFYRRQAEIAGQYLHKGSKVYVEGRIRTRKWQDQQGIERYTTEIQGDVLQMLDSRQDGQGAQTNAPPRQTQSTKSNAYANAKNGNYTPPVQGGNDGLDDDIPF >NZ_CP051638|286023:292503|286534_287422_+|WP_035688055.1|DBSCAN-SWA MQFQKAERKKSKLRLALTGPSGSGKTYGALLVAKGLGGRIAVIDTEKGSASLYSHLVDFDVLDLEAPYTPERYRQAVRLAVENGYDVVIIDSITHEWSGAGGCLELNDEIAKAKFKGNTWSAWSETKARHRALIDDLLASPTHIIVTMRSKTETAQAEINGRKQVQKLGMKAEQNDGIEYEFTTVLDLIHDGNFAQPSKDRTGLFPPNGNPFKLSAEIGKQLVEWLESGVDLTFKRAEVHRDKMLQKITTAETLELLGEMSKYVTDKFKDYPILLTELEQAILARKASLDNQGGE >NZ_CP051638|286023:292503|289753_290416_+|WP_035688071.1|DBSCAN-SWA MSNLQILNNSIRTLDNLYSLNDLHLASGNDPKHRPSLFVRNEQTKELVKEIESENTRSTKTIFALKTIRGGKDISVQGTWACEELVLSYAMWISPKFHLVVLRAFLAMHKGEVKQQQLALPEPEKKYTFEFTEYELEQLAWLWFSHKRMNTLLADLYEPLNALGSTFSGTVYSHAHEYRHHYEHTQATMQRLIEPFKHSTKLNWQRVIPRISPTQKQLGF >NZ_CP051638|286023:292503|287909_288158_+|WP_035688059.1|DBSCAN-SWA MDKLKFADVTLVNGGRAWINFHEIECIKDCYYRFDEETDDIIEGDKWEFKATKVIMKSGRIYYVDFTLDSFDDKFNLDQFRL |
10 | Mannheimia_phage(25.0%) | integrase | attL 280992:281007|attR 293500:293515 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1464798 : 1487873
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP051638|1464798:1487873|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP051638|1464798:1487873|1469045_1469687_-|WP_017807425.1|DBSCAN-SWA MTKKISNFKLNPDLIRARCLSARLLARKSPERAAAEMGYTNTSMISKMERKTSKTAINHNFLARASLCYGVSMDYLLGMSNYPERDPRSVEQLAIYSSVQHYANQLLEGLTETIVKGASAQVLSMHLSMLCDESAELVDAVNRMRELNPNFDEDIKAGSLVMKQVDKINQRISSTRRRLSKESYDDNILRQFKSVLSDGSEKQLDLVGYRYGD >NZ_CP051638|1464798:1487873|1470681_1471119_-|WP_035689209.1|DBSCAN-SWA MVKGAGGTFVPADEMFLPALQGFKNGEMYSVEIKRTRNPQFHRKVFAFFKFCFEYWAAENTELQFQSEAKQFDTFRKNLTVLAGFREVTYTIDGRMRVEPQSLSYGNMEQDEFEQCYSALINAAIKHIFNDTTDPNVINQLHSFF >NZ_CP051638|1464798:1487873|1471127_1471721_-|WP_035689193.1|DBSCAN-SWA MTEQQFDKDTWRTPRYFFDWLLQRFNWFDIDGCADHKNALAYRYIGKPAPEDDDDAEGFNKTCIATDFLGEDLFDRLLDEVAETCHFPLRIFVNPPYSNVTPYLKRAKELRDAGYLVVMLLNNDKSTQWYQNHIHNVANEVIDIVGGRINFIHPITGEEIKGNTKGQMVVVFDPAMEDFVQRSVTLDFVKKCGGYNP >NZ_CP051638|1464798:1487873|1482516_1483149_+|WP_046097549.1|DBSCAN-SWA 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MILSFKHKGLEKFYKTGSTAGIIVAHSAKLKRILARLNSSKQIQDMNIPGWNLHPLAGNLTNHWSVKVNGNWRVTFKLENGHAEIVDYQDYH >NZ_CP051638|1464798:1487873|1487390_1487873_+|WP_035689265.1|DBSCAN-SWA MQKPILDACCGSRMFWFDKQNPNVLFADNRRLETTMKDRDKLRKLEINPDVIHDFTDMPYPDKSFKLVIFDPPHLKAGGDSSWLVKKYGRLNKDWQTQLKKGFDECMRVLDGCGTLVFKWNETQITVSEIIKAIGHQPLIGHKSGKANNTHWLLFFKFPV >NZ_CP051638|1464798:1487873|1467990_1468284_+|WP_026138622.1|DBSCAN-SWA MNMYCPPHPAEVIKEDILPELGLTVTQAAKQLGVNRVTFSRLLNGKSAISAEMALRLHAWLGENSPSPESWLHQQADYDLWKASQKQTFSVQPAFVV >NZ_CP051638|1464798:1487873|1485364_1485574_+|WP_035689255.1|DBSCAN-SWA MNIIKRLAAKILKAEINAYAKQIAVLEDAISKQTKQMLGLQKIIENQRIDILELRKQAQKRPHFKRKRK >NZ_CP051638|1464798:1487873|1468393_1469056_-|WP_017807426.1|DBSCAN-SWA MATRKEAATTAKTKVKRKAKVSAAISKRELKLEEGQWETKRGRPYKFDPDLAIEKMEAAINDYVEGKLKYYELIQKDSEGKKMDILGVAFPTITRMALLCGVDEQTFTDNCTAKNEDGSIKNKQLFGAYKRFKDLGKTMLVEGGLVGMYDSRLVQFLGNVNYDLVPKQQVESTVEVKSMDKVYEELDAILASGQEETRLMQERAEMEERKALLDAENEEA 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38 | Mannheimia_phage(52.63%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1678777 : 1765604
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP051638|1678777:1765604|DBSCAN-SWA AATGATGCGTTATGCCCTAAGCCTCGCCGACAAAGCCGAAGCCTTGGGAGAAATCCCCGTGGGGGCGGTACTGGTTGATGAAACGGGGAATATCCTCGCCGAAGGTTGGAATTTATCCATAACCCACAACGACCCCACCGCTCACGCCGAGATTGTTGCCTTGCGTCAAGCGGGAGAAAAACGCCAAAACTACCGCTTACTCAACACCACCCTTTACGTTACCCTCGAGCCTTGCACGATGTGTGCAGGGGCAATTTTACATAGCCGAATCAGACGCTTAGTTTTTGGTGCGAGCGATTTAAAAACAGGGGCGGTGGGTTCACGCTTTCATTTCTTTGACGAGTACAAAATGAACCACAGCGTGGAAATCACCAGCGGCGTATTGCAGGAAGAATGTAGCCAAAAACTCAGCCGTTTTTTCCAAAAACGACGGGAACAAAAAAAACTAGAAAAACAAGTTCATAAAGAAAAAATTTCAGCCCTATAACAACTAGCTATGATTTAGAAGATTAAATCCGATCACTTGCCATTAAATAAAAATGGTCGTGCTTGGTCATAAAAAATCTGCTCTTTACTCAGTTGAGTATTCCCCCCAACCTTTCAAGAGCATTACTATGCTATCTTCTGAATAGAATAAATCCCTTGATAAAACTAATGAAAATCACGACAAATCAAAGTGCGGTTAGTTTTTATGCCATTCCCACTGCCCATTAACGGCGGTTGCTAGCACGTTAAAATCATTAGTGAACAAGGTTAAATTAGCAATTTTGCCTTCGCTAATATCCCCTAAGCGATCGGTAACGCCAATGGCTTTGGCAGGATAATAATTGCACATACGCAAGGTTTCGTCTAATGGAATACCAACGTGTTTCACCGCATTTTCGACCGATTCCATCATCGTGATCGCCGAGCCGCCCAGTGTGCCGTTGGCGTCATAGCATTTGCCATTGCGAACATAAACCGTTTTGCCAACAAAATCAAAAGAATCAATCTCCGCACCAGCTGCGGCGGTTGCGTCCGTAACAATGCACAACTTGTCGCCTTTCACTTTTTTATCGATCTTGATATTATCAAATTCAACGTGCAATCCGTCCACGATAATGCCTGCATAAATATCGCTTTCCAACACCGCGCCGACAACGCCCATTTCACGTCCTGAGCTAATTGGCGACATCGCATTATGCAGATGAGTAGCAAAACTCGCCCCATTTTCAATGGCTTGCTTGGCAATCTCATAAGTGGCATTGGAATGTCCAATAGAAACCACAATGCCTTTTGCGACAAACTCTGCCACATATTGAGCCGTTGGATTTTCTGGAGCAAGGGTGATTTTGCTAATCACTTCCGCATTTTGGCAAAGAAAATCTTTCATTTCCTCGCTAATCGCACGGATATATTCAACCTGATGCACCCCTTTTTTCTCAACGCTCAAATAAGGCCCTTCTAAATGCAAGCCCAACGCCTGATTTTGATGGGTTTTGAGATACTCACGCATCACCACAACGGCTTTTTTCATTCCCTCATCATCGGCGGTGATAAAGGTTGGCAAATAGCTGGTTGTACCTGAACGCAAATTGGTTTCCTGCATAATTTCAAGGGTTTTCACGCTAGTTTCGCCGTTAAACATCACCCCACCACAACCATTTAATTGCAGATCAATGAACCCAGCGGTCAAATTATGACCTTGTAAATCAATCTGTTCTAACTCTGACGGAACATTTTCTTGTGGCACAATGGCGACAATTTTATCGCCCTCCACCACCACAGCTTGCCCGTAAAGCACGGCTTCCGCTGTATAAATTACGCCATTTACTAACGCATAGCTCATTTTTTACCTTCTTTTTATACTACACTGTGAATCGCTTTCGCCTCTAACTCGGTGAAATATTTCACGGTTTTCACTTTCAATTCTTGCGTTGCGGGTTCATCGCATACAAAAATCGCGTGGCGGTGTAATTGCAAGGCACTGATTGTCCAGAAATGGTTTACACTACCCTCCACACCCGCTTGCAAGGCAAGTGCTTTGTTATGCCCAGTGATCAACAACATCACTTCTTCCGCATCAAGCAAGGTCGCCACTCCAATAGTTAAGGCATATTTCGGCACTTTATTTACATCATTATCAAAGAAACGCGAATTAGCGATCAACGTGTCTTCCGTCAAAGTTTTAATGCGAGTACGCGATGCCAAAGAAGAAGCAGGTTCATTAAAGGCAATATGCCCATCAACACCCACTCCGCCCATAAACAAATTGATCTTACCATAAGACTGAATTTTTTCTTCATAACGGCGGCATTCCGCATCAAGATCGGGGGCATTACCGTCTAATAAATTGATGTTTTTTTCTTGAATATCAACGTGATTGAAGAAATTGTTATACATAAAAGAGCGGTAACTTTCAGGGTGATCTTTTGGCAAGCCCACATATTCGTCCATATTGAACGTAACCACATTCTTAAAGCTCACCTCACCCGCTTGATACAATTTAATCAATTCTTTGTAGGTTTCCAACGGCGTTCCCCCCGTTGGCAAGCCCAACACAAAAGGGCGATCTTCCGTTGGTTTAAACGCATTAATGCGATCTGCAATATGACGAGCTGCCCATTTGCTCACCTGAGAAGCGGTTTTGAGTGGAATTAAACGCATAGCAATCTCCTATTTTGTAAAAATTAAAACATTATTCCGAAGAAATATTTCACACTTTGAATTATAAAGTAATATAAACTCCAAAATAAAGTGAATTTAGAGAAAAAAGGCAAAATAGTGAGATACATCACAAAATTAGACTATTTTTGTCAATTCCATAAAACATATACTCAAAAATAACCGCACTTTTACGACAGTGATCGCAAAACCAAACATTTCTACTTTCCATTTTCTTTTTACCTAATAAGCTAAGCCATATCCAAGCCCAATAAGGAAACTAGAATGAAAAAATTCGTTACTTACCTCATCACATTGCTGTTTATACCTAACCTCCTCAGTGCCACTCCACCAGATTTTATGCTGCTTGGCACTTACAGCAACCAAAATGTCGCAGGCTGGGTAATGAGCGAAAAATTAGATGGCGTAAGAGGCTATTGGGACGGTAAACAACTGTTCACTAGACAAAATAAAATCCTCACGCCTCCTGCTTATTTTGTAAAAGACTTTCCACCGTTTGCGATTGATGGCGAACTTTTTACCCAACGCAATGAATTTGAACGCATTTCATCCATTATCCGCTCACAAAAAGATAAAGGCTGGGAAGACATTAAACTCTACGTTTTTGATGTGCCAAATGCGGAGGGCGATCTTTTTGCCCGCCTCGCTGTGCTAGAGCAATACCTCGCTCAGCACCCAAGCAAACACATTACTATTATTCCGCAAATCCCCATTAAAAATCATCAACATATCAAAGAGTTTCTGTATCAAGTTGAAGCACAAAAAGGCGAAGGTATCGTACTACGCAATCCAAACGCCCCTTACGAAAAGAAACGTAGCAACCAAATTTTGAAACTGAAAAGTACTCACGACGAAGAATGTGAAGTCATCGCTCATCATCAAGGAAAGGGGCAATTCACCAACCTCCTAGGTGCAATCACCTGCAAAAACCAGCGTGGCGAATTTCGTATCGGGTCAGGGTTCACCTTAGAAGATCGCCAAAATCCTCCGCCTATCGGCTCAACCATCACCTACAAATATCGAGGATTAACCTCAAAAGGTCTACCTAGATTTGCGACTTATTGGAGAATAAAAAGCGAATAATCTCAAAATTCGTGGTCAGTATGTTTTAAATGAAACTATATTCATTCAATCCCGATCAATTTATGTGTTTGGATGCTCAGTTGCCATTTGGGTTTATTGGGACGCTGGTTGAGCAGCCCTAATTGGGTGATGGTGTGGAGCAAATTCATCTCGCCATTGATTTCACAAGGGGAAAGATAGTAATGGCTTGCTTGAAATATTTACACGAGCACTTCCATCCGAGAAGATAAAAATGGTTCAAAAAAGCACCGCACTTTATTTAATAGAAAAAATCAAACTGAAGCTCTATACCTCGTTTGATTTCAAAATAATACGGCACTAGCCTGCCTCGTCATAGTCGTCGTACTGTCTATGGAGTACAACGCTTTGCCTTATTTTGAACTAAAATGACTATAATCGAACAGCTACTATCATTCAATTTTCTCTTCTGGTAAGATCACTTTATTATAAAAACTGCCATTAATTTGGGTTTTATGCAAATGGTAGAGATGGTATGCCTTAAATGCTTTTTCATCGGGTTGTTGTGGAGTATGCCAAAATTCTTCTAGTGTTCCTTGGTGTGTAATATCAGGAATATTATAATTGGCTAGTCCTAGCGTCATTACAGGCATATTATGAATGAGTGCAGATAGTCCACTCGTACTGTTCAATGTTACCATTGCTTTTCCATATCGAAGTAAAACAGGCATTGGTACATCATAGACGTAGAATACCCGCCCTTGCAGTTCGGGATGTTCAGATAAATAGCATTTAATCACATTTTTATAGCTAATAAACCCGCGATCCATTGGATGATGCTTGATTACCAAACTCAATGACTTTGGAGCATTTTTTACAAAGGAATTCAGTACATAGATTAAAAATGCTTCAACACTATCAAAATCACAATGTACTTTCACTTGGCTATCATCATAAACTTGTAAAGGTAATATATAAAAATCACCTAATTTATTTTGCTCAATTTTGCGAATAAATCGCTTTTCTTTCACATAACGACAAACACGTTTTAGCCCTGAAATAAGCCATAATTTTATATAATAATTGAGGTTATAAACGCGGTGATGTTTATAATGAGGAAACTGTTCTTCCCTATGTCTAGCAACGACATAATATTGGGTGGCTAATTTAGCCATCGGGAAAAAACCTTTTGCAATAGGAATTGGCTGTATATATTCTGTTAAGTTTTCTGCTTGTTGCAGAAAGAATTGTTTATTTCTCGGAAGCGTTGAATAGGCATTTACGCCCTCTTTTTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP051638|1678777:1765604|1711886_1712069_+|WP_017805948.1|DBSCAN-SWA MKYSEFLRYLLEQGCKVENTKRGSHRKVMLNGHQTVFPYHGSQEIGTGLVHKIKKDLKLK >NZ_CP051638|1678777:1765604|1708312_1708645_-|WP_017805944.1|DBSCAN-SWA MFTIQLANKNDFITEVNFDDEVFFLHFSWNDTLSFWTLAIENAYNDELASNIVLLPNRPLIEPIRREALPLGELIIVREDNQQIIGRDDFVSGQATLIYIEVDDELPFFA >NZ_CP051638|1678777:1765604|1755913_1756762_+|WP_103846642.1|DBSCAN-SWA MKKKTLLLFILNPILCYSSEYNFITLNDEFDSYGKFTLLTSSSFYLRNSHEFLRRNIFDIESYNNSYGSEKYQVLSFEQGVRYGLTNKINILGNISGSYSKYSFLSSEEIGKEKSFNKLRFDTINIGLSTKLNDSESGWNKSIYFSVDAISKRANLFKNFYFDYIIDKTIDPIVLSLKTGVKYFSKIKSSNLDFKPSNEISIKPRVDFLVNQKISLSLSTEIQLRSSEKYNGKVTNVSGIENFLSMGISYNLDLKNRLYFETSFNTTGNSGATIYLNLEKDL >NZ_CP051638|1678777:1765604|1752193_1752541_-|WP_035688832.1|DBSCAN-SWA MTTHTNIQIINDHSGVPAFVVIPYPQYIAQQKLSQRDIDLSDAIPSEVVDLALDRNYSALRAWREYLGLTQIEIAKRLGITQAAYSQHEKAKYLRPTTRNKIANALGINPEQLDF >NZ_CP051638|1678777:1765604|1712569_1714828_-|WP_017805950.1|DBSCAN-SWA 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105 | Haemophilus_phage(23.94%) | tRNA,terminase,holin,plate,transposase,capsid,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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