Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP051642 | Avibacterium paragallinarum strain ADL-AP01 chromosome, complete genome | 1 crisprs | PD-DExK,cas3,DinG,DEDDh,cas2,WYL,cas14j | 0 | 1 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP051642_1 | 624152-624278 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP051642_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP051642_1
>1.1|624188|55|NZ_CP051642|CRISPRCasFinder TATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTT |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP051642_1
The CRISPR arrays of NZ_CP051642_1 >merge|NZ_CP051642|1|624152-624278|CRISPRCasFinder GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAATATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTTGGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA >NZ_CP051642|1|1|624152-624278|CRISPRCasFinder GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA TATCTTATCTCTTGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCTTGCCATGGTT GGGGTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAA
>NZ_CP051642.1|WP_035684723.1|623422_623971_+|oligoribonuclease MQLDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKDLNILAEGPVLAIHQPDSLLAKMSDWCKKTHRENGLIERVKQSKLNERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSVAQDKRFLFKYMPDLAEYFHYRYLDVSTLKELASRWSPEILNNFSKKNTHLALDDIRESIAELAYYREHFIKAP >NZ_CP051642.1|WP_035684717.1|622292_623351_-|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA MSKQKLTHNQQRRIKSNNVRALQRHKLKMKKEIEWQDEMLGPTQEGTVVTRYSVHSDVEDEQGQIYRCNLRRTLSNLVVGDKVIWRKGNEQLQGVSGVIEAIHPRKNEITRPDYYDGLKVIAANIDRIIIVSAVVPELSLNIIDRYLVVCENANIPAVILLNKVDLLSEEQRQQVETQLKIYQDIGYQTMMISAKTGKHMQDLTALLSSGTSIFVGQSGVGKSSLINAILPEVNAQVGEVSELSGLGKHTTTSSRLYHLPQGGDLIDSPGIRELGLWHLNANQITKGYREFQYFLGTCKFRDCKHLNDPGCALKEAVEKGKIHPIRFNNYHNLIESLSNIKGNRRFVIQDNG >NZ_CP051642.1|WP_017807274.1|621812_622070_-|phosphocarrier-protein-Hpr MYSKDVEITAPNGLHTRPAAQFVKEAKAFASDITVTSGGKSASAKSLFKLQTLGLTQGTVITISAEGEDEQKAVDHLVALIPTLE >NZ_CP051642.1|WP_035684716.1|619987_621715_-|phosphoenolpyruvate-protein-phosphotransferase-PtsI MISGIPASPGIVFGKALVLKEEKIVLDTQKIQDDQIEAEVERFYAGRNAAVEQLTAIKDRAYASLGEEKAAIFEGHLMILEDEELEEEIIDYLRSNKVNAGVAASTIIAQQVAMLSEIDDEYLKERAGDIQDIGNRLIKNILGMKIVDLGEINEEAILVAYDLTPSETAQLNLDKVLGFITDIGGRTSHTSIMARSLELPAIVGTNTVTQQVNTGDFLILDAVNNQVYINPTQEEIDRLRKLEQQLKEEKEELAKLKDLPALTLDGHRVDVVANIGTIRDIDGAERNGAEGVGLYRTEFLFMDRDQLPTEEEQFIAYKEVVEAMNGRLVVLRTMDIGGDKELPYLNLPKEMNPFLGWRAIRIALDRKEILHAQLRAVLRASAFGKLAVMFPMIISVEEIRALKAEIALLKEQLRNEGKAFDENIQIGVMVETPSAAVNAKFLAKEVDFFSIGTNDLTQYTLAVDRGNELISHLYNPMTPSVLNLIKQVIDASHAEGKWTGMCGELAGDEKATLLLLGMGLDEFSMSAISVPRIKKLIRNVNYQDAKVLADAALEQPTAADIERLVTDFLVEKALN >NZ_CP051642.1|WP_017807272.1|619424_619925_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MGFFDKLFGSKNSKTVEVEIYAPLSGEIVNIEDVPDVVFSEKIVGDGVAIRPTGNKLVAPVDGVVGKIFETNHAFSMESEDGVELFVHFGIDTVELKGEGFIRVADEGQKVKRGDTIIELDLEVLESKAKSVLTPVVISNMDEISHIEKKTGEVIAGESIILILKK >NZ_CP051642.1|WP_035684715.1|616436_619100_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type MSEMLTNDVDPIETNDWLLAIDSVIREEGVERAQFIIEQLMQHARANSVSLPTGVTTDYINTIPTSEEPNYPGNLDLERRIRGAIRWNAIMMVLRASKKDLELGGHMSSFQSSATIYEVCFNHFFKARTEKNGGDLVFFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLDNFRQEVHGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLNAIYQARFLKYLHHRGLKDTADQTVYAFLGDGEMDEVESRGGLAFAAREKLDNLVFVINCNLQRLDGPVTGNGKIIQELEAQFNGCGWEVIKVIWGRRWDRLLQRDTSGKLLQLMMEVVDGDYQTFKSKDGAYVRKHFFGRYPETEALVAEMTDDEIWALNRGGHDPLKVFAAFNKAKQVKDKPVVLLVKTVKGYGMGESAEGKNIAHQVKKMDMSGVKHVRDRFNIAVSDEDIEKLPYIKFEEGSEEYKYLHERRQALNGYVPTRSPRFSQALEVPALEEFAQLFEAQSRPISTTMAFVRSLNVLLKNKSVGKHIVPILADEARTFGMEGLFRQIGIYNPHGQNYTPQDREQVAYYREAIDGQVLQEGINEQGATASWIAAATSYSTNDVPMIPFFVYYSMFGFQRVGDLMWLAGDQRARGFMIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSAVIPNCISYDPAFAFEVPVIIQDGIRRMYGPEQEDVYYYITTLNETYDQPAMPKGAEEGIRKGIYKFETVTGQGKGKVQLLGSGAILRHVREAAQLLANDFGVTSDVYSVPSFTEVARNGADVERWNLLHPEAEARTPYIAQVMNDAPAVAATDYIRLYAEQVRAYVPAQSYRVLGTDGFGRSDSRENLREHFEVNAHYVVVAALAELVKQGIFDKKVVADAIAKYGIDADKINPLYA >NZ_CP051642.1|WP_035684713.1|614486_616385_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase MAKEIQIPDIGGDEVTVTEVMVKAGDTVEVDQSVINVEGDKASMEVPSPEAGVIKEVLVKVGDKVSTGTPMFILESADSAPASAPAVEEKAAPASTAPTQSAVSSVIEIHVPDIGGDEVNVTEILVNVGDSVAEEQSILNVEGDKASMEVPAPVAGVVKEILIKVGDKVSTGSLVMKFETTAATPAAQPAAEAPAAPAAVSGSVQDVHVPDIGGDEVNVTEIMVAVGDSVSEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEILVKSGDKVSTGSLIMRFEVAGSAPAAAPAAQPAATPAQTQAAAPVQSAQPANQAEVTASASFAHATPVVRRLAREFGVNLDKVKGTGRKGRILKEDVQAYVKAAVKAVESDSVSATASTGAANGAGLGLLPWPKVDFSKFGEVEQVELGRIQKISGANLHRNWVMIPHVTQWDKADITDLEQFRKEQNVLAEKQKLDVKITPLVFIMKAVAKALEAYPRFNSSLSEDAQSLILKKYINIGVAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGIIELSRELAEISKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGGTQFTPIVNAPEVAILGVSKSEMTPVWNGKEFTPRLMLPLSLSYDHRVIDGADGARFITFINGVLSDLRRLVM >NZ_CP051642.1|WP_035684710.1|612975_614400_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MNKEIKTQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLDTVIVERYSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKSLAEHGIVFGEPQTDIDKIRGWKEKVINQLTGGLAGMAKMRKVQVVNGYGKFSGPNTIIVAGDEGETTIHFDNAIIAAGSRPIQLPFIPHEDPRIWDSTDALKLKEVPKNLLIMGGGIIGLEMGTVYHALGSNIDVVEMFDQVIPAADKDIVQIYTKRIEKKFNLLLETKVTAVEAKEDGIYVSMEGKAANETRRYDAVLVAIGRTPNGKLIDANVAGVEVDDRGFIHTDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVIAGQKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGKTEKECKAEGINYEVAKFPWAASGRAIASDCADGLTKLIFDKDTHRIIGGAIVGTNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDLALTIHAHPTLHESVGLAAEVFEGSITDLPNPKAKKKK >NZ_CP051642.1|WP_035684708.1|610908_612678_-|autotransporter-outer-membrane-beta-barrel-domain-containing-protein MKTFNLNLVSISLGIAFTVTSINSFAAAANPLYAVNSTGSHSSSLNGSVNGGTSAFLYDNGDKSFNKLMIVDKLQQGAESQDRKDFETTYGIQFEWFEHDGSLTEEGKKHIYQAENGTFKSEVHLTKEEKVKFSAQKGSTADSQPTSNNSEATVHPKESSSIISNNSQPEAEGKSGEIIPTPSEKIETKERVEDASSHTELPKMGSATVIPATPTLKMTEARDTTEKAKPVMEIKAEQNLASATSAFSGTLSDLSQTTRAMATSFFNNTAVVQDQSAMVRNNAQYFVSYRHYFVEPIGIDKSDLRRQPSEMNVTTPNVNTYVDYAYHHYTLKNKNFHSKIHRNDITLGGYAQINGYNLGLAMISMKGNSTTLNNYTLASKVKMRTNGLLATFGWAFDKSYLNLGAYAVFSKVNTSRSPFGNSEQHASFNTQQYALDIVYGRSLYQTENSSILLNGGLTNVYYHQDSFNEQTDSQNATPYSLQVDSSAYFNSFAHLGMQASYQTYISSFTTRSDIALRVEQALTANRFDLKLQDGTTITGSKNDKFTVRLSVGQTFIFDKVSIRVGAEFIEGNRTNARLDTVSATLSYRF >NZ_CP051642.1|WP_035684706.1|609450_610824_+|TolC-family-protein MLKQSKLSLAIGLSVLLAGCANLDDSYKTSQQDFQQYEELTKQYNIQENWWTLYHDPQLNQLVQQALENNKDLAKAAIAVNTALYNANLIGANLVPSFSGSLSSSASKNINTGGNSTISHGGSLNVSYTLDLWRRLADASSAAEWRHAASEQDLEAARISLINSVILTYYQLGYLNDAISTVNKTINYYSEINRIMQNKFRQGVADRASSDQAQQAVLTAHNTLINYQTQKKTAEATLRNLLNLKPNDSLPATYPHILNVKNVGINLNVPLSAIANRPDVKGYQYRLNSAFKDAKAMQKSWFPSITLGGSLGSSGNKIDNAFNTPIAGGTVGISLPFLNWNAVKWNVKISESAYDLALVNFEQSITKALNDIDTNYFIYNQANQSFENLKQTYDYNKRITQYYKNRYDAGISELREWLNAASTERNSELSILNAKYNLIQSENAVYSAMGGYYSVEQ >NZ_CP051642.1|WP_035684725.1|624391_625474_-|peptide-chain-release-factor-1 MKPSIISKLDSLNERHEELEALLGDASVISDQEKFRAYSKEYAQLEDVVKCFARWKQLNSNMEEAQLLLDDPSMREMAQEEVEECKAEIEQVEAQLQILLLPKDPNDEYNCYLEIRAGTGGDEAGIFAGDLFRMYSRYAESKRWRVEMLSANESEQGGYKEVIVKISGENVYGQLKFESGGHRVQRVPKTESQGRIHTSACTVAVMPELPESELPEINPADLRIDTYRSSGAGGQHVNTTDSAVRITHIPTGIVVECQEERSQHKNKAKAMSVLASRIVQAEQEKLAAEQADTRRNLLGSGDRSDKIRTYNYPQGRVTDHRINLTIYRLDEVMNGKMDELIQPIITEYQADQLAALSDQG >NZ_CP051642.1|WP_035684727.1|625677_626967_-|serine--tRNA-ligase MIDPNLLRNNLAEVAEKLKIRRGFELDEARISELEDQRKALQVKTETLQAERNTRSKAIGAAKARGEDIAPLLAEVDNMGIELSMAKSQLDDVQAELQEIALSIPNIPADEVPLGNDENDNVEISRWGEPRTFDFEVKDHVTLGEHLQGLDFAAGVKLSGARFVVMKGQIAKMHRALAQFMLDLHTEQHGYSETYVPYLVNHATLYGTGQLPKFGEDLFHTKPLEGEQPYALIPTAEVPVTNLVRDEILEQAELPIKMTAHTPCFRSEAGSYGRDTRGLIRMHQFDKVEMVQIVEPEKSMEALEELTGHAEKVLQLLNLPYRKVLLCTGDMGFGSAKTYDLEVWVPAQNTYREISSCSNMWDFQARRMQARYRVKGEKKPRLVHTLNGSGLAVGRTLVAVLENYQNADGSITVPEVLRPYMGGLEVIGK >NZ_CP051642.1|WP_035684730.1|627040_628390_-|replication-associated-recombination-protein-A MSNFAFDFAENDFRPLAARMRPTNLEEYYGQRHLIGVGKPLRKAIEAGHIHSMILWGPPGTGKTTLAEIIAQRINAEVERISAVTGGVKEIREAIERAKQNRLTGQRTILFVDEVHRFNKSQQDAFLPYIEDGTVTFIGATTENPSFELNNALLSRAKVYILKPLTPQDIEQVLQRAIQDKEKGLGNEHFVLEDNVLQLLAEYVNGDARLALNSLELMADMAEEGKNGKILHRTLLTEVLGERQARFDKQGDRFYDLISALHKSVRGSSPDAALYWYARILTAGGDPLYVARRLLAIASEDVGNADPRGMQVALAAWDCFTRVGAAEGERAIAQAIVYLAVAPKSNAVYQAFNAAKKMAVESPDYDVPEHLRNAPTKLMKELGYGAEYRYAHNEENAYAAGENYFPEALKETKFYFPTQRGMEIQIGEKLEKLRQLDEKSQIQRYKLVK >NZ_CP051642.1|WP_017806586.1|628577_628937_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MVVKKKWEVIATARFKIWLKEQDEATRISVFNALNNLRFYGPQLSRPYVDTIKGSQYPNMKELRIQHKSKPLRAFFAFDPLRQAIVLCAGNKSNNKQFYKQMITIADAEFTDYLATLEK >NZ_CP051642.1|WP_017806585.1|628938_629247_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTQYTTLDELIAQESPETQQCIKEMSEELILETGLAMIREQLALSQKELAQAIGVSQSAIAQIEQRGNDVKLSTLKRYIEKMGGELSLTVKMPTGYSQIFPL >NZ_CP051642.1|WP_035684733.1|629298_629919_-|outer-membrane-lipoprotein-chaperone-LolA MKKMAVKMTALLCLGLSPLAWADAVSELQARLNKVEALSADYVQKVSDPKGKEIQQGKGKIQIKRPNLFRMDNQAPQESQVISDGKTLWFYDPFVQQVTANWVADAVNNTPFVLLTSNDTQYWKQYNVEQNADTFTLKPKSAKSQIKQFDIRIDGEGVLKNFSTTEKDGQTNLYLLRNITNQPLADSLFKFSVPKGVELDDQRKKK >NZ_CP051642.1|WP_035684736.1|630000_632853_-|DNA-translocase-FtsK MIKRITTNLTPKQYMGELCLGIISLFGLYLIVAWSSYSPFDNTWAVSSSQPETINKAGALGAWLIGLFFTLFGHIGNVIPFILCFVPIYLFKTKKFTQLTAIKAAIRTLGGVILFAGLTTLATLLLSNTSAYLAGGVLGGSLVVSLYPILGKAGLILSALLFTVAGFVLCSGKVLIQLFVRFYYWLTMNEHKTPTMATPEEPQEQSEPVPLEEIIIHKVEPRPEPQQAENTEQSEEAESPKSNQPFIQISGLKELTQPVASDNAPSSAENTENNATLFDPRKMELFSRYDVGQDDSLPNVSLPQSTSAVAPVVQVELVSPQISPPITPQKPELHAISQPANTQSAVSFSEEFLPYEAPNEPELKVSIPDYSVEAYQVTEDFAEPSDEMDDLARQFAAQEQQRLAEMQQRAKEINEEDTLEHILAEQEPASNQPSYKPYGDSLIHPALQKQVSIKEKPTTPLPSLDLLEKRQVEVQEITREEILDTSQRIEQQLRNFNVKATVKDVLVGPVVTRYELELQPGVKASKVTSIDTDLARALMFRSIRVAEVIPGKPYIGIETPNLHRQMVPLRDVLDSPEFRESKSLLSMALGKDISGNPIVVDLAKMPHLLVAGSTGSGKSVGVNTMILSLLFRVKPEEVKFIMIDPKVVELSIYDGIPHLLTEVVTDMKKAANALRWCVDEMERRYQLLSALRVRNIEGYNEKIEEYNAMGMPIPNPIWRPGDTMDAMPPALEKLSYIVVIVDEFADLMMVAGKQIEELIARLAQKARAIGIHLILATQRPSVDVITGLIKANIPSRIAFTVASKIDSRTILDQGGAETLLGRGDMLYSGQGSSDLIRVHGAFMSDDEVARVADDWRARGKPNYIEGILDSAEEEDSDTPRTGDDGELDDLFDEVMNFVIETGTTSASSIQRKFRVGFNRAARIMDQLEEQGIVSPLQNGKREILARRSDY >NZ_CP051642.1|WP_017806582.1|632854_633334_-|leucine-responsive-transcriptional-regulator-Lrp MEKKLPKALDAIDIKILNELQRNGKISNIDLSKKVGLSPTPCLERVKRLEKQGVIMGYRALLNPELLDSPLLVIVEITLVRGKPDVFEEFNDAVQQLDEIQECHLVSGDFDYLLKTRVADMAAYRKLLGTTLLRLPGVNDTRTYVVMEEVKQTNFLQLK >NZ_CP051642.1|WP_035684738.1|633480_634833_-|deoxyguanosinetriphosphate-triphosphohydrolase-family-protein MKNSINPLWLERFINDNPREKDHRPPFRRDRGRILHSAAFRCLQAKTQIHAVGENDFYRTRLTHSLEVAQIGSSLVSQLKFSEAFTHLAQQLNIENAQLQKQLKPLLPSNDLIESLCFAHDIGHPPFGHGGEVALNYMMQSHGGFEGNAQTFRVLTKLEPYTLNAGMNLTRRTLLGVVKYPAILDEVSPQYAELAMPNHSNPFSIKLTDWIPGKGLFREDKAMFDWLLAPLSEADRHLFQTLSSLRETSQQTLKTRYKSLDCSIMELADDIAYGVHDLEDAIVVGVIHLQQWQEALAQLKNSSSPWIREHIDALSEKLFSAHHYERKNAIGALVNYFITNVRWKITADFTEPLLRYNAELPEDVLAVLKVFKDFVLKYVICDVTTQRIEYKGQRMLTEMFQIFESDPERLLPRNTANRWKMASAEQKKRIICDYIAGMSDAYAIKVYQQL >NZ_CP051642.1|WP_035684739.1|634834_635521_-|CidB/LrgB-family-autolysis-modulator MIYAYTLLTIVVFALALQISKRLKSLVFNSFILTVAMLITIVLIFHLPYEDYYQGNAPLNHLLGVSVVALALPLYEQFRQIQAYWKTILFITALSSFFSMCVGAILALLLGAEPEIVATILPKSVTTPIAMEIADNLGGIPSVAAVAVLLAGLQGSMFGYVILKTIRIKHSQAIGLSVGAVSHVLGTVSCMETDPKAGNFSSISLVLCGILSSIFAPFVFKFIYLMVA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP051642_1 | 1.1|624188|55|NZ_CP051642|CRISPRCasFinder | 624188-624242 | 55 | NZ_CP010410 | Xanthomonas sacchari strain R1 plasmid unnamed, complete sequence | 454272-454326 | 10 | 0.818 |
NZ_CP051642_1 | 1.1|624188|55|NZ_CP051642|CRISPRCasFinder | 624188-624242 | 55 | NZ_CP048065 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p9, complete sequence | 33562-33616 | 11 | 0.8 |
NZ_CP051642_1 | 1.1|624188|55|NZ_CP051642|CRISPRCasFinder | 624188-624242 | 55 | CP022016 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence | 202572-202626 | 12 | 0.782 |
NZ_CP051642_1 | 1.1|624188|55|NZ_CP051642|CRISPRCasFinder | 624188-624242 | 55 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 683766-683820 | 18 | 0.673 |
1. spacer 1.1|624188|55|NZ_CP051642|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010410 (Xanthomonas sacchari strain R1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.818
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer gcactgctcccaagcgggaatagctcagttggtagagcgcaaccttgccaaggtt Protospacer ** **.* *************************.*********** ****
2. spacer 1.1|624188|55|NZ_CP051642|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048065 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p9, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.8
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer cctttccagttgcgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccaaggtt Protospacer . *.*. *. .************************************* ****
3. spacer 1.1|624188|55|NZ_CP051642|CRISPRCasFinder matches to CP022016 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.782
tatcttatctcttgcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgccatggtt CRISPR spacer gttgcttgatactgcgggaatagctcagttggtagagcacgaccttgccaaggtc Protospacer * .* * .****************************.********* ***.
4. spacer 1.1|624188|55|NZ_CP051642|CRISPRCasFinder matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 18, identity: 0.673
tatcttatctctt-----------gcgggaatagctcagttggtagagcacaaccttgcc CRISPR spacer -----------ttagaagtaaaaagcggaaatagctcagttggtagagcacaaccttgcc Protospacer ** ****.*******************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
257921 : 279057
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP051642|257921:279057|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP051642|257921:279057|260769_261549_-|WP_035689246.1|DBSCAN-SWA MTTALQTLTNKLAERFEMGSSENLPQTLMATAFRGQNVSPDQMTALLVVANQHGLNPWTNEIYAFPNNGGIVPIVGVDGWSRIMNDHPQFDGIEFTFNDDNSCTCNIYRKDRTRPTTVTEYMIECSRNTQPWKSHPKRMLRHKAMIQCARLAFGFTGIYDQDEAERIVENQKEPLNVTPKPNVIEGQAVELATSEQIDTLNQLIQLTNTDTEKAFAYYSVQSIEQLSKAKAEHFIKTLNGRLDESAQNDNNKASEEVPL >NZ_CP051642|257921:279057|276114_276336_+|WP_017806446.1|DBSCAN-SWA MQNEMKRYAISYFFKGKKWCSDVYANSFEEAQEKVKAMSQATIDGELYCSIYVPVKPQSRIARLLLKLLHKFS >NZ_CP051642|257921:279057|263676_263985_-|WP_046097548.1|DBSCAN-SWA MKIFINLTAKEATPEQKSAGVIDVDPALRHQFNRALTFFSQPSKALIEERAAYLTTMAAQLNADYVLVDAPLFLISTLESKLKARGIQPVYSLYPYSGFVEV >NZ_CP051642|257921:279057|268042_268696_-|WP_017807327.1|DBSCAN-SWA MKKPWNQYVREKMQDQNLKQDDIAEAMNKTQGAIGHWLTGRRNPNVGEVAQMIHLAGVDKVILNSDGTLEDFDPNASFTSVKKSYSYPLISSIQAGTWTEACDFHDSIGYDYIDTEIDAGEDAFFLRISGLSMEPKFSEGDLVLIDIRKRPHPGDFVAAVNGNGEATLKRYRELGEISESGHPHFELVPLNPDFPTLSSMRQDIRIIGVAVEHRSYL 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>NZ_CP051642|257921:279057|276592_276910_+|WP_035660437.1|DBSCAN-SWA MMNIVIERNPASKKYCEKAEIRSMGKAGRLARMFAKSRQKKIKTGKPDRIKTALVMLPIPSKSQIEKAAAQFQAVKPNYHKGEIGVNTVRATQKIRRGCQELMRI >NZ_CP051642|257921:279057|270062_270833_+|WP_046097539.1|DBSCAN-SWA MSRLSMISEQNASIKMSSREIAELCGKQHNHVLRDIRAYVGAILQIERGINVKSLDWSEKEGVELFGHTPIGGVVCQYEVNSQNNQRYPIYYLDKSATLTVISGYNVILRKRIIDRWLELENQQQSTALLPQNYLQALEALVEKERQNQALALENKELKPKAAFVDHYVDVGTSKSLRETAKILNMPEKAMIIRLIEDKALYRQSGNLLPYADKQQQGLFTVKTGTTDHDHNYTQTRVTGKGIEWIAQRYASELML >NZ_CP051642|257921:279057|265323_265545_-|WP_017806446.1|DBSCAN-SWA MQNEMKRYAISYFFKGKKWCSDVYANSFEEAQEKVKAMSQATIDGELYCSIYVPVKPQSRIARLLLKLLHKFS >NZ_CP051642|257921:279057|268833_269040_+|WP_017807328.1|DBSCAN-SWA MNKIAAFRKAANLTQADMAKHLNKTQGAIGHYELGIRQPSIETAKQIVQVLNEHGLTCSLDDVFPVGG >NZ_CP051642|257921:279057|277151_277859_+|WP_051128146.1|DBSCAN-SWA MTKKRFRFTDEHIAFIREHKDLAPKDLIQAFYQQFGLLKNRQVFRKLKKRLGIISTVQHCNRYTKEELAFIKENCTLPQAELTKLFNQKFNRNQTAQVIRVLCAKRGWLTGRNGRFKKGEHLKPIGYERFCPMAKAVLIKTGVKRYERKSRVIWEQAFGKIPQGFVLWFKDGNIQNCELSNLELISRNEMLWRHKLNYHELDSSVKQTFNVFIQLREKLIKLKKQQQQKDRIAKG >NZ_CP051642|257921:279057|266048_266345_+|WP_136711940.1|DBSCAN-SWA MIQIKSTTLFKKWLDELKDLRARAKIQTRIKRLQLGNFGDVKPVGEGISELRITEGKGYRIYLKNQNGVVVILLCAGDKSIQSKDIEKAKLLAKELGV >NZ_CP051642|257921:279057|272424_273060_+|WP_052716788.1|DBSCAN-SWA MASKTRRKTEIHAVKYANGAIVAETDYDRNLLKSLPIGSAVKIVPLSHNRNYQHHKKFFALLDAGFEYWHPEFSVLTQAEEWVAQAVAKEIAIAANDENLYTNITKPIADKVLAKVRSNREAKLDYEGMKTLEAYLDHVMKKAGFYDIKPNQDGGTIKIRWSIAFDRLPQEKFNEVYKGVYGVIWNETLCHIYQNEWELENKINQLIAFGG >NZ_CP051642|257921:279057|269545_269953_-|WP_168939907.1|DBSCAN-SWA MDMSSIFTSVKTTLDLLSGLESNAVLNERVALLKDQIEILRYAHETAQKELSEYKEKCAALENEIASYRQAEQFIFEQGAAFKKTSSGYIEAVYCPNCLTVAGGSFSAFPFQCGKCKWRSMFKVSEFKGIFKSLP >NZ_CP051642|257921:279057|275929_276100_-|WP_017807323.1|DBSCAN-SWA MYFEIFKGVNGQWYWRLKAANHEPIAQSEGYTTKQNCLHCIGLVMDTNRQTPVREV >NZ_CP051642|257921:279057|261559_262501_-|WP_035689276.1|DBSCAN-SWA MEFNLILSTESKVLSTNISTFQQQAENYLAGLSNRFETDDDFAQAKQDIKDLTELEKRTKEAIANAQNGEIKQLIEQAQAMAERFRQARLEREKLVKTKEAEIKASIVNDAFERLAVIKSGFENDVCIALEQVISKATIKKRLDEATKRRSTLATLTKAVNAEETLIGAEIAAEAARLSARRKLIPISYEYLFKDWLNLITGDDDLEPIIQARIADEEKREAKIKAKAEQEAKARAEAKANLNALQTNEKTETNENTAHIEPQTPTQETAATATQFILKIPAQEIPFTGTLEQLREYFAPVKALGITATIVKQ >NZ_CP051642|257921:279057|266782_267556_-|WP_017807325.1|DBSCAN-SWA MIDCQWLHNQIDLHCHKVTSLNGSAGVCVQTNHKWLDGSLLSFYIIPQGEQLLITDDCDTLFHFHTTGLIEHKRSWKKIKDKLNTVHTDIALEDDGEILCITTQEKATYAIADYTSALCGLMHYERELAGIPMQVNHLADEVELYLKAWKPYAKFTRSPKVNGISGHSYTLDFQLDDQLIMAINPTPNAVGSVMRKAGDILSGNDLAGRKMLVVVDDRSDQLFEQKAEEEIQIIASLVKAVPLSRLIEISAKTNQIQ >NZ_CP051642|257921:279057|271659_272316_+|WP_165381618.1|DBSCAN-SWA MQNAMARQAKFPSQPQQKSQRLPNEIEKLVDQIFSQLFAACPAMRGQFDEVQLPITKRTWVLGFAENNIRTIEQVRAGMRKVRSKPDDYFPGVGKFISWCKQDRFEALGLPNEEELYQRLKKFQGYGMLEIHKFQFESDAEYWLLTDLYCDNREATKKELRKAVGEALDSMATRLEAGETLPKPQITLPAKPSFVPPEVQRKINQHGIEKCKAILGMK >NZ_CP051642|257921:279057|278091_279057_+|WP_046097210.1|integrase|DBSCAN-SWA MQKLENPSFSNYFEHWITTYKKGTIQRVTYRKYENSLVKLREYEELNDINDYDKINYQQLINRYAQTHSIQTVKDFNIHLRSCVRELIDEGILLRDFTSKVKITGNPPPVRKKFLEEDELKKLVRALNLDRKELNWDHFIYLLLTTGMRFAEGMGLTPEDFDFDNLTVSINKTYDYKASSIKKNADSSNFTRTKTLSSVRVVRLDFRTAYILRDLIENAPQGKSIWADWYYSNSNAKAIYNTTINDQLKRACKRAGIDPISVHSLRHTHASLLIANEVDMQVVSKRLGHSKTSITQDVYTHLMGTAEQKAQSKINAVMAGI >NZ_CP051642|257921:279057|260140_260773_-|WP_046097549.1|DBSCAN-SWA MIDGLITLDCEQGSEEWLTARLGIPTGTGFKNIVRISGDRSATYIKYLAELVEESILGLPDSRYKSDYMERGNQLEPLARGAYEFLTGNKVQQVGGVYLDEKREVMVSPDGLIPELKKGLEIKCPKMSTHITYIIEGGIPLEYVIQVQANLWVTGYETWDFVSYCPEYQKQPLYLFTVERNQALMEAFDYHIPEFLTALKALKGENQWQA >NZ_CP051642|257921:279057|273060_273345_+|WP_035689367.1|DBSCAN-SWA MNLRKEAKGRECQVRLPGICNFNPETVVLAHYRMAGINGVGQKPDDIFGAWACSSCHDAADFRVKTSYSRDELRLALAEGVFRTQAILRMEGKL >NZ_CP051642|257921:279057|259269_259587_-|WP_051128139.1|DBSCAN-SWA MNTDLLNERAKTHGDFISGAETFYHLMKPIIDSQLFERNKVKAYAATMIAAKLTRICNGDENFPDHWDDIIGYAQLATGKQFEPTSAVSLPFAQHIHPDLGGENI >NZ_CP051642|257921:279057|274020_274383_+|WP_035689371.1|DBSCAN-SWA MRAIDDIHTTAIRYGKWANEGHGLGYPAIEPFLKEAEKWHHGIPVLDDDTALKINACTIKMRAVTPELFQAFMLRFVSGKSINQICQEMDVSDGTVKKYIYAALQSLKLLLTENQCIFIA >NZ_CP051642|257921:279057|270829_271636_+|WP_035689420.1|DBSCAN-SWA MSMLLMVKAMQCKVGNPTRKLVLLKLADNANDEGICFPSYQNIADQCEITRRSAISHIEALIETGFVEKKTRKTPEGNTSNLYVLHLDRDGENSALPSENDSLRVVKNLHHPSENISPTPSENISPRTSHSINQSINHTSSSEKISDGSVGKKSRFKFSDDDMTAAQWIFGLILKLNPNTKTPSFENWANEIRLMRERDKRTHREICGLFQWANQDLFWKTNILSPAKLREKWDQLTVKKNNSKPQRKTASELNAIEWNTEEGWRGML >NZ_CP051642|257921:279057|266345_266636_+|WP_017807324.1|DBSCAN-SWA MMELQDFDIAEHLRSEEEIQLYLNEVLQENDVDLILSALGDIAKARNMSQLAREVGVSREGLYKAFSGKGNPTFSTVLKVMKALNLSFEVKRVTHA >NZ_CP051642|257921:279057|263379_263655_-|WP_035689243.1|DBSCAN-SWA MHDLIKHTIQTLLFLVATIVVLSLAEAYAQTAEDYYAMQGFSTEQLAEMERQANLEWQQEQGDLQPNLTVEAEKYLKNYTALLQEALDNGK >NZ_CP051642|257921:279057|267557_268043_-|WP_017807326.1|DBSCAN-SWA MSRLNEHKFCLNNEEALQFIELLKSYDKDLYWNKGRNIHWRTINFVPNDRDELAGPVPGATVQVDYKYSKRVKESGKLVLTLFKRKQHEKLRAYQLELSDENKISSHDGNTIIKGSHEHIGKQVRKIIPDTEIENIAHWFALFCDKIRLEFTGSKLNLPEE >NZ_CP051642|257921:279057|259673_260153_-|WP_035689249.1|DBSCAN-SWA MAGINKAIIVGNLGNDPEIRTMQNGDQVATISVATSESWTDKQTGERRELTEWHRIVLYRRLAEIAGQYLKKGSKVYVEGRIRTRKWQDQQGIERYTTEIQGDVLQMLDSRQDGQGAQTNAPPRQTQSTKSNAYANAKNGNYTPPAQNNGDELDDDIPF >NZ_CP051642|257921:279057|274627_275632_+|WP_035689374.1|DBSCAN-SWA MVITNETEFLDYISSIIIDEGQKLNSKDFELPNIEFNGYPNLFFNVKGSTYSSTLTTPLLNALSELILEIQKSYCLIKYETSNLQRLTLEDRKNIDIIFKIKEGSSEGESDNTQIANGIFSVIKDGMVGMNGWQKLAVLVTFLGIIGGLGYKWLDNQAIEQATSAATINNAITALSDTNKQAFELLKERGKTEISNEIELHSEQAQAQFFKEVAKDPNAEQATLNQITADRTLLDDYKKRTSKHRTKTPKVDWFMIKGIELYAPQYIETDIDVSVIRESDDTEFTLSTSLTLMSDEELSALKDALGTNNLVKIAYEELKENGKITKSQFVRIEQ >NZ_CP051642|257921:279057|258877_259273_-|WP_051128140.1|DBSCAN-SWA MIIEIPTTKQVNIKYIKLVIPVRYDDEDIPYNFPLRDGDQWCGIIDLDASKIENWPENHPAKMNMKICDEGEYYLLDENKNVISSLINDYIPDCLPNDYGDYIDLHIDEAGKVTNMPNKLIFDQFFGGCSE >NZ_CP051642|257921:279057|265559_265730_+|WP_017807323.1|DBSCAN-SWA MYFEIFKGVNGQWYWRLKAANHEPIAQSEGYTTKQNCLHCIGLVMDTNRQTPVREV |
33 | Mannheimia_phage(44.44%) | integrase | attL 255931:255982|attR 282202:282253 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
285926 : 292406
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP051642|285926:292406|DBSCAN-SWA AATGAAACTTTACGAAATCGCAGAAAGCTACAACAACGTAGCAGAACTCTTAGCTAACCCAGAATTTGCCGAAAATGCGGATATTATCACCGCACTTGATGCCATAGAAGATGAGTTTAACAACAAAGCCATCAACACCATTAAAGCCATTAAACGCGTGGAAGGCGATATTGACTTACTTGATGCCGAAATCAAGCGACTAACGGCAATGAAAAAAGCCCGTCAAAACCGTATTGAGGAAGTGAAAAACTACCTTAAATACAATATGCAAAAAACGGGGATTTTCAAAATCGAAAGCCCGCTGTTCAAAATTGCCTACAGCGAACGAAAACAAAGTGCGGTGGAAATTGACGACAATTTATTCCTTGCCAATAACCTTGATGAAAACCTTGTCAGCGTCAAAATCACCCCGAACAAAACCGCCATTAAAGAGGCGTTGAAACGGGGTGATGATGTGATTGGGGCAAGGTTGGTTGATAGCCAAGTGTTAAGCATTAAATAGGAGTAATCAAATGCAATTTCAAAAAGCAGAACGAAAAAAATCAAAGCTCAGACTTGCCTTAACAGGTCCAAGTGGATCGGGTAAAACTTATGGGGCTTTGCTTGTTGCGAAAGGGCTAGGTGGAAGAATTGCGGTAATTGATACCGAAAAAGGGAGTGCTTCCCTTTATTCTCATTTGGTCGATTTTGATGTGCTAGACCTAGAAGCCCCTTACACCCCTGAACGCTATCGCCAAGCAGTTAGATTAGCCGTTGAAAACGGGTATGATGTCGTAATTATTGATAGCATTACGCACGAATGGTCAGGAGCTGGAGGTTGCCTTGAGTTAAATGACGAAATCGCCAAAGCGAAATTCAAAGGAAATACTTGGAGTGCGTGGAGTGAGACCAAAGCACGCCACCGTGCTTTAATTGATGACTTACTTGCCAGCCCAACTCACATCATTGTTACAATGCGAAGTAAAACTGAGACCGCTCAAGCAGAAATAAATGGTCGCAAGCAGGTTCAAAAACTTGGAATGAAAGCGGAACAAAATGACGGTATTGAGTATGAATTTACTACTGTATTGGATTTAATCCACGACGGCAATTTTGCTCAGCCGAGTAAAGACCGTACAGGCTTATTCCCACCTAATGGAAATCCATTTAAATTATCCGCTGAAATAGGGAAACAGCTTGTAGAGTGGTTGGAAAGCGGTGTTGATTTAACCTTTAAAAGGGCTGAGGTTCACAGAGATAAAATGCTACAAAAAATAACGACTGCAGAAACGCTCGAATTGCTAGGTGAAATGAGTAAATATGTTACTGATAAATTTAAAGATTATCCGATTTTATTAACAGAGTTAGAACAAGCAATTTTAGCTCGCAAAGCGAGTTTAGATAATCAAGGGGGAGAATAATGGCAGGCATAAACAAAGCCATCATCGTCGGCAATTTAGGCAACGATCCAGAAATCCGCACAATGCAAAATGGCGATCAGGTTGCAACAATCAGCGTGGCAACCTCAGAAAGCTGGACTGATAAGCAAACAGGCGAACGGCGAGAACTCACTGAATGGCATCGCATTGTTTTTTACCGCAGACAAGCAGAAATTGCAGGGCAATACTTGCATAAAGGCTCAAAAGTGTATGTTGAAGGACGTATCAGAACCAGAAAATGGCAAGATCAACAAGGCATTGAGCGTTACACCACTGAAATTCAAGGCGATGTATTGCAAATGCTAGACAGTCGCCAAGATGGACAAGGTGCGCAAACAAACGCACCACCACGTCAAACGCAATCGACAAAATCCAATGCTTATGCTAACGCCAAAAACGGTAACTACACACCACCAGTGCAGGGTGGTAATGATGGATTAGATGATGATATTCCATTTTAGGAGAGAGTATGGACAAATTAAAGTTTGCCGACGTAACATTAGTTAATGGAGGTAGAGCGTGGATTAATTTTCACGAAATAGAATGCATTAAAGATTGTTACTATCGCTTTGATGAAGAAACAGATGACATCATAGAAGGTGACAAATGGGAATTTAAAGCAACTAAAGTCATAATGAAAAGTGGGCGTATCTATTATGTAGATTTCACTTTAGACAGTTTCGACGATAAATTCAATCTAGACCAATTTAGATTATAGACAAATCGCCCTTATTTAAGGGCTTTTTTTACGAGGTAAAAAATGAACACAAACGAGCTACTCAACGAACGAGAAAAAACGCACGGCGATTTTATCAGCGGTGCAGAAACCTTTTATCACCTGATGAAGCCAATTATTGATAGTCAGCTATTTGAACGCAACAAAGTCAAAGCCTACGCCGCCACAATGATTGCCGCCAAACTCACCCGAATTTGCAATGGTGATGAAACCTTCCCCGACCACTGGGACGACATCATCGGCTACGCTCAATTAGCCACTGGCAAACAATTTGAGCCACAGCAAGCGGTAAGTGTGCCGGTTGTGGATTATATGAAAAAGCCTAACTCCAACTGTTAGGCTTTTCCGAACAGTTGCGAAGTTATGAATGGGCTTGTTTAAGTAACAAAATTGCTTGTTCTAATATCTTTCCTTTTGAAATACCAAGCTCAACAGCAAGCCTATCTATTTCATCTGAAACAGATTGTGGAATTTTAAAAGACTTCGTTACAATGCCCCGCTTTGCCTCGCTACGAGCATTTATTTCGGTTCTTGACAATGCCATAATTATTCCCTATGATTTGAAGAACTGGGGGACTGGTACTCCCCCAGTAAGTTATCAGATTAATAAACTGGCAAAGACCAGAGTAATAAAACGATAACTAGGATAATACGGATTAACATATTATTATCCTCTTCGTTATCGTGAGGATTAAGCCTCACACTCACTTTCAAGCTATCCCTTGAAAGTGAGATTATTATAATGTATGTTTACATACAAGGCAAGTAATATTTTAAGAAAGCCCGCAATGTTTATTGTGGGCTTTTTATTTGACACTGCCCAAAATCATTTAGGATAACCAAACAGGTCGCATTAAGCGACCTTATTTGTTTCAGCAAACAGCTTAATTCCCTCTGAAACAATCTGCGTTTTAGAAAGCCCCGTTTGGCTGCTAAGCTGAGCTAAAAGAGCGATAGTTTCCTCGTGAAGTTTATAAGATTGCAAACGCACGCCGCGTTTTTTATCGCTTTTTTCTTGCTGTTCTTGACGCGTTAAACCTGATTTAGGACGACCACGAGACATATTAACCTCTTGCATTTAATGAATTAACGGTTTATAGTAGGAGCCATTGGGGGACACTTCCACATATCCCCCGCAGGTTTATCCTAGAATGCTGGCATTGCCACCATTAGCAGGATAATTAGGATTGCGAGCTTCAAACACATATCCTAACTCCTTTTTTGATGCCCGATTTCAGTCGGGCTTCTCATTTTTAGAACCATTCCAAAAACAAGATTATTGTAGTTTATACTTCATAAAGAAGCAAGATTTATTTAGTATTTACTAATTATTTTTTATTTGACACCGCCCAAACTTCGGATTAAGATAACCGCACTTACTTTCCAAAAGCGGTTTCCGCCTCCGATATAAAGCGGTTTTTTTGTACCTAAATTTAGGTTTAATCCGATGAGATCGGGGCGAGAGAACGATATACAATACATCTGAATAAGTTCCGCCCATCTTTTGGAGGGTAAGTTGAACCCCGATCACCACTTAATGATCGGATTAATTACTTAAATCCAAAAGGTACAAAATTATGTCAAACTTACAAATCTTAAATAACTCTATCCGCACTTTGGATAATCTTTATTCATTAAATGATCTTCATCTTGCTAGCGGTAATGATCCAAAACATCGCCCTAGTTTGTTCGTTCGTAATGAGCAGACAAAAGAATTAGTCAAAGAAATTGAAAGTGAAAATACCCGAAGCACAAAAACGATCTTCGCTCTAAAAACCATCAGAGGTGGCAAAGATATTTCTGTTCAAGGCACTTGGGCTTGCGAAGAACTCGTCCTATCCTATGCAATGTGGATAAGCCCGAAATTTCATCTTGTTGTCTTGCGTGCTTTCTTGGCAATGCACAAAGGCGAAGTGAAACAGCAACAACTCGCCTTGCCCGAACCAGAGAAAAAATACACATTCGAGTTCACCGAGTACGAACTCGAACAACTCGCGTGGCTCTGGTTCAGTCACAAACGAATGAACACCCTACTTGCTGACCTTTACGAGCCACTCAACGCCCTTGGCTCAACCTTTAGTGGCACGGTTTACAGCCACGCTCACGAGTACAGACATCACTACGAACACACCCAAGCCACAATGCAACGCCTAATTGAGCCGTTCAAACACTCAACAAAGCTCAACTGGCAACGGGTTATCCCAAGAATTAGCCCAACGCAAAAACAGCTAGGCTTCTAAAAACGCCCCAAAAACCGACCGCACTTCCTCGTGAACCGTGTGGCAGTTTTGCTCAACCAAAATTCAGCAAAAAGGTGAAATTATGTTCAAGATTTTAATGATTATCGGCTTGTTGTGGTGTGCGTTCGAACTCGATTTAAGCTCAGACTGCGATGGGCATTATTGTGGAATAACCACTGATTTAATCACAAAAAATTAACTCAACCCAAGCCTACTTTGTAGGCTTTTTTATTAGGAAACCCTATGGAAAAACTCATCAAATCCCAAACGAGAGTAAGAGCGTTTGGCGAGGTGTACACGCCGCAAAAACTGGTGCAAAAAATGACCGCACTTTTACCCGAAGAGAGCTTTGAGCCTGAAAAGAAAATTCTCGAACCTAGCTGTGGCACGGGGAATTTTTTATATGACATACTCAACCGCAAGCTATGTAAAATCCTCGTAGGTCCAAAGCGTCCTTATTACAAGGTGCTGAATATGTATCAGGCACTAGCGAGCGTGTACGGCGTAGATATTCAACTCGACAACGTGATCGAATGCCAACAACGTTTAAAAAGCCTATTTTGCGAACGCCTCGCAATGCTGCACGTTAAGCCTTTTGACTATTTTGTCGATCACGTCTTAATTAACAACATCAGGCGAGGCAACGCCCTTGAGGACGCATTCACCTTTATTGATGTCGAGATCGTTTTCAAAGATCGTGATATTGGTATTAAGGTAGAGAAAGATAGCTTTTTGCTTAGCGAATATGAATGCCATTTGCAACAGAACACCTCTCAACTCCAAGCCGTGCGATTGCTGGCATTTGAAGATGAGATAGGGATTACCAGAAATGCAACCTAAGGCTAAAAAGCCTATTTTATTGGAGGGAATATGGAGTTTATAAATACAGAAAAAGCTGGAAAGCTCCTTAATATGCATCCAGCAACAGTGAGAGAAAGAGCGAAAAAGAAAGAAATACCCGCTTATAAAATTGGTAAGTATTGGAGGTTTGATCCTAAAGAGCTTGAGTTTTTTGTAAAAAATAGTCAAAATCGCCCCGAACAAGAGATGGGGCATAAGGAGAATTTATGTCGCGTCAAATCATCTCCCTCAAGAAAAGAGGGGAAATCTGGCATTACTCGTACACCTCACCAACGGGTGAGCGGGTACGCCGAAGTTCTCGGACTACCGATAAAACCCAAGCAATGCAATTAGCCTCGAAAGAATATAATGAATGTTGGCGAGTATTTAAACTTGGTGAACGTCCAGAATATTCTTGGCAAGAGGCGGTTATGCAATGGCTTGAAGAAAAGCCGAAACGTAAACAAGATCGCAATATGATTTATGGATTACGTTGGCTGGATCAGTATCTTGGAAATAAAAAATTAAATGAAATCGACCGTAATCTGATTAAATTTATCCAATCTGAAAAAGCAAAAGAGGGGGTTAAAAATAGGACTATTAACGCTATTTTGCAACAGATTAGAGTGATACTCAGAGCGGCAGTTGAATGGGATTGGCTAGATAAATGTCCCGCAATAAAACTCTTGCCCGAACCTAAGCGACGCATTCGTTGGCTGACGGAAAGCGAAGAAATGCGGTTAATGCAAGAATTGCCAGAGCATTTAAAAGCCATTGTACAATTTGCGATTTTAACTGGGTTAAGAATGTCGAATATAACGCAATTAAAATGGTCGCAAATTGATTTACCGAAAAAACTTGCTTGGATAAACTCAGACGAGTCAAAGACGGGAAACAGCATTGGTATTCCGCTCAATGACAAAGCAATTGAAGTTATTGTAGCACAGTTTGGTAAACACAAAGAAAACGTATTTACTTATAAAGGGAAGCCTGTAAGGATTGCAAATACAAAAGCATTCCGTAATGCGTTAAGTCGTGCGGGCATAAAGAATTTCCGGTTCCACGACCTAAGGCATACTTGGGCTACAAGGCATATTATGTCTGGAACACCTTTATATGTATTGCAAGAACTTGGTGGCTGGAGTAAAACAGATACTGTCCGAAAATATGCACACCTATCTGTTGAGCATTTACATAGCCACGTTAACAATGTTCAGCTTTTTGGTACAAAATTGGCACAACACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP051642|285926:292406|286437_287325_+|WP_035688055.1|DBSCAN-SWA MQFQKAERKKSKLRLALTGPSGSGKTYGALLVAKGLGGRIAVIDTEKGSASLYSHLVDFDVLDLEAPYTPERYRQAVRLAVENGYDVVIIDSITHEWSGAGGCLELNDEIAKAKFKGNTWSAWSETKARHRALIDDLLASPTHIIVTMRSKTETAQAEINGRKQVQKLGMKAEQNDGIEYEFTTVLDLIHDGNFAQPSKDRTGLFPPNGNPFKLSAEIGKQLVEWLESGVDLTFKRAEVHRDKMLQKITTAETLELLGEMSKYVTDKFKDYPILLTELEQAILARKASLDNQGGE >NZ_CP051642|285926:292406|291386_292406_+|WP_035688073.1|integrase|DBSCAN-SWA MSRQIISLKKRGEIWHYSYTSPTGERVRRSSRTTDKTQAMQLASKEYNECWRVFKLGERPEYSWQEAVMQWLEEKPKRKQDRNMIYGLRWLDQYLGNKKLNEIDRNLIKFIQSEKAKEGVKNRTINAILQQIRVILRAAVEWDWLDKCPAIKLLPEPKRRIRWLTESEEMRLMQELPEHLKAIVQFAILTGLRMSNITQLKWSQIDLPKKLAWINSDESKTGNSIGIPLNDKAIEVIVAQFGKHKENVFTYKGKPVRIANTKAFRNALSRAGIKNFRFHDLRHTWATRHIMSGTPLYVLQELGGWSKTDTVRKYAHLSVEHLHSHVNNVQLFGTKLAQH >NZ_CP051642|285926:292406|288103_288418_+|WP_035688062.1|DBSCAN-SWA MNTNELLNEREKTHGDFISGAETFYHLMKPIIDSQLFERNKVKAYAATMIAAKLTRICNGDETFPDHWDDIIGYAQLATGKQFEPQQAVSVPVVDYMKKPNSNC >NZ_CP051642|285926:292406|285926_286427_+|WP_035688053.1|DBSCAN-SWA MKLYEIAESYNNVAELLANPEFAENADIITALDAIEDEFNNKAINTIKAIKRVEGDIDLLDAEIKRLTAMKKARQNRIEEVKNYLKYNMQKTGIFKIESPLFKIAYSERKQSAVEIDDNLFLANNLDENLVSVKITPNKTAIKEALKRGDDVIGARLVDSQVLSIK >NZ_CP051642|285926:292406|290562_291159_+|WP_051128099.1|DBSCAN-SWA MEKLIKSQTRVRAFGEVYTPQKLVQKMTALLPEESFEPEKKILEPSCGTGNFLYDILNRKLCKILVGPKRPYYKVLNMYQALASVYGVDIQLDNVIECQQRLKSLFCERLAMLHVKPFDYFVDHVLINNIRRGNALEDAFTFIDVEIVFKDRDIGIKVEKDSFLLSEYECHLQQNTSQLQAVRLLAFEDEIGITRNAT >NZ_CP051642|285926:292406|288932_289142_-|WP_035688068.1|DBSCAN-SWA MSRGRPKSGLTRQEQQEKSDKKRGVRLQSYKLHEETIALLAQLSSQTGLSKTQIVSEGIKLFAETNKVA >NZ_CP051642|285926:292406|288440_288623_-|WP_035688065.1|DBSCAN-SWA MALSRTEINARSEAKRGIVTKSFKIPQSVSDEIDRLAVELGISKGKILEQAILLLKQAHS >NZ_CP051642|285926:292406|287324_287804_+|WP_035688057.1|DBSCAN-SWA MAGINKAIIVGNLGNDPEIRTMQNGDQVATISVATSESWTDKQTGERRELTEWHRIVFYRRQAEIAGQYLHKGSKVYVEGRIRTRKWQDQQGIERYTTEIQGDVLQMLDSRQDGQGAQTNAPPRQTQSTKSNAYANAKNGNYTPPVQGGNDGLDDDIPF >NZ_CP051642|285926:292406|287812_288061_+|WP_035688059.1|DBSCAN-SWA MDKLKFADVTLVNGGRAWINFHEIECIKDCYYRFDEETDDIIEGDKWEFKATKVIMKSGRIYYVDFTLDSFDDKFNLDQFRL >NZ_CP051642|285926:292406|289656_290319_+|WP_035688071.1|DBSCAN-SWA MSNLQILNNSIRTLDNLYSLNDLHLASGNDPKHRPSLFVRNEQTKELVKEIESENTRSTKTIFALKTIRGGKDISVQGTWACEELVLSYAMWISPKFHLVVLRAFLAMHKGEVKQQQLALPEPEKKYTFEFTEYELEQLAWLWFSHKRMNTLLADLYEPLNALGSTFSGTVYSHAHEYRHHYEHTQATMQRLIEPFKHSTKLNWQRVIPRISPTQKQLGF |
10 | Mannheimia_phage(25.0%) | integrase | attL 280895:280910|attR 293403:293418 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1464484 : 1487488
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP051642|1464484:1487488|DBSCAN-SWA TTTAACGTAAGTAATTTACGGTTTTTGTGGGGCTTTGCTCTGTTCTTGGGCTGTTAAAAATCAAGTTTTCGATTTCTTGCTGTATTTTTTTATCTTTAAGCGATTGGGTGTGCTTGGCGATAAAGCTTTCTAGCGTTTGTGCAAGTCGATTGCTAGCAGTACCAAGGTTGAAAGCGGTTTTGTAGTTTTTATGGCTTTCCAAGTCGGAAAATAGCTCCTCTAAACGCTCCCAAGCGGCAACAGAATGATTGATGTAATTCATTGCTTTAGCTAGCATATAGAAATTTTCCATATCTAACGCAAGGCTATTGGGTGGCAATTCTTGCATTGGGTGCATTGAAGCAATGTAAATCATCACATCACGATGATCTTTGCGTTTGATTTGCTCATATTTCGCCACCGCAAATTTATTTTTCACTCTTGCCCAGATTTCGCCATAACTCATTTTTGTGCGTTGATGGGTTGCAGCAACGGCGTTTTGAATAAGGCGTTGTTCTTCGGGGGTGATGGTGTCGTTTTCATTTATTGATAAAACTTTTTCTGCCTTGCCTTTATTCCAATAATCAAACAATGCTTGATAACATTCTCTTTTGTAGGTGATCAAGGTTTCTCTGATTTCAGGTTTCACCCGTTTTACATCAATGCCAAATAGCCAGCCGTTGAGGTATTGGATTGGAAGGCATAATGTTTGTTGTTCACCACCTTGTGAAGGTATGGTTATAATGACCATACCTTGAGAAAGAACTTCATCGCGTTTAATTCTTGCATATTGAGCTTTCCAGTCCAGACCAATATTTTCACAAATTGGCTTCATTGCGACATAATGAACGTTGTTTTGCTCAAATGTAGTTAAAGTGCGGTCGTAAAATTGGATTGTTTGGAGTTGAGTTTGAATTGACATAATAGCCTCTGTAATTTTCGAAATTTTGCTAGCCAATTTAAGGTGTTCTTATAACACGAATACCTTTTGAAATTGGTGATCGAGCGGTTCGAAAGCCTACAGCAGGCTGGAGTTATTTCCCTTGCGGGTATTGTATTCCTCGCCCACTCGATCATAGATTAAAATTACCATTTTTGTCCAAACTTGGCTGAGAAAAGGAGAAACACCAAATTCTAGATACAAAAAAACCGCAATGGATTTAGGTCTTGCGGAACTGACCGCTGTAAGGTTTCGACACCTATCAGACTAATACTAATAAAAAGCCTATTGCTTGTCAATAGGCTATATTGATGTTCGGCAACAGATCACTTTCTACGTCGTTTTCGGCGTTTTTTAGATGAATTGGAACCAAAAATACCTAATATTGATATTGCAACAAACAATACAAAAAACACAATTTTAAATATCCAAACTAGGATAGAAAATATCTTTTTAAATATCTTTTTTTTGCTGCCTTTTCTTTCTGCCAGCCAAACTTCCTTAGGAATAAGATGAAGAACTGGTTTAGTCGGTTCGTTAGACATTTTCGTTATCCTCATCATCTGATTCTGTTATTTCGTTATATTGATTGGATTTTTTCATAGCTTGTGATTGGCGATATTCATTGGCTTCTGCAACCATTGTGAACTCCACTTCACAACCTAATTTTTCAGCAGCTTTTGCAATTTCGGCAAGATCGACCTCAAAAAATTCTTTTTTAGTATTAACTCTATTGACCTGACAATGTGCGAATTTTTTATGTAATGTGTTTTCTAGTTTTGGTGCATCATCTGTCCTAATTAAAGCGTGGACATCAAAAGGGAATGGAACACTGGCATCACCTAATTCTTTAACTCGATCTAACGGTTCTAATCTTCTTGTCATTCCGATTTTATAAACATTTTCCCCAAAAGAACCAATGTTAGAAATGACATATACCGTACCTTGTTTGGTGAGTTGAGCCATTGATATAGCACGTTGAGAGTCTTCTATCGCTTGCTTTAAATCTTGTTCTGCTTGAGCCAGTTTAGCTAATAACTCTTTATTGGTTTTATCTAATTCAAGCAATTTTTTATACTGTGCGATCTCTTTTTGAGCTTCCCTCTCTTTTTGTTCCGCTAGTTTTCTTTGTTTTTCAGCTTCACGTTGAACTTTTTGTTCTTCTCTCATCTCTTCTTGAATACGTTGCTGTTCCTCTTTTTCTCGTTGTTTTTTAAGTTCATATTCAAAGGCTAGGTGTAATTCTTCGTGTTTCAGAGCTAAATAATCTTCGCTAATGAAGATCCGAAATATCACGCCTTGTTTGTTTAACCTTTCAAAGGACTTAGTCATTTTATTCTTGAACAAATCAAAGTTTCGGAAAGAGACATCGTTAATCAATAAATCACATTCTTTGTCAAATGCCGTAAGCATTATAGTTGATATGTTATTCATCATAGTAAAACCATCTTTTTCAGCTGTTTTACCTAGCCCGACGACCCATTCAGCATCGGAATATGTAGCTTGCTCTGATTTTTTTAATTCAGCTTGTTTCTGTTTATTTTCATTCCATTTTTCTTTGAAACGTTTAGAAGAGCGAAATCTGAATTTTGGTGTGTAAGGAGCAATAGTGGAGACTTCTTGAGCGCATTCTGATTGACTGCCCTTAGAAAAGGGTTGTCCTTGATTGTTTTTGAGTTTCTTCCATTTTCTATAGTAAATAACAAATAAGATTAAAAAAATAGGGGAGGATAAAAACCAAATGATTGGTAATGCGGCGTCCATAAATAAACTCCTAAAATGAATGTGGGAATTTATCATACCAAAATTAAGAAACTTTTAAAGTAAGTGAGAACACCTTAATCAGATTGTATTCAACGAGCTTAAAATTGAGCTGGCCAAATTTATCACTGAGATAGCAGCATTAAAACTAACAAAAATTAACTCATTGAAAAAGTGTAGTGCTATGATATACAATAACCGTATTATTAATTAAATTCTTACCTTATGATACTTTCATTTAAGCATAAAGGCTTGGAAAAATTCTATAAAACTGGCTCAACTGCTGGGATTATTGTTGCACATTCGGCTAAATTAAAGCGAATTTTAGCGCGATTAAATAGCTCAAAACAAATACAAGATATGAATATCCCGGGTTGGAATTTGCACCCATTAGCTGGAAACCTAACCAATCATTGGAGTGTTAAGGTAAATGGTAATTGGCGAGTTACGTTTAAACTGGAAAATGGACACGCTGAAATTGTGGATTATCAAGATTATCATTAGGAGATTACGATGAATATGTATTGCCCACCGCACCCAGCAGAAGTTATCAAAGAAGATATTTTACCCGAGTTAGGCTTAACTGTAACACAGGCGGCTAAACAGTTAGGCGTAAACAGGGTAACCTTTTCCCGATTATTAAACGGCAAGTCCGCAATTAGTGCTGAAATGGCTTTACGGCTGCACGCTTGGCTAGGGGAAAATAGCCCTAGTCCAGAGAGCTGGTTACATCAGCAAGCGGATTATGATTTATGGAAAGCCTCACAAAAGCAAACATTTTCGGTTCAGCCTGCTTTTGTAGTATAGCGAATATAAGAAAAGCCTATTGATTATCTATAGGCTTTGAACATATCTATTTTATTGATAATTCAACCAACCTGAAATGGGGTCGGCTAAACTCATCATCGTCCGTGTTTTACGCTTCTTCATTTTCCGCATCTAACAGTGCCTTTCTTTCTTCCATTTCAGCACGCTCCTGCATTAACCGCGTCTCTTCCTGTCCTGAAGCTAAAATTGCGTCAAGTTCTTCGTAAACTTTATCCATACTTTTCACTTCAACGGTTGATTCGACTTGTTGTTTTGGAACTAAATCATAATTTACATTCCCCAAGAATTGCACAAGTCTTGAGTCATACATTCCAACTAAACCGCCCTCAACAAGCATTGTTTTGCCTAGATCTTTAAACCTTTTGTACGCACCGAATAATTGTTTATTTTTTATACTTCCATCTTCATTTTTCGCAGTACAATTATCTGTAAATGTTTGTTCATCAACACCACACAATAGAGCCATTCTTGTTATTGTTGGGAAAGCAACGCCAAGTATATCCATTTTCTTTCCCTCACTGTCTTTTTGAATTAACTCATAGTATTTGAGTTTCCCTTCAACATAATCATTGATCGCAGCCTCCATTTTCTCAATAGCTAAATCTGGATCAAACTTATAGGGACGTCCCCGTTTGGTTTCCCATTGCCCCTCTTCTAATTTGAGTTCCCTCTTCGAAATTGCGGCACTCACTTTTGCTTTACGTTTAACTTTTGTTTTTGCCGTTGTTGCAGCTTCCTTTCTAGTCGCCATATCTATATCCCACTAAATCCAGTTGCTTTTCGCTTCCATCACTTAACACGCTTTTGAATTGACGCAATATATTGTCATCATAGGATTCTTTTGATAGCCTTCTTCGAGTGGATGAAATACGTTGGTTGATTTTATCGACTTGCTTCATCACTAATGACCCCGCTTTAATATCCTCATCGAAATTAGGGTTGAGTTCACGCATTCGATTTACCGCATCAACGAGTTCAGCACTCTCATCACAAAGCATTGATAAGTGCATACTCAGAACCTGAGCTGACGCACCTTTAACTATGGTTTCTGTCAGCCCCTCTAAAAGCTGATTAGCATAATGCTGCACACTGCTATAAATAGCGAGTTGCTCAACACTTCTTGGATCTCGTTCTGGGTAATTCGACATACCCAGCAAATAATCCATTGACACGCCATAGCACAATGATGCCCGAGCAAGAAAATTATGATTAATCGCCGTTTTCGAGGTTTTTCTTTCCATCTTGGAAATCATACTCGTATTAGTATAGCCCATTTCCGCTGCGGCTCTCTCTGGGCTTTTCCTTGCAAGTAAACGCGCACTTAAACAACGTGCACGGATTAAATCAGGATTTAACTTAAAGTTACTAATTTTTTTCGTCATACAACAACCTTACTTAACTAATCCACTTAACCACACTCTCATTTCTAACTTTTTATAAACGACTAAATCAATATTACCGCTCCCGCTTTTCTAATAACTTCACTTTCCGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP051642|1464484:1487488|1467676_1467970_+|WP_026138622.1|DBSCAN-SWA MNMYCPPHPAEVIKEDILPELGLTVTQAAKQLGVNRVTFSRLLNGKSAISAEMALRLHAWLGENSPSPESWLHQQADYDLWKASQKQTFSVQPAFVV >NZ_CP051642|1464484:1487488|1473864_1474326_-|WP_035689204.1|DBSCAN-SWA MKDESPFLYIQKALHTQLSRSREISNFAPAMGKTTTQLGQELNTNYDRNKLGFVDAIHLIALTDSINIVEMIAQAVDHTLMPCPQECKGSLDLLREVVVLSESVGKLCGESANALSDNSDLGQELSAKEREKLTGLINQLLSQLVCLKWELKQ >NZ_CP051642|1464484:1487488|1482751_1483231_+|WP_035689249.1|DBSCAN-SWA MAGINKAIIVGNLGNDPEIRTMQNGDQVATISVATSESWTDKQTGERRELTEWHRIVLYRRLAEIAGQYLKKGSKVYVEGRIRTRKWQDQQGIERYTTEIQGDVLQMLDSRQDGQGAQTNAPPRQTQSTKSNAYANAKNGNYTPPAQNNGDELDDDIPF >NZ_CP051642|1464484:1487488|1486654_1486939_+|WP_035689262.1|DBSCAN-SWA MKVEIARYELNDLVVYAERYALGRSTYAVNDVCSFIKNHYKKLSKNTLNILIKDIQDYCDNRGEVTFREMWKEILGLLEEEYAHWQPLPDEPKS >NZ_CP051642|1464484:1487488|1470813_1471407_-|WP_035689193.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP051642|1464484:1487488|1464484_1465384_-|WP_081637566.1|DBSCAN-SWA MSIQTQLQTIQFYDRTLTTFEQNNVHYVAMKPICENIGLDWKAQYARIKRDEVLSQGMVIITIPSQGGEQQTLCLPIQYLNGWLFGIDVKRVKPEIRETLITYKRECYQALFDYWNKGKAEKVLSINENDTITPEEQRLIQNAVAATHQRTKMSYGEIWARVKNKFAVAKYEQIKRKDHRDVMIYIASMHPMQELPPNSLALDMENFYMLAKAMNYINHSVAAWERLEELFSDLESHKNYKTAFNLGTASNRLAQTLESFIAKHTQSLKDKKIQQEIENLIFNSPRTEQSPTKTVNYLR >NZ_CP051642|1464484:1487488|1478253_1478826_+|WP_168952571.1|DBSCAN-SWA MKKYELTDEYIEIGFVTKIKLYRIKALVAIASIGVSAGDLGGYVEKESNLDQSGNAWVYGDAKVYGDAVVYGDAVVSGDAVVSGDAEVYGNAKVYGDAVVYGNAKVYGNAVVCGDAKVSERSDIVWFSNVGTEYGTLTVFKTKQGVLWATRGCFSGSVEEFLKKSAEVHDEKTKREYQLLIEVAKSRLGE >NZ_CP051642|1464484:1487488|1486345_1486579_+|WP_035689260.1|DBSCAN-SWA MSEWISANEKQPDIGSEVLYYSIENGAGLGLVKAIDYDFINDEGKPYKLLLIYDPNDETEFITSAEYWIPVPQPPKA >NZ_CP051642|1464484:1487488|1482131_1482764_+|WP_046097549.1|DBSCAN-SWA MIDGLITLDCEQGSEEWLTARLGIPTGTGFKNIVRISGDRSATYIKYLAELVEESILGLPDSRYKSDYMERGNQLEPLARGAYEFLTGNKVQQVGGVYLDEKREVMVSPDGLIPELKKGLEIKCPKMSTHITYIIEGGIPLEYVIQVQANLWVTGYETWDFVSYCPEYQKQPLYLFTVERNQALMEAFDYHIPEFLTALKALKGENQWQA >NZ_CP051642|1464484:1487488|1480403_1481345_+|WP_035689276.1|DBSCAN-SWA MEFNLILSTESKVLSTNISTFQQQAENYLAGLSNRFETDDDFAQAKQDIKDLTELEKRTKEAIANAQNGEIKQLIEQAQAMAERFRQARLEREKLVKTKEAEIKASIVNDAFERLAVIKSGFENDVCIALEQVISKATIKKRLDEATKRRSTLATLTKAVNAEETLIGAEIAAEAARLSARRKLIPISYEYLFKDWLNLITGDDDLEPIIQARIADEEKREAKIKAKAEQEAKARAEAKANLNALQTNEKTETNENTAHIEPQTPTQETAATATQFILKIPAQEIPFTGTLEQLREYFAPVKALGITATIVKQ >NZ_CP051642|1464484:1487488|1477174_1477345_-|WP_017807323.1|DBSCAN-SWA MYFEIFKGVNGQWYWRLKAANHEPIAQSEGYTTKQNCLHCIGLVMDTNRQTPVREV |
37 | Mannheimia_phage(52.63%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1678477 : 1765306
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP051642|1678477:1765306|DBSCAN-SWA AATGATGCGTTATGCCCTAAGCCTCGCCGACAAAGCCGAAGCCTTGGGAGAAATCCCCGTGGGGGCGGTACTGGTTGATGAAACGGGGAATATCCTCGCCGAAGGTTGGAATTTATCCATAACCCACAACGACCCCACCGCTCACGCCGAGATTGTTGCCTTGCGTCAAGCGGGAGAAAAACGCCAAAACTACCGCTTACTCAACACCACCCTTTACGTTACCCTCGAGCCTTGCACGATGTGTGCAGGGGCAATTTTACATAGCCGAATCAGACGCTTAGTTTTTGGTGCGAGCGATTTAAAAACAGGGGCGGTGGGTTCACGCTTTCATTTCTTTGACGAGTACAAAATGAACCACAGCGTGGAAATCACCAGCGGCGTATTGCAGGAAGAATGTAGCCAAAAACTCAGCCGTTTTTTCCAAAAACGACGGGAACAAAAAAAACTAGAAAAACAAGTTCATAAAGAAAAAATTTCAGCCCTATAACAACTAGCTATGATTTAGAAGATTAAATCCGATCACTTGCCATTAAATAAAAATGGTCGTGCTTGGTCATAAAAAATCTGCTCTTTACTCAGTTGAGTATTCCCCCCAACCTTTCAAGAGCATTACTATGCTATCTTCTGAATAGAATAAATCCCTTGATAAAACTAATGAAAATCACGACAAATCAAAGTGCGGTTAGTTTTTATGCCATTCCCACTGCCCATTAACGGCGGTTGCTAGCACGTTAAAATCATTAGTGAACAAGGTTAAATTAGCAATTTTGCCTTCGCTAATATCCCCTAAGCGATCGGTAACGCCAATGGCTTTGGCAGGATAATAATTGCACATACGCAAGGTTTCGTCTAATGGAATACCAACGTGTTTCACCGCATTTTCGACCGATTCCATCATCGTGATCGCCGAGCCGCCCAGTGTGCCGTTGGCGTCATAGCATTTGCCATTGCGAACATAAACCGTTTTGCCAACAAAATCAAAAGAATCAATCTCCGCACCAGCTGCGGCGGTTGCGTCCGTAACAATGCACAACTTGTCGCCTTTCACTTTTTTATCGATCTTGATATTATCAAATTCAACGTGCAATCCGTCCACGATAATGCCTGCATAAATATCGCTTTCCAACACCGCGCCGACAACGCCCATTTCACGTCCTGAGCTAATTGGCGACATCGCATTATGCAGATGAGTAGCAAAACTCGCCCCATTTTCAATGGCTTGCTTGGCAATCTCATAAGTGGCATTGGAATGTCCAATAGAAACCACAATGCCTTTTGCGACAAACTCTGCCACATATTGAGCCGTTGGATTTTCTGGAGCAAGGGTGATTTTGCTAATCACTTCCGCATTTTGGCAAAGAAAATCTTTCATTTCCTCGCTAATCGCACGGATATATTCAACCTGATGCACCCCTTTTTTCTCAACGCTCAAATAAGGCCCTTCTAAATGCAAGCCCAACGCCTGATTTTGATGGGTTTTGAGATACTCACGCATCACCACAACGGCTTTTTTCATTCCCTCATCATCGGCGGTGATAAAGGTTGGCAAATAGCTGGTTGTACCTGAACGCAAATTGGTTTCCTGCATAATTTCAAGGGTTTTCACGCTAGTTTCGCCGTTAAACATCACCCCACCACAACCATTTAATTGCAGATCAATGAACCCAGCGGTCAAATTATGACCTTGTAAATCAATCTGTTCTAACTCTGACGGAACATTTTCTTGTGGCACAATGGCGACAATTTTATCGCCCTCCACCACCACAGCTTGCCCGTAAAGCACGGCTTCCGCTGTATAAATTACGCCATTTACTAACGCATAGCTCATTTTTTACCTTCTTTTTATACTACACTGTGAATCGCTTTCGCCTCTAACTCGGTGAAATATTTCACGGTTTTCACTTTCAATTCTTGCGTTGCGGGTTCATCGCATACAAAAATCGCGTGGCGGTGTAATTGCAAGGCACTGATTGTCCAGAAATGGTTTACACTACCCTCCACACCCGCTTGCAAGGCAAGTGCTTTGTTATGCCCAGTGATCAACAACATCACTTCTTCCGCATCAAGCAAGGTCGCCACTCCAATAGTTAAGGCATATTTCGGCACTTTATTTACATCATTATCAAAGAAACGCGAATTAGCGATCAACGTGTCTTCCGTCAAAGTTTTAATGCGAGTACGCGATGCCAAAGAAGAAGCAGGTTCATTAAAGGCAATATGCCCATCAACACCCACTCCGCCCATAAACAAATTGATCTTACCATAAGACTGAATTTTTTCTTCATAACGGCGGCATTCCGCATCAAGATCGGGGGCATTACCGTCTAATAAATTGATGTTTTTTTCTTGAATATCAACGTGATTGAAGAAATTGTTATACATAAAAGAGCGGTAACTTTCAGGGTGATCTTTTGGCAAGCCCACATATTCGTCCATATTGAACGTAACCACATTCTTAAAGCTCACCTCACCCGCTTGATACAATTTAATCAATTCTTTGTAGGTTTCCAACGGCGTTCCCCCCGTTGGCAAGCCCAACACAAAAGGGCGATCTTCCGTTGGTTTAAACGCATTAATGCGATCTGCAATATGACGAGCTGCCCATTTGCTCACCTGAGAAGCGGTTTTGAGTGGAATTAAACGCATAGCAATCTCCTATTTTGTAAAAATTAAAACATTATTCCGAAGAAATATTTCACACTTTGAATTATAAAGTAATATAAACTCCAAAATAAAGTGAATTTAGAGAAAAAAGGCAAAATAGTGAGATACATCACAAAATTAGACTATTTTTGTCAATTCCATAAAACATATACTCAAAAATAACCGCACTTTTACGACAGTGATCGCAAAACCAAACATTTCTACTTTCCATTTTCTTTTTACCTAATAAGCTAAGCCATATCCAAGCCCAATAAGGAAACTAGAATGAAAAAATTCGTTACTTACCTCATCACATTGCTGTTTATACCTAACCTCCTCAGTGCCACTCCACCAGATTTTATGCTGCTTGGCACTTACAGCAACCAAAATGTCGCAGGCTGGGTAATGAGCGAAAAATTAGATGGCGTAAGAGGCTATTGGGACGGTAAACAACTGTTCACTAGACAAAATAAAATCCTCACGCCTCCTGCTTATTTTGTAAAAGACTTTCCACCGTTTGCGATTGATGGCGAACTTTTTACCCAACGCAATGAATTTGAACGCATTTCATCCATTATCCGCTCACAAAAAGATAAAGGCTGGGAAGACATTAAACTCTACGTTTTTGATGTGCCAAATGCGGAGGGCGATCTTTTTGCCCGCCTCGCTGTGCTAGAGCAATACCTCGCTCAGCACCCAAGCAAACACATTACTATTATTCCGCAAATCCCCATTAAAAATCATCAACATATCAAAGAGTTTCTGTATCAAGTTGAAGCACAAAAAGGCGAAGGTATCGTACTACGCAATCCAAACGCCCCTTACGAAAAGAAACGTAGCAACCAAATTTTGAAACTGAAAAGTACTCACGACGAAGAATGTGAAGTCATCGCTCATCATCAAGGAAAGGGGCAATTCACCAACCTCCTAGGTGCAATCACCTGCAAAAACCAGCGTGGCGAATTTCGTATCGGGTCAGGGTTCACCTTAGAAGATCGCCAAAATCCTCCGCCTATCGGCTCAACCATCACCTACAAATATCGAGGATTAACCTCAAAAGGTCTACCTAGATTTGCGACTTATTGGAGAATAAAAAGCGAATAATCTCAAAATTCGTGGTCAGTATGTTTTAAATGAAACTATATTCATTCAATCCCGATCAATTTATGTGTTTGGATGCTCAGTTGCCATTTGGGTTTATTGGGACGCTGGTTGAGCAGCCCTAATTGGGTGATGGTGTGGAGCAAATTCATCTCGCCATTGATTTCACAAGGGGAAAGATAGTAATGGCTTGCTTGAAATATTTACACGAGCACTTCCATCCGAGAAGATAAAAATGGTTCAAAAAAGCACCGCACTTTATTTAATAGAAAAAATCAAACTGAAGCTCTATACCTCGTTTGATTTCAAAATAATACGGCACTAGCCTGCCTCGTCATAGTCGTCGTACTGTCTATGGAGTACAACGCTTTGCCTTATTTTGAACTAAAATGACTATAATCGAACAGCTACTATCATTCAATTTTCTCTTCTGGTAAGATCACTTTATTATAAAAACTGCCATTAATTTGGGTTTTATGCAAATGGTAGAGATGGTATGCCTTAAATGCTTTTTCATCGGGTTGTTGTGGAGTATGCCAAAATTCTTCTAGTGTTCCTTGGTGTGTAATATCAGGAATATTATAATTGGCTAGTCCTAGCGTCATTACAGGCATATTATGAATGAGTGCAGATAGTCCACTCGTACTGTTCAATGTTACCATTGCTTTTCCATATCGAAGTAAAACAGGCATTGGTACATCATAGACGTAGAATACCCGCCCTTGCAGTTCGGGATGTTCAGATAAATAGCATTTAATCACATTTTTATAGCTAATAAACCCGCGATCCATTGGATGATGCTTGATTACCAAACTCAATGACTTTGGAGCATTTTTTACAAAGGAATTCAGTACATAGATTAAAAATGCTTCAACACTATCAAAATCACAATGTACTTTCACTTGGCTATCATCATAAACTTGTAAAGGTAATATATAAAAATCACCTAATTTATTTTGCTCAATTTTGCGAATAAATCGCTTTTCTTTCACATAACGACAAACACGTTTTAGCCCTGAAATAAGCCATAATTTTATATAATAATTGAGGTTATAAACGCGGTGATGTTTATAATGAGGAAACTGTTCTTCCCTATGTCTAGCAACGACATAATATTGGGTGGCTAATTTAGCCATCGGGAAAAAACCTTTTGCAATAGGAATTGGCTGTATATATTCTGTTAAGTTTTCTGCTTGTTGCAGAAAGAATTGTTTATTTCTCGGAAGCGTTGAATAGGCATTTACGCCCTCTTTTTC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105 | Haemophilus_phage(23.94%) | tail,plate,holin,capsid,tRNA,transposase,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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