Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040616 | Campylobacter sp. CFSAN093257 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,WYL,cas14j,cas2,cas1,cas9,csa3 | 0 | 1 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040616_1 | 1536183-1536284 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP040616_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP040616_1
>1.1|1536219|30|NZ_CP040616|CRISPRCasFinder TAGTGATGGTAATTGGCTTGAAAATATAGG |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP040616_1
The CRISPR arrays of NZ_CP040616_1 >merge|NZ_CP040616|1|1536183-1536284|CRISPRCasFinder TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATATAGTGATGGTAATTGGCTTGAAAATATAGGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA >NZ_CP040616|1|1|1536183-1536284|CRISPRCasFinder TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA TAGTGATGGTAATTGGCTTGAAAATATAGG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA
>NZ_CP040616.1|WP_002887719.1|1534871_1536062_+|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MLMSYEESLKILHSHIKTYEKIEKIALTECLGRILAQDIKAPKNQPEFPTSAMDGYAIKFEDQDKPLKILGITPAGTMPQFSVQNGTCVKTFTGSLMSEGSDTLVPVENICIENDTLFIEKKVPQAFAVRAVGENYKKDEILLKKGTKLNYSEIALLAELGFFHISVFIKPIVGVLSSGSEIKDLGEALENPAQIRSSNHIAIANLAKNLNCDTRVFPLLKDDEKATFSTLESALQSCDILVTTGGVSMGDFDFLKKAIKEYEIIIDKADIKPGRHIKIAKANEKFIIALPGFPYSAMVMFNLYAREILNSWLLQPKDYICKAFLQGSYKKKTPYLEFVACNIKFENGRILANLEGKKEGSSAIINNLNNKAALMVAPKECEILENESLVDIIFMP >NZ_CP040616.1|WP_002934784.1|1534421_1534868_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKHFTLYQGSLDISKIYSQWYEFSKDKNCGALLTFCGIVREEGGIEALSFDIYEPLLKKWFDEWQKRVDFDGISLLFAHSIGDVAIHESSYFAGILSKQRKLGLKLLNEFVEDFKASAPIWKYDVINKERIYAKERSTKLCGAGLLKG >NZ_CP040616.1|WP_002779488.1|1534199_1534421_+|MoaD/ThiS-family-protein MVKVEFLGPINKENLELEVKNLKELKEILQKDESLKEWLELCAVSLNDEIIFDENTKLKDGDKIALLPPVCGG >NZ_CP040616.1|WP_002874968.1|1532656_1534198_+|multicopper-oxidase-CueO MNRRNFLKFNALTLASMGVAYANPMHDMHSMHKNHSINHDLDTSFINFAPKNLKLLDPKQFPQGEILKALPLLKNESKEKNIFRATLEIKENHIELIKGKKTLFYTYNGLVPAPKIEVFEGDKLEILVKNKLKEATTIHWHGVPVPPDQDGSPHDPILAGEERIYRFKIPQDSAGTYWYHPHPHYTASKQVFMGLAGAFVIKAKKDALSHLKERDLMISDLRLDENAQIPNNNLNDWLNGREGEFVLINGQFKPQIKLATNERIRIYNATAARYLNLRIQGAKFILVGTDGGLIEKTIYKEELFLSPASRAEVLIDAPKDGNFKLESAYYDRDKMMVKEEPNTLFLANISLKKENVELPKNLKIFKPSEEPKEFKEIIMSEDHMQMHGMMGKSESELKIALASMFLINGKSYDLKRIDLSSKLGVVEDWIVINKSHMDHPFHIHGTQFELISSKLNGKVQKAEFRAFRDTINVRPNEELRLRMKQDFKGLRMYHCHILEHEDLGMMGNLEVKE >NZ_CP040616.1|WP_002868029.1|1531384_1532533_-|carboxynorspermidine-decarboxylase MFYEKIQTPAYILEEDKLRKNCELLASVGEKSGAKVLLALKGFAFSGAMKIVGEYLKGCTCSGLWEAKFAKEYMDKEIHTYSPAFKEDEIGEIASLSHHIVFNSLAQFHKFQAKTQKNSLGLRCNVEFSLAPKELYNPCGRYSRLGIRAKDFENVDLSTIEGLHFHALCEESAGALEAVLKVFEEKFGKWIGQMKWVNFGGGHHITKKGYDVEKLIALCKNFSDKYGVQVYLEPGEAVGWQTGNLVASVVDIIENEKQIAILDTSSEAHMPDTIIMPYTSEVLNARILATRENEKISDLKESEFSYLLTGNTCLAGDVMGEYAFDKKLKIGDKIVFLDQIHYTIVKNTTFNGIRLPNLMLLNVKNELQMIREFSYKDYSLRN >NZ_CP040616.1|WP_002851502.1|1530367_1531081_-|molecular-chaperone-TorD-family-protein MGALMDLEKLRLARSLYYQCLGELFVFSFSEERLSKLQEYLKTMQECLFDENLKSNFDILLKHLDDENSIQAFFKEYDLLFLSLKNSIPTTFSYIEEGFENSNPLLCVRQILVKSKIRRNEKFFKESEDSVGFCLLLMSEFLRQNEDDLAKELFEKVINKSIDEFLGDVFMNKNANLYKEIASIASAFMEFERLCFEVEKPAKINSKKVQNDLSRSEFLRREANKQRRTREKSQGIS >NZ_CP040616.1|WP_002851537.1|1530201_1530393_-|twin-arginine-translocation-signal-domain-containing-protein MKNRREFLKKSAFALGAAGVLGSTTLALAKDEERKDLVKGKSKKKEVLFQRSANWENYYIKAE >NZ_CP040616.1|WP_079263690.1|1527397_1530202_-|formate-dehydrogenase-subunit-alpha MSSVGENIKLTRRSFLKMAALSSLATPLLARSETLREASADELKEAYEGSKKVKTVCTACSVGCGIIAEVQNGVWVRQEIAQDHPVSSGGHCCKGSDMIDMVRSHVRLKYPMKKENGEWKRISYEQALSEIGEKLAAYRKENPESVMFLGSAKLNNEQAYYIRKFAAFFGTNNVDHQARIUHSATVAGVANTFGYGAMTNHLGDIQRSKCIIIIGANPAVNHPVGFRHFLKAKEKGAKLIVVDPRFTKSAAKADIYARIRPGTDIAFMYGMLKIIFDEGLEDTKYLDERVFGIDKIREEAAKWTAEEVENVTGISKELLVQITHEVAKNKPTTLIWAMGLTQHTVGTSNTRLAPIVQMVLGNIGKFGGGVNILRGHDNVQGASDMACLSENLPGYYPLNEATWRYYAKIWGVDYEWLLGNFVSKDWMHKTGLSLARWWAAALNGKDGNDAIDNAGTPLKALVVMGNGITSTAQQVKVKEGLEALELLVLADPFVNEAGIIAERKDGIYLLPAATQFETSGSVTATNRSGQWRFKVVDPLYESMEDQEILFELAKKLGFYEDFTKTLRDEKGEIVWPENATREIAKAVRSIGLNGWSPERLKKHTLYWDKFDEVTLEGKDEVAGEYYGLPWPCWSDKHPGSPVLYNTDIEVAKGGMGFRNNFGLEYEGESLLAKNAPLNSPIDTGYPQITKDNIEKVLGITLSAQEKEKMGSTWSYDDSNIIATKCIEKGIVPYGNAKARAVVWTFKDKIPLHREPLHSPRNDLVQKYPSFEDQKALYRVDTKFVSVQQAKDYSKEFPLNLVTARLVNLNGAGMENRASMYLTRLTPEMFCEINPQLAKEQDIKAGDMIWVHSPEGTKIHVRVKVNPGVAKDMIFLPFHFTGVMQGVDLTHNFPEGTKPYASGESANTVTNYGYDIMCQIPETKGGLCRISKDGK >NZ_CP040616.1|WP_002851264.1|1526759_1527401_-|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MSKVNFANLEKERLKFFCDNERCIDCNGCAVACDEAHELPIHIRRRRVITLNEGIQGKEVSTSISCMHCDDAPCSIVCPVDCFYIRADGIVLHDKEICIGCGYCLYACPFGAPQFPKDSVFGNKGIMDKCTMCAGGPEATNSEKERELYGQNRIAEGKVPVCAAMCSTKALLVGESSKIEEIYHNRLMNRNYGIPNPSESLEWKIAYTGKERL >NZ_CP040616.1|WP_032583972.1|1525830_1526763_-|formate-dehydrogenase-subunit-gamma MRKVFVTLLLSVVSLFAYGSERMGQDTQIWDFHRITNIPNYDTFGKLWTTLQGEYIATIALIAVIAVLSAFALHYMVIGPKQFSHDGKKIYAFTLFERLFHFIAAISWVILVPTGFVMMFGEVFGGGVFVRVCKNLHAFATILFIISIIPMFLCWIKRMLPASYDIRWMMIVGGYLSKVKRPVPAGKFNFGQKSWYYIAVFGGFLMIITGGFMYFLDFNSTAIQGLFGLTHIELLRISAIVHNFLGIVCAVFFGVHIYMAVFAIKGSIHSMISGYKEEEEVYILHSYWYKELSNKKQIEPSFSYDPNVKI >NZ_CP040616.1|WP_002780988.1|1536427_1536859_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MIEDKFMRVLLMFDVPTKSKKEQKLASKFRNNLIKLGYFMLQFSVYMRICKGLSSAKSSIENVKKILPPYGNVRALIITEKQFDKMELLLGGIVFNEKVNNETNLTLFDIDSHGEFKYKNSNNEEIQLNKKQEKYHQQNLFEF >NZ_CP040616.1|WP_002851193.1|1536851_1537742_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSYDEAFKTLLISSNAKLNLELNHLVIKQDENIAKLFLKDINIIVLESLQASLSSALFNAFARHKIILLTCDETHSINGIFTPFLGHFQSAKIAKEQINVSAQKKAILWQKIIKNKILNQAFVLKKHNKIEQSNELINLAKKVSLNDSKNIEAVAAALYFKTLFGTSFSRDELCFENSALNYGYAIIRACIIRAVCISGLLPWLGIKHDNIYNSFALCDDLIEVFRASVDDCVLKLKGESEFLSKDDKRALIGNLQSKINFDGQNYPLNRAINHYVANFKNALLYEDELKIVKFDD >NZ_CP040616.1|WP_100626311.1|1537738_1540693_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MARILAFDIGISSIGWAFSENDELKDCGVRIFTKAENPKTGESLALPRRLARSARKRLARRKARLNHLKHLIANEFKLNYEDYQSFDESLAKAYKGSLISPYELRFRALNELLSKQDFARVILHIAKRRGYDDIKNSDDKEKGAILKAIKQNEEKLANYQSVGEYLYKEYFQKFKENSKEFTNVRNKKESYERCIAQSFLKDELKLIFKKQREFGFSFSKKFEEEVLSVAFYKRALKDFSHLVGNCSFFTDEKRAPKNSPLAFMFVALTRIINLLNNLKNTEGILYTKDDLNALLNEVLKNGTLTYKQTKKLLGLSDDYEFKGEKGTYFIEFKKYKEFIKALGDHSLSQDDLNEIVKDITLIKDEIKLKKALAKYDLNQNQIDSLSKLEFKDHLNISFKALKLITPLMLEGKKYDEACNELNLKVAINEDKKDFLPAFNETYYKDEVTNPVVLRAIKEYRKVLNALLKKYGKVHKINIELAREVGKNYSQRAKIEKEQNENYKAKKDAELECEKLGLKINSKNILKLRLFKEQKEFCAYSGEKIKISDLQDEKMLEIDHIYPYSRSFDDSYMNKVLVFTKQNQEKLNQTPFEAFGNDSAKWQKIEVLAKNLPTKKQKRILDKNYKDKEQKDFKDRNLNDTRYIARLVLNYTKDYLDFLPLSDDENTKLNDTQKGSKVHVEAKSGMLTSALRHTWGFSAKDRNNHLHHAIDAVIIAYANNSIVKAFSDFKKEQESNSAELYAKKISELDYKNKRKFFEPFSGFRQKVLDKIDEIFVSKPERKKPSGALHEETFRKEEEFYQSYGGKEGVLKALELGKIRKVNGKIVKNGDMFRVDIFKHKKTNKFYAVPIYTMDFALKVLPNKAVARSKKGEIKDWILMDENYEFCFSLYKDSLILIQTKDMQEPELVYFNAFTSSTVSLIVSKHDNKFETLSKNQKILFKNANEKEVIAKSIGIQNLKVFEKYIVSALGEVTKAEFRQREDFKK >NZ_CP040616.1|WP_002851320.1|1542361_1543351_-|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MKISYEDAGVSIDNGNTFVEAIKPLVKETFNDNVVGGIGSFAGAFRMPSGFKKPVILGATDGVGTKLRLAIDAKKYDTIGQDLVAMCVNDLICNFATPLFFLDYYATAKLEVEVAKAVVSGIAKGCKMANCALIGGETAEMPGMYAKDDFDLAGFAVGMAEEDEIDRSKFVKNGDILLALSSSGLHSNGYSLARKVLFESLKLKFDDKIEGKNLIDILLEPTRIYVRDFLTLKPYISALAHITGGGLVENLPRVLPRGMGATIRKHHLKTPEIFYTIGQAVEESEMYRSFNMGVGLVMVVDPSNVSKILENSDAFIIGEICINEGIVLE >NZ_CP040616.1|WP_002872138.1|1543411_1544017_+|dephospho-CoA-kinase MKNAFFVTASIACGKSTFIEIANSLDFKSISADKIAHKILDENALELEKIFSPFNLKNLLTKEKKIDRKILGEIVFNNKEAKKILENFTHPKIRAKILEQMQILDKENKAFFVEIPLFFESGAYENLGKVIVIYTPKELSLKRIMQRDKLSLEAAKTRLDSQIDIEEKLKKADFIIKNTNSYADFRQECVKVIQEISKGKM >NZ_CP040616.1|WP_002872139.1|1544013_1544763_+|diaminopimelate-epimerase MKFYKYCASGNDFVITNADRKEDRSALAKELCNRYEGIGGDGFIVILPHEKYDFEWEFYNNDGSRAAMCGNGSRAAAHFAHHINKINPNMSFLTGAEIIKAKVNQDKVEVSLGKIKSVQNTFEELGKTWQLCDTGVPHLVHFCQNLDEFDTILCQKMRQKYNANVNFVKILDENHLKVRTYERGVEDETLACGTGMGACFYLAFLNKKVQNKVKITPKSGEEVGFTYKNEELFFEGKVKYCFEANYNFS >NZ_CP040616.1|WP_002872140.1|1544737_1545469_+|glucosaminidase-domain-containing-protein MKPIIIFLSLFLIPLFADDLKNGFGEEYYKLDIDQKRQIFFIKMNEMFDQSFKKIEQERAFIEAFFKDAYKTGFRTSNQINLEKLITIKNKYRIENLYDFAEYKKRIQKIPKSMGIAQALVESATGTSRFAREANNLFGEWTWGEKGLIPDLRHPDKKHKIKIFDSLQDSVDSYVLNLNRHFAYEKFRDARAKFESEGKEITGLEAIKTLDSYSERKGYYINLITKIIKRYNLEKYDTNSNNT >NZ_CP040616.1|WP_100621812.1|1545465_1546503_-|ATP-binding-protein MKVLNFFYENHPKFEVSYERKNQISKPNIIIKGPRFCGKKTLIFNFLSQFKASEILFLDLYDTRFEKQSLERLADFLNENLQIKILCLYNLDFIPNLEKINIPIILSANIKDLNVNGFEELELDYFDFEEFISVSKKNLPINNLVGLFLQSGRSKFGEKNILLRQSFTLLELEILKYLALNLGQQISISKIFIELKKRLKTSKDSVYQAIKKLENTYVIYTLKHDEKKLQKIYFKDFGLRNNLCISKDFSHLFENLVLSELFKFKEEFFYNKYFNFYSQISKIAYISSPTLDIDLIKLRAKKILPKALELGIFHVIFITLSSEDNFFEQGVKFEVISFDKFSLGF >NZ_CP040616.1|WP_002851546.1|1546567_1547017_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSVTKQLLQMQADAHHLWVKFHNYHWNVKGLQFFSIHEYTEKAYEEMAELFDSCAERVLQLGEKAITCQKVLMENAKSPKVAKDCFTPLEVIELIKQDYEYLLAEFKKLNEAAEKESDTTTAAFAQENIAKYEKSLWMIGATLQGACKM >NZ_CP040616.1|WP_002855462.1|1547146_1548367_-|glucose-6-phosphate-isomerase MLNNTLFFKQSEIHTISSYANRINDEVKSGDIGYYHLIDTSLNLIDESLQFIQDKEYVKNIVLVGMGGSSCGVKALRDMLFNEKSNQRELFILDNTSSHSFNKTLEKIKLEESLFLIISKTGSTIEVVSLFKLLIEHFKLDMQELKKYFVFITDKDSKLHQEGENLGIKCFFIPANVGGRFSILSAVGIVPLCFCGYNAKALLEGAKACFEDFFTHKKDEILQKAYHYCTHKNANINVLFSYSDAFKGFNEWYIQLIAESLGKKQGYKRIGLTPIALIGARDQHSFLQLIMDGPKNKTVTFLKIKDAQKAPIIPDIHFKFLDSLSNKVNLHELLNAQCDATMHALIAENLSVDVIELEKLDAWHAGYLMYYYELFTSTCGVMLGINTYDQPGVEVGKLILKNILNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040616_1 | 1.1|1536219|30|NZ_CP040616|CRISPRCasFinder | 1536219-1536248 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 8023-8052 | 3 | 0.9 |
NZ_CP040616_1 | 1.1|1536219|30|NZ_CP040616|CRISPRCasFinder | 1536219-1536248 | 30 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 869171-869200 | 7 | 0.767 |
NZ_CP040616_1 | 1.1|1536219|30|NZ_CP040616|CRISPRCasFinder | 1536219-1536248 | 30 | MT774377 | CrAssphage cr107_1, complete genome | 30099-30128 | 7 | 0.767 |
1. spacer 1.1|1536219|30|NZ_CP040616|CRISPRCasFinder matches to MN530981 (Campylobacter phage DA10, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tagtgatggtaattggcttgaaaatatagg CRISPR spacer tagcgatggcaattggcttgaaaatataga Protospacer ***.*****.*******************.
2. spacer 1.1|1536219|30|NZ_CP040616|CRISPRCasFinder matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tagtgatggtaattggcttgaaaatatagg CRISPR spacer aagatttggtaattggcttgaaaatctaaa Protospacer ** ******************* **..
3. spacer 1.1|1536219|30|NZ_CP040616|CRISPRCasFinder matches to MT774377 (CrAssphage cr107_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tagtgatggtaattggcttgaaaatatagg CRISPR spacer tagtgacggtaattggattgaaagtgctga Protospacer ******.********* ******.*.. *.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
486627 : 495074
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP040616|486627:495074|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP040616|486627:495074|491981_492365_+|WP_002875081.1|DBSCAN-SWA MSTENIIKEGAILGSLSGSALLGLMVFVLAGIAWHLYKTLHKEAGERTKELISETKNTNVLIREQIAVSRASSDSLVKFIETHCSKTNNKLEAIETDLMRMDERLVKLTQIRNDELRSIFKKKENND >NZ_CP040616|486627:495074|494876_495074_+|WP_002796174.1|DBSCAN-SWA MQTQQVVTKIEIQKVRIPQELLTLSPLEKPKAKNELDILNAYSMLFYKYKQCEIQISKIKELNNE >NZ_CP040616|486627:495074|494539_494959_+|WP_087691850.1|DBSCAN-SWA MFSYIIGDKKLYIALVLMTILAGYFYLRLDSTKAKLEKSQSDLALALKINENNQEKLKELNQIHKTELKALNEANTQKNKVKESVQYVKEYIYKSNENNITKLFNDVVDRLWDANSTSSNQNRNSKSKNSARTTNIKPP >NZ_CP040616|486627:495074|488046_488241_+|WP_002874379.1|DBSCAN-SWA MKEHGCNCNFTKKINRALSYKDYVQSINSADFIAYLDDKKWLLAMDDLLFFCEKRIKDSDYYEG >NZ_CP040616|486627:495074|489947_490886_+|WP_168940553.1|DBSCAN-SWA MANIEQGIKDKEQELEEIKKQIEEALNNNDELKQKNEELKEIKNQIDEALSQEPPADTSELEERKEELENQIAELEQEIAGELINKKEEIEKELEEANQNLEDKNNELEQNEKDKKLITQKVLDITIKTLEALIDTKVSLNGDEEINGNKTFANPILVKVDPTNDNHLTNKIYVDTTLNTKANLNGDNIFNGTNTFNQALTSPTNPTNDNHLTRKWYVDYGGGIKNLGTTGSINLDLRQAQHFILTANAGTSIGIANFGGVGKSGTITINNCQNVVAFNAPFKFRIAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT >NZ_CP040616|486627:495074|492728_494009_+|WP_087704157.1|DBSCAN-SWA MSLEQVINTQNESLNQIISSLQELVLSYKNGNLSLEDVKKLINETIENISNDYIKESELKEKLEALLEELDINANINEESLKEVVLKVVLENQESLKGDKGDPFTYEDFTEEQLENLKGQDGAKGADGKSAYELWLENEENTGKSQDEFLESLKAQTPTKEEIKPIIEEMLEDMKLNLGINGIKVSNSIPTPKTKANVNDLIITYNENVKQLWLCVASDDKYTSWINLLGNENITAQELIIISFDTNLNSGQYGGCLSDLRFGFENSLASTTQIIKGLNEGSFLITKDGMGLKSKNYTEVSVLSKPSKNQIEGNIKTSGIYNDPAWHNITNALKKYDGNANECCLWASNIKNSVSIELFTNEIPMSLFYRQAGYYGNVNLSNIKMQKALRVQNEIIVERSFIGIKKEIDKTTYGDNAFLFEFEEEK >NZ_CP040616|486627:495074|487661_488066_+|WP_002875078.1|DBSCAN-SWA MLCATAKKLIIAKVKNSYKMIEDDEVLKAYFMEAFYYISSKCVPSVLLKNVEQGEKVFRQVRNNHFLIIPDEPDFDNEKEHLMIDETLSFAVINYVCYLITRCEEKDFLALCDKIIYEYIANDGKELDDERTWL >NZ_CP040616|486627:495074|490887_491337_+|WP_002875080.1|DBSCAN-SWA MNCLLLSNNGIALNLPPSLGGSVANYNYMLKLDMIYKQAVVLPSNINNKEVVMLGEVWTTGNMSNKTSANTLHITWNNFNSSVELHALSKYYTANAKIKVEKKFNFGNINNLQIMLSSYQSGSANASAGWNLNDGNRLNPRANLTLYWN >NZ_CP040616|486627:495074|492357_492732_+|WP_004306042.1|DBSCAN-SWA MTKTELKRVCVKPYDKDRFEVIQDYEFILPNYKGIVPQGFKTDGASIPRLFWSLFPPFKSEYFSACVVHDYLCINAKSRDDYRLADLVLKEAMQALEINKFKIFVFYCSCNLFHQIKCLIKGIR >NZ_CP040616|486627:495074|494057_494534_+|WP_052773829.1|DBSCAN-SWA MKVTINRRYTGKTCVIGKFKVLDDEEKILFECFSLERKEEGLESGKNLRIPAGVYDLKRHINSSFNDKGKKEVAGVIVLKEDDSVVNIYNNDVDFERHILIHWGNTYKDTKGCILLGLTKDNNNESVGQSRLACKEFYDLMYGKNLEDIKLEITNELA >NZ_CP040616|486627:495074|486627_487662_+|WP_165433065.1|DBSCAN-SWA MALPSMGHTSPATENVKLKQSVYETIIKIGATETPILNKIGTSKVTNPLTHSWITDTFEEPKKNANLELSKFVGETKNTAQKTTNAIQIFITEAMVSKALLKANQYGGNEMEYQIGKKTKEHKMDMEYALFGLGRDSDVKKSVFKDYVQAQEAISGEMAGLFHYIAKGKDSFSDGKRGNVLAFDETGDWSGTATELTEDKLNQILQTIWNSGVTPKDVFLGADLKGAINKFATRILGNETKLAGQVVSLETDFGTVNFHMHRLLSPKYGLGDVLIAGDFEYMKHGLYIPTMIEDVPTDITAKAKRFYTQSTLEVRNADAFAIGVGLTSGNNAKAKAVLKAAKGA >NZ_CP040616|486627:495074|491349_491985_+|WP_002873428.1|DBSCAN-SWA MFYDLKNKSLKYDDIFLKDVKIQNEEGEIDAQDTYFLSACDDKLLKELGFAKVKEEEIPSFNEKIEELRQIQTYDEENNLYIISYEIKEKALEELKELKLEELKAIKEEKLLFMPFKNTIFQIDTEAKINISGKVSEIMLANLNNTPLENIAWIDKDNKITTFNKEEFLEFGVGIAKYTESIIFKNDELRNKVKNATSLEELNLIAWESEK |
12 | Campylobacter_phage(90.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
636941 : 738255
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP040616|636941:738255|DBSCAN-SWA 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MKLEDIFVYMVLMIVSFIAGLVGIVTKNKLSKALNLKGKFTLFLKGMLGSMFVAYLVFEIVNYLNFGIKLSVAVGGFAAYMGTDALLKIEQLVEKLINKKMEKL |
108 | Campylobacter_phage(43.9%) | protease,integrase,transposase,capsid,plate,tRNA,tail,terminase | attL 689948:689966|attR 724797:724815 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1439135 : 1445771
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP040616|1439135:1445771|DBSCAN-SWA TTCAATTATTGATTAGAAAATGATAATAATCCTCAGGCACACCAATATCTATAAAATAATCATCAAAAATACAAGCCCTAGCCTTTAGTTTTTTATAATTTTCTTGTAAAAACTCTTCAAAAGAAAATTTTTCCTGCAAAGCAAAATCATTAAAAATATCTTTAGTTAAAAGATAAATTCCACCATTGATTAAACCTTGCTTTTTAAATACCTTTTCCTCAAAAGAAATTACAAGATCTTGTTCATCAACATTTACTGTGCCGTATCTATCAAAATCATTCATTTGTTTTAAAGCAAGACAAATTTTACTTTCATTTAGCTTTAATTTACTTAAATCTATGTCAAAAAAAGTATCACCATTTAAAACATAAGCTTCATTTTTTACAAATTTCAAAGTCTCTTTTATGGCTCCGCCTGTTCCTAGAGGCTCTTTTTCGATGCTGTATTTTATTTTTATACCTAAAAACTCATCTTTAAAATACTCTTTTATCACTTCATATTTGTATGATACTGCTAAAATTACTTCTTTTATACCTTGCTTTTTAAGATACTCAAAAATAAATTCTAAAAAAGGCTTATCATTTATCGGTGCCATAGGCTTTGGAATGTCTTTTATAATACTTTTAAGTCTTGTTCCTAAGCCGCCACAAAGTATTATTGCTTGCAAGAAAAACCTTTACCAAAAAGCTCTTCTTCGACAATAGCACAAATAATATGTCCTATTAAAATATGCGCTTCTTGAATTCTTGGCGTGCAAGTTGAAGGCACTTTTATACAATAATCACAAAGTTCATTCATAGCCCCGCCACTAGCTCCACTTAAGCCTATACTTATGATTTCTTTTTGTTTGCAAAACTCTAAAGCTTTTAAGATATTTTTACTATTTCCACTTGTTGAAATGCCTATAAAAACATCTCCCTTAACACCTTGAGCTTGCACTTGTCTAGCAAACAAATTTTCATAACCATAGTCATTACCAATAGCTGTTAATATGCTAGTATCTGTAGTAAGTGCAATACTTGCGATACCGGGTCTATCAAAATAAAACCTACTTACAAATTCCCCTGCAATATGCTGTGCATCTGCAGCACTGCCACCATTTCCTGCTAATAAAGTTTTGTTACCATTTTTATAAGCTTTTATGACTTCTAATGAAGCATTTTTAATAAGAGTTATCAAATTCTCATCTTTTAAAATTTGTTCTTTTACTAAAATAGAATCTGCAAAATGTCCTTTTATATAGGAATTTAAATTCTCCATGATTTAACCCCCTCTTTTGTAAATGAAAAATCTTGCACATAACCTTGCTCTTTTCTTAAAGCTTTGATTAAGTTGTATTTTTTAGTAGGATCTACGAAGAAAAACATAAATCCACCAGCTCCTGCTCCGCTGGTTTTGCCACTATAGGCTCCGTTATCTATAGCAAGTTTATAAATTCTTTCAAGCTCATCATTACTAACGATTTCTGAAATGATTTTTTTTGACCGCCAAGATTTTCCTAAAATTTGCGCCAAAGTACCAAAATCGGCTCTAAATAAAGCTTCTTTCATCTTTATAGCATCTTGTTTTATCGCGTGCATGGCTTCTAAAGATTTTTCATCTCCAAGCTTTCCTTTTTTATGCTCTTCTATATCTTTTGCTTCTCTTGTGATATTTGTAAAATAAAGCACAGTTCTAGCTTCAAGCTCACTAGCTATCCAGTTTTTAATACGCAAAGGATTAACAATGACTCTTTTATTGTTATAAAATTCCATAAAATTAAAACCACCAAAAGTTGCGGCGTATTGATCTTGTGCTCCACCTACTATGCCTAAATCTTCTCTTTCTATCTCATAAGCAAGTTTAGCGATTTCATATTCTCCTAAAGGTAGATTAAGCCATTCTGCAAAGGCTTTTATAACCCCTACAACCAAAGTTGAGCTTCCGCCCAAGCCACTACCACTTGGTACATCCGAATAGGTATGCAAAGAAAAACTCAAAGGTTTTTTTGTAAAATCTTTTACAATGCGATTATAAATACTTTTAAAAATATCTAATTTTCCATCATTTCCTAAGAATTCTTTACTTTCGTACTCACAGTAAGAATTTGTATCAGGAGAATCAAAAATGATTTTTCCATCTTCTCTTTTGATCAAAGTACAATGTATGTATAAAGATATAGTCGCATTTAAAACATAACCTGTATATTTATCACAATATAAATTTATATCAGTCCCACCACCTGCTAGACCGAGACGAAGAGGAGTTTGTGTGCGTATGGTTTTCATAAATCTCCTAATTTATTTATCATATCCAATCAAGTAAAATATTTTGAATATTACATTTATTAATCAATTGCTTTAACTCCCCTATCTTTTTCTCTGAATCATCAAACATATATTCATGTGTTTCACAAGCAATATAATCAATTTTTTTATATATTTTTTTTTCAATAATTTTTTTCATTATCTCAAACTCCATTCCTTCAATATCAAGTTTTAGAAAATAAATCCTTTTATGTTGTGTTAAAATTTCATTTTCGATAAACTCGCATAAATCAATTACTTGAACTTTATATGTTTTTTCCGTCTGACTGTCTTGTACACTTTCAACTATACGATTGCCTTGAGATAGTATCCTATTTCCAAACATAATAAAATCTGTTTCATAATTTCTGTCCGATACTGCTTTTTGAAAAAGTTTTACATTTATATTATTTTCATATTTTTTTCTTAAAAAATAATTTAAATAAATATTTGGCTCAAAGATATAACTTTGCCCGCCACAATGTAAAATAATATCAGTAATTAAGCCTGCATGTCCACCACAATCAATACATACTGGACGATATCCATCCCCCCCCCCATATTTATCGACATAAAGCATCTTGTAAAAAATATCATAATATTGTTTTGGAATTCTGGCATTATCTAATAACAAATTTAATCTACCAAGCCCTTGTGGATCGGCTATAGCACCCTGAATTAAATGCAATGCATTATAAACATTTTCTTGCTTATTCCAATGGTTTAATACTTGCAACTCTGAAATTATCCTTTCTACATCAGCTATTGGTTTCCTAGCTTGCTGATGATTATCAATTTGATAAATCAAGCCATTTAGAGCCTCTTTTAATACTTCCAATTGTTCTTTTTTCATTATTTATCTCCTTTAATTTTAATTAAAATTTGCAAAGCGATTAACTTTCATCATTTTAAACGCTCTTAAAAGCTCTTTAATACCATCTTCTAAAGTATTATCTGGTTTCCAACCTGTAGCCTCTAATTTAGTATTTGAAACCAAATAATCTCTTTTATCTGGATCTTCACCTATGTTGGCTGAATGGATATAAAAATCAGGAATATACTTTTTAATTGTTTCAGCAAGCTGTCTTTTGGTCAAATTTGCAGAACTTAATCCCATGTTATAAGCCTGACCCTTCATCTTATCATAATTCTCAATTCCATGAATAAATCCTTTAACCACATCGCGAACATGAATATAATTGCGTCTAAAATGCTCTTCAAAAAGCACTATAAATTTATCTCTATATGCACGATAAGTAAAATCATTAACAAGTAAATCAAGTCTCATTCTAGGTGAAATTCCAAAAACAGTAGCTAAACGAAAAGTCACACAATTTCCTTTATCGAGCAAATATTGCTCCGCATGCACTTTATCGATCCCATATTCTGAGATAGGACGCAAGGGAGATTCTTCAGTACACATTGCATCTTTTTCTCCTATACCATAACCGCTGTTTGTATTGGGATAAATAAATATTTGAGAAGGACTTGCAAAATCACTTATCATTTTTACGGCTTCATAATTGATCATTTTAGCTAATTTTGGATTTCTTTTACAAAGTGGAGCTCCAACTAAAGCAGCTAGAGGAATAATAATATCAGCTTTTGCTACCTCTTGCCTAATAAGATTTTCATCCATAGCATCACCATTTATAAAAGTAAAATTTTTATTATGAAAACAAGATAAAAGAGAAATTTGATCAAACATCAAATTATCAATCACACAAACTTCATAACCTTTTTCAAGTAAAATCGGCGTTAAAACCGAACCTATATAACCTGCACCACCTGTAATTAAAACTTTTTTTGACATACTTTTCCTTTCGTCTTTGAAAATCAATTTTGTGTTTTATACCATTCATACATCATTTTAATACCATCTTTAAGTTCAATTTTATGCTTCCAACCTAAAGAATGAATTTTTGAGCAATCCATAAGTCTATCCATTGTGCTATCCGGTCTAGAAGTATTGAAAACTAGTTCTCCGCTAAACCCAACTATATTTTTTACCATCAAAGCAACTTCTTTGATTGAATAGTCAATACCTGTCCCTATATTAATATGGGTATTTTTACTTTTTCTATCTTTAATAAGATCTTTAAAATCAATATTTTGCATCGTATAGATAGCTACATCGGCTAGATCGTCACTATGAATAAATTCTCTCCTAACTTTTCCAGTGCCCCAAATTTCTACACTTTTTTTACTAATTCCAAAATTATGCAAATATTCTTTTGCTTCTTCAAAATTATTCATTTTCAAATCTTGAAGGATTTGAGTTATATTACCCTCGCTTAACAATTTTGCTAAATGAAATTTTCTAAGCAATGCGGGTAAGACTCTTGATTTTCCAAAATCAAAATTTGCTTTAGTTCCGTAAAGATTATTTAAAACAAGAGTAATGAAATTAGTACCATATTGAATATTATAACTTTCACACATTATAGCTCCAGCTATTTTGGCTGCACCAAAAGAATAAGCGCCATATTCTAAATCACCTTGAAATAAATATTCCTCTTTCAATGGGTTTTTAGCATTCTCAGGATACATATACCCAGAACCAAAAAATACCAATTTTTTAACATTATTAAGAAATGAATTGTGAATAACATTGTTTTGAATCATCAAATTTTCATAAATAAAATCAGCCCTTTGAGCGACATTTGCAGCACCACAAGGTAAGACTGCAGTCAAAAAAACATATTCTGGCTTTTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP040616|1439135:1445771|1442290_1443232_-|WP_002858299.1|DBSCAN-SWA MSKKVLITGGAGYIGSVLTPILLEKGYEVCVIDNLMFDQISLLSCFHNKNFTFINGDAMDENLIRQEVAKADIIIPLAALVGAPLCKRNPKLAKMINYEAVKMISDFASPSQIFIYPNTNSGYGIGEKDAMCTEESPLRPISEYGIDKVHAEQYLLDKGNCVTFRLATVFGISPRMRLDLLVNDFTYRAYRDKFIVLFEEHFRRNYIHVRDVVKGFIHGIENYDKMKGQAYNMGLSSANLTKRQLAETIKKYIPDFYIHSANIGEDPDKRDYLVSNTKLEATGWKPDNTLEDGIKELLRAFKMMKVNRFANFN >NZ_CP040616|1439135:1445771|1439135_1439801_-|WP_002857908.1|DBSCAN-SWA MQAIILCGGLGTRLKSIIKDIPKPMAPINDKPFLEFIFEYLKKQGIKEVILAVSYKYEVIKEYFKDEFLGIKIKYSIEKEPLGTGGAIKETLKFVKNEAYVLNGDTFFDIDLSKLKLNESKICLALKQMNDFDRYGTVNVDEQDLVISFEEKVFKKQGLINGGIYLLTKDIFNDFALQEKFSFEEFLQENYKKLKARACIFDDYFIDIGVPEDYYHFLINN >NZ_CP040616|1439135:1445771|1441420_1442272_-|WP_002857889.1|DBSCAN-SWA MKKEQLEVLKEALNGLIYQIDNHQQARKPIADVERIISELQVLNHWNKQENVYNALHLIQGAIADPQGLGRLNLLLDNARIPKQYYDIFYKMLYVDKYGGGDGYRPVCIDCGGHAGLITDIILHCGGQSYIFEPNIYLNYFLRKKYENNINVKLFQKAVSDRNYETDFIMFGNRILSQGNRIVESVQDSQTEKTYKVQVIDLCEFIENEILTQHKRIYFLKLDIEGMEFEIMKKIIEKKIYKKIDYIACETHEYMFDDSEKKIGELKQLINKCNIQNILLDWI >NZ_CP040616|1439135:1445771|1439788_1440394_-|WP_002857991.1|DBSCAN-SWA MENLNSYIKGHFADSILVKEQILKDENLITLIKNASLEVIKAYKNGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALTTDTSILTAIGNDYGYENLFARQVQAQGVKGDVFIGISTSGNSKNILKALEFCKQKEIISIGLSGASGGAMNELCDYCIKVPSTCTPRIQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGFSCKQ >NZ_CP040616|1439135:1445771|1440381_1441401_-|WP_002858413.1|DBSCAN-SWA MKTIRTQTPLRLGLAGGGTDINLYCDKYTGYVLNATISLYIHCTLIKREDGKIIFDSPDTNSYCEYESKEFLGNDGKLDIFKSIYNRIVKDFTKKPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGVIKAFAEWLNLPLGEYEIAKLAYEIEREDLGIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYNNKRVIVNPLRIKNWIASELEARTVLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDEKSLEAMHAIKQDAIKMKEALFRADFGTLAQILGKSWRSKKIISEIVSNDELERIYKLAIDNGAYSGKTSGAGAGGFMFFFVDPTKKYNLIKALRKEQGYVQDFSFTKEGVKSWRI >NZ_CP040616|1439135:1445771|1445225_1445771_-|WP_002858190.1|DBSCAN-SWA MAIEFDIQESKILKGVYIITPNKFRDLRGEIWTAFTDEYLSKLVPDGIKFKHDKFINSHFNVLRGIHGDVKTYKLVTCVYGEVHQVVVDCRKDSPTYLKWEKFIISYKNQQLILLPPNMGNSHYVSSKEAVYYYKLAYEGEYMDAPDQFTYAWNDERIGIDWPTNTPILSDRDILATKNKG >NZ_CP040616|1439135:1445771|1444295_1445222_-|WP_002852387.1|DBSCAN-SWA MEKLLKELNNNIKLSNQLSYQILMSNIISNLDIDKKDKEILLLLLQARDRNYIRINNNEQCYQNIINYLNLIRPLELPLCDLLRIGGNGDGGYVMYNGGGDMSDINAKALSLGVSDSSPWDLEMAQRGFKVIEYDASIEKCPYDHENIVFHKKFIGNVNNENTITLVQALKDNNLDESKPNILQCDIENCEWDMLENIDISILNKYFSQVIFEFHGCNPEEQDGVEKRISLLKKLNEYFVPMHTHFHNHGKIFYSQGLFFSTTLEVSYLRKNLINLDIMKYRDVAGGFKNLDFPWISNPEIPIRFRGY >NZ_CP040616|1439135:1445771|1443255_1444296_-|WP_002864205.1|DBSCAN-SWA MQTNSKIYIAGHKGTAGTALVENLQKRGFNNLVLKTRQELDLVNQQAVAKFFKEEKPEYVFLTAVLPCGAANVAQRADFIYENLMIQNNVIHNSFLNNVKKLVFFGSGYMYPENAKNPLKEEYLFQGDLEYGAYSFGAAKIAGAIMCESYNIQYGTNFITLVLNNLYGTKANFDFGKSRVLPALLRKFHLAKLLSEGNITQILQDLKMNNFEEAKEYLHNFGISKKSVEIWGTGKVRREFIHSDDLADVAIYTMQNIDFKDLIKDRKSKNTHINIGTGIDYSIKEVALMVKNIVGFSGELVFNTSRPDSTMDRLMDCSKIHSLGWKHKIELKDGIKMMYEWYKTQN |
8 | Tupanvirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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