Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP050412 | Acinetobacter baumannii strain PM192696 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 8 | 0 |
NZ_CP050414 | Acinetobacter baumannii strain PM192696 plasmid pPM192696_2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP050413 | Acinetobacter baumannii strain PM192696 plasmid pPM192696_1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP050412_1 | 2305915-2306000 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP050412_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP050412_1
>1.1|2305938|40|NZ_CP050412|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP050412_1
The CRISPR arrays of NZ_CP050412_1 >merge|NZ_CP050412|1|2305915-2306000|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP050412|1|1|2305915-2306000|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP050412.1|WP_000795915.1|2304677_2304914_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP050412.1|WP_001124846.1|2303783_2304395_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP050412.1|WP_000885229.1|2303101_2303713_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP050412.1|WP_000376215.1|2302489_2302945_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP050412.1|WP_001990047.1|2300784_2302431_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP050412.1|WP_000115408.1|2297154_2300619_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP050412.1|WP_000107128.1|2296198_2297158_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP050412.1|WP_001025680.1|2295770_2296055_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP050412.1|WP_002017921.1|2295547_2295661_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP050412.1|WP_000937460.1|2294823_2295459_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP050412.1|WP_000983628.1|2306631_2307045_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP050412.1|WP_000432330.1|2307186_2308065_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP050412.1|WP_001990041.1|2308121_2310266_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP050412.1|WP_001145693.1|2310320_2311730_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP050412.1|WP_000482091.1|2312045_2312525_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP050412.1|WP_000108365.1|2312809_2313031_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP050412.1|WP_163050434.1|2313136_2313454_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFQDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP050412.1|WP_000498477.1|2313538_2313760_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP050412.1|WP_001136759.1|2313847_2314276_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP050412.1|WP_000251637.1|2314545_2314689_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1152498 : 1167295
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP050412|1152498:1167295|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1514688 : 1564185
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP050412|1514688:1564185|DBSCAN-SWA 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65 | Acinetobacter_phage(98.31%) | integrase,terminase,capsid,transposase | attL 1514511:1514528|attR 1564693:1564710 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2515930 : 2531561
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP050412|2515930:2531561|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP050412|2515930:2531561|2517208_2517757_-|WP_000381220.1|DBSCAN-SWA MDTRVLYIVAVVVAAVSGGYYYYSGKAKKLDIGSAKNMTYSAQGVHLTQTDDKGNLYIRAEVRQLEQDMQQKTSKLDQLNATMYKLGKVDATFFAKQAYGYDDNQKVVLSGDVVATKLAPQGTIEFQTDELTGYPKTRDIETNHQVTVQSPQGEFVSKGLKANLNNGQYEFFNIRGKYAPKS >NZ_CP050412|2515930:2531561|2516676_2517225_-|WP_000554244.1|DBSCAN-SWA MHQSLNLKRSSAFLKQAAVITFVALSSASTFALPSDRNQQISLVADRATYNEKTGLTTYTGNVVIEQGTMKLQADSIVATLNSKREIQTITAKGRPSKFQQQISADKGIARGEGQTIVYNADTGIITLSGGAYLYQDGSSIRGNTLKYSMNKGDVEAQGSSSNRVQIIIPPSSSKSFPGARD >NZ_CP050412|2515930:2531561|2528043_2528823_-|WP_063963412.1|DBSCAN-SWA MTQLFFQAKNFVSKRSLPKLSNVDDLLPNLEYEAYGHWVFENTSASLTDKVNNRLLTLQTGATVQPVYSESGVTISTAVGNALVSDLSDTSTQSVTETAVVKCNNTQLAILLGNLVPSNSTTSSGLAGFASAGKGYLTVKPTAAAGSGGISSLALASGHNQTTNFFIAISVDKATKKGIIYVQQNSAELTNEAVYTAPVYESALNNFAFGNNAYTGSNNPANTATFAEAIIFDKALTLDEIKAVATRSKNRMANRGIIF >NZ_CP050412|2515930:2531561|2522345_2522543_-|WP_057694618.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP050412|2515930:2531561|2527580_2528003_-|WP_000792725.1|DBSCAN-SWA MKNLEAVQEALTWLGTPYHHQGRIKGVGVDCGTLICEVYEKVGLMDHLDPRPYPPDWHMHQMGQRYLELILGVCDPIEGPPQPGDIVLYHFGKCISHGAIVIEWPQVIHSYIHQGVIIQDGTKGSLARRIAGFFRMKRLK >NZ_CP050412|2515930:2531561|2528825_2530643_-|WP_000290422.1|DBSCAN-SWA MAVPDKDALIGPTVTEAQFKTNLGAIVDFIKPIESQSPNYATTALLTASRPVKNQSYAKALDTGKVWYWNKPAGSPEGNYWVETELSDLDQAITYTDGQFNLAIKRAVFETLSQLFGLAKSDDPTKIGVLLDGVGRILLGYDLEKDTGIYAGMLEQVVEIVPGLKIYNDGRYLGLLADSERRILIGYDMLNDLPIIAGLDELINGAGGINKKPEVKAYNHLLFYGQSLSVGATATTILSTSQPYSNKTFSTGPRMDSAATSVIPLVEQFNNPSSDGYDNRGETCCSGAANYASRAMMLENGIDPKDHVIFASTAGHGGYRIDQLEKGADWYNFFIEHVSEAKRLNGEDYKVQVVCWVQGENDAESSVQTSYEVYRQKLLKLQSDASADIKAITGQTDEVKFITYQMSYAARTWEKQALVQLHLCQQSDKFLMATPMYHMPYAIDNIHLTNVGYKWLSAYFGRAYKQLVVDNRKPDFINPKVAQLIGDEIHINFDVPKVPLVLDTTTLALTTDHGFKVLVNGSKATISNIATQEDKVILKISEPPTGEVKVRYALDYLGTGINLTGGASGNLRDSTTDSIEIAGVERPLYHVCPHFELNAFTDKGI >NZ_CP050412|2515930:2531561|2522779_2523958_+|WP_101673069.1|DBSCAN-SWA 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16 | Acinetobacter_phage(33.33%) | integrase,tRNA | attL 2516820:2516833|attR 2533490:2533503 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2539415 : 2559692
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP050412|2539415:2559692|DBSCAN-SWA 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32 | Acinetobacter_phage(66.67%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2689766 : 2718440
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP050412|2689766:2718440|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2722398 : 2734746
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP050412|2722398:2734746|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2970232 : 2979862
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP050412|2970232:2979862|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP050412|2970232:2979862|2978704_2979862_-|WP_000947475.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDAQVKSLKPKESRYSVADGEGLNISVFPNGKKKWVLSYRQNGKQNQKMLGEYPIMGCKEARQLARQLKLEYQGKVANSPPVHKVVEEWLSIMKSQWTSKKYYDTVEYRLAYLTEDFKNLPINEVERKHISKKIKEIVAKGTLETASRALRLGKQVFDFAIASDYTDRNPCTLVEDVIPEYESDSHPCLPVSEMPEFFKRMKASHSSSIVKMAMLLVCYTGTRITELLKARWDTGEIDFENKVWIIPAERMKKRKELMVPLVPQIYALFKELESVKTDDGYIFKKRGKPYEHMTSESVLTMIKRMGYTDKMVTHGFRSLFSTHANESKLFRGEVIDYQIAHVNKTTKADKTSKIYNRAEYWDERVELMTWYANEVENWIGTNS >NZ_CP050412|2970232:2979862|2974632_2975169_+|WP_000609004.1|DBSCAN-SWA MINLANQREALIAEVEVFKKDSMELWFVPDLAASYTNRDFFSYSIIEDNQVFFMIEQTRQLWEFWNKAKDHNLPKGSVLIVEDQIKTMWQDNEEPENCVNKEKDFNCLGDCLDIEDIISITKQRYAYISAEKVYGTWVAKFEAGELKKDYFFVGSQKECEEIVESNKALYSSRMGANS >NZ_CP050412|2970232:2979862|2977823_2978708_-|WP_001076477.1|DBSCAN-SWA MNQSLFVGFWNINLSPPIGNRWNKSKVDKKIKVSRVIQGLLKLDFDFLCLCEVSPEDMEFIDNSIQLIGMGYDYNIYRKNYGGLYFDTCVIFKNTFDFVQSKVEVDGEEKNKLKVFQKYEFLSGHLEERIIFYVTHWLSQLNDNKEKRRTVASFIKKDTNDEKKFFNKTKFVVLGDFNVEPYDSAILEGLRSTRDQKVISNNSSLFYNPFWKFLQIKEDQPSGTHHCTKNEFHHWHIYDQILVSGNFFRDGWNLDDNLVLVFDDKMISSLHNDSFSNPSDHLPICLKLEKTKCI >NZ_CP050412|2970232:2979862|2975877_2976093_+|WP_001292077.1|DBSCAN-SWA MSELEILESAPKDATHYFLVPNGSGEPYYVLEKEKKFYWFHGQDEITKPHILSWIKSIESLKEVKAESQEI >NZ_CP050412|2970232:2979862|2972307_2972988_+|WP_000644001.1|DBSCAN-SWA MKAIILDTETNKLNGYPIEIAYAPFSLENGQLLVHKDEVFNRFYSCPEPIDLEAMAVHNIIETDIEGQPSCESFRLPEGVEFIVGHNIDYDIKALNKCGPAIKVKTICTLALARDVWPDLTSHKLAVLYYFVMSNREEARKHLRHAHSARADVYFTGIILIALIERLGIKDLNSLFLMSEAVRLPKIMTWGKHKGTPLKELPRPYISWLLNKEDLDPHLRKALQNI >NZ_CP050412|2970232:2979862|2976093_2976264_+|WP_000119264.1|DBSCAN-SWA MSWYSLRQLAKELGMAPNTFKKYYLEKFPPDRESKTYKGWTSQSVAKIKVEIQGAK >NZ_CP050412|2970232:2979862|2974169_2974460_+|WP_000986115.1|DBSCAN-SWA MMRNIPDSMSFPFTVWMCENGYYPSHKNGFIILKRGKEVAKISMNETKDGYPMNDICQKKFASFCRAWMNRDKHFIEQLRLRGLARLNQKSYQMVA >NZ_CP050412|2970232:2979862|2975671_2975881_+|WP_000028957.1|DBSCAN-SWA MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG >NZ_CP050412|2970232:2979862|2971120_2971381_+|WP_000350172.1|DBSCAN-SWA MDHYKDKVIDEQGLISVSEALRAMACGRVIQCSSKDFPNWKDMEITNINAKNLIDEERINKNGLKYRYKPSQMSVNAELTQMKKPQ >NZ_CP050412|2970232:2979862|2971765_2972137_+|WP_001260063.1|DBSCAN-SWA MRTNYLRGSKRYENNLNGQVNHKSTFREFVGKDEERGLYKVRLGYTVYAANPTLTRVYTVNENNELTPVSQYTLNTNEWILRNLETEIKYRRGRELGQILQKTHIPSPDRKAYKIRRGFLGTR >NZ_CP050412|2970232:2979862|2973000_2974029_+|WP_000805214.1|DBSCAN-SWA MKPTLFTPETWAEFTQQLKNSWENDNAGTDSPIFVVQSKNIVWGLDPASDSVEITNIVDVDQESKYKSVEEFFDSLKAAEKHDLNGLAIDEEDELFLDVKASTQINILSDWNERNIHICHGKYFWEDVNCHLTRSAADAFIKRKSHDFGELRVFVKSLYWCEEFKNLLNAIISGEVGLTSIDDDNILNVLGPIEPKADKEINSTQAKKSAKKANNKEENWTRYHNDKPVESPLAGLIEKLKKTKTADAANSLIEETKDWASEDQKSFLTELNKHLVIIAGQSKENISISERVKRATDLTTLDAIEIDISEADERIQEPLMELVIKRRKELEVENNFLLESPQ >NZ_CP050412|2970232:2979862|2976270_2977263_-|WP_000527288.1|DBSCAN-SWA MGNKYYDQLVNNDSHFEITFNDFEEFITFIRPDKLHVKDLMTQLRLEFNPSAVNFPFFKIKDFKGYSTLDKSIIYRGHGESDWDLKPTFYRNKKNIGWVKTNWSVDQNYESEILLKFQDSCDLAGVQLPSDNDQLRRRQKNKLSKYRKSFGRDQLDWFDDDFFELAVYAQHYGVETRLLDWTKNPFVASYFACSHALKMNYDPNSKFCIWVLNSESITNELNQVLEVLDPPKGLNQHISHQQGVLTYTKNHIKIFNKFGTRPCLKDILKYYESGYRLLKITLGYELIVELFNYCNIHNFNACHLFRGANGAAMHTTDLLNFDDYKYPIED >NZ_CP050412|2970232:2979862|2974460_2974640_+|WP_000464381.1|DBSCAN-SWA MFEVKTAVQFDDDDVWIGSVLISKCGGNDEWTAYLDNDVEKEFETLEQAVTYCLEQAND >NZ_CP050412|2970232:2979862|2975165_2975675_+|WP_000578497.1|DBSCAN-SWA MIFYDRAFFEENFKKTETFKQESNIRKNDILVFSETMNGYFNIVTNKAWLLWKKEMQAHADWYKNDDPIAYKWAKDGSPEYEADFYTSAKAWAAAKAQAGPTWISVKDEEPPTDIMVLICWDDAPDVTPEQDYITIDEDLNSVWANYYNDPPSHWMHFHSVPNVSGAEQ >NZ_CP050412|2970232:2979862|2971439_2971769_+|WP_001072362.1|DBSCAN-SWA MNQKYINSQSAPSTPICFVPELSGNKTNKPATSKLYQHPSAEDLKFKKDSKWPYVLCFLIFSALAIAFLYACDAEAQVREQKTQHWQQQFNSGEPVDVQVHVVKLGGAQ >NZ_CP050412|2970232:2979862|2977377_2977833_-|WP_000549863.1|DBSCAN-SWA MHLDLSLAVEEGMQSSVTRDKSIEEIDNVLFEVDQAVKKATNNKVEFGWRKKGFNTLGLLTGLTSLPITDVKIESQEPESRVLYVSATDDKTQRFDITILVISPDGFPCEMNVNGNKLISHDAESLLEQFKPLLSSAFVGDKIRKLMKKGA >NZ_CP050412|2970232:2979862|2970232_2971036_+|WP_001290758.1|DBSCAN-SWA MSEKIEIEKFLGLAKPVIQLERGQLVALHHDYSVIAAEKFMDARFRPHGEFTTPTFNDFKDFVVAEGGKNTPIFVNQNDMKAIAVLNFHGEGQAQGHCDYLASLCLESTVVWKKLNQLKDHKLDQRNFAVFIEDWAQVLNAFDENNNVIDIKDALVAVRNMQIEASTTSNAEVENTRQVQSEMAQIAASAKKGVLPAYFTIQDSAYLGLAEREIKLRLIVNSTGSTPQFAIQIVKEELLRNEIIEDFKEEVIALLPENPVRIGSFKS |
17 | Acinetobacter_phage(50.0%) | integrase | attL 2978234:2978247|attR 2985737:2985750 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3646724 : 3728779
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP050412|3646724:3728779|DBSCAN-SWA 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MGQAKQRGTLEQRVKQAQEQKDDFYGTERSVAEVLAELGLPKESTVKGYVIHLPEKDEFVAAINDNNISFSVAYARTPELAMIYDEPQKAISDAKKISKHKLLVCVLFETSNQYMINDIWANY |
80 | uncultured_Caudovirales_phage(22.22%) | integrase,tRNA,transposase | attL 3688370:3688429|attR 3728069:3728934 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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