CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP052869	Lactobacillus plantarum strain AMT74419 chromosome, complete genome	1 crisprs	csa3,DinG,cas3,DEDDh	0	0	6	0

1. NZ_CP052869

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP052869_1

• CRISPR_ID: NZ_CP052869_1
• CRISPR_location: 2718959-2719044
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP052869_1

Consensus_repeat	Method
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP052869_1

>1.1|2718982|40|NZ_CP052869|CRISPRCasFinder
CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP052869_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP052869_1

>merge|NZ_CP052869|1|2718959-2719044|CRISPRCasFinder
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATTCGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAATAAGAAACTTAAAGTATCTTATT

>NZ_CP052869|1|1|2718959-2719044|CRISPRCasFinder
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT	CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA
TAAGAAACTTAAAGTATCTTATT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP052869.1|WP_063490528.1|2708909_2711492_-|SH3-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|119382
NZ_CP052869.1|WP_022638460.1|2717465_2718944_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|129794
NZ_CP052869.1|WP_044432936.1|2719781_2720663_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238558
NZ_CP052869.1|WP_003643400.1|2721738_2722737_+|iron-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
NZ_CP052869.1|WP_063490529.1|2716395_2717349_-|aldo/keto-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|381318
NZ_CP052869.1|WP_003642344.1|2714423_2715461_+|aldehyde-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187538
NZ_CP052869.1|WP_003642350.1|2720947_2721742_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224045
NZ_CP052869.1|WP_011102044.1|2724465_2725359_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187572
NZ_CP052869.1|WP_022638457.1|2726415_2726871_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|100047
NZ_CP052869.1|WP_003642355.1|2725652_2726399_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|226674
NZ_CP052869.1|WP_003642342.1|2712843_2713572_+|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|226674
NZ_CP052869.1|WP_003642340.1|2711777_2712062_+|DUF1905-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378097
NZ_CP052869.1|WP_003642357.1|2727180_2728017_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|212492
NZ_CP052869.1|WP_003643398.1|2719061_2719661_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NZ_CP052869.1|WP_003643401.1|2723972_2724485_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|274100
NZ_CP052869.1|WP_003642338.1|2707226_2708639_+|NAD-dependent-succinate-semialdehyde-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|143418
NZ_CP052869.1|WP_011102039.1|2712345_2712711_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224647
NZ_CP052869.1|WP_011102040.1|2713730_2714297_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NZ_CP052869.1|WP_011102043.1|2722733_2723729_+|iron-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
NZ_CP052869.1|WP_003642345.1|2715609_2716176_-|DUF1211-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226078

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP052869.1|WP_063490528.1|2708909_2711492_-|SH3-domain-containing-protein	gnl|CDD|119382	cd06522, GH25_AtlA-like, AtlA is an autolysin found in Gram-positive lactic acid bacteria that degrades bacterial cell walls by catalyzing the hydrolysis of 1,4-beta-linkages between N-acetylmuramic acid and N-acetyl-D-glucosamine residues. This family includes the AtlA and Aml autolysins from Streptococcus mutans which have a C-terminal glycosyl hydrolase family 25 (GH25) catalytic domain as well as six tandem N-terminal repeats of the GBS (group B Streptococcus) Bsp-like peptidoglycan-binding domain. Other members of this family have one or more C-terminal peptidoglycan-binding domain(s) (SH3 or LysM) in addition to the GH25 domain.	2.91765e-70
NZ_CP052869.1|WP_022638460.1|2717465_2718944_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit	gnl|CDD|129794	TIGR00711, Uncharacterized_MFS-type_transporter_YhcA, drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily. This subfamily of drug efflux proteins, a part of the major faciliator family, is predicted to have 14 potential membrane-spanning regions. Members with known activities include EmrB (multiple drug resistance efflux pump) in E. coli, FarB (antibacterial fatty acid resistance) in Neisseria gonorrhoeae, TcmA (tetracenomycin C resistance) in Streptomyces glaucescens, etc. In most cases, the efflux pump is described as having a second component encoded in the same operon, such as EmrA of E. coli. [Cellular processes, Toxin production and resistance, Transport and binding proteins, Other].	1.10264e-72
NZ_CP052869.1|WP_044432936.1|2719781_2720663_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|238558	cd01138, FeuA, Periplasmic binding protein FeuA. These proteins have predicted to function as initial receptors in ABC transport of metal ions in some eubacterial species. They belong to the TroA superfamily of periplasmic metal binding proteins that share a distinct fold and ligand binding mechanism. A typical TroA protein is comprised of two globular subdomains connected by a single helix and can bind their ligands in the cleft between these domains.	2.72098e-56
NZ_CP052869.1|WP_003643400.1|2721738_2722737_+|iron-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	2.31826e-81
NZ_CP052869.1|WP_063490529.1|2716395_2717349_-|aldo/keto-reductase	gnl|CDD|381318	cd19092, AKR_BsYcsN_EcYdhF-like, Bacillus subtilis YcsN, Escherichia coli YdhF and similar proteins. Bacillus subtilis YcsN and Escherichia coli YdhF are prototypes of this family. They are uncharacterized aldo/keto reductase family oxidoreductases.	9.94078e-132
NZ_CP052869.1|WP_003642344.1|2714423_2715461_+|aldehyde-reductase	gnl|CDD|187538	cd05227, AR_SDR_e, aldehyde reductase, extended (e) SDRs. This subgroup contains aldehyde reductase of the extended SDR-type and related proteins. Aldehyde reductase I (aka carbonyl reductase) is an NADP-binding SDR; it has an NADP-binding motif consensus that is slightly different from the canonical SDR form and lacks the Asn of the extended SDR active site tetrad. Aldehyde reductase I catalyzes the NADP-dependent reduction of ethyl 4-chloro-3-oxobutanoate to ethyl (R)-4-chloro-3-hydroxybutanoate. Extended SDRs are distinct from classical SDRs. In addition to the Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet) core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids. Extended SDRs are a diverse collection of proteins, and include isomerases, epimerases, oxidoreductases, and lyases; they typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	7.62333e-95
NZ_CP052869.1|WP_003642350.1|2720947_2721742_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224045	COG1120, FepC, ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components [Inorganic ion transport and metabolism / Coenzyme metabolism].	5.60764e-114
NZ_CP052869.1|WP_011102044.1|2724465_2725359_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|187572	cd05262, SDR_a7, atypical (a) SDRs, subgroup 7. This subgroup contains atypical SDRs of unknown function. Members of this subgroup have a glycine-rich NAD(P)-binding motif consensus that matches the extended SDRs, TGXXGXXG, but lacks the characteristic active site residues of the SDRs. This subgroup has basic residues (HXXXR) in place of the active site motif YXXXK, these may have a catalytic role. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Atypical SDRs include biliverdin IX beta reductase (BVR-B,aka flavin reductase), NMRa (a negative transcriptional regulator of various fungi), progesterone 5-beta-reductase like proteins, phenylcoumaran benzylic ether and pinoresinol-lariciresinol reductases, phenylpropene synthases, eugenol synthase, triphenylmethane reductase, isoflavone reductases, and others. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. In addition to the Rossmann fold core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	7.15129e-131
NZ_CP052869.1|WP_022638457.1|2726415_2726871_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|100047	cd03357, LbH_MAT_GAT, Maltose O-acetyltransferase (MAT) and Galactoside O-acetyltransferase (GAT): MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively at the C6 position of the nonreducing end glucosyl moiety. GAT specifically acetylates galactopyranosides. Furthermore, MAT shows higher affinity toward artificial substrates containing an alkyl or hydrophobic chain as well as a glucosyl unit. Active MAT and GAT are homotrimers, with each subunit consisting of an N-terminal alpha-helical region and a C-terminal left-handed parallel alpha-helix (LbH) subdomain with 6 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X).	4.35635e-53
NZ_CP052869.1|WP_003642355.1|2725652_2726399_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|226674	COG4221, COG4221, Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity [General function prediction only].	2.40011e-91
NZ_CP052869.1|WP_003642342.1|2712843_2713572_+|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|226674	COG4221, COG4221, Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity [General function prediction only].	1.6523e-89
NZ_CP052869.1|WP_003642340.1|2711777_2712062_+|DUF1905-domain-containing-protein	gnl|CDD|378097	pfam08922, DUF1905, Domain of unknown function (DUF1905). This domain is found in a set of hypothetical bacterial proteins.	1.07383e-22
NZ_CP052869.1|WP_003642357.1|2727180_2728017_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|212492	cd05327, retinol-DH_like_SDR_c_like, retinol dehydrogenase (retinol-DH), Light dependent Protochlorophyllide (Pchlide) OxidoReductase (LPOR) and related proteins, classical (c) SDRs. Classical SDR subgroup containing retinol-DHs, LPORs, and related proteins. Retinol is processed by a medium chain alcohol dehydrogenase followed by retinol-DHs. Pchlide reductases act in chlorophyll biosynthesis. There are distinct enzymes that catalyze Pchlide reduction in light or dark conditions. Light-dependent reduction is via an NADP-dependent SDR, LPOR. Proteins in this subfamily share the glycine-rich NAD-binding motif of the classical SDRs, have a partial match to the canonical active site tetrad, but lack the typical active site Ser. This subgroup includes the human proteins: retinol dehydrogenase -12, -13 ,and -14, dehydrogenase/reductase SDR family member (DHRS)-12 , -13 and -X (a DHRS on chromosome X), and WWOX (WW domain-containing oxidoreductase), as well as a Neurospora crassa SDR encoded by the blue light inducible bli-4 gene. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet), an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Classical SDRs are typically about 250 residues long, while extended SDRs are approximately 350 residues. Sequence identity between different SDR enzymes are typically in the 15-30% range, but the enzymes share the Rossmann fold NAD-binding motif and characteristic NAD-binding and catalytic sequence patterns. These enzymes catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH) numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser (Ser-138, 15-PGDH numbering) and/or an Asn (Asn-107, 15-PGDH numbering) contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Extended SDRs have additional elements in the C-terminal region, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif. Some atypical SDRs have lost catalytic activity and/or have an unusual NAD(P)-binding motif and missing or unusual active site residues. Reactions catalyzed within the SDR family include isomerization, decarboxylation, epimerization, C=N bond reduction, dehydratase activity, dehalogenation, Enoyl-CoA reduction, and carbonyl-alcohol oxidoreduction.	4.07613e-56
NZ_CP052869.1|WP_003643398.1|2719061_2719661_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	4.95133e-09
NZ_CP052869.1|WP_003643401.1|2723972_2724485_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|274100	TIGR02366, conserved_hypothetical_protein, probable dihydroxyacetone kinase regulator. The seed alignment for this family was built from a set of closely related uncharacterized proteins associated with operons for the type of bacterial dihydroxyacetone kinase that transfers PEP-derived phosphate from a phosphoprotein, as in phosphotransferase system transport, rather than from ATP. Members have a TetR transcriptional regulator domain (pfam00440) at the N-terminus and sequence homology throughout.	3.33884e-08
NZ_CP052869.1|WP_003642338.1|2707226_2708639_+|NAD-dependent-succinate-semialdehyde-dehydrogenase	gnl|CDD|143418	cd07100, ALDH_SSADH1_GabD1, Mycobacterium tuberculosis succinate-semialdehyde dehydrogenase 1-like. Succinate-semialdehyde dehydrogenase 1 (SSADH1, GabD1, EC=1.2.1.16) catalyzes the NADP(+)-dependent oxidation of succinate semialdehyde (SSA) to succinate. SSADH activity in Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is encoded by both gabD1 (Rv0234c) and gabD2 (Rv1731). The Mtb GabD1 SSADH1 reportedly is an enzyme of the gamma-aminobutyrate shunt, which forms a functional link between two TCA half-cycles by converting alpha-ketoglutarate to succinate.	0
NZ_CP052869.1|WP_011102039.1|2712345_2712711_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224647	COG1733, COG1733, Predicted transcriptional regulators [Transcription].	1.16334e-31
NZ_CP052869.1|WP_011102040.1|2713730_2714297_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	7.31502e-05
NZ_CP052869.1|WP_011102043.1|2722733_2723729_+|iron-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	2.80019e-78
NZ_CP052869.1|WP_003642345.1|2715609_2716176_-|DUF1211-domain-containing-protein	gnl|CDD|226078	COG3548, COG3548, Predicted integral membrane protein [Function unknown].	5.75015e-29

Protein sequences

>NZ_CP052869.1|WP_022638460.1|2717465_2718944_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit
MQAKAKISKATMTIAWVVVFGAMAPLLDSTMINIAINNLVTSFHSSVTTVQWAVTGYLLATGVAVPFSSWLLNRFDGKAVFVAGEILFGLGSIFAAVAPNIQLLIIARLVQGFAGGLIMPLLTTLLVQTAGAAVMGQMMATVGLPMILGPLIGPVIGGIIIKFASWHWIFWINVPVVLISIALILWKMPNYPAQNRTAKMDFIGILLLIVSSSAIIYSLVNAAHTDRFNNATSIEMLILGAIALISYVVWAAWQKERAVVPLHLFKFASFDGAGLGLFIAGTVLNGAMLLLPLYFQNVRGMSVINAALALLPQGAGMLVSRTLTGRLTDQIGAKYVVLGSVVITFVGTLPFYWFGQQTSYWILALILFVRGIGAGGILMPLMADAYTGMQPGQVPAATIGTRIIQNIGSAFGSALITTIVTAYSTHQVNVFERHLKAETYHVDAAHLQVFTTSHLQAIRLAAFQQGFLVIAIAAIVIILPTLLLTNKLKAAK
>NZ_CP052869.1|WP_063490529.1|2716395_2717349_-|aldo/keto-reductase
MKTIQIGASQLKASAVALGIMRMVRLDTDAAANVLETVHDRGVNFIDSADIYGNGDSERIFGQALKQSSLKRENFFIQSKGGIVLDPEKSSGELVFGQRYDFSKQHLIATVDKILQRMQLDYLDSFLLHRPDPLMDPAEVAAAFDELQATGKVRHFGVSNFNPMQVEMLQAAVSQKLMINQLQFGVMHTGPIQFGLHTNMQDTASLNHDGEIIEYSRLHHMTIQAWSPYQYGMFAGTFIDNPKFPELNAKLQELADQYHVTKNAIATAWILRHPANMQVILGSMNPQHLDESIAGTDVTLTRQEWYDVYFAAGNDLP
>NZ_CP052869.1|WP_003642345.1|2715609_2716176_-|DUF1211-domain-containing-protein
MNKARLEAFTDAIIAIVLTLLVLDLPRPQTPSVRALFAEWQSIYVYIITFTLLISIWLNHHDLFVQVKKIDRVVFWANSFWLLCQSFIPFMASWITKFPHSKWPAVFYILTGFVWMLAYQLLVAAVRRLNPHIHRMSSPALSVVFGGFLVVLTVALINPDVGLFLIPVHAFASVILATKRKWHLRKYF
>NZ_CP052869.1|WP_003642344.1|2714423_2715461_+|aldehyde-reductase
MQKQLVVVTGGSGFIAIHIIRQLLQQGYAVRTTVRSLAKAPVIKEMLTNGGITDLSALEIVVADLAHDEHWSEAMAGATYAIDVASPTPKLNFKNKAEMIRPAVDGVRRVLTASRDAGVKRVVLTSAYGAIFAGHKNRTTPYTEADWSDLNWKAIHPYQESKTRAELAAWDFINHEGRGLELTTVNPVAVMGPVLSAKYSHSNIQIQQFLEGQVKAVPNVDSGYVDVRDVASLHLLAMTAPQANGERFLATTGETLSMLDVANVLRQAFPAFASQLPTKTIPNAAVKLAAKARPELRMVASLVGTYAETSNHKAQTLLDWHPRPAAESIIATAQSMIDLGIVTKP
>NZ_CP052869.1|WP_011102040.1|2713730_2714297_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
MAATNHAQAIKKDSQTYLTTALLQLLRTHDLDTITVTQVVKRAGVSRMAFYRNFTTLEDLLTAYFAPAIAARFQDVLQHVPANRKLLAMGQFFSDFAPTLRLAEQRGFENIIQQLFNANMTNYYQATMTNGMLTAVQLKYWTRFMSAGVYAIWREWLLGGQLESLTTIHEILATLQTATMQALTQAQK
>NZ_CP052869.1|WP_003642342.1|2712843_2713572_+|SDR-family-oxidoreductase
MKPLVVITGASSGFGAEIAKLFAADNYPLLLLGRRQAKLAALSANFENAMIDTVDVTNYHQFETAVRKAEAKYGKTDLLVNNAGLMLLGNVQNQDPQEWQTMLNTNVMGVLNGTQIVLNDMRDREHGTILNMSSLAGKKTFVNHAAYVASKFGVHGLSETLREENAPKNVRVMLVAPGAAETELLTHVTSKSALSDYEAWKASMGGLTLDPKHVAATVKFMYDMPQNVNIREVDIAATAQDA
>NZ_CP052869.1|WP_011102039.1|2712345_2712711_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
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>NZ_CP052869.1|WP_003642340.1|2711777_2712062_+|DUF1905-domain-containing-protein
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>NZ_CP052869.1|WP_003643401.1|2723972_2724485_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
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MNVTREPSEIRERLAEITGQTIDISVEIRVPLWTDYGRNLKIGKRVFINDNVQITDLGGIKLADDVLIGPGAMLLSVNHPLDPAKRHAVEVQPIHIERNAWIGAGAKVLAGVTVGENAVVGAGAVVTKSVPANTVVAGVPAKVIKTIEQVD
>NZ_CP052869.1|WP_003642357.1|2727180_2728017_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase
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Prophage detection

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DBSCAN-SWA_3	1237682 : 1248322	10	Lactobacillus_phage(90.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	1464036 : 1507670	51	Lactobacillus_phage(58.33%)	capsid,plate,tail,portal,terminase,head,integrase	attL 1463247:1463260|attR 1511345:1511360
DBSCAN-SWA_5	2137280 : 2176564	52	Oenococcus_phage(39.39%)	capsid,tail,holin,protease,portal,terminase,head	NA
DBSCAN-SWA_6	2372862 : 2381373	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP052869|321572:373417|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003641934.1|329012_329483_+	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP052869|967899:1026909|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MDIALIKLIKAPCIQEYRWHGDKLFIWVADYDWTNFKEILKKLCSFDDGGIPARIQEDCIYIDLGDTEIMDDYFEELKVAFPED

Homologous phage analysis in the prophage region

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970454:970469	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_169484460.1|994025_994142_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_169484091.1|994117_995773_-|transposase	IS1182 family transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	6.7e-92	41.1
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WP_169484462.1|995836_996367_+	HNH endonuclease	Q8LTA9	Lactobacillus_phage	1.4e-14	39.2
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WP_060417461.1|998077_998386_+	hypothetical protein	E9LUN7	Lactobacillus_phage	6.2e-44	86.3
WP_133279612.1|998378_998537_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLB5	Lactobacillus_phage	1.5e-17	90.4
WP_060417460.1|998539_998794_+	hypothetical protein	A0A2H4PBA1	Lactobacillus_phage	1.1e-35	82.1
WP_080440299.1|998874_999309_+	hypothetical protein	A0A2K9VD97	Lactobacillus_phage	8.8e-36	55.3
WP_169484093.1|999305_999470_+	hypothetical protein	A0A2D1GPI6	Lactobacillus_phage	1.0e-13	65.4
WP_060417459.1|999525_999951_+	transcriptional regulator	E9LUP5	Lactobacillus_phage	4.1e-62	80.9
WP_033098961.1|1001159_1001972_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_169484097.1|1002131_1002791_+	HNH endonuclease	E9LUP6	Lactobacillus_phage	1.6e-17	89.6
WP_060417457.1|1002817_1003120_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_049821959.1|1003354_1003789_+|terminase	phage terminase small subunit P27 family	B8R648	Lactobacillus_phage	8.3e-18	37.7
WP_060417456.1|1003775_1005692_+|terminase	terminase large subunit	A0A0M7RDK9	Lactobacillus_phage	5.7e-135	42.0
WP_165274444.1|1005705_1005870_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_060417455.1|1005911_1007030_+|portal	phage portal protein	Q9AZM4	Lactococcus_phage	1.8e-64	39.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP052869|1237682:1248322|DBSCAN-SWA
TGTGGCACGTGACGGGACCGTCACAGAGACAAATGATTTAAAATTGCACGCATTAGGGGAGATTATCGGGATGAACGAACAAGAAGCATATGTAACGACATTTTATTGGCTCGCGGATTGTTGGTTGGAAACTAGCTATCTGGGACTTGAGGATGAATTTGACGACGATGAAATCGATGACGCCGTCAAGTCACTACTAAATCGGATGCAAGCCGGGGCAATTTATGAGGTAACGGCGGATGATCCAATGTGGCAAGCATGGAAGCGGGCAGTTAGGGCCGTGCTTACGCCCAATGATCATGCTGAACATGAAGTTGATGAGACCGACGGAGAGGATGAATTAGTGCTGCCAGCTGGGGTACGACCAGAACGTCAATTAGAAGAAGTTCAAGCCTATGCAGCGATGAACGCGTTTTTGCAGGCACAAGATCAGGAATATCTGCAAGAAATTGGTAAACGGGCGGCCACTCAGGTCAGTGGTGCCGGGTGGCAAGTGTGGCGTGCACATCGCCAGAGCATGCATCCGGAGTCTGCCGCCCCGCTGACGTTGACTGCTGAGCAATTACCAGCCGTGATGTGGGCCTTTTTCGATAAGTACCAGGATACTGAGGACTCTTTTGAGATTTTTGAATTGGTTAGCCAACTTGAACAATGGCAAAAAAGTGCTGATCGAGATTTGGACGCGCAATGGTCACAGCTTGTGGCGAAAAGTCAGATTGATCCGGCCGCAATTACGCTCATGCAGGGCTTGTCGTTAGCTATTGAGTTCTTTGATCAGCTTGAGTGGGACGGTGATTTGACTGCCAAGGCAACTTTGCAGAACAAATTGATGCAACGCACGCTCGATGACACGCTCAATGATGAGACGACAGCCAACTGGGCGGATGCCTGGCAACACTGGGATTTAGCAGATCCGTTGACAACTGAACAGTGGGCCCGACGGTTTGATCCGGCGGACGACTATGAAGAAGATGAAGACGAGAGTAAAGAAGATGGCTCGGCTCGGCCAGCTTGGCAACTTGGTGCGAGTTATAGTACCGTTTTGATTGCAATGCGCTTAGTCGCTTACGGTGTACTGCGGCCTGAGAGTGTGCCTGGTATGGCAACTGTGAAGATGGCGAACCGTGCACTGGCAGCTACCGTCAGTATTGGTATCGTGTTAGTTGCTTGGCTGGTCACAGCTATTCTGATTACAATTGTAATTTGGGGATGGCGGTGGCTGCGTAAGCTGATTTTTTAGTGCAGCTGAACGGCCAACTGAATCACAATAGTGCCGATTGACTAGGCTGAAGTTTGTGAATCCAGTAGTTGAAGCTGAAAGGACGGGGCGTCAGTGGTAGTGCTTCATGATGGTTCGTAACTCGGACAGAAAGTCGGCATCTAAATGGGGCGATTGTCCTAATTGTAATGGTGCCAATGGCTGATATAACGTTGGTATGTCTGGCTTTAACGGCTGGTTATTGAAGTATTGCTGACCATGGATTTTGACGGTCGCTTTGAGCGTTCCAATCGTCATGACGGCCACGGCGGTATTTAAAAAGACGCCACCATTGAGACTAGTATATCCAGCGGAAGAACGCCCAACTAAAGTAACGTGCGGGTTACGTTTTAGCGCCATGATGGTCACCTCCGCGGCACTCGCTGTCTGGTTACCAATAATGGCATAAATATGACGAAAGTGGGCCGCTGTTGGTTGCGAAAAGTTAAAGTCATCTTGACCGAGTCCACCAGTGATTCGGCCATGGTACATCATACGTGGCCGGTTGCGATGATGGTTCGTGATGCCGGTGTAGAGGGTGCCGTCTGGAATGATGGCGGCCAGGCCAGCAATCATCGGTGCCGAACTACCACCAGTATTTGCTGCGAAGTTTAAGATTAAATCGGTTGTCGGCTTAGTTTGTTTAATCAGGTGCTGGAGTTGTGTCCAATACTGTTTTTGTAATTGGTGCTGACTGCTGTAAAATGCTAGCACATTGATGATGGTGAGGCCGGCACTCATTGTCTTGGTCGGACGGGTGGCATGTTCGACTTGGCGGAGATTGGCGACGGCGAATGAATGTAAATTTGCAGCGCGCAGAATTTGATTGGGTTGGGTCAGTGACGTGATTTTGCGACCATGATCAGTCGCATGTAGCATGGCTTGCCATTGCGTGCGATGGTTGATAATGCCATATTTTGACATGTAGGTGATAGCCGGCATAGCGTTGAAGGACGCACGGAGCCGATTAGAAGCGGAAAGACCAAACGTTAGGACTATCGAAATTAGACCTACCAGTCCGTAACGGCATTTATTCGTTATCATGATAAGCCATCCTTACTTTTCGTGACTAGATTAGCATGTATTGGTTAGCTAAAGTGTAGGCGTGGCGTCAAAATTTCGCAACGAAAAGCATATCTTAACTGGTGCGTCTTTGAAATAATGGTTACTGTTAAAATACCCATCTACATTGGCCGTCTTAACGGCTAAGCAGATGGGTATTTGTTGTATCATGAAATTGTTGACGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCAACAAGTCTTTTTCCACCTGGTTCAGTGAATGCTCGGCTGGAAAGGCAATGAAATAATTCAGGGACATTAACGCTTGGGGCAAAGGTAAGATGTTATAGCGTTCTGGATCAGGTTGGGTATGCACACTGTCTGGTAAAAAGGTAATACCCAGTCCAGCAGTGGCTAGTTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATTACGATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAGTAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGAGACAAGACTAGAGGCGCTTGTAGCAGGTCGTTAAGGGGGAGCGCTCCCGGATTAATGAAGGCCTGATGTGGTTGGTACCAGTTGACGGTGTTCGGGATAATCGCGTAATACCCGTCCCGACCGCGGTCATAACTTTCAAGCCCCGGCGCGATGGTTTCCGGATTTTGACCAATTAAGAAGTCCAGTTCACCGTGGAGCACGCGCTGTTCGTTGCGACTAGCGATATCTTCGGTTAATTCGATCTTAGTGGCCGGGTGGGCTTTCAAAAAAGCAGGTAAAAATAGGGGCAATAAGTAATAGCCGAGGCTAGATAAGACGCCCAGCCGAATTACTTGCTGGTTGGCATGTGTGTATTGCCTAATTTGCTTATTAAAGTAATCCTTCTCGTTTTCGAGCGCCGTCAAATATTGATAATAAGTCCGCCCAGCCGTGGTCAGTCGCAGTGGCGTGACTTCACGATTGATGATGGTGACGCCCAATTCTTTTTCAACATTGCGGATGCTTTGGGTGAGGTAAGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTAGCCGCCCGGGTAAAATTGCCGTGCTTGAGCAACACATCTAAAAACCGTCGCATTTCGCTAGAATCTGATTTTGGCATAAAGCGCCTTCCTCTCGCATTGTGATTAGGTGAGTATTCGTTTGATTGCTGATTTGGTCATGTTGAGTTAGTTGCATCGCCATAAGGACGTTCAAAACATGTTCAATAAGTTCTGTCAACATCCTGGCGATAGTGGCTAAATAGCATTATGACCAACCATTTTAACATGATTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCGGGGTATAGATAAATAAATATTTCACAAGCAGAGCGCTTTCACGTACACTAATCAGTATTAAGAGTGGCCAATCATTCAATAGCTACTCGTCGAAAACGACTGTTTAAATCATCCTGAAAGGATCTGAAATTATGAAATTTGTTGGGATTGTTGGGACGAATGCAACCAAATCGACCAACCGGCAGTTACTGCAATATATGCAACGGCATTTTCAGCAACAAGCCACGATTGAAATTTGTGAAATAAAAGATTTACCGGCTTTTAATGAACCGGAAGACCGAACAGCACCAGTAGCAATTCAACAGCTCAGTGATAAGATCACCGCAGCAGATGGCGTGATCTTTGCCACGCCGGAGTATGATCATTCAATTCCGGCCGTACTAAAAAGTGCAATCGAATGGCTGTCATATACCACGCGGCCGTTAATTAATAAACCAGTTATGATTGTTGGGGCCTCGAACGGCTCACTGGGAACCTCACGCGCTCAAGCGCACTTACGCCAGATTTTAGAGGCGCCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCAAATATTGAATACTTACTAGGCCGTTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGCGACCTGACTTATCCGGATAAAGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCATTGATTTTGTAGATTTAACGAATAAAATCATGCCGTCGAGTCAGTTTTTCGAAAAGAGTAAGCAGTTCTCGTGGCGGCAAGTGACTGGGGAGGAATAAACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGAACGAATGCTCAGCATTCGTACAATCGGATGTTGCTGGAATTTATGCAACGACATTTTGCGACACAAGCCGAAATCGAAATTTTAGAATTGACTCATGTCCCGATGTTTGATGAATCGAATGATCAAACTGACAGTACCATCATTCAAAACTTTGCCACTAAAATTGCGACGGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTGCCTTCCGCGTTGAAAAGCATTATTGAATGGTTATCATTCAAAATTCACCCATTAGATGGTCAAGCAGTAATGATTGTTGGGGCTTCATACAGCGTCCAAGGATCGTCACGCGCGCAACTACACCTGCGCCAGATTTTAGACGCTCCCGGTGTTAACGCCAGTGTCATGCCCGGTTCAGAATTCTTATTAGGTCGTGCCCAAACGGCTTTTGACGATCAAGGTAATTTAAAGGTGCAAGGGACGGTTGATTTTCTGGACAGTTGTTTTGCAAAGTTTCAGAAGTTTGCGACCATCGTCGCCGAGATGCGGGCACCAGAAGCGCTTAGCTTTGCCCCGGGTACTTATCAGGTGACGGCCACTGGACA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

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>NZ_CP052869|1464036:1507670|1484777_1485848_+|WP_169484155.1|capsid|DBSCAN-SWA
MVNGNITKLSDMQIPENWGAYLAEKSTQNNAFFTSGVVQNVPQIAALLGAGKVANMPLFKPLADDEPQVPDDTTDLLVNKITTDLAQARKLGFDQAWSATDLSAELSGADPLSAIGDQVSDYWSHVYEKLLLKTLTGVFSSTSMKSVNQLDTTTDKTDTTFSLKNFNKARFLLGDRYKDLAIVAVHSDILRQLQDANLVDAKNNSTFVLNGNSNVPTAIQAPDAGDKIKGVQIVVDDSLPVDNGKYTSYLFAQGAVGYAELPVTNAVETNRDPLKNHGIDYLVNRRRFVFAPQGLSWNESNFVAKNPGKTYPSMTDLADGTNWSKVYDHKLIPMAQFVTSADAIVPSTMADPQTGK
>NZ_CP052869|1464036:1507670|1485862_1486228_+|WP_053566685.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MSDTQDSSKTLKNVITLLGITPTDSEKERLTLYIDHAEQAIVLYLGRSVRISKLPPGLDYIVENLAVTKFNKFHNEGEKSHSEEGLSFQFNVNDLAPYYPDLQAWIDGQANTTRGATAIGW
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MSVDIVVRSSVSVKNSLPKVMHLAKQTVTETGKKAGYSQPMISKLSSGVAKLPYENVRTLLNSIPEQYQPLLALDIAHELVGITPPIANGDGLKLDVEALGPRTIRELSQGIDALTNSQDEFETPAGHVSDTKDPQEAIYQVLDALFIGYNAVIGICNEYGFSLPALMRQREKFWKMKSYIK
>NZ_CP052869|1464036:1507670|1483063_1484008_+|WP_104880189.1|capsid|DBSCAN-SWA
MDINKLAHALAKILDVKDPVFQQLISIIERSHHAQVKNLTYFLHKNVTWQDDADNADIKELTDAVLELKQNANRKEEQVLATLLNNLPYKTNLDVAQAQARVNVANMGLKVNKLVQAKQAEIVQQVTKLTGSGLGGYNTQLRRRALYRLAAQNEPENTSLDLIFKHANKLAIDLDNIIKFQMQNHVNPNSISKIVAKELGVTGKPNPNEDLWETEMQKRYMSTKADMERILVTESKATQTRECAKQYNNLGFTKLKIVTRDNPHVCKYCEGHDGTIVEIKDAVVGMNVPPLHPRCHCNVIPVQMDYKDVLSELN
>NZ_CP052869|1464036:1507670|1495510_1496503_+|WP_103419954.1|DBSCAN-SWA
MSNTDKYYRDRSHITGKLDLQKLPKAIREKQYGIDVREAMAQTAEAIAGVQSTAQKFNQDTKNQVNQLDEKYTREIRAIVLGDTISVATPPIQEPNSEASNPLSNLYETARGQVLYDFVKQSSLTKVSKIGVIGDSVAATAGGFPDILAHQYNIYVENLSVGGAKMSDYNHDAIVNQASRLQQCDVVIIQGTDDDWVHNISLGYAGDTNIKTYLGGLRETIKRVKNNNPKAKLIVVNCTRQCVDVHGKYRTEQSKNTFGLTLIDYMEAQKKYLNQQDVPYVDLMKPTSIFEPDNPAFKKTMMHDGLHPTPEAHQYIVQEIAKDYSYYYDK
>NZ_CP052869|1464036:1507670|1497137_1497878_+|WP_011101128.1|DBSCAN-SWA
MSIKELQDVTGTVIHPRTETAAIVDADKLVNTTSTQNNIAGIKNFVDGISIKGVPLLDIDFNKVKLVPNDDVYQIKQAGLYFYTTNTKNVPLLSSRFHDGFVLYGAKDTKTAFLYYIGARVYQERFQGKWLRQESSIPQDLWVGEGKVGDVLKLRDTLDNYRQLRFRCYFTIGNTLQFIPAWASDNMLYLTQPALNFDGTILRALEVALQIGQDQRSLIIKSAKYFANGKSTSITDGFLKEVGGML

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1463247:1463260	attL	NA	NA	NA	NA
WP_058011823.1|1464036_1465257_-|integrase	site-specific integrase	A0A0P0I3D2	Lactobacillus_phage	2.1e-82	41.1
1463247:1463260	attL	NA	NA	NA	NA
WP_058011822.1|1466889_1467321_-	hypothetical protein	O03904	Lactobacillus_phage	2.8e-66	83.6
WP_053566661.1|1467329_1467728_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	O03970	Lactobacillus_phage	3.6e-68	97.0
WP_058011821.1|1467895_1468162_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	O03906	Lactobacillus_phage	3.0e-39	96.6
WP_053566663.1|1468259_1468574_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_058011820.1|1468611_1468848_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A0K2CNE2	Brevibacillus_phage	5.9e-10	42.7
1468566:1468579	attR	NA	NA	NA	NA
WP_072536108.1|1468851_1469187_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
1468566:1468579	attR	NA	NA	NA	NA
WP_058011819.1|1469326_1469533_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_058011818.1|1469532_1469829_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_058011817.1|1469853_1470036_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_072536110.1|1470100_1470649_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053566667.1|1470663_1470927_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053566668.1|1471459_1471969_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_104880184.1|1471975_1472644_+	AAA family ATPase	E9LUU1	Lactobacillus_phage	2.7e-92	75.1
WP_104880185.1|1472640_1473186_+	DUF669 domain-containing protein	D2KRE3	Lactobacillus_phage	8.5e-28	46.0
WP_069710545.1|1473266_1474055_+	DNA replication protein DnaD	NA	NA	NA	NA
WP_062688445.1|1474035_1474878_+	ATP-binding protein	O03914	Lactobacillus_phage	4.6e-158	99.3
WP_061871421.1|1475010_1475313_+	hypothetical protein	E9LUN7	Lactobacillus_phage	6.3e-41	81.0
WP_104880186.1|1475679_1477443_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_058011782.1|1477825_1478254_+	transcriptional regulator	E9LUP5	Lactobacillus_phage	3.3e-59	77.3
WP_104880187.1|1478773_1479256_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_169484152.1|1479296_1480145_+|terminase	terminase small subunit	V5URT8	Oenococcus_phage	2.7e-44	42.0
WP_104880188.1|1481405_1483064_+|portal	phage portal protein	D2IYW2	Enterococcus_phage	1.4e-65	33.4
WP_104880189.1|1483063_1484008_+|capsid	minor capsid protein	NA	NA	NA	NA
WP_104880190.1|1484116_1484764_+	DUF4355 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_169484155.1|1484777_1485848_+|capsid	phage capsid protein	A0A0S0N2Q7	Pseudomonas_phage	9.1e-34	30.6
WP_053566685.1|1485862_1486228_+|head,tail	phage head-tail connector protein	A0A2H4IYR7	uncultured_Caudovirales_phage	6.8e-05	38.2
WP_072536128.1|1486232_1486556_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_104880191.1|1486545_1487100_+|tail	phage tail protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101119.1|1487100_1487487_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053566689.1|1487498_1488086_+|tail	phage tail protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101121.1|1488103_1488616_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101122.1|1488684_1488921_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_104880192.1|1488920_1492925_+	tape measure protein	E9LUR1	Lactobacillus_phage	5.2e-82	44.3
WP_011101124.1|1492918_1493656_+	hypothetical protein	A0A1S5SA63	Streptococcus_phage	4.1e-41	36.6
WP_104880193.1|1493655_1495506_+|tail	phage tail protein	A0A1X9IGI5	Lactococcus_phage	7.8e-49	33.4
WP_103419954.1|1495510_1496503_+	SGNH/GDSL hydrolase family protein	Q8LTH0	Staphylococcus_virus	4.8e-37	41.0
WP_011101127.1|1496517_1497132_+|plate	phage baseplate upper protein	A0A1J0MFQ3	Staphylococcus_phage	7.3e-44	47.8
WP_011101128.1|1497137_1497878_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101129.1|1497878_1498199_+	DUF2977 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101130.1|1498198_1498375_+	XkdX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_104880194.1|1498352_1499510_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	A0A2K9V5A4	Lactobacillus_phage	8.6e-46	67.2
WP_058011763.1|1499509_1499773_+	hemolysin XhlA family protein	E9LUR9	Lactobacillus_phage	8.5e-26	73.6
WP_058011762.1|1499786_1500149_+	hypothetical protein	A0A2H4PBB2	Lactobacillus_phage	2.4e-18	67.1
WP_058011761.1|1500480_1500687_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_058011760.1|1500938_1501163_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_104880195.1|1501358_1501964_+	lytic polysaccharide monooxygenase	A0A0K1Y848	Apis_mellifera_filamentous_virus	3.5e-14	28.7
WP_104880196.1|1502600_1504721_+	DUF1906 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_104880197.1|1504779_1505316_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_126043865.1|1506623_1507235_-|integrase	site-specific integrase	A0A0P0I3D2	Lactobacillus_phage	1.1e-31	38.0
WP_022638004.1|1507244_1507670_-|integrase	phage integrase SAM-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
1511345:1511360	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP052869|2137280:2176564|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MEVTQEQLHEMVQSEVNAAIAAKSLAPVKARRNIAWMELKNDISKFVNEKYGKNPKAYSLSDAVKTIIRFHLGVSNVYQINESNIDEARRIFELLKANI
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MSDTILILYEAPKGFQFISEEEYERFQAWKQAQRGIRTWKLKDLAKYKYGTKSTERASRYLTKHRHDLDIEQGGFIDYVNTHNGWQIPAAEMMDYLLNHPD
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MSATWFKKFLACEAEALAELQGKLEPVMNSTALVVGNWLHSYFESEKAHAKFVDEHPEAISSQGPSKGHLKKDFKIAESMIEALSDDHDFNLLYQGDKEVIVTGEIGGYPWKGKIDCLNLKQGYFVDLKTTADIYKGYWNEESREREPFVYAYNYQLQMAVYQELIKQQFGVMCKPYIVAVSKQDPPDKQAIDLPEYRLTNAMNQVLESQQHIQDVIKGEADPTKCGHCAYCRSTKKLESVVSADDLLMD
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MKKMSIVFVAIIAIIFTLAGCGNKKPDYTASTAESALNANKDIEGKTVQFKVNKVVPNSAFGYNLETGKHLNFVSYENPKVNKGETVTVKVKKASSSVGSWVISYTNLKKD
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MAKPSPPDKAGQLTRLYTRLGVKKDTPDAAVVDDIFDDAVQTCLDYTRSSLSTPILIQAKRLAIIMYNEQGTEGEASRSEGGVSQSFELGLPNIIKTALAPYRVAKTRRF
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MNETQVLVINADLPDIDHPLAIGPEPEMFKLAQHNYKSGEWPFPVRLVKPGTKVRSDAAYLASMKQDPKQGEREDIKAIRQAHKHGKHSLRQISESTSIELKRVKDLVHKYSLPLTNGYWRAEKYNNPDEVIAYQTLARLCERIDAPEFSIRQASMSNGIVSGYYISRVPKV
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MQYDLNKKRGSNVAIDRELAGNIENPSFDVINYAINQQQKRIDRYNMLEHYYEGNQHILSRNLEMAAKLDRADEKVMTNHAKYITDMITGFTTGNPISISPANGKDIKAITDAQDQMDIDSHNTEMEKDLSVFGCAYELLYIKNVSDATTELAIEKIDPRGCVLVTDDTLDKNPLFGIYYVEKKDLLGNAKGYLITVYTAHWIIQYRTKTGRVLSDANLASKPKAIQHYFNGVPLIEYRNNEERQGDFEQTISLINAYNELQSDRITDKKNFVDALLVVYGFTLDEGEDGEGANLKDGILEAPGKGDQGASVEWLTKSFDESQLQVLVKSIKDDIHQTSYVPNMNDENFAGTISGEAMKYKLFGLLQLLATKQRYLTRGIRQRLQLMQNILAFKGQSVDASGATINIVPDIPVNMADVISNIKNAEGVIPQLVSLGWLPGTNDPQELIKMLDQEKEKALKLQQKAMGGEPATDNEEVTADDSGNVSIKQKAGSELSDNGPRE
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MHTLLGLGWDEWGSIVAIVTSVCVLANWILNKTVRIPLNDLGKRLSRFTNESLKVRQQNADAMNAIENRVIKVEGRLDGHDIEFKHLYEKEAKGNEKN
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MAYVFDKGTVEQKNFMASEKFVPFSRQVDDTSYAVKTDAFGHKVIPAGTIYPTNDAKAEGITINEVDVTRGPQMVGVIVEGYLFGQRLPVAPTAEAITALKKITFTDTDAAAKSQA
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MNWGNQLVKLAANHAYEPAALHWTKQRMKRHLKAGGSAQDEVCAHEYKLFALEVLIIEYQRDGLNFDLTQCWGKPAEYFIDLEQARQGLQTEVSE
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MKVRVKDYPIRYKDTRYKKGDELSITQDAFNDELFVCLDKQKDEKTADNAQLETDDEE
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MTHLSRTTLINALAKVKPETPRVMFEALSDKALDAEFRAVTAEYNEQASQLMSVSY
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MSKVVIKGELPSLNEYIKAERANRYAAANLKKRYTALCSVYARASRNSGVEFSWPCKLKFTWYTKNNRKDADNIAFAKKFVLDGFMKAGLLGNDNRKHITGFQDEFAVDKRNPRVEIDEITEDEDA
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MVQVIANNRNRIDDMRMRAVMDHKQAEMMAFALNDPSKMPSVEEAYPFIKTATSTSSDSVPEWKRDQLLLMQQSQKIKTARKFKKTT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016511341.1|2137650_2137947_-	hypothetical protein	A0A1I9KK55	Lactobacillus_phage	4.4e-39	77.6
WP_169484473.1|2137947_2139063_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	O03950	Lactobacillus_phage	2.8e-33	61.9
WP_021732622.1|2139241_2139676_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046811036.1|2139678_2140128_-	DUF1617 family protein	A0A2P0ZLE0	Lactobacillus_phage	2.8e-21	40.5
WP_169484277.1|2140149_2145516_-	hypothetical protein	Q6SE68	Lactobacillus_prophage	6.4e-144	59.1
WP_099739626.1|2145530_2145863_-	hypothetical protein	V5UQS8	Oenococcus_phage	2.2e-42	73.4
WP_169484279.1|2145906_2151738_-|tail	phage tail protein	V5URV5	Oenococcus_phage	5.6e-226	40.9
WP_031275283.1|2151753_2152017_-	hypothetical protein	V9QKH3	Oenococcus_phage	2.3e-23	65.4
WP_033608825.1|2152124_2152523_-	hypothetical protein	V9QJA0	Oenococcus_phage	6.6e-46	74.0
WP_099447638.1|2152622_2153006_-|tail	phage tail protein	V5USQ9	Oenococcus_phage	1.8e-37	58.4
WP_033608826.1|2153107_2153473_-	hypothetical protein	V5UQS4	Oenococcus_phage	1.8e-29	54.2
WP_169484281.1|2153472_2154024_-	HK97 gp10 family phage protein	V5URV0	Oenococcus_phage	6.7e-65	62.3
WP_003642822.1|2154025_2154373_-	hypothetical protein	V5US85	Oenococcus_phage	3.2e-36	62.3
WP_013355731.1|2154372_2154705_-|head,tail	phage head-tail connector protein	V9QJ97	Oenococcus_phage	1.8e-12	45.3
WP_003642820.1|2154716_2154893_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642819.1|2154905_2155928_-|capsid	major capsid protein	V5US24	Oenococcus_phage	3.7e-117	62.5
WP_169484283.1|2155947_2156298_-	hypothetical protein	V5UTH9	Oenococcus_phage	1.3e-29	61.9
WP_063096761.1|2156312_2156990_-	DUF4355 domain-containing protein	Q6SE80	Lactobacillus_prophage	4.6e-15	32.1
WP_057138636.1|2157161_2157368_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642815.1|2157419_2157698_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046947684.1|2157672_2159358_-|capsid	minor capsid protein	V5US81	Oenococcus_phage	5.9e-120	58.5
WP_003642812.1|2159504_2159801_-|protease	ribosomal-processing cysteine protease Prp	D2J003	Enterococcus_phage	6.7e-11	40.2
WP_046947683.1|2159730_2161239_-|portal	phage portal protein	V5US18	Oenococcus_phage	1.8e-136	52.0
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WP_072533558.1|2162478_2163006_-|terminase	terminase small subunit	O03926	Lactobacillus_phage	2.3e-54	72.8
WP_064522742.1|2163059_2163317_-	hypothetical protein	A0A0N9SKC5	Staphylococcus_phage	1.3e-15	47.6
WP_015380624.1|2163439_2163637_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015380625.1|2164532_2165150_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642805.1|2165414_2165876_-	transcriptional regulator	D6PSV8	Lactobacillus_phage	1.1e-39	57.0
WP_013355743.1|2166086_2166467_-	endodeoxyribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_169484285.1|2166463_2166982_-	hypothetical protein	O03915	Lactobacillus_phage	8.6e-38	52.6
WP_022638119.1|2166978_2167266_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642799.1|2167262_2168171_-	DnaD domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_169484287.1|2168251_2169004_-	PD-(D/E)XK nuclease family protein	A0A0P0IZH9	Lactobacillus_phage	1.0e-71	51.0
WP_169484289.1|2169035_2169923_-	recombinase RecT	E9LUM3	Lactobacillus_phage	5.9e-63	53.3
WP_080466469.1|2169919_2170306_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638124.1|2170676_2171189_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	D6PST4	Lactobacillus_phage	2.0e-23	39.4
WP_169484291.1|2171256_2171562_-	DUF771 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642792.1|2171573_2171744_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063485774.1|2171768_2172068_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_169484294.1|2172067_2172268_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_169484297.1|2172414_2172651_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A0K2CNE2	Brevibacillus_phage	1.0e-09	37.3
WP_169484300.1|2172680_2172890_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046811054.1|2173061_2173334_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046811055.1|2173330_2173528_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101083.1|2173540_2173771_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016511202.1|2173943_2174306_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0U4KKM4	Exiguobacterium_phage	2.6e-09	32.0
WP_063486623.1|2174317_2174734_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	A0A0M4RD70	Bacillus_phage	4.5e-05	30.6
WP_003642781.1|2174806_2175175_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063486624.1|2175775_2176111_+	hypothetical protein	A0A1B0Y4P2	Lactobacillus_phage	4.1e-25	52.2
WP_076636272.1|2176387_2176564_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL93	Lactobacillus_phage	2.6e-10	51.7

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP052869|2372862:2381373|DBSCAN-SWA
CTTAAATTGCTCCTTCATTAATGAGTGTCTGTAATACATCTGGATAAAATTGGTGTTCACAATCATGAATCCGGGTCGCCAGGCTGGCTAGCGTATCGTCTGGTGCAACCGGAACGACCCGCTGGGCAATAATTTGCCCGGTATCGATTCCGGCATCGATATAGTGAATGGTAACGCCCGTCTCAGTCACACCAGCGGCAAAAGCATCCTCGATGCCGTGACGACCAGGAAACTTTGGTAACAATGCTGGGTGAATATTGATGATTTTATGAGCATACGCATTCAAGAGGGTCGGACCAATAATGCGCATGTACCCGGCCAATAATACCAGTTCAATTTGCCGTGCTTGCAAGGCCGTCAAAATGATTGCTTCCGCGGCCGCTTTATTCGCATAATCATGAAAATCAACAATTAATATCGGTACGTTAGCTGCCCGGGCCTTGTCAATTACCGGCGCTGTCGGTTGATCACACACAAGTAACCCAATCACTACCGGTAATTGTCGTTCAATAATCGCTTGGTGGAGTGCAACAAAGTTGGTGCCATTACCCGAAGCAAATACTGCAATTTTATTAGGCATGCTCAGCCTCCTCAAAAACGACGGGTGTCGTACCAGTTTGGACTGTTCCAACTCGATAATAGGACTGAGCGTTGGCCGTCAAATTAGCCGTCACAGCTGCCACTTGGTCGGGGTGAACGATCAGAACCATTCCCAAGCCCAGGTTAAAGGTCGACCGAAGATCCGTAGCAGTCAGCCCACCGAGTTCGGCCAGTAACGTCATAATTGGCGGTACCGGCCATTGACCCAATTCAAGGTGCGCACTCAAGCCCGCCGGTAACGCTCTGGCGACGTTCTCAATCAAGCCGCCCCCGGTAATGTGGGCGATACTCGTCACTAATTTCTGCTGTAACAATGGTTGAACTGCATCAACGTAAATGGTCGTTGGTCGTAAAATTTCCGTTTGTAAATCATGACCAAGTTCGTCAAAAACCGTGGTCAATTGGTAGTCGTGTTGTTTGAATAAAATATCACGAACTAGACTAAACCCATTCGAGTGGAGGCCATTAGACGGCAACCCAATCAAGACGTCCCCAGCCCGAACATTTGCTGGTGATAACAGGTCCGCGCGGTTCGCAATTCCGACCGCAAAACCAGCGAGGTCGTAATGGTCCTGACCATACATATCGGGCATCTCCGCAGTCTCGCCACCAATCAACGCTGTATGGGCCTGCTGACAGCCCGTGACGACGCCAGTCAAAATGGCTTTGACCCGCTTCTGATCCGTATGTCCAAGACCTAAGTAATCTAAAAAGAACTGGGGGGTCGCGCCTTGTGCCAAAATATCATTCACACACATTGCGACCAAGTCAATTCCAATCGTGGTATGTTGATCAGCAGCGATTGCGACTAAGAGCTTAGTCCCCACACCATCCGTCCCCGCTACTAACACGGGATCGTTGGCAGTTGCATCCGGACTAAGTGGAAACGCCCCCCCAAACGCGCCTAATTGCTGATTGCCACTCATTTGTTTGACCGTCTTTAAGACGTCGTAACCAGCGTTGATATCAACGCCAGCCCGCTTATACGCATCGCTCACTTGATCACCCCTTCATGATTGGCTTGTAATTGCGCAATTTCCGCATCATACTCGGCTTGGTAATCATACAGGGCCGTTGGATAATCCCCATTAAAATAGGCCATGCATAGTCCACCATACGGTTCGGTGGTCGACAAGCCAACTGCATCAACGACGCCCTGTTCACTGAGAAAACCAAGTGAGTCCGCACCAAACGTCTGACACATCTCCCGAATCGTTTGCTGAGCCGCAATCAATTCATTAGTCGATTGAATATCGATACCGTAAAAACATGGATAGCGTAATGGTGGCGATGCAATTCGTAAATGAACTGACTTTGCACCCGCATCTTTCAATAATTTGACGATCCGCCGACTGGTGGTACCACGTACAATCGAATCATCGATTAAGACGACTCGTTTACCAGCGACAACACCTTTGACCGCTGAAAGCTTCATCCGAACCCCCTGTTCTCGCAATGCTTGGGTCGGCTGAATAAAGGTCCGTGACGAATATTGATTTTTAATTAATCCCATCTCGTAAGGCAGGCCACTCGCTTCCGCATAGCCGGTCGCCGCTGATAAAGATGAATTGGGTACCCCGACAACAATGTCGGCGTCCACGGGCTGTTCAACAGCGAGCTGAGCACCCATTCGTTTACGTGCAGAATGGACGTTGACGCCGTGAATATCAGAATCTGGACGTGCAAAGTAGATAAACTCCATTGAACAAATCGCCAACTGTGTATCAGTCGTATAATGGTCGATCGTCAAGCCATGATCATCGATCGTTAACAATTCTCCCGGCTGAACATCTTGAACAAACGTCGCACCAATCGTATCAAGCGCGCAAGTTTCACTACAAACGACGTACCCGCCCGTGGGTAACTGACCGACGACTAATGGTCGTAACCCGTTAGGATCCAAAGCGGCAATCAAACAATCATTCGTTAGTAGTAAGTAAGCAAAGCCTCCGTGAACTTGACGTAAAGCATCCTTAACCTGTTCCGTTAACGTTGCTGCGGGGCTGCGTCGAATCAGATGCATTAAAATCTCACTATCAGAACTAGCATGAAAAATGGCACCATGCTGTTCCAACCGTCGCCGCAGTGTCACCGCGTTCGTCAAATTGCCGTTATGTGCGAGTGCAAACTGTGAGTCGCTAAAATTAAAACTCAAGGGTTGAATGTTTTCCAATCCATGATTACCAGCCGTGGCATAACGTACATGGCCGACTGCAGCTTGACCCGTCAAACGTGCCAACCGCCGTGGGTCCCGAAAGACATCAGCCAACAACCCTAGTCCGCGTTCCGTCTGCAGTTTGCCGTGATCATTCGCCGTGATACCGGCTCCTTCTTGCCCCCGGTGTTGTAACGCATGGAGCCCAAAGTACGTTAATTGGGCGGCGTCCGGCGAGCCCCAAACCCCAAAGACGCCACATTCTTCATTCAGACTTCTTACTTCAGTAGGCATGGTAAGGCCCCTTCCCACAACTGTTTGGCGAAACTAACCTTAATATCAAACGCCTGATCAGCAGTTTGAACGTGTAGCCGATCCGTTGCAGTTGTTCGTCCTAAATAGGTCACATATGGTTCCATTAAACTTTCAAACGCGGCTTGCTGTGCTGGTGTCACCGAGATAACAAATCGTGACTGCGTTTCCGCAAAGAAGTTGGCAGCGGGCAAGTCACTGGCCAGTTCCACCCCGATATTTTGTGGAAAACATGATTCGGCAATCGTCGTAATCAAGCCACCTTCAGAAACATCGTGGGCACTAGCAACTAGTCCTTTTTGAATCGCAGTTAACAATAGACGCTGATTACGATTTTCAGTCACAAGGTCAAAATCAAACAGCTCGCCACTGATCGTTCCCGTCAACATCTTTTGCAGCTCACTACCATTGAAATCGGCTTCTGTGGTACCTAACACGTAGACTGCATCGCCAGCGTGTTTAAAATCGCTAGTCGTAATATCTTTCTGATGCTTAATTAACCCGACCATCCCAATCATTGGGGTGGGATAGATGGCTTCCCCGTTCGATTCATTGTTCAACGAGACATTGCCAGAAATCACGGGCGTATTGAATAATTGGCATGCACGAGCGATGCCCATCGCCGATTCGTCCAAATCGTAAAATTGTTCAGGTTTCTCTGGATTACCATAGTTCAAGCAATCAGTGATGCCTAAAGGTTGCCCACCGGAAGCGACAATGTTTCGAGCAGCTTCCGCAACGGCGATTTCTCCACCGACACGGGGGTTTAAGTATAAGTATCGCCCGTTAACATCGGTGGTGACCGCCAACGCCTTATCCGTATGTCGAATCCGTATGACCCCCGCATCGGAACCCGGCTTGACGACCGTATTCGTTTGGACCTGCGAGTCATACGTTCCATATAACGACGCTTTGGAAGCAATCGTTGGCTGTTGGAGCATCTTCTTCAATGTGCCAGTTGCATCAACTAGTCGTGGCATAAATTGATGATGGCTCTGATGGTTCAAGCGCGTTGGTCGTTTCTTTTCGCGTTCATAGACCGGCGCTTTGGTCGCAAGTGCATCGACGGGAACATCTGCAACTAACTTACCATGATGGAATAATTGATACTGGTGGCCGGCTGTCACTTTACCAATTGTGACAGCATCAAGACCGTACTTTTCAAAGACTTGATAAATTTCTGCTTCGGCACCAGCTTTGACACATAGTAACATCCGCTCCTGTGATTCAGAGAGCATCAGTTCAAACGGCGTCATGCCAGTTTCACGTTGTGGTACCAAGTCAAGATTCAGTGACAACCCACTGCCTGCTTTGGACGCCATTTCGGCTGAGGAGGAAACTAGGCCCGCCGCGCCCATATCTTGAATCCCGATTAAAACATCACGATGTTCATGAATAACCTCGAGACACGCCTCCATCAATAATTTTTCCATAAAGGGATCACCAACTTGAACCGCGGAACGCTGGGTTTCATTGGCGTCATTAAATTCAGCAGAGGCAAAGGACGCACCGTTAATGCCGTCACGCCCCGTTTTTGCGCCGACATAAATAACGGCGTTGCCAATTCCTGTTGCTTGGCCCTTCTGAATATCAGCTTGATCCAAGATTCCAACACACATGGCGTTCACCAACGGGTTCTTCTGATAACTCGCATCAAATACCGTATCACCACCGATTGTCGGAATTCCAATACAGTTGCCATAACCGCCAATGCCGGCGACTACTTGCGAAATCAAGTATTTCGTATGAGCATCAGTCGGTTCCCCAAAGCGAAGACTGTCCAGCAGCGCAATCGGCCGGGCCCCCATCGAAAAGATGTCCCGAATGATACCACCCACACCCGTTGCCGCACCCTCATAAGGTTCAACTGCAGACGGATGATTATGACTTTCAGCTTTAAAGACCACGGCCTGACCATCACCGATGTCGATAATACCGGCGCCTTCACCAGGCCCTTCAAGTACCTGTTCACCCTGCGTCCAAAATTTTTTCAAGACTGGTTTTGAATTCTTGTAGGAGCAATGTTCGCTCCACATGCCGGAAAACAACCCGGTTTCAGTCTCGTTAGGTAAGCGTTGAAGGACCTTATCCGTTAATAATTGATACTCAGCATCGGTTAAGCCCCAATCCCGATAGACCTTAGAATCGCGAACATCTGTAGGTGATAATGGTTGCTTTTTAAGCATGGGTGACCTCCTCTTGACTCGCAATGACCGATTGAAAAATTCCGAGACCGTCCGTGGAACCTAAGATCATCTCCACGGCCCGTTCCGGATGGGGCATCATCCCAAGCACATTTCCCGCTTCATTTGTAATGCCAGCAATATTAGCCGTGCTGCCATTTGGATTCTCGACGTATTCGAAGATGATTTGATGATTAGCACGTAATTGCGCCAAGGTGGCCTCATCACAATAATAATTGCCTTCGCCGTGGGCAATCGGTAAACTAATTTGATCTGTCGATCCGTATGCGGTGGTAAAAATCGTCTCATGATTGGCAATTCGTAATGGGCTGTCCTGACAAATAAACTTCGCTGAGCGATTGGCCTGCAATGCACCAGGTAATAATCCGGCTTCGGTCAAGACTTGAAAGCCATTGCAGATTCCGATGACTGGTTTACCAGCGTTAGCAAATGCAATAACGGCCGGCATGATGGGCGCAAAGCGGGCAATCGCACCACTCCGTAAATAATCACCGTACGAAAAGCCACCAGGTAACACCACCGCGTCATAACCTGCTAATGAGGTCGCTGTCGCCGGAATCAAATCAGCCGTAACGTGTAAAATATCGCGCAAGGCATTCACCATGTCATGATCACAATTAGAACCAGGAAAGACTGGTACGGCAAATTTCATCATTACAAAGCCTCCATCTCAGTAATTTCGTAACGATAAGTTTCCATATTAACGTTGGCTAACAAGCGATCACACATCTCGTCGATTTCAGCGGCAACTGGCCGATCATCCGCGTGAATTTTCACCTCAAAATACTTACCTAATTCAACGGCATCGACATTCGTATATCCAAGTCGGTGTAAGGCATCATGAATCGCCTCACCCTTGGGGTCTAGAATTGATTGCTTATAAGTCACATAGATTTTAACTAAGTACATGTTAGGCCTCCTCAACGGTTGCTAGCCGCGTCAATACTTCCTGATAAACACTAGTCAAGTCGCCTAGATCCTTGCGGAAGACATCCTTATCAAGCGATGCACCGGTCTTTAGGTCGACTAACCGACAACTATCTGGTGAGATTTCATCAGCCAGCAAGACTTTACCGGTGGTCGTCAACCCAAATTCGATTTTAAAATCAACGAGCTGTACCCCCATCGCCGCAAAAATTGCCGTCAAACGCTGGTTAACCTGTAAGGCCTGCCGTTTAATTTCCGCCACGATTGCCGGTGTTGCAACATTTAGCGCGTGGATTTGTGAATCATTGATAAATGGATCATCCAGCTGATCACTCTTATAGAAAAATTCCAGTACTGGTTCTGCAAATTTGGTTAAGTGTGGCACGGCAAATTTACGCTCAAAACTACCCGAAGCCGCATTCCGAACAACTGTCTCCAAGGGAATCATGGTCACGCGACGGACAAGTTGCACATAGTCTGAAGGTTGCTCAATAAAATGGTTGGCAATGCCGTGATTGGCTAAGTCTTTGAAAATCAAACTCGCGATGCGATTATTCAATCGGCCTTTCTGGTCAATGGGAACCTTCCGCTTACCATTTAGCGCTGTTGCTTGATCTAAGTATTCGACCCATAGAATTTCAGGATCATTAGTGGCATACATCGCTTTCGCTTTACCCGTGTAAAGCAAAGCTTGTTTCTCAATCGCTGCCGTCATTATTATTGTTCCCCTTTCAAATTTGCCACCGACGCTAATGCTGCGTCAATATCGTGATTTAATACGGTGACATGACCCATCTTGCGCTGGGGCTTAATGGCCGCCTTACCGTAGTCGTGAAAATGCCATTCTGGGTGTTCAACCAACTGTTGACGTGCCACTGTTAAGTCATCACCTAGCAGATTACGCATCACTGCCGGACTGGTCTGCGTAATGGCCGGAATCGGTAAGCCACAGATACTTCGAATATGGGCCTCAAACTGCGAGATGTTGCAGGCCTCAATCGTATAGTGACCAGAATTATGTGGGCGTGGTGCCAGTTCATTGACTAATAAAGTATCATCCGGTAAAACAAAGAATTCGATTCCTAGCACGCCGCGTAGTTCCAGAGATTCAGCAATCGAAACCGCAATTTTGCGGGCCGCACTATGAACACTGGGCTGAACATTAGCTGGGGCAATCGTTGTGTGTAAGATATGATGTTGATGCTGATTTTCAACTAACGGAAAAGTCGTAACAACACCAGCAGCACTACGCGTCACCATCATGGAAACTTCTGTTCGAAATTTCTGCCGCGCCTCTAGAATGCACGGCTGTGTCAATAAGACACTAGCGGCTTTTGTCACCACTGCTGTGTCTAGATCCGTTTGTCCGTGACCATCGTAGCCACCTGCCGCCGTTTTGAGAATTGCCGGCGTACCAACACGGTTGAGGGCGTAATTTAATGACTGTAAATCCGTCACCGGTGCGAAAGATGTGACTGGGATGCCATGATCATGAAGAAATTGCTTCTCATTAAGACGATCTCCAGTAATATGCAGGAGTGCAGTGCCCTGCGGTAACTTTGCATAGGCTTGCGCAGCAATCAAAGCATTCTCATCAACGTTTTCAAACTCGTAGGTCAAGACATCACTACGGCGCGCTAGATCAAGTAAAGCCGCCTGATCATCATAAGCCGCAACAATCTGAAAATCTGCGACCTGGGCTGCCGGTGCTTTGGGTGTCGGGTCAAGGACACCTACCCGATAGCCCATCGCCTTCGCGCTAAGCGTCATCATCTGACCGAGTTGACCGCCACCAACGATTCCGATCGTTGCGGGTGGTAAGAGTGCTTCCTTAAAATTGGCGTTCACTTTGTTCAGCCTCCTGACGTTGACGAGCACGAAATTCTCCAATTGCATGTTGTACTTGTGGTTCCCGTAAACCGATAATTTGGGCGGCCATTAGCGCACCATTCTTAGCCCCCGCATCACCAATCGCCATCGTCGCCACGGGTACGCCAGCTGGCATCTGTACGATTGACAATAACGAATCAACTCCGTTCAACGTATGGGTCTTAATGGGCACCCCAATTACCGGGAGTAGTGTATTGGCAGCTAGCATCCCGGGTAAATGGGCAGCGCCCCCCGCACCCGCAATAATAACTTGAATTCCCCGTGACGCTGCTTCTTCACCATAGGATTGTAATGTCTGGGGCATTCGGTGGGCCGAAATAACGTGACGCTCATAAGAGACTCCCAGTGCCGTTAACTGTTCTGCCGCTAATTGCATGGTTGGCCAATCAGAAATTGACCCCATAATCAAACCAACTTTCGCCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP052869|2372862:2381373|2380890_2381373_-|WP_003645861.1|DBSCAN-SWA
MAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF
>NZ_CP052869|2372862:2381373|2379776_2380907_-|WP_003642586.1|DBSCAN-SWA
MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASVLLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASVANLKGEQ
>NZ_CP052869|2372862:2381373|2372862_2373441_-|WP_003645867.1|DBSCAN-SWA
MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI
>NZ_CP052869|2372862:2381373|2375894_2378114_-|WP_003645864.1|DBSCAN-SWA
MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK
>NZ_CP052869|2372862:2381373|2379042_2379774_-|WP_003642587.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP052869|2372862:2381373|2378786_2379041_-|WP_003642588.1|DBSCAN-SWA
MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL
>NZ_CP052869|2372862:2381373|2374455_2375910_-|WP_003642591.1|DBSCAN-SWA
MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIREMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK
>NZ_CP052869|2372862:2381373|2373433_2374459_-|WP_024002687.1|DBSCAN-SWA
MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSPDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVTGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTEILRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPVPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLIVHPDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTTPVVFEEAEHA
>NZ_CP052869|2372862:2381373|2378106_2378787_-|WP_011101895.1|DBSCAN-SWA
MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003645867.1|2372862_2373441_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	1.3e-21	33.9
WP_024002687.1|2373433_2374459_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3F760	Synechococcus_phage	4.2e-60	40.7
WP_003642591.1|2374455_2375910_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	2.5e-50	34.0
WP_003645864.1|2375894_2378114_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	4.5e-144	39.3
WP_011101895.1|2378106_2378787_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_003642588.1|2378786_2379041_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_003642587.1|2379042_2379774_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4SM18	Cyanophage	1.6e-37	37.3
WP_003642586.1|2379776_2380907_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_003645861.1|2380890_2381373_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	2.3e-16	41.0