Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048827 | Acinetobacter baumannii strain ABF9692 chromosome, complete genome | 4 crisprs | DEDDh,csa3,cas3,PD-DExK,WYL | 0 | 0 | 6 | 0 |
NZ_CP048828 | Acinetobacter baumannii strain ABF9692 plasmid pABF9692, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048827_1 | 1592755-1592918 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048827_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP048827_1
>1.1|1592778|37|NZ_CP048827|CRISPRCasFinder GCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCG >1.2|1592838|16|NZ_CP048827|CRISPRCasFinder CTGGTTATTTTGTTGC >1.3|1592877|19|NZ_CP048827|CRISPRCasFinder ACCGTGTTGCTGTTGATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048827_1
The CRISPR arrays of NZ_CP048827_1 >merge|NZ_CP048827|1|1592755-1592918|CRISPRCasFinder TGGTTGTTATTTGAGTTTTGTTGGCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCGCGGTTATCATTTTGCTGTTGTTGCTGGTTATTTTGTTGCTGTTGATCGTTTTGCTGTTGGTTACCGTGTTGCTGTTGATTACGGTTGTCATTTTGCTGTTGTTG >NZ_CP048827|1|1|1592755-1592918|CRISPRCasFinder TGGTTGTTATTTGAGTTTTGTTG GCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCG CGGTTATCATTTTGCTGTTGTTG CTGGTTATTTTGTTGC TGTTGATCGTTTTGCTGTTGGTT ACCGTGTTGCTGTTGATTA CGGTTGTCATTTTGCTGTTGTTG
>NZ_CP048827.1|WP_000132045.1|1592321_1592639_-|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDM >NZ_CP048827.1|WP_000498477.1|1592015_1592237_+|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP048827.1|WP_001136759.1|1591499_1591928_+|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP048827.1|WP_000251635.1|1591086_1591230_+|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSKNDGMHEASDPATSHDMNKNS >NZ_CP048827.1|WP_001984002.1|1589827_1590118_-|hypothetical-protein MFFLYRFVLVSLLTIGVLNLMGCRPMSKNEFNTRCVWAGHDLSACNCIYNSLEQHYSPQFVESLPKLSLQNIDAKMNFVETMNQTMQQCQLSASKH >NZ_CP048827.1|WP_000119785.1|1588920_1589826_+|LysR-family-transcriptional-regulator MSYFDINRSGELAIFIRVVELGSFSAVARACNMTPSAVSKLISRLEKRLGVRLLNRSTRQFQLTSEGCQFYEQGIQILNDLDELEQSVTANHIPKGRIRIHTSFSYWTHFLLPCISLFNQRYPEIELEAHLSDEVINLVEQRIDVAIRTGPLKSSNLVARSLGSTYKHYVCSPVYIEKYGCPEHPDELHEHQLLDVSYQRQNKTWLFKKATQEISLTPSKVLKVNHGEAILQLALAGAGIAQLNEFQIRNALQQKQLVKILEDWNIHASEEFHAVWIGHDKYVPNRVRTFLDFLVEHASIN >NZ_CP048827.1|WP_020753041.1|1587570_1588809_-|SGNH/GDSL-hydrolase-family-protein MKLYQATLFSLVLITSFAQADVEKSQWITTWSASPQKVWNKDFVFPTLIPEQVSNQTIRQMSKISLGGEAVRLVFTNQYGKQPLYIDQTTIGLANAATLKSKSTYPVYFSGQLKARILPGKQLISDPIQLPVPDHAQLVMNSFIQKSTTFKTFHWDAKQTSWLISGNQTTNLTTPTDAKTTTARLLLSAIEVKPKQKAHVVAVVGDSITDGATATLDANTRWTDFLAKRLSAHRVAVINSGISGNRLLTDGMGDSVLKRLNSEIFQYSGVKTLIVLVGINDISWPGTAFAPKQQIPSFEALTQGYRHVVSEAHKHNIQVIGATLLPFSGALPNTPLDNYYQPNKDQLRQRINHWMRTSHTFDGVLDLDKGLKDPKHPNRLNPIYDSGDHLHPNDRGNQHMAELVDLDQIIKN >NZ_CP048827.1|WP_086225857.1|1586241_1587525_+|DcaP-like-protein MKILNTTIQKSLLAVSVTLLMSSAFAGQVNPEIEQLRQEIKELRAMLQTNMEAQKSLAQKRVEQAAPVVTQAPQPIQQTLTKSGAEFNLYGYIRADASYQIKGASTMYNNISGVPLENTPEESAQKDQLHSTVYVTRFGLNFKTPTAVGDVGGKLEMDFFGAATRDQFRIRHAYLTFDKWLIGQTWSTFIAPEYYPETIDAGTFVGSALLRSPLVRYSDNLTANTSFAVSVEDPKYTAATDPDNKMRLPALVGRLNHKFANGSMLSGRSFVAEKRTNNDSEWAWGVGLGGKYQITPDTLLKADYYHVKGDGRFLLWSNSGYAIDDQNNMHSNEFDTVSLGITHQFTPQIRSTLGYGYMKAKDDNRFAELQRTSTTQNKQLWQGWVNALYNPYKPITLGIEYVYGERETFDNRNGIDNRFNMIASYDF >NZ_CP048827.1|WP_001029900.1|1585326_1585998_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAKDFNSPKVVEGYDAHIRKLIPGYEVIHQQVDAILQSVLRPDAHILIVGCGTGYELEYLLKRHPNWQFTAVDPSLTMLQKAQEQVEILGKSAQVTFVHGETSALPLESCFDAALSILVAHFIADDIKPAFFKDIYKRLKEKAPLLTYDLMTCVNPQQLQALHYLCLAQGLTEEQCQKMLERMAEDFFSLTTEGYIKLLEETGFESVQPYTQILTYQGFIAKK >NZ_CP048827.1|WP_001183735.1|1583575_1585270_+|AMP-binding-protein MQQERLSYASGPSTQPLLGMTIGEQFDQACQQYAEKEAIVSFHQNRRLTYKALQDEVNAFACSLLKLGLKKGDRLAIWSPNCVEWTITQFAAFKAGIILVNLNTAYKSHELEYVLNKVSCKGLIIASQFKTTDYQELLTKIAPELTTCIDKVLSSERLPHLKFVIKIDDQQHTGIYRFSDLLTTPTSEQLEQLKQLARQLQFDETINIQFTSGTTGNPKGTMLTHHNILNNGYFVGEGIRLTPQDKVCISVPLFHCFGMVMGNLACVTHGATMVYPSAVFNPLETLKAIHQERCTAAYGVPTMFIATLEHEQFNDFDLSSLRTGIMAGSPCPREIMQRVIDRMHMSEITICYGMTETSPVSVQSSVNDSIDKRVSTVGHVHPHVEIKIVDLEGQIVPQGTLGELCVRGYSVMAGYWGEEEKTREVIDAAGWMHTGDIAEMDQDGFIKIKGRIKDVVIRGGENLFPKEIEDFLYTHPDVSDVQVIGLPDAKYGEELCACIILHEHHQVDEDSIRQFCKEHISHNKVPRYVRFFNEFPMTASGKAQKFKLQEIMRAELNLTGNVFD >NZ_CP048827.1|WP_000482091.1|1593250_1593730_-|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP048827.1|WP_001145679.1|1594045_1595455_+|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLAKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPSEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNKYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP048827.1|WP_085941324.1|1595509_1597654_+|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEQGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLNYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP048827.1|WP_000432325.1|1597708_1598587_-|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLEEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFAMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP048827.1|WP_000983630.1|1598728_1599142_-|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKLLDNIVVKNNKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIIESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP048827.1|WP_161794718.1|1599692_1600865_+|stress-induced-protein MDPERVREIASKGGRAAHASGNAHEFTSEEAREAGRAAHASGNAHEFTSEEAREAGALSHKNDDRNGRGRSRYDDDEDDDRGRSSGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSSGRGRGRSRRDDDDDDDDRRGRSDGRGQNSRNQKRDAYGRFTS >NZ_CP048827.1|WP_020753044.1|1600925_1601162_-|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAENIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP048827.1|WP_001124837.1|1601444_1602056_+|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTDNQTDFTSKLKIQQIHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFQPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP048827.1|WP_002048382.1|1602126_1602738_-|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNQSGSEKAQSWLSWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHMISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP048827.1|WP_000376213.1|1602894_1603350_+|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVAKDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP048827_2 | 1929939-1930040 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048827_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP048827_2
>2.1|1929963|54|NZ_CP048827|CRISPRCasFinder TCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048827_2
The CRISPR arrays of NZ_CP048827_2 >merge|NZ_CP048827|2|1929939-1930040|CRISPRCasFinder GAGGATAAACAAAGCAATGCTTTGTCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAAGAGGATAAACAAAGCAATGGTTTG >NZ_CP048827|2|2|1929939-1930040|CRISPRCasFinder GAGGATAAACAAAGCAATGCTTTG TCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAA GAGGATAAACAAAGCAATGGTTTG
>NZ_CP048827.1|WP_000465452.1|1927585_1928281_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MFFKQFFEKESSTYTYMLGCEETRVAVLIDPVASDIEIYAKELEQHQFTLIYTLDTHVHADHITAADLLRERFHCKSVLHRNSDVSCGDILITDGCMLKVGNLSIEARYTPGHTNACTSYLVGNMIFTGDALLIDGCGRTDFQQGSAGTLYDSIHKQLFSLPDETIVYPGHDYKGRLSSTIGYERLNNSRLGQNRSREDFIELMNNLNLPYPKQIDKALPANQACGSISQL >NZ_CP048827.1|WP_002126138.1|1926122_1927394_-|sigma-54-dependent-Fis-family-transcriptional-regulator MAKLNFELEQDFYILFEQLKALFPNAILFLVDTSTQAIHYKFNTDDISVESMAALTQDHHNQYLEINTPKMRRRFIYQEHDIYIAEHRIIGKLHILQPVSIENDIVDGVELTEQLQDLAKVFNSCSPEMTRMFSIIQRVAITEFPVLVRGESGSGKELVAKAIHDYSQRKNKIFVAINCAALNSNILESELFGHVKGAFTGAIRDHKGVFERAAGGTLFLDEIAEIPLELQAKLLRVLETGEFTPVGGEKPIQANVRIITATHKALREEAKAGRFRHDLLYRLRVIPIFIPPLRERKVDIPLIVDQILKESSTQLDTMPRHVNQKAMQVLLNYDWPGNVRELKNTLLYALTMANGKDEIEVEDLPNELLNADDYVKLPETNAELSPENVQAALEKYNHNLNMVANIFGISRTTLWRYRQKHKL >NZ_CP048827.1|WP_000637000.1|1925141_1926053_-|bestrophin MIVRDKSNVFKLLFAWKGTILPKVLPALSFVVLISACVVWLSYYHWIQIPTVPAIGFTIFGVILSICTGFRNNACYDRWWEGRKLWGALIANARHIVRDSHVLSNEQREHLIHQVLIFCNLLRDRLRQQTVEPTKFLEHAYLNNSSLNYLNEHINAPQFVLENIQKDLVKALKDGEISDIIYGTLTRHIVELGNIQAGCDRIAGTPLPYSYSVLLHRAVYCFCFILPFSLEAALGIWTPLIVGLIAYMFLGLDALSAQIEEPFGLQENDLPLDSIVRLIERESLSSLGQPLPPIIEAQNNNLL >NZ_CP048827.1|WP_000642319.1|1924035_1925094_+|2,3-butanediol-dehydrogenase MKAARFYDRGDIRIEDIPEPEVTPGTVGIKVAWCGICGTDLHEFMEGPIFIPPCGHPHPISGESAPITMGHEFSGVVYAVGEGVDDIEIGQHVVVEPYIVADDVPTGPGDNYHLSKNMNFIGLGGRGGGLSEKIAVKRRWVHPISNKIPLDQAALIEPLSVGHHAYVRSGAKAGDIALVGGAGPIGLLLSAILKAKGLKVIITELSAKRKEKAKESGVADYILDPSEVDVVSEVMKITNGDGVDVAFECSSVNKVLDTLVAAVKPTGVIVIVSIWSHPASINVHSVVMKELDVRGTIAYVNDHQETIKLVEEGKINLEPFITQRIQLDDLISQGFETLIHNNESAVKIIVHP >NZ_CP048827.1|WP_000238436.1|1923220_1924006_+|acetoin-reductase MVKGLKNKVALVTGAAQGIGRGIALRLAQEGAHIALVDMKQDRLNDVQQEIQALGVNASTFIADVSDREQVYAAINHAEQTLGGFDVMINNAGIAQVQAIADITPDEFQKIVDINIGGVLWGIQAAAAKFKQREHKGKIINACSIAGHDGFALLGIYSATKFAVRALTQAAAKEYASHGITVNGYCPGIVGTDMWVEIDKRFAEITGAAIGETYKKYVEGIALGRAQTPDDVAALVAFLASEDSDYITGQSILTDGGIVYR >NZ_CP048827.1|WP_001271394.1|1921790_1923194_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSAAQFDLIVIGAGPGGYVAAIRAAQLGLKTAIVEEQHLGGICLNWGCIPTKALLAGAELATQFKHAGQFGFQVSQLDFDVQKLVQHSRQVSAQLVQGIDYLLKKNQVTVFNGRAQLTAKEKIEVTDAQGNSQVLSAPHIILATGAKARHVPQLPVDGTYVWSYKEALVPEQLPKSLLVVGSGAIGSEFASLYQDLGCQVTLIDLAKQILPTEDAEVAQFVRKQFEQKGMKVITDAVVQSIQIENEQVHCVVETANDVQTLVFDRVLSAIGVQPNTTGLGLERLGVELNPQGFVAIDDYCKTNVAGLYAIGDVAGAPCLAHKASHEAMICIEKIAGVANVHSLDRSQIPGCIFTHPQVASIGLTENAAKAKNLPIRIGKFSLTANGKALAIGDASGFVKTVVHAETGELLGAHMVGHEVTEHIQGFAIAKYLEATDESLAQVIFPHPTLSEAMHESILASMQRAIHM >NZ_CP048827.1|WP_001289733.1|1920244_1921780_+|2-oxo-acid-dehydrogenase-subunit-E2 MSEIKTLEIPKWGLSMEEGTIAQWLIKEGDSFNKGDEICEIETTKIVNVLEAPFAGTLRKILAKDGDTLPVGGLIAVCADSEVSDAEIEKFIASLGGSAAQAPEAPSEQSKAETSAPVAEKTAQPQTAAASASAPAKVAKDDYAVPESLQGYQTSNELFATPHALKLAEKHNVNLAKVTGSGREGRISVQDIQKAVQASGGQWPDVRQQTQAKVVKSTADDSQVLATPVARRLAKQWGINLNDCRVSGTRGRVCKEDVEAVYYRNNPVSVSEQPVQCAAQPQSTVTTVAMNGMRKAIASRLQAAKRNAPHFRLVVDLNVEALQKLRKQINETVPQVKLSINDMLIKAAAAALIKVPEVNVQFDEATQSILQFSQADISVAVAIPNGLITPIVKAANQKSLAQISDDMRDLATRAKTGKLQPDEFQGGSFSISNLGMLGIKQFDAIINPPQGAIMALGASESRAVVENGNVVVREIVTATLSCDHRVIDGAVGAKFLASFKQFVENPALILV >NZ_CP048827.1|WP_001133053.1|1919223_1920243_+|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MPNKSFRNAIKEAIESEMRRDPTVFVVGEDVRGGHGGKNTEENQLEGFGGVLGVTKGLWTEFGSERVIDTPITESAIIGMAAGAAATGLRPVADLMFMDFYGVCHDMLYNQAAKFRYMFGGKAKAPMVVRGMIGAGFSAAAQHSQSPYNVFAAVPGLKVVVPSSPYDVKGLLIQAIRDDDPVVFCEHKMLYDIKGEVPDDAYTIPFGVANYTREGTDVTIIALGLMVHRANEVADKLAKDGISVEVVDPRTISPLDEEGILESVASTGRVVIVDESAARCGFGHDVAALIAQKGFHYLKAPVELVTPPHTPVPFSPVLEKEWIPSVERIEQAVRKTLEA >NZ_CP048827.1|WP_004841245.1|1918247_1919210_+|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MQLTEEQLLAAYKRMRDIREFEDRLHEENTNGDIPGFIHLYSGEEAVAVGICENLTDKDYITSTHRGHGHCIAKGCDIHAMMLEIFGKDDGLCRGKGGSMHIADLDKGMLGANGIVGGGPPLAIGAALTAKTLKTGGVGLSFTGDGGSNQGLTFEAMNMAVVLKLPVIFVFENNGFGEGTGHDYAVGSKDIAGRAAGFGLPAVKVDGTDFFAVYEAAQTAIDRARRGEGPSVIETITNRFYGHFEGDPGLIRSKEEVEFIKENKDPLKIFREKVKGKIDEAKLDEIDAASKANVDDAVAKARAAAYPKPEQLLTDVYVSY >NZ_CP048827.1|WP_000364551.1|1916896_1917883_-|lipoyl-synthase MDLKRQIETGIKLRGIDKVSRIPIKILPTEELPKKPEWIRAKITDFEEIQRIKNLLRQQKLHSVCEEAACPNLPECFAGGTATFMIMGDICTRRCPFCDVAHGRPMPLDENEPKHLAETVANLNLKYVVITSVDRDDLHDGGAAHFVKCIEEIRNRCPDTLIEILVPDFRGRLETALSTLSLSPPDVFNHNIETVPRLYKAMRPGSDYQHSLNLLKRFKKYCPDIKTKCGLMVGLGEIEAEVIALLNDLKDHDVDLVTIGQYLQPSKSHAPIHRFVNLQEFERYTQHGQRLGFKNIWSAPMVRSSYFADRQYFGESAPKPFSREDVLS >NZ_CP048827.1|WP_000925651.1|1930140_1930932_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MLLLVVEGIVIGFLLGLTGAGGGILAVPALMTSQGWSVAQAAPIGLLAVALSTLIGTIEGLFKKIVRYRAAIWIALIGAPMAHIGILIANTISPIWLMLMFSLVMFTVGYRLINNRVSDFHNPPCQVNPSTGRFIWNFKTGGVLASIGIIAGLLTGMLGVGGGFVIVPALRKVTNLDMHSIVATSLMIIFLISGMSIVMHIAEGFQYPVAITSAFALACAFGMLLGRRAIRFIPSAIVQKVFALMVFAVAIYMVIKIVNLTNI >NZ_CP048827.1|WP_000822394.1|1931041_1932046_+|hypothetical-protein MKRINVAICGFGRIGQQIAELLLNRSTYYKQKYQIDARLVGVCNSSSGLIDQEGLQASKWLDKTQYQAGLTEQKFLKQVQADVIIETGPSDYVTGGKGLFYLNYALTHSMNAIAVSKGALVVEGKKLINLAHQHNKKLFFSGATAAALPTVDLFEYNLAGCQILEIESVFTGTTNFILNDMLQHECAFTESLEKAQARGIAEPNSSFDVDGWDTAAKITILANTVLGVDVKIQDIPRQGISHVTTEHIRDWKKENIIPRLVGFIHIKNQQIQTGVELRLVPANHPFAHLQGSNKCIRVLTQEMGEFVVSGGASAPLATAAAALKDFELMLKTGC >NZ_CP048827.1|WP_001023744.1|1932078_1932996_-|EamA-family-transporter MNILLYVAVVLIWGTTWIGIAVQSHYATPVVAILWRFAISALLLWVVLLFSGKLQRIALKDHLFCMLQGLCVFGLNFICFYTAVKYVNSGLESVIFSMAVFFNAINALIFFKQKPSPNFAPAALLGLSGIVLLFWHDLINSQFNAQLLMGIGLCAIGTYGFSLGNMISVRHQKRGLNIFSTNCYAMTYGALVMLILALFTGQDLMPPMNFPFLSSVLYLAVFGTVIGFSAYFSLVGRIGAAKAAYSTLLFPLVALTVSTFFEGYEWTLNAVFGILLILLGNYLMFSKFEIGKKLFSSQKNCEKQA >NZ_CP048827.1|WP_000331400.1|1933162_1934017_+|AraC-family-transcriptional-regulator MAYQTLEQLQQSKAKLHETVVLDENMQLAFWSNQQDRVSVCSDHHTLSLYIQDGYESYQKTPAGWKNGGGPGRFCLLPEHQESTWDIRGGLKFVHLYYTDQHLRDVAEKIWDKEPNQIELNEVVFNDDERIRALYQFFLLDCDWQDSSNHLQMSTTASLLLNHLIRKYSSVQWQQPTIKGGLAPHKLKYIQEWIEDHLDQALTLSDLANVVNLSEYHFAHMFKQSMNMAPHQYVMQRRLTKAKGLIQSSQLSLQDIALVCGFSSASHLSHRFKQFYGMSPSQLR >NZ_CP048827.1|WP_004835232.1|1934013_1934409_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTVTIPHDIQSSDCQRVSQVLARVGEKWSILIVMTLASHPHRFSEIKRRINGISQRMLTLCLRGLERDGLVKRTVYPVVPSHVEYELTPLGHSLTEPVIALGQWAQQHIADIDAARAAFDAAQEKPITLDT >NZ_CP048827.1|WP_000771644.1|1934504_1935113_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MKLLQIDTSILGEQSVSRQLTSSVIRQLSTAYPDAEIIHHDFALEPIPHLSDAEFLAWQGVEPNNEIAQQRVARNTQYLDEFLSSDIVVIGAPMYNFSFPSQLKAWLDRLSVAGKTFRYTENGPQGLVEGKRVIIASSRGGVYSEGSPAEALDYQETYIKAFFNFIGVTDITFVRAEGIAFGPEARQTALDNAAAQIAQLAG >NZ_CP048827.1|WP_001186401.1|1935196_1936546_-|chromate-efflux-transporter MQQKQLNTPDDSVEQVTFWQAILFWLKLGFISFGGPAGQIAVMHQELVEQKRWISEKRFLHALNYCMLLPGPEAQQLATYIGWLMHRTTGGLVAGILFVLPSLFILIGLSWVYIKFGDVPVISGIFYGIKPAVTAIVFHATYRIGSRSLKNKFLWFVAIAAFFAIFFLKLPFPLIVLSAGIAGYLASKKYPELFSSAAGHKASQKDYGPAIIDDDTPTPEHAKFHWLRLAKLIFVAIALWLLPILALGAYFGWHHSYTQMAWFFTKAALLTFGGAYAVLPYVYQGAVNHFGWLSPTQMIDGLALGETTPGPLIMVVAFVGFLGGVNHSLLGSEHLFFAGALGAVIVTWFTFLFSFVFIFAGAPIIESTHNEIKFTAPLTAITAAVVGVILNLALFFSYHVLWPQGFSGHFDIVAALITVAAFIALFRFNINVLYVIFASALVGLAVTFF >NZ_CP048827.1|WP_000080821.1|1936787_1937531_+|GntR-family-transcriptional-regulator MSQLPQDPKNHKPLYDQLRELILNKIVNGEYAVLSQIPSENEFAEQFGVSRITVRQALNQLQLEGYIFKVPGKGTFVSKPKTFQNISSLQGFAEAMSSAGHEILNRVISAELKQVPMHVVPKLKLPVKANVYEIQRVRLLNRQPVSYELTYLSEHIGLKLKEKAIDLRTTDIFKALEQECDIPLGHADLSIDATVADEELAALLQVEIGTPVLRVERLTHDANGQPIDYEYLYFSGDTFQYRLRIHR >NZ_CP048827.1|WP_000448778.1|1937559_1939293_+|fumarate-reductase/succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit METKYFEFDIVVIGGGTAGPMAAIKAKQENPNLKVLLIEKANVKRSGAISMGMDGLNNAVIPGYATPEQYTKEITIANDGVVNQTTVYAYAKHSFTTIQQLDQWGIKFEKDETGEFAVKKVHHMGAYVLPMPEGHDVKKVLYRQLKRAQVKINNRIVTTKLLKNEQGAINGVLGFDCRSGDFYVIKTKAAILCCGAAGRLGLPASGYLMGTYENPTNAGDGYAMAYHAGAELANLECFQINPLIKDYNGPACAYVTGPLGGYTANSKGERFIECDYWSGQMMWEFYQELESGNGPVYLKVDHLAEETIQTIEEILHTNERPSRGRFHEGRGINYRQDMVEMHISEIGFCSGHSASGVWVNEKAETSVKGLYSAGDMAAVPHNYMLGAFTYGWFAGVNAAQYVNAVEDSELNQSEIEAEKARIFAPLDCSEGLPPEQVEYKLRRFVNDYLQPPKTRQKMEIGLKRFEEIKQDIKRISARNPHELMRAAEVSFIRDCAEMAARASLFREESRWGLYHYRADFPQKNNSDWFCHAHLKKDEHGNMVSFKKPIEPYVVPINQDEAVSYDRLRIQKDVALAD >NZ_CP048827.1|WP_000864074.1|1939313_1939559_+|ferredoxin-family-protein MAFIFKEVQHRTVAPVIIDEDKCIADKGCTVCVDVCPMDLLAIDPTTQKAYMQFDECWYCMPCEKDCPTDAVKVNIPYLLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048827_3 | 2193506-2193650 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048827_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP048827_3
>3.1|2193552|53|NZ_CP048827|CRISPRCasFinder CCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048827_3
The CRISPR arrays of NZ_CP048827_3 >merge|NZ_CP048827|3|2193506-2193650|CRISPRCasFinder AAATTAACCATAACTATGTTCATCTCGCGCTTCGCCAAAGCTTTAGCCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATACAAATTAACCATAACTATGTTCATCTTGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG >NZ_CP048827|3|3|2193506-2193650|CRISPRCasFinder AAATTAACCATAACTATGTTCATCTCGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG CCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATAC AAATTAACCATAACTATGTTCATCTTGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG
>NZ_CP048827.1|WP_000616034.1|2193221_2193455_+|hypothetical-protein MIQRISHHDLEHVYATAVNTIQSQMNFQDAVAQLEEVARAGHGKAALFLAELYYQGFRVERDSMKAQYWQKLATMQA >NZ_CP048827.1|WP_000185571.1|2192646_2193006_-|hypothetical-protein MTNTIDGFVFDNPPKEEQIIELAHYHRKLLDEAIFHQEIHLGDYCLAQRKRVFDYARQLDPNQKAWFYQVYDGELRKIADEDELHPADAEEGLSIFAMLLVLVIIAAILYFSVIRSLMG >NZ_CP048827.1|WP_000955083.1|2192219_2192546_-|hypothetical-protein MLTFKENFLKLKSELKADQCFNLVVIIIIGCIFMLSYLALLRPVNSEQYQRIVQLSRQATYPRTQDMAELIMAQSEIHRAEYLKLMHAYQFEHNHIKQYPALAQEDTQ >NZ_CP048827.1|WP_001187342.1|2191005_2192112_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MQQQSNMQNKFLIDAEIGDDDVTLPNLPAIDVPIVESPVKQEVKAEEVVEAAPSTEPEQPKSGFFGRMKEGLSKTRRNFTDGMVNILIGGKEIDDELLEEVEEQLLVADIGVDATKTIITNLTERTARGDLIYSHSLYKALQEELVALLAPRVKPLHIDPNKSPYVILMVGVNGVGKTTTIGKLAKRLQGEGKKVMLAAGDTFRAAATEQLQIWGERNDIAVVAQGHGADSASVIFDAFESARAKGIDVLIADTAGRLHNKSNLMEELKKVKRVMQKIDATAPHEIMLVVDAGTGQNAINQVQEFDQAVGLTGITITKLDGTAKGGVLFNIASRTHVPIRFIGVGEKIDDLRPFSAKSFVAALFETEK >NZ_CP048827.1|WP_000102943.1|2190220_2190817_-|nitroreductase-family-protein MSTFLDKIKNRRTIYAIGKNVALDRTKIEETIREAVKHSPSAFNSQSSRVVTLYGESHAKFWNLVREALRKIVPADAFAGTNAKIDSFVAGVGTVLFYEDQAVVKSLQEQFELYADNFPVWSEHSSAIAQFATWTALSELGLGASLQHYNPIVDADAAEAFDVPATWKLRAQLVFGSVEAPAGEKAFISDEDRFKTFN >NZ_CP048827.1|WP_000175351.1|2189323_2189995_-|DUF2057-domain-containing-protein MTLRLSVAAMGLLLSGSVFSAVTITAPEEIVILAVNGQEVNSGLFRSSKNNYKVDAGETSLSVRYQEYFEHLSGEHDIVKSGVVTIQTPALKDGQTYKLAMVDAPKQFEQAKKYAEQPTVALYNSNNELIVQQTGANNEARPWFASGLLGKVTDFTTKSSKQQPDAVYAVAKPTTTQANAPVATTMPPTGVAQTNDQRLAEIWKKSSKAERQKFMAWLAEQSN >NZ_CP048827.1|WP_000593796.1|2188726_2189251_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIKLNFRLAEFSDIPTLVELINQSYREQQGRSWTTEVEYVKGQRINKEQLKHQLELPNSVLLIGEIDSSKVVTCIGLTFQSNTVEIGTFCTDPHVQNMKIGRCVLEYAEQFALHKVPELDSAIMYVLNVRSELIAYYERRGYIKTGNHEPYPLDANVGLPLIPIKLIEMKKDLK >NZ_CP048827.1|WP_085916945.1|2188414_2188714_+|cyd-operon-YbgE-family-protein MMATAMTASNQRKAQAFAMAISFLLALPLAVILLVHPSLMLDANGHYNHSQLMLVMVGISGGFIYGVGFVPHFWLWKWLFSPWIAWPLMLLGYYIWFLT >NZ_CP048827.1|WP_000270276.1|2188312_2188414_+|cytochrome-bd-I-oxidase-subunit-CydX MWYFAWILGILMACFAGVLSALYIEHHQNLDEE >NZ_CP048827.1|WP_000575163.1|2187153_2188299_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIEYELLKIIWWVLVGVLLIGFALTDGFDMGSMALMPFVGKTDNERRAAINTIAPHWDGNQVWFITAGGALFAAWPMVYSVAFSGMYWALLLVLFALFLRPVGFDYRSKLENTQWRNSWDWGLCIGGAVPALVFGVAFGNLFLGIPFSLDSTLRSEYSGSFFALLNPFALVCGIVSLSMLCAHGGAWLMLRTDGALKQRSAKATQIMAAIFLVCFLVIGAWLYFGQVPGYSYAAAVDPNAALNPLAKEVVTNNNPGWMNNYSSYPITKVAPVLAILGAIIAFFTASKAKAGLSFAGTSLMIVGAILTAGFALFPFLLPSSVNPNSSLTMWDAVSSHRTLGVMTVAACIFVPIILIYTSWSYYKMWGVITNKHIESNSHSLY >NZ_CP048827.1|WP_077163451.1|2193932_2194265_+|DUF2750-domain-containing-protein MIKIYILRTMMYCGVLWGLFDEGWAIKSDQEDFIFPFWLNGVQAHRYAKTHWPNYKPRKITPKDFHESLLPTLTRLKVTPALFNSSHRKLKLSTQQMHHFFFNHPKWQVA >NZ_CP048827.1|WP_000156920.1|2194405_2194837_+|CBS-domain-containing-protein MTIVAQVIKNKSEQAIFTISPEATVLEAITIMAEKGIGALVVAEGEQVVGILSERDYTRKVTLMERSSYSTTVAEIMTAKVITVGLNNTVEECLQLMTDRHLRHLPVLDNGKLVGFISIGDLVKAAMEDQKVLIEQLKQYISG >NZ_CP048827.1|WP_000129938.1|2194887_2196096_-|aspartate-aminotransferase-family-protein MTDITLAPVQPDQPTHLMATYGRQAISFVRGRGAYLYAQDGTEYLDALTGIAVCGLGHAHPAIAEAIAEQAATLVHTSNLFEIPWQTAAAQKLAEVSGMEEIFFSNSGAESNEGAIKIARKFGTQQGISLPKIIVAEQSFHGRTLATLSATGNKKVQDGFAPLVEGFIRVPFGDIEAIQEAALQHPDIVAILIEPIQGEGGINTAPQGFSYLEEVRQICNQHNWLMMLDEIQTGNGRTGKYFAYQHTNIIPDVLTTAKGLGNGFPVGAVMTQGKAVGLLGPGSHGSTYGGTVLGSRVVYTVIDTIQKENAVENAAVVGNYIVDQLRAQLSDKNVQVRGFGMMIGIQLPKDCAELVAIARDEYKLIINVTAGSVVRLLPPINMTQAQADILLERLVALITNYL >NZ_CP048827.1|WP_000138830.1|2196323_2196665_+|Grx4-family-monothiol-glutaredoxin MTEQARDTEALIRDQIAKHPVLLYMKGTPQFPQCGFSARAVEALSQIGRPFAYVNILENPDIRATLPKIANWPTFPQLWVNGELIGGSDIMLEMFQNGELKPLIEQYSAAPEA >NZ_CP048827.1|WP_000121851.1|2196711_2197035_-|hypothetical-protein MSYQLVELENATANIICPICKLAVIDWTQEQYVQPCEHTVFIAMDLGFEFVADRFEQVMNQNVDELHEDPNMNIFDAITTTPYKNLTILKADLGVDGLFRYVGISVC >NZ_CP048827.1|WP_000954523.1|2197278_2198181_+|LysR-family-transcriptional-regulator MLTDLDDFYCFALVVEHGGFSAAERVTDIPKSKLSRRVYNLEENLGVRLIQRSSRHFAVTDIGMDIYRHAQVMMNAAQAAHDLVDHLSIQPRGVVKVSVPVDIAQNQLPKILPAFLKKYPEIRLQLIVSNRRVDVINEGIDIALRVRSKLDDDPSLVLRQFALIEQSLFASQAYLNEFGNIKSPDELSDHRILSLSEEHLDQQFILHGPDNQLKKVKVSPTIMGTNIYMLAQLASQNCGIALLPDTAAEDFVKSGQLVQILPDWKAAHGIFHAVYPSRRGLLPAVRVFIDYLVEHLSEHP >NZ_CP048827.1|WP_001202783.1|2198232_2199027_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MRASTVTIKTEQDLEKLRVSGRLAAQVLEMIGEYVKPGVTTEYLDNICNDYIVNTLKVIPANVGYHGFTKTICTSVNEVVCHGIPSQNKILKDGDIINIDVAIIKDGYFGDTSRMYYVGNVNPHAKKLVETTYEAMVAGIHVVKPGATLGDIGYAIQSVAHREGYSIVREYCGHGIGKVYHEQPNILHYGQRGQGLVLKKGMVFTIEPMVNAGKPQVKELNDGWTVITQDHSLSAQWEHMVAVTDTGFELLTPWPEGVGNYPEI >NZ_CP048827.1|WP_001186687.1|2199379_2200681_+|branched-chain-amino-acid-transport-system-II-carrier-protein MQQLRTGDIIALGFMTFALFIGAGNIIFPPIVAQQAGDHVWLAAIGFLITAVGLPVITIMALSRMQGSIEIISSPLGRIASLILTVVCYLSVGPLFATPRTATVSYEIGFSSYFGTSSSSLLIYSAIYFAFVTVVSLYPNKLLDTVGHVLAPLKIIALAILGIAAVMIPAGYVPTPINHYVNSPVSEGFVNGYLTMDTLGALVFGIVIIQAIYSRGVTDNKLVTKYAIIASLISGVGLTLVYLSLFKLGLGSHEVAPNAANGAVILHAYVQHAFGNMGSLFLTGLIFLACMVTAIGLTCACAEYFAQLTKLPYKLLVFILVGFSFIISNLGLTKLIAVSVPVLSAIYPPAIVVIMLSFFWKFWHKPSFIVGSVTSIALIFGIIDGLKVAGFGDYLPNFLQHLPLNEQNLAWLIPSLVVLVVTTLIDKVKHKSI >NZ_CP048827.1|WP_000838063.1|2200872_2201292_+|heme-binding-protein MKSKYYLTLADAEFLMEEAQKYAIEHNFKVSIAIVDETSSLLLMKRLDGASPLTTHLCLEKAKCSSMSGRPSKFYEELLQNGRLGFLSMPSAKGMLEGGKAIIYEGQILGAIGVSGVQSFEDAEIAQHAIDVFLKKQSS >NZ_CP048827.1|WP_000949688.1|2201551_2201797_+|hypothetical-protein MLSLHFNKQVFINTLNSKDSVVYGVTTLALMLTLLFQGMIKGNLKPEYFMYAMVVSFVFCVWAFVDHKMRKLAKRRLSQQK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048827_4 | 3153920-3154004 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048827_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP048827_4
>4.1|3153944|37|NZ_CP048827|CRISPRCasFinder GATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048827_4
The CRISPR arrays of NZ_CP048827_4 >merge|NZ_CP048827|4|3153920-3154004|CRISPRCasFinder GCTTGTCTTGCGCCAAAATTAAAAGATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACTGCTTGTCTTGCGCCAAAGTTAAAA >NZ_CP048827|4|4|3153920-3154004|CRISPRCasFinder GCTTGTCTTGCGCCAAAATTAAAA GATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACT GCTTGTCTTGCGCCAAAGTTAAAA
>NZ_CP048827.1|WP_000077301.1|3153355_3153859_-|L,D-transpeptidase MSQFKLEDADILIDLANQTLSLPKHNKFYVVSTGKNGIGEQENTGKTPRGWHRVAKKFGMQSPKNAVFIARQPTGEVYSSELAAQFPERDWILSRILWLDGLEEGFNKGEGHDTMQRYIYIHGTPDKEPMGVPMSHGCIRMRNEEIIELFDLVSEDALVYLSEQSLT >NZ_CP048827.1|WP_001198164.1|3151493_3152279_+|YdcF-family-protein MQVSKWIRIFLAVIGSILFLDGLFLAFLNKIHVGTLVPLVLGAFFCLYALFYYHLERFFFYHYRLHTLWRFGWLCFWIWLIGLGYFFNFIKENKDASQNLPAVKAIIVLGSGVENGQPSAILAKRLDTAAPVALSQPQAKVILTGGLDFSEKEPEALVMSRYLEQHFHIAKDRMILEDKSTSTELNLKNSKPLLEQAHISINQPIAIVTSDFHTPRAAAIAKKQGYTQVYMVAAETPLITRYNVWLREYFAYASGWLLNEY >NZ_CP048827.1|WP_169538865.1|3148820_3151367_+|PepSY-domain-containing-protein MFKKFLFQIHWFLGISAGLILSIMGVTGAIYSYDQQILKWVNTDSYVVQAQSSPKLTPAQLYQHFTTIQPEIKINSITIAKDPTASSVVNIEKEGERRGYNMMVNPYTAQVLPEVQGRKLLLLIQQIHRNLTAGEFGKQITGACALMLIYFVLSGLYLRWPKKHSARQWLALKPKLKGRNFIWDLHAVVGTWVIVFYLLFACTGLYWSYDWWRSGMFKVLGVEQPKMQGHSGSGRNKDQLPKIQLDNAQLITALNQTWSGFNNQIGRDYSTLTVNLPKKDDGKIELSFVDATPQHERARNQAVYNYKTANIEKMELYEDKKLNQKIMSSMLPVHRGSFFGPVYQFVAMLASLAMPLFFVTGWMLYLKRRKQKKLTQAARQSLAGHYIDQNAKPWLITYATQTGVAEQLAWSTATSLQEAHQPVQVKSVQQLTEADLQQHEQILFVISTYGTGEAPDLASNFAKKLLKTNLELQHVKYAVLALGSKEYPDTYCSFGYTVDEWLKNNGAKALFDIIEVDNANPADIQNWNQALVKATKLDLHVVNIEKVFDNWTLQQRDLLNPNSLGQPAYNIELTASHEAVWQAGDIAEIQPGNSPERINKFLQHHHILKNAVVDSLQVSIEKALWNKDLTGEIEPFANLDHLLEQLPTLPTREYSIASIPSQQVLRLVVRQQYDESGDLGLGSGWLTQHTEINQNVALRIRTNESFHLIDDNRPIICIGNGTGIAGLMSLLHTRTRHNYTENWLIFGERQRAHDFFYASTIEAWQTMGMLKRLDLAFSRDQEQRVYVQDIIRQNAAELVNWIERGAVLYVCGSIDGMASGVDQALIHILGEEQVDELRQQGRYRRDVY >NZ_CP048827.1|WP_000125649.1|3148087_3148663_+|SdpI-family-protein MTAKTLYAYTLQPVPYEVSEAEQRNAQLLIWRSTNKISTKIWAIMGVILALAILGLIFIKNYSTVICWVAIVCVVLYYLGRKYGLEWYVKRKMNEFPVQEIKGIRLGVQPHGIVMRQQMGLQEGVGTIGWKNIYEWYNTPDFILVNFKVKDPKGQEQQGAYILPKRMDSKNFSFNTIRKHLKESVGEPKTL >NZ_CP048827.1|WP_001984830.1|3145812_3147987_+|TIGR01666-family-membrane-protein MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLIYTYIGFFITAASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISFLLFPVRQLQDKLAASYASLGDFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRSLHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKPYIHNKRFKQSFENLRLSLVKLRDDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQSDKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAIRVSIVLFIGYVFIQMTHIEYGYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVLFFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFVDTLIGCALAWFGVTFIWPDWKFRRLPRSIRRSLQAQCNYLAEVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAVLNVLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASELASL >NZ_CP048827.1|WP_000003701.1|3144470_3145685_-|multidrug-effflux-MFS-transporter MSEQTAQRQYSIGWIMLLALLTALGPLSIDMYLPALPQMAHDFGVSTQMVANTLPAYFFGLAIGQLVYGPLSDRIGRKKPLYFGLALYAVASLFCVLATNEWSLIAARILQALGGCVGVVMARAAIRDRLDVQGSAQAFSSMMIVMGLAPILAPMIGAWILIWFPWQAIFIALSIVGAICWLCVHFFFKETLAVDKRLKLSLYQVATLYGAIFKDASFRLPMFAGCLTGAALFCYISSAPAVFMDQYGLNQQEFAYVFGLNAFGIMLMSSLNKHLTTRVEITKRLKAGSMVQVTGASIVLIAGLISAAPLWLVMLGLFLAISGIGLTGPNAMALAMSKQGARAGTASAIMGSMQFACGLLGGVLLNFLIWSASLNMGVMMVLFTLSGFIVVLKAIRQAKSQSLS >NZ_CP048827.1|WP_001047593.1|3143738_3144443_+|nitroreductase MNLEQVRLVDEAITSRHSVRAFLSTPIEPEVIKDILRVASRAPSGTNTQPWKVYVVTGHKRDEMVERVCAAQIEVSKNPELAEQYKETFAYYPEKWVSPFIDRRRENGWGLYGLLDIKKGEKEKMAAQQLRNFKLFDAPVGIFFTVNKAMGIGSKMDIAMMIQNVMVAAKARGLDTCPQAAWNHFHPLVLDILGAADDEELVCAIALGHADPEHIVNTFITPREPVENFAVFLD >NZ_CP048827.1|WP_002010643.1|3143024_3143228_-|hypothetical-protein MSLPLINKQFMKQGLAITIATMKMNVTHATTEPQEIQQLGTDLNALFFNEKEKGTDSRVMTMACYSL >NZ_CP048827.1|WP_000490937.1|3142701_3142842_-|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
893270 : 905556
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048827|893270:905556|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048827|893270:905556|899068_899557_+|WP_169538789.1|DBSCAN-SWA MDKPITFSEWLGTQGNMVLLHANCCRIAYEAGQQSQQAKVEEQAQEIANLKSLIQGHELRHQQNLSIKQKLTRRSEELQKQLSEYIFVAETIDEMYVKEVQKSDELQKRVEWLEDRLKATDTLSKMRAAVIGSFNSQEFNARTRRKMMILKRAEQALKGEGQ >NZ_CP048827|893270:905556|902932_903556_+|WP_169538793.1|DBSCAN-SWA MLNEQQETNTENVQTTEQTQTTPVDTATPPVESQTQEQKPPEANTEAKPDIPESADAYKVELEGFDFDSFKSNEDNKAFLESAHQAGLTNEQMSVVMKAYDQHTAVQVEALQQDWGNDYEANLRFANQAIQAAGLQTTDVDSPTFGIRLAAYFGKALQEDMPPQNTQQSGGENIQELMASEAYMNESHPDHKRVYAQVQSYHEKTYG >NZ_CP048827|893270:905556|894063_894249_+|WP_032049833.1|DBSCAN-SWA MTVDDLRAFYKAKSDADLARILGRDRSVINYWRKGIPLSTQAVFEISTKGKLKAKIGKLSA >NZ_CP048827|893270:905556|895060_895936_+|WP_169538783.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(50.0%) | tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1260315 : 1309392
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048827|1260315:1309392|DBSCAN-SWA 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64 | Acinetobacter_phage(88.89%) | terminase,capsid,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1992591 : 2000836
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP048827|1992591:2000836|DBSCAN-SWA AATGAAGCTACCTAAACCTATTAAACGTGGTGAAACTTATCGTATCACTGTGACTTACAACAAACAAAGATATTCTTGTACAAGGGATACTGCAAAAGAATGTGAGCAATGGGCAGCTTTAAAGTTACTTGAGCTAAAAACTGGAAAGGCGCAGACTGAGAAAGGTATTAAACCGCACTTCTCGTTTAAAAATCTTTGCGAGAAATATTATTTAGAAAAGGGGGTAAAACTTAAATCGAAAGAAATTATTAGAATAAAGCTGAATAATTTGGAAACTTTGTTTGGCGATTTAGCTTCAAAATCTATACATGATTTCGAACCTAACGATATTGTGAGATGGAGAAACAAGCGTTTGCTTGAAGTTCAAACAAGCACTGTACTTCATGAGTTTTCGCTTTTTTCAGCCATATTTACTTATGCTCAAAAAGAACTTTTTTTGATTCAAACCAATGTTTGGCATTCTGTAGTTAAGCCAGAAAAGGGTAAGTCGCGAAATCAGAGAATTTCACATAGCGAACAAGAAGCAATAATAAATCATATAGGTTGGGATAAAAATTCCACCCCAAAACTAGTAAAAGAATACGTTTGTTGGTCAATGCTCTTTGCGCTAGAAACTGCAATGAGACAGGGTGAGATCCTGACAATGCGCAGGGTTGATATAAAAGAAGGATTTATACATTTGCCAGTTACTAAGAATGGTGACTCTAGAAATGTTCCTTTATCTAGTGAAGCAAAACGTCTTTTATCATTGTTGCCAACTGATAGTGACTACTTAGTGCCAATAAAAGCAGAGACATTTAAAAGGGTATGGATCAGCACAAGAAATGCTGCTGGCCTTGGGCATATTAACTTTCATGACACGCGACATGAGGCAATTACAAGAATGGTCCGAGAAAGGAAATTACCAGTTGAAGTACTTGCAAAAATAACAGGGCATAAGACTATTGGTATTTTAATTAACACTTACTACAACCCTAACGCCCAAGACCTTGTAGAAATGTTTAATAGTAGTGAGAGCTAGTTAGCTCTCTTTCTACCACGTTTGTTTGCATCTTTTTTTGTTAGTATTTGTCGTGCTCGCTCAGGATCGTACATGTGCTTACCTTCTGTACCTTGATTGATTGAGACAAGCTTTTCTCGAATGGTAGTAACACTTAAGTTATATACCTTCGCCAATTCAGCAGCACTTACTAACTCTTGTTTAACCTGCTCAAGCTTGGTGACAATAGCGCCACCAAGATTTTGACCAAGTAAAATCTGAGGAGGGGTATCACCCTCCAAAGTGATTGAAAACTGCATGATCCCCATTCACCCCTCCTTACTTTCCGCTTTTCTAAAATCAGTGCCTTCTGGGTCGATACCAAAATGCTTACATATTTGATGTGCTTTGGTTGCACCTGGTCCGTGTCTGGATACATGTACCCAATTCAAAACATACTTTGGCTTTTTACTATTCATCAAAGCCATTAGATAAAGTTGCTCAAAGTCGAGACTGCTCATTGGGTCGGATTACAACGACGACCCAATCAAAGAATGCAGAAAGTGTGGAAAGATTAAAGTAATTTAATTTACTATTGAGAATACAATAACTTACGTGAATTTTGTTGTTGCAAACTGAGTAAAAAAACCTCATTATTTAACTTTAATTTTACTTGGTGAGGAGTATTCATGACTTATTTTATTGGTGGTTCTATTAGTGGGCAGCCAGTGCCATTTGAAGAATTGCATAAAGATGCAATCTGCGATGTCAATGAAAAAATGCGCTTTGCTGGACAGGAAAGAAAGTATTATAGGAAACTGCAAATTAGCTTCCATGGAACTGTAAAAACCTTTTATGTAATAGACGGTAAAAAGCCCATAGATTTTAGGGATCAAATTATTGATTTATGGGATCAAGTTAAAACAGATGTATATGCAATTTAGTACTTAGAGCAGATGATGACCTTCTTCGGGAGGTTTTCTTTTATGCCCTGCTTCGGCGGGGCTTTTTATTTAGAGAAGTGTGCAACGATGATTTGACCTCTTGGCACAGGAGTGCATTCAAAGTTGATGAGCTGTTCACTTCATCTAAGTTAAAAATAGGATTGTATATGGACACAATCGAAGCGAAGAAGAATTTAAATGCTTTGTGCAATGAAATAGAAAAGCTTCAAAACCTTTCACGTAGTTTGATGACTGCGAAAGAGATGCTTGATATTGACGCGAAAATAAAGCGACACAAAGACCAAGTGAAGAATATTAGAAGTAACCTTCATGCGTGATGCAAAGCGACTTGCTGCTATAAGAAAATTACCCTGTGTTATGTGTGGTAGAACTCCAGTAGACGCAGCGCACAGCAATCAAGGTGCTCACAATAAGGGCACGGGATTGAAGGCTTGTGATTCAAAGACAATCCCGCTTTGCAGACAACACCATATTGAGTACGACCAACTCTTAACAATGACAAGAGAGCAAGGAGTAATCTGGTTTGATGCAATGTTAGAAAAAACAGAGCGGATGCTTAATCTTAAAGATGAGGATGTTTTTTGATATGAATAAATTTAAATAATTACATATGTTTATAAAAAAAAATAATCGCCATTTTTAAAATTATGATAAACTCTTTCTACACCAAAGGGGTTTATTATGAGCATAGATGAAGCAAAACTAGTTGTGCCTGGGACAAATGTTCTCAGAAGAGCTGGCGCTGCACTTATAAGCGATACAGCCACTCAGGTAGAAAAGATAGAAGCCTATAATATTTTAAATAATTGGAGAGCGCTCCACTCTTACCCTATTGATGTATTTCAGAAAAACATTAGAAGTAAATGTACACAGCTAAAGTTTAGAGATTTTACGGTTGCGCAAAGATTGAAGCGTATGCCATCAATTATTTCTAAATTGCAAAGAAACCCAAGAATGAATTTAGCCAGAATGCAAGATATTGGCGGAGTTAGGGTTATTTTGCCAAGTATTGCTGATGTTAGGAAATTACATGAAGCACTAGTGGGGCGAAATAATAGGTTTAACCACGTTCCGATTGTGCCTTGCCATGATTATATAGAAAATCCGAAAAGTGATGGATATCGCAGTATCCATCAAGTTTTTACCTATAAAAGTAGAGATCACAGTGGGCTTGATGGTTTAAAAATCGAGTTACAAATACGTACAGCCTTGCAACACTCTTGGGCGACTGCGGTAGAAACATTGGGAGTAATTGAGAATGCATCTATTAAATCTGGCTTCGGAAGTGATGAGATTAGACGCTTTCTAAAACTAAGTAGCGCTTTATTTTCTATTAAAGAAGGCACACCTGTTGTTGAAGAGTTTTCAAAATCTACTCCAGAAGAGATCGCGATTGAAGCAAAAGATATCGAGCAACGGCTTCAAATCTTTACTAAATTAAAATGGTTGCAGATATCGGCAAAACATATTGAGTCTACGTCAAATAGTAGACATGCTTACCACCTATTAATTCTCAAGCAAGAGGAAAATAGCTGGAAAGTAAATGTAATTCCATTTACCAAGGCTCAGGAGGAAATTGCTCAAACAATGTATGCCACTTTGGAGTCACAAGTAAAACAGGAACATGATGTAGACATTGTCCTTGTTTCGGTGGGTGACATGAAGGCGATTAAGAAGGCCTATCCAAACTACTTTTTGGACACAAATCAATTTATTAAAGAAATGCAGGGTGCGTTCAAAAAATATACTTAGGTTTTGATAAAAATTAAATTAAGCCACCCTCGGGTGGTTTTTTATTGCGAGGTCAAAATGGAACCTAGATTCGTCATCAAAAACCAGTCTGACATCAACTATGTAATTGGCTATCTGAATAATAATCATGCAAAGGCAGCGAACGAAGGGAAGCCTTTAGTCGTATTGATTGCACCACAAGAGAAAGATCGTTCAAAGGCTCAAAATAGGCTTCTTCATATGTGGTTTGGTGAAATGGCCAAACGCACTGGAGATAGTGCTGAGTCAATCAAATATGAAATGAAAAAGAAGTTTCTAGCCAAGATCTATTTAAGAGATAATGCAGAAACCCAAGAAGCATACGAGGCTGTAATAGCTTATCGAGATGTAATAAAAACACTTCAGGATGAAGAAAAGAAAATACACACAGCACATTATCAACGCATCGTCAGAATGTTTGTCAAAGATCATGTGCGTTCAAGAGATGCAACCAAGAAACAGTTTTCTGAGTTCTGCGATAAGTTGCATGCATTTGCCAATGTAGAGCTTGGGGTTTATTTGAAGTGCCCTGATGATCTTAAGTATGTGTTGGAATAGGTAAGCAGTTAAGATATATTGTTTTTTCTTTAATCATTACTAAAAAAGGAAAAATAATGTTTGTTCAGCATGATGAATATCTAATTAATACATCAAATATTAACTTCATTAAATTAAATGAAAAGGTTTTAAAGGTTTATGTGTACTTTGGGCCTACTGGTGAAGGCACTGGAGCTGGAATGATTCCTTTAAGCTGCGAAGATGAAGCAGAATATGAAGAATTGATTGCTAAGTTAACTAAGTAAGAATGACCGCCCAAGTGGCGGTTTTTTAATGGGTGTCGTTATGGCCTGTAAAGGATGTGAGGAACGTCGTGACTGGATCAAACAACAATTCCAACTGTTCAAAGAAAGATTGCAGTTGCGGAAACAAAGAGATACTTCAACTGTTATCACAGATAGTGGAGCAGAACACAACGCTGATTCAGCAGGTAGCACAGAAGGATCAGGTGATACTGGCAGCACTGGAACAGAACAATGAGTTGCTTGTGCAGTTAAGTGAGCAAGAGTCTCCAGTTCTCTACCAAAATAAGACGTTGGATTGAGGTGAAGCATGGCTAAGCAATTAAGTGTTGCGAATATTGAATATGCAGGTGGTAAGACTGCAAAAGGAACAAAGGTAAAGCTAAGTGATGGTAGTTACTTAGCCGGTGTTAGCTTTGTTGAGACTACAGTAGGTGTTGATCAGGTCGCAGAAGTTCTTATCCGATTGACTCCAGACTTTGAGAATCCAAATGAAACTACAAACACTCAAGCCGAGACTACAGATACAACGTGCCTCAAGTAAGAGTAATTGGGGTTCAGGTCGTGGTGGTCGTCCTTGGCGTAGACTCAAGGCAAAGATACACCTAAGAGATAAATACACATGTCAATGCTGTGGTGTAGTCACTATGGAGCTTGAGTTAGATCACATCGTTAATATCGCACAAGGTGGTAATGATGATGAATCAAACCTACAGAGCTTGTGTGTGCCTTGTCATAAAGAGAAGACTCAGGCAGAAAGCAGGGCTTAATGGCAGCCAAGCACGAAATTTAAGCATTTTCAGTGGATTTATAGCTAAATGAGAACCATTCTCAAATAAAACCGTGTCAGGAGGGGGGAGGCAAAATTTTCGAGCTCGTCAGCACCGGACACCGCCCGCCCTCTCACTTATAAGAAAAAATCAGTTTTCAAAAATATGTTAAAGGAGGGTATATGGCTTTAACAGAAAAAAAGAAGGCATTTGCCCTCGCAAAACGAAACGGCAAAGATAATAAAGAAGCTGCCATTTTGGCTGGATGCCCTGAAAAGACTGCATCTGCGGCAGGTGCCCGTTTAGCAAAAGATCCCGATGTTATTGCTTATCTTGAAAGACTTGAGAAAGCTACTCCCGAACAAGTTGTTAAACATGACGTTAAACCATTAACAACTAATACAACTATTCAAGCAGCTAAGAATCTAGCAGACCCGCTAGCTTTTTTAGAGTCTGTTTATAGTGATCCAGTCGAAGACATGGCGCTACGTGTACGAGCAGCTCAGGCAGCCCTTCCATACGTTCACGGCAAAGTAGCCGAAAAGGGCAAGAAAGAAACCAAAGAAGATGCCGCTAAGGCTGCAACCAAATCAGGCAAGTTTGGCACTTTGAATAACCAATTACCGAGTTAAATATGATCTCACCTAAAGTCTGGACAACCGCTTGCCCAGACTGGGAGGAGCGTATTGTCGCTAAACAGTCGCTCATGCCTTGTGAGCCATTATTTCCACAAGTTGCTGATGTTGCTGAGCGCATATTTAAAGAACTGATTCTTGTCGATGTGATGGGTAGCCCTAAGATGGGCGATGTCACATTGCCTTGGGTAATTGAGTTTGTTCGAGCAATCTTTGGGGCGTACGACCCAAGAACAAAACGCCGATTAATCCGTGAGTTTTTTCTTCTAATTTCAAAAAAGAATACTAAGTCCACGATTGCAGCAGGTGTGATGCTTGTTGCTTTGCTGCTGAATGACCGCCTTTCTGCTGAGCTTATTCTGTTGGCGCCCACAAAAGAGGTCGCGGACAATAGCTTTAATCCGATTCGTGACTTTATTCGCGCAGACGAAGAACTCAGCGAAATGATTAATGTCTCTGAGCACACAAAAACAGTTACTCATTTGGGTACAGGTGCAACACTTAAGGTTATCGCAGCGGAATCCAATGCCGCAGCAGGTAAAAAAGCTTCAATCATTTTGATCGATGAGGTTTGGCTATTTGGTAAACGTGCCAACGCTGAATCAATGTTCCGTGAGGCAAAAGGTGGCTTAGCATCACGTCCAGAAGGTTGTGTGATTTATCTGTCTACCATGTCGGATGAAGTGCCATGTGGTGTGTTTAAGCAGCTTTTAGATTATGCCAGAGATGTGCGAGACGGCATTAAAGAGGATAAAAGCTTTCTGCCACTTATCTATGAATTCCCTAAGCATCTTGTAGAAGCAGGCGAACATTTAAAACCTGAAAACTTCTACATCACAAACCCAAACTTGGGTGCATCGGTTGATCTTGAATATCTGATTTCAGAGTTTAAAAAGGTCAAAGATGCAGGTGAGGAATCACTTCGAGACTTCTTGGCCAAACATTTAAACATCGAAATCGGCATGAATCTTCGTGCTAACCGATGGGCAGGTGCTGAGTATTGGAATACTCAAGCTAAAGATATCCAAATTGACCAACTAATTGAGCTATCCGATGTCATAACTTTGGGCATCGATGGCGGTGGACTTGATGACTTATTGGGCTTCGCTGCTTTAGGCCGATTAACAGAAGACCCGCGCATCTGGTGGTTATGGAATCATGCATGGGCAAATAAAATTGCTCTCGAGCGCAGAAAAGAAAACGTGCCTAAGTATGAAGACTTCAAGTCTGAGGGATCTCTTACAGTAGTTGATCGCATTGGCGACGACATTGACCAGCTCGCCGCAATTGCTAAGAAAGTTTATGACAGTGGCAAGCTCAACAAGATCGGGCTAGATCCATTGGGCTTAGGTGGGCTTTTAGATGGCTTACTTGAGGCAGGGATTCCAGAGGAAAGTATGTTTGCAGTGCCGCAAGGGTACAAGCTTATGTCTTACATCCTCACCACAGAGCGCAAATTAGCTGAAGGCAATCTCTACCACGCTGGACAGCAATTAATGACTTGGGCAGCAGGTAATGCGCGGGTAATTATGGTCGGCAATGGTATGCGAATCACTAAACAAGAATCAGGTGTTGGGAAGATTGACCCATTGATCGCCACATTTAACGCAGTTGCGCTCATGTCCATGAATCCAGAACCAACAAATAAAGAATATAACGTCTTTTTCGTCTAATTAAATTTTTAACTCAAAGCTCGCTAAATGCGGGCTTTTTCTTTTTTAAAGGAGAGCTTAATGCCTGCTCTACAGAAATCATTTGGCTCTTTTGAAATCAAGAGCACGAACGAGGAAAAGCGAACTTTTAAAGGGATTGCAAGTACACCAAATGCAGACCGCGCAAAAGACATCATGGTCCCAAGTGGGGCTAAGTTCGAGCTTCCTATGCCGCTTCTTTTTCATCATGACCATAGCGCTCCGATTGGGCAAGTGATTGATGCAAAGGTGACTGATAAAGGAATCGAAGTAGAAATCTACATTCCTGAGATCAAAGAAGAAGGGAACTTAAAAGCTCGTGTCGATGAAGCCTATCAAAGTCTCAAGTATGGACTAGTTAAAGGGCTTTCAGTTGGGTTTTTAGCCGATTGGGAACAAGCCGAATTTATCAAAGGTGGTGGCATCCAGTTTAACGAGTGGGAGTGGTACGAACTCTCACTGGTGACCATTCCATGCAATCGCGACAGTTCAACAGATTATTCAAAAGCTTTCGAGGAATACAAAGCCGCGTTGGGCAATACACCTCAGAAACCCGCAGCAGATGGCGATTCATCTGAGCAAAAACACGTAATTGTAAAACTTAATAGCCCAACAAAGGGTGGAGTAAAACTATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP048827|1992591:2000836|1994843_1995119_+|WP_038348523.1|DBSCAN-SWA MRDAKRLAAIRKLPCVMCGRTPVDAAHSNQGAHNKGTGLKACDSKTIPLCRQHHIEYDQLLTMTREQGVIWFDAMLEKTERMLNLKDEDVF >NZ_CP048827|1992591:2000836|1992591_1993611_+|WP_038348501.1|integrase|DBSCAN-SWA MKLPKPIKRGETYRITVTYNKQRYSCTRDTAKECEQWAALKLLELKTGKAQTEKGIKPHFSFKNLCEKYYLEKGVKLKSKEIIRIKLNNLETLFGDLASKSIHDFEPNDIVRWRNKRLLEVQTSTVLHEFSLFSAIFTYAQKELFLIQTNVWHSVVKPEKGKSRNQRISHSEQEAIINHIGWDKNSTPKLVKEYVCWSMLFALETAMRQGEILTMRRVDIKEGFIHLPVTKNGDSRNVPLSSEAKRLLSLLPTDSDYLVPIKAETFKRVWISTRNAAGLGHINFHDTRHEAITRMVRERKLPVEVLAKITGHKTIGILINTYYNPNAQDLVEMFNSSES >NZ_CP048827|1992591:2000836|1996343_1996862_+|WP_169538837.1|DBSCAN-SWA MEPRFVIKNQSDINYVIGYLNNNHAKAANEGKPLVVLIAPQEKDRSKAQNRLLHMWFGEMAKRTGDSAESIKYEMKKKFLAKIYLRDNAETQEAYEAVIAYRDVIKTLQDEEKKIHTAHYQRIVRMFVKDHVRSRDATKKQFSEFCDKLHAFANVELGVYLKCPDDLKYVLE >NZ_CP048827|1992591:2000836|1998508_2000182_+|WP_169538841.1|terminase|DBSCAN-SWA MISPKVWTTACPDWEERIVAKQSLMPCEPLFPQVADVAERIFKELILVDVMGSPKMGDVTLPWVIEFVRAIFGAYDPRTKRRLIREFFLLISKKNTKSTIAAGVMLVALLLNDRLSAELILLAPTKEVADNSFNPIRDFIRADEELSEMINVSEHTKTVTHLGTGATLKVIAAESNAAAGKKASIILIDEVWLFGKRANAESMFREAKGGLASRPEGCVIYLSTMSDEVPCGVFKQLLDYARDVRDGIKEDKSFLPLIYEFPKHLVEAGEHLKPENFYITNPNLGASVDLEYLISEFKKVKDAGEESLRDFLAKHLNIEIGMNLRANRWAGAEYWNTQAKDIQIDQLIELSDVITLGIDGGGLDDLLGFAALGRLTEDPRIWWLWNHAWANKIALERRKENVPKYEDFKSEGSLTVVDRIGDDIDQLAAIAKKVYDSGKLNKIGLDPLGLGGLLDGLLEAGIPEESMFAVPQGYKLMSYILTTERKLAEGNLYHAGQQLMTWAAGNARVIMVGNGMRITKQESGVGKIDPLIATFNAVALMSMNPEPTNKEYNVFFV >NZ_CP048827|1992591:2000836|1996918_1997107_+|WP_000497983.1|DBSCAN-SWA MFVQHDEYLINTSNINFIKLNEKVLKVYVYFGPTGEGTGAGMIPLSCEDEAEYEELIAKLTK >NZ_CP048827|1992591:2000836|1994258_1994513_+|WP_038348521.1|DBSCAN-SWA MTYFIGGSISGQPVPFEELHKDAICDVNEKMRFAGQERKYYRKLQISFHGTVKTFYVIDGKKPIDFRDQIIDLWDQVKTDVYAI >NZ_CP048827|1992591:2000836|1993607_1993898_-|WP_000512310.1|DBSCAN-SWA MGIMQFSITLEGDTPPQILLGQNLGGAIVTKLEQVKQELVSAAELAKVYNLSVTTIREKLVSINQGTEGKHMYDPERARQILTKKDANKRGRKRAN >NZ_CP048827|1992591:2000836|1997135_1997342_+|WP_169538838.1|DBSCAN-SWA MGVVMACKGCEERRDWIKQQFQLFKERLQLRKQRDTSTVITDSGAEHNADSAGSTEGSGDTGSTGTEQ >NZ_CP048827|1992591:2000836|1997414_1997648_+|WP_169538839.1|DBSCAN-SWA MAKQLSVANIEYAGGKTAKGTKVKLSDGSYLAGVSFVETTVGVDQVAEVLIRLTPDFENPNETTNTQAETTDTTCLK >NZ_CP048827|1992591:2000836|1995215_1996286_+|WP_038348524.1|DBSCAN-SWA MSIDEAKLVVPGTNVLRRAGAALISDTATQVEKIEAYNILNNWRALHSYPIDVFQKNIRSKCTQLKFRDFTVAQRLKRMPSIISKLQRNPRMNLARMQDIGGVRVILPSIADVRKLHEALVGRNNRFNHVPIVPCHDYIENPKSDGYRSIHQVFTYKSRDHSGLDGLKIELQIRTALQHSWATAVETLGVIENASIKSGFGSDEIRRFLKLSSALFSIKEGTPVVEEFSKSTPEEIAIEAKDIEQRLQIFTKLKWLQISAKHIESTSNSRHAYHLLILKQEENSWKVNVIPFTKAQEEIAQTMYATLESQVKQEHDVDIVLVSVGDMKAIKKAYPNYFLDTNQFIKEMQGAFKKYT >NZ_CP048827|1992591:2000836|1997595_1997874_+|WP_169538840.1|DBSCAN-SWA MKLQTLKPRLQIQRASSKSNWGSGRGGRPWRRLKAKIHLRDKYTCQCCGVVTMELELDHIVNIAQGGNDDESNLQSLCVPCHKEKTQAESRA >NZ_CP048827|1992591:2000836|2000242_2000836_+|WP_169538842.1|head,protease|DBSCAN-SWA MPALQKSFGSFEIKSTNEEKRTFKGIASTPNADRAKDIMVPSGAKFELPMPLLFHHDHSAPIGQVIDAKVTDKGIEVEIYIPEIKEEGNLKARVDEAYQSLKYGLVKGLSVGFLADWEQAEFIKGGGIQFNEWEWYELSLVTIPCNRDSSTDYSKAFEEYKAALGNTPQKPAADGDSSEQKHVIVKLNSPTKGGVKL >NZ_CP048827|1992591:2000836|1998056_1998506_+|WP_109067521.1|DBSCAN-SWA MALTEKKKAFALAKRNGKDNKEAAILAGCPEKTASAAGARLAKDPDVIAYLERLEKATPEQVVKHDVKPLTTNTTIQAAKNLADPLAFLESVYSDPVEDMALRVRAAQAALPYVHGKVAEKGKKETKEDAAKAATKSGKFGTLNNQLPS >NZ_CP048827|1992591:2000836|1994680_1994851_+|WP_000379606.1|DBSCAN-SWA MDTIEAKKNLNALCNEIEKLQNLSRSLMTAKEMLDIDAKIKRHKDQVKNIRSNLHA |
14 | Acinetobacter_phage(33.33%) | protease,integrase,terminase,head | attL 1992382:1992398|attR 2007307:2007323 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2283595 : 2315256
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP048827|2283595:2315256|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP048827|2283595:2315256|2301009_2302152_-|WP_038348069.1|DBSCAN-SWA MANLVFKFTWDHRPFPYNTSQGKRQFMLPFASGIPNLAPNFSQVVGTAAISQGGTGATTAADARNNLGAAASGVNSDITEIKGLTTVLSIAQGGTGGNSPSNAKSALGLGDAGVLGYSLTTVASLFSKTLVSEWTSVLGTSRLVNVAHGDWQGGSTANSLYMPQRYGSVLGYYSTDSIGTYAWQLFKGVSGHQMSYRYGAGSDAWSAWGHLKTSFNTSVDANGFLKSASPVVKLFNDHIELNSDAEKQPIEFKKVDVGDYLLKGSLGFAQEGWYIEVPKDANGNTIVAVVYDTLENGDLSIKTYKRKFDFELAAVVADLELPIDIPEGRWIDIRLHEEPEPEPEPPTTETPFEFQPTNLSEAVAAAMVGIAPPDLSEETQ >NZ_CP048827|2283595:2315256|2312385_2313177_-|WP_079393069.1|DBSCAN-SWA MSTDAARDKAIRIEAQEDLYFFTRYMFKERRGYKWMQNWHHLEICEALMKVYRGEIKRLIINVPPRYSKTEIAVINFMAWCFGKNPDCEFIHISYSAMLAANNAFQTRNMVQEKAYKKVFPDLKLREDSKAKDFWRTDAGGVCYATGTGGTITGFGAGKMREGFGGCIIIDDPHKADEAKSKTIREGVIDWFQNTLESRTNSPETPIIVIMQRLHEDDLAGWLLGDRKDGVPVAGGNGEVWEHLCLSAIQEDGSALWPAKHNI >NZ_CP048827|2283595:2315256|2309197_2310301_-|WP_038346488.1|capsid|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP048827|2283595:2315256|2305227_2305893_-|WP_000692544.1|DBSCAN-SWA MKIIYTRIAAAAALETGIIANPDYYENPNLKAKEVIIYGNYPKIQKDYETLEVPVEVRKLKEPEKTTLATVNVAVGITPELQAVMDDAKAECEKVVEENTQLKQKIAILEQAGGNQSELLSENSRLKDAAVLADKALKDAEAQVLGIKTEFDAFKNDIPAMQARIAELEAGKAEENPATETAANDFENWSNDQLKEYLASKNIGYKPSATKAELLKLIPKE >NZ_CP048827|2283595:2315256|2302151_2302505_-|WP_015451444.1|DBSCAN-SWA MSNFVFKRGDTFNLNLQLVDMDEALQYPPDDVRRAIDLTGYTFTSQVKALADGAAVATLTCTALSQSTQKGWLNIKSGTSTAAWPLGLCQMDIKAVVSGTTQHTETLTFQVIDGVTA >NZ_CP048827|2283595:2315256|2307826_2308141_-|WP_032049954.1|DBSCAN-SWA MIKEVTEQELAEKSVAPRVTKAQIESLMERVTYTVEQRPGGTTSTFVHAFLDGKFFLATGFSACVNAENFDAEIGERMARGNAEKSAENKLWELEGYRLFATNF >NZ_CP048827|2283595:2315256|2283792_2284170_-|WP_038346537.1|DBSCAN-SWA MKKYKYLVELGSALILYLVVLVFSLSYLKKDNLENTVQIFITLLPVIPCLLVVWSVLRQISRLDELQKHIQLFALAFAFTGTALLTFSYGFLENIGFPSFSMFIVWPIMAFLWGIGVVVGCLRYR >NZ_CP048827|2283595:2315256|2285936_2286326_-|WP_000433907.1|DBSCAN-SWA MEPVSTSGFTALLKLYGIAIMVTLAVGLVAAVVLMTRMPRSPQEWAVGLICTVVSSLAGGSFIIVKWGLHEWVTDVWGMIALGGFFFVCGLPGWALVRWIFNFIDKQEGKTIVEVIKEFKKARKDIENS |
41 | Acinetobacter_phage(91.18%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2319455 : 2326329
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP048827|2319455:2326329|DBSCAN-SWA TTCATATAGTTTTACAGTGTATGTTTTCATTTGAACCTCCATTTTGTCTTAATCTTTTATCATGACCTAATAAATAAAATCTAGCGCAACTCACCATAATTGCGACCTGAGCTTTAGATTGGTTTGTTTCTTGAGCAACCTTCAACAATCCTTTATTTTCAACCTTATTTTTAATTAAACAAATTAATGCAAACTTAGTTGTAAAATCTGTTTTATCAGAATTTAATAGACTTCGTAAAAGTGCTTGAATTTGATCCGCCTCATAATCACTGATCTCACATCGAATATAAGATTTACTTTTTTGTACTTCTTTGCCAGCTTCACGCATCAACCAGTAAATTTGATTGATATGAAGCCCATCTGGCAAATCACCCCCTTTCATTCTAACTGTTTCACACCATGCGCCAAACTGCTCTAACCAACCGTCAATAGTATATTTAGACCAATCCATTTGTTGTGTTTTTAAAACTGCACTCATTTTTCACCTACCAATTGCTCAATTTGTTTAATCGCCACGCCTGCTTTCACTTGCTCTGTGCTGAACCGTAAAACTGTAAAACCCATCATTGCTGCGGAGTTGTATTTCTCCATATCCCCTATATAGCCTTTGCCCCTTGTATGACGGCCTCCACTCCAGATCCCGCCTTCCACCTCAATCAAAATCTTTGTACCCGTTATTAAAAAATCTGCTCTCCATTTACGTTCAGGATGGAATTTATATTCCTGTTCAAAACTGATCTTGCATGCTTTTAAATGTGTTGCTAATACCGTCTCGCCTTCACTCGGCTGTCTTGTACCTTGCTTTGCTGAACGGCGCTTTTTATTTTTCTGAATAGGAAATAATTCACGATATTCAGCAAGGCTCATTGATGACATTAAGCACCGCCCTTTAATAAGTGATCTAATTGATTAGCAATGCCGTTATAAACACGTGATTTATCTAGGTCACCCAAAAGCGTTAATGCATGGGCATCGTTTATAAATTTATCTCTTAACTTTGTTAAACCAGCTTTTAACTTGATTAAAGGATCTATCTCATTTCCATTAACTGCTTCGTGGTCTGCTATAGCCTCCTGAACTCTTTTTATATGAACAACAAAATCTTTATTACCTATTAAAAATTTGATCATTTTGAAATCATTGAAATCAGCAATAAATACTTTGCCTTTAGCAACTTCAACTCCACCAATTTGCTCTATTAGTTCCAACGATTGAACCAATTTTTTAAGGTCTAAAATCTTTGGGGTTACAACACCACCTACTTCAGCAGATCCAATAACAAATCGAGCCTTTTCGATTCCATGTTCCTTCATAAACTCAACTGCATTCATACATTCGCCCCATCAATTAGCTGAAGAATATTTCTAGGGATTGGCATACCCTCCCGACGGCACATCTCTGCGTATTCGTGTGGATTATCGAAAGGATCAGGGCCCAACTCTTTTATAAGCTCAGGCTCTTTTTCTTTTGCCTCAAGTTTTTGAACTGGTGCAGGTTTACGACCATTGATTTTTAATCTTTCCATCAATGATTTGAGATGCTTTTGAGCCTCGTCATTGCTCACAGGAACGTGTTTAGGTTCTTTGTGTTCTAGTTGTAGCGGTGGAGTGTAAAACTCTTGCTGACGGCCTTTTAACTGAGCTTTAGCAACCATCACGTTGTAGGTCCCGAAGAAATTATCTTGAGCTGCTCGCATTTGGCCGGCTTCGATCAAATACATAACCTCGTCTAAGGCGTACTTAGTGATTTGGGTAATAACCACGGAACGGTCAGTTGTAAACTTACATGCGCGAGACCAAGCTTCTTCTGAAGACATCCAACTTTCACCGATACACCAGGTGCGAAACTCGGCAAATGACGGCATAAAGCGTCCACCTGCTGTAAGTAAACGAGCAAGTGCGTTGTTAAATTGGTTTTGTTGAACGCCAACCAGTGTTTTAAGTGCGATTTGCTCAACCACTGACAGAGGAATTGCACTTTCGCCTGTTGCTGGAAATTGCTTATTGAACTGAGCAGCGTAAACAGTGCGAAGAGAAGCGATTAATTGACGCACTTCGTTCAAGGTAATTTCATGCATGACCTACCTCCTCAATCATTGGAAGCTTTTTTGCTGGGGTTACATCCACGATTTGAGATTCGCTCTGTTCTTCAAAAAGATTAGCGAAGTAACCCGACTCTTCTGGTTTTTGACCGGTTGAAGTGATTTGCTCTTGTTTCTTGCGGTTTGCAGCAACTTGTTTCTCGTTGTTTTGAACCCAAGAGAACCACTTAACCAACCAGATGCTTGGTGTATTCAACGAACTTGATTCGTTTGCAAAGTACCAGTCACCGAAATTTTGAATCATGGTTCTCAAGTCGATTTCAGGTACAGAAACAAATCTTTGTTGAGCAAGTGAGATGAAATCGTATTGAAACTCGCTGTATTCAGAAATGAATTCACGCATTGAGTAACGCTTGTGATCATCGATCTGATACTGAGCAAATTGGATTGGTGTAAATTGCGAATTTTCTTCACGCGCATTACTACTACTATCTATATATTGGTTATCGGTTAACGGTTTATGGTTAAGGTTTTTTTGGCTTTCACTTTCAGAACCCAAAATTAACCCACTGGGTTTTTGTGGGTTTTCAGAATTAACCGAGTCGCCTTCACTTTGGTTTTCTTTTGGTTTTCCTTACGTGGACGCCCACCTTTCTTACCATTTTCACGATTTTTATCCCCTACTTTTTGATAAGCGGCGATTTCTGAATCACAACGTTTGTTGTGAAACCCGTCTTCCTCTTCCACAAAAAACTCTTGCAGCACAATTAATACTGCATCCCTTTCTTCTTGGGTATTTGCACGTAACCGACGAAAAACCGACTGGGTTTCTTTGGGTAATGGTTTTTCATTCAAATAATAAAAATCGAGAGCACGGCGATAAAAGCACTCTTCAACTGGGCTAAGGTGTGCTGTAGCAACCATAAAGTCGCTGATATGGTGGAGATATTTATACATCAGTGACTGCTCCTAATTTTACAAGACCGCGCATTTCCAACTGACGAATAATTCTTGGAGGAATAAATTCGTTGTTGATTTTGTAGCGAATACGAGACTTTTCTTTCACCTGAATTAGTTTGTGCCCATCCTCCATGAGACGGCGAACTGCTATAGCCTGCCCCCCCATATGGGTTAATTCTTCAAGTTGATAAAATCTTTCCTGAGCCTCAATTGCGGCATTCATAACTGAAAGTGGCATAGCTGCTAATTCTTTAGCCGAATAGATCTTTACTGGTTGTTCCAGTGGAATTACCACCTCTAGCGGTGTGGTGGAAACGGAAATATCCTGTTTTCTTTTTGCTGCATATCTCACTTTTCACCATCCTTTGGCTTAACATAGCCTCCAAAAGAATCAACCAAACACGCCTTGGTTAAGCTGGTTACAATCTGCTGTGCTAACCACTGCGTTATGCGAAATTGACGAGCCATAGCCTCTGAAAATTCAACTTTGGTTACCGCCGCATTATTTTCGTCATACCCTTTGTTGCGTAAATTTTGCTTTTTCACCTCAAATAGGTGGCCAAGTACTCGCAATGCAGGCTCATAGAAAGATTGGATTTCACTTTGCTGGCGAGAATATTTGATTTGGTGTGTAAAGCTGTTCATGACACCTCCGCTAATGCTTGCTCAGCGCTTGTTAGTCGGCGTTTGGCATTAAGTTCAGCAACTGTTGCTGTGCGGATTTCTTTTGAAGAAACCAGAATCAAATGATTCTCTGATTTGATGGTCCATAAACTAGTCAAAGTTTTGTTTTTAACTTCAAACAAATCATTTGATTTGAAAGTACGGCACTCTTTAGTAAGCACTACAACGTCACCTATTAAAAAATCTGGTGAGTTGAGTTCGATTGGTTGTTCTGATAAATTGTTTGTGTTCATTTGATCCACCTCAATTGAATGCCTAACCACTCCTGTTTCCGCAGGTAGTGGTTTTTTAATATCCGAGTTTTTCCTTTTGACAGCTGATTTCGTCATGAAATAAGTCATCCACCGTTTCTATACGGTTCATCCAACTTTTAGACATGACTAAAAGTGCAGCAACACGTTCCTTATCAATACTCTGATAATCTTTAGGGACGACTTTTAATCCAAGCAAACTCAATAGCTCGCAAAACATTTCAATTTCATTCAAGCCATTGTTTTTCTTATCTGTTTTAAGTCGAGTTATAGTGCTTGGATCAACTTTTAATTGTTCAGCAATCTCTTTTTGATTGCTTATATCAAGACCATGCAATATGCGGGATACGCCATTTCTGGCACTTGCAGAAATATCAACTGATAATTTGCTCATCTTGTTACCTAAGCCACTTGTTTGGTTTTGCAATGCTTTTTCCAAAGCTTTTGTAATTTGGTTGCAATTTCATGCGATAAGCGTTTACCACATACCCCGCGCTCTAAATCACTAACGTAATTCTGTGAGCACCCGATCTCGGTACCAATTTGAGTTTGTGTTAAGCCCTTTTCACGCAAATCTGAAATCATGTTTGGCCATTGATTCATGCGAAGCTCCTATATTTTTAGGTAAATATATAGGTTTTCCGATATTTTAACAATAGCCAAAGCGATACTAATTTGTATCAGAATTCCGATATACGTATTTAAGGAAATACATATGGCTACTTTGGGTGAAAACTTAAAAGCAATACGAAAAGCAAAAAAGATGACTCAAAAAGAGTTAGCTCAGAAATCTGGTGTAAAACAATCTGTAATTTCTGATCTTGAAACAGGAAATGCCAAGTCGACAGGTTCAATACTTGAATTAGCAAATGCCCTTGGGGTTACAGCTGAAGAATTAAAAAAAGGTGTAGTTGGGGAACTTATTACCACCAACGTTGTGCCAGTTCAAGCTCGAATGGCACCCGTTTTATCTTGGGTACAAGCAGGTAATTTTACTAATGTTGAATCAGTAGATATGTCTCAAGTTACGGAATGGTTCCCTCTCCCAGATGATTGCGAAAAATGTTTTTATTTAAAAGTACGTGGCGTAAGTAATGAACCCGATTTTGTAGAAGGTGATTATATTGTTGTAGATCCGACAGTATATTATTCAGATATGCAATCTGGAGATATCATTGTCGTCCGTAAAGACAAAGATGCTACTTTCAAAAAACTGGTTATTGAATCTGATGGAACAAGGTATCTAAAAGCGATTAACCCAAATTTTCATCCCAATATCATTCCAATTGACGAAGATTGCTATTTTATTGGTCAAGTAATAGATTCATTGAGATATACATACCGTGGAAAACGAAGAGTAAGAAAGAGTTAAGATGAAAGTTTTTAAAATAATTTTGTTATTGCCAGTCTTAGTTTTAACTGGATGTTCAGACACTATTAGCCGAGCTGAACATGATGCTATCGTGTATGAGAAAGATCAGAAAATTGCTGAATTAGAAGAGCATATTGCTGAGTTAGAAGCTAAACTAGAGGAAGTAAACAATCAATTTGAGCGCTTTGAAAATGAAAATTGGCGTGACGTCGTTCCAGATGTGGATAATGCTCTTGATGACTTAAATAGTGAAGTTGAAAATAATCCTTCATCAAACTACTAACAGTGCTAGACCATAAATATCAATTAAATAATTTTAATTAATCCCCCCTTGTTAAAGTGATTTTTGTGTTTCAAGAGATCAATATCGGAATACCAGTAAAAATATCGGAATAACTATTGACTACAAATATCGGAAATGCGATATTTGTCTCGTAGACAACAAAAAAGCACACCGCCCCTCCCCAGGTCCGATGTGCTTTTGCAAAACTGCGAGATCAATTATGAACGTAAAAACCTTTTCAAACAAGCATAAGGTAACTGGAGTTACAGCAATTGCTGTACTTGTAGCCTTGAGTTCTTGTGAATATCGAACTGCTAATTCTAGCGTCCCTTCTAATTACTCCGAAGTAGGCATCTTAGTAGCTGGGAAAACCCAATCGTTTTCTCTTAATAACCAACGTTCACGCAAAATACTGTGTAGATGATCACCAATAGGAAAAGTATGATCTGAACCATTTTTGGTATCTCTAAAAGTTAAGGTACCATTTTTAATATCTACATCAGCCCACTTTAGACAACATGCCTCCTGTTTACGGCATCCAGTATACATGCACATCAATACGATATCCCGATGCGTGTTTGACCTAGCAGTATTTTCCAGATTCAACTCATCTTCATAATGAAGCACCGCATTGTAATATTTGTGAATGATGTCTTTATGGAGATGTCTATCCCTACTTGCTATTTTATTCCAACCTCTTGTTACGGAAATAATGTCAACTGGATTACTTTTAAGGATCGGGTTCTCATCTGTTGAATAAAGAACATGAATATACTTCCATAAGGTACCTAAAAGAGATACAGCACCATTTGCTGACGACTCACTTACTTCTGATACCTCAATAAATCGATCCAATACTTCTTGCTTAGATATCTGGAAAAGCTTTTTATTGCCCCACCCCAAATATAAATCAAAGTACTTACGGTACTGCCTAATTGTTTTTGGTCTAAAGTCATTTCTATCAATATAAATTTGAAGGGCTTCATTCACTGTAATATCTAAAGGATTAGCAACATTCTTTAATTTGATAGGCTTTTCATATTCATTGTTTGAAATTTTCGCCAGAATCATCTGAGCTTTTGCTCGAGCATTTGTTGCAGGAATATCGGTAGTTTTGCCAATTGTCACTCGATAGAGTTCACCTTCATGCCTCCTTTCAACAATATAGGTTTTACTTTTATTAGTTACCCGAACAGCAAAACCGATCAGTTCTGCATCTCTATATATTTTTTGACCTTTTTCAGTTAATGGAATAGCATCAACAGTAGATTTGTTGAGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP048827|2319455:2326329|2319455_2319932_-|WP_001277128.1|DBSCAN-SWA MSAVLKTQQMDWSKYTIDGWLEQFGAWCETVRMKGGDLPDGLHINQIYWLMREAGKEVQKSKSYIRCEISDYEADQIQALLRSLLNSDKTDFTTKFALICLIKNKVENKGLLKVAQETNQSKAQVAIMVSCARFYLLGHDKRLRQNGGSNENIHCKTI >NZ_CP048827|2319455:2326329|2322803_2323100_-|WP_038346607.1|DBSCAN-SWA MNSFTHQIKYSRQQSEIQSFYEPALRVLGHLFEVKKQNLRNKGYDENNAAVTKVEFSEAMARQFRITQWLAQQIVTSLTKACLVDSFGGYVKPKDGEK >NZ_CP048827|2319455:2326329|2323792_2323993_-|WP_001077691.1|DBSCAN-SWA MNQWPNMISDLREKGLTQTQIGTEIGCSQNYVSDLERGVCGKRLSHEIATKLQKLWKKHCKTKQVA >NZ_CP048827|2319455:2326329|2320329_2320785_-|WP_005124477.1|DBSCAN-SWA MNAVEFMKEHGIEKARFVIGSAEVGGVVTPKILDLKKLVQSLELIEQIGGVEVAKGKVFIADFNDFKMIKFLIGNKDFVVHIKRVQEAIADHEAVNGNEIDPLIKLKAGLTKLRDKFINDAHALTLLGDLDKSRVYNGIANQLDHLLKGGA >NZ_CP048827|2319455:2326329|2324763_2325045_+|WP_000862387.1|DBSCAN-SWA MKVFKIILLLPVLVLTGCSDTISRAEHDAIVYEKDQKIAELEEHIAELEAKLEEVNNQFERFENENWRDVVPDVDNALDDLNSEVENNPSSNY >NZ_CP048827|2319455:2326329|2322444_2322807_-|WP_024434125.1|DBSCAN-SWA MRYAAKRKQDISVSTTPLEVVIPLEQPVKIYSAKELAAMPLSVMNAAIEAQERFYQLEELTHMGGQAIAVRRLMEDGHKLIQVKEKSRIRYKINNEFIPPRIIRQLEMRGLVKLGAVTDV >NZ_CP048827|2319455:2326329|2319928_2320330_-|WP_000097329.1|DBSCAN-SWA MSSMSLAEYRELFPIQKNKKRRSAKQGTRQPSEGETVLATHLKACKISFEQEYKFHPERKWRADFLITGTKILIEVEGGIWSGGRHTRGKGYIGDMEKYNSAAMMGFTVLRFSTEQVKAGVAIKQIEQLVGEK >NZ_CP048827|2319455:2326329|2323096_2323372_-|WP_001095601.1|DBSCAN-SWA MNTNNLSEQPIELNSPDFLIGDVVVLTKECRTFKSNDLFEVKNKTLTSLWTIKSENHLILVSSKEIRTATVAELNAKRRLTSAEQALAEVS >NZ_CP048827|2319455:2326329|2323427_2323784_-|WP_000041062.1|DBSCAN-SWA MSKLSVDISASARNGVSRILHGLDISNQKEIAEQLKVDPSTITRLKTDKKNNGLNEIEMFCELLSLLGLKVVPKDYQSIDKERVAALLVMSKSWMNRIETVDDLFHDEISCQKEKLGY >NZ_CP048827|2319455:2326329|2325381_2326329_-|WP_169538848.1|integrase|DBSCAN-SWA MKLNKSTVDAIPLTEKGQKIYRDAELIGFAVRVTNKSKTYIVERRHEGELYRVTIGKTTDIPATNARAKAQMILAKISNNEYEKPIKLKNVANPLDITVNEALQIYIDRNDFRPKTIRQYRKYFDLYLGWGNKKLFQISKQEVLDRFIEVSEVSESSANGAVSLLGTLWKYIHVLYSTDENPILKSNPVDIISVTRGWNKIASRDRHLHKDIIHKYYNAVLHYEDELNLENTARSNTHRDIVLMCMYTGCRKQEACCLKWADVDIKNGTLTFRDTKNGSDHTFPIGDHLHSILRERWLLRENDWVFPATKMPTSE >NZ_CP048827|2319455:2326329|2320781_2321531_-|WP_038346609.1|DBSCAN-SWA MHEITLNEVRQLIASLRTVYAAQFNKQFPATGESAIPLSVVEQIALKTLVGVQQNQFNNALARLLTAGGRFMPSFAEFRTWCIGESWMSSEEAWSRACKFTTDRSVVITQITKYALDEVMYLIEAGQMRAAQDNFFGTYNVMVAKAQLKGRQQEFYTPPLQLEHKEPKHVPVSNDEAQKHLKSLMERLKINGRKPAPVQKLEAKEKEPELIKELGPDPFDNPHEYAEMCRREGMPIPRNILQLIDGANV >NZ_CP048827|2319455:2326329|2324105_2324762_+|WP_000212394.1|DBSCAN-SWA MATLGENLKAIRKAKKMTQKELAQKSGVKQSVISDLETGNAKSTGSILELANALGVTAEELKKGVVGELITTNVVPVQARMAPVLSWVQAGNFTNVESVDMSQVTEWFPLPDDCEKCFYLKVRGVSNEPDFVEGDYIVVDPTVYYSDMQSGDIIVVRKDKDATFKKLVIESDGTRYLKAINPNFHPNIIPIDEDCYFIGQVIDSLRYTYRGKRRVRKS |
12 | Acinetobacter_phage(90.0%) | integrase | attL 2316852:2316865|attR 2328679:2328692 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2689447 : 2704244
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP048827|2689447:2704244|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
23163 : 30302
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048828|23163:30302|DBSCAN-SWA 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7 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
193503 : 239658
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048828|193503:239658|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048828|193503:239658|235409_235715_-|WP_001255015.1|DBSCAN-SWA MRRTNHRNLVNVGILSGRIPLISLVQFIAVAEHLNFRHAAKALGISQSSVSARVKALEDNLGVLLFERHARGVRLTDAGRHFMERVTAGVDQLDHAVKTAE >NZ_CP048828|193503:239658|224248_224785_-|WP_159138992.1|DBSCAN-SWA MKYKDIGESEKLDQVIKEMKNIFRTVPYGVDHTMKVLENTRTIIERENVDSQTGCIIELSAVLHDIGSVEALRKYGSMEGHLQEQEGVPIARNILNEHNYEPFVIERVCYIVGNHHTPEKIDGKDFQILWEADLIENMQVMDCTKDTETLRQFVSKKIKTQAGKALALCKYSPALKTL >NZ_CP048828|193503:239658|236779_237655_-|WP_078081115.1|DBSCAN-SWA MTFNNNENTRVWFITGASSGLGYEFTKKALESGEKVVGVARNIEKLNELKCQFEGMLLPLSLDVTDRSAVSTTVETAIKHFGRLDIVINNAGNMVMGMIEEFSEDEVRSQMETNFFGTVWVSQAVMPYLRAQESGHIIQISSIGGLISGPMSGIYSASKFALEGFSEALAQEAAHFGIKVSIVEPGGYWTNLYLKMSFTTQKKEYDSLREKLAQQYSNESVDSDPKLAAEAIMKLVNSENPPLRLVLGSLVYDLAVENAEKRIFTWKEWESVSRSSEHGIPAPEGYGIIEE >NZ_CP048828|193503:239658|197034_198675_-|WP_004201176.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP048828|193503:239658|238164_239658_-|WP_169538920.1|transposase|DBSCAN-SWA MPHVAARTASRDRDTGRYQSHRPEQTLLYQIVDEYYPAFAALMAEQGKELPGYVQREFEEFLQCGRLEHGFLRVRCESCHAEHLVAFSCKRRGFCPSCGARRMAESAALLVDEVLPEQPMRQWVLSFPFQLRFLFASRPEIMGWVLGIVYRVIATHLVKKAGHTHQVAKTGAVTLIQRFGSAHNLNVHFHMLFLDGVYVEQSHGSARFRWVKAPTSPELTQLTHTIAHRVGRYLERQGLLERDVENSYLASDAVDDDPMTPLLGHSITYRIAVGSQAGRKVFTLQTLPTSGDPFGDGIGKVAGSSLHAGVAARADERKKLERLCRYISRPAVSEKRLSLTRGGNVRYQLKTPYRDGTTHVIFEPLDFIARLAALVPKPRVNLTRFHGVFAPNSRHRALVTPAKRGRGNKVRVADEPATPAQRRASMTWAQRLKRVFNIDIETCSGCGGAMKVIACIEDPIVIKQILDHLKHKAETSGTRALPESRAPPAELLLGLFD >NZ_CP048828|193503:239658|220015_221230_+|WP_000214122.1|DBSCAN-SWA MTTTRPAWAYTLPAALLLMAPFDILASLAMDIYLPVVPAMPGILNTTPAMIQLTLSLYMVMLGVGQVIFGPLSDRIGRRPILLAGATAFVIASLGAAWSSTAPAFVAFRLLQAVGASAMLVATFATVRDVYANRPEGVVIYGLFSSMLAFVPALGPIAGVLIGEFLGWQAIFITLAILAMLALLNAGFRWHETRPLDQVKTRRSVLPIFASPAFWVYTVGFSAGMGTYFVFFSTAPRVLIGQAEYSEIGFSFAFATVALVMIVTTRFAKSFVARWGIAGCVARGMALLVCGAVLLGIGELYGSPSFLTFILPMWVVAVGIVFTVSVTANGALAEFDDIAGSAVAFYFCVQSLIVSIVGTLAVALLNGDTAWPVICYATAMAVLVSLGLVLLRLRGAATEKSPVV >NZ_CP048828|193503:239658|225133_225994_-|WP_077782102.1|DBSCAN-SWA MKEKIVKKNGIRLFTESFGCEKDPAILLIAGATVSMLYWDAEFCQKLSEKGFFVIRYDNRDVGKSTNYEPGSTPYDIVDLTHDAISILDGYKIVKANFVGISLGGLISQIASIKYADRVSSITLISSGPWGDSDPTIPEMDTRILDFHGKAETVDWTNEDSVANYLIQGAELMSGRKQFDKQRSEKLIRAEFKRANNYISMFNHAALQGGEEYWNRLSEINQPTLIVHGTDDKIWHFKNSAVLLEKINGSKLITLDGTGHELHFEDWNKIIDGITQHTTNNKRMNK >NZ_CP048828|193503:239658|207147_207609_+|WP_046127872.1|DBSCAN-SWA MNNKTIAKKMINQVKSVITDPQAKSLLAAYHVETSFTHFYETHSHIYLVGKDITAVMAKHFPYFTFKTRDNKKARHGIGDGSMSDCLNKLRRVYRLEIKKPISEKFIAEAGAPTFTKSQSVSPVAYLIDEVVQQETAPIARSDVQNSFQDLFN >NZ_CP048828|193503:239658|223657_223960_+|WP_000251875.1|DBSCAN-SWA MVRKYFGTDGIRGKANEGAMTAETALRVGMAAGRVFRRGDHRHRVVIGKDTRLSGYMLEPALTAGFTSMGMDVFLFGPLPTTYRKNKRPFHPSPTALDRS >NZ_CP048828|193503:239658|202515_203541_-|WP_001988464.1|transposase|DBSCAN-SWA MEYIKLSYHHLNFEDRTALMLESRKEGFSARKFAELIKRHPSTIYRELKRNSINDVYQAQYASDNTFARRRRGHRKLKIDSILWKFIVEAIRCLWSPQQIAKRLKTFPDLDQTMNVSHTTIYSTIRALPKGELKKDLLSCLRHENKKRKANGEPKKDSILQDIKTIHERPAEVQERKIPGHWEADLIKGKDNKSSIATLIERNTRLCILATLPDAKAESVRKALTEALKYLPAELRKTLTYDRGREMSEHKILEEDLGIDVYFCDPHSPWQKGTCENMNGLIRQYLPKGIDLNQADQHYLNQVAMSLNTRPRKALDWLTPLEKFAQLVDYHMAFETVAPHV >NZ_CP048828|193503:239658|209329_209848_-|WP_033917549.1|DBSCAN-SWA MSEKSEIPLKAGDLVEIEALAPGAPKRIPVALELLSAGFASPAQDFIEKSVDLNEMLITNEYSTFIGKVGSRSMLNAGIDINDKLIIDRSLDAKHLDIIVAQLETDFTVKRLMITKQMSAGEINEIFGPDAKSIPPVWLKAENQEHSHIFLKPEQELIVWGVVTYIIKDARK >NZ_CP048828|193503:239658|221257_222241_+|WP_014386425.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP048828|193503:239658|200590_201229_-|WP_004201168.1|DBSCAN-SWA MPAKIKICGISTPEALDATIAARADYAGLVFYPASPRAVTSNVAGALTSRAAGQIAMVGLFVDADDAVIADALVAAKLNALQLHGSESPERVAQLRARFGKPVWKALPVASASDVARAAAYAGAADLILFDAKTPKGALPGGMGLAFDWSLLAGYRGALPWGLAGGLNPTNVAEAIARTGAPLVDTSSGVESAPGVKDTDKITNFAFAVRLA >NZ_CP048828|193503:239658|201233_201599_-|WP_004201167.1|DBSCAN-SWA MADHVTPNLPSRDFDVTEAFYAKLGFATSWKDRGWMILQRGGLQLEFFPYPDLDPATSSFGCCLRLDDLDAMVALVNAAGAEEKSTGWPRFKAPQLEASGLRIGYLIDPDCTLVRLIQNPD >NZ_CP048828|193503:239658|233804_235298_-|WP_015344975.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MNKSLIIFGIVNITSDSFSDGGRYLAPDAAIAQARKLMAEGADVIDLGPASSNPDAAPVSSDTEIARIAPVLDALKADGIPVSLDSYQPATQAYALSRGVAYLNDIRGFPDAAFYPQLAKSSAKLVVMHSVQDGQADRREAPAGDIMDHIAAFFDARIAALTGAGIKRNRLVLDPGMGFFLGAAPETSLSVLARFDELRLRFDLPVLLSVSRKSFLRALTGRGPGDVGAATLAAELAAAAGGADFIRTHEPRPLRDGLAVLAALKETARIR |
41 | Staphylococcus_phage(21.43%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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