CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP041148	Acinetobacter baumannii strain CUVET-MIC596 chromosome, complete genome	1 crisprs	cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT	0	0	10	0
NZ_CP041149	Acinetobacter baumannii strain CUVET-MIC596 plasmid pCUVET596, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. NZ_CP041148

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP041148_1

• CRISPR_ID: NZ_CP041148_1
• CRISPR_location: 2474917-2475002
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP041148_1

Consensus_repeat	Method
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP041148_1

>1.1|2474940|40|NZ_CP041148|CRISPRCasFinder
GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041148_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP041148_1

>merge|NZ_CP041148|1|2474917-2475002|CRISPRCasFinder
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA

>NZ_CP041148|1|1|2474917-2475002|CRISPRCasFinder
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA	GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG
CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP041148.1|WP_038350334.1|2472785_2473397_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|182350
NZ_CP041148.1|WP_001990047.1|2469786_2471433_+|allantoin-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224374
NZ_CP041148.1|WP_000132044.1|2482138_2482456_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP041148.1|WP_001136759.1|2482849_2483278_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP041148.1|WP_000885229.1|2472103_2472715_+|LysE-family-translocator	unknown	unknown	gnl|CDD|224199
NZ_CP041148.1|WP_001025680.1|2464772_2465057_-|N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|379642
NZ_CP041148.1|WP_002017921.1|2464549_2464663_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP041148.1|WP_000482091.1|2481047_2481527_+|CinA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224463
NZ_CP041148.1|WP_000376215.1|2471491_2471947_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224439
NZ_CP041148.1|WP_000251637.1|2483547_2483691_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP041148.1|WP_000107128.1|2465200_2466160_-|response-regulator-transcription-factor	unknown	unknown	gnl|CDD|381147
NZ_CP041148.1|WP_000432330.1|2476188_2477067_+|glucose-1-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|187613
NZ_CP041148.1|WP_000108365.1|2481811_2482033_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|237171
NZ_CP041148.1|WP_000115408.1|2466156_2469621_-|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|274362
NZ_CP041148.1|WP_001990041.1|2477123_2479268_-|catalase-HPII	unknown	unknown	gnl|CDD|236886
NZ_CP041148.1|WP_000795915.1|2473679_2473916_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP041148.1|WP_001145693.1|2479322_2480732_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379634
NZ_CP041148.1|WP_000498477.1|2482540_2482762_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP041148.1|WP_000983628.1|2475633_2476047_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP041148.1|WP_000937460.1|2463825_2464461_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223836

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP041148.1|WP_038350334.1|2472785_2473397_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit	gnl|CDD|182350	PRK10276, PRK10276, translesion error-prone DNA polymerase V autoproteolytic subunit.	2.17143e-39
NZ_CP041148.1|WP_001990047.1|2469786_2471433_+|allantoin-permease	gnl|CDD|224374	COG1457, CodB, Purine-cytosine permease and related proteins [Nucleotide transport and metabolism].	9.5172e-23
NZ_CP041148.1|WP_000885229.1|2472103_2472715_+|LysE-family-translocator	gnl|CDD|224199	COG1280, RhtB, Putative threonine efflux protein [Amino acid transport and metabolism].	2.70108e-23
NZ_CP041148.1|WP_001025680.1|2464772_2465057_-|N-acetyltransferase	gnl|CDD|379642	pfam14542, Acetyltransf_CG, GCN5-related N-acetyl-transferase. This family of GCN5-related N-acetyl-transferases bind both CoA and acetyl-CoA. They are characterized by highly conserved glycine, a cysteine residue in the acetyl-CoA binding site near the acetyl group, their small size compared with other GNATs and a lack of of an obvious substrate-binding site. It is proposed that they transfer an acetyl group from acetyl-CoA to one or more unidentified aliphatic amines via an acetyl (cysteine) enzyme intermediate. The substrate might be another macromolecule.	1.0722e-24
NZ_CP041148.1|WP_000482091.1|2481047_2481527_+|CinA-family-protein	gnl|CDD|224463	COG1546, CinA, Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) [General function prediction only].	5.88094e-21
NZ_CP041148.1|WP_000376215.1|2471491_2471947_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224439	COG1522, Lrp, Transcriptional regulators [Transcription].	8.76675e-40
NZ_CP041148.1|WP_000107128.1|2465200_2466160_-|response-regulator-transcription-factor	gnl|CDD|381147	cd19920, REC_PA4781-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of cyclic di-GMP phosphodiesterase PA4781 and similar domains. Pseudomonas aeruginosa cyclic di-GMP phosphodiesterase PA4781 contains an N-terminal REC domain and a C-terminal catalytic HD-GYP domain, characteristics of RpfG family response regulators. PA4781 is involved in cyclic di-3',5'-GMP (c-di-GMP) hydrolysis/degradation in a two-step reaction via the linear intermediate pGpG to produce GMP. Its unphosphorylated REC domain prevents accessibility of c-di-GMP to the active site. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	6.21476e-55
NZ_CP041148.1|WP_000432330.1|2476188_2477067_+|glucose-1-dehydrogenase	gnl|CDD|187613	cd05355, SDR_c1, classical (c) SDR, subgroup 1. These proteins are members of the classical SDR family, with a canonical active site tetrad and a typical Gly-rich NAD-binding motif. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet), an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Classical SDRs are typically about 250 residues long, while extended SDRs are approximately 350 residues. Sequence identity between different SDR enzymes are typically in the 15-30% range, but the enzymes share the Rossmann fold NAD-binding motif and characteristic NAD-binding and catalytic sequence patterns. These enzymes catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH) numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser (Ser-138, 15-PGDH numbering) and/or an Asn (Asn-107, 15-PGDH numbering) contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Extended SDRs have additional elements in the C-terminal region, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif. Some atypical SDRs have lost catalytic activity and/or have an unusual NAD(P)-binding motif and missing or unusual active site residues. Reactions catalyzed within the SDR family include isomerization, decarboxylation, epimerization, C=N bond reduction, dehydratase activity, dehalogenation, Enoyl-CoA reduction, and carbonyl-alcohol oxidoreduction.	1.69173e-160
NZ_CP041148.1|WP_000115408.1|2466156_2469621_-|response-regulator	gnl|CDD|274362	TIGR02956, sensor_protein_TorS, TMAO reductase sytem sensor TorS. This protein, TorS, is part of a regulatory system for the torCAD operon that encodes the pterin molybdenum cofactor-containing enzyme trimethylamine-N-oxide (TMAO) reductase (TorA), a cognate chaperone (TorD), and a penta-haem cytochrome (TorC). TorS works together with the inducer-binding protein TorT and the response regulator TorR. TorS contains histidine kinase ATPase (pfam02518), HAMP (pfam00672), phosphoacceptor (pfam00512), and phosphotransfer (pfam01627) domains and a response regulator receiver domain (pfam00072). [Signal transduction, Two-component systems].	3.64852e-57
NZ_CP041148.1|WP_001990041.1|2477123_2479268_-|catalase-HPII	gnl|CDD|236886	PRK11249, katE, hydroperoxidase II; Provisional.	0
NZ_CP041148.1|WP_001145693.1|2479322_2480732_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein	gnl|CDD|379634	pfam14518, Haem_oxygenas_2, Iron-containing redox enzyme. The CADD, Chlamydia protein associating with death domains, crystal structure reveals a dimer of seven-helical bundles. Each bundle contains a di-iron centre adjacent to an internal cavity that forms an active site similar to that of methane mono-oxygenase hydrolase.	1.51279e-18
NZ_CP041148.1|WP_000108365.1|2481811_2482033_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|237171	PRK12678, PRK12678, transcription termination factor Rho; Provisional.	5.30417e-06
NZ_CP041148.1|WP_000937460.1|2463825_2464461_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|223836	COG0765, HisM, ABC-type amino acid transport system, permease component [Amino acid transport and metabolism].	2.9036e-64

Protein sequences

>NZ_CP041148.1|WP_000795915.1|2473679_2473916_+|hypothetical-protein
MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS
>NZ_CP041148.1|WP_038350334.1|2472785_2473397_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit
MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTLKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR
>NZ_CP041148.1|WP_000885229.1|2472103_2472715_+|LysE-family-translocator
MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI
>NZ_CP041148.1|WP_000376215.1|2471491_2471947_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator
MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG
>NZ_CP041148.1|WP_001990047.1|2469786_2471433_+|allantoin-permease
MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA
>NZ_CP041148.1|WP_000115408.1|2466156_2469621_-|response-regulator
MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ
>NZ_CP041148.1|WP_000107128.1|2465200_2466160_-|response-regulator-transcription-factor
MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH
>NZ_CP041148.1|WP_001025680.1|2464772_2465057_-|N-acetyltransferase
MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK
>NZ_CP041148.1|WP_002017921.1|2464549_2464663_+|hypothetical-protein
MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS
>NZ_CP041148.1|WP_000937460.1|2463825_2464461_-|amino-acid-ABC-transporter-permease
MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT
>NZ_CP041148.1|WP_000983628.1|2475633_2476047_+|hypothetical-protein
MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII
>NZ_CP041148.1|WP_000432330.1|2476188_2477067_+|glucose-1-dehydrogenase
MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG
>NZ_CP041148.1|WP_001990041.1|2477123_2479268_-|catalase-HPII
MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA
>NZ_CP041148.1|WP_001145693.1|2479322_2480732_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein
MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN
>NZ_CP041148.1|WP_000482091.1|2481047_2481527_+|CinA-family-protein
MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR
>NZ_CP041148.1|WP_000108365.1|2481811_2482033_+|hypothetical-protein
MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR
>NZ_CP041148.1|WP_000132044.1|2482138_2482456_+|hypothetical-protein
MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI
>NZ_CP041148.1|WP_000498477.1|2482540_2482762_-|hypothetical-protein
MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF
>NZ_CP041148.1|WP_001136759.1|2482849_2483278_-|hypothetical-protein
MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS
>NZ_CP041148.1|WP_000251637.1|2483547_2483691_-|hypothetical-protein
MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1075837 : 1140185	69	Moraxella_phage(37.5%)	integrase,tail,protease,capsid,transposase,tRNA,portal,head,terminase	attL 1084612:1084671|attR 1120311:1121022
DBSCAN-SWA_2	1213899 : 1280210	84	Acinetobacter_phage(95.65%)	capsid,terminase	NA
DBSCAN-SWA_3	1370931 : 1434438	60	Salicola_phage(12.5%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	1616391 : 1658197	60	Acinetobacter_phage(100.0%)	integrase,capsid,plate,transposase,terminase	attL 1616214:1616231|attR 1658705:1658722
DBSCAN-SWA_5	1997250 : 2062199	60	Acinetobacter_phage(25.0%)	transposase,plate	NA
DBSCAN-SWA_6	2067675 : 2094053	40	uncultured_Caudovirales_phage(19.23%)	integrase,transposase,capsid,head	attL 2062650:2062664|attR 2092338:2092352
DBSCAN-SWA_7	2238042 : 2287124	68	Acinetobacter_phage(37.14%)	integrase,tail,capsid,protease,tRNA,portal,head,terminase	attL 2237911:2237932|attR 2277011:2277032
DBSCAN-SWA_8	2786328 : 2815002	38	Acinetobacter_phage(93.55%)	capsid,terminase	NA
DBSCAN-SWA_9	2818960 : 2831308	24	Acinetobacter_phage(95.65%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_10	3043066 : 3062626	33	Acinetobacter_phage(40.0%)	integrase	attL 3049773:3049787|attR 3064799:3064813

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MKYKALSEAEVLAVLAEGELDASDLLYTANPNFEKRFKRLNTALAKLLDEVREYFPNAEYYCPSDAMVLLLGSSHADKDGQPHQQELVAANSDALSGRISGGDW

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000993080.1|1080035_1081424_-	adenylosuccinate lyase	A0A2H4UUU6	Bodo_saltans_virus	9.5e-100	45.2
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1084612:1084671	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_000071230.1|1114733_1115321_+	HNH endonuclease	Q38456	Bacillus_phage	7.2e-25	46.5
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WP_140992761.1|1121084_1122389_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2H4PI18	Pseudomonas_phage	9.7e-38	37.2
1120311:1121022	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_049594682.1|1132187_1132982_+|tail	phage minor tail protein L	A0A0R6PIG8	Moraxella_phage	2.0e-86	61.9
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WP_169538944.1|1133970_1134627_+|tail	tail assembly protein	A0A0R6PIW1	Moraxella_phage	2.5e-26	41.9
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WP_004835670.1|1139413_1139653_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_151789258.1|1139636_1140185_+	glycoside hydrolase family protein	A0A0B5L5F7	Acinetobacter_phage	3.3e-40	50.6

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP041148|1213899:1280210|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000893683.1|1214710_1216210_+	xanthine dehydrogenase small subunit	A0A0P0IVM8	Acinetobacter_phage	6.1e-286	100.0
WP_001076817.1|1216211_1218587_+	xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit	A0A0P0I429	Acinetobacter_phage	0.0e+00	100.0
WP_001164226.1|1218593_1219577_+	xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC	A0A0P0IKN7	Acinetobacter_phage	2.0e-189	100.0
WP_000066126.1|1219587_1220283_-	Smr/MutS family protein	A0A0P0IDT4	Acinetobacter_phage	5.8e-122	100.0
WP_000608304.1|1220292_1221099_-	indole-3-glycerol phosphate synthase TrpC	A0A0P0IR83	Acinetobacter_phage	7.9e-147	100.0
WP_001982145.1|1221108_1222158_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	9.8e-190	100.0
WP_000281127.1|1222513_1225246_+	TonB-dependent receptor	A0A0P0I887	Acinetobacter_phage	0.0e+00	99.9
WP_000960548.1|1225325_1228025_+	M1 family metallopeptidase	A0A0P0IY26	Acinetobacter_phage	0.0e+00	100.0
WP_000566784.1|1228120_1228696_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.2e-110	100.0
WP_000529848.1|1228819_1229089_-	hypothetical protein	A0A0P0J067	Acinetobacter_phage	8.7e-42	100.0
WP_000877062.1|1229089_1229425_-	hypothetical protein	A0A0P0HSE1	Acinetobacter_phage	3.7e-34	62.4
WP_000004577.1|1229421_1229817_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000418203.1|1229813_1230137_-	hypothetical protein	I2GUB3	Acinetobacter_phage	4.7e-18	57.5
WP_000132009.1|1230165_1230534_-	hypothetical protein	A0A1B1P9I4	Acinetobacter_phage	1.7e-64	98.3
WP_000210280.1|1230543_1231059_-	siphovirus Gp157 family protein	A0A0A8WFY3	Clostridium_phage	1.1e-05	26.4
WP_000528927.1|1231113_1231773_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000020435.1|1231785_1232454_-	AAA family ATPase	K7PMI2	Enterobacteria_phage	1.0e-62	56.2
WP_000454828.1|1232515_1232722_-	DUF551 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_001056783.1|1232721_1233102_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_031957618.1|1233101_1233302_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000560785.1|1233504_1233720_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000923284.1|1234148_1234658_-	hypothetical protein	A0A127KNL4	Pseudomonas_phage	1.3e-17	36.5
WP_000418027.1|1234803_1235013_-	hypothetical protein	A0A1B1P9G7	Acinetobacter_phage	2.5e-28	98.5
WP_000867174.1|1235022_1235769_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A1B1P9J5	Acinetobacter_phage	1.3e-140	100.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP041148|1370931:1434438|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000469223.1|1409683_1410010_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075878554.1|1412849_1413305_+	Csu fimbrial biogenesis protein CsuA	NA	NA	NA	NA
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WP_038350309.1|1417147_1418170_+	Csu fimbrial tip adhesin CsuE	NA	NA	NA	NA
WP_001149936.1|1418227_1418347_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000792950.1|1421530_1422085_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_000520927.1|1423272_1424871_-	bifunctional aspartate transaminase/aspartate 4-decarboxylase	NA	NA	NA	NA
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WP_000768105.1|1428335_1428953_+	paraquat-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
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WP_002016783.1|1429754_1431422_+	MCE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000791373.1|1431411_1432122_+	membrane integrity-associated transporter subunit PqiC	NA	NA	NA	NA
WP_000848609.1|1432314_1433043_+	aspartate/glutamate racemase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000782406.1|1433778_1434438_-|transposase	IS1595-like element ISAba36 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP041148|1616391:1658197|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP041148|1997250:2062199|DBSCAN-SWA
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MTLKQLKAFLALARTLNYANASLELHLSQSALSLTIKSLEEELGGKLFNRNTRRVELTQEGKSLIPYAKKLLANWDEMENDVKQRFKLNRGTLSIASMPFVTHAILPEVIHQFLAVHPNLNFSIHDIPNETIIEKVQDGIFELGICFEPDLTEGLEFKPLFEEDFLALLPKSHPLAQSSSITWHELCSNPFVTLQKPSIVRYLVEQNCLRNNITLDLKVECHQISSLSSFVAYGIGVSAIPRHFAKHIDKEHNVLIDLKDEAIHKTVGIVYKKNFEISNISAQFIEALVQYKF
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MKEQNLKLQIRILLEQNIAFGPGKADLLEAIARTGSISQAAKSMNMSYRRAWQLVDTMNQCFETALVETQTGGTHGGGAAITALGQKVLQHYRQMENNARQALEHDYQIMSSYLKG

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_085940413.1|2003551_2004642_-|transposase	IS4 family transposase ISAba1	NA	NA	NA	NA
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WP_169538949.1|2056998_2058450_+	aspartate ammonia-lyase	NA	NA	NA	NA
WP_000821010.1|2058495_2059767_-	hypothetical protein	E5EYU2	Acinetobacter_phage	1.6e-05	40.0
WP_000142501.1|2059763_2060300_-	DUF2313 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_000973841.1|2061716_2062199_-|plate	phage baseplate assembly protein	A0A0M3LPA3	Mannheimia_phage	9.8e-12	39.3

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP041148|2067675:2094053|DBSCAN-SWA
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MANYLHDQKFLNRGDIVHLDCDTQCNFMIMDNTNFQNYRNGRQFNYYGGHYTHFPARINVPHTGTWNVVIDLGGGRANIRYNLSYLTAN

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001102133.1|2073807_2074716_-|head	Mu-like prophage major head subunit gpT family protein	A0A2P9JZJ2	Alteromonadaceae_phage	7.9e-95	57.7
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WP_114890829.1|2076281_2076758_-	phage virion morphogenesis protein	F8TVC6	EBPR_siphovirus	9.4e-15	38.6
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WP_114890831.1|2078013_2079633_-	DUF935 domain-containing protein	A0A0M5MS00	Ralstonia_phage	1.3e-103	40.2
WP_000035039.1|2079855_2080125_+	DUF1883 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000968697.1|2080102_2080306_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_109114535.1|2080390_2081953_-	hypothetical protein	A0A2H4JF57	uncultured_Caudovirales_phage	1.0e-158	57.7
WP_109114536.1|2081949_2082498_-	DUF3486 family protein	A4JWJ3	Burkholderia_virus	2.2e-44	50.6
WP_109114537.1|2082506_2082818_-	hypothetical protein	A0A2H4JGU5	uncultured_Caudovirales_phage	5.5e-24	51.0
WP_109114538.1|2082814_2083159_-	hypothetical protein	Q6QIC4	Burkholderia_phage	2.6e-14	40.4
WP_169538953.1|2083155_2083542_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016802888.1|2083538_2084039_-	glycoside hydrolase family 108 protein	A0A0M3LSH2	Mannheimia_phage	3.0e-56	66.5
WP_024436631.1|2084120_2084450_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017480679.1|2084465_2085122_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2I7S9A5	Vibrio_phage	1.1e-24	37.4
WP_017480680.1|2085222_2085435_+	DNA-binding protein	B5TA78	Burkholderia_phage	2.7e-06	46.7
WP_017480681.1|2085495_2085657_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017480682.1|2085640_2085937_+	IclR family transcriptional regulator	Q5ZR02	Pseudomonas_phage	1.9e-13	44.4
WP_017480683.1|2085949_2086825_+	DUF3102 domain-containing protein	Q6QID9	Burkholderia_phage	9.5e-29	43.6
WP_046882902.1|2086827_2088570_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	Q5ZR04	Pseudomonas_phage	9.8e-102	36.0
WP_024436640.1|2088573_2089761_+	AAA family ATPase	Q6QIE1	Burkholderia_phage	3.9e-86	45.6
WP_000752926.1|2089949_2090168_+	TraR/DksA family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_024436641.1|2090164_2090395_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_024436642.1|2090384_2091056_+	hypothetical protein	A0A2H4JFV8	uncultured_Caudovirales_phage	9.5e-29	48.0
WP_024436643.1|2091055_2091559_+	host-nuclease inhibitor Gam family protein	A0A2K9VGT9	Faecalibacterium_phage	3.8e-14	32.3
WP_057047121.1|2091581_2091761_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_004716174.1|2093615_2094053_+	regulatory protein GemA	Q6QIE7	Burkholderia_phage	1.9e-22	43.2

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP041148|2238042:2287124|DBSCAN-SWA
ATTATTTTAAATCTACTTTAATGGGAAGTTCCCAACGGCGCCTATTAAATGTCACGGTTCCATCAATGTTGATTGGTAATTGATTACCGTTGTAGTCGAAAACCTTTATGACTTTACCGCCTTTGTTTACCTCAGCAAGCAAATTACATGTGTGCTCAAGCTTTCCAACTTCTGTGACCATAAGCATTAATTGCTGCATGATAAAACCTCGAGAGAAAAAGAGATGAGAATAAATCTGCTCAAAATGTGCAATTATCCAGATTATTGAGCAAATAATTACACATTAATAAAGGCTCTTACTCAAGAGCCTTCACAATCGCACCATGTCTTGCTTTGCAATCATTATATTTAGCAACCGTATCAATAGACCAAAGCATCCAATCTTTACCAGTAGTGCCCGTTAATTCATTCAAATTTGGGCATGGCTGCATTAAGTTAGCTGGTATTACCGGCTTTAATGAGTTCATTGAGTTGCTGCACCCCAGCATCGTCAATACAGCTAGACTTATAAACAGGACGCTCCACGATCTTTTGCACTTCACGCTCAATATATTCGACTTTAGTGTTTTGCTCTGCTTTGACTTGCTCATAGTCTGCGCTCACTTTATTGATCTGATTTTGCTTTTCTGCAAGAGCTTTCAAATTCTTGCGCTCAATCTCTTGGATCTGAGATTGACACTTTTGTTCAGCTTCTTTTAGCTGACCAGTTTTGTAATTGAGTACGGCCAAAGATATGGCCAATAAAAAAGCGAGAAACACAATAATGATTTCTCGCCAATATTTAGCAGCAAATACAATCCACATCACTGCGCTCCTATACATTTAGCATGTCTTTCAAGCTGTCTAGTCCAGACGCCATAGCATCCATTTTTACGAATAGAGCAATCGCGCTTTGCAACGTACTTATATTTAAGTAATGAGTCGCAAGCCGCTTTATATTGACCAGCTTTCAAGTGTTTAAGCATTGATGATTTTGCGAATGTTGGTACCCCGTACTGATATGAAAAATCCAAGTAAAGGTCATATTCAGTTTGTGATAATTTCACGCCCTTCAATGAATCTTTAAATGCTACTTCACGTTTTGCGACATCATTACGCAACCACTTATCTGCGGTTGCACGTGTAATTGGTGGATCTGTCATTTTTACGGGTGAGCCATCTGGTTTGAATGTTGAACCATAGCCCTGTGTTGGACGATCCCCTTTAACGGGTATCACTGGCTTTGATGTAAACCCTTCATCATTTTTTACGCCCACAAAAAAAGCAGCCGAAGCTGCTAAGAATGCTGCGATATATTTAGTCTTGTTTGACATTACAGTCACCTTTCTTTTCTAAGCTTTCTAAATAAGCTTTCAGTGCAATTTCATCGCGCTTATTTTTCTTTTTGGCGTAATACCAGTTCATTAAAAAACCAGCTAAACCAATGATGATACTGACCCAAAATGCTAAATCGATTGACCCGATCCACGCCGAAACTGCTCCTGCCACACTTCCCCCGTATGTTGCACCCTTGCTGGCCGCCAAAGCGGTCGATGTATCTATAATTTGCTGATTGTCTGCCATGCAGCCCCCTAATTTCGGCATAAAAAAAGCACCCAATTTAGGGTGCTTCATAACTATTGGATGAGTTAATCTCTTAAGACTAACTCATCATTTTTGACCAAGTATTTATTTGCTGACACCTGGTGATCTACTTCTAAAAATTGTTGCCCCTCTTCAAGATGAATTGTTTCAACTAGAAACTTAGGGCACTCAATTAAGTTTTGTATTTCACCAGTTTTAACCTCATAGACTGCAAAATATGCCATTACTTCCTCATCGTCATTGCATGAATATAACGTTGAGACACATTCATGGAACCACCAGCAACAACTTTCAATTGCAATTTGAATGTCCCTGCTATTCCTGTTGAATCGTGTCTTGAAATATTAATTGTTCCAGCACTACGCGAGTTACCAGTCACTAAAATGTTATGTCTATGTTCACCACCATCAGACATAGTCACGTTGCCATTTAAACTAACAGTATGGCTGTGTGACCCACCACTGTTTGTGTTTCCATTTGCGCTGAATGAGTGACTGTGAAATGTACCTCCTGCATTTGTCGAGCCAGTCGTACCATTCACATTGTAGCTATGACTATGCGAACCATCTTGCCCGGTATTACCCGAAACACTAACAGCAGAACCATTATGATTGTGCATGCCATTTGCATCGGTAATAGATGCCACTGAAGTGTGTTCAATGAAGTGAACTTCTAGATCCTCAAAAACGACTTGATCATTTTTGAGAACTCGGCAATAAACTTGCTGTTTCGGACTGTAGCCAGTAAAACTAAAGACTGCACCAAAGGTTAAAACCGTATGCCCCATATCAGATGGAACGTTTAAAGTCTGAATAGTGACATATTCAGTATCAACACCCACTGAGATTTCAGCAAACGCTGATACTGGAACAGTTACGGCATTATCAGCAATCTTCAAAGTATCAACTGCAAGATCAGCAATTTTACCTCTTGTCACTGCAAGATTATCAATCTGAGCACTTCCAACAGCTAATTGTGCAATCTTGCCTCGCTGTACAGCCAAGTCTTTAATATGAGATGTATCGACGGATTGATAATCCATAATGACAGTTTTTAGGTATGCACCCACTGGGAAAACTGTGCCTGTTACTGGGTCAGTAAAAGGGGTTGTACGGAAAATAAATGGATATGAAACAGTGCCATTACTACCGTTTCCGATTGCAATAGAATCAAAGTTAAAAATAAACTGAGACTCTACGCCATCATTGGCACCACCCCAGCCCGCAATTTTTCCGTTCACATCCAGCTTAATGAACTTTTGTGCATATAGCCCATTGACTGATTTAGTGACCTCTTGAACAGCAGCTTTATTACCATTCAAATCAGTTTGAATTGTATCTGTACGAATTGCTTGTGCTAAATCACTTTCAATACGCGCTGACTGTTCAGACCAGACACCCGCATAGCCTCCCTCATTACCAATTAACTCGGATTCCGAGCCGATTAAAGGCGGGTTAATTTGAGCATAGACACCATCAAGTCTGATCGTTTGGGCATTAACTTTGTCATCTACATTCTTAATATCAGACTTAACTTGCTCAAGTTCACCAGTTGAAGCTTTATCGTCAAGCTCAAGATTAATTGAATCAATTGCTTCAGCATTTGCCGAAGACTGATCTACCGCGACTTGTGCAGATTGGCGTACCGTGGCTAAAGCACTATCATTGCTAGCAATATAAGTATCAATCTTTTGAACTGTTACTTTGTCACCCTCTATACGCGCTTGAACCTCTTGCTGAGCGTACGCACGTAAATCATTTACTTCAACAACGGTTGTATCAATGCGCTTACTAAGTGCCAAGTCTCCTTCGATCATTGCCGATTGAACAGACCATGTGCCAGCAAAACCTTGATCGTTACCAATTAGATCTGATTCAGATCCAATCAAAGGTGGATTAAGCTGTGCATATACACCGTCCGTTTTTTCAGCTACAAGTGAAAGATCATTTGCAACAACTCGAATACTTTCTTGAGCCGCTGCAATTCCCTCATCACTTGACTGTTTAACAGTATTTACAACTTCAAGAACACCTTCATCACCTGCAATGATTTGCTGTGATAAACCTTCTTTGGCTTGCTGAATAGCGTTTTGACGATCAATGACTTCTTGTGCAATTTGATCTTTCGTATTTTGAATATCTTGCTTTATTGGTCCAATTTCAGCATCAATAGTCTCAATATGATCAATCTTGGTTTTAAGATCCTGACTAAGTTGTGTTTCACTGATTTGATCGTTCAGGAGCTCAAGAACATCTGTTGCATCGGCAGAAGTTGTCGCATGAGTCCAGTCCGACCATGGCCCAATATTTCCAATCCTGTCGATCAAGCGACCACGATAGAATTGAGTTAAATTTGGCTGTAAACCTTGCAAAGTATGTGTTGTCGTTGGATAAGCAAATAAACCCAATTGAGCAATGTTGCTGGTACCATCCGGTGAAACTTGAATCTCGGTATAAGCCGTATCAAGTGCACCAGTTGCAGGAAAACCCCAATTTAGGCGCATACCAAACAAAATACCTGTTGCTTGGATGAATGCTAAAGCTGGTGGCAAACCTTGCTTGCCATTAAGCTTAGTGACAACTGAATAAGTTGGTAAAGAGGAAATATCCGAAGCATTAACCGCTGTAACTTTTGCTTGATAGTTACCAGCATAAATACCCGGCACCTCAATTGAATTATTACCCGTGATTGGTAATTTAATCCAACTCCCATCATCTTTCCGCCATTCAACCAGATACTTAACCGCACCTTTTGCTTGCGTCCAAGACACAACCATAGTGGCAACATTAATACCTTGATCCACCCGATCTTCGCTTGTAATAACAATATTTGAAACTGGTTCTTGAATATTGGGATTAACAATTGAAATTGGCACATCGATGTAATGAGCACCCTTATCGATTGCATCAAACTTTTTCGGATTGTACTCAAGCGCAGTAATAGTAAATTGATGTGAATCACTTTGAACTACTGACAAAACCCTAAATTTAAGCGTTGCCAAATCTTGAGCATCAATAACCCAAACGTTTTGAGGTGCAATTTCATCAAAAGCTACAGTAACAGTTATGACCCGACCTGTAATTGATTGAATAATACGTGTTTGAGCTTTCCCGTTTTCTCCATTAATTACCAGGCGGTCCCCAGCTATTGCAACAACGTCATCACGATCAAGAGTAATACTTTTACGATCTGCTGAAATTGCTGAAATGCGACCACCGTTTGCTCTTCCAGCAAAAATAGGATCCGCAAATTCAATCACTTTACCCGGCAAAGGAATATGGCCGTCTAATCCAACTTTAAAAGTCACAGTACGTGTTTCAAGTTGTTCAGACTTTAAAGCCCACAAGCCTGCTCGTTGTGCTTGCCCACGCGATGTACAGCCCCAAGCATCAAGTTCAAGTAAGCGCACCTGTTTC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MAYFAVYEVKTGEIQNLIECPKFLVETIHLEEGQQFLEVDHQVSANKYLVKNDELVLRD

Homologous phage analysis in the prophage region

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2237911:2237932	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_031979547.1|2270580_2270832_-	hypothetical protein	A0A0N7IRE1	Acinetobacter_phage	9.6e-27	75.6
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WP_038350373.1|2271713_2271935_+	hypothetical protein	A0A0P0I8I5	Acinetobacter_phage	2.6e-20	74.3
WP_038350372.1|2272173_2272905_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_079393874.1|2274541_2274931_+	hypothetical protein	A0A1B1P9F6	Acinetobacter_phage	6.1e-28	82.2
WP_169538956.1|2274930_2275701_+	phage antirepressor KilAC domain-containing protein	A0A0P0IDX3	Acinetobacter_phage	5.4e-44	60.1
WP_000141159.1|2275697_2275949_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000190202.1|2275914_2276874_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A1B1P9F9	Acinetobacter_phage	4.5e-48	35.4
WP_000933387.1|2277050_2278193_-	cell division protein ZapE	NA	NA	NA	NA
2277011:2277032	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_000205997.1|2283176_2283479_-	integration host factor subunit beta	B5TA87	Burkholderia_phage	5.6e-13	42.9
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WP_000033178.1|2286620_2287124_-|tRNA	tRNA adenosine(34) deaminase TadA	A0A0B5J096	Pandoravirus	6.5e-06	31.3

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP041148|2786328:2815002|DBSCAN-SWA
TTCATATAACAACTCGATTGGCGATCCAACCATAGAAAAACTGTTCCTGGCTAGGATTGCGTTCACAGATTTCAATGTAACGTTGCCCTTGCATGATATTAAGAACACGCACCAGGACTTTTTCGCCGTCTTTTCCACGCTTGGCCAGATAAGTTTTGAGTGCATTAAGAGTTGCTGGACCATAAATTCCGTCAACTGTTAAATCTGGCCAACCTGCTTTACCTTGGTTATTCAGCAAATTTAAAGCACGCTGTAAGAGTGGTTTTGCAAATCCGGTACCGCAATTTACCCCAGTATCTAAAAGCTCTTCAGCAACTAACGAGCTAATTACATTCACTTGATCAAATCGCGGATCTGTCCAATACTGCTTTTTATAAATGGCTTTGGCCACATCAAGCGGTAAATCTTTCATGTTGCCCTTAAAGCCGTTAGTACGTGCTACTGCTTCAGTAATACCGTACTTTGTTTCACCGCCTCGATCTGCTGGGTTGTTTACGTACCCGCCCTCACGCTTAATTAACTCGTCCAGATATTGTTCAATGTTCATTTCGGTTTCCTTCAGATGTAAAAAACCGCCCGAAGGCGGCATTAGCTGTTTTCAATGTCTTTTCTGGCTTTCTTAAACTCTTTGATCACTTCAACGATCGTTTTACCTTCCTGTTTATCTATAAAATTAAAAATCCAACGGACTAAAGCCCAACCGGGTAAACCACAAACAAAGAAGAACCCACCTAGAGCAATCATCCCCCATACATCAGTAACCCATTCATGAAGTCCCCACTTCACAATAATGAATGAGCCGCCAGCCAAACTTGATACAACCGTACAGATCAAACCAACTGCCCACTCTTGTGGTGAGCGTGGCATACGAGTCATTAATACAACTGCTGCAACCAAACCGACTGCTAAAGTCACCATGATTGCAATCCCATATAATTTTAAAAGTGCTGTAAAACCGCTAGTGGAAACTGGTTCCATTAATTTCTCCAGAAAATTTAGGTAATAAAAAAGCACCCGAATTGGGTGCTCAAAGTTCTTATAAGGTTTAAAGGGTTTGTAAGATTTTCCCTCCATTAATCAATTGAGTTGTCAGTGGTGCAACTCCCACAATTGCAGGTCCACCTGGCCCCGGCTGACCTTCAGTTGTGCCATGGTATTTCCAGTTCCATGTTCCATCATTAGTAGACTTGGTACCACGTTCGCCCCAGTTTCCGCCATCACCTGATAATGGGGATCCATAACGGTCATTTTGGGTTCGGTAGCCTTTTCCGGGTACCGAAGCTTCGGCATCAGTAATTTTTAAGACATTGAAGTAACTTCCAAAATACCAGCGCCAATCTTGTGAGTCGCTTGAAATTGGCTGGCCTGTCATGACCCGTCCAAATGGTGCACCAGCTCCACCCGGAATACCTTGAACACCATAAGACAACCCAGTGTAAATACCGCTTGGTGTTGCTCCACCACCAGATCCACCTCGAGCTAGAGTGCCGCCATCAATAATCAGGTTTAGTTTGCTGTGCCGGTTCAATAAACCGGGTGCTCCCTGAAACCCATCACGTCGGGTTTTAGTAAAGTTGTAATCCGGATCGGACTCCCATGCGCCAAATGCCAAATGAGGTAAACCGCCATCACCACCACGCCCAACAACAGCACCTTTAATAGTCAGATTTACCACCAGATCAGGTGGGAACTCACCAGTATCAATGGCGGGTAGTTCAGTCGCTGCAGGGGCAATAAATTCCTGTTTCGGCGGACTGGAGTTGTAGTCGAATTTATAGACAAATCTGGTTTCCGGTCGATAAGAACTCGAACTAGAAACTAGTGCACCAGATTCAACTACAAAACTGATTTCGCCAGTCGTTGGCAAATCCCCTCTTTGCATCTGATATAAACGCGCCAGATTAATATCCAGCTGGTCATATCGAATGTAAATTGGAGAATCATCAACCGGCACGTCAATAAAGTCTTTATCGTTGAGGTAATAGCGCTCATCGTAATTAATTGCTGTAATAGTATTAGAGAACTGGTCAACCGGTTCTCTTTTTGCAACCAGATAAGGCAATGAACCTTTAGTATCATCATTAACTACTGTATAGATGGTATTTACAAAATCATCAGGACTTAGCTTTAAGGCCCCGTTCGGCAACCGCCCTAAAACCACCTTATTTTTGGCTGAACCCGGTGTAACAGGAATCAGGTCCACTGTGCCATCCGCCATTTGCAGATAAATCACATAGCTCTTGCCTGCAATGAAATCTACATCATGGCTTAAGGTGAGGACTAAACCTTCTTGCTGTACCACCTCACCGCTTTGATGAATACCATTGCGATAATCCGCTACAGCAATCCGGTCACGTAAAACCAGTAATTCTGATTCTGGTGCCGCATCAAAGGTAATGGATTTGCGCTGGAAGCGCATCTTGTTCCAAATCCGGTATGCATTGAAATGCGCTTGCCACTTGTTTCGTACACCAACAGATTTCACCTCTTTTGGGTTTTTGGCTCCTTTATCCGGTAAATAGATATTGATACGGCTATCGTCGGTCGGATCCGTGTATTCATAGATCAGTCCGTCGTAGTCATCCATCACGCCAAAGGTCAGGTCATGCTTGTAACTATCCGGAATGATATTCCTGAAGTTAAACAGCATTACCGAGTTATCAGTTGGCCGTTCAAAATAAAGCTTGAGCTTATTGTTTTGCCGATATGCAGTACAAAACACCGCATCACAAAGATTGGTAACCAGCTCTTCAAAAGATAGATTCGTATCATCAATGGTAGTACAGAACTCAGCCGCTAGCGGCGTACCAAAATAATCAACTACATCATTATAGGTCCGATAGATGTTTTCAAGATCAATCTCATCGATCGAACGGCGGCCAATCTTGTCATCGAGTGCCATAGATACCAAAGCATCAGCAAAGCTAGACGTTGGATATAGCTCTGTTGTCATTGCCCCGTTTTTATAAGTCGGCAACATTCGCTGAAGATCAAAATTGATCTTGCGGGACTTAACAGATAAAGCTCCAGTGGTTGCATAAGTACGCGCACGAAAAACCGTTTCATGTTCATACACTGTGCTTTGTAAAGGATAAGCACCGTAAAGCGCCTGCCACTTTACTTCATCAACAACTGTTGTGACTGTCGGAGTCGGAGTTAAACGGCGTGCACGGACACTACAACGCCCCTGAAACGTGACCATATCAAGTGTTGCACCAACGGTCTGACGTGACTTTGCCGAACCTTTCAAAATGATCTGCTTCAGCATCGGATTACCAATCGCTGCACCAGATTCATTTACCGGTGTTACTTCAACTTCAATCGTGACATTAACAGCGGCCTGATACCCACCTGAAGAAACGGTATAAAGTCCATTGGTGGCCACAAAATTACACAGCACCCGGCTACGTTCAACATTGTCCAGAATGAATGGACCAATCCATTTTTCACCTATTGAACTGATCTTTGGTGACAAAGCTGCAGTTTGTTGGTTATTTAACTCTTTAAGCTTTAACCAGTTAGCATTAACGGCCGCCGGATTTGATAACGTCATACGGTCATCAGCTACCGATAGAACGCTATAAGTACCATTTAAATCAAAAGTCTGGCCATTAAACGTGAATGAGGCATTGGTGATTTCTACGCGGTCATTACTTACAAACTTAGTGGTTAAATCTGTGTTGTTTGCCGTTGCCCGAAGAATCTCGTTTGGATATGCAAAATGAAGGTAGTTCGTACCTTCTAAAGATTGTGTATCAGCAGGACGTAAAACTTGGCCATTAACAGAAGTTTGATGCTGAACCGTTAGTGGCGGCGTGGTAATTTCGGTACCAAGCGAGAAATATGGCTCACCTGAAACAATATCTACACCTGGTCGAAAGACTTCTACCGATGCGCCAGCAATATCGACAATATTGGTTTCACCGTCATAAGCTCCATTGATTTTATAGTGTCCACGCCCAATACAGCCCACTACATGCTCAACTTCAACGTTGTTTTCATATACCTTGTAAGGTACTGCGATTAGGTCGGGAGTATTCCACCCAGCTCCATAGTTATCAGCAATACGACCATTCACCCGGATCTTGTTTTCCCGGTTAGAAAGTTCATTGTTTGCTGAAGAAGACTGGTTAGTATTTTGAGTCGTTTGTGCTATTGATGGCGTTGGCATTAAAAATGCGATCGCAATACTAATCACAATCGAAACAATAGCCGCGACCCATTTAGGGTTCTCAACTACGATAAAAGTGCCCGGTAAGAAATCAAGCTGCTTTAAGTCATATGCATTCTTTGGTGTGACTTCATTCGCAAATGAAATTTCGGCATGATCCATATTGCTTGTAGTATGAAAGATACGGACATGCTCAGGCATATGTTCATATTTTGAAGTGAGCCATTGCCCAATGGTTTGAGCCTGCTCAATTGTCTTTTCTTCAGACAAAGCGTCTTTTTTATAAATAACTTTAATCATAATAACTGACCCGATTAAACCCCATTTCCATCACAACCTCTTCAGGCAAATAAGTGACTCCGCTTTCCATGAGGTGAAGAATCTTTTGCCCACGAAAAAGCCCCACATGCGGGGGCTTATTTCTTTGTCTCGGATGGAAGGCGACTATGCAGCCTTCCTTGGGCATGGGTAGCGGATTTAAAAGTTTTAACCGTGAAGATAAAAAAGTAATTTTGCCCTTAGGCTGCATAAAGAGTTCAAGCGCTTCAGCCCGATCTATGCCATATAGGTCCATTGCAGCTTCATGAACAAAGTGAACACAGTTGTAGTGATCCTCGTCATATTGCCTATCGAGCAAATGATCATGACTTTTCATATAGCCCCCTTCAAACCACTAAAGCGATCCAGTGCAAAAATGTCCCCAGTTTTAGTGGTATTTAATCGTGGTGATTCAGCCTTGAATGTCACAGCTTTATGGTTCATGGCGACACTTGAGAGTTGCAGTCCAAGTAAATAAAACATTGGAGAGTTCAGATTGTCTGAACTGTAA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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000598554.1|2787372_2790798_-	hypothetical protein	A0A0P0HSH9	Acinetobacter_phage	0.0e+00	94.2
WP_000835160.1|2790790_2791153_-	hypothetical protein	A0A0P0J0A2	Acinetobacter_phage	8.1e-51	79.2
WP_000368388.1|2791149_2791656_-	DUF1833 family protein	J7HXQ5	Acinetobacter_phage	1.5e-90	97.0
WP_000277448.1|2791655_2792054_-	hypothetical protein	J7I0X8	Acinetobacter_phage	4.1e-72	97.7
WP_000721057.1|2792146_2792734_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000046573.1|2792824_2797135_-	tape measure protein	A0A0D4DC37	Acinetobacter_phage	0.0e+00	98.3
WP_001275792.1|2797262_2797526_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000721572.1|2797527_2798208_-	hypothetical protein	A0A0R6PJY5	Moraxella_phage	2.5e-53	49.3
WP_000274931.1|2798312_2798771_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0P0IRJ4	Acinetobacter_phage	1.1e-84	100.0
WP_000335868.1|2798779_2799079_-	DUF4258 domain-containing protein	A0A0P0IE58	Acinetobacter_phage	7.4e-50	100.0
WP_001185585.1|2799581_2800097_-	hypothetical protein	A0A0N7IRG3	Acinetobacter_phage	2.5e-77	96.6
WP_000094278.1|2800166_2801084_-	hypothetical protein	J7HXP7	Acinetobacter_phage	2.0e-170	100.0
WP_000002408.1|2801136_2802315_-	hypothetical protein	A0A0D4DCQ4	Acinetobacter_phage	1.2e-103	66.3
WP_000064593.1|2802314_2802668_-	hypothetical protein	A0A0D4DCF7	Acinetobacter_phage	3.3e-57	96.6
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP041148|3043066:3062626|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP041148|3043066:3062626|3057929_3058439_+|WP_000578497.1|DBSCAN-SWA
MIFYDRAFFEENFKKTETFKQESNIRKNDILVFSETMNGYFNIVTNKAWLLWKKEMQAHADWYKNDDPIAYKWAKDGSPEYEADFYTSAKAWAAAKAQAGPTWISVKDEEPPTDIMVLICWDDAPDVTPEQDYITIDEDLNSVWANYYNDPPSHWMHFHSVPNVSGAEQ
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MSELEILESAPKDATHYFLVPNGSGEPYYVLEKEKKFYWFHGQDEITKPHILSWIKSIESLKEVKAESQEI
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MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG
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MTSEKKVWPLGTNHTDSEGTPWKRDEQNNWWFWQENFGWSRYVGPVNQAFLDLRFEVGTEQ
>NZ_CP041148|3043066:3062626|3043977_3044511_-|WP_000990949.1|DBSCAN-SWA
MNAFIDMKKSEYALVAYSNVAAKSDERKALEKAVKKWLKHPGNKIRQVESLGRDLNMPHGTGPMYKRLCCRCETCVEWALSTGLIKSKPKPVVKRGPDARQLRILAQKSQLTPYATAFNEDWDLLALEVDYSVTAFQLERIYQGRSEIDHNFVWNRVKRVADRLVAEKLRAKGGGCK
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MAVQTLGRMNVSNLANHPCSGKCTDFKEEQCSTCLINQDAPHQIVNTQTDEEKFLDRAFNAQKEIS
>NZ_CP041148|3043066:3062626|3051072_3051306_-|WP_000335919.1|DBSCAN-SWA
MCMNIQDKVIYLSNSRGLTQQQISERTGISQSSVSKIASGEQKEVAYNKGVALDALVASEQKREYEESKTKQLNRSA
>NZ_CP041148|3043066:3062626|3056933_3057224_+|WP_000986115.1|DBSCAN-SWA
MMRNIPDSMSFPFTVWMCENGYYPSHKNGFIILKRGKEVAKISMNETKDGYPMNDICQKKFASFCRAWMNRDKHFIEQLRLRGLARLNQKSYQMVA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_000990949.1|3043977_3044511_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000994866.1|3044507_3045272_-	ATP-binding protein	A0A0D4DBZ2	Acinetobacter_phage	6.7e-63	48.8
WP_000124473.1|3045268_3046312_-	hypothetical protein	A0A2H4J580	uncultured_Caudovirales_phage	4.3e-28	52.8
WP_001055562.1|3046315_3047794_-	DNA cytosine methyltransferase	A0A1I9KFD6	Aeromonas_phage	9.7e-135	53.3
WP_002029044.1|3047790_3048177_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000606801.1|3048182_3049157_-	phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein	A4JX51	Burkholderia_virus	8.8e-76	48.5
WP_000218432.1|3049153_3049801_-	hypothetical protein	R9VWB9	Serratia_phage	2.0e-31	38.6
3049773:3049787	attL	NA	NA	NA	NA
WP_000575725.1|3049797_3050253_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000200037.1|3050249_3050435_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000290738.1|3050431_3050632_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000818521.1|3050665_3051040_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000335919.1|3051072_3051306_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000550612.1|3051432_3052122_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0R6PCY1	Moraxella_phage	5.0e-25	37.1
WP_000922095.1|3052133_3052409_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000105905.1|3052624_3052957_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001290758.1|3052996_3053800_+	DUF2303 family protein	A0A2R2Z323	Escherichia_phage	1.1e-26	33.3
WP_000350172.1|3053884_3054145_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001072362.1|3054203_3054533_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001260063.1|3054529_3054901_+	hypothetical protein	A0A0D4DCB5	Acinetobacter_phage	2.2e-11	38.8
WP_000644001.1|3055071_3055752_+	3'-5' exonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_000805214.1|3055764_3056793_+	ead/Ea22-like family protein	A0A2I7QY11	Vibrio_phage	1.3e-13	29.0
WP_000986115.1|3056933_3057224_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000464381.1|3057224_3057404_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032003041.1|3057396_3057933_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000578497.1|3057929_3058439_+	phage protein	A0A0P0I8H3	Acinetobacter_phage	1.6e-33	87.8
WP_000028957.1|3058435_3058645_+	hypothetical protein	A0A0P0IRG7	Acinetobacter_phage	6.3e-32	94.2
WP_001292077.1|3058641_3058857_+	hypothetical protein	I2GUB6	Acinetobacter_phage	8.5e-32	92.9
WP_000119264.1|3058857_3059028_+	hypothetical protein	A0A2H4JBW6	uncultured_Caudovirales_phage	2.4e-13	69.2
WP_000527288.1|3059034_3060027_-	FRG domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000549863.1|3060141_3060597_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001076477.1|3060587_3061472_-	endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032003042.1|3061468_3062626_-|integrase	site-specific integrase	A0A2H4J339	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-133	62.7
3064799:3064813	attR	NA	NA	NA	NA

2. NZ_CP041149

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	29166 : 70488	46	Acinetobacter_phage(42.86%)	terminase,integrase,transposase	attL 23457:23471|attR 76599:76613

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP041149|29166:70488|DBSCAN-SWA
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MNSPSKALMTRILVGYLGLYPTLLLVLTLLKPITHHQSFPMMVLIEVIVLVPVTQLISFPLAGWLITRLKNFKKKLCWQQQS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_005071527.1|39013_39262_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_002126642.1|47727_48744_+	zinc-dependent alcohol dehydrogenase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_005071535.1|49828_50569_+	SDR family oxidoreductase	A0A0N9R355	Chrysochromulina_ericina_virus	1.9e-06	26.0
WP_005071537.1|50641_51640_+	zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_005071539.1|51659_51944_+	antibiotic biosynthesis monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_126026108.1|52532_52757_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002125302.1|52778_53153_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_114190237.1|53357_53747_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_114190236.1|53855_54938_+	NADPH dehydrogenase NamA	NA	NA	NA	NA
WP_000269903.1|55576_55933_+	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_001140619.1|55925_56228_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_000069471.1|56220_56430_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_005071544.1|56539_56767_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002123990.1|58572_58893_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
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