Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053097 | Mycoplasma sp. Mirounga ES2806-NAS chromosome, complete genome | 1 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053097_1 | 92099-92192 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053097_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053097_1
>1.1|92124|44|NZ_CP053097|CRISPRCasFinder TTTTTATACAAAAATAACTTAAAACATGGGCCTTCAACTTTCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053097_1
The CRISPR arrays of NZ_CP053097_1 >merge|NZ_CP053097|1|92099-92192|CRISPRCasFinder TTATGCAAATGGAGATAAAGAATTATTTTTATACAAAAATAACTTAAAACATGGGCCTTCAACTTTCTATTATGCAAATGGAGATAAAGAAGTA >NZ_CP053097|1|1|92099-92192|CRISPRCasFinder TTATGCAAATGGAGATAAAGAATTA TTTTTATACAAAAATAACTTAAAACATGGGCCTTCAACTTTCTA TTATGCAAATGGAGATAAAGAAGTA
>NZ_CP053097.1|WP_171112442.1|91537_91702_-|hypothetical-protein MCNRPGSFLKLEDQFLWSYKWPFRNEISSSAYILKSTICILSKKFFVVFRNNFI >NZ_CP053097.1|WP_171112440.1|91404_91557_+|hypothetical-protein MNIKTENLNSTNSAVDSIKKLYNDYLKYYNIQKDFYFVILKKISIKWNCF >NZ_CP053097.1|WP_171112438.1|91105_91291_+|hypothetical-protein MLNWNDLNEIKIFLKQELKNIFKVYGNEIEIKAEDLNLLKSKNSCIRSSTAIGYILEEFIY >NZ_CP053097.1|WP_171112437.1|89245_89632_-|type-III-restriction-endonuclease-subunit-M MKNKDYLKLLEDYKNKIDELSVNDLNKDQKALCKMILDNLQDKSQLQNVYQFLMKRVKIGFTFDVAPEINNKMISVLKYNEEKSFSFPEAKSQNNLIIGENYDALKNLLIIERERERERDLAKILTLM >NZ_CP053097.1|WP_171113520.1|88028_89246_-|site-specific-DNA-methyltransferase MYIDPPYNTESSKKEGNNSANEKENISATKFIYRDKFSRNGWLNLMNERLRLAKKLLKDDGVIFVSIDDNEQAYLKVLMDEIFGEENFVTNFIWQKKSGGGLNTYIYEGHEYLICYGKHKNYLKKKLFFPKKINIKNIEKDSTGFYYWEKDFLRKNFGKKVDNEHRNIFYEELEQYKTKDEIKQINENIKLGNYKLFSYGDNKHLVAKKIYTQNNDYKLVTPYSIISGMWSSDGTSELENICGKTNFTTIKPLSLIKLIVNILNNKNARILDFFAGSGTTAHAVMELNKEDGGNRTFTLVTNNENNIAYGITYERLYRINHGVGTNGETFKWTEKNESYKQNLNVFNLKYDSIDIVNSTTETNLLIDTLRESLAKFGIKNITDEELLNNLTNLYALESDSKDETN >NZ_CP053097.1|WP_171112435.1|83802_86175_-|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein MKLTNTQFRAISELIGHFNKSYTENYSQIIEFKAPTGSGKTFMIANFIDKAISFNKQRDNKPIIFIVMTLSNAELPKQMEDNFNEYKFYLENKQDIIFERKESPSSSKNSVKDADYTFKIESNKVFILGASSFGKGKIYTEQGILEKFISEISNNYFVVFIRDEAHIGTNESGLKSEEKKQAENFYNKMKNAANFQINMTATPKGSYKQVKITENQLKEDDIKLIKTTSYLNEGLSEIKNEQISDLDLLEIACNRFNKIKQKYITEEGLIDNINPAMLIQVKDKTKNDLEFDEKIEKIIHKLEQHNLTWAKYFSSEKLDANMRGNFSLKDISKNSSDIDVIIFKVGPATGWNIPRACMLVQLRNVSSESLSIQTIGRIKRNPNPSFNFNHDSYAFKYWVYSNIKDIENLYKDKEFSVYKLNKDSIDDKFYYGEINKEVNQIEITNSDSIFNCLKQNKNKLINEYQYYCQYYNQYGFLPYKDQTIVDQKTNIQYQYINKKINNIVELSQYIKEFELKVANILTKKQINDINDYFNREYKDNINLLMWYTFINSIYVDVKKYILEERKKKINKLDINEFKLIYDKKLPEDVNFEITDEKNKIEFSEQNLKYKYELTGIKSNQNNHPHYYDSENEVSFINGIIHLFNDDLKKDEYMDVNLFRNPVGNGIFYEYYDDENNIKRQFPDFILVYKTKKIEHQISIEIKDFHSDNNINKTSKIIDSYKGYYSEMKKNQTPLQIVSSILIKVDKTNNYLNKFIVSGGGSTNLKSHNEIKNSIKNKKDITWIYNLAKNI >NZ_CP053097.1|WP_171112433.1|82938_83763_+|nucleotide-exchange-factor-GrpE MEKNNEIILKEFDTITLNIISKKENDKQLNETKKVILGFHEIDSFIEKYLLETKNFILHKQYKLQHPDLKTKYIIEIIGVFAPGKTRQEERKIIQTLKQKVNEQNLQIAEYITKIFSYEQELNQKQEEFKKIAADLQQKAQTEINKFRQQNSEQTKKEIEDIKKYALQDFFEDFLLSLNNLEIAIHTGLKSQNPEVSAYTKGFLMLLNKIQNTLEDYGITKIVAEVGDMFDANIHQIFDFDDQGVEKEMILKLKSPGYKLHDRVLKPALVIVQK >NZ_CP053097.1|WP_171112431.1|81943_82939_+|heat-inducible-transcriptional-repressor-HrcA MEQINFKEKDILKKIIDIYIETGQPVGSQFLGEKFKMDCSSATIRNVMHNLEKKGYLQKNHTSSGRIPSIQGLEYYAKYLAYNPQKYLEDKLQDILAKRRLNIDTTIEQAAHVISEVAGLTLITTSNNSTEVLKSIQLTVLNNYSAIIVLITSTGRVESKVFNFDNNKIDIEDVRIAVKLFKDRLVDTPLIELSSRAYALIPMFSAKVKNYELIIQEFIKNIFVFKEESVSKIYNKNQIILSHDISREKIVEILDFVEHHSVWEALENELDEDSSIRFDIKQPNISLISKKIEFENEKNIKEVTIIGSSRMDYSKAFDTLDTVEKLLKKDL >NZ_CP053097.1|WP_171112428.1|81332_81830_-|hypothetical-protein MENKDNLTNIRILNYIEENSNKFIKRVKLTNILESIVNFAILFLNLAVLVLSSFTIKLGIDQLKIASENDKKTLILTIFVSVSTIALFILAIIQSIYKSRAKTYSYKKIFESLFYVNMCYTNDTKYTTEEYKKQKKEILKLKDNKPNQKIKDIIINVLVGKNDNK >NZ_CP053097.1|WP_171112426.1|80917_81346_-|DUF4231-domain-containing-protein MITSNPIEFIDNIKSSLQKKVWVYSFWYYFLNIIIMLISLIISILGSIQLYNNFDGFGDWRKYVLITTAISAGITFLTSLISFFVLNKKINKYKIRINKINLETLLWKEKIGEYKHKNRDLNFFKQVAEICNLKWQGVENEQ >NZ_CP053097.1|WP_171112446.1|92430_93288_+|tRNA-pseudouridine(55)-synthase-TruB MFYALNKKKFVSSFQMIREFQKNYQIKKIGHAGTLDPLAQGLLIVATDDDTKLLDYIINQDKEYVCTMQLWAFSPSYDSQELVTYLPQNKITLKDLEDAFNKIKQQTKQTPPNYSAKNINGIRAYKLARQNQDFVLKANDIKIYSLDIIEYNLETGVIKFKTKVSKGTYIRSIVHDLGIELKTDAIMIDLFRNAIGNISITENQDFYKIIDFYKLFGLFFYKINNTQLNILNKRQTISHDKKENGKRLITYNDTIVAIAEFLDNKVNIIKIFWPQVLKEIEKRDP >NZ_CP053097.1|WP_171112448.1|93287_94109_+|HAD-family-phosphatase MNKKYKLIAFDIDGTILPFKDGEKNLPLSNTIKKMFKKLKEKGFVIAFSTARDIFTIGNKLDTPYVDYFIGGNGSFILDVQKNEYIFEQQISFDDFKVFYENTKDLEIAFSIVGKNKGYYNKYFNIDHWFYKPFKKDFFDIEEYFNSEDKSNFLITIISKEIPLTKKYYENLFNYNNLNLSVQANWEGGVFVATKGVNKAKSLDILAQKLNISLEQVIAFGDSGNDREMLEEVGLGVAMANAEETLKEIADDIAYHVDDFGTYKYLLEKGFID >NZ_CP053097.1|WP_171112450.1|94111_94948_+|riboflavin-biosynthesis-protein MDVYNWPIEHRENENKPEIIMILGAFESLHLGHYELFKLAKQLKNQNKNVQIACLLFKNKQNNNEKIFQLKTRIYTLEHLQVDKTIVINFDDNFKNIDPLKFINELKNLNVTTVIAGSDFKFGFNRQGNNQMLKQHFITHIIKEKKVNNNKISSTIIRQLIKEGNLDTTNNLLIEDYAFIVAVKDYKFDFPKNLIKLPAGIYFCNLVYKDIEYHGFIFINYQEKENQVVFLDLDEDILFFDELFIEVIKFFRNINHIAENKIFKSDLQEAMKFFKNNV >NZ_CP053097.1|WP_171112452.1|95023_95290_+|30S-ribosomal-protein-S15 MITKEKKLELIKKFGKNEKDSGSIEVQIAILTEDIESLKKHFQTNKKDLHSMRGFMAKVNHRKSLLSYLKANDQNAYFKLIQELKIRK >NZ_CP053097.1|WP_171113522.1|95553_96813_+|serine-hydroxymethyltransferase MMYKKVDLRDKEIAELINKEAQRQNENIELIASENYVSEDVMKAAGSCLTNKYAEGYPNARYYDGCEYADEIEKIAISRACQLFSCAYANVQPYSGSVANAAVYMSLCEPNDRVLGLQLSSGGHLTHGYKISFSGKFYDSHFYEVDENGILDYDKIEQIALEVKPKMIITGYSAYSQIIDFKRFREIANKVGAYLFADISHIAGLVVAGEHPSPFPYADVVMTTTHKTLRGTRGAIILTNSEEIIKKINRSVFPGYQGGPLVHQIAAKAVSFNEALTHDFKKYAQQIILNANVFCRQFISKGVKVISGLTQNHLFIIDVKTSYGLTGKKAADILSIIKITANKNSIPQDQEKPTVTSGIRLGVAAMTTRGFTENQFIILANLIHKALSEPENFVLHEIIKKEILKLSADFPIKKYTVNE >NZ_CP053097.1|WP_171113524.1|96913_97318_+|MarR-family-transcriptional-regulator MIKELKSVIGIMRANNKLILDLKQTLLNYDINQSEFAVLEYLFHKGRKNIDEIRKHILLTSGSVTYVIDKLEQKNYVIRTICSTDKRIFWVDITQKGKNLISEIFPLHKLNTKNIFKNLKEEEILLLNKLLQKI >NZ_CP053097.1|WP_171112454.1|97340_98411_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MKVELGITTFGETTIIEGQEVAIAHDQRIRDMIEEMKLADEVGLDVYAIGEHHRKDFAVSAPEILLAAGAAVTKNIKLSTAVTILSSIDPIRVYQQFSTIDAISNGRAEIMVGRGSFTESFPLFGYKLENYAELFNEKLEMFKKINDNEILNWQGKFTQSVTNTGIYPRIANNAKLPIWVATGGNPESTVNIAKQGLPISYAVIGGSPKYFKGLIDAYRSIGRQFGFSDEQLQVSTHSWGFLGDNDQEAIDKYFHPTKQLVDQISKERPHWEPLTKEQYLTSVSDDGAIFVGDAKRVTKKIISTMEYLGIDRFYLHIPVGSMKHQDVLRSIEIFGKEVAPKVREYFKDKQKREPGM >NZ_CP053097.1|WP_171112456.1|98415_99465_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MEIELGISSFGETTLIEGENKPLEHHKRIQNMMEEVQLADKLGVDVYAIGEHHRKDFAVSAPEIVLAAAAATTKNIKLSSAVTVISSIDPIRVYQQFSTIDAISNGRAEIMVGRGSFTESFPLFGYKLENYAKLFDEKLEMFKKINDNEILNWQGKFTHSVTNTGIYPRVANNKKLPIWIATGGTEESTYKIAKQGHFINYAIIWGNWNKWSDLISTYKKVALESGHKKENIKVATHSWGFIAETDKEAQDKYFIPTKILVDQLATEREKWRPLTYEGYLNGLGDKKPFFVGSPKTVAKKIIDFIEDLQIDRFLLHLPIGSLKHQDILKAIRLYATEVIPVVKNYFKNK >NZ_CP053097.1|WP_171112458.1|99590_101084_+|APC-family-permease MQNQVKKIGVFFSIMMLVGSVVGIGIFFKNQSVSKATNNDGLTWLIAWIIGGIISISCAVCFGEIGSFKHTKLSGISNWAYKIAGKHFGYFVNNAYALFYYGILISVLGIFGSEIFFYFISKSFNLDFSSIFPIWVHVIVGIFLSIFFIVLNLISTYISAFFQTIVTFIKFIPLLFALIVGIIFPFEHNNGGINAFINKSFSIKAVVVILPAILFSYDAFLISGSIGNKVKNSAKNLPKVIILGMSIVTILYTLIAISSILHNQGKIEDLILDSLKIKNASLLSNIILFFLIISTLGVINGITGAFVNEIENMVNAKLIFGSNYLVNKFGTKKSAFLISIIIKTIWGIFIFIPSIILNTDILIDAFTNFIVAIFFMIYIIIIFIYSKNRHKISETKKINSYLFYTMSFIAVFGILVAEIGYLVTSATFLFDDTLQNPANWGLFLSLNEHLIKHYLPYLLNILMVLVFLCIPYLNFYLEKKINKRNLIEEFPTLIQID >NZ_CP053097.1|WP_171112461.1|101199_101415_-|50S-ribosomal-protein-L31 MKQGIHPEYKEMKIACSSCGTEHEFGTTATKISIDVCSNCHPFYTGNRTSAKATGQVEKFNRRFQKSQDKK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
766046 : 773691
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053097|766046:773691|DBSCAN-SWA TATGCCAGAATTACCAGAAGTTAGGGTTGTAACTAAAGCATTAAAATCTAAAATTTTAAACAAAACAATTGATAAAGTTGAAGTTTTACAATCTAAGTTAATAAAAGAAGCTACAGTTGATGAATTTAGTAATTTTATTGTTAATGAAACTATTTTAGATATTTTTAACATAGCTAAACATATCATAATTCAATTATCTAATAATAAAATTTTAATTACTCATTTAAGAATGGAAGGTAAATATCGTTTTTTTGAATCACCATCTGAAAAACATAAACACACAAGACTAGTTTATTATTTTAATGATAATTCAGAACTTCATTATTTAGATTCAAGAATGTTTGGAACTATTCATTTAAGAACTAATAATAACTATTTAAACACCAAACCTTTAAATAAAGTAGCTTTCACACCTGATAAAGTTAATGTAAATAAATTGTATTTAAAAACTTCTAAATCTAATGTTGCTATAAAAACATTAATTTTAAATCAAGAATTAGTTTCTGGAATAGGTAATATTTATGCAGATGAAACATTATTTGCTTCAAAAGTTTTTCCTTTAAAAGAAGCGTCAAAAATATCTAAAACAAAACTAAAAGAAATTTTAACAAATGCTTATTTAATTATGGAAAAAAGTTTTGAATTAGGTGGTTCTACGATTGATAGTTATGAATCCTTAAATAAACAAGAAGGTCAGTTTCAAAACTTTTTGCAAGTCCATACTAGAGTAAATAAACCATGTAATATATGTTCTACATTGATAAAGAAAATTAAAGTTAATGGACGCGGAACTTATTATTGTCCAAATTGTCAAAAAGAAAACAAAAAGAGGTAATATGAAAATTATTGATTTACACGGTTATAATATCACAAAAGCCACTGCAGCAGTTTTAAATGCTCTTTTTGAGTTTGATAACAATAGTTATGAAAATAGTTTAGAAATAATTACTGGTAATGGCACTGGAAGTTTAAAATTATTAGTATCTGATATCTTAGATAAAGAAGGTTATTATTGAAAATATAATAACTCTCAACAATCATCAATTTTAGTACTAAAAAATAAATATTAAAATCAGGGTTAGACCCCTGATTTTAACTTTTAATACTTTTATAATAATAAGTACTAATTGCAGTTCTTAGTTGTGTATCTATTATTTGATAAATATATACATTATAATCATTTGATTGGTTTGGTTGATTGTATAACTGAATTGCTACGTCATCAGTGCCAAAATATCATTTTTTAATAAAATTATATGTTGATTGTAATGTTGGTGTGTAATTTATGTAATTAAAATTAATAATTTCTGTGTATTTTATATCACTAAAAGCATCTGAAAATTGATCTTCTCAAGCTTCTTCATCTTCATTATGTAAATTTCATATTTGGTTAATAATTTCCACACTAAGATTGTTATCAATATTATTTTCATTTAAAATATTAAATATTTGTTCTTCAACTGAATTTTTTAAAGGCTGTTTTTGAGATTCATTTATCAATGTTTTTAAAGTGTCTAAGTAAGCTATTTCATAACGTTTTTGAATTTCATCTACTGATTCTTTAACATCTAAACCATTATAAAGAGTATTTTTTAGTTCTAAGATAAAATCTTTTGATTGTTTATCAGTTAGAGATTTTGCTTGTATTCAAACATCTACTAGTAAGTAGTTATTTTTAGGTCTTATGAATCTAATATTCCCATCTGGAGTATTACCAAAATTATCACTTGAATAATATGCATCAATTGCATCCCCATTATATAAAATAGCTGCATCTGCTTTATTAAATTTAGGTTCAATTAATGTGTTGAGTAGTTCTAAACCATCTCCTATTAAAAAATTATGTTTAGTATCACGAATATCATATGAAGTTGTATCTTTTACAAAATTATTAAAACTATCAATAGCTTGTTTGTAATTAGAAAAATCGAATTGTTTTAATTGATTTGTTTGTTTATCAATCGTAGAACCAGGATTTTTAAAATCTTCATAAAATGCACCAATCATTAAATTATCATAATATGCATTATTTCATCCAAAGTTAGTGTAACCATGTTCTTTTAATGTTTTCATTATTCCAAATCATGATTTATCTTTAAAATCTATTCCATTTTCTTTTTCTTCATCAGTTAATTTAATATGTGGTCTAAAAGTATTATCTATATTGTATGCTATAACTTTATCTTGTGAATAATAAGGAATAACATATTCTCAAAAATGATCTGCTTTTTTATCACCATCAACGTCATAACTATTTTTATCAGATAAAAGTTTGTGAGGGTATTTAGTTGTAATTAACTGTAAAATATAGTCATCATAAATTTTTAGATGTTCAATAATTTCTTTACGAAATATATGTTCTAAACCATCTAAAACATTCCCTTCAATATTAAATAGTGATTTAAAATCTATTTTTTTAATTTTATCATCAATAATTAGTTGAGCAGCTTGAAAATCGCTTCCTACTCCTGCAATTGCTTTTTCGTTATTTAGGGCTGTTGTAAACTCATTTATATCATTAAAAACTTTGTAATTGTATTTTGATTTTAATTCATTAATTATAGAAGGTTGTAAATATGATCCATAATTATAAATACTAGGTTTATAGCCGGTTTGTAATTTAATTGTTACAGCAAATGTAACAGAAAGAATTGAAAAAATACTTAAAATAATTGTTATAAAAAAGCCTAATATTTTTTTAATTTTGCTTTTTATCATTTTTTTGTCCTATTTTTATAATTATTTTTTTCAATTTTTCTTGCGATGCTTTTAGAAAATGAGTTTTAGTTATAATGTAAAAAATATTTGCCAAAATAACAATTAAAAGTGAAATTGAACCAAGAGCTAAACTTCATGCTTGAAATTGTCCTTCATAAAGTTGAGTACCTAATGTTTCTGTATTTGATACTATTCTTGTAATGATAAAATCATCAAAACTTAAAACCATACTAATTACAAATACAAAACCGATACTTCCTAACATATAAATAAAATATGTTTTAAATCAAGTTTTAATTTTTGAATAACCTAAATCTTCTGAAGCTTCAAAAATATTTTTTGAAAATTTATCTGATTTAGGTAACATTATCATAATTGCATAAGGTAAGATAATAACGACGTGAGATATTATTACTCTAATAAAACCTTCATTTGTTGCTTTTAGTACACCAAAAAATGAAGTTAAAACTATAGCAAGTGTTAAAGCTGTAACAACATCACTATTAATCATTGGAATATTTGCTGAAGATTGTACGTATTGTCTTGCACGTTTATTTTTTTGTCTTCAAAGACCAAAAACAGTTAATAATGCTAATGCTATGACAATAATTGACGTAAATACAGCAATTAAAAATGAATTTATAAAAGCTGAAAAATGACTTCTTGAAAATAATTCTGTGTATGCAGCAAAAGTAAATTTATTTCAAGTAGTTACACTAAAAATACCTTTATCACTTGGAGAATTAAAAGAATAAATTGCTCCAAAAATTAAAGGAATATAAAAGATTAAGATAATTATTCCGATGTAAGATTTTTTTATAAATGTAGCAAGTTTATTCATTATTAGCTCCCTTATAACGGTATTTATTTAATAAAATAGGTATTAAATAAATAATTCCATAAATAGACATTAGTACTAATAACGTAATTAAAACTAGAGTTGAAGCGTTTGCTAAATCAAATGGATTAGATGCATTAGCAAAATTATTAATTAAGTTTCCGATTAATTGGTTTTGAGATCCATTTGGTAATAACCTATCACTTAATATAATAGATGTAGCAGTAATTAAAAATACTAAACTAAATCCCCCTAATATTGCTTTTAAGGTGTAAGGTATTACTACTTTTAACATAGTTTTAAATTTTCCATAACCTAAATCTTGTGATGCTTCAATAATATTTAAAGGCATATTTTTTAAAACTTGATAAAGAGGCATAATTACAAACGGAATGTATAAATAGACAATTCCTAATATTAAAAACGCTTCATTATTTAGTGAATTTTCATCAAAAATTACTGAAAATAAACCTCTGATTGATAAAGCTTTCGAAATTGTAAAAATTAATAATGGACTTAATATTAAACTTAGACCAATATTTTTTGTTACACTAGATTTTGAAGTGGAAATCATATATGCGTAGGGAAAACCAATTAATACACATAAAAATCCACCAACAAAACCAGTTCAAATACTTCTTCACATAATCACTCATGTAGTTTTTGAAGAAGCAATTTCTCAATTATTAAAAGAACTATTTAAAGGGGTAAAAGCTTTAATAATAACTAATATTAATGGCAAAATTATAAATAAACCACTGAAAATAACATAAGGTAAGATTAATGATAATCTTAAATTCAATGCTAGTTTATTTTTAATTTTTTCTATCATTATAATAATTCATTATCTCATTGTTTTGTGTCTTTTGCCATTATATGTATTGCATCTTCATCTCATGAAAGATAAACTTTTTGTTCTTCACTAAATTTATTTGTTGTTTCCACATAAAGAATTTTATTATTAACTTCAACATCAATGTAGTAATAACTTCCTTTATAAACAGTTTTTTTAACAATTCCTTCTAGTTTATAATTTTTATTTGCTTTAGATGAAATTATAATATCTTCTGGTCTTATTAAAACATCTACATTTTCATTTGCTTGAAATTCGGTGTGAATAGTATCAAATATTTTATTCATGAATTTTACTTTGTTTTTTTCAATAAAAATAGCATCAAAGAAATTACCGTCTCCAATAAAATTTGCTACTCATTTATTTTTTGGATAGTCATATAATTGATGTGGTGTTGTAAATTGTTCAACTTGTCCATCTCTTATTATTGCAATTCTATCACTTAGTTGTAATGCTTCATCACGATCATGAGTTACAAAAATGAATGTTAGATTTAATTTTTTTTGTAAATTTCTTAATAGAATTTGCATTTTTTCACGTATTTTTGCATCTAGAGCACTTAATGGTTCATCTAGTAAAAGAATTTTGGGACTAATTACTAAACTTCTTGCCAATGCAACTCTTTGTTTCATTCCTCCACTAAGGTTTGATATTTGTTTTTTTGCATTACCTTCAAGACCTACAAGTTTAATTATTTCTTCTACTTCTTTATTCATTTCTGCATTTGTAATTTTTCTTGTTAAGTGTTTTTTTTCATAATCTTCAGTTTTAAGATCGACGTAATTTTCTCAATATGAATATTGAAAATCACTATCATCAATTCATTTTTGAATTTTTGTGTGTTTTTTTGGTGATAGTTTTGCATTTTCTAATTCTTTTTCAAATTGAGACATAGTTTTATCAAGATTTTTCATCTTTGATTCAGCTATTTTTTTTCAATCTTTTTGTTTTTTTTGTAAAGTATTAAAATATGATGTATTTACATTTTCTCTAGGTTTTCTTTTTAGTCTTAAACCGTATTTAATATTGTTTTCAACATTTAGATGAGGAAAAAGTGCATAGTCTTGAAAAATAGTTGAAACATCTCTTTTATGCGGTGAAAGATCTTTTATATCTTTTCCATTGTATTTAACTTCTCCCCGTGTAGTTCATTCAAAACCACCGATTATTCTTAAAATGGTAGTTTTTCCACTACCACTAGGACCTAATAATGTAATAAATTCACCTCTGTTAATGCTTAAATTAATATGGTCTAAAACAGTTTTATTTTCGAATTCCTTAACTACATCAACAAGTTCAATAATTGGATATATTTTTTTATTTTTTTCGTGAGTTTTGTTATTTATTTCCATTGTACTTCCTTATTAATATTTTTTATACAAAGTGAAATTAAGTTTTTAGCTTAATTTCTAAATAACGGAGGCAGAATTATATACATACTGAGTATACTCAGTATTTAATCATTTAAGAGTACAAAAAGTTAAACTAAAAACCTTGACAAAAAAAAGTCACATTGTGTTATTTACATTTAATTTAAGTTTTTGTCTCTTTAACATAATATAAAAATTTTAGCACATTTTAATTTTTAAAATGTATAAATTATGAATGAGTTTTTTCAAAATATTTTTTTACAACAATTGATTTAATTTCATTATCTAAAGGAACATAAAATGAGTAATAAATATTGTCATTTGTATTTATGTTATATATATTTTGAGCTTTTTTATCTATTTCTTTATTTTCATTTAAAAAATAGTAATTTTTAAAAAAGTTAAATTCATTTTTTATAGTCGGTGTGTAATTTAAACTATCAAAATTAGTTAACATATTACTAAAACTAAAATCTTTAAATTTATCAAAATTTTGAGTAAAAAAATCAGTATTTATTTCAGAAATTGCTTTTGGTTTATCGTTATTAAACAGTTCATTTTTTGAAATATTTTTATTGTCTAAGGAATCTAAAATACTATTATAATAATCTGAAACTAGCTGTTCATATGAATAATTAAAAGTATCAAAAATAACTTCTTTTAAATACTTTAACATATCATCTGAATCTTTTTCACTAACAGATTTAGAAATGATTCATGCGTCTAGTAAAATCATATTATTTTTAGGTCTAATATAATCTACATTTTCACCATCTTTTAGTATACTAAAATTATCATTTGAATAATAACTGTCTAAAACATCACCATTATACATTAATGCAGCATCTAATTTTTCTTTACTTGGATCAATTAAGTCATTAACAAGTTCAAGTCCATTAGTTGCTAATCTATTGTATTTAGTTTCTAAAATTGAATGTTTAGTAGTAGACAATACAAATTCTTTAAAGTAATTAATGATGTCATCTATATTATTTAAATTGATATTTTCTAATCCATTTTTAGTTAAATAATTGTGTTTATTTTTTTCTTCTGAATCAAAATATTGTCCTAACATTAAATTATCATAATATACATTTGTTCATCCAAATTTACGATATCCTGCCTTATAAAGGGCATCATATATACTTTTTCATGTTAGTGATTTAAAATCTGTTTCTGATTTTAGTGGTGTTACATGAGGCCTTGAATTTTTGTTTATATTATAGGCCACAACTTTATCCTGAATAAAGTAAGGAATTAAAAATTCATAAAAATTATCAATACCTTCTTTAGAATCTACTTCAAAACCTAATATATTGTCTATGTTATTTCTTTTTTCTTTGTCTAGATTTTCATTTTTATAATATAAATAAGGCTTAACTACATTATTAAATTTATCACGCTCTTTGTTGTTATTTGGATTAATTTCAATTATTTTATCAATAATTCAATTTTCATATTTTTGAATATGTTTGTTTGTAACATCAGTAAAAAAGCTTTGAATTTGTTGTTTTTTAGTGTTTCGATCATTTGATAAATCATCGATTAAAATGTTTCAATTTATTTTTTTAATTTGTCCTTTTAACACTAGGTTAGCAATTTGAAAATCACTTCCTACTCCACCTACTGTTTTACCTTGTTCTATATCTTTTGTAAAAACATTTATATCGTTAAACAGTCGATAAGAATATTTTTTATTTATTTTTTCAATAAGTGGTTTTGCCAAATATGATTCATAATTATAAATACTTACTAAATATGGTGTTTTTATTTTAAAAACAACAGCAGTAGCAATGCTTGCTGTTAATAAGGATAAAAATGAAAAAAATATTATTTTTTTTAAAGTCTTAAACTTCATCATTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053097|766046:773691|769596_770433_-|WP_171113493.1|DBSCAN-SWA MIEKIKNKLALNLRLSLILPYVIFSGLFIILPLILVIIKAFTPLNSSFNNWEIASSKTTWVIMWRSIWTGFVGGFLCVLIGFPYAYMISTSKSSVTKNIGLSLILSPLLIFTISKALSIRGLFSVIFDENSLNNEAFLILGIVYLYIPFVIMPLYQVLKNMPLNIIEASQDLGYGKFKTMLKVVIPYTLKAILGGFSLVFLITATSIILSDRLLPNGSQNQLIGNLINNFANASNPFDLANASTLVLITLLVLMSIYGIIYLIPILLNKYRYKGANNE >NZ_CP053097|766046:773691|772053_773691_-|WP_171113497.1|DBSCAN-SWA MKMMKFKTLKKIIFFSFLSLLTASIATAVVFKIKTPYLVSIYNYESYLAKPLIEKINKKYSYRLFNDINVFTKDIEQGKTVGGVGSDFQIANLVLKGQIKKINWNILIDDLSNDRNTKKQQIQSFFTDVTNKHIQKYENWIIDKIIEINPNNNKERDKFNNVVKPYLYYKNENLDKEKRNNIDNILGFEVDSKEGIDNFYEFLIPYFIQDKVVAYNINKNSRPHVTPLKSETDFKSLTWKSIYDALYKAGYRKFGWTNVYYDNLMLGQYFDSEEKNKHNYLTKNGLENINLNNIDDIINYFKEFVLSTTKHSILETKYNRLATNGLELVNDLIDPSKEKLDAALMYNGDVLDSYYSNDNFSILKDGENVDYIRPKNNMILLDAWIISKSVSEKDSDDMLKYLKEVIFDTFNYSYEQLVSDYYNSILDSLDNKNISKNELFNNDKPKAISEINTDFFTQNFDKFKDFSFSNMLTNFDSLNYTPTIKNEFNFFKNYYFLNENKEIDKKAQNIYNINTNDNIYYSFYVPLDNEIKSIVVKKYFEKTHS >NZ_CP053097|766046:773691|770432_771806_-|WP_171113495.1|DBSCAN-SWA MEINNKTHEKNKKIYPIIELVDVVKEFENKTVLDHINLSINRGEFITLLGPSGSGKTTILRIIGGFEWTTRGEVKYNGKDIKDLSPHKRDVSTIFQDYALFPHLNVENNIKYGLRLKRKPRENVNTSYFNTLQKKQKDWKKIAESKMKNLDKTMSQFEKELENAKLSPKKHTKIQKWIDDSDFQYSYWENYVDLKTEDYEKKHLTRKITNAEMNKEVEEIIKLVGLEGNAKKQISNLSGGMKQRVALARSLVISPKILLLDEPLSALDAKIREKMQILLRNLQKKLNLTFIFVTHDRDEALQLSDRIAIIRDGQVEQFTTPHQLYDYPKNKWVANFIGDGNFFDAIFIEKNKVKFMNKIFDTIHTEFQANENVDVLIRPEDIIISSKANKNYKLEGIVKKTVYKGSYYYIDVEVNNKILYVETTNKFSEEQKVYLSWDEDAIHIMAKDTKQWDNELL >NZ_CP053097|766046:773691|766046_766880_+|WP_171113485.1|DBSCAN-SWA MPELPEVRVVTKALKSKILNKTIDKVEVLQSKLIKEATVDEFSNFIVNETILDIFNIAKHIIIQLSNNKILITHLRMEGKYRFFESPSEKHKHTRLVYYFNDNSELHYLDSRMFGTIHLRTNNNYLNTKPLNKVAFTPDKVNVNKLYLKTSKSNVAIKTLILNQELVSGIGNIYADETLFASKVFPLKEASKISKTKLKEILTNAYLIMEKSFELGGSTIDSYESLNKQEGQFQNFLQVHTRVNKPCNICSTLIKKIKVNGRGTYYCPNCQKENKKR >NZ_CP053097|766046:773691|768743_769604_-|WP_171113491.1|DBSCAN-SWA MNKLATFIKKSYIGIIILIFYIPLIFGAIYSFNSPSDKGIFSVTTWNKFTFAAYTELFSRSHFSAFINSFLIAVFTSIIVIALALLTVFGLWRQKNKRARQYVQSSANIPMINSDVVTALTLAIVLTSFFGVLKATNEGFIRVIISHVVIILPYAIMIMLPKSDKFSKNIFEASEDLGYSKIKTWFKTYFIYMLGSIGFVFVISMVLSFDDFIITRIVSNTETLGTQLYEGQFQAWSLALGSISLLIVILANIFYIITKTHFLKASQEKLKKIIIKIGQKNDKKQN >NZ_CP053097|766046:773691|767137_768763_-|WP_171113489.1|DBSCAN-SWA MIKSKIKKILGFFITIILSIFSILSVTFAVTIKLQTGYKPSIYNYGSYLQPSIINELKSKYNYKVFNDINEFTTALNNEKAIAGVGSDFQAAQLIIDDKIKKIDFKSLFNIEGNVLDGLEHIFRKEIIEHLKIYDDYILQLITTKYPHKLLSDKNSYDVDGDKKADHFWEYVIPYYSQDKVIAYNIDNTFRPHIKLTDEEKENGIDFKDKSWFGIMKTLKEHGYTNFGWNNAYYDNLMIGAFYEDFKNPGSTIDKQTNQLKQFDFSNYKQAIDSFNNFVKDTTSYDIRDTKHNFLIGDGLELLNTLIEPKFNKADAAILYNGDAIDAYYSSDNFGNTPDGNIRFIRPKNNYLLVDVWIQAKSLTDKQSKDFILELKNTLYNGLDVKESVDEIQKRYEIAYLDTLKTLINESQKQPLKNSVEEQIFNILNENNIDNNLSVEIINQIWNLHNEDEEAWEDQFSDAFSDIKYTEIINFNYINYTPTLQSTYNFIKKWYFGTDDVAIQLYNQPNQSNDYNVYIYQIIDTQLRTAISTYYYKSIKS >NZ_CP053097|766046:773691|766881_767115_+|WP_171113487.1|DBSCAN-SWA MKIIDLHGYNITKATAAVLNALFEFDNNSYENSLEIITGNGTGSLKLLVSDILDKEGYYWKYNNSQQSSILVLKNKY |
7 | Mycoplasma_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|