Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053183 | Staphylococcus aureus strain Guangzhou-SAU071 chromosome, complete genome | 13 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 6 | 5 | 10 | 1 |
NZ_CP053184 | Staphylococcus aureus strain Guangzhou-SAU071 plasmid pSAU071, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053183_1 | 639187-639294 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053183_1
>1.1|639226|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder GTTAAAGAATACAGTTGGTTTGCTTGCGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_1
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_1 >merge|NZ_CP053183|1|639187-639294|CRISPRCasFinder CAACTGCATAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGGTTAAAGAATACAGTTGGTTTGCTTGCGCACAACTGCATAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG >NZ_CP053183|1|1|639187-639294|CRISPRCasFinder CAACTGCATAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG GTTAAAGAATACAGTTGGTTTGCTTGCGCA CAACTGCATAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG
>NZ_CP053183.1|WP_001021155.1|637386_639048_+|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGGQFGYVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVAATNDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_CP053183.1|WP_000359043.1|636973_637390_+|DUF1934-domain-containing-protein MDKKVNIHTKQVLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_CP053183.1|WP_057504531.1|635688_636699_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGAIVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_CP053183.1|WP_001788287.1|634668_635190_+|YwhD-family-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_CP053183.1|WP_000180234.1|633345_634641_+|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVSPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NZ_CP053183.1|WP_000477504.1|632829_633306_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_CP053183.1|WP_000633786.1|632123_632660_+|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTTETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >NZ_CP053183.1|WP_000808897.1|630975_631914_+|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESLAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVIENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED >NZ_CP053183.1|WP_031845074.1|629944_630061_+|hypothetical-protein MILNRGAILEQGNKKAKVIKSELITNYIMLATLQIKNN >NZ_CP053183.1|WP_000882152.1|629258_629888_+|DUF443-domain-containing-protein MLCESRVINQNPKYRIIKYNNEYFMVDLVSTWIAYFLPMINWFIPKKYAKISRKEFESLNIVKPAKNNTFWPVAGFAVLLTTLTRKYIYLLNIHLEKEIVILTCCMILLGVFALFIYINTKLKLHIFDKNKSNNEKIILIPTFKNICLSFFAYIFFGGLSTMALSMLVTSSPQNIIEFLALIGMTACFFLLNMSSVLDKNIHVILKTNK >NZ_CP053183.1|WP_000901752.1|639313_639949_+|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNANHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKAELRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKSYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_CP053183.1|WP_000749048.1|640258_641146_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKSLIAFILIFMLVLSGCGMKDNDKQGSDDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NZ_CP053183.1|WP_000143689.1|641296_642247_+|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLSTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPCKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVIGGQIMVVADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >NZ_CP053183.1|WP_000365354.1|642301_643021_+|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >NZ_CP053183.1|WP_000362965.1|643004_643805_+|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLMLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNVDFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >NZ_CP053183.1|WP_000735555.1|643940_644447_+|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLANTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NZ_CP053183.1|WP_170833321.1|644608_645325_+|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNNKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVILVIYFTIRLSSRTRL >NZ_CP053183.1|WP_001045420.1|645493_646282_+|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFLSYYLNFLKSVS >NZ_CP053183.1|WP_001018677.1|646534_646909_-|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NZ_CP053183.1|WP_001824079.1|647856_648786_-|DMT-family-transporter MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIVLNIFINPDVFSLHFFSNQTFDYTWFVGGLLGVGYLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIIGIVIMNQFNKNNLLLTDQRYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSITLLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053183_2 | 755938-756023 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053183_2
>2.1|755966|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder CAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_2
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_2 >merge|NZ_CP053183|2|755938-756023|CRISPRCasFinder CAATGCGAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGGGCCCCAACAT >NZ_CP053183|2|2|755938-756023|CRISPRCasFinder CAATGCGAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA CAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGG CAATGCGAGTTGGGGTGGGCCCCAACAT
>NZ_CP053183.1|WP_000197262.1|755306_755849_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP053183.1|WP_000663039.1|754089_755148_+|histidinol-phosphate-transaminase MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISSHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP053183.1|WP_000180997.1|752335_753850_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRLMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYEQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK >NZ_CP053183.1|WP_000589262.1|751365_752343_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLEMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLDIMKPIDEVTTMSAYPIVYDNQQIEVLYQHLSESERVIVMQEDSVGQYVIDRKDIFKYLSQKKEVAQHD >NZ_CP053183.1|WP_000983680.1|749362_751144_+|DNA-helicase-RecQ MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNMLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFVLDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIESVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRVLFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV >NZ_CP053183.1|WP_000525113.1|747467_749351_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MGMEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMMDAQEAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNVLSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEIAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSSTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ >NZ_CP053183.1|WP_000098285.1|745256_747197_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK >NZ_CP053183.1|WP_000022323.1|743778_744783_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTEPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK >NZ_CP053183.1|WP_000708692.1|743084_743795_+|allophanate-hydrolase-subunit-1 MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDLESLLKHYKIKLETFIELHSKAQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN >NZ_CP053183.1|WP_014363392.1|742781_742988_+|hypothetical-protein MIIVYIALLLILVYVNYRLVNRLLSENRIYVVRLIATITTVISFILVYALIHELMPFVVRAMDLMYHQ >NZ_CP053183.1|WP_000429011.1|756456_757374_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP053183.1|WP_031760357.1|757466_757568_+|hypothetical-protein MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP053183.1|WP_000193751.1|757645_759151_-|peptide-MFS-transporter MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP053183.1|WP_170833322.1|759490_759991_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIKLMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP053183.1|WP_001068497.1|760010_760877_-|DMT-family-transporter MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP053183.1|WP_000692521.1|761677_762076_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP053183.1|WP_000855509.1|762038_764144_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYSVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP053183.1|WP_000562498.1|764261_765233_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP053183.1|WP_000499195.1|765732_765888_+|hypothetical-protein MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP053183.1|WP_000876317.1|765926_766898_+|ABC-transporter-permease MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMEGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053183_3 | 933340-933497 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP053183_3
>3.1|933380|27|NZ_CP053183|PILER-CR ATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCGT >3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR CTGTGTTGGGGCCCACTCC >3.3|933440|29|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder ACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_3
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_3 >merge|NZ_CP053183|3|933340-933497|PILER-CR,CRISPRCasFinder AACTTGTATTGCTTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCGTCCAACTTGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATCTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC >NZ_CP053183|3|1|933340-933484|PILER-CR AACTTGTATTGCTTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGC TCCGCGTCCAACTTGCATTGCTTGTAG AATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACTCCCC AACTCGCATTGCTTGTAGA ATCTCTTTTCGAAATTCTC >NZ_CP053183|3|3|933411-933497|CRISPRCasFinder TCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC ACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATC TCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC
>NZ_CP053183.1|WP_000390575.1|933026_933335_+|metal-sulfur-cluster-assembly-factor MEEALKDSILGALEMVIDPELGIDIVNLGLVYKVNVDDEGVCTVDMTLTSMGCPMGPQIIDQVKTVLAEIPEIQDTEVNIVWSPPWTKDMMSRYAKIALGVS >NZ_CP053183.1|WP_001182436.1|932088_932913_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MQPHLICLDLDGTLLNDNKEISSYTKQVLNELQQRGHQIMIATGRPYRASQMYYHELNLTTPIVNFNGAYVHHPKDKNFKTCHEILDLGIAQNIIQGLQQYQVSNIIAEVKDYVFINNHDPRLFEGFSMGNPRIQTGNLLVHLKESPTSILIEAEESKIPEIKNMLTHFYADHIEHRRWGAPFPVIEIVKLGINKARGIEQVRQFLNIDRNNIIAFGDEDNDIEMIEYARHGVAMENGLQELKDVANNITFNNNEDGIGRYLNDFFNLNIRYYC >NZ_CP053183.1|WP_001124491.1|930720_932037_-|CoA-disulfide-reductase MPKIVVVGAVAGGATCASQIRRLDKESDIIIFEKDRDMSFANCALPYVIGEVVEDRKYALAYTPEKFYDRKQITVKTYHEVIAINDERQTVSVLNRKTNEQFEESYDKLILSPGASAHSLGFESDITFTLRNLEDTDAIDQFIKANQVDKVLVVGAGYVSLEVLENLYERGLHPTLIHRSDKINKLMDADMNQPILDELDKREIPYRLNEEIVAINGNEITFKSGRVEHYDMIIEGVGTHPNSKFIESSNIKLDRKGFIPVNDKFETNVPNIYAIGDIATSHYRHVDLPASVPLAWGAHRAASIVAEQIAGNDTIEFKGFLGNNIVKFFDYTFASVGVKPNELKQFDYKMVEVTQGAHANYYPGNSPLHLRVYYDTSNRQILRAAAVGKEGADKRIDVLSMAMMNQLTVDELTEFEVAYAPPYSHPKDLINMIGYKAK >NZ_CP053183.1|WP_000902813.1|930159_930549_+|YisL-family-protein MLHLHILSWVLAIILFIATYLNISKNQGGTPYFKPLHMVLRLFMLLTLISGFWILIQSFMNGGANHMLLTLKMLCGVAVVGLMEVSIAKRKRHEQSHTMFWITIALIIITMVLGVILPLGPISKLFGIG >NZ_CP053183.1|WP_000670755.1|928929_929832_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVERLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >NZ_CP053183.1|WP_000154915.1|925110_928764_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTDWLDQLVTPYEEEAQQAELIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMRRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNITAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIHSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQVEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISKVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NZ_CP053183.1|WP_000172334.1|921633_925110_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSMKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDSELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDALQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYKDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNINIDDEFGGEQ >NZ_CP053183.1|WP_000711897.1|920898_921474_+|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKYNFNPENTKN >NZ_CP053183.1|WP_000758211.1|920358_920883_+|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLVDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >NZ_CP053183.1|WP_000007965.1|919778_920354_+|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLIVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NZ_CP053183.1|WP_057504518.1|933988_935803_+|acetyltransferase MNKTKGFTKYKKMIYMPGLDGLRAIAVLGIIIYHLNKQWLTGGFLGVDTFFVISGYLITSLLLKEYDDTGIIKLKSFWIRRLKRLLPAVIVLLMVVGTATLLLKSENIIRVKHDIIAAIFYVSNWWYIAKDVNYFEQFSFMPLKHLWSLAIEEQYYIFFPVILVTLLLTIKKRYKIGFIFWGVSIISLGLMMFIYSINGDHSRVYFGTDTRLQTLLLGVILAFLWPPFKLKNDPPKVVKYIIDSIGSLSFIVLILLFFIINDETNWIYDGGFYLISILTLFIIASVVHPSTWIAKIFSNPVLVFIGKRSYSLYLWHFAVISFVHSYYVDGQIPVYVYFIDISFTIIFAELSYRFIETPFRKEGIKALNWRPSYIPQFIRMAIVVTLLIPFMLILVGAFNKYGKDIIGEKANSFDTTIEDNYLMRIAPIDNIHIDGLVSEKKKESSDVYNNIKPLLIGDSVMVDIGESFKSSVPKSRIDGKVGRQLYQTLPLVKANYSQYKKSSDQVVLELGTNGDFTVKQLDDLLNQFGKAKIYLVNTRVPRIYEANVNRLLADAAKRKSNVTLIDWYKRSQGHSEYFAPDGVHLEYKGVLALKDEILKALKKK >NZ_CP053183.1|WP_000353962.1|936005_938615_+|ATP-dependent-chaperone-ClpB MDINKMTYAVQSALQQAVELSQQHKLQNIEIEAILSAALNESESLYKSILERANIEVDQLNKAYEDKLNTYASVEGDNIQYGQYISQQANQLITKAESYMKEYEDEYISMEHILRSAMDIDQTTKHYINNKVEVIKEIIKKVRGGNHVTSQNPEVNYEALAKYGRDLVEEVRQGKMDPVIGRDEEIRNTIRILSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVKKDVPESLLDKTVFELDLSALVAGAKYRGEFEERLKAVLKEVKESDGRIILFIDEIHMLVGAGKTDGAMDAGNMLKPMLARGELHCIGATTLNEYREYIEKDSALERRFQKVAVSEPDVEDTISILRGLKERYEVYHGVRIQDRALVAAAELSDRYITDRFLPDKAIDLVDQACATIRTEMGSNPTELDQVNRRVMQLEIEESALKNESDNASKQRLQELQEELANEKEKQAALQSRVESEKEKIANLQGKRAQLDESRQALEDAQTNNNLEKAAELQYGTIPQLEKELRELEDNFQDEQGEDTDRMIREVVTDEEIGDIVSQWTGIPVSKLVETEREKLLHLSDILHKRVVGQDKAVDLVSDAVVRARAGIKDPNRPIGSFLFLGPTGVGKTELAKSLAASLFDSEKHMIRIDMSEYMEKHAVSRLIGAPPGYIGHDEGGQLTEAVRRNPYSVILLDEVEKAHTDVFNVLLQILDEGRLTDSKGRSVDFKNTIIIMTSNIGSQVLLENVKETGEITEPTEKAVMTSLNAYFKPEILNRMDDIVLFKPLSIDDMSMIVDKILTQLNIRLLEQRISIEVSDDAKAWLGQEAYEPQYGARPLKRFVQRQIETPLARMMIKEGFPEGTTIKVNLNSDNNLTFNVEKIHE >NZ_CP053183.1|WP_001047064.1|938673_939543_-|LysR-family-transcriptional-regulator MNLDWYYTFVILAKTLNYRLASEEINLTIPSIHKQIKNLEQHLNVKLFETYKNQIILTEDGHTFLPIAQSFIEQYESGIKHIQLKKTMFQSKLNVVVSSYIATFIMPKFLKSFFNEHPFIDVSLHVKNENIEKDINNHTYDIGISRNQPKLREVHSEKVCEGKIVLIAPNKENNHLLTEASLFEKYKIISDNHPEYWSSLKNNILNIYEKAQFLSINDVHTSIKLIEMNQGISFLPLYITTNSDYNISVINTKILQAPISFTYIYSKKEIPEILVFIKSFKKYIANEQL >NZ_CP053183.1|WP_000619354.1|939652_940798_+|2-isopropylmalate-synthase MIRIQDNTIRDGMQQSNVRKSLFIKKEVLKQINKLNINSVEVGMCTTIEDEFNIHQFRDILSPEKELVVLTRLNEKEIKKIVKLKIHNLVVKILLPISDLHIKEKLNFSNKYYIQKIKDCLEILKKDKKGVDICFEDATRTSREKLKEYMEIISKYQVRTVTFADTVGCSTPLEYGDIFNYFVKKYSNIIFSAHCHNDLGLATANTLAAILNGAKQIETTFLGIGERAGNAPIEEIITILTKKQIESTEFTLPDVYKTSINISKILDFQISENKPIIGENIFKHESGIHQDGTKKNINMYQYLVPSDLGLKNSQVVQFPISNISSKKILHNKFKSIVNTEEIDENISFYKLVNKFSPEVAPEDTVDLLQIIKRRSKDGNFK >NZ_CP053183.1|WP_000404422.1|940781_941423_+|L-threonylcarbamoyladenylate-synthase MEILNDSVKSFEKLYLQLQDGFPVIVPTDTNYNLCSLPNNDLCIDKIFEYKKRSKDKPLSLFIDKPEDWKLYGDNQNTEIVDKLVEIFWPGPLNIILKNKTSYNYMLNNSDSIAIGCVQNKTMRRFISYINSPIAITSANISGTADDILITENEAIKHMGENVRYMLRSQNKTNYKTSSTIIKVTDNKIELLREGDIKFEEIKERLGTGIIYE >NZ_CP053183.1|WP_000695347.1|942517_943033_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MKIKTEFKGNNIPYEYAAGADVSDSINGNPIKSFPFEVTELPEGTKYLAWSLIDYDAIPVCGFAWIHWSVANVSVSGNSISIKADLSRTKGDYVQGKNSFTSGLLAEDFSEIENHYVGPTPPDKDHQYELTVYALGHSLNLKNGFYLNEFLKEVNQHKIDQTSINLIGRKI >NZ_CP053183.1|WP_000769690.1|943343_943778_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFITVTLALGMIATTGATVASNEVSAAEKDKLPATQKAKEMQNVPYTIAVDGIMAFNQSYLNLPKDSQLSYLDLGNKVKALLYDERGVTPEKIRNAKSAVYTITWKDGSKKEVDLKKDSYTANLFDSNSIKQIDINVKTK >NZ_CP053183.1|WP_000682089.1|944034_944220_-|YjzD-family-protein MKHLVTFFWALLLMQMVNFVLNSLVGGDSLNVVNPIIMAVLFTIFTAIFAAVIKPPKDSSQ >NZ_CP053183.1|WP_001100526.1|944514_945456_+|ketoacyl-ACP-synthase-III MNVGIKGFGAYAPEKIIDNAYFEQFLDTSDEWISKMTGIKERHWADDDQDTSDLAYEASVKAIADAGIQPEDIDMIIVATATGDMPFPTVANMLQERLGTGKVASMDQLAACSGFMYSMITAKQYVQSGDYHNILVVGADKLSKITDLTDRSTAVLFGDGAGAVIIGEVSEGRGIISYEMGSDGTGGKHLYLDKDTGKLKMNGREVFKFAVRIMGDASTRVVEKANLTSDDIDLFIPHQANIRIMESARERLGISKDKMSVSVNKYGNTSAASIPLSIDQELKNGKLKDDDTIVLVGFGGGLTWGAMTIKWGK >NZ_CP053183.1|WP_000081240.1|945467_946712_+|beta-ketoacyl-ACP-synthase-II MSQNKRVVITGMGALSPIGNDVKTTWENALKGVNGIDKITRIDTEPYSVHLAGELKNFNIEDHIDKKEARRMDRFTQYAIVAAREAVKDAQLDINENTADRIGVWIGSGIGGMETFEIAHKQLMDKGPRRVSPFFVPMLIPDMATGQVSIDLGAKGPNGATVTACATGTNSIGEAFKIVQRGDADAMITGGTEAPITHMAIAGFSASRALSTNDDIETACRPFQEGRDGFVMGEGAGILVIESLESAQARGANIYAEIVGYGTTGDAYHITAPAPEGEGGSRAMQAAMDDAGIEPKDVQYLNAHGTSTPVGDLNEVKAIKNTFGEAAKHLKVSSTKSMTGHLLGATGGIEAIFSALSIKDSKVAPTIHAVTPDPECDLDIVPNEAQDLDITYAMSNSLGFGGHNAVLVFKKFEA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053183_4 | 1051864-1051956 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053183_4
>4.1|1051894|33|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder TAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_4
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_4 >merge|NZ_CP053183|4|1051864-1051956|CRISPRCasFinder AAAAGCCCCTAACAACTAAAGGTTGTAAGGTAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG >NZ_CP053183|4|4|1051864-1051956|CRISPRCasFinder AAAAGCCCCTAACAACTAAAGGTTGTAAGG TAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCAT AAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG
>NZ_CP053183.1|WP_000033477.1|1050806_1051382_-|ECF-transporter-S-component MSKGLKLSEILVTVLISVVFAVIYNLWWFVYNGVQATGLHLEQLTNGVWFMAAIVCYLIIPKPGIALLAEFAAGAGETIIMGRFDIPTIVYAFIQGLACELVFAIFKYQSRSVMVAMLAGFCTAIAAFPIDYFYGYLNEVAGWNLTLFIVFRLISGAVVAGVLSYLLVKALDKTGVTKLFRPAAKEDYDNL >NZ_CP053183.1|WP_000921971.1|1049391_1050792_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKVSDLRLKYPSGQRKIFDHLNITIQDKEKVLLLGPSGCGKSTLLNVLSGIVPNLIELPMKYDELIVDPLSGVIFQDPDSQFCMPKVYEELAFVLENRQVPREDMDALIINALNMVNLNVTPETYIKDLSGGMKQKLAIVETILQQSKTLFLDEPTAMLDVQATEDLWTKLIELWEDQTVVIVEHKVKHIWNHVDRVILMDYNGNIIADECPEIILQKYVHLLSEYGVWHPRAWEFAPSRVDFPTTNSHLLQFKNGRIIRGKSTLLSFSDLEIGLGEWITITGANGSGKTTLLESIMQLIKYQGDVYFENQRLTKIKHAAKHMYLVYQNPELQFITNSVYDEINIHFNHLSKDQSDDETIQLLKLLDLENVKDQHPYELSIGQKRRLSVATALSSKADIIFLDEPTFGLDSHNTFQLIKLFQKRINLGQSIVMVTHDDEIIERYPSRRLKISDGALLDCDGDTNV >NZ_CP053183.1|WP_000273256.1|1048592_1049399_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MYEQWKVRQSFVDDVNIITKLFLGIILFFFIIFVHNFDFMLYITILMLVFLLMFNGTQFKITAIFITISIGFALLSSLFMILYGNGSHTILKFGFIHITTESLVRGLHVSLRTIAISFFGILIALTSQVVMIFYSLMQHLKVKSKVAYAFMAAIRMIPLMISSLIQLRRSLKMRYQMIDAANYRGLKRFKHLIIPLLSQNIRKAHQLSVAMESKGFRDGPRTYYYNVPFSYKDVIFIIVLIAIITLAYYCSITLPITGIDDVRLGRVG >NZ_CP053183.1|WP_001101926.1|1047079_1048327_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MNVLVIGAGGREHALAYKLNQSSLVKQVFVIPGNEAMTPIAEVHTEISESDHQGILDFAKQQNVDWVVIGPEQPLIDGLADILRANGFKVFGPNKQAAQIEGSKLFAKKIMEKYNIPTADYKEVERKKDALTYIENCELPVVVKKDGLAAGKGVIIADTIEAARSAIEIMYGDEEEGTVVFETFLEGEEFSLMTFVNGDLAVPFDCIAQDHKRAFDHDEGPNTGGMGAYCPVPHISDDVLKLTNETIAQPIAKAMLNEGYQFFGVLYIGAILTKDGPKVIEFNARFGDPEAQVLLSRMESDLMQHIIDLDEGNRTEFKWKNESIVGVMLASKGYPDAYEKGHKVSGFDLNENYFVSGLKKQGDTFVTSGGRVILAIGKGDNVHDAQRDAYEKVSQIQSDHLFYRHDIANKALQLK >NZ_CP053183.1|WP_000709285.1|1045579_1047058_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase MKKAILSVSNKTGIVEFAKALTQLNYELYSTGGTKRILDEANVPVRSVSDLTHFPEIMDGRVKTLHPAVHGGILADRNKPQHLNELSEQHIDLIDMVVVNLYPFQQTVANPDVTMDEAIENIDIGGPTMLRAAAKNYKHVTTIVHPADYQEVLTRLRNDSLDESYRQSLMIKVFEHTAEYDEAIVRFFKGDKETLRYGENPQQSAYFVRTSNAKHTIAGAKQLHGKQLSYNNIKDADATLALVKKFDTPAAVAVKHMNPCGVGIGDTIEQAFQHAYEADSQSIFGGIVALNRAVTPELAEQLHSIFLEVIIAPKFTGEALDILKQKKNVRLLEIDMIIDSNEEEFVSVSGGYLVQDKDNYVVPKEEMKVVTEVAPTDEQWEAMLLGWKVVPSVKSNAIILSNNKQTVGIGAGQMNRVGAAKIALERAIEINDHVALVSDGFFPMGDTVELAAQHGIKAIIQPGGSIKDQDSIDMANKHGIAMVVTGTRHFKH >NZ_CP053183.1|WP_000238670.1|1044998_1045565_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP053183.1|WP_000030810.1|1043967_1044996_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDLFLEPTKLYVKPVLTLKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGDIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP053183.1|WP_000483727.1|1042490_1043975_+|amidophosphoribosyltransferase MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP053183.1|WP_000032747.1|1040322_1042512_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP053183.1|WP_000666799.1|1039658_1040330_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-I MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP053183.1|WP_000064214.1|1051965_1052100_-|hypothetical-protein MSNENQNKKAAEKAKEVEEKLKDKKEEKTEDINQTKQDIQDTLN >NZ_CP053183.1|WP_000009075.1|1052251_1053547_+|hypothetical-protein MSFLRKHAEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVIIIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHYMWIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKGNVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFLFTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHGLLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP >NZ_CP053183.1|WP_000685063.1|1053971_1055144_+|class-I-SAM-dependent-rRNA-methyltransferase MKIATLNKGKETKYFNGYPLIEEEDIYSQDHLKEGDIFQIVTDKSQYVATAYVGRQHKGLGWVLTYDKAQEINTAFFVKLFNTALAERDYYFNIDGTNAFRLFNAEGDGVGGLTIDNYDGHLLIQWYSKGIYKFKYAILEAVRKVFDYKSIYEKVRFKDSEYSGGFVEGDAPEFPIVIEENFTFYNVDLEDGLMTGIFLDQKEVRKKLRDQYAKERHVLNLFSYTGAFSVIAASEASSTTSVDLANRSRSLTEENFGLNAIDPKSQYIYVMDTFDFYKYAARHGHSYDTIVIDPPSFARNKKRTFSVQKDYDKLINGALNILSSEGTLLLCTNASVYPLKQFKNTIKKTLEESGVDYELTEVMGLPKDFKTHPHYKPSKYLKAVFVNIRH >NZ_CP053183.1|WP_000505962.1|1055197_1055740_+|hypothetical-protein MGFKNNLTSNLTNKIGNSVFKIENINEKGAMPTTIKELNERRQRAEAIVKRKSLMSSTMSVVPIPGLDFGVDLKLMKDIIEDVNKIYGLDHKQVNSLGDDVKERVMSAAAIQGSQFIGKRISSAFLKIVIRDVAKRTAAKQTKWFPVVGQAVSASISYYFMNKIGKDHIQKCENVIKNVM >NZ_CP053183.1|WP_000437472.1|1055893_1056160_+|phosphocarrier-protein-HPr MEQNSYVIIDETGIHARPATMLVQTASKFDSDIQLEYNGKKVNLKSIMGVMSLGVGKDAEITIYADGSDESDAIQAISDVLSKEGLTK >NZ_CP053183.1|WP_000040057.1|1056162_1057881_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MSKLIKGIAASDGVAIAKAYLLVEPDLTFDKNEKVTDVEGEVAKFNSAIEASKVELTKIRNNAEVQLGADKAAIFDAHLLVLDDPELIQPIQDKIKNENANAATALTDVTTQFVTIFESMDNEYMKERAADIRDVSKRVLSHILGVELPNPSMIDESVVIVGNDLTPSDTAQLNKEFVQGFATNIGGRTSHSAIMSRSLEIPAIVGTKSITQEVKQGDMIIVDGLNGDVIVNPTEDELIAYQDKRERYFADKKELQKLRDADTVTVDGVHAELAANIGTPNDLPGVIENGAQGIGLYRTEFLYMGRDQMPTEEEQFEAYKEVLEAMNGKRVVVRTLDIGGDKELSYLNLPEEMNPFLGYRAIRLCLAQQDIFRPQLRALLRASVYGKLNIMFPMVATINEFREAKAILLEEKENLKNEGHDISDDIELGIMVEIPATAALADVFAKEVDFFSIGTNDLIQYTLAADRMSERVSYLYQPYNPSILRLVKQVIEASHKEGKWTGMCGEMAGDETAIPLLLGLGLDEFSMSATSILKARRQINGLSKNEMTELANRAVDCATQEEVIELVNNYVK >NZ_CP053183.1|WP_001289624.1|1058117_1058351_-|glutaredoxin-family-protein MSEIIVYTQNDCPPCTFVKNYLTEHQIVFEERNINNQQYRNEMIDFDAFSTPFILLNGNPMYHVDLDEINKVLNIQD >NZ_CP053183.1|WP_000381849.1|1058548_1059910_+|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I MDTVEISRFLTAMTLAVHIIFATIGVGMPLMFAIAEFLGIRKNDLQYIAMAKRWAKAYTITVAVGVVTGTIIGLQLSLIWPTFMEMGGHVIALPLFMETFAFFFEAIFLSIYLYTWDRFKNKWTHFLISIPVIIGGSFSAFFITSVNSFMNTPAGFELKNGKMVNVQPIEAMFNPSFIVRSFHVITTAGMTMAFVIASIAAFKLLRNRQPKDTVYHKKALKMSMIVGFFSTLLSMLAGDLSAKFLHKFQPEKLAAYEWHFDTSSHAKLLLFGVLDEKTQQVKGAIELPGLLSFLADNSVKTKVQGLNDFPKSLHPPMIVHYFFDLMVTMGILCFVISGVYVLTLMFKKLRKFSTHKWMLYGILLTGPASMLAIEFGWFLTEMGRQPWIVRGYMRVAEAATQAGGITFVTILFGILYIILMYTCAYVLIRMFKNKPAYEDVNRLAKKQGGEIEK >NZ_CP053183.1|WP_000638454.1|1059906_1060926_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIYAFIGITVLWLFLFCYIIIASIDFGAGFFALHSKLTGDEKKINHLISRYLNPVWEVTNVFFVFFFVGFVGFFPESIKYLGTVLLIPGSIALIMISLRNSFYAFENYGQDTKLAWMIMYGVSGLLIPASLSTALTITEGGYINVRNNVIDLDWVQLLLSPFAWSVVFLAIISVLYISSGFLTYYAKKANDEPAYNLTRQWHIFLGPPMIIICLFVFLSLRIQNSEHFYSAVFDYWWMFAISFLFFTLASLLTFFKKKHGLAFVFVILQMMFAFFGYGISKLPYLLYPFVKITDAYVNPEMGWTLVIVFILGLLLLLPSLILLLRLFVFDKEYVEGKKS >NZ_CP053183.1|WP_000514290.1|1061058_1061721_+|TrkA-family-potassium-uptake-protein MGKEYVVIGLGRFGGSIVRELNALDMDVMAIDHDENRVNEYSDIATHAVVADTTDEAVMKSLGIRNFDHVIVAIGENIQSSTLTTLILKELGVKKVTAKAQNDYHAKILNKIGADTVVHPERDMGRRIAHNVASASVLDYLELADEHSIVELKATEKMAGQSIIDLDIRAQYGINIIAIKRGKEFIISPNPNINLEIGDILIMIGHDNDLNRFEKNIATR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053183_5 | 1136054-1136200 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP053183_5
>5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR GAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAA >5.2|1136170|12|NZ_CP053183|PILER-CR CTTACAATAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_5
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_5 >merge|NZ_CP053183|5|1136054-1136200|PILER-CR GGCGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAATCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCAGAAAGTCAG >NZ_CP053183|5|2|1136054-1136200|PILER-CR GGCGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGA CAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACA GAAGCTGACGAAAAATCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGG GGCCCCAACATA GAAGCTGGCAGAAAGTCAG
>NZ_CP053183.1|WP_001802045.1|1135673_1135898_+|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >NZ_CP053183.1|WP_000765708.1|1135570_1135717_+|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >NZ_CP053183.1|WP_000857485.1|1133938_1134898_-|leukocidin/hemolysin-toxin-family-protein MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >NZ_CP053183.1|WP_000231631.1|1133228_1133462_-|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVANEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >NZ_CP053183.1|WP_001032817.1|1132424_1132610_-|hypothetical-protein MNKHINKKATKLLEDYKKVQQRKSEETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >NZ_CP053183.1|WP_000669535.1|1131358_1131709_+|complement-inhibitor-SCIN-family-protein MKFKKYILTGTLALLLSSTAIATLEGNKVEASSKKDYIIQSEYHDKQIADELRSLLNKSNVYDLAAGSLNRYYKQTIMMNEHRAKAALRSNNFDKMAEAKVALEKIYKEIYEIINR >NZ_CP053183.1|WP_000791583.1|1130707_1131205_+|complement-convertase-inhibitor-Efb MKNKLIAKSLLTIAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDVTIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >NZ_CP053183.1|WP_000584398.1|1129942_1130449_+|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NZ_CP053183.1|WP_000739567.1|1128873_1129272_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWRGLEIAKNLADQAKKDDERADKLIKEADEKNEHYKGKTVEDLYVIAKKMGKGNTRAVVKIKDGGKNGYYTFDITRPLEEHRKNIPVVGSGEISEITWQ >NZ_CP053183.1|WP_000739208.1|1128174_1128504_+|complement-convertase-inhibitor-Ecb MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNAETVKKYNEYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNLFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >NZ_CP053183.1|WP_001038858.1|1136567_1137284_-|superantigen-like-protein-SSL12 MNKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >NZ_CP053183.1|WP_001063565.1|1137391_1138117_-|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPISSSTEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQQHLTFSNKTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >NZ_CP053183.1|WP_000793607.1|1139376_1140378_+|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NZ_CP053183.1|WP_001074342.1|1140400_1141333_+|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NZ_CP053183.1|WP_000432082.1|1141503_1143060_+|YfcC-family-protein MENTINESEKKKRFKLRMPGAFMILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKKDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSSHFTLCKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGLLITQVLIYS >NZ_CP053183.1|WP_000149420.1|1143367_1143595_+|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWKLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >NZ_CP053183.1|WP_001239297.1|1143900_1144848_-|TDT-family-transporter MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMLKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLENVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIILLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPVIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKENQDKFLRNASQ >NZ_CP053183.1|WP_001245798.1|1145097_1145286_+|hypothetical-protein MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANGIFSDED >NZ_CP053183.1|WP_000398672.1|1146198_1146333_+|beta-class-phenol-soluble-modulin MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF >NZ_CP053183.1|WP_000147103.1|1146389_1146524_+|beta-class-phenol-soluble-modulin MTGLAEAIANTVQAAQQHDSVKLGTSIVDIVANGVGLLGKLFGF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053183_6 | 1210622-1210714 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053183_6
>6.1|1210652|33|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder AATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_6
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_6 >merge|NZ_CP053183|6|1210622-1210714|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACTAATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCATAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT >NZ_CP053183|6|5|1210622-1210714|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT AATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCA TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT
>NZ_CP053183.1|WP_000167269.1|1209763_1210498_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MTKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKEKAEAVVEEIKAKGVDSFAIQANVADADEVKAMIKEVVSQFGSLDVLVNNAGITRDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKATPQMLRQRSGAIINLSSVVGAVGNPGQANYVATKAGVIGLTKSAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTDALSDELKEQMLTQIPLARFGQDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >NZ_CP053183.1|WP_001043838.1|1208844_1209771_+|ACP-S-malonyltransferase MNKTAIIFPGQGAQKVGMAQDLYNNNDQATEILTSAANTLDFDILETMFTDEDGKLGETENTQPALLTHSSALLAALKNLNPDFTMGHSLGEYSSLVAADVLSFEDAVKIVRKRGQLMAQAFPTGVGSMAAVLGLDFDKVDEICKSLSSDDKIIEPANINCPGQIVVSGHKALIDELVEKGKSLGAKRVMPLAVSGPFHSSLMKVIEEDFSSYINQFEWRDAKFPVVQNVNAQGETDKEVIKSNMVKQLYSPVQFINSTEWLIDQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKLTSIQTLEDVKGWNEND >NZ_CP053183.1|WP_000239738.1|1207865_1208852_+|phosphate-acyltransferase-PlsX MVKLAIDMMGGDNAPDIVLEAVQKAVEDFKDLEIILFGDEKKYKLNHERIEFRHCSEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTIDGKGFVFLDVGANADAKPEHLLQYAQLGDIYAQKIRGIDNPKISLLNIGTEPAKGNSLTKKSYELLNQDHSLNFVGNIEAKTLMDGDTDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKDTIMSSTKNKLAGAILKKDLAEFAKKMDYSEYGGSVLLGLEGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEQNIVQTMKETVGESNE >NZ_CP053183.1|WP_001548538.1|1207288_1207861_+|transcription-factor-FapR MRGETLKLKKDKRREAIRQQIDSNPFITDHELSDLFQVSIQTIRLDRTYLNIPELRKRIKLVAEKNYDQISSIEEQEFIGDLIQVNPNVKAQSILDITSDSVFHKTGIARGHVLFAQANSLCVALIKQPTVLTHESSIQFIEKVKLNDTVRAEARVVNQTAKHYYVEVKSYVKHTLVFKGNFKMFYDKRG >NZ_CP053183.1|WP_001151491.1|1205026_1207087_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MAKVNLIESPYSLLQLKGIGPKKIEVLQQLNIHTVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQAEDQSNVTIEGQVYTAPVVAFFGRNKSKLTVHLMVNNIAVKCIFFNQPYLKKKIELNQTITVKGKWNRVKQEITGNRVFFNSQGTQNQENADVQLEPVYRIKEGIKQKQIRDQIRQALNDVTIHEWLTDELREKYKLETLDFTLNTLHHPKSKEDLLRARRTYAFTELFLFELRMQWLNRLEKSSDEAIEIDYDLDQVKSFIDCLPFELTEAQKSSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLMALFGDSMNVALLTGSVKGKKRKILLEQLENGTIDCLIGTHALIQDDVIFHNVGLVITDEQHRFGVNQRQLLREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIITTWAKHEQYDNVLMQMTSELKKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQQYYGVSRVGLLHGKLSADEKDEVMQKFSNHEIDVLVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSDQQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANLVEDYRMLEVARDEAAELIQSGVFFENTYQHLRHFVEENLLHRSFD >NZ_CP053183.1|WP_057504507.1|1203190_1204837_+|DAK2-domain-containing-protein MISKINGKLFADMIIQGAQNLSNNADLVDSLNVYPVPDGDTGTNMNLTMTSGREEVENNLSKNIGELGKTFSKGLLMGARGNSGVILSQLFRGFCKNIESESEINSKLLAESFQAGVETAYKAVMKPVEGTILTVAKDAAQAAVEKANNTEDCIELMEYIIVKANESLENTPNLLAVLKEVGVVDSGGKGLLCVYEGFLKALKGEKVEAKVAKLDKDEFVHDEHDFHGVINTEDIIYGYCTEMMVRFGKNKKAFDEQEFRQDMSQFGDSLLVINDEEIVKVHVHTEYPGKVFNYGQQYGELIKLKVENMREQHREVIRKEQHTAKPKMETVETAIITISMGEGISEIFKSMGATHIISGGQTMNPSTEDIVKVIEQSKCKRAIILPNNKNILMASEQAASIVDAEAVVIPTKSIPQGISALFQYDVDATLEENKAQMADSVNNVKSGSLTYAVRDTKIDGVEIKKDAFMGLIEDKIVSSQSDQLTTVTELLIEMLAEDSEIFTVIIGQDAEQAVTDNMINWIEEQYPDVEVEVHEGGQPIYQYFFSVE >NZ_CP053183.1|WP_000171418.1|1202801_1203176_+|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MTLEISNDYGKIDISNEVIASVVGGKAVECYGIVGMASRQQVRDGIAEILGHENYAKGIKVTENNGVVDIDMYIIVSYGVKISEVANNVQSTVKYTLEKSLNVSVNSINIYVQGVRVNNTGKKA >NZ_CP053183.1|WP_000517908.1|1202170_1202359_-|50S-ribosomal-protein-L28 MGKQCFVTGRKASTGNRRSHALNSTKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVTRV >NZ_CP053183.1|WP_000547905.1|1201147_1201789_+|thiamine-diphosphokinase MHINLLCSDRHLPQDIWAKSNEGKWGGVDRGALILLKHQIIPFFSVGDFDSVSKEERQLLTEQLQIKPVQAEKADTDLALAVDKAVALGFDSITIYGATGGRLDHFFGAIQLLLKKAYYKHDVHIEVIDQQNKIELLPKGQHTVEKDKSYPYISFIPMTDDVELSLAGFKYNLARQMLNIGSTLTISNEIESLQAKVTVHDGLILQIRSTDLN >NZ_CP053183.1|WP_000164340.1|1200496_1201141_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MTKLYPSLLSVDFLVLQHELKRLEEAGVDGVHFDVMDGQFVPNISIGLPILDAVRKGTTLPIDVHLMIENPEKYIASFAEHGADMISIHVESTPHIHRAIQMIKHLDKKAGVVINPGTPISQIEPILDIVDYVLVMTVNPGFGGQSFIDQCVEKIAGLNAIKMERQLNFDIEVDGGVNTDTAKVCVENGATMLVTGSFFFKQEDYKKVTQALKG >NZ_CP053183.1|WP_000426914.1|1210803_1211037_+|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >NZ_CP053183.1|WP_000043237.1|1211152_1211884_+|ribonuclease-III MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >NZ_CP053183.1|WP_000262685.1|1212030_1215597_+|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGKRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLIELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIKSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKSSLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFKQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >NZ_CP053183.1|WP_000007686.1|1215596_1216847_+|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGAK >NZ_CP053183.1|WP_000531320.1|1216833_1217166_+|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKQHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >NZ_CP053183.1|WP_000863474.1|1217191_1218559_+|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTKLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >NZ_CP053183.1|WP_000268754.1|1218904_1219180_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >NZ_CP053183.1|WP_001261990.1|1219367_1219871_+|ribosome-maturation-factor-RimM MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVHNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLEENEYYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKGSKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >NZ_CP053183.1|WP_000687320.1|1219870_1220608_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFAGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTEQTRVILMCPQGEPFSHQKAVELSKADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFKGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >NZ_CP053183.1|WP_000181404.1|1220710_1221061_+|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053183_7 | 1418677-1418756 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053183_7
>7.1|1418702|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder GCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_7
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_7 >merge|NZ_CP053183|7|1418677-1418756|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGGCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCGCCAACTTGCACTTTATTGTAAGCTG >NZ_CP053183|7|6|1418677-1418756|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTG GCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCG CCAACTTGCACTTTATTGTAAGCTG
>NZ_CP053183.1|WP_000192137.1|1417499_1418159_-|response-regulator-transcription-factor-ArlR MTQILIVEDEQNLARFLELELTHENYNVDTEYDGQDGLDKALSHYYDLIILDLMLPSINGLEICRKIRQQQSTPIIIITAKSDTYDKVAGLDYGADDYIVKPFDIEELLARIRAILRRQPQKDIIDVNGITIDKNAFKVTVNGAEIELTKTEYDLLYLLAENKNHVMQREQILNHVWGYNSEVETNVVDVYIRYLRNKLKPYDRDKMIETVRGVGYVIR >NZ_CP053183.1|WP_000166795.1|1416147_1417503_-|sensor-histidine-kinase-ArlS MTKRKLRNNWIIVTTMITFVTIFLFCLIIIFFLKDTLHNSELDDAERSSSDINNLFHSKPVKDISALDLNASLGNFQEIIIYDEHNNKLFETSNDNTVRVEPGYEHRYFDRVIKKRYKGIDYLIIKEPITTQDFKGYSLLIHSLENYDNIVKSLYIIALAFGVIATIITATISYVFSTQITKPLVSLSNKMIEIRRDGFQNKLQLNTNYEEIDNLANTFNEMMSQIEESFNQQRQFVEDASHELRTPLQIIQGHLNLIQRWGKKDPAVLEESLNISIEEMNRIIKLVEELLELTKGDVNDISSEAQTVHINDEIRSRIHSLKQLHPDYQFDTDLTSKNLEIKMKPHQFEQLFLIFIDNAIKYDVKNKKIKVKTRLKNKQKIIEITDNGIGIPEEDQDFIFDRFYRVDKSRSRSQGGNGLGLSIAQKIIQLNGGSIKIKSEINKGTTFKIIF >NZ_CP053183.1|WP_000180678.1|1413060_1415859_-|2-oxoglutarate-dehydrogenase-E1-component MTNERKEVSEAPVNFGANLGLMLDLYDDFLQDPSSVPEDLQVLFSTIKNDDSIVPALKSTSSQNSDGTIKRVMRLIDNIRQYGHLKADIYPVNPPKRKHVPKLEIEDFDLDQQTLEGISAGIVSDHFADIYDNAYEAILRMEKRYKGPIAFEYTHINNNTERGWLKRRIETPYKVTLNNNEKRALFKQLAYVEGFEKYLHKNFVGAKRFSIEGVDALVPMLQRTITIAAKEGIKNIQIGMAHRGRLNVLTHVLEKPYEMMISEFMHTDPMKFLPEDGSLQLTAGWTGDVKYHLGGIKTTDSYGTMQRIALANNPSHLEIVAPVVEGRTRAAQDDTQRAGAPTTDHHKAMPIIIHGDAAYPGQGINFETMNLGNLKGYSTGGSLHIITNNRIGFTTEPIDARSTTYSTDVAKGYDVPIFHVNADDVEATIEAIDIAMEFRKEFHKDVVIDLVGYRRFGHNEMDEPSITNPVPYQNIRKHDSVEYVFGKKLVNEGVISEDEMNSFIEQVQKELRQAHDKINKADKMDNPDMEKPADLALPLQADEQSFTFDHLKEINDALLTYPDGFNILKKLNKVLEKRHEPFNKEDGLVDWAQAEQLAFATILQDGTPIRLTGQDSERGTFSHRHAVLHDEQTGETYTPLHHVPDQKATFDIHNSPLSEAAVVGFEYGYNVENKKSFNIWEAQYGDFANMSQMIFDNFLFSSRSKWGERSGLTLFLPHAYEGQGPEHSSARLERFLQLAAENNCTVVNLSSSSNYFHLLRAQAASLDSEQMRPLVVMSPKSLLRNKTVAKPIDEFTSGGFEPILTESYQADKVTKVILATGKMFIDLKEALAKNPDESVLLVAIERLYPFPEEEIEALLAQLPNLEEVSWVQEEPKNQGAWLYVYPYVKVLVADKYDLSYHGRIQRAAPAEGDGEIHKLVQNKIIENALKNN >NZ_CP053183.1|WP_001115452.1|1411778_1413047_-|dihydrolipoyllysine-residue-succinyltransferase MPEVKVPELAESITEGTIAEWLKNVGDSVEKGEAILELETDKVNVEVVSEEAGVLSEQLASEGDTVEVGQAIAVIGEGSGNASKENSNDNTPQQNEETNNKKEETTNKSADKAEVNQTTDDNQQRVNATPSARRYARENGVNLAEVSPKTNDLVRKEDIDKKQQAPASTQTTQQAPAKEEKKYNQYPTKPVIREKMSRRKKTAAKKLLEVSNNTAMLTTFNEVDMTNVMELRKRKKDQFMKDHDGTKLGFMSFFTKASVAALKKYPEVNAEIDGDDMITKQYYDIGVAVSTDDGLLVPFVRDCDKKNFAEIEAEIANLAVKAREKKLGLDDMVNGSFTITNGGIFGSMMSTPIINGNQAAILGMHSIITRPIAIDQDTIENRPMMYIALSYDHRIIDGKEAVGFLKTIKELIENPEDLLLES >NZ_CP053183.1|WP_000334509.1|1410389_1411199_-|hypothetical-protein MCGLRSITLGTTNIEQTKHFMVDILGLNCEELLENSIRFGDADISPGTRLQFIQVPSEQLEESHFVGIGLRTPTDSGLEEYAEILSSKEIPFTTTKELNGNKYFSFEDNNGHIFSIYSNENNYGVGLGMPSFESAVNPLHQVQGLGPVILKVNHVDITGQILTNIFGLEVFAEYQPFDNADYHVQVFKIGTGGLGGEIHLMPVETEMTMPEYGAVDQVEFETKDADFFNQAKSRLDEVEIPYQTLEQDDIESIRITENSGLSFIFTLQK >NZ_CP053183.1|WP_000902174.1|1410157_1410361_-|hypothetical-protein MLHETWKERTPIKKVEVINTDAKKFTVSDMLTVGKQYDVINETEEYYQIIDNSGLIGGYYKTYFKEV >NZ_CP053183.1|WP_001185421.1|1409185_1409977_-|MoxR-family-ATPase MALKHYKNSDSTVFNDAKALFDLNKNILLKGPTGSGKTKLAETLSEVVDTPMHQVNCSVDLDTESLLGFKTIKTNAEGQQEIVFVDGPVIKAMKEGHILYIDEINMAKPETLPVLNGVLDYRRQITNPYTGEVIKAVPGFNVIAAINEGYVGTLPMNEALKNRFVVIHVDYIDGDILKNVIKEQSLLQDDKQIEQIIKFNEDLRTMSKQGQISEEAASIRALLDLCDLITVMPVERAIKRTIIDKLEDEREQQAIYNAVELNF >NZ_CP053183.1|WP_001283670.1|1407285_1409172_-|nitric-oxide-reductase-activation-protein-NorD MSDRFIKFNDEQLDAKQVMMLQDLARLLLKNEQTQVKIQKFPYYNPVQNVLITSWFWSHRPSHIEMAGLKTDVMLAAYGYHMMDVQIVNEVVQDKTFKHPKFYQQLFKLLEDMRVLNSIKVERPSTAKLIDLRLDTRISYTESQIKVYRTKTQYTDLLFLYLEHAFLSQDFFDIPSIHSDLDDILVNMFLYLPNFFQNQNSEDNMYLAQRIMYQVDDILKEDMLNEYYYLPKTLYNTLASPEFEDLKRTDASQVDGQDDTSEDDDNQSEKADSKSADSESKGGAYLEMELHEGQNSETLGNDEAREGDATDDMTDMMTKKGKGSNDTLNREEGDAVGQSQAFQLDGVNKNVEIKWQIPEIEPQYVLEYQESKQDVQYEIKDLIQIIKKTIEREQRDARFNLTKGRLQKDLINWFIDDQYKLFYKKQDLSKSFDATFTLLIDASASMHDKMAETKKGVVLFHETLKALNIKHEILSFSEDAFDSDEHAQPNIINEIINYDYSTFEKDGPRIMALEPQDDNRDGVAIRVASERLMRRNQHQRFLIVFSDGEPSAFNYSQDGIIDTYEAVEMSRKFGIEVFNVFLSQDPITEDVEQTIHNIYGQYAIFVEGVAHLPGHLSPLLKKLLLKSL >NZ_CP053183.1|WP_001039275.1|1405717_1407061_-|branched-chain-amino-acid-transport-system-II-carrier-protein MNKNTWVIGFTLFAMFFGAGNLIFPPNLGLDSGQFFWPAILAFVLTGIGLPLLGVIVGALDKEGYIGALNKISPKFSILFLIIIYLTIGPLFAIPRTASTSFEMTITPIIHSNSSIALFIFTIIYFIVVLYICLNPSKLIDRIGSLLTPLLLITILAMIIKGYLDFSGNSAGKGNEALYHSNFSSFAEGFTQGYLTMDAIAAIAFSMIVVNAVKLTGITKTNQIFKQTLTAGLIAAVALIFIYISLGYIGNHMPVSDMTLDQLKSKDRNIGTYLLTTMASTGFGSFGKYLLGIIVALACLTTACGLIVAVSEYFHRIVPKVSYKAFVLVFILMSFIIANQGLNAVISMSIPVLSIVYPVAITVVLLILIAKFIPTKRISQQIPVIIVFILSIFSVISKLGWLKINFIESLPLRAYSLEWFPVAIIATILGYLVGIFVKQDPIKYQQE >NZ_CP053183.1|WP_000138424.1|1404507_1405644_+|toxic-anion-resistance-protein MTENKSFKESHPLDDFISDKELSNTTIQKEKLTIEQQKQVDTISKQINPLDNEGLLAFGSGLQKQMSQFSHQMLDEVQSKDVGPIGDTLSDLMSKLKSVNPNELNTDKPSMLKRIFSRAKSSINEIFSRMQSVSAQVDRITIQLQKHQTHLTRDIELLDTLYDKNKQYFDDLSLHIIAAQQKKLQLENEKLPQLQQQAQQSTNQMDIQQVADMQQFIDRLDKRIYDLQLSRQIALQTAPQIRMIQNVNQALAEKIQSSILTSIPLWKNQMAIALTLMRQRNAVAAQRAVTDTTNDLLTANAEMLKQNAIETATENERGIVDLDTLKRTQRNIIETIEETLIIQQHGREERQLAEKELQQLEQDLKSHLVNIKGPNKQS >NZ_CP053183.1|WP_000084773.1|1419299_1419914_-|phosphatase-PAP2-family-protein MSQWKRISLLIVFTLVFGIIAFFHESRLGKWIDNEVYEFIYSSESFITTSIMLGATKVGEVWAMLCISLLLVAYLMLKRHKIEALFFALTMALSGILNPALKNIFDRERPTLLRLIDITGFSFPSGHAMGSTAYFGSGIYLLNRLNQGNSKGILIGLCAAMILLISISRVYLGVHYPTDIIAGIIGGVFCIILSTLLLRNKLIN >NZ_CP053183.1|WP_000160908.1|1419930_1421001_-|undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide-beta-N-acetylglucosaminyltransferase MTKIAFTGGGTVGHVSVNLSLIPTALSQGYEALYIGSKNGIEREMIESQLPEIKYYPISSGKLRRYISLENAKDVFKVLKGILDARKVLKKEKPDLLFSKGGFVSVPVVIAAKSLNIPTIIHESDLTPGLANKIALKFAKKIYTTFEETLNYLPKEKADFIGATIREDLKNGNAHNGYQLTGFNENKKVLLVMGGSLGSKKLNSIIRENLDALLQQYQVIHLTGKGLKDDQVKKSGYIQYEFVKEDLTDLLAITDTVISRAGSNAIYEFLTLRIPMLLVPLGLDQSRGDQIDNANHFADKGYAKAIDEEQLTAQILLQELNEMEQERTRIINNMKSYEQSYTKEALFDKMIKDALN >NZ_CP053183.1|WP_000620194.1|1421012_1421522_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRLGKMSDLDQILNLVEEAKELMKEHDNEQWDDQYPLLEHFEEDIAKDYLYVLEENDKIYGFIVVDQDQAEWYDDIDWPVNREGAFVIHRLTGSKEYKGAATELFNYVIDVVKARGAEVILTDTFALNKPAQGLFAKFGFHKVGEQLMEYPPYDKGEPFYAYYKNLKE >NZ_CP053183.1|WP_000342123.1|1421921_1423412_-|S41-family-peptidase MDDKQHKSSSDDERAEIATSNQDQQTNSSKRVHLKRWQFISILIGTILITAVITVVAYIFINQKISGLNKTDQANLNKIENVYKILNSDYFKKQNSDKLSKAAIDGMVKELKDPYSEYLTKEQTKSFNEGVSGDFVGIGAEMQKKNDQIMVTSPMKGSPAERAGIRPKDVITKVNGKSIKGKALDEVVKDVRGKENTEVTLTVQRGSEEKDVKIKREKIHVKSVEYKKKGKVGIITINKFQNDTSGELKDAVLKAHKDGLKKIVLDLRNNPGGLLDEAVKMANIFIDKGKTVVKLEKGKDTEAIQTSNDALKEAKDMDISILVNEGSASASEVFTGALKDYHKAKVYGSKTFGKGVVQTTREFKDGSLLKYTEMKWLTPDGHYIHGKGIKPDVTIDTPKYQSLNVIPNTKTFKVGDDDKNIKTIKIGLSALGYKVDNESTQFDQALENQVKAFQQANKLEVTGEFNKETNNKFTELLVEKANKHDDVLDKLINILK >NZ_CP053183.1|WP_000801007.1|1423603_1423825_-|hypothetical-protein MKNYSFYQFVMTVRGRHDDKGRLAEEIFDDLAFPKHDDDFNILSDYIETHGDFTLPMSVFDDLYEEYTEWLKF >NZ_CP053183.1|WP_000473654.1|1423824_1424325_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MFKKLFGKGKEVQKDIAIYAPLTGEYVKIEDIPDPVFAQKMMGEGFGINPTEGEVVSPIAGRVDNVFPTKHAIGLKADNGLELLVHIGLDTVQLDGEGFEVLVSSGDEVNVGDPLVRFNLEYINNNAKSVISPIIITNTDQAASINIYDENAVIKGETKVIDVTMN 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053183_8 | 1730635-1730714 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053183_8
>8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder CAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_8
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_8 >merge|NZ_CP053183|8|1730635-1730714|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGACCCAACA >NZ_CP053183|8|7|1730635-1730714|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACA CAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAA TGCAAGTTGGGGTGGGACCCAACA
>NZ_CP053183.1|WP_000626083.1|1729418_1730360_-|pApA-hydrolase-Pde2 MISTLNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGSKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNVLLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLEQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLATALRTKLN >NZ_CP053183.1|WP_000226897.1|1726200_1729398_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDACIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTIETVVLAKDNNGLKDLYQLSSEIKMNALEHVSFELLKRFSNNMIIIFKKVGDQHRDIVQVFETHNDTYMDHLSISIQGIKHVWIQNVCYQTRQDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTEKEIKQLDINQEYLTQVDVIAQKCNAELKYHQSLLPQYQTPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRRERVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILIQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKENGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSHEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVDERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKMFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDHRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSHIDTFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >NZ_CP053183.1|WP_000058390.1|1724521_1725751_-|NAD-dependent-malic-enzyme-4 MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVNPQDVYDKTMKLTDLQ >NZ_CP053183.1|WP_000471567.1|1723469_1724327_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYIEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >NZ_CP053183.1|WP_000883646.1|1722525_1723470_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >NZ_CP053183.1|WP_000717561.1|1721288_1722257_-|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >NZ_CP053183.1|WP_001232650.1|1719509_1721267_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIAEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >NZ_CP053183.1|WP_000818529.1|1717801_1719163_+|amino-acid-permease 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>NZ_CP053183.1|WP_000277602.1|1732311_1732725_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NZ_CP053183.1|WP_000777188.1|1733112_1733802_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >NZ_CP053183.1|WP_000161673.1|1733976_1735032_+|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLTSGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEISKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPNKEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >NZ_CP053183.1|WP_001824175.1|1735110_1735224_-|hypothetical-protein MNDIDLIHYMLLMNVPAYVFLACLLYIAVRLGQKFMF >NZ_CP053183.1|WP_000689998.1|1735347_1736466_-|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDRKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDDPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >NZ_CP053183.1|WP_000634175.1|1736606_1737107_+|universal-stress-protein MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >NZ_CP053183.1|WP_000040069.1|1737352_1738555_-|acetate-kinase MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLVERIGLKDSIFTIEVNGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKAHNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESVAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLLRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTFGGLK >NZ_CP053183.1|WP_000840587.1|1738642_1739590_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNERGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGVGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMPLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSKEFKLGFEKGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVVPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK >NZ_CP053183.1|WP_000136257.1|1739712_1740207_-|thiol-peroxidase MTEITFKGGPIHLKGQQINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053183_9 | 1970971-1971052 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053183_9
>9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder ACCTGTAGAATTTCTTTTTTCGAAATTCTCTA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_9
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_9 >merge|NZ_CP053183|9|1970971-1971052|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCATTACCTGTAGAATTTCTTTTTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATT >NZ_CP053183|9|8|1970971-1971052|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCATT ACCTGTAGAATTTCTTTTTTCGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATT
>NZ_CP053183.1|WP_000636142.1|1970029_1970788_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NZ_CP053183.1|WP_111058724.1|1969426_1969813_-|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLINSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NZ_CP053183.1|WP_000149064.1|1968710_1969412_-|cell-wall-active-antibiotics-response-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NZ_CP053183.1|WP_001017131.1|1967670_1968714_-|sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NZ_CP053183.1|WP_000153526.1|1967051_1967681_-|response-regulator-transcription-factor MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQRDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMEDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NZ_CP053183.1|WP_000037087.1|1965721_1966939_+|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKEDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIVFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYAEDTNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NZ_CP053183.1|WP_000428172.1|1965168_1965444_+|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NZ_CP053183.1|WP_000228666.1|1964697_1965162_+|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NZ_CP053183.1|WP_000180460.1|1964350_1964551_-|DUF1128-family-protein MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHD >NZ_CP053183.1|WP_078065149.1|1963091_1964348_-|aminopeptidase MGILTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHEIKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAEKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIEGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF >NZ_CP053183.1|WP_000999708.1|1971316_1972303_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYDRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKAHEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >NZ_CP053183.1|WP_025174552.1|1972735_1973149_-|hypothetical-protein MKPTKVILRDASYVHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEIKFEFALFDSDMDNLKHMEYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVTKSDFNKFINELASLH >NZ_CP053183.1|WP_001790257.1|1973177_1973288_-|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >NZ_CP053183.1|WP_000544973.1|1973373_1974105_-|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHNFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEKQAKQVLIDRANRQKKSR >NZ_CP053183.1|WP_001250333.1|1974106_1975420_-|Mur-ligase-family-protein MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLHLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQAIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NZ_CP053183.1|WP_000949467.1|1975711_1976212_+|H-type-ferritin-FtnA MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NZ_CP053183.1|WP_001790679.1|1976293_1976386_-|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >NZ_CP053183.1|WP_000613738.1|1976602_1977157_+|3'-5'-exonuclease MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >NZ_CP053183.1|WP_000140176.1|1977223_1978294_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >NZ_CP053183.1|WP_000548782.1|1978540_1979071_-|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADAYFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053183_10 | 2030742-2030827 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_10
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053183_10
>10.1|2030771|28|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_10
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_10 >merge|NZ_CP053183|10|2030742-2030827|CRISPRCasFinder TGTTGAGGCCCCACCCCAACTTACATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCACCCCAACTTACATTGT >NZ_CP053183|10|9|2030742-2030827|CRISPRCasFinder TGTTGAGGCCCCACCCCAACTTACATTGT TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCCACCCCAACTTACATTGT
>NZ_CP053183.1|WP_057504583.1|2029303_2030527_+|ArgE/DapE-family-deacylase MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLKDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWTYPPFQLTEKNGKLYGRGTTDMKGGLMALVITLIELKEQNQLPQGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLEDVDGLIIVEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYSELKKHDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINNVDSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNNKLITTIKDVASSYVDKDDIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >NZ_CP053183.1|WP_000791403.1|2027812_2028868_-|bi-component-leukocidin-LukGH-subunit-H MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSPVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNRKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDDNKPYKEG >NZ_CP053183.1|WP_000595398.1|2026774_2027791_-|bi-component-leukocidin-LukGH-subunit-G MIKQLYKNITICSLAISTVLTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDEGKSKFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >NZ_CP053183.1|WP_000239607.1|2025289_2026282_+|sphingomyelin-phosphodiesterase MVKKTKSNSLKKVATLALANLLLVGALTDNSAKAESKKDDTDLKLVSHNVYMLSTVLYPNWGQYKRADLIGQSSYIKNNDVVIFNEAFDNGASDKLLSNVKKEYPYQTPVLGRSQSGWDKTEGSYSSTVAEDGGVAIVSKYPIKEKIQHVFKSGCGFDNDSNKGFVYTKIEKNGKNVHVIGTHTQSEDSRCGAGHDRKIRAEQMKEISDFVKKKNIPKDETVYIGGDLNVNKGTPEFKDMLKNLNVNDVLYAGHNSTWDPQSNSIAKYNYPNGKPEHLDYIFTDKDHKQPKQLVNEVVTEKPKPWDVYAFPYYYVYNDFSDHYPIKAYSK >NZ_CP053183.1|WP_001068527.1|2021598_2022885_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MNPLAQSLNEQLQQSNATAFAMLSDLGQNMFYPKGILSQSAEAKSTTYNATIGMATNKDGKMFASSLDAMFNDLTPDEIFPYAPPQGIEELRDLWQQKMLRDNPELSIDNMSRPIVTNALTHGLSLVGDLFVNQDDTILLPEHNWGNYKLVFNTRNGANLQTYPIFDKDGHYTTDSLVEALQSYNKDKVIMILNYPNNPTGYTPTHEEVTTIVNAIKALADKGTKVIAVVDDAYYGLFYEDVYTQSLFTALSNLNSNAILPVRLDGATKEFFAWGFRVGFMTFGTSDQTTKEVLEAKVKGLIRSNISSGPLPTQSAVKHVLKNNKQFDKEIEQNIQTLKERYEVTKEVVYADQYHSHWQAYDFNSGYFMAIKVHDVDPEELRKHLIEKYSIGVIALNATDIRIAFSCVEKEDIPHVFDSIAKAIDDLR >NZ_CP053183.1|WP_000990056.1|2021300_2021399_-|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK >NZ_CP053183.1|WP_000681969.1|2020882_2021059_-|hypothetical-protein MKHLTKIFVVLAIILFIVGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNNK >NZ_CP053183.1|WP_000691584.1|2019961_2020342_-|GntR-family-transcriptional-regulator MKIILKNNSDFPIYEQIKQQVKQNILKGHVAPGEHLPSMRELAKDLQVSLITTKRAYEDLEKDGFVTTIRGKGTFVKEQDSSILKEKQFFTIENLVKELVNEAQAIEMSLEELQDILTFIYEEESS >NZ_CP053183.1|WP_000991298.1|2019068_2019965_-|phenol-soluble-modulin-export-ABC-transporter-ATP-binding-protein-PmtA MNAIELSNVNYSSDQFNLKNISFKVPQGFVTGFIGRNGAGKTTIIRLIMDLYQPQTGVIRVLEEDMALNPIELKNRIGFVYAENYFNERWTTKQLEKMIAPFYRKWDHQVFEFYLEKFDLPINKSIKTFSTGMKMKLSLAVAFSHHAELYIFDEPTSGLDPLARNELLEIIQQELIDENKTIFMSTHIISDLEKIADYIIHLSDGEVILNGSKEQLLQRYQVVSGAIEDLDDELASLLIFEEHKRTGFIGLTEHAQVFKEILGHKVNITTPSIENLMVYLEKRKPKYHENIKLMEEGF >NZ_CP053183.1|WP_000645729.1|2018387_2019068_-|phenol-soluble-modulin-export-ABC-transporter-permease-subunit-PmtB MKALLIRNFKLRRYTLIIYVLLLTLYPFYIMLDSTKFFYLLQSFISPTILIIWILDAGHLFRLNRRLGGNDSYYFYMSLPVSKKQLLNANYITCIVLTLIGTLVISLYAYEADVIEPNSIYFSTAYAFVISNFLSIPIAFSQFTELRRVKVPYGIYVFTIIILVPFLFSIAIVLVNYFVLSQSSFPDLYSYVLNIGFLIISIVILIVNYFKQLNKINTRKFKGGSR >NZ_CP053183.1|WP_001045084.1|2030967_2032275_+|TrkH-family-potassium-uptake-protein MNKVHKPLYFYLMLFFSTTIIGALLLYLPFTGKKPISFLDALFIASSAFTVTGLSPVDIGSQFNILGEIVILLLIQIGGLGIVTVTLLTLVFLNRKISMKNRFLIMVTWNIDEPGGVIKLIKHLAIYSLVTELIGMICLCLSFIPKFGIGKGLFLSLFTSVSAFNNAGFALFKNNLIDYSSDPIVIITTSILIIFGGIGHFVVIDFINCKKLSKLSLHSKLVLTTTSILIIIGAITFFLLEQFNTMQNMGLVEKIGNSFFQSVTTRTAGFNSIDIAIINKSTALMLMLLMFIGGAPLSAAGGIKITTFAVAFIFVLNYIRKENNVSVFNKEISDKHIKLSIVTINISFLFISIITFILSIINPNISLIKLLFEVVSAFGTVGLSMNLTTEYHGITKIIIIFVMLCGKVGLLTLLRTFIPPKSPKNYRYTKGQIYL >NZ_CP053183.1|WP_000240638.1|2032815_2034432_-|chaperonin-GroEL MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >NZ_CP053183.1|WP_000917289.1|2034507_2034792_-|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >NZ_CP053183.1|WP_000197629.1|2034966_2035710_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVKKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEHKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVYTQIFGTQQTSPNTERLIVIARKIPLFIFFVSIVGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFAIATTVSSLIFALAHNDYKFIPIYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >NZ_CP053183.1|WP_031896427.1|2035734_2036922_-|hypothetical-protein MSYHWFTKMLLSTSILILSSSSLGLATDTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNVTSPSVNSEINNNETGTPPESNQTGNEGTDSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSPDSKPDPNNPNPVPNPKPDPDKPKPNPEPKPDPDNPKPKPDPKPDPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNPNPSPDPNQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >NZ_CP053183.1|WP_000522383.1|2037118_2037745_+|nitroreductase-family-protein MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSNEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKSFNPVEDRFVIKK >NZ_CP053183.1|WP_000867953.1|2038105_2038891_+|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKVQIYQLPIIFGDSSKNETQITQWFEKNMNDEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNNQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >NZ_CP053183.1|WP_001823225.1|2039489_2039624_-|delta-lysin-family-phenol-soluble-modulin MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTISDLVKWIIDTVNKFTKK >NZ_CP053183.1|WP_001105712.1|2039859_2040429_+|accessory-gene-regulator-AgrB MNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQVLAKNIGKLIVMYTLAYILNIFLFTLITNLTFYLIRRHAHGAHAPSSFWCYVESILLFILLPLVILNFHINPLIMIILTVISLGVISVYAPAATKKKPIPVRLIKRKKYYAIIVSLTFFIITLIIKEPFAQFIQLGIIIEAITLLPIFFIKEDLK >NZ_CP053183.1|WP_001093929.1|2040425_2040566_+|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MNTLFNLFFDFITGILKNIGNIAAYSTCDFIMDEVEVPKELTQLHE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053183_11 | 2278309-2278393 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_11
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053183_11
>11.1|2278339|25|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder TGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_11
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_11 >merge|NZ_CP053183|11|2278309-2278393|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NZ_CP053183|11|10|2278309-2278393|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTT TGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NZ_CP053183.1|WP_031844964.1|2278059_2278230_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNDMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS >NZ_CP053183.1|WP_000066900.1|2277583_2277934_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP053183.1|WP_000184418.1|2276270_2277482_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDRSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAINLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP053183.1|WP_000951066.1|2275837_2276278_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKYQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP053183.1|WP_000600972.1|2274910_2275675_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIETVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKAKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP053183.1|WP_031844963.1|2274667_2274919_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNTLTILSIVLAIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP053183.1|WP_000413855.1|2273013_2274279_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEIQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP053183.1|WP_000592326.1|2269729_2272897_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSVQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASASNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGGNLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQYQEGLGVVSTTYKKALHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATMVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP053183.1|WP_001161085.1|2269225_2269543_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP053183.1|WP_170833337.1|2268816_2268981_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVSLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NZ_CP053183.1|WP_001824308.1|2278570_2279593_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLNVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEEHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP053183.1|WP_000643988.1|2279612_2280212_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP053183.1|WP_000866974.1|2280218_2280452_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQGLTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP053183.1|WP_000808500.1|2280457_2280904_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP053183.1|WP_000602934.1|2280917_2281403_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NZ_CP053183.1|WP_000259720.1|2281399_2282659_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQQDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKTVKAKVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP053183.1|WP_000134534.1|2282721_2283216_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIYKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >NZ_CP053183.1|WP_000503820.1|2283217_2283724_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP053183.1|WP_000076924.1|2283754_2284759_-|ThiF-family-adenylyltransferase MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSACTTCGDIPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP053183.1|WP_000913006.1|2284927_2285533_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINLKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053183_12 | 2432875-2432967 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_12
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053183_12
>12.1|2432900|43|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder GCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_12
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_12 >merge|NZ_CP053183|12|2432875-2432967|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG >NZ_CP053183|12|11|2432875-2432967|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG GCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTC TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG
>NZ_CP053183.1|WP_000019124.1|2431798_2432665_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLIMLIVFAVNQSLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQKVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP053183.1|WP_001125208.1|2430786_2431473_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP053183.1|WP_000762708.1|2430528_2430633_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP053183.1|WP_000038954.1|2428915_2430355_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILAHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >NZ_CP053183.1|WP_000825921.1|2428015_2428795_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEANKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_CP053183.1|WP_000479576.1|2427315_2428035_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_CP053183.1|WP_000615464.1|2426587_2427319_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTLVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >NZ_CP053183.1|WP_001012236.1|2425240_2426491_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEENPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPLLYKVQTYLNHKRR >NZ_CP053183.1|WP_000819839.1|2424623_2424986_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVAMVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP053183.1|WP_000162810.1|2424005_2424605_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NZ_CP053183.1|WP_014532694.1|2433171_2433267_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYG >NZ_CP053183.1|WP_000792557.1|2433361_2434672_+|B-domain-containing-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYTDKYFKYKGTIDKTVLSVFGNGYKSYIQPLKVEDQKNYVSKSYAQVRNYVTETLNTGKVLYAFYQNPNVVKAAITTAETAASIKNIFSSFTSFFK >NZ_CP053183.1|WP_000594519.1|2435163_2436093_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NZ_CP053183.1|WP_000916705.1|2436660_2437608_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSDLPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRIHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_CP053183.1|WP_000783428.1|2437609_2438587_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >NZ_CP053183.1|WP_000200957.1|2438638_2439106_-|hypothetical-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPVALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLILASVLGSLISRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NZ_CP053183.1|WP_000286874.1|2439116_2439809_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYIKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NZ_CP053183.1|WP_000971541.1|2439819_2440935_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAECPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDVDRLFEILHQED >NZ_CP053183.1|WP_001046638.1|2440912_2441920_-|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKEKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNDVSRAN >NZ_CP053183.1|WP_001110080.1|2441921_2443280_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIVIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMAAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYDAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSQIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053183_13 | 2790150-2790235 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053183_13
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053183_13
>13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053183_13
The CRISPR arrays of NZ_CP053183_13 >merge|NZ_CP053183|13|2790150-2790235|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NZ_CP053183|13|12|2790150-2790235|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NZ_CP053183.1|WP_000491384.1|2789572_2789926_-|DUF3147-family-protein MFSIGSAILHFVIGGIAVALASIIADKVGGKLGGIIATMPAVFLAAIIALALDHRGTQLVEMSMNLSTGAIVGILSCILTVFLTSLYINHKGYRKGAIFTVVCWFVISLAIFSIRHL >NZ_CP053183.1|WP_170833345.1|2789110_2789500_-|DUF3147-family-protein MNINEIFCGGFAVLLSYIVSVTLPWKEFGGIFATFPAVFLVSMFITGMQYGDKVAVHVSRGAVFGMTGVLVCILVTWMMLHMTHMWLISIIVGLLSWFISAVCIFEAVEFIAQKRLEKHSWKAGKTNSK >NZ_CP053183.1|WP_001054123.1|2788290_2788860_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNLSKQIKKYRERDGYSQEYLAEKLYVSRQSISNWENDKSLPDIHNLLMMCELFNVTLDDLVKGTIPFVPDIKVQRSLNLWAYVMIIFMTLAAILTGPLIVYWNWAWGITVMVIYGIGYYASMKIEDFKKVHKMDNYDRIVAFMNGKDPSEVQTTKARNIKTSVLSFIAFVGAIILVALISMYLANKFL >NZ_CP053183.1|WP_001059079.1|2787963_2788164_+|cold-shock-protein MNNGTVKWFNAEKGFGFIEQENGGDVFVHFSGIASDGYKTLEEGQKVTFEITEGQRGDQAVNVQTV >NZ_CP053183.1|WP_000672036.1|2787380_2787572_+|peptide-resistance-ABC-transporter-activity-modulator-VraH MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAMIVIVLSVVTTPIIGIPVGLLGGAYYLKRREEKGK >NZ_CP053183.1|WP_000586238.1|2786426_2786924_-|hypothetical-protein MIINLETQQIHFDLEHETPYFQSPEKNRIRLDIDVLNKKQISNIINVIFNNQSKTKCTFLSEYLYPVKFREKTRIGRFFNITNWYEEIHSTDEKYVIATIKNIKNKDLIDYSLYIKKGLVEPFIVFYNQENIFYISNTVIDIISVSKDTLGYIKSEFNDHCASPY >NZ_CP053183.1|WP_000672028.1|2785628_2785820_+|peptide-resistance-ABC-transporter-activity-modulator-VraH MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAMIVIVLSSVTTPIIGIPAGLLGGAYYLKRREEKGK >NZ_CP053183.1|WP_000143679.1|2783655_2785536_+|peptide-resistance-ABC-transporter-permease-subunit-VraE MTFNHIVLKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFVKRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILMLIIAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIILFLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTLISMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITVNNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKSLPNIINIHLNKDLVVKGTKNETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQAIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLLKITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIIVYTLIYIVFALIAFVHSNKLIKKTI >NZ_CP053183.1|WP_000154165.1|2782907_2783666_+|peptide-resistance-ABC-transporter-ATP-binding-subunit-VraD MTILSVQHVSKTYGKKHTFQALKDINFDIQKGEFVAIMGPSGSGKTTLLNVLSSIDQISSGSVIANGQELNKLNQKALAKFRKESLGFIFQDYSILPTLTVKENIMLPLSVQKMSKATMEENYKAITTALGIYDLGNKYTSELSGGQQQRTAAARAFVHKPQIIFADEPTGALDSKSANDLLQRLEEMNKSFDTTIVMVTHDPVAASFAERVIMLKDGQIHTQLYQEGRSKQAFYEDIVHLQSVLGGVSNDI >NZ_CP053183.1|WP_000410770.1|2782105_2782618_-|HdeD-family-acid-resistance-protein MEKGNQGIKWSSLIMGVLLLMLAVVIFTFPIENFYAITWLIGLFVLINGVIQIVYRRKAKALVGGNQNWILFMGIVDILFGLIVIFNVGASSAFFIYMFAFWFIFSSIAGLFTFSGSGSLKLISVIFNLLGIVFGVILLFNPLMGIVFISTMIAIAFVFVGVIYVVDALA >NZ_CP053183.1|WP_000742837.1|2790535_2791375_-|nucleoid-occlusion-protein MKKPFSKLFGLKNKDDIIGHIEEDRNSNVESIQIERIVPNRYQPRQVFEPNKIKELAESIHEHGLLQPIVVRPIEEDMFEIIAGERRFRAIQSLNLPQADVIIRDMDDEETAVVALIENIQRENLSVVEEAEAYKKLLEIGDTTQSELAKSLGKSQSFIANKLRLLKLAPKVLLRLREGKITERHARAVLSLSDSEQEALIEQVIAQKLNVKQTEDRVRQKTGPEKVKAQNLRFAQDVTQARDEVGKSIQAIQQTGLHVEHKDKDHEDYYEIKIRIYKR >NZ_CP053183.1|WP_000215588.1|2791417_2792137_-|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MTVEWLAEQLKEHNIELTETQKQQFQTYYRLLVEWNEKMNLTSITDEHDVYLKHFYDSIAPSFYFDFNQPISICDVGAGAGFPSIPLKIMFPQLKVTIVDSLNKRIQFLNHLASELQLQDVSFIHDRAETFGKGVYRESYDVVTARAVARLSVLSELCLPLVKKGGQFVALKSSKGEEELEEAKFAISVLGGNVTETHTFELPEDAGERQMFIIDKKRQTPKKYPRKPGTPNKTPLLEK >NZ_CP053183.1|WP_000249657.1|2792136_2794014_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-enzyme-MnmG MVQEYDVIVIGAGHAGVEAGLASARRGAKTLMLTINLDNIAFMPCNPSVGGPAKGIVVREIDALGGQMAKTIDKTHIQMRMLNTGKGPAVRALRAQADKVLYQQEMKRVIEDEENLHIMQGMVDELIIEDNEVKGVRTNIGTEYLSKAVIITTGTFLRGEIILGNMKYSSGPNHQLPSITLSDNLRELGFDIVRFKTGTPPRVNSKTIDYSKTEIQPGDDVGRAFSFETTEYILDQLPCWLTYTNAETHKVIDDNLHLSAMYSGMIKGTGPRYCPSIEDKFVRFNDKPRHQLFLEPEGRNTNEVYVQGLSTSLPEHVQRQMLETIPGLEKADMMRAGYAIEYDAIVPTQLWPTLETKMIKNLYTAGQINGTSGYEEAAGQGLMAGINAAGKVLNTGEKILSRSDAYIGVLIDDLVTKGTNEPYRLLTSRAEYRLLLRHDNADLRLTDMGYELGMISEERYARFNEKRQQIDAEIKRLSDIRIKPNEHTQAIIEQHGGSRLKDGILAIDLLRRPEMTYDIILEILEEEHQLNADVEEQVEIQTKYEGYINKSLQQVEKVKRMEEKKIPEDLDYSKIDSLATEAREKLSEVKPLNIAQASRISGVNPADISILLIYLEQGKLQRVSD >NZ_CP053183.1|WP_000362507.1|2794080_2795460_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MDLDTITSISTPMGEGAIGIVRLSGPQAVEIADKLYKGKHLLNDVPSHTINYGHIIDPESKEVVEEVMVSVLRAPKTFTREDIIEINCHGGILTINRVLELTMTYGARMAEPGEFTKRAFLNGRIDLSQAEAVMDFIRSKTDRASKVAMNQIEGRLSDLIKKQRQSILEILAQVEVNIDYPEYDDVEDATTEFLLEQSKEIKQEINHLLDTGAQGKIMREGLSTVIVGKPNVGKSSMLNNLIQDNKAIVTEVAGTTRDVLEEYVNVRGVPLRLVDTAGIRETEDIVEKIGVERSRKALSQADLILFVLNNNEALTQEDYTLYEVVKNEDVIVIVNKMDLEQNIDINEVKDMIGDTPLIQTSMLKQEGIDELEIQIRDLFFGGEVQNQDMTYVSNSRHISLLKQARQTIQDAIDAAESGVPMDMVQIDLTRTWEILGEIIGETASDELIDQLFSQFCLGK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 2278260-2278287 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053183_13 | 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2790180-2790205 | 26 | NZ_CP053183.1 | 603072-603097 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053183_13 | 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2790180-2790205 | 26 | NZ_CP053183.1 | 1136337-1136362 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053183_13 | 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2790180-2790205 | 26 | NZ_CP053183.1 | 1273264-1273289 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 802347-802365 | 1 | 0.947 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 811516-811534 | 1 | 0.947 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 1273331-1273349 | 1 | 0.947 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 1273389-1273407 | 1 | 0.947 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 1972424-1972442 | 1 | 0.947 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 2312612-2312630 | 1 | 0.947 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 349772-349799 | 1 | 0.964 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 349827-349854 | 1 | 0.964 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 868103-868130 | 1 | 0.964 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 1730719-1730746 | 1 | 0.964 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 1732936-1732963 | 1 | 0.964 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 2312632-2312659 | 1 | 0.964 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 848033-848060 | 1 | 0.964 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP053183.1 | 1132046-1132077 | 1 | 0.969 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP053183.1 | 1824136-1824167 | 1 | 0.969 |
NZ_CP053183_11 | 11.1|2278339|25|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2278339-2278363 | 25 | NZ_CP053183.1 | 1136223-1136247 | 1 | 0.96 |
NZ_CP053183_11 | 11.1|2278339|25|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2278339-2278363 | 25 | NZ_CP053183.1 | 1818968-1818992 | 1 | 0.96 |
NZ_CP053183_11 | 11.1|2278339|25|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2278339-2278363 | 25 | NZ_CP053183.1 | 2278395-2278419 | 1 | 0.96 |
NZ_CP053183_13 | 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2790180-2790205 | 26 | NZ_CP053183.1 | 765399-765424 | 1 | 0.962 |
NZ_CP053183_13 | 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2790180-2790205 | 26 | NZ_CP053183.1 | 765455-765480 | 1 | 0.962 |
NZ_CP053183_13 | 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2790180-2790205 | 26 | NZ_CP053183.1 | 1790122-1790147 | 1 | 0.962 |
NZ_CP053183_13 | 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2790180-2790205 | 26 | NZ_CP053183.1 | 2312670-2312695 | 1 | 0.962 |
NZ_CP053183_13 | 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2790180-2790205 | 26 | NZ_CP053183.1 | 811392-811417 | 1 | 0.962 |
NZ_CP053183_13 | 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2790180-2790205 | 26 | NZ_CP053183.1 | 2020696-2020721 | 1 | 0.962 |
NZ_CP053183_13 | 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2790180-2790205 | 26 | NZ_CP053183.1 | 2195934-2195959 | 1 | 0.962 |
NZ_CP053183_2 | 2.1|755966|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 755966-755995 | 30 | NZ_CP053183.1 | 797002-797031 | 2 | 0.933 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 164373-164391 | 2 | 0.895 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 603013-603031 | 2 | 0.895 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 913156-913174 | 2 | 0.895 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 1132086-1132104 | 2 | 0.895 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 1347966-1347984 | 2 | 0.895 |
NZ_CP053183_3 | 3.2|933447|19|NZ_CP053183|PILER-CR | 933447-933465 | 19 | NZ_CP053183.1 | 1644575-1644593 | 2 | 0.895 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 274683-274710 | 2 | 0.929 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 602975-603002 | 2 | 0.929 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 755913-755940 | 2 | 0.929 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 765528-765555 | 2 | 0.929 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 1132050-1132077 | 2 | 0.929 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 1624764-1624791 | 2 | 0.929 |
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NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP053183.1 | 2312574-2312601 | 2 | 0.929 |
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NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP053183.1 | 2312628-2312659 | 2 | 0.938 |
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NZ_CP053183_13 | 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 2790180-2790205 | 26 | NZ_CP053183.1 | 2116933-2116958 | 2 | 0.923 |
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56. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to position: 868099-868130, mismatch: 2, identity: 0.938
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer cagagaatttcaaaaagaaattctacaaacaa Protospacer **.********.********************
57. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to position: 2312628-2312659, mismatch: 2, identity: 0.938
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer cagagaatttcgaaaagaaattctacagacaa Protospacer **.************************.****
58. spacer 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to position: 2116596-2116621, mismatch: 2, identity: 0.923
ccgccagcttctatgttggggccccg CRISPR spacer ccgccagcttctgtcttggggccccg Protospacer ************.* ***********
59. spacer 13.1|2790180|26|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to position: 2116933-2116958, mismatch: 2, identity: 0.923
ccgccagcttctatgttggggccccg CRISPR spacer ccgccagcttttgtgttggggccccg Protospacer **********.*.*************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP040462 | Enterococcus sp. M190262 plasmid pM190262, complete sequence | 41884-41911 | 4 | 0.857 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | CP003185 | Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 plasmid pMU3262, complete genome | 27573-27600 | 5 | 0.821 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NC_019956 | Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795 plasmid pTHETHE01, complete sequence | 87802-87829 | 5 | 0.821 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | JX238501 | Bacillus phage phiAGATE, complete genome | 76147-76174 | 5 | 0.821 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_LT984809 | Cupriavidus taiwanensis isolate Cupriavidus taiwanensis STM 8555 plasmid I, complete sequence | 102954-102981 | 6 | 0.786 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | KM359505 | Prochlorococcus phage P-TIM68, complete genome | 102710-102737 | 6 | 0.786 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | MH617769 | Siphoviridae sp. isolate ctjc_2, complete genome | 30760-30787 | 6 | 0.786 |
NZ_CP053183_1 | 1.1|639226|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 639226-639255 | 30 | NZ_CP023312 | Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass plasmid p292, complete sequence | 270977-271006 | 7 | 0.767 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP034684 | Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence | 33234-33261 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_KY940428 | UNVERIFIED: Bacillus sp. (in: Bacteria) strain PUMK-07 plasmid pMK-07, complete sequence | 107760-107787 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP041978 | Bacillus pacificus strain NCCP 15909 plasmid unnamed1, complete sequence | 12750-12777 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NC_011655 | Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_270, complete sequence | 83383-83410 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NZ_CP029457 | Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.3, complete sequence | 55624-55651 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NC_010924 | Bacillus cereus strain AH187 plasmid pCER270, complete sequence | 139792-139819 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NC_011777 | Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_272, complete sequence | 97424-97451 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | CP045776 | Bacillus paranthracis strain CFSAN068816 plasmid p1CFSAN068816, complete sequence | 129107-129134 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | CP041980 | Bacillus paranthracis strain NCCP 15910 plasmid unnamed, complete sequence | 296476-296503 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NC_016792 | Bacillus cereus NC7401 plasmid pNCcld, complete sequence | 138661-138688 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | MW117966 | Synechococcus phage S-H9-1, complete genome | 132429-132456 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | NC_013085 | Synechococcus phage S-RSM4, complete genome | 71949-71976 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | FM207411 | Synechococcus phage S-RSM4 complete genome | 71949-71976 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_5 | 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR | 1136098-1136125 | 28 | HM452126 | Aeromonas phage phiAS5, complete genome | 16079-16106 | 7 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_KY270853 | Raoultella ornithinolytica strain YNKP001 plasmid pYNKP001-dfrA, complete sequence | 37339-37370 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_KX839207 | Klebsiella pneumoniae strain KP1814 plasmid pKP1814-1, complete sequence | 106205-106236 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP021328 | Raoultella ornithinolytica strain Ro24724 plasmid pRo24724, complete sequence | 319442-319473 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP025467 | Klebsiella pneumoniae strain JS187 plasmid p187-1, complete sequence | 229082-229113 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP019048 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain RJA166 plasmid pRJA166a, complete sequence | 17455-17486 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NC_018107 | Klebsiella michiganensis E718 plasmid pKOX_R1, complete sequence | 206727-206758 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP022441 | Klebsiella sp. LY plasmid unnamed3, complete sequence | 191028-191059 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | KU318421 | Klebsiella pneumoniae strain KP04 plasmid pKP04VIM, complete sequence | 37881-37912 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NC_023911 | Raoultella planticola strain KpNDM1 plasmid pKpNDM1, complete sequence | 256422-256453 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP025964 | Klebsiella pneumoniae strain WCHKP34 plasmid pIMP4_LL34, complete sequence | 172857-172888 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP038277 | Raoultella ornithinolytica strain WLK218 plasmid pWLK-238550, complete sequence | 221440-221471 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP024641 | Klebsiella michiganensis strain F107 plasmid unnamed1, complete sequence | 281239-281270 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | CP027603 | UNVERIFIED_ORG: Klebsiella pneumoniae strain AR_0080 plasmid unnamed, complete sequence | 71493-71524 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP046614 | Klebsiella pneumoniae strain WCGKP294 plasmid pWCGKP294-2, complete sequence | 37800-37831 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP026014 | Klebsiella variicola strain 13450 plasmid p13450-1, complete sequence | 118204-118235 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP026019 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence | 275327-275358 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_MF344561 | Klebsiella pneumoniae strain 11219 plasmid p11219-IMP, complete sequence | 38947-38978 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_MF344566 | Klebsiella pneumoniae strain A324 plasmid pA324-IMP, complete sequence | 37553-37584 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_MF344562 | Klebsiella pneumoniae strain 12208 plasmid p12208-IMP, complete sequence | 40101-40132 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_MF344567 | Klebsiella pneumoniae strain A708 plasmid pA708-IMP, complete sequence | 37881-37912 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_MF344563 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-VIM, complete sequence | 37792-37823 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_MF344564 | Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence | 38947-38978 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP026369 | Klebsiella quasipneumoniae strain A708 plasmid pA708-1, complete sequence | 83124-83155 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NZ_CP028952 | Klebsiella aerogenes strain AR_0161 plasmid unnamed, complete sequence | 436045-436076 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | MN661402 | Klebsiella quasipneumoniae strain KP18-31 plasmid pKP18-31-IMP,KPC, complete sequence | 222862-222893 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053183_2 | 2.1|755966|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 755966-755995 | 30 | KC139649 | Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds | 9669-9698 | 9 | 0.7 |
NZ_CP053183_2 | 2.1|755966|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 755966-755995 | 30 | KC139636 | Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, and hypothetical proteins genes, complete cds | 9669-9698 | 9 | 0.7 |
NZ_CP053183_2 | 2.1|755966|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 755966-755995 | 30 | NC_025443 | Salmonella phage 9NA, complete genome | 7835-7864 | 9 | 0.7 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | NC_010371 | Finegoldia magna ATCC 29328 plasmid pFMC, complete sequence | 149144-149175 | 9 | 0.719 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | MN103543 | Pseudomonas phage vB_PaeM_PS119XW, complete genome | 261900-261931 | 9 | 0.719 |
NZ_CP053183_8 | 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1730659-1730690 | 32 | MK599315 | Pseudomonas phage PA1C, complete genome | 261289-261320 | 9 | 0.719 |
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NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NZ_CP009062 | Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-1, complete sequence | 16532-16563 | 10 | 0.688 |
NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NZ_CP018749 | Borreliella garinii strain CIP 103362 isolate 20047 plasmid lp28-7 | 15178-15209 | 10 | 0.688 |
NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NZ_CP028869 | Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-7, complete sequence | 11910-11941 | 10 | 0.688 |
NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NZ_CP028878 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-7, complete sequence | 4741-4772 | 10 | 0.688 |
NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NZ_CP028879 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-9, complete sequence | 11876-11907 | 10 | 0.688 |
NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NZ_CP017215 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp28_6, complete sequence | 11994-12025 | 10 | 0.688 |
NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NC_018987 | Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_lp28-6, complete sequence | 12713-12744 | 15 | 0.531 |
NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NC_017412 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7, complete sequence | 17252-17283 | 15 | 0.531 |
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NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NC_015920 | Borreliella bissettii DN127 plasmid lp56, complete sequence | 16601-16632 | 15 | 0.531 |
NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NC_011779 | Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2, complete sequence | 16934-16965 | 15 | 0.531 |
NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NC_001852 | Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp28-2, complete sequence | 16891-16922 | 15 | 0.531 |
NZ_CP053183_9 | 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder | 1970996-1971027 | 32 | NZ_CP017219 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp56, complete sequence | 14876-14907 | 15 | 0.531 |
1. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NZ_CP040462 (Enterococcus sp. M190262 plasmid pM190262, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer aattttcaaaaagatatcctacagacaa Protospacer .* *********** **.**********
2. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to CP003185 (Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 plasmid pMU3262, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer aaatttcaaaaataaattctaaagcaaa Protospacer .*********** ******** ** **
3. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NC_019956 (Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795 plasmid pTHETHE01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer aaatttcaaaaataaattctaaagcaaa Protospacer .*********** ******** ** **
4. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to JX238501 (Bacillus phage phiAGATE, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
---gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer cttgaa---gaaaaagaaattatacagacaa Protospacer *** *********** *********
5. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NZ_LT984809 (Cupriavidus taiwanensis isolate Cupriavidus taiwanensis STM 8555 plasmid I, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer aaatttcaaaatgaaattctgcagtgga Protospacer .********** ********.*** .*
6. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to KM359505 (Prochlorococcus phage P-TIM68, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer ctatttccaaaagaaattatacagatca Protospacer ***** ********** ******. *
7. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to MH617769 (Siphoviridae sp. isolate ctjc_2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer gaagttcaaaaagaaattctattaaaat Protospacer *** *****************. .* *
8. spacer 1.1|639226|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023312 (Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass plasmid p292, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gttaaagaatacagttggtttgcttgcgca CRISPR spacer aagtaagaatacagttgctttgctcgcgcc Protospacer . ************* ******.****
9. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NZ_CP034684 (Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer agatttcaaaaagaaaaactacagaacc Protospacer ..************** *******
10. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NZ_KY940428 (UNVERIFIED: Bacillus sp. (in: Bacteria) strain PUMK-07 plasmid pMK-07, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer agatttcaaaaagaaaaactacagaacc Protospacer ..************** *******
11. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NZ_CP041978 (Bacillus pacificus strain NCCP 15909 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer agatttcaaaaagaaaaactacagaacc Protospacer ..************** *******
12. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NC_011655 (Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_270, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer agatttcaaaaagaaaaactacagaacc Protospacer ..************** *******
13. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NZ_CP029457 (Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer agatttcaaaaagaaaaactacagaacc Protospacer ..************** *******
14. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NC_010924 (Bacillus cereus strain AH187 plasmid pCER270, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer agatttcaaaaagaaaaactacagaacc Protospacer ..************** *******
15. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NC_011777 (Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_272, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer agatttcaaaaagaaaaactacagaacc Protospacer ..************** *******
16. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to CP045776 (Bacillus paranthracis strain CFSAN068816 plasmid p1CFSAN068816, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer agatttcaaaaagaaaaactacagaacc Protospacer ..************** *******
17. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to CP041980 (Bacillus paranthracis strain NCCP 15910 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer agatttcaaaaagaaaaactacagaacc Protospacer ..************** *******
18. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NC_016792 (Bacillus cereus NC7401 plasmid pNCcld, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer agatttcaaaaagaaaaactacagaacc Protospacer ..************** *******
19. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to MW117966 (Synechococcus phage S-H9-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer gtatttcaaaaagaaactctacaattct Protospacer * **************.******. .
20. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NC_013085 (Synechococcus phage S-RSM4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer gtatttcaaaaagaaactctacaattct Protospacer * **************.******. .
21. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to FM207411 (Synechococcus phage S-RSM4 complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer gtatttcaaaaagaaactctacaattct Protospacer * **************.******. .
22. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to HM452126 (Aeromonas phage phiAS5, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer agtcttcaacaagcaattctacagacat Protospacer .. .***** *** *************
23. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY270853 (Raoultella ornithinolytica strain YNKP001 plasmid pYNKP001-dfrA, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
24. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_KX839207 (Klebsiella pneumoniae strain KP1814 plasmid pKP1814-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
25. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021328 (Raoultella ornithinolytica strain Ro24724 plasmid pRo24724, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
26. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025467 (Klebsiella pneumoniae strain JS187 plasmid p187-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
27. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019048 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain RJA166 plasmid pRJA166a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
28. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NC_018107 (Klebsiella michiganensis E718 plasmid pKOX_R1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
29. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022441 (Klebsiella sp. LY plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
30. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to KU318421 (Klebsiella pneumoniae strain KP04 plasmid pKP04VIM, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
31. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NC_023911 (Raoultella planticola strain KpNDM1 plasmid pKpNDM1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
32. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025964 (Klebsiella pneumoniae strain WCHKP34 plasmid pIMP4_LL34, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
33. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038277 (Raoultella ornithinolytica strain WLK218 plasmid pWLK-238550, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
34. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024641 (Klebsiella michiganensis strain F107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
35. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to CP027603 (UNVERIFIED_ORG: Klebsiella pneumoniae strain AR_0080 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
36. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046614 (Klebsiella pneumoniae strain WCGKP294 plasmid pWCGKP294-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
37. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026014 (Klebsiella variicola strain 13450 plasmid p13450-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
38. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026019 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
39. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344561 (Klebsiella pneumoniae strain 11219 plasmid p11219-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
40. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344566 (Klebsiella pneumoniae strain A324 plasmid pA324-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
41. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344562 (Klebsiella pneumoniae strain 12208 plasmid p12208-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
42. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344567 (Klebsiella pneumoniae strain A708 plasmid pA708-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
43. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344563 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-VIM, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
44. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344564 (Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
45. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026369 (Klebsiella quasipneumoniae strain A708 plasmid pA708-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
46. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028952 (Klebsiella aerogenes strain AR_0161 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
47. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to MN661402 (Klebsiella quasipneumoniae strain KP18-31 plasmid pKP18-31-IMP,KPC, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa----- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-----acagcagcg Protospacer ***.******** ********** ***.
48. spacer 2.1|755966|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to KC139649 (Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
49. spacer 2.1|755966|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to KC139636 (Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, and hypothetical proteins genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
50. spacer 2.1|755966|30|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NC_025443 (Salmonella phage 9NA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
51. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NC_010371 (Finegoldia magna ATCC 29328 plasmid pFMC, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer gaaagaatttcaaaaagaaatactctttagca Protospacer **********.********* ** . * *
52. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to MN103543 (Pseudomonas phage vB_PaeM_PS119XW, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer gaaacaattgcgaaaagaaattctgagcaata Protospacer *** **** **************. . * *
53. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to MK599315 (Pseudomonas phage PA1C, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer gaaacaattgcgaaaagaaattctgagtaata Protospacer *** **** **************. . * *
54. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024776 (Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM8, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer caaattaggatttcttttttcgaaatccttga Protospacer ***.*****************.**. *
55. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009062 (Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
56. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018749 (Borreliella garinii strain CIP 103362 isolate 20047 plasmid lp28-7) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
57. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028869 (Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
58. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028878 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
59. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028879 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-9, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
60. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017215 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp28_6, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggcaacagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . * ..******* ****** ********.
61. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NC_018987 (Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_lp28-6, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
62. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NC_017412 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
63. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NC_017419 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
64. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NC_017408 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
65. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NC_015920 (Borreliella bissettii DN127 plasmid lp56, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
66. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NC_011779 (Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
67. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NC_001852 (Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
68. spacer 9.1|1970996|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017219 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp56, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
734288 : 742108
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053183|734288:742108|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTCACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAACCTTGCATTAACATAAAAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTATATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGATAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCACCTAAAGCTAATGTTGTGATAACAGCACCAGCTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTTAGTAAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTATTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATAAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTTATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCTACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAACGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCAGTCATGAGTTTTATATCGCTTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053183|734288:742108|739360_740029_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP053183|734288:742108|740956_742108_+|WP_001217800.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIVRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP053183|734288:742108|735343_736030_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP053183|734288:742108|738939_739359_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP053183|734288:742108|736819_737260_-|WP_001093553.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP053183|734288:742108|738222_738936_-|WP_001062976.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKSDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP053183|734288:742108|740379_740973_+|WP_000604508.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDIINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP053183|734288:742108|734288_735344_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP053183|734288:742108|736004_736478_-|WP_057504528.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIFMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP053183|734288:742108|737539_738124_-|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
754089 : 768599
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053183|754089:768599|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053183|754089:768599|755306_755849_+|WP_000197262.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP053183|754089:768599|760010_760877_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP053183|754089:768599|757466_757568_+|WP_031760357.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP053183|754089:768599|757645_759151_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP053183|754089:768599|765732_765888_+|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP053183|754089:768599|764261_765233_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP053183|754089:768599|765926_766898_+|WP_000876317.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMEGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP053183|754089:768599|754089_755148_+|WP_000663039.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISSHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP053183|754089:768599|767837_768599_+|WP_000616873.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQTILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP053183|754089:768599|766884_767841_+|WP_001245572.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFIITLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITIFLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP053183|754089:768599|756456_757374_-|WP_000429011.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP053183|754089:768599|759490_759991_-|WP_170833322.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIKLMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP053183|754089:768599|762038_764144_+|WP_000855509.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYSVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP053183|754089:768599|761677_762076_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
849256 : 870760
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053183|849256:870760|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP053183|849256:870760|856794_856941_+|WP_000784875.1|DBSCAN-SWA MKMYLAYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYAWLITLGCNLTGGLENE >NZ_CP053183|849256:870760|868818_869670_-|WP_001183851.1|DBSCAN-SWA MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NZ_CP053183|849256:870760|862328_862907_+|WP_000846285.1|DBSCAN-SWA MKTESYFKEYNQFVIDQQKAIQELKQERNALESKIKIDKSTYKQLIMDGQDDKADNLYQATDADEKKLKALNKRLETKKSVSKEVKYQKTIELLKHQSELSSLYESEKQSALGKLKKVVDAYNEIIDEIEDINDRYEDEHQQYASIYSQEQLYDDKEAREALNGYFRENIFTSYINGNDLPYEHNNKLFLKR >NZ_CP053183|849256:870760|849256_850282_+|WP_000571213.1|DBSCAN-SWA 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MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGSKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP053183|849256:870760|855729_856062_-|WP_001260004.1|DBSCAN-SWA MRTNDEIITIIKTSMKEQNMSLSELARRVGVAKSAVSRYLNLTREFPLNRAEDFAKVLGIKTEYLLGFAEREESTKQDTIAAHLDGDFTEEELIEIRKYAELVRKAHRNQ >NZ_CP053183|849256:870760|856510_856783_+|WP_000091731.1|DBSCAN-SWA MSRTKLHDVPAKENTITEPKQVVVNPLFAKPNALASIFGISYSSVNRILKEWEKDSKGVDDLYYSLSSTMIVISIPRFEEYMKARHKKWM >NZ_CP053183|849256:870760|866970_867081_+|WP_000139423.1|DBSCAN-SWA MTEQMYLILFLLSLPLLLFIGRKTHFYCLDKKNGRR >NZ_CP053183|849256:870760|861975_862317_+|WP_001190615.1|DBSCAN-SWA MQSIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIITTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIKV >NZ_CP053183|849256:870760|868391_868586_+|WP_000752917.1|DBSCAN-SWA MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >NZ_CP053183|849256:870760|853260_853989_-|WP_000733774.1|DBSCAN-SWA MKKLISILLINIIILGVSNSASAQGDIGIDNLRNFYTKKDFVDLKDVKDNDTPIANQLQFSNESYDLISESKDFNKFSNFKGKKLDVFGISYNGQCNTKYIYGGVTATNEYLDKSRNIPINIWINGNHKTISTNKVSTNKKFVAAQEIDVKLRKYLQEEYNIYGHNGTKKGEEYGHKSKFYSGFNIGKVTFHLNNNDTFSYDLFYTGDDGLPKSFLKIYEDNKTVESEKFHLDVDISYKETI >NZ_CP053183|849256:870760|867082_867268_+|WP_001286805.1|DBSCAN-SWA MSDYKLKIIELIKSDITGYQIHKQTGVAQYVISQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYSYARQVL |
32 | Staphylococcus_phage(76.92%) | coat,terminase,integrase | attL 847563:847584|attR 868229:868250 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
959161 : 1004886
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP053183|959161:1004886|DBSCAN-SWA 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39 | Streptococcus_phage(33.33%) | tRNA,bacteriocin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1037092 : 1045565
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053183|1037092:1045565|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053183|1037092:1045565|1037561_1038686_+|WP_001010401.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISSQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETCECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP053183|1037092:1045565|1039658_1040330_+|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP053183|1037092:1045565|1043967_1044996_+|WP_000030810.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDLFLEPTKLYVKPVLTLKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGDIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP053183|1037092:1045565|1039393_1039657_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP053183|1037092:1045565|1044998_1045565_+|WP_000238670.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP053183|1037092:1045565|1040322_1042512_+|WP_000032747.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP053183|1037092:1045565|1038689_1039394_+|WP_000174047.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKNLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATSANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP053183|1037092:1045565|1037092_1037575_+|WP_000861570.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP053183|1037092:1045565|1042490_1043975_+|WP_000483727.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1303426 : 1308376
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP053183|1303426:1308376|DBSCAN-SWA TATGAATTGCTATGATGAAATATACAATACAATCAAAAAATTGATAGAAAACAAAGAGATAACGAGTTATCAAATTAATAAAGATACAGGAATAAGTTACGGTAATATTAATGCTATGCGCCGTGGAGAAAGAAGAATAGAAAATTTAAGCTTAAAGAATGCAAAGATCTTATATGAATATGCGAAAAAGGTATTATAATATAAGCATTGAGTTCAATAGGCATACAATAACTGCCCAAACTAGTGACTGAGTGGGAGTTTTTATAGTATTAAAAGTTTTCTAAAAGCGAAAGAAATCATGTTTACTGATTTACTTATGTTTTTAGAAATAGTATAATAATTTTATATAATATATAGAACTTCAGTATACCTTTTGAGTATATATGGAGTTCTTTCTTTTTTACAAGATGTATATGTATAAATGGAAATGTTTATTACATTACATAAAAACCTTTAGGTGCTCTTAGATGGATGTTAATCATAAAACAAAGAGATTTTGAAAAATATAGGCTATTATAATTTAGAATTACAAATTATTAATCTTGCCATTGGATATGGGAATTCAAACATATCACTTACTCCAATTTGTGGAATGTTAAATAACTATAAAGAGGAAAGGAGAAAAAATGATAAGAATGGTTAAAGAAAAAGAACGAATAGCAAAATTAAATTTCGAATAGCTGTGACGAGCTTAATAATTCAAGTACTTAATTTTATCAAATCGTTCTTTTAAAAAGGCAAAGGGCAAAAGACCTTTACCACATTAAATAGGGAGGTGGTATTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTACCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACTAGAAAAAAATAAACTATTCTTTCATTTTGACAAAAATAATGAACCAGTTTAAAGAAATTTATAATACAATAGAAAAATTACTAAATGATAAATCAATATCTAATTATAGAATTAATCAAGACACTGGTGTTTCTTATGGTGGTATAAGTGAATCAAGAAGCGGGAAAAGAAAAGTGAATAATTTAACTTTAGAAACAGCGGAAAAACTCTATAATTACCAAAAACAATTAGAAATAATGATTGAAGATTAAAATAAGGCCATATCTTTTGAAATATCATGGAGTGAGCCTTTTAAATCATATAATTTTAAAGTATATTAAAGATGGATAGCTTAATGTGAATATAAATAAAAAATTATCGAATAATATAATATAGAATATATGAAGACAAGAAATTTTATCAATATATAATAAAAAAAGCCAATACTATTAGGTATTAGTTTTTGAATTAACTAGTTTGGCAACTACAAAGAAACAATGTATTGCTAAACGTAGTTACTGCATTAGGATTATTATAATTATAAATAGAAAGAGAGCGTGATTAAAAATGAATGAGATTGAAACTATTATAAGTGAAATAGAAAAGTTATTAACTAACAATACACCATATAGTATTTCAAAAAACTCAGGTGTACCACGTCAAACAGTTACTGATTTAAAGGTAGGTAATACTAAAATAAAGGATGCCAAATTTAAAACAATAATCAAGTTATACGAGTATCAAAAGTCGTCAGAAAATAATTCAGAGTGCTAATAAATATACCTTGTTTGATTAGGTGGACAAGAAATTAAATTTCTAATGATTTCATGGTTGTCTGTCCACGCTTTGTCCACCTCAATAAAATTATCTCTAGGTTTTTAAAATTGTACATGTTTAAACAATCAAAAGTATGCATTATTATATTATCATTTCCATAAAAATTTAAATGATCTTTAAGTGATGATATAAAAGGCTGAACATAGTAAATAAGTTAACTTTAATGCAGCATACTATACATATTTTATAATAATGTTTATGCACATAATTTTTTATTGACAATTTTTTATATTAAATTGTGTAATTGGCATATATGATGATTTGTGATAATTATATTGTAATATAGCATTTGGTTTTATGATTCTAAAATTAATAGATTTGAAAAGTATACTTTATTTCATGAAAGTTTTTGGTACATTTATTTGAAAATGTTTTTATTACAAAGTTACATGGCTAAATGTTTCTTAACAAAATTAATTCATCGAGTGTAAAGAATCGTGTGGTAAACATAATTTATATAGATTATAAGGAGGTGAAAATGGTCGAGGAAGTAAAAACGATAAAATAGTTTGAATGTTTTGATTTCAATTCTGATAGGACTATTGAATTTGCAAACTAATAAGAATGTGAGGTTTGATTTAATTCGAAGTCATATTCTTTGAATAAAATATTACTTTCTTACCATTAGTAAAATGAAGATGACTATTAAAGTGCGAAAAACAAATAAAAAAGAGAAAATAGAATTTTTAATAGGGACGTTTATAATTATTCTAGTAATATTAGGCTTCAAAATTATGAAATAAATGTATAGTATTTGAGAAGTCTATATGACTCCGGAAAAATTAAAGTCTAAAGATATTTCAATATCTCAAATTTAATAGACTACTGGAATTAGTAGTTTGAATATTGAAAGACTCTAATCTAATAAAAATACATAAAAGGTTAAACTTTAGAAGTGGTTGTAAACTTCAATGAATACTAAACATTGAAGTTTAGTAAAAGGCGTAAGGTATACAAGACAAATCGTTTGTCTTTGACAAAGTAATTGATGATGTAAAGTCGTTAATATGTAGAAACAAAAATTGAAAATATGAAATTTAACTATTATGAAGTGATGATAGCCATTAATGAATAGAAAAATAATAAAATCATTTATAAATAAAAAATACGTTAAGTTCACAGAATTTCGAAAAAAAGCAGTAAACATTGTACAGATATGGAGATGAAAAAAATGTCAGAATACAAGAAAAAGATAATTGAATTAATTGAAAGTAATTTAACAGGATATGAAATTTCTAAAAAAACTGGAGTTTCTCAATACGTACTTTCACAATTAAGACAGGGCAAACGCGAAGTAGATAATCTAACCCTGAATACAACAGAAAAATTATATGAATATGCCAATAAAGTTTTGTAATATAACTACTGTATAAATTAATCAAGCTATGTTTATTTGATTTAACTATTAATAAAAATCATATGGTGAATGGATATTATAATAATTAAAATACAAAAATAGTAGATTCCAATTTGTGAAAAAGGAGTATGTTGTTTCATTTAGAATTTATTGCACGAAATTAGCATCGAATAAGGGAAAATAAGTGTTAAGTTTTAAATGATAAAAAAGATTGGAATGGATCGTCTTGAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTCGAAGGGGGCATTTCCATTAAATTGTTATAGCTTTTTATATTTGTATAATGAACATATAAGTTTAAGAAGATGCGAGTGAAGGAAATAAAAAAGCTCAAATGTACCAAATTGTTAATCTTAATAAATCTCTACTTTATAAAGATTGAATGGACATTCGAGCGTTAATCAGTCAGGAGGGAATTTCACTCCTACAATTTAATAATAATACTTGCTTCACCACTGTACAAGGAGTGATTTGTTATGTTCAAAGTGAATTATTCGATTTTAAGTTATTATCCAGAATATAATATCGCAGTAAGTTGGCAACGTTTAAGAGAAGGAAAAATAATAAAAAACAAGATTTAATACTGCTGCGTCATGAGGCGCTTGAACATTATTTGATGAATAAGTATAATTACAACTATGATTATGCACATAAAATTGTATCAAAAAATACGATTATTCAATTTTTATAAAAATAAGGTGGATTAAATGCTTACATTAATAAAATTGAAAGAAGATGAACAGGTTATAATATATGAATATATACCTGAAGATGATATAAGTAACGGTAAAGGTTCAGTAACTTTTAATAAAAAAGATGCAGAGGTTATAGATTTTTCATTATCTGAAATAGAAAATGAAGAATATTTTATGTTATATCGTAATAAGTCTTTTTCTGTAGTAAGAGACTTTATCGAGAAGCAAGAATTTCCCGAAAATTATAAAATAGCTTGGTATTAAAGCATCCTTTCTACACAGATAAAGAGAAAGTGGTGCTATTTTTATACACTTTTTTAACTATTTACTGAAATAGCAGAATCACAAAAGTTAACATATTTAAAAGAACTTGGTGAAGATGGTGAATATAAATATGTTGCCAAAATAGATAGTGAAACATCTAAATTATGTCATTCACTCAACGGAAAAATATTTAAAGTTAAAGATATGATACCAGGTGTGAATGCGCCACCTATGCATCCTTGGTGTAGAAGTACCGCAGTGCCATATGTCGGCAAATGGCGAGACAAGTTCTTTAAAGAGCGTGAAGGTAAATATCAGGTAGAAGTAAAAGAAGCAAAATTACAGGAAAAAGCTAAAAACCAGATGAAAGAAATGATTGAAAGTGGTAAAATAAAAATAGAAATAAATCCTGAAAAACAGAATAGACATTCTTTAGGTCATAGACTATACGAAGAATATAAAAAAAGAATTTGTTGAAAGGAAAACAAACACCGAGTTATACACTACTAAAAAATGATGAATTAAATAAAATGCTAAATCAAAAATTTGGCACTGGACGGTTGATTATTGAAAATGAAAGAAAATGGAAAAATAAAGAAATAATTAATTTTGGTCAAATTATAGGAAAATATTACATAGATGGAAAATTTATAGAAACTAAATGGGGTACTGTTCATTATTCCAAAACTGGTAGTCATATTATTCCAAATGGAAAGGAAGGTAAGTAATGAAGTTATGGACTTACATTGGTAAAAAAGTAATGATCGAGTTAACTAATGGGCAAAAATTTATTGGAGAAGTTACAAATTATGACGATGAAATAGATAACGAAAGTGGAGAAGATTCTATACATTTAGATGACGGAATAGATTTATATGATTTTGATGAAAGCCAAATCAAATATATTGAAGTTTTAAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP053183|1303426:1308376|1306971_1307076_+|WP_000477491.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPEYNIAVSWQRLREGKIIKNKI >NZ_CP053183|1303426:1308376|1304313_1304538_+|WP_078065144.1|DBSCAN-SWA MTKIMNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTGVSYGGISESRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >NZ_CP053183|1303426:1308376|1308181_1308376_+|WP_000780597.1|DBSCAN-SWA MKLWTYIGKKVMIELTNGQKFIGEVTNYDDEIDNESGEDSIHLDDGIDLYDFDESQIKYIEVLK >NZ_CP053183|1303426:1308376|1303426_1303624_+|WP_001659797.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIYNTIKKLIENKEITSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL >NZ_CP053183|1303426:1308376|1306274_1306460_+|WP_000006110.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >NZ_CP053183|1303426:1308376|1307202_1307454_+|WP_000956747.1|DBSCAN-SWA MLTLIKLKEDEQVIIYEYIPEDDISNGKGSVTFNKKDAEVIDFSLSEIENEEYFMLYRNKSFSVVRDFIEKQEFPENYKIAWY >NZ_CP053183|1303426:1308376|1304833_1305040_+|WP_001002343.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGNTKIKDAKFKTIIKLYEYQKSSENNSEC >NZ_CP053183|1303426:1308376|1305735_1305846_+|WP_001788716.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >NZ_CP053183|1303426:1308376|1307927_1308182_+|WP_001813273.1|DBSCAN-SWA MKGKQTPSYTLLKNDELNKMLNQKFGTGRLIIENERKWKNKEIINFGQIIGKYYIDGKFIETKWGTVHYSKTGSHIIPNGKEGK |
9 | Staphylococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1580863 : 1589175
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP053183|1580863:1589175|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCTATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAACAAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTATTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACTTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACAATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAACGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCCGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCACGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATGCCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTCTATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACACACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTGCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTTTCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAGTGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCATCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCCGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGCGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACTCGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAACAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAATATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAACTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGTACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGATCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAACTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAACTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATTATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP053183|1580863:1589175|1580863_1581649_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP053183|1580863:1589175|1584134_1585235_-|WP_000683914.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVAVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGVSNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_CP053183|1580863:1589175|1586045_1587152_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP053183|1580863:1589175|1587375_1589175_-|WP_001217251.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPASYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERSFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNIINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP053183|1580863:1589175|1581774_1582665_-|WP_000924210.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDCFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP053183|1580863:1589175|1585237_1585915_-|WP_000624567.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVERIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP053183|1580863:1589175|1582674_1584021_-|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1659817 : 1668860
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP053183|1659817:1668860|DBSCAN-SWA TTTATTCGTCGTAAGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATTTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATACACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAAATTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATCGACGTAGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGTTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGCAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGTGCGGCGATATTACTTTCACCAAGCGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACCGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTATCAATATCCATCGTCATACCTGCTGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCATTTCTGCCATTGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATCTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATTGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGAATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGTTGGTTTATTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTCTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATCATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATAAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTGTTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCTGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAAGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAATGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTTATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAATGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTGAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP053183|1659817:1668860|1666828_1667854_-|WP_001019166.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFKPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGYRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP053183|1659817:1668860|1665387_1665648_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP053183|1659817:1668860|1662833_1665113_-|WP_000749798.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGMMKKRQLKKSPKQKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP053183|1659817:1668860|1660357_1662631_-|WP_000594983.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLNKPTEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDSLQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAEMKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIDNIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLNFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP053183|1659817:1668860|1667855_1668860_-|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP053183|1659817:1668860|1665666_1666806_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP053183|1659817:1668860|1659817_1660336_-|WP_000364543.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1794837 : 1892953
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP053183|1794837:1892953|DBSCAN-SWA 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115 | Staphylococcus_phage(95.19%) | holin,head,tRNA,terminase,portal,protease,tail,capsid,integrase | attL 1847853:1847869|attR 1899909:1899925 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2635264 : 2671466
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP053183|2635264:2671466|DBSCAN-SWA 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35 | Streptococcus_phage(44.44%) | holin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053183.1|WP_031879102.1|1876270_1876519_-|DUF1024-family-protein |
1876270_1876519_-
Protein sequences of NZ_CP053183.1|WP_031879102.1|1876270_1876519_-|DUF1024-family-protein>NZ_CP053183.1|WP_031879102.1|1876270_1876519_-|DUF1024-family-protein MNNREQIEQSVISASAYNGNDTEGLLKEIEDVYKKAQAFDEILEGLPNAMQDALKEDIYLDEAVGIMTSQVVYKYEEEQENE |
82 aa aa | NA | NA | NA | 1794837-1892953 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.1|1136098|28|NZ_CP053183|PILER-CR matches to NZ_CP053183 position: 1824140-1824167, mismatch: 2 gaatttcaaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer gaatttcgaaaagaaattctacaaacaa Protospacer *******.***************.**** 2. spacer 8.1|1730659|32|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053183 position: 1824136-1824167, mismatch: 1 caaagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer catagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa Protospacer ** ***************************** 3. spacer 11.1|2278339|25|NZ_CP053183|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053183 position: 1818968-1818992, mismatch: 1 tgtcagcttctgtgttggggccccg CRISPR spacer tgtcagcttctatgttggggccccg Protospacer ***********.************* |