Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053421 | Pediococcus acidilactici strain PMC65 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas9,cas1,cas2,csn2,DEDDh,DinG,cas3,csa3 | 0 | 2 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053421_1 | 421806-422171 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053421_1
|
5 spacers
spacers of NZ_CP053421_1
>1.1|421842|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTTACAATTCCGTGCAACAGGGTTGAATT >1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGAACAACTAAATGAAAAACCTAAGCGAA >1.3|421974|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAGCAGATTGTTGAAGTGTTGCAATACTT >1.4|422040|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACCCGTTGGTTATATCACACCTATGGGC >1.5|422106|30|NZ_CP053421|CRT GTGGCTGGTTAGTTTGGGTATCTAAGGGAG |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053421_1
The CRISPR arrays of NZ_CP053421_1 >merge|NZ_CP053421|1|421806-422171|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCCGTTACAATTCCGTGCAACAGGGTTGAATTGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCTCGAACAACTAAATGAAAAACCTAAGCGAAGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCACAGCAGATTGTTGAAGTGTTGCAATACTTGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCTTACCCGTTGGTTATATCACACCTATGGGCGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGAGCGTGGCTGGTTAGTTTGGGTATCTAAGGGAGTTTTCAGAAGGGGAATAAAGTTAAATGGAAGTCATA >NZ_CP053421|1|1|421806-422105|PILER-CR GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC CGTTACAATTCCGTGCAACAGGGTTGAATT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TCGAACAACTAAATGAAAAACCTAAGCGAA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACAGCAGATTGTTGAAGTGTTGCAATACTT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TTACCCGTTGGTTATATCACACCTATGGGC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGAGC >NZ_CP053421|1|1|421806-422105|CRISPRCasFinder GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC CGTTACAATTCCGTGCAACAGGGTTGAATT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TCGAACAACTAAATGAAAAACCTAAGCGAA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACAGCAGATTGTTGAAGTGTTGCAATACTT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TTACCCGTTGGTTATATCACACCTATGGGC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGAGC >NZ_CP053421|1|1|421806-422171|CRT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC CGTTACAATTCCGTGCAACAGGGTTGAATT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TCGAACAACTAAATGAAAAACCTAAGCGAA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACAGCAGATTGTTGAAGTGTTGCAATACTT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC TTACCCGTTGGTTATATCACACCTATGGGC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGAGC GTGGCTGGTTAGTTTGGGTATCTAAGGGAG TTTTCAGAAGGGGAATAAAGTTAAATGGAAGTCATA
>NZ_CP053421.1|WP_166481339.1|421105_421777_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MKLTYRTHEPVEIKPHAITVLGTNNSTVYIDLVNGMQERNELILAFDENYKELEISKVFDWIGDVGTQDLVIQKYLTKIERVFAEGLVDEQRNQIHDQVNQLFNTVAEQLFMLDLPISVSYDFDLKKLLKYCGVHFDPLSVGNPYGIIEAILKIHEECAINSCVVLTNVAHYLTATQIEELTQLVSQTNQALLLIEFTEIGNQEAYGNSEFYYIDNDFVDWHR >NZ_CP053421.1|WP_159208909.1|420803_421109_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMIMFDLPVETAVQRKQYRQFRKALINEGFLMIQYSVYVRVCVNKKSTTFMENRIKTYLPENGTIQALTLTEKQYNDMHFLVGERVKDVRNTSDRTVIL >NZ_CP053421.1|WP_166481338.1|419920_420826_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRSVIITQHAKLSYSAHAMIVQTNDGINQIPVDDVSLLLISTTQAVITTALISELSKKNVKIVFTDEAREPISEIYGYYPANRTAQLLREQVNWDSELQQILWTKLVANKIINQINVLNLLEHSTDELVTELEKLELNDLTNREAVVAHKYFPLLFESGFTRRDGSVINAALNYGYSILLSAVNQEIVANGYVTYLGIHHDSEENQFNLASDLMEPFRPVVDCWVANQKFNQLTPDIKYGLVELLSLELKYNGKKTILRNAITDHVRNCLKYLAGKANSFTIEMELSDEVPNNAINDNV >NZ_CP053421.1|WP_171461261.1|415604_419705_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MGDRKYNLGLDIGKSSIGFAAVDENNQPIRVKGKTAIGVRLFEEGKTAADRRGFRTTRRRLSRRRWRINLLNGIFDAHLAEVDPTFLARLKESNRSNLDPKKSFQGSLLFPERKDYQFYKEYPTIYHLRKALMEKDRKFDIREIYLAVHHIIKYRGNFLNGTPMRSFKVENIELDTLFDRLNQLYEEIIPDNELAFDLEQVADVKEVLSSTTIYKMDKKKQLVKMMLLPASNKALHSENKKIVTQFVNAILNYKFKLDVLLQVETDADWSLKLNDEGADDKLEEFTGDLDENRLEIIDLLQRLHNWFSLNEITKDGNSLSAAMVEKYKDHRHHLELLKKVIEDHPDAKKAKALKETYTAYVGKTDDKTQNQDDFYKAVEKNLDDSPDAKEIKRLIQLDQFMPKQRTGQNGAIPHQLHQQELDQIIEKQSKYYPFLAEPNPNVKRRKDAPYKLDELIAFKIPYYVGPLVTPEEQAQNKENVFAWMKRKAAGPITPWNFDEKVDRMESANRFIRRMTTKDTYLFGEDVLPAESMIYEKFVVLNELNNLKINGRHLSLKDKQDIYNDLFKQQKTVSIKALQNYYVTKKKAATAPTVGGLADPKKFLSSLSTYIDFKNMFGERVNDPQFQENLEQIVEWSTIFEDRGIFKAKLQALGWLSEKQIQQLVAKRYKGWGRLSKKLLTGLKNAEGYSILDEMWRSTENFMQIQSRPEFAALIQQANEKQFEGNDPNNVWENIENILGDAYTSPQNKKAIRQVVKVVQDIEKAVGNPPEKIAIEFTREAAANPQRTQSRLRTLEKLYESAEEVVDAGLTAELAEFKENKHVLSDKYYLYFTQLGRDVYTGDRIRLDQLNDYDVDHILPQSFIKDDSLDNRVLTIRAVNNGKSDNVPVELFGKKMSSFWRRLLDNGMISKRKYNNLITDPDNISKYAQKGFINRQLVETSQVIKLTANILNGIYDKDTEIIEVPAKMNSQMRKMFDLVKVREVNDYHHAFDAYLTIFIGNYLYKCYPKLRPYFVYGKFKKFSDNEDIEVGDGRFNFLNRIERLKNVTDPETGEILWSNVAPNETIKRIKKVYNYKFMIVSREITTRRAELFNQTVYPKNYRGKLIPIKEDRPTDLYGGYSGNTDAYLAIVALEDKKKGKYFKVVGIPTRAAAKLEKLKQQDSQQYLQALHEVIAPQFTKSTKKGIKKAEFEIVLDKVHYRQLVQDGPVKMMLGSSTYKYNAKQLVLSEKALQVIADDRKFDETQKDDNLIAVYDEILSIVNQSFDLYDINGFRKKLNDNRNQFIDLPAETKYEGRKVVAHGKREMILEILKGLHANASFGNLKPIGFATPFGQMQSKNGIELSENAFLIHQSPSGLFERKIKLSDL >NZ_CP053421.1|WP_075139704.1|414839_415421_-|hypothetical-protein MKKIASIAILAVLPLTLASCGNHSTSNSDTSSNSSKTEKVAKSSSKSSVSKDAKSSSDDKATSSSASANSSKDSTNSNSSSNSNSASSSTSSVTDSSSSADNQMSRSDLTKAEKKNGNRPLADEKIQNEQAAVALLTEKYGNQNWKVAFSSIGKSSPIYFHITSPKHGSYYVYANGDVQSADGDLSNHQIVNK >NZ_CP053421.1|WP_166481337.1|412077_414612_+|ERAP1-like-C-terminal-domain-containing-protein MANIERFYTKFHPTNYQIKLAISRETKEIKGTTTITGEALSSQIDIHQKDLQIEELRVDGTAGDFTVDQAAEAIHVKLPHTGTVTLEIKYTTKLTNTMMGIYPSYYEVNGETKQLVGTQFETTFARQAFPCVDEPEAKATFDLAIKFDEHPGEVVLSNMPETKVEDGYHYFARTVKMSTYLIAFAFGDLQSKQTKTKSGVQVGVFATKAHQPQELDFALDIAKRAIEFYEDFYQTPYPLPHSWQLALPDFSAGAMENWGLVTYREAYLLLDPKNTTLRTKQVVATVIAHELAHQWFGDLVTMQWWDDLWLNESFANMMEYVAVDALEPEWQIWELFQNSEAGAALQRDATDGVQSVHVQVNDPAEIDALFDGAIVYAKGARMLVMVRALIGDDALRQGLQKYFASHQYGNATGNDLWQALGEAANMPIGDIMHTWLDQPGYPVVTAQVENGDLVLEQQQFFIGEGQAQQRQWQIPLNGNYAEVPALLQTKTLNLGNYQDLRDQNQQPFRLNVGNSSHFIVRYDQRLLDDILADWEQLSAIDQLQLLQDLRLLAEGKQISYAEIVPLLPRFAKTDSALVTEMLYRVANDLKKFVAPQSSAEKQLKKFFGELSQAPAQRLGWQAAAGETNDDQLMRPMVLKAALYAENSAVTAQAHQLFEENEAQLPKLPAAIRSLVIRNEVEHFGSPELFARLLKEYQRTSDASYKSDLCQALTATPSLPLIQQLVQQFENAQVIKPQDLRAWFRGVLANPQGQGPAWNWIRDEWQWLEDTVGGDMEFATYITVIAGIFQTPTRLAEFKAFFEPKLATPGLTREITMDIKVIETRVALIETERDAVQAAVVQAIK >NZ_CP053421.1|WP_166481336.1|410641_412051_+|MFS-transporter MEAQNTRHTNPMIVVAVVALMSFMGILTETSMNVTFPALMKEFHVPLNTVQWVTAGYLLMAALVMLTSAYMKRRFTNRQLFTAAAILFSSGDLICGLATNFWVLLAGRLIQAGCVGLCTPLMVNIILDVVPQHKLGTYIGMANLIILIAPALGPTFGGAVVAFNSWRMIFWSTLPVALVLMLLGMKVIKQYAPTDQHYAFDWTRFLLLGMALVSLIVGLNALGEMQLGTFVGLLIVSIGLTILFVKRSHTATKALFSLQVFKQPAFLYSFLPYIMLQFANVGINFLLPNYVQDVFQATSLVGGLILLPGSLFNGFGQPLYGWLLDRFGGKVPLYTGDLLFTLALVGLMCWGPQLGVVGITIAYLIFAIGRSMAFGNSVAYGLKHIDKEFQNDANALYNTGQQVTGAIGTTVLAILMGSVKRPGYTHAQNVSAGSQLAFILLVIFGCVIFVFFHHLVNLKNLPEDKGVDL >NZ_CP053421.1|WP_058121014.1|409805_410450_+|SDR-family-oxidoreductase MAKIFIAGGSGRVATALIKNLVADSNEVVAGARHPENVVEMDHVNAVKLDLHDGVDAIADLMKGSDAVYFTAGSRGADLLQTDAMGAVKTMQAAEKLGIKRYVMLSSLYTLESERKWHEGGLADLLDYTTAKFFADNYLVHDTDLDYTIVQPTSLTEEAGTGQIYIGKDLPQKTNPIPDVAKVLADVLKHPNTVKKVFMMSSGSQAIDQALANV >NZ_CP053421.1|WP_166481335.1|407968_409522_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MANTDLSNFDKIIVLDFGSQYNQLITRRIREFGVYSELLSHKITAEEIKQINPKGIIFSGGPNSVYDDDAFRVDPEIYQLGIPILGICYGMQLMAYNLGGRVESADNREYGHADINVTDDQAALFKGLPATQTVWMSHGDLVREVPAGFKTVATSANCPIASMADDERKFYGVQFHAEVRNTQYGNDILKHFAFDVCQAQANWSMNDFIDMQVEKIREEVGDRKVLLGLSGGVDSSVVGVLLNKAIGDQLVCIFVDHGLLRKGEAKQVMDSLEGKFGLNIIKVDAQDRFLSKLAGVTDPEQKRKIIGNEFIEVFNDEAQKLKGIDFLAQGTLYTDVIESGTDTAQTIKSHHNVGGLPEDMHFELIEPLRTLFKDEARDLGEKLGMPEDLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLQIVRDSDLILREEIKNAGLDRDIWQYFTVLPGIRSVGVMGDGRTYDYTVGIRAVNSIDGMTADFARIPWEVLQKISVRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPATVEWE >NZ_CP053421.1|WP_166481564.1|405979_407842_+|heavy-metal-translocating-P-type-ATPase MIKMQRWFTRFANPLLGVAALLTATGWLLQHGGGSPEVAGMAYGIATLVAGMPILLKAIAALRARVASIELLVSIAVLGALIIGELEEAAMVTFLFGLGNYLERRTLKQTHRALANLTEMQPTQALLVSEGQTRTVAIDDVEVGDQLLVRIGDQVPVDGRVVTGTATVNEAAITGEARVVNKTPTDQVYTGTIVENGQMVVEARKVGEETTFGKIIELVEEAQDNQAPVSRFIDQFARFYTPLVLVLALLTQLVTQDFRLAITILVLACPGALVIGTPVSNVAGIGRGAQSGILIKGGQVIDQLAKVRTILMDKTGTITTGKPTVQSFYQYSQQDWLAVAAQLEKQTNHPLAAAVVEFYEQRTGQPVQNHDISITTVKGIGVTATWHGHQVKLGSPRILEPSAQKLSNKQTADLQKLRENGQSVILMIVDGALVLAMGLSDQVRPGVASALKRLRQTGVTNQWMVTGDQLNVAQSVAHIVGITQVKAGQLPNEKAQFLKELQASGQPVLFVGDGINDSPAIAQAAVGIAMGSGTDVAIETSDVVLINPDFKNVVFARQIAQTTLRNMMENVGIAVGTVALLMLGVSLGWVNMASGMFFHEVSILVVIFNAMRLLKLKRPG >NZ_CP053421.1|WP_024862570.1|423622_424270_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MKISKSSLLTLITYLAIFLLPSVINLFVRLGASFIWVETIDYLVGAALLVVINLKNSEINQIETRRIPFFRAIAWGIIGTALVIVLQFVVSYVTFILGQNPASANTATLVTLAKINPFFVLAITVGAPIMEELVFRKVLFGNLSTLFGMRSNLGLTIMAIISSLAFAFMHNDSHIFLYAAIGLLFCWLYHKTGRIQTSMIAHILMNGLVVLPLVM >NZ_CP053421.1|WP_002829962.1|424459_424744_+|co-chaperone-GroES MLKPLGDRVILEAKDEEEQTVGGIVLASNAKEKSQTGKVVAVGNGRVLDDGKTLPMNVKVGDTVVYDKYAGTEVTYEDQKYLVVHEKDLVAVVE >NZ_CP053421.1|WP_002829959.1|424766_426389_+|chaperonin-GroEL MAKEIKFSEDARTKMLKGVDKLADTVKSTIGPKGRNVVLEQSYGSPTITNDGVTIAKSIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDIAGDGTTTATVLTQAIVNEGMKNVTAGANPVGIRRGIEKATEKAVAALHNMSHEVKTKDDIAQIASISSANPEVGKLIADAMEKVGNDGVITIEESRGVDTTLDVVEGMQFDRGYMSQYMVTDNDKMEANLDNPYILITDKKIANIQDILPLLQSVVEQSRSLLIIADDITGEALPTLVLNKMRGTFNVVAVKAPGFGDRRKEQLEDIAILTGGTVITDDLGLNLKDVTIEQLGQANKVTVTKDDTTIVEGSGSQEQIAERVAMIKQQISETTSDFDKEKLQERLAKLAGGVAVIRVGAATETELKEKKYRIEDALNATRAAVEEGFVPGGGTALVNVIASLEDLDAEGDELTGINIVRRALEEPVRQIAENAGEEGSVIVTKLKTQKDGVGYNAATDEWVDMIEAGIVDPTKVTRSALQNAASVSALLLTTEAVVADLPEEKPAAPAAPNPGMGGMM >NZ_CP053421.1|WP_002829957.1|426687_428520_+|APC-family-permease MFSYLKRILIGKPLKTLDESGQALTKFKALALLSSDALSSIAYGTEEILSVLIVLSAAATWYSIPIAAIVLVLLFAITVSYRQIIKAYPSGGGAYVVASKNWGTSAGLVAGGSLLVDYMLTVAVSVTSGTEAITSAIPALQKYHVAIAVLIVLGIMALNLRGLRESASFLTIPVYLFVVVISIMIIVGLYNIVTGQVTYHAAAAIGSTVPGMTFVLFMRALSSGSSSLTGVEAISNAVPNFKKPRRKNAAATLAIMSLILASFFAGITFLAYYSGITPMSSQTVLSQIGVTVFGHGIFYYILQLSTALILAVAANTGFSAFPMLAYNLAKDKFMPHAYMDRGDRLGYSNGIISLAAGAIVLILIFGGQTGLLIPLYAIGVFVPFTLSQSGMIVHWKREGGAHWWINASANLLGALLSAVLVVCLLFLHFSNVWPYFVVMPLLLRMFYKIRKHYDEVADQLRVVEKGKVNLHDYDGSTVIVLVSNVTQVTSGAINYARSIGDYVIAMHVSFDANPEKEHKTAMEFKAEYPDVRFIDIHSSYRSITNPTLRFCDVIAKRAAERNYTTTVLVPQFVPRKPWQNILHNQTGLRLRAALNSRENIIVSTYNYHLK >NZ_CP053421.1|WP_002831110.1|428741_429917_+|undecaprenyl/decaprenyl-phosphate-alpha-N-acetylglucosaminyl-1-phosphate-transferase MRFEIVVSLFATMIISAILTPFVRRIAFKIGAVDKPNARRVNKVPMPTMGGLAIFLAFNFSLFFLLRNQIPNPQFYGIFFGECIIMLTGIIDDIFELKPSQKMIGILLAALAVYWFAEVQMTTLTLPFIGIVHLGWFSLPITLIWIAAITNAINLLDGLDGLATGVTIIALFTTGFTGLFFLPSTNIYIVIMIFTLVAAEVGFLPYNFFPARIYLGDTGALFIGFMIAVFSLSGLKNATFISVLIPVMILGVPLTDTIYAILRRLLNKQSIAHADKRHLHHRLMQMGLTHRQTVLVIYGISMIFSFIALLYPLSTLWGSVLLTIGILVGIELFVEAIGLVGENRTPMLSWIKRLVRTTTSKTASNEFKEEDTLKDRVRSRSERHQQKKHHD >NZ_CP053421.1|WP_002831111.1|429986_430625_-|YigZ-family-protein MKLILSVKEPVTTEQDIKKSRFISRIIPVQTEEEAQTKLQDIREIEAKATHNCFAYVLGDHQDIQRASDDGEPSGTAGAPILEVLKRENLTNVLVVVTRYFGGIKLGAGGLIRAYGSSTSLAVQSATLMESVDQELLAITIDYQNNDQLTYYLEQHQITQVNHEYTTQVITTVAVDQDQVADLKAELTGLFSGNVSFKDGGQQRVQVPYQPQ >NZ_CP053421.1|WP_008842440.1|430656_431976_+|DEAD/DEAH-box-helicase MEAKVKEKYYGRLVPVNQAEATDPTVNYFPAVIVKKRRIQCQRCGATTKLKEGSLPNQQYYCRHCINLGRMSTLVKLGNLPEPNHFPVGRSYLKWQGQLTPDQQRCANEIISSIKQQTDRLLWAVTGAGKTEMLFPGINFALKKALRVAIASPRIDVVLELHPRIQAAFPEIAIALLHGRTSTPYTYTQLVLCTTHQLLRFYHAFDVLIIDEVDSFPFAMNPALHYAAHQARKECGTTIYLTATPDGQLLKDSRSHRLPTSYLTRRFHGHPLPEIKMVSGCNWQKLIHRRRLPERLRQFLMAQAKTQRQFLVFVPRIDQLSSVLQAIQKQFPELDLATVYAEDPERIEKVSAMREGQLTGLITTTILERGVTFPGIDVAVLGADDEIFSMAALVQIAGRVGRSPKRPTGTVLFIGQMLTRRIKRAQRQIKFMNQQAFKQ >NZ_CP053421.1|WP_002829951.1|432775_433330_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MLDFNVRGENIEVTESIRDYVEKRIGKIEKYFDQGANPKAHVNLKVYQDRTAKVEVTIPLPYLVLRAEETSPDLYASVDLVTDKLERQIRKYKTKINRKSRETGYKGVEIPQEDAREDEEEASEFDIVRTKQVSLKPMGAEEAILQMDMLGHNFFIYEDADTGSVDIVYRRHDGRYGLIESANE >NZ_CP053421.1|WP_002829950.1|433478_435842_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MANILKKWVESDAREIKRLGKKADKIDALKDEMAQLSDEELKAKTPEFKERLKNGETLDDILIEAFAVAREGAKRVLGLFPFRVQLIGGMVLHGGNIAEMKTGEGKTLTATLPVYLNALGGEGVHVVTVNEYLAERDSTEMGELYKWLGLTVGVNTAEMSPDEKREAYNCDITYSTNSEIGFDYLRDNMVVYKEDMVQRPLNFALIDEVDSVLIDEARTPLIISGQTEPSVTLYQRADRFVKTLTDGDYTIDWESKSISLTENGIRRGEKYFNTDNLYDVENSALNHHIDQALRANYIMTKDKDYVVSDDGEVLIVDSFTGRVMEGRRFSDGLHQAIEAKEHVEIQDGSKTMANITYQNLFRMYKKLSGMTGTAQTEAEEFREIYNMEVVSVPTNRPVVRDDRPDLLYPTLESKFKAVVKEIKKLHTKGQPVLVGTVAVETSEYLSRLLDRERIPHVVLNAKNHAREAEIVANAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGPGVVELGGLAVIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDVGMSQFYLSLEDDLMIRFGSERIKDLLSRMKVADEDAVIQSRLISRQVESAQKRVEGNNYDARKNVLQYDDVMRAQREVIYAERQQVIMEEHSLKDVLMPMVYRTIDRVVDAHTAKTKKSYDLDTIVEFARTTLVNENDINIEDLEGKSANEIKDYLKQLADQMYKQKEDALYAPEQILEFEKVVILRVVDQHWTDHIDAMDQLRQSVGLRGYGQLNPLVEYQQEGYRMFNEMVTDIEYETTRLFMKSEIRQNLER >NZ_CP053421.1|WP_141782997.1|435919_437036_+|peptide-chain-release-factor-2 MELTDAKHQIEDMQKEVADFGRSLDLDALNESISVNEAKMAEPDFWNDQEKAQKIINETNVLKAKYDNYKNLTDHVENLEVTLELLEMEADPDVQAEFEDELSQTAKLLRDYRLGLLLNGKYDANNAILEIHPGAGGTESQDWGSMLLRMYTRWAEQHQFKVQIEDYQAGEVAGISSVTIRVMGHNAYGYLRSEKGVHRLVRLSPFDSAGRRHTSFASVDVMPELDDSVEVNINPDDLRVDVYRSSGAGGQHINKTSSAVRITHLPTGIVVASQAERSQLQNRVTAMNMLKAKLFELEEQKKAEEKAKLEGTQLEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNLETANVQGVMDGDLDDFINAYLQWKLQKRNPK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053421_2 | 620415-620518 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053421_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053421_2
>2.1|620439|56|NZ_CP053421|CRISPRCasFinder CCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCATTATCTTGAGCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053421_2
The CRISPR arrays of NZ_CP053421_2 >merge|NZ_CP053421|2|620415-620518|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCATTATCTTGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG >NZ_CP053421|2|2|620415-620518|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTG CCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCATTATCTTGAGCCG TTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG
>NZ_CP053421.1|WP_166481569.1|613833_614838_+|flippase-like-domain-containing-protein MILAGLVIFGYSLRGVNLHQVSHDILNLNVGWLLVALLCIILYLGFEAVATKVLVESSGDRLSWKDAIRIPLIEQLFNGLTPFSSGGQPAQLVALMQSGIEGGRASSVLLMKFVVFQSMVVLNFIFSLLIGFQYLEDKIKFLSWFVLFGFLIHLAVIIGLLMIMYWHNFTKKMFDLIFIPIKRFTKPERYLRWKTSIDAKVDTFYLESVRMKSQWRLLAKVALLTFLQLLFYYLIPYFILLALGKTHVHLIMVTCLHVLIFMVISLFPIPGGAGGAEYGFSVIFAQFVGNSSKLVLAMIIWRLLTYYFGMFAGMFATVIKPNRINRIVPKKTSE >NZ_CP053421.1|WP_004166561.1|612771_613788_+|glycosyltransferase-family-4-protein MPIKVNMFSSASKVKGQGVGSAYEELIRLLKTHFPKEIDLSINRYTQADISHYHTIDPQFFVSTFTKKRGVKVGYVHFLPETIEGSLKIPQPFRWLFYKYIIAFYKRMDQIVVVNPTFIDQLVKYGIKREIITYIPNFVRKDEFYQYDAEQRRQVREQLGVQDRFTILGIGQVQERKGVKDFIKLAQQHPEMYFIWAGGFSFGRLTDGYADLKKVVDNPPANLKFTGIVDRNKLVEYYNAADLFLLPSYNELFPMSVLEAFSCGTPVMLRDLDLYHSIIKGYYIAADNYAEMDQKLSALVKNPAQLRDYQQRADQASAEYSEDHLAEIWLNYYSSLLK >NZ_CP053421.1|WP_004166563.1|611553_612741_+|glycosyltransferase-family-4-protein MNIGLFTDTYFPQVSGVATSIKTLRDQLEKQGHQVYIFTTTDPKVDTNVYERNVFRFTSIPFVSFTDRRIAISGFIRATQIAKELNLDIVHTQTEFSLGWMGKFVAKALKIPVIHTYHTMYEDYLHYVANGKLLKPYHVKQMTRAFCYHIDGIVAPSERVQRTIQRYGIQVPTRIIPTGVNLEQYQKDSNPQQCREALGYDAKTPVLLSLSRLAYEKNIQEVIDCFPAILKEVPDAQLLIVGDGPARTSLENQVHDLGLEKHVKFTGEINNDQVYRYYQAADLFVSASDSESQGLTYIEAMASHLKVVAKSGPYTDELLDDPSLGKVFDTEGQLVQAIKRYIEHPDEFNDPRPREKKLYEISADYFGKRIVDYYNSAISAHADLEHGSKKESELE >NZ_CP053421.1|WP_004166564.1|610694_611468_+|alpha/beta-hydrolase MEFILKTGETIYYEDQGEGIPILFLTGFGGNTEIWSGQVNFFLQHGYRVIRLDYLNHGRSDRVDYDLKIGDLADEVLQLVDALEIKEPIGIGNSMGAAVLWNILSIRGWDFVSKAIFVDQSPRMMNDDQWHYGFKNLNEANFEQLMSEPILRPAYRRIEGYVYKNSKAIDSKYPFSQPKNRSLVKGHARKDWRPVLRAATKPVLFILGEKSPFFNPQMGDALKQLNSRIQVEVMSNVGHIPMAEEPAQFNQLVLRFL >NZ_CP053421.1|WP_002829776.1|608897_610622_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MTGTLKGIAASDGIAIAKAYLMVDPDLSFEKKTITDVDAEINRLHDALEQSKKELTLIKAKAAENLGAEEAEVFEAHLTILSDPELIGNIEDKIKNDTINAEEATKEVTDNFIAMFEAMTDNAYMQERAADIRDVTKRLMSHLLGVELPNPALIDSEVIIVAHDLTPSDTAQLDRRYVKGFITDIGGRTSHSAIMSRTLEIPAVVGSEKATTSVKQGDMMIVDGLTGDALINPSDDEIKEYEQKSADFKAQKAEWEKLKNERTVSKDGVHFDLAANIGTPDDLQGVLDNGGEAVGLFRSEFLYMNASELPSEDQQFEAYKKVVEGMNGKQVVVRTMDIGGDKDLPYLPLPEEMNPFLGYRAIRISLDRTDLFRTQLRALLRASAYGKLAIMFPMIATVAEFKKARAIYDDERQKMIDAGTKVGEIQVGMMMEIPAAAMIADKLAKYVDFFSIGTNDLIQYSFAADRGNEKVSYLYQPYNPSLLRLIKQTIDASHAEGKWTGMCGEMAGDQIAVPILMGLGLDEFSMSATSILKTRSLMKKLSTDDMKKLAEKAITEAETNKDVIKLVEETVNNK >NZ_CP053421.1|WP_002829779.1|608631_608898_+|phosphocarrier-protein-HPr MEKRDFHVIAETGIHARPATLLVQAASKFNSDIQLTYKDKSVNLKSIMGVMSLGVGQGADVTISADGDDEADAIAALEDTMKKEGLSE >NZ_CP053421.1|WP_002829780.1|608300_608489_+|hypothetical-protein MRDYLKLLNDLKDGVLDELTITAEEFQEFQPVFMDFPERKQLIGEAQRGGTITYRYENNKKQ >NZ_CP053421.1|WP_002829782.1|605876_608084_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit MLCQNCHKNEATIHLYTNVNGRRTEVNLCQNCYQLLKNQQLNNNNGNGGARMAQDPFGFGNLDDIFRAMQGGNVSRPEDMYGQQVPPTQAGRGGGNNPNGGNGSSLLGQYGLNLTDLAKQGKIDPVIGRDKEIERVIEILNRRTKNNPVLIGEAGVGKTAVVEGLAQRIVEGSVPQKLLNKQIIRLDVVSLVQGTGIRGQFEQRMQELMKEVQNNPDLIVFIDEIHEIVGAGNAEGGMDAGNVLKPALARGDFQLVGATTLKEFRDIEKDAALARRLQPVQVDEPSEEEAIKILKGIQKKYEDYHHVHYTDDAIVAAVKLSKRYIQDRYLPDKAIDLLDEAGSKKNLTINVADPETIQKKIDEAEAEKKKALESEDYEKAAYYRDQVSKLEKNKDGATNKEDEPTITAEDMEKIIESKTDIPVGDLQKQEQEQLQNLASNLKAHVIGQDEAVDKISRAIRRNRIGLNGTGRPIGSFLFVGPTGVGKTELAKQLADQLFGSKDAMIRFDMSEYMEPHSISKLIGSPPGYVGYEEAGQLTEQVRRHPYSLILLDEVEKAHPDVMHMFLQILDDGRLTDSQGRTVSFKDTIIIMTSNAGSGDVEADVGFGAAMQGKTHSVLDKLGNYFKPEFLNRFDDIVEFHALTKDNLMQIVDLMIADVNKMLATQGLHVNVTKPVEERLVELGYDPKMGARPLRRVIQEQIEDRIADFYLDHPSEKQLIARIKDDKIEVAPDDKK >NZ_CP053421.1|WP_004166854.1|604572_605550_+|GMP-reductase MKVFDYEDIQLIPAKCVVRSRSECDPTVELGKHTFKLPVVPANMQTIINEEIAEKLAADGYFYIMHRFEPETRLAFVKKMKAKGLISSISVGVKDGEYDFIDELAAKNLVPDYITIDVAHGHAQTVIDMIHYIKEKLPESFVIAGNVGTPEGVRELESAGADATKIGIGPGKVCITKLKTGFGTGGWQLSALRWCAKVARKPLIADGGIRNHGDIAKSIRFGATMVMIGSLFAGHIESPGETKVEDGVTYKEYFGSASQYQKGEAKNVEGKKIWIHQRGHLADTLKAMQEDLQSAISYAGGRDLESIRKVDYVIVKNSIFNGDIL >NZ_CP053421.1|WP_002829785.1|603699_603954_+|hypothetical-protein MSKNLKIDLNTDELIGSREASLMWGKQKDYVRTIYNKYPERFPTGTIRKFGKQLIVTREGMESVTGIKYEDLDKKNIEKAKLPR >NZ_CP053421.1|WP_166481366.1|622462_623194_-|hypothetical-protein MDKIKIPKINYHVDRKSYLPAILAVILTSTVWYFSSHFSSEPFKHNLTVQIIFFLASFMANFITFDQLTNKTNLRLIAPLAVIPVAFFIILLVSKERYVSLLGLLTLVPFISVFLPFQGKNGVGLISFAFSISVLSPIAFFYIRNAFVSSMFLKTCLLLCLVFLMILFSVFVAHPEQFIYLEIGLLVVIAIFSLVLFKQWSTVLYPMIGILGWYLPRVKLPRNFILLVLIILICVTFLFTAGH >NZ_CP053421.1|WP_002830669.1|623365_624556_+|methionine-adenosyltransferase MSERHLFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDELLKNDPDARVACETTVTTGLVVVVGEISTTAYIDIQKVVRKTIKDIGYVGGEYGFDGENCAVIVAIDEQSPDIAQGVDDSLETREGHEDRLNRIGAGDQGLMFGYATDETKELMPLPIMLSHHLMQRIAKLRKEQVISYLRPDAKAEVTVEYDDNDQPVRVDTVVLSTQHDPDVTLEQIRKDVIEKVIKEVIPAELLDEKTNFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGAAHHGGGAFSGKDATKVDRSASYAARYIAKNIVAAGLAKKAEVQIAYAIGVAEPVSVMVDTFGTGKVSEEALTKAVRQIFDLRPAGIIEMLDLKRPIYKQTAAYGHFGRTDVDLPWEKTDKVAELKAFFQK >NZ_CP053421.1|WP_036671172.1|624731_626201_+|MFS-transporter MKKKQTNVALVTVAIFVATFMSAIEGTIVSTAMPTIVGDLHGVNLMNWVISIFLLTNAIFTPIYGKLSDIFGRKRVFIIGIIIFLIGSMLSGLAHSMTTLIIWRALQGIGAGSIMPVSNTIIADIYSLEKRAKVMGLNGSAWGIASIIAPLLGGFIVDNLSWHWIFFINVPIGIITIILIQLYLKEEVSVHRKKIDYWGSVWLMLSLLGLMYGFQLLGESTASKLILGLSFIIFVVAGALFIRQERRAEDPIIFLDLFNDRTFVIQNVATMLVSGLLIGFEVYLPTWTQGILGLPASLAGFAVTPSSVLWIFGSFLAGKMLVKLKANQILRISLTILAIGSFLLAVIPASTPFVAFFFIAAILGVGFGITITSTLVISQQLVSKDRIGVATSFNTLAKTLGQTIMMSVFGIIMNGTINMGIAHHPRINMTMMNQVINPQTAKQLPANLLPTLRDILYSALHNIYICGFILIIVAIVINAFSRPRTQKNK >NZ_CP053421.1|WP_004165584.1|626280_626844_-|methyltransferase-domain-containing-protein MLDNAMQYSHRLLAEVVQPGDHVVDATMGNGHDTLFLANLVQSQGQVFSFDIQAAALSATEARLEKQLPDHQHVQLIQDSHDQLTQYVDTPISGAVFNLGYLPGGDKQIITHSASTIAAVQQCLQLLKVGGRVVLVCYYGHPGGAAELAKLLEFTANLDQHQFTCLRYEFINQVHQPPILLAIERRK >NZ_CP053421.1|WP_171461263.1|626836_627472_-|phosphatase-PAP2-family-protein MRFKKFGWLILNWLPLLGLLTLVISVSNRWNWVHTYDRYLQKIIHGWQSPGLTPLVKIYTQLGNAKPFIFISIVILGMLLWRGYDRLAAFFLANVVLGNAINHPIKLWIQRSRPHFRLITIGGYSFPSGHSVAAMLLFGSLIFITTQTVRSPKWRISWILTCIILMLLLGLSRVYLNVHYPSDVTAGLLLGLVILQTTHWIFYRKKESQHA >NZ_CP053421.1|WP_002830673.1|627878_630296_+|leucine--tRNA-ligase MAYNHKEIEPKWQRYWQKHETFKTVESEQKPKYYALDMFPYPSGQGLHVGHPEGYTATDIMSRMKRMQGYKVLHPMGWDAFGLPAEQYAMKTGNNPKDFTAHNIKNFKRQIQSLGFSYDWSREVNTTDPEYYKWTQWIFEQLYKKGLAYEKETLVNWAPDLMGGTVVANEEVVNGKTERGGFPVYRKPMKQWILKITAYADRLIDDLDLVDWPDSIKEMQKNWIGRSIGASVFFDVEDSDQKIEIFTTRADTLYGATYLVISPEHPLVDQLTTLESKAAVEEYKQAVATKSDLERTDLNKDKTGVFTGSYAVNPVNGKKIPIWIADYVLASYGTGAVMAVPAHDPRDYEFARKFKIDIVPVIGGGNLDEEAYTGDGPHINSGFLDGLNKQEAIDKMLDWLEEHGAGHKKVNYRLRDWVFSRQRYWGEPIPVIHWEDGETTLVPEDELPLRLPATDNIKPSGTGESPLANLEDWLNVVDENGRKGRRETNTMPQWAGSSWYFLRYVDPKNQNKIADEDLLKEWLPVDLYVGGAEHAVLHLLYARFWHKVLYDLGVVPTKEPFQKLVNQGMILGSNHEKMSKSKGNVVNPDDIVERFGADTLRLYEMFMGPLTESVAWSEEGLNGSRKWIERVWRLMIDDNNHLRDRITMINDHKLDLIYNQTVKKVTEDYENMRFNTAISQMMVFVNEAYKADALPMVYMEGLVKLLSPIVPHVAEEIWQIMGHEETITYEAWPTYDESKLVQDTVQVILQVNGKVRSKVEVEKDLDQAELEKIALADERIQQWTAEKDIKKVIVIPNKIVNIVAK >NZ_CP053421.1|WP_002830674.1|630551_632234_+|polysaccharide-biosynthesis-protein MDKPSEFDTAESQYLGSQPLRENSGNSSSKAKMLEGSAWMTAGSIFSRILGAIYIIPWVIWFGVYSDQANALYTKGYNIYSFFLIAAIAGIPSAISKQVAHYNAINEFALGQRLYKRGLLLSVGTGVVCAAILFFGAPFLNDGDPNVTTVLHALAWAVLVIPTMSLTRGFFQGYQEMGPSAVSQFIEQLARVAYMLVTAYLIMYKNHGDWVYGVAQSTFAAFIGALGGLLVLIGYFVKYRRRLRYLSQHSVNGLAISTTSLYKEIIAQAVPFIIIGSAITIFQLIDQYTFFRIMRSVSDYSATVLNNMFAIFAFNANKLVMIVISLASALAVTSVPILSEAKTRGDRAEISRQVADSILLFAFLMIPSALGMAAVAQPAYTLFYHLSDVGTAILQFNSYVAIVLGLFTVISAVMQGIGENVLAVKYFVVGMIVKFIFQFPMVAIFSAVGSLISTAIGFAVVNWLILRHINREYGLDYDKINGFIGKIITYSFGTFFIAFVVTNGLYLVMNPANKVQALIVILVAATLGGLFYVVCVLKSRLADEIIGGRAAGLRRMLKIK >NZ_CP053421.1|WP_004165588.1|632244_632964_+|rRNA-pseudouridine-synthase MRVDKFLHDMNVGTRSQIRKLIKEKAVFVNDVVAKSGRVKVDPVVDQVRLGEQVITYQQYFYFMMNKPLGVVTATEDRKQKTVMDLFNKVDFRKDLFPVGRLDKDTEGLLLITNNGPLAHQLLAPERHVQKTYEAVVTGQITDPAVKQFADGIVLKDGTQLKPADLTILNYSALDEQTLVHVTLKEGKYHQVRRMFGSLGERVVSLKRISFGPLQLEEGLLPGTYRELSDEEIEKLKTE >NZ_CP053421.1|WP_004165589.1|633070_633901_-|NAD(P)H-hydrate-dehydratase MLKINRQTLKSHWPVRQKQSHKGTYGHLLLIAGNAQYGGAGILAASAAIYAGGGLVTLATAKNNFTAVRATLAEIMLIDFTDFDQLSQSLANATGVVIGPGLGTDSTSLAVLNFTMAHIAEGVPLIIDGSAIDLVAQHDLRVSHHPTIYTPHQMEWQRLSGIKIADQSVERNQAVVDQLNATVVLKHYHTEIYAPAAPVAQIMAGNPGMATGGSGDSLTGILLALIAQANSVNEGVRLGTFLHSYTADLIYEHEAVVLPHRLICRLPAVLKQLSQP >NZ_CP053421.1|WP_002830677.1|634026_634488_+|universal-stress-protein MDYKKILFGYDGSPESMAAFNRAVEIAKSNHAKLIIASVMKKQPANTASVSLGFGVIETGIDLQDTLDQWKTTLEKLKQDAQQQGLPAEDIEVVFKQGSPKSMLSYTLPKEYDVDLIVLGATGMGTVAQVILGSTASYVVENAAPDVVIVKNN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053421_3 | 1482406-1482562 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053421_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP053421_3
>3.1|1482443|24|NZ_CP053421|PILER-CR TCAACGGTTCGGATCTTGCCAATC >3.2|1482504|40|NZ_CP053421|PILER-CR CTTCTTGGAGTCCTATCGCATGGAGCGTCTCTAGCAATCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053421_3
The CRISPR arrays of NZ_CP053421_3 >merge|NZ_CP053421|3|1482406-1482562|PILER-CR CTTCGTCGCCTAGCTCCTCAACATTACTGTGACGCTCTCAACGGTTCGGATCTTGCCAATCACTCGTCGCCTTGCTCCTCCTTCTTGGAGTCCTATCGCATGGAGCGTCTCTAGCAATCTCTTCGTCGCCTAGCTCCTCGACATTACTGTGACGCTC >NZ_CP053421|3|2|1482406-1482562|PILER-CR CTTCGTCGCCTAGCTCCTCAACATTACTGTGACGCTC TCAACGGTTCGGATCTTGCCAATC ACTCGTCGCCTTGCTCCTCCTTCTTGGAGTCCTATCG CATGGAGCGTCTCTAGCAATCTCTTCGTCGCCTAGCTCCT CGACATTACTGTGACGCTC
>NZ_CP053421.1|WP_024862997.1|1481411_1482038_-|N-acetyltransferase MEKDYLIRLEQPADYRKTEAMVREAFWNVYRPGCYEHYVLHVLRKSREFVPQLNLVMEKDHQIIGQICFVKAKMVDKNGNEVPVLTFGPLSIAPAYQRKGYGKKLLDYGIAQARKWGASALCIEGNLAFYKHAGFEVAATKGIRYAGEPENGELPYFLAKELREGFFEQVQGALYYTPSAYYVSESDVNKFDQQFPPKEKRVLPGQLA >NZ_CP053421.1|WP_002832208.1|1480751_1481210_+|flavodoxin MPTAKVVFATITGNNEDCADIITEALEDLGVEVDETEISQTDAAELKDYDINVIVPYTYDEGALPEEGLDFYDDLADLDLSGKIYGVAGSGDTFYEEFYCVAVDKFSEALTKANATKGTADLKINLAPESQEDLDHLDQFAQDLVDAYNAQN >NZ_CP053421.1|WP_004165485.1|1479883_1480699_-|recombination-regulator-RecX MININSEETKKITKITAQKRAGRYNVFLDGEYAFPISEETFIHFRLGKGMAVNGTLLKEIGEYETNAEAYNIALTYITGQLRTENEVRQKLRQQDYEESVIEAVIAKLADLNLLDDREYAKSYVRTMMRTGDKGPRYLINHLRQKGVLENDLQAGLQLFTDAEQVALAVRVGQKLQKRHQAQALRQQQLKIRQNLMQKGFTSEIIEKALAEIEFTVDSDAEYEKLRKLGERLLRRYQGQPEYQRTTKIKRSLYQKGFEMELIERFLNENDS >NZ_CP053421.1|WP_002832206.1|1479236_1479791_-|DUF402-domain-containing-protein MSQYSDGPKEGEYIAIKSYKHDGSLHRTWRETMVLKNSQDEFIGCNDHTVVIEDNDRRWVTREPALVYFNKHTWFNVVAMIRDNGVSYYCNIASPYVLDREALKYIDYDLDVKVFPNGERRLLDTDEFEQFSRQWHYSADTIQILLDSVRELTDWINKKRGPFSVEFINIWYKRYLNIAERNTR >NZ_CP053421.1|WP_008841091.1|1478025_1479156_-|AI-2E-family-transporter MFEKFRKTPLMYWSLELLIIATLLWVCTKIDFLFSPIGTFISTVFMPLILATFLYYMLHPLVKLLMKVHYKKFRISRTWAVVLVFVGFLLLIAWGISSFLPSLIDQISQMLGNLPMIAKKLQVAIPQLVDHSWLRKVDFDPYLKNLNSEIGQYAEQFLANMTNSIGNIIAALTNITVIVITVPIILFYMLKDGYKLIPTISRIVPEHNRKSVLDLFYSMSDTLSSYISGQVIECIFVGTFTVIGYMIIHQPYGLVLGVIAGICNIIPYVGPYFGIFPSLLVAIAQSPEQVISVIIVVLIVQQVDGNLIYPNVIGKSLQIHPLTIIILLLVAGKLAGILGMILAVPTYAIVKVLINFIHHIWVLDRDKIEEKVKPEK >NZ_CP053421.1|WP_002832202.1|1477545_1477950_-|glycerol-3-phosphate-cytidylyltransferase MTRVITYGTFDLLHKGHVRLLKRARELGDHLTVCLSTDEFNAVKGKKAYTPYEDRKYILEAIKYVDEVIPERGWDQKINDVKENDIDIFVMGDDWKGQFDFLKDYCKVIYLPRTEGISTTKIKRDLGLGDYKKD >NZ_CP053421.1|WP_166481473.1|1475910_1477479_-|peptide-chain-release-factor-3 MNQAELKAAVDKRRTFAIISHPDAGKTTITEQLLLFGGVVREAGTVKARKTGNYAKSDWMEIEKKRGISVTSSVMQFDYAGKRINILDTPGHEDFSEDTYRTLMAVDSAVMVIDSAKGIEPQTKKLFQICKMRGIPIFTFMNKLDRDGREPLDLVNELEEVLGIDAYPMNWPIGMGKGLAGLYDIYNNRIELHTDEPEYLALDSNGELKEPNPIEEESVFQDAMMEVDLMKEAGNQFDEAKIAKGELTPVFFGSALTNFGVKTFLDAYLQFAPAPSAHKVADGEQIQPTDEEFSGFVFKIQANMNPNHRDRIAFLRICSGEFDRGMDVTLKRTGKTLRLSNSTQFMADARENVERAVAGDIIGLYDTGNFQIGDTIYTGKQPVQFEKLPQFTPELFMGVSAKNVMKQKSFHKGIQQLVQEGAVQLYTNYTTGDYILGAVGQLQFEVFQFRMQNEYNSEVVMQPMGKKIARWINPEQLDEKMSSSRNLLVKDRAGQPLFLFENQFAERWFKGKYPDVELTAKL >NZ_CP053421.1|WP_005918921.1|1473638_1475807_-|LTA-synthase-family-protein MNRLWGKFRRGLNTKFGFFMLITGLFWLKSYIAYQTKFTLGVQGGMQELILAISPLGFAILLFGIGLYIRGKWAYWYMIVMDAILSTWLFANILYYREFSDFITFNLIKGSGAASDNLGKSLMGILRPTDFLVFVDVIFVIAILAFGFAKIDQQRFKLVNSLAVTILSIGVLAANLALAYSNRSGLLTRTFDNNYIVKYLGLQSFTLYDGVKTVQNSNKKKEAKSSQLKPINEFLKKNNVPANIEYKGVAKGKNVIIIHLESLQQFVINQKWKGKEITPNINKFYNDKNTLAYDNFFNQVGQGKTADAEMMLENSLFGLPEGSAMVTDGTTNTFQSMPAIMDQHGYTTAAFHGDVASFWNRDNAYKSFGYQYFFSKQYYSLKKGYVSGYGMKDKLFLQQSAKFLEELPQPFYAKLITVSNHYPYGIEKKNVSIDPWETGDSTVDPYVQTAHYLDQAVGELISYLKKTGLYDKSLIMMYGDHYGISNNHKPAIAKILGLKGVTNYDLAMFQKVPFMIHAPGLKGGVNHNYSGEIDVMPTLLNLLGIDTPGAYQFGHDINSKQYNQIVAFRNGDFVSKKYTKYGGDLYYTATGEQITDETASQKREVKQIQQYVNNELNYSDRIINGDLLRFADLDWFKKVNKADYSYTKKTALKNLKKAQKSKTSLLEQNHGRSTVDDYVTDAPELPENEDKAASSSSSSNSSSEDSSHSGSSSADPATQEDK >NZ_CP053421.1|WP_005918923.1|1472628_1473474_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MASHLIILLLVGLLAGVFGAILGIGGGMIITPVLTIGMGLDIKYAIGASIIAVIATSSGATIAYLKDEMLNLRVAMFLEIATTVGAIVGAIMTGIFNSTVLYVLFGSFLVFSSWNMYRKLRQGGSEEGSAKNDRLANRLNLSGSYYDKALQKQINYQVENVPGGSAVMFGAGLASGLLGIGSGAFKVMAMDNIMKMPLKPSSATSNLMMGVTAAASAMVYFFNGSIHADIAGPLAIGILFGAQLGSRIMQRLRPRWIRLIFIPVLLYMGLQMVLKGFGVNF >NZ_CP053421.1|WP_005918925.1|1472265_1472628_-|DUF1634-domain-containing-protein MNAKQKEMNHVELLIGRILQVGVYISAIVIICGIGLWLVKNGSGYAGALPTRLGVIFQGAMQLKPYAVLMLGIFLLILTPVLRVVVSIYAFAKEGDRLYVAITTIVLIILIIGMTIGYQG >NZ_CP053421.1|WP_166481474.1|1482842_1483004_+|hypothetical-protein MGMFSFVSKWNRAGELFRTRQFILTFAKEEYLVKIEEVIKKRREELAKKESNQ >NZ_CP053421.1|WP_141783081.1|1483109_1483199_+|putative-holin-like-toxin MSVYQALMLMLAFATFVIALLTFVFTFCA >NZ_CP053421.1|WP_141783082.1|1483346_1483832_+|restriction-endonuclease-subunit-S MLSIRYFVAWEQRKLGEITKTHSFKQYISEAFDHGKYMVIQQGENPIAGYANGDPFENFKDVTLFGDHTLSLFKPQEKFFVASDGIKILSPSLKMNGMFYYYLLEKYRPQSEGYKRHFTIMKKSTALFPIEIDEQIKISNFLEELDSLIALHQRKPNTLFS >NZ_CP053421.1|WP_171461275.1|1483828_1484758_-|site-specific-integrase MFKDNFTRDSLFKDYFSHWIKLYKEGAVRQVTLEKYRTNYQHLAQIMPDLKMKDFDRNVYQELLNKYAETHERQTVIDFHHQVKGAILDAVDDGLIDRDPTRKAIFKGKAPREKKKKYLNQFELHSLLEDLNLGTSINWDWLILLIAKTGLRFSEALGLTPADFDFARQTISISKTWDYKNNTGFQPTKNRSSIRKVQMDWQLGMRFQQLVNGLEVDKPIFVNGAVCNSTPNKWLAHHCKNCGIPEISLHGLRHTHASLLMFAGVSIASVSRRLGHSSITTTQKVYMHIINELENQDNDLVMRYLSSLS >NZ_CP053421.1|WP_166481572.1|1484775_1485222_-|restriction-endonuclease-subunit-S MGQSPSSKNYTENPNDHILVQGNADMKNGHVVPRVWTTQITKQAEKGDLILSVRAPVGDIGKTDYDVVLGRGVAAIKGNSFIFQLLTKMKINGYWTRFSTGSTFESINSDNIKNAQISIQSLREQEKIGGLFNEFDSLIALHQRKPKW >NZ_CP053421.1|WP_166481476.1|1485302_1488398_-|HsdR-family-type-I-site-specific-deoxyribonuclease 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>NZ_CP053421.1|WP_166481477.1|1488460_1489621_-|restriction-endonuclease-subunit-S MSKDKKRLVPVRRFKEFENAPAWEQRKLTEIVNRVNKSSNSDVLPKVEFEDIVSGEGRLNKDISSKLDSRKGTLFESENILYGKLRPYLKNWLFPDFEGVALGDFWVFEATDVSVPSFDYYLIQSDDYQKVANDTSGTKMPRSDWKNVSSTDFAIPSKDEQKQIGAFFKQLDDTITLHQRKLDKLKRVKSAYLTEMFPAEGEREPKRRFPGFTVAWEQRKLGDVVNRFDNLRIPVTASKRIHGEFPYYGANGIQDYVDGYTHNGEYILVAEDGASNVYDYPVNYVKGKVWVNNHAHVIQGKTNIADNLFLLNAIKSINIASFLVGGSRAKLNAEIMMELPIKIPSYNEQKKIGKYFANIDSLITLHQRKLDKLKKMKAAYLEEMFV >NZ_CP053421.1|WP_166481478.1|1489620_1492200_-|type-I-restriction-modification-system-subunit-M MITSEEIKRRLWDGANNLRGTMDASRYKDYMLGLMFYKFLSDKTLQTFKETAGLPDDANVLEEYRKAHEEYGEELETMIQQVLGYHVTPDHLYQTWEEDIENGDFELSEVMDSLNAFERSIAATDDSDDFKGLFSSSVIDLTNTALGSDLNKRSKNIRDLIGLFADLNMVDLQNGDVLGDAYEYLISQFASDSGKKAGEFYTPAQVSEVIAQIIARTTEIKSIYDPTVGSGSLLLTVGKHLSKDARKNLHYYGQEYITATFNLTRMNLLLHDVRPENMTIRNGNTMASDWPEDPSRPGEGVQFDAVVMNPPYSDKSWNKHEDKPLKVSDPRFSEFGALPPESKGDFAYLMHGLYHLGQQGTMGIVLPHGVLFRGDTEGEIRQRLIEKNYIDAIIGLPSNLFTNTGIPVAVLILKKNRKLTDPVLIIDASRDFIKVGKNNVLRERDTAKIVDTYVNKRELRGYSHLASRQEIIDNDYNLNIPRYVEAIDEEIPEDVDGHLLGGIPESNLARLTVLSSTTKQLLADSLEQVRPGYVKLKVSVDDLKKQALSNGNITGEQARLSETIRIYINKYYPQLKQINKDTNLAELKLSMVDEIKQVLSQFDNVDQYAGYQIVADLWESSLEEDAELIAANSFYEAGRTRKPNMVEKGSGAKKRTVQDGWLGAIVPNDLIADMLYQDDKAKISELEQKAADVESELGELVEAAKTEDTPEYDALFDVLKKNDDDEPQDSFESKKVKAALKESEESSDGTGYLKRVSDLMAAKTKVNRKIKNAKADLQEAIYDRIEKLTNEEIDQLMQEKWFGGFEEKMVKLVTQPLLADLQTLAILSDRYADTLDDIDSQISQAEADLNSFMQDLVVK >NZ_CP053421.1|WP_141783088.1|1492216_1492438_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MVEKKETTISYNKLWKLLIDRGMKKKELQEASGVSAASIAKLGRNGNITTEVLLKICIALDCDISDICEVEKK >NZ_CP053421.1|WP_141783089.1|1492451_1495067_-|helicase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053421_3 | 3.1|1482443|24|NZ_CP053421|PILER-CR | 1482443-1482466 | 24 | NC_031280 | Acinetobacter phage vB_AbaM_phiAbaA1, complete genome | 47059-47082 | 3 | 0.875 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | MF360958 | Salicola phage SCTP-2, complete genome | 110995-111024 | 6 | 0.8 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | NC_010632 | Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02, complete sequence | 29954-29983 | 7 | 0.767 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | NC_015432 | Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus MS1146 plasmid pSSAP1, complete sequence | 32213-32242 | 8 | 0.733 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | MG557618 | Staphylococcus phage HSA30, complete genome | 4295-4324 | 9 | 0.7 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | KY779849 | Staphylococcus phage qdsa002, complete genome | 49912-49941 | 9 | 0.7 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | MF001365 | Staphylococcus phage SA3, partial genome | 19388-19417 | 9 | 0.7 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | MH159197 | Staphylococcus phage VB_SavM_JYL01, complete genome | 19479-19508 | 9 | 0.7 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | MK250904 | Staphylococcus phage VB-SavM-JYL02, complete genome | 18051-18080 | 9 | 0.7 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | MT554104 | Staphylococcus phage ESa1, complete genome | 47035-47064 | 9 | 0.7 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | NC_019448 | Staphylococcus phage GH15, complete genome | 46544-46573 | 9 | 0.7 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | MT786458 | Staphylococcus phage vB_SauH_SAP1, complete genome | 141636-141665 | 9 | 0.7 |
NZ_CP053421_1 | 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421908-421937 | 30 | MN304941 | Staphylococcus phage vB_SauH_IME522, complete genome | 133105-133134 | 9 | 0.7 |
1. spacer 3.1|1482443|24|NZ_CP053421|PILER-CR matches to NC_031280 (Acinetobacter phage vB_AbaM_phiAbaA1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
tcaacggttcggatcttgccaatc CRISPR spacer tcaacggttcagatcgtgccaatg Protospacer **********.**** *******
2. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer taaaacaacttaatgaaaaatctaagaaaa Protospacer * .******* *********.***** .**
3. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010632 (Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer cagaactactaaaagaaaaacctaaccaga Protospacer . **** ****** *********** *..*
4. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015432 (Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus MS1146 plasmid pSSAP1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer gattacaacaaaatgaaaaacctaaacgtg Protospacer ***** ***************.** .
5. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG557618 (Staphylococcus phage HSA30, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
6. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY779849 (Staphylococcus phage qdsa002, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
7. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF001365 (Staphylococcus phage SA3, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
8. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH159197 (Staphylococcus phage VB_SavM_JYL01, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
9. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250904 (Staphylococcus phage VB-SavM-JYL02, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
10. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT554104 (Staphylococcus phage ESa1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
11. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019448 (Staphylococcus phage GH15, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
12. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT786458 (Staphylococcus phage vB_SauH_SAP1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
13. spacer 1.2|421908|30|NZ_CP053421|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN304941 (Staphylococcus phage vB_SauH_IME522, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tcgaacaactaaatgaaaaacctaagcgaa CRISPR spacer ctgaacaacctaatgaaaaacctaatgagg Protospacer ..*******. ************** ...
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
627878 : 694165
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053421|627878:694165|DBSCAN-SWA 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75 | Lactobacillus_phage(75.68%) | protease,head,tail,holin,tRNA,portal,integrase,terminase,capsid | attL 626934:626950|attR 684335:684351 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
917786 : 924971
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053421|917786:924971|DBSCAN-SWA CCTAGTCATGTTTGTGACGATCCCAAAAAATCTGAGTCATCGCAATTTTTAATTTTTGCTTCTCATCCTCGGTTAAATCATCTCCTCCATAAGTGAATGTCCCATCGTTGTCTTCAAGAAATCTCTTTAAATCGGTAGTGTCCTTTTCGTTTGCCCATTTAGGGGTGCTGTTTCTACCCAATAAGTAGTCTATTGTTACATTAAAATACTTAGATAGTTTTACCAAAGCTTCGTTATCAGGTTGGCGTGTATCATTTTCATAACCGGATATAGATACCTTTGATACGCCTAATATTCTACCTAACTCTTCTTGAGTCATCTTTTTTTCTTTTCGCAATTCTCTAATTCGTTGGCCTAATGGCATTTTAAGCACCTCACTTCATTTAAATTTTAATACGTTAACCTAAAGTTAACAACAAAAGTTAACAAATTAGGAATTTTCACTTGACATTTAACTTTAGGTTAACTATTATAATTAACGTAAGGTTAATTTAGGAGGTGATTCAATGATTTTATATAACTTGAAAAAAGCACGAGAACAAGCTGGTTTAACTATGGACGATATGGGCAATGCTTTAGGAATAAGTAAAGTTGCGTATTGGAAAATCGAACATGGTAAAACTAAACTCAGTTATAAAAATGCTGTTATTATTTCCGAAAAAGTTAACAAACCTGCAGAAGATATTTTTTTACAAGATGAGTTAATAAATAAGGAACTTAAGGGGGTGACAGCATGACTGAACAAAACAAGCCACTAATTGAAATTAAAACGTATTTTGACGATTTGAAAGAAATTAAAGAGCTGCTACCGCAAATAGCAACTCTTCAACAGAAGTATGAAGTTAGATTAAACATCAACTTACGTCCATAGAATCAATCAAATCATGGAGGTGGCAACAAAAATGGACAAAAACAAAGGTATCTCATTAAAAATCACTCGTCCCGAAAAGAATGCCGATGTTAAAGAATCTTGGGGATACGAAGTTAGAATTAATGGCCACAAAATCGAACAAGGTATTAACGCTATTTCGTTGGATATGGTTGCAAATAAGAAACCAGTTTTGACAATCAAGTGTTGGCCGGATGCAATTGAAGCTGATTTACAGGCACTAGTTAAATTAATGGACATCTCTGAAAAAAATAAAGTTCCTGATGTGCCACAAGATAAGTTAGTGAAAATTATTTCAGAATTTAAAAAAGTTGAGGATGAATTTGCGCTTCGCCCTCAACAACTTCATGAAATATTGAATTACATTACTAGATCAGTTTAATAACGTAATATCGTATTTTCCCCAGCTTGTATCAATTTTTATAGGTATGTCTTTAGCAGCAAACCATGAAATTACATCTCCTTCTGAGGGAGTATCTTCAACTACTAATTTAACGGGAAAAGATTTCTGATTGTTTTTAAGTGCTTCGTGATAAGCACTAACTAAGTTTTTCTCGAATTGCTCATTCATTAATAATCACCACCTTTCAGTGGTAATTATACGCTATCAAGTTTTCAAAGAACGTAGGAGGTGAAGACATGACGATCACGAAAGCAAAACAATTACACAGTCAGCTAGGAATGCAACAATGCTATGAATTGTGTAATGACTGGCTCGATGAACAAGATATTTTATTTGCAATCAAAAATAAAATCATCCATGAATTAACATTTCAAGCTATATGCAAGGATGTCATTCCAGCATGGGCTGTGAAACAAAAAATTAACTCAATGCCTACAGCTATGATTGGCTAATCAATCTTTTTTACACTTTTAATAATACCGTGGGATTACGTGTATTAAAATCCCACGATGTACACAAATAGGAGGTGATTCAAGTTGGTAATAGAGGACGTGATGGACGAGTTAGACAAATGTTTAATCCGTAATAGATTAACCCGAACTCAATTCGCAAATGCATTACACGTGTCCAAGCAGGCCGTATCGAACTGGTTCTCCGGTGATAATCACGTGATACCGCTAGACAAATTAATTAGCATTGCTGATTTGTTAAAGGATGAAAGATTTAAATTTGTCGTTGCTGATTATGTACTGGACACGCGATTGCTTGCTAAAAACGAATATGCTTCCGATCCATTATCACAATTTATGAGGGTAAATAAAGAGGAGGAAGAACGGAGACTACTTAATGAACAGGTACAAGTGATTTTAGCTAAACCAGTTACTTATTGGAACGACGAGGAACGAAGCTTCTTGATTAAATTTAGAAAAGAATTCTCTGAAGAGCGACAGGCGGAAAATGATTTCGCAATTGCGCTAGATGAGGCATTGGAGGTGATCTAATTGGCAGTAATCCAGTTTGAAGGAATTGACGAAAAAGTAGCTGATCGGGTAGTTGAATTAATCATTCCAAAAATAGAAGAACGACTGAGCCAAACGACTAAGCCTGACCAGTTACTTACACAAGAACAGGTAATGAAAAAGCTACACGTCGGTTTTGAGCTTTTTAAAAGAGATTACTATCCCACTATGCCACATATTGGGCATGGTAAGGGAATTCGGTACTCGGAAAAAGCTGTTGATAAATGGATTCAAGAAAATCAGAAGACGTTAATGGAGGAATAATATGAATTTTTTAGCTTATTTGGGACTTATATTTATCGGCGCAGTAGTCGACAGGGTAGTTATTTTTATGGATGACCCAAAAGACGATATTGAATATATCGAAGAAAAAAAGAAAGGGAATCGTTATGTTACGAAAAGAAATTAAGGCAATAAAAAAATCCCGCACGGCCATGCGAGATTCAAGAGCTATAAATATTATCTATGCTTTTATCTTACCACCGAAAGAAGGTGCCGTAAATGTTTCCATCTAAGCAGTTTGATAATTGGTTACAGAACACAACAGTTGATAATTATTACAACGGAATTGCGTTAAGGGAATTAACAGATGAAGAGATCCAAGACAAAGCTTATGCCAAGTTAGAAAAAATGGATTCAGTCGATATGGCTGAAATGTTTGAAGATTTAATTTATGACAACAAAATTCCGGCGCAGTTAATTGCTTACATTTTTGGAATCGATACGGAGGTAGGAACTAATGAGTAATGAACTAATGAATAAGACGGTAACCTATGCAGTTAATGGGGAGGACGTTAATTTATCGGGAAACATGGTTAAGAGTTATTTAACCAGTGGTAACGGAGCGGTTACTGATCAAGAGGTAACAATGTTTATCCAGCTATGCCGGTACCAACACTTAAACCCGTTTCTAAATGAAGCATACCTAGTTAAATTCGGTAACAACCCTGCTCAAATTATTACTTCGAAAGAAGCGTTTATGAAGCGTGCTGAAGCTAATGAGAATTATGACGGTATGAAAGCCGGTTGTATTGTCGAACGGGACGGCGATATTAAATATACCAACGGGGCATTCATATTAAAGGCAGATAAGATTCTCGGTGCTTGGGCAGAAGTATATCGCAAAGACCGAAGCCAGCCTGTCCACATCGAGATTTCGATGGAAGAGTTTAGCAAATCTCAAGCAACTTGGAAAAGCATGCCGGCAACAATGATTCGTAAGACCGCAATTGTTAATGCTTTGCGTGAAGCATTCCCACAAGACTTAGGAGCCTTATATACGGAAGATGATAAGAACCCCCATGAAAATAAGGTGGAGGATAAACCTAAGCAACCAGTAGTTAACGCAACAGAAGTAGCGGACACTTTGGCTAAGAAGTTTGCTAAGCAGGAAGATATTAAGCCTGCCGAAGGTGTAATCGAAACTAATGAGGAGGAATCAAATAATGCAAGCAACCATGGAGAAACAACAGAACCCGTTAATGACGTTGAGGAACCAACAGCCACTGCCGAAGTTGAACAGGGAAAATTACTATGATTTAGCAACTGAAAGCTACATGTCATTTTCGTTGTACAAACGGTTTAAGAAATGTGAAGCCGAAGCCATGGCTTACCTTAATGGAGAAATACCTAAGATTGAAGAAACTAATGCGGCCTTGTTAATGGGTAACTACCTCCATACTTATTTCGAATCAGGGGAAGCACACGCTTCTTTTATTGAAGAAAATCAAAAGGAATTAATTAGTAGCCGGGGTAAGAGTAAAGGATCGCTTAAGAGCAATTACGTTTTAGCGGACAAGATGATTAAAGCGCTTAATCAACAGGAGTTATTTAAAGGCGTCTATCAAGGCAAAAAAGAAGTGATCCTAACTGGCGAATTGTTTGGTATGAGCTGGAAAGTTCGCATTGATTGCTTACATGTCCCCGGAGATGAATCAGACGTAGCTTACTTTTGCGATTTAAAAACATCTAAGAACCTACATGCTAAGTTCTGGAACAATGATCTACATGAATGGCAACCATTTGTAACTGCCTATAACTATGATTTACAGATGGCGGTTTATCAAGAGATTATCCGACAAAACTATGGAATGACGTTTGCACCATTTATTTTTGGGGTTTCAAAAGAAGATGTGCCTGAAGTAGTGGGGATTGAATTTAAGCAGGTGGAATTAGACGAACCGCTATCCGCATTAGAAGCTGATATGCCACACATTATTAGGCTACTAAATGGCGAAGAGGAACCCCTTAGCTGTGGTAGATGTGATTATTGCAAAGCTCATAACCAATTAATTGGGTTCGTAGACATCGACTCGCTACTGGATTAGGAGGTGATGGCTTGAATTACATCAAACAGCTTAACGCATTCTATGATCAGCTCGAACTAAACCCGTTAAATTCATCTGAAATTGCTTTATGGCACGCATTGATGCGCATAAACAATAAAACAGCATGGTCAACGACGTTTACGGTGGCTTCATCAACGTTGTGTAAATACGCTGGAATGAAAGATACAAGCAAATCATCAACATTCTACAATGCGAGAAATGGATTACAGCAAAAGGGCTACATCAAGTGGAAATCACGTAAAGGGAACCAAGCCGCTTTATACCAATTAAAAGATTTGACTACATTATTTGTAGACAACTATGTAGACAGTACTGTAGACAGTTCTGTAGGCAATACTGTGGGCAACCCTGTAGCATTAAATAAACAAAACAAAACGAAACAAAACAATATTAATTCAATTACCGGCGCGCCACCGAAACCCAATGTGTACATTCCGTTAACCAAATTAACGTGAGTGGCAAATCGGGTGGGGAGGACGTTATGTTAAAAATGTTTGGTTATTTTACAAGCCTAGTCAAAGACGGCTTGCTATTTAAGCCGCAGTTTAAACTTACGGACCATGAGAAACATGTCCTGGCTAAACACCAAGGTGGCTTGATGGAAATACGGATTACTGATCCACGGCAAATTTCGAGTGACCAACGAGCAAAGATATACGCCATGTTTGGCGATATTGACCGTTGGCAGGAATACCGCGACCCGGATTATGTTAAGCATATTTGCAAGTCACAGTACTGCTACGAAAATGCCGTAGATTGGTTTAGTTTAAGCGATTGTTCGATGGAGCGAGCAAATTCGTTTATCAAGTTCCTAATTGATTTTTGCTTAAAATGGGACATTCCATGGTCAATGCGGACCATGGACATGATTGATGGTGATTATTGGCTATGCTACTACGGCTTAGTACACCGGCAGTGTTGCATTTGTCGTAATCCGGCTGATATAGCGCACATAACAGCGGTTGGCCGAACTAACCGGAACAAGATAGACCACCGGGGCAAGTATGTGATGCCGTTATGCAGGACCCACCATCAAGAGCAACACACAATTGGAATTTCAACATTTATGAAAAAGTATCACATCAAGGGCGTGAAGATTGATGACAAACTCGCCCGAATTTTAAATTTAGGAAATTGGAGAACACAAAATGGTGAAAATGAATGATCAAGACAAAAAGATTATTAAAGAGGCGCTTAAACAGGGCTTTACGTTCGATGAAGCGATGGAATTTATAGAAAAAATGAGAGAAGCGCATTACACACAAATTAGTTACAACTCCGAAAGGGGTAAAGGTTTGATGATTGGTGATGATGAAGATGTTTTAGTTGGGTTACTCGCTTTATCAAGCAAATTATTGCAAAGAACAGACGATTTTGAAATGAAGTTAAAAATCATCACCACTTATGAGAAATGGGTAACGCAGAAAACAGGCGAATTATTAGAAAAAAATAGCGTAATAGTTAGTTCAGCAGATGAATTAGACGAGCTTAATATTCCAGAACCAGTGAAAGAAGAATTACGTCAAATTCTCAATGAAAAATTTAACGGTAAATAAAACAAAGGAGTGTTATTAACGTGAAAAAAATTGATTTATTTAACAGCGACTTATTCGGGAGCAAGGAAGCTAGCTTAATGTGGGGCAAGCAACAGGATTATGTACGGACAATCTGGAATAAGTATCCAGAACGTTTCCCGGCGGGCACAATCCGCAAGTTTGGGCACCAACTGATTGTCACACGGGAAGGTATGGAAGCTGTAACTAAGAGGGAAGCTAAATACACATTTGACGAGATCATGAAAGGTTAGGACGGTGATTAAAAATGAAACTAATACAGAGGATTGGAAAAATGAATAATGGTTACAAGTCAGGCTACCAGGATGGCCAAAAAGAGGCGCTCTTAGAACTAGGGCGTAAATTGCGTGCTATGAGTGAACCTTTGTTTCAGAAATTGATGAAAGAGCAGAAATTTAGTGACAGCGATGATATACGTCTAGAAGTGCTCAACGAGATCGCAGACTGGGAAAAAGAAATGTTGGAGGCTGTAATTGATGATTAACCGAGCGGTATTAATCGGGCGCTTAACAAGGGACCCAGAACTAAAGTACACAACCAATGGCGTAGCGGTCGCTAGCTTTAACCTAGCAGTCAATCGCCAATTCACAAACCAAGATGGCGAACGTGAAGCAGATTTTATCAATTGCGTAATGTGGCGGAAAGCGGCAGAAATTTTCTGCGACTATACTCACAAAGGTTCGTTGGTTGGCATTGATGGACGAATCCAAACTCGTTCATACGAAAATCAACAAGGACAACGTGTTTATGTCACTGAAGTGGTCGCGGATAACTTTTCCTTTTTGGAATCTAAAAGTCAGAGCAATCAAAACAATGGCAGTTATGTGCCACAAGACAACGGGTTTGGTCAAAATAATGGGCCAACTACGCCGAATAACACGAACCCAAATGATCCGTTTAGCGGAAAGCAAGGACAATCCATTGATATCACCGATGAAGATTTACCGTTCTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053421|917786:924971|920361_920505_+|WP_158002712.1|DBSCAN-SWA MNFLAYLGLIFIGAVVDRVVIFMDDPKDDIEYIEEKKKGNRYVTKRN >NZ_CP053421|917786:924971|924265_924502_+|WP_052017553.1|DBSCAN-SWA MKLIQRIGKMNNGYKSGYQDGQKEALLELGRKLRAMSEPLFQKLMKEQKFSDSDDIRLEVLNEIADWEKEMLEAVIDD >NZ_CP053421|917786:924971|920597_920843_+|WP_008840859.1|DBSCAN-SWA MFPSKQFDNWLQNTTVDNYYNGIALRELTDEEIQDKAYAKLEKMDSVDMAEMFEDLIYDNKIPAQLIAYIFGIDTEVGTNE >NZ_CP053421|917786:924971|924494_924971_+|WP_008840867.1|DBSCAN-SWA MINRAVLIGRLTRDPELKYTTNGVAVASFNLAVNRQFTNQDGEREADFINCVMWRKAAEIFCDYTHKGSLVGIDGRIQTRSYENQQGQRVYVTEVVADNFSFLESKSQSNQNNGSYVPQDNGFGQNNGPTTPNNTNPNDPFSGKQGQSIDITDEDLPF >NZ_CP053421|917786:924971|917786_918149_-|WP_008840853.1|DBSCAN-SWA MPLGQRIRELRKEKKMTQEELGRILGVSKVSISGYENDTRQPDNEALVKLSKYFNVTIDYLLGRNSTPKWANEKDTTDLKRFLEDNDGTFTYGGDDLTEDEKQKLKIAMTQIFWDRHKHD >NZ_CP053421|917786:924971|919631_920078_+|WP_036685090.1|DBSCAN-SWA MDELDKCLIRNRLTRTQFANALHVSKQAVSNWFSGDNHVIPLDKLISIADLLKDERFKFVVADYVLDTRLLAKNEYASDPLSQFMRVNKEEEERRLLNEQVQVILAKPVTYWNDEERSFLIKFRKEFSEERQAENDFAIALDEALEVI >NZ_CP053421|917786:924971|921541_922423_+|WP_052017552.1|DBSCAN-SWA MQATMEKQQNPLMTLRNQQPLPKLNRENYYDLATESYMSFSLYKRFKKCEAEAMAYLNGEIPKIEETNAALLMGNYLHTYFESGEAHASFIEENQKELISSRGKSKGSLKSNYVLADKMIKALNQQELFKGVYQGKKEVILTGELFGMSWKVRIDCLHVPGDESDVAYFCDLKTSKNLHAKFWNNDLHEWQPFVTAYNYDLQMAVYQEIIRQNYGMTFAPFIFGVSKEDVPEVVGIEFKQVELDEPLSALEADMPHIIRLLNGEEEPLSCGRCDYCKAHNQLIGFVDIDSLLD >NZ_CP053421|917786:924971|924014_924251_+|WP_144235476.1|DBSCAN-SWA MNVKKIDLFNSDLFGSKEASLMWGKQQDYVRTIWNKYPERFPAGTIRKFGHQLIVTREGMEAVTKREAKYTFDEIMKG >NZ_CP053421|917786:924971|922925_923609_+|WP_008840863.1|DBSCAN-SWA MLKMFGYFTSLVKDGLLFKPQFKLTDHEKHVLAKHQGGLMEIRITDPRQISSDQRAKIYAMFGDIDRWQEYRDPDYVKHICKSQYCYENAVDWFSLSDCSMERANSFIKFLIDFCLKWDIPWSMRTMDMIDGDYWLCYYGLVHRQCCICRNPADIAHITAVGRTNRNKIDHRGKYVMPLCRTHHQEQHTIGISTFMKKYHIKGVKIDDKLARILNLGNWRTQNGENE >NZ_CP053421|917786:924971|923601_924000_+|WP_008840864.1|DBSCAN-SWA MNDQDKKIIKEALKQGFTFDEAMEFIEKMREAHYTQISYNSERGKGLMIGDDEDVLVGLLALSSKLLQRTDDFEMKLKIITTYEKWVTQKTGELLEKNSVIVSSADELDELNIPEPVKEELRQILNEKFNGK >NZ_CP053421|917786:924971|918291_918522_+|WP_008840854.1|DBSCAN-SWA MILYNLKKAREQAGLTMDDMGNALGISKVAYWKIEHGKTKLSYKNAVIISEKVNKPAEDIFLQDELINKELKGVTA >NZ_CP053421|917786:924971|918687_919056_+|WP_036685008.1|DBSCAN-SWA MDKNKGISLKITRPEKNADVKESWGYEVRINGHKIEQGINAISLDMVANKKPVLTIKCWPDAIEADLQALVKLMDISEKNKVPDVPQDKLVKIISEFKKVEDEFALRPQQLHEILNYITRSV >NZ_CP053421|917786:924971|920078_920360_+|WP_008840858.1|DBSCAN-SWA MAVIQFEGIDEKVADRVVELIIPKIEERLSQTTKPDQLLTQEQVMKKLHVGFELFKRDYYPTMPHIGHGKGIRYSEKAVDKWIQENQKTLMEE >NZ_CP053421|917786:924971|919313_919529_+|WP_036685013.1|DBSCAN-SWA MTITKAKQLHSQLGMQQCYELCNDWLDEQDILFAIKNKIIHELTFQAICKDVIPAWAVKQKINSMPTAMIG >NZ_CP053421|917786:924971|920835_921633_+|WP_008840860.1|DBSCAN-SWA MSNELMNKTVTYAVNGEDVNLSGNMVKSYLTSGNGAVTDQEVTMFIQLCRYQHLNPFLNEAYLVKFGNNPAQIITSKEAFMKRAEANENYDGMKAGCIVERDGDIKYTNGAFILKADKILGAWAEVYRKDRSQPVHIEISMEEFSKSQATWKSMPATMIRKTAIVNALREAFPQDLGALYTEDDKNPHENKVEDKPKQPVVNATEVADTLAKKFAKQEDIKPAEGVIETNEEESNNASNHGETTEPVNDVEEPTATAEVEQGKLL >NZ_CP053421|917786:924971|919047_919245_-|WP_166481435.1|DBSCAN-SWA MNEQFEKNLVSAYHEALKNNQKSFPVKLVVEDTPSEGDVISWFAAKDIPIKIDTSWGKYDITLLN >NZ_CP053421|917786:924971|922434_922899_+|WP_008840862.1|DBSCAN-SWA MNYIKQLNAFYDQLELNPLNSSEIALWHALMRINNKTAWSTTFTVASSTLCKYAGMKDTSKSSTFYNARNGLQQKGYIKWKSRKGNQAALYQLKDLTTLFVDNYVDSTVDSSVGNTVGNPVALNKQNKTKQNNINSITGAPPKPNVYIPLTKLT >NZ_CP053421|917786:924971|918518_918656_+|WP_008840855.1|DBSCAN-SWA MTEQNKPLIEIKTYFDDLKEIKELLPQIATLQQKYEVRLNINLRP |
18 | Lactobacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1092095 : 1100658
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053421|1092095:1100658|DBSCAN-SWA CTTATTTAATCAATTTTCGTTGTTTTAGAACTTCGCATAGGCTAACAAAATATAATTCATGCTCGACTTGGTGAATTCTTTGCGCTAATTTTGCCACATCATCATTGGGCAAAATAGGAACCGCCCGCTGCGCAATGATGGGGCCAGTATCAATTCCATCGTCAATCCAGTGCACGGTGACCCCGGTAACTTTTACACCGTATGCCAAAGCGTCTTCAATGCCGTGTCGTCCCGGAAAGGCAGGCAACAATGCGGGATGAATATTAATAATGGCCTGCGGGTAGGCTTCTAGTAGCACTTCCGTAATAATTTTCATGTAACCGGCTAATACAATTAGTTTTAAATCGTATTTTTGCAACTCGAGCAGAATTGCTTGTTCGTAAGCCGTTTTGTCGGCAAATTCGCCCAAACGGTGGGTCCAAACTGGAATCCCCAATCTGACCGCTTTTTCAACTACTGGTGCATCTGGTTGATCACAGACTAAACATGCAATGCGAATTGGTACGTTAGTTTCTTCGATGTGACGGGCAAGTGCAACAAAATTGGTGCCGGTCCCCGACGCAAATATTGCGATCTTAATCATTAATCAGCTCCTAAAAGTACGACGGCTGGTGCATTTTCTGGGCGCCTCTTCACTTGGCCAATCTTAAAATACGGTTCTTTTTGGCGGTCGAGTTCGTCCCTTACTTGCTGATATTGCTGAGGACTCACGGTTAACACCATGCCAATTCCCATATTGAAAGTTTGGTAACGGTCGGTTTGTGAAAGTTTTCCAAGCTTAGTGAGAACCTTAAAAATCGCTGGTTTAGGCCAACTAACCAATTTTATTTCAGCCTGTTGGTTAGGTTGTAACATCCGCGGTACGTTTTCTAGTAGTCCGCCACCCGTAATGTGGGCGATCCCGTTTAATAACCTTTTTTGTAATAGAGGTCGGATCGCGTTGCCGTATAACCGGGTCGGTTCCAAAAGTTCTTCGATTAATGGACGGGCAATCCCTGGCAAATAGTCGTCAAATTGGTAATGGTGATCCGTAAAGAGGATTTTACGCACCAATGAGTAACCGTTACTGTGTAATCCAGTCGAAGGTAAACCAATCAAATAATCCCCTTCACTTACCATGGCTGAACTGAGGAGATCTCTTTTAGCACCTAAACCAACCGCAAAGCCGGCTAAATCAAAATGCTGGTCTTGATAAAGTCCTGGCATCTCGGCCGTCTCTCCGCCTAATAACGGGATGGATTGGGCCTGGCAAGCTTTCAAAATCCCTTTTAAAATTGCATCTGTTTGGTCGCTTTCTAAATGTGAAAACGCCAAATAATCTAAAAAGAATAGCGGTAATGCGCCCTGTGCCAACAAATCGTTAACGCACATTGCTACCAAATCTTGCCCTAACGATTCGACTTTTCCAGTTTGGGCAGCTAACAGCACTTTAGTTCCCACTCCGTCAGCCCCCGCCACTAAAACTGGATCGTCTAATTGATCTTCGGAAAGTTGGTAACATCCGGCAAAATTGCCAATCCCATTTAGAATGTGGGGACCTTGTTCACCAATTGCTTGCTTTAAGCCTTCAATAATTTCTTCGCCCGCAGCAATGTTTACTCCCGCTTGTTCATAAGCATTTTTGGTCATTATTATTTCTCCTTTGCGACTCCCGTTGACGATAACGTAGTGTCTTTTGCGGTTTTAGGAACTTCAAAACCGGCCGCGTAATCGTAAAGCGGCGTAGGATATTTTCCATCAAAGTACGCTACGCAAAGTCCATCATTAGGGACATCTTGGTGCAAACCGATGGCTTCAATCAAACCGGGCAAGCTCAAAAAGTGCAACGAGTCCGCCCCGATTGCAACGCGCATTTCCTTTACCGTGAGGTTTGCCGCCATTAATTCACGAGTATGTTCGATATCAATTCCGTAAAAGCAAGGGTATTTCAACGGTGGTGAACTGATCATCAAATGCACCGCTTTAGCCCCCGCTTTTTTCAACATTTTTACAATGTACTTGCTGGTGGTCCCCCGAACAAGCGAGTCGTCAACGAGGGCTACCTTTTTCCCCGCAACTACCGCGGATAACACTGTCAACTTCATCTCAACCCCCTGTTCACGTAACTTAGGGGTGGGTTGAATAAACGTGCGGCTGCTGTACTGATTTTTAATCAGGCCCATTTCATTTGGGACTCCCAACTGCTCCGCCACTCCTGCCGCTGCTGATAGCGAGGAATTGGGTACCCCAACGACAATGTCCACATCTAACGGATTTTCTTGGGCTAATCGCTTACCCATTCGTTGTCGCGCGAGATGGACATTCACCCCGTAAAGGTTCGAATCTGGACGGGCGAAATAAATAAATTCCATCGAACAAATTGCTAGCTGAGTCTCGGTCGTAAAATGGCTAATTTTAACTCCCTGGTCGTCAATTTGGACTAGTTCGCCAGGTTCTACGTCCCGAACAAACTCGGCACCCACCGCCGTTAACGCACAAGTTTCACTTGCGATCACGAATGCGCCATTAGCTAATTGTCCAATCACCAAAGGTCGGAAACCATTGGGGTCCAGTGCTGCGTATAAAGCATTTTCCGTAAGAATTAGGTACGCGAACCCACCCTTAATTTGTCGCAAACTAGCCTTTAATTTTTCACTAAAACTCGCCTGCTTTTGGTGCTGAATTAGGTGCATTAGAACTTCGGTATCCGAATTGGATTGAAAAATTGCGCCCTGCTCTTCTAACTGGTGGCGCAGCGTAATTGCATTTGTCAAATTACCATTATGGGCCATCGCCACGTCCCCTTGTAGATAGTGAAAAAGCAGCGGCTGCACATTTTCAACCCCGCGGCTTCCAGCCGTACCATAACGGACATGGCCAATTGCACTGCGCCCAATTAAGTTCGTTAAGTCATCCGGGTTACTGAATACGTCCGCTAAAAGACCTAGGCCTTTGTGGATGGCAAATTTTCCCGTGGGAGTACGGGTTACGATGCCCGCCCCCTCTTGTCCGCGATGCTGTAAGCTGTGTAATCCGATATACGTTCGTTGAGCTGCATCAGAATCTTGCCAAACTCCAAAAATACCGCATTCTTCGTTGAGTCCCTTTAATTCAGTTGCCATGCGAGTGCTTCCTTCCAACTAGTTTCGGCCGCCGTTAAATCAACGTCCAACATGTCATCAGTGGTTAAGATTTTAAGCCGATCACCCCCTACATGCCCTAATGGCGTTGCTTTGCCAGCAGTTTTAGCTTCAAAATGCGCCCGGTTTGCTGGCGTAACGGTTACGAGGAATCGCGATTGGTTTTCAGCAAATAATTCGGCGGCCGCTAAGTCAGTTTGCACGTTAAACCCGATTTTTCCTGCGAAGGCACTTTCTGCGAGGGCGATCGCTAATCCACCTTCTGCCAAATCGTGCGCACTAGCCAAAAGTCCTTCATGAATTAGGTCGCTTACTAAGCGTTGTTGGTCAATTTCGTATTGCAAATCAAAGTCGAACAGTTTACCTTCCACGTGGCCTAATTGCATTTTTTGGAGTTCACTACCGTTTAAGGCATCCGTAGTTTCGCCTAAAACATAAATCAAATCACCCGTTTGTTTAAAATCTAAGGTGGTTATCCAAGCTGGATCTTCAATTATTCCGACCATGCCCACCATGGGCGTAGGGTAAATTGATTGCCGATTAAATTCGTTGTACAGTGAAACGTTGCCCGAAATCACGGGAGTATCAAAAACATCGCAGGCTGCGGCCATTCCATTAATGGCTTGGGCTAATTCGTAGTAACATTCTGGATCTTCTGGGCTCCCAAAATTCAGACAATCGGTAATTGCTAAAGGCTTTCCTCCCGTTGCCACCACGTTGCGGGCGGCTTCGCTAACGGCAATTTGTCCTCCAAGGTAAGGATCCAAGTATAAGTAACGGGGATTCGCGTCGGTAGTCATTGCGAGTGCTTTTTGGGTCCCGCGGATTCGAACTACTGCAGCGTCACTTTGAACGGTTGAAATCGTGTTAGTTTGTACTTGTGCATCGTAGCGTTCAAAGATTGCTTCTTTATTAGCAATCGTGGCTTGACGCAACATGGCATTAAAGGTTGCCGTCAAATCCTTAACTTGCGGTTGAAATTGCTTTCCATCGCCCTTGACACGTTGCGGTTTTTGGCTTGGTCGATGATAAGTCGGTGCTTCATCAACTAACGCATGAATTGGGACATCGGCTACGGTGGTCCCTTTAAAAATCAGTTGATATCGCTGGTCTTCGGTGACCTCCCCAATTTTTACAGCGATACTGTCATATTTTGCAAAAATTTCCTCTACTTCACGTTCGTGCCCCTGCTTAACGCAGAGCAACATCCGTTCTTGGGATTCAGAAAGCATTAATTCGTAGGGAATCATGTCTGTTTCCCGTTGAGGAACCAAGTCAAGATCCAAGCGCATCCCAAATCCCGCTTTGGCCCCCATTTCCGCTGATGAGGAAACTAAGCCCGCCGCCCCCATATCTTGAATCCCTACCAACCATTCGGCATGGTTATTAATTAATTCTAAGCAAGCTTCCATTAACTGTTTTTCGGCAAACGGATCCCCAACCTGGACCGCCGACCGTTGTGTAGCCTGTGCATCATTAAACTCAGTAGAAGCAAAAATAGCGCCTTGAATCCCATCTCGGCCAGTTTTAGCGCCCACATAATAGATTGAATTGCCGACCCCTGCGGCAGCTCCCCGCTGTTGGTCAGCAACGTTCAACAAGCCCACGCACATGGCGTTCATCACCGGGTTATTCTGGTAAATCGCATCAAAAGTCGTTTCTCCACCAACCGTAGGAATCCCCATGCAATTACCGTAGTCGCCAATTCCCGCTACGGTTTGGTCCACTAAGTATTTTGTCCGGGCGTCAGTCAATTCACCAAAATGCAGACTGTCCATTAACGCGATTGGTCGGGCGCCCATGGAAAAAATATCTCGAATAATGCCGCCCACGCCGGTTGCCGCACCTTGATAAGGTTCCACTGCCGTAGGATGATTATGACTTTCGGCTTTAAAAACTACCGCCTGCCCGTCGCCAATATCGACAATGCCAGCACCTTCTCCCGGTCCCTGTAATATTTGCTGACCCGTTGTGGGAAATTGTTTTAAAAGTGGCTTAGAGTTTTTATACGCACAATGCTCGCTCCACATGGCAGCAAATAATCCTGTTTCAGTGAAGTTAGGGAGTCGACCCAATGTGTTCCTGATCTGGTTAAATTCGTCTTCGCTTAGTCCCCACTGGACATATAATTTTTGATCCTTAATTTTGGTCGGTGTTAATTCCGTCATCATCGCAAAATCTCCCCTTATTAAACGTGTTGCGTGATACTAGCAACTAAACTTTGAAACAATATTTTTCCATCGGTTCCGCCTAAAACTGCTTCACTAGCTCGTTCCGGATGGGGCATTAATCCGAGTACGTTGCCCCCTTGGTTAGTAATTCCGGCAATGTTATCAGTACTGCCGTTAGGGTTGTTTACGTAACGCAGAACAATTTGGTTGTGTTCCTTCAAATCTTGTAAAGTTGTTTCATCGCAATAATAGTTTCCTTCACCGTGAGCGATAGGGAATGTTACGGTTTGCTTTAAACTAAATTGGCGGGTAAACGGCGTTTGGCAATTTTCAACAACCAATTTCTGGGGGCGGCAAATAAAATTCAAGCTCTCGTTAGGTCGCAATGCTCCGGGTAATAACCCGGCTTCGGTTAAAATTTGAAATCCATTGCAGACTCCGATCACTGGTTTTCCAGCTTCCGCAAATTCCTGCACCGCGGACATGATGGGCGAAAAACGGGCAATTGCGCCGCTTCGCAGGTAGTCACCGTACGAAAAGCCTCCCGGAATTAAGACGGCGCCGGTTTCAGCTGGTAAAACAGTCTCACGATAATCCACAAAACGCGGGGTGACCTTAAGAATGTCTCGTAAAACGTAATACATATCCCAGTCACAATTAGAGCCCGGAAAACGAAGGATGCTATATATCATTTTTCGCCCTCTTGAACGTCTTGAATCTCAAACCGGTAAGTTTCCATGTTAACGTTGGCTAATAATTCATCACACATTTTTTGGATTTGTTCGTTAACGTTTTGTCCGCCATCGGCCACCTGGATTTCGAAATATTTTCCCACCGTCACTTTTTGGACCTCTTGGTAATTCAAATGATGAAGTGCTTTTTTAATGGCAGCTCCCTGAGGATCCAAAATAGATTCTTTATAAGTTACGTAAACTTTAACTTTGTACATGCGCTTCCTCCTGTGAATTTATTAAACGCCGGAGTACCTCTTGATAAACCGTCACCAGATCACCCGTTTTTTTGCGGAAAACGTCCTTATCTAAGGAAGTCTTAGTGGTTAGATCTACCAACCGGCAAGAATCAGGTGAAATTTCGTCCGCAAGCATAATTTTTCCATTTGCGGTTTTGCCAAATTCAACCTTAAAGTCTACCAGTTGCAAGTGAGCCTGCCGAAACCGTTCCTTTAACAACCGGTTAATTTGGAGCGCTAAGTTTTCGAGGATTTCACCTTCTGCATAACTAATAATTTTCAAAGCAACGGCTTGATTAGTGTTGATAAATGGATCATCCAATTTGTCGGATTTATAAAAAAATTCCACAATCGGCTGGTCGAACTCTCGTAAATACGGCACCGCAAATTTTCGCTGAAAACTGCCCGCTGCTGCATTACGTACGACTACCTCTAGTGGAATAACGTCTACTTTGTAATTTAATTGTTCGGTATCGGAAATTTTTTTAATAAAGTCCGTATGAATCCCTTTTGCATCCAGCATTTTAAAAAGGATACAATCGATCTGATTATTCAAAGCTCCCTTGCCAATAACTTGGTCCTTTCGTTTACCATTTAACGCCGTTGCCTGATCTAGGTATTCAACCCACACCACGTCTGCCTCATCCGTATTATACAATCGTTTAGCTTTACCCTCTTTAATTAACGTCGTTTTCTTCATTGCTAATCTCCCAAATCTTTTCCGCTTGAATTGAATCTAAGCTTGGTTGCAGTTCGCCTAGCAAGGTAATGTGCCCCATCTTCCGGTTCACCCGACTTCCCGCTTTACCGTAATCGTGAAAATGCCAATGCGGCCGTTGTGCTAGCTTTTGGCGGGCTAATGTTAAATGTTGCCCGAGTAAATTGACCATCACTGCGGGGGCGTGTTGCGTAATTTTCGGTATTTCAAGTCCACAGATACTGCGAACGTGGGCTTCAAATTGTGAAATGTTACAGGCTTCAATCGAGTAATGTCCCGAATTATGGGGACGAGGGGCTAATTCATTCACTAACAAACGGTCATCAGCTAACATGAAGAATTCAATCCCCAATACTCCTCGTAAACATAAACCTTGCGCAATTTGCCGAGCAATTTTTTGTGCTTTTTGCTGAACCTCTTCCGTTACCCGTGCTGGGACAATGCTTTGATGGAGAATATGGTTGTGATGGATATTTTCCGCTACTGGAAAACATCGCACCTGGCCATCCCGGCTTCGCGTCACCATTACCGATAATTCTTTGCTGAATTTCTGACGCTTTTCCAAAATGCACGGTGTTTGGGATACTAAACTCCGGCCCGCTGGCAAATCGGCCTCTGAATTAATATCTTGCTGACCATGTCCGTCATAACCGCCCTCACAAGATTTTAAAATGCAAGGGTACCCTAGCTTAGTAATCGCGTCATTTAGCTCGGTTGGATTGCTGACGGGTTGATAAGGCGTTATCGGGAGGTCGTGGCTAGCAAGAAAATGTTTTTCACGAAGACGATCACTAGTTACGTATAGCAAATTAGTCCCTTGCGGAAGAGCCGCTAACTTTTGTGCAGCCTCCAAGCTAACTAAATCGACATTTTCAAATTCATAAGTTAAAACGTCGCTACGTTCGGCCATCTTTAATAGGGCTTGCTGGTCGTTATAAGCGGCCACGATTTGAAAATCACTAACCTGACCAGCCGGACAGTTAGGGGTCGGATCTAAAATACCCACCTTATACCCCATTGCCTTGGCAGCCAGCGCGATCATCTGTCCTAATTGGCCGCCTCCAATAATTCCAATCGTTGCTGGCGGTAGGTATACACCCGCTTCACCACTGCTTTTCACTATTCTGGGCCTCCTGTGTTTGTTTTTGCCGAAACTCAATCATTTTTTTAGCAAGCCGCGACTCGGTAACCGCTAAAATTTCGATTGCCAGTAAAGCTGCATTTTTAGCCCCGGCCTGTCCAATCGCCGTGGTTGCTACCGGTACTCCGCTGGGCATCTGCACAATTGACAATAAAGAGTCCAAGCCGTGCAACGCATGACTTTCAATCGGGACGCCCACCACCGGCAAAATGGTGTTAGCCGCTAACATTCCTGGTAAATGCGCAGCTCCACCAGCTCCCGCAATTATTACCCCATAACCATCCTTTTGGGCTTGCTTGCCAAATTTTTGAAGTTCACTAGGCATCCGATGCGCTGAAATTACGTGTCGCTCATAAGCCACCTCAAACTTATCAAGCATCGCTGCCGTTTCCTTCATCGTGGGCCAATCGGAAATTGATCCCATTACTACCGCAACTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053421|1092095:1100658|1092095_1092677_-|WP_008840996.1|DBSCAN-SWA MIKIAIFASGTGTNFVALARHIEETNVPIRIACLVCDQPDAPVVEKAVRLGIPVWTHRLGEFADKTAYEQAILLELQKYDLKLIVLAGYMKIITEVLLEAYPQAIINIHPALLPAFPGRHGIEDALAYGVKVTGVTVHWIDDGIDTGPIIAQRAVPILPNDDVAKLAQRIHQVEHELYFVSLCEVLKQRKLIK >NZ_CP053421|1092095:1100658|1098072_1098333_-|WP_008841001.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTYKESILDPQGAAIKKALHHLNYQEVQKVTVGKYFEIQVADGGQNVNEQIQKMCDELLANVNMETYRFEIQDVQEGEK >NZ_CP053421|1092095:1100658|1099031_1100192_-|WP_008841003.1|DBSCAN-SWA MKSSGEAGVYLPPATIGIIGGGQLGQMIALAAKAMGYKVGILDPTPNCPAGQVSDFQIVAAYNDQQALLKMAERSDVLTYEFENVDLVSLEAAQKLAALPQGTNLLYVTSDRLREKHFLASHDLPITPYQPVSNPTELNDAITKLGYPCILKSCEGGYDGHGQQDINSEADLPAGRSLVSQTPCILEKRQKFSKELSVMVTRSRDGQVRCFPVAENIHHNHILHQSIVPARVTEEVQQKAQKIARQIAQGLCLRGVLGIEFFMLADDRLLVNELAPRPHNSGHYSIEACNISQFEAHVRSICGLEIPKITQHAPAVMVNLLGQHLTLARQKLAQRPHWHFHDYGKAGSRVNRKMGHITLLGELQPSLDSIQAEKIWEISNEENDVN >NZ_CP053421|1092095:1100658|1093725_1095195_-|WP_166481451.1|DBSCAN-SWA MATELKGLNEECGIFGVWQDSDAAQRTYIGLHSLQHRGQEGAGIVTRTPTGKFAIHKGLGLLADVFSNPDDLTNLIGRSAIGHVRYGTAGSRGVENVQPLLFHYLQGDVAMAHNGNLTNAITLRHQLEEQGAIFQSNSDTEVLMHLIQHQKQASFSEKLKASLRQIKGGFAYLILTENALYAALDPNGFRPLVIGQLANGAFVIASETCALTAVGAEFVRDVEPGELVQIDDQGVKISHFTTETQLAICSMEFIYFARPDSNLYGVNVHLARQRMGKRLAQENPLDVDIVVGVPNSSLSAAAGVAEQLGVPNEMGLIKNQYSSRTFIQPTPKLREQGVEMKLTVLSAVVAGKKVALVDDSLVRGTTSKYIVKMLKKAGAKAVHLMISSPPLKYPCFYGIDIEHTRELMAANLTVKEMRVAIGADSLHFLSLPGLIEAIGLHQDVPNDGLCVAYFDGKYPTPLYDYAAGFEVPKTAKDTTLSSTGVAKEK >NZ_CP053421|1092095:1100658|1098319_1099054_-|WP_008841002.1|DBSCAN-SWA MKKTTLIKEGKAKRLYNTDEADVVWVEYLDQATALNGKRKDQVIGKGALNNQIDCILFKMLDAKGIHTDFIKKISDTEQLNYKVDVIPLEVVVRNAAAGSFQRKFAVPYLREFDQPIVEFFYKSDKLDDPFINTNQAVALKIISYAEGEILENLALQINRLLKERFRQAHLQLVDFKVEFGKTANGKIMLADEISPDSCRLVDLTTKTSLDKDVFRKKTGDLVTVYQEVLRRLINSQEEAHVQS >NZ_CP053421|1092095:1100658|1092676_1093723_-|WP_008840997.1|DBSCAN-SWA MTKNAYEQAGVNIAAGEEIIEGLKQAIGEQGPHILNGIGNFAGCYQLSEDQLDDPVLVAGADGVGTKVLLAAQTGKVESLGQDLVAMCVNDLLAQGALPLFFLDYLAFSHLESDQTDAILKGILKACQAQSIPLLGGETAEMPGLYQDQHFDLAGFAVGLGAKRDLLSSAMVSEGDYLIGLPSTGLHSNGYSLVRKILFTDHHYQFDDYLPGIARPLIEELLEPTRLYGNAIRPLLQKRLLNGIAHITGGGLLENVPRMLQPNQQAEIKLVSWPKPAIFKVLTKLGKLSQTDRYQTFNMGIGMVLTVSPQQYQQVRDELDRQKEPYFKIGQVKRRPENAPAVVLLGAD >NZ_CP053421|1092095:1100658|1100175_1100658_-|WP_008841004.1|DBSCAN-SWA MKKVAVVMGSISDWPTMKETAAMLDKFEVAYERHVISAHRMPSELQKFGKQAQKDGYGVIIAGAGGAAHLPGMLAANTILPVVGVPIESHALHGLDSLLSIVQMPSGVPVATTAIGQAGAKNAALLAIEILAVTESRLAKKMIEFRQKQTQEAQNSEKQW >NZ_CP053421|1092095:1100658|1097401_1098076_-|WP_036685062.1|DBSCAN-SWA MIYSILRFPGSNCDWDMYYVLRDILKVTPRFVDYRETVLPAETGAVLIPGGFSYGDYLRSGAIARFSPIMSAVQEFAEAGKPVIGVCNGFQILTEAGLLPGALRPNESLNFICRPQKLVVENCQTPFTRQFSLKQTVTFPIAHGEGNYYCDETTLQDLKEHNQIVLRYVNNPNGSTDNIAGITNQGGNVLGLMPHPERASEAVLGGTDGKILFQSLVASITQHV >NZ_CP053421|1092095:1100658|1095179_1097384_-|WP_171461270.1|DBSCAN-SWA MMTELTPTKIKDQKLYVQWGLSEDEFNQIRNTLGRLPNFTETGLFAAMWSEHCAYKNSKPLLKQFPTTGQQILQGPGEGAGIVDIGDGQAVVFKAESHNHPTAVEPYQGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALMDSLHFGELTDARTKYLVDQTVAGIGDYGNCMGIPTVGGETTFDAIYQNNPVMNAMCVGLLNVADQQRGAAAGVGNSIYYVGAKTGRDGIQGAIFASTEFNDAQATQRSAVQVGDPFAEKQLMEACLELINNHAEWLVGIQDMGAAGLVSSSAEMGAKAGFGMRLDLDLVPQRETDMIPYELMLSESQERMLLCVKQGHEREVEEIFAKYDSIAVKIGEVTEDQRYQLIFKGTTVADVPIHALVDEAPTYHRPSQKPQRVKGDGKQFQPQVKDLTATFNAMLRQATIANKEAIFERYDAQVQTNTISTVQSDAAVVRIRGTQKALAMTTDANPRYLYLDPYLGGQIAVSEAARNVVATGGKPLAITDCLNFGSPEDPECYYELAQAINGMAAACDVFDTPVISGNVSLYNEFNRQSIYPTPMVGMVGIIEDPAWITTLDFKQTGDLIYVLGETTDALNGSELQKMQLGHVEGKLFDFDLQYEIDQQRLVSDLIHEGLLASAHDLAEGGLAIALAESAFAGKIGFNVQTDLAAAELFAENQSRFLVTVTPANRAHFEAKTAGKATPLGHVGGDRLKILTTDDMLDVDLTAAETSWKEALAWQLN |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1138664 : 1145986
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP053421|1138664:1145986|DBSCAN-SWA GTTAGTCTTCACTGTAATATAGTAAACAAAATGCGCCCATGCCAGTGTGGGTAGCAATGATTGGCACCGTTTCACGAACCACAATATCCTTCACAGGGAAAAGTTCGCCAACGTGCTTCTTCATATCTTCAACCATTTCATCAGCATGCACATGTGAAATCCCGACTGACTTAATTTTACCGCTTTGTTTCATTTCTTCGTAAATATCAAGCCAGATCTTCTTCATGGCCTTCATACCACGAACTTTGTTAGCAACGTCTAATTTACCATCTTTTACCTGCAAAAGCAGCTTGATATTTAACAATCCGCCAAGCATTCCACTAACCTTACTAAGTCGGCCACCCTTAACTAAGTTTTCAAGGTTAACGATACCTAAATAAAGTTTAGTGTGGTCGCGAATGTAGGCAGCTCGTTCTAGAATTTCTTCTTTGGTTGCTCCAGCCTGAGCCATCTTAGCCGCTTCAATAACTTGAAAGGCTAGTGCCCGATCGGTAAATTGGCTATCCACCACCGTCACGTCGGACTTACTTAGTTCAGCAGCTTGTTGCGCAGTGTGTACCGTCCCACTAATGGCCGCAAGCATATTAAAACTAATCACCTGGCTGCCATCCGCACCTAACCGATCAAACATCTCAACGAATTTACCTAGCGGTGGTTGGCTAGTTTTAGGGAGTGAATTTGACTCGGCCATCTTTTGAATAAATTCTTCGTTAGAAATGGTCTCCCTTTCCACGTATACGGTGTCATCAATCATCACGCTCAATGGTACGATTGAAATATTATATTTTTTGATTTCTTCATCCGTTACACCACAGGATGAATCGGTGACAATTTTAATTTGAGTCATATGCTTCCACTTTCCCTTGTATCATAATTATTACGAGCCAACCAACGTCAATTAACACTTTCAATTAAGTTAGTAAAACTCGCTTGCTTAATAATATTATTATAACAATCTCTGTTGATTTTTGGCTGAATAATGCCGTTTTTTAATAAAAAGGTTGGGAAAAAACTAATAAAATGCTTTTCAAGGATGAAAAGGATCTTAAAAAGTTGTCTTGGTGTTTTGTCTTCAATAGAGCCAAAACGTGCGCCAAAAGTCAGTTTGTTCCGCTTAACCAAAAATTGACCATCATGCCCAATTCAGGCATCATGGTCAATTTTCAGTTAATGCTCGCAAATTACCCGACTTTTGTCCCACTCTCTTTCGTCATGGCTTTTTCATAGTTAATTTCACCCAAAATTAATTACGCTTGACCCATTGCTGAAAAACGTGGTCTGGAACTCCAGGTACACTTTTTCCCGGACGTTCTTCCTGTAAAGTAAACTTTTGTTTATCCACCACGGGAGCAAATACGTCGCATTGAAAGTCGCCAGTTACTTTAGTGATCAATAATTCATCCGCAACCGGCATTAACTTATGATATACCGCTGACCCACCAATTACGAAATGCTTTTCCGTTTTCGTAAGGCTAGCTAACAGTTCTTCGTAAGAAGAAAATCCCCGAACTTCCGAGGGCAAATGTTCCGGATGGTGAGTTAGTACCAGATTTGTTCGACGCGGTAACGGACGGCCAATCGACTCAAAAGTCTTGCGACCCATAATTACCGAATGGTCCAGCGTAGTTTGTCGGAAAAAAGCCATATCATCCGGTATATGCCACGGGATGGATTGCTGCCGACCAATTCCATGACGGTCATCTTCCGCCCAAATCATTGTAATCATGTAAATCTCCTAATTTCTTAAACAGCTACCGGAGCCTTGATGGTAGGATGTGGATCGTAGCCTTCTACCACAATGTCGGCTGGTTCGTAATCAAAGATATTTTCGTGAACTTGGTTAAACTTCAACCGCGGAGCCGGACGAGGGTCCCGAGTTAATTGTTCCTTAACTTGGGCAATATGGTTGCTGTAAATGTGCGCGTCTCCAAGGGTATGCACAAATTCACCAACTTCTAGACCACAAGTTTTAGCAATCATCGCCGTTAGCAATGCGTAACTAGCAATGTTAAACGGCACCCCGAGGAAAATATCCCCGCTACGTTGATAAAGTTGACAACTCAGCTTGCCATCAGCCACGTAAAATTGGAATAACGAGTGACACGGTGGCAAAGCAGCCGTTGGGACATCCTCTGGATTCCAAGCGGTCACGATCATCCGGCGCGAGTCAGGATGGTTCTTAATCAAATCAATCACGTTTTCAATTTGGTCAATAGTTTCTCCAGTACTGGTTTTCCAAGCCCGCCATTGACTACCGTATACATTCCCCAAATCGCCGTACTTAGCAGCAAAGGCGTCGTCTTCCAAGATCAACTTGGTAAAACGATCCTTTTGCACTTGATACTGTGCGTTAAAATCTGGATCAGTCAAGGCACGGTGCCCAAAATTGGTCATATCTGGCCCATCGTATTCGGCGCTCTCTACCCATTTTTTAAAGGCCCATTCGTCCCAAATGTGGTTCTTGTGTTGTAACAAATAGCGAATATTCGTATCACCCTTCAAAAACCACATCAACTCGCTTTTAATTAAGCCAAACGGCACCCGTTTGGTAGTCAGCAGGGGGAACCCTTCACTGAGGTCAAACCGCATTTGGTAGCCAAAGGTACTCAAGGTTCCCGTTTGTGTCCGGTCATTTTTTTGGTGACCATTTTCTAAGACGTATCTTTCTAGGTTCAGGTATTGTTCTTCGAGCATCCCGTTACTCCCCTTCTTCAAAACTTTCCAAATACTCCCAGCGCGCCATTTTATTCTCTAACTCATCGGATACCTGGTTGAGTTCAGCCTGAAGTTCCGATAGTTTGCCATAATCCGCAGCGTATTCGTTCATTTGTTCGGTAATTGTTTTAGATTTTTGTTCTAGTTTATCAATTTCTGCTTCAATTGTCTGCCATTCTTTTTCTTCGGCATAGGTTCTTTTTTTCTTCTTTTTTGGTTTAGCTACGGGAGTTGGTTCCGTCCGGGGCTTAGCCGTGGTAGCGCTAGTGGACGTGGTTTGCGCCCGCTGTTTAAGGTAGTCGCTAATTTGACCAGTGTATTGTTCAATCTGCCCGTTACCATCAAAAATCAATAATTGATCGCTAACCTTATCAAGGAAATAGCGGTCGTGAGAAACCGTTAAAACGGTCCCGTTGAAATGTTCAAGGTAGTTTTCTAATACGGTTAAGGTGGCAATGTCTAAGTCGTTCGTCGGTTCGTCTAGTAATAAGACGTTGGGTTGCTGCATGAGAACCTTAATTAAGTACAACCGGCGCTTTTCACCACCCGAAAGTTTTTTAATTAAACTTCCATGCATAAACTTTGGAAAGAGAAATTGCTCTAATAAACTGGTAACGCTAATTTTTTCACCGTCCCGGTTAACAACTTCTTGACCAATTTCCTTGATGTAATTAATTACCCGTTTGTCTTCTGGAATGGGTTCCATCTTCTGAGTATAATAGCCAATTTTAACCGTTTCACCAATGTCAATCGTCCCGCCTTGAATGGGGAGCTTTCCAGCAATCGCGTTCAAGAAGGAAGATTTACCCGCACCATTGGCCCCGGTAATTCCAATTCGATCGCCAGCTTGAATCAACTTGGTAAAGTCACGGGCAATCGGGTGGTCCCCCACCTGCAAATCAAGGTGCTTGATTTCAATAACTTTTTTTCCCAATCGTTGTTGGGTTAGTCCAATCTCAACGTCTTGGTCAATTTCCTTAGGCGCATGCACGTCTTGATCAAGTTTCTCAAACTTGTTAATTCGAGCCTGTTGCTTTGTTCCCCGGGCTTTAGGACCCCGCTTAATCCATTCCAGCTCTTGCTTATAAAGCTTGTACTTCTTTTCTTGGCTAGCTTCATTTTGCTGTTCGCGTAACGCCTTTTGTTCCACGTATTTAGCATAATTACCTTCATATTCGTACAGGTGACCGAAGCTTAGTTCCCAGATGTGGTTGGTTACCCGATCTAAGAAATACCGGTCGTGGGTGACTAGTAAAAGGGCACCCTTGTAATCGGCTAAATACTTTTCTAGCCACTCAATTGAGTCAAAATCCAAGTGGTTAGTGGGTTCGTCCAGTAGCAATAAATCCGCGGGTTCTAATAAAGCCTGCGCTAGCGCAATTCGCTTTACCTGGCCCCCTGATAGTTGGTTAATTGGGGCATCCAGCATATCCACGTGGAGTTGCGTTAGGATTGTCTTGATATTGCTTTCGGTATTCCAGGCGTCCAGCCGGTTCATTTCATCTTCGGCTTTGGTAAACTTCTCAAAAATCGTGCTTGAAGTGGGATTATCAGTATATTGAGCTAAAACTTGCTCGTAACGTTTGATGACCCGAAAAACTTCTTGGTCACCGCTATAAATAAAATCTCGAACCGTTTCATATTGGTTAATCTCCGAGCTTTGCTTTAAGTAGGCAATCCGGTAATCGTTGGGAGCTTCAAACTCGCCGCTATCGGCCGGATCAATCCCAGCGACCGCGTTTAAGAGATTGGTTTTTCCTGACCCGTTCGTCCCGATCAACCCAATCCGATCATTTTCGTTAATGGTGAAATTAATCGACTGAAAGAGTTGCTTTTCCCCATATGTTTTGGTTAAATTTTTAGCCTTTAATGTTTTCATTCTCAATCATCTTTCCCTAATTTTCGTGCTGCTGTAAACAATGCTTCTGGTTGGTTCGGTAATTGATCGTTAATTACCATAGTTTTTAAGGAGTTTAAAATCCGCCCCATTTGGGGTCCCGGAGTGACGATCTGGTTTGCAATCAAGTCCTTACCGGTCACCGCTAATTCTTTAGGTGATTTGATTTGTAGCGTTTGGTAAGTATCCAACCATCCCCGTTCGTCATGGCCTAAAATTTGCGCCACCCGGACTGCGTTAGCAACGCTATCAGCACCAGCTTCAAATAAAATTATCCGATCCACCCCGGGACTATCCAGCATGCTAAGTACCCGAACGGTTGCCGTAACGTGGCGAATCAATTCGTTAGAGGTCTTCCACTGTTTTAAAAAGCGGTTAATTTGTGCGCCGCGTAGCTGCAACATCCGCGCTAAAAGCGCCCAAACTTGGGTTTCGTTTTCTAACTGGCTTAGCGGATAAGCCAGTAATTCCTGCAGTACGGCTCCCTTACCGGCTAATCCTGGACAGTATTCATTGAGCCGCGTGGCAACCATATCAGCTAGCCCTCGGTTAGGGTTAGTTCCTAGCATCATCTTTTGAAACTCTACTAGGGTTCGTTCCACCGAGATTTTAGCCAACAAACTGCTATTCATTTTAATGGCCGCTAACGTTTGCGGTTCGATCACAAAATCTAATTGACTAGCAAACCGGACTCCGCGCATCATTCGCAAAGCATCTTCGTGAAAACGCGCCTTAGGATCCCCAACGGCGCGAATTTTATGCTGTTTAAGGTCGGTTAAACCGTCAAAAACGTCAATAACGGTTCGATCTTCCCGTAAGGCAAAGGCGTTAATGGTAAAATCGCGCCTCATTAAGTCTTCCTTTAGTGACCGGACGAACGTAACCTGATCAGGCCGCCGAAAATCTTGGTAACCACTTTCCGTTCGAAAAGTGGTGATTTCGTAACTATGTTCTCCAGTTAAAACCATTACGGTTCCGTGTTCGATTCCCGTATCAACGGTTCGTTTAAAAATTTGTTTAATTTCAGCGGGATAAGCACTCGTCGCAATGTCCACGTCGTGAATGGGCTTACCAAGTAACGTATCCCGGACGCTACCGCCCACAAAATAAGCTTCATATCCAGCTTCTTCGATTTGTTGTAACACGTTTCGTGCTTCTTCAAACTCTTGTGGCATTTTTTCTAACTGCACCATTCTCACATCCAATCCACATTTAATACTACCAGAAACCACCCTGATTTTGAAAAGGAAGTTCCACTTCTATGGTATGATATTTGCAAGTACTGCATAAGGAATAAGGAGGTTGTTTATGCAAAAAGATGAATCAATTCGGTTGTTAGATTTCGTCATGATTACGCTAGGCTGTTGTCTGTACGGGCTCGGCCTTGCCGTGGTTAACATCCCCAATCACCTCGCGGAGGGTGGGATCACCGGGGTAACTCTGATACTGCGGGCCTTGTTTGGGATTGATCCCGCGCTTTCCACGCTGTTAATCAACGTTCCCTTAATTTTGATTGGTTACCGCTTTTTGGGTAAGCGTTCCTTAATTTACACAATTTTTGGAACGTTAGCACTTTCATTTTGGTTGTACTTTTGGCAACGCATCCCCATTAGCTTGGATATTCATCACGACATGTTCATTGCCGGAATTCTCGCCGGGATCGCCGGTGGTTTCGGGAGCGGGGTCGTTTACCGTTTTGGTGGAACTACCGGTGGAACCGACGTCGTTGCCCGAATTTTGGAAAAGCGCCGCGGAATTGCAATGGGACACACCCTTTTCGCGCTTGATGCGGTTGTCTTAACCATTTCGCTTTGCTACATTGACGTCTTGCACATGATGTACACGTTACTAGCTGCCTACGTTTTCTCCCGCTTAGTTTCCCTGACCCAGGTCGGAGCTTACGCCGGCCACGGCTTAATCATTATCAGTGATCAAAATGAAGAAATTGCAGAAGCCCTTATGGACGAGCTCGGTCGTGGTGCCAGTTACATAAAAATGACGGGCGCGTATTCCAATAACGAACACCAGATGGTTTATTGCGTAATCGGTCCTAACGAACTCAACTTAGCTAAACGAATTATTGAACGCGTCGACCCCCGCGCGTTTACTTCCGTAATCGACGTTCACGAAGCCATTGGTGAAGGATTCACTTACGATTCCGATAAACAACCTGAATAATACAAAAAATGCAGAAGTCGCCAATTGGCAATTTCTGCATTTTTATTAACGCTGCCTAACCTTTAAAATACCGTTAAATCAGAATATTTCGGAGTTAACTCATTAAAATCATAGGTAGCTAAATTTTTAATATCTTCTCCATGGAAGAATGCTGCGTGACTACGAGCCAACATGAGGTTAATCTTGTCGGTGTCGTCAAATTGAACTAAAATAACTGGTTTGCCATTTTCAAATGCGGCGCCAATTTCAAATACCGTTCCAGGATCTGAAATCACTTCTTCATCTTGTTTAGCATAATCAAGAATTGCAACCACCACGTCTGATTTACGAACTTGACGAACGTCAGCTTCAAATACGCCAACTTGCCACTTAAAAGTACCAAACTTTTCTGCTTCGTATTGGTGATCCATTGGAACGTAGATGTTATCACCGTCGATCGTCGAATTTTTCTTTAAAAGTTCTTCAACCTTCCGTACCCGTTCAATTTGTAAATCACTGAAGAAAGGTGCTGCTAAATATACCGAATTTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP053421|1138664:1145986|1145515_1145986_-|WP_002830304.1|DBSCAN-SWA MANSVYLAAPFFSDLQIERVRKVEELLKKNSTIDGDNIYVPMDHQYEAEKFGTFKWQVGVFEADVRQVRKSDVVVAILDYAKQDEEVISDPGTVFEIGAAFENGKPVILVQFDDTDKINLMLARSHAAFFHGEDIKNLATYDFNELTPKYSDLTVF >NZ_CP053421|1138664:1145986|1144583_1145453_+|WP_008841059.1|DBSCAN-SWA MQKDESIRLLDFVMITLGCCLYGLGLAVVNIPNHLAEGGITGVTLILRALFGIDPALSTLLINVPLILIGYRFLGKRSLIYTIFGTLALSFWLYFWQRIPISLDIHHDMFIAGILAGIAGGFGSGVVYRFGGTTGGTDVVARILEKRRGIAMGHTLFALDAVVLTISLCYIDVLHMMYTLLAAYVFSRLVSLTQVGAYAGHGLIIISDQNEEIAEALMDELGRGASYIKMTGAYSNNEHQMVYCVIGPNELNLAKRIIERVDPRAFTSVIDVHEAIGEGFTYDSDKQPE >NZ_CP053421|1138664:1145986|1143259_1144468_-|WP_008841058.1|tRNA|DBSCAN-SWA MVQLEKMPQEFEEARNVLQQIEEAGYEAYFVGGSVRDTLLGKPIHDVDIATSAYPAEIKQIFKRTVDTGIEHGTVMVLTGEHSYEITTFRTESGYQDFRRPDQVTFVRSLKEDLMRRDFTINAFALREDRTVIDVFDGLTDLKQHKIRAVGDPKARFHEDALRMMRGVRFASQLDFVIEPQTLAAIKMNSSLLAKISVERTLVEFQKMMLGTNPNRGLADMVATRLNEYCPGLAGKGAVLQELLAYPLSQLENETQVWALLARMLQLRGAQINRFLKQWKTSNELIRHVTATVRVLSMLDSPGVDRIILFEAGADSVANAVRVAQILGHDERGWLDTYQTLQIKSPKELAVTGKDLIANQIVTPGPQMGRILNSLKTMVINDQLPNQPEALFTAARKLGKDD >NZ_CP053421|1138664:1145986|1141361_1143257_-|WP_008841057.1|DBSCAN-SWA MKTLKAKNLTKTYGEKQLFQSINFTINENDRIGLIGTNGSGKTNLLNAVAGIDPADSGEFEAPNDYRIAYLKQSSEINQYETVRDFIYSGDQEVFRVIKRYEQVLAQYTDNPTSSTIFEKFTKAEDEMNRLDAWNTESNIKTILTQLHVDMLDAPINQLSGGQVKRIALAQALLEPADLLLLDEPTNHLDFDSIEWLEKYLADYKGALLLVTHDRYFLDRVTNHIWELSFGHLYEYEGNYAKYVEQKALREQQNEASQEKKYKLYKQELEWIKRGPKARGTKQQARINKFEKLDQDVHAPKEIDQDVEIGLTQQRLGKKVIEIKHLDLQVGDHPIARDFTKLIQAGDRIGITGANGAGKSSFLNAIAGKLPIQGGTIDIGETVKIGYYTQKMEPIPEDKRVINYIKEIGQEVVNRDGEKISVTSLLEQFLFPKFMHGSLIKKLSGGEKRRLYLIKVLMQQPNVLLLDEPTNDLDIATLTVLENYLEHFNGTVLTVSHDRYFLDKVSDQLLIFDGNGQIEQYTGQISDYLKQRAQTTSTSATTAKPRTEPTPVAKPKKKKKRTYAEEKEWQTIEAEIDKLEQKSKTITEQMNEYAADYGKLSELQAELNQVSDELENKMARWEYLESFEEGE >NZ_CP053421|1138664:1145986|1140406_1141357_-|WP_005917050.1|DBSCAN-SWA MLEEQYLNLERYVLENGHQKNDRTQTGTLSTFGYQMRFDLSEGFPLLTTKRVPFGLIKSELMWFLKGDTNIRYLLQHKNHIWDEWAFKKWVESAEYDGPDMTNFGHRALTDPDFNAQYQVQKDRFTKLILEDDAFAAKYGDLGNVYGSQWRAWKTSTGETIDQIENVIDLIKNHPDSRRMIVTAWNPEDVPTAALPPCHSLFQFYVADGKLSCQLYQRSGDIFLGVPFNIASYALLTAMIAKTCGLEVGEFVHTLGDAHIYSNHIAQVKEQLTRDPRPAPRLKFNQVHENIFDYEPADIVVEGYDPHPTIKAPVAV >NZ_CP053421|1138664:1145986|1138664_1139510_-|WP_008841054.1|DBSCAN-SWA MTQIKIVTDSSCGVTDEEIKKYNISIVPLSVMIDDTVYVERETISNEEFIQKMAESNSLPKTSQPPLGKFVEMFDRLGADGSQVISFNMLAAISGTVHTAQQAAELSKSDVTVVDSQFTDRALAFQVIEAAKMAQAGATKEEILERAAYIRDHTKLYLGIVNLENLVKGGRLSKVSGMLGGLLNIKLLLQVKDGKLDVANKVRGMKAMKKIWLDIYEEMKQSGKIKSVGISHVHADEMVEDMKKHVGELFPVKDIVVRETVPIIATHTGMGAFCLLYYSED >NZ_CP053421|1138664:1145986|1139906_1140389_-|WP_008841056.1|DBSCAN-SWA MITMIWAEDDRHGIGRQQSIPWHIPDDMAFFRQTTLDHSVIMGRKTFESIGRPLPRRTNLVLTHHPEHLPSEVRGFSSYEELLASLTKTEKHFVIGGSAVYHKLMPVADELLITKVTGDFQCDVFAPVVDKQKFTLQEERPGKSVPGVPDHVFQQWVKRN |
7 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1483109 : 1522202
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053421|1483109:1522202|DBSCAN-SWA CGTGAGCGTCTACCAGGCACTCATGCTAATGTTGGCATTCGCAACCTTCGTGATTGCTTTGCTGACTTTTGTTTTCACGTTCTGTGCATAATAAAAGACCGTCCAGTTAACTTTGGCAGGTTGCGGACGATCTTTTATTAGATAACATGTAACCAAGCCACCGTCTTTAAAGTGGCTTGCTTTTTTCTGTACACTCATAGTTTACCATTAGTGGCCATCTGTAGCAAATCTTCCAAAAGTGCTGAGTATAAGATATTTTGTCGCTTGGGAACAGCGGAAGTTGGGGGAAATAACAAAAACTCATTCGTTTAAACAATATATTTCTGAAGCTTTCGATCATGGAAAATATATGGTTATTCAGCAAGGAGAAAATCCTATAGCCGGTTATGCAAATGGTGATCCGTTTGAGAATTTTAAGGATGTAACATTATTTGGAGACCACACTTTATCATTATTTAAACCTCAAGAAAAATTTTTTGTAGCATCAGATGGAATTAAGATATTATCACCATCTCTAAAGATGAATGGAATGTTCTATTATTATCTACTAGAGAAATATAGACCTCAAAGCGAAGGATATAAAAGGCACTTCACTATAATGAAAAAAAGTACAGCATTGTTTCCAATCGAAATTGATGAGCAAATTAAAATTAGTAATTTTTTGGAAGAGCTTGATTCTCTCATCGCCCTTCATCAGCGTAAGCCAAATACACTATTTTCCTAACTCAAACTAGATAAGTATCTCATGACCAAATCATTGTCTTGATTTTCCAGTTCATTGATGATATGCATGTACACTTTCTGTGTAGTCGTAATCGAAGAGTGCCCCAACCTCCGCGAGACACTCGCAATTGATACACCGGCAAACATCAACAACGAGGCGTGTGTATGACGTAACCCATGTAATGAAATTTCTGGTATGCCGCAGTTCTTACAATGATGGGCAAGCCACTTATTAGGGGTTGAGTTGCAGACTGCCCCATTAACAAAGATAGGCTTATCAACTTCAAGTCCATTGACTAATTGTTGAAACCGCATCCCTAATTGCCAGTCCATCTGTACCTTTCTGATGGAACTGCGATTTTTTGTCGGCTGGAAGCCTGTATTATTCTTGTAGTCCCAAGTCTTACTTATTGAAATCGTTTGTCTTGCAAAATCAAAATCAGCTGGTGTTAAACCTAAAGCCTCTGAAAAGCGGAGACCGGTTTTAGCGATTAACAGAATTAACCAGTCCCAATTTATAGAAGTACCTAAATTCAAATCCTCCAACAAACTATGGAGTTCGAATTGGTTTAGGTACTTCTTTTTCTTTTCTCTAGGAGCTTTTCCTTTAAAAATTGCCTTTCGAGTAGGATCTCTATCAATTAGCCCATCATCAACGGCATCTAAAATGGCGCCCTTCACTTGATGGTGGAAGTCAATGACTGTTTGACGTTCATGTGTCTCCGCATACTTATTTAACAGCTCTTGATACACATTCCTATCAAAATCTTTCATTTTTAAATCTGGCATAATCTGTGCCAGGTGCTGATAGTTGGTTCGGTACTTCTCTAGTGTAACCTGACGAACTGCCCCCTCCTTATACAGCTTAATCCAATGGGAAAAGTAGTCCTTGAATAAACTATCTCTTGTAAAATTGTCTTTAAACATTACTATGAACCTCCAATTTACCATTTTGGCTTACGCTGATGAAGGGCGATGAGGGAATCAAACTCGTTGAATAATCCTCCAATTTTTTCTTGTTCTCTAAGACTTTGAATCGATATCTGGGCATTCTTTATATTGTCAGAATTAATGCTTTCAAATGTTGAACCTGTACTAAATCTTGTCCAATATCCGTTTATTTTCATTTTTGTGAGTAATTGGAAGATAAAACTATTTCCTTTTATAGCTGCTACACCGCGACCAAGAACTACGTCATAATCTGTCTTACCAATATCTCCTACTGGTGCACGAACGCTAAGGATTAAATCACCTTTTTCTGCTTGCTTGGTAATTTGTGTTGTCCATACTCTTGGAACAACATGCCCATTCTTCATATCGGCGTTTCCTTGAACTAAGATATGATCATTTGGATTTTCGGTATAGTTCTTGGAGGATGGAGATTGACCCATTGTTATTTCTACCACTTCCCCCAACTTCCGCTGTTCCCAAGCGAGATCAAAAAAGCCCGAGTTTTACCTCGAGCCTTCTACTATTTATATTGTTTTGTGGTATTCACCATCCATTTAGGTAATTTTTTCATCACCGTCATCTTATGCTTCAAAAGATTACCGCAACTTTTATCCTCAGCATTGGCAAATGAAATAGCTTTATTTAAATCAGCAATATACGGAACTACTTCCGGGTCAGCTGGATTATAATTTTGTACAGATTTCTGTAGTAAATCTTCGTCGATTCCCCATTTCCGTGCAAACTTATCAATTGCCTGGTTCAATTTCTGTTGCTTCCATTTTTCAAACTCATCATTGATGTCTTCAAACGATGCTTTTTGATCAGCTAAAACAACTTCATTCAAGAATTGTTTGATTAATTGGGCTTTTTGATACTCACCCTGATCACTCAAATCTTGAATCCAATCTTCAATCTTTTGTAGGTCCTCTTCGGTCAATTGATTATTATGGGATTGCTTCTTTTGATTGCCAATTAACTTCAGGATGGAATCCGCCGTAACTTGTTGAGTATCCACTAACTTACTCTGAGTACTAATCAATTCTGCAGGTGGCTCCACCGGTGGTTCAACAATATTAGTTCCCCTAAGGTTCTGGTAGGCACCACGATACTTCATCCATTGGTGTTCACTGATTGTAAACTTCTTATCAGACCACTTATATTCATAATATTGTTGTACACGACTTAACTGCTTAGCCGCTACTAGAAATGCATCCATAAACTTTTTGGTGGCGTCTACATCACTTTTCAGATCCATCCAGTTAGCAGGCTCTTTTAATGTTTCCCTCATCTCACCTACTAGCTTAGCGAATTTTTCAACAGCAACTCCATATCGTTCTACAATTGCGAGGCTTGATTTACCGCCGCTGCCATAAAGTTTCAAAGCTGTTTCAACTCGTTTTTTAGTCAGCGCCGGATACTGGAAGTTAACAATCATTCCGAAGTCTTTTTTATTCTTCTTAAACACCCGGTTGGTTCGTGAATAGGCTTGAATCAACCCTTGTAATTCCAATGATCTGTCAACGTACAGAGTGTTCAGCTTTTTAGAATCATAACCAGTCAAAAGCTGATCAGCTACAATAACGAGGTCGATGTTCTTAGGGTTTAAACCACTACCACCACGGGTTGCACGATCTACTAAATCCTCAAAGTAAGCATCACTACCAGCTTTCTTATCGCCAAAAGCAAACTTGATCCCGGTAAATTTTTCATAGCTGGTAAACATGCGCTCTACCAATTCCGGATTGGCGATATTATCTGGATCATTTTCATTGCCAAAACTAAAGGTAACGGCGATATTGAGTTTCTGCTTATTCTTAGCTATTTGTTTTTGAAACTCATCAAAATAAGCCACTGCTCGATCTTTACGAGCAACAGTTAAAATGGCATTGAATTCTTTGTTTTGTGATTGGTAGTCCCAATTTTCAAGAATGGTTTTTACTACTTGCGGGATATGCGTTTCGTCGCGATAAATCAGCAGCTTGTTCTTGAGTGCTTCTTCCTCAACTTGAACATTATCCATCCCCCGAACCGTACGTTCAATTGCCCGGGCATCAGCTTCTTCGTTTTGCTTCAATTTAATCTGTATTAATTGATCACGGAGATCTTCATAATTCTTGAATTCTCCCGTATTAATATAATCGACATTGAAACCGAGAACATTACCATCACGAATTGCTTCATCAATGGTGTAACGATGTAATTCTAGTCCGAATAATTTCTCAGTGGTATCAATTAGGCGACTTCTATTCCGACTGGTTACGATCTTCCCTTTAACATGGTTTTCTTCAAAAAGCGGGGTCCCTGTAAACCCATAGAATAAACCATTCTTCTTAAAGTAGCGCTTAATCGTCACCATCATATCGCCCATCGTAGTTCGCTGCGCTTCATCAATAATAAAGACAATTTTCTTTTCCGCAAGTGAAGTGTCATGGTTCTCCATGAGCTTTTTTACCAGCGAGTTCATTTTAAAGATCGTCGTTACCACGATTCCTGAACGTTTATGGTTCATCTGTTGAGCAAGTTGATGCGTTGACGGTGTATTATCAACTTCTACGGGCTCATATGCCGCATAAGCCTTGAAGTTATCAGCCGTCCGTTGGTCCAACTCGGTCCGGTCAACCATAAACACAACTTTGTCATAGCTAAGGCGAGTTGATAATACTAAGGCCGTTTTAAAACTGGTGATGGTTTTACCTGATCCGGTTGTATGCCAAATATAACCTCCGTGGGGCATTCCTAAGCGATCTTTACCCAGCGCTGCTCCTTCAATTGCTTGCAGGGCATAAACTTGGTAGGGACGCATCAGCATATGACGGCGATTATCCTTATCACTGGCTTCGTCAATAACCAAGTAGTCTCCTACCATTTGATGGGCCATCGGGATCATCAAGAAGTGTTTGATAACCTTCTGCCATTGGTTAATAACATTGTTCTCCCTGTCTGCCCAGTGAAAGACAAAGCTCGGGTTAAAGTCATTCAAAGACTTAGGAGTCGCAAAATAACGAGTTTCGATTTCCGAAGTAACCACCATCATCTGGGAGAAAGCCATAAAGTTATTCTGGTACTCGCCATCGCGGTAGTAGCGTTTAAATTGGCCAAATGCCTCGTCGAGATTTTTATCGGTTCGCTTTTGTTCAATGTTAATTAGTGGTAAACCGTTAATCAACAAGACAATATCAAACCGATTTCCGTGTGGAGTTTGCACTTCACGAGCAATTTGATAACTTGAATCCCCACCCCCTACTTGGGATTTCTTGAAAATTGTCAGGGTAATTTGTTCCCGGGTGACCCCTGGATTATCATCCCGGTAAATTCCATCAATCTTA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41 | Erysipelothrix_phage(73.91%) | protease,head,tail,holin,capsid,portal,integrase,terminase | attL 1483369:1483397|attR 1485238:1485266 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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