Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP042652 | Pseudoarcobacter acticola strain KCTC 52212 chromosome, complete genome | 0 crisprs | WYL,cas6,csa3,PrimPol,DEDDh,RT,cas3,cas14j,cas4 | 0 | 0 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
246641 : 316054
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042652|246641:316054|DBSCAN-SWA CTCAAATTTCGCTTCCTTTAATTATTTCTTTTAACATAGACATAAACTCGTCTTTGCTCATGTTTGATTGCTCTCTTGTTCTTCTGTTTCTTAAAGCAACAGATTTATTAGCAACTTCCTCATCCCCAATAACAACTATCATAGGAACTCTTTGTTTCTCTGCCATTCTAATTCTTTTGTTTAAACTTTCGTTCATATCAAAGATTTTAGAATCCATATCATTTTGTTGTAACTCTTTTTGTAACTGTTTTGCATATTCAACATGTGTATCTGCAATTGGAACAAAAATTACTTGTGTAGGTGCAATTGCAAATGGAAACTCTCCCGCACAATGTTCAGTTAAAATACCAATAAATCTTTCAAAAGAACCAAGAATAGCTCTATGAATCATAACAGGTTGTTCTTTTTCACCTTTATCATTGATGAACTCAGCATTAAATCTTGAAGGTAAGTTCATATCTACTTGAACTGTTCCACATTGCCATTTTCTACCAATTGCATCAAGAATTTTAATGTCGATTTTTGGACCATAAAATGCTCCTCCACCTTCATCAATACCATAAGAGATATTTTTTTCATTTAAAGCATCCATAATACCAGCAGTTGTTTTTTCCCAGAAAATATCATCACCGATAGCTTTTTCAGGTTTTGTAGAAACTTCAATTTCATATTTGAAATCAAACATTTTTAACAATGCATCAACAAACTCTAAAACTTCAAAAATAACTTCTTTTATCTGATCTTGTGTACAAAATATATGTGAATCATCTTGTGTAAATTCTCTAACTCTAAATAATCCATGCATTGCTCCTGACATTTCATGTCTATGAACAACACCATATTCAAAAAGTTTTTTTGGTAGGTCTTTATATGAAACTAAATTGTTTTTAAAGATTTGAATATGTCCAACGCAGTTCATTGGCTTGATTCCATACTCTTGTTCATCAATAGTAGTAAAATACATATTTTCTTTATAGTTTGCATAATGTCCTGAAATTTTCCACATTTCTGCTTTTAAGATTTCTGGACCACGAACAGGTTCATAACCTCTAACTCTGTGAGCTTTATATAAAAGATGTTCAAGTTTACTTCTAAGTCTTGCACCATTTGGCAACCACATAGGAAGACCAGCACCTACATCGTCATTAAATGTGAAAAGTTCAAGTTCAGTTCCTAATTTTCTATGGTCTCTTTTTTTAGCTTCTTCAATCATTTTTGTGTAATCAAACAATGCTTGTTTATCAAAAAATGCAATACCATAAATTCTAGTAATCATTTCATTTTTTTCATCACCACCAAGATATGCACCAGCAACTCTTGTTAATTTGAAACTTCTAATCATTCTAGTATTTGGTAAGTGAGGACCTCTACATAAGTCTTCAAAATCACCTTGTTTATAAATTGTTAAGGTATCATCTTTGATATTTTTAAGAACAGCTTGCTTTAATTCATCATTTTTGAATTTTTCAAAAAACTCTTCTTTTGTAGTTTCATGTCTAGTAATAGGTAGTTTTCTATCTGCGATTTCTTTCATCTTTTTTTCAATAGTTGGTAAATCTTCATCTGAGATTTTACTTTCTACTTTAAAATCATAGTAAAAACCTTCTTTTACAACAGGTCCAACGAAGAATTTTGCTTCAGGATAAAGTTCTTTGATAGCTTGAGCCATCATGTGCGCACAAGAGTGTCTTAAAATGTCCAAAGATTCTTTTGAATCATCAGCTTTAATCTCAACTCCTTGGATATTTAAAGCCAAAGCAGTTTGAAGGTCGTAGACTTGACCATCTTTTAATATACCAATAGGTTCCAATAAATTCCTTTTTTTCTTAATTATTTATTAAATTACGAATATTTTACCTCAAAGTGACTTAAAGTTATTGAGATATAACTTAATTTAGTAAATTTTTGTTACAATTGAGCATGATTTTAAACTTATCAAAAATAAAAACGCAAAGCCTATTGTTGTTTTGTAAAGACTTGATTTTCTCGTATAAAGACCAAAATGATATAGAAAAATATATTATTGATAAAGATGTTATAGAAAAATTTAATAATATTGGAAATGATATGTTAAAACAAATTTCAAATGTTACATATCCTCAGAATTATTATTTAGAAAATAGAAAACATTATAGAATCAAAGCTATTTTAGATGGATACAATTTTATAAACAATGAAATATCAAAAAATTTAAAACAAAATGAAGAGTTCAACCCTTCGATGCTTTATTTTTCACTTCTTGATTTATGGTTTAAAGAGTTAAATAAAGAGTCACGATCAAAAGAGTATATATATTTTATTATATATCCATATTTTCACGCTTATGATAAATTGTTAGTTGAGATGAAAAATAAAGAGTTTAAAAAGTTAAATATTCAAATGATAGAGTTAGCAGAAAAAGTGATATATAAATTTGACAAATACTCTTTTATTTAAAAGAGTATAAAAAGAGGAAAACCTCTTTTTATTTTTATATTAGAATCTATATCTCATATATGCTCTAACGTCTTGTGCAGATACAACATTTAAAGTTGCATCTGGATCACCATCTGCTCCAAAGAATGAGTTTGAACCAGCGTAATCATAATCCATGTAAACATAACTAAGACCAAAACTTAAAGCATCTGTTAGTTTTTGATTTCTATAAACTTCCCATGCTTGACCACGAGTTGCTATTTTACTTCCTGCATATGTATCTTCACCATATGTCATAGATCTCCAGTATTTACTACCTTGATTCCATTCAAATCCAATTCTAGAGTCATCAGGGCTAATTGGACATGGTGCATTTATTCCTAGCCATACAGATGTACCAATTTCAGAATCAGGCGAACCTAACATTTCTAAAGCATTTGGATTTGTTTTACTCATGGCAAATGAAGCAAAAGCAATAGTATCATCTAAATAATCTGAAATACCATTTCCAATACCTTCTGTTTTAAATAAAATTGTTGCATAATCCATATCTCCAACATCTTTGAACTCTGAATCAGTATTATCAAATCCAATTAAATTCCATGCTTTTGCATAATTTGTATAAACAGAATATTGTCCATCATCATAAGGAACAGCTATTATTCCTAATAAATCAACATCTACATTTAAATCTTCATCTTCCGCATATGCTATGGCTGAATTATCTGGATCAGTATCAAATCTAGGAATTGCATTTGTTAATCCTCTTCCTCCACAAATTTTAAACCATGAACCTCTAAGCCCAGTAGTTAATTCTGTATCAAACCTAACTGAAAAACCATCAAACTCTACATCAACAACATGAGATAAAGGTGAGTTTGCTTTTTGATCATTTCTAAGATTTATAGGTAATCCATCAGTTGAAGGTCGTCTACCAACTGAAGCATTCCATGGAACATCTGTACCGAAGAAAGTATTATTTGTATATAACCAATAAGCTTCTTTTAGTTTAATTGTATTATCTGTTGCATTTTCATTTGTTACCCAATCAAAGTTTGAATAACCAGTAGTATTTACATTTGATTGAGAATGATTCGCTGTATCCCCAAATGCTTTGTTGTAAGATAATTTTCCATGAAAAGATGAATTATCATCAGCTTTATATCCCATGCCTAACCATAATCTATTTGTCATTAGTGCATTATTTTTTGATTTTGAGCCATCTGCATGTTTGTATTGAATATTATCAACTTGTGTTCTAAAGTCAACATCCCATTTCAGATTGTCATTACCACTTTGGATTTTCGCAGAAGTTGCTGTTTTTGAAACAGTATCAAGTTTCTTCTCAATATTCTCAATTCTTTTTTCATCAACAACAGTTTGTTGAACAACTGGCTTTTGAGCTTCTTGCTCAGCTACTTTTTTTTCTAAAGCTTCAATTTGTACTTTTAAAGCTTGAATTTGATTTAACATCTCTTTGTTCATATCACTTGCAAATGATGTAACAGAAAATGCTGCAACTGCAGACAGCATTATTAGACTTTTTTTCATATATTTCCCTTTTTAGATTTTTATGTAACAATAAAATCGTTAAAATTAAAGCATAAAAAAAGGGTGATATTACTCACCCTTTAAATTACTTAATCAGCGATTCCAACTACTAACAAGATGGAACGTTACCAGAGTCATTTGCGAATTCAATAGAGAAATCTATAATGTGCTCTTGTAAAGATTCTTTAACATCGCCAGCTTTTACATTTGGACAAATTTTAATAAGTTCTTCTTCAAATTTTCCAGAAGCTTTTAATGCTTTCCATTCTTCTTGAGAATGTTTAGCTGCAAATTTTGCACCAGTCATACCACAAGGTTCTTTTAGTAATTTACTAAATAGTTTTTGACCTTTTGCTGCATCTGCTGATAAAGTAGATGAAGCAATACCTAAAGCTAGTGTACCAGCCATAATGATTTTTAATAATTTCATATTATTCTCCTAATGAAAAGTTCGCTATAATTATAACTAATATTTATAAAAAAGTACTTATAAAAAATTATAATAATAAAGAGAATCAAAATGAAGTATTTCCTATTAAAAGAGATAGTCGCATATCTATCAACAAATGTCCAGAATATAAAGATAATCAAGAGAATTGACAATAATATAATTATAATTGAATTTAATAATAAGAATACCTTATATTTTGATATGTCAAAAGGCAATAGTACTATATTTAAATGTGAAAAAAGCATATCTTCTAAAAAAGATTTTAATGCACCATTTGATATTGCACTTCAAAAAAGATTTATTAATTCAAAAATTGAAAATATTGAATTATATAATGATGATAAAATTATAAACATAAGAGTAAATTCTTTTTCATCATATAAAAAACTAACAACAATTTTACAGTTAGAATTTACAGGAAAACATACAAATATAATTATATTAGATGAAAACAGAGTGATTTTAGAGGCACTTAGACATATAGATGAATTTTCATCAAGCAGAGTTGTAAAAGTTGGGATAAAATTAGAAGAAATCCCAAAACAAAGTTTCATTCCTAAAATAGAAGAAGTTGTTGATATTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042652|246641:316054|277768_279046_-|WP_172128477.1|DBSCAN-SWA MKEKLKIFLNSEELFDEEKSKKFEDLIKYCHIDFKEEKTFKNLENLLKNNQNEERIFYFSTSSDFYETICKSLNDYKLISENSRVVLEKPIGKDLDSSKEINEKVLGYFKEEQIYRIDHYLGKDTVQNLLALRFSNKMFVPLWDANNIDHIQITLSESVGVESRWEFYNEYGAMRDMVQNHLMQLVCLLAMEPPHSLDPNAIRDEKLKVLNSLRNIEEKDMKDHTVRAQYVAGTIDGKEVQGYLDDGKSTSDTETFVALKIFIDNFRWSNTPFYIRTGKRMSSKNSEIVIQFKSIPYSIFDNYTMPNKLVISFYPDESITLNLMHKIPGLDEKMKLQEVSLELNPPRSFVRKNEAYERLLLDVIRANPTLYMRLDEVKAAWKWTDKIISAWQNNITPMETYKAGTNGPNSVVSMMAKDGRVWHEH >NZ_CP042652|246641:316054|290326_291130_-|WP_172124333.1|DBSCAN-SWA MIKCENLHVTFNHGLATEKLALRGIDLTIPSGQFVTVIGSNGAGKSTLLNTIAGDIETTHGHIFFNDREVTNLPATGRTKDIARVFQDPLAGTCGDLTVEENMALAYGRGQKGSLSLALNNQLRKIFQEQLSRLNLGLENRLNSQMGLLSGGQRQSVSLLMSALQPSSILLLDEHTAALDPKTAALIMDISAQIIKEKSLTVMMVTHSMRQALDYGSRTIMLHEGKIIFDLEGKERSNYEVKDLLNLFALARKDGEELDDDKLLLDS >NZ_CP042652|246641:316054|291126_292035_-|WP_172124335.1|DBSCAN-SWA 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53 | Bacillus_virus(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1088346 : 1137768
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP042652|1088346:1137768|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP042652|1088346:1137768|1114020_1114560_+|WP_172125849.1|DBSCAN-SWA MKNYHKSDFRKSCIKRLEFTSLFLKYYKNKIIVRELKKFIQRSGSKNILLYIPLGIEVDVKPLIVSLRKSRNKSVYVPYMQGDSFKIVKYRLPLHKKKFGIKEPNNSFVNPAKVDLAIIPVVGVDALNKRIGYGKGMYDRFFDRLNYKPTMIFTQLILCKSEHVLSDCYDIQADYIITN >NZ_CP042652|1088346:1137768|1092092_1093436_-|WP_172125811.1|DBSCAN-SWA MNSTKINKYFKTFAIQFSLLIIISGELMSSNLPKYHTKTLENGLEIVAIPMKNNSGVISTDVFYKVGSRNEIMGKSGIAHMLEHLNFKSTKNLEAGEFDEIVKGFGGMNNASTSFDYTHYYIKSASKNMDKSLELFADLMENLTLKDEEFQPERDVVAEERRWRTDNNPMGYLQFRLFNNAYIYHPYHWTPIGFMSDIKNWTIEDIKDFHSTYYQPKNAIVVVAGDIDENKVFASVEKHFKEIKNKKEVPALIHTVEPKQDGEKRVIINKDSQVEMLAITYHIPNFEHEDQVALSALSELLSSGKSSILQKKLIDEKRLVNTIYAYNMELKDPGIFMFMAVANEGVDAKEIENEILDTIAQIKKGEVSQKDIDKLKINTKADFIFSLESSTEVASLYGSYLVRDNIKPLLNYEENVAKLTKDDLIKVANKYLIKSNSTTVILKKEEK >NZ_CP042652|1088346:1137768|1126745_1127714_+|WP_172125868.1|DBSCAN-SWA 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45 | Bacillus_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1195198 : 1260783
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP042652|1195198:1260783|DBSCAN-SWA 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47 | Hokovirus(37.5%) | integrase,transposase | attL 1196719:1196738|attR 1241512:1241531 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2408612 : 2441013
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP042652|2408612:2441013|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP042652|2408612:2441013|2410840_2411140_-|WP_172127296.1|protease|DBSCAN-SWA MSNEIEIELNDELDLQEPKKYKVFLLNDDFSTMDFVIDVLVKVFRKSVDEASVIMINIHNNGKEICGTYSYEIAGTKVAQVKAMAREKGFPLKATMEEE >NZ_CP042652|2408612:2441013|2408612_2410838_-|WP_172127294.1|protease|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP042652|2408612:2441013|2420695_2422072_-|WP_172127312.1|transposase|DBSCAN-SWA MKILNHQMYIYNQAYNIFLNLWQKENSKNKKLDKEDRVFRNAVSYDTVVKRALRLRKLSFSTVVTQQARINFLKAVKKSFSKENVSKRLKAIEIATTPKEKVKAFKLGMPTFKSSRDIFQSFNWNNQGYQILDDINNNTRFKTLRLLKTNFRFRCHRTFPNNYKLSSITISKDAIGYYVSFGIEFNKQVGLVVSKDNLDITKSIGIDLNAYNFAISNNVDFIQDSNIAKVTLNHLIDNGATNRKGLKYKNTIKVHIRKQSRRVLNELKNCKQSKTKFKLGSNHKKTQKKLNKLTKRISNQKIDLYHKITAELTNKFDLIVVEDLKTKNMSKSSKGNEITHGKRVKQKSGLNRTILNASFYQFVSMIQYKTTMLNDKLFVKVNPQYTSQECSCCGNIDKNNRPKQDKFKCTACGFEINPDIQASQTILKRGLESFGLGTSLVDLNKHKAFRSTSLEVAS >NZ_CP042652|2408612:2441013|2434848_2435922_-|WP_172127357.1|DBSCAN-SWA MSMSQEEIEALMSGLDIDDDATDSEESSEKTKVNTQEIEELLAQTEDYKKVDSKSKSEEDSRVTIDDSKDIISKKEESRVKTDEIEQLLHDIETNSSSKFEEEDEEDSLEDLDLDSLDKLEDEVKPEEQVDLENLTVEEAPKIEVKENSLKEKDISEKKETRSDEDVAKDWTSSRIEEGVFPLPVEKDTKVVSQLNQVANDSEEKVSQIFDVLSLTLDNNNELRNSIKSMESFIASQTSLLESLNNKFPNIEVFEEHLNNIKTVSTTLNNLKLQSSTEDAQIFQAMELMQFNDINRQKIERVMSVIRKLSMYLNNLFEDDGTASNVAVAKHIHGDHSTDLAGDDLEKLITEFSDHKE 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29 | Agrobacterium_phage(12.5%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2449535 : 2504320
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP042652|2449535:2504320|DBSCAN-SWA 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59 | Enterobacteria_phage(23.08%) | integrase,tRNA,transposase | attL 2469898:2469914|attR 2512706:2512722 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2651720 : 2658699
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042652|2651720:2658699|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042652|2651720:2658699|2654598_2654829_+|WP_128359949.1|DBSCAN-SWA MALLDDVKEVVIEQLDCDPAEVKEDSKFIEDLGADSLDVVELVMALEEKFDIEIPDEDAEKILTVADAINYIENNA >NZ_CP042652|2651720:2658699|2657706_2658699_+|WP_172127749.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTQWIEKITNAASLEELENLRIDTLGKKGVLTLEFAKMKSVPNEEKKAFAENLNTQKTIITDAIEAKKEILEKEALNKKLEAEKIDVTRFNNEMSCGATHPVVETMDRIIRYFQNLNFAVEEGPLVEDDFHNFEALNLPKYHPARDMQDTFYNKDYTLLRTHTSPVQIRTMLTQNTPIRMIAPGTVFRRDFDITHTPMFHQIEALVVDEADKVSFANLKHVLVEFLQHMFGDVEVRFRPSFFPFTEPSAEVDISCVFCKGDGCRVCSQTGWLEVLGCGIVDENVFKAVGYENKSGYAFGLGVERFAMLIHNIGDLRSLFESDTRLLGQFK >NZ_CP042652|2651720:2658699|2652930_2653695_+|WP_172127739.1|DBSCAN-SWA MLEINEIFGPTIQGEGKLVGSPSVFIRFGKCNFKCEGFAVEYETPSGVKKCACDTYYAVDTEFKDTWTKYKSYEEIVNEVDKLISIYPYNYKIDIVITGGEPLLYWNKEEFQKLLEHYINAGHKVTIETNASLNLNIDKEYQKELLFSMSVKLSNSLEPIKKRININTLNTILNNTKESYLKFVIGKDFLNDAKKEINEILSLIPKCDVYLMPLGDTAEQINKNCEDVINMSIENGFKYCDRLHIRVWDNKRGV >NZ_CP042652|2651720:2658699|2653762_2654506_+|WP_172127741.1|DBSCAN-SWA MKFTGSNVLVTGASRGIGAEIAKTLAGFGLKVWINYRSGAEAAEKIKEEIETAGGKAAIIKADVTNEEEFAAAIKTIVDADGELAYLVNNAGITKDKLALRMSVADFNDVISANLTSGFIGCKEALKVMSKKRFGAVVNISSIVGEMGNAGQTNYSASKGGLNAMTKSFAKEAASRGIRYNAVTPGFIQTDMTHELKAEVKAEYEKNIPLSRFGNPSEIADAVAFLLSDHSSYITGEILKVNGGLYV >NZ_CP042652|2651720:2658699|2652404_2652938_+|WP_172127737.1|DBSCAN-SWA MYWKISKEFDFCYGHRVWSQTLNTEFSLDGCLKCRHLHGHQGKILVYLEASELKDGMVTDFKHLNWFKQFIDDVLDHKFILDINDPLFSTLLPHIDKNELIKFEEGYSLVNLTKFSNEEIHIKELYEGYIIVDFVPTSENLSAWFLKIVQKKMDKLGIKVSHVEFLETPKSKSTFYA >NZ_CP042652|2651720:2658699|2656264_2657203_+|WP_172127745.1|DBSCAN-SWA MAAYLEFEDKIKKIEDDIIIAKTKADEHAVEILEKKLEKEVEKTFKNLSDYQKLQLARHPDRPYALDYINGLLTNAYEIHGDRHYVDDHAIVCYLGFIGTQKVLVIGEQKGRGTKDKLYRNFGMPSPEGYRKALRAAKMADKFQIPILMLVDTPGAYPGIGAEERNQSEAIARNLYEFADLTTPTVSIVIGEGGSGGALAISVADKLAMMRYSVYAVISPEGCSAILWNDPTKVETAANALKITAENLKELKLIDDVINEPLIGAHRKKDEAIKALKDYFLTSLDELKKLTPAQRYEKKYEKIMNLGSFLEK >NZ_CP042652|2651720:2658699|2651720_2652404_+|WP_172127735.1|DBSCAN-SWA MSSKSTRKAICILSGGMDSTLASYIAKNDGYEIIAVHFNYGQRTQDRELKAFRDICDDLEILEKYEIDIPFFTQIGASALTDKTIDVPTGGVEAGVPITYVPFRNGIFLSITAAIAEKEGATAMYIGVVQEDSSGYPDCTDEFIADMKKAINQGTKKDTHIDILTPLVHLSKAQIVQEAMKLNVPLEHTWSCYKEEDEACGICDSCRLRLNGFKLANQIDPIKYKAL >NZ_CP042652|2651720:2658699|2657247_2657577_-|WP_172127747.1|DBSCAN-SWA MCIFCKIVKGEIPNQTILEDENFLAFNDINPTRKIHVLIIPKEHYDSFDVMPPKVMASMTEFIQKVASKLDVRQSGYRLITNIGDDGGQEVHHLHFHLIGGEPVGRLVR >NZ_CP042652|2651720:2658699|2654939_2656196_+|WP_172127743.1|DBSCAN-SWA MRRVVVTGIGTINSTGHNVKDSFEAVVNGVCGIDTITLFDASDFSVKIAGEVKDFDPTTVMDKKEVKKADRFIQLGIKAAHEAMIDSGYVTADNKKVDGSIADRFGIISGSGIGGLSTIERNSVVCETKGSRKVSPFFIPSSLANMLSGFISIEHNLRGPSLAHVTACAASTHALNDAVKTIMIGGADRILVVGAESAICGAGVAGFAAMKALSTRNDDPKKSSRPFDIDRDGFVMGEGAGALVVEDLELALARGANIYAEIIGFGESGDANHITAPVMDGPLRAMEAAFEMAKNITGEYPKIDYINAHGTSTPVGDKNETKAIKALFEGKDVPLVSSTKGQIGHCLGAAGAIEAIFTIKALNEGIIPPTINIENQDPECDLDYVANVARKAELTTVMSNNFGFGGTNGSVIFRKYTK |
9 | Campylobacter_virus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2698358 : 2710419
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP042652|2698358:2710419|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP042652|2698358:2710419|2702243_2703017_-|WP_172127831.1|DBSCAN-SWA MINVGILGSTGRVGSLLIDDLANDEQARVAAVHVFDKLTRQVPDGTVVTNDMKVLLDSSDVVIDFSAPAATEALLTQVVENGEGKPLVIATTGFNKHQQNLLIEASKIVPILYATNMSLGVAVLNKLVALASKTLSDFDIEIVEQHHRHKVDSPSGTALTLAEHAANARDLDLDEVRISGRDGQIGARTKNEIAVMALRGGDIVGRHTVGLYNDGEFLELNHTATARNTFSKGAIKVAKWIIGKDPKLYSINDALGL >NZ_CP042652|2698358:2710419|2709132_2709753_+|WP_172127845.1|DBSCAN-SWA MNFKNLLIISMCIYLFTGCSYKSMEQSIDMTDNNTNSTFRSASLENTINQKDLKYNKYKTNSNIQAKNDTFQDNDYANSNTTIKQDLNTDLYDFYAKWEGVRYKLGGESMTGIDCSAFIQKAFEEKLALEMPRTTLLQAKVGKEVNKDELEVGDLVFFKTGRTKHVGIYMENGKFMHASTSNGVTISELNNSYFAKNYWKAQRIIN >NZ_CP042652|2698358:2710419|2704707_2707263_+|WP_172127837.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDIRKEYLEFFKSKGHDVISSMPLVPDDPSLMFTNAGMVQFKDIFTGAVPKPANPTATSCQLCIRAGGKHNDLENVGYTARHHTLFEMLGNFSFGDYFKEDAIAYAWEFITVNLALPVDKLWVTVHDSDDEAFNIWTKYIDSSRIIRFGDKDNFWSMGDTGACGPCSEIFYDQGDEHFNTPEDKMGGDGDRFLEIWNLVFMQYERTADGKLNPLPKPSIDTGMGLERVIAIKEGVLNNFDSSNFKPIIEKIEELASKKADKSSIGSYRVIADHLRATSFMLSQGILFGNEGRPYVLRRILRRAVRHGYLLGFRKPFMGKLLDTLISILGGHYTELIENRNFIKEQLTLEEDRFFKTIDLGMSLFNEELANTKEVFSGEIAFKLYDTYGFPLDLTEDMLKDKGLKVDLGKFDELMSAQKAMAKAAWKGSGDASNEGDFKQLIEKYGINEFVGYDNVTYKSKILALLDENFKEVKTLEKGSTGWVMLDKTPFYATSGGQNGDIGALEDNKHIAIIEDTSKFHGLNLSKVKIEHSNINQGERVEAVVVNRYEVAKHHSVTHLLQSALKMVLGETVSQAGSLNDASRLRFDFTYPKAMTTEQIDEVEDLVNSMIARGIAGNVEELPIEQAKGKGAIAMFGEKYGDMVRVVSFSDVSVEFCGGTHVKNTADIGSFYIVKESGVSAGVRRIEAVCGAAAIAYTKEIINSMNEIKSEIKNNDVITGIKKLKDQIKDLKKELEAAVSQTSAPISEEVIGDTKVVVAIVENGDLKKIVDDMKNSNEKLAILLLQAKDDKVLIVAGSKNTNIKAGDWIKNIAPIVGGGGGGRPDFAQAGGKDVTKVEDARIAALAYAKENL >NZ_CP042652|2698358:2710419|2698358_2699882_+|WP_172127825.1|DBSCAN-SWA MDTIDKIELMYLQIEDHKNIVDLMNDEYKHLDDSSWTYEEFSILLEKFPKGQVGIKINGELAGFALSIVVDYNKFDDSHTYKEITGNYTFSTHDDNGDSLYGVDVFVSKKYRGLRLGRRLYEFRQELCEELNLKGIIFGGRLPNYKKYSETLTPKEYISKVRDREIYDPVLNFQLSNDFYVKRVLKNYLEGDVESCEYASLLAWDNIYYTKPSKKPMSEKTVIRLGLIQWQVRPYKNIEEVLEQAEYFVDAVSNYRSDFALFPEFFNAPLMAAFNHLGEAEAIRELAKFTPKFKEEFSRLAIAYNINIITGSMPELVDGHLYNVGFVCKRDGSVEKYEKMHVTPDEKKVWGLTGSNNIKTIDTDCGKIGVLICYDSEFPELGRILAKEGMNILFVPFLTDTQNGYSRVKICAQARAIENECYVAIAGCVGNLPQVENMDIQYAQSAVFTPCDFAFPPNGIKAESTPNTEMILVADVDLESLKELHNVGSVTNLKDRRTDIYEVELKK >NZ_CP042652|2698358:2710419|2707272_2707752_+|WP_172127839.1|DBSCAN-SWA MSELFNNFSSSIVFLHVISAVIWVGGMIAIRFAVHYSIQEIEEPKIKLGRTLENLRRFFNMVIPAILVLLITAIIMIIALGFKGTELYTIVIVKEIIWTVMTIIFITIYMKRNKAQKAFNSGDFANAKNDLLPIATYYIPANIILGIVAIFLGITLRGF >NZ_CP042652|2698358:2710419|2704202_2704520_-|WP_172127835.1|DBSCAN-SWA MGKYVELTPANFEEVTKEGVSMVDFWAPWCGPCRMIAPVIEELAADFEGKANICKVNTDEEQDLAVKYGIRSIPTILFMKNGEVVDQMVGASSKQAFTDKINSLL >NZ_CP042652|2698358:2710419|2710110_2710419_+|WP_172128713.1|DBSCAN-SWA MGGISKTGIDCSAFTQKIYKDKFGIELSRTTRTQVNEGVEVARSELQPGDLVFFKTGKTDRHVGIYVGNNKFLHSSIKGVKYTSLDKPFYKKNYWTSRRIID >NZ_CP042652|2698358:2710419|2699917_2700880_-|WP_172127827.1|DBSCAN-SWA MNELKDVLTIGRYLKNKFGEKIYKVPISISGFTCPNIDGTVAKGGCSFCENDSFSPNLQEKKTKFKLNPRINENPYLDNQLKQLEMQFNATKQRLQNKFGTKKFIVYFQSFTNTYAPIATLKALYEKALSFENVIGLSIGTRTDCVTDEILDYLVDLSKDKEIWIEFGIQSFYDETLVNINRGDTADNMRYWIKRSKEKGLNVCGHLIYGLPKETQEMMLETFRQTVELKVDSIKFHPLYVVKNTLLTNEFKKGRFTPISEELYIDTVVKSIKNLPENISIQRITAGINDSTLLSPDWCRDKHTQMKNIRLALEKEGFNY >NZ_CP042652|2698358:2710419|2707861_2708434_+|WP_172127841.1|DBSCAN-SWA MHFKIFLTFIFSIIIFTGCSQKYEDQNVNYRNYNTQKSNLQKRYLNMLKNNNYVLNNRYIDFNTAQQIDFNTSLIEFYENWSGVKYEYGGNSRSGIDCSSFIQMAYKDNFNIALPRTTDSQANIGIEIDKSQLEMGDLVFFKTSSSSNHVGIYLENGKFMHASTSVGVTISYLDNIYFDKYYWKAQRIIY >NZ_CP042652|2698358:2710419|2703030_2703960_-|WP_172127833.1|DBSCAN-SWA MLDLAIIGGGPAGLTAGLYATRGGLKNVVMFEMGMPGGQITGSSEIENYPGQAEIVSGMDLMANWPEQCQRFGLKHEMNQITSITKNNDIFNITGVDGKTYEAKSVLMATGSVPRRAGFKGENEFFGRGISTCATCDGFFYKGKEVAVVGGGDSAIEEAVYLAKLCSKVYLVHRRDTYRAAPSTIEHMKHTKNIEEVTNVTVEEVFGDTSGVLGLRVKSKETGEIRELPTPGVFIFVGRDVLNAPLKQEDGSFLCDTNEAGEVIVDLKMRTSVKGLYAAGDIRIDASKQVVCAAGDGATAAVNIIEYLG >NZ_CP042652|2698358:2710419|2700881_2702231_-|WP_172127829.1|DBSCAN-SWA MCAIVGIYGNDNAARLASIALFAMQHRGQEATGISSSCNGKIHTIKNRGLVSEVFNEAALKILVGNMAIGHNRYSTAGGDSILDAQPVFAKYKLGEISIVHNGNLINKDEVRQDLIDKGAIFQTGMDTENLIHLIAKNTKDRLRDRIKEALGRTIGAYCFIVQSRSKQFVIRDRYGIRPLSLGKLKSGGYIVASETCAFDLVDADFIRDVNPGEMLIFSEDYDEPESIQLFESQYRPCAFEYVYFARPDSVIDGKNVYRTRENMGRALAKNDANQSIKADMVIPVPDSGVPAALGYAAESGIPFEYGIIRNHYIGRTFIEPTQEMRDLKVKMKLSPMRSLIAGKSLLVIDDSIVRGTTSKRIVKILKEAGAKEVHFRVASPEIKFPCYYGIDTPHKEELISNNMTKEEVCKYIEADSLEYLSVDDLVNAIGNDRKYALESFDGDYFVKE >NZ_CP042652|2698358:2710419|2708449_2709016_-|WP_172127843.1|DBSCAN-SWA MRNFLVIFILCLSIYGCNSINNLSDNMSEFTELTKKNTSDSCANFSYISNINDKEYGRLFSEYINLDNSCSWNSFQRGNFEYLFKSTLKLKSMKVIERVDYDNYEFTTYIIDDKYYVDLIYKYSTYEDLFILDYEGKYYSSLRKKFDKAYTNTYVDKLRFKSDYSKSLVNMNFINSYFSRERESIYDK |
12 | Bacillus_phage(22.22%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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