Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053958 | Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed1 | 2 crisprs | NA | 0 | 2 | 0 | 0 |
NZ_CP053957 | Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 chromosome, complete genome | 3 crisprs | csa3,DEDDh,cas3,DinG | 1 | 1 | 7 | 0 |
NZ_CP053960 | Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed3 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP053959 | Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053958_1 | 429-541 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053958_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053958_1
>1.1|460|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder CTATAATAATGATTAAACGAATTATAACACCTATTATATAGAGAATAAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053958_1
The CRISPR arrays of NZ_CP053958_1 >merge|NZ_CP053958|1|429-541|CRISPRCasFinder ATATAAGTGACTTAATTTACAAAATGTCCCTCTATAATAATGATTAAACGAATTATAACACCTATTATATAGAGAATAAAGAATATAAGTGACTTAATTTACAAAATGTCCCT >NZ_CP053958|1|1|429-541|CRISPRCasFinder ATATAAGTGACTTAATTTACAAAATGTCCCT CTATAATAATGATTAAACGAATTATAACACCTATTATATAGAGAATAAAGA ATATAAGTGACTTAATTTACAAAATGTCCCT
>NZ_CP053958.1|WP_172848608.1|0_409_-|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein MSGETVVYRNEMNLVPLRRFTSTEVDLFFTLCNKLKEQDTRKVIIPFEELKYLSNYYTRSQERFINDLEHVYDKMLNLTYVERNDRSFEKFVLFTSYKLDLDEECLSISVNPDLKHILFYTILKFNYGCLDKQYYV >NZ_CP053958.1|WP_002452564.1|1057_2266_-|plasmid-recombination-protein MKLAWNTQKNKMSDVKGKEMEQERKGRIKNDEIDLKRTNLNFDLVEDERHLYHRVKDRVDYYKEQGSRVQKNSVVMYSNIITLSKEEADRMGETRTKHYFKTCKDYFSERFGEANVVSAKVHMDESAPHMHLHFIPVNHQGRLSARTAMNRQAIHHIHDELTTHLCQQGFDVERGSTDDNKTYIQDIHEYKRKAKVLSELDQQIETKKQLLRDINDLHDEKEHLTRDIQNLKRKNHFLQEDSQQAQEDIDLYKQLRTISRDDFKKEEEKYQQEIEAYEASLSGLRMNYRDLDKRNQHLTTQNNQLEHHLDMLNARHQTMNDMVRNDTRILFAGLRCALKDRNIDLSAEIKYQRMPEVGIDPDTVDQGALTHAYQGNVSGIDHHIRKASAPIKKETENDLELE >NZ_CP053958.1|WP_002452563.1|2720_3128_+|hypothetical-protein MPKKQNSKEKILTVRVSQSQYEKICALADIREMNVTEYIRHTAIGNRIKPTIIEQIKESSEVSELFKKDNEALKSNNQALQHHIHQLEDEIDQLRQENDVFHHLLQHFDSTAFLNFNTYRDDRQLKNAIKRLKEQ >NZ_CP053958.1|WP_002452562.1|3379_4108_-|ABC-transporter-permease MSIYHLTKFNISRLLKNPFNYIGLLFVLMIPVFYTMAQVHNNNKVSGETILHLSTWLFAFWGVMIITAFLVRDFSQGTSQLYLNNLKNRVKYFVSQMISIFISSLIIFLVLYVFVLIMQNIGDGKAVENEMLVKALGIYILLFLFYGLFLFLITLLVKSSSLVFSIGVFLILIIPIATNLVPLIPEYGDEVKKTIKYIPFNFLIDNVWLGSLKLNNWQIFISIASTILLAIVDFLTISKRDY >NZ_CP053958.1|WP_002452561.1|4111_4969_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKIENITKKYKDNTVLDNLSFSFDSSRIVGLIGKNGVGKTTIMKIMNGNIVNFKGKVNLNQNIGYLIEHPKLYQDLSGIKNLKTISNILGVTFDKDYANKIIKAFDMESYINKKVKKYSLGMKQKLAIAVSLINKPNYLILDEPTNGMDPDGSIDVLNTIKNITNEFNMRVLISSHKLEDIELICDRAVFLRDGKFVKDVDMNNTSSQEYTAISFNENDVEKAKNLLNSKSYGSIKRKENILITHKLNNYQNLLKDLSKNNIFPIKIEDRTNTLRDTYFDINKGE >NZ_CP053958.1|WP_115172131.1|6293_6386_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Fst-family-toxin MSLIFVCIIAPIIVECCVAIFTFWLNNRNK >NZ_CP053958.1|WP_001106019.1|6626_7301_+|IS6-like-element-IS257-family-transposase MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRGRGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >NZ_CP053958.1|WP_002440835.1|7517_8045_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIKFEYFEEKDFDLLINWINSPELLVKWAGTDFNYPLDEEQLKEYIKDTNKENSSKIIYKVIIEENNSKKIIGHIALNNIDFKNCSATLGKVLVGDPQMRGQGLGPKIIKKLLKKAFEDLGLHRIELGVFAFNKSAIKSYKKIGFIKEGEKRDFRKLNGEYYNLWQMSMLESEWS >NZ_CP053958.1|WP_002489266.1|8237_8894_-|hypothetical-protein MNHNHEYHSNKPEIKANVVYRDGNIEITLEDEFNNAPLLDTMHEKEMHFVLVSNDMEKYYHLHPQKKHEGLFIINQQLEPGTYQAFVDVTPKNHVYSVHPIELQIGDKITYTTSLNSDKNWVKVNKGVHVTLNSISAKEDEHVPLTFNTELTPQPYLGALGHVIIFDEQLTDYIHVHPESPDSTTFYAHFPKKGMYKIWAEFKFNDEVHRFTYNIKVA >NZ_CP053958.1|WP_001831373.1|8957_9167_-|copper-chaperone-CopZ MTNEVINVEGMSCDHCKHSIEKALNGLDGVTSSEVSLANGNVEVEFDENQVAFNDFKEAIEDQGYDVIK >NZ_CP053958.1|WP_002452570.1|9200_11588_-|copper-translocating-P-type-ATPase MSENIKKTSLGITGMTCAACSNKVEKNLNKLDEVNANVNPSTEKATIEYNPNVTSLEDIANTIQKTGYGVLTEKVDLDVMGMTCAACSNKIEKVLNRISGVNKATVNLTTESATVEYNPDMTSVDEFQQRIKNLGYEAQPKKEASEKSSQKEKQLKRQLIKLVVSAVLAAPLLMTMFVHLFGIQIPHIFMNPWFQFVLATPVQFVIGWQFYVGAYKNLRNGSANMDVLVALGTSAAFFYSIYESIKWLINTNYEPHLYFETSAVLITLILFGKYLEARAKTQTTNALSKLLNLQAKEARILRNGEETMVPLSEVKEGDYLVIKPGEKIPVDGKIIKGMTSIDESMLTGESIPVEKMQNDNVIGSTMNKNGAITVEATKVGKDTALASIVKVVEEAQGSKAPIQRLADIISGYFVPIVVGIAIFTFIIWISLVQPGQFEPALVAAIAVLVIACPCALGLATPTSIMVGTGKAAENGILFKGGEHIEGTHAINTVVLDKTGTITNGTPEVTDFSGDDQTLQLLASAEKGSEHPLAEAIVSYAKEKSLEFLEVDHFEAIPGRGINATIDGKELFVGNRKLMSEKGIRTNEAETNLAQFEKEGKTAMLISVDNELRGVVAVADTVKDTAQQAIQKLHELGIEVAMLTGDNKRTAQAIAKQVGIDTIIAEVLPEEKASKVAEIQSEGKKVAMVGDGVNDAPALVKADIGIAIGTGTEVAIEAADITILGGDLLLIPKAIKASKSTIRNIRQNLFWAFGYNVAGIPIAAIGLLAPWVAGAAMALSSVSVVTNALRLKRMKL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053958_2 | 14548-14660 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053958_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053958_2
>2.1|14579|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder CTATAATAATGATTAAACGAATTATAACACCTATTATATAGAGAATAAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053958_2
The CRISPR arrays of NZ_CP053958_2 >merge|NZ_CP053958|2|14548-14660|CRISPRCasFinder ATATAAGTGACTTAATTTACAAAATGTCCCTCTATAATAATGATTAAACGAATTATAACACCTATTATATAGAGAATAAAGAATATAAGTGACTTAATTTACAAAATGTCCCT >NZ_CP053958|2|2|14548-14660|CRISPRCasFinder ATATAAGTGACTTAATTTACAAAATGTCCCT CTATAATAATGATTAAACGAATTATAACACCTATTATATAGAGAATAAAGA ATATAAGTGACTTAATTTACAAAATGTCCCT
>NZ_CP053958.1|WP_002452565.1|13667_14528_-|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein MSGETVVYRNEMNLVPLRRFTSTEVDLFFTLCNKLKEQDTRKVIIPFEELKYLSNYYTRSQERFINDLEHVYDKMLNLTYVERNDRSFEKFVLFTSYKLDLDEECLSISVNPDLKHILNSITADFTKFELKEMTHLKSTYAKNMFRLLKQYKHTGYIKINIADFKNRLDIPKTYQMNDITKRVLKPIINELSSIFNNLNINKIKAKKGRKIEWLEFTFDAEKRIHNKRQPQITNIGKSHQYTNREKTPKWLETGLYKGQHAHTDYDPQLKKDREAFQRQLEEKWEE >NZ_CP053958.1|WP_001106019.1|12854_13529_+|IS6-like-element-IS257-family-transposase MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRGRGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >NZ_CP053958.1|WP_002452569.1|12022_12313_+|glutaredoxin-family-protein MLKLILGEIYLDKNIQLELYTRPTCSDCQESKRYLNSQEISYSHKDVSQNLDLEEEMKKISGNRIVPLFVFYKKIFGVKKSCLNITWDLKITKKIY >NZ_CP053958.1|WP_001831396.1|11602_11878_-|metal-sensing-transcriptional-repressor MNTTTVKNNDALLNRLKRLEGQMRGLQSMIAEDRYCIDVLVQITAIQSALKQVGFIVTEDHISNCVSEGIKNGNGEESIKELMVVLKQFSK >NZ_CP053958.1|WP_002452570.1|9200_11588_-|copper-translocating-P-type-ATPase MSENIKKTSLGITGMTCAACSNKVEKNLNKLDEVNANVNPSTEKATIEYNPNVTSLEDIANTIQKTGYGVLTEKVDLDVMGMTCAACSNKIEKVLNRISGVNKATVNLTTESATVEYNPDMTSVDEFQQRIKNLGYEAQPKKEASEKSSQKEKQLKRQLIKLVVSAVLAAPLLMTMFVHLFGIQIPHIFMNPWFQFVLATPVQFVIGWQFYVGAYKNLRNGSANMDVLVALGTSAAFFYSIYESIKWLINTNYEPHLYFETSAVLITLILFGKYLEARAKTQTTNALSKLLNLQAKEARILRNGEETMVPLSEVKEGDYLVIKPGEKIPVDGKIIKGMTSIDESMLTGESIPVEKMQNDNVIGSTMNKNGAITVEATKVGKDTALASIVKVVEEAQGSKAPIQRLADIISGYFVPIVVGIAIFTFIIWISLVQPGQFEPALVAAIAVLVIACPCALGLATPTSIMVGTGKAAENGILFKGGEHIEGTHAINTVVLDKTGTITNGTPEVTDFSGDDQTLQLLASAEKGSEHPLAEAIVSYAKEKSLEFLEVDHFEAIPGRGINATIDGKELFVGNRKLMSEKGIRTNEAETNLAQFEKEGKTAMLISVDNELRGVVAVADTVKDTAQQAIQKLHELGIEVAMLTGDNKRTAQAIAKQVGIDTIIAEVLPEEKASKVAEIQSEGKKVAMVGDGVNDAPALVKADIGIAIGTGTEVAIEAADITILGGDLLLIPKAIKASKSTIRNIRQNLFWAFGYNVAGIPIAAIGLLAPWVAGAAMALSSVSVVTNALRLKRMKL >NZ_CP053958.1|WP_001831373.1|8957_9167_-|copper-chaperone-CopZ MTNEVINVEGMSCDHCKHSIEKALNGLDGVTSSEVSLANGNVEVEFDENQVAFNDFKEAIEDQGYDVIK >NZ_CP053958.1|WP_002489266.1|8237_8894_-|hypothetical-protein MNHNHEYHSNKPEIKANVVYRDGNIEITLEDEFNNAPLLDTMHEKEMHFVLVSNDMEKYYHLHPQKKHEGLFIINQQLEPGTYQAFVDVTPKNHVYSVHPIELQIGDKITYTTSLNSDKNWVKVNKGVHVTLNSISAKEDEHVPLTFNTELTPQPYLGALGHVIIFDEQLTDYIHVHPESPDSTTFYAHFPKKGMYKIWAEFKFNDEVHRFTYNIKVA >NZ_CP053958.1|WP_002440835.1|7517_8045_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIKFEYFEEKDFDLLINWINSPELLVKWAGTDFNYPLDEEQLKEYIKDTNKENSSKIIYKVIIEENNSKKIIGHIALNNIDFKNCSATLGKVLVGDPQMRGQGLGPKIIKKLLKKAFEDLGLHRIELGVFAFNKSAIKSYKKIGFIKEGEKRDFRKLNGEYYNLWQMSMLESEWS >NZ_CP053958.1|WP_001106019.1|6626_7301_+|IS6-like-element-IS257-family-transposase MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRGRGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >NZ_CP053958.1|WP_115172131.1|6293_6386_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Fst-family-toxin MSLIFVCIIAPIIVECCVAIFTFWLNNRNK >NZ_CP053958.1|WP_002452564.1|15180_16389_-|plasmid-recombination-protein MKLAWNTQKNKMSDVKGKEMEQERKGRIKNDEIDLKRTNLNFDLVEDERHLYHRVKDRVDYYKEQGSRVQKNSVVMYSNIITLSKEEADRMGETRTKHYFKTCKDYFSERFGEANVVSAKVHMDESAPHMHLHFIPVNHQGRLSARTAMNRQAIHHIHDELTTHLCQQGFDVERGSTDDNKTYIQDIHEYKRKAKVLSELDQQIETKKQLLRDINDLHDEKEHLTRDIQNLKRKNHFLQEDSQQAQEDIDLYKQLRTISRDDFKKEEEKYQQEIEAYEASLSGLRMNYRDLDKRNQHLTTQNNQLEHHLDMLNARHQTMNDMVRNDTRILFAGLRCALKDRNIDLSAEIKYQRMPEVGIDPDTVDQGALTHAYQGNVSGIDHHIRKASAPIKKETENDLELE >NZ_CP053958.1|WP_002452563.1|16843_17251_+|hypothetical-protein MPKKQNSKEKILTVRVSQSQYEKICALADIREMNVTEYIRHTAIGNRIKPTIIEQIKESSEVSELFKKDNEALKSNNQALQHHIHQLEDEIDQLRQENDVFHHLLQHFDSTAFLNFNTYRDDRQLKNAIKRLKEQ >NZ_CP053958.1|WP_002452562.1|17502_18231_-|ABC-transporter-permease MSIYHLTKFNISRLLKNPFNYIGLLFVLMIPVFYTMAQVHNNNKVSGETILHLSTWLFAFWGVMIITAFLVRDFSQGTSQLYLNNLKNRVKYFVSQMISIFISSLIIFLVLYVFVLIMQNIGDGKAVENEMLVKALGIYILLFLFYGLFLFLITLLVKSSSLVFSIGVFLILIIPIATNLVPLIPEYGDEVKKTIKYIPFNFLIDNVWLGSLKLNNWQIFISIASTILLAIVDFLTISKRDY >NZ_CP053958.1|WP_002452561.1|18234_19092_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKIENITKKYKDNTVLDNLSFSFDSSRIVGLIGKNGVGKTTIMKIMNGNIVNFKGKVNLNQNIGYLIEHPKLYQDLSGIKNLKTISNILGVTFDKDYANKIIKAFDMESYINKKVKKYSLGMKQKLAIAVSLINKPNYLILDEPTNGMDPDGSIDVLNTIKNITNEFNMRVLISSHKLEDIELICDRAVFLRDGKFVKDVDMNNTSSQEYTAISFNENDVEKAKNLLNSKSYGSIKRKENILITHKLNNYQNLLKDLSKNNIFPIKIEDRTNTLRDTYFDINKGE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053958_1 | 1.1|460|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder | 460-510 | 51 | NZ_CP053958 | Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed1 | 460-510 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053958_1 | 1.1|460|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder | 460-510 | 51 | NZ_CP053958 | Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed1 | 14579-14629 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053958_2 | 2.1|14579|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder | 14579-14629 | 51 | NZ_CP053958 | Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed1 | 460-510 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053958_2 | 2.1|14579|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder | 14579-14629 | 51 | NZ_CP053958 | Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed1 | 14579-14629 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053958_1 | 1.1|460|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder | 460-510 | 51 | NZ_CP023971 | Staphylococcus lugdunensis strain FDAARGOS_381 plasmid unnamed1, complete sequence | 6757-6807 | 3 | 0.941 |
NZ_CP053958_1 | 1.1|460|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder | 460-510 | 51 | NZ_CP014131 | Staphylococcus epidermidis strain FDAARGOS_161 plasmid unnamed2, complete sequence | 4640-4690 | 3 | 0.941 |
NZ_CP053958_2 | 2.1|14579|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder | 14579-14629 | 51 | NZ_CP023971 | Staphylococcus lugdunensis strain FDAARGOS_381 plasmid unnamed1, complete sequence | 6757-6807 | 3 | 0.941 |
NZ_CP053958_2 | 2.1|14579|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder | 14579-14629 | 51 | NZ_CP014131 | Staphylococcus epidermidis strain FDAARGOS_161 plasmid unnamed2, complete sequence | 4640-4690 | 3 | 0.941 |
1. spacer 1.1|460|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053958 (Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga CRISPR spacer ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga Protospacer ***************************************************
2. spacer 1.1|460|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053958 (Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga CRISPR spacer ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga Protospacer ***************************************************
3. spacer 2.1|14579|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053958 (Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga CRISPR spacer ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga Protospacer ***************************************************
4. spacer 2.1|14579|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053958 (Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga CRISPR spacer ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga Protospacer ***************************************************
5. spacer 1.1|460|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023971 (Staphylococcus lugdunensis strain FDAARGOS_381 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.941
ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga CRISPR spacer ctataataatgatcaaacgaattataacacctattatatagaggataaagc Protospacer *************.*****************************.******
6. spacer 1.1|460|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014131 (Staphylococcus epidermidis strain FDAARGOS_161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.941
ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga CRISPR spacer ctataataatgatcaaacgaattataacacctattatatagaggataaagc Protospacer *************.*****************************.******
7. spacer 2.1|14579|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023971 (Staphylococcus lugdunensis strain FDAARGOS_381 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.941
ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga CRISPR spacer ctataataatgatcaaacgaattataacacctattatatagaggataaagc Protospacer *************.*****************************.******
8. spacer 2.1|14579|51|NZ_CP053958|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014131 (Staphylococcus epidermidis strain FDAARGOS_161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.941
ctataataatgattaaacgaattataacacctattatatagagaataaaga CRISPR spacer ctataataatgatcaaacgaattataacacctattatatagaggataaagc Protospacer *************.*****************************.******
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053957_1 | 1625074-1625162 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053957_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053957_1
>1.1|1625106|25|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder AGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053957_1
The CRISPR arrays of NZ_CP053957_1 >merge|NZ_CP053957|1|1625074-1625162|CRISPRCasFinder CAACTTGCATTGTTTGTAGAATTTCATTTTAAAGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGCAACTTGCATTGTTTGTAAAATTTCATTTTAA >NZ_CP053957|1|1|1625074-1625162|CRISPRCasFinder CAACTTGCATTGTTTGTAGAATTTCATTTTAA AGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCG CAACTTGCATTGTTTGTAAAATTTCATTTTAA
>NZ_CP053957.1|WP_002453082.1|1623968_1624841_-|DNA-protecting-protein-DprA MIQHILLKLYWANFTTTQIHQFIKDYPEVISESPPTQKEMIEDWTIRQTTSTLKKKFNLFKSLDTEVLLQEMSKKNLKFLTYFDKNYPQLLKEIYDFPYIIFYKGNKQLFNYPHTLAVIGSRKSTSYTTQALEYLFPSFKQLKMTIISGLAYGADSVAHQVALKNQLPTIGVLGFGHSYHYPKSTFKTRESVEREGLVISEYPPHSPISRYKFPERNRLISGLARGLLITEAEEISGSQITVDCALEQNRNVYVLPGSMFNPMTKSNLLRLQEGAQVVLDESSILSDYNF >NZ_CP053957.1|WP_029625697.1|1621715_1623791_-|type-I-DNA-topoisomerase MTLADNLVIVESPAKAKTIEKYLGKRYKVIASMGHVRDLPRSQMGVDTEDNYEPKYITIRGKGPVVKDLKKYAKKAKKVFLASDPDREGEAIAWHLSKILELEDSKENRVVFNEITKDAVKDSFKHPRGIEMDLVDAQQARRILDRLVGYNISPVLWKKVKKGLSAGRVQSVALRLVIDRENEIRNFKPEEYWTIEGEFRYKKSKFNAKFLHFKNKPYKLNTKEDVEKITAALDGDQFEITNVNKKEKTRNPANPFTTSTLQQEAARKLNFKARKTMMLAQQLYEGIDLKRQGTIGLITYMRTDSTRISDSAKSEAHNYITDKYGKEYVSKRKATGKQGDQDAHEAIRPTSTLRTPDDMKPYLTRDQHRLYKLIWERFVASQMAPAILDTIALDVTQNDIKFRANGQTIKFKGFMTLYVEAKDDKENDKENKLPKLEEGDKVTATQIEPAQHFTQPPPRYTEARLVKTLEELKIGRPSTYAPTIDTIQKRNYVKLESKRFVPTELGEIVYEQVQEYFPEIIDVEFTVNMETLLDKIAEGDTNWRKVVGDFYNSFKQDVERAEEEMEKIEIKDEPAGEDCEVCGSPMVIKMGRYGKFMACSNFPDCRNTKAIVKSIGVKCPKCNEGEVVERKSKKNRIFYGCSQYPDCDFISWDKPVGRDCPKCNHYLVDKKKGRSSQVVCSNCDYKEEVQK >NZ_CP053957.1|WP_002453084.1|1620382_1621690_-|FADH(2)-oxidizing-methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)-C(5))--methyltransferase-TrmFO MTQTVNVIGAGLAGSEAAYQLAQRGLNVNLIEMRPVKQTPAHHTDKFAELVCSNSLRGNSLTNAVGVLKEEMRRLDSLIIQAADKARVPAGGALAVDRHDFAGYITDTLRNHPNVTVLNKEVNHIPEGYTIIATGPLTTEHLAQEIVDITGKDQLYFYDAAAPIVEKDTIDMNKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTEEEFNRFYDAVLEAEVAPVNEFEKEKYFEGCMPFEVMAERGRKTLLFGPMKPVGLEDPKTGERPYAVVQLRQDDAAGTLYNIVGFQTHLKWGAQKEVIRLIPGLENVDIVRYGVMHRNTFINSPDVLNEKYELEGHEHLYFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGINLAHKLAGKGEVIFPRETMIGSMAYYISHAKNEKNFQPMNANFGLLPSLEKRIKDKKERYEAQANRALEYLDNYKQTL >NZ_CP053957.1|WP_002453085.1|1619255_1620146_-|tyrosine-recombinase-XerC MNEIQKTFLYMLKVERNFSEYTLKSYHDDLIQFNDFLVSEHLDLATFEYKDARNYLAFLYSHNLKRTTVSRKISTLRTFYEYWMTQDELIVNPFVQLVHPKKEQYLPQFFYEEEMEALFQTVEQDNKKGMRDRVIIELLYATGIRVSELINIKIKDIDMNLPGVKVLGKGNKERFIPFGEFCKQSIERYLDEFQPRKSSDHEYLIVNMSGAPITERGVRYVLNDVVKRTAGVTDIHPHKLRHTFATHLLNQGADLRTVQSLLGHVNLSTTGRYTHVSNQQLRKVYLNAHPRAKKGE >NZ_CP053957.1|WP_002453086.1|1618709_1619252_-|ATP-dependent-protease-subunit-HslV MSNTLHATTIYAVRHNGEAAMAGDGQVTLGQQVIMKQTARKVRRLYEGKVLAGFAGSVADAFTLFEKFETKLQQFSGNLERAAVELAQEWRGDKQLRQLEAMLIVMNKDAILVVSGTGEVIAPDDDLIAIGSGGNYALSAGRALKRHASQLSAKDMAYESLKVAADICVFTNDNIIVETL >NZ_CP053957.1|WP_002453087.1|1617221_1618625_-|ATP-dependent-protease-ATPase-subunit-HslU MDTNGIKLTPKDIVSKLNEYIVGQDDAKRKVAIALRNRYRRSLLDEEAKQEIAPKNILMIGPTGVGKTEIARRMAKIVGAPFIKVEATKFTEVGYVGRDVESMVRDLVDVAVRLVKEEKKALVKDEAIAKANDKLVKLLVPSMKKKASQGNNPLENLFGGAIPNFGQNNEEEEEPPTEEIKTKRSEIKKQLEEGKLEKEKVRIKVEQDPAAMGMLGTNQNQQMQDMMNQLMPKKKVEREVSVETARKILADDYADELIDQETANQEALELAEQMGIIFIDEIDKVATNNHNSGQDVSRQGVQRDILPILEGSMIQTKYGTVNTEHMLFIGAGAFHVSKPSDLIPELQGRFPIRVELESLSVDDFVRILTEPKLSLIKQYEALLQTEEVTVNFTEEAVKRLAEIAYQVNQDTDNIGARRLHTILEKMLEDLSFEAPNMPHAVVDITPQYVDDKLKTISTNKDLSAFIL >NZ_CP053957.1|WP_002453088.1|1616425_1617199_-|GTP-sensing-pleiotropic-transcriptional-regulator-CodY MSLLSKTRELNTLLQKHKGIAVDFKDVAQTISSVTVTNVFIVSRRGKILGLSLNELLKSERIINMLEERHIPSEYTEKLMDVKQTQSNIDIDNVLTVFPPENKDVFVNSRTTIFPILGGGERLGTLVLGRVQDDFNENDLVLGEYAATVIGMEILREKHNEVEKEARDKAAITMAINSLSYSEKEAIEHIFEELGGNEGLLIASKVADRVGITRSVIVNALRKLESAGVIESRSLGMKGTFIKVKKEKFLDELERTK >NZ_CP053957.1|WP_002436327.1|1615381_1616170_-|30S-ribosomal-protein-S2 MAVISMKQLLEAGVHFGHQTRRWNPKMKKYIFTERNGIYIIDLQKTVKKVEEAYNFLKQVSEDGGKVLFVGTKKQAQESVKAEAERAGQFYVNQRWLGGILTNYKTISKRIKRISEIEKMEEDGLFEVLPKKEVVELKKEYDRLIKFLGGIRDMKSMPQALFVVDPRKERNAIAEARKLNIPIVGIVDTNCDPDEIDYVIPANDDAIRAVKLLTGKMADAILEGQQGVSNEEVAAEQNINLDEKEESEQAETTEENTSVESN >NZ_CP053957.1|WP_002453089.1|1614352_1615231_-|elongation-factor-Ts MAISAKLVKELREKTGAGMMDCKKALTETDGDIDKAIDYLREKGIAKAAKKADRIAAEGLVHVEVKGNEAAIVEINSETDFVARNEGFQELVKEIANQILDSKAETVEALLETKLSSGKTVDERMKEAISTIGEKLSIRRFAIRTKSDNDAFGSYLHMGGRIGVLTVVEGTTDESAAKDVAMHIAAINPKYVSSDQVSEEEINHEKEVLKQQALNEGKPENIVEKMVEGRLRKYLQEICAVDQNFVKNPDETVEAFLKSKGGQLTDFVRYEVGEGMEKREENFADEVKGQMK >NZ_CP053957.1|WP_002436299.1|1613493_1614216_-|UMP-kinase MAQTSKYKRVVLKLSGEALAGDKGFGINPIIIKSVAKQVAEVAKMDCEIAVIVGGGNIWRGKTGSDLGMDRGTADYMGMLATVMNALALQDSLEQLDCDTRVLTSIEMKQVAEPYIRRRAIRHLEKKRVVIFAAGIGNPYFSTDTTAALRAAEVEADVILMGKNNVDGVYSADPKVDENAVKYEHLTHIQMLQEGLQVMDSTASSFCMDNNIPLNVFSIMEEGNIKRAVMGEKIGTLITK >NZ_CP053957.1|WP_002453081.1|1625329_1626238_-|succinate--CoA-ligase-subunit-alpha MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTQIVAGVTPGKGGQVVEGVPVYNTVEEAKNETGANVSVVYVPAPFAADSILEAAEAELDMVICITEHIPVVDMVKVNRYLQGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKEFNEDPETKAVVMIGEIGGTAEEEAAQWIKQNMNKPVVGFIGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTADEKIKTLNDCGVETADTPSEIGTTLIDAAKKAGIYDELLTVDK >NZ_CP053957.1|WP_002436291.1|1626259_1627426_-|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAEEAVEKAKELDSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYANELLGKQLVTHQTGPEGKEVKRLYIEQGCDIQKEYYVGFVIDRATDKVTLMASEEGGTEIEEVAAKTPEKIFKETIDPVVGLSPYQARRIAFNINIPKESIGKATKFLLALYNVFIEKDCSIVEINPLVTTGDGQVLALDAKLNFDDNALFRHKDIVELRDLEEEDPKEIEASKYDLSYIALDGDIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDVGGGATKEKVTEAFKIILGDDNVRGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVAAVKEVELTLPLVVRLEGTNVERGKEILNDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >NZ_CP053957.1|WP_002453080.1|1627533_1628304_-|ribonuclease-HII MTSTIKEIRDQLALIQSIEELEAHVANEDTRKGVQKAIESRKKQLFKQQELESDYIIMNHYENEILNHNNEALICGVDEVGRGPLAGPVVACAVILNRDHHYLGLNDSKKVPAKQRSILNEKLKDNVMSYAYGIATPQEIDDLNIYRATQVAMQRAIDQLSIKPTHLLIDAMKLDNNIPQTSIIKGDAKSVSIAAASIMAKEYRDDYMKELANEYPNYGFEKNVGYGTKQHLEAIDTFGVIKEHRQTFEPIKSMLK >NZ_CP053957.1|WP_002453079.1|1628305_1629172_-|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MAIQWYPGHMAKAKREVSEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDEVIKQKPRVVILNKKDMTNLKELEKWEGFFKEQGFFPVAVDAKHGKNLKNVEAEAIKATKEKFEREKEKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLAKRSIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGKSLQLLDTPGILWPKFEDEEVGKKLSLTGAIKDSIVHLDEVAIYGLNFMIEHDIDGLKQHYNIDVDKDAEILEWFDAIGRRRGLLQKGNEVDYESVIELLINDMRNAKIGTYCFDILKEMKSDL >NZ_CP053957.1|WP_002453078.1|1629451_1632052_+|YfhO-family-protein MKRFLSYTVLFIALPIIGHSYIIFRFYHDGILSTGPNDGMEQMVPIQMYLFNQWHQGNLFYATNFGLGGDFFTDLSYYFSTNILFIINVLFISFLKLFISLDTHQVMFWMNNALIVSVFKGAIALYCTFLYAHYLSKNKILSVFIAFLFVISPLYFRFTAYWPFFSDVFIWLPLLLLAIERAIQKQKSGLLIVTITLVLINNFYFAYYFLIIASVYALIRIIFKHPNDNLTRFRTLCTLLIPALLALGNSLFIFFHGVQSFLNNRRVSFSGNVPAFEHLNINTNIFFDNYLIVILFLTIQSILSFKLYKHYYYRLFVLLTLALIIFTFIPLIDQIFNGFSAPQKRWHFILAFSSSLLIGLYVKYFRTVSIKSYITTNLIAQLVIYISAYCYHKFLPWLILVPVVSIIGLLILFLKEKKVRIHLTYIYIISIIALSMMMSFVFIKNQIYFQDHQDRANTFYANSSLYSSDLQRALVKEMKNSKKDDQRIDWRVNEQDNTPMYQNFKGLSLYSSIFHHNILDFYYDALKINLAEESLSRYQSTNARQNIDSLFSIKYVMLKKYQNNIPTYFKKVKSSGQYNIYENQLNLPSVKVTNNLYSSQSLKTPIDREHAMLRGAIVDSNDKDFNSKSRNLLKHAKITTKNIKSSSNNRLEVKNNIGTINIHVPKNIRKQFRDFYLTLYIKRGTPDSNYTVNINNYFNNRLYNNSVYKTGINTQLYRTQPDKNGNISIKLSPNGGFKFKLLNLNGENYKTLKTAHHNVNFNMNYKDIKNGVKVNLANHSKGLATINIPYRAGMRAYIDGRQVNVHKVNYMMTGIPVNKNDHTIIIKYQPPYWKTMIFISFITIIISMIYIRYTNSIKRKMRIHRD >NZ_CP053957.1|WP_002453077.1|1632044_1634666_+|YfhO-family-protein MIKKFWQTPKKRFLSIVIISCIFSFILYFPFIYQYMTKGVVFSGSGDGFRQMMPFQMYLYEHFASFKGFYDASFGFGGDYVKSLAYYYSMSPLMWINFACIWGLEHTIHINPHDISFWPTNQLIMAYVRTVITFIFTLYLFIYLKFKPAPMFIATILYGMSTVMTYYNFTWSFYGNLLIMLPMSLWAMERFFRERKVGWFIFAIAFTLFTNFYFSYYEAVVLGFYFIYRLIAAHPQDIVNRWQKLYILVIATLLSGLSSFFGLYTGVSSFLNNDRSQNPKFGITFLTNLFEKNYNIFTDGFYITISIIVIIALFSFKLYRHYYYKLFAIATWILLIGSLSQWFDSAFNGFSLPQRRWVYFLALSAGALIALFIQYLSELSLKNYLIIAIPIFLYSCFYVIYTDRSVNWMYIAIIIMIVLGLLIYRKSFLNRKWVAIGLVILFLVEQVIMVNDSKKITIEPYQTTMNTINDSSYRSKVLNNKINQMTRNKLDPLKRLDYFSFYALNSPFIYHYNGTSLYSSIFNGQTLKYYDQTMQINMPVDKNSTYRYLGNRANLMALWNVQDRLRHPNDLNIPYGFKKKDLIKDGKDQWIHSKNTISYPSAHITHKVYNSNDLKSPLDREQAMLQGVVFDNNKKSANTKFSPNKNLLNDAQLQLKDSQWEKKSQLNVDKNNGGVQLTLPQSLTKKYKDMYIEMDVELLTPDKEHSIGVNEYTQNRNALSYKYRRVVSPVTMRVKASDKLNIHMSEGTYRFKIKGIYGENYHTLKKASKQLQPVKVKKERNGYTITKNKNDSGYIVLPIAYENGMKAKANGKPLNVEKGNGIMTTIPVKSGQTTIRLTYTPPHFYWLIIISIIGIVLSVIFSKKFKEINFTNH >NZ_CP053957.1|WP_002453074.1|1636336_1636687_-|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPTFRSGDTLRVHVRIVEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGITETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >NZ_CP053957.1|WP_002453073.1|1636792_1637530_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MRIDYLTLFPEMFDGVLNHSILKRAQDKEIINVNTINFRDYSVNKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLKKDDNTRVILMCPQGRPFTQEIAQELSEAQHIVFICGHYEGYDERIREHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEASHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREYKEMKVPDVLLSGNHAHIEQWRHEQKLIRTYEKRPDLLENYELSQKDKEILETYKKQLKNK >NZ_CP053957.1|WP_002453072.1|1637529_1638033_-|ribosome-maturation-factor-RimM MEVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTETRFQPGENLIVKHNNEDLQYTVSSYRIHKGFHMLKFEGINNINDIEHLKGDYLYQERDHEDIELDEHEYYYSDIIGCTVFDDTDTPIGRVINIFETGANDVWVVKGDKEYLIPYIEDVVKDIDVEGKSIKITPMEGLLD >NZ_CP053957.1|WP_002453071.1|1638319_1638595_-|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQVGTYNPANVNAPEVKIDEELALKWLHDGAKPTDTVHNILSREGILKKFDEQKNAK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053957_2 | 1638699-1638791 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053957_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053957_2
>2.1|1638729|33|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder CATGAGCTTTAGCTCAGGCGCTCCTTTACTCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053957_2
The CRISPR arrays of NZ_CP053957_2 >merge|NZ_CP053957|2|1638699-1638791|CRISPRCasFinder TTTATGAAATAAATCGTACTTTTGGTTATGCATGAGCTTTAGCTCAGGCGCTCCTTTACTCATTTTATGAAATAAATCGTACTTTTGGTTATG >NZ_CP053957|2|2|1638699-1638791|CRISPRCasFinder TTTATGAAATAAATCGTACTTTTGGTTATG CATGAGCTTTAGCTCAGGCGCTCCTTTACTCAT TTTATGAAATAAATCGTACTTTTGGTTATG
>NZ_CP053957.1|WP_002453071.1|1638319_1638595_-|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQVGTYNPANVNAPEVKIDEELALKWLHDGAKPTDTVHNILSREGILKKFDEQKNAK >NZ_CP053957.1|WP_002453072.1|1637529_1638033_-|ribosome-maturation-factor-RimM MEVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTETRFQPGENLIVKHNNEDLQYTVSSYRIHKGFHMLKFEGINNINDIEHLKGDYLYQERDHEDIELDEHEYYYSDIIGCTVFDDTDTPIGRVINIFETGANDVWVVKGDKEYLIPYIEDVVKDIDVEGKSIKITPMEGLLD >NZ_CP053957.1|WP_002453073.1|1636792_1637530_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MRIDYLTLFPEMFDGVLNHSILKRAQDKEIINVNTINFRDYSVNKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLKKDDNTRVILMCPQGRPFTQEIAQELSEAQHIVFICGHYEGYDERIREHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEASHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREYKEMKVPDVLLSGNHAHIEQWRHEQKLIRTYEKRPDLLENYELSQKDKEILETYKKQLKNK >NZ_CP053957.1|WP_002453074.1|1636336_1636687_-|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPTFRSGDTLRVHVRIVEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGITETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >NZ_CP053957.1|WP_002453077.1|1632044_1634666_+|YfhO-family-protein MIKKFWQTPKKRFLSIVIISCIFSFILYFPFIYQYMTKGVVFSGSGDGFRQMMPFQMYLYEHFASFKGFYDASFGFGGDYVKSLAYYYSMSPLMWINFACIWGLEHTIHINPHDISFWPTNQLIMAYVRTVITFIFTLYLFIYLKFKPAPMFIATILYGMSTVMTYYNFTWSFYGNLLIMLPMSLWAMERFFRERKVGWFIFAIAFTLFTNFYFSYYEAVVLGFYFIYRLIAAHPQDIVNRWQKLYILVIATLLSGLSSFFGLYTGVSSFLNNDRSQNPKFGITFLTNLFEKNYNIFTDGFYITISIIVIIALFSFKLYRHYYYKLFAIATWILLIGSLSQWFDSAFNGFSLPQRRWVYFLALSAGALIALFIQYLSELSLKNYLIIAIPIFLYSCFYVIYTDRSVNWMYIAIIIMIVLGLLIYRKSFLNRKWVAIGLVILFLVEQVIMVNDSKKITIEPYQTTMNTINDSSYRSKVLNNKINQMTRNKLDPLKRLDYFSFYALNSPFIYHYNGTSLYSSIFNGQTLKYYDQTMQINMPVDKNSTYRYLGNRANLMALWNVQDRLRHPNDLNIPYGFKKKDLIKDGKDQWIHSKNTISYPSAHITHKVYNSNDLKSPLDREQAMLQGVVFDNNKKSANTKFSPNKNLLNDAQLQLKDSQWEKKSQLNVDKNNGGVQLTLPQSLTKKYKDMYIEMDVELLTPDKEHSIGVNEYTQNRNALSYKYRRVVSPVTMRVKASDKLNIHMSEGTYRFKIKGIYGENYHTLKKASKQLQPVKVKKERNGYTITKNKNDSGYIVLPIAYENGMKAKANGKPLNVEKGNGIMTTIPVKSGQTTIRLTYTPPHFYWLIIISIIGIVLSVIFSKKFKEINFTNH >NZ_CP053957.1|WP_002453078.1|1629451_1632052_+|YfhO-family-protein MKRFLSYTVLFIALPIIGHSYIIFRFYHDGILSTGPNDGMEQMVPIQMYLFNQWHQGNLFYATNFGLGGDFFTDLSYYFSTNILFIINVLFISFLKLFISLDTHQVMFWMNNALIVSVFKGAIALYCTFLYAHYLSKNKILSVFIAFLFVISPLYFRFTAYWPFFSDVFIWLPLLLLAIERAIQKQKSGLLIVTITLVLINNFYFAYYFLIIASVYALIRIIFKHPNDNLTRFRTLCTLLIPALLALGNSLFIFFHGVQSFLNNRRVSFSGNVPAFEHLNINTNIFFDNYLIVILFLTIQSILSFKLYKHYYYRLFVLLTLALIIFTFIPLIDQIFNGFSAPQKRWHFILAFSSSLLIGLYVKYFRTVSIKSYITTNLIAQLVIYISAYCYHKFLPWLILVPVVSIIGLLILFLKEKKVRIHLTYIYIISIIALSMMMSFVFIKNQIYFQDHQDRANTFYANSSLYSSDLQRALVKEMKNSKKDDQRIDWRVNEQDNTPMYQNFKGLSLYSSIFHHNILDFYYDALKINLAEESLSRYQSTNARQNIDSLFSIKYVMLKKYQNNIPTYFKKVKSSGQYNIYENQLNLPSVKVTNNLYSSQSLKTPIDREHAMLRGAIVDSNDKDFNSKSRNLLKHAKITTKNIKSSSNNRLEVKNNIGTINIHVPKNIRKQFRDFYLTLYIKRGTPDSNYTVNINNYFNNRLYNNSVYKTGINTQLYRTQPDKNGNISIKLSPNGGFKFKLLNLNGENYKTLKTAHHNVNFNMNYKDIKNGVKVNLANHSKGLATINIPYRAGMRAYIDGRQVNVHKVNYMMTGIPVNKNDHTIIIKYQPPYWKTMIFISFITIIISMIYIRYTNSIKRKMRIHRD >NZ_CP053957.1|WP_002453079.1|1628305_1629172_-|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MAIQWYPGHMAKAKREVSEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDEVIKQKPRVVILNKKDMTNLKELEKWEGFFKEQGFFPVAVDAKHGKNLKNVEAEAIKATKEKFEREKEKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLAKRSIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGKSLQLLDTPGILWPKFEDEEVGKKLSLTGAIKDSIVHLDEVAIYGLNFMIEHDIDGLKQHYNIDVDKDAEILEWFDAIGRRRGLLQKGNEVDYESVIELLINDMRNAKIGTYCFDILKEMKSDL >NZ_CP053957.1|WP_002453080.1|1627533_1628304_-|ribonuclease-HII MTSTIKEIRDQLALIQSIEELEAHVANEDTRKGVQKAIESRKKQLFKQQELESDYIIMNHYENEILNHNNEALICGVDEVGRGPLAGPVVACAVILNRDHHYLGLNDSKKVPAKQRSILNEKLKDNVMSYAYGIATPQEIDDLNIYRATQVAMQRAIDQLSIKPTHLLIDAMKLDNNIPQTSIIKGDAKSVSIAAASIMAKEYRDDYMKELANEYPNYGFEKNVGYGTKQHLEAIDTFGVIKEHRQTFEPIKSMLK >NZ_CP053957.1|WP_002436291.1|1626259_1627426_-|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAEEAVEKAKELDSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYANELLGKQLVTHQTGPEGKEVKRLYIEQGCDIQKEYYVGFVIDRATDKVTLMASEEGGTEIEEVAAKTPEKIFKETIDPVVGLSPYQARRIAFNINIPKESIGKATKFLLALYNVFIEKDCSIVEINPLVTTGDGQVLALDAKLNFDDNALFRHKDIVELRDLEEEDPKEIEASKYDLSYIALDGDIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDVGGGATKEKVTEAFKIILGDDNVRGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVAAVKEVELTLPLVVRLEGTNVERGKEILNDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >NZ_CP053957.1|WP_002453081.1|1625329_1626238_-|succinate--CoA-ligase-subunit-alpha MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTQIVAGVTPGKGGQVVEGVPVYNTVEEAKNETGANVSVVYVPAPFAADSILEAAEAELDMVICITEHIPVVDMVKVNRYLQGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKEFNEDPETKAVVMIGEIGGTAEEEAAQWIKQNMNKPVVGFIGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTADEKIKTLNDCGVETADTPSEIGTTLIDAAKKAGIYDELLTVDK >NZ_CP053957.1|WP_002453070.1|1639020_1640388_-|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSDRLQATMQKMRGKGKVTEADIKTMMREVRLALLEADVNFKVVKEFVKTVSDRALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQEELTSLMGGENTSIKMANKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAGDIYRPAAIDQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVPPQQIVENALQHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELQEVKEISKPDEIMLVVDAMTGQDAVNVAQSFDDQLDVSGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRDSSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSDKQIDHIKAIIQSMTPKERSNPETLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRSQMENMLKGMNLPF >NZ_CP053957.1|WP_002453069.1|1640418_1640751_-|putative-DNA-binding-protein MGQDDLVKTIRMNYLFDFYQSLLTQKQKSYLELFYLQDYSLSEIADTFEVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYETKLGLYRRFEKRQEIYDLMKQSLNNSDLLEEYITQLEELE >NZ_CP053957.1|WP_002453068.1|1640737_1641997_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFSSKSEDEIQKELTEDVESDETSDSDASNESGETNFNDTIEEPKPKKKPKKLSEADFDEDGLISIEDFEEIEAQKIGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMKLTDELRTEAQRRNIQETEDLREVIVEKIVEIYHQEDDHSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYQQEGKKVMLAAGDTFRAGAIQQLKVWGDRVGVEVVSQSEGSDPAAVVYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKSNLMQELDKMKRVISRSIPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARSFKDVTNVSGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEKLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEDIPDELIDESSTDTEEGTQDGPR >NZ_CP053957.1|WP_002453067.1|1641993_1645563_-|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADHTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVKLKLDNHSKKLQIDSDELVVTRRLYRSGESEYYLNNDRARLKDIIEIFLDSGLGKEAFSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESINKLDHTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYQQLSKQMEQSDVIVTVHDIDQYNEDNTQLDQRLNELKSQQADKEAQQAQVNQLLQKYKGERQQVDYDIEKLNYELVKTTEAYEQLAGKLNVLEERKKNQSETNARYEEELENLNAQMKTIEHDKHQNEETLNELKDKQKHLNKEVQDLESLLYVSDEKHDEKLEEIKNNYYTLMSEQSDVNNDIRFLEHTINENEAKKSRLDSRLVEAFNQLKEIQNNINETEKSNKISKKALSEAEQQIHRIEKDLTKSKKQQSEYEDKLYQAYRYNEKLKSRIDSLATQEEDYTYFFNGVKHILKAKNNELKGIHGAVAEVIDVPSQMTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKQRNLGRATFLPLNVIKPRHIASDIKDIARQTEGFIDIASDAVKVSSKYQSVIENLLGNTIIVNDLKHANELARAIRYRTRIVTLEGDVVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELSTMRHQLEDYQRQTADFERHFKESKDKAEQLSEQYFEASQQYNTLKEKVHHHELELDRLKTQETHLKNEHEEFEFEKNDGYQSDKSKETLTQKQARLSEIQQQLTELESEIERYTQLSKEGKESTTKTQQQLHQKQSDLAVVKERIKSQKIEIERLVKQQESTQQQINTVEEKIKLFNSDEMMGEQAFENLKSQIQEQEEARDQLNKQHEELKQQRININETIEKNESQLQVCHQDILAIENHYQDIKAKQSKLDVLINHAIDHLNDVYQLTVERARTLYESNEPIESLRKKVKLTKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLNEQRTDLREAKETLEQIINEMDREVEGRFKDTFHAVQDHFTTVFKQLFGGGQAELRLTEDDYLSAGVDIIVQPPGKKLQHLSLLSGGERALSAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAQYLNELSEQTQFIVITHRKGTMEFSDRLYGVTMQESGVSKLVSVNLNTIDEVMKEEQA >NZ_CP053957.1|WP_002453066.1|1645686_1646424_-|ribonuclease-III MANHKKREMVIEFQQKFANKMDEWGFSFNNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPHLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIDLNELILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFVGALYLDQGLDTVWKFAEKVIFPYVEDDELVGVVDFKTQFQEYVHRQNKGDVTYRLIKEEGPAHHRLFTSEVILENNAVAEGKGKTKKESEQKAAEQAYKIMKKNESF >NZ_CP053957.1|WP_001830184.1|1646540_1646774_-|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKYINSLEK >NZ_CP053957.1|WP_002435264.1|1647506_1648241_-|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MSKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKDKAEAVVEEIKAKGVDSFAIQANVANGDEVKAMIKEVVSQFGSVDVLVNNAGITRDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKVTPQMLRQRGGAIINLSSVVGAVGNPGQANYVATKAGVVGLTKSSARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTDALSDELKDQMLEQIPLARFGEDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >NZ_CP053957.1|WP_016898737.1|1648233_1649160_-|ACP-S-malonyltransferase MSKTAIIFPGQGAQKVGMASDLYNEETRSTEILNQAQEALDFDLLETMFTDEEGKLGETENTQPALLTHSVALLEALENLNADFTMGHSLGEYSSLVASGVLSFEDAVKIVRKRGQLMAQAFPNGVGSMAAVLGLDYEDVDKICKDLSNEEELIEPANINSPGQIVVSGHKTLIDKLVEEGKSLGAKRVLPLAVSGPFHSSMMSVIEEDFASYINQFEWHDANFPVVQNFNAQGETDAEVIKHNMVKQLYSPVQFIKSTEWLIEQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKITSIQTLEDVKGWNENE >NZ_CP053957.1|WP_002453062.1|1649152_1650139_-|phosphate-acyltransferase-PlsX MVKIAVDMMGGDDAPGIVLDAVKKAVEDFKDLEIILFGDKEQYHLNHDRIEFRHCSEKIEMEDEPVRTIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEAHGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVSRPALVVTLPTIDGKGFVFLDVGANADAKAEHLLQYAQLGNIYAQKIRGIKNPSVSLLNIGTEAAKGNSLTKKAYELFEKDHSFNFQGNIEAKTLMDGNTDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKETILGSFKNKIAGAILKKDLDAFSKKMDYSEYGGSVLLGLDGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEENIVQTMRETVGGKNE >NZ_CP053957.1|WP_002453061.1|1650131_1650701_-|transcription-factor-FapR MKLKKDERRIAIQNAIDANPFITDHELCEKFGVSIQTIRLDRTHLNIPELRKRIKLVAEQNYGQIRSIEANEIIGDLIQVEPDIEAQSLIEITEDTVFAKTQIARGHILFAQANSLCVALIHNPTVLTQESQVEFIAKVKLNDTVRAKAQVIDKTCKHYIIEVNSYVKDKLVFKGNFKMFYISEDEFNG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053957_3 | 2094383-2094490 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053957_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053957_3
>3.1|2094423|28|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder TGCTCTTCGTGGTTTACAATCGCTTTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053957_3
The CRISPR arrays of NZ_CP053957_3 >merge|NZ_CP053957|3|2094383-2094490|CRISPRCasFinder CGATTGCACTAAGAACTACTCACCTTCACTTTGTGAAGGATGCTCTTCGTGGTTTACAATCGCTTTTGCGATTGCACTAAGAACTACTAACCTTCACTTTGTGAAGGA >NZ_CP053957|3|3|2094383-2094490|CRISPRCasFinder CGATTGCACTAAGAACTACTCACCTTCACTTTGTGAAGGA TGCTCTTCGTGGTTTACAATCGCTTTTG CGATTGCACTAAGAACTACTAACCTTCACTTTGTGAAGGA
>NZ_CP053957.1|WP_039973745.1|2093623_2094190_+|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKRIAVYCGASKGKDPSYVKEAYELGKYMAEQGYELVFGAGSVGIMGAIQDGVLDHGGKAIGVMPKMLDEREITSQKVSELILVDSMHERKNKMTELADAFVMAPGGAGSLEEFFEMYSWAQIGIHQKPIGVFNLNGFFEPLQALIDHMIKEGFIDKKYQKLAPLFDTKEALLEGLNNYKPLGVRTYD >NZ_CP053957.1|WP_002452676.1|2093163_2093610_+|YaiI/YqxD-family-protein MVKVIIDGDACPVVNSVIELTKGTGIFVTVLRSFSHFSHQIQPEHLKTVYVDDGPDAVDYKIVQLAKKEDIVITQDYGLASLLIDKVHIVMHHKGSIYRADNIQALLDQRYLNAQIRKQGGRHKGPPPFTKNDRLKFEQAFTNVIKQL >NZ_CP053957.1|WP_002452677.1|2092470_2093157_+|hypothetical-protein MDKKRLIKTLINVLPIVIVPLVFERKRIKEHPDVRKATDATTKATSKATTTISNKASDVKEYVGDKKQEFDNKRELKKIAKENDPAYIEKKDEKLAKQNRKEAEKMDKKLQKNIEKRHKEEDKQREENKKQRIKDMKKSQKYEEKVGLTPGKLDDKTEKKGEKLEKDNRKDVKKLDKKLQKNIEKRHKKEEKQQEAEKKARKKEFKKYDDYVADSVVKQNKESDNTQG >NZ_CP053957.1|WP_002452678.1|2091380_2092253_+|undecaprenyl-diphosphate-phosphatase MFLLELIKGIILGIVEGLTEFAPVSSTGHMILVDDMWLKSTKFLGEQSAFTFKVVIQLGSVFAAAWVFRDRFLEILHIGHHKPNNESNVQRRSQPKRLNLLHVLVGMIPAGILGFLFDDLIEKYLFSVPTVMIGLFIGAIYMILADKYSERVQHPQTVDQINYFQAFVIGISQAIAMWPGFSRSGSTISTGVFMKLNHKAASDFTFIMSVPIMLAASGLSLLKHYEYIHLAHIPFYLLGFLAAFIVGLIAIKTFLHLINKVKLIPFAIYRIVLVVVIAILYFGFGIGKGI >NZ_CP053957.1|WP_002452679.1|2089525_2091154_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MKKLTNLVFKYKIYPALMFIMSVFLSITVVIQNVSIAKLLNHMLYHHKQSLIGLFILIFVILIARATFNMLNQRIGDRMATRVKYDLRQQVINKNSTCSVGEQINILTESIDGIAPFFQSYLPQVFKSMMIPVAIIVAMCYVHLSTALIMMVTAPFIPMFYIIFGLKTRDESKDQMTYLNQFSQRFLNIAKGLITLKLLNQTKNTEAHLYEDSTKFRDLTMKILKSAFLSGLMLEFISMLGIGLVALEAALSLVVFNKINFITAAIAIILAPEFYNAIKDLGQAFHTGKQSEGSSDVVFEFLDSENKPTHSNPTINTYQNPQIKVKELSYQYPNNEQDALTHINMVVYSGDKIAIVSPSGAGKTTLAHILSQAKTPTKGSISFNKEATRIGFLSQNPYIFTDSIKNNIAMYNSEVSDKTIIQVLEEIGLKDKVLSLKNGIHTQIGEGGEMLSGGQMRRIELCRLLLMNPELVIFDEPAIGLDIETERTIQNVIQNHFRDTTMIIIAHRDSTINKAKRRIYLENGRLIKDDMTISVSRNEVNQ >NZ_CP053957.1|WP_002452680.1|2087837_2089523_-|thiol-reductant-ABC-exporter-subunit-CydC MKSRIHFRKDKDLLLTIIVGVAGGLVALAIFFLSGYMVTQSALGAPLYALMVLVVTVKMFGFLRAITRYIERLLSHRTTFTMLRDVRVQFLNKLFPAVPDVYRKFNSSDLITRMVSRVEALQNIFLRVYYPPVVIGLTAIVSIITLIFISPMHSCLIALSMILTLWIVPWISAKKARILKRQVALHQSNFLQRFYDYKEGDEELRRFRQRDEFKVDVMHRLNQYDSMQSKERRFLSLYDYILNLIAMVSIFLSLVIGVQQVQSGHLDVVYITSIVLMILTLFEQAVPMSNVAYYKADTDQALDEINDVINAPQSNIMHPLKYTDSTMSLFEMNDVTFSYWSQQTPVLHNIDLTIQEGEKVAIIGPSGSGKSTLLQVMLGLYHVDQGIVKLKRQIVTDIDEEDKYHKMNGMLQSQHMFDGTVRDNLFSEKEDAVLIQVLQSVGLGYLDLERNVSLDGENLSGGEKQRLSLARLLLRDSADIWILDEPTTALDLENTTKMMNLIESSSETLIIATHDLDVLPRFDKIIVMIDGEIKESGSYESLLKGNGYLSQMIEINHSSRA >NZ_CP053957.1|WP_002433445.1|2087270_2087711_+|MarR-family-transcriptional-regulator MSDQHNLKEQLCFSLYNAQRQVNRYYSNKVFKKYNLTYPQFLVLTILWDESPVNVKKVVTELALDTGTVSPLLKRMEQVDLIKRERSEVDQREVFIHLTDKSETIRPELSTASEKVATASSLSKEEVKELNRLLGKVIDAFTETKE >NZ_CP053957.1|WP_002452681.1|2086119_2087046_-|GTP-binding-protein MRNNKDEKITISIISGFLGSGKTTLLKHYISEILKTDEKVKVIMNEFGSLDVDGNHLSNMVDVRSILNGCVCCDLKMDLVNQIELLLQSDETDHIIIEATGIAHPIEIIMACQDPRIVKYVHQPQVIGVVDAERFLNRKQYSESTMRLMEEQLEVSHVLIVNKTDLISEDQQQQLEDELYRINASVPIILTTYGQVNIDEISQFRDDVATIHTHSHHHGINSMQYTFSGSIDRQLFYQFILRLPDNVLRLKGYVQFRDTPNETYEFQYAYGLPDYGVVEKGMTLTIVIIGEQIDVNRLKNKLDMIQFS >NZ_CP053957.1|WP_002452682.1|2085817_2086102_-|hypothetical-protein MNNEDKREQQIKFEKNLITFPYLGFAIVVQLFNIFYPDIKVSMALFGLFFAYNLGLLFIAFIRHFKRTFILTLVLTILSGAAFFTLLYVFGLRH >NZ_CP053957.1|WP_002452683.1|2084730_2085672_-|malate-dehydrogenase MNTRRKVSIIGAGNTGSTLAFVLAQKEIADIVMIDRPQSEGFVKGKALDILESGPIFGFDTNVQGSVQIEDIQDSDIVVMTAGIPRKPGMTRDDLVQTNEEIVHQTSLNIAKYAPNATIIVLTNPVDAMTYTALKASGFPKERVIGQSGVLDTARYQSFIADELKVSVKDINGLVLGGHGDTMVPLVESTQVNGVPVKDLIAEDVLERIVNRTRKGGAEIVELLGKGSAYYAPATAIYEMIEAILKDQKRLLPSIAYLEGEYGFSDICLGVPTILSKNGIEKIVEVNLNEREQEQLKYSAESVQNVKNALKNK >NZ_CP053957.1|WP_002452673.1|2095151_2095448_-|hypothetical-protein MHEQDFNILEGQNITLLELGRELENITGRTIVDSTSEIKRVIAHLPNFESDTDTFVATYRLNHQNDFIDATFTAPKEQRDRLKEIPVHVKLISYISKA >NZ_CP053957.1|WP_002452672.1|2095681_2096026_-|hypothetical-protein MKKWFTLLLASTLMLTACGKSNEKASLETSIDQLEKENKDLKKQKKDLESQKNKLKDQQDNLQKDINELPAEDSSNKSSEKDSSDSSDDKNSEDSSTTSSEQATDSTKTKQSNQ >NZ_CP053957.1|WP_002452671.1|2096083_2096539_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MKRITLEDEGWINEIATIHEHLISENELDYQVTSTSIALRYEMIISRLKYADDHILINEYVGSLKGFIWGHYEPQLKIVQIEVLYVKPDFRRQGIATHLKRDIEQWANLLGAISIESTVNKDNSDMINLNKVLGYQTSHLKMSKNLKGKNE >NZ_CP053957.1|WP_002452670.1|2096681_2097371_+|DUF1129-family-protein MKSTAQLTKENNVKSLRLNNTDREIFENYMTYIRADLSVNPHDSELMLNRILKHLIRAEDKGMLAMEFFDHDPKAHAKKEIKALPNETIKNIFKYIYHNFIFLIGIFCFLKGFIGFFIGGDSNYLYLYTFPITVIVGLFIIFLFIWMSFRTVQLQCFNNSHWVWWLTYGVIALLLITLFYVFFIPQSFLAFGPYINVSNWTFIIIFILITPVAFYVDHHFYDRDANTRM >NZ_CP053957.1|WP_002452669.1|2097439_2097928_-|DUF456-domain-containing-protein MTAVLWILIILMFVLAFVGLIKPIIPSVLVMWIGSIIYQIGFNDGRLSWIFYVAMIIFTVFILVADFMMNKYFVNRFGGSKVGEYTALVGVIVGCFVFPPFGIILVPLIAVFVVELLNGFDFKKALKVSLGSVIAFLASTVAQAIIMVMMVIWFFVDVFLIN >NZ_CP053957.1|WP_002452668.1|2097934_2099143_-|sugar-efflux-transporter MFTALFHIKNYKLFVVNMMLLGMGIAVTVPYLVLFATKDLGMTTTQYGLLLALAAVSQFTVNSIIARFSDTHNVNRKVLIITALFMGAVSFSIYFYVHQIWLFIVLYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINISSSRDRAKFANTVLRSMFSLGFLFGPFIGSQLIELNGYTALFGGTVAILLFTLVLQVFFYQNLPVEHQISSQQHVEKSAPNMFRDKALFIPFIAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTNYLKERDSYVGYLASLCAGLEVPFMVILGILSAKLPTRTLLLIGSIFGGAFYFSIGVFKNFYMMLAGQVFLAIFLAILLGLGISYFQDILPDFPGYASTLFANAMVIGQLCGNLLGGVMSHWVGLENVFFVSATSILVGMILIFFTKDQIITEEDME >NZ_CP053957.1|WP_002452667.1|2099215_2100070_-|LysR-family-transcriptional-regulator MKIDDYRLLITLDETKTLRKAAEILYISQPAVTQRLKAIESSFGVEIFIRTKKQLITTTEGAMIIDHARDMLKRERLFFDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPEVLSLYNTQFPNVEIQVQVGSTEQIKANHRDYHVMITRGNKVMNLSNTHLFNDDHYFIYPKDRREDVTKLPFIEFQADPIYINQIKQWYNDNLGQDYHATITVDQVATCKEMLLSGVGVTILPEIMMKHIDKNMFEFEKVSIDDEPLIRSTYMSYDGSMLQLPQVDSFVNLMLNFIR >NZ_CP053957.1|WP_002452666.1|2100163_2100769_-|DUF402-domain-containing-protein MKVKYIDKRHWRRLVEREYTEVKVNNNRFKGIIGLVTMKKVREPLEVTVVGQNIIVADDNYRWLQILPEKKRYSITVMFDDKGNPLEYYFDINIKNITQKGNARTLDLCLDVLVLPTGEYELVDEDDLMYALQNKQISKKQYHEAYIIAHQLMIEIEENFSEVQDKVMHCYNKIYHKSLRNKHKRPFKPKNKRKQHRRKAK >NZ_CP053957.1|WP_002452665.1|2101170_2101641_-|cupin-domain-containing-protein MKTSQEWIQELALIAHPEGGYFRETLRDDTLNRSPYSSIYFLLTHDNISHFHRIDADEVWYHHAGETLTIHMITPEGKYHSVKLGQNISDGDQLQYCVPKGTIFASSIDDNEGYSLVGCMCQPAFEFEHFELLRQDQLIKQYPDLENMPYYSKRSL >NZ_CP053957.1|WP_002452664.1|2101640_2102357_-|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPNPESNQALRLVLERAKTYSVPNHIIDRAIDKAKGAGDENYDHLRYEGFGPSGSMLIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDHTATFGVEGKSADEILETLMEQDVDVRDVIDEDGLTIVYAEPDQFAQVQDALRESGVEDFKVAEFEMLPQTDIELSEDDQATFEKLVDALEDLEDVQNVFHNVDLK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053957_1 | 1.1|1625106|25|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder | 1625106-1625130 | 25 | NZ_CP053957.1 | 20192-20216 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053957_1 | 1.1|1625106|25|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder | 1625106-1625130 | 25 | NZ_CP053957.1 | 1542802-1542826 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053957_1 | 1.1|1625106|25|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder | 1625106-1625130 | 25 | NZ_CP053957.1 | 1710321-1710345 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053957_1 | 1.1|1625106|25|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder | 1625106-1625130 | 25 | NZ_CP053957.1 | 1767885-1767909 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053957_1 | 1.1|1625106|25|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder | 1625106-1625130 | 25 | NZ_CP053957.1 | 1797093-1797117 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053957_1 | 1.1|1625106|25|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder | 1625106-1625130 | 25 | NZ_CP053957.1 | 1927025-1927049 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053957_1 | 1.1|1625106|25|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder | 1625106-1625130 | 25 | NZ_CP053957.1 | 2045993-2046017 | 0 | 1.0 |
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3. spacer 1.1|1625106|25|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder matches to position: 1710321-1710345, mismatch: 0, identity: 1.0
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agaaattctctatgttggggccccg CRISPR spacer agaaattctctatgttggggccccg Protospacer *************************
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1. spacer 3.1|2094423|28|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder matches to KP063903 (Bacillus phage BalMu-1 copy 2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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2. spacer 3.1|2094423|28|NZ_CP053957|CRISPRCasFinder matches to KP063902 (Bacillus phage BalMu-1 copy 1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
tgctcttcgtggtttacaatcgcttttg CRISPR spacer ttttgaacgtggtttacaatcgctttta Protospacer * .* ********************.
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DBSCAN-SWA_1 |
1006832 : 1105789
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053957|1006832:1105789|DBSCAN-SWA 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113 | Staphylococcus_phage(48.15%) | terminase,tRNA,protease,plate,tail,capsid,head,integrase,portal,holin | attL 1019381:1019399|attR 1111416:1111434 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1233748 : 1245289
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053957|1233748:1245289|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053957|1233748:1245289|1243099_1245289_+|WP_039973828.1|DBSCAN-SWA MNNEYPYSADEVLHKAKSYLSASEYEYVLKSYHIAYEAHQGQFRKNGLPYIMHPIQVAGILTEMRLDGPTIVAGFLHDVIEDTPYTFEDVKDMFNEEVARIVDGVTKLKKVKYRSKEEQQAENHRKLFIAIAKDVRVILVKLADRLHNMRTLKAMPREKQVRISKETLEIYAPLAHRLGINTIKWELEDTALRYIDSVQYFRIVNLMKKKRSEREAYIDNAINKIEAEMEKMNLSGEINGRPKHIYSIYRKMMKQKKQFDQIFDLLAIRIIVNSINDCYAILGLVHTLWKPMPGRFKDYIAMPKQNMYQSLHTTVVGPNGDPLEIQIRTYEMHEIAEHGVAAHWAYKEGKTVNEKTQDFQNKLNWLKELAETDRTSTDAQEFMESLKYDLQSDKVYAFTPASDVIELPYGAVPIDFAYAIHSEVGNKMIGAKVNGKIVPIDYVLQTGDIIEIRTSKHSYGPSRDWLKIVKSSSAKSKIKSFFKKQDRSSNIEKGKFMVEAEIKEQGFRVEDVLTEKNLEVVNDKYHFANDEDLFAAVGFGGVTSVQIVNKLTEKQRILDKQKALNEAQEVTKSVPIKEDIITDSGVYVEGLENVLIKLSKCCNPIPGDDIVGYITKGHGIKVHRTDCPNIKNETDRLISVEWVKSKDSTQRYQVDLEVTAYDRNGLLNEVLQAVNSTAGSLIKVSGRSDVDKNAVINISVMVKNVNDVYRVVEKIKQLGDVYTVSRVWN >NZ_CP053957|1233748:1245289|1242170_1242689_+|WP_002453394.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGKAYGYATDQIVEYARERDVDVVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYSLEYGTNILTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLHGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP053957|1233748:1245289|1237455_1239741_+|WP_002453396.1|DBSCAN-SWA MKKTSRLIAFILLVALLFTGMGLTYKNVVKNVNLGLDLQGGFEVLYQVNPLDKGEKIDKKALQATSRTLENRVNVLGVSEPKIQIEDPNRIRVQLAGIKDQAQARKLLSTQANLTIRDAQDHVLMSGSDIKQGSAKQEFKQDQPTVTFKVKSKEKFKKVTEKISKKRDNVMVVWMDYKKGDSYKKEAKKQQEGKDPKYVSAANVDQPINSDSVEISGGFNGKKGVKEAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTIFASFIGVGIIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAYSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRGLLSLLVSSNFFKKKYWLFGVKKKDRHDINEGKDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIALSILIVIVGLFILSIFKLNLGIDFSSGTRADIETNQSLTQGKVEKAVKDVGLSPDQVQINGSGHKNATVQFKKNLSRAEDNKLSDKIKSEFGDTPQINSVSPLIGQELAKNAMTALILASIGIIIYVSLRFEWRMGLSAVLALLHDIFIIVAVFSLFRLEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLHKVKVVTSPEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVVVVVVAILIFGAPTIFNFSLALLIGLISGVFSSVFIAVPLWGIMKKRQLKKSPNNKLTVYKEKKTNDEKILV >NZ_CP053957|1233748:1245289|1235802_1236942_+|WP_002453397.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLCIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELKDIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKQAGGLHQFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPSEYDYVKNSIERTTRWAERCLKAHQRPEEQALFGIIQGGEYKDLREQSAKELVDLDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYDMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSKGRVVIKNAKYADDLGPLDDNCDCYTCRNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKDAFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP053957|1233748:1245289|1239878_1242152_+|WP_002453395.1|DBSCAN-SWA MIKSRYHWDLAQPTEYITDDLAKKLNLSPIVKKVLESKNLVQENNILDVLEDKVLDHDPWLLSDMQKAIDRINLAIDKNERILVYGDYDADGVTSTTILVNTLQQLGAQVGWYIPNRFSEGYGPNELAFRNAYDEGISLIITVDNGIQGHDEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGRTLPEALAIVHPMHPDFDYPFKYLCGAGVAYKLSQALLSHPPQQFIALAAIGTIADLVSLTDENRSIVKRGLKILNDQTPVSINAILKQAGYNDQINEETIGFIIGPRLNVVGRLEDASLAAELLMVDEFEEAEFLAEQVEHFNQERKDIVAEITEEALSLAEEQVQQGNLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETYALPTLVLNIDLEQNHAKGSARSIEQVSMFEILNAHQDLITKFGGHHMAAGMTMDIENIDELRKGLNEWMKQLSESTSLAPRKHVDVLLNESEITVKNIQDIQKLRPFGTDFNSPIFEVNDLNVKSIKAIGQEGKHLKVALGENQLAALYWSYGHLAKEIEMGQPLNLIGNLQINEWNGNQSPQLIIQDIATETIQILDYRSKRKHLQFTENNSNTAYVIHPKKDKTNEHHYYYGETIESQYDKVVLRDLPTTMNEIEETLKQLQFSQLYLVLQHDQSIYFEGMPSKALFKECFKALINKQETNLAKEGMMLCEFLKVKPEILKFMLKVFNELNFIYNEDGLIKINSHSSKKDIETSRLYQLRQSRIEVEKRLLYDDFSNIKNWIMSQLN >NZ_CP053957|1233748:1245289|1234754_1235780_+|WP_002453398.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYHLPESLIAQTPLKNRDQSRLLVLQRETGKMTHLHFKDVIDYLNPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNRLSFGDGKIVAECIKELEQGGRIMRLHYDGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDDLLNQIKQKGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVDNIDDHEMHSEYYQMTQETADLLNQTKAKGKRIISVGTTSTRTLETIRRGHEQFVEKSGWTDIFIYPGFEYKAIDGLITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENILNAYHKAVEMEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP053957|1233748:1245289|1233748_1234753_+|WP_002453399.1|DBSCAN-SWA MDKRMVDQQFHNEDSDFELSLRPTKLKQYIGQTSIKSNLEVFIKAAKLREEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTISGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSAVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNENDLKEIITRTADVLGTGIDEESALELARRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDDQIYIETTKRALQLLQVDKEGLDYIDHKMMNCIINQYNGGPVGLDTIAVSIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPFAYVHFNNTNEKRE >NZ_CP053957|1233748:1245289|1236957_1237221_+|WP_002436110.1|DBSCAN-SWA MGQFTSLILPILLLVLMWFFLIRPQQKRAKEHREMISRVESGQKVTTIGGIKGTVKSVDETTVVITVNGHGTEMTFEKPAIKQVDPS |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(57.14%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1363344 : 1375601
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053957|1363344:1375601|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053957|1363344:1375601|1372915_1373164_-|WP_002433578.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIEDEPFDGDALKFE >NZ_CP053957|1363344:1375601|1373272_1374235_+|WP_002453294.1|DBSCAN-SWA MYDILSYAIDHAFNYKTNKSIYNILIGKKSHQTFFDASSQQLLSLYHSLPNLKYPTFERFILQKDDFNHELDIKTHPRYTYDSLTRTFSCIQLLIQTLSNTRKDSFKFIPVVQNTYVQQKVKQLYNHIKLSQLEASFISEIYSLFDAIERRNNKNVLHYYLQGYEEPMYTRQQISLIEDIKQSELFELEMNQLIDLLDEIEDESNYPILSHTIILPQLLNQTFLSYQKLLHGMNMNEIAEHQNVKINTIEDHILEIFIKGYQNDYNTYVNQKQIDQFIQYYDHHIGLRLREYKQAFEDLTYFQIKLIIVGIERGDLRVRR >NZ_CP053957|1363344:1375601|1365520_1366408_+|WP_002433630.1|DBSCAN-SWA MNTIIEEYLNFIQIEKGLSSNTIGAYRRDLKKYEEYLEERKISHIDFVDRQVIQECLGHLIDLGQSSKSLARFISTIRSFHQFALRERYAAKDPTVLIETPKYEKKLPDVLEVQEVLDLLETPDLSKNNGYRDRTMLELLYATGMRVSEIIQLEVEDVNLMMGFVRVFGKGNKERIVPLGDAVIEYLTTYIETVRPQLLKQTVTHVLFLNMHGKPLSRQGIWKMIKQNGIKANINKTLTPHTLRHSFATHLLENGADLRAVQEMLGHSDISTTQLYTHVSKSQIRKMYNQFHPRA >NZ_CP053957|1363344:1375601|1367815_1368358_+|WP_002453300.1|DBSCAN-SWA MDNQGILEALLYTSGDEGLEQKQLLEILELNENELDQLIDTYQSPGLVIQKFGTTYVLTTKKDASSYIEQLIEQKSKMKLSQAAMETLSIIAYNQPLTRSDIEMIRGINSDGAVKTLIARGLVEAKEVDHSRSHHLITTDLFLNVFGIESLESLPTTEEDDAEMDEFFSNLVNQKGDSNE >NZ_CP053957|1363344:1375601|1367091_1367823_+|WP_002453301.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFNGPLDLLLHLIQKFEIDIYDIPMKALTEQYMQYVHAMNQLEINIASEYLVMASELLMIKSKLLLPQTSVEDDIEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTEILNDMKDQRELYYTKYPTDLSYLETDESWDPNQTIDLTELIVAYQRVKNRVELNTPKSVEIKKETFTIQQATEQVTNRLKEHESFNFFSLFTFHEPVEQVVTHFLAILEMSKSGIVNINQNNQFEDIDIIRGVNYNIG >NZ_CP053957|1363344:1375601|1363344_1364253_-|WP_002453305.1|DBSCAN-SWA MQKNILKSGIEISELGLGCMSLGTDFNKAQPIIESAIEQGITYFDTADMYDQGINEEIVGKALKKYQNRDDIVIGTKVGNRLTDDGNVTWDPSKKHIKEGVKGSLKRLGLDHLDLYQLHGGTIDDPLDETIGAFDELKQEGIIRAYGISSIRPNVIDYYLKHSQIETLMSQFNLIDNRPESLLDTIHEQQVKVLARGPVFKGLLTSNSVDALDKKFEDGIFEYTRDELGETIASVKEIESNLSALSFKYLTSYDALGSIIVGASSVEQLEENVRNYYKDVSLDQIKSARERVKNLEYTQHLK >NZ_CP053957|1363344:1375601|1364982_1365432_+|WP_002453303.1|DBSCAN-SWA MEERLNRVKQQLQQSSYKLTPQREATVRVLIENEKDHLSAEDVYLKVKDKSPEIGLATVYRTLELLAELKVVDKINFGDGVARFDLRKEGAKHFHHHLVCMECGKVDEIDEDLLPEVENRVENEFNFKILDHRLTFHGVCSDCQAKGKG >NZ_CP053957|1363344:1375601|1366460_1366994_-|WP_002453302.1|DBSCAN-SWA MDDALIHFYYQFHKHQHYFLCHDILEEAWKLNPSFSKNDAVVSLILFATACYHYRRDNIKGALKSYEKSLSVIKQAKDKTQLHLNIDEYQSMILHQINSIRDHHVFVPVKLPIHTSFEKVIKRVYQDYSFTQFVISEPYIVHHHIKRDRTEVIQAREEARQLRRSHTQRPYNTLKDQ >NZ_CP053957|1363344:1375601|1369932_1371699_+|WP_002453297.1|DBSCAN-SWA MNRLNSVVIKLWLTIILIVATVLILLSVSLITFIQYYFTQETENSIKEDAKRISSLVEKSHNKSLAIQNSQKLVDGPGGLIIMNNFNDKPHASYNNTKTQMLNEIKKSPKFKRVFNNGEFETQNVTIKNNGNTQSYILLGYPMKPQEDASSKHSGVFIYKDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFIAASTVFAFFLSNRITKPLRQLKTQAQKVSEGDYSQISSVSTKDEIGDLSRAFNNMNYEIQEHIDALSSSKSIRDSLLNSMVEGVLGINDQRVVIFSNKMADDIIHFIDDFSKESIEQQIEKTFESKGTEFLEIEISTRYYVFITSYINRIQPNGRSGIVVIIRDMTNEHNLDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPDEIRDSLGVVLDESKRLNRLVNELLNVARMDAEGLSVEKEVQPIKNLLDKMKAKYRMQADDLGLTMEFNSGNDHLLWDYDMDRMDQVLTNLIDNASRYTQPGDTIAVTASKDEQYNILYISDTGTGIAPEHLQQVFDRFYKVDASRKRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGQIDVKSELGKGTTFIIKLPQPKNNEAE >NZ_CP053957|1363344:1375601|1374221_1375601_+|WP_002453293.1|DBSCAN-SWA MLEDKLKEWFGFETFKRGQKEIIESILAGKHTLGILPTGSGKSLCYQLPTYLIEKPTLVISPLISLMDDQVMQMKLNGESHVSYIHSGMDEIEKRNHINQISQSRFIYLSPEFLLQPQNFKLISHLDFGLIVLDEAHCLSEWGYDFRPHYALIGQITSHFKNARILALTATAPPHLEEDLSHILSIDLNVIKTSMNRDNISLQHKNFNDDEEKIKWLIPFLSYSGPTIIYISSKKRCLELAKLIYEAGFLTGIYHGDLSYQERQTVQQQFLNNDIPIIVATSAFGMGINKKDIRTVIHFHLSSSPSNYLQEIGRAGRDGKPSQAISLYQPDDSFILETLLFADMMTEEDISMFELGEFLPPVKKDILDTLYRQFTINDLKSIFKKSFQRKRLGYMRILGYKNLDQCRRNYLLEFFGEHPDKPVRCCDNDTELEEIKTFNRKKVKRKMNYKEKLQNLFED >NZ_CP053957|1363344:1375601|1364335_1364878_+|WP_002453304.1|DBSCAN-SWA MRLNEKTIDRTVIYNGKIIDLELHDVELPDGSTSKRELVYHNGAVAVCAVTPEDEVLLVKQFRKPAEKPLLEIPAGKLEKGEEREEAAKRELQEETGYIASNLEFVTDMYGSPGFSSEKLSIFYTDQLSEGEMDLDDDEFVELHKVSIENVKSMLENKELEDAKTIIALQHLLLNYNHSK >NZ_CP053957|1363344:1375601|1369223_1369949_+|WP_002453298.1|DBSCAN-SWA MANEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFEIHEASDGKEAYQLAMDNNYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSANSEQSEPHARDIIEFNHLVIDNDAHRVLADNEQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKDVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSNDAAQMIQTVWGVGYKFEVKASDEPTK >NZ_CP053957|1363344:1375601|1368350_1369088_+|WP_002453299.1|DBSCAN-SWA MSKELERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGQVVTELGTKVSHSDTVEVEGIKIEQEDKMYILFYKPTQVITSVSDDLGRKVVTDYFEDIETRIYPVGRLDYDTSGVLLLTNDGEFTNLMTHPRYHIKKKYVAKLKGYLMREQVKELEQGIELEDGFTQPAQVKIKRQDKEKNTTLVEITISEGRNRQVRRMFEYFGHEVNKLTRIQFGPLDLKGLNAGEGRVLTPHEVKTLRHLAENGK |
13 | Bacillus_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1799967 : 1808437
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP053957|1799967:1808437|DBSCAN-SWA 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CCCCTTCTCCGGGACCCATTAGGACATGTTCGCCAGTAGTAGGGAACTGCTTTAAGAATGGTTTAGAATGTTTATATGAACAATGTTCACTCCACATTACTGAAAAGATTCCTACCTCAGTAAAGTTGGGTTCTCTGCCAAGAATTTCAACCACTTTATCGTATTCTTTATCACTAAGCCCCATATCTTGATAAAGCTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACACTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTAACCATTGATTCAAATAATTTCACTCCACTGTCAGTGCCTAATAAAGTTTCTAATGCACGTTCAGGATGAGGCATCATTCCACAAACATTTCCTTCTTTATTAACAATGCCTGCTATATCTTCATAAGAGCCATTAGGATTATCTGTATATTTAAGGATGATTTGATTATTTTGTTCAAGTTCATTAAAGATCTCTTCCGTACAATAATAATGTCCCTCACCATGAGCTACAGGATAAATAACTTCTTGATTGTCTTCATATAAATGCGTAAATAGAGTTTGGTTATTAACTATTTTTAAAGTTTCATTTCTACTTATAAAAAGATGTGAATCATTATGCAGTAACGCACCAGGAAGTAATCCAATTTCTGTTAATATTTGGAAACCGTTACATACACCAAGCACTGGTTTTCCTTCTTTTGCAAGACGTTTAACCTCATTAATAATAGGTGCTACACTTGCCATTGCTCCAGATCTTAAATAATCACCAAATGAAAAGCCACCAGGAATAAGCACCCCATCAAATCCTTCTAAGCTCGTTTCTCGATAATCGACGTAAGCTGCATCAACACCAGATTTAATTGCGGCATTATACATGTCTCTATCACAGTTTGAGCCAGGGAATACAAGCACTGCGAACTTCATCTTATGCATTCTCCTTTTCTTCAATCACTTTATAGCTATATTCTTCAATTACTGTGTTAGCAAATAACTTTTCACTTAATGTCGTAATGATATTATCTACCGCTTCATCTGTTGCTTCATCAACCGTCATATATAGAACTTTACCTACACGGATGTCGTTCACTTGCGTATAACCTAAATCATGTACGGCTCTGTTTAGGGCTTGTCCTTGAGTATCTAATACTTGTGGTTGTAAAGTGATGTGCAATTCGATTGTTTTCATTATTTAAGATCCTCCAATTTATTTAAGAATGTTTGATACGTATCAATAAGTGAGCCAGTATCATTTCTATAAACGTCTTTATCAAAGTTTGTATCTGAATATTTATCCCATATGCGACATGTATCAGGAGAAATTTCATCCGCTAATAAAATTTTGCCATCATGTGTTTTACCAAATTCAACTTTGAAATCAACAAGTCTAAGTTCCATTTCATCCATTAGTTGAACCAACACTTTATTGATCTCTTTTGCCATATGTTTTAACTTGGCGATTTCGTCATCATCAGCAATATGAAGAAGCTTTACATGATCATCTGTGATGAGTGGGTCGTTGAGGTCATCATTTTTATAGAAAAATTCGACTAATGGTTCTTCAAACTCGTGTCCTTTTTCAAATCCTAATCGCTTAGTAATAGAACCAGTGGCGATATTTCTCACTACGACTTCTAAAGGGATAATGTCTACTTGTTCTACGAGTTGCTCTGTCTCTGAGAGTTGCTTAATGAAGTGGTTATTGATGTCGTTACGAGTTAAATAATCAAATATAATAGATGTGATTTGATTATTTAACTTTCCTTTGCCGACCATTGTGTCTTTTTTGACCCCGTTGCCTGCGGTTACTTCATCTTTGTATTCTACTCGCAATTGATATTCTGTCTCAGTGGTGTAAACACGTTTTGCTTTTCCTTCATATAATAATGACACTTATTTGTCTCTCCCTTCGAATTTCATTAACATGTATTGTTCAGTTTGATTAACATCATTAGTAAGTAATGTCATGTGCCCCATTTTTCTATCTGGTTTACGTTGTGACTTACCATAAATATGAACATGCCATTCAGGATGATTCGCAAATTCATTTTCAAGCAAATCTAAATCGCGTCCGAGTAAATTCATCATTACAGCTGGTTTAAGTACATCAATTTGTTGTGGGAGCTTCTGTCCTGTTACTGCTAAAATATGTGTATCGAATTGAGAAAAGTCACATGCTTCTATTGAATAATGACCAGAGTTATGAGGGCGTGGCGCTATCTCATTAACGTAAAGGTTATTTTCTTTATCTATAAAGAACTCAACGGTAAATGTGCCTACAAAATGAATGACATTAGTTATTTTATCTACTTCTTTACGCGCTTCTTGTTCTTTATTAGATCTAGCAGGTACGATAGTCTTAAATAAGATTTGATTTCTATGTTCATTCTCTTGTAAAGGGAAATATGTTGTTTGTTGCTCATTTCCGATTGTTACTGTAAGAGAAACTTCCTTATCAATATCAAGATATTGTTCTGCTACACATTCTTGGTCGGAAATTAAATCAATCGCTTCATCTAAATATGATTCACTTTTGACTAGAATTTGTCCTTTTCCATCATAGCCACCAAAACGGGTTTTAACGATAAATGGATAACCTAGTTCTTTAGAAGCTAGATATAAATCTTGTTTATTTTTAATTTGTAAAAAAGGAACAATATGTGCACCAGCATCTTGTAAAGTTTGCTTTTCAGTGAGACGGTCTTGAAGTAACTGAATCGCTTGATATCCTTGAGGTACATTGTAGTTGTCAGTAAGTTGTTTAAGTAGTTGAGAAGAAATATTTTCAAATTCATAAGTGATGACGTCTGAACTTTCACCTAGTTCTGTTAATGCTTGTTCATCGTCATAATTAGCGTGGATAAAGTGATGTGCAACGTAGCGACATGGACTGTCTTCATTTGGATCAAGAACAATAACCTTATAGCCCATTTTTTGTGCAGACTGTGCCATCATCTTTCCTAATTGTCCTCCCCCAATTATTCCGATAGTTGAACCGAATTTCAGTTTATTGAAGCTCATTCTGCATTGCCTCCACTTTATTCACTAATGTTTTTTCATAATTTTCCAAATTCTTGTGAACCGAGTTATCAGTCATGCCAATCATTCTAGCTGCTAATATTCCAGCGTTTTTTGCACCTGATTTGCCTATAGACGTAGTTGCTACCGGTATTCCACCTGGCATTTGTACAATAGATAATAGAGAATCTAACCCCTTTAAACTTTTTGACTCTATTGGTACACCTATTACAGGTAAAGTAGTCATTGATGCTACCATACCAGGTAAATGTGCTGCGCCACCTGCTCCAGCAATAATGATGTCATAGCCGTTTTGCTTTGCTTGACTAGCGAATTCAAACATAAGTTGAGGCGTACGATGAGCAGAAACTACTTTTTTATCGTACGGAATATTAAATTCATCTAACATCAAGCAACTCTCTTTCATAATCTCCCAGTCTGAAGAACTACCCATAATGACTGCTACTCTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP053957|1799967:1808437|1803020_1805210_-|WP_002452931.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKLYQDMGLSDKEYDKVVEILGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELSVKQNQRLLKGVVSGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGVIDHDMVQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLNLDQVPTREPNISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTDRFVLTYEDEVFADIPVQPLSDEAPVYVLEGEDKEYNTSKNDYSNIDVRDVFSKLLKHPTIASKRYLYEQYDQQVGANTIVKPGLQSSVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACEVLNTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIEDINYLNDFHPKAGEKLYLVGDTRDDFGGSQIEKLLYGSVNHEFEAIDLSDEVEKGESIKEAIRNGVASHVQTVGKGGLLLTLAKISAYYNLGLNAQLDMTNAQLFSETQGRYIISVKDGQSLDVNQAIEIGQLTSDGTFEVSNSEVTISKKVSDIKHTWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP053957|1799967:1808437|1805202_1805874_-|WP_002452930.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKSGVDAAYVDYRETSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIINEVKRLAKEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNETLKIVNNQTLFTHLYEDNQEVIYPVAHGEGHYYCTEEIFNELEQNNQIILKYTDNPNGSYEDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFESMVKSWREQHV >NZ_CP053957|1799967:1808437|1801557_1803042_-|WP_002452932.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDDQTLKGERGLGLLTEAIKDTNMENLKGYPHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAQSLRQNLEEHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRQIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMENGAYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVIINDDGIVVKNYTRHINTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKRLAEESPAKADMVIGVPNSSLSAASGYAEQIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVEGKKIILVDDSIVRGTTCKRIVKMLKDSGADEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIDSIGLNYDAPYRGLCVESFTGDYPAGLYDYEKNYKSHLSERQKAYIANNKHYFDSEGNLHV >NZ_CP053957|1799967:1808437|1807954_1808437_-|WP_002452927.1|DBSCAN-SWA MRVAVIMGSSSDWEIMKESCLMLDEFNIPYDKKVVSAHRTPQLMFEFASQAKQNGYDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTSIGKSGAKNAGILAARMIGMTDNSVHKNLENYEKTLVNKVEAMQNELQ >NZ_CP053957|1799967:1808437|1806135_1806840_-|WP_002452929.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRVYTTETEYQLRVEYKDEVTAGNGVKKDTMVGKGKLNNQITSIIFDYLTRNDINNHFIKQLSETEQLVEQVDIIPLEVVVRNIATGSITKRLGFEKGHEFEEPLVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLHIADDDEIAKLKHMAKEINKVLVQLMDEMELRLVDFKVEFGKTHDGKILLADEISPDTCRIWDKYSDTNFDKDVYRNDTGSLIDTYQTFLNKLEDLK >NZ_CP053957|1799967:1808437|1806840_1807968_-|WP_002452928.1|DBSCAN-SWA MSFNKLKFGSTIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVIVLDPNEDSPCRYVAHHFIHANYDDEQALTELGESSDVITYEFENISSQLLKQLTDNYNVPQGYQAIQLLQDRLTEKQTLQDAGAHIVPFLQIKNKQDLYLASKELGYPFIVKTRFGGYDGKGQILVKSESYLDEAIDLISDQECVAEQYLDIDKEVSLTVTIGNEQQTTYFPLQENEHRNQILFKTIVPARSNKEQEARKEVDKITNVIHFVGTFTVEFFIDKENNLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDFSQFDTHILAVTGQKLPQQIDVLKPAVMMNLLGRDLDLLENEFANHPEWHVHIYGKSQRKPDRKMGHMTLLTNDVNQTEQYMLMKFEGRDK >NZ_CP053957|1799967:1808437|1799967_1800534_-|WP_002452934.1|DBSCAN-SWA MIKIAIFASGSGSNFENIVKRVQDGDLPHIEVTALYTDKANAQCIERAKKLNIPVHINQPKDFASKSAYEQQLLKHLSDGGVQWIVLAGYMRLVGQDLLQAFEGRMLNIHPSLLPKYKGLDAIGQAFESGDSVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQQQCDIRTDDTKEDLEERVKNLEYELYPRVIAKIIK >NZ_CP053957|1799967:1808437|1805875_1806136_-|WP_002435433.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYTQVNDIRVGKVLYMTVDEATDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVIEEKENA >NZ_CP053957|1799967:1808437|1800530_1801565_-|WP_002452933.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERITSHVERTMRKEVLGGLGGFGATFDLSQLNMKAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDHDKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPSIIEQIVKGVSDGCEQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDIAGFAVGAVEKDEYIDGSKVEAGQAIIGLASNGIHSNGYSLVRKLIKESGVNLNDDFNGKSFLETFLAPTELYVKPILKLKKHVDIKAMNHITGGGFYENIPRALPKGLSARIDTTSFPTQEVFNWLQRQGNISTDEMYNIFNMGIGYTVIVDKKDVSTALATLQELDVKAYEIGEVIEDAHTPLHLMGVES |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2060690 : 2067977
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053957|2060690:2067977|DBSCAN-SWA CTTACAAATTCTCCAAAATTTTAGTTTTAGCGTGAAATTCTTGAACCTCATTTTCAGGAATAGAATCAATCGTAATACCTGCACCTACGCCATAGATTGCACATTGATTTCTATACTCAATAGTACGTATAGGAATATTAAAAACCATACGCCCTTCTGGTAATAACATACCTATCGTTCCACAATAAATTGAGCGAGGAGATGACTCTAATTGTTCAATATATTTCATGGTACTTAATTTAGGTGCGCCTGTAATTGATCCACAAGGAAATAATGCATTAAAGATGTTTATAAGCTTCGTTTCCGATTCTAACTGTCCAGTAACCATGCTCGTCATTTGAAATACTGTGTTATAACATTCAATCATAAATGGTTTATATACATTAACCGTGCCACTTTGTGAAATTCGAGCAATATCATTTCTTAACAAGTCTACGATCATCACATTTTCGGCTCTATCTTTATTGGAATGCTTTAATTTATTAAATAATATTTTGTCTTCATCTGAAGTTTGACCTCTGGGCATAGTTCCTTTCATAGGTTTACTGACAATGACATTGTTCTTACCTCTAAAATCCCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGAGAAATAGATGCAACTTTTATTTCTGGTGTATCTATAAGAGCTGTATAACTACCATTTTGTTGATTATTTAATTTGTCATATACTTCCTTAATAGGTAACTGAATATCTGACATTAAACGCGTCGTATAATTAACTTGATAACTGTCGCCATCTACAATGGCATCTTGTACGTGCTTTATTTTGTTGATCATTTCTACGTCACTTTCTATAAAATTGAAGTGATGCGATAAATGATTATTTGTACTAGTGTAGCGTTGAGGACTATTTCTCCCTAACTTCTTACCACATTTGAATGCATATGCAGCTGCTAAAATATTTGTTTCTGGTAACATATTTACACACATATGCTTATTAAAATAAGGTGCCGCTTCATACGTCAAATATAATGCGACATAATGACCTTTTTGCTGTTCATTTTCAGCAAAATGAACAACGTTTCCCACATCCTCAATACTGTATGCAATTTCAGAATCTAAACATTCTTCCATTAATAAATGGTAGTCTGTATAACTATCTTCATCTTCATAATATCGATAATTGAATTCAACATGCATATTGAACGCCTGCCTCATTTAAAAATAATCTAAGTTGCTCATGACCATATTCACTTAAAATAGATTCTGGATGATATTGCACACCATAAATTGATAACTGTTGATGTTGAACAGCCATAATAACGTTTTCATCATTTATCGCAGTGACCTTTAAATTATTTGGTATGCATCCCGAATCAACCATCAATGAGTGATATCTCATAACGTTAAAATCCTGAGGAAGCCCTTCGAAGATACCTTCATTAGTATGGCGTAAAATGGTGGTGTGCCCATGTATAGGTTTAGGACTATGGATAACACGACCACCATAATATTCAACGATGGATTGAAACCCTAAGCATACGCCAAGAATAGGTATAAGTTGGTCATAATGAGAAAGAATGGTTGATAGTACTGGATAATCACTTGGTCTACCGGGCCCAGGTGAGATAATAATAGCTTTAGGGCTCAACTTTTTAAGCGTTGTAATCGTCACTTCATCAACTGATATCACTTTGATCTCATCAGTCGTTTGAACTTTAAGATAATCTATTAAATTATATGTAAAAGAATCATGGTTATCTATCATTACAATCATAAGTTTGCTCCGAAAAATTATATTTTATTATTTCATTATCAATGTCACTCTATTATCACAGAACTTGACTTGATTTTATACAGTATATCGTTTATTCTATTTTGCGTACAAAATTAATAAAAAGAGGTTCCTAGCCGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACAAGTATTCAACTACTATGAATGCGAGTATACATATACTTTTGGTTATATGATTAAAACTATATGTGTTCTTACATCCCCATGTCTATCTTTTTTATAGAGATAGACTTTTTTTATGTCAAAATTTAATAATAATGAGGAGTAATTGCTATGACTAAAAGTACCTTAGACAAAGACAAAGCTATCGTAGTATTTAGCGGTGGTCAAGACAGTACGACTTGTTTATTTTATGCAAAAAAACATTTTAAAGAAGTAGAACTTGTCACATTTAATTATGGTCAAAGACATGACACTGAAATTGAAGTAGCTAGAAAAATTGCAAATGAACAGAATTTAAAACATCATATCTTAGACATGTCTCTTTTATCTCAACTTACACCCAATGCGTTAACACAACATGATTTAGAAATTGAAGAAAACGAGGATGGTATACCTAATACGTTTGTACCAGCACGTAATTTATTATTTTTATCATTTGCCGGAGCCTTAGCTTACCAAGTTAATGCTAAACATATTATCACTGGCGTATGCGAAACAGACTTTTCTGGATACCCAGATTGTAGAGACAGTTTTATTAAATCAATGAATGTGACATTAAGTCTCTCAATGGATAAAGATTTTGTCATTCACACTCCATTAATGTGGCTAGATAAAGCCCAAACATGGGAATTGAGTGATGAATTAGGTGTATTAGATTATATACGCCATCATACACTTACATGCTATAACGGTATTATCGGAGACGGTTGTGGAGAATGTCCGGCTTGTAAGTTAAGAGCACGTGGTTTACATCATTATTTAGAAAGCAAAGGAGTGGAGTAATATGTTACAACAAATCTATCCAAGTGTTGAACACCCCTACCAATTCGAACTGAATAAGGACTTTAATTTTTCTGCTGCACATTATATCCCTAGTAAAGATGCCGGGAAATGTATGAGAACACATGGTCATACATATTTCGTAAATATAACGATAGCCGGTGATAAATTAGATCATAATGGCTTTCTTGTAAACTTTAGTGATTTAAAACAGTTAATCCATGATCAATTTGATCATTATTTATTGAATGATCTAGAACCTTTTAAAGGAAAAAGTCCATCTACAGAAATTGTCGCACAAACAATTTATACTATGGTACAAGACTACTTAAGTAACCGTGATAACCAACCTAAGTGTGTTCAAGTATTCTTACGTGAGACACCAACAAGCTATGTAGTTTATCGACCAAAGGATGCACAATAATTTATGGCTAAGATTCCAGTTTTAGAAGTATTTGGACCTACAATTCAAGGTGAAGGTCGTGTCATTGGCCGTAAAACGATGTTTGTGCGTACAGCTGGTTGTGATTATCGTTGTAGTTGGTGCGACTCAGCTTTCACTTGGGATGGTAGCGCTAAGGAAGATATACGTCTACTTACAGCTGAAGAAATCTATGAAGAATTACTTGAAGTAGGTGGCAACCATTTTAATCATGTCACTATTTCAGGAGGTAACCCAGCCCTAATTAAAGGGATTCAAGATTTAGTTGATTTGTTTGAAGAGAAAAATATTTATACAGCATTAGAAACACAAGGTAGTAAATTCCAACCATGGATGACTCAAATTAATGATTTAACAATTAGTCCTAAACCACCTAGTTCAATGATGAAACCGAATTTAGATATATTAGATTCAGTTATTGAACAATGTATAGATGACACACTTAATTTAAAAGTCGTTATATTTAATGAAGAAGATTATGAATTCGCGAAAATGATTCACCATCGTTACCCTTCAATTCCATTTTACCTTCAAGTGGGTAATCCCTATTTAGAGGATGAAGTTGAACATCACACTGATAAATTATTAGAAAGATATGAAAAACTAGTAGACAGAGTTATGGAAAGTGATGATATGAACCATGTATATGTACTACCACAATTACATACATTATTGTGGAGTAATAAAAAAGGAGTTTAAAATAAATAATAAGTTAAAGTTTCTTGAGTGTTTTGTAATGATTAAGTTTATGTTAATTGATATAATGTTGAGATGAAGAATTATGGATAGGAGTTCAACATGATTATATTTATATTAATTAATATTGCCGTTGTCCTACTCGTTATCGGCTTTGACTTATATCGGCATCAATACAAACAACTTAAGTTTAGCTCCATATTATTATCAATATCGATCAACTGTGTGATTGATATATTTGTTATTGATAAGTTTAATTTCATAACTTTATTCACTACAATTTTATTTTTAGTATGGACATTTTTACAGATATATTTAAATAAAAAATTGTACCCATTTTTTATAAAAGAACAAAAATTTATCGCTACTATATTTGCTATAGTCATCAGTTTAGCTCAATTTATCACTGATAGTTCAAGTGAACAATCTGTATACATGTCTTTACCTTATTTAGCACCAGCAGTATTTATAATTGGCGCTGTTTTGCTATTTGTGGGAACCTTTAAATTATCAGAAATCGAACGCCTGTCTTTATTACGAAAAGTTAAAAGACCGATTACCACTGGTACAATTATTATTATTTTATCATTGACGTTAATGATGATTTTGACGCCTTTTTGGTATGTCTTTGTGATTGTTTACTTCTTATTCATAGCATATATTTTGTGGCAAGGTATCTTTTTTGTGAAAGGAAACTTATAGTACTTATACATTGTTAAAAATTTGTATAGTGAGGCTCGCCTTAAAGAGATCTTAGGATTAAAAGAAGCTTGGTATAAGCATATTTTTAATTCACTTATCTACCTTAATCATGAATATCTGGACTGAGATAATACTTGTTATCTCAGTCTTTTTTTGTCCTTCTATATATTGTCTTTTAATTCTCCACTTTTCTTTTTAAATCTTTAAAATCACATTAATTCTTATATCTATAAATAAAAATTATTTTGATTTAATTCTTTTTTAAATGTAGTTAATAAATAGTTAATGGTTTATGTGTGTTACTCCGATTAAACTTATCTTAAATACAAATAGAAAAGAGGAATACACCATGAATACAAAATATTTATTTGCAGCAGGTGCAATTGTTACATCCCTTACTTTAGGAGCTTGTGGAAATTCGAATTCAAGTAATGAACACACTCAGAACAAAGATAAACAACAAGAAGAAAGCAAGGTTAAAACTGATAAATCGAAAAAATTATCTGGTACATTTAAATCTAAAAATGGCGAAAAGGTCGAAGGTACAGCAAAAATTGAAAACGGAAAATTAATGCTTGAAGACTATAAGTCATCTAAAGTACCAGACTTGTACGTTTACTTAACGAAAGATGGCAATATTAAATCAGGTAAGAAAATTTCAACAGTGGATTACAACAAATCTCAACAAACATTTGATTTAAAGAACGTTGATTTAAATCAATACAACGAAGTAACTATCTATTGCGAAAAAGCTCATGTCATTTTCGGTGGCGCAAAATTGAAATAACTTAATCACAGATTCATATGTTTGTAATGAGAGAAAGAGAGGAAAAACGATGAACAAATTAAGTTTATTAATCATCTTTATTATTCGCGTAGGTTCTGGCATTATCATTTTCCGACAAGGTTTGGAAAAGTTTACAGGCGATTTCACACTCAATGGTCTAGTACCTGTCATTCGCGATAATACAGATTCTCCACAGTGGTATAAATGGTTTTTCGAAAATATCGTTTCACATACAACAGGTTTATTCAACTTCATCATCCCGTTAGGAGAAATGGCCATAGGTTTAGGTTTAATTTTAGGCGTCTTCGCCTATACTGCAAGTTTCTTTGGTGCCTTTGTTATGATAAATTATATCTTAGCAGATATGATTTTTACGTACCCTCTACAATTAGCATTCTTTATAATCTTATTAATGAGTCACTCATTAATTAACAAGATTTCACTTAAAGAAGTTATCACTCATTTTAGAGAACGTAACAACCGAGGTGAAGACAAGCATGACCCACTTACTAATCGTAGATGATGAGCAAGATATCGTAGATATATATCAGACTTACTTTGAATATGAAGGTTATCATGTAACAACAACAACAAATGGTAAAGAAGCTATCAAATTACTGTCATCAGAAATCGATGTCATGATTTTAGATATTATGATGCCTGAAGTAACAGGATACGATATTGTAAAAGAAATGAAAGCACAGCAACTTGAATTTAACGGCCTTATTTTAAAAAATCCAAGTAAGACATTAACAATAAATAGTGAAGACATTCCTATGCGTATTAAAGAATTTGAATTACTATGGTACCTTGCCTCACGTGAAAATGAAGTCATCTCCAAGTCAGAGCTTTTAGAAAATGTTTGGGGATACGATTACTATGAAGATGCGAATACTGTTAATGTTCATATTCATCGCATAAGAGAAAAGTTAGAGAAACACCACTTCATCACATATACGATAACAACGGTATGGGGGGTAGGATATAAATTTGAAAGGAGCCGATAAGCATGTTCTCTATACGTAGTCAAATCGCTATCGGCGTTATTTCTAGCGTACTCTTAACAACCATAATACTAGTCATTGCGTATAAACTCATGTGGTTCAATGGTCATATGACATTAACCTTGAGCATTACAACAATGATTACAAGTTGTTTAACACTATCGATATGTAGTATCTTTATTAATCCTTTAATCCAGAAAATTAAACAATTTAACATTAAAACGAAACAATTCGTCAACGGTGAGCATTTAATAGACGATGATACTTTCCAATCACCTAGAGAAATTAGAGAATTAAACGACTCATTTAATAAAATGGCAGATGAAATCACGAAACAAATGGACATGATTAAAAATGAACAACAAGAAGTTCATGCAGCCTATGAGACATTGATTAAACAAGCCAATCGTTTATCTACCTTGTTTGATGACATGACTCATGTGATTTCACTCAACACAGGTCGTTCCTATCCATTAGAATTAATTCAGTTGGATCAGTTACTTGTAAATATATTACAAACATACGAACAACGTATTAAACTTGAACATCGATCATTAGAAGTTAATTTCTGTAGTCATATTGATGCTTTTTATCAATATCATCCTCCCTTAGAACGTATTTTGACTAATTTATTAGATAATGCATTAAAGTTTTCTAATTATGGAAGCCGAATTGATATTATTATTTCTGAAAATGCTAATAACGATAGCATTAATATAGCAATTAAAGACGAAGGCATTGGAATCTTGCCTGAACTTCAATCTCGCATCTTTGAAAGAACTTTTAGAGTAGAAGACTCAAGAAATACTAAAACAGGTGGTTCGGGATTAGGATTGTACATTGCGAATGAACTTGCGCAACAAATTGATGCCTCAATATCAGTGGAAAGCGAACTTAATGTTGGGACAACTATGACACTCACATTAAAAAAATTTACCTTTTCATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053957|2060690:2067977|2067035_2067977_+|WP_002452700.1|DBSCAN-SWA MFSIRSQIAIGVISSVLLTTIILVIAYKLMWFNGHMTLTLSITTMITSCLTLSICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFVNGEHLIDDDTFQSPREIRELNDSFNKMADEITKQMDMIKNEQQEVHAAYETLIKQANRLSTLFDDMTHVISLNTGRSYPLELIQLDQLLVNILQTYEQRIKLEHRSLEVNFCSHIDAFYQYHPPLERILTNLLDNALKFSNYGSRIDIIISENANNDSINIAIKDEGIGILPELQSRIFERTFRVEDSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQIDASISVESELNVGTTMTLTLKKFTFS >NZ_CP053957|2060690:2067977|2062730_2063402_+|WP_002452707.1|DBSCAN-SWA MTKSTLDKDKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVARKIANEQNLKHHILDMSLLSQLTPNALTQHDLEIEENEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQVNAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLSMDKDFVIHTPLMWLDKAQTWELSDELGVLDYIRHHTLTCYNGIIGDGCGECPACKLRARGLHHYLESKGVE >NZ_CP053957|2060690:2067977|2063403_2063823_+|WP_002452706.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSVEHPYQFELNKDFNFSAAHYIPSKDAGKCMRTHGHTYFVNITIAGDKLDHNGFLVNFSDLKQLIHDQFDHYLLNDLEPFKGKSPSTEIVAQTIYTMVQDYLSNRDNQPKCVQVFLRETPTSYVVYRPKDAQ >NZ_CP053957|2060690:2067977|2064639_2065239_+|WP_002452704.1|DBSCAN-SWA MIIFILINIAVVLLVIGFDLYRHQYKQLKFSSILLSISINCVIDIFVIDKFNFITLFTTILFLVWTFLQIYLNKKLYPFFIKEQKFIATIFAIVISLAQFITDSSSEQSVYMSLPYLAPAVFIIGAVLLFVGTFKLSEIERLSLLRKVKRPITTGTIIIILSLTLMMILTPFWYVFVIVYFLFIAYILWQGIFFVKGNL >NZ_CP053957|2060690:2067977|2066075_2066549_+|WP_002452702.1|DBSCAN-SWA MNKLSLLIIFIIRVGSGIIIFRQGLEKFTGDFTLNGLVPVIRDNTDSPQWYKWFFENIVSHTTGLFNFIIPLGEMAIGLGLILGVFAYTASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLAFFIILLMSHSLINKISLKEVITHFRERNNRGEDKHDPLTNRR >NZ_CP053957|2060690:2067977|2066523_2067033_+|WP_039973730.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDIYQTYFEYEGYHVTTTTNGKEAIKLLSSEIDVMILDIMMPEVTGYDIVKEMKAQQLEFNGLILKNPSKTLTINSEDIPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLENVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKHHFITYTITTVWGVGYKFERSR >NZ_CP053957|2060690:2067977|2060690_2061845_-|WP_002452709.1|DBSCAN-SWA MHVEFNYRYYEDEDSYTDYHLLMEECLDSEIAYSIEDVGNVVHFAENEQQKGHYVALYLTYEAAPYFNKHMCVNMLPETNILAAAYAFKCGKKLGRNSPQRYTSTNNHLSHHFNFIESDVEMINKIKHVQDAIVDGDSYQVNYTTRLMSDIQLPIKEVYDKLNNQQNGSYTALIDTPEIKVASISPELFFQKGDFRGKNNVIVSKPMKGTMPRGQTSDEDKILFNKLKHSNKDRAENVMIVDLLRNDIARISQSGTVNVYKPFMIECYNTVFQMTSMVTGQLESETKLINIFNALFPCGSITGAPKLSTMKYIEQLESSPRSIYCGTIGMLLPEGRMVFNIPIRTIEYRNQCAIYGVGAGITIDSIPENEVQEFHAKTKILENL >NZ_CP053957|2060690:2067977|2063826_2064540_+|WP_002452705.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEVFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKEDIRLLTAEEIYEELLEVGGNHFNHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFEEKNIYTALETQGSKFQPWMTQINDLTISPKPPSSMMKPNLDILDSVIEQCIDDTLNLKVVIFNEEDYEFAKMIHHRYPSIPFYLQVGNPYLEDEVEHHTDKLLERYEKLVDRVMESDDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP053957|2060690:2067977|2061834_2062422_-|WP_002452708.1|DBSCAN-SWA MIVMIDNHDSFTYNLIDYLKVQTTDEIKVISVDEVTITTLKKLSPKAIIISPGPGRPSDYPVLSTILSHYDQLIPILGVCLGFQSIVEYYGGRVIHSPKPIHGHTTILRHTNEGIFEGLPQDFNVMRYHSLMVDSGCIPNNLKVTAINDENVIMAVQHQQLSIYGVQYHPESILSEYGHEQLRLFLNEAGVQYAC >NZ_CP053957|2060690:2067977|2065588_2066026_+|WP_002452703.1|DBSCAN-SWA MNTKYLFAAGAIVTSLTLGACGNSNSSNEHTQNKDKQQEESKVKTDKSKKLSGTFKSKNGEKVEGTAKIENGKLMLEDYKSSKVPDLYVYLTKDGNIKSGKKISTVDYNKSQQTFDLKNVDLNQYNEVTIYCEKAHVIFGGAKLK |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2151363 : 2201238
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP053957|2151363:2201238|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(60.0%) | integrase,transposase | attL 2158372:2158411|attR 2208093:2208132 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2418046 : 2431805
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP053957|2418046:2431805|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP053957|2418046:2431805|2420509_2420842_-|WP_002454452.1|DBSCAN-SWA MTITIEKELTSDHIKVLNVLRNTKQEIITKQSIFNQLNIEFNKNNDRWLRNTIHSLVVDYDYPIGYSYKKDSKGYFMVKSDEQKELALRSIKRHIEGSMKRYEALKKMDI >NZ_CP053957|2418046:2431805|2426999_2427233_+|WP_002454442.1|DBSCAN-SWA MNFNDWKVTINGKGSHDVVTNEDTLLILQDYQHVEIALKLVNDTIQVKSLGYGEDVSINPTTKEITVNVTNLLEDDE >NZ_CP053957|2418046:2431805|2418930_2419146_-|WP_002454455.1|DBSCAN-SWA MARKYNLDKVYNYIMTETTLSGEECSDLLDVVEEQFSQNIQAQRKDELAQQSKASKRFSDLAKANRIIKDK >NZ_CP053957|2418046:2431805|2422102_2422924_-|WP_002454449.1|DBSCAN-SWA MKMYNAAKYLLSKDVQVVPLNDNKKPTVSFKNVTIDDDFIDNNFLAYAKTNVLGVLTRGLWCIDIDINHVNGESGFDSLKDIPYYDEFVTNAQNTLVQTTASGGKHVIFKKRDGVEYAQKIGYLPSVDIKAHDNNYFVLAGSKTAKGLYTSNKKSVIAYDGEFEGRIFSKRGNYLQQTMEKFSVKSVLPNHNFNHLQHTGKGGLGKEAYNRVINGESIERNNDVYKAISYALQCNVDIEPLKVIIGDVKATGDVYTLDEWEKSYNSARNSLRI >NZ_CP053957|2418046:2431805|2423094_2424708_-|WP_002454448.1|DBSCAN-SWA 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19 | Staphylococcus_phage(42.86%) | terminase,integrase | attL 2419135:2419149|attR 2436831:2436845 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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