Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053938 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_792 chromosome, complete genome | 4 crisprs | WYL,cas14k,DinG,csa3,cas3,DEDDh,cas14j,c2c9_V-U4,Cas14u_CAS-V | 0 | 1 | 6 | 0 |
NZ_CP053937 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_792 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053938_1 | 401638-401746 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053938_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053938_1
>1.1|401663|59|NZ_CP053938|CRISPRCasFinder GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053938_1
The CRISPR arrays of NZ_CP053938_1 >merge|NZ_CP053938|1|401638-401746|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAAGAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGATTGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA >NZ_CP053938|1|1|401638-401746|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAA GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT TGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA
>NZ_CP053938.1|WP_001079106.1|400047_400941_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MNRFTLKWDIESAEEGTLVREFLKTKGISKAALTDIKFHGGAIEVNGQHASVRHQLQVGEELRIFFPVEERSEGMIAEDIPLCIVYEDDAVLVINKEANMSTIPSREHPSGSVANALLSHYDKQYLASTVHIVTRLDRDTSGLMLIAKNRFVHHLLSKQHQQKAVKRTYEAIVHGEMVEREGTIDAPIGRKSDSIIERTVCEEGQRAVTHFRVIDSANHKTHVSLELDTGRTHQIRVHMAHIGHPLLGDNLYGGKRDEMKRQALHSTSLTFYHPILEKEMSFTAMIPSDMQEVLRQT >NZ_CP053938.1|WP_000673194.1|399234_400032_+|NAD-kinase MKFTIMSKGDQSSDTLASTMKEYLLDFGFIMDEQEPDIVISVGGDGTLLYAFHRYYNRLDETAFVGVHTGHLGFYADWLPTEVEKLVIAIAKTPFQVVEYPLLEVIIRYMNGSKESQYLAMNEATVKSAEGTLVTEVEIRGEYFETFRGDGLCISTPSGSTAYNKALGGAIIHPSIEAIQIAEMASINNRVFRTVGSPLVLPKHHTCVLKPTAGMNLQITVDHLTMVHQDVKSIQYRVANEKVRFVRFRPFPFWKRVRDSFVADK >NZ_CP053938.1|WP_001081482.1|398577_399216_+|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MNRNWEEFLAPYHQAVAELKVKLKGMRTQFAMLTEHSPIEFVTGRVKSVASIIDKAEKRNVPLDRLREDMQDIAGLRMMCQFVDEIKPVVEYLRKRNDFEIVEERDYVTQKKDSGYRSYHVVISYPVQTIQGEQKVLVEIQIRTLAMNFWATIEHSLNYKYSGRFPEDIKIRLQRAAEAAFLLDEEMSSIRLEIQEAQKAFSRKQETKDSES >NZ_CP053938.1|WP_001180009.1|398175_398547_+|hypothetical-protein MQNKIQVKSVEKRENALIFCAENSEIEVKGLSARNHVLVDSDNLSFLYILENESSFIYVSIPHTCWEAMHEAMNNDVVMFVRVNDIEMELEGLKEEVEYLVENIEGNANYGEELVTAVEKVFL >NZ_CP053938.1|WP_000191105.1|397450_398029_-|CYTH-domain-containing-protein MTQEIEIEFKNIVTEEEFHALCKSFSIEVFTKQVNHYFETPNFSLKEAGSALRIRHKGETYTLTLKQPAEVGLLETHQVVTENEAKMMMETNVIISGAVMNQLCKLQIPVSALTYMGSLTTERAETLFEGGTLVFDHSFYYNHDDYEIEFEVQDEETGKAAFIHLLKQHNIPIRHTNNKVKRFFLAKQNKAR >NZ_CP053938.1|WP_000043381.1|396871_397270_-|hypothetical-protein MSKQPMTPFEAIGGEQCIAILVDTFYSYVSKHPDLSPIFPDDLTETARKQKQFLTQYLGGPNLYTEEHGHPMLRARHLPFEITPKRAEAWLSCMEQAMDDTGVHGHIREFVFERLALTAQHMVNTPNETGEI >NZ_CP053938.1|WP_000360638.1|395978_396872_-|DsbA-family-protein MDKQEAKHINMPSPSACEHKSVEAYLFIDPLCKDCWEIEPFIIKLWLEYGKYFSIRHIVTGKVDGTNASSHKWNKPANIRFVWEKTTSLHGFSCDGKVHMQEASSTPYLVSMAIKAAELQGRKAGSKFLRKLQEYIFLENVSNPDCELLLACAKDSDIDVEEFKKDLYSASAKKAFQCDLKFTNEMHITEIPSLVFFHANSDEEGIKIAGTYSYDVYVQLLKELVKCEIEPEPLPPLEVLLEATQFISSKEVAFIYDCSKQEIERELKKLQLKRKVQMIDVKCERYWKWIAKEKDLV >NZ_CP053938.1|WP_001984995.1|395575_395749_-|hypothetical-protein MKKTYIFLIILAVIVSFFLYILSLLQAFPKMIAFPLLFGVIVIALSYFNHKKRFKGF >NZ_CP053938.1|WP_000003393.1|393629_395456_+|oligoendopeptidase-F MSEQNTAKTLPDRNEIEESSTWRLEDIFQTDTEWEKEFQAIKELLPKLTEFKGKLGDSANNLLEALQYEDEISMRLGKLYTYAHMRYDQDTTNSVYQALNDRATNLYSQVSSSTAYIVPEILSISEDTLQTFLKENRDLSVYEHALEEITRQRPHVLSEAEEALLAEASEVMSASSNTFGMLNNADLKFPSIKGEDGEEVEITHGRYIQFLESDDRRVREDAFKAVYETYGKYKNTFASTLSGAVKRNNFNARVRKYDSARQAALSNNNIPEAVYDQLIESVNDNLHLLHRYIDIRKRALGLDELHMYDLYTPLVPEVKMNVKYEEAQDMLLKSLHVLGDEYVDILKEAYENRWVDVYENKGKRSGAYSSGAYGTNPYILMNWHDNVNNLFTLAHEFGHSVHSYYTRKTQPHVYGDYSIFVAEVASTCNEALLNDYLLKTTEDKKERLYLLNHYLEGFRGTVFRQTMFAEFEHIIHKKVQEGHAVTPDMLTEIYYDLNKKYFGDALVIDEEIGLEWSRIPHFYYNYYVYQYATGFSAATALSKQILEEGQPAVERYINEFLKAGSSDYPIEVLKKAGVDMASPEPVKEALQVFEEKLNELEALLFEEK >NZ_CP053938.1|WP_000612272.1|392333_393578_+|competence-protein MIPIFIAKRENGEKIHLLDHHDEELLHHMRKRESFFCIACGKEVLMRLGKQKRWHFAHKKVDSCLAFYEAESTYHMYGKELLYRWFKRQNVHVEIEHYLPEIQQRPDIFIERAGRKIAIEYQCANLSIEQLCKRTYSYWQAGIQVIWIIGGNQLKKHSAYWMKFSSIMAFSLQSYPQPLLIFFCSKQKSFMKCTFITSFSTSVAFSHIIYLPIETTTFEMLFSPVPFQREVLNREWKRRKDYFRQNALPILNYNHKSLLRLLYQCKCNPANFPSEIGVPLPSSFAFQTNSFIWQAFLYMKCIGELAVGDCISLKYVCSYIKKYTKRRMLPYFSQHIWKVAVTEYMTFLCYAGVLYKVGIYTYRKIRDAVPLKTGGEIIKHDEICLAHALSLFEAKFNMRGGKGDIIKTDREGIT >NZ_CP053938.1|WP_000872716.1|402518_403259_-|bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase-PrpE MKYDIIGDIHGCLQEFQNLTEKLGYNWSSGLPIHPDQRKLAFVGDITDRGPHSLRMIEIVWELVIHKKVAYYAPGNHCNKLYRFFLGRNVTIAHGLETTVAEYEALPSHKQNMIKEKFITLYEQSPLYHVLDEKRLLVCHAGIRQDYIGRQDKKVQTFVLYGDITGEKHADGSPVRRDWAKEYKGTTWIVYGHTPVKEPRFVNHTVNIDTGAVFGGKLTGLRYPEMETVSVPSSLPFVPEKFRPIS >NZ_CP053938.1|WP_000654695.1|403333_404494_-|rod-shape-determining-protein-RodA MKDPNSQYQIDYVLLCILFAIGTVSCFAIASAQASLPPFLQNVNFVLKQIQWYFIGFIAIGVIMIIDFDRYQKIAWYLYSFALVLLIGLELQVPGAITIKGATAWYRLPGIGNFQPSEIMKLFLIIVTGRIIANHNEKYFYRTIHDDFLLLGKICSTSLPPLLLIAKEPDLGNTMVISAMLAAMILVSGIRWRFIFGLASGIFAAGVTLTYIFFTHTKFFKAHILQEYQLNRFYGWLAPYKYDAQGYQLRQAFLATGSGEMQGKGWENGQVYFPEPHTDFIFTNVAEQFGFLGASVIIALFFLLIFRMIHIAIESNDPFGSYICAGTIGMFTFQVFQNIGMTIGLLPITGITLPLMSYGGSSLLTYMIAIGFVLNVRSRTKIFMFN >NZ_CP053938.1|WP_000427734.1|404636_405572_-|glycosyltransferase-family-2-protein MENIKNVPLVSILIPTYNRPHYFKIALESALAQTYSNIEIIVGDDSTNNETEKLIYRDYLHKHKHITYIRNPSTLGQFHNALMLLEQSNGEYINFLMDDDIFYNNKIEKMMFYFQKDLDQNLALITSYRTWINDDGDIIEQHPSMKKLYDEDTLLNGKDFGNRMLILGQNIIGEPTTVLFRKRLLTEPFGTLNGRNYNCSVDMASWISLLSKGDAIYITEPLSSFRLHTGQQVHHKYLEGCEDFSHLVLHSKKYGFLQDIDYYKTSLLKACEWYKNATTFYQLYPELIPTTDTHTRLSHCLNIVTKELHAI >NZ_CP053938.1|WP_001004735.1|405578_406337_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNENEKKITLIPPPEFVQYVGGHFEEVGKEFMQYFIEIGNLKSNETVLDVGCGIGRMAVPLMNYLSDDGTYYGFDLFNKGITWCKNNISTRRNNFHFEHVDIYNQFYNPDGKEDASQYKFPYEDESFDFIFLTSVFTHLLPKELEHYVREIARVLKKDGRCFITFFLINPESSYYLNAGLSPLGFYHQIDNCYVLNKDIPNFAVAYPEEDIRTLLNKYGLEMQTPPHYGSWCGRTEHTSYQDIILAQKISER >NZ_CP053938.1|WP_000428855.1|406473_407319_-|O-methyltransferase MENKSAVQLYLELLKKTILFEIWLEYEPYLPASLHISKELSYEPVTVPLPLFLKQYVENHNLKIVNPNVSNNERQGGKDWPRAAHSMVGRKRMNQLQEAMETVVKENIEGDFIETGVWRGGSCIFMNGFLQANNITDRTVWVADSFEGLPAPNLEQYPKDYGDYLHTFDYLRVSLETVQENFRKYDLLNDQVKFLKGWFKDTLPSAPIEKIAIARLDGDMYESTMDSLVNLYDKVSIGGFIIIDDYGLITCAEAVTDFRSERNIKTPMTQIDDFGIFWRKE >NZ_CP053938.1|WP_000069738.1|407441_408320_-|hypothetical-protein MSNNNYSNGLNPDESLSASAFDPNLVGPTLPPIPPFTLPTGPTGPTGPTGPTVPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGDTGTTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGDTGATGLTGPTGDTGATGLTGPTGATGLTGPTGPSGLGLPAGLYAFNSGGISLDLGINDPVPFNTVGSQFGTAISQLDADTFVISETGFYKITVIANTATASVLGGLTIQVNGVPVPGTGSSLISLGAPIVIQAITQITTTPSLVEVIVTGLGLSLALGTSASIIIEKVA >NZ_CP053938.1|WP_000932921.1|408485_409586_+|glycosyltransferase-family-2-protein MLNKQGITISLCMIVRDEEKTIARCLDSVEKIVDEIIVVDTGSIDRTKEIVEKYTSNIYDFQWIDDFAAARNFSFSKATQEYILWLDADDVLLEDAQEALKLLKRELDPKIDAVSMPYHLAMDSNGKPLYCTKRNRLVKREKQFQWFGKVHEYLAISGETFSSNVAITHKKEKKVTNRNLKIFQDAVAAGEELSPRDLFYYANECMDNQKYDDAVLLYETFLNQDEGWYEEKIYACGKLGDCYAKLGLWEKAVESCVKSFRYAIPRGENCTRIGYIYMEQQKYNEAIFWFKLATEVPMATESPFHSPASYTWLPYLQMCICYSKLGEQDKAYYYNELAASYVPNNAAIEYNRKYFRSIFDQQKKSL >NZ_CP053938.1|WP_001087865.1|409737_410427_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNSPKNSLYEEKSGHYYNAVNPNLLKHIKKEWKEVLDIGCSSGALGAAIKENGTRVSGIEAFPEAAEQAKEKLDHVVLGDIETMEMPYEEEQFDCVIFGDVLEHLFDPWAVIEKVKPYIKHNGVILASIPNVAHISVLAPLLAGNWSYTEYGLLDKTHIRFFTFNEMLRMFLKAGYSISKVDRVYIDHKMYEPLIEELYGVCKKHRLGSGFMAETVVFQYIIEAEKSSL >NZ_CP053938.1|WP_001271203.1|410423_411110_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MSAAEKTILFVTCINDSKMYAQCVRHILRLAVPPGYVVQFMPIRNAKSMTSGYNQAISHPAKYKVYIHQDVFIMNVAFLHGLLQLFNEHEHLGMIGMIGAQYVPPNGVWNEGKGVVGKVIGYMNDLFYMASQEQPYHESKTFMPVECIDGLLMATQYDIPWREDLFDGFDYYDVSQSFEFRKAGYTVGVPVQRDAWCIHYHIDVNMTNYEKYRKIFVEHYMSDVNQDE >NZ_CP053938.1|WP_000651510.1|411122_411803_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MKDHTILVVVCINNEELFEQCERQIRNLFVPPGYVVQIFPIRDAKSMASAYNRALSYPAKYKVYIHQDTFLINREMFYTLISLFKDNEKLGLIGVAGAQFLPSNGIWWEGKNLVGKVIEYRRQNYQLLNLDQLFYGNQSFMSVQAIDGLLMATQYDIPWREDLFQGFHFYDVSQSLEFQKAGYLIGIPNQANLWCIHYNGDEFDADTYEKYRKVFVEHYKDILSPS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053938_2 | 1960772-1960954 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053938_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP053938_2
>2.1|1960821|30|NZ_CP053938|PILER-CR AATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGG >2.2|1960900|41|NZ_CP053938|PILER-CR GTACAGATTGATCATCTCCTGCTTTTCTTTTTCACACCCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053938_2
The CRISPR arrays of NZ_CP053938_2 >merge|NZ_CP053938|2|1960772-1960954|PILER-CR ATTTTGAAAACACCTTTTCGGAATGAACGTTCATTCCTTTCATTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGATTTCAGAATGAATATTCATTCCTTTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTGCTTTTCTTTTTCACACCCTCATCGGAATGAATGTTCATTCCTGTCCTTATAAT >NZ_CP053938|2|1|1960772-1960954|PILER-CR ATTTTGAAAACACCTTTTCGGAATGAACGTTCATTCCTTTCATTCTATT AATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGG ATTTCAGAATGAATATTCATTCCTTTAATTGTACAGATTGATCATCTCC TGCTTTTCTTTTTCACACCCTCATCGGAATGAATGTTCATT CCTGTCCTTATAAT
>NZ_CP053938.1|WP_000040250.1|1957593_1960710_-|MMPL-family-transporter MSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADNMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKTALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKDLEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQVFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPFVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQAGELNTGLGDANGGIKEINDGLTIAKDKMDSKDSNSLSNVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLLNGINDGAKGAQQIESGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQTKPELANDPNILQTIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGATGSKQIANKSSELQTGLTKINDGQGQLLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTAKMTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTLKGTELNNAKKAIGGTTARNVDLKKVTGQDFLRTATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLLLAYFASLGISEQISTHVLHVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRYNELEGDPAMKIVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLTLIQVASVVGVALLLLAIIVMPILLPALIGLTSKMKNYAKKLSERK >NZ_CP053938.1|WP_001093217.1|1956409_1957258_-|hypothetical-protein MNTKLIIVEGLPGFGKSTTAQLISDILSQNKIEVELFLEGNLNHPADYDGVSCFNKFEFDRLVSNSGDFKEVLLKRVLKKGSNYLLPYRKIKNEFGDQFPDELFNDISRNDIYELPFDKNVELIADKWNEFAEIALEDNKVYIFECCFIQNPLTIGMIKYGEQKEKIINYVMKVAKIIENLNPMLFYVEQDNLEFSFRKALKERNPEWATGIVDYYTNQGYGKEHNHSGVEGAIKVLEARRNLELEIFDMLKMKKEKINNTKYEIDSYRSMLKDKLTIQMVK >NZ_CP053938.1|WP_000633861.1|1954418_1956044_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVSNVSLRFADRKLFEDVNIKFTPGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEPSTGDIHITPGERLAVLKQNHFEYEEFPVLETVIMGHTQLYKVMQEKNAIYMKEDFSDEDGMRAAELEGEFAELNGWEAESEAAILLKGLGIGEDLHDKKLSELTGAEKVKVLLAQALFGKPDILLLDEPTNHLDLKAIQWLENFLMNFENTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADLDFGKIQLYVGNYDFWYESSQLALKLTQDANKKKEEKVKELQNFIARFSSNASKAKQATSRKKLLDKITLDDIRPSSRRYPFVGFTPEREVGNDLLTVEGLSKTIDGEKVLDNVYFTLNKGDKVAFIGRNDIAMTTLFKILMGEMEPDSGSFKWGVTTSQSYFPRDNSKYFENSDLNLVEWLRQFSPQDESESFLRGFLGRMLFSGEEVKKNVSVLSGGEKVRCMLSKMMLSGANVITLDDPTNHLDLESITALNNGLIAFKGTILFTSHDHQFVQTIANRIIEVTPNGVIDKEATYDEFLENEELQKQVDAMYKGQ >NZ_CP053938.1|WP_000808767.1|1951928_1953902_-|LTA-synthase-family-protein MKQFLLKSKSVLSNHFGFFLFAVILFWLKTYAAYVTEFNLGISNTIQKFLLFFNPLSSAVLFLGLALFAKGKRSYIWLIVINLLLSILLYANVVYYRFFSDFITFPTLTQTNNFGDLGGSIVALLHLYDSLYFLDTIILIVLVTTKFANPKPIRVAKYKVSLVFVAGILLFSVNLGLAESDRPELLTRTFDRNYIVKYLGAYNYTIYDGIQSAKASTERALADGDNMTEVRNYLTSTYASPNPEYFGKGKGMNVIYIHLESFQNFLIDYKLNGQEVTPFLNSFTKDANTLYFDNFFHQTGQGKTSDAEFMLENSMFGLPQGSVFTTKSHNTYQSAPAILGQQGYTSAVFHGNYKTFWNRDDIYKSFGFNKFFDASYYDMNEKDVVNYGLKDKPFFNESIPLLETLKQPFYTKFITLSNHFPYPIDKEEATIEPANTGDSSVDTYFQTARYLDESVKGFIDYLKQSGLYDNSIIVMYGDHYGISDNHNAAMSKVMGKEINSFENAQLQRVPLIVRVPGVKGGVQHQYGGEIDVLPTLLHLLGTDTKNYVQFGSDLLSPDHKQVVAFRNGNFVSPTVTALNGKYYDTTTGKPVEFTDEIKQNEQMVQNSLKYSDQVVNGDLLRFYTPEGFTPIDRSKYNYNNRDKNKTKVKTAPEGEAK >NZ_CP053938.1|WP_000346925.1|1951197_1951869_+|TerC-family-protein MDFLSAEYLSALLAIIVIDLVLAGDNAIVIGLAARRLPKDQQKKVIIWGTIGAIAIRALATLIVVWLLKIPGLLLIGGVLLIWIAYKLIAEGKDHDIKAEEGFWSAIKTIIIADALMGIDNVLAVAGAAHGNFSLVIIGLLVSIPVVVWGSTLILKWVDRYPIIITIGAAVLAYTAAKMIVDEKWFAAFFESNPFIKWAFIIIIIAGVVFFGKTKQKATDGSI >NZ_CP053938.1|WP_000551418.1|1949437_1950265_+|polysaccharide-deacetylase MHNGIRMTTLMKRAMLICAGVLFTYEAALGSAHTALASTEDEAKSVQLVSEIQSSLAPKEAPKQYNGQVRKVAYLTFDDGPGKYTAELLDMLKKENAKATFFLIGSNVKAFPDLVKREDAEGHYVGMHSMTHNYKKLYTEGHYVDEMKEDQGLIAGVLGKSPVLTRPSYGSMPGLNEALRNKVVENGLKVWDWTIDSLDWRYNKMPVDAASAKIVENVINGANKPTEVILMHDIHPQSVKAVPGIIKGLKEKGYELEAYSENEHFPLNFWHDNRM >NZ_CP053938.1|WP_001106987.1|1948959_1949220_-|hypothetical-protein MNYKKMLSILMTSIFTVGLLMGCNPAPKDEKEPDPTEEPSEQRQEEKNEKQDPAKEQNNELNKKDEQEPDPTEEPSEEKKKKKENE >NZ_CP053938.1|WP_000923440.1|1947910_1948594_-|DNA-alkylation-repair-protein MLLEEVMQQLEEYGTEQNRKTYKNHGAKEPLFGVSFANLKLLKKKIKKDHDLAISLWETKNMDAMTLATMILDPKKVTTELLNKWVQEVDYYCLMDVLMTAICTSPIAIERMEEWTKSDDEWIGRAGWSLLANIAIKNKTLQDDFFSPYLEEIKENIHNEKNRKREAMNSALIAIGIRNEDLEQTAIEIAREIGKVQVDHGATSCKTPDAESYIKKARERAEKKKVK >NZ_CP053938.1|WP_000646306.1|1947192_1947894_-|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MKAMEAAQSIITSHFPDCDVALLGGSVARGEATKTSDLDIVIVDQSLTSCYRESFYSNGWPVEVFVHNFETYKTFFKMDCDRGRPSLPQLVSEGIVLKGENEIVEKLKREANDLLNKGPAKWTEEMMKQKRYFITDTLDDFIGASKREEELFIANLLADLLHEYVLRVNGKWLGNSKWFIRVLRKYDEQYADQFVAAFDHFYTTGEKSKLITFVEKTLEQYGGRMFEGFSIGK >NZ_CP053938.1|WP_001102425.1|1946631_1947177_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNVPFVQLRELTLDDVEDRYQWSLDTKVTKHLVVPDQYPPFTLEDTKQWIEACINRKNGYEQRAITAENGIHIGWVDLKNFDKTNKNAELGIAIGNKEYWGKGYGIAALYSMLHVAFFEFELEKVWLRVDEDNLQARKSYEKAGFVCEGLMRNDRLRKGRFIHRYRYSMLREEYQSLISSL >NZ_CP053938.1|WP_001107293.1|1960963_1961530_-|TetR-family-transcriptional-regulator MAKNKQEDIFDAAIQLFAERGYDGTTIPMIAEKAKVGAGTIYRYFENKEALVNSLFTKSVLQLSELIKTDFPVNANIREQFSHTYNRLFEFARQNADAFLFTNSHCDSYFLDEHSNEIFEDFMGFFMDLIEDGIEKGFLRPLPPIALIIIVYQPIEKLIKVMETGQLEYTEELVKELEESCWNAIRII >NZ_CP053938.1|WP_001100961.1|1961839_1962997_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNVIRLKEDKFREALRLSEYAFQYKVDEDRLQQQLTKMKESHEVYGIMEGENLAAKLHLIPFHIYIGKEKFKMGGVAGVATYPEYRRSGYVKELLQHSLQTMKKDGYTVSMLHPFAVSFYRKYGWELCANLLICHMTKSDLVMKKQVNGTVKRFNKENHQEEVEKLYETFAERFSGMLVRNEKWWLQAVYDDLTLAIYYDENKTAAGYMLYKIEKSKMTVEEFVPLHNEARNGLWNFICQHDSMIKDFEMTVSENEPFLYTLQEPRVKTEIKPYFMGRIVDVEQFLKQYELNWNNVQQEVILHITDSFAQWNNITVRLANHEITIIEEPIDKGIKLDINALSTILFGYKRPLELNELELISGSEEEIRAFENVVPVRKPFIYDFF >NZ_CP053938.1|WP_000664618.1|1963284_1964574_-|3-phosphoshikimate-1-carboxyvinyltransferase MKERTIQPVNNGLNGNITIPGDKSISHRAVMFGAIAEGTTTIKGFLPGADCLSTISCFKEMGVDIVQDGDEVTVVGKGLEGLQEPKAVLDVGNSGTTIRLMSGILANTPFFSCVQGDASIAKRPMKRVTNPLKQMGANIDGREEGTFTPLTVRGGDLKAIEYTSPVASAQVKSAILLAGLRAEGVTAVTEPHISRDHTERMLEAFGVKVTREGKTVKLAGGQKLTATDVQVPGDVSSAAFFLVAGAIIPNSKLVLENVGMNPTRTGIIDVLEKMGATFTVEPINEGASEPAANITIETSSLKGIEIGGDIIPRLIDEIPVIALAATQAEGITVIKDAHELKVKETNRIDTVVAELTKLGARIEATDDGMIIYGKSALKGNTVNSYGDHRIGMMLAIAGCIAEGKTIIEDAEAVGVSYPTFFEELQKLAK >NZ_CP053938.1|WP_001228123.1|1964590_1965691_-|prephenate-dehydrogenase MRKKVVLIGTGLIGGSLALAIKKDHDVTITGYDIFQEQVERAKELYVVDEIAVDLQHACEEAHLIVFASPVEETKKLLHKLASFHLREDVIVTDVGSTKGSIMNEAEALFSKEISFIGGHPMAGSHKTGVESAKAHLFENAFYILTPMHHVPNEHVEELKDWLKGTGSHFLVLNTEEHDYVTGIVSHFPHLIAAGLVKQVEKHAGDNPLIHQLAAGGFRDITRIASSSPKMWSDIVKQNREHLMVLLKEWISEMEDLYDTVSSGDAGEIQNYFADAKEYRDSLPVRKRGAIPAYHDLYVDVLDKVGALAHITSILAREEISITNLQILEAREGLLGVLRISFQREEDRMKAKLALGEEKYQTYETI >NZ_CP053938.1|WP_001197241.1|1965683_1966784_-|histidinol-phosphate-transaminase MQVKDQLSSLQPYKPGKSPEQMKEVYGDHSFVKLASNENPFGCSPRVLDELQKSWLDHALYPDGGATTLRQTIANKLHVKMEQVLCGSGLDEVIQMISRAVLKAGDNIVTAEATFPQYRHHAIIEGCEVKEVALNNGVYDLDEISSVVDNNTKIVWICNPNNPTGTYVNDRKLTQFIEGISENTLIVIDEAYYEYVTAKDFPETLPLLEKHKNILVLRTFSKAYGLASFRIGYAIGQEELIEKLNVVRLPFNVSSLAQKAATIAFGDDEFIEEIVRVNTEGLRQYESFCKENEIPFYQSQTNFIFLPVENGGEIYEACAHAGFIIRPFPNGVRITVGTREQNEGVISVLQQHFENKKRKSRDEANA >NZ_CP053938.1|WP_001269404.1|1966801_1967974_-|chorismate-synthase MRYITAGESHGPQLTVILEGVPAGLTLAAEHINKELLRRQKGHGRGRRMQIETDTVEIVSGVRHGMTLGSPITLIVKNDDFKHWTKVMGAEPISEKESKEMKRTITKPRPGHADLNGAIKYGHRDIRNVLERSSARETTVRVAAGAVAKQILKELGVEIAGHVLEIGGVKAKHISNLSIEEIQIITENSPVRCLDKTVEQEMMDAIDNAKSSGDSIGGIVEVIAEGMPIGVGSYVHYDRKLDAKLAGAIMSINAFKGAEIGVGFEAARQPGSKVHDEILWDEEQGYTRKTNNAGGLEGGMTTGMPIVVRGVMKPIPTLYKPLASVDIDTKEAFQASIERSDSCAVPAAGVVAESVVAWELAHALVEQFGKDRMELIQQNITQHNKYAKEF >NZ_CP053938.1|WP_001273580.1|1968256_1969333_-|bifunctional-3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase/chorismate-mutase MANHELDQLRKQVDEINLQLLHLLNKRGEIVQKIGEQKQVQGTKRFDPVREREVLDMIAENNEGPFETSTVQHIFKTIFKASLELQEDDNRKALLVSRKKKQENTIVDVKGELIGNGTQTFIMGPCAVESLEQVRQVGQAMKDQGLKLMRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLQILRQVADEFDLAIISEILNPNDVEMALDYVDVIQVGARNMQNFDLLRAVGKVNKPVLLKRGLAATIDEFINAAEYIIAQGNDQIILCERGIRTYERATRNTLDISAVPILKKETHLPVIVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFHRFMDELKGFKNKLS >NZ_CP053938.1|WP_011181718.1|1970164_1973677_-|DUF4020-domain-containing-protein MTFLGKGESSVWITSEVEIPDELIDHLEKGKLVLFVGAGVSMKGKSNLPNFDDLVDEIAKTLYVEKREITEPHDYYLGKIAKTKDVHQVARDLVHIEKSKPNPLHYAIPRLFPLDTEVRIVTTNFDRHFTTAMKEMNRELNVYYAPALPTGRAFKGLAYIHGNIEQEKEALILTDGDFGRAYLTEGWARRFLVDLFSNYTVLFVGYSHNDPVMKYLATGLPPSTRRYAFVAQGENTYHWEHLGIRPIVYPNKGNNHQSLVKAVKRWAELMGDNYITKRMRIRDIVTVPPSVEQEQLSYIKQSIKKIETVRYFVEFAHDYEWVEWLEAEGKLQNLFLITSNYNEVDELLAKWLVEQFLFSHQKELFQLIFKNHSKLSPLLWRTICSYLNETKMKMDPLLFARWTLLLLETAEKDSKSIETISYLLQKCSFPEHKEIALLLLTFILDGKLKLKRERKWGNDNGESIELEESSRLPVSTFSFVEQIWNEKMKPHISYYAVPIMMMGIEKMRMLSLRQAALKKRDKENVEKEFQQNDLAFLIQIVKECLAYLCENNEKKANYYITEMIEANSVLQNRIAIDAMNKNVFVSADEKMKWLLQEGILLDVTYKHEVFQLIKNHFALSLEKTKEEVIQIVLKDLAEERAFDVCFVLDLLFTCDSNSPSTAKGYELMKQKHPHFHSERYSVQKKEAAEQSITCNVTADGLLQLKDEEIMKQVQQFSQDGVFEQRHFLEMLSKACKLNTEWSISFAYQLVGMHEISNEVWFVCIREWRNNRGLTNEQIQKVIPLLQKFVRNTAFHWLISSFLYEISNRLEELEENSIRNVKRFAFSVFPQVMKSDTNFKLAKQDFYNESIQHPVGKMTAVLLKLLSYDHLYDRNVYEYLFLFEEQVRISTERTNFMIARLVADITFLYHIEKQWCRKYLLPYLELKKENEITKYAWAGLCYTQINLPLFTEMKRFIKYAVEHLEVLHPHTREAFLKWLSFVFIKCVLYWEQKTDWLYPLLIRENEENKIKFMQFLCYYVKTLSAKEQQKFWAAWLSIFLRERPKMGGITAREYVMLLRIILFMDEIVERGLSIICKSFSDVGGKGNQTELKQLFHEILEKTESIKMYKELYANVFFTLLQALQEANLLETEIIQIKELLIGYRVEKCVINAIDNEIIRIGIVLENLQEEM >NZ_CP053938.1|WP_000997708.1|1973827_1974265_+|YndM-family-protein MNDFTVVLIKFISCIIAFSIGLALFFPATFVQIISFSLFVTIVSYMFVDKIILNRIGNTGAIMSDFLLTYLSVWIFGNILLDNYMQIAWGSILSAIVFTLSEVIVHRFSSSRTRHHNDNIHINRRFAYGTEFAEEQNILDKDKKK >NZ_CP053938.1|WP_000287749.1|1974434_1974929_-|cysteine-hydrolase MYTAGMSVHNGEKFLETLQELIGECRSNDIPVIYVQHNGPKDHPLEKGTDGWKIHAAITPLEGDSIVEKTTPDSFYKTNLNEVLQDKGITHVIISGMQTQYCVDTTTRRACSEGYKITLVSDAHSSTFDTEVLRAEDIVKHHNVVFGAFADVVTLKDLKVTASK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053938_3 | 3690173-3690323 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053938_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP053938_3
>3.1|3690204|29|NZ_CP053938|CRISPRCasFinder GCGCACCTCGATTTATATCAGCGATTCCT >3.2|3690264|29|NZ_CP053938|CRISPRCasFinder GCGATTTCCCAATTATATCGGCGCATCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053938_3
The CRISPR arrays of NZ_CP053938_3 >merge|NZ_CP053938|3|3690173-3690323|CRISPRCasFinder AAATTATATCGGCGATTTTTCGAATATATCGGCGCACCTCGATTTATATCAGCGATTCCTCATTTATATCGGCGCATCTCCATTTATATCGGCGATTTCCCAATTATATCGGCGCATCTCCATTTATATCGGCGATTCCTCATTTATATCG >NZ_CP053938|3|2|3690173-3690323|CRISPRCasFinder AAATTATATCGGCGATTTTTCGAATATATCG GCGCACCTCGATTTATATCAGCGATTCCT CATTTATATCGGCGCATCTCCATTTATATCG GCGATTTCCCAATTATATCGGCGCATCTC CATTTATATCGGCGATTCCTCATTTATATCG
>NZ_CP053938.1|WP_000118540.1|3689805_3690117_+|PepSY-domain-containing-protein MSWKGLVAGLGVGFAAGYFVANKVQEQSHISSEKALKMVKQALSHKGEITGSWVHMVPETFEKYDVAYEVYRGGLTTMLNDIQERFEFLVDAKTGTVLEVIAA >NZ_CP053938.1|WP_001031503.1|3688583_3689657_-|M42-family-metallopeptidase MNKETLQLFRTLTELQGASGFEHDVRRFMKQELSKYADEIVQDGLGSVFGLKKGDETGPRVLVAGHMDEVGFMITQITKNGMLRFQPLGGWWSQVLLAQRVQVMTKNGPVIGVVGSIPPHLLSDAQRAKPMDIKNMLIDIGADSYEDAIEIGVKPGQQIVPICPFTPMANEKKIMAKAWDNRYGCGLAIELLKELKDETLPNTLYSGATVQEEVGLRGAQTAANMIQPDIFYALDASPANDASGDKTQFGQLGKGALLRIYDRTMVTHRGMREFILDTAETNNIPYQYFISQGGTDAGRVHTSNSGIPSAVIGVCARYIHTHASILHVDDYAAAKELITKLVRATDKTTLETIKNNA >NZ_CP053938.1|WP_000869966.1|3687833_3688343_-|DUF84-family-protein MKVVVGSKNKTKVGAVEKVWSDAEITSLSVPSGVAAQPFSDEETMQGAINRAKRALEKGEAQIGIGLEGGVMKTEYGLFMCNWGALATSDGKIFVAGGARITLPDDFLAPLEEGKELSEVMEEFVQRKDIRSHEGAIGIFTDDYVDRTELFVHVVKLLVGQYKYDEKQA >NZ_CP053938.1|WP_000838193.1|3687435_3687750_-|thioredoxin-family-protein MKSLESMEQFQQLKNEENVVFMFSAEWCPDCRFVDPFMPEVEEKYSDFSFYYVDRDEFIDLCVKLDVFGIPSFVAYNKGEETGRYVNKDRKTQEQIEEFIEGLK >NZ_CP053938.1|WP_000784593.1|3686543_3687356_-|DUF1444-domain-containing-protein MKMTSKKMKDELMKKLSRPEWDFHYDSEKEVLRIEQKDSKKGINVSLPGVVAKWEVNKEKAIEEVAYYVQEALIAMHKEENSAAKILPVIRSTSFPKQAEEGNPFIMTDHTAETRIYYALDSNKTYRLIDERLLQKLGLTEQQVREMALFNARSLSYEFKQDTVAGNTFYFLNTNDGYDATRILNESLLQSMREKISGDMVVAVPHQDVLIIADIVNEIGYDIIAQMTMKFFAEGHVPITSLSFVYEDGDFEPIFILAKNRKKTDGKEKG >NZ_CP053938.1|WP_001006759.1|3685932_3686547_-|DUF4479-domain-containing-protein MNEVNVFYNLEGIGDTLIVALQDITLENRTFDRKGDVARVYDRESNETAGFNIFNASSYLEVKETGNLTLTKELVEKINEILAKNGFEETVEADLSPKFVVGYVAEKEKHPNADKLNICKVEIGTETLQIVCGAPNVDAGQKVVVAKIGAVMPSGMLIKPAELRGVPSAGMICSARELELPDAPQEKGILVLEDSFEVGQEFKF >NZ_CP053938.1|WP_000813285.1|3685276_3685621_-|hypothetical-protein MKQQLKIAELLKRIETSKQQDIELGSYEIYLFSENELEKGQIGYRYDKHQNSLISEEHGKWKDEWIVIGYETDMGDPVFVNIDDDAYPVYTAERGTEVWQPVHIGNIDEIIKQL >NZ_CP053938.1|WP_000888064.1|3681038_3685055_-|DNA-translocase-FtsK MLDWMKKLFNKEEEQTAMNKEVPKQVESQPKIPRVNHYTEAREAQMASRNAGKCRFPLVPDNGFDEEDVIETGRFEEQPVQAVTYENEPVQRGIKVERSRRPYVEKVVSTYEEPEMQYEPERESVVKKASAPAQESNRRPFRPTEMISPIYGYNRPSVEKKEEKQEEVKEREDLEISVEGKSVVDAWLEKKGYTLSDFSDGQAPTSSSHRAANEQGERQYEESKKEEKSVVDQWLEKNGYEIERQEPIVEEKEVVQEMSAPQEVPAAELLHETIAERMEGAKQESDVVDKNILQEELVDSKVEHEDTILSEEIKRSTEIEQPTIEVEKQAPEESVIVKAEEKLEETIVVEIPEEVEVIAEAEEREEVEVIAETEESEEVEVIAETEELEEVEVVAETEELEEVEVTAETEELEEVEVVAETEELEEVEVIAETEELEEVEVIAEAEESEEVEVIAETEAPEEVEPVALEEMQQEMVLNEAIEQKNEFIHVAVADEQTKKDVQSFADVLIAEEQSVVEETPIVEEQPVAEEAPVVEEQSVVEETPIVEEQPVAEEAPVVEEQSVVEETPIVEEQPVVEEAPVVEEAPIAEEQSVVEEAPVVEEQPVAEETSIVEEQPAAEETSVVEEQPVAEETSVVEEQPVAEETSIVEEQPVAEEAPVVEEQPVVQKEEPKREKKRHVPFNVVMLKQDRARLMERHASRTNAMQPSMSERVENKPVHQVEEKPQVEEKPVQQVVEPQVEEKPMQQVVVEPQVEEKPVQQVVEPQVEEKPMQQVVVEPQVEEKPVQQVVEPQVEEKPMQQVVVEPQVEEKPVQQVVEPQVEEVQPVQQVVAEQVQKPISSTEVEEKAYVVNQRENDVRNVLQTPPTYTIPSLTLLSIPQQAALDNTEWLEEQKELLDTTFNNFHVGAHVINVSQGPAVTRFEVQPDPGVKVNKITNLSDDIKLSLAAKDIRIEAPIPGKSAIGIEVPNKESKPVFLREILRSPVFTKSESPLTVALGLDISGDPIVTDIRKMPHGLIAGATGSGKSVCINAILTSILYKAKPHEVKLMLIDPKMVELAPYNSVPHLVAPVITDVKAATAALKWAVEEMERRYELFAHAGARDLTRYNTIVSGREIPGETLPYIVIVIDELADLMMVAPGDVEEAICRIAQKARACGIHLLVATQRPSVDVITGLIKSNIPTRIAFTVSSQVDSRTIIDIGGAEKLLGRGDMLFLGNGTSKPVRVQGVYVSDDEIEKTVDHVKKQMKPNYLFKQEDLLAKTEQAESEDELFLDACQFVVEQGGASTSSVQRKFRIGYNRAARLIEEMESQGIISEGRGTKPRDVLISEDEFAAMQETNV >NZ_CP053938.1|WP_000658369.1|3679858_3680977_-|nicotinate-phosphoribosyltransferase MKEIELKLKGEINRLTNKTFKFDERVGEGWFSAVYFLKTREIIEEFRPKSVVTMQFFQKENAVLCGTDEVIALLQTFAKNPEELEINSLKDGDKISPFETVLTIHGPYENFGFLEGVIDGILARRTSVATNVYNVVQAARSVDKEKPVIFMGDRDDHYTQQAGDGYAAYIGGMSAQATHAMNEWWGKSGMGTMPHALIQMFNGDVVEAAKAYHKKFPEDELVVLIDYNNDVITDALRVAREFGSTLKGVRVDTSRTMIDQYFIRHPEVLGTFDPRGVNPSLVFALRKALDEEGFQHVDIVVTGGFDEKRIREFEAQNVPVDIYGVGSSLLKMNIGFTGDNVELNGKPEAKAGRKYRPNPRLERVQLEKREDM >NZ_CP053938.1|WP_000219470.1|3678295_3679606_-|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MTVYHFVGIKGTGMSSLAQILHDMKHTVQGSDYEKRFFTQTALEKRSISILPFDKSNVKEGQVIIAGNAFPDTHEEIVAAKELNIPVHRYHHFLGDLMNQYTSVAVTGAHGKTSTTGLLAHVMQGAHPTSYLIGDGTGHGVENSKYFVFEACEYRRHFLSYNPDYAIMTNIDFDHPDYFTDINDVFSAFQEMALQVKKGIIACGDDEELQKIQAKVPVIFYGFGEDNDFQARNIQKRTDGTIFDVFVRNTYYDTFKITGYGNHSVLNALAVIALCHYENVDVEAVKHQLTTFEGVKRRFNEKPMGEQVIIDDYAHHPTEINATIEAARQKHPEREIVAVFQPHTFSRTEKFLDEFAESLSKADQVYLCDIFGSARENKGELTIEDLQKRIDGAELITDTTTDVLKKHKNGVLIFMGAGDIQKFEAAYVKEVQVAEK >NZ_CP053938.1|WP_000436857.1|3690412_3691267_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MEQLQIGDIKVTWLKGGNTHLDGGAMFGVVPKVLWSRKYKHNDTNHIYLRTDPLLLQTKDGNMLIDSGIGNGKLNEKMKRNQGVTEESSVYESLEKLGLKPEDIHYVLMTHLHFDHASGLTKGESNHLVPAFPNAKIYVSETEWNEMRNPNIRSRNTYWKENWEPIVDQVVTFQQEIEITDEIKMAHTGGHSDGHAVIALESKGETMLHLADLLPTHAHQNVLWVMAYDDYPMTSIENKQKWMKYGAEKDAWFTFYHDAYYRAVKWNEEGHIVEKIERKTSIEA >NZ_CP053938.1|WP_001239380.1|3691336_3691990_-|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MRLRHKPYAMDRINEYSHIVIGNPEERAGNWKEVFGNEQPIHIEVGTGRGRFMYDMAKANPHINYIGIEKFTSVVVDALDKLIEEELPNLKLINKDAEDLTVFFAKGEIDRVYLNFSDPWPKKRHTKRRLTYKTFLRNYEEVLVEGGEIHFKTDNQGLFEYSLMSMAEYGMLLTYLSLDLHNSDFEGNIMTEYEEKFSSKGHRIYRVEAKYRTEPMQ >NZ_CP053938.1|WP_001122234.1|3692222_3692501_+|hypothetical-protein MPINQQHQLEVLKDILVNHQSDCCGTVSECEQLERLIQSLLANDNISSDAKAMLNDVYSYSQSGKSSSNLDNHISNNQEQLTQWIAGMDNFS >NZ_CP053938.1|WP_001055736.1|3692504_3693302_-|phosphotransferase-family-protein MNMEWLEQLLGKEWSLVPAGGVTGDAYIAQNGQQKLFLKRNTSPFLAVLSAEGIVPKLLWTRRVTNGDVISAQKWLPGQKLEPEDMKLERVAKLLKKIHSSKALVQMIQRLGKQPLHAQELLQQLQLVLRGDIRDEETIQQGLQYLMDSLKDIEYNEFVVCHCDVNHNNWLLSDEDELFLIDWDGAVIADPALDLGMLLYWYIPRQEWSEWLGYYDIEMDESLLKRMRWYVIAQTILSIQWHTTKKQQAEAEYWHQYLQQLLASE >NZ_CP053938.1|WP_144405099.1|3693531_3695631_-|type-I-pullulanase MNKITILLPHAYGTSRTFRLQEGSNVKDLPIAHTIALPDATKYECFIEEPLDVGKYYTVRDERNEETDLQIGAVIRTEIFDEKYYYEGTDLGAVYQEEATTFKVWAPTARLAKVRIYKSDKEYTDHEMHREENGVWAHTLQGDLAGEKYTFLVCINLIWNEAVDPYAKSVTVNGKYGVVIDLEKTNVTKQEQLPPLQAMTDAILYELHIRDATIHEGSGVSKKGTYKGLMEEGTKGQNGTLTGLSHIKDLGVTHVELLPLYCFGGVDEANPSSAYNWGYNPLYYNAPTGFYATNPSDPYNRIVECKELIETFHEHGIRVIIDVVYNHVYERELSSFEKLVPGYYFRHGENGMPSNGTGVGNDIASERKMMRKFIVESILYWLTEYNVDGFRFDLMGILDVDTINIIEKEVRNIKRDALLLGEGWDLQTPLPLEEKATLNNANKMPHIAQFNDQFRDGIKGSTFHINKRGFAFGGHVDRNHLQYIVSGSLLSMKETGLFLEPVQSINYVECHDNMTMWDKLMRSNEESEEILKKRHVLATAMAILSQGIPFLHAGQEFYRTKQGNENSYNANDEINQLDWDRKEKEIETVNYIKGLIAIRKEHGAFRLQNADLIKKHMTFLQTSPEVLAYHLEHVESFGPWKEIVVLFNSSLEAKTVQLPKEETWHVLVNEKQAKIEPISSFRGKELRLSPISTYILTIM >NZ_CP053938.1|WP_000433233.1|3695810_3696356_-|RNA-2',3'-cyclic-phosphodiesterase MEPHYFVAITLPNHIKEVLSNYREEMQEELPFRSWVHKEDYHITLSFLGSATEEQLEGIKNGLQTLIETKELSFTLQGFSTFGMEDRPRIFWAKVSENQDLFPLQKQVHAICEGNGFSLETRPYHPHITVARKWVGEEKFNLEHIKEVPEISFQADTITLYESHVKETPKYKAIAEIKLQK >NZ_CP053938.1|WP_001274265.1|3696459_3697866_-|dipeptidase-PepV MSAINWTEEVAKRKDDLIRDTQQFLQIKSVWEEESAKEGAPFGEGVEKALSFMLHKGETEGFTSKNLEGYAGHLEMGQGEELVGILCHVDVVPEGDGWTTPAYSADIRDGKIFARGAIDDKGPTMAAYYAMKIVKELGLPLSKRVRMILGTDEESNWKCVDHYFKNEEMPTIGFAPDADFPIINAEKGISDIQVVQNGSEEKKGAYELVSFESGRRLNMVPDFAEAVVTGEDVNALTVAYEEYLQTAKKIGEAIVEGNTVTLQIKGISAHGSTPEKGENAGLLLANFLTTVALDGKANAFATFATETFTGDIFGEKATIAYKDEVSGPLTVNVGRLSYAKENGGNLGLNVRYPVTTNFEEMIAKLKEYVGTHGFAVADYSNSRPHHVDKDHVLIRTLQRVYEEQTGEKAELLAIGGGTYARSLKAGVAFGPLFPGKEELAHQKDEYIEIEDLLKATAIYAQAIHELAK >NZ_CP053938.1|WP_000805512.1|3698223_3698445_+|DeoR-family-transcriptional-regulator MKPTTTRMLTRIKSIYMYINENGTVTTKDLVDEFGITPRTIQRDLNVLQFNELVYSPCRGKWTTTGKKVRMTS >NZ_CP053938.1|WP_001234935.1|3698526_3699255_-|rRNA-pseudouridine-synthase MRLDKLLANMGYGSRKEVKKLLKDGVVKIDGISVKDAKVHVNVEEQEVMIHGEVVEYKEFVYLMMHKPQGVISATEDDNHETVIDLLELEDAIFNPFPVGRLDIDTEGFLLITNDGKLSHQLLSPKKHVPKKYYAHVAGVVTEEDVKEFAKGVILDDGYETKPGALTILKSDDISEIELVITEGKFHQVKRMFEAVGKKVVYLKRTEMGPLVLDEELELGQYRELTDEEVEMLKTYQVDTEK >NZ_CP053938.1|WP_001284049.1|3699296_3700949_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MSDSKFLRGTLIVTLGTFLVKFLGMIYVFPFHALVGTEGGTLYTYGYIPYTIFLSIATAGVPLAVSKFVSKYNALGDYKTSRRMFRSGMVMMIVTGVLSFLVLYMTAPLFAEAMLGKQSVHSNIGEVTTIIRLVSFALIVVPAASLIRGYFQGHQSMGPTTVSQIIEQIIRIVFLLAGSFIVIKVLGGTVATAVGVATFAAFVSAVGALGVLIWYWLKRKKHLDQYLIEQTVPESTVSTVQLFKELFAYAIPYVVIGLTIPLYQQIDTLTFNSIMQAIGQGDIAERALGIFTMWTHKLIMIPVSLATAFSLTLVPAITKSFTEKQYRYLKLQITQTFQANMFLTLPAVVGISSLAYPIYTAFYDSDPLGGQVLMWYAPVALLFALFTVTAAILQGINQQKHAIIALIMGVILKFVCNVIFIRYFGTVGAILATAVGFLASVWYTNQQIKKYAHYSFGVVYKRTFQIAVLTLVMVVTVKLSQWILSFMISPDSRIGALITVAICAGLGGLVYGLLAIRTGVLERVFGGEALEKIQRKLGNRFKIKLKSKGA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053938_4 | 3844281-3844367 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053938_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053938_4
>4.1|3844307|35|NZ_CP053938|CRISPRCasFinder TTTTAAGTATCGGTCGATAAAATGTGAAAATCGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053938_4
The CRISPR arrays of NZ_CP053938_4 >merge|NZ_CP053938|4|3844281-3844367|CRISPRCasFinder GATATATCTTAAAAATCGCCGATATATTTTAAGTATCGGTCGATAAAATGTGAAAATCGCCGATAAAAGTTAAGAATCGCTGATATA >NZ_CP053938|4|3|3844281-3844367|CRISPRCasFinder GATATATCTTAAAAATCGCCGATATA TTTTAAGTATCGGTCGATAAAATGTGAAAATCGCC GATAAAAGTTAAGAATCGCTGATATA
>NZ_CP053938.1|WP_001260128.1|3843273_3843996_+|lipase-family-protein MRTPLSFDKDTAILLASCCELTYEQYKQNGIFEIPNGFQYVQGFQGKTIQTTEWFGFILESEDTIIVAFRGTQTDTDWIIDSLVNQKPYPYALNSGNVHNGFLSIYESCRDSIMDMLVSLPAHKKLLATGHSLGGALATLHILDARINTAFAQYGLYTFASPKVGDIAFRNYYKLQVASSFRFVNLFDVVPLLPPRNVHFNEQDWEYAHVHHNMTFTKNTKSIANNHAMTTYKTCLTSHF >NZ_CP053938.1|WP_001147838.1|3842326_3843109_+|TIGR00266-family-protein MQAHEIEYKLYGDDMQFVEIELDPEESVIAEAGAMMMMEDYIEMETIFGDGSGPSGGLFGKLMGAGKRLVTGESMFMTVFTNTGHGKRHVSFAAPYPGKIIPVDLTEYQGKVVCQKDAFLCAAKGVSIGIEFTKKIGTGFFGGEGFIMQKLEGDGLAFMHAGGTVYKRELKPGEKLRIDTGCLVAMTKDVNYDVEFVGKVKTALFGGEGLFFATLEGPGTVWIQSLTLSRLSARLTSPAAQGSGEGSVLGGLGRLLDGKE >NZ_CP053938.1|WP_001193054.1|3841799_3842000_-|cold-shock-protein MQTGKVKWFNSEKGFGFIEVEGGDDVFVHFSAIQGDGFKTLEEGQEVSFEIVEGNRGPQAANVTKN >NZ_CP053938.1|WP_000957385.1|3841023_3841755_+|yteA-family-sporulation-protein MLTPQQINQFKSVLEKQKQELEQTIQTHENEDRASERESVGELSSYDNHPADMATELYERQKDFGLIELWHKQLEDTKHALQKIEAGTYGICEVSGEEIPFERLEAMPTATTCIQHTTNKLNMETRPVEEEVLSPSFHKHDEDHSVEYDAEDAWQDVANYGTSETPSDLERQDSKNYNGMYVNSEENVGYVEDFENFIGTDMYGKNPQVFATEEHEEYEQMLDDFEERTFKGELSSNESSSKE >NZ_CP053938.1|WP_000425747.1|3839960_3840914_+|1,4-dihydroxy-2-naphthoate-polyprenyltransferase MEMNVETNSSPTAPKPSKQTGWRIWWSLLRPHTLTAAFVPVFIGTAYAMQVGGINQIHLPLFLIMLLACLLIQAATNMFNEYFDYKRGLDHEGSVGIGGAIVRDGIQPKTVLNLAFGFFGIAILLGVYICMNSSWWLAAIGLVCMAVAYLYTGGPLPIAYTPFGELTAGLFMGVIIIGISFFIQTGTVTSEVVLLSIPSSILIGAILLANNIRDLDGDKENGRKTLAILVGRERAVGVLASMFIVSYIWTIALIIVGIVSPWMLIVFLSAPKAFKATKGFIGKSIPMEMVPAMIATAKTNTIFGLLMGIGLLLGYFL >NZ_CP053938.1|WP_000616720.1|3838371_3839766_-|isochorismate-synthase MIQTKQIGLQEVLSAAIKRATDEKILVSFVKQIDWMDPLLFYAAGKRISFENRCYFADPAQHVIFAGIGSVFTIATASHKRFQTARDEWDKVKEKAFVQREKYEFGTGPLLFGGFSFDQEKEKTDLWKEFDDTTFSLPAFLLTVKNEKAWLTMNTFVSATDCAETLYNEIVSLEEKIFEESKCALEGSKLTVTSKVEVDPKGWMKAIEKVQDEMKQGNVQKVVLARELKVEMDHHIDSALVLEALRIGQPDCYVFSFDYKGACFLGATPERLIRKEDEKFTSMCLAGSTGHGQSIEESKRNSNALLHDEKNLAEHGYVVNMIRSVLNEHCEFVNIPESPGLLTTKNLIHLYTPVEAKGDASLLTMVEELHPTPALGGTPRLEAMKLIRDVELLDRGLYGAPIGWIDDEGNGEFAVALRCGLLNGEKASLFAGCGIVIDSVPQLEYEETSLKFRPMLGALEELMK >NZ_CP053938.1|WP_001059249.1|3836620_3838375_-|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylic-acid-synthase MNNHIEALSYYLGAFVDELTRLNVCDVVISPGSRSTPIALLMEQHEGMNTYLHVDERSAGFFALGIAKAKKRPVALLCTSGTAAANYYPAVCEAFHSRVPLIVLTADRPHELRDVGAPQAMNQINLYGTFVKQFTEMALPEASEAMYHYARMTTQRMIASACLAPQGPVHLNFPVREPLIPDFSLESLWDKGRGEYTGVVQQGNAVMPSEYVDSLVGRLSHMKKGLIICGDDSHSEIATFATQLAEKTGYPILADPLSNIRSGHHDKTMVIDCYDTFLRNELLKETWKPDVLIRFGGMPVSKALTQFIKKQTKAVHIVVDESGQWRDPALVATEVVQASDIAFCSALIEKMPVMKKNDWFRMWQHINEKTKETLREMETYDTAFEGRVITDIVRVLPEGATLFASNSMPIRDTDSFFFTSDKTIQVMANRGVNGIDGIISTALGASMICDPLVLVIGDLSFYHDLNGLLAAKLHELNITIVVVNNDGGGIFSFLPQYEKKEHFESLFGTPIGLDYEHVVTMYGGSFSRVNGWEQFREEVQKGATTEGLHVVEICTNRDENVTLHRKLWAKTQDVITTSLQGESK >NZ_CP053938.1|WP_001103366.1|3835811_3836624_-|2-succinyl-6-hydroxy-2,-4-cyclohexadiene-1-carboxylate-synthase MNVTLQGVSYEYEVVGSGEPLLLLHGFTGSMETWRSFVPSWSEQFQVILVDIVGHGKTESPEDVTHYDIRNAALQMKELLDYLHIEKAHILGYSMGGRLAITMACLYPEYVRSLLLENCTAGLEREDERKERCEKDERLADKIEREGIESFVTMWENIPLFETQKSLAQNVQEAVRKERLANNSKGLANSLRGMGTGAQPSWWNELQNLKMPVLLMNGEYDEKFFRILKNIEKCVSDAKFVKIDGAGHAIHVEQPEKFDTIVKGFLKTMQ >NZ_CP053938.1|WP_000963873.1|3834923_3835742_-|1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA-synthase MAIEWVKEGNYEDIIYSTYNGIAKISINRPEVHNAFRPKTVMELIDAFAHARDDANVGVIILTGEGGRAFCSGGDQKVRGHGGYVGDDQIPRLNVLDLQRLIRAIPKPVIAMVAGYAIGGGHVLHIVCDLTIAADNAVFGQTGPKVGSFDGGYGAGYLARMVGHKKAREIWYLCRQYNAQEALDMGLVNTVVPLEELEAETVQWAQEILANSPMALRFLKAAFNADTDGLAGIQQLAGDATLLYYTTDEAKEGRDAFKEKRSPDFGQFPRFP >NZ_CP053938.1|WP_000449548.1|3833402_3834848_-|o-succinylbenzoate--CoA-ligase METMPNWLKQRAFLTPDRTAIEIEEEKVTFMQLHEKVVSVCEHLTHVGVKRGQKVAVLMKNGMEMITVIHALSYVGAVAVLLNTRLSREELLWQMDDAEVICLVTDQDFEAKDIPVYSFAEVMNGPKEEASIQEEFSLREAMTIIYTSGTTGKPKGVILTYGNHWASAVGSSLNLGLRDDDCWLACMPMFHVGGLSLLMKNIMYGMRILLVPKYDADFIHKALQTRGVTIISVVSKMLTDLLERLGEGTYPSSLRCMLLGGGPAPKPLLETCVDKGIPVYQTYGMTETSSQICTLSADYMLTKVGSAGKPLFQCQLRIEKDGVVVPPFAEGEIVVKGPNVTGGYFNREDATRETIQNGWLHTGDLGYLDEEGFLYVLDRRSDLIISGGENIYPAQIEEVLLSHPMVAEAGVVGMTDDKWGQVPAAFVVKSGEVTEEEILHFCEEKLAKYKVPKKACFLEELPRNASKKLLRRELRQLVEEM >NZ_CP053938.1|WP_000494076.1|3844422_3846831_-|glycogen-phosphorylase MFTHVESFKSAFLEKLETMYGKSFKDSTTRDQYNTLGYMVREYMNSQWIATNESYRSGERKQMYYLSIEFLLGRLLGSNILNLGIKDVCEQGLSELGISLQQLEEVEADAGLGNGGLGRLAACFLDSLASLNLPGHGCGIRYKHGLFDQKIVDGYQVEFPEQWLLHENVWEVRRHDQAVEVSYFGNVEPLYIDGRLEFRHTNAEVIMAVPYDVPVVGYETSTVNTLRLWNAEPVPFPQNCKDILKYKRETEAVSEFLYPDDTHDEGKILRLKQQYFLVSASLQNIVRMHRERYGDLRQLHEKIAIHINDTHPVLAIPELMRILLDEEKLAWEEAWHITTQTISYTNHTTLSEALEKWPIHIFKPLLPRIYMIIEEINERFCHELWERYPYEWHRIEEMAIIAHDLVKMAHLAIVGSHSVNGVAKIHTEILKQREMRLFYEFYPDKFNNKTNGIAHRRWLMKANPQLTNLISEAIGTEWKKEPIKLQELQLVQYDASFQEKFAEVKQERKEILAERIHNTMGITIDPNSIFDVQVKRLHAYKRQLLNVLHILYLYNRLKEDASFTFYPRTFIFGAKASPGYYYAKKIIKLINELARKVNNDPYVSQYMKVIFLENYRVSLAEDIFPAADVSEQISTASKEASGTGNMKFMMNGAITLGTLDGANIEIKDRVGDDNCFIFGLTAEEVLHYYQNGGYRASDYYHHNGHIKKVVDQLTNGFFAQSGAEFEAIYDSLVIQNDEYFVLRDFGPYAERQEAVGRAYENRTKWLEMSILNIAQSGHFASDRTILQYSNEIWGIGNTVTQI >NZ_CP053938.1|WP_042515450.1|3846849_3848280_-|glycogen-synthase-GlgA MNILFAVSECVPFVKSGGLADVAGALPKELKKLGVEVRIILPNYSLIPQKLRDGCTLHKVINVPLGWRNQYCGILKGEQDGITYYLIDNEYYFKRDSLYGHYDDGERFSYFSKAVLECIPHLDFEVDVLHSHDWHTAMVNFLLREKYQDNPSYEHIKTVYTIHNLQFQGVFSPEVMYDLLELGDEYFHSEQLEFYGNVNFMKGGIIASDQITAVSPTYKEEIQYEFFGEKLDGLLRKYNDKLSGIVNGIDTSVYNPETDSYITAQYDADSLYEKNENKRALQRYFGLPEKEDTPIISMVTRLTKQKGLDLVRTVFREIMEEDVQCIILGSGDSEYEQFFEWMAYEYPEKVKVYIGFNEELAHQVYAGSDLFLMPSLFEPCGLGQLIALAYGTIPIVRETGGLNDTVQSYDEETGEGNGFSFTNFNAHDMLHTVLRAIEFYHDKPVWDQLVKQAMTEDYSWEKSALAYKKLYKSLME >NZ_CP053938.1|WP_000504155.1|3848392_3849427_-|glucose-1-phosphate-adenylyltransferase-subunit-GlgD MGEKMLGIINATGSFPSLKKVTGHRSLAALPFGGRYRLIDFMLSNMVNSNIHSVAVFTSHKNRSLMDHVGSGKQWDLDRKRDGLFLFPPNCQCDQDEFGSFAHFRRHIDYFLRSREEYVVITNSHLVTALNFQAVLERHIHTAADITEVCHEGVSLQTYVLKKQLLLDLFEAYKDMEQYSLFDVVREKRGKSLHIATYEHTGYVAIIDSIESYYKHSLEILQPAIWKQVFKKEAPIFTKVKDEPPTRYVKGAAVKNTMIANGSIIEGEVENSVVSRSVKIGKGSIVRNSIIMQKSQIGDNCIIDGVIIDKDVKIGDGVVLKGNADEPYVVEKGSVQNSTINSYS >NZ_CP053938.1|WP_000057611.1|3849445_3850576_-|glucose-1-phosphate-adenylyltransferase MAQKQKCVAMLLAGGKGSRLSALTKNLAKPAVPFGGKYRIIDFTLSNCANSGIETVGILTQYQPLELHNYIGIGNAWDLDRVSGGVTVLPPYAESSGVKWYTGTASAIYQNLNYLSQYEPEYVLILSGDHIYKMDYSKMLDYHIEKEADVSISVIEVPWDEASRFGIMNTNEEMEIVEFEEKPQFPRSNLASMGIYIFNWAILKEYLEMDARNPESSNDFGKDVLPLLLDEGKKLMAYPFEGYWKDVGTVKSLWEANMDLLRDETSLNLNDRDWRIYSVNPNEPPQYIAEKAKVEESLINEGCVIEGDVKHSVLFQGVTVEEGSMVIDSVVMPGAKIGKNVVIERAIVGSEMVIEDGTIIRPEKNVDDVVLIAEGK >NZ_CP053938.1|WP_000111383.1|3850523_3852461_-|1,4-alpha-glucan-branching-protein-GlgB MSVINCEEVKRDEFHTEKYYESYNIFGAHIVTEDEMRGVRFTVWAPHAKAMSVVGDFNEWDYEQHKMLQVTEEGIWSLFIPHIEEREIYKYAIETMAGDVIFKADPYAVYAEVRPNTASVVFDIKGYEWNDKNWSRKKKKKSVYKEAMTVYELHFGSWKKKEDGTLYSYREMAEELIPYVVEHQFTHIEIMPLVEHPYDRSWGYQGTGYYAATSRFGTPYDLMHFVDECHKYGIGVILDWVPGHFCKDAHGLYLFDGTPTYEYKDKDVQENPVWGTVNFDLGKREVRNFLISNALFWMRYFHIDGFRVDAVANMLYWNKEGQEQSNEHAVSFLRELNEAVFAEDEDFLMTAEDSTAWPLVTAPTYEGGLGFNYKWNMGWMNDVLKYMECAPEYRKYIHDKMTFSLLYAYSENFILPLSHDEVVHGKKSLLNKMPGDYWDKFAQLRLLYGYFFTHPGKKLLFMGGEFGQFDEWKDLEDLDWNLHDFEMHRYMHDYFKELIALYKRSKPLWQLDHSREGFQWIDANNNEQSIFSFIRQGDKQEDALVVVCNFTKATYENYKVGVPDFEYYNEILNSDAEQYGGSGQVNKKRLKTIQEPYHNQTAHVEITIPPFGVSILRPVKTRKGSKKQDGSKTKVRSNVTSRGKR >NZ_CP053938.1|WP_000715339.1|3853451_3854396_-|L-lactate-dehydrogenase MKKGINRVVLVGTGAVGCSYAYSMINQGVAEEFVLVDVNEAKAEGEAMDLSHAVPFSPSPTKVWSGSYADCKDADLVVITAGLPQKPGETRLDLVEKNTKIFKQIVRGIMDSGFDGIFLIATNPVDILTYVTWKESGLPKERVIGSGTTLDSARFRYMLGDYLDVDPRNVHAYIVGEHGDTELPVWSHATIGVQKLETILANNEQYKQEDLDKIFENVRDAAYHIIERKGATYYGIGMSLLRVTKAILNNENSVLTVSAYLEGQYGEKDAYVGVPAVINREGVREIVELELNEEEKAKFAHSVKVLKETMAPVL >NZ_CP053938.1|WP_001030881.1|3854972_3856001_-|DUF4179-domain-containing-protein MNKEEFNYHINDIPIPEDRLIQREKTAILQAKKNQYRRTKTIKYSSLVACGICVSLLGFGFISPTMAKTLSSVPVIGPIYAQFKDIASHKIEKDELATSIERQDNHSGLTMKVKEAVYDGGRLVITVEYKGANTISNTNEEKPGFSYVTINGKEVKAAIASTSQKSKEGNTIIEQHEFTLANYGEFGDKIDVSVHGKDLFGKTGTWNVAFPLTKVEGEIRKFIPNIKTLTKDNLYALTVDQITFSSLSTRIDLTFDYPKEMEANDSWPALDYTVTDDKGKIYEGVSLQVGSTGLYGHHIVLALPPMDNPPRSLTIEPAYLSGLNDILKNGGAEDLKTTVLLQ >NZ_CP053938.1|WP_000355429.1|3855993_3856524_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MDISYLVKQAARGNDQAFEQLITFVRPKLYRTAYSYVRNEQDALDIYQETIYEAYLSLKKLKNPEKFQSWITKILVFKSIDFVRKSSRQFVVDDEIFTNLCTEESMNKLEQSLDLTEAFNFLDPTYKTIILLRYYHDLSIKEIAEVLNSPEGTVKSQLHRAKQALRPILKEGYSYE >NZ_CP053938.1|WP_000386684.1|3864000_3864681_+|MgtC/SapB-family-protein MDYTDLLIKLGLSAILGFAIGLERELKRKPLGLKTCLVISIISCLLTIVSIKAAYNLPHTDHMNMDPLRLAAQIVSGIGFLGAGVILRRGNDSIAGLTTAAMIWGASGIGIAVGAGFYIEAIFGMCFLMISVELIPLTMKFVGPRSFRQRDIVVKLVVRKMDNIPVVIEEIKEMDIKVKNMKLKTLENGSHYLHLKLCIDQKRHTADVYYSLQHLESVQQTEVESM >NZ_CP053938.1|WP_000842311.1|3864776_3865772_+|potassium-channel-protein MKSRPKLVDAFRDSIIFRLICFIVVLTAFSGFLIHILEPSHFTTWFDGIWWSIVTIFTVGYGDFAPHTLIGKLIGMGIILFGTGFCSYYMVLFATDMINKQYMKVKGEEAATSNGHMIIVGWNERAKHVVKQMHILQPNLDIVLIDETLSLLPKPFHHLEFIKGCPHHDQTLLKANITTAHTILITADKEKNESLADTQSILNILTAKGLNPNIHCIAELLTSEQIQNATRAGASEIIEGNKLTSYVFTASLLFPSISGVLFSLYNEISDNKLQLMELPSSCTGQTFANCSYTLLKQNILLLGIKRDEQYMINPVHSFVLIQSDILIVIHH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053938_2 | 2.1|1960821|30|NZ_CP053938|PILER-CR | 1960821-1960850 | 30 | NC_013940 | Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence | 246467-246496 | 7 | 0.767 |
NZ_CP053938_2 | 2.1|1960821|30|NZ_CP053938|PILER-CR | 1960821-1960850 | 30 | MG557979 | Lactobacillus phage Lpa804, complete genome | 58521-58550 | 8 | 0.733 |
NZ_CP053938_2 | 2.1|1960821|30|NZ_CP053938|PILER-CR | 1960821-1960850 | 30 | NZ_CP018141 | Acinetobacter larvae strain BRTC-1 plasmid pRW1, complete sequence | 10876-10905 | 8 | 0.733 |
1. spacer 2.1|1960821|30|NZ_CP053938|PILER-CR matches to NC_013940 (Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aatttactttttagctctattaaactatgg CRISPR spacer gatttacttataagctctattaaatgttgt Protospacer .******** * ************. **
2. spacer 2.1|1960821|30|NZ_CP053938|PILER-CR matches to MG557979 (Lactobacillus phage Lpa804, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttactttttagctctattaaactatgg CRISPR spacer cggatactttttagttctattaaactaact Protospacer . **********.************
3. spacer 2.1|1960821|30|NZ_CP053938|PILER-CR matches to NZ_CP018141 (Acinetobacter larvae strain BRTC-1 plasmid pRW1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttactttttagctctattaaactatgg CRISPR spacer aatttactttgtagcactattaattcctac Protospacer ********** **** ******* .. *.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1076823 : 1085558
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053938|1076823:1085558|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053938|1076823:1085558|1084685_1085558_+|WP_001258548.1|DBSCAN-SWA MRTEKEMMDLIINTAKEDERIRAVIMNGSRVNPNVKKDCFQDFDIIYAVKDIRSFTSNHNWIHRFGAIMMVQMPEEMSLIPADEDGKFPYLMQFMDGNRIDLTLVPVELINNFVRQDSLSKLLLDKDNCMEGFPPASDKDYLIKKPTEKEFLDCCNEFWWCSTNVAKGLWREELSYVKGMLDGPVRDMLIVMLEWHIGMKTDFIVNAGKFGKHFEKYIEKDMWVQFKRTFSNAEYENIWESFFVMGNLFREVANEIANAYGYPYPQGDDDRVTSYLKHVKALPKDSTSIY >NZ_CP053938|1076823:1085558|1081011_1081716_+|WP_170924614.1|DBSCAN-SWA MLIRKEMVSLIPNILIVDDDPHIRELVSVFLEREGFQIYEAIDGLDALQKMNEVKVDMVILDIMMPNMDGFDVCFELRKYYEIPILMLTAKGETSQKVKGFHLGTDDYLVKPFDPIELVVRVKALLKRYQITVSQSIQVGTVLLNRKTFEVTIGEQTVTLPLKEFELLFTLGSKAGRTCSREQLIEDVWGYDFEGNERTLDVHINRLREKFQEEKSKFSIKTIRGLGYRLEVSK >NZ_CP053938|1076823:1085558|1082810_1083398_-|WP_000823556.1|DBSCAN-SWA MKRKKWYLSLAAVGLFSIFLAMYFIFGNPLHYKVIEKDTNEYLHTIKGYKQKEIQSIAGKYTPLYNIGYYAEVVYKDEPYFTYSYTYDNNKKIIQDNGILGRHTESFEHLNLNWSLFDQLIQGIHTNLQERGLSEKRDYSIRHVHFIDIDDDKNGAEAYVDFKKDKESDYSYRMNSEGKAYQYSCSNGKCILKEK >NZ_CP053938|1076823:1085558|1078184_1078949_-|WP_001194301.1|DBSCAN-SWA MQTNIHSEKETIIFIHGLVGNRRAFKKEHKRFSTSYNIITYDLLGHGDDKGEAIEFSLQRLVDQLLNLYEKEGIQKAHICALSYGCYISTIFAQMHPEKVLSICHIGGHYNNPSLLYSVFQNFWEKRGDDYSKWLSQYANTIFPSGILKANPFAVISRNIYYRFGLQLHSSIIAQSLRHRLEFDLKSKLKSLPHPILWVMGEHDHLYKSCLFDLKSILPNVLYKEIPLAGHAANLFRPNYFHDLYDRFLNGKLK >NZ_CP053938|1076823:1085558|1076823_1078086_+|WP_000755548.1|DBSCAN-SWA MKKVIAGLAAASVVGVAVPGMDSAQAQVSNEALKEINGQTQTQTTVTETKTVETKSDLKYTVTADVLNVRSGAGTGHSVISKVKQGQVLQVIGQENGWFKVTVNGQTGYVSGDFVTTGGKTGTTVQQGTGTYTVNVSSLNVRTGPSTSHTVLGSVNKGKTVQVVSEVQDWFKINFNGGTGYVSKDFVTKGGSAVSNQTQQPTTNNNTTTVQTGGSYVVNTGALKVRTGPATYNAVIGGVTNGTVLNVTGAENGWYKINHNGRTGYVSADFVKFVKGGVNNVTNNVQQPVKDVQKPTTGGNTSSIAGFARSLNGSPYRTAGTTPAGFDCSGFIHYVLNQTGHKGARQTVAGYWSSKTKTSNPQPGDLVYFQNTYKSGPSHMGVYLGNGQFISAETDATGVRISSVSNSYWSKHLLGYTKAY >NZ_CP053938|1076823:1085558|1084429_1084543_+|WP_002036196.1|DBSCAN-SWA MHWKIEGDGIYMSTIEKWTAVDQYVSDILIPKDSTFS >NZ_CP053938|1076823:1085558|1083593_1084313_+|WP_000818985.1|DBSCAN-SWA MAELLQGKNALITGAGRGIGRAVAIALAKEGVNVGLLARSEENLKAVAKEVEAEGVKAVIATADVSSYEEVTTAIETLKNGLGSIDILINNAGISKFGKFLELDVADWEKIIQVNLMGVYYATRAALPSMIEQQSGDIINISSTAGQKGAPVTSAYSASKFGVLGLTESLAMEVRKHNIRVTALTPSTVATDMAVDLGLTDGNPDKVMQAEDIAEFIVAQLKLNKRTFIKSAGLWSTNP >NZ_CP053938|1076823:1085558|1079189_1080950_+|WP_000453764.1|DBSCAN-SWA MEVRDEIKKKGNWRQFLRLIQDTKPPKGILVFALLMSLLSTGASLFIPMLTKGLVDNFSLSSISTGQIVGLVAFFIMQTIAAGLSIYLLNYIGQKIVAGLRERLWKKVLILPVSYYDQNRTGDTISRMTNDTGVVKTLISEHLSNLLTGGISIVGSLIVLFVLDWKMTLLLLTVIPLSVLILVPLGRKMYKISKALQDETASFTSVLTQVLSEIRLVKSSNTEKREYETGNKGIEKLLQFGLKEGKVQALISPVMSFVLMALLVIIVGYGGMRVSSGALTTGELVAFILYLVQIIMPMSQLSMFFTQFQKAIGATERIYTILEYEVEDHETGVNVTNAKQPIVLENVYFEYNEEEQVLKNIDFTIESGKVTAIVGPSGSGKTTLFSLLERFYEPTTGAIKLGEEPITAYSLPSWRRQIGYVSQDSPLIDGTIRDNICYGVEGEVTDEEIEKVAAMAYVDAFIHDLPNGYATEVGERGVKLSGGQRQRIAIARALLRNPQILMLDEATSSLDSKSESVVQKALNNLMKGRTTLVIAHRLSTVVDADKIIFIEKGNLTGSGTHDELLRTHDMYREFATQQLKIKEAAL >NZ_CP053938|1076823:1085558|1081712_1082786_+|WP_001231492.1|DBSCAN-SWA MRKRERMSKFKMLKVTGAIIALFSFLTIIWSTAFYVSSSILDALAIHLSPFVTYLISDILSFIFMILLWILIAVLMRPKREAMIWTIIEPIQKIAKGDFSVKIRNEEKYDGEIGVLVKSINDMTDELNAMEKMRQEFVSNVSHEIQSPLTSIKGFARALQDTNLPEEKRKHYLTIIETETTRLSKLSQNLLKLTLLESEEYTPERVTYRLDQQLKQIVLNSEPLWAEKEIELDLDLEKVHITADQESMSQVWINLIHNSIKFTPSSGTISIKLKEYETLVEVRIRDTGIGISEEQKQHIFERFFKADSSRNRAYGGSGLGLAIVKKVVDLHQGEIKVESEEGNGTEFIVCIPNYEEK |
9 | Bacillus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1377211 : 1384313
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053938|1377211:1384313|DBSCAN-SWA ATTACTTTTTAAAAATTTCTCTTGAGATACTGTCCTTAGCGTGTATACCACCTTGATGTTCATCAGGGTATTTAGCTGGGTGCATATTCCACCATTCATGTTCTCCGCCATGTGCATTTTCAATAAAATGATGTGCATCAAATGGCTTATCAATTCTCCGTGATACTTTACCTCTTCTAGAAATAACTTCCTCCGTATATGTAGGCCATGTTTGGCCTGTTTCTTTTTCCCATTCAGCTATCAGCTTATTTTTTATAGTATTGAACTCAGCCCTTCTTTGATCTACTTCTTCCTTGCTTAATCGTTCATAAGCATTCTTTTCTAAAGCTTCCTGAAGCAATTCTCTTTGATTTTCAGGGATTTTTCTGTTTGTTATTTCTTCTACTTGGCTAAGATATTCTTGGAATCTAGGTGTATTTAAATTACCAGGGTCAGCAAACATAAATGTATTACGTGCATCTTCTAAAGAATTAAAAGAAGTTTTTGGAATATCTCTAAACTCACTAACGCTAGCATATGCAAAGCGATCTCCCATTTGCAATTTATTCGTAAAATGCGAAATACCTTCTGAGAATTTTGCTACACTCGCACCCTTTGCGAGTGTAGTGACTTTGCTTATTCCTTTATCACCAATAAGTCCTAAACCAACTTGAGTTAAAGCATAACTTCCCCATTTTGCACGACTTTCTGCGTCACCATTTATTACATCATTAATAAATGAATCTGACAATACATTATACATGGTACTAAGGGTATCAATAGGGTGCAGGGCGGCATTCCCCATGTTTTCCCACGTCTCCCATTTACCAAGTGCCTTAAAGCCTTCTACTGTATCTTCAACAGCTTGTCCCGTACCTTCTACAATACCGTCCCACACCTTTTTTATTGTAGATTTTTCAGGGGGTTTACCACACATTGCACCTTCTTCCATTGTAACATCTTGATTATCTGCATTGCGGAATTTTTCAGCAATCCGTTTCAAGTCTTCTTCTACTTTTACAAGTGAATTAATAGATGTAAAAGCTTTTGGTCTCGCATCATTGAACATTTGAATGAACTGTTGATTAGAGGCACCAATCCATTGAAAACACAATTGATCTATTTCGTTACATAAATTATTATGTATAGATTCTAATGCGATTCTGGTATTATTTGCACGATTAGCCACTTCTTCTAGCATTTCAGGTGTTACTTTGATTTGAACCATTTTTTTCCTCCCTTTCCCAATTAAAATTATGAGATAAAAAGAAAAAAATGTAAACATGGAAATTTTAGATTAGTATAATAATATTTATGTGAAGTAAAATCTGTTTAATTATAAATAAACCCTATGTGTACGTGAAGTAAAAAGAGCCGCCCTGTTGGGCAGCTTTTTTAATATCTATCAATTATTTTCTTTTAATACCTATGAATAATGAATCATAGCCTTTTGTTTGAGGACTTGTGCCTAACTCGATTTGGTATTTCCCTTTATCTAAGTAAGTGTGATAATCTCGCCCTCTTGCTTTTTGGGAAGGCATTGCTATAACATCATTAATTTCTTTATCTAGATTAAGATCTGAATTTATTAAAGTAATCCAACTTTTTGCTAATTCAACAGTTGCGTTATCAATTATAAACATAATATAGAAATCATGTTCATTTTCACCTTGTACAAAGAACTGTCCTTGTCCTAAATCATAAACCCTTCCCAAATTAGGGTTAGAAGTACGTAACTGTACACTTTCAGGAAGGCCCATACTACTGACAGATGCGCTTTCGTATTTATAATCTTCATTATATTTCTTGTTTATCTTTGTAATTAGATTTTGCGCTTCATTAGATACAGATTTTTTTAGCACCGGTGAAGCATTTTTCCAATTGTTACTGTTGTAATAAAAATCATTTGTAATCATAGAGCTAGGGATACCGAAAGGTGTTAATTCAGGTTTAACTTCTACTGTATTCATTGCATTATATAGAAATTGTGCATACTGCTCACGAGTTACAATATTTTTAGGTTCAAATAGATTATCTCCTGTGCCAGCAGCAATTTTATTTTCTTGTAATGCACTAATAGCATTTGTCGCCCAGTAATTTTTATCTACATCTTTGAAAGTGGTAGTAGATGTCGCTTTGAAGTTAAAAGCCTTTGTTAATACAACAGCTAATTGTTCACGTGTTAAAACATTATCTGGACCAAATTTTCCATCGCCAAAACCGTTCATAATACCTGCTTTACTAAGACTTAAAATTTCTTTTTCAAACATATGTCCTTTGACATCAGTGAAAGGATTTGGTGCATTATGTTCATCTGCTGGTTTCAAGTAGGCATATATCAGTCTAGCTACTTGTCCTCGTGTGATATTATCCCCAAAACCAAACATTCCGTTTCCATAGCCAGCCACAATATTTTTCTCTTTTAAACCATAATTGCATTATAAGACCAATGATCTGAAGGAACATCGCGAAATCCAGTCTCAGCTTGTGCGTTTGTTAAAGAGGTAAACGTTGATGTAGCAAGAACAGCGCCTGCTAAAATAATTTGTTTGAATTTCATTAGTGAGCTCCTTGTAATTAATTTTTTACAAATTAATTACTTATTTTATTAGTAAATTTAAATATAATAATTAATAGTATATTTGTGTTTGTAAATTAAATCAATATTTAGTTGTAAATGGATATTGAGATAGATGTTATAATTTAAAATAAAGAGATGTAGCGATGTAAAGGAGAGGGACAATATGAAACAAAAGATTTCAAATGTCACAGGAGAAATAATTTTATCTTATAAAGAAAATGGCTATCAAGTAGTACTAGATGAATTTAAACATGCAAAATGTATTAATATTGTGACTTATAATATTAATACATATGAATCTAATTCGGTACTAATCAAAGAACTTAGAAAGTTGAATAAAACTACAAAGATAAACATTATCTTGAATATTCCAAACGGTAGTTACGTGAAAAATTTCAAAAATAGGATAGACCAAAAAGAGTTTGATAAGGTTGAAAATTAAAAACGCTTTGAGTGTTTTGGAACAAGAGAAATTCGGAAATTTAGAAGTGTATATCAATCTTGAGAATCACGCAAAATTAATTATGACTGATCACATCGCCTATATTGGTTCACAGAATTTTTCTGATGCTAGTGAAGGTAATTTTGAATTAGGTTTTTTAGTAAAAGATTCAAAAGTAATCAGAGACATTGAGAGAAATATTTTTGCAGAAATTAAGAACAAATCAATATACTGTATCATTTCTGAATATAGGGCTACAATGGAAGAGATATCTGTAAAATTGGCAAATAAGTTACAAAATATTCGAGAAGATATTTTAACATGGGTTGGAGATCCACCTTTTACTTTTAGGCAAGAGGTCTTTTTTATTGATGACGCATATTTTCATAAAGAAAGATGGGAAGAATTTAAGGAGTTTCACTCTGAATTTGAAGTTATAACCGAAAAACTAATAGATGAGTATCCTTCTGAATTTAATAAAGAAAGCGCAAGGGAAACAGTAAAACATTTAAGAAAACTAGTAAAGCTACTTGTTTCTGAATTGGACGAACTGGCTAAATTTAAAACAAATCAAGAAGAGAGTATGATGTGGGATAAGTTTCATCAACTTGATGTGGGTGAAAATATGGAAGAAGCTTTAGAAGACGCCCGATATTATGTAGAAAATTATAAAGAAAAGAATTACCGAGAAATAGAGTATAAAGGGAAAGAGTTAATTAAAACATTTGATTATATAAAAGAATCTATTCAAGGTATTGAAACAATTGTTGATGAAATAAAGGATTCTATGATTAGAAAAGCTCTCAATCAAAATATAGAGAGAATCTTACAAGATATAAAAAAACAATAACAAAAAACGACTGTAAAAACGGTCGTTTTTTTTATGACTTCATCATATGAATGAGCGCTTCACCATCAATGAGCTCAATATTTTTGTTCGCAGCATATTGCCTTGCGTTCTTATTGAAATTACTCAGTGTAACGAAATATCCTCCAACTGCATCACCATCAATAATAGCACTATGTAATTTTTGAATGTATGGCCTTCCGATAGATTCTTTTGTATATCTTTTCACTTCAACAAATTTCACTTCATCGTCTTTCCAAAGGATAATGTCTTTTCCACCATCATTAGAGCCAGGGGTAACTTGTGCTCGATACCCAAGAGAATTAAACAAATCAGCAATTAAGTATTCAAAATTTCGTGGATCCATTTTCTCTAGATATTCACGATTAGCCTGCTCTCTTAAGTGGTTCATACGAATTTCCTCTTCTGAAACTTGTGGTGCTTTAAGGATAATTCCTAATGCAAAAACGACGACCAATGAAAGAATAGCCCAAATCATACAATTCACCTCAGTATGAGTATAACCAGCTTATGGCTATTCTATTTCCTCTTCAATCCAAATGTCTTCTACAGATAAATCAAGTGTTTTTGCAATGCGCATTGCAACTCTCAATGTTGGTTCACTTTTTCCTCTTGCTATTAAGCTAAGTGTTTGGTCTGTAATACCTACGATTTTAGCGATATCGGATTGCTTTATCATTCTCTCAGCCAAGATTACTTTTAATTTGCATTTCATAAATTTATCACCGTCCTAGTTTTATTGTTCAATTTAAATTTTAAAAAACCTTTTTGATTTTTTATGGTGGACAAACAAGATTTTTAATTTTAGGTCATATACCTATATCAAGACCACGAGGAATACCAAGTGGAATCAAGGACAACAGGAGGGGAGAGGGCGCGCATGCGTTGGCAATATTCACATTTAAACGAAACGCCTTACCTGTATCCATCGAAGGAATTAAGAAAAATGTATAGAGATTCTAATGGTAAAAAAGAAACAAATGCGATAGTGGACCACATGGAAAGATATGAGGTTTTTAACAATCGTGAATATAAAGGCTATTACCGTTTATCGAACGATATTATGGATGATTTATATGAAGATGAGGACGAAGTGCTTGATTGGGGAGATGTCATTAATGAGTATCAACCGGTTATGACACCGAAGGGATTACAACTCATTAGAAAAGAGGGATTCAAATGACAATCGTTGGTGAAGCGGTAATAGTATGGACGGCAACAGGCTTGTCAGTGATTACAATGAAAGTTGCAGAAAAAATGGGGCTGAGTGTTCCACATTGGCTTCCACGTATGACCATGTACACAACGCTCACAGGCTCGTTCTTGTATCTTCTACGTTATGTGCTTTTCGCGTTTCTATAAGGGAATATCAAACTGGAATTGTAGGACATTTACTGGTCATTGATATAAAACATGTACGGGATTCTTCCAAAAATAAGGGATATATACCCTTTATAAGGGTATATGGGGAGTGGAGAAAATGATTGAATTATTACTCGTTCCAGCTGCAGGTTTGACAGTGGCATTATTCGGTGAAAAGTTCAAAAGTAAAAATGATGATAAACGAAAGATACAGGTGTTCTTTGAGGTAGCTGGAATTGCAATTAAAAGAAATAATGAAGAAAAATTGCAATATCCAAAATTTCAAAAGCAAATTGATGATGATCGTAGTACGACTTATGTATACACCTTACCATTAGGTATGCCGAGTAAAATCATACAGAAGGTGGAGGATGTAGTTTCAGAAGGGCTAAATAAACCAGTACGTATTCAGTACGATAATTATAAATTGAACATTCGTGTATTCCGTAGAGAAATACCGAAGAATTGGTCATGGTCAATGGATTTAGTAACGAAAGGGAAATGGTGTATTCCAGTTGGCCAGAGTTTAGAAACAATTGTTTATCATGATTTCGATGAAACACCGCATATGGCTGTAGGGGGATTGATTCGTATGGGGAAAACAGTCTTCCTTAAAAATATGTTCGCTTCCTTATCATTAGCAAATCCTGATCATGCTCATTTTTATTTGATTGATTTAAAAGAAGAAGGACTTGAATTTAGTGAATATAAAAAACTGAAACAAGTCGAACAAATCGCAGAAACTTCAGAGCAAGCACACGGCATGCTGCTGAAAGTGATGGAAAAAATGCATGAACGTGGGAAGTACATGAAAGAACGTGGTATCAAGAATATTGTTCACACGAAAGAAAAGGATCGGTATTTTATTGTAGTGGATGAAGGGGCAGTACTTGCACCTGCAAAAGGGCTACCGAGAGCTCATAATAAAATGCTGGAAGAGTGCCAATACATGCTAAGTCACATCGCACGTGTTGGAGGGGCACTTGGGTTTCGTATTGTCTTTTGTACACAATATCCGACAGGGGACACATTGCCGAGGGTAGTCAAACAGATGGCAAATGCAAAACTTGGTTTTCGTTTACCAACTCGTACCGCATCAGAGGTTGTTATTGATCAGTCCGGATTAGAACAACTACCATCTATTCCAGGAAGAGCTATATATATGAAGGAAAGATTCACCGTACTGCAAGTGCCGTATATCGATGACGTGGTTATGTGGAAACATCTAAAAGAATACGAGGTGGAAAAATATGAACATCCAGAGCCATATGAAAATCAACCGTCAGATGGCGATACTTGCGACGATTAGGAAGTTGCAGTTTGCAACGAGAAGACATTTAATGAGTGTGCATAATATGGGTGGTATACGTAATGCAAACCGTATTTTGGGAGATTTAAAACCATACGTGAATAAAACGATGCAAGGGAAAGAATACGTGTATTATCTCAATAAAGAAGGGCACGCGATGTTTGGTGATGATGGTAAGGTTGTTTCGAGAGGGAAGCTTGCACATGCGTTATTACGGAATGAAGCATGGTTACATTTATTTTGTCCAGATGACTGGCAGATTGAAACGGATATACGTTATATAAAGAATAAAGAGAAAATGAAAATAGTTCCGGATGTGAAGTTTCGGGATGAAGAAAATATACTTCATGCAGTTGAGGTAGATCGCTCGCAGAAAATGAAAGTGAATGAAGAGAAGATAAAAAAATATGAAGAGTTTACGCAAATTTATAAACAGAAGCATAACGGGAAAATGCCAGTGATTCATTTTTTTACAGTGACGAAATATAGAGAAAAGAAATTGGAAGAGTTAGCTGCTAAATATGATGTTCTTGCGAGTGTGTATGTAATAGAAGAAATATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053938|1377211:1384313|1382560_1383751_+|WP_000571537.1|DBSCAN-SWA MIELLLVPAAGLTVALFGEKFKSKNDDKRKIQVFFEVAGIAIKRNNEEKLQYPKFQKQIDDDRSTTYVYTLPLGMPSKIIQKVEDVVSEGLNKPVRIQYDNYKLNIRVFRREIPKNWSWSMDLVTKGKWCIPVGQSLETIVYHDFDETPHMAVGGLIRMGKTVFLKNMFASLSLANPDHAHFYLIDLKEEGLEFSEYKKLKQVEQIAETSEQAHGMLLKVMEKMHERGKYMKERGIKNIVHTKEKDRYFIVVDEGAVLAPAKGLPRAHNKMLEECQYMLSHIARVGGALGFRIVFCTQYPTGDTLPRVVKQMANAKLGFRLPTRTASEVVIDQSGLEQLPSIPGRAIYMKERFTVLQVPYIDDVVMWKHLKEYEVEKYEHPEPYENQPSDGDTCDD >NZ_CP053938|1377211:1384313|1381093_1381558_-|WP_000637735.1|DBSCAN-SWA MIWAILSLVVVFALGIILKAPQVSEEEIRMNHLREQANREYLEKMDPRNFEYLIADLFNSLGYRAQVTPGSNDGGKDIILWKDDEVKFVEVKRYTKESIGRPYIQKLHSAIIDGDAVGGYFVTLSNFNKNARQYAANKNIELIDGEALIHMMKS >NZ_CP053938|1377211:1384313|1382259_1382442_+|WP_000156980.1|DBSCAN-SWA MTIVGEAVIVWTATGLSVITMKVAEKMGLSVPHWLPRMTMYTTLTGSFLYLLRYVLFAFL >NZ_CP053938|1377211:1384313|1381960_1382263_+|WP_001267637.1|DBSCAN-SWA MRWQYSHLNETPYLYPSKELRKMYRDSNGKKETNAIVDHMERYEVFNNREYKGYYRLSNDIMDDLYEDEDEVLDWGDVINEYQPVMTPKGLQLIRKEGFK >NZ_CP053938|1377211:1384313|1383728_1384313_+|WP_009879021.1|DBSCAN-SWA MAILATIRKLQFATRRHLMSVHNMGGIRNANRILGDLKPYVNKTMQGKEYVYYLNKEGHAMFGDDGKVVSRGKLAHALLRNEAWLHLFCPDDWQIETDIRYIKNKEKMKIVPDVKFRDEENILHAVEVDRSQKMKVNEEKIKKYEEFTQIYKQKHNGKMPVIHFFTVTKYREKKLEELAAKYDVLASVYVIEEI >NZ_CP053938|1377211:1384313|1377211_1378417_-|WP_000249923.1|DBSCAN-SWA MVQIKVTPEMLEEVANRANNTRIALESIHNNLCNEIDQLCFQWIGASNQQFIQMFNDARPKAFTSINSLVKVEEDLKRIAEKFRNADNQDVTMEEGAMCGKPPEKSTIKKVWDGIVEGTGQAVEDTVEGFKALGKWETWENMGNAALHPIDTLSTMYNVLSDSFINDVINGDAESRAKWGSYALTQVGLGLIGDKGISKVTTLAKGASVAKFSEGISHFTNKLQMGDRFAYASVSEFRDIPKTSFNSLEDARNTFMFADPGNLNTPRFQEYLSQVEEITNRKIPENQRELLQEALEKNAYERLSKEEVDQRRAEFNTIKNKLIAEWEKETGQTWPTYTEEVISRRGKVSRRIDKPFDAHHFIENAHGGEHEWWNMHPAKYPDEHQGGIHAKDSISREIFKK >NZ_CP053938|1377211:1384313|1381594_1381795_-|WP_000649834.1|DBSCAN-SWA MKCKLKVILAERMIKQSDIAKIVGITDQTLSLIARGKSEPTLRVAMRIAKTLDLSVEDIWIEEEIE |
7 | Bacillus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3916283 : 3961190
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053938|3916283:3961190|DBSCAN-SWA TTTACAGTTGAAAATTTACTAATAAATAAAATAAATTGTTTAATACATGAATTCCAATTGGAACGAGTAAATTATTTGTTTTCTTATATGTATAAGCTAGGCATATACCCATACCAAAAATATATAACACACTAGCTAAAGTAAGGGAATGCCCTAAAGTAAATATAAACGCACTTATAACAGCACCAATAAGTGTAGAAAAACGCTGAGATAATTTCGTAAAAAACATACCTCGGAATACAATTTCTTCCCAAACAGGTGCAAAAATTGTAAGCACAACTACATATAGAATTAGTTCATTTATAGTAGGCTCTATTACTATATTAGACTCATCCATACTAAATTCCGTTGGTAAAACTAAATTTAATACTGCGAGATATATAAGCAGTACAATCATCGTCATTACTATCGTTACATAATGTTTAAAGTGATTGAACTGTATTGATTTTAATAACTGCAAACAGTAATTTCTTGCTGGCGCATATATTAAAATAATAGTAAGAAATGTTAAAGGCGGAATAAGATGATCTACATACCACGGATATAATGAGGAGTCATATAAAAAGTTCAAATAACCAATTCCGTACATGATCCCAAAAATAATTACTATCATGCTGATTACTTCTAACATACTCATTTGTACATTCTTTTCTTTATATGTAACTAATTCCGTGTCCATCTCATCCCCTCCAGTATAATTAAACCTTTTTAACTATTATATTCCAAATTAAATATAAAAAAAGACAATACACCCAACTGTATTGTCCGTTTTCTGCCCTACCATTTCTCTCTGCATGTTTCAATTAAATGCAGTAAGTACCTCTTCGTCATATCTGCCCTTCTCCACCTTGAGAGCATTCTCTTTTCTTTTGGGTTCTGCCGTATTCTCGCTACTTCTTTTAATAAAAGCTCCCATTCTTCCGATGAACGTTCTAATAAGTATTGTAATCCTCTATCTTTTGAAACGATTGTTTTATAATTTAGTGTATATAAAATGCGCCCCATCGTAACAACCGCTGATTCTACCCATTCTTCTATAAAGAATAAATATGGCTGCTTCGCCTTCCCGCTCCAGTACTGTTCTACGTTGTATTTCATCGTATTGACTACATCATCCCACCTTATTTGGACCGAAAGTTCTTCTGCTTCTTTCCCGATTACTGTAATACCTTGATTTTTCAATGTCCACCATGTGACCGCATTAATATCCCAATGACCTACATTCGCTTTACCATCTGCACAATACACGTACTCATTCAGTTCATCATTGTATTTCCCTAAATCAGCAAGTGGAATATACATACCATCCATTCTTTTCCCTAACGTACTACCACTAAGTTTCTTATGAAGTTCTACAAGTTGCTGTTTTTCAGCTTTATTCACGGAATCACTTATTACCGTAACAAAATCAACATCGCTCGTTTCTGCATGAAATGCACCGAGTGCGATGGATCCGTAAATATATACGCCAACTATTTTTTCATCTAAAAAAATTTCTTTTAACCCTACTATGTACTGCTCCATCAACTGCTCTACTTCTTTTGGTAACGCATGCTTTACTACATTCTCCACATCTATCCCTCCAATAAAAAAAGCCTTTGCAAATTCGCAAAGACTTCCTGCTTTATAAGTATTTCTCGATTTCTTCGTAAACATCCTTCAAACGAGGATTTCCTTCTCCAACAATTTCTCCATTTACAAGAACGACCGGGTAAAATAAATCTTCCTCCACTACGCGCTCTGCGAATGCTTTTTTCTCTTCATCTTCTTGTTCTTCTTGAAAATCAATATACTCGAAATTAAATTTATTTTCTTGTCCTTCATATTTACGACCAATCGCCGCTTGTAACCACTCAAATGTTTCTGTTGAAGATGGCATTCCAACGCAGCTCGCACAAATTACTTTCGTCCCATACACTTGCACATTAACCATTTCTTCTCCCCCACTTCTTGTTCTAACAGTATATTCAGATACCTTATTACATAAGCACATCATTTTACAAACTTATTCCATACCCCTATACTGAAAAAACACGTTGTAAACATGATAAAAAATTTCGGCAATAAAACAAGAACAGAAAAAATAGATTTTCCCCTCTATCTTGATTATAATAAAACTGATGAAAGGAGTCGATAAAAATGGAAAACCCACATATGCAAGAACAAGTACTAGAAGTATTAGATAAATTACGTCCATTCTTACTTCGCGATGGCGGAGACGTTGAGTTAGTAGACATTGAAGAAGGTATCGTAAAATTACGTCTTATGGGTGCATGCGGAAGCTGCCCAAGTTCTACAATCACACTAAAAGCTGGTATCGAGCGCGCATTACTTGAAGAAGTACCAGGCGTTATCGAAGTAGAACAAGTATTTTAATCTAAAAGCAGAAGCGGCTCGTTCAAAATGTGAGGGGGATGGAGCTTCTGACATAGAGGCGCTTTTTGCCTCGGCGGAAGAAGCGAAGCCACCGAACATTTTAGCCGCTGGAGCTAGATATTATCTAGCGGCTCGTTCAAAGTCACTTGCTAAAAGGAGACCAAATTTGGTCTCCTTTTTTTATTTAAATAACAATCATCCGTTAACATCATAAAACAAAATTGGAAATCCTTCTCAAAAAATGCGATAATTGATACTATATAGTGAATCGTTCACACATATACAATCAAAAAAACATAGGGGGACGACACATGCCAAAAATGGGGAACACTTTTTTAACAATGCAAGAACTAGAAAAGAAAAAAGAGTATTTATTAGACCTTTCATCCGTTATACCGACATGGAATGCGAGCTACCAATTTTTATTTAAAGAAATCCAGCAAGAATTATTGGGTAAAGTAAATGAAAAACTCGAAAAACATCAATTCATTTTAAATATATGTGCAGAGCAACAAGTAGGGGCATAATCTATTACATACAGTTGTGGTATATAAAAAAGAGACCTCACTCGGTCTCTTTTTTATATTTTTAAGATAACCAATCTAATTTTCTAATCCCGAGCTTATCAACTGGTAAACGAAGTGAGCTATAAAAATGCTTCATAAATTGCTCTGAGCGGTTCACATCGTGTAAAATGACTTCTAAGCGATCTCTATATATGCTTTTTTGTTCTTCGTTTCCTGTTTGGTAGTACCGTTCAACTGTTTCAAAATAGTAAAGCGGGAACAAGAGCCTTGCAAATAATAGGCGCCAACCAAATGAGGATAGCGAATAATTTCGTTCGTAATCTGTAACAAATTGAACGATTGTTTTCTCCCAGTCTTTCTTTTTTTCAATCATCATATAACGGATTAATTCTGCTATATCTCGAGTTGGGTGATCATACACCCAATCAAAAGGGAGTTTGAGACGCTTCGTTTGATGCCATAATAAAGGTGTGAATCGTTCTTGGCAAATTGTTGCTGCATCAGTTAGTTGCGGCGTATCATCCATTTCTGTATCAACAACATATTGAATGGCATTTTCTGCAACCCCTAAGTAATACGGGAAGGATTCAATAAACAATTGATCGAATACGTCTGTAGGGTGGTTCATCACTTTTGATTGCCAAAACTTTTCTAATTGATCGAGCCTTTTTTCCCATAATGCTTTCCATTCACCAATGCGGCTTAGTTGCTCAATTTCTTCTGGAAAGAATGCACCTCGTTTATGGAATATAGAAAGCTCACTACCTAATGATATAGCATGTCGTTCTAACGCTCGCATACCTTTTAATAAGCAGTAATTTTGTTCTTCTATCTCACTTACATAGTAGCCGTGTATAGTTGGAACGAAAGTCGCTACAGTTATATCCCCTTGCTGGTTCATATAGTCACTGAGCTTTTTCATCTCTACAAGTACTTCTTCCTCCATTTCTCCAATTGGAACAAGTACATAAATTTTGTTGCGAATCCAAAAGCTTTTATAGGGGCCAAGGGGGATTAATTCTTTAACATGCATATGATAATGCTCATAAATATGATGAATCATCGCAGTCGCCACCTATGGTTTTTCTTTATATATATGAGCTTGTGCTCGCCTTTCATTCCTATGCACATGATAAAGCAACGAAACGTATACAAATACTAAAAAGAAAAAAAGGTGATAAACATGAAAGAATCAAATCAACTACAAGAAAAAGCATTACAACTATTACAAGAACGCGGTGTAACAATTGACGATATTGCTGAACTTGTTCATTTTCTTCAAAAAAAATATCATCCAAATTTAGAGATGTCAGAATGCCGTTATAACGTTGAGCGTGTATTATCAAAACGTGAAGTACAAAACGCACTAATTACTGGTATCGAGCTCGATGTCCTTGCTGAAAAAGGAATGTTAAGCGAGCCGTTACAAGATATTGTAAAACGTGATGAAGGCTTATACGGAATTGATGAAGTGATCGCACTTTCTATCGTTAATGTGTACGGCTCTATCGGTTTCACGAACTTTGGATATATCGATAAATTAAAACCTGGTATTTTAGAATACTTAAATGATAAATCGTCTGGAAAAGTGCATACATTCCTTGATGATATCGTTGGCGGAATCGCTGCCGCTGCTTCAAGCCGTTTAGCGCATAGAGCTGAGCATTCGGAATAAAATATGAAAGACCGTCAGTGTCATACTGACGGTCTTTCGTATTCCATGAGCATAAATTCTCTTCCTCGGCTCAAAAAAATAGGTCCTTGCTGAAAACCTATGTTTTTATATAGCTTAATCGCTCTTATATTAAATGTCGCTACGCTAAGGCGAAACGTTTGCGGCTTACATTCTTTAACAGCAAACGCTATCCCAGCTTGCAAAAACATTTTCCCTAGCCCTTTCCCTGTTAACGCCGGCTTCATGCCAAGTCCGATATCCATTACATCTTCTCCACCATATAAATGAGCATCTCTTCCCCCTGGCACTTGTGCATTTTCCCCAAAACAAAAATAGCCGATAAACTCTCCCTTATCGTCACAACAACCATAATACGTCCCATCTAATAATTCTTCTATTACTTCTTCCTCGCCTGAAAAACT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55 | Planktothrix_phage(25.0%) | transposase,coat,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
4384636 : 4438385
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP053938|4384636:4438385|DBSCAN-SWA 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50 | Streptococcus_phage(15.0%) | protease,transposase,tRNA,integrase,holin | attL 4411163:4411180|attR 4440987:4441004 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
4703630 : 4711579
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053938|4703630:4711579|DBSCAN-SWA 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GCAGCGTTAACGCACTTCGGAGATATTTTCACTGTTCAAATGGGGATTGTTATTATAACGTTCTTCTTTATCGATTTCTTTGATACAGCAGGTACACTTGTAGCGGTTGCGAATCAAGCAGGATTAATGAAGAACAATAAATTACCACGTGCAGGAAAAGCGTTATTCGCAGATGCAATTGCAACTGTAATTGGTGCAATCTTAGGTACATCAACAACAACATCTTACATTGAGTCGTCTGCAGGGGTAGCGGCAGGTGGACGTTCTGGTTTTACGGCAGTTGTAACAGCAGGATTCTTTTTACTGGCATTATTCTTCTCTCCATTATTAAGTGTTGTAACGCCAGCTGTAACGGCGCCAGCTTTAATTATTGTAGGGATCTTGATGGTTTCTTCTTTAGGGGAGATTGATTGGAAGAAATTCGAGATTGCAGTGCCAGCATTCTTTACAATCATTTCAATGCCACTTACGTATAGTATTGCGACAGGGATTGCGATTGGGTTTATCTTCTATCCAATTACAATGGTAGTAAGTGGTCGTCGTAAAGAGATTCATCCAATTATGTATGTTATGGGAGTTTTATTCGTACTATATTTCATCTACGTTCGTAAATAAAAGGGGTTTTTTGAAAGGTCTAGACTTAAGGGGAGTCTAGGCCTTTTTTGCGTCTTCAGAAAAACTTAAGGATTTCCGAGCGTTTTTCTTCAGAAGTTTTCCTATAATAGAGGTTAGGGATTAAAAAGTAATGGGGGAGATATTGTGGCACACGAAACAATACTTGTCGTAGATGATGAAAAAGAAATCCGAAATTTAATTACAATCTATTTAAAGAATGAAGGATATAAAGTATTGCAAGCAGGAGACGGAGAAGAAGGATTACGTCTCCTGGAAGAAAATGAAGTACATCTAGTCGTATTAGATATTATGATGCCGAAAGTAGACGGCATTCATATGTGTATGAAAGTAAGGGAAGAAAAAGAAATGCCAATTATTATGCTTTCAGCGAAAACGCAAGATATGGATAAGATTTTAGGATTAACAACGGGTGCAGATGATTACGTAACGAAACCGTTTAATCCGTTAGAGTTAATCGCAAGAATTAAATCTCAGTTACGCCGTTATATGAAAATGAATGGTTTCGCTATACAAAATGAGGACGAGCTAGAGATTGGGGAGATGAAAATAAACATATCAACCCATAAAGTCATTGTAGAGGGAGAAGAAGTGAAATTAACTCCGAGGGAATTTTCAATTTTAGAATTGCTAGCCCGTAATCCGGGGATGGTCTTTAGCGCGGAGCAAATTTATGAAAAGGTTTGGAACGAACGATCTTTCCAGTCGGATAACACGGTAATGGTGCATATTCGAAAAGTACGTGAAAAGATTGAGGAGAATCCAAGGAAACCTAGATATATAAAAACGGTATGGGGAGTGGGGTATAAGATTGAAAAAGATATTTAATCCTTTTACTTATGTAAGGAAAATTCGAGAATTAATCGGAAAGATAATGAAGAGCGTGAAACGGAGTATACGGATTCAACTTATTACGGCTTTTACTGCTTGTGCGTTATTAGGTCTCTTTGTATCAACGAAGATAGTGGCGCCTGTTTTTGAAGATGCTAGCCGACATGCTGAGATTAATTATAGAGATGGTATGGAACAAATTAATCGTAAAGCACAAAGTACTGCGGAAATGATGGTTGATGCAAATGAATTAGATGCCGTACAAAGTATGATAGAGCTAGAAAATGAGCATTTAGAGCAGGGGCAGGATGCTTTTAAAATATTAGTTACCGATGAAAACGGTAAGGTTTTGTATAAAACGAAGCAGGCGCAAGAAGAACAAATTAATTTGCATAATACAATTCGTAATGCAACTTCGTTTGCTATCAATTATTCGAATAATACTGATATTGAAAGATCTAGAAAAGAGTTTATTACTTTCTCACCTATTACAATTGAAGATAAAAACTTGTATATGTTTGTGAGCGGAATTCCTCAAGGGGAAGTAGTATATTATAAAGTAGAAGGACCATTTCCATTTTTAATTGGTGTACTTGTATTCATTTTCTCTTTCTTCTATATAACAAAGAGAAAGATGAAGCAAATTGAAGCGATGGCACAAGGTGTAAAGGAAATAGAAAAAGGCAACTTAGCGTACCGTATAGAGAAGAAAGGTGAAGATGAGATTGCATCTTTAACAGAAAATATTAATAATATGGCAGAAGAGCTTATGAATAATATAGAAAAGGAACGTAAGTTAGAGAAGCAAAAGAACGAGCTTATTACAAATGTATCTCACGATTTGCGTACACCACTGACTTCTATTATGGGTTACTTGCGATTACTTCGAGATTCTAAATATGAAAATAAAGAGCAACACGATGAATATACGAAAATTGCTTTTGCGAAGTCAGAGCAGTTGAAAAATTTAATAGAAGATTTATTTGAGTATACGAAGTTAACGAATGAACAAGTTGTATTAGAAAAACAAGAAGTATGTGTAAATGAATTGCTCGAGCAATTAATAGAAGAGTTAGTACCGCAGGCAGAAGAGCATGGACTTACGTTTGTTAAGAAGTTTCCTGAGGAACGTGCCTATGCAGCGATTGATTCGGAAAAGATGGTTCGTGTATTTGATAATCTATTAATGAACGCGATTAAGTATAGTAAAGATGATGGGGAGATAAAAGTTTCCCTTCAAAGGCAGCGCCGGGATATACAAATTGTAATTGCGAATCATAGTGAAGAGTTTACGAGAGAAGAGTTAGCGAGTTTGTTTGAACGTTTTTATAAGAAAGATCAATCTAGAAGTAGAGTAACAGAAGGATCAGGCCTTGGATTGGCGATTGCGAAAAGTATTGTTGAATTACAAGGTGGTAGTATTCGAGCTGAATATAAGGATGGTATTATTCAGTTTATCGTCTCGTTACCAATTATAGAAAGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053938|4703630:4711579|4707918_4709244_+|WP_000833093.1|DBSCAN-SWA MKRYFQFDELGTNYKTEFIAGLTTFLSMAYVLFVNPATLSLGNVKGLPAGTGMDPGAVFVATALAAAIGSLIMGIFAKYPIALAPGMGINAFFAYTAVLTMGIPWQTAIAGTLMSGIIFIILTASGIREKIINAIPSELKFAVAAGIGLFIAFLGFQNAGIIVKNDAVLVGLGDLTKGTTLLAIFGVVTTIIFMIKKVNGAVFYGMILTAILGVATGLIDTPKAVVGAIPSLEPTFGAALTHFGDIFTVQMGIVIITFFFIDFFDTAGTLVAVANQAGLMKNNKLPRAGKALFADAIATVIGAILGTSTTTSYIESSAGVAAGGRSGFTAVVTAGFFLLALFFSPLLSVVTPAVTAPALIIVGILMVSSLGEIDWKKFEIAVPAFFTIISMPLTYSIATGIAIGFIFYPITMVVSGRRKEIHPIMYVMGVLFVLYFIYVRK >NZ_CP053938|4703630:4711579|4703953_4705588_+|WP_001029999.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSEEARRSMLRGVDTLANAVKVTLGPKGRNVVLEKKFGSPLITNDGVTIAKEIELEDAFENMGAKLVAEVASKTNDVAGDGTTTATVLAQAMIREGLKNVTAGANPMGLRKGIEKAVVAAVEELKTISKPIEGKSSIAQVAAISAADEEVGQLIAEAMERVGNDGVITLEESKGFTTELDVVEGMQFDRGYASPYMITDSDKMEAVLDNPYILITDKKISNIQEILPVLEQVVQQGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGEVITEELGRDLKSATVESLGRAGKVVVTKENTTVVEGVGSTEQIEARIGQIRAQLEETTSEFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTSLMNVYTKVASIVAEGDEATGINIVLRALEEPVRQIAINAGLEGSVVVERLKGEKVGVGFNAATGEWVNMLETGIVDPAKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVADKPEPNAPAMPDMGGMGMGGMGGMM >NZ_CP053938|4703630:4711579|4703630_4703915_+|WP_000917306.1|DBSCAN-SWA MLKPLGDRVVIELVQAEEKTASGIVLPDTAKEKPQEGKVIAVGTGRVLENGERVALEVAAGDLIIFSKYAGTEVKYEGTDYLILRESDILAVIG >NZ_CP053938|4703630:4711579|4709388_4710090_+|WP_000929888.1|DBSCAN-SWA MAHETILVVDDEKEIRNLITIYLKNEGYKVLQAGDGEEGLRLLEENEVHLVVLDIMMPKVDGIHMCMKVREEKEMPIIMLSAKTQDMDKILGLTTGADDYVTKPFNPLELIARIKSQLRRYMKMNGFAIQNEDELEIGEMKINISTHKVIVEGEEVKLTPREFSILELLARNPGMVFSAEQIYEKVWNERSFQSDNTVMVHIRKVREKIEENPRKPRYIKTVWGVGYKIEKDI >NZ_CP053938|4703630:4711579|4710073_4711579_+|WP_000719242.1|DBSCAN-SWA MKKIFNPFTYVRKIRELIGKIMKSVKRSIRIQLITAFTACALLGLFVSTKIVAPVFEDASRHAEINYRDGMEQINRKAQSTAEMMVDANELDAVQSMIELENEHLEQGQDAFKILVTDENGKVLYKTKQAQEEQINLHNTIRNATSFAINYSNNTDIERSRKEFITFSPITIEDKNLYMFVSGIPQGEVVYYKVEGPFPFLIGVLVFIFSFFYITKRKMKQIEAMAQGVKEIEKGNLAYRIEKKGEDEIASLTENINNMAEELMNNIEKERKLEKQKNELITNVSHDLRTPLTSIMGYLRLLRDSKYENKEQHDEYTKIAFAKSEQLKNLIEDLFEYTKLTNEQVVLEKQEVCVNELLEQLIEELVPQAEEHGLTFVKKFPEERAYAAIDSEKMVRVFDNLLMNAIKYSKDDGEIKVSLQRQRRDIQIVIANHSEEFTREELASLFERFYKKDQSRSRVTEGSGLGLAIAKSIVELQGGSIRAEYKDGIIQFIVSLPIIER >NZ_CP053938|4703630:4711579|4705992_4707534_+|WP_165450126.1|DBSCAN-SWA MLKKQHDTIIVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELHPHTITAEEIKAMNPKGIIFSGGPNSVYGEGALHCDEKIFDLGLPIFGICYGMQLMTQQFGGTVERANHREYGKAVLKVENESKLYANLPEEQVVWMSHGDLVTGLPEGFVVDATSESCPIAGMSNEAKNLYGVQFHPEVRHSEHGNDLIKNFVFGVCGCSEGWNMENFIEVELEKIRETVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEAEGVMKTFSEGFHMNVIKVDAKERFMNKLKGVEDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEASKLEGMDFLAQGTLYTDIVESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRVLGSELGIPDEIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREEITKAGLDREIWQYFTALPGMRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVKHVNRIVYDVTSKPPATIEWE |
6 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
4748706 : 4757083
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP053938|4748706:4757083|DBSCAN-SWA GATGATTAGTCGTTATACACGCCCAGAAATGGGTGCGATTTGGACGGAAGAGAACAAATTTAAAGCGTGGTTAGAAGTTGAGATTTTAGCTTGTGAAGCATGGGCTGAGCTTGGCGATATTCCTAAAGAAGATGTTAAGAAAATTCGTGAGCATGCATCATTTGATATTGATCGTATTTATGAAATTGAAAAAGAGACACGTCATGACGTAGTTGCATTCACTCGTGCTGTATCAGAAACACCAGCATTAGGTGAGGAACGTAAATGGGTTCATTACGGTTTAACATCTACAGACGTAGTAGATACAGCGTTATCTTACATCTTAAAACAAGCGAATGAAATCATATTAAAAGACTTAGAAAACTTCGTAAGCATTTTAGCTAACAAAGCGAAAGAGCATAAATACACGATTATGATGGGAAGAACACACGGTGTCCATGCAGAACCAACAACATTTGGTCTAAAACTTGGTCTTTGGTATGAAGAAATGAAACGTAACGTAGAGCGTTTCAAACAAGCTGCTAATACAGTTCGTGTTGGTAAACTATCTGGTGCGGTTGGTACATATGCAAATATTGATCCATTCGTAGAAAAATATGTTTGTGAAAATTTAGGATTAGAAGCAGCACCAATTTCAACACAAACATTGCAACGTGATCGCCATGCTCATTACATGTCAACACTTGCATTAATCGCAACATCTATCGAAAAGATGGCAGTTGAGATTCGTGGTTTACAAAAGAGTGAAACACGTGAAGTTGAAGAAGCTTTCGCAAAAGGTCAAAAAGGTTCTTCTGCAATGCCACATAAGCGTAATCCAATTGGATCTGAAAATATGACTGGTTTAGCTCGTGTTATCCGCGGTTATATGATGACAGCTTATGAGAATGTTCCATTATGGCATGAGCGTGATATTTCTCACTCTTCAGCAGAACGCGTAATTTTACCAGATGCTACAATCGCGTTAAATTACATGCTAAATCGCTTTGGTAATATCGTTAAAAACTTAACTGTATACCCAGAGAATATGAAACGCAATATGACAAGAACATACGGCTTAATTTATTCTCAGCGCGTAATGCTTACATTAATCGATAAAGGTATGGTGCGTGAAGAAGCTTACGATATCGTACAACCTAAAGCGATGGAAGCTTGGGAAACACAAGTACAATTTAAAGAGCTTGTAGAAGCTGATGAGCGTATTACGAGCAAGTTAACACAAGAAGAAATTAATGAATGCTTTAACTATGAGCATCATATGCAACACGTTGATACAATCTTTGAACGCCTAGGATTAAACGAAGCATAAAATTTCATATGGCACAGAATAGAGTCATTCTGTGCCATTCTTTATAAAAACATTATTCACATTTTTCAAACTACAGGGGGCTTGCGAAATGCAAAAGCTAGAATTGCTGTATGAAGGTAAGGCAAAAAGAATTTATCGTACAGAATCAGCAGATATGGTTTGGGTAGAGTACAAAGATAGTGCGACTGCTTTCAATGGGGAGAAAAAAGAGACGATTACAGGAAAAGGTCGTTTGAACAATGAGATTACAACTTTATTGTTCAGAAAGTTACAAGAAGTTGGAATTAAAACACATTTTGTTGAGAAGTTATCTGAGACAGAGCAACTTGTTAAAAAAGTGAGTATTATTCCTTTAGAAGTTGTCACAAGAAATGTACTTGCAGGAAGCCTTTCAAAACGATTAGGAATGGAAGAGGGAACTGTACTTGCAGAACCAATCGTAGAATTTTACTTCAAAGATGATGATTTAGGAGATCCGCTTGTAACGGAAGATCATATTCGTGTATTAAACGTTGCATCGCCAGAGCAAGTAAGCGTATTACGAGATATGGCTCTACAAATCAATCAAGTGTTGATTGATCATTTCGCAAGCTGTCGTGTAAGATTAGTAGATTTCAAATTAGAGTTTGGTGTAACGGATGAAGGAGCAATCATATTAGCAGATGAAATTTCACCAGATACTTGCCGTTTATGGGATGAAACGAGCAATGAAAAGTTTGATAAAGACGTATTCCGTCGTGATCTTGGAAATTTAACAGATGCTTATGAAGAGATTTTAAAACGTTTAGGGGGAATTTCACATGTATAAAGTTAAGGTATATGTAACATTAAGAGAAAGCGTATTAGATCCACAAGGAACAGCAGTAAAAGGAGCACTTCATAGTCTTTCATTCACAGAAGTACAAGATGTTCGAATTGGAAAGTACATGGAATTAACAATTGATAAATCAGTATCTGACTTAGATAGCAAGGTAAAGGAAATGTGTGAAAAACTATTAGCGAACGTTGTAATGGAAGACTTCCGTTATGAAGTTGAGGAGGTTGTCGCACAGTGAAATTTGCCGTAATAGTATTTCCAGGTTCGAACTGTGATGTCGATATGTTCCATGCAATTAAAGATGAGCTTGGCGAAGAAGTAGATTACGTTTGGCACGATACAGAGAATTTAGATGAATATGATGCAATTTTACTACCAGGTGGATTCTCTTACGGTGACTATTTACGCTGCGGTGCTATTTCTCGCTTTGCAAATGCAATGAAGGCAGTACAGAAAGCCGCTGAGCAAGGAAAGCCAATTTTAGGTGTATGTAATGGATTCCAGATTCTTGTTGAATCAGGATTATTACCAGGGGCATTAATGAGAAACGAAAACTTAAAATTTATGTGCCGCACTGTTCAGTTGCGTGTTGAAAATAATGAAACGATGTTTACATCACAATATGAAAAAGATGAAGTAATCAATATTCCAATTGCACATGGTGAGGGGAATTACTATTGTGATGAAGAGACTCTTAAACAATTAGAAGAGAACAATCAGATCGCATTCCGTTATGTAGAAAATCCAAACGGAAGCGTTTCAGATATTGCTGGTATTGTAAACGAAAAAGGAAATGTACTTGGTATGATGCCACACCCAGAGCGTGCTGTAGATGAATTACTTGGCGGTGCTGAAGGGTTAAAAGTCTTTCAATCTATCTTAAAACAGTGGAGGGAAACATATGTCGTTAATGCTTGAACCAAATCCAACACAAATTAAAGAAGAGCGCATATATGCGGAAATGGGGCTAACAGACGAAGAGTTTGCCATGGTTGAAAAGATTTTAGGCCGTCTGCCAAATTATACAGAAACAGGATTATTCTCTGTTATGTGGTCTGAACATTGTAGTTATAAAAATTCAAAACCAGTGCTTCGAAAATTCCCAACAACAGGTGAGCGTGTTCTGCAAGGACCTGGGGAAGGTGCTGGAATTGTAGACATCGGTGATAATCAAGCGGTTGTATTTAAAATGGAAAGTCATAACCACCCTTCTGCTATTGAACCATATCAAGGAGCAGCAACAGGCGTTGGTGGTATTATTCGTGACGTATTCTCTATGGGGGCACGTCCAGTAGCTCTATTAAACTCACTTCGCTTTGGGGAATTACAATCACCACGTGTGAAATACTTATTCGAAGAAGTAGTAGCAGGGATTGCAGGATACGGTAACTGCATCGGTATTCCGACTGTTGGCGGCGAAGTACAATTTGATCCATGTTATGAAGGAAACCCACTTGTAAATGCAATGTGCGTAGGCTTAATTAACCACGAGGACATTAAAAAAGGGCAAGCGCACGGTGCTGGAAATACAGTAATGTACGTAGGAGCATCAACTGGTCGTGATGGTATCCACGGTGCAACATTCGCATCTGAAGAGTTATCTGAAAGCTCAGAAGCGAAGCGTCCAGCAGTTCAAGTAGGAGATCCATTTATGGAGAAACTTCTTATTGAAGCTTGCTTAGAACTTATTCAATTGGATGCACTTGTTGGAATTCAAGATATGGGTGCAGCTGGTTTAACATCATCTTCTGCAGAAATGGCAAGTAAAGCAGGAATGGGTATTGAAATGTACTTAGATGATGTACCGCAGCGAGAAACAGGAATGACACCATATGAAATGATGCTATCTGAATCACAAGAGCGTATGTTAATTGTTGTGAAAAAAGGTAGAGAGCAAGAAATAGTAGATTTATTTGAGAAGTATGGTCTTGCAGCCGTTACGATGGGGAAAGTAACGGAAGACAAAATGCTTCGTTTATTCCATAAAGGTGAAATGGTAGCTGAAGTGCCAGCAGATGCTCTTGCAGAAGAAGCACCAATTTATCATAAACCATCAAAAGAAGCGGCATATTTTGCTGAATTCCAGCAGATGAAAATGGAAACACCAAAAGTAGAAAATTATAAAGAAACGTTATTCGCTCTATTACAACAACCGACGATTGCAAGTAAAGAGTGGGTTTATGATCAATATGATTATCAAGTTCGCACAAGCACAGTTGTTACACCAGGTTCAGATGCAGCAGTTGTACGTGTACGCGGTACAGAAAAAGGATTAGCAATGACGACAGATTGTAACTCTCGCTACATTTATTTAGATCCAGAAGTGGGCGGTAAAATTGCAGTAGCAGAGGCGGCACGTAATATCGTATGTTCTGGGGGAGAGCCACTTGCAATTACAGATTGCTTAAACTTCGGTAATCCAGAAAAACCAGAAATCTTCTGGCAAATTGAGAAATCAGTAGATGGTATGAGTGAAGCTTGTCGTATGTTACAAACACCAGTTATTGGCGGAAACGTATCAATGTATAACGAGCGTAGTGGTGAAGCGGTATACCCAACACCGACAGTTGGGATGGTTGGACTTGTACATGATTTAAAACATGTAACAACACAAGAGTTTAAGCAAGCCGGCGATTTAGTTTATGTCATTGGAGAGACGAAAGCTGAGTTTGGTGGAAGTGAATTACAGAAAATGCTTCACGGAAAAATTTTCGGCCAATCACCAAGTATCGATTTAGACGTAGAATTAAAACGTCAAAAACAAGTATTAGCAGCAATTCAAGCTGGGCTTGTTCAATCTGCACATGACGTTGCTGAAGGTGGTTTAGCGGTTGCGATTTCAGAAAGTGCAATTGGTGCTAACGGCTTAGGTGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP053938|4748706:4757083|4750102_4750822_+|WP_001170550.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTESADMVWVEYKDSATAFNGEKKETITGKGRLNNEITTLLFRKLQEVGIKTHFVEKLSETEQLVKKVSIIPLEVVTRNVLAGSLSKRLGMEEGTVLAEPIVEFYFKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVASPEQVSVLRDMALQINQVLIDHFASCRVRLVDFKLEFGVTDEGAIILADEISPDTCRLWDETSNEKFDKDVFRRDLGNLTDAYEEILKRLGGISHV >NZ_CP053938|4748706:4757083|4753936_4755352_+|WP_000879029.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGVFGIWGHENAAQVSYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIVGHKGLGLISEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRSTKDSLIESVKEALNKVKGAFAYLLLTGNEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIHVDRFTNEVDHAICSMEYIYFARPDSNIAGINVHAARKNMGKRLAAEAPIEADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTVEEIREMIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >NZ_CP053938|4748706:4757083|4755458_4756499_+|WP_001262435.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKFALEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKAEPSKIENIVKGISEGCRQAGCALIGGETAEMPGMYSTEEYDLAGFTVGIVDKKKIVTGEKIEAGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGELSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKNHEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPEGIGAEIELGSWKIQPIFSLLQEVGKLEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEEDAKDIVRLLEEQGETARIIGRTVKGAGVTFNGGKAL >NZ_CP053938|4748706:4757083|4756495_4757083_+|WP_000088592.1|DBSCAN-SWA MSRLAVFASGSGSNFQSLVNAVEEKRLDAEISLLVCDKPEARAVGRANYHHIPCFAFSAKAYESKEAFEKEILNKLEEYEIDYVILAGYMRLIGPTLLEAYGGRIINIHPSLLPSFPGKDAVGQALEAGVKVTGVTIHYVDAGMDTGPIIAQEAVVVSEGDTRESLQKKIQQVEHKLYVNTVNQIVQSTKEPTVN >NZ_CP053938|4748706:4757083|4751065_4751749_+|WP_000666779.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEEVDYVWHDTENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGALMRNENLKFMCRTVQLRVENNETMFTSQYEKDEVINIPIAHGEGNYYCDEETLKQLEENNQIAFRYVENPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDELLGGAEGLKVFQSILKQWRETYVVNA >NZ_CP053938|4748706:4757083|4750814_4751069_+|WP_000278823.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVSDLDSKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEVEEVVAQ >NZ_CP053938|4748706:4757083|4751732_4753952_+|WP_000055546.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMVEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQLDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEIVDLFEKYGLAAVTMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFAEFQQMKMETPKVENYKETLFALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKGLAMTTDCNSRYIYLDPEVGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRMLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLVYVIGETKAEFGGSELQKMLHGKIFGQSPSIDLDVELKRQKQVLAAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAISESAIGANGLGATVKLDGEATAALFAESQSRFVITVKRENKEAFEKAVEAIQVGEVTNTNEVTIHNEKNEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >NZ_CP053938|4748706:4757083|4748706_4750014_+|WP_000625683.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKKIREHASFDIDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEIILKDLENFVSILANKAKEHKYTIMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNVERFKQAANTVRVGKLSGAVGTYANIDPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGYMMTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVYPENMKRNMTRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKELVEADERITSKLTQEEINECFNYEHHMQHVDTIFERLGLNEA |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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