Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039707 | Lactobacillus paracasei strain Lp02 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,csa3,DinG,csa5gr11,DEDDh,RT | 0 | 0 | 5 | 0 |
NZ_CP039708 | Lactobacillus paracasei strain Lp02 plasmid pLp02-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP039709 | Lactobacillus paracasei strain Lp02 plasmid pLp02-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039707_1 | 1182469-1182599 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039707_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039707_1
>1.1|1182516|37|NZ_CP039707|CRISPRCasFinder GTGTAGGTTCGAAGCCCTTATGCTTCGGTTTCTGGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039707_1
The CRISPR arrays of NZ_CP039707_1 >merge|NZ_CP039707|1|1182469-1182599|CRISPRCasFinder CGGTTTGCGCGTTTCGGAGTTCAGCAATATCAGGCAGGGCTTTGGTCGTGTAGGTTCGAAGCCCTTATGCTTCGGTTTCTGGGTCGGTTTGCGCGTTTCGGAGTTCAGCAATATCAGACAGGGCTTTGGTC >NZ_CP039707|1|1|1182469-1182599|CRISPRCasFinder CGGTTTGCGCGTTTCGGAGTTCAGCAATATCAGGCAGGGCTTTGGTC GTGTAGGTTCGAAGCCCTTATGCTTCGGTTTCTGGGT CGGTTTGCGCGTTTCGGAGTTCAGCAATATCAGACAGGGCTTTGGTC
>NZ_CP039707.1|WP_003563758.1|1182164_1182308_+|hypothetical-protein MASLSKEQKKALIAKVEKERQDHPEKKSKKSGFETIDEEAERLESEN >NZ_CP039707.1|WP_003587361.1|1178940_1182066_+|SMC-family-ATPase MQLKQLHMQFFGPYADAVVDFDDFRTSPLFLISGPTGSGKTTIFDALIYALYGETSGERDGGQMRSNFAGNSDLTKVTLTFDHDGKHYLIERQPPQLQSKKRGDGLTEVKAKVLLAISSDEKQVAEYRKKNQVQEQLDAVLHLDASQFRQIVLLPQGDFRRFLDADSNAKEDLLRDLFGTQLIQRWQTAMLAQMKAKGAAIQDQERMLDVLMSQFDFETAPDEHATMADKLSLMRATVASQAKVVTARQATAAQSHQRYQEAQTALQQGQQLAQAFTEREQAATALAKLAEQKQTHQKQLKQIEQLTWVQQHENAAQRVQKAGQDLKAAIVQSEQTQAALTTTEQKFSLDKQALARLQAKSDQIEAQKKQLNSLQAVQQQLTAIAEQNKQVIKQAAIVNEAELALTHAQQQLTDAQTVKTQQQTSLDNLGLDELINTVNTQRNLLAALVPQAANYQEAQADVAQLSMAIKKTQVTLEQAETQVAATTSHLNKLQQTQIRQQIAHLAAKLEPDSPCPVCGSTSHPHPALVVDEPLVSEAALKQADQERQKAAARKTMVETQLANLETQLKTAKAKTAQARQAFTEHWQEQAKLIAGVADKTGILQQLTALKTLAATNEHQLTEAQTEHAALQVALKKSDKAITTGTTKVQQCEASLNTARIDAAEAQSALKTMQKNLPAEATDLATVAAQATTLQTTITTYQAQLQEAQARVNALDRQLAGLQADEKHAAAQVTALTKEQAEAKATFTIAVTQYFGADGKQRFAELQLRVSQLPLLNEQVQTYEHTQLKQQTLLDAANKTIGTQAQPQLDQLEAEATAAETTATNDQTALIKISQAHDAAEKLAKQAATIFTANQTALAAYADLQTLATVMNGNGPKKLSLERYVLQAYLQEILNVANSRLQVLSNNRYQFVLHTSLGTQKIHSGLEIDVYDDQVGEKRAVQTLSGGESFIAALSLALALGEVIQQESGGINIDALFVDEGFGSLDANSLDVAMNALESLEGESRLIGIISHVTELRDNIPDQLQVEPAGTGRSRLKILHSA >NZ_CP039707.1|WP_016381496.1|1177819_1178941_+|exonuclease-SbcCD-subunit-D MRFLHTADWHIGKKLNDFDLLEDQQAVFEQLVETAETHKVDAIIIAGDLYDRALPSEAAVSVLDNMLIKLNRDHGYPLLVISGNHDSAVRLRTGRAWYAATKMFVNTQVAEAFTPIELDGVQFFLLPYFEPFAVRDYFQDKTITNVAQAIRPIVAKMKTLFKPDMRHILVSHFFAAGTDHSASETKVNVGGLDAVPLDDLAAFDYVALGHLHNHHALHGEPKIQYSGALLKYAVSEAHQEKGVYIVDTETMDREFVPLKPKHDLIELKASYADLTAPAYYQQQDRDAYIGIDLTDTQVIPNVMAQLRQIYPRIISLRRENGVNAVKPLQERQRDLDPMSLLQTFFKDMTQDDLSAAQIKWAKAGLTTAKKEQA >NZ_CP039707.1|WP_003563745.1|1177132_1177759_-|HAD-IA-family-hydrolase MNTFIFDIDGTLLDNVEAYLYGLQKTLRRHGREVPIHELTWTNGRAGVDSLAELGFSAAEIPEVHEQWREDSKEFLTDIAWFPGMQHALNQLKQTYKLGLVTSKDKTQFIEEDKKFHFSPYFDAIVVAGEAKRNKPFGDPITLARERLGSEPASTIYIGDTPTDAQAAADAKVAFALAGWTTPPSNEVMPRVAVLQQASDLLTLPTLA >NZ_CP039707.1|WP_003563743.1|1175911_1176688_-|DeoR/GlpR-transcriptional-regulator MLKDERLLTIRNLVDRKGIVTVNEIGESLGVSTMTVRRDLEELADQKELVRIHGGAQSTNFKPLTELSRNEKRSIHVNEKRKIAATIAALIIPGDTIYIGPGTTNEMIAQYLKKPDVRIITNSLPVFQSFQDRADFFSLQLIGGRLRARSGAFIGSLANEMLAHLTTTKAFISVNGIADNHISNASPEEGQTQRIALDNAGMKLVVADHFKLNRQDFYSFYDLDQTDGLITDPGISRDDLQHYNTFTHVITDKTNKGE >NZ_CP039707.1|WP_003569175.1|1175478_1175907_-|galactose-6-phosphate-isomerase-subunit-LacA MDVIIGADKDGFAMKEQVKKYLEDHQYRVKDMTPEPAEDFVDSSLAVTKELLSGDAHKAIMFDRYGMGSAMASNKVKGMVTAVVEEENTAHMTAEHNGAKAIAIGTGITGYDRALVIIQRYLDTEYAGGRHQIRLDMLEKMI >NZ_CP039707.1|WP_003569173.1|1174915_1175434_-|galactose-6-phosphate-isomerase-subunit-LacB MIIAIGNDHIVTMQKIEISNMLKDMGYTVIDEGTYDTHRTHYPIYGKKVAEDVADGRADLGIVMCGTGIGISTAADKNDGIRAAMCDDVTSAVYAREQLNANVLGIGGATVGIHMIQDIVKAYLDATYKETPQNKKIIDKIDNIAKPNPEQKDNPHFFDTELEKWAEGVYHD >NZ_CP039707.1|WP_003569171.1|1173875_1174877_-|tagatose-bisphosphate-aldolase MTVTLTAGQYKHLQQLSDDNNIISALAIDQRGSLKKMLAAAANKPADETTIVDFKKAVSEELTKYASSILLDPEYGLPAAKVRAPQAGLLLSYEKTGYDATEPGRFPDLIDDQSALRIKNEGGDAVKFLLYIDPDEPDAINDRKYAFVERVGAEAKANDLPLFLELVSYDGTLNETGTAAWAKVKPDKVIKITKEFSKPQYNVSVLKVEVPVDQKFVEGFTDEGVTPVYTKEEAAKYYKAQSDATDLPFIFLSAGVSNELFLEELKFAKQAGSTFNGVLCGRATWKPGVKPFAAEGEAAGKAWLQTEGKANIDRLNKVLAETATPWTDKVEHA >NZ_CP039707.1|WP_003569169.1|1172822_1173761_-|tagatose-6-phosphate-kinase MILTVTLNPSIDVSYPLEHLKIDTVNRVKTVRKTAGGKGLNVSRVIHMLNHEITATGFIGGYFGKWLENQLDRDGIDHDFFPIDAETRSSIAMLHDGGEQTEILEAGPTIAAEDAEKFLSHFDSLLDKSDLITISGSMPQGLPADYYTQMIAHAGQKNVKVLLDTSGATLKSALEAPVKPLLIKPNEEELGGLLNRDVDKTDYTALKHDLMDPIFDGVDWIVVSLGAAGAFVKHLDKFYHAAIPKIKVVNPVGSGDSTLAGLAMGIHDGKSDEDIMKTAMTTGMLNTMEAETGFVNPAKFDEYFAKVTIESY >NZ_CP039707.1|WP_003569168.1|1172120_1172801_-|DUF4867-family-protein MSTIDQLRTLNPDKTIHSLDEAAFADYGVTYAQYDVSELKTFMDQHVTIPAPSEANLYVPSNPDMEKIPVVQQIGRDVYAGLPIEAGECAGHAEALTAVEFHQGSEVNVFFTDVVMVIGKRGQMHDDQFNAEKDAKLFFVPAGTVVEFFSDTLHYSPCEAHASGFKFIVMLVRGSNQPLPADYHTDNKLIVKQNKFQVVHASRTDKIKQGIQVGVTGELVRVKHLN >NZ_CP039707.1|WP_003573966.1|1183055_1183532_+|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MANEVLNRRNNELMNNVNDPFFDNLARRFFGPVSDWMDWATPAITSTAVNGLLTDVKETKDAYEVHVDVPGIDKNNIKMNYHDGVLSINVHKDDITDHADKNGNVMMSERNYGTMSRSYQLPNVDASNIKAAYQDGVLNITMPKLTESKESGHNIEIQ >NZ_CP039707.1|WP_016363499.1|1183525_1183759_-|hypothetical-protein MFRFLTEPFRALQKNHPNDHTYRWDDFNDSMITATAAILIDFCLLTHGFCPLTAEVPLLFMLAMQSVNLGSTDDEHY >NZ_CP039707.1|WP_003569186.1|1184088_1185192_+|A/G-specific-adenine-glycosylase MTNKLMNWPPEKVAAFQKALLNWYDQHARQLPWREDHDPYHVMVSELMLQQTQVQTVIPYYERFMNQFPTVGALAKAPEAEVLKAWEGLGYYSRARRLQQAAKQIVADYGGVWPQTSETLQTLSGIGPYTAGAIASISFGEPVPAIDGNAFRVFARLFKVDADIARPQTRQIFFDLIQPLMPKDRPGDFNQAVMDLGSSYMSANHPDPAHSPVRDFDASYRDGVVSAYPVKTKKPRPVLHRYFALVIRSEKGYLLEQRPSTGLLADLWMFPLVDMADLESTMMSAQLDEVSTLFAASSGMQLTFADLGAKTVKHTFTHQQWQLTLIGVETAASDLSFLPARWVKADHFSELALPTVQKKLNAALGMN >NZ_CP039707.1|WP_003569189.1|1185402_1186188_+|alpha/beta-hydrolase MTVNVTRDIAYGDAALQKLDFYEPEKSNGAAILDIHGGGWFRGEKNKEGEMAERFAALGYTVAVPNYRLAPEAFFPAARDDVLAAFSWLREHTKGLQLGVFGSSAGGSLSVDVGLAEGVPTVSWSGIFDIRQWFADHPAVVAQPDTKTDFVKTASAKIDQGGRNDPFYKWFILNYVDSDETKFPEVEPFDRLTAQAGPLYLANSQEEIIPISGIYQLAHAAEKLGLPVTLQSIPGGQHAEGYLDEAWQGTVAFFAQYLLKG >NZ_CP039707.1|WP_003563776.1|1186190_1186859_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase METLVVVSHPEIEKSDTQQFLKASAASLSQVVWHHLDSRLPFDVTAEQQAITSADRLIFQFPLYWYMAPASLHQWLTDVWLKQFVYDARGGLLHGKSLGFVVTFSQPATAYQLGGSVGFSISQFLTPYAALAAKTGLTLLPPLTIAQFANQTDLEHQQLLVRYQQYLTLDHPDRPDEQAQWFIDRLSGNADTQLLADQLAAQTDDIDRLRLTLHELKAGESE >NZ_CP039707.1|WP_003563777.1|1186855_1187035_+|hypothetical-protein MTTDEQWLVNAAAVQEKQATSYENAAFFRALQAFVTQQAKRRESLEGEIDGRSWNHEQW >NZ_CP039707.1|WP_003569192.1|1187112_1187637_+|DUF308-domain-containing-protein MQTMFDRLQRWSWLRGLLMILIGAWILIAPRQVYRSFIWIVAAVLIIAAIPKLIDGFSARKASGTYGTSLFTGGFYLLLALMVPVIVRPLMSLGPLLLGIVLMIYGVNKILSARNRQQFVNVSVWPTVIYGVVLLIMGFIMALNPFRTVMMVFSFFGGLLVVMGILQLFTRPRA >NZ_CP039707.1|WP_011674244.1|1187870_1188503_+|hypothetical-protein MHKFDWREVERDEYSRSEEPSFVKLTTRSYITAMGVAPDRVTDQAFTSLAAAVTQIAERISEGPDAGIDIPNFKAYHPYPLQAVWSGGDKISKRHIFRLWLKQPLFIHEDQFEAALTQLHFEPAIAQQLHLEQLAEGFEIQSFNSTPLTDEAPAIARIQTVINRDHLVPKFDDRHREVYLEGYQGEVPVLYRVPLDENFGEVGDEQVAYN >NZ_CP039707.1|WP_003563790.1|1188574_1189396_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MANEFPQVMTIGGTDSDGSAGVQADLHSFFMRGVYGATILTAAVAGNSYGIQDSMVMPLPFIDAQFKSLAADLHIRAAKTGMLADRALVQNIIKNWQQYDFGALVVDPVIITKHGAMLLEQDAYDAVKNELIPLATVVTPNHYEAEHLTGMKLDTDAQTEAAAHQLQDSGAKNIVLKGAHDDPTQPTVRDFVLLESGKSFWLSEPYHATDRVNGTGDTLSAVITAEIGKGNSVEEAIRIAKRFTNQAIGHPIAVGHQYGPINHWANKIVYPQF >NZ_CP039707.1|WP_003563792.1|1189569_1190631_-|hypothetical-protein MLNLNDAHLAALITKPLTVAQARQQIGTAYQQEADRLANSPLWESNDEALTALLASYTNLLGNKLYQALQNLTSIPTPFLQTLWLQDTTADAHHSEIAVIQTTQDDNNTLLTIVDPLSDDAKLKAVNLPTLLQITAADSNAMTYDAETVKALSALAKALNQGGYRFTTVDETVLQPVNGLSFKTRFDNLKPLVAKKAVIKAGDFSIGTSLDQDAKVLGYQVLDEDGHDWQDLGSEEVKNDRFEWASTTVPQELVNHRLKLIIRVSAGSNSPALDELFVIASNNAILMRQGAKAGVYELPLPNQKIFTVMINPANNMVYLKYPDPETQIIELNHQYPFIGEWLKAVLPQKRAFN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
486902 : 538061
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039707|486902:538061|DBSCAN-SWA GTTATCCTAATTGTTGGGGAAGACTTTTAAGATGATGTTTATGCAGACGCACGACAATCATAATAAGCAGAATCAGTAGCATTATTGAAATAGCCCCACGTTCAATACCAAAGACGCCGCCATTCAGCCATTGTGTATTCGATGTCGGTGTCGAGGTGATAAATAAGCGGATGGCAGGAAAGCCGGAGACGACTGTCCCGAAGATAATTCCCTCCGAAAAATGCCATGCTGCATTGATAGCGCTACACAGCCAAATATTACCAGAGATCAATCGAATTTCGGACATCAAAACACTGAATAAGAATAGACTTAGTGCAGCATAGACATCAAATCCTGCATTAACGACATGTAAAAAAACATACAAAATTGAGTTTGTTAAAAAAGCGAAGACAACACGTTTCTTTTTAAGCCAATACCCCATCAGATAGCCACGGCATATTAATTCTTCAGCGATTGCCTGAATCGTATAGCCAATCAAAAAGAGAAAAAAGACGGGTAGATAAGACCATTGATAGTTGAAGATTAGCTTGTAACCACCCAAAAGTGTGATGATGCCCCAGTTAATGAGAACAGCTGACAAGCCGATTAATGAACCTAACACACAAGTTTTAAAAGCGACTTTAGTTGAAAATTTGATCATTTGCAACTGGCTTTTATGACGTTGCCACATCAAATAGGCACCTAGAAATTGAGCTACGAAACCTATTAGTATGATAAAACGCGTGTCCAACAGTGTTGCTGTATTCATGGATAGCAAACCAAGTAACATACCAACTGCAAGCGAAGGAAGAATTCCCCAGCCAATCGCTATCATTGACACCGATATGATTTCTTTAAGCAAAGTTCTGTTATCGACCATATCCTCACCATAAAAAAGAGTCCTGTATAAAGTCTAATCTTCATAGAGGATTCTTCCCTTTCATGAAAAATAAGTAATATTAGTGACGTGGAAAATTTCGATGATTGCCTTCGTTAAACCCAGCGACAATATCATCAATGTGGCCAAATGCTTCTTGAGCTAGGCCAATTCCGATGTCAACCCAACCTTTGCGTTTGCTGCCACCGGTCACGGCAGCGCAATCTTGAAGTGAAAGCGTGGAAAACATAGTTAATGATGTCATGGAATACCTCCGATTTTTTCAGTATTTGGTAGCAACAGGGAAACACCAGATCAGCAATGACCAGGTCCGCCATATTTATGTGCCCGGCAGTAACCTGCATCACCTGCTGCGGCCCAAATGATACCTAGTTCTTTGCCGACGCCGCGCCAGAAGTCACTTGAGCCGTCCCCTCCAACTACGAGTTGAAGCTCTTGCATACTTAATTCGGTTAAAGATAATTGTTTTACCATTTTGTCCCTCCTAATATTTAGTCTTGCCTAACTTTTGAAACGCAGTAATTCAAGGAGCTAGCTGTCCTAAAAACAAGTTACAATAGTGCACAGGATTTTTGGTGAGTTTTATATAAACGCTTGTTATTCGCCGATAAACGTTAGAAAATTTGCTAAAATGCGTAAAAAGTGACGTTAAAAGCTATTTTCATGACGTTCAGTTTTAAGAGACCGTGTCCAATGGCTATTAGGAGAGGTAGATGATCAGCAGCAGTCTTGATTTAGTCGAGCGAGTAGTCTCTATCTTGACAATTGCGATACCTGTTATGTCGCGTGTGATTGCTAGCGGGTGTCTCGAACAAGCGAAATAGTCACTGATAAACCTCCTTAAGTGCCAAAAAAAGAAGTCACAAGGAATGCGATCAAACATTCCTTGTGGCTTCTTTTAGATAACTCGGTAGTTTTTAGGTTGGGGTCGTGGTTTGATCCCAAGACGTGATTAAGGGTGGGTGTAAAAATTACCGGTGGATATAAACGTAACTGCTTGCACCAGAGATGGTTTGGGTGTTCGGGCCGGTTGGTGAGCTGAAGCCCATGCCGCCTTGGCTGATCGTGACACTGTCACCAGAGACAGATTGGACGTAAGCAACGTGACCGTATGAACCATCGGCTGTCCATTGACCGCCAACAGATTGACCAGCGGCGAAGACGATGATTGAACCGGCTGCTGGCGTGTGGTTGACTGTGAAACCAGCAGCTGCAGCGGAACTACCCCATTGGGCACCATTGCCCCAGCCATTACCAGCCCATGAAGCGACTGACTTGACGTACCAGGTGCACTGACCCCAAGGATACGTGTTGCCTGAACTGCTGTAATCAGCGTGACTGCCGCTACCTGAAGTCGTGTTGTTGTTGATAATGGAGGAACTGTTGTTTGAAGAACTTGATGTGTTGTTGGCGATGGTGCTGGTTGAAGTTGCGCTGCTTGAACTGCTGGTAGTAGAAGAACTTGCGGTTGAAGCGGCAACGGTCTTCAAAGCGGCTTGGGTTGCAGCAGCTGCTTCAGACTGTTCTTGGGCAAATTGGCTTTGCAAAGCAACCAACTCATCTTTATGATCAGCAATTTGCTTATTCAAAGCATCTTGTTTATCGTTAGCATCTTTTTGTAGGGAAACCAACTGTGATTTCTGGGTTTCCAATGAAGCCTTAGTTGAAACCAGCGTCTGACGGGCATTTTCCTGTTCCGTCTTCAAGCCAGCTAATTTATCCTTGGCAACTGTCACGGCATCAAGCGCATCTTTGCTGGCTTGGCTAAGTTTGCCAACCGTCATGGTGCGGGCAATTAAGTCAGACAAGTTCTGGGAATTCAGAACAAAGTCGATATAGACATTGCCGCTGACAGAGTTGCCAGCCTTTTTTTGCAAGGAGATCAACTGATCTTTCAAGTTGTTCTTGCGTGCTGTGACATTCTTTTGAGCGGCAACAATTTCACCGCTGAGTGATGAAATCTTGGCATCAGTTGCGCTGATCTTAGCCGTTGCATCGCTGATTTGACCATTCTTGGTATCGATCTGCTTGTTCAAATTGATAACTTCTGTGTTCGCATCTTCAATTTGCTTCAACAGTGCATTGGTTTCGCTTTTGTTGGAAGCGATACTGTCGCTTGTATCAGCGAAAACTGGTGTTACGGCGCTAGCAGAACCTGCTAAGGTAACTGCAGCAACCAACGTGATCATGACTTTATTGAATTTCATTTTTGACCTCACCCTTAATTTGATTAACTAAAGGCTACTTTACTGTGTCAATGTTACGTCAGCGTTACAGGACTGTTAGGAGTTGGTCTCAATCTTCATTTGCGCTTCAAAATTGCGATCATGAACGTTTTTAATCCCAATTTTTGATGAATTTTGTATGAAAAAAGCAGCGCCGTGACGACGCTGCCTGACAAAATTGTAAGTTATTCGTTTGATTTCAGGGCTTCGACCATGTCCACCCGTTGGAGTCGACGATGCGTGAGCCAGGTGACGACGCCGGTGAAGGCCAACATGAGTAACGTGGCCGTGAGGTAGCCGACAATGCTGATCGTGAGTGGGAAAACCACGGCCTCGGTTTCGGCTTGATACAAAATGTAGGCTGTCAGCAAATTGCCGAGCAGATAGCCGAACACGATGCCGATCACTGTCAACACAATGCTCTCGCGACTGATGTACATGGTGACCTCGCGATCGAAAAAGCCCAGCACCTTGATTGTGGATAGTTCCCGAATGCGTTCCGAAACGTTGATGTTATTCAGATTGTACAAGACCACGAATGACAAAACCGCACTGAGCAGAATAAAAATCAAAACAATAGGATCTAACATACCGCTCATATTGCTTAACGTTTTCTTTGCTGTCGTCGTGAAACTAATCCCGACAATCGCGTGATGATTGAGCAATTGCTTAGCGAGTCGATCATTTTGTTTGCTGCTTTGGGGCTGCAAGCGGACTAGCAAGGTGTTTGGTTTCGCACTATTACCAGCGAGCTGTTGATAAGCGGTGTTGGAGAGATAGCCAAAATGGCCAACGTAATTCTTAGCAATGCCTTTAATTGTGAATCGCTTGCTCTGACCATTAGTTGTGGCGACTTTAAGCGTATCGCCCGTTGTCACGTTGAGTGCTTTAGCCAGTTTGCTGGTGATCACGATACCGTGGCGCGGCAAGGTCAGTTTGCGATTTGACGCCGTTGAACGGAGACTGACATAAGGTTCAAGATCGTTGCCGTTTGCTGGGGCAAACAAATTAACATCGCTCAGGCTATGGCCTTTAGCACTGAGCTTAGCCACCGCGCCGCTAACCGTGCCCGCGCTGCGATAAGCTTTGCTTTTAGCCAGAATGTCGCGGGCCGCAGCTGGCTTTTTGCCATCAGCCAATCGCACAATGGCTTGATAATGGATGACATCACCATACTGTTGAACACCAGTAGCAGTGATTGAGTCTTTGATGCCAAACCCGGTGAGGATCAAGGCGGTGCCGCCAGCAATCCCAAGAATGGTCATCACCAGCCGTGATTTGTATCGGAAAAGATTACGATAGCTGACTTTTTGGTTAAAAGACAGACGCGACCAAAGCGGCGTGATCCGCTCCAGCAAAATGCGTTTGGCTGATTTCGGTGCTCGCGGCCGCATCAAGGCAGCCGGCTTTTCGGTTAGTTCATTGCGGACCACAATGGCGGCGGCCCCTAATGTTGCGATCAGCGCCAATAACAATGACAAGGCGATCAACGGCCATTGCAAAGAGACGACTTGTTGGAGCGGAATGTAATTTTTATACAAACTCAAGACAATGCGCGGAATGCTCAAGTTGCCAGCAAAAACCCCGATGATCCCACCTAATAAACCAGCTAAGGCAGCATAGGCGAGGTAATTGCGCGCAATCGCCCATTTGCCGTAACCAAGCGCCTTGAATGTGCCGATTTGCGCGCGGGCTTCTTCGACCATGCGACTGACCGTGGTGAAAGTAATCAGCGCAGCGACAAGAAAGAAGAAAACTGGGAAAACGTTGGCAATGGCGGCAATTCGATCAGCAGAGCCGCCGTAATCGCCAAAGCCAGGCAGATCTTCCCGAGTTTGCCATGTGAGGCTGGTTGACAGTTGTTTGCGAGCTGTGACAGTGGCCTGTTGCTGAAAGGT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48 | Streptococcus_phage(33.33%) | holin,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
946427 : 1059753
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039707|946427:1059753|DBSCAN-SWA 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102 | Lactobacillus_phage(42.42%) | holin,integrase,transposase | attL 946408:946467|attR 994730:995780 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1347858 : 1389117
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039707|1347858:1389117|DBSCAN-SWA AATGGCATACGATCATCATGAGATCGATAAGAAGTGGCAGCGTTATTGGGCCGAGCATAACGAATTTAATACCACAACCGATCCTAAGAAGCCGAATTATTATGCGTTGGACATGTTTCCTTATCCGTCAGGCCAAGGCCTGCATGTTGGGCATCCGGAAGGGTATACGGCAACTGATATTGTTGCACGCATGAAACGGATGCAAGGGTTCAATGTTCTTCATCCTATGGGCTGGGATGCATTCGGCTTGCCAGCTGAGCAATATGCCTTGAACACGGGTCACAATCCGAAGACCTTTACCAAACAAAATATTGAGACCTTTAAGCGTCAAATCAACAGCCTTGGCTTTTCATATGACTGGAATCGTGAAATCAACACAACGGATCCGAATTACTACAAGTGGACCCAGTGGATTTTTGAACAACTTTATAAACATGGTCTGGCATATGAAGCTGAGGTACCGGTTAACTGGAGTCCGGATCTAGGGACGGTTGTTGCAAACGAAGAAGTGATTGATGGCAAAACGGAGCGTGGCGGGTTCCCAGTTGTTCGGAAGCCGATGCGTCAGTGGATGCTGAAAATCACAGCCTATGCTGAAAAGCTGTTGACGGATCTGGACGATCTTGACTGGCCGGAATCAATTAAGCAGATGCAACGCAACTGGATTGGCAAATCAACTGGGGCACAGATCACCTTCCGGGTAACTGACAGTCATGAGCCGTTTGATGTCTTTACCACTCGTCCAGATACGCTGTTTGGTGCAACGTATGTCGTGATGGCACCAGAACATGAATTAGTTCAGAAAATTACCACCCCGGCACAACAGGCCGTCGTTGATGCGTACATTGACGAAGCCGCCCATAAGTCAGATCTTGATCGTACCGCTTTAGATAAGGAAAAGACTGGTGTTTGGACCGGGGCCTACGCGACTAATCCGGTTAACGGCGAAAAACTACCGATTTGGATTTCAGACTACGTTTTAGCCTCTTATGGGACTGGCGCAATCATGTCCGTGCCTGCGCATGATGATCGTGACTACGCTTTTGCCAAAAAGTTTGGTATTGAAATCAAGCCTGTTATTGAAGGCGGCAATGTCGATGAAGCAGCTTATACTGGCGATGGCGTGCACATCAACTCCGGGTTCCTTGATGGTTTGAATGAACACGACGCGATTGATCGAATGATCAAATGGCTTGAAGATAAAGGTATCGGCAGTGCCAAGATCAATTACAAACTGCGTGATTGGGTCTTTTCACGCCAGCGTTATTGGGGTGAACCGATTCCTGTCATTCACTGGGAAGATGGCGAAACCACGTTGGTGCCAGAAGACGAACTGCCTCTCACATTACCTGAAGAGGCTGATATCAAGCCAAGCGGTACTGGCGAGAGTCCACTGGCAAATCTGACTGACTGGGTTAATGTGGTCGACAAGAACGGGCGGAAAGGTAAGCGTGAGACCAATACAATGCCGCAATGGGCAGGGTCTTCATGGTACTTCCTGCGGTTTGTTGATCCTCACAACAAGGAAGCTCTTGCGGATTACGACAAACTTAAGGCATGGATGCCAGTTGATCTGTACATTGGAGGGGCTGAACATGCTGTGCTGCACCTGCTGTATGCCCGTTTCTGGAATCTGTTCCTTTATGACATCGGGGCGATCCCGAACAAAGAACCGTTCCAACGGCTATTTAACCAAGGGATGATTCTGGGCGATAATCATGAAAAGATGAGTAAGTCCAAGGGCAATGTGGTTAATCCAGATGATGTGGTTGATGAGTATGGTGCCGATACCTTGCGGCTGTACGAAATGTTTATGGGGCCGCTGGATGCTGGTATTGCTTGGTCAACAAAAGGGTTAGCTGGTGCCCGCAAGTTCTTGGATCGCGTCTGGAGTGCTTTCATTGATGATGAAGGCAAACTGCGTGATCGGATTACAACGATCAATGACGGTCGACTTGATAAGGTTTACAATGAGACGGTCAAGAAGGTTACCGAGGACTACGACGCTTTGCATTTCAACACGGCAATTTCACAGATGATGGTCTTCATCAACTCAGCGCGTAAAGATGATGACCTGCCACTAGAATATGTTGAAGGATTCGTGAAAATGCTTGCGCCGATTGCCCCGCATCTAATGGAAGAGATTTGGTCACGGCTAGGTCACGATCATAGTCTGACTTATGCGCCATGGCCAAGTTATGATGAAAGCAAAATCAAAACCGACACTTACGATATGATGATCCAAGTCAATGGCAAGCTGCGCGGTTCGATTACGGCGGATGTCAACGAATCAGATGATGAGATCAAACAAGCGGCTTTGGCAAATGATAATGTTCAGAAATTTACGGCGGGCAAAGACATTAAGAAAATTATTGTCGTACCGCGAAAAATCGTGAATATTGTCGCAAAATAACCGCACTGGCTTCACCAATTAACTGAAAGAAAAAATGGTCAACGAATGGTTCCTGAAGGAAGCGGGCGTTGACCATTTTTTTAGCGATTCAGCTGCATGAAAAGTTTTGTATTTTTGGCCTTTCGATTGTGAGATCACTTGCTACGTGGCGGCTGGTAATTGTCAAAGTTTTCTTTTGATTCCCGAAAGAAGCCCGGGAAAGATTGCAAGTCGCGCTGGGATTGCCTAAAATATAAAGGATTATGCAACACGACAGGAGTTTATCATGGAGAATTCGCTGGGCAGCGGTAATCAACCGCAACGTTCAGATAAGGAAAAAATGATCCGCGGCTCGGCGTGGATGACTGCCGGCAGTGTTTTTTCGCGGATTTTAGGGGCCATTTATGTCATTCCATGGCGTATTTGGCTTGGAGCAGCGTTTCTAACTGCCAACGCTTTGTTTACAAAAGGTTATCAAATTTACAGTCTTTTTCTGATTATTTCGACTGCTGGTGTTCCTGGTGCTGTTTCCAAACAGGTTGCCCGGTACAATGCTATGGGCGAATATAAAACCGGGATGCGTCTTTTTTACCACGGCACTTTTGCCATGGTGCTGATGGGGATTGTCTCGTGTGGTGCCATGTGGCTGCTGTCGCCGCTTTTAGCAGCGGGTGACGCGCGCATGATACCGGTTTTTCGGTCACTGGCATGGCCGTTGCTGCTAATTCCGTCGCTTAGTTTGATTCGCGGGTTTTTCCAAGGTTATAACGAGATGGCGCCGAGTGCCATCAGTCAGTTTATTGAACAAGTGGCGCGAATTCTTTATATGTTAGTGATGACTTACGCGATTATGGTGGCGGGTAACCACAGCTATCTGAGTGCGGTGATTCACTCCACCTTCGCCGCGTTCATCGGGGCCGTTTTCGGACTTGGACTGTTAGTTGTTTATTTCCTCCGGCAAAAACCACGGTTGGATGCGTTGGTTGCCCAAAGTGCTAATTCCTTGCAGATCAGTGTCAATGAGATTCTCTTAGATGTGGCACGGCAGGCGATTCCATTTATTATCATGGATTCAACGATTAATATTTACTATATTGTTGACCAGTACACATTTAATCCAATGATGAAGGCTTTTTATCTCGTTAGCGAAGATCAGCTTGACCGTTTTTATGCGCTGTTTGCCGGAAACGCTAATAAACTGATTATGATCGTTGTTAGTCTGGCAGTTGCTATGGCCATTACCGTAGTACCATTATTGGCAGGTGCGAAAACGCGCGGTGATGTTGAGGGATTGGCCCGGCAAATCACGAATACACTGCAGTTGTTTTTTATCGTCATGATACCTTCGGCGTTGGGGATGGTGGCAGTCGCGCGCCCACTGTATGTTTTGTTCTATCGGGATATGGACTGGTTGGGCATTCGCTTGTTGCAGATTTCATCACTTTTAGCGATTATGCTGGGCTTGTTTACGGTTTTGGCAGCAATTCTTCAGGGATTGTTCAATAACCGTCTTGCTATTCAAGAGATGCTGATTGGCTTGGCAGTTAAAGTGATTGTACAGTGGCCAATGATTTTCTTCTTCAATGTTTACGGTCCGGTTTTGTCCACAATGTTAGGCATGACGGTCTCGAGTCTCCTAATGCTCTATTCAACGAATCGGATGTACAATATTCATGTACGCCAAACCATTCGCCGCGGCGTCGGTATTCTGGCCTTTTCCCTGATCATGTGCGCCGTTTGTTACCTGATTGTGAATGCATCAACCTTGGTGATCAATCCGCGGAGTCAGTTCGGGGCAGCGTTCGTCTTGCTGATTGCAGTTGGGGTGGGCGTTTTGATTTACGTTTATTTGATTTTGAAAACGCGTTTGGCTGATTTAATCATTGGTGAGCGAATTAGTCGACTTCGCGATATTTTACACATTCGGTGAGCTTATGCGATTAGATAAATATTTGAGTCATTTACAATTTGGTAGTCGAAAAGAAGTTAAGGCACTTATTCGCGACAAGCGGGTACGTGTGGCCGGTGATTTAATCACTGATCCTGGTTACAATGTGTTGCCGGGTATCGCGGTCGAGGTGAACGATGCCCAAGCGGATGGGCCGCTTGAGGTCGATTATTTGATGAACAAACCGGCCGGGGTGATTACCGCAACAGAAGATCCTACGCAATCAACGGTGCTGGATCTGATCCGACCACATGATTACCGACCGGGTTTATATCCCGTAGGTCGTCTGGATAAAGACACTACTGGTCTGTTGTTACTTACGACCGATGGCAATTTAGGCCATGCACTGCTTTCGCCTAATCGTCATATTGCCAAAACCTATGCTGCAACTTTGGCTAAGACATTAACTGCTGACATGAAGCAGCAACTCGAAACCGGCATTGATTTAAAGGACTTCACAACCGCCCCGGCACAAGTCGTTGTCTTGCCCGATACCGATGGCAAACGCATCCAGATTACACTCACGGAAGGTAAGTTTCATCAAGTCAAGCGCATGTTGTTGGCAGTTGATAATGAGGTGACGGCCTTGACGCGAATTGCTATGGGACCATTGTCATTGCCAGCCGATTTAGCTGCTGGGGAGTATCGGGCTTTAACCGA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>NZ_CP039707|1347858:1389117|1386518_1386944_+|WP_173959154.1|DBSCAN-SWA MKITLENANIANVYRLVEQIKVKGRDALALAKFIKLLKQTLKSAGEDEQALVAQYALKDENGESKTDSSGNIQLNPDLAREYNKVHGEWLEQEAEIEGGTYVNHIDDVQRIISDYVDENEIGGPDLDAYLALYEAFEKGEK >NZ_CP039707|1347858:1389117|1373464_1374172_+|WP_136868186.1|protease|DBSCAN-SWA MTTVVPIKGDIVTNDYGWLYDLFGDDYASPKSVSDLINKANGDDLSVEINSGGGIVDAGSEIYTMLRAYKGPVNVNVVGVAYSAASLIAMAGDVVAMSPAGMMMIHNVSGGQVGDYHDMENAADSLKKSNTAMANAYMAKTGLSQAEILDLMDSTYWLDPQTAIEKGFADKMMFDNAEKPGKMIMTASLNKIPSLATLNQMKHLRNTTALKRAPSDDDQMALLNAEYNLLNLKGE >NZ_CP039707|1347858:1389117|1377062_1377710_+|WP_003657874.1|DBSCAN-SWA MPDTPSRANDIELELTIGDMFFAMKTQNETASTDPVFDTSVIRIPNIKKIAFKGNGKSNDIYASGKKFGTITQETSIEVTHTHIGMPIAVLDAMKGIAAKHGVEFGSTLAQSMPEFAIGFDTWLANGQHDGIWLTSCTLNPAVNETHATSEESFKEVNPDIVYNAGGLRNSSIYYARYNSARDSADLTVDDFFKQVIFSPEQLETIAQEKATPKP >NZ_CP039707|1347858:1389117|1357422_1358778_-|WP_173959134.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039707|1347858:1389117|1350535_1352179_+|WP_003564130.1|DBSCAN-SWA MENSLGSGNQPQRSDKEKMIRGSAWMTAGSVFSRILGAIYVIPWRIWLGAAFLTANALFTKGYQIYSLFLIISTAGVPGAVSKQVARYNAMGEYKTGMRLFYHGTFAMVLMGIVSCGAMWLLSPLLAAGDARMIPVFRSLAWPLLLIPSLSLIRGFFQGYNEMAPSAISQFIEQVARILYMLVMTYAIMVAGNHSYLSAVIHSTFAAFIGAVFGLGLLVVYFLRQKPRLDALVAQSANSLQISVNEILLDVARQAIPFIIMDSTINIYYIVDQYTFNPMMKAFYLVSEDQLDRFYALFAGNANKLIMIVVSLAVAMAITVVPLLAGAKTRGDVEGLARQITNTLQLFFIVMIPSALGMVAVARPLYVLFYRDMDWLGIRLLQISSLLAIMLGLFTVLAAILQGLFNNRLAIQEMLIGLAVKVIVQWPMIFFFNVYGPVLSTMLGMTVSSLLMLYSTNRMYNIHVRQTIRRGVGILAFSLIMCAVCYLIVNASTLVINPRSQFGAAFVLLIAVGVGVLIYVYLILKTRLADLIIGERISRLRDILHIR >NZ_CP039707|1347858:1389117|1376026_1376365_+|WP_012491255.1|head|DBSCAN-SWA MTQTVNLTNQLRWIATLLELKDGVDAHDRPKQTWEDKRVLYYADIGITSTEKYLAQQNKQDVVLRILIRRDMSITQGGNRVRIRGTDYKITRIYETPDNQRMELSLDYVDHI >NZ_CP039707|1347858:1389117|1363964_1364210_+|WP_173959141.1|DBSCAN-SWA MAIRNNLAVLLAERKLKTSQVAVDTGISRSSLASIVYNRSKMIQLSTLDILCQYLQVTPAEFFVYDPHPTSPDWYFSIKQR >NZ_CP039707|1347858:1389117|1376667_1377051_+|WP_136868189.1|DBSCAN-SWA MVNNNGFETMAKYLSGLKVNDSVSKEGLVAAASQFADKLRPELPSEPNAPLAQTYGTLRDKLQVVDKGDHIQVTFGNAFWWLFLEHGTSPKNHQGIRARNYVHNTFAANKNTIMQTMVKPVMDALKK >NZ_CP039707|1347858:1389117|1375481_1375748_+|WP_173959150.1|DBSCAN-SWA MADTPDRSAEFLKALQKGKVVAVGNKGTGEVDVTGLADGTVVKDGDYQVVFDTDNTKTLSSVASDPVDAPGATVPTTPTTPTTPPSQG >NZ_CP039707|1347858:1389117|1378231_1378393_+|WP_003582283.1|DBSCAN-SWA MGYSLQEFMKLTPNLWLKQYLIYIEINNPDGIYKEKPKPIRKQVTLDDIPFFN >NZ_CP039707|1347858:1389117|1355012_1356152_-|WP_173959132.1|integrase|DBSCAN-SWA MATISITQENTGKWRYRVYYYDNQGIRHAKSKRGYARQAAAKRDAQILASELEQGANMLDREVGFVNYFEEWLTRYKRGKHAKVTENRYDYFKAALEDFFGVAKLKDITLDRWQDFINSYGKTHAKDTVRKINAYVRGMVKTAINNQILNRDFTQGVEFVGKAAKGPGLKFLELPFLKKLKDLVYKTANFQANTSYAIAVGLGTGMRYSEVVGLTWADVDFKNQQLNIDKTWDYHFGQGLMPTKTPSSVRVIDMPDDLTQLLKKLKKEQTEAFMAQGYRDPLNLVFRSTRHLVPTDAATNKMLKSYQTQIQVPAHKQITFHGLRHDHVAYLASQNVDIYYISRRLGHKDVSMTLRIYEHMFKKAEAKQVKKTLKALDNL 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48 | Lactobacillus_phage(95.24%) | head,portal,tail,integrase,holin,tRNA,protease,terminase | attL 1333777:1333791|attR 1382452:1382466 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1502601 : 1556994
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039707|1502601:1556994|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(25.0%) | head,portal,capsid,integrase,tRNA,terminase | attL 1515204:1515220|attR 1560156:1560172 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2825041 : 2904735
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039707|2825041:2904735|DBSCAN-SWA 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76 | Bacillus_phage(26.67%) | bacteriocin,transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 8565
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039709|0:8565|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039709|0:8565|2908_3238_+|WP_080596909.1|transposase|DBSCAN-SWA MTDEEYFMTNTAIRYTPEFKQTLIDLHEKGHSFKELHEEYGPSLDTIRKWVQAATVIAIDHQGTAVTNEQFKQLQKENRRLREELDILKRAAVLLAKRWRWSASSRQVK >NZ_CP039709|0:8565|4919_5783_+|WP_143145457.1|transposase|DBSCAN-SWA MIHSGRKAALFMIQDQLSRGHRITVILRALRIPSSTYYDWLRWHPKSRNRRRIKLKELVQVLWQRRKFYGYVWIAKRIRKLLKCRLSDRTIWKVMRELGIQSTMYRKRSKKPTTTTDMPQKPNLMRHLADLSEVVTTDITYIQLINQNWVYLATAYDPKARKVLAWQVGQQMTQDLAVAPIQALIHQGYTFKMVHSNMGSQYTSRLFETTLTDAHLRHSYSRKGKPADNGRIEAYHSLLKREWVRLEQINYESILDVTESIARYNTFYNHDRETNGRGACKRKSAAA >NZ_CP039709|0:8565|7425_8565_-|WP_011668826.1|DBSCAN-SWA MSKIQIEHLYKRYDNAENDTLKDINLEIDDKEFVAIIGPSGCGKSTLLRCFSGLEEVTKGKINVDGKRFDNIPPQKRSIAMVFQDYALYPHMTVYNNMAFNLKLSKFSKSEIDSRVKEAAQKLNLTDYLARKPAQLSGGQRQRVALGRAMVRAPEVFLMDEPLSNLDAKLRVSTRQDIIELHKQLGTVTIYVTHDQAEAMAMADKILIMRDGVVQQYGKPEELYDNPRNLFVARFIGSPSMNILKGTLSNKGIFNSGGVNYDLSEFVKKEVLPTDKREIVLGFRPEKVTQVKKSGDNDTAPENSAQKEGFFVLSASKNLAEYMGGHTLVYLKTKDGVNIVTQTPKRIPNDDSHKKLDLYIRNSNIYLFDAKSGLTLQNG >NZ_CP039709|0:8565|6640_7322_+|WP_112199679.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGRHFQKDIILVAVGYYFRFSLSYRDIVELLRDRGITVHHTTVMRWVHHYGPIFKALWRRHQTAHAKSWRIDETYIRVKGRWAYLYRAIDSNGLTMDFELRKHRDYTASYHFLKRLLTTNGRPDRLVTDQYRATLKAVKHLIKQDYLSKSAHQCSKYRNNLIEQDHRFIKRHRVRSASFQSIRTASATLSGVETVHAIRKRTRRELSLIGFSVVDELEALLAA >NZ_CP039709|0:8565|3247_4189_-|WP_173959349.1|transposase|DBSCAN-SWA MGKKECRSDEQYQTIQQLAQEVNPDAGKLYGISKACRMMGVSRAAYYKWTHRKVTVHEQENQAIRDYIIELEEKNHYVFGVKRIMTYINAETQYHVSHGRVRRIMRLAGIRASIRVAKRDRQVEKKAFLLVNKLYTVNMGHAFHPVAPNVVWVTDCSEITYGKDNKQRLRLSAVKDLHDHSVIAWCVAPTETADLATKTMKLAIENNDGIKPDTVHSDQGTAYTSSTYNTFLAGEGITHSMSRPGTPGDNSPMESLWSHLKIERFSFEHCLSELEMMKRIEAAINWYNNERRQETLNGMTPMTYRNHAVKKTA >NZ_CP039709|0:8565|4122_4851_-|WP_003582147.1|DBSCAN-SWA MGRKGSRYTLEEKLFYIGLVREGGWAPWAVQREYGVRHNQVRQWLERFEATGVDGLKPRSVHQKYAEEFKLEIVQKYLAGHTSYPVLAREYGIPDNSVIVRWVSLYTSGQPLQTTGRARPMKDGRKTTQIERIEIAQWTIANDYNYGAAMQQFKISYGQVYAWVKKFKQGGESALEDRRGKAKKDNGQLTEIERLKLENKRLQARLVHVSTEAAVLKKLQELERRNAGQTNNIRPFNNLHKK >NZ_CP039709|0:8565|1608_2691_-|WP_072672328.1|DBSCAN-SWA MKILICVENLLMDGVKRVATVVGNELAKTNKVAYFTLATTPAFFELNAPLITTVNPVNTGKSFRGSKPLTKYSSQINDLIQVLIKGDYDVVILTAGLLTSFSSRIKARVPQVRIIAWLHNNYETYMDNYYRNMQSEFIAGLRSADRVVVLTSHDVIRFSKIQPRSIKIYNPLTIKRGIISSLTNHVISMVSRIDIQQKGLDLLVKIAANIPDDWEIRLAGSGPDENKLKNLISQMNVNNKLKLTGSLTDEQLAVHYQTSSIFMMTSRWEGLPLVIGEAMSFGLPVISMNNTGAQEYLNGGKFGVLTQDHRVHDLSIKLDTLMYSPSIRDYWANQALQRSHDFSLSDVTNQWQQLFKELNL >NZ_CP039709|0:8565|552_1380_-|WP_072672326.1|DBSCAN-SWA MRVKIVIATLTASLLLGGCSKLSNNSKTPSTSISSATKVSNSAKERMSSSSSSTVASPISSQASSVKEDTTDSRIQELNQKLSMAIGTTKKPTVDGLNANHNRLNMHYISNAYGYTVYYSVGATAKEFNASTLASETPYATFNKTAYVSTAAAVTAVNHHAQETGLPVIDLGSGVQGTIDRGAGQAYLTWQAGRWSVTVHASPVMGQDPVAMSKQLVALFNQYSLPIPSQVGAANFDVTDNGLNQTITWQEGAILYKVSARSAEIAIKMASSMSR |
8 | Shigella_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
11773 : 14549
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039709|11773:14549|DBSCAN-SWA GTTATGCCGTGATTTGGTAGATTCGTTTGAAGAAGTTCAGCTGATTCTTGAAGCCAAAACAGGATCGTTTGAGTGACTTGATGAGGCGGTTAACCCCTTCGATCGGACCGTTGGAATAAGGGCTGGTGACAGCGGCGAGAACAGCGACTTTGTGTCGCTTAAGCGTCGCGATCGTCATGTCCATTGCCGTACCGTTTGGCTCGTAAGTAGCTAACAGGTTTGCCAGTTCCGCGGGATGTTTCTTCACCATCAAAGCATCATGAAGCGCTAAGTAGGTCTCGTAGGTTTGCTTGAGCTTGGGCTCAGTATCAAGTGCAATATCGATGGCCTCCTGTTGCGTGACGTATTCATTCAAACCAAACAGGAACTGTTTGTGTTTAGCGTCAGGCGCAGTTTGATGAAAAAGCCGCCAGTTTGTCTTCATGATCTTATAAGGACGGCTGTGTTTGTCATCAAGCTGTTTGAGCGCTTGGACGCGTACCTGATCAAGGGCACGAGCCGCAAGTTGAATGATATGGAACCGATCAATGACGACTTGGGCCTTGGGGAAAACCTCATGAATAATCGTCTGATAAGCTGCATTCATGTCCATGGTGACCGTCTGGACCCGAGTGCGTTCAGCGAGTGAATAATGAGCGATGAAGAAGTTTTTAATCGTGCGGTTGAATCGGTCACCAAGCAAGGCAATCAGACGATGTGAATCGGCATCAAGACAGATAAACGACATCATGCCATGAGTGGAACGGAACTCATCAAAGCAGAGTCGCGTGGGTAGCCGGCGAGCCGGTCGGAGTTTGAGATTTTGGTCAATGATCCGTTGAACCGAGGAAGCTGAGATCCCGATAATACGGGCGATGGTTTTGACTGGCAACCGTTCATGCGCTAACTTCATGATTCGCTCTGTCATGTGAGCGGCGATCGTGTGGTTGGGTTGCACGAGTGGCGTCTTGGCACTGACTGTGTGGTAACAGTTATGACAGCGCCATCGTTGCTTGTGCAAGTCAATGACTGTCGGCATTTCAACCCCATTGAGGACGCGCACGTGGGCCGTGTAAAACCCGTTAGGGTGCAAGGCCTCAAAGCCACACAGTGGGCACCGGGTTAACCGGTAAGTCAGCTCGGCATCAATCACATGATACTGGCGGCGACGTACCCCGTTGCCGCGATATTCATGACGAACAAAGGCAACTTTGATATTATGGTCTGGTATTCCAAGGACGGACAGTGTAGGATCGTATTGGGACATTTACTCATAACCTCGCTTGCTTTTGGTTTCGACGCTAACAAGCATAGCATGGACACTGAGTAGGTGTCTTTTTGCGTTATCCAAAAAGGGCCTACACGTTCAGTGTTGATTATTTCTCAACACCAGAAAGTGTAGACCCAATAAAAATAGTACAAGAGACCAGGTCAATCTGACCTGGTCTCTTGTACTATTTTTGTAATGTTCATATTATTCAGCAGTTGGATCCTCTGGACTTAATTACTCATAATTAAACTCAGGCTATGTGCATACATGACCAATGAACTAGTTCTAAAAACTATCAACCGTGCGGTTGATAAATATAAACCAAGCAATTTAATTATTTATACAGATTTAGGATCTCAATATACCAGCGATGATTACAATCAACGTTTAACTGAACTACATATCCGCCACTCATACAGCCGTAAGGGTTGTCCGTATGATAATGCGCCAATGGAATCCTTTCACGCTTCCCTCAAAAAGGAATGTGTTTATCCAGTGCCGGTCTTTGAAGATTATGAAACTGTCGCTGCCGTCCTTTTTGAATATGTGCATGCTTTCTACAATAGGAAGAGAATTCATAGTTCACTGGGCTACCAGACCCCCTTACAAGTTGAAATTGCAACACTTACGAGCCAAATGGCCGCCTGATTTAATGCTTTCCAGGGTTCAAATAAGTTATTAATCGCGATTAATGATTTATTTGAGCTGTGGAAGGTAAACGCGGTTCTGAATGTCTCTTAAAATCTGTCTCAAATATTGACTTCAATCCAATATTAAACCAACAGTATAAATGTAACGATAGAGTGTACCCTATTGTAACTAAAGAGAGAAGGGAGTGTTATTAGTTACATATAAGTGACCCGGATGTGATCTAGAATTGTCTAAAATCGGTTATGCGCGTGTTAGTACGCGTGATCAAAATCTGGCGCGTCAAATTGAACAGCTACATGATGCCGGTGTTAATAAAATCTTTCAAGAGAAGCTTTCAGGTAAAAATGCCGATCGTCCTCAACTGAAAGCAATGTTAGACTATATTCGTGATGATGATGAAGTAGTGGTACTGAGCCTTGATCGACTTGGTCGCAATTCTCATGATTTGACTGACATCATCGAAACCATTCGGCATCGTGGAGCTCAATTGAACGTTCTAAATCTACCTAGCTTTGCAAGTATTGAAGATACTAACCTTCGTAACTTGATTACGACAATTATTGTCGAACTATATAAGTATATTGCTCAAGAAGAGCGCGAAACTATTAAGATACGGCAACAACAAGGCATAGAAATTGCCAAACGCCAGGGCAAATATAAAGGCAAAATTCGCGAATATGGTCCTCATTCACCTAATCGTCAAAAACGCTATATTTATAAAGAAGCCTGTCGCCTTTTAAATAGGAAGAAAGACGGAGATGAAACTCTGACCAAGCGACAAATTGCCCGCATGTTAGGTATTGCACCAGTAACCTTATATCGCATCGAAAAGTATCAGGCAGAAGATCTAGCAAATGTTCCCCGTAGTGAGAGGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039709|11773:14549|13898_14549_+|WP_072672273.1|DBSCAN-SWA MSKIGYARVSTRDQNLARQIEQLHDAGVNKIFQEKLSGKNADRPQLKAMLDYIRDDDEVVVLSLDRLGRNSHDLTDIIETIRHRGAQLNVLNLPSFASIEDTNLRNLITTIIVELYKYIAQEERETIKIRQQQGIEIAKRQGKYKGKIREYGPHSPNRQKRYIYKEACRLLNRKKDGDETLTKRQIARMLGIAPVTLYRIEKYQAEDLANVPRSER >NZ_CP039709|11773:14549|11773_13018_-|WP_013245703.1|transposase|DBSCAN-SWA MSQYDPTLSVLGIPDHNIKVAFVRHEYRGNGVRRRQYHVIDAELTYRLTRCPLCGFEALHPNGFYTAHVRVLNGVEMPTVIDLHKQRWRCHNCYHTVSAKTPLVQPNHTIAAHMTERIMKLAHERLPVKTIARIIGISASSVQRIIDQNLKLRPARRLPTRLCFDEFRSTHGMMSFICLDADSHRLIALLGDRFNRTIKNFFIAHYSLAERTRVQTVTMDMNAAYQTIIHEVFPKAQVVIDRFHIIQLAARALDQVRVQALKQLDDKHSRPYKIMKTNWRLFHQTAPDAKHKQFLFGLNEYVTQQEAIDIALDTEPKLKQTYETYLALHDALMVKKHPAELANLLATYEPNGTAMDMTIATLKRHKVAVLAAVTSPYSNGPIEGVNRLIKSLKRSCFGFKNQLNFFKRIYQITA |
2 | Streptococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
34616 : 35779
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039709|34616:35779|DBSCAN-SWA GCTAAGCGACTTTTTGTGAAGCTTGGTCATACAAGGAAAGCCATGCTACTGGTGCAAGATAGTCTAAGCGTGCTTGTACCCTTACGCGGTTGTAAAAGGTCTCGATGTAAGCGAAGACTTGCGCTCTCAGATCATTGATATCTTTAAATTGTATCTGATAAATGAGCTCTTTCTTCATGATGGCAAAGAAGCTTTCGCTCCAAGCGTTATCACCCGGTTTTCCCAATGCTGAGAAGCTACGTTGCCAATGATATTGGTTGACCAACTTTGTCACTGCTTTGGCCGTGTATTGGCTACCACGGTCACTATGAAAAATACACGTTTCTGGCAAAGCCCACCTTTGGTGGGCTTGTTTAAGTGTCGCTAAGACTAAATCCTTGTCCATATGATTGGATATTTGATGAGCTAACACTAGGTTGCTGGTCAAATCCCTTATTTGGCAAATGTAAGCTTTTCCTTCTGATGTTGTCGTCTGTGTAATGTCACTTGATAAGGCTTCAAACGGCTTAAAAGATTGGTGTTTCACTAGATTGGGATAATCACCTTGACGAGCAAGGCAGCTATCGGTCAAACTCTTCCGATGACGACAACGTAGCGTTGAATACAGACCGGCATCAGCCATCAGACGGGCAACTCGGTGATAGGAAGCTTTATTACCATTTTTACGCAATAAACCGCAGATGCGTTTGGGCCCGTAAGTGCCCTGTCCTTGATCAAAAAAGTGTTTGATTCGTTGACGATATTGCCTTTCTTTGGCGTTTCGCTTTGGCAAAGCTCTCCGCCAAGCATAATAACCACTCGTTGATACGTCTAACAAACGCGCCCACCTTACCACAGAAACAGAGGTTTCCCTCAACATAAAAGCATACTTATCGCTGGGGGTTACTTCTGGAGACTGGCAAAGTAGGCGGCGGCTTTTTTTAACATATCACGCTCCAATGCTAATTCGGCATTTTCACGTTTTAAGGCACGGTTCTCAGCTTCTAAAGAAGCAAACGGCGTTTGCTTTCCATCTTCGGTATATAGCTTCCGCCAACGATACAGGGCACTTTCAGGAACACCAAGTTCGGAGGCAATGATTTTAACTGGTTTGGAAGAGTTAAAACTCAAACGTACCGCATTTTTCTTAAAATCTTGGTCGTAGCGATTGCGTGAATAGGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039709|34616:35779|34616_35779_-|WP_128538915.1|transposase|DBSCAN-SWA MTYSRNRYDQDFKKNAVRLSFNSSKPVKIIASELGVPESALYRWRKLYTEDGKQTPFASLEAENRALKRENAELALERDMFKKSRRLLCQSPEVTPSDKYAFMLRETSVSVVRWARLLDVSTSGYYAWRRALPKRNAKERQYRQRIKHFFDQGQGTYGPKRICGLLRKNGNKASYHRVARLMADAGLYSTLRCRHRKSLTDSCLARQGDYPNLVKHQSFKPFEALSSDITQTTTSEGKAYICQIRDLTSNLVLAHQISNHMDKDLVLATLKQAHQRWALPETCIFHSDRGSQYTAKAVTKLVNQYHWQRSFSALGKPGDNAWSESFFAIMKKELIYQIQFKDINDLRAQVFAYIETFYNRVRVQARLDYLAPVAWLSLYDQASQKVA |
1 | Acinetobacter_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
43046 : 46052
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039709|43046:46052|DBSCAN-SWA AATGCAATCCAAGCTAAATCTCAAACGCCCGCTAACAATAACCGTTGCCAACGCTAAGGGAGGAGTTGGAAAGACGACCATCACGCGCTATCTTCCTTATGATTTGGCAGAACGTGGTTACAAGGTTCTCGTGATCGATGCTGACCCCCAAGCTAATTTGACGAAATCCATGGGGATCACCAAACAACAACATGATCCAGACAACATCTTTACAATTGATAAGTCAATGATGGCTGCTGTGCGTGACGGAAGCTTTAAAGGCGCTGTTCTTGAAATCGTACCTAATCTTTACGAATTACCATCTCAAATTGACTTTAGAGGTTTTGAAACCTTCCTTAGTAAGAAATACGGTGTTGCAGAAAAAGGTGATCCCGAATATCTTTCCGTTGAATCCAAAAAAGTTTCTCTCCTTAAGGGGCTTATCGAACCTATCAAAGCTGATTATGACTTTGTCTTCATTGACACACCACCAACTGCCGGACAATATGTTCGAAATGCGACATTTGCTAGTGATTATGTCATTATTGCTTTTCAAACTCAGTCTGATAGCCTTGATGGCGCTATTCAATTCATAAGCGATGACTTGACCGAACTTGTAGAAACCTTTGGGGCTAGAACTGACGTTCTTGGAATCCTTCCTAATCAAGTTTCTAAAAGTGGGGCAATCGATCAAGTAGTCATTAAAGACGCTATTGCCCGTTTTGGCCAACAAAATCTATTCGATCACATCATTCCCTTTGCACGTCGTATTCAAGCCGCTCCGAGAATGGGCCTCTCTCGGCAGGGATACTGGAACCAGAAATTGTTTGATGACATCGTAGATCCACTAACAGACGACTTTCTTCAAAGACTAAAGATTGTAGGTGAAGTAACCAATGGCTGACACAAAGAAAAACACTATCGGATTCTTCAATAAAGAAAAGAAGCACTCTCCAGATATGGCTTATAAAGAAGATATTCCGGTCAAGGAGACATACAAAGGATCTGGTCTAAAAGCTTTTGATCCTAGTGCTGAAAAAAAGACAACCCCAGTCACGCATAAAGTCAAAGATGCGCGCAGAACCATTCGAATTCCAAGACAACAATACTATGAACTGCTGGCACTTCTCGAACTGTCGCCAAATAAGTATGTATATGAACTAATTGCTGAGCTAGTAGATAGGGCTGTTAAAGAAATTTCTACCGATAGGCCCGACGAATTACGTCTTTATCAGCAAGCCATTGAAAGAATTAAAGCAACTGACGAGCGTAGAAGTCGTTGATACATGTGTAAATGTGTAAATGTGTAAATTTATACATAATCTAAATTGCCTGCTATGTTAGCAATAATAAAGTTACACATGTGTAAATGTGTAAATCTTTTGGCTTCCCTCGAAGTCGAAATCATGAAGTGTCCCTTGACTAATGCAACATCATGTGCGGAGAAGTATTCTAAGGCCGAAAAATTTAAAATCAGTAACCGCAACATGAAGTTCATTGAGTCGAAGAGTAGGGGAGGGCGGCCAAATCGACATCGTCCTTTTACAATCAACAAAGTAGAAGGCCCGGCTGAGGTTGAAAAACGTCTTATACAGCAACGAGACAAGGCAGCCAAAGCTGTCCGTCAGCTTAGCCACCTTGATGATAAAACCCTTCAGGCAACGCTCAAGCAACTGAGACAGGCCCAATCAGAAGATGAGATCAAAGCCGCGATCGACCAGGCCAAGTCTCTTGATCAAAAAGCGGCAATTCAGTCGCAGGCCCGGCAACATCAACAGAACCTTAGTCAGCTCCAGACCTCACTTGATCGAACGCACGCTGCCCTGAAGGCATGGAAGAAGCCGCATGGCCAATGCACTGTGAAAGCCCTGGGTGAGGCTAATATTGCCATTCGGTACTTCGCGACTGCTGACGGCATCACGCCTAAGCAGTACCGCTGGCTCGTCCCGGAAGATTTAGAGATCCCAGAACACGTGGCAGGACATCTCATGTTGGTCCCAGGGTGTGACGATGACGAACAGGTTGCCGTGATTGCTTATGTTAGGCACGACAAAATTCGAGAGTACAGCAATGGTAAAATTGTTCCTGCCGTAAAAATGTTAAAATTCTTGGACGACCATGCGACCACACAGCAACAAAGCGCCATCGCTGCGCACGAAAGGAAAATCACGGCCACATATGCTACCAAGCCGAAAAGTGGGCCGAAGCGGCGCCCAAAGATTCGCCGGCTGCTTAAGTTCAGCATTGAATCAAAGATCGAATTTCTGAAGAATCGCAACAACGGATCTGGTGCAAACAGTCTGAGAGATGACCATCTAACCAGCTATTGATCCTATGTTGAAGGTTATGCAGCTAACAATGCTTCTAACTCGTCCACGACTGAGAACCCGATGAGACTTAACTCTCGTCGGGTTCTTTTGCGTATTGCGTGAACAATTTCCACACCGCTCAACGTTGCACTAGCGGTTCGAATGCTTTGAAAGCTTGCTGAGCGGACACGATGACGTTTAATGAATCGGTGGTCCTGTTCAATCAAATTATTTCGATATTTGGAACATTGGTGGGCTGATTTGCTCAAATAGTCTTGCTTTATCAGGTGCTTCACTGCTTTCAGTGTTGCCCGATATTGATCAGTGACTAATCGATCAGGCCGACCATTGGTCGTCAAGAGACGCTTCAAAAAGTGATAGGATGCGGTATAATCGCGGTGTTTTCGTAGCTCAAAATCCATGGTCAAACCGTTACTGTCAATAGCGCGATACAAATAGGCCCAACGGCCTTTAACTCGAATATAGGTCTCATCGATTCGCCAACTTTTAGCGTGAGCTGTTTGATGCCGACGCCATAGAGCCTTAAAGATGGGGCCATAGTGATGAACCCAACGCATGACCGTGGTGTGATGAACAGTGATACCCCGATCCCGAAGCAATTCAACGATGTCACGATAGCTGAGACTGAATCTGAAATAGTAGCCAACGGCTACTAAGATGATGTCCTTTTGAAAGTGGCGTCCCTTAAAGTGATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039709|43046:46052|43046_43928_+|WP_003582592.1|DBSCAN-SWA MQSKLNLKRPLTITVANAKGGVGKTTITRYLPYDLAERGYKVLVIDADPQANLTKSMGITKQQHDPDNIFTIDKSMMAAVRDGSFKGAVLEIVPNLYELPSQIDFRGFETFLSKKYGVAEKGDPEYLSVESKKVSLLKGLIEPIKADYDFVFIDTPPTAGQYVRNATFASDYVIIAFQTQSDSLDGAIQFISDDLTELVETFGARTDVLGILPNQVSKSGAIDQVVIKDAIARFGQQNLFDHIIPFARRIQAAPRMGLSRQGYWNQKLFDDIVDPLTDDFLQRLKIVGEVTNG >NZ_CP039709|43046:46052|44442_45354_+|WP_173959348.1|DBSCAN-SWA MTNATSCAEKYSKAEKFKISNRNMKFIESKSRGGRPNRHRPFTINKVEGPAEVEKRLIQQRDKAAKAVRQLSHLDDKTLQATLKQLRQAQSEDEIKAAIDQAKSLDQKAAIQSQARQHQQNLSQLQTSLDRTHAALKAWKKPHGQCTVKALGEANIAIRYFATADGITPKQYRWLVPEDLEIPEHVAGHLMLVPGCDDDEQVAVIAYVRHDKIREYSNGKIVPAVKMLKFLDDHATTQQQSAIAAHERKITATYATKPKSGPKRRPKIRRLLKFSIESKIEFLKNRNNGSGANSLRDDHLTSY >NZ_CP039709|43046:46052|45368_46052_-|WP_002816607.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGRHFQKDIILVAVGYYFRFSLSYRDIVELLRDRGITVHHTTVMRWVHHYGPIFKALWRRHQTAHAKSWRIDETYIRVKGRWAYLYRAIDSNGLTMDFELRKHRDYTASYHFLKRLLTTNGRPDRLVTDQYRATLKAVKHLIKQDYLSKSAHQCSKYRNNLIEQDHRFIKRHRVRSASFQSIRTASATLSGVEIVHAIRKRTRRELSLIGFSVVDELEALLAA >NZ_CP039709|43046:46052|43920_44307_+|WP_003582590.1|DBSCAN-SWA MADTKKNTIGFFNKEKKHSPDMAYKEDIPVKETYKGSGLKAFDPSAEKKTTPVTHKVKDARRTIRIPRQQYYELLALLELSPNKYVYELIAELVDRAVKEISTDRPDELRLYQQAIERIKATDERRSR |
4 | Enterococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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