Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP054439 | Staphylococcus saprophyticus strain UTI-042y plasmid pUTI-042y-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP054438 | Staphylococcus saprophyticus strain UTI-042y chromosome, complete genome | 1 crisprs | WYL,csa3,DEDDh,cas3,DinG | 0 | 1 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP054438_1 | 1879564-1879669 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP054438_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP054438_1
>1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder TATACACTAATTTCACATTATATGTGAATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP054438_1
The CRISPR arrays of NZ_CP054438_1 >merge|NZ_CP054438|1|1879564-1879669|CRISPRCasFinder AGTAGTTCTTATGCATGAGCTTTAGCTCAGGTAATCCTTATACACTAATTTCACATTATATGTGAATTAGTAGTTCTTATACATGAGCTTTAGCTCAGGTAATCCT >NZ_CP054438|1|1|1879564-1879669|CRISPRCasFinder AGTAGTTCTTATGCATGAGCTTTAGCTCAGGTAATCCT TATACACTAATTTCACATTATATGTGAATT AGTAGTTCTTATACATGAGCTTTAGCTCAGGTAATCCT
>NZ_CP054438.1|WP_174543998.1|1877502_1878663_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MKLSLNNNSKHLSAPSIRQFSSRISGIKDCINLTIGQPDFPMPDVVKSAYIQAINENQTSYSHNKGLVETRNAVSQYFHQRYGFKYSSEEIIITNGASEALDTALRSIIDEGDEILIPGPVYSGYIPLIKTLGGVPVYIDTTETNYKVTPEAIEAHLTAKTKAILLNYPTNPTGVILNHNEVQALTETLKHMPIFVISDEIYAENTFTGKHTSFAEFPSIREQLLLVGGLSKSHSATGIRIGFLIGPEYLIEKLTFMHAYNCICANVPAQIACIAALNEGLEAPQYMNEAYIDRRNFLIQKLESLGFELDAKPEGAFYIFPSIQRFTENDFDFCVDVLENAHVAIVPGSSFTDIGKGHVRISYAYELDALKEAMRRLEDYLKNKYN >NZ_CP054438.1|WP_174543997.1|1876254_1877259_+|acyltransferase-family-protein MSQLKERDYFFDNARAMLIFLVVFGHLLQPYTEASKHLSSLYLTIYSFHMPGFLFISGYFAKKAGQAGYLEKVSKKLLIPYVIFFGFFSFYYYLTGKEDSMKFDPFDPVFALWFLLTLFFFHVILVIMKDYKPYYVLPIAIIISLFAGYSSNIDNYLSFSRTIMFFPIFYLGYLFTNKHIQTLKNKKLVPISIIILIVFYVTYTYHPINADWLLGDSPYMSLEGKQDLYSPIKRLLLYFIILITLFSFLNLIPEKEKFYTYIGRRTLYVYLLHGLVIGVIRGFGIYPFKDSVSILTYVYLLLFTTIIVYALSTRFVSKWTNPIINLQSPSKFKE >NZ_CP054438.1|WP_002483721.1|1875628_1876054_-|MarR-family-transcriptional-regulator MYKQLEQLITLTSNDLNLVSRRFGQRTDLTSEQLEMLRILYNYKKLSQYDLTMKINKEQSIVSRWIKKLCQMGYITSKQSNKDMRCKDLMVTEKSKALVEQINEVRIALIEARCQNLTAKDIESLNQLLKKLNAHHTYFIK >NZ_CP054438.1|WP_174543996.1|1871025_1875435_+|SH3-like-domain-containing-protein MAKKKNTYKVPSIVALTLAGIALTTHHAQAASNTQDQTPNKNVLDDEKALNQSEQIKSEISKPTTNISGTQTYQDPTQVKDASSNEDTNYDAQLDELNDQTSEQTSNQDTYNQETDVQEDQQDVSSDNDTKSLDTEQTSVEDNNQENEENNTDSIQSETNSTNEASQTSNDVSSNAEETNTNENSSDVANQNEPVAQNDKAETSNEDVASSDVKQDGTHSDDNASDDVTDQNKSETLNDKAETSNEDVASSDVKQDDTQSDANTSDDVTGQNESETQNDKAESSNEDVASSDVKQDDTQSDANASDDVTNQSESETQNDKAETSKEDDVASNEDVAFSDVKQYDTHSDANASDVADQNESETQDDKAETSNEDDVASSDVNQDDAHSDYSASDIADQNESETQNDKAESSNEDVASSDKQDDTHSDANASDIADQNESATQDDKATSKEDDVASNDKQDNAKVSTSSKEASTAENKVQPATFSAKVTPKLRVATTSANTAVATRSAVTKEATTRAALPKYSPKVNSSINNYIRKNNFKVPNYEQDIANYLPQYNYRYGKPEGIVMHDTANDNSTITGEINYMKNNYTSAFVHAYVDGDRIIETANTDYLAWGAGPQANDRFIHVELVHTHDYDSFARSINNYADYAATNLQYYGLVPDSAEYDGVGTVWTHQAVSNYLGGSDHSDPHGYLAAHNYSYDELYDLIYEKYLIKTGQAAAWGTTSSGSTGGTGGSTGSGNTGTTTPSKSGTVKVSENNGLGRINSKNDGLYTTVYDQKGKKTDRVNQTLKVTKSATLGKEQYYLVSDYNKGTLIGWVHKGDVSYNAAKATAKINKTYKIKPGEVIYTVPWGTSSQKAGSVSGKSAQTFKATKQQQIGKTNYIYGTVNNLTGWVSLSKLTAPSTTLSKPSTTAKLVVSNLTNQQGTVAKSNHGVYTSVYDKQGVQKSYVNGQTYKLSKKATLGSNAFYLITDNKTNTNLGWMQTGDITVKETAKKPAATQTQTVSKIGQLNATNSGIKTTVYDPKGKDASKFSGKTFTVTKQRTQGNNTYVLIQNTNQNTPIGWVNTKDINTRNLSKTTAKNGQYTVKATNNGLYAVPWGTKSQQLDTLKNVKNNQFNASKSVYVDKDEYIYGIVNNKTGWIAAKDLNSTTKTPSVTKSAVTPIKYDYIIHNQKGSYYIDPLTGKAAGSLKDFYEGIFTVFEKQVINGVTWYHGKLANGKVVWVKEDDLRKELVKYYKSGLTLDQAVAIQKGLKFKPQIQHTAGKWEDASATEIKNAMDSSKLIKDPTQKYQFLRLDKSQNISSADLDKLLVGKGILEGQGEAFSEAAKAYNINEVYLISHALLETGNGTSKLANGGDVVNGKVVTNGKDKYYNMFGIGAVDSDAVKQGFATAKNNGWNTVKKAIVGGAKFIAGSYINQGQNTLYKMRWNPENPGVHQYATDVAWAAHNATRIKGFYDSMGKLGKYFDVDTYK >NZ_CP054438.1|WP_174543995.1|1870367_1870790_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFNIVTTPKMMDDALEIRKEVFVKEQGVPLENEIDQFEDVATHVIGYDSNHIPFATGRFRPVNDSVKIERVAVRATHRKSGYGQLLMQFLETSAKQQGYNKLALNAQYHAKPFYEALGYKSTGDIFMEENIKHIAMTKII >NZ_CP054438.1|WP_174543994.1|1869819_1870290_+|DUF2538-family-protein MSRKTYEKLAHVNGMFNVLEQQLVHSKDMALFRNEFFYVNHEHRENYEALRIYYKDSDLNPVVDGACYIVALPEIFEKVDVFESELPFTWVYDQNGITDTMKQISVPIQYLIAAALEVTDVNLFKPSGFTMGMNNWNIAQMRIFWQYTAIVRKEAQ >NZ_CP054438.1|WP_174543993.1|1868506_1869799_+|LCP-family-protein MNKFLKYFLIFLSLVLVVVPIIFAIILLKSSQGAFESSFNDSDSSRKSNIRDSKVNPSKDPISILFLGIDDNSGREKNGQTAEKSRTDAMILSTFNADKEQIRMLSIPRDTISYIPKVGYYDKITHAHAYGGPTASMDSVEATLDLPVDYYVRINMEAFVDAVDELGGIKYDVPYNINEPNTNDTGKIKVKKGYQNLNGDEALAVARTRHQDSDLKRGQRQMDLIKKLFAKAQKADSFNKLDDVVEIVGKNAKHNLSYDEIKILATSYLKDDIKIKSSQLEGDDDYLNGIYYYNPDIKNILSTTNMLRSDLDLPKIKDKDELLNQRVIDYYGTLVPLTELDDNLLTKSQKDSSEDENSNENQSNENDNSNSETNNAEDYNNQQQTDQFGNEQNNVNQPQNDSNQQQNDPNQQQIDPNQQQNAQEVPTNQY >NZ_CP054438.1|WP_174543992.1|1866288_1867947_-|phospho-sugar-mutase MKALWLENINESLVKDFYETQTEEEQNAGFEGVLSFGTAGIRSTFGLGPARLNAFTVRKVALGLAQYLNHNVDDASVVIHFDTRFLSKAFSQEMASVLANNGITAIISDNYKSTPELSFAVRHLQVNAGIMITASHNPKNYNGIKIYNEKGGQLLPEASEQLSEYINSIETLLNIEKGDFNAFIENGKIKYMSNEVTESYKKEVKSLVGSIDAHDAKVILTSLHGTSLPLVSDILTELDYHNFVIEKEQSEPNGNFPTVAIANPEDEAAFALGKQLADKTDAQLIIATDPDADRLGFIERYGDNDFRYFNGNEIGLLLMKLRFQDLTEDSTPQYMIKSIVTSELAERLATSLNVEVNDVLTGFKFISDLIEQKQKDDDKQLLLAFEESHGYLAQPISRDKDAIQMVPLLVKYKNLLDKNGITFKETIEDIYENIGYFKDRTLAPTFEGKAGVKKIESIMAQFRNEQVFSICGMDVLKIEDYHVGEVRDMITGHTEKLTLPKTNLIKFIFENGFIALRPSGTEPKIKLYFSLEVENIDEITQQFEANYINNIV >NZ_CP054438.1|WP_174543991.1|1865092_1866268_-|beta-lactamase-family-protein MTTKILKKITIILIILLIVIIITIAYKLYHLSHQETPMVQNETKQETTNKQIGHLQTIVDNQNPQMMQINQYLEQVKFNGTAAVFENGQLKLNKGYGLQNIQENKQNQADTLYLIGSSQKFATGLMLKQLESENKINMNDSVTKYLPWFKTKQPITLNQLMLHKSGLFKYKASPNYKNLNEAVHAIQQKGIEPKFYNKNRYNDGNYLVLSRVIEEVTNKSYKKNFEDRISKPQHLNFTAFFDDPNFQAYMAKGYKKDGKFGKPLQQYPNVLEQYYGAGNLYMTPSDMGKLILGLQNNRILNSHISKPLIHESKTSKYPQPYRYGFYSFADKNRINGGFFGQVFTSYFNDKYIVILGTNYENSDVNNEQKIQHIYNQILKQGGPYNHVGKSY >NZ_CP054438.1|WP_174543990.1|1864131_1865040_+|ribonucleoside-hydrolase-RihC MKQPIIIDSDPGIDDAAAISIALNHPNFDLRMITTVNGNVGIEKTTANALKLKRFFSSTVPVHRGSSQPLLSEIVDASAVHGESGMGGYDFPKINYNDLSSTHAVEAMRKELQSSEDPITLIPIGPLTNIALLLSTYPEVKDYIKEIVLMGGSAARGNVTPLAEFNIYCDPEAAHIVFNSGLPITMVGLDVARSSTLSHATVNELQSLNKTGDMLHQLFKHYKGDDFEKGINVYDAYTILYLLHPEKFDVKEADVQIETTGTLTKGATVTDFNTHFPNCSVVMSIETNDFKKLFIEALKYCI >NZ_CP054438.1|WP_174543999.1|1879696_1880515_-|1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA-synthase MTRQWETIREYEEIKYELYDGIAKVTINRPEVRNAFTPNTVQEMIDAFTRARDDQRISVIILTGEGDKAFCSGGDQKVRGHGGYVGDDQIPRLNVLDLQRLIRVIPKPVVAMVRGYAIGGGNVLNVVCDLTIAADNAIFGQTGPKVGSFDAGYGSGYLARIVGHKKAREIWYLCRQYNAQEALDMGLVNTVVPLDQVEDETVQWCQEMKQHSPTALRFLKAAMNADTDGLAGLQQMAGDATLLYYTTDEAKEGRDAFKEKRDPDFDQFPKFP >NZ_CP054438.1|WP_174544000.1|1880507_1881314_-|2-succinyl-6-hydroxy-2,-4-cyclohexadiene-1-carboxylate-synthase MLHYKFHQSTVPTDKLLVMLHGFISDQQTFDQHIHSLNKNINILTIDLPGHGADQSDLEDKWDFPFISHELDQTLRLFTNYQIYLHGYSMGGRIGLYYALYGQAQLTGLILESTSPGIENSDERQERQLVDQARAKVLEIAGLEVFVNDWEKLPLFYTQYELDKSTRNAIRDMRLRQNPMRLAKALRDYGTGQMPNLWPQLNQIQIPTCIIVGELDGKFCKIAKNIVSVMPNFEMHVVANSGHTIHVEEMAEFDRIVIGFINKEEQND >NZ_CP054438.1|WP_174544001.1|1881300_1882983_-|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylic-acid-synthase MNNHTDALTKQVFTIVSELYAYGIREVVISPGSRSTPLAIAIEAHPKLKSWIHPDERSAAFFAMGLMKGSEKPVAILCTSGSAAANYTPAISESSLSHLPLVVLTSDRPHELRGIGAPQAINQTNMFANYVQYQFDFPIAEKNDNEDIMANTIKFQLQKASQFLYGPHRGPIHLNLPFREPLTPNTEKVEWLTSDTKILPHYQKTTSLNEISAMMKKRKGLIIVGDMQHQDVDQILTFSTIHDMPILADPLSQLRREHHPNVVATYDLLLRSGLELEADFVIRVGKPVISKKLNQWLKVTEAFQILVQNNDRPDAFPITPHVSYEMSANDFFRQLSEMPTVERKQWLEKWQTVEKHAIVEIKDHLRTATDEAAYVGNVLDKLTKDDAIFVSNSMPIRDVDNLFIDCEAEVFANRGANGIDGVTSTALGMAVHKKITLLIGDLAFYHDMNGLLMSKLNDIQLNIVLLNNDGGGIFSYLPQKNEADAYFERLFGTPTGLNFEHTALLYDFAFDRFDTIEAFKYADLSQFGSHIYEIMTHREDNKQQHLKLYKKLSDIIDVTL >NZ_CP054438.1|WP_011303459.1|1882975_1884328_-|isochorismate-synthase MTLDLRESEIVEAVYESNHTWVSVEAKIDYELDPTVLFHLTEENAGDRFYYKKNDNKTSFFGYHAITRFKNDFENKQSIFREWQKYKSDIELIHPSSDKHHLKICGGFQFSMHKSGDEWREFGINHFILPEVLITMENGVSYITYTVKAEQFEIEQFKALIAHLTQNTIDSEFEIGNIKRIEDIYKDEWRDLVKDTIDVLDEHKKIVLARKRLVMFDKNINIPYILQKASQGEHNSYLFVLESQDSIFFSQTPEQLMEVNNGILSTKAVAGTIKRTHQDEVDKENIQAFLNDDKNLNEHRFVVESILNDIAPYVRDITFNETPQILTNDHLYHLYTKIKGQLENDSYIGLLDNLHPTPALGGYPKAEAIEYIEQNEFGTRGLYGAPVGYIDMNDDCEFIVAIRSMLIKKNQATLFAGCGIVKNSDADSEVEETAVKFNPMMKALGVEEYE >NZ_CP054438.1|WP_174544002.1|1884516_1885455_+|1,4-dihydroxy-2-naphthoate-polyprenyltransferase MSSQYQQYSTVKKYWQLMRPHTLTAAVVPVLVGTASAKLFLLGSEDHLKLSLLLAMLIACLLIQAATNMFNEYYDFKKGLDDHTSVGIGGAIVRNGMSPKLVMNLAIAFYIIAALLGIFIAIQSSFWLLPIGLVCMAVGYLYTGGPLPISWTPFGELFSGVFMGMIIILIAFFIQTGNLQSLVVWISIPVVITIGLINMANNIRDRVKDKESGRKTLPILLGKNNSVRFLGLMYIIAYVLVIYITFFIPGGSIFFLLALLSFPMPIKAVRRFKKNDTPQTMMPAMAATGKTNTFFGLLYALGIYISALLGGI >NZ_CP054438.1|WP_002483730.1|1885565_1886123_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRKANPNDIQKIAELCYIIWQELEVDMVKGIEKERLLKVMEQSMIEVPYRGHYSNTWIYEIDGEVAGCLIAYPGNKELEMERAWLDMTLDDDIRAYGSPMPMKEANDDEWYIETVATFPQYRGRGVATQLVKHVLNAYKDEKWSLNCDVTNEGALSVYKKLGFEANSKFDLYGHIHYHMVYKAN >NZ_CP054438.1|WP_011303462.1|1886300_1886513_+|TM2-domain-containing-protein MKVNKVIYVVLAFILGWCGIHKFYSNQLLQGILHLIFFWTGIPYIIAIISGLLTIFFNKADEDGLIILEK >NZ_CP054438.1|WP_174544003.1|1886809_1887238_-|organic-hydroperoxide-resistance-protein MVKPLYETKVISNGGRDGKVFSEDNTFYQDLAVPKEMGGNGVTESNPEQLFAAGYSSCFNNAIMHILKSDSKGTIEPEVSVTAYLLPDKNDGGVKLAAELDVTLTDMTQEEAENYVEKAHNYCPYSKALKESIDIEIQVSVN >NZ_CP054438.1|WP_174544004.1|1888009_1889008_-|restriction-endonuclease-subunit-S MMKLSDRVWKTFDIEEVFEIVNLKPEHKVNLKILGNIPYVTRTEKNNGIESFYKGLHIKNGNCITFGAETAKFYYQEYDFINGNKLYAIYNDNLNKYIALFLTTLFKNQFSDYGYGFGLTGTRFSKKKIKLPTLDNQPDYDFMEKYIKDKYFILKSKIKDKQKYEIYDYRELNEVEWKDYYINTLFNFKRGNQNNMSDLKSGELPLISAKKTNNGYKDFVKKNNKQIYPSKIISLNNDGEGGVGIAYYQPFKSLIDTHVTALINKYRINKHAKLFVARMITTQRNKFSHGYAISTNRLNRQIIKLPTINKQPDYKFMEQYMKRKENEVLDRL >NZ_CP054438.1|WP_174544005.1|1888991_1890884_-|N-6-DNA-methylase MNEKTGIDQFMRKEIEALGVDYDEEQSSNIEIAEALKTASKSLSGKSGKPEFLFFSNDFLVVVEDKKDIHKHEMKSENDELILDSPKILKDYAVNGAVHYARHIIKNTNIIDKVFAIGASGDGHTNQISIYYVDSEQYKFVDNVKSLEDIHPDNIIEFYKVSVLGELTKEEKEVQDVKKFAAEIHEDLRNYGSLESERKASVVSAILLALENEDEIFNLNMLSGLEDDGVKDGDKIYSAVQMYLNKNADIRPAKNGEILESFMFIKNDLKLNRVHDQLNMTPLKYFSIKLKNKFIHNDMDVLGSFYGEFVKYGGNDGNALGIVLTPRHITNLMCELIDINYTDFVLDPCCGSGGFLVTAMNRMLKQVDSKDSINSIKQNQIHGIELTQNLFTTATTNMILRGDGKSNLRRDDIFHVNKDDYTDKINKVLLNPPYSQAKTKNLSHLSEISFIKEALEYVKIGGKLAAIVPQSTMIGKTKHDKNYKREILEYNSLETVITLNKDTFYGVGVNPCIAIFTAGIPQDERKRVNFVNFADDGYEVRKHIGLVGNGTEKSKKVNLFEVLNDFKEPDTNFLVKSPISWEDEWLHSFFYYNEEIPTDEDFEKTIADYLSFEFDMKLHGRGYLFDDETE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP054438_1 | 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder | 1879602-1879631 | 30 | NC_049445 | Acinetobacter phage AbTZA1, complete genome | 32098-32127 | 5 | 0.833 |
NZ_CP054438_1 | 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder | 1879602-1879631 | 30 | NC_049494 | Acinetobacter phage vB_AbaM_PhT2, complete genome | 25414-25443 | 6 | 0.8 |
NZ_CP054438_1 | 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder | 1879602-1879631 | 30 | X53751 | Clostridium botulinum C phage gene for C1 neurotoxin | 986-1015 | 7 | 0.767 |
NZ_CP054438_1 | 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder | 1879602-1879631 | 30 | NC_007581 | Clostridium phage c-st, complete genome | 76437-76466 | 7 | 0.767 |
NZ_CP054438_1 | 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder | 1879602-1879631 | 30 | D90210 | Clostridium phage c-st gene for botulinum C1 neurotoxin, complete cds | 1093-1122 | 7 | 0.767 |
NZ_CP054438_1 | 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder | 1879602-1879631 | 30 | X72793 | Clostridium botulinum C phage BONT/C1, ANTP-139, ANTP-33, ANTP-17, ANTP-70 genes and ORF-22 | 8804-8833 | 7 | 0.767 |
NZ_CP054438_1 | 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder | 1879602-1879631 | 30 | AP008983 | Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome | 76437-76466 | 7 | 0.767 |
NZ_CP054438_1 | 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder | 1879602-1879631 | 30 | NZ_CP021285 | Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence | 21377-21406 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054438_1 | 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder | 1879602-1879631 | 30 | NZ_CP015940 | Legionella pneumophila strain C8_S plasmid unnamed1, complete sequence | 22228-22257 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054438_1 | 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder | 1879602-1879631 | 30 | NZ_CP021271 | Legionella pneumophila strain D-7787 plasmid unnamed, complete sequence | 20106-20135 | 8 | 0.733 |
NZ_CP054438_1 | 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder | 1879602-1879631 | 30 | NC_006366 | Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL, complete sequence | 38879-38908 | 8 | 0.733 |
1. spacer 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder matches to NC_049445 (Acinetobacter phage AbTZA1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tatacactaatttcacattatatgtgaatt CRISPR spacer tttacactaatttcacattatatagtgatt Protospacer * *********************. .***
2. spacer 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder matches to NC_049494 (Acinetobacter phage vB_AbaM_PhT2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tatacactaatttcacattatatgtgaatt CRISPR spacer tttacactaatttcacgttatatagtgatt Protospacer * **************.******. .***
3. spacer 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder matches to X53751 (Clostridium botulinum C phage gene for C1 neurotoxin) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tatacactaatttcacattatatgtgaatt CRISPR spacer catactctaatttcacattatattgagaat Protospacer .**** ***************** ..* *
4. spacer 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder matches to NC_007581 (Clostridium phage c-st, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tatacactaatttcacattatatgtgaatt CRISPR spacer catactctaatttcacattatattgagaat Protospacer .**** ***************** ..* *
5. spacer 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder matches to D90210 (Clostridium phage c-st gene for botulinum C1 neurotoxin, complete cds) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tatacactaatttcacattatatgtgaatt CRISPR spacer catactctaatttcacattatattgagaat Protospacer .**** ***************** ..* *
6. spacer 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder matches to X72793 (Clostridium botulinum C phage BONT/C1, ANTP-139, ANTP-33, ANTP-17, ANTP-70 genes and ORF-22) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tatacactaatttcacattatatgtgaatt CRISPR spacer catactctaatttcacattatattgagaat Protospacer .**** ***************** ..* *
7. spacer 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder matches to AP008983 (Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tatacactaatttcacattatatgtgaatt CRISPR spacer catactctaatttcacattatattgagaat Protospacer .**** ***************** ..* *
8. spacer 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021285 (Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tatacactaatttcacattatatgtgaatt CRISPR spacer tatacactaattcctcattatattgacaag Protospacer ************.* ******** . *
9. spacer 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015940 (Legionella pneumophila strain C8_S plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tatacactaatttcacattatatgtgaatt CRISPR spacer tatacactaattcctcattatattgacaag Protospacer ************.* ******** . *
10. spacer 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021271 (Legionella pneumophila strain D-7787 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tatacactaatttcacattatatgtgaatt CRISPR spacer tatacactaattcctcattatattgacaag Protospacer ************.* ******** . *
11. spacer 1.1|1879602|30|NZ_CP054438|CRISPRCasFinder matches to NC_006366 (Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tatacactaatttcacattatatgtgaatt CRISPR spacer tatacactaattcctcattatattgacaag Protospacer ************.* ******** . *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1111363 : 1145503
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP054438|1111363:1145503|DBSCAN-SWA AGTGGATTTTTGGTTAAAACAACAGGCGCAACAAAAGGGTGAACATATATTTATTGATGATGGTGAAACGCAAGTCACGTTTGCGACAATGTACGACAGAGCTTCAAAACTTGCTTGTACTTTACATCAGTTAAATAAAAAGAGAATAGGCTTTTATATTGATAATACTATTGAATCTGTTTTGCTTATTAATGCTGCTTGGCTGGCAGGGATTGAAGCAGCTATGATAAATACTCGGTTAACTCGAAATGAGATGATAGCACAGATGGATTCAATAAATGTTGATACAGTAATTTCCATGCATGATCTTGAATTAGAACATATTCAAGTTGTGCCTTTTAATGAGCTTATTTCAGTTAATAATGATAAGTATTTTGAAGAGATATTTTCATTAACGCGTATAGCATCTATTATGTTTACATCCGGTACTACAGGGCCACAAAAAGCAGTGCCGCAAACATTCAATAATCATTTGGCGAGTGCTCTTGGATGTCGAGAAAGCTTGGGCTTTAATGAGAAAACAAAATGGTTATCTGTGTTACCGATATATCATATTTCAGGATTAAGTGTCGTATTACGTTCATTAATTGAAGGCTTCACATTACGGTTAGAATCAAAATTTAATACGGAGCAAATGTTAAATATCATAAAAAATGAAGCGCCAACGCATGTATCGCTAGTGCCACAAACATTAAAATGGTTAATGGATGCTGGATTACACCGTCCATTCTATATTGAGAAAATACTGTTAGGTGGGGCTAAGCTTTCTCGTAACTTAATTCAACAAGCTTTAAGCTATGATTTACCAATATATAATTCGTTTGGCATGACAGAGACATGCTCGCAATTTTTAACGGCGACACCTGAAATGCTTGAACATCGATTTGATACTGTTGGCAAACCGAGTAATGATGTTGAAGTTAAAATTAAATCACCTAATATAGATGGACATGGAGAACTATTGATTAAAGGTAAAAATGTAATGGATGGTTATCTTTTTCCTAAAGTAAAAATGGATACATTCGAAGACGGTTATTTTAAAACTGGTGATATAGCGGAAATAGATGAGGAAGGCTACGTCATGATATACGATCGTAGAAAAGATTTAATTATTAGCGGTGGTGAAAACATATACCCATTTGAAATAGAATCTGTAGCCAAACAATTCCCTAATATCGAAGATGCTATGTGTATCGGTGTTGAGGACGATACTTGGGGTTCAGTACCTTATCTGTATTATGTTGCAAATAAAGATATCGCAGAAGAACAATTAACTGTGTTTTTTAAAGAAAAACTTGCAAAATATAAAGTACCTAAACAATTTCAACGAGTATCTCGTTTACCTTACACGTCAACTGGTAAACTTCAAAGAACGCGTTTATAATCTTAACTAAGGAGTACATATGAAAATAGTTAACATGCATTTGTATGATTATAATGCAAAATTTAAAACACCTGTCATTACCCCTAAAGTAAAAATGAATACGCGCAAAGCGCTTTTCGTTGAATTAATAACAGATAAAGGTAAATCATATTTTGGTGAAAGCAATGCGTTTGAAACGAATTGGTATGCAAATGAAACAATAGAGGATGTAAAACATTTTTCAAAACTATGGTTTCAACAGGTTCAGGGTAAAACGTTTCATTCTTTTTTAGAAATTCAAGATGCATTAACGCAATTATCTAATTATCCTGCAACACGTAGCATGTTGGTGATGGCTTGTTATCAAATGTTTCATGTTTTAGAATCATTGAATGTGCCTTATGGCGCGACAGTTAATGGCATGACTTCAAGAAATTTTCAACAACTTGTTCAAACGCAACCGCAACGCGTAAAGCTTAAATGGAATGCTGATATCTTAGATGATGTGGAAAAGGTGTCACAATTAGCTTTTCGACCTGATATAGCCATCGATGCGAATGAATCATTAAGCAAAGTAGATTATGATAAATTAAAAACACTAAGTGAAGCGCAAATATTATATATTGAGGAACCTTTTAAGTCACTACAACATTTAACACATTTTGAAAAAAATGAACTACCACCCGTTGCGATTGACGAGAAAGCGACATCTAAATCACTTATTTCACAAGCTATTAATGATTTTGGCATTGATGTCGTTGTGTTAAAACCATTTAGATTGGGTGGCATAGATAAAGTGATGGATTTGATAAAAATGCTCAATACTCTAGATGTGAAAATCGTGATAGGTGGTATGTATGAATATGGCCTAAGTAGGTATTTTACAGCGATGTTAGCACAATATGCTGATTATCCTAGTGATATTACACCAGAAGGTTATTACTACGAGGTAGATATGATTAATCAGGCAGGTATATTAAAAGGAGGCTCAATTTATTTTGAGCCTCCAGTGGTAAATCATAAGATATTGAATTTTATTTGTTAATGTTTTTATCTTTTTTATGCTTTGTTTTCTTTAGCGGTACGGGATCAAAGCCACCTTTATGAAGCGGGTGACATTTTGAAATTCTTTTAATACCTAACCATGTGCCTTTGAAGGGACCATACACTACTATGGCTTCTCTAGTATATTCAGAACAGGTTGGATAAAAACGACAAGTTGCAGGGGTTAATGGTGATATAAAGCGTTGATATATATGGATAAGTCCTAGAAATATAGTTTTCATAATTTTGCCTCCAACAAAAATCTTAGCATAGCTAGTTTAACATAATAAGGGGAAGAGTGATGTATGTGAAGTTTAAAGACAAAGAAAATGACGATGTGTACCTAACATTTAAAAAGAAAGCAGATTATGCCAACGGTAATCATGTACTTATAATCCCTAAATATAAGGGTAGCTTGTTATTCACAAAACATAAAATACGTGGTATTGAATTTCCGGGTGGTAAAAGAGAAAAAGGTGAGGCGAGTGAAACTGCTGCAGCACGAGAAGTCTTTGAAGAAACTGGCGCAACGATTAAATACTGTGAATACATAGCGCAATATAAGGTTGATCGTCAAATTGGAATGTCCTTTACTAAAGATGTCTTTATGGTGGAGATAGAAGCTATCACTGAGCAACCAGATTATTTTGAAACGGATGGACCACTATTGTATAAATCATTATCTGAGATTCCAGAAGATAAAAAAAGTTACTTATTGAAAGATCCAGCAATATTACAATGTTTAGAGAGAGTGATTGAACTTGGATTTTATTCATAAAAAGAGAATGCCGGTTGAATCAAATAGCCATATATTTGATGAAGTAATCTATAGAGTAGATCATTTAAATGTTAAGGGGCTGCTGATGACACCTCATGCAAAAGTGCAGAGAATTGTTTTATATTTACGAGGTGGTAAAGGGCAAGTAGGTAAGGTGAGAACGGGAAGATTGATGCAATTTGCGGATGAACATACATTGGTCTTTGGACCTTATTATAGAGGTAATAATGGTAGCGAAGGCAAAGATGAGTTTTATGGTTCGGATCTGCATGACGTTACAGTTGCGATACGTTTGTTAAATCAAAAGTACCCTGGTATTCCCATTCACATGATTGGTTTTTCTAGAGGTGGACTTCAAGGTTTATTAACATTTCAAGATTTACCGGTGACGAGTTATATTATTTGGGGCGGTGTCTCAGACATAAATCTGATGTATGAAGAACGCGTTGATTTAAGGGGAATGCTTAAACGTATGATTGGAGATCCTAAAAAGAATATAGAAGCTTATAAACAACGTGATGCTATCGCTCAAATTAAAAACACAAGCCCGCCCATATTTATAGTTCATGGGGGTAAGGATAAACAAGTAGGTATTCATAATGCTTACTATTTAGTGGAACAACTTGAAAAGATTGGTGCGACATTTCGTACTTATTACCAAATGTCGGAGGGACACGTACCAAGACCATTTGCGCTCAAAGATACGCTACTGGCAATTAAACAGTGGATGGATGATGTTGAACAGAACAAGCTTAAAAACCAATATGATAGATAAGATGTTATAGATATAAAGTATTTACAAATAAAAAGTAGCCATGTAGTTTTCTATTGTAATAGAAGACTACATGGCTACTTTTCTAATATTTTAAATTATTCAAATCCGCCATTGACGGCTAATTCGTCAACATCTTCTCCAAATTTTTCAAAATTAGATTTAAAACGATTAATTAAATCTTGAGCTTGTGTTCTGTATGCTTCTGGCTTACTCCAAGCATTGATAGGATTGAGCAATGTTTGAGGGACATCTTCTACTTCAACAGGAATATCTAATCCGAACATATCATCTTTCACATATTCTGCATCTCTCAATTTACCTGTAATGGCTTGATTAACCATTTGTCTTGTATAATTTAGGCTAATACGACGTCCAACGCCATACTTTCCGCCAGTCCAACCCGTGTTAACTAAGTAAACATCAACGCCATGTTTATCTATTAAGTTACCTAATAAATCAGCATAAACTTTAGCGTTTAATGGTAAGAATGGGGAACCAAAACAAGTAGAGAATGATGGTTCAGGCTCAGTAACGCCTCGTTCTGTTCCAGCTAATTTAGCAGTGAAACCACTTAAAAAATGATACATCGCTTGGTCTTTGGTTAATTTTGAAATAGGTGGTAATACACCAAATGCATCTGCAGTTAAGAAAATAATTGTATTAGGATGCGCTGCTTTAGATGGTGTCACAATATTATCAATGTGGTGAATAGGGTATGCAGCTCTAGTATTTTCCGTGTATTGATTGTCGTCAAAATCAACATCGCCTTCTTCATCAACAACAACGTTTTCTAGAATTGTTCCGTATTTAATAGCATCATAAATTTGTGGTTCTTTTTTCTGTGATAGATTAATTGCTTTTGCGTAACAGCCACCTTCGATGTTGAAGATACCGTTATTATTCCATCCATGCTCATCATCACCGATGAGTTTACGTGTAGGGTCAGCAGAAAGTGTTGTCTTTCCAGTACCTGATAAACCAAAGAATAGAGCTACGTCGCCTTTTTCGCCAACATTTGCTGAACAATGCATACTCATAAT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35 | Staphylococcus_phage(96.15%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1267273 : 1276395
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP054438|1267273:1276395|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP054438|1267273:1276395|1270487_1270748_+|WP_011302951.1|DBSCAN-SWA MQFTSLILPILLLVLMWFFLIRPQQKKAKEHREMISQVSSGQRVTTIGGIKGTVRSVDETTVVLTLNGNGTEITLEKPAIKQVDPS >NZ_CP054438|1267273:1276395|1267273_1268278_+|WP_002483095.1|DBSCAN-SWA MDDRMVDQSMHDEESSFELSLRPTKLRQYIGQSTIKSNLEVFIKAAKMRQEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRIISGPSIERPGDLAAILSSLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIVIGKGEEARSIRIDLPPFTLIGATTRAGSLTAPLRDRFGVHLRLEYYQELELKEIIVRTAEVLGTSIDDESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDELISIATTRASLQLLQVDDEGLDYIDHKMMNCILEQYKGGPVGLDTIAVSIGEERVTIEDVYEPFLIQKGFIERTPRGRKATPYAFEHFSKKNGKKE >NZ_CP054438|1267273:1276395|1268280_1269306_+|WP_041080566.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDIEAFDYHLPEALIAQTPLKNRDESRLLILGRQSGNIEHKHFKDVTDYLNEGDTLVLNDTRVMPARLFGMKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLTFGEGKIIAECIEELDQGGRIMRLHYDGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDQERYQTVYAKASGSAAAPTAGLHFTDELLERIKAQGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVDNIDDHEMHSEYYQMDEATANLLNSTRDNGNRIISVGTTSTRTLETIMQSSDRFVAKSGWTDIFIFPGFNFKAIDGLITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRDYIINAYNQAVASEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP054438|1267273:1276395|1271128_1273405_+|WP_174543882.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIVGFILLVVLLFAGMGLTYKNVVKDVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLQKGDKIDDKAVKATAKTLENRVNVLGVSEPKIQVEDNNRIRVQLAGVKNQSQARDILSSQANLTIRDADDNVKLTGKDIQQGSAKQEFKQNTNQPAVTFKLKDSDKFKKVTEEISKKDENVMVVWLDHEKGDTYHKEMDKKDPKYVSAASVDKPINSDSVEISGGFNGEEGVEKAKQIADLLNSGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVLAAAIGIAVIYLFMLGFYRLPGLVAVIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELKIGRTLKQAYKKANKSSFLTIVDAQLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRWLLSLLISSNFFKKSIWLFGVSKKNIHNANEEKEIHDLKTPYERIDFMKLAKPLLGLSVLIIVVGAIILFIFRLNLGIDFTSGTRVDFESNNKVDENKVTNTLESKGFKPDQVSLGENDKNATVQFKHDLSKDEVSKIQDTVDQSFGNKPTVNTVSPVIGQELAKNAMLALIYAAIGIIIYITFRFEWRMGLSSVLALLHDAFMIVAVFSLFRIEIDITFIAAVLTIIGYSINDTIVTFDRVRENLHKVKVITKNEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVVIVVIALLIFGAPSIFNFSLALLIGLISGVFSSVFIAVPLWGIMKKRQLKKSDNNKIIVHKEKKSNDEKILV >NZ_CP054438|1267273:1276395|1275876_1276395_+|WP_002483102.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVEDWPKPGVNFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVEYAKLRDVDIIVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYED >NZ_CP054438|1267273:1276395|1273584_1275864_+|WP_002483101.1|DBSCAN-SWA MIKSKYTWDVKSPENEITEDVSLDLKLTPIVKKILESKEITDKAAIDQLLKNKQVMHDAWLMSDMEKAIERINLAIDQNQKILVYGDYDADGVTSTTILVETLKALGAHVGWYIPNRFSEGYGPNEMAFKNAHEEGISLIITVDNGIQGHDEIQMIQDLGVDVIVTDHHEIGRTMPSAFAIVHPMHPEFDYPFKYLCGAGVAYKLAQNLLDEPPAYFLGLVAIGTVADLVSLTDENRALVQKGLEILNDHCPASIKAILKQAGYNDVITEETIGFIIGPRLNAVGRLEDAALAAELLMTDNDEEAEFLAEQVEFFNQERKDIVAQITEEALVAAEDQVKQGTKFLLLAQADWHEGVLGIVASKIVETYSLPTLILNIDEAQDHAKGSARSIEQVSMFEILNAHSDLISKFGGHHMAAGITMPIENIESLRQGLNDWMAQLASTTSLEPRKKVDVKVAETDITIKNIQDIQRLRPFGTDFSSPCFELEGVIVNQAKAIGQDKKHLKMVLGDSQLQAIFWQNGHLVKELGEQQPINVIGTLQINEWNGFQSPQFMIQDLASNNLQILDYRSKSKVSGFEQDSSNVAYLIHNKSEKLDDNYYYYGDTIDQSYDKYVFRDLPPSIQAIKTTLKTVDVSQIYLVLNHERSIYFEGMPKMETFKKCFKALATKKETDLAKEGMQLCQFLNIQPSMLKFILKVFLDLEFIKDENGIIKMNSVSTKREIESSKYYQGRLDRIEVEKVLLYDDFANLKKWIKTELVDK >NZ_CP054438|1267273:1276395|1269326_1270472_+|WP_011302950.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPTPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELHQMETKIILGNTYHLWLQPGNDIIRKSGGLHQFMNWNGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYKYVKDSIERTTRWAERCLKAHSRPEDQALFGIIQGGEYKDLRKQSAEELVALDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYDMVHHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSHGRVIIKNAKYAEDLGPLDDNCDCYTCKNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTYHNLHFLLKLMENIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1402699 : 1412662
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP054438|1402699:1412662|DBSCAN-SWA CTTGGATACGATTATTGAAGAATATTTGAAATTCATTCAATTAGAAAAAAGATTAAGCTCGAATACAATAGGAGCTTATCGGAGAGATTTAAAAAAATATAATACGTTTTTAGAGTTACAAAAGATTAGTCATATTGATTTTATTGATAGAGCATCCATTCAACAATGTCTGGGGTATTTACATGATAATGGCGCTTCTGCTAAATCGTTAGCACGGTTTATTTCAACAATTAGAAGCTTTCATCAATTTGCGTTGAGAGAAAAGTATGCTGCAAAAGATCCAACTGTACTTATCGAGACACCCAAATATGATCGCAAATTACCTGATGTATTAGAAATAAATGAAGTGTTAGCACTATTGGAAACGCCCAATTTGGCTAAAATAAATGGCTATCGAGATCGCACAATGCTAGAGTTATTATATGCGACAGGCATGCGTGTTTCTGAGCTCATCCAAATTGAGTTAGAAGATGTAAATTTAATTATGGGCTTTGTCAAAGTATTTGGAAAAGGTAATAAAGAGCGTATTGTACCTTTAGGTGACACAGTAATAGAATATTTAAAGACGTACATAGAAACCATTCGTCCTCAATTGTTGAAGAAAACAGTGACGAATACCTTATTTCTAAATATGCATGGCAAACCTTTATCAAGACAAGCTATATGGAAAATGATTAAACAAAACGCTATCAAAGCTAATATCACAAAATCATTAACACCACATACATTGAGACATTCATTTGCCACGCATTTACTAGAAAATGGGGCGGATTTACGTGCAGTTCAAGAAATGTTAGGACATTCTGATATATCTACCACACAATTGTATACACATGTATCCAAATTACAAATTAGAAAAATGTATAATGAATTTCATCCACGTGCATAAACACAGACAAGTTGATTCGTTGAATAACTCGCCTGTGTTTTTATATGCAAACAATTGGTTTAGTACTTTTATTTTCTATCTTGTTGTTTTTGATATAATGCGTTTAAACGAGCCTCATTCACTTCTGTTCTATCTCTTTCTAAATGATGATTAACAATGTAACTATCTCTAATAACATATTCCGTCATGATATAGTTTGGATACGTTGTTAAAATTTTTTGTTGCATTTGTGAAGTGATTGGTAACTGTACTGGTGCAAATTGTTGACCATTTTCAATAGCATGTACTAATTCAGCAATCACTTTTTGGTATGCTTTGATATCAATACCTAGATTGATTTCTTCTTTGTAAGGTTCAATAACTTTTAATGCTTTTCTAAAAGATTTGATAGCACCTTTATCATTTTCTCTACGAAAGTGATAACATCCAGTTGCAAATAAAATTAAACTGACGACAGCGTCATCCTTACTGAAAGATTTATTTTCCTTCCAAGCTTCCTCTAAAATGTCATGACATAAAAAGTAATGTTGATTCGTATGAAATTGAAAATAAAATTCCTTTAATGCATTTTCCATAAAAAACCGCTCCAAATTTAAATGTTTTCATTAAACATGCTATAATACTTTAGTGAATTACGCACTTAACTTGCGATATGAGGTAGATAAAATGTACGAAGTAAAACTAGATGCCTTTAATGGACCATTAGATTTATTATTGCATCTTATACAAAAAATTGAAATTGATATTTATGATATTCCTATGAAAGCATTAACTGAGCAGTATATGCAATATATACATACGATGAATCAATTAGAAATTAATATTGCTAGTGAATACTTAGTCATGGCTTCAGAATTATTGATGATAAAAAGTAAAATGCTTCTACCTCAAACGAATGAAGTGGAAGATTTAGATGATGATCCACGAGACGAATTGGTGGGTCGTTTAATCGAATATCAAAATTATAAAGCCTACACTGAATTTTTAAATGAACGTAAAGTCGAACGTGCTTTATATTTTTCTAAACATCCAACGGATTTATCCCATTTAGAATCCAATGAAACATGGAGCCCAGATAATACAATTGATTTAACAGAATTAATCATTGCCTATCAAAAAGTAAAAAACAGAGTTGAGTTCCATACACCTAAAACAGTAGATATACGTAAAGAAACATTCACAATACAACAAGCAACTTCACAAGTCACTGATAAATTAAAGCAGCATGAGTCCTTTAACTTCTTTAGCTTATTTAATTTTACAGAACCGATAGAAATGGTAGTGACACATTTCTTAGCTATACTTGAAATGTCGAAATCCGGTATAGTAAATATTGAACAAGCAAAAAGTTTTGATGATATTAATATTTTAAGAGGAGTAAACTATGGCGTTGCAAGATAAAGGCATATTAGAAGCACTACTATACACAGCCGGAGACGAAGGTTTGGATCAACAGCAACTACTAGAAATTTTAGAAATTGAACCAACAACATTAACAGAATTAATTGAAGCGTATGATTCACCCGGTTTAACGATTCAACACTACGGTAATACTTATGTATTAACTACCAAGAAAGAAGCATCTGATTATATCGAACAATTAATTGAACAAAAATCAAAAATGAAATTATCACAAGCTGCAATGGAATCTTTATCCATCATTGCATATAATCAGCCCTTATCACGCAGTGATATTGAACTAATTAGAGGTATTAATTCAGACGGCGCTGTTAAAACATTAATCGCTCGCGGTTTAGTAGAAGCTAAAGAGGAAGCCGATTCTAGAAGTCATCAACTTTATACCACTGAACTATTTTTAAACGTATTTGGTATTGAACATTTAGACGATTTACCTACTACAGACGAAGAAGATGAAGAAATCGAAGCGTTCTTTAGTAACTTAGTTAATCAAAAAGGAGATAATCATGAATAAAGATACAGAAAGACTTCAAAAACGTATTGCCAACAGTGGCTATACTTCACGTAGAAAAGCAGAAACTTTAATTACTGAAGGCAAAGTAAAAGTGAATGGCACAGTTGAAACTGAATTAGGCACTAAAGTTAAACCTTCTGATAGCATCGAAGCAGAGGGTATCAAATTAGAACAAGAAGACAAATTATATATACTATTTTATAAACCTGCACAAGTCATCACCAGTGTTTCAGATGACAGAGGGCGTAAAGTTGTAACTGACTACTTTAAACAAATTAAAACAAGAATTTATCCAGTTGGCCGTTTAGATTATGATACATCTGGTTTATTATTACTGACAAATGACGGCGAATTCACTAATCTTATGACACATCCACGTTATAAAATAAAGAAAAAATATGTAGTAAAATTAAAAGGTTATCTCATGCGTGAAGAAGTGAAATCGCTTGAACAAGGTGTCCAACTAGAAGATGGTGTTACTCAACCTGCTATAATTAAAGTGAAAAATCAAGATAAAGATAAAAACACAACATTAGTTGAAATCACTATTACTGAAGGACGTAATCGACAAGTGCGTCGCATGTTTGAACATTTTGGACATCAAGTAACCAAATTGCAACGCATTGAATTTGGACCATTAAACTTGAAAGGTTTAAATGCTGGTGAAGGTAGAGTACTTACGCCACACGAAGTTAAAATGATACGCCAAATTGCAGAACACGGTAATTAATCTGAATTTAAATTATCAACTATGATAATTTTTTCACAAACTTTTTCTTCATAACCACTTTTAACCTTAAAGCTATGATATAATATGGTTGAATTAGAAAGTTAGTCGTGTGGGAGGTATATACGTATGTCAAACGAAATACTAATTGTAGACGATGAAGATCGTATTAGAAGATTATTGAAACTATATCTCGAAAGAGAATCTTTTGAAATACATGAAGCAAATGATGGAAATGAAGCATATAGAATGGCAATGGAACATGACTATGCTTGCATTTTATTAGATTTGATGCTACCTGAAATGGATGGCATTACCGTTGCGTCTAAATTAAGAGAGCATAAGGAAACACCCATTATCATGTTAACTGCTAAAGGTGAGGAAACAAATCGTGTAGAAGGATTTGAATCTGGTGCGGATGACTACATCGTAAAACCATTCTCTCCAAGAGAAGTGGTCCTACGTGTTAAAGCATTATTAAGACGTACACAAGTGGCAACTGCCGAACAAAGCGAACCACATGCACGTGATTTAATAGAATTTGATCACTTAGTGATTGATAACGATGCACATAGAGTGTTGGCAGATGGTAGTCAAGTGAATTTAACACCTAAAGAATATGAATTATTGATCTTCCTAGCAAAAACACCTAATAAAGTATTTGATAGAGAACAATTACTAAAAGAAGTATGGCATTATGAGTTCTATGGTGACTTGCGAACTGTAGATACTCACGTTAAACGTTTAAGAGAGAAATTAAATCGTGTATCAGAGGACGCTGCACATATGATACAAACTGTATGGGGTGTTGGTTATAAATTTGAAATCAAATCAAATAATGAATCAACTCAATAGCGTCGTCATTAAACTGTGGTTAACTATTATTTTTATAGTGACTACAGTTTTAATTTTATTAAGTGCAGCGCTTATAACGTTTATACAATCTTATTTCACGCAAGAAACAGAAGACTCATTATTAAAAGATGCAAAACGAATTAGTCAACTTTTAGAAAGCGCAGATAATAGAGAAACTGCAATTCAACATAGTAGAAAATTAATCGAAGGACCAGTTGGACTTATCATAATGAATGATAAGCATATAGATAGACAGGATAAAGATAAAACGAAAAACAAAATGGTCAAAGAAATTAAAAAAAGCAATGATTACAATCAAGTATTTAATAATGGTAAACAAGTTTCTGAACATGTCACCTTAAATATGAATGGAAATCAACGAACTTATGTATTAATCGGTTATCCTACAAAAGCCATTTCATCAGCGGATAATCACACAAATAAGTTTAGTGGTGTATTCATTTATCAAGACTTAAAAACGATTGAAGACACAAACAATGTCATTACCGTTATCATTTTAATTATTGCGATTATCTTTTTAGCGATAACAACTATCTTTGCCTTCTTCTTATCTTCTAGAATTACAAAGCCTTTAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP054438|1402699:1412662|1407082_1408849_+|WP_174544266.1|DBSCAN-SWA MMNQLNSVVIKLWLTIIFIVTTVLILLSAALITFIQSYFTQETEDSLLKDAKRISQLLESADNRETAIQHSRKLIEGPVGLIIMNDKHIDRQDKDKTKNKMVKEIKKSNDYNQVFNNGKQVSEHVTLNMNGNQRTYVLIGYPTKAISSADNHTNKFSGVFIYQDLKTIEDTNNVITVIILIIAIIFLAITTIFAFFLSSRITKPLRNLRTQALKVSKGDYAQVVPVNSRDEIGELSRAFNTMSSEIQQHIDALSSSKNIRDSLINSMVEGVLGFNDKKEIIISNKMANTTLQMLDDFALEKLDEQNELTFKNKKTQFEVYEINTRYFVIITSYIEQIQPDGRSGIVAIIRDMTNEHNMDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPAEIHESLSIVLDETKRLNRLVNELLNVARMDAEGLTVEKVVQPIDHLLDKVQQKYQKHAKDLGLNMNLSPNTHNQMWYYDSDRIEQVLTNLIDNASRYTEPGDEIKIEYGETQTENILYISDTGSGIAPEHLQQVFDRFYKVDTARKRGKQGTGLGLFICRMIIHEHGGTIDVKSTLGKGTTFIITLPKPKTN >NZ_CP054438|1402699:1412662|1405512_1406250_+|WP_174543887.1|DBSCAN-SWA MNKDTERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGTVETELGTKVKPSDSIEAEGIKLEQEDKLYILFYKPAQVITSVSDDRGRKVVTDYFKQIKTRIYPVGRLDYDTSGLLLLTNDGEFTNLMTHPRYKIKKKYVVKLKGYLMREEVKSLEQGVQLEDGVTQPAIIKVKNQDKDKNTTLVEITITEGRNRQVRRMFEHFGHQVTKLQRIEFGPLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKMIRQIAEHGN >NZ_CP054438|1402699:1412662|1410330_1411290_+|WP_002483239.1|DBSCAN-SWA MYNIIHFAYTNAHNYKTEKSIFNIITGKKSHQTFFDACSQQLLSLYHSLPNLKYPSFERYSNNFNIETAQYQSIINHPRHTYDSLVNTFNAIQLLTQTLSNTGHAIYEFIPITQHRTVQKQVKQLYKKITDEDLKSRFIEELTNLFHTLSEKNNHVYLHYYLQGFEESMYTRQQVSLIESVSQEHLYELEIRDLVTLMYEIEDDSQYPLLNQLIILPALLHKTTLTYEGIKQGMHFDKLAAQQNVKQNTIQDHILELFIKGYLTDYHSFLIHKTYEQFIPHYLSNRSERLRNYKTIFPDLSYFEIKLIIVGIERGDLHA >NZ_CP054438|1402699:1412662|1404253_1404988_+|WP_041080657.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFNGPLDLLLHLIQKIEIDIYDIPMKALTEQYMQYIHTMNQLEINIASEYLVMASELLMIKSKMLLPQTNEVEDLDDDPRDELVGRLIEYQNYKAYTEFLNERKVERALYFSKHPTDLSHLESNETWSPDNTIDLTELIIAYQKVKNRVEFHTPKTVDIRKETFTIQQATSQVTDKLKQHESFNFFSLFNFTEPIEMVVTHFLAILEMSKSGIVNIEQAKSFDDINILRGVNYGVAR >NZ_CP054438|1402699:1412662|1411282_1412662_+|WP_041080659.1|DBSCAN-SWA MLNEALKKHFGFDTFKPGQKEIITHVLEKKDTLGILPTGSGKSLCYQLPTYINQQPTLIISPLISLMDDQVMQLKLHGEHHVACIHSGMDEHERAQNIKQLTKSRFIFLSPEFLLQPHNFKLIKHINLGIIVLDEAHCLSEWGYDFRPHYALVGKIVNHFHNATVLALTATAPSYLTFDLEQILNKSFHIVKTTMNRDNISLSHKNFADDDEKLKWLLPSLEHAGPTIIYVSSKKMCLLLAQQIYNYGFLTGIYHGDLSYQERHTVQHQFLNNEIPIIVATSAFGMGINKKDIRTIIHFHLSTSPSNYMQEIGRAGRDGGQSQAISLYQPDDRFLLETLLFTDMITMEDVETFELGQFLPPEKSEVLQILYSYYTYQQLRNIFEISYKRKHLGYMRMLGYKHLDQCRRAYMIEFFNEQLSEKPNQCCDNDSKINAINILNRKKVKRKMDFNEKIQNLFK >NZ_CP054438|1402699:1412662|1406376_1407102_+|WP_011303060.1|DBSCAN-SWA MSNEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFEIHEANDGNEAYRMAMEHDYACILLDLMLPEMDGITVASKLREHKETPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQVATAEQSEPHARDLIEFDHLVIDNDAHRVLADGSQVNLTPKEYELLIFLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAHMIQTVWGVGYKFEIKSNNESTQ >NZ_CP054438|1402699:1412662|1409271_1409817_+|WP_037538408.1|DBSCAN-SWA MHQQTKRLITISMLSAVAFILMFIKFPIPFLPPYLTLDFGDVPALLATFILGPVAGLIVEFIKNLLNFLFNIGDPVGPVANFLAASSFLLTAYFVTKYKDKIKSQIVGLSIATVVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIMNLSDVVENVKIVIVSGVIPFNIIKGIVISIIFILLYNRLKNVLPK >NZ_CP054438|1402699:1412662|1404971_1405520_+|WP_002483233.1|DBSCAN-SWA MALQDKGILEALLYTAGDEGLDQQQLLEILEIEPTTLTELIEAYDSPGLTIQHYGNTYVLTTKKEASDYIEQLIEQKSKMKLSQAAMESLSIIAYNQPLSRSDIELIRGINSDGAVKTLIARGLVEAKEEADSRSHQLYTTELFLNVFGIEHLDDLPTTDEEDEEIEAFFSNLVNQKGDNHE >NZ_CP054438|1402699:1412662|1409972_1410221_-|WP_002483238.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAYVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALDGCPTDSIKIEEESFDGDALKFE >NZ_CP054438|1402699:1412662|1402699_1403587_+|WP_174543886.1|DBSCAN-SWA MDTIIEEYLKFIQLEKRLSSNTIGAYRRDLKKYNTFLELQKISHIDFIDRASIQQCLGYLHDNGASAKSLARFISTIRSFHQFALREKYAAKDPTVLIETPKYDRKLPDVLEINEVLALLETPNLAKINGYRDRTMLELLYATGMRVSELIQIELEDVNLIMGFVKVFGKGNKERIVPLGDTVIEYLKTYIETIRPQLLKKTVTNTLFLNMHGKPLSRQAIWKMIKQNAIKANITKSLTPHTLRHSFATHLLENGADLRAVQEMLGHSDISTTQLYTHVSKLQIRKMYNEFHPRA >NZ_CP054438|1402699:1412662|1403655_1404162_-|WP_002483231.1|DBSCAN-SWA MENALKEFYFQFHTNQHYFLCHDILEEAWKENKSFSKDDAVVSLILFATGCYHFRRENDKGAIKSFRKALKVIEPYKEEINLGIDIKAYQKVIAELVHAIENGQQFAPVQLPITSQMQQKILTTYPNYIMTEYVIRDSYIVNHHLERDRTEVNEARLNALYQKQQDRK |
11 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1847993 : 1856468
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP054438|1847993:1856468|DBSCAN-SWA CTTATTGAATGATTTTTGATATGACTTCTGGATATAATTCATGCTCTATTGTTTTAATTCTTTCTTCAAGATCAGATTTATTATCGTCCGGATAAATATCACATTGACGTTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTGTCAACATAATGTACTGTTGAACCAGTTATTGTATCGCCACTTGCTAGCGCTTGTCCTATAGCATCTTTCCCTTTATATTTTGGTAATAATGAAGGGTGAATATTTAAAATGCGTTTATCATAAGCTCTTAAAATATTTTCACCTATTAATTTCATATAGCCAGCTAGAACAATCCACTCTACTTTTTCAGACGTTAACCATTCTATAATTTTACGTTCATAATCCGCTTTAGAATCAAAATTTTTCAATTCATTAATATGAACATCTAAATGATATTTGCGCGCGCGTTCAATACAATATGCATTTACTTGATCTGTATAAAGTGAGGTTACTTCAATATTTGGTAGTTCCCCTTGTTTGATTTTAGACATAATACTTTCAAAATTACTTCCAGAACCAGAAGCAAATATAGCTATTTTGGTCAATTTTATACCCCCGTTAATTGGATTGGTTCGTTGCCTTTAACAGTTTCACCAATTTTATATGCCTTGATATTTTGACCATTAAGTATTTCTAATGTTGCTTCAATTTGGTTTTTATCAACGACTAAAGTAAAGCCAATACCCATGTTAAAAATGTTATACATTTCATCAGTTGAGATGTTTCCTTGTTCCTGTAACCAATCAAATATAGCTGGCGTAGGAAATTGCGTGACATCAATCTTGGCTGTTATCCCCTCAGGTAAAGCTCTAGGTATATTTTCATAAAAACCGCCCCCTGTAATATGGGTCATGGCATATATCTTAATAGATGATTTAACAGCTAACACGGGTTTTACATATAAACGTGTGGGTTCCAAAAAAGCATCTAAAAATGTCTGTTCTTGATTGAATGGTTCACTTAATTTAATACCTGATTGTTGTATTAATTTTCTAACTAAACTATAACCATTGGAATGTATGCCACTAGATTCAAGGCCTATAATTGCTTGTCCAGGTTCAACAGATGAGCCATCAATATAGTCATCCTTTTCTACTGCACCTACTGCGAAGCCTGCTAAATCATATTCACCCTCGTGATACATTTCTCCCATTTCAGCTGTTTCTCCACCGATTAAAGCTGTATTGGTCTCTTCACAGCCATCACTTACCCCTTTGACAATTTGCTCAATGACTTCAGGAACGACTTTATTAGTTGCAATATAATCTAAAAAGTAAAGTGGTTCTGCACCTGTAGTTAAAATATCATTGACACACATTGCGACAGCATCTATACCAATCGTGTCATGTTTATCGTTATCGATGGCTAATTTTAATTTTGTACCTACACCATCTGTACCTGATACAAGTAAAGGTGCTTTCATATTTAACTGTGACAAATCAAATGTAGCACCAAAGCCACCCAATCCACCAAGTACTTCTTTGCGCATTGTTCTTTGGACATGACTTGTCATTCGTTCTACCGCTTCATACCCTGCATTAATATCGACGCCTGATTGTTGATATGCTTTAGACATTTAAATTACCCTCTCTATCAAAGTATTGTTGATGATTTGCTAAGTACGCTTTTTGACGTTCACTTAAATGCGCTACATAATCTTGCTCATAATCATATAAACCTGCAGGATAATCACCTGTGAAACTTTCAACACAAAGTCCACTATAAGGGGCATCGCAATTAAGTCCAATAGAATCAATTAGACCTTCGACTGTTAAATAAGCCAGTGAATCTGCTCCAATATAATCACTAATCTCCTCGGGCGATTTATTTGATGAAATAAGCTCTGCCGTTGTTGAAACATCTATGCCATAAAAACTTGGAAACATAAACTCAGGAGAAGCAATGCGTACATGAACTTCCTTAGCGCCTGCGTCTTTCAACATTTGTACTATACGTTTACTCGTAGTACCTCTGACAATCGAATCATCTACTAAGACAATATTTTTATCATAGACAATATCTTTTACAGCAGATAATTTTACGCGGACGCCTTGTTCACGTAATTCTTGTGTCGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACAAGACCCATTTCATACGGCAGTCCACTCTCTTCAGCATAGCCAGATGCTGCTGAAAGTGAAGAATTAGGTACACCAATAACCATGTCCGCATTTGATGCTGGACTTTCTTTCGCTAATTGTTTACCAGACTGTTTTCTAACAGCATGTACGTTTTTACCGGCAATGGTTGAATCAGGTCTAGCAAAGTAAATATACTCCATAGCTGAAATAGCCGTCGTTGTATGACGCGTATAAGATTCAACTCTGATCCCATCATCATTGATGACTACATATTCCCCAGCATGAATATCTCTTACAAATTCAGCACCTAGGACATCGATTGCACATGTTTCACTTGCAATGATATATGAACCATTTTTCATTTTACCAATAGCTAATGGTCGAATCGCATTAGGGTCAACTGCACCATATAAAGCGTCTTTAGTTAGTACCGCAAAAGTAAATCCGCCTTTTATTTTTCTTAAACTTTCTTGAAAAGCATCTTCAAATGTAGGTGCTTTACTTCTTCGTATCAAGTGCATGATAACTTCAGTATCTGAAGAAGAGTGAAAAATAGAGCCTTGATGTTCTAAAGATTTTTTTAGACTTTGCGCATTGATAAGATTACCATTATGACAAACTGCAACACTCATATCATAAAAATGATATAAAAACGGTTGAATATTCTCTATACCTTTATTCCCGGATGTTGCGTATCTCACATGCCCAATTGCATGTTGATATGTTTTAAATGATTCCATTTGTGTATCTGATATCGCATCTGTCAATAAACCTAAACCACGTTCACCTTTAAGCACTTCACCATTTGAACAAACGATTCCAGCACCTTCTTGACCACGATGTTGTAAACTGTGTAGTCCCATATAGGTTAATTGAGCAGATTCCGGATGATTCCATATGCCAAACACACCACATTCTTCATTTAATCCGTTGCTGTCATACATTGAGGTATAGCTCCTTCCCATAAATCATTTAAATGTTTTACATCACGCACAATTTCGCTCTGTTCATTTGTCACTTTAAATTGTTGATCATTAGTCACTTTACCAATCTCAACAGCATGATCGCAGTTTAATGATTGACCATTTTTTACGATTACAATATAACGTCCTTGTGTTTCACTAAACAGTTGCGCATTCGTAACACTTAGTTTCGCCTGTAAACCAAGTTGGTAATGTGCACTGATACGAGCTAAAGTAAGCAATAAGCCACCTTTACCTACTGTTTGCACATGTGAAGCTACCCCTTCTCGAATTGCTTGTTTTATCGATTCACCTTTACGAACTTCTTCCGATAAATCAATGGATTCAAATTCATGATTCACTTGACCATACAACAATTTCTCTATTTGACTACCACCGAAATCGTCATTTGTATCACCAACAACATATAATGTATCTCCTACAGAATGATTAAAATGATTAAGATAACTTATGTCATCGATGAGACCAACCATACCTACTACAGGTGTTGGGAATATAGATGTTTCTCTCGTTTCGTTATATAAAGACACATTACCCGAAACAACAGGTGTGCTTAAAATCTCACATGCTTCTACCATACCTTTTGTTGAATCTGCTAATTGTTGATATATTTCTTTCTTCTCAGGTGAGCCATAATTTAAACAATCCGTCATAGCTAAAGGCGTTGCACCTACAGAAATTAAATTTCTATACGCTTCGGCAACAACCATTTTTCCACCTTCATATGGATTGTTAAATACATAGCGGGCTTCTCCATCAATCGTTGACGCAATAGCTTTATCAGTTCCTTCAACGCGCACAACAGACGCTTGTAATCCTGGCTTAACTATCGTATTAGCACCTACTTGTTGATCATATTGTTCGTATAAATAACGCTTCGACGCTATAGTTGGGTGTTGTAATAATTGATCAAATACGGATTCAACATCTACATTGCTATAGTCATTTTTAATTTCATTGTATTCTGGCGAAGTACCTTCAAGTACATAAACTGGCGCTTCATCAGATAAAGGTTGAACAGGAATATCGGCAAATACTTCATCTTCATAAGTTAATACGAAACGATCCGTGTCAGTTACTTCTCCAATTACTGCACTGTCTAACTCATGTTTATCAAAGAGGTCTAAGAATTTTTGTTCTGTTCCCTTTTCTACAACAAGCAACATACGTTCTTGAGTTTCAGATAACATCATTTCATACGGTGAAATACCTTGTTCTCTTGTAGGGACTTGTTCTAAACGTAAATGTAAGCCACTACCACCTTTAGCTGCCATTTCTGAGGATGATGATGTTAGTCCTGCAGCCCCCATGTCTTGGATACCAACGAGTTCATCAAATGTGATGGCTTCAAGCGTGGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCTATTTGAACAGATGGTCGTTTGCTTTCACTATCTTCACTTAATTCTTCAGAAGCAAAAGTCGCACCATGAATACCATCGCGGCCAGTTTTTAAACCAACATAAATAACAGAGTTTCCAACGCCTTTAGCTGTCCCTTTTTGAACCATGTCGTGATCAATAATGCCTACACACATCGCATTGACGAGTGGGTTGCCATCATATCGATCATCAAACTCTATTTCTCCAGCAGTTGTAGGAATTCCTATACAGTTACCATAGCCACCTATACCTGCAACAACGCCACGTAAAAGTCGACGGTTTTGTTTTTCTGTCAATTCACCAAACCTTAGACTATTCAATAAATTAATTGGACGTGCACCAATAGAAACAATATCTCTAATAATGCCTCCCACACCAGTAGCTGCGCCTTGGTATGGTTCAACTGCAGAAGGGTGATTGTGTGACTCAACCTTGAACACAACCGCTTGGTTATCACCAATATCAACAACGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP054438|1847993:1856468|1853902_1854163_-|WP_002483703.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYKQVNDIRVGKVLYMTVDEATDEAVHNVVITLSEKLFANTVIEEYSYKVLEEGEKA >NZ_CP054438|1847993:1856468|1847993_1848560_-|WP_129531004.1|DBSCAN-SWA MTKIAIFASGSGSNFESIMSKIKQGELPNIEVTSLYTDQVNAYCIERARKYHLDVHINELKNFDSKADYERKIIEWLTSEKVEWIVLAGYMKLIGENILRAYDKRILNIHPSLLPKYKGKDAIGQALASGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIYPDDNKSDLEERIKTIEHELYPEVISKIIQ >NZ_CP054438|1847993:1856468|1851049_1853239_-|WP_174543983.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSSEDIKIEQLYKDMGLSDEEYAKVCDILGREPNFTEIGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLTQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAVEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELTEKQNRRLLRGVVAGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMVQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELSEDSESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREQGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTDRFVLTYEDEVFADIPVQPLSDEAPVYVLEGTSPEYNEIKNDYSNVDVESVFDQLLQHPTIASKRYLYEQYDQQVGANTIVKPGLQASVVRVEGTDKAIASTIDGEARYVFNNPYEGGKMVVAEAYRNLISVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLADSTKGMVEACEILSTPVVSGNVSLYNETRETSIFPTPVVGMVGLIDDISYLNHFNHSVGDTLYVVGDTNDDFGGSQIEKLLYGQVNHEFESIDLSEEVRKGESIKQAIREGVASHVQTVGKGGLLLTLARISAHYQLGLQAKLSVTNAQLFSETQGRYIVIVKNGQSLNCDHAVEIGKVTNDQQFKVTNEQSEIVRDVKHLNDLWEGAIPQCMTATD >NZ_CP054438|1847993:1856468|1854871_1855999_-|WP_174543985.1|DBSCAN-SWA MNLSKLKFGSTIGIIGGGQLGKMMAQSAQQMGYKVIVLDPDSSCPCQYVANEFINAAYDEQIALDRLGALSDVITYEFENISANQLQALASKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKQTLQDSGSNIAPFLQLTDYDDLVKAVDSIGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLVKDATHLDEAHQLIQAQECVAEQYLNLSKEVSLTVTIGTNNQITYFPLQENEHQNQILFKTIVPARVQDNKEQEARNEVNKIIKAIHFIGTFTVEFFIDQQNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHIKAITGQQLPQQVTLLIPAIMMNLLGRDLDLLEDQFAEHPEWHVHIYGKNERKFNRKMGHLTVLTNDINETEQKLLKQFEGR >NZ_CP054438|1847993:1856468|1849583_1851071_-|WP_174543982.1|DBSCAN-SWA MYDSNGLNEECGVFGIWNHPESAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVCSNGEVLKGERGLGLLTDAISDTQMESFKTYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAVCHNGNLINAQSLKKSLEHQGSIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEDAFQESLRKIKGGFTFAVLTKDALYGAVDPNAIRPLAIGKMKNGSYIIASETCAIDVLGAEFVRDIHAGEYVVINDDGIRVESYTRHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKQSGKQLAKESPASNADMVIGVPNSSLSAASGYAEESGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVYDKNIVLVDDSIVRGTTSKRIVQMLKDAGAKEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISSNKSPEEISDYIGADSLAYLTVEGLIDSIGLNCDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEQDYVAHLSERQKAYLANHQQYFDREGNLNV >NZ_CP054438|1847993:1856468|1848562_1849591_-|WP_174543981.1|DBSCAN-SWA MSKAYQQSGVDINAGYEAVERMTSHVQRTMRKEVLGGLGGFGATFDLSQLNMKAPLLVSGTDGVGTKLKLAIDNDKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGVSDGCEETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKDDYIDGSSVEPGQAIIGLESSGIHSNGYSLVRKLIQQSGIKLSEPFNQEQTFLDAFLEPTRLYVKPVLAVKSSIKIYAMTHITGGGFYENIPRALPEGITAKIDVTQFPTPAIFDWLQEQGNISTDEMYNIFNMGIGFTLVVDKNQIEATLEILNGQNIKAYKIGETVKGNEPIQLTGV >NZ_CP054438|1847993:1856468|1853231_1853903_-|WP_174543984.1|DBSCAN-SWA MKFAVLKFPGSNCDRDMYNAALKSDVEAEYVDYRNTSLDGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPITEAVKQFAKEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFVSRNESLRVVNHNTAFTNLYNEDEIVVYPVAHGEGHYYCTQDMYDRLEANNQIILKYVNNPNGSFNDIAGIINEQGNVCGMMPHPERAIEPILGTDSGVKLFQAMVNSWREQNV >NZ_CP054438|1847993:1856468|1855985_1856468_-|WP_011303441.1|DBSCAN-SWA MKVVVIMGSSSDWETMKESCSMLDQFEIPYDKKVVSAHRTPQLMFEFSREARDAGYDVIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGMDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKAGAKNAGILAARILSIGNQTVQKNLENYEKSLVEKVSDMQDELE >NZ_CP054438|1847993:1856468|1854165_1854867_-|WP_041079043.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRIFSTGTSDVLRVEYKDEVTAGNGAKKDFIEGKGRLNNQITSRIFNYLKAKGLNSHFIEQISETEQLVNSVEIIPLEVVVRNIAAGSITKRLGFEKGHTFETPLVEFFYKNDDLNDPLITEDHIKLLQIADDGEIEKLKEAATEINEVLVNLMDKMNLRLVDFKIEFGRTNEGEILLADEISPDTCRIWDKQSDTNFDKDVYREDTGSIIETYQTFLNKLEAL |
9 | Synechococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1888009 : 1941869
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP054438|1888009:1941869|DBSCAN-SWA 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69 | Staphylococcus_phage(54.39%) | protease,tail,capsid,portal,integrase,terminase,plate,head,holin | attL 1887445:1887463|attR 1933010:1933028 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2147529 : 2166263
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP054438|2147529:2166263|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP054438|2147529:2166263|2153193_2154081_+|WP_174544128.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILVSAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLYFIYKYKQPLFGKLSSQPLLISRSTLGLIGVLLNIYAIDHMILSDADTLMKLNPFWTILLSLIFLNEKVRNYQIIAMVIAIFGMLFVVKPEFSSSMIPAIGGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSFFSIVVLIPFTIFTFEPMSMMQVIYLIGAGLAAAAGQIGITLAYSYAPAKDISIFTYASIIFTALFGFILFGESPDFYAILGYVIIIASSYYMFEKARRQPLSIQKEEQKPKT >NZ_CP054438|2147529:2166263|2163212_2164175_-|WP_011303655.1|DBSCAN-SWA MIEFKNVVKRYGDKTAVDDISFNIQKGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLISLSEGYIYFNDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWNEQTTNQRVEELMDMVGLEPETYKNRKPDELSGGQQQRVGVVRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLLELQQQIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDRICLLNKGHVEQIDTPEGFINHPKNDFVKQFMGNQLQRTVNDLKLSEIIDGLPIHEQDVKAGYPVIDSDKYVKDIYSALASHEAIIVQDITNATQHVLSRQDIFEILSERKGGHHE >NZ_CP054438|2147529:2166263|2164484_2166263_-|WP_174544134.1|DBSCAN-SWA 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14 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2174564 : 2182114
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP054438|2174564:2182114|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP054438|2174564:2182114|2176539_2177211_+|WP_002483950.1|DBSCAN-SWA MSEQTLDNNKAIVVFSGGQDSTTCLFWAKKHFESVELVTFAYGQRHDTEIEVAKQIADEQGVKHHLLDMSLLSQLTPNALTQHDLDIEVGDDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQTNAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFVKSMNVTLSLSMDKDFVIHTPLMWLDKKATWALSDDLGVLDYIRYNTLTCYNGVIGDGCGECPACQLRANGLNAYLAEKGVD >NZ_CP054438|2174564:2182114|2179718_2180780_-|WP_069825716.1|DBSCAN-SWA MQMRVIVPCYNEGEVILKTYEKLTEILSKDSQYHHYDYDILFVDDGSKDKTINYIQDMATKDHHVKFISFSRNFGKESAMIAGYQHSKDCDGVIMIDADLQHPPELIPQMIEGYMDGYDQVIAKRDRTGEKQSRKVMTKIYYKLINHFVEDIKLEDGIGDFRLLSQRAVISLTQLDEYNRFSKGLYEWIGYNTKVFTYENVEREDGESKWSFGKLLNYGIDGLISFNNKPLRAMIYLGLIVFFISLLYIGYISVGIMIRGVETPGYFSTIAAILLLGGIQLISIGIVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQATNFNYACDNNKQNINQDINHEIERNNRQHEMSEKSKSEKELIKNR >NZ_CP054438|2174564:2182114|2178587_2179181_+|WP_174544137.1|DBSCAN-SWA MLINIIINIAAICIILGIDLYRQNFKQLKFSSILIAICLNSIINIFLVGEYDYIVFYTCGQLIIWTLLQLYLDRKVAAFKVTDQKFIVVVLTIILSTSLILTYSTSHDSYYMSIPYLAPAIFLIGAILLFYSTFQPKEKEQLKPMNRIERPIFVGQLLIILSFTIMTLLTPYWYAFIIIHLLFIGFLLWQNIFFSNK >NZ_CP054438|2174564:2182114|2177630_2178347_+|WP_002483952.1|DBSCAN-SWA MSKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSSFTWDGSAKEDIRMMSAEEIYDQLYHIAGDSFNHVTISGGNPALIKGIQQLVDLFDDKGIQSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSKMKPNLPILDEVIEQCVPESLNLKVVIFDDEDYQFAKMIHHRYPTVPFYLQVGNPYLDGEHVEAHTEKLLSLYETLVDRVMVSSDMNNVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP054438|2174564:2182114|2175690_2176284_-|WP_069825720.1|DBSCAN-SWA MILIIDNKDSFTYNIVDYVKQSYRGLIEVIDVKYLTVNKIHELAPKAIIISPGPGAPRDYPLLNEVIKTFSEAMPILGVCLGFQQIVTYFGGDIIKSDRPIHGHTTQIRHSGKGLFHQLPETFKVMRYHSLKAHAQTFPNALEITAINENNIIMGLEHKALPIYGVQYHPESILSEHGLTQIQTFINIVEAYHANTL >NZ_CP054438|2174564:2182114|2177212_2177638_+|WP_069819972.1|DBSCAN-SWA MFQQNYPSVQHPYSFELNKDFNFSAAHYIPSDDAGKCMRTHGHTYFVNLTIAGDTLDHNGFLVNFSELKQLVHGQFDHYLLNDLPQFEGKSPSTEIVAQTIYEMVQTSLNQRDNQPKCLQVYVRETPTSYVVYRPKETKHE >NZ_CP054438|2174564:2182114|2181274_2182114_-|WP_002483956.1|DBSCAN-SWA MLEDVYYLNNGYPMPKVGLGVYKITDDEMNVSVATALDAGYRAFDTAYFYKNEIALGNALKKADIPREDLFITSKLWNDYQGYDRTIEFFTKSIENLGTDYLDLFLIHWPCEADDLFIESYKAMEALYEAGRIRAIGVCNFKQHHLEKLMSETDIVPAVNQIEVHPYFNQQELQAYCDSKDIAVTAWMPLMRNRGLLEHEVILKLAERYEKTPAQIVLRWHLAHNRLIIPKSKTPERIKENYDIFDFNLELTDIAEIDAMNRDERQGKDPDEVRIGTLK >NZ_CP054438|2174564:2182114|2174564_2175707_-|WP_069825721.1|DBSCAN-SWA MQIHFNYRYTLDEENYEMHQYLLTQCTDKKVALNIETVGEVISFAESKQKAGYYVALYIAYEAAPYFNPQMSTVKIEDAYIYAAAYAFDQATNAEKQNDKQPPQQKCNFKFKRPSSQLVEHIKMIQSAIIEGNTYQVNYTTRLTDQIRQPIADLYYTLLQQNHGFYAALIDTEEIQIASMSPELFFQRGPFKNKADVLLSKPMKGTIARGKTKAEDQLNQMTLAESAKDRAENVMIVDLLRNDMSRIAKTGTVKVYKPFHIETYSTVFQMTSMVTSELSSKTDLIDVLTALFPCGSITGAPKLNTMQYIKDLEQTPRHAYCGTIGLLLPEGKSIFNVPIRTIQYLNDEAIYGVGSGITIDSIPENEVQEFKDKTKILERL >NZ_CP054438|2174564:2182114|2179249_2179501_+|WP_069825717.1|DBSCAN-SWA MGFILMLIVGGLIGWIAGGIVGKDIPGGILGNIIAGIVGSALGSWLLGDWGWHLGGIAVFPALIGTIILVAIVSFIVGKLRKK |
9 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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