Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP054442 | Staphylococcus saprophyticus strain UTI-058y plasmid pUTI-058y-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP054440 | Staphylococcus saprophyticus strain UTI-058y chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,WYL,DEDDh,cas3,DinG | 0 | 0 | 10 | 0 |
NZ_CP054441 | Staphylococcus saprophyticus strain UTI-058y plasmid pUTI-058y-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP054443 | Staphylococcus saprophyticus strain UTI-058y plasmid pUTI-058y-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP054440_1 | 288826-288923 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP054440_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP054440_1
>1.1|288851|48|NZ_CP054440|CRISPRCasFinder CGTAACATTAATTTCCAAGTGAAATTAATGAATACAAAAGAAAATCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP054440_1
The CRISPR arrays of NZ_CP054440_1 >merge|NZ_CP054440|1|288826-288923|CRISPRCasFinder TTGCATAAGAATCACTAAGGAAATTCGTAACATTAATTTCCAAGTGAAATTAATGAATACAAAAGAAAATCTTTTGCATAAGAATCACTAAGGAAATT >NZ_CP054440|1|1|288826-288923|CRISPRCasFinder TTGCATAAGAATCACTAAGGAAATT CGTAACATTAATTTCCAAGTGAAATTAATGAATACAAAAGAAAATCTT TTGCATAAGAATCACTAAGGAAATT
>NZ_CP054440.1|WP_077461027.1|287454_288525_+|ROK-family-protein MLERHVKLIRLMLINRNQFLNADEIARYLNVSNRTARNDIQYINSEILDDLIVSVKGRGYKLNQSLYSMQQIETIVTDFTNKESELLIKLGYQLLMYQQPLTSEAIGKTFHLTKAEVTDYINKIKAWCISFDVNIQITKKKGITVNGSEMNIRNAILHLNQLSENVKTVDAFILAEHQYMKHQTEDFIYLTISTGVGMAYIRKGELVSGVNGNFGEIGHTIIKGDSDYQCPVCKQYVCVENEISGLAISRKASHILNKHVSTREAIEMYLHQAHSEITEMIDEVLILTQQLCTNLFSIFNINNIVLGGGVTQSKLPYKSSIENYAQKHYLIQNSTLNVTISNLEANVLTGLYHVNK >NZ_CP054440.1|WP_011302238.1|286356_287289_+|lactate-dehydrogenase MSKLGIIGLGKVGTQVLTDVQQLNLFSEIILIDDRADVASGEALDHIHSQGLINTAHIKIRSGVYQDLTDADFIVIAASEATDKNNGDRTLLAQGNHDIIKGIMSQIAEVTQEAVVILISNPVDSMVYFANQIDYPAHKIIGTGTALETSRFKTIIADHYQIDPNNVEAFVIGEHGQHAIPVWSKVHIHGMELSEFEALSDRPAIDKSHISSIINEVSMDVFYQKGWTNAAISKVTSFLIQSIALDQRTITPLTSLSSEYGLEDGAFSLPTLIDKKGIVQRFAITLDKEEERELKEAYEYIRQTIHTAQQ >NZ_CP054440.1|WP_011302237.1|285494_286313_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MRKWFILGSLFVLTIILAACGKSNGEKEDKEITIAASPAPHGVVLEHAKEEMKKKGYDLKIKTVNDYKVPNKLLDKGDVDANAFQHTPYLKAEKKDHNYKIEEAGKVFTTPMGVYSKKYKDIKDIPKGSTIYVSNNPAEEGRFLSFFVDKGLIKIKKGVSIEDAKFDDIVENKKDLKFNNKQGAEFLPKTYNSKEGAAVIMNSNYAIDNGLTPHKDAIAIEGKSSPFANIVAVQEGHKNDKKFKELMKVLQSKEMKKFITDKYGQDVIPYEK >NZ_CP054440.1|WP_011302236.1|284397_285153_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MSFKNDHKYQWKDMQGKDFLLPFIYLIGNFCLSIVILTIMIGINETQGKNNANFNANFSGTPGILMEMIAFIIIFALWILFHRHSFRQSWKQGLQNIKQHWKLIVITFIVIIVFKEIYPYLVNAFAPEHWKFEETQNDKMVEEMFATPVSTILAFFSIVIIAPMTEEFLFRHLIIGELGKKLNFYVMSVISIIVFASLHVTEAKSPLEIVMYLAIAVGIVYVYMKSQRSLAVAIALHALNNLLAYIFMIIM >NZ_CP054440.1|WP_011302235.1|283266_284184_-|2-dehydropantoate-2-reductase MRILVLGAGGIGGYFGGRLAESGQNVTFLVRPKRKSFLERNGLAIHSEQGDYHFNPQLITKDDRVAPFDVILLSSKSYHLEQAMTDLKPFVDGHTAIIPLLNGVAHIPQLQSIFGKDKVMGGYCVIETTLDSMGEIIQTSPFDKLFFGELDGSKSERAQKIAQAFSETKAEFKLSTSIEQGMWHKYLMITVLSSITTLMHAPIGPIRDSDGGINFVRSLYNEVASIMRAHRAPLADDIVSQYMTSFNQLSYHFKTSMQRDMEKGLNIETGHLQGYLLNLADTYQIDAPLLKCVYQNHKVYKEMLK >NZ_CP054440.1|WP_002482190.1|281582_282314_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKNIKKSFDDKEVIKGIDLNVNQGEVVTFIGRSGSGKTTLLRMINALELPTEGAVYVNGETYSNADKKSQIKVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKTKKDEAKQQALALLEKVDLTAVKDQRPNALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLRVIKDLANEGMTMIIVTHEMRFAKEVSNKIVFIHDGVIGESGPPEQIFNHPQSAELQRFLNMIREV >NZ_CP054440.1|WP_011302233.1|280866_281586_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNTEQQHALDAAGQAFAPMLEGLVKFSIPITLVTFLLGLVIALLTALMRISTSRILRGIARFYISIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNNSENQWTLAPVIAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIMSIPKGQTEAAYSIGMNYRQTIQRIILPQAIRVSVPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYLLVALMYWVVCFIISIAQNFYESYLERGYRS >NZ_CP054440.1|WP_011302232.1|280088_280883_+|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKILLGILTLLLVVGLAACGTSDKKDNDNKNKTASENKTFVVGTEGTYAPFSYHDKQDKLTGYDIDVMKAVAKEMGYKVKFKETQWDSMFAGLDSGRFNVIANQVGINDERKEKYKFSEPYTYSEAVLVVNKNNKDIKSFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKSKGAELTKVDGFNQAMDLLQSNRVEGTFNDNISYLDYKKQKPNADVKIIEGNAEKSQSALTFSKKEDDATIEKVNKAMKKLKDNGELAKISKKWFGEDVSKS >NZ_CP054440.1|WP_061050468.1|279561_279855_+|PTS-lactose/cellobiose-transporter-subunit-IIA MSLIAYSGDAKSHAMEAIYAAKKNAFEEAEKKLKLAEVSLLEAHHIQTNMLTKEAQGDEIKMSLLTIHSQDHLMTAITFKDMAAEMIDLYKKMDSKA >NZ_CP054440.1|WP_061050467.1|279197_279518_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MAEKTIMLVCAAGMSTSMLVQKMQKEAEKQKLDRDIFAVSTSEADQKIESDNIDVLLLGPQVRFKKDEYTKKCSEKDIPVAVIEMRDYGTMNGENVLNTAEQLMKK >NZ_CP054440.1|WP_011302240.1|288930_290220_-|homocysteine-synthase MTQNPWHLDTLSIHGGQVVDDFSKARAVPIYQTSSYVFDNTEHARKLFALEEDGNIYTRIMNPTQNVFEERIAALEGGVGALATSSGQAAIHLALLNIVESGDEIVASSNLYGGTYNLLNITFKKLGIKVHFVDPSHPDNFKNAITDKTKAVYAETIGNPRIDVLDIEAVADIAHNHNIPLIVDNTFPTPYLLRPFEFGADIIVHSATKFIGGHGTSIGGVIVDSGKFNWDNGKFPGLVEPDESYHGISYAKDVGEAAYITKARVQLLRDLGSAVSPFNVHEFLIGLETLHLRLERHSENALRVAQYLEQHPKVTWVNYPGLKNNAYHQLAQKYLPDGQGAILTFGIDGTVDDIAKFVDGLNLFSHLANVGDSKSLIIHPASTTHLQLSPEDQKASGVVPELVRLSVGTENINDIIADLDNGFKESLGN >NZ_CP054440.1|WP_047504698.1|290437_291343_+|cysteine-synthase-family-protein MIAFDLIGNTPLVLLESFSNKDVQIYAKLEQYNLGGSVKDRLGKHLIETAIRENIIQKGDVVVEASAGNTGIGVAIAANHYGVSAVIFAPEGFSEEKISIIKALGAEVIRTDQTLGMAGAQKAARDYELQTGAYYLNQFESYRNPETYKSTIGKEITDKLKDIDYFVGGVGSGGTFTGVAEHLAATYHTESVIVEPEGSILSGGNAHSHDIEGIGSEKWPSFLPKALVSDIIKVSDDAAFQNVKLLARQEGLLVGSSSGAALQGALEIKKHINKGVIVTIFPDGSDRYMSKQILNYKETIK >NZ_CP054440.1|WP_011302242.1|291339_292485_+|bifunctional-cystathionine-gamma-lyase/homocysteine-desulfhydrase MNKKTQLIHGGQTTDPYTGAVTTPIYQTSTYMQDGIGDMRQGYEYSRSANPTRSALEGLIADLEQGESGFAFGSGMAAISAVIMLLDKGDHLLINSDVYGGTYRALTKVFNRFGIDAEFIDTTNIEAVEQYIKPETKMLYIETPSNPLLRVTDIKKSAEIAKKHHLISVVDNTFMTPYFQNPLTLGIDIVLHSATKYIGGHSDVVAGLVATSDAELAERLGFIQNSTGGVLGPQDSYLLIRGIKTLGLRMEQVQRNTLAIIDMLQQHSAVKQVFHPSISDHLNHDIHEAQSEGHTGVVAFEVADIESAKKVISESHYFTLAESLGAVESLISVPALMTHASIPKDIREKEGIADGLVRLSVGIEDTKDLVEDLEQSLNALG >NZ_CP054440.1|WP_002482211.1|293968_294523_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MSQKKQDILSVAERLFYEYGFKGVGLKQIIQEANVATMTLYNHFESKDNLVAQVLKQRETRYWHYLDSHVEQHPEKPFISAVTAHCQWLNDYSYKGDMFMRAIEDYADTDNEIESTARGHKERLLHYLEKLADDAGIENGYDLAVQYTLLLEGTTSMTALLGSKDATSHAITMAKLLLNEAHNQ >NZ_CP054440.1|WP_011302245.1|294696_295167_-|acyl-CoA-thioesterase MTDEYIYKNTVQPSWIDNNNHMHDAQYYSIFSDAVVGFFESIDFSTDYRHSQDVTMFSVEAHISFLKELLLDESFYIKVHIYDYDAKRVHLFLTMYNSNDERNATYEAIMMGVGNETRRSMDFPKPIQEKIKHYFDQQNTFDVPKQLGHVIGIPKK >NZ_CP054440.1|WP_011302246.1|295344_295551_+|hypothetical-protein MVLVALILFIISIVFLIYSITLLMGKDGTMFSLFTKEEKALTKGQKLTIYLITIVLFVASLVWLLNLI >NZ_CP054440.1|WP_002482214.1|295637_296480_-|urease-accessory-protein-UreD MSNNKQAWTGQLDLSVFNNGKKSVARDVFFEKALKVMRPVYLNQSDIPTFYIVNVGGGYLDGDRYTMNFNIDSDAKVILTSQGATKIYKTLNDHVEQYQTFNIKNNGYAEYVGDPIIAFENAKFYQHNVFNLESTASLFYTDILTPGYSKSDKRFSYTYMHLLNEIYVDDALVTFDNMLLDPQKQNVDGLGYMEDYTHLGSCYFIHPSVNQKFIEQVYEEIKHFQHKYDCRFGITHLPTHGFSLRILSNKTQVIESIITAVQCYVVKQIFDRDVDFLRKY >NZ_CP054440.1|WP_011302247.1|296480_297095_-|urease-accessory-protein-UreG MTDTIKIGVGGPVGAGKTQLIEKIVKRLAKDMSIGVITNDIYTKEDEKILVNSGVLPEDRIIGVETGGCPHTAIREDASMNFAAIDELKERNDDIELIFIESGGDNLAATFSPELVDFSIYIIDVAQGEKIPRKGGQGMIKSDFFVINKTDLAPYVGASLDRMAEDTKVFRGNRPFTFTNLKTDEGLDEVIQWIEQDVFLKGLA >NZ_CP054440.1|WP_011302248.1|297108_297798_-|urease-accessory-protein-UreF MIDHAHLRLFQFCDSQFPTGAFSHSFGLETYIQRDTVHDEESFQQWLVLFLNEQLTYADGLTMRLVYDALNENDTKAILKLDRILFVQNLPKETRQGSKQMGNRMVKLASELYDSDWINWYHAQMKDKKASLHPAICFTMLGHHLGVDIETIIDYYLYQNVSSLTQNAVRAIPLGQTAGQRIVHKMIPIMKETRDHIMTIPASQLGITAPGLEINQMEHENVNVRIFIS >NZ_CP054440.1|WP_002482217.1|297790_298243_-|urease-accessory-protein-UreE MIIEEIVGNIANLSDSEKGKHMEKVYLENSDLVKRIQRVTTDHGNEIGIRLKQPIDLQYGDILYKDDKNMIVVDVNSEDLLVIKPRTLQEMGDIAHQLGNRHLPAQFTETEMLVQYDYLVESLLKDLGIPYEHEDRKVNKAFRHIGHSHD |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
895408 : 911123
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP054440|895408:911123|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP054440|895408:911123|910601_911123_-|WP_037554460.1|DBSCAN-SWA MGVGNSNLEIKPTLSNLQFYIGQTGKPEHDPLLDFSLLYEHAELGIKFTLSGLDKIDNPYNTDNELYLIILLYDKVGGIGFDLRNFWTLNLNAETMKKPYETIQFTLYKFEPNNRSYDFTNIYQQLKVLVLPEEIGKEEIDKDTFMNWMTWPQQNEILSTKIPIYHHKEINNE >NZ_CP054440|895408:911123|905277_905751_+|WP_174543100.1|DBSCAN-SWA MSYTVLSPIKQDYALGFDEKKNTIILKPLYSNTQVGIATVDGVASSDINYKKGSLTRRVFKNFKDTDGINIVINNNENSFVANSKDKGMLTVINEEYIGFGIQVDKVEDKGEGLQELVDIAKNKKSVSVQSYASKIGMDNTTIGNIDKIELISVNTK >NZ_CP054440|895408:911123|909434_909923_-|WP_002455578.1|DBSCAN-SWA MNNLGTLYFFSGKMGAGKSTRSKEIAQTENAVLLSEDEWLEKLYPNQINDFDDYLSYSKLIKPLLKEHIQRILKVGSNVVLDFPGNTKTQRKWLLSVASEINANHQLIFLNISDDKCLKQINIRRSEEPEREQFDTKETFEYVSSFFEPPEFSEGLNIIEIK >NZ_CP054440|895408:911123|900707_901016_+|WP_174543092.1|DBSCAN-SWA MLYTEKVQESVEFADLRNKVQAVLDYLGMETSELEDEREYAVKKNQPIYHQAINNNIKQNYIVSSTLQAIRTDIENMHDDIQADIKQEKSASENFGERSDNA >NZ_CP054440|895408:911123|903648_903933_+|WP_064783239.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP054440|895408:911123|906912_907386_+|WP_064783232.1|terminase|DBSCAN-SWA MAQRKLLSQQKSRLTTEAQETKQATEEALKQLTKLQPEPPEWLDDTATKEWHRIFPLLEELPIASLDLALVSAYCTAYSDYINATIRMKNESAIIETERGTKLNQNHAIKRDSLSQLNSIAPKLGLTVESRLKILDPSKEKVTGKSVFDIFGMDDDD >NZ_CP054440|895408:911123|908282_908618_+|WP_064783228.1|DBSCAN-SWA MRYDKATVKEFILNYHKIQDNSYTCDEDVGIDDFFNVNNQVETHEIDNSNIEDVIFYNELEAVIERVATEKEHNLFLLICNGVSFEKAGNIFGVKEARAKQMLNRLLDKLE >NZ_CP054440|895408:911123|907426_907963_+|WP_064783230.1|DBSCAN-SWA MILKRCKSVLWYKEEMKITEYELLTNYNPQFINSKIRAIQEQINAMYHLNTSHTVCDEIAGVITVSYPLDKLVIWITDQKDELNRFKINSTKKLNLLKKLISNYTPKEQKEVMRYFKSNGSNKPYKTIDKLQEDLYKIHHNKRIERNEQREKENEVIYQNFVVEVKESLNKEREELVV >NZ_CP054440|895408:911123|900177_900354_+|WP_174543090.1|DBSCAN-SWA MKLFAALITASSLTSFAVGYVTEDIFNAISLYTPLAITSWAITEWFNDRKIKKQLLED >NZ_CP054440|895408:911123|895408_895696_+|WP_002482789.1|DBSCAN-SWA MLKPLGNRVIIQKSEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGTIIAVGAGRILKDGSRVAPEVNEGDKVVFQQYAGTEVKRGDETYLIVNEEDILAIIES >NZ_CP054440|895408:911123|908794_908986_+|WP_174543102.1|DBSCAN-SWA MEPNLDWNKDFQEFQDILNSGIHPEWLYNAKANMILNPAYTGQGKQFFFTKNIIKASKTIPFF >NZ_CP054440|895408:911123|900358_900706_+|WP_064205791.1|DBSCAN-SWA MNNDILNAFEEMTSASNKVYSLNAELNRLSELVGVLSEKVKAYREEGDNLGANAIANIALDDIEPEINYLYEDFHKSLKEFKQKAKRLKNVCAFYGINVQLGKNNKVINFNKESK >NZ_CP054440|895408:911123|897492_898662_-|WP_115338437.1|integrase|DBSCAN-SWA MANYEKRGNNWRYRISLGKNPNTGKYEYISKSGFARKSDAKNHAEMVERQIRNGEYIAPSTHTFNFVADEWIKHYSRDAKISSVRAREKAIYHAKELFGNRSIQTITKRDYQAFVDDISTRFSKNYVDSIVSSTNLIFKYALDMKIIAKLPIEGIKRAKFKPTVEDLEQNNIQQKFLEKDELFEFLSVAKHHHKPLNSFELFTFLSYSGMRAGEVLALKWSDIDFEKCTVSITKTYYNPNNNKKNYQILTPKTESSIGKISIDPNVIKLLQDYKVNVQDKWKNELYVDNGFIFTDNNGYPLVIKKLSQWIQSIMSMTDIDKNITTHSFRYTHCSLLIEAGVHIKEIQERLRHKDIQTTMNIYASITKSYKKDASQRFSNLMENVSKELF >NZ_CP054440|895408:911123|908995_909406_+|WP_048787476.1|DBSCAN-SWA MKPINPDVPDEYKYETDYRNIPREYLNPRIPKGRGIVKWQAFKTLPEQYEQLEQYIQDQNKIEKPILDDDQLNELNNTLIFKMYNDPSIELRYFENGYIKTKVGYIHKVDVYTKTLHMYEDTGISILNLKDIVEIK >NZ_CP054440|895408:911123|895758_897381_+|WP_047503246.1|DBSCAN-SWA MAKDLKFSEDARQSMLRGVDKLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEYTSPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVEVAIEALHEISQNVDNKNEIAQVGSISAADEEIGKYISEAMEKVGNDGVITIEESSGFNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVADLERPYILITDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADDVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLELKEATMDMLGTANKAEITKDNTTVVDGDGDQNSIDARVSQIKAQIEETDSEFDKEKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTAFMNIYEKVAKIEAEGDIATGINIVLKALEAPVRQIAENAGLEGSIIVERLKNADIGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSSLQHAASVAAMFLTTEAVVANIPEESNNDSQAGMGGMPGMM >NZ_CP054440|895408:911123|903929_904343_+|WP_145461619.1|DBSCAN-SWA MRYLYNSGNRYGTVVTKNNVNRVITEYPREVFYFTDEELQQYMSDNNLGFNAIDFNDMTMEQLETVLMWCKQLEPMKSVNENCSSYNLKHMFERESYGFYISNGNMKEVMALAGFKPKSADDLNWFYTISERSIKQL >NZ_CP054440|895408:911123|898662_899505_-|WP_174543086.1|DBSCAN-SWA MLLKDLLKELRESRGLNKQELANKVDISRSYISTIESGKVEKPTKKTLMKIAYVFDPDDEQSIYSALLEASGYDTESSKEEYRDYINEMSTNFQETKKFNGEVISGMKYRVNKHDNSVVFLDKPYMNVLWLLEQEDFKVYLGYEDDEFFIDDNGTPFNKPLELDDEDKNNLLIQVHNFQSNLLLMKKALKNKNDIEALNIESMEYTLIFDLLNNRINDKNELISKLAVINKEREIFNAKEYHEELDKAAQEQDALKLQRLIRMTTIVELKQYLSEQNKGD >NZ_CP054440|895408:911123|902858_903662_+|WP_174543096.1|DBSCAN-SWA MTGYHVAKYLLKKNIQVIPLNQYKKPSVSFADIDVTDDFIEYHSSLYHQTHVLGVLTRGLWCIDIDVDHAKGKNGFESLKMIPYNDEIVANAQNTLVQTTPSGGKHIVFKKRVGIEYGQKIDYLPSVDIKAHNNNYFVLANSRTHKGTYKHNGINVSEYNGGFENRIFSKRGNYTQQVLEPYSMKRVLSDYNFDHLGAGKGGLGKQAYQRIVNGESEYRNDDLYKAASYAKQCNIDIEPLRILIGDNKNGDIFDERSWEATVRSAGY >NZ_CP054440|895408:911123|899878_900181_+|WP_174543088.1|DBSCAN-SWA MFNIGIDEDEARELLQQAIDERVEELAKEKYFMTYNELSKYLNLSKPTIEDLLIKNGMKYFRVGSTYRFKKSDVDDFMDHITSQMDITNNDLKSLKKVNL >NZ_CP054440|895408:911123|904648_905266_+|WP_174543098.1|DBSCAN-SWA MAKVNEKSIEVFNKVIEPKVENKKHVALEKIKVTDKLKEFDYKMSHYRAENDYTMIASLKKEQGKLEDEIVALHEQSEDENHKLLDEEIKSFNNAYDKEVNELRNTNDKLIQEFNDKLNAAYEVYEKIAANKVEAMRRATRRNYLNTAISNPDQWRLSLQRNTSLVDDPFRTNTDPRIIANKFEQKLFNINGRADSEFNNGNKKW >NZ_CP054440|895408:911123|908007_908286_+|WP_065581084.1|DBSCAN-SWA MRNYHSMVDTYKYQPSDVNELKYMNLESIVKGITEVYNDSEVKVQQIIKLTWWKDKKYTDEVIASVIGITEYTLRHAREVILKRVAKAVEYV >NZ_CP054440|895408:911123|899648_899864_+|WP_103301597.1|DBSCAN-SWA MSVAIKRMAFKFSIVKKGWNAKQLAEHVPMDYVYLNKIINGKASPSDLMAIKISNALEVDVSEIFEIKEKV >NZ_CP054440|895408:911123|904428_904635_+|WP_145461620.1|DBSCAN-SWA MHMWYRDVVNQIVARLPTDISNVSESYLDCVIKRYVTRREDIEEVKQCINELKINKQIKTYKDFITKK |
25 | Staphylococcus_phage(66.67%) | integrase,terminase | attL 897364:897383|attR 912893:912912 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1034439 : 1048665
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP054440|1034439:1048665|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP054440|1034439:1048665|1042844_1043681_+|WP_061050593.1|DBSCAN-SWA MENISFYNGNEMPIVGLGTFRVENNDECKASVKHAIESGYTHIDTAMIYENEHKVGEGIAEGLASTGLKRSDLFITSKLWLDDYGRKNVENAYETSLKKLNLDYLDLYLMHWPGTDEALMIDTWQGMEDLYKDNKVKNIGVSNFNVEHLEALLAQVSIKPVINQVEFHPYLLQESLRRYLEVQNIHMESWSPLMNAQILEDATVKSVAEEVGKSPAQVIIRWNIEHGVVVIPKSVTPSRIEENLNVFDFNLTPTQIEKLDSLNEDKRIGPDPIGYNGH >NZ_CP054440|1034439:1048665|1043951_1044308_-|WP_047504130.1|DBSCAN-SWA MIQCILVMLGGGIGAVIRGFVTDVFNQKFNTSLPIPTLLVNVVGSFCIGLLMGMCLNINWINPFIIVGILGGLTTFSTLSSELVKLLTTPKQINLFILYSILQYGVSFVACLLGYYLF >NZ_CP054440|1034439:1048665|1036835_1037087_-|WP_011302826.1|DBSCAN-SWA MKTIFLGLIHIYQRFISPLTPATCRFYPTCSEYTREAIVVYGPFKGTWLGIKRISKCHPLHKGGFDPVPLKKTKHKKDKNINK >NZ_CP054440|1034439:1048665|1045470_1046184_+|WP_011302836.1|DBSCAN-SWA 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16 | Staphylococcus_phage(92.31%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1053104 : 1070192
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP054440|1053104:1070192|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP054440|1053104:1070192|1058724_1059726_-|WP_047504116.1|DBSCAN-SWA MPIVKDFFIGLSNNSFLNKTAKEVGPMFGANKVVAGNTIKSLIDTIERLNNKGITVTVDCLGEFVVTEGEAIQAKDQILEVMYAIYNHSLAGHMSVKLSQLGSEFDIDLAYRNLREILLKANEFDNMHINIDTEKYDSLFDITQVLDRLKGEFKNVGTVIQAYLYKADALIDKYPELRLRMVKGAYKENEVIAFQTKEEIDENYIRLIKKRLLSAKNVTSIATHDDKIITQIKQFIKDNKIDKDRYEFQMLYGFRSDLAEQIAGEGNNFCIYVPYGDDWFSYFMRRLAERPQNLNLMFKELLKPDILKKVGTIAGIFAGVVATGSILYRVLKK >NZ_CP054440|1053104:1070192|1058001_1058460_+|WP_002482978.1|DBSCAN-SWA MNFEGKLVGSDLKVAIVVSRFNDFITNRLLDGAKDTLIRHEVPEANIDVAYVPGAFEIPLVAKKLAKKNDYDAVITLGCVIRGSTSHYDYVCNEVAKGVSKANDVTDTPVIFGILTTENIEQAVERAGTKAGNKGAEAAVSAIEMANLLREI >NZ_CP054440|1053104:1070192|1068431_1068743_+|WP_002482987.1|DBSCAN-SWA MESITVTELKEKILDANPVNIVDVRTDQETAMGIIPGAETIPMNSIPDNLNYFNDNETYYIICKAGGRSAQVVQYLEQNGVNAVNVEGGMDEFGDEGLDIKSI >NZ_CP054440|1053104:1070192|1059992_1060817_+|WP_011302852.1|DBSCAN-SWA 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MNYSHNEIEKKWQDYWEANKTFKTSDNLGQKKFYALDMFPYPSGAGLHVGHPEGYTATDIISRYKRMLGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALDTGNDPREFTKENIQTFKRQIKELGFSYDWDREVNTTDPEYYKWTQWIFIQLYNKGLAYVDEVAVNWCPALGTVLSNEEVIDGVSERGGHPVYRRPMKQWVLKITEYADRLLEDLDELDWPESLKDMQRNWIGRSEGASVAFDVKDYNEQIEVFTTRPDTIYGASFLVLSPEHELVDLITTEDNKDDVEAYQKEAAKKSDLERTGLSKEKSGVFTGAYAVNPLSGQQVPIWIADYVLSTYGTGAVMAVPSGDQRDYEFAKTFDLPIIEVIEGGDMSKEAYTGDGPHINSGELNGLYNEAAIEKAIELLENKNAGTRKVNYKLRDWLFSRQRYWGEPIPVIHWEDGSMTTVPEDELPLLLPETDEIKPSGTGESPLANIDEFVNVVDEATGMKGRRETNTMPQWAGSCWYYLRYIDPDNEQMLADPEKLKHWLPVDLYIGGVEHAVLHLLYARFWHKVLFDLGVVPTKEPFQKLFNQGMILGEGNEKMSKSKGNVINPDDIVKSHGADTLRLYEMFMGPLDAAIAWSENGLDGSRRFLDRIWRLLITEDGSISNKVVNNHSKALDKSYHQTVKKVTEDYNSLNFNTAISQLMVFINDCYKAEEIYKPYIEGFIKMLAPIAPHISEELWSRLGHDETITYQPWPSYDEALLVDDEIEIVVQVNGKVRAKINVSKDIAKEEMEQIALDNEHVKSEIEGKDIKKVIAVPKKLVNIVAK >NZ_CP054440|1053104:1070192|1053104_1054571_+|WP_048787170.1|DBSCAN-SWA 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15 | Staphylococcus_phage(100.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1191961 : 1201086
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP054440|1191961:1201086|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP054440|1191961:1201086|1195175_1195436_+|WP_011302951.1|DBSCAN-SWA MQFTSLILPILLLVLMWFFLIRPQQKKAKEHREMISQVSSGQRVTTIGGIKGTVRSVDETTVVLTLNGNGTEITLEKPAIKQVDPS >NZ_CP054440|1191961:1201086|1195817_1198094_+|WP_047503968.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIVAFILLVVLLFAGMGLTYKNVVKDVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLQKGDKIDDKAVKATAKTLENRVNVLGVSEPKIQVEDNNRIRVQLAGVKNQSQARDILSSQANLTIRDADDNVKLTGKDIQQGSAKQEFKQNTNQPAVTFKLKDSDKFKKVTEEISKKDENVMVVWLDHEKGDTYHKEMDKKDPKYVSAASVDKPINSDSVEISGGFNGEEGVEKAKQIADLLNSGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVLAAAIGIAVIYLFMLGFYRLPGLVAVIALTTYIYLTLIAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELKIGRTLKQAYKKANKSSFLTIVDAQLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRWLLSLLISSNFFKKSKWLFGVSKKNIHNANEEKEIHDLKTPYERIDFMKLAKPLLGLSVLIIVVGAIILFIFRLNLGIDFTSGTRVDFESNNKVDENKVTNTLESKGFKPDQVSLGENDKNATVQFKHDLSKDEVSKIQDTVDQSFGNKPTVNTVSPVIGQELAKNAMLALIYAAIGIIIYITFRFEWRMGLSSVLALLHDAFMIVAVFSLFRIEIDITFIAAVLTIIGYSINDTIVTFDRVRENLHKVKVITKNEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVLIVVIALLIFGAPSIFNFSLALLIGLISGVFSSVFIAVPLWGIMKKRQLKKSDNNKIIVHKEKKSNDEKILV >NZ_CP054440|1191961:1201086|1200567_1201086_+|WP_002483102.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVEDWPKPGVNFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVEYAKLRDVDIIVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYED >NZ_CP054440|1191961:1201086|1191961_1192966_+|WP_047503974.1|DBSCAN-SWA MDDRMVDQSMHDEESSFELSLRPTKLRQYIGQSTIKSNLEVFIKAAKMRQEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRIISGPSIERPGDLAAILSSLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIVIGKGEEARSIRIDLPPFTLIGATTRAGSLTAPLRDRFGVHLRLEYYQELELKEIIVRTAEVLGTSIDDESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDELISIATTRASLQLLQVDDEGLDYIDHKMMNCILEQYKGGPVGLDTIAVSIGEERVTIEDVYEPFLIQKGFIERTPRGRKATPYAFEHFSKKNRKKE >NZ_CP054440|1191961:1201086|1194014_1195160_+|WP_011302950.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPTPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELHQMETKIILGNTYHLWLQPGNDIIRKSGGLHQFMNWNGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYKYVKDSIERTTRWAERCLKAHSRPEDQALFGIIQGGEYKDLRKQSAEELVALDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYDMVHHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSHGRVIIKNAKYAEDLGPLDDNCDCYTCKNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTYHNLHFLLKLMENIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP054440|1191961:1201086|1198275_1200555_+|WP_048787235.1|DBSCAN-SWA MIKSKYTWDVKSPENEITEDVSLDLKLTPIVKKILESKEITDKAAIDQLLKNKQVMHDAWLMSDMEKAIERINLAIDQNQKILVYGDYDADGVTSTTILVETLKALGAHVAWYIPNRFSEGYGPNEMAFKNAHEEGISLIITVDNGIQGHDEIQMIQDLGVDVIVTDHHEIGRTMPSAFAIVHPMHPEFDYPFKYLCGAGVAYKLAQNLLDEPPAYFLGLVAIGTVADLVSLTDENRALVQKGLEILNDHCPASIKAILKQAGYNDVITEETIGFIIGPRLNAVGRLEDAALAAELLMTDNDEEAEFLAEQVEFFNQERKDIVAQITEEALAAAEDQVKQGTKFLLLAQADWHEGVLGIVASKIVETYSLPTLILNIDEAQDHAKGSARSIEQVSMFEILNAHSDLISKFGGHHMAAGITMPIENIESLRQGLNDWMAQLASTTSLEPRKKVDVKVAETDITIKNIQDIQRLRPFGTDFSSPCFELEGVIVNQAKAIGQDKKHLKMVLGDSQLQAIFWQNGHLVKELGEQQPINVIGTLQINEWNGFQSPQFMIQDLASNNLQILDYRSKSKVSGFEQDSSNVAYLIHNKSEKLDDNYYYYGDTIDQSYDKYVFRDLPPSIQAIKTTLKTVDVSQIYLVLNHERSIYFEGMPKMETFKKCFKALATKKETDLAKEGMQLCQFLNIQPSMLKFILKVFLDLEFIKDENGIIKMNSVSTKREIESSKYYQGRLDRIEVEKVLLYDDFANLKKWIKTELVDK >NZ_CP054440|1191961:1201086|1192968_1193994_+|WP_047503971.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDIEAFDYHLPEALIAQTPLKNRDESRLLILGRQSGNIEHKHFKDVTDYLNEGDTLVLNDTRVMPARLFGMKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLTFGEGKIIAECIEELDQGGRIMRLHYDGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDQERYQTVYAKASGSAAAPTAGLHFTDELLERIKAQGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVDNIDDHEMHSEYYQMDEATANLLNSTRDNGNRIISVGTTSTRTLETIMQSSDRFVAKSGWTDIFIFPGFNFKAIDGLITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRDYIINAYNHAVASEYRFFSFGDAMLII |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1327387 : 1337354
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP054440|1327387:1337354|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP054440|1327387:1337354|1328940_1329675_+|WP_011303059.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFNGPLDLLLHLIQKIEIDIYDIPMKALTEQYMQYIHTMNQLEINIASEYLVMASELLMIKSKMLLPQTNEVEDLDDDPRDELVDRLIEYQNYKAYTEFLNERKVERALYFSKHPTDLSHLESNETWSPDNTIDLTELIIAYQKVKNRVEFHTPKTVDIRKETFTIQQATSQVTDKLKQHESFNFFSLFNFTEPIEMVVTHFLAILEMSKSGIVNIEQAKSFDDINILRGVNYGVAR >NZ_CP054440|1327387:1337354|1330199_1330937_+|WP_002483234.1|DBSCAN-SWA MNKDTERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGTVETELGTKVKPSDSIEVEGIKLEQEDKLYILFYKPAQVITSVSDDRGRKVVTDYFKQIKTRIYPVGRLDYDTSGLLLLTNDGEFTNLMTHPRYKIKKKYVVKLKGYLMREEVKSLEQGVQLEDGVTQPAIIKVKNQDKDKNTTLVEITITEGRNRQVRRMFEHFGHQVTKLQRIEFGPLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKMIRQIAEHGN >NZ_CP054440|1327387:1337354|1328342_1328849_-|WP_011303058.1|DBSCAN-SWA MENALKEFYFQFHTNQHYFLCHDILEEAWKENKSFSKDDAVVSLILFATGCYHFRRENDKGAIKSFRKALKVIEPYKEEINLGIDIKAYQKVIAELVHAIENGQKFAPVQLPITSQMQQKILTTYPNYIMTEYVIRDSYIVNHHLERDRTEVNEARLNALYQKQQERK >NZ_CP054440|1327387:1337354|1331769_1333536_+|WP_174538820.1|DBSCAN-SWA MMNQLNSVVIKLWLTIIFIVTTVLILLSAALITFIQSYFTQETEDSLLKDAKRISQLLESADNRETAIQHSRKLIEGPVGLIIMNDKHIDRQDKDKTKNKMVKEIKKSNDYNQVFNNGKQVSEHVTLNMNGNQRTYVLIGYPTKAISSADNHTNKFSGVFIYQDLKTIEDTNNVITVIILIIAIIFLAITTIFAFFLSSRITKPLRNLRTQALKVSKGDYAQVVPVNSRDEIGELSRAFNTMSSEIQQHIDALSSSKNIRDSLINSMVEGVLGFNDKKEIIISNKMANTTLQMLDDFALEKLDEQNELTFKNKKTQFEVYEINTRYFVIITSYIEQIQPDGRSGIVAIIRDMTNEHNMDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPAEIHESLSIVLDETKRLNRLVNELLNVARMDAEGLTVKKVVQPIDHLLDKVQQKYQKHAKDLGLNMNLSPNTHNQMWYYDSDRIEQVLTNLIDNASRYTEPGDEIKIEFGETQTENILYISDTGSGIAPEHLQQVFDRFYKVDTARKRGKQGTGLGLFICRMIIHEHGGTIDVKSTLGKGTTFIITLPKPKTN >NZ_CP054440|1327387:1337354|1327387_1328275_+|WP_002483230.1|DBSCAN-SWA MDTIIEEYLKFIQLEKGLSSNTIGAYRRDLKKYNTFLELQKISHIDFIDRASIQQCLGYLHDNGASAKSLARFISTIRSFHQFALREKYAAKDPTVLIETPKYDRKLPDVLEINEVLALLETPNLAKINGYRDRTMLELLYATGMRVSELIQIELEDVNLIMGFVKVFGKGNKERIVPLGDTVIEYLKTYIETIRPQLLKKTVTNTLFLNMHGKPLSRQAIWKMIKQNAIKANITKSLTPHTLRHSFATHLLENGADLRAVQEMLGHSDISTTQLYTHVSKSQIRKMYNEFHPRA >NZ_CP054440|1327387:1337354|1329658_1330207_+|WP_047503875.1|DBSCAN-SWA MALQDKGILEALLYTAGDEGLDQQQLLEILEIEPTTLTELIEAYDSPGLTIQHYGNTYVLTTKKEASDYIEQLIEQKSKMKLSQAAMESLSIIAYNQPLSRSDIELIRGINSDGAVKTLIARGLVEAKEQADSRSHQLYTTELFLNVFGIEHLDDLPTTDEEDEEIEAFFSNLVNQKGDNHE >NZ_CP054440|1327387:1337354|1334664_1334913_-|WP_002483238.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAYVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALDGCPTDSIKIEEESFDGDALKFE >NZ_CP054440|1327387:1337354|1333963_1334509_+|WP_037538408.1|DBSCAN-SWA MHQQTKRLITISMLSAVAFILMFIKFPIPFLPPYLTLDFGDVPALLATFILGPVAGLIVEFIKNLLNFLFNIGDPVGPVANFLAASSFLLTAYFVTKYKDKIKSQIVGLSIATVVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIMNLSDVVENVKIVIVSGVIPFNIIKGIVISIIFILLYNRLKNVLPK >NZ_CP054440|1327387:1337354|1335022_1335982_+|WP_047503872.1|DBSCAN-SWA MYNIIHFAYTNAHNYKTEKSIFNIITGKKSHQTFFDACSQQLLSLYHSLPNLKYPSFERYSNNFNIETAQYQSIINHPRHTYDSLVNTFNAIQLLTQTLSNTGHAIYEFVPITQHRTVQKQVKQLYKKITDEDLKSQFIEELTNLFHTLSEKNNHVYLHYYLQGFEESMYTRQQVSLIESVSQEHLYELEIRDLVTLMYEIEDDSQYPLLNQLIILPALLHKTTLTYEGIKQGMHFDKLAAQQNVKQNTIQDHILELFIKGYLTDYPSFLIHKTYEQFIPHYLSNRSERLRNYKTIFPDLSYFEIKLIIVGIERGDLHA >NZ_CP054440|1327387:1337354|1331063_1331789_+|WP_011303060.1|DBSCAN-SWA MSNEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFEIHEANDGNEAYRMAMEHDYACILLDLMLPEMDGITVASKLREHKETPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQVATAEQSEPHARDLIEFDHLVIDNDAHRVLADGSQVNLTPKEYELLIFLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAHMIQTVWGVGYKFEIKSNNESTQ >NZ_CP054440|1327387:1337354|1335974_1337354_+|WP_047503869.1|DBSCAN-SWA MLNEALKKHFGFDTFKPGQKEIITHVLEKKDTLGILPTGSGKSLCYQLPTYINQQPTLIISPLISLMDDQVMQLKLHGEHHVACIHSGMDEHERAQNIKQLTKSRFIFLSPEFLLQPHNFKLIKHINLGIIVLDEAHCLSEWGYDFRPHYALVGKIVNHFHNATVLALTATAPSYLTFDLKQILNKSFHIVKTTMNRDNISLSHKNFADDDEKLKWLLPSLEHAGPTIIYVSSKKMCLLLAQQIYNYGFLTGIYHGDLSYQERHTVQHQFLNNEIPIIVATSAFGMGINKKDIRTIIHFHLSTSPSNYMQEIGRAGRDGGQSQAISLYQPDDRFLLETLLFTDMITMEDVEIFELGQFLPPEKSEVLQILYSYYTYQQLRNIFEISYKRKHLGYMRMLGYKHLDQCRRAYMIEFFNEQLSEKPNQCCDNDSEINAINILNRKKVKRKMDFNEKIQNLFK |
11 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1666856 : 1732757
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP054440|1666856:1732757|DBSCAN-SWA 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73 | Staphylococcus_phage(43.24%) | plate,holin,transposase,portal,tRNA,terminase,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1817517 : 1825992
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP054440|1817517:1825992|DBSCAN-SWA CTTATTGAATGATTTTTGATATGACTTCTGGATATAATTCATGCTCTATTGCTTTAATTCTTTCTTCAAGATCAGATTTATTATCGTCCGGATAAATATCACATTGACGTTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTGTCAACATAATGTACTGTTGAACCAGTTATTGTATCGCCACTTGCTAGCGCTTGTCCTATAGCATCTTTCCCTTTATATTTTGGTAATAATGAAGGGTGAATATTTAAAATGCGTTTATCATAAGCTCTTAAAATATTTTCACCTATTAATTTCATATAGCCAGCTAGAACAATCCACTCTACTTTTTCAGACGTTAACCATTCTATAATTTTACGTTCATAATCCGCTTTAGAATCAAAATTTTTCAATTCATTAATATGAACATCTAAATGATATTTGCGCGCGCGTTCAATACAATATGCATTTACTTGATCTGTATAAAGTGAGGTTACTTCAATATTTGGTAGTTCCCCTTGTTTGATTTTAGACATAATACTTTCAAAATTACTTCCAGAACCAGAAGCAAATATAGCTATTTTGGTCAATTTTATACCCCCGTTAATTGGATTGGTTCGTTGCCTTTAACAGTTTCACCAATTTTATATGCCTTGATATTTTGACCATTAAGTATTTCTAATGTTGATTCAACTTGGTTATTATCAACGACTAAAGTAAAGCCAATACCCATGTTAAAAATGTTATACATTTCATCAGTTGAGATGTTTCCTTGTTCTTGTAACCAATCAAATATAGCTGGCGTAGGAAATTGCGTGACATCAATCTTGGCTGTTATCCCCTCAGGTAAGGCTCTAGGTATATTTTCATAAAAACCGCCCCCTGTAATATGGGTCATGGCATATATCTTAATAGATGATTTAACAGCTAACACGGGTTTTACATATAAACGTGTGGGTTTCAAAAAAGCATCTAAAAATGTCTGTTCTTGATTGAATGGTTCACTTAATTTAATACCTGATTGTTGTATTAATTTTCTAACTAAACTATAACCATTGGAATGTATGCCACTAGATTCAAGACCTATAATTGCTTGTCCAGGTTCAACAGATGAGCCATCAATATAGTCATCCTTTTCTACTGCACCTACTGCGAAGCCTGCTAAATCATATTCACCCTCGTGATACATTTCTCCCATTTCAGCTGTTTCTCCACCGATTAAAGCTGTATTGGTCTCTTCACAGCCATCACTTACCCCTTTGACAATTTGCTCAATGACTTCAGGAACGACTTTATTAGTTGCAATATAATCTAAAAAGTAAAGTGGTTCTGCACCTGTAGTTAAAATATCATTGACACACATTGCGACAGCATCTATACCAATCGTGTCATGTTTATCGTTATCGATGGCTAATTTTAATTTTGTACCTACACCATCTGTACCTGATACAAGTAAAGGTGCTTTCATATTTAACTGTGACAAATCAAATGTAGCACCAAAGCCACCCAATCCACCAAGTACTTCTTTGCGCATTGTTCTTTGGACATGACTTGTCATTCGTTCTACCGCTTCATACCCTGCATTAATATCGACGCCTGCTTGTTGATATGCTTTAGACATTTAAATTACCCTCTCTATCAAAGTATTGTTGATGATTTGCTAAGTACGCTTTTTGACGTTCACTTAAATGCGCTACATAATCTTGCTCATAATCATATAAACCTGCAGGATAATCACCTGTGAAACTTTCAACACAAAGTCCACTATAAGGCGCATCGCAATCAAGTCCAATAGAATCAATTAGACCTTCGACTGTTAAATAAGCCAGTGAATCTGCTCCAATATAATCACTAATCTCCTCGGGCGATTTATTTGATGAAATAAGCTCTGCCGTTGTTGAAACATCTATGCCATAAAAACTTGGAAACATAAACTCAGGAGAAGCAATGCGTACATGAACTTCCTTAGCGCCTGCGTCTTTCAACATTTGTACTATACGTTTACTCGTAGTACCTCTGACAATCGAATCATCTACTAAGACAATATTTTTATCATAGACAATATCTTTTACAGCAGATAATTTTACGCGGACGCCTTGTTCACGTAATTCTTGTGTCGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACAAGACCCATTTCATACGGCAGTCTACTCTCTTCGGCATAACCAGATGCTGCTGAAAGTGAAGAATTAGGTACACCAATAACCATGTCCGCATTTGATGCTGGACTTTCTTTCGCTAATTGCTTACCAGACTGTTTTCTAACAGCATGAACATTTTTACCGGCAATGGTTGAATCAGGTCTAGCAAAGTAAATATACTCCATAGCTGAAATAGCCGTCGTTGTATGACGCGTATAAGATTCGACTCTGATCCCATCATCATTGATGACTACATATTCTCCAGCATGAATATCTCTTACAAATTCAGCACCTAGGACATCGATTGCACATGTTTCACTGGCAATAATATATGAACCATTTTTCATTTTACCAACAGCTAATGGTCGAATCGCATTAGGGTCAACTGCACCATATAAAGCGTCTTTAGTTAGTACCGCAAAAGTAAATCCGCCTTTTATTTTTCTTAAACTTTCTTGAAAAGCATCTTCAAATGTAGGTGCTTTACTTCTGCGTATCAAGTGCATGATAACTTCAGTATCTGAAGAAGAGTGAAAAATAGAGCCTTGATGTTCTAAAGATTTTTTTAGACTTTGCGCATTGATAAGATTACCATTATGACAAACTGCAACACTCATATCATAAAAATGATATAAAAACGGTTGAATATTCTCTATACCTTTATTCCCGGATGTTGCGTATCTCACATGCCCAATTGCATGTTGATATGTTTTAAATGATTCCATTTGTGTATCTGATATCGCATCTGTCAATAAACCTAAACCACGTTCACCTTTAAGCACTTCACCATTTGAACAAACGATTCCAGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTGTGTAGTCCCATATAGGTTAATTGAGCAGATTCCGGATGATTCCATATGCCAAACACGCCACATTCTTCATTTAATCCGTTGCTGTCATACATTGAGGTATAGCTCCTTCCCATAAATCATTTAAATGTTTTACATCACGCACAATTTCGCTCTGTTCATTTGTCACTTTAAATTGTTGATCATTAGTCACTTTACCAATCTCAACAGCATAATCGCAGTTTAATGATTGACCATTTTTTACGATTACAATATAACGTCCTTGTGTTTCACTAAACAGTTGCGCATTCGTAACACTTAGTTTCGCCTGTAAACCAAGTTGGTAATGTGCACTGATACGAGCTAAAGTAAGCAATAAGCCACCTTTACCTACTGTTTGCACATGTGAAGCTACCCCTTCTCGAATTGCTTGTTTTATCGATTCACCTTTACGAACTTCTTGCGATAAATCAATGGATTCAAATTCATGATTCACTTGACCATACAACAATTTCTCTATTTGACTACCACCGAAATCATCATTTGTATCACCAACAACATATAATGTATCTCCTACAGAAGGATTAAAATGATTAAGATAACTTATGTCATCGATGAGACCAACCATACCTACTACAGGTGTTGGGAATATAGATGTTTCTCTCGTTTCGTTATATAAAGACACATTACCCGAAACGACAGGTGTGCTTAAAACCTCACATGCTTCTGCCATACCTTTTGTTGAATCTGCTAATTGTTGATATATTTCTTTCTTCTCAGGTGAGCCATAATTTAAACAATCCGTCATAGCTAAAGGCGTTGCACCTACAGAAATTAAATTTCTATACGCTTCGGCAACAACTATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTAAATACATAGCGGGCTTCTCCATCAATCGTTGACGCAATAGCTTTATCAGTTCCTTCAACGCGCACAACAGAGGCTTGTAATCCTGGCTTAACTATCGTATTAGCACCTACTTGTTGATCATATTGTTCGTATAAATAACGCTTCGAAGCTATAGTTGGGTGTTGTAATAATTGATCAAATACGGATTCAACATCTACACTGCTATAGTCATTTTTAGTTTCATTGTATTCTGGCGACGTACCTTCAAGTACATAAACTGGCGCTTCATCAGATAAAGGTTGAACTGGAATATCGGCAAATACTTCATCTTCATAAGTTAATACGAAACGATCCGTGTCAGTTACTTCTCCAATTACTGCACTGTCTAACTCATGTTTATCAAAGAGGTCTAAGAATTTTTGTTCTGTTCCCTTTTCTACAACAAGCAACATACGTTCTTGAGTTTCAGATAACATCATTTCATACGGTGAAATACCTTGTTCTCTTGTAGGGACTTGTTCTAAACGTAAATGTAAGCCACTACCACCTTTAGCTGCCATTTCTGAGGATGATGATGTTAGTCCTGCAGCCCCCATGTCTTGGATACCAACGAGTTCATCAAATGTGATGGCTTCTAGCGTGGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCAATTTGAACAGATGGTCGTTTGCTTTCACTATCTTCACTTAATTCTTCAGAAGCAAAAGTCGCACCATGAATACCATCGCGGCCAGTTTTTAAACCAACATAAATAACAGAGTTTCCAACGCCTTTAGCCGTCCCTTTTTGAACCATGTCGTGATCAATAATGCCTACACACATCGCATTGACGAGTGGGTTGCCATCATATCGATCATCAAACTCTATTTCTCCAGCAGTTGTAGGAATTCCTATACAGTTACCATAGCCACCTATACCTGCAACAACGCCACGTAAAAGTCGACGGTTTTGTTTTTCTGTCAATTCACCAAACCTTAGACTATTCAATAAATTAATTGGACGTGCACCAATAGAAACAATATCTCTAATAATGCCTCCCACACCAGTAGCTGCGCCTTGGTATGGTTCAACTGCAGAAGGGTGATTGTGTGACTCAACCTTGAACACAACCGCTTGGTTATCACCAATATCAACAACGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP054440|1817517:1825992|1823689_1824391_-|WP_011303439.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRIFSTGTSDVLRVEYKDEVTAGNGAKKDFIEGKGRLNNQITSRIFNYLKAKGLNSHFIEQISETEQLVNSVEIIPLEVVVRNIAAGSITKRLGFEKGHTFETPLVEFFYKNDDLNDPLITEDHIKLLQIANDGEIEKLKEAATEINEVLVNLMDKMNLRLVDFKIEFGRTNEGEILLADEISPDTCRIWDKQSDTNFDKDVYREDTGSIIETYQTFLNKLEAL >NZ_CP054440|1817517:1825992|1820573_1822763_-|WP_011303436.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSSEDIKIEQLYKDMGLSDEEYAKVCDILGREPNFTEIGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLTQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAVEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELTEKQNRRLLRGVVAGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMVQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELSEDSESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREQGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTDRFVLTYEDEVFADIPVQPLSDEAPVYVLEGTSPEYNETKNDYSSVDVESVFDQLLQHPTIASKRYLYEQYDQQVGANTIVKPGLQASVVRVEGTDKAIASTIDGEARYVFNNPYEGGKIVVAEAYRNLISVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLADSTKGMAEACEVLSTPVVSGNVSLYNETRETSIFPTPVVGMVGLIDDISYLNHFNPSVGDTLYVVGDTNDDFGGSQIEKLLYGQVNHEFESIDLSQEVRKGESIKQAIREGVASHVQTVGKGGLLLTLARISAHYQLGLQAKLSVTNAQLFSETQGRYIVIVKNGQSLNCDYAVEIGKVTNDQQFKVTNEQSEIVRDVKHLNDLWEGAIPQCMTATD >NZ_CP054440|1817517:1825992|1818086_1819115_-|WP_011303434.1|DBSCAN-SWA MSKAYQQAGVDINAGYEAVERMTSHVQRTMRKEVLGGLGGFGATFDLSQLNMKAPLLVSGTDGVGTKLKLAIDNDKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGVSDGCEETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKDDYIDGSSVEPGQAIIGLESSGIHSNGYSLVRKLIQQSGIKLSEPFNQEQTFLDAFLKPTRLYVKPVLAVKSSIKIYAMTHITGGGFYENIPRALPEGITAKIDVTQFPTPAIFDWLQEQGNISTDEMYNIFNMGIGFTLVVDNNQVESTLEILNGQNIKAYKIGETVKGNEPIQLTGV >NZ_CP054440|1817517:1825992|1817517_1818084_-|WP_011303433.1|DBSCAN-SWA MTKIAIFASGSGSNFESIMSKIKQGELPNIEVTSLYTDQVNAYCIERARKYHLDVHINELKNFDSKADYERKIIEWLTSEKVEWIVLAGYMKLIGENILRAYDKRILNIHPSLLPKYKGKDAIGQALASGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIYPDDNKSDLEERIKAIEHELYPEVISKIIQ >NZ_CP054440|1817517:1825992|1822755_1823427_-|WP_011303437.1|DBSCAN-SWA MKFAVLKFPGSNCDRDMYNAALKSDVEAEYVDYRNTSLDGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPITEAVKQFAKEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFVSRNESLRVVNHNTAFTNLYNEDETVVYPVAHGEGHYYCTQDMYDRLEANNQIILKYVNNPNGSFNDIAGIINEQGNVCGMMPHPERAIEPILGTDSGVKLFQAMVNSWREQNV >NZ_CP054440|1817517:1825992|1825509_1825992_-|WP_011303441.1|DBSCAN-SWA MKVVVIMGSSSDWETMKESCSMLDQFEIPYDKKVVSAHRTPQLMFEFSREARDAGYDVIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGMDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKAGAKNAGILAARILSIGNQTVQKNLENYEKSLVEKVSDMQDELE >NZ_CP054440|1817517:1825992|1819107_1820595_-|WP_011303435.1|DBSCAN-SWA MYDSNGLNEECGVFGIWNHPESAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVCSNGEVLKGERGLGLLTDAISDTQMESFKTYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAVCHNGNLINAQSLKKSLEHQGSIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEDAFQESLRKIKGGFTFAVLTKDALYGAVDPNAIRPLAVGKMKNGSYIIASETCAIDVLGAEFVRDIHAGEYVVINDDGIRVESYTRHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKQSGKQLAKESPASNADMVIGVPNSSLSAASGYAEESRLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVYDKNIVLVDDSIVRGTTSKRIVQMLKDAGAKEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISSNKSPEEISDYIGADSLAYLTVEGLIDSIGLDCDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEQDYVAHLSERQKAYLANHQQYFDREGNLNV >NZ_CP054440|1817517:1825992|1823426_1823687_-|WP_011303438.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYKQVNDIRVGKVLYMTVDEATDEAVHNVVTTLSEKLFANTVIEEYSYKVLEEGEKA >NZ_CP054440|1817517:1825992|1824395_1825523_-|WP_011303440.1|DBSCAN-SWA MNLSKLKFGSTIGIIGGGQLGKMMAQSAQQMGYKVIVLDPNSSCPCQYVANEFINAAYDDQIALDRLGALSDVITYEFENISANQLQALASKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKQTLQDSGSNIAPFLQLTDYDDLVKAVDSIGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLVKDATHLDEARQLIQAQECVAEQYLNLSKEVSLTVTIGTNNQITYFPLQENEHQNQILFKTIVPARVQDNKEQEARNEVNKIIKAIHFIGTFTVEFFIDQQNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACEYSQFDTHIKAITGQQLPQQVTLLKPAIMMNLLGRDLDLLEDQFAEHPEWHVHIYGKNERKFNRKMGHLTVLTNDINETEQKLLKQFEGR |
9 | Synechococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2063973 : 2082703
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP054440|2063973:2082703|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP054440|2063973:2082703|2078138_2079656_-|WP_002483939.1|DBSCAN-SWA MNAFIDTLIQRRGELLTTIFEHIQISFIALLIAALIGVPLGIALTKTRKLSEVIMNIAAVLQTIPSLALLGLMIPLFGIGKVPAVIALVVYALLPILRNTYTGINEVDPSLVEAAKGIGMKPGRRLSKVELPIAMPVIMAGIRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNDTSLILIGAIPAALLAILFDLVLRYMQNMSYKKLLISLGVIVIILLLVIIAPMLGQKGDKVTLAGKLGSEPSVITNMYKILIEQDTEDTVEVKDGMGKTSFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEDLKSKKEAQVYQQAKSSLEDKFDMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAEAHHIKTIGDLNKVSDQIKPGFTLEFNDRGDGYPAVKKAYDLDLGDVKTMEPKLRYQAIENGDINLIDAYSTDAELKEYDMVVLEDDKHVFPPYQGAPMFKESYLKEHPEIKKPLNKLEGKISDEDMQQMNYDVTVKNKDPYQVAKDYLEKHNLIKH >NZ_CP054440|2063973:2082703|2070541_2071042_+|WP_002483932.1|DBSCAN-SWA MTEGRNKEELEDITLLGNQNNKYDFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNIKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPDSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP054440|2063973:2082703|2080924_2082703_-|WP_047502733.1|DBSCAN-SWA 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14 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2091006 : 2098556
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP054440|2091006:2098556|DBSCAN-SWA ATTATAATCTCTCCAGTATTTTTGTTTTATCTTTAAATTCTTGCACTTCATTTTCAGGTATAGAATCAATAGTAATCCCTGAACCCACTCCATAAATTGCTTCATCATTTAAGTATTGTATTGTGCGAATTGGCACATTGAAAATAGATTTACCCTCCGGCAATAATAAGCCTATTGTGCCACAATAAGCATGTCTCGGTGTCTGTTCTAAATCTTTAATATATTGCATCGTATTCAATTTAGGTGCACCGGTAATTGAACCACATGGGAATAAAGCAGTTAATACATCTATTAAATCTGTCTTGCTACTAAGTTCACTTGTTACCATTGAAGTCATTTGAAAAACGGTGCTATACGTTTCGATATGAAAAGGTTTATAGACCTTTACGGTTCCAGTCTTTGCAATTCGACTCATATCATTACGTAATAAATCTACAATCATCACGTTCTCCGCTCTATCTTTTGCTGATTGTGCCAGTGTCATTTGGTTAAGTTGGTCTTCTGCTTTCGTTTTACCTCGTGCGATTGTCCCTTTCATTGGTTTACTTAATAGTACATCTGCTTTGTTTTTAAAAGGTCCTCGTTGGAAAAATAATTCGGGTGACATAGAGGCAATTTGTATTTCTTCTGTGTCTATAAGTGCAGCATAAAAACCATGATTTTGTTGTAATAACGTATAATATAAATCTGCAATGGGTTGTCGTATTTGATCTGTTAAACGTGTTGTGTAGTTTACTTGATATGTATTGCCTTCAATAATCGCCGATTGAATCATTTTAATATGTTCTACCAGTTGAGACGATGGGTGTTTAAATTTAAAATTACATTTCTGTTGCGGTGGTTGTTTGTCATTTTGTTTTTCAGCATCCGTAGCTTGATCAAACGCATAAGCTGCTGCATATATATACGCATCTTCAATTTTCACTGTAGACATTTGAGAATTAAAATACGGTGCCGCTTCATAGGCTATATAAAGCGCAACATAATAACCTGCTTTTTGCTTAGCTTCTGCAAAAGAAATCACTTCCCCAACCGTTTCAATGTTCGGAGCTACTTTTTTATCTGTACACTGTGTGAGTAAATATTGATGCATTTCATGATTTTCTTCATCTAATGTATAACGATAATTAAAGTGTATTTGCATGATACGCCTCCACTATATTTATAAATGTTTGTATTTGTGTTAACCCATGTTCACTTAGGATTGATTCAGGATGATATTGAACGCCATATATAGGTAATACTTTATGTTCTAATCCCATAATAATATTGTCTTCATTGATTGCAGTAATTTCTAATGTATTCGGAAAAGTTTGTGCATGTGCTTTTAAAGAATGATAGCGCATAACTTTAAAAGTTTCCGGTAATTGATGAAATAGACCTTTGCCACTATGTCGAATTTGAGTAGTATGCCCATGAATCGGTTTATCACTTTTGATAATATCGCCACCAAAATAAGTCACAATTTGTTGGAAGCCAAGGCAAACACCTAGTATGGGCATTGCTTCAGAGAATGTTTTAATAACCTCATTTAATAATGGATAATCTCTGGGCGCACCTGGCCCCGGAGAAATAATAATTGCTTTAGGTGCTAGCTCATATATTTTATTTACTGTTAAATACGTAACGTCTATCACTTCGATTAAGCCACGATAACTTTGTTTTACATAGTCTACAATGTTATAAGTAAACGAATCTTTATTATCAATAATTAATATCATGTTGTCGCCTCTTTTTAAAAATGTTCAATAGTCTGTTATACTTATTATCACAAATATTAGCTTGATTTTACAGTTTAAATATATTATTCTGAATCACGTTATAAATGAATATAAAGAGGTTCCTAGCTGATACCCTCTATAAAAAACTAGACACATGTACAACGTCTGTCTTTTTTATAGAGATAGGCGTTTTTTTATGCGCTTATCTAAACCCTGTACCAGTTAGTTCGACTATTTTTAAGGAGTGCAAGACAAATGTCAGAACAAACATTAGACAATAACAAAGCCATCGTCGTATTTAGTGGTGGTCAAGATAGTACGACGTGCTTATTTTGGGCAAAAAAACATTTTGAGTCGGTAGAACTTGTCACATTCGCATATGGCCAAAGACATGACACCGAAATTGAAGTCGCAAAGCAAATTGCAGATGAACAAGGTGTGAAGCATCATCTACTTGATATGTCATTACTTTCACAACTTACACCCAATGCATTAACGCAACACGACTTAGACATCGAGGTTGGTGATGATGGTATTCCAAATACCTTTGTACCTGCAAGAAATTTATTATTCCTTTCATTTGCTGGTGCATTAGCTTACCAAACCAATGCCAAACATATTATTACCGGCGTTTGCGAAACTGACTTTTCAGGATATCCAGACTGTAGAGATAGCTTTGTTAAATCAATGAATGTCACATTATCACTTTCTATGGATAAAGACTTCGTCATTCATACACCATTAATGTGGTTAGATAAAAAAGCCACATGGGCTTTAAGCGATGATTTAGGCGTTTTAGATTATATCCGTTACAATACGTTAACTTGTTATAACGGCGTCATTGGAGATGGCTGTGGAGAATGTCCAGCTTGTCAATTAAGAGCAAATGGTTTAAATGCTTATCTAGCGGAAAAAGGAGTGGACTAATATGTTCCAACAAAATTATCCAAGCGTACAACATCCCTATAGCTTCGAACTAAATAAAGACTTTAATTTTTCTGCCGCACATTACATACCAAGTGAGGATGCAGGAAAATGCATGCGTACACATGGTCACACATACTTTGTAAATTTAACAATTGCTGGTGACACTTTAGATCACAATGGTTTCTTAGTGAATTTTAGTGAATTGAAACAATTGGTTCATGGCCAATTTGATCATTATTTACTTAATGATTTACCGCAATTTGAAGGCAAAAGCCCTTCTACCGAAATCGTTGCCCAAACTATTTATGAAATGGTTCAAACTTCGTTGAATCAACGTGACAACCAACCTAAATGTTTACAGGTCTATGTCAGAGAAACGCCTACCAGTTATGTTGTTTATCGACCAAAGGAGACAAAACATGAGTAAAATACCCGTTTTAGAAATATTTGGCCCAACTATTCAAGGTGAAGGACGCGTGATAGGTAGAAAGACCATGTTTGTGCGTACAGCAGGGTGTGATTATCGTTGTAGTTGGTGCGATTCAAGTTTCACTTGGGACGGTAGTGCTAAAGAAGATATTAGAATGATGTCAGCTGAAGAAATATATGACCAACTTTATCATATTGCTGGCGATTCATTTAATCATGTCACTATATCTGGTGGAAATCCTGCTTTAATTAAAGGCATTCAACAATTAGTAGATTTATTTGATGACAAAGGGATTCAAAGTGCTTTAGAAACACAAGGTAGCAAATTCCAACCATGGATGACTCAAATTGATGACTTAACTATTAGCCCCAAACCACCAAGTTCAAAAATGAAACCTAATCTCCCTATTCTAGATGAAGTCATCGAGCAATGTGTGCCGGAATCATTGAACTTGAAAGTTGTAATCTTTGATGACGAAGACTACCAATTCGCTAAGATGATTCATCATCGTTATCCTACTGTGCCTTTCTATTTACAGGTCGGAAATCCCTATTTAGATGGCGAGCATGTAGAAGCTCACACTGAAAAATTATTATCATTATATGAAACATTGGTAGACCGTGTGATGGTGAGTAGTGATATGAATAATGTATATGTATTACCTCAATTACACACACTGCTTTGGAGTAACAAAAAAGGTGTTTAAATTGAGTATTGAATGCGATCCATTGTATAATGCTCTTTGTCTATATAACGAATCGCTTTTTTTGTGATGCAAATATTATATAGTGGATTATCACTGTAGACATCATTTCATTCATTTATATCAAGTTATTCTTATTCAAACTATATTGGATAATTTTTAATTAAAGACACGAAATTAAATGATTAACTTTAACTTAATTGATATAATGTTTCAATGAAGTATCTAGGTTAGGAGAGCATCATGCCGATTAATATCATTATAAATATCGCTGCGATATGCATCATACTTGGTATTGATTTATATCGTCAGAATTTTAAACAACTAAAGTTTAGCTCTATACTAATAGCAATCTGTCTCAACAGTATTATTAATATATTTCTAGTTGGAGAATATGATTACATCGTATTTTATACATGTGGTCAACTAATAATTTGGACATTATTACAATTATATCTAGACCGAAAAGTAGCTGCTTTCAAGGTAACAGACCAAAAATTTATCGCAGTTGTACTCACAATCATTTTGAGTACTTCACTCATTCTTACATATAGTACGAGTCATGATTCTTATTACATGTCTATCCCTTATTTAGCGCCAGCTATTTTCCTTATTGGAGCAATTTTACTATTTTATAGTACCTTTCAGCCAAAAGAAAAAGAACAACTTAAACCTATGAATCGGATTAAGCGCCCTATCTTTGTCGGGCAATTATTGATTATACTTTCCTTTACGATAATGACCTTATTAACACCTTATTGGTATGCTTTCATCATAATTCATTTACTATTTATCGGGTTTTTATTATGGCAGAATATATTTTTTTCTAATAAATGATTAAGATATTATATTTTGTGGTATATGATAACAGTTAATTAAGTTTTTATTAAAGGAGGTAAATCATTATGGGCTTTATTCTTATGTTAATTGTCGGTGGTTTAATCGGCTGGATTGCTGGTGGTATCGTCGGTAAAGATATTCCAGGTGGTATTTTAGGTAATATTATTGCTGGTATCGTTGGTTCAGCATTAGGTTCTTGGCTACTTGGAGATTGGGGTTGGCACTTAGGTGGCATCGCTGTGTTCCCAGCACTTATCGGTACAATTATCTTAGTAGCAGTTGTATCATTTATTTTTGGTAAATTACGTAAAAAATAATCGCAATTTTTAAAAGCCAATTTCGAATAATTGAAATTGGCTTTTTTTCTATGTCTTTGTAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP054440|2091006:2098556|2097716_2098556_-|WP_002483956.1|DBSCAN-SWA MLEDVYYLNNGYPMPKVGLGVYKITDDEMNVSVATALDAGYRAFDTAYFYKNEIALGNALKKADIPREDLFITSKLWNDYQGYDRTIEFFTKSIENLGTDYLDLFLIHWPCEADDLFIESYKAMEALYEAGRIRAIGVCNFKQHHLEKLMSETDIVPAVNQIEVHPYFNQQELQAYCDSKDIAVTAWMPLMRNRGLLEHEVILKLAERYEKTPAQIVLRWHLAHNRLIIPKSKTPERIKENYDIFDFNLELTDIAEIDAMNRDERQGKDPDEVRIGTLK >NZ_CP054440|2091006:2098556|2096160_2097222_-|WP_011303667.1|DBSCAN-SWA MQMRVIVPCYNEGEVILKTYEKLTEILSKDSQYHHYDYDILFVDDGSKDKTINYIQDMATKDHHVKFISFSRNFGKESAMIAGYQHSKDCDGVIMIDADLQHPPELIPQMIEGYMDGYDQVIAKRDRIGEKQSRKVMTKIYYKLINHFVEDIKLEDGIGDFRLLSQRAVISLTQLDEYNRFSKGLYEWIGYNTKVFTYENVEREDGESKWSFSKLLNYGIDGLISFNNKPLRAMIYLGLIVFFISLLYIGYISVGIMIRGVETPGYFSTIAAILLLGGIQLISIGIVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQATNFNYACDNNKQNINQDINHEIERNDRQHEMSEKSKSEKELIKNR >NZ_CP054440|2091006:2098556|2093654_2094080_+|WP_011303665.1|DBSCAN-SWA MFQQNYPSVQHPYSFELNKDFNFSAAHYIPSEDAGKCMRTHGHTYFVNLTIAGDTLDHNGFLVNFSELKQLVHGQFDHYLLNDLPQFEGKSPSTEIVAQTIYEMVQTSLNQRDNQPKCLQVYVRETPTSYVVYRPKETKHE >NZ_CP054440|2091006:2098556|2091006_2092149_-|WP_011303663.1|DBSCAN-SWA MQIHFNYRYTLDEENHEMHQYLLTQCTDKKVAPNIETVGEVISFAEAKQKAGYYVALYIAYEAAPYFNSQMSTVKIEDAYIYAAAYAFDQATDAEKQNDKQPPQQKCNFKFKHPSSQLVEHIKMIQSAIIEGNTYQVNYTTRLTDQIRQPIADLYYTLLQQNHGFYAALIDTEEIQIASMSPELFFQRGPFKNKADVLLSKPMKGTIARGKTKAEDQLNQMTLAQSAKDRAENVMIVDLLRNDMSRIAKTGTVKVYKPFHIETYSTVFQMTSMVTSELSSKTDLIDVLTALFPCGSITGAPKLNTMQYIKDLEQTPRHAYCGTIGLLLPEGKSIFNVPIRTIQYLNDEAIYGVGSGITIDSIPENEVQEFKDKTKILERL >NZ_CP054440|2091006:2098556|2095029_2095623_+|WP_011303666.1|DBSCAN-SWA MPINIIINIAAICIILGIDLYRQNFKQLKFSSILIAICLNSIINIFLVGEYDYIVFYTCGQLIIWTLLQLYLDRKVAAFKVTDQKFIAVVLTIILSTSLILTYSTSHDSYYMSIPYLAPAIFLIGAILLFYSTFQPKEKEQLKPMNRIKRPIFVGQLLIILSFTIMTLLTPYWYAFIIIHLLFIGFLLWQNIFFSNK >NZ_CP054440|2091006:2098556|2094072_2094789_+|WP_002483952.1|DBSCAN-SWA MSKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSSFTWDGSAKEDIRMMSAEEIYDQLYHIAGDSFNHVTISGGNPALIKGIQQLVDLFDDKGIQSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSKMKPNLPILDEVIEQCVPESLNLKVVIFDDEDYQFAKMIHHRYPTVPFYLQVGNPYLDGEHVEAHTEKLLSLYETLVDRVMVSSDMNNVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP054440|2091006:2098556|2092132_2092726_-|WP_011303664.1|DBSCAN-SWA MILIIDNKDSFTYNIVDYVKQSYRGLIEVIDVTYLTVNKIYELAPKAIIISPGPGAPRDYPLLNEVIKTFSEAMPILGVCLGFQQIVTYFGGDIIKSDKPIHGHTTQIRHSGKGLFHQLPETFKVMRYHSLKAHAQTFPNTLEITAINEDNIIMGLEHKVLPIYGVQYHPESILSEHGLTQIQTFINIVEAYHANTL >NZ_CP054440|2091006:2098556|2092981_2093653_+|WP_002483950.1|DBSCAN-SWA MSEQTLDNNKAIVVFSGGQDSTTCLFWAKKHFESVELVTFAYGQRHDTEIEVAKQIADEQGVKHHLLDMSLLSQLTPNALTQHDLDIEVGDDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQTNAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFVKSMNVTLSLSMDKDFVIHTPLMWLDKKATWALSDDLGVLDYIRYNTLTCYNGVIGDGCGECPACQLRANGLNAYLAEKGVD >NZ_CP054440|2091006:2098556|2095691_2095943_+|WP_002483954.1|DBSCAN-SWA MGFILMLIVGGLIGWIAGGIVGKDIPGGILGNIIAGIVGSALGSWLLGDWGWHLGGIAVFPALIGTIILVAVVSFIFGKLRKK |
9 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2422223 : 2434143
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP054440|2422223:2434143|DBSCAN-SWA 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ACCTTCTGGAATTTCGATCACTTTATCTGAGTGGCTCATCCAAACATTTTGTTCTTCTGGTAAACCAAAGAATAACTCATCAGTCTTCGCATTAATAATGGCTTTACCATATTCACGTTCATTGGCACGCTCTACTTTTCCACCTAAAAGTTTTGTAGTTAGTTGCATACCATAACAAATACCTAAAATAGGTACTCCCAAGTTATAAATTTCTGGGTCAATTGTGAATGAATCTTCTTCATAAACTGAGTTAGGACCACCAGAAAGGATAATCCCTTTAGGATTTAAACGTTTAATTTCTTCCATGCTAATCTCGTGGTCATGTAATTCACTATATACACCCATTTCACGAATGCGTCGTGTAATTAATTGGTTGTATTGGCTACCAAAGTCTAAAACAAGTATGAGCTCTTGCTCTTTCGCCATTTCCATATCTTTTTTATCTCCTTTTAACTTAGAATGAATAATTTGGTGATTCTTTTGTAATTTGAACGTCATGTGGATGACTTTCTGCTAGTCCAGCAGGTCCCATGCGCGTAAATTGTGCTTCTTCTCTTAATGCTTCTAAGTTTCTAGAACCTGTATAACCCATACCAGATCTTACGCCGCCCATAAGTTGATAAATTGTATCTTGTAATGAACCTTTATATGCAATACGACCTTCGATACCTTCTGGCACGAATTTTTTAGGTGCTTTATCTTCTTGGAAATAACGGTCGTTTGAGCCGCTTTCCATTGCGCCTAATGAGCCCATACCTCTATATACTTTGTACTGTCTGCCTTGGAATACTTCTGTAGCCCCTGGGCTTTCTTCAGTACCAGCAAGTAGACTACCTAACATAACTGCATGGCCACCAGCCGCTAATGCTTTGATGATGTCTCCAGAGAATTTAATCCCGCCATCAGCAATAATTGCTTTACCATGTTTGCGCGCTTCTGTTGCACAGTCATAAACTGCTGTAATTTGCGGTACACCAACACCAGCAACGACACGTGTTGTACAAATAGAACCAGGACCAATACCAACTTTCACTACATCAGCACCCGCTTCATATAACGCTTTTGTACCTTCGGCTGTAGCTACGTTACCTGCGATTAATGTAACTTGTGGGAATGTTTCTTTAATATGTTTAACTTGCTCTAATACACCTTTAGAGTGACCATGAGCTGTATCAATAACTAATGCATCTACACCAGCTTCTACTAATTTTTGAGCACGGATGTCTGTATCTTTAGCAATACCGATAGCAGCACCAACTAATAAGCGGCCGTGTTCATCTTTTGCAGAATTAGGGAATTCTAGTACTTTTTCAATATCTTTAATTGTAATCAGACCTTCTAAACGGCCTTCTTTAACTAATGGAAGTTTTTCTATTTTATGTTGTTGTAATAACTTTTCTGCTTCATCTAATGTCGTACCAACTGGAGCTGTAACGAGTTGCTCTTTTGTCATCACATCAGAAATTTTAATTGAGAAGTCTTCAATAAAGCGTAAATCACGGTTAGTAATAATACCGACAAATTGTCTGTCTTCTTTATTATTCACAATTGGCACACCTGAAATACGATATTTACCCATTAATGCTTCTGCTTCAAAAACACTTTCTTCTGGAGTTAAAAAGAATGGATTTGAAATAACGCCATTTTCTGAACGTTTTACTTTTTGTACTTCATCAGCTTGATCTTCAATATTCATATTTTTATGAATAACACCAAGTCCACCTTGTCGTGCCATTGAGATTGCCATTTTTGATTCAGTTACTGTGTCCATACCTGCTGAAATAACAGGGATGTTTAATTTAATACCTTCTGATAATTGCACACTTAAATCCACTTCTTTCGGTAACACATCTGATTCTGCTGGTAACAATAACACATCGTCAAAAGTTAAAGACTCTTTTTCAAATTTATTTTCCCACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP054440|2422223:2434143|2430503_2431019_+|WP_061050400.1|DBSCAN-SWA MAIIALIISIISILITIFITVRNLLAERKNVKVEIINQAYLINIKRVHLNVIFTNKSKNPISITGLSITSQIKDKIITRYGRYLKHEVAHTAKNGEIKQEITNTTIPISIEPYGAIYALITIDLIDHKNEEFLNDSSYITIYTSRGKLKDYIYTKNIKKIDAISMLDFPNK >NZ_CP054440|2422223:2434143|2424668_2424896_-|WP_142351111.1|DBSCAN-SWA MIIALEEKMEQEQLSYRRLSKKIGVSTDTLNMFIKGKKKRLYSDTLIRIAIYANFNLNELKDDYREAGKQDAAHT >NZ_CP054440|2422223:2434143|2422223_2422709_-|WP_061050388.1|terminase|DBSCAN-SWA MNERQQRFADEYIKTGNAKQSALTAGYAKQSAEKYSSGLLKRPEVQEYIQERLELLKSKAIADQQEILEGLTRIARREEPDYTVVTVEHSENGTTEKTPQTVETPTQVKDSIRAYELLGKSNVMWTDKVQSDERRKIELTIGSWEDEEEQPTITLGEYVEE >NZ_CP054440|2422223:2434143|2429300_2430503_+|WP_061050399.1|integrase|DBSCAN-SWA MWNVEEKNKKGATVYRFYEKYKDPYSDKWKRVSVTMHRNGKQSQKEAQKRLNKKIKAKIEDKTPNTLKALTFHAACDEWLERYKLVSGSKQSTIKTKEYKVQHIKRNIDSDILVKNMNTDIVQTLVNNALKDNLSQKVVKDAISIIRNIMKYVQQYYNLSDISYLDNVVIPKKAVSREEVKAKRENYLEMNEINAIAHDLNHTATTKRASYMKRSYIMTAYIIEFQANNGMRIGELLAIQPDNIDFDNKTLTIDGTINWNNEGFKDTTKTEASYRTISLTIRSCDILRKVMLDNKKMSQWESEYQDRGFIFTNQKGNPLSLSTINRNIQASANNVGINKHITSHTMRHSHISLLSQLGVSLKTIMERVGHTDHKTTLQIYSHVTEQMDKDMMNKLEKVGN >NZ_CP054440|2422223:2434143|2424126_2424606_-|WP_061050392.1|DBSCAN-SWA MYRVSNLGRVMRLDGVNEPRLLGRGGGGNNVVTFIKNDKPVKHYTSDLVVAAFIGRNPDKPLVNFIDGDLSNVKADNLELCDEKGYKVNDERVQSGLTKSKNKPLIAKHIITGEELYFESKRVAVNQGYDKDAIASNIAGGRSHHKNYEWWYLEDYEKM >NZ_CP054440|2422223:2434143|2428139_2428412_-|WP_061050397.1|DBSCAN-SWA MARPVLTAPNKANTVTENEQITFKPLFARPKALSEVMGISFSTVRRVLLEYEADTDTNVEDLFIYVTETLKVVDIQKFVDYLKEREQNSL >NZ_CP054440|2422223:2434143|2425016_2425256_-|WP_061050394.1|DBSCAN-SWA MENYKISSWNEFKSSVIRGIEKGDISFSKKLSEFDLAVQYATNLLYVQGKQQFSSVEVIEVLDKSVPSAEKLSREKIYG >NZ_CP054440|2422223:2434143|2431112_2432654_-|WP_002484263.1|DBSCAN-SWA MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISMEEIKRLNPKGIILSGGPNSVYEEDSFTIDPEIYNLGVPILGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKTDELFFGLPEEQNVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTNYAAIEDKSRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLRNFVRRVCDCTGEWSMENFIEIEIEKIRNQVGDRKVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVDAQERFMSKLQGVSDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFQLIEPINTLFKDEVRELGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPGIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP054440|2422223:2434143|2423303_2423540_-|WP_061050390.1|DBSCAN-SWA MSEYLNGLIEHLELTEAQKLSKMNYDKAHKDKQEQEKAENPNDNLDSTQIQLKKENIMSIQDDTARQAEIAKNISLFK >NZ_CP054440|2422223:2434143|2426992_2427832_-|WP_061050396.1|DBSCAN-SWA MDDRKFHLLIYRSLDAKSFKKEANADWEQLKRLLNRPTVSTEKYRKGLAVYGDMADMNGVRKHRNDKNVQYKSAITIDYDDLSGDFDFIGNLEAKAGEFAWILYSTYNHTADKPRFRLVIPLSEDLKNPKLYPKAVRLIAEQIGVKYDTNSGSPSQLMNLPIRKTEDSEFIFKANEAPFLSIDDLLERIIDSGSNEPKKALHERRSDDYWVDLGAGVGDGERNSAAASLTGKLLRCRVPDGLAYQLVLHWNEANNPPLDEAELNKTFLSIFNKHYNIQR >NZ_CP054440|2422223:2434143|2422726_2423290_-|WP_061050389.1|DBSCAN-SWA MAELKNLDNIHNSIQYIRDYETNTKELHSDIDTVEQELNELKDRYKHLVINNKLDEADELHNELESKENEYNKKVRRFATMQDTIPKVITEHSKKIAKYSQLLELEYREVYADEAEQLEKARIEYNKAKQKVKELEGKFNANINYAAHTLDTFKREYNMHPTQVHSPKSASHNPFSNVLYDANGKEL >NZ_CP054440|2422223:2434143|2425608_2426703_-|WP_174543135.1|DBSCAN-SWA MEYGLKFNKEDLAEIVTRESRKNAYHPVKTFIESKDWDGVERVESVFIDYLGAEDSPYIRQVTRKWLIAGVTRIYEAGIKFDEMPVLYGKQGAGKSYIADRLAIGKWFKDDIDSFEGKDAKVGLQKAWIVEIAELSAMNKTVIEQTKKFLATRVDDFRPPYARQNIESPRHCVFIGTTNKYDFLKDTTGNRRFLPVAVDASKRNKSPFRDELSDEVVQQIWAEAYHYYKQGEGMKLDAEAEKVAVQMQESHTEDDPLVGEIEEFLNRPITNKYWELDVYEKRRMVTHKGYNEVYEKQGYVERDKTCATEIWKVMMGNLNSTPKKHETRKINQALDQLDICSKDAKARRFGRDVGVQRGYTVKLD >NZ_CP054440|2422223:2434143|2432676_2434143_-|WP_002484264.1|DBSCAN-SWA MWENKFEKESLTFDDVLLLPAESDVLPKEVDLSVQLSEGIKLNIPVISAGMDTVTESKMAISMARQGGLGVIHKNMNIEDQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVFEAEALMGKYRISGVPIVNNKEDRQFVGIITNRDLRFIEDFSIKISDVMTKEQLVTAPVGTTLDEAEKLLQQHKIEKLPLVKEGRLEGLITIKDIEKVLEFPNSAKDEHGRLLVGAAIGIAKDTDIRAQKLVEAGVDALVIDTAHGHSKGVLEQVKHIKETFPQVTLIAGNVATAEGTKALYEAGADVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAVYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEVFQGRQYKVYRGMGSLGAMESGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRIAYKGSLQDTIYQLMGGVRSGMGYTGSRNLEALREEAQFTRMGPAGLAESHPHDVQITKESPNYSF >NZ_CP054440|2422223:2434143|2423536_2423959_-|WP_061050391.1|DBSCAN-SWA MWTQTPYKQYYSDEELLTYYNPYYISEKIENMQMYIESSYTRGLPRLTNDGTNVMYESVSVENLAFDVIQLKEDMTTFKIKALHKLRACRYALSRFDKQSQCEIMRYFESFGEYRPDKLINDFSTLVYGIRNKLYGGNNT >NZ_CP054440|2422223:2434143|2428752_2429298_+|WP_069844463.1|DBSCAN-SWA MKIVISNLRVKMAERGLTIKDVNQATLLSRTTISNLYNGYSDGIKFHTLEKLCELFNCYPNDLLRTFTIDIVDIEIKKETSTYNYMCQFKLIVDGTPELKEAAIKLDIMEQTPASDGSMVNWAEVSLNDVKDILPYSLNIPDNHMKYFVGKLHDALLDELRNNEILRNEAELIEFTEYGGG |
15 | Staphylococcus_phage(50.0%) | integrase,terminase | attL 2418465:2418479|attR 2438303:2438317 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
29160 : 39458
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP054441|29160:39458|DBSCAN-SWA AATGAAAATTGGTTATGCCCGAGTATCAACAAAAGATCAAAATTTAGAAAGACAAATAGAAATTTTAAAAAGATATGGTGCTACAAAAATCTTTGAAGAAAAACAATCTGGAAAGAACATTAAAGATAGAAAAGTATTTCAAGAAGTTATGGATTTTGTAAGAGAAGAAGATACATTAATTGTTGATGCATTAGATAGACTTGGACGTAACTATGATGAAGTAATTAAAACTGTAGATTTTCTTAGAGAAAAAAATGTTAAATTAATTATTACAAGTCTACCAATGATGAATGAGATTGTAGGAAATGAATTATTTGATAAGTTTTTAAAAAATTTAATCATTCAATTGTTAGCAATGATTTCAGAGCAAGAAAGAAATGATAGTAAGCGTAGACAAGCAGATGGTATAGCAGTAGCAAAGGCAAAAGGTATTTATAAAGGCCGACCTAAGCTATATAGTCCAAACGCTAAAGACCCACAAAAGCAAGCAGTTTATTTTAGAGTGATAGGCTTTATAGATGAGGGTATGGCTATTAGTAGAATAGCAAAGAAAGTAGGACTATCAAGACAGACTATATATAGGATAAAAAATGATTATCAAAGTGGATTATATAAGGACTATGAATAACAATTATTAATTACACAAATGTAATTTACGCATGTATAACTTACATTTGTGTAAAGGAGGAGTTATTATGAATAGAAGTGATAGAGAAAGATATGAGGAAGAAAAAAGACAGCAACAATATTATGATGAAGAACGTAAAAGACAAGCATATCTTGAAGAAGAAGAACGAAGAAGATCATATTATAATGATAGAGATTACAGAAGAGAACAACAATTGTATGAAGAAAATAAAAAAAATAAGCGTAGTAAAAAAGGCTATCATTTCTTGTAGTTATTCTATTGATTGTAGCTTTATTATTTGCTTTTAAATCATGTAGTAATAGTAACCAAGAACAAGAAAATGTAACGGATAATCAGACACAGCAGCACCAACCAACTAATGAACAATATGTTCAACAAAAAGATAATGAAATTCAAAGTAAGATTGAAGATACAAAATCTAGTATTGAAAACTCAAATGAAGATACACAAGCAACTATACAAAGTTTAAAAGATGAAGTAAATAGTCTGAAACAAAATGCAAATGATGAAAAAACAGAAAAAGTAGCGAATGACTATCAAGATACTGTAAATCAACTTGACGAAGCAAATACAGCTAAGCAAAACGGTAATGATAGCAAAGTACAAGAAGAATTAGATAAAGTGAATAATAAATTAGATGAAATTAAAAATAAATTTTCAGAATGGTTTGGTAAAGATAATGAAAAACAATGATGAAAATAATTCTGAAAGTAAAAGAAGAAAATATATATTGGCTACTTTCATTTTCATAATATTTTTATTAATAGGGCTATTGATTTATATAATTCTTAATCAAACAAATGCACATGGTCAAATAGTAGACTTTAAACAAGCAGCTAAGGATAAAGATTATAATAAAATTTCAAAATATTTATCAAGTGGTCAACGTGATTTATCTAAAAATGAAGCTAAAGCATTTATTAATTATATTAATAATCCTAAAAATTCAAAAAGATTTGATAAGGAAATCAACGAAATAGAGAAAAACGTAAAAGAGAATAATAAGTATGCTATTGATTTAGGCGCTATTACTGATAGTAATGGAAAGAAAATAATTAATGTTAAAAAAGATGGCAAAAAGTTTTTCTTCATAGAAAAATTAAAATTTGCCCCTAATTATACTAATGTATATGTAAAAGAGAATGATAATACGGCTGTATATAATTATAATACTAATAAAGAACATCAAATTGTAGCAGATAAAAATAGACTAACAAGTATTGGAACATTTTTTACAGGAAAATATAATATTAATGCCAAAAAGAAAATAGAAGATACTTTATTGACTGGTGAAAGCAGTGGAAAGTTAGAATTTAATACAGAAGTGACTGATAAAAATAATAAAGTAGTTGCTATACAAAATTTTGATCAGTCTAGTTTTAAAATAAACTTAAAAAATAGTGAAGCATTAGATAATAGTAAGAAAGTTGTAGTTGATGGTAAAGAGGAAGATTATGTAGACAATAAAATTTATGGTCATTATTTTAATAATGATGAATTTAAAGTGCATGTAGTTGGTACAATTGATGGTAAAGAATTTGTTACTAATGATAGAAATATAAGTAAAAATAAATATCAAAGTCCACAAGAAGTAGATTTATCTTTTAATCAAGACTCTATTAATAAATTTGAACAAGAAAACAAAGAAATAGAAAATAAGGGCAAGAAATTTATGATTGATTATACCAACGATTTGAACCAAGCATACAAAAAATCTGACTATAAATACATTTCAGATTATATAGAAGAAGATAGCAAAGTAGCAAAGCATATGAAAAAGATGGTGGAATCAAAAGCTAAGAACAAATATAGTAATCCACAAATTGATGATATTAGTAAAGATAAGGACAAGTTAAAGGTTATACTAACTAAAGAAGTTAACAACAATAAAATTCAGTCTAAATATTCTCTGAAATACAACAAAGACACGAATGACTTTAAAATAATTGAATATACAGATATATAAAAGAAAACCTAGTTTTAGGTTTTCTTTTATTAGGTTTAAGAAGAAAAATTAGTATAGATAGAAACGAATAAACTCACTATAGAAATAGAAATTGGTAATATCTTAGCAATTAAAACATATTTTTTCTGCTCTAAATAAGATATACCTTTTTCTCCAATTACAAGTTTTAAATCATCTTTCTCTAAATCTTGTACATTAAAGGTATTTTCCTTACCAGATATATGATTATATATGTACTTTTCTTCTAATAGATATTTTACAATCATAGCAGTTGATATATGAGAACTATTTGGTAATAACTCTCTTATTTCAGAATAAGTAGTTTTCGATGTATTCCAATTTTTCTTTGAATTAGGTAATTTTTCAAAATCTTTTTCTTTTTTATATAGAGCTTTTAAAATTTTTTCTGAATTATTACTTAGCAAAACTATCCCTCCTTTAATATGGTAAATAACCACAAATTTTATTCTACACTAACTATGCTACTTAAAGGTAAGTTACTTGAAACACTACCATTTTCCTCAACTACTTTCATAATTCCACTAATTTCATCTACCTTTTTAATATAGCAGTTCTTTGAATAAATATATCCTTTTTCCCAATAGTTGATTTCAGAGATGATTTTATTATTAATTTTATAAGTAACTTTATCATTAATTTCTTCCAATTGTTCTTGAGATAGTAATGGCATATCAATTTTATTTTGGTCATCTATATATTGATCTAAAATTTCATATTGCTGTGGTACAGTTTTAAATGGTTGCCATTTCAGGTTCTGTTGCAAAGTAAAAAATATAGCTAACCACTAATTTATCATGTCAGTGTTCGCTTAACTTGCTAGCATGATGCTAATTTCGTGGCATGGCGAAAATCCGTAGATCTGAAGAGACCTGCGGTTCTTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTAATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGCTCCATTTTCCTTTTATTTTGATGTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTCCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCATGTTTATTAATATAGTACATATTTTTATAAGGAGTTGTACGCATGTATAATCCATTCGACGAAGCTTATCATGGCTTATGCGAAGAGATATTAGAAATAGGGAATAGACGCGATGATCGCACACATACCGGGACAATTTCCAAATTTGGGCATCAATTGCGTTTCGATTTAACCAAAGGGTTTCCTTTACTTACAACCAAAAAGGTTTCTTTTAAATTAGTAGCAACTGAATTATTATGGTTTATTAAAGGAGATACAAACATTCAATACCTACTTAAATATAATAACAATATATGGAATGAATGGGCATTTGAAAATTATGTTCAGTCTGATGATTATCATGGACCAGACATGACAGATTTTGGACATCGTTCCCAGCAAGACCCTGAATTTAACGAGCAGTATAAAGAAGAAATGAAAAAATTTAAAGAACGTATTCTAAACGATGATGCATTTGCTAAAAAATATGGCAACTTAGGGAATGTTTATGGTAAACAATGGAGAGATTGGGAAGATAAAAATGGAAATCATTACGATCAATTAAAATCAGTTATACAACAAATTAAAACCAATCCAAACTCTCGACGTCACATTGTTTCAGCATGGAATCCTACTGAAATCGATTCAATGGCATTACCACCTTGCCACACAATGTTTCAATTTTACGTACAAGAGGGTAAATTAAATTGTCAATTATATCAAAGAAGTGCTGATATATTTTTAGGTGTTCCTTTCAATATTGCAAGTTATGCTTTACTGACACATCTTGTTGCAAAAGAATGTGGACTTGAGGTGGGTGAATTCATTCATACATTTGGAGATGC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AATAAATCTGCCTTCTCTTTAAGTGCAGTATCAATATAATCTTGTGTTATTTCTCCACCACTTTGAACTGTATTTGTTTGTTTTAGCTGTGGGAGAAGCGTGGTGGTAGCCTCACCTGTAACCATTCCTTGTTCTGTTCGTTTTTTCCCTGCGATTATTTCAAGGAGACTCGTTTTACCAGTCCCATTCTTCCCAACAAGTCCAATGCGTTCTTTTGCTTGCACTTGTAACAGAGGGATTTCAAAGAGGGTTCGATCTCGAATTCCAAATTTTAATTGTTTGATTTCTTTAATAACCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP054441|29160:39458|34375_34861_+|WP_000175735.1|DBSCAN-SWA MTLSIIVAHDKQRVIGYQNQLPWHLPNDLKHIKQLTTGNTLVMARKTFNSIGKPLPNRRNVVLTNQASFHHEGVDVINSLDEIKELSGHVFIFGGQTLYEAMIDQVDDMYITVIDGKFQGDTFFPPYTFENWEVESSVEGQLDEKNTIPHTFLHLVRRKGK >NZ_CP054441|29160:39458|32603_33278_-|WP_001106019.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRGRGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >NZ_CP054441|29160:39458|31809_32199_-|WP_031884086.1|DBSCAN-SWA MLSNNSEKILKALYKKEKDFEKLPNSKKNWNTSKTTYSEIRELLPNSSHISTAMIVKYLLEEKYIYNHISGKENTFNVQDLEKDDLKLVIGEKGISYLEQKKYVLIAKILPISISIVSLFVSIYTNFSS >NZ_CP054441|29160:39458|35324_35999_-|WP_001106022.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRGRGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMVKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >NZ_CP054441|29160:39458|32237_32570_-|WP_078091644.1|DBSCAN-SWA MFFTLQQNLKWQPFKTVPQQYEILDQYIDDQNKIDMPLLSQEQLEEINDKVTYKINNKIISEINYWEKGYIYSKNCYIKKVDEISGIMKVVEENGSVSSNLPLSSIVSVE >NZ_CP054441|29160:39458|37886_39458_-|WP_031896209.1|DBSCAN-SWA MVIKEIKQLKFGIRDRTLFEIPLLQVQAKERIGLVGKNGTGKTSLLEIIAGKKRTEQGMVTGEATTTLLPQLKQTNTVQSGGEITQDYIDTALKEKADLLLADEPTTNLDTEKIEKLEKTLHRFHGAIIIVSHDRAFLDAICDTIWEIDDGKLNVYKGSYSDYVAQKELKIRQQEAAYETYMQKKQQLEQALVQKERKANRASKKPKNISASEARIIGAKPYFAKKQKKLQQAAKSIETRIDKLEKVEKVREQPKIKMDLPSSEGLHGKFIIRGEHVGGKVGKRTLWKPTDFYIKGGDKVALIGNNGTGKTTLIKHIMKEETGITVSSAVKLAYFSQNLDILNKQESILDNVMSTSIQDETTVRTVLARLHFFRDDVYKTVNILSGGERVKVAFAKIFVSDSNMLILDEPTNFLDIEALEALEELLIDYEGTLLFVSHDRVFVNNIANRIFSIEDNKLNIFDGTYEHYKNYSPKPAADTNKQELLVIENKITEVLGKLSLEPSEELDQEFQELLRLKNKLLSD >NZ_CP054441|29160:39458|33377_34334_+|WP_000282655.1|DBSCAN-SWA MYNPFDEAYHGLCEEILEIGNRRDDRTHTGTISKFGHQLRFDLTKGFPLLTTKKVSFKLVATELLWFIKGDTNIQYLLKYNNNIWNEWAFENYVQSDDYHGPDMTDFGHRSQQDPEFNEQYKEEMKKFKERILNDDAFAKKYGNLGNVYGKQWRDWEDKNGNHYDQLKSVIQQIKTNPNSRRHIVSAWNPTEIDSMALPPCHTMFQFYVQEGKLNCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTHLVAKECGLEVGEFIHTFGDAHIYSNHMDAIHTQLSRDSYLPPQLKINTDKSIFDINYEDLELINYESHPAIKAPIAV >NZ_CP054441|29160:39458|29160_29787_+|WP_031884083.1|DBSCAN-SWA MKIGYARVSTKDQNLERQIEILKRYGATKIFEEKQSGKNIKDRKVFQEVMDFVREEDTLIVDALDRLGRNYDEVIKTVDFLREKNVKLIITSLPMMNEIVGNELFDKFLKNLIIQLLAMISEQERNDSKRRQADGIAVAKAKGIYKGRPKLYSPNAKDPQKQAVYFRVIGFIDEGMAISRIAKKVGLSRQTIYRIKNDYQSGLYKDYE >NZ_CP054441|29160:39458|30487_31774_+|WP_095312408.1|DBSCAN-SWA MKNNDENNSESKRRKYILATFIFIIFLLIGLLIYIILNQTNAHGQIVDFKQAAKDKDYNKISKYLSSGQRDLSKNEAKAFINYINNPKNSKRFDKEINEIEKNVKENNKYAIDLGAITDSNGKKIINVKKDGKKFFFIEKLKFAPNYTNVYVKENDNTAVYNYNTNKEHQIVADKNRLTSIGTFFTGKYNINAKKKIEDTLLTGESSGKLEFNTEVTDKNNKVVAIQNFDQSSFKINLKNSEALDNSKKVVVDGKEEDYVDNKIYGHYFNNDEFKVHVVGTIDGKEFVTNDRNISKNKYQSPQEVDLSFNQDSINKFEQENKEIENKGKKFMIDYTNDLNQAYKKSDYKYISDYIEEDSKVAKHMKKMVESKAKNKYSNPQIDDISKDKDKLKVILTKEVNNNKIQSKYSLKYNKDTNDFKIIEYTDI |
9 | Staphylococcus_phage(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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