Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN908214 | Clostridium beijerinckii isolate C. beijerinckii DSM 6423 plasmid II, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_LN908215 | Clostridium beijerinckii isolate C. beijerinckii DSM 6423 plasmid III | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_LN908213 | Clostridium beijerinckii isolate C. beijerinckii DSM 6423 chromosome I | 2 crisprs | DEDDh,RT,cas3,csa3,DinG,WYL | 0 | 1 | 19 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
2210 : 13245
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN908215|2210:13245|DBSCAN-SWA AATGAGATTTGAAAAGTTCTTAACGTTAATAGGAATTGTAGGAGGTGGAATTTCAATGGCTTTTGGAGGATGGACAACAGCAACAACTACATTATTAATATTTATGTGTATAGATTATGTAACAGGGTTTATTGTTGCTCTAATCTTTAAAAATTCACCTAAGACAGATACAGGAGGTTTAAGTTCAAAAGTTGGATATAAAGGGTTAGCAAAAAAGGTTATGATATTACTATTTCTATTAATCGGTTATAGATTAGACTTAACTTTAAATACTTCCTATATAAAGGATGGTATCTGTATAGCATTTATAGTTAATGAACTTGTATCAATAACAGAAAATGCAACGCTAATGGGATTTCCTACACCTACAATTATTACAAATGCTATTGACATATTAAAACAAAGGTCAACTAAAACAGATGATACAAATATAATAGATAATTAAACAGCTAAGGCACTCGAGAGAGTGCTTTTATTATAGGAGGGATAAAATATGACTAGAGAAGAAATAGAACAGACTACATGGGATTATTTACGTAGTCAAGGATTACCAGAATTAAGTTGTGCTGCTGTTATGGGTAATATAGAAGCTGAAAGCGAATTTGACCCTAATTTAATAGAAGAAGGTAATGGAATTGGTTTAGGTTTGTGTCAATGGAGTTTTGAAAGACGTACACAGTTAGAAGCATATGGAACGGATTTACATCATCAATTTAGGTTCTTATGGGCTGAATTAAGTGGAGATTTAGGAGATACAGGAGCGAATTTTCAATGGGGTAATAAAAGTAATTATTTGAATCACGACCAGTTTATGAGTGGGCAGGGTTCTTTAAATGAATTAACAAGTGCTTTTTGTTTTTGTTGGGAACGTCCAAATGTTGCTCTAGCACACTTAGCAAGGAGACAAGATTCAGCTAATACTTATTATAATAAATTTACTGGTAGACAAACTACAGACCCACCTATTGACCCACCGACAGACCCTGCAACTCCTGGTGATGTTAAATTAAAGAATAGATATTTATATGGTGCTACAGATTCATTATTTGGTAGAAAGTTCATAAGTAAAAATAATACATTTGTAGTATCAAAGGTAATAGGTGATATTTGTATAATAAAAGATGGGAATATAACGAGAAAAGTTCCAAAAAATAATATAATAAATCAATAAAAAATTTTTTAACTAAAATTGAAAAAAATTTGATAAAATTGTTGCAATTATTTCATAAACGTGTATAATATAGTTATAAGGTTAATACACGTGTATGACCTATCAAACATAAGGGAGGAGAAATTTAATGAAAGCGATAAAAAGAAAGGTAAAATTTTATGTAACTACAGCACAAAAATTTAGAACTGAAAATGGTCAAGCGATAGCCGAAGAACTTCCAGTTCTAGAAACAACAAAAAAATTATCAAAAGTATCACTTGAAAAACACTTCAAATCACTAATAAAAGAGGGTGAAACTGTATTAGTCGGTGAAACAGTTCACAAAGAGAAAACATTTGAAATGAATCTAGATTATTTTATCAAAAATTCAAAAGAAATTCAAGAGGAACAAGCAAGTTAATGTAAAATTTAGTAGAAAACAGAAAAAATTTAAATTTAGAGGAGAATGAAAATGGAAAATAGAGATTTAATACCCGTAAACAATGAAGAAAGAGCAGTTGCAAACCAATTTACTTTTGATGATGATAATAGTTTTATAGCTGATTTAACAGCACCAAGAACACAAGCATATAGCTCAATAGATTTATTAAAAACTTCTGAAAAAGAAAAAATAGCTTATTTCAACGCAATAAATTCAAGTGATAAAAGACTTGGAGATAAAATTAACGAAGTGATCGAGTTAAAAAATGTGTATGTTGAAATAGTACAGTTAAAAAATGAAGTAACAGGAGAAATGCAGGACGCTCCACGAATAGTTTTAATTGATAGTAAGGGAGAAGGTTATACTTGTGTATCTACTGGAGTATTTAGCTCATTGAAAAAAGTATTTCAAGTATTTGGTATGCCTCCTACATGGAGTTCACCTAAGAAAGTTAAAATAAAACAAGTTACTAAAGGTGAAAAGAAAATTCTTACTTTAGCAATATCAGAGTAACATAAGAAAATAATTGCAAATTGAAAAGATACAAACAGAACAGGGGTAAAGTTTAAGTTTATCCCTTTTCTTTTACAAAATTTTAATGTAATGAGGTGTATTTTCATGGGTAAAAAAGAGCGTGAAATGGCTTTAAAATTCAATAAGAAAATCGATGATATTAAAAGGATTAATAAGGGTGAATGTGTATCTTATAAACAGTTGAATTGTAAATTATGTGAATATAAAGAAGATTGTAAAATTAATAAATAGTCTGAGGTGTTAATATGAGTAAATTTAGCTTTAGACGTGGGGAACTAGATAAATTAGATAAGAAGATAAAATCATTCAATAGAAAAGTAGAGCAATTAAAATCACAAGGTTATAAGGAAACTTTATTACCTGAAAAAATGAGTTATAAAGTTGAACTTGCAAAAATAATCCATAATGAAAATTATGTTCGTCAAGATTTTAAAGATACATTTTCCATTATGGATGCCTTCCTTAAAAAAGGTTCTGAAAAAATTCTTAAATCATCTAGAGGAATGGAACTACCACGTTTTAAAAAGAAAGAAATTGATATAAAAGTTAAGAGAATAAATAAAGAACGTGCTAAATTGCAAAAACAATATGACTTAGAACCTTTGACGGATAGAAATGAACCGATTGAAATGCCAGAAGAAAATAAAAAATTATTTAGAGCATATAAGATTACACCTAAAAAATTTAACTGGAAAAATATGAGTAGAAAAGATTTTGAAATGTTTCAGAAAACTTTAGTTGAGTATGACAGAAAACAGGATGAAAAGGACAAGCTTTATAGAGAAAATTTTTATAAAGCTTTAGATAATCAACTACTACCAGATGATGCAAAAAGAATAAAAGAAATATTAGATAAAATACCCACTGATGAAATAGTTAAAAAATATTATACTGACTTAAACATGGATATTGATTTTATTTATGATAAAAGCGATTATGAGGGTAAAATTGAGAGCATTATAGAAAGTTGGAATAGTCTAAAAAGGGAGGGAGGATACTAAGATATGATTGCTACAGCAGACTTTGAGACAACCACACTAGAAAATGATTGTAGAGTGTGGGCTTATGCTATTTGTGAGATAGGAAATTATGATAATTTCATATGTGGTAATAGTATAGATGATTTTTTCGAGTTCTGCATGGATAAGTATGAAAATCATATCTTGTATTTCCATAACCTTAAATTTGATGGTGAATTTATCTTCTATTGGTTATTTAGAAATGGTTATGAACATGTGGAAGATAGAAAACAACTAGAAAGTAAAACATTTACAACATTAATAAGTGATAAAGGTCAATTTTATTCAATAGAAATATGTTTTACTAAGAAAGGTAAGAAAACGAACAAGCTTACAATTTATGATTCACTTAAAATATTGAATTTTAGTGTGCAAAAAATAGGTAAAGATTTTAATTTACCAGTTTTAAAAATAGATAAGGAACAAGAATTTTATACAAAGTTTAGAGAAGTAGGACACATATTAACAGAAGAAGAAAAGCAATACATACAAAATGACGTTGAGGTTGTTGCAAGAGCGTTAAAAGAATTATTCGATAGAGAAATGAATAAAATGACGATAGGTGCTGACGCACTAAATAATTATAAAGTAATGACAGGAAAAGCAACATTTGAAAAGATGTTCCCTATACTTGATAATGAAACTGATAAAAACATACGAGCAAGTTATCGTGGAGGTTTTACATTTTTAAATGAAAAATATAAAAATAAAGCTGTTGCAAATGGTATTGTATTAGATGTTAATTCACTTTATCCTTGGGTAATGTATGAATGCCCCTTGCCTTTTGGTGAACCTATTTATTTTGAAGGTAAGTACAAGCAGGACAAGATATACAATCTATACATTCAACATTTTAAATGTCAGTTTGAATTGAAAAAAGGGTATATTCCTACATTACAATTAAAACACAACCTTGCATTTATTCCCACCGAATATGTTAAAGATTCTGGAACAGAAGAAGTTATACTAACTCTCACAAGTGTTGACCTAGAATTATTTTTAGAGCATTACAATGTTTATAATGTTGAGTGGATAAGTGGTTATAAATTTAAATCAAGTACAGAAATGTTTAAAAGTTATGTTGATTTTTGGATAAATGAAAAGATAAATGCTAAGAAAGAGCATAACGGTGCAATGTATACCCTTGCAAAATTAATGCTAAATTCACTTTATGGTAAATTTGCTTTATCACCAGTTGTAAGAGGAAAATTCCCTCTATATGATGAGAAGGAAGATTTTATACATTATAAATATTCACAGGAAGAAAGCAGAAAACCTATCTATATCCCAGTTGGAACATTTATAACCAGTTGGGCTAGAAATAAAACTATAAGGTCAGCACAGAAAAATTATGATAGATTTATATATGCTGATACTGATAGTCTTCATTTAGAGGGGTTAGAGATTCCAGAAGAATTGCAAATAGATGATTATATTTTAGGTGCATGGAAACACGAATTAACATTTTCAAAAGCTAAATATTTACGTGCTAAAAGTTATATGGAATATGGAAAAGAACCTAATACAGATGATGAAGAAAAGTGGAAAATTACAGTTGCAGGTATGCCAACAAATTGTTATCAATATGTAGATTTTGAAAATTTCAAAGTTGGAGCAGTATACAAAGGAAAATTACAACATCATAGGGTATCTGGTGGTGTAATATTAAAGGAAACAGAATTCACAATAAAAATGTAATAACCTACTTTTATTTGCAATCGTGTATTGAATGTATATACGATTGCACTTTTTTCATACACGTGTTTGACAAATTCATACACGTGTATTATAATGTAATAGAGGGATAAATTACTATTAATTTGTACTTTATATTACAGGTCAACACTGATGAAGTGTGTAATAAAAGGTTCGGGTTGACACCTTGCAATTAAGTTTTTATTTACCTCACATAATTTAAATGTTGTATACTTCCATTTTAAACTACCTAAAAGGAGTTAGGAGGGTACAACATTTTATCATATATGTGAAGGAGGAAGGAGAAAGAAAATTTATGTCAATGTATTGGGATATAACGAAAAGCTTAACATATAATGCTTTATTTACTTTTATTGTTGGTAATCGTGGAGCTGGTAAAACTTATAATTCAACTAAATGGGCTATCAAAGACTTTCTTAAAACTGGAAATCAGTTTATTTATGTCAGACGATATGACGAAGAATTTAAAAAAGGTAAGAAAGAAAAATTTTTTGATGCAATTATAAAGAATAATGAGTTTCCACAATGTGAATTTAAAATAAAAGGTTATACAGCTTATATTAATGGAAAACCGGCAGGACAGTTTATGCCACTTTCTAAAGCTAAGATTGAAAAATCTGTTGCCTTTCCAAATGTAAATAAAATCATATTTGATGAATTTATTTTAGATACTGGATTTTATCATTATATTCCAGATGAAGTTATGAATTTTCTAGACCTATATGAAACAGTTGCAAGAGATAGAGAAGGAGTAAGAGCATATTTTTTAAGTAATGCAATTACAATTACAAATCCCTACTTTATGTATTTCAAATTGAAAGTTAGAAATGATAAAAAATTTCAGCGTTTCAGAAATGGTGAAATTATAGTTGAAATGGTCCAAGACGCTGATTTTATTGAGCATAAGAAAAAAACTAGATTCGGTAAATTAATTGAGGGTACAGAATACGGAAATTATGCTATTGAAAATAAGTTTTTAAGAGATAACGATATTTTCCTTATGAAAAAGACAGGAAAAGCAAAAAACTTTTTTATTATGAAATATAATGGACAATCTTATGGTGTTTGGATTGATTTCACTATAGGTAAATATTTTGTGAGCTATGACTTTTATCCAGATTGCTCACTTATCTATTCAATAACATTAAATGACCATTCACCTAACACAATGCTTTTAAAAGGTGAAAAGAGTAAAACCTTAAAATTATTTATTGAAAATTATAAATTAGGGAATGTTTATTTTGAGAATATGAACATAAAAAATATATTCTTTGAAATAGTAAGATTATTTTTAATTTAATAAGGAGGAATAAAAATGACCATAGAAGAACATGAACAAATTTTAACAAATATCATGCAAAATGCAGGAGACCAAGGAGCATTGAGTGAGTATTTACAATCACTTAGAGAAGATTACTCCGAAACAACAAGTACATTATCAACTTTAAATACAGACAAGCAAGACCTATTAAATAAAAATGAAAAATTAAGAGAGGTAAATAGCAATTTGTTTTTAAAAGTTGGTAATGTAAAAGACTTATTTGAACCCAAAAAAGACCCAGAACCAGAACCAGAACCAGATCTAAAATTCGAAGATTTAATAAGCGAAGAAGGAGAGTTGATTTAACATGTCAGATATGATTAAAGTTCTTAATACTATAAGAGCAAACGCGTCAAAGAACTATAAAGACACAGTTCCAGTCGCTACGCAAAATAACTTTTTACAAGTTGGAAGTAACATTTTAAATTATGAGCCAAACGCAAATGAATTTGCAAATGCCTTAATAAATATGGTTGCATTTACAGTTGTAAAAAATAAACAATTTAAAAACCCATTATCACCACTTAAAAAAGGCGGGATTCCACTAGGACAAGACATTCAAGAAATATACACTAATCCTGCTAAGGGTGGAACATATGACGGAAATTCTACTCAACTATTAACAGTATTTAAAGCAGATACTAAAGTTGCTTACTATAGAATGAACAGACAAGCTAAGTTTAGAGTAACAATAAGCTTACCAGATTTACAACGTGCCTTTACTTCTATTCAAGCTTTAGACCAGTATACACAATCTATTATTAATTCTATGTATTCTGGTGATGAAATAGAGCAATTTGAATTAACAAAAGGCTTAATTTCACAAGCTTATGAAAATAATATGCTTACAGAAATTAGCGTATACAATGACCAAACACAATCATTAACAGACGCTGAAATTGCAAAGGCTCTAGTAAAATCTATTCAAACATATTCGGATTTAATGGTATTCCCATCAACTCAATATAATAAGTTTGCAGCATTAAAAGGTGGTGGAGCAACACCAGTAAAAACATGGACACCTAAGAAAGATCAAGTTTTGATAATTCCATCTACAGTAAAGACCAATATAAATGTTGAATTATTAGCTACTGCTTTTAATAAATCATATTTAGAAATGGAAGAAATGATGTTGGTTGTTGATTCTTTTGTGGGACAACCAATACTAGGAATTTTATGCGATAAGTCATGTTTCCAAATTTATGAAAACTATTATGCTGTCAAGAGTTTTGACAACCCAGACACAAACATGCAAAATTATTGGTTACATCATTGGCAGACTTTCGGGTTTAGTTTACTTGCAAATAGTATAGTGTTTACTTACACTCCTGCAACAGTAACACTCACAACGGGGTCACTAGGGGTTGCAGGAGACAGTAAAATTACTGGATTAACTCCAACTACTCAATACAAGTTATTTACAGACGATATCGAAACACCTCAAACAGTAACAACAAATGCAAGTGGTGAAATTACTGGATTGAGTAATAAAAACACTTATTTAGTGCAAGCTAATTCATAGGAGGAAATCATCTAATGGTTTCCCCTCCCAAAGGAACTGTATTTCTTACTAATTCACCACTTAGTAAGGATAATGAACATCAAATAAAGTTTAATTCGGAGCAAGAACAACAAACTTATTTCAATAGTTTAGAAGGAAAACAATTTAGTTACAATTATGTTAGACATGAAAATACTATGATTGTACCTTGTGACTATTACGAAGCTATAAAATATAACTACGTTGTGTATCAAAATACTTATGTAAATGATAAATGGTTTTTCTGTTTTATAGAAAAATTTGAGTATGTTAATGTTGGGACAACTAAACTCTATTTAAAATTTGATGTTTGGCAAACATGGCAATTTGACATTGATATACAAAAATCATTTATTGAAAGAACCCATGTACAAAATGATGAACAGAATACATTAAGTGATAACCCATCAACAGGAAATCTAATTGAATATAAATCATTTCAAAGAAATTTCAGTGGTGGTTATTTTATTTTTTGTAATGCTGATGTGACACAAGAAGATACATCAAGTTCAAATGGTTATGATTTTAAATTAGGTAATTATTCTATTCCTGCTATGGTTTTATTTTACAATGAACAACAGGCAGCAAGTATGGCATTAGATTTACAACGAATTGCAAATAAAGGTTATGGAGATAGAATTACAAGTGCAGTATATGCTCCATGTTGTAACTTGATTAGTACATTAGTAGTAGACACTGTAAATGGTTTTCCAGTATGCAGGGGTACAAATTACCCAGATGAGTTGTTAAAACAAACAATCAGTTTTGACTTTTCAGATGTTGATTTAGGTCATGAGAAATGTTTAACTTTCCCTTATGCGAAAATTGTTGTTCAAGATTTAGCAACAGGACAAACTATTGAATTAGAACCTAACAAATTCGGCAGTAAAGTTATTAATTTTGAAGTTCAAGCAACAGTAAGTGAAACTCCATCTTATAGAATAATACCTTTAGGTTATAAAAATTTAGATAAGAGTTATAGTGATAGTTTAGTTGTAAAATGTAATACTAGCTTACCAGTTGCAAATAGTTCTTATGCAAAATACTTAATGAACAATCAAGATTTTAACGCTTTAAGAATGGCAGGAAGTACAATAGGAATTGCAGGGAGTATAATGTCAGGGAGTGCAATGGGTGCAATTACTGGTTTTGAAAGTATAACAAACGTTTTATTACAAGAACAACAAGCACAGAAACAACCTAATCAGTTAAGTAACATAACAGATGGAGCATTAGAGAGATTACAATTTCAAAATGGTGTGAGAGTTTCATTGTTTGTTATGGATACAGACCATAGACAAATGGCGAATGATTACTGGACTTTATTTGGCTATCCTAAACGTACTCTTGAATATCCTGTATTTTATTCAACACTTGATTATCAATTTATGAAAACTCAATCAGCTAATATTAACGGTAACATTCCACAAGATGATTTAGTTGAAATACAAGATATGTTTAATAGAGGTGTAACTATGTGGAAAGCTGATAAATTTAGACAATATTAGGAGGTGATATAAATGTATGGGTTTAGTCCTAGCCAAGTTTTAAAGGTAGAAATGAATGTTGAAAATTATATGAATAACGAAACATACTATCATTATTTTAATAGAATTATGTTGATGCTTACATCATTATTTAAATGGGAAAACCTACCTAATAATATTCCAGAACGTTTTATAGAAAAAACCTTATTCAATGAAGGTGTTTGTGCTTTCATTAATGATAATGAATATGGTCAAATAATAACACAATGTACGCAAGGAAGTGAAGTAAATCTTTATAATGAACCCATTGCATGGGAATGTTTTTCAGTCAACGGATATAGAAAAACCTTTCAAAGTGATGAATTATCCATAATAAGGAACAACAAATACTCTATTCCTACTCAATATTTAATACACCATCATTTAAAAAGATTATATGATTTAGAAAGAACCATTGATAAAAACTTGTGGTATCAAAGAAGATTAGCAATTTTAAAAGGGACAGAAGATTCAAGACTTACTTTAGAAAATATAATGAAAGATTATGATGAAAATAAATTTCTTATATTTGGTAGTAAAAAACTTGATTTAATGAATAACCTTGAAATGTTAAATTTCAATATTCAATATACAGGTTTAGAAATGGAACAACATAAAGAAATCAAATGGAACGACCTTTTAAATATGTTTGGTATTAATACAGTAAACACTCAAAAAAGAGAAAGATTAATAAGTGATGAAGCTAACGCAAATAACCAGATGATAGAAATAAATGTTGATGTAATGTTAGAAGAAAGAGAACTAGCTGCAAAAGCTATAAATGAAAAATATGGAACTAACATAAAGGTTTCTATAAGACATAATATGAATGATACTTTGAATAAAGAAAACAAGGAGGATGATGAATAAATGGCTTATTATACTACAGAACTTAGACAAATAGTTAATAACAGTAATTTAGATATTGGTCTTAAAAATTATCCTCTTTACGAATTTAAAAATGGACTCAAATATATTAATGATTTTGGTTACGATTTAAAAGGTAATAAAATTACTAATTATAGAGACTACCTAAATAATAAAATAATAACACATTTTTACTTTCGTGAAATTGGTTATGAAACTCCTGCATTATTCGTATTTAAATTAAATGCTAGAATGAACGAGATAATGCCACTTTATAATCAAATGTATGCTTCGACAGATTTAGAATGGAATCCTTTATGGAATATGGATTTAACAGAGACATTTAGTCATGAAGTTACTGACAACGGTAATAGCATTTCAAAAGTTACAGGAAATCAATCGCTAGACGGAAAAACAACAGAAAGTTCAGAAAGCGAAAGAAATGAAGATTTAGAACAAAATTCTGATAACACAATAAATAACAATAACATAAAAACTCCAAACTTAACTAATGACACAGTCATTGCAGAAATGGACACACCACAAGAAAACCTTACAGTTGACCAAATTAAACAGCATGAGTTTTTATCAAAAGCTACTCATAATATAAACCAAACTACAGGAACAGAAACAGACAACGGAACAACAGAAGAAATTCTAAAAACTACAAATGACAACCTTATAAAAACTACAAATGATAGTGAAACAAAGATAACCCAGACAAATGAAAGTTCTACCGACTCCACAATGGACACTTCCAATAACAGAAGTGAAACTTATACAAGAAAACAGGAAGGTAACACAGCGGGTTTTCATGCTCCAATAGCCTTAAAGCAATGGAGAGATAATATGATTAACGTAGATATGATGATAATTGAAGAACTAGAATCATTATTTATAGGAATATATAAATCAATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN908215|2210:13245|3507_3780_+|WP_077841608.1|DBSCAN-SWA MKAIKRKVKFYVTTAQKFRTENGQAIAEELPVLETTKKLSKVSLEKHFKSLIKEGETVLVGETVHKEKTFEMNLDYFIKNSKEIQEEQAS >NZ_LN908215|2210:13245|12327_13245_+|WP_077841617.1|DBSCAN-SWA MAYYTTELRQIVNNSNLDIGLKNYPLYEFKNGLKYINDFGYDLKGNKITNYRDYLNNKIITHFYFREIGYETPALFVFKLNARMNEIMPLYNQMYASTDLEWNPLWNMDLTETFSHEVTDNGNSISKVTGNQSLDGKTTESSESERNEDLEQNSDNTINNNNIKTPNLTNDTVIAEMDTPQENLTVDQIKQHEFLSKATHNINQTTGTETDNGTTEEILKTTNDNLIKTTNDSETKITQTNESSTDSTMDTSNNRSETYTRKQEGNTAGFHAPIALKQWRDNMINVDMMIIEELESLFIGIYKSI >NZ_LN908215|2210:13245|3831_4314_+|WP_077841609.1|DBSCAN-SWA MENRDLIPVNNEERAVANQFTFDDDNSFIADLTAPRTQAYSSIDLLKTSEKEKIAYFNAINSSDKRLGDKINEVIELKNVYVEIVQLKNEVTGEMQDAPRIVLIDSKGEGYTCVSTGVFSSLKKVFQVFGMPPTWSSPKKVKIKQVTKGEKKILTLAISE >NZ_LN908215|2210:13245|2702_3380_+|WP_162680658.1|DBSCAN-SWA MTREEIEQTTWDYLRSQGLPELSCAAVMGNIEAESEFDPNLIEEGNGIGLGLCQWSFERRTQLEAYGTDLHHQFRFLWAELSGDLGDTGANFQWGNKSNYLNHDQFMSGQGSLNELTSAFCFCWERPNVALAHLARRQDSANTYYNKFTGRQTTDPPIDPPTDPATPGDVKLKNRYLYGATDSLFGRKFISKNNTFVVSKVIGDICIIKDGNITRKVPKNNIINQ >NZ_LN908215|2210:13245|7365_8370_+|WP_162680660.1|capsid|DBSCAN-SWA MSMYWDITKSLTYNALFTFIVGNRGAGKTYNSTKWAIKDFLKTGNQFIYVRRYDEEFKKGKKEKFFDAIIKNNEFPQCEFKIKGYTAYINGKPAGQFMPLSKAKIEKSVAFPNVNKIIFDEFILDTGFYHYIPDEVMNFLDLYETVARDREGVRAYFLSNAITITNPYFMYFKLKVRNDKKFQRFRNGEIIVEMVQDADFIEHKKKTRFGKLIEGTEYGNYAIENKFLRDNDIFLMKKTGKAKNFFIMKYNGQSYGVWIDFTIGKYFVSYDFYPDCSLIYSITLNDHSPNTMLLKGEKSKTLKLFIENYKLGNVYFENMNIKNIFFEIVRLFLI >NZ_LN908215|2210:13245|4419_4566_+|WP_162680659.1|DBSCAN-SWA MGKKEREMALKFNKKIDDIKRINKGECVSYKQLNCKLCEYKEDCKINK >NZ_LN908215|2210:13245|2210_2654_+|WP_077841607.1|holin|DBSCAN-SWA MRFEKFLTLIGIVGGGISMAFGGWTTATTTLLIFMCIDYVTGFIVALIFKNSPKTDTGGLSSKVGYKGLAKKVMILLFLLIGYRLDLTLNTSYIKDGICIAFIVNELVSITENATLMGFPTPTIITNAIDILKQRSTKTDDTNIIDN >NZ_LN908215|2210:13245|4580_5336_+|WP_077841610.1|DBSCAN-SWA MSKFSFRRGELDKLDKKIKSFNRKVEQLKSQGYKETLLPEKMSYKVELAKIIHNENYVRQDFKDTFSIMDAFLKKGSEKILKSSRGMELPRFKKKEIDIKVKRINKERAKLQKQYDLEPLTDRNEPIEMPEENKKLFRAYKITPKKFNWKNMSRKDFEMFQKTLVEYDRKQDEKDKLYRENFYKALDNQLLPDDAKRIKEILDKIPTDEIVKKYYTDLNMDIDFIYDKSDYEGKIESIIESWNSLKREGGY >NZ_LN908215|2210:13245|5339_7052_+|WP_077841611.1|DBSCAN-SWA MIATADFETTTLENDCRVWAYAICEIGNYDNFICGNSIDDFFEFCMDKYENHILYFHNLKFDGEFIFYWLFRNGYEHVEDRKQLESKTFTTLISDKGQFYSIEICFTKKGKKTNKLTIYDSLKILNFSVQKIGKDFNLPVLKIDKEQEFYTKFREVGHILTEEEKQYIQNDVEVVARALKELFDREMNKMTIGADALNNYKVMTGKATFEKMFPILDNETDKNIRASYRGGFTFLNEKYKNKAVANGIVLDVNSLYPWVMYECPLPFGEPIYFEGKYKQDKIYNLYIQHFKCQFELKKGYIPTLQLKHNLAFIPTEYVKDSGTEEVILTLTSVDLELFLEHYNVYNVEWISGYKFKSSTEMFKSYVDFWINEKINAKKEHNGAMYTLAKLMLNSLYGKFALSPVVRGKFPLYDEKEDFIHYKYSQEESRKPIYIPVGTFITSWARNKTIRSAQKNYDRFIYADTDSLHLEGLEIPEELQIDDYILGAWKHELTFSKAKYLRAKSYMEYGKEPNTDDEEKWKITVAGMPTNCYQYVDFENFKVGAVYKGKLQHHRVSGGVILKETEFTIKM >NZ_LN908215|2210:13245|8698_9913_+|WP_077841614.1|DBSCAN-SWA MSDMIKVLNTIRANASKNYKDTVPVATQNNFLQVGSNILNYEPNANEFANALINMVAFTVVKNKQFKNPLSPLKKGGIPLGQDIQEIYTNPAKGGTYDGNSTQLLTVFKADTKVAYYRMNRQAKFRVTISLPDLQRAFTSIQALDQYTQSIINSMYSGDEIEQFELTKGLISQAYENNMLTEISVYNDQTQSLTDAEIAKALVKSIQTYSDLMVFPSTQYNKFAALKGGGATPVKTWTPKKDQVLIIPSTVKTNINVELLATAFNKSYLEMEEMMLVVDSFVGQPILGILCDKSCFQIYENYYAVKSFDNPDTNMQNYWLHHWQTFGFSLLANSIVFTYTPATVTLTTGSLGVAGDSKITGLTPTTQYKLFTDDIETPQTVTTNASGEITGLSNKNTYLVQANS >NZ_LN908215|2210:13245|8385_8697_+|WP_077841613.1|DBSCAN-SWA MTIEEHEQILTNIMQNAGDQGALSEYLQSLREDYSETTSTLSTLNTDKQDLLNKNEKLREVNSNLFLKVGNVKDLFEPKKDPEPEPEPDLKFEDLISEEGELI >NZ_LN908215|2210:13245|11451_12327_+|WP_077841616.1|DBSCAN-SWA MYGFSPSQVLKVEMNVENYMNNETYYHYFNRIMLMLTSLFKWENLPNNIPERFIEKTLFNEGVCAFINDNEYGQIITQCTQGSEVNLYNEPIAWECFSVNGYRKTFQSDELSIIRNNKYSIPTQYLIHHHLKRLYDLERTIDKNLWYQRRLAILKGTEDSRLTLENIMKDYDENKFLIFGSKKLDLMNNLEMLNFNIQYTGLEMEQHKEIKWNDLLNMFGINTVNTQKRERLISDEANANNQMIEINVDVMLEERELAAKAINEKYGTNIKVSIRHNMNDTLNKENKEDDE >NZ_LN908215|2210:13245|9927_11439_+|WP_077841615.1|DBSCAN-SWA MVSPPKGTVFLTNSPLSKDNEHQIKFNSEQEQQTYFNSLEGKQFSYNYVRHENTMIVPCDYYEAIKYNYVVYQNTYVNDKWFFCFIEKFEYVNVGTTKLYLKFDVWQTWQFDIDIQKSFIERTHVQNDEQNTLSDNPSTGNLIEYKSFQRNFSGGYFIFCNADVTQEDTSSSNGYDFKLGNYSIPAMVLFYNEQQAASMALDLQRIANKGYGDRITSAVYAPCCNLISTLVVDTVNGFPVCRGTNYPDELLKQTISFDFSDVDLGHEKCLTFPYAKIVVQDLATGQTIELEPNKFGSKVINFEVQATVSETPSYRIIPLGYKNLDKSYSDSLVVKCNTSLPVANSSYAKYLMNNQDFNALRMAGSTIGIAGSIMSGSAMGAITGFESITNVLLQEQQAQKQPNQLSNITDGALERLQFQNGVRVSLFVMDTDHRQMANDYWTLFGYPKRTLEYPVFYSTLDYQFMKTQSANINGNIPQDDLVEIQDMFNRGVTMWKADKFRQY |
13 | Bacillus_phage(75.0%) | holin,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN908213_1 | 3996920-3997494 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN908213_1
|
8 spacers
spacers of NZ_LN908213_1
>1.1|3996943|46|NZ_LN908213|CRISPRCasFinder AGTTATGCTGGCTAAATTTGTGCAGCCTGCAAATGCACTTCTTTGT >1.2|3997012|46|NZ_LN908213|CRISPRCasFinder TATTATGCTTGTTAAATTAGTACAACCTTGAAATTCAAACTCGTTT >1.3|3997081|46|NZ_LN908213|CRISPRCasFinder TGTTATGCTTGTTAAACTACTACAATCACCAAATGCACCGCAGCCT >1.4|3997150|46|NZ_LN908213|CRISPRCasFinder AGTTATACTTTTTAAATTAGTACACTCCTGAAATACATCATTTCCC >1.5|3997219|46|NZ_LN908213|CRISPRCasFinder GGTTATACTTTCTAAACTACTACATCCTGCAAATGCCTTTGTATTA >1.6|3997288|46|NZ_LN908213|CRISPRCasFinder AGTCAAGCTTTTTAAACTACTACACCCGCTAAACGAGGCTGTATTT >1.7|3997357|46|NZ_LN908213|CRISPRCasFinder AGTTATACTTTTTAAATTACTACATCCATTAAACGCAAATGGATCT >1.8|3997426|46|NZ_LN908213|CRISPRCasFinder ATCTACGTGTGTTAAGTTACTGCAATTCATACATACTATAGATTCT |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN908213_1
The CRISPR arrays of NZ_LN908213_1 >merge|NZ_LN908213|1|3996920-3997494|CRISPRCasFinder ATACTTGTTACACTATCTGGAATAGTTATGCTGGCTAAATTTGTGCAGCCTGCAAATGCACTTCTTTGTATACTTGTTACACCATTTGGTATTATTATGCTTGTTAAATTAGTACAACCTTGAAATTCAAACTCGTTTATGATTGTTATACCATTTGGTATTGTTATGCTTGTTAAACTACTACAATCACCAAATGCACCGCAGCCTATACTTGTTACACTATCTGGAATAGTTATACTTTTTAAATTAGTACACTCCTGAAATACATCATTTCCCATACTTGTTACACTATTTGGAATGGTTATACTTTCTAAACTACTACATCCTGCAAATGCCTTTGTATTAATAGTCTTTACACTATTTGGAATAGTCAAGCTTTTTAAACTACTACACCCGCTAAACGAGGCTGTATTTATACTTGTTACACCATCTGGAATAGTTATACTTTTTAAATTACTACATCCATTAAACGCAAATGGATCTATACGTTTTACACTACTTGGAATATCTACGTGTGTTAAGTTACTGCAATTCATACATACTATAGATTCTATACCCGTTGTACTATCTGGTAT >NZ_LN908213|1|1|3996920-3997494|CRISPRCasFinder ATACTTGTTACACTATCTGGAAT AGTTATGCTGGCTAAATTTGTGCAGCCTGCAAATGCACTTCTTTGT ATACTTGTTACACCATTTGGTAT TATTATGCTTGTTAAATTAGTACAACCTTGAAATTCAAACTCGTTT ATGATTGTTATACCATTTGGTAT TGTTATGCTTGTTAAACTACTACAATCACCAAATGCACCGCAGCCT ATACTTGTTACACTATCTGGAAT AGTTATACTTTTTAAATTAGTACACTCCTGAAATACATCATTTCCC ATACTTGTTACACTATTTGGAAT GGTTATACTTTCTAAACTACTACATCCTGCAAATGCCTTTGTATTA ATAGTCTTTACACTATTTGGAAT AGTCAAGCTTTTTAAACTACTACACCCGCTAAACGAGGCTGTATTT ATACTTGTTACACCATCTGGAAT AGTTATACTTTTTAAATTACTACATCCATTAAACGCAAATGGATCT ATACGTTTTACACTACTTGGAAT ATCTACGTGTGTTAAGTTACTGCAATTCATACATACTATAGATTCT ATACCCGTTGTACTATCTGGTAT
>NZ_LN908213.1|WP_077844467.1|3993810_3995718_-|threonine--tRNA-ligase MINIKLKDGSIKGIADESSIYDLANSISKNLAKVAVVGEVNGTLVDLNYKLKNNDEVNILTYDDEKAVEVIRHSTSHVMAQAVKRIYKDSKLAIGPAINNGFYYDFDIENSLSNEELDKIEAEMNKIINENLSFERIDISRDEAIKLMEEKGETYKVELIKDLPEAEKISLYKQGDYIDLCRGPHIPSTKYIKAFKLLSVAGAYWRGNEKNKMLQRVYGVAFSSKKELEVHLHNLEEAKKRDHRKLGKELKLFTFAEEGPGFPFMLPKGVILKNTLIDFWRKLHYEDGYVEIETPIMLNKKLWETSGHWYHYRENMYTSTIDEEEFALKPMNCPGGMLVYKSESHSYRDFPMRVGELGRVHRHELSGALHGLMRVRAFTQDDAHIFMLPDQIKSEIKGVINLIDKVYSKFGFKYNLELSTRPEDSMGSDEEWELAESSLKGALDELNLEYKINEGDGAFYGPKIDFHLEDSIGRTWQCGTIQLDFQLPQRFELEYVGSDGEKHRPIVIHRVVFGSIERFIGILIEHFAGKFPTWLSPVQVKILPISNKFNSYSEKIKDKLSSEGIRVEIDQKDEKIGYKIREARNERVPYIIIVGEKEETENNISLRSRSNGDEGTLNLEDLIERINNEVKNKAL >NZ_LN908213.1|WP_077844468.1|3992143_3992761_-|hypothetical-protein MFLFGGNKLKVRSEEDEDGVKTFVEYYGMKKSDEFKVKVLNEMIGENLCLIVLDSRMLYFGNQVEHEVPVEEIVEHLGISRIAYKKFEIKKVPEVSMFGISIKKGTKKTDRDYVIGFVVNKYNFKRIEEYVNRMNLYYFIDNAGLGEEDLLQKLSENYEEIDEMSKEFYCEIFNNNYISQLVISSENENAMAIKETVGRCHSELK >NZ_LN908213.1|WP_077844469.1|3987451_3991792_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MKRINEAFSDYESAGSINTAVIQSVVLRKKTKVLEMEISSDNYIELGEIESFNSFIKDKFGLNDSKIIVKYSDEVEIRPIEKELKNIVYSLSMKYPALKAAVNNSDYEIEGNTINFNFKIPVSGFLKTMEYDKQINKAIKHMYGKHYNINFIDQIDSEELVKIAEDKRANEMKVIKEIKINQSNNPPELPKAEEGKQEVKAEGDGKKASNPFLILGRNANIKENIIKINDITPDEGRVALEGEISNLEAKELRSGKMLISFDLYDGSNSMTCKIFAKPTEYDEVFSRIKKAKGLRLAGNAGYSNFSHEVELIANTVIETNGIKKYKRQDNSEVKRVELHMHTQMSQMDAMSSASDLIKRAMSWGMKSIAITDHGVVQSFPEAHKLLGRDNPDMKVIYGVEAYLAPDKKPSVTNVREESIDTVYCVLDLETTGFSPQTEKITEIGVMKIKDGKVIDKFSTFVNPQKSIPMRVVEVTKITDDMVKNAETIDKVFPKLLEFIEGSVLVAHNADFDIGFLKHNAKVLGYEFDFTYIDTLGLAQDVFPDYKSYKLGRIAKNLGIKVEVAHRALDDVDTTVKVFNIMIEKLKERGAQTLSDIDLYAADEEAKKVAYKKVKTHHAIILAKNYVGLKNLYKLVSYSHLDYFYKKPRILKSMFKKYSEGLIIGSACSEGELYQAILLGKPEEQIEEIANFYDYLEIQPLGNNDYLVRQEQVPSKEYLKEINKKIVELAERLGKPVVATGDVHFLDPEDEIYRRILEAGQGFKDADNQAPLYLRTTEEMLDEFSYLGRTKAYEVVVTNTNIVADMCEQISPISPEKCPPHIEGCEQTIKDIAYEKAHELYGDPLPEIVQARLDKELDSIIKNGFSVMYIIAQKLVWKSNEDGYLVGSRGSVGSSFVANMTGITEVNALPPHYRCPKCKYSDFEDYGVLNGFDLPDKVCPVCGEKLHKDGIDIPFETFLGFNGDKEPDIDLNFSGEYQAKAHRYTEVIFGKGTTFKAGTIGTIAEKTAFGYVKKYYEEKNLPINKAETMRISVGCTGIKRTTGQHPGGIIVVPKGREIFEFCPVQHPADDPNSDIITTHFDYHSIDQNLLKLDILGHDDPTVIRMLQDITGVDPHEIPMDDKDTMSLFFSTKALGVTPQQINSEVGTFGIPEFGTKFVRGMLVDTKPKTFSDLLCISGLSHGTDVWLGNAKDLIDNGVITSISDAVCTRDDIMVYLIRKGLPPNTAFKIMETVRKGKALKEPKFPEYEAMMREHDVPEWYIESCKKIKYMFPKAHAAAYVMMAFRIAWFKVHIPQAYYATYFTIRAKAFDAEFMIFGKEKVKAKMQEIQALGNDAGPKDKDMYDDLEIVLEMYERGFKFLPIDLYKSSATKFQLEEDGIRPPINSIAGMGNVAAEGIASAAKEKEFNSVDDVKKRSKIGNAAIELLRKFDCLNGLPESDQMSFFDAV >NZ_LN908213.1|WP_077844470.1|3985873_3986257_+|DUF4440-domain-containing-protein MNNIKDHILQLEQELLKSEVRKSADKINDMLSDDFIEFTSSGNEYHYKNGDVFQEQNNPQTLYGEISNFKIKELADDCILAMYKIIKLNELDENKKYSLRSSIWKCFDGKWKMIFHQGTLSSKSEII >NZ_LN908213.1|WP_077844471.1|3985492_3985822_+|hypothetical-protein MIFRNVMSIVSSLISLIYGFSILLILDMINHKVNCTPIFKYPSNKSILIFLISFAIYTLSVFLLSLAARLDSKKQRIRFILVNVISFAMGLILFIWIGVIFFINTDSGP >NZ_LN908213.1|WP_031275648.1|3984978_3985422_+|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MHFIEGLFSKLVKKYNTTDVYELCKLEKITYRELDLHPEINGIYQYVMRNRIITINQNLSPECKRITCEHELGHAILHKKYNCTYLKTKTFFNVNKFEKEADIFSSLFEIPFISKDILIGKTLDEVARELNVSRYLLDLRIGICNFD >NZ_LN908213.1|WP_023973793.1|3984356_3984827_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MFNAELLSSLIKEAQGDISLNNFASQCKISSSTLSRIINNKNSCPPAPSTLQKIASVAHNGVTYADLMAAAGYINDGETPVEIPDATNTVLSKKDERDIAKRIEALKEDLLNGEGLMLSGNPMSPEAIESLIEALSSGIRQAKIANKKYTPNKYKK >NZ_LN908213.1|WP_077844472.1|3983926_3984139_-|hypothetical-protein MNTTKESVKKFVDEQFDGNFNKCARNLDLAPSTIWRIANGNGKAGIKVITNIIKYCDDKKINYRKYIFLR >NZ_LN908213.1|WP_077844473.1|3982459_3983374_-|YqaJ-viral-recombinase-family-protein MDKLQWLKERQKGIGGSDVGAIMGVNRWKSPFEVYVDKTEEIREVKESGESSYFGNTLEEVVAREFSIRSGKKVRKDKRQLVHKTHEFMMGNIDRRIVGENSLLECTTVNAFRAKEWDGEEIPPSHILQCQHYMEVLGADTCYIAALIGGQRFVYKEIKRDEELISMIVEAEKDFWINHVQKRIPPKLDGSEAASKYLSKTFKCIDKTLEVNLKEEYKDKINEYLNIKNQMKILDESLKVIENNLKNQLGNAEKGIVEKFQVIWKGVTSNRIDSRVLKEKYPEIYKEVCKQSMSRRFEIKEISS >NZ_LN908213.1|WP_077844474.1|3981629_3982400_-|recombinase-RecT MATNSSLKNQLIEKEQSTVNVQETIFKNLINSDDVKSKFTEVLKDKAFEYINSIINLVKETPAPNAIGASDSHQSADLGSLLIECEPRSIIDACMIAVSLDLSIDKNLEYVWIIPYKKKSNFQLGYKGYIQLLLRTGEYKAINVIEVYEGQLKSWNPLTEEFDIDVSAKKSDAVIGYAGYFEMVNGFRKYVYWSKDNMDAFRNNSFKGDPRWNNDYKAMVKRTVMRNMLSKWGRLSAEMQKAYLEDINTDKFIQGN >NZ_LN908213.1|WP_077844465.1|3998148_3998340_-|hypothetical-protein MPNKIKSYYQHEDEEENDQFLRNFEYKGEEILVCDICETEISEEEYELNDGRCDECSADIHEP >NZ_LN908213.1|WP_077844464.1|3998466_3999030_-|flavin-reductase-family-protein MIKKKIANIPFGPFITVLAGAMVNGKPNYATIGAYGVVSEKPVLYISLKNSHYTTSGVVENGFFSVNIPSSESIYKTDLCGCVSGNKEDKSNVFDSFYDDAGNAPMIKECPVNYLCKVIQTISIFDFTMFIGEIVAVYANEDCLENGTPNALEVKPTIMMYPGYYDLKDKVGTLFKTYKSTSTDEPR >NZ_LN908213.1|WP_077844463.1|3999300_3999975_-|HD-domain-containing-protein MDTEMKHKKIIEIVQDKLTCSAHNLDHVFRVYNLCLLIAQHEKDIDLEILIPSALLHDIARVEESQDKTGEIDHAVLGSVIAEDILRTLEYQEEKIEKIKHCIIAHRFRTGNEPNTMEAKILFDSDKVDVIGASGIARTFMLAGQFGQRLTVNESLDEYLKGNTVENGRLKDVSKHTPFIEYEVKFKKIPDKLYTDKAKEIGKERLKFMDEYFNRLKSEIEGIK >NZ_LN908213.1|WP_077844462.1|4000161_4000476_-|DUF4304-domain-containing-protein MDNFSYGSPYLDSLSEKHNYAQMLHETFDNVIVPGFKEKGFRKNGKTFYRKRDGLTEVCNVKFSRDNSRVHARFWLHVCIAMPSFYDSIGKKYDKKWEATIFDI >NZ_LN908213.1|WP_162680584.1|4000672_4001125_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNKNNISIQKAQKGDYDELRKIFFNTRQENFKWVEHGSIKLEDFDSSTEGELILTAKIDNEIAGFISIWEEDKFIHNLFVSSNFKRCGVGKALINQSAKVVGLPLTLKCVKANVNALHFYLSQGWTIEEEAIENEPYYLMKYEDINILKK >NZ_LN908213.1|WP_077843939.1|4001392_4001839_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIDIETLNNIDKEDMDNILDVWESSVRATHTFLNEGDIISIKPQVKEGAYYVSKFVCVRDDEGIIQAFMGVHDGKIEMLFVSDECRGKGVGKRLLEYAINSLNINYVDVNEQNIQGVGFYKHMGFEIFKRSELDEQGNPFPIFHMKLK >NZ_LN908213.1|WP_077843938.1|4002020_4003175_-|MFS-transporter MKNNRNFLLLCAIDLVQGLVFYGPIATLYREARGLTIYEIFIIESIFMLLMILLEIPWGWFADRFGYKNTLLVAFFLNFISKIIFYKANTFILFLIERIVLAISVSGVSGCDSALLYSSVGEEKSEKAFAFYSSCSTFGFLIATLLSTFTISISMDFTVWITIFPYGIAVLLSLFLKNIPFENENKKRESIVNVLKTSIKGRKIIYFLISMALISEVSHSIMVFLNQLQYRRSGIDIKYYGIILMIVQIASMVSSQTHKITSKFGKFKTFIFIICSVAISSIVLASTTNSIVSILLIILIGIANSISIPISLDIQNKSITIANRATVLSVYAMIIDVISATVNLAIGKASSVSIQTSFILCGVIAIIALSLNIYYFKLQNQEEI >NZ_LN908213.1|WP_012059396.1|4003486_4004050_-|nitroreductase-family-protein MKTVLEVIKERRSIRFFKEEQIKKEELEKILEAGLWAPCAGNLQAVKFVVVQDKRLNDELGKINRELFGAARRNDKSSGSIADDDSIKSAFYKAPVVIYLFAPDNYPYAIHDCCVASQNIMLEAAEINIGSVCISRGEKTFETELGKKSKEKWGLDSTYKCHSIIPLGYISKNGKPQPRKENRIIFD >NZ_LN908213.1|WP_023973813.1|4004487_4004805_+|hypothetical-protein MKKSIIVFSIFLFISFSMNSITSVAQTNTFSEGIYSIEDLKLLPNVPYKVRNVSGGRTFITILNEDLIMEQSIRFEPNSLQYVLNPMQYGYKVIIAGSGQLSFTS >NZ_LN908213.1|WP_077843937.1|4005370_4006030_-|type-A-chloramphenicol-O-acetyltransferase MNFNLIDINHWSRKPYFEHYLNNVKCTYSMTANIEITDLLYEIKLKNIKFYPTLIYMIATVVNKHKEFRICFDHEGSLGYWDSMNPSYTIFHKENETFSSIWTEYNKSFLRFYSDYLDDIKNYGNIMKFTPKSNEPDNTFSVSSIPWVSFTGFNLNVYNEGTYLIPIFTAGKYFKQENKIFIPISIQVHHAICDGYHASRFINEMQELAFSFQEWLENK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN908213_2 | 5899690-5899843 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN908213_2
|
2 spacers
spacers of NZ_LN908213_2
>2.1|5899724|26|NZ_LN908213|CRISPRCasFinder CCGTTGTCATTGAACCAACCAGTTTG >2.2|5899784|26|NZ_LN908213|CRISPRCasFinder GTTCCATCTTGAACCCAACCTGTAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN908213_2
The CRISPR arrays of NZ_LN908213_2 >merge|NZ_LN908213|2|5899690-5899843|CRISPRCasFinder CATAGCACCTGATCCATTTAAGTAGTACCAAGTTCCGTTGTCATTGAACCAACCAGTTTGCATAGCACCTGATCCGTTTAAGTAGTACCAAGTTGTTCCATCTTGAACCCAACCTGTAGCCATAACACCATCAGCTTTTAAGTAGTACCAAGCA >NZ_LN908213|2|2|5899690-5899843|CRISPRCasFinder CATAGCACCTGATCCATTTAAGTAGTACCAAGTT CCGTTGTCATTGAACCAACCAGTTTG CATAGCACCTGATCCGTTTAAGTAGTACCAAGTT GTTCCATCTTGAACCCAACCTGTAGC CATAACACCATCAGCTTTTAAGTAGTACCAAGCA
>NZ_LN908213.1|WP_077842055.1|5896523_5898356_+|O-antigen-ligase-family-protein MTNSRNNSNEKSFNFFLPIAFILSIVPLIVRIAAVKLDENLIKIWGTTVKTDLFSQRKALLLIIFSVILIITCVIFFKKIFSRKDKLVNYILIACGVFTLFTFLSAIFSKYRQVSFWGMFDRAEGFITIACYIVLFLYSLYTFKTTNNYKYIITPLLILVFINAFLGLFQYIGQDLIKTSLGASIAGASSNSGIDLLNEKGTIYGTLASYNYMGSFVSIALPILFCYTIFEDEVMYKILSFIGTLLSFWLLFGSTARSGIIGVLGALIFGIIIFYKPLIKRWKGILIGVVALIILVVGANFASKGSLFKRIPSLASDAFSIFKDTSDFDYTNYTPVKDIKYIDSTTEVVLPNDTLKITYESGNPVFKNSNGEVVPYTLNGKVLSTNIDAFKNITFAFGKLDKKSVISDSLLLNINNQPTFLFKLNDNKIFHLIDMSTKNYIDLQTPETFGFKGKEKLGSSRGYIWSRSLPLIKNTMILGTGPDTFVFDFPQGDLIGKYYAYDTPNIVVDKAHNLYLQIAINYGVIALVGFIAMLLIYIIDSIKLYALKNNFEDRNQALGSITCLGIIGYLFAGIFNDSVVGVAPIFWIIFGVGIAINFMNRENLRKKSNK >NZ_LN908213.1|WP_077853723.1|5894784_5896215_+|undecaprenyl-phosphate-glucose-phosphotransferase MIKENQNLLNKINAASDVAILFISMTLAYLIRFYIFSTDMQYIKLITYIQFSVIIVPIYLIVFNFFNLYHSFRTTVFIKECSQVIKANTIVTTLLLSLLFAFKLVHDISRWVIIIFYFVNIILIIVKRFLLRKTLAKIRSKGLNLKHVIIVGAGDVADEYLKVIKSNRNFGYSYSGYIANTSNSEGKKLGNYSDLYEVLDRYKPDEVVCALDISDAKYIENIVSDCEKSGTKISIIPFCYKYIPSQPYIDQIGSIPLINIRRIPLDNFGNAFIKRALDIIGSLLLIICTSPIMLVTALIIKLTSNGPIIFKQKRVGLNKSLFTMYKFRSMKVNSKEETGWSTDNDPRKTRFGSFIRKFSIDELPQFFNVLKGDMSLVGPRPELPHFVDNFKDEIPLYMVKHQVKPGITGLAQVNGFRGDTSIKKRIEFDIQYIENWTILMDITILFRTAFKGFKNNEKIIIKNDTLIENNDLDLKL >NZ_LN908213.1|WP_077853724.1|5893262_5894342_-|NTP-transferase-domain-containing-protein MKITAVVMAGGKGERFWPKSRKSLPKQFLSLTDDGKTMIQLTIERLKSLVDIDDVYIVTNKDYKNLVLEQIEGIPEENILLEPVAKNTAPCIGLAAMHIKKKYEDAVMIVLPSDHLIKYNEIYIDTLKAAIEVAKEDENLITIGITPSYPETGYGYINFGRDEEDIKRSNIYRVKRFVEKPNLETAKEYLSSGRYLWNSGMFVWKSSTILNNFRSLLAETYEGLEKIYETIGSEEEEYILEREFSKFESESIDYGIMERAGNIYTIPGSFGWDDVGSWLALERINRTNEDGNVIKGNVITINSKKSIIQGQDKLIAAIGVEDLIVVDTEDALLIASKDSTQEVKKVIENLKICNRNEYL >NZ_LN908213.1|WP_077841329.1|5892379_5893153_-|ABC-transporter-permease MNSLKELYNYREMLFSLVRKDLRTRYKGSVLGFLWTFLNPLLQLCVYTIVFSVILRSDVPKYYIHLFVALVPWLFFATSIQGSSASIIGSKDLIKKVYFPRIIIPISVVNAAFMNMLFTMIVVFFALIFSGIGFSWYILLLPIIMILEYLLALGLSFIFSALDVYFRDLEHILGIVIMVWMYLTPVLYGIDMIPDNFKPIFKINPMTPIVVAFRDILYYKKMPDFSNMWIILAWSIALIVIGYVVFEKLQKKFAEEL >NZ_LN908213.1|WP_017212052.1|5891142_5892378_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MEVIKIDNVYKSFKIYYDKGSTLKEKILFKNRNKHEIHKVLNGVSLNVEKGEVVGLVGENGSGKSTLLKLMTKIIYPDKGSIEIKGKISSLLELGAGFHPDMTGRENIYTNASIFGLTKKEIDDRIERIIDFSELGDFIDNPVRTYSSGMYMRLAFSVAINVDAEVLLVDEILAVGDASFQAKCFNKMQEIKNDGTTIVIVSHDLNSIEKLCDKAVWIDEGYKKLEGTPHDVIAEYLDKIMNKNVESKLQHETELEEDSEDKENEQKFENRTGNRDVEVRLVKIIECDSNEEKYIFKPEDSVKIIIEYVRKNDELLESVVGFGIMRKDGVNCYGTNTYIDNASKVKLNKSGIIEIFLEKIELLEGEYTLDIAFHDEYGKPYDYIRKIKEFSVYSSIKDSGIFRLKHEFRVK >NZ_LN908213.1|WP_077841328.1|5889736_5891122_-|methyltransferase-domain-containing-protein MDYSDDIYRKIKLRKEAEENINYKNNKNSNIDNGKSILNELEENVILINSLWNIDYDFQIRSHRKIIGRLLVFGKKVTRKLLKWYVRDTGIEQNKFNAYIVKAMNSTWDYINELNNINGKISQEINTVYDNNKDLKREIELIQVKNKNLEIRNKDLEIRNKDLEIRNKELDALIKFTEDNINNKIGILEERFNNSLNNYKEDITYLRYRMKYLINNKENSEKNNSNLIDSINSEIKERIIDDEIDYFDFENKFRGSESNVVEKQQIYLQYFNSTNKVILDIGCGRGEFLTMLSQNNIPCKGVDAYPEFVDYCKDKGLDVVLDDAISYLNTLEDNSLGGVFIGQVVEHLETSYVIRLFNLCRQKLCNGGKIIAETQNPETLGIFGDSFYVDPSHKKPIHPLQLTYIAESAGFKKVNRLYLNEFEEKIPYPIGIENDEDVNAAVDRLNKLLYGPRDYSIIGEK >NZ_LN908213.1|WP_017212054.1|5888671_5889724_-|glycosyltransferase-family-4-protein MKKKKVLVCSAKTPFMYGGAEIHAENLRYNLEARGFDTELINLPFKWYPNERLITECLTWNMIDLTEANGEKIDLVIPLKFPSYFVRHENKVTWLMHQYRPIYDLYGTKYSDFDLNNGFHRKIRDQVIKIDEKALLESKKIFANSKNVSNRLYKYNKIQSEPLYHPPKNIGKYFTEKSRNYILSVGRLDPLKRVDIIIKALKFCDKNISAIIAGTGGMEKDLRKLAEKEGVSDRVKFTGFVTDEELIKLYAEALAVMFPPVDEDYGYITIESFLSKKPVLTASDSGGSLEFVVDNRNGFICDTAEEFGEKINFLYKNKRIAEDMGIEGYEAVKGISWDNVIDRLTESIRY >NZ_LN908213.1|WP_077841327.1|5887243_5888527_-|glycosyltransferase MKIAFVTPLSPEKTGIADFCEEILPLMKDYFQIDLFSSHNNPSNKIISENFKVYKYEKLEDENIRNQYDRIVYQIGNNVECHGKIYELALKYKGIVELHDISIEGLIWGMTLKNNNRDKYLDIVEYCHGKEARRRAEGAFNGECIPLWDEPLRFPLNKKLIDSAEAVIVHSDLGFQIVKGTRNNFNIAKIYHHTNDIYNNYDELKEIYKKELGMGNELIISSFGFATRTKRIPQILEALSKVKEQGCKFKYIVAGKVEEEINIKDLVDKFGLRDNIEITGYLSLEELKKYMLATDICLSLRYPSHGESSGIFHRILGMGKLAVITDEGTFSEYPNKVCLKISMENETENIKNAIIDIINGKINMKEYERNAMEYAKSNFDIKENVLMYKSFIENPYDNNLYDPLDIISDYLYKLGIVEKDLINSLKF >NZ_LN908213.1|WP_111938439.1|5885088_5887152_-|hypothetical-protein MFNKEDSNKRIVFALGCLLGALVFIWFYGIRVLDVTYDSWLMEGGDLSQHYIGWQFFRNSSWSFPFIGLIDGLIYPYKVSVIYMDTIPGLSIIFKILSPILPQTFQYFGIWGILCFMLQGGIGALIIRKFTSQYIICIASSMLFLLSPIMIYRLFGHASLAGHWLILLSIYIILNKSKFRDIKKSIGAWSIIVFLCVNVHMYFLAITMLLLLCYLAIDYFENKSIARVISVLGSSIFIALITLFILGAFYGSADYETVGLGFYSANINALFNPQGYSRYLFNLPTATEGQYEGLAYIGLGVIIALIVALYFDIENVLKIKNEKISIFIKNNYIKFIIFITMIIFFIIALSPQVSLNGKMLLNIPYPKIIIKFLNVFRSTGRFMWPICYFIVIYAIRKILNISVKKQAIIFILICVIIQMSDLSNTRNDRYDRFSHNIEYNSEIKSPLWYKLIKNNYKHIAFMKYTVQNYKSLWSLCKYAADNNLTMNDGYVSRKDSKAVNAIKDEYLQQLESGICRDDTIYVFGNDQNILESLKDYPLSYYNLDGIIVGIKEKFTDINDYREEHEEKLKQGINILPKEDKYMNYGRDTDKGRILNPQGRSFGPYSEIAQGTYNVVIEGENLNKIVKYDLCYKQGEKTINLQEIERNNEKIVFTFNLETDIQDLECRVVNGNDENVILTKIVINKIVQ >NZ_LN908213.1|WP_017212057.1|5884093_5885062_-|glycosyltransferase-family-2-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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1. spacer 2.1|5899724|26|NZ_LN908213|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030933 (Enterococcus gilvus strain CR1 plasmid pCR1A, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
ccgttgtcattgaaccaaccagtttg CRISPR spacer ccgttgtcattgaaccaaccgaggaa Protospacer ********************.. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
377541 : 449099
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN908213|377541:449099|DBSCAN-SWA 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75 | Clostridium_phage(59.26%) | integrase,head,tail,capsid,terminase,protease,portal | attL 437607:437622|attR 450634:450649 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
454224 : 516821
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN908213|454224:516821|DBSCAN-SWA 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59 | Clostridium_phage(46.88%) | tail,integrase,capsid,transposase,terminase,portal,coat | attL 459758:459773|attR 510901:510916 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
526212 : 581796
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LN908213|526212:581796|DBSCAN-SWA TATGGATAAAAAAATAATTTTAGCAATAGAATCAAGTTGTGATGAAACTGCTGCTGCAGTTGTTGTGAATGGTAGAGAAGTTTTATCAAATATAATTGCATCACAAATTGATACTCATAAAAAATTTGGAGGAGTGGTTCCAGAAGTTGCATCTAGAATGCATATTGAAGCAGTAGATAGCGTTGTAAAAGCCGCATTATTAGAGGCAGGGATATCAATAGATGATGTTGACGCAATAGGAGTTACTTATGGACCAGGACTTGTTGGGGCACTTTTGGTTGGGCTTCAATATGCAAAAGGATTGGCATTAGGTTCTAAAAAGCCTTTAATTGGGGTTAATCATATACAAGGACATATTAGTGCTAATTTTATTGAGCATAAAGATTTAAAGCCACCTTTTGTCTCACTAGTGGTTTCAGGAGGACATACTTTTATTGTGCATGTAAAAGGATATAGGGATTTTGAGGTTATTGGCCAAACAAGAGATGATGCGGCAGGAGAAGCTTATGATAAGGTGGCAAGAGCATTAGAACTTGGATATCCGGGCGGACCCAAAATAGATAAGCTAGCGAAGCAAGGAAATAAGGATGCAATAGAATTTCCAAGAGCTAAGTTTCAAGATGATACATTAGATTTTTCTTTTAGTGGAGTTAAATCAGCTGTGTTGAATTATTTAAATAAAGCAAAAATGAAAGAAGAAGAGATAAATAAAGCTGATATTGCAGCGTCATTTCAAAATGCGATAATAGATGTATTAAAGACCAATTTATTCTTAACTTGTGAAAGAAAAGGAATAAAAAAGATTGCAGTGGCAGGTGGTGTTGCATCGAATTCTTGTTTAAGAGAAACTTTGCTAGAGGAAGGTAGAAAAAAGGGGATTGAAATTCTATTTCCGTCACCTATATTGTGTACAGATAATGCAGCAATGATAGGAAGTGCAGCATATTTCAACTATCAAGAGGGAGCAGTATCAGATTTAAATATAAATGCAAAACCTAACTTAAAACTAGGGGAGAGGTAGAGTCTAGGTATGAAGCTGTTATCACATTCTAATGGAGTACATAAGGTTGAGAAAGATAAAACCAGCAAAAGGAGCATTTTAAAAAAATGTGTTATCTTTTTTGTGGGATTATTTATCTTTGGTTTTTTAGTGCAAATTTTAAATGACTTTGTAGATAATACAAGATTAAAATCTAGATTTAAGTACGTCAGAATAGATGGACGAAAAATGGAGTATAAACTTAAGACTGGTGGAGATTATACTGTAGTATTTGATGGATCAATCGGAACTACAATGTATGAGTGGGATGATGTTTGTAAGTCATTAGAGGAAAAGAAGATATCTACCTTTACATATAATAGAGAAGGATATGGATTTAATGATGGTGGAGACAATAGAACACCAGAAGAGCAAGCGAAGGATTTGAAAGCACTGCTTAGGAAAGCTGGAGCACCAGAGCCATACGTTTTAGTTGGAGAGGAGTACGGTAGCCTGGTTCTTAGTAATTTTGCCAATTTATATTCGGATTCAGTAGCAGGAGTTGTGTTAATTAACCCAATATCAGAGGAAAATATGCAAACTAAGGAATTTAAGGATAGTATTAAATCCAAATATTATAGAAGTATATTTGAAAAAATCGGTACAAATTTTAGTCTGACTGCATTGCTAAATAAAGCAGGGCTAACTATGGAGAATGATACTTTTAAGAAGTATTTAAATCAGAATGAATTAGATGAATTTCAGAGTTTTGAAAATAAGAAAAATTATAAACAGGCAGTTTCAAACGAGCTAGAAAACTTATATAAAGGCATTTCGAATAGTCAAACCAATGAACTACTAGGAAATAAGCCATTATATTTAATAACTAATAATGAAGCTGATCCTGTTAAAAAGATTGGTAATGCAACAGTAACAACTATATATAAAGAGGAAATAGAGGGATCTCCAATGTCTGTATTAGATCCTAACTCAGTAGTTACCGGCGTTAATAGTGTTTTAAAAGATGCTAAGAAGGTAGCTAAAAAATCTTGATGCTAATAAATATGTATATTTTCTTAAATATTAAGTATTATTGAATAATTAAGAAATAAAGCTTCTATTGGGCTAAAATTCATAAAAAATTATATCAAATTATATATTCTTGTCATTTGTTTGACACATAATAAATCTATACTAACATTATAAAGATAATACTAGTAGATATTTAAAGTATGCTAATATACTTTATGCGAACAAATTTGTATAGTTTAATTACTAGTCATATAAGTTGAGAATTGATATATAGGAGGAAAAATACATGAATAATAATGATAATAATGAAAAATTTATTGATGTAGAATCATTACCAGTAGATAAAGGTCAGCAAGTTGCATGGGAAAATTGTTTTCAAAATAGTAATAATTATGTAGAGCCGAAGAGAAAGAAAAGAAGAGGTCTGCGCATGCTAGGAAGGATTGCAGGAATTTTAGTTCTTACAATGGTAGGAGGGGCAATTGGAAGTGCTGCTACTTATTCATTCATGAAAACTAATAATGTTGCTGCAACTAAACAAATAACAAGTTATATTCCGCAATCATTCACATCAAGCACTCCTGATGCAATGTCAGCGGCAGATGCATTTAATAAAGTTGCACCAGCAGTTGTCATTGTTTCCACTAAAGGTTCATCTAACAGTGGATTTATGAACGGCGAAGTTGAGGGGATGGGATCAGGATTCATTATAAATGAAGAAGGATATATACTAACTAACTATCACGTAATTGCAAATGCTAAAGAAATTACAGTAACTTTAAGTAATAATACTGAGGTAAGTGCAACAGTAGTAAATTACGATCAAGATAGAGATGTTGCGATGCTTAAATTAAAAGACGGAACTAAAGTTCCTGCAGTTGCAGAACTTGGAGACTCTGATGAAGTATATCCAGGAGCTGAGGTTATAGCAATTGGAACACCTCTTTCAAAGAATTTTGCTCAGACACTTACAAAGGGAGTTATAAGTGGAAGCAATAGAACAATAGATGATAGTGGAAAAAGTGTAGATTTCATTCAAACAGATGCAGCTATTAATCCTGGAAATAGTGGAGGTCCATTAGTGAATGCTAAAGGGCAAGTTATAGGAATAAATTCTATGAAGATAGGTTCTGATGCATCGGGATCATCAACACCAGTTGAAGGTATAGGGTTTGCAATACCTATAAATGAAGTTAAAAATAAGATAGATGCTTTATCAAAACCTATATTAAATCTAGGAATCCAAATAAGAGAAATTGACAGCGCTACTGCTAAGAAATACGATTTGGTAGAAGGAATATATGTATCTTCTGTTGAAGAGTATTCACCGGCTGAAAAAGGTGGTCTTAAGATTGGAGATATAATTGTTAAATGTGACGGAAAAGAAGCTAAGAAATTCGATGAACTTAAGGCAATAAAGGAAAGTAAGAATGCTGGAGATACTATGAAGATAGAGGTAATTAGAGATAAGAAAACTGTTGATTTATCAGTTGTATTAGAAGAAAAATCTAATTAAAATTTTTCTAGATGGAAATTGAATATATTTGATTATTAAAACTAGAATTGATAAATATAATATTATCAATTCTAGTTTTTATTGCATCAAAATAATATTCTTTAAAACTTTAAGGAAAAGTAGTAAAATTAAAGATTATAAGGGTAAGATATCTTAATTTAATAGTTTTTTGATATCTAAATGGAGAAGGGGATAAATATATGGAGGAAATAATATTAAATATAATAATGCACAGCGGGGAAGCGCGAACTTTTTCTATGGAAGCAATTACTTTAGCTAAACAAGGAAATTTTGATAAAGCAAAAGGGTTAATAATAAAAGCTGATGAGGAATTAGGATATGCACATAATTCTCAAACAAGTTTAATTCAGGGAGAAGCCGTAAATGAGAAAATAGAATTCTCATTGCTTTTAGTTCACGCTCAAGATCACTTAATGACTACAATGGTTTTGAAGGATTTAGCAGTTGAATTAATAGAAGTGCATGAAAAAATAAGTTCTATTAAATAGAGGTATGTAAATATGAAAAATAAAATTAAATATGCTATTGTATTTTCGGTTCTTTTGCTAATGGGAATAGTAAGCATTAATCTATTTCAACCAAATAAAGAGCAGCAAGTTAGAGGAAATATAGAGCTCTTAGTAAATGAGAATTCCTATGAGTACTTAGTTGAGTGCGCAAATAATTTTATGAAGGAGAATGATAGGACTTCAATAAGTGTAAAAAAGTTAGAAAATTACAATCAGATACTTAATAATAATTCAGAAGGAAGTACGAAATCAAAGATTTCTAGTATAGTTCAGATAGATAGGTTTAGTTTTGATAAACTAAAATTAGATAACTATGAATATTATAATAAGGATGATAAGCTCTTGAGCGAATATGCTAAGAATTTTTCTAAGTATAGGGTAGCTCAGGTTAAGTATGGTGATAATTCCATAGGAATACCTTTAACATCTAGGCCATTAGCTTTCTATGTCAGAGAAGATTTATTAAAAAGTTATGGATATGAAAGAGATAGTTTGAATACATGGGATGATATCATAAGGGTTGGAAAAGATATTCATGAAAAAAGTAACGGAAAAATATTTATAATTAATGCAACTGATCAAGATTACGAAGATTTGATGGATTTATTAACCATGGAAACATTAAGTGATGGTGATAAAAGTATAGATGTAGTTAAATCAGAAGTTCAAGCTATGATGAAAAAATTAGAGGATAATAACATTTTAAACTTACAAAGTGGAGGGGAATTCTTAGCAAGAATATCGTCTATTAATGCCATGAAAGAAATAGCAGCATTAGATGTTCCTTGTACGTGGAGCGTTAATAACGTGCCTAGCCTTAAACCAGGGGCTAATAAGTTTTTTTCATCAGAAGGCGATAATTTATTGATATTGAACCAAAACAGCGAGAATGATAAGCTAATTGAAAAATTTATAACTTACGTAATAACTAACAATAAGGAAG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53 | Clostridium_phage(16.67%) | transposase,tRNA,coat,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1080088 : 1160845
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LN908213|1080088:1160845|DBSCAN-SWA 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76 | Clostridium_phage(67.5%) | integrase,head,tail,capsid,terminase,protease,portal,coat | attL 1087856:1087873|attR 1156053:1156070 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1314345 : 1324559
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN908213|1314345:1324559|DBSCAN-SWA AATGTTAAATATTAGAAGCGTATTCGTTGAAAAGAAAAAAGGATTTAATGTAGAAGCTCAAAGTTTACTAAATGACTTTAGAGATAACTTGGGAGTAACTGGATTAGAAGACGTGAGACTTGTTAATAAATATATAATATCAGATATACCTGAAGAATATTATAATAAGGCTTTACATACAATTTTTTCTGAAGCAACAGTAGATGTAGTTTACGAATCAGAATTACCAATGAATGAAGGAGAAATAGCTTTTGGTGTAGAATATTTGCCAGGTCAATACGATCAAAGAGCAGATTCAGCTTCAGAATGTCTAGCTCTATTAACAGCAGAAGACAAGGTTGAAATAAAATCAGCTAAAGTAGTAGTATTAAAAGGAAACCTTTCAAAAGATGATATTGAAAAAATTAAGAAATATTATATAAACCCAGTCGATTCTAGGGAAGTAGATATAAATAGCAAAGATTTATCATCACTTTCAAGCATACCTAAAGATGTACAAATCTTAGATGGATTTACCAGCAAGACATTGGATCAATTAAAAGAATTTCATAGTGGACAAGGTTTAGCTATGAGTATTGATGATCTTCTTATGATTCAAGATTATTTCAAAGGAGAAAAAAGAGATCCAAGTATAACTGAAATTAAAGTTATAGATACATACTGGTCAGATCACTGTAGACATACAACATTCTCAACTATCTTAGAAGATGTCCAAATTGAAGATAATAAATATACAGCTCCAATAAAAGCAAGTTATGAAGGATATATAAAATCTAGAGCATACGTTTATGGCGAGAAAGAAAAAAATAAAACTCTTATGGACATGGCTGTAATTGCTATGAAAGAACTTAGAAAAAGAGGAAAACTTGAAGATTTAGATATTTCCGAAGAAATAAATGCTTGTTCAATTAATGTAAAAATTGAAACTGATAAAGGCATGGAAGATTACTTAGTAATGTTCAAGAATGAAACACATAACCATCCAACAGAAATTGAACCTTTTGGTGGAGCAGCAACATGTCTTGGGGGAGCTATAAGAGATCCACTATCAGGAAGAACTTATGTGTATCAAGCAATGAGAGTTACAGGAGCAGCAGATCCAACAGTTCCAGTTGAAGATACATTAGAAGGAAAACTTCCTCAAAGAAAGATAACACTTGGAGCAGCTCATGGATATAGTTCATATGGAAATCAAATTGGTCTTGCAACAGGTCAAGTTGAAGAAGTATATCATCCAAACTATGCAGCTAAGAGAATGGAAGTTGGAGCAGTTATTGCAGCAGCACCTAAGGAAAATGTGGTAAGAGAAGAACCAGCTTTAGGAGATGTAATTATCTTACTAGGTGGAAGAACTGGAAGAGATGGTGTTGGAGGGGCTACAGGTTCATCTAAGGAACATACAGTAGACTCAATAAATGAATGTGGAGCAGAAGTACAAAAAGGTAATGCACCTACTGAAAGAAAACTTCAAAGATTATTTAGAAATTCTAAAGTAGCAAAGATGATTAAGAGATGTAATGACTTCGGAGCAGGTGGAGTTTCAGTTGCAATAGGAGAACTTTGCAGAGGATTAGATATAGATTTAGATAAGGTTCCAAAGAAATATGAAGGTTTGGATGGAACAGAACTTGCGGTTTCAGAATCACAAGAAAGAATGGCAGTAGTTGTAACAAAAGAAAATGCAGATGAATTTATAAAACTTTCTAATGAAGAAAATTTAGAGGCTACTTTGGTGGCACATGTTACTGATACAGACAGACTTAGATTATTCTGGAGAGGTAAAAATATAGTTGATTTAAAAAGAACATTTTTAGATACAAACGGAGCAACTCAAAAGACAAATGTTACAGTTAAAGCTCCAGTTGATTATCCATATGTAGTCGCAGATATTGATGTTAAGGAAGAATGGATCAACAACTTAAAGAAATTAAATGTTTCATCACAACAAGGGTTGTCTGAAAGATTTGACGCAACAATAGGTCACGGAACAGTACTTATGCCATTTGGTGGGAAGTATGCAAAAACTCCAGCAGAAGGAATGGCAGCTAAAATCCCAGTTCTAGATGGAGAAAGTGCAGATGCTACATTAATGACATTTGGATTTAATCCAGAATTAGGTACTTGGAGTCCATATCATATGGCCTATTATGCAGTAATAGAAAGTATATCAAAACTTGTAGCTATGGGTGGAGATTATAGAAAAGCTAGACTTACATTCCAAGAGTATTTTGAAAGATTAGGATCAGAAAGTTCAAGATGGGGTAAACCATTTGCAGCATTGCTTGGTGCATATGAAGCTCAAATGGCATTTGAAACAGCAGCAATCGGTGGTAAGGACTCAATGTCAGGAAGCTTTGGAGATTTAGATGTACCTCCAACATTAGTATCATTTGCTGTAGGAGTAGAAAAAGCTAGAAAGATAATATCACCAGAATTTAAAGAAGAAGGATCAAGTTTAGTTTTACTTCAAACTGAAAAACTAGAAGATGGAACTATAAATTTAGATAAGCTTAAGAAGAACTTAGATGTACTATATAAATTAATTCAAGATGAAAAAGTAATTTCAGCATCTGCTGTTAAGTATGGTGGAGTTTCAGAAACAGTTACTAAAATGACACTTGGAAATAGAATTGGTGCAGAAATTGATAACTTAACAAAGGATGAGTTATTTGGATTTAACTATGGAACTATAGTGCTAGAAGTTAAGAACAATATTAATGTAGAAGATGAATTTAAAGATTGCTTATACAAAGAAATCGGTAAGACAATAAGCTCAGAAGCTATAGTTTCTAAACAATATAACTTAAATCTAAGCATTCAAGCTTTAGAAAAAACTTACGAAGAAAAACTAAGCTCAGTATTTAAAATTAAAACTGAAGATGTAGAAGGAAAAGTAGAAACAGTTTTATATGATAAAAAATCAACACTTTCTCCAGCAATTAAAGTAGCTAAGCTAAAGGTTGTAATTCCAGTATTCCCAGGAAACAACTGTGAATATGACTGTGCTAGAGCATTTGAAAAAGAAGGAGCAGAAGTTACTCAAGTGGTATTTAGAAATATTACTAAGGAAGCTCTTAATGATTCAATTGAAAGACTTGCAAAAGAAATAAACACAGCTCAAATTCTTATGATTCCAGGAGGTTTCTCAGCAGGGGATGAACCAGATGGTTCAGGTAAATTCATTGCCAATGCTCTTAGAAATGAAAAGATAAGTAATAGCGTAATGGAATTACTTAAGAATAGAGATGGATTAGCACTTGGTATTTGTAACGGCTTCCAAGCGTTAATTAAATTAGGATTAGTACCATATGGGGAAATAGTTGATATTAAAGAAGATATGGCAACATTAACTTACAATAATATAAATAGACATATGTCCTCAATTATAAGTACAAAAGTTGTTTCAAATAAATCACCTTGGTTTAGTGAAGCTAATGTAGGAGATATACATTCAGTTGCAATCTCTCATGGTGAAGGAAGATTTGTTGCACCAGAAAACTTAATTAAAGAATTAATCGCTAATGGTCAAGTGGCAACTCAATATGTTGATTTTGATGGAAATGTATCATTAAATATGCCGTTCAATCCAAATGGATCAATGTACGGAATAGAAGGTATAACAAGTCCAGATGGAAGAGTTTTAGGTAAGATGGCACATAGTGAAAGAATAGGTACAGATTTATATAGAAACATCCCAGGAGACTTTGATCAAAAGATCTTCAAAGCAGGAGTGAATTACTTTAAGTAATGAACAATTCATGCCCTTTAGGGTATCCTGTGGGCAGTGCACATTTCACAATGAAGGAACAAATTCCTGTGGAATTTGAAAAAAGTTATGTGCATTGTTGATGGATGTAATAAAATTTCCAAAATATAAAAACTTAAATGTGAAAATAGTTTTATATTTAAAAATTTAAAAAGATAAATATGAAGATATGTAAATATATAAATATGTAAATATTTATAGTTGTAATGCGGGCTACAGGGAGTTAGAGGAAACTCGACTCACATGCGTTCGCTGAGTAAGTTCGAAGGGCGAAATATAAAATTTCGATTCTCACTTATAATGCTGTTTAAGAAAAAATATTTTAAATAATGCACATTGACAATTCACAATGAGGGTACAAATTCAAGTGGGATTTGAAACGAGAATAAAAGAGTATTCCGAAGGAATGGTTACCTAAATTGTGAATTGTGAATTGAGAATTGTGAATTGAAAGGATGTTTAAGATGCAAGTAGCAATATTTTTTGGAAGTAAATCAGACACGGAGGTTATGAGAGGAGCGGCAAATGCTTTAAAGGAATTTGGAATAGAATATAAAGCTTTTATACTTTCAGCTCATAGAGTACCAGAAAAATTAGAAGAAACATTAGAAGAAATTCAAGCTCAAGGATGTCAAGTTATTATAGCAGGAGCAGGTCTTGCAGCACATTTACCAGGAGTTATTGCATCAAAGACAATACTTCCTGTAATAGGAGTTCCAGTTAAAGCAGCAATAGAAGGTCTTGATGCATTATATTCTATAGTACAAATGCCAAAGTCAATTCCAGTTGCAACTGTTGGTATAAATAACAGCTACAATGCAGGAATGTTAGCAGTTCAAATGTTATCAGTTAATAATGATGAATTAAAAAATAAATTAAAAGAATTCAGATTAAATATGAAGAAAAAATTCATTGAGGAAAATGCGGAAGGGGTAGAACTATAATGGAAAAATTAGAAATGTTATATGAAGGAAAAGCAAAGAAAATTTACGCAACAGATAAGGCTGATGAAGTAATTGTATATTACAAAGATGATGCAACAGCATTCAATGGAGAAAAGAAAGGTCAAATCGAAGACAAAGGTATAATGAATAATGCTATAACTTCAGTATTGTTTGAAATATTAGAAAAAGCAGGAGTTAAAACTCACTTTATAGAGAAACTAAATGATAGAGAACAATTATGTAAAAAGGTTGAAATAGTTCCACTTGAAGTAATAGTGAGAAATGTTGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN908213|1314345:1324559|1323050_1324559_+|WP_077841360.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFDKEGVLDFAKFLVSKDVEIVSTGGTYKYLKENGLNVIEINEVTDFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDNEEHMNTLKGRNIHTIDYVVVNLYPFFEKVKEDLEFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVVVISDKNDYKVVMEEIEADGETSYKTKKKLAGKVFNLMSAYDGAISNFLLADDEEEYPEYLSVSYKKMQSLRYGENSHQTAAVYASTMLDGAMNTFETLNGKELSYNNFKDVDIAWKCANEFDEPACCALKHNTPCGVAIGKDSYEAYMKAYEVDPTSIFGGIIGFNRKVDKKTAEEMVKIFLEVIAAPEYDEDALEVLKTKKNLRVLKFHNTPKADKYMVTVDGAMLVQEEDNKLVEEIKVVTEKKPTDEEMKDLLFGMKVVKYVKSNAIVVAHNGIALGIGGGQVNRIWPTEDALKRGKGATILASDAYFPFRDVVDEAAKNGIKAIIQPGGSMNDQKSIDACNEHGIAMVFTGYRHFKH >NZ_LN908213|1314345:1324559|1322425_1323037_+|WP_077841361.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGTDLQSVIDAVENNYMNVKIEMVIGSRDNIYALERAKKHNIDTFVVTRREYGEESSNKILELTKGKVDLIVLAGFLAILDGEILKEFDNRIINIHPSLIPSFCGPGMYGLKVHEAVIKSGVRFSGCTVHFVNSEVDGGAILLQEVVPVYFEDDAETLQKRILEKEHEILPKAIKLISENKIRLIDGRVKIEE >NZ_LN908213|1314345:1324559|1319053_1319761_+|WP_011968398.1|DBSCAN-SWA MEKLEMLYEGKAKKIYATDKADEVIVYYKDDATAFNGEKKGQIEDKGIMNNAITSVLFEILEKAGVKTHFIEKLNDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGFKLKTTVFELSYKDDSLGDPLINDYHAVGIGATTFEELKVIYDMTAKINDTLKAVFKEQNINLIDFKVEFGRCADGTIVLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYVEILKRISK >NZ_LN908213|1314345:1324559|1318574_1319054_+|WP_077840103.1|DBSCAN-SWA MQVAIFFGSKSDTEVMRGAANALKEFGIEYKAFILSAHRVPEKLEETLEEIQAQGCQVIIAGAGLAAHLPGVIASKTILPVIGVPVKAAIEGLDALYSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSVNNDELKNKLKEFRLNMKKKFIEENAEGVEL >NZ_LN908213|1314345:1324559|1314345_1318092_+|WP_077841363.1|DBSCAN-SWA MLNIRSVFVEKKKGFNVEAQSLLNDFRDNLGVTGLEDVRLVNKYIISDIPEEYYNKALHTIFSEATVDVVYESELPMNEGEIAFGVEYLPGQYDQRADSASECLALLTAEDKVEIKSAKVVVLKGNLSKDDIEKIKKYYINPVDSREVDINSKDLSSLSSIPKDVQILDGFTSKTLDQLKEFHSGQGLAMSIDDLLMIQDYFKGEKRDPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTILEDVQIEDNKYTAPIKASYEGYIKSRAYVYGEKEKNKTLMDMAVIAMKELRKRGKLEDLDISEEINACSINVKIETDKGMEDYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGAADPTVPVEDTLEGKLPQRKITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVEEVYHPNYAAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPALGDVIILLGGRTGRDGVGGATGSSKEHTVDSINECGAEVQKGNAPTERKLQRLFRNSKVAKMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGLDIDLDKVPKKYEGLDGTELAVSESQERMAVVVTKENADEFIKLSNEENLEATLVAHVTDTDRLRLFWRGKNIVDLKRTFLDTNGATQKTNVTVKAPVDYPYVVADIDVKEEWINNLKKLNVSSQQGLSERFDATIGHGTVLMPFGGKYAKTPAEGMAAKIPVLDGESADATLMTFGFNPELGTWSPYHMAYYAVIESISKLVAMGGDYRKARLTFQEYFERLGSESSRWGKPFAALLGAYEAQMAFETAAIGGKDSMSGSFGDLDVPPTLVSFAVGVEKARKIISPEFKEEGSSLVLLQTEKLEDGTINLDKLKKNLDVLYKLIQDEKVISASAVKYGGVSETVTKMTLGNRIGAEIDNLTKDELFGFNYGTIVLEVKNNINVEDEFKDCLYKEIGKTISSEAIVSKQYNLNLSIQALEKTYEEKLSSVFKIKTEDVEGKVETVLYDKKSTLSPAIKVAKLKVVIPVFPGNNCEYDCARAFEKEGAEVTQVVFRNITKEALNDSIERLAKEINTAQILMIPGGFSAGDEPDGSGKFIANALRNEKISNSVMELLKNRDGLALGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIKEDMATLTYNNINRHMSSIISTKVVSNKSPWFSEANVGDIHSVAISHGEGRFVAPENLIKELIANGQVATQYVDFDGNVSLNMPFNPNGSMYGIEGITSPDGRVLGKMAHSERIGTDLYRNIPGDFDQKIFKAGVNYFK >NZ_LN908213|1314345:1324559|1319951_1321367_+|WP_077841362.1|DBSCAN-SWA MSNPNFELIMDPSNDKFKDECGVFGVYTNKPIDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVADGEKIDIHKGLGLITEAFKQEDLQKLKGHIAIGHVRYSTAGGKGIENAQPILVSSKMGPIAMAHNGTLVNADVIKELLEDGGQIFHTTTDSEVIACLIARSAKKGFAKAVVDAMSAVRGSFALTIMSKDRLIGARDPHGIRPLSLGKIEEGYILTSESCALDAIGAEFVRDIEPGEIVIIDSEGIQSYRYSENTKCQTCAFEYIYFARPDSRIDGLEVHTTRVKAGEQLYKEHPLDADVVIAVPDSGIPAAIGYAKASGIPYDTGFIKNRYVGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKSNLEGKRVILIDDSVVRGTTSKHLVESLRRVGVKEVSFLLASPSVKYPCYFGIDTPYRSELVAANHTIEEIRDMIGADYLGYLSEEGVYKSCGDREEFCMGCFNGVYPVATPVEKEI >NZ_LN908213|1314345:1324559|1321436_1322438_+|WP_017210866.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYKSVKLIKEYAARTMSQYVLNGLGSFAGMVELPSGYEKPVLVSGTDGVGTKLEIAFKNKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAADLVKGISDGCVDSDCALIGGETAEMPGFYSDGEYDMAGFAVGIADKDKIINGSNIKDGDKLIGIASSGIHSNGYSLIRKIFPDLNEEFNGEEVWKTLITPTKIYVKPVLKLLESYEIKGMAHVTGGGFIENVPRMFNGGDFTAVINKDSYPLPAIFERIIEKGVDKEHMYNTFNMGIGFVLAVKDEDVEPIIKALVEMGEKAYEIGYVTSGGEGICLK |
7 | Cyanophage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1946496 : 1998743
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LN908213|1946496:1998743|DBSCAN-SWA ATTAAATTACTTTCTTTACTAAATCCTCTTTCATTTGTGGAGTAATATAACCAATAGAGCCGTGAATTCTTTTACGGTTATACCATGATTCGATAAATATAAATAAATCTAGTTTTGCGCTTTCAAAATCCAAGTATTGAACATTGTTCACTTGTTCTTTTTTCAAAATTGAATGAAAAGACTCAATACAGGCATTATCATAAGGGCATCCTTTTCTGCTATTAGAGCTTTTCATTTTGTATTTTTTTAATCTATTAAGAAAATCTGTGCTCGTATATTGTACTCCAAGATCAGAGTGAAAAATAACGGAGCCGACAGGCTGTTGAAGTGTATACGCATTATCTAAAGCAGCTATCGCTACGGAAGCATCCATTGTTTTTGAAAATGAATATCCAATTATCTTTCTTGTGAATAAATCCATAACAGATGCCAAATAGCACCATCCATCTTTTAGGGTATAGATATAAGTTATGTCTCCAACCCATTTCTCGTTTATTTCATTAGTAGTAAAATCTTGATTAAGGAGATTTTTTCGTTCTATAACTTTTCTATTAGCTTTTGCAGGTCTAAATTTCTTAATTACTATCGAATGTATATTTAACTGCTTCATAAAACGTTGAACTCTTTTAATACTAATTTTATGTCCTGATTGTTCAAGGATTTTTTGAATTTTGGGCGCACCATACCTACGATTACTTTCAGTATAAATTTTAAGTATTCGATCTTTTAGAGTTTCATTTTCCAACGTCCTTCGGGACGGAGTATAGTGATGAGATTGATAGTAAGTGCTTTTGGGCATGTGTAAGACTTTACACATCAATCTCACTGGATAAATCGATTTATTATCATCAATAAATTTAATTATATCTCTTGGTCTTTTGAGAATATGGCTATAGCTTTTTTTAAGATTTCAAGTTCCATTCTAATCTTTTCATTTTCTTTTTTTAACTTAGAAATCTCTTCAACATCTTTTTTGTCTTTTATTTCATTATTTCTAATCTTATTGTTAGTTATTATTGGTTTCTTAGATATTTTCTCTTTTGGCTGAACTTGATTGATCCAGTTATTAAGTGATGTTGTTGAAACGCCATATTCTTTACAGATTTCTTTAATCGGTTTTCCAGTGTTGTAGACCTCAATTATCATTTTCTTAAAATCTTCTGTATAACTTTTCCTTCTCATTCGGACACACCTCTCTTACTTTAATTATAATTTATTTCAAGAATGTGTCCATAAAACTATACTAACATCAATTTGAACCATACCGAAATAATATAAAAATTTACAATTATTTAATTGCAAATGAAGTAGAACATTTTATTTTAAGGCTACCAGTTATATTAGATATTTTACAAAAACAATTTTTAAATCTAATTAATAATAATTTTAATAGTATTGATGATGTAATTCCATTGAATTCGGATATAAAAGTAATAAAGAAAATTAGAAATGAAATTATTCATCATGGTGCTAAATGTATAATAAGAAGCGATGCATCTCAAGTAGTTTTCAATATTCATATTTATCGTCAGATAAATAAACTAAGTTTACCTAATGAATTTCTGATGGTGTGCGGAGGTAATGAGTATTATAGTATTTCAAATTATATGACATGGATGCTTTGCATACTGTTGAACTACTTAGAGAATTTTTTTAATGAAGTGAGTAGATTAAGAGCAAATAAAGAGAGAATTGGTGAAAAAGAAATTTCAGAAATTACTTATACAGATAGATTGCTGGGGCATTCATTTTCTCGAATACAATTTAATTATGATGAACTTAAATTATATCAAAATAATTTAAATGAGTTATTAATTCATATAATTTTGTATGAAAAAGAAATGAAAAATCTTAAGATAAATTAAATAATTTACGAATGTAATGTTAATTAAATAAATACCACAGTATTCAGAAATGAATTTATGGTATTTTTTATTTTATAGAATATGATTGGAAAAGCATGTTACAATAAATATATATATGCAATATTTTGTAAGTAAAATATTAAAAAAGATTTTGAATAGAATACAAATAATCTAGATAATTATTTAATTAAAGGGGACAAAAGCATTTAGTAAGAAATAGTAGTAGAAAAATTTCTTTAAGTTAATGTTTGTGTAAGTATATTCAGAGAATTATGAATATATATTTTATAGTTAACTCTGTAGTAATATAAATTATGAAAAATTAGATTAAATGAAATATAAAATAAGTAGAAAATAGAAATATTATGAAAACAGATAGTTGATTATTTATATGGAGGAAAATATAAAAATGAAATTCAGGGTTATACAGACTTGGGATAATTATAAAAATATAGTTGTGTTAATGGCTAGTAGTTGGGATGATTGGTTTACTTATGAAACAAAATATAGTGTGTATTATTTTGACGAAAAAGGAGTGTCCCATGATATAGGAACAATTAAAGTGGGAAAAAAGCCATATCCTACTAATTCTAAAAAACCTGGTATTCCAGAAGAGTTTGATGAATTGCCAGATGGTTTCTTTTCATTAGGGCAGAGTGAATATTATTATGAAAGATTAAAAGACTTAAATGACAAAATTTATAATGGTTTTAGAATAGATCTATTAGAACGATTGAAAGATATAGCATTTAATGAGGAATTGTTTGAAAAAGTAAAAGATTATAGAGTAACACTTAGTTCTCTCTTAAGAGATATTTCGGCAACTACAGTGAAAGGGCAATTTAGGAGAATAGCTGGAGGTGGAGCTAAGCTTACTCCATATGATTTTAAATATATATCTTCTAATGAAAACGGGGTTACTCCTTTTGAGATTTCTTTTAGTGTAAAACCTAACTCTAAAATACCTACTAATATCCATGTATTAATTGGGCGAAATGGTGTTGGAAAAACGCATTTAATGAGAAATATGATTTATAGTTTAATGGGTGCTTCAGATGACAAAAGATATGGAGAATTCATATTTGATGAAGTTAGTAATCATATTACTTTTGCTAATATAGTGTATGTATCATTTAGTGCCTTTGACAATATTAGTGAATGGTATTCAAGAGATAAGTTTAAAAACTCAATTCCATTTACGCCAATAGGATTAGATTCAAGTTTAGAAGATACCCATTGCATTAATAAGAGTCCATCGACTAAAGAGGAAATAACTAATTTAACATTGGAAGAAAGATTTGCCAATAGCATCGAGATATTCTCAGGAGGATATAAGGTTGAGTTATGGAAAAATGCAATTATATTACTGGAATCAGATCCATTATTTAAAGAATCAGATTTGCTAAGCATTTTTAATGGTGATGGAACAGTAAATAAAGAAGTTGCTAAAAAATTATATCATAAATTAAGTTCTGGTCATAAGATAATAATGCTTACAATAACAAAGTTAGTTGAGAAAGTTGAAGAAAAGACGTTAGTTTTTTTAGATGAACCAGAGGGCCATTTACATCCACCACTACTTGCATCTTTCATTAGAGCTCTATCAGAATTACTTAATAATAGAAATGGAGTTGCTATTATTGCAACTCATTCTCCAGTGGTTTTACAAGAAGTACCTAAGAGATGTGTCTGGAAATTGAGAAGAAATGGACATATAGCTGTAGCGGAAAGACTTGAAATAGAATCTTTTGGACAAAGTGTTGGCTCTTTGACAAGGGAAGTATTTGGATTGGAGGTAACAAATTCAGGTTTTCATAATATTCTTAAAAAAGCTAGTGATATTAATGATGACTTTGATGAAATGATGGAGTATTTTAATTATGAGTTAGGAGTAGAGGCTATGGCCATGATACAAACTATTTTAGCTAATAAGGAATAAGGGGAGAGCTTAATGATAAAAATTGAGAAACCGATGGATGAGGTAGAAGAAGTTTTAGCAAGTTGTACAAGTAATATGCATAATAATAAAAAAAATAATTTTTTAAAAGATAGAGTGCTGCAAAATAAAGATATAATTATAAAGTATACACAAGAATTTGAAAACAAAGTTATACAAAATAAAGTTTATGAGTTAAAAGAACATACGAAAGTAGGAGAAAATGTTGATAAAGAGGAAATGATAAAAATATATGAGAATGGAATGGTTGGAAGTAAATTAGGGAGAATTTATTATGATAAAATTCTTGCGTTAGCTCCAAGGGGTATTTGTCCATTATGTAATAAAAGGGTTTCTAACACGTTAGATCATTATTTGCCTAAAGCAAAATTTCCTACTTTAGCAATATCACCTATAAATTTGGTTCCAGCATGTTCGGATTGTAATAAAGATAAACTGGCCGAGAGTTCTAGCAGTATGGAAACACAACCAATACATCCATACTTTGATAATATTGATAATGAAGAATGGCTTTTTGCAACAATCGAACAGGATGAAAAAATAATGGTTAATTATTATGTAAAAAAACCAGAAAGTTGGGATGAAATATTATATAAAAGAGTTTGTAATCACATGGAAATATTAGGGTTGAATTCATTGTATGGAAAATCAGCTGGTTTAGAAATGGCAGATATGAGATTTTTTTTCAATCAAACTTATAATGTTAATGGTGTTGAAGGAGTAAAAAAAATCATTAGAAGCATGATAACTAGTTTTTCAGTTAATAATAAGAATTCATGGAGAATAGCCCTTTATAGGGAAATGTATAATAACGAATGGTTTTTAAATAAATTTATAGTATAAAAAGTAATTTGGAATTAGACTAGAATTAATTTAATTAAAAGTTTAATGATCTGTAATCTGCAAATGAAAGGGTAGATGAAAACAATGTGTCTAGATAAAGATGAATTTTGTAAAAAATTAATTGAAATACTAAAAAAAAGAACTGCTAGTAATGAAATAGAGTGGCTAGCATTTGCGGATGAATCTAATAAAAATTACCATCTTGAAAATAATATTTTCTCGTATAATGAAAGGGATATTTTGGAGGAATATAAAGATTATAAATTGAAAATTGATGAAAGCTTATATTGTGATATTCAATATGGTAAAAACTTAAATAAGATTATTAGAGTATC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65 | Clostridium_phage(48.84%) | tail,transposase,terminase,plate,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2001929 : 2040703
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LN908213|2001929:2040703|DBSCAN-SWA 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54 | Clostridium_phage(27.27%) | integrase,tail,capsid,transposase,portal | attL 2020886:2020904|attR 2026937:2026955 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2044228 : 2059462
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LN908213|2044228:2059462|DBSCAN-SWA 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16 | Clostridium_phage(72.73%) | tail,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2287625 : 2322069
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LN908213|2287625:2322069|DBSCAN-SWA 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47 | Clostridium_phage(48.0%) | integrase,head,tail,capsid,terminase,plate,portal | attL 2290043:2290058|attR 2308477:2308492 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3090227 : 3099586
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_LN908213|3090227:3099586|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_LN908213|3090227:3099586|3091584_3092034_-|WP_077843016.1|DBSCAN-SWA MIDGVVIKKLNKIPDDRGTILKMQDSTDDEFKGFGEIYFSTIYPNVVKGWHLHKKAVLNYAVIKGMIKLVLYDSRENSSTTNELMEIYMGTENYCLVQIPAGVWNGFRTVGNEYAIVADLITVNHKDDEMLRMDPWESFIKYDWNVRDR >NZ_LN908213|3090227:3099586|3090227_3091580_-|WP_077843015.1|DBSCAN-SWA MSEIFIQDENSIRKEILDKVKDIYKVRKESEKFIEGKTKIHYSGRVFDENEMIAVVDSALDFWLTLGRKSIEFTDAFKNFLGIKNCLVTNSGSSANLIAVSSLCSRQLINPLNDGDEVITTAVTFPTTLNPIIQNNLKPVFVDVEQGTYNIDPKLIEQAITDKTRAIIFAHTLGNPADMDAIMEIAEKNKLYIIEDTCDALGSTYDGIFCGTFGDFSTYSFYAAHHITMGEGGAICTNNPELSRIALSIRDWGRACYCQQDEKNPNGACNHRFDFKFGNMPEGYDHKYIYTNIGYNLKPLDIQCAMGIKQLEKLPVFIQKRKENFKKLYNCLKKYEDKVILPKSYKKADPAWFSFPITVRDNVGFTRRDFVRFLESRGIETRMLFAGNILNQPAYKNINHKIIGELSNSTQVLSSTFFIGVYPGITTEMMDYMISTIEDFFKNIATGLKI >NZ_LN908213|3090227:3099586|3098105_3098681_-|WP_077843022.1|DBSCAN-SWA MGNFNFIETKISGVYVIEPKIFGDNRGYFMETYNRKHFEEVGLNMNFVQDNESRSTKGVLRGLHFQKRHSQGKLIRVSKGEVFDVAVDLRNGSKTYGKWEGIILSEENKKLFYIPEGFAHGFLVLSDEAIFNYKCTDFYAPKYEEGIKWNDPNINIAWPLDKVNNVILSEKDKLNIGINEIDLREYPDYNI >NZ_LN908213|3090227:3099586|3097200_3098082_-|WP_077843032.1|DBSCAN-SWA MKILITGAKGQLGREITEIIKVGRADIGEISESIKIAEVIGFDVDELDITNLVKVKEVLSYLKPEVVINCAAATNVDRCEIDEDFAFRVNSIGPRNLAIACDLIGAKLVQVSTDYVFNENTHKPLKEYDLASPSSVYGKTKFLGEQYVQLLCSKHFIVRTAWLYGYIGSNFVYTIMKLSKEKSHINVVNDQMGNPTYANDLAYHILKLIETDGYGIYHCTNNGECTWYEFAKRIVKLSGEECEVIPCTSEEYKTQAKRPKYSSLDNAMLRNTVGDEMRDWKDAIEAFISKLGK >NZ_LN908213|3090227:3099586|3093116_3094067_-|WP_077843019.1|DBSCAN-SWA MNILITGGFGYLGSYCAEYLSLKGNKVTIIGRKIPKYMEEWTKKFNVVIADIIDEKLFLKLLGNKYDCVIHCAAANEVKCKNSPKESILINTYGTENMLDICTKLGIGRFIYVSTFHVYGSSNIVGTINEKSSIEASTLYGITHYFGELLTKRYSNNSNILGTSIRLANLCTRPLFSEIERWSIVPNNFIVQAFKTNKIIINSSGNQKRNFLSIKDLCSAIDIILEEQKQKYDVFNIGGDSNYSINEVAEIVKSVGEKLLKGKQIEIAHTKKLDQIIEKDDYIFDISKIESIGYKPNCNIEDEIKETFEQFIESEV >NZ_LN908213|3090227:3099586|3098698_3099586_-|WP_077843023.1|DBSCAN-SWA MRGIILAGGSGTRLYPVTKAMSKQMIPIYDKPMIYYPMSVLMLSGIRDILIISTPRDIVSFKELFKDGKDLGLNIQYAVQKNPNGLAEAFIIGEKFIKDDNVAMVLGDNIFYGQGFSDILKKAASLENGAYVFGYYIQNPKAFGVVEFDSNGKVISLEEKPENPKSKYVVPGLYFYDNTVVEKAKKLKPSVRGELEITDLNKAYLEEDSLKVQLLGRGMAWLDTGTHSAMLQASNFVETIQSTQGIYIACLEEIAYCKGWITAEKVLEIAETLKKTGYGRYLIDVVNSVESNTKC >NZ_LN908213|3090227:3099586|3096132_3097182_-|WP_077843021.1|DBSCAN-SWA MKTYLVTGGAGFIGSNFILYMLNKYEDINIINLDKLTYAGNLENLKSIENDKRYEFVQGDICDKELVAILFKKYHINYVVHFAAESHVDRSIKEPEVFAKTNILGTVNILNCAKNAWENDQGFEEGVKFLQVSTDEVYGSLGSKGFFKETTPLDPHSPYSSSKAGADLIVKAYYDTYKMPINITRCSNNYGPFQFPEKLIPLLINNCLNHKRLPVYGDGMNIRDWLFVEDHVKAIDMVINNGRIGEIYNIGGHNERTNIQIVKTVISYINENVDRNVSESLIKYVEDRKGHDRRYGIAPDKIKKELGWYPETAFEIGIKQTIKWYLDNKEWMKNVTSGDYQKYYKNMYK >NZ_LN908213|3090227:3099586|3092154_3092340_+|WP_077843017.1|DBSCAN-SWA MNKARCLVVSDFTAIGGIIIKAGTICEVLNDGEEFIWINPYIKEADEEIPIPILKSHVRFL >NZ_LN908213|3090227:3099586|3095164_3095938_-|WP_077843020.1|DBSCAN-SWA MDVVILCGGKGMRMREYSERIPKPLVTVGDRPIIWHIMKTYYHYGYDHFILCLGYKGELIKQYFANMLILNRNFTITMCDDDYKIKYLDGEKEKWSITLVDTGLEAKTATRLKRVSDYIEGEEFFMTYGDGLSDVNINDLLEYHKNKGTYVTLTGINPVSTFGELKTNNGIVENFEEKPIKDTIINGGYMVINKKALNYIPNEDCMFEQEPLRSLVKDRQVSVFNHYGFWKAVDTAKDVEDINNLYNAGEGKWKIWE >NZ_LN908213|3090227:3099586|3094082_3095174_-|WP_077843031.1|DBSCAN-SWA MGVEDKRLNLDKYKGKKVLVTGHTGFKGSWLCMWLLKAGASVIGVSKDPYTKYDNFVLAKLSNKIVDLRNDIRNLDEMEKIFDKYEPEVVFHLAAQPLVRLSYEMPVETFDINIKGTINILECIRKSKSVKAGIIITSDKCYENINQIWGYKETDRLGGYDPYSCSKACAELVTGSYINCFFNPNECKEHGKFIATVRAGNVIGGGDWSKDRIIPDIIRSLQNKVPIVIRNPIAIRPWQHVLEPLRGYLMLGTHLISHESEFIGAWNFGPNSNDILTVKDIVSRTIKLWGEGDFIISQNNGPHEAELLSIDCTKAKRYIKWNPILGIDEALKMTVEWYKGYKNSDVYELCMKQIETIENKSFE >NZ_LN908213|3090227:3099586|3092386_3093115_-|WP_077843018.1|DBSCAN-SWA MKNKTVIITSMFNVKPYIQNGRDRYTKEWINYRIKVFQEFTLRSLKLQTNQDFNFFLCYEDATDELIKSALNKYEPLPSNVHFVMKSKYREEIKEYLKDYKYVYFVRLDSDDAYHKTFIQQLYDYNPKPETVSLINRSGYIYDSVNKSIGKCYCKVVTFYTFIYKTQDYLNGKIYNQDFTDIDNEQYIAIRVPHEFIEKRNYLWHVHGKNTITSFNNWFTQVDDATDDIEVVNKIIPEYIGE |
11 | Escherichia_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3152278 : 3161407
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_LN908213|3152278:3161407|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_LN908213|3152278:3161407|3156964_3157183_+|WP_041896900.1|DBSCAN-SWA MEYSLSMIFLTTSGEKSTLSVSGVKPTLTKDEVNALMETVITKNIFKTNSGDLVKKSGAQVTQRQVTKFDVA >NZ_LN908213|3152278:3161407|3156503_3156728_+|WP_077841457.1|DBSCAN-SWA MAVTKTIDSVSLSIEVQKGLDKSGDPIYTKKTFSGIKTDATPDNVYAVADAIKGVMEANTRDYFINESSSLANA >NZ_LN908213|3152278:3161407|3157750_3157993_-|WP_077841456.1|DBSCAN-SWA MKSSGIVRKLDPLGRIVIPKEIRKVLGIDEGDSMEIIKVDNGVVVRKYIKGCIFCGSDKDVVEFNGAVVCDGCRKALGQM >NZ_LN908213|3152278:3161407|3160554_3160779_-|WP_041896890.1|DBSCAN-SWA MYSKLKGIMVEKRITQQELAEKLKITASALNYKVNGKSDFSVTEAKFISDFLGKTIEELFIIDDFNNMKTDKNA >NZ_LN908213|3152278:3161407|3161032_3161407_+|WP_041896888.1|DBSCAN-SWA MSKFPTRLKELREEKGLLGKDFAKIMSVEPATVTNWEKGNRFPKDDVLIKIADYFDCSTDYLLGRTDDKLAKVYSGTLHNQTIEIEIDKGYPHELTPEDVQNILKQLDAVGLDVNKLIENFKNK >NZ_LN908213|3152278:3161407|3160216_3160438_-|WP_077843292.1|DBSCAN-SWA MEPVLYTVYEATELLKVNKNSVYDLLRNNVIRGLKLGSLKITRTELMKFLEENNDKDLSNLDDIKDLTFGKDV >NZ_LN908213|3152278:3161407|3152278_3155911_-|WP_077841459.1|DBSCAN-SWA MGIKKLMIGQKLFLGFGIVILIMLVVIGNSYMNFIKESESVEWSVHTYGVIRESDELLNSIINMETGARGYVITGDKSFLEPFNQGESSYEQQYNKLKGLTVDNLDQQQRLIALDKQYREWLNWEKTKIITNRQKVTEGRSELQEVIAIVQSGEGKTMMGNMRLILGEINSEEERLLQNRNTNLVKMENETKTIMLAGGITATVVAAIIASLVVRMILKPVKVVTNTFKEIAEENVNLEARLEINSKDELGDMAKYFNIFMTKLKDLIIENRNQSWLSAGRAELSEELRGIEDINELSLQIISYISKYVDAQIGRIYILTGENKYKLYGGYADKTNGELPDEFNCGEGLVGQSALERKSILIKNVPENYMKITSGVGEAIPRNILVIPCIYHNEVECIVELGAFNEFTDVQLKFMEQVNENIAISINLTKAQLKMKELLNKTLVQAEELQVQQEELRQNNEELEEQAIILKHSEMNLQTQQEELKVSNEELQEQARELEIQKKVISESNEKLRKANSEIKKKAEDLKLANQYKSEFLANMSHELRTPLNSILVLSQLLENNKDSEILTDKQHEYARTIHSSGENLLRLINDILDLSKVEAGKMDINFEEVYLIELAEDIKRLFNPISLQKGLAFEVRIEEGIPEKIVSDRQRLQQIISNLLANAFKFTSEGLIRMNICKTKEHDIEYFDIKGAPSNLISIEVTDTGIGIPEDKQKLIFEEFKQVDGTISRKFGGTGLGLSISKELAHLLGGTIYLKSKEGMGSTFTLVISSYSSDNIDLKQLEGESYSIKNSNKETNITVNDENSSMVSEINYEEIKRKSERLLLIIEDDKQFLGILSELAEKKGYKVLSVNNGEEGIKLAERYKPDAILLDIGLPDISGWMVADKLKSMEVTMNIPIHVISGRDDMVSVERKKNLVEWIKKPANLKEIDNLFNNIEVNIPKKLKKLLIIDENSEEVNSIYNNLSEKGFEVTLLDNGLHAYNLMKTEKYDCLILDLKLKDMTGIEFLEKLEKENSINFPILIHTKEDITQDYEAKLKKYVDNIIIKGKRSVDRLIDEASLFFNNVDLKLEDKKIQDIKYNHELESSLINKKVLIIDDDMRNVFSLSSALQEKGISVIVGRNGAEGIEKLHENLDIDLIIMDVMMPEMDGYTAMKKIRKEPKLQNIPIIAVTAKAMKDDRQKCIEAGANDYLTKPIEIDRLISLLRVWLYK >NZ_LN908213|3152278:3161407|3158100_3158727_-|WP_012058443.1|DBSCAN-SWA MQPLAVACECRKIEKLKNEWKYSGINVEQSKLTFSSFEVWNNASQRMKDTAAAYCTDFDEIKDNRRNSILLCGQVGSGKTHCSIAVALNFLKQRIKVVYMPYRDVITKVKQNMIDEEYYTRTISKYQLCEVLLIDDLFKGKINETDTNIMFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIDRLLTFDEGVASRIYEMSKDYVVEIEKDISNNYRLK >NZ_LN908213|3152278:3161407|3158776_3160081_-|WP_077853753.1|DBSCAN-SWA MADIKWIKLATNMHDDEKMKLIDAMPNRDTIHYVWIRILLLGGKLNANGKVFLSEEKPLTAKMLAVLFSRPLEDIKIALKVLSNFGMIEIDSNKVIRIVNWDKHQNIEGMERVREQNRKRVENHREKKKEEKNAAKSNKEETQEDQILEEHIDLETNQDLNENVELEERNNLERKKDYSRNSSIEENKALGKNDILENWGVREEISEDTAIDDKSNTVTNTANIISIMETSDNNCTVTKNTSNVTVTQQNKKEIENKKKNKKEKKEIDKYKNIEGKKNTGFDINNKGSAYDEEVSQSNLFKKHNNTKSESGEEEDINLKALELMHYHEKITGKPGGCDYVALRSAIDIHGEKMVKMAMDVGFEKNCPDIKYAIGVLKNWRRDGYPEDNMEVKKNGVRSNRKSNTADKNEFAGFKPKEPRKLTEAERKRIEENLI |
9 | Paenibacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3629162 : 3635746
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_LN908213|3629162:3635746|DBSCAN-SWA TTCATTCTTCTTTTAATGCTTTTTCGCATTCCCTACAAATAAGCGAATTTCTGAATTCCATCACATCCTTATTATTTCCACAAAAGATACATCCTCTATTGTATTTCCTTACAGCTATTTCATTATTAACTTGGATTATTTCCATAGGATCTCCATAGTTAATTTTCATTACTGACCTTATTTCTTTTGGTATTACAAGTCTTCCCACATTATCAAGCTTTCTTACTATTCCTGATGTTTTCATGTCAAATAACTTCCCTTCATACTTTAATTTAGTTTAAAAATACATTATCATCTTTTATTTAAGTCTGTAGTTATTTCTAATATCTTTTTCAATTTCTACAGCATAATCCTTGCACATTTCATATATACGAGAGCCTACTCCTTCATCAAATGCTAATAGTCTATCGATTGTAAATTCACTACTAACTATCACTGGTAAAAAATTCAAATATCTATAATTAATAATCTCAAATATTATATTGACATCACTTTCGTTAATTTTCCCCTTAAAGAGATCATCAATAAGTAGCACTTCACATAACTGGTACTTTGAAATAGCTTTACTGTAGTATTCTTGATCAATCATATTTTGCTTTATCTTTGTAATCACATCGCGATAAGGCATATACACCACTTTGATTTTTTGTTTTAAAAAATTTAATGCAACTGCAACACTTATATGGCTTTTCCCACTACCAACTTGACCACATAATAACAGGCTATTTCTTCTCTTATTTCTAATCTCATCAAATTCTGTACAATAAGCTGCTGCTGTGTCCTTTACTCTGCTAGCCGCTTCATTCCACTCTTCAAAATTAGAAAACGTGAGCTTACTCTGCTCAACATTAATTCCTGAATACTTCCACTCACTTTTTAGTTTTTCTATTTTTCTACAATTACAACTTATAGCAAGAGGCTGCCTATTATCCTGTGGTATTAGCAACCATCCTGTATCACGGCATTTATCGCATTTATATAAGATTTGACTCTGCCTTTTTTCGTTGAATTTCTGTAAGTTTTCGTGGTTCCTTTGGCTTGAATCCTGTAAATTCATTTTTATCTGCTTTGTTACTCTTTCCAGCGCTTCTAAATCCATTTTCCCTTACCTCCATATTATCTTCAGGATACCCTTCTCTTCTCCAATTACTCAGTATTCCATTTATATAATCCATCTCTGCTTTGCCTACTTTTATTGCCGCATCAATAGCCATTTTCACATGTGACTCACCATGCATAGCAATAGCCCCTCTAAGCTTTCCATGTTCTAATCCTCCAATTCTGCATGTCACAGATTCATGATATTTAGAAAGTCTTTCACATCCATTGCTTAAATTTAACGCAAAATCCTTGATTTCATATTTTTCTAAAATTTGATCTTTATTATTACTTACACCATCCATCTTTCTTTCTGTATTCTGTTTGATAAGAGTGATGGATGAATTCAAAGCTTCATCTTCCTCACTCTCAATATCTTTATCTTCCTTCTTAGTCTTTTTCTTGTTCTTTATCTTATCTGTTACAGTAACGTTACTACACGTTACTTCATTGTTACATGTAACATTAATTTTCAAACCTTTCGTATTACATGAATCGTTTTTATTTGAATGTATATCAGAATAATCTTCATCTCTATTTTTTCTTGTCGTATTAGATATTTCTTCATTTGTAACTTCATTCTCGCTAGTGGTATCTTCTACTTTTGTTTCATTTACATTATTATTGATATTTTCAAATTCATCCCCATCACTATTTCCCATATTATTATCTTGATTCATTTCCTTAAATTTTTCGCTTTTAATTTTAGCCCTATGTTTAGCAACTCTATTATTTCTGTCTATTCTTATTTTCTCTAAAGCATCGATATTCTGATGTTTTGTCCAATTCTTTACTCTAAAAAATTTATCTTCTGTGTATTCAATCATTTGAAGTTTTTTTAGTACTTTAATTGCATACTTTACATCATCGATTGACCTATTAAATTCTATGGCAAGAGTCTTTATTGTATAAGGCATATCTTTATTAATATATAAATATCCATTATCATTAACTGCTCCAGCAAGTGTCATACATCTAAACCAAACATAATGAATAGTATCATTCTTATCATAAGTATCAATTATCTTTGATTTCGGTCCATTAAACATATTAACTTCTACTTTTATCCATATATTCTCATACATAACGATTTCTCTCCCACTCATAGAATTTTTTGAATAATAATAATCCTTCAAAAGTTGGCGTAACTTTTATTTCGTTACATACCCATATATAATATTTGAAAATTTTAAAATCCAATAAGTTACGCCACCCTTCTTTATTGTTAATTTTATTTTAAATCTTGAAAAGTTAATTCACGTATTTTTTCTTTACTTGTATTTATAGAATTAGCACTCTCTAAAACTATAGGAGTTCTTTTACTATTATTCTTAAAAAGATCAAGAAGTTTATTAAATATTATTTCTTCTTCGTTCATCCCTTTCTCCCTCACATGCCATTTCAATTTCTTCAATGCTTTTTCTATGAATCTCACTCAAATTTTCTATCTTTAGCATGCTTAGTTTATATACATCGTTTTCAAAGTCGTTAAACTGTGCTTTATTTATATAAAGCTTTTCTGAAAATTTATATGCTTTTATACCATTTTCTTCTCTCAATTGTTTTAAATCCATTCCAATTTCCCCCTTTATTTAATTGTAAATTTATACCACTTATTTGTAAATAGTTTTTTTCTATAAATTTCAATTTTGAAGTATAATTTTCAATTTTGAAAATTCCAAAAAACACCTATATAACTTCAATTAACACTTTTATCTTAAAATGTTGCATTTTATAACATTATTCATGTAAAATGTTACTTTTCCTGACATTATATCCGATATACAATTTATATTTCAATTATTTGAAATAATAATTTACAAATCTGCAAAGTTGCTTTATAATAAATTATACGAATATCGGATAATTTATACTCTATCCATTTAACTAATTCAAAGTAAAAACTTAACCAAGCCATAAATTTTCACCTTAAAAGGTATTTGGTCTTAAGGCAAGATGAATTAAACCTGCTTATAATTTTAATTTATACTTATAAAGCAAAGGAGACATATATATATGTTTAGTGATCGTTTGGAAAAATATAGAAGCGGACTATATTTAAAAAGAAAAGAAATGGCTGATAAATTACAAGTAAGCGAAAGTTACTACAGTTTAATAGAAAGCGGTAAGAGATCTCCTTCAAAGAATTTTATAGAAAAGCTAGTAGTAGTAAGTGAATTACCTGAGGAATATTGGATATACGGAATAAATCAAGAAGATTATATAAATACTAGAGATGAATTTAAATCTTTAAAAAAAGCTTTAGATACTATTTTGGATCTTGGCTATTTTAATAATGTTAATGAAATTTTTGATGAAAATAATGATCCCAAAGATTCGCTTGGTAGATTATTGATATCGGCTCTTAAAGCGGATATCAGCTGTATGATCGAAAAAAGAAAAGGAAATTGACAAGTTCGATACTTTCTTCTTGTCGATTTCCTTATATCTTTTAATTCTCTATATTTTAAATATTGATACTGCTTCTAATAATTTATCTGCACATTCTTTTGTCTTATGTGTTTGTTCTACAACTTCTTCTGTTAAATTAACTACCTCATTTGACTTATTTGCAATTAAAGTTGTTCCTGTAGCACCTTCATTAGTTGCCTCTGCAACTTCATTTATAGCTGTTATAATATCTTCTGTGGAATTAATCAATTCATCTGATATTTCACCTATAGTACTAACTAATTCATTAAATACAATAGCATCATTTCTATATTGTTCCCCTGTGTCTACAAGTTTGTCATAGTCTTTCATCACTTGAGTTCCAATAAAATTAATAACTTCATTTGATGTTCCTTTAAGGTCATTGACAGCCATAACAACCTCTTTATTTATCTGCTGTATCTCCATTGTCGTTTCTTTTGAGTTTTCCGCAAGTTTTCTTATTTCATCTGCTACAACAGCAAATCCTTTGCCAGCTTCTCCTGCCCTTGCTGATTCTATAGCTGCATTTAATGCTAATAGATTAGTTTGCTCTGTTATTTCTAATATACTGGCTGTTAATTCATTTATTTTATCTACTGCTTTAGATTTCTCCACTGCAACTCTTAAGCTTTCTTGCATTTTTGAAGTTATGCTGCTAGATTGCTCCCTTGATTGCAACGCATCAGATTTAAGTTTTTTAGCCCTTTCTTCAATTTCCTTTGCAGTTATCTCTCCACTTTCAACACTTGATTCCATAGTCTTTATTATGGATTTCATATTTGCTGATGAAGCATTTACTTCCTCTGTAGATGCTGCCGTTTCCTCCATACTTGCAGATAACTCCTCGGTTGTAGCTGATACATCTGAAATTTGGTTATTTAAGTCTACTATATTCTCTTGTGTAAAGTTTATTGAATTTAGAACCACATTGCATTCACCTTTAACACCAGATATTATATTTCTTAATGATTTTTGCATCTCATTTATAGACTTAAACATTTTTCCTATTTCGTCTTCTCTGTCCACATATTTTTTGTCAACCTCTACTGTAAGATCTCCTTTAGCCAGTAACTCCATTTGCTCTTCTGCGTATCTTATTCCTTTTGTCATTCTTTTAATTACAATATGTATTACAGCTATAACAATTAATAATGATACAACTGCTGAAATTAAAATAACATTAAATATTTTATTATAGCTTTCTAATGTTTTCTCTTTTGGAATTTGGCTGCATAGTATCCAATTAGTCTTTGTATTTTCTAAGTTAACTGGATATGCTACCATTAAAACTTCCTGTCCTTTTTTTACTGAAGTTCCATAAGTATAAAATTCTTTACCTTGTGAAGTTTCACTTATAACTTTCGCCCAAGCTGCATTATTTTGTTTTGCATCTTTCATCTTTAGGCTTGGATCTTCACCACTTGCTACATAAATACCTTGATTAGATATTAGTTCAACTGTGCCTCCGAGTGGCGTTTTTTCCAATATAAATTTTTCTAATGTATCAAGTTTATAATCTATTGATATTACTCCTAAAAACTTTCCGCTATCATCTACTATAGGCATAGCTAAAGATACCATTGAGATATCTTGTCCATTAACATTATAAACTGTTGGTTCTGTAATATAAGTTCCTTTTAGTTCTTTTGGCTTATTGTACCATGTCATATCTGTCTGATCATCATACGCTGATAATACTACTATTTGATCTCCATCTCTACTTGCATATGGTATAAACTTTCCATCCTCTGCAAACTCTTTTCGCCCTTTATAGTAATCATCTTTTCCATCAAACGCATTAGCCTCAAATGCAACTGTAACACCAAAAATTTCAGGATCTGTCTTTAATATTTCTTTTTGCATTTCAATAACAAGATCCCTGTTCTGTGAATTAAGCTTAATTTCATTGGTTAGTGAACCCCTTAAATCCTTACCTATTGTTTCTAACTTTTCAAAGTTAGATGTAATCTGTTCTGCATAAGATGAAGATACTTCTTTTGCTAAAGTTTCACTATCCATTATGCTTTTAGACTTTATTTGTACTAATATACTTGCGAACACTGCTATATAACACACAAAAATTATTGATCCTATTATTATACTTATTTTTGTCCCTAAATTAAACTTTTTAATCATGCAACGGTCCCCCTTATGTTCTAATCTATTGCAACAATATAATTAATTATAGCATTAATTTGTCATATCTTGTAGTTTATTAACACAATTCTAACAGTTTTATACTGATTAGTATAATTATACTGTGTATCCTGAGATTTTTTTACGTATCTATATTTTCGAAAGCACATATAAAAAATCTACACATCAGAAATGACAGCTATGCTACATATAAAAACATTTTATGCAAACGGATATATTTTATTTCATAGAAACAAAAAAGTCTAACCCTATGACCATAAATTACTAGGTTAGACTCGCATTAGTTTAATTCTAATTTTATAAAAAAATTTATTCAGAAGGTTTAGTTACATGCACTGTTCCACGTGGATGCTTAGGTGGCGCATAAATAGAGTATACTTTAAGTGGTTTGTTCCCTGTGTTAATAACATTGTGCCAAGTACCAGCAGGGATAATGATTGCAAAGTCATTACGGGCATTTGCTTGAAACTCTAGATTATCTTTGCTTTTTCCCATTTTAACAATCGCTTGTCCATCTTCAATACGTATGAACTGATCAGTGTCTGGATGAATTTCTAGGCCTATATCATCTCCTACATTTATGCTCATTAATGTAACTTGAAAATGCTCTCCTGTCCATAAAGCAGTACGAAAATTTGTATTTTGCTTTGTAGCTTTATCAATATTAACTACCAAAGGTTGTGGTCCATAGTCTTTCAGATCCATTTTGCTATTTCCATTTTCTGATTGTGGAATATCAGCCCTATAATCGCACTCCGTTTCATCAAATAACATAGAATATGGAACAGACCTGAAATTAGAATTCTGGTATGTCCAATTATTATTGTATCTGTCCTCTAAGTTATAATCTGATGTTTCAGATGAATAATCTGCTGAATACATTCTGTCATTATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_LN908213|3629162:3635746|3635158_3635746_-|WP_077844258.1|DBSCAN-SWA MNNDRMYSADYSSETSDYNLEDRYNNNWTYQNSNFRSVPYSMLFDETECDYRADIPQSENGNSKMDLKDYGPQPLVVNIDKATKQNTNFRTALWTGEHFQVTLMSINVGDDIGLEIHPDTDQFIRIEDGQAIVKMGKSKDNLEFQANARNDFAIIIPAGTWHNVINTGNKPLKVYSIYAPPKHPRGTVHVTKPSE >NZ_LN908213|3629162:3635746|3632719_3634828_-|WP_077853659.1|DBSCAN-SWA MIKKFNLGTKISIIIGSIIFVCYIAVFASILVQIKSKSIMDSETLAKEVSSSYAEQITSNFEKLETIGKDLRGSLTNEIKLNSQNRDLVIEMQKEILKTDPEIFGVTVAFEANAFDGKDDYYKGRKEFAEDGKFIPYASRDGDQIVVLSAYDDQTDMTWYNKPKELKGTYITEPTVYNVNGQDISMVSLAMPIVDDSGKFLGVISIDYKLDTLEKFILEKTPLGGTVELISNQGIYVASGEDPSLKMKDAKQNNAAWAKVISETSQGKEFYTYGTSVKKGQEVLMVAYPVNLENTKTNWILCSQIPKEKTLESYNKIFNVILISAVVSLLIVIAVIHIVIKRMTKGIRYAEEQMELLAKGDLTVEVDKKYVDREDEIGKMFKSINEMQKSLRNIISGVKGECNVVLNSINFTQENIVDLNNQISDVSATTEELSASMEETAASTEEVNASSANMKSIIKTMESSVESGEITAKEIEERAKKLKSDALQSREQSSSITSKMQESLRVAVEKSKAVDKINELTASILEITEQTNLLALNAAIESARAGEAGKGFAVVADEIRKLAENSKETTMEIQQINKEVVMAVNDLKGTSNEVINFIGTQVMKDYDKLVDTGEQYRNDAIVFNELVSTIGEISDELINSTEDIITAINEVAEATNEGATGTTLIANKSNEVVNLTEEVVEQTHKTKECADKLLEAVSIFKI >NZ_LN908213|3629162:3635746|3629162_3629405_-|WP_077844253.1|DBSCAN-SWA MKTSGIVRKLDNVGRLVIPKEIRSVMKINYGDPMEIIQVNNEIAVRKYNRGCIFCGNNKDVMEFRNSLICRECEKALKEE >NZ_LN908213|3629162:3635746|3631611_3631833_-|WP_077844255.1|DBSCAN-SWA MDLKQLREENGIKAYKFSEKLYINKAQFNDFENDVYKLSMLKIENLSEIHRKSIEEIEMACEGERDERRRNNI >NZ_LN908213|3629162:3635746|3632275_3632671_+|WP_077844256.1|DBSCAN-SWA MFSDRLEKYRSGLYLKRKEMADKLQVSESYYSLIESGKRSPSKNFIEKLVVVSELPEEYWIYGINQEDYINTRDEFKSLKKALDTILDLGYFNNVNEIFDENNDPKDSLGRLLISALKADISCMIEKRKGN >NZ_LN908213|3629162:3635746|3629459_3630260_-|WP_173706808.1|DBSCAN-SWA MDLEALERVTKQIKMNLQDSSQRNHENLQKFNEKRQSQILYKCDKCRDTGWLLIPQDNRQPLAISCNCRKIEKLKSEWKYSGINVEQSKLTFSNFEEWNEAASRVKDTAAAYCTEFDEIRNKRRNSLLLCGQVGSGKSHISVAVALNFLKQKIKVVYMPYRDVITKIKQNMIDQEYYSKAISKYQLCEVLLIDDLFKGKINESDVNIIFEIINYRYLNFLPVIVSSEFTIDRLLAFDEGVGSRIYEMCKDYAVEIEKDIRNNYRLK >NZ_LN908213|3629162:3635746|3631490_3631637_-|WP_162680627.1|DBSCAN-SWA MNEEEIIFNKLLDLFKNNSKRTPIVLESANSINTSKEKIRELTFQDLK |
7 | Clostridium_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
3974815 : 3991792
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_LN908213|3974815:3991792|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_LN908213|3974815:3991792|3984356_3984827_+|WP_023973793.1|DBSCAN-SWA MFNAELLSSLIKEAQGDISLNNFASQCKISSSTLSRIINNKNSCPPAPSTLQKIASVAHNGVTYADLMAAAGYINDGETPVEIPDATNTVLSKKDERDIAKRIEALKEDLLNGEGLMLSGNPMSPEAIESLIEALSSGIRQAKIANKKYTPNKYKK >NZ_LN908213|3974815:3991792|3979001_3979244_-|WP_077844476.1|DBSCAN-SWA MKASGIVRKLDPLGRIVIPKEIRKVLGINDGDSMEIIKVDNEVVVRKYIKGCIFCGSDKGISKFRDALVCDECKKALGQE >NZ_LN908213|3974815:3991792|3981629_3982400_-|WP_077844474.1|DBSCAN-SWA MATNSSLKNQLIEKEQSTVNVQETIFKNLINSDDVKSKFTEVLKDKAFEYINSIINLVKETPAPNAIGASDSHQSADLGSLLIECEPRSIIDACMIAVSLDLSIDKNLEYVWIIPYKKKSNFQLGYKGYIQLLLRTGEYKAINVIEVYEGQLKSWNPLTEEFDIDVSAKKSDAVIGYAGYFEMVNGFRKYVYWSKDNMDAFRNNSFKGDPRWNNDYKAMVKRTVMRNMLSKWGRLSAEMQKAYLEDINTDKFIQGN >NZ_LN908213|3974815:3991792|3979323_3979500_-|WP_162680634.1|DBSCAN-SWA MDKKAIEEIINENIKLTGENIKLGYENLVLKKKIKILEEKTRVIQGKKSSQYIVVMMA >NZ_LN908213|3974815:3991792|3983926_3984139_-|WP_077844472.1|DBSCAN-SWA MNTTKESVKKFVDEQFDGNFNKCARNLDLAPSTIWRIANGNGKAGIKVITNIIKYCDDKKINYRKYIFLR >NZ_LN908213|3974815:3991792|3977924_3978491_-|WP_077844478.1|DBSCAN-SWA MKVLGINGSSRKDGNTALIMKIVFDELEKEGIETEIVQFSGNIIEPCKGCFACKGKNNCVFKKDMFYECFEKMKLADGIVLGSPVYSADVTANMKAFLERAGVVVATNPGLLKHKVGASISAVRRGGGLTAVDTMNHFLLNKEVIIAGSTYWNMVYGKDVGDIFKDEEGINNMHNLGQNMAWLLKKIN >NZ_LN908213|3974815:3991792|3982459_3983374_-|WP_077844473.1|DBSCAN-SWA MDKLQWLKERQKGIGGSDVGAIMGVNRWKSPFEVYVDKTEEIREVKESGESSYFGNTLEEVVAREFSIRSGKKVRKDKRQLVHKTHEFMMGNIDRRIVGENSLLECTTVNAFRAKEWDGEEIPPSHILQCQHYMEVLGADTCYIAALIGGQRFVYKEIKRDEELISMIVEAEKDFWINHVQKRIPPKLDGSEAASKYLSKTFKCIDKTLEVNLKEEYKDKINEYLNIKNQMKILDESLKVIENNLKNQLGNAEKGIVEKFQVIWKGVTSNRIDSRVLKEKYPEIYKEVCKQSMSRRFEIKEISS >NZ_LN908213|3974815:3991792|3979891_3980539_-|WP_077844487.1|DBSCAN-SWA MLIPQENRQSLAVSCECREIEKVKNEWKHSGINVEMTKHTFANFNVWNRASQRAKDTSAAYCTDFDEIRNSRRNSILLCGQVGSGKTHLSVAIGLNLLKQKIKVVYMPYRDVITKIKQNILDQEYYVKTISKYKLCEVLLIDDLFKGKINESDINIVFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIERLLNFDEAVGSRIYEMSKDYVVEIEKDIHNNFRLK >NZ_LN908213|3974815:3991792|3985492_3985822_+|WP_077844471.1|DBSCAN-SWA MIFRNVMSIVSSLISLIYGFSILLILDMINHKVNCTPIFKYPSNKSILIFLISFAIYTLSVFLLSLAARLDSKKQRIRFILVNVISFAMGLILFIWIGVIFFINTDSGP >NZ_LN908213|3974815:3991792|3984978_3985422_+|WP_031275648.1|DBSCAN-SWA MHFIEGLFSKLVKKYNTTDVYELCKLEKITYRELDLHPEINGIYQYVMRNRIITINQNLSPECKRITCEHELGHAILHKKYNCTYLKTKTFFNVNKFEKEADIFSSLFEIPFISKDILIGKTLDEVARELNVSRYLLDLRIGICNFD >NZ_LN908213|3974815:3991792|3980567_3981554_-|WP_077844475.1|DBSCAN-SWA MSDIKWIKLSTNMHDDEKMKLVDAMPERDTIHYLWIRLLIQAGKTNANGLIYLNENIPYTDEMLSTIFSRPLASIRLALKVLSDFQMIEIAENNVIRIVNWERHQNVEGMDRVRDQNRKRVQNHREKKKQLEAVVNESEETSVEIEEHRCAENKEYSIEVTNDICDITKKSCNVTDDKSNVTVTVQNKRENKNKIKNENNKDREIKKEEDINSKSIELAKYCELIAGIPNVLNLGALKLAIGVHGQEYAKMAIDIALKANKPNMTYIDGILKNWRREGYPDDKEVKKNVNRGYGKNSNPDKNKFAGFKPKEPRSLTDEQRKKAEKSLI >NZ_LN908213|3974815:3991792|3978530_3978857_-|WP_077844477.1|DBSCAN-SWA MNKTVKVIIDRPLGSYHPKHKNIYYSVNYGYVPGIIAPDGEEQDAYVLGINKPIKEFTGEVVAIIHRNDDIEEKWVVVPQGMKITKAEIQEQVHFQEKYFESLIEMLI >NZ_LN908213|3974815:3991792|3976909_3977662_-|WP_173706812.1|DBSCAN-SWA MESLRIFKDERFGEIRWLKINNKDYAVGIDIAKALGYKNPRDAILRHCKGVVKHDIGVVTGKRRDGTDVIQNIEMSVIHEGDIYRLAAKSELPGAEKFEAWIFDEVLPSIRKTGMYATDELLDNPDLLIAAATKLKEERKARLEAENKVRLLEPKGQFYDDVAGSKDSIEVGHVAKVLAIRGMGRNNLFSLLREKKVLDKNNIPYQQFVDLGYFRVLEQKYTVPSGETKINIKTMVFQKGIEFIRRKIGE >NZ_LN908213|3974815:3991792|3985873_3986257_+|WP_077844470.1|DBSCAN-SWA MNNIKDHILQLEQELLKSEVRKSADKINDMLSDDFIEFTSSGNEYHYKNGDVFQEQNNPQTLYGEISNFKIKELADDCILAMYKIIKLNELDENKKYSLRSSIWKCFDGKWKMIFHQGTLSSKSEII >NZ_LN908213|3974815:3991792|3987451_3991792_-|WP_077844469.1|DBSCAN-SWA MKRINEAFSDYESAGSINTAVIQSVVLRKKTKVLEMEISSDNYIELGEIESFNSFIKDKFGLNDSKIIVKYSDEVEIRPIEKELKNIVYSLSMKYPALKAAVNNSDYEIEGNTINFNFKIPVSGFLKTMEYDKQINKAIKHMYGKHYNINFIDQIDSEELVKIAEDKRANEMKVIKEIKINQSNNPPELPKAEEGKQEVKAEGDGKKASNPFLILGRNANIKENIIKINDITPDEGRVALEGEISNLEAKELRSGKMLISFDLYDGSNSMTCKIFAKPTEYDEVFSRIKKAKGLRLAGNAGYSNFSHEVELIANTVIETNGIKKYKRQDNSEVKRVELHMHTQMSQMDAMSSASDLIKRAMSWGMKSIAITDHGVVQSFPEAHKLLGRDNPDMKVIYGVEAYLAPDKKPSVTNVREESIDTVYCVLDLETTGFSPQTEKITEIGVMKIKDGKVIDKFSTFVNPQKSIPMRVVEVTKITDDMVKNAETIDKVFPKLLEFIEGSVLVAHNADFDIGFLKHNAKVLGYEFDFTYIDTLGLAQDVFPDYKSYKLGRIAKNLGIKVEVAHRALDDVDTTVKVFNIMIEKLKERGAQTLSDIDLYAADEEAKKVAYKKVKTHHAIILAKNYVGLKNLYKLVSYSHLDYFYKKPRILKSMFKKYSEGLIIGSACSEGELYQAILLGKPEEQIEEIANFYDYLEIQPLGNNDYLVRQEQVPSKEYLKEINKKIVELAERLGKPVVATGDVHFLDPEDEIYRRILEAGQGFKDADNQAPLYLRTTEEMLDEFSYLGRTKAYEVVVTNTNIVADMCEQISPISPEKCPPHIEGCEQTIKDIAYEKAHELYGDPLPEIVQARLDKELDSIIKNGFSVMYIIAQKLVWKSNEDGYLVGSRGSVGSSFVANMTGITEVNALPPHYRCPKCKYSDFEDYGVLNGFDLPDKVCPVCGEKLHKDGIDIPFETFLGFNGDKEPDIDLNFSGEYQAKAHRYTEVIFGKGTTFKAGTIGTIAEKTAFGYVKKYYEEKNLPINKAETMRISVGCTGIKRTTGQHPGGIIVVPKGREIFEFCPVQHPADDPNSDIITTHFDYHSIDQNLLKLDILGHDDPTVIRMLQDITGVDPHEIPMDDKDTMSLFFSTKALGVTPQQINSEVGTFGIPEFGTKFVRGMLVDTKPKTFSDLLCISGLSHGTDVWLGNAKDLIDNGVITSISDAVCTRDDIMVYLIRKGLPPNTAFKIMETVRKGKALKEPKFPEYEAMMREHDVPEWYIESCKKIKYMFPKAHAAAYVMMAFRIAWFKVHIPQAYYATYFTIRAKAFDAEFMIFGKEKVKAKMQEIQALGNDAGPKDKDMYDDLEIVLEMYERGFKFLPIDLYKSSATKFQLEEDGIRPPINSIAGMGNVAAEGIASAAKEKEFNSVDDVKKRSKIGNAAIELLRKFDCLNGLPESDQMSFFDAV >NZ_LN908213|3974815:3991792|3974815_3976030_-|WP_077844479.1|DBSCAN-SWA MSKVLFLSIPAHGHINPTLGLVNELVKQGEEITYFCSEDFKEKIEKTGAKFKSYRVELSLFKRKHKTSSDMGADKLLDYINETLKSSDKIIKDILNQIEGKKFDYIMYTAMFPFGSIIAQILKIPSVSSFAVFATPKELRSQHKELMNENLIKNHPVIETYKKVSRQIKEEFNVEMSHNIFDLFFNKGDINIAYTSKYFVAHPEYYDDSFKFIGPPIYDRKENLDFPFEKLEGRKVVYISLGTVFNNTDSNLYDIFFKTFGNTDEVVVMAAYNVDLSEFDIPNNFIVRNYVPQSEVLKYTDVAITHAGMNSTSDLLYNNVPFVAIPIGADQPYMAKRAEELGATISLDKDNINQEILRKSVEKVLTDPSYLENMKKISDSFKESGGYKKAVEEIFKLKREKIYH |
16 | Clostridium_phage(30.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
4189892 : 4281493
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_LN908213|4189892:4281493|DBSCAN-SWA 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89 | Clostridium_phage(60.0%) | tRNA,tail,transposase,terminase,plate,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
4510389 : 4543854
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_LN908213|4510389:4543854|DBSCAN-SWA 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34 | Planktothrix_phage(37.5%) | transposase,integrase | attL 4506010:4506026|attR 4553701:4553717 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
4567403 : 4577930
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_LN908213|4567403:4577930|DBSCAN-SWA ATTAAAATTCTTCGTAAACTCTAGGGTCTTGATTAGTTGTACGACCATCTTCACGAGAAAGTCCAGAAATGATTTTCATTTCATCTTCTGATAATTCAAAATCGAAAATATTCAAATTATCTAATTGATGCTCCTTTGATGATGCTTTTGGTAGTGGAATTGCACCTAATTGTATATGCCAACGTAAAATTACTTGTGAAATAGATTTTTTATGTGTTTCAGCAATTCCAGCAATTTTCTTATCTTGTAGCATACTATTACCTCTTCCAAGAGGACTCCAAGATTCTGTAATTATACCATGTTCTTTGTTACAATCACGTTGCTCTTCTTGATTAAAATAAGGATGAAGCTCAATTTGATTAATACTAGGAGCTACACCAGTTTCTTTTATTAAAGTTGTTAAGTGTTCTGGCATGAAATTGCAAACACCTATTGATCTAATTAAACCTTTTTTCTTTAATTCAATCATTGCCTGCCAAGCTTCAACATATAAATTAATTCTTGGATTAGGCCAATGAATAAGATATAAATCATAATAATCTAATCCAGCTCTAAATAATGATTCTTCAACTGTATTAATGGCTTCTTTATATGAATGATGACGACCAGGCAATTTAGAAGTAATTATGAGTTTTTCTCTTGGAACAGAGCTTTTCCTTACTGCTTCACCAACTGCACCTTCATTTTCATAATTAAATGCTGAATCAATTAATCTGTACCCTAAATCAATTGCCTCTTTAATCCTATTAGCTCCGTCTATACCATTTAGACTGTATGTCCCAAAGCCAATGCTTGGCACTTTAAGCCCATCATTTAATGAATATTCTGTAATGTTCTCTACCATAAATTATCAATCTCCTTTATGTTTCCAATATTCTCATAAAATTTAATAACAACGTTTACTATTACTTTATTTTAACGTTTACTTTATTATAGCATATCTTTGCTTTTTTACAAAAAAACGGAGGGCACAAAATTATTTTCATGCCCTTAAAACTATTTTATATTATAGAAAATTAAAAACTAAACAGAATCAGGATAACTATATTTTAATTCTAAATTTGTATTATTAATAATAGTATCTAAAAACAGCTTCTTATCCTCCATTGAAGAAAGCGACCATAGAGGTATTACTAAACTTTCACCATTCATTGTAGGTATAAAAATATATTCTTCTAATAAATACAAACCTTTTATAGAATTCCAATTATGAACTTTCTCAGAAAATTTAGTATTAGTTTTTATTCCTTTTTCCATAAGCTTTAAATGTGTTGCTTCAAATGTATCTGTTAATTTATCTGTTCCATATATTTTTAGAAGTTTTCTTCTTAATGATCTATCAAATATTTTTTTTCTAGAAAAGAAGAATATAATGTACATAATAATAATAGTTTCAGTATATAAAATACTTCTAAGTAAAAGTATCAATCCAAGCAGTATAAAAGAAACAAGTCCAACATATGCACGGATTTGTTTTTTATAAATTTTTGTGTTAACAATATACTTCATATTAAAATTTATTAACTCATCCCTTGAAATTTTAAACTCTATATCCATAATACCTCCTATTTTGTACCTTATTCTAATCTTAAAGAGAAGCATTTATTGCTACTATTTAAAAATATGTTAATATCTAAGCAACTACAAACTTTTCTTCATTTTTATATAGGTTGTTTTACCGTATTTTCCACTTAATATTCATATTATAAAAATATCACTTGCACAAAATACATTAGCAATACATCATCTCAATTTTCATTAAGTACACATTTTAAGAATATTGCGAATTATTAGAACTTCAATTCTACTAATTAATTACATAAATGTTGGGTCCGCCCCATACCACGTTTGCACATCATTTTCATCAGTATAATCATTAATCCAAGCTATTCCAAAAACAAGTTCATGAGATTCAGTTGTTGATAATATGCTGTATCCTATTCCGTTTTCTAAATACCTACTGTCATAATCATAGTTACCAATTCTTTCTCCAGTATCAAAGTAACCAGTATCGCATTCTATTCCGATTGATAACTTTACCTTTCCTTGATAAAAAGCTTGGCATTCCAGTCTTTCTCCTGATTCAGGATAACATTTAACTTTGCTGTATTCCACGTCATCAATTACGCAACAAATCAAATGTGGTAAATTATCACTTTCATATTCTACTGCTATTCTATATCTGCCATCAACATTAGGAAATATAACTGAATCATTATCCAATTTTACAGCATTATATTCTATCTCAATATCATCGATATATATTTTAATAAAACCTAATGGTGTCTTCAAATTATTCATTAACATCACCTCACATGATTCGTATTTATTTACTATTCTGAACCAAATTTCTGTTCCATATAATGATTATTATAACATATATTTCAAAACACCACACAAGCCACTCATATAATAGCTCCCCCACAATTCTTTTACTAGAAATATAGCAGAAAAGTACAAAAAAAAAATAGAGGTCACAAGATTACTCTCATGCCCTTTAAACTATTTTATATCATAAAACCAACTTTCTAACGTATCTTTTAATTCTAAACATTTGCTCATAGGCAAATTTTGAGTTTCAACCCAAATTCCATTTTCATTTGAATTAGGTGTACATTTCTTTTAATTTCTAAAAATCATATTTAAAATTCTTCTTTACAAAATCAGCCATGGGGCTATCCTTATCTTTTCGTATATAATCTAAATCATCATCATAGAAATATAAATATGCTATACTCTTTTTTTCATCAGATGTTCCAATCATACCAAATGACTTTGGATATCTTGCTTCATAATTATCATTTCCCTCTACAACTTTAAAATCATAATTGTTTATTGAGAATTCATATTCAGGAATATAATATTTACTTTTATCAAAATCAGAAACAACTTTATGGTCTAAAAACTTATACTTTTCTGTTAATTTTTCTTTTTCTTTTTCATATGTTTCTTCATCATAGTTAACAACAAGCGTTATTGCATCTGTCTCAAATAATATTATTGAAAAATGATTATATTTATATGATATATCTTTATATTTAGGTAAATCCTCAATAGCAGGCATAAAGTTTTTCGCATTTGTATCAATCTTAGTTCCGCTATTAAGATACCTATTAATGTTTGTTGTATTTGACTTACTAAATCCAATAAAAATTAGTATTAAAACACTAATGATTATAAAAAAATATTTTTTCATTTTTAATCATTACCCCTAAAATGTATTTAATGCACATTTAATTACTATTCTAAACCAAATCTCCATTCCATATAATGATTATTATAATATATATTTCAAGATACCACATAAACTGCTCCTATAATAACTCTCTACAATTCTGTTACTAAGGACATATTAGAAAAGTACAAAAAAATAGAGGGCATAAGATTGCTCTCATGCCCTTTAAACTATTTTATATCACAAAACCAACTTCCTAACGTATCTTTTAATTCTAAACATTTGCTCATAGGCAAATTTTGAGTTTCAACCCAGATTCCATTTTCATTTGAATTAGCATAGATACGAATATCTTCAAAATATTCTTGCACATATTCCATGTCAACTCCAGCAAAACTTCCATCCCCTCTATATCCAATTGGAAGATAATTAGTTCTTACATATCCATTAGTTTTATTTAGTATTCCATCATTAAACTCATTCATATCGCAATCAGTATCTATACCATTTACACATCCTGTTTCCGAATATTGGTGCCCCACTCTATTAGCAAAGAAATTAGAATTTAATTTCCATGGAGTATTATTATAATTCGCCTCCCATAACGGATAGCCAGCAATTCTATCATCCAGGTTATCTGTAAAACTAGTATAAGTATAAATACCAATTTGCATCTTTGATATCTCTTTAAATTTAGCAATAAATCGTAATACAAAGTCCATTAATCCATCAAAATTACTTTCCACATCTAACATTGGAATTAGATCATTTGCTTTATCCTTTATAGCATTATAAAAACTATTAGCCTGAGTTTCTGGCTCACTAGTCCCAACTAAGAAATGATAAAATCCAGTTTTTAATCCTTCGCAATGTGCATTGGAATAATTAACCTCTAAACAGCGATCTTTGAATGTTGTACCTTCTGTAGCTTTAATGTAAACAGCTTCTATTCCTGAATATTTCACCTGTCCAAAATTTATGCTTCCATTATGATTACTTACGTCTATACCTTTCATATATACCATCCTTTCTACTACACTCCCTTTATTATTTATTTTTATATAATAAAAACACTTACTTTTTGATATGCTCCCTTTATAATAGTCAGTTAAAATAATAAACTTGACAGTATGAAGGGAACATATCATTTCCGTAAGTGTTTTTAGTTCATCTATTATTATAGATGATTTCAGTATTAATTTTTTATAGATATTATTTACGATTTCTAAAATTTTTCTATTACTTTTATTTTGCTCCAAGTGAATAATCTGTTAATTTGGAAATAATATCTTCAAAAACTCAAAGAGTCTACAATAAAATGCTGTAGACTTTTTGGGGTATTTTATATACATAAATATGGCTATTGATTATAATATTATTATATATGTTGCGATTCACAATGCACATTCCCTTTGAATTTTTCAATTTTACAACAAATATTTCCGAGGAAATATATTTCCAAAATCATTATGATATATACTTTTCCATCTTAGTGGCTGCCTGCTTTTCTAGCTGCTTGATCCTTTGATAAGATAGCTTTAATTTTTCCTGAACAACATAATATTTTCTATGTTCTATATGAACAATTTTTATAATGTCACTTTCTTCTTCAGTCAATATAGTAAGCGCATTTTCTATCCTTTTTAATTCTCTTTTCTTATTTGATTGCTCCCTATATAAAGCTTCTTTTCTTTCCATTAACTTTTCTGCTTGCTGTTCCACACTTGAAGTAATCTTATAAGTTTTTCCTGTTCTTTCTCCCATCTCTATTCCACTTATCCCTATGATTTCTTCCTCAAGCTCCTGAACTCTTATTTCTATATCT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CACAGAATAACCAAACTTAGCAAGTAATCCACCTAGAGTTGGACCAATGACAGTACCTACGCCTACAATAGCGCTCACCCACCCAAAGTATTTAGTTCTCTGATTACTAGGAATTATGTCTGCAAAATATGCAAAAATAGTACTTATGGTCCCACCTGTTATACCATCTATTATACGCCCGGCAAATAGTATCCATAAGGCTCCTCCTATACCAAAGACTACGTACCCGATTGCTGAACCCAAGAGACATACTAAGAGTACTGGACGACGTCCATATCTGTCGCTCAAAGCGCCAAGTCCTGGAGCTGCTAAAAACACACAAACTGCATAAACAGATGTAAGAAGTGTAACAACTATAGCTTGCTCTCCTGGATTACTTGTATAGGGCTGAACTAAAAATGGAACGACTGGTGCTATGATCGTAAAGCCTATTCCACAAAGAAATACAGATATAAGACCGAATATTAAAGCGTGTTTATCTATAATTTGTTCTGAACTTTGTTCATTATTTGATTTAAATTTGGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_LN908213|4567403:4577930|4569217_4569703_-|WP_077842694.1|DBSCAN-SWA MNNLKTPLGFIKIYIDDIEIEYNAVKLDNDSVIFPNVDGRYRIAVEYESDNLPHLICCVIDDVEYSKVKCYPESGERLECQAFYQGKVKLSIGIECDTGYFDTGERIGNYDYDSRYLENGIGYSILSTTESHELVFGIAWINDYTDENDVQTWYGADPTFM >NZ_LN908213|4567403:4577930|4575416_4575605_-|WP_017213046.1|DBSCAN-SWA MLIKCNWRTCKNYKDGVCRADSIELKSFDYEEDNEELEGLKCATYEYDSFWMCDKGREVDVR >NZ_LN908213|4567403:4577930|4570031_4570598_-|WP_077842693.1|DBSCAN-SWA MKKYFFIIISVLILIFIGFSKSNTTNINRYLNSGTKIDTNAKNFMPAIEDLPKYKDISYKYNHFSIILFETDAITLVVNYDEETYEKEKEKLTEKYKFLDHKVVSDFDKSKYYIPEYEFSINNYDFKVVEGNDNYEARYPKSFGMIGTSDEKKSIAYLYFYDDDLDYIRKDKDSPMADFVKKNFKYDF >NZ_LN908213|4567403:4577930|4570807_4571593_-|WP_077853688.1|DBSCAN-SWA MKGIDVSNHNGSINFGQVKYSGIEAVYIKATEGTTFKDRCLEVNYSNAHCEGLKTGFYHFLVGTSEPETQANSFYNAIKDKANDLIPMLDVESNFDGLMDFVLRFIAKFKEISKMQIGIYTYTSFTDNLDDRIAGYPLWEANYNNTPWKLNSNFFANRVGHQYSETGCVNGIDTDCDMNEFNDGILNKTNGYVRTNYLPIGYRGDGSFAGVDMEYVQEYFEDIRIYANSNENGIWVETQNLPMSKCLELKDTLGSWFCDIK >NZ_LN908213|4567403:4577930|4572044_4572458_-|WP_077845133.1|DBSCAN-SWA MNSTIDKVRRYREILADIQDIEIRVQELEEEIIGISGIEMGERTGKTYKITSSVEQQAEKLMERKEALYREQSNKKRELKRIENALTILTEEESDIIKIVHIEHRKYYVVQEKLKLSYQRIKQLEKQAATKMEKYIS >NZ_LN908213|4567403:4577930|4567403_4568246_-|WP_077842696.1|DBSCAN-SWA MVENITEYSLNDGLKVPSIGFGTYSLNGIDGANRIKEAIDLGYRLIDSAFNYENEGAVGEAVRKSSVPREKLIITSKLPGRHHSYKEAINTVEESLFRAGLDYYDLYLIHWPNPRINLYVEAWQAMIELKKKGLIRSIGVCNFMPEHLTTLIKETGVAPSINQIELHPYFNQEEQRDCNKEHGIITESWSPLGRGNSMLQDKKIAGIAETHKKSISQVILRWHIQLGAIPLPKASSKEHQLDNLNIFDFELSEDEMKIISGLSREDGRTTNQDPRVYEEF >NZ_LN908213|4567403:4577930|4576694_4577930_-|WP_077845138.1|DBSCAN-SWA MSKFKSNNEQSSEQIIDKHALIFGLISVFLCGIGFTIIAPVVPFLVQPYTSNPGEQAIVVTLLTSVYAVCVFLAAPGLGALSDRYGRRPVLLVCLLGSAIGYVVFGIGGALWILFAGRIIDGITGGTISTIFAYFADIIPSNQRTKYFGWVSAIVGVGTVIGPTLGGLLAKFGYSVPMYFGAIITLLNVVYGIFFMPESLHNEDRLEKITFVRLNPFTQLASILSMKSIKMLLISGFLLWIPNGSLQAVFSQFTIDTFNWKPTVIGLMFSIMGFQDIISQSLIMPKLLLKLNDRQIAILGMGSEIMGYAFIALSALLSFYPLFIIGMFIFGFGDSIFGPSFNGMLSKSVDSSEQGRIQGGSQSIQALARMIGPIIGGQIYVSLGHSAPAFMGILLIALAIPVLYKRTHVNI >NZ_LN908213|4567403:4577930|4568425_4568959_-|WP_077842695.1|DBSCAN-SWA MDIEFKISRDELINFNMKYIVNTKIYKKQIRAYVGLVSFILLGLILLLRSILYTETIIIMYIIFFFSRKKIFDRSLRRKLLKIYGTDKLTDTFEATHLKLMEKGIKTNTKFSEKVHNWNSIKGLYLLEEYIFIPTMNGESLVIPLWSLSSMEDKKLFLDTIINNTNLELKYSYPDSV >NZ_LN908213|4567403:4577930|4573247_4573904_-|WP_077845134.1|DBSCAN-SWA MSNIHWCICLKSSNMPGKIIFKKHAEFGDKINKILEKKSAELMGGEVLKDEFRYADENKGLECENDFALIKEINALDYENNQTSKNDENIKNKVLINKVEGRNNMDSKGIIQRLNTCIIALNRSNTQLKTLGLKKAQAEKEYKVKQAEEILKLREDKYPATLIMELVKGNKEVAELRLQRDVAENAYFTCLDGIDNLRIEIELIKNKLKWLRAELNSL >NZ_LN908213|4567403:4577930|4573908_4574691_-|WP_077845135.1|DBSCAN-SWA MDALQRILNQVRENSISKSQNGNQKKVQAAQETGHFKCEKCKDTGYIIKAQFHAQPLMTPCSCLEIENVKRLWKNSGINPENLEKTFSNFEEWSRTSKKMKFIATEYYMSFDEIRSNRKNSILLCGNPGSGKTHIALALANNFLKNNIKVVYMPYRDVITSLKQNILDKEYYKKTLSKYQTSEILLIDDLYKGKVNETDVNIMFELINYRYFNHLPVIVSSEFTVERLLNFDEAIGSRIYEMTKDFIVEIQGTENNYRLR >NZ_LN908213|4567403:4577930|4575699_4575906_-|WP_077845137.1|DBSCAN-SWA MKLTPIRLRRLNSGLDSEEVIEALKISKSTFYKLEQGWTRPSPALIKRLADIYKCSTDDIFRDLRITG >NZ_LN908213|4567403:4577930|4574581_4575370_-|WP_077845136.1|DBSCAN-SWA MSEGWFKIHRVLFEKAIWLNSTLEQKVILITILSMANHEKREWEWKGTKFKAEAGQFVTSLEGIVKKSGDGISLQNVRTALKKFERYDFLTQEVTTTGRLIKIVNWELYQGKQEKNSRHSNSELTSISQTADKELTTNKNNKNYNNHKNNVFVEEFTENKLLIESILEFIKMRERIKKPITDKGLKILLNKLKDLSQDEEIQIKILENSIEHCWQGLYPLKEEKYIYGRTSKNIKSGERKFNIKIPERKPKEGAGCARDRPF |
12 | Clostridium_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
5260303 : 5267771
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_LN908213|5260303:5267771|DBSCAN-SWA CCTAGTATAATTCTTCAATATATTTTAATAATGGCAAGCTCTTATCTTTCTCAGATAAAATCATCTCACAATCACCCAACTTATCTAAAGGCCATTCAATATTTATACTTGAATCATTCCAAAGTACGCCCCCCTCATCTTCGGGATGGTAAAATTCCGTACACTTGTAACAAAATTCCGCTTCATCTGATATAACCAAAAAACCATGCGCAAAGCCTTCTGGTATATAAAATTGTTTTTTATTTTCTTCTGATAATATAACTCCAGTCCATTTTCCATATGTTTTTGATTCTTTTCTCAAATCTACTGCCACATCAAAAACAGTGCCTTTAATAACCCTTACTAATTTTCCTTGTGGAAACTTTTTTTGAAAATGCAATCCTCTTAGAACACCTTTTTTTGACTTTGAGTGATTATCCTGCACAAACTTCATATTAAGCCCAGCTGCTTTAAATTCTTTTTCATTATAAGTTTCCATGAAAAATCCTCTATTATCTCCTAATACAGTATTTTCTATTATGTAAACACCTGATATTTCTGTTTCTGTAAATTTAAACTTATCCAACATATATTCTCCTTTCATCTTTCTAGCGTTTTTATTTCACTAATTTTATGAATTCCTTGAGAGCTTCTTCCCAATTTCTCATTCTATTCATATTTTTTGCATTTAACATCATGTTTTCTAGAGCTGAAAAAATAGGTCTTTTAGCTGGTCTATTTAAATTTTCTGAAGTTATTGGTTTTATCTGACATTCTATTTCTGAAAATTCTATAATTTTTTTAGCAAAGTCATACCAGGTACATTTACCTTCTCCTGTGCAGTGATATATTCCGTATCCTTCAGTTAATGCTATCTCTAATATCTGATAGGCTAAATCTTCTGCATTAGTAGGACAGCCTGTTTGATCATTCACAACTTCCAGGTAGCCTTTTTCCTTGGCAGCATTCATTATTGTATAAACAAAATTTTTTCCAAACCTTCCATAAAGCCATGCTGTTCTAAATATGAAATATTTACTGCATTGCTCCCTTATATAGGCTTCTCCTAACAGTTTAGTCTTACCATATGTGGTGCTTGGACTAGGAAGATCATATTCTGTTAAAGGCTCTTCATAATCTCCGCTAAATACATAATCAGTTGAAACATGCATGAGCTTTGCTGAAATTTCTTCAGCTGCTATAGCTAAATTTTGTGGACCTATTGCATTTACTTTTAAGGCAGTTTCTCTATCAGTTTCACATTTATCTACATTAGTAAACGCTGCACAATTTATAATAAGCTCAGGCTTAAATTCACTTACACAAACTTTAACCTTTTCAAAATCTGTTATATCAAGTTCTCTTGAATTTAATGCCTTTATATTTGCATTTTTATACGCTTCATCAACATATCCAATATCTGCTTTCATATTTTTAAGTAAATGTAGTATCTCTTGCCCTAACTGTCCATTAGCTCCAGTTATTAATATATTCAAAACTCTTCACTCCAAATTGAAACTTTACTCATTAGCTGTGCCAATAAGATATTTGCCATAATCTGTCTTATCTAAATCTTTAGCTAAATTTAGCAATTGTTCCTTGCTTATATATCCATTTTTATATGCTATTTCTTCGATGCAAGCAACATATAATCCCTGTCTTGTTTGCATAGCTTCTACAAAGTTAGCAGCATTTAAAAGACCTGAAGGTGTTCCCGTATCTAACCACGCCATGCCTCGTCCAAATAATTCTACCTTTAATTTTCCTTCTTTTAAATACTCATTATTCACATCAGTTATTTCTAATTCGCCTCTAAGTGATGGCTTTATTTTTTTAGCTATATTAACAACACTATTATCATAAAAATACAAACCTGGAACTGCATAATTTGATTTTGGCTCTTTGGGTTTTTCTTCTATAGAAATCACATTATTACCATTATCAAACTCTACAACTCCAAAATCTTTAGGATTTACAACATGATATCCAAATATAGTAGCACCATCTTTTCTACTAGCTGCGCACTTTAGCCTTTCAGTAAAACCATATCCATGAAAAACATTATCTCCAAGTACCAAAGCTACATTGTCATTTCCAATAAAGCTCTCTCCAATAATAAATGCTTCTGCTAATCCCCTTGGTTTTTCTTGAACAGCATATTCAAATCTAATGCCTAATTGACTTCCATCTCCAAAAAGTTCCTTGTAGGTAGCTATATCCCTTGGCGTAGATATTATTAGTATTTCTCTAATTTCAGCTAACATAAGAACTGATAAAGGATAATAAATTAATGGTTTATCATATACAGGTATTATCTGTTTTGATATAGCTTTTGTCATAGGGTATAATCTAGTTCCAGATCCTCCTGCTAATATAATTCCTTTCATTTGCTCCCCCTTACTTAAACTTTAGTAATTAATTCTATATTAATCTAATGCCTCTTATACATTCTATTGTAATATTCTTGATAATCACCAGACGTTATATTTTCCATCCATTCCTTATTTTCAAGATACCACTTAATAGTTAACTTTATACCATCTTCATATTTAGTCTCAGGATACCACCCAAGTTCATTTTTTATTTTGCTCGGATCTATACCATAACGTTTATCATGTCCTTTTCTATCCTCAACATAAGTAATTAGGCTTTCATCTATGCTTGCATCCACATTTTCTTTAAGATACTTGATTATGGTTTTTATAATATGGATATTAGTTCTTTCATTGTGACCACCAACATTATAAACTTCTCCTATTTTTCCTTCATTAATAACCATATCGATAGCTTTGCAGTGATCTTCTACATAAAGCCAGTCTCTAATGTTCATTCCATCTCCATATACAGGAAGAGGCTTCTTACTTAAACAATTGTTTATTATAAGTGGAATTAACTTTTCTGGAAATTGATACGCTCCATAATTATTAGAGCATCTTGTTATATTAATTGGCATTTTATATGTATCAAAATATGACTTGACCATTAAATCAGCTGAAGCCTTGCTTGAAGAATATGGACTATGGGAATCTATAGGAGTTGTTTCTGTAAAATATCCTGTTTCGCCTAAAGATCCATATACCTCATCTGTTGAAACTTGAACATATTTTTTACCACCTTTAAATCCACGTTTTAATTCCCAAGCTTTCTTTGAAATATCAAGTAAATTCACTGTTCCTAAAACATTCGTTTTAACAAAGGTTTCAGGATCTAATATACTTCTATCAACATGTGATTCGGCTGCAAAATTCACTACATAATCAATATCATACTTTTCAAATAGATTACTTACAGAATCTCTATCACATATATCTCCTTGAACAAAATTATAATTTTCGTTATTTTCTATGGATTTAAGATTTTCAAGATTACCTGCATATGTTAATTTATCTAGATTTATAATTTTAATATCTTTATATTTTTTTAGCATATAATGTATAAAGTTCGAGCCTATAAAGCCGGCTCCGCCTGTTACTAAGTAAGTTTTCATACCTATCTGCTCCTAATGATTTAAATTCTAGTTACTATTACACTATTTTATATATTTAATTGCTTTAACTTAAAGAACTCTTCAAATTTGTTAATCATATATTCTATACATTGTTCATTTATTCCAGGCCAAACACCTATCCAAAATGTATTATTCATAATGATATCTGTATTTTTAAGCCCACCTATTACTCTATATATATACTCATTTTCTGTAAATGCTGGCTGCTTTAATAAATTCCCAGCAAAAAGTAGTCTTGTGCCTATTTTATTTTCTTCTAAGAAACTTACTAAATCTCTTCTATTGAATCCACTATTTTCTTTTATTGTTATTGGAAACCCAAACCAACTTGGCTGACTATTTTTTGTTGCCTTTGGTAATATCAAACAACTTTCAAATTTCTTTAACCCTTCATATAACAATTTATAATTTTTGTTTCTCTTTTCAATAAAACCGGGTAACTTTTTTAGTTGAGAAACACCAATTGCAGCTTGCATATCAGATACTTTTAAATTATATCCTAAATGAGAATAAACATATTTATGATCATAACCTTCTGGTAATTCGCCATGTTTTTGAGTAAATCTATGACTACAAATATTATCATGGCCCGGAGGACATACACAATCTCTTCCCCAATCTCGTATAGATTTAATTATTTTAGATAGTAAAGGATCGTTAGTTAATACAGCACCACCTTCACCCATTGTTATATGATGCGCAGGATAAAAACTATATGTTGAAATATGTCCAAATGTACCTGTGTATTCACCGTCATATCTTGCTCCTAATGCATCACAATTATCTTCTATAACCCATAAGTTATACTTTTTAGATAACTCCATTACCTTATCTAAATTAAATGGATTTCCTAAAGTGTGTGCCATAAAAATAGCTTTTGTTTTTTTAGTAATTGCTTTTTCAATTACCGATTCATCAAAATCATAATTTTCAAGCTTAACATCAATAAATACTGGCACTAATCCATTTTGTATGATAGGTGCAACTGTAGTTGGGAAGCCTGCTGCTACAGTTATTACTTCATCTCCTGGTTTTAACCTTCTGTCCTTTAACTCATGAGAAGTTAACGCCGTCATCGCCACAAGATTAGCTGAAGAGCCTGAATTTACTAAAGCACAATGCTTTATTCCTAAAAACTTAGCAAATTCTGTTTCAAATTCATCTCCATATCTACCAGATGTTAACCACATATCTAGAGAGGCATCTATTATGTTAGCTAAATCATCTGAGTTTACCATCTTACCAGATGCCGGTATATACTTTTCACCTGGAACAATTTCTTTTCCTTCAATTTGTTCCTTATAATATTCTTTCGATAGATTTATTATTTGTTCTCTCAAATTCCCCATAGTCGTCACCTCTTCTTAAATTCGCTTTACATTAATTAATTTTTCATCTATTAAAAATCTTCAACATATTTTATAGATTTATATACTCCTTTATTTGCTTCAGTGTATAATTCTCCATATTCTCCTTATCATCATAAAATTCCTTATACCAACTTATAGTTTTATTTATTGCTTCATAGACATTGTACTTTGTTCTCCACTTTAATTGTCCTACTGCTTTACTTATATCTAGTTTCAGTAAATTAGCTTCGTGAGGTTGATCTCTTTTATCAACCTGATAAGATCCTGTTCCCCATACTTTTATACATTCATCAAGTATACTCTTTACACTCAACACATCTGTATCATTAGGCCCAAAATTCCATCCTGTAGCAAATTCTTGATTTCCATTTAATAATTCTGCTCCTAACATCAAATAGCCTGTTAATGGATCTAAAATATACTGCCACGGTCTTACTGCAAAAGGATTTCTTATGGTTATTGGTTCATTTTTAGATAATGCCCGTACAAGATCAGGTACAAGCCTATCTTCAGACCAATCACCACCGCCAATAACATTTCCTGCTCTTGCTGTTGCTAACAATATACCTATTTCGTTCATAAAACTTCTTCTATATGAAGATGAAAGTAATTCAACACATCCTTTACTTGAACTATAAGGATCGTATCCCCCCATAGGATCTGTTTCCCTATATCCATAAATCCACTCCTTGTTCTCGTAACACTTATCTGTTGTAATAGTTACAATAGCTTTAATACTATTGCACTTTCTAGATGCTTCATACAGATTTAATGTACCTATTAGGTTAGTTTCATAAGTTAATTTAGGCTTTTCATATGATGACCTTACTAATGGTTGGGCGGCTAAATGAAAAATTATATCTGGCTTAAATTCCATTATAGTCTTTGTTAGTTTTTCTTCATCTCTAATGTCTCCAAAAACATTCTTTAACTTTTCCATGTTATTTATTGTTGAAAACATATTGGGATTAGTATTGAATTCTAGTGAATATCCTAAGATTTCAGCTCCTAGCTCTATTAAATAACTTGTAAGCCAACTTCCTTTGAAACCTGTATGGCCAGTAACTAGAACTTTCCTATTTTTATATTCCCTTAAAAGCATATTTAAACCTCCAAATATTTTTATATAGTATAATTGTGTTCACAATATCTTTTTAATTTTTTCTATATCAAATAGTGTAGCAATTTTGTGCCGAACTAACAATTTCAACCAAATTCCATATTACAGTTGGTTTTTCAATAAAAAATTACTTAAAACCAAAATATTTATATAGCAAACCCAATTGCTATTTATATACACTTACAGAGATCAATACCAAATTATTTCATTTCCAATGTTATATAGTATACACTTTTGTTATTTTAATGAGAATTACTACAAATACTTTTAATGATAGTTATAGAAAATGAATTGCTTTTTCATAAATTATATCATCAATACTAAAGCGACTCGGCTTATTAACTTTTCCTCAATCATATTCAAAATTAATGTAAAAACCTATAATTTTAGTGTTTTAATCGATAATTACCTGAAACAACTATAGTAAATTCTCTTACAATGTCTTTTATACTCTATGGTGTACTTTACGATTTTGATTCAATAATATTTATATAGTAATTTTCACGTGATTTATTTTCGACCTGTAAGCAAATATATATAATTTTTAATATATTCTATGCATCTTTTAACTCTTTAACCTATGCCATTCTATACTCATTCTAATTCCATCTTCAAGCGATACATGTGGAGTCCAATCAATTAAACTTTTAATCTTTGAATTATCTCCTACAAAATACATAACCTCATTATCCCTATAAGGTATTTCTCCAAGATTAAAAATATCTTTGTCACATCCAGAAACATCACAAAATACATAAACAAATTCCTTTATAGATATAGATTCTGATGAACAAATATTAACTATACTATATGGTTCAATATTTCTACACCTTCCTAATTTTATATACGCATCAATTAGATCATCTATATATAAATAATCCCTTATCTGTTCTCCCTTAGTCATAGGCAACTTTTTTCCATTTATTGACGCCTCAATTAATTGTGGTAGTAATCTATAATATGATTCTCCAGGCCCATATACACCAAATGGTCTTACTGTAATCATATTCAATTCCTTTAACTTAGCGTATGTATTACCAATAATGGTTCCAGATACTTTAGCTGATGCGTATAGAGATTGTGGATCTAAATTACATTCTTCTGACAACTTTTCACCTTTATTAATTCCATATTCAAAACATGAACCTGTATGAATTAATAATTTTGCTTTATTTTGGCATGCAAAATCTATTATTTTTATAACAAAATTAATATTAGTATTTATCATATCATTAATATTTTGATTATCATAATTAACTCCATATGCTACTAAATTGAAAATAACATCAAATTGAGGAATACATTTAATATTTTTCAATTCTTCCATTGTAGAATTTATATATGTAATTCCAATAACATCATTTAATCGCTCCATTTCTGACGTTGAATTTGGTCGAGTTAATACATATACGTTAACTCCATCATTTATCAATCTCCTTACAAGATTTGATCCTATGAAACCAGTACCGCCAGCAACAAGTACATTTCTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_LN908213|5260303:5267771|5263815_5265138_-|WP_077829615.1|DBSCAN-SWA MGNLREQIINLSKEYYKEQIEGKEIVPGEKYIPASGKMVNSDDLANIIDASLDMWLTSGRYGDEFETEFAKFLGIKHCALVNSGSSANLVAMTALTSHELKDRRLKPGDEVITVAAGFPTTVAPIIQNGLVPVFIDVKLENYDFDESVIEKAITKKTKAIFMAHTLGNPFNLDKVMELSKKYNLWVIEDNCDALGARYDGEYTGTFGHISTYSFYPAHHITMGEGGAVLTNDPLLSKIIKSIRDWGRDCVCPPGHDNICSHRFTQKHGELPEGYDHKYVYSHLGYNLKVSDMQAAIGVSQLKKLPGFIEKRNKNYKLLYEGLKKFESCLILPKATKNSQPSWFGFPITIKENSGFNRRDLVSFLEENKIGTRLLFAGNLLKQPAFTENEYIYRVIGGLKNTDIIMNNTFWIGVWPGINEQCIEYMINKFEEFFKLKQLNI >NZ_LN908213|5260303:5267771|5265208_5266261_-|WP_077829614.1|DBSCAN-SWA MLLREYKNRKVLVTGHTGFKGSWLTSYLIELGAEILGYSLEFNTNPNMFSTINNMEKLKNVFGDIRDEEKLTKTIMEFKPDIIFHLAAQPLVRSSYEKPKLTYETNLIGTLNLYEASRKCNSIKAIVTITTDKCYENKEWIYGYRETDPMGGYDPYSSSKGCVELLSSSYRRSFMNEIGILLATARAGNVIGGGDWSEDRLVPDLVRALSKNEPITIRNPFAVRPWQYILDPLTGYLMLGAELLNGNQEFATGWNFGPNDTDVLSVKSILDECIKVWGTGSYQVDKRDQPHEANLLKLDISKAVGQLKWRTKYNVYEAINKTISWYKEFYDDKENMENYTLKQIKEYINL >NZ_LN908213|5260303:5267771|5260303_5260867_-|WP_077829648.1|DBSCAN-SWA MDKFKFTETEISGVYIIENTVLGDNRGFFMETYNEKEFKAAGLNMKFVQDNHSKSKKGVLRGLHFQKKFPQGKLVRVIKGTVFDVAVDLRKESKTYGKWTGVILSEENKKQFYIPEGFAHGFLVISDEAEFCYKCTEFYHPEDEGGVLWNDSSINIEWPLDKLGDCEMILSEKDKSLPLLKYIEELY >NZ_LN908213|5260303:5267771|5262712_5263768_-|WP_077842347.1|DBSCAN-SWA MKTYLVTGGAGFIGSNFIHYMLKKYKDIKIINLDKLTYAGNLENLKSIENNENYNFVQGDICDRDSVSNLFEKYDIDYVVNFAAESHVDRSILDPETFVKTNVLGTVNLLDISKKAWELKRGFKGGKKYVQVSTDEVYGSLGETGYFTETTPIDSHSPYSSSKASADLMVKSYFDTYKMPINITRCSNNYGAYQFPEKLIPLIINNCLSKKPLPVYGDGMNIRDWLYVEDHCKAIDMVINEGKIGEVYNVGGHNERTNIHIIKTIIKYLKENVDASIDESLITYVEDRKGHDKRYGIDPSKIKNELGWYPETKYEDGIKLTIKWYLENKEWMENITSGDYQEYYNRMYKRH >NZ_LN908213|5260303:5267771|5260898_5261777_-|WP_077829618.1|DBSCAN-SWA MNILITGANGQLGQEILHLLKNMKADIGYVDEAYKNANIKALNSRELDITDFEKVKVCVSEFKPELIINCAAFTNVDKCETDRETALKVNAIGPQNLAIAAEEISAKLMHVSTDYVFSGDYEEPLTEYDLPSPSTTYGKTKLLGEAYIREQCSKYFIFRTAWLYGRFGKNFVYTIMNAAKEKGYLEVVNDQTGCPTNAEDLAYQILEIALTEGYGIYHCTGEGKCTWYDFAKKIIEFSEIECQIKPITSENLNRPAKRPIFSALENMMLNAKNMNRMRNWEEALKEFIKLVK >NZ_LN908213|5260303:5267771|5266844_5267771_-|WP_077829613.1|DBSCAN-SWA MRNVLVAGGTGFIGSNLVRRLINDGVNVYVLTRPNSTSEMERLNDVIGITYINSTMEELKNIKCIPQFDVIFNLVAYGVNYDNQNINDMINTNINFVIKIIDFACQNKAKLLIHTGSCFEYGINKGEKLSEECNLDPQSLYASAKVSGTIIGNTYAKLKELNMITVRPFGVYGPGESYYRLLPQLIEASINGKKLPMTKGEQIRDYLYIDDLIDAYIKLGRCRNIEPYSIVNICSSESISIKEFVYVFCDVSGCDKDIFNLGEIPYRDNEVMYFVGDNSKIKSLIDWTPHVSLEDGIRMSIEWHRLKS >NZ_LN908213|5260303:5267771|5261801_5262668_-|WP_077842346.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPMTKAISKQIIPVYDKPLIYYPLSVLMLAEIREILIISTPRDIATYKELFGDGSQLGIRFEYAVQEKPRGLAEAFIIGESFIGNDNVALVLGDNVFHGYGFTERLKCAASRKDGATIFGYHVVNPKDFGVVEFDNGNNVISIEEKPKEPKSNYAVPGLYFYDNSVVNIAKKIKPSLRGELEITDVNNEYLKEGKLKVELFGRGMAWLDTGTPSGLLNAANFVEAMQTRQGLYVACIEEIAYKNGYISKEQLLNLAKDLDKTDYGKYLIGTANE |
7 | Enterobacteria_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
5465288 : 5545847
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_LN908213|5465288:5545847|DBSCAN-SWA CTTAAGCTATTTTTAATGACTCAAAAATTTTTTCTATCGGCGTACCGCTTGCGGCAGCTTTGTAAATATATATTACTTTGGACTTTTCTAAAATTTTTTTAGCAGCTTTATATCCAGTATTAAAGTGAAGAGAATCAGTACAGTATATTTTGCAATAAGTATAATTTACTAACATTATGATTAGATATCTATTAATGCTTTTTCCACTTCTTACTTGATATCCATCTAGTCCTAAGTACGTTTTGCAATCTCTAAAAAATGGTTCGATTGCCCATCGGTCGGTATATTGAGTTAAAATATCTAACGGTGATAATGATTTCTCTAAGGAAATAAAAGTTTTCAATGCGCCATCTTTTTGGAAAGCATCTTTAGGATAACTTAAAACAATGGAAACATTCTTTCTATCTTTTAAGTTGCCAACATAATTGTAAATGTAGTATTGCTTGTCTTTGACGGTGACGAGGTCAAAGTCTTCAATCTTTAATAATGTAGCAAACTTATGAAGTTTTATTCCTAGTCTTTCATGGCCATACGGAAAAATGACCCTATTAGTTTTTAAAGCACCAATATAGCTATAGCCGGCTTTTTCAGAAGCATTAAAAATATCCTTACAACTATACCAACTATCTGCTAACACATAGCCTTTATTTTCAGGCTTTGGAAGTGTTGTAATTAATTTTTGAGTTAATTCTATTTTACTCATATATTCTTTATCATAGATATCAATTGAGTATGGTAGCACTAATCCGTCACACGATAGTAAAGAAACTACTATTTGATGACCATATACATTCTTACCTTTTAAATGAGAATTATGAAACGAACACTTTTCAATTGGATTTTTAGCCTTTGACGAGGGCTTTGTCTTTTCAGAAATAGTGTCATCAATAATAAAGTATATTGGCTGTTTGGATTCTCTTGATTTATCCCAAATAAGTTCTATGATATATGCTTTTAATGCTCTTTCTAAAAGTTTTTCATTCCAATTACTATTTGAAAAAAATCTAGTAATACTAGTTCGATGTTTCGAAGGAGCAAGCTCCGCTATGTCGGAAATTTTACCGTTATAACCTTTTGATATCATAGCATTCATTATATTTCCTAAATGCCTTAATTGAGGCTTAGTTAAGTAAAAATCAAAATTTAGTTGTTTTAAAAAATTGTATATTGATAGCTCATCTGATATAATTGTGTTCTGAAACATTTATGTATAGCTCCTTGCTGTCATTGTTGTGTGGTAACTCAATTATAACAAGGATTTATCATAGATGTTTTTTTATTTTATTCAGTTGTAAAATTATTCAAGTATTTTTGCACTATTATAGTACTGATTATTTTTAATGTAACATATACCAAAGCATTATTTTTTTTAATTTAATCATAAATAAGTTTATAACCGAATTCTATTTACATAGAATTTACTCTTACGTAAGGAATTTAACTTTTCATTTTAGTTTTTTTATCAAAACTTTAAAATGAATTTATTGCCACAGAACATATATTCGTATATAATATTTTTAACGAATATATGTTCTTTTTCTATTTGTATATGTTCTAAATAATATTATTCAATCATTATAGAATTATCTAATTTTTTATTATCTTATATTTAAAAATAAACTTCGATGAATTAATTTTTTTAGAGCGTGTATATTTTATGATAATTAATTTAACTTTAAAATTCTATTCTCTACGTGCTTAGTTAATACAAAAATACAAAAACTAAATTTCAATACATCATTCAAGTTTTGTCAGAGCATATATTTTAATTTTAAAGTTTCATTTTATAAGGAAGTGTAATCAAAATGGATTTAATAGAAAAATTAAAAATATTATCTAATGCTGCAAAATATGATGTCTCTTGTTCCTCTTCTGGCTCAAAGAGACAGAATGCTAAAAATGGAATAGGCAATGCTTCGGAAGCTGGTATTTGTCACAGCTTTACTCCAGATGGACGTTGCATTTCTCTCCTTAAAATATTATTTTCAAATGATTGTATTTTTGATTGTAAATATTGTATTAATGGATCATCTAGAGATTTTTTAAGAGTAAGCTTTACTCCTGATGAAATATGCAGTCTTGCTATTAATTTTTACAGGCGTAATTATATAGAGGGTCTCTTCCTAAGTTCTGCTGTTATTTATAATCCTAATTATACTATGGAACTTCTACTCAAAACTGTGAAAAAACTTCGAATGGAAAATAAATTTAATGGCTATATTCATCTAAAAGCTATACCTGGAGCTGATAATGCTTTAATTGAGGAAGCTGGAAAGTTTGTAGATAGAATGAGTGTTAATATAGAACTTCCTTCTAGCAATAGTCTTAAACTTTTAGCACCTCAAAAAAGTAAAGAAAAAATTTTACAACCTATGAAAACTATAAAAAATTCAATAATTAATTATAGCGAAATGAAAAAAAGCATAAAAAGTACACCATTGTTTGTACCAGGTGGTCAAAGTACTCAATTAATTGTTGGCGCAACTCCTGAAAGTGATGGGAAAATCCTAAAACTCTCTGAAGCTCTTTACGATAAATATAGCCTAAAGAGAGTGTACTACTCTGCTTATGTCCCTGTAATTAAGGACAATAACCTGCTTCCTGACATTACGCATCCACCAATGCTTAGGGAACATAGACTTTATCAAGCCGATTGGCTTCTTAGATATTATGGATTTAAAGCTAATGAGCTCTTGAAGAATGATGATGATAACTTTGATTTAAATTTTGACCCAAAAACACATTGGGCATTATCCAATTTAAATGAATTTCCTGTTGAAATTAACAAAGTTTCTTATGAAAAGCTATTACGAGTGCCCGGTATAGGTGTTACTTCTGCTAAAAAGATTTTAAAAATAAGAAGAGTTCATAATCTGACCTTTGATGATTTGAGAAATTTAAGAGTTGTTCTTAAAAGAGCTAAATATTTTATTACCTGTAACGGAAAATATCATGGAGATGTTCTTTTTGATACTATTAAAATAAAGAATAAACTTCTAGAACAAGATATTTCTAAAAGCAATAGTATAAATCCTAATCAAATATCGTTTTTTGATAATATTTCATTTAATGATGTAAAACTTCCTTCTGGAATTATATTACCAAAAGATAATATTTCTTTATCACATATATCACCTATAAAAAATGAAAACTCTTTAAATAATATAATTCCTAAATCAAATATATTAACATTAGGTGATAAAATTACTTCTTTAACTGGAGAGTTTTGATTATGAAAATATATTTATATGATGATACCTTTGAAGGCCTATTAACTTCCATATATGATGCTTTTTACTCAAACGGATCACCTCCAACATCTATATATGGAAAAAGCCAGACAAATACTCCCCTTTTACTAGGGAATATAGTTGAAATTTCTACTGATATTAATAAGTTCAAAAAAGTAAAAAATGCCATTATAAATAAAATTAACTTCCTCTCATTAAAAAAAATATACTTTGCATTTTTAAGTAATTATGAGGACAAAGGAATAATAATATTTAATTATTTAAAGGTAGCCTTTAAACTCGGACCAGATGTTCACGATTTTTTAAATGTAGATGTAATAAGACTTGTAGATAACATTACAAAAAAAGTTTTAAATGAATGTCATAGATTTGAAGGGTTTATTAGATTTAATCAGATTGAAGATAAACTTTTATATTCCTCTATTGAACCAGATAATGATATTTTAGAGCTTATTGGAGATCATTTTAAAAATAGATTTCCTAGGGAATATTTTATTATACACGATGTTTCTAGACAAAAGGCTTTAATATATAATACAAATTTTTACGAAATAATAGACATGGATATAGAAACTTATGAAAAACTAAAATCTCACAACGATGAATACACAGACCTTTGGAAAACATATTTTAAAGCTACTACTATACAAGAGCGAAAAAATCTTAAACTTCAATGTAGAATGATGCCTAAAAGATATTGGAAGCACATACTAGAAATAAAAGTATAATTTACCATGTTCATAAAAGTACATATTGACAAACGAGCTAAATATAAAAACACTTGCAAGTATTGAGGACAATTTAAATTTGCTGCTAAAAAGACGAAATGGAATATATTTGTTTGCTCCGGTTCCTTGAAGATTTTACTGGATAATTCTACAATTATAAGTTGCATCCAAAGTGCTTGCTTCAAAGACAATGCTTTGAACAAGCACATTTGGAACAACTTATAATCTAGAATTACAGCCAGCAAAATCTTCTTATGAACACTGCACAAAAACATATATTCCCTTTCTCTGTATTAGAAGTAAATTTAAAACAAAACTATATAAATGCAAATATTTTTATATTTCTATTGTTAGTAGCTTAAGTAGATGAAAAAAATAATATATTCCAAACACAGTGATTACTTCGTGCCAGACAAATAATTATATTGGTCCCCCATATAGATATACAAGTTTTACTCATCAGAATGTTAAATTTTTAAGTTTAAAATTATAGAGTATTTATTAACACTGTAGATTTGATAACACATAAATATATGCAACGGAATCACAATGCTTGTATTAATCCCTAGGTATTTCGTATCTAGATACTGAAGTTAAATTAAAACATATATTTTCAATTATGATATATACCAGAAAGGAAGGTCATGCTTTTGTGGAGGTGTTACATATAGGATTTAGCTGCAGACATTTCTTCATTAGAAGTTGTTCCATTTTTTGCTTGTCCTGTGCTTGTCACAGGAGCATGCAGAAATGGGCGCAACTTCTACTGTTAGAAATTCACAGCAAAATCCTTAAGTAACCCGAACAAATGCATGACCTTCCTTTCGGCATTTACACACCTAACTATAATTTTCAACTTCGGTATCTAGTTCTTCGTAATACCTTTAGTCTGCAACTTTAATATCTCCATTTACTATAATTTCTAATTCTCCAGTTTCAGGACTCATAATGAGACCGTGTACCCTTACGTCATTAGGTAAAAGAGGATGATCTTTTATCATTTTAACACTTTCTTTTATTG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56 | uncultured_Caudovirales_phage(21.43%) | transposase,integrase,protease | attL 5483826:5483861|attR 5520696:5520731 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
6080869 : 6088998
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_LN908213|6080869:6088998|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_LN908213|6080869:6088998|6084690_6084882_-|WP_026015855.1|DBSCAN-SWA MIRKFEGLTANDLIEILKNYPRDIKVCTQMLGEGFPVKQVEECVYYDWKNGKKVQEHKGILIK >NZ_LN908213|6080869:6088998|6087633_6088998_-|WP_077842485.1|DBSCAN-SWA MLERNKEYIVKIDSLGYEGEGVAKIDGYPIFIPGALIGETVKIEIIKNKKNYSYGKLIDIVEKCDERTVPECNYYEKCGGCTLMHSNYDSQLKFKYNRVKDCIERIGGLSGDIVQNTIGMKFPYRYRNKGIYSIALTDNELSMGFFSEKTHEVVDMDKCLIQDEETDKIIKIIRNWMKKHSILPARKDNLFFSEGLIRNVMVRKGFKTNEIMVVLITNDKEIPKKEELIENIRLEVENLKGIIQNINTKNNSLVLGDKCITLWGQDYISDYIGKYKFNISPLSFFQINPIQTEVLYNKALEYADLSGNEIVFDAYCGAGTITLFLSQNARKVYGVEIVEQAIDNAIDNAKINGIDNSEFYVGKSEEVIPELIKNGIKPDIIVVDPPRKGCDINLLNAIGEAKPKRVVYVSCDPSTLARDLKHLEGLGFKTVEVQPVDMFPNTKHVETVALLTKR >NZ_LN908213|6080869:6088998|6086410_6087568_+|WP_077842484.1|integrase|DBSCAN-SWA MEGSVRKKGNKWYYSFEVGKENGKRKKIERAGGSTKKEALEALRKAIIEFENAGSYIDESNISVSDYFDYWFKEYVLLNCKPNTQKGYKRLINNHIKPQIGIYQLKKITPAKLQELINLKYRNGFSKNYLSNLYGVLSGAFKSAVYPYQLIKENPMLFVKTPKYNKLNNKQDDLKIITLEQFNTILKRFPYGNNMHIPLQIGFHTGMRVGEVMSLTWDCIDLEAKTIKVEKVLYLNEFNKWVFGTPKTYSSYRTIKIGDTLTSLLKRFHIDQKTNRLRYGEYYTKHDYDFVCLKENGDLLTTNSIKYLSRVVNYELNIQFKFHSLRHTHATMLLEASANIKDIQERLGHSTSSITMDVYSHVTNNMSNNSVNIFENIISMQLPTN >NZ_LN908213|6080869:6088998|6084943_6085159_-|WP_017212218.1|DBSCAN-SWA MEPVLYTVSEAAELLKVNRNSVYDLLKKNVIRGLKLGSLKITRAELMKFLEESNGKDLSNLEDIKELTFDR >NZ_LN908213|6080869:6088998|6082389_6083016_-|WP_077853686.1|DBSCAN-SWA MQHLAVACECRKIEKLKSEWKYSGINVEQSKLTFSSFEVWNEASQRMKDTAAAYCTDFDEIRNNRRNSILLCGQVGSGKTHCSIAVALNFLKQRIKVVYMPYRDVITKIKQNMIDEEYYTRTISKYQLCEVLLIDDLFKGKVTESDVNIIFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIDRLLAFDEGVSSRIYEMSKDYVVEIEKDIRNNYRLK >NZ_LN908213|6080869:6088998|6083065_6084406_-|WP_077842483.1|DBSCAN-SWA MADIKWIKLATCMPDDEKMKLIDAMKERDTIHYVWIRILLLGGKLNANGEIFLSEGKPLTSKMLAILFSRPLEAIKLALRVLSKFGMIEIAPDKVIRIVNWDKYQNIEGMEKVREQNRKRAETHREKKKQEKKTDKSDAQESYEYEVLEESITLNENEQLEKTNNLEQKKSSSEENYAPEENKALDENATLENLETREEASVNTDTDEAASDISSEIANNKDISNNIIESTDNNSTVTKNTSNVTKNKSNVTVTQQNKKEIENKIKKEKKEIDKDKNIKSTKRIFDLNNKSLTYDMNNKNLDCDEAVSQPNLFDNNNNNNGSVEEVDINSKAMELMKYHEKITGKPGGCNYVALRSAIDIHGEKLVKMAMDVGFEKNCPDIKYAIGVLKNWKRDGCPEDNVEVKKNGFRGTRKSNTADKNEFAGFKPKEPRKLTESERKRIEANLI >NZ_LN908213|6080869:6088998|6081696_6082089_-|WP_077843899.1|DBSCAN-SWA MNRPKDLPNRLECAYCKRNYKHGGECQGKSTNRNEDGCLYFSMDEKGCIRNIDQSIPFNLYSDIPPIGMWRDGWTIYNQDTKIRINKIYALSWNERKGLLYIKCNFDYFINEFSEDYKKEANKPNLKIIK >NZ_LN908213|6080869:6088998|6086250_6086427_+|WP_173706832.1|DBSCAN-SWA MLWKYILKIKLNNEIVYKRDIGENENFIHKNDDELSSINNANCETIANVEVLKHGRKR >NZ_LN908213|6080869:6088998|6080869_6081622_-|WP_173706831.1|DBSCAN-SWA MGGLLIFKDERFGEIRWVKINNKDYAVGIDIAKALGYKKPNDAISRHCRGAVKHGVGVVTGKRKDGTDAIQNVEMTVIPEGDIYRLVTKSELPGAEKFEVWIFDEVLPCIRKTGMYATDELLDNPDLLIAAATKLKEEREGRLESEKRLKLLEPKAQFYDDVAGSKDSVEMGHVAKVLGIRRMGRNRLFSLLRDKKVLDKNNIPYQQYVDLGYFRVLEQKYSVPSGETKINIKTMVFQKGIDFILRKIRE >NZ_LN908213|6080869:6088998|6082090_6082333_-|WP_077843900.1|DBSCAN-SWA MKSSGIVRNLDNLGRVVIPKEIRKVLGINEGDPIEITKVNNDIVLRKYSKGCIFCGSDKDISEFNNLLVCSGCRKTLGQN >NZ_LN908213|6080869:6088998|6085221_6085446_-|WP_017212219.1|DBSCAN-SWA MYSKLKGLMVEKRITQQKLAEVLKITGSALNYKINGKSDFSVTEAKLVSTFFGKTIEEIFVIDEVNNMKTSRSA >NZ_LN908213|6080869:6088998|6085692_6086067_+|WP_017212220.1|DBSCAN-SWA MSKFPTRLKELREEKGLLGKDFAKIMSVEPATVTNWEKGNRFPKDDVLIKIADYFDCSIDYLLGRTDDKLAKIYSGTLHNQTIEIEIDKGFPHELTAEEVQNIIKQLDAVGLDVNKLIENSKKK |
12 | Paenibacillus_phage(25.0%) | integrase | attL 6075986:6076001|attR 6101039:6101054 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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