Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN999987 | Enterococcus faecium isolate EFE11651 chromosome I | 1 crisprs | DEDDh,RT,DinG,cas3,cas2,csa3,cas14j | 0 | 0 | 12 | 0 |
NZ_LN999989 | Enterococcus faecium isolate EFE11651 plasmid III, complete sequence | 0 crisprs | WYL | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_LN999990 | Enterococcus faecium isolate EFE11651 chromosome IV | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_LN999988 | Enterococcus faecium isolate EFE11651 plasmid II, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN999987_1 | 2333765-2333874 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN999987_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LN999987_1
>1.1|2333791|58|NZ_LN999987|CRISPRCasFinder CCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN999987_1
The CRISPR arrays of NZ_LN999987_1 >merge|NZ_LN999987|1|2333765-2333874|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTATTCATCACCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCGCTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCA >NZ_LN999987|1|1|2333765-2333874|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTATTCATCA CCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG CTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCA
>NZ_LN999987.1|WP_002291634.1|2333188_2333692_-|50S-ribosomal-protein-L10 MSEAIIAKKAAIVDEVSEKFTAAASVVVVDYRGLTVDEVTRLRKQLRDANVEMKVIKNSILSRAAKKAGLEGMDEVFTGPTAVAFSNEDVVAPAKIMDEFAKEAKALEIKGGIIEGKVSSLEEITALAKLPNREGLLSMLLSVLQAPVRNVAYAVKAVADKEDGDAA >NZ_LN999987.1|WP_002294588.1|2332767_2333136_-|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MALNIENIVAELKEATILELNDLVKAIEEEFGVSAAAPVAVAAAGGAAAAEEQTEFTVELTAAGDQKVKVIKAVREATGLGLKEAKAVVDGAPAPVKEGVSKEEAEELKAKLEEVGASVTVK >NZ_LN999987.1|WP_002296327.1|2331972_2332662_-|TVP38/TMEM64-family-protein MKKKIIRLMLISLGIILILVVGYRLYLEYQTDIQLFLNPRASKAELLAHIRSHGTFASILLIVLTAVMCAVPGIPTSVVGVIAGLSFGPLTGAIINILGNALGNITAIFLMHRLKFLDKKTETNHWVQAIRQMKHPKIGVMLGYMIPVIPSSMVNFAADAMKLPLQQIILSIVIGVIPSSVLYACGGEALFHGYNKTAVTLVASVTVLVGLVVFIYKDRKKKQGKQKHK >NZ_LN999987.1|WP_002320938.1|2330841_2331891_-|MFS-transporter MKSNEKTPLTTSLILLLSITCGVVVANMYYIQPIGTKVAASLSVSTSAVGILTMLTQLGYALGLLFLVPLGDVVDRPKLIIRMVALSAVSLLAAFFAPSFTLFACASFLIGLLSIVPQIIIPYGAVLAGPKARGKVMGTLLSGLLVGILLSRTVSGIVASLFSWRMIYLFALCAVGILTLLLYWKMPRSVQQSSTAVSYLDSLKSLPHLVASQRLLREAAVSGFFMFGTFSIFWSTLIFYISSPAYNWGTFEAGILAIFGLSGAVAAPIVGRLADSYSERKIVYMGLVMQTISFIALLVGGSHLAILLLAIILLDVGNQFGQVANQTRVQGLGEAASNRNNTVFTRGAS >NZ_LN999987.1|WP_002295743.1|2329839_2330748_-|IS982-like-element-ISEfm1-family-transposase MRSSKYTEHYTDTFITFKEIMRTVSNIYHNCVPDKIKNRRNTDQLKQRDTVIIACVIWGIINGYTSQRATYRAVCSVLFPNGDFPSRSRFTRLSSNLAYTIKIIRYFFIKKLTKGELVGIIDSFPSPLCKPVRNRQAKLLNQIAKVGYNSTKKSYFYGLKIHMIVTKTGFPITYSITNPGVHDVKVLETLSEEANLPNILGDKGYISHKIHEKLALKGITISVPPRKNMDKSEKLDHSLLGKQRKTVETVFSSLEKLGCQNFNSRSVKGLESRFESILLAYSVLLSRAQRRFEGTLRYSLGY >NZ_LN999987.1|WP_002290558.1|2327917_2329450_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MSILTLNNITQQFGDKILYEGVDLQLNAGEHLGLIGQNGAGKSTLIKIITGEILPDDGQIHWQKNIHKGYLDQYVEVDETLTIEEFLKTAYAKEYEKEEKIAFLYQTYSETFDDSLLEKAGKLQTELDQGVFYQIDTLVAEMSSGLGIDVLGLDSLLKNLSGGQRSKVILAKLLLENPDVLILDEPTNHLDDQHIQWLTQFLQDFDGAYIVISHDQEFLDQITTHIADIEFGKITKYTGHLKQALKQKEQNRESYLRQYHAQQKQIEKTEAYIRKYKAGSRSTMAKSRQKQLDKIERLTPPASASKAVFDFPFSPIVTTLAVETTDLVIGYDRPLLAPINLTIRFGENIAIRGFNGIGKSTLLKTLIGEIEKISGDFHFPDNTKINYFSQDLYWENPLETPLQYLSSQFPKATIKELRRQLAKAGLVNQLASEPLTTLSGGEQTKVKLAQLTMNQGNLLILDEPTNHIDQETKESLQDGIQKFPGTVIIVSHEQEFYQDLVQRVIEIEPK >NZ_LN999987.1|WP_002287787.1|2326982_2327684_-|glucosamine-6-phosphate-deaminase MEIIRVKNAEEGGKKAFEIIKEGMNKGAKVLGLATGSTPVTLYKEMTSSDLDFSEMTSVNLDEYVGLGGSDEQSYRHFMDVQLFDKKPFKETFVPDGKAEDLEAACKKYDQIIDAHPIDIQILGIGQNGHIGFNEPGASFDGTTSVVDLTESTINANKRFFDKAEDVPTKAVSMGIGSIMKSKEIVLMAFGESKADAIKGMIEGPVTNHLPASVLQNHDNVVVIIDEEAASKL >NZ_LN999987.1|WP_002287788.1|2326015_2326729_-|MgtC/SapB-family-protein MNDMVLTIPEIILRLGIAMLFGGAIGFERQYKNRPAGMRTHILVCMGACIIALIQVEIASGALRDALEYPQLAGTIRSDEARLIAQVVSGVGFLGAGTIIVTKQSVTGLTTAASLWAIAGLGIAIGMGYYSIAIISFIGIAIALTVVKRVIHVPTTKKLEIQFIHRKETKDFLTDYFEEKNIVIEDVNFDVKFVDDYRVYKNIYTIDLPKGLTYADVIEELSVHKNITKLHLVSIAQ >NZ_LN999987.1|WP_002287791.1|2324567_2325707_-|AI-2E-family-transporter MQSRFKQSKLFFWTVELVLTIIGVYFILQMPNIFSPILKMLSAIFLPLLVAGFIYYMFDPIVVFLEKHRIPRVFGFLLTFLVVIILVVLTVMNVVPQLMEQTIQLTQSLPMYADETSKWLNELAQREEFKNFNLEEQLASANLSLSNLFNIILVSLSASVSKIISFMMQFFILLFTVPFILLFMFKDGHKFIDALSHFFPKAIRKELRQTVKELNETLSAYISSTILDALIIGVMSFLAMRIFDQPYSLLLAVICGITNIIPYVGPFIGAVPAIIVGLFISPFQALYMALSILVIQQLDGNLIKPLLFGKSMNIHPLTIILVLIGAGSVAGILGMLICIPVYAVIKTIILNIRKIYLLRRMEHVSEKLDSPKVLEETSE >NZ_LN999987.1|WP_002287792.1|2323513_2324479_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MSETYYEAINWNEIEDIIDKSTWEKLTEQFWLDTRIPLSNDLDDWRTLSQLEKDTVGHVFGGLTLLDTVQSESGMDQLRKDVRTPHEEAVLNNIQFMESVHAKSYSSIFSTLNTKKEIEEIFDWTNTNPYLQKKAERINEIYKHGTPLEKKIASVFLETFLFYSGFYTPLYYLGNNKLANVAEIIKLIIRDESVHGTYIGYKFQLGFNELPEAEQETLKDWMYNLLYELYENEERYTEELYDPIGWTEEVKTFLRYNANKALMNLGMDPLFPDTANDVNPIVMNGISTGTSNHDFFSQVGNGYLLGHVEAMKDDDYLIGLE >NZ_LN999987.1|WP_002294587.1|2334101_2334791_-|50S-ribosomal-protein-L1 MAKKSKKMQDALKKVDSSKVYPVAEAVALAKETNIAKFDATVEVAYRLNVDPKKADQQIRGAVVLPNGTGKTQTVLVFAKGDKAKEAEAAGADFVGDDDMVQKIQNGWFDFDVVVATPDMMATVGRLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVTKAVNEVKAGKVTYRVDKAGNIHVPIGKVSFDDEKLVENFAAIHDVLLKAKPSAAKGQYMKNVTITTTFGPGIHVDQASF >NZ_LN999987.1|WP_002291638.1|2334894_2335317_-|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEKIVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKEFNARTADQAGLIIPVVISVYEDRSFTFVTKTPPAAVLLKKAAKIEKGSGEPNKNKVAKVSSDQVREIAELKMEDLNAANVEAAMRMVEGTARSMGITVE >NZ_LN999987.1|WP_002294585.1|2335659_2336328_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKDLRYRSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAARIGKIIRSIFGEQPDSVDIYLYESFAKTYRGHGTDIALVGGLLGMEPDDERLADSLKLAYEAGMEVLFVPKSEKAEHPNSVKMLLKKGTRKLSVTGISIGGGNIQISELNGFKISLSMGTPTLIVVHQDVPGMIAKVTSILSETNTNIGTMTVTRESKGENAIMIIEVDDPQVEETVKRLKQLPNIDSVNYFD >NZ_LN999987.1|WP_002294584.1|2336340_2337213_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFLSIEELVDQAKAYPSVAELMIAVEMEMSGRSRSHIIEIMEKNLSVMEQSINEGKEGVTSVTGITGGDAKKLDDYLNEADFLSGETILKAVRNAVAVNEVNAKMGLICATPTAGSAGVVPGVLMAVRDRLDLTHEQQLEFLFTAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMAAAALVCAKNGTPHQAAQAVAITLKNMMGLICDPVAGLVEVPCVKRNALGSSQAFISADMALAGIESVIPPDEVVAAMYQVGRQMPSIFKETAEGGLAVTPTAKRLAEEILNKRA >NZ_LN999987.1|WP_002294583.1|2337303_2338323_-|alpha-hydroxy-acid-oxidizing-protein MEAGAFGYIRGGSEDEWTMKENTTSFNTKKIMPRILRGIDSADLHTSVFGIELDTPIIQAPSAAQGLAHEKGEADTAKGVAAAGSIFSISTYANTTIKDAADAAPGAPQFFQLYMSKDDRFNEFILNKAVEAGAKAIILTADSTLGGYREEDVINQFQFPLPMPNLAAYSEQSASGNGEGKGIAEIYAAAKQGLTPDDIKTIKEITHLPVIVKGIQSPEDAVIAISAGADGIWVSNHGGRQLDGGPASFEVLPKIAEVVNKRVPVIFDSGVRRGEHVFKALASGADLVAIGRPVIYGLNLGGAEGVTSVFEHLNKELSITMQLAGTKTIDEVKNTKLMD >NZ_LN999987.1|WP_033705696.1|2338495_2339401_-|alpha/beta-fold-hydrolase MERKRCMTEPIKNLCKRATAAALVLISLFALSGCQTTKINTTEVSDKEKTAESSKVIEKTTIPTLFFHGYSGTENSFKGMLRRLEKNQQAVKELVLTVGTDGQIQATGDLSGKADNPMVQVLFEDNKNNEWNQAEWIKTSLLYLKENYGIDKVNIVGHSMGGVSALRYLGTYGQDTSLPQVQTLTAIGAPFNDFVDDSAQSLTDELAKGPAVVSNRYQDYQQMIGNIPITTRFFLIAGQLDETDLSDGTVPLNSALAVYALLKQRGNEIEEKVVTGENASHSMLHENQEVDQLVSRFIWKE >NZ_LN999987.1|WP_002294580.1|2339459_2340005_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusG MESFEKNWYVLHTYSGYENKVKANIESRAQSMKMADFIFRVVVPEEKETEVKNGKEKEIVHKTFPGYVLVEMIMTDASWYVVRNTPGVTGFVGSHGAGSKPAPLLPEEVNHILRSIGMSLRQNDLEVEVGEVVKIIEGAFAGLEGQVTEVDGEKEKLKVNIDMFGRETSTELDFDQVDKID >NZ_LN999987.1|WP_002294579.1|2340105_2340276_-|preprotein-translocase-subunit-SecE MKFLKSVKDEIKQVTWPSRKQLRKDTLVVIETSIIFGLMFYVMDTAIQSLFGWILK >NZ_LN999987.1|WP_002294578.1|2340299_2340452_-|50S-ribosomal-protein-L33 MAKKKAALACSVCGSRNYTKSVSEGKSGERLEINKFCKYCNQYTLHKETK >NZ_LN999987.1|WP_002294577.1|2340613_2341258_+|CBS-domain-containing-protein MLLKTLVYKKKDLTTVTETSTLEEALKILETSGYRCVPILDSSGNIFRGNIYKMHIYRHKANGGDMTLPVTHLLKNATKFIYLDTSFFKVFFTIKELPYIAVLDSENHFYGILTHSTLLNMLSQSWSVEQGSYVLTIASTGKQGDLAAIAKIISKHSSIASCITLDIEKDEYIRRTLITLPANTEAKVCETIVNHLEKKNYKVVEIENLQNQEA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
717049 : 725520
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN999987|717049:725520|DBSCAN-SWA TGTGAACGGACTATTTATTACAATCGAGGGGCCTGATGGTGCAGGAAAAACCAGCATCTTGAATGAACTTTACCCTCTTTTGAAAGAAGTAGCAAAAACAGAAATCATTCAAACAAGAGAACCAGGAGGCATTCCGATTGCTGAAGAGATCCGAGCAGTGATCCTTGATCCAAAAAATGATCGGATGGATGAACGTACGGAAGCACTGCTTTATGCAGCAGCAAGAAGACAACATCTAGTCGAAAAGGTTCTGCCTGCTCTGGCAAAAGGGAAAATCGTTTTATGCGATAGATTTGTCGACAGTTCTCTTGCTTATCAAGGTGCAGGCCGACGCATCGGCGTTACCGAGATTGCTCGGTTGAATGAGTTTGCTACAGAAGGTACTACGCCGGATTTTACCCTTTATCTTGACGTAGATTCAGACACCGGATTAAGAAGAATCAAGAAAAACAGACAAAATCAAATCGACCGTTTAGATTCGGAAGGTTTGGAATTCCACCAGCGTGTACGTCATGCTTACTTAAAGCTGGCAGAAGAGAATCCGGAAAGAATCCACAAAGTTGATGCAAGAAAAAGCTTTGAAGAAGTGCTGCAAACAAGTTATCATACAATTATTGAACAGTATCCGCAATTTTTTGAAAACTAGGAAGGTGAACGTTTATGAAAATTATTTTAGCGATTATCCAAGACAAAGACAGCAACCGTTTATCAAATGAATTGATTGATGCAAATATCCGTGCCACAAAACTATCATCGACAGGCGGCTTCCTTAAGGCTGGAAACAGTACGTTTATCGTGGGTATTGAAGATGACCGTGTAGAAGAAGCATTGGAAATCATCAAAAAAACGTGTGAATCAAGAAAGCAATTTGTATCTACACCTGTTACACTGGATATTTCGATGGATGGGGGCGTCCCTTATCCAGTAGAAGTAGAAGTAGGCGGTGCCACAGTCTTCGTCTTACCTGTTGAAGGATTCCATCAATTTTAGGAGGAGCTGAGCTATGAATCAAGAAATAAACTTGGCTCAAATGCAACCGATCGTGTATCAGCAGCTTCAACGGAGTTTTGAGCATGGGCGTATCGCTCATGCTTATCTTTTTGAAGGGGAGAAAGGAACAGGAAAACATGAAGTAGGTATATGGCTTGCACAGCACCTGTTCTGTACCCAAATGAAAGACAATCTGCCTTGTGGAAAATGCAACAATTGTCAGCGGATCGAAAAGAAAGAACATCCAGATGTTTTGGTTATTGAACCGGAAGGACAAACCATCAAAGTCGATCAGATCAGACGTTTGCAGACGGAATTCAGTCGCAGCGGTTACGAATCAAGAAAAAAAGTTTTTTTGATCAAAGAAGCTGAAAAAATGAATAGCAGTGCGGCAAACAGTTTGTTGAAATTCTTGGAAGAGCCCCCTGGAGATTTTTTAGCGGTGTTAGAAACAGATGCAGTAGGAAGAATTCTCCCTACTATTCAATCTCGTTGTCAAGTTCTGCATTTTCAAGAACTTTCGAAAGAAGCACTGATCCATCGATTGCAAGAAGAGCAGATTCCATTGGAAAAAGCAAAACTTTTGGCTTTCTTAACAAACAGTTTAGGAAAAGCAGTTGAAATCTCTCAAGATGAATGGTTTAATGATGCTAAGGACTTGATTTATCAATGGTTCGTTTACTTGCAAAAGCAAGATACTCAAGCCTTTATCTATGTCCAAAAAAAATTGGTAAAATCATTTAAAGAAAAAACACAACAGTTTACAGGATTATCTGTCTTGATGTTTTATTATCAGGAAGCACAGCGTCAAGCAGTAGCAAACGGCGAATATGGCAAAGTGAAACAGATAAACCAGATAATTGAACGGATATTGATCGCAGAGCAGAAACTACGCAGCAATGTCAGTTTTCAGGCTGTTGCGGAACAGTTCGTTTTGCATACGATTTTTTAGCTTGCCGCAAAGGATGATGATCAAGGAGGATGGAAATGGTAGAAGTAGTAGGTGTCCGATATAGAGATGCAGGTCATATCTATTATTTTGCACCAGGAGACTCTGAATATGTTTATAGTGACAAGGTATTAGTCGAATCTCAGCAATCCTTACATATTGCTACTGTTGTCCTTCCTAAAAAAGAGATTGATCCCAATGACCTTCCTGAAGCTATCCGTCCGATCTTGCATAAAGCGTCACAAGCTGAATTAGAAAAAGACAAAAAAAACAAAAAAGATGCTTATGATGCATTGAAAATCGCAAAAGAAAAAGTGCAGTTGCGTGAGTTGGAAATGAAAATGGTCAAAGCCGAATACACATTTGATCGAAATAAATTGATTTTTTCTTTCACAGCGGACGGGCGAATTGACTTTAGAGAATTGGTAAAAGATCTGGCCGCTGTATTTCGTACTCGTATTGAGCTTCGACAAATTGGTGTCCGCGATGAAGCAAAGATAATAGGCGGAATTGGTCCATGTGGGCGTCCATTATGCTGTTCTTCTTTTTTAGGCGATTTCGTGCCTGTATCAATCAAAATGGCAAAAGATCAAAGTTTATCTTTGAATCCAACAAAAATTTCCGGTTTATGCGGACGCTTGATGTGCTGTCTGCAAATGAGAGCGAAGAATACGAGACAGCGAAAAAAGAACTCCCTGACTTTGGAAAAGTAATTGCTACACCTGATGGTAAAGGGAAAGTCGTAGGGTTGAATCTGCTTAGCCGTATCGTTAGTATTCGGCTGACTGGACGGGAAAATCCTGTCGAATATGAATGGGATGAATTGAAAGAATTTATCCAAGTAGGTGAGATGAATGGATAAGAGATCATTATACGACGGATTGAATCAATTAGAATCAGAGTTGAGAAATACATTAACAGAACTTGTTGAAATGAAGCATGCTTTGCATGAGATCGTAGAAAAAAATACAACTTTGGAGATGGAAAATCAACGTCTGCGGGAACACCTGCGGGAATTGAACCAAGTTGCACAAGCTCCAGCTGAAAATGTGAAGCAGGAACTTTCTAAGTCTCGTATGAATCTTGAAAAAATTTATGAAGAAGGATTCCATGTCTGCTACGATTTATATGGATCAAGAAGGGACAATGACGAGCCTTGTGCGTTTTGTCTAGAAGTGATCTATCGCGAAAGCGGTCGATGACCAATAACAAGAGGAGACTGGAGCGGAGAAATACTGCTCCAGTCTTTTTATTAAGGAGATTGTGACAGATGTATAATCAAAAAAGTTTCAAGGGAAATCCGGTATATGGGGATTTATATCTTGTACCGACGCCAATTGGAAATTTAGAAGATATGAGCTACAGAAGTGTTCGTATGCTGCAAGAATCCGATCTTATCGCAAGTGAGGATACGCGTAATACACAAAAGTTATTGAATCATTTTGAAATCCATACACCCCAAAAAAGTTTACATGAACATAATTATAAAGAACGTGTCCCTCAATTGATTGCTTTGTTAAAAGAAGGAAAAACGATTGCTCAAGTCAGTGACGCAGGAATGCCTTCCATCAGCGATCCTGGACATGAGCTAGTTTTAGCCTGCATAAAAGAAGGGATTTCTGTGATCTCTATCCCAGGACCTACAGCTGGGATGACGGCTTTGATTGCTTCAGGGCTAGTGCCTCAACCATTTTTATTTTATGGCTTCCTTCCACGTAAGAAAAAAGAACAGAAAGAAACATTGAAAAAGCTAAAAGAACAGACAGTTACGCTGATTTTTTATGAGTCACCTTATCGGATCACTGCTACATTGACGAATTTCTTAGAAATTTTTGGAAATCGCCAAGTCGTTTTGTGTCGGGAATTGACAAAGGTCCATGAAGAATACCTTAGAGGAAGTACGGAAGAGCTACTCGCTTATATCGAAGAACATCCAGTAAAGGGTGAATGTTGTCTGCTTGTAGAAGGGAATTTGTTCGAAATGCCAGTGACGGAAGTTGATGAAGAGTTGGGAACGTTAAAGGAACAAGTAGAAGCAAAGATCGCTTCAGGCGAAAAACCAAATGCTGCTATCAAAGCAGTAGCGCTGAAAAATGGGCTGAAAAAACAAGAAGTCTACCGTCAGTACCATGAATTAGACTGAGATAGTATAAGTTGTCTATAATGAAAGACTAATGAGGAAATCAGCTACTAACTTTTCAAATCTCTTGAACGCGAACGAATGTTCTTGTATAATGAATAAGAGGTGAGGATGATGGAGCTGCAATTTCCTTTACATAATGATACATCAAGAAAAATCATTCATATTGATATGGATGCTTTTTTCGCTTCGGTTGAAGAACGAGATCATCCTGAGTTTCGCGGACATCCATTAGTAATTGCCAGACACCCCAGTGACACTGGTGGGCGTGGAGTAGTGACTACAGCAAATTATGAAGCAAGAAAATTCGGAATTCATTCAGCAATGAGTGCACAAAAAGCGTATGAGCTTTGTCCGCAAGCCATCTTTAAGCCTGGCGACCATCATAAATACAGCGATATTTCCAAACAAGTACGGGAAGTATTCTATCGTTATACAGATATTGTGGAACCAGTTAGTATCGATGAAGCGTATCTTGATGTGACCGAAAATAAAATCAATTGCAAGTCAGCCATCAAAATCGCCCGAATGATCCAAGCAGATATTTGGGAGAGTGTCCAGCTAACATGTTCTGCGGGAGTAAGTTACAATAAGTTTTTGGCCAAATTAGCATCAGACTATCAAAAACCTAGAGGAATCACGGTAGTTGCCCCTCAAGACGCTGTGCCATTTTTAAAAGCTTTGCCAATTGAAAAATTTCATGGGGTAGGGAAGAAAACTGTACCTAGAATGCATGAGCTAGGGATTTATACAGGAAAAGACCTATATGAATGCACAGAAATGATGTTGATTCGAAATTTTGGAAAAATGGGCTATTCTCTTTATCGTAAAGTCAGAGGAATCCATGATTCTCCAGTAAACGTTACAAGAGAGCGAAAATCTGTGGGAAAAGAGCATACTTATGGGCAGCCGTTGCAAACG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN999987|717049:725520|717049_717694_+|WP_002294039.1|DBSCAN-SWA MNGLFITIEGPDGAGKTSILNELYPLLKEVAKTEIIQTREPGGIPIAEEIRAVILDPKNDRMDERTEALLYAAARRQHLVEKVLPALAKGKIVLCDRFVDSSLAYQGAGRRIGVTEIARLNEFATEGTTPDFTLYLDVDSDTGLRRIKKNRQNQIDRLDSEGLEFHQRVRHAYLKLAEENPERIHKVDARKSFEEVLQTSYHTIIEQYPQFFEN >NZ_LN999987|717049:725520|721238_722360_+|WP_002294035.1|DBSCAN-SWA MMELQFPLHNDTSRKIIHIDMDAFFASVEERDHPEFRGHPLVIARHPSDTGGRGVVTTANYEARKFGIHSAMSAQKAYELCPQAIFKPGDHHKYSDISKQVREVFYRYTDIVEPVSIDEAYLDVTENKINCKSAIKIARMIQADIWESVQLTCSAGVSYNKFLAKLASDYQKPRGITVVAPQDAVPFLKALPIEKFHGVGKKTVPRMHELGIYTGKDLYECTEMMLIRNFGKMGYSLYRKVRGIHDSPVNVTRERKSVGKEHTYGQPLQTEEAVLTQLRQLAEKVEEALRRVQKHGKTVVLKVRYTDYSTVTKRVTLPEYIYKKEALFYQASLIWEEILGVEKGIRLLGITLTNLDPMTYENIVLPLWENQEI >NZ_LN999987|717049:725520|720257_721130_+|WP_002288078.1|DBSCAN-SWA MYNQKSFKGNPVYGDLYLVPTPIGNLEDMSYRSVRMLQESDLIASEDTRNTQKLLNHFEIHTPQKSLHEHNYKERVPQLIALLKEGKTIAQVSDAGMPSISDPGHELVLACIKEGISVISIPGPTAGMTALIASGLVPQPFLFYGFLPRKKKEQKETLKKLKEQTVTLIFYESPYRITATLTNFLEIFGNRQVVLCRELTKVHEEYLRGSTEELLAYIEEHPVKGECCLLVEGNLFEMPVTEVDEELGTLKEQVEAKIASGEKPNAAIKAVALKNGLKKQEVYRQYHELD >NZ_LN999987|717049:725520|718051_718990_+|WP_002288071.1|DBSCAN-SWA MNQEINLAQMQPIVYQQLQRSFEHGRIAHAYLFEGEKGTGKHEVGIWLAQHLFCTQMKDNLPCGKCNNCQRIEKKEHPDVLVIEPEGQTIKVDQIRRLQTEFSRSGYESRKKVFLIKEAEKMNSSAANSLLKFLEEPPGDFLAVLETDAVGRILPTIQSRCQVLHFQELSKEALIHRLQEEQIPLEKAKLLAFLTNSLGKAVEISQDEWFNDAKDLIYQWFVYLQKQDTQAFIYVQKKLVKSFKEKTQQFTGLSVLMFYYQEAQRQAVANGEYGKVKQINQIIERILIAEQKLRSNVSFQAVAEQFVLHTIF >NZ_LN999987|717049:725520|723330_725520_-|WP_002288083.1|DBSCAN-SWA MKVNYEEKTVVTQQPETSQMKVIKRDGRHVDFDEQKINEALIKAEKKIHGSLSPLTYEKIQMIADLVVQEIKSRFAENVKIYEIQNIVEHILLEKNEYELAEEYINYRTKRDFARSKATDINFSIEKLINKDQTVVNENANKDSNVFNTQRDLTAGIVGKSIGLKMLPPHIANAHQKGDIHYHDLDYHPYTPMTNCCLIDFKGMLNNGFKIGNAEVESPKSIQTATAQISQIIANVASSQYGGCSADRTDELLAPFAELNYKKHLKDAEEWIDSPERQKEYAKAKTKKDIFDAMQSLEYEINTLFTSNGQTPFTSLGFGLGENWFEREIQKAILQIRINGLGSEKRTAIFPKLIFTLKKGVNLNPEDPNYDIKQLALECATKRMYPDILNYDKIVELTGSFKVPMGCRSFLQGWKDENGQEVNVGRMNLGVVTLNLPRIAIESKGDQNKFWQLLSDRLEIMKDALLYRVERCKEAIPANAPILYMYGAFGKRLSRTDSVNELFKNRRATVSLGYIGLYEVASAFFGGEWETNPEAKAFTLDIVKELKANADAWGDEYGYHFSVYSTPSESLTDRFCRLDTEKFGIIENITDKEYYTNSFHYDVRKNPTPFEKLEFEKDYPKYCSGGFIHYCEYPMLQQNPKALEAVWDFAYDKIGYLGTNTPIDHCYQCGFEGDFKPTERGFECPECGNHDPKTCDVVKRTCGYLGNPQARPMVHGRHKEISSRVKHMK >NZ_LN999987|717049:725520|722413_723016_-|WP_002288081.1|DBSCAN-SWA MRNPKPKEWLAKDYSQNYIADYKPFNFVDGEGVRNSLYVSGCLFACEGCFNKAAQNFRYGKPFTPELEEQIIADLRNDYVQGLTLLGGEPFLNTDVCLQVVRRIRKEFGTTKDIWSWTGYTFDELLQDSEDKLELLSQIDILVDGRFELSKRDLKLQFRGSSNQRIIDVQKSLESNQVVIWEKCTDATETYEQIKKQDLI >NZ_LN999987|717049:725520|717708_718038_+|WP_002292340.1|DBSCAN-SWA MKIILAIIQDKDSNRLSNELIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIVGIEDDRVEEALEIIKKTCESRKQFVSTPVTLDISMDGGVPYPVEVEVGGATVFVLPVEGFHQF >NZ_LN999987|717049:725520|719841_720189_+|WP_002288076.1|DBSCAN-SWA MDKRSLYDGLNQLESELRNTLTELVEMKHALHEIVEKNTTLEMENQRLREHLRELNQVAQAPAENVKQELSKSRMNLEKIYEEGFHVCYDLYGSRRDNDEPCAFCLEVIYRESGR |
8 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
778530 : 869267
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN999987|778530:869267|DBSCAN-SWA AATGAAAATGAAAGAAACCTTGCAATTAGGAAAAACAAAATTCCCTATGCGTGGTAATTTGCCAAACCGAGAAGGCGAGTGGCAAAAAGAATGGGAAGAAAATCGAATCTACCAAAAAAGACAAGAGTTGAACGAAGGAAAACCTAGCTTTGTTCTTCATGATGGACCTCCATATGCCAATGGTAATATCCATTTAGGACATTCATTGAATAAAATCAGTAAAGACATTATCATTCGTTCAAAATCAATGTCTGGCTATCGTGCACCATATGTTCCAGGATGGGATACACATGGATTGCCGATTGAACAAGTATTGGCTAATAAAGGCGTGAAACGTAAAGAAATGTCCATGGCAGAATACTTGGAAAAATGTCGTGAATATGCACTTTCCCAAGTAGATAAGCAACGAGCAGATTTCAAACGCCTAGGAGTTGCAGGAGATTGGGAACATCCTTATGTTACATTAGATCCTTCTTATGAAGCTGCACAAGTACGCGTATTTGGTAAAATGGCTGAAAAAAGCTATATTTACAAAGGATTGAAACCAATTTACTGGTCTCCGTCAAGTGAGTCTTCTTTAGCGGAAGCTGAAATTGAATATAAAGATGTAAAATCTCCATCTATTTTTGTAGCTTTCAATGTCAAAGACGGCAAAGATATTCTTGATGAAGATACAGCTTTTGTCATTTGGACGACAACACCATGGACATTGCCAGCAAACCAAGGTATTGCTGTAAATCCAAAATTTACGTATGTATTGGTGGAAGCCGATGGCCGTAAGTTTGTCGTAGCGAAAGATTTGCTAGAAACAGTCCAATCAGAAATCGGTTGGGAAAATGTAACAGTTCTAAAAGAATTTGCTGGACAAGAAATGGAATATATGACTGCAAGTCATCCATTCTATGAACGTGAATCACTTGTGATTTTAGGCGATCATGTTACTTTAGACGCTGGTACTGGATTAGTCCATACTGCTCCAGGACATGGGGAAGATGACTATATCGCTGGTAGCAAATATAAACTATCTGTAGTGTCACCTGTAGACTCAAAAGGATTGTTTACAGAAGAAGCACCTGGATTTGAAGGTATCTTTTATGACAAAGCAAATCCTATGATCACTGATCTATTAAAAGAAAAAGGAGCTTTGCTGAAGCTAGATTTCTTTACTCATAGTTATCCTCACGATTGGCGGACGAAAAAGCCTGTGATCTATCGGGCAACTCCACAATGGTTTGCATCTATCGATAAATTCCGTCAGAATATTTTGGATGAAGTAGAAAAAGTAGAGTGGGTTATCCCATGGGGTAAAACACGTTTGTATAATATGATCCGTGACCGCGGCGATTGGGTAATTTCCCGTCAGCGTGCATGGGGAGTACCACTTCCGATTTTCTATGCTGAAAATGGAGAAGCAATCATCACACCAGAAACAATCGAACATGTGGCAAAATTATTTGCTGAACATGGATCAATTATCTGGTTTGAAAAAGAAGCGAAAGAACTTCTTCCTGAAGGATTTACCCACCCAGGTTCTCCTAATGGCGAATTTACAAAAGAAAAAGATATCATGGATGTCTGGTTTGATTCTGGTTCTTCTCATGAAGCTGTTTTACGTCAGCGACCAGAATTATCATTCCCAGCAGATATGTATTTAGAAGGATCAGACCAATATCGTGGCTGGTTCAACTCAAGTATCACGACTAGTGTGGCTATCAATGGTGTAGCACCATACAAATCAGTTATTTCTCAAGGATTTGCTTTAGATGGTGAAGGCCGTAAGATGAGTAAATCTTTAGGAAACATCATTGCACCAGAAAAAGTGATCAAACAATTTGGTGCAGATATCCTTCGCTTATGGGTATCTAGTGTAGATTATGAAGCAGATGTTCGTGTTTCTATGGATATCTTAAGTCAAGTGGCAGAAGTATATCGTAAAATCAGAAATACGATGCGTTTCTTATTAGCGAATACAGAAGATTTCGATCCTAAAAAAGATACTGTTTCGTACAATGATTTACGTTCTGTAGACAAATATATGACCGTTCGATTGAACCAAGTAATCAAAGAAATCCGAGAAGAAGGGTACGACAAATATAACTTCATGCATATTTACCGTACAGTTATGAACTTCTTGACGGTTGATCTATCGTCATTCTACCTGGATTTTGCTAAAGATGTAGTTTATATTGAAGCAGAAGATGATTATCAACGTCGTTGCATGCAAACTGTTTTCTATCAAACAGCTGTAGCTTTGACAAAATTATTGACTCCTATCATTCCGCATACAGCAGAAGAAATCTGGTCATTCCTGAAAGAAGAAGAGGAGTACGTTCAGTTAAGCGAGTTTCCTGGTTATGAAGAGTTTGCAAACCAAGAAGAATTGATGGATACCTGGACTGCTTTCATGGACTTCCGTGATAATGTCTTAAAAGCATTGGAAGAAGCAAGAAACAGCAAATTGATTGGTAAATCTTTGGAAGCAAAACTAACTGTTTATCCAAAACAACAAGTTCGTGAAATGTTAAAAGCTTTGGATGCAGATATTGCACAATTATTGATCGTTTCACCAGACTACTTTGAAGTTATGGCAGCAGATGAACAAGTGCCAGATAACGCTATGGTATTTGATGATGTTGCTATTACAGTGGAAAAAGCAGACGGGGAAACTTGCGATCGCTGTCGCCAAGTTCGTAAAGATGTAGGAGTAGATGAAAAACTTCCTCATCTATGCGGTCGTTGTGCAAAAATCGTTGAAGACTTCTATCCTGAAGCTGTAGCTGAAGGATTCGAAGAAAAGTAAAAGGGAAAAGGGGGTGTGACATGTTCTTTGTCACACCCCCTTTTGTTATCAATCGTTTAATTTTCCACGTTCACGATACCAGTTATCTGGTTGCCAGATCCATTCGAATCCGTCTTTTTCAAGTAGTTCGAAAGCTGCTTTAGGTCCCATTGATCCAGCTTTGTAGTTGGGAAAATCCGGTTGTGTTTGGTCCCAAGCTTTTCGAATGACATCCACGATATGCCAAGATTGAGCGACTTCTTCCCAATGAGAGAAGTTCGTTCCATCACCATTCAACGCATCTAATAGTAATTTTTCGTAAGCTTCTGGGCTATTTTCAACCATTTCTGCACTATTTCTAAATTCCAATTTGATTGGTTCCGTTTCAAATCCTTGCCCTACTTCTTTCCCATTCAAGGATAAAGAAAATCCTTCAGTTGGCTGAATATAGATCGTTAGAACATTAGGTGGAAGTGTCGTATCGTCACATGGTTCATCGACAGATGTTTTGAATACATTAACAGGAACTTGTTTGAATACGATGTTGATCCGAGTCCCTTTTTCAGTCAAACGTTTGCCTGTACGTACATAGAAAGGAACACCTGACCAACGGAAGTTATCGATAGTGAATTTGCCTGCGACGAATGTTTCAGTCTCTGATTGAGCATCCACTTTGTCTTCTTCGCGATAGCCCTTGAATTGTACACCATCCAATTCACCTTGAGCATATTGCCCGCGAACGAAGTTTTCTAACACTTCTTCTTCGTTATAAATGCGGATAGCTTTCAATGCTTTGATCTTTTCTGTACGGATTTCTTTTTCGGAAAATGCTACTGGCGGTTCCATTGCAAGTAATGCTACAACCTGTAAAATATGATTTTGCACCATGTCTTTAAGTGCGCCACTATGATCGTAGTAGCCCCCGCGATCTTCTACACCGAGGTTTTCGCCAAAAGTAATTTGGATATTGTCGATATAGCGATTGTTCCATTGAGCCTCAAAAATATTATTGGCAAAACGGATAGCTGAGATGTTTTGGATCATTTCTTTTCCTAAATAATGATCAATCCTGAAAATATCTTGTTCTGGGAATACTTCTCTGATTTGCTGGTTCAATTCAAAAGCAGACTGGTAATCAGAACCGAACGGTTTTTCTATGATCAAACGATTGAAGCCATTTTTTGTCATAATATTTTGTGATTTCAAATGAGAAACGATCGTTCCAAAAAATTGAGGTGCCATAGCCAAATAATAGACACGGTTACCGTTTAATTGATAGTGTCCATCTAATCGGTCAGACAATTCTTTTAATGTCTGATAATGCGTTGAATCATTTACATCATGGGATTGATAGTAAAAATGGCTTGCAAAGGTAGTTGCTTCTTCATCTGAAGGATTCAATGCACGGATTGTTTCTTTGACAACTTCACGGTAGTGCTCATCGCTCCAGGGACGGCGAGCGGTTCCGATTACAGCAAAATGCTCGCCTAAATTTCCTTTTCTGTAAAGGCGGAACAAAGACGGGTACAATTTACGCTGGGCTAGGTCACCTGTACCGCCGAATATCGTAAACAATACATTTTTTTCATTAGACATGTGGATACACTCCTTTATATTTTATCGACAAAAATCGTGCTGGCCGCCTTAAAGCTGACGGGGATTTTCTTTCTATCATTTTGGATAGTGATCGGTCCTTCATAAGCTGCGATGTCAACGATCTCATATTCTTCGTTGATATTCAGGTCAATAGTGACTAAGTAATCCAACAATTCTTTTTCATCAAGCACTCGTGCGATACGCACTTTTGTACCGACAGGATAGGACTCCAATGTTTGTCGGCGTTCTTCATGGACAACTTCCTCTTTTTTAGGAATCGATCCTCCATGAGGACAATGTTCAGGATGATTCAAATAGTTTTCTAAATGATCTGCAAGATGTTCCGAAGTCACATGTTCCAATACTTCAGCATCATCATGGACTTCATTCCAGCTATAGTCTAAATGTTCAACTAAAAAAACTTCCCATAAGCGATGTTTGCGAATCAGACTGCTAGCTTTTTGCAGTCCGCTTGCAGTCAATTGTACACCTTGATAAGGGGAATGTTCTACAAGCTCTTCTTTCACAAGTTTAGAAATCATTTCACTGACAGATGCAGCTGAGACATCTAGACTAGATACGATTTGTTTATTGTTGACTTTCGTTGTATCTCCACCTAGTTCTA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110 | Streptococcus_phage(26.53%) | capsid,tail,head,transposase,protease,holin,terminase,tRNA,portal,integrase | attL 769010:769025|attR 859598:859613 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
883178 : 936113
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LN999987|883178:936113|DBSCAN-SWA TTTGGAAACTACAGATACGTTGCTTCAGTTGCTTCAAGAAGCCCATAAAACCAATCAAACACAACAACAAACCATTCAGAATCTTACAACTGAAATCCAACTATTGAATGAAAAGGTCAATTATTTAACCAACAAATTATTTGGACGCTCTAAAGAGACTCTCTTTGAAGAAACGAATGGGCAATTGAATCTTTTTAGTGATGAAGAAATTTCTGTAAGTGTTCCAGAAGCAGCTGCCACCATTATTCCAGTAAAAGGACATCAACGAGTTGTAGGAACGAAAACAGACAAAATCAAACACTTACCTATAACAGAGAAAGAACATCTCCTTCCTTTGGAAGAACAATTTTGTGAACATTGCGGTTCACAGATGAAAGATATCGGACGGACAAAAGTACGAGAAGAAATTCGTTTCCATCAGGCTATGTTGGATTGTCTCACCCATTATCAACATACCTATTGTTGTAAAAGCTGCGAAAAAGAAGGACTTTCTTCTTTTAAAAAAGCGATCGTTCCTAAACCTTTGATTTCTAATAGCTTAGGTTCCAATAGTTTAGTGGCGGAAACGATCCGGATGAAATTTGGTCAGAAAGTTCCTGCCTATCGGCAAGAGAACTATTGGAAACAAACACATGGGTTGGATATTTCGAGAGATAATATCACCAATTGGCATATTAAAGCAGTGCAAAACGCGTTAGACCCTTTAGGAGAACGATTAAGAGTCTATCTTAATCAAGAAGAGATTCTACACGGGGATGAAACAAGTTATCGTGTGATTGAAAGTGCCAAAACAGATACCTATTACTGGCAGTTTTGTACAGGAAAAGACAGTCAGCATCCCATCGTTTATTATCACCACGACGAAAGTCGTGCTGGAGATGTTCCGAAAACTTTTCTCAAGGAGTTTACAGGGTATTTACACTGTGACGGCTATAGCGGGTATAATGCCGTGGAAAGTGTACGACTTGTCTATTGTTTCGCGCATGTTCGGCGGAAATTTTTCGAAGCAATTCCAAAAGGAAAGAAAAACACGGATATTCCCGCAGCTCAAGCAGTCAAACAATTGGATAAATGGTTTGTCCTAGAAAAGAAATGGAAAGACTTTTCTCCTGAGAAGCGATTAAGCTGTCGGCAACAAGAACTGCGTCCATTATTTATTGCTTTTTATGAGTGGATGGCAACGATAGATCCTGTTGCAAAATCCAAGTTGGATGCAGCCGTTCAATATGCGTGTAAACTACGAAGTGGTTTTGAACCTATTTTTGAAGATGGTCGTTTAGAACTCACAAATAATCGTGCGGAGCGAAATATCAAAGAGCTGGTGATAGGACGGAAAAATTGGTTGCATTCCACAAGTCTTGAAGGAGCACGAACTTCAGGAATCATTCTGAGTGTATATAAAACAGCAGAACTTAACGGATTGAATCCTGTAAAGTATCTAGAGTTTCTATTTGATAAGATACCAAATCTTCCCGTACTTTCAGCAGAAACTTTAGATCAACTGTTGCCTTGGAACAAGGATGTACAACAACATTTTTCTCGTAACTAAAAACGCCAAACATTCCCGATTCTATTCTATAGGTCGGGTTATTTGACGTACAGGTACTGTTCTATGGGGCGCTTACCTCCTAGATTGTAGTAATAATGGAAAGGGATAGAAGTAAAACGAGTTGAATGAATTTTTTGAGGGGGAGAATATTATGGGCGACTCAGAGGAAACCCACATTCAACATACGTTTGACAGTTTTTGTAAGAAAGTAGTCTGCAATGAGGCGTTAAATATTCAAAAGAAGTACGCTAGATTTCGCCAACGGCAAATATCAATGGAAATATTGGAACAAAAAGGGTTAGGTACAGAGTTCTATTATTTGGAACCAAATTTGAATAGTAGTGGTACTTTTATTGTCCTTGGTATGAAAATCTTTATTTCCAATGAGGAGTTGGCAAATGCGATTGCAGCATTACCTAGTCAAAGACAAGAAATCATTTTTATGTCCTTCCTCATCGGTCTTAATGATCGTGAAATTGGCGATATTATTGGGAAAAGTCTCGGCAGTGTTTGGTACCAACGACAAATGGCTTTGGAAGAGCTAGGAAAGTATTTGGGTGTCAAATATGAAGCAAAATAAACGATATATACCATTCATACCACTAACGACAATCAAAGCCGCAGCTTCTGGTGATTCAATTGCCATGTCCATCGTTCTGTCAAAATATCAAAATTATATTTCACGGTTAGCCATGAAACCAGTTTATGAAGAAGAAAAAGGAATGGTTATGTATGTAGATGAATATATGCGTAGACAACTGGAAACAAAATTGATTGAGAAGATACTTGAATTTGATACAACTCGTTAAAGTATTTTTTCCCTTTCCTTTTCATTCTATGGAAGTTTTTTATCGGGTCAAAATAAAGGATTTCCATAGGCTGAAAATAGCCTAGCGCTCTTTGACAAATGAATAGCAAATCTATCAGTACATGTAGATTTTGATTCTCTAGTTACGCCATGACAAGGTTAGCTTTTAAGCGACAAATTTTAATATGAGAATCGCGACTACGATAATGATACTTCCGTAACCAAATCGGCCCGCCATTACTGGGGGGAGGTGAGATTCCTATGTGCTTTGGCAAAACAGCTGATAGATCAGAAAAACTACTATTTCCATATTTCGATTTTGGTTGGCATATTTTTCATGCCAAATTCTGTGATTTTAATAGCATCGGCAAGATTTAATTTTTCTTCAGCTCTCTCTCCACTTTTAAGTTTTTTTACTGTACTCAAGTTGATTCCTGTTCCGAATGCTATTGCATTAGCCGTAGATTTTTCAAGAATTTCTTTAATTATTTTTATGTCTGCAATTCCTTGTTTCATATTAAAAATTCCTCTTTTCTAGTCCGTTTTGATGGAGTACTGGAGTGTTTTTTTACAATTTTAAGGGGTACCGTGGTGGTCGTTTTGATTTTGAGAGAGAAGGGTGATGGAGTTGGAAGTTAAAACAAATGTTAATTCTCTGGAAATAGAGTTCTATTCAATTTTACAAAAAAAACTGGAAGATTACACGGAAAAATTGCTTGCAGTCAGTCATTTACCTCTGGTATTAACAAATACTGATTTAAAGCGACTATTTCAGATAAGTGATAGTACACTGAACCGTTTAGTAAAACTTGGTGAGTTTCCTCCCTGTTGGTACGGGATTCGAGGACACTATTTTCGTGATGATGTTTTAGAATGGATGAGAAAGAGTGATTCGAATGACTATCGAGAAAAATTGCGACTACTTCGATCTTTATAAGTTACATTTTCTTTCTAAGATGCGGTACAATGATGACATAGATAGAAAGATTTCCAAAGGGTTTCTGCTTGTTGGGTTCCTTCAAAATAGGAGGAATCAATAAATGGAAAAAACAGATCGATTCAAGAAGCAAATCAGTTCTACTGGTAGGATCACATGGTACTTTCAAGCATATCGAACAACAAGACGTGGCTTTAATTCAAAACGTGAGGCGCAACTCGCTTATCTGGAAATGGAGAAACAACAAAGGCTTAAGAAAAAAATTGTTGCAAGCAATGACAAGTTTAGTGTTGTAGGTGAGCAATGGTTCCAATATTACCGTTCGTTAAATGAACAAAAGGAAATAACCTATGATAAGCGAGAGGAACAATTAAAAATTATTGTTCGATGGATTGGTGATAAAAAGTTGTCTGATTTGACACCAGAGTGCCTTCAAGAATTGCTTTTTACCTTAAAGGAATGTGGCGTTAATGGAACAAATGTTGGCTATGCCAAAAATAGTTTACAATCACTTATTCAAGTTCTAAATATGATTTTTAAATATTGTCAAAGAAAGAATTTGATAAGTGAAAATCCAATGAAGTCTGTGAGAATGCCAAAATATCAGTTAACGGTAACTGATTTAAAAGAAGCCATAAATAATATTGAGGACAAGTTTCTTACTGTCGATGAATTGAGAACTTTTTTGAATTATGGCATTGTTCATGAGGAATTACCGATGTCTGTACTTTTCCATGTTCTATTTTACACTGGCTGCCGAGTCAGCGAGGCGCTTGCTCTACAGCCTGGAGATATAGATTTCAAAAGAAATGAAATTCTGTTCTATAAGCAAACGGCAGTTAAAGGTAAGAGTAAGGATTTTCGAATTGAAACTACTAAGACAGTTAGTTCTGCTAGACGAGTTCTAGTAACTCCTCTAGTTATGGAAAAGCTACAACAGTTGATTAAGGCTTTGGGTGAGATGAGGCAACATTACAGGTTTATTATAGAAGAAACATATTTGTTTGTGTATCTTGATTCTAGTAAACGTGGTGTTCCTTATCGTCGAGAGTATGTAAATGATCACGTCAAACGGTGCGTGAATCGCTCAGGAATTAATAAGCCATTTCATACTCATTTAGCTCGTCATACAATGGCAAGCTTAGTAGCGGAACACTGTAGCTGGGAAGTCTTGAAAGATCGCTTAGGCCATACTGACCAAACAACTTCGAAAATTTATCGCCACTTAACGTCAAATGAAAAGGTAAAACCTCTGATTGCTTTTAGTTCTTTAGAGAGTTAAAAAAACGGTGAAAGCACTGGTATTACAGGATTCTTGAAAAACGATTTTTTAACAAATTAGTCAATATGTAGTCAGAGGTAATAAAAATCCTTTTATATCAATACTTTAACGACTTTTCACAAGTATCAAAGAAATCCGTCGTTAATCATTGTTATCAGACTGAGAAAGAACCCTTGGTATTCAAGGGTTCTTTTTTCTTAGCATGTAATTTGAACACCCTGATCCAGTTTTTTCTTTAATTATTGGTAGGGGAGAATAATGGATTAGAATAAATCTACCTATAAGTAGTAGTAAAAAAAAGAGCACTATGATAATATCTTTCTTAAGAGTAACCGCTTTAATAAAAAATCCAGAATATTCTAACATAAATGGAGTATTCTTAGAATCAAAAGGAGAAAGAAGATGGTTTATACTTATACGGAGC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51 | Streptococcus_phage(36.36%) | tRNA,transposase,integrase | attL 876790:876805|attR 891713:891728 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1120730 : 1254820
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LN999987|1120730:1254820|DBSCAN-SWA 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113 | Streptococcus_phage(25.93%) | tRNA,transposase,integrase | attL 1116605:1116621|attR 1261348:1261364 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1415470 : 1424531
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN999987|1415470:1424531|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN999987|1415470:1424531|1418544_1420767_-|WP_002288015.1|DBSCAN-SWA MKTLKEPTAEEIKKKRIYAEWGLTDEEYRMIEEDILGRMPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTSGPHVLQGPGEGAGIVDIGDGLAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGELDNPRTKYLLEEVVAGIGGYGNCIGIPTVGGEIAFDPCYEGNPLVNAMCVGLIEHKHIQKGQAAGVGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFNQEEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELILHHSDSLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLILTLDEVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLICVKSGEEEKIQELFQKYDLDAVTIGKVTDDGQYRLYHQGEEVANLPVDALAEDAPVYHKEMKEPARIVEFQQLAPYQPVIEEPGQVLLDLLQQPTIASKRSIYETYDSQVQTNTVVRPGSDAAVMRVRGTNKALAMTTDCNARYLYLDPKIGGQIAVAEAARNIIASGGKPLAITDCLNYGSPDKPEVFWELSTSADGIAAACETLGTPVISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLIEDHKHITTQEFKKSGDLIYILGKTFADFDGSELQKMQLGRIEGVIRNFDLSIEKRNQELVLTAIQNGLIESAHDCSEGGLAIALAESAFKHQLGISVQFELSSAQLFAETQSRFVLTVAPENKTRFEEMMGDAAVLAGKVTDEAIIEISATDGQIKIETAVARKCWEDAIVCLMK >NZ_LN999987|1415470:1424531|1421694_1422423_-|WP_002288021.1|DBSCAN-SWA MEKKELLYEGKAKKIYLTSDENLIWIEYLDQATALNGARKDQISGKGELNNQITSAIFRYLTQRGIKNHFIEQLSKTEQLAKKVQIIPLEVVIRNIAAGSFSKRLGVPEGKEFIKPIIEFYYKDDQLDDPFINEEHIYFLQLAKPEEISELKAQALAINEILTELFAKVGLVLVDFKLEFGRSNGQILLADEVTPDTCRLWDERTNEHMDKDVYRRDLGDLIPVYQEVYNRLSELTEEKERV >NZ_LN999987|1415470:1424531|1420767_1421439_-|WP_002288017.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDADMLWAVREIMGADAEFVRHDESSLEGFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSTIMEEVIRFAEEGKPVFGTCNGFQILTEAGLLPGVLRRNESLHFICKTVPLKVNPKTAFTSEYEADEIIYLPVAHGEGNYFCDEETLQELKKNNQIAFTYNDNINGSVENIAGITNKAGNVLGMMPHPERAVEDLLGSEDGKRFFASILKNFGKVTV >NZ_LN999987|1415470:1424531|1421440_1421695_-|WP_002295474.1|DBSCAN-SWA MYFVKVYVTYKDSVLDPQGEAVKKAVHRMGYETIEDIRIGKYFEIQLADAEEPIDTVIETICDKLLANVNMETYRYEIKKMEEV >NZ_LN999987|1415470:1424531|1423235_1424531_-|WP_002288023.1|DBSCAN-SWA MLERYTRPEMGNIWTEENKYRAWLEVEILADEAWAELGEIPQEDVKKIREHASFDIDRILEIEKLTRHDVVAFTRAVSETLGEERKWVHYGLTSTDVVDTAYGYLIKQANDILREDLKRFTEIIGEKAKEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLATWYSEMKRNIERFEHAAKGVEAGKISGAVGTFANIPPFIEEYVCKQLGIRPQEISTQVLPRDLHAEYFSAMALIATSIERFATEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMAGLARVVRGHMVTAYENVTLWHERDISHSSAERIILPDTTILLNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMSATFGLIYSQRVMLKLIDKGMTREEAYDLVQPKTAYAWDNQVQFRPLLEEDPTITSVLSKEEIDDAFDYHHHLKNVDVIFKRVGLE >NZ_LN999987|1415470:1424531|1416045_1417098_-|WP_002288011.1|DBSCAN-SWA MNSMANAYAKAGVDVEAGYEVVERIKKHVKKTERLGMMGAIGGFGGCFDLSVFQLKEPVLVSGTDGVGTKLAVAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLYFLDYLATGKNDPLRLENVVKGVADGCVQGNMALIGGETAEMPGMYSGNDYDLAGFAVGIAEKSQLLTGETINPGDVLLGIASSGIHSNGYSLVRKIFFEQQQFSLSSKLPELKKTLGEELLEPTKIYVSSLLPLIKEKKIKGAAHITGGGFVENIPRMLPESMAAQIKLGSWPILPIFGCLQKYGEIPEMEMYEIFNMGIGMVLAVEESKVKEIVHEIEQAGEKVYEIGKVIAKEKHRVVFIGEER >NZ_LN999987|1415470:1424531|1417120_1418560_-|WP_002288013.1|DBSCAN-SWA MSYEVKSLNEECGIFGVWGHPDAASVAYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDRGKLKGHRDLGLLSEVFKDQRKLQQLTGEAAIGHVRYATAGNGSVDNIQPFLFKFHDQSIGLAHNGNLINARSLRKELEENGAIFHSNSDTEILMHLIRRSEETDFLNKLKSALNEVKGGFAYLLMTETAMIAALDPNGFRPLAIGQMKNGAYVIASETCALEVIGARFIRDVQPGEIVIINDEGIQIDCFTKDTQLSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHTARKNMGRNLAKESPVKADMVVGVPNSSLSAASGYAEASGIPYEIGLVKNQYIARTFIQPTPELREQGVRMKLSAVRGVVEGKKVIMVDDSIVRGTTSRRIVHLLKEAGAKEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTIDEIKECIGADSLGFLSEEGLIESIGLEKDAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEKYQESLKEKVSFF >NZ_LN999987|1415470:1424531|1415470_1416049_-|WP_002288010.1|DBSCAN-SWA MRIAVFASGNGSNFQALADYLSKKGLESSIDWLFCDQPEAYVLKRATALSVPADCFSPKEFDSKKEYEEAILHKLKEKKIDLIVLAGYMRIIGPVLLKNYDKRIINIHPSLLPAFPGLHGIRDAFEAGVKETGVTIHYIDQGVDTGPIIRQEKVRIEQEDTFDSLEEKIHRVEHRIYPEVISEIIENGGYLK >NZ_LN999987|1415470:1424531|1422678_1423056_+|WP_002297115.1|DBSCAN-SWA MEDAIKQGQLFLSELTAEERSCLYNDLLSIKDVYLCNKDTSFYTFRKIRRATKRCAECRKRTFLYQTEHKGELSISQIHEQKRFKNHYRIQILFNGQEMEYAFLENLLQHLHNQHFSYNSQAIYA |
9 | Synechococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1679156 : 1735922
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LN999987|1679156:1735922|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(20.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1757364 : 1795944
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LN999987|1757364:1795944|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LN999987|1757364:1795944|1794125_1794692_+|WP_002339928.1|DBSCAN-SWA MAKKVMGQDGKMYKVKKPFYKRVWFWLLAVVVVFIAIGSQGGSDDAKNTVAETTKESVTEVSSAESVAESTVVEEETETTETTIEEVTQEESVPREYRNALSKAESYLGWAGMSEQGLREQLEFEEYPSDAIDYALANVDVDYNEQALAKAESYDDWASMSDSQLYDQLIFEGFTDEQAQYALDNLPQ >NZ_LN999987|1757364:1795944|1785200_1785518_-|WP_033705817.1|DBSCAN-SWA MDLITQYSDIILKKIMMKIQKDKKSKERAEIVKLEMAETGSGVRTSRHWKATANIEFYYKEIQKGFEQMRELDRQTNWSKKLHQDRFKFVEKYREILDEYMEEQR >NZ_LN999987|1757364:1795944|1778050_1778737_-|WP_002286527.1|protease|DBSCAN-SWA MTTMKTFLAVKNEGAVPQIFIQGFIGSSWFFEGNTDKGIKNILDSLGDQEEIEVVINSNGGDVFQGIAIGNLLKSNKAKVNVVINGLAASAASIIAMAGDTIKIYNNAQLMIHRASTYGEGNVDDFRTIADQLESIDKSVKASYKTRFNGTDEALQELLEKESFMDAETALSYGLVDEIIDAENSSGTEAKKEQSVEEILNDVKEKRAEKIAAFTAALNKTFGQGDVK >NZ_LN999987|1757364:1795944|1763614_1763908_-|WP_002286686.1|DBSCAN-SWA MINLGEWGAIAGSITAIVSLILLVIKPITASFSKITETLSKVSHNLDLLTKDLESSKSDRLMIHEELKKHDERLDTHAEKLVEHTQQIKTLFRERRK 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56 | Enterococcus_phage(31.03%) | tail,capsid,head,transposase,protease,holin,terminase,portal,integrase | attL 1780141:1780156|attR 1795965:1795980 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2072242 : 2085875
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LN999987|2072242:2085875|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LN999987|2072242:2085875|2072564_2072849_-|WP_002296484.1|head,tail|DBSCAN-SWA MVILDSIKKSMRIDHTIDDDFIQQLIDTAGEYIKSAIDSSATDKDMDNYQQFDLAVSLLTQHWYLNRQEASSERIPVTVQALVQQMRGAYYANH >NZ_LN999987|2072242:2085875|2081011_2081860_-|WP_002296494.1|DBSCAN-SWA MANNYQAATELQKSGWSIYPLSPGTKIPIKGSSGWNDATNDSNQINEWWTEDATRNIGLMLEDHQMVVVDLDQHSETRNGVENYKKLASMYDPFPSTYTEITPGKGIHFFFKIPDGVIIQQETGAFADIFGRDDKGKSLSGIDIITKGVPIAPTMIISRSVGRAYEPIENVSLNNIAPAPDWLVNLLLKKPQEIKTQYRPVAKTGTAKKLDMIVQGAGEGSRNDHLTKLCGWLLWHGVDNQTLAELIYTANAYNEPPLKDKEVNQIIRSMIKKDLRGKAHGS >NZ_LN999987|2072242:2085875|2078271_2078652_-|WP_002304527.1|DBSCAN-SWA MAVKKQCNHAGCKTLIDYRQKYCGKHKAKQTAIKREERKQSEGKYFQFYQSRTWRKASYLYRLNHPVCEDCLEEGLIRKADVVDHKIELKDDWNRRLDETNFRSLCHAHHNSKTANERQRREKSTL >NZ_LN999987|2072242:2085875|2072904_2074428_-|WP_002296485.1|capsid|DBSCAN-SWA MNNEEEKEKRLTEEAELTADSPKVEKENEKQPTDGKTISGYALKFGQPSKDLGGFVEVITPEALKEVDLSNVFLLYGHDYSKPLASVKAGTLKLNVDDTGLHFEAELTDTTYSNDVYENISKGVVDSMSFGFVLGLDSFDKKEDGTIERSIDKIKALNEISVVTVPAYDSSNVQVNKRSYESFMSNNQAKQTNNSLESTSKAQKESNNMEKTLIDNEKTELRGYEEYIRSQGEVRDGVTTVNAAAVVPEEVIGEVFDLKRSNYNLAQYATVKTVSNGQGKYPVATNQQAVLATKAELAEIGDIDAEMFTSVDYKVETRAGKIALSNEVVEDSAVNIVQEVKDQLAKLVENTDNKHIMDLLKTFTKKTAATLDDLKQLYNVALDPALNKMVILNQSGYYHLDTLKDSDGRYILQPDVTAPSGKSLFGMPVVLIADTLFANPKAGTFPMIMGDIAQSIFVARRNQVTTQWEKFDYYSQGLAVIVRNDYKKIDQNASVYIEFTPVVTPKV >NZ_LN999987|2072242:2085875|2084021_2084669_+|WP_002296501.1|DBSCAN-SWA MNGGENVARKKYPEAVETGQRIRLARIEKGLSMEQLGGKLSPPASKGAVSNWENGYNLPNNTRLKQLSKVLDVSTTYLLNGSYTLRDMHMMPEIKRNVLEKQLKKTIEKNNSIIDSNLSNAINNIEEDNLTVSQKIYLTNAIKYLKTGSRIEFPDGSTPIAYLAALLNTLLRYDSLINDSEKNTDEKKEYQEFYENDLLKEFTALVTELNKHYSK >NZ_LN999987|2072242:2085875|2083534_2083828_-|WP_002296500.1|DBSCAN-SWA MELKIDKLTLDDPAFKIIDDRVVQQVEQTQGTLLSLLEKKYQFPKYMNKAQAAKYMNVSYNTMMQKYVPNGLKLIIVDGVVRISQDECDRFMEEYQK >NZ_LN999987|2072242:2085875|2078873_2079281_-|WP_002296492.1|DBSCAN-SWA MLNIISTNKAPNFQYTDEMDRFLMNTLAFSVGLVTEDYSTFDPEVLKIMEEEPDWLQESVAWCQSLVVGSLVDSGNYDDTGELMDEFNCLLNLYDRARQRELTSNEDNLFLNIHDKFLALLLTDDELITNLLEVE >NZ_LN999987|2072242:2085875|2077440_2077914_-|WP_002296488.1|terminase|DBSCAN-SWA MGHPKILHDTKGNISSEEKAIRVDAREELFKQQPLINITPPDWMAASARSEWNRIVPTLKKDYPLSEADYGSLVAYCLAFARMKTAEAEIRKSGTFITCENGVKKANPAVRVQSQAMSDLKKQATSLGMTLESRSKLALNKVKNDEPEDPFKELMNS >NZ_LN999987|2072242:2085875|2082259_2082418_-|WP_002296496.1|DBSCAN-SWA MKRNLIIGSILIGGIFGLLPLIAKIAIFAGLALYLFTAYDEYDYQLRTGGHK >NZ_LN999987|2072242:2085875|2083179_2083491_-|WP_002296499.1|DBSCAN-SWA MESTQNKAIEKVLSTILTEDTAAELANLEGKALEETFECLYEQMDYQKLLPQEPTVSGVLRGLNDLVQAEFKERLSIEEYQEILYQQVELLASLLGLELEDVE >NZ_LN999987|2072242:2085875|2077982_2078138_-|WP_002296489.1|DBSCAN-SWA MKVGDLLKNTIVITDKTGKQRTIELPHFGQVTIQMQNGKIIYIDKLDKEKF >NZ_LN999987|2072242:2085875|2079546_2081022_-|WP_002296493.1|DBSCAN-SWA MAHKHKLDSILDFPEASEREDNIIELKTWMSRLRCNKDDQIKSNSVVNAELILTNDSNLAGTIAYNEFSGYIHLLKDSPWINRTAGEWEDSFEDALTAYIEENYNVVFDDNKIHKAVVNVARKNVFNPVKERIEKVKWDQQPRLETLFIDLLGVDDNLYTREVTKRWIVGSVARIYKPGIKFEIVPVLDGPQGIGKSTVPALLYTDDFFTDSLDSLGEKKDDYMQLQGNVIIELGELSSMNKTKIEQIKNFISAKIDKIRPPYGRNVIAWARQCVFIGTSNDGQYLKDDTGNRRFYPLPCKNKPKMNPFKTKDEYFLQVLAEAKVLFDKGQRIYFSPDEDKEVLEIAKDYQEDAKMENPIKEAITKYLEMEIPYKWEEAPAWARRSYYQNYPDSKCNEKNLQHFYNGATMQQEFYLVDSVLTADILEAVFDKQAKDLLNGRSDAETKKIALIISSIPGWERKQLPKRNKRRGFYNKSNAYENKNRAGKYKK >NZ_LN999987|2072242:2085875|2072242_2072578_-|WP_002296483.1|head|DBSCAN-SWA MPIIKNVNELTERVKFKKTKRVKDEDGQMVDSEETVFECWANVRSQMLKDVLASVGTILEGTLTFIIRYDQDYELTNDMKVAWKNKSYKIISINEGTAFKDYTTIIAKQIS >NZ_LN999987|2072242:2085875|2078655_2078871_-|WP_002296491.1|DBSCAN-SWA MHMESIRYFDGEKHIEYSNTQEDVDFISFEEDKITKVNFKDGTCLKIVSPYIEYKSKWEQDDSDERDRFGW >NZ_LN999987|2072242:2085875|2084729_2085875_+|WP_002296502.1|integrase|DBSCAN-SWA MATFKQYETKKGKFWLYEAYLGMNKMTGKPDKVRRRGYKTKKEAQLALSRLQVDYDKNGIKKANNETFKEVYDLWLETYKTTVREATFMKTEIKFRKWILPKYGNLRVNEVTVKKAQQIVNSWAETTDQYKVLHSTSKRIFSYAINLGIIETNPLDNVLMPKRTTTKHKEKVKVYSKEQLITLFDYLNSKPETYRNDFDKTLLRFLFYSGVRISEALALNWSDIDFQENTVTINKTLSQSKNGYKISDPKTDCSAGVLPLDERTISILKKWQINQRKYMLTLGVTDPTMIFCGIYKELITHHAIYARLITICEKAMVPFLGVHVARHTHASMLLDAGATMVEVQTRLRHTKISQTIDCYGHLAKETKEKTVEKLVQHLNID >NZ_LN999987|2072242:2085875|2075599_2075785_-|WP_002317249.1|DBSCAN-SWA MNFIQVKNFLSNYIHTVLLLLGLVCVLVAITLLTNVYYGLLALGIVLIGVAVMLNTEQKGG >NZ_LN999987|2072242:2085875|2074420_2075596_-|WP_002296486.1|portal|DBSCAN-SWA MAFFKARQNTTGDPFLQHVVSIQSDDYTTSFTSVRALRNSDVFAAVRIIASDIASSPIQLVKNNMPQADNELVKLLNEKPNSEMDGWHLKFALAVNMLLNGNSFAEIKRNGEKVEEIHLLPNSSVTVTQLDNGTLSYQIGDKKRRVKSSDILHFKYFTQDGLTGLPPLYALRDELKIQQAGNRTLHNFFTRGVSGSGILKVHKSDLDGSAKNAIREKFEEANGSSSGDNALRTIILDETMDYKTLEINTDVLKLINSNDWNTKQIAKAFGVPIERLGVENEHSSTVQSNLQYIQSTLIHYFNVFVSELDTKLETNIRFNSDQLLETDPETKVKNVLDQVKGSLLTINEGRSKMGLPPMDGGDRLLASLNFTYLDTLEKYQLKEQEGVTPVE >NZ_LN999987|2072242:2085875|2081896_2082259_-|WP_002296495.1|DBSCAN-SWA MYKTKLLNQLDSLELEEINQGIAELENNIGKTYFGNSFNEKLTVLYVLKKHAEHKIICREINELKNQILTAWLNITDMQEARVKTFNTWVKYQNQLKGAEFVRDGLKYELEQLKLMEVSE |
18 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tail,capsid,head,terminase,portal,integrase | attL 2071148:2071174|attR 2085955:2085981 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2204007 : 2212323
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LN999987|2204007:2212323|DBSCAN-SWA TCTATGCGATTTCTGAGCCATTTGGCATGGATTTTGGTGCTTCGATTACTTGTAAAGAGCCATCTGGTGCTTCTGCAGAAAGGATCATTCCTTGACTGATTTGTCCACGCATCTTTCGTGGTTTCAGATTTGCTACAATGACGACTTTTTTCCCGATCAATTCGCTTGGATCAGGATAAAATTCAGCGATTCCTGACAAGATTTGACGGTCTTGGCTGTCTCCAGCATCTAGTCGGAATTGCAGCAACTTATCTGCCCCTTCTACTTTTTGACAGTTGATGACTTCTGCTACTTTTAGTTCTACTTTTTCAAATACATCAAATTTGATTTGTTTTTCTTTCGTTGAAACAAGTTCTGTTTCTTCTGGATCCCATTTGACTGTATCTTCGTTTGTTTGAGTACCTTCAGACATTTTTTCTTGAATAAAAGCAACTTCTTCTTCCATATCTAAACGTGGGAAGATTGGTGTACCTTTTGCAACTACTTTTGTTCCTGAAGGAAATTCGCCAAAGTGTAATCCTTCAAGATTCATTGTTTCAGAGTCCAATCCTAGTTGATTGAAGATCTTCTCTGGCGTTTCTGTCATGATTGGCTGAAGTAATATCGCTGCGATACGCAAAGATTCAGCTAAATGGATCATGACACTATTCAATTCAGCTTTCTTTTCTTCGTCTTTTGCTAATACCCATGGTTCTGTTTCATCAATGTATTTGTTTGCACGAGAAATCAGCACCCAGATTTCAGCCAATGCTGTATTGAATTCCATTTTTTCCATTGCATCATGGTAACGTCCGACAACGTTAGCAGCCGTCGTAGACAGTTCACTATCAAATGGAGTGACAAGTGAGGCATAGTCAGGAACGAGTCCATCACAATATTTGTTGATCATAGCAATCGTTCGATTCAATAAGTTCCCTAGATCATTTGCCAGATCATAATTGACACGGGAAACAAAATCTTCTGGCGTAAAGACACCATCTGACCCAAACGGAACAGCACGAAGCAAATAATAACGGAGTGCATCTAAACCATAACGTTCCACAAGCATTTCAGGATAAACGACATTTCCTTTTGATTTAGACATTTTTCCGTCTTTCATCAATAGCCAGCCATGCCCAAATACTTTTTTAGGTAGAGGCAAATCAAGGGCCATCAGCATGATTGGCCAATAGATCGTATGAAAGCGAACGATTTCTTTACCGACCATCTGAACATCTGCAGGCCAGTATTTTTCGAATAGACTTTCATCTTCGGAGCCATATCCTAGTGCAGTAATATAATTGGATAATGCATCGATCCATACATACACCACATGTTTCGGATCACTCTTGACTGGTACTCCCCAAGTAAAAGTTGTTCGTGAAACTGCAAGATCCTCTAATCCTGGTTTGATAAAGTTGTTGATCATTTCGTTTTTACGAGATTCTGGCTGGATGAATTCGGGATGTTCTTCATAGTATTCCAATAGACGGTCTGCGTATTTGCTCATGCGGAAGAAGTATGATTCTTCTTTTACCAATTCTACTTCGTGTCCACTTGGCGCTTTACCACCGATCACGTTACCTTCGTCATCTTTGTACACTTCTGCAAGTTGTGTTTCTGTAAAGAATTCTTCGTCAGAAACAGAGTACCAGCCTTCATATTCACCTAAGTAAATATCTCCCTGTTCTAATAAACGATCAAATATTTTTTGAACAGCTGCTTTATGGTAATCATCTGTCGTGCGAATGAATTTATCATAACTGATATCAAGCGTTTTCCATAATTTCTTGACATCAGCCGCCATTTTATCTACATATTCTTGCGGTTTTACACCTAGTTCTTCTGCTTTTGTTTCGATTTTTTGACCATGTTCATCCACTCCAGTGAGATAAAACACATCAAAGCCCATCAACCGTTTATAACGAGCAATTGCGTCACATGCAATCGTAGTATACGAGTTGCCGATATGAAGTTTGCCGCTTGGATAATAGATTGGCGTAGTGATATAAAAAGTTTCCTTTTCTGCCACGGGGCTCTTCCTCCTTTATCGCATGATGCGAATTCGTTTCCTTGCTAGTATACCATAAAAAAAGCATGCTGTTAGCTTTTTTTCAAAATGAAAAAGACTGGATAAACGACTTCTATCTACGTTCAATCTATCCTTTAAAAGGATGAATAGGTTGAATAAATGCGGGTTTTTGTTTTGTTTCATATCTACTAAAAAACGGCTTTTTATTTCTCCCCTCACACGTGGTATAATAAAGACTATCTATCTTAGTAAGGGACTGGAACAATCATGCAGAAGAAACATCTTTTTTTTACACTTAGTATTGCTTTTCTTTCATTAGCACATTTAATATTCAGCTATTTTTATATTCGTATGTATGGTTATTTTAACCTCCATGGGCATTTGAACAGTTTTATGACAGCAGCTTGGATTTTGCGTTTTATCATTGACGTATATATCGTTATTTGTGGCTTCTTTGCCATTCGTGAAGAGCGGTATAAAGTATTGCCGTTTTATCTGCTTTTCTTTTTATTCAATCTCATACTTCCATTTATTTTTCATATTTAAATGATAACCTAGATTTTTCAAGTAAATCCTTGGTTTTTTTTCAGAGTCTGCTACAATAAGGTAAAAAGTACTTTTACTGTCAATGGAGGTGGTCAGATGAACCGTTTTGCTTCTAAAGAAGAAGAAAAATTATATTATGAACATAAAGCAAGTGAAGAAGAATTTCTTAACTGGTATCAAAAACAGGAACGTCCAGAATATGACAAGCCCTCTTTGACTGTCGATATCGTACTGATGTGCTATAACAAAGAAGAAGATCAGCTGAAAGTTTTGTTGATCCAAAGAAAAGGGCATCCTTATCGAAATTCATGGGCATTGCCTGGTGGCTTTGTCCAAAAGGATGAGTCAACTGGAGAAAGCGTCTTAAGAGAAACAAAGGAAGAAACTGGTGTGGTTATTTCAAAAGAAAATATTGAGCAACTGCATACATTCAGTACGCCTAATCGAGATCCGCGAGGCTGGGTCGTCACAGTCAGCTACTTAGCCTTTATTGGAGAAGAACCGCTAATCGCCGGAGATGATGCCAAGGAAGTACGCTGGTTCACACTAGAACGTCATAGTAACAAGATCCATTTATCTAGCGGAGAAGTGGCTATCTCGCTTGATTTAGTCACTGGAGAGTCTTCTGGCAAAGATACTTTGGCTTTTGACCATAGTCAAATCATCTTGAAAGCATTCAACCGTGTAGTCAATAAAATGGAACACGAGCCGCAAGTTCTACAAGTTTTAGGTAAAGATTTCACGATTACGGAAGCTCGAAAAGTATTTGCTAAATTCTTAGGGATCGATTATAAAACGATCGATCATTCCAATTTTAAGAAAGCTATGCTCCAATATTTCGATGAGATCGGTGAACGTCCTGTAGGAATCGGCCGTCCTTCAAAAATCTATCAGCTCAAGCCGGGGCACCATGAATAAGGTTGTGAGCAAAAGATTCAGACCTAATCATTCAAGAAAAAACGCAAAAACAACTCTTTGTGAGTTACGTTTTTTGTTTCAGAATTTTGATGTATTCGTAAACTTTCTGAATAAAAAATGGCTCTATAATTTATGGGACTGATGAATCAGAATTGATTCTTCAGCCCCATTTTCATTTTAGGTATTAAAAAACATATCGTTCTCTAGTATGATTAAATCACCACAAAATAAACAACTGAGAGGACGATACGCTATATGAATGATTCTATCAAAAAAATGCTGAGAATAACAGAGAAAGATTTGATGATTACAGAGGTCTCTTACGAGACCCTTCAGAAGAAAAAGACGTTGGTCGTCGATGCTGTTCTCTCGCCTACTCCTCGTGCTTGTAGAAGTTGTGGTTCTACTGTGGTAGATGGAAACGGGAAAGCAATTATAGTGAAAAATGGAAAAAAGGAAACGATTGTCCGTTTTGAACAATACAATCATATGCCTTTGGTTATGCGCCTAAAAAAGCAACGCTATACCTGTAAAAACTGTCGCACCCATTGGACGGCTCAAAGTTATTTTGTCCAACCCAGACATTCAATCGCAAATCATGTTAGATATAAAATTGCTTCTTTACTGACTGAAAAAGTATCTTTATCTTTTATTGCGAAAAGCTGTCAGGTATCTTTGACCACCGTTATTCGTACATTGAAAGAGTTTAAAAGCTATTTACCAAAGCAATCTAAGAAGATCCTCCCCAGAGTATTGATGGTTGACGAATTTCGTTCGCATGCTTCCATAGAAGATAAGATGAGCTTTATTTGCGCGGATGGCGAAACAGGAAAATTAATAGATGTTTTGCCTACGCGTAAATTACCTCGATTAACAAGCTATTTCTTAGGTTGTACCAATCCAGAAGAAGTAGAATTCTTGGTGACAGACATGAACGCCGCCTACTTCCAGCTCACCAAACGTGTTCTGCCAAATGCGAAAGTCGTGATTGATCGGTTTCATATTGTCAAACACATGAATCAAGCGTTCAATGAGTTGCGTATCCGTGAAATGAATGAACTTCGTAAAGCCGGACAGAAAAGCCAGGCAGAAAAACTGAAAAAGAACTGGCGCTTTTTGCTAAAAAATCGTGCAAACATCAACCATTATGAATACAAAACATGGAAAAGTTTCCGAGCACCAAAATACCCATTTCTTACTGAAGCAATGATGATTGATCGATTGCTTGAGTTTTCTCCGCCCCTAAAGGAGGCGTATCCCTTTTTTCATGAATTAGTTGAAGCCTTTCGAGACAAAGACCCTGACTTATTTTTCTCCTTATTGGCAGAACTTCCCGAAACGTTAGATGACAGCTTTCGGGAAAAGCTTCAAAACCTTCTGACCTATGAAGAAGGCATCACCAACGCAATGATCTATCCTTATTCCAATGGAAAAATAGAAGCGAAGAATACCCACATAAAGACAATGAAACGAGTATCCTACGGATTTAAATCATTTGAGAACATGAGAATTAGAATCTTTTTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LN999987|2204007:2212323|2209287_2210298_-|WP_002289328.1|DBSCAN-SWA MLKAFKFRMYPTEEQKQQLIRTFGCARFTYNHLLKKRQKSWQQTGVANFSLTPATLKKEYPFLKEVDSLALANAQLNLDRAFRNYFKGRASFPKLKTKKSMWQSYTTNNQTRTIYLENGYLKLPKQKELIKINQHRPVEGSIRSATISARYNEEFYVALLCDVSPVKKESLAKWIGIAYHPKTLIQTSRPLEVTLPKFHQTEEKLQHAQRKLNVKVRSAHHRKIRLDQASNYQKQKRKVMDLYLKQKNQREDYLEQLSGKLVKQYDYLFVESFPKEEAHADFSIHDWHKLITKLRYKSQWYNKKFLLINTDGAEESNSVRKSQVVEKMGRHSVIKG >NZ_LN999987|2204007:2212323|2211252_2212323_-|WP_002289332.1|DBSCAN-SWA MTKILEVKDLEISFDTYAGKVRAIRGVNFHLNKGETLAIVGESGSGKSVTTRSIMRLLSSNANIDAGQILFKGNDIVGKSEREMQKIRGKEIAMIFQDPMTSLDPTMPIGKQVAESLRKHNKVSKKEGQKAALELLKLVGIPEAEKRINSYPHQFSGGQRQRIVIAIALVCYPEILIADEPTTALDVTIQAQILELLKEIQTKIDTSIIFITHDLGVVANVADRVAVMYGGRIVEVGTSEEIFYNPQHPYTWGLLGSMPTLDSANDRLYAIPGSPPDLLNPPKGDAFYPRNEFAMKIDAEQEPPFFELSKTHKAATWLLAPQAPKVTPPEEIQRRWAIFKEKQKHTYGQGGIADAK >NZ_LN999987|2204007:2212323|2210309_2211263_-|WP_002289330.1|DBSCAN-SWA MPNKLLEVKGLKQYFNVGKKNEVHAVNDISFHIYEGETFGLVGESGSGKSTTGRTIIRLNEPTDGEILFDGQDITKIKDKKGLTKFRHDVQMIFQDPYASLNPRMKVRDIIAEGIDVNGLAKSSEERAKKVDDLLRTVGLNPSHGTRYPHEFSGGQRQRIGIARALAVKPRFIICDEPISALDVSIQAQVVNLLQDLQKEHQLTYLFIAHDLSMVKHISDRIGVMHNGLLLEMGTSDEIYNHGVHPYTESLLSAIPLPDPDHERKRRRIKYQPEPDDGQVRQLREIAPEHFVYATEQEVPYYAKKLKRQKESLLVAN >NZ_LN999987|2204007:2212323|2207736_2209032_+|WP_002297218.1|transposase|DBSCAN-SWA MNDSIKKMLRITEKDLMITEVSYETLQKKKTLVVDAVLSPTPRACRSCGSTVVDGNGKAIIVKNGKKETIVRFEQYNHMPLVMRLKKQRYTCKNCRTHWTAQSYFVQPRHSIANHVRYKIASLLTEKVSLSFIAKSCQVSLTTVIRTLKEFKSYLPKQSKKILPRVLMVDEFRSHASIEDKMSFICADGETGKLIDVLPTRKLPRLTSYFLGCTNPEEVEFLVTDMNAAYFQLTKRVLPNAKVVIDRFHIVKHMNQAFNELRIREMNELRKAGQKSQAEKLKKNWRFLLKNRANINHYEYKTWKSFRAPKYPFLTEAMMIDRLLEFSPPLKEAYPFFHELVEAFRDKDPDLFFSLLAELPETLDDSFREKLQNLLTYEEGITNAMIYPYSNGKIEAKNTHIKTMKRVSYGFKSFENMRIRIFLINQLINVR >NZ_LN999987|2204007:2212323|2206284_2206563_+|WP_002289337.1|DBSCAN-SWA MQKKHLFFTLSIAFLSLAHLIFSYFYIRMYGYFNLHGHLNSFMTAAWILRFIIDVYIVICGFFAIREERYKVLPFYLLFFLFNLILPFIFHI >NZ_LN999987|2204007:2212323|2206659_2207481_+|WP_002289327.1|DBSCAN-SWA MNRFASKEEEKLYYEHKASEEEFLNWYQKQERPEYDKPSLTVDIVLMCYNKEEDQLKVLLIQRKGHPYRNSWALPGGFVQKDESTGESVLRETKEETGVVISKENIEQLHTFSTPNRDPRGWVVTVSYLAFIGEEPLIAGDDAKEVRWFTLERHSNKIHLSSGEVAISLDLVTGESSGKDTLAFDHSQIILKAFNRVVNKMEHEPQVLQVLGKDFTITEARKVFAKFLGIDYKTIDHSNFKKAMLQYFDEIGERPVGIGRPSKIYQLKPGHHE >NZ_LN999987|2204007:2212323|2204007_2206017_-|WP_002289325.1|tRNA|DBSCAN-SWA MAEKETFYITTPIYYPSGKLHIGNSYTTIACDAIARYKRLMGFDVFYLTGVDEHGQKIETKAEELGVKPQEYVDKMAADVKKLWKTLDISYDKFIRTTDDYHKAAVQKIFDRLLEQGDIYLGEYEGWYSVSDEEFFTETQLAEVYKDDEGNVIGGKAPSGHEVELVKEESYFFRMSKYADRLLEYYEEHPEFIQPESRKNEMINNFIKPGLEDLAVSRTTFTWGVPVKSDPKHVVYVWIDALSNYITALGYGSEDESLFEKYWPADVQMVGKEIVRFHTIYWPIMLMALDLPLPKKVFGHGWLLMKDGKMSKSKGNVVYPEMLVERYGLDALRYYLLRAVPFGSDGVFTPEDFVSRVNYDLANDLGNLLNRTIAMINKYCDGLVPDYASLVTPFDSELSTTAANVVGRYHDAMEKMEFNTALAEIWVLISRANKYIDETEPWVLAKDEEKKAELNSVMIHLAESLRIAAILLQPIMTETPEKIFNQLGLDSETMNLEGLHFGEFPSGTKVVAKGTPIFPRLDMEEEVAFIQEKMSEGTQTNEDTVKWDPEETELVSTKEKQIKFDVFEKVELKVAEVINCQKVEGADKLLQFRLDAGDSQDRQILSGIAEFYPDPSELIGKKVVIVANLKPRKMRGQISQGMILSAEAPDGSLQVIEAPKSMPNGSEIA |
7 | Planktothrix_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2297293 : 2330748
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_LN999987|2297293:2330748|DBSCAN-SWA 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31 | uncultured_virus(15.38%) | transposase,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2494682 : 2505507
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_LN999987|2494682:2505507|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_LN999987|2494682:2505507|2502966_2503533_+|WP_002285906.1|DBSCAN-SWA MLQTALHFSHTLLQEILQPGDHVVDATMGNGHDTVFLAEHIGKTGHVYSFDIQQQAIDATRERLEQRQLEERVSLFLQGHETLGEVIAEQQNLKAGIFNLGYLPKSDKAIITMPETTRTAMEEILKRLVPRGRLILVVYYGHEGGEKELDMVDSFCSKLPQETYNVLNYRFINQKNQPPILYCIEKKR >NZ_LN999987|2494682:2505507|2502010_2502967_+|WP_002285909.1|DBSCAN-SWA MTFPYSEGNKRYHSWNYALRNEFGGKIFKVPIDGGFDCPNRDGTVAHGGCTFCSVSGSGDMIVAPEDPLPIQFQKEIDMMHQKWPHVQQYIVYFQNFTNTHAPVEIIKERFEQVVNLPGVVGLSVGTRPDCLPDEVVDYLAELNERMYLWVELGLQTTFEETSKLINRAHDYQTYLDGVAKLRKHNIRVCTHLINGLPGESLEMMKENVRRTILDSDIQGIKLHLMHLMRKTRMLRDYHEGRLQLMSRPDYVNVICDQLEMIPKEIIIHRLTGDAPWDSLIGPMWSLKKWEVLNAIDEELLRRDSFQGKYDVRKKVSV >NZ_LN999987|2494682:2505507|2501354_2502011_+|WP_002285911.1|DBSCAN-SWA MKYKTSFQVAGSFFLVLFFILGWIVKFHLSWLSGFDQWFTGIVRASYPDLNSYQLFMTKFGNPLTVIILFACAALWMWYKKKRAETFWFVSGFIVIAGIINPVIKLFFMRERPSLAHLVVETSYSFPSGHAAGSMILYGSLLFLLPAFVQKRTLRTLLQLLMMFIIVSVGISRIYLGVHFPTDIIGGYLLSLSWLCLTYPVYREKRKQIDNSYRKKDF >NZ_LN999987|2494682:2505507|2498966_2500985_-|WP_002285913.1|DBSCAN-SWA MENIARKERRRLEQTKRFRKAKRGAAIVGTAMVGCSVAAPLVQPVPVQADETPVQFSARINTAAFITEIATYAQPIAQANDLYASVMIAQAVVESGWGSSALSQAPYYNLFGIKGSYQGQTVYMDTLEFLNNQWVNKKEPFRQYPSFAESFNDNAYVLRNTSFGNGYYYAGTWKSNTKSYTDATACLTGRYATDPGYAGKLNNIIATYGLTQYDTPASGNAGGGATTGGNNTGSAGSTGGSSNSGNTNSGSATSTTYTVQSGDSVWGISNKFGITMDQLIQWNNIQNNFIYPGQKLTIKGSQENGSSTNNSGNNTNSSGNAGTSNGGQTTGAKYTVQSGDSVWKISNDHGITMAQLIEWNNIKNNFVYPGQQLIVSNGGSSNAGANTGSNTGNTSGSSSSSSSSSNTASGTKYTVKAGDSVWSVSNKYGITMAQLIQWNNIQNNFIYPGQQLTVSNSGSTNSTSGNTGSSTNTNNSSSVNTGSSSSQGTYTVKAGESVWSVANKNGITMDQLIEWNNIKNNFIYPGQQLIVKGGTSANTNTGSTTSAAKPNTPNTSATTSTSSTGNTMYTVKAGESVWSVANKHHITMDQLIEWNNIKNNFIYPGQQVIVKKGSSQSTNQQSVTGSKTYTVKSGESVWSVADSHGITMAQLIEWNNIKNNFIYPGQTLIVAK >NZ_LN999987|2494682:2505507|2494682_2495978_+|WP_002297218.1|transposase|DBSCAN-SWA MNDSIKKMLRITEKDLMITEVSYETLQKKKTLVVDAVLSPTPRACRSCGSTVVDGNGKAIIVKNGKKETIVRFEQYNHMPLVMRLKKQRYTCKNCRTHWTAQSYFVQPRHSIANHVRYKIASLLTEKVSLSFIAKSCQVSLTTVIRTLKEFKSYLPKQSKKILPRVLMVDEFRSHASIEDKMSFICADGETGKLIDVLPTRKLPRLTSYFLGCTNPEEVEFLVTDMNAAYFQLTKRVLPNAKVVIDRFHIVKHMNQAFNELRIREMNELRKAGQKSQAEKLKKNWRFLLKNRANINHYEYKTWKSFRAPKYPFLTEAMMIDRLLEFSPPLKEAYPFFHELVEAFRDKDPDLFFSLLAELPETLDDSFREKLQNLLTYEEGITNAMIYPYSNGKIEAKNTHIKTMKRVSYGFKSFENMRIRIFLINQLINVR >NZ_LN999987|2494682:2505507|2496125_2498540_-|WP_002285916.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSYNHKEIEKKWQKYWAKTNTFNTHDDPEKPKFYALDMFPYPSGQGLHVGHPEGYTATDILSRVKRSQGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALDTGNDPAEFTQKNIETFRRQINSLGFSYDWNREVNTTDPEYYKWTQWIFTKLYEKGLAYEAEVAVNWVPELGTVISNEEVIDGKSERGGYDVVRKPMRQWMLKITAYADRLLDDLELVDWPESIKEMQRNWIGRSVGANIEFKVAGTDKSYTVFTTRPDTLFGATYSVLAPELDLVREITTPEQKAAVEAYIEETAKKSDLKRTDLAKEKTGVFTGAYAINPVNGKEIPIWIADYVLSSYGTGAIMAVPAHDERDFEFAQTFGLEILPVIEGGDVEKAAYTEDGTHINSEFLDGMNKQEAIDKMNEWLEENGVGKKEVSYRLRDWLFSRQRYWGEPIPIIHWEDGTVTAVPEEELPLRLPKTKNIKPSGTGESPLANIEEWVNVVDPVTGKKGRRETNTMPQWAGSSWYYLRYIDPHNKKELADYEKLKRWLPVDIYIGGAEHAVLHLLYARFWHKFLYDIGVVPTKEPFQKLYNQGMILGENNEKMSKSRGNVVNPDDVVETYGADTLRMYEMFMGPLDASIAWSENGLEGSRKFLDRVWRLIVDENNKMRDRITTLNDGKLDKVYHQTVKKVTEDYENLHFNTAISQLMVFINEAYKVDALPYEYIEGFVQLLAPIAPHMGEELWAILGNDGGISYAPWPTYDEAALVEDEVEVVFQVNGKVRAKSNVPRDLGKDELEKAALANEIVQEYIEGKTVRKVIAVPNKLVNIVAN >NZ_LN999987|2494682:2505507|2503737_2505507_-|WP_002285885.1|DBSCAN-SWA MTDLIKASKFFYHYLKRYKLSFFFIFITVIIATYLQVKAPQYIGEAFQELANYVGGLMQGVDDKSKFVSVIWKLLLFYVLASAANFIYSILFTQVVGKSTNRMRIGLFNKLEKLTIRFFDSHQDGEILSRFTSDLDNIQNSLNQALLQVITNAVLLVGILIMMFRQNVELAWATIASTPVAVLIAVLIIRKARKYVDLQQDEVGKLNGYMDEKISGQRVIITNGLQEETIEGFLEHNQSVREATFKGQAYSGLLFPMMQGMSLVNTAIVIFFGGWLALNGDLERSVALGLVVTFVQYSQQYYQPLMQISSGYSMIQLAITGARRLNEIFDEKDEVKPENGKAFDGVEKGLALQHVDFGYSPEKLVLKDVSINVDKGEMVALVGPTGSGKTTIMNLLNRFYDVNDGSVVIDGIDIRDYDLDALRRHVGIVLQESVLFSGTIKDNITFGKPDASDEEVINAAKQANIHDFIMTLEKGYDTEISEENNLFSTGQKQLISIARTIITNPSLLILDEATSNVDTVTEARIQKAMDEAIKGRTSFVIAHRLKTILNADRIVVLRDGEVIEEGSHHELLAENGFYAELYHNQFVFE |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2634434 : 2651330
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_LN999987|2634434:2651330|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_LN999987|2634434:2651330|2643647_2643872_+|WP_033658092.1|DBSCAN-SWA MSGTYLSIYQWFLTNAQSLVLLAIVVIGLFLGFKREFSKLIGFLVIALIAVGLVFNASGVKDVLLSLFNRIVGA >NZ_LN999987|2634434:2651330|2636981_2637656_+|WP_002297358.1|DBSCAN-SWA MESNDSYLEYAKANKDKFISYIIKGKSPEVGRDAVFMAGSPGAGKSEVAIGLAENYDNHVIIDADYFRTQFPDYNGKNSSLFQKASSWLVEQAFRYVLDHGYSFILDATFAILSAEKNISRALKKHFRVTIFYVYQDPKIAWKFTQEREIAEGRHVPKKAFINAFFKSRENIAKVKSKHPDVLLHIIIKDYTNNISEVHYATDNLELFLPLGYSRKDLEVQLHD >NZ_LN999987|2634434:2651330|2635145_2635481_+|WP_002297364.1|DBSCAN-SWA MEINVEHILDCLDQYGKGELTEEQLVKALTSDEKMFLIIHQGLLGENSDSEEDSDVLDWLGEEESFFIVVEVNENLCRQAESILEEIGVEMPDAIEGFLNQLVETKQLPSS >NZ_LN999987|2634434:2651330|2643884_2644388_+|WP_002297350.1|DBSCAN-SWA MEQMRVYIANLGKYNEGELVGAWFTPPVDFDEVKERIGLNDEYEEYAIHDYELPFEIDEYTPIEEINRLCGLAEELEGTPVGEVASEIQHAFFNSFEEMVEHVDDIIYYPDCDDMSDVAYFLIVEAGDFGEVPEHLKTYIDFDACGRDLEIGGNYLVTSRGVFEYPY >NZ_LN999987|2634434:2651330|2635563_2636904_+|WP_002321809.1|DBSCAN-SWA MYKGHRIRAGDQHLVYHFVLGWLLALFIGWMSVFYFQEFRQFDISKLSLSTIEIVWSIKDLVCLLGSLAFSGAMILLYIHFFLDHWRSLWHRQKLARMILENHWYEVKQTQSEGFFKDLNSSRTRETISYFPKIYYRMKDGLLSIRVQISLGKYQDQLLKLEKKLESGLYCELVEKELKDSYVEYTLLYDMIANRIGIDEVVAENGTLRLMKNQVWAYDSLPHMLIAGGTGGGKTYFLLTIIEALLKSDAELFILDPKNADLADLGTVMPHVYSQKEEISACVEDFYERMMARSKAMKEMSNYKTGENYAYLGLPPNFLIFDEYVAYMEMLTTKESAVILNKLKQIVMLGRQSGFFLILACQRPDAKYLGDGIRDQFNFRVALGRMSELGYSMMFGEVEKNFFMKHIKGRGYVDTGGSVISEFYTPLVPKGYDFLDSISKLEKMND >NZ_LN999987|2634434:2651330|2640750_2640888_+|WP_002317225.1|DBSCAN-SWA MKRGIVMGIVKDIFLVFGGSMLGVTVMCLMNASAAADRAMEKKGK >NZ_LN999987|2634434:2651330|2639020_2639311_+|WP_002297354.1|DBSCAN-SWA MVYDELIGEIYWVIGKIQSDPELEEQLRRLKFDIRKNGVKVAGDPYLMNEETDARIEINQVIAEFERIADQAKEPDIRQYLLEMKAELEVNGITDE >NZ_LN999987|2634434:2651330|2637888_2638323_+|WP_002321810.1|DBSCAN-SWA MRFLDLFAGIGGFRLGMEQASHHCIGFCEIDKFARRSYKAIHDTSKEVEMHDITSVSDEFIQSLGPVDILCGGFPCQAFSIAGKRQRFSDTRGTLFFEIARFTTLLRPKLLFLENVRGLLNHEGGATFETILRTLDGLGYDVEW >NZ_LN999987|2634434:2651330|2650418_2651330_+|WP_002297345.1|DBSCAN-SWA MKIKIERNQKEKSPKKKKERVVSVGKHRKMVLALWLLLSCSLAFGVYKNFTAIDQHTTHEKVVIKEKVVNTSGVESFTEDFAKEYFSWKNNKEAIEKRMSNLEQYLTENGLALIQDMVRADIPTSSEVQSVKILDVEKHSEEFVVSFLVEQHITEGKKTQSISSAYRVTIFEDENRNHLVTSLPTMIGKPDKAKYEAKQVENDSEIDAKTTEEITDFLETFFKLYPSASEKELEYYVENGAMRPINIDLKFSELENPVYLQNGKNFLVSTKIKYLDNVSKTTSYFQYKLVLQKNGNWKIVDVK >NZ_LN999987|2634434:2651330|2638323_2639031_+|WP_002297356.1|DBSCAN-SWA MLNSKAYIPQSRERIFLIGHSRDACTEQVFPIIGPSSTSDQNIRNLVNINPSNRGMGGQVYGSDGVAPTLTGDEGIKIALPARDGISVAGLLPGKFEQGNRVYEVTGTAPTLSTKQGGTKIMIRKNETEYQEVKPEDSVNLAFPNSTSRRGRLGKQSVHTLLTGDQQAIVTDQYQIRKLTPRECWRLQGFPDWAFDRDSQVNSDSQLYKQAGNSVTVPVIFDIARRLKELDVHGL >NZ_LN999987|2634434:2651330|2641633_2643544_+|WP_002286940.1|DBSCAN-SWA MPKNKNETLCVEDLRHAEYYEMQNTFDDLYAKSKNGDIFTHLMDIILSRENILLAYRNIKANAGSKTAGTDGTIIKDIGKLPAETVVKKVRYIVAGSPHGYRPKPVRRKEIPKPNGKTRPLGIPCMWDRLIQQCIKQVLEPICEAKFSENSYGFRPNRSVENAIKATYNRLQISQLHYVIEFDIKGFFDNVNHSKLIKQIWAMGIRDKHLIFILKRILKAPIKMTNGTITYPEKGTPQGGIISPLLANIVLNELDHWVESQWQENPVTKNYVVHINKSGSPCKSNAYKEMKKTKLKEMYMVRYADDFRVFCRYKESAEKAKIAITQWIEQRLKLEVSQEKTRIVNVRKRYSDFLGFKIKMIPRRKKLVVKSHISDKQFKNQKDKLVSQAKKIASPSKGKTELEETRLYNSMVLGMQNYYQIATNVNLDCMKLNRAVMAIFTNRLGTNKRGRLRKTGRQLTTKEATRYGKSKMLRYVAGEGEPIFPVGYIQHRKPMAKVYLANCYTLEGRKFIHTNLSVDKLLMYQLMKLSLENRTIEYADNRISLFSAQHGKCAITLEEFQQANEIHCHHIVPTGAGGNDDYKNLILVKEAVHRLIHAKTEETIQKYIALLKLNKVQLIRLNKYRVLAGNQELNLI >NZ_LN999987|2634434:2651330|2634434_2634749_+|WP_002297366.1|DBSCAN-SWA MELKFVVPDMAETFGKLSYAGEGEIITEGYGRNTTVIGRSYHLYSSKQRADDIEVVVAAEAGEKDFDQDQPLKAVNPHLVAKGYEIENRGFTDYVLYVDDLVKA >NZ_LN999987|2634434:2651330|2644447_2644837_+|WP_002297349.1|DBSCAN-SWA 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MNLKKVGVISLTFLTISFMGILMCVGLLFGEDSEGNGSSGTSPGGTSVSEEVLKHRAMVEKYAKESDITEYIPILLAIIQVESGGTMEDVMQSSGSAGLPPNSLSTEASIKQGCLYFASLVKRSKELGCDQDSIIQAYNYGGGYLDHVGKNGKKHSFALAESFSKEKSGGQKVDYPNPIAIKENGGWRYNYGNMFYCLLVKQYLTTTQFDDKIVQEIFDEAFKYEGTAYVFGGSSPETGFDCSGLTQWCYAKVDLKLPRVAQDQYDAMTHIDLKDAKPGDLVFFHSTYDAGTYVTHVGIYAGENRMFHAGDPVGWTNLTENYWRQHLIGAGRYK >NZ_LN999987|2634434:2651330|2647275_2649399_+|WP_002297347.1|DBSCAN-SWA 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MYPIKYIENNLVFNQEGECFAYYELIPYNYSFLSPEQKYQVHDNFRQLIAQNREGKIHALQIATESSIRATQERSKKEITGRLTEVAKQRIDLQTEALVSMIGDSQIDYRFFIGFKLIATDEEVNLKNLKKSFFSGFQEFVYGVNHHLMGDFVSLSNEEIRRYTKLEKLMESKLARRFKVRRVTPSDLMYLIEHIYGEKGTPFEEYEFQLPKKKLKSETLVKRYDLLRPSRCLIEEKPRYLCMEHENHESYVAYLTINTIVGEMEFPSSELFYYQQQQFTFPIDTSMNVEIVTNKKALATVRNKKKELKDLDNHAYQSDNETNSNVLDALDSVDELETTLDQSKESMYKLSYVVRVSAESVDELKRRCDEVLDFYDDTNVKLVRPFGDMMGLHEEFLPSSKRYMNDYIQYVTSDFLAGLGFGATQMLGELEGIYFGYNVDTGRNVYLKPALASQGVKGSVTNALAAAFLGSLGGGKSFSNNLLVYYAVLFGGQAVIVDPKGERGGWKETLPEIADEINILNLTSKPKNQGLLDPYVIMEKKKDSESLAIDILTFLTGISSRDGEKFPVLRKAIRTVTQSNQRGLLQVINELRKEGSPVAENIADHIESFTDYDFAHLLFSDGSITQSISLDRQLNIIQVADLVLPDAETTFEEYTTMELLSVSMLIVISTFALDFIHSNREIFKIVDLDEAWSFLQVAQGKTLSNKLVRAGRAMNAGVYFVTQNSDDLLDERLKNNIGLKFAFRSTDIHEIKKTLEFFGLDREDESNQKRLRDLENGQCLMQDLYGRVGVVQVHPVFEELFHAFDTRPPVQERME |
19 | Streptococcus_phage(92.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
15134 : 24010
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN999989|15134:24010|DBSCAN-SWA GATGAATCATTTTAAAGGAAAGCAATTTCAGCAGGATGTGATTATTGTAGCCGTGGGCTACTATCTTCGTTATAACCTTAGCTATCGTGAAGTTCAAGAAATCTTATATGATCGTGGCATTAACGTTTCTCATACGACGATTTATCGTTGGGTGCAAGAATATGGCAAACTACTCTATCAAATTTGGAAAAAGAAAAATAAAAAATCCTTTTATTCATGGAAAATGGATGAAACGTACATCAAAATTAAAGGAAAATGGCATTATTTGTATCGAGCCATCGATGCAGATGGTTTAACCTTGGATATTTGGTTACGTAAAAAACGGGACACACAAGCAGCCTATGCTTTTCTTAAGCGGTTAGTGAAGCAGTTTGATGAACCGAAGGTTGTAGTCACAGATAAAGCCCCCTCTATTACAAGTGCCTTTAAGAAACTAAAAGAATACGGCTTTTATCAAGGGACAGAACATCGTACCATTAAATACCTGAATAATTTGATTGAACAAGACCATCGTCCAGTAAAGAGACGCAATAAATTCTATCGAAGTTTACGCACTGCCTCTACCACGATTAAAGGCATGGAAGCCATTCGAGGATTATATAAGAAAACCCGAAAAGAAGGCACTCTCTTCGGGTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCTAGCAGACTATGAGAATTTAATAAAAAAGATATATAGGATGCTGAAGGCTGGTGGCAATTTAGTTTTTACAGTTGAACATCCTGTTTTTACTGCTCATGGAACACAAGACTGGTATTATAACGAAAAAGGAGAAATACTGCATTTCCCGGTGGACAATTATTATTATGAGGGCAAACGGACAGCTATGTTTTTGGAAGAAAAGGTTACAAAATATCATAGAACACTGACCACATATCTAAATACACTGCTTTCAAATAGTTTTATAATAAATCAGATTGTGGAGCCACAGCCGCCAGAGAACATGATGGATATTCCGGGGATGGCGGATGAAATGCGACGCCCAATGATGCTGATTGTATCGGCAAAAAAGAAGATGTAATAATATAGAAAAAATAAACGAGGAGTATGTAAATGAGATCAGAAAAAGAAATGATGGATTTAGTACTTTCTTTAGCAGAACAGGATGAACGTATTCGAATTGTGACCCTTGAGGGGTCACGCGCAAATATTAATATACCTAAAGATGAATTTCAGGATTATGATATTACATATTTTGTAAGTGATATAGAACCGTTTATATCTAATGATGACTGGCTTAATCAATTTGGGAATATAATAATGATGCAAAAGCCGGAGGATATGGAATTATTCCCACCTGAAGAAAAGGGATTTTCCTATCTTATGCTATTTGATGATTACAATAAAATTGATCTTACCTTATTGCCCTTGGAAGAGTTAGATAATTACCTAAAGGGCGATAAATTAATAAAGGTTCTAATTGATAAAGATTGTAGAATTAAAAGGGACATAGTTCCGACTGATATAGATTATCATGTAAGAAAGCCAAGCGCAAGGGAGTATGATGATTGCTGCAATGAATTTTGGAATGTAACACCTTATGTTATTAAAGGATTGTGCCGTAAGGAAATTTTATTTGCTATTGATCATTTTAATCAGATTGTTCGCCATGAGCTGCTGAGAATGATATCATGGAAGGTCGGCATCGAAACAGGCTTTAAATTAAGTGTAGGCAAGAACTATAAGTTTATTGAAAGGTATATATCCGAGGATTTGTGGGAGAAACTTTTGTCCACCTACCGGATGGATTCCTATGAAAACATATGGGAAGCATTATTTCTATGCCATCAATTGTTCAGGGCGGTATCCGGTGAGGTGGCGGAAAGGCTTCATTATGCCTATCCGGAGTATGATAGGAATATAACAAAATATACCAGGGACATGTATAAAAAATACACTGGTAAAACCGGCTGCCTGGATAGCACATATGCCGCTGATATAGAAGAGAGGCGGGAACAGTGATTACAGAAATGAAAGCAGGGCACCTGAAAGATATCGATAAACCCAGCGAACCATTTGAGGTGATAGGTAAGATTATACCGAGGTATGAAAACGAGAATTGGACCTTTACAGAATTACTCTATGAAGCGCCATATTTAAAAAGCTACCAAGACGAAGAGGATGAAGAGGATGAGGAGGCAGATTGCCTTGAATATATTGACAATACTGATAAGATAATATATCTTTACTACCAAGACGATAAATGCGTCGGAAAAGTTAAACTGCGAAAAAATTGGAACCGGTACGCTTATATAGAAGATATCGCCGTATGTAAGGATTTCAGGGGGCAAGGCATAGGCAGCGCGCTTATCAATATATCTATAGAATGGGCAAAGCATAAAAACTTGCATGGACTAATGCTTGAAACCCAGGACAATAACCTTATAGCTTGTAAATTCTATCATAATTGTGGTTTCAAAATCGGCTCCGTCGATACTATGTTATACGCCAACTTTGAAAACAACTTTGAAAAAGCTGTTTTCTGGTATTTAAGGTTTTAGAATGCAAGGAACAGTGAATTGGAGTTCGTCTTGTTATAATTAGCTTCTTGGGGTATCTTTAAATACTGTAGAAAAGAGGAAGGAAATAATAAATGGCTAAAATGAGAATATCACCGGAATTGAAAAAACTGATCGAAAAATACCGCTGCGTAAAAGATACGGAAGGAATGTCTCCTGCTAAGGTATATAAGCTGGTGGGAGAAAATGAAAACCTATATTTAAAAATGACGGACAGCCGGTATAAAGGGACCACCTATGATGTGGAACGGGAAAAGGACATGATGCTATGGCTGGAAGGAAAGCTGCCTGTTCCAAAGGTCCTGCACTTTGAACGGCATGATGGCTGGAGCAATCTGCTCATGAGTGAGGCCGATGGCGTCCTTTGCTCGGAAGAGTATGAAGATGAACAAAGCCCTGAAAAGATTATCGAGCTGTATGCGGAGTGCATCAGGCTCTTTCACTCCATCGACATATCGGATTGTCCCTATACGAATAGCTTAGACAGCCGCTTAGCCGAATTGGATTACTTACTGAATAACGATCTGGCCGATGTGGATTGCGAAAACTGGGAAGAAGACACTCCATTTAAAGATCCGCGCGAGCTGTATGATTTTTTAAAGACGGAAAAGCCCGAAGAGGAACTTGTCTTTTCCCACGGCGACCTGGGAGACAGCAACATCTTTGTGAAAGATGGCAAAGTAAGTGGCTTTATTGATCTTGGGAGAAGCGGCAGGGCGGACAAGTGGTATGACATTGCCTTCTGCGTCCGGTCGATCAGGGAGGATATCGGGGAAGAACAGTATGTCGAGCTATTTTTTGACTTACTGGGGATCAAGCCTGATTGGGAGAAAATAAAATATTATATTTTACTGGATGAATTGTTTTAGTACCTAGATTTAGATGTCTAAAAAGCTTTAACTACAAGCTTTTTAGACATCTAATCTTTTCTGAAGTACATCCGCAACTGTCCATACTCTGATGTTTTATATCTTTTCTAAAAGTTCGCTAGATAGAGTTCTATATTAGAGATGTAAAGAGTTTTGGTGAAGAGGTTTGTGAGTATGGCTTTTATAACCAGGGTGCAATGAGAAGCACTAACAGCAGCTAGCTTAAGAACGCATAGGATATACTTTTTATGGAAGTCACAGAGGAGGAATAAAATTTGAACAGGATTAACAGAGTAACCTCTATTCTTATTCAGCTGCAATCAAAAAAAATAATTCCTGCCAAAGAAATTGCACAGCGATTTAATATAAGCTTAAGGACAGTTTACAGAGATATCCGGACACTTGAAGAAGCCGGAATACCAATTGGATCTGAGGCCGGAAAAGGATATTTTCTTGTAGAGGGCTTCCTACTTCCGCCGGTAATGTTTACAGCGGCGGAAGTGGGTGCATTGATTACAGCAGGGAAATTTTTAAATTGCCATGGAGATGAATCATTTATAAAGGATTTTGATTCAGCTATGTATAAAATCAAATCTATTTTGAAGCATGGTGAAAAAAACTATGCACAGGAGTTGGAGAACAGTATTAACGTGTACAGCACATCTGGACAGAAAAATACATTGGCGGATAACGTTATTGCAGCAATTCAGACTGCAATCTGCAATAAAAGGGTAATATCAATTCAATATCCTGCATCAGGAGGGCAAGAACCGGAAAGCAGAATGATAGAGCCGGTTCTGTTGCAAAGTTTTAAATAAAGAATAAAATCCCTTACGGTATCTATGATTTAAGCTGGGATTCCCAATAATACCTTGATTTCAGTACAGACCGAAAACCCGAAGAGAGTGCCTTCTTTTCGGGTTTTCTTATATAATCCTCGAATGGCTTCCATGCCTTTAATCGTGGTAGAGGCAGTGCGTAAACTTCGATAGAATTTATTGCGTCTCTTTACTGGACGATGGTCTTGTTCAATCAAATTATTCAGGTATTTAATGGTACGATGTTCTGTCCCTTGATAAAAGCCGTATTCTTTTAGTTTCTTAAAGGCACTTGTAATAGAGGGGGCTTTATCTGTGACTACAACCTTCGGTTCATCAAACTGCTTCACTAACCGCTTAAGAAAAGCATAGGCTGCTTGTGTGTCCCGTTTTTTACGTAACCAAATATCCAAGGTTAAACCATCTGCATCGATGGCTCGATACAAATAATGCCATTTTCCTTTAATTTTGATGTACGTTTCATCCATTTTCCATGAATAAAAGGATTTTTTATTTTTCTTTTTCCAAATTTGATAGAGTAGTTTGCCATATTCTTGCACCCAACGATAAATCGTCGTATGAGAAACGTTAATGCCACGATCATATAAGATTTCTTGAACTTCACGATAGCTAAGGTTATAACGAAGATAGTAGCCCACGGCTACAATAATCACATCCTGCTGAAATTGCTTTCCTTTAAAATGATTCATCGTCATTCCTCCTGCTATCTTTTTCTATTATTCTACCTTATTTGATAGTAGATTTAAAACTTTGCAACAGAACCGTCTGCTACATAATGAAACGCAAGCGAACTTAGTATTACATCAAAGCTCTCCTCTGGGAAATCCACATCTTCTATGGCACAGCATTCATATTCAATCTGTGGAAAATGGGTTTTTCCTTTTGCTACTTCGAGCATTTTATGAGAAATATCAACACCTACTACAGAGGAAGCACCGTTTTCCATCGCATATATACAGTGCCATCCATAGCCGCATCCTAAATCAAGCACACGCTTACCCTTAAAATCAGGTAGCATCTTTTTCAAAGTCTCCCATTCTCCCGCACCAGCCAGTCCTTTCTGCGAGCGACTCATTTGACTGTATTTTTGAAAAAATATATTATCATCATATTTGTTTTCTTTCATCTGAACTCTCCTCGTTTAAAAAGTTATTTATCTCCGATACAATTTCATTCACTTCATTATAAAGCTTCTCGGTCATGTCGTAGCATTCAAAAAGTGAGATACCGAGTACTTCAAAAATATGATTTACCTTCTCGGTATATTTTTCAGGTTTATGTTCAAAAGTTTCAAGCAGTTTTATAGCTTTCTTTTCGTTGATACAATAAGCATTATTACATGCAAATAACACTTGATTTAAACATGAAACTATACGAAAAACATGACCCGCAATATAATATTTATCGTCTGTTCCCGAATTTGCTTTTACAAACATTAAAGAGAACCCTGCTTCAAACATAAAAAAGTTAACTAAACTTTTCTGCAAAGCATTGGGATAAGTTTCTGCCTGTTTTTTTAATTCGCATAAGCTTTCATTCTTAGCATATAGTATTTTGCTAATCGCTAATTCTCCTCGATACATTGCACTAATATAACCATGGGGATGCCCAGTCTGATAATTGGCAGTAACAATTCCGTGCTCTGTATCTTTCATTATTTGTTCCACACGTTTAATATCACGTAAAATTAAATCCACATGATACCCGTTTATGACTAACCATCCGCCGCCATTAATCCAATCACCCCATGCTCCGGGAGGTACAACAAGGTTATTTCTATGCTCATCATCCAGCTTTGTAGCGAATTGATTAATAGTATTTATGTCAAATGATTCTGAATTGTAATAGATGCCGATATCTATATCCGAATCCTCTGTATGGGTGCCCCTTGCACGTGAACCACCTAAAACAATACCTTCTATATAAGACAGAGAGGATAATTTCTCTGCTACTGATTTAATAATATTATCTACCATCAAGCATGCTCCTTTTATCGATTCACTGCTGTAAAAATTCCAAGCCAAATCTTTTGCTTCTACTCAACATATTTATAATTTTTTTAATTTCACAAAAGATAGTTAAAACTTATCAATTGTCTTTTTATACCTCTGCTGATTAGATGAAGTCTTTTCAATAGCCTTTAAATTACCATTCATTTTGCTAACATGGTTTAAAAATAACGTTCCAAGCAGAAGTCGATCCTTTCTGGGTATCCTATTCCCCACATATCCCTTGAATAAATCTTTAACAAGAAAAACTTCGCCATCATTTAGATTTTCAGTTTCTCTAATAGCTTCTTCCAATAGCTCATTTACATCAATCATGTTGTCCACTCCTTATTAATAATGGGTCAGCCCCCTTCTACTGTTTCGGTTTGGTCAATCGCTTCAATTAATTGATTTTCCTTTTCTTCCAAAGATTGACGAATCCTTTCAATCTCTTCTATAGAAAGTTCATCCTTTAAATCATCTATTAACTCAGGTAAGATTTTTGTTTCCACCATTTGTTGGTAGTTTTCAAGGGCTTTTTGATCAAGGCTATCCTTATACTTTAAAATACTTTTTTTCCAAACGAAAGAGTATTTATTCGCATCCGCTTCAATTTTTGTACCATCAATGTATAGAGCACTGCCACTGATTAAGCCACTTTGAACCAGTAGCTCACGAAATTGAACAAATGAATGATCTAGAATATCGTTCATAATCGGATGAACGCGAAAACGATTAATAGTACGAAAGTTAGGGAATTGCTCTTGAGATAAGTAGCGCATCCGAATACTATCTATCAGCATATTTTGTATTTGGCGGCCCGAATAAACCCCTTGAATATAGGCACAAAGAATAATGGAAAGTAGCATACGAGGATGATATTGGGGTCTACCCATAGATTGATAATAAGGAAGAAAGACTTCATCGGGAATAGAGTCAACAAACTGCACAATGGCATGAGCAAAATCATTTTCTTCTAATTTAATTTCAAGATCTATAGGCAAACAAAGTTGGTTTATGGTATAATTTTGATACATGATAAAGCACCTCTCTCAAATGGATTAATCACCTATATTATAGCAGAGTGTGCTTTATTTTTGTATTCACTTTCAAAAGATAAATAGAGGTCTTTCCACTACTATCTAAATGGGCTCTATACTTTTTGATGTTGGTGAACTTCACCAACATCTTTTTTGTATAAAAAAATATAGAAAAGACACCCTGAAATCCTTTAGAATTAATTTGGCTACCAATTCATAGGAGGATTCAAGATGTCTCATACTCAGCTTATCAAAGATACCCTAAATATTCTAGACCTAAATATCTATTTCGAGGAAAATTGTTTAACTAAAGAAAAATACAAAGGGCAAATTTGCTTGATTTACAAAGGAACTCTTCTGTACAAGCCAGAAGAGTGTTCCCATTGTCTTTGTGTCGTCCCCTCTAGGATCATTCGTTGGGGGACGACAACCGTTCGGTTGTTACTGAATGATGTGTCTGAGTATCGCACTTATCTGGAGCTGAAGAAACAACGATTTAAATGTAAGTCTTGCCAAAGAACATTCGTAGCGGATACCTCTGTTGCTGAAAAACACTGTTTCATTAGTCAAAAAGTTCGTTGGTCTGTCATTGCTCGCTTAAAAGAGAATACTTCCATGACGGAAATCGCTCGTCAGAAAAATATTTCCACTTCTTCGGTCTATCGTGTCATGAAGCGATTCTACCGCCCATTGAATCCTTTCAAACAGACTTTGCCAAAGGTCTTATGCTTTGATGAATTCAAATCGGTTCGAAGTGTTGCCAGTGCAATGAGTTTTATCATGATGGACGGACAAAGCCATGCATTATTGGATATTGTCGAAAATCGACGCTTGCCTTATTTAGAACGCTATTTTTCTCGGTTTTCATTAGCGACTCGTGAAGCCGTTCAATTGATTGTTATTGATATGTATGCGCCTTATGTTTCGTTGGTGAAAAAGCTTTTCCCGAATGCTCAGTTGATCATCGATCGTTTCCACATCGTCCAACATATTGGCAGAACTTTCTTGAATCATCGAGTGAAAGAAACCACGGTACGACTTAAAGGAAATTCCCACTCTCAACGAGGGTTAGGGAAAAAATTGAAGCGCTATTGGAAACTCCTACAAAAAGAAGAAGCAAAGTTAAACTATGAAAAACGGGTTTGGCGTGCCAGTTTTAAAGATTATTTGACTGAAAGTGAGATTGCCGATCGACTGTTAGCTGCTTGTCCCAACTTACGCCAAGGCTATCAGTTATACCAAGACATTCTTTATGCGGTAAAGAAAAGAGATCAGTCACTATTTGAGGATTGTTTAACTAGAGACATTAGCGGTCTGCCAGAAACCTATACAACCACTTTACGAACGTTTAAAAAGTTTCTGCCACAGATCCAAAATGCGCTTCACTACAGCTATTCAAACGGACCATTGGAATGCTTAAACAACCACATCAAAGTATTAAAACGCAATGCGTACGGCTTTCGCAACTTTTACAATTTCAAACTACGAATTATGATTCGTCATGGCAAAACATTTTTAACCAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN999989|15134:24010|22714_24010_+|WP_002296623.1|transposase|DBSCAN-SWA MSHTQLIKDTLNILDLNIYFEENCLTKEKYKGQICLIYKGTLLYKPEECSHCLCVVPSRIIRWGTTTVRLLLNDVSEYRTYLELKKQRFKCKSCQRTFVADTSVAEKHCFISQKVRWSVIARLKENTSMTEIARQKNISTSSVYRVMKRFYRPLNPFKQTLPKVLCFDEFKSVRSVASAMSFIMMDGQSHALLDIVENRRLPYLERYFSRFSLATREAVQLIVIDMYAPYVSLVKKLFPNAQLIIDRFHIVQHIGRTFLNHRVKETTVRLKGNSHSQRGLGKKLKRYWKLLQKEEAKLNYEKRVWRASFKDYLTESEIADRLLAACPNLRQGYQLYQDILYAVKKRDQSLFEDCLTRDISGLPETYTTTLRTFKKFLPQIQNALHYSYSNGPLECLNNHIKVLKRNAYGFRNFYNFKLRIMIRHGKTFLTK >NZ_LN999989|15134:24010|19463_20144_-|WP_001015311.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >NZ_LN999989|15134:24010|18891_19434_+|WP_002321977.1|DBSCAN-SWA MNRINRVTSILIQLQSKKIIPAKEIAQRFNISLRTVYRDIRTLEEAGIPIGSEAGKGYFLVEGFLLPPVMFTAAEVGALITAGKFLNCHGDESFIKDFDSAMYKIKSILKHGEKNYAQELENSINVYSTSGQKNTLADNVIAAIQTAICNKRVISIQYPASGGQEPESRMIEPVLLQSFK >NZ_LN999989|15134:24010|15134_15815_+|WP_001015311.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >NZ_LN999989|15134:24010|20561_21431_-|WP_000228166.1|DBSCAN-SWA MVDNIIKSVAEKLSSLSYIEGIVLGGSRARGTHTEDSDIDIGIYYNSESFDINTINQFATKLDDEHRNNLVVPPGAWGDWINGGGWLVINGYHVDLILRDIKRVEQIMKDTEHGIVTANYQTGHPHGYISAMYRGELAISKILYAKNESLCELKKQAETYPNALQKSLVNFFMFEAGFSLMFVKANSGTDDKYYIAGHVFRIVSCLNQVLFACNNAYCINEKKAIKLLETFEHKPEKYTEKVNHIFEVLGISLFECYDMTEKLYNEVNEIVSEINNFLNEESSDERKQI >NZ_LN999989|15134:24010|17821_18616_+|WP_001096887.1|DBSCAN-SWA MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >NZ_LN999989|15134:24010|16281_17190_+|WP_001255866.1|DBSCAN-SWA MRSEKEMMDLVLSLAEQDERIRIVTLEGSRANINIPKDEFQDYDITYFVSDIEPFISNDDWLNQFGNIIMMQKPEDMELFPPEEKGFSYLMLFDDYNKIDLTLLPLEELDNYLKGDKLIKVLIDKDCRIKRDIVPTDIDYHVRKPSAREYDDCCNEFWNVTPYVIKGLCRKEILFAIDHFNQIVRHELLRMISWKVGIETGFKLSVGKNYKFIERYISEDLWEKLLSTYRMDSYENIWEALFLCHQLFRAVSGEVAERLHYAYPEYDRNITKYTRDMYKKYTGKTGCLDSTYAADIEERREQ >NZ_LN999989|15134:24010|21533_21779_-|WP_000567888.1|DBSCAN-SWA MIDVNELLEEAIRETENLNDGEVFLVKDLFKGYVGNRIPRKDRLLLGTLFLNHVSKMNGNLKAIEKTSSNQQRYKKTIDKF >NZ_LN999989|15134:24010|17186_17729_+|WP_000627290.1|DBSCAN-SWA MITEMKAGHLKDIDKPSEPFEVIGKIIPRYENENWTFTELLYEAPYLKSYQDEEDEEDEEADCLEYIDNTDKIIYLYYQDDKCVGKVKLRKNWNRYAYIEDIAVCKDFRGQGIGSALINISIEWAKHKNLHGLMLETQDNNLIACKFYHNCGFKIGSVDTMLYANFENNFEKAVFWYLRF |
9 | Streptococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4013 : 33118
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN999990|4013:33118|DBSCAN-SWA TTTAAAAACGTTTTTGGTCAAGCACTGTGCTATCATATGCTGTATCCTCTTTTAATCTAATATCTTCATACCCTAGACGGTGTGCCACTAAATTCCATCTAACTAATACGTTTGGCTTACTAGTTTCAATGATGAAATGGTCAATATCTTCATGAGTAACAGCACACAAAACTAGTTCTGTAGGTGTCACATGTGTCATATACCGACTTAGATTTACTGTTTCAGCAAACATGGGGTCAATATCAACACGAACTTTACCATTGTCACCTGTAACGGCTTCCCCATAATCAGCGAAATAATATTCTGGAGTTTCATAAGCGTTCAATAGTCGTTGTCCATAATGTTCTGTTGGTACAGTTGAGTTTTTAGTACCTCTAACAGTAAAATCTTTATATACTTGTACCGTTGATTGTTCAAACCTAGCAAGTTTCCCATCTTCCCATGAACCAAAAAAACAACCTGGTAACGTTAGCATACCATCACTAGTAAATTTCATAGTCCTACCAGCTACCTTAAATTCCCATGAGTTACCCGCACTACCATTAATGCTTAAAGAACTACCGTCGCCAGAAGTTACATAACTAGCATTGCTATACCTGAAATTGGGCGCACCAAAAGATAGAAACGGTCTGTTATTACCATTATCCCACGTACTAAAAACCAAGTTACCCTGTGGATTTCTAATCATGAAACCACCACCAGTTTTCATGGTGTATGATACAATACCGGCATCAGCACTTACATAATCACGTGCTTCTAGCTCCATAATATCTTTGTTAACTTTTTTTGAGTACCAAGTCATTTTGCCATTAGCAATACTTGTTCTATAATCAGCACCATCACTAATTAATGTAGTACCTCTAATAGTAATTCCTACTATTTCACCAGCCGTAATAAACGAGGCATTGAATCCGCCATCTAACGTCCATGCCGTTTCATATGTTCCATTAATGCCAGTTTTAGAAAAACCAATACCAGCATTGTTGATTTGTAAAACATTCCTTGCGGTATTCTTATCTGGTGTGTCCATAATCAAAATACGACTAGGCGCTTCTTTAGGATCTAATAAAACATAACCACCATTTTGACCAGTAATCATATCAGTTTGATGATCTACAATATCATTGAGTAAATCACTGATTTCGCCACCGTTTTTCAATTGATCAATGGCATCATTAATCAAATTGCTGACATTATTCTCTGTGTTTTCTAAGAAGTTTGTTTTGACGTTTCCTACAACTAATTTATCGTATGAATTGGTTAGAACATTAAACGTATATTCCACAATTCTCGCTGACATATTCACTTTTAACTGTGGATGATACACATCTACTCCGTCACCCATCGAAACTTTTTCTAGATCAACAAATTTTTCATAGCCTCTTTGATGCCTCAATGGTACTAATTCAATCGAACCACTCACTTGTGGTTTTTGTTTATCTATGTTTGTTTTCAACCAGTCTTTAGCAGCTTCCCTTAATGTGGCTACATCAGTCGCTTTGTCTTTAAAATCAACAAAAGAAACATATCCAGCAGGATAATCATCCACGTAATCCGTGAAAATAACTTCTTCTGGTAGAGTGATCTCGTCTTCTCCTTCTGAAGAGCTGCTAATGAATGGATAAACTCCAACTAAAACACTTTGAGCATCAATCTCTAAGTCAAGACCAGTTAAGTTTTTAGTATAAATCGCTTTGATTTTATGATCCGTACCTAGACTTTTTTCATGACGTAATGTGTTATTATCTTTTAGAAACTCACCATGAAATCGATCTAGAATAGATCCCTCTTTTCCACCAAAGAATTCTAAAAAATTCGCCTTTTCTATCTTCACATTAGCAAGCGTATCTACTAATGACGAGAAAGAAAACTGCGAAGGGATAGCTGGTTTCGCTAAAACTTTTGCGTTTTGCCATGCCTGAGTAGCAGTGATCTTTTCTGTTCCGCTGTCATATTTATTCAACACCGATTTTCTTATATCATTGAAAATAGGTTCAGCTTTTACTTCTATCGTATTGCCTATTACAGAAGTTTTTGCATAATAAATCCGTAGACGCTGTTTTGCTCGATTTTCATCTACATAACACTGAATAATACGTCCGTCTACAATCAAATCTGCATTAGTTCCGTTTATTGAATAAGTACCCTGAAATATCTCGGCTCCGTTTAGTTTATTGCTAACAGTAGCTGTTAACCAGTCTGACAAAGCGCCTAAACCTTGCGTATCATATAAATGTTCAGCTAAATTATTCGCGTCATTTTTATCGTAAATAGTTATTAAATTATCGATCATCTATTTCACCTACCTTAACCCGTTACGATAAATTTGTATTTTGCTCAAACCAGTGCAATTAAAATGATTGATATCCACTTGCAATGTCGGATATTGCATGGTCTTCATTTTGTTGGACCGATCTAAAATATCTCCGTCCGATTGCTCTTCGTAGCAAAGCATCAAATCACTATCAATGACTACATCAGTTCCTGCTACTAAGCCTTCGAAACTAAACACATAATCATTTAAGATGAACTGGCATGAAGTAGCTGAAGGAGTGATGATAATCTTTGGAAAACTTTCTTCTAAACTATTATTCAGCAAGTTAAATGACTGTGGTTTATCTACGGTTATAGGTACATCTTCTTGAACTCTTGCGAATGGTTTCGCAGTAATATTTACATCGAACTCTCCCCATTCAACAATATCGTTTTCTGCATCCCCAATATCGATAGTCTGGATAACGTAATAGACGTTGGGATCGTCAGAGAATTCTAATTTCTTTGCATAGTTTAACCAATGACGCATGATATAAAACGATTGCTTGAACGCTTGATGGTCTTCCACATCCTCTAAATAGTTATAGTGCAATGTAAACGACATATCTTCAAACGAGTAATCTTGTACTAAGCCACCTAACCTACCTAAAACAGAAGTTTCAACTCTCTGTCTTTTTGGAGAAGGTATGGTTGGTCTTTCAGCTAAAGCCAATTTATGCAAATAATCAGGAAATCCATCGATTATAGAATGTATACAATCAGTCATTTTTTCACATCCTTTTTAATACTAAAAAAACAGGAGAAATACTCTCCTGTTTAACGCCATGCCGAAGCATTATCATTTTGAATTTTTGTAATGCTATCAATGATTTGTTGAGTTGTTTGCTTCATAGTAACCTCATCTGCGTTACCATCAATTGTGAAATTGAATTCGTAGTTATTCACAGGTTGAATCGTTTGTGCCCTAGATGAAACTGATGTGCTACTCAAGATACGATCACCAATTTCTTGCAAAACAGATCTTTTCAAAGGTAAAACTGCTTCAGGTCCTGCTTCACCGACACCGTTCATTCCACCTAGTAAAGTTGGTTTAGTAAAGATACCTCCTTTAGCATGCCATTTTACACGCAAATGGGGGATTTGACCTTTTAGCGGGTTAAAGCTGCCTTCCATGATAAATTCCGGTAACGGAATATGTGGTATAGAAATATTCAAATTATCAAAAATGCCACTGATTTTGTCTCTAATCCAATCAATTGGAGCGCTAACAGTCTTTTTGATGCCTTCCCATATGTTAGCAATTGTACTTTTAACATTATTGAATATGTCGGAAACAATACCTGTTAGATTGGACCAACCGCTTGAAATTGCATTTTTTCCATCGTTTACTTTAGAGCTAATAGTGCTTGTAATTCCATTCCAAAGATTCAAAGCAGTATTTTTGATACCGTTCCAAATTCCGCTAATCCACGAAGATATACTATTCCAAACACTTTGAATGGCACTTTTAGCTGCGTTTATAGCATTGCTTATACTACTAGTCACACTATTCCAGATATTTGATGCTGTAGAGCTGATTGAATTCCAAATTCCACCTAACCAACTAGATACAGTTGACCAAATATTTTGAATTACTGTAGCAGCTGCTTGTACCAAGCTAGTGATTGTATTCTTGATACTGTTCCAAATACTAGAAGCTGTTGCACTAATTGAATTCCAAATATTTGAAGCCGTAGTACTAATAGCTGTCCATATACCATTCCACCATGCCACTACTGGATCAAATATAGTATGGAATGTAGTTACAATCCCATTCCAAGCGATACTTATCCATTGTGTCATAGTATCCCAAGTATTTTTAAGGAAATCAGAAATAGGTGTCCAAACAGCTTGCCAAGCTGCGCCCAATAACTGTCCAGCTACATCAAAAATACCCACGATAATATTAATACCAGCTTGAATCAATGACGTTATTAATGTCCATGGTATTTGAACAATTCCTACAATGTCTGCCCAAATAATCGACCATACTTCTTTGACTCCGTTCCAAATATTTGAAACCCAATCAACGAATGTTTGCCAAGTTTCTTGGACTCCTTGCCAGATGTTGGAAGCTCCTTCAACTAATCCGCTCCATAGCTCTCCAAACCAATCAGAAACTCCTTGCCAAATATCTTGAACCCAATCTACAAATCCAGACCAGGTTTCTTTAACCCCATCCCAAACTGATGAGGCTCCGTCTTTTATACTTTCCCAAGTATCACCCAACCAATCAGTAAATTTTTTCCATAAACCACTAAACCAGTCAGTAATTGCACCCCAGTTCTTAATTGCCACAATAACGCCTGCTATAACAGCTATAATTCCTCCAATTATAAGCATCATCGGACCAAATAAATATGACACGGCTAGTATTGCCGGTAACAGTATGCCAAATGCTGCTGTAAGACCACCTATAGCAACAATGAAATCCTGTACTGGTTGTGGAAGATTATTAAACGCATCAGCCATCTTTCCTAGAAAATCAATTACTGGTTCGAGTGCATCTATGATTGTGTTGCCTATAGGAGCTAATGAATCCTTTAATTCAGCTATTTTCCCGTTCAACTCTTGCAACGGAGTAGTAGAATCTTCATTCATTTTTTGTGCAGATCCACTAACATCATCAAATGTATGGTTAACATCAGTTAAAGATTGGACAACTTTCATCGCATTATCTTCGCCAA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MVIDNSKEKERLNKQISAIKTSLEEHFGLKLFQDSVGEDELPDDFNYFILETGEIEMITEPKYSVGQNLYLTFYSENREDLTGDSLDIISLIQNRSIRFQRMDPNHLKLENQDRYIDQLVFTFRRLLKSDCHG >NZ_LN999990|4013:33118|31981_33118_+|WP_010725018.1|integrase|DBSCAN-SWA MWIETKTDKNGKKVYKYNERYIDPKTRKRKKVSITYKNKSRETQKVALLELNKKIDIKLNEKTLHKPDLTFHELVEEWLVIYKRQVKESTYYPTNNILNTIKKKIPETYIVSGINTIDLNNIFEDMIYKDDLSNKYVSVIKSKLNLLFSYAMKKGYVEKNPIDEVVIDYKRESKTIKIKDKFLEDDEYNRLVDFTTSHNKRYSLLFQWLYLTGMRPGEAIALSKDDVHITNNNASVVINGTMMYRERSIADMKKSDSTKTAAGMREIDLPKKAIAIYNELLELNPNGQFLFQTTKGTPFQLTAINTYLRNHKADMKIDKKLSSHIFRHTHISKLAELGTPLYAIQDRVGHENSDITEKIYLHVTKGVKEKLKEDIEKL >NZ_LN999990|4013:33118|28699_28873_-|WP_002306340.1|DBSCAN-SWA MGKFNRALVFSAPLIIYALGLWGSRQALIGTIVYMVWIFMGLDEAEYRAKKPTEGAD >NZ_LN999990|4013:33118|4013_6305_-|WP_002296595.1|tail|DBSCAN-SWA MIDNLITIYDKNDANNLAEHLYDTQGLGALSDWLTATVSNKLNGAEIFQGTYSINGTNADLIVDGRIIQCYVDENRAKQRLRIYYAKTSVIGNTIEVKAEPIFNDIRKSVLNKYDSGTEKITATQAWQNAKVLAKPAIPSQFSFSSLVDTLANVKIEKANFLEFFGGKEGSILDRFHGEFLKDNNTLRHEKSLGTDHKIKAIYTKNLTGLDLEIDAQSVLVGVYPFISSSSEGEDEITLPEEVIFTDYVDDYPAGYVSFVDFKDKATDVATLREAAKDWLKTNIDKQKPQVSGSIELVPLRHQRGYEKFVDLEKVSMGDGVDVYHPQLKVNMSARIVEYTFNVLTNSYDKLVVGNVKTNFLENTENNVSNLINDAIDQLKNGGEISDLLNDIVDHQTDMITGQNGGYVLLDPKEAPSRILIMDTPDKNTARNVLQINNAGIGFSKTGINGTYETAWTLDGGFNASFITAGEIVGITIRGTTLISDGADYRTSIANGKMTWYSKKVNKDIMELEARDYVSADAGIVSYTMKTGGGFMIRNPQGNLVFSTWDNGNNRPFLSFGAPNFRYSNASYVTSGDGSSLSINGSAGNSWEFKVAGRTMKFTSDGMLTLPGCFFGSWEDGKLARFEQSTVQVYKDFTVRGTKNSTVPTEHYGQRLLNAYETPEYYFADYGEAVTGDNGKVRVDIDPMFAETVNLSRYMTHVTPTELVLCAVTHEDIDHFIIETSKPNVLVRWNLVAHRLGYEDIRLKEDTAYDSTVLDQKRF >NZ_LN999990|4013:33118|21934_22138_-|WP_033705812.1|DBSCAN-SWA MNTRHRRITKLRKQELNVLKTKFEKEYGISAEEVYKVLSQCVADASETIRKFGISILNDDRKWEEMR >NZ_LN999990|4013:33118|20017_20392_-|WP_010738779.1|DBSCAN-SWA MEDKMYLRQNVFTKKDIENQINGFIQKLENANSYLINKELNKAYDQWKEVYDELKLIQNETKLVRTEKKNENSFFFDGYAILMLETVAKQNIKAPKKELSDNIDNALAELRYYVMQIKDVRITR >NZ_LN999990|4013:33118|12524_12878_-|WP_002286522.1|head|DBSCAN-SWA MANNRRLEETFNDGWLKILTQTTKRNELGKKIGVEDTEITSLKFRNLSMRDSDITAMDAMGSKLTKKVKTPFHPIAKKFNKDQYFIVIDSMRYNVIYADYDNFYIYFYLESVGEYGD >NZ_LN999990|4013:33118|24683_25517_-|WP_033705806.1|DBSCAN-SWA MSDNKRYYYLKLKENFFDSDEMVLLESMPDGYIYSNILLKLYLRSLKHEGKLMFNDRIPFNSTMLATITRHSVGVVEKAVQIFRDLQLIDVLDNGAIYMSDIQSFIGKSSTEADRKREYRKKIEEAKRNLITGGQVSDKCPDKTTPELEIEIEKDIDIDKEEKRGKYSDEHLRLAKKLQSNLTEDFPKEMNKVDIEKWADTIRLMEERDKASIEAIEYVINWLPTNEFWFGNIRSAKKLREKFEKLKFEIKTDKKNHKKQSQKLQYSNPSEYDDLPI >NZ_LN999990|4013:33118|10735_11098_-|WP_002286510.1|DBSCAN-SWA MNEDYSKIELNDGTILNLEPKLNIKKLLMINRDFNTDEFAKMTVGKGSMDISVIQGAKAVYIAYRQANMTDYISFDEFIDKWDFDMATASYIYQLMMFKQARDAYQKEFEKANKEKKLQK >NZ_LN999990|4013:33118|27400_28126_-|WP_112020401.1|DBSCAN-SWA MQELVILKNKEAVTTSLQVADSFEKKHKHVLEAIESIKRSVENSANVEDGSNFGQMFVEGNEPDSYGRSRRVYFMNRDGFSLLAMGFTGSKAINFKLKFIEAFNEMEDVIRKNTVPQTIEDMMIYQLKEMKDVKKDVSMLKDTMRISGQQEFEIKQKGNMKVMEVLGGKESRAYEEISKKVFSKFWSEFKRTFSIPRYGELPRKRFDDAVSFIEMWLPETAIRMEIDQLNRQQRLFGDENE >NZ_LN999990|4013:33118|21629_21938_-|WP_033705813.1|DBSCAN-SWA MKLKDGFYASSHGIGGLMLDMPTKNPKTRKKPKFKVGDMVRCEAEEFIYPFRGYVEHLYNHSAIIRIENTMECDKWLAKSKENLAVARLVDIELINKKTESQ >NZ_LN999990|4013:33118|17067_18762_-|WP_002286533.1|terminase|DBSCAN-SWA MNQFLSYKHIENWFKAIEEGTIKVCKEQLLLKNYLEERVFTREDIYFDKQMVEDSINIPAQYFPFELIPWEKFLQCFIYGVRWKKDKTLVFNRYLSLMGRGNGKTGFASWNNFFLLTAKHGIKNYDIDIYANNESQAKTSFDDVFKVIKDHPDLDKKVFKATKEVIQNIATNSKLRYNTANARTKDGKRPGANRFDEIHENEDYSMINVATSGGGKIRDYREFYDTTNGHVRGGPLDDIIEESKMILSGELGIDKDGAEFSSLFPFICRLDNDNEVDDPDMWEKACPTINYNADLKRKMFQEYSQMQRNAGLRLTFMTKRMNRPMEDTRFAVASYDDVLHTKEKEFPEKMDEVIGTVDFADRRDFASVGLLGKYDKDVYFTQHTFIHESALRLQNIKREVIDISIDQGKSQIVHGKNIEADYIVGWFLEMSNKYYIKKIAMDMYRAKILKPALEEAGFTVEIVRSGSVTHGMLKDLVDDLFINQRLFFGDDAIMRWYCMNVYEEHISNGNIRYEKIEPETRKTDGFFSFLHGLNFLDDIYDSAPVTVTNSSVENTGTGFTPLVF >NZ_LN999990|4013:33118|11736_12141_-|WP_002286516.1|DBSCAN-SWA MAKNSWELKINGHDELLVRMERYSSESERLINEALKSKGSAIAVDRITEKIPVSEADLRRGHQHAKNSRPLKTQYINLGFIIRPTRKFEYLKYPDLGIGTSKRNQPDEFMRRGLGLALDPITELLIRQFDKLNK >NZ_LN999990|4013:33118|28178_28586_+|WP_002323904.1|DBSCAN-SWA MSFDNTITISIILALVALISPWITAVINNKHAESMKDKEIELQKHDSKTQTIQTTFSTFLNNVGICIGSNTDKNISAVKASGYAVLPYIQNEDIEVMKIFLSRFGYGNTNAEQKSLETYLIDKVLPILNKSLEKL |
41 | Bacillus_phage(38.46%) | tail,protease,capsid,head,integrase,portal,terminase | attL 17311:17326|attR 33139:33154 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN999988_1 | 97611-97739 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN999988_1
|
2 spacers
spacers of NZ_LN999988_1
>1.1|97635|18|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder TTATCAACGTTTTGGCAC >1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder GCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN999988_1
The CRISPR arrays of NZ_LN999988_1 >merge|NZ_LN999988|1|97611-97739|CRISPRCasFinder GGTATGATTTTCATACCCTCTGATTTATCAACGTTTTGGCACGGTATGATTTTCATACCCTCTTGAGCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTGGGTATGATTTTCATACCCTCTGAT >NZ_LN999988|1|1|97611-97739|CRISPRCasFinder GGTATGATTTTCATACCCTCTGAT TTATCAACGTTTTGGCAC GGTATGATTTTCATACCCTCTTGA GCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTG GGTATGATTTTCATACCCTCTGAT
>NZ_LN999988.1|WP_002322486.1|95969_96302_-|hypothetical-protein MSYTGILSLKDICHYGKRCTATEKITKKLSTGQSKTVVQCKKYIIQKDKVSEEMIYYIGKQKQIILKDPIPLKELYPTIKHVYDQNGVLIGRRKNGVLRCTAKGMGRLIS >NZ_LN999988.1|WP_002375758.1|95009_95351_-|DUF5406-domain-containing-protein MKNYDPNIRLGTHTIKVSFQRWDYKGFVTFRRGGNCKGLDVLALNEDDLYDQTLTDNPIGFGLLPEDDEGDEWFKMTLTNDKGDELSVEDTWSYLSDYIVSVEIIDFVADKEE >NZ_LN999988.1|WP_002347362.1|94603_94843_-|hypothetical-protein MARPVLDAMDMDTLTKGRYVQLLARGYSPKDVFKALSKGTDMEKERLRKEFDYWRTYNGIKDLKPARPVVKRKKKITQE >NZ_LN999988.1|WP_002322851.1|94298_94538_-|hypothetical-protein MNCKEIENRKKVSKEMEEKLLKTMKQKHLKRLSVMQYISDMQITGKEKACLLGSMKNFEQLRRTYVKISSNCQLLLEVS >NZ_LN999988.1|WP_002338747.1|92541_93213_-|class-A-sortase MKKWLFGFLGVALIVFCSVFGYVSYQKHEGEVFKQNIEKKMPVDQINAHAKSYKEDATNVNNDMSLGQMLSIQKEAIEMGVNKQVFAQIQIPALGLALPIFKGANQYTLSLGAATYFYEDAEMGKGNYVLAGHNMEMPGVLFSDIQKLSLGEVMDLVSNDGVYRYKVTRKFIVPEYFKLIDGVPEENSFLSLPKKGEKPLLTLFTCVYTSQGKERYVVQGELQ >NZ_LN999988.1|WP_033705675.1|90512_92489_-|isopeptide-forming-domain-containing-fimbrial-protein MAINRYVKKAGMLIGMLGIIAGCFQGYRAYAEDVTQKTPPEKVNITVHKLMYDQGTQLNVDIDGIKNDGYTHDQYPTGVTKYNKADYGDVEFTLGNITDQVLPTEDSDLTNAKVDEIVKDVEDKGSNSEYVKNATNKITSAVDENGEITFADQPAYVNSKGNVYVVYESKSAAGLVTQKAKPMVVIAPMTDNTGSGFLKDIHLYPKNIVSKLSFELTKFGDDGTAQSKQTPLKGAKFELYKGEPGKGTKLGDLVSDDQGKLAATDLTLGKYYFVEVPSEVVVGSDKEPTADQYLLGADARNDAHNKLTFEITNDGVTSDLKASYVNYKAPVIDKTVTNGTGQEHSFQIGDAVNYQGTIHIPTDIAGGADGITVNGVKSETSPYSVFKWGDTAGQGLSYVAAKANIKVTNKDGSVVLKENTDYKIQNSENGFVIDFIVNNGQVSDTVASLHGQDLQMTYNMYVNDSAAVANPLTNSVDFVYNNNPFNQEEHHEKTKADVVTYGAKFLKVDSGLFGTGIKATPLESAEFAAKNAEGKYYGGLVDTDKNGVKEAVWVDDVANAAILKSDKEGHFEITGLTEGEYSLEETKAPENYQKLTKEISFKVDKDSYKEENRITIKNNQKASVPMTGSNGFQTYVLISCLLLGAGALSAVVYFKKKA >NZ_LN999988.1|WP_002316053.1|89745_90498_-|class-C-sortase MIIRKPKKKRIMGKWIIAFWLLSAVGVLLLMPAEASVAKYQQNQQIAAIDRTGTAAETDSSLDVAKIELGDPVGILTIPSISLKLPIYDGTSDKILENGVGITEGTGDITGGNGKNPLIAGHSGLYKDNLFDDLPSVKKGEKFYIKVDGEQHAYQIDRIEEVQKDELQRNFVTYLEPNPNEDRVTLMTCTPKGINTHRFLVYGKRVTFTKSELKDEENKKQKLSWTWLLGSTVFLSVMIIGSLFVYKKKK >NZ_LN999988.1|WP_002320589.1|88974_89730_-|hypothetical-protein MRNRKWLFVCAAALFSFTAYTQLTFADRQESTDSTEQTIQTSDSSTIQSSDETVDSSTVDSSEEPKIAEDDQIVKQTIHVQKIISSEQLDNQGHEKQEGVNGAKFSVYDVSDILQKMDVKDLTTDQIESQLKDRVKKLSSDQLKLVSNGETKTIDQQTGVFEFSVEVQANQKQAYYIVNESSPENISNSEDILLLTPVSDKNGEFLKDVWIYPKSEASQPKEEVKKIVSTGVKKNFFENCWDFVTHLFSRD >NZ_LN999988.1|WP_002310964.1|88701_88962_-|hypothetical-protein MKLIKLLLFILSCLTAVFLYCGLLFSQLSILPSYQLYLMRILNIPAASMPLDIMEKLIRNPLFTTINLIVIVGISLVIYKKEGMKG >NZ_LN999988.1|WP_002310965.1|86614_88705_-|isopeptide-forming-domain-containing-fimbrial-protein MNFKHSWTRRLKYVFPIMMMLGTLFGLKTANVFAEKVIVDPSNPIQNVKNNFIIPKDVPNAKTNITVNGASKVYKYHVDANKGGFTDDYVGLVEGNKNIRYPSFQKEYGETNLVLEGVTTNTKVNIDFGKIGTYNGKKVNIKLVLSNIHLYSDTLPWNLLDNNYTKTHFRDDGYKNTNGAMSKSKKRTVLWISDNLFSGIVYHSTQMNVQLVATYEDGSPVQFSGDTFISFNSLNPAGGKSTDLKGEYSHYDKMNTTDWYVRKDTVLSEFKSFYNNLNVVGGHPGGSSKLTQADNDFNNLHDKLGDPKFGQGTVSFKISEANPTFVIGSSNVQTWFTLSSATIFSVVPDQPEKTGVDKNGNNVNDKMLQVGDTIQYRIKQKVNRLGVDLLAVYDRFELIDNLPKEVNYVDAHVESGTNKKFDVSGEVTYDKTKHQVKYAAKADTLKNRMKYNGETYELVINVKVNELANQNSVAKNQGTSIINKVEKDTNIITVYFPKIPVKEVQQNGKDVNGRNDGKKGTPTAPLNAGSEVQYLVTQKWHTKGVDAASDHYKQFSIQDPIEARLTYKEGSAQVIDKSKGKDITSEGTLTYDSNSRTLKWEASADFLSNNLLDGREIQLIFTAKTPLQSEKNIDNQAVVAVDNVSNKTNVVTIGVDPNLPQVIVPKTGSTHLVTISAVSLLLLVLATFSYAVLRYI >NZ_LN999988.1|WP_002290397.1|100453_100708_+|AbrB-family-transcriptional-regulator MGKELKVRKIGNSVGVILPSSLGLKSGDTIQAKQEGNLFILDTTQIAKEHDRKLIEESFQDFEKGLTVSEIEMVKAFGKYGWSE >NZ_LN999988.1|WP_112020405.1|100708_101023_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MKEYTLVYSKSFQTNLETIIEEWENELALSPASIKRFVGAIQKALELTKNFPTMHEEVSEIYGMDIPTYRIVIGKSYALFYRIDHEKKEILVGVLLQSFKSTIK >NZ_LN999988.1|WP_001015311.1|101060_101741_+|IS6-like-element-IS1216-family-transposase MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >NZ_LN999988.1|WP_050580236.1|101782_102217_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MQQNLQANNFEEAIRKALQPFLEADVVTEKYVETILKIYEETGPYIVITENIALPHATVESGAKDVAIGFMRLKTPVTSGHRTNDPVKYLFPLSAKNNQAHIELLSELANLLGNPDFLKFIKVVSSREEFKNYIEKAEGENKYE >NZ_LN999988.1|WP_002307675.1|102209_102506_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MNSHKALVACRAGVGSSLMLKIKVNEVVKENNFPLEVEHSSLDGVPGFQGDMIITLPDVANELIEKNLPQKIVGIANIVDKNEIKIKLEEAFIELEKQ >NZ_LN999988.1|WP_002331324.1|102525_103155_+|hypothetical-protein MDFIISFLSTPAVLLGLVAMIGLLAQKKSGTEVLTGTSKTIIGFLIFNAGGTIMTGALQNFNTLFQTGFHIKGVVASPEAATALAQTEFAFVTSSTLILGFIMNLVIARITPFKNIFFTTGHSLFFACVLSLILKAHNFSDVAAIIVGGLLLGFFSAVLPQLCQPFMRKITGSDATAIGHFNMVGYALSGYIGKLFSKYKDRTTEDIIG >NZ_LN999988.1|WP_033705792.1|103094_104000_-|MATE-family-efflux-transporter MRDLTTGTPAKLIFLFTIPLLVGNIFQQFYNMVDMIIVGQTIGKEALAAVGATGSITFLIIGFAQGLTAGLSIIMAQRFGAQDFRGVKKSFAVATIISFTVTAILTVLSLVFLRPLLLLMQTPPDIIQQAQEFISVILGGMFASMAFNLLSNMIRALGDSRTPLFFLIFAVIINVILDLVFIINFHMGIAGAGYATVIAQISASLMCVIYIKRKIPLLQVSKSDFKIDKDTIFTHLNAGLPMAFQSSIIAIGAVVLQSALNSLGTDVVAAQAAAGRIDQFATQPMMSSVVRSLYLLNSLPI >NZ_LN999988.1|WP_002290085.1|105052_105319_+|ACT-domain-containing-protein MKAILTVVGKDKVGIIAGVSQKLAELNINILDVSQTIMEDYFTMMMMLQMQPEADLEAIKQALSQVENTLGVKISIQNEEIFNAMHKL >NZ_LN999988.1|WP_002290081.1|105333_106677_+|PFL-family-protein METKQILETIRMVEEENLDIRTITMGISLLDCIDASTEKTCQNIYNKITSKAKNLVKVGDEIASEFGIPIINKRISVTPIAIVASASGGQDCVAFARVLDKAAKAVGINFIGGYSALVEKGYQGADLSLIQSIPEALAETEFVCSSVNIGSTRAGINMDAVKLMGETIKQTAEASDMGCAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADCEINVGVSGPGVVKRALEKVKGESFDVVAETVKKTAFKITRMGQLVGQIASERLHVPFGIVDLSLAPTPAVGDSVALILEEMGLESVGTHGTTAALALLNDAVKKGGVMACNHVGGLSGAFIPVSEDAGMIKAVEEGYLNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIPGDTPAETIAAMIADEAAIGVINHKTTAVRIIPAKDKKVGDSVEFGGLLGTAPVMRTNSAKSTDFIQRGGRIPAPIHSFKN >NZ_LN999988.1|WP_077933103.1|106752_107277_+|transposase MLDSMMKALEDRQVVADPKAVYRLLKEKSSKALTEKYHLDFREFSDDFHQYETLDTRQPVTFDHVYDTLTQLKQQGSKHYILTHRTIASTRELLVKEGMLEFFEENARRLALIFLPPYSPQLNLMEGVWKWLKESVINNVFFDHVQKIKQSVRGFLADVNERPLEVIDRLCVRM |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN999988_1 | 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder | 97677-97715 | 39 | NZ_CP011282 | Enterococcus faecium strain E39 plasmid p1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_LN999988_1 | 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder | 97677-97715 | 39 | NZ_CP025426 | Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p1, complete sequence | 221216-221254 | 0 | 1.0 |
NZ_LN999988_1 | 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder | 97677-97715 | 39 | LT603679 | Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 2 | 452-490 | 0 | 1.0 |
NZ_LN999988_1 | 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder | 97677-97715 | 39 | NZ_CP018832 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence | 244126-244164 | 0 | 1.0 |
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NZ_LN999988_1 | 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder | 97677-97715 | 39 | NZ_CP043485 | Enterococcus faecium strain DMEA02 plasmid pDMEA1, complete sequence | 27883-27921 | 0 | 1.0 |
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NZ_LN999988_1 | 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder | 97677-97715 | 39 | NZ_LR134096 | Enterococcus faecium isolate E1334 plasmid 2 | 453-491 | 1 | 0.974 |
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1. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011282 (Enterococcus faecium strain E39 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025426 (Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to LT603679 (Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018832 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040369 (Enterococcus faecium strain VB3240 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020485 (Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013995 (Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018073 (Enterococcus faecium strain VRE001 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027518 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135298 (Enterococcus faecium isolate E7429 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135288 (Enterococcus faecium isolate E7199 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135333 (Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 3) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135294 (Enterococcus faecium isolate E7237 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
29. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135255 (Enterococcus faecium isolate E7098 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
30. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135236 (Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
31. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135198 (Enterococcus faecium isolate E6055 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
32. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135259 (Enterococcus faecium isolate E4457 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
33. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135182 (Enterococcus faecium isolate E1774 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040905 (Enterococcus faecium strain N56454 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041256 (Enterococcus faecium strain 515 plasmid p26, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
36. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019209 (Enterococcus faecium strain 2014-VREF-41 plasmid p41-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
37. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019989 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-63 plasmid p63-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017798 (Enterococcus faecium strain E243 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135429 (Enterococcus faecium isolate E8927 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135436 (Enterococcus faecium isolate E8691 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135483 (Enterococcus faecium isolate E4456 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135476 (Enterococcus faecium isolate E8423 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135204 (Enterococcus faecium isolate E7171 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135180 (Enterococcus faecium isolate E0595 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135227 (Enterococcus faecium isolate E7025 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135489 (Enterococcus faecium isolate E8414 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135365 (Enterococcus faecium isolate E8195 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135220 (Enterococcus faecium isolate E7040 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135415 (Enterococcus faecium isolate E8328 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135395 (Enterococcus faecium isolate E8290 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NC_021987 (Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135345 (Enterococcus faecium isolate E8202 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135325 (Enterococcus faecium isolate E7654 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135358 (Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135409 (Enterococcus faecium isolate E8284 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135352 (Enterococcus faecium isolate E8014 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050649 (Enterococcus faecium strain BIOPOP-3 ALE plasmid pBIOPOP-3_ALE) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050651 (Enterococcus faecium strain BIOPOP-3 WT plasmid pBIOPOP-3_WT) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
59. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135385 (Enterococcus faecium isolate E7933 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044265 (Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135318 (Enterococcus faecium isolate E7663 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134106 (Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
63. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135373 (Enterococcus faecium isolate E8172 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006031 (Enterococcus faecium T110 plasmid pEFT110, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011829 (Enterococcus faecium strain UW8175 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR132068 (Enterococcus faecium isolate E0139 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019395 (Enterococcus faecium strain QU 50 plasmid pQL50, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LN999988 (Enterococcus faecium isolate EFE11651 plasmid II, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033042 (Enterococcus faecium strain Enterococcus faecium JE1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025687 (Enterococcus faecium strain CBA7134 plasmid pCBA710401, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040741 (Enterococcus faecium strain VRE1 plasmid pVRE1-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014530 (Enterococcus faecium strain E745 plasmid pl1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023424 (Enterococcus faecium strain K60-39 plasmid pTT39_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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74. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP022342 (Enterococcus faecium strain KUHS13 plasmid pKO1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040877 (Enterococcus faecium strain HB-1 plasmid punnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032307 (Enterococcus faecium strain HY07 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040704 (Enterococcus faecium strain HOU503 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044275 (Enterococcus faecium strain V2937 plasmid pHVH-V2937-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017793 (Enterococcus faecium strain E240 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019993 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-268 plasmid p268-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035655 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023790 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04462.3A plasmid pER04462.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023800 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04526.5A plasmid pER04526.5A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035137 (Enterococcus faecium strain SRCM103341 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035661 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035667 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NC_017963 (Enterococcus faecium DO plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035649 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040850 (Enterococcus faecium strain F17E0263 plasmid p_unnamned1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042840 (Enterococcus sp. DA9 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135171 (Enterococcus faecium isolate E4227 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135192 (Enterococcus faecium isolate E4438 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041271 (Enterococcus faecium strain VVEswe-S plasmid pVVEswe-S1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037956 (Enterococcus hirae strain CQP3-9 plasmid pCQP3-9_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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95. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135308 (Enterococcus faecium isolate E7240 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040237 (Enterococcus faecium strain VB3025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018066 (Enterococcus faecium strain E1 plasmid pE1_230, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023809 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04526.3A plasmid pER04562.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033207 (Enterococcus faecium strain RBWH1 plasmid pRBWH1.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018129 (Enterococcus faecium strain A_020709_82 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023805 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04619.3A isolate isolate plasmid pER04619.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035221 (Enterococcus faecium strain SRCM103470 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019409 (Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NC_020208 (Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034948 (Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016164 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_11 plasmid ISMMS_VRE11_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018827 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to LR135186 (Enterococcus faecium isolate E4413 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012461 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023795 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04484.3A plasmid pER04484.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG674581 (Enterococcus faecium strain HL1 plasmid pHLSA, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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112. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023781 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER03933.3A isolate isolate plasmid pER93933.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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113. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LT598664 (Enterococcus faecium isolate Ef_aus00233 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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114. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027401 (Enterococcus faecium strain FDAARGOS_323 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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115. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135175 (Enterococcus faecium isolate E4402 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgcctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ******************.********************
116. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134096 (Enterococcus faecium isolate E1334 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgcctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ******************.********************
117. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042833 (Enterococcus faecium strain FA3 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgaggatg Protospacer ************************************.**
118. spacer 1.2|97677|39|NZ_LN999988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012367 (Enterococcus durans strain KLDS 6.0933 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer agccccaaggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer . *** *.*******************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1682 : 65698
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN999988|1682:65698|DBSCAN-SWA TTTAACAGACGTCAAGCTTTTTCATACAGACCGTGGAAAGGAATTTGATAACCAAACCATTCATGAGATTCTGAATGGTTTGGTTATCAAATTCTTTTCCACGATCCGTATGGAAGAGTTCGATTTCTTGAAGTGAGTAAGGAATGCTTTGAATGGCCCTTTTTACAAGCTGCGCATCTTTTTTATTTCCGCAAGAATGGCCAATAATTTCACGATTGAATAAATCAATCATCAAACAAATATAAGCCCAATTTGTCCCGACCCGAACATAAGTTAAATCCGTGACAACCGCTGACAATGCTTTTGTTTGAGTAAACTTTCGATCTAAGTGATTCGCAATTTTCTTTTGATTGCTTTGGCACGATCATAAAGACGGGAGCAGATATTGTCTATTGATATAATGATAGTAGACAAACAGAGTTGGCTGATTAGCTAAAGCATATCGAGTATAATTTGAATATTAGACGCATGATTTATCAGTGTAAGAAAGGGTGAGGATTATGAAAAGGTTTTTGAAAATATTTATCTTTCTCGAAATAATACTTTTTGTATATATTTTTAATACTTCTATTTACAATATTTATGAAAAGAATAATAGAGAGTGTAAAATATTTTGTGTAAATAAATTGTCCTCCTGCAAAATAATTAGTTACTCAGTAAACATTGAAACTAATGTATCGGTTACCTGTTGAAAACCTTTATGGCTTCTGTTTAGAAATTTTTGATTGTATGTATCAAAAATGCTGACTAGAAAGCGTTCTAGTGATTCTTCATTTTGAAACTGCTCTTTTCTACGGCTGTATCTTTTAATTTGCTTATTGAAAGACTCGATTAGATTGGTTGAGTAAATGGTTCTACGAATGCTAGGTGGAAAATCATAAAAAGTTAATAAGTCTTGGTTTTCTATGAGTGACTGCGTCACTTTAGGATAGTTTTTCTTCCATTTCTCAATCATGCCGGATAAGAAGGTATTCGCTTCTTCTTTTGAGTTAGCTTGATAAACAGCCTTAAAGTCATCACAGATTTCTTTTCGGTCTTTGACACGTACTTTATGAGCGATGTTACGAGATACATGGATACAACAATGCTGATATTTTGCTTTAGGATAAATTTGATGGATAGTATCTTTCATGCCTTTTAAGCCGTCCGTAATAAAAAGCAAGACTTCTTGAACTCCTCTGGAGTTAATATCCTGTAGCAGCTCATTCCAAACGTATGTTGATTCAGTTGGAGCAATCGCATAACTCAGTACTTCTTTAGTGCCGTCTTCTCGTATACCAATGGCAATATAAATCGCTTCTTTGGATACGGTTTGACGTTTTAGTGGAATGTAAGTAGCGTCCATAAAAATAGCGACATACTTATCATTTAAGGCTCTGGATTTAAAGGCATTTACTTCTTCAGTCAGAACTTTAGTCATGTTGGACATGGTTTGTGGAGTATAGTGATGACCGTACATTTTTTCGATCAAATCAGCAATTTCAGACATCGTAACACCTTTTTCGAATAAATGGATAATAGTGGTTTCCAATGTATCGTTTGTTCTTTTGTAGGCTGGTAAAGTTTGTTGTTTAAACTCACCATTACGATCTCTAGGTATTTCCGTAAGCGCCCCATAGAACAGTACCTTACTAACAAATGCACCTCAAGATATACTTGAGCTATCAAGAAGTCTGGAGGTTTTCTATGTATAAATTAAATGAGATTGTTCCTGTCCAATTAGGAAACGAAAAGAGTGCACCAGAAAAAGGTAAACCCGCGGCTGCCAAGTTAGCGATGCGCATCAAAAGAGAGAATGGTTCTGAAGTTTTGATCTATAACGGTATTAACAATTATATTCTTCAAGCTATTTTGAAAGAACTGTTGTCCAATGCTTTATGATTTACTTCAAACCAAACATATTTATATTGTGTGCGGAAAAACAGATTTGCGAAAAGGAATTGATGGTCTTGCCAGTCTTATTCAACAAGAGTATCAACTCGAGCTTTACGAAGATGCCGTTTTTTTATTTTGCGGGAACCGTCAAGACCGTTTCAAACTTCTCTATTGGGACGGTGATGGTTTTCTTCTCTGTTATAAGCGGATAGAAAACGGCAAGTTAAAATGGCCTCGGACGAAAGACGAAGTTCGAACCTTAACGAACCAACAGGTTCGATGGTTGTTAGAAGGATTAAGTATCGATCAACCTCGAGCTATTTTGCCAGGAAAAAAAGGAGTTTTTTAAGCTGGGGGGTTAACACAAAAAATGTGTTGAACCCCTATTTCTTGTGCGTTTCTTGTGGTATTCTGTAACAAAATCAGTTCGATTCAAGGTGGTGAAAAATTTTGGAAACTACAGATACGTTGCTTCAGTTGCTTCAAGAAGCCCATAAAACCAATCAAGCACAACAACAAACCATTCAGAATCTTACAACTGAAATCCAACTATTGAATGAAAAGGTCAATTATTTAACCAACAAATTATTTGGACGCTCTAAAGAGACTCTCTTTGAGGAAACGAATGGGCAATTGAATCTTTTTAGTGATGAAGAAATTTCTGTAAGTGTTCCAGAAGCAGCTGCCACCATTATTCCAGTAAAAGGACATCAACGAGTTGTAGGAACGAAAGCAGACAAAATCAAACACTTACCTATAACAGAGAAAGAACATCTCCTTCCTTTGGAAGAACAATTTTGTGAACATTGCGGTTCACAGATGAAAGATATCGGACGGACAAAAGTACGAGAAGAAATTCGTTTCCATCAGGCTATGTTGGATTGTCTCACCCATTATCAACATACCTATTGTTGTAAAAGCTGCGAAAAAGAAGGACTTTCTTCTTTTAAAAAAGCGATCGTTCCTAAACCTTTGATTTCTAATAGCTTAGGTTCCAATAGTTTAGTGGCGGAAACGATCCGGATGAAATTTGGTCAGAAAGTTCCTGCCTATCGGCAAGAGAACTATTGGAAACAAACACATGGGTTGGATATTTCGAGAGATAATATCACCAATTGGCATATTAAAGCAGTGCAAAACGCGTTAGACCCTTTAGGAGAACGATTAAGAGTCTATCTTAATCAAGAAGAGATTCTACACGGGGATGAAACAAGTTATCGTGTGATTGAAAGTGCCAAAACAGATACCTATTACTGGCAGTTTTGTACAGGAAAAGACAGTCAGCATCCCATCGTTTATTATCACCACGACGAAAGTCGTGCTGGAGATGTTCCGAAAACTTTTCTCAAGGAGTTTACAGGGTATTTACACTGTGACGGCTATAGCGGGTATAATGCCGTGGAAAGTGTACGACTTGTCTATTGTTTCGCGCATGTTCGGCGGAAATTTTTCGAAGCAATTCCAAAAGGAAAGAAAAACACGGATATTCCCGCAGCTCAAGCAGTCAAACAATTGGATAAATGGTTTGTCCTAGAAAAGAAATGGAAAGACTTTTCTCCTGAGAAGCGATTAAGCTGTCGGCAACAAGAACTGCGTCCATTATTTATTGCTTTTTATGAGTGGATGGCAACGATAGATCCTGTTGCAAAATCCAAGTTGGATGCAGCCGTTCAATATGCGTGTAAACTACGAAGTGGTTTTGAACCTATTTTTGAAGATGGTCGTTTAGAACTCACAAATAATCGTGCGGAGCGAAATATCAAAGAGCTGGTGATAGGACGGAAAAATTGGTTGCATTCCACAAGTCTTGAAGGAGCACGAACTTCAGGAATCATTCTGAGTGTATATAAAACAGCAGAACTTAACGGATTGAATCCTGTAAAGTATCTAGAGTTTCTATTTGATAAGATACCAAATCTTCCCGTACTTTCAGCAGAAACTTTAGATCAACTGTTGCCTTGGAACAAGGATGTACAACAACATTTTTCTCGTAACTAAAAACGCCAAACATTCCCGATTCTATTCTATAGGTCGGGTTATTTGACGTACAGGTACTGTTCTATGGGGCGCTTACGTATTTCCAATGTTAATTCACCATATTCGGTTTTGATTGATCGAAAGTAAGAACCGTTTCTCGAATTACCTGAATTAAAACCAGTGCGATCATATTTTTCGTAATCTAAAAAAGCCGTTAATTCAGTCCGTAGGAGTGTGTTTATCGCTTTTTCTAAGTGCGAACGGAATAATTCATTTAAATCGCCTTTAGTGACTAGAGTTTGCACAATTTCTGTAGTAAAATCATTCATAGGGAAGTCCTCTTTTCTGTGAATTGGTTGTCGTTAACTTTATTCTACAGAAGCGCCTTCCTTTTTTGTATGGATTTTTTCATTTACACAAAATATTTTACACTCTCGGATGGCTCTGAACGATTAACAATATTTTTTTGTTTTGACTATCATTTTATTGTTCAGAAATAATTTATTGCACTTTTTGAGGTAAATAGTTTAGAATTATTTTAATATAAGTACTTCAGATTTAATAAAGGAGAAATATCTAATGAAAAAAATTGATTTAATAAATATGATAGGTATGTTAATAGGGATATTAGTAAATATAGTAATTTTCACAGATTGGCTCGGGGTGTTATTTTCTAATCTTATTCCCATACTTATTATAGGCATTTGTGGAATTATACTTTCAATATTAGAACTTTTTGAAAGCAGAAATACAATGAATAGAATATTTGCTTGTATTATATTAATTGTTAATCTATTGCCTATGGTCTATTTTACTTTTTTATATTTTGCACTGGGATGAAATAAATTAACCAAAAGTTTCTTTTTCTTATAATGTGTATCAATATTAAAACTGAAAAAGATATGGATAATAGGATCAAAGCCCTCATTGGAACACTCAATATATTATCAGATTTAAATTTCAAATAGATAATTTCATTGTTTAGTAATATCGAAAGATACTTTTTTAATGATGAGAGTGTAATATAAACCGTGTAAGTAACCATTAATCCTAGGCAGGTGGTTGCTTCGCGGTTTTTCTTTTTCTACAATAAGATCAAGAGGTGATTACACGATGGCTAGAAAGAAAAGAAATCCTGATGCCGAAAA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58 | Paenibacillus_phage(15.79%) | holin,integrase,transposase,bacteriocin | attL 2292:2351|attR 48514:49507 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
70895 : 127719
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN999988|70895:127719|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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