Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT571451 | Staphylococcus epidermidis isolate BPH0662 plasmid 3 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_LT571450 | Staphylococcus epidermidis isolate BPH0662 plasmid 2 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_LR736240 | Staphylococcus epidermidis isolate BPH0662 plasmid 4 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_LT571449 | Staphylococcus epidermidis isolate BPH0662 chromosome 1 | 4 crisprs | cas3,csa3,DEDDh,DinG,WYL | 2 | 2 | 9 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LT571449_1 | 133737-133824 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT571449_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LT571449_1
>1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder AGAAATTCAACAAGCAAAGCAAGTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT571449_1
The CRISPR arrays of NZ_LT571449_1 >merge|NZ_LT571449|1|133737-133824|CRISPRCasFinder GGATGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCACTGAGAAATTCAACAAGCAAAGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCACTG >NZ_LT571449|1|1|133737-133824|CRISPRCasFinder GGATGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCACTG AGAAATTCAACAAGCAAAGCAAGTTG GGGATGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCACTG
>NZ_LT571449.1|WP_002456826.1|132907_133498_+|histidine-phosphatase-family-protein MEIYLVRHGESQSNYDNKHGYLYFCGQLDVPLTERGIKSAKELSVYFKNKYIDNVYVSDLKRTRQTYEELFPYDIPTIYTKTLRERSLGVFEGKNKEEVCKDKRFEKYFRDPNYKYFRHSFSQKAPQGESYQDVYDRVVTFIENELNQQQRRVVIVAHQVVIRCFFVYFKMITKEEALTTEIHNCYPYLIKEEMKF >NZ_LT571449.1|WP_001830914.1|132254_132887_+|LysE-family-translocator MDGLITFIIITLLIIIVPGPDFIIVMKNTINSSKMNGFMAAFGITTGHILYSSLAIFGIIYILTSLHFVFLTIKILGACYLIYLGIKSILSAHSSVDFSKQALADVRNVSYITSFRQGFLSTSLNPKALLFYVSIFPQFLSNGNIHMKSEVALFAFSVVVVICLWFLFCVFIFQYIKLLFSRPRFKAIFDYIVGFVLIGLSINLLLSKSS >NZ_LT571449.1|WP_001832461.1|131528_131783_+|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MFGLIGMIIVGGIIGWIAGLILGKDVPGGILGNIIAGIVGSWVGTMILGEWGPQLGKIHIFPALLGSIILIFIISLILKALRKK >NZ_LT571449.1|WP_001830921.1|131046_131307_-|hypothetical-protein MQHKNKFQRINQIIQVIGFLSFLAILTIITLNFFIKGHLQGHFEIGFNIQSNQVYVVTTLIIVTIICTILSAILNMLSNKKQNYKH >NZ_LT571449.1|WP_001831354.1|130334_130577_+|30S-ribosomal-protein-S18 MAGGPRRGGRRRKKVCYFTANGITHIDYKDTELLKRFISERGKILPRRVTGTSAKYQRMLTTAIKRARHMALLPYVKEEQ >NZ_LT571449.1|WP_001831333.1|129780_130290_+|single-stranded-DNA-binding-protein MLNRVVLVGRLTKDPEYRTTPSGVSVATFTLAVNRTFTNAQGEREADFINCVVFRRQAENVNNYLSKGSLAGVDGRIQSRSYENQEGRRIFVTEVVCDSVQFLEPKNAQHGGQRSQNNNFQDYGQGFGGQQSGQNTSYNNNNSSNSNQSDNPFANANGPIDISDDDLPF >NZ_LT571449.1|WP_001831345.1|129461_129758_+|30S-ribosomal-protein-S6 MRTYEIMYIVRPNIEEDAKKALVERFNGILASEGSEVLEEKDWGKRRLAYEINDFKEGFYNIVRIKTDNNKSTDEFQRLAKINDDIIRYIVIREDQDK >NZ_LT571449.1|WP_002455908.1|128267_129077_-|lysozyme MLKKFSYSIISLSIFATSLNFIDTQAQASSSSVSEKGTMGYGYQQYLKDHPKKQTHKTQNRSTFSAESNITETNNGERVLDISEWQGLLTNEQIKQLKKNYDFIILRAQYGSEYVDKTFEKNAELLEQNKMKYGVYSYSMYESPKDARYEAKTLSQRAPKAAFYINDYEEQTVKSGDDETATQAWANEMRKLAGNKKILFYSYENFMLNHASNAVSSYDGYWLAAYQAEEPNREKVLWQYTNSYYSPELNQNVDANYIDENVNSSWFTS >NZ_LT571449.1|WP_001831355.1|128002_128194_-|hypothetical-protein MRLNLDWNKDFQEFQDILNSGIHPEWLYCAKANLVLEPAYTGEGKQFFSTQDIIKASKIIPFF >NZ_LT571449.1|WP_002484799.1|126672_127770_+|redox-regulated-ATPase-YchF MALTAGIVGLPNVGKSTLFNAITKAGALAANYPFATIDPNVGIVEVPDSRLIKLEEMVQPKKTIPTTFEFTDIAGIVKGASKGEGLGNKFLSHIREVDAICQVVRAFDDENVTHVSGRVNPLDDIEVINMELVLADLESVEKRLPKIEKMARQKDKTAEMELRILTQIKEALEDGKPVRSIDFNEDDQKWVNQAQLLTSKKMLYMANVGEDEIGDKDNDKVKAIREYAANEDSEVIVISAKIEEEIATLDDEDKEMFLEDLGIEEPGLDRLIRTTYDLLGLSTYFTAGVQEVRAWTFKQGMTAPQCAGIIHTDFERGFIRAEVTSYEDYVQHGGENGAKEAGRQRLEGKDYIMQDGDIVHFRFNV >NZ_LT571449.1|WP_002437185.1|133855_134233_-|hypothetical-protein MKIRLTFIILAILSTIGLVLVLAKYPTGPHTINYNEPYTVLIAITTIVIMALPALILGIFNHLACRIISAILQISALMMWGFLVIISLIMGQIVIMLMASLTILALLVSSIVTLSVHPSTSDKIN >NZ_LT571449.1|WP_002456828.1|134452_135076_-|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRVITYLILALSLTLAACSNTNDNNNQEHHSNAHAPKNAKTLKEKDIFSSNKKGQKISEKEMKQALEKYLQANSDVLDNKYVMQHKLDKQSDSNPKITESQADRLSKLSNLAVKNDLHFKKFIKNNHIPEEYKDPTDRIINYFHALNSTISNVDEDIEKLNYQPQNSINVVDVATKYSGDVNKKQQDKITTFLKKKGIDTEVFNK >NZ_LT571449.1|WP_002437172.1|135336_136860_-|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLQQLLELMEGDVEFVASLGSDDKSNELKELLNEMAEMSAHITITEKSLKRTPSFSVNRPGEETGITFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKGLEGPFHFETFVSLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHTMIDGAVFREESENIMAVPAVFLDGQEFGNGRMTVQDILTKLGSTQDASEFNDKDPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAEHIAQYDIDTMTGIRATNIEKTDSAIRVTLENDAVLESKTVIISTGASWRKLNIPGEDRLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVKHVTLFEYASELKADSVLQERLRSLPNVDIKTSAKTTEVIGDDYVTGISYEDMTTGESQVVNLDGIFVQIGLVPNTSWLQNAVELNERGEVMINRDNATNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >NZ_LT571449.1|WP_002437170.1|136874_137444_-|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAYDPKKDEFKEVTQEDFKGSWNVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYAKLQELGVNVYSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKLEYSMIGDPSQTITRNFDVLDEETGLAQRGTFIIDPDGVVQAAEINADGIGRDASTLVNKIKAAQYVRQHPGEVCPAKWEEGSESLQPGLDLVGKI >NZ_LT571449.1|WP_002437166.1|137888_138668_-|hypothetical-protein MTLTNKEVAKVLFKAYRYKKPIDFISENYQLNEEEAYHVQEELIDQLTFKDRSTVTGYKVSMTSKATQAIANTNEPAYGTLLSNQIVNDGASVSLSELFSPLLEPEIIFIVQEDLPYDADLETIRYHTRIAPGIEIPDARYKNWFPNFTLSDLISDNTATGLVVVGDPVDGLDNDAFANVHLNLYKDDKCIATGESSKVLGNPLNAIHWLIKKLHTHGKQLKKGDIISSGTFISPLKLEYGTYRAEYSGIGKVSFSVNK >NZ_LT571449.1|WP_002455899.1|138808_139564_+|NADPH-dependent-oxidoreductase MSDYVYELMKQHHSVRKFKNQPLGSETVEKLVEAGQSASTSSYLQTYSIIGVEDPSIKARLKEVSGQPYVLDNGYLFVFVLDYYRHHLVDEVAASNMETSYGSAEGLLVGTIDVALVAQNMAVAAEDMGYGIVYLGSLRNDVARVREILNLPDYTFPLFGMAVGEPSDEENGSPKPRLPFKHIFHKDQYDANQHQQRKELEAYDQVVSEYYKERTHGVRTENWSQQIETFLGRKTRLDMLDELKKAGFIQR >NZ_LT571449.1|WP_001829358.1|139685_141074_-|L-cystine-transporter MEILFTVINVIVLLVFLIMLNIMARKHVSFPKRVFTALAIGIVFGIVLHLIYGAESKTLEQSTDWFSIVGDGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFSKIQIGEKFAKIGSYIFMFLIGTVAIAAIVGIFYALIFGLDASSIDLGSAEHSRGTEISKQAKDLTANTLPQQILEVFPSNPFLDFTGQRTTSTIAVVIFATFVGFAYLRVARKQPEHGSLLKRGIEAIYSIVMAIVTFVLRLTPYGILAIMASTLATSDFSAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSVLGINPVKYVKKTIEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTKRLGVPEGIANFSATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAVMVAPVANVEIDFQFVVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISIEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTARLTNHWDKKTFDSNDYGDLSAN >NZ_LT571449.1|WP_001829387.1|141382_142285_-|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYHLSKTEYRGREATDFKEDDIELFTDIANKVKQTNSYDLAFEELEKEKDFLQVIVKDEDSQLPTDQNVAQLVEDLRSEIQKMREERQMLGQMINQVHQQQQELKELQTDITTKLDSNAQSLKSIQNSQEAIQSAQEQQSKDIAKANELKDSELRSHFDSMSNSASISQSNVASQSTTASLSQSESANDSMSSSLSESNSITSESNTNSKSEIESKSTSTSEFLSESGSVSNSEKSESISHSQSTSATPSSQSTYQQQPKEEKKGFFARLFNL >NZ_LT571449.1|WP_002455897.1|142410_143076_-|hypothetical-protein MEFKVIESAKDPLFNEALKLYDDKLDIGLDEDSKIFKRSLENNKTENDYAFIVGIENQTVVSLATAHYEATTNSAFLIYLIAKESPNHDERMSLTLEAIEKQLNLLSQEVHNRDINFIMLEVPKEPSTANIDDKLRNALEHRRQFLFENQFEKQDDIDYIHPNQNQKETPQKVDLFIKANIELTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGISREIIYPLLKEMNLR >NZ_LT571449.1|WP_001829411.1|143203_143611_-|general-stress-protein MAKITVVNNQDELYKVINQKKSEGYLETELAVISKSKLHLDDLHNSQISLMATSGSFSDRMSRLLTGEDGEETVLSRYDLTDNELEGYKQDILNDKMLVVANSDRSSHDEVEDNNAAYKEVDITHYAAESEGPKA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LT571449_2 | 928096-928197 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_LT571449_2
|
1 spacers
spacers of NZ_LT571449_2
>2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder AAAAGAGGAACACATGAGCTTGAGGT |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT571449_2
The CRISPR arrays of NZ_LT571449_2 >merge|NZ_LT571449|2|928096-928197|CRISPRCasFinder TCATGTATAAGAAACACTAAATACCTATGTATTAAGTGAAAAGAGGAACACATGAGCTTGAGGTTCATGTATAAAAAACACTAAATACCTATGTATTAAGTG >NZ_LT571449|2|2|928096-928197|CRISPRCasFinder TCATGTATAAGAAACACTAAATACCTATGTATTAAGTG AAAAGAGGAACACATGAGCTTGAGGT TCATGTATAAAAAACACTAAATACCTATGTATTAAGTG
>NZ_LT571449.1|WP_001830161.1|927322_928057_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MNKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKDKAEAVVEEIKAKGVESFAIQANVAKGDEVKEMIKEVVSQFGSVDVLVNNAGITKDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKVTPQMLRQRSGAIINLTSIVGAMGNPGQANYVATKAGVIGLTKTAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTNALSDDLKDQMLEQIPLKRFGEDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >NZ_LT571449.1|WP_002469385.1|926403_927330_+|ACP-S-malonyltransferase MGKIAVVFPGQGAQKVGMASDLYNEEERSTRVLNLAQETVDFDLLETMFTDNDGKLGETENTQPALLTHSVALLESLNHLKVDYTMGHSLGEYSSLVSSGVLSFEDAVRIVRKRGQLMAQAFPNGVGGMAAVLGLDYDDVDKICQTLSTKEQLIEPANINSPGQIVVSGHKSLIDELVEKGKELGAKRVLPLAVSGPFHSSMMKVIEEDFANFINQFEWHNANYPVVQNVNAKGETDAEVIKRNMVKQLYSPVQFIQSTEWLINQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKITSIQTLEDVKGWNNHE >NZ_LT571449.1|WP_002469384.1|925424_926402_+|phosphate-acyltransferase-PlsX MVKIAVDMMGGDDAPGIVLDAVKKAVEDFKDLEIILFGDESQYNLSHERIEFRHCTEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTTDGKGFVFLDVGANADAKAEHLLQYAQLGNIYAQKIRGIQNPSVSLLNIGTEAAKGNSLTKKAYDLFEKNQSFNFTGNIEAKTLMDGNVDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKETIMSSFKNKLAGAVLKKDLETFAKKMDYSEYGGSVLLGLDGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEENIVQIMKDTVGE >NZ_LT571449.1|WP_001830099.1|924862_925423_+|transcription-factor-FapR MKLKKNDRRVAIKEAIELNPFITDYELCEKFDVSIQTIRLDRTHLNIPELRKRIKLVAEQNYGRIKSIEANEIIGDLIQVNPDVSAQSLIEITIDSVFAKSEIARGHVLFAQANSLCVALIHKPIVLTHESQVEFKEKVKLNDTVRADARVIDITDKHYIIEVNSYVSDMLVFKGKFKMYYTSEDE >NZ_LT571449.1|WP_002456579.1|922655_924704_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MSKVHLIESPYALDKIKGIGPKRLALLEELNIKSVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQADDQATVTVQGEVYSSPTVAFFGRNKSKLTVHLMINHIAVKCVFFNQPYLKKKLELNSIVTIKGKWNRNKQEINGNRIFFKDQKNQEDTHLEPIYRIKEGIKQKQLRDNIRQALSDVTIHEWLTDDLREKYKLETLAYTIQTLHHPINKQNLLRARRTYAFTELFMFELRMQWLNRLEKTSDEAIEINYDINKVKQFIDSLPFELTDAQKVSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLIQLFGNTMNVALLTGSVKGKKRRLLLEQLENGTIDCLIGTHALIQDDVVFNNVGLVITDEQHRFGVNQRQILREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIKTSWAKHEQYDQVLAQMSNELKKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQSDYGNEKVGLLHGKMSAEDKDQVMQKFSEHEIDILVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSEHQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANVVEDYRMLEVARDEAAELIQSGQFFEQQYSHLREFIKQNLRHIRFD >NZ_LT571449.1|WP_002456580.1|920793_922452_+|DAK2-domain-containing-protein MISKINGKLFADMIIQGAQNLSNNADLVDSLNVYPVPDGDTGTNMNLTITSGREEVENNLSQNIGELGKTFSKGLLMGARGNSGVILSQLFRGFCKNIEEEKEISVQQFAESFQAGVETAYKAVMKPVEGTILTVAKDAAKAAMDYVDQAEDCVDLMAHLIEAASESLDNTPNLLAVLKEVGVVDSGGKGLLCVYEGFLKGLKGEKIEAQAPKLDTESFVNDDHDFHGVINTEDIVYGYCTEMMVRFGKNKKAFDEQEFRNDMSEFGDSLLVINDDEIVKVHVHTEHPGDVFNYGQKYGELIKLKVENMREQHREVIRKEQDGLQSKEANESKTVETAIVTISVGDGIAELFKSMGATHIISGGQTMNPSTEDIVKVIEQSQCKRAIILPNNKNIMMASEQAASIVEAETVVIPTKSIPQGISALFQYDLESSLEDNKRHMSDALETVQSGSITFAVRDTKIDGIEIKKDEFMGLAEDKIVTSDVNQFHAVKGLLSKLLNEDSEILTMISGEDADNSITNQIINWIESEYPDVEVEQHEGGQPIYQYFFAVE >NZ_LT571449.1|WP_001830156.1|920404_920779_+|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MTLEISNDYGKIDISNDVIASVVGGKAVESYGIVGMASRQQVRDGIAEILGHDNYAKGIKVREDNGIIDVDMYIIVSYGVKISEVASNLQSTVKYTLEKTLNVKVNSINIFVQGVRVNETVKKV >NZ_LT571449.1|WP_001830107.1|919858_920047_-|50S-ribosomal-protein-L28 MGKQCFVTGRKASTGNHRSHALNANKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVTRV >NZ_LT571449.1|WP_001830164.1|919140_919776_+|thiamine-diphosphokinase MKINLLCSQRLLPNHIFEKEKDSNWAGIDRGALILVKQGIQPIFSVGDFDSVNNEERLMLMKNLQIEPVEAEKDDTDLALGVAQAVERGYTEITIYGATGGRLDHFMGVLQILQKPQYLHQSIKIKVIDQQNHIQLLNEGKYVINRDSTYPYISFIPLNDKTILTLQGFKYNLNQEHLNLGSTLTISNEVKVNEAIIRVEQGTVLKIRSRD >NZ_LT571449.1|WP_001830173.1|918491_919136_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MVKILPSLLSIDFLNLKEELQLLETAKVDGLHFDVMDGKFVPNISIGIPILDAVRQQSHLPIDVHLMIEQPENYINLFAEHGADMISVHVESTTHIHRAIEQIKQLGKKAGVVINPGTSVETILPILSIVDYVLVMTVNPGFGGQTFIEQCVTKIEQLNQLKHENHLTFDIEVDGGINDQTSKRCVEQGATMLVTGSYFFKQEDYAKVTSLLKE >NZ_LT571449.1|WP_001830184.1|928284_928518_+|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKYINSLEK >NZ_LT571449.1|WP_002456575.1|928632_929370_+|ribonuclease-III MANQKKKEMVHDFQQKFTDKMKSLGLHFKNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLEHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDRHPHLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIKLNELILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFVGALYLDQGLDSVWTFAEKVIFPYVEDDELVGVVDFKTQFQEYVHSQNKGDVTYQLIKEEGPAHHRLFTSEVILENKAVAEGKGKTKKESEQKAAEQAYKLMKNKKSL >NZ_LT571449.1|WP_002484841.1|929496_933066_+|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADHTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGAKMEDIIFSGAEHRKAQNFAEVKLKLDNHSQKLQIDSEELVVTRRLYRSGESEYYLNNDRARLKDIIDLFLDSGLGKEAFSIISQGRVDEILNAKPINRRQIIEESAGVLKYKKRKAESIQKLDHTEDNLNRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKQLSKEMEQSDVIVTVSDIDHYTEDNQRLDERLNHLKSQQAEKEGQQAQINQLLQKYKGKRQQNDYDIEKLNYELVKATENYEQLSGKLNVLEERKKNQSETNARYEEELDNLESQIDSIKNEKAQNEKLLADLKNKQKQLNKEVQELESLLYISDEQHDEKLEEIKNSYYTLMSEQSVVNNDIRFLEHTINENEAKKSRLDSRLVEAFNQLKDIQQNITQTQKEYQSSKKSMEKVEQNIQQLEQQLTDSKRLLSEYENKLYQAYRYNEKLKSRIDSLATQEEDYTYFFNGVKHILKAKDKELRGIHGAVAEVINVPSEMTQAIETALGASLQHVIVDNEKDGRQAIQYLKQRGLGRATFLPLNVIQPRHVAADIKDVARGSQGFINIASDAINVSAKYQNIIENLLGNTIIVENLKHANELARAIRYRTRIVTLEGDVVNPGGSMTGGGARKTKSILSQKDELSTMRNQLEDYQRQTAEFERQFKEQKTQAEQLSEQYFSASQQYNNLKEQVHHHELELDRLKTQEAHLKNEHEEFEFEKNDGYQSDKSKETLKEKQNHLIEIQQQLKQLESDIERYTQLSKEGKASTHQTQQQLHQKQSDLAVVKERIKSQKQVYERLDKQLSDSERQKIEVNEKIKLFNSDEMMGKDAFEKLKEQIQQQENVRQNLNQQLSEIKQQRKDLNEKIEINESQLQKCHQDILFIENHYQDIKAKQSKLDVLINHAIDHLNDTYQLTVERARMEYDSDETIDNLRKKVKLTKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLNEQRTDLREAKETLEQIIHEMDKEVEGRFKTTFHAVQDHFTTVFKQLFGGGQAELRLTEDDYLSAGVDIIVQPPGKKLQHLSLLSGGERALSAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAQYLNELSTETQFIVITHRKGTMEFSDRLYGVTMQESGVSKLVSVNLNTIDEVMKEEQA >NZ_LT571449.1|WP_002456573.1|933062_934289_+|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFSSKSEDDIQKDLDETVDSNANSDSDSMDPNDSDEQVKPKKKPKKLSEADFDEDGLISIEDFEEIEAQKIGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMKLTDELRTEAQRRNIQETEDLREVIVEKIVEIYHQEDDYSEAMNIEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYQQEGKKVMLAAGDTFRAGAIQQLNVWGERVGVEVVSQNEGSDPAAVVYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKSNLMQELDKMKRVINRAIPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARSFKEVTNVSGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEKMDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEDIPEEISRNSSVESEEGN >NZ_LT571449.1|WP_002457379.1|934290_934623_+|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQKNYLELFYLQDYSLSEIADTFEVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYESKLRLYQRFEKRRELYNLMKQSLNQPELLKQYITQLEELE >NZ_LT571449.1|WP_001830113.1|934653_936021_+|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSDRLQATMQKMRGKGKVTEADIKTMMREVRLALLEADVNFKVVKEFVKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQEELTSLMGGENTSIKMANKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPLLVAGDIYRPAAIDQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVSPQQIVENALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELQEVKEISKPDEIMLVVDAMTGQDAVNVAQSFDEQLDVSGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSDKQIDHIKAIIQSMTPKERSNPETLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKAKRNQMQNMLKGMNLPF >NZ_LT571449.1|WP_002439483.1|936328_936604_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQLGTYNPAHVNAPEVKIDEELALKWLHDGAKPTDTVHNILSREGILKKFDEQKNAK >NZ_LT571449.1|WP_001832559.1|936730_937234_+|ribosome-maturation-factor-RimM MEVEVGQIVNTHGIKGEVKVKSNSDFTETRFQPGEQLLVKHNNTEIVYTVASYRIHKGFHMLRFEGINNINEIEHLKGDYIYQERDHQDIELGEHEYYYSDIIGCTVFKDDDTPIGRVINIFETGANDVWVVKGEKEYLIPYIEDVVKDIDIETKTIKITPMEGLLD >NZ_LT571449.1|WP_001829466.1|937233_937971_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFEGVLNHSILKRAQDKGIINVNTINFRDYSINKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMEDINHNEHTRVILMCPQGRPFTQEIAQELSEAKHIVFICGHYEGYDERIRKHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNQASHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREYKNMSVPEVLLSGNHAHIDQWRHEQKLIRTYEKRPDLLEQYPLTEKDREILETYKKKLKND >NZ_LT571449.1|WP_002436293.1|938076_938427_+|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPTFRSGDTLRVHVRIVEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGISETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT571449_3 | 936128-936223 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_LT571449_3
|
1 spacers
spacers of NZ_LT571449_3
>3.1|936162|28|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder AGAGTAGTGGAACGCCTGAGCTAAAGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT571449_3
The CRISPR arrays of NZ_LT571449_3 >merge|NZ_LT571449|3|936128-936223|CRISPRCasFinder CATGCATAACCAAAAGTACGATTTACTTCGTAAAAGAGTAGTGGAACGCCTGAGCTAAAGCACATGCATAACCAAAAGTACGATTTACTTCGTAAA >NZ_LT571449|3|3|936128-936223|CRISPRCasFinder CATGCATAACCAAAAGTACGATTTACTTCGTAAA AGAGTAGTGGAACGCCTGAGCTAAAGCA CATGCATAACCAAAAGTACGATTTACTTCGTAAA
>NZ_LT571449.1|WP_001830113.1|934653_936021_+|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSDRLQATMQKMRGKGKVTEADIKTMMREVRLALLEADVNFKVVKEFVKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQEELTSLMGGENTSIKMANKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPLLVAGDIYRPAAIDQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVSPQQIVENALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELQEVKEISKPDEIMLVVDAMTGQDAVNVAQSFDEQLDVSGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSDKQIDHIKAIIQSMTPKERSNPETLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKAKRNQMQNMLKGMNLPF >NZ_LT571449.1|WP_002457379.1|934290_934623_+|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQKNYLELFYLQDYSLSEIADTFEVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYESKLRLYQRFEKRRELYNLMKQSLNQPELLKQYITQLEELE >NZ_LT571449.1|WP_002456573.1|933062_934289_+|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY 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>NZ_LT571449.1|WP_002456575.1|928632_929370_+|ribonuclease-III MANQKKKEMVHDFQQKFTDKMKSLGLHFKNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLEHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDRHPHLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIKLNELILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFVGALYLDQGLDSVWTFAEKVIFPYVEDDELVGVVDFKTQFQEYVHSQNKGDVTYQLIKEEGPAHHRLFTSEVILENKAVAEGKGKTKKESEQKAAEQAYKLMKNKKSL >NZ_LT571449.1|WP_001830184.1|928284_928518_+|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKYINSLEK >NZ_LT571449.1|WP_001830161.1|927322_928057_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MNKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKDKAEAVVEEIKAKGVESFAIQANVAKGDEVKEMIKEVVSQFGSVDVLVNNAGITKDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKVTPQMLRQRSGAIINLTSIVGAMGNPGQANYVATKAGVIGLTKTAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTNALSDDLKDQMLEQIPLKRFGEDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >NZ_LT571449.1|WP_002469385.1|926403_927330_+|ACP-S-malonyltransferase MGKIAVVFPGQGAQKVGMASDLYNEEERSTRVLNLAQETVDFDLLETMFTDNDGKLGETENTQPALLTHSVALLESLNHLKVDYTMGHSLGEYSSLVSSGVLSFEDAVRIVRKRGQLMAQAFPNGVGGMAAVLGLDYDDVDKICQTLSTKEQLIEPANINSPGQIVVSGHKSLIDELVEKGKELGAKRVLPLAVSGPFHSSMMKVIEEDFANFINQFEWHNANYPVVQNVNAKGETDAEVIKRNMVKQLYSPVQFIQSTEWLINQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKITSIQTLEDVKGWNNHE >NZ_LT571449.1|WP_002469384.1|925424_926402_+|phosphate-acyltransferase-PlsX MVKIAVDMMGGDDAPGIVLDAVKKAVEDFKDLEIILFGDESQYNLSHERIEFRHCTEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTTDGKGFVFLDVGANADAKAEHLLQYAQLGNIYAQKIRGIQNPSVSLLNIGTEAAKGNSLTKKAYDLFEKNQSFNFTGNIEAKTLMDGNVDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKETIMSSFKNKLAGAVLKKDLETFAKKMDYSEYGGSVLLGLDGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEENIVQIMKDTVGE >NZ_LT571449.1|WP_001830099.1|924862_925423_+|transcription-factor-FapR MKLKKNDRRVAIKEAIELNPFITDYELCEKFDVSIQTIRLDRTHLNIPELRKRIKLVAEQNYGRIKSIEANEIIGDLIQVNPDVSAQSLIEITIDSVFAKSEIARGHVLFAQANSLCVALIHKPIVLTHESQVEFKEKVKLNDTVRADARVIDITDKHYIIEVNSYVSDMLVFKGKFKMYYTSEDE >NZ_LT571449.1|WP_002439483.1|936328_936604_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQLGTYNPAHVNAPEVKIDEELALKWLHDGAKPTDTVHNILSREGILKKFDEQKNAK >NZ_LT571449.1|WP_001832559.1|936730_937234_+|ribosome-maturation-factor-RimM MEVEVGQIVNTHGIKGEVKVKSNSDFTETRFQPGEQLLVKHNNTEIVYTVASYRIHKGFHMLRFEGINNINEIEHLKGDYIYQERDHQDIELGEHEYYYSDIIGCTVFKDDDTPIGRVINIFETGANDVWVVKGEKEYLIPYIEDVVKDIDIETKTIKITPMEGLLD >NZ_LT571449.1|WP_001829466.1|937233_937971_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFEGVLNHSILKRAQDKGIINVNTINFRDYSINKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMEDINHNEHTRVILMCPQGRPFTQEIAQELSEAKHIVFICGHYEGYDERIRKHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNQASHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREYKNMSVPEVLLSGNHAHIDQWRHEQKLIRTYEKRPDLLEQYPLTEKDREILETYKKKLKND >NZ_LT571449.1|WP_002436293.1|938076_938427_+|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPTFRSGDTLRVHVRIVEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGISETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >NZ_LT571449.1|WP_002504748.1|938956_941560_-|YfhO-family-protein MIKNIWNKPIKRFTLIVLVSCILSFILYGPFLYQFITKGIVFSGSGDGFRQMMPFQMYLYEHFTSLKGFYDASFGLGGDYVKSLAYYYSLSPLMWINFSMIWILEQTINVNPHDISFWPINQLIMAYVRTVITFIFSFYLFSYLRLKPAPMFIATILYGMSTVVTYYNFTWSFYGNLLIMLPMSLWAIERFFKERKIGWFIFAIAYTLFSNFYFSYYEAIVIGFYFIYRFAIPHEKDIVNRWQKLYILVCATLLSVLVSIYGLYTGISSFLDNDRAQNPNFKITFFTNLFETNYNIFADGFYITISFIAIIALFCFKLYQHYYYKLFAIATWILLIGSFSQWFDSAFNGFSLPQRRWVYFLALSTSVLIALFIQHLSEISIKEYTFVAIPVFIYGFIFIALSERSVKWMFVALILIIVLFIFIKYKSLLTRTSMMVLLVVLFLAQQVLMTNDSRKITIEPYQTTIKTINDSNYRSPVLNKKIKYMHQSSTDPLKRLDYFSYYALNSPLIYHYNGTSLYSSIFDGDILKYYDQTLQINMPVDKNSTYRYLNNRANLMSLWDVQDRLRHPDDLNMPYGFKKKELITDKKDQWIHSVNTINYPSAHITNKIYDARKLKSPLDREQAMLKGVVLNHKSQANTDFKPNPNLLSNAKQNLNHANWIDSKHLKVKQHNGGVTLNLPRNIVKNYKDMYIEMDVELLSPDKEHKVGVNEYSQERNRLSYKYRRFVSPVTMRAKASNQLNIKMSKGVYRFKVKGIYGENYQTLKKASQQLQPVKVKKERNGFTIIKKKKEHGYLVLPMVYAKGMHAMANGKPLKVQQGNGIMTTIPVKEGQTKIKLSYTPPYFYLLITVSCIGIILSILFTHYVKRK >NZ_LT571449.1|WP_002456571.1|941552_944153_-|YfhO-family-protein 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>NZ_LT571449.1|WP_001829495.1|944481_945345_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MAIQWYPGHMAKAKRQVSEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDDVIKQKPRVVILNKKDMTNLKELEKWEIYFKNEGFYPVAVDAKHGKNLKNVEVEAIKATQEKFDREKAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLAKRSIAETGNKPGVTKQQQWIKVGKSLQLLDTPGILWPKFEDEEVGKKLSLTGAIKDSIVHLDEVAIYGLNFMIKHDVSALKRHYNIDTHEDAEILDWFDAIGRRRGLLQKGNEVDYESVIELIINDMRNAKIGTYCFDILKEMKSE >NZ_LT571449.1|WP_001829514.1|945349_946120_+|ribonuclease-HII MSLTIKEIKEKLSRIETLEELHKHEANNDSRKGVINAIKSREKNILKQQALEEHYLSMNQYENNIMSSNRDALICGIDEVGRGPLAGPVVACAVILEKNHHYIGLDDSKKVSPKNRARLNQNLKENVYQYAYGIASSVEIDELNIYRATQLAMLRAINQLDVTPTHLLIDAMTLDIDIPQTSIIKGDAKSVSIAAASIMAKEYRDQYMRQLSKQFPEYGFDKNAGYGTKQHLKAIDQVGIINEHRQSFEPIKSMMK >NZ_LT571449.1|WP_002439496.1|946227_947394_+|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAEEAVEKAKELNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYANELLGKQLVTHQTGPEGKEVKRLYIEEGCDIQKEYYVGFVIDRATDKVTLMASEEGGTEIEEVAAQTPEKIFKETIDPVVGLSPYQARRIAFNINIPKESVGKATKFLLALYNVFIEKDCSIVEINPLVTTGDGQVLALDAKLNFDDNALFRHKDILELRDLEEEDPKEIEASKYDLSYIALDGDIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDVGGGATKEKVTEAFKIILGDDNVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVAAVKEVELTLPLVVRLEGTNVERGKAILNESGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT571449_4 | 2323764-2323847 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT571449_4
|
1 spacers
spacers of NZ_LT571449_4
>4.1|2323789|34|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder TCGGTGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCGAACCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT571449_4
The CRISPR arrays of NZ_LT571449_4 >merge|NZ_LT571449|4|2323764-2323847|CRISPRCasFinder CAACTTGCCTTGTCCGTGGAATTTCTCGGTGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCGAACCCCAACTTGCCTTGTCCGTAGAATTTC >NZ_LT571449|4|4|2323764-2323847|CRISPRCasFinder CAACTTGCCTTGTCCGTGGAATTTC TCGGTGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCGAACCC CAACTTGCCTTGTCCGTAGAATTTC
>NZ_LT571449.1|WP_002484434.1|2322912_2323701_+|VOC-family-protein MTNFHSIDATQVTNVTLNVKDLNKSTDFYSNVLGFSIEKQTNQQTVFNIGNLGYTLTLNELNNGRQPEFREAGLFHVAYLLPTRSDLADFLYHANNLNIAMGGGDHLVSEALYFTDPEGNGIEVYHDRPSEDWVWRDGFVKMDTLEVNVNDLMAQRSNEGWPEEGKIGHLHLKTHNLESAYEFYVEKLGFEHISNFPQALFMSTQKYHHHIATNTWQSNKIRTQNEQTYGLCHFDIYQPNANTTHVTSPEGFDITIHGNETK >NZ_LT571449.1|WP_001831535.1|2322369_2322651_+|N-acetyltransferase MAAEIKQGDHKFYVGNDENNPKAVITFKEVDNNEIDIDHTGVSDELGGQGLGKKLVNRVVEHARENNLKIIASCPFAKNVLEKDDHAQDVYLG >NZ_LT571449.1|WP_001831461.1|2321255_2322203_-|zinc-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLIIVSIIILMLSGCSSFDHRKRESINDKNKMKVYTTVYAFQSLTQQIGGKYVDAQSIYPAGADLHSYEPTQKDMIDIAKSDLFVYSSHQLDPVAAKITNSMTNNSMKLALAEGLKQSDFIHSKDHDENHEHHSHHEESNQDPHVWLDPVLNQKFAFMIKEKLIEKDPKHQAYYNKNYKIVNKDIVHIDQQLQSITKHYKRDKVVISHDSLGYLAHRYGFKEQGVKGMNDEEPSQKEILNIVKDIQHSHAPYVLYEQNITSKITDVIKKETDTKPLSFHNLAVLTKEEQNDDSISYQSLMKKNIYVLNRALNN >NZ_LT571449.1|WP_001831598.1|2319760_2321185_+|aldehyde-dehydrogenase MTNQLFINNEFIESQSKETMDVINPATGEAFDTITLATEEEVNDAIEKSQQAQLEWERVPQPTRAEHVKLLIPLLEKNRDQIAQLYVKEQGKTLAQAYGEIDKSISFIDYMTSLSMSDKGRVLQNSIANETIQIINKPIGVTAGIVPWNAPILVLMRKVIPAIVTGCSVVIKPSEETTLLTLRLAELFRASTIPAGLIQIVPGTGETVGTQLASHKDIQLISLTGSMRAGKSVYENAAQTVKKVNLELGGNAPVIVTSNADLDKAVNYIVTARINNAGQVCTCPERIFVHEDVHDDFLNKVTSKMKSLTVGDPFDENTDYGAIINQKQLDSIHEKVQDAIKNGATLMTGGHQLKRHGFFYAPTVLDNVRKDYNVFKDEIFGPVLAITTYRDFEQVIEDANDTNAGLSSYIFSENLTEVMTATERLKFGEVYANCEAEEVVNGYHAGWRESGLGGADGIHGFEEYYNTTVSYIRY >NZ_LT571449.1|WP_002484437.1|2318462_2319512_+|membrane-protein MSNVKESIIVAFAFVGVVVGAGFATGQEIFQFFTSHGIYSIGGIFITGLIITLGGIFVLNTGFRLRSQNHSESIRYYLHPTIAKLFDIILTVFLFSLAIIMTAGGASTINESFGLPFWLSSLILVILILLTLFLKFDRLIAVLGGVTPFLVAVVVMIAVYYFITGDLNFSDVSQYSNQNKSISPGWWFDAINYASLQIAAAFSFLTVMGGKLRYQSSTIYGGLIGGIIVTLLLLLINFGLVTEFNQIKEVALPSLLLAKQISPSIGIIMSVIMVLVIYNTVVGLMYAFASRFSRPFTKRYYILIVMMAIITFACTFVGFISLIGKVFPIMGLFGFILLIPVIYKGILRK >NZ_LT571449.1|WP_001831423.1|2316327_2318115_-|sodium:proton-antiporter MSLELPVMLTIVLFLALGIFSQWLASRIKWPSIVVMAIVGLLVGPIFGLANPKEALGPEAFSSIVSLAVAIILFEGSSNLDFRELKGISKAVIRIITIGAGIAWILGAIALHVTMNFPLSISFVIGGLFLITGPTVIQPLLKQAKVKRNVDSVLRWESIILDPIGPIIALTAFYVFQIFEEGIGFVVIILFILKLLAAILIGFGAAFLFNWLIGQDKIPQSLMPPIQFVFILLTFSICDEILSESGLLAVTIFGLMMARKKRHDLIFKESDHFIDNASSILVSTVFILITSSLTKDVLLNVLSWQLILFSLVMIVLVRPISVLLSTLGTEITKKERAVVALMAPRGIVVLTVAQFFSSLFMDDKIPMAQYITPVTFGLVFITVVIYGFGFTPLSKLFGVASTEPPGVIIVGESEFSFHLGINLRDHGIPVMMFNLFENTSEKAHEAGFEVFKGNLLSSNDRIYSDLLRYNKCILMTQSFIFNSLAFNELVPEFGLNNVDMMPVSFNDEQARNNLNGPIRNHILFDENHTPRWFNQFITQHNIVEVPAEDYEKITENDMLIYHINEDKEVTFKRSNRDIPEHETGVYGILKNAYLT >NZ_LT571449.1|WP_001832881.1|2314134_2316099_+|fructose-1,6-bisphosphatase 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>NZ_LT571449.1|WP_001831616.1|2312240_2313239_+|thiazole-biosynthesis-adenylyltransferase-ThiF MSRYERQTRFAPFGEEGQQKLSSSQILIFGAGALGSHIVDQLARMGAHHIAIVDMDIVEISNLHRQTLFDEEDAHTLISKVEAIKHKVNQININVNLTTYDLEVTSSNIENLIKNVEPDIIIDGMDNFKIRYLINEVCHKYQIPWVYGAAVGSKGSVYGIDHQGPCLKCLLQTIPDTGESCAINGVIPPVISMIASYEVAEAVRYLSGKGFSKQLITIDAFNINYKSMNVDALKNKDCPVCEKHEYTLLESQQERTIEDLCGNAYLFRFPPKAFKHAAHFPGNMVKSTSFAKLIQYQTYEFTLFKDGRMNAYGIHNDEEAHHLYNTLLKSIR >NZ_LT571449.1|WP_001831506.1|2311471_2312239_+|thiazole-synthase MFKIGNLELQSRLLLGTGKFENEEVQSKAIEASETNVLTFAVRRMNLYDRNLPNPLANVNLKDFITFPNTAGAKTAQEAIRIAEIANHAGVCDMIKVEVIGDDETLLPDPFETYEACKVLLEKGYTVCPYISNDLVLAQRLEELGVHAVMPLASPIGTGRGINNPLNLSYIIENASVPVIVDAGIGSPKDACHAMELGADGILLNTAISAAKDPVKMAEAMKLGINAGRLSYEAGRIPVKYTAQASSPSEGLGFL >NZ_LT571449.1|WP_002456688.1|2324529_2326023_-|aldehyde-dehydrogenase-family-protein 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MTQHTLPMESSVLIPTNNISRHVNDIAETIPDTEFDEFRHYRGLI >NZ_LT571449.1|WP_153801572.1|2331862_2333041_-|IS110-family-transposase MSKRSSVVAHYKNGKFQKEFFIQNNKNGYNYLLKYLNDLHHPQLIFESTGIYSRGMERFCCVNQINYIQMNPLEAKFKTSALRSWKTDQADAHKLACLGPTLKQTGNLPIHELIFFELRERVRFHLEIENEQNRLKFQILELLHQTFPGLERLFSSRYSIIALNIAEIFTHPDMVLDIDKDVLITHIFNSTDKGMSMDKATKYALQLRVIAQESYPNVDRHSFLVEKLRLLIQQLKQSIHHLKQLDDAMIQLAQQLDYFENIHSIPGIGKLSTAMIIGEIGDIKRFKSNKQLNTFVGIDIKRYQSGHTHCSDTINKRGNKKARKLLFWVIMNIIRGQHHYDNHVVDYYYKLRKQPNEKPHKTAIIACINRLLKTIHYLVMNHKLYDYQMSPH >NZ_LT571449.1|WP_001832363.1|2333422_2334322_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFDSIRETIDYSVENNISFADMMINDEMEREGKSREEVRDLMRQNLNVMREAVEKGTTGDGVESVTGYTGHDAAKLRDYNENNHALSGHEMIDAVKGAVATNEVNAAMGIICATPTAGSSGTIPGVIFKLEKTHNITEDQMIDFLFTSALFGRVVANNASVAGATGGCQAEVGSASAMAAAAAVSIFNGSPEQSGHAMALAISNLLGLVCDPVAGLVEIPCVMRNAIGSGNALISADLALAGVESQIPVDEVIGAMDRVGRNLPASLRETGLGGLAGTPTGEEIKRKIFGEADNMVKNK >NZ_LT571449.1|WP_002493287.1|2334334_2335015_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MAKSYDYQSAFDIIGPVMMGPSSSHTAGAVKIGNSARAVLGDMPKHIEIRYYESFAKTHQGHGTDVAIVGGAMGYSTFDSRIKSSLDIAKDENITIDIIEDEGESIGQHPNCAYIKANTKDGRYIEVIGISIGGGTIKLKGINVNGLNVELNHGLPMLVIDGNMNKAKINHLINDLSDMDLDLGEELIETNDNEGLVVFPLNKAISESALNIIKDKHSDLNVSYIK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_LT571449.1 | 194089-194114 | 2 | 0.923 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_LT571449.1 | 415321-415346 | 2 | 0.923 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_LT571449.1 | 1400283-1400308 | 2 | 0.923 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_LT571449.1 | 1400341-1400366 | 2 | 0.923 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_LT571449.1 | 1673350-1673375 | 2 | 0.923 |
NZ_LT571449_4 | 4.1|2323789|34|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 2323789-2323822 | 34 | NZ_LT571449.1 | 1431722-1431755 | 2 | 0.941 |
1. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to position: 194089-194114, mismatch: 2, identity: 0.923
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaattcaacagacaaagcaagttg Protospacer ************..************
2. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to position: 415321-415346, mismatch: 2, identity: 0.923
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaattcaacaggcaaagcaggttg Protospacer ************.********.****
3. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to position: 1400283-1400308, mismatch: 2, identity: 0.923
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaattcaacaggcagagcaagttg Protospacer ************.***.*********
4. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to position: 1400341-1400366, mismatch: 2, identity: 0.923
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaattcaacaggcagagcaagttg Protospacer ************.***.*********
5. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to position: 1673350-1673375, mismatch: 2, identity: 0.923
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaattcaacagacaaagcaagttg Protospacer ************..************
6. spacer 4.1|2323789|34|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to position: 1431722-1431755, mismatch: 2, identity: 0.941
tcggtgaaattctctttgttggggccccgaaccc CRISPR spacer tcagtgaaattctttttgttggggccccgaaccc Protospacer **.**********.********************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT571449_2 | 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 928134-928159 | 26 | MN369743 | Streptomyces phage Tribute, complete genome | 80738-80763 | 4 | 0.846 |
NZ_LT571449_2 | 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 928134-928159 | 26 | MT310865 | Streptomyces phage Bmoc, complete genome | 78515-78540 | 4 | 0.846 |
NZ_LT571449_2 | 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 928134-928159 | 26 | MH576968 | Streptomyces phage Wofford, complete genome | 80704-80729 | 4 | 0.846 |
NZ_LT571449_2 | 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 928134-928159 | 26 | MF358542 | Streptomyces phage Sushi23, complete genome | 80852-80877 | 4 | 0.846 |
NZ_LT571449_2 | 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 928134-928159 | 26 | MK494112 | Streptomyces phage EGole, complete genome | 81544-81569 | 4 | 0.846 |
NZ_LT571449_2 | 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 928134-928159 | 26 | MF347639 | Streptomyces phage Samisti12, complete genome | 81875-81900 | 4 | 0.846 |
NZ_LT571449_2 | 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 928134-928159 | 26 | NC_042011 | Streptomyces phage Peebs, complete genome | 80496-80521 | 4 | 0.846 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | MN694088 | Marine virus AFVG_250M454, complete genome | 24350-24375 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | MN694007 | Marine virus AFVG_250M456, complete genome | 24395-24420 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | MN694027 | Marine virus AFVG_250M455, complete genome | 27746-27771 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP034911 | Ensifer alkalisoli strain YIC4027 plasmid unnamed, complete sequence | 337057-337082 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP040783 | Bacillus thuringiensis strain HM-311 plasmid p1, complete sequence | 80159-80184 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NC_020394 | Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-233, complete sequence | 137021-137046 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP014283 | Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850636, complete sequence | 280870-280895 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP031069 | Bacillus sp. JAS24-2 plasmid pl626, complete sequence | 622506-622531 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP020005 | Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed3, complete sequence | 75068-75093 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP022446 | Bacillus cereus C1L plasmid pC1L1, complete sequence | 414799-414824 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP044979 | Bacillus thuringiensis strain BT62 plasmid pBT62A, complete sequence | 497401-497426 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP032614 | Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.1, complete sequence | 454459-454484 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP007513 | Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome | 88318-88343 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_AP014865 | Bacillus thuringiensis serovar tolworthi strain Pasteur Institute Standard strain plasmid pKK1, complete sequence | 382031-382056 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP053952 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed1, complete sequence | 247116-247141 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | CP046512 | Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence | 459206-459231 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP023246 | Bacillus cereus strain HBL-AI plasmid unnamed1, complete sequence | 513161-513186 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP042875 | Bacillus cereus strain 09 plasmid unnamed1, complete sequence | 258661-258686 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP011154 | Bacillus cereus strain CMCC P0011 plasmid pRML05, complete sequence | 310868-310893 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP011152 | Bacillus cereus strain CMCC P0021 plasmid pRML04, complete sequence | 236022-236047 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP040345 | Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence | 500606-500631 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP045607 | Bacillus cereus strain SB1 plasmid p1, complete sequence | 543660-543685 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | CP020755 | Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence | 374432-374457 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP050184 | Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID1, complete sequence | 314629-314654 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP021062 | Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence | 5344-5369 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP016589 | Bacillus thuringiensis strain KNU-07 plasmid pBTKNU07-01, complete sequence | 124811-124836 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP053657 | Bacillus cereus strain CTMA_1571 plasmid p.1, complete sequence | 330728-330753 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | NZ_CP053949 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed1, complete sequence | 377266-377291 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_1 | 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 133768-133793 | 26 | MN693811 | Marine virus AFVG_250M463, complete genome | 40836-40861 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_2 | 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 928134-928159 | 26 | NZ_CP020749 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed6, complete sequence | 9314-9339 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_2 | 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 928134-928159 | 26 | CP024687 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence | 200447-200472 | 5 | 0.808 |
NZ_LT571449_2 | 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder | 928134-928159 | 26 | MF358541 | Streptomyces phage Warpy, complete genome | 80974-80999 | 5 | 0.808 |
1. spacer 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to MN369743 (Streptomyces phage Tribute, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aagagaggaacacaggagcttgagcc Protospacer **.*********** ********* .
2. spacer 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to MT310865 (Streptomyces phage Bmoc, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
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3. spacer 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to MH576968 (Streptomyces phage Wofford, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aaatgaggaacacaggagcttgagca Protospacer *** ********** *********
4. spacer 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to MF358542 (Streptomyces phage Sushi23, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aagagaggaacacaggagcttgagcc Protospacer **.*********** ********* .
5. spacer 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to MK494112 (Streptomyces phage EGole, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
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6. spacer 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to MF347639 (Streptomyces phage Samisti12, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
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7. spacer 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NC_042011 (Streptomyces phage Peebs, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
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8. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to MN694088 (Marine virus AFVG_250M454, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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9. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to MN694007 (Marine virus AFVG_250M456, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer tttaattcaacaagcaaagcaactta Protospacer ******************* **.
10. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to MN694027 (Marine virus AFVG_250M455, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer tttaattcaacaagcaaagcaactta Protospacer ******************* **.
11. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034911 (Ensifer alkalisoli strain YIC4027 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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12. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040783 (Bacillus thuringiensis strain HM-311 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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13. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NC_020394 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-233, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaatacaacaagcaaaacaagacc Protospacer ****** ***********.**** .
14. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014283 (Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850636, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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15. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031069 (Bacillus sp. JAS24-2 plasmid pl626, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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16. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020005 (Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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17. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022446 (Bacillus cereus C1L plasmid pC1L1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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18. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044979 (Bacillus thuringiensis strain BT62 plasmid pBT62A, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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19. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032614 (Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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20. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007513 (Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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21. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP014865 (Bacillus thuringiensis serovar tolworthi strain Pasteur Institute Standard strain plasmid pKK1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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22. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053952 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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23. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to CP046512 (Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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24. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023246 (Bacillus cereus strain HBL-AI plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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25. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042875 (Bacillus cereus strain 09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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26. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011154 (Bacillus cereus strain CMCC P0011 plasmid pRML05, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
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27. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011152 (Bacillus cereus strain CMCC P0021 plasmid pRML04, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaatacaacaagcaaaacaagacc Protospacer ****** ***********.**** .
28. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040345 (Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaatacaacaagcaaaacaagagc Protospacer ****** ***********.****
29. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045607 (Bacillus cereus strain SB1 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaatacaacaagcaaaacaagacc Protospacer ****** ***********.**** .
30. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaatacaacaagcaaaacaagacc Protospacer ****** ***********.**** .
31. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050184 (Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaatacaacaagcaaaacaagacc Protospacer ****** ***********.**** .
32. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaatacaacaagcaaaacaagacc Protospacer ****** ***********.**** .
33. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016589 (Bacillus thuringiensis strain KNU-07 plasmid pBTKNU07-01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaatacaacaagcaaaacaagacc Protospacer ****** ***********.**** .
34. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053657 (Bacillus cereus strain CTMA_1571 plasmid p.1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaatacaacaagcaaaacaagacc Protospacer ****** ***********.**** .
35. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053949 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agaaatacaacaagcaaaacaagacc Protospacer ****** ***********.**** .
36. spacer 1.1|133768|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to MN693811 (Marine virus AFVG_250M463, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaaattcaacaagcaaagcaagttg CRISPR spacer agatattcaacaagcaaagcagaatc Protospacer *** *****************.. *
37. spacer 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020749 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer tatcaaggaactcatgagcttgaggt Protospacer * .****** **************
38. spacer 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to CP024687 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer tatcaaggaactcatgagcttgaggt Protospacer * .****** **************
39. spacer 2.1|928134|26|NZ_LT571449|CRISPRCasFinder matches to MF358541 (Streptomyces phage Warpy, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aaatgaggaacacaggagcttgaacc Protospacer *** ********** ********. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
52503 : 100929
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT571449|52503:100929|DBSCAN-SWA 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38 | Streptococcus_phage(22.22%) | integrase,protease,transposase | attL 44656:44673|attR 73747:73764 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
448860 : 459396
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT571449|448860:459396|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT571449|448860:459396|454859_455459_-|WP_001830331.1|DBSCAN-SWA MIIYILINIAIVLLILGFDLYRHRFRQLKFSSILLSVLINSMIDIFAINQFNFITMFTVTLFMIWTLLQIYLNFKLYPFVISDQKFIAIILAIVISLLQFITDKSSTQSVYMSIPYLSPTIFIIGAILLFVGTFKIDEVERLSLFRKIKRPMTTGTIIIILSLISTMILTPFWYVFLIIYSLLIGFILWQGVFFIKDKK >NZ_LT571449|448860:459396|452797_453271_-|WP_001830332.1|DBSCAN-SWA MKKISLFIIFLIRVISGIVIFRQGWEKFTGDFTLNGLVPVIRDNTDSPQWYKWFFEHIVAHTTGLFNIIVPLGEMAIGLGLILGIFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLAFFIILLMSHSLLAKVSLKEIIAYFRDRNNRGEDKHDPLTNRG >NZ_LT571449|448860:459396|456699_457371_-|WP_001830328.1|DBSCAN-SWA MSQNDLNKEKALVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDKEIEVAKKIAKEQNLKHHILDMSLLSQLTPNALTQHELSIEDNDDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIHAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLSMDKDFVIHTPLMWLDKAQTWALSDKLGVLDYIRHNTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRARGLKHYLEHKGEE >NZ_LT571449|448860:459396|454354_454492_-|WP_049361804.1|DBSCAN-SWA MTQHTLPMESSVLIPTNNISRHVNDIVETIPDTEFDEFSHHRGLI >NZ_LT571449|448860:459396|453321_453759_-|WP_001830329.1|DBSCAN-SWA MNTKYLLAVGAIVTSLTLGACGNSNSESDHANHKDKQQEDSNVKTDTTKKLSGNFESKNGEKVEGKAKIENGKLMLENYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKSGKKISTVDYNKSKQTFDLKNVDLEKYNEVTIYCEKAHVIFGGAKLK >NZ_LT571449|448860:459396|455561_456275_-|WP_001830330.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKEDIKLMTAEEIYDALLEIGGHRFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFEDKHIYTALETQGSRFQSWMTQIDDLTISPKPPSSGMKTNLEILDSVINQCTFHSLNLKVVIFDDADYDFAKLIHHRYPNIPFYLQVGNPYLDDNVDQHTDKLLERYEQLVDRVMQSSDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_LT571449|448860:459396|449902_451009_+|WP_001830351.1|DBSCAN-SWA MKIRVIVPCYNEGEVVLKTYDKLTEIMKKDSLIKNYEYDLLFINDGSTDTTIHHIKNIVAYDNHVKYLSFSRNFGKEAAMIAGYQHSTMHDAVIMIDGDLQHPPEYIPQMIEGYIEGYDQVVAKRNRQGENFVRKTLSRCYYKLINAFVEDIQFEDGVGDFRLLSRRAVQALTTLDEYNRFSKGLFEWIGYETKVFQYENVTREDGESKWTFRKLLNYGIDGLISFNNKPLRMMIYLGMFTFSISILYIIYLLINILINGINIPGYFTTIAAILLLGGIQLMSIGVVGEYIGRIYYEVKHRPKYIVENSNIQTENLDMRYNALNLNKNRNNKRSNDLYKLSSFYKVKTYSDTYASNYSQDEGFKERVH >NZ_LT571449|448860:459396|452133_452823_-|WP_001830352.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEKDIVDICQTYFEYEGYQVTTTTCGKEALKLLSSDIDIMILDIMMPEVSGYDIVKKMKDMQLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYIKKPFSPRELVLRTNNLLARMSKSNHSNKIEQLEFDGLVLKNLSKTLTINNIEIPMRIKEFELLWYLASREGEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKHDFLPYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_LT571449|448860:459396|458244_459396_+|WP_001830323.1|DBSCAN-SWA MHIEFKYRYYENEKDYEDYQLEMDNFQDSKIAYRLDEVGDVIHFAEQEQRNGSYVALYVTYEAAPFFNKEMVVNNVKQSHIFAAAYSFKSVNSIKNIKKVMPNKNHIKTEGFYFCESDKAMINKIKSIHKAIIEGATYQVNYTTRLKAEVFCPISHLYYQLTMSQNGNYTVLMDTPDIKVASISPELFFQKGDYKGKSNMIVSKPMKGTMPRGKNVKEDELYYNNLKTSSKDMAENVMIVDLLRNDITRIAQSGTIDVPELFSIEKYDTVFQMTSTVCGRLQDDIQLIDMMRALFPCGSITGAPKINTMQYIAQLEDMPRSIYCGTIGLLLPNQRMIFNIPIRTIEYNHEEAVYGVGAGITIDSVPENEVQEFHDKTKILERL >NZ_LT571449|448860:459396|457667_458255_+|WP_001830349.1|DBSCAN-SWA MILMIDNQDSFTYNLIDYIKVQTTEEVKIISVNDLMTQHLDALNPRAIVISPGPGKPSDYPILSSVLEIFHRHVPILGVCLGFQLIIEYFGGNIIHNDKPIHGHITKIRHSNEGIFKGLPSYFNVMRYHSLMADPSTIPSALKVTALNNENVIMAVAHHKYPIYGLQYHPESILSEYGHEQLNLFLTEVGVKYAH >NZ_LT571449|448860:459396|448860_449700_+|WP_001830355.1|DBSCAN-SWA MTNDVQILNNGYPMPAVGLGVYKIADEQMEEVVRTALDAGYRAFDTAYFYGNEKALGSALKHSNVERDELFITSKLWNDYQGYDQTIEYFNKSLDNLGLDYLDLFLIHWPCENDQLYIESYKALEHLYEEGKIKAIGVCNFKIHHLEKLMKETKITPQVNQIELHPYFNQQDVQDFCDEHDIKVTAWMPLMRNKGLLDDPVITDIAHRYDKTPAQIVLRWHLAHNRIIIPKSQTPKRIKENFDIFDFNLELTDVAEIDSLNKNARQGKDPDDVSIGDLK >NZ_LT571449|448860:459396|451078_452131_-|WP_025987135.1|DBSCAN-SWA MFSIRSQIIIGVISSVILTTIILVIAYKLMWFNGHMTLTLAITTMITSCLTLSICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFINHEKFIDDETFQSPREIKELNDSFNKMAYEINNQMNMIKNEQQEKTEIIQNLAHDLKTPLAGIRSYSEGLRDGVISDPQEVHEAYEILIKQANRLSILFDDITHVINLNTGRSYPLELIQLDQLLVNILQPYEQHIKQENRTLEVNFCTDIDAFYQYRPPIERILTNLLDNALKFSNSGSRIDIIISECKENDVISISIKDEGIGIVPELQSRIFERTFRVEDSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQIDASITVQSDLDIGTTMTLTLKKFQFKK >NZ_LT571449|448860:459396|456275_456695_-|WP_001830341.1|DBSCAN-SWA MQQIYPSVTHPYQFELNKDFNFSAAHYIPFEEAGKCIRTHGHTYYVNLTIAGNTLDKCGFLVNFRDLKKLVHEQFDHYLLNDLPAFKDKSPSTEIVAQTIYHIIQKELNQRENQPKCVQVYLRETPSSYVVYRPKEDQV |
13 | Staphylococcus_phage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
480819 : 491254
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT571449|480819:491254|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT571449|480819:491254|488560_489535_+|WP_002438902.1|DBSCAN-SWA MKFIFKGYTLFILLVILTIVSLFIGVSQLSLIDIFHLSDEQINILFSSRIPRTVSILLSGSSLALSGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILMSLLFFPNGPILIKLLFAVVLSIVGTFLFVQLINLIRVKDVIFVPLLGIMIGGILSSFTTFVALRTNALQSIGNWLTGNFAVITSGRFEVLYLTIPLLILAFVFANHFTIAGMGKDFSHNLGVSYEKIIKIALFITATLTALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISIYRGDHLKNALPHTLMLGAIFVLIADIIGRIIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYANER >NZ_LT571449|480819:491254|488281_488545_+|WP_002456931.1|DBSCAN-SWA MKTLFLIINIVLLKRFLLKLVGISFFMKVGIIKYFDVLLLLDKTFIKFPKNMKKLLKKENRVYNIDVNDNHYHYHYFRILTLYIFNI >NZ_LT571449|480819:491254|484753_485152_+|WP_001829589.1|DBSCAN-SWA MKVVYYSFSGNVRRFISRAGIKDTFEITQDNCNESVNEPYILVTGTIGFGEVPQPVQSFLNVNHTQLQAVAASGNRNWGQNFAKAGHTISEEYKVPLMMKFEVQGTNKDIIEFKDKVGNFNENHGRKEIQSY >NZ_LT571449|480819:491254|490474_491254_+|WP_001829596.1|DBSCAN-SWA MIQIRNLDKTIDNKPILKDISVDIKKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAISRLFSYENGSILIEDKEISEYKTDDLAKKLSILKQSNHTDMNITIEQLVKFGRFPYSKGRMKQEDYDKVEYALDLLQLNEIKHRNIKTLSGGQRQRAYIAMTIAQDTDYILLDEPLNNLDMKHSVQIMQTLRDLCRQLNKTIIIVLHDINFASCYSDDIIALKQGELVKADDKDNVIQSDILKSLYEMEVRIEEIRGQRICLYYDETTFDSV >NZ_LT571449|480819:491254|487338_488307_+|WP_001829597.1|DBSCAN-SWA MKAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLTDSEKNTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVIEEPHLKYKSDKIVENYHKLWGKEASIYDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQSLRNELSESEKQKADQEMYKLLNELYDNEVSYTHLLYDDIGLAEDVLNYVRYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTSTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEPLRDEDFVFDN >NZ_LT571449|480819:491254|480819_482325_-|WP_002438897.1|DBSCAN-SWA MTSNKSHEKAVQEIPQHGFFGHPKGLGVLFFVEFWERFSYYGMRAMLIFYMYFALQENGLGMDKTTAMSIMSVYGSLIYMSSIPGGWIADRITGTRGATLIGAILIIIGHICLSLPFAMVGLFTSMFFIIVGSGLMKPNISNIVGRLYPENDVRMDAGFVIFYMSVNMGALVSPIILQHYIDIRNFHGGFLIAAIGMALGLVWYLLFNRKTLGSIGMKPTNPLSSSEKKKYGTIIGIVVIAIVLILMIAYFTHTLSFNLISNTVLILGIALPIIYFTTMIRSKEVTDTERSRVKAFIPLFILGMLFWSIQEQGSNVLNIYGIENSDMKLNLFGWKTHFGEAIFQTINPLFILLFAPVVTLLWQKLGKKQPSLPIKFAIGTILAGASYILMGAIGHIYGDTQFSVNWVILSYVICVIGELCLSPTGSSAAVKLAPKAFNAQMMSLWLLTNASAQAINGTLVKLIKPLGQTNYFIFLGVVATVITLIILAFIPKISKAMKGIR >NZ_LT571449|480819:491254|482608_483109_-|WP_001832596.1|DBSCAN-SWA MTQGRQKDELKDITLLGNQNNTYEFDYRPEVLETFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNIKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLINLMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPDTKYEKMAEHRLMNHDMYPEKIDNR >NZ_LT571449|480819:491254|485114_487220_+|WP_001829582.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRKDNGFFDLEKDQEALKVYLEEIHDKMISFDDEIERLHYLVDNNFYFNVFEKYSEAELIEITEYAKSIHFQFASYMSASKFYKDYALKTNDKTKFLEDYNQHVAIVALYLANGNVKQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKALEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNIDKKKKDAREMLNMIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSVINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVFTGMDALTVVSDEANIQNAPGVKKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMIMNYYSIERSMEIAKERGEKYQDFEQSDYANGKYFEFYTSQEFEPKFEKVRQLFDGIDIPTSNDWKELQNKVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLVATIQTHVDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHHKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >NZ_LT571449|480819:491254|489518_490478_+|WP_002438903.1|DBSCAN-SWA MQMSANKKISILVVMAICMAIFYLLVGLDFDIFEYQFQSRFKKFILILLVGASIGTSVVIFQSITTNRLLTPSIMGLDSVYLFVKVLPIFILGEQATVVTNIYLNFLITLIAMVFFSLLLFQVIFKLGHFSVYFILLVGVILGTFFRSITSFLQLIMNPESFLAVQNVMFASFEASNSKLVTVSGILLVILIIVTIILRPYLDVLLLGRAQAINLGVSYENMTRMFLILVALLVSISTALIGPVTFLGLLTVNLAHEFMKTYEHKFILPATILFSWISLFIAQWVVENLFEATTEFSLIVDLVGGSYFIYLLVKRRNAN >NZ_LT571449|480819:491254|483122_483998_-|WP_001829684.1|DBSCAN-SWA MILNSKVKGIIAILISAVGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNFVAMFIPLFFIYKYRQPMFGKLSSQPLLISRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADTLMKLNPFWTIVLSLIFLHEKVRKYQITAMIIAIIGMLLIVKPEFSSSVIPSIAGLLSGIFAASAYTCVRALSTREKPYTIVFYFSLFSVVVLIPFSIFTYTPMTTIQILFLLGAGLSAAVGQIGITLAYSFAPAKDISIFTYASIIFTALFGFILFGESPDMFATVGYIVIIGASYYMFDKARRETTINQNN |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
692241 : 743171
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LT571449|692241:743171|DBSCAN-SWA 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80 | uncultured_Caudovirales_phage(69.86%) | tail,terminase,portal,head,protease,capsid,plate,integrase,holin | attL 680737:680753|attR 711241:711257 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
774400 : 782870
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LT571449|774400:782870|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LT571449|774400:782870|774869_775997_+|WP_001831674.1|DBSCAN-SWA MNFSKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVIVLDPNEDCPCRYVAHQFIHANYDDEQALNQLGENSDVVTYEFENISSEQLKKLTQLYHIPQGYQAIELLQDRLTEKQTLLEANTQIVPFVQIQTNQDLLKAIEKLGFPFIVKTRFGGYDGKGQILVRNDSELDEAYQLVEKQECVAEQYLDIQKEVSLTVTIGNEQQTTYFPLQENEHQNQILFKTVVPARSDKENEARKEVEKITRAIHFVGTFTVEFFIDKENNLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAITGQKLPQAIELLKPTVMMNLLGRDLDLLENEFSRHPDWHIHIYGKKERKPDRKMGHMTLLTDDVNQTEQYMLMKFEGRDK >NZ_LT571449|774400:782870|776701_776962_+|WP_001831728.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYEQVNDIRVGKVLYMTVNEPTDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVIDEKEKA >NZ_LT571449|774400:782870|777627_779817_+|WP_001831715.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSNEEIKLEKLYQDIGLSDKEYDKVVEILGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELTVKQNQRLLKGVVSGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGIIDHDMVQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFNKHELDSAVIGEVTDTDRFVLTYDDEVYADIPVQPLADEAPVYILEGEEKEYNTSKNDYSNIDVHDTFIKLLQHPTIASKHHLYEQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTQKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACKVLQTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIEDVSYLKEFKPKAGDKIYLVGETRDDFGGSQLEKLLYGSVNHEFESIDLSDEVSKGKLIKQAIRNGIASHVQTVGKGGLLVTLAKISAHYDLGMQAQLDVTNAQLFSETQGRYIVVVKEGQTLDIDQAQEIGHLTHQQLFDISNSDVKIKENVSDIKQKWEGAIVQCLTTQD >NZ_LT571449|774400:782870|782303_782870_+|WP_001831672.1|DBSCAN-SWA MTNIAIFASGSGSNFENIVKHIQTGQLSGINVTALYTDNEGVPCIDRAKNLNIPIHINKPKDFSSKSLYEQHLLKLLSSEEVQWIVLAGYMRLVGQDLLQAYEGRILNIHPSLLPKFKGLDAIGQALESGDTVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQQQCDIKPDDTKEQLEDRVKHLEYELYPRVIAKIIK >NZ_LT571449|774400:782870|775997_776702_+|WP_001831723.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRVFTTNIDGQLRVEYKDEVTAGNGAKKDTMIGKGKLNNQITSIIFDYLTHNHIDNHFIKQLSQTEQLVQQVDIIPLEVVVRNIATGSITKRLGFKKGHTFEEPLVEFFYKKDELNDPLITDDHVKLLGIANDEEIKQLKQMAKDINQVLIQLMNEMSLRLVDFKVEFGKTNGGKILLADEISPDTCRIWDKNTDTNFDKDVYRNNTGSLIETYQTFLNKLEDLK >NZ_LT571449|774400:782870|781272_782304_+|WP_002504799.1|DBSCAN-SWA MSKAYEESGVNIQAGYEAVERITSHVERTLRKEVLGGLGGFGATFDLSQLKMKAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPSIIEQIVKGISDGCEQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDIAGFAVGAVEKEDYIDGSNVEEGQAIIGLASSGIHSNGYSLVRKMIKESGVQLHDQFNGQTFLETFLAPTKLYVKPILELKKHIDIKAMSHITGGGFYENIPRALPKGLSAKIDTQSFPTLEVFNWLQKQGNISTNEMYNIFNMGIGYTIIVDKKDVQTTLTTLRAMDTTAYEIGEIIKDDDTPIHLLEVE >NZ_LT571449|774400:782870|779795_781280_+|WP_001831721.1|DBSCAN-SWA MSNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNHETLKGERGLGLLTEAIKDEHMSNIKGYPHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEEQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRLIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMENGAYILASETCAIDVLGAEFIQDIHAGEYVVITDEGIEVKTYTRQTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKRLAQENPAKADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKDIVLVDDSIVRGTTIKRIVKMLKDSGANRIHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKNHIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYHGLCVESFTGDYPAGLYDYEKNYKKHLSERQKSYIANNKHYFDSEGNLHV >NZ_LT571449|774400:782870|776963_777635_+|WP_001831727.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKSGVDAAYVDYRETTLDGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIIKEVKRFAKEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNETLKITNNQTPFTHLYVKNENVVYPVAHGEGHYYCTDEIYRELNDNNQIILKYTNNPNGSYEDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETLLGTNSGVKLFESMVKSWREQNV >NZ_LT571449|774400:782870|774400_774883_+|WP_001831735.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMKESCSMLEEFEIPYEKKVVSAHRTPQMMFNFASQARQNGFDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKSGAKNAGILAARMLGITNESVQNNLENYEKSLVAKVEEMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1001904 : 1058028
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LT571449|1001904:1058028|DBSCAN-SWA 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63 | Staphylococcus_phage(44.12%) | tail,terminase,tRNA,portal,head,protease,capsid,plate,integrase,holin,transposase | attL 1022163:1022222|attR 1056669:1056791 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1529991 : 1649546
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LT571449|1529991:1649546|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LT571449|1529991:1649546|1611228_1612077_-|WP_001829860.1|protease|DBSCAN-SWA MKKRFLSICTMTIAALATTTMVNTSYAKTDTESHNHSSLGTENKNVLDINSSSHNIKPSQNKSYPSVILPNNNRHQIFNTTQGHYDAVSFIYIPIDGGYMSGSGVVVGENEILTNKHVVNGAKGNPRNISVHPSAKNENDYPNGKFVGQEIIPYPGNSDLAILRVSPNEHNQHIGQVVKPATISSNTDTRINENITVTGYPGDKPLATMWESVGKVVYIGGEELRYDLSTVGGNSGSPVFNGKNQVIGIHYGGVDNKYNSSVYINDFVQQFLRNNIPDINIQ >NZ_LT571449|1529991:1649546|1571918_1573343_-|WP_002456429.1|DBSCAN-SWA MNFWLQEQAQSNGNRLAIVTNQLSLTYEELYHRAKTIAEYLTSLNQKRIGLYISNDIDSVVLIHACWLAHIEIAMINTRLTRHEMINQMNSVDIATIVHTLPLELEGFNLYHFNDLTQLDKHDVSGYKFNLESIASIMFTSGTTGPQKAVPQTFNNHLASAKGCKQSLGFEQNTVWLSVLPIYHISGLSVILRAVIEGFTVRLVKKFQTDDMLTQIKTYPITHMSLVPQTLKWLMDAGLTQPFSLEKILLGGAKLSPQLIEQALTYRLPVYNSFGMTETCSQFLTASPQMLKERFDTVGKPSENVEVKIKNPNAYGHGELLIKGENVMNGYLYPKYLKDTFDNDGYFQTGDIAEIDDEGYVIIYDRRKDLIISGGENIYPYQIETIAKDFEGIEDAVCVGISDDTWGQVPILYYVTNQDINQTELIEHFENHLARYKIPKKYYQVKSLPYTSTGKLQRKKVKSEDLNEGKNNES 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118 | Staphylococcus_phage(53.03%) | tail,terminase,tRNA,portal,head,protease,capsid,integrase,holin,transposase | attL 1578830:1578889|attR 1650249:1650324 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1719354 : 1762000
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LT571449|1719354:1762000|DBSCAN-SWA 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49 | uncultured_Caudovirales_phage(44.0%) | integrase,transposase,terminase | attL 1742515:1742533|attR 1760040:1760058 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1772845 : 1906238
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LT571449|1772845:1906238|DBSCAN-SWA 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148 | Staphylococcus_phage(96.53%) | tail,terminase,integrase,holin,transposase | attL 1794235:1794256|attR 1908019:1908037 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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