Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT594096 | Acinetobacter baumannii strain BAL062 plasmid 2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_LT594095 | Acinetobacter baumannii strain BAL062 chromosome 1 | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LT594095_1 | 2377544-2377629 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT594095_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LT594095_1
>1.1|2377567|40|NZ_LT594095|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT594095_1
The CRISPR arrays of NZ_LT594095_1 >merge|NZ_LT594095|1|2377544-2377629|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_LT594095|1|1|2377544-2377629|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_LT594095.1|WP_000795915.1|2376306_2376543_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_LT594095.1|WP_001124846.1|2375412_2376024_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_LT594095.1|WP_000885229.1|2374730_2375342_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_LT594095.1|WP_000376215.1|2374118_2374574_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_LT594095.1|WP_001990047.1|2372413_2374060_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_LT594095.1|WP_000115408.1|2368783_2372248_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_LT594095.1|WP_000107128.1|2367827_2368787_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_LT594095.1|WP_001025680.1|2367399_2367684_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_LT594095.1|WP_002017921.1|2367176_2367290_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_LT594095.1|WP_000937460.1|2366452_2367088_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_LT594095.1|WP_000983628.1|2378260_2378674_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_LT594095.1|WP_000432330.1|2378815_2379694_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_LT594095.1|WP_001990041.1|2379750_2381895_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_LT594095.1|WP_001145693.1|2381949_2383359_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_LT594095.1|WP_000482091.1|2383674_2384154_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_LT594095.1|WP_000108365.1|2384438_2384660_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_LT594095.1|WP_000132044.1|2384765_2385083_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_LT594095.1|WP_000498477.1|2385167_2385389_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_LT594095.1|WP_001136759.1|2385476_2385905_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_LT594095.1|WP_000251637.1|2386174_2386318_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
531601 : 598627
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT594095|531601:598627|DBSCAN-SWA ACTATTGAGATTTAAAATAAGGTTTCTTAGGTTTAACTTTCTTTTGAAAACGTTGGGCATCTAATTTCTGTAATAGGCTTTTGGGAACAGGACAAGCTTCACCTAAAATTTGGGCCACTAAAACTTCACTACAAAGCGGCGCAAATAAAAAGCCCTTTGAGCCTAAACCTGCAAAAGTAGAAATACGGCTTTCATTCTGCATTTTTCCCACAAGTGGAAAATAATCTGGACTTTGAGCGCGAACTGATGCTCGTCCTTGCCATTGTTCGACTGGTGGTAATTGTTTTGCATAATGAGGGAAAACGCTGTGGATTAATTCAAAGTTATGCACATGGTCATCAAGCAGTACTTCTTGATCGTCTCGGTTTGGGTAGAAAGAAGCCCCTAGAATAAGTTCAGACGTATTCAGTTGCATACAATAACCGCCATAGCTATAGGCTTCGTTTAAAGGTAAGGTTGCAAAAGAATTATCAACCCAGCTCACCTGTCCACGTATAGGTTTTAATAGCGGATAATTTTCAAATAAAGCAGCACTTTCTCTGGCGCAGCACACCACGACATGATCAGCCTCTAAAGTAGTTTCATTACCACTTTTTAATTGAACTTTATTTTCAAAAGAAATAAGTGTCGTGATATTGGCAATTTTCAGTTCAATACCTGGATGTTGCAAAATCTCATCGCGTAATTGGTGCGGAGAAACTGCTCCAGCTTCGGTCAACAAAATATGTGGATAGTCTGATTCAAGTGAGCTTGTTTGCTGCGTGACAATATCAGCAGGATATTGATCAGCAAGATCGAGAAGATCTTGTGCATTTTTTAAAGCCATTTGCTGTATTTGAATGGGACGAAAGGCTTGAAAATTTTTATAGAAATTTAATGCATGTTGCCAGCTTAAAGTCATGAGATGCTCATGGCTTTGTTCAATTGGGCATAGTTTCGGATTAAGCAATGCCAACGGATTGCCAGAAGCACCTGATAACGGCACTGTACGCTCAAATAGAGTGACCTGATGCCCACGTTGAGCAAATGCCCAAGCTGTGCTTAAACCTGCAATCCCAGCGCCAATTACGGCGATACGCTGCTGAGTAAATTGGAAAGTATCTCTAACTGGTTCTAATAAAATTTCTTCACTTACAGGTGCTTTCCAAACGGCTTTAAGCATTTCCCGTTTATGCCCAAAACCGCGAGGACGAGTAATATCGACTCCGTGAGCCTTTAGCCCACGTTTGAGAATACCAGCTACACTAAATGAGGCAAAGGTAGTGCCATAGTCGGAAAGCCGAACAATATTATTTAAAACATTTTGTTCCCACATGTCCGGATTACAAGAAGGCGCAAAACCATCTAGAAACCAAGCATTCACTGCCTTCGTTTTTACCATACTTGGAAAAATATCTTGTGCATCTCCTAACCATAGGTCGATGCTGAAGCGCTCTTCTGGAAAACTTAAACGATGGCAGCCTGCAAGAGGGAAGGGATATTGCTCAATAAGTTGTTTGGAAAGCGGTCTAAGTTCATCCCATACATTTAAAGCACGAATGAGATCAGCTTTGCTTAAAGGAAACTTTTCGACGCTAATTGCATGTAAATGACTGTGGTTATTTGGACGTACTTGTTGCCATAGTTGCCAGAGCGCAAGAATATTTAAACCAGTGCCGAACCCGGTTTCTCCTACACTGAAATATTCAAAATCTTGTAAATTGGCTAATCGTTCTGATAGGTCATTGCCATTTAAAAATACATGCCGTGTTTCAAGCAGACCATTATCTTTAGAAAAATAGACATCACCAAATTGTTTGGAAATGGGAACTTCAATACCATCAATAGATTCCCAATCCAGCTCAGCAGTTTGTATACGGTTTGATTTGTTCATTCGGTTTAATAAGTCGCTCAGGATTACCACTGACGTCGACGTTTGGTGTAAACATAACTCGCAATAAAGAAGCCAAGCAGTACGCCACCTGCAAGAGTTACTGCGCCATATAAGAACATTTGAGCACTACGTTCACTTTGTAAAACTTGTACCTGAACAGACAAGTTATCGTTCTTTAGCTGCAATTCTTGGTTTTGTGCTAGCGCTTCAAGGTTTGCATGTTCTAGCTGTTTTAGACGAGATGCTTGATCTTGAACTAAAGCCTTAATTTTTGCATCTTGCTGTTGCTTGTTCTTTGCGATTTGTTCTGCTGTAAGCGGTTGTGTTGAGGTTGGTGCTGTTGTAGTCGCGGGTTTAGCTACAGTTGCAGAAGTAGGTGCTGGTTTAGCATTCTGTGTTGACGCTGCAGTTGGAGGCGTTGCTGGTGTCGCAGCAGGTTCAACTGCTCCGGCAGTTGAACATATCAAACACAAGCCAAGAAAGCTTTTGGTTGCAAGCTGCATGCGTTTACCCTTTTGGAAATGCTTTATTAAATGGTTTGACATCAACATGACTATAGATGCCTTCTTTCAAAAATGGTTCTTCTTTTAACCATTCATCTAAGGCTTCACGTGTATCAAACTCTACAATCATGGTGCTGCCATAGAAACCAGCTTGCGGGTCATTAGGGTCTTTTGGCATCGCTCCAGCAGCAACTAGACGACCTTCATCATCAAGTTTTTGCAAACGTTCGATATGTTGAGGACGTACTGCTAAACGTTTCTCTAGAGTTCCTTCGTTATCGGTACAGCTTAGAACAAAAAAAGGCATGTCATCGTATCTCTATAATCAATCCGAAACCACATTAAGCATCTGGTGACTTAAAATGTTTACGTAAAATAATGAACTGAATAATGATAAATGAAAACATGACAATCATGTCACCAAATGCAGTAAATTCACCCCAATATTTTCCGCCGTGGAATAAAAACGCAAAGAAAACATGTAAACCAGACATCACGACAAACATAGCTGCCCAAGCAAAGTTTAAATTTTTCCAACCTTTTTCGCTTAAGGCTAAAATCGGATCAAATAAACGTTGAATAAGAGGCTTACGGTCTTTACCAAACCAAGGTGAAACTAAGAAAGCACCTGCAAAAACTAGATTCAAAATAGCGGCTTTTAAGCGGATGTAAAAATCATCGCTCAACATAAGGGTAATACCACCAAAAATGACTGTCATGAACAGCACAATCCATTGCTGTTTATCCAGACGGAACTTTTGCATGATGAACAACGCACCATACACTACCAGCATTGAAATAATTAAACCGGTAGTAGCGACAAGAATATTATTATTATCAACACCGCCAGCAGACCCGATCAGTTTGAGTAAAGGATGCTGTGTATCGGCTGGATCAACTGTCTTATATAAATAAAAGAAAATAATTAATGGAACAAAGTCCAGTAGTGCTTTCATGTTAGAGTATCTGATCAGGTTTGGTGAATGGCATAGTATAAAAGATGCAAGGCATAGATTTACATACACATAGCAATATTTCTGATGGAACTTTGTCTCCGGAATTGCTAGTGCAAGCTGCTGTCGATGTGAAGTTGCATACTTTAGCGCTAACCGATCACGATACGATGGATGGATTGCAGCGTGCAAAAAATGCTGCACAACCCCATGATTTGCAAATTATTTCTGGTGTAGAGATTTCAAGCCAGTGGTCACGACCAAGCACGAAAAAAAGCTATGGCGTACATATTGTGGCTTTAAATATGCAAGATGAAGCTCCAATTTTAGAAGCATTAGAACAACAAAAAAGAATTAGAGCACAAAGGGCTGAAGTTATTTGTGAACTATTAAAAAAATGTATTGGCTTTGATATTTATCAAGATGTGCTCGATAAAGTTGAAAATCAACCAGACCGGATTACCAGAACCCATATTGCTAAAGCCTTAGTTGAAAAGAATGTAGTGAGCCGTCCTCAACAAGCTTTCGATCGTTTTTTAAAAGAAGGGAAGCGTGCTTTTGTAAAGTTTGAAGGATTGGGTTTAAAAGAAACCATTGAGGTTATTCATAACAGTAAAGGATTTGCAGTTTTAGCTCATCCAACCCGTTATGATTTATCGGCTACAAATACCCGGTATTTGATTGAGATATTTGCAAGTTATGGTGGAGATGCGGTGGAGCTGCCGCCTCCTGTAGATCCTTTATCTACTCGCCAAATGATTGATCGTATGATTGAACAGCATCATTTGGCTATTTCAATTGGTAGCGATTTTCATGGTGAAAATATGCCGTGGATTAAATTAGGAAACACCCCTAAACCAGCGAGTAACCAGCAAGGCATTTGGGAACGTTTTATCTAATCGCATTTTAGAGCAAGTTGTTATCTTGAGCTTGAATTGGAGGAGGTGTGGGCTTACCAAGTGTCCCCAAAAGCTCAATTTCGATACTACGTACCATTGCATCTAAAGGTAAATCATTACTTTGCGTGCCAAATGGTTCTTCAATTTCGGTACTTAAAGCATCAAGTCCTAAAAATGTATAAGCCAGAATTCCAACCAGTAAAGGCGTTGCTAAACCAAGCAAAGATCCTAAGCTAAACGGCAACATAAAACAGAAAAAATAAACAGTACGGTTAAGCAAAACTGAATAAGCAAACGGAATAGGAGTATTTGCAATACGGTCACAGCCAGTTTGTACGACACTTAGATCTGCAACATTCTTATTCATTTGAGCATAAATAATATCTGAAATTTCCCCTTCTTTAAGCGCTTGTAATAATTCCCATTGAATAAGGCTAAGCGTATATTGAGGTGCGTTATTTTGTTGGTAAAGTTGGGTAAGTGCTTGTTGGCTCATGCCACTGGTTTGTATTAGCTCGGTGGGGTTGGCTGTTTGACGGCGTAAACGGTCACGTAATACATTGGCAAATACAATAACGTGCTGAATGACACGTTCACGGCGGGCTTGAGTTAAAATTCGGCAGTCACGGTCGAAATGACGCGAAGTTGCAATCAGGACCCCCCATAATTTTCGGGCTTCCCACCAGCGGTCATAACATGCAGTATTCTTAAAACCTAAAAAAATAGAAAGTACGACACCAATTAAAGTAAAGCCAACTAAAGGAATTTCTGG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76 | uncultured_Caudovirales_phage(32.35%) | portal,transposase,capsid,integrase,terminase,plate,tRNA,tail,head,holin | attL 535810:535825|attR 553631:553646 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1185756 : 1245226
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT594095|1185756:1245226|DBSCAN-SWA 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74 | Acinetobacter_phage(78.69%) | capsid,integrase,plate | attL 1200546:1200562|attR 1243111:1243127 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1585429 : 1635750
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT594095|1585429:1635750|DBSCAN-SWA 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69 | Acinetobacter_phage(95.38%) | capsid,transposase,integrase,terminase | attL 1574636:1574650|attR 1598779:1598793 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2566528 : 2587309
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LT594095|2566528:2587309|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LT594095|2566528:2587309|2583847_2584288_+|WP_064792734.1|DBSCAN-SWA MNVKAPPFNSFAFVSMAALAISGGSLVACQLQPAFQTKEAPTLFTPKTQPSTYGVLTAKITGKHTGVAVIKLDSFRLNVSFDFEAHLDSYGVPGSEFTAVDITQLTVNEITDINGKSYNDFTEFEDIRNINDLLKGFIERNKLVEA >NZ_LT594095|2566528:2587309|2570916_2572251_-|WP_064792722.1|DBSCAN-SWA MAETKKPDAIGDAGAYTNFVSNIGTERDKASHGSFVKKVIPDEQLEAVYQHWLAKRIVNRPASDMLRAGWFFEGIQDNDLLKLKEACKAFNLDGVLLSSLVLSRLYGVCYVLLGTVDGGNLDQPFDLNKLGIGRLEFFTVLKKKHIEADTSKYLSPKEAGGVLKQPEFYKLKLDGKSNQRIHHTRLIKFGHADVVNEEPVSVLQEVYEDLLDHAAVKKATASLVHESKIDVIRTPNLVDKIKEDMKSVAERFLSVGLLKGLNGMIVLDKEEEYDSKSYSFGGLPDLMREYSIQTAGAADMPYTILFGQSPAGMNATGEHDTRNYYDSIATKQIWSLKPFMMKLLRVIVQATFGRQIPSLDVVFNPLWQLDAKVRSEVEKANAERDSKYLEMGIITEPQIAKQLVIDGVYSVIDEAHIKELETMVKLNDNDNSDPETPPPAGEET >NZ_LT594095|2566528:2587309|2576678_2577179_-|WP_064792728.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_LT594095|2566528:2587309|2573763_2574246_-|WP_064792724.1|DBSCAN-SWA MARLNKRVKLYIVRSLATYETPSETARGVQEEFGITVTKQQCEAYDPTKKTGQDLSEEFKTEFYRVRKEMNDNLSAIPIANIAYRLKRLQRFIDHEQFKENPVIVPSLLEQAAKEVGGLYTNRKEITGAGGGPLQSEHVTQVVATPEQIRQVLDELKGKY >NZ_LT594095|2566528:2587309|2579360_2580290_-|WP_064792731.1|DBSCAN-SWA MYKYLHHISDFMVATAHLSPVEECFYRRALDFYYLNEKPLPKETQSVFRRLRANTQEERDAVLIVLQEFFVEEEDGFHNKRCDSEIAAYQKVGDKNRENGKKGGRPRKEKPKENQSEGDSVNSENPQKPSGLILGSESESQKNLNHKPLTDNQYIDSSSNAREENSQLTPIQFAQYQIDDHKRYSMREFISEYSEFQYDFISLAQQRFVSVPEIDLRTMIQNFGDWYFANESSSLNTPSIWLVKWFSWVQNNEKQVAANRKKQEQINSAGQKPQESGYFANLFEEQSESQIVDVTPAKKFLVSEEVGHA >NZ_LT594095|2566528:2587309|2580289_2580643_-|WP_064792732.1|DBSCAN-SWA MRYAERRKQDISVSTTPLEVVIPLEQPVKIYSAKELAAMPLSVMNAAIEAQERFYQLEELTHMGAGYSSSPSDGGWAQANSGERKVAHSLQNQQRIYSSKNYSSVGNARSCKIRSSH >NZ_LT594095|2566528:2587309|2584625_2585696_+|WP_064792735.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_LT594095|2566528:2587309|2578199_2578622_-|WP_000647820.1|DBSCAN-SWA MKASKLIRDKGLQYAKEIVDSAPDNATEWNEGYEFQCGQSVEISPADREKYFVDLVELKRLVESLKIISDLGGVEKLTPAFITTDKHVGYTHVRMVGNGRLSFLDDFCDFIPDGSISIKRVMTAIRDHESIYGGGESHAN >NZ_LT594095|2566528:2587309|2582674_2582890_+|WP_000370485.1|DBSCAN-SWA MDNSKRPINQIIARINDAAKHGEALVLTAEEVKILSKDIGDKVFIPVLTNEQVVQLVKEGKLGQKINNTKD >NZ_LT594095|2566528:2587309|2567992_2569192_-|WP_064792720.1|DBSCAN-SWA MKTIYQLKIGDFAPSESTRSFTKEGYLKCVNVRLAKAPQVRQYYAYEFPSLEGYTADQVINVYTPPEELFKPEAIQSFDGVDATDYHPPKNEINASNWKDYHIGYCENVRQEGDYLVGDLLIKDKISIDLIQSNERLEMSLGYGALLIVEQGTAPDGTPYQAKFINFIGNHVALVKYGRCGGDCRIGDKQQTPHKGNISMEVIVNGVRYNIGDNTPLADALKIQQEQLENLKAAKLKVGDKQFSIGDELGAIQAVVDQLYAEKTGLEQKVGDLEKNQMTPEKLEQAAAERAAVIADAKALVPTVKTEGCTCEQIKRDVIAAKAGDALVTALMGSVSVGDAKPEQIDTTFRALCAVKGAQPSNPVGDALHQQQSVKAGDGNPAGGGDEKTYSKENAYKTI >NZ_LT594095|2566528:2587309|2584290_2584614_+|WP_000148663.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_LT594095|2566528:2587309|2577175_2577571_-|WP_064792729.1|DBSCAN-SWA MSSVSIAEYRKLFPIKKNKKRRSAKQVARQPSVGEMVLATHLRACKIGFEQEYKFHPGRKWRADFLITGTKILIEVEGGIWGGGRHTRGKGYLGDMEKYNSAAMMGFTVLRFSTEQVKAGVAIKQIEQLVG >NZ_LT594095|2566528:2587309|2580639_2580936_-|WP_064792733.1|DBSCAN-SWA MNSFTQQIKVSRQQSEIQSFYEPALRVLGHLFEVKKQNLRNKGYDENNAAVTKVEFSEAMARQFRITQWLAQQIVTSFTKACLVDSFGGYVKPKDGEK >NZ_LT594095|2566528:2587309|2572259_2573786_-|WP_064792723.1|terminase|DBSCAN-SWA MNSKVNTKLLEMQLERELCEKEHLFFTRRFFLPRMGFKFSVNWHHEYIADKIDEVIAGKVKNLVINVPPGSGKTELLTNLIARGIARNPRSRFLYLSFSQSLVEDVSATARNIVKSEDFQNLWPVKISTSTDAKSSWKTTVDGYDAGHVYSASMGGQVTGRRAGTLANEGFTGAIILDDPLKPEDAFSQTARRKANRKILNTVNSRKAKSDTPIILIMQRLHVEDPTNFVLTGNVPGEWEQISIPALIDDEYISKLPEHIQRKIPRDVERDEKGRQSYWPLKESLLSLLQLEKGGEDKDGATVSRYTFASQYMQNPKKLGGDLVKAEWFGRYVELPVLKWRAIWADTAQKTKEHNDFSVFLCAGLGYDNNLYIIDVKRGKWEAPELLKEAKAFINKHKDSNTKIGKLRYMAVEDKASGTGLIQSISKQTTLPIRAIQRSTDKLSRTMDVILYVEERRVWLPANAPWLLNYIEEIEGLTADWSHDHDDQWDPTIDAINDSLAKKPTVFD >NZ_LT594095|2566528:2587309|2575660_2575879_-|WP_064792727.1|DBSCAN-SWA MNICVGGELDGQKLEKEGRLLKASDIDPTFKTEYYKQVFNRDNINYHFWLPIGSDLHDMSEKVLNILRAPKS >NZ_LT594095|2566528:2587309|2585692_2586652_+|WP_064792736.1|DBSCAN-SWA MNNLITAAEAFAALQKGKTVLCRPIGDMLDFSDLDQFPASVFGKPGFEFCIKIETIELAGITFTKPLTIDEYEDGQEVYVISTYSPTVYVLDFKTNALIDSINSGFVQRDAENAKLQLKAFSKALGIEINNDLSVIRLGEEPKKQRGKKSKVEKPSDVISAETQPTIVITEQTNVTTSEDLLVPETNEPKVDPEYLKALDALLQRVKESKTPEEVNAVYRYTRTWNDKQMEPLLLATHKRLEELEKEKASANEPPSLMVQIQNAPDLTTLDALEIDVAARDPQIQPKLMGYVRKRRYELENPAVSQPEVEPDYLLVDGF >NZ_LT594095|2566528:2587309|2581895_2582660_+|WP_000792745.1|DBSCAN-SWA MKNLETMGQRIRALRREKKLTQGELAKIAGVSAPNVTGWEKDAYAPKADPLSKMAAYFGVSTSYITNGDESGPKLDSTVTQLKVLDIEAFKKKYNIPDSEDAVKFLETPVKSFPTQKRYVPVKAYSKMGMDGYFTDMGYEGNAGDGYVPTHSAGPRAYGIKGTGDSMFPAIRNGWYVVCDPDADLVPNEFVQVCLKDGRCTIKEFVGINGGVLSLLSVNGGERFFFEMDEVESITAITDIVPPSQHRQEHPYSH >NZ_LT594095|2566528:2587309|2580932_2581217_-|WP_064792761.1|DBSCAN-SWA 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35 | Acinetobacter_phage(81.48%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2743757 : 2775793
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LT594095|2743757:2775793|DBSCAN-SWA 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46 | Acinetobacter_phage(43.33%) | portal,capsid,integrase,terminase,tail,head,protease | attL 2743544:2743597|attR 2779630:2779683 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2786824 : 2815498
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LT594095|2786824:2815498|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2819456 : 2831804
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LT594095|2819456:2831804|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3076569 : 3084666
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LT594095|3076569:3084666|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LT594095|3076569:3084666|3078973_3079264_+|WP_000986115.1|DBSCAN-SWA MMRNIPDSMSFPFTVWMCENGYYPSHKNGFIILKRGKEVAKISMNETKDGYPMNDICQKKFASFCRAWMNRDKHFIEQLRLRGLARLNQKSYQMVA >NZ_LT594095|3076569:3084666|3077111_3077792_+|WP_000643997.1|DBSCAN-SWA MKAIILDTETNKLNGYPIEIAYAPFSLENGQLLVHKDEVFNRFYSCPEPIDLEAMAVHNIIEADIEGQPSCESFRLPEGVEFIVGHNIDYDIKALNKCGPAIKAKAICTLALARDVWPDLTSHKLAVLYYFVMSNREEARKHLRHAHSARADVYFTGIILIALIERLGIKDLNSLFLMSEAVRLPKIMTWGKHKGTPLKELPRPYISWLLNKEDLDPHLRKALQNI >NZ_LT594095|3076569:3084666|3081074_3082067_-|WP_000527288.1|DBSCAN-SWA MGNKYYDQLVNNDSHFEITFNDFEEFITFIRPDKLHVKDLMTQLRLEFNPSAVNFPFFKIKDFKGYSTLDKSIIYRGHGESDWDLKPTFYRNKKNIGWVKTNWSVDQNYESEILLKFQDSCDLAGVQLPSDNDQLRRRQKNKLSKYRKSFGRDQLDWFDDDFFELAVYAQHYGVETRLLDWTKNPFVASYFACSHALKMNYDPNSKFCIWVLNSESITNELNQVLEVLDPPKGLNQHISHQQGVLTYTKNHIKIFNKFGTRPCLKDILKYYESGYRLLKITLGYELIVELFNYCNIHNFNACHLFRGANGAAMHTTDLLNFDDYKYPIED >NZ_LT594095|3076569:3084666|3082627_3083512_-|WP_001076477.1|DBSCAN-SWA MNQSLFVGFWNINLSPPIGNRWNKSKVDKKIKVSRVIQGLLKLDFDFLCLCEVSPEDMEFIDNSIQLIGMGYDYNIYRKNYGGLYFDTCVIFKNTFDFVQSKVEVDGEEKNKLKVFQKYEFLSGHLEERIIFYVTHWLSQLNDNKEKRRTVASFIKKDTNDEKKFFNKTKFVVLGDFNVEPYDSAILEGLRSTRDQKVISNNSSLFYNPFWKFLQIKEDQPSGTHHCTKNEFHHWHIYDQILVSGNFFRDGWNLDDNLVLVFDDKMISSLHNDSFSNPSDHLPICLKLEKTKCI >NZ_LT594095|3076569:3084666|3080681_3080897_+|WP_001292077.1|DBSCAN-SWA MSELEILESAPKDATHYFLVPNGSGEPYYVLEKEKKFYWFHGQDEITKPHILSWIKSIESLKEVKAESQEI >NZ_LT594095|3076569:3084666|3080475_3080685_+|WP_000028957.1|DBSCAN-SWA MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG >NZ_LT594095|3076569:3084666|3083508_3084666_-|WP_000947475.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDAQVKSLKPKESRYSVADGEGLNISVFPNGKKKWVLSYRQNGKQNQKMLGEYPIMGCKEARQLARQLKLEYQGKVANSPPVHKVVEEWLSIMKSQWTSKKYYDTVEYRLAYLTEDFKNLPINEVERKHISKKIKEIVAKGTLETASRALRLGKQVFDFAIASDYTDRNPCTLVEDVIPEYESDSHPCLPVSEMPEFFKRMKASHSSSIVKMAMLLVCYTGTRITELLKARWDTGEIDFENKVWIIPAERMKKRKELMVPLVPQIYALFKELESVKTDDGYIFKKRGKPYEHMTSESVLTMIKRMGYTDKMVTHGFRSLFSTHANESKLFRGEVIDYQIAHVNKTTKADKTSKIYNRAEYWDERVELMTWYANEVENWIGTNS >NZ_LT594095|3076569:3084666|3079436_3079973_+|WP_000609004.1|DBSCAN-SWA MINLANQREALIAEVEVFKKDSMELWFVPDLAASYTNRDFFSYSIIEDNQVFFMIEQTRQLWEFWNKAKDHNLPKGSVLIVEDQIKTMWQDNEEPENCVNKEKDFNCLGDCLDIEDIISITKQRYAYISAEKVYGTWVAKFEAGELKKDYFFVGSQKECEEIVESNKALYSSRMGANS >NZ_LT594095|3076569:3084666|3080897_3081068_+|WP_000119264.1|DBSCAN-SWA MSWYSLRQLAKELGMAPNTFKKYYLEKFPPDRESKTYKGWTSQSVAKIKVEIQGAK >NZ_LT594095|3076569:3084666|3076569_3076941_+|WP_001260065.1|DBSCAN-SWA MRTNYLRGSKRYENNLNGQVNQKSTFREFVGKDEEHGLYKVRLGYTVYAANHTLTRVYTVNENNELTPVSQYTLNTKEWILRNLETEIKYRRGRELGQILQKTHIPSPDRKAYKIRRGFLGTR >NZ_LT594095|3076569:3084666|3082181_3082637_-|WP_000549863.1|DBSCAN-SWA MHLDLSLAVEEGMQSSVTRDKSIEEIDNVLFEVDQAVKKATNNKVEFGWRKKGFNTLGLLTGLTSLPITDVKIESQEPESRVLYVSATDDKTQRFDITILVISPDGFPCEMNVNGNKLISHDAESLLEQFKPLLSSAFVGDKIRKLMKKGA >NZ_LT594095|3076569:3084666|3079264_3079444_+|WP_000464381.1|DBSCAN-SWA MFEVKTAVQFDDDDVWIGSVLISKCGGNDEWTAYLDNDVEKEFETLEQAVTYCLEQAND >NZ_LT594095|3076569:3084666|3077804_3078833_+|WP_000805204.1|DBSCAN-SWA MKPTLFTPETWAEFTQQLKNSWEKDNAGTDSPIFVVQEKKIVWGLDPASDSVEITNIVDADDESTYKSIDDFFESLKATDKHALNGLAIEEEDELFLDVKASTQINILSDWNERNIHICHGKYFWEDVNCHLTRSAADAFIKRKSHDFGELRVFVKSLYWCEEFKNLLNAIISGEVGLTSIDDDNILNVLGPIEPKADKEINSTQAKKSAKKANNKEENWTRYHNDKPVESPLAGLIEKLKKTKTADAANSLIEETKDWASEDQKSFLTELNKHLVIIAGQSKENISISERVKRATDLTTLDAIEIDISEADERIQEPLMELVIKRRKELEVENNFLLESPQ >NZ_LT594095|3076569:3084666|3079969_3080479_+|WP_000578497.1|DBSCAN-SWA MIFYDRAFFEENFKKTETFKQESNIRKNDILVFSETMNGYFNIVTNKAWLLWKKEMQAHADWYKNDDPIAYKWAKDGSPEYEADFYTSAKAWAAAKAQAGPTWISVKDEEPPTDIMVLICWDDAPDVTPEQDYITIDEDLNSVWANYYNDPPSHWMHFHSVPNVSGAEQ |
14 | Acinetobacter_phage(57.14%) | integrase | attL 3077414:3077428|attR 3089326:3089340 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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