Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT622246 | Bacteroides ovatus V975 chromosome I | 1 crisprs | RT,PD-DExK,PrimPol,cas3,DEDDh,WYL | 0 | 1 | 2 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT622246_1 | 3347746-3347822 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT622246_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LT622246_1
>1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder ATTCTTTTGATTGAAATATATTTGTCTGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT622246_1
The CRISPR arrays of NZ_LT622246_1 >merge|NZ_LT622246|1|3347746-3347822|CRISPRCasFinder TTGCGCAAGAGGCTCTTGCGTAAATTCTTTTGATTGAAATATATTTGTCTGAAATTGCGCAAGAGGTTCTTGCGTAA >NZ_LT622246|1|1|3347746-3347822|CRISPRCasFinder TTGCGCAAGAGGCTCTTGCGTAA ATTCTTTTGATTGAAATATATTTGTCTGAAA TTGCGCAAGAGGTTCTTGCGTAA
>NZ_LT622246.1|WP_052588018.1|3344960_3346142_-|lactonase-family-protein MIKTYLSKTYIFKAFAAVCIFGISISGCTSKKKTPMETTDTTENELTMLVGTYTSGTSKGIYSYRFNEENGTATPLSETEIENPSYLVPSADGKFVYAVSEFNSTQAAANAFAFNKEKGTLQLLNSQQTGGEDPCYIIASGNNVITANYSGGSISVFPIAKDGSLLPASDIIQFKGTGVDKERQEKPHLHCVRITPDGKYLFADDLGTDQIHKFIINPAANAENKEAFLKEGSPAASKVKAGSGPRHLTFSPNGHYAYLINELSGTVIAFEYKDGDLKEIQTIAADTVNAQGSADIHISPDGKFLYASNRLKADGIAIFSIHPDNGMLAKAGYQLTGIHPRNFIITPNGKYLLVACRDSNVIQVYERDADTGLLTDVQQDIKVDKPVCIKFVP >NZ_LT622246.1|WP_004301906.1|3344278_3344917_+|M23-family-metallopeptidase MKNILILLTVLLLPLTAAGQDKSSFSAREMADVRVATPGLFAKSNHIYLHLDSLKDHEYAFPLPGGKVISAYGTRGGHSGTDIKTCAKDTIRAAFDGVVRMSKPYYAYGNIVVIRHANGLETLYSHNFKNLVKTGDVVKAGQPIGLTGRTGRATTEHVHFETRINGQHFNPNLIFDLKERTLRKECIKCTKNGSKIVVKTQIPDNRIAQNKK >NZ_LT622246.1|WP_004301905.1|3343584_3344250_+|hypothetical-protein MFEIKVSKEIKDACPVFAGAAVYAAVKNTAYSEGLWREINAFTEQLTSTTQMEDIKHQPVIFATREAYKRCGKDPGRYRPSAEALRRRLMRGIPLYQIDTLVDLINLVSLRTGHSIGGFDADKIQGTHLELGIGKAGEPFEGIGRGVLNIEGLPVYRDSFGGIGTPTSDHERTKMDLGTTHILAIVNGYNGKDGLQEAVEMIQTLLRNYTESDGGEIVFFE >NZ_LT622246.1|WP_004301904.1|3342721_3343534_+|peptidoglycan-editing-factor-PgeF MISLTKNNELKGYKSLDVYPEVAHFVTTRHEGISTGAYGSFNCSPYTNDSCMNVNRNQSWLFQCMNHQIKELFIPEQSHGCASLIINESFFKESLEMRRLLLRGMDALITNVPGYCVCVTTADCVPVLLYDKKQHVVAAVHAGWKGTVKHIVSHVMDHLNQKFGTQGEDVVACIGPSISLESFEVGDEVYDAFKESGFDMSLISMKKKETGKYHIDLWEANRIELLNAGVPAEQIEVAGICTYIHHDEFFSARRLGIDSGRILSGIMIRK >NZ_LT622246.1|WP_004301903.1|3341558_3342725_+|GTPase-ObgE MAESNFVDYVKIYCRSGKGGRGSTHMRREKYCPNGGPDGGDGGRGGHIILRGNRNYWTLLHLKYDRHAMAGHGESGSKGRSFGKDGADKIIEVPCGTVVYNAETGEYLCDVTEDGQEVILLKGGRGGQGNWHFKTATRQAPRFAQPGEPMQEMTVIMELKLLADVGLVGFPNAGKSTLLSSISAAKPKIADYPFTTLEPNLGIVSYHGGKSFVMADIPGIIEGASQGKGLGLRFLRHIERNSLLLFMVPADSDDIRKEYEVLLNELRTFNPEMLDKQRVLAVTKSDMLDQELMDEIEPTLPEGIPHVFISSVSGLGISVLKDILWEELNKESNKIEDIVHRPKDVTRLQQELKDMGEDEDIVYEYDDNVDDDDDDIDYEYEEEDWEEK >NZ_LT622246.1|WP_004301902.1|3340899_3341469_+|adenylate-kinase MLNIVIFGAPGSGKGTQSERIVEKYGINHISTGDVLRAEIKNGTELGKTAKGYIDQGQLIPDELMIDILASVFDSFKDSKGVIFDGFPRTIAQAEALKKMLAERGQDVSVMVDLDVPEEELMVRLIKRGKDSGRADDNEETIKKRLHVYHSQTAPLIDWYKNEKKYQHINGLGTMEGIFAEICEAVDKL >NZ_LT622246.1|WP_004301901.1|3340303_3340840_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase MDTIQIKDKLFTVSIKEQEIQKEVIRVANEINRDLAGKNPLFLSVLNGSFMFTADLLKHITIPCEISFVKLASYQGITSTGVIKEVIGLNEDIAGRTIVIVEDIVDTGLTMQRLLETLGTRNPEAIHIASLLVKPEKLKVNLNIEYVAMEIPNDFIVGYGLDYDGFGRNYPDIYTVID >NZ_LT622246.1|WP_004301900.1|3338718_3340263_+|peptide-MFS-transporter MSALKGHPKGLYLIFATSTAERFSYYGMRAIFILFLTQALLFDKEAAASIYGSYTGLVYLTPLIGGYIADKYWGIRRSVFWGAVMMAVGQFLMFMSASTLDNTNLAHWMMYGGLGFLILGNGCFKPTVSSLVGQLYEPGDRRLDAAYTIFYMGVNVGSFAAPLICGYLGDTGDPHDFKWGFLAAGIMTLFTVVLFETQKNKYLFSPSGEPIGIIPDAKREKKEDKADHISHPKMDKRTKVRNTLVITILTIALIAFFNYAFEGDWVSIGIFTACIVFPVLILLDGSLTKIERSRIFVIYIVAFFVIFFWAAYEQAGASLTLFASEQTNRDIFGWEMPASWFQSFNPLFVVVLAYIMPGVWSFLNKRKMEPASPTKQAIGLLLLSLGYLFICFGVKDAVPGVKVSMIWLTGLYFIHTMGEIALSPIGLSMVNKLSPLRFASLMMGIWYLSTATANKFAGMLSGLYPEAGKVKSIFGYQIATMYDFFMVFVVMSGVASLILFLLSKKLQKMMHGVE >NZ_LT622246.1|WP_004301899.1|3338300_3338525_+|winged-helix-turn-helix-domain-containing-protein MMEKTKIGLNAGKVWRILNEKGELSMFDLCRELSLTFEDVALAIGWLAREDKIFLRKREGMLFASIENVEFTFG >NZ_LT622246.1|WP_004301895.1|3335726_3337238_-|bifunctional-ADP-dependent-NAD(P)H-hydrate-dehydratase/NAD(P)H-hydrate-epimerase MKIFPSSSIKKLDAYTIENEPITSIDLMERAATVLTKAITDRWNTETPVTIFAGPGNNGGDALAVARMMAEKGYKIEVFLFNTKGELSPDCQTNKELVEMMEEVKFHEISTQFVPPALTPDHLVIDGLFGSGLNKPLSGGFAAVVKYINSSPAMVVAIDIPSGLMGEENTFNVKANIIRADVTFSLQLPKLAFLFAENTEFVGEWEVLDIQLSEDGIEEMETNYEMLEIEEIRSLIKPRKQFAHKGNFGHALLIAGSKGMAGASVLAARACLRSGVGLLTVHAPMCNNDILQTSIPEAIVETDINETCFAVPTDTDDYQAVGIGPGLGRNEETEAALLEQLEHCLTPVVVDADALNILANHRHALTHLPKGSILTPHPKELERLTGKCQDSYERLMKACELARAAHVHIILKGAYSAIITPEGKCFFNPTGNPGMATGGSGDVLTGVILALLAQGYPTEEAAKIGTYIHGLAGDVAQKKQGMIGMIASDIITCLPTAWRLVSE >NZ_LT622246.1|WP_004301909.1|3348047_3349475_-|DUF4419-domain-containing-protein MKNTLFCLFIFCSVSTFAQNGITFKVEKLSKPEELLHLDSPNEIYESLILSDMNIEPYEIKEKNIKVPYHIIAKSESPDSLVSFGPNSFFNGMYQAYADHRPFVLSPDMIWLLISQGFARHINANQESMRNELVDFSGKLSLIIREDKKLEDPTLSWEEIFPQFTEQISQYTGNHLTELLTCNFSTTTSLEKVASEITIMEAVKPYFEFIIIRIVCGIPEITLEGTPEDWEKLLHKARGLKEYKLDWWISELEPLLEEFVKASKGEVNKNFWRNMFKYHSQKRYGAPNIIDGWIVKFFPYDKEGKRNYLKQLEGKNCLPDEIVKVDVKYQEVYGDAVKETPLEFWAGFIGLEQNSKTFALRPQIGWMVRKKDVNKEGLKSKLSADAQKDGWGSGINIRVKEFPAVLLELKEIKRLDIQFIDTIDIPDEISKIKIGSLSLYGKITKEEIERIKRLLPDTDIKINGSRSGSASFMTP >NZ_LT622246.1|WP_004301910.1|3349691_3350783_+|DNA-polymerase-IV MTQRKIIHIDMDAFYASVEQRDNPELRGKPLAVGHAEERGVVAAASYEARRYGVRSAMASQKAKRLCPQLIFVPGRMDVYKSVSRQIHEIFHEYTDIIEPLSLDEAFLDVTENKKDISLAVDIAKEIKQKIREQLNLVASAGVSYNKFLAKIASDYRKPDGLCTIHPEQALDFIARLPIESFWGVGPVTAKKMHLLGIHNGLQLRKCSLEMLTAHFGKAGALYYECSRGIDERPVEAIRIRKSIGCERTLERDISARSSVIIELYHVAVELIERLQRKDFKGNTLTLKIKFHDFSQITRSLTQSQELTTLDRVLPLAKELLKSVEFEQHPIRLIGLSVSNPKEEADEQHGVWEQLSFEFSDWD >NZ_LT622246.1|WP_052588019.1|3351260_3353195_+|heparinase-II/III-family-protein MNRMKHLFCVLLLAALGSFSFKASAYTERNMLQKAADETTLKNVLVMKQAWVPYPAYTDRAAWDSLMGPNKQRLIEAGEKLLDYKWQLIPATAYLEYERSGNRKIMEVPYDANRQALNALMLAELAEGKGRFIDQLLNGAYMSCEMNSWVLSAHLPRQSSKRSLPDFREQIIDLGSGGYGALMAWVHYFFRKPFDKINPVVSLQMRKAIKERILDPYMNDDEMWWMAFNWKPGEIINNWNPWCNSNALQCFLLMENNKNKLAKAVYRSMQSVDKFINFVKSDGACEEGTSYWGHAAGKLYDYLQILSDGTGGKLSLFNEPMIRRMGEYMSRSYVGNGWVVNFADASAQGGGDPLLIYRFGKAVNSDEMMHFAAYLLKGRKPYATMGNDAFRSLQSLLCCNELAKATPKHDMPDVTWYPETEFCYMKNKNGMFVAAKGGFNNESHNHNDVGTFSLYVNTIPVIIDAGVGTYTKQTFGKDRYTIWTMQSNYHNLPMINGVPQKFGQEYKATNTVCNEKKRMFSTDIATAYPAEAKVKSWVRSYALDDKKLIIGDIYTLDEAIVPNQMNFLTWGNVTFPSAGKIRIEVKGQKVEMNYPSQFKAELETIKLDDPRLSNVWGKEIYRITLKTEEKKVTGKYGFVIQQVK >NZ_LT622246.1|WP_004301912.1|3353254_3353956_+|DUF4627-domain-containing-protein MKKVLFAGLLVLAGVSVSAQNLIKNEKFATEVKTKVTNANKATAGEWFIMNNEADGVTTIAWEETGDAKYPNAMKLDNSGAEKTLSWYKAFLGQRITDGLDKGIYVLTFYAKAKEAGTPVSVYIKQTNEEKNDNGKYNTTFFMRRDYDADAQPNASGAQYNFKIKDAGKWTKVVVYYDMGQVVNAISSKKANANLEVSDTDDDAAILKDCYVAILSQNKGGVVEISDVTLKKK >NZ_LT622246.1|WP_004301913.1|3354116_3355295_-|aminopeptidase MKKLFMSVALLLLVVTSFAQTPGYEFTTVVSHQATPVKDQGSTGTCWCFATASFMESELLRMGKGEYDLSEMFIVRQKYMNQMEDNYLRRGKGSIGEGSLAHTFKNAYKKAGIVPEEVYTGLLGDNKDHNHGALSRYLKALVDANIESKKRTPQFDALINNLFDIYLGKLPEKFTYKGKEYTPQSFTESLGLNMDDYVELTSFTHKPYYETFSPEVPDNWENQPMYNLPLDELIGAIDYALNKGYTVCWDGDVSEQGFSFKNGIAINPQVEDVKDYSTTDRARFEKMPKYQRMDEVFKFEHPYPEINVTPEIRQDGYEKFVTTDDHLMHITGIVKDQNGTKYYITKNSWGAESNKSGGNLNMSESYVRAKTICVMVHKDSLPKELKKKLGIQ >NZ_LT622246.1|WP_004301916.1|3355850_3358607_+|transglutaminase-domain-containing-protein MKTFTHLLCVLILSIALFACNNAHFLKEEAYRNQVIQDFELKKQALPHGDLFAIFADSVLSVYEREALMFLYAYMPIGDVTDYSGDYYLENVRLSKQTRGEMPWGKEIPDEVFRHFVLPIRVNNENLDDSRRVFYGELKDRVKGLPMKEAILEVNHWCHEKVVYRPSDARTSSPLASVKTAYGRCGEESTFAVAALRSVGIPARQVYTPRWAHTDDNHAWVEAWADGHWYFFGACEPEPVLNLGWFNAPASRGMLMHTKVFGRYNGPEEMMLETLNYTEINVTENYAPTAKASVTVRDKNGQPVAGARVDFKVYNYAEFYTVATKYTDTNGQVSLTAGKGDMLVWASDKGTFGFSKLSFDKQPELTLTLDKKEGDIFEEDIDIVPPVENPILPEVTPEQRAENDRRMMQEDSIRNAYVATFPTAEQADSIVSCLKGKLSSFAGKALASFLLDSRGNHDVLVRFLNEADRQGKLMKGAALLSILTKKDLRDVRYEVLIDHLLNTKDVDTYLYDCVIPPFHCMDASTEYVYDILAPRASTEALTPYKSFFQSKFSEAEMDTFRTRPQALVEWVNRNITIDEENNFQRIPISPEGVWRAKVADSYSRDLFFVALARSMNIGADIRSTDGRVRYVSWPENRWGSEFMEVDFDKQEAVEASRGIYHFYEGDKAIARDDKRVKYYSKFTISRLREGRPELISYEEQDPRLRNMGVLDAGYYLLVTGTRLADGGVLARISSFVLPAQKDEFKPVATKVPYHLRESGEKVAVIGNFNSESLFTPVERIGEKVMPLARQSILQTCGRGYFVVAVLGAGQEPTNHALKDIAALGNDFEQWGRKMVFLFPSEEQYKKFNAAEFKGLPSTITYGIDTDDSIRKGIVQAMNLNNSILPVFIIADTFNRVVFVSQGYTIGLGEQLMKVVHGL >NZ_LT622246.1|WP_004301917.1|3358689_3359127_+|hypothetical-protein MTKYIFCILACAFLVLGLSNVSDKELQGFQKETEISSNRMQYTAESSCRISSADLNKSSKVSHSQFVDETSNCKVSDCIFDNISFPRSIVPFKNLKFNTNTVIIQILSSLNVLLPENRLGHTDLDVNYTKYSCKYYVYTLAHILI >NZ_LT622246.1|WP_004301919.1|3359229_3359784_+|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MENKECISYDLEQKTGIDVSYCYQCGKCTAGCVLSEEMDYAPSYILRLLQTKNAQNDRRVLSSNAIWICLNCENCIARCPKEINIPEVMDYLREKSRKEGCISKESRPVVAFHSAFLESVKRTGRLYEVGLVAGFKARTLRLTQDLNVAPVMFVKGKLNLLPERVKDENKIKKIFAQTIEKTQK >NZ_LT622246.1|WP_004301920.1|3359786_3360653_+|CoB--CoM-heterodisulfide-reductase-iron-sulfur-subunit-B-family-protein MRIGFYPGCSLNGTSREYNESVKALAQAMGLELIELKDWNCCGATAAHSMSKQLSLALPTRVLALAEQQGFQEIVVPCASCYNRLSVAQYELMHNEALKDEILTTVGMRYLGNVKILNVIQMIEKYMLDALKEKIVRPFAHQVACYYGCLLVRPHKILNFDRLEDPQSMDKIMSLIGATPIDWAFKTECCGAGLSVSRTDLVGRLSGNILKDADDRGAEAVIVACPMCHSNLDMRRPAINHYLAKPVTIPVLYITQAIGLAVGLAPKELGLGRHFVAVNLKEAEVCLK >NZ_LT622246.1|WP_004301921.1|3360640_3362641_+|CoB--CoM-heterodisulfide-reductase-iron-sulfur-subunit-A-family-protein MSKIGVFICHCGENISATVDCEKVAEAAKEMEGVAYAIDYKYMCSDPGQTLIKNAIKEYGLDGVVVAACSPRMHEPTFRRACAEAGLNPYLCEIANIREHCSWVHEKGEATTRKAVDIVKSLVEKVKRNHPLVPIQVPITKKALVIGGGIAGIQASLDIANCGHQVILVEKEPSIGGHMSQLSETFPTLDCSQCILTPRMVEVAQHPNITLYTYAELEHVEGFIGNFKASIRLKAKSIDEKLCTGCGLCTTKCPNKKIPSEFNAGLGMRTAIYVPFPQAVPNKPVIDKEHCTHYRNGKCGVCEKLCPTGAIRFGQEDRIITEEVGAIVVTTGFNVLNTDFFPEYGYGKYKDVITGLQFERLASASGPTFGEIRRPSDGQIPQKIVFVACAGSRDPAKGIPYCSKICCMYTAKHAMLYQHKVHGGESYVFYMDIRAGGKNYEEFVRRAIEEDGVNYVRGRVARIYEKNGKLIVKGVDTLLGASPVEIEADMVVLATAGVANKGAEELAQKMHISYDPYQFFAESHPKLKPVETNTAGIYLAGACQAPKDIPETVGMASGAAVKVAGLFSQANLVREPLIAVVNRTAPPLFSTCVGCFMCQTACPYQAIEREEIKDRNGNVIKTVAKVNPGLCQGCGTCVAFCRSKSIDIQGYSNEQVYAEVMALLNH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | NZ_LR134423 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 14 | 2866-2896 | 7 | 0.774 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | NC_007501 | Lactobacillus phage Lc-Nu, complete genome | 30638-30668 | 7 | 0.774 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | AY131267 | Bacteriophage Lc-Nu, complete genome | 30638-30668 | 7 | 0.774 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | MH983004 | Lactobacillus phage BH1, complete genome | 32670-32700 | 7 | 0.774 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | NZ_CP004877 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB431, complete sequence | 52386-52416 | 7 | 0.774 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | NZ_CP045273 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence | 1065035-1065065 | 8 | 0.742 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | NZ_CP013615 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence | 67130-67160 | 8 | 0.742 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | NZ_CP014173 | Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence | 37911-37941 | 8 | 0.742 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | AP013657 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S32-C172, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 3482-3512 | 9 | 0.71 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | MH791414 | UNVERIFIED: Aeromonas phage Aswh_1, complete genome | 66404-66434 | 9 | 0.71 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | AP014421 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S43-C174, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 2 ordered pieces | 8851-8881 | 9 | 0.71 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | AP013664 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S45-C223, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 5115-5145 | 9 | 0.71 |
NZ_LT622246_1 | 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder | 3347769-3347799 | 31 | AP013658 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S33-C129, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 4640-4670 | 9 | 0.71 |
1. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134423 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 14) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
attcttttgattgaaatatatttgtctgaaa CRISPR spacer ttttatttgattgaaatatttttgcctggat Protospacer **. ************** ****.***.*
2. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to NC_007501 (Lactobacillus phage Lc-Nu, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
attcttttgattgaaatatatttgtctgaaa CRISPR spacer atcgttttgaatgaaatatacttgtctagca Protospacer **. ****** *********.******.. *
3. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to AY131267 (Bacteriophage Lc-Nu, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
attcttttgattgaaatatatttgtctgaaa CRISPR spacer atcgttttgaatgaaatatacttgtctagca Protospacer **. ****** *********.******.. *
4. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to MH983004 (Lactobacillus phage BH1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
attcttttgattgaaatatatttgtctgaaa CRISPR spacer atcgttttgaatgaaatatacttgtctagca Protospacer **. ****** *********.******.. *
5. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP004877 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB431, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
attcttttgattgaaatatatttgtctgaaa---- CRISPR spacer tttcttttgattttaatatatt----tgaaatatt Protospacer *********** ******** *****
6. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045273 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
attcttttgattgaaatatatttgtctgaaa CRISPR spacer tttctttttattgaattatatttgagcgcta Protospacer ******* ****** ******** .* *
7. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013615 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
attcttttgattgaaatatatttgtctgaaa CRISPR spacer attcttctgatttaaatatatttttaatatc Protospacer ******.***** ********** * *
8. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014173 (Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
attcttttgattgaaatatatttg----tctgaaa CRISPR spacer cttcttttaattcaaatatatttgataattt---- Protospacer *******.*** *********** *.*
9. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to AP013657 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S32-C172, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attcttttgattgaaatatatttgtctgaaa CRISPR spacer tttctcttgatagaaatatatttgataaacc Protospacer ****.***** ************ . .*
10. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to MH791414 (UNVERIFIED: Aeromonas phage Aswh_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
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11. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to AP014421 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S43-C174, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 2 ordered pieces) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
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12. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to AP013664 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S45-C223, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
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13. spacer 1.1|3347769|31|NZ_LT622246|CRISPRCasFinder matches to AP013658 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S33-C129, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2582119 : 2661826
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT622246|2582119:2661826|DBSCAN-SWA 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59 | unidentified_phage(25.0%) | tRNA,transposase,integrase | attL 2600097:2600112|attR 2667964:2667979 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
4236524 : 4273173
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT622246|4236524:4273173|DBSCAN-SWA TTTAACATTCCGGTTTATAGAAACATGGCAGAAGAGCCTTCTTGTCGCAGTCCTTACCATGAAGAATACATTCAAACAAGTGTTTCAGGTAATTCTGAGGGTCTATGCCGTTCAACTTACAGCTTTCTATCAGAGAGAAGGTGAATGCAGAGTTTTCTGCCGCATCCTCACTGCCAACGTTCATACAGTTCTTGAGCAGCAGCTTTACAGGTTTCATCCTTTGCTCACAGAGGTTGTTCGAGATTTCTGCTGAACCGTCCTTGAGGATATTTCTCAAGGATTTCCACTGGTTTATCGTATAGTTCACGGCCTTTCTCATCAGTTCGTTAGCCATAATCTTCGCATCCTGCATCATAATGACCACCTTATGATGGATACGTTCAAGAATCGGTCCTGTTAGCTTAAGCCTTCTTTCCTTAATCTGCTCACCGCTGAGTTTCATCATACGGAACAGGTCTTCATTTCTGAACATCTCACCGATAGGATCTATTATGTCCATCGCTGTTCTGTCTGAAGGCAGGGCATCAACCCACAACCTTCTACAATGCGTCCAGCATCCTATATGAAGCACCTTTGAGTCGTCTCCGTCAAACATCCTGTAAACCGTATATCCGTCAGTGGATATGGTTCCCATAAAATATTCCAGGAATGATTTTGCCGCATCGGACGACCTGCTGCCGTTATTATAGTGATAATAGACCATCTTAATATGCTTGGCAAAGAAAGCCCATAAGTACTTTCTCCTGTAAGCCTTACCTTCCTTTGTTTCCACTCCAACAAGCTCAGTAGTCTCATCAACCATAAGGTAATTAGCTCTCTGTACAAACTCCTTGAAGACATCTTCCATGAACTCCCTTAGTTTGGCGATTCCGTTATGGATATAGCTGTTCAGCGTGGTATTGCTTATGTGGATACCCTCTCTTGCAAGCAGTCTTATCTGTCTGTTCTCAGGCATGCTGAAGTCATATTTCAGACAAAGCAGACGGGCAAGCAGTTCAGGAGAGAAGATACCTCCAAGGTTTTTCAGCGGATGTTCCATGGTGCTTGTGAAAGTGCCGTCCGCAAGCTTTACCCTTGCCACCTTGTAAACATGCTCCACGTTATAAGCCCTTACATGTTCTATGACCCTGTATTCCCACACATCAGGCATACCGTTGCGGTTCATAAACCGTCCCCCTTCTGGAAGCGTGTAATACTCGTCCACTTCATGTACTACCACCTTGTCAACTTTCAATTTTGTTTTCCCGGCACGTGGTGCGGTTTCCTTTCTCCTTGAAGGTTTGCTGTTCTGGGCAGGTATGTTGCCGGAAGAGGTATTGCTGCCGGTTTCGTTATCATCGGTCTTATTATTATCATCCTTCCTGTCAGAACCGTCATACTCGGATTGTTCCAGAGCGGACTTGTCGAGATTACGGTTGTTCAACAGCCTTCTTTGCTCGGAAGTACGGCCGAAACGGTGTTTCCTGCTGTCCTCAAGCTGAAGTCTGAGATTGGAGATCTCGTTTGCCAGCATCCTGTTCACCTCATCCTTTGCTTCAAGCTGCTTTCTCATAAGTTCCATTTCTTTCCTGTAATGTTCAACCGTGGTTGACTGCTTTTCGATGGTATCTTTGAGATCATTGATGGTATCTATCAGATTTTTAGAGTTCTCCCTGTTGGATTCTTCAATAGACTCAAGCCTCGCAATCAATTCTTTATTCTGTTTGCGAAGACCTGCCTTTTCCTCATTCGCCAGACCCAGCTGGCAGCAAAGTAACTCGTATGCTCTTTCATCAATCATGATATAAAGGTACGAAAAATCAGGCACTTACGCAAACTTTTTACCGTTTATTTTTTATACTATCCTGTTGATAATCAGTATGTTAATATTAGCCTTTCGGACTAACGTACATCTTGTCAACTACAATGCTTTCCGTAAGATAAGCCATGTCCGACCACTGTATCCGGTAGCACCTGGAGACTTCATCAAATACAGGTTTCTTGAATTTGCCCATAACAGGACGTTTTTCGTAAAGCACATAAAAACCGCGTTCGTAATGAAGTATCTTCACAACCTTTCGGTTCCGGGACATGAACATATATACATTGGACGCATCGCTCGGGTCAAGGGACATTTCTTCCCTTATACTCTCACACAGACGGAAAATGCCTTTCCGCAAATCAACATTACCGTTAAACAGGTAATAGTTAAGGTTAGCACTCAGTCCAAGCATATCATCCTATCATTTTATTAAGCAACAGGCTCAAATCAAGAACGGTGGTGTTTCTCAGGAACAGTGTTGCGCCAGACGCCAGCTGTAACTTGATCCATTTTATTGGTGGTTCACCTTCAGGATGTTTCACGTCCAACTTCACAGTTGGACTATTGCATGGTTTCCCGGTTATCTGGACTTTGGCAACCTTGGGCTGCTCAACCTGGACTGTCTTGCCTAACTTCTCACTCCACAACTGGTGACGCTGCCAGTTCATGAACTTGTCGTAATTTACACCATAATCAGCACAGAACTCTCGAAGATCTTTGGTCTCGCTGCATAACTGGTAGAGGTCATATACCTCCTGATAGTTTACTTTTTCTTTTGCCATAATCATTCTTGTTAAAGGTTACGGCGCAAAGATATGGCGGCTAACAACTTATGTCAAGGCGGAAAATAGAATGGTTACATCAAGATTTCTATATTTCATATTTTATATTACTTTAAATATTATATTTGCGCATTGTCAAACTAAAATAGTGCGTTTATGAAATCGTTATTAAAAAATGTCCTAAGAAGGATAAGTAAAAAACAATCTTCTAAAGAAGATAATGCAACAGCCTTTTATCCCCAGTGTTGTGCAAAAGTGGATGATTCCGCTCGTATGCGTATAAAAATGTCTTATGACCAAAATGTAAAAGAAACTATATCAAGCTTGAAAACACTTGCTAATGATATGTCTAGTGGCTTTGTTACTTTTAAAAAGTTTCAGACTAGGCGTTATCAATACAACCCGGATGCAGATGCAACTCTATATGCTTCAAGACTGCTTCGTGCAGCTTCTATATTGGAGTTCCTATTAACTGATCCTGATAATAAATCTTAGAGATTCATTTTTTCAGCTAGAGCAGAGAGCCCTATCAGTAGTTCAGTTATATTTTTGGCTTTTCCGACAACATCATCAACTTTTGCTGCTGTATCAGGGCTTAACTCCTTTTCTAATCGTTCTAGCTGCATTTGAAATGTATCAAAACTTAATATATATAAGTCTCTTTCAACAGTGAATCCCCCTTTTTCTGCAAAATTGAATATTTCAAAATTCAACGTAAGATATTCAATACCATATCCTTTATAGTCAATAAATCTCCTATTTTTGAACTCCTCTAAAACTATTTCATATTGTTCTTTACTGATCCTAAGGTCTGGTATATCTTTATAATTTAGTTTAGCTGTTCTTTTCCCGTTTGCTACAACCAAAATATAATTTAATACTTTATCCTTTTCTTCAGCCGTTATAACTAAAGGATATTCTCTTTCATCTTTGGGTGGTGCAGTTCTAATTTGGCACATATAATAATTAAATTATTTTTCTCAATACCTCTTTTTGTGAATCGATGTTGAATTTTGTATCATTTACTTTGGCAGCCTCTTCTTCAGATATATTCATGTATTTTATAGCTTCATTTAGTTTACCGGAACTTATTGCCCAATATGCAAGATTTCTATATACATATTGTTTTTTAGTGTAAAATTTGCCGGAATCTACATCTTGTTTAGATATCTTGTATTCTTTATTCGGGTCTGTTGCTTCCCTGAACATTTCAACACACCAAAGGCTATTTTCCTTATTCAAATACATTACTACTATCATCTTTTTGTCAATATATTGTCCTGCTTTGTTTTTTATTTTACAGTTAATTATTGCTTTATATCCTTTAATATTTAATGTATCTGTATCAAATAATATACCTGTTGGCTCTTCATAATTTAGTAAATCATACATATTTCCTAGATTAAAAGAATATTTAGAAATAATTTCTTTAGATTCTTCAAATTCAAAAGTCTTACATGCATCTAAGAATTTAATCAAATCACTTTTTTGTCCCCATGTTATAATAGGAGTAAAAAGCATTAGTATTAACAGTATCTTTTTCATTCGTTAATGTGTTTATTTATCCTATATTACGTTCATTCTTCAACATAGCTAATTCGCCTTTCAGTTTTTGGTTCTCTTCAGTGAATAGTTGAATTGTTTTCATCTGCTCATTTATAGTCCCCTGAAGGGTTGCTATTGTATCAACTAAACGTTCCATGCGTTCAATATTTGGATCAGGTTTGATATCTGAAATCAGCATTGGACCTTTATTGCGTAGTAACCAATCTGCTGAAATATCCGTAAATGCGTTTAATGTGAGCCTAATTACTTTAGAGGAAGGTTCTGTGTTTTTTTGAAACATAGAACCAATCACCGATTGGGTTACCCCAATTTTAATGGAAAACTGCCTGTCTGACAGCTTATAATAAGAGATAATCTCTCTAATTTTTTCGTTTACGCTTGTTTCAGCCATATCTATATTAATAGTTAATTAACGTAAATGCGATTATTTATCAAGTTTTATGTTTTGTAATTAACGTAAATACGTTTATATTTGCATCATAAATCAATCAATCATACAAACATACAAAAAATGATTGATAAAACCAATTAAAAAATAACGATTATGAGCTACAATTTATCACAAATAATGAAGTCTGCACACCGCAATTACAAGAAGGGTGGAAAAACATTTTCAGAGTGTTTAAAATCTGCATGGAGCTTTGCAAAACTCCAAGAAAGTTTCTCACCGGAAGCAGTGAAATCAAGAACTGATAAATTTTTAGCTGAAAGACATGAAGCTATGAGCAAGACTGCCAAAGCTACACCTAGCAAGGAATATAATAACCTTAATATTCCCGCTTCCGCTTACTACAACCCAAATAGTACTCATTACGGTGCACATTACGTCGGAGATTAATCAAATTATACAA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>NZ_LT622246|4236524:4273173|4245602_4246052_+|WP_004300206.1|DBSCAN-SWA MSLNKLMLIGHVGKDPDIRILEAGSKVATFSFATTEKGYTLANGTQVPERTEWHNIVVWRGLADVVEKYVHKGDKLYLEGKIRTRSYDDSRGIKRYITELFVDNMEMLSVKPQQAPPPPPLPEHTNNQTRSAVNECPPPPPPTKDDLPF >NZ_LT622246|4236524:4273173|4264506_4264704_-|WP_004300249.1|DBSCAN-SWA MNNKYYLFIAACKGAALLGEFIYLHGRGEFSGARGAYNYCKRTGDKAGELAIYNCVVNRKGQKVY |
52 | Bacteroides_phage(12.5%) | portal,terminase,transposase,head,integrase | attL 4241848:4241863|attR 4267069:4267084 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
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NZ_LT622246.1|WP_004295672.1|5011256_5011679_-|PcfK-like-family-protein |
5011256_5011679_-
Protein sequences of NZ_LT622246.1|WP_004295672.1|5011256_5011679_-|PcfK-like-family-protein>NZ_LT622246.1|WP_004295672.1|5011256_5011679_-|PcfK-like-family-protein MKGTEQFKEIIKNYLDNRAKEDELFRAKYETTERTIDDVVTYILNEVKQSGCCGFSDMEVFSMAVHAIDELTLEIGKPVNCDVVVNRHIDLTEEEKAEQKALALKRYQEEELRKLQVRHSKPRTSKPQETKQPQPSLFDF |
140 aa aa |
40
gnl|BL_ORD_ID|40 information
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NA | NA | No | NA |