Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LT799839 | Clostridium chauvoei JF4335 chromosome I | 4 crisprs | cas3,csa3,DEDDh,WYL,cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas4,cas1,cas2,cas3HD,DinG | 0 | 5 | 6 | 0 |
1. NZ_LT799839
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LT799839_1 | 391813-391888 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT799839_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LT799839_1
>1.1|391837|28|NZ_LT799839|CRISPRCasFinder TAGGCAACAGAAAAACCTAAAAGATTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT799839_1
The CRISPR arrays of NZ_LT799839_1 >merge|NZ_LT799839|1|391813-391888|CRISPRCasFinder CGTGATTTAATTGCACGTCGTTGGTAGGCAACAGAAAAACCTAAAAGATTTGCGTGATTTAATTGCACGCCGTTGG >NZ_LT799839|1|1|391813-391888|CRISPRCasFinder CGTGATTTAATTGCACGTCGTTGG TAGGCAACAGAAAAACCTAAAAGATTTG CGTGATTTAATTGCACGCCGTTGG
>NZ_LT799839.1|WP_021874740.1|391172_391559_-|hypothetical-protein MLIVASVLKIKETITASKIVAALSKPKWLGEECNRKAFKGAYEQDKYKTLTEFPVYTGTTSKSRRIDVLVAENLRVKEHFNLNLHGIEIKVSKSDLVNDMKYSEYAEFINYLWLELLSICLFLILIRL >NZ_LT799839.1|WP_079481078.1|390652_390958_-|hypothetical-protein MDIQGLLAYLDGIYPSLKLIVNNSTKRQKTTIYVERKLILKLLYQPLSTVKGLDTKLFELLCSQYTNVSKILELVNRFRSILKAKDITKLDLWNILSILDI >NZ_LT799839.1|WP_021874739.1|389429_389933_+|hypothetical-protein MLKVFKNEGTKKENIEFDIYTPINIEFGVWNISKEPTIYWRTGDFSSSLIEIGIGQYKKDIRSITLTICKNVYELDNYSENNFNIFKGSPILELENINDEIYTDEKGTLKVYIESKNVSIIFSENEISDCLQNDNVDFYLDANKSLVGLSVNNISEENKAILKEALV >NZ_LT799839.1|WP_021874737.1|388263_389028_+|hypothetical-protein MDSVKASANIFTRECQEYWVFSLDGAATHNNSITDEQDQLIENKLNLEKLGYGNLRNYNGQITAEWNEQFNKVVNQFISDFGLKDKYDKLGGNKKTQLYVWISQAVNGQIIKVQRDTGSQGTNNKTHKEVITLESIRENFYLGIGDALIGAVKGVFEFVSHPIDGVIGVANGIQFLNKVISNPNCEEAIILDKIIVEAVNNFIDSNLNEKSRVLGRIVGEILIIVATDGIAESIMEHLPQIANQVKNGGKVEKY >NZ_LT799839.1|WP_079481077.1|386650_387865_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MDSIITYLITYNQYLIAIIGQLLLFISQHIPLNQMIFDDSNSPEYQKFKVDKLPTIIRFEKVDYILLLAYYKHKYNKTVKPAQRRNGKSIPKKTKCPKCGAPHEYIYDNNGSKGQFQCKVCGLTFKETNYTTKPIVFICPYCGATLTEQKQRKHFKIHKCNNSKCLYYQRNLKNLPKNIDPCDKYKYKLHYIYREFNINFLKLNPISKHATGFSFKKFSPHIMGLCLTYHVNCKMSILGYQVSDTRATDPCILTMRMAFDKFKDFSGKALNFVADGYSSYPLAKQQFELEKNKEFNLTQVIGLTNDDPVSEEFRWVEQVVERLNRTFKSSYRGTCGYGSDEGALYGFSLWVAYYNFLRPHPYNYWRPLNELKQLDGIDNMPAKWQILISLGQQTILHMQESQTS >NZ_LT799839.1|WP_079481036.1|384887_386327_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MDSIITYLITYNQYLIAIIGQLLLFISKHIPLNQMIFDDSNSPEYQKFKVDKLPTIIRFEKVDYILLLAYYKHKYNKTVKPVQRRNGKSIPKKTKCPKCGAPHEYIYDNNGSKGQFQCKVCGLTFKETNHTTKPIVFICPYCGATLTEQKQRKHFKIHKCNNSKCLYYQRNLKNLPKNIDPCDKYKYKLHYIYREFNINFFKMDLYPISKHATGFSFKKFSPHIMGLCLTYHVNCKMSTRQTAHVLKEVHGIKISHRTVANYALTAAAVIKPFVDTFDYKPSKILSADETYIKVKGIKHYVWIVMDACKRSILGYQVSDTRDTGPCILAMRMAFDKFKDFPGKALNFVADGYSSYPLAKQQFELEKNKEFNLTQVIGLTNDDPVSEEFRWVKQVVERLNRTFKSSYRGTCGYGSDEGALYGFSLWVAYYNFLRPHPYNYWRPLNELKQLDGIDNMSAKWQILISLGQQTILHMQESQTS >NZ_LT799839.1|WP_021874736.1|384332_384620_-|hypothetical-protein MDGTGTVIGGSLYNTNGAKNSANASTANKSNNKYRAYVQLYAYKTNGVIDRNSTRTGAESGDVGVSSYAANVGIWESLHSTDQSIDQNCGLRLYM >NZ_LT799839.1|WP_161493077.1|383213_384242_-|FtsX-like-permease-family-protein MKKNINTLLTLGFSIALFTISFIISSNYINIKYVIDENKFNDTFSYLDIHLQTPLSLLESNKLLKSIGINKYATQPSLVVNRIGETDYANKLIGVSENFNIEDYFNIEWLSNGKNDFYNRTDVVIIGNSLMQALNKLNSSTEYIEIQGENRKIAGVLKDSQYASFMTFMPIEYLRKENELSNIIQCFVDKNTNIAFGNLKGAIHNSPAKNVLKFAIDKSMTIEGEIVDIILGILTIVIFSICYVQINKRKFSIMRLVGAKQKHILYEYIRCLLPMFSIAFFIAIYFSSITINYISNNIDDIFFKVDLINICMTGIIGFILILLTSLLCMINTLRFRILEDIR >NZ_LT799839.1|WP_131431558.1|382017_383211_-|ABC-transporter-permease MKDKLFFTFRKDKVINIILIIQLTLSIFCIYNFLTTFFFKTEYTKLYNSSYDIENGIIIKFTPANISGQNVNPLPILKSLEKNNIKGGIMLEMPDEKYSIPLKTLNISPKLLMNREEYIFGDNTAILPIKMNYTSLNRHSDKINGQIEENMWKIEGNTIPVVVGVNFSNKFKIGDIIKFNGNDFHIIGVMSESILYQTHYDSILTAKDTSGKFIIPIEDKDYTSSYNNDPIIISNSDITSVETALKDFSNLFEIRNYGEDYEWFSKEIKYDLFKKNIRTLILMLATIGSLFITLLIKILSSKDRFGILYSLGFKQKEINNIFILEFSPILYIIIITSFILTNTVGKFSFRRFLVQNKVCYWGVSISIVILLIIICFKFIFNKINKLSPKEMMEDFNK >NZ_LT799839.1|WP_079481076.1|381328_382021_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MITLLNIEKIYGKNENQTIALKNINLQINEGDFISIMGSSGCGKSTLLNILGMIDKPTKGDYIFENQKINFNNINSLSEIRNTKISFIFQNFALINDMTVLNNCLLPLKFRKGKKSDKHNLIDKYLSELGILNIKNKLIKELSGGQQQRVAIARALVQDTKIILADEPTGALDEENSIKILEIFKLLNEKYKKTIILVTHDLDVSKYAHTTYIIKDGKFISNSKDFILNE >NZ_LT799839.1|WP_021874741.1|391961_392243_+|hypothetical-protein MAKLNKKDVLKTIISSAKLYKKALSGKLSVNDFELRTDGTTELKLLVLPSLMDFKDHVRMIGEFEDCSPKLFTEVLAGNIQGALGFVHDNKGE >NZ_LT799839.1|WP_021874742.1|392527_393487_+|sugar-ABC-transporter-permease MLKKSKKEESTKKNRFKTFKSNKELLLLTIPGAIWFLIFAYLPMFGVVVAFKDWRIHGGFLESLVKSEWVGFDNFKFLFQSSDAWLITKNTIAYNVVFIVLGIVIPVTLAILLKELLNKRGSKFYQSSMFLPYFLSWVVVSYCLYAFLSPEKGYINGLLTSFGMDKISWYTEPKFWPFIIIFMSQWKGIGYGTVVYLAAICGIDKTYYEAAIIDGASKWQQIKHITIPLLKPVLIIMFITAVGGMFKSDFGLFYQLPKNSGALYPVTNVIDTYVYRGLMNLGNIGMSSAASLYQSIVGLVLILVTNGIVRKVDNENAFF >NZ_LT799839.1|WP_021874743.1|393506_394472_+|carbohydrate-ABC-transporter-permease MLEMNRKTARFRGKKSKEPAEEISKFNSISKGTNVGFNILFMILAALCIIPFIFVVIISLTSEQALQANGYRFWPQEWSFAAYKYIFSSGSQIMRAYGVTIIVTVSGTLLGLAIMSMYGYALSRKSFAYRKFFTKLIFIPMLFSGGMVSSYLVVTKFLGLKNSILALILPMCVSSFNIIILRTFFKTTVPDAIVESAKIDGASEWKLFLKIVLPISLPGIATIALFLTLGYWNDWFNAMLYIDDNSLMPLQYLLIRIESSMEFLSNNAALMGANAIEASANMPKDTAKMAIVVITTLPIIFAYPFFQRYFVNGLTIGAVKE >NZ_LT799839.1|WP_021874744.1|394598_397730_+|alpha-mannosidase MHYLLERIEKTCGEIAKYVYRDQINLEDYKYIDGNYHNIDLIKEAPEEGWREFKTGDLWGGKDCHGWFKCSVEVPEHFKGQTIALNFHTFEEGWDATNPQFILYVNGEQIQGVDINHREIILTHDAVPGTRYDIDLHAYAGMLADKLATLHGKLVVIDMVARDLYFNLKVPVDVCKELDKEDKNRIDMITVLNDAINLIDLRRPKSKEYNESVIKANEFLNEKFYGELCGHEYVTATCVGHTHIDVAWLWTVAQTREKVARSFSTVLKLMEEYPEYIFMSSQPQLYKFLKEDHPKIYKKVKEKVKEGVWEAEGAMWLEADCNVTSGESLVRQILHGKRFFKEEFNVDNKVLWLPDVFGYSAALPQILKKSDVDYFMTTKIAWNQFNKIPNDTFMWRGIDGTEVLTHFITTTCPGQDRASHFTTYNGHIQPDAIMGAWRRYQNKNINDDVLISFGWGDGGGGATLEMLENGRRLAKGIPGAPRVKMGTALDYFKRLDEKTKNNSKLPKWVGELYLEYHRGTYTSMARNKRDNRACENLYTSAEKINSLSMLYGKNYPYRSITDSWETVLLNQFHDIIPGSSIKEVYDVTEVEYKELLENGSKLVNEGVDYIASKINLKDRSVVVSNTLGFERSDIATFEVPEDIKNPAVIDNNGEELVCQRIEENKAIFFAKNVPANGHKSFKIVESTKEVTLDTVLTDKEAENKFVKIKFDDKGQIVSFIDKASGREILKDGAIGNELQAFEDKPMCFDNWDIDIYYKEKMWKVDDVRSIEVVEKGPVRSTLRIERKFLESTIVQKIYIYNDLQRVDFDSYADWKEFDVLLKTAFPIEVNANEATYEIQYGNVTRSTHNNTSWDVAKFEVCGHKWADLSEGEFGVSMLNNSKYGHDIKDGNMRLTLIKSSTDPNPDADKEEHYFTYSIYPHLGTWKDAETTQKAYELNVPLYTKVEEAHEGELSDELSLVKVNKNNVMIEVIKKAEDTDHLVVRMYEFHNKRTTATLEFLSDIEEIFECNLMERNLEAIEAHGNKIEFTIKPYEIKTFKFKLK >NZ_LT799839.1|WP_079481079.1|397760_398144_-|hypothetical-protein MKISKGNKYLLTITILFCSFYTLMISPVKEDRLSMGFIVLFIPALTIFILLMENSKLKKVLLSILLVLTALFIIVVVYLIAISGNFYPINGDRFNFSMFLQVCLFTSPILICYILLLRSIFKEIVSI >NZ_LT799839.1|WP_021874746.1|398410_399856_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MRKVKKLLALATCAVLTTSLALTGCGNSSSSGSKGDETVNLTWYTIGQEPKDLQLVEDEINKYLKDKINATIDMKFADFGDYDQKLSVVINSGEAYDLAFTCSWAGNYVGNARKGAFLELDDYLETTGKDMKKEIDQRFWDGAKVEGKTYAVPNQKELGVQPMWVFTKELVDKYNIPYQDIHELEDLEPWLKVIKEKEPEVVPLYIDKNLSPPQYFDFFSEPFGVEYEDEGLTVKNIFDTDKFKSTLKTLRKYYEAGYINTDSSIAQYDKSIKRFVTKADGQPYAEGIWAKDVGYELVASPIMDTHITSASTTGSMIAVSKNSKNPEKAVEFLNLLNTDEHLRNLVNYGIEGTHYDKVADKQIKLLPRSVDYGVAYFSTGNLFKTYVLDTEPTTKWDEFEEFNKNSKVSPALGFKFNPEPVSTQIAGISNAYQEFRALIFSGSVDIDEYIEKLNTKLKEQGMDEVMKEMQKQLDEWKKENK >NZ_LT799839.1|WP_021874747.1|399941_402332_+|chitobiase/beta-hexosaminidase-C-terminal-domain-containing-protein MISIVNIYNFIRKTVYPSGEFVLDDYETVVRQIEILKQYGLPSTYALKYDALMDERYSNLIKSSVDEYDEVGVWWEFDKQLAEKAGVKWKGETPVDDHVDMGYSLGYLPEDRIKMVDVYMEDFKSIFGYYPKSVGSWVIDIVTLNYFKEKYGVVAAAICRDQIGTDGFTLWGGYFNQGYYPSKLNEYMPAQNKENQVDLPIFRLLGPDPIYCFEDGLRKGISDVYTLEPAGRMGGTKEWIEWIFDRLTKEKTLGFSYAQVGQENTFLWNTMMKGYEIQIPYVAKLAKEGKVRVETLEESGKWFKKKYKLTPPTTFVASEDWNKEEDLRTLWYNSRFYRVSLLWDDNELSIRDLHLFNEDYKSRYYNDVLNGNESVFDTLPILDAHRWSDGDFRASIDVVLVDEDGNIEKLKGEEPEFYIEDDSTYKIVWKCSQGKIKIICDEAKITFEAIESFKNNEKLALYINTLPVLKNSDTKVLKCSHNGFNYSLIAENGEFKLKENKVIVLSENNKITFTFSKGEGNKKYDFFNKEYVENKETIDNYIPKYKRIKSTSKVMPRAFAPIITPKVILKEAPYEGEFRIENINKGGEVYYTLDGSEPNKNSSLYKTPIKVKGETIIKAIAYNEGFKESSIIEGRLYTTLPIKDIKGLTKATENKKYNNNGVYDLIDGQKGTTSYREGGWLGYTDDMDVIVDLGEVLDINKITVGFLQDTRAWIYYPRYVDFSVSIDGENFEKLDRVNYKNRVPRQEVGVENISIQNKIKARYIRVFAKNEGVCPPWSIMKGEGPAFMFVDQITCM >NZ_LT799839.1|WP_021874748.1|402466_402943_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MHQEQFIENNNDKILKVITAVKTLILVFAALTYIFESLTLAVLILLVYVIVHFLTLSFFVEYEYELTEDELDLSKIMSKKKRKLIKTINLRNAEFFKDASEFSPQRYSNVKVVKLYTKEYVNKEKQVILINESGDMRAYELSLKDDLKKAIERIKRRG >NZ_LT799839.1|WP_021874749.1|402949_404800_+|family-20-glycosylhydrolase MYLIPSPKKLVNSSGSFNIRRDTEIILNYNCNFNDFEGALILKKEIEDNLGFDIKINKAYIDEKSKNAIKLIKSEVVGNEECYELEINKDSITIIGYGDSGLFYGIQTLRQILRQEGAILSNVKINDEPYFKNRGFYHDVTRGRVPKLETLKKLVDKAALYKINQIQLYIEHTFAFKGMSEVWIDKDPLTAEEILILDKYCKSRHIELIPSLATFGHLYEVLRTKSYSNLCELENMEDDEYSFVDRMAHHTLDVSNAESLKLVENMLKQFIPLFTSDKFNICGDETFDLGKGKSKELGEKLGQGKLYTGFLNKIIDIVKGYNKEVMFWGDVILNHTEVIKDIPQDVICLNWNYGAEATEEGTRKIHEAGREQYVCPGVAGWSHLMNLMDNGFENITRMISYGVKHEAKGVLNTNWGDYGHINILEASIPGMAYGGALSWNPKGEKEFETIYKGLSLLEYGDTSLTVVSILRDLSKTQVVTWSDLVRWKELFDKNSEVREGIKNLNIEDIIEGYNNATEIEIKLTALLNKVKNKEALQEFIVCTRGIILINKFFISLLKAKFKQECIGFDFDNNTLAKELEEWFYDYSYIWKKDSKESELNRIREVIKYTSKELRTF >NZ_LT799839.1|WP_021874750.1|404951_406400_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKFKKLLALAACATLTTTTLLTGCGNSGAKAGNKGDEPVTLTWYTIGQEPKDLQMVEDEANKYLEEKINAKIDMKFIDYGDYNQKLSVIINSGESFDLAFTCSWAGDYLGNSRKGAFLELNDYLDTTGKDMKEAIDQRFWDGATIDGKIYAVPNQKEISTAPMWVFTKEYVDKYNIPYQDIHTIQDLEPWLKVIKENEPGVTPLYITKGFSAPQYFDQLVDPVGVEHNDDSLKIKNMFETDKMKEQLEVLRKYYQAGYINADAATAQDDKSVKRFVTKADGQPYAENLWSKDLKYDVVASTIMDTYITNASTTGSMIGISKNSKNPEKAVEFLNLLNTDEYLRNLINYGVEGTHYEKVGDKQIKLLPKEEDYRVGYYTVGNLFLTYVLDKEPLTKWDEFEDFNNKAKNSPALGFKFDPAAVSTEIAAVNNVLEEFKSTIYSGSMDIDEYLPKLNAKLKEQGVDKIIAEMQKQIDEWAKTNKQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LT799839_2 | 1113676-1115873 | TypeI-B |
II-B
Consensus repeat of NZ_LT799839_2
|
33 spacers
spacers of NZ_LT799839_2
>2.1|1113706|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATAACAACTGGAGAATAAAACCTATAGAAGAAG >2.2|1113771|37|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTGTGTTCCGCCGGGTGCAAAATTCCCTTATATA >2.3|1113838|37|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGGAGTCGTTGTATTTGATGAAATACATGAATATGA >2.4|1113905|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGGAGAAATATATAGAGTTGATAAAAAAATATTT >2.5|1113971|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCTCCTAAAGATGATAAGAATGAATCTTTTAATG >2.6|1114037|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATAAGCTAGGTAGTGACCCTGCTGGAAAATTACA >2.7|1114103|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGAATCTGGTGAGGACAATGTTGATATAACAATT >2.8|1114169|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTGCAATACTATAGATATAGCAAGTGCAAGTTC >2.9|1114235|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATCTGACACTAATAAAATAGAACTAGAGATTTACA >2.10|1114301|34|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTTCTGATGATATAACATTTGCTATAAGTTGTG >2.11|1114365|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTAAAAATTTTCACCCACAAGGAACTTTTATACAA >2.12|1114431|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGAAAAAGAAAAGGAAATTAGAAAGAAAATAAG >2.13|1114496|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTCAGTTTATGTGTGGATTAATCCAAAAGCATT >2.14|1114561|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGACTTTCCTCCCAAGCTTATTATTTTTTAAAACA >2.15|1114627|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTAGCTTTCTGTATTTGCAAATCGCATATAATT >2.16|1114693|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTTGGAGGGATAATTTAAATGGGTATATTAAA >2.17|1114758|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTAACATATCCCAATCCTTGATAACGAGAATAC >2.18|1114824|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGCTTTGAAGAAGTTAAATGATGAAGAGAAGTT >2.19|1114889|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGATTGAATGAGCATAAAAGCTTTTACTGTTTAAC >2.20|1114955|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTACAAGTGCAAGAATAAAGAATAGTGGAAAGGAA >2.21|1115020|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATTATTTCAGCTAAATCTAACATTCCCGTATCA >2.22|1115086|37|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAAGTAGGAGGATAAAGAGAGCTATAAAACATTTAA >2.23|1115153|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAACTTACGAACTAGCTAACAAAATAAGCGGGGT >2.24|1115218|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAAGTTTCGGTTAGCTACGTCCATATTTTCCCTG >2.25|1115284|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGAAAGAGGTGTATTAATATGCCTATTTTTTTAT >2.26|1115350|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGCAAGAAGAATATAGTACATCAAAAAATAATGA >2.27|1115415|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACTTAGGGTTTTCCTCATAACACCCGATATGGTAT >2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCTTTGCTTTTATCTCTATATTTAACTATCTCT >2.29|1115546|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGAAAGGCTAGGAATTCTAATAAAGAGTACGATGA >2.30|1115612|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGTAAATCAAGTGAGACCTTTCCCAACACCGGCT >2.31|1115678|34|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGGAGCTGATGGGAATCAAGGACCAATTGGA >2.32|1115742|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGGAAATGTACAACAGTATAATTGGTAAAATGAA >2.33|1115808|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAGAAAATAATGATGAAATAAAATATTGTTTTTA |
cas2,cas1,cas4,cas5,cas7b,cas8b1,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT799839_2
The CRISPR arrays of NZ_LT799839_2 >merge|NZ_LT799839|2|1113676-1115873|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NZ_LT799839|2|1|1113676-1115873|PILER-CR GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AGATAACAACTGGAGAATAAAACCTATAGAAGAAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAATTGTGTTCCGCCGGGTGCAAAATTCCCTTATATA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CAGGAGTCGTTGTATTTGATGAAATACATGAATATGA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAAGGAGAAATATATAGAGTTGATAAAAAAATATTT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATTCTCCTAAAGATGATAAGAATGAATCTTTTAATG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AGATAAGCTAGGTAGTGACCCTGCTGGAAAATTACA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GCTGAATCTGGTGAGGACAATGTTGATATAACAATT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TTTGTGCAATACTATAGATATAGCAAGTGCAAGTTC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CATCTGACACTAATAAAATAGAACTAGAGATTTACA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CCTTCTGATGATATAACATTTGCTATAAGTTGTG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GTTAAAAATTTTCACCCACAAGGAACTTTTATACAA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AGTGAAAAAGAAAAGGAAATTAGAAAGAAAATAAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAGTCAGTTTATGTGTGGATTAATCCAAAAGCATT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TGGACTTTCCTCCCAAGCTTATTATTTTTTAAAACA 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>NZ_LT799839.1|WP_079481275.1|1113217_1113508_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKKQINYNYVFIFYDIKEERVNKVFKVCKKYLSHFQKSVFRGGITPSKLILLKKDLNKVIEKEEDFICIIKLLNGDVFGEEIIGVQGQTTGESLII >NZ_LT799839.1|WP_021875392.1|1112217_1113216_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTKYITSMGELTRKDNSLCFRKDGKNVYIPVEGTSEIYCLNEISINTKLLDFISRNNITVHFFNYYEGYSGTFYPKNKYNSGKLLINQVKTFERNRIIIARSIVRGIGINIMEVLYHYYKHNKKEVKETIDWIKKDFLKKVDYIENINSLMALEGEVWQRFYSEFKNILPEDFIMNKRVKRPPDNPINAMISFGNSLLYTKTISAIYKTHLDQRISYLHEPSEGRFSLSLDISEVFKPIIVFKTIFELVNNRRIQVSKHFDKSVNYCLLNEDGRNIFIKAFEDRLESVFLHPKLKRKVTYRTAIKLDCYKLIKFIMEDKTFLPFNLKDGM >NZ_LT799839.1|WP_079481815.1|1111719_1112208_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKINGTLINYYFHCKRQCYLHGNRLNFEDNSENVKIGKALHEIKENKNTEIEIDNIKIDKLTKDYLTEIKKSDADPEAAKWQLIFYLNALNDKGIRRKGKLEFIEKNKTKNKIIYVELNSELIKELEKHIRDIKILINSNNVPDILNKSKCKRCAYYEYCYI >NZ_LT799839.1|WP_021875388.1|1108327_1109107_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 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MTGRVLIILRILSDKKIHTLEELSYKSEIPSSTIRRYINSFKDFGVEIESTRGPYGGYILKKFYYM >NZ_LT799839.1|WP_021875383.1|1103203_1104424_+|peptidase-T MKKVEERFLEYIKIDTKSDENTGLTPSTKGQLKLAEILAKELKEIGVDKVEISEHGYVYATVEKNCNKDIPTIGFIAHMDTAPDYCGSNVNPQIVKNYDGGDIKLNSEVTLSPKFSPELKNYIGKTLITTDGNTLLGADDKAGIAEIMTAIEYLLNNKEIKHGDIKIGFTPDEEIGEGADHFDVEGFKADFAYTLDGGAIGELEFENFNAAGVKVEINGVNVHPGYAKNKMINSIMVAHEFINKLPLNEVPEKTEKYEGFSHLTDIKGTIEKTTLDFIIRDFFADGFEDRKEKFKAIEKELNEVYGEGVVKVNIKEQYRNMKEKIEPIMHIVETAKKAMEEAGVAPKVKPIRGGTDGARLSYMGLPTPNLFAGGENFHGKYEYVPVESMEKAVDVILNIIRIYSER >NZ_LT799839.1|WP_079481272.1|1102073_1103096_+|polysaccharide-deacetylase MNNIERKSYNRKYKEKIKKCKTKHSNINKLKKQRKIRKLRNKIIFKLVMISLFTIMLIVIINNIGNYRNEKNNIVTTNFNDKKDTEFKQKEKKEIKKTHPREIMPNSNVTYEGMTYAMDASEVQSMIYGTYPGLKKYVFLTFDDGPSPNTEKVLDILKENNVKATFFVVGNRIEESAKAQETLKRIIKEGNAIANHTYTHNFSKLYPQNSINIDYFMEEVNKTNELIKKILGENFNTKVLRMPGGYISRKYYKDASLKAFDDRLNLEGIFSIDWNTLNGDAEGKDYTVEEMVNKVKEGSKDVNQSIVLMHDAYGKEKTVEALPEIINYFKSQGYQFRTIK >NZ_LT799839.1|WP_172000993.1|1115993_1117220_+|IS256-family-transposase MDTNFDYNEEIKRCKTIDDVMGKNGLIQRLVKDVLENILEGEMEEHLGRNKYERVEAVDQTKKNYRNGYSRKNLRSSFGDVDLDVPRDRNAEFEPQIIKKYETVCTELDKKIISLYAKGMSTSDIQAEIEDLYGITISPSMVSKITDKVLASAAEWQNRVLDKIYPIVYLDAMYFKVRSNGKIVNKAVYICLGYTMEGYKDILGIWVDEAEGAKFWLGICNDLKNRGVKEILIACMDGLKGIPQAIKTVFPSVNIQTCIVHQIRNSIKYIASKDKKAFMKDLKEVYKATTEELALAQLDNLKEIWGDKYGIVIDSWYNNWSNLSTFFDFSPTIRKMIYTTNILEGFNRQIRKFTKVRVIFPTDESLNKCVYLATMEILEKWTQPIHNWGATLAELSIIFEDQLKDELA >NZ_LT799839.1|WP_161493089.1|1118336_1118498_+|hypothetical-protein MYLATVIDLFDRRITGWAMDSTMTRRLVIDAFNTAVLKDVVMIMLVQNYSSYL >NZ_LT799839.1|WP_079481817.1|1118443_1118671_+|IS3-family-transposase MKGCCYDNACAELFFLSLKKHFLYGRKFKTRAESKQAIVEYIELFYNAKRLHSTLGYKSPREYRKNYYNNLNKAA >NZ_LT799839.1|WP_079481277.1|1118872_1119112_+|hypothetical-protein MTGDLITANIKIKSTEYPCFSVSENSDNTDLEGNALINPSETREIHYVAEVPKTDATGQIEVTLTINGKNYSNKFLLDC >NZ_LT799839.1|WP_079481278.1|1119414_1119951_+|DUF4825-domain-containing-protein MRISNFKRLVILAVFMVLLGMVGCGKYIEQKEAINESKVNLTKVLKYKGSYVGDNSAIVNIINNLPANIYKEGVELQTTSKPYEITIQYKYFEDLDIRFEDGSFISSSLSQIMKNNALILLSLVKNVDIVNFNIDDGTIITYEGTDLINDNKDAFGNDLKEITKDKSSLENFIKTNKN >NZ_LT799839.1|WP_021875397.1|1120124_1120772_+|hypothetical-protein MYLIKNIKQIFDYKIKEFLALSGGLTLIFLLTRLDNPEFIDGYMIAILITISMIGRYNFVSEHIVKEDYIYLKKYKATLKYIISKNIVTLLLVISLVFIVFLLEFIITRATLSYEFYFESLILSILTIAFNNISFMFNNKTEKSTSDKFDEWTSIVLGFKSLINSLPSILIVFIILYFNKYLYNINLYDALIVEIMSIILLNFKLKNQFKVNLKN >NZ_LT799839.1|WP_079481819.1|1120836_1122588_+|DUF4091-domain-containing-protein MVKDVYLGASIGSTDFHYLQKNYNEIKLLNKTTWHDTAWIGDELNSKIVTWTKNSPVSNVTIASSDFVNKNGDIINSNNVEISWLKETLANIGRGNSSAPVELFPDIIHKSGSLNIEANKVSSAWVNISIPRDINTGIYNGTITVNAEGLEAPYVFDYSFEVLNLIQPLPKETNTQIEIWQHPYAVARYYDIPKEELFTERHFNYLRESLEEYRDMGGKGVIAHIVEEAWNHQSYDSDPSMVKWTKKSNGNFKFDYTDFDRWIQFNIDLGVINPKDGVGQIKCYSIVPWNNRIEYYNEVTGSKESISPTPGTSEWRIPWTEFLRDFMKHLEEKGWFKITYISMDERNMNDLRASVELIESIKNTNGESFKISSAMNYQSGSDYSFLDRIDDISIGLSHINHDLEDMRNMAKHRQERGLLTTIYTCTGDYPSSFTISDSSESAWTMWYSLSQNTDGFMRWSWDGWVENPLENVSYKYWEPGDPWFIYPAEKNSDSKTFYSTPRYERLKEGIRDINKAKYLMENSLELKRQVETLVQSLRRPNKGNNSYGSAVAATEMDRELTNNEVKRIRDGVNKLAKQYIKSK >NZ_LT799839.1|WP_079481279.1|1122801_1123677_+|hypothetical-protein MNNNLSRVRELKEIKKEPKTNLQILLAIILGVIVVFTTLKVIQKVVYPPEKIVEDFRAAMVNEDVEGVKNVIKVYDKRVEVNDENVKVLINYFKENKDELTSICNSLNNKNLRNKRENPIYLDKETGFSRLLGKHKVIINPIFIKVSSKINNTEIFINDKKQCTINKDETQEFGPLMPGKYDISAKYSTDYIETQDKVTIDRIKKFNDRSNYTMFKDIKKVILYTHLETAEIIVNGKDTGKTVKEINKILSPVNKDTKVQLKMMVDGKEVITDEEVVGDNDYIYFGELKNS >NZ_LT799839.1|WP_021875400.1|1123734_1124865_-|hypothetical-protein MFIKSYNSQTKELTLSIYNNDVALINEVRDISKAKLNSTIEYSDISKLIYENSVIIQGAEVSQINFNYKCYNDNNSKNKETICSKCLNTFIDAITIEAKSINSTDIRLYYLSGGIKWTSSYTLILKSQKLDLEAWINISNKSGISYNHANLKCIAGDVNISSSTSTPYSKTSYVASSSSENTSLENLEDYYIYNLKGLYNLENNSTKRIKSFLAEDISYSTLYDFGYYNNSADILIEFENTQSNNLGTPMPSGVINVYTTSGKTLAFLGSDSIKNTSIDENLSLNIGKAFDITCERKIIDYQKYDTYEFKEIELIISNAKNEEVPIKICYPIFAPWESTSSTENYSKDNNGNPCFMVNVSANDKKSIFFTYKVKIS >NZ_LT799839.1|WP_079481280.1|1125020_1125809_+|endonuclease/exonuclease/phosphatase-family-protein MKNNFMTFNLKYDFTDDKENRWEDRAKRIVTVIKENNPICFGTQEGLIHMLKDINELLEEYSWFGEGREGNEEGEFNAIFYKREALELIENGQFWLSETPNIKGSISWKSGCKRICTWGVFKEKQYGNIFRIYNTHLDNASDLAREEGIKVILDFAKEKYDKDKLPFIITGDFNSYMEENLFKIIRSYNNENFNIKNSYNEVSHNIKGTFHDFKGGYSGGIIDYILFSKEISCNKINIDDRLINGGYPSDHYAVTANLNIEN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_LT799839_3 | 1117437-1118127 | TypeI-B |
II-B
Consensus repeat of NZ_LT799839_3
|
10 spacers
spacers of NZ_LT799839_3
>3.1|1117467|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTGAAACTAGTATCACTGATTCTTTTTTTTCTT >3.2|1117533|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGGATTTCTTGTTCCGTATTTTTTAGATAAATTA >3.3|1117599|37|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGCACTTGGTAAAATATACCTTTTGCTTAAACTCTGC >3.4|1117666|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAATACCACTCTTCTATTAATCTTTGGCTTGTA >3.5|1117731|37|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTGCTTAGGATAGTCTTGTGTTTCTTCAAAGCTAG >3.6|1117798|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGATGGAATGGTTAATTGATTATAAGAGATTGAA >3.7|1117864|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTATCCATCTGCCCATACCAGTTATACCATTCCA >3.8|1117929|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATATTTAACTTTCAAAAGCAACTGATTGCAATTC >3.9|1117995|37|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGTAGGCAATATATTTGTTGGAACTTATACTAAAG >3.10|1118062|36|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTTATAGTTTTGACTATGATGATGAGTATATATA |
cas2,cas1,cas4,cas5,cas7b,cas8b1,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT799839_3
The CRISPR arrays of NZ_LT799839_3 >merge|NZ_LT799839|3|1117437-1118127|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTAATTGAAACTAGTATCACTGATTCTTTTTTTTCTTGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAAAGGATTTCTTGTTCCGTATTTTTTAGATAAATTAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGGCACTTGGTAAAATATACCTTTTGCTTAAACTCTGCGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTAAAATACCACTCTTCTATTAATCTTTGGCTTGTAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATATCTGCTTAGGATAGTCTTGTGTTTCTTCAAAGCTAGGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATATTGATGGAATGGTTAATTGATTATAAGAGATTGAAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATCTTATCCATCTGCCCATACCAGTTATACCATTCCAGATTAACATTAACATGAGATGTAGTTAAATACATATTTAACTTTCAAAAGCAACTGATTGCAATTCGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATATGGTAGGCAATATATTTGTTGGAACTTATACTAAAGGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGATTTATAGTTTTGACTATGATGATGAGTATATATAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT >NZ_LT799839|3|2|1117437-1118127|PILER-CR GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAATTGAAACTAGTATCACTGATTCTTTTTTTTCTT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAAGGATTTCTTGTTCCGTATTTTTTAGATAAATTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GGCACTTGGTAAAATATACCTTTTGCTTAAACTCTGC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAAAATACCACTCTTCTATTAATCTTTGGCTTGTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATCTGCTTAGGATAGTCTTGTGTTTCTTCAAAGCTAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATTGATGGAATGGTTAATTGATTATAAGAGATTGAA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CTTATCCATCTGCCCATACCAGTTATACCATTCCA GATTAACATTAACATGAGATGTAGTTAAAT ACATATTTAACTTTCAAAAGCAACTGATTGCAATTC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATGGTAGGCAATATATTTGTTGGAACTTATACTAAAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GATTTATAGTTTTGACTATGATGATGAGTATATATA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT >NZ_LT799839|3|3|1117437-1118127|CRISPRCasFinder GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAATTGAAACTAGTATCACTGATTCTTTTTTTTCTT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAAGGATTTCTTGTTCCGTATTTTTTAGATAAATTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GGCACTTGGTAAAATATACCTTTTGCTTAAACTCTGC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAAAATACCACTCTTCTATTAATCTTTGGCTTGTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATCTGCTTAGGATAGTCTTGTGTTTCTTCAAAGCTAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATTGATGGAATGGTTAATTGATTATAAGAGATTGAA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CTTATCCATCTGCCCATACCAGTTATACCATTCCA GATTAACATTAACATGAGATGTAGTTAAAT ACATATTTAACTTTCAAAAGCAACTGATTGCAATTC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATGGTAGGCAATATATTTGTTGGAACTTATACTAAAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GATTTATAGTTTTGACTATGATGATGAGTATATATA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT >NZ_LT799839|3|2|1117437-1118127|CRT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAATTGAAACTAGTATCACTGATTCTTTTTTTTCTT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAAGGATTTCTTGTTCCGTATTTTTTAGATAAATTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GGCACTTGGTAAAATATACCTTTTGCTTAAACTCTGC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAAAATACCACTCTTCTATTAATCTTTGGCTTGTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATCTGCTTAGGATAGTCTTGTGTTTCTTCAAAGCTAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATTGATGGAATGGTTAATTGATTATAAGAGATTGAA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CTTATCCATCTGCCCATACCAGTTATACCATTCCA GATTAACATTAACATGAGATGTAGTTAAAT ACATATTTAACTTTCAAAAGCAACTGATTGCAATTC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATGGTAGGCAATATATTTGTTGGAACTTATACTAAAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GATTTATAGTTTTGACTATGATGATGAGTATATATA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
>NZ_LT799839.1|WP_172000993.1|1115993_1117220_+|IS256-family-transposase MDTNFDYNEEIKRCKTIDDVMGKNGLIQRLVKDVLENILEGEMEEHLGRNKYERVEAVDQTKKNYRNGYSRKNLRSSFGDVDLDVPRDRNAEFEPQIIKKYETVCTELDKKIISLYAKGMSTSDIQAEIEDLYGITISPSMVSKITDKVLASAAEWQNRVLDKIYPIVYLDAMYFKVRSNGKIVNKAVYICLGYTMEGYKDILGIWVDEAEGAKFWLGICNDLKNRGVKEILIACMDGLKGIPQAIKTVFPSVNIQTCIVHQIRNSIKYIASKDKKAFMKDLKEVYKATTEELALAQLDNLKEIWGDKYGIVIDSWYNNWSNLSTFFDFSPTIRKMIYTTNILEGFNRQIRKFTKVRVIFPTDESLNKCVYLATMEILEKWTQPIHNWGATLAELSIIFEDQLKDELA >NZ_LT799839.1|WP_079481275.1|1113217_1113508_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKKQINYNYVFIFYDIKEERVNKVFKVCKKYLSHFQKSVFRGGITPSKLILLKKDLNKVIEKEEDFICIIKLLNGDVFGEEIIGVQGQTTGESLII >NZ_LT799839.1|WP_021875392.1|1112217_1113216_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTKYITSMGELTRKDNSLCFRKDGKNVYIPVEGTSEIYCLNEISINTKLLDFISRNNITVHFFNYYEGYSGTFYPKNKYNSGKLLINQVKTFERNRIIIARSIVRGIGINIMEVLYHYYKHNKKEVKETIDWIKKDFLKKVDYIENINSLMALEGEVWQRFYSEFKNILPEDFIMNKRVKRPPDNPINAMISFGNSLLYTKTISAIYKTHLDQRISYLHEPSEGRFSLSLDISEVFKPIIVFKTIFELVNNRRIQVSKHFDKSVNYCLLNEDGRNIFIKAFEDRLESVFLHPKLKRKVTYRTAIKLDCYKLIKFIMEDKTFLPFNLKDGM >NZ_LT799839.1|WP_079481815.1|1111719_1112208_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKINGTLINYYFHCKRQCYLHGNRLNFEDNSENVKIGKALHEIKENKNTEIEIDNIKIDKLTKDYLTEIKKSDADPEAAKWQLIFYLNALNDKGIRRKGKLEFIEKNKTKNKIIYVELNSELIKELEKHIRDIKILINSNNVPDILNKSKCKRCAYYEYCYI >NZ_LT799839.1|WP_021875388.1|1108327_1109107_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MEAIKFTLRGRTAFFKKPEVNSYLYFTYGHIHKVALVGIFGAILGYKGYNQMKKDDQYPEFYQKLKDIKISIVPNNKNGIIDKKINIFNNSVGYASQEKGGNLIIKEQWLENPSWEIYLLLNDDESQKIANALMDRTYIYLPYLGKNDHLAEITNIKRINNIKTIDRFIKIDSFFKKNEFKYKELDLDDLDDLDDLDDLDDDNVTDEELIFKYEEMLPVGLDLQTNRYKLEGLVYTNKPIEKRLNCEVYEIEGKILTFI >NZ_LT799839.1|WP_021875387.1|1107377_1108325_+|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MNKRVYGLIGISSKMANWNADFSGYPKTTSKGEIFGSDKALKYPMKKLWDNSGEKVLYIKSMKLSKTKDSVVLVPRSLKERYEYIFGIEDLKKEKNTETVLKNLFDAVDVKNFGATFAEEGNNISITGAVQIGQGFNLYDETVADEQQILSPFRDASIKPGKEDKEEAKNSTLGTKIVTDEAHYCYPFTINPLSYKDYIDLGVTEGYTEKDYIKFKEVALNSATAFATNSKVGCENEFCIFIETEQTLYLPNLDNYISFEKSEDQNIIRFKATNILNEVKEKISNIEIYYNPYTTIVEADIEGAKYYNIITKKEV >NZ_LT799839.1|WP_021875386.1|1105641_1107375_+|hypothetical-protein MLSEIIDSFKRVFKDNLDEAILGSYVPTDGTYIFLKEDEHNNLKVIQKEEIKLNKKTKDVDRTINNFSLLAKADYYSKLTDMNKPIDSKKIIHSNNYLSFFVKKESLKNGKLTNEIIENYYNVLLNPISKYEKKSKAKELYIEIERELGEVNKDRIFKIKEWIKENIYKVEEDIEKKDYLKIFFIYDEDDFIKESKRYLIPNIYNNNDFNIKVDNEILGLPNDNMGLNSKKPYLENKTRKVKIPHLITQEEALFQKKVFDYLLNQSAQGFYNIYIGDEVIPLKDNETLNRDFNGYYIRLKKGKEAEIHNFDVISKYNPMLINPFEFINVLGINYETLYLNKKINWEYGFIDTRKEMQELINSIIFNNYLKTNYFSEDISIKENVLKRSILLSRAKLFDWFYKGNDYNIWPLLNKVSRDLMKSSIESGYSIKAMNQFNLRYSLKLYFEGGEEKMADILSKVKNDLREKIEVRDSSISNDNEYFFAIGQLANFFITRSKGKNKPLSLANPIINAKKDNIIKEKLKSLYKKYNYDINSSFIKFKNMYYMVLAYQVEGKINEDLIIAGYLSSSLLFEKKED >NZ_LT799839.1|WP_079481274.1|1104933_1105626_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MNNFEITVKVYLTKDILQEDCQQEISAILDRVLAENCDYLNFHKENYFKNYCFNSLYPLERDKVYKEDNIYSFQIRTNNIELAEYLSINLKNAFSNSIKILKVDIRKIPIKHIDKIFSITPLVIKTDNGYWKGLISLEDFERRIKENLIKKYNQITGEKIDEKFPLFVALELKNKKPIAIKFKGKTLLGDKISLKIADDELSQKIANLAIGSGLGEINARGYGYVNYRWL >NZ_LT799839.1|WP_021875384.1|1104688_1104889_+|HTH-domain-containing-protein MTGRVLIILRILSDKKIHTLEELSYKSEIPSSTIRRYINSFKDFGVEIESTRGPYGGYILKKFYYM >NZ_LT799839.1|WP_021875383.1|1103203_1104424_+|peptidase-T MKKVEERFLEYIKIDTKSDENTGLTPSTKGQLKLAEILAKELKEIGVDKVEISEHGYVYATVEKNCNKDIPTIGFIAHMDTAPDYCGSNVNPQIVKNYDGGDIKLNSEVTLSPKFSPELKNYIGKTLITTDGNTLLGADDKAGIAEIMTAIEYLLNNKEIKHGDIKIGFTPDEEIGEGADHFDVEGFKADFAYTLDGGAIGELEFENFNAAGVKVEINGVNVHPGYAKNKMINSIMVAHEFINKLPLNEVPEKTEKYEGFSHLTDIKGTIEKTTLDFIIRDFFADGFEDRKEKFKAIEKELNEVYGEGVVKVNIKEQYRNMKEKIEPIMHIVETAKKAMEEAGVAPKVKPIRGGTDGARLSYMGLPTPNLFAGGENFHGKYEYVPVESMEKAVDVILNIIRIYSER >NZ_LT799839.1|WP_161493089.1|1118336_1118498_+|hypothetical-protein MYLATVIDLFDRRITGWAMDSTMTRRLVIDAFNTAVLKDVVMIMLVQNYSSYL >NZ_LT799839.1|WP_079481817.1|1118443_1118671_+|IS3-family-transposase MKGCCYDNACAELFFLSLKKHFLYGRKFKTRAESKQAIVEYIELFYNAKRLHSTLGYKSPREYRKNYYNNLNKAA >NZ_LT799839.1|WP_079481277.1|1118872_1119112_+|hypothetical-protein MTGDLITANIKIKSTEYPCFSVSENSDNTDLEGNALINPSETREIHYVAEVPKTDATGQIEVTLTINGKNYSNKFLLDC >NZ_LT799839.1|WP_079481278.1|1119414_1119951_+|DUF4825-domain-containing-protein MRISNFKRLVILAVFMVLLGMVGCGKYIEQKEAINESKVNLTKVLKYKGSYVGDNSAIVNIINNLPANIYKEGVELQTTSKPYEITIQYKYFEDLDIRFEDGSFISSSLSQIMKNNALILLSLVKNVDIVNFNIDDGTIITYEGTDLINDNKDAFGNDLKEITKDKSSLENFIKTNKN >NZ_LT799839.1|WP_021875397.1|1120124_1120772_+|hypothetical-protein MYLIKNIKQIFDYKIKEFLALSGGLTLIFLLTRLDNPEFIDGYMIAILITISMIGRYNFVSEHIVKEDYIYLKKYKATLKYIISKNIVTLLLVISLVFIVFLLEFIITRATLSYEFYFESLILSILTIAFNNISFMFNNKTEKSTSDKFDEWTSIVLGFKSLINSLPSILIVFIILYFNKYLYNINLYDALIVEIMSIILLNFKLKNQFKVNLKN >NZ_LT799839.1|WP_079481819.1|1120836_1122588_+|DUF4091-domain-containing-protein MVKDVYLGASIGSTDFHYLQKNYNEIKLLNKTTWHDTAWIGDELNSKIVTWTKNSPVSNVTIASSDFVNKNGDIINSNNVEISWLKETLANIGRGNSSAPVELFPDIIHKSGSLNIEANKVSSAWVNISIPRDINTGIYNGTITVNAEGLEAPYVFDYSFEVLNLIQPLPKETNTQIEIWQHPYAVARYYDIPKEELFTERHFNYLRESLEEYRDMGGKGVIAHIVEEAWNHQSYDSDPSMVKWTKKSNGNFKFDYTDFDRWIQFNIDLGVINPKDGVGQIKCYSIVPWNNRIEYYNEVTGSKESISPTPGTSEWRIPWTEFLRDFMKHLEEKGWFKITYISMDERNMNDLRASVELIESIKNTNGESFKISSAMNYQSGSDYSFLDRIDDISIGLSHINHDLEDMRNMAKHRQERGLLTTIYTCTGDYPSSFTISDSSESAWTMWYSLSQNTDGFMRWSWDGWVENPLENVSYKYWEPGDPWFIYPAEKNSDSKTFYSTPRYERLKEGIRDINKAKYLMENSLELKRQVETLVQSLRRPNKGNNSYGSAVAATEMDRELTNNEVKRIRDGVNKLAKQYIKSK >NZ_LT799839.1|WP_079481279.1|1122801_1123677_+|hypothetical-protein MNNNLSRVRELKEIKKEPKTNLQILLAIILGVIVVFTTLKVIQKVVYPPEKIVEDFRAAMVNEDVEGVKNVIKVYDKRVEVNDENVKVLINYFKENKDELTSICNSLNNKNLRNKRENPIYLDKETGFSRLLGKHKVIINPIFIKVSSKINNTEIFINDKKQCTINKDETQEFGPLMPGKYDISAKYSTDYIETQDKVTIDRIKKFNDRSNYTMFKDIKKVILYTHLETAEIIVNGKDTGKTVKEINKILSPVNKDTKVQLKMMVDGKEVITDEEVVGDNDYIYFGELKNS >NZ_LT799839.1|WP_021875400.1|1123734_1124865_-|hypothetical-protein MFIKSYNSQTKELTLSIYNNDVALINEVRDISKAKLNSTIEYSDISKLIYENSVIIQGAEVSQINFNYKCYNDNNSKNKETICSKCLNTFIDAITIEAKSINSTDIRLYYLSGGIKWTSSYTLILKSQKLDLEAWINISNKSGISYNHANLKCIAGDVNISSSTSTPYSKTSYVASSSSENTSLENLEDYYIYNLKGLYNLENNSTKRIKSFLAEDISYSTLYDFGYYNNSADILIEFENTQSNNLGTPMPSGVINVYTTSGKTLAFLGSDSIKNTSIDENLSLNIGKAFDITCERKIIDYQKYDTYEFKEIELIISNAKNEEVPIKICYPIFAPWESTSSTENYSKDNNGNPCFMVNVSANDKKSIFFTYKVKIS >NZ_LT799839.1|WP_079481280.1|1125020_1125809_+|endonuclease/exonuclease/phosphatase-family-protein MKNNFMTFNLKYDFTDDKENRWEDRAKRIVTVIKENNPICFGTQEGLIHMLKDINELLEEYSWFGEGREGNEEGEFNAIFYKREALELIENGQFWLSETPNIKGSISWKSGCKRICTWGVFKEKQYGNIFRIYNTHLDNASDLAREEGIKVILDFAKEKYDKDKLPFIITGDFNSYMEENLFKIIRSYNNENFNIKNSYNEVSHNIKGTFHDFKGGYSGGIIDYILFSKEISCNKINIDDRLINGGYPSDHYAVTANLNIEN >NZ_LT799839.1|WP_021875402.1|1125863_1126202_+|hypothetical-protein MGSDKKNLEGIIFIGISTIAWCIAGNISYFFIRNGIYNSLVHLVDIESSIIMVSLPLIAMAIGTFANYKIEVTEEKLYEINKKMLSFKLLNIIFIGYIAFTLFAVRNGKIIL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LT799839_4 | 2416377-2416471 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT799839_4
|
1 spacers
spacers of NZ_LT799839_4
>4.1|2416400|49|NZ_LT799839|CRISPRCasFinder ACTTTCAATTAAGTTTGAATTTAAAGATAATGTCTTTAAATTAACTAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT799839_4
The CRISPR arrays of NZ_LT799839_4 >merge|NZ_LT799839|4|2416377-2416471|CRISPRCasFinder TTATCAAATATTCCTTCTGGTAAACTTTCAATTAAGTTTGAATTTAAAGATAATGTCTTTAAATTAACTAAATTATCAAATATTCCTTCTGGTAA >NZ_LT799839|4|4|2416377-2416471|CRISPRCasFinder TTATCAAATATTCCTTCTGGTAA ACTTTCAATTAAGTTTGAATTTAAAGATAATGTCTTTAAATTAACTAAA TTATCAAATATTCCTTCTGGTAA
>NZ_LT799839.1|WP_021876577.1|2413784_2414414_-|NEAT-domain-containing-protein MRHFRIIFSIFLIGILVSVFSTTNTKAVENNAIESGIYELENDVYHSSEIGRSMARTYLNNIMTLEARGGELFCTIGFSSSDYMENYKMIVDEQEVANEIVDKNEENKTVKIKFKINSLDSKINANMYVIPMGRDVSFDIIPKKDTLKLIEKIEEPKVESSDSKEKDVEEKDKEESMGKTSTITVGAIIIGLAAMVIIGSKVKNKYKQV >NZ_LT799839.1|WP_021876576.1|2412795_2413671_-|heme-ABC-transporter-substrate-binding-protein-IsdE MKRLLSAIIVGLVMTSFTGCYGPKEGNEESKSKQEGDVVVATSVAVTEILDKLGVSLAGVPTTAYTLPESTKDAVKVGNPMNPDLEKIKSLNPTVVVSVDTLGDDFKNTFIENNIPSEFVTLTSLKGLKEAIKTLGDKFNKETEADNLLNDISAKEGEIVKKNDGKEKENILIIFGAPGSIMIGTSKCYVGNLVDVVGGKNIVENNSTSFVQLNIEEVLKSNPDKVLVMTHGNPEESKAMVAKELKNNPMWQKLSAVKEDKVYYLDSKKFGMSANLKVTEALDELASILNN >NZ_LT799839.1|WP_079481627.1|2411787_2412777_-|iron-ABC-transporter-permease MKNNNIRKKYIYIGISIIALILLSLTSMKIGSIDITLRELLIGIFTNNGSETWEIIRDLRMPRVISAILVGASLAVSGVLLQAVIRNPLAEPSITGISSGASLFSILIMVFLPSLNPYRYLFGFLGGILACIIVYSLAFKNTLSPIRIVLSGIAVNAMLGGFISIMTIFNGNNASSVQMWLTGSLVAVTWKDVIPLLIYTTIGLVCALILCKTCNVIVLGDKTSKGLGFNADKTRIIISLVAVFLAGISTSIAGIISFVGLVVPHICRIIIGSDHKYLIPFSCTLGAILLLIADTLGRIVAKPYEIPVGIVMAILGAPFFLYLLRKSNV >NZ_LT799839.1|WP_021876574.1|2410977_2411754_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLAGEKLSFSYDDKEFINNLDIKVEKGKITTIIGPNGSGKSTLLSMLCSVNKIKKGSIYIDGKNIVNYKSKSLARIIATVYQQNNVPEDIIVEDLVGYGRIPHKGYFEKNNEDDNKIIEWAIKSTNVEHLKNKPISHLSGGERQRVFIALALAQKPKILFLDEPNTYLDIFNQIELLELVKKLNEENNITVVMVLHDINQAVKYSDNLVIMKNGKIIKVGKSDDVINAEIIESVYNVKGIVAEVESKEKYFIPLSVVH >NZ_LT799839.1|WP_021876573.1|2409530_2410874_+|Zn-dependent-exopeptidase-M28 MKKKVSYYLLLFIITIAFGFSIFFNITYSSFNSDNVKKNIASFSSQTYSGRLPGSDENNLVAEIIRKDFQDNKLVPLNDDYKESFNTICPVKTNTMPYMQISANGITLEELKYGVDFKDDMLNFKNNTISFSKADNVNIYKKSIDVITPNGKCLFYVNTKDGFSFRSSFCSEFPYDMVICITTDTYNKILDSVRKGLEVSVHVPFKNEEKTISNIVGVIEGSSGKLPPLVLTAHYDHLGKDGLENIYSGALDNASGTSFLLELQRSLSTYGKPKRDIIFVALNAEEFGLLGSKEFAEKNLDKLNGAEVINFDMIGSEGYPITLMQGLSFKDKDSKLLKSIEKIAKKKGVQTEVAYEDASDHASFNNAGIDSVSLCHSDTSKIHTPKDTVEFISTDAIDTAYQVVETKILDSSYGFLTKFFYDKVSIIFSSVLLILLIAYGIRKKKTA >NZ_LT799839.1|WP_021876572.1|2409103_2409445_+|hypothetical-protein MNKLASILNKTINILLIFFVVFLVLNEYYVVEFSATLRNVIAFLTMILILISAMKELLTNKSGLSRFINGVILFTSIVGGVFAIISKQLNLFLYTCILFSVVYGFVDLVYKKA >NZ_LT799839.1|WP_021876571.1|2406737_2408909_-|RNA-binding-transcriptional-accessory-protein MVKIEDRLAEELGIKLSQVNNVIGLLDEGNTVPFISRYRKEQTGGLTDELLRKFQERLTYLRNLEERKSDVSRLIEEQGKLTEEITNSLKKAMTLTEVEDIYRPYKQKKRTRATIALEKGLKPLSELIINGEFKGNLLEEASKFVNEEKGVKTNEEALSGALDIVAEMISDEAKYRKWIRELVLREGKIESKGGSDDTTQYEMYYEYSEDVNKIPPHRILAINRGEKEKILSVKIIVNEEKILNYLEREVLKGNKVTDDYLKLAVKDSLKRLIYPSIEREVRAELTNIGEEGAIKIFKENLKALLMQPPIKGKVVMGYDPGFRTGCKVAVLDSTGKFLEKATVFPTVPKRDIEGTKRILKDLVKKYNVDVISLGNGTASRESEEVISEMLSEIKNEMGKELAYVIVSEAGASVYSASELATKEYPDLDVTIRGAISIGRRLQDPMAELVKIDPKAIGVGQYQHDVTQKRLEESLAGVVEDSVNKVGVDLNTATPSLLNHIAGINTTIANNIVLYRDEVGGFKTRKELLKVKRLGQKAYEQCAGFLRVMESKEALDNTSVHPESYDIAKKLIGLLGYTKDDLQNKNLNDIEKRVNEKGLSNLVKELEVGEPTLRDIIKELQKPGRDPREEMPKPILKTGVIELKDLTPGMVLMGTVRNVSDFGAFVDIGVHQDGLVHKSQMANRFVKHPLDIVKVGDVIKVRIMEVDEKRNRISLSMKDIKEEE >NZ_LT799839.1|WP_079481626.1|2405800_2406397_-|ECF-transporter-S-component MNNQNKNLNKFVKISLLGAIAVVLMYLDFPVIPLFPWLKIDLSDVPALMGAFAFGPVAGIVIELIKNLLILIVKGTGTVFVGEIANFIVGISLVVPASWFYHRNKSKKTALIGMALGFIGIEIMGIIANVYFLLPAYGMHMESAQLLEYVTVGLLPFNGIKAVLVCGITYMLYKKVSMAIFKVDSHFEPNKDKNLTTV >NZ_LT799839.1|WP_079481625.1|2405291_2405741_+|ribosomal-protein-S18-alanine-N-acetyltransferase MKIAYNLMTSNDIDGVYEISNLCFSVPWSIESIKSELNNPLAKYIVAKEIASNRIIGFVGVWIIAGEGDITNIGVHPNYRKNHIATNLLQCLFKLCEDLNCNTINLEVRESNIPAQNLYTNFEFKNIGLRKGYYEDNKENAVLMQYNKF >NZ_LT799839.1|WP_079481624.1|2404591_2405308_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-dimerization-subunit-type-1-TsaB MIVLSIDSSSKVATAAIVKDDSLIGEYTLNNKREHSILIMDMVEMLLKDNNLDIDDIDAFVVSKGPGSFTGLRIGMATVKGLSFGSNKPYISVSSLDALAYSLICFDGIICPIMDALRDSVYTCLYKNEDGNLKAITDYDALDLSDLVALLKEKNEKVIFTGDGLEKHKEFLKDNLPNAFFAPNHLSIIRASSLGELGLKMLLEGKSDDINSSPFYLKKPQAERELEKRLALKNENSL >NZ_LT799839.1|WP_096145305.1|2418150_2419249_-|peptide-chain-release-factor-2 MLIKLENELAKLSNIKNNIEEMGASLDKEALEKRVQELEMQMQEKGFWDNVKRAEEVTKETKQIKGKIERYELLKSRIEDVEVLSELMEEDDLESAEEIIAEIKSIEKTLDEYKVEILLSGEYDRNDAILTLHAGVGGSDANDWTDMLLRMYTRWCEKKGFKVEVIDLLQGDEAGIKSVTLKVKGEFAYGYLKAEKGVHRLVRISPFNANGKRQTSFASLEVLPELTEDQDIDIKSEDLKIDTYRASGAGGQHVNKTESAIRITHIPTGIVVQCQNERSQFSNKDTAMAMLKSKLIELKERAHKEKIEDLTGELKDMGWGSQIRSYVFHPYNMVKDHRTNEETSNLNAVMNGEIDNFIKAYLNNF >NZ_LT799839.1|WP_021876580.1|2419307_2421827_-|preprotein-translocase-subunit-SecA MGFLEKLFGSYSDREVKRLEKTANQIEALDADMQKLSDEELKSKTDEFKKRIQDGESLESILPEAFAVCREASWRVLGMKHYKVQLIGGMVLHQGRIAEMRTGEGKTLVATLPLYLNALTGKGVHLITVNDYLAKRDQEWMGQLYSFLGLTSGCIVHGLTAEQRREAYGSDITYGTNNEFGFDYLRDNMVIYKEERVQRGLNFAVVDEVDSILIDEARTPLIISGAGEKSTKFYNVADNFVKQLLAERDYTIDEKANAVMLTEEGVEKAERAFGIENYADAANLELQHYITQALKANYSMKRDKDYMVKDDQVVIVDEFTGRLMEGRRYSDGLHQAIEAKEGVKIERESKTLATITFQNYFRMYDKLSGMTGTALTEENEFREIYALDVIVVPTHRPIARIDNPDLIYKNTNGKYNAIIEDIIKSYEKKQPVLVGTVSIEKSEIISALLKRRGIKHQVLNAKYHEQEAEIISHAGELGMVTIATNMAGRGTDIKLGEGVLEVGGLKIIGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDKGESTFYISLEDDLMRIFGSERIQGLMEKLGLEDDEAIDHKMVSKALENAQKKVEGNNFDIRKNLIGYDDVMNMQREVIYKQRAEVLEGKNLKDQIQNMISEIVTSAVNSHLTGEEDDYETEINKLLKYLEDICLPHGVIALSDVVDLSNEEIINKINAILREIYTGKELEFGEEHFREIERVVLLRVVDQKWMAHIDNMDHLKQGIGLRAYKQVDPIQAYQMEGSAMFEEMIEGIKLDTVRFLFHIQVERPVERERVAQETSASHASTGDSAEVKKEPVRNEDKVGRNEVCPCGSGKKYKNCCGREA >NZ_LT799839.1|WP_021876581.1|2421965_2422490_-|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MKVTVVTRNTKLTPALKEMVERKISKMDRYFEPHVSAKATLTVQKNRHIVEVTIPFNGIILRAEEATDDMYKSIDLVEEKLERQIRKQRTKLARRNNESLRFSHIDEVAMEEDDGKVVKTKKFGLKPMSSEEAVLQMELLGHSFFVYQDADKNKLCVMYKRKDGDYGLLEPEYI >NZ_LT799839.1|WP_079481629.1|2423570_2424587_-|hypothetical-protein MGYEKIINHKEFTNCLTKINKWYLRKSKILNIITSPYNSTLIYSSIINEIARKGGNILYIWGNNSPNDELIKEIKLKDKGITYSYIEKGESEKTITFTSFKNMINVRGEYDLCIIDDISKFSLMNKDELIELIEAMYIYSKRIIVYSIERIVSMGEKVEISSLISNKPYVEPRILNTRIKLDDDIPYSLYDYLLWFRDNKSKVIIYAPTEEKARRVYKQYSNTIKISGAKFLLLLRDGPLKELESSLKIKDKGVFIITNYFGDYLKAITELNIVALFSDNRFYSYKKIIYLCAEAGKNPEKHGEILLVSRDISNDMEEAKKFSRNLNKKIWEKGLLRY >NZ_LT799839.1|WP_021876584.1|2424598_2426830_-|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MEILNGVIETIVFKSEDTGYVVSKVRVDKELINAVGVVPLLKEGQQVKIKGDWVLHKQFGRQFNINEYEEVLPSSVEGIEKYLSTGIIRGIGPVTAKKIVGKFGEKTLDILDNHIEMLQDIEGIGEKKYKIIYESYLEQKDLKDIIIYFQNNGMTTNQCIKIYKKYSNAAIDVVKENPYVLSDEISGIGFITADRIAKSLGIENTSPFRIQSGIRYVLNQFSAAGNTYMPKEMLIDETSKVLVVDKELVEENIYNASLDGKIKIEKIGEIEGVFLIPYYYCELGVTNKIITLGIENFRTINTDVEFEIKSFEKKNNIEFAQSQREAIIGAFDNGIEIITGGPGTGKTTIIKAIIEIYENNGMKVLLAAPTGRAAKRMTESTGREAKTIHRLLEMGVSDEENSFFGKGETSPLEGDVIIIDEASMIDIMLMHSLLKAVKLGTRLIIVGDVDQLPSVGPGNVLKDLIESEFIKVVRLKDIFRQGKESMIVTNAHKINNGEMPETNKKEGDFFFENKQELDDILNTIIDLINRRLPNFNKSWDKLRDMQVLTPTRKGILGVQNLNNKLQEVLNPKSPNKKEKESKEMVFREGDKVMQTKNNYSLKWFRINGDGDNEGVGVFNGDMGFIEKINESEKTITIIFDDERRVIYDYIYLDELELAYAITIHKSQGSEFKVIITPAFMGSPFLMNKNLLYTGITRAKELVVVVGIPKALKYMVSNVRSMDRYSSLKERILDVKSEEVFSEE >NZ_LT799839.1|WP_021876585.1|2426962_2428099_+|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase MLIKNCNIIFLDRIENGSVLIEDGKIKEINPTNINCNDVINGEGLYLSPGFIDVHIHGAAGYDTMDGTVEAINEISKAIVKHGTTSFTPTTMTVSIDDIRKSMESIKKCKENGTDGAIVLGAHLEGPFISPSAIGAQNPKFLIPPTIENYNSMVGDAKDAVISITIAPEVPGATDLIKHLSVEGIVCSMGHTKTTYAEAMEGIKCGCCHSTHLFNAMTPFSHREPGVVGAIFDSNITTETISDGIHISYPSLRVAYNQKTTDKVLLVTDAMMACGMPDGMYSLGGQDVVVSDGAARLTTGSLAGSVLTLDKAIRNVYNNTNYSLNEVVKMATFNGARHCKVEDRKGLIKEGYDADLVLFDENINVKKVIVNGKVVHTA >NZ_LT799839.1|WP_079481630.1|2428167_2429343_-|methionine-adenosyltransferase MRRLFTSESVTEGHPDKICDQISDAVLDSILEKDPNARVACETAVTTGMVLVMGEISTNCYVDIPKVVRETIKEIGYDRAKYGFDCATCSVLTSIDEQSTDIAMGVDEALESRQGEKDAVEAVGAGDQGMMFGFATNETEEYMPLPIAMAHRLSRRLSEVRKNGQLSYLRPDGKTQVTVEYDDNKVIRIDAIVISTQHGEDVTQEQIRQDLMEHVIRAVVPAELLDENTKYFINPTGRFVVGGPQGDSGLTGRKIIVDTYGGAGRHGGGAFSGKDPTKVDRSAAYAARWVAKNLVAAGIADKLEVQLAYAIGVAKPVSISIETFGTGKKSEEEIASIVEKVFDLRPGAIIRDLGLRRPLYKQTAAYGHFGRNDLNLPWEQLNKVEEIKKYI >NZ_LT799839.1|WP_021876587.1|2430503_2431106_+|spore-protease-YyaC MYFLPITIIFLILFSYILSIGGEALIKHKVFYESDLAYYEIANVLKNYISKNTVIVCIGTDKCIGDCLGPLVGTYLIDNQFKLPVYGTIEAPIHALNIEHRLSQIKKLHPNANIIGIDACLGDAKSIGEIHVRNYPIHPGKGVGKRLPDVGSTSIIGIVDSSDNAEFFTSRSIRLHLIMSMAKVIARGICKGYYLSNIDN >NZ_LT799839.1|WP_021876588.1|2431163_2432198_-|rod-shape-determining-protein-MreB MWFWRNGTNLGIDLGTATVLVYAKGKGIILKEPSVVAINKSNNKVLAVGEEARKMIGRTPGNIVAVRPLRDGVISDYDITEKMLKEFIKKAYGKSKITAPKVMVCVPSQATEVEKRAVMDATRNSGAKRVHIIEEPLAAAIGAGLDITKPNGSMVVDIGGGTTDIAVISLGGVVVRASIKVAGDTFDDAIIKYVRNKYKIMIGEKTAEDLKITVGAAFVGSRDLTTTMKGRNLVTGLPDEVTVATSEIAEALKESVTLIVEQVKSVLEKTPPELAADIIEKGILMTGGGSLLDGLDKLIEKETGVGVSVANNPVEAVVEGTGKVLGYLDKLDSSLIGQEITLID >NZ_LT799839.1|WP_021876589.1|2432325_2432577_-|sporulation-transcriptional-regulator-SpoIIID MKDYIQERVLEVAQYIIDSKDTIRKTAKVFGVSKSTIHKDMTERLPKINPVIAEQTHTILELNKAERHIRGGKATKLKYKAVD |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LT799839_1 | 1.1|391837|28|NZ_LT799839|CRISPRCasFinder | 391837-391864 | 28 | AP014333 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C55, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 176-203 | 6 | 0.786 |
| NZ_LT799839_1 | 1.1|391837|28|NZ_LT799839|CRISPRCasFinder | 391837-391864 | 28 | NZ_AP018256 | Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome | 20366-20393 | 6 | 0.786 |
| NZ_LT799839_2 | 2.3|1113838|37|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1113838-1113874 | 37 | GU233956 | Bacillus phage 11143, partial sequence | 909-945 | 6 | 0.838 |
| NZ_LT799839_1 | 1.1|391837|28|NZ_LT799839|CRISPRCasFinder | 391837-391864 | 28 | CAJDKA010000002 | Enterococcus phage 163 genome assembly, contig: phage163-genome, whole genome shotgun sequence | 140826-140853 | 7 | 0.75 |
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| NZ_LT799839_1 | 1.1|391837|28|NZ_LT799839|CRISPRCasFinder | 391837-391864 | 28 | NZ_CP006904 | Clostridium botulinum 202F plasmid pCBI, complete sequence | 23073-23100 | 7 | 0.75 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 208366-208400 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NZ_CP004872 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB64, complete sequence | 49358-49392 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NC_017205 | Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72, complete sequence | 52490-52524 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NZ_CP010581 | Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB68, complete sequence | 60071-60105 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NZ_CP015179 | Bacillus thuringiensis serovar alesti strain BGSC 4C1 plasmid pBMB57, complete sequence | 44583-44617 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NZ_CP015156 | Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC6, complete sequence | 57641-57675 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NZ_CP004869 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB67, complete sequence | 13874-13908 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NZ_CP010093 | Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB71, complete sequence | 44424-44458 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NZ_CP021065 | Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh4, complete sequence | 21905-21939 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NC_018488 | Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04, complete sequence | 34185-34219 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NZ_CP011358 | Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC2226, complete sequence | 45960-45994 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NC_018879 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p, complete sequence | 9313-9347 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NZ_CP013057 | Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-2, complete sequence | 45135-45169 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115481-1115515 | 35 | NC_020382 | Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68, complete sequence | 15049-15083 | 7 | 0.8 |
| NZ_LT799839_2 | 2.3|1113838|37|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1113838-1113874 | 37 | NZ_CP026602 | Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed2, complete sequence | 9474-9510 | 8 | 0.784 |
| NZ_LT799839_2 | 2.12|1114431|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1114431-1114465 | 35 | NZ_CP042875 | Bacillus cereus strain 09 plasmid unnamed1, complete sequence | 367216-367250 | 8 | 0.771 |
| NZ_LT799839_2 | 2.12|1114431|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1114431-1114465 | 35 | NC_010858 | Campylobacter fetus subsp. venerealis plasmid pCFV108, complete sequence | 1505-1539 | 9 | 0.743 |
| NZ_LT799839_2 | 2.31|1115678|34|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115678-1115711 | 34 | MG788324 | Lactobacillus phage PM411, complete genome | 33624-33657 | 10 | 0.706 |
| NZ_LT799839_2 | 2.31|1115678|34|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115678-1115711 | 34 | NZ_CP024415 | Lactobacillus plantarum strain ATCC 8014 plasmid pLP39, complete sequence | 15902-15935 | 11 | 0.676 |
| NZ_LT799839_2 | 2.31|1115678|34|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1115678-1115711 | 34 | NZ_CP018210 | Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence | 34470-34503 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.1|391837|28|NZ_LT799839|CRISPRCasFinder matches to AP014333 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C55, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
taggcaacagaaaaacctaaaagatttg CRISPR spacer gatttaacagaaaaacctaaaagttttt Protospacer * .****************** ***
2. spacer 1.1|391837|28|NZ_LT799839|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP018256 (Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
taggcaacagaaaaacctaaaagatttg CRISPR spacer caaccaacagaacaacctaaaatatttc Protospacer .*. ******** ********* ****
3. spacer 2.3|1113838|37|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU233956 (Bacillus phage 11143, partial sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
caggagtcgttgtatttgatgaaatacatgaatatga CRISPR spacer atggtgcagttgtatttgatgaaatacatcaatatga Protospacer ** *. ********************* *******
4. spacer 1.1|391837|28|NZ_LT799839|CRISPRCasFinder matches to CAJDKA010000002 (Enterococcus phage 163 genome assembly, contig: phage163-genome, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
taggcaacagaaaaacctaaaagatttg CRISPR spacer taggcaacagaaaaacctaatattcaaa Protospacer ******************** * . .
5. spacer 1.1|391837|28|NZ_LT799839|CRISPRCasFinder matches to MN241318 (Enterococcus phage PEf771, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
taggcaacagaaaaacctaaaagatttg CRISPR spacer taggcaacagaaaaacctaatattcaaa Protospacer ******************** * . .
6. spacer 1.1|391837|28|NZ_LT799839|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006904 (Clostridium botulinum 202F plasmid pCBI, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
taggcaacagaaaaacctaaaagatttg CRISPR spacer atggcaagagaaaaacctgaaagatcat Protospacer ***** **********.******.
7. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttg-----cttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer
-----ttgaaatttttttatctctatatttaaatatctct Protospacer
*** .****************** *******
8. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004872 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB64, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
9. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017205 (Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
10. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010581 (Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB68, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
11. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015179 (Bacillus thuringiensis serovar alesti strain BGSC 4C1 plasmid pBMB57, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
12. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015156 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
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13. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004869 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB67, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
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14. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010093 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB71, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
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15. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021065 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
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16. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018488 (Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
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17. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011358 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC2226, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
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18. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018879 (Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
19. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013057 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
20. spacer 2.28|1115481|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020382 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
21. spacer 2.3|1113838|37|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026602 (Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
caggagt-----cgttgtatttgatgaaatacatgaatatga CRISPR spacer
-----gtgcttgccttatttttgatgaaatacatgaatatga Protospacer
** * **.* ***********************
22. spacer 2.12|1114431|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042875 (Bacillus cereus strain 09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
agtgaaaaagaaaaggaaattagaaagaaaataag CRISPR spacer acagattttgaagaggaaattaaaaagaaaataag Protospacer * ** ***.*********.************
23. spacer 2.12|1114431|35|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010858 (Campylobacter fetus subsp. venerealis plasmid pCFV108, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
agtgaaaaagaaaaggaaattagaaagaaaataag CRISPR spacer agacaaaaataaaagaaaattagaaagaactatac Protospacer ** ***** *****.************* *
24. spacer 2.31|1115678|34|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG788324 (Lactobacillus phage PM411, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaaggagctgatgggaatcaaggaccaattgga CRISPR spacer cttaactggtgatgggaatcaaaaaccaattggc Protospacer *. * *************..*********
25. spacer 2.31|1115678|34|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024415 (Lactobacillus plantarum strain ATCC 8014 plasmid pLP39, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
aaaaggagctgatgggaatcaaggaccaattgga CRISPR spacer cttgactggtgatgggaatcaaaaaccaattggc Protospacer .. * *************..*********
26. spacer 2.31|1115678|34|NZ_LT799839|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018210 (Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
aaaaggagctgatgggaatcaaggaccaattgga CRISPR spacer cttgactggtgatgggaatcaaaaaccaattggc Protospacer .. * *************..*********
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
319348 : 387865
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT799839|319348:387865|DBSCAN-SWA ATTATTTTTCTTTATTAGCAATTTCTAATATTAATCTATTTTTTAATTCAGAAACAGCAATAGCCCCTTCTTCACCATTCTTTCTACTTCTTACAGAAACTTCATTATTAGCAGCTTCCTTTTCACCAACAACTAAAATATAAGGAATTCTTTCAAGTCTAGCTTCTCTAATTTTATATCCTATTTTTTCAGCTCTATAGTCTGAAGTAGTTCTTATACCAGCATTTTTAAATTCTTTAACAATTGATTCTGCATAATCATTATATTTGTCTGATATAGGAAGAACGATAGCTTGAGTTGGAGATAACCAAGTAGGGAAAGCTCCAGCATATTTTTCTATAAGCATTGCTAAAGTTCTTTCATAACATCCGATTGATGATCTATGAATAACGTAAGGACGCTTTTTATTGCCATCTTTATCTATATAAGTCATATCAAATCTTTCTGCAAGAGCAAAGTCGATTTGAATAGTTATTATTGTATCTTCTTTTCCGTGAACATTCTTAAATTGAATATCAAGTTTAGGACCGTAGAATGCAGCTTCACCATCAGCTTCTACATAATTAATGTTAAGGTGATCTAATATACCCTTCATTAACACTTGAGTTTCTTCCCAAGCTTGAGGATTATTTATATATTTTTCAGTATTATTTGGATCCCATTTAGAGAATCTATAAGAGATATCTCCATCAATTCCTAAAGTTTTCATTATGTAGTCTATTAATTCAACGCAACCTTTAAATTCTTGTTCTATTTGTTCAGGTGTACAAACTATGTGACCATCAGCTAAAGTGAATTGTCTAACACGAATTAATCCATGCATTTCACCAGAAGATTCATTTCTATAAAGAGTAGAAGTTTCTGCATATCTTATAGGTAAATCTCTATAGCTGTGTTGATCTGAATTATAAATAGCGAATTGGAATGGACAAGTCATAGGTCTTAAAGCCATAATTTCAGCATCTTTTTCTTCATCACCTAAAACAAACATACCATCTTTATAATGATCCCAATGTCCTGAAACCTTAAATAAATCATTCTTAGACATTGAAGGAGTTTTAGTTAAAACATAACCTCTTCTATCTTCTTCATCTTCAATCCATCTTTGTAGAGTTTGAATTATTTTAGCTCCTTTAGGCATTATTAAAGGAAGTCCTTGACCAACATTTTCGTCAGTTGTAAATATTCCAAGTTCTCTACCTAATTTATTGTGATCTCTTTTCTTTGCTTCCTCTAAAGCTTCTAAATGAGCATCTAAATCAGCTTTTTTTAAGAATGCTGTTCCATAAACTCTTGAAAGCATTTTATTCTTTTCATCGCCTCTCCAGTAAGCACCAGCACTTCTGATAAGCTTAATTGCCTTAACTGCTTTTAATGATATAAGATGAGGGCCAGCACATAAATCAGTAAAGTCACCAATCTTGTAGAATGAAATAATTTCATCTTCCCCTAAATCATTAATTAACTCAATTTTATAAGGTTCATTAGCTTCTTCCATAAGCTTTAAAGCTTCTGCTCTTGGAAGTTCGAATCTTTCAATTGAAGGATTTTCTTTTATTATTTTCTTCATTTCATCTTCAATTTTAACTAATTCTTCAGTAGTAAAAGCTTTTTCTAAATCAAAATCATAATAGAATCCATTTTCAATTGAAGGTCCTATAGCTAACTTAGCATTAGGGAATAATCTTTTAACAGCATAAGCTAATACGTGAGAGATACTGTGTCTTACAGCATCTTTACCTTCTTTAGAGTCGAATGTACAAATTGCAAGTTCAACATCTTCATTAACAATATGACGAAGATCTACAACCTCACCATTAACTATTCCACAACAAGCATTTCTAGCTAAACCTTCGCTAATTGATTTAGCTATATCAAGAACTGATATACCAGCTTCAAATTCTTTAACTGATCCATCTTTTAAAGTAATTTTAATCATAATAATTTACTCCTCTCAAAAAAATATTTTAAAGTTAAAAATAATAATAAAAAAAGCTCTCATCACAATTTCTATATAAAATTTATACAGAAAAGGGACGAGAGCGTAATATTCCCGCGGTTCCACCCTTAATTGCCTAAAAAGGCCTCTTAAAGTAGTTATCGTAACGTGATAAAACGGACTTTATTAGAGTCACTCAGAGGGGGTCTTCAACTAATTTCAAATAAGAATACTTACACCAAACGTAATCTCTCTCTGTAAATGAAGCTTTAGTTTACTCTTCTCTTCAACGTATTTTCATTATTTGTTATTAATTATAATAATATAAAATATTAATGTCAACTAGAAAAAAATAAGATATTTATTTACTAAAAGGTTAAAAATTATAAATTTTATATTGATTTTTCATGAATATTTTTATATAATGAAGTAAATAGGTAAGCAGATGTGGCGGAATTGGCAGACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCCATTGGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCATCTGCACCAATTATATTTGCGGAAGTGGCTCAATGGTAGAGCGTCACCTTGCCAAGGTGAATGTTGCGAGTTCGAGTCTCGTCTTTCGCTCCAAAAAAATAACACAGGCAACTGTGTTATTTTTTTTGCTTTCTAAACATATTATGTAATACAAAGGTTTTAAAAAAAGGGTGATAAAAAATCACCCTATATTGAATAATAAGTTAAATTTTAGCTAATATTAATATTATTAAATAAATGTTCAAGTTCAAGTTCATCTAACATAGAGTGGGAGTAGAGTTTTCCACCCATTAAGTGTTTTATAATTTCATCTTTTTGATAACCTTCTTTATATAGTTTAAGATTTTTTATTAATCGTTTAAGAGAGCAACTAGGTAATTTTAAAATTTCTGAAATCTCTTTGACGCTATAAAAATCTTTAGGTAAAAGCTTGTACAATTTGTCTTGAAATTCAAGTTTATATTTTAAATCTGTTTCAATACAATTATGGGGGCCATTTTTTCCTCTATGATGAAGGTTACAAAGATATTTATAATTTAAATCGAAGTCGTACCCCCCTTCATGTTTGTGGACTATATGATGAACATCCGCTGGTGAGCCGCAAATTTCACAGTGGTACAAAGCTTATGCCTCCTTTTTTTTACTATCCTTACTTAAATTATAAGGTAAAAATGGTTAAAATTCAAAGGTATTAATAGGCAAGTTTTCAGAATGTTCATTTAAGCAAGGGATTTAAAATAACCTTTAATACACAATGAAACAACTTGAAAAGATGGTACATTATACTATATAATATATTATATAGTAGAAAGAAAGGTGATAAAGGTGAGACAGAATTACGACTCTTTTGACTACTGGGAAAATCTTATAAGTGAAAATAAAACTATAAGAGGACATATGTTTATGGATACTCCCCCTACAGAGAAAAGCCTTTACATTCACACATTAATTTATTGTAGGAATAATGGACTTAACAATGTTTGGAGTTATTTTCCAAATGAAAAAGCTTTACTGGGGTATATCCAATATTCTTTTTTACAAGAAGCTTTTTATAAATGGATCTATGGAAAAGATAGATTAATTTTAAGGGTACCAAATACTCCTGTAGAAAAAGTAATATCTGATGCTCAAAGTAGTAGAAAGATATCAGAAGAAGAAGCTTCACTAATGATAAAACAACTAGATATGCTTAAGAAGTGTTGGGATTTACCAACTGAAAAGGTTCTACCTGAAATATTAAAATTTGTAAGAGAATTTAATAGAGTATGGTATGGAGATCATACAGAATTTTTATATATAAAGATATTCAAAAGTGCTGAGGATTTAGGTGAGTTTGTAATTTCATCTAGCTATATGACCTCAACAACAAGTGACTTCGAAAAAAGAGTTACTGTTGATATAGACAATTGGAGAGAAATCTGCAAGAATGCCGTAGTAGATAGAAGAATAGGAGAGAAATTCAAAGATATTTTATTGAAATCTCTAACAGAAGTGATTTAAAGTGTACAAAAATTGTTGACAGTAATTATTATGTATATTATAATAATTACTGTCAGTAAGACATGCGGGTGTAGCTCAATGGTAGAGCCCTTGCCTTCCAAGCAAGTTACGTGAGTTCGATTCTCATCACCCGCTCCATTATGCGTTATTAGCTCAGTTGGTAGAGCACCTGACTCTTAATCAGGGTGTCCCGGGTTCGAATCCCTGATGACGCACCAGAAAAGATTAGCAATTGCTAATCTTTTTTTATTTCTACTTTAAGTGTACTAAATAAAAAATAGTAATAGATATTTAATAAAAGAATATCTAAATAAATAAAGAAATAATTTTTATATTGACATCTTACTATTAAATTGATAGTATAATAAAGAAAATTTAAAATTGATATCTTATCAAGAGCGGTGGAGGGACTGGCCCTATGAAACCCAGCAACCAAAAAACATTCATTAGTTTTTATGGTGCTAAATCCTGCAGGTAAAACCTGGAAGATAAGAGGCGTAGTATATACTTTTTTAAATAAGTTATTTAAGCTTCTGATTTTGTCAGAAGCTTTTTTTTATGACGTTTTAAATTTAGATTCTATAAAATAGGAGGCGGAGAAAATGAAGAGTAAATCATCAATATTATCATTATTACCTTTAGGTGTATTTATAGCAGTATATTTAGGAATATCTATAATTGCTAAAGATTTCTATGCAGTATCTGTAATTGTACCATTTTTAGCAGCAGCATTAACTGCAATAATCATGAATAGAAAAGAAAAATTTGAAAGTAAAGTAGAAATATTTTGCAAGGGGGCGGGAAATTCTAATATATTATTAATGGTATTAATTTTTATTTTAGCAGGAGCTTTTGCTCAAACGGCTAAAGATATGGGAGCTGTTGACTCAACTGTAAATTTGGGGTTATCATTACTTCCAAGTAGTTTATTAATACCAGGGATATTTATAATAGCTTGTTTTATAGCATTATCAGTAGGAACATCTATGGGAACAATAGTAGCGTTAGTTCCAATTGCTGTAGGAATTGCAGATAGAACTGGAAT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52 | Planktothrix_phage(20.0%) | tRNA,integrase,transposase | attL 327000:327016|attR 389709:389725 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
510766 : 542751
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT799839|510766:542751|DBSCAN-SWA 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30 | Synechococcus_phage(25.0%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1073504 : 1086585
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT799839|1073504:1086585|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT799839|1073504:1086585|1076057_1076684_-|WP_021875364.1|DBSCAN-SWA MNFATKRETITFLTILILFILLSFFNNYTTFFHYIIDFITILIIIYILYASIFKRLCIKKKRKKFLGNHRYSFKPTPCYSTLFVIFILIFNFFSSSLNNYFTGTSTSVEVLNLVSVLIALLFSFIYDFKNETAFYENGILTCDGEAINYDDILKIEKFTFSTTIKYKIKVKNYYNKLELLMYIEDIDIVNNLFNEKFPNYVDLEKLNK >NZ_LT799839|1073504:1086585|1075208_1075364_+|WP_008677523.1|DBSCAN-SWA MEDKKIICKDCGKEFVFTVGEQEFYKEKGFDNEPVRCIDCRRARKAQNNRR >NZ_LT799839|1073504:1086585|1084453_1085065_+|WP_079481269.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLASGSGSNLQAIIDAIESKRLNCKIEMVIGSKEGIFALDRAKANNIETYIVSKKEYGNKTSDKILELTKSKVDLIVLAGYLSILQGDILKEFKDRIINIHPSLIPSFCGSNMYGIKVHEAVLKSGVKVTGCTVHFVNEEVDGGAIILQETVKIDFYDTKEEIQKKVLVLEHRLLPRAIDLIVKGNIKIINGRVKIVE >NZ_LT799839|1073504:1086585|1077032_1080779_+|WP_021875365.1|DBSCAN-SWA MLGTRCIFVEKKKGFNVEAKSLLQDFKSNLGVSGLESVRLINKYTLGEINEEFYKKALYTIFSEKTVDNVYENNLELKDGEIAFAVEYLPGQYDQRADSAAECYQILTAEDKVEVKSAKVIILNGTINDEEINKIKDYYINPVDSREVSLDSMELTSFFTEPKEVEFLTGFINKDNKELEAFHKELGLAMSLEDIKIIRDFFKKEERDPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTAIEKVNIEEGLYSKPVSKAYEAYLKSRDYVYGKTNRDETLMDIAVITMKEMRKRGMLEDLDVSEEINACSIKVNIETNNGIEEYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGSADPTTPVEETIKGKLPQRTITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVSEVYHPNYVAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPKAGDVVILLGGRTGRDGLGGATGSSKEHTEDSINECGAEVQKGNAPTERKIQRLFRNKEVCQMIKRCNDFGAGGVSVAIGELTRGLDIDLDRVPKKYEGLDGTELAISESQERMAVVVEKENADRFIALSKEENLEAVVVAKVTDKERLRMYFKGNKIVDLKREFLDTNGARQTTEVEVKAPTNYPFEVKDIDVKEKWINVLKNLNVASQKGLVERFDSTIGTGTVLMPFGGKYQNTEAEGMAAKIPVLNGESKDATLMSYGFNPYLGTWSPYHMAYYSVIEAVTKLAAMGGNYKKARLTLQEYFEKLGTNKEKWGKPFAALLGAYKAQMELGIPAIGGKDSMSGSFGNIDVPPSLVAFAVGVEKAANIISSEFKEVGSEIIFLMGQRKEDMTLDIESYKKNLEVLYKLILEGKVISASAIKFGGVSEALTKMALGNRIGVEFKNLTKEELFGLNYGSLVLEVKLGVNIKDEFEGCAYKAIGNTINSGAIISKEYDINFKIEKLSDVLEEKLSKVFKIKTEDKNEKVETVLYKEGTIKSPGIKVAKPRVFIPVFPGTNCEYDCARAFRNEGADVSELVLNNLNKDSLKESILKMEKTIRESQIIMLPGGFSAGDEPDGSGKFIATVFRNERIKDAVMDLLKNRDGLMLGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIEEDMATLTYNEINRHMSAMVRTKVVSNKSPWFSEVTPGDIHTIAISHGEGRFVASEKLISKLRENGQIATQYVDLNGDISMDMPYNPNGSVLGIEGITSEDGRILGKMGHSERIGENLYKNIPGDFDQKIFKSGVNYYK >NZ_LT799839|1073504:1086585|1083464_1084466_+|WP_021875369.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYKSVKLIKEYASRTMSEYVLNGLGSFAGMVELPEGYKKPVLVSGTDGVGTKLDIAFKTKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAADLVKGVSEGCVQGDCALVGGETAEMPGFYRDGEYDMAGFAVGIVDKDKIINGKNIKEGDKLIGISSSGLHSNGYSLVRKIFTDLNEDLNGEEVWKTLITPTKIYVKPILELLNNFEIKGMAHITGGGFIENVPRMFNGNNLTAVIKKDSYPLPAIFEKIIEKGVDKNHMYNTFNMGIGFVLCVKESDVEDIIKRLIELGEKAYEIGYVTAGGEGCCLK >NZ_LT799839|1073504:1086585|1080791_1081271_+|WP_021875366.1|DBSCAN-SWA MKVAIFFGSKSDTDVMRGAANCLKEFGVSYEAYILSAHRVPEKLTETLKNAEKSGCEVVIAGAGLAAHLPGVIASQTIMPVIGVPIKGSVEGLDALFSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILAVKDKAIREKLNKFRENMKEKFIEENAEGVDL >NZ_LT799839|1073504:1086585|1073504_1074443_+|WP_021875361.1|DBSCAN-SWA MGMILMGVLLVFLLFIVLSTIKIVNTGYLYVVERFGQYHRILEPGWHFLIPFVDFVRKRISTKQQILDVPPQTVITKDNVKISVDNVIFYKLLNARDAVYNIEDYKAGIVYSATTNMRNIIGNMTLDEVLSGRDKINQDLLSIIDEVTDAYGIKILSVEIKNIVPPEEIQEAMEKQMKAERDKRAMILQAEGLRQSEIEKAEGEKQSQILRAEAEKQANIRRAEGLKESQLLEAEGKAKAIAKIAEAEAEAIRKVNEAIIQSGTNETVIALKQVEALKEMANNPANKLILPNETLSSLGSIAAIGEMLKGEK >NZ_LT799839|1073504:1086585|1074508_1074919_+|WP_079481268.1|DBSCAN-SWA MTLLENISYIFLGLSFLTYIFVGLAMYNIAKKDGFNKSWLSWIPIAQDYVVIKYGKGIPWALLLYIPFFFTTGLISSVIAFTIGIYLTIMAVKICKEFKVSYVWVILGLFIPGFSIISYYKLYKTTKNNELLLENK >NZ_LT799839|1073504:1086585|1085082_1086585_+|WP_021875371.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKEGILDFSNFLSGKGVEIISTGGTFKHLKENGVKVTEVNEVTNFPEMLDGRVKTLHPILHAGILAIRDNEEHMNTIKERNIEPIDMVIVNLYPFFKKVREDLSFDEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFKDVVVISDKDDYKLVMEEIQSLGEVTLKLRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLGDEEYPEYLSVSYKKMQNLRYGENPHQSAAYYGRTEVNGAMNSFEILNGKELSYNNIKDLDIAWKVACEFEETACCGLKHNTPCGVAIGETPFEVYTKAYNADPTSIFGGIVAINRKIDKATAEEMVKIFLEVVIAPEFDEDALEVLKTKKNLRVIKCNNAPKDEKFMVTVDGGMLVQEEDKKLVEEIKVVTEKAPTEEEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVTIKDGVAVGIGGGQVNRIWPTEDALRRGKGATILASDAFFPFRDVVDTCAKYGVKAIIQPGGSMRDQESIDACNEHDIAMVFTGIRHFKH >NZ_LT799839|1073504:1086585|1075668_1075824_+|WP_021875363.1|DBSCAN-SWA MEDKKIICKDCGNEFVFTVGEQEFYKEKGFDNEPVRCIDCRRARKAQNNRR >NZ_LT799839|1073504:1086585|1081270_1081975_+|WP_021875367.1|DBSCAN-SWA MEKLEMMYEGKAKKIYATESKDEVIVYYKDDATAFNGEKKGEIEDKGVLNNAITSMLFEMLNKKGIKTHFVKKLSDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGFELKTTVFELSYKDDFLGDPLINDYHAVGIGATTFEELQKIYDMTAKINELLKKFFKEQNIRLIDFKLEFGRYNGEIVLADEISPDTCRFWDAKTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYVEILNRISK >NZ_LT799839|1073504:1086585|1082027_1083455_+|WP_021875368.1|DBSCAN-SWA MNSSLELILDPSNDKFKDECGVFGVYANREMDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVANGNMVNLHKGMGLITEAFSQDDLSKLQGNSAIGHVRYSTSGDTRIENAQPLLSKTKLGSIAMAHNGTLVNAEVIRELLEDGGHVFHTSIDSEVIANLIARGAKKGIQRAVLDAIQAVRGSFAMVILTENKLIGVRDPHGIRPLCLGKFEDGYILSSESCALDAIGAELVRDIDPGEIVVIDESGISSYRYSENTQCQTCAFEYIYFARPDSTIDGLDVHESRVKAGQELFKQYPIEADVVVAVPDSGIPAAVGYAKASGIPYDTGFVKNRYVGRTFITPSQEIRERAVAVKLNPLKVNIKGKKVVLIDDSIVRGTTSKHLVDSLKRAGAKEVHFLVASPIVKFPCYFGIDTPYRSELIGTKGSVDEIREMIGCDTLGYLDIENMYKCFKENSGYCVGCFNGVYPVATPIETSKDHLER |
12 | Cyanophage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1529984 : 1538701
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LT799839|1529984:1538701|DBSCAN-SWA ATTATTTTTTTTCATATTCCTTAATATCTATTTTAGTATTGCTTATAAGTGGAGACTTATAACGTTCTTTATTATTATCTTTTAGAACTATTTTCCCTAAAACATCTCCTTCTCTTATATCTAATACAGGTTTAAATACCTCTACTTCTAAATTATCATTCTCTTTATATCCATATTTAAATTCTTCATCTTGAATTACAGCACCTAAATCCATGAAACCTTCCTTTTCTACTAATTCTTTTTTAGATACTGTTTTTAAGGTGTTTGTTTCTATTACATAATTATAAATTTTTTCTGTTTGATTCCATCTATCAACACAATTTAATACTACTATTATTATATTTCTTCCATCGTGATTTACAGAAGAAACTAAACACTTTCCTGCTTGACCTGTATATCCAGTTTTTACGCCATTAGCTCCTGGAATTCTATATAATATTTTATTTATATTTTGATAATCCCTTGTAAAATTATATTTTTCTTTACCTATAGATTTTTCTCCAACTATTTCTCTAAAAACTTCACTTTCCATCCCTTTTGAAGCTAAAACAGCTAAATCATATGCAGATGAATAATGCTTTTGACTATCTAATCCATGAGGAGATTCAAAATGTGAATTTAAAACTCCTATACTTCTAGCAAAATCATTCATTATATTTGCAAATCCTTCTACTGATCCCCCTATGTCTTCGGCTATTGCTATTGCAGCATCATTTCCTGACCTAAACATAAGTCCAAATAGAAGTTCTCTCATAGTTATTTCTTCACCGGCCTTATACCCTACAGTTGATCCTCTAATTGATGAAGCATTTTTACTGATGGTTACTTTTCTATCTAAATCTCCATAATTAATGGCTATCAATGATGTAAGGATTTTTGTAGTACTTGCCATTGGAACTATTTCGTATCCTTTTTGATCCCAAAGTACTTGCTTTGATTCTGCATCAATTGCTATAGCATTTCTTGCACTTACTCTTAATGGCCCCTTAGTATCAACTTTAGTATTATCTACATCATAGCTATCTTCCTCATCTAAATTAATAATTTCATCGTCTGTATCTATATCTTCTTCTTTAATTACTGCTTTTGGAGAAAATATAATACATTGTGTTGTTAATAACAATGTTATTAATACTATTGGTATTTTTTTAATTTTTTTCATAAAATCACCCTCTAAATTAACCATCTATGACTAGTGTGTTCTAAAAGTAAAATTTTAAACCTGATAATCAAAAAAAATTTTAGTTTATTTTAATAATTTATGGTAATACTATAAGATAATCTCATTAGGAGGATATTAATGGTTATAATTATTATAGTTTCATGTATACTTTTATTATTTTTACTCCCTATTCCACTAAAAATAACAATATATAAAAATAAGGCTTACTTTCATATAAAGGTCTTCAACTTAGTTTTATTATCTCCTGAAAAAGGAATATTAAATGATTTATTAAAAAAACCTAACGAAAAAAAATCTTCAAATAAAAATATAAATACTAAAGTTAATAAGCATAATCTATTTTCAAAAAAAAATAAAAAGCTTTCCTTAATATCACTATATAGAAGTATTACAAATAATAAATTTAGACCTTGGTTTAAACTTAAAGGCGAGCTTGATTTCGCCTTTAATGATGCTGCATATACTGCTATAGGTTATGGATTATTATGTAATCTTAACCCTATACTTTTTGCTGTTTTTAATCAGATTTTTTCAGTAAAAAAATTCAAATTACAAATTAATCCTCATTTTAATGAAGATAAAATATTAAATTTTACTATCTCTAGTATAATTTACTTTAATCTTGCACATGCTATACGTATATTATATTTAATATATAATTCTTTTGAAAACATAGAGGAGGTGTCCCCTGTTTAGGGATATATTATGGCAAATGAACATCCAGTAGAAAATTTAATGAGAAGTACTATGGAAAATTTAAGAGATATGATAGATGTAAACACCGTTATTGGTGAAGCGGTAGAAACTAGAGATGGCAGTTATATCATCCCAATTTCAAAGGTTACATTTGGATTTGCTTCAGGAGGTAGTGAATTTGGAAATCAAAGTAAATCCTCACCTAATCAAGATGCAAAACATCCTTTTGGTGGTGGTTCTGGTGCAGGAGTTACTGTAAAACCTGTAGCATTTCTAGTAGTACGAGAAGATTCTGTTAGATTATTACCTGTAGATCAAGATAATGCTTGCGATAGAGTAGTTGATTCTATTCCTACTGTTTTAGAAATGTTTAAAGGCTTCTTTAATGATATAGGTAAACATAAAAAACATAAAGATAAGCATCAATCTGATAGTTGTAATATTTGTGATTCTTCAATTGATCAATGTAACTGTGATGATACTGATTCTTCATCTAATAATCTTCATTAATTTTCATAACATTTCAAATGTAAAAAGTACAGAAATAAATTCATTTCTGTACTTTTATATTATAACTCTTTCATTGCGTTATTTAAAATTTCCAAAGACTCATCTTGTTCTTTTTCAGAATATAAATCTAAAGATGGAAGGTCATTTAAAGCCTTAAGCCCGAATTGTCTTAAAAACTCTTCCGTTGTTCCAAACAAAATAGGTCTTCCTGGAACCTCTAATCTTCCAACTTCTTTTATCAACTCTTTTTCTATTAATCTTTGAATAGCACTTTCTGACTTTACCCCTCTAATTTCATCTATATCAACTCTTGTAATTGGTTGTTTATATGCTATAATAGCTAAACTTTCAAGAGAAGCTTGAGATAAGGATTGACGTTTGTTTTTCTTTAATAAACGTTGTACAAATTCACTATTTTGTGCTTTAGTTACTAATTGATATTCTCCATTTATAGAAATTAGTTTTATCCCTCTAGATTCCTCTTCATACTCATCCATCATCTCATCTAATATTTTTTCTAATACTTTAGGTGCAACTTCTACATTAGAACTCAATGTTTTTAAATTTAAAGGCTCTCCACTTACAAATAATAAGGATTCAATTGAAGATTTTATTCTATTCTTTTTAGATGCACCCTGAAACTCGAACTGATTTATTTCTATTTTATTCATTATTTCTCCTTTTTATTAATATGTTCCCAAAACTATTATCTTGAAAAACCTTAATCATTCTTAACTTTATAAGTTCTAATAAAGCTAAAAATGTTACAACTGTTTCCATTTTACATTCACTTTCTTTTATAAAATCATTAAATTCAAATACTTTAACACTATTAAGTTTATCTAATACATATTGCATTTTATCTTCAAGCTTATACCTATCTACAAATATCTTTTTTTGTATTACATTTTCTCGGTTTTGTTTAAGCCTATAATTCTCAAGTAATTCATTATATAACTTATATAAATCTAATAAAGTAACATTTTTTAACAAATCTTCTGTCTTTATTTTTTCTTCTTCCTCTTGGATTAATTCAGGCATTTTAGTGTATACATCACCTGAACTAATATATCTATCTTTAAAGAATCTAGAAACTCCTTTAAACTTCTTATATTCTATTAATTTAGTCATAAGATCTTTTTCTACATCTTCTTCGTTTTCTTCTTTAATAACTACTTTTGGAAGTAATTTTTTAGATTTTATTTCTATTAAAGTGGCTGCTACTACTATAAATTCTGATGTTATTTCTAGATCCATTTCTTTCATTTCTTCTAAGTACTTTAAATATTGATTAGTGATTTTATATATTTCTATATTATATATATCCATTTCATGCTTTTTTATTAAATGTAATAACAAGTCAAAAGGACCTTCAAAATCTGCCACTTTTATCTTAGGCATTTCCATTAAACTATCACCTCCATATTATAGAATATATGTACTTTATTATATATTCTATAATATCAACTTTCATAAAAAAGAACAAGAAAAAGTGAACCTATTAAGGTTCACTTCTATTATATCCCTTTTTTAAACATATTCTTCATATTAAACTTAAAGTTTTCAAAGAAACCACCTTTTTCTATATCTCTATCTGCATATAGTTCTACTTCTCCAACTTTTTCTTCTCCTAAGTAAACTTCACATCTACCTACTATTTCTCCAGCTTTGTATTCCTTTTTAACTTCATCCATAACAAGTCTCTTTTCTAGTTCACCATTGCTTCCTTTAGGTAATACAACTATTAAATCATCTTTTGCCTTAGCTATAAAGAATTTATCTGTTTGTTTACTTAAATAAACTGTATCAACATCTTCATCTTTTGCAACAAGCTTTTTACCCTCATATTTTGAAAATCCATAATTTAAAAGCATTCCTGCATCTCTATTTCTAATCTTATATGTAGGCGCCCCCATTATAACTGAAAGCATTCTAACACCATTTTTTGTTGCTGTTGCACTTATACAATACTTAGCCTCTTCTGTATAACCAGTTTTTAATCCATCACAACCATCAAAAAATCTAACTAATTTATTATGATTTACTAATTCTATAGGAGATTTACGACCTTCTGATATAGTTTCCATATATGTACCTGAGTATTTTAATATTTGAGGATGTTTTAATAATTCCATAGACATTAGAGAAATATCTCTTGCTGTTGATTCATGTCCTGCTGCTGGTAATCCATTACAATTTTTAAATGTTGTATTAGTCATTCCAAGCTCTTGTGCTCTTTTGTTCATCATACCAACAAATGCTTCTTCTGTACCTCCTAAATATTCAGCTAATGCCACTGCCGCATCATTTCCTGATGCAATTGCTACACCTTTTAATAACTCCTCTACAGTTCTAATTTCTCCTGTTTCAAGAAGCATAGTGCTACCACCCATTTTTTTAGCATTTTCGCTACATGTAACTTTATCTTGTAATGTTATCTTTCCGCTATCCACTTCTTCCATAGTTAATAGCATAGTCATTATTTTTGTAACTGATGCTGGCGCAAATTTTTCATCTATATTCTTTTCATAAATTAACTTTCCTGTGGTTGGTTCTATAAGTAAAGCTGACCTTGCTTCTACATCAATACCTTCATCATTAAAGACCTCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LT799839|1529984:1538701|1533889_1535143_-|WP_021875779.1|DBSCAN-SWA MKKSFIKRISIFALSLFCLTSLPIKAEERNYQNVEQTYENIDDGVEETYEEWTTEVFNDEGIDVEARSALLIEPTTGKLIYEKNIDEKFAPASVTKIMTMLLTMEEVDSGKITLQDKVTCSENAKKMGGSTMLLETGEIRTVEELLKGVAIASGNDAAVALAEYLGGTEEAFVGMMNKRAQELGMTNTTFKNCNGLPAAGHESTARDISLMSMELLKHPQILKYSGTYMETISEGRKSPIELVNHNKLVRFFDGCDGLKTGYTEEAKYCISATATKNGVRMLSVIMGAPTYKIRNRDAGMLLNYGFSKYEGKKLVAKDEDVDTVYLSKQTDKFFIAKAKDDLIVVLPKGSNGELEKRLVMDEVKKEYKAGEIVGRCEVYLGEEKVGEVELYADRDIEKGGFFENFKFNMKNMFKKGI >NZ_LT799839|1529984:1538701|1537822_1538701_-|WP_021875782.1|integrase|DBSCAN-SWA MKEIVNDYRESLLKSHKSENTVYAYVTDVNLYVKYLNSKNMDINETDNVSVLGYIQYLLGQGKSERSINRIVISLRSFYNYLKDQKVVQEIPKIYYKSTATAKKLPEILTVEEVDRIIKIVDKDCNKGIRDNALLELMYATGMKVSEIIGLKVWDVNLDLSFVKCHDNKNYERLIPIGRSALEALKEYFKVRDQIASAGVDNLFVNLNGNQLTRQGVWRIVKEYSHKAGIKKEVNLNTFRHSFAVHLLQNGANVRAVQKLLGNQVLTYMDTYYEIINNDKINLVYKNSHPRA >NZ_LT799839|1529984:1538701|1536608_1537775_-|WP_021875781.1|DBSCAN-SWA MKRAILVVMDSLGVGALPDADLYGDAGSHTLDHVYKACGGLDIPNLESLGFGNIEGVTELKKVAKTTGAYGRLMERSKGKDTVTGHWEIGGVILEKPLNTYPDGFSDEIINEFLAKVNKKAVLGNCVASGTAIIEELGDEHVKTGNPIIYTSADSVFQIAAHEDVIPLEELYKMCQIAREMLVGEHAVGRVIARPFIGKSGEYKRTSNRRDYALDPFSKTMLEYLKEDGKEVAAVGKIEDIYNQKGVTSAIHTKNNMDGVDVTLKYMDTVKEGLIFTNLVDFDMLYGHRNNPEGYGKAIEDLDGRLKEIYAKMTDEDILILTADHGCDPTTESTDHSREYIPVLIHGKNIKPVNLGTRTGFTDIGKTILDYFNIENDIDGKSFLKEIL >NZ_LT799839|1529984:1538701|1535242_1536547_-|WP_021875780.1|DBSCAN-SWA MRMYDVILKKRIGEELSKEEIEFFVNGYTKGEIPDYQASALLMAIFFNKMNKRETADLTMAMVRSGDEIDLSSIKGVKVDKHSTGGVGDKTSICLTPLVASLGAPVSKMSGRGLGHTGGTIDKLESFPGFTVELTEEQFIKNSNDIGIAIMGQTGNITPADKKIYALRDVTATVDNRSLIAASIMSKKIASGSNAIVLDVKVGEGAFMKTPEDAKALAQAMVDIGTHCGRQTIGVISDMDQPLGYAIGNALEVKEAIELLKGNGPKDLLELVLTLGSNMLVCGKIAKDFEEGKKLLMQNIENGKGLAKLKEFVAAQGGDASYVDDVEKLPKAKHVVEVKCEEDGFVSKIHAEEFGLIAMELGAGRATKESEIDLAVGIVLNKKRGDKVSKGDVLAYIHSNDENNIAKTSKKIKENFVITEKFENNIPLIYDIVK >NZ_LT799839|1529984:1538701|1533035_1533779_-|WP_021875778.1|DBSCAN-SWA MEMPKIKVADFEGPFDLLLHLIKKHEMDIYNIEIYKITNQYLKYLEEMKEMDLEITSEFIVVAATLIEIKSKKLLPKVVIKEENEEDVEKDLMTKLIEYKKFKGVSRFFKDRYISSGDVYTKMPELIQEEEEKIKTEDLLKNVTLLDLYKLYNELLENYRLKQNRENVIQKKIFVDRYKLEDKMQYVLDKLNSVKVFEFNDFIKESECKMETVVTFLALLELIKLRMIKVFQDNSFGNILIKRRNNE >NZ_LT799839|1529984:1538701|1532431_1533043_-|WP_079481388.1|DBSCAN-SWA MNKIEINQFEFQGASKKNRIKSSIESLLFVSGEPLNLKTLSSNVEVAPKVLEKILDEMMDEYEEESRGIKLISINGEYQLVTKAQNSEFVQRLLKKNKRQSLSQASLESLAIIAYKQPITRVDIDEIRGVKSESAIQRLIEKELIKEVGRLEVPGRPILFGTTEEFLRQFGLKALNDLPSLDLYSEKEQDESLEILNNAMKEL >NZ_LT799839|1529984:1538701|1529984_1531145_-|WP_079481387.1|DBSCAN-SWA MKKIKKIPIVLITLLLTTQCIIFSPKAVIKEEDIDTDDEIINLDEEDSYDVDNTKVDTKGPLRVSARNAIAIDAESKQVLWDQKGYEIVPMASTTKILTSLIAINYGDLDRKVTISKNASSIRGSTVGYKAGEEITMRELLFGLMFRSGNDAAIAIAEDIGGSVEGFANIMNDFARSIGVLNSHFESPHGLDSQKHYSSAYDLAVLASKGMESEVFREIVGEKSIGKEKYNFTRDYQNINKILYRIPGANGVKTGYTGQAGKCLVSSVNHDGRNIIIVVLNCVDRWNQTEKIYNYVIETNTLKTVSKKELVEKEGFMDLGAVIQDEEFKYGYKENDNLEVEVFKPVLDIREGDVLGKIVLKDNNKERYKSPLISNTKIDIKEYEKK >NZ_LT799839|1529984:1538701|1531871_1532372_+|WP_021875776.1|DBSCAN-SWA MANEHPVENLMRSTMENLRDMIDVNTVIGEAVETRDGSYIIPISKVTFGFASGGSEFGNQSKSSPNQDAKHPFGGGSGAGVTVKPVAFLVVREDSVRLLPVDQDNACDRVVDSIPTVLEMFKGFFNDIGKHKKHKDKHQSDSCNICDSSIDQCNCDDTDSSSNNLH >NZ_LT799839|1529984:1538701|1531283_1531862_+|WP_021875775.1|DBSCAN-SWA MVIIIIVSCILLLFLLPIPLKITIYKNKAYFHIKVFNLVLLSPEKGILNDLLKKPNEKKSSNKNINTKVNKHNLFSKKNKKLSLISLYRSITNNKFRPWFKLKGELDFAFNDAAYTAIGYGLLCNLNPILFAVFNQIFSVKKFKLQINPHFNEDKILNFTISSIIYFNLAHAIRILYLIYNSFENIEEVSPV |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | integrase | attL 1536606:1536621|attR 1541106:1541121 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1750852 : 1821546
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LT799839|1750852:1821546|DBSCAN-SWA TATAGATTCAATTATAACTTATTTAATTACTTATAATCAATATTTAATTGCCATTATCGGTCAATTACTTTTATTCATCTCACAACATATTCCACTTAACCAGATGATATTTGATGATTCTAATAGCCCAGAATACCAAAAATTCAAAGTAGATAAGCTACCCACAATTATTAGATTTGAAAAAGTAGACTATATATTACTTTTAGCTTATTACAAACATAAATATAACAAGACCGTAAAACCCGCCCAAAGACGGAACGGGAAGTCTATCCCTAAAAAAACTAAATGTCCTAAGTGTGGTGCACCACATGAATATATATACGATAACAATGGCAGTAAAGGACAGTTTCAATGTAAAGTTTGTGGTCTTACATTTAAAGAAACTAATTACACAACTAAACCAATAGTATTTATATGTCCTTATTGCGGTGCTACGCTTACGGAACAAAAGCAACGCAAGCACTTTAAAATACATAAATGTAATAATTCTAAATGCTTATACTATCAAAGAAATCTTAAGAATCTTCCAAAGAATATTGATCCTTGTGATAAATACAAGTATAAGCTTCATTACATATATCGTGAATTTAATATTAACTTCTTAAAACTAAATCCAATATCAAAACATGCTACCGGATTTAGTTTTAAGAAGTTTAGCCCGCATATAATGGGACTATGCTTGACTTATCACGTTAATTGTAAAATGTCTATTCTAGGTTATCAAGTATCTGATACAAGAGCTACTGACCCTTGTATACTAACAATGCGTATGGCTTTTGATAAGTTTAAAGACTTCTCTGGAAAAGCTTTAAACTTTGTTGCCGATGGTTACAGTTCATATCCGTTAGCGAAGCAACAATTTGAATTAGAAAAAAATAAAGAATTTAATCTAACTCAAGTTATCGGACTTACTAACGATGATCCAGTATCTGAAGAATTTCGTTGGGTTGAGCAAGTTGTAGAGCGTTTAAACCGTACCTTTAAATCTTCCTACAGGGGTACCTGTGGTTATGGAAGTGATGAAGGTGCTCTTTATGGCTTCTCCCTTTGGGTTGCTTATTACAATTTCTTACGCCCGCATCCTTACAATTACTGGCGTCCTTTAAACGAATTAAAGCAACTAGATGGTATTGACAATATGCCTGCAAAGTGGCAAATTCTTATCAGTCTCGGTCAACAAACCATATTACATATGCAAGAATCACAAACTTCTTGATAAATCATAAAATCAAATATTGATTAAGTTTTTGCCTCCGTTACCGAAGGTCTTTTTAGCATATTCAATTTTAAAATTTTCTTAGATATTGCAAAGATATTTTTAACTATTATTCCAAATTAGCTGTAAGCTATTTTTTCATACGAAACTTTACACTATCATAAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTTATATATTAAGTAAATGTTCCATTTTTTCTTTTTTAGTTTTTAAATAAAACCTATTATCTTTATTGGATTCAATTTCTATTGGAACTCTCTCAATAATACTAAGCCCATATCCTTCTAAACCTGAAATTTTTTTAGGGTTGTTAGTCATTAAACGGATTTTCTTAACTCCTAATACTTTTAATATTTGAGCTCCAATACCATAATCTCTAAGATCCTCTGGAAAGCCTAATTTTATATTTGCTTCAACAGTATCTAAGCCTTCATCTTGAAGTTTATATGCTTTTAATTTGTTTATTAACCCTATTCCTCTTCCTTCTTGCCTCATATAAAGAAGAATACCTTTTCCTTCCTTAGCTATTTGCTTCATTGCTCTATCAAATTGTTCACCACAATCACATCTTTTAGATCCAAAAACATCTCCTGTTAAACATTCTGAATGAACTCTAATTAAAACAGAATCTTCCTTCTCTACCTCTCCTTTTACTAAAGCAACATGATGCTCTCCATTTAATTTATTTATAAATCCTATAGCTTTAAATTCTCCATATTGTGTTGGCATTTTAGTTTCTACTACTTTTTCAACAAGAATTTCTCTTTGATTTCTATAAGCTATTAAATCTTTAATAGTTATAATACCGATATCATGCTTTTTACTAAACTCTACCAGTTCTGGTGTTCTTGCCATAGTCCCATCTTCTTTAATTATTTCACATATAACTCCAGCTTCTTTTAGCCCAGCTAATTTAACTAAATCTAATGATGCTTCTGTATGTCCAGCTCTTTTTAAAACCCCACCTTTTTTACCTATTAAAGGAAAAATATGACCTGGTCTTCTAAAATCTCCTGGCACACTATCCTCTTTAATTAAGTTTATAATTGTATTTGCTCTTTCAAAAGCTGAAATTCCTGTATTAGTATCTTTATAATCTATTGATACTGTAAATGCTGTTTCATGATTGTCTGTATTATCCTCTACCATTGGATTTAAATTTAACTTATTTGCTATCTCTTCACTTATAGGTGTACAAATTAACCCCTTACCATATGTGGCCATAAAATTTATACTTTCTCCATCTACAAGCTCTGCTGCCATTACTAAATCGCCTTCATTTTCTCTATCTTCATCATCTATAACTATAATCATCTTTCCTTTTTTTATTTCCTTTATTGCTTCTTCTATAGAAATAAATTTACTCATAATCTTAGGGAATTTCTTCCCTTCACCACCCTTCACTCAATATTATAATCACTACATAAATCCATGTTTTATTAGATATTCTCTTGAAATATTAGAATTATTATCTTCAATATCTTTCTTTACATATAAACGCTCTAAATATTTAGCTAAAATATCACCTTCAATATTAACTTTATCTCCTATATTCTTACTAATTAAAGTAGTTCCTTCTTGGCTATGTGGAATTAATGATACACTAAAAATATTATTATTAACCTTAGCTACTGTTAAGCTTATTCCATCAAGAGCAATAGATCCTTTATATACTATATATTTACTTGTAGCTTTATCTGCTTTTAAGGTAATCCAAGTAGTTTGCTCTTCTTTTCTAAAACTAACTATTTCAGCTGTAGAATCAATATGCCCACTTACAATATGTCCATTAATCCTATCATTAATTTTCATAGCTCTTTCTAAATTTAACTTAGAACCTATCTTTAAATAAATTAAATTACTTTTATCTAGAGTTTCTTTCATTACATAAGCTGAAAAAAAATCTTTCCCCTTTTCTGTTATGCTTAAACAAACACCATTTGTTGCTATACTATCACCTATTTTTACTTCATCTAATACTTTTTTGCATTTTATAAATACCTTATATGCTTTCTCTCTTTTTTCTATAAACTTTACTTCTCCTATTTCTTCTATAATTCCTGTAAACATTTATAACCCTCCTAATTAATCTAAAGCTTATAAAGTTAATTGTTGAATTTTCCCACCAATAAAATATCATTATCAAATCTTAAAAGCTCTTCTATTTCTGGCTTATATGCTTCTTCAACTTGTCCAACTCCACCCCCTTCAACAGGAGTTAATGCCTCTTTTCCACCAAAAATTTTAGGAGATATAAATTCATATATTTTATTGGCTAGCCCTTCTTTTAAAAGGGAAAAATTTAAAGTGCCTCCTCCCTCAACAAGAATAGAATCTATATTTTTATTACCTAATATCTGCATTACTTCTTTTAAATTTATTTTGCCTTCTTTTTCTTTTACTTCTATAACTTCTATTCCTTTATTTTCTAGAAGTACTTTATTTGTCTTATTAGCCCCTTTAGTTGTAAAAATAATAGTTTTAGAATAATCTTGATTTTCTAAAACTTTTGACTCTAAAGGAATTCTTAAATTACTATCTAAAATTATCCTAAAATGATCTTTGTTTTTAAAATCTTCATTTCTACACCTTAAATCTGGGTTATCTTTTAATATAGTATTTATACCAACCATTATTCCTTTATATTTATTTCTTAAATTATGGACAAAAGCTCTAGATTTTTCGTTGGTAATCCACTTTGATTTATAATCACAAGTAGCTATCTTACCATCCATTGTCATTGCCCATTTTAAAGCTACAAATGGTTTTTTTTTCATAATATAATGATTAAATATTTCATTTAAAATTCTACAATCCTCTTCTAAAATCCCTACTACTACTTCTATACCTGCTTCTTTAAGAATTTTAATGCCTTTTCCTCTTACTATTGGGTTTAAATCTAAGGTTCCTATTATTACCCTTCTGAATCCATATTTTTTTATTGTTTCAACACAAGGAGGTGTTTTACCATAATGACAACAGGGTTCTAAAGTTACATATAAATCTGCTCCATTTAAATTATCTTTAGCATTTTTTATTGCATTAATTTCTGCATGCTCCTTACCAAACTCACGATGATATCCCTCTCCTATAACCTTACCACTTTTTACTATAACTGCCCCAACTAATGGATTTGGATTAACACTACCTTCCCCTTTCTTAGCTAACTCTAATGCTCTTCTCATAAAAGCTTCATCCATAGATTTATCCTCCCCTAAAAAATAATAAAAGCCCTGAGTATTATTATTCAGGGCTTTTATAAACTTAAAATTTCTATGCAGAAATACACTATATCTATTTATAAAAACAAAAAACTCTGAACTAAAAAAGTTCAGAGCAAAAAATCTATAAATATAATCATAGTTTTAAATTTAAATTTTTCTTCTCTCATCCAGACTATACTGTCGGCCTCGGAATTTCACCGAATCATGCTAAAAATAGCTCGCGGGCTTTACCGCCGGTAGGGATTTTCACCCTGCCCTGAAGAAACTTATTAACTTTTATACTATTATATTATATCTATTCTAAATATTTGTCAATATTTCCTTGTTTTACTAATTCATGATGACATACTAAATTTCATGTTTTAAAGAACTCTTCACAAAATTCCTTTTTATTTCTAAGAATTCCTCCATATCATTTAAAAGCTGAAGTAATTGTGATCTATTTTCAAATTCTTCTCTGGTTTTTGGTAACTCCATTTTTTTAAATTCAGCTCTTAATATATTTAATTTTCTAAGTAGCTCTCTACAATCATTAGCTTCT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72 | Clostridium_phage(32.0%) | portal,transposase,integrase,tail,head,capsid,terminase,coat | attL 1799411:1799429|attR 1827705:1827723 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2430503 : 2478615
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LT799839|2430503:2478615|DBSCAN-SWA 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47 | Clostridium_phage(25.0%) | coat,integrase,transposase,protease | attL 2450152:2450211|attR 2472165:2472324 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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