Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT906447 | Staphylococcus piscifermentans strain NCTC13836 chromosome 1 | 2 crisprs | csa3,WYL,cas14j,c2c9_V-U4,DEDDh,cas3,DinG,cas2,cas1,cas9 | 0 | 8 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT906447_1 | 1840076-1841022 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_LT906447_1
|
14 spacers
spacers of NZ_LT906447_1
>1.1|1840107|33|NZ_LT906447|CRT CGTTTCCTTGTTAGATTCTTAACATTCTGTTCT >1.2|1840171|34|NZ_LT906447|CRT GACCGCGCAAATTGAATGCAACGAAAAAGGTTCT >1.3|1840236|34|NZ_LT906447|CRT AAATCATTATCAATACCGCGTATCGCTAACTTCT >1.4|1840301|34|NZ_LT906447|CRT CATAGTACGGGATTCTAAATGAAATTAAAGTTCC >1.5|1840366|35|NZ_LT906447|CRT TCGCCAATCGCACCCGAAATTACTAACACGGTTCC >1.6|1840432|35|NZ_LT906447|CRT CATGCTTCCGCAGCACGAGTTAAATGATTAGTTCC >1.7|1840498|35|NZ_LT906447|CRT ACTTATTTTGCTTTTTCGCCTTTATGCGCAGTTCC >1.8|1840564|35|NZ_LT906447|CRT ATTGCTTTTCGTTTATCAGATTCAGGCACTGTTCC >1.9|1840630|35|NZ_LT906447|CRT AAGCCTTCCGTCCACATTAACACGTTGACCGTTCC >1.10|1840696|35|NZ_LT906447|CRT TATAGCGCGTTCCGTAGTTCACAAAGCCCGGTTCC >1.11|1840762|34|NZ_LT906447|CRT ATTCTCACATGGTCGAAAATATTTTCAACGTTCC >1.12|1840827|34|NZ_LT906447|CRT TTGGCGGTATCAGTAAAGGCATTGGCGGAGTTCC >1.13|1840892|34|NZ_LT906447|CRT AGTGATTTAAAAGCACCCTCTAATCCTTGGTTCC >1.14|1840957|35|NZ_LT906447|CRT AAAGGTGTATATATTTTAGAAATTGTGGTTGTTCC >1.15|1840171|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder GACCGCGCAAATTGAATGCAACGAAAAAG >1.16|1840236|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder AAATCATTATCAATACCGCGTATCGCTAA >1.17|1840301|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder CATAGTACGGGATTCTAAATGAAATTAAA >1.18|1840366|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGCCAATCGCACCCGAAATTACTAACACG >1.19|1840432|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder CATGCTTCCGCAGCACGAGTTAAATGATTA >1.20|1840498|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTTATTTTGCTTTTTCGCCTTTATGCGCA >1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTGCTTTTCGTTTATCAGATTCAGGCACT >1.22|1840630|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGCCTTCCGTCCACATTAACACGTTGACC >1.23|1840696|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder TATAGCGCGTTCCGTAGTTCACAAAGCCCG >1.24|1840762|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTCTCACATGGTCGAAAATATTTTCAAC >1.25|1840827|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGGCGGTATCAGTAAAGGCATTGGCGGA >1.26|1840892|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTGATTTAAAAGCACCCTCTAATCCTTG >1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAGGTGTATATATTTTAGAAATTGTGGTT |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT906447_1
The CRISPR arrays of NZ_LT906447_1 >merge|NZ_LT906447|1|1840076-1841022|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTAAATTCTAAAGATTATAATTCTAAAACACGTTTCCTTGTTAGATTCTTAACATTCTGTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAACGACCGCGCAAATTGAATGCAACGAAAAAGGTTCTACTTCATTCTAAAAGAACATAATTCTAAAACAAATCATTATCAATACCGCGTATCGCTAACTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAACCATAGTACGGGATTCTAAATGAAATTAAAGTTCCGCTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAACTCGCCAATCGCACCCGAAATTACTAACACGGTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAACCATGCTTCCGCAGCACGAGTTAAATGATTAGTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAACACTTATTTTGCTTTTTCGCCTTTATGCGCAGTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAACATTGCTTTTCGTTTATCAGATTCAGGCACTGTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAACAAGCCTTCCGTCCACATTAACACGTTGACCGTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAACTATAGCGCGTTCCGTAGTTCACAAAGCCCGGTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAACATTCTCACATGGTCGAAAATATTTTCAACGTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAACTTGGCGGTATCAGTAAAGGCATTGGCGGAGTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAACAGTGATTTAAAAGCACCCTCTAATCCTTGGTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAACAAAGGTGTATATATTTTAGAAATTGTGGTTGTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC >NZ_LT906447|1|1|1840076-1841022|CRT TTTAAATTCTAAAGATTATAATTCTAAAACA CGTTTCCTTGTTAGATTCTTAACATTCTGTTCT ACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC GACCGCGCAAATTGAATGCAACGAAAAAGGTTCT ACTTCATTCTAAAAGAACATAATTCTAAAAC AAATCATTATCAATACCGCGTATCGCTAACTTCT ACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC CATAGTACGGGATTCTAAATGAAATTAAAGTTCC GCTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC TCGCCAATCGCACCCGAAATTACTAACACGGTTCC ACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC CATGCTTCCGCAGCACGAGTTAAATGATTAGTTCC ACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC ACTTATTTTGCTTTTTCGCCTTTATGCGCAGTTCC ACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC ATTGCTTTTCGTTTATCAGATTCAGGCACTGTTCC ACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC AAGCCTTCCGTCCACATTAACACGTTGACCGTTCC ACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC TATAGCGCGTTCCGTAGTTCACAAAGCCCGGTTCC ACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC ATTCTCACATGGTCGAAAATATTTTCAACGTTCC ACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC TTGGCGGTATCAGTAAAGGCATTGGCGGAGTTCC ACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC AGTGATTTAAAAGCACCCTCTAATCCTTGGTTCC ACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC AAAGGTGTATATATTTTAGAAATTGTGGTTGTTCC ACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC >NZ_LT906447|1|1|1840135-1841022|PILER-CR GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC GACCGCGCAAATTGAATGCAACGAAAAAG GTTCTACTTCATTCTAAAAGAACATAATTCTAAAAC AAATCATTATCAATACCGCGTATCGCTAA CTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC CATAGTACGGGATTCTAAATGAAATTAAA GTTCCGCTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC TCGCCAATCGCACCCGAAATTACTAACACG GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC CATGCTTCCGCAGCACGAGTTAAATGATTA GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC ACTTATTTTGCTTTTTCGCCTTTATGCGCA GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC ATTGCTTTTCGTTTATCAGATTCAGGCACT GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC AAGCCTTCCGTCCACATTAACACGTTGACC GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC TATAGCGCGTTCCGTAGTTCACAAAGCCCG GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC ATTCTCACATGGTCGAAAATATTTTCAAC GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC TTGGCGGTATCAGTAAAGGCATTGGCGGA GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC AGTGATTTAAAAGCACCCTCTAATCCTTG GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC AAAGGTGTATATATTTTAGAAATTGTGGTT GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC >NZ_LT906447|1|1|1840135-1841022|CRISPRCasFinder GTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC GACCGCGCAAATTGAATGCAACGAAAAAG GTTCTACTTCATTCTAAAAGAACATAATTCTAAAAC AAATCATTATCAATACCGCGTATCGCTAA CTTCTACTTCATTCTAAAAGATCATAATTCTAAAAC CATAGTACGGGATTCTAAATGAAATTAAA GTTCCGCTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC TCGCCAATCGCACCCGAAATTACTAACACG GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC CATGCTTCCGCAGCACGAGTTAAATGATTA GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC ACTTATTTTGCTTTTTCGCCTTTATGCGCA GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC ATTGCTTTTCGTTTATCAGATTCAGGCACT GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC AAGCCTTCCGTCCACATTAACACGTTGACC GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC TATAGCGCGTTCCGTAGTTCACAAAGCCCG GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC ATTCTCACATGGTCGAAAATATTTTCAAC GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC TTGGCGGTATCAGTAAAGGCATTGGCGGA GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC AGTGATTTAAAAGCACCCTCTAATCCTTG GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC AAAGGTGTATATATTTTAGAAATTGTGGTT GTTCCACTTCATTCTAAAAAATCATAATTCTAAAAC
>NZ_LT906447.1|WP_095105813.1|1839110_1839638_-|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR MSERIVLDEAAMKRTLTRMAHEILEYNRGTKDLVLLGVKTRGEFLAKSIQSKIQQIEDTTVPTGTIDITQFRDDLELPTPKISEKSFVIDVDITDKVVIIIDDVLYTGRTVRASLDAILLHSRPQKIGLAALVDRGHRELPIRADFVGKNIPTARDEAVSVYVKETDGRNAVIIE >NZ_LT906447.1|WP_095105811.1|1837598_1838885_-|purine/pyrimidine-permease MENEQMFERTVKPVLDVNEKPKPSQWAFLSLQHLFAMFGATVLVPFLTGLPISAALLASGVGTLLYILITKAMIPAYLGSSFAFITPIITGLSTHSLGDMLVALFMSGVMYVIIGILIKLSGIGWLMHLLPPVVVGPVIMVIGLSLAPTAANMAMFENSADMKGYNVTYLIVAMITLVTTLVVQGYMKGFFSLIPVLIGIIVGYIAATILGIVDFKPVMKASWLDWPHIYLPFKDYTPSFHMGLILLMLPIVFVTVSEHIGHQMVINKIVGRNFFEKPGLHRSIIGDGVSTMFASLIGGPPSTTYGENIGVLAITKIYSIYVIGGAAVIAIILAFVGKFTALISSIPTPVMGGVSILLFGIIASSGLRMLVESKVDFSENRNLVITSVILVVGIGNLMFDIHGVKVEGMALAALSGIVLNLILPKAKA >NZ_LT906447.1|WP_095105808.1|1836645_1837554_-|aspartate-carbamoyltransferase-catalytic-subunit MKQLVSMEDLTNEEIYSLIETAIEYKKGNKPNKFTDKYVANLFFENSTRTKCSFEMAERQLGLQEIPFETSTSSVKKGESLYDTCKTLESIGVDALVIRHPQNDYYKELDGLNIPVINGGDGSGQHPTQSLLDIMTIYEEYGNFDGLNVLICGDIKNSRVARSNYQALTALGANVKFAAPDEWVDETLDAPYVKIDDVIEETDIVMLLRVQHERHDGELSFDPHEYHEKYGLTLERYNQLKPEAIVMHPAPVNRGVEIDSDLVEAPKARIFKQMKNGMFLRMSVITHILNEKKEGVIFDVAN >NZ_LT906447.1|WP_095105802.1|1835384_1836659_-|dihydroorotase MLLIKNAKVLNNNGELTEASILVENDKVKEIAPEIAVGNEVEVIDAKGRFAAPGLVDVHVHLREPGGEHKETIETGTKAAARGGFTTVCPMPNTRPVPDTVEHLEQLNKLIADNASVRVLPYASITVRQAGSELVDFKGLADHGAFAFTDDGVGVQTAGTMYEAMQQAAKVNKAVVAHCEDNSLIYGGAMHEGKRSEELGIPGIPNICEAVQIARDVLLAEAADCHYHVCHVSTKESVRAIRDAKRAGIRVTAEVTPHHLLMTEDDIPGDNAMFKMNPPLRSKEDREALIEGLLDGTIDCIATDHAPHAADEKDQPMVKAPFGIVGSETAFPLLYTHFVKNGDWSLQQLVDYLTIKPSKIFDLPYGTLEEGKTADLTLIDLEEEREIKAEDFQSKSSNTPFIGYKVYGNPVLTMVAGEVAFKED >NZ_LT906447.1|WP_095105799.1|1834271_1835378_-|glutamine-hydrolyzing-carbamoyl-phosphate-synthase-small-subunit MLAKRYLVFEDGSIYEGRKLGSDHLTKGEIVFNTAMTGYQETISDPSYTGQIITFTYPLIGNYGINRDDFESLVPTLNGVVVKEASTHPSNFRKQKTFDAVLKEFDIPGISGVDTRSITRKIRQHGVLKAGFTDHAEDIPELVESLKHFELSRDEVPTVSTKSPYVSTGFDLSVVLVDFGKKQNIVRELNARGCNVTVVPYNTSAEEIIRMAPDGVMLSNGPGDPEDVPEAIEMIKGILGKIPFFGICLGHQLFALSQGATSFKMKFGHRGANHPVKDLATGKVALTSQNHGYAIDADSVEQTDLEVTHIALNDQTVEGLKHKTLPAFSVQYHPEACPGPTDSNYLFDQFVSMMNEFKANEKERYTNA >NZ_LT906447.1|WP_095105797.1|1831105_1834279_-|carbamoyl-phosphate-synthase-large-subunit MPKNNEIKTILVIGSGPIIIGQAAEFDYAGTQACLALKEEGYKVILVNSNPATIMTDKEIADKVYIEPLTHDFIARIIRKEQPDALLPTLGGQTGLNMAIQLHDSGVLEANNVQLLGTKLSSIQQAEDRELFRSLMNELDVPVPESDIVNTVEQAFAFKEQVGYPLIVRPAFTMGGTGGGICHNDEELKEVVTNGLHYSPATQCLIEKSIAGFKEIEYEVMRDKNDNAIVVCNMENIDPVGIHTGDSIVVAPSQTLTDVEYQMLRDVSLKVIRALGIEGGCNVQLALDPHSMNYYIIEVNPRVSRSSALASKATGYPIAKLAAKIAVGLTLDEMLNPVTGTSYAAFEPALDYVISKIPRFPFDKFEKGERVLGTQMKATGEVMAIGRTYEESLLKAIRSLEYGVHHLGLPNGESYELDYIKERILQQDDERLFFIGEAIRRGTTLEEIHEMTQIDYFFLNKFQHIIDIEHELKEHKGDIEYLKYAKDYGFSDKVIAHRFDMTEDEVTELRKANDIHPVYKMVDTCAAEFESSTPYYYGTYERDNESIVTEKEKVIVLGSGPIRIGQGVEFDYATVHAVWAIQNAGYEAIIVNNNPETVSTDFSISDKLYFEPLTVEDVMNIIDLEQPKGVVVQFGGQTAINLADKLAEKGVRILGTSLENLNRAEDRKEFEALLNKIHVPQPKGKTATSPAEALENAREIGYPVVVRPSYVLGGRAMEIVYNDAELENYMREAVKASPEHPVLVDRYLTGKEIEVDAISDGETVIIPGIMEHIERAGVHSGDSIAVYPPQTLTPDEISTLEDYTTKLAKGLDIIGLINIQFVLAHDGMYVLEVNPRSSRTVPFLSKITHIPMAQLAMRAILGEKLSDLGYQPGLQPYTKGVFVKAPVFSFNKLKNVDITLGPEMKSTGEVMGKDLTLEKALFKGLTASGVEVKDHGTVLITVSDKDKDEMVKVAKRLNEVGYKILATAGTAQKLSEHHIPVETVGKIGGEDDLLTRIQNGEVQIVINTMTKGKTIERDGFQIRRASVENGVPCLTSLDTANALTNVIESMTFTMKQM >NZ_LT906447.1|WP_095105794.1|1830152_1830917_-|dihydroorotate-dehydrogenase-electron-transfer-subunit MEENIIVSNQEIADRIFEIKVKGPVTRKMKQPGQFVHIKVGEGSLHMLRRPISICHIEPELDTFTMLYRAEGAGTQRLSEMKAGDTIDIIAPLGNGFPIEKAERKALLVGGGIGVPPLYELSKQLNRLGIETVHVLGFRSKKDVFYAEQFEQLGETHIVTEDGSMGAKGFVTNVISDLPVDYDIYYTCGPKPMLKAIKEHEKLADVEGFLSLEERMGCGIGACYACVCHTPESDTSYVKVCTDGPVFEKGAVIL >NZ_LT906447.1|WP_095105791.1|1829238_1830156_-|dihydroorotate-dehydrogenase MSRLNVEIPGLDLKNPVMPASGCFAFGAEFSQFYDLSELGAIMIKAATKEARYGNETPRVAETDSGMINAIGLQNPGVHHIIEHELKKLEQFDVPIIANVAGSIEEDYVYVAEHISKAPNVKALELNISCPNVKEGGMQFGVDPQVAAELTRKVKAVSEVPVYVKLSPNVTNIVEMAEAIAEYADGLTMINTLVGLRIDGKSGRPIIANTVGGLSGPAIKPVALRMVYEVRKAVDIPIIAMGGVQNAQDVIDYISVGANAVAVGTANFQNPMVCKEIIDELPALLDKLGVNHINELYGRTHEVTK >NZ_LT906447.1|WP_095105788.1|1828534_1829239_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase MTNTNLPLPIIALDFATAEEVENFLDLFDEPLYIKIGMELYYQTGPELINRIKDRGHHLFLDLKLHDIPNTVKQAMAGLGRLNVDLVNVHAAGGTEMMRQAVEGLRSVNKDTKIIAVTQLTSTTEEMLNKEQNIQTTIEEAVLNYAKLTKQAGLDGVVCSPLEAKLLTDELGPEFLKVTPGIRPADYGQDDQKRITTPDEARKLGSTHIVVGRPITQSENPVESYHQIKESWLG >NZ_LT906447.1|WP_095105784.1|1827921_1828533_-|orotate-phosphoribosyltransferase MSKKIAQSLLDIGAVALSPNDLFTWSSGIKSPIYCDNRVTLGYPAVRNDIRDGLIELIQEHFPEAEIVSGTATAGIPHAAFISEKLDMPMSYVRSKSKSHGKQNQIEGAPSKGKKIVVVEDLTSTGGSSLVAAEALREAGAEVLGVVAIFTYGLAKADTMFKEADLPLYTLSNYNELIDVAEDEGKISTEDIKSLVEWRDNLA >NZ_LT906447.1|WP_095105816.1|1841072_1841924_-|hypothetical-protein MKVVGAFNHPVEIAKQQLNVISFQESRKINTLIEGLIKYSCSKAKHYDEKVRLVTDDYQTILPNRINLIVVPCGDMNLFDSKIFKAALYHRFEQQIFSDEMTNLLYNEVELTIEKFLNSLEIKNESYQVDFQTPNIVLKKFLGMFKPDFHNDLENLDTIEQRKLFIDTLASTEKENVLVLIFPETKLGLLDMKLFKNYIKKLNMYTIIVTSHPYFIIEADILALVKTNGEAVDIEQIKDELVLFKSEEAIKDISKTSKMIAYHEFCQHPYLDDELFIQFTNKY >NZ_LT906447.1|WP_167376370.1|1841920_1842229_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 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MKKTNPYILSLDIGTASIGYACMDLDFNILKYHDKDAIGVLTFEGADTAAERRGFRTSRRRKNRRIKRLGLLQEVLAPLVKNPNFYQLLNLHKWKNSNEDFKHRSLSEVLKNLGKNPKTYPTIYHLQQEIQNHPEKKFEPELIFLSLYHLVKYRGHFLFNNLSFDKGKTVDNEAQLSELLIQYQSINPYEDTISNKDIKVIIDTLNDDYLTRNDKFKDLKKKVSKSHAELFKMLAGLKFKQSNLFENMENAEDIKETTTGSDSISLSEDYYENLSEFLTDEQLNFIESANTFFMGIMLDRILKGASSISAAKVRDYDNFKNQLKLIKDIVYQNKYDKYHEFFVTSKENMNAYKKNPDAKNFGKLSKFDQYLIHPKDQYSKLMKDLKEIVPKAYTEVLNLIEEQKFLVLQNTIDNASIPYQNNVFEAVNILRNQQKYYPEITEEMIDKVINLITFRIPYYVGPITNKNGQSDFAWMVRKSDGQTLPWSFDKVIDKSKSAEKFIRRMTSKCTYLLEEDVLPKNSLLYQEMEVLNELNNVQLRGENEPKNRIHRLEPKVKQFIYHKLFQKKKNVTHKDIIELLQNSEYGSMINKLSGQKVKVFGTQNESKFATKLSTYNDMKSIFGSVESRRDMIEQLVLWITIFEDKAILKEKIQEKYPNITENQLSQIIKLNYSGWGRLSEKLLTEEVNNRSVIDLMYNTENNFMEIITDKTLGFVEFIKNSNKVKNAKISYKDVAELRTSPALKKGIWNAIKMVREISGIFGVPEKIIIEFATEDQVKGKRQKSRSELWDDLVKKHNLKRNKEFKDLFEELKVYPEFDFSNPKLWLYIHQNGKCMYSKQPIDLGKLISDKNDSLYEIDHILPRTFVKDDSINNKVLVIKSTNQKKSGDKMPLEIFDNHTLVPFWKLLHENDLISSSKLSKLMKKEFNDLDKEGFIQRQLVETRQIISHVSDFLTEEYPSTTVVPMKANVVSELRRKFDIPKIRQLNDWHHAVDAYLNGFVYQAARVLYPKVNLFEFNFKWEKVREKWKQLGEFTENNKQREFFLFKRMEKYVNEYGERMISKLIFDLDNFKFNYSRKVESTESAFYKQSAFSPKNTVALYESDKSNTAVYKEMKNKRGIVVSYAYLKKDKEIIDYGVFNETVFDYVNNLDKDMNARALKIVQKTFPKLDIKKAQYLFSLNKGDAIFVNSHPFLFVSAKERINAKQLEFDIHMQRKLKQALNPYNKMTELEKTEVYDQFAEKVVMEFENSFGIKSRNEKVELIRNQFNESDKSNEALIQCILEVLKMTKVSAERSAKLKIRWNGQSPNTFIDIKNNTEIQYKSITGLKTIKPKSIFKLAESKNEL >NZ_LT906447.1|WP_095105826.1|1847399_1848317_-|RluA-family-pseudouridine-synthase MTEFNYEITEAEQAGQRIDKLLPEFNSDWSRSQIQDWIKEDLVTVNGKKVKANHKVKLNDKIEVTEKETVEADIKPENLNLDIYYEDADVAIVYKPKGMVVHPSPGHYTGTLVNGLMYQIKDLSGINGEIRPGIVHRIDKDTSGLLMVAKNDIAHRNLVEQLMAKTVTRKYTALVHGNIPHDYGTIDAPIGRDKKDRQSMAVVDDGKDAVTHFNVLEHFKDYTLVECELETGRTHQIRVHMKYIGHPLVGDPKYGPKKTMDIGGQALHAGVIGFEHPVTGEYIERKADLPDDFKQVLEDIRLREA >NZ_LT906447.1|WP_095105828.1|1848329_1848812_-|signal-peptidase-II MKKPYFVSITLFITIAILVLDQVTKAVIAKSMAVGDSYTVIPKFLYITSHRNNGAAWGILSGRMSFFFIVTVVVLGLLVFFYIKEAKGNFLMQVAISLLFAGALGNFIDRMLHGEVVDFIDTKIFSYDFPIFNVADSSLTIGVILVLIALLFDSRKSKVQ >NZ_LT906447.1|WP_095105832.1|1849152_1849503_-|hypothetical-protein MNKNNIYKIEYNDIIDFRLLLNDYINCFTRKKCFLHISDKSIKVAEIRFSKDHLPHILGLHKVINESANVFLTKILQGKLTHSSIKKHHNYQNIKDWLYSYNFLHRCFIEKIWHGV >NZ_LT906447.1|WP_095105834.1|1849819_1850311_-|CHAP-domain-containing-protein MKKLLKIAVLLVIFGGAAFFFYENKNEVAKWIEQLKPDPMRNNTYEKGQCTYYVFDKVKKDGNLISNRWGDAENWAKDAKKDGYVVNHKPAVHALMQTTKGKLGHVAYIEHVNKDGSFDVSEMNYIKPYKVSSRPITAEEAKTYEYIHPKKNPKAKDEKGKTE >NZ_LT906447.1|WP_095105836.1|1850323_1851118_-|VOC-family-protein MTEYKRDHYPNGVTLNVRDKEALKPFYEDMLGFTVMNETYTSIQYEVGDSGHRITLRQLDHGREPLVSEAGLFHIGIKLPTHADLADLMAHLTEQDIVINGAEHDVSTSIYLSDPEGNGFEFYADLPEETWNYDKEDRVIMDTRPLYASKLMNLRTHKDWETLPPDTKIGNVHLKTIRLKEVKDFYLKYFGLAESSYVNSSSLFMASGGYHHHLAVNHWMSSMKRMESSETYGLAYVDYHYPETAHKWIKGPDGIEFRFNYLGA >NZ_LT906447.1|WP_095105838.1|1851326_1854074_-|isoleucine--tRNA-ligase MNYKDTLLMPKTDFPMRGGLPKKEPEIQKQWDEQDLYHKILEKNKGHESYILHDGPPYANGNLHMGHALNKILKDFIVRYKSMQGYYSPYVPGWDTHGLPIEQALTKKGVKRKEMPISEFRKLCEEFALEQIDIQKKDFKRLGVNGDFNDPYITLKPEYEAAQIRLFGEMADRGLIYKGKKPVYWSPSSESSLAEAEIEYHDKRSPSIYVAFDVKDGKGVVDEDAKFIIWTTTPWTLPSNVAITVHPDLKYGQYNVNGEKYVVGQDLVEEVAEELGWNKEDIQLEKEFTGKELEYVETQHPFIDRVSLVINGLHVTTDAGTGAVHTAPGHGEDDYIVGQKYGLPVISPLNDKGVFTEEGGQFEGMFYDKANKAVTDLLKENGSLLKLKFITHSYPHDWRTKKPVIFRATPQWFASISKVRQDILDAIEDTHFKVDWGKTRIYNMIRDRGEWVISRQRVWGVPLPVFYAENGDIIMDKEVIYHVANLFEKYGSNVWFDREAKDLLPEGFTHPGSPNGEFTKEEDIMDVWFDSGSSHRGVLETRPELSFPADLYLEGSDQYRGWFNSSITTAVATRGQSPYRMLLSHGFVMDGEGKKMSKSLGNVIVPDQIVKQKGADIARLWVSSVDYLADVRISDEILKQTADVYRKIRNTLRFMLGNVNDFNPETDAVPEAELLEVDRYLLNRLREFTESIINHYDNFDYLNIYQEVQNFINVELSNFYLDYGKDILYIEKQDSHKRRSMQTVLYQILVDMTKLLAPILAHTAEEVWSYIPHVKEESVHLANMPEVVKPDEELLEKWNTFMKLRDDVNRALEEARNNKVIGKSLEAKVIIGSNESFDAADFLKDFENLHQLFIVSQVEVEDKVEDGTEYYHGDIKVVHADGEKCERCWNYSTELGSVNGLDHLCPRCQGVVADL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT906447_2 | 1904211-1904308 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT906447_2
|
1 spacers
spacers of NZ_LT906447_2
>2.1|1904239|42|NZ_LT906447|CRISPRCasFinder GGCTAACTAGAATAGGGAACAGAACAGAAATAACATGGGCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT906447_2
The CRISPR arrays of NZ_LT906447_2 >merge|NZ_LT906447|2|1904211-1904308|CRISPRCasFinder AAATTATTTCGTCGTTCTGCCCCAGCAAGGCTAACTAGAATAGGGAACAGAACAGAAATAACATGGGCTAAAATTATTTCGTCGTTCTGCCCCGGCAA >NZ_LT906447|2|2|1904211-1904308|CRISPRCasFinder AAATTATTTCGTCGTTCTGCCCCAGCAA GGCTAACTAGAATAGGGAACAGAACAGAAATAACATGGGCTA AAATTATTTCGTCGTTCTGCCCCGGCAA
>NZ_LT906447.1|WP_095105928.1|1903242_1904169_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MVKISRLLRNSVAGAAGIVSGLILYSKFKGQPESHPIPPFFTRKNQYIFAHRGGMALRPELTQLAFDTAQDYEVDGFETDVRVTRDEQLIVFHDAEVDRTTNGSGKVSEHRLDEIQRLDAGYHFKDINNETPYRNHPDAKIMTFDELLEAYPEMLINVDLKDHPDSMEGQIAPELIYESIVRHNAQNRVLVTSFYQEQIRRFNEISLGTVAIGASEEEVTVGLMKFFAGLGNMFEVQANTFQMPTTYHNIPLTSVRLINWLNERNIVPGYYGVNSIDLMGDLFNKGAHTVVTDRPDLAFQYRQNQVKK >NZ_LT906447.1|WP_095105927.1|1902852_1903107_-|DUF2129-domain-containing-protein MTEIIPRTSLIIYLKHMKHERHIRKYGHIIHSNRQQKYVIMYINENDADRIVNRLMKLKYVRQIDGSPYKYLKKTYEKEKYEIN >NZ_LT906447.1|WP_095105926.1|1902410_1902800_+|hypothetical-protein MKQSFIVLGEGLTDLFEFKTLIEYDHSRINRIVFFNSPDSHKGLSSAAIIMNPTEGNYFQAMYIMVNAFPYPHPEDNKKSEMIRNWAEQYDLTLNELDVKSTDDFPDLELYFNYLVGVLRLYHWIPPLQ >NZ_LT906447.1|WP_095105924.1|1901797_1902349_-|16S-rRNA-(guanine(966)-N(2))-methyltransferase-RsmD MRVIAGKHKSKALESLEGRNTRPTMDKVKEGIFNSLHEVSGIGLDLFAGSGGLGIEALSRGMDEMIFVDQNFKAVKIIKNNLKNLDLTKQSEVYKNNADRALKALAKREIQFDIIFLDPPYQKGLIDDALAKIEEFNLLKKSGIIVCEFNHKENIDIQSFEVIKRYHYGLTDTMLLEKGERDD >NZ_LT906447.1|WP_046100552.1|1901319_1901805_-|pantetheine-phosphate-adenylyltransferase MTESKAVIPGSFDPITYGHVDIIERVAQRFDEIHICVLKNSNKEGTFTVEERMALIEASVADIPNVEVHQFNGLLVDFCDEVGAKTIIRGLRAVSDFEYELRLTSMNKKLNSDVETLYMMTSTNYSFISSSVVKEVAQYKADISEFVPEPVEKALKEKFGK >NZ_LT906447.1|WP_095107295.1|1900311_1901262_+|ornithine-cyclodeaminase MQVFSETQVEEHYKMSDAIRDIEQAFGHLEDIQQAQRTVIPTGEGAKAMLYMPCVDLKQQLGTIKITSITPDNPKSGKPTTQAQIVITSLDNGEHKAIIDGSYLTRLRTGALSGIATQYMSKAEAHILGMIGTGGMAYEQFLGNMEVRPIDTVILYNRTTEKAKTFKQRILKDYPNLEVKVTEDVSELVKQSDIINCQTPSTEPVFKAGDVQPGTHINGIGSYQPSMKEIDYNIFPKADWVVVDDLEGVKDESGELIEANDEGVFTFEEIDDELKTLSLNKQTRKNDEAITVFKCVGAAYFDLAVAVGAYQKLNQE >NZ_LT906447.1|WP_095105922.1|1899139_1900282_+|nucleotidyltransferase MKCAALITEYNPFHNGHVYHAEQARQIADADVTIAIMSGQFVMRGEPAIYNKFLRTQMALSTCDLVVELPAYAALSAGEYFAQTGVEVADYMNADALVFGSESGSIQAFEELALQINHIEEHPEFQLKLREGKSYPRIINELLEEPALLQTPNNILGLSYVQAILKSAPTIQPFSIPRHKTEHHNQVINDQHFASGTAIRHALNTNDKMWEKVVPENIRSLYVEPHLSMNQLFPFLKYKIISTDPAELHEIHTISEGFEHRIKAHIINTDTFEQLMSQLKTKRYTYTRIQRMLMNILLNFKQQNKPRTLEAVRILGMNETGQRYLKQLKQQFPERRYITNVNKTNALYFQPEIKATEIYNLISGQTQTDFNTPVIRVKNE >NZ_LT906447.1|WP_095105921.1|1898460_1899012_-|DNA-binding-protein MKWSITQLRKYQGKPFEFDQTVNFNHLIDKLGLIDLSEIRVKGQLDVKSNEVVADMHITGEYTMEDARTLEPVKVPIDVETTEIFDLEGHEYSDDEDDENEHYHLALSGMIDLRDIAEELVIIEKPIRAVADDSSIDDMLQGGQGWDVIDEDELEQNEQAEEESSKKVDPRLQKLQQFYDEKQ >NZ_LT906447.1|WP_002480558.1|1898201_1898375_-|50S-ribosomal-protein-L32 MAVPKRRTSKTRKNKRRTHFKLSVPGMTECPNCGEYKLSHRVCKNCGSYNGEEVVSK >NZ_LT906447.1|WP_095105919.1|1896807_1897554_-|RNA-methyltransferase MEQITSAQNAKIKQANKLKKKKERDKTGLILVEGTHLIDEAIKSGLTIQQLFVVEPERFAPELVEAAEEQYQINFKVAEVLSGTVTPQGIFAVIEKPDVSKQAEASQQVLLLDRIQDPGNLGTLIRTADAAALDLIVMSPGSADPFQDKVLRASQGSVFHLPIISNDIKEFVEHFDGPVYGTALEDAINFNDTAAQEKFALLLGNEGQGVDPELLEYTTERLTIPMYGKAESLNVAIAGSILIYKLKG >NZ_LT906447.1|WP_095105929.1|1904859_1905300_-|YlbF-family-regulator MINTEVIDVLDQVDKVSDMILDSDIYQAYTKARSVMNDDPVAHARYQEFMKNKARYDEVMRFGKYHPDYQQVTRATRKCKREYEMVPSVMAYKQQEVELQNLVDEVITIIATSISEHVKVEVGNPFFRTDMHGCSTGGTCQCKVHA >NZ_LT906447.1|WP_095105931.1|1905318_1906359_-|CAP-domain-containing-protein MRNLLIKVIGVLLLITFLIYLFYSPRLKFDVLENPNKKAPTKTELIKKNNNQTENPKPKTGIGTWINNDISLLTKKFGQADRVYAYHDNYKNYVFRENNQYYIVTTKENKIKSVYATGSKAEISPVKINQNASHIFENTSINPEPRIKANGKEYDLELSDEDMKTQMLIKYGDEYAQVYIDQQNNKVVGVRFLDPEALVMFNPYQMTKASDDKTIENNHKEEPYEQNANQLMTLYEVTNQIRNLKGLKPFKVNNDLGHIASVNLYESTNNKSVEFTEAALKQQLDDRGVHFKSVGQNVGYDFNDVPTLLHSWLNSDTHRSRILNTQYTEMGGDVMDGYYTLIFIED >NZ_LT906447.1|WP_095105932.1|1906492_1906954_-|DUF420-domain-containing-protein MSLPILPTISTSCIQICAVLVAIGWYLIRKGNIEAHKKVMLAAAFFALTFFIIYASRTFFIGNTAFGGPAWLKGPYTFFLVFHIILSTVGGLLGLNQIITAFKDKFNIHRKMGPIAAVVWFCTAFTGIIVYILLYVMYPGGETTSLFKATFGF >NZ_LT906447.1|WP_095105933.1|1906979_1907891_-|protoheme-IX-farnesyltransferase MDKGHTLSQTSGRVTFKELKTIIKMGLVQGNLIPAFAGSWLAIVLANHSFLSSIPQILLMLIGSTLIMGGACALNNYYDQDIDRIMPSKQGRPTVNDRISNKNLLILSFGMMVIGEIALFILNIPSGVIGLMGMIGYVSFYSIWSKRHTTWNTVIGAFPGAVPPLIGWTAIEGQLSMTAIALFLVIFCWQPIHFYALAIKRQDEYSAANIPMLPSVKGFNRTRIGMFVWLVLLLPLPFLLSDLGPVFIGLATLLNLGWIYLGFTSYKKKSDHMKWATLMFVYSLNYLVLFFALVVVISLINMI >NZ_LT906447.1|WP_095105934.1|1908162_1909089_+|heme-A-synthase MFKKRNLKWLSILATIIMAWVQLGGALVTKTGSANGCGSSWPLCHGALLPQNLPIDTIIELSHRATSALSLIVVLWLVITAWKNIGYIKEVKPLSIISVGFLLIQALVGAAAVLWQQNDYVLALHFGISLISFSSVFVLTLIIFDVDQKYEANKVHIDRKLRIYTWTMAICLYVGIYTGALVRHTKSSMAYGSWPLPFADLIPHTEQDWVQLAHRTLALIASISVFLAFNYAIKHYQNNRTIRYGYTAALLLIILQIITGALSIFTHVNLLIALLHALIITFEFGLIAYFILLMLRTKRVEKAKNNAY >NZ_LT906447.1|WP_095105935.1|1909441_1912891_-|pyruvate-carboxylase MKKINKLMVANRGEIAIRIFRAATELNIKTVAIYSNEDKGSLHRNKADESYLVGEDLGPADSYLNIERIIQVAKNAGVDAIHPGYGFLSENETFARRCAEEGIIFVGPELKHLDMFGDKVKARATAIEAGLPVIPGTDGPIEDYHKAADFAKEAGYPLMIKATSGGGGKGMRIVNSEDELEEAFSRAKSEAEKSFGNSEVYIEKYINEPKHIEVQIMGDSEGHIVHLYERDCSVQRRHQKVVEVAPSVGLDEGLRERICEAALQLMNNVGYVNAGTVEFLVSGDDFYFIEVNPRVQVEHTITEMITGIDIVKTQILVADGESLFGEEIGMPRQEDIQTLGYAIQCRITTEDPENDFMPDTGHIIAYRSSGGFGVRLDAGDGFQGAEISPYYDSLLVKLSTYAMTFKQTIEKMDRSLREMRIRGVKTNIPFLINVIRNKQFQEGDYTTKFIEETPELFNIQATQDRGTKTLEYIGNVTINGFPNVEKRPKPDFERPHIKQIPQAEINQLRGTKQLLDEQGPKAVADWLLKQDDVLITDTTFRDAHQSLLATRVRTNDILAIASETAEILQDAFSLEMWGGATFDVAYNFLKENPWERLEKLRTAIPNVLFQMLLRASNAVGYKNYPDNVIKKFVKESAEAGIDVFRIFDSLNWLDQMKVANEAVQEAGKISEGTICYTGDILDPARSNIFTLEYYVNLAKELEREGFHILAIKDMAGLLKPKAAFELVGELKAAINLPIHLHTHDTSGNGILVYKQAADAGVDVIDTAVSSMSGLTSQPSANSLYYALNGFGRDARTNIEGLERLGQYWDTVRHYYSDFESDFKSPNTEIYQYEMPGGQYSNLNQQAKSLGLGNRFHEVKDMYRRVNFLFGDIVKVTPSSKVVGDMALYMVQNDLNEEDVIKDGYKLDFPESVVSFFKGEIGQPTSGFNKELQKVVLKGQEPLTERPGEYLQAIDFEALREELQAKQEKPVTDQDLISYAIYPKVYEQYINTKEQFGNISLLDTPTFFFGMNVGETVEVEIDKGKTLIITLEAITEPDDKGIRTIFFIMNGQTRQIKIQDENVKTDATVKPKADKSNPNHIGAQMPGTVSEVKVAVGDHVDAGQALLITEAMKMETTVQAPFAGTVKKVTVTDGEGIQTGDLLVELEKDE >NZ_LT906447.1|WP_095105936.1|1913311_1914532_-|FtsW/RodA/SpoVE-family-cell-cycle-protein MNNLKAIFRHVAKYSKFIDYPLVITYITLCLIGLIMVYSASMVAATKGTLTGGIPVSGTYFYTRQLMYVIMSFIIVFFMAFFMNVKFLQQKKVQQGMMFIIFILLFATLLIGKDINGSKSWINLGFMNLQASELLKIAIILYLPYMINKKRPQVFTNSKLIRGPIIFILLCVGLVFLQKDVGQTMLILIIFFSILFYAGIWVKQVLKYGIGIFILGIVIFGGAALLGLLPPYLVARFSIVTNPFKYESGTGYHVANSLMAIGNGGLFGKGLGNSVLKLGYLPEPHTDFIFAVICEELGLVGGMLVLGLLFFIVYRAFRLASQTTSYFYKLVCVGIASYIGSQTFVNLGGISALIPLTGVPLPFISFGGSSMIALSIALGLLLITAKQIKLDKKRAKQQHVDIPRKY >NZ_LT906447.1|WP_095105937.1|1914774_1915050_-|YlaN-family-protein MAKTKSINNAAYDQLNKDADRILQLIKVQMDNLTLPQCPLYEEVLDTQMFGLQKEVDFAANLGLIDIEMGKEIMLRLEKELSKLHEAFTNV >NZ_LT906447.1|WP_095105939.1|1915186_1915669_+|hypothetical-protein MIQIKGNVKFPITLDSTTWIFDDRKVKIEDLENGVFEGTKPIEFQNNRAWNRAILEGQTNPPTLNSETKYKKRAMIEDTFVINMTPFFKNAEPSDNATAIRLSNDEDSIEIPISLLPYLFFKFADHGKRLYDDNGVDSFIYIPEEGYSHEFKHVIYIEVV >NZ_LT906447.1|WP_095105945.1|1915670_1915859_+|DUF2197-domain-containing-protein MKKVQCIICDTEVLIDENTLEAKQLKNNPMRTFMCGECKSRLDVPKQRNNFYQENNEFHFNE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT906447_1 | 1.24|1840762|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840762-1840790 | 29 | MK504442 | Lactobacillus phage 3-SAC12, complete genome | 32308-32336 | 5 | 0.828 |
NZ_LT906447_1 | 1.16|1840236|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840236-1840264 | 29 | NZ_CP013110 | Sinorhizobium americanum strain CFNEI 73 plasmid C, complete sequence | 241805-241833 | 6 | 0.793 |
NZ_LT906447_1 | 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840957-1840986 | 30 | MN694527 | Marine virus AFVG_250M568, complete genome | 22929-22958 | 6 | 0.8 |
NZ_LT906447_1 | 1.18|1840366|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840366-1840395 | 30 | NZ_AP017961 | Synechococcus sp. NIES-970 plasmid plasmid2 DNA, complete sequence | 57001-57030 | 7 | 0.767 |
NZ_LT906447_1 | 1.25|1840827|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840827-1840855 | 29 | MK016664 | Synechococcus phage S-B68, complete genome | 105703-105731 | 7 | 0.759 |
NZ_LT906447_1 | 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840957-1840986 | 30 | NZ_CP015351 | Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p150790, complete sequence | 139944-139973 | 7 | 0.767 |
NZ_LT906447_1 | 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840564-1840593 | 30 | MT822286 | Erwinia phage pEp_SNUABM_10, complete genome | 23777-23806 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840564-1840593 | 30 | MT822284 | Erwinia phage pEp_SNUABM_03, complete genome | 21597-21626 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840564-1840593 | 30 | MT822287 | Erwinia phage pEp_SNUABM_11, complete genome | 23775-23804 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840564-1840593 | 30 | MN184885 | Erwinia phage pEp_SNUABM_09, complete genome | 23782-23811 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840564-1840593 | 30 | MT822285 | Erwinia phage pEp_SNUABM_04, complete genome | 23782-23811 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840564-1840593 | 30 | MN855773 | Siphoviridae sp. isolate 219, complete genome | 39393-39422 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840957-1840986 | 30 | MK250021 | Prevotella phage Lak-B2, complete genome | 16677-16706 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840957-1840986 | 30 | MK250024 | Prevotella phage Lak-B5, complete genome | 15743-15772 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840957-1840986 | 30 | MK250028 | Prevotella phage Lak-B9, complete genome | 16656-16685 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840957-1840986 | 30 | MK250023 | Prevotella phage Lak-B4, complete genome | 16677-16706 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840957-1840986 | 30 | MK250025 | Prevotella phage Lak-B6, complete genome | 15712-15741 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840957-1840986 | 30 | MK250022 | Prevotella phage Lak-B3, complete genome | 15745-15774 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840957-1840986 | 30 | MK250027 | Prevotella phage Lak-B8, complete genome | 16677-16706 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840957-1840986 | 30 | MK250026 | Prevotella phage Lak-B7, complete genome | 16677-16706 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1840957-1840986 | 30 | MK250020 | Prevotella phage Lak-B1, complete genome | 16636-16665 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906447_1 | 1.1|1840107|33|NZ_LT906447|CRT | 1840107-1840139 | 33 | NC_015417 | Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925, complete sequence | 46690-46722 | 9 | 0.727 |
NZ_LT906447_1 | 1.3|1840236|34|NZ_LT906447|CRT | 1840236-1840269 | 34 | NZ_CP013110 | Sinorhizobium americanum strain CFNEI 73 plasmid C, complete sequence | 241800-241833 | 10 | 0.706 |
1. spacer 1.24|1840762|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK504442 (Lactobacillus phage 3-SAC12, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
attctcacatggtcgaaaatattttcaac CRISPR spacer attcacaaatggtcgaaaatattcagaac Protospacer **** ** ***************. ***
2. spacer 1.16|1840236|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013110 (Sinorhizobium americanum strain CFNEI 73 plasmid C, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
aaatcattatcaataccgcgtatcgctaa CRISPR spacer caatcattatcaatcccgcgcatcgcggc Protospacer ************* *****.***** .
3. spacer 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN694527 (Marine virus AFVG_250M568, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaaggtgtatatattttagaaattgtggtt CRISPR spacer gaaggtatatatattttagaagttattgat Protospacer .*****.**************.**.* * *
4. spacer 1.18|1840366|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_AP017961 (Synechococcus sp. NIES-970 plasmid plasmid2 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcgccaatcgcacccgaaattactaacacg CRISPR spacer gcgccaatcgaacccgaaatttctagaata Protospacer ********* ********** ***. *..
5. spacer 1.25|1840827|29|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK016664 (Synechococcus phage S-B68, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
ttggcggtatcagtaaaggcattggcgga CRISPR spacer tgttcggcatcagtaaaggcattggtgtc Protospacer * ***.*****************.*
6. spacer 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015351 (Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p150790, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaaggtgtatatattttagaaattgtggtt CRISPR spacer gaaggtgtttatattttagatattcttatg Protospacer .******* *********** *** * .*
7. spacer 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MT822286 (Erwinia phage pEp_SNUABM_10, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgcttttcgtttatcagattcaggcact CRISPR spacer cgcgctttgcgtttatcagattcagtctga Protospacer .***** **************** *
8. spacer 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MT822284 (Erwinia phage pEp_SNUABM_03, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgcttttcgtttatcagattcaggcact CRISPR spacer cgcgctttgcgtttatcagattcagtctga Protospacer .***** **************** *
9. spacer 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MT822287 (Erwinia phage pEp_SNUABM_11, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgcttttcgtttatcagattcaggcact CRISPR spacer cgcgctttgcgtttatcagattcagtctga Protospacer .***** **************** *
10. spacer 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN184885 (Erwinia phage pEp_SNUABM_09, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgcttttcgtttatcagattcaggcact CRISPR spacer cgcgctttgcgtttatcagattcagtctga Protospacer .***** **************** *
11. spacer 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MT822285 (Erwinia phage pEp_SNUABM_04, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgcttttcgtttatcagattcaggcact CRISPR spacer cgcgctttgcgtttatcagattcagtctga Protospacer .***** **************** *
12. spacer 1.21|1840564|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN855773 (Siphoviridae sp. isolate 219, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgcttttcgtttatcagattcaggcact CRISPR spacer cccggtgttcgtctatcagattcaggcaga Protospacer ..* * *****.***************
13. spacer 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK250021 (Prevotella phage Lak-B2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaggtgtatatattttagaaattgtggtt CRISPR spacer aaatgtgtatatattctagaaatttaaaag Protospacer *** ***********.******** ..
14. spacer 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK250024 (Prevotella phage Lak-B5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaggtgtatatattttagaaattgtggtt CRISPR spacer aaatgtgtatatattctagaaatttaaaag Protospacer *** ***********.******** ..
15. spacer 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK250028 (Prevotella phage Lak-B9, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaggtgtatatattttagaaattgtggtt CRISPR spacer aaatgtgtatatattctagaaattaaaaag Protospacer *** ***********.********. ..
16. spacer 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK250023 (Prevotella phage Lak-B4, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaggtgtatatattttagaaattgtggtt CRISPR spacer aaatgtgtatatattctagaaatttaaaag Protospacer *** ***********.******** ..
17. spacer 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK250025 (Prevotella phage Lak-B6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaggtgtatatattttagaaattgtggtt CRISPR spacer aaatgtgtatatattctagaaattaaaaag Protospacer *** ***********.********. ..
18. spacer 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK250022 (Prevotella phage Lak-B3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaggtgtatatattttagaaattgtggtt CRISPR spacer aaatgtgtatatattctagaaattaaaaag Protospacer *** ***********.********. ..
19. spacer 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK250027 (Prevotella phage Lak-B8, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaggtgtatatattttagaaattgtggtt CRISPR spacer aaatgtgtatatattctagaaattaaaaag Protospacer *** ***********.********. ..
20. spacer 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK250026 (Prevotella phage Lak-B7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaggtgtatatattttagaaattgtggtt CRISPR spacer aaatgtgtatatattctagaaattaaaaag Protospacer *** ***********.********. ..
21. spacer 1.27|1840957|30|NZ_LT906447|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK250020 (Prevotella phage Lak-B1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaggtgtatatattttagaaattgtggtt CRISPR spacer aaatgtgtatatattctagaaattaaaaag Protospacer *** ***********.********. ..
22. spacer 1.1|1840107|33|NZ_LT906447|CRT matches to NC_015417 (Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cgtttccttgttagattcttaacattctgttct CRISPR spacer ttcttacttattagattcttaacattctctatc Protospacer . .** ***.****************** * ..
23. spacer 1.3|1840236|34|NZ_LT906447|CRT matches to NZ_CP013110 (Sinorhizobium americanum strain CFNEI 73 plasmid C, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaatcattatcaataccgcgtatcgctaacttct CRISPR spacer caatcattatcaatcccgcgcatcgcggccaaga Protospacer ************* *****.***** . *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
669959 : 702690
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT906447|669959:702690|DBSCAN-SWA TATGAATAACGGATTTTTCGGAAATGATTTTGACTCAATTTTTAGAAGAATGATGCAAGATATGCAAAACGCAGATGGAAATAAAAAATATTATATCAACGGCCGCGAAGTGTCACCTGAGCAATTGCAACAAATTCAACAACAACAAGCTCAAGGCGGACAACCAGCACAAGGTGTTCAAGCAGGACAACCTGGTCAAGCTGGCGGCGGTCAAGGCGGCGACGATTACTTAGAAAAAATCGGCCGTAATTTAACACAAGAAGCTAAAGACGGTTTATTAGATCCAGTTATTGGCCGTGACAAAGAAATTCAAGACACTGCAGAAGTGTTAAGCCGTAGAAATAAAAACAACCCTATCTTAGTAGGTGAAGCTGGTGTAGGTAAATCAGCAATTGTTGAAGGTTTAGCACAAGCCATTGTAAAAGGTAACGTGCCAGCTGCAATTAAAGACAAAGAAATTATTGCAGTCGATATTTCTTCATTAGAAGCAGGCACACAATATCGTGGTGCTTTTGAAGAAAATATCCAAAACTTGATTAACAGTGTAAAAGAAAGAAAAAATGTCATCTTATTCTTTGATGAAATCCATCAAATTATCGGATCTGGTTCAACTGGCGGAGACTCAGGAAGCAAAGGCTTATCTGATATCATCAAACCAGCTTTAGGTCGTGGAGAAATTTCATTAATCGGTGCTACAACTCAAGACGAATACCGTAACAACATCTTGAAAGACCCAGCATTAGCACGTCGTTTCAACGAAGTAGTTGTCAAAGAACCTTCAGCTAAAGATACTGAAGAAATCTTGAAAGGTGTACGCGAAACATTCGAAAAACACCATAACGTGAAATTACCTGACGAAGTCTTAAAAGCATGTGTAGACTTATCTATTCAATATATTCCACAACGCTTATTACCAGATAAAGCTTTAGACATCTTGGATATTACAGCTGCACACTTAGCTGCTAAAAATCCAGTTGTAGATAAAGTGGAAGTTGAAAAACAAATCAAAGAATTAGAAGATAAAAAATCTAAAGCAGTCAGCGAAGAAGCTTATTCTGAAGCAGATAAATATCAAAAACAAATTAAAGAATTACAAGACAGCTTAGAGTCAGGCAACGGCGAAGCTACAACAGCTACTGTACAAGACGTGGCTGCTACTGTAGAACGTATTACTGGCATTCCAGTATCACAAATGGACGATAATGATATCGAGCGCTTGAAAAACATTTCAAAACGCTTAAAAGATAAAATTATCGGACAAGACAAAGCCGTTGAAATGGTGTCTCGTGCAATCCGCCGTAACCGTGCAGGATTCGACGAAGGCAACAGACCAATCGGCAGCTTCTTATTCGTAGGTCCTACTGGTGTAGGTAAAACAGAATTAGCTAAACAATTATCTATCGATTTATTCGGTAACAAAGAAGCACTCATCAAATTAGACATGAGTGAATATATGGACCGTACAGCTGTATCTAAATTAATCGGTACAAGCGCTGGTTATGTTGGTTATGAAGATAACTCAAATACTTTAACTGAAAAAGTAAGACGTAATCCTTACTCAGTTATCTTATTCGATGAAATCGAAAAAGCAAACCCTCAAATCCTAACTTTATTATTACAAGTTATGGATGACGGTAACTTAACAGACGGTCAAGGTAACGTCGTAAACTTCAAAAACACAATCATCATCTGTACTTCAAACGCTGGTTTCGGAGATGAAAGTGAAAAAGAACGCGAAGACTTAATGGAAGACCTTAAAAAATTCTTCCGTCCAGAATTCCTTAACCGCTTCAACGGTATCGTAGAATTCACTCACTTAGACAAAGATGCTTTACAAGACATCATCAACTTATTACTTGACGATGTACAAAATACGCTTGAGAAAAAAGGCATCACACTAGAAGTCAGCCAAGATGCTAAAGATTGGTTAATCGACCAAGGTTACGACGAAGAACTAGGTGCACGCCCATTACGCCGTGTAGTTGAAAGAGAAGTACGTGACCGTATCACAGACTACTACCTAGAACACACTGACGTAAGTGATGTTAAAGTCACATTAGAAGACGACAACATCTTAATCAATGGTGAAAAAGTAGATTCACTATAAGTTGTAAAGCGTCAATAAATACAAATCCTAAATAGCTATTAAACAAGCACCTCGTTTCATTCCATAGCGTTTGAAGCGGGGTGCTTTTTACATAAGAGAAAAAAGGGTATAGAATGCATTAAGCGTCTAATCACAGACCATTAAAACATATTATATTAATAGCGAGGTTGCATTATGTTTATAGTCAATTTAATTATCGTACTCATCTTATTCTTATTAACCGGCTTTTTATCAGGACGCTACCAAGATAAATACCTATTTGCCAAATCCTTTTTAATCAGTGTAGGCATGGTGATTTCCGGATTCCTCTCACTCATAATTTCCGGATTCATCATCTACTGGTTGCTCATTCGCTTACTCGGCGACCGCAGCAGCATCTTCGTACTCGGCATCATCATTATCTTATTTGCCGGAATCATGAACTATTTCATCGTTCATCAACTCGTTAAATGGAACGATTACAACGAAATGCTCGTCGCCATACTGGAATACTACATACAGTGGACCACCATCTTTTTCACACTCTACCAATTCTTGACCTCCAGTCCGCAGAACCTGAAGAGCATCGCCAAACTAGAAATCTCTACTGATACCCTAGATTTGAACCTGCTCAACATCATAATCCTGCCAGTCCTCCTCATCAGCTGGATCGCACTCGCCATGGTTCGTCTGTACATTAAAGACCATAAATGGGCCGAAGAAGAAAGCCAAGCACAAGACGAAGAGAACAAAGAGAACGATTCTAATTCTACTTCTGGAAAAGAAACCTCTGGAGAGCAGAAAAGCTGAAGAAAGTACCTCAAACCTAAAAGTGTTGGAGCTATCCGCCTGGAGCTCCAACACTTTTTTAATCCTGCTCATCCTTCATTGCGTCAGCCACGCCATTATGTTCATCTTCTAAATGGTGAATAATATTTTGATAATCCGTATGATTGCGGTTTTGACTCAATTTATAAGCAGCAAATACTTCTGATACTGTAATATGAAAACCGACCACACCATGAATTTGCTGCAAGGTCTCTTCAGACAAATTGTCCCAGCGTGCACCGTCCTTTTTTTCAAAGCGGTTTAATAACTGTATCAAATCCTGCTTTACTTCACCCTCAGTTAATAAGGCGGGTTGGCCATATACTTGAATACTTTGATAATCCCATGTCGGTACATCTTCGTGACCATACCAGGTAGAGGAAACATAAGCATCTGGTCCTTGAAAGATGATTAAGACCTCATCACTATGTTCTAAAGTGTGCCACTGCGGATTCGCTTTCGCAAAGTGGCCTGCGAGTATTAAACTTTCGCCATCTTCATGAATCAGTATCGGTAAATGCGTTGCTAAAGGGCGTCCGTTTTCAGCAGTCGAAACAATGGTCGCAAAAGGATGATCATGAATAAAAGCTTTGATTTTGTTCATGTTATGTTCTTGATAATACTTCGGAATATACATTTTCATCGCCTCCAAGTCTCACTTTATTATTCCTTTTTTTATGAAAATTAATGTAAGCGATTGCATTTATAGCGAATTTGTATTAATATACTTGTATACAAGTATGTAGAAGCAAGGGGTTGTACTACACATGGGAGAAAATTATCCACAACAATGGATGGATAGCATGACAACGGGGGAGAAAGTCGCAGCTGAATTAAGACTGCAAATTGTAGAGGGGAATATAGAAGCTGGAACATGTTTGACAGAAAATCAAGTTGCCAAACAATTTAATGTCAGTCGTTCGCCTGTGCGCGATGCATTTAAATTATTAAAACAAGATCAATTGATTTGTTTAGAACGTATGGGCGCTGATGTACTGCATTTCGGCGAGGGAGAACGCCGTGAAATTTATGATTTGCGTATCATGATGGAATCTTTTGCTTTTACCAAAGTCAAGGACCATCAAAGAATAGAATTAGCGAAAGAAATGCGCAAACATTTAGAAATGATGAAAGTCGCTGTACAATTTCAAGATGCAGAGGCTTACACTGAACATGATATCAAGTTTCACGAAGTCTTAATTTATGCGACACAACATCGTTATCTGCTCAGCAGTTGGAATAATTTGAAGCCTTTAATGTTGTGTTTGATTTTGTTATCGATGAGAAAACGGATGCGTGAAGAGCCTGAAGACTTTGAACGTATTCATCACAATCACGAGGTATATGCAGAAGCAGTTGAGAAAAATGACACAGCACAATTAAAAGAAGCGTTCCATTTGAATTTTGATGATGTAGGAGATAACATTGCTGGTTTGTTTTATAGATGATTTAACTTTTGGAGGAGGATAAGCCATGAAGTATATGATTGGGGTCGATGTCGGCACAACAAGTACAAAGTCAGTTTTGTATGATGAAAATGGACAATTTATACGTAAACACAACATTGGTTACGATATGGATACACCTAACGTTGACACTTCCGAAGAGAATCCTGATGAAATTTTTGACGCAGTATTGATGACTATCAAAGCTGTGATTCGTGAAGAAAGGGTAGCTGCAGAGGATGTTAAATTGATTGCCTTCAGTGCACAAATGCATAGTTTGATAGCAATGGACAATAACCAACAACCTCTCACTGAGAGTATTACTTGGGCGGATAACCGCGCGAGCAAATATGCAGAAGCTATCCACTCTGAACATAATGGGCATGAGATTTATAAACGTACAGGAACACCGATTCATCCTATGTCGCCGTTATCTAAGATTTTTTGGATGAAACATGAGAAACCAGAAATTTATAACAACGCTAAGAAATATATCGATATTAAAAGCTATATCTTATATCAACTTTATGGCAAATATGTAATGGATCAATCTATTGGTTCAGCGACAGGCATGATGAATCTAGAAACATTAGATTGGGATAATGAAGCGCTAGATTTACTTGGCATCACTAAAGACCAAT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29 | Enterobacteria_phage(33.33%) | protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1216112 : 1245788
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT906447|1216112:1245788|DBSCAN-SWA 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34 | Staphylococcus_phage(87.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1497817 : 1505674
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT906447|1497817:1505674|DBSCAN-SWA TATGACAAAAATACTTGTCGTTGATGATGAAGAAAGAATCCGAAGACTGCTTAAATTATATTTAGAAAGAGAATCTTTTGATATCGAAGAAGCTCAAGACGGCAAAGAAGCATTAGATATGGCATTGAATAATGATTATGCTTGTATCTTATTAGACTTAATGCTTCCCGAATTAGACGGTATAGAAGTTGCAAACCGTTTAAGAGAGTATAAAGACACACCTATTATTATGTTGACCGCTAAAGGGGAAGAGACAAACCGCGTGGAAGGATTTGAATCTGGGGCAGATGACTATATCGTCAAACCATTTTCACCGCGCGAAGTTGTTTTACGTGTTAAAGCCTTACTAAGACGTACTTTAACAGCAGCTTCTGAGCAAAATGAGCCACACGCTAGAGATTTGATTGAATTCAAACATTTAGTGATTGATAACGATGCACATCGCGTACTTGCTGATGGTACTCAAGTCAACTTAACACCGAAAGAATATGAACTATTAATCTTCTTAGCGAAGACACCGAACAAGGTTTTTGACCGTGAACAATTATTGAAAGATGTATGGCATTATGAATTCTACGGAGACTTGCGTACTGTAGATACACATGTCAAACGTCTTAGAGAAAAATTAAATCGTGTTTCCTCAGATGCAGCGCACATGATTCAAACTGTCTGGGGCGTCGGTTATAAATTCGAGGTCAACAGCAATGATGAAACGGCTCAATAATGTCGTAATAAAACTGTGGTTAACTATAATTCTTATAGTGACGACAGTTTTAATTTTACTCAGTGCAGCTTTAATTACGTTTATTCAAAACTATTATACGCAAGATACTGAACAATCCTTAATTAAAGATGCCGAACGCATCAGTGTATTACTCGAAGAATCCGATAACAAGGGACTGGCAATCAAGCATAGTAAAGCATTGATCGAAGGTCCGAGCGGCTTGATTATCATGAAAAATAAAAATGATGAATTCTATAATTCACATTCTAAGTTGAAAAACGAAATGATGAATGTGATTACTAAAAATTCTAATTATCAAAAGGTGTTTAAAGACCATCAAAAAACCTCACAGCATGTGAAGTTAAAAGTCGATGATAAAACTAGAACTTACGTATTGTTAGGTTATCCGACAAAAATAGATGCTGCCACTCCAAACGGTGCAGTATTTATTTATCAAGACTTAAAGAGTATAGATGATACCAATAATGTGATTACTATTATTATTTTAGCGACAGCAGTTATCTTCTTAATTATAACAACTGTTTTTGCATTCTTTTTATCATCAAGAATTACCAAACCGCTTCGCCAACTCCGTACTCAAGCAATGAACGTATCTGAAGGCGACTATACGCAAGTTAACAATATTAATTCGAAAGATGAAATTGGTGAATTAGCACATTCTTTCAATAAGATGAGTAATGATATCCAAAGACATATTGATGAAATTTCTGCTTCAAAAAACATCAGAGACAGCCTCATCAATTCAATGGTCGAAGGCGTATTGGGGATTAATGAAAACAGAGAAATTATTCTTTCTAATGAAATGGCTAAAAAAATGGCCGAACAGCTCCGTGCGACAAAAAAAGAACAATTTACTGAACAGATGGATCGTACGTTTGAAGAAAAAGAAATCCAGTTCCAAGAATATGAAGTCAAAAATCGTTACTATGTCGTTATTATGAGTTATATTGAACAATTCCAACCTCACCAAAGCGGTGTAGTAGCGATTATTCGAGATATGACCAACGAGCATCAATTAGATCAGATGAAAAAAGACTTCATTGCTAATGTTTCTCACGAACTACGTACACCTATTGCCTTATTGCAAGGTTACACAGAATCTATTGTAGACGGCGTGGTTTCTGAACCGGAAGAAATCAGAGATTCACTTTCAATTGTTCTAGACGAAACACAGCGCTTGAATCGTCTCGTCAATGAACTGTTAAATGTAGCAAGAATGGATGCTGAAGGCCTATCAGTAAATAAAGAAGTGCAGCCTATCGATAACTTATTGGAGCGCATGCAACTGAAATATCGTCAACAAGCTGAAGATTTGCAGATTGATATTAATTTGGCACCAGATACTAATGGAAAACTTTGGTACTATGATACAGATAGAATGGAACAAGTACTGACTAACTTAGTAGACAATGCCTCTCGCTATACTTCACCGGGAGATGCGATTACTATCAGTACAGGCGAATCAGATCAATACGATATCTTATATGTTTCTGATACAGGCAGCGGAATAGCACCCGAGCATATTGATTTAGTATTTGACAGATTTTACAAAGTGGATGCTTCTAGAAAACGTGGTAAAGAAGGAACAGGGTTAGGCTTATTTATCTGCCGTATGATTATCGAAGCACAAGATGGCACGATTGACTTGAAAAGTCATTTAGGCGAGGGCACAACCTTTATTATTAAATTGCCCAAGCCGCCAAAGCATTAATTCAACGAATTGAGAAGTATTAAAGCATTGATATCAACTCCCTATATAAAGTAGTCACTTAAAAAGTGCAAGCTTTATATGGGGAGTTTTATGTTGACAGAAAAATGTCTCTTCTGTTTAAGCATCGGGATTGAATCAAAACATCTAATCCGATATAATAGATAAGAAAATAAAATAATAATGAAATTCATCTTCGGGGTCGGGTGAAAGTCCCAACCGGCAGTAATTAAAGCCTGCGACCTGTATTTATTAATCATAAATATGGCTGATCTAGTGAGACTCTAGAGCCGACAGTATAGTCTGGATGGGAGAAGATGGAGGGTTTATTTGTTGTGCGTAAATTCCTCCTATTCGCGTAAGATGAATGGAAGGAGTACTTATGAATCAACAAAAAAACAAACGCTTTATCATTATAAGTATGATGAGTGCCATTGCGTTTATTTTGATGTTTATCAAATTTCCGCTGCCATTTTTACCACCATACTTAACGCTTGATTTCAGCGACGTTCCTGCATTGCTTGCAACATTTCTATTTGGGCCTGTAGCAGGCGTGATTGTAGAACTCATCAAAAATCTGCTTAACTTCCTTTTCAATATGGGAGATCCGATAGGGCCTGTAGCAAATTTTGCAGCTGCAGTCAGTTTCTTGCTTACTGCATTTTATGTAAGTAAATTATCTAAAGGCAAATTAAATATAATTATAGGTTTAATTGCAGGTACTTTAGTAATGACTTTAGTCCTGAGTATCTTAAACTATTTTGTCTTATTGCCTTTATATGGTATGATTATGAACCTTGCTGATGTAGTAAAAAACTTAAAAATTATCATTGTATCAGGCATTATTCCGTTTAATATAATTAAAGGAATTGCGGTATCCATCATTTTCCTTTTACTCTATAAACGACTTAAAAAAGCATTGAACTATTAAACAAATAATCATTGCTCATTCATATATTAGGGGCTGGAACATATCGATTTGTTCCAGCTCCTGTCTATATAATTGGCGACAACTAATTCTTAAGGAAACAAAAAGAGACCAAAATACGAATCATATTTTGATCTCACACATTCATCTATATTTAGCGAAGAATACTAACTTAAAAGACGATTGATAGTCATTATTCGAATTTTAATGCATCCCCATCGAAAGGCTCATCTGCAATTTTAATAGAGTCTGTAGGACAACCTTCATCTGCATCTTCTAAATCTTCATAAAGTTCTTCAGGAACTTCTGCTGTACCTTCATTATCATCTAAAATAACATATGCGATACCTTCATCGTCATAATCATAAATATCTGGAGCTGCAGCACCGCAAGCACCGCATGCAATACAAGTATCCATATCTACAATCGTATATTTAGCCAATTTTACTTCGCCTCCTTTTACAAAAATGCTACACTTATAACGTATTTTTATTTTAACACCAGGAATTCTTTTTTCAATACAACAGATTATTAAGGTGATGATTGATTTGAAAGAAATTATTCAATACATAAAAACACATGCTTATCATTATAAAACTGCTAAAAGTCTTTATAATATCATCGTTGGTGCTAAAACCCATCAAACTTATTTTGATGCATGTAGCCAACAACTTTTATCATTATATCACAGTCATCCAAATTTGAAATATCCGTCATTCGAACGAATATTCAATAGTTTGAATGAAAGCGATGACAATTTAAATATTGATTTAAAAATTACTCCTCGCTATACTTTTGAAAGCATACAACAGACATTCCAAGTGATTCAATTATTAATTCAAACAATTTCTTATAATAATCATCACACTTTATCTTTTATACCCGTCTCACAAATAAACAAAGTCCAGCATAGAGTGAAAAGAATTTTTCGTAAAATTAATCAAGAACATAAAGAAAAATTATTTGAAGAGGAAATATATCTACTGTTCAGACGAATTAATAAGGAAAATAATAGCTCCATCCTGCATTATTTTTTACAAGGTTTTGAAGAAACGATGTATACCAACCAACAAGTAGGGATGATAGAGTCATTAACTTACGATGATTTATTACGTATAAAAATGAACGATCTTGTAGAAATGATGAATCAATTAGAAAACAAAGTCGATTTTCCTATTTTAAATGAAGCGATTATCCTACCAGTCTTATCCCAAAACGCATATCAAACTTATCAACATGTTAAAGAAGGATTAAAAATGAACCAGATCGCTCATTTAGAAAACGTCAAAGAAAATACAGTAGAAGATCATATATTAGAACTATTTATTAAAGGTTACTTATCAGACTATAGCAAGTATCTTCATGAGGGTTTTTATAAAGATTTCAAACCTTTTTATCAGAATCAGAAAGAATCGCGCCTCAAGGAATTTAAAACAGAATTTCCAAATTACAGCTATTTTGAAATTAAACTTGCGATTATACGCACAGCCAGGGAGGAGTAGGACAGTTACTAAAAATATAATTAAATGTTTATAAACATACCCAAACCTATTTATAATTGAATTGAGGCGACAATCATGTATAAGACTATAGAAATAAACGGAAAATTAGGGAGTGCAATTTCTTACCCATCTAACCCTAAATATACAGCATACAGTCGGGTTGCGAACCCATCGCATGATGCATTACAAAATAAAATGGAAATTTTAACACATCACCGCAACTATCCCTGCTTTTAGCGGTTGTATCTATGGTTTTGGTCCATTGAAAAAAGAAGGTGACAAAATATGCTGAGAGCGTATAAAACCGAAATCAATCCTTCTTTTGAACAATGTCAAACCATCAACCAAACTATCGGCACATGCCGTTGGATTTACAACAAATTCATTGAAACCAATCAATATCTATATGAAAAAGAAAAATCGTATATGGACGGTTATACATTCAGCAAATGGATGAACAATGTATATCTTCCAAGTCATCCGGATAAACATTGGGTTAAACAAAGTGCCAGCAAAGCCATTAAACAATCCATTATGAATGCGCATCGTGCTTATCAGACATTTTTCAAAAATAAACAAGGTTATCCGAAGTTCAAAAAGAAATCGGGTATCGGAAGTTATTATTTGATCGGTACCATTCATGTACAACGGCATCGCATCCAATTGCCGAAGTTGGGATGGATTAAATTAAAAGAAAGAGGTTACATTCCCACAAATAATATAAAATCTGCCACCATCGTTAAAGAATATGACAGATATTATGTGTCGGTATTAGTTGATCAACCGCCTCCCCCTATTTTCAAACCGGAACAGACAGAGGGAATCGGTATTGATTTAGGATTGAAAGAAGCTGTATTCACACCCTCCGGTGTAAAAATCAGAAGCTTCAAAACGAATCAAACTATTATTAAACTTGATAAATCTTTGAAAAGGCAGCAGCGAAAATTATCCAGAAAGAAAAAAGGTTCTCGTAATTGATATAAACAGTTGTTGAAAGTACAAAGATTATACCGACGTATTAAAAATATTAAAAAAGACATCAAACGCAAAGGCATACTCTCTATTCTCCGTACAAATCCGCAATTTATTACGATTGAAAATTTAAATATCAAAGGCATGATGAGAAACAAAAGGTTGGCCAACAGTTTTCAACAGATCGGACTCGGTTACATTGTTGAATGGTTGAAAATCAAGTGTCAAGATTATGGCATCGAATTACGCCAAGTCGACAGATTTTATCCATCCAGCCAAATATGTTCCGATTGCGGACATACACAACCCATGCCTTTGAATCAAAGAACGTATTATTGTAATCATTGCGGAATGATGAAGGACAGAGACATCAATGCCAGTATAAATTTGAAACAAGCAACAGATTACACCGTGATAGTGTAATAAAATAAAGAAAGGAAAACTGCTAAAAGGTTATCACACAATTTAAATGTATAGATAAAGTTTCAAACTACGGTGGGCTACATCGGAAGTAACGCTCTGGGAGAGGTTCATAGACCTGATTTCAATCGAAATCAACCTCATTGAAAAGAGAAATCCTCTAATAACATTTGAATATGTTTTTAGTAGCAGGGATAGAGATGCTGCAAGAAGCCCTTGAAAATTGGTTTGGTTTCGATTCATTTAAACCAGGACAAGAAGCAATCATCGAAAGTATATTACGTCAACAAAATACTCTAGGGATCTTACCAACCGGCAGTGGTAAAAGTTTATGTTATCAATTGCCGACTTATATCATGCAAAAGCCAACCTTAATCATTTCACCCTTGATTTCTTTAATGGATGATCAAGTGATGCAAATGAGAAAAAAAGGTGAACGCGCAGTGTGCTATGTGCATTCCGGTATGGGAATAGATGAAAAAATACAAAATCTTAAGTTAATTAAAAAGGCGAAATTTATATTTTTAAGCCCAGAATTTATATTACATCGCGATAATATTAAATACTTGAACAACATCGATTTAGGTCTGATTGTCTTAGATGAAGCACATTGTATTACAGAATGGGGCTATGATTTCAGACCTCATTACGCCTTAGTCGGTAAAATTACAAAGCGTTTCCCTAAAGCTACAGTATTAGCTTTAACTGCTACTGCCCCTAAGCACTTAAAACAAGATTTGGACGAGATAGTGGGCACGCAGTTTCATGAAATTAAAACTAAAATGGACCGAAGTAATATTTCATTATCACATTTTAATTTCGAGAATGATAAAGAGAAAACGGAATGGTTAATAAACAAGGTAAGCTCAAGTGGACCTACTATCATTTATGTTTCATCTAAGAAAAAATGTCGTGAACTTGCTCAACTTATCTATAATGCCGGTTATTTAACTGGAATTTACCATGGGGACATGTCTTATCAAGAAAGGCAAACTGTTCAACAACAATTTTTGCAAAACGATATTCCAATTGTTGTAGCAACCAGTGCTTTCGGAATGGGAATTAATAAACCTGATATCAGAACTGTAATACATTATCATCTGCCTCCTAGTCCCTCTAGCTACATTCAAGAAATAGGCAGAGCAGGAAGAGATGGCACATACAGTCAAGCTATAAGTTTGTTTCAGCCAGATGATGCATATTTACTAGACACCTTAATGTTTGCTGATGTTATCAACGAAGCCGATATTGAGGCGTTTGAAGCAGGTGGCTTACTTCCAGAAGAAAAACAACGTATTATTGAAGTTCTTCGACAACGCTTTTCCCTAAAAGAAATTCGCCAAATATTTCAACGCTCAGAAATACGCAAAAAAGACGGTTTGATTAGAATGCTAGGATATAAAAACCTTACGACTTGTCGCCGAGAATATCTGATGTCTTATTTTGGTGAAACTATCGAAAAACCTGCATCTTGTTGTGACAATGATCATAATGTAGAAATTATTAATGAAAGAAATACTAAAAAAGTAACAAGAAAGATGGATTATTTAGAAAAACTCAATCAAATATTCATGAAAAATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT906447|1497817:1505674|1500651_1501200_+|WP_095105152.1|DBSCAN-SWA MNQQKNKRFIIISMMSAIAFILMFIKFPLPFLPPYLTLDFSDVPALLATFLFGPVAGVIVELIKNLLNFLFNMGDPIGPVANFAAAVSFLLTAFYVSKLSKGKLNIIIGLIAGTLVMTLVLSILNYFVLLPLYGMIMNLADVVKNLKIIIVSGIIPFNIIKGIAVSIIFLLLYKRLKKALNY >NZ_LT906447|1497817:1505674|1501745_1502699_+|WP_095105159.1|DBSCAN-SWA MKEIIQYIKTHAYHYKTAKSLYNIIVGAKTHQTYFDACSQQLLSLYHSHPNLKYPSFERIFNSLNESDDNLNIDLKITPRYTFESIQQTFQVIQLLIQTISYNNHHTLSFIPVSQINKVQHRVKRIFRKINQEHKEKLFEEEIYLLFRRINKENNSSILHYFLQGFEETMYTNQQVGMIESLTYDDLLRIKMNDLVEMMNQLENKVDFPILNEAIILPVLSQNAYQTYQHVKEGLKMNQIAHLENVKENTVEDHILELFIKGYLSDYSKYLHEGFYKDFKPFYQNQKESRLKEFKTEFPNYSYFEIKLAIIRTAREE >NZ_LT906447|1497817:1505674|1502984_1503677_+|WP_095105164.1|DBSCAN-SWA MLRAYKTEINPSFEQCQTINQTIGTCRWIYNKFIETNQYLYEKEKSYMDGYTFSKWMNNVYLPSHPDKHWVKQSASKAIKQSIMNAHRAYQTFFKNKQGYPKFKKKSGIGSYYLIGTIHVQRHRIQLPKLGWIKLKERGYIPTNNIKSATIVKEYDRYYVSVLVDQPPPPIFKPEQTEGIGIDLGLKEAVFTPSGVKIRSFKTNQTIIKLDKSLKRQQRKLSRKKKGSRN >NZ_LT906447|1497817:1505674|1501390_1501639_-|WP_095105156.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAYVILDDNEGTAEVPEELYEDLEDADEGCPTDSIKIADEPFDGDALKFE >NZ_LT906447|1497817:1505674|1503686_1504094_+|WP_095105168.1|transposase|DBSCAN-SWA MLKVQRLYRRIKNIKKDIKRKGILSILRTNPQFITIENLNIKGMMRNKRLANSFQQIGLGYIVEWLKIKCQDYGIELRQVDRFYPSSQICSDCGHTQPMPLNQRTYYCNHCGMMKDRDINASINLKQATDYTVIV >NZ_LT906447|1497817:1505674|1497817_1498540_+|WP_095105150.1|DBSCAN-SWA MTKILVVDDEERIRRLLKLYLERESFDIEEAQDGKEALDMALNNDYACILLDLMLPELDGIEVANRLREYKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTLTAASEQNEPHARDLIEFKHLVIDNDAHRVLADGTQVNLTPKEYELLIFLAKTPNKVFDREQLLKDVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSSDAAHMIQTVWGVGYKFEVNSNDETAQ >NZ_LT906447|1497817:1505674|1504291_1505674_+|WP_095105172.1|DBSCAN-SWA MLQEALENWFGFDSFKPGQEAIIESILRQQNTLGILPTGSGKSLCYQLPTYIMQKPTLIISPLISLMDDQVMQMRKKGERAVCYVHSGMGIDEKIQNLKLIKKAKFIFLSPEFILHRDNIKYLNNIDLGLIVLDEAHCITEWGYDFRPHYALVGKITKRFPKATVLALTATAPKHLKQDLDEIVGTQFHEIKTKMDRSNISLSHFNFENDKEKTEWLINKVSSSGPTIIYVSSKKKCRELAQLIYNAGYLTGIYHGDMSYQERQTVQQQFLQNDIPIVVATSAFGMGINKPDIRTVIHYHLPPSPSSYIQEIGRAGRDGTYSQAISLFQPDDAYLLDTLMFADVINEADIEAFEAGGLLPEEKQRIIEVLRQRFSLKEIRQIFQRSEIRKKDGLIRMLGYKNLTTCRREYLMSYFGETIEKPASCCDNDHNVEIINERNTKKVTRKMDYLEKLNQIFMKN >NZ_LT906447|1497817:1505674|1498520_1500272_+|WP_095105151.1|DBSCAN-SWA MMKRLNNVVIKLWLTIILIVTTVLILLSAALITFIQNYYTQDTEQSLIKDAERISVLLEESDNKGLAIKHSKALIEGPSGLIIMKNKNDEFYNSHSKLKNEMMNVITKNSNYQKVFKDHQKTSQHVKLKVDDKTRTYVLLGYPTKIDAATPNGAVFIYQDLKSIDDTNNVITIIILATAVIFLIITTVFAFFLSSRITKPLRQLRTQAMNVSEGDYTQVNNINSKDEIGELAHSFNKMSNDIQRHIDEISASKNIRDSLINSMVEGVLGINENREIILSNEMAKKMAEQLRATKKEQFTEQMDRTFEEKEIQFQEYEVKNRYYVVIMSYIEQFQPHQSGVVAIIRDMTNEHQLDQMKKDFIANVSHELRTPIALLQGYTESIVDGVVSEPEEIRDSLSIVLDETQRLNRLVNELLNVARMDAEGLSVNKEVQPIDNLLERMQLKYRQQAEDLQIDINLAPDTNGKLWYYDTDRMEQVLTNLVDNASRYTSPGDAITISTGESDQYDILYVSDTGSGIAPEHIDLVFDRFYKVDASRKRGKEGTGLGLFICRMIIEAQDGTIDLKSHLGEGTTFIIKLPKPPKH |
8 | Bacillus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1956608 : 1967595
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LT906447|1956608:1967595|DBSCAN-SWA CTTAATGTTTGAAGTGGCGTACACCTGTCATTACCATTGCAATGCCGTGTTTGTCTGCCATATCGATAGAGTCTTGATCTTTAATAGATCCGCCTGGTTGAATAATCGCTTTGATGCCTGATTTAGCTGCTAATTCTACTGTGTCATCCATAGGGAAGAAGCCGTCTGATACAAGTGCTACATTGTCGTTAATTTCAATCGCACGTTCAATTGCAATTTCAGCTGAACCTACGCGATTCATTTGACCTGCGCCAATACCAACTGTTTGATGATCATTACTTAAAATGATGGCATTACTTTTTACTGAAGGAACGACTTTCCAGCCTAATTCCATAGCTTTCCATTGTTCTTCAGTCGGTTCTGCTTTAGTCACTACTTTCATATCGTCACGAGAAATTGTTTTTGTATCTTTGTCTTGTACTAAATAACCGCCAGATACAGATACATATTCTTTCTCATCGTGGTCTACTGTCATTTCAACTTCTAGCAAACGAATATTTTTCTTTTTAGTCAATACTTCTAGCGCTTCTTCAGTAAATGAAGGTGCAATGACTACTTCTAAGAAGATTGAATGTAATTTTTCAGCTAGTTCTTTGGAAACGGGACGGTTAACTGCTACAATTCCGCCGAAAATAGATTGACTATCTGCATCGTAGGCGTTTTGGAAAGCTTCTTCGATTGAAGATCCTACACCTACACCGCAAGGATTCATGTGTTTCACTGCTACAGCAGCAGGTTCTTCGAATTTCTTAGCTAATGCAAGCGTCGCATCTGCATCTTTAATGTTATTGAAGCTTAATTGTTTACCGTGTAATTGTTTCGCACCTGCAATGGTATTCGACGCATCAGATGTACGTACAAAGTATGCATCTTGCTGTGGATTTTCGCCATAACGTAAAGGTTCTTTATTTTCTTTAAAGAAATTAACGATTGCATTGTCGTAATCATTGGTATGTTCAAATACTTTAATCATTAATGATTTGCGGAATGCTTCATCTAAAGTATCATTTTTGATGTGTTCGATTACCGCATCATAATCAGCAGGATTTACTACAGTAGTGACATGTTTAAAGTTTTTCGCAGCTGCACGCAACATTGTTGGTCCGCCGATATCAATATTTTCAATCGCGTCCATTTCAGTTACATCTGGATTAGCAACTGTTTCTTTGAATGGATACAAGTTTACAACGACCATGTCAATTAAGTCGATGCCTTTATCTTTCAATTGTTGTAAATGTTCAGGTTTGTCTCTATCTGCTAAAATACCTCCATGCACGGCTGGATGTAATGTTTTCACACGACCATCCATGATTTCATCAAATTGTGTTAAATCTGATACTGATTTAACTGGCACCCCTGCTTCGTCTAGAGCACGTTTTGTACCGCCAGTTGAATATAATTCGTAGTCTAAGCTTACTAATGCTTTAGCAAAGTCTACAATTCCACTTTTATCTGAAACACTTAAAATTACTTTTTTCATTTTAAAAATAGCCCCTCTTATCGAATAATGTTCGCAATGACTTTAGGATATAATTCATATTCTAAGTTCTTAATGCGGTCTTCAAGTTGTTCTTTAGTATCATCTGGATAGATGTCACATTGGCTTTGCTCGATAATTTCACCCGTATCCATACCGCTGTCGACAAAATGTACTGTTGTACCTGTGACTTTATCGCCACTGTTATAAGCTTGACCAATTGCATCAATGCCTTTATATTTCGGCAATAATGCAGGGTGAATATTTAAAATGCGACCTTCATATGCATCTAATAAATCCGAACCGATTAAACGCATATAACCTGCTAAGATAATCCACTCTACTTCTTCTTCTTTTAAATATTGCAGCAATTGCTGCTCATATTCTTGTTTAGAATCAAAGTTTTTAGGAAGTGTTACATGTACTGGAATATCTAGTTTCTCAGCACGTTCAATCGCATAAGCATCTGCATGATCCACATATAATGCTGTAATTTCAATATTGTCTAATCGTCCATCTTGGACACGTTGTGCGATATTTTCAAAATTGCTTCCAGAACCTGAGGCAAAAACTGCTACTTTAGTCACGCTTTAACCCCCGTTAATACAATCGGTTCGTCGCCCGCTTCAACAATTTTACCGATTTGATAAGCATCCACATTTTGTTCTTTCAAAATACGCAATGTTTTTTCAGCTTCTGCTTCATCAACCACTAATGTAAAGCCGATACCCATATTGAAGATATTGTACATTTCTTGAGTTTCGATGTTGCCTTCTTTTTGCAGCCAATCAAAAACAGCTGGTGTCGGGAAGGATTGAACATTGATTTCAGCTGTGACACCTTCAGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAGAATCCGCCACCTGTGATATGTGTCATCGCATGCAATTTCACTTGTTCTTTTACTGCAAGCACGGGTTTGACATATAAACGTGTCGGTTCCAAGAATGTGTCTAAGTACGTACGTCCGTTAGCAAATTCAGCGTTTAAGTCCACACCTGATGTTTTAATCAAATGACGTACTAAACTGTAACCATTTGAGTGAATGCCGCTTGAAGCGAGTCCGATAATGACTTGAGCTGGTTCAACTGACGAACCGTCAATGTAGTCATCTTTTTCAACTGCACCTACTGCAAAGCCTGCTAAATCGTATTCACCTTCGTGATACATTTCGCCCATCTCAGCAGTTTCGCCGCCGATTAAAGCGGTATTTGTTTCTTCACAACCATCGCTGACACCTTTAACAATTTGTTCAATGACTTCAGGTACAACTTTATTCGTTGCGATATAGTCTAAGAAATAAAGTGGTTCAGCACCTGTTGTTAAAATATCGTTGACACACATTGCGACTGCATCGATGCCGATTGTGTCATGTTTGTCATGATCAATCGCAAGCTTTAATTTAGTGCCGACGCCGTCAGTACCTGAAACTAAAACTGGTTTCTGCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGCTGCACCGAAGCCTCCTAAACCGCCTAAGACTTCTTTACGCATTGTACGTTGCACATGACTTTTCATACGTTCAACCGCTTCATAACCTGCATGAATATCTACACCTGCATTTTTATATGACTCTGCCACAGCTTTACACTCCTCTTCTCTTAAGTTCTTTTACTTCTGGTAATTGATGATCGACAATTTCAATTGGATAGTTTCCTGTAAAGCAAGCATCACATTCGCCTTTTGAATCAAATTCATGGAATACTTCGTGCATACCTTCTACTGAAAGGTACGTTAATGAATCTGCTCCGATTATTTCTTGCATTTCTTCTACTGTATGTTGTGCAGCCATTAACTCAGCATGTGTTGACACATCAATACCGTAATAACAAGGATCGATGAGAGGTGGAGAAGAAATACCCATATGTACTTCTTTCGCTCCTGCTGATTTTAATGCTTTCACAATATACTTACTTGTTGTACCACGCACAATAGAGTCATCAATGACAACCACACGTTTGCCTTCAATGACATCTCTGATTGGAGAATGTTTCATTCGTACTTGTTTTTCACGAACACTTTGATCAGGTGTAATAAAGGTACGCCCGATATAACGGTTCTTCAATAAACCTTGTTCATTTGGAATGCCTGTATATTCGGAAAAACCTTTCGCTGCTTGCAATGACGAATCAGGAACACCGATAACAATATCCGCTTCAATTCCCATCTCACTCGCAAGCTTTTTACCTAAGGCTTTACGCACATTGTAAATAGAATGTTTATGGAATTCTGAATCGGGACGTGCAAAATACACATATTCCATAGAACACATATTGTGATTGATATTGGTTGAGTAATAATCATAATCGATATCATTTTCGCCGCTGAAAGTAATCAATTCACCTGGTTCGATGTCTCGAATATAAGTTGCACCAATGGCTTGAAACGCACAAGTTTCACTTGCGACACAATAGGCGCCGTCTACTTCGCCTAACATCAATGGTCGCACGCCGTTATTATCTCTTACTGCTGCTAATTGATCAGTGTTCAGCATGACACAGCTGAATGCACCTTTAACTTGATTTAATGCCGCTTTTTGATTGGTTTTAATGTTAGGTGATTTCCCTCTGATCAACAAATGTGCAAGTACTTCTGAATCACTCGTTGTTTGGAACACACTGCCTTCAGATTCTAGTGCATGGCGGATTTGAACTGCATTCGTCAAATTACCATTGTGGGCTAATCCTAAATCACCTTTTGAATGTTTGAATAAAAATGGTTGTACGTTGGCAATCTCGCTTGCTCCTGTTGTCGCATAACGCACATGTCCGATTGCATTTTGATAACCTTGCAATGATTCTAATTGTGCATCTGAAATCGCTTCAGTTAACAAACCCATACCGCGTGCGCCAAACAGCGATTCGCCGTTTGAACACACAATGCCGGCACCTTCTTGGCCACGGTGCTGCAAGCTATGCAGCGCCATGTAAGTCAGCGTGGCTGCATGAGGATGATTCCATATTCCAAAGACTCCACATTCTTCATTTAATCCGCGGATGTCATACATTGAGGAATTGCTCCTTCCCAAATTTCGTTTAACGTCGACACGTTGTCTTCTACTGTTGTTTGACCATTTGTGACTTTGAATTCCTTGTTATCAGTTACTGTTCCGATTTCTTGAGCGTCCGGAATATCTAAAGTTTGTCCATCTTTCACTGCCACAATATAACGCCCTTGAGATTCACTGAATAATTGTGCATCTGTAACATCTAATTTCACATCTACACCTAAACCGTAGTAAGCACTGAAACGTGCAAGTGTAATCAATAAACCGCCTTTACCGACAGTTTGTACATGAGAAGCTTTGCCGTCTCTGATTGCTTTTTTAATTGCTTCGCCTTTTGCTACTTCTTCAGATAAATCTAAGGCTTCTGATTCATGATTGACTTTGCCATACAATAATTTTTCAAGTTGGCTGCCGCCGAAATCGTTACGTGTTTCACCTACAACATATAATTTATCTCCAGCATGCGGTTGGAAATC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LT906447|1956608:1967595|1963962_1964229_-|WP_095106041.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYNQVNDIRVGKLLYFTVDEATDEAVHNIVNTLSEKLFANTVIEEYNYKVVEDDEKENA >NZ_LT906447|1956608:1967595|1964932_1966060_-|WP_095106047.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGFKVIVLDPDPDAPCQYVAHDFINAAYDDMEALRQLGEASDVITYEFENIAADQLQTLTEEFNVPQGYQAIHLLQDRLTEKQTLESAGTKIVPYAQLTRPSDLEETAEKLGYPFMVKTRFGGYDGKGQILVRNEQDMDEAKELVEKQECVAEQFLDLYKEVSLTVTIGNGGQICYFPLQENEHRNQVLFKTIVPARSDKEAEARAEVDKITEKVHFVGTFTVEFFIDKNNHLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILGVTGQKLPESIEILKPAVMMNLLGKDLDLLEDEFGDHPEWHVHIYGKAARKPARKMGHMTVLTDNIDQTEQEMLATFKGGNK >NZ_LT906447|1956608:1967595|1959709_1961131_-|WP_095106032.1|DBSCAN-SWA MYDIRGLNEECGVFGIWNHPHAATLTYMALHSLQHRGQEGAGIVCSNGESLFGARGMGLLTEAISDAQLESLQGYQNAIGHVRYATTGASEIANVQPFLFKHSKGDLGLAHNGNLTNAVQIRHALESEGSVFQTTSDSEVLAHLLIRGKSPNIKTNQKAALNQVKGAFSCVMLNTDQLAAVRDNNGVRPLMLGEVDGAYCVASETCAFQAIGATYIRDIEPGELITFSGENDIDYDYYSTNINHNMCSMEYVYFARPDSEFHKHSIYNVRKALGKKLASEMGIEADIVIGVPDSSLQAAKGFSEYTGIPNEQGLLKNRYIGRTFITPDQSVREKQVRMKHSPIRDVIEGKRVVVIDDSIVRGTTSKYIVKALKSAGAKEVHMGISSPPLIDPCYYGIDVSTHAELMAAQHTVEEMQEIIGADSLTYLSVEGMHEVFHEFDSKGECDACFTGNYPIEIVDHQLPEVKELKRRGV >NZ_LT906447|1956608:1967595|1958104_1958671_-|WP_095106030.1|DBSCAN-SWA MTKVAVFASGSGSNFENIAQRVQDGRLDNIEITALYVDHADAYAIERAEKLDIPVHVTLPKNFDSKQEYEQQLLQYLKEEEVEWIILAGYMRLIGSDLLDAYEGRILNIHPALLPKYKGIDAIGQAYNSGDKVTGTTVHFVDSGMDTGEIIEQSQCDIYPDDTKEQLEDRIKNLEYELYPKVIANIIR >NZ_LT906447|1956608:1967595|1964228_1964933_-|WP_095106045.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRIFSTDEDGVLRVEYKDEVTAGNGAKKDHIDGKGRLNNQITSIIFEYLKKHGIQSHFIEQTSETEQLVRSVEIIPLEVVVRNIAAGSITRRLGFEKGHEFETPLVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLNIANEEEIAKLKKMALEINKALVEMLDSINLRLVDFKIEFGRTKDGDILLADEISPDTCRIWEKDSDTNFDKDVYREDRGSIIDTYQTFLNKLEALK >NZ_LT906447|1956608:1967595|1963291_1963963_-|WP_095106038.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMLNAALKTGAEAEYVDYRETSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRFAAEGKPVLGVCNGFQVLTEVGLLPGALLHNETHLFVSRNEALKVVNNRTPFTREYAENETVIYPVAHGKGNYYCTEEMYKALEANNQIILKYTDNPNGSYDDIAGIVNEQGNVCGMMPHPERALESILGTEDGVKLFESMVNSWREQNA >NZ_LT906447|1956608:1967595|1958667_1959705_-|WP_095106031.1|DBSCAN-SWA MAESYKNAGVDIHAGYEAVERMKSHVQRTMRKEVLGGLGGFGAAFDLSQLNMQKPVLVSGTDGVGTKLKLAIDHDKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGVSDGCEETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKDDYIDGSSVEPAQVIIGLASSGIHSNGYSLVRHLIKTSGVDLNAEFANGRTYLDTFLEPTRLYVKPVLAVKEQVKLHAMTHITGGGFYENIPRALPEGVTAEINVQSFPTPAVFDWLQKEGNIETQEMYNIFNMGIGFTLVVDEAEAEKTLRILKEQNVDAYQIGKIVEAGDEPIVLTGVKA >NZ_LT906447|1956608:1967595|1966737_1967595_+|WP_095106054.1|DBSCAN-SWA MVAKILDGKQIAKDYRQGLQDQVEALKEKGYTPKLSVILVGNNGASLSYVKSKKKAAEKIGMISEIVHLEETATEEEVLNELDRLNNDDSVSGILVQVPLPSQVSEQKVLEAINPEKDVDGFHPQNIGKLYIDEQTFVPCTPLGIMELLKNADIDLDGKDAVVIGRSHIVGQPVSKLLIQQNATVTILHSHSKDMSKHLKDADIIVSAVGKPGLVTKDDVKEGAVVIDVGNTPDENGKLKGDVEYEDVKEIAGAITPVPGGVGPMTITMVLNNTLLAEKMRRSIQ >NZ_LT906447|1956608:1967595|1961109_1963299_-|WP_095106034.1|DBSCAN-SWA MPKFIEPSIEEIKAEKIYSDMGLTDAEYDKVVDILGREPNFTEIGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTSEHVLMGPGEGAGVVDIGDDQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELNEIQNRTLTRGVVAGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGIIDHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELSEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFPELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGMHMRLDQVPVREEGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTDRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKEYNTSKNDYSNVDVNDVFKKLLAHPTIASKRYLYEQYDQQVGANTIVKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACEVLKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIEDIDYLNDFQPHAGDKLYVVGETRNDFGGSQLEKLLYGKVNHESEALDLSEEVAKGEAIKKAIRDGKASHVQTVGKGGLLITLARFSAYYGLGVDVKLDVTDAQLFSESQGRYIVAVKDGQTLDIPDAQEIGTVTDNKEFKVTNGQTTVEDNVSTLNEIWEGAIPQCMTSAD >NZ_LT906447|1956608:1967595|1966046_1966529_-|WP_095106049.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWDMMSESCQMLDQFGIPYDKKVVSAHRTPKLMFDFATEARLNGYDVIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKAGAKNAGILAARILSIQSDEVRQKLDEYQQSLVDKVGEMQSELQ >NZ_LT906447|1956608:1967595|1956608_1958087_-|WP_095106029.1|DBSCAN-SWA MKKVILSVSDKSGIVDFAKALVSLDYELYSTGGTKRALDEAGVPVKSVSDLTQFDEIMDGRVKTLHPAVHGGILADRDKPEHLQQLKDKGIDLIDMVVVNLYPFKETVANPDVTEMDAIENIDIGGPTMLRAAAKNFKHVTTVVNPADYDAVIEHIKNDTLDEAFRKSLMIKVFEHTNDYDNAIVNFFKENKEPLRYGENPQQDAYFVRTSDASNTIAGAKQLHGKQLSFNNIKDADATLALAKKFEEPAAVAVKHMNPCGVGVGSSIEEAFQNAYDADSQSIFGGIVAVNRPVSKELAEKLHSIFLEVVIAPSFTEEALEVLTKKKNIRLLEVEMTVDHDEKEYVSVSGGYLVQDKDTKTISRDDMKVVTKAEPTEEQWKAMELGWKVVPSVKSNAIILSNDHQTVGIGAGQMNRVGSAEIAIERAIEINDNVALVSDGFFPMDDTVELAAKSGIKAIIQPGGSIKDQDSIDMADKHGIAMVMTGVRHFKH |
11 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2226342 : 2239331
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LT906447|2226342:2239331|DBSCAN-SWA 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AAGTTTTGTCCCCAATTTCGATTACCGCTACCAACTACTCCTCTTATCATTGTGCCGTTATGTTGCAAGAACGTCTTGACGACATCCGGTACTTCTCCAAATCCGATGGTACTAGTGACCAATATATAAGGTTCATCTATGCGTATTTCCGCACAGTTATCATTTGTAATCTCTAAGGTGTTATCAAAGCCTGTTCTTGTTATAAACCGTCTTACGTTTCCTGTGAATGAGAAATAAACTACCTTCATTGAATCACCCGCTTTCTTATAAAGAACGCGTCATCCTTTATCTCCATAGATTAAAGCAGAAGCCATAAATAAAAAACATGACAGGCTGTCTTATTGCTATTGTTGTTTCTTGAATGAGACTTTATGACTGCTGCATGTTTGCATTTGATAATGATATTAGAATGCACTTTCCTTTGACACTATATGTAGTGGTCATTCAATTTACGAGCTGTATATATTTGAATCTTTACCTTATCATTTTATCTGTTCCACTTTAAACGCATTTACAAGAATATCAACGCATTTTAACTGCTTTCAACCATTAAAAACACTTTAATCATGAATTAATCGTTTAAACGTTACTTTGTACTTTTAAAATAATAAGGTGTGAAAATGCATTAAAATAGTTAATTTTAAATTTAGCATTTTCCAACTTAACCACAACATATAGTGTTGGTTTTCGTTCTTCAATACTATATTATGTGATTCATTATACCTAACACACTTTGTAATTTCAAAGAGAATCATTGCTCAAAAATTATTTTTAAATTGTCATAATCGATGTAATGACCGTCACATCTATCGTTGAGGAATAAAAGTTTTTTAAAAAAAGGCCTCAAAATAAATAATTGTAGTTTTACCCTTGATTTTTTCAAAAATTATGCACTTCTTATGAAATCAAGTGTCTGCGATTATAGACCTGATCAGCTTGATACAACTATTTTAAAAAACTTAATTATTTACATCTTAAATCCTATATGGAAATTCAAACCTCTAAGTAGAACGTATGTTCGATTTGATTATAACTATTCTGCTAAAGAATTGCAAGGACTTATAGCAATACTAATTTGAATTATGCTAAGATGATATACGTTAAGTTTTGAAGAAAGTAGAGGCGAAAGTATGGATCCGAAAATTAAAGGCATCATTGCTATCCTCATTTCAGCAATCGGCTTTAGTTTTATGTCATTGTTCTTCAGACTTTCAGGTGACTTACCTGTATTTCAAAAGTCTTTAGCACGTAATTTAGTTGCGATGTTGATTCCTTTATATTTCTTATATAAATATAAACAACCGATGTTCGGTAAATTGAGTAGTCAACCCTTGTTGATTACCCGTTCTACTTTAGGTTTAGTCGGCGTATTATTAAATATTTATGCGATAGACCATATGTTGTTAAGTGATGCTGATACTTTAATGAAATTAAATCCTTTCTGGACTATTTTGTTAAGTTTAGTATTCTTGCATGAGAAAGTACGTAAATATCAAATTACTGCAATGATTGTAGCCATTATAGGAATGTTGTTTGTGGTACAGCCTCAATTTTCATCAGCTATGATACCTGCAATCGGCGGTTTATTCTCGGGTATTTTCGCCGCAGCTGCGTATACCTGCGTACGTGCCTTGAGCACTCGTGAAGCACCTTATACTATCGTGTTTTATTTTTCATTCTTCTCAATTGTAGCTTTAATTCCATTTGTAATCTTCACATATGAACCGATGTCTATGAAACAAATAGTTTATCTGATCGGCGCTGGATTATCTGCTGCAGTAGGTCAAATCGGCATCACCTTAGCGTACAGTTATGCTCCAGCACGTGACATTTCAATATTCACCTATGCATCTATCATCTTTACGGCTATCATGGGAATTGTCATCTTTGGTGAATCGCCAGATTTATACGCTACGCTCGGTTACGTTATTATTATTAGTGCAAGTTATTATATGTTTGAAAAAGCACGTCGGCAAGGTCGTAAAAATAAACCTGCTCGTGCACACAAAGGAGCGAATTAAAAAGTGTCAAATGAAGGACGTAAAAAAGAAGAACTTGAAGACATTACGTTATTAGGCAATCAAAACAATACTTATCATTTCGATTATAGACCAGATGTATTAGAAACTTTTGATAACAAGCATCAAGGTCGTGATTACTTTGTTAAATTTAATTGTCCAGAATTCACCTCTCTTTGTCCTATTACAGGACAACCAGATTTTGCGACAATTTATATTTCCTATATTCCAAATATCAAAATGGTAGAATCAAAATCATTGAAACTTTATTTATTTAGTTTCAGAAATCATGGTGATTTCCATGAAGATTGCATGAATATCATTATGAATGATTTAATTGAATTAATGGATCCGCATTATATTGAAGTATGGGGAAAATTCACGCCACGAGGCGGTATCTCAATCGACCCTTATACTAACTATGGTCGTCCAGATTCAAAATACGAACAGATGGCTGAATACCGTATGATGAATCATGACTTATATCCAGAAAATATCGATAATCGTTAATATTAACGCTCCTATTCAGGGGCGTTTTTTTAACAAACAAATATTATTAAACTTTTTGTGTAATTATTGTGCAATGAATAGCACAATAATTTTCAGAATTTTCTTGTATAACTTTTCCTTATCGCTTAAAATAACATTTAAGCAGTTAGGGGGAAATTTATGAATAAAAAACAATATACACGAGAAGAAGTTGTCAACAGTGTGCCACGTACAGGCTTCTTCGGACATCCTAAAGGACTAAGCACTCTATTCTTCACTGAATTTTGGGAGAGATTCAGTTACTATGGTATGAAAGCCATTTTAGTTTACTATCTATACTATTCAGTTGCTAAAGGCGGATTTGGACTCGATGAATCTGTAGCTATGCAAATTGTGGCCTTATACGGAACATTAATTTATATGTCTGGTGTCATTGGCGGTTGGATAGCAGACCGAATCACAGGTACGCAGAATGCTGTCTTTGTCGGCGGAATCTTTATTATGTTTGGTCACATCATTTTAAGCTTACCTGGCAATTTAACAGCTGTTATGATTGCATTACTACTGTTAATTATTGGTACAGGACTCTTGAAACCGAACATTTCAACTACAGTTGGTGAACTTTACGAGAAAAATGATCCACGTGTAGATTCAGCATTTACGATTTTCTACATGGGTATTAATGCAGGTGCTTTGTTGTCACCCATTATTACTGGATATTTACAAACACGTGTAGGTTTCCATGCAGGTTTCGCAACTGCTGCCATCGGTATGTTTATCGGACTTGTAATTTATTGGACAAAACGCAAAAAATATTTGAATTTAGCCGGACTGACTGTACATAATCCTATGACTAAAAATGATGTGAAGAAATTCTCTATCATTACTATTGTGATTGTAGCGGCGTTCGCTCTCTATCTTATTATTTTAAAAGCTTTTAACGCATTAACAATCGAAAACTTCAGTTTACTTGTTACTATTCTCGGAATTGCTTTGCCAGTATTCATTGTGGCTCGTATGTTAATGAGTAAAGAAGCAACGTCTGAAGAAAAATCACGTGTTCGCAGTTACATTCCTTTGTATATTACATCAGTAGCATTCTGGATGATTCAAGAACAAGGTTCAACTATTCTTGCAAACTTTGCAGATAAAAATACACAACTAAAAATGTCTGAACTTACAGGCGGCGCAATTCATTTTGATATTCCAGCAGCTTGGTTCCAATCACTGAATCCTATCTTTATCGTTGCATTAGCACCTGTATTCGCAACTTTATGGGTGAAATTAGGAAAACGTAACCCATCTACAGTAATGAAATTTGCAATGGGCGCTATTATTGCTGGCCTATCTTATCTCATTATGATGATTCCATTAGCTGGAGGATTGCATGGAGCACTGATCAATCCTATATGGCTCGTGCTCAGTTTCTTGCTTATTACAATCGGTGAACTTTGTATTTCTCCTGTTGGATTAGCGACTACTACTAAACTTGCACCTTATGCTTTTACAGCTCAAATGATGAGTTTATGGATGTTGAGTAATGCGACAGCTCAAGGGTTAAACGCACAGCTGGTAGTACTTTATAAAGGTATGAATCCTTCTGAGTATTTTATGTATTCAGGCTTATTAACAATCGTTATTGGTGTCTTGCTCATCGTAGTTTCTCCTATGGTTAAACGAGGCATGAAAGGTATTCATTAATTAATTAAAAAATATATTTCGTGGAGCGGGGACATAATGTCTCCGCTTCTTTTGTTTCCAAAGTAATTTATTCACTACTTTGACTGATAATTTGTAGATTAAATTGATGACTACAATAATCTGAAAATTGTTAATATTATTATTTTTAGAAAATTATTGAAACTATTAATTGATGAGAGTAAAATCTAATATAATCAGCCCGTTTAGGATAGAAAGGTCGGGATTAATTTGCAGAATAATTTGCATAATCAGCATGTTCAAGAAATTCCTCAAAGAGGTTTCTTCGGACATCCAAGAGGATTAGGAGTACTCTTCTTTGTAGAATTTTGGGAGAGATTCAGTTATTACGGAATGCGTGCACTCTTAATCTTTTACATGTTTTACGCCATTAAAGATGGCGGTTTAGGAATGGATGAGGTTACAGCACAATCTGTAATGTCTATTTATGGTTCACTTATTTTTATGACTACAATTATTGGAGGTTGGGTAGCCGACAGAATCACAGGTACACGTGGTGCTACTATGTATGGTGCCGTATTGATTATCATCGGCCATGTGGTGCTTAGTCTGCCACTCGCAAATATTGGTTTATATGTGTCGATGTTCTTTATTATTATAGGTTCTGGTCTTATGAAACCGAATATTTCTAATATTGTAGGTCGCTTGTACCCTGAAAACGATTCACGTATCGATTCAGGTTTTGTTATTTTCTATATGTCAGTGAATATGGGTGCCTTAGTCGCACCGCTTATTTTAAATCAATTCTCTGACAACCACAAATTCCACCAAGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LT906447|2226342:2239331|2232471_2233362_+|WP_095106527.1|DBSCAN-SWA MDPKIKGIIAILISAIGFSFMSLFFRLSGDLPVFQKSLARNLVAMLIPLYFLYKYKQPMFGKLSSQPLLITRSTLGLVGVLLNIYAIDHMLLSDADTLMKLNPFWTILLSLVFLHEKVRKYQITAMIVAIIGMLFVVQPQFSSAMIPAIGGLFSGIFAAAAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSFFSIVALIPFVIFTYEPMSMKQIVYLIGAGLSAAVGQIGITLAYSYAPARDISIFTYASIIFTAIMGIVIFGESPDLYATLGYVIIISASYYMFEKARRQGRKNKPARAHKGAN >NZ_LT906447|2226342:2239331|2233365_2233869_+|WP_095106529.1|DBSCAN-SWA MSNEGRKKEELEDITLLGNQNNTYHFDYRPDVLETFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNIKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPDSKYEQMAEYRMMNHDLYPENIDNR >NZ_LT906447|2226342:2239331|2237585_2238128_-|WP_095106534.1|DBSCAN-SWA MERKSIAIDMDEVLADTIKALIEEVNARTDLGIKEALLDGNKIRHFMPEHEGVLDEVLREPGFFKNLEVIQDAQEVVEKLSEHYDIYIATAAMDVPTSFHEKYEWLRTHFPFLDSQQFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLERFTGKSLMYTAAHNIHNEDFERVNNWKEVEKYFLGNEEI >NZ_LT906447|2226342:2239331|2234028_2235549_+|WP_095106531.1|DBSCAN-SWA MNKKQYTREEVVNSVPRTGFFGHPKGLSTLFFTEFWERFSYYGMKAILVYYLYYSVAKGGFGLDESVAMQIVALYGTLIYMSGVIGGWIADRITGTQNAVFVGGIFIMFGHIILSLPGNLTAVMIALLLLIIGTGLLKPNISTTVGELYEKNDPRVDSAFTIFYMGINAGALLSPIITGYLQTRVGFHAGFATAAIGMFIGLVIYWTKRKKYLNLAGLTVHNPMTKNDVKKFSIITIVIVAAFALYLIILKAFNALTIENFSLLVTILGIALPVFIVARMLMSKEATSEEKSRVRSYIPLYITSVAFWMIQEQGSTILANFADKNTQLKMSELTGGAIHFDIPAAWFQSLNPIFIVALAPVFATLWVKLGKRNPSTVMKFAMGAIIAGLSYLIMMIPLAGGLHGALINPIWLVLSFLLITIGELCISPVGLATTTKLAPYAFTAQMMSLWMLSNATAQGLNAQLVVLYKGMNPSEYFMYSGLLTIVIGVLLIVVSPMVKRGMKGIH >NZ_LT906447|2226342:2239331|2231196_2231589_-|WP_095106525.1|DBSCAN-SWA MKVVYFSFTGNVRRFITRTGFDNTLEITNDNCAEIRIDEPYILVTSTIGFGEVPDVVKTFLQHNGTMIRGVVGSGNRNWGQNFAKASDTISREYLVPLLMKFEVQGTQKDVEEFKDKVGHFYEDNERKAI >NZ_LT906447|2226342:2239331|2229119_2231225_-|WP_095106523.1|DBSCAN-SWA MKTMNEKQYNHIELNNEVTKRKEDGFFSLEKDQEALEVYLEEIKDHTIYFDSEIERLHYLVDNDFYVDVFAQYSEEDLKELTEFARSIPFKFASYMSASKFFKDYALKTNDKQQYLEDYPQHVTIVALYLADGDKTQARQFISSMIEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDIRLSTISTGLIVPAKFFELAKKGEDFYMFAPHTVYNEYGVTLDDIDLDKYYDDMVANPNILKHKKDAREMLNTIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGVEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHTGMDALTVVSDEANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNQIGYESEEAKDFANVFFMTMNYYSIERSMQTAKERGEAYQDFDKSDYASGKYFEKYTQADIVPEYEKVKALFEGLEIPTAEDWKALEEDVKEYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNSETFYPMPFLSPKTMWYYKSAFNTDQMRLIDLVATIQQHVDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHHKGLKSLYYTRNKLLSVDECTSCAI >NZ_LT906447|2226342:2239331|2238266_2239331_-|WP_095106536.1|DBSCAN-SWA MKKQIQQLSAYQPGLSPRALKEQFDLDIELHKLASNENLYGPSPKAKEAIKEHVDEVLYYPETGAPTLRKKIAENLNIDEKRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDKIVTSQATFGQYYHNAIVESAEVVQVPLKENGQFDLEGILQEIDENTALVWICNPNNPTGTYVTHEELEAFLEQVPGNVPVLVDEAYFEFMTAKDFPDTLKLQEKFPNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYIIATEEAIHNYNIIRPPFNVGRLSEYAAVAAYEDQDYLKEIQKRNAEEREKFFAIPESKHFFDSQTNFIFVKTKRPKALYEALLKVGCITREFPIGVRITIGFPEQNAKMIEVLKNFDFEA >NZ_LT906447|2226342:2239331|2228004_2228982_-|WP_095106521.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLTPEEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTKDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVLEEPHLKYKSDKIVGNYHKLWAKEASIYDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGRMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSENEKQRADQHMYKLLEELYKNEVSYTHKLYDDIGLTKDVLNYVRYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTSTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEPLKDEDFIFDDEEK >NZ_LT906447|2226342:2239331|2226342_2227311_-|WP_095107329.1|DBSCAN-SWA MRQLMRGPILFFIFIVLSILSLFIGVSQLGLADIFHLSTEQRNILFSSRVPRTVSIIISGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPQAHILIKLIFAILLSITGTFFFMKLIQVIRFKDVIFVPLLGIMIGGIISSLTTFIALRTNAVQSIGNWLNGNFAVITSGRYEVLYLSIPLLIVTYIFANYFTIAGMGKDFSHNLGVNYERIMMYGLAITATMTALVVVTVGALPFLGLIVPNIVSIYRGDHLKHALPHTALLGAIFVLFSDIIGRLIVYPYEINIGLTLGVFGTFIFLAMLLKGSRNYES >NZ_LT906447|2226342:2239331|2235777_2237280_+|WP_095106532.1|DBSCAN-SWA MQNNLHNQHVQEIPQRGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMFYAIKDGGLGMDEVTAQSVMSIYGSLIFMTTIIGGWVADRITGTRGATMYGAVLIIIGHVVLSLPLANIGLYVSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDSRIDSGFVIFYMSVNMGALVAPLILNQFSDNHKFHQGFLIAAIGMAVALVIYLIFNKRNLGNVGLRPTNPLSAAEKKCYGIIVGAVAAIIAIVILITVLTGTFTFDMISTTVLILGVALPIIYFTIMIRSKEVSSDERSRVIAFIPLFIIGVIFWSIQEQGSNVLNIYAFKGTDMTINLFGWTSAFGKTYFQSINPLFIVLLGPVISYIWKKMGERQPSLATKFVWGAVLAGISYIMIAFVMMGSGGHQITVNWVILSYIICVIGELCISPTGNSAAVKLAPKAFNSQMMSLWLLTNATAQAINGTLVKLIKPLGYQNYFLFLGCLAVVIGLVTLAFVPKIVKGMRGIR |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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