Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_LT906463 | Haemophilus pittmaniae strain NCTC13334 chromosome 1 | 0 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,cas2,cas1,cas9 | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
188294 : 196777
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT906463|188294:196777|DBSCAN-SWA TTTAATCATTATTAAAAGTATCACATCGTGCAGGATCACCACTTTGTAACCCTTTTCTAAACCAGCTCAAACGTTGTGCCGAAGTACCATGCGTAAAACTATCCGGCACCACATAACCCTGGCTGCGTTTTTGCAAACGATCATCACCTACGGCTTCCGCTGCTTTAAAGGCTTTTTCCTCATCGCCTAGTTCAAATAATCCACTCTTCACCGCACTCCTTGCCCAAACACCGGCAAAGCAGTCTGCTTGTAATTCTAATTTAACTGAAAGCTGATTAGCCGTTTTGCTGTCAGATTTCTGCCGTAATCGATTTACCTGTGGCAAAATACCTAACAGATTCTGCACATGATGACCAACTTCGTGAGCAATCACATAAGCAAACGCCGAATCCCCCGCTGCGCCCAATTTATTTTTCATTTCCTGATAAAAAGACAAATCCAAATAAACCTGATTGTCATTCGGGCAATAAAATGGCCCCATTGCAGCCTGTCCGGTACCACAAGCTGTGGAAGTATAACCGCTATAAAGCACTAAGGTTGGATTGGCATAACGTTTACCCATTCTCTGAAAATACCCTTGCCAACTGTCCTCTGTGCTAGCCAACACAGTACGGGAAAGATCCTCTAAGTGAATTTCCTCGCTTGAGCTTTGTCTGCTTTCTGTGGGTTGATTTAAACCGCCAACATCCACTAAACCGGTTAAATCGACACCATAATAGGCTCCGACCAATACAATAATCAGTCCGATAATACCGCCTTTTCCGCCGCCAAAATTACCTCCGCTGCCACGTCGGTCATCAACATTATCACTCCGGCGATGTCCCTCTAAACGCATAATTACCTCGTAGTATTCAATTGAGGGGCGCATTCTATCAAAATCCGTTGGGATTTCCTCAAACAATTCAACACTCATTCCTAAAAAGAACTAACCCATTGATTTTAGTAGTGTTATAAACGCCTCTCCGATTTTAAAAGTTTTGCAAAAACAGCACATAAGTCATTGATTTTATTATAATTGATTTCAAATTCACAATTTTGCATTTTTTTCGTGCTGAATGTTGAACTATTTGCCGTTTTACCTGACCAAAAGTCGCCGTTGTCAAATGATAAAACGTCACGGCAGAAATTATTTTCAACCAACAAAAAGGAACAAATTATGGGTTTATTCGATTTTGTCAGCGATATCGGTAAAAAAGTATTTTCTAAAGAAGAAGATGCATCAAAAGCCGTCACCGACCACATCAATGCCGACAATCCAGGGATTGAAAATCTTAATGTGAGCGTACAAAACGGTACTGCAACCATTCATGGCGTAGCTTCGACTGCTGCTGCGTTAGAAAAAGCCGTTCTCATGGCTGGCAACATCCAAGGTATCAGCAATGTAACCATTAATGCCGATATCGGTAACGGGGAATCCTTGGCGGGTGACGATGCCTTTTATGTTATTCAAAAAGGTGACACCCTTTGGAAAATTGCCGAAACCCACTACGGTAATGGTGCCAAATATACTGCAATCGTAGATGCCAACAGAGAAGTTATCAAAGATGCGGATAAGATCTTCCCTGGTCAAAAAATCCGTTTACCAAAATCGCTTTAATCATTAACAAAATATGAAAGTGCAGCCTTAGAGCTGCACTTTTTTATGTGCGATATTGCCGATAAAATACCCAAAACCGACTGAATGTCGGGGATTTTTGCGGTTTCTATCGACTGTTCGATTTTCTTTCGCTATAATTCGGCGGTTTTTTATTTCTTAACAACGTGTTCGGTGTGGTTTTTACCGAGTGCAACATTAATTGAGGTTACAAATGTCATTAAATATTGAAACAACTCAAGGTTTAGAGCGTCGTGTGACGATCACCGTTCCGGCTGAAACCGTAGAAAAAGCGATCCGTGAAGAATTCAAACGCGCAGCTAAAAATGTGCGCGTAGACGGTTTCCGTAAAGGCCACGTTCCGGCTCACATTATTGAACAACGTTTTGGCGCATCTATCCGTCAAGATGTACTAAATGATCTATTACCTCGTCATTTCTTTGACGCGGTTATTGCAGAAAAAATCAACATTGCAGGTCGTCCGACTTTTGCAATCGAAACCTTTGAAGCTGGTAAAGATTTAGCTTTCACTGCAACTTTTGAAGTATATCCAGAAGTGGAATTAAAAGGTTTAGAAAACATTAAAGTTGAAAAACCAACCGTAGAAATCAACGAAACCGATGTCGACAATATGATCGATGTATTACGTAAACAACAAGCTACTTGGGCTGAAAGCAACGATGCAGCGAAAGCGGATTCCCGTGTAACTATCGATTTCGTCGGTTCTGTTGACGGTGAAGAATTCGATGGTGGCAAAGCTTCCGACTTCGTATTATTCATGGGCCAAGGTCGTATGATTCCAGGATTCGAAGATGGCATCGTTGGTCACAAAGCAGGCGAACAATTCGATATCAATGTGACTTTCCCAGCGGAATATCATGCTGAAAACTTAAAAGGTAAAGACGCGAAATTTGCGATCACCTTGAAAAAAGTAGAAGAAATGGAATTACCGGAACTTACCGATGAATTCGTTGCTAAATTTGGTCCTAACACCAAAACTGTTGCCGATTTACGTGCAGAAATCCGTAAAAACATGGAACGTGAATTAAAAAATGCATTGGTTTCCCGCGTTAAACAACAAGTGATCAATGGCTTAATCGAACAAAACCCTATTGATGTTCCAGCTTCAGCGATTGAAGAGGAAATCAATGTGTTACGTAACCAAGCTGCACAACGTTTTGGTGGTAATGCACAACAAGCAGCACAATTACCACGTGAATTATTTGAAGCTGATGCAAAACGTCGCGTGCAAGTCGGTTTATTGTTCTCTGAAGTGATCAAATCAAACGAATTAAAAGTTGATGATGAACGCGCGAAAGCAATGATTGCCGATATCGCATCAGCTTATGAACAACCGGCTGAAGTGATCGAATACTACAGCAAAAACGAAGAATTGATGAACAATATTCGTAATGTAGTGTTGGAAGAACAAGCCGTTGATGCAGTATTAGCAAAAGCGCAAGTTACTGAAAAACCATCTAGCTTCAATGAAATTATGAATCCACAAGCATAATTTTTTCACTTTACGCATAGAAATGCGGTTGATTTTTTAAAGTTTCGAAAACTGCAAAAAATCACCGCATTTTTGTTTTTAGCGTATTTCGGATAGAATATGCGCGTTTTTTTATACTGAATTTCGAGGAACAAATGAGTGTAATTCCTATGGTCGTCGAGCAAACCTCCCGCGGTGAGCGCTCTTACGATATTTATTCGCGTCTATTAAAAGAACGCGTTATCTTTTTAAGCGGCGAAGTTGAAGACCACATGGCCAACCTAATTGTGGCACAACTGCTTTTCTTAGAATCTGAAGATCCCGATAAAGATATTAATATCTACATCAATTCGCCTGGTGGCTCTGTTACAGCGGGAATGGCAATCTACGACACCATGCAATTTATCAAGCCCGATGTGCGAACATTGTGTATTGGTCAAGCTTGCTCAATGGGGGCATTTTTATTAGCCGGGGGGACTGCAGGCAAACGCGCGGCATTACCTAATGCCCGTGTGATGATTCACCAACCATTGGGTGGTTTCCGCGGACAAGCCTCGGATATTCAAATTCATGCACAAGAAATCTTAAAGATCAAGCAAACCTTAAATGATCGTTTAGCATTCCATACCGGGCAAAGCATCGAACGCATTGAAAAAGACACCGACCGAGATAATTTTATGTCGGCACAAGAAGCCAAAGATTACGGTCTCGTTGATGCTGTTTTGCTAAAACGTGAAGGATAAAATCATGACAACTGAAGATAAAGATAAAAACCTCCACTGCTCTTTTTGTGGCAAACCTAAAAATGAAGTGAATAAACTCATCGCTGGTACCGAAGGATATATTTGTAACGAATGTATCGATCTGTGCCATGGAATGCTGCTTAATGAATCAGATAGCGTTAGTAGCCCAGAAAAAGCAGCGGAAAATGAACCTTTACCAACCCCTCATCAGATCCGTCAACATCTAGATGATTATGTTATCGGTCAGGACTATGCCAAAAAGGTATTGTCCGTTGCGGTCTATAATCATTACAAAAGATTGCGTTCAAACCATCAAACCAATGATGTGGAATTAGGCAAAAGCAATATTTTACTTATTGGCCCTACCGGTAGTGGTAAAACCCTACTTGCCCAAACCTTGGCTCGTCGCCTGAACGTACCTTTTGCTATGGCTGATGCAACAACATTAACCGAGGCCGGCTACGTAGGCGAAGATGTAGAAAATGTCTTGCAAAAACTGCTGCAAAATAGTGAATACGACGTCAAGAAAGCTGAACAAGGTATTATTTACATTGATGAAATCGATAAGATCAGCCGCAAATCTGAAAGCGCCTCCATCACGCGAGATGTTTCTGGTGAAGGCGTACAACAAGCCTTGTTAAAACTGATCGAAGGGACTATTTCTAATATTCCGCCACAAGGAGGAAGAAAACACCCGCAGCAGGAAATGACTCAATTAGATACTTCCAAGATCCTATTTATTTGCGGCGGCGCGTTTGCCGGCTTGGATAAAATCATAGCCAAACGAAGCCAAAACCATACCGGTATCGGTTTTGATGCAAAAGTAGAAAAAGAGTCAGAAAAAGCCTCTCTTTCCGAACTATTCCGTCAAGTTGAACCGGGTGATTTAATGAAATTCGGTTTAATCCCCGAGTTTATCGGTCGTTTACCAATGATTGCACCGTTAAGCGAATTGGATGAAGCGGCATTAATCAGCATTCTTACCCAACCCAAAAACGCCTTGGTAAAACAATATCAAGCGTTATTCGGTTTAGAGAATGTGGAATTAGAATTTACCACAGATGCATTACAAGCCATTGCTGAAAAAGCATTGCAGCGAAAAACTGGGGCTCGAGGTCTACGTTCCATCGTTGAGGCGATTCTGTTGGATACAATGTACGATTTACCATCCATTGAAAATCTACGGAAAGTCATCGTCACTAAGGAAACGGTTACCGAGGATCAAAAACCGCTTTTAGAATATAAAAATTAACCTCTGTCGCGATTGTTTTACCGATTTTCCATAGGAAAAGCCAAAAGAAAATGATACAATCGCGGCTCTTTTACTATTGACTATTTTATTTAATAAACGGATTCCATCATGGCAACTGAAATTGTTGAGAAAAAGAAAAACGCTGCCGAACCTTCTTTTGAAGGAAAATCTAAAAAATTAAACATCTTCTTGTGGGTTTTGGTTGTTATCTTTTTTACAGCCGCCGCAGTCGGTAATATTTATTTCGAAAAACGTTTTTCATTACCGATTCGCGTAATCGGCGTTACTGTCGCAGTCCTTATCGCGTTAGGTTTAGCGGCGATCACTAATCAAGGAAACAAATTCCTTACTTTCTTTAAAGAAGCGAAAGTAGAAGCACGTAAAGTCGTTTGGCCTAATCGTCAAGAAGCCCGTCAAACTACCTTAATCGTGGTTGCGGTAACTGTAATTACCTCACTTTTCTTCTGGGCTATCGATTCAATTATCGTGTCCGTAATTAATTTTTTAACTGATTTGAGATTCTAATAATGACTGAAACAACCGTATCGAAAAAACGCTGGTATGTGTTACAGGCATTCTCCGGTTTTGAAGGCCGTGTTGCTGCTACTTTGCGTGAATACATCAAACAATACCAAATGGAAGATCAGTTTGGCGAAGTGTTAGTACCGACCGAAGAAGTAGTTGAGAATGTCGCAGGTAAACGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCGGGTTATGTGTTAGTAGAAATGGAAATGAATGACGACACATGGCACTTGGTAAAAAGTATTCCACGCGTAATGGGCTTTATCGGTGGAACACCAGATAAACCGGCACCGATTTCTAAACGCGAAGCGGATATGATTTTAAATCGTTTAGAACAAACCTCCGATAAGCCACGCCATCGTAATGAATATCATCCTGGTGAGGAAATTCGCGTAACTGAAGGACCGTTTGCCGACTTCAATGGTACCGTGGAAGAAGTTGATTACGAAAAAGGCCGCTTAAAAGTATCCGTATCTATCTTTGGTCGAGCAACTCCAGTTGAATTGGAATTTAGCCAAGTAGAAAAACAAAACGGTTAATCCCATTATAGGAAAAAGAGGAGAAATCATTTTCTCCTCTTTTTTTTGTGCATATCATTAAAGAGTAATGATTAACCATCGTAAAACAACATAAACTGACTAAAAACGCTTGAAAAATGTGCGAGTTTTTTATAAAATCCGCGCTCTCAATGTGGGCCATTTATTGGCTCACATTTTTGTGTAGCACATCGTGCTTTTTATCATCGGGGAGCTAGTAATAGCGCTATCACCCACTTAGAGGAAACTTAAAAATGGCAAAAAAAGTCCAAGCATACGTTAAGTTGCAAGTTGCAGCTGGTATGGCTAACCCATCACCGCCAGTTGGTCCTGCATTAGGTCAACAAGGTGTGAACATCATGGAATTCTGTAAAGCATTCAACGCTCGTACTGAGAGCTTAGAGAAAGGTTTACCAATTCCAGTTGTTATCACTGTATATGCAGACCGTTCATTCACTTTCATCACTAAAACTCCACCGGCAGCTGTATTATTGAAAAAAGCCGCAGGTATCAAATCTGGTTCCGGTAAACCGAACAAAGATAAAGTGGGTAAAGTGACTTTAGATCAAATCCGTCAAATCGCTGAAACTAAAGCAGCAGATATGACTGGTGCGACTATCGAAACTAAAATGAAATCAATTGCTGGTACTGCTCGCTCTATGGGCTTAGTGGTGGAGGAATAATACGATGGCTAAATTGACTAAAAAAATGAAAGCAATCAAAGCTGGCGTAGATTCTACTAAAGCATACGAAATCAACGAAGCAATCGCGGTATTAAAACAATTCGCAACTGCTAAATTCGTTGAAAGTGTTGACGTTGCAGTAAACTTAGGTATCGATCCTCGTAAATCTGACCAAAACGTTCGTGGTGCAACTGTATTACCACACGGTACTGGTCGTGAAGTACGCGTAGCTGTGTTCACTCAAGGTGCTAACGCAGATGCTGCTAAAGAAGCTGGTGCTGATTTAGTAGGTATGGAAGATTTAGCAGAGCAAATCAAAAAAGGCGAAATGAACTTTGATGTTGTTATCGCTTCTCCTGATGCAATGCGTGTTGTTGGTCAATTAGGTCAAGTATTAGGCCCACGTGGTTTAATGCCAAACCCTAAAGTTGGTACCGTAACACCAAACGTTGCTGAAGCGGTGAAAAATGCTAAATCTGGTCAGATCCGTTATCGTAACGATAAAAACGGTATCATCCACACAACTATTGGTAAAGCGAACTTCTCTGAAGTTCAATTAAAAGAAAACCTTCAAGCATTATTGGCTGCTTTAAACAAAGCTAAACCAACCACTGCAAAAGGTATCTTTATCAAGAAAGTAAGCATCTCTACTACTATGGGTGCTGGTGTGGCTGTTGATCAAGCTTCACTTTAAGCTTAACTAAGTACAAAAAACCGCATTTTTCAATGCGGTTTTTTTATTTTTATAGCATTTATAATAAAATCAATGACTTAGCATTGATTTTTCCCAAAACTCTGAAAAACAAGATGGCGTTTTGCAGCCTATGCTTTCTTTTGACAATGTGGACATACAAAGCTATTGCGTTGCCCGATAATCAAACTTTCAATCACGTGACCACAAACTGGACAAGGTTTTCCTGCTTTACCGTAAATTTGCAACTCTTGTGCAAAGTATCCAGGACGCCCATCCGGTTGCAAAAAGTCTTTTAAGGTCGTGCCTCCTTGCTCAATAGCTCGGGTTAATTCAGCTTTAATGACCAAAACTAAGCGTTCACATTGTTTATGGGTAAGATTAGCGGCTAGTTTTTGCGGATGCAGGCGACAGTAAAATAAGCTTTCATTCGCATAAATATTGCCTACCCCAACAACCACGGCATTGTCCATTAAAAAGGATTTTACTGGAATTCGCCGCCCACGGGACTTTTTAAATAAATACTCCGCATTAAATTCATCGGCAAGTGGCTCCGGTCCAAGCTTAGCAAATAAATGAAAATTAGCTAAGTTATTCGTCCATAACCATGCACCGAAACGACGTGGATCGTTATAGCGCATCACTTTGCCATTATTCATTACAATATCTAAATGATCGTGCTTATCCGGTGGACTATCCTGCGACACAATACGCACAGAGCCCGACATGCCTAAATGACCGATGATATACCCCTGCTCCGTATGAATGACAAGATATTTAGCGCGCCGCGTCAGCGCTAAAATCTTCACATGCTTAAGTTGAGCCAATTCAGCTGACACTGGCCAGCGTAGATTCGCCTGACGAATCACTATATTTTCAATCGTAAAGCCTTTTAAGTAAGGACTGACTCCGCGTAGGGCCGTTTCAACTTCTGGAAGTTCTGGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT906463|188294:196777|195143_195833_+|WP_005649467.1|DBSCAN-SWA MAKLTKKMKAIKAGVDSTKAYEINEAIAVLKQFATAKFVESVDVAVNLGIDPRKSDQNVRGATVLPHGTGREVRVAVFTQGANADAAKEAGADLVGMEDLAEQIKKGEMNFDVVIASPDAMRVVGQLGQVLGPRGLMPNPKVGTVTPNVAEAVKNAKSGQIRYRNDKNGIIHTTIGKANFSEVQLKENLQALLAALNKAKPTTAKGIFIKKVSISTTMGAGVAVDQASL >NZ_LT906463|188294:196777|189449_189890_+|WP_007241589.1|DBSCAN-SWA MGLFDFVSDIGKKVFSKEEDASKAVTDHINADNPGIENLNVSVQNGTATIHGVASTAAALEKAVLMAGNIQGISNVTINADIGNGESLAGDDAFYVIQKGDTLWKIAETHYGNGAKYTAIVDANREVIKDADKIFPGQKIRLPKSL >NZ_LT906463|188294:196777|195961_196777_-|WP_007241710.1|DBSCAN-SWA MPELPEVETALRGVSPYLKGFTIENIVIRQANLRWPVSAELAQLKHVKILALTRRAKYLVIHTEQGYIIGHLGMSGSVRIVSQDSPPDKHDHLDIVMNNGKVMRYNDPRRFGAWLWTNNLANFHLFAKLGPEPLADEFNAEYLFKKSRGRRIPVKSFLMDNAVVVGVGNIYANESLFYCRLHPQKLAANLTHKQCERLVLVIKAELTRAIEQGGTTLKDFLQPDGRPGYFAQELQIYGKAGKPCPVCGHVIESLIIGQRNSFVCPHCQKKA >NZ_LT906463|188294:196777|193901_194459_+|WP_164703776.1|DBSCAN-SWA MTETTVSKKRWYVLQAFSGFEGRVAATLREYIKQYQMEDQFGEVLVPTEEVVENVAGKRRKSERKFFPGYVLVEMEMNDDTWHLVKSIPRVMGFIGGTPDKPAPISKREADMILNRLEQTSDKPRHRNEYHPGEEIRVTEGPFADFNGTVEEVDYEKGRLKVSVSIFGRATPVELEFSQVEKQNG >NZ_LT906463|188294:196777|194710_195139_+|WP_007241834.1|DBSCAN-SWA MAKKVQAYVKLQVAAGMANPSPPVGPALGQQGVNIMEFCKAFNARTESLEKGLPIPVVITVYADRSFTFITKTPPAAVLLKKAAGIKSGSGKPNKDKVGKVTLDQIRQIAETKAADMTGATIETKMKSIAGTARSMGLVVEE >NZ_LT906463|188294:196777|188294_189128_-|WP_039847750.1|DBSCAN-SWA MRLEGHRRSDNVDDRRGSGGNFGGGKGGIIGLIIVLVGAYYGVDLTGLVDVGGLNQPTESRQSSSEEIHLEDLSRTVLASTEDSWQGYFQRMGKRYANPTLVLYSGYTSTACGTGQAAMGPFYCPNDNQVYLDLSFYQEMKNKLGAAGDSAFAYVIAHEVGHHVQNLLGILPQVNRLRQKSDSKTANQLSVKLELQADCFAGVWARSAVKSGLFELGDEEKAFKAAEAVGDDRLQKRSQGYVVPDSFTHGTSAQRLSWFRKGLQSGDPARCDTFNND >NZ_LT906463|188294:196777|190101_191400_+|WP_007241819.1|DBSCAN-SWA MSLNIETTQGLERRVTITVPAETVEKAIREEFKRAAKNVRVDGFRKGHVPAHIIEQRFGASIRQDVLNDLLPRHFFDAVIAEKINIAGRPTFAIETFEAGKDLAFTATFEVYPEVELKGLENIKVEKPTVEINETDVDNMIDVLRKQQATWAESNDAAKADSRVTIDFVGSVDGEEFDGGKASDFVLFMGQGRMIPGFEDGIVGHKAGEQFDINVTFPAEYHAENLKGKDAKFAITLKKVEEMELPELTDEFVAKFGPNTKTVADLRAEIRKNMERELKNALVSRVKQQVINGLIEQNPIDVPASAIEEEINVLRNQAAQRFGGNAQQAAQLPRELFEADAKRRVQVGLLFSEVIKSNELKVDDERAKAMIADIASAYEQPAEVIEYYSKNEELMNNIRNVVLEEQAVDAVLAKAQVTEKPSSFNEIMNPQA >NZ_LT906463|188294:196777|193482_193899_+|WP_007241519.1|DBSCAN-SWA MATEIVEKKKNAAEPSFEGKSKKLNIFLWVLVVIFFTAAAVGNIYFEKRFSLPIRVIGVTVAVLIALGLAAITNQGNKFLTFFKEAKVEARKVVWPNRQEARQTTLIVVAVTVITSLFFWAIDSIIVSVINFLTDLRF >NZ_LT906463|188294:196777|192126_193374_+|WP_007241758.1|protease|DBSCAN-SWA MTTEDKDKNLHCSFCGKPKNEVNKLIAGTEGYICNECIDLCHGMLLNESDSVSSPEKAAENEPLPTPHQIRQHLDDYVIGQDYAKKVLSVAVYNHYKRLRSNHQTNDVELGKSNILLIGPTGSGKTLLAQTLARRLNVPFAMADATTLTEAGYVGEDVENVLQKLLQNSEYDVKKAEQGIIYIDEIDKISRKSESASITRDVSGEGVQQALLKLIEGTISNIPPQGGRKHPQQEMTQLDTSKILFICGGAFAGLDKIIAKRSQNHTGIGFDAKVEKESEKASLSELFRQVEPGDLMKFGLIPEFIGRLPMIAPLSELDEAALISILTQPKNALVKQYQALFGLENVELEFTTDALQAIAEKALQRKTGARGLRSIVEAILLDTMYDLPSIENLRKVIVTKETVTEDQKPLLEYKN >NZ_LT906463|188294:196777|191534_192122_+|WP_007241571.1|DBSCAN-SWA MSVIPMVVEQTSRGERSYDIYSRLLKERVIFLSGEVEDHMANLIVAQLLFLESEDPDKDINIYINSPGGSVTAGMAIYDTMQFIKPDVRTLCIGQACSMGAFLLAGGTAGKRAALPNARVMIHQPLGGFRGQASDIQIHAQEILKIKQTLNDRLAFHTGQSIERIEKDTDRDNFMSAQEAKDYGLVDAVLLKREG |
10 | Bacillus_virus(33.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
493223 : 555784
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT906463|493223:555784|DBSCAN-SWA 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84 | Mannheimia_phage(22.81%) | tail,capsid,lysis,plate,portal,head,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1540903 : 1549207
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT906463|1540903:1549207|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT906463|1540903:1549207|1543455_1545216_+|WP_095176960.1|DBSCAN-SWA MTWQTELNSSFAWLLQAFAWIILGFFITIGLFSRTEFGRKFARIVRPSLHRGNILKFGGLLLLLIMMVLLEVRFSVLNSFFYNGLYSSMQELDADKFWFFAKLNALLVGVQVLHTIVDYFLQQLFQIRWLESLNAVLVQRWLENKKYYRLKYERELPDNIDQRIEQDAREFIASTVQIVRGMINAILTTIEFTIILWSLSGVLSLFGLNIEKGVVFFIYAFIIFATLMSVWIGHPLIKLNFNKEKLNGDYRYSLIRVRDNAESIAFYQGEPREGQLLQQKFRDIIHNRWAIVLRMLGLDGFNGGVTRVAKLLPLMLQAPRFFSGQIKLGDMHQTVQAFNRLMTALSFFRLFYEEFTLYQARLNRLHGFLSKLDELDANAVTQPSKCAHRVALHDFGVKDEQGAILLNNINLTLEAGDALLIQGPSGTGKTTLLKAIAGIYPFETLGLAEHPCSGTLFLPQRPYMPQGTLRDAICYPALNPSHQELVQAMRDCCLEKYLPALHDENDWQAILSPGELQRVAFIRILLSRPEVVFLDETTSALDEPTEQLLYQTIKARLPQMIILSVGHRSTLYPFHNKRLDLAVCRL >NZ_LT906463|1540903:1549207|1547947_1549207_-|WP_039847715.1|DBSCAN-SWA MQIYLVGGAVRDQLLGLPIKDRDYVVVGATPEILLAQGYQQVGKDFPVFLNPQTKAEYALARTERKSGQGYHGFICDFSADISLEQDLLRRDLTINAIAQDEAGNLHDPYHGVSDLHNRILRHVSPAFAEDPLRVLRVARFAARFHHLGFQIAPETLQLMASLCQQGELLHLTAERVWLETEKALSEPNPEVYFETLKNVGALAQLFPELHALSGVPNPPQHHPEIDSFLHTMLVLKQAVRLTQQEPQRAIAVRFGALCHDLGKGLTDPQLWPRHHGHEKTGVAQTRLLCKRLKAPHAIQELAELTAEYHTHIHKAFELRAETIVKLFNRFDVWRKASRFEDFLLICLADSRGRLGFEDKDYPQIAYIHTLYQAALAVDVQQVIRDGFEKQAIRDELTRRRIVAVAAAKKAFSLPSLSL >NZ_LT906463|1540903:1549207|1546363_1547275_-|WP_007241485.1|DBSCAN-SWA MNTQANSLTPAHWPSRFPSPAKLNLFLYINGRLPNGYHELQTLFQFINICDWLTITPRADNEIHITPEIADLPVEQNLIYRAAKLLQQHCQYPLGADIQLEKNLPMGGGIGGGSSNAATALLVLNELWQCGLTLEQLSALGLQLGADVPIFIHGHAAFAEGVGEKLQHCNPPEKYYLLLKPDAFVSTPAVFKHPELPRTTPKRALEELLQTNFANDCEKVVCLTYPAVEKALQWLLQYAPARLTGTGACVFAEFADESSAQAVFRQKPADWQGFVARGMNVSPLHSLLARYRAETAPNKPIFS >NZ_LT906463|1540903:1549207|1542445_1543108_-|WP_007241425.1|DBSCAN-SWA MQSRLIVESQEASLLSTHKVLRNTYFLLGLTMAFSAVVAYLSMALDLPYPNLIVLLVGFYGLLFLTNALANSAWGILSAFAFTGFLGYTIGPILNMYVARGMEDLIMLSFAGTAIVFFACSAYVITTKKDMSFLGSAIFALFIVLLLGIVASFFFQIPALAVGISALFVIFSTMTILYETSNIIHGGETNYIRATVSIYVSIYNLFLSLLRLLSIFSSRD >NZ_LT906463|1540903:1549207|1541840_1542389_+|WP_007241415.1|DBSCAN-SWA MNLETKLQQIKLVICDVDGVLTDGLLHYDAQGEAIKSFHVRDGLGIKMLMDAGIQVAILSGRDSAVLRKRIDDLKIPLFFLGKLEKESACFELMHLAGVQPEQTAYIGDDSVDLPAFAVCGLSFAVADAADYVQSQADYVLKLGGGRGAVREMSDMILKAQGKDAVYRSAQGFLHSVTNMGQ >NZ_LT906463|1540903:1549207|1547274_1547895_-|WP_007241479.1|DBSCAN-SWA MQFTKSFLLAGLSAMILAGCTLDAERPSGVQYIDKNDAAWLNHLQTIQQIKSYHAQGQIGYISPQERFSSRFDWQYTGPQSYSLKLYSLISKQTLLIEMQPSGMTISDNQGNRQSARNAKALLQEIIGMDVPLEHFAYWLKGQPASNADYQVGTNHLLAEFSYPVNGSLWTADYLSYQTNQMPENILLKNKSTAQTLKIRVDDWQF >NZ_LT906463|1540903:1549207|1545395_1546343_-|WP_095176961.1|DBSCAN-SWA MPDIKLFAGNATPELAKKISERLYISLGDATVGRFSDGEIQVQINENVRGADVFIIQSTCAPTNDNLMELIVMVDALRRASAGRITAVIPYFGYARQDRRVRSARVPITAKVVADLLSTVGIDRVLTCDLHAEQIQGFFDVPVDNAFGSPVLIDDILKKTDLVNPIVVSPDIGGVVRARAVAKLLNDTDMAIIDKRRPRANVAQVMHIIGDVADRDCILVDDMIDTGGTLCKAAEALKERGARRVFAYATHPVFSGKAAENLASDALDEIVVTDTIPLSPQIAALGKVRVLTLSSMLAEAIRRISNEESISAMFN >NZ_LT906463|1540903:1549207|1540903_1541839_+|WP_095176959.1|DBSCAN-SWA MDYLQIARNSLAVEQTALSQLGARLDDEFCRVVELILHCKGRLVIGGIGKSGLIGKKMVATFASTGTPSFFLHPTEAFHGDLGMLKAVDVVMLISYSGETDDVNKLIPSLKNFGNKIIALTANPQSTLATHADYVLNIAVEREVCPNNLAPTTSALVTLALGDALAVALITARDFKPADFAKFHPGGSLGRRLLTRVKDQMQSRLPVSALTTPFTDCLSIMNEGRMGLTLVMENHKLMGIITDGDIRRALTANGAATLQKCARDLMTSKPKTINQDAFIGEAEDLMKQLKIHSLVVVNDADDVVGLIEFAS |
8 | Tetraselmis_virus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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