Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT906477 | Clostridium cochlearium strain NCTC13027 chromosome 1 | 6 crisprs | WYL,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,RT,cas8b1,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,cas10,csa3 | 0 | 20 | 10 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LT906477_1 | 916184-919111 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_LT906477_1
|
44 spacers
spacers of NZ_LT906477_1
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cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT906477_1
The CRISPR arrays of NZ_LT906477_1 >merge|NZ_LT906477|1|916184-919111|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTACGATATTTAAGCCAGAACCACTGCATTGGGCACGGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTATTTAGAAGCTACTAGACAACTTAAAGCAAATACAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATGTTATAACTAAGAGTATGGAGGATATTGGTTTAGAGGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTCTATTGCAGCAGGTGGATTTTTAGCAATGGCAACTGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATACTGGTGATATGAATTTAAGTAATGTAGAACACATTGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATACATACTTGCATCTTCTTCGCTTGCTAATTTACTTATAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATGTATATTGGTTATTTTCAACTTCTTTTAAGAGTTCTAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATCTTATATGCCGAACTGATTTATTGTGTTCTATAACTCGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATCCTGTGGTAATACTTCCACTATTTTCATCGACATAAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATCCAAAGATAGCAGAAATAGAAGAATTTAAAGAAATAATGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATCCGATAATATTGGAAATATAACAATAGGGGTTAATGAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATATCGCTTTATAATTTCTTGTATCTTTTTCAAATATTAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTCTTTATATATTAGTCGCGGTAGCAATTTTAAATAATTGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTAAGAATAGATATATAAAATATGTAAATTAATTAAACAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATGGAATTGACGTTGGCTACAGCCATACAAAAGTATAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATCCAATTAGCATGTGTGGGAACTTATTCATATCTACTATGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTCTTTTATGTTATTCATTGTTTATTCCTCCAGCACGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATCATGTCGCTTATAGTTAGTTACTATTTTATTTACTATGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATATAGTATATGGTATTGCAAGTGCTTTGGGAATTTACGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATCGATCACTCTACGCATGTTGTACGAGTTGGAGGCGTGCGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATGGAGAAAATGAAGAGGATAACGAAAATTTGTATGCTAGGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATCTAAAGAAGATATAGAAAATGTAGACAAGAAAGTAGATAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTACACACACATCTAAAAACTTATACAGCAACCTCCTAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATCTCTCAACTCAATTAATGTCATGATAGCGTAGTTGGCGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATACAAAAGATACAATGGAAAGAATTGCTATTGCTCTTGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATGAAGGAGACAACGGGGTATATGTAGTAGACGGATGGGGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTCTTTAGTAAGATACACGCTGCTGTAGAAACTTGTATTGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTAAAGATATACTACCAATTTTAAAGAAAATAAAAACGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTTGTATATATTGTTATAATTTCTGTATTAAGTGTATTGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATAAATGTTACAGAGTATAAAACTACTTATCAACTTGAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTGTCTATATTGTAAAATAACTTTTCAAATTTGAAAAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATCACTTCATTAGAATCTTTATTAGTTGGAATATTTAATGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATATGTCGTAGGTAGGAATAATCCCTCCATCGTGATAATGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTGGTGTTTTTTAAAGTTTGTGTTTTACTTTTTAGGGGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTCGTTATCTGGAATATGCATAAAAGATAGCAGATTTATGTTTTATATTAACTATGCGATATGTAAATTTATTTATATTATATAATATGTGTCAGAATAAAAAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTTGTATCTGTTGCAAATCTTCTCAAAATCATTGCTAAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATGATGATCCATACCTCTATGAATTTTTCTGTTACATCTGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTGATATATTGAAAGGTGGATTAGTGATTATTACATCAAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATCTTCTTATTGCTATTTTCATTTGACCATCCTTTCCTTTGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTTATGGAATGGTAAAGGAACAGTACAAGTAATCCCTAGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATAATGAAAATGATTATGAGAGTTTTGGATTTGGTGATGTGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTATCCTTTTTTATAAAACATGAGTGAGTGGAGATACGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAATTTTAGTGATGAACTTAGAAAAAATATTAATCAAGAATGTTTTATATTAACTATGTGATATGTAAAT 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>NZ_LT906477.1|WP_095177598.1|915711_915975_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVILTYDVEEKRINRVRKLLKKYLTWTQNSVFEGEITEGKLHKCLCEIDKIVNRNSDSVYIYIVKNSKNITKSVIGIEKSFNDLFL >NZ_LT906477.1|WP_095177596.1|914720_915707_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MFKDYYIFNNGRIKRKDNTIYFLNKDGSKRALPIEQVDKIHLFGEVDLNTKLLNYISRYGVIFNFYNYYGYYSGSYYPREKNVSGFLLVNQAIHYHYYDKRLYLAKCFIESAAHHILRNLRRYKDKTSNLMEKIQIERENVKKANTIQVLMGAEGRMRKIYYEAFNSILKKDIFQFKKREKRPPTDPINALISFGNSLMYTTVLGEIYKTQLNPTVSYLHEPSTKRFSLSLDLAEIFKPLIIDPIIFNLVNNNIIRNKDFLFEEGICFLNEEGRKKFILNYEKKLHTTVKHRSLNRKVSYQMFIRLECYKLIKHLIGDEKYKALKAWW >NZ_LT906477.1|WP_095177594.1|914199_914721_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKFNLDNFKTQGVKINYYYVCKRKLWLFSKGITMEQNSDRVLSGKLVHENSYKRSKNKEVLIDDILRLDILEDDYVKEVKISSKMPIPDKMQLVYYLFYLKNIGIYKKGMIKYVKEKRIEEIELTKDLEEEIKRTLIDIKNIENSNCPPKLIRLPYCRKCSYYNFCFVREEDD >NZ_LT906477.1|WP_095177592.1|911874_914184_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 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NZ_LT906477_2 | 979067-981180 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_LT906477_2
|
31 spacers
spacers of NZ_LT906477_2
>2.1|979097|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATACCAGTATTAAATATGTGATATAATATAAGCAG >2.2|979165|39|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGCTTTAAGACATCAATTAACCTTGCTAGAAGTCGATA >2.3|979234|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTCTAGTTCATAGCTTTCTTCTAATTCCAATAGA >2.4|979300|39|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGGTAGAAAGAAAATCGAGAACGCAAGATATACTTATG >2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCAAAATCTTTTAATCCTAAGTCAATTCCTACT >2.6|979434|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATTACAATGGGAAAACAAATGAAATAACTAATTTT >2.7|979502|39|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTCTTTTCCCTGCTTCTATTGTATCGTCTGTAATTA >2.8|979571|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAGTTGAAAGAGGGAATGGAGCAAATGCAAGAAGT >2.9|979637|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGATACTGAAATAAAACAATTAAAAAAATCAAATA >2.10|979703|37|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTAGATACTACGCTCCTATTCTTTACTAAATCCCTA >2.11|979770|37|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGACTTAATACACATATTATTCAAGGGGATAGACCT >2.12|979837|39|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTTCAACAACGTACTTTATCAAGAATGAAATTAGGA >2.13|979906|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCGGAATTTTAGCACAGGATAATAAAAAAGTTTTA >2.14|979972|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAACAATGTTGGAGTATAAAGCTAATTGGTATGGAAGA >2.15|980040|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAACTAGGAATAAATATAAAAGCAAGAGATAAGAA >2.16|980106|39|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTCACTAACCTTTTGAACCTTAGCATGTTTTTTAACA >2.17|980175|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTTCTTCTATTTGAGGATAAATTATATCTTCATAC >2.18|980243|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAAAAGATGAATTAATTAAATAAAAGGAGTTTGATA >2.19|980311|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATGGACCTTAATAAATTAAATGGTTATATAGGTAA >2.20|980377|39|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTTGTATGTATTTCCAGAAACCCAGATCCAAGTCCCGC >2.21|980446|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATCTCATCTCTTATATAGTTGTTTATGTTCTCTT >2.22|980512|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACTCAGTTAAATATGTATTTAATAGAGTTGTAGT >2.23|980578|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAATCAAGACGTATTTAATGACAATGGCAGTGGGTAC >2.24|980646|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGGAGTATTAAGAAGGCAGCAACCACACCGATT >2.25|980711|37|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTTATAACAATGATAAAGAATATGAGGAAATTTCT >2.26|980778|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTTGTGCTGTTTCCAACTTTGGTCACGTGTCTAA >2.27|980844|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGGAAAGGGCTTTTTAGGTTGAACCCTTTAGAACC >2.28|980910|39|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATTTTCCACGAATGGTAATCTTAAAACTTCTCCTAATG >2.29|980979|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAGCTTGGTTAACATTAAACAATTAAAAATAAAG >2.30|981044|39|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGATTCTTCGTTACCTCCAAGTCTGTCCGGATGTAAT >2.31|981113|38|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT TCTTAAAATACATAGTAAATAATAGATAAACATACATA |
RT,cas6,cas8b1,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT906477_2
The CRISPR arrays of NZ_LT906477_2 >merge|NZ_LT906477|2|979067-981180|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACAATATACCAGTATTAAATATGTGATATAATATAAGCAGGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACATGCTTTAAGACATCAATTAACCTTGCTAGAAGTCGATAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTATTCTAGTTCATAGCTTTCTTCTAATTCCAATAGAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTGGGTAGAAAGAAAATCGAGAACGCAAGATATACTTATGGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTTGCAAAATCTTTTAATCCTAAGTCAATTCCTACTGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACAAAATTACAATGGGAAAACAAATGAAATAACTAATTTTGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTTTTTCTTTTCCCTGCTTCTATTGTATCGTCTGTAATTAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACGAAGTTGAAAGAGGGAATGGAGCAAATGCAAGAAGTGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTCGATACTGAAATAAAACAATTAAAAAAATCAAATAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACAGTAGATACTACGCTCCTATTCTTTACTAAATCCCTAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACATGACTTAATACACATATTATTCAAGGGGATAGACCTGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACAAATTTCAACAACGTACTTTATCAAGAATGAAATTAGGAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTCCGGAATTTTAGCACAGGATAATAAAAAAGTTTTAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACGAACAATGTTGGAGTATAAAGCTAATTGGTATGGAAGAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTAAACTAGGAATAAATATAAAAGCAAGAGATAAGAAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACCTTTCACTAACCTTTTGAACCTTAGCATGTTTTTTAACAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTTTGTTCTTCTATTTGAGGATAAATTATATCTTCATACGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACAACAAAAGATGAATTAATTAAATAAAAGGAGTTTGATAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTATGGACCTTAATAAATTAAATGGTTATATAGGTAAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACCGTTGTATGTATTTCCAGAAACCCAGATCCAAGTCCCGCGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACCTATCTCATCTCTTATATAGTTGTTTATGTTCTCTTGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTAACTCAGTTAAATATGTATTTAATAGAGTTGTAGTGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACGTAATCAAGACGTATTTAATGACAATGGCAGTGGGTACGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACATTGGAGTATTAAGAAGGCAGCAACCACACCGATTGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTGGTTATAACAATGATAAAGAATATGAGGAAATTTCTGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTCGTTGTGCTGTTTCCAACTTTGGTCACGTGTCTAAGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTGGGAAAGGGCTTTTTAGGTTGAACCCTTTAGAACCGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACCATTTTCCACGAATGGTAATCTTAAAACTTCTCCTAATGGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACCCAGCTTGGTTAACATTAAACAATTAAAAATAAAGGTTTTTAGAATAACTATGAGAGATTGAAACAAAGATTCTTCGTTACCTCCAAGTCTGTCCGGATGTAATGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTCTTAAAATACATAGTAAATAATAGATAAACATACATAGTTTTTAGAATAACTGTAAGCGTCAAAAAT >NZ_LT906477|2|2|979067-981112|PILER-CR GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC AATATACCAGTATTAAATATGTGATATAATATAAGCAG GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC ATGCTTTAAGACATCAATTAACCTTGCTAGAAGTCGATA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TATTCTAGTTCATAGCTTTCTTCTAATTCCAATAGA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TGGGTAGAAAGAAAATCGAGAACGCAAGATATACTTATG GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TTGCAAAATCTTTTAATCCTAAGTCAATTCCTACT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC AAAATTACAATGGGAAAACAAATGAAATAACTAATTTT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TTTTTCTTTTCCCTGCTTCTATTGTATCGTCTGTAATTA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC GAAGTTGAAAGAGGGAATGGAGCAAATGCAAGAAGT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TCGATACTGAAATAAAACAATTAAAAAAATCAAATA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC AGTAGATACTACGCTCCTATTCTTTACTAAATCCCTA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC ATGACTTAATACACATATTATTCAAGGGGATAGACCT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC AAATTTCAACAACGTACTTTATCAAGAATGAAATTAGGA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TCCGGAATTTTAGCACAGGATAATAAAAAAGTTTTA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC GAACAATGTTGGAGTATAAAGCTAATTGGTATGGAAGA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TAAACTAGGAATAAATATAAAAGCAAGAGATAAGAA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC CTTTCACTAACCTTTTGAACCTTAGCATGTTTTTTAACA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TTTGTTCTTCTATTTGAGGATAAATTATATCTTCATAC GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC AACAAAAGATGAATTAATTAAATAAAAGGAGTTTGATA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TATGGACCTTAATAAATTAAATGGTTATATAGGTAA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC CGTTGTATGTATTTCCAGAAACCCAGATCCAAGTCCCGC GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC CTATCTCATCTCTTATATAGTTGTTTATGTTCTCTT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TAACTCAGTTAAATATGTATTTAATAGAGTTGTAGT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC GTAATCAAGACGTATTTAATGACAATGGCAGTGGGTAC GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC ATTGGAGTATTAAGAAGGCAGCAACCACACCGATT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TGGTTATAACAATGATAAAGAATATGAGGAAATTTCT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TCGTTGTGCTGTTTCCAACTTTGGTCACGTGTCTAA GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TGGGAAAGGGCTTTTTAGGTTGAACCCTTTAGAACC GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC 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>NZ_LT906477.1|WP_095177630.1|977158_978844_+|cobaltochelatase-subunit-CobN MPGFEEAVSFIKEYIQNNSKNATLIKKLCENDYIYNVTIMELIEEYIKIGRYIQSGDSTKIGEELYEKYKHIEKTILDNLRDEILNIYDKLKLVKFETKNLIKGLNGSFVEPGLSGMPCDDLENILPTGRNFYLMDYEKIPTKEAYKIGCKLANGIIEKYIEEEGTIPEKIAMNMISTDISMAKGEQLSQMLYLMGITHVWDQSGKVVDLEAIPLEKLKRPRIDVIVRISGVLRDAYPNVINLMDKGTVIASSLEEPFESNFVRKNTFEIARVLKELGENEDIERRSTMRVFGDKPGTYGSGVNLALMASAWKDEKDIGKIFVYFSSHAYGENLNGRMAKHEFVENIKASEISYDTTISNRYDVLSSGFAASVQGGFRAVKKLLSGKEMKQYHGGTENKDNIRICTLKEEIKKTMEETFFNPLWKENVKKNGYTGASEFMRRIQSVFDWQCLSKNIDNKDIDKLVDLYVNDEEMVKWFSEHNKYAVEEIGRRFLELYERKKWNPDKEILDKLRKNYIKIEGDMEELSENSKGEIQGGDIEILNYEDIESWSDKLKDVDDIF >NZ_LT906477.1|WP_095177629.1|976867_977107_+|cobaltochelatase-subunit-CobN MAIFLHNAPCSGVEATVGLGAGLDVFESVVNILKELKKNGYKKLLNKKLIGKIKEINGAEEIVNSKENFIEGVEKLKDY >NZ_LT906477.1|WP_096635641.1|976144_976450_+|hypothetical-protein MKMYDMAGGDYVFKYVEKDKSGANSIIFEDFYAKSSNTYIYVCELMGKTRPKNIDEFVKQVSIMKNMKSIKNGELRVSQPCWYQSVDKLDEIIEDLAAIYH 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MNEAKKIKYQLTILIIFFLIYNIAIIYENNYWGNILSPVIAFLTSYFLIIISKKIDIYKNNWMLLALSCLSWGICDLLWGIYDLIFKINPENIDLFMYIYIIPNLFIISTVILYFIKNIKKLEYVQLIVDTTTTLILMLSFFWILILGEQFEFILSNIYELTTFLYIATDFISLSIIYIMFISIRSKKKSVTNILIVLGIIVYTISELLYVHQKLMGVYIPNSILDGLFMLTFILFAIAGAYKLLYEKQYIEESFNLPDNIDNNKKGRLILLIPLIMLFMLHKLDIQWIIFFTGIILIHKVLSSYVKISTYNKYMLDKEIEINDLLEKKIEERTKELIKANDRLKVLSQQDVLTNLYNRRYFMKKIDEMILTKKTDETIVVFYMDLNGFKIINDSYGHDMGDKVLLEVSNRLESFIPDDAILARLGGDEFIIARKGVWDLIEIQDFVEEMASLYEKPIIIEPYKFKVSFSVGIAMCAEDNLDRNTLIKNADVAMYYAKEDLNKMYVFYDKNLSRKVERKNKLELLLKNAVFDEEFEIHYQPQFNSNTKEIIGVEALIRWNSPLEGIISPVEFIPIAETCGIIVDIGYWVMKNAIKQVSYWNKYNNMNLRVAINVSPKQINSLDFIKNLKTIIQHNEIDPKLIDIEITENIELTQEGVIKEVLEELACIGVKISIDDFGTGYSSLSYIKRFHIDRLKIAKELVDNISSDSVNLKVVKAIIMIAKTMNIKTIAEGVEDEFQLQKLIELGCDEIQGYIWDKPLKIKEFEKKYLSKTGRVIDFL >NZ_LT906477.1|WP_169712383.1|966476_967232_+|polysaccharide-deacetylase-family-protein MLKKIYKIIFPILIIVFVLPGFLNQSHSKSEKESSIPIFMYHSISENEKGLFKVPEDNFYKQMKYLKDNGYNTLSLDELYDHLTNNIPFLDKSVVITFDDGYSDNYKNAYPILKEFGLRATIFTITDYIEGSSYFMNSDQLKEVALNGIDIESHTTNHSKLDKLSKEDRARNLRESKNTIEKLLDKEVKYIAYPFGKYNKEVIEDLKEEGYKMAFTTKRGIANSNNGLYELKRVFISGYTNIKKFKRKIEN >NZ_LT906477.1|WP_160110524.1|964483_965506_-|G5-domain-containing-protein MISNLKDFFKRNNSKKSTAQILVLLSVIVITTFVALSRKTVTLAIDGEEKKFTTYQSNVQSFLDKENIKLNPKDKIDKDMDSKLSNKDVINIRRAVNVKINVDNKELAIKSAEKDVASMLKAEKIVLGSDDKVLPTKNTALTDGMKVDITRVEKKTITLSAPVNFNTVVKNDTSMLKSQKKVLQEGEKGEKQITTNVVYENGKETSRKVIKEIITKKPKDKIIAQGTLSPTPVSRGTSNSFANSGVLRVKATAYWAVNGVNNTYTYSGRKAVRNPNGYSTIAVDPRVIPLGTKLYVEGYGYAIAADTGTSVKGNFIDVYFDTYKEACNWGLKYVNVYIQN >NZ_LT906477.1|WP_089867660.1|963859_964426_+|rubrerythrin-family-protein MSVKNAMTADFLRSAYGGESMAHMRYLVWGESAKKDGFPNIGRLFEAVAYAERVHASNHFTVLKEQVGDFTVPAGAVFGKTNIVENLQGAINGELHEIEQMYPVYLETAKFQEEKDAQRSFHYAVEAEKQHAELFKKAQDLAKENKDMEDNKFYVCPVCGFTIEVESLDQVPDKCPVCGVPKDKFKEF >NZ_LT906477.1|WP_095177364.1|981249_981582_+|hypothetical-protein MYKKLDNDAWEEYLNKFNSVKDTITVKDFCAENNLNKSQFYYHKKRVEKAIESKEPVFQPISLNSKVDNTKENKSTLKEVKINVGNANILIPVSEATLITAIIKELILKC >NZ_LT906477.1|WP_095177631.1|981575_981926_+|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MLNIDKVEKVYLACGYTDLRKSIDGLVMIVQNQFKLDPFDKALFVFCNKKMDKLKILHFDEGFWLYYHRLEANRFKWPATAADALKINLDELRWLLKGYEVRTKSKFKPVKASNYY >NZ_LT906477.1|WP_095177632.1|982015_983650_+|IS66-family-transposase MSYEILTNELDENTKALIEKMEHEINRKDKELNSKDEEIKKLKNELEFLKGVISNRNRKIFGASSEQVDANQLSLFNEAEKFSDTKVEKPTLEEITYKRAKKSNYTGKKDNLANLERVVVEHKLEGDDLNCKECGEELTPIGVKSRKEIVKYIPAKLIIEEHVIYSYACKTCERATGESKIVSPEAPKTIFYNSMASNELIAHTLILKYQHAMPLYRQETYFDMMGASLSRQTLCNWTMSAADALEPIYNHMKKELLSRNYINADETTLKVINDNGKDSKTKKYMWLYMSNTKSKPVILYDYQRTRSSSCPKNFLGDFKGFLQTDGYNGYNSVSGATRVYCLAHIRRYFHNIIVDLDEEALKNSRAIIGFNYCEQIYKLEKELRESYSNDENYYDIRFKIRTEKLAPIIDNFIDYVEREIKDALPRSPLGKALEYAKKHLPGLKNVLLDGSLEVDNNAAERAIKPFVIGRKNFLFANTAKGATASSNIYSIVETAKANNLVVERYLVYLFDNLSKIDIYDSESLENLMPWNDKIPENMKIKDKK >NZ_LT906477.1|WP_095177633.1|983901_984639_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRANLEISFSDKLEVPIQYNYLVQAMILNWLGDEKYQKFIHDKGYEYNNRSYKMYTFSKLYGKFSVNSKNGIITFFDKVNLIVSSLDTRFIQYLASNVIMEDNLRLGKNSVKVNKIETSYNELGNSEKIYTKSPITVYSTLQNADKKKTYYYSPYEEEFNELIRNNLINKYKALYNKFPQNDSFDIKLLSTREPKESVLNYKGTIIKGWNGEFLIKGSKELLQIAYDAGLGSKNSQGFGCIELKK >NZ_LT906477.1|WP_157726534.1|984662_986660_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MQEGIYQIGCAVALDSSEEDRIVQKIPTEKKGKVQHILKINFNTKDETLSIDGNEEVKKDSHKKYLFVDKVGGPNSPQWLVTRNSLQYHVSETINSLTDLDFGQEINENIKQVLQKFFIDLGEEVDKKYRYILDFKKFNIVEEDLKEEFNKILEEENTEDKKEIKKLAKTFTNKYVKIFENYIKEKTSLKPNEIAIYTIFINDKALAQTKEYREVVVDKKLGGKPKKKGKTKELVCSMCNSTSSDIGDTKKLSLKFYTTNQVIFSSDLTGDYTKNMVLCEECLNNIMAGENYIKDNLNTNIAGLSVYLIPHFIFGQPLDKNSLDNTTKWIKNSFNTVKNIKSIEKFKEHATSEKKLEDEIEDKNSYFLLNILFYKRVNQATKIKRLIKDINPSIFDEIYKSQSKARQVYEKAIDKSLKTFLGLESIYYLTPIRIKDGEMQQYNNLLYMYDAIFTKRTLDKKVIIKSILDAIVIKYLKKEGYNIKAGENNEIRDMVIQSGMYLKFLEYLGCIKGSEKMDVTKLIVKDDIKNYIDNMSYNEEETAMFLLGYLMGEIGNCEYKRAKEGKKPILNKLNYSGIDKNKIIRLSNLVFNKLRQEKILTYNEIIYNQCKQLIDENLNHWKMDKSENLYYILSGYSYSSTKAILNSKKENNEEKENEGGNVNEQ >NZ_LT906477.1|WP_095177635.1|986649_987522_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 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MKFYSHKDKLIIEHLKEVRDLSKNNIPKDLENANNITSVCHDFGKYTTYFQEYLFSKDKNKSELSNHGFISAVFAAYVALCIYGKKTYMPYIIYNCVLHHHGSLENPSLDLPKDFSKIDENEDEVLLNKIDNCKKQLKDIKNNRKYIEKDYEELGFIDEFNSFLDKEPIDDTLLNIKKLDSIFDMKNKDEKFYFIHQLLYSALISADKISASNTYMPSIKYAEYEFLNKVKEDKFKNGELSKINKIRGEIFYNIQNELEKNYKDEKIFSITSPTGTGKTLSGFFAALKLKDLLKDNRKIIYSLPFTSIIDQNYESIYELLESIENFSKCENEYIIKHHNLSNVEYSSENENYDKNKAELLIENWTSGIVVTTFVQLLQTLIGNKNRMLKKFNSMRGAIILLDEIQAIDIKYLRLVDFILKGAVKYLDCRIIMMTATKPLILKESCELLYNNEEYFKMFNRTSIMPKINPITVEEFIEEFTNNIEEKSYLIICNTINQSLKIYDSLKNLDREVYYLSTNLLPFHRKNIINEVSYMLKKGENIILVSTQVVEAGVDFDFDVVIRDIGPMDSIIQAAGRCNRNGKKKNGEVYLYSMINDKEEYFGNIIYGKSIIAISKELLENKDLIPEKEYFYIIKEYFEKVNENINTEASDEFMESIKKLYFSYAPEEKYSINKFSLIKNNPDYIDVYFIINDEAEEVYKKFLNMLSEKDIIKRKYIYLQIKNKLKEYTLSLPSKYHGNFTKSVVPNIPFLVLPKEGCDDLYHPKTGFKREEEDFMVF >NZ_LT906477.1|WP_089867867.1|990817_991309_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT906477_3 | 992860-993353 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_LT906477_3
|
7 spacers
spacers of NZ_LT906477_3
>3.1|992890|37|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT GAAAATTCACGAATAGTGTAAAAGATGCAGGTGGAAT >3.2|992957|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT CAGATTCGGCTGTTAGGTAGTCGCCTAACTGTTGAT >3.3|993023|38|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT AAAACTTGAAGAAACATTTTTCTTTTTGTCGCTGTGCT >3.4|993091|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT TTAAATACATAATCTATTTTTTTGAATCTGTTTCTT >3.5|993157|37|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT TTTAATGCATTAGTAGCCTCTGTAAAAGGTTTTCCCC >3.6|993224|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT GAAGCTCCGCCAGATTTTGTGTATGTCGTTCCTTTG >3.7|993290|34|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT AAAAAATGAAGTATAAACGACCGTAGAGTTTTCT >3.8|992890|38|NZ_LT906477|PILER-CR GAAAATTCACGAATAGTGTAAAAGATGCAGGTGGAATG >3.9|992957|37|NZ_LT906477|PILER-CR CAGATTCGGCTGTTAGGTAGTCGCCTAACTGTTGATG >3.10|993023|39|NZ_LT906477|PILER-CR AAAACTTGAAGAAACATTTTTCTTTTTGTCGCTGTGCTG >3.11|993091|37|NZ_LT906477|PILER-CR TTAAATACATAATCTATTTTTTTGAATCTGTTTCTTG >3.12|993157|38|NZ_LT906477|PILER-CR TTTAATGCATTAGTAGCCTCTGTAAAAGGTTTTCCCCG >3.13|993224|37|NZ_LT906477|PILER-CR GAAGCTCCGCCAGATTTTGTGTATGTCGTTCCTTTGA >3.14|993290|35|NZ_LT906477|PILER-CR AAAAAATGAAGTATAAACGACCGTAGAGTTTTCTA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT906477_3
The CRISPR arrays of NZ_LT906477_3 >merge|NZ_LT906477|3|992860-993353|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACGAAAATTCACGAATAGTGTAAAAGATGCAGGTGGAATGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACCAGATTCGGCTGTTAGGTAGTCGCCTAACTGTTGATGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACAAAACTTGAAGAAACATTTTTCTTTTTGTCGCTGTGCTGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTTAAATACATAATCTATTTTTTTGAATCTGTTTCTTGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACTTTAATGCATTAGTAGCCTCTGTAAAAGGTTTTCCCCGTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACGAAGCTCCGCCAGATTTTGTGTATGTCGTTCCTTTGATTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAACAAAAAATGAAGTATAAACGACCGTAGAGTTTTCTATTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC >NZ_LT906477|3|3|992860-993353|CRISPRCasFinder GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC GAAAATTCACGAATAGTGTAAAAGATGCAGGTGGAAT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC CAGATTCGGCTGTTAGGTAGTCGCCTAACTGTTGAT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC AAAACTTGAAGAAACATTTTTCTTTTTGTCGCTGTGCT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TTAAATACATAATCTATTTTTTTGAATCTGTTTCTT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TTTAATGCATTAGTAGCCTCTGTAAAAGGTTTTCCCC GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC GAAGCTCCGCCAGATTTTGTGTATGTCGTTCCTTTG ATTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC AAAAAATGAAGTATAAACGACCGTAGAGTTTTCT ATTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC >NZ_LT906477|3|3|992860-993353|CRT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC GAAAATTCACGAATAGTGTAAAAGATGCAGGTGGAAT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC CAGATTCGGCTGTTAGGTAGTCGCCTAACTGTTGAT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC AAAACTTGAAGAAACATTTTTCTTTTTGTCGCTGTGCT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TTAAATACATAATCTATTTTTTTGAATCTGTTTCTT GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TTTAATGCATTAGTAGCCTCTGTAAAAGGTTTTCCCC GTTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC GAAGCTCCGCCAGATTTTGTGTATGTCGTTCCTTTG ATTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC AAAAAATGAAGTATAAACGACCGTAGAGTTTTCT ATTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC >NZ_LT906477|3|3|992861-993353|PILER-CR TTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC GAAAATTCACGAATAGTGTAAAAGATGCAGGTGGAATG TTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC CAGATTCGGCTGTTAGGTAGTCGCCTAACTGTTGATG TTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC AAAACTTGAAGAAACATTTTTCTTTTTGTCGCTGTGCTG TTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TTAAATACATAATCTATTTTTTTGAATCTGTTTCTTG TTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC TTTAATGCATTAGTAGCCTCTGTAAAAGGTTTTCCCCG TTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC GAAGCTCCGCCAGATTTTGTGTATGTCGTTCCTTTGA TTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC AAAAAATGAAGTATAAACGACCGTAGAGTTTTCTA TTTTTAGAATAACTATGAGGGATTGAAAC
>NZ_LT906477.1|WP_095177639.1|992366_992630_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFAILVYDFGEKRVGRALKTCRKYLTWVQNSVFEGEISDANLKKLEMELDRIMHSNEDSVIIYKFRSTRYTTREVIGLSKNEQDIFL >NZ_LT906477.1|WP_095177638.1|991324_992317_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKDIYIFNDGDLKRKDNTLYFESDGKKKYIPVEEINNLYVFSEITLNKRFLDFASQKEICIHFFNYFGYYMGTFYPREHLNSGYVILNQAKYYLDYDKRLDLAKRIINTAIYNIIVVLRYYKNRGIDLEEEINNIEYKQYSIDTLESIEELMAIEGNIRETYYKTFAKIIKNKEFEFTVRSRRPPLDKINALISFGNSLMYSTVLGEIYETHLDPRIGYLHSTNMRRFTLNLDVAEIFKPIIVDRIIFSLLNRKVITEKDFEKNFNGILLTDKGKMKFLKEYNDKLYSTIKHRKLNKNVSYKRLIRMELYKIQKHIIEDEPYEGFVMNW >NZ_LT906477.1|WP_089867867.1|990817_991309_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDINGTHIWYYKICKRETWLMMRNIVPDQHDENIDLGRFMHEFYYKRDKKEIAFGNVKFDILFQSKNEIVIGENKKSSKYEEASKWQLLYYLKVLKKAGINAKGQLVYPSERKRVNLELTKEVEDELNNIIDEIEKLSKMRKPPKVKKISFCKNCGYREFCFS >NZ_LT906477.1|WP_095177637.1|988400_990734_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MKFYSHKDKLIIEHLKEVRDLSKNNIPKDLENANNITSVCHDFGKYTTYFQEYLFSKDKNKSELSNHGFISAVFAAYVALCIYGKKTYMPYIIYNCVLHHHGSLENPSLDLPKDFSKIDENEDEVLLNKIDNCKKQLKDIKNNRKYIEKDYEELGFIDEFNSFLDKEPIDDTLLNIKKLDSIFDMKNKDEKFYFIHQLLYSALISADKISASNTYMPSIKYAEYEFLNKVKEDKFKNGELSKINKIRGEIFYNIQNELEKNYKDEKIFSITSPTGTGKTLSGFFAALKLKDLLKDNRKIIYSLPFTSIIDQNYESIYELLESIENFSKCENEYIIKHHNLSNVEYSSENENYDKNKAELLIENWTSGIVVTTFVQLLQTLIGNKNRMLKKFNSMRGAIILLDEIQAIDIKYLRLVDFILKGAVKYLDCRIIMMTATKPLILKESCELLYNNEEYFKMFNRTSIMPKINPITVEEFIEEFTNNIEEKSYLIICNTINQSLKIYDSLKNLDREVYYLSTNLLPFHRKNIINEVSYMLKKGENIILVSTQVVEAGVDFDFDVVIRDIGPMDSIIQAAGRCNRNGKKKNGEVYLYSMINDKEEYFGNIIYGKSIIAISKELLENKDLIPEKEYFYIIKEYFEKVNENINTEASDEFMESIKKLYFSYAPEEKYSINKFSLIKNNPDYIDVYFIINDEAEEVYKKFLNMLSEKDIIKRKYIYLQIKNKLKEYTLSLPSKYHGNFTKSVVPNIPFLVLPKEGCDDLYHPKTGFKREEEDFMVF >NZ_LT906477.1|WP_095177636.1|987574_988309_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MDILIVDIKGKFAHFRKFYTNSSSLSYSVPPRTTIAGMLAGILGYDRDSYYEIFSKEQLNIAIRKLTPTRKIMQSLNYIKADNPGKILNPKEHTQIPFEIITSDKGRVSYRIYINHRDKNIMDELQKRILEKKYYYSPYLGAAPFNCTFEFVDRVQGTLMKEKEEVLIYSLINKESINKCFVTLEDKELFLVKEKMPSEILKNRVIEKVDNYIYDENTNSLKVNLNCNYIKLKYKFTEENILFM >NZ_LT906477.1|WP_095177635.1|986649_987522_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MNNSEILYLYDAKLTNPNGDPDEENRPRMDYERDINLVSDLRLKRYIRDYLLSRGYELFVMKLNDKPVTAEKRTKALKSFDDDTILDTLIDVRMFGATMPVKGDNKTFIGPIQFNWGYSLNKVELLESSITSHFSTGENKIQGAIGKDYRVKYSLIAFSGVVSGKRAQKTKLKNEDIELLDEAMKNAIPELVTRSKIGQYPRLYMRVEYKDDETILGDLRDYISLKQTEESIRDIRECELEIDELVDFLNKNKDRIKCINYHYDERLKLSLKGENVEFKQAFSNIEIKEI >NZ_LT906477.1|WP_157726534.1|984662_986660_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MQEGIYQIGCAVALDSSEEDRIVQKIPTEKKGKVQHILKINFNTKDETLSIDGNEEVKKDSHKKYLFVDKVGGPNSPQWLVTRNSLQYHVSETINSLTDLDFGQEINENIKQVLQKFFIDLGEEVDKKYRYILDFKKFNIVEEDLKEEFNKILEEENTEDKKEIKKLAKTFTNKYVKIFENYIKEKTSLKPNEIAIYTIFINDKALAQTKEYREVVVDKKLGGKPKKKGKTKELVCSMCNSTSSDIGDTKKLSLKFYTTNQVIFSSDLTGDYTKNMVLCEECLNNIMAGENYIKDNLNTNIAGLSVYLIPHFIFGQPLDKNSLDNTTKWIKNSFNTVKNIKSIEKFKEHATSEKKLEDEIEDKNSYFLLNILFYKRVNQATKIKRLIKDINPSIFDEIYKSQSKARQVYEKAIDKSLKTFLGLESIYYLTPIRIKDGEMQQYNNLLYMYDAIFTKRTLDKKVIIKSILDAIVIKYLKKEGYNIKAGENNEIRDMVIQSGMYLKFLEYLGCIKGSEKMDVTKLIVKDDIKNYIDNMSYNEEETAMFLLGYLMGEIGNCEYKRAKEGKKPILNKLNYSGIDKNKIIRLSNLVFNKLRQEKILTYNEIIYNQCKQLIDENLNHWKMDKSENLYYILSGYSYSSTKAILNSKKENNEEKENEGGNVNEQ >NZ_LT906477.1|WP_095177633.1|983901_984639_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRANLEISFSDKLEVPIQYNYLVQAMILNWLGDEKYQKFIHDKGYEYNNRSYKMYTFSKLYGKFSVNSKNGIITFFDKVNLIVSSLDTRFIQYLASNVIMEDNLRLGKNSVKVNKIETSYNELGNSEKIYTKSPITVYSTLQNADKKKTYYYSPYEEEFNELIRNNLINKYKALYNKFPQNDSFDIKLLSTREPKESVLNYKGTIIKGWNGEFLIKGSKELLQIAYDAGLGSKNSQGFGCIELKK >NZ_LT906477.1|WP_095177632.1|982015_983650_+|IS66-family-transposase MSYEILTNELDENTKALIEKMEHEINRKDKELNSKDEEIKKLKNELEFLKGVISNRNRKIFGASSEQVDANQLSLFNEAEKFSDTKVEKPTLEEITYKRAKKSNYTGKKDNLANLERVVVEHKLEGDDLNCKECGEELTPIGVKSRKEIVKYIPAKLIIEEHVIYSYACKTCERATGESKIVSPEAPKTIFYNSMASNELIAHTLILKYQHAMPLYRQETYFDMMGASLSRQTLCNWTMSAADALEPIYNHMKKELLSRNYINADETTLKVINDNGKDSKTKKYMWLYMSNTKSKPVILYDYQRTRSSSCPKNFLGDFKGFLQTDGYNGYNSVSGATRVYCLAHIRRYFHNIIVDLDEEALKNSRAIIGFNYCEQIYKLEKELRESYSNDENYYDIRFKIRTEKLAPIIDNFIDYVEREIKDALPRSPLGKALEYAKKHLPGLKNVLLDGSLEVDNNAAERAIKPFVIGRKNFLFANTAKGATASSNIYSIVETAKANNLVVERYLVYLFDNLSKIDIYDSESLENLMPWNDKIPENMKIKDKK >NZ_LT906477.1|WP_095177631.1|981575_981926_+|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MLNIDKVEKVYLACGYTDLRKSIDGLVMIVQNQFKLDPFDKALFVFCNKKMDKLKILHFDEGFWLYYHRLEANRFKWPATAADALKINLDELRWLLKGYEVRTKSKFKPVKASNYY >NZ_LT906477.1|WP_157726535.1|993599_994481_-|IS66-family-transposase MKKELLSRNYIHADETTLKVINDNGKDSKSKKYMWLYMSNTKSKPVILYDYQSTRSSSCPKNFLGDFKGFLQTDGYTGYNSVSGATRVYCLAHIRRYFHNIIVDLDKETLKNSRGVIGFNYCEQIYKLEKELRESYSNDENYYDIRFKIRTEKLAPIIDNFIDYVEREIKDALPRSPLGKALEYAKKHLPGLKNVLLDGSLEVDNNAAERAIKPFVIGRKNFLFANTAKGATASSNIYSIVETAKANNLVVERYLVYLFDNLSKIDIYDSESLENLMPWNDKIPENMKIKDKK >NZ_LT906477.1|WP_095177641.1|994485_995019_-|IS66-family-transposase-zinc-finger-binding-domain-containing-protein MSHEFLTNELDENTKALIEKMENEINEKDKELSSKDEEIRKLKNELEFLKGVISNRNRKIFGASSEQVDVNQLSFFNEAEKHSDSKVEEPTLEEITYKRAKKSNYTGKKDNLANLERVVVEHKLEGEDLNCRECGKKLTPIGVKSRKEIVKYIPAKLIIEDHVIYSYACKTCERANI >NZ_LT906477.1|WP_095177365.1|995108_995459_-|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MLNIDKVEKVYLACGYTDLRKSIDGLVMIVQNQFKLDPFDKALFVFCNKKMDKLKILHFDEGFWLYYHRLEANRFKWPATAADALKINIDELRWLLKGYEVRTKSKFKPVKASNYY >NZ_LT906477.1|WP_095177364.1|995452_995785_-|hypothetical-protein MYKKLDNDAWEEYLNKFNSVKDTITVKDFCAENNLNKSQFYYHKKRVEKAIESKEPVFQPISLNSKVDNTKENKSTLKEVKINVGNANILIPVSEATLITAIIKELILKC >NZ_LT906477.1|WP_078024877.1|996932_997142_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MQNNIRKIVQNKNLKITDLINETKLSKSYFYDVMNGNSVPTLSVARKIAEVIKEPLDEVFPNDDLKESD >NZ_LT906477.1|WP_078024876.1|997223_997952_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MLRTINLGASAYAPENTMSAFKKAIDMNADGIELDVHLSKDGHIVIIHDEKVDRTINGKGEVKNFTLDELKKLDAGFWFSDEYKGEKIPTLEEVLNLINNTDIYLNIEIKAGYRFYPNIEEKVIDMVKKYKMLDRVIISSFDHYSLVRVKEINSNIKTGMLYEAALYEPWDYARSIKVEALHPNYITLTKEFIDKASINNLEVNPYTVNDETDMEALIKSKVTSVITNYPDKAYKIISNLTL >NZ_LT906477.1|WP_078024875.1|998267_1000430_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein MKNIFRIYKRDIKNIITNWVAIVVMLGLMILPSLYAWFNIKSSWDPYSNTKSISVAVVNKDKPAFFKEESINVGKELVNKLKMNKNIGWKFVDEKEAERGVKHGKYYASIVIPEDFSYKILSITRDKQEKPVLIYSVNEKINAVAPKITSTGVTTVQSEITKTFVRTVNGIIFEIFNNLGIELEKGKPKLKDLMNMIFYVNDKIPEINSSIDKLEKGAITLEEFIEKINKDIPLIKDTINRALIAGDKTKVFLSKSKEGINNVAPYIKQDLIIAKKINNTSEILIEEGLGLIEKNSSKAKENLVLAKDKLNNVKEILNSILELVEIINKDKNNIVMNDFENKIKAMKERTNNKIDNINSIISSLDKGEEVSLETLNRLKDKSNEIDAILEKIIDDFNPKIVPAINNVLNDLIVTADNTIQLLKNANENLPQATELLENGYTGAEKGIRGIKILKSNLPSIEKSIKELTNRLKTLDNDERLNEIIKLMKNDSRMESDFISNPIKIKENRIYPIPNYGSAMTPFFTTLSLWVGALILVSILSVEVKDIKGVKKLKVHEKYFGRYFTFMTIAIFQALIVSLGDIYLLKVYVSNKPIFILFSIFISIVFSMIIYTLVSVFGNIGKALGVILLVLQISASGGTFPIEVTSPFFQNINPLLPFTYAISGMREAVGGAIEAILLRDIVVLLIYFTLSILLALLLKKKLDKINKNFVKKFKESGVVGE >NZ_LT906477.1|WP_078024874.1|1000549_1000897_+|cupin-domain-containing-protein MIKKTLIKNIDFAKPIEMESLVNYEEGRVVSRTLAQGKPLSVTLFAFDKGEEISSHSASGDAMVYILDGEAEITIGEEKFNVKKGETIVMPANVPHALLATERFKMLLTVVFSLQ >NZ_LT906477.1|WP_078024873.1|1001117_1001588_-|alginate-lyase MFIDDYSYLENNTGGDNMNMRPMPYMTWGNFPMYDPHMNNMNSCTDNIDYDNMNRSCNIPNGCDNAIYTVNASPTGTNQPNTVPSVENDNLYTQGFLRNQIGKKVKIEFLIGTNMLMDREGILLDVGISYVLIREVDTNDLVMADMYSIKFVRIFD >NZ_LT906477.1|WP_078024872.1|1001609_1002053_-|cell-wall-hydrolase MAYSDRELLARIIKCEAGGEGDDGMKAVATVIMNRVRVPYGEYHRIGQGNIRNIIYQTGQFDCVRDVLKGVPNPQTIWANPPEQIHYDIADWALSGNRLYNIGYSLWYFNPYRPKCPTTFPSNGVGIFQVKVNQHCFYNPTELYAQT |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT906477_4 | 1192056-1192479 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_LT906477_4
|
6 spacers
spacers of NZ_LT906477_4
>4.1|1192085|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAACCCAACAGAAGGAGCTTTTTTAAATTTTTCTAGT >4.2|1192152|39|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCAACTGCAACAGGAAATATTGTGAAAGGCATAAAATC >4.3|1192220|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATAGAGGGCGTAAAGTCTTTTAAATTAAATTTT >4.4|1192284|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATCAAACTAAGAAAGTCTTAAAAGCTCATAAAGA >4.5|1192349|37|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTTATTATTAGATGGAATAAGTCAATACATAACTAC >4.6|1192415|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAAAGAACTAGAAAAGAGTTAGAAATAAATCATAC |
cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT906477_4
The CRISPR arrays of NZ_LT906477_4 >merge|NZ_LT906477|4|1192056-1192479|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAACTAAACCCAACAGAAGGAGCTTTTTTAAATTTTTCTAGTATTTCACTTCCTCATAGGAACTATTAAAACGCAACTGCAACAGGAAATATTGTGAAAGGCATAAAATCATTTTACTTCCTCATAGGAACTATAAAACCTATAGAGGGCGTAAAGTCTTTTAAATTAAATTTTATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAACAAATCAAACTAAGAAAGTCTTAAAAGCTCATAAAGAATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAACGGTTATTATTAGATGGAATAAGTCAATACATAACTACATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAACTGAAAGAACTAGAAAAGAGTTAGAAATAAATCATACATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC >NZ_LT906477|4|4|1192056-1192479|PILER-CR ATCTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC TAAACCCAACAGAAGGAGCTTTTTTAAATTTTTCTAGT ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATTAAAA CGCAACTGCAACAGGAAATATTGTGAAAGGCATAAAATC ATTTTACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC CTATAGAGGGCGTAAAGTCTTTTAAATTAAATTTT ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC AAATCAAACTAAGAAAGTCTTAAAAGCTCATAAAGA ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC GGTTATTATTAGATGGAATAAGTCAATACATAACTAC ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC TGAAAGAACTAGAAAAGAGTTAGAAATAAATCATAC ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC >NZ_LT906477|4|4|1192056-1192479|CRISPRCasFinder ATCTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC TAAACCCAACAGAAGGAGCTTTTTTAAATTTTTCTAGT ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATTAAAA CGCAACTGCAACAGGAAATATTGTGAAAGGCATAAAATC ATTTTACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC CTATAGAGGGCGTAAAGTCTTTTAAATTAAATTTT ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC AAATCAAACTAAGAAAGTCTTAAAAGCTCATAAAGA ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC GGTTATTATTAGATGGAATAAGTCAATACATAACTAC ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC TGAAAGAACTAGAAAAGAGTTAGAAATAAATCATAC ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC >NZ_LT906477|4|4|1192056-1192479|CRT ATCTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC TAAACCCAACAGAAGGAGCTTTTTTAAATTTTTCTAGT ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATTAAAA CGCAACTGCAACAGGAAATATTGTGAAAGGCATAAAATC ATTTTACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC CTATAGAGGGCGTAAAGTCTTTTAAATTAAATTTT ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC AAATCAAACTAAGAAAGTCTTAAAAGCTCATAAAGA ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC GGTTATTATTAGATGGAATAAGTCAATACATAACTAC ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC TGAAAGAACTAGAAAAGAGTTAGAAATAAATCATAC ATTTCACTTCCTCATAGGAACTATAAAAC
>NZ_LT906477.1|WP_157726542.1|1191456_1191615_+|hypothetical-protein MARKNKIKSVVVHYPSVENEEEFELRVANAMAKVLCKNYPPEIINKLIDELR >NZ_LT906477.1|WP_095177729.1|1190441_1191176_-|CBS-domain-containing-protein MVREMTNSEKFLAIYNELDDYMRKELKEDTYVGHTDLIYKMARKGKNVFKCYGEDLKKYARLRNAIVHNPEKRISDPLAEPHEIIVSKYQDLLEKVLNPTLAINSIAVLKDDMYTTTLDANVLEVMKVMNKKTYTHVPIIEDGKLIGVFSENTIFSYITQKENVIIDDELKISDFIDFIPIHNHVSEIFVFVPRDITVIEIEDIFREEFENNKRISAIFITQNGKENEKLLGLITLWDVAGNGK >NZ_LT906477.1|WP_095177728.1|1189412_1189847_-|hypothetical-protein MPKDKDFLDFFKDDIKFKNLNTLINNSDLSLEYFINTVIKSDKQLPSLHLKLTNDNVDNTEELFNIYAKEMTLINELEKLNQKPFLTPKNKEDIHLFHNFCVKTELLKVSFLRSFMAINELIPYDKKTITSVLEPLIPNCSYNE >NZ_LT906477.1|WP_095177727.1|1189049_1189295_-|hypothetical-protein MKNKPKYNENAVLIIFSLYSPYLFDVDNVEFKYIIDAFRYSGFFYNDNCNCVSYMVEGKQTKKHPLIKVKIIKKSDLKLCN >NZ_LT906477.1|WP_095177726.1|1185961_1187950_-|AAA-family-ATPase MYISKLQIENFRCFDYFEVEFNEGLNVIIGENNGGKTTLIKALQYIFGDSNSKPTIDDFNREVEINEVPPEITIIATIRGTKNESLEDKAVVANWLTKLEEPWEATLTYKCFLPETSINDYAKDINRVDELDKNNNEKKKLKWSILEKHLKKYVSRIYGGNLASKNKAETEYLDKFHCEVLDALRDVESKMYTGKNALLKEVLSYFVDSDLQGLDQEKKDKEQEKRNEKFNSSANQIVSNMVGRLEVSDIFELAEETGATVGGKPLLGGRLEESDVISVLKLMIKKETGIEIPVVNNGMGYNNLIYISLVLSKFKMITSPEMGENAKIFPVLLIEEPEAHLHPALQYSFLRFLKNEIDNQNISRQIFITSHSTHITSAVGLDPIICMDLGEKGKIVATYPAKVFSGSKEDQESKKYVERYLDATKSTMLFSKGIIFGEGLAELMLFPILAEYEYENFEQSHVSIVRVDGVTFKHFIKIFGAGIKEENKKFALKRRVSCIVDTDPSRKKIKVEEGKKRTWRSCYPYELYLEPDKYKYKEVSGVVTNLLDACKDSTNVRIFYNNTGKGKTLEYDLAYANSTSTLIFDDKVEIIEIEDINNLDIEEVDKEKIKKAVSYLNHVEDGKGEASFVLAEKLKENLKCDKREIFNLPEHIKYAIDWVCCK >NZ_LT906477.1|WP_095177725.1|1184152_1185943_-|ATP-dependent-helicase MIARNNIECITSDCALEDIDVNFKIIAGPGGGKTYWLVRHIRNVLKNSTKILSASKIACITYTNVAVDEIWERLEIMENKVEVSTIHSFLYKNIVKPYIYLLKDSTGKSLVNYKEMDGHDDHIPSSGKINIWKKENNLYGIITDDKKLNDCLKSLDWIFEEEEIVLTTKDVYKRKVGKYFIKEEYFPSYKQLYWNEGTIHHEDVLYFSYLLLENHPIILKFLRARYPYVFIDEFQDTNPIQTRIIKLLADSGVVVGVIGDPAQSIYKFAGAERQDFLDFELPKQKNYYMNSNRRSTNKIIDFLNYLRGEDQFHQNYHRNVIGNDICLIIGKTPLEIINKFKLKRQLLELNDRCCFLTRKNEQVTKLKACINNYNYNYEIWEELYFLDYKRYEFLNYIFVAQGYAIDTRYEMAVKEVLKIFKTNQEGYLKEPFKNSKINNKLFKRSYALELLEFLINNYEMHLDKNLYQFYNEELYNFFIKFDFHLKRLTGKGKFKVKSEKVTVKELVNSLNIREVRNDNIRTIHKAKGTEFESVLVYFDDINEIDAIINPDIDSEEDDYRLYYVAFSRAEDFLCIATKSIDDEQEKKLRQLNIRIL >NZ_LT906477.1|WP_095178369.1|1183103_1183811_-|hypothetical-protein MSFTKKDPDIPIEEVLNSINKYYSELQSDKNARYLSWEHCYKQFIEAHEKEYLNDEDIDYLSLHLGFYLASWGMLRGSSFLLQKDYRVHIDIIKELFKPRYDELWEIDYLKLKNERNIEILIELIKNIKKLYGEKRKNIREVNTEISDTLVTKVLLGTMGCVPAYDEYFKIGVGKYNITTQLLNKCSIHGLAEYYEENKTELENIRKVISDERELEYPQMKVLDMAFWQVGFDYK >NZ_LT906477.1|WP_157726541.1|1182825_1182993_-|hypothetical-protein MLFDCRQYIEVHGIQRNAEKVFWNQGNYYDAILNEIFTENRKNNEKVFKKDGVEL >NZ_LT906477.1|WP_114648759.1|1180984_1181101_-|hypothetical-protein MNLYYSFSKALKLPFDEEWVYEERLKVSEDINNILVRI >NZ_LT906477.1|WP_169712386.1|1178435_1180910_-|DUF3298-domain-containing-protein MEYKINFSNFIKTCLPPGAEIIMLEAPYEKPAICIGDLDGDKALEIVIGYKWQGENYILILKKHGDLWYVVANIKGTGYGINYLDIARITEININSLIVGWQVGAIWWQLNIIQWTPQGYKNLLKNDIYYSKIQVEDMKGFNGYDGICEIALWVHDTGEAYKVEVYRFKNGELIPAKDVYPYYFPRVVAYYKERVREMPDAAFYWYYLADAQFKACMYEDALVSINKAIDLNLEYPPRDVLIELKKDLLNKLNCKDESISLYPASIKTVKGVLWGYINSKGDLIIKPQYGEAFDFQNNGLAIVELNNLYGIINQSGKYVVEPKYESISQFSEGRAIAMDSKGFKVIDEKGNELTSKAYNYIGNYKDGRAVFGVPSENGSYFYGYLNRQGKEIIPAKYQTASDFSDGKAVVKVKENEFRLIDINGKTLNTYKYNVVGSFGEGLLAFQEKLDSKLGYIDEAGNVVIKPSFTQAMSFNEGRAVVNISEDYGNEFGLIDRNGKYVIEPKYNNIDRLGEGRLAVGKAILEDKPYIGSKYAIGDINGDFLTDFIYYGVSNYKNGLASAYNNKDTFFIDKKGVRVKNLPTVKGSGTLEFKKDIIKAYVDFRVSYLDKSGRVIWEQNKIIPLNNKYKILEKKYRPNKDYLVYYPEISGMEDSQEKEVNKKLQELSNVKYIPANAQLDYNYFGDFLVEFFKKNLLVLELNGYMYYFGAAHGIPTKVYPHIDLTSGRFYELEDLFKKDSDYVKVISDIINYQIEHDEQYSYVFPDAFKGIKKNQPFYVGKDALYIYFEPYEIAPYAAGFPTFKIPYKEIMSIIDTKGGFWKSFN >NZ_LT906477.1|WP_095177730.1|1192683_1193442_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIKVCMFAERNITLPIAYNHIIQKSIYNILDEEYATKLHNSGYKYKNKIFKLFNFSKLKIQNKTIKNNKITIQKGKVELIISSIDEVFIFKIISAFIEHKCLKFKEGILKVNEIYSKKQLNKERIAVLTISPVVVVKPIRKSRMEFYNPKDNEFLNSIKNNIIAKYNSFYNEEYKGIMNISILDENNIRKKIDKYKNWIYEGYLGAFIIEGDTKIVELAYSCGLGSKSSQGFGFVETFKDLNSIKNYRRII >NZ_LT906477.1|WP_095177731.1|1193431_1194655_-|hypothetical-protein MKKFDVALKEYKITIEVLSGLCTGSNDTSYYSSDEYIVQDGKIYFINFNDILQLREKGILKDSELETVYNNICEKNFISDKLKKHLKSLRLLSGYDNKMDIHKFGSIKEISENAISEIRTITGSTIKGIFRHGFEIFNVESVNYKYERYKRLNLYGVNTINDKDYSNYYYTKEEKEKKNLIRCFPKGKLINYRYNIKFNKDKITNYNDIRDIEDSNFKKNIRNIASDTIFRNIIFSDCKETKVDFVIEKIYRWNRKSKKEIIPQYYEMAQKGGLFEGKISCKDIEFKKENLTTISLMYKDKTPIEIALESLRQFYSKVIDLEEQYYIIPRYFDALKEFYKCLREENNKNNQFVCKLGYSGAISKTLLCYDNVNNKDKLLPYTSKYMAQANLPFGWVKVKLEEIKHED >NZ_LT906477.1|WP_095177732.1|1194656_1195583_-|hypothetical-protein MIYRADFTVNNLKGRLISPVIFGNIAKIYFDIFSEDRANEEIQRLIDSNTLISDMILKDELPFKISMIKKEKRNLILGKDFCDKSEKQITKIKPKDRNDFTQNLLKKRDEFRSYKKAVKKVELESGIPSPRLRNSISRFNGTTIDKALFLHNEFKYHSKNIFSIYVFTNDKYVIDLMELAFKIIEKVGIGTDTTIGNGIMNFKKYNDSIFVEANDVELFKNPNKETQYFNIASTIITDNILKEFRFKNYNVKRYDSRTPEKIKPCYYYIECGSIINSIKEYRAYIVSNLSEKIKTYTCVFPVKFKEGD >NZ_LT906477.1|WP_095177733.1|1195579_1196293_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MSLKSLKLINIITIRKLMILKSGVKIGGSNEELNIGGVDNPIVRNPITKEPYIPGSTLKGVLRSILEIVKGVSDEKGGICTCGKCLVCKLFGVHPNDNNENKTYREPSRLIFRDAELTDKSRVILRKLNPSMVEIKKENTINRITSEAKPRTFERIPSGVEFNIEIQLKVFEGDNKEDLQNYINIAFELLKHNYIGSSGSRGYGKVEFKDCEEQECLDIIKELTEVENKYFKEQQKQ >NZ_LT906477.1|WP_095177734.1|1196292_1196859_-|hypothetical-protein MSNLKTNNHKRYKEYKNQNLDDIIQILNNEKSFYYDNKINMDIVNKIENAAKGFGREVTRTSVRNIYNAFKDIEMQLNQRYINELNNIDKFEEDESVDEIELKMNKQKEEVFNEIKPIIRLMKGKVHYLISRKIEGLSQHKKIEKVAYQHLEKFFEQSIIVINEAKEFEAFLKVFECMYGYLEKGSEN >NZ_LT906477.1|WP_157726543.1|1196851_1199407_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MNNEEKYYRNITAAAALLHDLGKFIRRTKIEKTKHWELSYKYIKKYFKGFQCVSDEQINLIAGIAALHHKSELNKTISKIKDKTRLKQLNEIKNILDDLKNKEDKTEYKIIEKIITGDLDSCSERRIFRDEDSRKIKKELEIKNAQSEYSPLIDLFCTLSNMLSEQSSKIIYKNYVYFEPKSLIDFYNIVQLEVFSKRMPEKIKENLNFFEKDINCLKAFRNCTFEDCINSWNFLFKKYTSLICSSKWEYLKDISLYNHIQTTAAAAVSVYKEEHLKNNCGEYLIIHGRIYNIQNYIYDGINTNIEHPMQRIFTRSFIISLINILIPNILVKKIGLYTFNILFCGGGTFTVLIPDEDIIKNKSIEIMDDMKKELGNILNNKIYLEYEIEKIAFKTNGDRTGYEKGFKIASMNLYEKKYNRTIENLVYDDSKEYRKCKNCGINYIKYDKKDRCSTCSLEDKWIKFSEYNGIENFYIDYNNVNLDDIKDPIKFTKSEIKEGTPIICFSYDEAERIKEEYPIIDVYDIGKTYIKKTYDKCKRCYGKDACDGPLKSNEQDNTQLVSLDCFSHMSENDTIIATAKVDVDDFQFLLYHVYPRKIMSEVYNFSISRLANTSLFFNLFFSMYLRRIIEEKYKDSVMVLYAGGDDIMITGNWEKVVDAVLSIKKEMRKITGADKDGNTDNITITSGILFHNSHRPFNLVAKEVDGLLENGKDYGKNCVNLNGKILTFKELEEVSNTSNDLVNTKLRKNIINRSILFKMNELIKMVSSDDDIERMRAYAIYNYLINSEIKEKKFAEDKKKDSRIKKELIEKLESIIIKDKQEHNKEYKYAKEKAIIEFAIRKSRERINSDE >NZ_LT906477.1|WP_095177736.1|1199463_1200093_-|hypothetical-protein MKKILFCNIAWMEHYKGVNDDDIPINGGEWVNKNKYAHEAYNFCPIKFEGDDTEYCLGFVETKSTNGKDKNQLHIEKIVNVGRLEDIESVDDVLVVWCAKSDCADYTSVVGWYNNATVYRNYEVAYFEEEEQYYNIIAKADNCVLLPSNIRYRRTLWYVPRTGKKNAPSYGFGQANIWFPNNFSDNPNLNMYLEKIINRIENYDGENWV >NZ_LT906477.1|WP_095177737.1|1200433_1200709_-|DUF4351-domain-containing-protein MTLAEIFRQEGKEEGIKQGIEKGIEKGIEKGIQQGERRKSLNYAIKLLTKKFGKLPEEYKEKLNNADIEILDLIIEEIFSLESLDDVDKYL >NZ_LT906477.1|WP_095177738.1|1200878_1201883_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKIQNPHDKFFKETFGNVEVTKDFLNNYLPQNIMKIIDMNTLEPQKDSFINEELQEGFSDMLFKVNINKREGYIYFLFEHKSYTSKDIAFQLLKYMIEIWEAKIKKEKTDELPMIIPLVIYHGKDSWNIKTTLGEMITGYKNLPQDIQKFIPNYEYLIYDISRYTDEEIKGEAQLRILLTIFRDIFTKNHKDLQESIYRASEYLQKLEDKHTGIEYFETLIKYVFSARADLTTKDINEIIDKIENTYPEGSEVAMTLAEKLRQEGIEKGIEKGIEKGETKALIKTAIKLLTRKFGILPEELKMKISKLDTTTLEVIIEGILDYKSLEDVKKYIQ >NZ_LT906477.1|WP_095177739.1|1201946_1202357_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MYDELYNILEEDTLGKRLKKARLKLRLSQEKLAKECGLSSGAIAGYEYDTIHPSKVALIKLGKVIDLDYLCCDEYTKFILSDYVSFLKKWRKDNNLSVRKAARILGIPSSTYSSWEREIYGISKENYYKLKKNKIF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT906477_5 | 1406477-1406560 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT906477_5
|
1 spacers
spacers of NZ_LT906477_5
>5.1|1406504|30|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder ATCTTCTACATGGGATGTATTTTCTTTAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT906477_5
The CRISPR arrays of NZ_LT906477_5 >merge|NZ_LT906477|5|1406477-1406560|CRISPRCasFinder AGATTTTAAATAACCGTCCCCTCTTTTATCTTCTACATGGGATGTATTTTCTTTAGCAGATTTTAAATAACCGTCCCCTTTTTT >NZ_LT906477|5|5|1406477-1406560|CRISPRCasFinder AGATTTTAAATAACCGTCCCCTCTTTT ATCTTCTACATGGGATGTATTTTCTTTAGC AGATTTTAAATAACCGTCCCCTTTTTT
>NZ_LT906477.1|WP_095177844.1|1404776_1405334_-|hypothetical-protein MSDAVDALLSKKAVTGNYTDRGTKIIRPGEELDKNAFLQILAAELANQDPLNAKDGTEYVTQMAQFASIEQMSNLNSNMKFTGATALIGKYAMVNSADIYGNLYHGVITGVSRNKANIKVNMIVGEEKGEDGKPRPKVEQFNLEDIIELIELPEPSEDEKEPPKDGGEGEKPVEPANPEEENKVV >NZ_LT906477.1|WP_095177843.1|1404377_1404773_-|flagellar-biosynthesis-protein MGYRVINGKIHFIEDFKGYCNTQLNKLNENTKKTTFDEVFKKQVNKEDSFVLSNHAHERLRQRNIVLNPQDMKKVNEGINMGEKKGCKEIVILYKDIALVTNIKNRTVITAMAKDESQGNVFTNIDGMVIL >NZ_LT906477.1|WP_095177842.1|1403288_1404278_-|flagellar-hook-basal-body-complex-protein MLRSMYSGISGLKVNQTKLDVIGNNIANVGTTAFKNQRIRFQDVLSQNLKFGTGASANIGGTNPSQVGLGVEVAGIDTMVSQGNMQPTGRNLDFAVDGDGYFVVARGKADGTLKVKADGTVETKNDDLTVNYTRDGSFTLDDQGQLLTSDGYRVLGYLPEDATADYKTGKDASTLTVPKNTTTVKAELQPLLIPDEVTYGKNGPKMKIKNFSVDKNGTINAVLASNEVVPIGQIAMASFKNPAGLTKEGKNMYSTSASSGEALYRNGAGVKDSNEKAYGDIIQGRLEMSNVDLAEQFTEMIVASRAFQANGKIITTGDEILQDLVNLKR >NZ_LT906477.1|WP_089864766.1|1402758_1402956_-|flagellar-FlbD-family-protein MIYLTGLDNKAFVLNADHIEKLQSVPETVITLTNGKKYLVKEDIDDIINRVLKYKRSIYTLHNEI >NZ_LT906477.1|WP_089864769.1|1401908_1402739_-|MotA/TolQ/ExbB-proton-channel-family-protein MKRRDVLTAIGIVVGFLMMIWAMAMVTITEYNIGQLKLFWDISSIIITIGGSFCAMLVNYPIHQFRKLTKIIIQAFKENEKSGIDIINQFIDLSRKARREGLLSLEDEINNISDDFLKKGLQMVVDGIEPETIQDIMDLEIGEMERRHGEGVDMLKAWGAYAPAFGMAGTLIGLIQMLGNLNDSSQIASGMAKALITTLYGSLMANIIFNPMAANLALKSQQEVAVREMMLEGILAIQSGVNPRIVEEKLISYLSPEERKRYAQGVSTGEGVSENV >NZ_LT906477.1|WP_095177841.1|1401178_1401916_-|OmpA-family-protein MSRRKKRKSGGDSGADWLQTYADTVTLLLTFFVLLYSFSSVDAQKFKQIATAFQSVLSGQSGETVFDFNMKNGDIPLVGETVEMGTATGGRENELYDKVRDAVQKNNLQESVKIKSDARGVLLELNDSILFETAQADIKQDSLPILEKINKIISTLPNNVMVEGHTDNVPIKNYKYPSNWELSTQRAVNVLKYFVETKKQNPQRFTAAGYGEFKPIYPNDTLENKAKNRRVTIVIVSIDREGLKK >NZ_LT906477.1|WP_095177840.1|1400672_1401182_-|flagellar-basal-body-associated-FliL-family-protein MSENNVEKKSKIKIVIMVVTLLILVGGGAFAGYYFSQKGKQANNTPQSNNQQMASSVSVNQNSGYVRSIVPSNTFEAGEFLVNLSDEESRRFVKTKVYLGYENKRLTKELEQKKPIILDAINSVLRSKKSTDFNEKGVEKIKLEILEKVNIAFQNGRCETVYFTELIIQ >NZ_LT906477.1|WP_089864778.1|1400284_1400647_-|flagellar-biosynthetic-protein-FliO MAVLGFELQYIYSILKILIFLPVILCLIYVFAKYGGSSLQNIQKGRYMSVLDRLPLSKDNALLIVKIGEKLYLISSSQGNVEVIEELNSEEAEKIQKSREIKEYASIKEFYSKLINKKED >NZ_LT906477.1|WP_095177839.1|1399495_1400281_-|flagellar-type-III-secretion-system-pore-protein-FliP MENKNSSKRKIFLAIGIVFLLTLLCFQQKALAAPGEIPIPKINISPGDTTDPKGYVDNLKLFLMITVLSILPSFIVMMTSFVRISVVFGFLRNAMGTQQSPPNQVLIGLALFLTIFIMNPVYQVINKEAIQPFIKNEINQEQAFETGTKPLREFMLKQTREKDLKLFVEISNIDKNVTKENIPLYVVIPSFIISELKTAFQIGFLLYIPFLVIDLVVASVLMSMGMFMLPPVMVSLPFKLLLFVMVDGWHLLIKSLIMSFK >NZ_LT906477.1|WP_089864785.1|1399213_1399483_-|flagellar-biosynthesis-protein-FliQ MSENMIMGVMKDAISTGLLVAAPILISAIVVGLLISILQATTQIQEQTLTFVPKLITVAIVGLFTGNWMLHNLMGLTNRIFELIANIVK >NZ_LT906477.1|WP_089864753.1|1406676_1407114_-|flagellar-export-protein-FliJ MKGYKFNLQKLLDIRKDREEQCKIQFQNAQKLKMDVENKLVNLKDSYRKYSCETVDESVIGRKIRHQYLINLSHNIECTTVELRKKEEEVEKVRVDLKQKQIDRKTVETLKEKDKIAFIKEQNLLEQKANDEFALYGFIRNLERR >NZ_LT906477.1|WP_089864750.1|1407140_1408460_-|flagellar-protein-export-ATPase-FliI MELLDFNYINKKIKETDFYSYEGVVKKVIGLTIEVEGIKAFIGEVCTIYNQQNNPIECEVVGFVEDNVILMPLGELIGIAPGCRVVPSKNPLNVKCSEKLFGKVLDGLGRPLNGEKIEGGVPYPLDREPPDPLKRRRIKDVIPTGIRAIDGYLTCGEGQRIGIFAGSGVGKSTSLGMIAKYAEADVNVICLIGERGREVLDFVEKDLGEEGMKKSIVVCATSDKPALVRIKGAFTATAIAEYFRDKGKKVILMMDSVTRFAMAQREVGLAIGEPPATKGYTPSVFAMLPRLMERSGMSDKGSITAFYTVLVDGDDFNEPIADAVRGILDGHIVLSRDLAAKNHYPAIDVLSSISRLMSEIAQKEHKESASIGRDLIATYKEAEDLINIGAYVKGSNEKIDTAIKYIDSINEFLKQKVDEHNNFEESIQWLNSIFKNLKK >NZ_LT906477.1|WP_095177846.1|1408482_1409283_-|hypothetical-protein MLSLYNVVKNTNVIKKEKKQIITKYEPPVKKTKEIKENKEDENVKNVETNSEEYDSIATLIFENYRKKGEEIINEAYKKVVLIEEEAYKKAYDKGLKEGMDKGYKDAYEKAYIENMEKARVEGNAIIEEAKEISKTMIDSSESQCRQYIEGKSLELKKLIENIVESVFKREIKDEAALNQMITEALDNAKKSKSITIKCRELYKDEIKKSIDLWKSQNVFNGDIFIIADNSLEEGVALLEKDNGVVKIDVPKSLDKIKEILKSEEY >NZ_LT906477.1|WP_089864744.1|1409266_1410289_-|flagellar-motor-switch-protein-FliG MARTEEVKNLTGVQKAAILFITLGPEASAGIIKKLPETEIQKITYEIANISTVKPEQKQQILEEFIQMNKAKDYLVEGGIDYAKNLLAKALGSQRALEILEKVTEATQQFRPFAIARKADAHQLLNIISNEHPQTIALILCHLQPDKAGQILGELEEELQSDVAFRIATMNNTSPMVIKEIEKVLDSKLSSVVRADMKSIGGVQTIVDILNQVDRTTEKHITEAMEREDPELAEKIKESMFVFEDIITLDDVSIQRVLREVETKELALALKGCSEEVAEAIFRNQSKRAATSLKEDIEFLGPVRLMDVEKSQQRIVNIIRRLDEAGEIVISRGGEDAIIV >NZ_LT906477.1|WP_089864741.1|1410295_1411855_-|flagellar-M-ring-protein-FliF MNKLSQWFNTLKDKIKNLSKKKKIAYGAIAVGIIGALISGIVYISKPKYAILFSNMEQEDMGAVYNKLKENKENFKVDGNTILVPKEKVDSLRMEVMSQVPIKNGSNGFELLDKNKFGATEEEMKINYQRALQGEIERTIKGFPEVENVRVHLVMPEDSVFIKDDTPAKASITLKLKPYKKLTDDQVRAIVALVSGSVKNLPKENVEINDTNQILTKNLFDEDEFDSSESVQKQQGIKKQYEKTLEDKVTSMLEAVYGKERAKVKVNADLNFDAIQDESTLYDPKNVVVSEKNIKETTPGGNNLATGGSPVDDNMRNRAGDNEDDALVTHEENVKNYEVSERKNKTIRAPGSVRRLTVSVVLDGNLDNATRNAVQNTVQSAVGYNEQRGDTISVEGLPFDTAYKERIQKDKEAMEEELAREKKMKLYKILAALGVIALIIIIGILVKRRRDKEDEELLNEGLDVVIDDEIKEEKPKFKPIQLEEESEGAYIEKEIRKYATEKPDQVSEIIKAWLAEDER >NZ_LT906477.1|WP_089864739.1|1411871_1412177_-|flagellar-hook-basal-body-complex-protein-FliE MKVNEFIPSNMIFKNQFNNNKVEHKKEENNDFVHMLKNKLDQVNEKQIKAEETTSSFLRGEETDIHTVMLDSEEAKLSVELAVQVRNKLIEAYQELNRMQL >NZ_LT906477.1|WP_095177847.1|1412187_1412619_-|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgC MKIFNNMRISASGLSAERLRIDTIASNIVNSRSTRGKNGQPYRRKVAIFQENLTKEINKQTGKREETLNGVKAIGIEEDQSEFRRVYEPSHPDADENGYVLMPNVNILNEMADMIAATRSYEASVDAINSSKSMFMKALEIGR >NZ_LT906477.1|WP_160110558.1|1412655_1413036_-|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgB MDRQNYQLIKKSLDVSSARGRVINNNISNANVKGYKRHYVEFEENLKKNKEDLDLKFTKNKHISTESEYGKMEIKRDDISSMREDGNNVDIDIEKVNQAANTLMYNALISQLNNRISTKRYIISNK >NZ_LT906477.1|WP_095177849.1|1413391_1414225_-|flagellin MRLNHNLASLNVYRGYLKNLKSNSVAMKKVSSGVKIQSAKDDPNNLAKSERMRLNIRGLQMANRNVQDGVSMLQSADGSLSSINAILGRIRELTVQYGNGSNSEEDKEIIKKEIDQMIEGCEDIVNNSEFNGVKLFKDGGKKPMQLGTEVGDSMEVEFFNLEKKLEDLKDLKDLKSTKGLDTDKALGKIDGAINTIVDVRSKYGAIMNKFEDTMNNLSSFELATQESESRVRDADIAEEMVEVARTNILLEAGRAIMVQTNQLPQDMLRILENVRAK >NZ_LT906477.1|WP_095177850.1|1414975_1415848_+|DegV-family-protein MNTVLLTDSSCDLPLEYIEENHVKFLSLTYNLSYGSFPDDFGKTMSHEKFYNELRNGELSTTSQINAYSFKKCFEKLIKENKSILYLGFSSVLSGCINSAEIAKNELLEEYPNADITIINTKSAAIGQGLLIRKAVEMLKNGSSKEDIISWIETYKYHMNHWFIVDDLMYLKRGGRLSTISSAIGSLMNIKPMLTLNNEGAIVNVTNIRGRKKAIKSLLEMYEKNRENFEDETIGISHSDCLEDAKYLKELILEKYNIKNILIAPIGPVIGSHTGPNTLALCFLGKKREK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT906477_6 | 1466841-1466922 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT906477_6
|
1 spacers
spacers of NZ_LT906477_6
>6.1|1466864|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder GAGGACAATGATTGATAACTTTTCTCCACTTTGTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT906477_6
The CRISPR arrays of NZ_LT906477_6 >merge|NZ_LT906477|6|1466841-1466922|CRISPRCasFinder CATTTGACAGAGGACAGAGGACAGAGGACAATGATTGATAACTTTTCTCCACTTTGTTACATTTGACAATTGACAGAGGACA >NZ_LT906477|6|6|1466841-1466922|CRISPRCasFinder CATTTGACAGAGGACAGAGGACA GAGGACAATGATTGATAACTTTTCTCCACTTTGTTA CATTTGACAATTGACAGAGGACA
>NZ_LT906477.1|WP_095177889.1|1466383_1466821_-|flagellar-assembly-protein-FliW MKLDTKHHGIIDYEEKDIISFKKGLPGFEHLKKFIVYSVEENNIFSILQSIEECGIGIPVLSPFTVCKDYEVKLTDDQISSLKIKSEKDVWILNTVTISSDYKEITTNLRAPIVINIKEGIGEQIILKNEDYKIKHPIFQEENRC >NZ_LT906477.1|WP_095177888.1|1466177_1466390_-|carbon-storage-regulator-CsrA MLVIGRKKGQSVIIGDDIEVTVVKVEDGAVKLAINAPKEVTILRKELVEEIQQENKKAASVDFTILNKLK >NZ_LT906477.1|WP_095177887.1|1465771_1466152_-|flagellar-protein-FlaG MEVNIVSQGRHTATLNGNGVDSLEVVVPQSSVSEVNIPKGESREGLTKDKDYTLDEVKKAADKLNKLFEDKSTYVEYEVYGKSKSITIKILDHKTKEVVKEIPPKKLIDMVDKLCELAGVFLDKKA >NZ_LT906477.1|WP_095177886.1|1465468_1465753_-|hypothetical-protein MEFKLNKIDTELRQQVQDSTKEGLIHRKKEIIINKDLQEENKQKFQQSLKKHSKKDAKRLSVEAEKVEEVTVEAFMDKDSKKETSRGRFLDIKR >NZ_LT906477.1|WP_095177885.1|1465069_1465456_-|flagellar-export-chaperone-FliS MYANNAYNAYKTNSVNYASKEQLLLMVVDGAVKFSKIAKQGIEEKDIKKAHENIIKTQNIFYELMATLDVEKGGEWAENLMKIYDFIIQRLVQANIKKDVKIMDEIIPIIEDIRDTWHEAYKISKNAK >NZ_LT906477.1|WP_095177884.1|1462992_1464648_-|flagellar-filament-capping-protein-FliD MVNGVGGYGGLKMGGLATGLETDDIIKKMLAGQQAKIDKAKQERQQIQWKQEMYRDIIKDVKDLQNTYFDIMSKDNLASEKAFYDYEVKSSNESIITASAGQGAIEGNYKVSVKRLARGARTFKNLGTDATNTSKLSDLGIHKSDFGVTVNGKEFQVKIGDSSTVSDLINAIKNATTADGKGKLSDYVDVSFSEISKNLVVETKETGEAQKMSINGASVFGTDFSVEGQDAKISVVTPKLEKNEDGTYKSYEITNAKNNFTLDGITFNLKGISKEGETTNLNVTKDADKTFDRFKEFIDKYNSLVGNIKGKLTEKKSYSYKPLTEEQKKEMKEDDIKKWEEKAKQGILRNDPNLEKMLRELRGTFFASVDGAGESFGRHIGLDTTNDYKTAGQIRFTEGGEEKFKKALLERPEDIMNLFTKKPDKNFLKEIENDKSLSQAQKDKKIYDNSGIFTRMDNILRNYVGAPGTTLNNSILTKYVNKQEDHSISGNIGANNLPDQIYRKDILIKKLDENLREREEKLYKQFATLEKAMTKYNAQAGWLSQQFGGGM >NZ_LT906477.1|WP_095177883.1|1462640_1462973_-|hypothetical-protein MDLRTYLEKFTDVTIDVIDAFKKEDYELGNDLLDKRREVIGEIEQIEYTIEEFRALDEEFKLLDLNKELEETIEKERIKIRKQLDEINIRRNANNGYNTQNKSVIFSRKI >NZ_LT906477.1|WP_168944015.1|1462242_1462503_-|hypothetical-protein MNNEELRIFFFVALRKILILFDLLKIILLWKTRSAKLNIEDILDLVNIKKGLALAKPKDFIKLKTFRNNSGEKLSFIVLCALSSVK >NZ_LT906477.1|WP_095177881.1|1461217_1461586_-|four-helix-bundle-protein MKQNLTYEKAFAFSKGIVNLYKYLSDKKNEYVLSKQILRSGTSIGANIKEGLEAQSKRDFLNKMNIALKEASETEYWLELLIATKYIDATASRTILVECKELNKILNTIVKTTKKNLRILDN >NZ_LT906477.1|WP_095177880.1|1460165_1460993_-|flagellin MIINHNLNAMNAHRQMGINLGNTGKATEKLSSGLRINRAGDDAAGLAISEKMRAQVRGLNQASRNAQDGISLIQTAEGALTESHSILQRMRELAVQSANDTNVIVDRGEIQKEIDQLSQELTRIADTTEFNTQNLLGGKFEAKFHIGANSGQNITLEITGMGAKSLGVQGASAGVGIDVSKQSVASKAISTINSAIEKVSAERSKLGAYQNRLEHTIANLDNSSENLQAAESRVRDVDMAKEMMNFSKNNILQQAAQAMLAQANNAPQGVLQLLR >NZ_LT906477.1|WP_095177890.1|1467238_1468555_-|flagellar-hook-associated-protein-FlgL MRVTNRMLANNFLTDMTTNLNNLQTLQQQLTSGKEIRRPSDDPLKVARAMQLHSEIGANKQYNENIKDTLSWLEQTDTALGQLGDQTHRIRELLVSAGNVAYGTDERKKINDEVKEIIGQMSQTLNASFDGRFIFGGTRGTAKPVNVINNKLVYADRFGNEMTDVVEVTKVGDWNNGKVKFEDIDSGSKFEITLGTIDTTKGIDDLVKNINDKIDGDADKPGELKGKLKAEVVEVNGKSYIEFTSLGKDTNIKIESTTVSDMKSIEGKKVPSDRSLDEKKQNIRETQMMGEKLVTEISQGVRIEYNTTAVDVIEFKDNKGKDRDLREILEDIVAHLDSPDSDADAVKKITNEDLAALDAVMDNILKLRSQVGAKGNRMESALEKNKEENFNLTEILSKTEDIDLTEKTMEYAVAISVYMASLQTSARVLQPTLMDYVR >NZ_LT906477.1|WP_095177891.1|1468567_1470367_-|flagellar-hook-associated-protein-FlgK MSGLFGTLHVGKSGIFANQRSIDVTSHNIANANTEGYSRQRAELQTERPFCTPSMNNAAGAGQLGRGVNVADINRIRDTFLDYQVRIELGVQGKYAGRHKFLNEIENIFNEPSETGISTLLGNFFDGWQELSKQPHSSNARTVVAEQSKALTDELNHLYGQLHKLKDNAKTSIRQDLNDVNSILDQMERLNEEIIQVTAAGQKPNDLLDRRDLLLDKLSSKFGINIEKKGLNGIDVNTKGDAGAEPPDGLNLIQMVKPEEALRFAYISSISPAKAPELGKTKTYTITYYKNADMTNDDNKVTFKIELGKDEYDALDKSRTLWTNKDGEAILVDDNNKVIGKVDKDGNLVGEKGIATPTDPKIPRFQPSTGNLNGYMSVQDDIDNQIEQLDKLARTLAYAVNAVHSQSQDNLKDELLFFVNKDKTGEEGEKEITARNITVNEEILKDVMKIKVGRGDKPGETDGTRALAIANIMDKLIAIQNLDLSKGRQEALNAIGGDWTQDEAEIWTIKGNTDGMTFGGYFKDMVDRLGVQTQEAKRMVKNQHSVLASFQQSRDAVSGVSLDEEMTNLIQFQHAYQANAKLISTVDELLDVVVNGLKR >NZ_LT906477.1|WP_095177892.1|1470397_1470805_-|flagellar-protein-FlgN MVSELNSVILEEIKAFEELLEALDKQHEYIVKNDVFKMESIVDEIEEKSKNIAKWEMDRRKITKGRAMSEIIRECKDEELENNYRKARKLVEELNLQKDTNETLLKQGIVYANKMLQIINPNREAKTYSAYGKMK >NZ_LT906477.1|WP_157726554.1|1470823_1471102_-|flagellar-biosynthesis-anti-sigma-factor-FlgM MKIGGVGSNSAINSYDRNKNTLDNKKVSNNKKQDSIEISSLGKSLSKYSIEEGKINSKERVETIRQEISKGTYNINSRYIAQGLIDAMKGRI >NZ_LT906477.1|WP_157726555.1|1471688_1471865_-|hypothetical-protein MTEDIGQLTEDIGQLTEDIGQLTEDIGQLTEDIGQLTEDNERGFSSTTLQKILYCRYN >NZ_LT906477.1|WP_095177894.1|1471930_1473163_-|flagellar-motor-switch-phosphatase-FliY MNDGFLSQDEIDSLLNGASSESEESIEENEESIDSAVEDADNGEQQDLSDLEKDLLGEIGNISMGSASTALSNIINQQVNITTPVVSVTTLNKLKNTFEVPNIALEVKYTSGILGENLLVMKITDAAVIANLMMGGDGLVQDVSSLSEIEVSAVSEAMNQMIGSAATSMATMFGREVNISPPVSNIWDDLTSPLSQGLDENEALVKVSFKLTIGTLVDSQIMQLLPMEMAKKIVKIMMGEDVQEEVAQETPQAEKPQQVPDTIGGDKVPKTQERPQIEQQPTYTEPSPSYAAPKETPVVHEKPIEVQEAVFQPLQQTTKRQELPNNIDLIMDVPLDISVVLGRTKLNIKEILNLGTGSLIELDKLAEEPVEILVNGKPVAFGEVVVIDENFGVRITDIVNSVDRIKSLGK >NZ_LT906477.1|WP_089866909.1|1473155_1474154_-|flagellar-motor-switch-protein-FliM MGEVLSQSEIDALLAAVSSGELSPDEMPKEEEKQKVKVYDFRSPQKFSKDHVRTLELIHDNYARIMSNYLTAHMRKNVKAKIESVQQITYEEFIHSIPNPTVLTVFKAPPLNGSVLFETNPQFIFEVMDVLLGGNADGRKYKLREFTDIDKNIIKQINEGLIDGIKLAWEDIMEVYPEIESIETNPALSQTLAPNEPVALITFSVDMGDNSTFVNICIPYLSIEKILDRLVVQYWFQENNEEIREESNKKLRDRLNIVETELVAVLGNAKITVEEFLKLSLGDVLILDNEIDKPIKINVEDQLYAYGKPGVVGKNMGIEILDILDKDVENYE >NZ_LT906477.1|WP_095177895.1|1474170_1474575_-|purine-binding-chemotaxis-protein-CheW MQIVIFKLKDEQFAVETEKIESINDTMEITKVPNAPAYIKGLINLRGNIISLLDINLLLEAENHESEQENIIILKLEEELVGITVDNVDEVIDIKADMVEKVDEEGKKDYIKGVINFKDRIVTLIDIDKLLLNQ >NZ_LT906477.1|WP_089866904.1|1474643_1475003_-|response-regulator MAKVLIVDDAAFMRMMIKDILEKNGFEVVGEANNGIKAVELYKKEKPDVVTMDITMPDMDGIEAVKEIKSIDPDAKVIMCSAMGQQTMVMDAIKAGAKDFIVKPFQPDRVLEAIKKVVG >NZ_LT906477.1|WP_168944008.1|1475018_1475627_-|chemotaxis-protein-CheC MYMTAYSNLTPLQIDALKEVGNIGTGNAATALSQLLNRKIDMSVPNINIVSFDEIFHGIGEEEIVYGVLVRVLGDTPGNILFVFEKDTANNIIEILTGTRETELSELGKSVIEELGNIVSASYMNAIARFTNLTIIPSVPAVAYDMLGAILSTTFIESGQFDDYVLDIETVFLEDDSEIKGHFYYIPMPGSLEKILNSLGVM |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT906477_1 | 1.4|916408|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT | 916408-916443 | 36 | KM983333 | Clostridium phage phiCTC2A, complete genome | 27893-27928 | 1 | 0.972 |
NZ_LT906477_1 | 1.4|916408|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT | 916408-916443 | 36 | KM983330 | Clostridium phage phiCT19406A, complete genome | 27893-27928 | 1 | 0.972 |
NZ_LT906477_1 | 1.7|916605|37|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT | 916605-916641 | 37 | KM983329 | Clostridium phage phiCT9441A, complete genome | 1316-1352 | 1 | 0.973 |
NZ_LT906477_1 | 1.50|916410|36|NZ_LT906477|PILER-CR | 916410-916445 | 36 | KM983333 | Clostridium phage phiCTC2A, complete genome | 27893-27928 | 1 | 0.972 |
NZ_LT906477_1 | 1.50|916410|36|NZ_LT906477|PILER-CR | 916410-916445 | 36 | KM983330 | Clostridium phage phiCT19406A, complete genome | 27893-27928 | 1 | 0.972 |
NZ_LT906477_1 | 1.53|916607|37|NZ_LT906477|PILER-CR | 916607-916643 | 37 | KM983329 | Clostridium phage phiCT9441A, complete genome | 1316-1352 | 1 | 0.973 |
NZ_LT906477_2 | 2.14|979972|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979972-980009 | 38 | NZ_CP031095 | Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence | 33898-33935 | 2 | 0.947 |
NZ_LT906477_2 | 2.14|979972|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979972-980009 | 38 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 70298-70335 | 2 | 0.947 |
NZ_LT906477_2 | 2.14|979972|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979972-980009 | 38 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 48147-48184 | 2 | 0.947 |
NZ_LT906477_2 | 2.14|979972|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979972-980009 | 38 | NC_012654 | Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence | 78224-78261 | 2 | 0.947 |
NZ_LT906477_3 | 3.4|993091|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT | 993091-993126 | 36 | NC_022778 | Clostridium tetani 12124569 plasmid p12124569, complete sequence | 20316-20351 | 2 | 0.944 |
NZ_LT906477_3 | 3.4|993091|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT | 993091-993126 | 36 | NC_004565 | Clostridium tetani E88 plasmid pE88, complete sequence | 29667-29702 | 2 | 0.944 |
NZ_LT906477_1 | 1.31|918189|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT | 918189-918224 | 36 | NC_029006 | Clostridium phage phiCT19406C, complete genome | 2525-2560 | 3 | 0.917 |
NZ_LT906477_1 | 1.77|918191|36|NZ_LT906477|PILER-CR | 918191-918226 | 36 | NC_029006 | Clostridium phage phiCT19406C, complete genome | 2525-2560 | 3 | 0.917 |
NZ_LT906477_3 | 3.11|993091|37|NZ_LT906477|PILER-CR | 993091-993127 | 37 | NC_022778 | Clostridium tetani 12124569 plasmid p12124569, complete sequence | 20315-20351 | 3 | 0.919 |
NZ_LT906477_3 | 3.11|993091|37|NZ_LT906477|PILER-CR | 993091-993127 | 37 | NC_004565 | Clostridium tetani E88 plasmid pE88, complete sequence | 29666-29702 | 3 | 0.919 |
NZ_LT906477_2 | 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979369-979403 | 35 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 177682-177716 | 4 | 0.886 |
NZ_LT906477_2 | 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979369-979403 | 35 | NC_007581 | Clostridium phage c-st, complete genome | 136943-136977 | 4 | 0.886 |
NZ_LT906477_2 | 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979369-979403 | 35 | NC_007581 | Clostridium phage c-st, complete genome | 162211-162245 | 4 | 0.886 |
NZ_LT906477_2 | 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979369-979403 | 35 | ACSJ01000017 | Clostridium phage D-1873 CLG.Contig173, whole genome shotgun sequence | 60512-60546 | 4 | 0.886 |
NZ_LT906477_2 | 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979369-979403 | 35 | AP008983 | Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome | 136943-136977 | 4 | 0.886 |
NZ_LT906477_2 | 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979369-979403 | 35 | AP008983 | Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome | 162211-162245 | 4 | 0.886 |
NZ_LT906477_2 | 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979369-979403 | 35 | NZ_CP026601 | Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed1, complete sequence | 86240-86274 | 5 | 0.857 |
NZ_LT906477_1 | 1.5|916473|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT | 916473-916508 | 36 | KM983333 | Clostridium phage phiCTC2A, complete genome | 38252-38287 | 6 | 0.833 |
NZ_LT906477_1 | 1.5|916473|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT | 916473-916508 | 36 | KM983330 | Clostridium phage phiCT19406A, complete genome | 38252-38287 | 6 | 0.833 |
NZ_LT906477_1 | 1.51|916475|36|NZ_LT906477|PILER-CR | 916475-916510 | 36 | KM983333 | Clostridium phage phiCTC2A, complete genome | 38252-38287 | 6 | 0.833 |
NZ_LT906477_1 | 1.51|916475|36|NZ_LT906477|PILER-CR | 916475-916510 | 36 | KM983330 | Clostridium phage phiCT19406A, complete genome | 38252-38287 | 6 | 0.833 |
NZ_LT906477_2 | 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979369-979403 | 35 | NZ_CP024444 | Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-1, complete sequence | 80173-80207 | 7 | 0.8 |
NZ_LT906477_2 | 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979369-979403 | 35 | NZ_CP024446 | Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-3, complete sequence | 22112-22146 | 7 | 0.8 |
NZ_LT906477_2 | 2.13|979906|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979906-979941 | 36 | NZ_CP012423 | Spiroplasma kunkelii CR2-3x plasmid pSKU226, complete sequence | 21681-21716 | 8 | 0.778 |
NZ_LT906477_2 | 2.29|980979|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 980979-981013 | 35 | MT701590 | Klebsiella phage Miami, complete genome | 85206-85240 | 8 | 0.771 |
NZ_LT906477_5 | 5.1|1406504|30|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder | 1406504-1406533 | 30 | MN694310 | Marine virus AFVG_250M603, complete genome | 29808-29837 | 8 | 0.733 |
NZ_LT906477_1 | 1.10|916802|38|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT | 916802-916839 | 38 | NC_007581 | Clostridium phage c-st, complete genome | 156590-156627 | 9 | 0.763 |
NZ_LT906477_1 | 1.10|916802|38|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT | 916802-916839 | 38 | AP008983 | Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome | 156590-156627 | 9 | 0.763 |
NZ_LT906477_1 | 1.56|916804|38|NZ_LT906477|PILER-CR | 916804-916841 | 38 | NC_007581 | Clostridium phage c-st, complete genome | 156590-156627 | 9 | 0.763 |
NZ_LT906477_1 | 1.56|916804|38|NZ_LT906477|PILER-CR | 916804-916841 | 38 | AP008983 | Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome | 156590-156627 | 9 | 0.763 |
NZ_LT906477_2 | 2.25|980711|37|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 980711-980747 | 37 | MF403008 | Agrobacterium phage Atu_ph07, complete genome | 402811-402847 | 9 | 0.757 |
NZ_LT906477_2 | 2.9|979637|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979637-979672 | 36 | NZ_LN831028 | Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum strain NCTC10562 plasmid 2, complete sequence | 11453-11488 | 10 | 0.722 |
NZ_LT906477_2 | 2.9|979637|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 979637-979672 | 36 | NZ_CP029750 | Staphylococcus aureus strain Smith plasmid pSS41, complete sequence | 40355-40390 | 10 | 0.722 |
NZ_LT906477_4 | 4.6|1192415|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1192415-1192450 | 36 | NZ_CP039220 | Piscirickettsia salmonis strain NVI 5692 plasmid unnamed1, complete sequence | 66065-66100 | 10 | 0.722 |
1. spacer 1.4|916408|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT matches to KM983333 (Clostridium phage phiCTC2A, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tctattgcagcaggtggatttttagcaatggcaact CRISPR spacer tctattgcagcaggtggatttttaggaatggcaact Protospacer ************************* **********
2. spacer 1.4|916408|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT matches to KM983330 (Clostridium phage phiCT19406A, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tctattgcagcaggtggatttttagcaatggcaact CRISPR spacer tctattgcagcaggtggatttttaggaatggcaact Protospacer ************************* **********
3. spacer 1.7|916605|37|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT matches to KM983329 (Clostridium phage phiCT9441A, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gtatattggttattttcaacttcttttaagagttcta CRISPR spacer gtatattgtttattttcaacttcttttaagagttcta Protospacer ******** ****************************
4. spacer 1.50|916410|36|NZ_LT906477|PILER-CR matches to KM983333 (Clostridium phage phiCTC2A, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tctattgcagcaggtggatttttagcaatggcaact CRISPR spacer tctattgcagcaggtggatttttaggaatggcaact Protospacer ************************* **********
5. spacer 1.50|916410|36|NZ_LT906477|PILER-CR matches to KM983330 (Clostridium phage phiCT19406A, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tctattgcagcaggtggatttttagcaatggcaact CRISPR spacer tctattgcagcaggtggatttttaggaatggcaact Protospacer ************************* **********
6. spacer 1.53|916607|37|NZ_LT906477|PILER-CR matches to KM983329 (Clostridium phage phiCT9441A, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gtatattggttattttcaacttcttttaagagttcta CRISPR spacer gtatattgtttattttcaacttcttttaagagttcta Protospacer ******** ****************************
7. spacer 2.14|979972|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gaacaatgttggagtataaagctaattggtatggaaga CRISPR spacer gaacaatgttagaatataaagctaattggtatggaaga Protospacer **********.**.************************
8. spacer 2.14|979972|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gaacaatgttggagtataaagctaattggtatggaaga CRISPR spacer gaacaatgttagaatataaagctaattggtatggaaga Protospacer **********.**.************************
9. spacer 2.14|979972|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gaacaatgttggagtataaagctaattggtatggaaga CRISPR spacer gaacaatgttagaatataaagctaattggtatggaaga Protospacer **********.**.************************
10. spacer 2.14|979972|38|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gaacaatgttggagtataaagctaattggtatggaaga CRISPR spacer gaacaatgttagaatataaagctaattggtatggaaga Protospacer **********.**.************************
11. spacer 3.4|993091|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022778 (Clostridium tetani 12124569 plasmid p12124569, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ttaaatacataatctatttttttgaatctgtttctt CRISPR spacer ttaaatacataatctatttttttaaatctatttctt Protospacer ***********************.*****.******
12. spacer 3.4|993091|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004565 (Clostridium tetani E88 plasmid pE88, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ttaaatacataatctatttttttgaatctgtttctt CRISPR spacer ttaaatacataatctatttttttaaatctatttctt Protospacer ***********************.*****.******
13. spacer 1.31|918189|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_029006 (Clostridium phage phiCT19406C, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
tgtctatattgtaaaataacttttcaaatttgaaaa CRISPR spacer tgtctatactgtaaaataacttttcaaatttgggaa Protospacer ********.***********************..**
14. spacer 1.77|918191|36|NZ_LT906477|PILER-CR matches to NC_029006 (Clostridium phage phiCT19406C, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
tgtctatattgtaaaataacttttcaaatttgaaaa CRISPR spacer tgtctatactgtaaaataacttttcaaatttgggaa Protospacer ********.***********************..**
15. spacer 3.11|993091|37|NZ_LT906477|PILER-CR matches to NC_022778 (Clostridium tetani 12124569 plasmid p12124569, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
ttaaatacataatctatttttttgaatctgtttcttg CRISPR spacer ttaaatacataatctatttttttaaatctatttctta Protospacer ***********************.*****.******.
16. spacer 3.11|993091|37|NZ_LT906477|PILER-CR matches to NC_004565 (Clostridium tetani E88 plasmid pE88, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
ttaaatacataatctatttttttgaatctgtttcttg CRISPR spacer ttaaatacataatctatttttttaaatctatttctta Protospacer ***********************.*****.******.
17. spacer 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
ttgcaaaatcttttaatcctaagtcaattcctact CRISPR spacer ttgcaaaatctttaattcctaagtcaattcctatc Protospacer ************* * *****************..
18. spacer 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007581 (Clostridium phage c-st, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
ttgcaaaatcttttaatcctaagtcaattcctact CRISPR spacer ttgcaaaatcttttagtcctaagtcaatcccaatt Protospacer ***************.************.** *.*
19. spacer 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007581 (Clostridium phage c-st, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
ttgcaaaatcttttaatcctaagtcaattcctact CRISPR spacer ttgcaaaatcttttagtcctaagtcaatcccaatt Protospacer ***************.************.** *.*
20. spacer 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to ACSJ01000017 (Clostridium phage D-1873 CLG.Contig173, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
ttgcaaaatcttttaatcctaagtcaattcctact CRISPR spacer ttgcaaaatcttttagtcctaagtcaatcccaatt Protospacer ***************.************.** *.*
21. spacer 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP008983 (Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
ttgcaaaatcttttaatcctaagtcaattcctact CRISPR spacer ttgcaaaatcttttagtcctaagtcaatcccaatt Protospacer ***************.************.** *.*
22. spacer 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP008983 (Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
ttgcaaaatcttttaatcctaagtcaattcctact CRISPR spacer ttgcaaaatcttttagtcctaagtcaatcccaatt Protospacer ***************.************.** *.*
23. spacer 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026601 (Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
ttgcaaaatcttttaatcctaagtcaattcctact CRISPR spacer ttgcaaaatcttttattcctaagtcaatcccaata Protospacer *************** ************.** *.
24. spacer 1.5|916473|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT matches to KM983333 (Clostridium phage phiCTC2A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
actggtgatatgaatttaagtaatgtagaacacatt CRISPR spacer aagtgtgatatgaatttaagtaatgtagaaaatata Protospacer * ************************** *.**
25. spacer 1.5|916473|36|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT matches to KM983330 (Clostridium phage phiCT19406A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
actggtgatatgaatttaagtaatgtagaacacatt CRISPR spacer aagtgtgatatgaatttaagtaatgtagaaaatata Protospacer * ************************** *.**
26. spacer 1.51|916475|36|NZ_LT906477|PILER-CR matches to KM983333 (Clostridium phage phiCTC2A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
actggtgatatgaatttaagtaatgtagaacacatt CRISPR spacer aagtgtgatatgaatttaagtaatgtagaaaatata Protospacer * ************************** *.**
27. spacer 1.51|916475|36|NZ_LT906477|PILER-CR matches to KM983330 (Clostridium phage phiCT19406A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
actggtgatatgaatttaagtaatgtagaacacatt CRISPR spacer aagtgtgatatgaatttaagtaatgtagaaaatata Protospacer * ************************** *.**
28. spacer 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024444 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
ttgcaaaatcttttaatcctaagtcaattcctact CRISPR spacer tggcactgtcttttaagcctaagtcaatgcctacg Protospacer * *** .******** *********** *****
29. spacer 2.5|979369|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024446 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
ttgcaaaatcttttaatcctaagtcaattcctact CRISPR spacer tggcactgtcttttaagcctaagtcaatgcctacg Protospacer * *** .******** *********** *****
30. spacer 2.13|979906|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012423 (Spiroplasma kunkelii CR2-3x plasmid pSKU226, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tccggaattttagcacaggataataaaaaagtttta CRISPR spacer gcctataaattagcagatgataataaaaaagtttta Protospacer ** . * ****** * ******************
31. spacer 2.29|980979|35|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT701590 (Klebsiella phage Miami, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ccagcttgg--ttaacattaaacaattaaaaataaag CRISPR spacer --atcctaggtttaacattaattaattaaaaataaat Protospacer * *.*.* ********** .*************
32. spacer 5.1|1406504|30|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder matches to MN694310 (Marine virus AFVG_250M603, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atcttctacatgggatgtattttctttagc CRISPR spacer gtaggctagatgggatgtatattctttatt Protospacer .* *** *********** ******* .
33. spacer 1.10|916802|38|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007581 (Clostridium phage c-st, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ccaaagatagcagaaatagaagaatttaaa-gaaataat CRISPR spacer ttatggatagcagaaaaagaagaatttaaacaagatga- Protospacer ..* .*********** ************* .*.**.*
34. spacer 1.10|916802|38|NZ_LT906477|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP008983 (Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ccaaagatagcagaaatagaagaatttaaa-gaaataat CRISPR spacer ttatggatagcagaaaaagaagaatttaaacaagatga- Protospacer ..* .*********** ************* .*.**.*
35. spacer 1.56|916804|38|NZ_LT906477|PILER-CR matches to NC_007581 (Clostridium phage c-st, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ccaaagatagcagaaatagaagaatttaaa-gaaataat CRISPR spacer ttatggatagcagaaaaagaagaatttaaacaagatga- Protospacer ..* .*********** ************* .*.**.*
36. spacer 1.56|916804|38|NZ_LT906477|PILER-CR matches to AP008983 (Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ccaaagatagcagaaatagaagaatttaaa-gaaataat CRISPR spacer ttatggatagcagaaaaagaagaatttaaacaagatga- Protospacer ..* .*********** ************* .*.**.*
37. spacer 2.25|980711|37|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF403008 (Agrobacterium phage Atu_ph07, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tggttataacaatgataaagaatatgaggaaatttct CRISPR spacer ttataaaattaatgataaagaatatgaggcattttca Protospacer * .* * * .******************* * ****
38. spacer 2.9|979637|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LN831028 (Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum strain NCTC10562 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tcgatactgaaataaaacaattaaaaaaatcaaata CRISPR spacer agaaaaaagaaataaaaaaattaaaaaaataaaaac Protospacer .* * ********* ************ ***
39. spacer 2.9|979637|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029750 (Staphylococcus aureus strain Smith plasmid pSS41, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tcgatactgaaataaaacaattaaaaaaatcaaata CRISPR spacer ttggagaacaaataaaacaattgagaaaatcaaatg Protospacer *.*. . *************.*.**********.
40. spacer 4.6|1192415|36|NZ_LT906477|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039220 (Piscirickettsia salmonis strain NVI 5692 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tgaaagaactagaaaagagttagaaataaatcatac CRISPR spacer agttttaactaggaaagagttagaaaaaaatcttga Protospacer * ******.************* ***** *.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
168183 : 177408
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT906477|168183:177408|DBSCAN-SWA AATGTATTTATTAAAAAGATTTTTTGCAAGTATACTAGCTAGTATACTTATTGTAATTATTTTTTGCTTTATAATATTAAAACCATCTTTAATAGGAAAAGACAACAAAAATAATATATCTGAAAATAAGAAGATTGAAGAAATAAAAGTAAAAGTATATATCTCAAAAGATAAAAAAATAATAGAATTAGATTTGGAAGATTATATAAAAGGAGTAGTTTCAGCTGAAATGCCTGCTGAGTTTCATGAGGAGGCCTTAAAAGCTCAAGCTATAGCAGCAAGAACTTATGCTATACCTCGTATAAAACAATTAGGTGGAGTCAGTTGCAAAAATGTAAATGGTGCAGATTTATGTGATACAGTACACTGTCAAGCATTTTTAACTAAAGAAGTTAGAATGAAAGGCTGGTCAGAGAAAAAAAGAAATGAATATTGGAATAAGATTGAAAATGCAGTTGAAAGTACTGCAGGAGAAGTTTTGGTGTATAAAGATGAAATCATAAAAGGAGCATATTATTTCTCAACTAGTAGTGGATTTACGGAAAACGGCCAAGATATATTTGCATCTACAGAGCCATATTTAAAGAGTGTAAAAAGTCAAGGAGAAGAAATTGCACCAAAATATAAGAGTAATAAAAACTATTCGTATAGTGAATTTATAAATATAATTAATAAAAAATATCCTAAATCTATATCAAATATAAAAAATATAAAAAATGAAGTAAAAATAAAGAGCAGAACTTCTGGAGGAAGTGTAAAAGAGATAGTATTAGGCAAAACCATTATAACAGGTCCAACATTTAGAAAAATTTTTAATTTAAATTCATCAAATTTTAATATAAAATTTGAGAAAGATAAGATAAATATAGAATGCAAAGGATATGGACATGGTGTAGGTATGAGCCAATGGGGAGCCAATGTATTAGGAAAATCTGGTGAGAATTATAAGGATATATTAAAACATTATTATACAGGTGTAGAAATAAAAAAATATAAAGAAGTTTTAAAAAATAATTAAAATACTAAAAAGAAATTTAAAGTTTCTTTTTAGTATTTTTTATTTTTATAAAATTAATGACTATTTGTCAAAAAATGATGAAAATAGGAGAAAGAATTTTAAATAAAATATGTATTTTTTACTACAGACTGGACAAACTACAAAAAGGAGGTGCTTATATGGGTAAAAAATTTTCAAGTAAATTTCGTATAAAGAAGGAGGGATTCTATCTAGTTCTATTTATATGTCTATGTTTAATAGGATCAGCAGCTTACATATCTTCAAAAAACAATAAAGAAGCAAAAAGATTAGCTGTTAAAGAAGAAAATAAAATTCAAGAATCAAATGAAAATAAAGAACAAGAAACTGTAGAAACTAGAGAGCCAAGTGTAGAATATGATAATGCTTTACAAGTTAAAGAAGAAGATAAAAAGGTTGAAGAAAAAACTGAAAAAGTAGCTCAAGTGTCAGCTAAAACAGACAACAAATTTGTCAAACCAGTAGAAGGAACTATAGCTAGGGATTATTCAGAAGAACCTGTTTATTGGAAATCTACAAATAGTTATAGACCTAATTTTGGAATAGATATTAAATGTGAACTAGGAAAACCTGTTGTTGCTGTATTAGATGGGAAAATAGAAGATATAAAGAAAGATACAGTAGATGGTGTTCAAGTTACTATTAATCATCAAAACGGGTTGAAAACAATTTACGCTAATTTAGATGAGAAATTAGATGTAAAAGTAGGAGATGAAGTTAAAAAAGGAAGTAATTTAGGAAAAGTAGGGAAAACAACATTAAGAGCAGCTTATGAAAATTATGGAGAACATCTTCATTTTTCTGTAACTAAGGATGGAGATTATGTAAATCCAAATAAGTATATAAAATATTAAATAAAATAAAGCCATTTTCCACATAACTGAGTGGAAAATGGCATTATAAAAATAATTTAGTTACTAAATATATTTATAAATAGTAAGGAGGTAGTAATTTGAAGGATTACATTGAAGAAAGAGTTTTAGAAGTCGCTAATTATATAATAAGTTCTAAAGCTACTATAAGAAAAACGGCCAAAGTCTTCGGTGTAAGCAAAAGTACAATTCATAAAGATATGACAGAAAGATTGCCTAAAATAAATCCTCAAATTGCAAAAGAAGCTAAAAATATATTGGAATTTAATAAGGCAGAAAGACATATAAGAGGTGGAAAAGCTACAAAATTGAAGTATAAAGCTATTGAAGGTTAAAAACATTCCTATTATAATTGATATTAGGTAGTATCAAAATTTACCAAAGAAGAATAAGGAAAGAGCAGGTGTGAAAAATAGGGATGTTTTTTAATGTAGGAACAGATATGGGAATAGATCTTGGAACAGCCACTGTACTAGTTTATATTAAAGGAAAAGGTGTAGTATTGAATGATCCATCAGTAGTAGCCATTGATAAAAGTAAAGATAAGCTTTTAGCAGTAGGAGAAGAAGCAAGGCAAATGATTGGTAGAACTCCTGGCAATATTGTTGCATTAAAACCCCTTAGGGAAGGAGTTATTTCTGATTACGATTTGACAGAAAAGATGTTGAAACATTTTATTACTAAAGCTTGTGGTAAAAAGAAAATGGTTTCACCAAGAGTAGTAGTATGTATACCTTGTGAGTCTACGGAAGTTGAGAAAAGAGCAGTTATAGATGCAGCAAGGAATGCAGGTGCTAAAAAGGTTTTTTTAATAGAAGAACCTCTAGCTGCGGCAATAGGTGCTGGTGTTGATATAACTAAAGCTAGTGGTAATATGATAATTGATATAGGAGGAGGGACAACCGATATAGCGGTTATATCACTAGGAGGAATAGTTGCAAGATCAACAATAAGTATAGCCGGTGATAGCTTCGATGAAGCTATAATAAAATACATACGAAAGAAGCATAATCTTATGATAGGAGAAAGGACTGCAGAGGATTTAAAGATAAATATAGGATCTGTTTATGATGTTGGTGAAGAAAATTTTATGGATATAAAAGGTAGAGATTTAATATCAGGGTTACCTAAGAATATAACTGTATCGTCATCAGAGATGAGAGATGCTTTAATAGAGCCTATAAATACTATAGCTGAAAGTACCCATGCTATCTTAGAAAAAACCCCACCAGAATTAGCGGCAGATATATCTGATAAAGGTATAGTAATGACCGGAGGTGGAGCATTATTAAATGGTTTAGATAAGTTAATATCAGAAGTAACCCATGTACCAGTATATGTTTCTGAAAATGCAGTTACATGTGTAGCTATTGGTACAGGGAAGATGTTAGAATACTTGGATAAGTTAGATATAACTTTTCAAGGAGATAGTATAGTTTTAATAGACTAAAAATAAAAAAGCAAAGAATTTATATCTTTGCTTTATTTTTATTTGACAAAATGTATTCTTTACAAGATAATTTTAAACCATATATTATGGATTCAGAAATAGATTTGGCCATATTAAGTATAAAATTAAGTCGAATAGAATTATTATTAAATATATTCATTTCAGTGGAATCGATTATTCCAACTACGGAACGATTTCCCACATGAGGAAGTTCCTTACCAACACCTTTTCCAGGATATATTGGATAATTTCGTGATTGTATAAATCCAATATTATTAGGTTCTCCTAAACAAGCATCTATGCCAAGTATACTATGATTAGGGTATAAAGAAGATATTTCTTCCATTTTTATTTTTATATTTAACGCATGGATTGGATTTTCTATTGTTCCAAAGACAGGCAGAGGAAAATCTTTTGTTTTTAAAATTGTACCAGTTATAGGACCAAGAGAATCTCCTATGCATTTATCTGTTCCTATACACACTATTATAGTTTTTTCATTTAAAAAGTTTATTAAACTATTTCCTATTATTTTATAAGCCAAAGGATCATTATAATGGACCATGGTTTTATCCAAAAATTACACCTCCTTCAATAATTTATATGAAGGTGGTGTAATTAATATTATAGCAAATTGTTTAATTTTGTTTATTCCAAATACAAAGTTGATTAGAATTTGTTAAAGCACCTAATAATCTATTATCTAAATCAGGAAAATCTTTTTTTAGAGATTTTATTAAATTTTTTATAGATTCTCTTTTAGTAAAACCATTAGCAGGACAAGGATTTTGTATTATAGGAAAATTATATTTTATTGAAGTATTTTTAATAGATTCTTCATCTATATATACCATAGGTCTAATTACAGTTATATCTTTCCTATCTAAATAAGTTTTTGGAAGAAAGCAACTAATTCTACCTTCATAGAACATAGATAATAAAAGTGTTTCAACAGCATCATTTTTATGATGACCTAATGCTACTTTATTACAACCTAGCTTTTTAGCATTATCATTTAGTATTCCACGTCTTAAATTGGCACAAAGAGAACAAGGATTCTTTTCTTTTCTAATATCAAATACTATTTCCTTTATATTAGAATCTATTATGTGAAAATTTACATCTAAATCTTTACAAAGAGCTTTTAAAGGAGAAAAATCCATATTTGTTCCTGGATCTATAGTAATTGCTATTATGTTAAATTTTTCAGGAGAAAACATTCTATATTTACTTAAAAGATACAGAAGAGCGATACTATCTTTTCCACCAGATAGGCCAATTGCAATATTATCGCCATCTTCTATTAAAGAAAAATCACTTACTGCTTTCCTAAGTTTACTTAAAAGTTGTTTCATATCAATCTTCCTTTTCAAAATTAAAATTTTATCTAAATAGCATTATAATATAAGCAATACATTAAGTGAAGTATAAAAAATAGTACAATTTAAATTATCTACATAGTTAAGAAAGAGATAGTAAGAGAAAAATAGAGATATAATGATTAATATCGATTTATTATACTATAATCACATTTGAATTTTTAACAATATAATTGTATACTTGTTTTTGTCGACAAGTTCGATAGAAAATGTGCTGGCATGGCTCAATTGGCAGAGCAGCTGACTTGTAATCAGCAGGTTGTAGGTTCAAGTCCTATTGCCAGCTCCATATGTGGAGGAGTTCCCGAGTGGCTAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGGCTTTCGCCTTCGATGGTTCGAATCCGTCCTCCTCCACCATAGTTTCTTAAAATGTGCTGGCATGGCTCAATTGGCAGAGCAGCTGACTTGTAATCAGCAGGTTGTAGGTTCAAGTCCTATTGCCAGCTCCATATATGGAGGAGTTCCCGAGTGGCTAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGGCTTTCGCCTTCGATGGTTCGAATCCGTCCTCCTCCACCAAAAAATAACACTAAAATATTAGTGTTATTTTTTTATTATAGCATAATATATAATTGACAGCTAAATATTAATGTGCTAATATTAGTTAGTAATATAATTAGATAAAAAGCTCTTATCGAGAGAGGTGGAGGGAAAGGGCCCAATGAAACCCGGCAACCAATATTTTTTAATATTAAGGTGCCAATTCCTGCAGAAAATTCTGCAAGATAAGAGGGATAGCAAGTAAAAAGCAAGTCTCTTCTTATCAGAAGAGACTTTATTTTTATATAAGAGCTACACAATAGGAGGTAAAAAAATGAGGAAATTATTTACATCTGAATCAGTTACAGAAGGACATCCAGATAAAATTTGTGACCAAATTTCCGATGCAGTACTTGATGCTATACTTGAAAAAGATCCAAATGGTAGAGTTGCTTGTGAAACTAGTGTAACTACAGGAATGGTTTTGGTAGCAGGGGAAATAACTACCAATTGTTATGTAGATATACCTAAAATAGTAAGAAATACAATAGAAAATATAGGATATACTAGAGCTAAATATGGATTTGATTCAGATACCTGTGCGGTATTAACATCTATATCAGAACAATCTCCAGATATAGCTATGGGTGTTAATGAATCTTTAGAATCTAAACAAGGTGGAATAGATAATGAAGATGTTATAGGAGCAGGGGATCAAGGAATGATGTTTGGATATGCAGATAATGAAACTCCAGAATATATGCCAATGGCAATATCTATGGCTCATAAATTATCTAGAAGATTATCCGAAGTAAGAAAAAATGGAACATTACCTTATTTAAGACCAGATGGTAAAACACAGGTTACTGTAGAATATGAAGATGGTAAAGTAGTAAGAATAGATACTATAGTAGTATCTACTCAGCATGGACCAGAAATTACAAGAGAACAAATAGAAAAAGATATTATTGAGCATGTAATATCTAAAGTTGTACCAGCCGAACTTTTAGATGAAAATACTCATTATTATATAAATCCAACAGGAAGATTTGTTGTAGGTGGACCACAAGGTGATGCTGGATTAACTGGAAGAAAAATAATAGTTGATACCTATGGTGGATATGGAAGACATGGTGGTGGAGCATTTTCAGGAAAAGATCCTACAAAGGTGGATAGATCTGCAGCATATGCAGCTAGATGGGTAGCTAAAAATCTTGTAGCAGCTGGAGTAGCAGATAAATTGGAAGTTCAACTAGCTTATGCTATAGGAGTAGCAAAACCTGTTTCTATTTCAGTAGAGACTTTTGGAACAGGCAAAATAAAAGATGAGAAAATTATAGAAATAATTAATAAGGTATTTAATTTAAGACCTTCAGCTATAATAAAGGAGCTAGATTTGAGAAGGCCTATATATAAACAAACAGCAGCCTATGGACATTTTGGAAGAACAGATATAGAACTTCCATGGGAAAATCTAAATAAAGTGGAACAAATAAAAGCCTTAATCTAATATAAAAGCATATAAAAAAACCCTGGTAAATTTTTACTGGGGTTTTTTATTGATGGATAATAGACAATTTAGTGAAACTTTATTTCTTGAATCAGAAAACTTTTAATTTTATTGGGTATAATTAAAAATAAATATTATATAGTTTTATAAATTGTTCATTATTCATTAACCAGAGGCGGTGTATGATATAATATATAAAAATAGTAAAATTAGGGGAGATCTTATGGAAGAAATACAAGGAACCGTTGATTCCATAATATTTAGGAATGATGAAAATGGATATGTTGTCAGTAGAATTAAGGAAGATGCTAATTCTATAACAACTATAGTAGGATGTATACCTTATATATCGGAGGGACAAAATCTTAAATTATATGGAGAATGGGTAATTCATCCTCAATTTGGAAGACAATTTAAAGTTGAAAGTTGTGAAGAAATCATTCCTGATACTAAAAAAGGAATTGAAAGATATTTATCATCAGGTATAATTCCCGGAATAGGGCCTGTAACAGCTAAAAAAATTGTTCAAAAATTTGGATTGAAGACTTTTCATATATTAGAGAATGATATTGAAAGATTAAAGGAAATAGAGGGCATAGGAGATAAAAAAATAGGTATAATTCAAGAGTCTTACGAAGATCAAAAAGAAGTTAGAAATATAATGATGTTTTTTCAAGAGTATGGTATATCTATAAATCATTGTCTCAAGATATATAAGAAATTTAAAAGCGAATCTATTAGAATAGTGAAAGAAAATCCATATATATTAACAGAAACTATTTCAGGAATAGGATTTAAAACAGCGGATAAAATAGCTAAAAATTTAGGAGTTGATATAAATTCTCCTTTTAGAATACAAAGTGGTATAAATTATGTATTGAATCAATTTTCTGCATTAGGAAATACTTGCATGCCAGCGGATAAATTAATAAAAGATGGAAAAGAAATATTAAATGTAGAAGAAGAAGAGATAAAAGAAAATGTATTACAAAGTGCTCTTCAAGGTAAATTAAGAGTAGAAATAGTGGATGGAAAAGAATATATTTTTTCTATACCCTATTATTATTGTGAATTAGGCGTAACAAAGAATATATTAAAATTATCATTATATAATCATAAGGATTTAGATATGACTGTAGAAGAAGAAATAAGAAATTTTGAAGATAATAATAATATAAAATTTTCTCCTTCACAAAGAGAAGCTATAATAGGAGCCTTTTTGAATGGAGTAGAAATAATAACAGGTGGACCTGGTACGGGTAAAACAACTATTATAAACTGTATTTCGGATATATATGAAAAATATGGATATACTGTTTGTATGGGAGCACCTACAGGGAGAGCAGCAAAAAGAATGACAGAAGCTACAGGAAGAGATGCAAAAACTATCCACAGATTATTGGAAATGGGGGTAGGGGAAGAAGAAATATTTTCTAAAACAGAAGAAACTCCCTTAGAATGTGATGTAGTGATAATAGATGAAGCATCAATGATAGATATAATGCTTATGAATAACTTACTAAAAGCTATATCTATAGGAACTAGACTTATAATAGTGGGTGATGTAGATCAATTACCATCGGTAGGTCCTGGAAATGTATTAAAAGATTTAATAGAAAGCAATTGTGTTAAAGTAGTAAGATTAAAGGATATATTTAGACAATCAGAAACTAGTGCAATAACTTTAAATGCACATAAGATAAATAGTGGACAAATGCCTATTTTGAATGAAAGGAATAAGGATTTCTTTTTTTTAAACGGTGATTCTAATGAGAATATATTGGATATTCTATTAGGACTAATTCATAAGAGATTACCAAATTTTAATAAGGATTGGGATAAATTAAAACATATACAAATATTAAGTCCTATGAGAAAAGGAATATTAGGAGTTGAAAATTTAAATAGAAACCTTCAAAAAGTACTAAATCCTCCATCAAAAGAAAAAAAAGAGAAGAAGTTTAAAGACTGTATTTTTAGAGTGGGCGATAAGATTATGCAAACTAAAAATAATTATAATATTAAGTGGAGAAAGATAGATAAATATGATCCAGAAGAAGGAATGGGAATATTCAATGGAGATATAGGATATATAGAGGATATAGATGAAGAAAACAACAATATGACCATTATTTTTGATGAAGAAAAGAAAGTAATTTATGAAGATATTTATTTAGATGAAATAGATTTGGCATATGCTATAACTATACATAAAAGTCAAGGAAGTGAGTTTCCAGCAGTTATAATACCTGCTTTTATGGGGCCACCTATGCTTATGAATAGGAATTTATTGTATACAGGAATAACAAGAGCAAAAGAATTAGTGGTTGTAGTAGGAAAATTAAAAGCATTAAAATTTATGGTTGATAATAATAGGAGTTTTGAAAGATATTCCTTATTAAAGTGGAGAATACAAAACATACTAGAAAATTTTTATGAAGATAATGGACAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT906477|168183:177408|173777_174953_+|WP_089866027.1|DBSCAN-SWA MRKLFTSESVTEGHPDKICDQISDAVLDAILEKDPNGRVACETSVTTGMVLVAGEITTNCYVDIPKIVRNTIENIGYTRAKYGFDSDTCAVLTSISEQSPDIAMGVNESLESKQGGIDNEDVIGAGDQGMMFGYADNETPEYMPMAISMAHKLSRRLSEVRKNGTLPYLRPDGKTQVTVEYEDGKVVRIDTIVVSTQHGPEITREQIEKDIIEHVISKVVPAELLDENTHYYINPTGRFVVGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYGRHGGGAFSGKDPTKVDRSAAYAARWVAKNLVAAGVADKLEVQLAYAIGVAKPVSISVETFGTGKIKDEKIIEIINKVFNLRPSAIIKELDLRRPIYKQTAAYGHFGRTDIELPWENLNKVEQIKALI >NZ_LT906477|168183:177408|172178_172895_-|WP_089866030.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKQLLSKLRKAVSDFSLIEDGDNIAIGLSGGKDSIALLYLLSKYRMFSPEKFNIIAITIDPGTNMDFSPLKALCKDLDVNFHIIDSNIKEIVFDIRKEKNPCSLCANLRRGILNDNAKKLGCNKVALGHHKNDAVETLLLSMFYEGRISCFLPKTYLDRKDITVIRPMVYIDEESIKNTSIKYNFPIIQNPCPANGFTKRESIKNLIKSLKKDFPDLDNRLLGALTNSNQLCIWNKQN >NZ_LT906477|168183:177408|169358_170072_+|WP_168944056.1|DBSCAN-SWA MGKKFSSKFRIKKEGFYLVLFICLCLIGSAAYISSKNNKEAKRLAVKEENKIQESNENKEQETVETREPSVEYDNALQVKEEDKKVEEKTEKVAQVSAKTDNKFVKPVEGTIARDYSEEPVYWKSTNSYRPNFGIDIKCELGKPVVAVLDGKIEDIKKDTVDGVQVTINHQNGLKTIYANLDEKLDVKVGDEVKKGSNLGKVGKTTLRAAYENYGEHLHFSVTKDGDYVNPNKYIKY >NZ_LT906477|168183:177408|170170_170425_+|WP_089866036.1|DBSCAN-SWA MKDYIEERVLEVANYIISSKATIRKTAKVFGVSKSTIHKDMTERLPKINPQIAKEAKNILEFNKAERHIRGGKATKLKYKAIEG >NZ_LT906477|168183:177408|175176_177408_+|WP_095177198.1|DBSCAN-SWA MEEIQGTVDSIIFRNDENGYVVSRIKEDANSITTIVGCIPYISEGQNLKLYGEWVIHPQFGRQFKVESCEEIIPDTKKGIERYLSSGIIPGIGPVTAKKIVQKFGLKTFHILENDIERLKEIEGIGDKKIGIIQESYEDQKEVRNIMMFFQEYGISINHCLKIYKKFKSESIRIVKENPYILTETISGIGFKTADKIAKNLGVDINSPFRIQSGINYVLNQFSALGNTCMPADKLIKDGKEILNVEEEEIKENVLQSALQGKLRVEIVDGKEYIFSIPYYYCELGVTKNILKLSLYNHKDLDMTVEEEIRNFEDNNNIKFSPSQREAIIGAFLNGVEIITGGPGTGKTTIINCISDIYEKYGYTVCMGAPTGRAAKRMTEATGRDAKTIHRLLEMGVGEEEIFSKTEETPLECDVVIIDEASMIDIMLMNNLLKAISIGTRLIIVGDVDQLPSVGPGNVLKDLIESNCVKVVRLKDIFRQSETSAITLNAHKINSGQMPILNERNKDFFFLNGDSNENILDILLGLIHKRLPNFNKDWDKLKHIQILSPMRKGILGVENLNRNLQKVLNPPSKEKKEKKFKDCIFRVGDKIMQTKNNYNIKWRKIDKYDPEEGMGIFNGDIGYIEDIDEENNNMTIIFDEEKKVIYEDIYLDEIDLAYAITIHKSQGSEFPAVIIPAFMGPPMLMNRNLLYTGITRAKELVVVVGKLKALKFMVDNNRSFERYSLLKWRIQNILENFYEDNGQ >NZ_LT906477|168183:177408|168183_169200_+|WP_089866137.1|DBSCAN-SWA MYLLKRFFASILASILIVIIFCFIILKPSLIGKDNKNNISENKKIEEIKVKVYISKDKKIIELDLEDYIKGVVSAEMPAEFHEEALKAQAIAARTYAIPRIKQLGGVSCKNVNGADLCDTVHCQAFLTKEVRMKGWSEKKRNEYWNKIENAVESTAGEVLVYKDEIIKGAYYFSTSSGFTENGQDIFASTEPYLKSVKSQGEEIAPKYKSNKNYSYSEFINIINKKYPKSISNIKNIKNEVKIKSRTSGGSVKEIVLGKTIITGPTFRKIFNLNSSNFNIKFEKDKINIECKGYGHGVGMSQWGANVLGKSGENYKDILKHYYTGVEIKKYKEVLKNN >NZ_LT906477|168183:177408|171559_172105_-|WP_089866135.1|protease|DBSCAN-SWA MVHYNDPLAYKIIGNSLINFLNEKTIIVCIGTDKCIGDSLGPITGTILKTKDFPLPVFGTIENPIHALNIKIKMEEISSLYPNHSILGIDACLGEPNNIGFIQSRNYPIYPGKGVGKELPHVGNRSVVGIIDSTEMNIFNNNSIRLNFILNMAKSISESIIYGLKLSCKEYILSNKNKAKI >NZ_LT906477|168183:177408|170508_171540_+|WP_089866033.1|DBSCAN-SWA MFFNVGTDMGIDLGTATVLVYIKGKGVVLNDPSVVAIDKSKDKLLAVGEEARQMIGRTPGNIVALKPLREGVISDYDLTEKMLKHFITKACGKKKMVSPRVVVCIPCESTEVEKRAVIDAARNAGAKKVFLIEEPLAAAIGAGVDITKASGNMIIDIGGGTTDIAVISLGGIVARSTISIAGDSFDEAIIKYIRKKHNLMIGERTAEDLKINIGSVYDVGEENFMDIKGRDLISGLPKNITVSSSEMRDALIEPINTIAESTHAILEKTPPELAADISDKGIVMTGGGALLNGLDKLISEVTHVPVYVSENAVTCVAIGTGKMLEYLDKLDITFQGDSIVLID |
8 | Clostridium_phage(33.33%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
313334 : 322148
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT906477|313334:322148|DBSCAN-SWA AATGAGCAAAATCAAACTGGCACTAGATGTGGTGGAGGATCTACGAAGTCTTGCAGATAGTATTGAAACCTTAGCAGGAGCTGTAGAAGGAAATGAACCTAAAGAAAAGGTGAAAGACAATCTACCAACTTTAGAGGAAGTCAGAGCAAAGTTAGCTTCTCTGTCTAAAGCTGGAAAGCAAGCACAGGTAAGAGAGCTTATTACAGGATTTGGAGTTAAGAAGCTAAGTGATATACCAAGAGAAAAATACCCAGAATTACTTGAGAAAGTCGAGGTGATGTAATGGGAGAACATGCCCTACTCTCTGCTTCATCGGCTCACAGATGGCTTAAGTGCAGCCCTAGTGTAAGGCTGGAAGAAGAGGTGGAAGATAATACAAGCATTTATGCAAAGGAAGGAACCTTTATGCATGGATTAGGAGAGTTACATCTTAAACTTTTTCTAGATGATATTACAAAGGCAGAGTTCAATAAAAGACTAAAAGAAATGAAGCAAAATGATTTTTATACAGATGAAATAAAAAAAGCAGTAGAGATTTATGTAGATACAGTAATTGAAAAGATTAATGAAGCAAGGGCAAATACTTATGACTCACTTATTCTAATAGAAGAAAGATTAGATTACAGCCCTTGGGTTAAAGAAGGATTTGGAACAGGAGATGTCCTCATTATTGCAGATGGAATTATTGAAGTTATTGATTTAAAAGGTGGCAAAGGAGTAGCAGTATCAGCAATAGGAAATCCCCAAATGCGTCTATATGCCTTAGGTGCAATTAACGGATTTGGAATGCTCTATGATACCCAGAAAGTTAGAATGACCATTATCCAACCAAGACTTGATAATATCTCCAGCGATGAAATGGAAGTAGAAGAACTTATACATTGGGGAGAGAAAATAGTAAAGCCAAAGGCTGATGAAGCTTGGAAGGGGGAAGGTGAATTTAAGGTAGGAGAGCATTGCAGGTTCTGTAAGGTAAAAGCCATATGTCGAGCTAGAGCAGATGAAAACATAAAACTAGCTTGTATGGATTTTAAGCTACCAGCATTATTAACAGATGTAGAAATTTTAGAAGTACTAAATCAAATAGATGAACTAAAAAAATGGGCAAGTGATGTAGAAGCATATGCATTCAACCAAGCAGTAAATGAAGGCAAAGAGTGGCCTGGATTTAAGCTGGTGGAAGGCAGAAGTAGTAGGAGATATTCAAATGAAGATAAAGTTGCCAAAGCTTTACTTGCTGCAGGATTTGAAGAAGAAAAGATATTCAGTAAATCTTTACTAAGCCTTACCAAACTTGAAAAGAAATTAGGAAAGAAAGTATTTGAAGAAACCATAGGAGATTTAATAATCAAACCTCCTGGGAAACTTCAGTTAGTTCCAGAGGAAGATAAAAGACCTGCTATAAGAAGCAGTGCAGAAATAGATTTTAAGGAGGAATTTTAATATGAAAATAGTTACAGGTAAAGTTAGATTTAGTTATGCAAATGTGTGGGAGCCACAAAGTGTTAATGGAAGTGAACCTAAGTATTCTGTTAGCTTAATTATTCCAAAGAATGATAGGAAAACACTAGAAAAGATAAATAAGGCAATTGAAGCTGCCGAGAAAGAGGGAATATCAAGATTTGGTTCAAAGTTTACCAGCGGTTCAAATTTTAGAAGACCATTAAGAGATGGAGATTTAGACAAACCAGATGACCCAGCATATAAAAATAGTTACTTTATAAATGTAAACAGCAAGATAAAACCAGGTATTGTAGACAAAAATGTAGAGCCTATATTAGACCAAACAGAATTTTATTCAGGCTGCTATGGTAGAGCAAGTATTAGCAGTTTCCCATATAGCATTAATGGGGCAAAGGGAATTACATTTGGATTAAACAATCTTCAGAAGCTTGAGGATGGAGAGCCCTTAGGTGGAATATCAAGACCTGAAGATGATTTTGAAGCTATAGATGATGATTTTGATGATATTTTAGGATAATGCCTTATGAAAATATTAGCTATAGATATAGAAACTTATAGTAGTGTAGACCTCGGTAAATCTGGGGTCTATGCCTACACTGAAGCAGAGGATTTTGAAATACTAATCATTGGTTATGCCTATGATGATGATGAAGTACAGGTTATAGATTTAGCAAGTGGTGAAAAGGTTCCAGCTGATGTAGTAGAAGCTATAACTAATCCTAAAGTAATTAAAACAGCTTTTAATGCACAGTTTGAAAGAACTTGTTTATCAAAATATTTTAAAGAGGAAATGCCACCAGAACAGTGGAGATGCAGTATGGCCCACGCATTAACTTTAGGCCTTCCTACCAGTTTAGCAGGTGTGGCTAGGTGTTTAAATCTAGAACAGCAAAAGATGAGTGAAGGGAAAGCACTAATTAGATACTTCTCAATTCCCTGTAAGCCTACTAAAGCTAATGGGGGAAGAACTAGAAATCTTCCTCATCATGATAAGAATAAGTGGGAAACATTCAAAGCATATTGTAAGCAAGATGTGGAAGTGGAAAGGTCTATTCGTAAAAGATTAGAGAATTACCCTATGACAGATAAAGAATTAAAGCTATGGTTTTTAGACCAAAGAATTAATGATTATGGAGTTAGAGTGAATAACGAATTAGTAGAAAATGCAATACACTGCGATGAAATCTACCAAAAGGAATTAGTAGACGAAGCTATAGATTTAACAGAACTTGAAAATCCTAACAGCCCAGCCCAGCTAAAGACTTGGCTTAAAGATAAACATGGTATTGAAGTGAAAAGTCTATCCAAAGCAAAAGTAGCAGAGTTACTAGATGAAGTTGATGACCCTATAGCAAGAAGGGTTTTAGAGTTAAGGCAAGATATGTCTAAGACTTCAGTTAAGAAATATGAAACCATGGAAAGAGCCATGTGTAAGGATGAAAGAATACGAGGATTACTACAGTTTTATGGAGCAAATCGAACTGGAAGATGGGCGGGAAGATTAGTTCAAGTTCACAATCTTCCTAGAAATGATATGAGTGATTTGGATTTAGCAAGGGAACTTCTTCTAGCTGGAGATTATGAAACACTAGAACTACTCTTCGATTCAGTACCAGATGTTCTATCTCAGCTTATTAGAACAGCTTTTATACCTTCTCCTAATTCAAGATTCATAGTAGCAGACTTTAGTGCTATAGAAGCTAGAGTTATAGCTTGGCTTGCAGGAGAGAAATGGAGAATGGATGTGTTTAATTCTCATGGAAAGATATATGAAGCTTCAGCATCTCAAATGTTTGGAGTTCCTGTAGAAGAAATTCATAAGGGCAGCGTCTTAAGACAGAAAGGAAAGATTGCAGAGTTGGCCCTTGGATATGGAGGAAGTAAAGGTGCCTTAAAGGCTATGGGTGCAATAGACATGGGACTTAGTGAAGAAGAACTACCTGAGCTTGTATCTGCTTGGAGAAAGTCCAATTCAAATATAGTTAGACTTTGGTGGGATGTAGAAAGTGCTGCAATTAAAGCAGTTAAGGAAAGAACAGTAGTTAGTATGCAATATGGTCTTAGGTTCTACTTTAAATCAGGAGTGTTATTTATAAGACTACCCTCTGGCAGAAGCCTTGCCTATGTAAGGCCCAGGATTGAAATAGATGAAAGATTTAATAAAGATAAATTGACCTATGAAGGTATAGAAGGGATGAAGTGGGGTCGTATTGACACCTATGGAGGAAAATTAACAGAGAATATTATACAAGCCATAGCAAGGGACTGTTTAGCTGAATCTATGCTAAGGCTTGAAAAGTACGGATATAGGATTGTATTTCATGTTCATGATGAAGTTATACTAGATGTTCCAAAGGATAATGGTTCATTAGAAGAAGTGGAGGGAATTATGGGACTTGATATCCCTTGGGCCCCAGGACTTCCATTAAGAGCTGAAGCCTTTGAGAGTGATTACTATAAAAAAGATTAGGTGGGTCATGAAATACGACCTACCTAAAGAGGAAGGTGATATTAGTGAAACCAATTATCTATGTATGTTCTCCCTTAAGGGGAGATGTTAAAAGGAATATAAATAAAGCTATAGGTTATTCAAGGTATGTCTATGTCAAGGGTGGTATTCCCTTGGCACCTCATACCATCTTTACTCAGTTTTTAGATGACGAGGATGAAGATGAAAGAAACGCAGGAATAGATATGGGACTTGAACTTTTAAATATATGTGATGAACTATGGGCCTTTGGAGATAAAATCTCTGAGGGAATGCTTAATGAAATTGAAAGGGCTAAGTCACTAGGGATTATAGTAAGAAGGTTTAATGAAAGGTGTGAACCTTTGGATGAATAGGGAAACCATTAAGTTTATAAAACTTCTAAAAGACTATAGAGGAATTCTCCCAAGACAAACCATTAAAACCTTACGAGGTCAGGCATTAGCTGGAGATATAGAAGGAGCAAAGAAAGGACTTAAGAAAGAGGTGAGTAAATATGCAAGAGCCATATAAGCTTAAGGAACCTAAACTTAAACATGATGGAGTTCTTACCATTGCTACAGGTAGAAGTAGAAAAGAAATGAACTGGAAGAATCGAGAGATGCTATGGTCGGAATTGGTAGATAAATTAAGCAGTACCATAAGAACTTATGAAACCTATGAAGAATACAAGAAGCTATCTAAATCGAAGAAAGATGAAATAAAAGATGTAGGTGGTTTTGTAGGTGGAACTTTAAAGGAAGGCAGAAGAAAAGCTGATAATGTAGTTTGGAGGCAAATTGTAACACTTGATGCTGACTTTGTTAAGGGAGATTTATGGGCAGGAGTTGAGACCATGTTTGGATATGGATGTGTAATGTATTCTACTCACAGTCACAGTCCTAAAGCTCCAAGATTAAGACTTGTTATTCCACTAAAAAGGGCAGTAACTTCTGATGAATATGGAGCAGTATCAAGAAGAATTGCAGCAGATTTAGGCATAGATTTCTTTGATGATACCACCTATGAGCCACATAGATTGATGTATTGGCCATCAACTTCTTCTGATGGAGAGTTTATTTTCAAAGTATTAGATGAAGAATGGGTAGATCCAGATGAAATACTTGCAAGGTATAAAGATTGGAGAGACTCTTCCTATTGGCCTGAAAGTTCAAGGACTAAAGAGAATAGAAAGAGATTAGCAGAAAGACAAGGAGATCCTAAAGAAAAGCCAGGTGTAGTAGGTGCCTTTTGTAGGACATACTCTATCATTGATGTAATTGAGAAGTTTTTATCTGATATATACTCACCTTGTGAAACTTCTAATAGATACACATATATTCCAGGATCATCTGCAGGTGGATTAGTTATATATGAAAATGGAGACTTTGCATATTCACACCATGGCACCGACCCCATTAGTGGCAAACTATGTAATGCTTTTGACCTTGTAAGACTTCATAAGTTCGGTGAATTAGATGAAGAGGCAAAGGAAGGAACACCTGTAAATAAGCTGCCATCTTATCTTTCTATGCAGAAGTTAGCTAGAGAGGATTTAGAGGTTAAAAAGACTATAGCTAGTGAAAGGATGACTTCAGCTAGTGAGGATTTTAATGAGGAAGATTGGCAAGTAAACCTTGAAATTAATAATAAGGGAGAGCTTAAAAATACTCTTACCAATATAATTCTTATAATAAGACATGATCCACAACTTAACAGTATTTTTTATAACGAGCTTCGAGAAGGTGTTGATGTAGAAGGAGATGTTCCCTGGAAAAGGTTAAAGTCTGGGTGGAATAAAACTGATGAAGCATCTCTTGCTGGATATATTGATTTAAACTATAACCTTTATGCACCAGGAAAGCTTAAGGAGGCTGTATTAAAAGTAGCCGTTGAAAGGTCTAGACATCCAGTAAAGGAGTATCTATTAAATCTTCCAAAATGGGATGGTGTTAAAAGAGTAGATACCCTATTAGTTAAATATCTAGGAGCAGAAGATAATATCTACACCAGAGAAGCAACGAGAAAGACACTAGTTGCAGCAGTAGCAAGAACCATGAATCCAGGAATTAAATTTGATACAGTTCTAGTTTTAAATGGGCCACAGGGAATAGGAAAGAGTACTTTGTTTTCAAAGCTAGGAGGAAAGTTTTTTAGTGATTCTCTTTCCATCTCAGATATGAGAGATAAAACTGCAGCGGAAAAACTTCAAGGTTACTGGATACTTGAAATTGGAGAACTAGCTGGAATTAGAAAAATTGATGAAGAGACATTAAAGTCTTTTTTATCAAGGCAAGATGATAAGTTTAGAGCAAGTTATGGATACTCAGTAGAAGACCATCCAAGACAGTGTATTATTGTAGGCACCACAAATCAAGAAGCAGGATTTTTAAGGGATATTACTGGTGGGCGTAGGTTTTGGCCAGTTAAGACTCCAGGAGATACTAAATTAAAACCTTGGGATATAGATGATGTAGACCAGATTTGGGCAGAAGTAATGGAATATTACCATAAAGGTGAATCTTTAGTATTAAGTAATGAAGCTGAAAAAATAGCAAATGCAGCCCAAGTGGATGCTTTAGAAAGTGATGATAGAGAAGGAGTAGTTAGAGAATATTTAGATATGCTCCTTCCAACGAACTGGGATGATATGGACTTATATGCAAGAAGAAGCTTTATTCGTGGTGATGAGTTTAGCGATAATGTTATAGGAACTGTAAGAAGAGAGCAAGTCTGCACCATGGAAATTTGGTGTGAGCTATTTGGTAAAGAAGCTACTGCCATGAGAAAGATAGACTCTTATGAGATAAATGCAATAATGAGAAAGATTGATGGATGGGAAAAGTACACTGGAAATAAATTAGGAAATGCCAAAGTTCCTCTCTATGGAATACAAAGAATTTATGTTAGATGCGATAAACAAGATTAAACAAGATTTAGGCTTGTTACCATTCTTGTTTACCACCCCTACCCTAGTTATATTAAGGCTTTAATTTATATTATTAACAAGATAAACAAGATTATATATATAGATAAATAAAATAAAGAATATATAGGTATATGTATATGCCTAATCTCTATAATTAAGAGTAGTCTATAGGAAATTCTTGTTACTTGTTTATTGAAAACCTTTTAAAAGTTACTAAAAGCCTTATAAATACTGGAGTGTAGAGATTAACAAGATTGTTAACAAGATTTATACTTGTTTAAGAAATGGGGAGTGTTTGAGATTTTAGAGAGTAAAATAGAGGCTAGATTAAAACGGGAGGTAGAAGATTTAGGTGGCCTTGCACTTAAGTTCACCTCTCCAGGAATGGCAGGTGTGCCTGATAGATTAGTTTTACTACCAAAAGGAAAAATCTACTTTGTAGAACTAAAAGCACCTGGGAAAAATTTAAGGCCTCTCCAATTAAAAAGAAAAGAGCAACTGGAAAGCTTAAGCTTTAAAGTTTATGTAATAGATTCATATGAAAAAATAGATGTATTTTTACAGGAGGTGGTTGATTGAAATATAAGCCTTATGATTATCAAGAATACGCTACTCAGTGGATTTTAGATAAAGAAAAAGCAGGATTACTGCTGGATATGGGAATGGGCAAGAGTGTTATTACACTAACAGCTATAGATGAATTGATGTTTGATTACTTTGAAGTATCAAAAGTATTAGTTATAGCACCTCTTCGTGTAGCGGAAAGCACATGGGATGAAGAAGCAGCTAAATGGGATCATTTAAAACATCTAAAAATATCTAAGGTTTTAGGAACGGAAAAAGAAAGAATTAATGCCTTATATACTAAAGCTGATATTTACATCATCAACCGAGAAAATGTGAAGTGGTTAGTAGATAAATGTGGTAAGGATTGGCCCTTTGACATGTTGGTAATAGATGAACTATCCAGCTTTAAATCCCATAGAGCACAAAGGTTTAAAGCCTTAAAAAAGGTAAGGCCCTTTATGAAACGAGTAGTGGGCCTTACTGGAACTCCAGCACCAAATGGACTTATAGATCTATGGTCTCAAATTTATCTACTAGATGGTGGAGAAAGGCTAGGAAAAACCATAACTGGATACAGGGAGAGATACTTCTTACCAGATAAGAGAAATCAGCATATAGTATTCACCTATAAGTTAAAGGAAGGTGCCGAGGAAGCCATCTATGAAAAACTATCAGATATTTGTGTCAGTATGAAAGCAGAGGATTATTTAAAACTACCAGAAAGAATTAATAATATCATACCAATTTATCTGCCAAAGAAGGCAAAGGATAAATATGACCAACTGGAAAGGGACTTATTACTGCCACTTAAAGATTCAGATATTGTAGCAAATACAGCAGGTGTTCTAGCTAATAAGCTACTCCAAATGTCCAACGGAGCTGTCTATGATGAAAACGGAGATGTAAAAGAAATACACAATGCAAAGCTTAAAGCATTAGAAGACAGCATAGAAGCTGCAAATGGAAAGCCAGTATTAATCTTTTATTCCTATAAGCATGATTTAGATAGAATTAAAAAGCACCTAAAAAGAGATGATTTAACAGTTCTTGATACAGCTGAAGATATAAAGAATTGGAATGAAGGTAAAATACCAATTATGCTGGCCCACCCAGCTAGTGCTGGACATGGATTAAACCTTCAAGCTGGTGGAAATATCATCATTTGGTTTGGGCTTACTTGGAGCCTTGAATTATATAGTCAAGCAAACGCAAGACTTTATAGACAAGGCCAAAAGCAAAATGTAATCATCCATCACTTAGTATCCAAAGGTACTATGGATGAAGATGTTATGAAAGCACTTGAAGGTAAAGAAGTAGGACAAGAAGCATTGCTAAATGCAGTGAAGGCGAGGGTTAGAAAGATGGGAGGTAATGAGAATGAACGCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT906477|313334:322148|315320_317267_+|WP_095177260.1|DBSCAN-SWA MKILAIDIETYSSVDLGKSGVYAYTEAEDFEILIIGYAYDDDEVQVIDLASGEKVPADVVEAITNPKVIKTAFNAQFERTCLSKYFKEEMPPEQWRCSMAHALTLGLPTSLAGVARCLNLEQQKMSEGKALIRYFSIPCKPTKANGGRTRNLPHHDKNKWETFKAYCKQDVEVERSIRKRLENYPMTDKELKLWFLDQRINDYGVRVNNELVENAIHCDEIYQKELVDEAIDLTELENPNSPAQLKTWLKDKHGIEVKSLSKAKVAELLDEVDDPIARRVLELRQDMSKTSVKKYETMERAMCKDERIRGLLQFYGANRTGRWAGRLVQVHNLPRNDMSDLDLARELLLAGDYETLELLFDSVPDVLSQLIRTAFIPSPNSRFIVADFSAIEARVIAWLAGEKWRMDVFNSHGKIYEASASQMFGVPVEEIHKGSVLRQKGKIAELALGYGGSKGALKAMGAIDMGLSEEELPELVSAWRKSNSNIVRLWWDVESAAIKAVKERTVVSMQYGLRFYFKSGVLFIRLPSGRSLAYVRPRIEIDERFNKDKLTYEGIEGMKWGRIDTYGGKLTENIIQAIARDCLAESMLRLEKYGYRIVFHVHDEVILDVPKDNGSLEEVEGIMGLDIPWAPGLPLRAEAFESDYYKKD >NZ_LT906477|313334:322148|313615_314776_+|WP_095177258.1|DBSCAN-SWA MGEHALLSASSAHRWLKCSPSVRLEEEVEDNTSIYAKEGTFMHGLGELHLKLFLDDITKAEFNKRLKEMKQNDFYTDEIKKAVEIYVDTVIEKINEARANTYDSLILIEERLDYSPWVKEGFGTGDVLIIADGIIEVIDLKGGKGVAVSAIGNPQMRLYALGAINGFGMLYDTQKVRMTIIQPRLDNISSDEMEVEELIHWGEKIVKPKADEAWKGEGEFKVGEHCRFCKVKAICRARADENIKLACMDFKLPALLTDVEILEVLNQIDELKKWASDVEAYAFNQAVNEGKEWPGFKLVEGRSSRRYSNEDKVAKALLAAGFEEEKIFSKSLLSLTKLEKKLGKKVFEETIGDLIIKPPGKLQLVPEEDKRPAIRSSAEIDFKEEF >NZ_LT906477|313334:322148|320493_320772_+|WP_095178344.1|DBSCAN-SWA MLESKIEARLKREVEDLGGLALKFTSPGMAGVPDRLVLLPKGKIYFVELKAPGKNLRPLQLKRKEQLESLSFKVYVIDSYEKIDVFLQEVVD >NZ_LT906477|313334:322148|320768_322148_+|WP_095177262.1|DBSCAN-SWA MKYKPYDYQEYATQWILDKEKAGLLLDMGMGKSVITLTAIDELMFDYFEVSKVLVIAPLRVAESTWDEEAAKWDHLKHLKISKVLGTEKERINALYTKADIYIINRENVKWLVDKCGKDWPFDMLVIDELSSFKSHRAQRFKALKKVRPFMKRVVGLTGTPAPNGLIDLWSQIYLLDGGERLGKTITGYRERYFLPDKRNQHIVFTYKLKEGAEEAIYEKLSDICVSMKAEDYLKLPERINNIIPIYLPKKAKDKYDQLERDLLLPLKDSDIVANTAGVLANKLLQMSNGAVYDENGDVKEIHNAKLKALEDSIEAANGKPVLIFYSYKHDLDRIKKHLKRDDLTVLDTAEDIKNWNEGKIPIMLAHPASAGHGLNLQAGGNIIIWFGLTWSLELYSQANARLYRQGQKQNVIIHHLVSKGTMDEDVMKALEGKEVGQEALLNAVKARVRKMGGNENER >NZ_LT906477|313334:322148|314777_315314_+|WP_095177259.1|DBSCAN-SWA MKIVTGKVRFSYANVWEPQSVNGSEPKYSVSLIIPKNDRKTLEKINKAIEAAEKEGISRFGSKFTSGSNFRRPLRDGDLDKPDDPAYKNSYFINVNSKIKPGIVDKNVEPILDQTEFYSGCYGRASISSFPYSINGAKGITFGLNNLQKLEDGEPLGGISRPEDDFEAIDDDFDDILG >NZ_LT906477|313334:322148|317305_317641_+|WP_095178343.1|DBSCAN-SWA MLVKPIIYVCSPLRGDVKRNINKAIGYSRYVYVKGGIPLAPHTIFTQFLDDEDEDERNAGIDMGLELLNICDELWAFGDKISEGMLNEIERAKSLGIIVRRFNERCEPLDE >NZ_LT906477|313334:322148|317633_317798_+|WP_169712334.1|DBSCAN-SWA MNRETIKFIKLLKDYRGILPRQTIKTLRGQALAGDIEGAKKGLKKEVSKYARAI >NZ_LT906477|313334:322148|313334_313616_+|WP_095177257.1|DBSCAN-SWA MSKIKLALDVVEDLRSLADSIETLAGAVEGNEPKEKVKDNLPTLEEVRAKLASLSKAGKQAQVRELITGFGVKKLSDIPREKYPELLEKVEVM >NZ_LT906477|313334:322148|317781_320193_+|WP_095177261.1|DBSCAN-SWA MQEPYKLKEPKLKHDGVLTIATGRSRKEMNWKNREMLWSELVDKLSSTIRTYETYEEYKKLSKSKKDEIKDVGGFVGGTLKEGRRKADNVVWRQIVTLDADFVKGDLWAGVETMFGYGCVMYSTHSHSPKAPRLRLVIPLKRAVTSDEYGAVSRRIAADLGIDFFDDTTYEPHRLMYWPSTSSDGEFIFKVLDEEWVDPDEILARYKDWRDSSYWPESSRTKENRKRLAERQGDPKEKPGVVGAFCRTYSIIDVIEKFLSDIYSPCETSNRYTYIPGSSAGGLVIYENGDFAYSHHGTDPISGKLCNAFDLVRLHKFGELDEEAKEGTPVNKLPSYLSMQKLAREDLEVKKTIASERMTSASEDFNEEDWQVNLEINNKGELKNTLTNIILIIRHDPQLNSIFYNELREGVDVEGDVPWKRLKSGWNKTDEASLAGYIDLNYNLYAPGKLKEAVLKVAVERSRHPVKEYLLNLPKWDGVKRVDTLLVKYLGAEDNIYTREATRKTLVAAVARTMNPGIKFDTVLVLNGPQGIGKSTLFSKLGGKFFSDSLSISDMRDKTAAEKLQGYWILEIGELAGIRKIDEETLKSFLSRQDDKFRASYGYSVEDHPRQCIIVGTTNQEAGFLRDITGGRRFWPVKTPGDTKLKPWDIDDVDQIWAEVMEYYHKGESLVLSNEAEKIANAAQVDALESDDREGVVREYLDMLLPTNWDDMDLYARRSFIRGDEFSDNVIGTVRREQVCTMEIWCELFGKEATAMRKIDSYEINAIMRKIDGWEKYTGNKLGNAKVPLYGIQRIYVRCDKQD |
9 | Erysipelothrix_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
325651 : 384014
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT906477|325651:384014|DBSCAN-SWA ATTGAAAACAACAGAAGAATTAAAACTAATTAATATAGATGAGTTGATACCTTATGCAAATAATGCTAGAACCCATAGTAAAGACCAAATTAATAAATTGAGAAGTAGCCTTAGAGAATTTGGTTTTATAAATCCCATCCTTATAGATAAGGATTATAATATCTTAGCTGGCCATGGCAGAGTAATGGCAGCAAGGGAAGAAGGAATAAAAGAAGTTCCCTGTGTGTTAGTGGAACATCTGACAGAGGCCCAGAAGAAGGCATACATTTTAGCGGATAACAGATTAGCTATGGATGCAGGCTGGGATGATGAGATGTTAGCTTTAGAATTAGAAAATTTAAAAGAACTGGATTTTGATATGGACCTTACAGGCTTTGATACTGCAGAAATAGATGAGCTTTTTAGTAATATCCACGATAAAGATGTGCAGGATGATGATTTTGATGTAGATGCAGCTTTAGCAGAAGAGCCTATTTCAAAACAGGGTGATATTTGGCTACTTGGAAGGCACAGACTTATTTGTGGAGATAGTACCAAGGCAGAAATTTATGAGAAACTAATGGAAGGAAAGAAAGCAAATCTCTGTGTTACAGACCCTCCTTACAATGTGAATTATACAGCTGGAAGTGAAAATGAGAGAAAAATTAAAAATGACAATATGGAAGATAAAAACTTTTATGAATTCCTATTAGCTTCATTTAAAAATATATTTAATTCTCTTGATGATGGTGCTGCAGCTTATATATTCCATGCAGATACAGAAGGGTTAAATTTTAGAAAGGCTTTCAAGGATGCAGGATTCCATCTTGCTAATGTGTGTATTTGGGCCAAGCAATTATTGGTATTAGGTCGTTCTGATTATCAATGGCAGCACGAGCCTATTCTTTATGGGTGGAAACCTACGGGAAAGCATAGATGGTATGCAGATAGAAAACAAACAACTATCTGGAATTTTGATAGGCCTACAAAATCAGAACTTCATCCAACTATGAAACCAGTACCTCTTGTAGCTTATCCGATCCAAAATAGCAGTATGAGTAATTGTATTATATTAGAGCCTTTTGCTGGCAGTGGTTCTACTTTAATTGCCTGCGAGCAGTTAGGAAGAATTTGTTATGCTATAGAACTTGATGAAAAATACGCAGATGTTATTGTGAAAAGATATATTGAGTATGTTGATTCTTATGAAGAAGTTTTTATAATAAGAGACGGAGAGAAAGTACCATATAAAGGGCTTATGAAATCTACTAGAAACTAAAATACAAAGTATGTGATTTAGACTTATTTTTATTTAAAATTCTTGAAAATCAGATAAATAAATGATATAATTGCACTAAAATACCCGCACTGCTAATCGTAATGCGGATAATGGGGTGCAATTATGATTGAAAAAGGTGTTATTTACGAAGAATTTAAAAATCGTGGTGGAGTATTAAAACATCAGAACTTAATGCGTTAGGGCTTTCAAGTCGGCAAATAAAGAAACTTGTAGATAGTGGAGATATTACAAGAATTAAACGTGGTTATTATGAACTATCAGATAATATCTATCCAGAAGAAGCTGTAATAGCAAGACTATTTCCAGATGCAGTAATTTTTCTTGAAAGTGCACTGATGCATTATGGATATACAGATAGAATACCTCTAGCATGGCAAATAGCTGTTGATAGAGACAGTGAAAAAAGTCAGTATAAAATTGACTACCCATTAATAGAAGTCTTTTATATTGAACCAAAATTACTAGAAATCGGCTTGGATGTAATTCAAGTAGAAGAGGTAGAGATAAAAATATTTAATCGAGATCGCACTATATGTGATGTTCTTCGCTATGAGAATAAGTTGGAGAGAGAAGTATTTACTAATGCCATAAAGCGTTATATAAAAGATCCAAAGAAAAATGTGAGGAACTTGTTTGAATATGCTAAAGTTTTTAACATTAAGAATAAGGTACAGACATATATAGGAGTGTGGTTGTAATGGGAAATATTGAAGCATCAGTTTTAGCAAGACTAAAAAACAAATCGAAAGAACAAGGCATCCCATTGCAACAACTACTAAATTTATTTTGTCAAGAAGAATTTATTCGAAGACTTTCAGGGAGTAATTATAAAGAAAATCTTATTCTTAAAGGTGGTTTTTTATTATATTCAATTAGTGGATTTACTACAAGACCAACAGTTGATGCAGATTATCTTTTAAAGAATTATTCAAATGATTTAGATGCTATAGAAAAGCTTGTTAAAGAAGTTATTTCTTCACCTAGCAATAATGATTTTGTAGAGTTTAAAATTAGAGGTTTAGAGGAAATTAGTGAGGTTAAAGAGTATCATGGTATCAGGGTCAACCTTACTGGTATTATTGGAAGGACAAAGACACCTTTTAGTATAGACTTTGGAGTTGGGGATATTATTGTACCTTCCCCAGTTGAAAGAACTCTACCAGTATTACTTCCAGAGTTTAAAAAACCTGAGGTATTAACTTATTCTTTAGAATCTACAGTAGCAGAGAAATTAGATGCGATTATATCTTTAATGGAAGCTACAGGTCGTATGAAGGATTTTTATGATATATATTATTTAGCAACAACATTTGATTTTGAGGGTAGGAAACTTCAAGAAGCAATATATGAAACATTATCTAATCGAGGCACACCATATGAAAAGGACTCTGTTGCTGTAATTGCAAGACTTACTAAAGATAACCAAATTCAAAAGAGGTGGGACAATTTCTGTAAAAAAATATTAAAATATGAACTTGATTTTACTGATGTAGTTAATATAATTATTGATTTTACATTACCACCATATGAGTCAATGGTTGATGAAGATGAATTTTTTAAAAATTGGAGCTATAAAGATAAAAAATATATTTAATAAAAGGTAGGCCTTTATTAGCCTGCTTTTTTTATATGCAATTATACGATATAATCCTTGCAATTCCCTGTGTTTAGAGTGATATATGTAAGTAACCTAAATACAGGAGGGATTGAAATGGATAGAAAGGAAATGATAAAAATCTTAGGTGAGTACTTAGGTGTGAAGCCTAGGTATCTAGGAGCACCAAGTTTTCACTACCAAATAGAAACACCTAAAGAAACTTACATCATAGATAGGGAGGGAAGGATTATGACATCTGATGGAACAGAAGTAGAATTTGAAGAACTGCTAGCTGGGCCTGAAGATATAAATCAAGCTGAAACAGCAGAGCCTGAAGAAGAAATTAACTATGAACTTGAAATACCAATGGATGGTCACAGTGGTAAGACTTTAAGAAACATCATTAACATAATTCACAGCAAACAGCCTCTTATAAAGAAATCTCTAGGCTTGGAAGAAGACTTAGTTGATAGTGACTTTGTTAAGAAGCTCAATGAAGAAGATATCAACAGCATAGACAGTTTTGAAAGAGCACTTAATAGAATTGGAGGAGACAAGGGCCATCCTGGAATTAAGTTTAACTTTAAAGAAAAGACCTTCACCTTTAAACATAATGGCACTGAATCTGCCATCTGGCTATTTGCAGGAATAAACAAGCAAGCTAAAAGACAATCTTATGCTTCAGCCATAGTAAGTCCAATGGAAAATGAAAAGTACACATTTAGGTCTTGGCTTAATAGACTTGGACTTTCTGGTGATGAGTACAAGGAAATTAGAAAAGAGCTTCTTAAGAACCTATCAGGAAACTGTGCCTTTAGAATTCCAAAAGAGAAGGTGAAGAGACATGAAGCCTAAATGCAAACTAATCGGTGAAGATGGAAATATATTTAACCTTATGGGAATAGCAGGAAGGGCACTTAAAGAAGCAGGACAGAAAAAAGAAGCAGATGAAATGGTGGATAGAATAACAACAACAGCTAAAAGTTATTCAGAAGCTCTAGCTATAATCTCTGAATATGTTGAAATACATTGAAAATACTGTGTTTAATTGAAATATGACTTGCTATTTATCCCTTTTAGAGTGATATATATACACAACGAAAACACACTGAAAGGAGATAAAACCATGGCAGAGAGAGATTTTTTAAAAGGAAACTTTGGAATTGAGATTGAACTAACAGGAATTACAAGAGAAAAGGCAGCAAAAATTGTGGCAGAGCATTTAGGGGGAAGCATTCAAAAACAGTATGATTACTACGATAGCTACAAAGTTACTGCACCAGATGGAAGGGATTGGAAGATTATGTATGACGGAAGCTTGAGATGCCAAAGAAAAGTAAATGGGCAAAAGGTTGCAGCAGGAAGAGAATACAGCGTAGAGCTAGTAAGCCCAATCCTAACCTACGAAGAAGACATTGAAACTTTGCAGGAGATAGTAAGAAAAATCAGAAAGGCAGGAGGTTTTCCAAACTCAACAGCAGGAATACATATACACCTAGATGGGGCTGACCATACACCAAGAAGCTTAAGAAACTTTGTAAACATCATCTACGCTAGAAACGATTTGCTTTACGATAGCCTACAAATTGAAAGGGAAAGGATGCGTTACTGCAAGAAGATGGATAAGGATTTAGTGGAAAGAATGAATAAGAAAAAACCTAAAACCTTCAAAGAAATCGAGGACATTTGGTACAAAGGCTACGGCTCCAGTAGAGATAGACACTACCATGAAAGCAGATACCATTTCCTAAACCTTCACAGCTTTTTCAATGGAGTAGGAACAGTAGAGCTTAGGGGATTTAACGGAACCCTTCATGCAGGAAAGATTAGAAGCTACATTGTTTTGGCTTTAGCAATAAACAATCAAGCCTTGACCCAAAAGAGTGCCAGCACCAAGAAGCCACAAATTGAAAATCCAAAGTTTGCAATGAGAACTTGGCTAAACCGAATAGGACTTATCGGGGATGAATTTAAAAACTGCAGAGAGCACTTAACTAAACGCCTAGAAGGAAGTGCAGCTTGGAGATTTCGAAGAGCCGCATAGAGAAACCTAAAAATAGCGGCAGGCCCAAGAGCCACAGAGGGGGAAACCCCTCTTAAGCTGGTAGAAGGACTCCCTCACTT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55 | Paenibacillus_phage(25.0%) | capsid,holin,tail,portal,transposase,integrase,terminase,protease,head | attL 358200:358216|attR 363778:363794 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
481087 : 491459
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LT906477|481087:491459|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LT906477|481087:491459|487028_488663_+|WP_095177366.1|transposase|DBSCAN-SWA MSHEFLTNELDENTKALIEKMENEINEKDKELSSKDEEIRKLKNELEFLKGVISNRNRKIFGASSEQVDVNQLSFFNEAEKHSDSKVEEPTLEEITYKRAKKSNYTGKKDNLANLERVVVEHKLEGEDLNCRECGKKLTPIGVKSRKEIVKYIPAKLIIEDHVIYSYACKTCERATGESKIISPEAPKTIFYNSMASNELIAHTLILKYQHAMPLYRQETYFDMMGATLSRQTLCNWTMSAADALEPIYNHMKKELLSRNYIHADETTLKVINDNGKDSKSKKYMWLYMSNTNSKPVILYDYQSTRSSSCPKNFLGDFKGFLQTDGYNGYNSVSGATRVYCLAHIRRYFHNIIVDLDEEALKNSRAIIGFNYCEQIYKLEKELRESYSNDENYYDIRFKIRTEKLAPIIDNFIDYVEREIKDALPRSPLGKALEYAKKHLPGLKNVLLDGSLEVDNNAAERAIKPFVIGRKNFLFANTAKGATASSNIYSIVETAKANNLVVERYLVYLFDNLSKIDIYDSESLENLMPWNDKIPENMKIKDKK >NZ_LT906477|481087:491459|482677_483187_+|WP_089865214.1|DBSCAN-SWA MKKGYIAGKLFKQGDIRQRLYEEEILKKEISNVKWHNPINDPEANDKSKAPTAETIFKNDCKKVLESDYIVAELDDEDSGTIAELFIAWTVNYFYKLFEEGYTLEEIKEKIPYKDIYCHLSDIRQDSKGYEGIRLPWGINQFVIGGLINDGKIMRNFEEIVEDISSKEK >NZ_LT906477|481087:491459|481087_482674_+|WP_095177362.1|DBSCAN-SWA MISTNNISLRYGGRVLFEDVNVKFTPGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEANKGDVIIEPGKRMAVLKQDHFQFDSEPVLETVIMGHQRLYNIMKEKEEIYSKPDFSEEDGIKVAELEGEFTELNGWEAESEAATLLTGLGIPVELHNKLMKDLDGAQKVRVLLAQALFGKPDILLLDEPTNHLDIKSIQWLEEFLINFENTVILISHDRHFLNKVCTHIADLDFGKIQLYVGNYDFWYESSQLALEMAKDQNKKKEEKIKELEEFIARFSANASKSKQATSRKKMLDKINLEDIKPSSRRYPYVAFKPDREAGNDLLTVEGITKTIDGEKVLNNVSFRVNKGDKIAFVGENSIAKTALFQILMGEEEADSGEFKWGITTSQSYFPNDNSKYFNGVNLNLVDWLRQFSEEKSETFIRGFLGRMLFSGEEALKSAEVLSGGEKVRCMLSKMMLSGANVLILDEPTNHLDLESITAVNNGLINFPGTILFTSHDHQFVQTIANRIIEITPDGIIDRQMTYDEYLNRSC >NZ_LT906477|481087:491459|485679_486147_-|WP_095177363.1|DBSCAN-SWA MAFAYCPIQGGPLAPSIRGMVYFADVPGGCNVCININGLPPYKPASGNNSPIGPHGFHIHEFGNCSIGDPNDPFKAAGGHWNPTNQPHGNHAGDFPVIFSNNGYSSMCFFTNKFKVRDIIGKSIIIHESPDDYRSQPAGNSGRRLACGVIQGSTW >NZ_LT906477|481087:491459|488877_489996_-|WP_168943748.1|DBSCAN-SWA MAMLFLIFISIIVILSFLTPVKEFSSSENRMLEQKPKISLSLIANGKFTKNFEKYISDQFPLRDFWIGVKSNVDKSIGKKESNGVFLGKDGYLLQDFKTPNSKILDETVKSINTFAESNKNVNTYFMMAPTSIKVYEDKLPNFASTEDELKYINIMKEKLDESVSFIPIYKTLNSKKHEYIYYKTDHHWTTNGAYYAYKTLGKYMGFTPLKKDYFNIKDLSNNFLGSLYSRGGFRNINPDTIQAFVPKNIENIDYEVWYSDTNKTLNSFYNKEKLNEKDKYAVFFDSNHPLVKVKTKVNGAINDKKLLIIKDSYANCLVPFLTSHYGEIYMVDLRYYDKNINDLIQSEGIEDALILYNINTFFEDASITNIM >NZ_LT906477|481087:491459|483945_485502_-|WP_089865223.1|DBSCAN-SWA MSILSVENLTHGFGDRAIFNDVSFKLLKGEHIGLVGANGEGKSTFMNIITGSLEPDEGVVEWSKRVRVGYLDQHTVLKSGTTIGEFLKTAFQYLFDLEKEMNEICNKMGTASPDELELLLEDMGTIQDILTNNDFYIIDAKIDEVARGMGIADIGLDKDVHDLSGGQRTKILLAKLLLEKPDILLLDEPTNYLDEQHIQWLKRYLQDYENAFILISHDIPFLNSVINLIYHMENGELNRYVGNYDEFLKVYEAKKQQLEAAYKKQQQEIQDLKDFVSRNKARVSTRNMAMSRQKKLDKMEIIELPKDKPKPEFNFKQGRTSGKMLFETKDLVIGYNEPLSKPLNLYMERGQKIALVGANGLGKTTLLKSILGEINPISGETTLGDYLSIGYFQQEIKKANYNTCIEEVWADFPSFTQYEVRAALAKCGLTTKHIESKVCVLSGGEQAKVRLCKLINKETNFLVLDEPTNHLDVDAKEELKRSLKCYKGSILLICHEPEFYEDIVDDVWNCENWTTKIV >NZ_LT906477|481087:491459|483318_483867_+|WP_089865217.1|DBSCAN-SWA MLDLEVILEDIIKFGAQYAKSFELQDVEFDNKIRNYCKENLCGHYGTNWMCPPGVGEIEDLKKEVMKFKKGIIYQTIHPVKNIRDRKETDVIRDRHNNFTRELTENLREKYSNLEFFPMGAGPCELCTTCGYLKGKKCIYPQKAISSAEAYGINLGSLLKSCGLEFNYSDDTLAYVGVLLIK >NZ_LT906477|481087:491459|490046_491459_-|WP_089865232.1|DBSCAN-SWA MVFSSLVFIFVFLPITLFIYYLSPKKLKNLVLLISSLIFYAWGEPIYIFLMIFTTVFSYVSAILIDKYKSKKTSSLAIFILSVAVNLSVLCFFKYYGFFIDNINNLFSMNIKFKKLPLPVGISFYTFQTLSYIIDVYLKKVPVQKNIISFSTYVTMFPQLVAGPIVKYGDINKQLENRKESLDKFGDGVSYFIRGLSKKVLLANNIGLLWSNVKALSPDKISVFSAWLGILAFTFQIYFDFSGYSDMAIGLGKFFGFDLMENFNYPYISKSVTEFWRRWHISLGSWFREYVYIPLGGNKKGALKQYRNLFIVWFLTGFWHGANWNFIIWGLYFGILITLEKIFVLKWLDKLPNFISHVYALIIIIVGWAIFEFENTSVLFSFIKTMFGMGSNTFIDNQSIYYLYTNLFLFILAIIFSTPLPKKLFEKLICNVKFKPYAKLIVPTIYLILIFLCTTYLVNETYNPFLYFKF >NZ_LT906477|481087:491459|486262_486595_+|WP_095177364.1|DBSCAN-SWA MYKKLDNDAWEEYLNKFNSVKDTITVKDFCAENNLNKSQFYYHKKRVEKAIESKEPVFQPISLNSKVDNTKENKSTLKEVKINVGNANILIPVSEATLITAIIKELILKC >NZ_LT906477|481087:491459|486588_486939_+|WP_095177365.1|DBSCAN-SWA MLNIDKVEKVYLACGYTDLRKSIDGLVMIVQNQFKLDPFDKALFVFCNKKMDKLKILHFDEGFWLYYHRLEANRFKWPATAADALKINIDELRWLLKGYEVRTKSKFKPVKASNYY |
10 | Tupanvirus(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
884160 : 973003
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LT906477|884160:973003|DBSCAN-SWA 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66 | Bacillus_phage(15.0%) | capsid,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1257279 : 1269810
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LT906477|1257279:1269810|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LT906477|1257279:1269810|1265591_1266920_-|WP_095177776.1|DBSCAN-SWA MKKTIVKDFKEEYVLLASLFKWLLISVFIGAIVGGATSFFIKLVHVSTNFSYGFKYYYLLMPLGFFLSSFIVTKLAPDAKGHGTEKAIESINRYDGKMDIKVVPVKLLTTVITLACGGSVGLEGPSTQIGAGIASKVSDIFKLKDLDSKRLAVCGVASGFVGVFGSPVGAAIFASEVLYIGQFSYISLFPSLIAAFTSFFVGKFLKTKPLITYFIDMKKFSGSRMLMRMILFGIIIGVLSVIFIRFVTFVEKLFEKIKVYPPIKGIIGGVLIILIIFITGTTDYLGIGEEIINKAVMGYSVRPTDFIWKSIATAITLGSGGSGGILTPMLFVGAVIGNLWASVVSGSVTFYAAVGMVAFMATCANTPIAGIVMCMELFGSEVGIYAAVVCVVGYLIVGHKSIYPTQILAKSKTPSLYIDTNSEIFKAEKNIKVKNKFFKKEN >NZ_LT906477|1257279:1269810|1263311_1263530_+|WP_095177774.1|DBSCAN-SWA MGGFNCASPEELSFIANIIALELSAGKSADELNVLGNLIVAIGSLMLVMAAQKQNLESLSKDNNNKKRGSSS >NZ_LT906477|1257279:1269810|1267071_1267326_-|WP_089866655.1|DBSCAN-SWA MNLMDYIMEQVLVLVPALYILGMMLKNTEKIKDWTIPWILLTCGIACCIAIMGFSIQAILQGIIITGVAVFGNQLVKQTTEKRD >NZ_LT906477|1257279:1269810|1259775_1260126_-|WP_095177365.1|DBSCAN-SWA MLNIDKVEKVYLACGYTDLRKSIDGLVMIVQNQFKLDPFDKALFVFCNKKMDKLKILHFDEGFWLYYHRLEANRFKWPATAADALKINIDELRWLLKGYEVRTKSKFKPVKASNYY >NZ_LT906477|1257279:1269810|1260119_1260452_-|WP_095177364.1|DBSCAN-SWA MYKKLDNDAWEEYLNKFNSVKDTITVKDFCAENNLNKSQFYYHKKRVEKAIESKEPVFQPISLNSKVDNTKENKSTLKEVKINVGNANILIPVSEATLITAIIKELILKC >NZ_LT906477|1257279:1269810|1268364_1269810_-|WP_095177777.1|DBSCAN-SWA MNIKKRLIISNSIIVIVPIIITTIIMSSILFVSLKITGNRVEYDEFERRMFIESELITITDDILEQENKNIEEDKFQSDLSSKLSKINGKFVIIKSHKIIAKPEDVSKIDVEKSMEISKGNNMGMGKKIKINNTSHIIKTIKFNLKDKSEGIIILLVPIEEEKINLLTKFIIVSTVIFIISFVITNMIMSYFLSKSIIKPIKSLKKATTEISNGNLDCAISEEGDEEIRELCRGFETMRVQLKDSIIMKMKYDDNRKGLISSISHDLRTPITSIKGYVEGILDGIANTAEKREKYLKTIYSKAEHVDHMIDDLLLYSKLDLNQIPFNFEKVDIVEYFDYCIYESEPELQKDNIKIWLNNELKTCKFVMMDRERLKRVILNIIGNSQKYMDKEQGEIVITLRETTSSIIIEIRDNGAGINNEDANKIFDRFYRTDEARSGAKGSGLGLAIAKQIVEGHNGRIWAISHGNEGTSIMISLNKVF >NZ_LT906477|1257279:1269810|1262680_1263169_-|WP_095177773.1|DBSCAN-SWA MVKSSKEKNIGLLLLIIIFIQGVGFLSGRLGMSNQNTYNDFVKPSFSPPGWIFPIVWGILYFLMALAFYRIIIKGKQGENINKSVIYFIIQLTLNFLWAIIFFRFKLYGFAFLELLILLVFILLSIFEFYKLDKIAAYLMIPYAIWVSFAGILNCAIWILNR >NZ_LT906477|1257279:1269810|1263549_1265424_-|WP_095177775.1|DBSCAN-SWA MAVKQFRAESKRLLDLMINSIYTNKEIFLRELISNASDAIDKRYYRSLTDENISFNKEDFYIRILPNKEERTLTIIDTGIGMTMEELENNLGTIAKSGSLAFKNEMEQKEGIDIIGQFGVGFYSAFMVADKIIVKSRSMDSNEAYKWESKGVEGYEIEKCEKDEVGTEIILKIKENTDDENYDKFLEEYTIKNLVKKYSDFIKYPIKMHMKKSKLKEGTKDEYEDYIEDETLNSMIPIWKKNKNEVKTEDYERFYMDKHFGYDKPLKSIRSKVEGLVSYTLLLFIPSTTPYDFYTRNFEKGLELYSNGVLIMEKCGDLLPDYFSFVQGLVDSEDLSLNISRELLQHDRQLKLIAKNIKEKIKSELLSMLKNHREDYIKFYNNFGRQLKYGIYSDFGANKDTLQDLIMFYSSTEKKLVTLDEYISRMKEDQKYIYYAPGENIDKIEKLPQTEMVRDKGYEILYLTDEVDEFAIKMLMNYKEKEFKSVYSKDLGFEAEEKDDQKENDENKEIFEFMKDVLNGKVKEVRASKRLKSHPVCLANASDISIEMEKVLSMMPNNENIKADKILEINTNHDMFNTIKSAFKDDKDKLKMISNLLYNQALLIEGLPIEDPVQFANDVCKLIK >NZ_LT906477|1257279:1269810|1267629_1268328_-|WP_089866558.1|DBSCAN-SWA MKKILIVEDDLSIAELQKDYLEISGFQVKICTDGVCGLNEIKENEYDLIILDVMLPKMDGFDILRIIQENKDVPVLMVSAKKEEIDKIKGLSLGADDYITKPFSPGELVARVKSHIQNYERLKNKFSNKEKNNNVISIRGLEIHKDSRQVFINGKEVSLAQKEFDLLLHMAQCPNRVFGKDELFESIWGLDSLGDSATVTVHIRRIREKIEFNPSKPQYIETVWGVGYRIRV >NZ_LT906477|1257279:1269810|1257279_1258020_+|WP_147269573.1|DBSCAN-SWA MAIVLTDLEKYIGYHNANEFTLDLSEGKSIKGIKTIEDCIKNKKDISDSVPPEVYGRTLKTLFTPIYGVNNEVIGTLSSGIDFENNSKLVESVSNLAEVIKQITESINQVAQSAGSLADSGQDSIEKVNELTNKQKDTAQILQIIKNIASQTNLLGLNAAIEASRAGENGRGFAVVATEVRKLSEQSQESVKNIEAILKEMTDSVNDINNTIGNVGAISQEQAAATEGKRQSFSTFNNSKNSIKIS >NZ_LT906477|1257279:1269810|1258051_1259686_-|WP_095177771.1|transposase|DBSCAN-SWA MSHEFLTNELDENTKALIEKMENEINEKDKELSSKDEEIRKLKNELEFLKGVISNRNRKIFGASSEQVDVNQLSFFNEAEKHSDSKVEEPTLEEITYKRAKKSNYTGKKDNLANLERVVVEHKLEGEDLNCRECGKKLTPIGVKSRKEIVKYIPAKLIIEDHVIYSYACKTCERATGESKIISPEAPKTIFYNSMASNELIAHTLILKYQHAMPLYRQETYFDMMGATLSRQTLCNWTMSAADALEPIYNHMKKELLSRNYIHADETTLKVINDNGKDSKSKKYMWLYMSNTNSKPVILYDYQSTRSSSCPKNFLGDFKGFLQTDGYNGYNSVSGATRVYCLAHIRRYFHNIIVDLDEEALKNSRGVIGFNYCEQIYKLEKELRESYSNDENYYDIRFKIRTEKLAPIIDNFIDYVEREIKDALPRSPLGKALEYAKKHLPGLKNVLLDGSLEVDNNAAERAIKPFVIGRKNFLFANTAKGATASSNIYSIVETAKANNLVVERYLVYLFDNLSKIDIYDSESLENLMPWNDKIPENMKIKDKK >NZ_LT906477|1257279:1269810|1260707_1262501_-|WP_095177772.1|DBSCAN-SWA MKKLKSLKKILCLVFCLTLVTSLIGCQSKDDKKGISFKPGTYQGTSKGHNGELKLEVTVDKESIKEIKMLEHKETPGISDPAIERIPKAIINDQSLAVDTISGATVTSHAIISAVTNALKQSEVDMEALKVKKEKKEVSRKAVEHNTDVVVIGGGGAGLAAAVSANQKGAKVILVEKMPRLGGNTILSGGAFNAVDPKRQKAQGIEDSIDKHYTQTYEGGDKLGNPELIRTLVENAYPAVEWLEGLGMKFNDKVFTVLGGMWPRAHKPSSPVGTGFIDTYSKYIDKNDGIKVLLDTEATEIIMKDGKAVGIKAKGLEENLTIHAKNGVVIAAGGFAGNSKMVDKYNKTWPSLTKVKSTNHPGATGDGIVLAEAVGANLVGMENLQLLPMGDPNTGSLSGNIEQGVENRIFVNKSGKRFVDEGARRDVMTKALLEQEDAYMWVVLDHKNYPTPETTNNFNETIEELIEQGRAFKADTLEELAKKIKVDPANLVKSVEEFNKAVDSGKDSFGRTLFDKKIDTAPFYAGPRMPTVHHTMGGIEINKNAEVLGKDGKVIPGLYAAGEVTGGIHGSNRLGGNALADITVFGKIAGENAAKAK |
12 | Leptospira_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1307109 : 1314134
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LT906477|1307109:1314134|DBSCAN-SWA GTTATCTAAAAAAATCTTTTAAGAAAAAAGATTTTTTTAAGATAGGTACCTTATAATTATTCTTTGCTACAAGATTTTCTGTAAATATGAGTTTATCTTCCTTAAATACATTTATGCTTCCAATTTTATCTCCCTTGTATACATTATTGTTTATTTCATTGGGTACATTAATTTTTACATTATATTTAACTCCTTTTTCTGTCGGAATTATTATATCTTCTTTGCATATAACTTCCATATCTTTTTTATCTTTAGGAGCTTTAGCTAAAACTTCCCCTTTAGAATACAATTTTTTATATTCATAATTTTTCTCAACATAATTGTTTATTTTTATAGTCTCTTTCCATCTCCCTGGACAATTAAAAAGCACTATTATTACTTCCCTTCCTGAAATATCTACAGAACTTACAAGACATTTACCAGCCCCTCCAGTGTATCCTGTTTTAACTCCTGTAGCATTTGGAAGCTGCCAAAGTATTTTATTTATATTATGGTAATCCCTTGAAAAACCATACTTTCCTTTGCTAATATCTTTTGTGCTAACTATTTCATGAAATAGAGGATGCTTTTTACTTTCTGATGTAAGTATAGCTAAATCGTATGCTGTTGAGTAGTGTTCCTCGCTATCTAATCCATGAGGTGAACAAAAATGGCTATCAATAAGACCTAAACTTGCTGCATATTCATTCATAAGTTTAACAAATTCTTCTTGGCTACCAGCTACTCCCTCTGCTATTGCTATTGCTGCATCATTTCCTGATCTAAGCATTAATCCAAATAAAAGTTCCTTTAATGATATCTTCTCTCCTTTTTTATATCCCACAACAGATCCTCTTATAGATGCTGCTTTAGGAGATATTTCTACCATTTTATCTAATTCTCCATATTTTAAAGTTACTAAGGCTGTTAGTATTTTAGTAGTACTTGCCATGGGCATAATAATTTCTGAATTTCTTTCTGCTAAAACTACCTTAGATTCAGAATCCAAAGCTATATAGGCTCTAGCATTTACATTTAATTTATTTTCTTCTTTATTTAATTCTGAATTTGCTAAAACTCCATAAGTATTTATATTTATAGTAACTATAAAGCATATAAAATATAAAAGTATTTTTTTTAACCTCACCTACAATACACCTCTTCTTATTATTGTTTTTATATAAATTTTATTGATCATTAATTTATTATTCCACATTTTTGTATATTTTTTCTCCGTTGGGATATAATTTCTAATATTATATGGAGGATGAATTTTATGTACATAGCTCTTATACTAATATTATCTTTAATCATTCTTTTATTTATTCCTATTCCAATAAAAATTTACATAACATATTGGGAAAATACCTTGTCTTTAAAAATAGGTAATAAAGTATTTTCTTTAGATAGATTAAAATTAAAAGATATTAATAAAAATTTTTCTGCGGAAAAAATAAGAAAAAAAGAAAGTAAACAAAAACTTTCTTTTAAAAGTATTTTAGGATATTTAAAAAACACATCCTCAAAACCAAAATTAAAACTTGAAATAGATTTAGACTATGGCTTCGAAGATGCATATGTAACTGCTGTTTCTTATGGAATATTTTATTCCATTTACCCCGTTATTTTAGGAGTAATGACTCCTTATTTTACTATAAAAAAAGAAAACCTTAACATAAAACCTCATTTTAACAAAAGAATATTTACTTTTGAAATAAAGAGTATATTTTTCATGAGTATAGCTAAAATTATGTATATATATGTTTATTTACTTATAAAGTAATAAATTAAAAAGGAGGTAATACATAGTGGAAAATCATCCAATAGAAAATTTAATGCAAAACACTATGGAAAACATAAAAAACATGGTAGATGTAAATACCATTGTGGGAAATACAATTCTAACTCCTGATGGGGCTTCCATTATACCTATTTCTAAAGTTTCCTTCGGATTTGCTTCCGGTGGAAGTGAATATAATTCTTCTGTTAGTTCAGATTTAGGAAAATATCCCTTTGGTGGGGGTTCTGGAGCAGGAGTATCACTAAAACCTGTAGCATTTTTATTTATTAAGTCTGGTTCTGTAAGGCTATTACCTGTAAACCAAACAAATCCTTACGATAAAATAATAGATACGGTACCACAACTTGTAGATATGTTTAAAGATGTGTGTAAAAATAAATCTTCCTCAAATAATCAGGAAGATTCCCAAGACTCCATTAATATTGATGATATTAATGAATAAATCCCTTTATATAAAAAATATAGCTTTAGAAATCACCTTCTAAGGCTATATTTTTTATATAGTAAATAACTACGATATTAAACTTTATCTTAACGATTCTTATCATAAAAAGCGATATTTAGCGCAGCAAACGAGCCTTGAAAATAAAGTTAAATTTTTTCAGAGCAAAGCGAAGAAAAATATCCTTAATTGTTCATTATTAATTGTTCATTCTTCAAAGCTTTTCCTCTTCAAACTCCTCTAAAAACTCTTCTAAACTTGGAAGTTCTTTTATGCTTTCCAAACCAAAATGTTTTAAAAATTCTTCTGTAGTACTATATAGTATAGGTCTTCCTGGCACCTCTAATCTACCTGTTTCTTTAATTAAGTTCTTTTGAATTAAGGTTTGCAGTGCTCTATCACTTTTAACTCCTCTAATTTCATCTATATCTACCCTTGTTACAGGTTGTTTGTAGGCCACAATAGATAATGTCTCTAAAGCTGCTTGAGAAAGAGATTGGCTATTATTAGTTTTTAAAAGTTGTTCTATAAAAGAACTATTTTCTTCTTTTGTAACTAATTGATATTTCTTTTCTATTTCTATTAGCTTTATGCCTCTTTTTTTATTATCATATTCTCTTATCATTTTTTCTAAAATCCCCTTAGTTTCTACAACATTTAATTCTATTATTTCACTTACATCTTTTAAACTTAAGGGTTCTCCACTGGCAAATAAAAGAGATTCTATTATTGAAAAAAATCTTAATTCATCCTCTTCATTAATAATACAATTCATTTGTTCCATTATCTTCTATCCTTTCTAAATAGATTTCTTTAAAATTACCTTCTTGAACTACTTTAACTATTTTTATTCTTATTAATTCTAATAAAGCTAAAAAGGTAACTATAACTTCTCCTTTGCAGCTACACATTTTACTAATTTGAGAAAAAGATAAATTTTTATTCTCTATTATTTTATTTTTCAAATATTCCATTTTATCTTCTATTTTAAATTCATCTAATTCTATTTTGTCTGGTATTGTATTGTTCAAATTTATTTTATCTTTATAGTTAGTTATTAGTTCATTATATAAATTGTATAATTCTAATATAGTTATATTTATAAAAATATCTTTATCCTCTTCTTCTTTTTTTTCAATTATCTCTGGTTTCTTAGAATATACTGTAAAACCTTTTTCTAATCTGCCTTTCAAATAACTAGCTGCATTTTTAAACTTTTTGTATTCTATTAGCTTGTCCAATAATATTTTTTCTGGATTTTCTTCTGATAAATCATCTTCTTTTTCCTCTTGAATCTTAGGCAGTAATTCTCTAGACTTTATTTGAAGAAGAGTTGAAGCTATAACTATAAATTCAGAGGTTACTTCTAAATCCATTTCCTTTAAATTTTCAATATACTCCATATATTGTCCAGTGATTTCTGATATCTTTATATTATATATATCTAATTGATTTTTCTTAATTAAATGAAGTAATAAATCAAAAGGTCCCTGAAAATTATGTATTTTAATCTGTAATTCCATATGATCCTCCTGTAGTTTTCTATTTTAAGTTTTAAAAAACATTATGATAGCCTACTAATAGACTATCATAATCTTTATTAAACCGCATTATCAAAAATATTTCTGAAATTATGCAACATATTATCTAATATACCTGATTTTTTTATATCTCTATCAGAATATAATTTAACTTTACCTACTAATTTGTCCCCTACATACACTTCACAATGCCCTACTACTTCTCCTTTATTATAATATTTTTTATCTAGGTTTACTATAGGTTTTTTAGTAATTTTTTCTTTAGAACCTCTCTCCACTACAATATCCAAATCTTCTAGCGCCTTAGCTATAAAAAATTTATCTTCTCTTTTACCTAATTTTACTTGTTCTACTTCACTATCTTTTTTTATAATTTTTTTATTTTCAAATTTGGAAAAACCATAGTTCATAAGATTAGAAGCTTCTTTATTTCTTATTTTATAATTAGGTGCACCCATAATTACCGCAAGTACTCTAACTCCATCTCTTACAGCAGTAGCAGATATACAGTATTTCGCTTCACTAGTATAACCTGTTTTAAGTCCATCGCAACCTTTAAAAAACCTAACTAATTTATTGTGGTTAACCAATCCTATAGGGCTTTTTCTTCCTTCCGAAATTGTTTCCATATATGTTCCCGTATATTTTAACACTTGAGGATGCTTTAAAAGCTCTTGAGACATTAATGCTATATCATAAGCCGTTGTTACATGCCCTTCTTCTGGAAGACCAGAACAATTTTTAAAATTAGTATTTTTCATTCCCAATTTTTTTGCTCTATCATTCATAGCTTTTACAAAAGCCTCTTCGCTACCCTCTAAGTACTCTGCCATGGCAGTAGCAGCATCGTTACCTGATGCTATAGCTATGCCTTTTAATATTTCTTCTACAGTTCTTATTTCTCCCGTATCTAATAGCATACTGCTATTACCACCCTGACCATTTTTCTTAGCATTTTCACTTACAGTAATTTTATCTGTTAATTTTATCTTACCTGAATCTACAGCTTCCATTGCAAGTAACATGGTCATAATCTTTGTTACAGAAGCTGGTGGTAGTTTTTCATTGGCATTTTTTTCGTATATTATCTTACCAGAATTAGGTTCCATTAATAAAGCTGATGATGCCTCCACTTGTATTTCCCCTTTATCTTCTCCCTCTGCTCTTACCCTTACTGGTACCGCAGTGCACTGGAATATAAAAATTAAAAGTATGGTAAATATAAATATCTTTTTAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LT906477|1307109:1314134|1310088_1310853_-|WP_095177797.1|DBSCAN-SWA MELQIKIHNFQGPFDLLLHLIKKNQLDIYNIKISEITGQYMEYIENLKEMDLEVTSEFIVIASTLLQIKSRELLPKIQEEKEDDLSEENPEKILLDKLIEYKKFKNAASYLKGRLEKGFTVYSKKPEIIEKKEEEDKDIFINITILELYNLYNELITNYKDKINLNNTIPDKIELDEFKIEDKMEYLKNKIIENKNLSFSQISKMCSCKGEVIVTFLALLELIRIKIVKVVQEGNFKEIYLERIEDNGTNELYY >NZ_LT906477|1307109:1314134|1312372_1313188_-|WP_095177799.1|DBSCAN-SWA MNLEKILESVEFVKSEINITPEIGVILGSGLGDLAEEIEDKVTVKYEDIPNMPKSTVTGHKGQYVFGKYKGKNVVMMQGRIHYYEGHPMEILSLPIHIMKYLGAKTLLVTNAAGGVNESFNPGDLMIITDHINLAFNNPLIGENNEKIGPRFPDMSNVYDKNLVKLAEDTAKDINVDIKKGVYCMMTGPTYETPAEVRMVRILGGDAVGMSTVPDAITAKHCGMKVLGISCITNMAAGILDQPLNHKEVIETSNKVKNIFINLVGNIIERV >NZ_LT906477|1307109:1314134|1313219_1314134_-|WP_095177800.1|DBSCAN-SWA MFEGYDKVNIRTRDELINKYISYLMNKGLSKNTLDAYIRDINRFLEFLKERKENILEVEEVTIMAFVQFLQKSRKANSSIVRNIVSIRNFYKFLYKKGYIDEDPVINYEIPKVKRNIPKVLTVEEVDILLNAPDISKEKGIRDKAMLEVMYATGVKVTELLNMTVFDVNLKLSYIKCTGSKDKERIIPIGSYAVKCLDDYLRIRPNINIYNLDYLFLNLKGTQMTRQGFWKIVKKYAKISGIKKSIDSYTLRHSFAVHLLQNGADIKSVQELLGHSDLAATQIYSTISKKSKIAEVYRKAHPRA >NZ_LT906477|1307109:1314134|1308895_1309330_+|WP_089865059.1|DBSCAN-SWA MENHPIENLMQNTMENIKNMVDVNTIVGNTILTPDGASIIPISKVSFGFASGGSEYNSSVSSDLGKYPFGGGSGAGVSLKPVAFLFIKSGSVRLLPVNQTNPYDKIIDTVPQLVDMFKDVCKNKSSSNNQEDSQDSINIDDINE >NZ_LT906477|1307109:1314134|1308363_1308870_+|WP_157726549.1|DBSCAN-SWA MYIALILILSLIILLFIPIPIKIYITYWENTLSLKIGNKVFSLDRLKLKDINKNFSAEKIRKKESKQKLSFKSILGYLKNTSSKPKLKLEIDLDYGFEDAYVTAVSYGIFYSIYPVILGVMTPYFTIKKENLNIKPHFNKRIFTFEIKSIFFMSIAKIMYIYVYLLIK >NZ_LT906477|1307109:1314134|1310930_1312118_-|WP_095177798.1|DBSCAN-SWA MKKNKKIFIFTILLIFIFQCTAVPVRVRAEGEDKGEIQVEASSALLMEPNSGKIIYEKNANEKLPPASVTKIMTMLLAMEAVDSGKIKLTDKITVSENAKKNGQGGNSSMLLDTGEIRTVEEILKGIAIASGNDAATAMAEYLEGSEEAFVKAMNDRAKKLGMKNTNFKNCSGLPEEGHVTTAYDIALMSQELLKHPQVLKYTGTYMETISEGRKSPIGLVNHNKLVRFFKGCDGLKTGYTSEAKYCISATAVRDGVRVLAVIMGAPNYKIRNKEASNLMNYGFSKFENKKIIKKDSEVEQVKLGKREDKFFIAKALEDLDIVVERGSKEKITKKPIVNLDKKYYNKGEVVGHCEVYVGDKLVGKVKLYSDRDIKKSGILDNMLHNFRNIFDNAV >NZ_LT906477|1307109:1314134|1307109_1308234_-|WP_089865065.1|DBSCAN-SWA MRLKKILLYFICFIVTININTYGVLANSELNKEENKLNVNARAYIALDSESKVVLAERNSEIIMPMASTTKILTALVTLKYGELDKMVEISPKAASIRGSVVGYKKGEKISLKELLFGLMLRSGNDAAIAIAEGVAGSQEEFVKLMNEYAASLGLIDSHFCSPHGLDSEEHYSTAYDLAILTSESKKHPLFHEIVSTKDISKGKYGFSRDYHNINKILWQLPNATGVKTGYTGGAGKCLVSSVDISGREVIIVLFNCPGRWKETIKINNYVEKNYEYKKLYSKGEVLAKAPKDKKDMEVICKEDIIIPTEKGVKYNVKINVPNEINNNVYKGDKIGSINVFKEDKLIFTENLVAKNNYKVPILKKSFFLKDFFR >NZ_LT906477|1307109:1314134|1309544_1310117_-|WP_089865056.1|DBSCAN-SWA MMEQMNCIINEEDELRFFSIIESLLFASGEPLSLKDVSEIIELNVVETKGILEKMIREYDNKKRGIKLIEIEKKYQLVTKEENSSFIEQLLKTNNSQSLSQAALETLSIVAYKQPVTRVDIDEIRGVKSDRALQTLIQKNLIKETGRLEVPGRPILYSTTEEFLKHFGLESIKELPSLEEFLEEFEEEKL |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1661476 : 1669141
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LT906477|1661476:1669141|DBSCAN-SWA TTTAATAAAACAATCTGTCCCAAGTAGATATCCCTACAATTCCATCTACCATAAGGCCATTATCTCTTTGAAAATTTTTAATAGCATTAAAAGTAGCGGTACCAAAATATCCATCAGCTCCATAGGAACCAACACTATATCCATTTTCTATTAAATTTTCTTGAATGATTTTTACATTATTATCTTTAAAATTAGCATTAATTTTAATTAAATAGCCAGGATAATTTTTATAAGGACAATTTATGTCCTTTATAAATTCTCTTCTTATTTCCTCCAAAGGATAGTTTCTTCCTGGACAACTTGTTGAGTTAAGTTCTCCATGGCCATAGATTTCTTTTATTCCATATTTGATACATAGATATTTAATAAGTTCTATTAATGAATTTTTTTGATTTGATGGCATATATTCTATCATGTAATTTCCTTCTACACATATTCCTATAGATATGGAATTATAATTTATACAATGAGCTCCTAGAGAATTTTCAGGTCTACCCCTATATACACTTCCATTTTTTCTTACTAAGTAATGATACCCACATCCGGACCAGCCATTATGTAAATGCGAAATATGAATATCTTCTATACTACAGTTTGTAGCAGCTGCATGGTGTAAAATTATTTTTATTGGATTATTGCCATAGGTTAATCCTCTAAATTTTAAATTAGAATCTATAACATTCATGAAATCCCTCCATTTTTTAATGAACAAAGATTTTCTGTAGCAAAGCGGAAGAAAATCCTCCTTAATTGTTCATTGTTCACTATTAATTATTCACTAAATAAAGCTCTCACCCAAAAGTGAGAGCTTTATTTTACGCCTTATAAACTTCATTAACTGTTCTTTCTACTATTTGAGCAGAATCCTTTGCAACTAAAGGATCATTTAATTTGAAAGCTGATTTCTTAGCTAATATAACATCCATAAGAATGGATATTTCTTCCTCAGTTAAGTCATCTTTTATTTCAGTTATAGACATATTAACTTTTTTACCTTTTTCATCTACAAACTTCATAACTAATGTCTTTTGCATTATCTATTCCCTCCTTTATTTTATTCACCTAATAATAAGTTCTTATTTACTCTAGATATAGATACCATAGGATCCTTTAAAACTTCTGCTGCTGCTTGTCCTATTGCATATACATCTTCATCTGTAGCAAGTACATCAAGCTTGAATAATGATTTATTCTTTCTTTTTTGCTTACCTTTTTCATCTAATCCAAGATCCAGTTCTAAAACTAGGCTAGTTGCATAAATGTCTTTTGTTATAGCCATGTTTATTACCTCCTTTTATTTTGTATTTCACCTATATATATGACATATTAATAAAGTTTGTAGTAAAATTTAAAATGAAAAAGTGAGAAAATCACTTTTCTAAGATTTTCTCACTTTTTTGGTGTTCTGAAGCAGTTTCTATAACCTTTGTAAGAACCATAAAAGCTTTAGTTAATTCTTCTAGCCTTTGATCAAGTCTTACTAAAAGATAAGTAGTTACCGCTACGGGGAACCCTACATTACTTATAAGCATTATAATTTCGTCAAACATGTTCCCACCACCTTTGCAGCTTAGAGCTACTATCTTTATATATGTTCTTTAAGTATCCTTTGCAGTTTTTTTATTGCTTTATCTTTAGCATAACGAATTTCATTATAGCTTTTGTTGGTAGTGGAAGCTATCTCCCCCATAACTTTATCTTTTATGTAAAAACTACCTATGATATATCTTTCTTTGTCGGAAAGCTTGTCCAAAGCATTATATAATTCTTTTACTTTTTCATAGGCTATTATTTCATCTTCTAATGTAAATAAATAATCATTATCTGTTTTATTTAATATATATTCATCTGGAATCTCTCGGTAATGCTTTATCTCCCCTTTTAAAAGGGCTTTATAGTTAGTTTTTATAGCTTTAATACAATAAGGGGTAAAATTATTATCATTCCCTTTATACATATTACAAGCTTTTATAACAGATAAATATCCATGTTGTACTAAATCTTCAAAGTCATAGCATTTAATTTTATATCTAGCAGCTTCTTTAAGTATTAATGGCTTAAATTTCTCTATTATTTTTTCTAATACCATAGTATCTCCATCTTTATACTTTTTAAATAGCTGTTCCAATGCTAAATCACCTCACCCTTTACCATTATTATACATTAACTCTATTATATTTTATATCTATTCAATTGTTTATTTCTTTAGAGAATGGGAATAATCGAGTTGAGGTGATAAATTGAAATATAATATATCTTATAAACTCCATTTGAAAGTTATAATTGTATCAATATTTTTTTGTATATCATGTTATGATTTTGTTGAATATACAATACTAGATTTTTGCATAAATATAATAACTCATAACCATATTTCTATCCTTTTACTTTATACTTATGCAATATTAACTATGGGATTACTATCGATAGTACATGAACTTATACATGGCTTAACTTATAAATTATTGGGTGGAAAGGTTACATATAAATTTAGAATACTATATTTAGCTACTCAAGAGATCTCTGGAAAGGCACTAGCTATATATAAATTTGCTATTGTATTATTAGCTCCTTTTATAATAATATCTTTAGGTTCTCTATTATTTCCCACATGGATAAGTAATTTTTTATTGATTGTTAATTTTATATCCTCTTTAGCTGATATTTTAATGACTTTAGAACTTATAAAATATCCTAGATATAGTAAAATTATTGATAGAGATTACGGATATGATATCATCTTTTAATTTTTATTACATCCAATCATGTTTCTTTAATCCCATCCTAAGAGTTTTCTTTCTAACTCTTCAAAATTATACTCCCTTTGACCCTCATAATCCCAAGCATCACTATCTTTTTTACTTCTTTTATTCTTATTTTTCTCCCATTCCATTTTGTATTTTTGTACCTTTTCCGGTGTATCTACTTTTTTATCTATCCATGTATTAATTATTTTTTCTATATATTTTATAGATTTAGCATTATAACTTATAGCTTCCTCTATGGCTGAAATAATAACATCACAATTTATCTTCTCACCCCATTCTAAGATTTTTTTATGTTCAAATTCTGTAGGATTATATACATTATTTTTAAAAAATAATAATACATCTCCCACATTAGTATCAGCTCCATCATTTCTTATTTCTATTACTTCTTCTTTATTATTTGTTATTTCTTCTTTATTACTTATTACTTTATTACTCCCTATATCCTTACAAGCACCTTCATAGTCCCTTATATCCTCCTTATAAGAGTCTTGTTTTAAAGTTCCTATATTTAAATCCTCTACTCCAAAAAACAATTTATGCATATCTAATTTTAAATCAGAATACTGTTTGTATAAAATAATTATAAATTCCTTATTTTTTACACTTTTAATTTCTTTATTAACACATTTTATTGCATTAGGATTACTTGGGATGTTATATTTAGCCCAATTTATTATCATTATTTCTTTTGTTTTATCACAGTAGCTTATTTTATTATATTCTTCAAATCTCTTTAACAACTTGTCTACAGTTTCTCTATTATATCCTGTATGTGTTTCTATAATTCTTTTAGGAAGTTCATAAATACCACATTGTGTAGTGTGAGAGTTGCTTATTAAATAAAGATAAAAATATTTTTCCTCTGGTGTAAGATCAAGTACAAAAGCATCGCTCCAAAATTCTGTGTGTATCTGTCTATACTTGGCCATTTTAAAATCTCCTTATTCTATATTATTTTTTAAATTTAAATCTTTTATATTATCGAGATCTGACAAATCCTTGCCATCATAATCTCTCAAAAATCTTATTAATGTTCCTTTGGTTATTTTAAGCCTCCCAAGTTTAAGTGCTATTAAAATTCCTTTTCTAATCAAATCATATACAGCATTTTTGTTAACTTTTAAAATTGTTGCTACTTCTTCTACAGTATATAAATATTCTTCCATAGCTATCTCCTCCGAATTGTCAAATTTAAAATTTACTTAACTTATATAGGAAATATGTCCTTAACATTGACGCCATAGGCTTCAGCAATGGATATTTGACTATCTTTCCTAGGATAGTTCTTTCCTTTCTCCCAACTCCAATACATCTTTTGATTAGTTTTACATTTTCTTGCCGCTTCTTCTTGCGTCCAATTATTAATTGCTCTAAAAACTTCAATTTTTTTATTCCAAGATAAACTACTGATTATTTTGCTAATATCCATATTAAAACCTCCACATCCTTTTTAAACGTGTTTTACGTTAACCATAATGTACCATAAATACCTATATTTTTACAACCCCATTTAATTGCGATTATTGTTTAATTTTTCGTGAATTTTCAGATTAGTTTAATCTTTCTTCATTTAACTGTAAATGACGTTCATTAGTAGACTATTTCACGTTAAACAATTGACTTTATACGTTATTTACGTTACAATATGTAATAATAATTTTATTTTAGGGGTGGTTTAAATTGGCACTAAGCAAAAAGCAATTGGGGAATTTAGTTAAAGAAGCTAGGAAAATAAAATCCCAAATGCTTGGAAAACGATATACCCAACAAATGTTAGCAGATGATATAGGTAAATCTCAAAGTTATATTGGAGATATAGAATCTGGGAGAACTTATCCAAGCTTCTTAGTTTTAAATGCTATAGCAACAGCTTGTGAAGTACCTATTGGATACTTTCAAGATGAAAATAAAGTAGATAATGATATAGACAATTTTATTAAGATTCACTTTAATAATTTAGATGCTTTAGAAATATATGCAATAAGGGAAGAAATAAAAAAAGATCCAGATGCAAAAATTAATCATATATATGATTCTTTAAACAAAGATAATTTATTAAAGGAGACTGTTTCATTAAATACTCCAGAAAATTTAATGAGAATGTTATTAAGTAATCCTGTAATAACAGATTTTTTACAAATTGATATAAATGAAATGACAGAAAAAGAAATATTAGATTTCTCAAAAGAATCATTAGAGCAGTTAAAACTTATTAGCTATAAATATAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LT906477|1661476:1669141|1662290_1662509_-|WP_095178000.1|DBSCAN-SWA MQKTLVMKFVDEKGKKVNMSITEIKDDLTEEEISILMDVILAKKSAFKLNDPLVAKDSAQIVERTVNEVYKA >NZ_LT906477|1661476:1669141|1663745_1664222_+|WP_169712361.1|DBSCAN-SWA MKVIIVSIFFCISCYDFVEYTILDFCINIITHNHISILLLYTYAILTMGLLSIVHELIHGLTYKLLGGKVTYKFRILYLATQEISGKALAIYKFAIVLLAPFIIISLGSLLFPTWISNFLLIVNFISSLADILMTLELIKYPRYSKIIDRDYGYDIIF >NZ_LT906477|1661476:1669141|1664248_1665175_-|WP_095178005.1|DBSCAN-SWA MAKYRQIHTEFWSDAFVLDLTPEEKYFYLYLISNSHTTQCGIYELPKRIIETHTGYNRETVDKLLKRFEEYNKISYCDKTKEIMIINWAKYNIPSNPNAIKCVNKEIKSVKNKEFIIILYKQYSDLKLDMHKLFFGVEDLNIGTLKQDSYKEDIRDYEGACKDIGSNKVISNKEEITNNKEEVIEIRNDGADTNVGDVLLFFKNNVYNPTEFEHKKILEWGEKINCDVIISAIEEAISYNAKSIKYIEKIINTWIDKKVDTPEKVQKYKMEWEKNKNKRSKKDSDAWDYEGQREYNFEELERKLLGWD >NZ_LT906477|1661476:1669141|1662845_1663025_-|WP_095178002.1|DBSCAN-SWA MFDEIIMLISNVGFPVAVTTYLLVRLDQRLEELTKAFMVLTKVIETASEHQKSEKILEK >NZ_LT906477|1661476:1669141|1662529_1662754_-|WP_095178001.1|DBSCAN-SWA MAITKDIYATSLVLELDLGLDEKGKQKRKNKSLFKLDVLATDEDVYAIGQAAAEVLKDPMVSISRVNKNLLLGE >NZ_LT906477|1661476:1669141|1665453_1665675_-|WP_095178007.1|DBSCAN-SWA MDISKIISSLSWNKKIEVFRAINNWTQEEAARKCKTNQKMYWSWEKGKNYPRKDSQISIAEAYGVNVKDIFPI >NZ_LT906477|1661476:1669141|1665926_1666481_+|WP_095178008.1|DBSCAN-SWA MALSKKQLGNLVKEARKIKSQMLGKRYTQQMLADDIGKSQSYIGDIESGRTYPSFLVLNAIATACEVPIGYFQDENKVDNDIDNFIKIHFNNLDALEIYAIREEIKKDPDAKINHIYDSLNKDNLLKETVSLNTPENLMRMLLSNPVITDFLQIDINEMTEKEILDFSKESLEQLKLISYKYKK >NZ_LT906477|1661476:1669141|1663060_1663603_-|WP_095178003.1|DBSCAN-SWA MEQLFKKYKDGDTMVLEKIIEKFKPLILKEAARYKIKCYDFEDLVQHGYLSVIKACNMYKGNDNNFTPYCIKAIKTNYKALLKGEIKHYREIPDEYILNKTDNDYLFTLEDEIIAYEKVKELYNALDKLSDKERYIIGSFYIKDKVMGEIASTTNKSYNEIRYAKDKAIKKLQRILKEHI >NZ_LT906477|1661476:1669141|1667782_1669141_-|WP_095178010.1|DBSCAN-SWA MRKGKEYELNIEEIEFPSVGIAYHEGLKVYVKHGIPGQKVLARITTKKKDHAKGKIIEVLEDLPYKIEAKCPVFGQCGGCAHQDIPYEKQLEIKQHEIKELFKKANLYGFEFLPIEGSPKQYEYRNKMEFTFGDLEKGGELTLGMHVKGKSFGIISADECKIVDEDFRNITKTTLNYFRKKKLPHYKIMAREGYLRNLVIRKAENTGEILINLVTTSQIDFDLDEYKDIIKNLNYKGNLVGILHTINDSFSDVVQCDKLNILYGRDYIMEDILGLKFKITPLSFFQTNSKGAEKLYSIVRDFIGESKSKTVFDLYCGTGTIGQIVAPEAKKVIGIELIEEAVKSARENAKLNNLNNCEFIAGDIAQVIKEIKEKPDVIILDPPRPGVHPKALEYVIKFNAPTIVYVSCNPKTLVEDLKVLVENGYAIEKVKSMDMFASTPHVETVVRLSKQK >NZ_LT906477|1661476:1669141|1665187_1665412_-|WP_095178006.1|DBSCAN-SWA MEEYLYTVEEVATILKVNKNAVYDLIRKGILIALKLGRLKITKGTLIRFLRDYDGKDLSDLDNIKDLNLKNNIE >NZ_LT906477|1661476:1669141|1661476_1662160_-|WP_095177999.1|DBSCAN-SWA MNVIDSNLKFRGLTYGNNPIKIILHHAAATNCSIEDIHISHLHNGWSGCGYHYLVRKNGSVYRGRPENSLGAHCINYNSISIGICVEGNYMIEYMPSNQKNSLIELIKYLCIKYGIKEIYGHGELNSTSCPGRNYPLEEIRREFIKDINCPYKNYPGYLIKINANFKDNNVKIIQENLIENGYSVGSYGADGYFGTATFNAIKNFQRDNGLMVDGIVGISTWDRLFY >NZ_LT906477|1661476:1669141|1666563_1667703_+|WP_095178009.1|integrase|DBSCAN-SWA MKGSVRKKGNRWYYSFYVGTIDGKRKRIERAGGDTKKEAEKALRDALLEFENVGSVLNESNISVADYFDYWFNEYVVINCKYNTQLNYRRIIDNHIKPALGIYKLKTVTPAALQEFINKKYINGLAKNTISGFYGVLSGALRMAVYPYQLIKENPMQYVNMPKYDDAKKEKNYLRMITLDQFNRIINRFPQGSSFHIPLQIGFNTGLRAAEVCGLTWDCINFDEQTLTVEKILLKKEREWIFGTPKTKSSNRTILIGKTLYDILKRHKKWQIENKLKYGTHYTESNFICTKENGQLVTPDTLKYLSRVVNYELAIDFSFHSLRHTHATMLLESGANIKDIQHRLGHSKLATTMDVYSHVTKTLSEDSVARFESIISSLK |
12 | Clostridium_phage(50.0%) | integrase | attL 1662236:1662258|attR 1677546:1677568 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1685917 : 1693786
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LT906477|1685917:1693786|DBSCAN-SWA ATCATACATTTTTAATTATTTTAATTGCTTCTTCTAAAGACATGCTTTCTTGATTACCTGTTTCCATATTTTTAACACTTACTTTTTCTTCTTTTAACTCATCTTCTCCAATTAATATTACATAAGGTATTTTTAATTTATCTGCATAAGCAAATTTTTTACCTATTTTTGTATCTTCTAAATATAACTCTGATATAATTTCATTTTCTCTTAATTTATTGGCAACCTTTATTGAATATTCCATAGTATCCCCTACAGGAATAACTAATACCTGTGAAAGTGTTGATGATGCATTTTCTCCTATTATTTTTGCTTCTCTTAATTGATAAAATAACCTTGTTAATCCTATAGATATACCTACACCTGGTAACTTTTGATTGGTATAGTGTTCAGCCAAATTATCATATCTTCCACCAGAACAAACACTTCCTATTTGTGGATAATTATTTAACACGGTTTCATAAACTGTTCCTGTATAATAATCTAATCCTCTAGCAATAGTTAAATCTATTTTATAATTTTCATCTGGAACATTAAAGCTTTTTATATAGTGTATAATTTTTGCTAATTCTTCTACTCCTTCTTTAAATACATCATTTTCTATGTTTAGTTCTTTTAAGCTTTTTATTACATCTTCTTTTGAACCCTTTATATTTATAAAATTTATTATTTTATCTATTTTTTCATCTTCCAAGCCTAATTCTTGTAATTCTTTTCTTACTCCAGATTCCCCTATTTTTTCAAGCTTATCTATAGATCTTAGCACACCTTTTCTATCTTCTACATCTGTTCCTTCAAAAAATCCATTTAGAACTTTTCTATTATTTATTCTTATAGTAAAATCTTCAAATCCTAATTCTTTAAAAGTTTGATATATGATACTTGGTATTTCTGCATCATTTATTATGCTCAAACTACCATTACCTATAATATCTATATCACATTGATAGAATTCTCTAAAACGTCCCTTTTGATTTCTCTCTCCTCTAAACACTTTTGATATATGATATCTTCTAAAAGGAAAGGTCAAATCTGAAAAGTGTTGTGCTACATATCTTGCTAGTGGAACAGTTAAATCAAATCTTAATGATAAATCTGTGTTTCCTTTATTAAATCTATATATTTGTTTTTCGGTTTCCCCTCCACCTTTAGCTAATAATATTTCTGACTTTTCTATAGTAGGTGTATCTAAAGGGATGAATCCAAACTTTTCATAATTATGTCTTATTGTATCCTTCATTTTGTTAAAAACTATTTGATCAGCCGGCAATAATTCCATAAAACCTGGCAATATTGATGGCTTTACAATATCCTTACTCATATATATCCCTCCGTTGCTTTAGTATGATAAACTATTAATATTTTAACTTAATTTAATAAGAAATTCAAATATTTTCTAGTAAATTATATCCCTTAGCTTAATATTATAGCATACAATTTTTTTTTATGAATAGCAAAGTAAAGTGGTAGCTAAAATATTTCAACCACCACTTTACTTCTAATATCTAAGTTTTCCAATATCTTTTCTAAAATACATACCGTGAAAATCTATTTTATTCATTTCTTCATAGGCTTTATTTATACTATCTTCTAATTTATTTTCTACAGCATAAGTACATAAAACTCTTCCGCCATTGGTTATAAGATTTCCTTTTTTAAATATTCCTCCAGCTACAAAGGAGTTAACTTCTTTAGACATGTTTATTTTAAAGCCTTTTTCATACTTTCTTGGATATCCTTCTGATACTGCTACTACACAGCAAGAGTGAGCTTTTTTCCACTTTAAATCAAAAGAAGAAAGTTCATCATTTAAAGAAGCCTCTATAAGCTCTACTAAATCACTATCCATTAGAGGTAATACTACTTGAGTTTCTGGGTCTCCCATTCTAACATTATATTCTAAAAGATAAGCTCCTTTTTTAGTTATCATTATCCCAAAAAATATTATTCCTTTATAATCGAAATTTTCTTCTTTTATTCCCTTTAATGTTGGTTTTAATATATTTTCATTAAAGTCTTTCATAACTTCTTCAGTAACATATGGATTTGGGGCAATGGCACCCATACCTCCTGTATTTGGTCCCTTATCTTCATCATAAATTTGTTTATGATCCTTTGATGATATAAATGGTAATATAACTTTCCCATCAGTTATAGATAAAATAGATGCCTCTACTCCTACTAAAAACTCTTCTATTACTACTTTTTTACCTGCATCACCAAACATATCTTCTACCATGAATTTTGTTATGATATCCTCCCCTTGGGAATAATTTTCACATATAACTACTCCCTTACCTGCTGCTAAGCCATCTGCTTTTATTACTATTGGATAACTACATACTTTTAAATACTCTAAAGCCTTATTTTTTTCATAAAACACTTCATAAGCAGCGGTTTTTACTCCATATTTTTTCATAAAGTCCTTTGAAAAAGACTTGCTTCCTTCTAAAGCTGCTGCCTTTTTACTAGGGCCAAAAATCTTTAACCCTCTTTCTTTAAAAATATCTACTATACCATTTACTAAAGGTACTTCTGGTCCTACAATGGTTAAATCTACTGCATTTTCTTCTGCAAAATCTGCTAAAATACCTATTTGTTCTATATCTATATTTTCACATTTATTCATTAAAGCTGTACCACCATTTCCTGGTGCACAATATATTTTCTCTACTTTAGGATTTTGTGCTACTTTCCAAGCTATTGCATGTTCTCTTCCGCCACTGCCAACTATTAATATTTTCAAACTTAACACCTCTTTTATTCAATTAATGCTTAAAATGTCTAATTCCTGTAAATACCATGGATATTTCATTTCTATTGCATTCTTCTATAGAGTCCTTATCTCTAATAGATCCCCCTGGTTGAATTATAGCTTTTATTCCATATTCTGAAGCTTTTTTAACTACATCATCAAAAGGGAAAAAGGCATCTGAAGCTAAAACTACTGAGCCATTACCTCTTTCTAACGCCTGACATGCCGCCCATATTCTATTTACTTGTCCTCCAGCAATTCCTATAGCTTTCTTATCTTTAACAACTACTATAGCATTAGACTTTACATATTTAACAACTTTCATGGCAAAAATCATATTTTCCATTTCTTCTTCTGTTGGTTTTTTTGCTGTTACTACATCTATATCTTTTATAAGAGTATTATCTGTGCTTTGAACTAATATGCCTCCATCTACTTTGCAAACCTCAATTTTATCTGAGGGTTTAGTATTACACTTTATAATTCTTAAATTTTTCTTTGCTTTTAATATTTCTAAAGCATCATCATCATAGTCTGGGGCTATTATTACCTCTAAAAATATTTTAACAAGTTCCCTTGCAGTTTCCTTATCAACTTTTCTATTAAAAGCAACTATTCCTCCAAATATAGATACTGGATCGCATTCATAGGCTTTTTTATAGGCTTCACATAAAGTATTTCCTATAGCTACACCACAAGGTGAATTATGCTTCAATGCACAACATGCTATTTCCTCAAACTCTCCCACAACCTTCCAAGCAACATCCATATCTTTTATATTATTATAAGAAAGATCTTTTCCATTTAATTTTTCAAAATCCTTAAAAGCTCCACCTTCTGTAAGAGAAGTATAAAAAGCTGCTGTTTGATGAGGATTTTCTCCATATCTTAAATCCTTATCTTTTTTATAACTTAATGAAAGATATTCTGGATATTCTTCTTCTAACAAAAATTTACTTATAGCTCCATCATAAGCTGACATTAAATTAAATACTTTTCCTGCTAAAGTCTTTCTAGTATTAAAATCCACTTTTCCTTCTTTTTCTAACTTTTCTTCTATATTTTTATAATCCTTAGGATCTGTAATTACTAATACATCTTTAAAGTTTTTAGCCGCTGCCCTTATCATTGTAGGTCCACCTATATCTATAAATTCTATTTGTTCTTCTAGAGATAAACCTTGTCCTATTTTTTCAAAGAAAGGATATAAATTTACTACAACCATATCTATAGGTGCTATATTTTTATTTTTGATTGTATCCATATGCTCTTTGTTATCTCTTATAGCTAGTATTCCACCATGAATAACTGGATGTAGGGTTTTTACTCTTCCATCTAATATCTCATCAAAATTGGTTATTTGAGATACTTCTGTTACCTTTACCCCATTGTCTTTTAGATGTTTGTAAGTTCCCCCTGTGGATATTATTTCCACATTATTTTTTTCTAAAAATCTAGCAAACTCTAATATACCTTCTTTATTGTATACACTTATTAAAGCTCTCTTAATCAAGTTTATGTCCCCCTTACTTATGAATTCTAACTTTTCTTCCTTCTATAGCTATTTTACTATCTATAAAAAGTTTTATAGTTTCTGATAAAGCTTTATGCTCTTCTATTAATACTCTTTCTTGAAGAGCTTTTGCATCATCATCTTCATGTACTTGAACTATCTTTTGGCATATTATAGGCCCCGTATCTGTACCACCATCTACAATATGCACAGTGCAACCTGAAAATCTTACACCGTATTTTATAGCTTCTTCGTGAACCTTTATGCCAAACATTCCTTTGCCTCCAAAAGATGGCAATAATGAAGGATGAATATTTATTATTCTATCTTTAAATACTTTTAAAATATCTCCTTCTAATATAGAAAGCCATCCTGCAAGAACTATTAAGTCTACTTTACCTTCTACAAGATTTAATATTTTAGAGGATAGTTTTTTACCTTGTTCTTTTCTATCTACTATGTAAGTTTTTATATTATTTTCTTGGGCTCTTTTTAGAGCATAAGCTCCCCGTCTATCACTTATTACCATATCTATAGTACAATTTAAATTACCTTGTTTTATATTATCTATAATACTTTGTAGGTTTGTTCCCCCTCCTGACACCAATACTGCAATTTTAAAGCCTTCTGCCATATGCACTCTATCCCTTCTTTACTCCCTTTTGTTTAAACTATTTTATGATAACTTTTCTTTCTCCTTTTTCTATATGTCCTATTTTATAAGCTTTTTCACCTTGCTCAATTAATTTTTCTATAACCTTTTGTTCATAGGAAGGATCTACACATATTACAAAGCCTATACCCATATTAAATACATTAAACATATGCTCTTCTTCTACGCCCTTTGAAATTATATACTTAAATATATCAGGTCTTGGGAATGAATTTTTATTTATTACTGCATTTAAATCATCTTTAAACATTCTTGGAATATTTTCATAAAACCCTCCTCCAGTTATATGAGCCATTCCCTTTATTGGATAATTTTTTAATAATTCCAATACTGGTTTTACATATATTTTAGTGGGAGTTAAAAGTTCTTCTCCTATAAATTTCCCATTAAACTCTTCCTTAAAATCCTTTATAACATTTCTAACTAAAGAATATCCATTACTATGGACTCCTGAAGATGCAATTCCTATTAAAACATCCCCTTCTTTTATATCTTGTCCATTTACAATATTTTCTTTTTCTACAACTCCTACAGCAAAGCCTGCAATATCGTATTCTCCTTCTTTATAAAATCCAGGCATTTCTGCAGTTTCTCCACCTATTAAAGAACATCCTGCTCTTAAACATCCATCACTAACGCCCTTTACTATATCCGCTGCTACTTCACCTTTTAATTTTCCACATGCCATATAATCTAAGAAAAATATAGGTTGAGCTCCATGACACAATATATCATTTACACACATTGCCACACAATCGATTCCTATAGTATCATACTTTTCTAACTCAAAAGCTATTTTTAATTTAGTACCAACTCCATCAGTACCTGATACTAGTACAGGATTTTTATATTTTCCAAGCTCATACATAGCTGCAAAACTGCCTATACCATTTAGCACACCTTTATTAAAAGTTTTTTCTACATGTTTCTTCATTAAACTTACTGATTTATATCCCTCTTCTATGTTTACCCCTGCATCTTTATATGTTGCCATCACTATCTCCTCCTAAATTTATTCCCTAGGTATTGATACTGGATATTCTCCACTAAAACATCCTAAGCAAAATTCTTTTTTACAATCTTTACATTCTAAAGCTTTTGTAAGTCCTTTAATACTTAAATAACCTACACTATCTGCGCCTATCATTTCTCTTATTTCTTCTAAATTGTAATTAGATGCCATTAAATCTTCTTTGTTAGGTGTATCAATACCTAAATAGCAAGGAAATTTAACCATTGGTGATGCTACTCTAAAATGAACTTCCTTTGCTCCTGCTCGTCTTAGGGAACTTATAAGTTTTTTACTAGTAGTTCCTCTTACTATAGAATCATCTATAATTACAACTCTTTTTCCTTCAACATTATATTTTAATGGATTTAATTTTACCAAAACTGCTCTTTCTCTCATTTCTTGTGAAGGTTGTATAAAACTTCTTCCTATATATTTATTTTTTATAAAACCTATGCCATAAGGAATTCCTGAAGCCTTTGAATATCCTATAGCAGCAGGTATTCCTGAATCCGGAACCCCTACTACAATGTCTGCTTCAGCAGGACACTCTTTATAAAGTTCTTCTCCAGATTTAACTCTGTATTCATAAACGCTTATATTGTCAATATTACTATCTGGTCTTGCAAAATATATATATTCAAAAGCACATATACTTCCTCTTGTCTTTTCTGCAAATCTTAAACTCTTTAATCCATCTTTATCTACAACTACCATTTCTCCTGGTTCTACATCTCTTATAAACTCCCCACCTATAGCATTTATAGCACAACTTTCAGAGGAAATAACATAACTATCTTCAAGTTTTCCTATGCAAAGTGGTCTTATTCCTTTAGGATCCCTTAGCCCAATTAATTTGTCCTGGGTCATTAAAAGCATTGCATAAGATCCTTTTATGCTTTGAAGTGCTTCAATTAAAGCATCTTCTATATGTTTTTTGTTTGATCTAGATATTAAATTTAATACCACTTCTGATTCTACACTAGTCTGAAAAACAATTCCTGCCTCTTCTAAAAGCTCTTTTATTATTTTTGCATTCACTAAGCTTCCATTGTGAGCTACAGCAATAGATCCTAGTTTAGATTTTCCAAGTATTGGTTGAACATTATCTAAATCTCCATTTTTACAACTTGAATATTTTACATGGCCTATACCACATATTCCCTTAAGCTTATTTAACTTATCGTAATTAAATACATCTCCAACAAGTCCTGTTTTTTTATGTAATATTAATTTTTCTCCATTAGATACTACCATTCCCGCACTTTCTTGTCCTCTATGTTGTAATGCAAATAATCCATAATAATTTATTATCCCTATTTCCTTTTCTTCACCAGTAAATATTCCAAAAACTCCACATTCGTCTTTAAATTTATCTTCTTTAATATTATTACATTCCATAATCTCACCTATCATCCATTAAATTTTTATCTTTTTATTTTATAATATTATACCTTCTTCATTTTCATCAATAAATTTTTTTTTCATATTTGTTCTATAATTAAGCATTTTAATTTTTAAATCTTCATATTTTAATGATAAAATTTGAACTGCTAACATACCAGCGTTGTAGCCATTATTTATACCTACAGTTGCTACTGGTATAGATTTTGGCATCTGAACTATGGAAAGTAATGCATCCATACCATTTAATGAAGCGTTGATAGGAACTCCTATGACTGGAATTATAGTTTTAGATGCTATAACTCCAGGAAGATGGGCAGCAAGTCCTGCACCTGCTATTATACATTCGTAATTGTCTTGTTCTAATTTTTTTAAAGTTTCATCTAATTTTTCCGGTACTCTATGGGCTGAAAGTATATATGCTTTGTATTCAATATCAAATTCTTTTAATGCTTTTGCAGCTCCACTCATAACTTCTTTATCGGATTTACTGCCAAATATTATAGCAACTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LT906477|1685917:1693786|1690197_1690818_-|WP_089867714.1|DBSCAN-SWA MAEGFKIAVLVSGGGTNLQSIIDNIKQGNLNCTIDMVISDRRGAYALKRAQENNIKTYIVDRKEQGKKLSSKILNLVEGKVDLIVLAGWLSILEGDILKVFKDRIINIHPSLLPSFGGKGMFGIKVHEEAIKYGVRFSGCTVHIVDGGTDTGPIICQKIVQVHEDDDAKALQERVLIEEHKALSETIKLFIDSKIAIEGRKVRIHK >NZ_LT906477|1685917:1693786|1691869_1693282_-|WP_169712363.1|DBSCAN-SWA MIGEIMECNNIKEDKFKDECGVFGIFTGEEKEIGIINYYGLFALQHRGQESAGMVVSNGEKLILHKKTGLVGDVFNYDKLNKLKGICGIGHVKYSSCKNGDLDNVQPILGKSKLGSIAVAHNGSLVNAKIIKELLEEAGIVFQTSVESEVVLNLISRSNKKHIEDALIEALQSIKGSYAMLLMTQDKLIGLRDPKGIRPLCIGKLEDSYVISSESCAINAIGGEFIRDVEPGEMVVVDKDGLKSLRFAEKTRGSICAFEYIYFARPDSNIDNISVYEYRVKSGEELYKECPAEADIVVGVPDSGIPAAIGYSKASGIPYGIGFIKNKYIGRSFIQPSQEMRERAVLVKLNPLKYNVEGKRVVIIDDSIVRGTTSKKLISSLRRAGAKEVHFRVASPMVKFPCYLGIDTPNKEDLMASNYNLEEIREMIGADSVGYLSIKGLTKALECKDCKKEFCLGCFSGEYPVSIPRE >NZ_LT906477|1685917:1693786|1688684_1690184_-|WP_095178017.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVYNKEGILEFARFLEKNNVEIISTGGTYKHLKDNGVKVTEVSQITNFDEILDGRVKTLHPVIHGGILAIRDNKEHMDTIKNKNIAPIDMVVVNLYPFFEKIGQGLSLEEQIEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVLVITDPKDYKNIEEKLEKEGKVDFNTRKTLAGKVFNLMSAYDGAISKFLLEEEYPEYLSLSYKKDKDLRYGENPHQTAAFYTSLTEGGAFKDFEKLNGKDLSYNNIKDMDVAWKVVGEFEEIACCALKHNSPCGVAIGNTLCEAYKKAYECDPVSIFGGIVAFNRKVDKETARELVKIFLEVIIAPDYDDDALEILKAKKNLRIIKCNTKPSDKIEVCKVDGGILVQSTDNTLIKDIDVVTAKKPTEEEMENMIFAMKVVKYVKSNAIVVVKDKKAIGIAGGQVNRIWAACQALERGNGSVVLASDAFFPFDDVVKKASEYGIKAIIQPGGSIRDKDSIEECNRNEISMVFTGIRHFKH >NZ_LT906477|1685917:1693786|1690855_1691851_-|WP_095178018.1|DBSCAN-SWA MATYKDAGVNIEEGYKSVSLMKKHVEKTFNKGVLNGIGSFAAMYELGKYKNPVLVSGTDGVGTKLKIAFELEKYDTIGIDCVAMCVNDILCHGAQPIFFLDYMACGKLKGEVAADIVKGVSDGCLRAGCSLIGGETAEMPGFYKEGEYDIAGFAVGVVEKENIVNGQDIKEGDVLIGIASSGVHSNGYSLVRNVIKDFKEEFNGKFIGEELLTPTKIYVKPVLELLKNYPIKGMAHITGGGFYENIPRMFKDDLNAVINKNSFPRPDIFKYIISKGVEEEHMFNVFNMGIGFVICVDPSYEQKVIEKLIEQGEKAYKIGHIEKGERKVIIK >NZ_LT906477|1685917:1693786|1693306_1693786_-|WP_095178020.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDKEVMSGAAKALKEFDIEYKAYILSAHRVPEKLDETLKKLEQDNYECIIAGAGLAAHLPGVIASKTIIPVIGVPINASLNGMDALLSIVQMPKSIPVATVGINNGYNAGMLAVQILSLKYEDLKIKMLNYRTNMKKKFIDENEEGIIL >NZ_LT906477|1685917:1693786|1687414_1688662_-|WP_095178016.1|DBSCAN-SWA MKILIVGSGGREHAIAWKVAQNPKVEKIYCAPGNGGTALMNKCENIDIEQIGILADFAEENAVDLTIVGPEVPLVNGIVDIFKERGLKIFGPSKKAAALEGSKSFSKDFMKKYGVKTAAYEVFYEKNKALEYLKVCSYPIVIKADGLAAGKGVVICENYSQGEDIITKFMVEDMFGDAGKKVVIEEFLVGVEASILSITDGKVILPFISSKDHKQIYDEDKGPNTGGMGAIAPNPYVTEEVMKDFNENILKPTLKGIKEENFDYKGIIFFGIMITKKGAYLLEYNVRMGDPETQVVLPLMDSDLVELIEASLNDELSSFDLKWKKAHSCCVVAVSEGYPRKYEKGFKINMSKEVNSFVAGGIFKKGNLITNGGRVLCTYAVENKLEDSINKAYEEMNKIDFHGMYFRKDIGKLRY >NZ_LT906477|1685917:1693786|1685917_1687237_-|WP_089867693.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSKDIVKPSILPGFMELLPADQIVFNKMKDTIRHNYEKFGFIPLDTPTIEKSEILLAKGGGETEKQIYRFNKGNTDLSLRFDLTVPLARYVAQHFSDLTFPFRRYHISKVFRGERNQKGRFREFYQCDIDIIGNGSLSIINDAEIPSIIYQTFKELGFEDFTIRINNRKVLNGFFEGTDVEDRKGVLRSIDKLEKIGESGVRKELQELGLEDEKIDKIINFINIKGSKEDVIKSLKELNIENDVFKEGVEELAKIIHYIKSFNVPDENYKIDLTIARGLDYYTGTVYETVLNNYPQIGSVCSGGRYDNLAEHYTNQKLPGVGISIGLTRLFYQLREAKIIGENASSTLSQVLVIPVGDTMEYSIKVANKLRENEIISELYLEDTKIGKKFAYADKLKIPYVILIGEDELKEEKVSVKNMETGNQESMSLEEAIKIIKNV |
7 | Synechococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1998004 : 2026007
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_LT906477|1998004:2026007|DBSCAN-SWA TATGTTAGGTTATTGGCGTAGCCATTGTGATTACCAAAGTCTTCTTTTGTCAAGCATTAGTGAACTTTATAAAACTGATCCCACTATCGTGGAATACTACTCATCAAGTATTGAAAAACTATATAATTTAAATCTTGATGATATAAAACCATTAATTAGAGAAACATATTCTCTAACTGGTAAACCTTCAAACCAGCAACCGGAACTCTTCAGATCATTTATATTAATGTCTGACTTAGGTTTTCATAGTCTACAAAAATGGATTAAGCACTTACGTGCACATGATATACTTTGCACCATCATTGGTGTTGAAAAATCTAATGTACCAGGATTAGGTACTCATTATGATTTCATATCGAGATTTTGGGGTATGAGCCCTAAGGCTGAAAAATCAGCCAAGGACTCACTTCATTCTTTTACTTCCAAGCCCCACAAAAAACTTGGCAAGAATGAAAAACTACCACCAAAACATCCTGGTGTTATTAAAAATTTAGTTGAACAGGCTCTTAAAGGACGAACTGTCGAAACTCGCCCTGAAAAGCTATTTCAACAAATTTTTGCTAAGTTAGCTATTGAGCCTTCCGCTAAACTCGGTCTCCTTGGTAATACTCAAAAACTTGATATATCAGGAGATGGTACCTGTCTTGAAACTGGCGGTAGCTCATTAGGCATTAAGACCTGTGATTGCATTAAAAAAGGTATTTTTAACTGCAAATGTAATAGAAGATTCTCTGACCCTGACGCTAGACGCGGTTGGGACAGTTACCACGAAAAATGGTATTATGGTCATTGCCTATATTTTCTTAGTGTCTATAATCCTAAACTTAAAAAGGATCTTCCTATATATTTTAGGATGGTACAAGCGCAGCGTTATGATGGTGTTACTGCAATTTTTGCACTTTCAGAAGTTAGAAAGATGTATCCTCAATTTAACTTTGATAAGTTCATCGCAGATGCTGCTCATGATAACTATCCTACGTATAAGCTTCTTAATGAATGGAATATAAAAGCTGTTATATCCCTTAATCCAAAGGGTGAAGGTAAAAATAAATATGAACCACCAATTGGATATACTAAGGACGGTATTCCCATCTGCAAATGCAACCAACCAATGGTATATGATTGGTACGATAAAGGCAGAAGTAGAATTAAATATAGATGTCCTTTAGTAAAAGGTAAAATTAAAGAATGTCCTCATAAGGAAGAATGTTCTCCTAGTGCCTACGGCCGTGTAATATACGTAAAGCCAAGTGATGACTTACGTTTATTTACTGCTATACCTAGAAACTCTGACCTTTGGAAACAAATAATGAAAAAGAGAACTTCTTCAGAGCGAGTAAATAAAAGAATACTTGAAGACTACAACATGGAACAAACCCACTGCCGTGGTAAAAAACGTTGGTCTTGGTGGACATTAATCCATAGCATCAATATTCATTTGGATGCTCAACTATCTGTTTCTAAAACTAACCTATTAGACATTATAAAATTAACTGCAAACAAAGCATGCTAGTCTAGATAATTGTTAAATTTTAAGAAAATTCACCTATCGGTGAGTTAGCTTTGCTATACTCTTTTTTAAAATAAAGTTAAATAAAAACAGTAATATAACAAATGCTCCGCACTAAAATAATATTAAAGCCATTTTGGAGCCAATTGGAAATTAGTTTCCGAATTCACTCATTAAATATTTATATTTAAATTTATTTCTTGCTTTTTTTATCTATTAAAACAGCTAAAAGTATTACTAAACCCTTTACAATGGATTGATAATAAGCAGATACACCTGCTAAGTTTAATCCATTATTTAAAACTCCTATTATCATAGCACCTATTATAGTTCCAACAACTGTTCCTTCTCCACCGGCTAAACTAGTTCCTCCAAGTACTACCGCTGCTATGGCATCTAATTCAAAACCAAGACCCGCATTAGGAGAAGCTGATCCTACCCTACTAGTTGTAATTACGCCACTTAAAGCAGCTGTTATGCCACATATTACATACACAAGCGTTTTAATTTTATCTGTATTTATTCCTGATAATCTAGCTGAATCTTCATTTCCTCCAAGAGCATAAACATATCTTCCATATCTAGTTTGACTTAAAATATACCATGCTATAATAAGTACTACTATAGTTATTATAGCAGGAACTGGTATATACCCCAGTATTTTTTTATTTCCTATTAACATAAACTTATCAGATAATCCTGATATTGGCGTACCATTTGTGTATACCATGGTAACTCCTCTAAATATAGTCATAGTTGCTAAAGTTACTATAAAAGCTTGTATCTTTCCTTTAGCTACTACAACTCCGTTCATTAGACCAATTATAGCTCCAATTATTAAAGCTACAATTATAGATAAAAATATACTATTAGTTGCTCTAATTATGCTAGCAGAAATAGCACCAGATATAGCTAATGTTGATCCTACAGATAAATCAATACCTCCAGTTAGAATTACAAAAGACATTCCTATAGCTAATATGGCATTAACAGATACTTGAGTAAATACATTCATTATATTAGATACATTTAAAAATCTCGGAGTTAATATAGAAATTATTACGCATAATAGTATCAAGCCAAATAAAGATTTAAACTTTAAAAGAAATTCTTTCATATCGTTATTCATTTTGTTTTTCTTCATCCCCTTACATTTCTAATTTAAAGAAGCTACTGCATATTTCATAATCTTTTCTTGAGTTGCTTCTTCTCTTGATAATTCTCCTGCCAGATTTCCTTCACTCATAACTAATATTCTATCACTTATGCCTAATACCTCTGGCATGTCAGAAGATATCATAATTACAGCTTTACCTAAACTTTTAATTTCATTTAAAACCTCATATATTTCTTTTTTAGCACCTACATCTATTCCTCTTGTAGGTTCATCTATTATTAAAATACTTGGGGAAATCATAATCCATTTTGCTATAATAGCTTTTTGTTGATTACCTCCACTTAGGTTCTTTATTATCTGATCTGCTGAAGGTGTTTTTACAGATAATTTTTTTATATACTCATCTACTTCTTTTAATTCCTTTTCTTTATCTATTTTCTTCATACTATTTTCATATTTTTTTAAATTACAAAGACTTATATTATTACCTACAGACATATTTAAAATAAGTCCTTCCTTTTTTCTGTCTTCCGATAAATAAGCTATACCATTTTCTATAGCTTGTTTAGGAGAATTTATATTAACTTTTTTATCATTTACATATATTTCTCCACTGGTTTTCTTATACTCTCCAAATATAGTCTTAGCTAATTCTGTTCTTCCAGATCCCATAAGTCCTGCTAATCCTAATATTTCTCCTGCCCTTACTTGAAAGGAGACATTTTTTACTTTATCTTTATATGATAGATTATTTACTTCTAGTAATGTATCTCCTTTATCAACTTTTTTATATGGAAATTGTTCTTCTAATTTTCTTCCAACCATCATAGTTATTAAATCATCTTTTGTTGTATCTTCTACCTTAACTTCTCCTACATATTTACCATCTCTTAATACATTTACTCTATCGCATATTTGGAATATTTCATCTAACCTATGTGATATATATATTATAGAAATTCCTTCAGATTTTAATTTATTTATAACTTTAAAAAGCCTTTCTGTTTCTACTTCAGTTAAAGCAGTGGTAGGTTCATCCATTATTATTAGTTTGGATTTTTTAGAAATAGCTTTAATGATTTCTATCATTTGCATTTCACCTATGCTTATATCCTTAACTAAAGTATCCTCATCTGTTGTAAATCCTATAGTAGATAATAATTTTTTACTTTCCGATCTCATATAATCCTTATCAAGTTTATTAAAAATCCCATTATATTTTTCATTGCCTAAAAATATATTCTCATATATCTTTAAATTTGGAAGTAAACTTAATTCCTGATGTATTATAGATATCCCTAATTTTTCTGCTTGCTTTATACCATTTATATCAACTTCTTCTTCATTTATAAAAATACTTCCTTTATCTTTTGTATATACACCACTTAATATTTTCATCAATGTAGATTTACCTGCTCCATTTTCCCCCAAAAGAGCTAATACTTCTCCCTCATATACTTTAAGTTCCACATTATCTAATGCTTGTACACCAGAAAAAGCCTTGGAAATTCCTTTCATCTCTAAAAAAGGTTTCTTTTCTAATTTATCTTTTTCCATTAGAAAATCACTCCTGATTTTAATATTATATTTGCATAGGGTGTTTGTTCTCCTGTCCTTATAACAGCTTTACAATCCTTCAAATTATTTTTTAATTCTTCATGAGATATGAATATTATTTTTTTATCTCCTAATTGTTTTTTTATTTCTTTAAAAATTTCTGGACTTACCTCTTTAGTTTCATTAGCTATTTGTACTTCTTCTACTTCAAGCTCCATCATTACACTTTTTAAAGTATCCATAAAAGTTGGAATATTTTTTATTAATGCTAAATCTATTCTTTTAGTTCCTTCAGGTATAGGCAATCCACAATCTCCTATAGCTAAAGAATCTGTATGTCCCATTTTAGATATTACATGGGATATTTCACTATTTAAAATTCCTACTTTTTTCATATTTAACCCTCCTTAAAAACTTCTTCAACTTCTTTTAAATATGGTATGGAGGACTGAGCTCCTTCTTTTTGTACTACTATAGATGATACTTTATTCCCATAAAGTACACCTTCTTTTATATTATCAAAATTTAATTCACTATCTCCTAATTTATGCGCTAAAGCACCTATAAAGCTATCTCCTGCTGCTGTAGTATCTACAGCATTTACTTTATAAGCTGGCACTATTTCAAATTTATCTTTGGATACAATTGCTGCTCCTTTTTCTCCAAGAGTAATAACTACGAATTTCACTCCATTCTCCAAGAAAAACTTTGCAGATTCTCTCATATCTTTTTCATCTTTTATTTCTACTTTTGTAATTTCAAAAGCCTCTGTTTCATTTGGAACAATAATATCTGTATTTTCCAAAAGAGCCTTAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_LT906477|1998004:2026007|2000669_2002187_-|WP_089863588.1|DBSCAN-SWA MEKDKLEKKPFLEMKGISKAFSGVQALDNVELKVYEGEVLALLGENGAGKSTLMKILSGVYTKDKGSIFINEEEVDINGIKQAEKLGISIIHQELSLLPNLKIYENIFLGNEKYNGIFNKLDKDYMRSESKKLLSTIGFTTDEDTLVKDISIGEMQMIEIIKAISKKSKLIIMDEPTTALTEVETERLFKVINKLKSEGISIIYISHRLDEIFQICDRVNVLRDGKYVGEVKVEDTTKDDLITMMVGRKLEEQFPYKKVDKGDTLLEVNNLSYKDKVKNVSFQVRAGEILGLAGLMGSGRTELAKTIFGEYKKTSGEIYVNDKKVNINSPKQAIENGIAYLSEDRKKEGLILNMSVGNNISLCNLKKYENSMKKIDKEKELKEVDEYIKKLSVKTPSADQIIKNLSGGNQQKAIIAKWIMISPSILIIDEPTRGIDVGAKKEIYEVLNEIKSLGKAVIMISSDMPEVLGISDRILVMSEGNLAGELSREEATQEKIMKYAVASLN >NZ_LT906477|1998004:2026007|2004434_2004932_-|WP_089863580.1|DBSCAN-SWA MKIGIISDTHITKKVENIDKILNDYFYDVDTIIHVGDFNSLEVIKRIRSKKKFIGVYGNNDSKDVKNTLPIKDIIRINGYKIGIFHGHGSGKNALDRAYDEFKDDKVDIIIFGHSHQPIIKTRNKILMINPGSPMRKLKERWYSYVLLELHKRRIEAKMVLFKKK >NZ_LT906477|1998004:2026007|2008732_2010211_-|WP_095178397.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_LT906477|1998004:2026007|2018997_2019705_-|WP_095178167.1|protease|DBSCAN-SWA MEEFLKSIVVYIFIYLPPLIIFWKVWTRRRKNKFILLLISIIYVVGSLFTQNLLPFIFVIINIIYMKREDNFSYIEYKFNFRDFNFFKALIISLFSYAVTIIVAIIALNLFSSYEVPIKDQEIVEIMSKLSLKKFIFMMPITMVFAPIIEEYIFRWLIFEKILKRYMGIFISTLLSSIIFALIHFNIKSFPAILWMGIFNCFLIHKKGYWYAVFNHSFFNSVSTIAILIQKLTYM >NZ_LT906477|1998004:2026007|2016012_2016312_-|WP_089863555.1|DBSCAN-SWA MSKKKKHKKNRNDMNNNMNDNLMDLINNLDLEQVMSLLSGGNNVNTNYDEENTQIPNKNLFNDPTIQLINMLRPIVENNRESIEKLLQVYFLSRLINKK |
27 | Staphylococcus_phage(28.57%) | protease,transposase,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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