Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT906465 | Chryseobacterium taklimakanense strain NCTC13490 chromosome 1 | 1 crisprs | PrimPol,csa3,DEDDh,WYL,cas3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LT906465_1 | 1328489-1328581 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT906465_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LT906465_1
>1.1|1328519|33|NZ_LT906465|CRISPRCasFinder TCATCCGGAAATCCTTTGAATGATATCCTTGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT906465_1
The CRISPR arrays of NZ_LT906465_1 >merge|NZ_LT906465|1|1328489-1328581|CRISPRCasFinder CAGGTTCTGGGTGGCGGGCAGCAACAGCAGTCATCCGGAAATCCTTTGAATGATATCCTTGGCCAGGTTCTGGGTGGCGGACAGCAACAGCAG >NZ_LT906465|1|1|1328489-1328581|CRISPRCasFinder CAGGTTCTGGGTGGCGGGCAGCAACAGCAG TCATCCGGAAATCCTTTGAATGATATCCTTGGC CAGGTTCTGGGTGGCGGACAGCAACAGCAG
>NZ_LT906465.1|WP_095071541.1|1327377_1327887_+|DUF2480-family-protein MSEDFEIKNKVAESGLINFDLSSLVPKGERIGIDLKDFLYEGLILKEKDFREKVAAVNSQDYNGAYVYIYNSAEAIVPLWAYFLLTAKLTDSAKKVVFGNREDLEVLLMHSVMQTHDFSELEGKRVLVKGCSDESIPENAYIELVEQLKPLVKSLMFGEACSNVPIFKN >NZ_LT906465.1|WP_095071539.1|1326152_1327262_-|lipid-A-disaccharide-synthase MKYYIIAGEASGDLHGSNLMKAIKNQEPEAKFRFWGGDLMAEVTGEKPVKHYRDLAFMGFLEVAMNLKTILTNIKFCKEDIKNYKPDVLVLIDYPGFNLRIAKFAKELGIRVVYYISPQLWAWKEGRVEIIKKYVDDMLVILPFEKDFYKKHDVDAHFVGHPLLDAISDLSEINAEKFKKENSLNDREIIALLPGSRKQEVEKMLEIMLSVRPYFGDYQFVIAGAPSLPKSFYQKYVDENVHFVSNKTYDLLRCSRAALVTSGTATLETALLNVPEVVCYKSSRISYEIGKRLVKNIKFISLVNLIMDREIVTELIQNELNTNRLVGELKSILDGSRRGQILNDYQQLRERLGGQGASENAAKIITTKK >NZ_LT906465.1|WP_095071537.1|1324328_1326104_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein MRKQPLLISLVSFIVGILLYDRFPVDSLYIYNALALSLITLGFAIFQFKKFRSFAVVVFFCVLGAFTHFLNFKKPQIPTFDGKQNMVFQLRKKLNSSEKYRRYEVEILKVVNSDSAPFNAVVSVPKADEQLDFTKYYQTETYINRVEPPNNNFQFNYAKYLSRKNIFHQAFINGELITVPKKTLTVSEKIKQQRLNALQNIDHSSLQPRNKEFLKGIILADRTEMDDETVSDFNKSGLVHLLAISGTHMVIIFWLLIWVLRKLIPLKFKNLSIILALVFIWFFAIFIDYGSSVLRSCIMITAYYVFVLLQRKSDLLHALALAGFMILIFDTNQIYDVGFQLSFLAVLGIYWLNQPILRYLPKPKNNFQNFLVNIPSVSLSAQLATLPLVIYYFHQYSLVSILANLIIIPFSEIIIISSLVMTVLLVFKIDFSLFNLIYDFMVNTLLSAIKWFANLDFAFFKNIPMTLLEASLLLLSFYFLRDVLLKKDFKSAVRFSYGMLIFFALRISLNFYHYQRDEVLATSYFRDIVLVSKHHGEAVFYIREKSKPDKIEKYIVESYLNSRRIKDFKIETVKPNVSAVKIGKKVYKLDD >NZ_LT906465.1|WP_157727381.1|1323554_1323758_-|hypothetical-protein MDYFKSRQPTKEQLMAEAKKRNIPFRKEENGVMYELHSFDEHTGMPIYYTTKDIQGQSQKVSVEERK >NZ_LT906465.1|WP_095071533.1|1318980_1323414_-|S8-family-serine-peptidase MTNSTLGIIKVRKRGLLLASSLLSVVMYAQTETEARKIRSLSNTAETVNFQKIREKEMPSPQELMAKAKQMNIKYSDEYNGKMFQLVGFDEKGMPLYYETTNAGAAAGTGADVLNDLSGPYKLDGEGVNVFEWDGGAVRVAHQEFGGRAKQMDSPLSTSDHATHVAGTLIAAGVDKKAKGMAYKANLKAYDWTSDLTEMAAAAANNAMLMSNHSYGFTGGFSYGSSSGNTGWHWMGDDSETEFIGFGQYRTTDGDWDFLLTRNPYYLPVKAAGNPRGDGPAPGGLHYVRILENGKYVWKTSTKVRQVNGGVDGFDTVNQGATSKNTLIVAAAEKLPYGYRNPQDVKIASFSAFGPTDDGRIKPDITGIGVDLYSTNSTGNADYFSISGTSMASPNVTGNIALLQQHFNRLNASFMKSATTRALVIHTAKEAGDAPGPDYKHGWGLLDSKKAAEVISVRNKYSLLREETLENGSLKEIDLVASGNEPLKVTIAWTDPRPAVLSNPSVLDDPAKMLVNDLDIKITDGTNEYRPWVLDPANPAAPATTGDNVRDNVEQIVINNPTPGATYKLVVSHKGILKKNELGTLNTVKLVDAASQDFSLVASGIKKDVQKDLAVSEVKVLAESTEYSTKTPVQISYANIGALPVQEANIITTLKNKASGEVLATITSPVANLAAGEKQTLTIELDLSKPFIAYEIQTKAEFANDEVEVNNYANTSAYTTVVDLVPQGTMHTFGFEDDFVLNGWTSEDIDGNGRTWYKYNGASFAKNGSSFAINFANLAKGSNDWLFSNPLRLKANTKYLISFHASKLRDMAEPLQVFFGKEAKSAAMLTAVSPVIQAQSTYKQYIYEVMPTEDGVYHFGFQQKVDTNVQSYAVFVDDVVVKRAEDKPTAAFTASKTNPTSFENIILNNETVVSPSLATSYSWTVAPATFEYITGNANTASPTIKFNAEGVYAVTLKATNSFGSDELTKTSYITVKNTATTAGFSANKTYLFEGEQVAFSNSSAGNPAPTSYVWNITPSTGFTYAAGSSSTSKNPTVVFNKKGVYTVSLTAKSLMNEDTVEKKDYITVDSYNSPVRNLSHVLDSSTKDVKLTWVRPEMLNNYFESFENAGAVTPGYTFYDENKDGKNWVVRANTVSGGLSFIYSKTGTYGMVSYSYSGGLAIDADNWMITDKLKKGSEILKFSAYAPFPEDVEVYVVPAPASGSAPTLDEVKAGHKVLDQRFENENFEDVTVNIKSKTGSDFFLAFYHKTKKEADAWYLAVDDITLGYDNSLPATGASKNAKKVVEQLNETKAEMKKVKEGITLSADEKFVQNSQNSQPVTFAATKYPELLGYDVKKNDVTIQEIRDISTTVATDNVNGAQGQVKYDVYAVYSDGKTSVPQTVIVDLTTLAADDIKVDKAGLVVYPNPSSGLFIIDGGASVTALDAKVYDMGGKLILDKKSKERKLDLDLTRFGKGVYILNAVDQNGKRVSVKLIVK >NZ_LT906465.1|WP_095071531.1|1318101_1318773_-|succinate-dehydrogenase-cytochrome-b-subunit MAGLTSSTIGRKYAMALSAMFLLIFLVMHLSVNMLSVFGEDGPFNAASYFMGYNPAVQFLMQPILIFAVFFHFIMGFILETRNNKARPVKYAVNNGKANSTWMSRNMIISGAVVLAFLALHMYDFWMHEMTYKYVPGEGDPTDMTRFWGELHEKFADPLRVGFYVISFVLLGLHLAHGFQSSFQSIGARHPKYTPVIKTLGNWYSILIPAGFIFIALFHFLTQ >NZ_LT906465.1|WP_095071529.1|1316033_1318046_-|fumarate-reductase/succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit MSKLDSKIPHGPLAEKWTNHKNHMNLVAPNNRDKIDIIVVGTGLAGGSAAATLAEQGYNVKAFCYQDSPRRAHSIAAQGGINAAKNYQGDGDSTYRLFYDTIKGGDYRAREANVYRLAEVSANIIDQCVAQGVPFGREYGGQLDNRSFGGVQVKRTFYAKGQTGQQLLLGAYSAMSRQIGKGRIKMYNRHEMMDLVIVDGKARGIIARNLVTGEIERHSAHAVVIASGGYGNVYFLSTNAMGSNVSAAWKIHKKGAYFANPCFVQIHPTCIPVHGTQQSKLTLMSESLRNSGRIWVPKNIEDAEAIRAGKLRPENIKEEDRDYYLERRYPAFGNLVPRDVASRAAKERCDAGYGIENNDTKEGVYLDFSTEIMKKGKEAAIEKNIHNPSQQQIYDLGKAWVEEKYGNLFVMYEKITADNPYVTPMKIYPAVHYTMGGIWVDYNLQSTIPGCFVIGEANFSDHGANRLGASALMQGLADGYFVLPYTIADYLSADIRTGAIPTNSEAFDAAEKEVKEKINFFLTNNGKYSVDHFHKKLGHIMWNKVGMGRTPEGLREAIAEIAQVREEFWRDVKVPGDANEMNMELEKAFRVADFLELGQLMAKDALERNESCGGHFRWDHATEEGEAERDDENYMYAACWEYQGADINAEVMHKEPLIYENIEVKQRSYK >NZ_LT906465.1|WP_095071527.1|1315432_1316032_-|hypothetical-protein MENRLMKIIGVFLFFCAFLFSTELNAQKQSIEIPTDGTVNVYIVNGSTRKFDIYDAEKRITNLKAGYYTIYNVQPGEHIFWTAENPVNFLKGNFEGNSTYVVALEAQDSALMFGVVGALTAGAKMMVFNPNEFRDKKLFYQVVKRFKKVDADGVILENDKEMVKKAMEKYQKFSNDKEKKILVVTPDMKFFDADKPVKN >NZ_LT906465.1|WP_095071525.1|1314643_1315411_-|succinate-dehydrogenase/fumarate-reductase-iron-sulfur-subunit MSAKKGLNLTLKIWRQKNNKTKGQFEVYKISDVSTDSSFLEMLDILNENLINDGKEPVAFDHDCREGICGMCSLYINGRPHGPDTGITTCQLHMRMFRDGETITIEPWRSAAFPVIKDLVVDRSAFDRIMAAGGFISVNTSGNTLDANAIPVPKDDADKAMDAAACIGCGACVATCKNGSAMLFVGAKVSQFALLPQGRVEAKRRVLNMVRTMDEEGFGNCSNTGACEVECPKGISLEVIARMNREFMAAKVDQG >NZ_LT906465.1|WP_095071523.1|1312922_1314494_-|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MKSQIQSFQKNNKQIKVKKFFLLFILAFFAVSCSKKVEIKGRVSNGSPLERIEIIEASGVGTLPLVNLGVNNKGEFNGNFEAPKNGLYVVTYGGKSNMVYLKGGQALNISGNAQNFPAEFTITGDAKANNDFLKDSQKAFETYASKIQMQDLISKDEAAFLAQFKKIQEDVNKLLETSAKKLNADGDALDYKKDEATARLMGLLDAYEEQHAAATAKPGFKVSENFKKVQKDLQKNDDRLIRDFPMYREYKLSKIQPDFQKYLATLPQNQKEQPMISEVFANYLKTRKDLSNTAKDYFFGYVLAQGDLNFMNAKNYDKLTKLIDSNVTDGTVKKDLKELQKVLMGFRAGTAPDMKIVSKDGKVQSLSDFKGKPTLVTFYASWNPNIALMTIPVLKEVTEFYKAKMNYAYVNLDDTKEQFTKTSAALLKGFNGGHYWVDGGINAAEAKKFGLYGFKIPSYIIVDKDGKLLGRPYFNLGDPEFVETMTKLTGIQAPQMQPQAQPQPQMEIAPQEKAPQVDSAAVK >NZ_LT906465.1|WP_095071545.1|1328701_1329025_-|preprotein-translocase-subunit-YajC MMTILLQAAAGDSMMPTLLMFGLFFVFMYFVMLRPQMQKQKKEQNFQGSLKVGQRVVTTSGMHGRIAQIHEDGVVIETLSGKLKFEKAAISREFTAQRFPESAEEKK >NZ_LT906465.1|WP_095071547.1|1329031_1329544_-|DUF1573-domain-containing-protein MKKNILILSVLALAFSSCKKNEQADVLVEETATTQPVTQASGDVLMPGAAPEIMSQESLIQETKNKPQTSLALSENHWDFKDVKKGESVEHVYEVTNTGSNPLVISQVKPGCGCTAPDYTKEPIMPGQKGQITLKFDSSNFDGLQNKQAEVYANVEKAPIVLTFSANVVK >NZ_LT906465.1|WP_095071549.1|1329548_1330457_-|antitermination-protein-NusB MLGRRQIREKVIESLYAYHQNPIQYEVLEKNMFSDIEKIYNLYVYQLNFLVALKDLAEKQIEIGKQKYIKSDADLNPNQKFINNQILKQLEQNTERLNFTSKHKELKWELHDELLVKTFQRIVAGKRYQDYMMEDGHSFEEDQKFIGKLFLRYVAENEDFHDRLEEKEMSWADDLHIGNSMVQKTIGFMKENEPSHTLIRMIKDEDDKSFARKLLWEAIKNWDSAEKKIEERLQNWDLDRVSLMDKIILIAAITEFDFFKATASRIIINEYVEISKVFSTDKSNIFINGILDKYSKDTNRIN >NZ_LT906465.1|WP_095071552.1|1330612_1332274_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNALKTLNPYFWKHRLLLFWGFLFIVASNFFNIYKVQFVGKSVDELSKNGHLGFNKQVLIYVGIIVGSSLLTGFFTFMMRQTIIVASRRIEYELKNKIYRHYQELSLTDYKKTTIGDLMNRLSEDVVAVRMYLGPGVMYVVNLLVLMIITSIYMLKTDVEMTLWTLIPLPVLSFIIYKVSSIINKKSKVMQKSQSAISTFVQDSFSGIRVVKYFAKEKYIAKNYGIRVKDYQEKALDLAKTEAYFFTIILFVIGLLNVAILLIGGQKYLANEISVGKIADFFLYINILIWPFSMVGWVTSVNQRAEASMSRINEFLGKKSEIANHNLEEYPIKGDIEFRNVSYVYPNTGIRALDNVSFKINAGETLAIMGKTGSGKTTIALLLARLIDPTEGEILIDGKNLKDHNLQNYRKYIGYIPQESYLFSDTIANNIGFAIDNPTEEQIVEYAKKADVHKNIVEFKEQYQTLVGERGVMLSGGQKQRICIARALIKQPEILIFDDSLSALDTETEENILQNIEKDLKNATSIIITHRESSAKRADKVLNLSEIKDIKSA >NZ_LT906465.1|WP_095071554.1|1332390_1332726_+|PUR-family-DNA/RNA-binding-protein MSDYKERHENEIFTKVLKAGRRTYFFDVRETKAGDYYLTITESKKNFGENGEATFEKHKIYLYKEDFKAFQEMFNESTDFIVNEKGEDVISEKHDKDFKSRSFTIESDEEF >NZ_LT906465.1|WP_095071556.1|1333058_1333778_-|bacillithiol-biosynthesis-deacetylase-BshB1 MKVDILAIGAHPDDVELGCGGTIAKMISEGKTVAIIDLTKGELGTRGTDKTRKQEAADAAKILGISARENLEMKDGFLQNSEEYQMRIVKMIRKYQPEIVLANATDDRHPDHGKAAKLVSDACFLSGLKKIETALDGKNQEFWRPKHVFHFIQWKEIEPDFVIDISNFMEKKIEACMAYKTQFYNPESKEPVTPIATKDFLESLTYRAQNLGRLSGCTYAEGFTAEKMIALKNFEGIVL >NZ_LT906465.1|WP_095071558.1|1333841_1335509_-|tetratricopeptide-repeat-protein MKNMISLSKKIVLSAGVVFANFAFAQTVQEGIANVDSHKYAKAKQIFGDMITKAPNDASNYFYLGNSYLSQFDPNFEKAEEYFKKGLALDSKGYLNKIGLASVKLAKGDKSAIAEIQKIVTDSREKDPEVLYRAAEALTMFEKASSPDLAIGYLTKAVEKAQKGGVPAYYYYSLGDAYRLKKDPGNAMTAYDKASAVAKNKASVFTRMGTLWMAAQQWKQAKENIDKAIAVDPTYAPAYKALAAYNFRFQENAKVTQNLIDYTKYADEDGYTMLEIAKLHFINNDYDNAKTVLNKVFDKVDDPIKYKLKAYLDYSADGNYASAQENLNKFNSSVKDKERIQPADRGLEGLIIAALAKDEKDAAKKAQMMSDATAKVAIAKNAKDQTMDWDAELSKIQSGGAINAASVDAGPTSPKVEGLKAKIKANPKDVNALVELGTAYQEVQNWNGAIMTWDKMIALSPNWAYSHYAKGSAYQQLGNHDMAEASYEKFIAVVKGQTAEEQAQNKETMSYAYYLVAFYNQDKNIAKAKEYAAKAVELNPAYADAVTLNNQLMKK >NZ_LT906465.1|WP_095071560.1|1335580_1336456_-|substrate-binding-domain-containing-protein MKTKLLLFLLAIVLISCSKKEKQPKEKIGYNKGSVAIVTDDSFKSVTQAMADAYMINYPETSVSVKVQKEDMAFLDLLKNKSKLIVMSRSLSPQEIAEYERVIDLKFNPAKFAADAVVFVAPINSSRTSVDVKEIEQMLSSTEKQIIFDGTNSGNLNFVAQKFNKKPSDLQFSIISGNANVIRELNKYPSKVGAISLNTISRPYGTDAQNLRKMVKILPVTENGKMFEPTAENLRQLQYPFTRILYLLTNEGNFGIANGIIRFACTQLGQMVVEKEGLQPYNIFRREVQMN >NZ_LT906465.1|WP_095071564.1|1336702_1337545_-|energy-transducer-TonB MADETTYKDNLTLDEIVFENRNKEYGAYDLRSKYPKILTKAFIIGTLLFILLAVAPFIVMKIQQMNKEATTEVDAKLVEVLQEDKIIEPEEKEAPPPPPPPKVEPPKIEVIQNVVPEPKRAPKVETPPPPITEQLKTTTGLQNQEGVKAPAYTPPPPPPSTGTKVATVEAKPAPSTTEIYAEVEQQADFPGGINSFRTKVADNFDSGAMEGGEGTLRTEITFVVERDGSLTQVKATGPNADFNREAERTVKSIRNKWTPAKINGQPVRYRFRLPLTMNFE >NZ_LT906465.1|WP_095071566.1|1337563_1338133_-|biopolymer-transporter-ExbD MAEVQVQEKGDKGGKVRSKKQSTRVDMTPMVDLGFLLITFFMFTTTFSKPNVMDLGLPAKPKENQKAPDTEIKLSNSVSILIGKDNRVFWHQQDNTSLTDANLNETTFDREGIRKVIQQAKANAADQSKFTVIIKPTDDAVYKNFVDILDEMAITKSEQYGVTDVKPWEKAVYDRKVAGAATPAPAATN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
345292 : 425722
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT906465|345292:425722|DBSCAN-SWA 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80 | Synechococcus_phage(14.29%) | integrase,protease,transposase,holin,plate | attL 392261:392279|attR 408256:408274 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
488990 : 545899
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT906465|488990:545899|DBSCAN-SWA 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57 | Streptococcus_phage(28.57%) | transposase,integrase | attL 501351:501368|attR 546592:546609 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1602541 : 1613997
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT906465|1602541:1613997|DBSCAN-SWA 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ACATCTTTGTCCCATTTTTCCTGAGCTGCAGAAAGTTCCATTACCAGACGCTCCTCCTCATCTTTCAGTTTTCTGGCTTCAAGATAATCCTGGGCTTTTACGGCCTGCTGTTTCTGTTCCTTGATCTCTTCTATTTTCTTTTCATTTTTAATGATCTCTGTAGGCACTTTCATGTTTTTGATGTAAACACGAGAACCAGCTTCGTCCATCGCATCAATAGCTTTGTCCGGAAGGAAACGGTCGGTAATATATCTCGAAGTAAGATTCACACACGCTGCAATCGCCTCATCAGTGTAGGTTACGTTGTGGTGATCTTCGTATTTATCTTTAATCTGATTTAAAATCTGAATGGTTTCCTCAATGGAAGTTGGCTCTACCATAACTTTCTGGAAACGTCTCTCCAAAGCACCGTCTTTCTCGATGTACTGCCTGTATTCATCAAGTGTTGTAGCACCGATGCACTGAATTTCGCCTCTTGCCAGCGCAGGTTTGAACATATTTGATGCGTCTAAACTTCCGGTAGAACTTCCCGCTCCAACAATCGTATGCAATTCATCAATGAAAAGAATGACATCACGGTTTTTTTCGAGTTCGGTCATGATGGCTTTCATACGTTCCTCAAACTGCCCGCGGTACTTTGTGCCGGCAACCAAACTTGCCAAATCCAAAGTAATCACACGTTTTCCGTAAAGAACCCTCGAAACTTTTTTCTGATGAATTCTAAGCGCCAAACCTTCTGCGATGGCAGATTTACCAACGCCCGGCTCACCAATTAAAAGTGGATTGTTTTTCTTTCTTCTGGAGAGAATCTGCGAAACGCGTTCAATTTCCTTCTCACGGCCGATTACCGGATCAAGCTTGCCGTCTTTAGCCAAAGCGGTTAAATCCCTACCGAAATTATCCAGCGTAGGCGTTTTGCTCTTCCCTGTTCCGATATTACCGGTGGGTCTGCGCATCTGTCCGTATTCTTCACGCTCATCATCATCGTCGTAAGCACTCATTTTCGGTCCTTCGCCGGAATTTTTAAGCATGGTCTGATATTCTCTGGAAACTCTTTCATAATCTACGTCATAAGCTCCTAAAATACTGGAAGTAGGATCTTCGAACTTGTAAAGAATTCCAAGAAGAAGATGAACTGTATTAATTTCACCGCTGCGGTATTGCCTGCATTCCAGCTCAGCACGTTTTACTGCCTGATCTGCCATTTTTGTAAAAGAAATGTTTGAAACCTCTTCCGCCAAAGGGTTGATGCCGGAAACGTTCATCGTTTCAATTTTTCTTCTGATTTGTGTAAGGTCGGCATTCAGGTTCTGAAGGATTTCCCGTGCAGAGTTATCAGTTTTGATGATGCCCAGCAGCAGGTGCTCTGTGTTCAGGAACTCACTTTTCAGTCTTCGTGCCTCGTTTTTGCTTTGTTTGAACACTTTGTCCAAACCGTCTGAAAACTTATAATCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT906465|1602541:1613997|1604625_1605378_-|WP_095074362.1|DBSCAN-SWA MKTIFITGATSGIGKACAELFAKQGNRLILCGRREDKLAELKERFSGTNEVHTLKFDVRNADEVENAINSLPEGFKSIDVLINNAGNAHGLEPVCDGSFADWDAMMDGNVKGLLYVSKFLIPGMKDRKSGHIVNISSVAARQTYANGVVYCASKRAVDVISEGMRLELTEFGIKVTNIQPGAVETEFSEIRFKGDKERAATVYAGYEALKPDDIADAIGYCVNAPKHVSISDLTIYPSAQSEPRTIHRNL >NZ_LT906465|1602541:1613997|1610264_1611308_-|WP_095074364.1|DBSCAN-SWA MERSNHIKGQGAQRNVINRFDKYTYEPEDEDFETVKTTFTEVFPKSIVNPVKSPDLSMEYSLNPYQGCEHGCSYCFARPTHEYWGFSAGIDFERKIMVKKNAPELLEKFFKKRGYTPKTIVMSGNTDPYQPVERKLEITRKLLQVFLDYRHPVSFITKNALILRDLDLLIQLAEKNLVSVNLSIPTINEDLRKVMEPRTSSVKNKLKALEILSQNGIPVNVMAAPVIPGLNSEEGLNIYKTVSELGAKSAHHALIRLNDTVEPVFVQWVNAHFPERSQKVLNLIRSMRAGNLGEKRYFERYKGEGNIAEMIHQTFALARRKYFHGKHIAPLATEHFTGSKEQQLRLF >NZ_LT906465|1602541:1613997|1603938_1604616_-|WP_095072036.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKILHLETSSKNCSVAISDGEKLLCLCEEVSENYKQSESLHTFVEWAFEGAEISLKDIDAVSLGKGPGSYTGLRIGASAAKGFCFGLNVPLIAINSMETMVEPFVDQGFELIIPLIDARRMEVYTAVYDGKIGQELSKTDNLILDESSFQQYSGKKILFVGDGCTKAKEILKLENAEYKEDIFPSAQYLIKKAAEKFNNKDFEDVAYFEPFYLKDFHGVKKSEKS >NZ_LT906465|1602541:1613997|1609168_1610209_+|WP_095072045.1|DBSCAN-SWA MRIENDIKLGFKDVMFRPKRSTLKSRSEVNLEREFTFLHTQKKWKGVPVIAANMDTVGTFEMAVALAKDRIITAVHKHYTIGEWTDFLKDKPDELYNYIALSTGTGKADEEKIKKICELHPKIQFLCIDVANGYSEHFVSFVKQARQNFPDKIIIAGNVVTGEMVEELLLAGADIIKVGIGPGSVCTTRVKTGVGYPQLSAIIECADAAHGLKGHIIGDGGCKVPGDVAKAFGGGADFVMLGGMFAGHDESGGEMMEENGKKYRLFYGMSSKTAMDKHSGGVAEYRASEGKTVKVPYKGPVSETVKDILGGVRSTCTYVGASELRELSKRTTFIRVQEQENQIFKD >NZ_LT906465|1602541:1613997|1611483_1613997_-|WP_095072047.1|protease|DBSCAN-SWA MDYKFSDGLDKVFKQSKNEARRLKSEFLNTEHLLLGIIKTDNSAREILQNLNADLTQIRRKIETMNVSGINPLAEEVSNISFTKMADQAVKRAELECRQYRSGEINTVHLLLGILYKFEDPTSSILGAYDVDYERVSREYQTMLKNSGEGPKMSAYDDDDEREEYGQMRRPTGNIGTGKSKTPTLDNFGRDLTALAKDGKLDPVIGREKEIERVSQILSRRKKNNPLLIGEPGVGKSAIAEGLALRIHQKKVSRVLYGKRVITLDLASLVAGTKYRGQFEERMKAIMTELEKNRDVILFIDELHTIVGAGSSTGSLDASNMFKPALARGEIQCIGATTLDEYRQYIEKDGALERRFQKVMVEPTSIEETIQILNQIKDKYEDHHNVTYTDEAIAACVNLTSRYITDRFLPDKAIDAMDEAGSRVYIKNMKVPTEIIKNEKKIEEIKEQKQQAVKAQDYLEARKLKDEEERLVMELSAAQEKWDKDVKEKKETVTEENVAEVVSMMSGVPVTKVGKNELDKLAQMDDKLNGKVIGQEDAVKKVVKAIQRNRAGLKDPNRPIGTFIFLGTTGVGKTELAKVMARELFDSDEALIRIDMSEYMEKFAVSRLVGAPPGYVGYEEGGQLTEAVRRKPYAVVLLDEIEKAHPDVFNILLQILDEGHVTDSLGRKIDFRNTIIILTSNIGTRDLKDFGDGVGFGTSAKKSTSDARARATIENALKKAFAPEFLNRIDDIIIFNSLQQEDIRKIIDLELSKLYGRLEKLGYKVELTDEAKDFIAEKGWDKDFGARPLKRAVQKYIEDLLAELLVNKQISENETVVLRLNDSKDALEKEASVTEKA >NZ_LT906465|1602541:1613997|1608565_1609123_+|WP_095072043.1|DBSCAN-SWA MDEILAKITDFGDQAHGEQLRKYAPDRYMVHPVRVMQKLKSYTDDITILAAALLHDVLEDTPVTRSEMQDFLETLLTAQQAERTAELVVELSDVFVKKDFPNLNRRTRKSKELARLEKTSADSQTIKYSDILDNSLEISDQDPQFARVYLSEVSLVLKKLDKGNPELRKEAIKAVEQSLQKIKRR >NZ_LT906465|1602541:1613997|1607729_1608497_+|WP_095072041.1|DBSCAN-SWA MQKPLILVTNDDGITAPGIRNLVEFMNEIGEVVVVAPNSPQSGKGHAITINSTLTFEEISLDGPQTDYSLSGTPVDCVKFALDKILDRKPNIVVSGINHGANSSINVIYSGTMSAAVEAGVEGLQAIGFSLLDFSWDADFSQAKEYIQQIVLKTLENPLPKGVVLNVNIPKLKKEEIKGVKVCRQANAKWEESFDERTNPHGKKYYWLTGYFNNMDDGKDADETALGEGYISVVPVKFDLTAHEHLENIGKVLNT >NZ_LT906465|1602541:1613997|1605466_1607587_-|WP_095072039.1|DBSCAN-SWA MFKKFKLNTLLLFLPLTTLIFCFNSPKNDDEKMQTIMVSVKNTLSYLHYSPKPINDAYSQNVYDKYLEMIDPAKRYFLQSDIDEFAKHKTKLDDYINKGDLVFYNLTYNRLFDRIDKIDKATKDILSKPINLDEDETIILEPKKKKFPATEQEQYNEWKKFIKYNILQEIETLNAREETQKKKKDSVQKHNLKDTIKVEILTPEQKRLKATNEVKDLVTESFKRIKKRKKMDWFTVYMNAYTEVFDPHTSYFSPKDKDEFDSQFKGKIIGIGALIQEKKGYLYLGPLTIGAPAWKSKQLNEGDKILKVRSKPNEEPVNVVGMLSDEAVRLIRGEKGTKVTLTVEKKDKTIREVTMIREEVAIEDTFARSIIINAPNGKKYGFINLPGFNADFEDAKGRNASDDIKNEIIKLKAQGISGIILDLRNNGGGSLTEVGDIMGLFMNEGPYVQVKEGNGKIQTLRSKTNAPIWTGPLVIMQNELSASASEILAGVIQDYGRGVVIGSPQSFGKGTVQTFVDLNRFLSSNDDFGALKLTIQKFYRVTGESTQRKGIESDIKMNDYFTHSEIGERFDEYALAWDKIAPAKFNRLTSFDIAKLQKNSAARLEVNKAYQLLQESAKWKEDLDKEETITLNQTKFNELMKHRKEQIKKFESLNKFENGLKFVRYTDELAREKTDEAFKKKSENWIKNLQRDIYLKEAVNIVSEIK >NZ_LT906465|1602541:1613997|1602541_1603895_+|WP_095071642.1|transposase|DBSCAN-SWA MGKSKYSADFKLKAIKRYHKGDIGTDDLGKRIGVCGSLVRKWIKFYELYGVSGLVRLSNRHYTKDFKLKILSVIEKENLSLKEASRRFNIPAESSILSWQRNYKKNGILGLENRPRGRPKTMSNYKRKKKKTGKPLTREEELLERIYYLEAENAILKKFRRLNSGKEKSKAIEELRQDFDLAVLLDCTSMARSSFYYYQKRFQMKDKYAEIKEMIKQIYHRHKGRLGYRRITLLLKEKGILINHKTVLRLMKILGLKSIIRVKKYKSYKGEQGKIAPNVLQRNFKSDAPNQKWATDVTEFNVSGNKLYLSPIIDLFNGEIVSFDLSERPVFSQIIRMLKKSFRKVKSTQNIILHSDQGWQYQMKHYQNLLKEKGIIQSMSRKGNCLDNAVIENFFGTIKSEMFYTRKFGSIQELKMEIVKYIHYYNNDRIRLNLKGKSPVQYRTLSFENIV |
9 | Bacillus_phage(14.29%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
2237978 : 2282777
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LT906465|2237978:2282777|DBSCAN-SWA 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51 | Brevibacterium_phage(14.29%) | transposase,integrase | attL 2245108:2245123|attR 2275666:2275681 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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