Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT992462 | Staphylococcus aureus isolate 5_3949 chromosome I | 11 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,TnsE_C,WYL | 5 | 4 | 14 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT992462_1 | 331074-331166 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_LT992462_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LT992462_1
>1.1|331104|33|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder TGCATGAGCTTTAGCTCAGGTGTTCCGCTTATT |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT992462_1
The CRISPR arrays of NZ_LT992462_1 >merge|NZ_LT992462|1|331074-331166|CRISPRCasFinder AGTTATCAATTTATTGATTACTGTTTCTTATGCATGAGCTTTAGCTCAGGTGTTCCGCTTATTAGTTATCAATTTATTGATTAGTGTTTCTTA >NZ_LT992462|1|1|331074-331166|CRISPRCasFinder AGTTATCAATTTATTGATTACTGTTTCTTA TGCATGAGCTTTAGCTCAGGTGTTCCGCTTATT AGTTATCAATTTATTGATTAGTGTTTCTTA
>NZ_LT992462.1|WP_000426914.1|330750_330984_-|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >NZ_LT992462.1|WP_000043237.1|329903_330635_-|ribonuclease-III MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >NZ_LT992462.1|WP_000262716.1|326190_329757_-|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGQRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLIELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIQSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKASLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFKQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >NZ_LT992462.1|WP_000007685.1|324940_326191_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVNGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGSK >NZ_LT992462.1|WP_000531320.1|324621_324954_-|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKQHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >NZ_LT992462.1|WP_000863474.1|323228_324596_-|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTKLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >NZ_LT992462.1|WP_000268754.1|322518_322794_-|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >NZ_LT992462.1|WP_001261979.1|321827_322331_-|ribosome-maturation-factor-RimM MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVHNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLDENEFYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKGSKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >NZ_LT992462.1|WP_000687328.1|321090_321828_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFDGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTEQTRVILMCPQGEPFSHQKAVELSKADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFKGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >NZ_LT992462.1|WP_000181404.1|320637_320988_-|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >NZ_LT992462.1|WP_000167269.1|331451_332186_-|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MTKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKEKAEAVVEEIKAKGVDSFAIQANVADADEVKAMIKEVVSQFGSLDVLVNNAGITRDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKATPQMLRQRSGAIINLSSVVGAVGNPGQANYVATKAGVIGLTKSAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTDALSDELKEQMLTQIPLARFGQDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >NZ_LT992462.1|WP_021285949.1|332178_333105_-|ACP-S-malonyltransferase MSKTAIIFPGQGAQKVGMAQDLYNNNDQATEILTSAANTLDFDILETMFTDEEGKLGETENTQPALLTHSSALLAALKNLNPDFTMGHSLGEYSSLVAADVLSFEDAVKIVRKRGQLMAQAFPSGVGSMAAVLGLDFDKVDEICKSLSYDDKIIEPANINCPGQIVVSGHKALIDELVEKGKSLGAKCVMTLAVSGPFHSSLMKVIEEDFSSYINQFEWRDAKFPVVQNVNAQGETDKEVIKSNMVKQLYSPVQFINSTEWLIDQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKLTSIQTLEDVKGWNEND >NZ_LT992462.1|WP_000239748.1|333097_334084_-|phosphate-acyltransferase-PlsX MVKLAIDMMGGDNAPDIVLEAVQKAVEDFKDLEIILFGDEKKYNLNHERIEFRHCSEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTIDGKGFVFLDVGANADAKPEHLLQYAQLGDIYAQKIRGIDNPKISLLNIGTEPAKGNSLTKKSYELLNQDHSLNFVGNIEAKTLMDGDTDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKDTIMSSTKNKLAGAILKKDLAEFAKKMDYSEYGGSVLLGLEGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEQNIVQTMKETVGESNE >NZ_LT992462.1|WP_001548538.1|334088_334661_-|transcription-factor-FapR MRGETLKLKKDKRREAIRQQIDSNPFITDHELSDLFQVSIQTIRLDRTYLNIPELRKRIKLVAEKNYDQISSIEEQEFIGDLIQVNPNVKAQSILDITSDSVFHKTGIARGHVLFAQANSLCVALIKQPTVLTHESSIQFIEKVKLNDTVRAEARVVNQTAKHYYVEVKSYVKHTLVFKGNFKMFYDKRG >NZ_LT992462.1|WP_001151513.1|334863_336924_-|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MAKVNLIESPYSLLQLKGIGPKKIEVLQQLNIHTVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQAEDQSNVTIEGQVYTAPVVAFFGRNKSKLTVHLMVNNIAVKCIFFNQPYLKKKIELNQTITVKGKWNRVKQEITGNRVFFSSQGTQTQENADVQLEPVYRIKEGIKQKQIRDQIRQALNDVTIHEWLTDGLREKYKLETLDFTLNTLHHPKSKEGLLRARRTYAFTELFLFELRMQWLNRLEKSSDEAIEIDYDLDQVKSFIDRLPFELTEAQKSSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLIALFGDSMNVALLTGSVKGKKRKILLEQLENGTIDCLIGTHALIQDDVIFHNVGLVITDEQHRFGVNQRQLLREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIITTWAKHEQYDKVLMQMTSELKKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQQNYGVSRVGLLHGKLSADEKDEVMQKFSNHEIDVLVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSDQQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANLVEDYRMLEVARDEAAELIQSGVFFENTYQHLRHFVEENLLHRSFD >NZ_LT992462.1|WP_000623896.1|337113_338760_-|DAK2-domain-containing-protein MISKINGKLFADMIIQGAQNLSNNADLVDSLNVYPVPDGDTGTNMNLTMTSGREEVENNLSKNIGELGKTFSKGLLMGARGNSGVILSQLFRGFCKNIESESEINLKLLAESFQAGVETAYKAVMKPVEGTILTVAKDAAQAAVEKANNTEDCIELMEYIIVKANESLENTPNLLAVLKEVGVVDSGGKGLLCVYEGFLKALKGEKVEAKVAKIDKDEFVHDEHDFHGVINTEDIIYGYCTEMMVRFGKNKKAFDEQEFRQDMSQFGDSLLVINDEEIVKVHVHTEYPGKVFNYGQQYGELIKLKVENMREQHREVIRKEQHTAKPKMETVETAIITISMGEGISEIFKSMGATHIISGGQTMNPSTEDIVKVIEQSKCKRAIILPNNKNILMASEQAASIVDAEAVVIPTKSIPQGISALFQYDVDATLEENKAQMADSVNNVKSGSLTYAVRDTKIDGVEIKKDAFMGLIEDKIVSSQSDQLTTVTELLNEMLAEDSEILTVIIGQDAEQAVTDNMINWIEEQYPDVEVEVHEGGQPIYQYFFSVE >NZ_LT992462.1|WP_000171418.1|338774_339149_-|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MTLEISNDYGKIDISNEVIASVVGGKAVECYGIVGMASRQQVRDGIAEILGHENYAKGIKVTENNGVVDIDMYIIVSYGVKISEVANNVQSTVKYTLEKSLNVSVNSINIYVQGVRVNNTGKKA >NZ_LT992462.1|WP_000517908.1|339591_339780_+|50S-ribosomal-protein-L28 MGKQCFVTGRKASTGNRRSHALNSTKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVTRV >NZ_LT992462.1|WP_000547904.1|340160_340802_-|thiamine-diphosphokinase MHINLLCSDRHLPQDIWAKSNEGKWGGVDRGALILLKHQIIPFFSVGDFDSVSKEERQLLTEQLQIKPVQAEKADTDLALAVDKAVALGFDSITIYGATGGRLDHFFGAIQLLLKKAYYKHDVHIEVIDQQNKIELLPKGQHTVEKDKSYPYISFIPMTDDVELSLAGFKYNLARQMLNIGSTLTISNEIESLQAKVIVHDGLILQIRSTDLN >NZ_LT992462.1|WP_000164332.1|340808_341453_-|ribulose-phosphate-3-epimerase MTKLYPSLLSVDFLDLQHELKRLEEAGVDGVHFDVMDGQFVPNISIGLPILDAVRKGTTLPIDVHLMIENPEKYIASFAEHGADMISIHVESTPHIHRAIQMIKHLDKKAGVVINPGTPISQIEPILDIVDYVLVMTVNPGFGGQSFIDQCVEKIAGLNAIKMERQLNFDIEVDGGVNTDTAKVCVENGATMLVTGSFFFKQEDYKKVTQALKG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT992462_2 | 680593-680673 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT992462_2
|
1 spacers
spacers of NZ_LT992462_2
>2.1|680618|31|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder ATCACTTATGCTTTATTATGTATTGGTTCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT992462_2
The CRISPR arrays of NZ_LT992462_2 >merge|NZ_LT992462|2|680593-680673|CRISPRCasFinder GGGAGTGGGAGAGAAATGATAAAGAATCACTTATGCTTTATTATGTATTGGTTCTTGGGAGTGGGACAGAAATGATAAAGA >NZ_LT992462|2|2|680593-680673|CRISPRCasFinder GGGAGTGGGAGAGAAATGATAAAGA ATCACTTATGCTTTATTATGTATTGGTTCTT GGGAGTGGGACAGAAATGATAAAGA
>NZ_LT992462.1|WP_000752917.1|680255_680450_-|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >NZ_LT992462.1|WP_001183849.1|679170_680022_+|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEFVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NZ_LT992462.1|WP_000168845.1|678081_678843_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >NZ_LT992462.1|WP_000205572.1|676675_677983_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >NZ_LT992462.1|WP_001825559.1|675319_676570_-|cysteine-desulfurase MNEVAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSTIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF >NZ_LT992462.1|WP_001010508.1|674865_675330_-|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MNFNNLDQLYRSVIMDHYKNPRNKGVLDNGSMTVDMNNPTCGDRIRLTFDIEDGIIKDAKFEGEGCSISMASASMMTQAVKGHSLGEAMQMSQEFTKMMLGEDYVITEEMGDIEALQGVSQFPARIKCATLAWKALEKGTVAKEGKAEGTTEEE >NZ_LT992462.1|WP_001074405.1|673317_674715_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MAKKAPDVGDYKYGFHDDDVSIFRSERGLTENIVREISNMKNEPEWMLDFRLKSLKLFYKMPMPQWGGDLSELNFDDITYYVKPSEQAERSWDEVPEEIKRTFDKLGIPEAEQKYLAGVSAQYESEVVYHNMEKELEEKGIIFKDTDSALQENEELFKKYFASVVPAADNKFAALNSAVWSGGSFIYVPKNIKLDTPLQAYFRINSENMGQFERTLIIADEGASVHYVEGCTAPVYTTSSLHSAVVEIIVHKDAHVRYTTIQNWANNVYNLVTKRTFVYENGNMEWVDGNLGSKLTMKYPNCVLLGEGAKGSTLSIAFAGKGQVQDAGAKMIHKAPNTSSTIVSKSISKNGGKVIYRGIVHFGRKAKGARSNIECDTLILDNESTSDTIPYNEVFNDQISLEHEAKVSKVSEEQLFYLMSRGISEEEATEMIVMGFIEPFTKELPMEYAVEMNRLIKFEMEGSIG >NZ_LT992462.1|WP_000274033.1|672671_672986_+|hypothetical-protein MYFVLAIFTIISASVSLGYSIQACASSHNINAYYALSRSLPLFLLAIFSLVIHSAIFLITISIAMILVQFLDAIVGYKSNDVFKTYGPLATSVVNLILLIVFLF >NZ_LT992462.1|WP_000582322.1|671262_672303_-|DUF21-domain-containing-protein MIIAIIILIFISFFFSGSETALTAANKTKFKTEADKGDKKAKGIVKLLEKPSEFITTILIGNNVANILLPTLVTIMALRWGISVGIASAVLTVVIILISEVIPKSVAATFPDKITRLVYPIINICVIVFRPITLLLNKLTDSINRCLSKGQPQEHQFSKEEFKTMLAIAGHEGALNEIETSRLEGVINFENLKVKDVDTTPRINVTAFASNATYEEVYETVMNKPYTRYPVYEGDIDNIIGVFHSKYLLAWSNKKEDQITNYSAKPLFVNEHNKAEWVLRKMTISRKHLAIVLDEFGGTEAIVSHEDLIEELLGMEIEDEMDKKEKEKLSQQQIQFQQRKNRNVSI >NZ_LT992462.1|WP_000267231.1|670181_671249_-|nitronate-monooxygenase MWNKNRLTQMLSIEFPIIQAGMAGSTTPKLVASVSNSGGLGTIGAGYFNTQQLEDEIDYVRQLTSNSFGVNVFVPSQQSYTSNQIENMNAWLKPYRRALHLEEPVVKITEEQQFKCHIDTIIKKQVPVCCFTFGIPNESIIKRLKEANIKLIGTATSVDEAIANEKAGMDAIVAQGSEAGGHRGSFLKPKNQLPMVGTISLVPQIVDVVSIPVIAAGGIMDGRGVLASIVLGAEGVQMGTAFLTSQDSNASELLRDAIINSKETDTVITKAFSGKLARGINNRFIEEMSQYEGDIPDYPIQNELTSSIRKAAANIGDKELTHMWSGQSPRLATTHPANTIMSNIINQINQIMQYK >NZ_LT992462.1|WP_000732338.1|681257_682079_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGSKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGNVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_LT992462.1|WP_000520233.1|682096_682792_-|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_LT992462.1|WP_000571213.1|682784_683810_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NZ_LT992462.1|WP_001065802.1|684059_684356_-|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFQSVTDLLENLK >NZ_LT992462.1|WP_001018957.1|684348_684735_-|hypothetical-protein MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKFDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPFLPNINNERLVLVNE >NZ_LT992462.1|WP_153170730.1|685091_685250_+|hypothetical-protein MQVGGAPTQRNWIPNFYRQCKLAGPQHREIGFPISTDNASWGGTTIKKYFFY >NZ_LT992462.1|WP_021285965.1|685436_686315_-|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPILPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPISDLSLKDIQAHLKSLNADNEDIPFSGAFSIEFRLLKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQGLKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NZ_LT992462.1|WP_000290492.1|686494_686875_-|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEVSDESQLEALLSAEKYAEMIGE >NZ_LT992462.1|WP_000589549.1|687032_687389_-|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NZ_LT992462.1|WP_001147955.1|687532_687853_+|thioredoxin-family-protein MQAIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT992462_3 | 982939-983047 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT992462_3
|
1 spacers
spacers of NZ_LT992462_3
>3.1|982978|31|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder AAAGCCTCTTGAACTCTAGTGATTAGAGGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT992462_3
The CRISPR arrays of NZ_LT992462_3 >merge|NZ_LT992462|3|982939-983047|CRISPRCasFinder TTTATGCAGTTGTGCGGTAGCATCCAACTGCGTTCCTTTAAAGCCTCTTGAACTCTAGTGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCGGTAGCATCCAACTGCGTTCCTTT >NZ_LT992462|3|3|982939-983047|CRISPRCasFinder TTTATGCAGTTGTGCGGTAGCATCCAACTGCGTTCCTTT AAAGCCTCTTGAACTCTAGTGATTAGAGGCT TTTATGCAGTTGTGCGGTAGCATCCAACTGCGTTCCTTT
>NZ_LT992462.1|WP_000749060.1|981999_982887_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKSLIAFILIFMLVLSGCGMKDNDKQSSDDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NZ_LT992462.1|WP_010922824.1|980898_981849_-|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVIGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >NZ_LT992462.1|WP_000365352.1|980124_980844_-|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKIDNKGENYGSIY >NZ_LT992462.1|WP_000362963.1|979340_980141_-|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLMLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >NZ_LT992462.1|WP_000735556.1|978698_979205_-|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLANTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNENGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NZ_LT992462.1|WP_001222139.1|977820_978537_-|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFILNFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTLDAMIHNPQSAQTFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >NZ_LT992462.1|WP_001045424.1|976863_977652_-|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLESHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFLSYYLNFLKSVS >NZ_LT992462.1|WP_001018677.1|976237_976612_+|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NZ_LT992462.1|WP_021285860.1|974360_975290_+|DMT-family-transporter MLLFYIIGVIVGMFIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIVLNIFINPDVFSLHFFSNQTFNYTWFVGGLLGVGYLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIITMNQINKCNILLTNQKHLIFWLLLGFTFGFFPPIQTTINSLLASHTHSPAFASLVSFTIGSITLLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >NZ_LT992462.1|WP_000169038.1|973943_974168_+|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNIVTEQVARDSMNALVDLNILKSNSGAITKVHSAQIIDKTTTVLFEAKK >NZ_LT992462.1|WP_000901759.1|983216_983852_-|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIRPSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKAELRKELLTLKGIGSETADVLLVYIFERIEFIPDSYTRKIYNKLGYENTKSYDQLKKVITLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_LT992462.1|WP_001021133.1|984192_985854_-|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNILLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVAAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIVKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_LT992462.1|WP_000359090.1|985850_986267_-|DUF1934-domain-containing-protein MDKKVSIYTKQVLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQATTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_LT992462.1|WP_001200750.1|986542_987553_-|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADVIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_LT992462.1|WP_016187113.1|988051_988573_-|YwhD-family-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKVILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_LT992462.1|WP_000180233.1|988600_989896_-|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVSPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGKIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NZ_LT992462.1|WP_000477504.1|989935_990412_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_LT992462.1|WP_000633790.1|990581_991118_-|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQGLDYQWIDVTQHRFKPIRDVRHIEESITDYEDDYQEILDKVLASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTANKPGDIMKDNYALARATEWNQLLQ >NZ_LT992462.1|WP_000808883.1|991563_992502_-|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINFLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVNALEKIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVIENIKAADIVLSKDEIQYIDELFPIED >NZ_LT992462.1|WP_000923047.1|992771_993398_-|DUF443-domain-containing-protein MLLCESKIINKNPKYRIIKYNDEYLMVDIISTWISLFFPFINWFIPKRYVKISKEDFENLNIVKPAKKNVFWPVAGISALFAVTLRKYTHLLDTQLDKKLVIAICCITFIGILIFYVRLIKKSSLNIYNPKNERSKIILIPTLKNFCFTLFGYILFGGLTMLFLDALLSMSHQNIIVYFTWIAVIMGFFLVNIALIIDKNIYVILKNQ |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT992462_4 | 1551972-1552054 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT992462_4
|
1 spacers
spacers of NZ_LT992462_4
>4.1|1551997|33|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT992462_4
The CRISPR arrays of NZ_LT992462_4 >merge|NZ_LT992462|4|1551972-1552054|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTACTATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC >NZ_LT992462|4|4|1551972-1552054|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC
>NZ_LT992462.1|WP_000277602.1|1551232_1551646_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NZ_LT992462.1|WP_000160430.1|1549729_1551028_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVIDFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANQTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >NZ_LT992462.1|WP_000626092.1|1548418_1549360_-|pApA-hydrolase-Pde2 MISTMNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGRKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLKQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLAKALRTKLN >NZ_LT992462.1|WP_000226933.1|1545200_1548398_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDTCIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTVETVVLAKDNNGLKDLYQLSSEIKMNALEHVSFELLKRFSNNMIIIFKNVADEHRDIVQVFDSHEDTYLDHRSVLVQGIKHVWIQDVCYQTRHDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTENEIQQLDVNPEYFTQADRIAQKCDAELKYHQSLLPQYQAPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRREKVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVEERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKKFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDLRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSQIDMFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >NZ_LT992462.1|WP_021285932.1|1543522_1544752_-|NAD-dependent-malic-enzyme-4 MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPLFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >NZ_LT992462.1|WP_000471571.1|1542470_1543328_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >NZ_LT992462.1|WP_000883646.1|1541526_1542471_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >NZ_LT992462.1|WP_021285933.1|1540289_1541258_-|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSTRCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >NZ_LT992462.1|WP_001232654.1|1538510_1540268_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >NZ_LT992462.1|WP_000818532.1|1536805_1538167_+|amino-acid-permease MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAYKTQFGHASFTNLYEHGVFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKKATYKLFGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVETRRAIYFIPIWFILLGFMYLRYKRIAAKSNN >NZ_LT992462.1|WP_000777188.1|1552151_1552841_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >NZ_LT992462.1|WP_000161656.1|1553015_1554071_+|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEINKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPSQEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >NZ_LT992462.1|WP_000690004.1|1554386_1555505_-|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDRKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDNPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >NZ_LT992462.1|WP_000634175.1|1555645_1556146_+|universal-stress-protein MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >NZ_LT992462.1|WP_000040067.1|1556392_1557595_-|acetate-kinase MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLVERIGLKDSIFTIEVDGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKKHNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESAAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLQRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTYGGLK >NZ_LT992462.1|WP_000840583.1|1557682_1558630_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNERGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGAGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMPLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSRDFKLGFEEGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVVPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK >NZ_LT992462.1|WP_000136251.1|1558752_1559247_-|thiol-peroxidase MTEITFKGGPIHLKGQLINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI >NZ_LT992462.1|WP_000365308.1|1559344_1560115_-|TSUP-family-transporter MDLNLTMIIIIILFGFIAAFIDSVVGGGGLISTPALLAIGLPPSVALGTNKLASSFGSLTSAIKFIRSGKVDLYVVAKLFGFVFLASACGAYIATMVPSQILKPLIIIALSSVFIFTLLKKDWGNTRTFTQFTFKKAILFAALFILIGFYDGFVGGGTGSFMLFVLLIFGFDFLSAAGNAKVLNFASNIGALVLFMVLGQVDYVIGLVMAASMIVGSYAGAHFAIKQGVGYVKVLFIIITAILILKNAFDYIQQFV >NZ_LT992462.1|WP_000872673.1|1560158_1561382_-|tRNA-4-thiouridine(8)-synthase-ThiI MKYDHLLVRYGELTLKGSNRKKFVNQLRNNVNKSLKGLDGFVVKGKRDRMYIELEDHADINEITYRLSKIFGIKSISPVLKVEKTLEAMSATAIKFAQQFEENSTFKIDVKRADKNYPMDTYELQRELGGAVLKHFDNISVNVKRPDHEIRVEVRLDAIYMYEEVVQGAGGLPVGTGGKTLLMLSGGIDSPVAGMEVMRRGVTIEAIHFHSPPFTSDQAKEKVIELTRILAERVGPIKLHIVPFTELQKQVNKVVHPRYTMTSTRRMMMRVADKLVHQIGAYAIVNGENLGQVASQTLHSMYAINNVTSTPVLRPLLTYDKEEIIIKSKEIGTFETSIQPFEDCCTIFTPKNPVTEPNFDKVVQYESVFDFEEMINRAVENIETLEITSDYKTIKEQQTNQLINDFL >NZ_LT992462.1|WP_072434776.1|1561381_1562530_-|cysteine-desulfurase MFILIYLDNAATTKAFEEVLDTYLKVNQSMYYNPNSPHKAGLQADQLLQQAKVQINDMVNTNMTYDVVFTSGATESNNIALKGVAYRKFDTAREIITSVLEHPSVLEVVRYLEEREGFKVKYVDVTKDGSINLEHFKELMSDKVGLVTCMYVNNVTGQIQPIPQMADVIKNYPKAHFHVDAVQAFGKISMDFNNVDSISLSGHKFNGLKGQGVLLVNHIQNVEPTVHGGGQEYGVRSGTVNLPNDIAMVKAMKIANENLEALNAFVTELNNDVRQFLNKYHGVYINSSTSGSPFVLNVSFPGVKGEVLVNAFSKYDIMISTTSACSSKRNKLNEVLTAMGLSDKAIEGSIRLSFGAMTTKEDITKFKETFTIIYEEIKELLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LT992462_5 | 1640326-1640419 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT992462_5
|
1 spacers
spacers of NZ_LT992462_5
>5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder AGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAG |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT992462_5
The CRISPR arrays of NZ_LT992462_5 >merge|NZ_LT992462|5|1640326-1640419|CRISPRCasFinder GCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCTCAACATAG >NZ_LT992462|5|5|1640326-1640419|CRISPRCasFinder GCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCCCAACATAG AGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAG GCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCTCAACATAG
>NZ_LT992462.1|WP_000492903.1|1639398_1640019_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MFSRNNNIFVDDLSVTKDNYLIAVLKMLVIFLVINYGTDVSYDHEYVGLFIILLGVVLLKILNINLLSFKKLKFTHMLYIIFGFLLMYGLDYLYDTFAPPTLNEILIDEESEDAPYHIALLSTAIIPPITEEIICRGLIIRILFRNHLFLGFIVSTVFFTLIHESDTLIGYLPYFYSGLIFGYTYLKTKRLEVPILIHFINNLLAM >NZ_LT992462.1|WP_001168915.1|1638596_1639232_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MQKFKDLFYDDLSVARGNYFLTLLSAFLITIILLIGFVVSDTHILYGVFIVLIGIVLLRLFKINLLSFKKLTMSQVIYIIGGALLIYGLDYLYLHFHDVPTNEQELDRELQHMPLYMSIVTIAIIPAIVEEIVFRGMIIRVVFRKHLFIGLVVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGVIFGLIYLKTKRLEVVILIHFINNLSSLLILLWG >NZ_LT992462.1|WP_001030474.1|1637855_1638299_-|hypothetical-protein MNKASFDKKVKKQLWFLNKKEKQALDQRLSSITDKDNVNFNKPITFANTYLRENVFRSKESKSYSIFVTLVVMMFAYVALLGLFLFGLITSLSGVQFFVNPKVDLSTTVVILTIIGAILLMLVSIYLIKITTSYFTKKLLEHKFNGH >NZ_LT992462.1|WP_001153741.1|1637425_1637869_+|competence-protein-ComK MQDNSTKYLLYIQTATSNHLETNCVFLHCDYILKVPINKLVSYYAKLHLSSQSVLIETAKNILNINKLVPIYINAKTILFPLKHKRAPIQIYINAHYIVGMTAIENSTLIHFQEGIQLEVDEPFSLVSKKCHESLALKHFIENTNDH >NZ_LT992462.1|WP_000671058.1|1636842_1637313_+|RNA-polymerase-sigma-factor MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSNQSLSSFLFMRLNFYLIDLFRQQKRLNDIILCENHSPILTEQPTYFNEYDLRLQDVCALLKHRERQWLMLYLEGYKQYEIADIMSLSTSTIKLIKASVKRKCQRFLN >NZ_LT992462.1|WP_000384171.1|1636419_1636644_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK >NZ_LT992462.1|WP_001032832.1|1635289_1636144_-|glucosaminidase-domain-containing-protein MNKHKKGSIFGIIGLVVIFAVVSFLFFSMISDQIFFKHVKSDIKIEKLNVTLNDAAKKQINNYTSQQVSNKKNDAWRDASATEIKSAMDSGTFIDNEKQKYQFLDLSKYQGIDKNRIKRMLVDRPTLLKHTDDFLKAAKDKHVNEVYLISHALLETGAVKSELANGVEIDGKKYYNFYGVGALDKDPIKTGAEYAKKHGWDTPEKAISGGADFIHKHFLSSTDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNATIIADFYKNMKTEGKYFKYFVYKDDSKHLKK >NZ_LT992462.1|WP_000989103.1|1633910_1635203_+|arsenite-efflux-transporter-membrane-subunit-ArsB MMTTLATFIFLVTLLFVLWQPKGLDIGFTALAGAFIAVITGVVSFSDVFEVTGIVWNATLTFVSVILISLILDKIGFFEWSAIHMLHASKGSGLKMFVYIILLGAVVAAFFANDGAALILTPIVLAMVKNIGFSKRAIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIISADYFNISFSQYLSRMIIPNLFSLLASLLVLWLYFRKAIPKSFDANHIKKPIDAINDLKLFKISWIVLVILLFGYLISEFTKIPVSIFTGIIAFIFLILARKSNAVNIKQVIKGAPWNIVLFSIGMYIVIFGLRNAGITLILAKILEYISNYGLFSTILGMGFISAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSNVHGMLKEGLIYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKDVKISWGTYFKTGIIITIPVLFFTLIGLYLTLILF >NZ_LT992462.1|WP_000221190.1|1633596_1633911_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTYKELATYLKVLSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNLVTTRKIGNKHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC >NZ_LT992462.1|WP_001261672.1|1631451_1632954_-|FAD/NAD(P)-binding-protein MRVAIIGMGTAGVSVLRELVKHPKFNQLDIDLYDDKVNMGQGVPFQNDSSELLINMPSKKMSLNLDDETEFWKWYKQQTDFNFDEPAYLPRFVFGHYMKSYLSMFTKKYPNISTNYNKVQEIYTNSNIDETNLTYYICTTNSEQSWQAYDYVFLTCGTFAYHDPYNLKGKKGYIATPYPTYNTLDEVNELDDIAIIGTGLASLDVVRYVAAHHPKLPITMTSRSANLPSVRGTMIDVTFKYLTKDKLNDIKKHHFGNAPLDTLVSLFLKECAEYDIDFEKLVHRRTGNHIADLKYDLARLTEMGIFQSIIEHLKENLNWIWNSLSIEDQHQFNQKYSKMIQLNSNPMPPRTAELIIELIENKSLILKKDLEDVKHDGKLYYFSYKNQESVDIYKVVINATGAKSHLNELDQDDQLIKNLENRQIVQAHPMGGIQIIPETNQVISPRFGTLTNMIAIGQMTNGVNKLRNGVKMIVEQVAHTVSQLYDALESNEQEQRSDNQ >NZ_LT992462.1|WP_001096494.1|1640581_1641295_-|transaldolase MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEAAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL >NZ_LT992462.1|WP_000091443.1|1641553_1641856_+|hypothetical-protein MSRSKKYFYLSSLMIILSFFFNTNNVFLSGLFNSFIKLILFCSVINSIILILSIIFADRSIKSLKPDADWIRIASKSLPWIILIVILVHIFSIVHTFGFI >NZ_LT992462.1|WP_001200546.1|1642110_1642476_+|fluoride-efflux-transporter-CrcB MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIEFFSNHPTLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDYQQFITLLLYAVTSYVFGILLCYVGIKLGGGLS >NZ_LT992462.1|WP_000623484.1|1642472_1642826_+|CrcB-family-protein MISIILVMIGGGLGAIARSAVTDYFNHIFTSKLPIATLIVNLVGSFLIGLTIGLSISISWFPAFFVTGFLGGLTTFSTLAKELTLMMTPKFDIKLFLNYSLLQFIIGFIACYIGYHI >NZ_LT992462.1|WP_000453302.1|1643075_1643909_-|aldo/keto-reductase MEVKTFYNGNTMPQIGLGTFRVENDENCMESVKYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGAGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRENVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAIMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDETIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFRIFDFELSDEQMTRIDDLNQDKRIGPDPKTFEG >NZ_LT992462.1|WP_000366160.1|1644120_1645029_-|NERD-domain-containing-protein MDLSSPVVIGLIIAVVIALIFFVLFLVALGSKKKVKRQTEEKYEQQEQNIKKSHEEALEKERIQNKKTITKQQEDYNHMISTKDREIDALKLFSKNHSEYVTDMRLIGIRERLVKEKRIRPEDMHIMANIFLPKDGFNNIERISHLVLTRTGLYIIDSQLLKGHVYNGISGGQFKDLPPMEQVFDTLDLDKSRPQTIVMDQNDDKRSLSFVNYSDQIEAIKQLAEDLQKHLGAKYTPTSILYFNPKNEGDVTISNYNQNSAVKVLVGAEQLDEFFNKFVFHGRIQYNVEDLQQMMDKIESFN >NZ_LT992462.1|WP_000933822.1|1645153_1646347_-|methionine-adenosyltransferase MLNNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDAILKDDPNARVACETTVTTGMALIAGEISTTTYVDIPKVVRETIKEIGYTRAKYGYDYETMAILTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRDKDSEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLAIYLSHQLAKRLSDVRKDGTLNYLRPDGKVQVTVEYDENDNPVRIDTIVVSTQHAEDVTLEQIQEDIKAHVIYPTVPENLINEQTKFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAYAIGVAEPVSIAIDTFGTGKVSEGQLVEAVRKHFDLRPAGIIKMLDLKQPIYKQTAAYGHFGRTDVLFPWEKLDKVEELKDAVK >NZ_LT992462.1|WP_000109913.1|1646718_1648311_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase-(ATP) MSVDTYTETTKIDKLLKKPTSHFQLSTTQLYNKILDNNEGVLTELGAVNASTGKYTGRSPKDKFFVSEPSYRDNIDWGEINQPIDEETFLKLYHKVLDYLDKKDELYVFKGYAGSDKDTMLKLTVINELAWHNLFAKNMFIRPESKEEATKIKPNFTIVSAPHFKADPEVDGTKSETFVIISFKHKVILIGGTEYAGEMKKGIFSVMNYLLPMQDIMSMHCSANVGEKGDVALFFGLSGTGKTTLSADPHRKLIGDDEHGWNKNGVFNIEGGCYAKAINLSKEKEPQIFDAIKYGAILENTVVSEDGSVDFEDNRYTENTRAAYPINHIDNIVVPSKAAHPNTIIFLTADAFGVIPPISKLNKDQAMYHFLSGFTSKLAGTERGVTEPEPSFSTCFGAPFFPLHPTVYADLLGELIDLHDVDVYLVNTGWTGGKYGVGRRISLHYTRQMVNQAISGKLKNAKYTKDSTFGLSIPVEIEDVPKTILNPINAWSDKEKYKAQAEDLIQRFEKNFEKFGEKVEHIAEKGSFNK >NZ_LT992462.1|WP_016187361.1|1648607_1649354_-|S9-family-peptidase MPIESFTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPHHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTQLLRLLHDKYPQAFIHMVGFSRGGLQGLLTFQDLPVSSYIIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPPILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGAAHETFYQMAEGHVPRPPAMVETLTYIKEFMNQVELHR >NZ_LT992462.1|WP_000672013.1|1649358_1649832_-|nucleoside-triphosphatase-YtkD MKFRDKDNRQVNLTFKKDNEIADGNHVLAIPTFKNQLLFTKHNLRGIEFPGGKRERGESSAEAVTRELYEETGAKVKNIHYIAQYTIETHDQTDFVKDVYFIEVESLVSKNDYLETAGPVLFNCINDIELAQRSFLLQDSTILKCVERVQSLGFYQT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT992462_6 | 1904597-1904809 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT992462_6
|
2 spacers
spacers of NZ_LT992462_6
>6.1|1904644|34|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder TGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTA >6.2|1904725|38|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder TGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT992462_6
The CRISPR arrays of NZ_LT992462_6 >merge|NZ_LT992462|6|1904597-1904809|CRISPRCasFinder TGACGTATTGTTGCGGGAACTTGGTGTCATGACATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCGTGCCATGCTACTTTGATGTGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTTTGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCATGCCATGCTACTTTGATG >NZ_LT992462|6|6|1904597-1904809|CRISPRCasFinder TGACGTATTGTTGCGGGAACTTGGTGTCATGACATGTTACTTTGATG TGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTA TGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCGTGCCATGCTACTTTGATG TGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTT TGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCATGCCATGCTACTTTGATG
>NZ_LT992462.1|WP_001187614.1|1903915_1904563_+|HD-domain-containing-protein MQQSDIISAAKKYMESIHQNDYTGHDIAHVYRVTALAKSIAENEGVNDTLVIELACLLHDTVDEKVVDANKQYAELKSFLSSLSLSTEDQEHILFIINNMSYRNGKNDHVTLTLEGQIVRDADRLDAIGAIGVARTFQFAGHFGEPMWTEQMSLDKINDDLVEQLPPSAIKHFFEKLLKLESLMHTDTAKMIAKERHDFMMIYLKQFFTEWNYHD >NZ_LT992462.1|WP_000571550.1|1902403_1903888_+|cardiolipin-synthase MIELLSIALKHSNIILNSIFIGAFILNLLFAFTIIFMERRSANSIWAWLLVLVFLPLFGFILYLLLGRQIQRDQIFKIDKEDKKGLELIVDEQLAALKNENFSNSNYQIVKFKEMIQMLLYNNAAFLTTDNDLKIYTDGQEKFDDLIQDIRNATDYIHFQYYIIQNDELGRTILNELGKKAEQGVEVKILYDDMGSRGLRKKGLRPFRNKGGHAEAFFPSKLPLINLRMNNRNHRKIVVIDGQIGYVGGFNVGDEYLGKSKKFGYWRDTHLRIVGDAVNALQLRFILDWNSQATRDHISYDDRYFPDVNSGGTIGVQIASSGPDEEWEQIKYGYLKMISSAKKSIYIQSPYFIPDQAFLDSIKIAALGGVDVNIMIPNKPDHPFVFWATLKNAASLLDAGVKVFHYDNGFLHSKTLVIDDEIASVGTANMDHRSFTLNFEVNAFIYDQQIAKKLKQAFIDDLAVSSELTKARYANRSLWIKFKEGISQLLSPIL >NZ_LT992462.1|WP_000138932.1|1901944_1902238_-|copper-sensing-transcriptional-repressor-CsoR MTEQDNAHHSEQIKTNLKSRLNRIEGQVRAINRMIEEDVYCDDVLTQIRATRSALNSVAIKLLEQHMKSCIMNKVNQGAQEEAMEELLVTFQKLIKD >NZ_LT992462.1|WP_000581792.1|1901723_1901933_-|heavy-metal-associated-domain-containing-protein MIHQNTIYTAGIETEEQVSQLTERISNMIGVHQVNINIIDGQVTVSYETPANLNSIEKEIYDEGYKIVF >NZ_LT992462.1|WP_000828354.1|1901458_1901596_-|hypothetical-protein MKRPEKIQNVVKLLSSLGVNIKKTKSRLDIINTLPASNKVSHELK >NZ_LT992462.1|WP_001109939.1|1899992_1901195_+|rod-shape-determining-protein-RodA MNYSSRQQPDKHWLRKVDWVLVATIAVLAIFSVLLINSAMGGGQYSANFGIRQIFYYILGAIFAGIIMFISPKKIKHYTYLLYFLICLLLIGLLVIPESPITPIINGAKSWYTFGPISIQPSEFMKIILILALARVVSRHNQFTFNKSFQSDLLLFFKIIGVSLVPSILILLQNDLGTTLVLAAIIAGVMLVSGITWRILAPIFITGIVGAMTVILGILYAPALIENLLGVQLYQMGRINSWLDPYTYSSGDGYHLTESLKAIGSGQLLGKGYNHGEVYIPENHTDFIFSVIGEELGFIGSVILILIFLFLIFHLIRLAAKIEDQFNKIFIVGFVTLLVFHILQNIGMTIQLLPITGIPLPFISYGGSALWSMMTGIGIVLSIYYHEPKRYVDLYHPKSN >NZ_LT992462.1|WP_000159641.1|1898604_1899675_-|D-alanine--D-alanine-ligase MTKENICIVFGGKSAEHEVSILTAQNVLNAIDKDKYHVDIIYITNDGDWRKQNNITTEIKSTDELHLENGEALEISQLLKESSSGQPYDAVFPLLHGPNGEDGTIQGLFEVLDVPYVGNGVLSAASSMDKLVMKQLFEHRGLPQLPYISFLRSEYEKYEHNILKLVNDKLNYPVFVKPANLGSSVGISKCNNEAELKEGIKEAFQFDRKLVIEQGVNAREIEVAVLGNDYPEATWPGEVVKDVAFYDYKSKYKDGKVQLQIPADLDEDVQLTLRNMALEAFKATDCSGLVRADFFVTEDNQIYINETNAMPGFTAFSMYPKLWENMGLSYPELITKLIELAKERHQDKQKNKYKID >NZ_LT992462.1|WP_000611457.1|1897234_1898590_-|UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D--alanine-ligase MINVTLKQIQSWIPCEIEDQFLNQEINGVTIDSRAISKNMLFIPFKGENVDGHRFVSKALQDGAGAAFYQKGTPIDENVSGPIIWVEDTLTALQQLAQAYLRHVNPKVIAVTGSNGKTTTKDMIESVLHTEFKVKKTQGNYNNEIGLPLTILELDNDTEISILEMGMSGFHEIEFLSNLAQPDIAVITNIGESHMQDLGSREGIAKAKSEITIGLKDNGTFIYDGDEPLLKPHVKEVENAKCISIGVATDNALVCSVDDRDTTGISFTINNEHYDLPILGKHNMKNATIAIAVGHELGLTYNIIYQNLKNVSLTGMRMEQHTLENDITVINDAYNASPTSMRAAIDTLSTLTGRRILILGDVLELGENSKEMHIGVGNYLEEKHIDVLYTFGNEAKYIYDSGQQHVEKAQHFNSKDDMIEVLTSDLKAHDRVLVKGSRGMKLEEVVNALIS >NZ_LT992462.1|WP_001178939.1|1895198_1896719_-|DEAD/DEAH-box-helicase MQNFKELGISDNTVQSLESMGFKEPTPIQKDSIPYALQGIDILGQAQTGTGKTGAFGIPLIEKVVGKQGVQSLILAPTRELAMQVAEQLREFSRGQGVQVVTVFGGMPIERQIKALKKGPQIVVGTPGRVIDHLNRRTLKTDGIHTLILDEADEMMNMGFIDDMRFIMDKIPAVQRQTMLFSATMPKAIQALVQQFMKSPKIIKTMNNEMSDPQIEEFYTIVKELEKFDTFTNFLDVHQPELAIVFGRTKRRVDELTSALISKGYKAEGLHGDITQAKRLEVLKKFKNDQINILVATDVAARGLDISGVSHVYNFDIPQDTESYTHRIGRTGRAGKEGIAVTFVNPIEMDYIRQIEDANGRKMSALRPPHRKEVLQAREDDIKEKVENWMSKDSESRLKRISTELLNEYNDVDLVAALLQELVEANDEVEVQLTFEKPLSRKGRNGKPSGSRNRNSKRGNPKFDSKSKRSKGYSSKKKSTKKFDRKEKSSGGSRPMKGRTFADHQK >NZ_LT992462.1|WP_001190840.1|1894150_1894846_+|response-regulator-transcription-factor MQSKILIIEDDHAITHLLDVALTLDYYNVTTADNATQAHFKIQIDKPDVILLDLGLPDKDGLCLISEIRQHTDIPIIVISARQEEQTIIQALDNGANDYMTKPFNVDELRARIRVIERIAKSHQETNFVFTNGLLSIDFGSKSVVINNQEVHLTPNEFSLLELLSNHKGKVLTYEMILKRIYGYVNKTEMPSLRVHMTSLRQKLSQCHEDAKDIIKTHPRIGYQMLQWKEK >NZ_LT992462.1|WP_001825748.1|1904842_1905163_+|hypothetical-protein MIWRCGVMGGIARGIDAMPLQFYDMALGRCNVYYAVVTLLFHTVTCICELLWKCCDIYCYTDESLCQDDIAMMNSNSVINHFLHAEISLILFGSMSNWTDAFNIGS >NZ_LT992462.1|WP_000725800.1|1906804_1907677_-|membrane-protein-insertase-YidC MKKKALLPLFLGIMVFLAGCDYSKPEKRSGFFYNTFVDPMKNVLDWLGNNLLNDNYGLAIIILVLVIRIILLPFMLSNYKNSHMMRQKMKVAKPEVEKIQEKVKRARTQEEKMAANQELMQVYKKYDMNPIKSMLGCLPMLIQLPIIMGLYFVLKDQLVDGLFKYPHFLWFDLGRPDIWITIIAGVLYFIQAYVSSKTMPDEQRQMGYMMMVISPIMIIWISLSSASALGLYWSVSAAFLVVQTHFANIYYEKVAKKEVQPFIEAYEREHNGGNNKKGKNTQVVSKKKKK >NZ_LT992462.1|WP_000483161.1|1907762_1908404_-|thiamine-phosphate-synthase MFNQSYLNVYFICGTSDVPSHRTIHEVLEAALKAGITLFQFREKGESALKGNDKLVLAKELQHLCHQYDVPFIVNDDVSLAKEINADGIHVGQDDAKVKEIAQYFTDKIIGLSISDLGEYAKSDLTHVDYIGVGPIYPTPSKNDAHTPVGPEMIATFKEMNPQLPIVAIGGINTSNVAPIVEAGANGISVISAISKSENIEKTVNRFKDFFNN >NZ_LT992462.1|WP_001108486.1|1908405_1909197_-|hydroxyethylthiazole-kinase MNYLNKIRIENPLTICYTNDVVKNFTANGLLSIGASPAMSEAPEEAEEFYKVAQALLINIGTLTAQNEQDIIAIAQTANEAGLPIVFDPVAVGASTYRKQFCKLLLKSAKVSVIKGNASEILALIDDTATMKGTDSDANLDAVAIAKKAYAIYKTAIVITGKEDVIVQGDKAIVLANGSPLLARVTGAGCLLGGVIAGFLFRETEPDIEALIEAVSVFNIAAEVAAENENCGGPGTFSPLLLDTLYHLNETTYQQRIRIQEVE >NZ_LT992462.1|WP_000594965.1|1909180_1910011_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MIKPKIALTIAGTDPTGGAGVMADLKSFHSCGVYGMGVVTSIVAQNTLGVQNIHNLNHQWVDEQLDSVFNDTLPHAIKTGMIATADTMETIRHYLMQHESIPYVIDPVMLAKSGDSLMDNDTKQNLQHTLLPLADVVTPNLPEAEEITGLTIDSEEKIMQAGRIFINEIGSKGVIVKGGHSNDTDIAKDYLFTKEGVQTFENERFKTKHTHGTGCTFSAVITAELAKGRPLFDAVQKAKKFISMSIQYTPEIGRGRGPVNHFAYLKKEGLDDELSK >NZ_LT992462.1|WP_000396068.1|1910003_1910693_-|thiaminase-II MEFSQKLYQAAKPIINDIYEDDFIQKMLLGNIQADALRHYLQADAAYLKEFTNLYALLIPKMNSMNDVKFLVEQIEFMVEGEVLAHDILAQIVGESYEEIIKTKVWPPSGDHYIKHMYFQAHSRENAIYTIAAMAPCPYIYAELAKRSQSDHKLNREKDTAKWFDFYSTEMDDIINVFESLMNKLAESMSDKELEQVKQVFLESCIHERRFFNMAMTLEQWEFGGKVND >NZ_LT992462.1|WP_000751995.1|1911079_1911775_-|lytic-transglycosylase-SceD MKKTLLASSLAVGLGIVAGNAGHEAHASEADLNKASLAQMAQSNDQTLNQKPIEAGAYNYTFDYEGFTYHFESDGTHFAWNYHATGANGADMSAQAPATNNVAPSADQANQVQSQEVEAPQNAQTQQPQASTSNNSQVTATPTESKASEGSSVNVNDHLKQIAQRESGGNIHAVNPTSGAAGKYQFLQSTWDSVAPAKYKGVSPANAPESVQDAAAVKLYNTGGAGHWVTA >NZ_LT992462.1|WP_000932694.1|1912163_1912559_-|single-stranded-DNA-binding-protein MLNKIVIVGRLTKDAQIFEKEDRKIATFCVATHRNYKDENGEIVCDYLFCKAFGKLASNIEKYTNQGTLVGITGQMRSRKYDKDGQTHFVTELYVETIKFMSPKSQNNEILSDSILDIDSQNIDNHDLLEI >NZ_LT992462.1|WP_000846746.1|1912752_1913193_+|YwpF-like-family-protein MKTFKAVRFQIVNEHGRIIEYELEDGVIINKEESGTGWLLEIVISNEHYETFKEYQDNEQLLDIRVVITRPANDPALFESTVKSIKNFKTTMSIVFECHIYTLRQQYAESLLEQLIDDGLSGEELKKSFNRMMQSKPKLKDEKLEE >NZ_LT992462.1|WP_000447678.1|1913249_1913690_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ METIFDYNQIKQIIPHRQPFLLIDKVVEYEEGQRCVAIKQVSGNEPFFQGHFPEYAVMPGVLITEALAQTGAVAILNSEENKGKIALFAGIDKCRFKRQVVPGDTLTLEVEITKIKGPIGKGNAKATVDGQLACSCELTFAIQDVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LT992462_7 | 1960228-1960378 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT992462_7
|
2 spacers
spacers of NZ_LT992462_7
>7.1|1960256|29|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA >7.2|1960313|38|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder GTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT992462_7
The CRISPR arrays of NZ_LT992462_7 >merge|NZ_LT992462|7|1960228-1960378|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTAAACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGAGCTTCTTTCTA >NZ_LT992462|7|7|1960228-1960378|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA AACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCA GTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC AACTTTAGTTGTTAGGAGCTTCTTTCTA
>NZ_LT992462.1|WP_000495673.1|1959118_1960210_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQTIAIYSQFGQKPPGDAYLKVIALLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLVGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPVFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILYVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_LT992462.1|WP_000019735.1|1957872_1958853_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHHDHMHSHVNTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALIAFIYAEKNATATKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_LT992462.1|WP_000003759.1|1957550_1957871_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_LT992462.1|WP_001024099.1|1956733_1957399_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFEGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >NZ_LT992462.1|WP_001127960.1|1955361_1956300_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_LT992462.1|WP_000808818.1|1955100_1955331_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQTSASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_LT992462.1|WP_000123397.1|1953055_1954429_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIAEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_LT992462.1|WP_001123309.1|1952184_1952598_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQQPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_LT992462.1|WP_000070865.1|1951541_1951985_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_LT992462.1|WP_000160304.1|1950710_1951421_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >NZ_LT992462.1|WP_001802298.1|1960707_1960812_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_LT992462.1|WP_001807897.1|1961328_1961499_+|hypothetical-protein MSPKDTTRFETKPDHQAQFDWKESINFKTKDNQRIPLYIGVLLLYYSRFIIMHDNE >NZ_LT992462.1|WP_001792784.1|1961491_1961650_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_LT992462.1|WP_000220902.1|1962085_1962178_+|hypothetical-protein MTYGSIVAILCALFAIFFIPYMEKKDKKKK >NZ_LT992462.1|WP_000370942.1|1962307_1963165_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQIINLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWLRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIEHFGINQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_LT992462.1|WP_000908191.1|1963232_1964015_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQVGRMKQGKTILKNISWQINGGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGSVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_LT992462.1|WP_000101714.1|1964304_1964913_-|TIR-domain-containing-protein MARKTFISYKYSEAKDLRDKIVESLGEDAKYYQGETSDSPDMSDRITEYIKKELKNKIYSTSVTIVVISPNMKESNWIDWEIEYSVKQMKRGDRTSSTNGVVGVVMKHNGDYSWLRNSVINSDGHTAIHTDNSYLYDIIVKNRFNQEPIEYTCDECKNIDALTGSFISLVEEDEFLGNPTKYIENAYEKSKKATNYNICRRK >NZ_LT992462.1|WP_000876896.1|1964940_1965975_-|toll/interleukin-1-receptor-domain-containing-protein MKYPIRQVAEVLPEKYTRYILLKEFQRLFPYQWNIIVERQQTYKEKAQHLYKVKKIKNRYNTKSAEEYFFSIPQVKYILSAGRMKKHKENYNASEIKIKKAALEKSRKNKNWKIEERLIKAKRYTQKVDPEYLNIYMKAYHKKDITTEEKLEILTELKKFDTENIVRFFRKLNDAEQNKMIRNLAFKYLQDYGHYVKLRKNFKGKKKVYQTERASLDTKKPEDLYNDLTNKNIQSQKVYDIFISHSTKDKKTVEDIIRVFNEQNKTCYCDWTMDQDYLKRKYVGEYTKQVLKARMEQSKMLVLLRTENSVQSDWVSFEIEYFENLKKPIYIVESLEELLEAFSD >NZ_LT992462.1|WP_044555027.1|1966068_1967538_-|SIR2-family-protein MNGDGKMTIDKKKFIEKYVKALESNTAAIFAGAGLSCGAGYVNWKTLLNEAAEELELNIDKEEHDLVGLAQHYINKKRSRGNLNTVIMEQFSTRAELTENHKLLAKLPIDTYWTTNYDCMIEKALDSEGRIVDVKRNQNQLTVSVADKDATVYKMHGDIDSIDKIILTRDDYEKYNLTHPKFREILEGDLLSKTFLFIGFSFTDPNISYILSRIRLVLEDNTRPHYCILKEVEEKEYDNTEEFMYAKIKQQLHIEDLSRFSIETLLVKDYIEITEILESIYKRYRRKTIFISGSATEYLPFNSETGKYFLHQLSKKLVENDFKLVTGFGLGVGSYVINGVADYINSNKKSKLQNHLNILPFSQDSSGDLDLKEVWKKNRLEMISECGMALFLFGNKEKDGKIVLADGLEEEYKIAERQELVRLPINVTGYKTKNLSEQYNEEINIQFKEKILKMYNEINEYKCDFSNKQSIDELVQKIVNLVIEIKKTK >NZ_LT992462.1|WP_099184063.1|1967597_1967888_-|DUF3387-domain-containing-protein MVMEENAFYDALASHDTAEHVLGDDTLKIIAHELTQSIKENMSIDWNLCESARAKMRVIVRRLLKKYGYPPEISKQAVETVIEQAELMSEQLAMEL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LT992462_8 | 2124216-2124301 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT992462_8
|
1 spacers
spacers of NZ_LT992462_8
>8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT992462_8
The CRISPR arrays of NZ_LT992462_8 >merge|NZ_LT992462|8|2124216-2124301|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >NZ_LT992462|8|8|2124216-2124301|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>NZ_LT992462.1|WP_000684154.1|2122720_2123845_-|FAD-dependent-monooxygenase MKIAIIGAGIGGLTAAALLQEQGHTIKVFEKNESVKEIGAGIGIGDNVLKKLGNHDLAKGIKNAGQILSTMTVLDDKDRPLTTVKLKSNTLNVTLPRQTLIDIIKSYVKDDAIFTNHEVTHIDNETDKVTIHFAEQESEAFDLCIGADGIHSKVRQSVNADSKVLYQGYTCFRGLIDDIDLKHPDCAKEYWGRKGRVGIVPLLNNQAYWFITINSKENNHKYSSFGKPHLQAYFNHYPNEVREILDKQSETGILLHNIYDLKPLKSFVYGRTILLGDAAHATTPNMGQGAGQAMEDAIVLVNCFNAYDFEKALQRYDKIRVKHTAKVIKRSRKIGKIAQYRSRLVVAVRNRIMKMMPNALAAGQTKFLYKSKEK >NZ_LT992462.1|WP_000417008.1|2121675_2122629_+|2-hydroxyacid-dehydrogenase MEKVYVAGAIPEVGLKLLQEHFEVEMYEGKGLVDKDTLIKGVKDATALISLLSTNVDKDVIDAGKDLKIIANYGAGFNNIDIEYAREKSIDVTNTPKASTNATADLTIGLVLAVARRIVEGDQLSRTTGFDGWAPLFFRGREVSGKTIGIIGLGEIGSAVARRARAFDMDVLYTGPNRKEEKEREIGAKYVDLDTLLKNADFITINAAYNPKMHHLIDTEQFKMMKSTAYLINASRGPIVHEQALVQALKNNEIEGAALDVYEFEPDITDDLKSLNNVVLTPHIGNATFEARDMMSKIVANAAISAVQGEKPQFVVN >NZ_LT992462.1|WP_000737699.1|2120812_2121313_+|CHAP-domain-containing-protein MKKLVTATTLTAGIGTALVGHAQHADAAENYTNYNNYNYNTTQTTTTTTTTTTTSSISHSGNLYTAGQCTWYVYDKVGGEIGSTWGNANNWAAAAQGAGFTVNHTPSKGAILQSSEGPFGHVAYVESVNSDGSVTISEMNYSGGPFSVSSRTISASEAGNYNYIHI >NZ_LT992462.1|WP_000206106.1|2120153_2120576_+|DUF4870-domain-containing-protein MTTEMNDVTNHQPNRKSNDENIMAMLIYLLSLFTSIIGPLIIWLLKKDESKLVDRAGKNYLNYTISYIIWSIVLVVITFIGVFLIATDIDFIIIIGFIITFIGILSIFAFSILSFVFTIIACVKYYNGQEYVIPLTIRFI >NZ_LT992462.1|WP_000684571.1|2118823_2119906_-|NAD/NADP-octopine/nopaline-dehydrogenase-family-protein MKIAIVGSGNGAVTAAVDMVSKGHDVKLYCRNQSISKFQNAIEKGGFDFNNEGEERFVKFTDISDDMEYVLKDAEIVQVIIPSSYIEYYADVMAEHVTDNQLIFFNMAAAMGSIRFMNVLEDRHIETKPQLAEANTLTYGTRVDFENAAVDLSLNVRRIFFSTYDRSCLNDCYDKVSSIYDHLVKEESLIKTNLENGNPEVHPGPTLLNVGRIDYAGEFALYKEGITKHTVRLLHAIELERLNLGRRLGFELSTAKESRIERGYLERDKEDEPLNRLFNTSPVFSQIPGPNHVESRYLTEDIAYGLVLWSSLGRVIDVPTPNIDAVIVIASTILERDFFEEGLTVESIGLDKLDLEKYLK >NZ_LT992462.1|WP_000988993.1|2117328_2118729_-|Na+/H+-antiporter-NhaC MMTRKPTFLESISTMIVMVIVVVTGFVFFDIPIQVLLIIASAYAAWIAKRVGLTWQDLEKGIAERLNTAMPAILIILAVGIIVGSWMFSGTVPALIYYGLDLLNPSYFLISAFFISAVTSVATGTAWGSASTAGIALISIGNQLSISPGMAAGAIIAGAVFGDKMSPLSDTTNLAALVTKVNIFKHIRSMMWTTIPASIIGLLVWFIAGFQFKGHSNDKQIQTLLSELAHIYQINIWVWVPLIVIIVCLLFKMATVPAMLISSFSAIIVGTFNHHFKMTDGFKAIFSGFNDSMIHQSHISSSVKSLLEQGGMMSMTQILVTIFCGYAFAGIVEKAGCLEVLLTTISKGIHSVGSLICITVICCIALVFAAGVASIVIIMVGVLMKDLFEKYQVSRSVLSRTLEDSSTMVLPLIPWGTSGIYYTNQLHVSVGEFFIWTVPCYLCAIIAIIYGFTGIGIKKSSNSRLT >NZ_LT992462.1|WP_001826088.1|2116960_2117155_-|hypothetical-protein MTKLIENLKASIFVSTLTKNLSMYSRFDAPKFGCVNGCMLFILYYRVNRIGENRSFEISTNPIF >NZ_LT992462.1|WP_000717395.1|2116082_2116892_+|CHAP-domain-containing-protein MKKIATATIATAGFATIAIASGNQAHASEQDNYGYNPNDPTSYSYTYTIDAQGNYHYTWKGNWHPSQLNQDNGYYSYYYYNGYNNYSYNNYNNGYSYNNYSRYNNYSNNNQSYNYNNYNSYNTNSYRTGGLGASYSTSSNNVQVTTTMAPSSNGRSISSGYTSGRNLYTSGQCTYYVFDRVGGKIGSTWGNASNWANAAARAGYTVNNTPKAGAIMQTTQGAYGHVAYVESVNSNGSVRVSEMNYGYGPGVVTSRTISASQAAGYNFIH >NZ_LT992462.1|WP_031913988.1|2113517_2115473_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTDNYSLHIFKSMKMSSVKEANLKIIYWLQGTGVVSINLQQYDVKRNDVTVIMLNDLYQIDGHDDSVCCVVEVSAKTFLKFMNANYMMRGKILTNEVASTLRILIKYLIYSKIKQQPYNANDKIINYMCVELMSLNTYDGSRHLVAEEVHDYLTNNHHKKINRKDVINQVSITNKALSDMFKATPYSNFIQYLNHIRLEHCLIDILTSKKPIEEIASSHGFNHYSRFIHLFKETYGDTPKLIRKRNSPTSHSINHSQLVEIDKNIIELFDDTNQSSSSMREIDIPFEPTKRSQMYQPKNIYIKGSNFYWMDYYTIKQIIQRLGVNPENLHIIVTIDTSNELSLEQITLLLQKIVNYNVNVVFRIKHEYKELLTSTERGKIEKLVATIFNMTFESNRCKIAFLINDLNTTAIQKLKRLIDNYIGVFELIYHLEPNELNTRYDKEIDHLIDYFILPLRQIEQVSIARSKIICDVDLINENNDLKEKITMSDINKVTELLTNYTKFRGLIMHMSIISEASKEINLTRLSIFIFIINILNQLRGIVIYQNDTMIVTKFKHEVQCVICLPAALLNENSDAIRLSCKGLQQFSHAKTKQIVLSIDKDNHTSENGVLVNDIMQQHSYWKANFIERNIYDHSLMVSSNSIVHLKYHLEI >NZ_LT992462.1|WP_000032840.1|2112748_2113492_-|transcriptional-regulator MSKFKVKRLTAHILMLKVINDMLKYSFHLTLTQVKLLNLLVKYDNSDSNSASIDRLLKMKEIQSKMALLQMLSYLNNHQWLLKARDQRDQRKLTISINKMHIDKIEYMNNELSDYIERYFGQYTFDFSCDYVSYLLSSQELLLNLKCYLNMCQLSLEELYVLGILNLHKGQLTVKELQGEFHHPIFAVSPILKCLILKGLVKKERCELDERRVIVTIKREKFSKVTMLIQACYNYLEKGIQVKLNNK >NZ_LT992462.1|WP_000739235.1|2124453_2125230_-|glucosaminidase-domain-containing-protein MKKNFKLRISTLLLIVILVVFSVLLIVNETKLFKNDVNYSFDEAVSMQQGKGIVQTKEEDGKFVEANNNEIAKAMTISHKDNDMKYMDITEKVPMSESEVNQLLKGKGILENRGKVFLEAQEKYEVNVIYLVSHALVETGNGKSELAKGIKDGKKRYYNFFGIGAFDSSAVRSGKSYAEKEQWTSPDKAILGGAKFIRNEYFENNQLNLYQMRWNPENPAQHQYASDIRWADKIAKLMDKSYKQFGIKKDDIRQTYYK >NZ_LT992462.1|WP_000921246.1|2125251_2125485_-|hypothetical-protein MLKTSAVISNTLLVIGLVCLFMMKLVLAITFFAVSLSISLVVFNMMFRDRTTMKVIVNASFLIVILAIVVAYFLLSK >NZ_LT992462.1|WP_000840813.1|2125779_2126253_-|DUF1641-domain-containing-protein MAERISSKIRRLEKSEEQIKLESLNEVTEAIAANKDSILKAIKLIKVLDDAKILDALNGAVRGRQVIINKFAVELNKDIYTGLLSNMASMVFLLGELNVSDLSDFLNKVNKGLHVANQASPNAKTSVRSLFGVLKDDDMNRSLTYMLNMLKGMSRED >NZ_LT992462.1|WP_001155267.1|2126252_2129207_-|formate-dehydrogenase-subunit-alpha MQEHLVVTLDGKDYLVEPGTNLLEFIKSQDTFVPSICYNESMGPIQTCDTCTVEIDGKIERSCSTVIDRPMTVNTVNNDVKDAQKEALDRILEKHMLYCTVCDYNNGDCEIHNTMDAWGLQHQTYEYKEKPYEKDYGPFYRYDPNQCILCGRCVEACQDIEVNETIRIDWDREHPRVIWDNDVPINESSCVSCGQCATVCPCNAMMEVNMEGNAGYMTDTEPGSLAAMIDLTKKAEPGYGPLFAISDSEAEMRKERIKKTKTVCTYCGVGCSFEVWTKDREILKVQPSHDSPANKIATCVKGKFSWGHINSDQRLTKPLVRKNGEFHEVEWDEALNVIADNFTSIKEKHGPDALSFISSSKATNEESYLMQKLARQVIGTNNVDNCSRYCQAPATKGLFRTVGHGGDSGSIEDLEKAAMSVLIGTNTAEAHPVIASRMKRAQKLFGQKIHVFDIRKHEMAERADRFYQPKPGTDLAWLSAVTKYIIDHDLHDKAFIEEWVEDFDEYYKSLETFTMAFAEEATGIPEAELIKFAEECAKAESVVICWAMGITQQDIGSDSSTAISNLLLVTGNYRRPGTGAYPLRGHNNVQGCSDMGSMPDKITGYQSIEADDIRAKFEKEYGVKLNPKAGKDNHEMVEGIHDGQIHSLYLYGEDTGIVDSNINFVQAAFEKLDFMVVQDEFLTFTATFADVVLPASPSLEKDGTFTNTERRIQRLYQALKPLGESKPDWKIFQAIANKLGFDWNYKHPSEIMDEIARLTPLYAGVSYERLEGFNSLQWPVHPDGTDEPILYLEGFNFDNGKAKLFPLSFDNYFKQDEVYDIHVNNGRLLEHFHEGNMTYQTPMLKYKVPRAFVEISPELAEDRGIHEGAEVKLISETGEAVLQVHVTDRVKGKEIYIPLNNDAMENGDLGAINLLTNSDVDQYTDTPSYKRTSCRLEVITKRGKSPLNPNNFRVNKKRHPQYSVQVQKKWERPDYVFPGNQVDK >NZ_LT992462.1|WP_000831053.1|2129808_2130756_-|LCP-family-protein MKRSSKSKMSLPKKIFLWVFGILVILAIVAVVYVAAKIFITGNKIHNPLDRNHSELRDKKVSLNDGDPFTIALFGVDSDADRKKKGGGERSDSIMILSINPKTKKTEIVSIPRDTRAEIVGRDTTEKIAHAYAYGGPNMAVKSLEKLMNVPIDHYATIDMDGLHNMIDSIGGVDVVSNDTFTVDGVRFTKGQQTHVNGDQALKFIRSRKEEGAGGDFGRQQRQQIVLEAMANKIASPSSITHFNSLMNEIQNNVKTDLTLGDLNTIRSNYKDANDTINKHQLSGQGGIQSDGLYYFIPSEQSKAESTKLLKDNLE >NZ_LT992462.1|WP_000130460.1|2130888_2131686_-|inositol-monophosphatase MTDKTLQQIDKLICSWLKQIDNVIPQLIMEMTTETKRHRFDLVTNVDKQIQQQFQQFLATHFQEHQLLAEEKSNEMITNEINHLWIMDPIDGTANLVKQQEDYCIILAYFYEGKPMLSYVYDYPHKKLYKAIRGEGAFCNGIKMEEPPSLKLEDAIISFNAQVMNLDTVQDLFDASFSYRLVGACGLDSMRVAKGQFGAHINTNPKPWDIAAQFLFAELLNLKMTTLDGKAIDHLKGAPFIISNKACHETVLKILNANGGYQKYR >NZ_LT992462.1|WP_001030125.1|2132070_2132763_+|YafY-family-transcriptional-regulator MNKAERQNLIITAIQQNKKMTALELAKYCNVSKRTILRDIDDLENQGVKIYAHYGKNGGYQIQQAQSKIALNLSETQLSALFLVLNESQSYSTLPYKSEINAIIKQCLSLPQTRLRKLLKRMDFYIKFDDTQHMTLPMLFSDILIYCTERNVMLVDHRVDDNIKAENVIFIGLLCKHGHWHAVIYDIAQDKTAELEIENIIDISYSFGKTIQTRDISIDNYHQFLNPIDS >NZ_LT992462.1|WP_000426692.1|2132787_2133525_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease-SdpB MENEKKKYTFKDIAWRDLFIIPIIGVLSFALTIAAYIVPILFGYYEIDSNLIFVGTITQALAYTIGIGAFYLFHLKVMPSRLRAGFAYIKKYWLRLSITYIIALILIYTYEYMTQFLPKHLQYSETANELELNKMFEVPVFLPVAFLLIVIVGPIVEEIVFRHILIGELGKKFNFIAMSIVSVFLFAFIHVTDAKSPFEFGPYLILSIILVFTYIKSGRNLGSTIALHIANNFVSFVISVISIYA >NZ_LT992462.1|WP_000606724.1|2133573_2133903_+|hypothetical-protein MINETKYMRQQITNLIQIIDTIKYNTLMTDWNIQTHIYKFNQIVTNELNKFKGFETSYIINENQVFYYEIITLLNKRPLRQVDYGNKIQYLNFYHTELSNALFAIKFAH >NZ_LT992462.1|WP_000073196.1|2134347_2135220_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MSNVLTEIDSQYPYMTKNEKKIAKFILNSPQKVIKMRSQDLASLLDISTSSVIRFSKKITDGGFHDLKINISKYVPKASSIYNVELMNNESTESLRTKLHTRTTRALNHANNELNDKTIDQICHCLKRSETIFIYGFGASFVVATDLYQKLSRIGLNIQLVQETHIFATLLATHNSNDSVILITNNGTQSEMQSMVKVIDDYHIPIITITSTRDNPVAQASNIVLTYGKTDENEMHMGATTSLFAQMFTIDILYYRYVALNYHASLDYITQSKMALDNYRKHLSNINFKH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT992462_9 | 2300365-2300459 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT992462_9
|
1 spacers
spacers of NZ_LT992462_9
>9.1|2300393|39|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder GCAACTGTATTCCTCTAAAACTGTAATTTTAATTACTAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT992462_9
The CRISPR arrays of NZ_LT992462_9 >merge|NZ_LT992462|9|2300365-2300459|CRISPRCasFinder AGGCTCTTATGCAGTTGGTGCGAAGCAAGCAACTGTATTCCTCTAAAACTGTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAA >NZ_LT992462|9|9|2300365-2300459|CRISPRCasFinder AGGCTCTTATGCAGTTGGTGCGAAGCAA GCAACTGTATTCCTCTAAAACTGTAATTTTAATTACTAG AGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAA
>NZ_LT992462.1|WP_001081687.1|2299357_2300179_-|histidine-racemase-CntK MNRQVIEFSKYNPSGNMTILVHSKHDASEYASIANQLMAATHVCCEQVGFIESTQNDDGNDFHLVMSGNEFCGNATMSYIHHLQESHLLKDQQFKVKVSGCSDLVQCAIHDCQYYEVQMPQAHRVVPTTINMGNHSWKAIEIIYETYVHYVIPVKQVTTEIQHLVETYVRKQQWNHKYKTVGMMLFDEQRQFLQPLIYIPEIQSLIWENSCGSGTASIGVFNNYQRNDACKDFTVHQPGGSILVTSKRCHQLGYQTSIKGQVTTVATGKAYIE >NZ_LT992462.1|WP_001058850.1|2298528_2299347_-|D-histidine-(S)-2-aminobutanoyltransferase-CntL MNNFNNEIKLILQQYLEKFEAHYERVLQDDQYIEALETLMDDYSEFILNPIYEQQFNAWRDVEEKAQLINSLQYITAQCVKQVEVIRARRLLDGQASTTGYFDNIEHCIDEEFGQCSIASNDKLLLVGSGAYPMTLIQVAKETGASVIGIDIDPQAVDLGRRIVNVLAPNEDITITDQKVSELKDIKDVTHIIFSSTIPLKYSILEELYDLTNENVVVAMRFGDGIKAIFNYPSQETAEDKWQCVNKHMRPQQIFDIALYKKAAIKVGITDV >NZ_LT992462.1|WP_000040594.1|2297234_2298536_-|staphylopine-dehydrogenase-CntM MSKLLMIGTGPVAIQLANICYLKSDYEIDMVGRASTSEKSKRLYQAYKKEKQFEVKIQNEAHQHLEGKFEINRLYKDVKNVKGEYETVVMACTADAYYDTLQQLSLETLQSVKHVILISPTFGSQMIVEQFMSKFSQDIEVISFSTYLGDTRIVDKEAPNHVLTTGVKKKLYMGSTYSNSTMCQRISVLAEQLKIQLEVVESPLHAETRNSSLYVHPPLFMNDFSLKAIFEGTDVPVYVYKLFPEGPITMTLIREMRLMWKEMMAILQAFRVPSVNLLQFMVKENYPVRPETLDEGDIEHFEILPDILQEYLLYVRYTAILIDPFSQPDENGHYFDFSAVPFKQVYKNEQDVVQIPRMPSEDYYRTAMIQHIGKMLGIKTPMIDQFLTRYEASCQAYKDMHQDQHLSSQFNTNLFEEDKALVTKFLEINRTLS >NZ_LT992462.1|WP_001229077.1|2295493_2297092_-|staphylopine-dependent-metal-ABC-transporter-substrate-binding-protein-CntA MRKLTKMSAMLLASGLILTGCGGNKGLEEKKENKQLTYTTVKDIGDMNPHVYGGSMSAESMIYEPLVRNTKDGIKPLLAKKWDVSEDGKTYTFHLRDDVKFHDGTPFDADAVKKNIDAVQENKKLHSWLKISTLIDNVKVKDKYTVELNLKEAYQPALAELAMPRPYVFVSPKDFKNGTTKDGVKKFDGTGPFKLGEHKKDESADFNKNDQYWGEKSKLNKVQAKVMPAGETAFLSMKKGETNFAFTDDRGTDSLDKDSLKQLKDTGDYQVKRSQPMNTKMLVVNSGKKDNAVSDKTVRQAIGHMVNRDKIAKEILDGQEKPATQLFAKNVTDINFDMPTRKYDLKKAESLLDEAGWKKGKDSDVRQKDGKNLEMAMYYDKGSSSQKEQAEYLQAEFKKMGIKLNINGETSDKIAERRTSGDYDLMFNQTWGLLYDPQSTIAAFKAKNGYESATSGIENKDKIYNSIDDAFKIQNGKERSDAYKNILKQIDDEGIFIPISHGSMTVVAPKDLEKVSFTQSQYELPFNEMQYK >NZ_LT992462.1|WP_000472235.1|2294545_2295481_-|ABC-transporter-permease MFKFILKRIALMFPLMIVVSFMTFLLTYITNENPAVTILHAQGTPNVTPELIAETNEKYGFNDPLLIQYKNWLLEAMQFNFGTSYITGDPVAERIGPAFMNTLKLTIISSVMVMITSIILGVVSALKRGKFTDRAIRSVAFFLTALPSYWIASILIIYVSVKLNILPTSGLTGPESYILPVIVITIAYAGIYFRNVRRSMVEQLNEDYVLYLRASGVKSITLMLHVLRNALQVAVSIFCMSIPMIMGGLVVIEYIFAWPGLGQLSLKAILEHDFPVIQAYVLIVAVLFIVFNTLADIINALLNPRLREGAR >NZ_LT992462.1|WP_000584764.1|2293679_2294549_-|ABC-transporter-permease MIILKRLLQDKGAVIALGIIVLYVFLGLAAPLVTFYDPNHIDTANKFAGMSFQHLLGTDHLGRDILTRLIYAIRPSLLYVFVALFVSVLIGSILGFLSGYFQGFVDALIMRACDVMLAFPSYVVTLALIALFGMGAENIIMAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTASDHVRFAKTIGMNDMKIIHKHIMPLTLADIAIISSSSMCSMILQISGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMMFAPGIAIVIIVMAFNFLSDALQIAIDPRISSKDKLRSVKKGVMQS >NZ_LT992462.1|WP_000173877.1|2292867_2293683_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLLTVKHLTITDTWTDQPLVSDVNFTLTKGETLGVIGESGSGKSITCKSIVGLNPERLRVTGDITFDGTSMLSLSESQLKKYRGKDIAMVMQQGSRAFDPSTTVGKQMFETMKVHTSMSTQEIEKTLIEYMDYLSLKDPKRILKSYPYMLSGGMLQRLMIALALALKPKLIIADEPTTALDTITQYDVLEAFIDIKKHFDCAMIFISHDLTVINKIADRVVVMKNGQLIEHGTRESVLHHPEHVYTKYLLSTKKKINDHFKHVMRGDVCD >NZ_LT992462.1|WP_000590515.1|2292125_2292875_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKIKDVEKSYQSAHVFKRRRTPIVKGVSFECPIGATIAIIGESGSGKSTLSRMILGIEKPDKGCVTLNDQPMHKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVREILFEVMCQCDGQPKDVMEVQAITLLEEVGLSKAYMDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPKYILFDEAISSLDMSIQTQILDLLIHLRETRQLSYIFITHDIQAATYLCDQLIIFKNGKIEEQIPTSALHKSDNAYTRELIEKQLSF >NZ_LT992462.1|WP_000675405.1|2290920_2292114_-|MFS-transporter MKGAMAWPFLRLYILTLMFFSANAILNVFIPLRGHDLGATNTVIGIVMGAYMLTAMVFRPWAGQIIARVGPIKVLRIILIINAIALIIYGFTGLEGYFVARVMQGVCTAFFSMSLQLGIIDALPEEHRSEGVSLYSLFSTIPNLIGPLVAVGIWNANNISLFAIVIIFIALTTTFFGYRVTFAEQEPDTSDKIEKMPFNAVTVFAQFFKNKELLNSGIIMIVASIVFGAVSTFVPLYTVSLGFANAGIFLTIQAIAVVVARFYLRKYIPSDGMWHPKYMVSVLSLLVIASFIVAFGPQVGAIIFYGSAILIGMTQAMVYPTLTSYLSFVLPKVGRNMLLGLFIACADLGISLGGALMGPISDLVGFKWMYLICGMLVIVIMIMSLLKKPTPRPANSL >NZ_LT992462.1|WP_000072469.1|2289950_2290697_+|hypothetical-protein MSNTNKHYIEEYATEQSRFFKRDIGFIFLYIFLVNILPIIIVFLTFELVAVFTQQAPWGFSFPISMNISYLLAVIISLAIFRLMHEDAFIPMIRSQIVASAKYKWHILISFTLSIVLFLLLNHFDIFALNVDSFTVFDIYPLIREYGSISLIAIFSLTIILNTLICQLIFRHILIQELSRLIPLKITIVLSVILETLYYYPYINTWWEFIPALILASSATYLYLKSNRNFMVSYFYQLAVILVLHIFM >NZ_LT992462.1|WP_000910577.1|2301127_2301490_-|hypothetical-protein MLKEKESFRLLYQAIREIADKIGDNQLETNSVSLLLLDFDFEHEVFDELYLAILKYLNTVSIENISHSELLNLIENTIPEDREINTFVKNKIIIGFANNYFPELQVLANEIKSDMASSLK >NZ_LT992462.1|WP_000824952.1|2301752_2302571_-|SDR-family-oxidoreductase MKRLENKVAVVTGASTGIGQASAIALAQEGAYVLAVDIAEAVSETVDKIKSNGDNAKAYTVDISDEQQVVDFVSDIKEQFGRIDVLFNNAGVDNAAGRIHEYPTDVYDKIMNVDMRGTFLMTKMMLPLMMTKGGSIVNTSSFSGQAADLYRSGYNAAKGAVINFTKSIAIEYGRDGIRANAIAPGTIETPLVDKLTGTSEDKEGKTFRENQKWMTPLGRLGKPEEVGKLVVFLASDESSFITGETIRIDGGVMAYTWPGEMLSDDSWKRTLE >NZ_LT992462.1|WP_000202032.1|2302804_2304343_+|AbgT-family-transporter MTSKHQQKGSIVNRFLNSVEKIGNKLPDPSVLFFLMCVGLAIMTWVISLFNVSVKHPGTHQTIYIKNIISHDGFTMIMNDTIKNFSEFPALGLVLAVMIGIGVAEKTGYFDKLMISVVNRAPRFLILPTIILIGILGSTAGDAATIILPPLAAMLFIKIGYHPIAGLTMAYASAVGGFAANIVVGMQDALVYSFTEPATRIVSDSIKTNVAMNWYFIAASVIVLLPTILLVTTKLIIPRLGQYDDRLMHDDHEETSSHITDKEAHALKWANISFIVTIILLIITAIPEHSFLRNAKTGSLLDDAPLINGVGLIILVVFLVPGLVYGILSKEIKNTKDLGKMFGDAVGSMGTFIVIVFFAAQLLAYLKWSNLGIIAAVKGAKLLEHQNGIVLILGIIVLSAMVNMLIGSASAKWGILGPIFVPMLILIGFHPAFTQVIYRVGDSITNPITPMMPYLPLLLTYAQKYDKRMKLGALLSSLMPYSIALSIVWTVFVIIWFLLGIPVGPGGPIFVK >NZ_LT992462.1|WP_001146763.1|2304454_2304877_-|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein MPYNYKKQNGELMSVMSQGEKFIHQSPVNDELSALIKLLISKINGCHYCVDIHKKELKELGVTQMKIDEVLSFRHLDLFTDQEKVTLEFAEMLNSIKDFKKFEIIDRLKSFYDEEQIIDLVFVVNQINGWNRLNIISDRL >NZ_LT992462.1|WP_001807941.1|2305348_2305747_-|DUF1433-domain-containing-protein MNKKHVFIIIGVILCIRIVATVIYLKVKYDEKEKQKAIYYKEQQERITLYLKHNTKEPNTIKSVHFTSLKTGPMGDAVIEGYINENKKADFVAYGSPEHNYQFGGDMIESEKLSELLKPAQELKSQKKSKKN >NZ_LT992462.1|WP_000037506.1|2305773_2306184_-|DUF1433-domain-containing-protein MSKKHVFIIIGVILCICIVVTAMHLKMKYDEKEKRKAIYYKEQQARITLYLKHNTKEPNTIKSVHFTNLETSPMGSAVIEGYINENKKDNFTAYATPEHNYQFGGAMIKSEGVDKLLKPAHERKSPDDIKKELNKK >NZ_LT992462.1|WP_000905462.1|2306638_2307022_-|DUF1433-domain-containing-protein MLIILIIIVCVYLKIKIDEKEKQKAIYYKEQQERITLYLKHNTEEPNTIKSVHFTSLKRGPMGDAVIEGYINENKEDDFVAYGSPEHNYQFGGDMVESERLSELLKPAHERKSPDDIKKELNKKKNH >NZ_LT992462.1|WP_001084931.1|2307088_2308297_+|hypothetical-protein MNSIYDKDTTYRALAKEAYHLEPDQEKIFVPYSKEKKIEFRIVAFRQNKFNGLKMAGLSPVEKGAKLNTDELYIVYAGTDPDLLADFGSDSIEDLKVGMAKFGGGLRIPPTKKERAIYGNLNKKMIDYDDGISGISQNIMTNPISQSKESYIFTGALINKQKPKHVYGAAHSLGGGLALLNGVMYNFDGVRAFSAPNTFDLLPDEVKANYRSEKYDGKFINYLHRSDIIGNSDLFAQRIGTQIYGKDVGRFSLLNPILGHGMDTFEFKGDNVRIKMDTEEMSKIASDLKASCEFVNDAIKSYQKYMDDTKAAAKRIERKYTKKIRTGNYKHIKPSDIEDYMEELSVSGKYEFYNDTAFETVMSELNRIRKNVESFADKLKHAGEKMESRDKEIGELYKIFER >NZ_LT992462.1|WP_000505991.1|2308302_2308617_+|hypothetical-protein MGFLDDLAESIEEQSDLSEFKQAMKSELQTKVEEAKAKIESIDEDIWDWQTTVNNKRDAIEEYCEGKTAEHAIERLMQDKQDIAGMRWTAEDAEKSCKVGSWFW >NZ_LT992462.1|WP_001124998.1|2310493_2310913_-|DUF1433-domain-containing-protein MPKKTIFIIIGVILCISIVTGGIYLKMKHDEKEKQKEIYYKEQQERITLYLKHNTKEPNTIKTVHFTNLKTGPMGDIEIYGYINSKKDYDFIAYNSPEENYQFTGGLTGSNEVLGKLKNAENLKSPEKIKEELNNKKDH |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT992462_10 | 2328310-2328420 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT992462_10
|
1 spacers
spacers of NZ_LT992462_10
>10.1|2328337|57|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder TCGCCTGGCTCACTCGGCACTTCTGGTGTCGGTGGTGTTGGTGTTTCCGGCTCACTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT992462_10
The CRISPR arrays of NZ_LT992462_10 >merge|NZ_LT992462|10|2328310-2328420|CRISPRCasFinder GGTACTTCTGGTGTCGGTGGCGTTGGTTCGCCTGGCTCACTCGGCACTTCTGGTGTCGGTGGTGTTGGTGTTTCCGGCTCACTCGGTACTTCTGGTGTCGGTGGTGTTGGT >NZ_LT992462|10|10|2328310-2328420|CRISPRCasFinder GGTACTTCTGGTGTCGGTGGCGTTGGT TCGCCTGGCTCACTCGGCACTTCTGGTGTCGGTGGTGTTGGTGTTTCCGGCTCACTC GGTACTTCTGGTGTCGGTGGTGTTGGT
>NZ_LT992462.1|WP_000721337.1|2323457_2324324_-|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MKKIKKAIIPAAGLGTRFLPATKAMPKEMLPILDKPTIQYIVEEAARAGIEDIIIVTGRHKRAIEDHFDSQKELEMVLKEKGKSELLEKVQYSTELANIFYVRQKEQKGLGHAISSARQFIGNEPFAVLLGDDIVESEVPAVKQLIDVYEETGHSVIGVQEVPEADTHRYGIIDPLTKNGRQYEVKKFVEKPAQGTAPSNLAIMGRYVLTPEIFDYLKTQKEGAGNEIQLTDAIERMNNDNQVYAYDFEGERYDVGEKLGFVKTTIEYALKDDSMREELTRFIKELGL >NZ_LT992462.1|WP_000217726.1|2323023_2323332_+|hypothetical-protein MTVNIVVSIVFCISMVVLSIYVAITKDFTLISYINQTTIADKHKNQIAYIFALCISLSAVFLMSAILCFEYDFIALAFLFLTIALLLIALFYVCFYKITKYP >NZ_LT992462.1|WP_000678764.1|2322613_2322880_+|hypothetical-protein MKGSKQILLIMGIISLIVLFIFTLFIMAQYAKHYEQKSDSSNAHTLNSSSAIIEQHTMSNLASLDLYAPVRNITSSRDIHPIYFMTKD >NZ_LT992462.1|WP_014653252.1|2320578_2322330_+|phospho-sugar-mutase MFFYFWGVFLYNSLHKCKGFSFHVLLSLTEILKGCLATMDKELWIERANDSLVKHFYEQQSDIEQREGFESKLTFGTAGIRGKFGLGEGRLNKFTIEKLALGLSRYLNAQTNNPTIVIHYDIRHLSTEFAQIIANVLANHQITVYLPDTYKTTPELSFAVRNLNTTAGIMITASHNPKDYNGIKVYGSDGAQLSTDASELVSRYIEDVGDPLQIDISFSKHNSSYIKPLPKSVAENYIKHIQNMIGYIPKSDLQVVFTSLHGTSVPIVPELLKSLNFNQFNLVEAQCKPDPNFSSVQSANPEDHRAFDQAVELANKSHADLLISTDPDADRLGIAERDAHGHITYFNGNQIGALLLNYRIQQTSQLRHRLMIQSIVSSELTKSLARYNNVEYKEVLTGFKFIAQEIRQLDDHQNMIFAFEESYGFLSEPFVRDKDAVQIVPLIIKYASELKLYGKTLKDELEQIYQTVGRHEDTLFSHTLEGLEGKKKIESIMTHFRSHPPQEIQGLKVKAIEDYLTSEVHQLDKDTTSQINSPKSNVIRVLFDEGFIALRPSGTEPKIKLYVSLKCPNFDDVAQKINAMIFS >NZ_LT992462.1|WP_000282632.1|2319309_2320503_+|DNA-(cytosine-5-)-methyltransferase MYNNIITKNESDNSIPLNYGDFIKEKRNKLNMTQKELADSIGLPKFGDRTIRRWENYETSPSYLEYKTIMNFPDTPPYLNPNIYDYKMIDLFAGIGGTRLGFQLHGNVKCVFSSEWDKFSAKTYKANFGETPKGDITQIIADEIPTHDILVAGFPCQAFSQAGLKKGFNDTRGTLFFDIARILKAKRPKCFLLENVKNLRSHDKGKTFDIIMNTLLELDYDVSSSILRARDFGCPQNRERIYIVGFDKQQIKNAENFSFPEPLPIETSLGSILESNVNDKYTISDRLWYGHQRRKREHKAKGNGFGYSIFNETSPYTNTLSARYYKDGSEILIEQNKKNPRKLTPREAARLQGFPENYIIPVSDTQAYKQFGNSVSVPVVHAIASNIFQVLQQNKNN >NZ_LT992462.1|WP_016187290.1|2318284_2319214_-|hypothetical-protein MTNLNNQLKEFKNTIKVERSKLLPSPFDMVYKNFEKLGYHKQNEQFFYDNASIIIDELRNQSWIEFKKIEKEFSKKLYSHLLDQDSENYKNMTVKEGIEKFTSKHTDEIYALQLSNTQSRRSRAGKEFESIIELVLMGANIEFVTQGSIGSGVFESSELAKLVDCVVPGAAEYNLNKRNTSLISTKTSLRERWQEVGDEMSRTKAKEMYLVTLDESISEKTLKLIEKNNIIIVTTKSVIDKNYLNSSNVISFEDMLNELHIQLLQWNNYGYPATELNNKKELYQTLIEKYDGNMFVRNYYENMLSNINV >NZ_LT992462.1|WP_031774865.1|2317268_2318042_-|tandem-type-lipoprotein MIHSRKLRLCLYLVLLAVFIGACGMKKEESSKDKQIKENFTKTLNLYPTKNLEDFYDKEGFRDQEFEKGDKGTWIVDSEMVIELKDKKMESRSMVLYINRNTRTTKGNFIVRELWEDSKGYAQSKDTKYPVKMEHNKIIPTKPIADDKLRKEIENFKFFVQYGDFKDINDYKDGDISYNSNVPSYSAKYQLSNDDYNVKQLRKRYDIPTKKAPKLLIKGDGDLKGSSIAHKNLEFTFIENKEENIYFTDSINFKPTE >NZ_LT992462.1|WP_000581897.1|2316392_2317157_-|tandem-type-lipoprotein MIHSKKLTLGICLVLLIILIVGYVIMTKTNGRNAQIKEAFNKTLNVYPTKNLEDFYDKEGFRDQEFDKRDKGTWIINSGMNIQLKGGALKSRAMVLYINRNTRTAKGYFLISETTEDKKGYVHNKDKKYPVKMEHNQIIPTKPIRDDKLKKEIENFKFFVQYGDFKDYKDGDISYNPNVPSYSANYQLNNDDYNVQQLRKRYDISTKRAPELKLRGSGDLKGSSVGSKELEFNFIRNKEENVYFTDSINFKPTE >NZ_LT992462.1|WP_014937076.1|2315359_2316145_-|tandem-type-lipoprotein MIHSKKLKLCLCLIILSVFIGGCGMKKEESSKDKQIKENFNKTLSLYPTKNLEDFYDKEGFRDEEFEKGDKGTWIIHSKMIIETNGRNMESRGMVLYINRNTRTTKGNFVIREITEDSKGYSDSKDKKYPVKMENNRIVPMKPIHDEKLRKEIEDFKFFVQYGNFKDINDYKDGDISYNPNVPSYSAKYQLSNDDYNVKQLRKRYDIPTKKAPKLLLKGDGDLKGSSVGSKNLEFTFVENKEENIYFTDSVQYTPSEDNNL >NZ_LT992462.1|WP_000083859.1|2314007_2315363_-|hypothetical-protein MSQTEYQIKPGNIKANSEETSTVSKISYEIENANNSGLKKGKINEQIEGLKEEGKFPKNLKYLKSYTDPNTGTTTTAFKNKDTGKVTLGMTGTNLHFEEMGNVLKHPFNHSDQDMKDMKEMLKDFGADANIGLGAVTDKDPHFKDTQDFIKDIKKEYEIDTITGHSLGGRDAIILGVSNDIKNIVVYNPAPLSITDFRIIALNNMTYSAIGDIEIKEMLKNYNGHIVRFVSDKDELDGFVSQFMYDTAGEKIVLNNGEGHDMGAFLRKYAQAKILAELRKVKGYEDANNKSFKSVKDNTKSKLGKVEELRVNWLQANGGALTSSQLKLLESVSALIIAEGLSQLVKEESNQLEKMYDNMKDKFQENWKNSQEAGNKIGTKLSHDGVLTALRNGDAYESKFETEPLTKIEQKLKELNDINSDCHNYVSKIKDSVNAIVGNDQLLASQIAGVI >NZ_LT992462.1|WP_000481425.1|2331560_2332919_-|gluconate-permease MFNEIWPLISVVLGIVILLVLIIGFKLNTFISLIITSMITALMLGIPLTKIMETIEKGMGSTLGHIALIFGLGAILGKLLADGGGATRIADTLIQKFGQKHVQWAMLVAAFIVGIALFFEVGLVLLIPLVFTVAKRANVSVLKLGLPMVTALSVTHGFLPPHPGPVVIAKELKANVGDVLLYGMIIAIPVTLIAGPIFNKVAQKMIPSAYTREGDISALGAQKEFTDQEMPGFGMSLLTATLPVILMLVSTITQLVTGHDKPTNLFESIIYMIGTAGTAMLIAVLFAIVTMGLMRKRKMNHIMESVTNAIYPIGMMLLIIGGGGTFKQVLIDGGVGNTIAKMFEGTEMSPILLAWIVAAVLRIALGSATVAAISTTGIVLPLLQSSDVNVALVVLAIGAGSVILSHVNDAGFWMFKEYFGLTVKETFLTWSLLETIISVSGIIFILFISLFV >NZ_LT992462.1|WP_000876647.1|2333035_2334589_-|gluconokinase MKYMIGVDIGTTSTKSVLYDENGTFIMKHQIGYDLHTPNVDVSEENPDELFDAVLMTIKYIMRESKVNQDDIKFVSFSAQMHSLIAMDQQHQRLTNNITWADNRAAKYATVINEVHDGNAIYQRTGTPIHPMSPLAKIFWMKHEWQDVFQRTAKFADIKTYIFYHLFDRYIIDYSMASATGMFNLETLDWDVGALELLGISEEMLPELVPTTYVMKGMKERYATLMGLNEDTPFVIGASDGVLSNLGVNSVGKGEVAVTIGTSGAIRTVIDKPRTDYKGRIFCYVLTEDHYVIGGPVNNGGVVLRWLRDELLASEVETAKRLGVDPYDVLTQIAKRVKPGADGLIFHPYLAGERAPLWNANARGSFFGLTLSHKKEHMIRAALEGVLYNLYTVYLALIEVMNETPKMIKATGGFAKSEVWRQMMSDIFDTELVVPESYESSCLGACVLGLKAVGDIEDFSIVSSMVGATNNHTPIEENVAVYQELVSIFINLSRSLTENYEQISDFQRQHMAENKTQ >NZ_LT992462.1|WP_000274558.1|2334613_2335291_-|GntR-family-transcriptional-regulator MYGYPEKWLEGMTTGEGIAAELRLGIVNGHIAEGTLLTENQMAKQFNVSRSPIRDAFKLLQQNQLIQLERMGAHVLPFGEQEKKEMYDLRLMLESFAFSRVKNQERLPIVKEMKKQLEMMKVAVKFEDAESFTKHDFEFHETLIKASNHQYLNSFWSHLKPVMMALVLTSMRQRMQQNPQDFERIHHNHQVFIDAVEQYDSQILKEAFHLNFDDVGKDIEGFWLN >NZ_LT992462.1|WP_000074000.1|2335447_2336212_-|MerR-family-transcriptional-regulator MSNYSTGELAKLCNVTTRTIQYYDRKGILKPQGFTEGKRRVYTEQQRQTLELILLLKDLGCALSDIDMLLKGEGTLKTLNTLLTMKQQEINQQVKQQQAVLDKIKNVQYYVNEASTSPITHLKDIEHVMSKSAEMKSIRRNIWISAGIIGIIQYSSIISAILMKNKWPFLIALPFMISYGIGITIYYQRKVAYLCPNCQHIFSPSLWAVIKAKHTATTRRFECPNCHETHYCIEVPKTHMSTEQLEVPRTKNNN >NZ_LT992462.1|WP_000289136.1|2336376_2337069_-|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MYVDRKPSLYLEDLRHDFKNSLSKFENGDEAFDTLLGFVELDHIYSSALKEISTKLSILDDNFNHIYKHNPIHHMERRVKEMRSLIEKLNRKGLQISAETAKEHILDIAGIRVVCNYLDDIYLIEEMLLKQEDVQLIKRKDYIQHPKENGYRSLHIVVSIPVFLAERVEVLPVEIQIRTIGMDMWASLEHKIRYKNNAETEKYRDLLKECATEITEVEDKLQQIHSEITE >NZ_LT992462.1|WP_001117057.1|2337299_2337716_-|DUF2188-domain-containing-protein MPFTMKGYPEKWKEFEVIKRQKAIEIANAMLKEGYLEKDVVPIAAKKAKDWYRALSKEEIKALEEENFVQFHTATMEKTEVDSEYATTDNEEHIQEQSNQDKSYFDSESIVNQSGGVRQREPLMDGPHPKVVESFKDV >NZ_LT992462.1|WP_000586373.1|2337854_2339678_-|FUSC-family-protein MIIPAIIGYLCGNFQFGLLVATGTLAHIYVFKGPSRSKLRTVIICNLAFAICMILGTLTATTPLVFGMTLLIVTVIPFYIFTALKIAGPSSTFFIVTFSLPINLPIAPEEALYRGFAILVGGVLATMMVLITILLSKNKAEEQAIQNDFKLISKLLHAYNDKSAFSQVAKTAVDSFKASDKLLITSNSSSDKLSGRFQKLLLLHTSAQGIYSELLELNAKQIRPLPDELIEMMDHIITQRDDRNKNVRYWRKEVTVTEEFQNLFNHILKIDEMVHANEARIAYEAEMRKPLYSKRIYQNLTLDSIVFRNTLRYAAIMMIAIFIALMFDFEKAYWIPLSAHTVLLGTSTIHAIERGIARGLGTILGVLVLSVILLFSIPTPVAVILMGIAALFTEALVGANYTIAVVFITIQVILMNGLASQNLTINIAFPRVIDVAMGIVIAIIGLFVLGQRTASALLPYVMAEVVRKEATLFHYLFSENQYKDDVYQKNTAMNLSVKLNNMTQVYNAANGELFSDKTLIQNYYPSLFALEEISFMLNRAMANEDRLTINEQLMGEYLATFENIAKHLELNTELEIKILPDLPQYNYIQSAMMNIQHNGFRERDKNV >NZ_LT992462.1|WP_000660709.1|2340589_2341867_-|MFS-transporter MKEKRTNVRWMFALAFFFIGVIAYMDRANISYIAKQMMDDLGMTKPQFGLLASFFSLGYALMQVPSGMLAEKFGPRKMITIALVWWSAFTILTGMIKNHGLIYLVRFLFGVGEAPMYPSNAVFNSFWFSKNEKGRASSALLAGSYFGPVLAPIVTIAIVNAFNWQAVFYIFGAVGILMAVLWAIIAKDLPEQHRMVNEAEKRFIMENRDIVATEKSSPPWNDFFKRFSFYAIAIQYFVVQFIITLFLIWLPTYLTEVFHVNFKEMSISSLPWLLMFFLILSAGAISDRVLGLGRSKFVARGVIAIAGFIVFAVSIIFAVRTGNLYVSIFWLSLGLGGIGISMGMSWAAATDLGRNFSGTVSGWMNLWGNIGALISPLLAGLFVEHLGWTMTFQLLIVPAVIAVIMWFYVKPDQPLIVSDDKAIEK >NZ_LT992462.1|WP_000435037.1|2342413_2343025_+|DedA-family-protein MEQIITEFISRFGYAAIFILILLENILPIVPSEIILTFAGLMSVKSHLSILTLFIIATIASFIGLLILYYICRLISEERLYRFIDRHGKWIKLKSKDLKRANDWFKKYGVWAVFICRFIPVLRVLITIPAGVNRMNVVTFTVISLIGTTIWNFGLILLGRTLSDSFGMLMTGLHTYSRIMYVVIIIAVIYFAIRYIGKRKRVK >NZ_LT992462.1|WP_000167480.1|2343122_2344286_-|MFS-transporter MTKSNIRLYILGFLAFFASLIQNIYTPIIPRLYDDFQVPLFWINATVGGFIFIVAVMQIVLGRSIDSRDSIKVLLTGLGIVIISSFICAVTHNFILFAISRLFQAIGCGIIPLVTLTLLAKLSTDNGRAQAMANYQIFLSCAPTLAPILGSTLGARWDYIGIFSFLLVISIVLFLIIFFIDIPNVEKGIVKLTEKIEEKYLTDKVFITLVTLGFLIFFTYFSILVYLPTLLNNTYDIGVGISGVLFLPITVSVILGSLFYKRFSKKYNEIMILRVTITGFAMFTLLFGWLNESNVIILSVIIFILGTCVGIVPALLATIISKRFEHIKGKVLGVFNFVRYIGMTVGALLIGIISQPLVAFYFTTITIMLIIIFLYIKIGDFQLKYAK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT992462_11 | 2872926-2873125 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LT992462_11
|
3 spacers
spacers of NZ_LT992462_11
>11.1|2872957|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder GGCGAAAATACAGCTTACAATAATG >11.2|2873013|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder TTGGAACAGCAATTTCTACAGACAA >11.3|2873069|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder AGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LT992462_11
The CRISPR arrays of NZ_LT992462_11 >merge|NZ_LT992462|11|2872926-2873125|CRISPRCasFinder GTTATATTGGCGGATCCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAATACAGCTTACAATAATGTGCGAGTTGGCAGGCCTCCAACACAGAGAAATTGGAACAGCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTAGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGGCCCCAACACAGAAGCT >NZ_LT992462|11|11|2872926-2873125|CRISPRCasFinder GTTATATTGGCGGATCCCCAACACAGAAGCT GGCGAAAATACAGCTTACAATAATG TGCGAGTTGGCAGGCCTCCAACACAGAGAAA TTGGAACAGCAATTTCTACAGACAA TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCT AGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGT GCAAGTTGGCGGGGGCCCCAACACAGAAGCT
>NZ_LT992462.1|WP_000164008.1|2871423_2872860_+|6-phospho-beta-glucosidase MTKLPQSFMWGGALAANQFEGGYDKGGKGLSVIDVMTSGAHGKARQITESIDPNHYYPNHEGIDFYHRYKEDIALFKEMGLKCLRTSIAWTRIFPNGDEDVPNEEGLAFYDRIFDELIAQGIEPVVTLSHFEMPLHLAKHYGGFRNREVVDYFVHFARVVFERYKDKVTYWMTFNEINNQMDTSNPIFLWTNSGVALTENDNPEEVLYQVAHHELLASALAVRLGKEINPKFKIGTMISHVPIYPYSCHPKDMMEAQIANRLRFFFPDVQVRGYYPSYAKKMLARKGYDVGWQEGDDSILQQGTVDYIGFSYYMSTAVKHDVNTTVENNIVNGGLNHSVENPHIATSDWGWAIDPDGLRYTLNVLYDRYQLPLFIVENGFGAVDEVVDGHIHDDYRIEYLKAHITAAIEAVDQDGVDLIGYTPWGIIDIVSFTTGEMKKRYGLIYVDRDNDGHGTMERLKKDSFYWYQQVIASNGDKL >NZ_LT992462.1|WP_000066924.1|2870616_2871408_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MSNKYKDQAQDILTAVGGVENIVDVSYDTVRMTIHMHHAIPSTANEVTQIDGVASVDENETQLVIVFNEEVKYVYQQLQLLMDDAKHQEDTNHDAVDTQETEQKAQAKVTTPILVKAPIAGRRILLKEVRDSIFREKMVGEGLAIKAHKEFKVIAPFSGKVSMIVPTKHAVGIQSEDGVDIVIHIGVNTVDLEGKGFKCFVKQNDRVEAGQTLLQFDQQYIQEQGYNSDVIVVISNSSDFNKVELTMNEIITTEDVIFKIFKN >NZ_LT992462.1|WP_000922329.1|2869763_2870468_-|GntR-family-transcriptional-regulator MLKYEHIAKQLNAFIHQSNFKPGDKLPSVTQLKERYQVSKSTIIKALGLLEQDGLIYQAQGSGIYVRNIADANRINVFKTNGFSKSLGEHRMTSKVLVFKEIATPPKSVQDELQLNADDTVYYLERLRFVDDDVLCIEYSYYHKEIVKYLNDDIAKGSIFDYLESNMKLRIGFSDIFFNVDQLTSSEASLLQLSTGEPCLRYHQTFYTMTGKPFDSSDIVFHYRHAQFYIPSKK >NZ_LT992462.1|WP_000062646.1|2867246_2869538_+|cbb3-type-cytochrome-c-oxidase-subunit-I MSMQSSYKRLVKVLLTILVIVFSILLVGGWYIFKNEAPRPTKIVDQQGHTLVTKGELISGQAIYEKYGLTDYGSYLGNGSYLGPDYTAEALHHYLIGMRKYYAQDIYHKQLHKLNHVEIAVVKDKVMKEIRINRYSEKEDQLVLTPGQVYGLKYLQDYYKKEFVNNPKQVGLNENMIKQFQNDDYMVAGNKIEHLSQFFFWGAWLSSTDRPGKTFSYTNNWPYDVDAGNTLPSAGILWTAISVTLLIAGLAFIIYIQKRYEFDMKPTYESERELPKIEVDSKITDSQRKVGKYLVVVMLLFLVQILLGELLAHYYVENKFFGIEIQRLFPFNIVKTWHVQLVIFWVATTWLAAGIYIVPKVLGNEPKKQGVLVDILFWALIIVVMGSMIGEWSHILGWIDSHWWLFGHFGWEYIELGKFWQILFIVGMVLWVIILCRGFLPAIRNKVQVNHDKRHLLTLLFVGAIAIPLFYLASLFIMPNSHVTFADYWRWWIVHLWVEGIFEAFAVVLIGFLMVNMKLTTIETTIRALYFQLILLLGTGIVGMGHHYYWQGDHSIWLALGSCFSALEVVPLCLLIWEAYTHYRLYKKSDIAFPYKGTFIFLASTGLWNAIGAGALGFLINTPAVNYFEHGTQWTAAHAHGSMAGVYGMFSIAIALYVFKNITKKEFWTPKVEKWIKISCWALNVGLAGMVFVTLIPVGYIQLKDGLEDGYWHSRLTSFYEQPLVKAIMWGRMPWDIIFTVGVIILVVIFIRGYRHLKPKYRV >NZ_LT992462.1|WP_000607067.1|2866204_2866906_+|antiholin-like-protein-LrgB MINHLALNTPYFGILLSVIPFFLATILFEKTNRFFLFAPLFVSMVFGVAFLYLTGIPYKTYKIGGDIIYFFLEPATICFAIPLYKKREVLVKHWHRIIGGIGIGTVVALLIILTFAKLAQFANDVILSMLPQAATTAIALPVSAGIGGIKELTSLAVILNGVIIYALGNKFLKLFRITNPIARGLALGTSGHTLGVAPAKELGPVEESMASIALVLVGVVVVAVVPVFVAIFF >NZ_LT992462.1|WP_001792906.1|2865768_2866212_+|antiholin-like-murein-hydrolase-modulator-LrgA MVVKQQKDASKPAHFFHQVIVIALVLFVSKIIESFMPIPMPASVIGLVLLFVLLCTGAVKLGEVEKVGTTLTNNIGLLFVPAGISVVNSLGVISQAPFLIIGLIIVSTILLLICTGYVTQIIMKVTSRSKGDKVTKKIKIEEAQAHD >NZ_LT992462.1|WP_000645457.1|2864915_2865656_+|DNA-binding-response-regulator MKALIIDDEPLARNELTYLLNEIGGFEEINEAENVKETLEALLINQYDIIFLDVNLMDENGIELGAKIQKMKEPPAIIFATAHDQYAVQAFELNATDYILKPFGQKRIEQAVNKVRATKAKDDNSASTIANDMSANFDQSLPVEIDDKIHMLKQQNIIGIGTHNGITTIHTTNHKYETTEPLNRYEKRLNPAYFIRIHRSYIINTKHIKEVQQWFNYTYMVILTNGVKMQVGRSFMKDFKASIGLL >NZ_LT992462.1|WP_000950281.1|2863158_2864913_+|sensor-histidine-kinase MLSLTMLLLERVGLIIILAYVLMNIPYFKNLMNRRRTWKARWQLCIIFSLFALMSNLTGIVIDHQHSLSGSVYFRLDDDVSLANTRVLTIGVAGLVGGPFVGLFVGVISGIFRVYMGGADAQVYLISSIFIGIIAGYFGLQAQRRKRYPSIAKSAMIGIVMEMIQMLSILTFSHDKAYAVDLISLIALPMIIVNSVGTAIFMSIIISTLKQEEQMKAVQTHDVLQLMNQTLPYFKEGLNRESAQQIAMIIKNLMKVSAVAITSKNEILSHVGAGSDHHIPTNEILTSLSKDVLKSGKLKEVHTKEEIGCSHPNCPLRAAIVIPLEMHGSIVGTLKMYFTNPNDLTFVERQLAEGLANIFSSQIELGEAETQSKLLKDAEIKSLQAQVSPHFFFNSINTISALVRINSEKARELLLELSYFFRANLQGSKQHTITLDKELSQVRAYLSLEQARYPGRFNININVEDKYRDVLVPPFLIQILVENAIKHAFTNRKQGNDIDVSVIKETATHVRIIVQDNGQGISKDKMHLLGETSVESESGTGSALENLNLRLKGLFGKSAALQFESTSSGTTFWCVLPYERQEEE >NZ_LT992462.1|WP_000608834.1|2862237_2862912_+|iron-sulfur-cluster-repair-di-iron-protein-ScdA MINKNDIVADVVTDYPKAADIFRSVGIDFCCGGQVSIEAASLEKKNVDLNELLQRLNEVEQTNTPGSLNPKFLNVSSLIQYIQAAYHEPLREEFKNLTPYVTKLSKVHGPNHPYLVELKETYDTFKNGMLEHMQKEDDVDFPKLIKYEQGEVVDDINTVIDDLVSDHIATGQLLVKMSDLTSSYEPPIEACGTWRLVYQRLKALEVLTHEHVHLENHVLFKKVS >NZ_LT992462.1|WP_000975356.1|2860372_2862094_+|poly(ribitol-phosphate)-beta-N-acetylglucosaminyltransferase MMKFSVIVPTYNSEKYITELLNSLAKQDFPKTEFEVVVVDDCSTDQTLQIVEKYRNKLNLKVSQLETNSGGPGKPRNVALKQAEGEFVLFVDSDDYINKETLKDAAAFIDEHHSDVLLIKMKGVNGRGVPQSMFKETAPEVTLLNSRIIYTLSPTKIYRTALLKDNDIYFPEELKSAEDQLFTMKAYLNANRISVLSDKAYYYATKREGEHMSSAYVSPEDFYEVMRLIAVEILNADLEEAHKDQILAEFLNRHFSFSRTNGFSLKVKVEDQPQWINALGDFIQAVPVRVDALVMSKLRPLLHYARAKDIDNYRTVEESYRQGQYYRFDIVDGKLNIQFNEGEPYFEGIDIAKPKVKMTAFKFDNHKIVTELTLNEFMIGEGQYDVRLKLHSRNKKHTMYVPLSVNANKQYRFNIMLEDIKAYLPKEKIWDVFLEVQIGTEVFEVRVGNQRNKYAYTAETSALIHLNNDFYRLTPYFTKDFNNISLYFTAITLTDSISMKLKGKNKIILTGLDRGYVFEEGMASVVLKDDMVMGMLSQTSENEVQILLSKDIKKRDFKNIVKLNTAHMTYSLK >NZ_LT992462.1|WP_000031255.1|2873435_2874197_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSKEAGHTFLAKLGKTRLRPGGKAATDWLIQQGAFSQDKHVLEVACNMCTTSIYLAHTYGCHIQGVDINKKALEKAQENISAAGLESYIQVQQANAVKLPFDDNQFDIVLNEAMLTMLPIAIKEKALREYYRVLKPGGILLTHDIVIVNESHATHVVKSLSAAINVNVSPQTKLGWLDLYHQAGFNHVHYHTGPMSLMTPKGLIYDEGIVGTIKIINNALKKENRPMFCKMFKTMTRLRKDMNYITFVAKKEH >NZ_LT992462.1|WP_000182750.1|2874448_2875363_-|ribokinase MTNKVVILGSTNVDQFLTVERYAQPGETLHVEEAQKAFGGGKGANQAIATARMQADTTFITKIGTDGVADFILEDFKAAHIDTSYIIKTTEEKTGQAFITVNAEGQNTIYVYGGANMTMTPEDVINAKDAIINADFVVAQLEIPIPAIISAFEIAKAHGVTTVLNPAPAKALPNELLSLIDIIVPNETEAELLSGIKVTNEQSMKDNANYFLSLGIKTVLITLGKQGTYFATKNQSQHIEAYKVNAIDTTAAGDTFIGAFVSRLNKSQDNLADAIDFGNKASSLTVQKHGAQASIPLLEEVNQV >NZ_LT992462.1|WP_000750483.1|2875390_2875795_-|D-ribose-pyranase MKKTAVLNEHISKAIATIGHFDLLTINDAGMPIPNDHRRIDLAVTKNLPRFIDVLATVLEEMEIQKIYLAEEIKEHNPTQLQQIKQLISSEIEIIFIPHEEMKSNLAHPLNKGNIRTGETTPYSNIALESNVTF >NZ_LT992462.1|WP_000029208.1|2875809_2876691_-|ribose-transporter-RbsU MSIVALLIGLGPLIGWGFFPTVASKFGGKPVHQIIGATVGTLIFAIILAVVTSSGFPTGTNLLFALLSGAGWGFGQIITFKAFELVGSSRAMPVTTAFQLLGASLWGVFALGNWPGIGHRIIGFTALVVILIGARMTVWSERKEASNAKNLRRAVVLLLIGEFGYWLYSAAPQATSIDGLTAFLPQAMGMVIVAVIYGFMNMKAENPFRNKITWLQIISGFFFAFGALTYLISAQPNMNGLATGFILSQTSVVLATLTGIYFLKQHKTSKEMVITIIGLVLILVAASVTVFIK >NZ_LT992462.1|WP_000757874.1|2876922_2877921_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MKKVSIKDVAREAGVSVTTVSHILNHNDSRFSATTIKNVHAVSECLGYAPNKHAKQLRGSKIQTIGVILPSLTNPFFSALMQSIHDHKPSDVDLCFLTSTATDLYDNIKHLIDRGIDGLIIAQYISSPDALNNYLKKHHVPYVVLDQNDHQGYTDFVRTNEYQGGQLAAQHLIELGHNNMMIVAPYDMMANMSTRVTGFVDTLRANQLPEPQIVHTELSKRGGLTIVDDIMVQSATAIFAINDELAIGILRGLIEHGISIPKDISLIGYDDIDYAAYVSPPLTTVAQPITDIGKTSLTLLLQRLQHLDKSIDMIELPTTLKIRATTGYHLSN >NZ_LT992462.1|WP_001159764.1|2878301_2878694_+|hypothetical-protein MQFKLKEEEIISFLELKYPEKEFEYGRLLVGQHKRDDLDVYYFGDTFLMCTIISFKTFEIKETVELSYDAVNRIVLKDGWLFRKMRIETMQKVLKYGTSKLMLTDFQKDNYNKYIQGQKQRVIFENGHFV >NZ_LT992462.1|WP_001066542.1|2878822_2880199_-|MFS-transporter MNNTQSSPRSNIIIAIMLSALTYWLFAQSFINIGPLVGQTYQTSPAVLNLSISLTSFATGIFMVAAGDIADKIGQLRMTYMGLIISMFASLLLIISDITALLIIGRILQGLSAAILLPSTVGVLNNQFKGDHLRRAISYLMISTVGGIGLAGVIGGLIATNFGWQTNFIISIVIAFIAILLLKGTPEKVSQHSHRHPFDYKGMSIFAVMIGSFTLLLTQGFEQGWFSTFSFICLSIIIITTLIFIIIERRHEVPFIDFSVLRNRPFIGAFLNNFVLNSGLGVTVVFFIYAQTHLGLSAAQSGLVTLPYAIVAVAMIRLGEKATLRFGGKLMLIIGPLFPVIGITIISMTSLQPSQYIIAVVIGFVICAIGNGLVATPGLTIAIFSMPNEKVGLATGLYKMSGTLGGAFGIALSTTVFSMLQLNYAPSVAATITFIVSIVLMILGSLSAYMIIPKTVKS >NZ_LT992462.1|WP_000337367.1|2880432_2881425_+|linear-amide-C-N-hydrolase MCTGFTIQTLNNQVLLGRTMDYDYPLDGSPAVTPRNYRWTSRTGTTGQTQYGFIGTGTDMEGFIYGDGVNEHGVAISTQYFRGYSSYGSIHKADAMNITQNEIVTWILGYTTSIEDMKQQASQIHVVAVYLNDIGEVPPLHYHVSDATGHSVEVSFKEGEVVIKDNPIGVLTNHPDLDWHYSNLRQYINISPYPAPANLLEGVTIEPLGNEAGTFGLPGGFTSTERFVRMAFMKANIAQNNDKEMDLMNAFYLLDAVNIPIGIVRPHDADNHYTMYQTVINLTTRTLYIKYYGSNEIVALKLTDDLINRKDMTIFKPEKHITIRKLNDNQ >NZ_LT992462.1|WP_000736798.1|2881750_2882701_+|glycine-glycine-endopeptidase-LytM MKKLTAAAIATMGFATFTMAHQADAAETTNTQQAHTQMSTQSQDVSYGTYYTIDSNGDYHHTPDGNWNQAMFDNKEYSYTFVDAQGHTHYFYNCYPKNANANGSGQTYVNPATAGDNNDYTASQSQQHINQYGYQSNVGPDASYYSHSNNNQAYNSHDGNGKVNYPNGTSNQNGGSASKATASGHAKDASWLTSRKQLQPYGQYHGGGAHYGVDYAMPENSPVYSLTDGTVVQAGWSNYGGGNQVTIKEANSNNYQWYMHNNRLTVSAGDKVKAGDQIAYSGSTGNSTAPHVHFQRMSGGIGNQYAVDPTSYLQSR >NZ_LT992462.1|WP_000570073.1|2882752_2883412_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEINNLSKRYRNKQIFNHLTMSFDSNRLTVLLGDNGAGKSTLLRMIAGIEKANDGTINYFGEKWNQRQIQNHIGYVPQDIALFEHMTVAENIKFFKSLCKNSINDTTINEYLQQLNFNDTSAKVSTLSGGNKRKINILVGLLGQPRILILDEPTVGIDLKSRHDIHQLLNIMKSKCLIILTTHHLDEVEALADDIKLIGQDPFYQHVLEDKQWAYTYY |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT992462_5 | 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 1640360-1640385 | 26 | NZ_LT992462.1 | 1738126-1738151 | 0 | 1.0 |
NZ_LT992462_8 | 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2124246-2124271 | 26 | NZ_LT992462.1 | 1429461-1429486 | 0 | 1.0 |
NZ_LT992462_8 | 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2124246-2124271 | 26 | NZ_LT992462.1 | 684991-685016 | 1 | 0.962 |
NZ_LT992462_2 | 2.1|680618|31|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 680618-680648 | 31 | NZ_LT992462.1 | 823159-823189 | 2 | 0.935 |
NZ_LT992462_8 | 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2124246-2124271 | 26 | NZ_LT992462.1 | 199063-199088 | 2 | 0.923 |
NZ_LT992462_8 | 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2124246-2124271 | 26 | NZ_LT992462.1 | 635911-635936 | 2 | 0.923 |
NZ_LT992462_8 | 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2124246-2124271 | 26 | NZ_LT992462.1 | 680846-680871 | 2 | 0.923 |
NZ_LT992462_8 | 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2124246-2124271 | 26 | NZ_LT992462.1 | 1915709-1915734 | 2 | 0.923 |
NZ_LT992462_8 | 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2124246-2124271 | 26 | NZ_LT992462.1 | 2256077-2256102 | 2 | 0.923 |
NZ_LT992462_11 | 11.1|2872957|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2872957-2872981 | 25 | NZ_LT992462.1 | 2873126-2873150 | 2 | 0.92 |
NZ_LT992462_11 | 11.2|2873013|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2873013-2873037 | 25 | NZ_LT992462.1 | 1915671-1915695 | 2 | 0.92 |
1. spacer 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to position: 1738126-1738151, mismatch: 0, identity: 1.0
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer agaatttcaaaaaagaaattctacag Protospacer **************************
2. spacer 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to position: 1429461-1429486, mismatch: 0, identity: 1.0
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagaagctggcgg Protospacer **************************
3. spacer 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to position: 684991-685016, mismatch: 1, identity: 0.962
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagaagctgacgg Protospacer **********************.***
4. spacer 2.1|680618|31|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to position: 823159-823189, mismatch: 2, identity: 0.935
atcacttatgctttattatgtattggttctt CRISPR spacer atcactaatgatttattatgtattggttctt Protospacer ****** *** ********************
5. spacer 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to position: 199063-199088, mismatch: 2, identity: 0.923
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cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagaagctggtgg Protospacer *************.*********.**
7. spacer 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to position: 680846-680871, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagtagcaggcgg Protospacer **************** *** *****
8. spacer 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to position: 1915709-1915734, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacaaaagctggcgg Protospacer *************.*.**********
9. spacer 8.1|2124246|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to position: 2256077-2256102, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagtagctggcgg Protospacer *************.** *********
10. spacer 11.1|2872957|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to position: 2873126-2873150, mismatch: 2, identity: 0.92
ggcgaaaatacagcttacaataatg CRISPR spacer ggcgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ******** ***************
11. spacer 11.2|2873013|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to position: 1915671-1915695, mismatch: 2, identity: 0.92
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ttggaacaccaattcctacagacaa Protospacer ******** *****.**********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LT992462_11 | 11.1|2872957|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2872957-2872981 | 25 | NC_014792 | Enterobacteria phage vB_EcoM-VR7, complete genome | 154175-154199 | 3 | 0.88 |
NZ_LT992462_5 | 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 1640360-1640385 | 26 | NZ_CP053838 | Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence | 17379-17404 | 4 | 0.846 |
NZ_LT992462_5 | 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 1640360-1640385 | 26 | NZ_CP017210 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp9, complete sequence | 2023-2048 | 4 | 0.846 |
NZ_LT992462_11 | 11.2|2873013|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2873013-2873037 | 25 | MW117966 | Synechococcus phage S-H9-1, complete genome | 42366-42390 | 4 | 0.84 |
NZ_LT992462_5 | 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 1640360-1640385 | 26 | NC_008443 | Borrelia burgdorferi strain Ip21 plasmid, complete sequence | 5652-5677 | 5 | 0.808 |
NZ_LT992462_5 | 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 1640360-1640385 | 26 | NC_010631 | Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN01, complete sequence | 3460-3485 | 5 | 0.808 |
NZ_LT992462_5 | 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 1640360-1640385 | 26 | NC_010632 | Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02, complete sequence | 13739-13764 | 5 | 0.808 |
NZ_LT992462_11 | 11.2|2873013|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2873013-2873037 | 25 | NZ_CP038259 | Acinetobacter baumannii strain 39741 plasmid pEH_gr13, complete sequence | 11151-11175 | 5 | 0.8 |
NZ_LT992462_5 | 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 1640360-1640385 | 26 | MK448662 | Streptococcus satellite phage Javan97, complete genome | 6198-6223 | 6 | 0.769 |
NZ_LT992462_11 | 11.2|2873013|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 2873013-2873037 | 25 | NZ_CP047617 | Lactococcus raffinolactis strain Lr_19_5 plasmid pLraf_19_5_1, complete sequence | 79395-79419 | 6 | 0.76 |
NZ_LT992462_6 | 6.1|1904644|34|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 1904644-1904677 | 34 | NC_027332 | Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome | 68639-68672 | 11 | 0.676 |
NZ_LT992462_6 | 6.1|1904644|34|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder | 1904644-1904677 | 34 | KY000079 | Acinetobacter phage AM24, complete genome | 74925-74958 | 11 | 0.676 |
1. spacer 11.1|2872957|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to NC_014792 (Enterobacteria phage vB_EcoM-VR7, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
ggcgaaaatacagcttacaataatg CRISPR spacer gacgaaaatacatattacaataatg Protospacer *.********** ***********
2. spacer 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053838 (Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer agaatttcaaaaaataaaatctattg Protospacer ************** *** ****. *
3. spacer 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017210 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp9, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer acaatttcaaaaaagaaatattacac Protospacer * ***************** .****
4. spacer 11.2|2873013|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to MW117966 (Synechococcus phage S-H9-1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ttggaacagcaatttctactggtat Protospacer ******************* *..*
5. spacer 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to NC_008443 (Borrelia burgdorferi strain Ip21 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer ccaatttcaaaaaagaaattttccac Protospacer ******************.* **
6. spacer 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to NC_010631 (Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer tgaatgtcaaaaaagaaattcttgaa Protospacer **** **************** *.
7. spacer 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to NC_010632 (Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer tgaatgtcaaaaaagaaattcttgaa Protospacer **** **************** *.
8. spacer 11.2|2873013|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038259 (Acinetobacter baumannii strain 39741 plasmid pEH_gr13, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ctggaacagcaatttctccagaggt Protospacer .**************** **** .
9. spacer 5.1|1640360|26|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to MK448662 (Streptococcus satellite phage Javan97, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer gctttttcaaaaaagaaattctagac Protospacer . ******************* *
10. spacer 11.2|2873013|25|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047617 (Lactococcus raffinolactis strain Lr_19_5 plasmid pLraf_19_5_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ctggaacagcaatttctacattatc Protospacer .*******************
11. spacer 6.1|1904644|34|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to NC_027332 (Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tgctggtaccacgatgcgtcttgatgtagtgcta CRISPR spacer gatcaataccacgatgcgtcttgaagtggtagaa Protospacer .....****************** **.**. *
12. spacer 6.1|1904644|34|NZ_LT992462|CRISPRCasFinder matches to KY000079 (Acinetobacter phage AM24, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tgctggtaccacgatgcgtcttgatgtagtgcta CRISPR spacer gatcaataccacgatgcgtcttgaagtggtagaa Protospacer .....****************** **.**. *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
8250 : 19689
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT992462|8250:19689|DBSCAN-SWA AATGCAATCTTTTGTAAAAATCATAGATGGTTACAAGGAAGAAGTAATAACAGATTTTAATCAGCTTATATTTTTAGATGCAAGGGCTGAAAGTCCAAACACCAATGATAATAGTGTAACTATTAACGGAGTAGACGGTATTTTACCGGGCGCAATTAGTTTTGCGCCTTTTTCACTAGTATTAAGGTTTGGCTATGATGGTATAGATGTTATAGATTTAAATTTATTTGAGCATTGGTTTAGATCTGTATTTAATCGTAGACATCCTTATTATGTTATTACTTCTCAAATGCCTGGCGTTAAATACGCAGTGAATACAGCTAATGTTACATCTAATTTAAAAGATGGTTCTTCAACTGAAATTGAAGTAAGTTTAAATGTTTATAAAGGATATTCTGAATCAGTTAATTGGACTGATAGCGAGTTCTTATTCGACTCTAATTGGATGTTTGAAAATGGAATTCCTCTTGATTTCACACCTAAATATACTCATACATCAAATCAATTTACTATTTGGAACGGTTCTACTGATACGATAAATCCACGATTCAAGCACGATTTGAAAATATTAATTAATTTAAATGCGAGTGGAGGATTTGAACTGGTTAACTATACAACAGGTGATATTTTTAAGTACAACAAAAGTATAGATAAAAACACTGATTTTGTTTTAGATGGTGTGTATGCATATCGAGATATAAATAGAGTGGGAATTGATACAAATAGGGGCATTATAACATTAGCGCCAGGTAAAAATGAATTTAAGATTAAAGGAGACGTCAGTGATATTAAAACTACATTTAAGTTTCCTTTTATTTATAGGTAGGTGATTTAATGGATTATCATGATCATTTATCAGTAATGGATTTTAATGAATTGATTTGTGAAAATTTACTAGATGTAGATTACGGTTCTTTTAAAGAATATTATGAACTGAATGAAGCTAGGTACATCACCTTTACAGTTTATAGAACTACTCATAATAGTTTTGTTTTTGATTTATTGATTTGTGAAAACTTCATAATTTATCATGGTGAAAAATACACAATTAAGCAGACAGCGCCAAAGGTTGAAGGTGATAAAGTTTTTATTGAAGTTACGGCATATCACATAATGTATGAATTTCAAAATCACTCAGTGGAATCAAATAAACTTGATGACGACAGTAGTGAAACGGGTAAAACGCCCGAATACTCTTTAGATGAGTACTTAAGATATGGATTTGCAAATCAAAAAACGTCAGTCAAGATGACCTATAAAATAATTGGAGATTTTAAAAGAAAAATACCAATTGATGAATTAGGTAATAAAAATGGCTTAGAATATTGTAAAGAAGCAGTAGATTTGTTTGGTTGTATTATTTATCCAAATGATACGGAGATATGTTTTTATTCTCCTGAAACATTCTATCAAAGAAGCGAAAAAGTAATAAGGTATCAATATAATACTGATACTGTGTCTGCTACTGTCAGTACGTTGGAATTAAGAACAGCTATAAAAGTTTTTGGGAAAAAGTACACAGCCGAGGAAAAGAAAAATTACAATCCTATTAAAACAACTGACATTAATTACTCAAATGATTTCATAAAAGAAGGCACTTATCGCACAGAAACAATTGGTTCTAAAGCAACTATTAACTTTGATTGCAAGTATGGTAATGAAACAGTTAGGTTTACAATCAAAAAAGGTTCCCAAGGTGGAATATATAAGTTGATTTTAGACGGCAAGCAAATTAAGCAAATTTCTTGTTTTGCTAAGTCGGTTCAGTCTGAAACAATAGATTTAATAAAAAATATTGATAAAGGCAAGCACGTTTTAGAAATGATATTTTTAGGAGAAGACCCCAAAAATAGAATTGATATATCTTCAAATAAAAAAGCTAAGCCTTGTATGTACGTTGGAACTGAAAAATCAACAGTCTTAAATTTAATTGCTGACAATTCAGGTCGCAATCAATACAAAGCAATTGTTGACTACGTCGCAGATAGTGCAAAGCAGTTTGGGATTCGATATGCTAATACGCAAACAAATGAAGATATCGAAACACAGGATAAGTTGTTAGAATTTGCAAAAAAGCAAATAAATGATACTCCTAAGACTGAATTAGATGTTAATTATATAGGTTATGAAAAAATAGAGCCAAGAGATAGCGTATTCTTTGTTCATGAATTAATGGGATATAACACTGAATTAAAGGTTGTTAAACTTGATAGGTCACATCCATTTGTAAACGCAATAGATGAAGTGTCTTTCAGCAATGAAATAAAAGATATGGTACAAATTCAGCAAGCGCTTAACAGACGAGTTATTGCACAAGATAATAGATATAACTATCAAGCAAATCGTATAAATCATTTATACACTAGTACTTTGAATTCTCCTTTCGAGACAATGGATATAGGGAGTGTATTAATATAATGGCAACAGAAGAAGTTAAAATCAAAGCGCTACTTGAAAACGATAAACAGTACTTTCCAGCTACACATTGGAAAGCTATAAATGGGGTACCTTATGCAGGAAGTAGTGATATTGATGGGTTACCTCAAGACGGTATCATTTCGGTAGATGATAAAAATAAATTAGATAATTTAAAAATAGGCGAAGCAGGAATTATTCAAAATAGCATTGTACAGAAATCCCCAAACGGTAAATTGTGGAAAATAACAGTTGACGATAGTGGGAAACTTGGTACAGTGCTATTTTATTAGAAAGGAAGGTGCATTATGGAAAATTTGTATTTAATAAAGGATTTGGGAGCTTTAGCAGGTCGAGATTATAGAGCTAAGGAAATACAAAACTTACAAAGAATAGAGCAATTTGCGCTTGGATTGACAACAGAGTTTAAGTTGCATCAGAAAGCTAAAACAATTCAACACTTCGCTGAGCAAATTTATTATAATGGTAGATCGCAAGCATCAGTAAATAAATCTTTACAAAGTCAAATTAACTCACTTGTTTTGGCACCGCGTAATAATAGCGCTAATGAGATTGTTCAAGCTCGAGTTAATGTAAATGGCGAAACCTTTGATACATTAAAAGAACATTTAGACGATTGGGAAACCAAAACTCAAATTAATAAAGAAGAAACTATAAGAGAACTAAATAAGGCTAAACAACAAATTCTTGATATCGAGTACCGTTTTGAACCTGATAAGCAAGAGTTTTTATTTGTGACAGAACTTGCACCTCTTACAAATGCAGTAATGCAATCCTTCTGGTTTGATAATAGAACAGGCATAGTATACATGACACAAGCTAGAAATAATGGCTATATGCTAAGTCGTTTAAGACCTAATGGTCAATTTATAGACAGCTCATTGATTGTAGGTGGGGGTCATGGTACACATAACGGTTATAGATATATTGATGATGAGTTATGGATTTATAGTTTTATCTTAAATGGTAATAATGAGAATACATTAGTTCGTTTCAAGTATACGCCTAATGTGGAAATTAGCTATGGCAAGTATGGTATGCAAGATGTATTTACAGGACACCCAGAAAAACCCTACATCACCCCTGTCATAAATGAAAAAGAAAATAAAATTCTATACAGAATTGAGAGACCTAGAAGTCAGTGGGAACTTGAAAACTCAATGAATTATATAGAGATAAGAAGTTTAGACGATGTTGATAAAAATATTGATAAAGTTTTGCATAAAATCAGTATCCCTATGAGACTAACAAACGAAACCCAACCAATGCAGGGTGTGACTTTTGATGAAAAATACTTGTATTGGTATACAGGAGACAGTAATCCAAATAATAGAAACTATTTAACGGCTTTCGATTTAGAAACAGGAGAAGAAGCGTATCAGGTTAATGCTGACTATGGTGGAACACTAGATTCATTTCCTGGCGAATTTGCGGAAGCAGAAGGTTTGCAAATATACTATGACAAAGATAGTGGTAAAAAAGCTTTGATGCTAGGTGTTACTGTCGGTGGTGATGGAAATAGAACACATCGTATTTTCATGATTGGGCAAAGAGGCATTTTAGAAATACTTCACTCAAGAGGCGTTCCTTTTATCATGAGTGACACAGGTGGTAGAGTTAAACCTTTACCAATGAGGCCTGATAAACTTAAGAATCTTGGGATGTTAACAGAGCCAGGTCTTTACTATTTATACACTGATCATACAGTTCAAATCGATGATTTCCCATTACCAAGAGAATGGCGTGATGCAGGTTGGTTCTTGGAAGTTAAGCCACCACAAACTGGCGGTGATGTAATTCAGATATTGACGCGTAATAGTTATGCAAGGAATATGATGACTTTTGAAAGGGTGCTTTCTGGAAGAACTGGAGACATTTCGGACTGGAATTATGTGCCTAAAAATAGTGGTAAATGGGAGAGAGTACCTTCATTCATCACAAAAATGTCAGATATTAACATAGTAGGCATGTCGTTTTATTTAACTACGGATGATACAAAACGTTTTACAGATTTTCCAACTGAACGTAAAGGGGTAGCTGGTTGGAACTTATATGTAGAAGCTTCAAACACAGGTGGCTTTGTTCATAGGCTAGTTCGTAATAGTGTTACAGCATCTGCTGAGATACTATTGAAAAATTATGATAGTAAAACAAGTTCAGGGCCATGGACTTTACACGAAGGGAGAATTATAAGTTAATGAGTAATTTAGAGAAATCTGTAGCTATAAATTTAGAAAACACAGCGCATTATGAAAATATTTCAAATCTAGATATAACTTTTAGAACAGGAGAGAGTGATTCTTCTGTTCTTCTTTTTAATATCACTAAAAATAATCAACCGTTATTATTGAGTGAAGAAAATATCAAAGCACGAATAGCGATTCGAGGTAAAGGAGTCATGGTAGTTGCTCCACTAGAAATATTAGATCCATTTAAAGGTATTTTAAAATTTCAATTACCTAATGATGTAATTAAACGAGATGGAAGTTATCAAGCTCAAGTTTCGGTTGCAGAATTAGGTAATTCAGACGTGGTAGTTGTCGAGAGAACTATCACATTTAACGTTGAAAAAAGTTTGTTTAGCAAGATTCCCTCTGAAACAAAACTACACTATATTGTTGAGTTTCAAGAATTAGAAAAAACTATTATGGATCGCGCGAAAGCAATGGACGAGGCTATAAAAAATGGTGAGGATTATGCGAGTCTGATTGAAAAAGCTAAAGAAAAAGGTCTATCAGATATTCAAATAGCAAAATCTTCAAGTATTGATGAATTAAAGCAACTTGCTAATAGCCGTATATCTGATTTGGAAAATAAAGCGCAAGCATATTCAAGAACATTCGATGAGCAAAAGCGATATATGGATGAGAAACATGAAGCCTTCAAGCAGTCAGTGAATAGTGGTGGTTTAGTCACAAGTGGTTCTACTTCAAATTGGCAAAAAGCTAAGATTACTAAAGATGATGGTAAGATAATGCAGATTACTGGATTTGATTTTAATAATCCAGAACAAAGAATAGGTGATTCAACCCAATTTATTTATGTTTCGCAAGCTATAAATTATCCAAGAGATGTTAGTACTAACGGTACTGTCGAATATTTAGTAGTAACTTCAGATTACAAGCGTATGACTTATCGACCGAACGGTACAAATAAAGTGTTTGTTAAAAGAAAAGAAGCGGGTTCATGGTCTGAGTGGTCAGAATTAGCTATTAATGATTACAATACACCTTTTGAAACTGTTCAAAGTGCCCAATCAAAAGCTAATATGGCCGAAAGTAACGCTAAATTATACGCAGATGACAAGTTTAATAAAAGGTATTCGGTTATTTTTGATGGAACAGCAAATGGTGTGGGCTCTACATTGTACTTAAATGAGAGTTTAGACCAATTTATTTTATTAATTTTTTATGGGACTTTTCCAGGTGGTGACTTTACAGAGTTTGGCAGTCCTTTTGGAGGAGGAAAGATTTCATTGAATCCCTCAAATCTTCCAGATGGTGATGGAAATGGTGGAGGTGTTTATGAGTTTGGATTAACTAAATCTAGTCGTACATCTTTAACTATATCAAACGATGTCTATTTCGACTTAGGAAGTCAAAGAGGCTCTGGTGCGAACGCAAATAGAGGGACAATTAACAAAATTATAGGAGTGAGAAAATAATGCAAATATTAGTTAACAAACGCAATGAGATTATTTCATACGCTGTTATTGGTGGTTTTGAAGAAGGTATTGATATAGAAAGTCTTCCAGAAAACTTCTCTCAAGTTTTTAGACCTAAAGTATTTAAATATTCAGATGGAAAAATAATTTTTAATGAAGATTATACAGAGGAAAAGGATGACTCACATCAACAGATTGATAATGAAGAGAATAGTACAGGTGCTTCTGATGACATATTACGAAAAATGGTTGCTAGTATGCAGAAGCAAGTTGTTCAAAGTACAAAGTTATTGATGCAAGTTAATAAACAAAACGCTTTGATGGCAAAACAGATTGTAGCATTCAATAAAAAATTAGAAGAGATTAAAGGAGAGACGGAAAATGCTTAAATTGATTTCACCAACTTTCGAAGATATTAAAACATGGTATCAATTGAAAGAATATACTAAAGAAGATATAGCGTGGTATGTAGACATGGAAGTTATAGATAAAGAGGAATACGCAATTATTACAGGAGAAAAGTATCCAGAAAATCTAGTGTCATAGGCCAAGAGTCTATGGCTTTTTAATTTGAATAAAGTGGGTGGCAGAATGTTTGGATTTACCAAACGACATGAACAAGATTGGCGTTTAACGCGTTTAGAAGAAAATGATAAGACTATGTTTGAAAAATTCGACAGAATAGAAGATAGTCTGAGAGCGCAAGAAAAGATTTATGACAAATTAGATAGAAATTTTGAAGAATTAAAGCGCGACAAAGAAGAAGATGAAAAAAATAAGGAAAAAAATGCCAAAAACATTAGAGACATTAAGATGTGGATTCTTGGATTAATAGGGACGATACTAAGTACGTTTGTTATAGCAATTTTAAAAACAGTATTCGGTATTTAAAGGAGGTGATTACCATGCTTAAAGGGATTTTAGGTTATAGTTTTTGGGCTTGTTTTTGGTTCGGTAAATGCAAATAACGATTAAAGGTCAGTGCTTCGGCACTGGCTTTTTATTTTGGATAAAAGGAGCAAATAAATGGATATTAACTGGAAATTGAGATTTAAAAATAAAGCGGTATTAACGGGATTGATTGGGGCATTATTGCTATTTATCAAGCAAATCACAGATTTATTCGGATTCGATTTATCAAATCAATTAAATCAAGCTAGCGCGATTATAGGCGCTATCCTCACGCTACTTACAGGTATTGGCGTTATTACTGACCCAACGTCAAAAGGTGTTGCCGATTCATCTATAGCACAGACTTATCAAGCGCCTAGAGATAGTAGCAAAGAAGAACAACAAGTCACTTGGAAAACTTCACAAGATGCTAGCTTAACGCCCGAATTAAGCACGAAAGCCCCAAAAGAATATGATACATCACAGCCGTTTACAGACGCCTCTAACGATGTTGGCTTTGACGTAAACGAATATCATTATGGAGGTGGCGACAATGCAAGCAAAATTGACTAAAAAAGAGTTTATAGAGTGGTTGAAAACATCTGAGGGAAAACAATTTAATATCGACCTTTGGTATGGATTTCAATGCTTTGACTATGCCAATGCAGGTTGGCAAGTCTTATTTGGCTACAACTTAAAAGGTGTAGGTGCCAAAGACATCCCAAGTGCTAATAATTTTAACGGACTAGCTACTGTATACCAAAACACACCAGACTTCTTAGCACAACCTGGCGACATGGTTGTATTCGGTAGCAACTACGGTGCTGGATATGGTCACGTTGCATGGGTTATCGAAGCAACTTTAGATTATATCATTGTATATGAGCAGAATTGGCTCGGCGGTGGATGGACTGACGGAATCGAACAACCCGGCTGGGGTTGGGAAAAAGTTACAAGACGACAACATGCTTACGATTTCCCTATGTGGTTTATCCGCCCGAACTTCAAAAGCGAAATATCGCCACGATCAGTTCAATCTCCTACACAAGCACCTAAAAAGGAAACAGCTAAGCCACAACCTAAAGCGGTAGAACTTAAAATCATCAAAGATGTAGTTAAAGGTTACGACCTGCCTAAACGTGGTGGTAATCCTAAAGGTATTGTCATTCATAATGACGCAGGAAGCAAAGGGGCAACAGCAGAAGCGTATCGAAACGGATTAGTTAACGCACCTTTATCGAGATTAGAAGCAGGTATTGCGCATAGTTATGTATCAGGTAACACAGTGTGGCAAGCCTTAGATGAATCACAAGTAGGTTGGCATACCGCTAATCAAGTTGGTAATAAATATTATTACGGTATTGAAGTGTGTCAATCAATGGGTGCAGATAACGCGACGTTCTTAAAAAATGAACAGGCAACTTTCCAAGAGTGCGCTAGATTGTTGAAAAAATGGGGGTTACCAGCAAACAGAAACACAATCCGATTGCACAACGAATTCATTTCAACATCATGCCCGCACAGAAGCTCAGTATTGCACACTGGTTTTGACCCAATAACTCGCGGTCTATTGCCAGAAGATAAACGGCTACAACTTAAAGACTACTTTATCAAGCAAATTAGAGCATACATGGATGGTAAAATACCGGTTGCCACTGTCTCAAACGAGTCAAGCGCTTCAAGTAATACAGTTAAACCAGTTGCAAGTGCATGGAAACGTAATAAATATGGCACTTACTACATGGAAGAAAGTGCTAGATTCACAAACGGCAATCAACCAATCACAGTAAGAAAAGTGGGGCCATTCTTATCTTGTCCAGTGGGTTATCAGTTCCAACCTGGTGGATATTGTGATTATACAGAAGTGATGTTACAAAATGGCCATGTGTGGGTAGGATATAATTGGGAGGGGCAACGTTATTACTTGCCTATTAGAACATGGAATGGTTCTGCCCCACCTAATCAGATATTAGGTGACTTATGGGGAGAAATCAGTTAATATAAAATTGTGGTGAGCCTTTTCTAGGCGGGTGCATTATATGCATTCGCCTTTTTATTTGCATTAAAAAATAATTGTGGTATTATTTCTATATACTTTATTCAACATTTCTCTCTCAAGTTGAAATCGTGAGTAGTAGGCAGGTACTTCGGTGCTTGCCTATTTTTTATGTTATAATCATTTTAGACGTTTTCAAGGGACGTCTCTTTAGATTGTATATTGTAACTAGCCTTCGGGCTAGTTTTTTGTTATTATAACGTCACATGCATAAGCTGTATACATTTATCCTTGTTCACTCAAGCATGTCACTGGGTGTTTTTTAATGAATATTTAGACATTAGTTATGTAAAAGTCGATTATACAGATGATGTTTAAAGGGTTGAATAAACTTCAGATATATGATAGATTAATACGACATGTAATTACAAATAAATTTATAATAATTATAATTAGAAACCACTTATGCATGTCACTGAGTGGTTTACAGCTTATATAACTCAAGCATAAAGCCGTACTACTCCCCCGTAGTATAAGATGTATGTTCCCGTAGTTTCGCGGGAATATTTTATGTTATACTTACATAGGTATATAGTAGGAGTGAACTATATAGCCTGTTAAGTGACCTGGTAACTTAATACTTATCCCGGCAATTGATGCCCTTTTTGCCCGTCACTCGATACATATATCTCAACAACATAGAAATATTACAGTCGCTACACCACTCAATGTATGGGTGGTTGTTTTTTTTATGTTATTAGGAACAAAACATTTTAAGAGTAAAAACAGAGATACTAAAGAAATTTGGCAAATCTGTTGTCGGAAATATACTTTCATGATACATTTTAAACAGGTAGACAAGGTATACCCGATAGACAAATGATGAAAATGAGGAAGTGAGTAGTATGGCTACAAAAAGTTTTACTACAGATTATAAATTTAATAACAAAGCAGCTGAAAAATTAGTGAATGCCATGAATAAAAGTGAAGATGCTCAATTCAATAGATCTAATGTTTTTGCTCAACGTTTAAAAACAATGGAAGACTTACAAAATTTTAAGAATAAAGTAAAGGTTATTTTATAAAAAATGAAAGGAGTGGTTAGTATGGAATGGCAACCTAATAACACATACGTTATAGCTCAAAACTTGATTACAAAATATCAAGAAATTACCGGAAACAGCATAGTGGGAGACGAGATGAAAGTGCATAAATTAATGTACTATATCCAGAAAACTTCTATTGCTTTAACAGGGAACGCTATAATCGATGAACAATTTGAAGGTTGGGTACATGGTCCAGTTTTACCGTCCTTAAGAGGGTTATTTGATTACTTTGTGGAAGACAATACTTCTAGAAATAAAGTTAATGATACTGAAGAATTTATAATCGAGAATGCTATTTATCAATATGGTAAATATGCAACATGGGCTCTTAGAGAGAAATCACACGAAGAAATTTCGTGGCTTAATAGCCGTAAAGGCTTAAGTGCTAATGAACGAGGGTATAGAAATCTCACAATTGAGGATATCAAAGAAGATGCAAACAAAATAAGATTATATGATTATAGTTACGATATGTATATAGATGAATTTGAAGATTTAGATGAGGAGGAATTTATTAGTGCACACTAGATCCCCTCATGACTATATAGGTAAAATCGTTAAAATAAGATTACCTTATTATGATGTGAAAAGCGCAAAAGTTGCTTTTAAATCTAGGCCTGGTTTAATAATAGGTTGCGAAAAGAATCAATTCCCTTGTGATTTCACTTATTTGCCTATTTCGAAAATAAGTGATGAAAGCAAAAGACATTCTATATATGATTTTGAAGTAAACGATGAGACTTGTAATTTGTTAAATTTGAATAACGTTCCATCATTTGTTAGGTGTCATAAGGTTAGTACTGTATATAGCAAGAATGTTCACAGAAATTACATTAGTGATTTAAACGAAACGAACAATCGACTTTTTAATGAGATTAAATCTATCTTTGATGCATTTGCAACTGGTTTATTTTAATCGCATCTTAACTGATGCGTTATTTTTAATCCCCTACAACCAACAAAACCACAGATCCTATTAATTTAGGATTGTGGTTATTTTTTGCGTTTTTTCGGGGCGAAAAAAGGGCAGATTATTTGAAAAAGGGCAAACGCTTGTGGAAAATCTAAAAGGTTAAAAATGACAAAAACATTGATACAACAGTGTTTTTGGACGCTCGTGTACGTTAGAGAATGACCGCTTTACCATCACATTATGACGATATGTTTATTTTAAACACACAAGCTCATGCGCGTCTTGATCAAATGGCACAACAGTTTGAAGTTGTTTGTAATGGCTTGAACGAAAATGAAGGACAAGCAATTCAAACGATGGATCAATCCGCCTCTCTAATACGGTCAAACTTAATTCAAGTTAAAGAACAATTAGAAAAACTAGCTGTATACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LT992462|8250:19689|10666_10957_+|WP_000179864.1|DBSCAN-SWA MATEEVKIKALLENDKQYFPATHWKAINGVPYAGSSDIDGLPQDGIISVDDKNKLDNLKIGEAGIIQNSIVQKSPNGKLWKITVDDSGKLGTVLFY >NZ_LT992462|8250:19689|19473_19689_+|WP_000126130.1|DBSCAN-SWA MTALPSHYDDMFILNTQAHARLDQMAQQFEVVCNGLNENEGQAIQTMDQSASLIRSNLIQVKEQLEKLAVY >NZ_LT992462|8250:19689|12882_14349_+|WP_021285990.1|plate|DBSCAN-SWA MSNLEKSVAINLENTAHYENISNLDITFRTGESDSSVLLFNITKNNQPLLLSEENIKARIAIRGKGVMVVAPLEILDPFKGILKFQLPNDVIKRDGSYQAQVSVAELGNSDVVVVERTITFNVEKSLFSKIPSETKLHYIVEFQELEKTIMDRAKAMDEAIKNGEDYASLIEKAKEKGLSDIQIAKSSSIDELKQLANSRISDLENKAQAYSRTFDEQKRYMDEKHEAFKQSVNSGGLVTSGSTSNWQKAKITKDDGKIMQITGFDFNNPEQRIGDSTQFIYVSQAINYPRDVSTNGTVEYLVVTSDYKRMTYRPNGTNKVFVKRKEAGSWSEWSELAINDYNTPFETVQSAQSKANMAESNAKLYADDKFNKRYSVIFDGTANGVGSTLYLNESLDQFILLIFYGTFPGGDFTEFGSPFGGGKISLNPSNLPDGDGNGGGVYEFGLTKSSRTSLTISNDVYFDLGSQRGSGANANRGTINKIIGVRK >NZ_LT992462|8250:19689|18841_19258_+|WP_016187462.1|DBSCAN-SWA MRRNLLVHTRSPHDYIGKIVKIRLPYYDVKSAKVAFKSRPGLIIGCEKNQFPCDFTYLPISKISDESKRHSIYDFEVNDETCNLLNLNNVPSFVRCHKVSTVYSKNVHRNYISDLNETNNRLFNEIKSIFDAFATGLF >NZ_LT992462|8250:19689|10972_12883_+|WP_000429556.1|DBSCAN-SWA MENLYLIKDLGALAGRDYRAKEIQNLQRIEQFALGLTTEFKLHQKAKTIQHFAEQIYYNGRSQASVNKSLQSQINSLVLAPRNNSANEIVQARVNVNGETFDTLKEHLDDWETKTQINKEETIRELNKAKQQILDIEYRFEPDKQEFLFVTELAPLTNAVMQSFWFDNRTGIVYMTQARNNGYMLSRLRPNGQFIDSSLIVGGGHGTHNGYRYIDDELWIYSFILNGNNENTLVRFKYTPNVEISYGKYGMQDVFTGHPEKPYITPVINEKENKILYRIERPRSQWELENSMNYIEIRSLDDVDKNIDKVLHKISIPMRLTNETQPMQGVTFDEKYLYWYTGDSNPNNRNYLTAFDLETGEEAYQVNADYGGTLDSFPGEFAEAEGLQIYYDKDSGKKALMLGVTVGGDGNRTHRIFMIGQRGILEILHSRGVPFIMSDTGGRVKPLPMRPDKLKNLGMLTEPGLYYLYTDHTVQIDDFPLPREWRDAGWFLEVKPPQTGGDVIQILTRNSYARNMMTFERVLSGRTGDISDWNYVPKNSGKWERVPSFITKMSDINIVGMSFYLTTDDTKRFTDFPTERKGVAGWNLYVEASNTGGFVHRLVRNSVTASAEILLKNYDSKTSSGPWTLHEGRIIS >NZ_LT992462|8250:19689|15375_15813_+|WP_000354117.1|holin|DBSCAN-SWA MDINWKLRFKNKAVLTGLIGALLLFIKQITDLFGFDLSNQLNQASAIIGAILTLLTGIGVITDPTSKGVADSSIAQTYQAPRDSSKEEQQVTWKTSQDASLTPELSTKAPKEYDTSQPFTDASNDVGFDVNEYHYGGGDNASKID >NZ_LT992462|8250:19689|14348_14738_+|WP_001166606.1|DBSCAN-SWA MQILVNKRNEIISYAVIGGFEEGIDIESLPENFSQVFRPKVFKYSDGKIIFNEDYTEEKDDSHQQIDNEENSTGASDDILRKMVASMQKQVVQSTKLLMQVNKQNALMAKQIVAFNKKLEEIKGETENA >NZ_LT992462|8250:19689|18342_18870_+|WP_000455173.1|DBSCAN-SWA MEWQPNNTYVIAQNLITKYQEITGNSIVGDEMKVHKLMYYIQKTSIALTGNAIIDEQFEGWVHGPVLPSLRGLFDYFVEDNTSRNKVNDTEEFIIENAIYQYGKYATWALREKSHEEISWLNSRKGLSANERGYRNLTIEDIKEDANKIRLYDYSYDMYIDEFEDLDEEEFISAH >NZ_LT992462|8250:19689|9083_10667_+|WP_000384460.1|tail|DBSCAN-SWA MDYHDHLSVMDFNELICENLLDVDYGSFKEYYELNEARYITFTVYRTTHNSFVFDLLICENFIIYHGEKYTIKQTAPKVEGDKVFIEVTAYHIMYEFQNHSVESNKLDDDSSETGKTPEYSLDEYLRYGFANQKTSVKMTYKIIGDFKRKIPIDELGNKNGLEYCKEAVDLFGCIIYPNDTEICFYSPETFYQRSEKVIRYQYNTDTVSATVSTLELRTAIKVFGKKYTAEEKKNYNPIKTTDINYSNDFIKEGTYRTETIGSKATINFDCKYGNETVRFTIKKGSQGGIYKLILDGKQIKQISCFAKSVQSETIDLIKNIDKGKHVLEMIFLGEDPKNRIDISSNKKAKPCMYVGTEKSTVLNLIADNSGRNQYKAIVDYVADSAKQFGIRYANTQTNEDIETQDKLLEFAKKQINDTPKTELDVNYIGYEKIEPRDSVFFVHELMGYNTELKVVKLDRSHPFVNAIDEVSFSNEIKDMVQIQQALNRRVIAQDNRYNYQANRINHLYTSTLNSPFETMDIGSVLI >NZ_LT992462|8250:19689|8250_9075_+|WP_001190533.1|tail|DBSCAN-SWA MQSFVKIIDGYKEEVITDFNQLIFLDARAESPNTNDNSVTINGVDGILPGAISFAPFSLVLRFGYDGIDVIDLNLFEHWFRSVFNRRHPYYVITSQMPGVKYAVNTANVTSNLKDGSSTEIEVSLNVYKGYSESVNWTDSEFLFDSNWMFENGIPLDFTPKYTHTSNQFTIWNGSTDTINPRFKHDLKILINLNASGGFELVNYTTGDIFKYNKSIDKNTDFVLDGVYAYRDINRVGIDTNRGIITLAPGKNEFKIKGDVSDIKTTFKFPFIYR >NZ_LT992462|8250:19689|14940_15240_+|WP_000466774.1|DBSCAN-SWA MFGFTKRHEQDWRLTRLEENDKTMFEKFDRIEDSLRAQEKIYDKLDRNFEELKRDKEEDEKNKEKNAKNIRDIKMWILGLIGTILSTFVIAILKTVFGI >NZ_LT992462|8250:19689|15793_17239_+|WP_001148129.1|DBSCAN-SWA MQAKLTKKEFIEWLKTSEGKQFNIDLWYGFQCFDYANAGWQVLFGYNLKGVGAKDIPSANNFNGLATVYQNTPDFLAQPGDMVVFGSNYGAGYGHVAWVIEATLDYIIVYEQNWLGGGWTDGIEQPGWGWEKVTRRQHAYDFPMWFIRPNFKSEISPRSVQSPTQAPKKETAKPQPKAVELKIIKDVVKGYDLPKRGGNPKGIVIHNDAGSKGATAEAYRNGLVNAPLSRLEAGIAHSYVSGNTVWQALDESQVGWHTANQVGNKYYYGIEVCQSMGADNATFLKNEQATFQECARLLKKWGLPANRNTIRLHNEFISTSCPHRSSVLHTGFDPITRGLLPEDKRLQLKDYFIKQIRAYMDGKIPVATVSNESSASSNTVKPVASAWKRNKYGTYYMEESARFTNGNQPITVRKVGPFLSCPVGYQFQPGGYCDYTEVMLQNGHVWVGYNWEGQRYYLPIRTWNGSAPPNQILGDLWGEIS >NZ_LT992462|8250:19689|14730_14895_+|WP_000916022.1|DBSCAN-SWA MLKLISPTFEDIKTWYQLKEYTKEDIAWYVDMEVIDKEEYAIITGEKYPENLVS >NZ_LT992462|8250:19689|18141_18321_+|WP_000201920.1|DBSCAN-SWA MATKSFTTDYKFNNKAAEKLVNAMNKSEDAQFNRSNVFAQRLKTMEDLQNFKNKVKVIL |
14 | Staphylococcus_phage(71.43%) | plate,holin,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
232528 : 237716
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT992462|232528:237716|DBSCAN-SWA ATTGAGACATGACATTTATGAAGGAGTGCTATTTTACATTACGAAAGGTATTAAACCAAATTATGCTGAGCTTGGTCGACAATATAATTGTGATCCAATAACAGTTAAAAAATATTATGAAGCAGGAAAAGAAAATGAATTAGAACGATTGAAGAAAAGACAACAAAATAAGTAAACATCAAAACTAGATTCATTTAAAGAAATTAATAATAAAAAAATTGAATTAGGATATACAGCTATGGCCATTTTTAAATATATAGAGGAAAAGGGATATGAAGGTAAATATACTATTCTACGAGAATACTGTAAAAATAAAATACAAAATGAGACTAAAAAAATAACATTTTTTGAAGATAATATAAATATTTGTTTCTTAGATAACCGTGTTGTTGGTAAAACACACCTAACAATCTCATTAGGAATTGAGGCATGTAAACAAAATATAAAGACTAGATTCTATACTTTCAAAGAATTAATAGACTTATTAACTGTCACAGATTCCAAAGAAATCATTAATAAAACATTAAAACAATTAAGCAGAATAGAGTTACTTATCATTGATGAAATTTGTTATTCTGCCATCACCAAAGAACAAGCTGATTTATTCTACCAGTTAATGTCACTAAAATATGAAATGAAATCAACAATAATTACGACTAATATTACATTTTCGAGTTGGGGAGAGTCATTTAGTAATAAGATTGTATCAGCAGCTATAATTGATCGGTTAGTTCACCATTCAAAAGTATTTAAAATTACTGGAGAATCATATCGATTAAAAGATTATAAAACCGAAAAATCATTAAATATACGACAATCTTAAGCTGCTAAAAAACTACATTTTCAAACCGCCATAAAACAGCATTTTTAAACCGCTATTGACATTAAGATTATATAAAAGGCAAATATTAAAGCTAAAATTCCGATTAGATAATTAATAAAGATTATTATTCTAATTTTAGTTAAGTTTGTCATTTTCATCACCTCGTAATATAATACGAGGGAGGGGATATCCCCCTCTATAAAAAACATTTTTATTATTGTGGCAAGTGTTGCAAAGCCTAAAGTGTAGTTGCGGAAGATTTCGCTTTTGGCTTTTGCGATATTTGTCATTTTTTCTTCTCTTTCCAACCTGTTTTGTATCCAACACTTTTTTTAAAACTTTTTTCGTTTTTTTACATAAAAAATAACCGCATCAATAAAGGTACGGTTATTACTTATTTATATTCAGAACAATATGTTTGACCTTTTTACTTAGCTATTCAAAAGTTCTTTCTCAGTTTTCTTAAGTCTTTCTTTTTTATCTAAACCAATATGTAATACATATTTATATGTTTTTTCAATAAAATTATTAACTTCTTTTAATGAGTCAAACATTTTATATTCAATATTCTCAAAGTAAAAATTATTAACAAACTTTTTCTTATAATTTTTTATTGATTGATTAGTTTGTTCGAATTCACATTTAAGTCCATCCAAAAACATATTAATAAGTACTAAATTGTCTATTTCATCATCAAATGATGAAATTTTTCTTCTTTGGGTTATAAATTTAATTTCATTCTTATGATAACTTTCTCCTATAATTTCAAATGCCACACCTACAGCTAAATTACTATGGAGATAAATATCTGGATAATAACTTAAAATCGAATAATTCACTTTGAACATAACAACTCACTCCTTGTATAGTGGTGAAGCAAGTATTATTATTACATTGTAGGAGTGAAATTCCCTCCTGACTGATTAACGCTCGAATGTCCATTCAATCTTTATAAAGTAGAGATTTATTAAGATTAAAAATTTAGTACATTTGAGCTTTTTTATTTCCTTCACTCGCACCTACTTAACCTTATATGTTCATTATACAAATATAAATAGCTATAACAATTTAATGGAAATGCCCCCTTCGAAGTAGACATTGAAAAATGAAAACTTTGAAGGGAGCATTTCAAGACGATCCATTCCAATCTTTTTTATCATTTAAAACTTAACACTTATTTTCCCTTATTCGATGCTAATTTCGTGCAATAAATTCTAAATGAAACGACATACTCCTTTTTCACAAATTGGAATCTACTATTTTTGTATTTTAATTATTATAATATCTATTCACCATATGATTTTTATTAATAGTTTAATCAAATAAACATAGCTTGATTAATTTATACAGTAGTTATATTACAAAACTTTATTGGCATATTCATATAATTTTTCTGTTGTATTCAGGGTTAGATTATCTACTTCGCGTTTGCCCTGTCTTAATTGTGAAAGTACATATTGAGAAACTCCAGTTTTTTTAGAAATTTCATATCCTGTTAAATTACTTTCAATTAATTCAATTATCTTTTTCTTGTATTCTGACATTTTTTTCATCTCCATATCTGTACAATGTTTACTACTTTTTTTCGAAATTCTGTGAACTCAACGTATTTTTTATTTATAAATGATTTTATTATTTTTCTATTCATTAATAGCTATCATCACTTCATAATAGTTAAATTTCATATTTTCAATTTTTGTTTCTACATATTAACAACTTTTCATCATCAATTACTTTGTCAAAGACAAACGATTTGTCTTGTATACCTTACGCCTTTTACTAAACTTCAATGTTTAACCTTTTATGTATTTTTATTAGATTAGTGTCTTTCAATATTCAAACTACTAACTCCAGTAGTCTATTAAATTTGAGATATAGAGATATCTTTAGACTTTAATTTTTCCGGAGTCATATAGACTTCTCAAATACTATACATTTATTTCATAATTTTGAACCCTAATATTACTAAAATAATTATAAACGTCCCTATTAAAAATTCTATTTTCTCTTTTTTATTTGTTTTTCGCACTTTAATAGTCATCTTCATTTTACTAATGGTGAGAAAGTAATATTTTATTCAAAGAATATGACTTCGTATTAAATCAAACCTCACATTCTTATTAGTTTGCAAATTCAATAGTCCTATCAGAATTAAAATCAAAACATTCAAACTATTTTATCGTTTTTACTTCCTCGACCATTTTCACCTCCTTATAATCTATATAAATTATGTTTACCACACGATTCTTTACACTCGATGAATTAATTTTGTTAAGAAACATTTAGGCATGTAACTTTGTAATAAAAACATTTTCAAATAAATGTACCAAAAACTTTCATGAAATAAAGTATACTTTTCAAATCTATTAATTTTAGAATCATAAAACCAAATGCTATATTACAATATAATTATCACAAATCATCATATATGCCAATTACACAATTTAATATAAAAAATTGTCAATGAAAAATTATGCACATAAACATTATTACAAAATATGTATAGTATAGAATACTGCATTAAAGTTAACTTATTTACTGTGTTCAGCCTTCTATATCATCACTTAAAGATCATTTAAATTTTTATGGAAATGATAATATAAAAATGCATACATTTGATTGTTTAAACATGTACAATTTTAAAAACCTAGAGATAATTTTATTGAGGTGGACAAAGCATGGACAGACAACCATGAAATCATTAGAAATTTAATTTCTTGTCCACCTAATCAAACAAGGTATATTTATTAGCACTCTGAATTATTTTCTGACAACTTTTGATACTCGTATAACTTGATTATTGTTTTAAATTTGGCATCCTTTATTTTAGTATTACCTACCTTTAAATCAGTAACTGTTTGACGTGGTACACCTGAGTTTTTTGAAATACTATATGGTGTATTGTTAGTTAATAACTTTTCTATTTCACTTATAATAGTTTCAATCTCATTCATTTTTAATCACGCTCTCTTTCTATTTATAATTATAATTATCCTAATGCAGTAACTACGTTTAGCAATACATTGTTTCTTTGTAGTTGCCAAACTAGTTAATTCATAAACTAATGCCTAATAGTATTGGCGTTTTTTATTATATATTGATAAAATTCCTTGTCTCAATCTATTCTATATTATATTATATTATTTGATAATTTTTTATTTATATTCACATTAAGCTATCCATATTTAATATACTTTAAAATTAGATGATTTAAAAGGCTCACTCCATGATATTTCAAAAGATATGGCCTTATTTTAATCTTCAATCATTATTTCTAATTGTTTTTGGTAATTATAGAGTTTTTCCGCTGTTTCTAAAGTTAAATTATTCACTTTTCTTTTCCCGCTTCTTAATTCACTTATACCACCATAAGAAACACCAGTGTCTTGATTAATTCTATAATTAGATATTGATTTATCATTTAGTAATTTTTCTATTGTATTATAAATTTCTTTAAACTGGTTCGTAATTTTTGTAAAAATTAAAGAATATTTTATTTTTTTCTTGTTAAATTAATAATAAATAATATTAAAGTTGCAATGTTAAGATAGAGAGTTAATTTTTTCCTTAATTCTCTTGTCATAAATACCACCTCCCTATTTAATGTGGTAAAGGTCTTTTGTTCTTTACCTTTTTAAAAGAACGATTTGATAAAATTAAGCACTTGAATTATTATGCTCGTCACAGCTATTCGAAATTTAATTTTGCTATTCGTTCTTTTTCTTTAACCATTCTTATCATTTTTTCTCCTTTCCTCTTTATAGTTATTTAACATTCCACAAATTGTTGTAAGTGATATGTTTGAATTCCCATATCCAATGACAAGATTTATAATTTCCAATTCTAAATTATAATAACCTATATTTTTCAAAATCACTTTGTTTTATGATTAACATCCATCTAAGAGCACCTAAAGGTTTTTATGTAATGTAATAAACATTTCCATTTATACATATACATCTTGTAAAAAAGAAAGAACTCCATATATACTCAAAAGGTATACTGAAGTTCTATGTATTATATAAAATTATTATACTATTTTGAAAAACATAAGTAAATCACTAAACATGATTTCTTTCACTTTTAGAAAACTTTTAATACTATAAAAACACCCACTCAGTCACTAGTTTGGGCAGTTATTGTATGCCTATTGAACTCAATGCTTATATTATAATACCTTTTTCGCATATTCATATAAGATCTTTGCATTCTTTAAGCTTAAATTTTCTATTCTTCTTTCTCCACGGCGCATAGCATTAATATTACCGTAACTTATCCCAGTATCTTTATTAATTTGATAACTCGATATCTCTTTGTTTTCTATCAATTTTTTGATTGTATTGTATATTTCATCATAGCAATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LT992462|232528:237716|233781_234198_-|WP_000477489.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPDIYLHSNLAVGVAFEIIGESYHKNEIKFITQRRKISSFDDEIDNLVLINMFLDGLKCEFEQTNQSIKNYKKKFVNNFYFENIEYKMFDSLKEVNNFIEKTYKYVLHIGLDKKERLKKTEKELLNS >NZ_LT992462|232528:237716|236097_236304_-|WP_001002341.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGNTKIKDAKFKTIIKLYEYQKLSENNSEC >NZ_LT992462|232528:237716|235286_235397_-|WP_001788716.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >NZ_LT992462|232528:237716|234708_234894_-|WP_000006110.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >NZ_LT992462|232528:237716|232528_232702_+|WP_001215406.1|DBSCAN-SWA MRHDIYEGVLFYITKGIKPNYAELGRQYNCDPITVKKYYEAGKENELERLKKRQQNK >NZ_LT992462|232528:237716|232765_233350_+|WP_000974166.1|DBSCAN-SWA MAIFKYIEEKGYEGKYTILREYCKNKIQNETKKITFFEDNINICFLDNRVVGKTHLTISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVTDSKEIINKTLKQLSRIELLIIDEICYSAITKEQADLFYQLMSLKYEMKSTIITTNITFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >NZ_LT992462|232528:237716|236604_236832_-|WP_074347689.1|DBSCAN-SWA MFTKITNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTGVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >NZ_LT992462|232528:237716|237518_237716_-|WP_001807853.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIYNTIKKLIENKEISSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL |
8 | Staphylococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
493974 : 502447
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT992462|493974:502447|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTGTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAATCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAAAATAATCCACTCTACCTTATCTTCATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATATGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATACATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATGTTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTCTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGCGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGCAAGTACAGGTTTAACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCTATAAATGGACGATTATCAAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCAGCTACATCATATTCGCCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACACATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTATTTGTAGCGATGTAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCACCCGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCAACTGCATCGATTCCTATCGAATCATGTTTACCATAATCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCTCCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGTGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATAAGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAACGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCATAAAAACTTGGGAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATACGTCGAATTGTCGTACCTCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATAATATTTTTACCGTCTACAATATCTTTCACTGCAGATAGCTTAACTCTTACACCTTGTTCACGTAACTCTTGCGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCGATTTCTTCAGCATAACCGCTCGCTGCAGATAATGATGAATTAGGTACACCGATGACCATATCAGCTTTTACCGGACTTTCTTGTGCTAACATTTTACCTGAAGCCTTACGCACTGCATGAACATTTTTACCAGCAATCGTTGAATCTGGTCTCGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCATTAATCACGACATATTCACCCGCATGAATATCTTGAACGAATTCTGCACCTAACACATCAATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCCTTTGTTAAAATTGCAAATGTAAAACCACCTTTAATTTTTCGAAGACTTTCTTTTAATGCTTCTTCAAAAGTTGGCGCCTTACTGCGTCGAATCAAATGCATAATAACTTCTGTATCTGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTTTGACGTAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGGTCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACTTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGACCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGTGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTAAAGACTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACCGTTTGAACATGTGATAATACCCCTTGACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTTAACTTCTGAACTCAAATCTATAGATTCAAATTCGTGATTTACTTTGCCATAAATCAATTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCAATTACATATAACTTATCTCCAACTTGAGGTTGAAAATCATTTAAATAGTCTACGTTTTCAATCAGACCTACCATACCAACAATTGGTGTAGGGAAAATAGAAGTGCCTTTCGTTTCGTTGTATAAAGAAACGTTTCCAGAAACAACAGGTGTCTTAAGTATGTCGCAAGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTGCTAATTGTTGATAAATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAGCAGTCAGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTACGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGATCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATTTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCTTCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTTACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCGTAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAAACCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGAAGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTACCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCTCCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCACCTTGATATGGCTCAATTGCAGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCGATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCTGGACCCATAAGCACATGCTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATAGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCGCCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGTTCATAAAGATTTGTAAAAGCCGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGCTGCAAGACGTTTAACTTCAGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATATCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCTTCTAAAACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATCGCATCCATTAATTGTTTTAATACTTGATTAATTTCTAGCGCTTTCGTTTTTAATGTTTCAATATCTTTATCAGTCGCAATATTCAGTAATTTGACGTGATCATCTGTAATCAAAGGATCATTTAAAGCATCATTTTTATAGAAAAATTCCACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCGCTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGCTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAGTAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCTCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAGTCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCAGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCAATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCAACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTTACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAATAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGTGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAATGGGACAACCTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGGTCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGCAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTCAACATTCTTGTTGCAAGTATACCTGCATTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATAGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACTCCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTCTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LT992462|493974:502447|501964_502447_-|WP_001807816.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILATRMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_LT992462|493974:502447|499209_499881_-|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_LT992462|493974:502447|500853_501978_-|WP_001010409.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_LT992462|493974:502447|499882_500146_-|WP_000848351.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLEDEKENA >NZ_LT992462|493974:502447|495564_497049_-|WP_000483707.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKMLAQESPVKADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_LT992462|493974:502447|493974_494541_-|WP_000238668.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLDSFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_LT992462|493974:502447|500145_500850_-|WP_000174055.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_LT992462|493974:502447|494543_495572_-|WP_000030815.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIETNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_LT992462|493974:502447|497027_499217_-|WP_000032750.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLADSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPIVGMVGLIENVDYLNDFQPQVGDKLYVIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESIDLSSEVKKGESIKTAIRQGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSLIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
522230 : 546698
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LT992462|522230:546698|DBSCAN-SWA TATGAATAGTTCATGTAAATCTAGAGTATTCAATATTATAAGCATCATAATGGTTTCAATGCTTATTTTATCACTAGGCGCATTTGCTAATAACAATAAAGCCAAAGCCGATTCACATTCAAAACAACTTGAAATCAATGTTAAGAGTGACAAAGTACCTCAAAAAGTAAAAGATCTAGCTCAACAACAATTTGCTGGTTATGCTAAAGCGTTAGATAAACAAAGTAATGCAAAAACTGGTAAATATGAACTTGGCGAAGCTTTTAAAATTTATAAATTTAATGGCGAAGAAGATAATAGTTACTATTATCCAGTTATAAAAGACGGTAAAATTGTTTATACTTTAACACTTAGCCCTAAAAATAAAGATGATTTAAACAAATCAAAAGAAGACATGAATTACAGTGTTAAAATTTCAAACTTCATCGCTAAAGATTTAGACCAAATTAAAGATAAAAATTCAAATATCACTGTTCTTACTGATGAAAAAGGATTTTATTTTGAAGAAGATGGCAAAGTTAGATTAGTAAAAGCTACGCCACTAGCTAATAACATAAAAGAAAAAGAAAGTGCTAAAACAGTTTCACCACAATTAAAGCAAGAGCTAAAAACTACAGTAACACCTACAAAAGTTGAAGAAAACGAAGCGATACAAGAAGATCAAGTTCAATATGAAAACACACTAAAAAACTTCAAAATTAGAGAACAACAATTCGATAACTCATGGTGTGCAGGATTCAGTATGGCAGCATTATTAAATGCAACTAAAAATACAGACACTTATAATGCACATGATATTATGCGTACATTATACCCTGAAGTAAGTGAGCAAGACCTTCCTAATTGTGCAACATTCCCTAATCAAATGATTGAATACGGTAAATCACAAGGCAGAGACATTCATTATCAAGAAGGCGTACCATCATATAATCAAGTTGATCAACTTACAAAAGATAATGTGGGTATTATGATTCTTGCTCAAAGTGTATCTCAAAATCCTAATGACCCACATTTAGGTCATGCCCTAGCAGTTGTTGGTAATGCTAAAATTAATGACCAAGAAAAACTTATTTACTGGAATCCTTGGGATACAGAATTATCAATCCAAGATGCAGATTCAAGCCTATTACATTTATCATTCAATCGTGATTATAACTGGTATGGTTCAATGATAGGTTACTAAAAAGTAATATAGATATTGATTAAAGGCAGGTAAAACTATGTATCAACTACAATTTATAAATTTAGTTTACGACACAACCAAACTCACACATCTAGAACAAACCAATATCAATTTATTCATTGGTAATTGGAGTAATCATCAATTACAAAAATCAATTTGTATACGTCATGGCGATGATACAAGTCACAATCAATATCATATTCTTTTTATAGATACGGCACATCAACGCATTAAATTTTCATCTTTTGATAATGAAGAAATCATTTATATTCTTGATTATGATGATACACAGCATATCCTCATGCAAACGTCATCCAAACAAGGTATTGGTACTTCGCGCCCAATCGTTTATGAGCGCTTAGTATAACTAATTTAAATGGTTTCACTTCATAAAGCGGGTTGGCGAGAATTCAATTTCTCACCAGCTCGTTTTTTCATTGTAATAATAATCTTTAACATTTATTCTTTCTCTATTAATTTTCTCAAACTATCTTATCTTTATGATAATTAATTAAAATGCCCTTTTAAATTCTTATAAAATAAAAAAGCCACCTATCGTCGCTAATATACGACGCAAGTGACTTAATATCATATTCAAAATAACTTATGGGAATTTAGGGAATTGATCGAAGTCAGGATCACGTTTTTCTTTAAACGCATCACGGCCTTCTTTCGCTTCATCAGTTGTGTAATAAAGCAATGTTGCATCCCCAGCCATTTGTTGTAAACCAGCTAAACCATCTGTGTCAGCATTCATAGCTGCTTTAAGGAATCGTAAAGCTGTTGGTGAGTGTTTCATAATCTCTTTACACCATTGTACAGTTTCATCTTCAACTTTTTCTAAAGGTACCACTGTATTTACTAGACCCATATCTAAAGCTTCTTGTGCATTGTATTGACGACATAAGTACCAAATTTCACGTGCTTTCTTATGTCCAACGATACGTGCTAAATATCCTGAACCATAACCCGCATCAAATGAACCTACTTTAGGACCAGTTTGTCCAAAAATAGCATTATCAGCAGCAATCGTTAAGTCACAAACAACATTTAGTACATTACCGCCACCTACAGCATAACCTTTTACCATCGCGATAACCGGTTTTGGAATAATACGAATTAAACGCTGTAAATCTAATACATTTAAGCGAGGGATTTGGTCTTCACCTACATAACCACCATGTCCACGTTTCTTCTGGTCACCACCAGAACAGAATGCTAAATCACCTTCACCAGTTAATACGATAACTGAAACGTTTTGATCATCACGTGCACGTGAAAATGCGTCAATCATTTCAGCAACTGTTTTAGGTGTAAACGCATTGCGTACTTCAGGGCGATTTATTGTTACCTTAGCAATCCCTTCGTAAAATTCATATTTGATTTCATCATATTCTCTAAGTGTTTCCCATTGTCTGTTAGTCATTTTGCTCCTCCTTTAAAAATCCTAATATCATTGTATCAAATTCATCACTATCTTCCACATGAATTGTATGACCTGTAGCAGAAATTAATTTACATTTACTATTAGGAATTAAATTTGCCATTTTTTTCGCAATCTGTACAAATTTTTCATCATATTCTCCAGCTAATATTAATGTTGGTACTTTAATTTCTTTCAGGCGCGGCCATAAGTTTGGCATTTGACCTGTACCATAATCTCTTAATGCTTTGGCCATTTTCTGTGGCGATTGAGACAATCGTTGTTGTCTTATTTGATGTTGTATTTCAACTGGTAAACCTTGTTGCGATTGAAATAATGGCAACTTTTCCCAATCATTAACAAATAATTCAATACCTGCTATGTCTAATACTTTAGCACGTGCATCATCAACAAGACGACGTTCTAGTTGATTTGCTTCTTCTTTAATACCTGGTGACGTACTTTCTAATATCAAATTAGATATAGGGATGTGACCATTAATTGCATAATATAATGCAACACGCCCACCCATGGAGTAACCTAGCATTGTTATCGATTGATCTTTATATTTATCTAAAATTCGATCTAACAACGTCGTAATATAATCAAAATTCCACGTTTCATCCATTGAAGACTGATCTTCGCCATGTCCTGGTAAGTCTATAGTGATGACATGACAGATATCGGTATATTTATCGATGTGATTATGATAAGTACGACTGTCGCTAAGAAAACCATGCAGTAATACTAAAACTTGATTGGTCTCAACGTTTGCTTCATAGTAATTATAATGTGTCATGAATCATTTCACTCAATTTCTGATATAAAATTTGATGCTGTTTAAAGTTATCTTCGCGATTCGTTATCAATTCATAAATCGTCGAAGTTTCAGATAACAATGTGGCATTTTTAAATTCTGAAACACTGTTAAAACGTTTAAAATCGAATTGATATAACTTAGCTGTATATTCGAAATCCAATCCCGTCGGTGTGCCAAACAACCGTTCAAAATAGACGGTTGCACTTTCTTTTTGTGGTAAATATGAAAAAATACCGCCACCATCGTTGTTCAATAATACAATATTCATCTGAATATTATTTAATTTTGACATTAATAGTCCATTCATATCATGATAAAATGACAAATCACCTATCAATAATGTAACTCGTTTATGCACAGCCATACCAAGCGCTGTTGATACGATACCATCAATACCATTTGCGCCGCGATTTGCATAGATGTCTATATTTTTGTTTAATAACAAATTATCAATATCTCTGATTGGCATACTATTACTAATAAACAAAGCATCCTCTTCAAACGTCTTCTTAATCAATTCACCAACGAATGCACTCTCATCTGTAGCTTGCTCCAAATAATTTTCAATCTCTTGGCGCCCTTTTTTCTCTAAGCTTTGCCATTTTTCTAGCCAATTGACACGATTAACTGTCGTGTCTCCCATTAATGACCTAAAGAAATCATTCGCAGATATTTCATAAGAAATATCTGGTGCTATTGGAAAGACATCAATCTTATCATTATTTTGCACTAATATTTGAAATGCATCAGTTTTCTTTAACCATTGATTTAACTTTTTAGAAATCACTGGTTTCCCAACACGAATTACGAAATCGACTTTTAAGTCTAAACCGCTTCTAAACAACAAATCATATGTACAGATAACATTCGGATGATCAAATTTTCTTAAATGACTTAAAGGATCAGCTAAAATAGGCAAATCATATATCGTTGAATACGTCAGAATTTGCTCAACTTCTTGGTGCTGCATATCCCCTACAATAATTAAACCTTTTTTCTTATTTAAAATGTGTCTTATTGCCGATGCATCTATACTTTTTTGATAGTGGGGTAAAATCTTCATCTCAGAAGTTAACAATTCTGTTGCATTCAAATCAGGTGTTAACGGATCTCTAAATGGCAAGTTAAAATGAATCGGCCCTTTATGTGGTCCATATAAATATTGACTAGCAATTTGCATTTGATAATAAATTGCATCAATGGTCTCTTTACTATCATCCGCAATAGGCATATCGAACTCATAACTTACATAATTATTAAACATATTTACTTGATTAATCGCTTGTGGTGCGCCTACACTTCTTAATTCATGCGGACGGTCACTTGTTAAAACGATTAATGGAATTCTACTAATTTGGCTTTCAGCAATTGCAGGCGTATAATTCGCTGCTGCTGTACCTGACGTACATAATATAGCGACAGGTCTTTCACTGCCTTTAATTAACCCAACTGCAAAAAACGCTGCACTTCGCTCATCGGGGTGTATCCATGTTTTAATATTTGGATGTGCTTCAAATGCAAGTGCAAGTGGCGTTGAGCGTGATCCCGGACTGATAACTACTTCCCTTACGCCG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27 | Planktothrix_phage(50.0%) | holin,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
601168 : 618691
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LT992462|601168:618691|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LT992462|601168:618691|604724_604946_+|WP_001009056.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYNWFLSNAQSLVLLAIVVIGLYLGFKREFSKLIGFLIIAIIAVGLVFNAAGVKDILLELFNRIIGA >NZ_LT992462|601168:618691|610648_611650_+|WP_000769868.1|DBSCAN-SWA MKLKTLVIGGSGLFLMVFSLLLFVAILFSDEQDSGISNIHYGGVNVSAEVLAHKPMVEKYAKEYGVEEYVNILLAIIQVESGGTAEDVMQSSESLGLPPNSLSTEESIKQGVKYFSELLASSERLSVDLESVIQSYNYGGGFLGYVANRGNKYTFELAQSFSKEYSGGEKVSYPNPIAIPINGGWRYNYGNMFYVQLVTQYLVTTEFDDDTVQAIMDEALKYEGWRYVYGGASPTTSFDCSGLTQWTYGKAGINLPRTAQQQYDVTQHIPLSEAQAGDLVFFHSTYNAGSYITHVGIYLGNNRMFHAGDPIGYADLTSPYWQQHLVGAGRIKQ >NZ_LT992462|601168:618691|617473_618691_+|WP_001291561.1|integrase|DBSCAN-SWA 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MCPVCGNKTRLKIREDTELKKFPLYCPKCRQENLIEIKQFKVTVITEPDAKTQSR >NZ_LT992462|601168:618691|608474_610652_+|WP_000804748.1|DBSCAN-SWA MKPSIVNRIKSNWTLKRLGKVAMTVAFTLVIAIFLLAMLGTVVQAAGLVDDTVNVANEYSRYPLENYQLDFYVDNSWGWLPWNWSDGIGKQVMYGLYAITNFIWTISLYVSNATGYLVQEAYSLDFISATADSIGKNMQTLAGVSANGFSTEGFYVGFLLLLILVLGVYVAYTGLIKRETTKAIHAIMNFVLVFILSASFIAYAPDYIKKINDFSSDISNASLSLGTKIVMPHSDSQGKDSVDLIRDSLFSIQVQQPWLLLQYNSSDIESIGIDRVESLLSTSPDSNNGEDREKIVAEEIEDRSNTNLTITKTINRLGTVFFLFVFNIGISIFVFLLTGIMIFSQVLFIIYAMFLPVSFILSMIPSFDGMSKRAITKLFNTILTRAGITLIITTAFSISTMLYTLSAGYPFFLIAFLQIVTFAGIYFKLGDLMSMFSLQSNDSQSVGSRVMRKPRMLMHAHMHRLQRKLGRSMTTLGAGSAIVTGKKGQSGSGSSARTQADHSRPDGKEKSTLGKRIGQTIGTVADTKDRMVDTASGLKEQVKDLPTNARYAVYQGKSKVKENVRDLTSSISQTKADRASGRKEQQEQRRKTIAKRRSEMEQVKQKKQPASSVHERPTTRQEQYHDEQTSKQSNIQTSYKESQQAKQERPAVKSDFSSPKVERQGNTVQEKTVQKPATSTTTADRTSQRPITKERPSTVQRVPLQNTRSRPPIKTATIKKVGKKP >NZ_LT992462|601168:618691|606024_608472_+|WP_000331160.1|DBSCAN-SWA MAYPIKYIENNLVWNKDGECYAYYELVPYNYSFLSPEQKIQVHDSFRQLIAQNRDGKIHALQISTESSIRSAQERSKNEVTGKLKAVAYDKIDQQTDALISMIGENQVNYRFFIGFKLLLNDQEFSMKSLTVEAKNALSDFVYDVNHKLMGDFVSMSNDEILRFQKMEKLLENKISRRFKIRRLDKDDFGYLIEHLYGQTGTAYEEYEYHLSKKKLDNETLIKYYDLIKPTRCLVEEKQRYLKIQQEDETVYVAYFTINSIVGELDFPSSEIFYYQQQQFTFPIDTSMNVEIVANRKALSTVRNKKKELKDLDNHAWQSDNETSSNVAEALESVNELETNLDQSKESMYKLSYVVRVSANDLDELKRRCNEVKDFYDDLSVKLVRPFGDMLGLHEEFLPASKRYMNDYIQYVTSDFLAGLGFGATQMLGENEGIYVGYSLDTGRNVYLKPALASQGVKGSVTNALASAFVGSLGGGKSFANNLIVYYAVLYGAQAVIVDPKAERGRWKETLPEISHEINIVTLTSDEKNKGLLDPYVIMKNPKDSESLAIDILTFLTGISSRDGERFPILRKAIRAVTNSEVRGLMKVIEELRVENTPLSTSIADHIESFTDYDFAHLLFSNGYVEQSISLEKQLNIIQVADLVLPDKETSFEEYTTMELLSVAMLIVISTFALDFIHTDRSIFKIVDLDEAWSFLQVAQGKTLSMKLVRAGRAMNAGVYFVTQNTDDLLDEKLKNNLGLKFAFRSTDLNEIKKTLAFFGVDPEDENNQKRLRDLENGQCLISDLYGRVGVIQFHPVFEELLHAFDTRPPVRKEV >NZ_LT992462|601168:618691|612823_612940_+|WP_001814923.1|DBSCAN-SWA MILKYPENICMLCMPMVMHKNPSDKSIYHWDFYALLGF >NZ_LT992462|601168:618691|601168_601483_+|WP_000420682.1|DBSCAN-SWA 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MKQRGKRIRPSGKDLVFHFTIASLLPVFLLVVGLFHVKTIQQINWQDFNLSQADKIDIPYLIISFSVAILICLLVAFVFKRVRYDTVKQLYHRQKLAKMILENKWYESEQVKTEGFFKDSAGRTKEKITYFPKMYYRLKNGLIQIRVEITLGKYQDQLLHLEKKLESGLYCELTDKELKDSYVEYTLLYDTIASRISIDEVEAKDGKLRLMKNVWWEYDKLPHMLIAGGTGGGKTYFILTLIEALLHTDSKLYILDPKNADLADLGSVMANVYYRKEDLLSCIETFYEEMMKRSEEMKQMKNYKTGKNYAYLGLPAHFLIFDEYVAFMEMLGTKENTAVMNKLKQIVMLGRQAGFFLILACQRPDAKYLGDGIRDQFNFRVALGRMSEMGYGMMFGSDVQKDFFLKRIKGRGYVDVGTSVISEFYTPLVPKGYDFLEEIKKLSNSRQSTQATCEAEVAGVD >NZ_LT992462|601168:618691|616078_616501_+|WP_000804885.1|DBSCAN-SWA MKPSSFQTTIENQFDYICKRAMEDERKNYMLYLSRIAKREVSFSDVGDYLVSQFATTDNYSTDFQIFTLNGLSVGVENDLLSEALRELPDKKREILLLFYFMDMSDSEIADLLKLNRSTVYRHRTSGLALIKKFMEEFEE >NZ_LT992462|601168:618691|603476_604682_+|WP_000398284.1|DBSCAN-SWA MEGFLLNEQTWLQHLKEKRLAYGLSQNRLAVATGITRQYLSDIETGKVKPSEDLQQSLWEALERFNPDAPLEMLFDYVRIRFPTTDVQQVVENILQLKLSYFLHEDYGFYSYSEHYALGDIFVLCSHELDKGVLVELKGRGCRQFESYLLAQQRSWYEFFMDVLVAGGVMKRLDLAINDKTGILNIPVLTEKCQQEECISVFRSFKSYRSGELVRKEEKECMGNTLYIGSLQSEVYFCIYEKDYEQYKKNDIPIEDAEVKNRFEIRLKNERAYYAVRDLLVYDNPEHTAFKIINRYIRFVDKDDSKPRSDWKLNEEWAWFIGNNRERLKLTTKPEPYSFQRTLNWLSHQVAPTLKVAIKLDEINQTQVVKDILDHAKLTDRHKQILKQQSVKEQDVITTKK >NZ_LT992462|601168:618691|615220_615574_-|WP_001227347.1|DBSCAN-SWA MRKKEDKYDFRAFGLAIKEARLKRGLTREQVGALIEIDPRYLTNIENKGQHPSIQVLYDLVSLLHVSVDEFFLPANNLVKSTRRLQIEKYMDSFTDKELSLMESLASGINEARNIED |
20 | Streptococcus_phage(100.0%) | integrase | attL 616466:616481|attR 624798:624813 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
705913 : 802177
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LT992462|705913:802177|DBSCAN-SWA AATGAAAAAAGTAATGGGGATATTATTAGCAAGTACACTTATCTTAGGTGCTTGTGGACATCATCAAGATAGTGCAAAAAAAGAGAGCACTAGTCACAAAAAGAAAGAAAATGACAATGAAGAATTAAATGAAGAACTTAAAGAATTTAAAAGCAAAAAAAATATGGATATAAAAATTAAAGGCGATACTATTGTTAGTGACAAATTTGAAGCTAAAATAAAAGAACCGTTTATCATCAATGAAAAAGATGAGAAAAAGAAATATATCGCTTTTAAAATGGAAATTACTGCTAAAAAAGACGATAAAGATTTAAATCCATCTTCTATTTCTCATGACTATATTAATATCACTCAAGATGATAAAAATACAGTAAATAAATTAAGAGATGGTTATCTTTTAAGTGATAAAAAATATAAAGATTGGACAGAACATAACCAAGATCAAATTAAAAAAGGCAAAACTGCACAAGCCATGTTTATCTATGAGTTAAGAGGTGATGGAAATATTAATTTAAATGTCCATAAATACTCAGAAGATAAAACAGTTGATTCTAAATCATTCAAATTTAGTAAACTTAAAACCGAAGATTTTTCTCATAGAGCGGAAACAAGAGAAGAAGTAGAAAAGAAAGAAAAAGAATTTGAAGAAGAGTACAAAAAAGAACAAGAACGAGAGAAAGAAAAAGAAAAGCAAAAAGATGACGACCACAGTAGTTTAGATGAAGTATAAATTTATGAATGCTCGCATTTAGCGTTATAATCTTTGTAATTATTATTGTCATTGTAAATTAGCTTACTTACACTCATAATGACACACTAATTTAATTGTTAAATATAACAAAAAAGAGTAGCTCGCCTACTCTTTTTTGTTGTTTTGAAATGGTCATTTTTGAAATGACTCGATCATAATTTCACGAATACCATGCAACATTTTTCGTGAACTCATTTTTCAAACAATACTTAATTTGTTACTATTTCACTTCTTTTTATTATTAGATGAAAACAAAAATGCTCCAAAAAAGAGTAAGGGAAAAATAACAAACAAACGAGCATCAAATGTATTTTTCCCAAGAATTACAGGTAAAGATATATAAATAATAAAAGTTATTATTAAAAACAACAAATAAACTTTTTTATTGGTACTCATCACAAACACACACCTATAATACAATAGCAATGAAAGCTCTTGCTACAATATATGCAAATTGTTTATTGAAACCAAAATTATTAGTCAATCCTGTAGCTATACCCTCAGCTAAATTACCCTCAAAACCTGTTAAAATATCGCAAAACTTATTAATACTTTGATAATGGAACATAACTAGCTTTGTGCCAGTAGTATTTTCTATTTTAGCAACTAATTTATCCCAAGCTTTCTCTCCAATCTTATTTACAGTAGCTCGGATAGCTTTAGCTCCAGCTTTTGCCGTTATAGTAGCTTTACCTCTCTCTGCAACACCATTTTTATAATCTCTAACTTGCCCTTTTAATTTTTCAGTTACACTTGGGTCTTTAAAATCTTCTTTACTATTATCTATCTCTTCTAACAAAGCATTTCCAATTTTTTCTCTTTGCTTCATTTCCTTATCAACCGCTTTAGCAGTTTCAGCATTAGCTTTACCTGATTCTACCGTAGAATAAACAGGCCCCACCAAAACAAAAGACGCAATAGTAGCAACGGAAATTTTTCTTAAGTATTTGTACATTGTAAAAACTCCTTATTAGAACTTATACAATCCCTTAATAAACACCCTTTTTCAGCATATCATATAATAATTATCTTTCAATCACTTTTGGACATCAAGATTCATTTCCATATTCTGGCAGTCTATATTAGCCACTTCACATCATATTTAACACATATAACAGTTTCGCAATTACGATTATCCCGAAAATTTCAATATAGAATTTGTCCAATTAAGTGTAGACGATTCACAGTTAAATACTTAAAAGGCACTACCAACTAAATTTGGTGGTGTCTTTTTGTATCATGTGCATTTTCTGTGCGCTTTTTGTGCACTCTAAAATAAAAAGCCCACAACCACAAAGGCTGTAGGCTACAAATATGGAGACGGCGGGATAAATCTTATCTTGGTATATAGCTGAAAAACCTATAACTATGCGGTTTATGAGCGATTAACTTTAGAAAGAAAACTAAAGAAATAGAACTAAATTGACACGTATTTGACACGCGCAAACCTAAAAAATAACCACGTCTTAATTGACGTGGTTATCTATTTATTTAGCTTGCTAATTTTCTTTTGATATATTTTGGGTATGCTTTTTGCGGGTACAAATCGCCTTTTTTATGGTCAAGTACTACGTATCTATCATTTACCCAATATATTGCATGTCTTCCATCTGTGATTTTTATAAAGTTTTTACCTGATTCAAATACTTCTTTTACATTCAAATTTTTAAATTCTTCTTTTGTAACAAACATTTCGTTAGCTCCTTTTATTTATCTTCTTCGTTTTCAAGTGATCTTTGATAGTTATAAAGTTTTTCTGCAGAATCAAAACTTAATTTTTCAACCGTTCTTTCGCCTCTTCTGATTCTTCTTATAGTTGCTGGGTCTACGCCGGTTTTTTTGCCGATTTCATACGCTGATAAATTTGAGTTTATTAATTTTTTTACTGTTTCTATTAACATAATTTTTCATGGACAGGCTAAAGTTTTATTTTAAGATTATATAGAAAGCAAATATTAAAGCTAAAATTCCGATTAGATAATTTAAAAAGATTTTTATTCTCGTTTTAGTTAAGTTTGTCATTTTCATCACCTCGTAATATAATATGAGGGAGGGGATAACCCCCCTCTAGTAAAACATTTTTATTATTGAGACAAGTGTTGCAAAGCCTAAAGTGTAGTTTCGGAAAATTTCGCTTTTGGCTTTTGCGATATTTGTCTTTTTTTCTTCTCTTTCTAGCCTGTCCATGTTGTCACCTCCCTTACTACACTACTTATTATACAGGACAGTTGCCCTTTAGTCAACACTTTTTATAAACTTTTTTCGTATTTTTTGCATAAAAAAATAACCGCATCAATAAAGATACGGTTAACTAGTAAAGACCACGTACTTACAAATACGTTTAGAATCTCTTCGGCAACTTTACTATAGACAGTCTGTGCTGTAGGCGAGCCCCCACAATTATGTAGGAACTCACAATTAATCTGTAATTACATTATAACATAAAAAAATAGGCAAGTACCGAAGTACCTGCCATATGATGTGGTGGATATTAATTATAACATATTAACTGATTGTTCCCCATAAATTACCTAGTCCATAATTTGGTGGCGCGGAACCATTCCACGTTCTAATAGGCAAGTAGTAGCGTGCGCCTTGCCAATCGTAACCAATCCACACATGCCCGTCTTGTAACATTACCTCATCATAATTACAGTATCCACCTGGTTGGAATTGATAAGCTTCTGGACATGATATAAATGGTCCTACTGTTCTTACAGTTATAGGTTCACTACCATTTGTGAACGTTGCTTTCTCTTCCATGTAGTAAGTGCCGTAGCTGTTACGCTTCCACGCACTGCCTACTGGCTTAACTGTATTACTTGAAGCGCTTGAATCGCTTGAGACAGTTGAAACTGGTATTTTTCCGTCCATATACGTTCTAATTTGCTTGATAAAATAGTCTTTTAACTGTAATTGTTTATCTTCCGGCAATAGACCGCGAGTTACTGGGTCAAAACCAGTGTGCAATACTGAGCTTCTGTGTGGACATGATGTTGAAGTGAATTCGTTGTGCAATCTGATTGTGTTCCTGTTTGCTGGTAAGCCCCATTTTTTCAACAATCTAGCGCATTCTTGGAAAGTTGCCTGTTCATTTTTTAAGAACGTAGCATTATCTGCGCCCATTGATTGACACACTTCAATACCGTAATAATATTTATTCCCAACTTGATTAGCGGTATGCCAACCTACTTGTGATTCATCTAAGGCTTGCCACACTGTGTTACCTGATACATAACTATGCGCAATACCTGCTTCTAATCTCGATAAAGGTGCGTTAACTAATCCGTTGCGATAAGCTTCTGCTGTCGCTCCTTTGCTTCCTGCGTCATTATGAATGACAATACCTTTAGGATTACCGCCACGTTTAGGTAGGTCGTAACCTTTAACTACATCTTTGATGATTTTAAGTTCTACCGCTTTAGGTTGTGGCTTAGCTGTTTCCTTTTTAGGTGCTTGTGTAGGAGATTGAACTGATCGTGGAGCTGTTTCGCTTTTGAAGTTAGGACGGATAAACCACATAGGGAAGTCGTAAGCGTGTTGTCGTCTTGTAACTTTTTCCCAACCCCAACCGGGTTGTTCAATTCCGTCAGTCCAGCCACCGCCTAGCCAATTCTGCTCATATACAATGATATAATCTAAAGTTGCTTCGATAACCCATGCAACGTGACCATATCCAGCACCGTAGTTACTACCGAATACAACCATGTCGCCAGGTTGTGCTAAGAAGTCCGGTGTATTTTGGTATACAGTAGCTAGTCCGTCAAAATTGTTGGCGAATGGAATATCTTTTGCACCTACACCTTTTAAAAGACAACCATATAAAGCCTGCCAACCTGCATTACCGTAATCAAAACATTGAAATCCATACCAACCATCTTTGTTATATTGTTTTCCCTCAGAAGTTTTCAACCACTCTATAAACTCTTTTTTAGTCAATTTTGCTTGCATTGTTGCCACCTCCATGATGATACTCGTTCACGTCAAAACCGATTTCATTAGAGGCGTCTGTAAATGGTTGTGATGTGTCGTACTCTTTCGGTGCTTTTGTACTTAATTCCGGCGTTAAGCTAGTATCTTGTGAAGTTTTCCAAGTGACTTGTTGTTCTTCTTTGCTACTATCTCTAGGCGTTTGATATGTCTGTGCTATAGATGAATCAGCAACACCTTTTGACGTTGGGTCAGTAATAACACCAATCCCTGTAAGTAGCGTGAGGATAGCGCCTATAATCGCGCTAGCTTGATTTAA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141 | Staphylococcus_phage(88.89%) | portal,plate,integrase,protease,terminase,holin,capsid,tail,head | attL 769945:769963|attR 800844:800862 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
854916 : 869232
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LT992462|854916:869232|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LT992462|854916:869232|857958_858930_-|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_LT992462|854916:869232|856617_857589_-|WP_000876311.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_LT992462|854916:869232|859049_861155_-|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_LT992462|854916:869232|863203_863704_+|WP_000930016.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEQMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_LT992462|854916:869232|861117_861516_-|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_LT992462|854916:869232|868173_869232_-|WP_000663034.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFIPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_LT992462|854916:869232|862317_863184_+|WP_001068490.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGKLSSQPLLLTRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQTQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKVIKK >NZ_LT992462|854916:869232|867472_868015_-|WP_000197271.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_LT992462|854916:869232|855674_856631_-|WP_001245567.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTFLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVIILVITIFLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWIVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_LT992462|854916:869232|865620_865728_-|WP_014936998.1|DBSCAN-SWA MVINEIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILISCI >NZ_LT992462|854916:869232|865818_866736_+|WP_000429003.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKAKDYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTYDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISITTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_LT992462|854916:869232|854916_855678_-|WP_000616865.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILDDISIEIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRKRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVAMKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_LT992462|854916:869232|864043_865549_+|WP_000193750.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVILAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
881202 : 888957
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LT992462|881202:888957|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTCACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTACGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTTAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTAGTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATGAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAACTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGATGCTACTTGGATTTCATCTGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATGCTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTACTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGAACACATAACATGATTAAAGTACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAAACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTGGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATGTAATATGCTCAACTGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTTGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTAGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGTGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAGGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGTCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGTGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTTATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCAGCTGCACATCACATTCCGTGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTTTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTCGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTAAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAACCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACGCCTGATTTAAAAAAATTAGATGAAGTGATTGCACAATGCGTACCTTCCTCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTAGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGTAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTACAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACTATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTATTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAATCTGCTGAAAATAATAATAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTTTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTAAAAAACACTTCTGATATTCTTAATTCGCTATATCAGAAGTGTTTTTTAGTGATAAGTAGTTCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGTTGGTGCTGTTGCCTCTGTATTAATTTTAGGCGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAACACCTAACTGGTACATTCAGTTCTAAAAACGGTGAAACTGTTGAAGGTAAAGCTGAGATTAAAAATGGTAAATTAATGCTTACTAACTACAAATCATCAAAAGGTCCAGATTTATACGTCTATCTAACAAAAAATGGCGACATTAAAAACGGTAAAGAAATCGCAATGGTTGACTACGATAAAGAAAAACAAACATTTGATCTTAAAAATGTAGATTTAAGCAAATATGATGAAGTAACAATCTATTGTAAAAAAGCTCACGTCATCTTCGGCGGCGCTAAATTAAAATAATCAATTTCTGAGTTAAACTTTTATTTACAACATACTATTACTATACATTACAAATTTTAAAAATATACATTACACTCATTACTCAATGGAAGCGTATGATTTCACAGCCCCCCTAGCTTGTAGAAATCATACTTTCCTTTTTTCAATATATATACAACTATTAAATTCCATAAGATTGTAGAGCACATAAGTAAATTTTTTTAGAGCTTGAGGTTTGTTTAGCTTAAGCAGCCCATGAGCTCAAACACTTCCTGTTCACATAACACTACAAATCGCATTATGTTGCTTAATCTTATGTTTATATAAATTACACACAATAAATAGAAAGAATGTGAACATCATGAATAAATTATTGCTACTCGTTACATTTATCATTCGTGTGGGTTCAGGTATTGTTATGTTAATGCAAGGCTACGAAAAATTAACGGGCGGATTTACGCTGAAAGGTCTAGTACCAGTCATAGCTAACAATACTGATTCACCAGAGTGGTATAAGTGGTTTTTCGCAAATATAGTTGCACATACGACGTCATTATTTGATATTATTGTTCCACTTGGAGAGATTGCAATTGGATTAGGTTTAATTTTTGGAGTTTTTGCATATGCTGCTAGTTTCTTTGGAGCCTTTGTTATGATAAATTATATCTTAGCAGATATGATATTTACGTATCCTCTTCAATTAACTTTCTTTATCCTTTTACTAATGAGTCACTCATTGTTAAAACAGATTTCACTTAAAGAAATCATTAATTACTTTAGAGGTCGTAAGAACAGAGGTGAAAAAATAGATGACCCACTTACTGATCGTGGATGATGAACAAGACATTGTAGACATTTGTCAAACCTATTTTGAATATGAAGGTTACAAAGTAACAACGACAACTAGCGGTAAAGAAGCAATTTCTTTACTATCAAATGATATTGATATCATGGTACTTGATATCATGATGCCAGAAGTTAATGGTTACGACATTGTCAAAGAAATGAAAAGGCAAAAATTAGATATCCCCTTTATCTATTTAACTGCCAAAACACAAGAACATGATACCATTTACGCCTTAACTTTAGGTGCAGATGACTATGTCAAAAAACCATTTAGTCCAAGGGAACTCGTTTTACGTATTAATAATTTACTTACAAGAATGAAGAAATACCATCATCAACCAGTTGAACAACTGTCGTTTGATGAATTAACACTTATTAACTTAAGTAAAGTTGTGACTGTAAATGGTCACGAAGTCCCTATGCGTATTAAGGAATTTGAGTTATTGTGGTATTTAGCTTCTAGAGAAAATGAAGTTATTTCTAAATCAGAATTACTTGAAAAAGTTTGGGGATATGACTATTACGAAGATGCTAATACCGTGAATGTCCATATACACCGTATTAGAGAAAAATTAGAAAAAGAGAGCTTTACAACATATACCATCACAACTGTATGGGGATTAGGATATAAATTTGAAAGGAGCCGATAATGGTGTTATCAATTAGAAGTCAAATCATTATTGGCGTCGTATCGAGTATACTATTAACTTCAACTATTTTAGCAATTGCATATATTTTAATGTGGTTTAACGGCCATATGGCACTAACTTTGACCTTAACGACAATAATTACAAGTTGTTTAACCTTATTAATATGTAGTATTTTTATTAATCCACTTATACAAAAAATTAAGCAGTTTAATATAAAAACTAAGCAATTTGCTAACGGAAATTACGCAAGCAATGATAAAACGTTTAATTCACCAAAAGAAATTTATGAATTAAATCAATCTTTTAATAAAATGGCTTCTGAAATTACGCAACAAATGAATCAAATTAAATCCGAACAACAAGAAAAAACAGAACTGATTCAAAACTTAGCCCATGATTTAAAAACACCTTTAGCAAGCATTATTTCATATTCTGAAGGACTACGTGATGGTATAATCACAAAGGATCATGAGATTAAAGAGTCATACGACATATTAATTAAACAAGCAAACAGATTATCAACATTATTTGATGATATGACTCATATTATCACTTTAAATACAGGTAAAACATATCCCCCAGAATTAATACAACTAGACCAATTACTTGTATCAATATTGCAACCATATGAGCAACGTATCAAACATGAGAACCGCACATTAGAAGTGAATTTCTGTAGCGAAATTGATGCATTTTATCAATATCGAACGCCACTTGAGCGTATTTTAACAAACTTACTTGATAATGCGCTAAAATTTTCAAATGTTGGTAGTCGCATTGATATTAATATTAGTGAAAACAAAGATCAAGATACTATCGACATTGCTATTAGCGATGAAGGTATTGGCATTATACCAGAACTACAAGAACGTATATTCGAACGAACATTCAGAGTAGAAAACTCTCGTAATACAAAAACGGGTGGTTCTGGATTAGGCTTATATATAGCTAATGAACTCGCGCAACAAAATAACGCAAAAATCAGTGTAAGCAGTGATATAGATGTAGGAACTACGATGACTGTAACATTACACAAATTAGACATTACGTCATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LT992462|881202:888957|883951_884371_+|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_LT992462|881202:888957|885186_885771_+|WP_000637685.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDESAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLFWQKVYKF >NZ_LT992462|881202:888957|884374_885088_+|WP_001062968.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_LT992462|881202:888957|886767_887241_+|WP_001037805.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIIVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_LT992462|881202:888957|883281_883950_+|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_LT992462|881202:888957|882337_882931_-|WP_000604516.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAVEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_LT992462|881202:888957|887901_888957_+|WP_031913976.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMALTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_LT992462|881202:888957|881202_882354_-|WP_001217786.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCSHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_LT992462|881202:888957|885986_886427_+|WP_001093557.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_LT992462|881202:888957|887215_887902_+|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1221658 : 1231202
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LT992462|1221658:1231202|DBSCAN-SWA TTTAATTTACTAAACTAAATGTTACTGGTAGCCAATGATCTATTTTTATATTTTTATTCTTTACAATTGGTAGCCTTAGACCTTTACCATCAATAAGATAGTACATTGGCGGACAAATTTGCATTTCAATTAGCCCGTCGCGTTTTAAATCTGCCACAATATTAAACGCTTCTTCATTCCAACCCATCCAAAATATAATATTCTTATGGTTGCCACTGGTATATGCGCCGTTACCTTTGTATTTAAAACCTTGTTCTTCAAATACATTCTCAATCTCTACAAACGAAGTGCTGCCATTGTTCTTTATATATTCTAAAATGATTTGTTTCATTCTACTTCTATTCATGTTACTCTAGTCCTCCAATCTATCCAGTTACTAAAGCAACCACGTTAGATACTAAAAACCACTGAATTTATGTTTTTCAATAACCACTGTAAACACAGTGATGTCAATACATACAGGCTGTTGGTTACTGAGTTACTGAAAATTCACGGTATTTTATATAATCTTTTATTACCTTAATTCTCTATTATACATTTCTACTAAAAAGAAATAATTTATAGTAACTCAGTAACTTTTTGTCAAAAAGACTAATATGAAAGTAAAAACTGTGGTTACTGAATTCTAGAATTTTAGTATCTTTTAGTGACTTAAACGTTTTTTAGTAACTTTAGTATCTTAGGCAATTTTGTATAACTGCAAGTCTCTTCCGATTATGTGCAACTGAAATTTACAGCTATGCAACTCGTTTTAAATTTTCCAGTTGCAATTTTTTTCTTACTGTCACAAGGGGTTAATCCAATTTTGCAACTATGCAACCGAAATCACACAAATTAGTTTATATAATTTTTGATACTATTTCTTATTTATATTTTGGTTATTTACTTTTCTACTAATAAGTTATAGATTTTGAGTTGCTCAGTTGCATAAGTGCCCTAAACCCTTGATATAACTGTGATTATAGGTGCAACCCGTTTTAAAATTTTCGGTTGCATTCGGTTGCATTCGGTTGCACCTATATTGCTTTTAGCTTCACCTTTTCATACGATTTATAGTTTTTTCCACTTTCAATAGGTTCAATGTAATTTCTATTGTCATTAAAGTTGTATATCCTCTTAGCAAGTTCTTCATTGTCATATCTTCGCTGTGCATCAGTTTTCCAATAATTTTCTAAATAATGTTCAAATTGTTTATAAAACTTGTTTGAACTCAATGCATTATAGCCATTTTCATCACAATATTCTTTATAAAATGCGTATACAATATATTTCGGCACTTTTCTAATAGTCCATTGATCAAACATATTTACTTTAAACCCATAAACTGGATCGTTATCTTCTTTAAATACTTCAAGCATTTTTTTAGATGCATCAGGAATGTCAAAGGTTTCAAAATCTAAATTAATTGCTTTATAAAGCACATACTCTAGCACTTGCTGATTTTTTATATAGTCTTCTTTGATTTTAAAATTCTCTTTAATGCCATTAAAATTGGCATTAAACGGTACTATCAATAACCTTCTTAAAGTCCCGCCTGTTTTGTCTTTAAATTTAGGCATTCCATTCGTTGATTGAATAACTGTACACTTAAAAGTCGCTCTATATAAGGGTTTATTTTTAAACTCAACCAACACTGGATCGCCAGTAACTACACTTTTAAAGTTTGAAGAATCATCGACATACACACCAACTGGTACATCGTCTCCAATTACTGCTGTCTTGCCCTCTAACACACTCAATTTAAAACGTTCATCAAACTCATTCACTTTTAAGCTAGCAATATTGCTATAACCTATTACATTAGACAATAATTCTTGAAATGTACCTTTACCATTGTTACCATTACCAACCAAAAATAATGCTTTTTTACGTGTGTAGTTTCCATTCATTGAATCATTAATTACTTGCCACAATAATTTAACAACCTGATTATCATTACAAGCAATCTCTTCTATCCACCGATCTATATTCCAGCCATTTATTTCAGGTACTATATCTTGCCTTACATACGATGTATCTATTTTACTGGTAAATATATAATCAGGTGTAAATGATTCTAGTTGCTTCGTTTTACGGTTAAATACACCATTTTTAACTGGTATTAAGTATGGTGAGTTAGTTTTCTCTTTTATATCTACCATATTAGTTAAATGATAAATAACTTCATCAGCTTTGTTGCTATTATGTTTGGGCTCTAAATAGGAAATCACTCGTTTTATAATTGTAGTGTTCTGTGTATATATCCCTTCATCAAATTGATACATAGCTAACTTAGTATTTTCTTCATCATCAAAAAGTATAAATGTTAAATGCTCATTCAAAATATATGCACATTTTATAGGGCTAATTGTTGTAGGCTTTCGCCCTCGTTTTCCTCCTTCAATCCACTTTTCTTCCATTTTTGTTCTTTCTTCATGCCCCAATTGATTCAATAACTGTTTAACATCTTTACTCCCCTGTGGTATCGCATCAAATTCATTTATCGATTTAGTATAAACTGTCTTTTGATTCTTTATAGCTTTATCTAACTCAAGCTGTCCCCAAGTCGTATTACCTCGTTTACTTTCCCATTTATCCGTAAGATTATTGTAGTTTAAAAATATACGCTCCATTTGCTGTTTGTTTTTACCTGTGTAAAATGCTAAATAGTGTAATAAGCTTTGTACTGCTTCGCTTGAACTCTCAAAATATGATTCATATGTGCCTTGTAAAAGATCTTTAATTTTATCTTTTTGTTTAGATTTCATCATAATGTTTATAATATCTTCATCAGATAATTGCATATTGGTATTAGATTCCTCTCTCACAACATCATTTACTGGCAAATTCTCTTTAAAGTATTCATCAATGAGAGTATTTAATACTTCCTGATTATCACAAATATCATTTTGACCAATTGTGCATCCTGTAACAGTCATAAACCTTGCTGAATCATATAACTCTATGTCTAAATCCGTTCTTTTCTTTTTACGGTTATCTGGTAGTTTACCTTTAAAGAAACAATGTAATCCTGTACCACTTGGAGACTTTTCACAATATGTGAGTTGCATCATTTTTAATGCTAATTCAGAATTGATTTGTCCTTTTTCATCAATTGCATTATCAATATCTAAGCAAACAAAATTATTATCATCACTTAATACAAAGCCTATACCGCTATATTGCTCATCAACTTCATATTCAATACTTACACTTTCAAAGTCACACCATGTTTTTTTATTGGTTGTACTAGCTCTGTAACCATTAATACTATATGGTACTTTTCCATAATTTTGTTGCTTCTCGTTCCATTCAGCTCGCCATAATACCCAATTAGGCACTAACTTTAATTCTTGCGGTATTTCTAATTCTTTAACGCCAATAATACTATCTTTTTTCTTAATTGCCACAGAATGCCTCCTTTCTAATCTGATTTCTCTGTATTTTCAATGCAATTAATGTTAAAATATTGATGGTATGTTTTTATAAATTTTTATTTTTTATGCGTTATCTTGGCTTTGGTCGGCGAAAGATGACGCTTTTTCTAATGCATCAAACCTCGTTATTAATTCATCAAAACGATTTAAATAAATACCAAAAAGCTCTAGAACTTGTTCATTTAGAATTCTATGTTCGGTATAAGCTCGGCAGTATCTTTCATATTCTTTTATTGTTGTTATATCTCTAGAAATATATGTGTTTTCAATCCACCAACCATAAGTTTCATTTAAATCATTAAGTTTTTCTTTTATCAATTTAATGTCACACATTAAATTTTTAATTTCCCAATTCATTTATAATTCCTCCACTTCAGTATCATTATAAAAATCAAAGTTATTTTCTATTTGTTGTAATGCCCACTCGATTATGGCTTGTAAGTGTTCCTCACGATTTACGTTTTCTATCCATTCTTTCTTACCATCTACGCAATTATGGATGTATTTCATTGATGTGTTATAAGCTACTGCTTCTAAAGTATTATAGATGTCTTGAATAACTTCTTTTTGTTCATTATTCATTTTCTAATCCTCCTGTTAAATTAAATCCATAAGTTACCATCATGCCGTACACACTGAAAGCAACGTACATATTGGATATTGCGAGTAATAATATTGTTAACAGCGATGTTAAAGTTATATAAAGTAAATTCAATTTCATTGTGTTGCCTCCTGATAGGTTAGAATTCTCACGCGTTGCAGGCGTTTCAATTTTTCATTTGTTCAATTACATTTTCGATATCTTGTCGATCATAGCGAATTGTTTTACCAATCTTAACTTTACGAAGTCCCATCATTTCCCACTCGGTTATAACCTTGTGAGTCACGTTGTATTCTTCCATGACTTCTTTTTGAATGAGATATCTCTTACGTGATTGTTTAACTTTTTCTAAAACTATTTTTTCGGCAATATCAACTATGCTATTAACTAACTGTTGACTAGCTTGTTCACTAAGCAATTGGCTCATTTAACCCCTCCTTTTGTACGAATAAACTCGTTTTCATTACCAAAAAAAATATATTCCAGCGGTATGCTGTATATTTTTTCCATCAATAGCATTTTAGACCGTGATAAATCAGAACTATCTTTTTCCCAAGATGCTAAAGTTTGATAATGTACACCTAATAAGCTAGCCGCCTTTTTTTGACTCATACCATTATTTATCCTTGCTGCTCTGAGTAATAATTTTACGTTTTCATTCATTAATCAAACCTCCTCACAAGTCACTATAAACGCATTTATTCGTTTTGTCAACGTTTAAATTCGTTATTTTACATATTTTCTATTGTTTTAATCGTATTTATTCGTTAATATAACGTAAAGGAGTGATAAAAAATGCCAAGACCCTCATTAAGTTACCACGAAAAAATCTTAAGAAAAACTATTTCTAAAAACCTAAAGCGATTGTCTGAAGGAAAGACGCAAGCAGAAATATCCCAGCATACTAATATACCAACTTCAACTTTATCAGGCTATTTTGCTGAACGATCAACAATCAATCCTGAAAATACAGAAAAATTAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LT992462|1221658:1231202|1226939_1228076_+|WP_031588067.1|integrase|DBSCAN-SWA MIKKYKKKDGSTAYMFVAYLGTDPITGKQKRTTRRGFKTEREAKIAEAKLQTEVSQNGFLNNDITTFKEVYELWLEQYQNTVRESTYQRVLTLFDTAILEHFKDVPIKKITVLYCQKVINKWNKKYSDIKAIRIYTSNVFKYAVSLKIIADNPFTHTKAPRKKETQQNASMKYYSSDELKQFLTFVEDDPLYYAIFRTLAFTGFRRGELMALTWNDIDFTKQTISINKTCARGANYKLVIQEPKTKSSHRTISIDDKTASVLKSWRTHQRAESLKYGHNTSDKHQHVFTTVRDNKPLYPEHCNKALDLICEKNNFKRIKVHGFRHTHCSLLFEAGLSIQEVQDRLGHGDIKTTMDIYAHVTEKQRDQVADKFAKYINF >NZ_LT992462|1221658:1231202|1225430_1225655_-|WP_031774950.1|DBSCAN-SWA MNNEQKEVIQDIYNTLEAVAYNTSMKYIHNCVDGKKEWIENVNREEHLQAIIEWALQQIENNFDFYNDTEVEEL >NZ_LT992462|1221658:1231202|1229735_1231202_-|WP_000264071.1|DBSCAN-SWA MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_LT992462|1221658:1231202|1225136_1225430_-|WP_001103957.1|DBSCAN-SWA MNWEIKNLMCDIKLIKEKLNDLNETYGWWIENTYISRDITTIKEYERYCRAYTEHRILNEQVLELFGIYLNRFDELITRFDALEKASSFADQSQDNA >NZ_LT992462|1221658:1231202|1226097_1226337_-|WP_031588042.1|DBSCAN-SWA MNENVKLLLRAARINNGMSQKKAASLLGVHYQTLASWEKDSSDLSRSKMLLMEKIYSIPLEYIFFGNENEFIRTKGGVK >NZ_LT992462|1221658:1231202|1222673_1225046_-|WP_031593609.1|DBSCAN-SWA MAIKKKDSIIGVKELEIPQELKLVPNWVLWRAEWNEKQQNYGKVPYSINGYRASTTNKKTWCDFESVSIEYEVDEQYSGIGFVLSDDNNFVCLDIDNAIDEKGQINSELALKMMQLTYCEKSPSGTGLHCFFKGKLPDNRKKKRTDLDIELYDSARFMTVTGCTIGQNDICDNQEVLNTLIDEYFKENLPVNDVVREESNTNMQLSDEDIINIMMKSKQKDKIKDLLQGTYESYFESSSEAVQSLLHYLAFYTGKNKQQMERIFLNYNNLTDKWESKRGNTTWGQLELDKAIKNQKTVYTKSINEFDAIPQGSKDVKQLLNQLGHEERTKMEEKWIEGGKRGRKPTTISPIKCAYILNEHLTFILFDDEENTKLAMYQFDEGIYTQNTTIIKRVISYLEPKHNSNKADEVIYHLTNMVDIKEKTNSPYLIPVKNGVFNRKTKQLESFTPDYIFTSKIDTSYVRQDIVPEINGWNIDRWIEEIACNDNQVVKLLWQVINDSMNGNYTRKKALFLVGNGNNGKGTFQELLSNVIGYSNIASLKVNEFDERFKLSVLEGKTAVIGDDVPVGVYVDDSSNFKSVVTGDPVLVEFKNKPLYRATFKCTVIQSTNGMPKFKDKTGGTLRRLLIVPFNANFNGIKENFKIKEDYIKNQQVLEYVLYKAINLDFETFDIPDASKKMLEVFKEDNDPVYGFKVNMFDQWTIRKVPKYIVYAFYKEYCDENGYNALSSNKFYKQFEHYLENYWKTDAQRRYDNEELAKRIYNFNDNRNYIEPIESGKNYKSYEKVKLKAI >NZ_LT992462|1221658:1231202|1225840_1226101_-|WP_031588030.1|DBSCAN-SWA MSQLLSEQASQQLVNSIVDIAEKIVLEKVKQSRKRYLIQKEVMEEYNVTHKVITEWEMMGLRKVKIGKTIRYDRQDIENVIEQMKN >NZ_LT992462|1221658:1231202|1228169_1229711_-|WP_000424968.1|DBSCAN-SWA MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCECKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_LT992462|1221658:1231202|1226469_1226856_+|WP_031588064.1|DBSCAN-SWA MPRPSLSYHEKILRKTISKNLKRLSEGKTQAEISQHTNIPTSTLSGYFAERSTINPENTEKLATFFNVSLEKIDPRFSRNMLFLEDSDDEEYSLTVEILDMIEQLNKENKYKAFINTQKLLINQEKTN >NZ_LT992462|1221658:1231202|1225647_1225794_-|WP_162852058.1|DBSCAN-SWA MKLNLLYITLTSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGGLENE >NZ_LT992462|1221658:1231202|1221658_1222003_-|WP_001082128.1|DBSCAN-SWA MNRSRMKQIILEYIKNNGSTSFVEIENVFEEQGFKYKGNGAYTSGNHKNIIFWMGWNEEAFNIVADLKRDGLIEMQICPPMYYLIDGKGLRLPIVKNKNIKIDHWLPVTFSLVN |
11 | Staphylococcus_phage(33.33%) | integrase | attL 1214399:1214419|attR 1228161:1228181 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1295824 : 1345937
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_LT992462|1295824:1345937|DBSCAN-SWA 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74 | Staphylococcus_phage(89.04%) | portal,plate,integrase,protease,terminase,holin,capsid,tail,head | attL 1297812:1297829|attR 1344454:1344471 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1401059 : 1409371
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_LT992462|1401059:1409371|DBSCAN-SWA 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CCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTCTTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCAATCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATCTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTAGTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCATCATTCAAACTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCTGCTTTTTCTTGCCGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGACTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGTGCAACATCATTTAAAGCCTTTTGTTGCAAAATCGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTACGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTATCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAAGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTACGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAGTAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGGCAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_LT992462|1401059:1409371|1402870_1404217_-|WP_001062170.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKADVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAITGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_LT992462|1401059:1409371|1401059_1401845_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_LT992462|1401059:1409371|1406241_1407348_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_LT992462|1401059:1409371|1407571_1409371_-|WP_001217255.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIARNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPVNYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_LT992462|1401059:1409371|1401970_1402861_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_LT992462|1401059:1409371|1405433_1406111_-|WP_000624563.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_LT992462|1401059:1409371|1404330_1405431_-|WP_000683941.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDYHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGSIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADFKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1478850 : 1487893
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_LT992462|1478850:1487893|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCATATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTCACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACATTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCTCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTATTTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAGTCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATATACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTATCAATAGCCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGACATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTAAACTCTTTAATGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATCGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTGTTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAATATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAAAGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAAGCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTTGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTCGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_LT992462|1478850:1487893|1484699_1485839_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_LT992462|1478850:1487893|1485861_1486887_-|WP_001019177.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSNRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_LT992462|1478850:1487893|1481866_1484146_-|WP_000749801.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQYWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_LT992462|1478850:1487893|1479390_1481664_-|WP_000595008.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIDRIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSILPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPMSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCEHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_LT992462|1478850:1487893|1478850_1479369_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_LT992462|1478850:1487893|1486888_1487893_-|WP_001005766.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDAIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_LT992462|1478850:1487893|1484420_1484681_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1611628 : 1659474
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_LT992462|1611628:1659474|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(91.89%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
2928138 : 2957078
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_LT992462|2928138:2957078|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(88.0%) | portal,integrase,terminase,capsid,head,tail,protease | attL 2915905:2915920|attR 2942649:2942664 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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