CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_LS483301	Staphylococcus aureus strain NCTC13394 chromosome 1	13 crisprs	cas3,DEDDh,DinG,WYL,csa3	13	2	12	1

1. NZ_LS483301

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_LS483301_1

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_1
• CRISPR_location: 441123-441223
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_1

Consensus_repeat	Method
TTATGAATTGAGTATTAAATTTG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483301_1

>1.1|441146|55|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder
AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_1

>merge|NZ_LS483301|1|441123-441223|CRISPRCasFinder
TTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTATTAAATTTG

>NZ_LS483301|1|1|441123-441223|CRISPRCasFinder
TTATGAATTGAGTATTAAATTTG	AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT
ATATGAATTGAGTATTAAATTTG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_000158374.1|433082_433664_+|histidine-phosphatase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223483
NZ_LS483301.1|WP_000868248.1|433729_434113_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_001789518.1|440347_440449_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000052781.1|436977_437547_-|peroxiredoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|211789
NZ_LS483301.1|WP_000394698.1|442313_442976_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000991007.1|438874_440263_-|L-cystine-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224736
NZ_LS483301.1|WP_000551776.1|449067_449604_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_061642057.1|438038_438794_+|oxygen-insensitive-NADPH-nitroreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|380322
NZ_LS483301.1|WP_000793009.1|444616_445885_+|purine-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|274468
NZ_LS483301.1|WP_000956132.1|441239_442196_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235334
NZ_LS483301.1|WP_000041883.1|449996_450701_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin	unknown	unknown	gnl|CDD|367091
NZ_LS483301.1|WP_000424966.1|447413_448955_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234614
NZ_LS483301.1|WP_000264071.1|445922_447389_+|IMP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|235507
NZ_LS483301.1|WP_000930486.1|435438_436962_-|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F	unknown	unknown	gnl|CDD|237942
NZ_LS483301.1|WP_000466748.1|432405_432657_+|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225170
NZ_LS483301.1|WP_000746687.1|434367_434994_-|NDxxF-motif-lipoprotein	unknown	unknown	gnl|CDD|380196
NZ_LS483301.1|WP_000211676.1|432695_432905_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000421410.1|444038_444617_+|xanthine-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|181705
NZ_LS483301.1|WP_000159787.1|451099_451372_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225511
NZ_LS483301.1|WP_000763768.1|443118_443526_-|general-stress-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378584

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_000158374.1|433082_433664_+|histidine-phosphatase-family-protein	gnl|CDD|223483	COG0406, phoE, Broad specificity phosphatase PhoE and related phosphatases [General function prediction only].	2.78414e-49
NZ_LS483301.1|WP_000052781.1|436977_437547_-|peroxiredoxin	gnl|CDD|211789	TIGR03137, AhpC, peroxiredoxin. This peroxiredoxin (AhpC, alkylhydroperoxide reductase subunit C) is one subunit of a two-subunit complex with subunit F(TIGR03140). Usually these are found as an apparent operon. The gene has been characterized in Bacteroides fragilis, where it is important in oxidative stress defense. This gene contains two invariant cysteine residues, one near the N-terminus and one near the C-terminus, each followed immediately by a proline residue. [Cellular processes, Detoxification, Cellular processes, Adaptations to atypical conditions].	1.50623e-124
NZ_LS483301.1|WP_000763768.1|443118_443526_-|general-stress-protein	gnl|CDD|378584	pfam11181, YflT, Heat induced stress protein YflT. YflT is a heat induced protein.	2.0219e-12
NZ_LS483301.1|WP_000991007.1|438874_440263_-|L-cystine-transporter	gnl|CDD|224736	COG1823, COG1823, Predicted Na+/dicarboxylate symporter [General function prediction only].	0
NZ_LS483301.1|WP_061642057.1|438038_438794_+|oxygen-insensitive-NADPH-nitroreductase	gnl|CDD|380322	cd02146, NfsA-like, nitroreductase similar to Escherichia coli NfsA. This family contains NADPH-dependent flavin reductase and oxygen-insensitive nitroreductase. These enzymes are homodimeric flavoproteins that contain one FMN per monomer as a cofactor. Flavin reductase catalyzes the reduction of flavin by using NADPH as an electron donor. Oxygen-insensitive nitroreductase, such as NfsA protein in Escherichia coli, catalyzes reduction of nitrocompounds using NADPH as electron donor.	1.16159e-87
NZ_LS483301.1|WP_000956132.1|441239_442196_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|235334	PRK05035, PRK05035, electron transport complex protein RnfC; Provisional.	0.000748442
NZ_LS483301.1|WP_000424966.1|447413_448955_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase	gnl|CDD|234614	PRK00074, guaA, GMP synthase; Reviewed.	0
NZ_LS483301.1|WP_000264071.1|445922_447389_+|IMP-dehydrogenase	gnl|CDD|235507	PRK05567, PRK05567, inosine 5'-monophosphate dehydrogenase; Reviewed.	0
NZ_LS483301.1|WP_000930486.1|435438_436962_-|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F	gnl|CDD|237942	PRK15317, PRK15317, alkyl hydroperoxide reductase subunit F; Provisional.	0
NZ_LS483301.1|WP_000466748.1|432405_432657_+|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein	gnl|CDD|225170	COG2261, COG2261, Predicted membrane protein [Function unknown].	1.58864e-09
NZ_LS483301.1|WP_000746687.1|434367_434994_-|NDxxF-motif-lipoprotein	gnl|CDD|380196	NF033193, lipo_NDxxF, NDxxF motif lipoprotein. Members of this family are lipoproteins, about 200 amino acids long in precursor form, found in Staphylococcus aureus, Bacillus cereus, and various other Firmicutes. The protein family is named for one of its several highly conserved motifs.	1.67126e-71
NZ_LS483301.1|WP_000041883.1|449996_450701_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin	gnl|CDD|367091	pfam02452, PemK_toxin, PemK-like, MazF-like toxin of type II toxin-antitoxin system. PemK is a growth inhibitor in E. coli known to bind to the promoter region of the Pem operon, auto-regulating synthesis. This family represents the toxin molecule of a typical bacterial toxin-antitoxin system pairing. The family includes a number of different toxins, such as MazF, Kid, PemK, ChpA, ChpB and ChpAK.	9.65175e-08
NZ_LS483301.1|WP_000421410.1|444038_444617_+|xanthine-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|181705	PRK09219, PRK09219, xanthine phosphoribosyltransferase; Validated.	9.01486e-119
NZ_LS483301.1|WP_000159787.1|451099_451372_-|transposase	gnl|CDD|225511	COG2963, COG2963, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	9.23077e-11
NZ_LS483301.1|WP_000793009.1|444616_445885_+|purine-permease	gnl|CDD|274468	TIGR03173, pbuX, xanthine permease. All the seed members of this model are observed adjacent to genes for either xanthine phosphoribosyltransferase (for the conversion of xanthine to guanine, GenProp0696) or genes for the conversion of xanthine to urate and its concomitant catabolism (GenProp0640, GenProp0688, GenProp0686 and GenProp0687). A number of sequences scoring higher than trusted to this model are found in different genomic contexts, and the possibility exist that these transport related compounds in addition to or instead of xanthine itself. The outgroup to this family are sequences which are characterized as uracil permeases or are adjacent to established uracil phosphoribosyltransferases.	2.75897e-170

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_001789518.1|440347_440449_+|hypothetical-protein
MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNSVVIGGKGK
>NZ_LS483301.1|WP_000991007.1|438874_440263_-|L-cystine-transporter
MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLIYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFDSNDNAALTSH
>NZ_LS483301.1|WP_061642057.1|438038_438794_+|oxygen-insensitive-NADPH-nitroreductase
MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNHKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR
>NZ_LS483301.1|WP_000052781.1|436977_437547_-|peroxiredoxin
MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI
>NZ_LS483301.1|WP_000930486.1|435438_436962_-|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F
MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDDKSKELKDLLTEITDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKKLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMNTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLNDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN
>NZ_LS483301.1|WP_000746687.1|434367_434994_-|NDxxF-motif-lipoprotein
MKKRLLLSTFLASTLILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK
>NZ_LS483301.1|WP_000868248.1|433729_434113_-|hypothetical-protein
MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVEKNDSP
>NZ_LS483301.1|WP_000158374.1|433082_433664_+|histidine-phosphatase-family-protein
MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSRAEAVDLKVENCKPYIIE
>NZ_LS483301.1|WP_000211676.1|432695_432905_-|hypothetical-protein
MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPKFPHINLLLFNPILSTFSNIIIHIDHFHANKKDDN
>NZ_LS483301.1|WP_000466748.1|432405_432657_+|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein
MFGFIGMLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK
>NZ_LS483301.1|WP_000956132.1|441239_442196_-|hypothetical-protein
MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKALAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNDNAAETSNKEATVDAEAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL
>NZ_LS483301.1|WP_000394698.1|442313_442976_-|hypothetical-protein
MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF
>NZ_LS483301.1|WP_000763768.1|443118_443526_-|general-stress-protein
MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHQEVHENNSAYEEIDITHFAEASKGPKA
>NZ_LS483301.1|WP_000421410.1|444038_444617_+|xanthine-phosphoribosyltransferase
MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE
>NZ_LS483301.1|WP_000793009.1|444616_445885_+|purine-permease
MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILLLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK
>NZ_LS483301.1|WP_000264071.1|445922_447389_+|IMP-dehydrogenase
MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF
>NZ_LS483301.1|WP_000424966.1|447413_448955_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase
MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCRGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE
>NZ_LS483301.1|WP_000551776.1|449067_449604_-|hypothetical-protein
MHNNNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYVNEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNTIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY
>NZ_LS483301.1|WP_000041883.1|449996_450701_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin
MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSYSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALAQKYREIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN
>NZ_LS483301.1|WP_000159787.1|451099_451372_-|transposase
MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI

Crispr_ID: NZ_LS483301_2

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_2
• CRISPR_location: 677844-677936
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_2

Consensus_repeat	Method
CTAAAGGTGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483301_2

>2.1|677876|29|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder
AGGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_2

>merge|NZ_LS483301|2|677844-677936|CRISPRCasFinder
CTAAAGGTGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTAAGGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCGCTAAAGATGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTA

>NZ_LS483301|2|2|677844-677936|CRISPRCasFinder
CTAAAGGTGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTA	AGGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCG
CTAAAGATGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_000477504.1|670449_670926_+|GNAT-family-N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|366181
NZ_LS483301.1|WP_001045421.1|683236_684025_+|alpha/beta-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223669
NZ_LS483301.1|WP_000359086.1|674593_675010_+|DUF1934-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226896
NZ_LS483301.1|WP_001222133.1|682351_683068_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000169042.1|686721_686946_-|DUF2922-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378571
NZ_LS483301.1|WP_000808902.1|668595_669534_+|aldo/keto-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|381309
NZ_LS483301.1|WP_000655099.1|674393_674501_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000735558.1|681683_682190_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_001790232.1|679039_679990_+|iron-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
NZ_LS483301.1|WP_001021145.1|675006_676668_+|arginine--tRNA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|234964
NZ_LS483301.1|WP_000633782.1|669744_670281_+|flavodoxin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223728
NZ_LS483301.1|WP_061642064.1|673308_674319_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP	unknown	unknown	gnl|CDD|181842
NZ_LS483301.1|WP_001018677.1|684275_684650_-|transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|130944
NZ_LS483301.1|WP_001553862.1|685597_686527_-|DMT-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|225778
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NZ_LS483301.1|WP_061642063.1|680044_680764_+|HAD-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223943
NZ_LS483301.1|WP_000901764.1|677056_677692_+|endonuclease-III-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225140
NZ_LS483301.1|WP_000180230.1|670965_672261_+|HD-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224004
NZ_LS483301.1|WP_000362967.1|680747_681548_+|alpha/beta-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223669
NZ_LS483301.1|WP_015581799.1|678004_678892_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238563

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_000477504.1|670449_670926_+|GNAT-family-N-acetyltransferase	gnl|CDD|366181	pfam00583, Acetyltransf_1, Acetyltransferase (GNAT) family. This family contains proteins with N-acetyltransferase functions such as Elp3-related proteins.	1.13315e-11
NZ_LS483301.1|WP_001045421.1|683236_684025_+|alpha/beta-hydrolase	gnl|CDD|223669	COG0596, MhpC, Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) [General function prediction only].	1.55978e-34
NZ_LS483301.1|WP_000359086.1|674593_675010_+|DUF1934-domain-containing-protein	gnl|CDD|226896	COG4506, COG4506, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	2.62525e-58
NZ_LS483301.1|WP_000169042.1|686721_686946_-|DUF2922-domain-containing-protein	gnl|CDD|378571	pfam11148, DUF2922, Protein of unknown function (DUF2922). This bacterial family of proteins has no known function.	1.74707e-13
NZ_LS483301.1|WP_000808902.1|668595_669534_+|aldo/keto-reductase	gnl|CDD|381309	cd19083, AKR_AKR11A1_11D1, AKR11A and AKR11D families of aldo-keto reductase (AKR). Bacillus subtilis aldo-keto reductase IolS, also called vegetative protein 147 (VEG147), is a founding member of aldo-keto reductase family 11 member A1 (AKR11A1). It is able to reduce the standard aldo-keto reductase (AKR) substrates DL-glyceraldehyde, D-erythrose, and methylglyoxal in the presence of NADPH, albeit with poor efficiency in vitro. Bacillus aryabhattai aldo keto reductase is a founding member of aldo-keto reductase family 11 member D1 (AKR11D1).	7.3194e-168
NZ_LS483301.1|WP_001790232.1|679039_679990_+|iron-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	5.19191e-48
NZ_LS483301.1|WP_015581799.1|678004_678892_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|238563	cd01143, YvrC, Periplasmic binding protein YvrC. These proteins are predicted to function as initial receptors in ABC transport of metal ions in eubacteria and archaea. They belong to the TroA superfamily of periplasmic metal binding proteins that share a distinct fold and ligand binding mechanism. A typical TroA protein is comprised of two globular subdomains connected by a single helix and can bind the metal ion in the cleft between these domains.	6.03257e-73
NZ_LS483301.1|WP_000633782.1|669744_670281_+|flavodoxin-family-protein	gnl|CDD|223728	COG0655, WrbA, Multimeric flavodoxin WrbA [General function prediction only].	3.16348e-26
NZ_LS483301.1|WP_061642064.1|673308_674319_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP	gnl|CDD|181842	PRK09422, PRK09422, ethanol-active dehydrogenase/acetaldehyde-active reductase; Provisional.	0
NZ_LS483301.1|WP_001018677.1|684275_684650_-|transcriptional-regulator	gnl|CDD|130944	TIGR01889, Pleiotropic_Regulator_Of_Virulence, staphylococcal accessory regulator family. This model represents a family of transcriptional regulatory proteins in Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis. Some members contain two tandem copies of this region. This family is related to the MarR transcriptional regulator family described by pfam01047. [Regulatory functions, DNA interactions].	1.77309e-26
NZ_LS483301.1|WP_001553862.1|685597_686527_-|DMT-family-transporter	gnl|CDD|225778	COG3238, COG3238, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	7.93315e-37
NZ_LS483301.1|WP_001021145.1|675006_676668_+|arginine--tRNA-ligase	gnl|CDD|234964	PRK01611, argS, arginyl-tRNA synthetase; Reviewed.	0
NZ_LS483301.1|WP_001788287.1|672288_672810_+|YwhD-family-protein	gnl|CDD|378039	pfam08741, YwhD, YwhD family. This family of proteins are currently uncharacterized. They are around 170 amino acids in length.	8.7406e-98
NZ_LS483301.1|WP_061642063.1|680044_680764_+|HAD-family-hydrolase	gnl|CDD|223943	COG1011, COG1011, Predicted hydrolase (HAD superfamily) [General function prediction only].	4.45233e-38
NZ_LS483301.1|WP_000901764.1|677056_677692_+|endonuclease-III-domain-containing-protein	gnl|CDD|225140	COG2231, COG2231, Uncharacterized protein related to Endonuclease III [DNA replication, recombination, and repair].	3.98158e-90
NZ_LS483301.1|WP_000180230.1|670965_672261_+|HD-domain-containing-protein	gnl|CDD|224004	COG1078, COG1078, HD superfamily phosphohydrolases [General function prediction only].	1.70707e-150
NZ_LS483301.1|WP_000362967.1|680747_681548_+|alpha/beta-hydrolase	gnl|CDD|223669	COG0596, MhpC, Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) [General function prediction only].	7.17592e-26

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_000901764.1|677056_677692_+|endonuclease-III-domain-containing-protein
MLGTDELYKVLYEHLGPQFWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK
>NZ_LS483301.1|WP_001021145.1|675006_676668_+|arginine--tRNA-ligase
MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM
>NZ_LS483301.1|WP_000359086.1|674593_675010_+|DUF1934-domain-containing-protein
MDKKVSIQTKQVLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE
>NZ_LS483301.1|WP_000655099.1|674393_674501_+|hypothetical-protein
MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMAYIYEALIKYGIVN
>NZ_LS483301.1|WP_061642064.1|673308_674319_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP
MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGGRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF
>NZ_LS483301.1|WP_001788287.1|672288_672810_+|YwhD-family-protein
MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN
>NZ_LS483301.1|WP_000180230.1|670965_672261_+|HD-domain-containing-protein
MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN
>NZ_LS483301.1|WP_000477504.1|670449_670926_+|GNAT-family-N-acetyltransferase
MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF
>NZ_LS483301.1|WP_000633782.1|669744_670281_+|flavodoxin-family-protein
MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ
>NZ_LS483301.1|WP_000808902.1|668595_669534_+|aldo/keto-reductase
MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDNNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED
>NZ_LS483301.1|WP_015581799.1|678004_678892_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKKSLIAFILIFMLVLSGCGMKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTCIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK
>NZ_LS483301.1|WP_001790232.1|679039_679990_+|iron-ABC-transporter-permease
MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVTGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH
>NZ_LS483301.1|WP_061642063.1|680044_680764_+|HAD-family-hydrolase
MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQKDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY
>NZ_LS483301.1|WP_000362967.1|680747_681548_+|alpha/beta-hydrolase
MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLTLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV
>NZ_LS483301.1|WP_000735558.1|681683_682190_+|hypothetical-protein
MKKLLTASIIACSVVMGVGLVNTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK
>NZ_LS483301.1|WP_001222133.1|682351_683068_+|hypothetical-protein
MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL
>NZ_LS483301.1|WP_001045421.1|683236_684025_+|alpha/beta-hydrolase
MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLKFLKSVS
>NZ_LS483301.1|WP_001018677.1|684275_684650_-|transcriptional-regulator
MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL
>NZ_LS483301.1|WP_001553862.1|685597_686527_-|DMT-family-transporter
MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIILNIIINPEVFTIHFYNNQSFNYTWVVGGLLGVSFLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSIALLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF
>NZ_LS483301.1|WP_000169042.1|686721_686946_-|DUF2922-domain-containing-protein
MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNVVTEQVARDSMNALVDLNIIKSNSGTITKVHSAQIIDKTTTVLFEDKK

Crispr_ID: NZ_LS483301_3

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_3
• CRISPR_location: 795057-795139
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_3

Consensus_repeat	Method
CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483301_3

>3.1|795084|29|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder
CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_3

>merge|NZ_LS483301|3|795057-795139|CRISPRCasFinder
CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG

>NZ_LS483301|3|3|795057-795139|CRISPRCasFinder
CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG	CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG
CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_001790641.1|796595_796697_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000562498.1|803391_804363_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta	unknown	unknown	gnl|CDD|275027
NZ_LS483301.1|WP_000855505.1|801168_803274_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha	unknown	unknown	gnl|CDD|236069
NZ_LS483301.1|WP_000708692.1|781951_782662_+|allophanate-hydrolase-subunit-1	unknown	unknown	gnl|CDD|224960
NZ_LS483301.1|WP_000692521.1|800807_801206_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI	unknown	unknown	gnl|CDD|224694
NZ_LS483301.1|WP_000193751.1|796774_798280_-|peptide-MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|225646
NZ_LS483301.1|WP_000589260.1|790232_791210_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224050
NZ_LS483301.1|WP_000930014.1|798620_799121_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF	unknown	unknown	gnl|CDD|223851
NZ_LS483301.1|WP_000429014.1|795587_796505_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|224513
NZ_LS483301.1|WP_000022323.1|782645_783650_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224895
NZ_LS483301.1|WP_000983677.1|788229_790011_+|DNA-helicase-RecQ	unknown	unknown	gnl|CDD|273594
NZ_LS483301.1|WP_000197271.1|794365_794908_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase	unknown	unknown	gnl|CDD|226895
NZ_LS483301.1|WP_000663030.1|792956_794015_+|histidinol-phosphate-transaminase	unknown	unknown	gnl|CDD|235106
NZ_LS483301.1|WP_000525109.1|786334_788218_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223562
NZ_LS483301.1|WP_000098285.1|784123_786064_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS	unknown	unknown	gnl|CDD|224287
NZ_LS483301.1|WP_000499195.1|804876_805032_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000876318.1|805070_806042_+|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|226965
NZ_LS483301.1|WP_001790169.1|781657_781864_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
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NZ_LS483301.1|WP_061642025.1|791202_792717_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270328

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_000562498.1|803391_804363_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta	gnl|CDD|275027	TIGR04171, ribonucleotide-diphosphate_reductase_subunit_beta, ribonucleoside-diphosphate reductase, class 1b, beta subunit. Members of this family are NrdF, the beta subunit of class 1b ribonucleotide reductase. This form uses a dimanganese moiety associated with a tyrosine radical to reduce the cellular requirement for iron. [Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides, 2'-Deoxyribonucleotide metabolism].	2.30551e-164
NZ_LS483301.1|WP_000855505.1|801168_803274_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha	gnl|CDD|236069	PRK07632, PRK07632, ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha; Validated.	0
NZ_LS483301.1|WP_000708692.1|781951_782662_+|allophanate-hydrolase-subunit-1	gnl|CDD|224960	COG2049, DUR1, Allophanate hydrolase subunit 1 [Amino acid transport and metabolism].	1.29969e-94
NZ_LS483301.1|WP_000193751.1|796774_798280_-|peptide-MFS-transporter	gnl|CDD|225646	COG3104, PTR2, Dipeptide/tripeptide permease [Amino acid transport and metabolism].	1.22605e-172
NZ_LS483301.1|WP_000692521.1|800807_801206_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI	gnl|CDD|224694	COG1780, NrdI, Protein involved in ribonucleotide reduction [Nucleotide transport and metabolism].	5.52807e-56
NZ_LS483301.1|WP_000930014.1|798620_799121_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF	gnl|CDD|223851	COG0780, COG0780, Enzyme related to GTP cyclohydrolase I [General function prediction only].	7.91282e-79
NZ_LS483301.1|WP_000429014.1|795587_796505_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase	gnl|CDD|224513	COG1597, LCB5, Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase [Lipid metabolism / General function prediction only].	3.10512e-78
NZ_LS483301.1|WP_000022323.1|782645_783650_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein	gnl|CDD|224895	COG1984, DUR1, Allophanate hydrolase subunit 2 [Amino acid transport and metabolism].	1.25641e-144
NZ_LS483301.1|WP_000983677.1|788229_790011_+|DNA-helicase-RecQ	gnl|CDD|273594	TIGR01389, recQ, ATP-dependent DNA helicase RecQ. The ATP-dependent DNA helicase RecQ of E. coli is about 600 residues long. This model represents bacterial proteins with a high degree of similarity in domain architecture and in primary sequence to E. coli RecQ. The model excludes eukaryotic and archaeal proteins with RecQ-like regions, as well as more distantly related bacterial helicases related to RecQ. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0
NZ_LS483301.1|WP_000197271.1|794365_794908_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase	gnl|CDD|226895	COG4502, COG4502, 5'(3')-deoxyribonucleotidase [Nucleotide transport and metabolism].	1.15481e-107
NZ_LS483301.1|WP_000663030.1|792956_794015_+|histidinol-phosphate-transaminase	gnl|CDD|235106	PRK03158, PRK03158, histidinol-phosphate aminotransferase; Provisional.	0
NZ_LS483301.1|WP_000525109.1|786334_788218_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|223562	COG0488, Uup, ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains [General function prediction only].	0
NZ_LS483301.1|WP_000098285.1|784123_786064_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS	gnl|CDD|224287	COG1368, MdoB, Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	0
NZ_LS483301.1|WP_000876318.1|805070_806042_+|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|226965	COG4606, CeuB, ABC-type enterochelin transport system, permease component [Inorganic ion transport and metabolism].	1.32603e-150
NZ_LS483301.1|WP_000589260.1|790232_791210_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224050	COG1125, OpuBA, ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components [Amino acid transport and metabolism].	4.80291e-155
NZ_LS483301.1|WP_001068497.1|799140_800007_-|DMT-family-transporter	gnl|CDD|223769	COG0697, RhaT, Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily [Carbohydrate transport and metabolism / Amino acid transport and metabolism / General function prediction only].	3.8323e-10
NZ_LS483301.1|WP_061642025.1|791202_792717_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein	gnl|CDD|270328	cd13610, PBP2_ChoS, Substrate-binding domain ChoS of an osmoregulated ABC-type transporter and related proteins; type 2 periplasmic-binding protein fold. Osmoprotectant binding lipoprotein ChoS of Lactococcus lactis is predicted to be involved in uptake of compatible solutes such as choline and glycine betaine, but the relative substrate preference is not known. To counteract the efflux of water, microorganisms accumulate the compatible solutes for a sustained adjustment to high osmolarity surroundings. ChoS belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	3.68636e-152

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_000197271.1|794365_794908_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase
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>NZ_LS483301.1|WP_000663030.1|792956_794015_+|histidinol-phosphate-transaminase
MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE
>NZ_LS483301.1|WP_061642025.1|791202_792717_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein
MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKVIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRFMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYEQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK
>NZ_LS483301.1|WP_000589260.1|790232_791210_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLEMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLDIMKPIDEVTSMSAYPIVYDNQPIEVLYQLLSESERVIVMQEDSVGQYVIDRKDIFKYLSQKKEVAQHD
>NZ_LS483301.1|WP_000983677.1|788229_790011_+|DNA-helicase-RecQ
MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNMLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFILDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIESVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRVLFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV
>NZ_LS483301.1|WP_000525109.1|786334_788218_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein
MGMEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMMDAQDAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNILSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREENEIAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSSTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ
>NZ_LS483301.1|WP_000098285.1|784123_786064_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS
MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK
>NZ_LS483301.1|WP_000022323.1|782645_783650_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein
MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTEPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK
>NZ_LS483301.1|WP_000708692.1|781951_782662_+|allophanate-hydrolase-subunit-1
MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDLESLLKHYKIKLETFIELHSKAQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN
>NZ_LS483301.1|WP_001790169.1|781657_781864_+|hypothetical-protein
MIIVYIVLLLILVYVNYRLVNRLLSENRIYVVRLIATITTVISFILVYALIHELMPFVVRAMDLMYHQ
>NZ_LS483301.1|WP_000429014.1|795587_796505_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase
MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL
>NZ_LS483301.1|WP_001790641.1|796595_796697_+|hypothetical-protein
MVINEIDFYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIS
>NZ_LS483301.1|WP_000193751.1|796774_798280_-|peptide-MFS-transporter
MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR
>NZ_LS483301.1|WP_000930014.1|798620_799121_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF
MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR
>NZ_LS483301.1|WP_001068497.1|799140_800007_-|DMT-family-transporter
MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK
>NZ_LS483301.1|WP_000692521.1|800807_801206_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI
MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY
>NZ_LS483301.1|WP_000855505.1|801168_803274_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha
MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI
>NZ_LS483301.1|WP_000562498.1|803391_804363_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta
MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK
>NZ_LS483301.1|WP_000499195.1|804876_805032_+|hypothetical-protein
MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ
>NZ_LS483301.1|WP_000876318.1|805070_806042_+|ABC-transporter-permease
MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ

Crispr_ID: NZ_LS483301_4

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_4
• CRISPR_location: 836107-836187
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_4

Consensus_repeat	Method
TTCTTTATGTTGGGGCCCCGCCAACT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483301_4

>4.1|836133|29|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder
TGCATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_4

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_4

>merge|NZ_LS483301|4|836107-836187|CRISPRCasFinder
TTCTTTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTTTATGTTGGGGCCCCGCCAACT

>NZ_LS483301|4|4|836107-836187|CRISPRCasFinder
TTCTTTATGTTGGGGCCCCGCCAACT	TGCATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAA
TTCTTTATGTTGGGGCCCCGCCAACT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_000229253.1|830977_832963_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB	unknown	unknown	gnl|CDD|235395
NZ_LS483301.1|WP_001790093.1|828557_828665_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_001224793.1|838208_838694_+|acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|100053
NZ_LS483301.1|WP_001790092.1|827020_827125_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000958224.1|836423_837356_+|HPr-kinase/phosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|235459
NZ_LS483301.1|WP_000134963.1|840207_841143_+|thioredoxin-disulfide-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|273540
NZ_LS483301.1|WP_001587544.1|842022_842934_+|RNase-adapter-RapZ	unknown	unknown	gnl|CDD|224574
NZ_LS483301.1|WP_000506531.1|824447_826979_+|preprotein-translocase-subunit-SecA	unknown	unknown	gnl|CDD|237259
NZ_LS483301.1|WP_010956549.1|827293_828404_+|peptide-chain-release-factor-2	unknown	unknown	gnl|CDD|234799
NZ_LS483301.1|WP_000538141.1|829825_830476_+|HD-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378993
NZ_LS483301.1|WP_061642028.1|823461_824034_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA	unknown	unknown	gnl|CDD|224461
NZ_LS483301.1|WP_000006551.1|844035_844980_+|DNA-binding-protein-WhiA	unknown	unknown	gnl|CDD|273194
NZ_LS483301.1|WP_000749380.1|828812_829652_+|CHAP-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226451
NZ_LS483301.1|WP_001248939.1|842930_843926_+|YvcK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|211689
NZ_LS483301.1|WP_001049165.1|845552_846140_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP	unknown	unknown	gnl|CDD|178955
NZ_LS483301.1|WP_000513308.1|837361_838201_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|183527
NZ_LS483301.1|WP_000638419.1|830472_830709_+|CsbA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227234
NZ_LS483301.1|WP_000816295.1|846382_847285_-|TIGR01777-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224015
NZ_LS483301.1|WP_000662681.1|832970_835817_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	unknown	unknown	gnl|CDD|234734
NZ_LS483301.1|WP_000057551.1|838701_840141_+|tetratricopeptide-repeat-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|276808

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_000229253.1|830977_832963_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB	gnl|CDD|235395	PRK05298, PRK05298, excinuclease ABC subunit UvrB.	0
NZ_LS483301.1|WP_000513308.1|837361_838201_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	gnl|CDD|183527	PRK12437, PRK12437, prolipoprotein diacylglyceryl transferase; Reviewed.	1.39921e-119
NZ_LS483301.1|WP_000816295.1|846382_847285_-|TIGR01777-family-protein	gnl|CDD|224015	COG1090, COG1090, Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase [General function prediction only].	4.94096e-153
NZ_LS483301.1|WP_000958224.1|836423_837356_+|HPr-kinase/phosphorylase	gnl|CDD|235459	PRK05428, PRK05428, HPr kinase/phosphorylase; Provisional.	1.22623e-170
NZ_LS483301.1|WP_000134963.1|840207_841143_+|thioredoxin-disulfide-reductase	gnl|CDD|273540	TIGR01292, Thioredoxin_reductase, thioredoxin-disulfide reductase. This model describes thioredoxin-disulfide reductase, a member of the pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases (pfam00070). [Energy metabolism, Electron transport].	4.19425e-154
NZ_LS483301.1|WP_001587544.1|842022_842934_+|RNase-adapter-RapZ	gnl|CDD|224574	COG1660, COG1660, Predicted P-loop-containing kinase [General function prediction only].	1.27584e-168
NZ_LS483301.1|WP_000506531.1|824447_826979_+|preprotein-translocase-subunit-SecA	gnl|CDD|237259	PRK12904, PRK12904, preprotein translocase subunit SecA; Reviewed.	0
NZ_LS483301.1|WP_010956549.1|827293_828404_+|peptide-chain-release-factor-2	gnl|CDD|234799	PRK00578, prfB, peptide chain release factor 2; Validated.	0
NZ_LS483301.1|WP_000538141.1|829825_830476_+|HD-domain-containing-protein	gnl|CDD|378993	pfam12917, HD_2, HD containing hydrolase-like enzyme. This is a family of bacterial and archaeal hydrolases.	6.51021e-58
NZ_LS483301.1|WP_061642028.1|823461_824034_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA	gnl|CDD|224461	COG1544, COG1544, Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	6.2536e-37
NZ_LS483301.1|WP_000006551.1|844035_844980_+|DNA-binding-protein-WhiA	gnl|CDD|273194	TIGR00647, DNA_bind_WhiA, DNA-binding protein WhiA. This family describes a DNA-binding protein widely conserved in Gram-positive bacteria, and occasionally occurring elsewhere, such as in Thermotoga. It is associated with cell division, and in sporulating organisms with sporulation. [Cellular processes, Cell division].	7.40812e-153
NZ_LS483301.1|WP_000749380.1|828812_829652_+|CHAP-domain-containing-protein	gnl|CDD|226451	COG3942, COG3942, Surface antigen [General function prediction only].	2.23913e-42
NZ_LS483301.1|WP_001248939.1|842930_843926_+|YvcK-family-protein	gnl|CDD|211689	TIGR01826, Putative_gluconeogenesis_factor, conserved hypothetical protein, cofD-related. This model represents a subfamily of conserved hypothetical proteins that forms a sister group to the family of CofD, (TIGR01819), LPPG:Fo 2-phospho-L-lactate transferase, an enzyme of cytochrome F420 biosynthesis. Both this family and TIGR01819 are within the scope of the pfam01933. [Hypothetical proteins, Conserved].	5.06652e-172
NZ_LS483301.1|WP_001049165.1|845552_846140_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP	gnl|CDD|178955	PRK00277, clpP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit; Reviewed.	4.59321e-148
NZ_LS483301.1|WP_001224793.1|838208_838694_+|acetyltransferase	gnl|CDD|100053	cd04647, LbH_MAT_like, Maltose O-acyltransferase (MAT)-like: This family is composed of maltose O-acetyltransferase, galactoside O-acetyltransferase (GAT), xenobiotic acyltransferase (XAT) and similar proteins. MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively while GAT specifically acetylates galactopyranosides. XAT catalyzes the CoA-dependent acetylation of a variety of hydroxyl-bearing acceptors such as chloramphenicol and streptogramin, among others. XATs are implicated in inactivating xenobiotics leading to xenobiotic resistance in patients. Members of this family contain a a left-handed parallel beta-helix (LbH) domain with at least 5 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X). They are trimeric in their active form.	4.85181e-30
NZ_LS483301.1|WP_000638419.1|830472_830709_+|CsbA-family-protein	gnl|CDD|227234	COG4897, CsbA, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	4.73465e-34
NZ_LS483301.1|WP_000662681.1|832970_835817_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	gnl|CDD|234734	PRK00349, uvrA, excinuclease ABC subunit UvrA.	0
NZ_LS483301.1|WP_000057551.1|838701_840141_+|tetratricopeptide-repeat-protein	gnl|CDD|276808	sd00008, TPR_YbbN, C-terminal Tetratricopeptide repeat (TPR) region of YbbN and similar motifs. The Tetratricopeptide repeat (TPR) typically contains 34 amino acids and is found in a variety of organisms including bacteria, cyanobacteria, yeast, fungi, plants, and humans. It is present in a variety of proteins including those involved in chaperone, cell-cycle, transcription, and protein transport complexes. YbbN is a thioredoxin-like protein containing two tandem TPR repeats at the C-terminus, separated by two alpha helices. Its N-terminal thioredoxin-like domain is not a functional oxidoreductase. It functions in heat stress response and DNA synthesis as a chaperone or co-chaperone.	4.28078e-06

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_000662681.1|832970_835817_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA
MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK
>NZ_LS483301.1|WP_000229253.1|830977_832963_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB
MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG
>NZ_LS483301.1|WP_000638419.1|830472_830709_+|CsbA-family-protein
MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR
>NZ_LS483301.1|WP_000538141.1|829825_830476_+|HD-domain-containing-protein
MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE
>NZ_LS483301.1|WP_000749380.1|828812_829652_+|CHAP-domain-containing-protein
MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVTKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH
>NZ_LS483301.1|WP_001790093.1|828557_828665_+|hypothetical-protein
MCLLKQHMQCAFSNITYGDFQGIELIIENVLNYMV
>NZ_LS483301.1|WP_010956549.1|827293_828404_+|peptide-chain-release-factor-2
MELSEIKRNIDKYNQDLTQIRGSLDLENKETNIQEYEEMMAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD
>NZ_LS483301.1|WP_001790092.1|827020_827125_+|hypothetical-protein
MLWEESFYFTSVKYFKKCEEVVKRCYVLSFKKSV
>NZ_LS483301.1|WP_000506531.1|824447_826979_+|preprotein-translocase-subunit-SecA
MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK
>NZ_LS483301.1|WP_061642028.1|823461_824034_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA
MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVLNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ
>NZ_LS483301.1|WP_000958224.1|836423_837356_+|HPr-kinase/phosphorylase
MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE
>NZ_LS483301.1|WP_000513308.1|837361_838201_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase
MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGSVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK
>NZ_LS483301.1|WP_001224793.1|838208_838694_+|acetyltransferase
MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR
>NZ_LS483301.1|WP_000057551.1|838701_840141_+|tetratricopeptide-repeat-protein
MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDMEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDVMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI
>NZ_LS483301.1|WP_000134963.1|840207_841143_+|thioredoxin-disulfide-reductase
MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA
>NZ_LS483301.1|WP_001587544.1|842022_842934_+|RNase-adapter-RapZ
MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFSPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK
>NZ_LS483301.1|WP_001248939.1|842930_843926_+|YvcK-family-protein
MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK
>NZ_LS483301.1|WP_000006551.1|844035_844980_+|DNA-binding-protein-WhiA
MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL
>NZ_LS483301.1|WP_001049165.1|845552_846140_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP
MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK
>NZ_LS483301.1|WP_000816295.1|846382_847285_-|TIGR01777-family-protein
MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKALFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE

Crispr_ID: NZ_LS483301_5

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_5
• CRISPR_location: 841505-841590
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_5

Consensus_repeat	Method
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483301_5

>5.1|841535|26|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder
CCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_5

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_5

>merge|NZ_LS483301|5|841505-841590|CRISPRCasFinder
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT

>NZ_LS483301|5|5|841505-841590|CRISPRCasFinder
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT	CCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_000513308.1|837361_838201_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|183527
NZ_LS483301.1|WP_000538141.1|829825_830476_+|HD-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378993
NZ_LS483301.1|WP_000816295.1|846382_847285_-|TIGR01777-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224015
NZ_LS483301.1|WP_000070826.1|847987_848617_+|DUF4887-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|234750
NZ_LS483301.1|WP_000958224.1|836423_837356_+|HPr-kinase/phosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|235459
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NZ_LS483301.1|WP_001224793.1|838208_838694_+|acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|100053
NZ_LS483301.1|WP_000638419.1|830472_830709_+|CsbA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227234
NZ_LS483301.1|WP_000279414.1|850442_851453_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|273675
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rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_000513308.1|837361_838201_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	gnl|CDD|183527	PRK12437, PRK12437, prolipoprotein diacylglyceryl transferase; Reviewed.	1.39921e-119
NZ_LS483301.1|WP_000538141.1|829825_830476_+|HD-domain-containing-protein	gnl|CDD|378993	pfam12917, HD_2, HD containing hydrolase-like enzyme. This is a family of bacterial and archaeal hydrolases.	6.51021e-58
NZ_LS483301.1|WP_000816295.1|846382_847285_-|TIGR01777-family-protein	gnl|CDD|224015	COG1090, COG1090, Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase [General function prediction only].	4.94096e-153
NZ_LS483301.1|WP_000070826.1|847987_848617_+|DUF4887-domain-containing-protein	gnl|CDD|234750	PRK00409, PRK00409, recombination and DNA strand exchange inhibitor protein; Reviewed.	5.85535e-05
NZ_LS483301.1|WP_000958224.1|836423_837356_+|HPr-kinase/phosphorylase	gnl|CDD|235459	PRK05428, PRK05428, HPr kinase/phosphorylase; Provisional.	1.22623e-170
NZ_LS483301.1|WP_000654030.1|849376_850390_+|sugar-binding-transcriptional-regulator	gnl|CDD|225263	COG2390, DeoR, Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain [Transcription].	1.39665e-92
NZ_LS483301.1|WP_001260089.1|852903_853665_+|triose-phosphate-isomerase	gnl|CDD|234589	PRK00042, tpiA, triosephosphate isomerase; Provisional.	2.84083e-146
NZ_LS483301.1|WP_001587544.1|842022_842934_+|RNase-adapter-RapZ	gnl|CDD|224574	COG1660, COG1660, Predicted P-loop-containing kinase [General function prediction only].	1.27584e-168
NZ_LS483301.1|WP_001074749.1|851591_852782_+|phosphoglycerate-kinase	gnl|CDD|234613	PRK00073, pgk, phosphoglycerate kinase; Provisional.	0
NZ_LS483301.1|WP_000229253.1|830977_832963_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB	gnl|CDD|235395	PRK05298, PRK05298, excinuclease ABC subunit UvrB.	0
NZ_LS483301.1|WP_000057551.1|838701_840141_+|tetratricopeptide-repeat-protein	gnl|CDD|276808	sd00008, TPR_YbbN, C-terminal Tetratricopeptide repeat (TPR) region of YbbN and similar motifs. The Tetratricopeptide repeat (TPR) typically contains 34 amino acids and is found in a variety of organisms including bacteria, cyanobacteria, yeast, fungi, plants, and humans. It is present in a variety of proteins including those involved in chaperone, cell-cycle, transcription, and protein transport complexes. YbbN is a thioredoxin-like protein containing two tandem TPR repeats at the C-terminus, separated by two alpha helices. Its N-terminal thioredoxin-like domain is not a functional oxidoreductase. It functions in heat stress response and DNA synthesis as a chaperone or co-chaperone.	4.28078e-06
NZ_LS483301.1|WP_000134963.1|840207_841143_+|thioredoxin-disulfide-reductase	gnl|CDD|273540	TIGR01292, Thioredoxin_reductase, thioredoxin-disulfide reductase. This model describes thioredoxin-disulfide reductase, a member of the pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases (pfam00070). [Energy metabolism, Electron transport].	4.19425e-154
NZ_LS483301.1|WP_000006551.1|844035_844980_+|DNA-binding-protein-WhiA	gnl|CDD|273194	TIGR00647, DNA_bind_WhiA, DNA-binding protein WhiA. This family describes a DNA-binding protein widely conserved in Gram-positive bacteria, and occasionally occurring elsewhere, such as in Thermotoga. It is associated with cell division, and in sporulating organisms with sporulation. [Cellular processes, Cell division].	7.40812e-153
NZ_LS483301.1|WP_000749380.1|828812_829652_+|CHAP-domain-containing-protein	gnl|CDD|226451	COG3942, COG3942, Surface antigen [General function prediction only].	2.23913e-42
NZ_LS483301.1|WP_001248939.1|842930_843926_+|YvcK-family-protein	gnl|CDD|211689	TIGR01826, Putative_gluconeogenesis_factor, conserved hypothetical protein, cofD-related. This model represents a subfamily of conserved hypothetical proteins that forms a sister group to the family of CofD, (TIGR01819), LPPG:Fo 2-phospho-L-lactate transferase, an enzyme of cytochrome F420 biosynthesis. Both this family and TIGR01819 are within the scope of the pfam01933. [Hypothetical proteins, Conserved].	5.06652e-172
NZ_LS483301.1|WP_001049165.1|845552_846140_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP	gnl|CDD|178955	PRK00277, clpP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit; Reviewed.	4.59321e-148
NZ_LS483301.1|WP_001224793.1|838208_838694_+|acetyltransferase	gnl|CDD|100053	cd04647, LbH_MAT_like, Maltose O-acyltransferase (MAT)-like: This family is composed of maltose O-acetyltransferase, galactoside O-acetyltransferase (GAT), xenobiotic acyltransferase (XAT) and similar proteins. MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively while GAT specifically acetylates galactopyranosides. XAT catalyzes the CoA-dependent acetylation of a variety of hydroxyl-bearing acceptors such as chloramphenicol and streptogramin, among others. XATs are implicated in inactivating xenobiotics leading to xenobiotic resistance in patients. Members of this family contain a a left-handed parallel beta-helix (LbH) domain with at least 5 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X). They are trimeric in their active form.	4.85181e-30
NZ_LS483301.1|WP_000638419.1|830472_830709_+|CsbA-family-protein	gnl|CDD|227234	COG4897, CsbA, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	4.73465e-34
NZ_LS483301.1|WP_000279414.1|850442_851453_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase	gnl|CDD|273675	TIGR01534, Glyceraldehyde-3-phosphate_dehydrogenase, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I. This model represents glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), the enzyme responsible for the interconversion of 1,3-diphosphoglycerate and glyceraldehyde-3-phosphate, a central step in glycolysis and gluconeogenesis. Forms exist which utilize NAD (EC 1.2.1.12), NADP (EC 1.2.1.13) or either (1.2.1.59). In some species, NAD- and NADP- utilizing forms exist, generally being responsible for reactions in the anabolic and catabolic directions respectively. Two Pfam models cover the two functional domains of this protein; pfam00044 represents the N-terminal NAD(P)-binding domain and pfam02800 represents the C-terminal catalytic domain. An additional form of gap gene is found in gamma proteobacteria and is responsible for the conversion of erythrose-4-phosphate (E4P) to 4-phospho-erythronate in the biosynthesis of pyridoxine. This pathway of pyridoxine biosynthesis appears to be limited, however, to a relatively small number of bacterial species although it is prevalent among the gamma-proteobacteria. This enzyme is described by TIGR001532. These sequences generally score between trusted and noise to this GAPDH model due to the close evolutionary relationship. There exists the possiblity that some forms of GAPDH may be bifunctional and act on E4P in species which make pyridoxine and via hydroxythreonine and lack a separate E4PDH enzyme (for instance, the GAPDH from Bacillus stearothermophilus has been shown to posess a limited E4PD activity as well as a robust GAPDH activity). There are a great number of sequences in the databases which score between trusted and noise to this model, nearly all of them due to fragmentary sequences. It seems that study of this gene has been carried out in many species utilizing PCR probes which exclude the extreme ends of the consenses used to define this model. The noise level is set relative not to E4PD, but the next closest outliers, the class II GAPDH's (found in archaea, TIGR01546) and aspartate semialdehyde dehydrogenase (ASADH, TIGR01296) both of which have highest-scoring hits around -225 to the prior model. [Energy metabolism, Glycolysis/gluconeogenesis].	0
NZ_LS483301.1|WP_000662681.1|832970_835817_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	gnl|CDD|234734	PRK00349, uvrA, excinuclease ABC subunit UvrA.	0

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_000134963.1|840207_841143_+|thioredoxin-disulfide-reductase
MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA
>NZ_LS483301.1|WP_000057551.1|838701_840141_+|tetratricopeptide-repeat-protein
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>NZ_LS483301.1|WP_000513308.1|837361_838201_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase
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>NZ_LS483301.1|WP_000958224.1|836423_837356_+|HPr-kinase/phosphorylase
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>NZ_LS483301.1|WP_000662681.1|832970_835817_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA
MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK
>NZ_LS483301.1|WP_000229253.1|830977_832963_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB
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>NZ_LS483301.1|WP_000538141.1|829825_830476_+|HD-domain-containing-protein
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MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVTKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH
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>NZ_LS483301.1|WP_000654030.1|849376_850390_+|sugar-binding-transcriptional-regulator
MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE
>NZ_LS483301.1|WP_000279414.1|850442_851453_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase
MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK
>NZ_LS483301.1|WP_001074749.1|851591_852782_+|phosphoglycerate-kinase
MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK
>NZ_LS483301.1|WP_001260089.1|852903_853665_+|triose-phosphate-isomerase
MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK

Crispr_ID: NZ_LS483301_6

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_6
• CRISPR_location: 886110-886191
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_6

Consensus_repeat	Method
CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483301_6

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ATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_6

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_6

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CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA

>NZ_LS483301|6|6|886110-886191|CRISPRCasFinder
CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA	ATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT
CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_000255561.1|879867_880485_-|amino-acid-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224198
NZ_LS483301.1|WP_000932216.1|885127_886006_+|DUF1963-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226395
NZ_LS483301.1|WP_000589549.1|884054_884411_+|arsenate-reductase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239334
NZ_LS483301.1|WP_000290485.1|884568_884949_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH	unknown	unknown	gnl|CDD|234918
NZ_LS483301.1|WP_000571218.1|887672_888698_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224058
NZ_LS483301.1|WP_000974460.1|881532_881955_-|organic-hydroperoxide-resistance-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274649
NZ_LS483301.1|WP_000520233.1|888690_889386_+|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224922
NZ_LS483301.1|WP_000195429.1|892161_893334_-|IS256-like-element-IS256-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|307151
NZ_LS483301.1|WP_001183858.1|891005_891857_-|DUF368-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224946
NZ_LS483301.1|WP_000422909.1|882901_883441_+|nitroreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|380312
NZ_LS483301.1|WP_001018962.1|886747_887134_+|topiosmerase	unknown	unknown	gnl|CDD|224572
NZ_LS483301.1|WP_001065801.1|887126_887423_+|thioredoxin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239245
NZ_LS483301.1|WP_000752917.1|890578_890773_+|CsbD-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225777
NZ_LS483301.1|WP_000150017.1|882102_882819_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|184156
NZ_LS483301.1|WP_000732326.1|889403_890225_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224381
NZ_LS483301.1|WP_001190694.1|883590_883911_-|thioredoxin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239245
NZ_LS483301.1|WP_000205572.1|894375_895683_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD	unknown	unknown	gnl|CDD|223791
NZ_LS483301.1|WP_000168845.1|893516_894278_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC	unknown	unknown	gnl|CDD|223473
NZ_LS483301.1|WP_001140686.1|879213_879795_+|histidine-phosphatase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223483
NZ_LS483301.1|WP_000569884.1|880639_881134_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|372596

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_000255561.1|879867_880485_-|amino-acid-transporter	gnl|CDD|224198	COG1279, COG1279, Lysine efflux permease [General function prediction only].	9.12336e-62
NZ_LS483301.1|WP_000932216.1|885127_886006_+|DUF1963-domain-containing-protein	gnl|CDD|226395	COG3878, COG3878, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	1.16579e-75
NZ_LS483301.1|WP_000589549.1|884054_884411_+|arsenate-reductase-family-protein	gnl|CDD|239334	cd03036, ArsC_like, Arsenate Reductase (ArsC) family, unknown subfamily; uncharacterized proteins containing a CXXC motif with similarity to thioredoxin (TRX)-fold arsenic reductases, ArsC. Proteins containing a redox active CXXC motif like TRX and glutaredoxin (GRX) function as protein disulfide oxidoreductases, altering the redox state of target proteins via the reversible oxidation of the active site dithiol. ArsC catalyzes the reduction of arsenate [As(V)] to arsenite [As(III)], using reducing equivalents derived from glutathione via GRX, through a single catalytic cysteine.	1.06191e-56
NZ_LS483301.1|WP_000290485.1|884568_884949_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH	gnl|CDD|234918	PRK01202, PRK01202, glycine cleavage system protein GcvH.	2.81086e-68
NZ_LS483301.1|WP_000571218.1|887672_888698_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224058	COG1135, AbcC, ABC-type metal ion transport system, ATPase component [Inorganic ion transport and metabolism].	3.37873e-170
NZ_LS483301.1|WP_000974460.1|881532_881955_-|organic-hydroperoxide-resistance-protein	gnl|CDD|274649	TIGR03561, organ_hyd_perox, peroxiredoxin, Ohr subfamily. pfam02566, OsmC-like protein, contains several deeply split clades of homologous proteins. The clade modeled here includes the protein Ohr, or organic hydroperoxide resistance protein. [Cellular processes, Detoxification].	5.58225e-61
NZ_LS483301.1|WP_000520233.1|888690_889386_+|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|224922	COG2011, AbcD, ABC-type metal ion transport system, permease component [Inorganic ion transport and metabolism].	9.67625e-100
NZ_LS483301.1|WP_000195429.1|892161_893334_-|IS256-like-element-IS256-family-transposase	gnl|CDD|307151	pfam00872, Transposase_mut, Transposase, Mutator family.	0
NZ_LS483301.1|WP_001183858.1|891005_891857_-|DUF368-domain-containing-protein	gnl|CDD|224946	COG2035, COG2035, Predicted membrane protein [Function unknown].	4.58436e-76
NZ_LS483301.1|WP_000422909.1|882901_883441_+|nitroreductase	gnl|CDD|380312	cd02135, YdjA-like, nitroreductase family protein similar to Escherichia coli YdjA. A subfamily of the nitroreductase family containing uncharacterized proteins that are similar to nitroreductase YdjA from Escherichia coli. Nitroreductase catalyzes the reduction of nitroaromatic compounds such as nitrotoluenes, nitrofurans and nitroimidazoles. This process requires NAD(P)H as electron donor in an obligatory two-electron transfer and uses FMN as cofactor. The enzyme is typically a homodimer. Members of this family are also called NADH dehydrogenase, oxygen-insensitive NAD(P)H nitrogenase or dihydropteridine reductase.	1.47647e-49
NZ_LS483301.1|WP_001018962.1|886747_887134_+|topiosmerase	gnl|CDD|224572	COG1658, COG1658, Small primase-like proteins (Toprim domain) [DNA replication, recombination, and repair].	2.45102e-36
NZ_LS483301.1|WP_001065801.1|887126_887423_+|thioredoxin-family-protein	gnl|CDD|239245	cd02947, TRX_family, TRX family; composed of two groups: Group I, which includes proteins that exclusively encode a TRX domain; and Group II, which are composed of fusion proteins of TRX and additional domains. Group I TRX is a small ancient protein that alter the redox state of target proteins via the reversible oxidation of an active site dithiol, present in a CXXC motif, partially exposed at the protein's surface. TRX reduces protein disulfide bonds, resulting in a disulfide bond at its active site. Oxidized TRX is converted to the active form by TRX reductase, using reducing equivalents derived from either NADPH or ferredoxins. By altering their redox state, TRX regulates the functions of at least 30 target proteins, some of which are enzymes and transcription factors. It also plays an important role in the defense against oxidative stress by directly reducing hydrogen peroxide and certain radicals, and by serving as a reductant for peroxiredoxins. At least two major types of functional TRXs have been reported in most organisms; in eukaryotes, they are located in the cytoplasm and the mitochondria. Higher plants contain more types (at least 20 TRX genes have been detected in the genome of Arabidopsis thaliana), two of which (types f amd m) are located in the same compartment, the chloroplast. Also included in the alignment are TRX-like domains which show sequence homology to TRX but do not contain the redox active CXXC motif. Group II proteins, in addition to either a redox active TRX or a TRX-like domain, also contain additional domains, which may or may not possess homology to known proteins.	7.01368e-14
NZ_LS483301.1|WP_000752917.1|890578_890773_+|CsbD-family-protein	gnl|CDD|225777	COG3237, COG3237, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	5.95583e-07
NZ_LS483301.1|WP_000150017.1|882102_882819_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase	gnl|CDD|184156	PRK13575, PRK13575, type I 3-dehydroquinate dehydratase.	1.26721e-148
NZ_LS483301.1|WP_000732326.1|889403_890225_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|224381	COG1464, NlpA, ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen [Inorganic ion transport and metabolism].	2.15951e-112
NZ_LS483301.1|WP_001190694.1|883590_883911_-|thioredoxin-family-protein	gnl|CDD|239245	cd02947, TRX_family, TRX family; composed of two groups: Group I, which includes proteins that exclusively encode a TRX domain; and Group II, which are composed of fusion proteins of TRX and additional domains. Group I TRX is a small ancient protein that alter the redox state of target proteins via the reversible oxidation of an active site dithiol, present in a CXXC motif, partially exposed at the protein's surface. TRX reduces protein disulfide bonds, resulting in a disulfide bond at its active site. Oxidized TRX is converted to the active form by TRX reductase, using reducing equivalents derived from either NADPH or ferredoxins. By altering their redox state, TRX regulates the functions of at least 30 target proteins, some of which are enzymes and transcription factors. It also plays an important role in the defense against oxidative stress by directly reducing hydrogen peroxide and certain radicals, and by serving as a reductant for peroxiredoxins. At least two major types of functional TRXs have been reported in most organisms; in eukaryotes, they are located in the cytoplasm and the mitochondria. Higher plants contain more types (at least 20 TRX genes have been detected in the genome of Arabidopsis thaliana), two of which (types f amd m) are located in the same compartment, the chloroplast. Also included in the alignment are TRX-like domains which show sequence homology to TRX but do not contain the redox active CXXC motif. Group II proteins, in addition to either a redox active TRX or a TRX-like domain, also contain additional domains, which may or may not possess homology to known proteins.	2.53615e-24
NZ_LS483301.1|WP_000205572.1|894375_895683_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD	gnl|CDD|223791	COG0719, SufB, Cysteine desulfurase activator SufB [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	8.11734e-136
NZ_LS483301.1|WP_000168845.1|893516_894278_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC	gnl|CDD|223473	COG0396, sufC, Cysteine desulfurase activator ATPase [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	1.29081e-150
NZ_LS483301.1|WP_001140686.1|879213_879795_+|histidine-phosphatase-family-protein	gnl|CDD|223483	COG0406, phoE, Broad specificity phosphatase PhoE and related phosphatases [General function prediction only].	1.48911e-47
NZ_LS483301.1|WP_000569884.1|880639_881134_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	gnl|CDD|372596	pfam13420, Acetyltransf_4, Acetyltransferase (GNAT) domain.	2.53639e-47

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_000932216.1|885127_886006_+|DUF1963-domain-containing-protein
MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS
>NZ_LS483301.1|WP_000290485.1|884568_884949_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH
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MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA
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>NZ_LS483301.1|WP_000150017.1|882102_882819_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase
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>NZ_LS483301.1|WP_000569884.1|880639_881134_-|GNAT-family-N-acetyltransferase
MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK
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>NZ_LS483301.1|WP_001140686.1|879213_879795_+|histidine-phosphatase-family-protein
MAKTLYIMRHGQTLFNFKGLIQGFGDSPLTELGIAQAQKARSYYETKGINFDLYASSTQERASDTLENVAPNQSYQRFKGLKEWHFGIFEGESVYLFDNLYKPEDLFGDRIVPFKGEARQQVEERIVKTLHDIMSQTKNNALVVSHGTIMGVFLRYCLKLDEALKHNIGNCNILKFEYDNGTFKFVELIDPNL
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>NZ_LS483301.1|WP_001065801.1|887126_887423_+|thioredoxin-family-protein
MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK
>NZ_LS483301.1|WP_000571218.1|887672_888698_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein
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>NZ_LS483301.1|WP_000520233.1|888690_889386_+|ABC-transporter-permease
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>NZ_LS483301.1|WP_000732326.1|889403_890225_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK
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MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE
>NZ_LS483301.1|WP_001183858.1|891005_891857_-|DUF368-domain-containing-protein
MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTSLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE
>NZ_LS483301.1|WP_000195429.1|892161_893334_-|IS256-like-element-IS256-family-transposase
MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK
>NZ_LS483301.1|WP_000168845.1|893516_894278_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC
MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE
>NZ_LS483301.1|WP_000205572.1|894375_895683_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD
MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK

Crispr_ID: NZ_LS483301_7

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_7
• CRISPR_location: 1072507-1072594
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_7

Consensus_repeat	Method
CCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483301_7

>7.1|1072532|38|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder
AAGGAGAGGGATACATGCGCCGAGCACATGCATAAAAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_7

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_7

>merge|NZ_LS483301|7|1072507-1072594|CRISPRCasFinder
CCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGGAAGGAGAGGGATACATGCGCCGAGCACATGCATAAAATCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG

>NZ_LS483301|7|7|1072507-1072594|CRISPRCasFinder
CCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG	AAGGAGAGGGATACATGCGCCGAGCACATGCATAAAAT
CCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_000033477.1|1071444_1072020_-|ECF-transporter-S-component	unknown	unknown	gnl|CDD|227065
NZ_LS483301.1|WP_000921968.1|1070029_1071430_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|213192
NZ_LS483301.1|WP_000709290.1|1066218_1067697_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|234854
NZ_LS483301.1|WP_000514290.1|1081696_1082359_+|TrkA-family-potassium-uptake-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223643
NZ_LS483301.1|WP_000238664.1|1065637_1066204_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223376
NZ_LS483301.1|WP_015581815.1|1060297_1060969_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-I	unknown	unknown	gnl|CDD|235140
NZ_LS483301.1|WP_000040054.1|1076800_1078519_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|224006
NZ_LS483301.1|WP_000273253.1|1069230_1070037_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT	unknown	unknown	gnl|CDD|223692
NZ_LS483301.1|WP_000638456.1|1080544_1081564_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II	unknown	unknown	gnl|CDD|224213
NZ_LS483301.1|WP_001289614.1|1078755_1078989_-|glutaredoxin-like-protein-NrdH	unknown	unknown	gnl|CDD|239274
NZ_LS483301.1|WP_000030812.1|1064606_1065635_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|235439
NZ_LS483301.1|WP_015581816.1|1067718_1068966_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|237507
NZ_LS483301.1|WP_000483713.1|1063129_1064614_+|amidophosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|235984
NZ_LS483301.1|WP_000685079.1|1074609_1075782_+|class-I-SAM-dependent-rRNA-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|224017
NZ_LS483301.1|WP_000437472.1|1076531_1076798_+|phosphocarrier-protein-HPr	unknown	unknown	gnl|CDD|237503
NZ_LS483301.1|WP_000505965.1|1075835_1076378_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368297
NZ_LS483301.1|WP_000009069.1|1072889_1074185_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000381849.1|1079186_1080548_+|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I	unknown	unknown	gnl|CDD|376587
NZ_LS483301.1|WP_000032727.1|1060961_1063151_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL	unknown	unknown	gnl|CDD|234921
NZ_LS483301.1|WP_000064214.1|1072603_1072738_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_000033477.1|1071444_1072020_-|ECF-transporter-S-component	gnl|CDD|227065	COG4721, COG4721, ABC-type cobalt transport system, predicted permease component [Inorganic ion transport and metabolism].	4.34592e-70
NZ_LS483301.1|WP_000921968.1|1070029_1071430_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|213192	cd03225, ABC_cobalt_CbiO_domain1, First domain of the ATP-binding cassette component of cobalt transport system. Domain I of the ABC component of a cobalt transport family found in bacteria, archaea, and eukaryota. The transition metal cobalt is an essential component of many enzymes and must be transported into cells in appropriate amounts when needed. This ABC transport system of the CbiMNQO family is involved in cobalt transport in association with the cobalamin (vitamin B12) biosynthetic pathways. Most of cobalt (Cbi) transport systems possess a separate CbiN component, the cobalt-binding periplasmic protein, and they are encoded by the conserved gene cluster cbiMNQO. Both the CbiM and CbiQ proteins are integral cytoplasmic membrane proteins, and the CbiO protein has the linker peptide and the Walker A and B motifs commonly found in the ATPase components of the ABC-type transport systems.	1.67975e-64
NZ_LS483301.1|WP_000709290.1|1066218_1067697_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase	gnl|CDD|234854	PRK00881, purH, bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase; Provisional.	0
NZ_LS483301.1|WP_000514290.1|1081696_1082359_+|TrkA-family-potassium-uptake-protein	gnl|CDD|223643	COG0569, TrkA, K+ transport systems, NAD-binding component [Inorganic ion transport and metabolism].	4.35421e-66
NZ_LS483301.1|WP_000238664.1|1065637_1066204_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase	gnl|CDD|223376	COG0299, PurN, Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN [Nucleotide transport and metabolism].	7.23817e-92
NZ_LS483301.1|WP_015581815.1|1060297_1060969_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-I	gnl|CDD|235140	PRK03619, PRK03619, phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ.	8.23688e-141
NZ_LS483301.1|WP_000273253.1|1069230_1070037_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT	gnl|CDD|223692	COG0619, CbiQ, ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters [Inorganic ion transport and metabolism].	7.39205e-29
NZ_LS483301.1|WP_000638456.1|1080544_1081564_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II	gnl|CDD|224213	COG1294, AppB, Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2 [Energy production and conversion].	6.42118e-76
NZ_LS483301.1|WP_001289614.1|1078755_1078989_-|glutaredoxin-like-protein-NrdH	gnl|CDD|239274	cd02976, NrdH, NrdH-redoxin (NrdH) family; NrdH is a small monomeric protein with a conserved redox active CXXC motif within a TRX fold, characterized by a glutaredoxin (GRX)-like sequence and TRX-like activity profile. In vitro, it displays protein disulfide reductase activity that is dependent on TRX reductase, not glutathione (GSH). It is part of the NrdHIEF operon, where NrdEF codes for class Ib ribonucleotide reductase (RNR-Ib), an efficient enzyme at low oxygen levels. Under these conditions when GSH is mostly conjugated to spermidine, NrdH can still function and act as a hydrogen donor for RNR-Ib. It has been suggested that the NrdHEF system may be the oldest RNR reducing system, capable of functioning in a microaerophilic environment, where GSH was not yet available. NrdH from Corynebacterium ammoniagenes can form domain-swapped dimers, although it is unknown if this happens in vivo. Domain-swapped dimerization, which results in the blocking of the TRX reductase binding site, could be a mechanism for regulating the oxidation state of the protein.	5.00495e-16
NZ_LS483301.1|WP_000030812.1|1064606_1065635_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase	gnl|CDD|235439	PRK05385, PRK05385, phosphoribosylaminoimidazole synthetase; Provisional.	0
NZ_LS483301.1|WP_015581816.1|1067718_1068966_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase	gnl|CDD|237507	PRK13790, PRK13790, phosphoribosylamine--glycine ligase; Provisional.	0
NZ_LS483301.1|WP_000483713.1|1063129_1064614_+|amidophosphoribosyltransferase	gnl|CDD|235984	PRK07272, PRK07272, amidophosphoribosyltransferase; Provisional.	0
NZ_LS483301.1|WP_000685079.1|1074609_1075782_+|class-I-SAM-dependent-rRNA-methyltransferase	gnl|CDD|224017	COG1092, COG1092, Predicted SAM-dependent methyltransferases [General function prediction only].	5.6543e-145
NZ_LS483301.1|WP_000040054.1|1076800_1078519_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase	gnl|CDD|224006	COG1080, PtsA, Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria) [Carbohydrate transport and metabolism].	0
NZ_LS483301.1|WP_000505965.1|1075835_1076378_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|368297	pfam05128, DUF697, Domain of unknown function (DUF697). Family of bacterial hypothetical proteins that is sometimes associated with GTPase domains.	0.00779365
NZ_LS483301.1|WP_000381849.1|1079186_1080548_+|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I	gnl|CDD|376587	pfam01654, Cyt_bd_oxida_I, Cytochrome bd terminal oxidase subunit I. This family are the alternative oxidases found in many bacteria which oxidize ubiquinol and reduce oxygen as part of the electron transport chain. This family is the subunit I of the oxidase E. coli has two copies of the oxidase, bo and bd', both of which are represented here In some nitrogen fixing bacteria, e.g. Klebsiella pneumoniae this oxidase is responsible for removing oxygen in microaerobic conditions, making the oxidase required for nitrogen fixation. This subunit binds a single b-haem, through ligands at His186 and Met393 (using SW:P11026 numbering). In addition His19 is a ligand for the haem b found in subunit II.	2.48829e-165
NZ_LS483301.1|WP_000032727.1|1060961_1063151_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL	gnl|CDD|234921	PRK01213, PRK01213, phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL.	0
NZ_LS483301.1|WP_000437472.1|1076531_1076798_+|phosphocarrier-protein-HPr	gnl|CDD|237503	PRK13780, PRK13780, phosphocarrier protein HPr; Provisional.	2.44795e-51

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_000033477.1|1071444_1072020_-|ECF-transporter-S-component
MSKGLKLSEILVTVLISVVFAVIYNLWWFVYNGVQATGLHLEQLTNGVWFMAAIVCYLIIPKPGIALLAEFAAGAGETIIMGRFDIPTIVYAFIQGLACELVFAIFKYQSRSVMVAMLAGFCTAIAAFPIDYFYGYLNEVAGWNLTLFIVFRLISGAVVAGVLSYLLVKALDKTGVTKLFRPAAKEDYDNL
>NZ_LS483301.1|WP_000921968.1|1070029_1071430_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein
MLKVSDLRLKYPSGQRKIFDHLNITIQDKEKVLLLGPSGCGKSTLLNVLSGIVPNLIELPMKYDELIVDPLSGVIFQDPDSQFCMPKVYEELAFVLENRQLPREDMDALIINALNMVNLNVTPETYIKDLSGGMKQKLAIVETILQQSKTLFLDEPTAMLDVQATEDLWTKLIELWEDQTVVIVEHKVKHIWNHVDRVILMDYNGNIIADECPEIILQKYVHLLSEYGVWHPRAWEFAPSRVDFPTTNSHLLQFKNGRIIRGKSTLLSFSDLEIGLGEWITITGANGSGKTTLLESIMQLIKYQGDVYFENQRLTKIKHAAKHMYLVYQNPELQFITNSVYDEINIHFNHLSKDQSDDETIQLLKLLDLQNVKDQHPYELSIGQKRRLSVATALSSKADIIFLDEPTFGLDSHNTFQLIKLFQKRINLGQSIVMVTHDDEIIERYPSRRLKISDGALLDCDGDTNV
>NZ_LS483301.1|WP_000273253.1|1069230_1070037_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT
MYEQWKVRQSFVDDVNIITKLFLGIILFFFIIFVHNFDFMLYITILMLVFLLMFNGTQFKITAIFITISIGFALLSSLFMILYGNGSHTILKFGFIHITTESLVRGLHVSLRTIAISFFGILIALTSQVVMIFYSLMQHLKVKSKVAYAFMAAIRMIPLMISSLIQLRRSLKMRYQMIDAANYRGLKRFKHLIIPLLSQNIRKAHQLSVAMESKGFRDGPRTYYYNVPFSYKDIIFIIVLIAIITMAYYCSITLPITGIDDVRLGRVG
>NZ_LS483301.1|WP_015581816.1|1067718_1068966_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase
MNVLVIGAGGREHALAYKLNQSNLVKQVFVIPGNEAMTPIAEVHTEISESDHQAILDFAKRQNVDWVVIGSEQPLIDGLADILRANGFKVFGPNKQAAQIEGSKLFAKKIMEKYNIPTADYKEVERKKDALTYIENCELPVVVKKDGLAAGKGVIIADTIEAARSAIEIMYGDEEEGTVVFETFLEGEEFSLMTFVNGDLAVPFDCIAQDHKRAFDHDEGPNTGGMGAYCPVPHISDDVLKLTNETIAQPIAKAMLNEGYQFFGVLYIGAILTKDGPKVIEFNARFGDPEAQVLLSRMESDLMQHIIDLDEGKRTEFKWKNESIVGVMLASKGYPDAYEKGHKVSGFDLNENYFVSGLKKQGDTFVTSGGRVILAIGKGDNVQDAQRDAYKKVSQIQSDHLFYRHDIANKALQLK
>NZ_LS483301.1|WP_000709290.1|1066218_1067697_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase
MKKAILSVSNKTGIVEFAKALTQLNYELYSTGGTKRILDEANVPVRSVSDLTHFPEIMDGRVKTLHPAVHGGILADRNKPQHLNELSEQHIDLIDMVVVNLYPFQQTVANPDVTMDEAIENIDIGGPTMLRAAAKNYKHVTTIVHPADYQEVLTRLRNDSLDESYRQSLMIKVFEHTAEYDEAIVRFFKGDKETLRYGENPQQSAYFVRTSNAKHTIAGAKQLHGKQLSYNNIKDADATLALVKKFDTPATVAVKHMNPCGVGIGDTIEQAFQHAYEADSQSIFGGIVALNRAVTPELAEQLHSIFLEVIIAPKFTDEALDILKQKKNVRLLEIDMTIDSNEEEFVSVSGGYLVQDKDNYVVPKEEMKVVTEVAPTDEQWEAMLLGWKVVPSVKSNAIILSNNKQTVGIGAGQMNRVGAAKIALERAIEINDHVALVSDGFFPMGDTVELAAQHGIKAIIQPGGSIKDQDSIDMANKHGIAMVVTGTRHFKH
>NZ_LS483301.1|WP_000238664.1|1065637_1066204_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase
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>NZ_LS483301.1|WP_000030812.1|1064606_1065635_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase
MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV
>NZ_LS483301.1|WP_000483713.1|1063129_1064614_+|amidophosphoribosyltransferase
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>NZ_LS483301.1|WP_000032727.1|1060961_1063151_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL
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>NZ_LS483301.1|WP_015581815.1|1060297_1060969_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-I
MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKDNNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV
>NZ_LS483301.1|WP_000064214.1|1072603_1072738_-|hypothetical-protein
MSNENQNKKAAEKAKEVEEKLKDKKEEKTEDINQTKQDIQDTLN
>NZ_LS483301.1|WP_000009069.1|1072889_1074185_+|hypothetical-protein
MSFLRKHAEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVIIIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHFMWIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKGNVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFLFTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHGLLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP
>NZ_LS483301.1|WP_000685079.1|1074609_1075782_+|class-I-SAM-dependent-rRNA-methyltransferase
MKIATLNKGKETKYFNGYPLIEEEDIYSQDHLKEGDIFQIVTDKSQYVATAYVGRQHKGLGWVLTYDKAQQINTAFFVKLFNTALAERDYYFNIDGTNAFRLFNAEGDGVGGLTIDNYDGHLLIQWYSKGIYKFKYAILEAVRKVFDYKSIYEKVRFKDSEYSGGFVEGDAPEFPIVIEENFTFYNVDLEDGLMTGIFLDQKEVRKKLRDQYAKERHVLNLFSYTGAFSAIAASEASSTTSVDLANRSRSLTEENFGLNAIDPKSQYIYVMDTFDFYKYAARHGHSYDTIVIDPPSFARNKKRTFSVQKDYDKLINGALNILSSEGTLLLCTNASVYPLKQFKNTIKKTLEESGVDYELTEVMGLPKDFKTHPHYKPSKYLKAVFVNIRH
>NZ_LS483301.1|WP_000505965.1|1075835_1076378_+|hypothetical-protein
MGFKNNLTSNLTNKIGNSVFKIENVDGKGAMPTTIQELRERRQRAEAIVKRKSLMSSTMSVVPIPGLDFGVDLKLMKDIIEDVNKIYGLDHKQVNSLGDDVKERIMSAAAIQGSQFIGKRISNAFLKIVIRDVAKRTAAKQTKWFPVVGQAVSASISYYFMNKIGKDHIQKCENVIKNVM
>NZ_LS483301.1|WP_000437472.1|1076531_1076798_+|phosphocarrier-protein-HPr
MEQNSYVIIDETGIHARPATMLVQTASKFDSDIQLEYNGKKVNLKSIMGVMSLGVGKDAEITIYADGSDESDAIQAISDVLSKEGLTK
>NZ_LS483301.1|WP_000040054.1|1076800_1078519_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase
MSKLIKGIAASDGVAIAKAYLLVEPDLTFDKNEKVTDVEGEVAKFNSAIEASKVELTKIRNNAEVQLGADKAAIFDAHLLVLDDPELIQPIQDKIKNENANAATALTDVTTQFVTIFESMDNEYMKERAADIRDVSKRVLSHILGVELPNPSMIDESVVIVGNDLTPSDTAQLNKEFVQGFATNIGGRTSHSAIMSRSLEIPAIVGTKSITQEVKQGDMIIVDGLNGDVIVNPTEDELIAYQDKRERYFADKKELQKLRDADTVTVDGVHAELAANIGTPNDLPGVIENGAQGIGLYRTEFLYMGRDQMPTEEEQFEAYKEVLEAMGGKRVVVRTLDIGGDKELSYLNLPEEMNPFLGYRAIRLCLAQQDIFRPQLRALLRASVYGKLNIMFPMVATINEFREAKAILLEEKENLKNEGHDISDDIELGIMVEIPATAALADVFAKEVDFFSIGTNDLIQYTLAADRMSERVSYLYQPYNPSILRLVKQVIEASHKEGKWTGMCGEMAGDETAIPLLLGLGLDEFSMSATSILKARRQINGLSKNEMTELANRAVDCATQEEVIELVNNYVK
>NZ_LS483301.1|WP_001289614.1|1078755_1078989_-|glutaredoxin-like-protein-NrdH
MSEIIVYTQNDCPPCTFVKNYLNEHHIDFEERNINNQQYRNEMIDFDAFSTPFILLNGNPMYHVDLDEINKVLNIQD
>NZ_LS483301.1|WP_000381849.1|1079186_1080548_+|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I
MDTVEISRFLTAMTLAVHIIFATIGVGMPLMFAIAEFLGIRKNDLQYIAMAKRWAKAYTITVAVGVVTGTIIGLQLSLIWPTFMEMGGHVIALPLFMETFAFFFEAIFLSIYLYTWDRFKNKWTHFLISIPVIIGGSFSAFFITSVNSFMNTPAGFELKNGKMVNVQPIEAMFNPSFIVRSFHVITTAGMTMAFVIASIAAFKLLRNRQPKDTVYHKKALKMSMIVGFFSTLLSMLAGDLSAKFLHKFQPEKLAAYEWHFDTSSHAKLLLFGVLDEKTQQVKGAIELPGLLSFLADNSVKTKVQGLNDFPKSLHPPMIVHYFFDLMVTMGILCFVISGVYVLTLMFKKLRKFSTHKWMLYGILLTGPASMLAIEFGWFLTEMGRQPWIVRGYMRVAEAATQAGGITFVTILFGILYIILMYTCAYVLIRMFKNKPAYEDVNRLAKKQGGEIEK
>NZ_LS483301.1|WP_000638456.1|1080544_1081564_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II
MIYAFIGITVLWLFLFCYIIIASIDFGAGFFALHSKLTGDEKKINHLISRYLNPVWEVTNVFFVFFFVGFVGFFPESIKYLGTVLLIPGSIALIMISLRNSFYAFENYGQDTKLAWMIMYGVSGLLIPASLSTALTITEGGYINVRNNVIDLDWVQLLLSPFAWSVVFLAIISVLYISSGFLTYYAKKANDEPAYNLTRQWHIFLGPPMIIICLFVFLSLRIQNSEHFYSAVFDYWWMFGISFLFFALASLLTFFKKKHGLAFVFVILQMMFAFFGYGISKLPYLLYPFVKITDAYVNPEMGWTLVIVFILGLLLLLPSLILLLRLFVFDKEYVEGKKS
>NZ_LS483301.1|WP_000514290.1|1081696_1082359_+|TrkA-family-potassium-uptake-protein
MGKEYVVIGLGRFGGSIVRELNALDMDVMAIDHDENRVNEYSDIATHAVVADTTDEAVMKSLGIRNFDHVIVAIGENIQSSTLTTLILKELGVKKVTAKAQNDYHAKILNKIGADTVVHPERDMGRRIAHNVASASVLDYLELADEHSIVELKATEKMAGQSIIDLDIRAQYGINIIAIKRGKEFIISPNPNINLEIGDILIMIGHDNDLNRFEKNIATR

Crispr_ID: NZ_LS483301_8

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_8
• CRISPR_location: 1154159-1154347
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_8

Consensus_repeat	Method
CAACAGACAATGCAAGTTGG	CRT

spacers of NZ_LS483301_8

>8.1|1154179|36|NZ_LS483301|CRT
CGGGGCCCCAACAGAGAGAAATAGGATCACCAATTT
>8.2|1154235|37|NZ_LS483301|CRT
GGTGGGGCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAAGTCAGCA
>8.3|1154292|36|NZ_LS483301|CRT
CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACCCCAATTT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_8

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_8

>merge|NZ_LS483301|8|1154159-1154347|CRT
CAACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACAGAGAGAAATAGGATCACCAATTTCAACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAAGTCAGCATACAAAAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG

>NZ_LS483301|8|1|1154159-1154347|CRT
CAACAGACAATGCAAGTTGG	CGGGGCCCCAACAGAGAGAAATAGGATCACCAATTT
CAACAGACAATGCAAGTTGG	GGTGGGGCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAAGTCAGCA
TACAAAAATGTGCAAGTTGG	CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACCCCAATTT
CTACAGACAATGCAAGTTGG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_000231632.1|1155320_1155554_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000041896.1|1158546_1159263_-|superantigen-like-protein-SSL12	unknown	unknown	gnl|CDD|171995
NZ_LS483301.1|WP_001802045.1|1157765_1157990_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_001032814.1|1154513_1154699_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000669537.1|1153454_1153805_+|complement-inhibitor-SCIN-B	unknown	unknown	gnl|CDD|371594
NZ_LS483301.1|WP_000857483.1|1156030_1156990_-|alpha-hemolysin	unknown	unknown	gnl|CDD|273388
NZ_LS483301.1|WP_000793605.1|1161353_1162355_+|ornithine-carbamoyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|235269
NZ_LS483301.1|WP_000049484.1|1149275_1149779_+|metallophosphoesterase	unknown	unknown	gnl|CDD|223695
NZ_LS483301.1|WP_000739523.1|1160190_1160916_-|superantigen-like-protein-SSL14	unknown	unknown	gnl|CDD|171855
NZ_LS483301.1|WP_001039659.1|1147883_1148684_+|glutamate-racemase	unknown	unknown	gnl|CDD|234851
NZ_LS483301.1|WP_000584398.1|1152038_1152545_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000765708.1|1157662_1157809_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_049314188.1|1150965_1151367_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|171849
NZ_LS483301.1|WP_000791587.1|1152803_1153301_+|complement-convertase-inhibitor-Efb	unknown	unknown	gnl|CDD|289007
NZ_LS483301.1|WP_000739209.1|1150267_1150597_+|complement-convertase-inhibitor-Ecb	unknown	unknown	gnl|CDD|289007
NZ_LS483301.1|WP_000659317.1|1148695_1149283_+|XTP/dITP-diphosphatase	unknown	unknown	gnl|CDD|184835
NZ_LS483301.1|WP_001074342.1|1162377_1163310_+|carbamate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237071
NZ_LS483301.1|WP_001791787.1|1149906_1150074_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_001063559.1|1159370_1160096_-|superantigen-like-protein-SSL13	unknown	unknown	gnl|CDD|106307
NZ_LS483301.1|WP_001791789.1|1150913_1151006_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_000041896.1|1158546_1159263_-|superantigen-like-protein-SSL12	gnl|CDD|171995	PRK13350, PRK13350, superantigen-like protein; Reviewed.	1.29441e-152
NZ_LS483301.1|WP_000049484.1|1149275_1149779_+|metallophosphoesterase	gnl|CDD|223695	COG0622, COG0622, Predicted phosphoesterase [General function prediction only].	9.91823e-44
NZ_LS483301.1|WP_000857483.1|1156030_1156990_-|alpha-hemolysin	gnl|CDD|273388	TIGR01002, synergohymenotropic_toxin, beta-channel forming cytolysin. This family of cytolytic pore-forming proteins includes alpha toxin and leukocidin F and S subunits from Staphylococcus aureus, hemolysin II of Bacillus cereus, and related toxins. [Cellular processes, Toxin production and resistance].	4.27434e-141
NZ_LS483301.1|WP_000793605.1|1161353_1162355_+|ornithine-carbamoyltransferase	gnl|CDD|235269	PRK04284, PRK04284, ornithine carbamoyltransferase; Provisional.	0
NZ_LS483301.1|WP_000669537.1|1153454_1153805_+|complement-inhibitor-SCIN-B	gnl|CDD|371594	pfam11546, CompInhib_SCIN, Staphylococcal complement inhibitor SCIN. SCIN is released by Staphylococcus aureus to counteract the host immune defense. The protein binds to and inhibits C3 convertases on the bacterial surface, reducing phagocytosis and blocking downstream effector functions by C3b deposition on its surface. An 18 residue stretch 31-48 is crucial for SCIN activity.	2.0882e-48
NZ_LS483301.1|WP_000739523.1|1160190_1160916_-|superantigen-like-protein-SSL14	gnl|CDD|171855	PRK13043, PRK13043, superantigen-like protein; Reviewed.	8.18566e-161
NZ_LS483301.1|WP_001039659.1|1147883_1148684_+|glutamate-racemase	gnl|CDD|234851	PRK00865, PRK00865, glutamate racemase; Provisional.	2.38427e-134
NZ_LS483301.1|WP_049314188.1|1150965_1151367_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	gnl|CDD|171849	PRK13033, PRK13033, formyl peptide receptor-like 1 inhibitory protein; Reviewed.	8.77023e-77
NZ_LS483301.1|WP_000791587.1|1152803_1153301_+|complement-convertase-inhibitor-Efb	gnl|CDD|289007	pfam12199, efb-c, Extracellular fibrinogen binding protein C terminal. This domain family is found in bacteria, and is approximately 70 amino acids in length. There is a conserved VLK sequence motif. It is the C terminal domain of bacterial extracellular fibrinogen binding protein. It contains a helical motif involved in complement regulation. This motif binds to complement and changes its conformation to a form which cannot activate downstream components of the complement cascade.	5.40265e-27
NZ_LS483301.1|WP_000739209.1|1150267_1150597_+|complement-convertase-inhibitor-Ecb	gnl|CDD|289007	pfam12199, efb-c, Extracellular fibrinogen binding protein C terminal. This domain family is found in bacteria, and is approximately 70 amino acids in length. There is a conserved VLK sequence motif. It is the C terminal domain of bacterial extracellular fibrinogen binding protein. It contains a helical motif involved in complement regulation. This motif binds to complement and changes its conformation to a form which cannot activate downstream components of the complement cascade.	4.63429e-22
NZ_LS483301.1|WP_000659317.1|1148695_1149283_+|XTP/dITP-diphosphatase	gnl|CDD|184835	PRK14822, PRK14822, XTP/dITP diphosphatase.	1.88157e-114
NZ_LS483301.1|WP_001074342.1|1162377_1163310_+|carbamate-kinase	gnl|CDD|237071	PRK12353, PRK12353, putative amino acid kinase; Reviewed.	0
NZ_LS483301.1|WP_001063559.1|1159370_1160096_-|superantigen-like-protein-SSL13	gnl|CDD|106307	PRK13349, PRK13349, superantigen-like protein; Reviewed.	1.29834e-148

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_000669537.1|1153454_1153805_+|complement-inhibitor-SCIN-B
MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR
>NZ_LS483301.1|WP_000791587.1|1152803_1153301_+|complement-convertase-inhibitor-Efb
MKNKLIAKSLLTLAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK
>NZ_LS483301.1|WP_000584398.1|1152038_1152545_+|hypothetical-protein
MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK
>NZ_LS483301.1|WP_049314188.1|1150965_1151367_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein
MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKEFDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSITWY
>NZ_LS483301.1|WP_001791789.1|1150913_1151006_-|hypothetical-protein
MLKTVKSTRLLGIKKHTELNSCTPNVRKQC
>NZ_LS483301.1|WP_000739209.1|1150267_1150597_+|complement-convertase-inhibitor-Ecb
MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNVEAAKKYDQYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNFFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK
>NZ_LS483301.1|WP_001791787.1|1149906_1150074_+|hypothetical-protein
MKRIVILENVIVDNPIWLNHVDYLVKSVLLKSIKLRFQEVRKFEILVKIMNRIHI
>NZ_LS483301.1|WP_000049484.1|1149275_1149779_+|metallophosphoesterase
MSKWIIVSDNHTESGVLYQIYEMHPDADVYLHLGDSEFAYDDTELSLFNRVKGNCDFYPEFENEAVAKYNDVKAFYTHGHLYQVNRTRDLLAEKGLELGCLFAFYGHTHVAKYEYINGVHVINPGSISQSRSSMEETYAEVIIDDQTLHGTINFKNRHHETISHTTF
>NZ_LS483301.1|WP_000659317.1|1148695_1149283_+|XTP/dITP-diphosphatase
MKEIVIASNNQGKINDFKVIFPDYHVIGISELIPDFDVEETGSTFEENAILKSEAAAKALNKTVIADDSGLEVFALNGEPGIYSARYAGENKSDEANIEKLLNKLGNTTDRRAQFVCVISMSGPDMETKVFKGTVSGEIADGKYGENGFGYDPIFYVPKLDKTMAQLSKEQKGQISHRRNAINLLQAFLEGDKNV
>NZ_LS483301.1|WP_001039659.1|1147883_1148684_+|glutamate-racemase
MNKPIGVIDSGVGGLTVAKEIMRQLPNETIYYLGDIGRCPYGPRPGEQVKQYTVEIARKLMEFDIKMLVIACNTATAVALEYLQKTLSIPVIGVIEPGARTAIMTTRNQNVLVLGTEGTIKSEAYRTHIKRINPHVEVHGVACPGFVPLVEQMRYSDPTITSIVIHQTLKRWRNSESDTVILGCTHYPLLYKPIYDYFGGKKTVISSGLETAREVSALLTFSNEHASYTEHPDHRFFATGDPTHITNIIKEWLNLSVNVERISVND
>NZ_LS483301.1|WP_001032814.1|1154513_1154699_-|hypothetical-protein
MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ
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MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH
>NZ_LS483301.1|WP_000857483.1|1156030_1156990_-|alpha-hemolysin
MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWIDRSSERYKIDWEKEEMTN
>NZ_LS483301.1|WP_000765708.1|1157662_1157809_+|hypothetical-protein
MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE
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MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH
>NZ_LS483301.1|WP_000041896.1|1158546_1159263_-|superantigen-like-protein-SSL12
MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD
>NZ_LS483301.1|WP_001063559.1|1159370_1160096_-|superantigen-like-protein-SSL13
MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN
>NZ_LS483301.1|WP_000739523.1|1160190_1160916_-|superantigen-like-protein-SSL14
MKKNIMNKLVLSTALLLLETTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNAEIEVILEKSN
>NZ_LS483301.1|WP_000793605.1|1161353_1162355_+|ornithine-carbamoyltransferase
MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEIMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF
>NZ_LS483301.1|WP_001074342.1|1162377_1163310_+|carbamate-kinase
MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK

Crispr_ID: NZ_LS483301_9

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_9
• CRISPR_location: 1158146-1158332
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_9

Consensus_repeat	Method
GGCGGGGCCCCAACATAGA	CRT

spacers of NZ_LS483301_9

>9.1|1158165|37|NZ_LS483301|CRT
GAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTG
>9.2|1158221|37|NZ_LS483301|CRT
AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTT
>9.3|1158277|37|NZ_LS483301|CRT
GAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_9

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_9

>merge|NZ_LS483301|9|1158146-1158332|CRT
GGCGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGTGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA

>NZ_LS483301|9|2|1158146-1158332|CRT
GGCGGGGCCCCAACATAGA	GAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTG
GGGTGGGCCCCAACACAGA	AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTT
GGCGGGGCCCCAACATAGT	GAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTT
GGCGGGGCCCCAACATAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_000231632.1|1155320_1155554_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000041896.1|1158546_1159263_-|superantigen-like-protein-SSL12	unknown	unknown	gnl|CDD|171995
NZ_LS483301.1|WP_001802045.1|1157765_1157990_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_001032814.1|1154513_1154699_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000669537.1|1153454_1153805_+|complement-inhibitor-SCIN-B	unknown	unknown	gnl|CDD|371594
NZ_LS483301.1|WP_000398672.1|1168173_1168308_+|beta-class-phenol-soluble-modulin	unknown	unknown	gnl|CDD|368464
NZ_LS483301.1|WP_000739523.1|1160190_1160916_-|superantigen-like-protein-SSL14	unknown	unknown	gnl|CDD|171855
NZ_LS483301.1|WP_000584398.1|1152038_1152545_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000765708.1|1157662_1157809_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000857483.1|1156030_1156990_-|alpha-hemolysin	unknown	unknown	gnl|CDD|273388
NZ_LS483301.1|WP_000791587.1|1152803_1153301_+|complement-convertase-inhibitor-Efb	unknown	unknown	gnl|CDD|289007
NZ_LS483301.1|WP_001245802.1|1167073_1167262_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_LS483301.1|WP_000793605.1|1161353_1162355_+|ornithine-carbamoyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|235269
NZ_LS483301.1|WP_001074342.1|1162377_1163310_+|carbamate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237071
NZ_LS483301.1|WP_001063559.1|1159370_1160096_-|superantigen-like-protein-SSL13	unknown	unknown	gnl|CDD|106307
NZ_LS483301.1|WP_049314188.1|1150965_1151367_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|171849
NZ_LS483301.1|WP_000432077.1|1163481_1165038_+|YfcC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224207
NZ_LS483301.1|WP_001239288.1|1165877_1166825_-|TDT-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|187765
NZ_LS483301.1|WP_000149423.1|1165345_1165573_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_001791789.1|1150913_1151006_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_000041896.1|1158546_1159263_-|superantigen-like-protein-SSL12	gnl|CDD|171995	PRK13350, PRK13350, superantigen-like protein; Reviewed.	1.29441e-152
NZ_LS483301.1|WP_001245802.1|1167073_1167262_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	0.00787195
NZ_LS483301.1|WP_000669537.1|1153454_1153805_+|complement-inhibitor-SCIN-B	gnl|CDD|371594	pfam11546, CompInhib_SCIN, Staphylococcal complement inhibitor SCIN. SCIN is released by Staphylococcus aureus to counteract the host immune defense. The protein binds to and inhibits C3 convertases on the bacterial surface, reducing phagocytosis and blocking downstream effector functions by C3b deposition on its surface. An 18 residue stretch 31-48 is crucial for SCIN activity.	2.0882e-48
NZ_LS483301.1|WP_000857483.1|1156030_1156990_-|alpha-hemolysin	gnl|CDD|273388	TIGR01002, synergohymenotropic_toxin, beta-channel forming cytolysin. This family of cytolytic pore-forming proteins includes alpha toxin and leukocidin F and S subunits from Staphylococcus aureus, hemolysin II of Bacillus cereus, and related toxins. [Cellular processes, Toxin production and resistance].	4.27434e-141
NZ_LS483301.1|WP_000739523.1|1160190_1160916_-|superantigen-like-protein-SSL14	gnl|CDD|171855	PRK13043, PRK13043, superantigen-like protein; Reviewed.	8.18566e-161
NZ_LS483301.1|WP_001074342.1|1162377_1163310_+|carbamate-kinase	gnl|CDD|237071	PRK12353, PRK12353, putative amino acid kinase; Reviewed.	0
NZ_LS483301.1|WP_000791587.1|1152803_1153301_+|complement-convertase-inhibitor-Efb	gnl|CDD|289007	pfam12199, efb-c, Extracellular fibrinogen binding protein C terminal. This domain family is found in bacteria, and is approximately 70 amino acids in length. There is a conserved VLK sequence motif. It is the C terminal domain of bacterial extracellular fibrinogen binding protein. It contains a helical motif involved in complement regulation. This motif binds to complement and changes its conformation to a form which cannot activate downstream components of the complement cascade.	5.40265e-27
NZ_LS483301.1|WP_000793605.1|1161353_1162355_+|ornithine-carbamoyltransferase	gnl|CDD|235269	PRK04284, PRK04284, ornithine carbamoyltransferase; Provisional.	0
NZ_LS483301.1|WP_000398672.1|1168173_1168308_+|beta-class-phenol-soluble-modulin	gnl|CDD|368464	pfam05480, Staph_haemo, Staphylococcus haemolytic protein. This family consists of several different short Staphylococcal proteins, it contains SLUSH A, B and C proteins as well as haemolysin and gonococcal growth inhibitor. Some strains of the coagulase-negative Staphylococcus lugdunensis produce a synergistic hemolytic activity (SLUSH), phenotypically similar to the delta-hemolysin of S. aureus. Gonococcal growth inhibitor from Staphylococcus act on the cytoplasmic membrane of the gonococcal cell causing cytoplasmic leakage and, eventually, death.	6.35158e-13
NZ_LS483301.1|WP_001063559.1|1159370_1160096_-|superantigen-like-protein-SSL13	gnl|CDD|106307	PRK13349, PRK13349, superantigen-like protein; Reviewed.	1.29834e-148
NZ_LS483301.1|WP_049314188.1|1150965_1151367_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	gnl|CDD|171849	PRK13033, PRK13033, formyl peptide receptor-like 1 inhibitory protein; Reviewed.	8.77023e-77
NZ_LS483301.1|WP_000432077.1|1163481_1165038_+|YfcC-family-protein	gnl|CDD|224207	COG1288, COG1288, Predicted membrane protein [Function unknown].	0
NZ_LS483301.1|WP_001239288.1|1165877_1166825_-|TDT-family-transporter	gnl|CDD|187765	cd09325, TDT_C4-dicarb_trans, C4-dicarboxylate transporters of the Tellurite-resistance/Dicarboxylate Transporter (TDT) family. This subfamily contains bacterial C4-dicarboxylate transporters, which is part of the Tellurite-resistance/Dicarboxylate Transporter (TDT) family. It includes Tellurite resistance protein tehA; the tehA gene encodes an integral membrane protein that has been shown to have efflux activity of quaternary ammonium compounds. TehA protein of Escherichia coli functions as a tellurite-resistance uptake permease.	1.39126e-83

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_001802045.1|1157765_1157990_+|hypothetical-protein
MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH
>NZ_LS483301.1|WP_000765708.1|1157662_1157809_+|hypothetical-protein
MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE
>NZ_LS483301.1|WP_000857483.1|1156030_1156990_-|alpha-hemolysin
MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWIDRSSERYKIDWEKEEMTN
>NZ_LS483301.1|WP_000231632.1|1155320_1155554_-|hypothetical-protein
MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH
>NZ_LS483301.1|WP_001032814.1|1154513_1154699_-|hypothetical-protein
MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ
>NZ_LS483301.1|WP_000669537.1|1153454_1153805_+|complement-inhibitor-SCIN-B
MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR
>NZ_LS483301.1|WP_000791587.1|1152803_1153301_+|complement-convertase-inhibitor-Efb
MKNKLIAKSLLTLAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK
>NZ_LS483301.1|WP_000584398.1|1152038_1152545_+|hypothetical-protein
MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK
>NZ_LS483301.1|WP_049314188.1|1150965_1151367_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein
MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKEFDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSITWY
>NZ_LS483301.1|WP_001791789.1|1150913_1151006_-|hypothetical-protein
MLKTVKSTRLLGIKKHTELNSCTPNVRKQC
>NZ_LS483301.1|WP_000041896.1|1158546_1159263_-|superantigen-like-protein-SSL12
MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD
>NZ_LS483301.1|WP_001063559.1|1159370_1160096_-|superantigen-like-protein-SSL13
MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN
>NZ_LS483301.1|WP_000739523.1|1160190_1160916_-|superantigen-like-protein-SSL14
MKKNIMNKLVLSTALLLLETTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNAEIEVILEKSN
>NZ_LS483301.1|WP_000793605.1|1161353_1162355_+|ornithine-carbamoyltransferase
MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEIMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF
>NZ_LS483301.1|WP_001074342.1|1162377_1163310_+|carbamate-kinase
MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK
>NZ_LS483301.1|WP_000432077.1|1163481_1165038_+|YfcC-family-protein
MENTINESEKKKRFKLKMPGAFMILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKNDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSAHFTLRKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGVLITQVLIYS
>NZ_LS483301.1|WP_000149423.1|1165345_1165573_+|hypothetical-protein
MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWNLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV
>NZ_LS483301.1|WP_001239288.1|1165877_1166825_-|TDT-family-transporter
MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMIKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLKNVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIIFLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPDIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKEKQDKFLRNASQ
>NZ_LS483301.1|WP_001245802.1|1167073_1167262_+|hypothetical-protein
MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANSIFSNEN
>NZ_LS483301.1|WP_000398672.1|1168173_1168308_+|beta-class-phenol-soluble-modulin
MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF

Crispr_ID: NZ_LS483301_10

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_10
• CRISPR_location: 1902289-1902499
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_10

Consensus_repeat	Method
CAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGANNN	CRT

spacers of NZ_LS483301_10

>10.1|1902327|21|NZ_LS483301|CRT
AGCTGGCCAATAGTCAGCTTT
>10.2|1902386|20|NZ_LS483301|CRT
GAATTTCGAAAAGAAATTCT
>10.3|1902444|18|NZ_LS483301|CRT
TGGCCAATAGTCAGCTTT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_10

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_10

>merge|NZ_LS483301|10|1902289-1902499|CRT
CAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCCAATAGTCAGCTTTCAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCCAATAGTCAGCTTTCAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGA

>NZ_LS483301|10|3|1902289-1902499|CRT
CAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGA	AGCTGGCCAATAGTCAGCTTT
CAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGA	GAATTTCGAAAAGAAATTCT
ACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGC	TGGCCAATAGTCAGCTTT
CAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_001051860.1|1902802_1903225_-|YtxH-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378938
NZ_LS483301.1|WP_001025060.1|1917318_1918491_-|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|340887
NZ_LS483301.1|WP_000434765.1|1898336_1899128_-|phosphotransferase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223584
NZ_LS483301.1|WP_000526539.1|1918600_1919554_+|TIGR01212-family-radical-SAM-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224163
NZ_LS483301.1|WP_000411085.1|1899677_1900526_-|D-amino-acid-transaminase	unknown	unknown	gnl|CDD|130191
NZ_LS483301.1|WP_000836465.1|1914272_1914584_-|rhodanese-like-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238089
NZ_LS483301.1|WP_001266157.1|1897677_1898322_-|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB	unknown	unknown	gnl|CDD|234649
NZ_LS483301.1|WP_000689580.1|1896365_1897208_-|MBL-fold-metallo-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|293814
NZ_LS483301.1|WP_061642058.1|1907386_1913947_-|LPXTG-anchored-repetitive-surface-protein-SasC	unknown	unknown	gnl|CDD|275089
NZ_LS483301.1|WP_000285019.1|1906001_1907270_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|367519
NZ_LS483301.1|WP_001217125.1|1903241_1903937_-|rRNA-pseudouridine-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|224108
NZ_LS483301.1|WP_001091387.1|1893433_1894291_-|DUF1444-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|237463
NZ_LS483301.1|WP_000265417.1|1900529_1901939_-|Mn(2+)-dependent-dipeptidase-Sapep	unknown	unknown	gnl|CDD|235988
NZ_LS483301.1|WP_001549041.1|1914605_1917023_-|leucine--tRNA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|234743
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NZ_LS483301.1|WP_001048368.1|1892808_1893405_-|DUF4479-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|234804
NZ_LS483301.1|WP_000764419.1|1919550_1920114_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|377744
NZ_LS483301.1|WP_001024576.1|1894766_1895843_-|M42-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|349906
NZ_LS483301.1|WP_000163826.1|1895929_1896241_+|PepSY-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227871

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_001051860.1|1902802_1903225_-|YtxH-domain-containing-protein	gnl|CDD|378938	pfam12732, YtxH, YtxH-like protein. This family of proteins is found in bacteria. Proteins in this family are typically between 100 and 143 amino acids in length. The N-terminal region is the most conserved. Proteins is this family are functionally uncharacterized.	0.000542053
NZ_LS483301.1|WP_001025060.1|1917318_1918491_-|MFS-transporter	gnl|CDD|340887	cd17329, MFS_MdtH_MDR_like, Multidrug resistance protein MdtH and similar multidrug resistance (MDR) transporters of the Major Facilitator Superfamily. This family is composed of Escherichia coli MdtH and similar multidrug resistance (MDR) transporters from bacteria and archaea, many of which remain uncharacterized. MDR transporters are drug/H+ antiporters (DHA) that mediate the efflux of a variety of drugs and toxic compounds, and confer resistance to these compounds. MdtH confers resistance to norfloxacin and enoxacin. MdtH-like MDR transporters belong to the Major Facilitator Superfamily (MFS) of membrane transport proteins, which are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	3.28992e-94
NZ_LS483301.1|WP_000434765.1|1898336_1899128_-|phosphotransferase-family-protein	gnl|CDD|223584	COG0510, ycfN, Thiamine kinase and related kinases [Coenzyme transport and metabolism].	5.2385e-83
NZ_LS483301.1|WP_000526539.1|1918600_1919554_+|TIGR01212-family-radical-SAM-protein	gnl|CDD|224163	COG1242, COG1242, Predicted Fe-S oxidoreductase [General function prediction only].	0
NZ_LS483301.1|WP_000411085.1|1899677_1900526_-|D-amino-acid-transaminase	gnl|CDD|130191	TIGR01121, D-alanine_aminotransferase, D-amino acid aminotransferase. This enzyme is a homodimer. The pyridoxal phosphate attachment site is the Lys at position 146 of the seed alignment, in the motif Cys-Asp-Ile-Lys-Ser-Leu-Asn. Specificity is broad for various D-amino acids, and differs among members of the family; the family is designated equivalog, but with this caveat attached. [Energy metabolism, Amino acids and amines].	6.28892e-159
NZ_LS483301.1|WP_000836465.1|1914272_1914584_-|rhodanese-like-domain-containing-protein	gnl|CDD|238089	cd00158, RHOD, Rhodanese Homology Domain (RHOD); an alpha beta fold domain found duplicated in the rhodanese protein. The cysteine containing enzymatically active version of the domain is also found in the Cdc25 class of protein phosphatases and a variety of proteins such as sulfide dehydrogenases and certain stress proteins such as senesence specific protein 1 in plants, PspE and GlpE in bacteria and cyanide and arsenate resistance proteins. Inactive versions (no active site cysteine) are also seen in dual specificity phosphatases, ubiquitin hydrolases from yeast and in sulfuryltransferases, where they are believed to play a regulatory role in multidomain proteins.	1.46882e-25
NZ_LS483301.1|WP_001266157.1|1897677_1898322_-|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB	gnl|CDD|234649	PRK00121, trmB, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase; Reviewed.	1.9831e-87
NZ_LS483301.1|WP_000689580.1|1896365_1897208_-|MBL-fold-metallo-hydrolase	gnl|CDD|293814	cd07728, YtnP-like_MBL-fold, Bacillus subtilis YtnP and related proteins; MBL-fold metallo hydrolase domain. Bacillus subtilis YtnP inhibits the signaling pathway required for the streptomycin production and development of aerial mycelium in Streptomyces griseus. Members of this subgroup belong to the MBL-fold metallo-hydrolase superfamily which is comprised mainly of hydrolytic enzymes which carry out a variety of biological functions.	1.38932e-155
NZ_LS483301.1|WP_061642058.1|1907386_1913947_-|LPXTG-anchored-repetitive-surface-protein-SasC	gnl|CDD|275089	TIGR04263, cell_wall_surface_anchor_family_protein, SasC/Mrp/FmtB intercellular aggregation domain. This domain, about 375 amino acids long on average, occurs only in Staphylococcus and Streptococcus. It occurs as a non-repetitive N-terminal domain of LPXTG-anchored surface proteins, including SasC, Mrp, and FmtB. This region in SasC was shown to be involved in cell aggregation and biofilm formation, which may explain the methicillin resistance seen for Mrp and FmtB.	2.701e-115
NZ_LS483301.1|WP_000285019.1|1906001_1907270_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|367519	pfam03486, HI0933_like, HI0933-like protein.	0
NZ_LS483301.1|WP_001217125.1|1903241_1903937_-|rRNA-pseudouridine-synthase	gnl|CDD|224108	COG1187, RsuA, 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	2.1062e-94
NZ_LS483301.1|WP_001091387.1|1893433_1894291_-|DUF1444-domain-containing-protein	gnl|CDD|237463	PRK13668, PRK13668, hypothetical protein; Provisional.	2.02352e-168
NZ_LS483301.1|WP_000265417.1|1900529_1901939_-|Mn(2+)-dependent-dipeptidase-Sapep	gnl|CDD|235988	PRK07318, PRK07318, dipeptidase PepV; Reviewed.	0
NZ_LS483301.1|WP_001549041.1|1914605_1917023_-|leucine--tRNA-ligase	gnl|CDD|234743	PRK00390, leuS, leucyl-tRNA synthetase; Validated.	0
NZ_LS483301.1|WP_000004335.1|1903933_1905595_-|polysaccharide-biosynthesis-protein	gnl|CDD|240529	cd13124, MATE_SpoVB_like, Stage V sporulation protein B, also known as Stage III sporulation protein F, and related proteins. The integral membrane protein SpoVB has been implicated in the biosynthesis of the peptidoglycan component of the spore cortex in Bacillus subtilis. This model represents a subfamily of the multidrug and toxic compound extrusion (MATE)-like proteins. Proteins from the MATE family are involved in exporting metabolites across the cell membrane and are often responsible for multidrug resistance (MDR).	1.63186e-123
NZ_LS483301.1|WP_000811163.1|1894390_1894702_-|thioredoxin-family-protein	gnl|CDD|239245	cd02947, TRX_family, TRX family; composed of two groups: Group I, which includes proteins that exclusively encode a TRX domain; and Group II, which are composed of fusion proteins of TRX and additional domains. Group I TRX is a small ancient protein that alter the redox state of target proteins via the reversible oxidation of an active site dithiol, present in a CXXC motif, partially exposed at the protein's surface. TRX reduces protein disulfide bonds, resulting in a disulfide bond at its active site. Oxidized TRX is converted to the active form by TRX reductase, using reducing equivalents derived from either NADPH or ferredoxins. By altering their redox state, TRX regulates the functions of at least 30 target proteins, some of which are enzymes and transcription factors. It also plays an important role in the defense against oxidative stress by directly reducing hydrogen peroxide and certain radicals, and by serving as a reductant for peroxiredoxins. At least two major types of functional TRXs have been reported in most organisms; in eukaryotes, they are located in the cytoplasm and the mitochondria. Higher plants contain more types (at least 20 TRX genes have been detected in the genome of Arabidopsis thaliana), two of which (types f amd m) are located in the same compartment, the chloroplast. Also included in the alignment are TRX-like domains which show sequence homology to TRX but do not contain the redox active CXXC motif. Group II proteins, in addition to either a redox active TRX or a TRX-like domain, also contain additional domains, which may or may not possess homology to known proteins.	2.34221e-24
NZ_LS483301.1|WP_001048368.1|1892808_1893405_-|DUF4479-domain-containing-protein	gnl|CDD|234804	PRK00629, pheT, phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta; Reviewed.	7.47641e-48
NZ_LS483301.1|WP_000764419.1|1919550_1920114_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase	gnl|CDD|377744	pfam06962, rRNA_methylase, Putative rRNA methylase. This family contains a number of putative rRNA methylases. Note that many family members are hypothetical proteins.	2.38341e-67
NZ_LS483301.1|WP_001024576.1|1894766_1895843_-|M42-family-metallopeptidase	gnl|CDD|349906	cd05656, M42_Frv, M42 Peptidase, endoglucanases. Peptidase M42 family, Frv (Frv Operon Protein; Endo-1 4-Beta-Glucanase; Cellulase Protein; Endoglucanase; Endo-1 4-Beta-Glucanase Homolog; Glucanase; EC. 3.2.1.4) subfamily. Frv is a co-catalytic metallopeptidase, found in archaea and bacteria, including Pyrococcus horikoshii tetrahedral shaped phTET1 (DAPPh1; FrvX; PhDAP aminopeptidase; PhTET aminopeptidase; deblocking aminopeptidase), phTET2 (DAPPh2) and phTET3 (DAPPh3), Haloarcula marismortui TET (HmTET) as well as Bacillus subtilis YsdC. All of these exhibit aminopeptidase and deblocking activities. The HmTET is a broad substrate aminopeptidase capable of degrading large peptides. PhTET2, which shares 24% identity with HmTET, is a cobalt-activated peptidase and possibly a deblocking aminopeptidase, assembled as a 12-subunit tetrahedral dodecamer, while PhTET1 can be alternatively assembled as a tetrahedral dodecamer or as an octahedral tetracosameric structure. The active site in such a self-compartmentalized complex is located on the inside such that substrate sizes are limited, indicating function as possible peptide scavengers. PhTET2 cleaves polypeptides by a nonprocessive mechanism, preferring N-terminal hydrophobic or uncharged polar amino acids. Streptococcus pneumoniae PepA (SpPepA) also forms dodecamer with tetrahedral architecture, and exhibits selective substrate specificity to acidic amino acids with the preference to glutamic acid, with the substrate binding S1 pocket containing an Arg allows electrostatic interactions with the N-terminal acidic residue in the substrate. The YsdC gene is conserved in a number of thermophiles, archaea and pathogenic bacterial species; the closest structural homolog is Thermotoga maritima FrwX (34% identity), which is annotated as either a cellulase or an endoglucanase, and is possibly involved in polysaccharide biosynthesis or degradation.	2.36515e-152
NZ_LS483301.1|WP_000163826.1|1895929_1896241_+|PepSY-domain-containing-protein	gnl|CDD|227871	COG5584, COG5584, Predicted small secreted protein [Function unknown].	4.78628e-46

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_000265417.1|1900529_1901939_-|Mn(2+)-dependent-dipeptidase-Sapep
MWKEKVQQYEDQIINDLKGLLAIESVRDDAKASEDAPVGPGPRKALDYMYEIAHRDGFTTHDVDHIAGRIEAGKGNDVLGILCHVDVVPAGDGWDSNPFEPVVTEDAIIARGTLDDKGPTIAAYYAIKILEDMNVDWKKRIHMIIGTDEESDWKCTDRYFKTEEMPTLGFAPDAEFPCIHGEKGITTFDLVQNKLTEDQDEPDYELITFKSGERYNMVPDHAEARVLVKENMTDVIQDFEYFLEQNHLQGDSTVDSGILVLTVEGKAVHGMDPSIGVNAGLYLLKFLASLNLDNNAQAFVAFSNRYLFNSDFGEKMGMKFHTDVMGDVTTNIGVITYDNENAGLFGINLRYPEGFEFEKAMDRFANEIQQYGFEVKLGKVQPPHYVDKNDPFVQKLVTAYRNQTNDMTEPYTIGGGTYARNLDKGVAFGAMFSDSEDLMHQKNEYITKKQLFNATSIYLEAIYSLCVEE
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>NZ_LS483301.1|WP_000434765.1|1898336_1899128_-|phosphotransferase-family-protein
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>NZ_LS483301.1|WP_000163826.1|1895929_1896241_+|PepSY-domain-containing-protein
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>NZ_LS483301.1|WP_001024576.1|1894766_1895843_-|M42-family-metallopeptidase
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MYQTIIIGGGPSGLMAAVAASEQSSSVLLIEKKKGLGRKLKISGGGRCNVTNRLPYAEIIKNIPGNGKFLYSPFSIFDNESIIDFFESRGVKLKEEDHGRMFPVSNKAQDVVDTLVTTIERQHVTIKEEEAVSRIEVNTDQTFTVHTQNNSYESHSLVIATGGTSVPQTGSTGDGYKFAQDLGHTITELFPTEVPITSAEPFIKSNRLKGLSLKDVELSVLKKNGKKRISHQMDMLFTHFGISGPAALRCSQFVYKEQKNQKTQHISMAIDAFPELNHEQLKQHITSLLSDTPDKIIKNSLHGLIEERYLLFMLEQAGIDENTTSHHLSNQQLNDLVNMFKGFVFKVNGTLPIDKAFVTGGGVSLKEIQPKTMMSKLVPGLFLCGEVLDIHGYTGGYNITSALVTGHVAGLYAGHYSHASME
>NZ_LS483301.1|WP_061642058.1|1907386_1913947_-|LPXTG-anchored-repetitive-surface-protein-SasC
MNLLKKNKYSIRKYKVGIFSTLIGTVLLLSNPNGAQALTTDNNVQSDTNQATPVNSQDKDVANNRGLANSAQNTPNQSATTNQATNQALVNHNNGSIVNQATPTSVQSSTPSAQNNNHTDGNTTATETVSNANNNDVVSNNTALNVPTKTNENGSGGHLTLKEIQEDVRHSSNKPELVAIAEPASNRPKKRSRRAAPADPNATPADPAAAAVGNGGAPVAITAPYTPTTDPNANNAGQNAPNEVLSFDDNGIRPSTNRSVPTVNVVNNLPGFTLINGGKVGVFSHAMVRTSMFDSGDNKNYQAQGNVIALGRIHGTDTNDHGDFNGIEKALTVNPNSELIFEFNTMTTKNGQGATNVIIKNADTNDTIAEKTVEGGPTLRLFKVPDNVRNLKIQFVPKNDAITDARGIYQLKDGYKYYSFVDSIGLHSGSHVFVERRTMDPTATNNKEFTVTTSLKNNGNSGASLDTNDFVYQVQLPEGVEYVNNSLTKDFPSNNSGVDVNDMNVTYDAANRVITIKSTGGGTANSPARLMPDKILDLRYKLRVNNVPTPRTVTFNETLTYKTYTQDFINSAAESHTVSTNPYTIDIIMNKDALQAEVDRRIQQADYTFASLDIFNGLKRRAQTILDENRNNVPLNKRVSQAYIDSLTNQMQHTLIRSVDAENAVNKKVDQMEDLVNQNDELTDEEKQAAIQVIEEHKNEIIGNIGDQTTDDGVTRIKDQGIQTLSGDTATPVVKPNAKKAIRDKATKQREIINATPDVTEDEIQDALNQLATDETDAIDNVTNATTNADVETAKNNGINTIGAVVPQVTHKKAARDAINQATATKRQQINSNREATQEEKNAALNELTQATNHALEQINQATTNADVDNAKGDGLNAINPIAPVTVVKQAARDAVSHDAQQHIAEINANPDATQEERQAAIDKVNAAVTAANTNILNANTNADVEQVKTNAIQGIQAITPATKVKTDAKNAIDKSAETQHNTIFNNNDATLEEQQAAQQLLDQAVATAKQNINAADTNQEVAQAKDQGTQNIVVIQPATQVKTDTRNVVNDKAREAITNINATTGATREEKQEAINRVNTLKNRALTDIGVTSTTAMVNSIRDDAVNQIGAVQPHVTKKQTATGVLNDLATAKKQEINQNTNATTEEKQVALNQVDQELATAINNINQADTNAEVDQAQQLGTKAINAIQPNIVKKPAALAQINQHYNAKLAEINATPDATNDEKNAAINTLNQDRQQAIESIKQANTNAEVDQAATVAENNIDAVQVDVVKKQAARDKITAEVAKRIEAVKQTPNATDEEKQAAVNQINQLKDQAINQINQNQTNDQVDTTTNQAVNAIDNVEAEVVIKPKAIADIEKAVKEKQQQIDNSLDSTDNEKEVASQALAKEKEKALAAIEQAQTNSQVNQAATNGVSAIKIIQPETKVKPAAREKINQKANELRAKINQDKEATAEERQVALDKINEFVNQAMTDITNNRTNQQVDDTTSQALDSIALVTPDHIVRAAARDAVKQQYEAKKREIEQAEHATDEEKQVALNQLANNEKRALQNIDQAIANNDVKRVETNGIATLKGVQPHIVIKPEAQQAIKASAENQVESIKDTPHATVDELDEANQLISDTLKQAQQEIENTNQDAAVTDVRNQTIKAIEQIKPKVRRKRAALDSIEENNKNQLDAIRNTLDTTQDERDVAIDTLNKIVNTIKNDIAQNKTNAEVDRTETDGNDNIKVILPKVQVKPAARQSVGVKAEAQNALIDQSDLSTEEERLAAKHLVEQALNQAIDQINHADKTAQVNQDSINAQNIISKIKPATTVKATALQQIQNIATNKINLIKANNEATDEEQNIAIAQVEKELIKAKQQIASAVTNADVAYLLHDEKNEIREIEPVINRKASAREQLTTLFNDKKQAIEANIQATVEERNSILAQLQNIYDTAIGQIDQDRSNAQVDKTASLNLQTIHDLDVHPIKKPDAEKTINDDLARVTALVQNYRKVSNRNKADALKAITALKLQMDEELKTARTNADVDAVLKRFNVALSDIEAVITEKENSLLRIDNIAQQTYAKFKAIATPEQLAKVKVLIDQYVADGNRMIDEDATLNDIKQHTQFIVDEILAIKLPAEATKVSPKEIQPAPKVCTPIKKEETHESRKVEKELPNTGSEGMDLPLKEFALITGAALLARRRTKNEKES
>NZ_LS483301.1|WP_000836465.1|1914272_1914584_-|rhodanese-like-domain-containing-protein
MKSITTDELKNKLLESKPVQIVDVRTDEETAMGYIPNAKLIPMDTIPDNLNSFNKNEIYYIVCAGGVRSAKVVEYLEANGIDAVNVEGGMHAWGDEGLEIKSI
>NZ_LS483301.1|WP_001549041.1|1914605_1917023_-|leucine--tRNA-ligase
MLNYNHNQIEKKWQDYWDENKTFKTNDNLGQKKFYALDMFPYPSGAGLHVGHPEGYTATDIISRYKRMQGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALDTGNDPREFTKKNIQTFKRQIKELGFSYDWDREVNTTDPEYYKWTQWIFIQLYNKGLAYVDEVAVNWCPALGTVLSNEEVIDGVSERGGHPVYRKPMKQWVLKITEYADQLLADLDDLDWPESLKDMQRNWIGRSEGAKVSFDVDNTEGKVEVFTTRPDTIYGASFLVLSPEHALVNSITTDEYKEKVKAYQTEASKKSDLERTDLAKDKSGVFTGAYATNPLSGEKVQIWIADYVLSTYGTGAIMAVPAHDDRDYEFAKKFDLPIIEVIEGGNVEEAAYTGEGKHINSGELDGLENEAAITKAIQLLEQKGAGEKKVNYKLRDWLFSRQRYWGEPIPVIHWEDGTMTTVPEEELPLLLPETDEIKPSGTGESPLANIDSFVNVVDEKTGMKGRRETNTMPQWAGSCWYYLRYIDPKNENMLADPEKLKHWLPVDLYIGGVEHAVLHLLYARFWHKVLYDLAIVPTKEPFQKLFNQGMILGEGNEKMSKSKGNVINPDDIVQSHGADTLRLYEMFMGPLDAAIAWSEKGLDGSRRFLDRVWRLMVNEDGTLSSKIVTTNNKSLDKVYNQTVKKVTEDFETLGFNTAISQLMVFINECYKVDEVYKPYIEGFVKMLAPIAPHIGEELWSKLGHEESITYQPWPTYDEALLVDDEVEIVVQVNGKLRAKIKIAKDTSKEEMQEIALSNDNVKASIEGKDIMKVIAVPQKLVNIVAK
>NZ_LS483301.1|WP_001025060.1|1917318_1918491_-|MFS-transporter
MNIPKSVWWLVIGMALNITGSSFLWPLNTIYMKQELGKSLTVAGLVLMINSFGMVIGNLLGGSLFDKLGGYKTILIGTFTCLCSTTLLNFFHGWPWYAVWLVMLGFGGGMIIPAIYAMAGAVWPNGGRQTFNAIYLAQNIGVAVGAAMGGFVAEFSFNYIFLANLIMYVVFALVAVTQFNIEINAKVKYPTHLDITGKKNKARFISLVLICAMFAICWVAYIQWESTIASFTQSINISMAQYSVLWTINGIMILVAQPLIKPILYLLKGNLKKQMFVGIIIFMLSFFVTSFAENFTIFVVGMIILTFGEMFVWPAVPTIANQLAPDGKQGQYQGFVNSAATVGKAFGPFLGGVLVDAFNMRMMFIGMMLLLVFALILLMVFKENNTQPKK
>NZ_LS483301.1|WP_000526539.1|1918600_1919554_+|TIGR01212-family-radical-SAM-protein
MGNHFQYAFENKRYHTWNYHLKNKFGQKIFKVALDGGFDCPNRDGTVAHGGCTFCSAAGSGDFAGNRADSIAVQFKEIKEKMHEKWHEGKYIAYFQAFTNTHAPVEVLKEKFEPVLKEPGVVGLSIGTRPDCLPDDVVEYLADLNQRTYLWVELGLQTIHQSTSDLINRAHDMKTYYDGVAKLRKHNINVCTHIINGLPGEDYDMMMATAKEVAQMDVQGIKIHLLHLLKGTPMVKQYDKGLLTFMTQEEYTNLVVDQLEVIPPEMIVHRITGDGPIDIMVGPMWSVNKWEVLNGIDAELARRNSYQGLRYKSKVKQ
>NZ_LS483301.1|WP_000764419.1|1919550_1920114_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase
MKLERILPFSKTLIKQHITPESIVVDATCGNGNDTLFLAEQVPEGHVYGFDIQDLALENTRDKVKDFNHVSLIKDGHENIEHHINDAHKGHIDAAIFNLGYLPKGDKSIVTKPDTTIQAINSLLSLMSIEGIIVLVIYHGHSEGQIEKHALLDYLSTLDQKHAQVLQYQFLNQRNHAPFICAIEKIS

Crispr_ID: NZ_LS483301_11

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_11
• CRISPR_location: 2192522-2192610
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_11

Consensus_repeat	Method
GTTTTTGACTGACTTCTCAATCA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483301_11

>11.1|2192545|43|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder
ATTTATAACTTTATTATACATAATCGTTTTTCTTTTGCAATAG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_11

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_11

>merge|NZ_LS483301|11|2192522-2192610|CRISPRCasFinder
GTTTTTGACTGACTTCTCAATCAATTTATAACTTTATTATACATAATCGTTTTTCTTTTGCAATAGTTTTTCGACTGACTTCTCAATCA

>NZ_LS483301|11|8|2192522-2192610|CRISPRCasFinder
GTTTTTGACTGACTTCTCAATCA	ATTTATAACTTTATTATACATAATCGTTTTTCTTTTGCAATAG
TTTTTCGACTGACTTCTCAATCA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_001549197.1|2201349_2201484_-|delta-lysin-family-phenol-soluble-modulin	unknown	unknown	gnl|CDD|173213
NZ_LS483301.1|WP_048667711.1|2193364_2194537_+|tyrosine-type-recombinase/integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271189
NZ_LS483301.1|WP_000522384.1|2198980_2199607_+|nitroreductase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226090
NZ_LS483301.1|WP_015581889.1|2196756_2197500_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease	unknown	unknown	gnl|CDD|376806
NZ_LS483301.1|WP_000867960.1|2199967_2200753_+|carbon-nitrogen-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|143607
NZ_LS483301.1|WP_000917289.1|2196297_2196582_-|co-chaperone-GroES	unknown	unknown	gnl|CDD|178988
NZ_LS483301.1|WP_061642102.1|2197524_2198784_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223021
NZ_LS483301.1|WP_048667709.1|2191811_2191967_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_001103965.1|2190911_2191238_-|DUF1474-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|369323
NZ_LS483301.1|WP_001002722.1|2189977_2190847_-|primase-C-terminal-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|214926
NZ_LS483301.1|WP_061642142.1|2188595_2189966_-|DNA-primase	unknown	unknown	gnl|CDD|273716
NZ_LS483301.1|WP_000403839.1|2191238_2191622_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_001231376.1|2191623_2191827_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000240645.1|2194605_2196222_-|chaperonin-GroEL	unknown	unknown	gnl|CDD|234573
NZ_LS483301.1|WP_000481967.1|2191963_2192281_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|200128
NZ_LS483301.1|WP_001105707.1|2201719_2202289_+|accessory-gene-regulator-AgrB	unknown	unknown	gnl|CDD|214819
NZ_LS483301.1|WP_000620857.1|2192676_2193351_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|379188
NZ_LS483301.1|WP_000153640.1|2192285_2192504_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|197775
NZ_LS483301.1|WP_001003076.1|2187731_2187995_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_001059599.1|2187996_2188353_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_001549197.1|2201349_2201484_-|delta-lysin-family-phenol-soluble-modulin	gnl|CDD|173213	PRK14752, PRK14752, delta-lysin family phenol-soluble modulin.	8.25732e-15
NZ_LS483301.1|WP_048667711.1|2193364_2194537_+|tyrosine-type-recombinase/integrase	gnl|CDD|271189	cd01189, INT_ICEBs1_C_like, C-terminal catalytic domain of integrases from bacterial phages and conjugate transposons. This family of tyrosine based site-specific integrases is has origins in bacterial phages and conjugate transposons. One member is the integrase from Bacillus subtilis conjugative transposon ICEBs1. ICEBs1 can be excised and transfered to various recipients in response to DNA damage or high concentrations of potential mating partners. The family belongs to the superfamily of DNA breaking-rejoining enzymes, which share the same fold in their catalytic domain and the overall reaction mechanism. The catalytic domain contains six conserved active site residues. Their overall reaction mechanism involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA.	5.29619e-47
NZ_LS483301.1|WP_000522384.1|2198980_2199607_+|nitroreductase-family-protein	gnl|CDD|226090	COG3560, FMR2, Predicted oxidoreductase related to nitroreductase [General function prediction only].	5.71771e-116
NZ_LS483301.1|WP_015581889.1|2196756_2197500_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease	gnl|CDD|376806	pfam02517, Abi, CAAX protease self-immunity. Members of this family are probably proteases (after a isoprenyl group is attached to the Cys residue in the C-terminal CAAX motif of a protein to attach it to the membrane, the AAX tripeptide being removed by one of the CAAX prenyl proteases). The family contains the CAAX prenyl protease. The proteins contain a highly conserved Glu-Glu motif at the amino end of the alignment. The alignment also contains two histidine residues that may be involved in zinc binding. While they are involved in membrane anchoring of proteins in eukaryotes, little is known about their function in prokaryotes. In some known bacteriocin loci, Abi genes have been found downstream of bacteriocin structural genes where they are probably involved in self-immunity. Investigation of the bacteriocin-like loci in the Gram positive bacteria locus from Lactobacillus sakei 23K confirmed that the bacteriocin-like genes (sak23Kalphabeta) exhibited antimicrobial activity when expressed in a heterologous host and that the associated Abi gene (sak23Ki) conferred immunity against the cognate bacteriocin. Interestingly, the immunity genes from three similar systems conferred a high degree of cross-immunity against each other's bacteriocins, suggesting the recognition of a common receptor. Site-directed mutagenesis demonstrated that the conserved motifs constituting the putative proteolytic active site of the Abi proteins are essential for the immunity function of Sak23Ki - thus a new concept in self-immunity.	1.67124e-11
NZ_LS483301.1|WP_000867960.1|2199967_2200753_+|carbon-nitrogen-family-hydrolase	gnl|CDD|143607	cd07583, nitrilase_5, Uncharacterized subgroup of the nitrilase superfamily (putative class 13 nitrilases). The nitrilase superfamily is comprised of nitrile- or amide-hydrolyzing enzymes and amide-condensing enzymes, which depend on a Glu-Lys-Cys catalytic triad. This superfamily has been classified in the literature based on global and structure based sequence analysis into thirteen different enzyme classes (referred to as 1-13). Class 13 represents proteins that at the time were difficult to place in a distinct similarity group; this subgroup represents either a new class or one that was included previously in class 13. Members of this superfamily generally form homomeric complexes, the basic building block of which is a homodimer.	1.8432e-126
NZ_LS483301.1|WP_000917289.1|2196297_2196582_-|co-chaperone-GroES	gnl|CDD|178988	PRK00364, groES, co-chaperonin GroES; Reviewed.	5.94304e-45
NZ_LS483301.1|WP_061642102.1|2197524_2198784_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223021	PHA03247, PHA03247, large tegument protein UL36; Provisional.	5.63349e-09
NZ_LS483301.1|WP_001103965.1|2190911_2191238_-|DUF1474-family-protein	gnl|CDD|369323	pfam07342, DUF1474, Protein of unknown function (DUF1474). This family consists of several bacterial proteins of around 100 residues in length. Members of this family seem to be found exclusively in Staphylococcus aureus. The function of this family is unknown.	3.47781e-22
NZ_LS483301.1|WP_001002722.1|2189977_2190847_-|primase-C-terminal-domain-containing-protein	gnl|CDD|214926	smart00942, PriCT_1, Primase C terminal 1 (PriCT-1). This alpha helical domain is found at the C terminal of primases.	2.15847e-16
NZ_LS483301.1|WP_061642142.1|2188595_2189966_-|DNA-primase	gnl|CDD|273716	TIGR01613, putative_primase, phage/plasmid primase, P4 family, C-terminal domain. This model represents a clade within a larger family of proteins from viruses of bacteria and animals. Members of this family are found in phage and plasmids of bacteria and archaea only. The model describes a domain of about 300 residues, found generally toward the protein C-terminus. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair, Mobile and extrachromosomal element functions, Prophage functions].	4.99817e-60
NZ_LS483301.1|WP_000240645.1|2194605_2196222_-|chaperonin-GroEL	gnl|CDD|234573	PRK00013, groEL, chaperonin GroEL; Reviewed.	0
NZ_LS483301.1|WP_000481967.1|2191963_2192281_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|200128	TIGR01764, Probable_excisionase, DNA binding domain, excisionase family. An excisionase, or Xis protein, is a small protein that binds and promotes excisive recombination; it is not enzymatically active. This model represents a number of putative excisionases and related proteins from temperate phage, plasmids, and transposons, as well as DNA binding domains of other proteins, such as a DNA modification methylase. This model identifies mostly small proteins and N-terminal regions of large proteins, but some proteins appear to have two copies. This domain appears similar, in both sequence and predicted secondary structure (PSIPRED) to the MerR family of transcriptional regulators (pfam00376). [Unknown function, General].	5.89089e-17
NZ_LS483301.1|WP_001105707.1|2201719_2202289_+|accessory-gene-regulator-AgrB	gnl|CDD|214819	smart00793, AgrB, Accessory gene regulator B. The accessory gene regulator (agr) of Staphylococcus aureus is the central regulatory system that controls the gene expression for a large set of virulence factors. The arg locus consists of two transcripts: RNAII and RNAIII. RNAII encodes four genes (agrA, B, C, and D) whose gene products assemble a quorum sensing system. At low cell density, the agr genes are continuously expressed at basal levels. A signal molecule, autoinducing peptide (AIP), produced and secreted by the bacteria, accumulates outside of the cells. When the cell density increases and the AIP concentration reaches a threshold, it activates the agr response, i.e. activation of secreted protein gene expression and subsequent repression of cell wall-associated protein genes. AgrB and AgrD are essential for the production of the autoinducing peptide which functions as a signal for quorum sensing. AgrB is a transmembrane protein. AgrB is involved in the proteolytic processing of AgrD and may have both proteolytic enzyme activity and a transporter facilitating the export of the processed AgrD peptide.	4.40383e-47
NZ_LS483301.1|WP_000620857.1|2192676_2193351_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|379188	pfam13443, HTH_26, Cro/C1-type HTH DNA-binding domain. This is a helix-turn-helix domain that probably binds to DNA.	1.58614e-10
NZ_LS483301.1|WP_000153640.1|2192285_2192504_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|197775	smart00530, HTH_XRE, Helix-turn-helix XRE-family like proteins.	9.85461e-11

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_000153640.1|2192285_2192504_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
MTILANTRKFKEAMFLKGFNLSDLSRETGVGISYLSQIINGKKIPSPKLAKKMAEVLQVEVNELFEFEVKEA
>NZ_LS483301.1|WP_000481967.1|2191963_2192281_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MFNINIDEDEARELLEQAINARVDELAKEKYFMTYKELSNYLNLSKPTIEELLINNGMKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEQLTAHMNIQNNDFKQVNIKKLLEARQ
>NZ_LS483301.1|WP_048667709.1|2191811_2191967_-|hypothetical-protein
MKIYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGEITTCENK
>NZ_LS483301.1|WP_001231376.1|2191623_2191827_-|hypothetical-protein
MRKQVIITKTVVGWYNIKDTQHNLMLNIPPKVFEQYFPDVSKDVQVACLEMDLSKITEIKNKKKVGS
>NZ_LS483301.1|WP_000403839.1|2191238_2191622_-|hypothetical-protein
MEIKQKYQLSKVVKILEVVLYEEDKFQSDKDYHYQDKALYEYALKLVHNGLFNILAELDFEDEAFLILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHTTDRKGHVIGMLEWALDYIAGNIEVEEL
>NZ_LS483301.1|WP_001103965.1|2190911_2191238_-|DUF1474-family-protein
MNWEINDLFSDLKLLKDRFEDLKDNHGWHFEELYPHEPNHNLNKDELIREGASYHERRIHNNQMFDLFHLYIEQFDKIIEKFHEIEKASSENFGEESDDAKNSIKVAE
>NZ_LS483301.1|WP_001002722.1|2189977_2190847_-|primase-C-terminal-domain-containing-protein
MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFNSFSKPKWSKLVNKLSVPIEANYKYARGVAIYGDMKDDTDENGNEYKKYRKDENVIYRDVLVLDYDDIPKLRILHDAITETLKGVSWMYHTTFNHRTESPRVRLYIALNEHISADEYRKYTKVLESKIGHPVDEGSYQPSRAMALPVKKSNDSIYIFKYNDAPILSVETLEEWSKELKSQYKESNKFKYPKRRDNEFWKSIAFGVSTGNRNQMLTSLIGVLLNRRVPDPLVYAYCFMWNENCNPPLNSREFNATFESIYKREHR
>NZ_LS483301.1|WP_061642142.1|2188595_2189966_-|DNA-primase
MTIFPDFLENKTMFDEKDFFDGNKFKFYEFALFLYEEYHGCYIDNRPHVFTGKKYEPLNIDVVRKITIKYIPSLREQQNKEVFQKLKTLCLGNHQEQCPARYIGLKNGIYDTVEERLNPFSPQYYITNIIDVDFDKGAQSDLIERFIKDISNEDEEVEQLIYEMIGYGLYRDNFLQVAFFYYSPGGNGKTTLLKLLHHFYNPENTTALSFNDLNDKFKPANLQGKLVNIADDIDPNRIKDTGNFKIIVTGNYITLEFKGQDAFEFKPYVKLIFASNELPMSNDKSEGFYRRMVIIPMLRKFGKGGQKKDPMLLNKLITPHNMSALLNLALKGLKRTLENNEIIEPKIARKTKEEYQFENNPVLQFIEDATDKDYRQLPVVEGRNTDKAYEIYQIWCVNNGYHHLNKFNFSKELAKIGYKTFSYYSRVEEKSKRFYKKENTINIYDVDGSILKKLTE
>NZ_LS483301.1|WP_001059599.1|2187996_2188353_-|hypothetical-protein
MNNIKGELVNYIKNNAGTSFVEIEKVFDENAFDYKGQGAYTSAVNNNIVYWYGWNKQAFNLVSDLVNDGVIEMNICESIIYIVDGKGLNFPILKSDDVDTYHWLPVTFTISKKEMECV
>NZ_LS483301.1|WP_001003076.1|2187731_2187995_-|hypothetical-protein
MNEKHNIFNRFGRNTSIQTVAVKDTYFIEYRKGDEIKYFPIELATVVKALNIDLHDSDTVSNYENGPKFDIKKLNLYTGDMDQIGDE
>NZ_LS483301.1|WP_000620857.1|2192676_2193351_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
MIRNRLSELLSERGLKISRVAKDVKIARSSLTSMAQNDSEMIRYDAIDKLCSYLHISPSEFFEHNPINFDFTFDEEPNYKINDVFEGFEVTANITHAFSIENFDFEILVDVELDNRQKLNFDLDVSYKETEKITNSQHRFIFTIKNEDENIGLKKYVDSLSAGLKNLLFKKINQKLSGYVSEIIVKNIDDIEELFPNKGEKSTTLHKEILQTDSRLSSDIFKEY
>NZ_LS483301.1|WP_048667711.1|2193364_2194537_+|tyrosine-type-recombinase/integrase
MASYEKRGNTWRYRISLGKDAETGKYKYISNSGFKRKSDAKHHAEMVERQLRNGDYIAPSTSTFKQVADDWISQYANEVKVSSVRAREKAINHAIERFNNKPIQTINKHEYQRFVNDISAQYSKNYVDSIIASTNMIFKYAYDMKLIRILPSEGIKRPKKKVSVEELEDTEIYKKFLEKDELFQFLEIAKNHHSPQNSFEVFCTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTINITKTYYNPNNNKKQFQILTPKTESSIGKISVDPHVIKLLKNYKTDVQDTWKNELYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLQLWIKAILKKTDITNKQISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASQKFSKLMENVSKDLF
>NZ_LS483301.1|WP_000240645.1|2194605_2196222_-|chaperonin-GroEL
MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEEGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM
>NZ_LS483301.1|WP_000917289.1|2196297_2196582_-|co-chaperone-GroES
MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE
>NZ_LS483301.1|WP_015581889.1|2196756_2197500_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease
MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVKKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEPKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVLTQIYGGQQVSPNTEKIIIIARKIPIFIFFVSIIGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFIIATTVSSLIFALAHNDFKFIPVYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP
>NZ_LS483301.1|WP_061642102.1|2197524_2198784_-|hypothetical-protein
MSYHWFKKMLLSTSILILSSSSLGLATHTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNITSPSVNSEMNNNETGTPHESNQTGNEGTGSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSTDSKPDPNNQNPSLNPKPDPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNPDPKPDPDNPKPNPDPKPDPDKPKPNPDPKPDPDKPKPNPNPKPDPNKPNPNPSPDPDQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR
>NZ_LS483301.1|WP_000522384.1|2198980_2199607_+|nitroreductase-family-protein
MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSNEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKTFNPVEDRFVIKK
>NZ_LS483301.1|WP_000867960.1|2199967_2200753_+|carbon-nitrogen-family-hydrolase
MKVQIYQLPIVFGDSSKNETQITQWFEKNMNAEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNNQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGEYVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK
>NZ_LS483301.1|WP_001549197.1|2201349_2201484_-|delta-lysin-family-phenol-soluble-modulin
MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTIGDLVKWIIDTVNKFTKK
>NZ_LS483301.1|WP_001105707.1|2201719_2202289_+|accessory-gene-regulator-AgrB
MNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQVLAKNIGKLIVMYTIAYILNIFLFTLITNLTFYLIRRHAHGAHAPSSFWCYVESIILFILLPLVIVNFHINFLIMIILTVISLGVISVYAPAATKKKPIPVRLIKRKKYYAIIVSLTLFIITLIIKEPFAQFIQLGIIIEAITLLPIFFIKEDLK

Crispr_ID: NZ_LS483301_12

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_12
• CRISPR_location: 2319412-2319562
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers
• Cas_protein_info: csa3

Consensus repeat of NZ_LS483301_12

Consensus_repeat	Method
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483301_12

>12.1|2319440|29|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder
TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA
>12.2|2319497|38|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder
GTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_12

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_12

>merge|NZ_LS483301|12|2319412-2319562|CRISPRCasFinder
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTAAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCTTTCTA

>NZ_LS483301|12|9|2319412-2319562|CRISPRCasFinder
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA	TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA	GTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCTTTCTA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_001292149.1|2332380_2332815_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA	unknown	unknown	gnl|CDD|227014
NZ_LS483301.1|WP_000370924.1|2324238_2325096_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223635
NZ_LS483301.1|WP_000115564.1|2320684_2321821_-|SAP-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|366887
NZ_LS483301.1|WP_045177733.1|2315917_2316583_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187554
NZ_LS483301.1|WP_000927363.1|2330236_2332369_+|BglG-family-transcription-antiterminator	unknown	unknown	gnl|CDD|226234
NZ_LS483301.1|WP_000908176.1|2325163_2325946_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224044
NZ_LS483301.1|WP_000808817.1|2314283_2314514_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000083807.1|2328663_2330202_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB	unknown	unknown	gnl|CDD|225123
NZ_LS483301.1|WP_001802298.1|2319893_2319998_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000495671.1|2318302_2319394_+|lytic-regulatory-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_001123303.1|2311367_2311781_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225556
NZ_LS483301.1|WP_000123393.1|2312238_2313612_-|EVE-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376640
NZ_LS483301.1|WP_061642134.1|2314544_2315483_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|224399
NZ_LS483301.1|WP_000019744.1|2317056_2318037_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB	unknown	unknown	gnl|CDD|224151
NZ_LS483301.1|WP_000070866.1|2310724_2311168_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223854
NZ_LS483301.1|WP_000334465.1|2326177_2327983_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)	unknown	unknown	gnl|CDD|234729
NZ_LS483301.1|WP_001790138.1|2322109_2322202_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000195429.1|2322654_2323827_+|IS256-like-element-IS256-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|307151
NZ_LS483301.1|WP_000160304.1|2309893_2310604_+|purine-nucleoside-phosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|180275
NZ_LS483301.1|WP_000003759.1|2316734_2317055_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA	csa3	COG0640_csa3_CAS-I-A	gnl|CDD|238042

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_LS483301.1|WP_000003759.1|2316734_2317055_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA	csa3	COG0640_csa3_CAS-I-A	3.8e-21	70.4	0.1

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_000370924.1|2324238_2325096_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase	gnl|CDD|223635	COG0561, Cof, Predicted hydrolases of the HAD superfamily [General function prediction only].	5.39747e-59
NZ_LS483301.1|WP_000115564.1|2320684_2321821_-|SAP-domain-containing-protein	gnl|CDD|366887	pfam02037, SAP, SAP domain. The SAP (after SAF-A/B, Acinus and PIAS) motif is a putative DNA/RNA binding domain found in diverse nuclear and cytoplasmic proteins.	3.91533e-06
NZ_LS483301.1|WP_045177733.1|2315917_2316583_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|187554	cd05243, SDR_a5, atypical (a) SDRs, subgroup 5. This subgroup contains atypical SDRs, some of which are identified as putative NAD(P)-dependent epimerases, one as a putative NAD-dependent epimerase/dehydratase. Atypical SDRs are distinct from classical SDRs. Members of this subgroup have a glycine-rich NAD(P)-binding motif that is very similar to the extended SDRs, GXXGXXG, and binds NADP. Generally, this subgroup has poor conservation of the active site tetrad; however, individual sequences do contain matches to the YXXXK active site motif, the upstream Ser, and there is a highly conserved Asp in place of the usual active site Asn throughout the subgroup. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Atypical SDRs include biliverdin IX beta reductase (BVR-B,aka flavin reductase), NMRa (a negative transcriptional regulator of various fungi), progesterone 5-beta-reductase like proteins, phenylcoumaran benzylic ether and pinoresinol-lariciresinol reductases, phenylpropene synthases, eugenol synthase, triphenylmethane reductase, isoflavone reductases, and others. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. In addition to the Rossmann fold core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	1.24936e-47
NZ_LS483301.1|WP_000927363.1|2330236_2332369_+|BglG-family-transcription-antiterminator	gnl|CDD|226234	COG3711, BglG, Transcriptional antiterminator [Transcription].	4.09729e-67
NZ_LS483301.1|WP_000908176.1|2325163_2325946_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224044	COG1119, ModF, ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA [Inorganic ion transport and metabolism].	4.88024e-103
NZ_LS483301.1|WP_000083807.1|2328663_2330202_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB	gnl|CDD|225123	COG2213, MtlA, Phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component [Carbohydrate transport and metabolism].	0
NZ_LS483301.1|WP_001292149.1|2332380_2332815_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA	gnl|CDD|227014	COG4668, MtlA, Mannitol/fructose-specific phosphotransferase system, IIA domain [Carbohydrate transport and metabolism].	2.08822e-62
NZ_LS483301.1|WP_001123303.1|2311367_2311781_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein	gnl|CDD|225556	COG3011, COG3011, Predicted thiol-disulfide oxidoreductase [General function prediction only].	3.14887e-46
NZ_LS483301.1|WP_000123393.1|2312238_2313612_-|EVE-domain-containing-protein	gnl|CDD|376640	pfam01878, EVE, EVE domain. This domain was formerly known as DUF55. Crystal structures have shown that this domain is part of the PUA superfamily. This domain has been named EVE and is thought to be RNA-binding.	3.86989e-06
NZ_LS483301.1|WP_061642134.1|2314544_2315483_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase	gnl|CDD|224399	COG1482, ManA, Phosphomannose isomerase [Carbohydrate transport and metabolism].	9.63085e-128
NZ_LS483301.1|WP_000019744.1|2317056_2318037_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB	gnl|CDD|224151	COG1230, CzcD, Co/Zn/Cd efflux system component [Inorganic ion transport and metabolism].	1.049e-108
NZ_LS483301.1|WP_000070866.1|2310724_2311168_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein	gnl|CDD|223854	COG0783, Dps, DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) [Inorganic ion transport and metabolism].	1.22744e-67
NZ_LS483301.1|WP_000334465.1|2326177_2327983_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)	gnl|CDD|234729	PRK00331, PRK00331, isomerizing glutamine--fructose-6-phosphate transaminase.	0
NZ_LS483301.1|WP_000195429.1|2322654_2323827_+|IS256-like-element-IS256-family-transposase	gnl|CDD|307151	pfam00872, Transposase_mut, Transposase, Mutator family.	0
NZ_LS483301.1|WP_000160304.1|2309893_2310604_+|purine-nucleoside-phosphorylase	gnl|CDD|180275	PRK05819, deoD, DeoD-type purine-nucleoside phosphorylase.	2.10672e-157
NZ_LS483301.1|WP_000003759.1|2316734_2317055_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA	gnl|CDD|238042	cd00090, HTH_ARSR, Arsenical Resistance Operon Repressor and similar prokaryotic, metal regulated homodimeric repressors. ARSR subfamily of helix-turn-helix bacterial transcription regulatory proteins (winged helix topology). Includes several proteins that appear to dissociate from DNA in the presence of metal ions.	1.8473e-17

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_000495671.1|2318302_2319394_+|lytic-regulatory-protein
MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK
>NZ_LS483301.1|WP_000019744.1|2317056_2318037_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB
MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH
>NZ_LS483301.1|WP_000003759.1|2316734_2317055_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA
MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL
>NZ_LS483301.1|WP_045177733.1|2315917_2316583_-|SDR-family-oxidoreductase
MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGIRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD
>NZ_LS483301.1|WP_061642134.1|2314544_2315483_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase
MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDISYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV
>NZ_LS483301.1|WP_000808817.1|2314283_2314514_-|hypothetical-protein
MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN
>NZ_LS483301.1|WP_000123393.1|2312238_2313612_-|EVE-domain-containing-protein
MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRISNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD
>NZ_LS483301.1|WP_001123303.1|2311367_2311781_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein
MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD
>NZ_LS483301.1|WP_000070866.1|2310724_2311168_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein
MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS
>NZ_LS483301.1|WP_000160304.1|2309893_2310604_+|purine-nucleoside-phosphorylase
MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE
>NZ_LS483301.1|WP_001802298.1|2319893_2319998_-|hypothetical-protein
MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK
>NZ_LS483301.1|WP_000115564.1|2320684_2321821_-|SAP-domain-containing-protein
MSVNARDLLVLHTNVNRLVGEEIFANKCLANNDVQIMNSIKKLIEAELLTTTNDFEVSIYKKTRPELQSILKSFGIKTTGNKPDLIKRIDDNFHIINNLDLPYVYIPTKKGEEILKKTEYLTSFIQSYGEISLERAYYLVENYIDENCDDKVAEIYKFEFQRKYDNGEFDFNHGYNFELNMLIDHYKRDVKDYDNARKYSNIYLYFGLRDFLKKLMSNYSYYDSKGNIDLNEIQNDLNRFINSSASGMYERLIYNENLSNNIMFELFKKDTQDYSDLEEQLIEKFINYVVSNVKKESRSNTLIELSKILENGYTIDKEEFKKEDDYLSKYIFTDIDYLKKLESKINVAIDIRSGEIHLVLDDDSLDILIQNQKYGNEF
>NZ_LS483301.1|WP_001790138.1|2322109_2322202_+|hypothetical-protein
MFIFKTTSKSHFHNNVKSLECIKIPINKNR
>NZ_LS483301.1|WP_000195429.1|2322654_2323827_+|IS256-like-element-IS256-family-transposase
MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK
>NZ_LS483301.1|WP_000370924.1|2324238_2325096_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase
MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAEHFLAE
>NZ_LS483301.1|WP_000908176.1|2325163_2325946_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein
MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEIRNEAHQLLKLVGMFAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE
>NZ_LS483301.1|WP_000334465.1|2326177_2327983_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)
MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE
>NZ_LS483301.1|WP_000083807.1|2328663_2330202_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB
MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA
>NZ_LS483301.1|WP_000927363.1|2330236_2332369_+|BglG-family-transcription-antiterminator
MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI
>NZ_LS483301.1|WP_001292149.1|2332380_2332815_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA
MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA

Crispr_ID: NZ_LS483301_13

• CRISPR_ID: NZ_LS483301_13
• CRISPR_location: 2448904-2449097
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483301_13

Consensus_repeat	Method
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CRT

spacers of NZ_LS483301_13

>13.1|2448927|33|NZ_LS483301|CRT
CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTG
>13.2|2448983|36|NZ_LS483301|CRT
TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA
>13.3|2449042|33|NZ_LS483301|CRT
CATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483301_13

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483301_13

>merge|NZ_LS483301|13|2448904-2449097|CRT
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA

>NZ_LS483301|13|4|2448904-2449097|CRT
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTG
TGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACT	TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTG
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483301.1|WP_061642031.1|2454422_2455427_-|ThiF-family-adenylyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|181084
NZ_LS483301.1|WP_001790034.1|2448673_2448844_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000643988.1|2450280_2450880_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA	unknown	unknown	gnl|CDD|234725
NZ_LS483301.1|WP_000503817.1|2453885_2454392_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB	unknown	unknown	gnl|CDD|223595
NZ_LS483301.1|WP_000592303.1|2440344_2443512_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|223911
NZ_LS483301.1|WP_000230173.1|2449238_2450261_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA	unknown	unknown	gnl|CDD|274250
NZ_LS483301.1|WP_000051206.1|2439431_2439596_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000184419.1|2446884_2448096_+|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|341042
NZ_LS483301.1|WP_000066900.1|2448197_2448548_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV	unknown	unknown	gnl|CDD|130944
NZ_LS483301.1|WP_000866971.1|2450886_2451120_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1	unknown	unknown	gnl|CDD|340452
NZ_LS483301.1|WP_000602937.1|2451585_2452071_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B	unknown	unknown	gnl|CDD|224677
NZ_LS483301.1|WP_000134528.1|2453389_2453884_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC	unknown	unknown	gnl|CDD|236483
NZ_LS483301.1|WP_000913019.1|2455596_2456202_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226628
NZ_LS483301.1|WP_000413865.1|2443628_2444894_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX	unknown	unknown	gnl|CDD|225224
NZ_LS483301.1|WP_000600967.1|2445525_2446290_-|VOC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379203
NZ_LS483301.1|WP_001549681.1|2445282_2445534_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483301.1|WP_000951058.1|2446451_2446892_+|winged-helix-DNA-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|197670
NZ_LS483301.1|WP_000259718.1|2452067_2453327_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA	unknown	unknown	gnl|CDD|238452
NZ_LS483301.1|WP_000808500.1|2451125_2451572_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE	unknown	unknown	gnl|CDD|223391
NZ_LS483301.1|WP_001161085.1|2439840_2440158_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483301.1|WP_061642031.1|2454422_2455427_-|ThiF-family-adenylyltransferase	gnl|CDD|181084	PRK07688, PRK07688, thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein; Validated.	4.78962e-132
NZ_LS483301.1|WP_000643988.1|2450280_2450880_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA	gnl|CDD|234725	PRK00317, mobA, molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA; Reviewed.	5.68918e-67
NZ_LS483301.1|WP_000503817.1|2453885_2454392_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB	gnl|CDD|223595	COG0521, MoaB, Molybdopterin biosynthesis enzymes [Coenzyme metabolism].	1.02752e-64
NZ_LS483301.1|WP_000592303.1|2440344_2443512_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit	gnl|CDD|223911	COG0841, AcrB, Cation/multidrug efflux pump [Defense mechanisms].	0
NZ_LS483301.1|WP_000230173.1|2449238_2450261_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA	gnl|CDD|274250	TIGR02666, Cyclic_pyranopterin_monophosphate_synthase, molybdenum cofactor biosynthesis protein A, bacterial. The model for this family describes molybdenum cofactor biosynthesis protein A, or MoaA, as found in bacteria. It does not include the family of probable functional equivalent proteins from the archaea. MoaA works together with MoaC to synthesize precursor Z from guanine. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Molybdopterin].	1.0538e-165
NZ_LS483301.1|WP_000184419.1|2446884_2448096_+|MFS-transporter	gnl|CDD|341042	cd17489, MFS_YfcJ_like, Escherichia coli YfcJ, YhhS, and similar transporters of the Major Facilitator Superfamily. This subfamily is composed of Escherichia coli membrane proteins, YfcJ and YhhS, Bacillus subtilis uncharacterized MFS-type transporter YwoG, and similar proteins. YfcJ and YhhS are putative arabinose efflux transporters. YhhS has been implicated glyphosate resistance. YfcJ-like arabinose efflux transporters belong to the bacterial MdtG-like and eukaryotic solute carrier 18 (SLC18) family of the Major Facilitator Superfamily (MFS) of transporters. MFS proteins are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	1.27961e-72
NZ_LS483301.1|WP_000413865.1|2443628_2444894_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX	gnl|CDD|225224	COG2348, COG2348, Peptidoglycan interpeptide bridge formation enzyme [Cell wall/membrane/envelope biogenesis].	4.8324e-143
NZ_LS483301.1|WP_000066900.1|2448197_2448548_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV	gnl|CDD|130944	TIGR01889, Pleiotropic_Regulator_Of_Virulence, staphylococcal accessory regulator family. This model represents a family of transcriptional regulatory proteins in Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis. Some members contain two tandem copies of this region. This family is related to the MarR transcriptional regulator family described by pfam01047. [Regulatory functions, DNA interactions].	2.64009e-20
NZ_LS483301.1|WP_000866971.1|2450886_2451120_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1	gnl|CDD|340452	cd00754, Ubl_MoaD, ubiquitin-like (Ubl) domain found in molybdenum cofactor biosynthesis protein D (MoaD) and similar proteins. MoaD, also termed molybdopterin synthase sulfur carrier subunit, or MPT synthase subunit 1, or MPT synthase small subunit, or molybdopterin-converting factor small subunit, or molybdopterin-converting factor subunit 1, is a conserved small sulfur carrier protein that has beta-grasp ubiquitin-like (Ubl) fold involved in biosynthesis of the molybdenum cofactor (Moco), an essential cofactor of a diverse group of redox enzymes. MoaD is activated in an ATP-dependent manner by sulfurtransferases similar to the activation mechanism of ubiquitin-activating enzyme E1.	8.16473e-25
NZ_LS483301.1|WP_000134528.1|2453389_2453884_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC	gnl|CDD|236483	PRK09364, moaC, cyclic pyranopterin monophosphate synthase MoaC.	3.63862e-98
NZ_LS483301.1|WP_000913019.1|2455596_2456202_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|226628	COG4148, ModC, ABC-type molybdate transport system, ATPase component [Inorganic ion transport and metabolism].	3.32197e-115
NZ_LS483301.1|WP_000600967.1|2445525_2446290_-|VOC-family-protein	gnl|CDD|379203	pfam13468, Glyoxalase_3, Glyoxalase-like domain. This domain is related to the Glyoxalase domain pfam00903.	1.50083e-38
NZ_LS483301.1|WP_000951058.1|2446451_2446892_+|winged-helix-DNA-binding-protein	gnl|CDD|197670	smart00347, HTH_MARR, helix_turn_helix multiple antibiotic resistance protein.	2.35323e-15
NZ_LS483301.1|WP_000259718.1|2452067_2453327_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA	gnl|CDD|238452	cd00887, MoeA, MoeA family. Members of this family are involved in biosynthesis of the molybdenum cofactor (MoCF), an essential cofactor of a diverse group of redox enzymes. MoCF biosynthesis is an evolutionarily conserved pathway present in eubacteria, archaea and eukaryotes. MoCF contains a tricyclic pyranopterin, termed molybdopterin (MPT). MoeA, together with MoaB, is responsible for the metal incorporation into MPT, the third step in MoCF biosynthesis. The plant homolog Cnx1 is a MoeA-MogA fusion protein. The mammalian homolog gephyrin is a MogA-MoeA fusion protein, that plays a critical role in postsynaptic anchoring of inhibitory glycine receptors and major GABAa receptor subtypes.	9.49423e-160
NZ_LS483301.1|WP_000808500.1|2451125_2451572_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE	gnl|CDD|223391	COG0314, MoaE, Molybdopterin converting factor, large subunit [Coenzyme metabolism].	5.56799e-58
NZ_LS483301.1|WP_000602937.1|2451585_2452071_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B	gnl|CDD|224677	COG1763, MobB, Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein [Coenzyme metabolism].	4.35501e-50

Protein sequences

>NZ_LS483301.1|WP_001790034.1|2448673_2448844_+|hypothetical-protein
MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNGMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS
>NZ_LS483301.1|WP_000066900.1|2448197_2448548_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV
MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN
>NZ_LS483301.1|WP_000184419.1|2446884_2448096_+|MFS-transporter
MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFLVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN
>NZ_LS483301.1|WP_000951058.1|2446451_2446892_+|winged-helix-DNA-binding-protein
MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND
>NZ_LS483301.1|WP_000600967.1|2445525_2446290_-|VOC-family-protein
MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV
>NZ_LS483301.1|WP_001549681.1|2445282_2445534_+|hypothetical-protein
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Self-targeting detection

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***********.********

52. spacer 10.3|1902444|18|NZ_LS483301|CRT matches to position: 1902271-1902288, mismatch: 1, identity: 0.944

tggccaatagtcagcttt	CRISPR spacer
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***********.******

53. spacer 13.2|2448983|36|NZ_LS483301|CRT matches to position: 1902209-1902244, mismatch: 1, identity: 0.972

tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta	CRISPR spacer
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************************.***********

54. spacer 4.1|836133|29|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to position: 886176-886204, mismatch: 2, identity: 0.931

tgcattgtttgtagaatttcttttcgaaa	CRISPR spacer
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*******..********************

55. spacer 4.1|836133|29|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to position: 957172-957200, mismatch: 2, identity: 0.931

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*******..********************

56. spacer 4.1|836133|29|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to position: 1704210-1704238, mismatch: 2, identity: 0.931

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*******..********************

57. spacer 4.1|836133|29|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to position: 2076934-2076962, mismatch: 2, identity: 0.931

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********.***********.********

58. spacer 4.1|836133|29|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to position: 2646359-2646387, mismatch: 2, identity: 0.931

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*******..********************

59. spacer 5.1|841535|26|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to position: 804585-804610, mismatch: 2, identity: 0.923

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***** ******.*************

60. spacer 5.1|841535|26|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to position: 936259-936284, mismatch: 2, identity: 0.923

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**.*****.*****************

61. spacer 5.1|841535|26|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to position: 936315-936340, mismatch: 2, identity: 0.923

ccgccagcttctgtgttggggccccg	CRISPR spacer
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**.*****.*****************

62. spacer 8.3|1154292|36|NZ_LS483301|CRT matches to position: 795028-795063, mismatch: 2, identity: 0.944

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************************** .********

63. spacer 9.1|1158165|37|NZ_LS483301|CRT matches to position: 886171-886207, mismatch: 2, identity: 0.946

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*******.****************.************

64. spacer 9.1|1158165|37|NZ_LS483301|CRT matches to position: 1704205-1704241, mismatch: 2, identity: 0.946

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*******.****************.************

65. spacer 9.1|1158165|37|NZ_LS483301|CRT matches to position: 2076929-2076965, mismatch: 2, identity: 0.946

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*******.***.*************************

66. spacer 9.1|1158165|37|NZ_LS483301|CRT matches to position: 2646356-2646392, mismatch: 2, identity: 0.946

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*******.****************.************

67. spacer 9.1|1158165|37|NZ_LS483301|CRT matches to position: 2892850-2892886, mismatch: 2, identity: 0.946

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*******.***************.*************

68. spacer 9.2|1158221|37|NZ_LS483301|CRT matches to position: 1158333-1158369, mismatch: 2, identity: 0.946

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agctggcggaaagtcagcttacaataatgtgcaagtt	Protospacer
*****.**.****************************

69. spacer 9.2|1158221|37|NZ_LS483301|CRT matches to position: 2066123-2066159, mismatch: 2, identity: 0.946

agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtgcaagtt	CRISPR spacer
agctgacgaaaagtcagcttacgataatgtgcaggtt	Protospacer
**********************.**********.***

70. spacer 9.2|1158221|37|NZ_LS483301|CRT matches to position: 2892795-2892831, mismatch: 2, identity: 0.946

agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtgcaagtt	CRISPR spacer
agctggcggaaagtcagcttacaataatgtgcaagtt	Protospacer
*****.**.****************************

71. spacer 10.2|1902386|20|NZ_LS483301|CRT matches to position: 809129-809148, mismatch: 2, identity: 0.9

gaatttcgaaaagaaattct	CRISPR spacer
gaatttcaaaaaggaattct	Protospacer
*******.*****.******

72. spacer 13.1|2448927|33|NZ_LS483301|CRT matches to position: 841571-841603, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********** *************** ******

73. spacer 13.1|2448927|33|NZ_LS483301|CRT matches to position: 1367738-1367770, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********** *************** ******

74. spacer 13.1|2448927|33|NZ_LS483301|CRT matches to position: 1459589-1459621, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcatcttctg	Protospacer
********** ***************.******

75. spacer 13.1|2448927|33|NZ_LS483301|CRT matches to position: 2066190-2066222, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********** *************** ******

76. spacer 13.1|2448927|33|NZ_LS483301|CRT matches to position: 2727303-2727335, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********** *************** ******

77. spacer 13.2|2448983|36|NZ_LS483301|CRT matches to position: 1704210-1704245, mismatch: 2, identity: 0.944

tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta	CRISPR spacer
tgcattgcctgtagaatttcttttcgaaattctcta	Protospacer
*******.****************.***********

78. spacer 13.2|2448983|36|NZ_LS483301|CRT matches to position: 2076934-2076969, mismatch: 2, identity: 0.944

tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta	CRISPR spacer
tgcattgtctgtagaatttcctttcgaaattctcta	Protospacer
********************.***.***********

79. spacer 13.3|2449042|33|NZ_LS483301|CRT matches to position: 841571-841603, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********************..***********

80. spacer 13.3|2449042|33|NZ_LS483301|CRT matches to position: 1367738-1367770, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********************..***********

81. spacer 13.3|2449042|33|NZ_LS483301|CRT matches to position: 2066190-2066222, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********************..***********

82. spacer 13.3|2449042|33|NZ_LS483301|CRT matches to position: 2727303-2727335, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********************..***********

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_LS483301_5	5.1|841535|26|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder	841535-841560	26	NZ_CP022541	Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence	333735-333760	5	0.808
NZ_LS483301_5	5.1|841535|26|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder	841535-841560	26	NZ_CP034332	Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence	3359-3384	5	0.808
NZ_LS483301_5	5.1|841535|26|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder	841535-841560	26	NZ_CP022605	Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence	715511-715536	5	0.808
NZ_LS483301_4	4.1|836133|29|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder	836133-836161	29	MN693281	Marine virus AFVG_25M371, complete genome	6448-6476	7	0.759

1. spacer 5.1|841535|26|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022541 (Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808

ccgccagcttctgtgttggggccccg	CRISPR spacer
acgccagcttctgtgttgaggcctta	Protospacer
 *****************.****...

2. spacer 5.1|841535|26|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034332 (Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808

ccgccagcttctgtgttggggccccg	CRISPR spacer
ccgccagcttctgtgtctgggcctac	Protospacer
****************. *****.  

3. spacer 5.1|841535|26|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022605 (Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808

ccgccagcttctgtgttggggccccg	CRISPR spacer
ccgccagcttctgtgtttggccctga	Protospacer
***************** ** **. .

4. spacer 4.1|836133|29|NZ_LS483301|CRISPRCasFinder matches to MN693281 (Marine virus AFVG_25M371, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

tgcattgtttgtagaatttcttttcgaaa	CRISPR spacer
tgcattgtttgtaggatttcttctaagtg	Protospacer
**************.*******.* .. .

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	410230 : 426921	28	Staphylococcus_phage(100.0%)	integrase,terminase,coat	attL 399707:399721|attR 419591:419605
DBSCAN-SWA_2	773163 : 780984	10	Hokovirus(16.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	792956 : 807743	14	uncultured_Caudovirales_phage(50.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	982638 : 1037745	53	Streptococcus_phage(28.57%)	protease,bacteriocin,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	1057731 : 1066204	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_6	1426584 : 1479805	37	Staphylococcus_phage(35.71%)	lysis,transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	1528729 : 1577793	49	Staphylococcus_phage(47.83%)	tail,holin,plate,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	1584006 : 1619377	55	Staphylococcus_phage(92.45%)	head,tail,terminase,protease,integrase,portal,capsid	attL 1570887:1570904|attR 1617894:1617911
DBSCAN-SWA_9	1675832 : 1684144	7	Staphylococcus_phage(16.67%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_10	1731776 : 1788709	55	Streptococcus_phage(42.86%)	protease,integrase,transposase,tRNA	attL 1768323:1768339|attR 1793283:1793299
DBSCAN-SWA_11	1907386 : 2031650	113	Staphylococcus_phage(89.55%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_12	2077590 : 2219139	171	Staphylococcus_phage(79.65%)	head,tail,terminase,holin,tRNA,protease,coat,integrase,portal,transposase,capsid	attL 2177735:2177754|attR 2194604:2194623

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_LS483301|410230:426921|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MRKQVIITKTVVGWYNIKDTQHNLMLNIPPKVFEQYFPDVSKDVQVACLEMDLSKITEIKNKKKVGS
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MTDDNIDDHIVKNHLEMIVDRVANDKEFYIFDSLIQGRSFKDISNVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE
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MFMTVKEVAQLLRISERHTYKLLQKNVIPHTKIGGKILVNKERLLETLEKKEVK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001611932.1|414976_415141_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_001138305.1|415141_415414_+	winged helix-turn-helix domain-containing protein	Q4ZE77	Staphylococcus_phage	1.2e-43	94.4
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WP_061642140.1|416544_417414_+	primase C-terminal domain-containing protein	A0A1W6JQL5	Staphylococcus_phage	6.9e-157	93.1
WP_000390455.1|417430_418888_+	hypothetical protein	A0A1W6JQD6	Staphylococcus_phage	1.0e-277	96.1
WP_001039168.1|419188_419551_+	hypothetical protein	A0A1W6JQD5	Staphylococcus_phage	8.9e-66	99.2
WP_000998181.1|419552_419837_+	hypothetical protein	A0A1W6JQE4	Staphylococcus_phage	1.9e-47	95.7
419591:419605	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_048667708.1|421382_422036_+	hypothetical protein	Q4ZE82	Staphylococcus_phage	8.4e-115	99.1
WP_048667706.1|422088_422616_+|coat	spore coat protein	Q4ZE87	Staphylococcus_phage	4.9e-89	97.7
WP_025174984.1|422747_422960_+	hypothetical protein	Q4ZE86	Staphylococcus_phage	3.2e-31	97.1
WP_001281787.1|422956_423526_+|terminase	terminase small subunit	A0A1W6JQF0	Staphylococcus_phage	4.6e-101	97.9
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WP_000705255.1|424884_425664_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_LS483301|773163:780984|DBSCAN-SWA
ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTCGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGTTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTAGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCACCTAAAGCTAATGTTGTGATAACAGCACCAGCTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGGGTCAAAATAAGAGGAGGGCGTTTTTTTAAGTAAGGAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTAATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGATGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACATGGAATGTGATGTGCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG
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MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL
>NZ_LS483301|773163:780984|779832_780984_+|WP_001217785.1|DBSCAN-SWA
MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHAMCTHSLAKDDIYAAAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKYHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML
>NZ_LS483301|773163:780984|774218_774905_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA
MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000244412.1|773163_774219_-	two-component system sensor histidine kinase SaeS	A0A1V0SGX0	Hokovirus	2.1e-14	30.0
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WP_001037807.1|774879_775353_-	DoxX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001093553.1|775695_776136_-	DM13 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000637687.1|776415_777000_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001062972.1|777098_777812_-	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	A0A1U9WRB6	Streptococcus_virus	6.5e-52	43.5
WP_000941336.1|777815_778235_-	6-carboxytetrahydropterin synthase QueD	S4U060	uncultured_phage	6.3e-07	28.7
WP_000446724.1|778236_778905_-	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	9.6e-66	57.5
WP_000604514.1|779255_779849_+	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	4.4e-38	42.9
WP_001217785.1|779832_780984_+	anthranilate synthase component I family protein	A0A0B5J984	Pandoravirus	1.6e-23	35.7

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_LS483301|792956:807743|DBSCAN-SWA
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MVINEIDFYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIS
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MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI
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MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL
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MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000663030.1|792956_794015_+	histidinol-phosphate transaminase	A0A1X6WGT4	Pacmanvirus	7.9e-22	26.7
WP_000197271.1|794365_794908_+	5'-3'-deoxyribonucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_000429014.1|795587_796505_-	diacylglycerol kinase family lipid kinase	A0A1V0SBJ0	Catovirus	3.7e-07	22.0
WP_001790641.1|796595_796697_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000193751.1|796774_798280_-	peptide MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	2.0e-58	32.2
WP_000930014.1|798620_799121_-	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	E7DN65	Pneumococcus_phage	5.9e-52	71.5
WP_001068497.1|799140_800007_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_000692521.1|800807_801206_+	class Ib ribonucleoside-diphosphate reductase assembly flavoprotein NrdI	A0A2H4J545	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-52	72.0
WP_000855505.1|801168_803274_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A0A2H4J2N6	uncultured_Caudovirales_phage	0.0e+00	91.7
WP_000562498.1|803391_804363_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A2H4J4P3	uncultured_Caudovirales_phage	4.2e-171	91.3
WP_000499195.1|804876_805032_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000876318.1|805070_806042_+	ABC transporter permease	A0A2H4IY97	uncultured_Caudovirales_phage	4.3e-139	78.9
WP_001245577.1|806028_806985_+	iron chelate uptake ABC transporter family permease subunit	A0A2H4J116	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-05	57.8
WP_000616842.1|806981_807743_+	ABC transporter ATP-binding protein	Q9EMR9	Amsacta_moorei_entomopoxvirus	8.5e-18	31.6

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_LS483301|982638:1037745|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_LS483301|1057731:1066204|DBSCAN-SWA
AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCTTCCGATTGGAAAATTATGCAAGAGAGTTGTAACATGTTGGATTATTTTGAAATTCCGTACGAAAAACAAGTAGTATCCGCACATCGTACGCCAAAAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCAATTGTTCAAATGCCAGGAGGTATTCCGGTTGCAACGACTGCAATTGGTGCAGCAGGTGCTAAAAACGCAGGTATACTTGCAGCAAGAATGTTAAGTATTCAAAATCCTTCTTTAGTTGAAAAACTAAATCAGTATGAATCTTCGTTAATTCAAAAAGTGGAGGACATGCAAAATGAACTTCAATAAATTAAAGTTTGGTGCGACTATTGGCATTATTGGTGGTGGTCAGCTTGGAAAGATGATGGCACAATCAGCTCAAAAAATGGGTTATAAAGTGGTTGTATTGGATCCTTCTGAAGATTGTCCATGTAGATACGTTGCACACGAATTTATACAAGCCAAGTATGACGATGAAAAGGCACTCAATCAATTAGGACAAAAATGTGATGTGATTACTTATGAATTTGAAAACATTTCAGCCCAACAATTAAAACTATTATGTGAAAAGTACAATATTCCGCAAGGTTACCAAGCTATACAGTTATTACAAGATCGCTTAACTGAAAAAGAAACATTAAAAAGTGCTGGTACCAAAGTTGTCCCGTTCATTTCAGTAAAAGAATCTACAGATATTGACAAAGCAATTGAAACATTAGGATATCCTTTTATTGTAAAAACTAGATTTGGTGGCTACGATGGCAAAGGTCAAGTTTTAATTAACAACGAAAAAGACTTACAAGAAGGTTTTAAATTAATTGAAACTAGTGAATGCGTAGCTGAAAAATATTTGAATATCAAGAAAGAAGTATCTCTTACTGTTACAAGAGGAAACAACAATCAAATCACTTTTTTCCCATTACAAGAAAATGAGCATAGAAATCAAATACTTTTCAAAACAATTGTTCCAGCGAGAATAGATAAAACAGCTGAGGCGAAAGAGCAAGTTAATAAAATTATCCAATCGATTCATTTCATTGGAACATTTACAGTTGAATTTTTTATAGATAGTAACAACCAATTGTATGTGAACGAGATAGCACCAAGGCCTCACAATTCCGGACATTATTCAATTGAAGCATGTGATTATTCACAATTTGATACTCATATTTTAGCAGTTACCGGACAATCATTACCAAATTCAATTGAATTATTAAAGCCAGCAGTCATGATGAACTTACTAGGTAAAGATTTAGATTTATTGGAAAATGAATTTAATGAACATCCAGAGTGGCACTTACATATTTATGGTAAGTCTGAGCGTAAAGATAGCAGAAAAATGGGGCATATGACTGTACTAACGAATGATGTAAACCAAACTGAACAAGATATGTACGCTAAATTTGAGGGGAGTAATTAAAGCATGACATTATTATATGAAGGAAAAGCGAAGCGCATTTTCTCAACAAATCAAGAAAATGAATTAAGAGTTGAATATAAAGATGAAGTTACTGCTGGAAACGGGGCTAAGAAAGACACAATGGCAGGTAAGGGGCGATTAAATAATCAAATTACTTCTATTATATTTAAATATTTACAAGAAAATGGAATAGAAAGTCACTTTATTAAACAATTATCTGAAACAGAACAATTAGTTAAGCCTGTGAAAATAATTCCATTAGAAGTAGTTGTTCGTAATATTGCTAGTGGATCTATTACAAAGCGTTTAGGTTTTGAAAATGGTGAAGTTTTTAGAGAACCACTTGTAGAATTTTTCTATAAAAATGATGCGTTAAATGATCCGTTGATAACGGATGACCATGTTAAATTGCTCAATATAGCATCAGATGAAGATATTGAAATACTAAAATCCAAAGCATTAAAGATTAATAATGTGTTGAAACAATTAATGGATGCTATGAATTTAAAATTAGTAGATTTTAAAATCGAATTTGGAAAGACTGAGACTGGTCAAATTTTGTTAGCGGATGAAATATCTCCAGATACATGTCGAATTTGGGATAAAGCTACCAATGCAAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAATAACACTGGATCACTGATTGAAACATATCAAATATTTTTAAACAAATTGGAGGATTTAAAATAATGAAAACAATTGAACTACATATCACATTACAACCACAAGTATTAGATACGCAAGGACAAACGCTTACTCGAGCTGTACATGACTTAGGTTATGCACAAGTGAATGATATTCGTGTAGGAAAAGTATTATATATGACAGTGGATGAGGTTAGTGATGAAAAGGTACACAACATTATTACAACTCTAAGTGAAAAATTGTTTGCAAATACAGTGATTGAAGAATATAGCTATAAAGTGTTAGATGATGAAAAGGAGAATGCATAAAATGAAATTTGCGGTTCTTGTTTTTCCAGGTTCGAATTGTGATAGAGACATGTTTAATGCTGCTATTAAAAGTGGTGTTGAAGCGGAATATGTAGATTATAGAGAAACATCACTAAGTGGATTTGATGGCGTACTTATTCCTGGTGGATTTTCATTCGGGGATTACTTAAGATCTGGGGCAATGGCTAGTGTAGCGCCGATTATTTCGGAAGTTAAACGTCTTGCAGCTGAAGGTAAGCCAGTATTAGGTGTTTGTAATGGGTTTCAAATTTTAACTGAAATAGGCTTATTACCTGGTGCATTATTGCATAACGATTCACATTTATTTATTAGTAGAAATGAAGAGTTAGAAATAGTGAATAATCAAACGGCATTTACAAATCTTTATGAACAAGGTGAAAAAGTTATATATCCTGTAGCTCACGGTGAAGGTCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCAACAATTAAAAGATAACAATCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAACAACATGTCTAAATTTATCGAACCAAGCGTTGAAGAAATTAAACTTGAAAAAGTATATCAAGATATGGGATTAAGTGATCAAGAATATGAAAAAGTTTGCGATATTTTAGGCAGACAACCTAACTTTACAGAAACAGGTATCTTTTCTGTTATGTGGAGTGAACATTGCTCTTATAAACATTCTAAACCGTTTTTAAAGCAATTTCCTACGTCAGGTGACCATGTGCTTATGGGGCCTGGTGAAGGTGCAGGGGTAGTCGATATAGGTGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTAGAGTCTCACAATCATCCATCAGCAATTGAACCATATCAAGGGGCTGCTACAGGCGTTGGTGGAATCATTCGTGACATTGTCTCTATTGGGGCTAGACCTATTAATTTGTTAAACAGTCTTAGATTTGGAGAATTAGATAATAAACAAAACCAAAGATTACTTAAAGGTGTTGTAAAGGGTATCGGAGGTTATGGTAACTGCATTGGTATTCCAACAACTGCTGGTGAAATCGAATTTGATGAACGTTATGATGGCAATCCACTTGTTAATGCAATGTGTGTTGGTGTTATCAATCACGACATGATTCAAAAAGGCACAGCAAAAGGTGTAGGTAATTCGGTCATTTATGTTGGTTTGAAAACTGGTCGAGATGGTATTCATGGTGCTACTTTTGCATCTGAAGAATTGACGGAAGAAAGCGAAAGTAAACGACCTTCTGTACAAATCGGTGATCCATTTGTAGGTAAAAAATTAATGGAAGCAACACTTGAAGCAATTACATTTGATGAATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCTGCTGGTTTAACATCTTCATCGTCTGAAATGGCGGCAAAAGGTGGTAGTGGGTTACATTTGAGATTAGAACAAGTGCCAACACGTGAGCCAGGTATTTCTCCTTATGAAATGATGCTTTCAGAAACTCAAGAACGTATGTTACTAGTTGTTGAAAAAGGTACTGAACAAAAATTCTTAGATTTATTTGATAAGCACGAATTGGATAGTGCTGTTATAGGTGAAGTTACAGATACAAATCGTTTTGTTTTAACATATGATGACGAAGTTTATGCTGACATTCCAGTTGAACCACTAGCTGATGAAGCACCTGTATATATTTTAGAAGGAGAAGAAAAAGATTATAATACTTCTAAAAATGATTATACACACATCGATGTTAAAGATACTTTCTTTAAATTACTTAAGCATCCGACTATAGCATCTAAACACTATTTATATGATCAATACGACCAACAAGTTGGTGCCAATACGATAATTAAGCCAGGACTTCAAGCATCGGTAGTACGTGTGGAAGGCACAAATAAGGCAATTGCTTCAACAATTGATGGTGAAGCGCGTTATGTATATAACAATCCATATGAAGGTGGAAAGATGGTAGTAGCTGAAGCTTATCGAAATTTAATTGCCGTGGGTGCAACACCATTAGCAATGACAGATTGTTTAAATTATGGTTCTCCTGAAAAGAAAGAAATCTATCAACAGTTGATAGATTCAACGAAAGGTATGGCAGAAGCATGCGACATTCTTAAGACACCAGTAGTTTCTGGTAATGTATCTTTATATAACGAAACGAAAGGTACTTCTATTTTCCCAACACCAGTTGTTGGAATGGTAGGTTTGATTGAAAATGTAAATTATTTAAATGATTTTGAACCTCAAGTTGGAGATAAATTATATTTAATCGGTGATACTAAGGACGACTTTGGTGGTAGTCAACTTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ
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MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000861572.1|1057731_1058214_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	6.2e-22	44.7
WP_001010412.1|1058200_1059325_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_000174053.1|1059328_1060033_+	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4R1E8	Synechococcus_phage	7.3e-48	42.1
WP_000848350.1|1060032_1060296_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_015581815.1|1060297_1060969_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase I	NA	NA	NA	NA
WP_000032727.1|1060961_1063151_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	1.0e-140	39.7
WP_000483713.1|1063129_1064614_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	3.2e-45	31.7
WP_000030812.1|1064606_1065635_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.3e-61	41.4
WP_000238664.1|1065637_1066204_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	6.1e-29	40.1

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_LS483301|1426584:1479805|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000809131.1|1428189_1428390_-	cold-shock protein	Q9AZD3	Lactococcus_phage	8.4e-18	66.2
WP_000269923.1|1428560_1428869_-	DUF1033 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001215907.1|1429031_1429301_+	acylphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_001788788.1|1429319_1429949_+|lysis	5-bromo-4-chloroindolyl phosphate hydrolysis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000138413.1|1429980_1431117_+	toxic anion resistance protein	A0A291I9K4	Lactobacillus_phage	7.4e-34	28.3
WP_001039275.1|1432129_1433473_-	branched-chain amino acid transport system II carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_061642129.1|1433697_1435584_-	nitric oxide reductase activation protein NorD	NA	NA	NA	NA
WP_061642128.1|1435597_1436389_-	MoxR family ATPase	R4TG24	Halovirus	3.3e-12	34.2
WP_000902175.1|1436569_1436773_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_061642127.1|1436801_1437611_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001115440.1|1438190_1439459_-	dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_061642126.1|1439472_1442271_-	2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component	NA	NA	NA	NA
WP_000195429.1|1442396_1443569_+|transposase	IS256-like element IS256 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	3.5e-135	100.0
WP_000166801.1|1443886_1445242_-	sensor histidine kinase ArlS	A0A1V0SGX0	Hokovirus	3.5e-14	27.8
WP_000192137.1|1445238_1445898_-	response regulator transcription factor ArlR	W8CYM9	Bacillus_phage	1.1e-34	33.8
WP_001788795.1|1446159_1446291_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000093392.1|1446810_1447296_+|transposase	IS200/IS605 family transposase	A0A1P8BMC0	Lactococcus_phage	4.9e-19	35.4
WP_111769689.1|1447426_1448041_-	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000160904.1|1448057_1449128_-	undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_000746372.1|1479301_1479805_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_LS483301|1528729:1577793|DBSCAN-SWA
CTTATGGATATAAACGGTTTAATAATCTTGGGAATGGCGCTGTTTCACGAACGTGTTCAACACCAGAAATCCATGCTACTGTACGCTCTAAACCTAAACCAAATCCACAGTGTGGCACACTACCATAACGACGTAAGTCTAAGTAGTAACTATATGCTTCTTCGTCTAATCCATGTTCTTTAACGCGTTGTTCTAACAATTCTAAGTCATCCACACGTTCAGATCCACCAATAATTTCACCGTATCCTTCAGGTGCAATTAAGTCTGCACATAATACAGTTTCTTCATTTTCAGGATTTGGTTGCATATAGAAAGGCTTAATTTTAGTTGGATAATTAGTAATAAACACCGGTAAATCATAATGATTAGCAATGGCTGTTTCATGTGGCGCACCAAAATCTTCGCCCCATTCAATATCATCAAAGCCTTCTGCTTTTAAGAATTCAATTGCATCATCATATGAAATTCTAGGGAATGGTGTCGCAACTTTTTCAAGTTTTGATGTATCACGCTCTAAAATTTTCAACTCTAGTTTACAATTTTCTAAAACTGATTTTACAACATGTGTTACATATTGTTCTTGAATTTCTAAACTTTCAGCATGATTTGTGAAAGCCATTTCTCCTTCAATCATCCAGAACTCGATCAAGTGTCTACGTGTTTTTGATTTTTCAGCTCTGAAAGTTGGACCAAATGAAAATACTTTTCCGTGTGCCATTGCTGCAGCTTCTAAGTATAACTGACCACTTTGAGATAAAAACGCATCTTGATCAAAGTATTTAGTATGGAATAATTCACTTGTACCTTCTGGCGCACTTGCTGTCAAAATTGGTGGATCAACCTTTGTAAATCCATCTTTGTTGAAAAATTCATACGTTGCACGAATAACTTCATTTCTAATTTTCATTACAGCATGTTGTTTTTTAGAACGTAACCATAAATGACGGTGATCCATTAAGAATTCTGTACCATGATTTTTAGGTGTAATCGGATAGTCATGCGCTTCTGAAATAACTTCAATTGATTTCACTTGCATTTCGTATCCTAAGTCAGAACGATTATCTTCTGTAATTGTGCCTGTAACGTATAGAGATGATTCTTGAGTAATTTCTTTCGCAAGTTTGAATACCTCTTCATCAACTTCTGATTTAACTACTACGCCTTGCATAAAGCCTGTTCCATCACGTAATTGTAAAAAGGCGATTTTACCACTTGAACGTTTATTTGTTAACCAAGCACCAATTGTAACGTCTTGGTTTAAATGATCTTTCGCTTGTTTAATCGTTGTTTTCATAACCATTCTCCTATTTATTTTTTCGTTATACAATACTCATTCATTTTAACAAAATCCGCTTTCAAGTTCTAGAACTAGACTAAAAGATAACGTGTAAATGGTAATGATTTACGCACAGATTTGAACATTAATTTATATTAAGACAATACAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAGAACATAGCACATGTCATGTCACAAGAATTTTACTTTGTATTTCACTTTTTCTTTTTTTGAATTTGTCTTAATAATTTTCCAAACTGTTGAATGTCGCCTTTTTTCTGACGATAATTTTCAAGTGTTTGTTCAAAAAAGTTTTTATAATTACTGTTTATGAGTCGATCATCAAATGAAACTATTATGCCGCGATCATTTTCATTTCTAATTAATCTTCCAAGTCCTTGTCTAAAACGTGTAACTGCATCAGGTAATACATATTCCTTGAAAGTTGAAGTGAATTCAGAATCCATAAGCCAATATTTTGCATTATGCTTGTTCATAAACGGTAACTTCGCTATCATCACACATTTAATACCATTTGCTTGAAAATCAAAACCTTCAAAAAATGTTGACGTACCAAGCAGTATGGCCTTATCAAAATTATTAAACTGTTGTACTATTTTATAATTTTGGTTCTGCTGTTGTGTTAATACAACATAATCTTCAAATTCTGGCAATTCATTTAGCATATCTTGTACCATATGCATCATTTTATAACTCGTAAATAAGACTAAACATTTTGATGACGTTATAGTCGTATATTCAATAATATAGCTTACAATCGATGCTACATACTCATCTATATTTTTATATTGATAAGATGCTACATCACTCGGTATAAATACACTTGTATTTTTTGCACTTTGTAACGACGTGTTAACTTCAAATGTATTAAAGTGAACATCTTTGTTGAATAACTGTTTAAAAGCTTCAAACGAATGATTAAATTTTAAAGTACCAGATATAAAAATGAGCGATTTAAATTTTTCCAATACTTGTTTCGTTAATACATCTTTTACAGCGTAATCTTTCACATATAAACGTATTGTTGATTTTTGAGATAAATTTTTAATCGAAATGAAACTAGTATGTCCAGCTTTTAAACTTTGTTCGATATTTTTAAATTTATCTTTTAAATACAACAACTGTTTCCGTAATGATTTAACTGTTTTATGACTAATGCCATTGAATATTTCTAGCGTTTTATTTAACTTATCGATAATCGCATGTAAATCCTTCAAAATGTCTTTTGTTTCAAAAGTAAATACATTATGGAAGCGATGAATATCATCATCATAAACATCAGAATCATTGATAATCGTAAATATCGTTGAGAACAATTGCTCATTTAACTCATGAATCTCATTCATACTAGCCTTCAAGCCAAAAATATCAATTGGTGCAATATCTAATTTTTCCAAAATTCGCTGCTTTTCCAGTTGATCAATTGCCTTTAACAATTTTTCATTTTCGTTTTTACCAATCAAACCAAGCTGATATTTAATATCAGCATAACTCAACTCATTTGTCACTTGATTTAAGGCATAGTCTGGTAAGCGATGTGCTTCATCCACTATACAATCATCAAACAATTGATATATTGAATTTTCAACATCAGAATGAATTAAATGTGCATGATTTGTAATACCAATTTGAATGTTCTGTGCATTTCGCTTAATAAAATTATAATAATGAACATCGTGACGTGCCGGTACATATGTTTCAATTTTCTGGTCAAAATACATCTTTTGACCACCTTTTAAATTTAATTCCTGTATATCTCCGGACGGCGTCTCTGTAATCCAAATCAGCAATTGCATTTTCAAGATATTCACTTCGTAATTACTTGTGTCATCTTTTAAAATTTGACTAATAAGCCCCAATGAAATGTAATCACTTTTACTTTTAATCAATAGTGCATTAATTTTAAAATTCAACGCTTCATTCATTGCTGGAATATCTTTTTCTAACAATTGACTTTGCAGTAATTTAGTATTGGTAGAAATCATGACATGCTTCCCAGTTTCAATATTATACATCAAGGCCGCAAGTAAATATGCTAATGATTTACCACTGCCTAGTGATGCTTCAATCATTGCTTTTTCACTATGCATGAGCTGATCTAATATAGTTTCCGCTAAATATAATTGTTGCGGTCGATATGTTAAGCCAAGTTGATCTACAGCTTTGCTATATAAAGACTTCAAGCTGCCATTATAATTTGTTGTCGGCTTTTTAAAATCAACTTGCTTACGATAGATAATCTGTTCGAACTTTTCGTACGATTTATCCAATGGCTTTGCATCATATTGCCTAACCATCTCAAAGAAAATATCATACAAATCGTATTTCAACTGTTTACTTAAATAATATAATTGCTTCAAAGTATCTAACGGTAACTTTTCAAATTTTTCAAAAGCTAATATCATCAATTTAGCAGTAGTAGCGGCATCTTCGTCAGCTCGATGGGCATTTGCTAAGGTAATACCATGTGCCTCTGCTAATTCACTTAATTGATAGCTTTTATCTGTAGGAAAAGCTATTTTAAAGATTTCTAGTGTATCTATAACTTTTTTGGGACGATATTGAATATTACAATCTTTAAATGCCTTTTTAATAAAATTCAAATCAAAATCTACATTATGAGCTACAAAAATGCAATCTTTTATCTTATCGTAGATTTCTTGTGCAACTTGATTAAAATATGGCGCTTGTTGTAGCATATTTTCTTCAATGGATGTTAACGCTTGAATGAACGGCGGAATCTCTAAATTTGTTCTAATCATAGAATGATATGTATCAATAATTTGGTTATTGCGCACAAACGTTATACCAATTTGAATGATATCGTCAAAATCTAATTGGTTGCCTGTTGTTTCCAAATCCACAACGGCATAGGTTGCCATACCCATAGCTATCTCTCCTTGCTTTAGTGTTAAAAATCTATATCTGCACTAATTAAACGGTGTGATTCACCCGCTTCATCTCTAACAATTAGATAGCCATCGTAATCTAAATCAATTGCTTGTCCTTTAAACTGTTTATCATTTTCTGTAAATAGCAACGTTCTATTCCAAATATTAGAAGCTGCAGTATATTCTTCACGAATTTCAGAAAAAGGTAACGTTAAAAATTGATTATATCTTTTTTCAATTTCTTGAAGTAATATCTCTAAAAATTGATATCTATCTAATTTATTTTTATCATGTAATTGTATACTTGTTGCTCTATGTCTAATACTTTCATCAAAGTTTTCTAGTTGTTGCGTCAAATTAATACCTATACCACATATTATTGCTTCTATACCATCATTATTAGCAACCATTTCAGTTAAGAAACCACACACTTTACCATTATCAATATATATATCATTCGGCCATTTCACTTTGACTTCATCTTGACTAAAATGTTGAATCGCATCTCTTATCCCTAATGCAATAAATAAATTAAATTTAGATATCATTGAGAATGCAACGTTAGGTCTTAACACGACAGACATCCAAAGTCCTTGCCCTTTTGAAGAACTCCAATGTCTATTAAATCGCCCACGACCTTTCGTTTGTTCATCACTCAAGATAAAAAATGAAGATTGATTTCCAACAA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MTIFTQLSDRIKKAISKINQANNIPNNARKSPMYHSPIT
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MSVTNLNIAKEADLVTKNVLCNNSRKMHYIRSSYYSNVKVAYLRGFLFYKSIKFYYNISCREQ
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MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDAIDGCPTDSIKIADESFDGDALKFE
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MFKRTKLILIATLLLSGCSTTNNESNKETKSVPEEMEASKYVGQGFQPPAEKDVVEFAKKHKDKIAKRGEQFFMDNFGLKVKATNVVGSGKGVEVFVHCDDHDIVFNASIPFDKSIIESDSSLRSEDKGDDMSTLVGTVLSGFEYRTQKEKYDNLYKFFKDNEEKYQYTGFTKEAINKTQNVGYKNEYFYITYSSRSLKEYRKYYEPLIHKNDKEFKEGMEQARKEVNYAANTDTVTTLFSTKENFTKDNTVDDVIELSDKLYNFKNKPEKSTITIQIGKPTINTKKAFYDDNDPIEYGVYRKDE
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MLKLISPTFEDIKTWYQLKEYSKEDIAWYVDMEVIDKEEYAIITGEKYPENLES
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MQQNKRLITISMLSAIAFVLTFIKFPIPFLPPYLTLDFSDVPSLLATFTFGPVAGIVVALVKNLLNYLFSMGDPVGPFANFLAGASFLLTAYAIYKNKRSTKSLITGLIIATIVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIFNLADIANNLKVIIVSGIIPFNIIKGIVISIVFILLYRRLANFLKRI
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MIIYFVILMVLPLWAQHKVKSNYEKYSQVRSTSGKTGREVALEILHANGIYDVEVVKGEGFLTDHYDPKKKVVSLSPANYDRPSVAGTAIAAHEVGHAIQDHQGYWFLRFRAALVPVANLGSSLSYMIIMLGIILTAIGSAFGSTALWIGAGLMSLAVLFSIVTLPVEFDASSRAMKQITALNIVNEKEYKHARKVLSAAAMTYVAATAVAVAELVRIILIARSSD

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000525078.1|1530343_1533037_-	ATP-dependent helicase DinG	A0A1X9I5C8	Streptococcus_phage	8.2e-47	34.4
WP_000049919.1|1533060_1534032_-	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_000361544.1|1534018_1535221_-|tRNA	CCA tRNA nucleotidyltransferase	H7BUW3	unidentified_phage	3.2e-35	42.5
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WP_000839926.1|1536608_1536926_-	nucleotide pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_001827022.1|1537262_1537943_-	zinc metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_000004947.1|1538590_1539166_-	YpiB family protein	G3MAV7	Bacillus_virus	2.7e-08	27.2
WP_015581847.1|1539179_1540424_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000245895.1|1540430_1541729_-	3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_001269929.1|1542828_1543995_-	chorismate synthase	A0A291AU41	Pandoravirus	7.6e-34	32.1
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WP_000442480.1|1544789_1545239_-	nucleoside-diphosphate kinase	D2E8E1	Anguillid_herpesvirus	2.4e-28	43.8
WP_001096471.1|1545330_1546290_-	polyprenyl synthetase family protein	A0A1V0SE37	Indivirus	1.3e-10	24.4
WP_000774684.1|1546291_1547017_-	demethylmenaquinone methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_000450553.1|1547019_1547592_-	heptaprenyl diphosphate synthase component 1	NA	NA	NA	NA
WP_000195429.1|1547765_1548938_-|transposase	IS256-like element IS256 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	3.5e-135	100.0
WP_000284571.1|1549488_1551093_+|transposase	IS1182-like element IS1182 family transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	1.1e-128	44.4
WP_001043863.1|1551208_1551481_-	HU family DNA-binding protein	A7KV42	Bacillus_phage	4.2e-28	73.3
WP_000161738.1|1551651_1552650_-	NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_000165530.1|1552666_1553977_-	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
WP_000133954.1|1554198_1555374_-	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
WP_001789944.1|1555630_1555822_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001789945.1|1555938_1556055_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000644395.1|1556085_1556745_-	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_061642130.1|1556821_1557790_+	asparaginase	NA	NA	NA	NA
WP_001174260.1|1557904_1558891_-	YpdA family putative bacillithiol disulfide reductase	NA	NA	NA	NA
WP_001789943.1|1559051_1559168_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000069282.1|1559292_1560753_-	elastin-binding protein EbpS	NA	NA	NA	NA
WP_000902119.1|1560905_1562285_-	ATP-dependent DNA helicase RecQ	L7RCS0	Acanthamoeba_polyphaga_moumouvirus	2.9e-56	33.6
WP_001163801.1|1562274_1563228_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_001151997.1|1563335_1563584_+	ferredoxin	A0A127AYY7	Bacillus_phage	8.3e-15	48.0
WP_001186912.1|1563689_1564235_-	ECF transporter S component	NA	NA	NA	NA
WP_001789947.1|1564513_1564633_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001033757.1|1565761_1565968_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000472936.1|1565960_1566899_-	DUF1672 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000476873.1|1566955_1567873_-	DUF1672 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000209712.1|1567963_1568179_-	hypothetical protein	A0ZS61	Staphylococcus_virus	2.0e-25	100.0
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WP_000339141.1|1570365_1570668_-|holin	phage holin	A0A2I6PF56	Staphylococcus_phage	3.1e-48	100.0
WP_000466784.1|1570803_1571103_-	DUF2951 domain-containing protein	A0A2I6PER2	Staphylococcus_phage	2.0e-31	100.0
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WP_001166599.1|1571305_1571695_-	DUF2977 domain-containing protein	A0A2I6PER1	Staphylococcus_phage	2.2e-62	100.0
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WP_000179858.1|1575086_1575377_-	hypothetical protein	U5U457	Staphylococcus_phage	2.1e-49	100.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_LS483301|1584006:1619377|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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MAILEDIFEELKLLNKNLRVLNTELSTVDSSIVQEKVKEAPMPKEETAQLESIEEVKETSADLTKDYVLSVGKEFLKKADTSDKKEFRNKLNELGADKLSTIKEEYYEKIVDFMKARINA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001023806.1|1585837_1586233_-	DUF3168 domain-containing protein	A0A2I6PEQ4	Staphylococcus_phage	8.8e-67	100.0
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WP_000395498.1|1586631_1586964_-	hypothetical protein	A0A2I6PES3	Staphylococcus_phage	4.1e-57	100.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_LS483301|1675832:1684144|DBSCAN-SWA
ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCGATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATAAATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTGATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTAACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAATGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCCCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAACCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGCTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAATACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGACCAGTTCGTCCGACTCTATGCGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAGCCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAATAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGGATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTAAATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGCTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAATTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGGACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGATATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGCGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAAACCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATACGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATGATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTACTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTCTGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGTTGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGGTTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCAGCAATACCGCATTCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCAATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCAAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTTTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCTTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAATTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGTGCAACATCATTTAAAGCCTTTTGTTGCAAAATCGATGATTTCATAAGCGAAATATCATGACTTAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCATCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCCGGATCCATGCCTGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATTTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAAGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACGATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGCGCTTTATCTAAGTTGTATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAAGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAATTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTACGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_LS483301|1675832:1684144|1675832_1676618_-|WP_015581861.1|DBSCAN-SWA
MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYLSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN
>NZ_LS483301|1675832:1684144|1682344_1684144_-|WP_001217261.1|DBSCAN-SWA
MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM
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>NZ_LS483301|1675832:1684144|1680206_1680884_-|WP_000624584.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTELIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL
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MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKALLMNWFNTEKINLDVEASTINTDPFQYI

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000924214.1|1676743_1677634_-	deoxyribonuclease IV	A0A2H4UU70	Bodo_saltans_virus	2.0e-26	33.1
WP_001062180.1|1677643_1678990_-	DEAD/DEAH box helicase	A0A1V0SIR5	Klosneuvirus	5.3e-55	33.7
WP_000683931.1|1679103_1680204_-	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	A0A1S5V250	Saudi_moumouvirus	5.2e-08	29.6
WP_000624584.1|1680206_1680884_-|tRNA	tRNA (adenine-N(1))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_001283055.1|1681014_1682121_-	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	1.1e-37	38.1
WP_001217261.1|1682344_1684144_-	DNA primase	A0A0K1LMQ9	Caulobacter_phage	4.6e-54	36.0

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_LS483301|1731776:1788709|DBSCAN-SWA
ATTATAGATTTTTAATGTAATCTTTAATAAAGCTTAATGATTTTGAGATATTTTCAGGTTGTGTACCGCCACCTTGAGCCATATCTGGACGACCGCCACCTTTACCACCAACGATTGGTGCCATTTGTTTGATAAGATCACCGGCTTTAACGTTATTTGTTAAAGATTTAGGGACAGTTGCAACCATCGATACTTTATCATCAACATTACTTGCAAGAATGATAATTGTATCTTGTAGTTTAGATTTAAAATCGTCCATTGTCGAGCGAATTGCTTTCGCATTTGGTACATCCACTTCAGTAACCAATACTTTATAGCCATTGATTTCTTCAACTTGATCTTCAATATTACCCATTTTAAGTGATGTGATTTCTTTGTCACGTTGCTCTAATTGTTTTAATAATGCTTTTTCTTCATCTTGTAATTGTGTTAACTTATCGACTACTTGATCATCAGATTTCACTTTCAGCTGTGATTTCATCGTATTAAATTTCTCTTGAATATCTTCTAAATATAAGAAAGCTGCTTTACCTGTTAATGCTTCAATACGACGCACACCAGCTCCTGTACCTGACTCACTTACTATTTTGAATAAGCCAATTTCAGAAGTATTGCGGACATGAATACCACCACATAATTCAATTGAAAATGGTGCCATATTTACTACACGCACAACATCACCATATTTTTCACCGAATAATGCCATTGCGCCCATTTCTTTAGCTGAAGCAATATCCATTTCTTGAATGTTAACGTCAATACCTTTCCAAATTTCTTCATTTACTAAGCGTTCAACTTGATCAATTTCATCATTAGTCATTGGACCAAAATGAGAGAAATCAAAACGTAAACGATCTGCTTCTACTAGTGAACCAGCTTGGTTAACATGATCACCCAGTACTGATTTCAACGCTGCATGTAATAAATGTGTTGCACTATGGTTCTTTTGAATGTCACGTCGATCATTTTGGTTCACTTCAGCAGACACTGTAGCGCCAACATTTACTTGGCCAAATTGTACTACTCCTTTATGCAAGTTTTGACCATTTGGTGCTTTGGTTACTTCACTAACAGCAATTTCAAAATTGTCATTATAAACAATACCTGTATCCGCAACTTGTCCACCACTGATTGCATAAAATGGTGTTTCCGTTAACATGAAGTATACTGTTTCACCCGCTTCAACTTGTGAAACTTCTTCACCATTGTATATCAAGTGTGTTAGTGTTGTTTGAGCTGTCGCAGTATCATAACCAACAAAAGTACTTGCAGATGTAATATTTTTCAATACTTCACTTTGAACTTGCATTGATTGAGAATTTTGACGTGCTTGACGTGCACGATCACGTTGTTGTTGCATTTCTGACTCGAATGTTGTCATATCAACTTTCAATCCTGCTTGCACTGCTATTTCTTCAGTTAATTCAATTGGGAACCCATACGTATCATACAATTTAAATGCATCTTTCCCATTAATTTCATTTGTTGTCGCTTTAGCTTTTTTAATTAATTCATTTAAAATCGCTAAACCATCTTCTAATGTTTCATGGAATCGTTCTTCTTCAGACTTTATAACACGCTTAATGAAATCTGCTTTTTCCTTAACATTTGGATAATATGGTTCCATAATGTCTGCAACAATATCAACAAGTTTGTACATAAATGGCTCATTGATTCCTAACGTTTGACTAAAACGAACGGCACGACGTAACAATCGACGTAATACATACCCTCTACCTTCATTGGCAGGTAATGCACCATCAGAAATTGCAAATGCAATCGTACGAATGTGGTCAGCAATTACTTTAAATGCCACATCTTGTTCGTTGTTTACTAAATATTGTTTACCTGATACTTTTTCGATTTCATTCATTATAGGCATAAATAAATCTGTTTCATAGTTAGTACGTACATTTTGAGAAACTGAGGCCATACGCTCAAGCCCCATGCCAGTATCAATATTTTTATTAGGTAATGGTGTGTAACTATGATCTTTATTATGATTGAATTCACTAAATACTAAGTTCCATACTTCAAGATAGCGTTCATTTTCTCCACCTGGATACATTTCTTCTGCCGGATCGTCTTGTCCATATGCTTCTCCGCGATCATAGAAAATCTCAGTGTTCGGTCCTGAAGGCCCTTCACCAATATCCCAGAAGTTACCTTCAATGCGAATAATACGACTTTCTTCAAGCCCAATATCTTTATGCCAAATGTTGTATGCTTCCATATCTTCCGGATGAATCGTAACGTACAATTTATCTGGCTCCATACCCATCCATTTATCACTCGTTAAAAATTCCCAAGCAAATTCAATCGCTTCTTGTTTAAAATAATCACCAATTGAGAAGTTACCTAACATTTCAAAGAATGTATGGTGACGCGCTGTGAAACCAACATTTTCAATATCATTTGTACGAATAGCTTTTTGAGAGTTTACAATTCTTGGCTTTTTAGGTGTTTCACGTCCATCAAAATATTTCTTTAATGTTGCTACACCTGAATTAATCCATAATAATGTATCATCATCAATTGGCACTAATGGTGCAGAAGGTTCAACCATATGTCCTTTTTCAACAAAGAAATCTAGATATTTTTGTCTAATTTCACTCGCTTTTAACTTTTTCATCATTTACACATCCTATTTACTGTTTTTAAATTACCATTCCATAAAAATTGATGACACAGATAGTCGATTTGCAAAACTAGTATAAATCAATATCATTTTTTATTATTAAAAAATAAAAAACGCCCATCCTCAAAAGGGACGAACGTTATCGCGGTACCACCCTAGTTATAAATGCAATTCAACACATTTATCACTTTAATTCGACTATACAGTTGTGCATAAAGTAGCGTTCACTAATGTTTGTTGTACTTTTCACCAACCAGTACATCTCTGATAAACAAATCATTAACTACTCATCTTTATACGAATTTAATTCTATTTTAGTTACATTTACGCTTGTTGTCAACGTTCTATAAAGTCATACGGCGTGATTTCTCCCATATTAATCATTGGGTCAATTTTAAACATTGTAGCTTCCGTTAATACATTTGTATCTGTTTTTGTTGAATCAGACATAACTTCTTCACTATCATTCGATGACATTGGCGCTTCTACTTGATCATCTATTGTCGTTTGTGAAGCTCCTGTATCATTAGTTGCTGTGTTTTCCAGCATTTCTTCATCTTCTGAATTAAAATAATTTTTCAACAATGTACATAATTGTGTTAAACGCGCTTGACCATTTGTTTTCAATCCAATATCAAATGCTTCCGGATCACCAAGTAAAACTAAACTCGTTTTCGCTCTAGTTAAACCAGTATATAATATCGGTCTTTGTAACATTCTAAAATACTGTTTAACAATAGGCATGATAACAATAGGAAATTCTGAACCTTGTGATTTATGGATTGATGTACAATAAGCATGTGTTAATTCCATCATATCTTGTTTCGTAAATGTAATTTCATTACCTTCAAAATCCACAACAAGTACATCTTTATTAAGGGCATTTTCTTTCGCCCAAAAAATACCAACAATAACTCCTATGTCACCATTGAATATGTTATCATTTGGCCTATTAACAAGTTGTAATACTTTGTCACCTTTTCTAAAGACTACATCACCAAACTCAATTTCTCGTGTGTCTTTCTTTTTAGGGTTTAAAATATCTTGTAAAACTTGATTTAAACGTTTAATACCGGCATTTCCTTTATACATTGGTGCAAGCACTTGAATATCAGCCATAGTATACCCTTTATTAACAGCACTAGTAACTACCTTCTCAACAACTGTTGGTATTTGGTTTGCCTGACAGTTAATAAAACTTCTATCATGAAAACGCTGTGTAATATCAATTTTCTGACCCAACTTCATTCGATGTGCTAATTCTATAATGCTTGAACCATCTTGTTGACGATATACTTCAGTCAGATTTACTCGTGGTATAGCTTTCGATTCAATTAAATCTTTAAATACTTGACCAGGACCTACAGAAGGCAATTGGTCCTCATCACCTACAAATATCAATTGTGCATCTAAAGGAACTGCACTTAAAAATTGGTGGAACAACCAAGTATCTACCATAGACATCTCATCAATGATTATGAGTCGTGCGTTTATTTCATTTTCTAATATATCCTCTGGCTTTGTGTCTTGATTCCAACCTATTAAACGATGAATCGTCATTGCTTCTAATCCAGTTGACTCTTGTAGTCTCTTAGACGCTCTTCCTGTTGGCGCTGCTAATACAACTGGATAATCATCATTGACATAATCATCATAATCTAATGATAAGCCATGAATCTCAGCATATAATTCAACAATACCTTTAATTACTGTCGTTTTTCCTGTTCCCGGTCCACCGGTTAATAGCATCACCTTAGAATTGATAGCCGTTTGCAAAGCTTCTTTTTGTGAAGCTGCATAGTTCACTTGATTCGCATCTTCTATTTCACCAATATGCATTTGTAAATCTGACTGTTCAATTTCTGTAAGTTTATTTGTATGCGTCTTTATTCTGAATAAGTTTTGAACACTTTTGATTTCAGAATAATACAAACTTGGAATTGCAACTTGTTCATTGTCAATAATTAGTCGTTTTTCCTCATTTAAGTATTGCAACATTTCGTCTAATTTTTCAGGTTCGATGACCTCTTCATCTTGATAATTTAATACATCAACCGTTAAATCTATAACAACATTGATAGGCAAATATGTATGTCCCTGTTTAATACATTCTTCTTCTAACGTATAGAGCAACGCAGCTTTTAATCGTTCATTATCGTTATAAGCGATACCAATATTTCTAGCAAGTTGATCTGCTTTATTAAAACCAATACCTTTAATATCATAAATCAATTGATATGGATTTCGATCTAAAATAGTCAGTGTATCGCCGAGATAAAACTGATAAATTGCCATTGAAAGTTTAGGACCAAACCCTAAATCATGTAAACGAATCATTATTTTTTCAGATTCTTGATTTGCT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MGNLGAQKAKRNDTPISAKKDIMGDKTVRVRADLHHIIKIETAKNGGNVKEVMDQALEEYIRKYLPDKL
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MIDVNELLEEAIRETENLNDGEVFLVKDLFKGYVGNRIPRKDRLLLGTLFLNHVSKMNGNLKAIEKTSSNQQRYKKTIDKF
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MADESKFDQFKGNVKETVGNVTDNKELEKEGQQDKVIGKAKEVVENAKNKITDAIDKLKK
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MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFTLAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI
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MNASSKRKIISQSEISKKIAVMNEEMQGVWANNSWDIRKCPHPSAIELSKNPALRNRWVRFERVKNLWLRTELKYFYFYHLNNGIWNAKTVWIRKGTVINKMLDFLDLKYPSITSITEVPIEKAMTEYRTYLTKRGVRITTTNYKITANQEKTPVKANSYYVTNLKQFMEFYENFYFDGEEWDKDVWDRRNLPLPDDKVNPTQYEYTINFKGFRNTYFKQLVKRYCKLRLNVDSFSYVSDIAQRLKEFFNFLDMKFKQVQRVHQLTRVEIEAYLSELNMMGIKPSTITGRISILEGLFSTLLRLEWDDVPSKILIYSEDYPKIPRAKPRFIDEFVLEQLNSHLDKLPEYIATMTMIVQECGMRISELCTLKKGCLLEDKDGDFFLKYYQWKMKKEHIVPISKEVALLIKVREDKVSEEFPDSEYLFPRKDGSPLKQETFRGELNKLAYEQNIVDKSGEIYRFHAHAFRHTVGTRMINNGMPQHIVQKFLGHESPEMTSRYAHIFDETLKNEFTKFQEKLVTNNGDVLDLDEDNEVDDVELQWFKKNINAQVLPNGYCRLPVVAGGCPHANACLDCTHFCTSKQFLPQHEEQLERTEELLAIAKDKQWQRQVETNSRVKERLEQIIGSLTG
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MKKIEAWLSKKGLKNKRTLIVVIAFVLFIIFLFLLLNSNSEDSGNITITENAELRTGPNAAYPVIYKVEKGDHFKKIGKVGKWIEVEDTSSNEKGWIAGWHTNLDIVADNTKEKNPLQGKTIVLDPGHGGSDQGASSNTKYKSLEKDYTLKTAKELQRTLEKQGATVKMTRTDDTYVSLENRDIKGDAYLSIHNDALESSNANGMTVYWYHDNQRALADTLDATIQKKGLLSNRGSRQENYQVLRQTKVPAVLLELGYISNPTDETMIKDQLHRQILEQAIVDGLKIYFSA
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MAVTYEKTFEIEIINELSASVYNRVLNYVLNHELDTKNTRLLEVNLLNQLEVAQEVDLFQQPFEELQAIHEYWRSMNQYSKQILTKEKVA
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MKPKIIMHTQISLDGRIKGFDNPEVYYQVAGGIHSDAVLFGSNTVFTAFEKYPAETEADFEKIITSPEDPRPIGVIPDSRGILRSLHCLRNLGYLKEIVILVSTATPKEYLNYLEERHYPYIVSGNDHVDYEKAFQILHEQYGCKYMRTDSGGGLTNKLLENGLIDEISLVISPCFVGNKEKQLFDNLLLSEKVNLELQGTENAEHGCLSLRYAVKNKD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_001283311.1|1734749_1737227_-	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A0K2FLP8	Brevibacillus_phage	1.1e-66	29.0
WP_000567028.1|1737228_1737897_-	tetratricopeptide repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_061642011.1|1738358_1739477_-|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA
WP_000409167.1|1739477_1740620_-	cysteine desulfurase	A0A1X7QGF3	Faustovirus	8.3e-33	29.3
WP_000985886.1|1740931_1741945_+	LLM class flavin-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
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WP_000752913.1|1742367_1742550_-	CsbD family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000704122.1|1742649_1743072_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_000102735.1|1743156_1744431_+	replication-associated recombination protein A	A0A127AWE7	Bacillus_phage	1.8e-105	50.7
WP_000682646.1|1744591_1745365_-|tRNA	tRNA threonylcarbamoyladenosine dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_001790559.1|1745364_1745493_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000044799.1|1745825_1747592_-|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L0E9	Tupanvirus	1.3e-16	27.3
WP_000590826.1|1747607_1748870_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_061642010.1|1749330_1750206_-	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	A0A0N9SGH1	Paenibacillus_phage	4.7e-12	33.7
WP_044289948.1|1750670_1752860_-	bifunctional (p)ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase	A0A1B1IUF0	uncultured_Mediterranean_phage	5.3e-12	38.0
WP_000364542.1|1753287_1753806_-	adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	5.6e-29	46.5
WP_000594993.1|1753827_1756101_-	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	1.2e-62	28.8
WP_000749795.1|1756303_1758583_-	protein translocase subunit SecDF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-31	35.8
WP_001160682.1|1758857_1759118_-	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	8.2e-05	35.3
WP_001112045.1|1759136_1760276_-|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	5.4e-85	44.7
WP_061642009.1|1760298_1761324_-|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_001005767.1|1761325_1762330_-	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	1.7e-05	29.1
WP_000271547.1|1762361_1762964_-	Holliday junction branch migration protein RuvA	NA	NA	NA	NA
WP_000368902.1|1762977_1763433_-	ACT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000496100.1|1763445_1764738_-	GTPase ObgE	NA	NA	NA	NA
WP_000916187.1|1765092_1765377_-	50S ribosomal protein L27	NA	NA	NA	NA
WP_000633692.1|1765388_1765709_-|protease	ribosomal-processing cysteine protease Prp	NA	NA	NA	NA
WP_000457386.1|1765714_1766023_-	50S ribosomal protein L21	NA	NA	NA	NA
WP_001259925.1|1766189_1766720_-	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_000911041.1|1766719_1767562_-	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_000840602.1|1767761_1767881_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001236735.1|1767954_1768428_-	DUF4930 family protein	NA	NA	NA	NA
1768323:1768339	attL	NA	NA	NA	NA
WP_000025835.1|1768587_1768785_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000171859.1|1768901_1769186_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001092058.1|1769634_1770297_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_002326825.1|1770959_1771232_-	antitoxin	A0A1X9I6E5	Streptococcus_phage	5.4e-07	96.7
WP_000527318.1|1771249_1771459_-	peptide-binding protein	A0A1X9I6D5	Streptococcus_phage	1.4e-31	98.6
WP_025175259.1|1771557_1772454_-	ParA family protein	A0A1X9I765	Streptococcus_phage	1.2e-151	96.8
WP_061730497.1|1772686_1774291_+|transposase	IS1182-like element IS1182 family transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	1.5e-128	44.4
WP_000802831.1|1775011_1775671_-	RibD family protein	A0A1B0RXM8	Streptococcus_phage	3.1e-125	100.0
WP_072387101.1|1775781_1776189_-	WYL domain-containing protein	A0A1B0RXM3	Streptococcus_phage	1.1e-59	98.3
WP_001079938.1|1776161_1776734_-	HTH domain-containing protein	A0A1B0RXM1	Streptococcus_phage	5.5e-102	99.5
WP_001096887.1|1777009_1777804_-	aminoglycoside O-phosphotransferase APH(3')-IIIa	E4ZFP6	Streptococcus_phage	2.3e-154	100.0
WP_000627290.1|1777896_1778439_-	streptothricin N-acetyltransferase Sat4	A0A1B0RXL7	Streptococcus_phage	8.9e-94	100.0
WP_001255866.1|1778435_1779344_-	aminoglycoside nucleotidyltransferase ANT(6)-Ia	E4ZFP8	Streptococcus_phage	2.8e-177	100.0
WP_000662263.1|1779376_1780111_-	class I SAM-dependent methyltransferase	A0A1X9I6N4	Streptococcus_phage	1.5e-141	100.0
WP_000228166.1|1780091_1780961_-	nucleotidyltransferase domain-containing protein	A0A1X9I6C9	Streptococcus_phage	4.3e-159	95.8
WP_000567888.1|1781063_1781309_-	single-stranded DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_061730497.1|1781435_1783040_-|transposase	IS1182-like element IS1182 family transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	1.5e-128	44.4
WP_001072201.1|1783560_1784292_+	23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(A)	E4ZFQ0	Streptococcus_phage	1.9e-51	47.5
WP_000067268.1|1784417_1785200_-	aminoglycoside nucleotidyltransferase ANT(9)-Ia	NA	NA	NA	NA
WP_000361059.1|1785350_1785728_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_049291207.1|1785734_1787627_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	NA	NA	NA	NA
WP_000868132.1|1787623_1788709_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A0A8WIF9	Clostridium_phage	4.5e-12	28.3
1793283:1793299	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_LS483301|1907386:2031650|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

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ATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATTGTGGATTAGCTTGACCTTTAGACGCTTTCATAATTTGACCAACTAAGAAGCCCATAGCTTTGCCTTTACCATTTTTGTAATCTTCAACTGATTGTTCGTTATTGTCTAATGCTTCATTTACAAATTTTAGAAGTGTTGCTTCATCAGAAATTTGAACTAAGCCATTATCTTCCATAATCTGTTTAGCATTACCACCTTTAGCTGCTAACTCTGGGAAGACTTTCTTCGCAATTTTACTGCTCATTGTTCCGTCTTCGATAAGTTTAATCATACCTGCTAAATTTTCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAGGTAAACCTAATTCATTTACATACTTAGCTTTACGTTCATCTGGTAATTCAGGAATTGTCTGACGAACACGCTCTTTCCAAGCATCATCAATATATAAAGGTACAATGTCAGGCTCTGGGAAGTAACGGTAATCATCAGAACCTTCTTTAACACGCATTAAAATTGTTTTACCTGTAGATTCATCAAATCGACGTGTTTCTTGTCCGATTTCTCCACCATTTAACAATTCTTCTTCTTGGCGTTTTTCTTCATATTCTAAACCTTTACGTACATAGTTAAATGAGTTTAAGTTTTTCAATTCGGCTTTAGTACCAAATTTTTCTTGACCATATGGACGTAAAGAGATGTTAGCATCACAACGTAAAGATCCCTCTTCCATCTTAACGTCTGATACACCAGTGTATTGAATAATTGAACGCAATTTTTCTAAATATGCATATGCTTCTTTAGGTGAACGAATATCTGGTTCAGATACGATTTCAATTAGCGGTGTACCTTGACGGTTCAAGTCAACTAATGAATACTCACCTTTATGTGTTGACTTACCAGCATCTTCTTCCATGTGAAGACGAGTAATACCGATTCGTTTTGTTTCACCGTCGACTTCGATATCGATATATCCATTTTCACCAATTGGTTGATCAAATTGAGAAATTTGATATGCTTTTGGATTATCTGGATAGAAATAGTTCTTACGGTCAAACTTAGATTCTGTTGCGATTTCCATATTTAGTGCCATTGCAGCACGCATTGCCCAGTCTACTGCACGCTTATTAACAACTGGTAAGACACCTGGATATGCTAAGTCGATAACATTTGTATTTGAGTTAGGTTCTGCTCCAAAATGCGCTGGTGATGGAGAAAACATTTTTGAGTCCGTTTTTAACTCTACGTGAACTTCAAGTCCTATAACTGTTTCAAAATGCATGATTTCCACTCCTTATAATTTTTCATAAACGTCATGTAAATTGTATTGTGTTTCATATTGATAAGCGACACGATATAACGTTTTTTCATCGAATGGTTTACCAATGAACTGTAAACCGATTGGTCGGCCATTTGATTGTCCACAAGGAACAGAAATACCAGGTAATCCAGCTAAGTTTACTGGTGTTGTTAATAAATCATTGGCATACATTGTTAATGGATCATCAATTTCTTCACCTAAATTAAACGCAGTTGTAGGCGCTGTTGGACCAACTACTACATCATAATTTTCGAATACTTTATCAAAGTCATTTTTAATCAATGTTCTAACTTTTTGAGATTTTTTATAGTAAGCATCATAGTAACCTGAACTTAATGCAAATGTACCTAAGAAAATACGACGTTTTACTTCTTTACCGAAACCTTCAGATCTTGACATTTTATATAATTCTTCTAATGAATGAGCTTCTTTAGAATGATAACCATAACGAATTCCGTCAAAACGAGAAAGGTTTGACGAAGCTTCTGATGATGCAATCACGTAATATGATGGAATACCAAATTTAGTATTTGGCAATGATACTTCCTCAACGACAGCACCTAAAGATTTTAAAGTTTCTACAGCGTTTTGAACTGCTTCTTTTACGTCATCAGCTACACCTTCACCTAAGTATTCTTTAGGTAATGCAACTTTTAATCCTTTAATATCTTTACCAATTTCAGATGTAAAGTCTACATCATCAACTGGTGCACTTGTAGAGTCATTAACATCTGCACCAGAAATAGCTTCTAATACGATTGCATTATCTTTTACATTTCGAGTCAATGGACCAATTTGGTCTAATGAAGATGCAAAAGCAACTAATCCAAATCGAGATACACGACCGTATGTTGGTTTCATACCGACAACGCCACAATATGCAGCCGGTTGTCTAATTGAACCACCTGTGTCTGAACCTAAGCTAAATGGTACTAAGCCAGCTGCAACTGCTGCTGCAGATCCACCTGATGAACCACCTGGCACTGCTTTATGGTCAAATGGGTTAACTGTTTTTTTGAAATAAGATGTTTCTGTTGAACCACCCATTGCAAACTCATCCATATTTAATTTACCGATTAAAACGGCATTTTCATTATGTAGTTTTTCCATTACAGTAGATTCGTAAATTGGCACAAAACCTTCTAACATTTTACTTGCACATGTTGTTTCTAATCCGTTTGTAATAATGTTATCTTTTATACCCATTGGAATACCAAATAATTTGCCATCCATTTGATCTTTTGCTTGTAATTCATCCAATTCTTGCGCTTTTTTGATTGCATTTTCTTTATCCAGCGCTAGAAAAGACTTAATTGTTGGATCAGTCTCTTCAATTGCATCATATATATCTTTAACAACATCAGATGGTTTGATTTTTTTGTCTTTTATTAAAGTTAATAAATTCTCAACCGATTCGTAGCGAATGCTCATCTTACGCGTCCTCCTCATTCATGATTGTAGGCACTTTAAATTGTCCATCTTCTGTTTCTTTGGCATTTTTCAAAGCTAATTCTTGTGGAATACCTTTAATTGCTTTATCTTCACGTAAAACGTTTTGTAAATCTAAAACGTGATATGTAGGTTCAACGCCTTCTGTATCAGCGCTATCATTTTGTTTTGCAAAATCTAAAATGCTTTCTAATGTGTTGGCCATTTCTTCCGTTTCTTCAGGAGAAATTTGAAGTCTTGCAAGATTCGCGATATGCTCAACTTCTTCACGTGTTACTTTTGTCATTAATAAAAGCCTCCTTTAAGTCATTCATCACTAAATTGTATCAAATTTCCAATTAAAAATCTAAGTATTTATGAGGTGCTACTTTAATTTCATATAAACTGTATAAACATTATCATTCGTTTATCAAATCATTTTTTATGAAAACAACACTCTTTTAATATTAGACAACCCAATTCAATATTATGATTATGCAATTTTAATTATAAAAATTTGCTCATATCCAAAAAATACGAAAGCGCTTTCTATATTGGTATGCAAGTATTTCAAAAAGAATAAATTTAATTTTCCTACTTTTCTAAACATTTATCTTTATGTATAATGTTTTCAAGTAACTAAATTATAAATTAAATAAAGGGAGTGTTTATCATGCTTACAATGGGGACAGCATTAAGTCAACAAGTAGATGCCAATTGGCAAACTTATATTATGATTGCCGTCTACTTCTTGATACTAATCGTTATTGGCTTTTACGGTTACAAGCAAGCAACTGGTAACCTAAGCGAGTACATGTTAGGTGGACGTAGTATTGGACCGTATATTACTGCATTATCAGCTGGAGCTTCAGATATGAGTGGATGGATGATTATGGGGCTACCTGGTTCTGTCTATAGCACTGGTCTATCAGCTATGTGGATTACAATCGGTTTAACATTAGGTGCTTATATAAATTACTTTGTTGTTGCTCCTAGACTTCGTGTTTATACCGAATTAGCTGGAGATGCAATTACATTACCAGATTTCTTTAAAAATCGTTTAAACGATAAAAATAATGTGTTAAAGATTATTTCTGGATTGATTATCGTAGTATTCTTTACATTATATACACATTCTGGTTTCGTATCTGGTGGTAAACTATTTGAAAGTGCTTTTGGATTAGATTATCATTTCGGTTTAATATTAGTTGCTTTCATTGTCATTTTCTATACTTTCTTTGGTGGATATTTAGCTGTATCAATTACAGATTTCTTCCAAGGTGTCATTATGTTAATTGCGATGGTTATGGTCCCTATTGTTGCTATGATGAATTTAAACGGCTGGGGAACGTTTCATGATGTAGCAGCTATGAAACCTACAAATTTAAATTTATTTAAAGGGTTATCATTTATAGGAATTATCTCTCTATTTTCATGGGGATTAGGTTATTTCGGTCAACCTCATATCATTATAAGGTTTATGTCTATTAAATCACACAAGATGCTACCTAAAGCTAGACGTTTAGGTATTAGCTGGATGGCTGTTGGTTTATTAGGCGCTGTGGCTGTTGGTTTAACAGGTATTGCATTCGTACCTGCTTATCATATTAAACTAGAAGATCCTGAGACATTATTCATCGTGATGAGTCAAGTACTCTTCCATCCTCTTGTAGGTGGTTTCTTACTTGCTGCGATTCTAGCTGCAATTATGAGCACGATTTCTTCACAATTACTTGTAACATCTAGTTCACTAACGGAAGACTTTTATAAATTAATTCGTGGTGAAGAAAAAGCTAAAACGCACCAAAAAGAATTTGTTATGATTGGAAGATTATCTGTATTAGTTGTAGCAATTGTTGCCATCGCGATTGCATGGAATCCAAACGACACAATTCTAAACTTAGTAGGTAACGCTTGGGCCGGATTTGGTGCATCGTTCAGTCCACTTGTGCTATTTGCACTTTACTGGAAAGGTTTGACACGTGCCGGTGCTGTAAGTGGAATGGTTTCAGGTGCCTTAGTCGTTATCGTTTGGATTGCGTGGATTAAACCATTGGCACATATCAACGAAATATTCGGCTTATATGAAATTATTCCTGGATTT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001549197.1|2201349_2201484_-	delta-lysin family phenol-soluble modulin	NA	NA	NA	NA
WP_001105707.1|2201719_2202289_+	accessory gene regulator AgrB	NA	NA	NA	NA
WP_001093929.1|2202285_2202426_+	cyclic lactone autoinducer peptide	NA	NA	NA	NA
WP_001554031.1|2202450_2203743_+	GHKL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_001790167.1|2204548_2204656_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001253312.1|2204843_2205803_-	carbohydrate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_000141414.1|2205799_2207284_-	sucrose-6-phosphate hydrolase	S6ATV4	Bacillus_phage	4.0e-19	25.6
WP_000790330.1|2207432_2208383_-	LacI family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_001052270.1|2208565_2209816_-	ammonium transporter	H8ZJB2	Ostreococcus_tauri_virus	4.5e-40	31.2
WP_000581077.1|2210022_2210247_-	sulfurtransferase TusA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000266883.1|2210306_2211386_-	YeeE/YedE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001283612.1|2211689_2212325_-	redox-sensing transcriptional repressor Rex	NA	NA	NA	NA
WP_000602071.1|2212577_2214506_+	ABC-F type ribosomal protection protein	A0A2K9L0W2	Tupanvirus	5.4e-53	30.4
WP_001790685.1|2214650_2214779_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_061642103.1|2214867_2216478_+	MutS family DNA mismatch repair protein	A0A0N9R0S5	Chrysochromulina_ericina_virus	2.5e-19	26.9
WP_000159034.1|2216579_2217605_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	6.9e-63	40.9
WP_000372758.1|2217597_2218062_-	ribosomal protein S18-alanine N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_001086744.1|2218034_2218697_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
WP_000590798.1|2218677_2219139_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_LS483301.1|WP_000009238.1|1742181_1742328_-|hypothetical-protein	1742181_1742328_-	48 aa aa	NA	NA	NA	1731776-1788709	yes

Protein sequences of NZ_LS483301.1|WP_000009238.1|1742181_1742328_-|hypothetical-protein

>NZ_LS483301.1|WP_000009238.1|1742181_1742328_-|hypothetical-protein
MSFMDKAKDAVEKFKNSDNEQVKNVKDKINEYTGSNNEEKKENEDKEK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_LS483301_10	Orphan	10.2|1902386|20|NZ_LS483301|CRT	1902386-1902405	20	1738208-1738189	1

1. spacer 10.2|1902386|20|NZ_LS483301|CRT matches to NZ_LS483301 position: 1738208-1738189, mismatch: 1

gaatttcgaaaagaaattct	CRISPR spacer
gaatttcgtaaagaaattct	Protospacer
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