Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483302 | Staphylococcus aureus strain NCTC8726 chromosome 1 | 5 crisprs | cas3,casR,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 4 | 1 | 7 | 0 |
1. NZ_LS483302
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483302_1 | 230045-230129 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483302_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483302_1
>1.1|230071|33|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483302_1
The CRISPR arrays of NZ_LS483302_1 >merge|NZ_LS483302|1|230045-230129|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCGAGTTGGGGTG >NZ_LS483302|1|1|230045-230129|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTG TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCGAGTTGGGGTG
>NZ_LS483302.1|WP_111680709.1|228674_229826_+|PrsW-family-intramembrane-metalloprotease MALESKQSVNQSTASNIHNESIDKQMDDKAYETAQNTDLKHEARSLFDNATKSIGRLAGNDESLNLNLKDMFSEVFKPHTKNEADEIFIAGTAKTTPAICDISEEWGKPWLFSRVFIAFTVTFIGLWVMAAFFNNTNAIPGLIFIGALTVPLSGLFFFYESNAFKNISIFEVIIMFFIGGVFSLLSTMVLYRFVVFSDQFERFGSLTFFDAFLVGLVEETGKALIIVYFVNKLKTNKILNGLLIGAAIGAGFAVFESAGYILNFALGENVPLLDIVFTRAWTAIGGHLVWSAIVGAAIVIAKEQHGFEFKDILDKRFLIFFLSAVGLHGIWDTSLTILGSDTLKIFILIVVVWILVFILMGAGLKQVNTLQKEFKEQQNKVVE >NZ_LS483302.1|WP_001265706.1|227781_228453_+|type-1-glutamine-amidotransferase MRVNVLQHTPNEGVGYIGEWAKESGHEVYIYHPYMNDGVLPLAEETDMLVILGGPMNPDDEMPWIQSERELILVLMAQNKPIYGACFGAQQISKALGYAVLKSPVKEVGWDDVYLESEIIPNIPSRLKALHWHEDMFQIPQQAELLFSGNHIRNQGFIINHHVIGLQFHFEPGPDDVREMVLNDAQYINHSILEQSAEDILAFEVPKQNRQAIFRILDFITQA >NZ_LS483302.1|WP_111679956.1|225845_227423_-|acyl-CoA:acetate/3-ketoacid-CoA-transferase MEVTCLKQITWHDLQHIIKDGDVIGLPALAVANLPAEVLRAVLAQHDTYHTPNDLTFILANDIHSLGVAPDLDDFIERRMIKRVIMSILTASSKTAQAIKNNDIEAYFLPQGIITTHYRQSNQLLPGVITKIGLNTAVDPRYGGGKVNTRTTDDLVSLVTIDDETYLHYTFPSVDVALLRGTYADQQSNIYLTQEAYLSECYHVALNTKANHGKVIVQVKALVDDYQLKPNEVVIPGNLVDYVYVTEDEKNHRQVIQSHYLPALSGEERIDGIPEPALPFNSRKLILRRAAQFLTYGDTISIGYGINNELSNLLHEECVEHDVQPILDIGIFGGFVGSREHFGMNYNADVRMPHDRAWDFIYNNGVSVAYLSFAEVDQYGNVNVSYFNGRLNGCGGFIDITQSVNKIIFSGTFVAGSHVSCHNQRLSIETEGQNQKFVSDVSHIDFNAQYSQSLEQEVYFVTDRAVFELTNQGLKLIEIAPGLDLHKDILNQMAFKPIIADHLKLIDTSIYKEKWGELKQSIHKV >NZ_LS483302.1|WP_001008389.1|224314_225820_-|acyl--CoA-ligase MNFDWIKTRSDFDDDKPAVIDHAKQTSWTYQQLNARADNMAHYLTSQGVKKGDVIGIFAPNDIAILDLLFACFKTGAVFLPLNWRLNPKEIAAIVEDAQLKLLFYAEKHLSSLTDIDQNLLHMDIDVAQYDEIVNPDYHQPFQATPVEPQDLAALIYTSGTTGSPKGVMFSYESFVHNGANLELTYKFNSNYITIVSTPMFHVLGFNDTVLPVLMSGGTLILQRYFNGEELNDMIAQYHPTFIIMIPTMYYSTLRASNFNPENFKAMDYIIQGGSQPLPSIQAAFKQYGINIINGYGLTEAPLVLVNTPENSKRKPMSIGKAVMFVDARILDDNGEEVPSGEIGELAIKAKNVTPGYWNKPAETAKAFHGRYLLTGDLAKMDDDGDIFIIDRKKELIITGGENVLPSEVENALAEHPLVDRCVVVGYDHPKYGESIAAAIILREDEPHYAEILDQHMRSRLAGYKVPRMYVPVTHMPLNSTQKPDKLAIRQMMNDKVSQTL >NZ_LS483302.1|WP_000142189.1|222991_224203_-|acyl-CoA-dehydrogenase-family-protein MTFEKETVLKTLFPEDVLSIAKGLTDGEVEFLQQVDSLLESKYRENINQHWIDATVPEDYFKDLGELNYFNNPLLYKDRPNAKMPSQLFQFFMSYLLARFDISLATLLGVHQGLGHNTFYFGGSKEQIAKYVPKLQSHELRTCFALTEPEHGSDVAGGLETVAERQGDTWVINGEKKWIGGAHVSDVIPVFAVNKETGKPHCFVVRPEQDGVDIEVIDNKIALRIVPNALIKLTNVKVDEADRLQNITSFKDIAKILYSTRAGVAYMATGGMAGALRATLDYVTERKQFGKPISKYQLIQEKLAMMQGNLAQAMATCAQLANMQAHGEYDEVATSTAKMMNALRLRETVAMGRGITGGNGILADDYDIARFFSDAEAIYTYEGTHEINALVIGRALTGDSAFV >NZ_LS483302.1|WP_111679955.1|220543_222805_-|3-hydroxyacyl-CoA-dehydrogenase/enoyl-CoA-hydratase-family-protein MTINKVTVLGAGTMGAQLAALFVNAGLKVKLLDIVVDKNDPNLIAKKSYDKVTDKKRPLLFDLNLASHLTYGNFDDDLVNDDADLYIEAVKEDIEIKHAVWQQVLQHAKEDALFATNTSGIPINAIAKAFNEKDQERFFGLHFFNPPRIMKLVELIPTSHTKESIILDVKNFAQNVLGKGVIVVNDVPGFVANRVGTQTMNDIMYRAEQHKLSIVDVDALTGQAIGRPKTGTYALSDLVGLDIAVSVIEGMQQVPEETPYFHDVKIVNTLFENGALGRKTKQGFYKKDKETKARLVYDVEKQDYVPVSQPQLPILNEFNKDLVHNLDVIFNAQDEAGLFLWETLRNNFYYSAINVPKATDDFRDIDRALVWGFNWKLGPFQLWDAMGYERVKTRMEDELGDLPQWISDLDGGFYKQDETIEYATPVSHFVKDELWDKGDAKLSVTHDDQLLLKLQSKNNVITDEFNDALVDAIDLLENEHYTSMVIYADGNNFSVGANLFLMKKAHEDGLVDDVVAQSIDKLHYSFNRLKYSLKPVVTAVQGRALGGGCELVLYSPIVVAASETYIGLVEAGVGLLPSGGGLAEMADRILRTSHKFDDKQASMTKVLTNIAFAKVSTNAFEARRYGYLRDTDTIIFNTTQRVEVALKRAKYEAETNYIPNTRHQYIALGEDFKALIQGQLDAQRRGHFISDHDYHIALNIATILAGGDLPRNTFINQRYIQSLEKIGFIDLLKSKKSYERIAHMLKTGKPLRN >NZ_LS483302.1|WP_111679954.1|219329_220514_-|thiolase-family-protein MQEAYIVAYGRSAAAKAKQGALFHERPDDVAAKVLQGVLKRIDGKFNKNMIEDVIVGTAFPEGLQGQNIARTIALRTGLSDTVPGQTVNRYCSSGLQTIAIAANQIMAGQGDILVAGGVELMSAVPMGGNEPTNNPTLQYDDIGASYPMGLTAENVASQFDVSREDQDAYAVRSHQRAYDAQRDGRFKDEIIPIQVNSVEYTNAGPKVHTNIFDQDEFIRPDTTMEALAKLRTVFKADGTVTAGTSAPLSDGAGFVVLMSGDKVKELGVTPIARFVGYKAVGVDPKIMGIGPAYAIPEVLSLSNLSVEDIDLIELNEAFASQTIASIKEVGLDISRTNVNGGAIALGHPLGATGAMLTARLLNEMGRCPDSRYGMVTMCIGVGMGAAAIFEYVR >NZ_LS483302.1|WP_031774836.1|218924_219032_-|hypothetical-protein MCVRTRLVSSSSVRLSKAIIIAVIVVCHIDVRGLF >NZ_LS483302.1|WP_111679953.1|216859_218743_+|staphylocoagulase MKKQIISLGALAVASSLFTWDNKADAIVTKDYSGKSQVNAGSKNGTLIDSRYLNSALYYLEDYIIYAIGLTNKYEYGDNIYKEAKDRLLEKVLREDQYLLERKKSQYEDYKQWYANYKKENPRTDLKMANFHKYNLEELSMKEYNELQDALKGALDDFHREVKDIKDKNSDLKTFNAAEEDKATKEVYDLVSEVDTLVVSYYGDKDYGEHAKELRAKLDLILGDTDNPHKITNERIKKEMIDDVNSIIDDFFMETKQNRPKSITKYNPTTHNYKTNSDNKPNFDKLVEETKKAVKEADESWKNKTVKKYGETETKAHVVKEEKKVEEPQSPKVSEKVDVQETVGTTEEAPLPIAQPLVKLPQIGSQGKIVEGPKYPTMEQHTIYGEIVKGPEYPTMENKTLQGEIVQGPGFLTMEQSGPSLSNNYTNPPLTNPILKGIEGNSTKLEIKPQGTESTLKGIQGESSDIEVKPQASETTEASHYPARPQFNKTPKYVKYRDAGTGIREYNDGTFGYEARPRFNKPLETNAYNVTTNQDGTVSYGARPTQNKPSKTNAYNVTTHANGQVSYGARPTQNKSSETNAYNVTTHANGQVSYGARPTYNKPSETNAYNVTTHADGTATYGPRVTK >NZ_LS483302.1|WP_000211606.1|216325_216670_-|complement-inhibitor-SCIN-family-protein MTTQMKIKTYLVAGIKAALLDTTGIKLASKSETTSHTYQHQALVDQLHELIVNTDLNKLSYLNLDAYQKRDILAAHYIAKSAIRTKNLDQMTKAKHRLESIYDSISNPLHSQNN >NZ_LS483302.1|WP_000361246.1|230310_230862_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MDKRIKKTQRTLKQTMITLLKEQHIEDITVTDICDKSDIVRRTFYAHFNDKYDLVERIMSDYISDFVEICHFKEQINFKLGNIKWFEYLYNNKDIFSVLFKSSISALFSKKLETVIYKQLENKISKSVINEGISKSTLLCFLTSAVLGVMVNFALNGDSDYQNKADETLILLKPYLKNDILNS >NZ_LS483302.1|WP_000412502.1|231015_231660_+|SDR-family-oxidoreductase MEKKNILIIGASGQISQELIDLLLDKTEHHLTLYLRNKAKLMNIEDGNRVTLIEADATDEAALENALDQIDVVFASLAGNIDEQAQAIVSAMEKKNVQRLIFVTALGIYDEVPGAFGKWNNDNIGPYLPPYKKAADIIEASSLDYTVLRPAWLTNNDEIEYETTVKGENFKGTEVSRKSVAALGLEIIENPSIHVKESLGVNKPNTDGDKPHWL >NZ_LS483302.1|WP_000757488.1|231672_232575_+|alpha/beta-hydrolase MKKVNFKSNNLNVVANMYFPENFDENNQYPAIVVNHPAGGVKEQTAGLYAERLATLGYVTMAYDASYQGESEGQPHNLENPSSRVEDVRAAVDYFNTLDFIDDSRIGALGICAGGGYTIKAAQTEKRIKAVVGISAADIGQNFRKGWTGNQDEKDINPLLEQVAEQRKAEANGAPQKLVGFVPEEPTEDMDQETKDGWEYYRTPRAQHERSINQFPFISFDRIIEFTAFDLVDKLLTQPVLFIAGSEAGTLWQSENAYERALEPKDIHIVEGANHFDMYDKEPFVTEAVEKMNSFYGQYL >NZ_LS483302.1|WP_172452432.1|232917_234393_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKFKRLATIFSAVLVLSGCGSMHSSGKDLNISLPLKTKSIAPYETDVPVKIGAAESLFKTNDQGKIEKVLVKSYHQPNDTTLDIELKDNVKFQNGQKLTAKKVKSSLENSMKKSDLVKYSLPISSITAKGQKLTIKTNSAYPELVSELANPFMAIYDTDAKSDVNQTPVGTGPYQIKNYKQSRKISLSNFKDYWQGKPKLDHITVTYQEDGNNRVRNLESQKDDLITDVPVNKVQDIENNQNLKVSKESGFRTSLLMYNHTNKKMTKSVREALDHIIDRQGIADHIYQGYAKPATSPFNDKIPYIKEPKLTKQNIEQAKTLLAKDGYTKEHPLKIKLITYDGRPELSKIAQVLQSDAKKANIEIDIKSVDDIEGYLKDRSAWDATMYSFGTIPRGDTGYFFNQAYKKDGAINKGDYNNNNVDALINQLNHTVDVKERHNISNDIIKLSSRDVPNSYIAYNDQIVAANSKVKNYKVTPEGIYLIDYRTTIER >NZ_LS483302.1|WP_111679957.1|234590_234947_-|DUF488-domain-containing-protein MTVDIGRIYDNKDNTDAIRILVDRVWPRGISKRTANLDYWLKDIAPSTELRQWFQHDPKLFGAFKEKYEKELRDNETQKDAFEKLKDIVNQHNHVLLLYAAKDTEHNQAVVLQQLLNT >NZ_LS483302.1|WP_000773988.1|235103_235277_-|hypothetical-protein MKLNQRYVKVFALYFVSIVTANIIVKNNNLIKTLIQTIAGYTVFALGLKYLTKRKNK >NZ_LS483302.1|WP_000954817.1|235302_236448_-|nitric-oxide-dioxygenase MLTEQEKDIIKQTVPLLKEKGTEITSTFYPKMFKAHPELLNMFNQTNQKRGMQSSALAQAVMAAAVNIDNLSIIKPVIMPVAYKHCALQVYAEHYPIVGENLLKAIQDVTGLEEDDPVIQAWAKAYGVIADVFIQIEKEIYDQMMWIGFKPFKITNIKQESEDIKSFTVETEEYDFSEFTPGQYITVDVSSDKLPYRAKRHYSIVSGDKNHLTFGVKRDVTTEHEGEVSTILHDEIKEGDMINLAAPVGGFVLENTTEPQLFLGSGIGVTPLVAMYETASAKGLDTQMVQVAENEQHLPFKDNFNSIASHHDNAKLYTHLKDKQGYIGAEELQVFLANKPEIYICGGTKFLQSMIEALKSLNYDMDRVHYETFIPRLSVAV >NZ_LS483302.1|WP_031785494.1|236602_236710_+|hypothetical-protein MSVCTPTIVRIYLANSKNIVVFLEKSKHDNKNVKV >NZ_LS483302.1|WP_001031874.1|237020_237974_+|L-lactate-dehydrogenase MNKFKGNKVVLIGNGAVGSSYAFSLVNQSIVDELVIIDLDTEKVRGDVMDLKHATPYSPTTVRVKAGEYSDCHDADLVVICAGAAQKPGETRLDLVSKNLKIFKSIVGEVMASKFDGIFLVATNPVDILAYATWKFSGLPKERVIGSGTILDSARFRLLLSEAFDVAPRSVDALIIGEHGDTELPVWSHANIAGQPLKTLLEQRPEGKAQIEQIFVQTRDAAYDIIQAKGATYYGVAMGLARITEAIFRNEDAVLTVSALLEGEYDEEDVYIGVPAVINRNGIRNVVEIPLNDEEQSKFAHSAKTLKDIMAEAEELK >NZ_LS483302.1|WP_111679958.1|238294_239824_-|PTS-transporter-subunit-EIIC MKSLFEKAQQFGKSFMLPIAILPAAGLLLGIGGALSNPNTVKAYPILDITLLQNIFTLMSAAGSIVFQNLPVIFAIGVAIGLSRSDKGTAGLAALLGFLIMNATMNGLLTITGTLAKDQLAQNGQGMVLGIQTVETSVFGGIITGIMTAILHNKYHKVVLPPYLGFFGGSRFVPIVTAFAAIFLGVLMFFIWPSIQAGIYHVGGFVTKTGAIGTFVYGFILRLLGPLGLHHIFYLPFWQTALGGTLEVKGHLVQGTQNIFFAQLGDPDVTKYYSGVSRFMSGRFITMMFGLCGAALAIYHTAKPEHKKVVGGLMLSAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPILYVIHAFFDGLAFMMADIFNITIGQTFSGGFIDFLLFGVLQGNSKTNYLYVIPIGIVWFCLYYIVFRFLITKFNFKTPGREDKVAAQQVEATERAQTIVAGLGGEDNIEIVDCCATRLRVTLHQNDKVDKVLLESTGAKGVIQQGTGVQVIYGPHVTVIKNEIEELLGD |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_LS483302_2 | 923336-923416 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483302_2
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483302_2
>2.1|923361|31|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGTGGAAAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483302_2
The CRISPR arrays of NZ_LS483302_2 >merge|NZ_LS483302|2|923336-923416|CRISPRCasFinder CAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGTGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >NZ_LS483302|2|2|923336-923416|CRISPRCasFinder CAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGTGGAAAGT CAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>NZ_LS483302.1|WP_000138487.1|921934_923179_+|Glu/Leu/Phe/Val-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVNEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >NZ_LS483302.1|WP_111680193.1|920635_921826_+|ornithine--oxo-acid-transaminase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAILVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >NZ_LS483302.1|WP_111680192.1|919200_920328_+|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDVELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSDIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELTPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTAQEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPIAVIEEVLKAKEMYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >NZ_LS483302.1|WP_001067294.1|918461_918839_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >NZ_LS483302.1|WP_000035064.1|917452_918046_+|peptidylprolyl-isomerase MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYNGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >NZ_LS483302.1|WP_000781162.1|917005_917389_-|kinase-associated-lipoprotein-B MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHERKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK >NZ_LS483302.1|WP_063651631.1|914469_916875_-|Na+/H+-antiporter-subunit-A MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLALPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWIWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFLSTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTVFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >NZ_LS483302.1|WP_001081626.1|914048_914477_-|Na(+)/H(+)-antiporter-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >NZ_LS483302.1|WP_000402803.1|913707_914049_-|Na(+)/H(+)-antiporter-subunit-C MEIIMIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >NZ_LS483302.1|WP_111680191.1|912218_913715_-|Na+/H+-antiporter-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVFFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQSKGYDLNKKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK >NZ_LS483302.1|WP_000185319.1|923574_924504_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >NZ_LS483302.1|WP_000066053.1|924745_926125_-|argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >NZ_LS483302.1|WP_000660050.1|926114_927320_-|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDTADEIILTFVKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ >NZ_LS483302.1|WP_064136235.1|927670_929002_+|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKKIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >NZ_LS483302.1|WP_000007968.1|929926_930502_+|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGVLMLVVLIVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NZ_LS483302.1|WP_000758209.1|930506_931031_+|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLIDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >NZ_LS483302.1|WP_000711896.1|931046_931622_+|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN >NZ_LS483302.1|WP_111680194.1|931781_935258_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLNAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDALQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKELIKYAKSVTIILTTDGNNDQFSLFRKPSEVLQHIEEIANELNISIERQYFNQFYRFNNQDLKHLEQEFDAFQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILYFEKQMSQAATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMDRFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLTQIQALFNRLEITNIPRYHEVAPLSLMQHVKQTKIALFEALRSWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVQLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSAILDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQAVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >NZ_LS483302.1|WP_111680195.1|935258_938912_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPDPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLATTNYIFKHMMDEQVGEVNYDESAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELALIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQIEDSSRPNVNISILYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYRYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSKQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NZ_LS483302.1|WP_000670752.1|939077_939980_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483302_3 | 1731337-1731417 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483302_3
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483302_3
>3.1|1731360|35|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder GTGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGACCCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483302_3
The CRISPR arrays of NZ_LS483302_3 >merge|NZ_LS483302|3|1731337-1731417|CRISPRCasFinder TTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGACCCCCAATTTCTACAAACAATGCAAGTTGGG >NZ_LS483302|3|3|1731337-1731417|CRISPRCasFinder TTCTACAAACAATGCAAGTTGGG GTGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGACCCCCAAT TTCTACAAACAATGCAAGTTGGG
>NZ_LS483302.1|WP_111680382.1|1730218_1731160_-|pApA-hydrolase-Pde2 MISTLNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGSKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDIISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLEQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLATALRTKLN >NZ_LS483302.1|WP_111680381.1|1727000_1730198_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGLPKFYDACLANNIKPIFGMTIYVTNGLNTVETVVLAKNNDGLKDLYQLSSKIKMNSMENVSFELLQQFSSNLIIIFKNVADEHRDIVQVFDSHEDTYLDHRSVLVQGIKHVWIQDVCYQTRQDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTEKEIKQLDINQEYLTQVDVIAQKCNAELKYHQSLLPQYQTPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRREKVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEGISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVDERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKMFVAKQYLTIFKLSNAQKNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDFRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSHIDTFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >NZ_LS483302.1|WP_000058389.1|1725321_1726551_-|NAD-dependent-malic-enzyme-4 MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >NZ_LS483302.1|WP_000471571.1|1724269_1725127_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >NZ_LS483302.1|WP_000883646.1|1723325_1724270_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >NZ_LS483302.1|WP_000717561.1|1722088_1723057_-|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >NZ_LS483302.1|WP_001232655.1|1720309_1722067_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNVLVTIDAAQGKIFEGYANVL >NZ_LS483302.1|WP_000818532.1|1718600_1719962_+|amino-acid-permease MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAYKTQFGHASFTNLYEHGVFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKKATYKLFGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVETRRAIYFIPIWFILLGFMYLRYKRIAAKSNN >NZ_LS483302.1|WP_000829167.1|1717131_1718253_-|citrate-synthase MAELQRGLEGVIAAETKISSIIESQLTYAGYDIDDLAENAQFEEVIFLLWNYRLPNEEELAHLKGKLNQYMTLNPRVYTHFEEYVTDHVHPMTALRTSLSYIAHFDPDAENESDENRYERAMRIQAKVASLVTAFARVRQDKEPLKPNPDLSYAANFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALILHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANEQVMTMLSEIGSIENVDAYLDEKFANKDKVMGFGHRVYKDGDPRAKYLREMSRQITKDAGREELFEMSVKMEKRMAEEKGLIPNVDFYSASVYHCMEIPHDLFTPIFAVSRSAGWIAHILEQYKDNRIMRPRAKYIGETNRKYIPLEERK >NZ_LS483302.1|WP_111680380.1|1715814_1717083_-|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MTAEKITQGTEGLNVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKRIEWKEVLAGQKAFDTTGEWLPQETLDTIKEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQELDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTTEVKKVIDFLQNEMGATNIRFPETSGIGIKLVSKEGTERLVRAAIQYAIDNNRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLALTEFGDQVFTWQQYDEIVEKEGRDAANAAQEKAEKEGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSVILSSVLMLEHLGWQEAADKITDSIEDTIASKVVTYDFARLMDGAEEVSTSAFADELIKNLK >NZ_LS483302.1|WP_000160435.1|1731468_1732767_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVINFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANRTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >NZ_LS483302.1|WP_000277602.1|1732971_1733385_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NZ_LS483302.1|WP_000777188.1|1733715_1734405_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >NZ_LS483302.1|WP_000161656.1|1734579_1735635_+|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEINKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPSQEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >NZ_LS483302.1|WP_031785418.1|1735712_1735817_-|hypothetical-protein MILIHYMLLMNIPAYVFLACLLHIAFRLGQKFMS >NZ_LS483302.1|WP_000689993.1|1735944_1737063_-|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGAGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDKKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDDPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALHL >NZ_LS483302.1|WP_000634175.1|1737203_1737704_+|universal-stress-protein MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >NZ_LS483302.1|WP_000040066.1|1737948_1739151_-|acetate-kinase MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLVERIGLKDSIFTIEVDGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKAHNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESVAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLLRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTFGGLK >NZ_LS483302.1|WP_111680383.1|1739238_1740186_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNERGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGAGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMPLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSKEFKLGFEEGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVAPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK >NZ_LS483302.1|WP_000136257.1|1740308_1740803_-|thiol-peroxidase MTEITFKGGPIHLKGQQINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483302_4 | 1821897-1821985 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483302_4
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483302_4
>4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder CAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAGA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483302_4
The CRISPR arrays of NZ_LS483302_4 >merge|NZ_LS483302|4|1821897-1821985|CRISPRCasFinder CAATGCGCGTTGGGGTACGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAGACAATGCGCGTTGGGGTACGGGCCCCAACAT >NZ_LS483302|4|4|1821897-1821985|CRISPRCasFinder CAATGCGCGTTGGGGTACGGGGCCCCAACA CAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAGA CAATGCGCGTTGGGGTACGGGCCCCAACAT
>NZ_LS483302.1|WP_000492904.1|1820969_1821590_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MFSRNNNIFVDDLSVTKDNYLIAVLKMLVIFLVINYGTDVSYDHEYVGLFIILLGVVLLKVLNINLLSFKKLKFTHMLYIIFGFLLMYGLDYLYDMFAPPTLNEILIDEESEDAPYHLALLSNAIIPPITEEIICRGLIIRILFRNHLFLGFIVSTVFFTLIHESDTLIGYLPYFYSGLIFGYTYLKTKRLEVPILIHFINNLLAM >NZ_LS483302.1|WP_001168913.1|1820167_1820803_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MQKFKDLFYDDLSVARGNYFLTLLSAFFITIILLIGFVVSDTHILYGVFIVLIGIVLLRLFKINLLSFKKLTLSQVIYIIGGALLIYGLDYLYLHFHDVPTNEQELDRELQHTPLYMSIVTIAIIPAIVEEIVFRGMIIRVVFRKHLFIGLVVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGVIFGLIYLKTKRLEVVILIHFINNLSSLLILIWG >NZ_LS483302.1|WP_111680408.1|1819427_1819871_-|hypothetical-protein MNKASFDKKVKKQLWFLNKKEKQALDQRLSSITDKDNVNFNKPITFANGYLRENVFRSKETKSYSVFVTLVVMMFAYVALLGLFLFGLITSLSGVQFFINPKVELSTTVVILTIIGAILLMLVSIYLIKITTSYFTKKLLEHKFNGH >NZ_LS483302.1|WP_111680407.1|1818997_1819441_+|competence-protein-ComK MQDISTKHLLYIQTATSNHLETKCVFLYHEYNLEFPITKAIPYFAKLHFTSASILIDAAKSILNINKLVPIYLNPKTILFPIKQKRAPIQTYINAHYIIGMTEMGNSTMLHFKNGKTLEVDEPMSLISKKCYESLALKHFIENTNDH >NZ_LS483302.1|WP_000671060.1|1818414_1818885_+|RNA-polymerase-sigma-factor MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSNQSLSSFLFMRLNFYLIDLFRQQKRLNDIILCENHSPILTEQPTYFNEYDLRLQDVCALLNHRERQWLMLYLEGYKQYEIADSMSLSTSTIKLIKASVKRKCQRFFE >NZ_LS483302.1|WP_000384171.1|1817991_1818216_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK >NZ_LS483302.1|WP_001032834.1|1816861_1817716_-|glucosaminidase-domain-containing-protein MNKHKKGSIFGIIGLVVIFAVVSFLFFSMISDQIFFKHVKSDIKIEKLNVTLNDAAKKQINNYTSQQVSNKKNDAWRDASATEIKSAMDSGTFIDNEKQKYQFLDLSKYQGIDKNRIKRMLVDRPTLLKHTDDFLKAAKDKHVNEVYLISHALLETGAVKSELANGVEINGKKYYNFYGVGALDKDPIKTGAEYAKKHGWDTPEKAISGGADFIHKHFLSSTDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNATIIADFYKNMKTEGKYFKYFVYKDDSKHLNK >NZ_LS483302.1|WP_111680406.1|1815482_1816775_+|arsenite-efflux-transporter-membrane-subunit-ArsB MMTTLATFIFLVTLLFVLWQPKGLDIGFTALAGAIVAMITGVVSFSDVFEVTGIVWNATLTFVSVILISLILDKIGFFEWSAIHMLHASKGSGLKMFVYIILLGAVVAAFFANDGAALILTPIVLAMVKNIGFSKRAIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIISADYFNISFSQYLSRMIIPNLFSLLASLLVLWLYFRKAIPKTFEDNKIKRPIDAINDLKLFKISWIVLVILLFGYLISEFTKIPVSIFTGIIAFIFLILARKSNAVNIKQVIKGAPWNIVLFSIGMYIVVFGIRNAGITLILAKILEYISNYGLFSTILGMGFISAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSNIHGLLKEGLIYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKDVKISWGTYFKTGIIITIPVLFFTLLGLYLTLILF >NZ_LS483302.1|WP_000221190.1|1815168_1815483_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTYKELATYLKVLSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNLVTTRKIGNKHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC >NZ_LS483302.1|WP_001261660.1|1813022_1814525_-|FAD/NAD(P)-binding-protein MRVAIIGMGTAGVSVLRELVKHPKFNQLDIDLYDDKVNMGQGVPFQNDSSELLINMPSKKMSLNLDDETEFWKWYKQQTDFNFDEPAYLPRFVFGHYMKSYLSMFTKKYPNISTIYNKVQEIYTNSNIDETNLTYYICTTNSEQSWQAYDYVFLTCGTFAYHDPYNLKGKKGYIATPYPTYNTLDEVNEQDDIAIIGTGLASLDVVRYVAAHHPKLPITMTSRSANLPSVRGTMIDVSFKYLTKDKLNDIKKHHFGNAPLDTLVSLFLKECAEYDIDFKKLVHRRTGNHIADLKYDLARPTEMGIFQSMIEHLKENLNWIWNSLSIEDQHQFNQKYSKMIQLNSNPMPPRTAELIIELIENKSLILKKDLEDVKHDGKLYYFSYKNQESVDIYNVVINATGAKSHLNELDQDDQLIKNLENRQIVQAHPMGGIQIIPETNQVISPRFGTLTNMIAIGQMTNGVNKLRNGVKMIVEQVAHTVSQLYDALESNEQQQRSDNQ >NZ_LS483302.1|WP_001096494.1|1822149_1822863_-|transaldolase MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEAAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL >NZ_LS483302.1|WP_000091443.1|1823121_1823424_+|hypothetical-protein MSRSKKYFYLSSLMIILSFFFNTNNVFLSGLFNSFIKLILFCSVINSIILILSIIFADRSIKSLKPDADWIRIASKSLPWIILIVILVHIFSIVHTFGFI >NZ_LS483302.1|WP_111680409.1|1823678_1824044_+|fluoride-efflux-transporter-CrcB MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIAFFSNHPSLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDHQQFITLLLYAITSYVFGILLCYVGIKLGGGLS >NZ_LS483302.1|WP_111680410.1|1824040_1824394_+|CrcB-family-protein MISIILVMIGGGFGAIARSAVTDYFNHIFTSKLPIATLIVNLIGSFLIGLTIGLSISTSWFPAFFVTGFLGGLTTFSTLAKELTLMMTPKFNINLFLNYSLLQFIIGFIACYIGYHI >NZ_LS483302.1|WP_111680411.1|1824642_1825476_-|aldo/keto-reductase MEVKTFYNGNTMPQIGLGTFRVENDENCMESVKYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGTGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRENVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAVMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDETIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFQIFDFELSDEQMTRIDGLNQDKRIGPDPKTFEG >NZ_LS483302.1|WP_000366165.1|1825687_1826596_-|NERD-domain-containing-protein MDLSSPVVIGLIIAVVIALIFFVLFLVALGSKKKVKRQTEEKYEQQEQNIKKSHEEALEKERIQNKKTITKQQEDYNHMVSTKDREIDALKLFSKNHSEYVTDMRLIGIRERLVKEKRIRPEDMHIMANIFLPKDGFNNIERISHLVLTRTGLYIIDSQLLKGHVYNGISGGQFKDLPPMEQVFDTLDLDKSRPQTIVMDQNDDKRSLSFVNYSDQIEAIKQLAEDLQKHLGAKYTPTSILYFNPKNEGDVTISNYNQNSAVKVLVGAEQLDEFFNKFVFHGRIQYNVEDLQQMMDKIESFN >NZ_LS483302.1|WP_111680412.1|1826720_1827914_-|methionine-adenosyltransferase MLNNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDAILKDDPNARVACETTVTTGMALIAGEISTTTYVDIPKVVRETIKEIGYTRAKYGYDYETMAILTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRDKDSEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLAIYLSHQLAKRLSDVRKDGTLNYLRPDGKVQVTVEYDENDNPVRIDTIVVSTQHAEDVTLEQIQEDIKAHVIYPTVPENLINDQTKFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAYAIGVAEPVSIAIDTFGTGKVSEGQLVEAVRKHFDLRPAGIIKMLDLKQPIYKQTAAYGHFGRTDVLFPWEKLDKVEELKGAVK >NZ_LS483302.1|WP_001600685.1|1828284_1829877_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase-(ATP) MSVDTYTETTKIDKLLKKPTSHFQLSTTQLYNKILDNNEGVLTELGAVNASTGKYTGRSPKDKFFVSEPSYRDNIDWGEINQPIDEETFLKLYHKVLDYLDKKDELYVFKGYAGSDKDTMLKLTVINELAWHNLFAKNMFIRPESKEEATKIKPNFTIVSAPHFKADPEVDGTKSETFVIISFKHKVILIGGTEYAGEMKKGIFSVMNYLLPMQDIMSMHCSANVGEKGDVALFFGLSGTGKTTLSADPHRKLIGDDEHGWNKNGVFNIEGGCYAKAINLSKEKEPQIFDAIKYGAILENTVVAEDGSVDFEDNRYTENTRAAYPINHIDNIVVPSKAAHPNTIIFLTADAFGVIPPISKLNKDQAMYHFLSGFTSKLAGTERGVTEPEPSFSTCFGAPFFPLHPTVYADLLGELIDLHDVDVYLVNTGWTGGKYGVGRRISLHYTRQMVNQAISGKLKNAEYTKDSTFGLSIPVEIEDVPKTILNPINAWSDKEKYKAQAEDLIQRFEKNFEKFGKKVEHIAEKGSFNK >NZ_LS483302.1|WP_111680725.1|1830171_1830918_-|S9-family-peptidase MPIESVTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPLHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTELLRLLHDKYPQAFIHMVGFSRGGLQGLLTFQDLPVNSYIIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPPILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGVMHETFYQMAEGHVPRPPAMVETLTYIKEFMNQVELHS >NZ_LS483302.1|WP_000672013.1|1830922_1831396_-|nucleoside-triphosphatase-YtkD MKFRDKDNRQVNLTFKKDNEIADGNHVLAIPTFKNQLLFTKHNLRGIEFPGGKRERGESSAEAVTRELYEETGAKVKNIHYIAQYTIETHDQTDFVKDVYFIEVESLVSKNDYLETAGPVLFNCINDIELAQRSFLLQDSTILKCVERVQSLGFYQT |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483302_5 | 2238081-2238219 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LS483302_5
|
1 spacers
spacers of NZ_LS483302_5
>5.1|2238132|37|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483302_5
The CRISPR arrays of NZ_LS483302_5 >merge|NZ_LS483302|5|2238081-2238219|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGATTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA >NZ_LS483302|5|5|2238081-2238219|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA TTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA
>NZ_LS483302.1|WP_000136271.1|2237783_2237963_-|hypothetical-protein MTEIVEFLSDGKLASRLEIQETMGLQKSYTSELIAELKKLEIIGSEGRGLGTRYYLIRD >NZ_LS483302.1|WP_000655242.1|2236962_2237145_-|hypothetical-protein MKDSIFWKKAFIPVYFIVAMLVFLLFRFYIKTDNFSIYLMIIFLICLGTASIIYNYKTNR >NZ_LS483302.1|WP_000130145.1|2234827_2236492_-|acetolactate-synthase-AlsS MTDKKYTAADMVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGVVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPVESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGVISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELETQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISEKVDEPFINQQHLDELEQLRTHIDEETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDDTTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVDFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN >NZ_LS483302.1|WP_111680531.1|2234086_2234791_-|acetolactate-decarboxylase MTNVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHVRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGSVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIHDEDFTNANIDYKDISDEIREAE >NZ_LS483302.1|WP_000769708.1|2233269_2233695_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNSIDPSTIKQIQIVVK >NZ_LS483302.1|WP_000044373.1|2232159_2232975_-|HAD-IIB-family-hydrolase MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVMTAVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILRHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSTGNHNKDRRILESLVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY >NZ_LS483302.1|WP_000214774.1|2230410_2231928_+|glycosyltransferase MTTYMLMYSIPEKAGGITSVMLNRSKLLAEKGYSCALLTLDDKNYDPLRAKLTNSGRLHKEVKIVNLYEELKMLYDVENTEIENKNMQTFEKLNLLNQEGFYIQKDEYEEKKYARYFKDNNYIMYKKWINGQLSHIDYFQNRKRIKRHVFQNKILRKEITFNDKNKMSEVKYLSNDGFCYLSYWYGDNENIVNIFYFDKNSKEVLNFKNNKMFHSYWLDKNLTSNDVLILDGIGTYPKVENMQNNDVKKIFTIHTNHFLSPYSYGAEIKPEFRNMLLNLKELDTLVVLTKEQKDDIIKQFGDYNNIKVIPNAVSFEENLTQNIREKNSIIVLQRFVAMKNITHIISAINIVRKKVKDVKLHIYGTGTQKENYTKLIKKLKLQDNVFIHDYAFDIRGLYTKASLSVLTSDYEGLPMSLLEAMSYGVPVISYPINYGPKSIIQNNINGIITKKKDNINELAKKIIHVLKKETLISQFSENARTTIKTNFSYEAVSKKWIELIDEKSK >NZ_LS483302.1|WP_000143638.1|2230122_2230401_+|hypothetical-protein MTFNEYNYNNELILKLNKIEVQKNNEKISEVFKDYEILKPKIVFNGSNPYLALNHIIVAEIENYSSLETFSKIYVDEDYYYNYGELIIKCKK >NZ_LS483302.1|WP_111680530.1|2228396_2229251_-|M23-family-metallopeptidase MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKRAFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDGTMEQIWIDKANQFGVAVIWKNNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTHKNQGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVNGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFLNNRELIKGDVVCGLQGE >NZ_LS483302.1|WP_111680529.1|2225777_2228198_+|polysaccharide-lyase-8-family-protein MTYKMKKWQKLSTITLLMAGVITLNGGEFRSIDKHQIAVADTNIQTPDYEKLKNTWLDVNYGYDKYDENNEAMKKKFEVTEKEAEKLLKEMKTESGRKYLWDNSKDLDTKSADMTRTYRNIEKIAEAMKHPKTTLKNDENKKKLKDALEWLHKNAYGKDPDKKVADLKTNFSKSAPQKNTNLNWWDYEIGTPKSLTNTLILLNGDISSDEKKKYTAPIKTFAPKSDEILSSVGKAEPAKGGNLVDIAKVKLLESIIEEDKDMTKNSIDSFNKVFTYVQSNSTGKERNGFYKDGSYIDHQDVPYTGAYGVVLLEGISQMMPMIKETPFKETSQNDTILKSWIDDGFMPLIYKGEMMDLSRGRAISRENETSHSASVTVMKSLLRLSDAMDESTKAKYKKIVKTSVKSDSSYKQNDYLSSYSDISKMKALMEDSTLSTNDLTQQLKIYNDMDRVTYHNKDLDFAFGLSMTSKNVARYESINGENLKGWHTGAGMSYLYNSDVKHYRDNFWATADMKRLAGTTILENEEPKENKNSDKTFVGGTKFDDQHASIGMEFENQDKTLTAKKSYFILNDKIVFLGTGIKNTDSSKNPVTTIENRKANGYTLYTNDKQTTNSDNQETNSVFLESTDTKKNIGYHFLNKSKINVKKESHTGKWSDINKSQKDTQKADEYYEVTQKHSNSDNKYGYVLYPGLSKDVFKSKASQVTVVKQDDDFHVVKDNESVWAGVNYSNSTQTFEINGTKVEVKAKGMFILKKKDDNTYECSFYNPESTNTASDIESKISMTGYSITNKNTSTSNESGVRFELTK >NZ_LS483302.1|WP_000170975.1|2239996_2240395_-|30S-ribosomal-protein-S9 MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR >NZ_LS483302.1|WP_001250038.1|2240408_2240846_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKVTYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG >NZ_LS483302.1|WP_111680533.1|2241085_2241889_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRMHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTELNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQHRDPFQSGLKTFIPETLDLDKMNKAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKSDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEISDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSLQND >NZ_LS483302.1|WP_111680534.1|2241893_2242700_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MKNKLIIGRYLPINSFVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFFCHSPLTYLWVFALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGIYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVQRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPIAIILFVLKYSGV >NZ_LS483302.1|WP_111680535.1|2242689_2243550_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MSIRFNDVSYTYQQGTPYEHQAIHDINTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALIKPTSGTVTIDDVTVTHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMDLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSVLAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKAIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKDKEKLADWHIGLPEIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK >NZ_LS483302.1|WP_111680536.1|2243546_2244356_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIENVKSGEIFYNNQTITDDNFEKLRKNIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALKQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRKVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTAIEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKINQMLGHQTSFLTYEGLVNQL >NZ_LS483302.1|WP_000542274.1|2244893_2245262_-|50S-ribosomal-protein-L17 MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV >NZ_LS483302.1|WP_000569649.1|2245278_2246223_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MIEIEKPRIETIEISEDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVKYIEIEGVLHEFSAVDNVVEDVSTIIMNIKQLALKIYSEEDKTLEIDVRDEGEVTASDITHDSDVEILNPELKIATVSKGGHLKIRLVANKGRGYALAEQNNTSDLPIGVIPVDSLYSPVERVNYTVENTRVGQSSDFDKLTLDVWTNGSITPQESVSLAAKIMTEHLNIFVGLTDEAQNAEIMIEKEEDQKEKVLEMSIEELDLSVRSYNCLKRAGINSVQELADKSEADMMKVRNLGRKSLEEVKYKLEDLGLGLRKED >NZ_LS483302.1|WP_000101625.1|2246297_2246687_-|30S-ribosomal-protein-S11 MARKQVSRKRRVKKNIENGVAHIRSTFNNTIVTITDEFGNALSWSSAGALGFKGSKKSTPFAAQMASETASKSAMEHGLKTVEVTVKGPGPGRESAIRALQSAGLEVTAIRDVTPVPHNGCRPPKRRRV >NZ_LS483302.1|WP_000090796.1|2246710_2247076_-|30S-ribosomal-protein-S13 MARIAGVDIPREKRVVISLTYIYGIGTSTAQKILEEANVSADTRVKDLTDDELGRIREVVDGYKVEGDLRRETNLNIKRLMEISSYRGIRHRRGLPVRGQKTKNNARTRKGPVKTVANKKK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483302_1 | 1.1|230071|33|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 230071-230103 | 33 | NZ_LS483302.1 | 2310926-2310958 | 0 | 1.0 |
| NZ_LS483302_2 | 2.1|923361|31|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 923361-923391 | 31 | NZ_LS483302.1 | 784607-784637 | 2 | 0.935 |
| NZ_LS483302_2 | 2.1|923361|31|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 923361-923391 | 31 | NZ_LS483302.1 | 1625827-1625857 | 2 | 0.935 |
| NZ_LS483302_2 | 2.1|923361|31|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 923361-923391 | 31 | NZ_LS483302.1 | 2052019-2052049 | 2 | 0.935 |
| NZ_LS483302_2 | 2.1|923361|31|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 923361-923391 | 31 | NZ_LS483302.1 | 2310981-2311011 | 2 | 0.935 |
| NZ_LS483302_4 | 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 1821927-1821955 | 29 | NZ_LS483302.1 | 1422087-1422115 | 2 | 0.931 |
| NZ_LS483302_5 | 5.1|2238132|37|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 2238132-2238168 | 37 | NZ_LS483302.1 | 2238043-2238079 | 2 | 0.946 |
1. spacer 1.1|230071|33|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 2310926-2310958, mismatch: 0, identity: 1.0
tgggccccaacaaagagaaattggattcccaat CRISPR spacer tgggccccaacaaagagaaattggattcccaat Protospacer *********************************
2. spacer 2.1|923361|31|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 784607-784637, mismatch: 2, identity: 0.935
cggggccccaacacagaagctggtggaaagt CRISPR spacer cggggccccaacatagaagctggcggaaagt Protospacer *************.*********.*******
3. spacer 2.1|923361|31|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 1625827-1625857, mismatch: 2, identity: 0.935
cggggccccaacacagaagctggtggaaagt CRISPR spacer cggggccccaacatagaagctggcggaaagt Protospacer *************.*********.*******
4. spacer 2.1|923361|31|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 2052019-2052049, mismatch: 2, identity: 0.935
cggggccccaacacagaagctggtggaaagt CRISPR spacer cggggccccaacagagaagctggcggaaagt Protospacer ************* *********.*******
5. spacer 2.1|923361|31|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 2310981-2311011, mismatch: 2, identity: 0.935
cggggccccaacacagaagctggtggaaagt CRISPR spacer cggggccccaacatagaagctggcggaaagt Protospacer *************.*********.*******
6. spacer 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 1422087-1422115, mismatch: 2, identity: 0.931
cagagaatttcaacaagaaattctacaga CRISPR spacer cagagaatttcgaaaagaaattctacaga Protospacer ***********.* ***************
7. spacer 5.1|2238132|37|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 2238043-2238079, mismatch: 2, identity: 0.946
agctcacaaaacccttgatatcattggtttcccatga CRISPR spacer agctcacaaaacccttgatatcactggtttctcatga Protospacer ***********************.*******.*****
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_LS483302_4 | 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 1821927-1821955 | 29 | MN693250 | Marine virus AFVG_25M507, complete genome | 24474-24502 | 5 | 0.828 |
| NZ_LS483302_4 | 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 1821927-1821955 | 29 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 202405-202433 | 6 | 0.793 |
| NZ_LS483302_4 | 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 1821927-1821955 | 29 | NC_021539 | Listeria phage LP-030-2, complete genome | 30990-31018 | 6 | 0.793 |
| NZ_LS483302_4 | 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 1821927-1821955 | 29 | MN693116 | Marine virus AFVG_25M217, complete genome | 37740-37768 | 6 | 0.793 |
| NZ_LS483302_4 | 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 1821927-1821955 | 29 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 36648-36676 | 6 | 0.793 |
| NZ_LS483302_4 | 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 1821927-1821955 | 29 | NC_009928 | Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3, complete sequence | 24267-24295 | 7 | 0.759 |
| NZ_LS483302_4 | 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 1821927-1821955 | 29 | NZ_CP039965 | Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence | 1307898-1307926 | 7 | 0.759 |
| NZ_LS483302_4 | 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder | 1821927-1821955 | 29 | HM452126 | Aeromonas phage phiAS5, complete genome | 16082-16110 | 8 | 0.724 |
1. spacer 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to MN693250 (Marine virus AFVG_25M507, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
cagagaatttcaacaagaaattctacaga CRISPR spacer aagagaattgcaacaagaaattctaatgc Protospacer ******** *************** *
2. spacer 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cagagaatttcaacaagaaattctacaga CRISPR spacer tagagaatatcaacaagaaattataaatg Protospacer .******* ************* ** * .
3. spacer 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to NC_021539 (Listeria phage LP-030-2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cagagaatttcaacaagaaattctacaga CRISPR spacer tagagaatatcaacaagaaattataaatg Protospacer .******* ************* ** * .
4. spacer 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to MN693116 (Marine virus AFVG_25M217, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cagagaatttcaacaagaaattctacaga CRISPR spacer agcaaaatttcaacaagagattctacaaa Protospacer . *.*************.********.*
5. spacer 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cagagaatttcaacaagaaattctacaga CRISPR spacer tagagaatatcaacaagaaattataaatg Protospacer .******* ************* ** * .
6. spacer 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to NC_009928 (Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
----cagagaatttcaacaagaaattctacaga CRISPR spacer
gctgttga----ttcaacaagaaattctccaga Protospacer
. ** **************** ****
7. spacer 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039965 (Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cagagaatttcaacaagaaattctacaga CRISPR spacer atgagaatttcaccaagaaattcggcatc Protospacer ********** ********** .**
8. spacer 4.1|1821927|29|NZ_LS483302|CRISPRCasFinder matches to HM452126 (Aeromonas phage phiAS5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
cagagaatttcaacaagaaattctacaga CRISPR spacer ccccagtcttcaacaagcaattctacaga Protospacer * .. .********* ***********
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
710456 : 718275
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LS483302|710456:718275|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTACGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCGTATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCATGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAATGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAATAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAACCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTTAGCAACATAATGTGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTTTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGCGGCAGCAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACGCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTAAGTGAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACAAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACCTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGACTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LS483302|710456:718275|713706_714291_-|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_LS483302|710456:718275|712986_713427_-|WP_111680123.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAAAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKKKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_LS483302|710456:718275|712172_712646_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_LS483302|710456:718275|715106_715526_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_LS483302|710456:718275|717123_718275_+|WP_001217805.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFKKAENINSIYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_LS483302|710456:718275|716546_717140_+|WP_000604517.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKVTAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_LS483302|710456:718275|714389_715103_-|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_LS483302|710456:718275|715527_716196_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_LS483302|710456:718275|710456_711512_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_LS483302|710456:718275|711511_712198_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
733892 : 744529
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LS483302|733892:744529|DBSCAN-SWA ATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGATGCGTTAGTTAAATACCAAATACTCATCATTTGAGCATTGAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCTGTTGGTGATAAGCAAAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGTACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGACTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGTGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAAATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATACCATAAATGTTTAATACATTAGAACCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATGAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATTACAATAATTAATACAATTGCTAACACAACACTTCCGATGATAAGACCATATTTTTTCTTTTCTGCTGGAGTCAATGGATTAGTAGGTTTCATACCCACACTACCTAAGTTTTTACGATTGAAAAGTACATACCAAACTAAACCTAGCGCCATACCAACAGCTGCAATTAAGAATCCGCCATGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAGCGGCCAACAATATTTGAAATATTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATAATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAACGCAAACGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAGTAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCACCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCGTAAACTGACATGATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCGAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAAAATAGTACGCCTAGTCCTCTAGGATGCCCGAAAAATCCTGTTTGAGGTATGTCTTGAATATGATTTCCATGGGAGTTTTGTTGTGTCATATATACATCCCATCCTTTCTTCCCCTAATACAATAGTTTAATTAAATTTGATTGTGCCTTATCAACTAAATACCTCATTAAATCACAAAAAAATAGAAATATTGAGAATATTCTGTTATTAAGTGCGCACAATTAATTAGAGATAATATAAAAATATACTTATTGACGTTAAAGTGCAATAGATTTCTATAAAAATGTTGTTTATTTCGTGTACTAATATTCTTTTGGTGTACTTTGGGGTAAAATGTTATTTTAATGTAACCTATTATGTATGCTAAATGAAAAACACACCGATAATGTAGGAAAACCTACTTATTGGTGTGTTTATTGAATGATACATTTAACGGTTATCTATTTTTTCGGGATATAAATCATGATTCATTAAACGATGCTCAGCCATTTTTTCATATTTAGAATTTGGACGTCCATAGTTTGTATAAGGATCAATAGAAATTCCACCACGTGGTGTGAACTTGCCCCAAACTTCAATATAATGTGGGTCCATAAGCTCTATCAAGTCATTCATAATGATATTCATACAATCTTCGTGGAAATCACCGTGATTTCTGAAACTAAACAAGTATAATTTCAAAGATTTTGATTCGACCATTTTAACATTTGGAATATATGAAATATAGATAGTTGCAAAATCTGGTTGCCCAGTAATCGGACATAATGATGTGAATTCTGGACAGTTGAATTTTACGAAATAGTCACGACCTTGATGTTTATTATCAAACGATTCTAATACATCAGGACGATAGTCAAAATTGTAAGTATTGTCTTGATTTCCTAATAAAGTTATATCTTGTAATTCATCTTGTTGACGGCCATGTGCCATATAAAGCGCTCCTTTAAATTTATTTTTTTATTATTTTGGCGTCTCGGCGTGCTTTTTCAAACATGTAATAACTTGCACCGATAATAACGACGTAACCTAATGTTGCATAGAAATCTGGAGATTCTCCGAATAGAATAAATCCTAGTATTGCTGTGAAAATTATAGATGCATACGTGAAAATAGAAATATCTTTTGCTGCTGCAAAACTATATGCTAATGTAACACCAATTTGACCCACAGCGGCAGCTAAGCCAGCCCCTAATAGATAAAGTATTTGCATCTGACTCATTGGTTCATAAGTATATGCAGTGAAAGGTATTAAAACGATGACAGAAAATAAGGAGAAGTAAAATACTATAGTATATGGTGCTTCTCTTGTACTAAGTGCTCGAACACATGTATATGCTGATGCTGCAAAAATACCTGAGAATAAGCCAGCTAATGATGGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTTATTTGATACTTCCTTACTTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCGATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGTTGACTTGAAAGTCTGCCAAACATTGGCTGATGGTATTTATATATAAAAAATAATGGAATAAACATTGCTACTAAGTTTCGTGCTAATGATTTTTGAAAAACAGGAAGGTCACCTGCAAGTCTGAAAAACACTGACATAAAACTGAAACCAATAGCCGAAATTAAAATGGCAATGATACCTTTTACTTTAGGATTCAATTTTATCGCCTCTTTTATATAAAATTAACGTATTTATATTAGCATAAAACAACATGTTGTGCATAAATAGTTGAAATTTACTATAAAAAGACTATAATAGACTGTACCGAACAAATGTTCTGTGTTTATTTGTCGGAATAATAGGGCATTACACTTTTATGAATGTTTGTGTTATTACTTAAAACAAATATCAATTCAGTATCAAGCTAATAAGCTTTTTCTTGATTTCTGTTGATACAATTGAGATTGACACAGATTTTAAAAAATCAAGTGATATCTACTGAAAAAATTTTTTTAATTTGTTCAAGTTTTTCTAATTAAGTATTGGTGCCTAGTTGGAACGTTTTACGAACATTCGATTAGAAAATGACACTTTAAATCATAGTGTGTCTTATGTATAATGAAACACATAATATAGTGTTGGTTAAACGAAAAAGACACAATATCTTGTGTTTTGTATGCAAATGCTTTATTTATGAAGAAATTACATTTAAAAGTAATTTAACACAGAAATTTAATAGTTATTATCAATGAATAGTCATATTTTTTAGAAAATGTACTGAGCAAATGGAAGGTATCTAATGATCTAAACACTACATATAGTGATTTTTATACATTCAACCCATATAAGCTACTATTTTCTCAAATATAAATCTATGCAATTGGTTTACATTTGAGAAAATAAGTAGCTTCATTATAGTTAATACAATGCTGAGATAACCATAGTAGCGACGTTGTTAAAGCATTTTTTAATTGTAATGACTACTTAATTTAAAAGGGTTGAAGAAAGAAGGTGATCCAATGAAAATAATATATTTTTCATTTACTGGAAATGTCCGTCGTTTCATTAAGAGAACAGAACTTGAAAATACGCTTGAGATTACAGCAGAAAATTGTATGGAACCAGTTCATGAACCGTTTATTATCGTTACTGGCACTATTGGATTTGGAGAAGTACCAGAACCCGTTCAATCTTTTTTAGAAGTTAATCATCAATACATCAGAGGTGTGGCAGCTAGCGGTAATCGAAATTGGGGACTAAATTTCGCAAAAGCGGGTCGCACGATATCAGAAGAGTATAATGTCCCTTTATTAATGAAGTTTGAGTTACATGGAAAAAACAAAGACGTTATTGAATTTAAGAACAAGGTGGGTAATTTTAATGAAAACCATGGAAGAGAAAAAGTACAATCATATTGAATTAAATAATGAGGTCACTAAACGAAGAGAAGATGGATTCTTTAGTTTAGAAAAAGACCAAGAAGCTTTAGTAGCTTATTTAGAAGAAGTAAAAGATAAAACAATCTTCTTCGACACTGAAATCGAGCGTTTACGTTATTTAGTAGACAACGATTTTTATTTCAATGTGTTTGATATTTATAGTGAAGCGGATCTAATTGAAATCACTGATTATGCAAAATCAATCCCGTTTAATTTTGCAAGTTATATGTCAGCTAGTAAGTTTTTCAAAGATTACGCTTTGAAAACAAATGATAAAAGTCAATATTTAGAAGACTATAATCAACACGTTGCAATTGTTGCTTTATACCTAGCAAATGGTAATAAAGCACAAGCTAAACAATTTATTTCAGCTATGGTTGAACAAAGATATCAACCAGCGACACCAACATTTTTAAATGCAGGCCGTGCGCGCCGTGGTGAGCTAGTGTCATGTTTCTTATTAGAAGTGGATGACAGCTTAAATTCAATTAACTTTATTGATTCAACTGCAAAACAATTAAGTAAAATTGGTGGCGGCGTAGCAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LS483302|733892:744529|738287_740393_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_LS483302|733892:744529|733892_735398_-|WP_111680127.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNHIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGTSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_LS483302|733892:744529|741856_742828_+|WP_000876313.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINVALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRVIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_LS483302|733892:744529|735738_736239_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_LS483302|733892:744529|737926_738325_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_LS483302|733892:744529|740510_741482_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_LS483302|733892:744529|743767_744529_+|WP_111680129.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTIHNQTILEDISIVIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRTRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLQMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGRLVKSDLKDNVIQSNVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_LS483302|733892:744529|742814_743771_+|WP_111680128.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQSITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVIPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLVTMVLFALLLFQVIFKIGQFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVILVTLLIITIYLVPYLDVLLLGRAEAINLGISYEQLTRFLLVIVSILVSISTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVKRRNAQ >NZ_LS483302|733892:744529|736258_737125_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(62.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
825288 : 885480
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LS483302|825288:885480|DBSCAN-SWA 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82 | Staphylococcus_phage(82.09%) | head,portal,plate,holin,transposase,terminase,tail,capsid,integrase | attL 836287:836302|attR 892367:892382 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1582957 : 1591269
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LS483302|1582957:1591269|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGCTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAGCCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAGCATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGATCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAATCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAATGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCCTGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAGCCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAAAAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCTTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGCAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAACTTTCGGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCACCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTACCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAATTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACATATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTCGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAATACCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATGGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAACTATATTGTTCTAGGCTAATTAATGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGTACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCTGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAATGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGCGCTTTATCTAAGTTGTATAACAACTTTCTTTTTTGAAAAATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCATTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAATCGCATCTGTAAAACCACGTTCTAGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAGTAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCGATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LS483302|1582957:1591269|1587331_1588009_-|WP_000624564.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTESLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSAQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINEEIAVIERVL >NZ_LS483302|1582957:1591269|1586228_1587329_-|WP_111680351.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTFLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_LS483302|1582957:1591269|1583868_1584759_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_LS483302|1582957:1591269|1584768_1586115_-|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_LS483302|1582957:1591269|1589469_1591269_-|WP_111680352.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLLERGFTDAIIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISFMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_LS483302|1582957:1591269|1582957_1583743_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_LS483302|1582957:1591269|1588139_1589246_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1660761 : 1669802
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LS483302|1660761:1669802|DBSCAN-SWA TTTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCACCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTTTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATTTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATTGACGTAGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCGTTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGTGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGTATATTTTTAATCGTTATGTCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTGTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGTCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCATTTCTGCCATTGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATTATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAGTCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAAATGTTGAAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAAGGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCGAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGCCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCTATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTTAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATCATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAAAGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCAGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTCGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAGTTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACTTTTCTTAGAGATTTCTTCTGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCTTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGGTCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTATTACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATTGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAAAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCGTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCAGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGCGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATAATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATACGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATTAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCGGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCATAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATACGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATACATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTGCCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCATGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTTGCAACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATAGCACTTTCATCATCAATACCTGTGCCCAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTACCAGCTCGAGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTCGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LS483302|1660761:1669802|1661301_1663575_-|WP_000594986.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQHLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNNQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAEMKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIDNIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_LS483302|1660761:1669802|1666329_1666590_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_LS483302|1660761:1669802|1667770_1668796_-|WP_001019180.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETANLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDYDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_LS483302|1660761:1669802|1660761_1661280_-|WP_111680372.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLKMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_LS483302|1660761:1669802|1666608_1667748_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_LS483302|1660761:1669802|1663775_1666055_-|WP_111680373.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKSDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGMMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_LS483302|1660761:1669802|1668797_1669802_-|WP_001005764.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDDESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1793200 : 1850841
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LS483302|1793200:1850841|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCATTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAATAATGCTGCGCCTGTAATTAGTGCTAATTCTTTTAATGGTAAATCCATTTCTTCAGAACCAGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCGCACTTCTTGTTTATCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCAGGTTGCCCCACTTTTGGTGACGCTTTTATCACTTCAGCAGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAATAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCGATCATTCTATTACCATCTGCAACATATTGATCTATTAACGCTTTCACTTTAGCCAATTGTTCTGGTGTTGCAATCGCTTTGAATTTCGCATAGGTTTGTTGCGCAATATTTTCAATGCGCATTAAGCTATGTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACCGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCTGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGTACTAAATGCGTAACACGTGCAATATCTTGGTTGATTGTTTTTTCGGCCTCCGGTTTTTTAACAGGATGCACATCTAAACCTTGTATTGTTTGAAGATTAAATGATGCTGTTTTATCCACTTGTGCATTGCTACGGTCATGATCAAGTTGTCCGATTGCTGCGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAAAACACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAACATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCATTGAGCAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCATTTCTGTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCCCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATGTGTTGTTTCGCTTTTATTAATGCTTGTTCTACTTGTGCTATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCATTATTTGATTTGATTAAATTAATTTTATGAGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAACGCTGTTGTTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATCGATACTATTTTGATTAACTTGCGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAATCTTTCTTCTTCGGTAGATAAATCACTTTGATCAATAAGTGCATTTTGAGCTTCAGCTTTTGCGCTGACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTTGTTACCATCAGCCTCAGTTTGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATATCATTTTTAATTGCATTAACAATTTTATTTAACGCAGCAATAGCAACATTTCGTTCATCTTGCGTTGTATCTAGCGTATTTCGTATTGCAGCGAGTTGATTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCACGTTTGCGTCTAACTTTCGGTTTAATTTGTTCGATTGCCTTAATCGTTTGATTTCTAACATCATTGACAGCTGCATCTTGTGTCGTATTGTCTATATTTTGTTGACCTTGTTTAAGTGTGTCGTTAATTTGTTGGTTTGCTTCATCTAATTCATCAGTCGTAGCATGTGGTGTATCTTTTATAGATTCTACTTGGTTATCTGCGCTCGCTTTTATGGCTTCTTGAGCTTCAGGTTTAACCACAATGTGCGGTTCTACGCCTTTTAACGTAGCAATACCATTTGATTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGTGCTTTTTAACCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGTTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAATGCAATGTCGTCAAGCGCTTGATTTGTTGAGTCATTAACTTGCTGATTTGTTCTATCATTTGTGATATTTGTCATAGCTTTAGCAACTAAATCATTGATTTTATCTAACGCCGCTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCTTGATTAATTTGCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCTGCTGGTTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATCATTTTTATCGCAGTTATACCATCTGTTGCTGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTAGCTAATGCTTGTAAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCATTAATCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACTGCAGCCTGCTTTTCTTCGTCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCCACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCTGCATTTGTATTAGCTAGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAATGTTGATTGCAGCATTCTTCTCATCATCTGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATACTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTCATTGCTTGTTTACCTGCTTGTAATGCTTGATCTACTTCTGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAAATCTTGATCTACTTGATTTAATGCTACTTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAGTCCGTTAATACACCTGTGGCTGATTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGTACCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATCTATTGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTAGCATTGATATTTGATATCGCCTCACGTGCTTTTTCATTTACAGTATTACGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTCGCCGGTTGAATCGCAAGTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGCAATTGTTGTGCTGCTTGTTGCTCTTCTAAGGTCGCATCATTATTATTAAATATCGCATTATGTTGCGTTTCTGCACTTTGATCAATAGCGTTTTTAGCATCTGTTTTAACCTTTGTAGCTGGCTCAATGGCCTGTATTCCTTGAATCGCATTTGTCTTCACTTGCTCAACATCAGCATTGCTATTAGCATTTAAAATATTAGTATTCGCAGCAGCTACAGCAGCATTTACTTTCTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTTGCATCAGGATTAGCATTGATCTCTGCGATATGCTGTTGTGCATCATGTGATACGGCATCTCTTGCAGCTTGCTTAACAACAGTTACAGGAGCAATTGGATTAATGACATTTAGACCATCACCTTTGGCAGTATCTACATCATCATTGGTTGTCGCTTGATTGATTTGTTCTAATGCGTGGTTTGTGGCTTGCGTTAATTCATTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCTTGTGTTGCTTCTCTATTGCTATTTATTTGTTGTCGTTTCGTTGCTGTCGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCTGCTTGTTTGTGTGTCACTTGTGGCACAACTGCACCAATTGTATTAATACCATTATTTTTAGCTGTTTCAACATCAGCATTGGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTTGTTAATTGATTTAATGCATCTTGAATTTCGTCTTGAGTAGCATCTGATGTGTTATTGATAATTTCTCTTTGTTTCGCTGCTTTATCACGTATAGCTTGTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCACCACTTAAGGTCTGTATACCTTGATCCTTAATTCTAGTAACGCCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTCCCAATAATTTCATTTTTATGTTCCTCGATAACTTGAATCGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGGTTAACTAAATCTTCCATGTCATCAACTTTTCTATTAACGGCATTTTCAGCGTCAACACTACGAATTAACGTATGTTGCATCTGATTTGCTAATGAATCGATATCTGCTTGAGAAACTCTTTTGTTTAAAGGTACATTGTTACGGTTTTCATCTAAAATTGTTTGTGCGCGTCTTTTAAGATCATTAAAAATATCTAATGATGCAAATGTATAATCCGCCTGTTGAATTCGTCTATCGACTTCGGCTTGCAATGCGTCTTTATTCATGATGATATCGATAGTATATGGATTTGTACTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGTATATGTTTTATACGTTAATGTCTCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTCGGCACATTATTTACACGTAATTTATATCTTAAATCGAGTATTTTATCAGGCATTAGTCGTGCCGGAGAGTTTGCTGTACCT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56 | Staphylococcus_phage(93.18%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1937240 : 2032884
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LS483302|1937240:2032884|DBSCAN-SWA ATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATTGTGGATTAGCTTGACCTTTAGACGCTTTCATAATTTGACCAACTAAGAAGCCCATAGCTTTGCCTTTACCATTTTTGTAATCTTCAACTGATTGTTCGTTATTGTCTAATGCTTCATTTACAAATTTTAGAAGTGTTGCTTCATCAGAAATTTGAACTAAGCCATTATCTTCCATAATCTGTTTAGCATTACCACCTTTAGCTGCTAACTCTGGGAAGACTTTCTTCGCAATTTTACTGCTCATTGTTCCGTCTTCGATAAGTTTAATCATACCTGCTAAATTTTCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAGGTAAACCTAATTCATTTACATACTTAGCTTTACGCTCATCTGGTAATTCAGGAATTGTCTGACGAACACGCTCTTTCCAAGCATCATCAATATATAAAGGTACGATGTCAGGCTCTGGGAAGTAACGATAATCATCAGAACCTTCTTTAACACGCATTAAAATTGTTTTACCTGTAGATTCATCAAATCGACGTGTTTCTTGTCCGATTTCTCCACCATTTAACAATTCTTCTTCTTGGCGTTTTTCTTCATATTCTAAACCTTTACGTACATAGTTAAATGAGTTTAAGTTTTTCAATTCGGCTTTAGTACCAAATTTTTCTTGACCATATGGACGCAAAGAGATGTTAGCATCACAACGTAAAGATCCTTCTTCCATCTTAACGTCTGATACACCAGTGTATTGAATAATTGAACGTAATTTTTCTAAATACGCATATGCTTCTTTAGGTGAACGAATATCTGGTTCAGATACGATTTCAATTAGCGGTGTACCTTGACGGTTCAAGTCAACTAATGAATACTCACCTTTATGTGTTGACTTACCAGCATCTTCTTCCATGTGAAGACGAGTAATACCGATTCGTTTTGTTTCACCGTCGACTTCGATATCGATATATCCATTTTCACCAATTGGTTGATCAAATTGAGAAATTTGATATGCCTTTGGATTATCTGGATAGAAATAGTTCTTACGGTCAAACTTAGATTCTGTTGCGATTTCCATATTTAGTGCCATTGCAGCACGCATTGCCCAGTCTACTGCACGCTTATTAACAACTGGTAAGACACCTGGATATGCTAAGTCGATAACATTTGTATTTGAGTTAGGTTCTGCTCCAAAATGCGCTGGTGATGGAGAAAACATTTTTGAGTCCGTTTTTAACTCTACGTGAACTTCAAGTCCTATAACTGTTTCAAAATGCATGATTTCCACTCCTTATAATTTTTCATAAACGTCATGTAAATTGTATTGTGTTTCATATTGATAAGCGACACGATATAACGTTTTTTCATCGAATGGTTTACCAATGAACTGTAAACCGATTGGTCGGCCATTTGATTGTCCACAAGGAACAGAAATACCAGGTAATCCAGCTAAGTTTACTGGTGTTGTTAATAAATCATTGGCATACATTGTCAATGGATCATCAATTTCTTCACCTAAATTAAACGCAGTTGTAGGCGCTGTTGGACCAACTACTACATCATAATTTTCGAATACTTTATCAAAGTCATTTTTAATCAATGTTCTAACTTTTTGAGATTTTTTATAGTAAGCATCGTAGTAACCTGAACTTAATGCAAATGTACCTAAGAAAATACGACGTTTTACTTCTTTACCAAAACCTTCAGATCTTGACATTTTATATAATTCTTCTAATGAATGAGCTTCTTTAGAATGATAACCATAACGAATTCCGTCAAAACGAGAAAGGTTTGACGAAGCTTCTGATGATGCAATCACGTAATATGATGGAATACCAAATTTAGTATTTGGCAATGATACTTCCTCAACGACAGCACCTAAAGATTTTAAAGTTTCTACAGCGTTTTGAACTGCTTCTTTTACGTCATCAGCTACACCTTCACCTAAGTATTCTTTAGGTAATGCAACTTTTAATCCTTTAATATCTTTACCAATATCAGATGTAAAGTCTACATCATCAACAGGTGCACTTGTAGAGTCATTAACATCTGCACCAGAAATGGCTTCTAATACGATTGCATTATCTTTTACATTTCGAGTCAATGGACCAATTTGGTCTAATGAAGATGCAAATGCAACTAATCCAAATCGAGATACACGACCGTATGTTGGTTTCATACCGACAACGCCACAATATGCAGCCGGTTGTCTAATTGAACCACCTGTGTCTGAACCTAAGCTAAATGGTACTAAGCCAGCTGCAACTGCTGCTGCAGATCCACCTGATGAACCACCTGGTACTGCTTTATGGTCAAATGGGTTAACTGTTTTTTTGAAATAAGATGTTTCTGTTGAACCACCCATTGCAAACTCATCCATATTTAATTTACCGATTAAAACGGCATTCTCATTATGTAGTTTTTCCATTACAGTAGATTCGTAAATTGGCACAAAACCTTCTAACATTTTACTTGCACATGTTGTTTCTAATCCGTTTGTAATAATGTTATCTTTTATACCCATTGGAATACCAAATAATTTGCCATCCATTTGGTCTTTTGCTTGTAATTCATCCAATTCTTGCGCTTTTTTAATTGCATTTTCTTTATCCAGCGCTAGAAAAGACTTAATTGTTGGATCAGTCTCTTCAATTGCATCATATATATCTTTAACAACATCAGATGGTTTGATTTTTTTGTCTTTTATTAAAGTTAATAAATTCTCAACCGATTCGTAGCGAATGCTCATCTTACGCGTCCTCCTCATTCATGATTGTAGGCACTTTAAATTGTCCATCTTCTGTTTCTTTGGCATTTTTCAAAGCTAATTCTTGCGGAATACCTTTAATTGCTTTATCTTCACGTAAAACGTTTTGTAAATCTAAAACGTGATATGTAGGTTCAACGCCTTCTGTATCAGCGCTATCATTTTGTTTTGCAAAATCTAAAATGCTTTCTAATGTGTTGGCCATTTCTTCCGTTTCTTCAGGAGAAATTTGAAGTCTTGCAAGATTCGCGATATGCTCAACTTCTTCACGTGTTACTTTTGTCATTAATAAAAGCCTCCTTTAAGTCATTCATCACTAAATTGTATCAAATTTCCAATTAAAAATCTAAGTATTTATGAGGTACTACTTTAATTTCATATAAACTGTATAAACATTATCATTCGTTTACCAAATCATTTTTTATGAAAACAACACCCTCTTAATAATAGACAACCCAATTCAATATTATGATTATGCAATTTTAATTATAAAAATTTGCCTATATCTAAAAAATAAGAAAGCGCTTTCTATATTGGTATACAAGTATTTCAAAAAGAATAAATTTAATTTTCCTACTTTTCTAAACATTTATCTTTATGTATAATGTTTTCAAGTAACTAAATTATAAATTAAATAAAGGGAGTGTTTATCATGCTTACAATGGGGACAGCATTAAGTCAACAAGTAGATGCCAATTGGCAAACTTATATTATGATTGCCGTCTACTTCTTGATACTAATCGTTATTGGCTTTTACGGTTACAAGCAAGCAACTGGTAACCTGAGCGAGTACATGTTAGGTGGACGTAGTATCGGTCCGTATATTACTGCATTATCAGCTGGAGCTTCAGATATGAGTGGCTGGATGATTATGGGTTTACCAGGCTCTGTCTATAGTACTGGTCTTTCGGCAATGTGGATTACAATCGGCTTAACATTAGGTGCTTATATAAATTACTTTGTTGTTGCTCCTAGACTTCGTGTTTATACCGAATTAGCTGGAGATGCAATTACATTACCAGATTTCTTTAAAAATCGTTTAAACGATAAAAATAATGTGTTAAAGATTATTTCTGGATTGATTATCGTAGTATTCTTTACATTATATACACATTCTGGTTTCGTATCTGGTGGTAAATTATTTGAAAGTGCTTTTGGATTAGATTATCATTTCGGTTTAATATTAGTTGCTTTCATTGTCATTTTCTATACTTTCTTTGGTGGATATTTAGCTGTATCAATTACAGATTTCTTCCAAGGTGTCATTATGTTAATTGCGATGGTTATGGTCCCTATTGTTGCTATGATGAATTTAAACGGCTGGGGAACGTTTCATGATGTAGCAGCTATGAAACCTACAAATTTAAATTTATTTAAAGGGTTATCATTTATAGGAATTATCTCTCTATTTTCATGGGGATTAGGTTATTTCGGTCAACCTCATATCATTGTAAGGTTTATGTCTATTAAATCACACAAGATGCTACCTAAAGCTAGACGTTTAGGTATTAGCTGGATGGCTGTTGGTTTATTAGGCGCTGTGGCTGTTGGTTTAACAGGTATTGCATTCGTACCTGCTTATCATATTAAACTAGAAGATCCTGAGACATTATTCATCGTGATGAGTCAAGTACTTTTCCATCCTCTTGTAGGCGGTTTTTTACTAGCAGCGATTTTAGCAGCAATTATGAGCACGATTTCTTCACAATTACTTGTAACATCTAGTTCTTTAACGGAAGACTTTTATAAATTAATTCGTGGTGAAGAAAAAGCTAAAACGCACCAAAAAGAATTTGTTATGATTGGAAGATTATCTGTATTAGTTGTAGCAATTGTTGCTATCGCGATTGCATGGAATCCAAACGACACAATTCTAAACTTAGTAGGTAATGCTTGGGCCGGATTTGGTGCATCGTTCAGTCCACTTGTGCTATTTGCACTTTACTGGAAAGGTTTGACACGTGCCGGTGCTGTAAGTGGAATGGTTTCAGGTGCTTTAGTCGTTATAGTTTGGATTGCATGGATTAAACCATTGGCACATATCAATGAAATATTCGTCTTATATGAAATTATTCCTGGATTT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114 | Staphylococcus_phage(84.62%) | head,portal,holin,tRNA,tail,terminase,protease,capsid,integrase | attL 1998760:1998777|attR 2024140:2024157 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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