CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_LS483310	Staphylococcus aureus strain NCTC9752 chromosome 1	4 crisprs	cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL	3	0	9	0

1. NZ_LS483310

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_LS483310_1

• CRISPR_ID: NZ_LS483310_1
• CRISPR_location: 100561-100642
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483310_1

Consensus_repeat	Method
TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483310_1

>1.1|100585|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder
ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483310_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483310_1

>merge|NZ_LS483310|1|100561-100642|CRISPRCasFinder
TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG

>NZ_LS483310|1|1|100561-100642|CRISPRCasFinder
TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG	ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT
TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483310.1|WP_000723455.1|94965_96111_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing)	unknown	unknown	gnl|CDD|223458
NZ_LS483310.1|WP_000197961.1|103666_104428_+|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223673
NZ_LS483310.1|WP_000171919.1|101087_101600_+|DUF4242-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379428
NZ_LS483310.1|WP_000779494.1|93626_94889_+|nucleotide-sugar-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|223749
NZ_LS483310.1|WP_000480603.1|96175_96502_-|staphylobilin-forming-heme-oxygenase-IsdI	unknown	unknown	gnl|CDD|183968
NZ_LS483310.1|WP_000826655.1|102695_103670_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270271
NZ_LS483310.1|WP_001092004.1|105688_106048_+|DUF2294-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227896
NZ_LS483310.1|WP_111686133.1|109328_116504_+|amino-acid-adenylation-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|237108
NZ_LS483310.1|WP_001013481.1|99452_100412_+|cation-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224151
NZ_LS483310.1|WP_000706137.1|106220_107246_+|NAD-dependent-formate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|181041
NZ_LS483310.1|WP_001230676.1|92685_93573_+|capsular-polysaccharide-type-5/8-biosynthesis-epimerase-CapN	unknown	unknown	gnl|CDD|187543
NZ_LS483310.1|WP_111686047.1|107631_108882_+|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|340887
NZ_LS483310.1|WP_111686046.1|97318_98806_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143435
NZ_LS483310.1|WP_000825098.1|92128_92686_+|sugar-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|225059
NZ_LS483310.1|WP_000356963.1|100705_100909_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483310.1|WP_001291017.1|90912_92118_+|glycosyltransferase-family-4-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|340825
NZ_LS483310.1|WP_000239649.1|89706_90912_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483310.1|WP_000590860.1|101941_102682_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224041
NZ_LS483310.1|WP_001236999.1|96508_96892_-|YbaN-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377291
NZ_LS483310.1|WP_000171645.1|104440_105472_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483310.1|WP_000723455.1|94965_96111_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing)	gnl|CDD|223458	COG0381, WecB, UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	0
NZ_LS483310.1|WP_000197961.1|103666_104428_+|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|223673	COG0600, TauC, ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component [Inorganic ion transport and metabolism].	1.22607e-73
NZ_LS483310.1|WP_000171919.1|101087_101600_+|DUF4242-domain-containing-protein	gnl|CDD|379428	pfam14026, DUF4242, Protein of unknown function (DUF4242). This family of proteins is functionally uncharacterized. This family of proteins is found in bacteria and archaea. Proteins in this family are typically between 90 and 170 amino acids in length. There is a single completely conserved residue C that may be functionally important.	2.56603e-26
NZ_LS483310.1|WP_000779494.1|93626_94889_+|nucleotide-sugar-dehydrogenase	gnl|CDD|223749	COG0677, WecC, UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	0
NZ_LS483310.1|WP_000480603.1|96175_96502_-|staphylobilin-forming-heme-oxygenase-IsdI	gnl|CDD|183968	PRK13313, PRK13313, staphylobilin-forming heme oxygenase IsdI.	1.40112e-64
NZ_LS483310.1|WP_000826655.1|102695_103670_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270271	cd13553, PBP2_NrtA_CpmA_like, Substrate binding domain of ABC-type nitrate/bicarbonate transporters, a member of the type 2 periplasmic binding fold superfamily. This subfamily includes nitrate (NrtA) and bicarbonate (CmpA) receptors. These domains are found in eubacterial perisplamic-binding proteins that serve as initial receptors in the ABC transport of bicarbonate, nitrate, taurine, or a wide range of aliphatic sulfonates, while other closest homologs are involved in thiamine (vitamin B1) biosynthetic pathway and desulfurization (DszB). After binding their ligand with high affinity, they interact with a cognate membrane transport complex comprised of two integral membrane domains and two cytoplasmically located ATPase domains. This interaction triggers the ligand translocation across the cytoplasmic membrane energized by ATP hydrolysis. These binding proteins belong to the PBP2 superfamily of periplasmic binding proteins that differ in size and ligand specificity, but have similar tertiary structures consisting of two globular subdomains connected by a flexible hinge. They have been shown to bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	5.03649e-50
NZ_LS483310.1|WP_001092004.1|105688_106048_+|DUF2294-domain-containing-protein	gnl|CDD|227896	COG5609, COG5609, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	6.06834e-49
NZ_LS483310.1|WP_111686133.1|109328_116504_+|amino-acid-adenylation-domain-containing-protein	gnl|CDD|237108	PRK12467, PRK12467, peptide synthase; Provisional.	0
NZ_LS483310.1|WP_001013481.1|99452_100412_+|cation-transporter	gnl|CDD|224151	COG1230, CzcD, Co/Zn/Cd efflux system component [Inorganic ion transport and metabolism].	3.08716e-108
NZ_LS483310.1|WP_000706137.1|106220_107246_+|NAD-dependent-formate-dehydrogenase	gnl|CDD|181041	PRK07574, PRK07574, NAD-dependent formate dehydrogenase.	0
NZ_LS483310.1|WP_001230676.1|92685_93573_+|capsular-polysaccharide-type-5/8-biosynthesis-epimerase-CapN	gnl|CDD|187543	cd05232, UDP_G4E_4_SDR_e, UDP-glucose 4 epimerase, subgroup 4, extended (e) SDRs. UDP-glucose 4 epimerase (aka UDP-galactose-4-epimerase), is a homodimeric extended SDR. It catalyzes the NAD-dependent conversion of UDP-galactose to UDP-glucose, the final step in Leloir galactose synthesis. This subgroup is comprised of bacterial proteins, and includes the Staphylococcus aureus capsular polysaccharide Cap5N, which may have a role in the synthesis of UDP-N-acetyl-d-fucosamine. This subgroup has the characteristic active site tetrad and NAD-binding motif of the extended SDRs. Extended SDRs are distinct from classical SDRs. In addition to the Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet) core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids. Extended SDRs are a diverse collection of proteins, and include isomerases, epimerases, oxidoreductases, and lyases; they typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	8.67203e-118
NZ_LS483310.1|WP_111686046.1|97318_98806_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143435	cd07117, ALDH_StaphAldA1, Uncharacterized Staphylococcus aureus AldA1 (SACOL0154) aldehyde dehydrogenase-like. Uncharacterized aldehyde dehydrogenase from Staphylococcus aureus (AldA1, locus SACOL0154) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_LS483310.1|WP_000825098.1|92128_92686_+|sugar-transferase	gnl|CDD|225059	COG2148, WcaJ, Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	3.08096e-87
NZ_LS483310.1|WP_111686047.1|107631_108882_+|MFS-transporter	gnl|CDD|340887	cd17329, MFS_MdtH_MDR_like, Multidrug resistance protein MdtH and similar multidrug resistance (MDR) transporters of the Major Facilitator Superfamily. This family is composed of Escherichia coli MdtH and similar multidrug resistance (MDR) transporters from bacteria and archaea, many of which remain uncharacterized. MDR transporters are drug/H+ antiporters (DHA) that mediate the efflux of a variety of drugs and toxic compounds, and confer resistance to these compounds. MdtH confers resistance to norfloxacin and enoxacin. MdtH-like MDR transporters belong to the Major Facilitator Superfamily (MFS) of membrane transport proteins, which are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	1.08526e-71
NZ_LS483310.1|WP_001291017.1|90912_92118_+|glycosyltransferase-family-4-protein	gnl|CDD|340825	cd03794, GT4_WbuB-like, Escherichia coli WbuB and similar proteins. This family is most closely related to the GT1 family of glycosyltransferases. WbuB in E. coli is involved in the biosynthesis of the O26 O-antigen. It has been proposed to function as an N-acetyl-L-fucosamine (L-FucNAc) transferase.	1.1999e-72
NZ_LS483310.1|WP_000590860.1|101941_102682_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224041	COG1116, TauB, ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component [Inorganic ion transport and metabolism].	1.48266e-112
NZ_LS483310.1|WP_001236999.1|96508_96892_-|YbaN-family-protein	gnl|CDD|377291	pfam04304, DUF454, Protein of unknown function (DUF454). Predicted membrane protein.	7.54946e-41
NZ_LS483310.1|WP_000171645.1|104440_105472_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	2.67474e-20

Protein sequences

>NZ_LS483310.1|WP_001013481.1|99452_100412_+|cation-transporter
MNGKKANTINRYKYFHHVNHQKIQQSSKKTLWASLIITLLFTVIEFVGGLVSNSLALLSDSFHMLSDVLALGLSMLAIYFASKKPTARYTFGYLRFEILAAFLNGLALIVISIWILYEAIVRIIYPQPIESGIMFMIASIGLLVNIILTIILVRSLKQEDNINIQSALWHFMGDLLNSIGVIVAVVLIYFTGWRIIDPIISIVISLIILRGGYKITRNAWLILMESVPQHLDTDQIMADIKNIDGILDVHEFHLWSITTEHYSLSAHVVLDKKYEGDDYQAIDQVSSLLKEKYGIAHSTLQIENLQLNPLDEPYFDKLT
>NZ_LS483310.1|WP_111686046.1|97318_98806_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MAVNVRDYIAENYGLFINGEFVKGSSDETIEVTNPATGETLSHITRAKDKDVDHAVKVAQEAFESWSLTSKSERAQMLRDIGDKLMAQKDKIAMIETLNNGKPIRETTAIDIPFAARHFHYFASVIETEEGTVNDIDKDTMSIVRHEPIGVVGAVVAWNFPMLLAAWKIAPAIAAGNSIVIQPSSSTPLSLLEVAKIFQEVLPKGVVNILTGKGSESGNAIFNHDGVDKLSFTGSTDVGYQVAEAAAKHLVPATLELGGKSANIILDDANLDLAVEGIQLGILFNQGEVCSAGSRLLVHEKIYDQLVPRLQEAFSNIKVGDPQDEATQMGSQTGKDQLDKIQSYIDAAKESDAQILAGGHRLTENGLDKGFFFEPTLIAVPDNHHKLAQEEIFGPVLTVIKVKDDKEAIDIANDSEYGLAGGVFSQNITRALNIAKAVRTGRIWINTYNQVPEGAPFGGYKKSGIGRETYKGALSNYQQVKNIYIDTSNALKGLY
>NZ_LS483310.1|WP_001236999.1|96508_96892_-|YbaN-family-protein
MRLILIVIGLIFTALGIAGAVLPLLPTTPFLLVAVFCFARSSDRFYNWLINQKIYKEYVENFYLHRGYTLQQKIKILISLYIVIAFSIYMVDVLAVRVGLIIMVIIQTAVLFTFVKTLPKSNHKIEE
>NZ_LS483310.1|WP_000480603.1|96175_96502_-|staphylobilin-forming-heme-oxygenase-IsdI
MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQGIETIEGFQQMFVTKTLNTEDTDEVKILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK
>NZ_LS483310.1|WP_000723455.1|94965_96111_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing)
MKKIMVIFGTRPEAIKMAPLVKEIDHNGNFEANIVITAQHRDMLDSVLSIFDIQADHDLNIMQDQQTLAGLTANALAKLDSIINEEQPDMILVHGDTTTTFVGSLAAFYHQIPVGHVEAGLRTHQKYSPFPEELNRVMVSNIAELNFAPTVIAAKNLLFENKDKERILITGNTVIDALSTTVQNDFVSTIINKHKGKKVILLTAHRRENIGEPMHQIFKAVRDLADEYKDVVFIYPMHRNPKVRAIAEKYLSGRNRIELIEPLDAIEFHNFTNQSYLVLTDSGGIQEEAPTFGKPVLVLRNHTERPEGVEAGTSRVIGTDYDNIVRNVKQLIEDDEAYQRMSQANNPYGDGQASRRICEAIEYYFGLRSDKPDEFVPLRHK
>NZ_LS483310.1|WP_000779494.1|93626_94889_+|nucleotide-sugar-dehydrogenase
MKLTVVGLGYIGLPTSIMFAKHGVDVLGVDINQQTIDKLQSGQISIEEPGLQEIYEEVLSSGKLKVSTTPEASDVFIIAVPTPNNDDQYRSCDISLVMRALDSILPFLKKGNTIIVESTIAPKTMDDFVKPVIENLGFTIGEDIYLVHCPERVLPGKILEELVHNNRIIGGVTKACIEAGKRVYRTFVQGEMIETDARTAEMSKLMENTYRDVNIALANELTKICNNLNINVLDVIEMANKHPRVNIHQPGPGVGGHCLAVDPYFIIAKDPENAKLIQTGREINNSMPAYVVDTTKQIIKALSGNKVTVFGLTYKGDVDDIRESPAFDIYELLNQEPDIEVCAYDPHVELDFVEHDMSHAVKDASLVLILSDHSEFKNLSDSHFDKMKHKVIFDTKNVVKSSFEDVSYYNYGNIFNFIDK
>NZ_LS483310.1|WP_001230676.1|92685_93573_+|capsular-polysaccharide-type-5/8-biosynthesis-epimerase-CapN
MRKNILITGVHGYIGNALKDKLIEQGHQVDQINVRNQLWKSTSFKDYDVLIHTAALVHNNSPQARLSDYMQVNMLLTKQLAQKAKAEDVKQFIFMSTMAVYGKEGQVGKSDQIDTQTPMNPTTNYGISKKFAEQALQELISDSFKVAIVRPPMIYGAHCPGNFQRLMQLSKRLPIIPNINNQRSALYIKHLTAFIDQLISLEVTGVYHPQDSFYFDTSSVMYEIRRQSHRKTVLINMPSMLNKYFNKLSVFRKLFGNLIYSNTLYENNNALEVIPGKMSLVIADIMDETTTKDKA
>NZ_LS483310.1|WP_000825098.1|92128_92686_+|sugar-transferase
MKRLFDVVSSIYGLVVLSPILLITALLIKMESPGPAIFKQKRPTINNELFNIYKFRSMKIDTPNVATDLMDSTSYITKTGKVIRKTSIDELPQLLNVLKGEMSIVGPRPALYNQYELIEKRTKANVHTIRPGVTGLAQVMGRDDITDDQKVAYDHYYLTHQSMMLDMYIIYKTIKNIVTSEGVHH
>NZ_LS483310.1|WP_001291017.1|90912_92118_+|glycosyltransferase-family-4-protein
MSEKKILILCQYFYPEYVSSATLPTQLAEDLIANHINVDVMCGWPYEYSNHKQVSKTEMHRGIRIRRLKYSRFNNKSKVGRIINFFSLFSKFVINIPKMLKYDQILVYSNPPILPLIPDVLHRLLKKKYSFVVYDIAPDNAIKTGATRPGSMIDKLMRYINRHVYKNAENVIVLGTEMKNYLLNHQISKNADNIHVIPNWYDMRQLQDNRIYNDTFKAYREQYDKILLYSGNMGQLQDMETLISFLKLNKDQPQTLTILCGHGKKFADVKTAIEDHRIENVKMFEFLTGTDYADVLKIADVCIASLIKEGVGLGVPSKNYGYLAAKKALVLIMDKQSDIVQHVEQYDAGIQIDNGDAHAIYNFINTHSSKELHEMGERAHQLFKDKYTREINTMKYYNLLK
>NZ_LS483310.1|WP_000239649.1|89706_90912_+|hypothetical-protein
MVKKVFIMDSVKTIIGTLLIALGLQFLAYPIINQRVGNEAFGSILTIYTIITITSVVLGNTLNNIRLINMNLYKSNHYYWKFVSILLISILIESIALIIVFLYFFNLNTIDIIFLILLNILMCLRIYLNVFFRMTLKYNQILYIALIQFLGLLIGLFLYYLTQNWIVCFITSELFATIYTLVKLRGLTIGEYQSEDNNVVKDYVMLLSTNSLNNLNLYLDRLILLPIIGGTAVTISFLSTFIGKMLATFLYPINNVVLSYISVNESDNIKKQYLKTNLFAIAALCLVMIICYPITIIIVSLLYNIDSSLYSKFIILGNIGVLFNAVSIMIQTLNTKHASITLQANYMTLHTITFIFITILMTIAFGLNGFFWTTLFSNIIKYVILNIIGLKSKFINKKDVD
>NZ_LS483310.1|WP_000356963.1|100705_100909_-|hypothetical-protein
MDKESVVASLARNKKIAVETMAGQRYIIERILHTNDEKHIHILKPKDVVLDVDSIKEIDENHLNDAT
>NZ_LS483310.1|WP_000171919.1|101087_101600_+|DUF4242-domain-containing-protein
MTLFLLEANNLDFASTKEELEAKAASLSTKTIPTLIEVQATENLTHGYFIVEANDEAEAKQFLTEADISIQLVKEVRLVGKDLDEVKNGDAHVDYLVTWNIPEGITMDQYLARKKKNSVHYEEVPEVEFKRTYVCEDMSKCICLYNAPDEEAVRRARKAVDTPIDGIEKL
>NZ_LS483310.1|WP_000590860.1|101941_102682_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
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>NZ_LS483310.1|WP_000826655.1|102695_103670_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKRLSIIVIIGIFIIIGCDWQRTSKEPSKNAQNQQVIKIGYLPITHSANLMMTKKLLSQYNHPKYKLELVKFNNWPDLMDALNSGRIDGASTLIELAMKSKQKGSNIKAVALGHHEGNVIMGQKGMHLNEFNNNGDDYHFGIPHRYSTHYLLLEELRKQLKIKPGHFSYHEMSPAEMPAALSEHRITGYSVAEPFGALGEKLGKGKTLKHGDDVIPDAYCCVLVLRGELLDQHKDVAQAFVQDYKKSGFKMNDRKQSVDIMTHHFKQSRDVLTQSAAWTSYGDLTIKPSGYQEITTLVKQHHLFNPPAYDDFVEPSLYKEASRS
>NZ_LS483310.1|WP_000197961.1|103666_104428_+|ABC-transporter-permease
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>NZ_LS483310.1|WP_000171645.1|104440_105472_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
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>NZ_LS483310.1|WP_001092004.1|105688_106048_+|DUF2294-domain-containing-protein
MNTIDTHTKEQQFSNLVRSYRKEYVGKGPNSIRVSFKDNWAIAHMTGVLSKVESFYLNDKRNESMLHYTRTEKIKQMYKEIDVNEMESLVGAKFVKLFTDIDLNDDEVISIFVFDKSIE
>NZ_LS483310.1|WP_000706137.1|106220_107246_+|NAD-dependent-formate-dehydrogenase
MKIVALFPEAVEGQENQLLNTKKALGLKTFLEERGHEFIILADNGEDLDKHLPDMDVIISAPFYPAYMTRERIEKAPNLKLAITAGVGSDHVDLAAASEHNIGVVEVTGSNTVSVAEHAVMDLLILLRNYEEGHRQSVEGEWNLSQVGNHAHELQHKTIGIFGFGRIGQLVAERLAPFNVTLQHYDPINQQDHKLSKFVSFDELVSTSDAITIHAPLTPETDNLFDKDVLSRMKKHSYLVNTARGKIVNRDALVEALASEHLQGYAGDVWYPQPAPADHPWRTMPRNAMTVHYSGMTLEAQKRIEDGVKDILERFFNHEPFQDKDIIVASGRIASKSYTAK
>NZ_LS483310.1|WP_111686047.1|107631_108882_+|MFS-transporter
MKRLSTTLKVRLISNFLQLIITTAFIPFIALYLTDMLSQSIVGIYLVGLVVLKFPLSIISGYLIEIFPKKLLVLIYQATMVIMLVFMGVFGSHQLWQIIGFCVAYAIFTIVWGLQFPVMDTLIMDAITEDVEHYIYKISYWMTNLSVAIGALLVGLMYGYSMLLLFLIAACIFLIVLFILYIWLPQDRNQVKQSDDKRHASRYQKLQIMNIFRSYKLVLKDRNYMLLISGFSIIMMGEFSISSYIAIRLKDQFETISIGSYDITGAKMLAILLMINTVVVILLTYSISKVVLKIDFKKALITGLLIYIVGYSGLTYLNQFGLLVVFMIIATVGEIIYSPIVSEQRFKIIPKAKRGTYSAVNALGIHFSETLARLGIVLGVFLTSLQMGLYMFIVLTIGASMLVAGVFGGQKQVNTN
>NZ_LS483310.1|WP_111686133.1|109328_116504_+|amino-acid-adenylation-domain-containing-protein
MIMGNLRFQQEYFRIYKNNTESTTHRNAYWVKLAKNVEATKMMYALSTIVQQHASIRHFFDVTTDDNLTMILHEFLLFIEIKQVPSSSANYDLEAFFKQELSTYHFNDSPLFKVKLFQFADAAYILLDFHVSIFDDSQIDIFLDDLCNAYRGNTVINNTRQHAHINRNDDKDNQDASHIALDSNYFRLENNSDIHIDSYFPIKHPFEQALYQTYLIDDMTSIDMASLAVSVYLANHIMSQQHDVTLGIHVPSHLPNDLHGNIVPLTLTIDAKDVCQRFTTDFNKCVLQNMSQLQCAKSSLSLETIFHCYHHMMSCCNDVIEDVHQIHDAHTSLADIEIFPHQHGFKIIYNSAAYDLLSIETLSDLVRNIYLQITEENGNKRTTVDELNLMTERDIQLYDDINLSLPEIDDAQTVVTLFEQQVEATPNHVAVQFDGVFITYQTLNARANDLAHRLRNQYGVEPNDRVAVIAEKSIEMIIAMIGVLKAGGAYVPIDPNYPSDRQEYILKDVTPKVVITYQALYENGKQNINHIDLNKIAWKNIDNLSKCNTLEDHAYVIYTSGTTGNPKGTLIPHRGIVRLVHQNHYVPLNEETTILLSGTIAFDAATFEIYGALLNGGKLIVAKKEQLLNPIAVEQLINENDVNTMWLTSSLFNQIASERIEVLVPLKYLLIGGEVLNAKWVDLLNQKPKHPQIINGYGPTENTTFTTTYNIPNKVPNRIPIGKPILGTHVYIMQGERRCGVGIPGELCTSGFGLAAGYLNQPELTADKFIKDSNINQLMYRSGDIVRLLPDGNIDYLYRKDKQVKIRGFRIELSEVEHALERIQGINKAVVIVQNHDQDQYIVAYYEAMHTLSHNKIKSQLRMTLPEYMIPVNFMHIEQIPITINGKLDKKALPIMDYVDTDAYVAPSTDTEHLLCQIFADILHVNQVGIHDNFFELGGHSLKATLVVNRIEASTGKRLQIGDLLQKPTVFELAQAIAKVQEQNYEVIPETIVKDDYVLSSAQKRMYLLWKSNHKDTVYNVPFLWRLSSELNVAQLRQAVQRLIARHEILRTQYIVVDDEVRQRIVADVAVDFEEVNTHFTDEQEIMRQFVAPFNLEKPSQIRVRYIRSPLHAYLFIDTHHIINDGMSNIQLMNDLNALYQHKLLLPLKLQYKDYSEWMSHRDMTKHRQYWLSQFKDEVPILSLPTDYVRPNIKTTNGAMMSFTMNQQMRQLLQKYVEKHQITDFMFFMSVVMTLLSRYARKDDVVVGSVMSARMHKGTEQMLGMFANTLVYRGQPSPDKMWTQFLQEVKEMSLEAYEHQEYPFECLVNDLDQSHDASRNPLFDVMLVLQNNETNHAHFGHSKLTHIQPKSVTAKFDLSFIIEEDRDDYIINIEYNTDLYHSETVRHMGNQCMIMIDYILKHQDTLQICDIPNGTEELLNWVNTHVNDRMLNVPGNKSIISYFNEAVSRQGNHVALVMNDLTMTYETLRNYVDAIAHMLLSNGVGNGQRVALFTERSFEMIAAMLATVKVGASYIPIDIDFPKKRQGAILEDAKVTAVMSYGVEIETTLPVIQLENAKGFVESKENEQYDDLHGNQLENTAMLDNEMYAIYTSGTTGMPKGVAIRQRNLLNLVHAWSTELQLGDNEVFLQHANIVFDASVMEIYCCLLNGHTLVIPDREERVNPAQLQQLINKHRVTVASIPLQMCSVMEDFYIEKLITGGATSTASFVKYIEKHCGTYFNAYGPSESTVITSYWSHHCGDLIPETIPIGKPLSNIQVYIMSDGLLCGIGMPGELCIAGDSLAIGYINRPELMADKWQNNPFGKGKLYHSGDLARYTSDGQIEFLGRIDKQVKVNGYRIELDEIENAILAIRGISDCVVTVSHFDTHDILNAYYVGEQQMEQDLKQYLNDHLPKYMIPKTITHIDCMPLTTNDKVDTTRLPNPSPIQQSNKVYSEPSNEIEQTFVDVFGEVLKQNDVGVDDDFFELGGNSLEAMLVVSHLKRFGHHISMQTLYQYKTVRQIVNYMHQNQQSLVALPDNLSELQKIVMSRYNLGVLEDSLSYRPLGNTLLTGATGFLGAYLIEALQGYSHRIYCFIRADNEEIAWYKLMTNLNDYFSEETVEMMLSNIEVIVGDFECMDDVVLPENMDTIIHAGARTDHFGDDDEFEKVNVQGTVDVIRLAQQHHARLIYVSTISVGTYFDIDTEDVTFSEADVYKGQLLTSPYTRSKFYSELKVLEAVNNGLDGRIVRVGNLTSPYNGRWHMRNIKTNRFSMVMNDLLQLDCIGVSMAEMPVDFSFVDTTARQIVALAQVNTPQIIYHVLSPNKMPVKSLLECVKRKEIELVSDESFNEILQKQDMYETIGLTSVDREQQLAMIDTTLTLKIMNHISEKWPTITNNWLYHWAQYIKTIFNK

Crispr_ID: NZ_LS483310_2

• CRISPR_ID: NZ_LS483310_2
• CRISPR_location: 704133-704215
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483310_2

Consensus_repeat	Method
CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483310_2

>2.1|704160|29|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder
CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483310_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483310_2

>merge|NZ_LS483310|2|704133-704215|CRISPRCasFinder
CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG

>NZ_LS483310|2|2|704133-704215|CRISPRCasFinder
CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG	CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG
CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483310.1|WP_000708692.1|691084_691795_+|allophanate-hydrolase-subunit-1	unknown	unknown	gnl|CDD|224960
NZ_LS483310.1|WP_000692521.1|709882_710281_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI	unknown	unknown	gnl|CDD|224694
NZ_LS483310.1|WP_000562498.1|712466_713438_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta	unknown	unknown	gnl|CDD|275027
NZ_LS483310.1|WP_000197275.1|703441_703984_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase	unknown	unknown	gnl|CDD|226895
NZ_LS483310.1|WP_001068497.1|708215_709082_-|DMT-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|223769
NZ_LS483310.1|WP_001790169.1|690790_690997_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483310.1|WP_001836972.1|697361_699143_+|DNA-helicase-RecQ	unknown	unknown	gnl|CDD|273594
NZ_LS483310.1|WP_070020912.1|691778_692783_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224895
NZ_LS483310.1|WP_000930014.1|707695_708196_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF	unknown	unknown	gnl|CDD|223851
NZ_LS483310.1|WP_000499195.1|713951_714107_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483310.1|WP_000589260.1|699364_700342_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224050
NZ_LS483310.1|WP_000098285.1|693256_695197_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS	unknown	unknown	gnl|CDD|224287
NZ_LS483310.1|WP_031797439.1|705670_705772_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_LS483310.1|WP_000876318.1|714145_715117_+|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|226965
NZ_LS483310.1|WP_000180991.1|700334_701849_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270328
NZ_LS483310.1|WP_000193751.1|705849_707355_-|peptide-MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|225646
NZ_LS483310.1|WP_000429006.1|704663_705581_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|224513
NZ_LS483310.1|WP_000855505.1|710243_712349_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha	unknown	unknown	gnl|CDD|236069
NZ_LS483310.1|WP_000525103.1|695466_697350_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223562
NZ_LS483310.1|WP_000663025.1|702088_703147_+|histidinol-phosphate-transaminase	unknown	unknown	gnl|CDD|235106

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483310.1|WP_000708692.1|691084_691795_+|allophanate-hydrolase-subunit-1	gnl|CDD|224960	COG2049, DUR1, Allophanate hydrolase subunit 1 [Amino acid transport and metabolism].	1.29969e-94
NZ_LS483310.1|WP_000855505.1|710243_712349_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha	gnl|CDD|236069	PRK07632, PRK07632, ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha; Validated.	0
NZ_LS483310.1|WP_000197275.1|703441_703984_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase	gnl|CDD|226895	COG4502, COG4502, 5'(3')-deoxyribonucleotidase [Nucleotide transport and metabolism].	1.69885e-107
NZ_LS483310.1|WP_001068497.1|708215_709082_-|DMT-family-transporter	gnl|CDD|223769	COG0697, RhaT, Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily [Carbohydrate transport and metabolism / Amino acid transport and metabolism / General function prediction only].	3.8323e-10
NZ_LS483310.1|WP_000562498.1|712466_713438_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta	gnl|CDD|275027	TIGR04171, ribonucleotide-diphosphate_reductase_subunit_beta, ribonucleoside-diphosphate reductase, class 1b, beta subunit. Members of this family are NrdF, the beta subunit of class 1b ribonucleotide reductase. This form uses a dimanganese moiety associated with a tyrosine radical to reduce the cellular requirement for iron. [Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides, 2'-Deoxyribonucleotide metabolism].	2.30551e-164
NZ_LS483310.1|WP_001836972.1|697361_699143_+|DNA-helicase-RecQ	gnl|CDD|273594	TIGR01389, recQ, ATP-dependent DNA helicase RecQ. The ATP-dependent DNA helicase RecQ of E. coli is about 600 residues long. This model represents bacterial proteins with a high degree of similarity in domain architecture and in primary sequence to E. coli RecQ. The model excludes eukaryotic and archaeal proteins with RecQ-like regions, as well as more distantly related bacterial helicases related to RecQ. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0
NZ_LS483310.1|WP_070020912.1|691778_692783_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein	gnl|CDD|224895	COG1984, DUR1, Allophanate hydrolase subunit 2 [Amino acid transport and metabolism].	3.32405e-143
NZ_LS483310.1|WP_000930014.1|707695_708196_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF	gnl|CDD|223851	COG0780, COG0780, Enzyme related to GTP cyclohydrolase I [General function prediction only].	7.91282e-79
NZ_LS483310.1|WP_000589260.1|699364_700342_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224050	COG1125, OpuBA, ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components [Amino acid transport and metabolism].	4.80291e-155
NZ_LS483310.1|WP_000098285.1|693256_695197_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS	gnl|CDD|224287	COG1368, MdoB, Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	0
NZ_LS483310.1|WP_000692521.1|709882_710281_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI	gnl|CDD|224694	COG1780, NrdI, Protein involved in ribonucleotide reduction [Nucleotide transport and metabolism].	5.52807e-56
NZ_LS483310.1|WP_000876318.1|714145_715117_+|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|226965	COG4606, CeuB, ABC-type enterochelin transport system, permease component [Inorganic ion transport and metabolism].	1.32603e-150
NZ_LS483310.1|WP_000180991.1|700334_701849_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein	gnl|CDD|270328	cd13610, PBP2_ChoS, Substrate-binding domain ChoS of an osmoregulated ABC-type transporter and related proteins; type 2 periplasmic-binding protein fold. Osmoprotectant binding lipoprotein ChoS of Lactococcus lactis is predicted to be involved in uptake of compatible solutes such as choline and glycine betaine, but the relative substrate preference is not known. To counteract the efflux of water, microorganisms accumulate the compatible solutes for a sustained adjustment to high osmolarity surroundings. ChoS belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	3.03165e-152
NZ_LS483310.1|WP_000193751.1|705849_707355_-|peptide-MFS-transporter	gnl|CDD|225646	COG3104, PTR2, Dipeptide/tripeptide permease [Amino acid transport and metabolism].	1.22605e-172
NZ_LS483310.1|WP_000429006.1|704663_705581_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase	gnl|CDD|224513	COG1597, LCB5, Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase [Lipid metabolism / General function prediction only].	7.55646e-79
NZ_LS483310.1|WP_000525103.1|695466_697350_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|223562	COG0488, Uup, ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains [General function prediction only].	0
NZ_LS483310.1|WP_000663025.1|702088_703147_+|histidinol-phosphate-transaminase	gnl|CDD|235106	PRK03158, PRK03158, histidinol-phosphate aminotransferase; Provisional.	0

Protein sequences

>NZ_LS483310.1|WP_000197275.1|703441_703984_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase
MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDVVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK
>NZ_LS483310.1|WP_000663025.1|702088_703147_+|histidinol-phosphate-transaminase
MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPLHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE
>NZ_LS483310.1|WP_000180991.1|700334_701849_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein
MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRFMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYEQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK
>NZ_LS483310.1|WP_000589260.1|699364_700342_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
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>NZ_LS483310.1|WP_001836972.1|697361_699143_+|DNA-helicase-RecQ
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>NZ_LS483310.1|WP_000525103.1|695466_697350_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein
MGMEAYKIEHLNKSYADKIIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQTVQAYADDQSDKLFKRMMDAQDAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNILSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEIAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSSTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ
>NZ_LS483310.1|WP_000098285.1|693256_695197_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS
MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK
>NZ_LS483310.1|WP_070020912.1|691778_692783_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein
MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTEPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENFAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRIGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK
>NZ_LS483310.1|WP_000708692.1|691084_691795_+|allophanate-hydrolase-subunit-1
MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDLESLLKHYKIKLETFIELHSKAQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN
>NZ_LS483310.1|WP_001790169.1|690790_690997_+|hypothetical-protein
MIIVYIVLLLILVYVNYRLVNRLLSENRIYVVRLIATITTVISFILVYALIHELMPFVVRAMDLMYHQ
>NZ_LS483310.1|WP_000429006.1|704663_705581_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase
MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL
>NZ_LS483310.1|WP_031797439.1|705670_705772_+|hypothetical-protein
MVITDIDVYRVGRENIVIAVYIEHIKLLFILIS
>NZ_LS483310.1|WP_000193751.1|705849_707355_-|peptide-MFS-transporter
MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR
>NZ_LS483310.1|WP_000930014.1|707695_708196_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF
MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR
>NZ_LS483310.1|WP_001068497.1|708215_709082_-|DMT-family-transporter
MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK
>NZ_LS483310.1|WP_000692521.1|709882_710281_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI
MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY
>NZ_LS483310.1|WP_000855505.1|710243_712349_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha
MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI
>NZ_LS483310.1|WP_000562498.1|712466_713438_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta
MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK
>NZ_LS483310.1|WP_000499195.1|713951_714107_+|hypothetical-protein
MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ
>NZ_LS483310.1|WP_000876318.1|714145_715117_+|ABC-transporter-permease
MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ

Crispr_ID: NZ_LS483310_3

• CRISPR_ID: NZ_LS483310_3
• CRISPR_location: 750650-750732
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483310_3

Consensus_repeat	Method
CCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483310_3

>3.1|750675|33|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder
CTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483310_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483310_3

>merge|NZ_LS483310|3|750650-750732|CRISPRCasFinder
CCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATT

>NZ_LS483310|3|3|750650-750732|CRISPRCasFinder
CCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATT	CTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACC
CCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483310.1|WP_000229236.1|740053_742039_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB	unknown	unknown	gnl|CDD|235395
NZ_LS483310.1|WP_001224793.1|747297_747783_+|acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|100053
NZ_LS483310.1|WP_001049165.1|754528_755116_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP	unknown	unknown	gnl|CDD|178955
NZ_LS483310.1|WP_000279414.1|759362_760373_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|273675
NZ_LS483310.1|WP_000749383.1|737888_738728_+|CHAP-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226451
NZ_LS483310.1|WP_001248939.1|751905_752901_+|YvcK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|211689
NZ_LS483310.1|WP_000958224.1|745512_746445_+|HPr-kinase/phosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|235459
NZ_LS483310.1|WP_001836960.1|742046_744893_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	unknown	unknown	gnl|CDD|234734
NZ_LS483310.1|WP_000816304.1|755358_756261_-|TIGR01777-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224015
NZ_LS483310.1|WP_000513312.1|746450_747290_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|183527
NZ_LS483310.1|WP_000134963.1|749296_750232_+|thioredoxin-disulfide-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|273540
NZ_LS483310.1|WP_001074757.1|760511_761702_+|phosphoglycerate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|234613
NZ_LS483310.1|WP_000070831.1|756963_757593_+|DUF4887-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|234750
NZ_LS483310.1|WP_000057543.1|747790_749230_+|tetratricopeptide-repeat-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|276808
NZ_LS483310.1|WP_000006551.1|753011_753956_+|DNA-binding-protein-WhiA	unknown	unknown	gnl|CDD|273194
NZ_LS483310.1|WP_000638419.1|739548_739785_+|CsbA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227234
NZ_LS483310.1|WP_000654030.1|758296_759310_+|sugar-binding-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|225263
NZ_LS483310.1|WP_000369722.1|750997_751909_+|RNase-adapter-RapZ	unknown	unknown	gnl|CDD|224574
NZ_LS483310.1|WP_000538141.1|738901_739552_+|HD-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378993
NZ_LS483310.1|WP_001260101.1|761823_762585_+|triose-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|234589

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483310.1|WP_000229236.1|740053_742039_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB	gnl|CDD|235395	PRK05298, PRK05298, excinuclease ABC subunit UvrB.	0
NZ_LS483310.1|WP_001224793.1|747297_747783_+|acetyltransferase	gnl|CDD|100053	cd04647, LbH_MAT_like, Maltose O-acyltransferase (MAT)-like: This family is composed of maltose O-acetyltransferase, galactoside O-acetyltransferase (GAT), xenobiotic acyltransferase (XAT) and similar proteins. MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively while GAT specifically acetylates galactopyranosides. XAT catalyzes the CoA-dependent acetylation of a variety of hydroxyl-bearing acceptors such as chloramphenicol and streptogramin, among others. XATs are implicated in inactivating xenobiotics leading to xenobiotic resistance in patients. Members of this family contain a a left-handed parallel beta-helix (LbH) domain with at least 5 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X). They are trimeric in their active form.	4.85181e-30
NZ_LS483310.1|WP_001049165.1|754528_755116_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP	gnl|CDD|178955	PRK00277, clpP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit; Reviewed.	4.59321e-148
NZ_LS483310.1|WP_000279414.1|759362_760373_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase	gnl|CDD|273675	TIGR01534, Glyceraldehyde-3-phosphate_dehydrogenase, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I. This model represents glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), the enzyme responsible for the interconversion of 1,3-diphosphoglycerate and glyceraldehyde-3-phosphate, a central step in glycolysis and gluconeogenesis. Forms exist which utilize NAD (EC 1.2.1.12), NADP (EC 1.2.1.13) or either (1.2.1.59). In some species, NAD- and NADP- utilizing forms exist, generally being responsible for reactions in the anabolic and catabolic directions respectively. Two Pfam models cover the two functional domains of this protein; pfam00044 represents the N-terminal NAD(P)-binding domain and pfam02800 represents the C-terminal catalytic domain. An additional form of gap gene is found in gamma proteobacteria and is responsible for the conversion of erythrose-4-phosphate (E4P) to 4-phospho-erythronate in the biosynthesis of pyridoxine. This pathway of pyridoxine biosynthesis appears to be limited, however, to a relatively small number of bacterial species although it is prevalent among the gamma-proteobacteria. This enzyme is described by TIGR001532. These sequences generally score between trusted and noise to this GAPDH model due to the close evolutionary relationship. There exists the possiblity that some forms of GAPDH may be bifunctional and act on E4P in species which make pyridoxine and via hydroxythreonine and lack a separate E4PDH enzyme (for instance, the GAPDH from Bacillus stearothermophilus has been shown to posess a limited E4PD activity as well as a robust GAPDH activity). There are a great number of sequences in the databases which score between trusted and noise to this model, nearly all of them due to fragmentary sequences. It seems that study of this gene has been carried out in many species utilizing PCR probes which exclude the extreme ends of the consenses used to define this model. The noise level is set relative not to E4PD, but the next closest outliers, the class II GAPDH's (found in archaea, TIGR01546) and aspartate semialdehyde dehydrogenase (ASADH, TIGR01296) both of which have highest-scoring hits around -225 to the prior model. [Energy metabolism, Glycolysis/gluconeogenesis].	0
NZ_LS483310.1|WP_000749383.1|737888_738728_+|CHAP-domain-containing-protein	gnl|CDD|226451	COG3942, COG3942, Surface antigen [General function prediction only].	1.97111e-42
NZ_LS483310.1|WP_001248939.1|751905_752901_+|YvcK-family-protein	gnl|CDD|211689	TIGR01826, Putative_gluconeogenesis_factor, conserved hypothetical protein, cofD-related. This model represents a subfamily of conserved hypothetical proteins that forms a sister group to the family of CofD, (TIGR01819), LPPG:Fo 2-phospho-L-lactate transferase, an enzyme of cytochrome F420 biosynthesis. Both this family and TIGR01819 are within the scope of the pfam01933. [Hypothetical proteins, Conserved].	5.06652e-172
NZ_LS483310.1|WP_000958224.1|745512_746445_+|HPr-kinase/phosphorylase	gnl|CDD|235459	PRK05428, PRK05428, HPr kinase/phosphorylase; Provisional.	1.22623e-170
NZ_LS483310.1|WP_001836960.1|742046_744893_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	gnl|CDD|234734	PRK00349, uvrA, excinuclease ABC subunit UvrA.	0
NZ_LS483310.1|WP_000816304.1|755358_756261_-|TIGR01777-family-protein	gnl|CDD|224015	COG1090, COG1090, Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase [General function prediction only].	6.73087e-155
NZ_LS483310.1|WP_000513312.1|746450_747290_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	gnl|CDD|183527	PRK12437, PRK12437, prolipoprotein diacylglyceryl transferase; Reviewed.	4.82832e-120
NZ_LS483310.1|WP_000134963.1|749296_750232_+|thioredoxin-disulfide-reductase	gnl|CDD|273540	TIGR01292, Thioredoxin_reductase, thioredoxin-disulfide reductase. This model describes thioredoxin-disulfide reductase, a member of the pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases (pfam00070). [Energy metabolism, Electron transport].	4.19425e-154
NZ_LS483310.1|WP_001074757.1|760511_761702_+|phosphoglycerate-kinase	gnl|CDD|234613	PRK00073, pgk, phosphoglycerate kinase; Provisional.	0
NZ_LS483310.1|WP_000070831.1|756963_757593_+|DUF4887-domain-containing-protein	gnl|CDD|234750	PRK00409, PRK00409, recombination and DNA strand exchange inhibitor protein; Reviewed.	5.80381e-05
NZ_LS483310.1|WP_000057543.1|747790_749230_+|tetratricopeptide-repeat-protein	gnl|CDD|276808	sd00008, TPR_YbbN, C-terminal Tetratricopeptide repeat (TPR) region of YbbN and similar motifs. The Tetratricopeptide repeat (TPR) typically contains 34 amino acids and is found in a variety of organisms including bacteria, cyanobacteria, yeast, fungi, plants, and humans. It is present in a variety of proteins including those involved in chaperone, cell-cycle, transcription, and protein transport complexes. YbbN is a thioredoxin-like protein containing two tandem TPR repeats at the C-terminus, separated by two alpha helices. Its N-terminal thioredoxin-like domain is not a functional oxidoreductase. It functions in heat stress response and DNA synthesis as a chaperone or co-chaperone.	4.14043e-06
NZ_LS483310.1|WP_000006551.1|753011_753956_+|DNA-binding-protein-WhiA	gnl|CDD|273194	TIGR00647, DNA_bind_WhiA, DNA-binding protein WhiA. This family describes a DNA-binding protein widely conserved in Gram-positive bacteria, and occasionally occurring elsewhere, such as in Thermotoga. It is associated with cell division, and in sporulating organisms with sporulation. [Cellular processes, Cell division].	7.40812e-153
NZ_LS483310.1|WP_000638419.1|739548_739785_+|CsbA-family-protein	gnl|CDD|227234	COG4897, CsbA, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	4.73465e-34
NZ_LS483310.1|WP_000654030.1|758296_759310_+|sugar-binding-transcriptional-regulator	gnl|CDD|225263	COG2390, DeoR, Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain [Transcription].	1.39665e-92
NZ_LS483310.1|WP_000369722.1|750997_751909_+|RNase-adapter-RapZ	gnl|CDD|224574	COG1660, COG1660, Predicted P-loop-containing kinase [General function prediction only].	4.97899e-170
NZ_LS483310.1|WP_000538141.1|738901_739552_+|HD-domain-containing-protein	gnl|CDD|378993	pfam12917, HD_2, HD containing hydrolase-like enzyme. This is a family of bacterial and archaeal hydrolases.	6.51021e-58
NZ_LS483310.1|WP_001260101.1|761823_762585_+|triose-phosphate-isomerase	gnl|CDD|234589	PRK00042, tpiA, triosephosphate isomerase; Provisional.	2.48635e-146

Protein sequences

>NZ_LS483310.1|WP_000134963.1|749296_750232_+|thioredoxin-disulfide-reductase
MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA
>NZ_LS483310.1|WP_000057543.1|747790_749230_+|tetratricopeptide-repeat-protein
MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI
>NZ_LS483310.1|WP_001224793.1|747297_747783_+|acetyltransferase
MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR
>NZ_LS483310.1|WP_000513312.1|746450_747290_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase
MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYVENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEKLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK
>NZ_LS483310.1|WP_000958224.1|745512_746445_+|HPr-kinase/phosphorylase
MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE
>NZ_LS483310.1|WP_001836960.1|742046_744893_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA
MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREVLSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK
>NZ_LS483310.1|WP_000229236.1|740053_742039_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB
MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIEEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQIRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG
>NZ_LS483310.1|WP_000638419.1|739548_739785_+|CsbA-family-protein
MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR
>NZ_LS483310.1|WP_000538141.1|738901_739552_+|HD-domain-containing-protein
MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE
>NZ_LS483310.1|WP_000749383.1|737888_738728_+|CHAP-domain-containing-protein
MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKTPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH
>NZ_LS483310.1|WP_000369722.1|750997_751909_+|RNase-adapter-RapZ
MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK
>NZ_LS483310.1|WP_001248939.1|751905_752901_+|YvcK-family-protein
MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK
>NZ_LS483310.1|WP_000006551.1|753011_753956_+|DNA-binding-protein-WhiA
MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL
>NZ_LS483310.1|WP_001049165.1|754528_755116_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP
MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK
>NZ_LS483310.1|WP_000816304.1|755358_756261_-|TIGR01777-family-protein
MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNEGGALQTMKLPYKYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE
>NZ_LS483310.1|WP_000070831.1|756963_757593_+|DUF4887-domain-containing-protein
MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDNASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK
>NZ_LS483310.1|WP_000654030.1|758296_759310_+|sugar-binding-transcriptional-regulator
MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE
>NZ_LS483310.1|WP_000279414.1|759362_760373_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase
MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK
>NZ_LS483310.1|WP_001074757.1|760511_761702_+|phosphoglycerate-kinase
MAKKIVSDLNLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK
>NZ_LS483310.1|WP_001260101.1|761823_762585_+|triose-phosphate-isomerase
MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTVVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSENQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK

Crispr_ID: NZ_LS483310_4

• CRISPR_ID: NZ_LS483310_4
• CRISPR_location: 793771-793852
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_LS483310_4

Consensus_repeat	Method
CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_LS483310_4

>4.1|793795|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder
ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LS483310_4

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_LS483310_4

>merge|NZ_LS483310|4|793771-793852|CRISPRCasFinder
CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA

>NZ_LS483310|4|4|793771-793852|CRISPRCasFinder
CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA	ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT
CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_LS483310.1|WP_000290490.1|792229_792610_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH	unknown	unknown	gnl|CDD|234918
NZ_LS483310.1|WP_000752917.1|798406_798601_+|CsbD-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225777
NZ_LS483310.1|WP_001006453.1|802286_803537_+|cysteine-desulfurase	unknown	unknown	gnl|CDD|131034
NZ_LS483310.1|WP_001065801.1|794954_795251_+|thioredoxin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239245
NZ_LS483310.1|WP_000569884.1|788301_788796_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|372596
NZ_LS483310.1|WP_001140697.1|786875_787457_+|histidine-phosphatase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223483
NZ_LS483310.1|WP_001190695.1|791251_791572_-|thioredoxin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239245
NZ_LS483310.1|WP_000932212.1|792788_793667_+|DUF1963-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226395
NZ_LS483310.1|WP_000255553.1|787529_788147_-|amino-acid-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224198
NZ_LS483310.1|WP_000589549.1|791715_792072_+|arsenate-reductase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239334
NZ_LS483310.1|WP_001183858.1|798834_799686_-|DUF368-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224946
NZ_LS483310.1|WP_000168845.1|800013_800775_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC	unknown	unknown	gnl|CDD|223473
NZ_LS483310.1|WP_000520233.1|796518_797214_+|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224922
NZ_LS483310.1|WP_000571218.1|795500_796526_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224058
NZ_LS483310.1|WP_000205579.1|800873_802181_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD	unknown	unknown	gnl|CDD|223791
NZ_LS483310.1|WP_000150013.1|789763_790480_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|184156
NZ_LS483310.1|WP_000422908.1|790562_791102_+|nitroreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|380312
NZ_LS483310.1|WP_001018962.1|794575_794962_+|topiosmerase	unknown	unknown	gnl|CDD|224572
NZ_LS483310.1|WP_000732326.1|797231_798053_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224381
NZ_LS483310.1|WP_000974460.1|789193_789616_-|organic-hydroperoxide-resistance-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274649

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_LS483310.1|WP_000290490.1|792229_792610_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH	gnl|CDD|234918	PRK01202, PRK01202, glycine cleavage system protein GcvH.	1.28962e-69
NZ_LS483310.1|WP_000752917.1|798406_798601_+|CsbD-family-protein	gnl|CDD|225777	COG3237, COG3237, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	5.95583e-07
NZ_LS483310.1|WP_001006453.1|802286_803537_+|cysteine-desulfurase	gnl|CDD|131034	TIGR01979, Probable_cysteine_desulfurase, cysteine desulfurases, SufSfamily. This model represents a subfamily of NifS-related cysteine desulfurases involved in FeS cluster formation needed for nitrogen fixation among other vital functions. Many cysteine desulfurases are also active as selenocysteine lyase and/or cysteine sulfinate desulfinase. This subfamily is associated with the six-gene SUF system described in E. coli and Erwinia as an FeS cluster formation system during oxidative stress. The active site Cys is this subfamily resembles GHHC with one or both His conserved. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Other].	0
NZ_LS483310.1|WP_001065801.1|794954_795251_+|thioredoxin-family-protein	gnl|CDD|239245	cd02947, TRX_family, TRX family; composed of two groups: Group I, which includes proteins that exclusively encode a TRX domain; and Group II, which are composed of fusion proteins of TRX and additional domains. Group I TRX is a small ancient protein that alter the redox state of target proteins via the reversible oxidation of an active site dithiol, present in a CXXC motif, partially exposed at the protein's surface. TRX reduces protein disulfide bonds, resulting in a disulfide bond at its active site. Oxidized TRX is converted to the active form by TRX reductase, using reducing equivalents derived from either NADPH or ferredoxins. By altering their redox state, TRX regulates the functions of at least 30 target proteins, some of which are enzymes and transcription factors. It also plays an important role in the defense against oxidative stress by directly reducing hydrogen peroxide and certain radicals, and by serving as a reductant for peroxiredoxins. At least two major types of functional TRXs have been reported in most organisms; in eukaryotes, they are located in the cytoplasm and the mitochondria. Higher plants contain more types (at least 20 TRX genes have been detected in the genome of Arabidopsis thaliana), two of which (types f amd m) are located in the same compartment, the chloroplast. Also included in the alignment are TRX-like domains which show sequence homology to TRX but do not contain the redox active CXXC motif. Group II proteins, in addition to either a redox active TRX or a TRX-like domain, also contain additional domains, which may or may not possess homology to known proteins.	7.01368e-14
NZ_LS483310.1|WP_000569884.1|788301_788796_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	gnl|CDD|372596	pfam13420, Acetyltransf_4, Acetyltransferase (GNAT) domain.	2.53639e-47
NZ_LS483310.1|WP_001140697.1|786875_787457_+|histidine-phosphatase-family-protein	gnl|CDD|223483	COG0406, phoE, Broad specificity phosphatase PhoE and related phosphatases [General function prediction only].	2.29633e-48
NZ_LS483310.1|WP_001190695.1|791251_791572_-|thioredoxin-family-protein	gnl|CDD|239245	cd02947, TRX_family, TRX family; composed of two groups: Group I, which includes proteins that exclusively encode a TRX domain; and Group II, which are composed of fusion proteins of TRX and additional domains. Group I TRX is a small ancient protein that alter the redox state of target proteins via the reversible oxidation of an active site dithiol, present in a CXXC motif, partially exposed at the protein's surface. TRX reduces protein disulfide bonds, resulting in a disulfide bond at its active site. Oxidized TRX is converted to the active form by TRX reductase, using reducing equivalents derived from either NADPH or ferredoxins. By altering their redox state, TRX regulates the functions of at least 30 target proteins, some of which are enzymes and transcription factors. It also plays an important role in the defense against oxidative stress by directly reducing hydrogen peroxide and certain radicals, and by serving as a reductant for peroxiredoxins. At least two major types of functional TRXs have been reported in most organisms; in eukaryotes, they are located in the cytoplasm and the mitochondria. Higher plants contain more types (at least 20 TRX genes have been detected in the genome of Arabidopsis thaliana), two of which (types f amd m) are located in the same compartment, the chloroplast. Also included in the alignment are TRX-like domains which show sequence homology to TRX but do not contain the redox active CXXC motif. Group II proteins, in addition to either a redox active TRX or a TRX-like domain, also contain additional domains, which may or may not possess homology to known proteins.	2.70086e-24
NZ_LS483310.1|WP_000932212.1|792788_793667_+|DUF1963-domain-containing-protein	gnl|CDD|226395	COG3878, COG3878, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	1.72543e-74
NZ_LS483310.1|WP_000255553.1|787529_788147_-|amino-acid-transporter	gnl|CDD|224198	COG1279, COG1279, Lysine efflux permease [General function prediction only].	1.40612e-61
NZ_LS483310.1|WP_000589549.1|791715_792072_+|arsenate-reductase-family-protein	gnl|CDD|239334	cd03036, ArsC_like, Arsenate Reductase (ArsC) family, unknown subfamily; uncharacterized proteins containing a CXXC motif with similarity to thioredoxin (TRX)-fold arsenic reductases, ArsC. Proteins containing a redox active CXXC motif like TRX and glutaredoxin (GRX) function as protein disulfide oxidoreductases, altering the redox state of target proteins via the reversible oxidation of the active site dithiol. ArsC catalyzes the reduction of arsenate [As(V)] to arsenite [As(III)], using reducing equivalents derived from glutathione via GRX, through a single catalytic cysteine.	1.06191e-56
NZ_LS483310.1|WP_001183858.1|798834_799686_-|DUF368-domain-containing-protein	gnl|CDD|224946	COG2035, COG2035, Predicted membrane protein [Function unknown].	4.58436e-76
NZ_LS483310.1|WP_000168845.1|800013_800775_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC	gnl|CDD|223473	COG0396, sufC, Cysteine desulfurase activator ATPase [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	1.29081e-150
NZ_LS483310.1|WP_000520233.1|796518_797214_+|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|224922	COG2011, AbcD, ABC-type metal ion transport system, permease component [Inorganic ion transport and metabolism].	9.67625e-100
NZ_LS483310.1|WP_000571218.1|795500_796526_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224058	COG1135, AbcC, ABC-type metal ion transport system, ATPase component [Inorganic ion transport and metabolism].	3.37873e-170
NZ_LS483310.1|WP_000205579.1|800873_802181_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD	gnl|CDD|223791	COG0719, SufB, Cysteine desulfurase activator SufB [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	9.69519e-136
NZ_LS483310.1|WP_000150013.1|789763_790480_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase	gnl|CDD|184156	PRK13575, PRK13575, type I 3-dehydroquinate dehydratase.	5.95463e-148
NZ_LS483310.1|WP_000422908.1|790562_791102_+|nitroreductase	gnl|CDD|380312	cd02135, YdjA-like, nitroreductase family protein similar to Escherichia coli YdjA. A subfamily of the nitroreductase family containing uncharacterized proteins that are similar to nitroreductase YdjA from Escherichia coli. Nitroreductase catalyzes the reduction of nitroaromatic compounds such as nitrotoluenes, nitrofurans and nitroimidazoles. This process requires NAD(P)H as electron donor in an obligatory two-electron transfer and uses FMN as cofactor. The enzyme is typically a homodimer. Members of this family are also called NADH dehydrogenase, oxygen-insensitive NAD(P)H nitrogenase or dihydropteridine reductase.	2.10032e-49
NZ_LS483310.1|WP_001018962.1|794575_794962_+|topiosmerase	gnl|CDD|224572	COG1658, COG1658, Small primase-like proteins (Toprim domain) [DNA replication, recombination, and repair].	2.45102e-36
NZ_LS483310.1|WP_000732326.1|797231_798053_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|224381	COG1464, NlpA, ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen [Inorganic ion transport and metabolism].	2.15951e-112
NZ_LS483310.1|WP_000974460.1|789193_789616_-|organic-hydroperoxide-resistance-protein	gnl|CDD|274649	TIGR03561, organ_hyd_perox, peroxiredoxin, Ohr subfamily. pfam02566, OsmC-like protein, contains several deeply split clades of homologous proteins. The clade modeled here includes the protein Ohr, or organic hydroperoxide resistance protein. [Cellular processes, Detoxification].	5.58225e-61

Protein sequences

>NZ_LS483310.1|WP_000932212.1|792788_793667_+|DUF1963-domain-containing-protein
MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMKEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDNLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQEHLKSLDADNEDIPFSGAFSIKFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS
>NZ_LS483310.1|WP_000290490.1|792229_792610_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH
MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSKMIGE
>NZ_LS483310.1|WP_000589549.1|791715_792072_+|arsenate-reductase-family-protein
MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA
>NZ_LS483310.1|WP_001190695.1|791251_791572_-|thioredoxin-family-protein
MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK
>NZ_LS483310.1|WP_000422908.1|790562_791102_+|nitroreductase
MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY
>NZ_LS483310.1|WP_000150013.1|789763_790480_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase
MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDLYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY
>NZ_LS483310.1|WP_000974460.1|789193_789616_-|organic-hydroperoxide-resistance-protein
MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD
>NZ_LS483310.1|WP_000569884.1|788301_788796_-|GNAT-family-N-acetyltransferase
MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK
>NZ_LS483310.1|WP_000255553.1|787529_788147_-|amino-acid-transporter
MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGEAQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLIF
>NZ_LS483310.1|WP_001140697.1|786875_787457_+|histidine-phosphatase-family-protein
MAKTLYLMRHGQTLFNFKGLIQGFGDSPLTELGIAQAQKARSYYETKGINFDLYASSTQERASDTLENVAPNQSYQRFKGLKEWHFGLFEGESVYLFDNLYKPEDLFGDRIVPFKGEARQQVEERIVKTLHDIMSQTKNNALVVSHGTIMGVFLRYCLKLDEALKHNIGNCNILKFEYDNGTFKFVELIDPNL
>NZ_LS483310.1|WP_001018962.1|794575_794962_+|topiosmerase
MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE
>NZ_LS483310.1|WP_001065801.1|794954_795251_+|thioredoxin-family-protein
MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK
>NZ_LS483310.1|WP_000571218.1|795500_796526_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein
MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG
>NZ_LS483310.1|WP_000520233.1|796518_797214_+|ABC-transporter-permease
MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR
>NZ_LS483310.1|WP_000732326.1|797231_798053_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK
>NZ_LS483310.1|WP_000752917.1|798406_798601_+|CsbD-family-protein
MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE
>NZ_LS483310.1|WP_001183858.1|798834_799686_-|DUF368-domain-containing-protein
MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTSLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE
>NZ_LS483310.1|WP_000168845.1|800013_800775_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC
MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE
>NZ_LS483310.1|WP_000205579.1|800873_802181_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD
MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDKNASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK
>NZ_LS483310.1|WP_001006453.1|802286_803537_+|cysteine-desulfurase
MNEVAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF

Self-targeting detection

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_ID	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_LS483310_1	1.1|100585|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder	100585-100618	34	NZ_LS483310.1	1367826-1367859	0	1.0
NZ_LS483310_3	3.1|750675|33|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder	750675-750707	33	NZ_LS483310.1	1367946-1367978	0	1.0
NZ_LS483310_3	3.1|750675|33|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder	750675-750707	33	NZ_LS483310.1	1873455-1873487	0	1.0
NZ_LS483310_1	1.1|100585|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder	100585-100618	34	NZ_LS483310.1	1147383-1147416	1	0.971
NZ_LS483310_4	4.1|793795|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder	793795-793828	34	NZ_LS483310.1	1367826-1367859	1	0.971
NZ_LS483310_1	1.1|100585|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder	100585-100618	34	NZ_LS483310.1	1280324-1280357	2	0.941
NZ_LS483310_4	4.1|793795|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder	793795-793828	34	NZ_LS483310.1	1147383-1147416	2	0.941

1. spacer 1.1|100585|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder matches to position: 1367826-1367859, mismatch: 0, identity: 1.0

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atgggccccaacaaagagaaattggattcccaat	Protospacer
**********************************

2. spacer 3.1|750675|33|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder matches to position: 1367946-1367978, mismatch: 0, identity: 1.0

cttttcgaaattctctgtgttggggcccacacc	CRISPR spacer
cttttcgaaattctctgtgttggggcccacacc	Protospacer
*********************************

3. spacer 3.1|750675|33|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder matches to position: 1873455-1873487, mismatch: 0, identity: 1.0

cttttcgaaattctctgtgttggggcccacacc	CRISPR spacer
cttttcgaaattctctgtgttggggcccacacc	Protospacer
*********************************

4. spacer 1.1|100585|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder matches to position: 1147383-1147416, mismatch: 1, identity: 0.971

atgggccccaacaaagagaaattggattcccaat	CRISPR spacer
atgggccccaacaaagagaagttggattcccaat	Protospacer
********************.*************

5. spacer 4.1|793795|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder matches to position: 1367826-1367859, mismatch: 1, identity: 0.971

attgagaatccaatttctctttgttggggcccat	CRISPR spacer
attgggaatccaatttctctttgttggggcccat	Protospacer
****.*****************************

6. spacer 1.1|100585|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder matches to position: 1280324-1280357, mismatch: 2, identity: 0.941

atgggccccaacaaagagaaattggattcccaat	CRISPR spacer
atggagcccaacaaagagaaattggattcccaat	Protospacer
****. ****************************

7. spacer 4.1|793795|34|NZ_LS483310|CRISPRCasFinder matches to position: 1147383-1147416, mismatch: 2, identity: 0.941

attgagaatccaatttctctttgttggggcccat	CRISPR spacer
attgggaatccaacttctctttgttggggcccat	Protospacer
****.********.********************

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	682297 : 690117	10	Hokovirus(16.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_2	702088 : 716818	14	uncultured_Caudovirales_phage(50.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	888430 : 942434	53	Streptococcus_phage(28.57%)	bacteriocin,transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	962453 : 970926	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_5	1227268 : 1243475	27	Staphylococcus_phage(54.17%)	terminase,integrase,head,portal	attL 1220992:1221009|attR 1247208:1247225
DBSCAN-SWA_6	1518452 : 1526782	7	Staphylococcus_phage(16.67%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_7	1594355 : 1603398	7	uncultured_Mediterranean_phage(50.0%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	1728661 : 1792819	62	Staphylococcus_phage(95.35%)	protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	1886284 : 1996468	130	Staphylococcus_phage(85.39%)	terminase,protease,tRNA,holin,tail,head,portal,capsid,integrase	attL 1882777:1882801|attR 1999672:1999696

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_LS483310|682297:690117|DBSCAN-SWA
ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTAGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGCTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTGAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGCGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGGGTCAAAATAAGAGGAGGGCGTTTTTTTAAGTAAGGAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTAATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCTTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACAACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGCCGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACATTTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATGACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCACGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGATAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGACAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGGAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCTTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCGCCTGGGCCGGGTAATCCGGATGATTATCCTATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGATTACAGCCAAAAACGATGAAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTACATTTCCAGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAAGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTACTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATTTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGGTTTATAAAGAAGTATGTTGCTACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTCTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTGAAAAAGCGGAAAGCATAAATTCAACATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAGCATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTTGAAGGCGAAACGTATCAAGTGAACTATACGGCGCGCTTAACGGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACTGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAATTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGTAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTACTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTTATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAATTAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATTACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTAGAAAGTTCACCTCGTGGTATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCGATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_LS483310|682297:690117|687369_688038_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA
MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL
>NZ_LS483310|682297:690117|688388_688982_+|WP_000604515.1|DBSCAN-SWA
MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI
>NZ_LS483310|682297:690117|688965_690117_+|WP_001217794.1|DBSCAN-SWA
MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKINTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML
>NZ_LS483310|682297:690117|682297_683353_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA
MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS
>NZ_LS483310|682297:690117|684828_685269_-|WP_001093556.1|DBSCAN-SWA
MNTKYFLAVGAVAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK
>NZ_LS483310|682297:690117|683352_684039_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA
MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR
>NZ_LS483310|682297:690117|686231_686945_-|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA
MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV
>NZ_LS483310|682297:690117|685548_686133_-|WP_000637687.1|DBSCAN-SWA
MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF
>NZ_LS483310|682297:690117|686948_687368_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA
MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV
>NZ_LS483310|682297:690117|684013_684487_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA
MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000244415.1|682297_683353_-	two-component system sensor histidine kinase SaeS	A0A1V0SGX0	Hokovirus	3.6e-14	29.8
WP_000149344.1|683352_684039_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_001037807.1|684013_684487_-	DoxX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001093556.1|684828_685269_-	DM13 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000637687.1|685548_686133_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001062972.1|686231_686945_-	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	A0A1U9WRB6	Streptococcus_virus	6.5e-52	43.5
WP_000941336.1|686948_687368_-	6-carboxytetrahydropterin synthase QueD	S4U060	uncultured_phage	6.3e-07	28.7
WP_000446724.1|687369_688038_-	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	9.6e-66	57.5
WP_000604515.1|688388_688982_+	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	1.2e-38	43.5
WP_001217794.1|688965_690117_+	anthranilate synthase component I family protein	S4VNU7	Pandoravirus	3.5e-23	36.1

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_LS483310|702088:716818|DBSCAN-SWA
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MVITDIDVYRVGRENIVIAVYIEHIKLLFILIS
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MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK
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MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ
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MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFENGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD
>NZ_LS483310|702088:716818|712466_713438_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA
MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000663025.1|702088_703147_+	histidinol-phosphate transaminase	A0A0H3TLT9	Faustovirus	1.5e-20	27.3
WP_000197275.1|703441_703984_+	5'-3'-deoxyribonucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_000429006.1|704663_705581_-	diacylglycerol kinase family lipid kinase	A0A1V0SBJ0	Catovirus	2.1e-07	22.0
WP_031797439.1|705670_705772_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000193751.1|705849_707355_-	peptide MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	2.0e-58	32.2
WP_000930014.1|707695_708196_-	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	E7DN65	Pneumococcus_phage	5.9e-52	71.5
WP_001068497.1|708215_709082_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_000692521.1|709882_710281_+	class Ib ribonucleoside-diphosphate reductase assembly flavoprotein NrdI	A0A2H4J545	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-52	72.0
WP_000855505.1|710243_712349_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A0A2H4J2N6	uncultured_Caudovirales_phage	0.0e+00	91.7
WP_000562498.1|712466_713438_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A2H4J4P3	uncultured_Caudovirales_phage	4.2e-171	91.3
WP_000499195.1|713951_714107_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000876318.1|714145_715117_+	ABC transporter permease	A0A2H4IY97	uncultured_Caudovirales_phage	4.3e-139	78.9
WP_001245577.1|715103_716060_+	iron chelate uptake ABC transporter family permease subunit	A0A2H4J116	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-05	57.8
WP_000616842.1|716056_716818_+	ABC transporter ATP-binding protein	Q9EMR9	Amsacta_moorei_entomopoxvirus	8.5e-18	31.6

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_LS483310|888430:942434|DBSCAN-SWA
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MEKNENINVEILTTSDMHSHFLNGDYGSNIYRAGTYVNQIRAQNHRVILLDSGGSLAGSLAAYYYAIVAPYKRHPMIKLMNRMHYDASGVSPSEFKFGLSFLTRSIALARFPWLSANIEYNVTKEPYFSTPYCIKHFGDLKIAIVGVTADGLMENEYSEMEQDVSIEKTLVASKRWIRYIHEVEEPDFLIVIYHGGLNKISNSTKNKKASSNEAEKLMEELGVIDLMITAHQHQTIVGQDHETYYVQAGQDAKELVHLSINFKKRTTTYDVESIDSKVIDLNEYEEDQELLDLTFYDRKAVAYWSQEIISDKGLMLSVNGLQDLVCQTHPFSQLLHDAIQLAFDNDITCVHVPMNGEKGLSGQIRNEDLYHAYPYPDKPMDMTISGQNIKDILEYSYSHLDFVNEQLSLTIIDETLCTMWQGFNYEIDMNQEPGQRVMLDQIDLTKSYRVTMTDYCYRNYKNYLKNAIIHESYDETMSTLIAEKLRDPNYRISCSDNFVVKNR

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001836771.1|909962_910472_+	2'-5' RNA ligase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001154224.1|910584_911775_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_000340119.1|913360_914845_+	UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--L- lysine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_001795833.1|914825_915086_+	YueH family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001049951.1|915085_916648_+	peptide chain release factor 3	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	1.7e-36	28.2
WP_000928413.1|916949_917753_+	TerC family protein	S5MAL1	Bacillus_phage	1.6e-30	40.5
WP_001795272.1|917971_920296_+|protease	serine protease	W5SAB9	Pithovirus	2.8e-11	27.4
WP_000021865.1|920312_921671_+	TrkH family potassium uptake protein	NA	NA	NA	NA
WP_000414165.1|921809_923321_+	bifunctional metallophosphatase/5'-nucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_000287265.1|923807_924377_-	competence protein ComK	NA	NA	NA	NA
WP_000876826.1|924586_924805_+	IDEAL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_000214898.1|926070_926247_+	YkvS family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001033865.1|926261_926864_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
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WP_001797239.1|927889_928162_+|bacteriocin	lactococcin 972 family bacteriocin	NA	NA	NA	NA
WP_000870827.1|928205_930170_+|bacteriocin	bacteriocin-associated integral membrane family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_000571167.1|930489_931131_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-19	33.0
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WP_000766009.1|931875_932232_-	DoxX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001081351.1|932719_933679_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_001790177.1|933724_933856_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000867357.1|933919_934135_-	TM2 domain-containing protein	A0A060AN66	Enterococcus_phage	1.5e-07	49.1
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WP_001089094.1|941252_942434_-|protease	cysteine protease staphopain B	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_LS483310|962453:970926|DBSCAN-SWA
AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCTTCCGATTGGAAAATTATGCAAGAGAGTTGTAACATGTTGGATTATTTTGAAATTCCGTACGAAAAACAAGTAGTATCCGCACATCGTACGCCAAAAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAAACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCAATTGTTCAAATGCCAGGAGGTATTCCGGTTGCAACGACTGCAATTGGTGCAGCAGGTGCTAAAAACGCAGGTATACTTGCAGCAAGAATGTTAAGTATTCAAAATCCTTCTTTAGTTGAAAAACTAAATCAGTATGAATCTTCGTTAATTCAAAAAGTGGAGGACATGCAAAATGAACTTCAATAAATTAAAGTTTGGTGCGACTATTGGCATTATTGGTGGTGGTCAGCTTGGAAAGATGATGGCACAATCAGCTCAAAAAATGGGTTATAAAGTGGTTGTATTGGATCCTGCTGAAGATTGTCCATGTAGATACGTTGCACACGAATTTATACAAGCCAAGTATGACGATGAAAAGGCACTCAATCAATTAGGACAAAAATGTGATGTGATTACTTATGAATTTGAAAACATTTCAGCCCAACAATTAAAACTATTATGTGAAAAGTACAATATTCCGCAAGGTTACCAAGCTATACAGTTATTACAAGACCGCTTAACTGAAAAAGAAACATTAAAAAGTGCTGGTACCAAAGTTGTCCCGTTCATTTCAGTAAAAGAATCTACAGATATTGACAAAGCAATTGAAACATTAGGATATCCTTTTATTGTAAAAACTAGATTTGGTGGCTACGATGGCAAAGGTCAAGTTTTAATTAACAACGAAAAAGACTTACAAGAAGGTTTTAAATTAATTGAAACTAGTGAATGCGTAGCTGAAAAATATTTGAATATCAAGAAAGAAGTATCTCTTACTGTTACAAGAGGAAACAACAATCAAATCACTTTTTTCCCATTACAAGAAAATGAGCATAGAAATCAAATACTTTTCAAAACAATTGTTCCAGCGAGAATAGATAAAACAGCTGAGGCGAAAGAGCAAGTTAATAAAATTATCCAATCGATTCATTTCATTGGAACATTTACAGTGGAATTTTTTATAGATAGTAACAACCAATTGTATGTGAACGAGATTGCACCAAGGCCTCACAATTCAGGACATTATTCAATTGAAGCATGTGATTATTCACAATTTGATACTCATATTTTAGCAGTTACCGGACAATCATTACCAAATTCAATTGAATTATTAAAGCCTGCAGTCATGATGAACTTACTAGGTAAAGACTTAGATTTATTGGAAAATGAATTTAATGAACATCCAGAGTGGCACTTACATATTTATGGTAAGTCTGGGCGTAAAGATAGCAGAAAAATGGGGCATATGACTGTACTAACGAATGATGTAAACCAAACTGAACAAGATATGTACGCTAAATTTGAGGGGAGTAATTAAAGCATGACATTATTATATGAAGGAAAAGCGAAGCGCATTTTCTCAACAAATCAAGAAAATGAATTAAGAGTTGAATATAAAGATGAAGTTACTGCTGGAAACGGGGCTAAGAAAGACACAATGGCAGGTAAGGGGCGATTAAATAATCAAATTACTTCTATTATATTTAAATATTTACAAGAAAATGGAATAGAAAGTCACTTTATTAAACAATTATCTGAAACAGAACAATTAGTTAAGCCTGTGAAAATAATTCCATTAGAAGTAGTTGTTCGTAATATTGCTAGTGGATCTATTACAAAGCGTTTAGGTTTTGAAAATGGTGAAGTTTTTAGAGAACCACTTGTAGAATTTTTCTATAAAAATGATGCGTTAAATGATCCGTTGATAACGGATGACCATGTTAAATTGCTCAATATAGCATCAGATGAAGATATTGAAATACTAAAATCCAAAGCATTAAAGATTAATAATGTGTTGAAACAATTAATGGATGCTATGAATTTAAAATTAGTAGATTTTAAAATCGAATTTGGAAAGACTGAGACTGGTCAAATTTTGTTAGCGGATGAAATATCTCCAGATACATGTCGAATTTGGGATAAAGCTACCAATGCAAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAATAACACTGGATCACTGATTGAAACATATCAAATATTTTTAAACAAATTGGAGGATTTAAAATAATGAAAACAATTGAACTACATATCACATTACAACCACAAGTATTAGATACGCAAGGACAAACGCTTACTCGAGCTGTACATGACTTAGGTTATGCACAAGTGAATGATATTCGTGTAGGAAAAGTATTATATATGACAGTGGATGAGGTTAGTGATGAAAAGGTACACAACATTATTACAACTCTAAGTGAAAAATTGTTTGCAAATACAGTGATTGAAGAATATAGCTATAAAGTGTTAGATGATGAAAAGGAGAATGCATAAAATGAAATTTGCGGTTCTTGTTTTTCCAGGTTCGAATTGTGATAGAGACATGTTTAATGCTGCTATTAAAAGTGGTGTTGAAGCGGAATATGTAGATTATAGAGAAACATCACTAAGTGGATTTGATGGCGTACTTATTCCTGGTGGATTTTCATTCGGGGATTACTTAAGATCTGGGGCAATGGCTAGTGTAGCGCCGATTATTTCGGAAGTTAAACGTCTTGCAACTGAAGGTAAGCCAGTATTAGGTGTTTGTAATGGGTTTCAAATTTTAACTGAAATAGGCTTATTACCTGGTGCATTATTGCATAACGATTCACATTTATTTATTAGTAGAAATGAAGAGTTAGAAATAGTGAATAATCAAACGGCATTTACAAATCTTTATGAGCAAGGTGAAAAAGTTATATATCCTGTAGCTCACGGTGAAGGTCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCAACAATTAAAAGCTAACAATCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAACAACATGTCTAAATTTATCGAACCAAGCGTTGAAGAAATTAAACTTGAAAAAGTATATCAAGATATGGGATTAAGTGATCAAGAATATGAAAAAGTTTGCGATATTTTAGGCAGACAACCTAACTTTACAGAAACAGGTATCTTTTCTGTTATGTGGAGTGAACATTGCTCTTATAAACATTCTAAACCGTTTTTAAAGCAATTTCCTACGTCAGGTGAGCATGTGCTTATGGGTCCAGGTGAAGGTGCAGGGGTAGTCGATATAGGTGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTAGAGTCTCACAATCATCCATCAGCAATTGAACCATATCAAGGGGCTGCTACAGGCGTTGGTGGAATCATTCGTGACATTGTTTCTATTGGGGCTAGACCTATTAATTTGTTAAACAGTCTTAGATTTGGAGAATTAGATAATAAACAAAACCAAAGATTACTTAAAGGGGTTGTAAAGGGTATCGGAGGTTATGGTAACTGCATTGGTATTCCAACAACTGCTGGTGAAATCGAATTTGATGAACGTTATGATGGCAATCCACTTGTTAATGCAATGTGTGTTGGTGTTATCAATCACGACATGATTCAAAAAGGCACAGCAAAAGGTGTAGGTAATTCGGTCATTTATGTTGGTTTGAAAACTGGTCGAGATGGTATTCATGGTGCTACTTTTGCATCTGAAGAATTGACGGAAGAAAGCGAAAGTAAACGACCTTCTGTACAAATCGGTGATCCATTTGTAGGTAAAAAATTAATGGAAGCAACACTTGAAGCAATTACATTTGATGAATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCTGCTGGTTTAACATCTTCATCGTCTGAAATGGCGGCAAAAGGTGGTAGTGGGTTACATTTGAGATTAGAACAAGTGCCAACACGTGAGCCAGGTATTTCTCCTTATGAAATGATGCTTTCAGAAACTCAAGAACGTATGTTACTAGTTGTTGAAAAAGGTAATGAACAAAAATTCTTAGATTTATTTGATAAGCACGAATTGGATAGTGCTGTTATAGGTGAAGTTACAGATACAAATCGTTTTGTTTTAACATATGATGATGAAGTTTATGCTGACATTCCAGTTGAACCACTAGCTGATGAAGCACCTGTATATATTTTAGAAGGAGAAGAAAAAGATTATAATACTTCTAAAAATGATTATACACACATCGATGTTAAAGATACTTTCTTTAAATTACTTAAGCATCCGACTATAGCATCTAAACACTATTTATATGATCAATACGACCAACAAGTTGGTGCCAATACGATAATTAAGCCAGGACTTCAAGCATCGGTAGTACGTGTGGAAGGCACAAATAAGGCAATTGCTTCAACAATTGATGGTGAAGCGCGTTATGTATATAACAATCCATATGAAGGTGGAAAGATGGTAGTAGCTGAAGCTTATCGAAATTTAATTGCCGTGGGTGCAACACCATTAGCAATGACAGATTGTTTAAATTATGGTTCTCCTGAAAAGAAAGAAATCTATCAACAGTTGATAGATTCAACGAAAGGTATGGCAGAAGCATGCGACATTCTTAAGACACCAGTAGTTTCTGGAAATGTATCTTTATATAACGAAACGAAAGGTACTTCTATTTTCCCAACACCAGTTGTTGGAATGGTAGGTTTGATTGAAAATGTAAATTATTTAAATGATTTTGAACCTCAAGTTGGAGATAAATTATATTTAATCGGTGATACTAAGGACGACTTTGGTGGTAGTCAACTTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAINDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_000174053.1|964050_964755_+	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4R1E8	Synechococcus_phage	7.3e-48	42.1
WP_000848350.1|964754_965018_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_000666806.1|965019_965691_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase I	NA	NA	NA	NA
WP_000032740.1|965683_967873_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	3.5e-141	39.8
WP_000483720.1|967851_969336_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	1.9e-45	31.7
WP_000030811.1|969328_970357_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	3.4e-62	41.7
WP_000238669.1|970359_970926_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	6.1e-29	40.1

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_LS483310|1227268:1243475|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MKSIATIEAEQYLYDSLIIDKMGMCGCHEVVIGRKPLTHGREIVDFLTYDTRNIFRAYEIKVSKADLKSSAKLSFVGHYNYLVLPRNLYEEVKYTDLSSILKQENVGIVIIGEGIIRKSGRKTLTMGDNVMLMDSLNCALNRENVKIRRGKRLS
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MAQYLITTFKDSTGRKHTHITRAKSNQRFNEVLQK
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MKTYPALAFEHKDESGVYIGEFEGWCQDLDEAILFANKDGSKPDKKKAKEIFLREEKNLSDILKERYGEDAIQNYRPSEWFKTCNLVDVEISEEKFKELLNND
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MSNTYKSYIIAVMCITILAICLMPFLYFTTAWVIAASTGIAIFIFYDEYFFRE
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MTIYTQEINNTKFSKTANNDFLISNVEQLLKEEVLLSLISKHKTEQVPRLEMLEDYYLNRNTDILTDNRRINDYSDKADHRAVHNYAKYVTRFIVGYLTGNPITITHKDEITNEKLVDLNKINDADATNSDLAFNLSIYGRAYEIVYRDTDDKDTFKLLDSKSTFVVYDTSLDKNMIAGVRYFNVKDFDNTPIQKIEIYTTNKIYYIEVRGGSFNSIDEIPHYYNDVPIIEYLNDQFKQGDFENVISLIDLYDQAQSDTANYMTDLNDAMLAIVGNIEIDGDEAKKFRQANMVHVKPSINVNGSEGNADVKYIYKQYDVNGSEAYKTRLQKDIHKYTNTPDLSDENFSGVQSGESMKYKLFGLEQVRAIKERLFKKGLMKRYKLLFHILNLTGVHKYDYSTIDITFTPNLPKSLNESIEAFNSLNGGVSEQTRLKLLPIIDNPLEEIKKMEDEQNKVKKISDNSSFKAPFSHENEMTDINVR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1220992:1221009	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_001209962.1|1230245_1230464_+	DUF739 family protein	A0A2I6PE94	Staphylococcus_phage	4.9e-19	62.5
WP_000932238.1|1230490_1230766_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000392387.1|1231030_1231201_+	hypothetical protein	Q4ZDZ8	Staphylococcus_virus	2.4e-21	89.3
WP_000800341.1|1231189_1231396_-	hypothetical protein	A1BTY8	Staphylococcus_virus	3.3e-25	75.0
WP_001157025.1|1231456_1232140_+	phage repressor protein	A9CR56	Staphylococcus_phage	5.2e-107	85.6
WP_000072840.1|1232238_1232400_+	DUF1270 family protein	R4IH12	Staphylococcus_phage	1.1e-12	69.8
WP_000786993.1|1232486_1232804_+	DUF2482 family protein	W5RAK4	Staphylococcus_phage	1.6e-39	80.6
WP_000786634.1|1232793_1233060_+	hypothetical protein	A0A2I6PDG2	Staphylococcus_phage	3.0e-18	53.6
WP_001004327.1|1233064_1233601_+	host-nuclease inhibitor Gam family protein	A0A0H3U480	Staphylococcus_phage	1.7e-76	82.5
WP_000907597.1|1233601_1234381_+	ATP-binding protein	A0A1W6JPW0	Staphylococcus_phage	2.3e-127	88.0
WP_000702007.1|1234407_1234956_+	hypothetical protein	A7TWM8	Staphylococcus_phage	1.1e-91	92.9
WP_000929466.1|1234968_1235871_+	DnaD domain protein	A0A1P8L6F0	Staphylococcus_phage	2.9e-49	52.0
WP_000946005.1|1235871_1236162_+	hypothetical protein	A0A223LIA9	Staphylococcus_phage	7.2e-18	58.1
WP_000714410.1|1236176_1236341_+	hypothetical protein	A0A0E3T9L7	Staphylococcus_phage	1.1e-18	88.9
WP_000860979.1|1236340_1236652_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000185176.1|1236644_1237175_+	nucleotide pyrophosphohydrolase	A0A1P8VVP1	Streptococcus_phage	5.2e-22	38.2
WP_025174970.1|1237316_1237424_+	DUF1381 domain-containing protein	C8CH06	Staphylococcus_phage	3.2e-08	87.5
WP_000835355.1|1237420_1237885_+	hypothetical protein	C9E2P0	Enterococcus_phage	3.2e-20	43.0
WP_000653930.1|1238161_1238650_+	hypothetical protein	R9TMH4	Paenibacillus_phage	4.3e-07	27.7
WP_000090969.1|1238802_1239231_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A1EAE0	Streptococcus_phage	1.1e-25	45.1
WP_111686085.1|1239217_1240492_+|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	Q4ZE37	Staphylococcus_virus	2.7e-194	76.2
WP_000158568.1|1240504_1241953_+|portal	phage portal protein	Q4ZE36	Staphylococcus_virus	7.4e-196	69.4
WP_001836893.1|1241942_1243475_+|head	phage head morphogenesis protein	Q4ZE35	Staphylococcus_virus	1.9e-109	61.6
1247208:1247225	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_LS483310|1518452:1526782|DBSCAN-SWA
ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCGATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGGGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATCGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGTATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTGATTCTGTCGACTCCAATAATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATACGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAATACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGACCAGTTCGTCCAACTCTATGCGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTTTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGTTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGGACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGATATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAAACCCATCGTCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGCGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATGATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTACTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGTGTAGAATGTTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGTTGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGGTTTGCAGCTACATTTTTTACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCAGCAATACCGCATTCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCAATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGCGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCAAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTTTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCTTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAATTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATATAACCGCCATACTCATCATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAACTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGCAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTTACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGTAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCCGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGCGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAATTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAGATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTACGTCCTCTCTTTTCTAGTTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_LS483310|1518452:1526782|1520263_1521610_-|WP_001062187.1|DBSCAN-SWA
MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLTLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG
>NZ_LS483310|1518452:1526782|1519363_1520254_-|WP_000924220.1|DBSCAN-SWA
MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAYEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ
>NZ_LS483310|1518452:1526782|1522826_1523504_-|WP_000624583.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEHSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL
>NZ_LS483310|1518452:1526782|1518452_1519238_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA
MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN
>NZ_LS483310|1518452:1526782|1524964_1526782_-|WP_001217257.1|DBSCAN-SWA
MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTTFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM
>NZ_LS483310|1518452:1526782|1521723_1522824_-|WP_000683929.1|DBSCAN-SWA
MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKTMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI
>NZ_LS483310|1518452:1526782|1523634_1524741_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA
MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_001213908.1|1518452_1519238_-	metal ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	8.0e-19	28.3
WP_000924220.1|1519363_1520254_-	deoxyribonuclease IV	A0A2H4UU70	Bodo_saltans_virus	3.4e-26	36.0
WP_001062187.1|1520263_1521610_-	DEAD/DEAH box helicase	A0A1V0SIR5	Klosneuvirus	2.4e-55	34.0
WP_000683929.1|1521723_1522824_-	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	A0A1S5V250	Saudi_moumouvirus	5.2e-08	29.6
WP_000624583.1|1522826_1523504_-|tRNA	tRNA (adenine-N(1))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_001283055.1|1523634_1524741_-	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	1.1e-37	38.1
WP_001217257.1|1524964_1526782_-	DNA primase	A0A0K1LMQ9	Caulobacter_phage	7.9e-54	36.3

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_LS483310|1594355:1603398|DBSCAN-SWA
ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACAATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTATTTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTTGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAGCCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTATGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTATCACTAAAATTGTAGTTGCGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCTATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTGTTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTGTCTTTACCATTGATCTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCTACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACGCGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAATGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCCGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE
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MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000594991.1|1594895_1597169_-	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	5.2e-63	28.8
WP_000749795.1|1597371_1599651_-	protein translocase subunit SecDF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-31	35.8
WP_001160682.1|1599925_1600186_-	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	8.2e-05	35.3
WP_111686097.1|1600204_1601344_-|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	2.1e-84	44.4
WP_001019178.1|1601366_1602392_-|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_001005768.1|1602393_1603398_-	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	1.7e-05	29.1

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_LS483310|1728661:1792819|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000266096.1|1742482_1743310_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_001790712.1|1743312_1743432_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_001008551.1|1744666_1745131_-	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	5.8e-70	99.4
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WP_001836682.1|1746974_1748018_-	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A2H4PQS8	Staphylococcus_phage	1.6e-195	98.5
WP_111686099.1|1748498_1750001_-	FAD/NAD(P)-binding protein	A0A2H4PQX2	Staphylococcus_phage	1.9e-29	98.6
WP_000221177.1|1750523_1750838_+	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2H4PQT4	Staphylococcus_phage	9.8e-53	98.1
WP_000989122.1|1750837_1752130_+	arsenite efflux transporter membrane subunit ArsB	A0A2H4PQU3	Staphylococcus_phage	9.4e-227	99.3
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WP_000384171.1|1753346_1753571_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001153742.1|1754351_1754795_+	competence protein ComK	NA	NA	NA	NA
WP_001030469.1|1754781_1755225_-	hypothetical protein	A0A2H4PQT8	Staphylococcus_phage	2.4e-57	98.6
WP_001168901.1|1755520_1756156_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease SdpA	NA	NA	NA	NA
WP_001096494.1|1756595_1757309_-	transaldolase	M1PR54	Cyanophage	5.5e-19	35.3
WP_000091445.1|1757568_1757871_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001200542.1|1758126_1758492_+	fluoride efflux transporter CrcB	A0A2H4PQR0	Staphylococcus_phage	3.6e-59	100.0
WP_000623478.1|1758488_1758842_+	CrcB family protein	A0A2H4PQQ7	Staphylococcus_phage	2.6e-22	100.0
WP_000453314.1|1759224_1760058_-	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	5.4e-159	100.0
WP_000366163.1|1760269_1761178_-	NERD domain-containing protein	A0A2H4PQQ8	Staphylococcus_phage	3.4e-138	100.0
WP_000933822.1|1761302_1762496_-	methionine adenosyltransferase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	1.9e-218	99.7
WP_000109906.1|1762867_1764460_+	phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)	A0A2H4PQN1	Staphylococcus_phage	0.0e+00	100.0
WP_001834463.1|1764837_1765584_-	S9 family peptidase	A0A2H4PQM6	Staphylococcus_phage	1.4e-142	98.8
WP_000672014.1|1765588_1766062_-	nucleoside triphosphatase YtkD	A0A2H4PQM4	Staphylococcus_phage	4.7e-83	98.1
WP_000718107.1|1766127_1766385_+	membrane protein insertion efficiency factor YidD	A0A2H4PQM5	Staphylococcus_phage	7.2e-46	100.0
WP_000778525.1|1766381_1767383_-	o-succinylbenzoate synthase	A0A2H4PQM0	Staphylococcus_phage	2.2e-186	97.9
WP_000348374.1|1767387_1768866_-	o-succinylbenzoate--CoA ligase	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	8.1e-283	97.4
WP_072433592.1|1769024_1769480_-	DUF4909 domain-containing protein	A0A2H4PQN7	Staphylococcus_phage	5.7e-78	97.9
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

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Homologous phage analysis in the prophage region

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1999672:1999696	attR	NA	NA	NA	NA